Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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CP027780 | Clostridium botulinum strain Mfbjulcb3 chromosome, complete genome | 0 crisprs | DEDDh,csa3,DinG,WYL,cas3,cas14i | 0 | 0 | 5 | 0 |
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---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
297880 : 306057
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP027780|297880:306057|DBSCAN-SWA TATGAAAGAAACTATACTTGTTATAGATGATGAAGTTAAGATAATAGAAGTTATAAAATTGTATTTAGAAAATGAGGGATATACTGTTATACAGGCTACAAGTGGGATTGAGGCATTAGAAAAGCAAAGTGAGTTTAATCCTGATCTATTAATATTAGATTTAATGTTACCTGATATATCAGGTGAAAATGTCTGTGAGAGCATAAGGAGAGAATCTGAAGTACCAATAATTATGCTAACTGCTAAATCAAGTGAAGATAGTATATTAAATGGATATTCAATTGGAAGTGATGATTATATAGCAAAACCATTTAGTCCAAAGCAATTAGTAGCGAAGGTTAATGCAGTTTTGAAAAGAGTTAAGGGAAATCAATGTAAAAACTTAATTTTTAATAATGAATTAATCATAGATATTGTTAATAAGAAAGTAGAATACAATAACAAAGAAATTATATTAACTGCTTCGGAATATAAAATACTATCTATACTGGCTAAAAATCCTAATAAAATATTCTCAAGGGAAGAGTTAATGGATTATATAAGTAGAGATAATACTTGTATCTATGATAGAATAATTGATACTCATATAAAAAATATAAGAGCCAAATTAGATCAAGATAGTAAAAGTCCAATCTATATAAAAACTATTCGTGGTATGGGATATAGGTTCAATGTTTAATAAATTGAGATATAGAGTAAGCTTGATTTTTATATTATTTTCATTGAGTATCATATTTTTAGCAAACATAATAAACCATTATTGTATCGAAAAGAAGTTTAATATATATACTAGTGAAAAAATACAACAGTCGAAAATGGAAATCAAAAATAAAATATCAAATGCATACAGTAATAATTCATGGGATAAGAAAGCTATTGAGAACATAGGAACAGATGCGATAACTGGAGGATTGCTTATAACAGTTAAAGATAAAAATGATAATATTATATGGAATGCAAGGGAATATGATAATATTGTATGTGAAAAGATTTTAAATAAAATTATAGAAAATACTAATAAAGTAAGCCCAGATGTAGATATTAAAAATACATTTGATAAATTTGATCTAAAACAAGATGAAGCTTTAATAGGGAAATTAGAAGTTGAGTATATAGGTCCGATTTATTATGAAGATTCAGATGTTATATTTTTGAGAATGCTAGACAGAATATTATTTATACTAGGGCTACTATTTTTCATTATATCTATTATAGTAGGATGGTTATTGTCTTATGCTATCAGTAAGCCTATCTTAAAGGTAATAGATGCAACAAATCTTATATCAGAAGGAAATTATTCCAAAGGCATAAAAGAAGATTACAGTATATATGAAATCAATAAACTTATAAAATCAATAAATATGATGGCAGGAGATTTAGATAAACAAGAAAAAATAAGACAAGAGCTAACGAAGGATATATCACATGAGCTTAGAACCCCTATAACGACTATGCAAGCACAACTTGAGGCAATAATGGATGGCCTATGGGAACCATCCCAAGAAAGGTTAAAGAGTATATATGATGAACTTCAAAGATTAAATAGATTAACTGTATCCATAGAGGATTTATCAAGATGTGAGGATAGTAAACTAAGGCTAAATAAGTCAGAAGTAGATTTAGAGACTGTAATAACTACAATTTTAACAAATTTTGAAAAGCAGTTATTAGATAAAGATATAAATTTACAAGTAGATATTAAACATATTAATATTATGATAGATAAGGATAAAATAAGCCAGGTAATAATTAATATTATCTCAAATGCTATTAAGTATACTCCAGATAAAGGAGAGATATTTGTTAGGTGTTTTACTAAATCTGATAATGTATATATATCCATAAAAGATAGCGGAATAGGTATAAGTGATGAAGATAAAGACTATATATTTGAGAGATTTTATAGAACAGATAAGTCAAGGGCTAGAGAGACCGGAGGAGTTGGGATAGGCCTTACAATATCAAGAGAAATAGTCAAGGCTCATGGTGGCAGTATAAATGTATATAGTAAATTAGATGAAGGTAGCAACTTTGTAATAAAACTGCCAATAAAATTTTGTAGGACATAATATCTAAACTTAATTTTTATATCAATCTAGAAGACACTCTTACTTTCGATGGGCAGGAGTGTCTTTTAAATTTATCAAATTGCTTCTTATTGAAAATATGAATACTTTTAACAAGAAAGGCTCTTAAAAAATCATAAGTTTTTCAGGAACTACAGAATAGAACAAATCTTTTTTGTTTTTAAAGCATATATAGATATTTCCTACAGATATGTTTGCAGTTTTTTGCAATACGATTCATTCTCGTATCTAAATGGCATTTTGAGAAAAATTTTTAATGCTGCACTTTCTACATCCTTTTTTATTTATAAAAGCTAAAACTTTATTAAATACATTTTATGATTGGTTTTATTTTTTACTTAGGCTGAAATTTATAGAATTATTTATATAGCTCAAGTAAATAATAAACGTCTAATTTAGTTCAATGCTTTCTTAATTATTTATCACTGTGCACTAAAAGTGGATGGTTTTATATTTTCTATAAATAAATTTTAAATTTTCGTAAGAAAAAAGTTAAAATTAAAAATTTATTTTAGTATAGAATTTAACTGTAAAATAATTAAGGAGTTGGGATATATGAAGATGAAAGCAAGGAGAGTTATAGCAATATTATTAAATACTATTTTTATAACATTAGGGTTAAGCAGTAATAGTTTTGCCAAGCAAATAGACGGTACAAAGGAAATTAATAAAAAACATGTTGTTGCAGATAATAGTGAAGATTTACAACAATTTATGGATAAGTTTTTCAAGAAGAATATGGAGAAGTATTCAGTTCCAGGAGCAGCTATAGTTGTTGTTAAAGATGGTAAAGAAGTATTTAAAAAAGGATATGGATATAGCGATGTAAAAGAAAAAATATTGGTAGACCCAGATAAAACTGTGTTTCCAGCTGCTTCTGTAAGTAAGTTGTTTACTGCAACAGCTGTAATGCAATTACAGGAAGGGGGAAAAATAGATTTAAATGAAAATATTGATAAATATATAAAACCTTATAAGATTATAAATAATTATAAAGAACCAGTAACATGTAGAAATTTATTGACTCATTCTAGTGGAGTTGATGAAGCTAGTGAACTTAATGGTAGTACTAAGGATGAAAAATCAATAAAATCACAGGAATATTATTTTGATAATCATATACCTAGAGTAGTAAGAGAGCCTAATACCGCTAGTAGATATTGTAATCAAGGATATAACCTTTTAGGATATGTTGTAGAAAAGGTGTCTGGTATTAGCTATGAAAAATATATAAAGAGAAACATATTAGAGCCTCTGAAAATGGAAAATAGTTTAGTTAGACTAAAAAATAATAATACAACTAAGAGTTATGGATATGGTGGTACAGGTGGAACTTATAATGAAAGTCCTTTAGCTTATCAATATACTTCTGGATCTTCAGGAATAAATGCAACAGTTAAAGATATGGAAAATTTCATGATAGCTCACTTAAATAATGGAGAGCTTAAAGGAAATAGACTCTTAAATGAAAAAACATCAGTAATGATGAAGAATAAACAGTTTTCAAATGATAATAGCTTACCTGGAATGGGGTATGGATTTATAAGAAGTAATAGAAATGGACGGGAAATATTAAAACATGAAGGTGGATTACCATCAGGTAGCACTACTACATTATTTTTAATGCCAAAGGAGAAATTAGGAATATATGTGGCAACCAATTCTTTAAATCCACTTCCATTTAATTTTGAAGAAGAGTTTTTAAATTATTTTTATCCTAATAAAAGTAATAGTTTTAACAAAATAAAACCAAATCCATCTGAGGACTTTAGCAAATATGAGGGAACATATAGGAGCTATGATGGAATATCAAAAAGTAATATTATGAAGATTGGTTTTTTGTTTGATCCTTTAATGGATATGAGAATTGCAGATAATAAAGATGGTACATTAACTCTTAAGGAATGTACTTCTGCTAAAGAAGAAATTACCACAACTCTTGTTGAGAAAAAAGATGGAGTATTTGCAAGAAAGGATGGTAGAGGAGACTTTGCATTTAAGATAGATGATAAGGGCAAGGTAACTTATGCATTTAATGATGTAAGTCATAACTCTTTTGAAAAGATAAATTTTTTTGAAACACAAAATTTTAATATAACTATATTTATTATATCTATTGTTATGTTTATTATAAATTTAGTTGGGACAATAATTCTATTTATAAAAAGAAAGTTTAAAGAAACAGGATACAAAAGTTGTAGAAGTATTAAATTAATTAAGGGAATAAATTTATTTATTAATGTTCTTAATATAGCTGGAATTGTTGGATCAGTTATAATGGCAACTACTATGATTAGTATTAATGATTTTAGCTTTGCATATTTACTTTATATATTTTTATGTTTTCTTATAATATCAACTATTTTAAGTATTTGTGGGTTAATTATTTTAATATATATTTGGATTAGTAATTGTGAAAGAAAAGTAGAAAAAATTTATTTTACCATATTAACTATAATTAATTTTACATTCATATGGTTTATATATTATTTCAACCTTTTAGGATTCAAAATATAGCATGATACATTAATTATTTTAAAGTATGATATAATTTCATTTAGATTAGTTATATGATAGGAGTGTTAGCAGTATGTTTAATGTACTTATTGTGGATGATGAAGCAGAAATAATTGAACTTATGGAAATATATCTACTAAATGACGGTTATAAAGTATTTAAAGCTACAAATGGATTAGATGCACTTAATATAATCAATGCGGAAAATATTCATCTTGTGATTTTAGATATAATGATGCCAGGAATAGATGGGTTACAGGTTTGTATGAAAATTAGAAAAGAGTATAATATACCAATTATAATGGTTAGTGCAAAAGGACAAGAAATGGATAAAATACAAGGTTTATCTACAGGTGCAGATGACTATATAGTAAAACCATTTAGCACAATGGAATT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP027780|297880:306057|300521_302483_+|AVQ51595.1|DBSCAN-SWA MKMKARRVIAILLNTIFITLGLSSNSFAKQIDGTKEINKKHVVADNSEDLQQFMDKFFKKNMEKYSVPGAAIVVVKDGKEVFKKGYGYSDVKEKILVDPDKTVFPAASVSKLFTATAVMQLQEGGKIDLNENIDKYIKPYKIINNYKEPVTCRNLLTHSSGVDEASELNGSTKDEKSIKSQEYYFDNHIPRVVREPNTASRYCNQGYNLLGYVVEKVSGISYEKYIKRNILEPLKMENSLVRLKNNNTTKSYGYGGTGGTYNESPLAYQYTSGSSGINATVKDMENFMIAHLNNGELKGNRLLNEKTSVMMKNKQFSNDNSLPGMGYGFIRSNRNGREILKHEGGLPSGSTTTLFLMPKEKLGIYVATNSLNPLPFNFEEEFLNYFYPNKSNSFNKIKPNPSEDFSKYEGTYRSYDGISKSNIMKIGFLFDPLMDMRIADNKDGTLTLKECTSAKEEITTTLVEKKDGVFARKDGRGDFAFKIDDKGKVTYAFNDVSHNSFEKINFFETQNFNITIFIISIVMFIINLVGTIILFIKRKFKETGYKSCRSIKLIKGINLFINVLNIAGIVGSVIMATTMISINDFSFAYLLYIFLCFLIISTILSICGLIILIYIWISNCERKVEKIYFTILTIINFTFIWFIYYFNLLGFKI >CP027780|297880:306057|304734_306057_-|AVQ51597.1|DBSCAN-SWA MIEVITPISNYYDDARQVWNRAIDKYPAAIAYCKTYEDVKKSILFARKNNFKIRVRCGGHNYEGFSIANDALIIDISNLNKIQINYECNTVTVQGGAYLGQVYNFLGASEYPFPGGSCPTVGISGVVLGGGWGYSSRYFGLTCDSLLELKMIDYRGCLLTANKNINSDLYWACKGGGGGNFGIVVSMTFKLPPKVDKVTVFNIYYTKPSKDTQLKFLNTWQNWISTTSNKINMKGSIVNSAADGVNIICTGLLYGTPKKLNKLLVPFSKIESYELSYEYTSFLQATEIIASVYPRYEYFISYGRFVSETYSYETLKSLINLINEERPSGSITTELNVYGLGGQVSEIDKKDTAFYYRNSNYIILLETNFRNNLYKQDNINWININSEYIYNITSGSYINFPYYPLPNYLYDYYGGNVQRLKCIKFKYDPLNVFKFPQSIK >CP027780|297880:306057|297880_298558_+|AVQ51593.1|DBSCAN-SWA MKETILVIDDEVKIIEVIKLYLENEGYTVIQATSGIEALEKQSEFNPDLLILDLMLPDISGENVCESIRRESEVPIIMLTAKSSEDSILNGYSIGSDDYIAKPFSPKQLVAKVNAVLKRVKGNQCKNLIFNNELIIDIVNKKVEYNNKEIILTASEYKILSILAKNPNKIFSREELMDYISRDNTCIYDRIIDTHIKNIRAKLDQDSKSPIYIKTIRGMGYRFNV >CP027780|297880:306057|298550_299948_+|AVQ51594.1|DBSCAN-SWA MFNKLRYRVSLIFILFSLSIIFLANIINHYCIEKKFNIYTSEKIQQSKMEIKNKISNAYSNNSWDKKAIENIGTDAITGGLLITVKDKNDNIIWNAREYDNIVCEKILNKIIENTNKVSPDVDIKNTFDKFDLKQDEALIGKLEVEYIGPIYYEDSDVIFLRMLDRILFILGLLFFIISIIVGWLLSYAISKPILKVIDATNLISEGNYSKGIKEDYSIYEINKLIKSINMMAGDLDKQEKIRQELTKDISHELRTPITTMQAQLEAIMDGLWEPSQERLKSIYDELQRLNRLTVSIEDLSRCEDSKLRLNKSEVDLETVITTILTNFEKQLLDKDINLQVDIKHINIMIDKDKISQVIINIISNAIKYTPDKGEIFVRCFTKSDNVYISIKDSGIGISDEDKDYIFERFYRTDKSRARETGGVGIGLTISREIVKAHGGSINVYSKLDEGSNFVIKLPIKFCRT >CP027780|297880:306057|303289_304330_+|AVQ54803.1|DBSCAN-SWA MVLSIISTFIIVFSVIMELHIFHPRLYMKFINAYNKNSLFMLQFTMAIFVAFIVLMCFIFIKRINKITDYIEEISQNVNIVANGNMDIDIPIRTEDELGELASDVNKMAYSIEELMRKERQWEKQKNNLITNLSHDLRTPLTSVVGFLELIQKKKYKNDDELNHYCEVSLNKARELKSSVDQLFEFTKLSNGDIKLNICSISLHQLIEQAAIGFIPSFETSGMEYRVFSKDTGLIINGDAILLARAFENIISNAIKYGSEGKYLDIHIEKENNIAVVSFVNYGDIIEEKDVKNLFQRLYRIEKSCDKKEGTGLGLAIAKTIVDLHNGNIDIMSSKEKTEFKIRLPY >CP027780|297880:306057|302556_303252_+|AVQ51596.1|DBSCAN-SWA MFNVLIVDDEAEIIELMEIYLLNDGYKVFKATNGLDALNIINAENIHLVILDIMMPGIDGLQVCMKIRKEYNIPIIMVSAKGQEMDKIQGLSTGADDYIVKPFSTMELLARVKAQIRRYVYLNENHKQLDNKDVIEIKGITINKRNHKVHLFGTELKLTPTEYKILLLLASNGGKVFSAEDIYKEIWTEKYFEGNNTVMAHIWRLREKLEDNPKEPKIVETVWGVGYKIEA |
6 | Bacillus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
2588826 : 2645566
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP027780|2588826:2645566|DBSCAN-SWA 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63 | Clostridium_phage(55.56%) | transposase,tail,tRNA,portal,terminase,bacteriocin,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2805774 : 2835954
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP027780|2805774:2835954|DBSCAN-SWA 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34 | Clostridium_phage(42.31%) | tail,capsid,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
3188939 : 3198522
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP027780|3188939:3198522|DBSCAN-SWA 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TTCTTTAAACTTATCTTCTTCTAAATCAAAGGGCATATTTTCATTTAAATCATCTAACATATAGCACATACTCATTTTTACTCCCCACTTATTTTCTATTTTTTAAGTTTAATCTCTTCTAGACTATTCCCAGCTACTGCAAAAATAATTTTAAACTATAACAATCTATTTATTGACTCTCTTTAATATTTCCATATAAGCTTCTTTTACATTTCCCATGTTTCTTCTAAATCTATCTTTATCTAACTTTTCCCCTGTGCTTTTATCCCATAATCTACAAGTATCTGGGGATATTTCATCTGCTAAAAGGAGCTCACCATTAAATCTTCCTATTTCTATTTTAAAATCAACTAAATTTATTCCTTGCTCATCAAAGAATTCTTTTAATGTATTATTTACTTTTTCTGCTATAGAATACATTTCTTTTAGTTCCACAAAGGTTGTAAGTCCTATAGCAACTGCATGATAGTCATTTATAAGAGGGTCATTTAAATCATCATTTTTATAACTTATTTCAAACACAGTAGTATCTAATTTTCTTCCTTCTGAAAGACCTAATCTTTTTGCCATACTTCCTGCTGCTATATTTCTAACTATAACTTCTAGTGGAACTATTTCTACTTTTTTGCAAAGCTGTTCTCTTTCATTTATCTTTTCTATGAAATGTGTTTTTACGCCCTTTTTTTCTAAAAGTTCAAATAACATTGCTGTTATAGAGTTGTTCATAACTCCCTTATCTTCAATAGTCCCTTTCTTTTCCCCATTAAAAGCTGTGGCATCATCTTTATAATACACAACAACTGTATCCTTATCATCCGTTCTGAATATTTTTTTAGCCTTTCCTTCATATAACATATCCTTCTTTTCCATTATAACTCCACTCCCTCTTTGTTATCATTTATAAATTTTTCTTTCATATCTTTTCTATATTCTATAAGTTTTTCTTTTAATTCATCATATTTTAAAGATAATATTTGTACCGCAAGCATTCCTGCATTATAACTATTATTTATACCCACTGTAGCTACAGGTATAGATTTGGGCATTTGAACTATAGATAAAAGTGAATCCATTCCTCCAACTGCGGCTTCTATAGGCACTCCTATAACCGGAAGAATCGTATGAGAAGCTATAACCCCAGGTAAATGCGCTGCAAGACCTGCCCCAGCAATTATACATTCATAACCTTCCTTTTCTAAATCTTCAATTGTTTCCATCAACTTTTCTGGTACTCTGTGCGCTGAAAGTATGTAAGCTTTATATTCTATACTAAACTCTTTTAAAGCTTTAGCCGCTCCCTTGATTTTATCAGTGTCAGATTTACTTCCAAAAATAATAGCTACTTTCATGTACTAGACCTCCTTATATTTAAATATATAAAAAATTCCGCTAAGATTTCTATGGAGAATCCTAAAGCGGAACTTAAGCGCACTGCAAAAGCATAGCTAAGATTCATCCATAGACAGGGAATTTATGGTTCCCTCGTAGAGACTCTCAAACCTTATTATTGAGATTATATGGATGATATATTCATTTGTTTTATGTACTCATGGTAACATACAATTCTTAATAAATCAACATACTTTTATAAAAACATTCGTATTTTATTGGTATTTTATTTATTTTTTAATAATATCATTCGTAACGGAACGAACAATTAGTCAAGTGAGAAGTTTACTCAAATATATATTATATTGTAATAGAAATAATTTATAATATGAAAATAAAATAGATTTAATTTTTATATATCAAGCAAAATAATATATGGTAATAAACATATGAATAAACTTTAACATTTTCTAATCTTTTTAAATCGGGATCTTTTGTTATTAATCAAAGAATGAAGGTAAAAAACCGATGGCCAAGCCACGCATGACTTTTCCACCGGGTAAAAAATTTTTAATAGAGAGGATTTGAAATCCTTAGTCAAATAATTGATCTATCTATACGTGTATTTTTTATATTTGCATGGTTGAAATTAAATCTATTTTAAAATAGTGCTATCTAAGATAATTATTTTTTTCTTCTATAAGCAGTATCTTTGAGAGGAAGTTTTTTTCTAAATTCTCCATCAAATTTATAATACGCTCCTTGGGCGGCTGGCGCTGTTGGTATGGTTGTAATTTCTCCTATTCCTTTTGCACCATAAGCTAAATCATTAGTATTCTTTTCAATTATTGTTGTTTCAATTTCTGGTATGTCAGTAGCCCTAAACAAACCTAATGTACCAAATTTAGCCGTTGGAATAGATTTATTTAAAGGATAATCTTCTGTAAATGCATATCCAAGCCCCATAACTATTCCTCCCTCAATTTGCCCTTCCACATTAGTTAAATTTATAGCTTTTCCCACATCATGAGCTGCAACCACTTTTTCTACTTTTCCCTCATCATTAAGAATAACCACTTGTGTTGCATAACCATAAGCCACGTGACTTACTGGATTCTTTTTATCAGAATTAATAGGATCTGTAACCCCTTGATATTCCCCATAAAATTCTTCACCTTCACACTCTTCTAATGATGTAGTTAATAATTTTTCCTTAAGCTTTAATGATGCTATTCTTGTGGCTTCTCCAGTAAATACTGTTTGTCTTGATGCTGTAGTTGTCCCTGAATCTGGTGCAAATTTTGTATCTGGTAAATCTAAAATTATCTGTTCTGGTAATAAACCTATTGTTTCACATATTATTTGTGTAAGAATTGTTCCTAATCCTTGACCTATACAAGCTGCACTAGTTCTTATATGAACCTTTCCATCTATTACTACTAAGTTGCACCTTCCAATATCTGGTATTCCAACACCAACTCCTGAATTTTTCATACAACAGGCTATTCCTGCACATTTACTCTTTTCATATACATCTTTAACAGCTAATATACTTTCTTTAATTGCAGTTCCTTTATCAGCAATTTGTCCATTAGGCAGTGCATCTCCAGGTTCTACTGCGTTTTTAAATCTTATTTCCCAAGGAGATATACCAACTTTTTCAGCTAAAAGATTTAAGTTGCACTCTGATCCAAAAACTGATTGTGTTACTCCAAATCCCCTAAAAGCTCCTCCTGGGGGATTGTTAGTATATACAGCCGTACCCTTTATTTTCACATTAGGGCATTTATATGGGCCAGCTGCATGAGTACAAGCTCTTTGAAGTACAGGCCCTCCTAATGATGCATAGGCACCAGTATCTGATATAATATCTGCTTTAAAAGCTGTTAAGTTTCCTTTTTCATCACAAGCAGTAGTAATTGTCATCTCCATAGCATGTCTTTTAGGATGAATCTTAATACTTTCTTTACGACTTAATGTTACTTTAACAGGTTTTTTAATAATCCATGCAAGAAGAGCCGCATGATGTTGTACACTCATATCTTCTTTTCCACCAAAGCCTCCGCCTACATATTTGCTAATAGTCCTTACTTTTTCTTTAGGCAGTCCCAAAAGCTCTGAAATCTCTCTTTGCTCATCATATATACCTTGGCTTCCTGTATAAATAATAACTCCATCTTCATCTGGCATAGCTAAAGCACTTTCAGGCTCTAAAAAAGCATGTTCTGTAAAGGGAGTGGAATAGTGATTACTAACCACATATTTAGAATTAGCTATTGCCGCATCCACATCTCCTCTATTAACTTTTTCTACTGTCAACACATTTCCCTTAGGGTGAATTTTAGGGGCATCTTCATCCATTGCCATATCAGGATTAGAAATAGGTTCTAATTCTTCATATTCTACTTTTATTAAATTAAGTATTTCTTTTAAAGCTTTCTTATTTTTTGCTGCTACTAAGGCTACTGAATCTCCAACATACCTTGTTTCTTCACCTACATCTATCATTGCTGGCCAATCTTTTATAATGTGTCCTATATATCTATTTCCTGGAATATCTTTTGCTGTAATAATTGTTTCTACATCTGGATGTTTTAAAGCTTCACTTATATCAATACTTTTTACTAATGCTCTAGGATATTTTGTTCTTAAAGCAGAGCCATAAATCATCCCTTCTACTTTCATATCATCTACATATTTTCCTATACCCAAAATTTTATCTTTTGCATCTATTCTTGGAATATTTTCACCTATTTTTCCTTTATATTCTTTCGCAAATGGAAGTTTACCATTTCTAAATGCCTCTGCTGCCATTTCAATAGCTTTTATTATTTTCACATATCCAGTACATCTACATACATTTCCTCTAATAGCAGTTTTAATTTCTTTCTTATTTGGATTTAGATTTTTATCTAAAAGTGCCTTTGCACTTATTATCATCCCTGGAATACAATATCCACACTGTACTGCTCCAGCTTTAGAAAAAGCCCAAGTAAAAACATCCTTTTCAAATTCTGTTAACCCCTCTACAGTCTTAACATCTTTTCCATTCACCTTTGCAGTTGTACATATACAGGCTCTAAGTGCCTTACCATTAACAAGTATCATACAGGCTCCACATGCTCCTTCTGCACACCCATTTTTTACTGAAGTTAAATCCTCATTATCCCTCAAATATTCAAGTAAATTAATATCCTCTGAAACAGATACATTTCTTTCATTTAATATAAATTCATACACATTTATTACCCCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP027780|3188939:3198522|3190652_3191270_-|AVQ54110.1|DBSCAN-SWA MFKIAVLVSGGGSNLQSIIDKIEEGYIKNCKIEMVIGDRSNIYGIERAEKKGIKTLTLDRKIYKSNLSNKICECLYENVDLIVLAGWLSILNGDLINKFENKIINIHPSLIPSFCGDGMYGIKVHQRALEYGVKVSGCTVHFVDEGTDSGPIIIQKSVPVFAEDTAEILQKRVLEKEHEALPEAIKLISEEKVKLQGRKVFIKTY >CP027780|3188939:3198522|3195951_3198522_-|AVQ54115.1|DBSCAN-SWA MGVINVYEFILNERNVSVSEDINLLEYLRDNEDLTSVKNGCAEGACGACMILVNGKALRACICTTAKVNGKDVKTVEGLTEFEKDVFTWAFSKAGAVQCGYCIPGMIISAKALLDKNLNPNKKEIKTAIRGNVCRCTGYVKIIKAIEMAAEAFRNGKLPFAKEYKGKIGENIPRIDAKDKILGIGKYVDDMKVEGMIYGSALRTKYPRALVKSIDISEALKHPDVETIITAKDIPGNRYIGHIIKDWPAMIDVGEETRYVGDSVALVAAKNKKALKEILNLIKVEYEELEPISNPDMAMDEDAPKIHPKGNVLTVEKVNRGDVDAAIANSKYVVSNHYSTPFTEHAFLEPESALAMPDEDGVIIYTGSQGIYDEQREISELLGLPKEKVRTISKYVGGGFGGKEDMSVQHHAALLAWIIKKPVKVTLSRKESIKIHPKRHAMEMTITTACDEKGNLTAFKADIISDTGAYASLGGPVLQRACTHAAGPYKCPNVKIKGTAVYTNNPPGGAFRGFGVTQSVFGSECNLNLLAEKVGISPWEIRFKNAVEPGDALPNGQIADKGTAIKESILAVKDVYEKSKCAGIACCMKNSGVGVGIPDIGRCNLVVIDGKVHIRTSAACIGQGLGTILTQIICETIGLLPEQIILDLPDTKFAPDSGTTTASRQTVFTGEATRIASLKLKEKLLTTSLEECEGEEFYGEYQGVTDPINSDKKNPVSHVAYGYATQVVILNDEGKVEKVVAAHDVGKAINLTNVEGQIEGGIVMGLGYAFTEDYPLNKSIPTAKFGTLGLFRATDIPEIETTIIEKNTNDLAYGAKGIGEITTIPTAPAAQGAYYKFDGEFRKKLPLKDTAYRRKK >CP027780|3188939:3198522|3191397_3192393_-|AVQ54111.1|DBSCAN-SWA MVSYKEAGVNIEEGYKSVDLIKKHASKTFTKGVLNNLGSFAGMFELPKYKNPVLVSGTDGVGTKLDIAFRMKKYNTVGIDCVAMCVNDILCHGAKPLFFLDYIACGKLEAKVAAQLVEGVSNGCIQSECALIGGETAEMPGFYRDGEYDIAGFAVGIAEKDEIIDGSKIENGDILIGIASSGPHSNGYSLIRKLVEDLHKDFEGDKIGNALLTPTKIYVKPIMKLLEKYNIKGMAHVTGGGFYENIPRMFKEDFTAVINKKSYPLPNIFSHLTSLGIEEDHMYNTFNMGIGFVLCVNEKDGEDIIKDLIEMGEKGYKIGYVKKGDKSVELI >CP027780|3188939:3198522|3188939_3190439_-|AVQ54109.1|DBSCAN-SWA MIKRALISVFDKTGILDLAKFLESRDVEIISTGGTYKHLKENGVKVIDIEEVTGFPEMLDGRVKTLNPLIHGGILAIRDNEEHMKVIEEKGINPIDMVVVNLYPFFNKVEENLSFDEKVEFIDIGGPTMIRAAAKNFKDVVVLTDTKDYENVIDEIKENDQVNIKTRKKLAGKVFNLMSAYDAAISNFLLEEEYPEYLTLSYKKNMDLRYGENPHQTAAYYTSTVGKYPMKNFEKLNGKELSYNNIKDMDIAWKTVCEFEEVACCALKHNTPCGVAIGDTVQEVYTKAYECDPISIFGGIVAFNRKVDKETAENLAKIFLEIVVAPDFDEDALEVLKNKKNLRVIKCEEKSTESKDMAKVDGGILVQKGDNKLLEDTKVVTEKSPTEKEMKDLIFGMKVVKYVKSNAIAVVKDGMAKGIGGGQVNRIWAAKEALDRAGDGVVLASDAFFPFGDVAEEAAKWGIKAIIQPGGSIRDEESIKVCNEKGISMVFTGIRHFKH >CP027780|3188939:3198522|3194807_3195287_-|AVQ54114.1|DBSCAN-SWA MKVAIIFGSKSDTDKIKGAAKALKEFSIEYKAYILSAHRVPEKLMETIEDLEKEGYECIIAGAGLAAHLPGVIASHTILPVIGVPIEAAVGGMDSLLSIVQMPKSIPVATVGINNSYNAGMLAVQILSLKYDELKEKLIEYRKDMKEKFINDNKEGVEL >CP027780|3188939:3198522|3194103_3194808_-|AVQ54113.1|DBSCAN-SWA MEKKDMLYEGKAKKIFRTDDKDTVVVYYKDDATAFNGEKKGTIEDKGVMNNSITAMLFELLEKKGVKTHFIEKINEREQLCKKVEIVPLEVIVRNIAAGSMAKRLGLSEGRKLDTTVFEISYKNDDLNDPLINDYHAVAIGLTTFVELKEMYSIAEKVNNTLKEFFDEQGINLVDFKIEIGRFNGELLLADEISPDTCRLWDKSTGEKLDKDRFRRNMGNVKEAYMEILKRVNK >CP027780|3188939:3198522|3192564_3194013_-|AVQ54112.1|DBSCAN-SWA MSMCYMLDDLNENMPFDLEEDKFKEECGVFGVFSKDNESKSAEITYYGLYALQHRGQESAGIVVSDGEKFKYHKGMGLVSDVFSKETIEGLKGNSAIGHVRYSTTGASKSDNAQPIVGTYKLGSIAIAHNGNLVNAAVIRELLEDGGCIFQTSIDTEVLLNLIARSAKKGIDKAVVDAIQVIKGSYAIVILTEDKLIGARDPHGIRPMCLGKIGDDYLLSSESCAFDCVGGEFIRDIEPGEIVIIDESGINSIKFAEKTRCHTCAFEYIYFARPDSTMDSINVYESRVRAGRKLYEEYPVEADIVIGVPDSGIPAAVGYAEASEIPYGIGFIKNKYVGRTFIAPSQELREKAVSVKLNPLKINVEGKRVVIIDDSIVRGTTSKRLVQTLRKAGAKEVHFRVSSPVVKYPCYFGIDTPYRKDLIGAHSEVEEIREKIGADSLAYISMEGLVETLNKDKGFCLGCFNGVYPISAPIEMPKDSLE |
7 | Synechococcus_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
3332816 : 3361949
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP027780|3332816:3361949|DBSCAN-SWA CTTAGCTTTTATATAAAAATCTATATATATTATATATAGCCCTTACCTTTTTTACATATTTGTCTGTTTCCTTAAAAGGTATATAATGAAGACTTTCACCGTCTTTTGAATGCTCTGAGTCCTTTAACCACTTCTGAACATTTCCTCTACCTCCATTATATGCAGCTAATACAAGATCCATATTACCATCGAATTCTTCTTTTAAATTATTTAAATACCAACATCCCATTTTTATATTAGTTTCTGGATCTTTTAAATCATTAATATCAAAATCTTTCATTCCCATTTTTTCTGCTACCCATTTTCCTGTCTCTGGAGTTATTTGCATAAGTCCCTGTGCATTTTTTTTAGAGGTAGCATCTTTTTTAAAATTACTTTCAGTTTTTATAACTGCTGCTACAAAGTAAGGATCTAATTTATGTTCATTAGCATACATATCTATATAATCTCTATATTTCATAGGGAAAATATATTTTGCTATAGTTGTTATATTTATTAATAAAATAATTGTTAATATTAAAATCAAAAGTCTTCTTAAAAACTTCACTTTTTTTTGCCCTAATATTAGAGCACTCCCCCTTTCTGTTTTGCTTTAATCATTACTTCCATAAAAATCTTATCTAATTCTCCCTTTGTATTTTCTATATCTTTAGAATTATCTATTATATAATCTACAAACTTCTTCTTTTCTTCCATAGACATTTGAGCATTTATTCTGTTTATAACTTCCCCTGTAGTTAATCTATCTCTTTTTACAACCCTATTTATTTGTGTATTTTTATCCACCCAAACTAATATATTTATATCCATATATTTATATAACCCCTGTTCTATTAATGTAGGAGCATCTAAAACACAAATTTGTTCTTTATTTTCTTCTAGTTCTTTTACTCTTCTAAACGTTTCTTTTATTATATAAGGCATTATTATATTTTCATATTCTATTCTTCTATTTTTATTTCTGAATATATAACTACCAAATTCTCTTCTTTTTAAATGCCCATTATCATCTACAAATTCTTTACCGAAAACTTCTTTTACCTCTATTAAGATTTCTGGATATAATCTTAATACCTCTCGGCTTATTTTATCCGCATCTATTACCGGTATATTTTTTTCTTTTATCATTTCTGATATAGTACTTTTGCCAGCACCTATACCACCTGTAAGCCCAATTTTAAAAATACCTTCTAAGCAATCCATAAAACAACTCCCTACTTTGCTTCATACCAATTGTTACCTATATTTATATCCACGTCTAGCCCAACCTTTAATTCTAAAACCTGCTCCATTTCTTTTTTTACTAAAGCTTTAACTTTTTCTAGTTCACCTTTATAAACATTTAATATTAATTCATCATGCACTTGTAATATTATACTACTTTTAAAATTATCTTCTTTTAATTTTCTATGAACATTTACCATAGCTAATTTTATTATATCCGCTGCACTTCCTTGTATTGGGCTGTTCATAGCTAATCTTTCCCCTGCAGCTTTAACTATTTTATTTGAAGATTTAACCTCTTTTATGTATCTTCTTCTATTTAATATGGTAGTTACATAACCCTTCTGGATAGCCTCTTCCACTATATTTTCTAAATAAAGTTTTACATTAGGATATCTCTCCAAATAAGCATCTATATACTGCTTTGCCTCTTTTCTAGTTATATTTAAATCTTGGGATAAACTAAAGTCTCCTATACCATAAACTATACCAAAATTAACTGCTTTAGCATTACTCCTCATAAGAGGGGTTACTTCATCTATTGGAACTTTAAACACTTCTGATGCAGTTTTAGTATGAATATCATCATGTTCATTAAAAGCACTTATCATATTTTTATCATTAGATATATGTGCCAATACTCTTAATTCTATTTGTGAATAATCCGCTGAAAGTATTACAGAATCCTCTGTATTTGGAATAAATACCTTTCTTATTTCTCTTCCCATTTCATATTTTATAGGTATGTTTTGAAGATTAGGCTCTGTACTAGATAATCTTCCTGTAGCTGTAACAGTTTGATTAAAATTTGAATGTATTTTCCCATCTTCATCTATAGCAGCTTTTAATCCTTCTATATAAGTAGAATATATTTTTGTTAACTGTCTATAATAAGTTATCTTATCTATTATTGGATGCTTATCTCTTAATTTATCCAGTACCTCTGCATTAGTAGAATATCCTGTCTTAGTTTTCTTTATAACGGGTAAATCTAATTTTTCAAAGAGTATTTTCCCTAACTGTTTAGGAGAATTTATATTAAATTCTTCCTCAGACATTGAATATATTTCTAACTGAGTGCTTTCTATTTCACCTTTAAATTTTTTCTCTAACTGTAAAAGTATATTTTTATCAACTTTAAAACCTTCTGTTTCCATAGCTGATAATGTCTCTGTAAGAGGTTGTTCTACCTTATATAATAATTCTTCTATATCTTGCTCTTTTATCTTTTCTTCCAATACTTTGTATAATTTAGGCATTATATTAGCTTCTCTTATTTTTAGATCTTCATCTTCTCTATTTATATTTTTAAACAAATATTCTGAAGCTAAACTAGATATTTCATATTCTTTCCTAACTGGATCTATTAGATATGCAGCTAAATTTATATCAAAATTTATACCATTAAACTCTATTCCTAGTTTTCTAAGGACAGTCCTTGGATTCTTGGAATCATAGGTAATTTTTTTAATTTCTTTACTTTCAAATATTTCTTTACACACTTCTATAAATTCTTCTTTAGTATCCTTTAGCAAAGTTTCAAAGTCTATTCTATAAACTTCATCTTTAAAACTAACATATAATATTTTTATTTTAGATTTAGAAAATAAAGCTATATCCTCTAATTCAAAATATAGATATAATTTATTTTCTTTATATTCTATTATATTATCTTTTAAACCTTTAAATTCTTCTATAGAAACTATATTTTTATAAGAAATTTCCTCTTCTACAGTTTCTTCCTCATTACTTTTACCTACTTTATTCATTAAAGATTTAAATTCTAATCTTTGAAGCATTTCTCTAACTTTGTTTATATCATATTCTTCCTTTGATTTTATCTCTTCTAAACTCATGTCTATGGGAACATTACACATAATAGTAGCTAGTTTTTTGCTAAATATGGCCTGCTGACTATATTCATGTAAATTTTCTTTTAATTTCTTTCCTCTTATGTTTTCTATATTTTCAAGTACTGTTTCTATACTTTTATATTCCTTTATAAGCTTGAAGGCAGTTTTTTCACCTATTCCAGGTACTCCAGGTATATTGTCAGAGCTATCTCCCATAAGACCTTTTACATCTATAAATTCTTTAGGAGTAACTCCAAACTCCTCTATCATTCTATTTTTATCATAAATTTCTTTTTCTGTAATACCCTTTTTAGTTATAACTACTTTTACATTATCCGTAGCCAATTGTAGAGCATCTTTATCTCCTGTAACTATGTAAACTTCTATTCCTTTTTCCTCTGCAAATACAGACAAAGTTCCTATTAAATCATCTGCTTCAAATCCATCAATTTCAAATATATTTATAGCCAATGCGAATAAAAGATCCTTTACTATAGGAAACTGCTGTGCAAGTTCCTCTGGCATTTTTTTTCTACCTGCTTTATAATCCTTATATTCTTCATGTCTAAAGGTAGGTGCCTTTCTATCAAAAGCTGCTACTATATAATCTGGTTTTATCTCTTCTTTCATTTTTAAAAGCATATTTACAAAACCATATATAGCATTAGTATGAATTCCCTCTTCAGTCATAAGATCAGGAAGTGCATAAAAAGCTCTATTTAATAAACTATTACTGTCTAATATTAATAATCTTTCTTTATTCATAAATGAACCTCCAAATTTTACATTTCTCTCATATATTTTTTTAGCGTGTTGAAATCATCACAAGGATATGTGCTTAAAATCTCTTTTAATATTTCAAAGGCACATACATTTTCCAAAACTATAGAAGCTGGCACAACACCACAAACATCAGATCTTTCATATCTATTTTCTACATTGATTTTTTCTTTTAAATTTATAGTTTTTATAGTTTTTTTTATAGATGGTATTGGTTTCATATAAACCTTTATTATTATGTCTTCACCATTAGATACCCCAGCTTCAATTCCTCCAGCATTATTGCTTTTTCTTTTTATATTATTTTCATCATAATATATTTCATCATTAAATGTGCTGCCTCTTTTATTTAAATCTAAGCCTTCCCCAAACTCTACTGCCTTTATCCCTTGTACAGACATAATAGAATAACTTAATAGGGCGTCTAATTTTCTATCCCATTGAGTATAACTTCCTATACCTACTGGCATACCTTTTACGGATATATATATACTTCCACCTATAGTGTCTCCTTCTTTTTTACAGTTATCTATTTCATCCATCATATTTTTTTCTGCTTTTTTATTGTAACATCTTAGAAGACTATCTTCTATTTCTCTATATACATCATTATCATATATATCTACGTTTTCATCAAATATTTCTCCTATACTTTGGATTTTACTTCTTATATCTATACCTAATAATTTCAATATATATTTACACATAGCACCTACAGCTGTTCTAATAGCTGTTTCTCTTGCTGAGGTTCTCTCTATTACATTTCTTATATCTCCTGTATTATATTTAATGTGTCCAACTAAATCTCCATGACCTGGTCTAGGAACAAAAATTTTATCTTTATCTTCTGCTTCTTTATCCATAAGTTCTTTCCAATTATTATAGTCTTTATTATAAATAATTAAAGTTATGGGATTCCCTGTAGTTTTGTTGGCTCTGACACCGGACCATATTTCCACTTTGTCCTTTTCTATTGTCATTCTTTTTCCTCTACCATAGCCAGTCTGTCTTCTTTTTAATTCCTCATTTATAAAATCTATATCTATATGAATATTTGATGGTATACCTTCTATTATAGCTGTTAATGCCCTTCCATGAGATTCTCCTGCATCTAAAAATCTAAGCATATTATCACTTCCCCTA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33 | Clostridium_phage(76.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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