CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
CP028109	Fusobacterium nucleatum subsp. nucleatum ATCC 23726 chromosome, complete genome	0 crisprs	WYL,csa3,DEDDh,cas6,cas8b2,cas7,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2,DinG,PD-DExK	0	0	1	0

1. CP028109

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	1498385 : 1505818	8	Prochlorococcus_phage(33.33%)	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>CP028109|1498385:1505818|DBSCAN-SWA
AATGAAAGTAGGAATTATATTTGGTAGTAAATCAGATGTTGATGTAATGAAGGGAGCAGCAGACTGTTTAAAAAAGTTTGGGATAGAGTATTCTGCACATGTTTTATCTGCACATAGAGTTCCAGAACTTTTAGAAGAAACTTTGGAAAAATTTGAAAAAGAAGACTATGGAGTTATCATTGCTGGAGCAGGACTTGCAGCACATTTACCAGGAGTTATTGCTTCAAAAACTGTTTTACCTGTGATTGGAGTACCTATAAAAGCTGCAGTGGAAGGTTTAGATGCACTGTTCTCAATAGTACAAATGCCTAAATCAATTCCAGTTGCAACTGTGGCAATTAATAATTCATATAATGCAGGAATGTTAGCAGTAGAAATATTAGCAATTGGAAATAAAGAATTAAGAGAAAAACTTTTAGAATTTAGAAAAGAAATGAAAGAAGATTTCAAAAAAAATATACATGTAGAATTATAGGAAATATAAAGAAAATTATTCATTACTAAGTAGATTTTTTATCTAAAATCTGCAATCGTAACTCATTTATTTTCTTTATATAATAAATTAAAATGAATATTTTTATTAAAAACTAGGAGGAAATAGAGATGGAAAAAGGAAAATTTATTTATGAAGGAAAGGCAAAACAATTATATGAAACTGATGATAAGGATCTAGTTATTGTTCACTATAAAGATGATGCAACAGCGGGAAATGGAGCAAAAAAAGGAACTATTCACAATAAGGGAATAATGAATAATGAAATAACAGCTTTAATATTTAATATGTTAGAAGAACATGGAATAAAAACTCATTTTGTAAAAAAGTTAAATGATAGAGATCAATTATGTCAAAGAGTAAAAATATTCCCTCTTGAAGTAATAGTTAGAAATATAATAGCTGGTTCTATGGCTAAAAGAGTTGGAATAAAAGAAGGGACTAAAATAAATAATACTATATTTGAAATTTGTTATAAAAATGATGAATACGGGGATCCTTTAATAAATGATCATCATGCAGTGGCAATGGGACTTGCAACTTATGATGAATTAAAAGAAATTTATGATATAACTGGAAAAATTAATAATCTTTTAAAAGAAAAATTTGATAATATTGGAATAACATTAGTAGATTTTAAAATTGAATTTGGTAAAAATTCTAAGGGTGAAATTTTACTTGCTGATGAAATTACTCCTGATACTTGTAGATTATGGGATAAGAAAACAGGAGAAAAATTAGATAAAGATAGATTCAGAAGAGATTTAGGAAACATAGAAGAAGCATATATAGAAGTAGTTAAAAGATTAACTGAAAAGAAATAATAAAAATTGTAGAGGCTATTACAAAAAAGGAGTATTAATAAGAAATGGGAATATTAGCTTTACATTCAAAAAAAGTTAGAAATGATTTAGTGGGAATCGCATATTATGGAATGTATGCTTTACAACATAGAGGACAAGCAGGAGCAGGATATACTATCTGTGACTCTAAAACTAATAATGAAGTAAGAATAAAAACTATTAAAAATGTAGGACTTGTATCAGATGTATTTAAAGTTGAAGATTTTCAAAAATTTACTGGAACTATCTTAATAGCTCATACAAGATATGGTAGTAAAAATACAGTTTCTTCAAGAAATTGTCAACCTGTTGGTGGAGAATCTGCTATGGGTTATATATCTCTTGTACATAATGGTGACATATCAAATCAAGCTGAATTGAAACAAGAATTATTAAACAATGGTTCTTTATTCCAAACAGCAATAGATACTGAAATTATACTAAAACTTTTAAGTATCAATGGTAAATATGGTTATAAAGAAGCAGTTTTAAAAACAGTTAAAAAATTAAAAGGTTGTTTTACTCTTGGAATAATAATAAATGATAAACTTATAGGAGTTCGTGATCCTGAAGGATTAAGACCATTATGTCTAGGTAGAATAGTTGAAAATGATATGTATGTTCTGGCTTCTGAAACTTGTGCATTAGATGCTATTGGTGCAGAATTTGTGAGAGATATAGAAGCAGGAGAAATGGTAATTATAGATGACAATGGAGTGGAAAGCATAAAATATAAGGAAAGTAGTAAAAAAGCAAGTTCATTTGAATATATTTATTTTGGAAGACCAGATAGTGTTATAGATGGAATTAGTGTTTACGATTTTAGACATCAAACAGGAAAATGCTTGTATGAACAAAATCCGATAGAAGCTGATATTGTCATTGGTGTTCCTGACTCAGGGGTTCCAGCAGCAATAGGATATTCTGAAGCAAGTGGAATACCTTATTCAGCAGCACTTTTAAAAAATAAATATGTAGGTAGAACATTTATTGCTCCTGTACAAGAATTAAGAGAGAGAGCAGTAAAAGTTAAATTGAATCCTATTAAAGAATTAATTAAGGGAAAAAGAGTTGTAGTTATAGATGACTCTATTGTTCGTGGAACAACTTCTAAAAAATTAATAGATATTTTATTTGAAGCAGGAGCAAAAGAAGTTCACTTTAGATCAGCTTCACCAGTTGTTATTGAAGAATCATATTTTGGAGTAAATATAGATCCTAATAATAAGTTAATGGGAAGCTATATGAGTATTGAAGAAATTAGAAAAGTAATAGGAGCAACAACTTTAGATTATCTTTCATTAAAAAATTTAAAGAAGATTTTGAATGGTGGAAAAGATTTTTATATGGGTTGCTTTAAGGAGGATGAATAATGATAAATTCTTATAAAGATTCAGGTGTTGATAAAGAAGAAGGATACAAAGCAGTTGAATTAATGAAGAAAAATGTTTTGAAAACTCATAATAAATCTGTTCTAACAAATTTAGGTAGCTTTGGAGCTATGTATGAATTAGGACAATATAAAAATCCTGTTTTAATTTCTGGAACTGATGGAGTTGGAACTAAATTAGAAATTGCTATGAAGCAAAAAAAATATGATACAGTTGGTATAGACTGTGTTGCTATGTGTGTAAATGATGTATTATGTCACGGAGCTAAACCATTATTTTTTTTAGATTATTTAGCTTGTGGAAAACTTGATGCAGAAATTGCTGCACAATTAGTTTCAGGAGTTACAGAAGGATGTTTACAATCTTATGCAGCTTTAGTAGGGGGAGAAACTGCTGAAATGCCAGGCTTTTATAAAGAAGGTGACTATGATATAGCAGGTTTCTGTGTTGGAATAGTTGAAAAAGAAGATTTAATAGATGGTTCAAAAGTTAAAGAAGGAAATAAAATAATAGCAGTGGCTTCAAGTGGATTTCATAGCAATGGATATTCATTAGTAAGAAAAGTATTTACTGATTATGATGAAAAAATTTCTTTAAAAGAATATGGAGAAAATGTAACTATGGGAGATGTTTTATTAACTCCTACAAAAATTTATGTAAAACCTATCTTAAAAGTTTTAGAAAAATTTAATGTAAATGGTATGGCACATATAACAGGTGGAGGTCTATATGAAAATTTACCTCGTTGTATGGGAAAAGATTTATCTCCAGTAGTATTTAAAGATAAGGTAAAGGTTCCTGAAATTTTTAAATTAATTGCTGAAAGAAGTAAAATAAAAGAAGAAGAATTATTTGGAACTTTCAATATGGGAGTAGGTTTTACTTTAGTAGTAGAAGAAAAAGATGTTGAAGCTATCATTGAATTATTAACTTCATTAGGGGAAATTGCTTATGAAATAGGCCATATTGAAAAAGGAGATCATTCTTTATGTTTAAAATAATAGTGTTAGTATCTGGTAGTGGAACTAATATGTTGCAACTTATAAAAAATAATATAAAAATAGATTGTATAATTGCTGATAGAGAATGTAAGGCAAAAAATATTGCAGATGAATATAAAATTGATTTTGTTCTTTTAAATAGAAATAAAGAAATTTCTAAAAATTTATTAAAAATATTTGAAGAAAGAAAGCCTGATTTAATTGTATTGGCAGGATTTTTATCTATATTAGATGGAGAAATTTTAGAAAAATATAAGAATAAGATTATAAATATACATCCCTCATTACTTCCAAAATATGGAGGGAAAGGAATGTATGGTTTAAAAGTTCATCAAGCAGTATTTGAAAATGGAGATAAAGAAAGTGGTTGTACAGTACATTATGTAACTTCAAATGTTGATGCTGGTGAAATTATAGGACAGGAAAAAGTTGATATCAGTATGGCAAAATCTCCAGAAGAAATACAAAAAATAGTCTTAGAAAGAGAATGGAAATTATTACCAAGAGTTGTAAAAAAATTGATTAAATAATTTTCAGGGAGGACAGCCTATGGAAAAATTAGATGGAGTAGCTAATACATTATATGTACCATTATATGGAAGAATTTATGTGTCAAAAAAATTTCCAGAATATTTTTATGATGAAATGGCATTAAAAATAGAAGAGAAATTTACATCAGGTATTTCTAAAGGTAGTTTTGAATATACAAATATGGCTTATGCTGCTAGATATTATAATATGGATAAGATGATAATTAAATTTATAAAAGAACATAAAATATCTAATATTGTTTTACTAGGAATAGGTTTAGAAACAGCTTATGATCGTATAACTCAAAAATGTGGACTAGGAGAAGTAAATTATTATGGTATAGATCTTCCAGAGGTAATTGAAATTCGTAAAAAATATTTTGGTGAAAGAAAACAAGAAACATTAATAGCTGGGGATATGTTTGAAATGAAATGGAAAGAGCAAATTGACACATCTATACCGACACTTTTAATTGTTTCAGGGGTATTTCAATATTTTTTTGAAGATAAGATTATTGAATTTATTAAAAATTTAAAAAAAGAATTTCCTTATGGTGAGTTAATTTTTGATACTGCAAGAAAAAAAACTGGTTTAAGATTTGCTAATTGGTATATTAGGAGAACTGGAAACCTAGAAGCATTAATGCATTTCTATATTGAGGATAGTGTTGATTTTTCTAAAAAAACAGATACTATATTAGTGGAAGAGCTTGCCTTTTTTAGAGATGCTAGAGAACTTCTTAGAAAAAAACTTAATTTTATAACTAAATTATTTATGAAAATTGCTGATTACAAAAGACAAGCATTAATTATATATCTAAAATGGTAACAATTTTATATAAATTTGATTTTAGGGAGGACATAGGATGAGTTTTAATTTATTTATTTTTGAAAGAAGGGAAAATATAAAAACATCAATAGATATAAATAATTATATAGAAGAATTTACTAAATATGAAGAAGAAGAAGATTATAACTCACTTGAAGGGTGCTCTGAAACAATAGTGAAGTTTGCTAAAAAAATGTTTGAAAAATTTCCACCAGTAAATGGAAAATACCTACATTTAGATGAAATAGCTTTTACTTCAAAGAACTCTGAAACACATTTGACTGATTACTCATTAGGAAAATATGGAGTGTTTTGTGCACTTGACTATTCAGTTGCTGATGAGGCTATCAGTTATATAATTTCTCTTGCTGATGAATATAAAATAGGTGTATATAATCCACAAAGTAGTGAAGTAATATATCCAAAAAATATTGAAATTTTAAAATATAGGACAGAAGATAGAGATGATACATTCACAGATTGGTATACTATTGAGAATTCAATTAATACTCTTGATAGCTTGGAAAGAGGAACTTCAAATAGAGAGAATGCCTTTGTAACAGTATGGTTTGAAAAGAATGGAAAAGATGAAGATGAGTATATCCAATGTACACCGAATTATCTAAAGAAAGGATTTTTCAAATCTAAAATATTAATAGATAAATATTATTTTGAAGTAATGATAGATAAAAAATTATATCAAACCAATGTCTCAGATAAAAAAGATTTAATTAGATTAATGAAAGAATGGTGTTGTGAAAGAAAAAATCCTGATGTAAAAAATTATGAAATAATTATGGAGTTATAAAATCAAAATAGAAAGGGAAATAGATATGAGAAAAAGAGCCTTAATTTCAGTATATGACAAAACAGGTATATTGGATTTTGCAAAATTTTTAGTCAGTAAGGGAATAGAAATTATTTCCACTGGCGGAACATATAAATATTTAAAAGAAAATAATATTGAAGTTATTGAAGTTAGTAAAATAACAAATTTTGAAGAAATGTTAGATGGTAGAGTTAAAACTTTACATCCAAATATACATGGTGGAATTTTAGCATTGAGAGATAATGAAGAACATATGAGAACTTTAAAAGAAAGAAATATTGACACTATTGATTATGTCGTAGTAAATCTATACCCTTTCTTTGAAAAAGTTAAAGAAAATTTATCATTTGAAGAAAAAATTGAATTTATTGATATAGGTGGACCTACAATGCTTAGATCTGCTGCTAAATCTTTTAAAGATGTAGTTGTTATTTCTGATGTGAAAGATTATGAACTTGTAAAAGAAGAAATGAATAAGTCTAATGATGTTTCGTATGAAACTAGAAAAAGATTAGCAGGAAAAGTTTTTAATTTAACTTCTGCTTATGATGCAGCTATATCACAATTCTTATTAGATGAAGACTTTCCAGAATATCTAAATATATCATATAAAAAATCTATGGAAATGAGATATGGAGAAAATTCTCATCAAAAAGCTGCATACTATACTGATAATATGTCAGATGGGGCTATGAAAGATTTTAAACAGCTTAATGGGAAAGAGCTTTCATATAATAATATTAGAGATATGGACTTAGCTTGGAAAGTTGTTTCAGAATTTGATGAAATTTGTTGTTGTGCAGTAAAACATTCAACACCTTGTGGAGTAGCATTAGGAGATAATGTAGAAGAAGCTTATAAAAAAGCTTATGAGACAGATCCAGTGTCTATTTTTGGTGGAATAGTAGCTTTTAATAGAGAAGTTGATGAAGCAAGTGCAAAATTACTAAGTGAAATATTTTTAGAAATTATAATAGCACCAAGTTTTTCAAAGTCTGCCTTAGAAATTTTAACTAAAAAGAAAAATATAAGATTAATTGTATGTAAAAATAAACCAAGTGATAAAAAAGAATTAATAAAAGTTGATGGTGGAATTTTAATTCAAGATACAGATAATAGATTATATGAAAATTTAGAAATTGTAACAAAAGCTAAACCTACAAGTCAAGAAGAAAAAGATTTAATTTTTGCGTTAAAAGTAGTAAAATTTGTAAAATCAAATGCTATTGTTGTAGCAAAAAATTTACAAACATTAGGAATAGGTGGAGGAGAAGTAAGTAGAATTTGGGCTGCTGAAAAAGCATTAGAAAGAGCAAAAGAAAGATTTAATGTAATAGATGTTGTACTTTCTTCAGATGCTTTTTTCCCATTTAAAGATGTTGCTGAATTAGCAGCTAAAAATGGAGTTAAAGCTATAATTCAGCCTAGTGGTTCTGTAAATGATGAAGATTCTATTGAAGAATGCGATAAAAATAATATCTCTATGATATTCTCAAAATTAAGACACTTTAAACATTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>CP028109|1498385:1505818|1502660_1503470_+|AVQ23378.1|DBSCAN-SWA
MEKLDGVANTLYVPLYGRIYVSKKFPEYFYDEMALKIEEKFTSGISKGSFEYTNMAYAARYYNMDKMIIKFIKEHKISNIVLLGIGLETAYDRITQKCGLGEVNYYGIDLPEVIEIRKKYFGERKQETLIAGDMFEMKWKEQIDTSIPTLLIVSGVFQYFFEDKIIEFIKNLKKEFPYGELIFDTARKKTGLRFANWYIRRTGNLEALMHFYIEDSVDFSKKTDTILVEELAFFRDARELLRKKLNFITKLFMKIADYKRQALIIYLKW
>CP028109|1498385:1505818|1501091_1502111_+|AVQ23376.1|DBSCAN-SWA
MINSYKDSGVDKEEGYKAVELMKKNVLKTHNKSVLTNLGSFGAMYELGQYKNPVLISGTDGVGTKLEIAMKQKKYDTVGIDCVAMCVNDVLCHGAKPLFFLDYLACGKLDAEIAAQLVSGVTEGCLQSYAALVGGETAEMPGFYKEGDYDIAGFCVGIVEKEDLIDGSKVKEGNKIIAVASSGFHSNGYSLVRKVFTDYDEKISLKEYGENVTMGDVLLTPTKIYVKPILKVLEKFNVNGMAHITGGGLYENLPRCMGKDLSPVVFKDKVKVPEIFKLIAERSKIKEEELFGTFNMGVGFTLVVEEKDVEAIIELLTSLGEIAYEIGHIEKGDHSLCLK
>CP028109|1498385:1505818|1503507_1504278_+|AVQ23379.1|DBSCAN-SWA
MSFNLFIFERRENIKTSIDINNYIEEFTKYEEEEDYNSLEGCSETIVKFAKKMFEKFPPVNGKYLHLDEIAFTSKNSETHLTDYSLGKYGVFCALDYSVADEAISYIISLADEYKIGVYNPQSSEVIYPKNIEILKYRTEDRDDTFTDWYTIENSINTLDSLERGTSNRENAFVTVWFEKNGKDEDEYIQCTPNYLKKGFFKSKILIDKYYFEVMIDKKLYQTNVSDKKDLIRLMKEWCCERKNPDVKNYEIIMEL
>CP028109|1498385:1505818|1504303_1505818_+|AVQ23380.1|DBSCAN-SWA
MRKRALISVYDKTGILDFAKFLVSKGIEIISTGGTYKYLKENNIEVIEVSKITNFEEMLDGRVKTLHPNIHGGILALRDNEEHMRTLKERNIDTIDYVVVNLYPFFEKVKENLSFEEKIEFIDIGGPTMLRSAAKSFKDVVVISDVKDYELVKEEMNKSNDVSYETRKRLAGKVFNLTSAYDAAISQFLLDEDFPEYLNISYKKSMEMRYGENSHQKAAYYTDNMSDGAMKDFKQLNGKELSYNNIRDMDLAWKVVSEFDEICCCAVKHSTPCGVALGDNVEEAYKKAYETDPVSIFGGIVAFNREVDEASAKLLSEIFLEIIIAPSFSKSALEILTKKKNIRLIVCKNKPSDKKELIKVDGGILIQDTDNRLYENLEIVTKAKPTSQEEKDLIFALKVVKFVKSNAIVVAKNLQTLGIGGGEVSRIWAAEKALERAKERFNVIDVVLSSDAFFPFKDVAELAAKNGVKAIIQPSGSVNDEDSIEECDKNNISMIFSKLRHFKH
>CP028109|1498385:1505818|1498385_1498859_+|AVQ23373.1|DBSCAN-SWA
MKVGIIFGSKSDVDVMKGAADCLKKFGIEYSAHVLSAHRVPELLEETLEKFEKEDYGVIIAGAGLAAHLPGVIASKTVLPVIGVPIKAAVEGLDALFSIVQMPKSIPVATVAINNSYNAGMLAVEILAIGNKELREKLLEFRKEMKEDFKKNIHVEL
>CP028109|1498385:1505818|1499745_1501092_+|AVQ23375.1|DBSCAN-SWA
MGILALHSKKVRNDLVGIAYYGMYALQHRGQAGAGYTICDSKTNNEVRIKTIKNVGLVSDVFKVEDFQKFTGTILIAHTRYGSKNTVSSRNCQPVGGESAMGYISLVHNGDISNQAELKQELLNNGSLFQTAIDTEIILKLLSINGKYGYKEAVLKTVKKLKGCFTLGIIINDKLIGVRDPEGLRPLCLGRIVENDMYVLASETCALDAIGAEFVRDIEAGEMVIIDDNGVESIKYKESSKKASSFEYIYFGRPDSVIDGISVYDFRHQTGKCLYEQNPIEADIVIGVPDSGVPAAIGYSEASGIPYSAALLKNKYVGRTFIAPVQELRERAVKVKLNPIKELIKGKRVVVIDDSIVRGTTSKKLIDILFEAGAKEVHFRSASPVVIEESYFGVNIDPNNKLMGSYMSIEEIRKVIGATTLDYLSLKNLKKILNGGKDFYMGCFKEDE
>CP028109|1498385:1505818|1498987_1499701_+|AVQ23374.1|DBSCAN-SWA
MEKGKFIYEGKAKQLYETDDKDLVIVHYKDDATAGNGAKKGTIHNKGIMNNEITALIFNMLEEHGIKTHFVKKLNDRDQLCQRVKIFPLEVIVRNIIAGSMAKRVGIKEGTKINNTIFEICYKNDEYGDPLINDHHAVAMGLATYDELKEIYDITGKINNLLKEKFDNIGITLVDFKIEFGKNSKGEILLADEITPDTCRLWDKKTGEKLDKDRFRRDLGNIEEAYIEVVKRLTEKK
>CP028109|1498385:1505818|1502098_1502641_+|AVQ23377.1|DBSCAN-SWA
MFKIIVLVSGSGTNMLQLIKNNIKIDCIIADRECKAKNIADEYKIDFVLLNRNKEISKNLLKIFEERKPDLIVLAGFLSILDGEILEKYKNKIINIHPSLLPKYGGKGMYGLKVHQAVFENGDKESGCTVHYVTSNVDAGEIIGQEKVDISMAKSPEEIQKIVLEREWKLLPRVVKKLIK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AVQ23373.1|1498385_1498859_+	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	2.6e-25	48.3
AVQ23374.1|1498987_1499701_+	phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase	G8EYA2	Synechococcus_phage	4.2e-43	42.8
AVQ23375.1|1499745_1501092_+	amidophosphoribosyltransferase	A0A1B1ISH6	uncultured_Mediterranean_phage	2.6e-49	31.6
AVQ23376.1|1501091_1502111_+	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	A0A127KMF9	Cyanophage	6.6e-66	44.4
AVQ23377.1|1502098_1502641_+	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	E3SNR5	Prochlorococcus_phage	4.2e-19	35.2
AVQ23378.1|1502660_1503470_+	class I SAM-dependent methyltransferase	NA	NA	NA	NA
AVQ23379.1|1503507_1504278_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AVQ23380.1|1504303_1505818_+	bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase PurH	Q58MG4	Prochlorococcus_phage	7.5e-58	42.3