Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP028333 | Listeria monocytogenes strain CFSAN054108 chromosome, complete genome | 0 crisprs | DinG,csa3,WYL,cas3,DEDDh,casR | 0 | 0 | 4 | 0 |
1. CP028333
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
215650 : 222177
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP028333|215650:222177|DBSCAN-SWA CCTACCGATAAATGAACGGAAAATTAAAAGCAATCGTTACATCCGTTACACCTTTGATTTCAAAATCGTTCCAGCCTTTTTCAAGGGTGATAATCCCATGATTGGTATCTTTTCCAACACGGCGGTTATTAACAAGTGGATAAATATTGTTCAACAGTAAAACATCTGTTTTTTGTAGCTCTTTCCGATACTCGAAGGATTCTCCCGTTGTAAGATTATGAATCGTTGGTGTCCCATTCGCCGTCATAGCAATATCTAATTCATGTCGCATCAGTGGATTAACACGGTCGCTCCCCGCATTATAGACCCGAAATGTATTTTCTTTAAAAATATAAAATAAATCATCACGGTTCGATAAATTCATTCCCATTTGCCATAAATCCACTTCAAAAGTCATAGGGTCAAGGCTCGTGCCACGTGACTCCGCATAGCCTTTAAATACATCAAATTCTATAGTGAGTAAACCAACACGATCCGATTCTCGACTAAAATCAACTGGTTTAGGATGCACCTCATACCGAATTCCTGGCATTTGATCGCTCCAAATATAATAACTATCGCGCTGGAATAAAAATTCATAAATTTCTCTGACTGCCAAATGATAATCTGGAATATCAAGTGCTTGCAAATTACATTTTGCTGAAAAGATAAACGGTTTAAATTGGGTCATTCCCGGGATAACCCCATCAGTCCCAGCGATTTCAGCAGTTTCCATGCTTAACTGGGGACTTTGTCTGGAAACTTCTTGTACAGAAAGACCTGGAAATGTCTCACTAAGCGAATGCACTTTTCCATTTAATTCTAAAAACAAGTCGCTCATGAATAAGCTGCACCTCCCATTGTGTAATTGTACTGATCAAATGAGTTAGCTTGGTTACGGCTAACTACCTCGGCTACCACTTTGTCATCCATTTTGATTACAGGATTTTTTTGTAGTAAGCGCTCGAGAAGATTTTCAACTCTAGCCAAATCAGCACCTTGACTCGTGTAAAGCATTGATTTATTTCCGCGCGCACTTTCCCTTGCGTATTTCATCGTTGCATCGTGCGGAATTACTTGCGAACCCGACGGTAAAACCACCATTTCGCCTCGGCCGCCTTCATTCATTCGAGCAAAGCCACCTTGGAAATTTGTTGTACCGGAAATTAATTGTGGTATTTTGCCGATTTCAACGCCTGGAATCTTATTAATTAAACCAATGGCTCCATTAATCCCTCGAATTACGACGTTTACAAAACCTTTGACATTATCTACCACGGTTTGAATTGCACTTGAAACACCATCGAAAATATTTCCTACAAAATCAGTTAAACCACCCCAAGCACTTTTGATTCCGTCAAAAACACCTGTAATAATGCGCTTCACTCCGTTAAACACTGATGAAACCGTAGTAGAAATACCTGTGATGACTGCTTTGATTCCTTCAATAATTCCGGAAATCGTCGTCATAATGGCATTCCAGATTTTGGATGCAACAGTAAATACCATTTGGAAAGCTGCACCAATAATCGTCACGATAGTCGTAAAGATATTAGTAATAAAGCCAATAATTGGTTGCACAATCCCGATAACCGCCGTAATAACACTCGCAATAAAGCTAATAATTTTCCCAATAACACTAGCAATCGTCGTCGCAATAATAACGACGTAACTAATAATCGTTGTGATAATCGAAACAATAACGCCAATAATCGTCATAACAATCGGCATAATTTTACTTATATAAGAAATAATCGTTACAACAATTTGTACAACCACCGTCGCAATTTGCATGATTATCGGAATTAAAAATTGAATAACGCTCATAATGCCTTGAATCACTGTCATGATGCTCGGTAATAGTGCCGAAACAAGTGACATAACAACTTGAACAATCTGCATAATAACAGGCATAAGCATGGAAATCAGCATATTAATAAACGGCATTAATTGGGCTAACAATTGCGCAAAAAAGCTAATAAATTGCATAACCATCGGCATTAACGCGGCACCAATTTGCATAACCGCAGTAACAATTTGCATGATAATCGGCATTAAACTGGCGACAAGTTGACCGAACAGTTGCGCAACCTGTGTTACAACTGACATCACCGTATTTCGGAATGATTCATTCGTCGTCATCAAATACGCAAATGCAGCTACTAACGCTACAATCCCGATAATTACTAACCCCATTGGAGAGGTCAGTTTACCCATAATTCCACCAACGCCACCAATAGATGACATCAAACCGCCTAGATGCTTCTTCAATTCCATAAATCCACTAGCTAGATTTGTAATTCCTTGAACGCCGCCAGATACTCCACCAAGCATTGTACTCATGCCACCAATCCCGGTTGCCAAGCTTGAAAATAACGTACCATTTTGCACACTTGAACCTAGATTTTTAAACGCATCCGTGATTCCACCAACAGAACCAACCGCAGTACCGAATCCGGATGTAATCGCCTCACTACTAGAACCCAGTTGTCCAAACGCCGAACTAATCGTGCCAAGCCCAGACTGCAGCCCACCTAAAGATTCGGAAATTTTCGAACCTGGATCAGCATTTCCAACATCTTCAATAGTCATTTTGAGCTCTGAAAACCGCCGCTCTACAACCATCGCCATCTCATCTAGCCTGCCAACTTGCGCTGTTAAAACGCTCTCGTTCAGTTCAAATGTAAAACTTTTAGAATCCGCCATTCACTTTCCCCCTTTCTTCTTTATTCTTAGGTCTTCGTAACCCATTTGCACCATAAATCCGATCAATCCACGCTTTACCTTCCTTCGCTTCATTATCGGAAATTGCTTGAAGTGCATTTACTGTATAATTAACATCGGCTTTCTTCTGACGTTTTTTATGCAAGTCGATAAAACGTGAATTTCGTTTTCGATTGAGATTTTGTTCCGCATTTAAAACTGCATTTCGAAGCATAGTAGATTCAAAAATCACCTTGTTTTCCCATTCTTTCATGATGAAATTTTTCTCCACTTCAGTAAGTTCTTCAAAATCATGCTTGGACATCTGAAAATTAACTACAAAAAAAGCGAATTGTTTTTCCAAATCAAAATCATGGTTCATTTCACTATCCACTTCTTCGTCCTCAGCACCAAAATACTCAAATTCAATCTGTTTTAACGGAACAAAAAACCCATATCCTCTTGCAATTTCTCAATAACAGCTACATTAAGCGAAATTAAGCCTTGTTCTTCTACTAATTTGTCGAAAATCTCCAAAGCTTCTTTTTGTTTTACAGGTACTAAGCCTTTTTCTTCCACAAGTCCTGAAACAAATAGCGTTTCAATCACTTGGTAGCTCAAAATCCCTTTATTCGCAGTCAAAGCTGCAACTAAACTAATCCCTGATGTTAATTCCACCGTTTTAACTTTTTGTTTATTAAATCGTAAAATATAAGTTGTATCATTCACTTCAAACATTTATTTTCCTCCTAAGGGAAAGCCACTTATTTCAGTGGCTCTCTATTTTATTCTGCTGGTGCTACAGGTGTTTCGCCGGGCATTTGATCTCCGCCCTCAGTAATCGTTAAATCAACAAGCGCACCCATTCCGTCTAGTTTTACAGAGTAAGTCATCGCTTCATCAAAAGGTGCTTCAAAACTATAGTCAGCTACAATTGCCAAACCACCGAAAAGACCTTTTTTAGATGCTTGATTAATGATTTTCACGCAAACCGGGCTATCACTTTCGAAATATTTCGCCAATTCTTTGTGAGACTCTGCATCAGCGACATATAATCCGTCATTTTCAATTGACCATTCTTTCATACCGCCAATTTTGGATTTCCATCCGCCAACTGTATCTTTAGATGTAATTTCAATGCTATCTTTAGAACGGTTTACAGTTAGACCTTGTTGCCCCGCAACCGCTAATAGCTTATCCCCCGCTGCGTTAAAAACTGCTAAAATTACATCTTTCCCCGCGACCGCTTTAGCAGCTCCCGGTGTATAATCACAATATAAATTCTCTTCAAATGCCATTAATATTTCCCCCTAAATTTTTACTTTTAATTCACGACAAATACTTACTTCAAAACTGGTTTTTGCGTGAATTAACGTATTTTCTTTGACTAAATTTTGTTTTCCGTAATGTCGAACAGCGATTAATTTGTATCCTTCAGGCAAAGTGAACCCTGTTTGGATAAGCGTATCTATCATTTCGACTCCCGCTAAGTCCGTTTCATTTGTATAATGATGGATTGCAAAACGGTATTTTTCTTTCCAGGCAGTTTGGCTTTCTTCTTCCTCTTGATCAATCATCTCGATCATCGTTGTAGGCATTTCCACTTGGTCACGCATTACAATAGAAACATCTAGTCCGCCTTTTTCCTGGAGCATTGTTCTCACTGCTTCCAAAACTCTCATGAAGCTTAAACTCTTCACCAAGCGTTCACTCCTTTAAAAACAGAAAGTAAAATTCGGTCGAGACCACATTTGATAATTTATTCCTCCGAACATTACTTTCCAAAATAGAATATTTGTTTATGTCAACGGATGAAAAATCCAATCATAAAAACAAATTTCTTGTACAACCTCTTGTATTATCAGAAAATCGGTGCACCTTCATTCTGATGCAGCTTTTATTGTCATCCGCTTACTGGACAATTAGCTTACTTCTATATTAATCGTAAAATGACGTTTCAAAATATCACGAAAGTATCATCATTTCCTTACTAAAATTCCCATTAGCGTTGCGATTTCTAATACTGCTCGTTTTTTTATCCGTTTAAACTGGGCAATTTCGTACGGTAAATCCATCATTACCGCCACATCTTGTTTTCGTTCCACGTAACATTCCATCAAAATAGTGCGATATAAATCATCCATCTGATTTAACATTTCAGTATATTTCTCTACCAACCATCGCGCTTCCAAAATGACCTCTTTATTATATCTAGCAGAAAATGCTACCGGCTCAAACTGCGGCTCTTCCAGAAAACCATTTCTAAGTAAGTGTGGCTTTTTTGATAACCCCGTAATCATCCGAAACCGCTCAAGATCCGCAAAAAATCGCTTTACTTCTTGGACCGTTTTTATATAATTGATATCCTTATTTTCTGGTAACACTAAAACCTGCATGTTATCACTCCTTAATTGTGCGCTTCATTAATCACAAAAGCCTCATACTGACATTCAATCGCCGAAGCAGGTAAAGCGCCAATTTCGTCTTTTGTTTTATCTAAATGAAAAGCTAATACATCAATCATTTCCTGCTGAACCGGTTGCGGCTTTTTTCTATTTAAACCTTTTTTTCGCTTCCATTCCGCAAGAGACGATCTCGATACTCCAATTAACCTACTAATTTGCACATCTGATTTAGTTCGTTTGTATTCTCGGTACTCACTTGGTGTTAAAATAAGCAACTTTTGCTCCGCCGTTAACAGTCCTTTTTCTCTGTCCCCAAGCGCTTCAAAAAACTCCAACTCTTCTATTAAACGCTTTCGAATAAATCGATTTTCTTCTTGTTCTAGTTGAAAAATTAGTTGGATTTGCTTTTCTTTTAAAAGTTTTCTATCCATCCATTCCCACTTCCATCTCATAAATTAATATAGTAACATTGTCACCAATTCGGTGCTATTGGCGCAAAATCAGCCGTATTTATTTTCTAGCTCTACAAATATTATAGCACCATTTTGGTTACTGGTAAACTTTATCCGACAAATATGTTCGAAAAAGTTCCGTTTTGGTGCTAAAAGTGCTATACTGAAGCCATAAACATGTGGAGGGCAATTATTATGGAGTTAAATAAATTTGTAGGAAATAAAATAAAACAATATCGCGAGGAACGAGGCTTAAATCAAGAAGCATTAGCAGAAAAGCTTCATACAACTCGCCAAACTATTAGCCGTTATGAAAATGGTGATCGAAAAGCAAATCAAGACGTTTTATTTGAACTTGCAAAAATTTTCAACAAACGATTAGATGACTTTTTTCCTGAAAGAAATTTACCACCTGTTGATGAACGCTTGGTAACAATTGCAGCCCATATTGATGATGACGTAACCGAGGAAGAAATGCGGGATATTTTAGCTTATATAGAGATGAAGAAAAAACTCCATCGCGGGATGTGATTTTATTGTACGAAAAATTGGTAAATAAATACCAAGATGAGGTAACAATCAGAGAAGAAAAAATGCCTTACAAATTGCCAGGTCTTTATTTAAATGGGACGATTTTTATTAGTAAGGATCAATCTTCCATTGAAAAAGGCTGTGTTTTAGTAGAAGAATTGATGCATTACAAATACACTGTAGGTAACATCACTAAACAGGAAACAATTATGGATAAAAAACAAGAAATTTTTGCTCGTCGTAAAGGTTATGAGGAACTAATACCGCTTGATGACATCATTGCTTGTTTTTATCTAGGCTTACGAGAATATTTTGAAGTAGCGGAGTTTTTAGAGGTAACAGAAGAATTTTTGCGCCATACAGTTACTCATTACGCAGAAAAATATGGTCCGATGTATGATTATGGTGGATATTTCATTAATTTTGGCAATTCCATTGATGTTTACAAGAAGTTTTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP028333|215650:222177|221724_222177_+|AVS33346.1|DBSCAN-SWA MYEKLVNKYQDEVTIREEKMPYKLPGLYLNGTIFISKDQSSIEKGCVLVEELMHYKYTVGNITKQETIMDKKQEIFARRKGYEELIPLDDIIACFYLGLREYFEVAEFLEVTEEFLRHTVTHYAEKYGPMYDYGGYFINFGNSIDVYKKF >CP028333|215650:222177|220310_220727_-|AVS33343.1|DBSCAN-SWA MQVLVLPENKDINYIKTVQEVKRFFADLERFRMITGLSKKPHLLRNGFLEEPQFEPVAFSARYNKEVILEARWLVEKYTEMLNQMDDLYRTILMECYVERKQDVAVMMDLPYEIAQFKRIKKRAVLEIATLMGILVRK >CP028333|215650:222177|218766_219069_-|AVS33340.1|DBSCAN-SWA MFEVNDTTYILRFNKQKVKTVELTSGISLVAALTANKGILSYQVIETLFVSGLVEEKGLVPVKQKEALEIFDKLVEEQGLISLNVAVIEKLQEDMGFLFR >CP028333|215650:222177|220738_221167_-|AVS33344.1|DBSCAN-SWA MDRKLLKEKQIQLIFQLEQEENRFIRKRLIEELEFFEALGDREKGLLTAEQKLLILTPSEYREYKRTKSDVQISRLIGVSRSSLAEWKRKKGLNRKKPQPVQQEMIDVLAFHLDKTKDEIGALPASAIECQYEAFVINEAHN >CP028333|215650:222177|221383_221719_+|AVS33345.1|DBSCAN-SWA MELNKFVGNKIKQYREERGLNQEALAEKLHTTRQTISRYENGDRKANQDVLFELAKIFNKRLDDFFPERNLPPVDERLVTIAAHIDDDVTEEEMRDILAYIEMKKKLHRGM >CP028333|215650:222177|219116_219629_-|AVS33341.1|tail|DBSCAN-SWA MAFEENLYCDYTPGAAKAVAGKDVILAVFNAAGDKLLAVAGQQGLTVNRSKDSIEITSKDTVGGWKSKIGGMKEWSIENDGLYVADAESHKELAKYFESDSPVCVKIINQASKKGLFGGLAIVADYSFEAPFDEAMTYSVKLDGMGALVDLTITEGGDQMPGETPVAPAE >CP028333|215650:222177|219641_220031_-|AVS33342.1|DBSCAN-SWA MKSLSFMRVLEAVRTMLQEKGGLDVSIVMRDQVEMPTTMIEMIDQEEEESQTAWKEKYRFAIHHYTNETDLAGVEMIDTLIQTGFTLPEGYKLIAVRHYGKQNLVKENTLIHAKTSFEVSICRELKVKI >CP028333|215650:222177|215650_216469_-|AVS33337.1|tail|DBSCAN-SWA MSDLFLELNGKVHSLSETFPGLSVQEVSRQSPQLSMETAEIAGTDGVIPGMTQFKPFIFSAKCNLQALDIPDYHLAVREIYEFLFQRDSYYIWSDQMPGIRYEVHPKPVDFSRESDRVGLLTIEFDVFKGYAESRGTSLDPMTFEVDLWQMGMNLSNRDDLFYIFKENTFRVYNAGSDRVNPLMRHELDIAMTANGTPTIHNLTTGESFEYRKELQKTDVLLLNNIYPLVNNRRVGKDTNHGIITLEKGWNDFEIKGVTDVTIAFNFPFIYR >CP028333|215650:222177|218320_218725_-|AVS33339.1|DBSCAN-SWA MDSEMNHDFDLEKQFAFFVVNFQMSKHDFEELTEVEKNFIMKEWENKVIFESTMLRNAVLNAEQNLNRKRNSRFIDLHKKRQKKADVNYTVNALQAISDNEAKEGKAWIDRIYGANGLRRPKNKEERGKVNGGF >CP028333|215650:222177|216465_218334_-|AVS33338.1|DBSCAN-SWA MADSKSFTFELNESVLTAQVGRLDEMAMVVERRFSELKMTIEDVGNADPGSKISESLGGLQSGLGTISSAFGQLGSSSEAITSGFGTAVGSVGGITDAFKNLGSSVQNGTLFSSLATGIGGMSTMLGGVSGGVQGITNLASGFMELKKHLGGLMSSIGGVGGIMGKLTSPMGLVIIGIVALVAAFAYLMTTNESFRNTVMSVVTQVAQLFGQLVASLMPIIMQIVTAVMQIGAALMPMVMQFISFFAQLLAQLMPFINMLISMLMPVIMQIVQVVMSLVSALLPSIMTVIQGIMSVIQFLIPIIMQIATVVVQIVVTIISYISKIMPIVMTIIGVIVSIITTIISYVVIIATTIASVIGKIISFIASVITAVIGIVQPIIGFITNIFTTIVTIIGAAFQMVFTVASKIWNAIMTTISGIIEGIKAVITGISTTVSSVFNGVKRIITGVFDGIKSAWGGLTDFVGNIFDGVSSAIQTVVDNVKGFVNVVIRGINGAIGLINKIPGVEIGKIPQLISGTTNFQGGFARMNEGGRGEMVVLPSGSQVIPHDATMKYARESARGNKSMLYTSQGADLARVENLLERLLQKNPVIKMDDKVVAEVVSRNQANSFDQYNYTMGGAAYS |
10 | Streptococcus_pyogenes_phage(33.33%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_2 |
229640 : 301466
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP028333|229640:301466|DBSCAN-SWA AATGCTTTCTAAACATCAACAACAGGCGCGAAATCAATTAATAGCCATCTCTTTAGATGATTTGGTCCCAGAGGACCATTTAGTAAGAAAAATAGATAAGGTGATTAATTTTGATTTTATCTACCCATTAGTAGAACATACTTATTCTCATACAGGAAGACCTAGTGTAGACCCGGTAGTTCTTATAAAGCTAGTACTCATCCAATATCTTTTTGGCATCCGTTCCATGCGCCAAACTATAAAAGAAGTAGAAACGAACATGGCTTACCGCTGGTTTTTAGGATATGATTTCAATCAAAAAATCCCTCACTTCTCTACTTTTGGTAAAAATTACGTGCGACGTTTTGCAGAAACAGAGGTGTTCGAACACATTTTTTATCGCATTTTAAAACAAGCCATGGAGGCTGGTTTAGTGGACCCTGACGTTGCGTTTGTGGACTCTACCCATGTGAAAGCCAATGCGAATAAACACAAATTTCATAAAAAATTGATTCGAAAAGAAACACGCGTTTATCAAGAAGTACTAGAAGATGAAATTAATGTCAGCCGAGTTGCCGAAGGAAAAAAGCCATTCGCCAGGAAAGAAAGTCAGGAGGAGAAAGAAAGCAAAATAAGTGATACGGATCCCGAAAGCGGCTACTATGTCAAAGGAGAACGGGAAAAACAATTTGCTTATTCTTTCCATACGGCTTGTGATACCAATGGTTTTATTCTAGGTTCCATTGTCACTCCAGGTAATATTCATGATAGCCAACAATTGATTCCACTTATTGAAAAATTAAAAAACACCCTTTCTACCCCTTTGGTGGTCGTTGCAGATGCTGGATATAAAACACCCATTATCGCTAAATACCTTTGGAGTCAAGGAATAGAAGCGGTGCTTCCGTATACTCGACCAAAAGGAAAAGAAGGCTTATTTTCGAAACGAGCGTTTCTCTATGACCATTATTTAGACAGTTATCTTTGTCCAAATGAGGCATTGTTATCCTATGTTCGTACTACAAGAGATGGTTATCGTCTTTATAAATCTAATTCACTTCACTGTAGTAGTTGCGCTCTCTTAAAGGATTGCACGCAAAATAAACAAAAAGAAAAAATGATTTTACGACATCTTTGGGAGCCTTACTTAGAAGTTTCGGAGGAACTGCGCTACACAGAACAGCATAAAAAATGGTATAGACGCAGGAAAGAAACCATCGAAAGATGTTTTGCGGATGCCAAAGAAAAGCATGGTATGAGATGGACTACTTATCGCGGACTTGCAAAAGTAACCCTCCAAGCGATGCTTACTTTTGCAGCCATGAACCTGAAAAAAATGGCTAATTGGCTATGGAAAAAGGCGGTGCCTTTTTATTTTTTTGACTTTAAACAGAAAAAAACGGTCCTTCTCAAATATTAAAGCTTGAGAAGGACCGTTTTTCTACAGTCTGAGGTAACTAGAGATTCTAGTTACCTTTTATTTTGCGCATCCATTTGTAAAAAGAAATTATACAATGCTCCGTACAAATTCGCATCATTTTGGAAATGACAAGTGACGATTTTCGGTTGTGCGGCATGATAAGGATTAGCATCTTTTATTTCTGCGACAGCTTCGTTTAGTCTATCAACAACAACTGGTTGAGCGCTAATGCCACCACCAATTGCAATAATTTCCGGATCAATCAAATACTGGATATTTAAAATTTGAGATGTTAATTCATAAATATACACATCAAAAATAGCATTCGCTTCTTCATCGCCTTGGTTAATTAATTCGAAAACCTGCTCACCATCTTTTTTATTGGGTAAATTCTTCTTTGATGCAATGCGCTTAATTAACTCCACCGCTGATCCAGTTCTTCCAAAGAATGTACCTCGCAATTTCTTCGTATCAAAAGAAGTCTCCATAAAACTAACTTCTCCCGCCATCAAATGATAGCCAGATTGTAATTTACCATCCATAATAATTCCGCCACCAACGCCACTTCCAAGCGTTAAAATCGCCGCGCTATGTACATTTTTTGCCACACCTAACCAAAGTTCCGCTAAAGCCGCACTCTTCGCATCATTTTGCAAGACAACGGGAACATGACATTCACGCGCTAGCATTTCAGCCAAATTTTTCTCATGCATAAATAATAGCGAGCCACCTTGGTAAATCACGCCTTTTTCCGTATCTACCACTCCCGGACAACTCACAGCTATGCCCTTCACTTCTGTACTATAGGGGCGCCACTTTTCGACCATTTGAGCTACAAGTTCTTCTGCACTTTTGGCAGTTGTAGGGAATTTATCTTTCATTTTCACCGTACCGTTATTTTCCATCAACGCAAATTTAACAAAAGTTCCACCAATATCGTATACAAAATACATCCTTCTGCACCCTCTCTTGTCGCTTTTATTCATTGTAATACGTTTGGTCACTTTTTCAAATAAAAACAGAGATTCTCCGAAAAGAATCTCTGTTTTTGTCTATTAATTTATTAACAACCAAGGACCCCACTGTTCAGCTCCTGGCTCATTTCCCTGAGTCCACCACTGTGCTTCATATGTTTTCCCTTTGTAAGAAACCCTATCTCCCTTATTGTACGTTTTGGCAGCGTCCCATGCTGGAGTTGCTGGTGGTGTTGCCGCATCAAGCGTTGTTACAGTTAGGACCGAGCTTGCTGCCGAGAAATTCCCCGCCGCATCATATGCCTTTACTGTATAAGAATACGCTGTTTTTGCAGTTAAGCCACTATCTGTAAAAGTAGTTCCTGAAACAGAGCCAACTTCGGTCCCATTTCGGTACACTTTATATCCAGCCACTGCTTTATTGTCCGTTGAAGCTGTCCACGTTAGAGTAGCAGATTTATCGGTTACATTAGAAGATGCAAGTGCTTTTGGTACTGTTGGAGCTTCTGTATCGCTTGGATCAGGTACAACAGTTCCCCCGCCAAAAATCGTTTGTTTACCAAATTCGACACTCGATTTTACCATCCGTTGTGTTAAATCAATTTTAGAAATGTTAGCTACATCCACACTAGATGCACTCGATTTTAAACGGAACGTATAAGATGCGCCTTGCGGAATTTGTTGCGCGTCGTATACAGAAGCTAAATCAACTACTGTATTGCCACCTGAAGTAGTAACTGTACCCGCTTTATAATCGCCAGCAGTTAACGTTTCGCCCGCTTTTACTGGAATATAAAACTTAGGTAATTTCACTGTTTCAAACGATAGCTCAGTTGATTTCAAAACTTCATTGGTTTCGTCCGCTTTTTCATTGTTTGTAATTGTAATTTCGTACCCGACCCCATTTTCGCTATAAGGTTTCACTGTCGCTACCACATTTAAATTCGCATAAGTAATCGCGTTTTGCGGGATAGCGTTTGTGCCGAATAATCCTGATTTAATCGCCTTTGTGAGTTCATCGCGCTTAGTCGAAGTCGTTGTTTTATCCTGCGACTGCATCCAAGAAATCATCCCACCAAGATTATTATCTTTTACATATTGTGCCTTATAGCCAATCGAGCGCGTATTGTCATATGTGTAAAACTCCCCAGTTTCCTTACTATAAAGATACGGCGCCTTGGCAGTATCATCCCAATATTCTTTCAATGTTGGCGTTTTAGCTTTTAGCGCATCAATACTTCTATACGCCCAAACTCCGCCAGCACGGCCCCCATCGCCTGTTTTAATTGGGTTTTCGTTGTTTGCCCCGTAAGTAAGCGAGCCATCCGCATCTTTATTCGTTTTTTCAGCAGCTTGGAAAAGCCCTGGCAATGCCGTATCCGTTCCAGCAGCTACTTTATTCCAGCCTCGAGTGTAAAATGCTGCCCCAACAACAATTTTATTCGAAACTGCTCCCTTTTCTTTTAAGTATTTAACGGTTTGGTCGACAGAAAAACCACTATCATAATTCGGATCTTTCGGATTGCCGTAAAGCGCTGTATGATGCGCACTATTCGGTGTCCAAGCACCATTTAAGTCATACGTCATCACATTCGCAAAATCGACTACTTTAAATAAATTCGCTACATCAATCCCATTTTCTAAAGTAGATTTTGCAGCTGGTAAAGCAACCGATAATTCGTATTTCTTGTTAATATCCACGCCTTGTTTATCCAAAGCCGTTCTTAAATCTTGTAAAAGTGTAATAAAGTTTTGCTTATCCGCAGGTTTTGCATTTGGTGTGCCTTCATCGTTTTTATTATCAACAAGGTCAGCGTCCCGTACCGAAGCAGGATATTCCCAGTCCAAATCAACAAAATCCATATTGGTATATTTCACAAACTTCATCACGTTTTTCACAAAGTTAGCCCGTTTTGTTGGATCCGCTGCAACTGTCGAGAAATCTCCCGACTTAGACCAGCCTCCAACTGAAAGCCCTATTTTCAAATTCGGATTTTGAGCGCGCAAATCTTGAATCGCATTCAAAACGCCTGCATTTGCTCCGCCCCATTGAACTCCCTCTTGTCCAACAGGCGCCCCAACAGCAGCATCTTTATCAGTAAAAACTAAATCCCCATTACTATTAAAATCCAGAAAAGCAAAATTCAAATGTGTTAATTGATCAGCTGGAATATCTTTCGGATAAAAGTTCCCTTCTCCTCCCCAAATCGACCAATCACCGTAATACATAACATTTCGATACTGTGGTACATTTTCAGCCGCTTTCGCCCGTTTTGGCTCTGCACCAATTGATACAACCACTAACGATAAAACTAACAACACAACAGAAGTAATACTAAAAAGCTTTTTCATCTTCTTATTCATCTCTTCACCCCGATTTTTGATTTATAAACCTCATTTCGGTAGTTCTAAGTTTGTCTCTCTGTACCCCTTTTTGTGTGGTTGCCCGAATGTTCTTCTCTCTAATTTCCTCCCTCCAATTAAAGATTCATTCCGAGCATCTGTATATCATGCAATTATCATGCCAAAAGAAAGCGCTGTCATTCTGCGGTTTAAGACCCCTTCCTAAGATACACAGATGGAATAAAAACTTACACAGATAAAAAAAGCATGAGAACATATCCCAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP028333|229640:301466|242968_243529_-|AVS33366.1|DBSCAN-SWA MTSEFFSTLLLIIGLLLGFFLAILLILVGIRRFLCSAEEPLKRIQRYQLWHNRYQLNAEVTSFLIVIGASLSVSLITLQITAIPFQYTVLIFWSSWLFHLLSFWKKIRVPKKMKNEMKQLAGFLLITVLYFVGFFAMKSVHFSIIQVADFPGVIQFGIRTYLTICSFFVACGALIVWQRIYVKLLK >CP028333|229640:301466|295674_295884_-|AVS33433.1|DBSCAN-SWA MGNNLKELRGERSKASVARSLGITPQHLGYIEDGSRNPSLTLMFNIAKLYNRKVDEIFFDRIVTKSHKN >CP028333|229640:301466|266655_267021_-|AVS33388.1|DBSCAN-SWA MYEGLTKVFDYALAKEMFFAALFVALFIILLIITKRIWDDSKIVRVEMKEERDKMETEREKRDKESKEERDKFISTMNEQQRLMDKQNDMMGQQQQSIDSLSKSVGKLAHKVDLLEHKITK >CP028333|229640:301466|242161_242794_-|AVS33365.1|DBSCAN-SWA MTFLEFHQLVKEDLLIYSWIIKNFHLTRQKLMAGGEITMNREQVIVMEKGLLVQVNEEGKDDLYRVFIDQRIIFTTKGDITLTALEDTSYSIIRAEELIGKLEDQHLLPTFFLEIAEDFEKGLDWQRTLISVDPAERAEMILAKIIERYQINSENKPEFPRWLRINVLARFAKCSVSTMSSVVNELVNEGDLNIKGTPWLLTRPYQATCA >CP028333|229640:301466|231088_231991_-|AVS33354.1|DBSCAN-SWA 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>CP028333|229640:301466|264294_264798_-|AVS33384.1|DBSCAN-SWA MKDVTLFARYLIHSYESYSRSLFENSEMKLQKLIYLAQRQSIALTGEILFQNDIQGWKHGPVVPELRYFLENGYTPYEGEPLSETEKYIIDNVVNTYGKFEAWSLREMTHNELSWKNSRIGLNDEDSGCEVLKLEDIEKDAEKVRIFDHQYGMYLDEFEDFNEEVLR >CP028333|229640:301466|283514_284834_-|AVS33407.1|terminase|DBSCAN-SWA MSKIDELVFTPKQQETITFPFRGVTLEVNEGTPRSGKTTADIFKMAYIYSISEDQNHLVAAFNQEQAFRLFMDGDGFGLMHIFGNLAEMKHDEHGDHLLIHSPNGPKKIYYKGGGKVNSVGAITGMSLGTVTFLEVNLLHKDFIEECFRRTFAAKNRFHLAELNPPAPNHPVLEIFSNYEKSGRYKWRHWTAKDNPALSEERKQEIYNEVKHSSYLLQRDWYGKRVLPKGIIYETFDMQKNQISKLEGHPIEMVFFGDGGQQDATVCECYVITEHEADGHYKYKLNQVASYYHSGRDTGEVKAGSTYAIEIKQFIQWCMKEYEVPVNEPVFIDPACRWLREELEKVGVDTAGADNNAHDVTGKAQGIEVGIERMQSLLSERRYLLVEQPNDQYDHYSWLQEIGMYVRDENSGKPVDKNNHAMDTSRYATNYFYRNYEDI >CP028333|229640:301466|296049_296472_+|AVS33434.1|DBSCAN-SWA MFGDRLRSLRENKNLTQQKVADDLNIKRENLSNYERNKREPDYEMLKKLAEYYGVSRSYILGETDKKQYWELDDKDERSIQKDLQKMIDDLSNSDAFAYSKEDGEMDENTKKLLIMSLENSLRIAKEESKKRFTPKKYRK 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MKNIEITLTKKEADYVKTMLLNNTYKIQAICKKREEMKEFFRENTVLNGNISRKITNALKVSMGKEEQA |
90 | Listeria_phage(95.0%) | terminase,capsid,holin,transposase,integrase,tail | attL 263089:263133|attR 300348:300392 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
773940 : 781785
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP028333|773940:781785|DBSCAN-SWA AATGGCTAGTGAAGAAAAAATTTATGATGTGATTATTATTGGAGCGGGACCAGCTGGAATGACAGCTGCTTTATATACTTCCCGTGCAGATTTAGATACGTTAATGATTGAACGCGGAGTACCCGGCGGACAAATGGTTAACACAGCTGAGGTTGAAAATTACCCTGGATTTGATAGTATTTTAGGACCAGATTTATCCGATAAGATGCTTAGCGGTGCGAAACAATTTGGCGCTGAGTATGCTTATGGGGACATTAAAGAAGTCGTTGATGGCAAAGAATTTAAAACTGTAACGGCTGGATCGAAAACCTATAAAGCTCGGGCGATTATTATTGCGACTGGTGCTGAACACCGGAAACTTGGTGCAGCTGGCGAAGAAGAGCTTAGTGGACGCGGCGTTTCTTATTGTGCTGTTTGTGATGGAGCTTTCTTCAAAAATCGCGAATTAATCGTGGTTGGCGGCGGAGACTCTGCAGTGGAAGAAGGAACTTATTTGACTCGTTATGCAGATAAAGTAACGATAGTACACCGTCGTGATAAATTGCGCGCACAACAAATTTTACAAGATCGTGCTTTCAAAGATGAAAAAGTTGATTTCATTTGGAATAGTACAGTAGAAGAAATTGTTGGCGATGGCAAAAAAGTAACTGGAGCAAAACTTGTTTCCACAGTGGATGGTTCCGAATCTATTATGCCAGTGGATGGTGTTTTCATCTATGTTGGACTTGTTCCACTTACGAAAGCATTCTTAAATTTAGGTATTACAGATGATGAAGGATACATCGTAACGGACGAGGAAATGCGTACAAACCTTCCTGGTATTTTTGCAGCTGGTGATGTTCGTGCGAAAAGCTTACGCCAAATTGTAACAGCAACAGGCGATGGCGGACTTGCTGGACAAAACGCTCAAAAATATGTAGAAGAATTAAAAGAGTCGCTAGAAGCAGAGGCAGCTAAATAACAGTAAAGAAAACTCGAATGGGTCTGAGATTATTTATCTTAGACCCATTTTTGCGTGACTATATAGACTTGAGTAGTGTAAAATGGAAGACAAAGACTATTGTTAGGAGAGAGATAATAATGAGTATTGTTGTACTTGGTGGCGCTGGCTATATCGGTTCACATGCAGTAGATGAGTTAATTACTCGCGGATATGAAGTAGTAGTTATTGATAATTTAAGAACAGGGCACAAGGAATCCATTCATACAAAGGCAAAATTTTATGAAGGAGATATTCGAGATAAGGCATTTTTAAGTTCAGTTTTTGAAAAAGAAAAGGTAGATGGTGTGATTCACTTTGCTGCTAGTTCACTTGTAGGAGAATCGATGGAAGTACCGCTTGTTTATTTAAATAATAATGTTTATGGTACGCAAATTGTCTTAGAAGTGATGGAGCAATTTGGTGTGAAGCATATTGTCTTTTCTTCTAGCGCTGCAACATATGGTGAGCCAGAACGAGTACCGATTACGGAAGATATGCCAACAAATCCGGAAAGTACTTACGGCGAAACGAAGCTAATCATGGAAAAAATGATGAAATGGTGCGATAAAGCGTATGATATGAAATATGTTGCACTCCGGTATTTTAATGTTGCTGGCGCCAAAGCGGATGGTTCAATTGGGGAAGATCACAAACCAGAATCACACTTAGTCCCAATTATTTTACAAGTTGCGCTTGGTCAACGAGAAAAATTAGCGATTTACGGTGACGACTACAATACGCCTGATGGTACTTGTATTCGTGATTATGTACAAGTAGAAGATTTAATTGACGCGCATATTAAAGCGCTAGAATACTTGAAAAATGGCGGGGAAAGTAATATTTTCAACCTTGGTAGCAGTAACGGTTTTTCAGTGAAAGAAATGCTTGAAGCAGCTCGTACTGTAACAGGTAAAGAAATTCCAGCTGAAGTTGTACCACGCCGTGCAGGAGATCCAGGAACGTTAATTGCTTCAAGTGATAAAGCGCGTGAAATTCTTGGTTGGGAGCCAACTTATACAGACGTAAAAGATATTATCGCCACTGCTTGGAAATGGCACGTATCTCATCCAAATGGCTATTAATAACTTATGAAGGAATGTGATTTTTATCGAAGTAATGAAGGAGCGATTTGGGGAGTTTGAGGGAGAAACTGTTTGGAAGTGGACGATGGTAAATGATCATGGTATGCGCATGAGTGTTTTAAATTACGGAGCGATTGTTACTTCCCTTGAAACAAAAGATAAATTTGGTGATTTTGCGAATATTAGTCTTGGTTTTACAAATTTAGATGATTATTTGGCACACTCCCCATACTTCGGCGCGACACTTGGCCCTGTTGCTGGACGCATTACAAATGGGCAATTTAGTTTGGACGGTAAACAATTTCAACTGATTCAAAATGAAGGAGCTAACCATCGTCACGGTGGGAAATTCAATTTTAGTAAGAAGCTTTGGGATGTTTCAGTAGAAAAAAGTCTTGATCAAATTGTGATGACTTTTGAATACTGCTGGGCGGATGGAGAAAATGGCTATCCAGGAAATATTGATGCAAAAATGACATATACGTTAAATAATAAAAATGAATGGCTGCTTGATTATGAAGCGAAAAGCGATCAGCCGACTATATATAACCCGAGCAATCATATTTATTTTAATCTAAGCGGAGAAGCTGGTTCAACGGTTTTACAACATCAGCTTTGGGTTAATAGTGACAGCTTCCTACCAATTGATGAAGAGTTTCTCCCAATTGGGGAAAAGCGGTTAGCGGAAAATACTATCTTTGATTTGCGTGCAGGTCGTGAAGTAGCGGAGATTACACAAAGTCAGGACCAGCAAGTAAAATTAGTTGGTGCGGGGCTGGATCATGCATTCATTTTAAAACATGAAAATAGTCGTCCAGATGCAGTTTTGTTTGATCCAAAGTCAGGACGGCGCTTGGAAATGGAAACCAAAGCTGACTCGGTATTAATTTATACGGCGAATAGTTTGGATGGCTCTTTTGAGATTGGCGAGCGAACTGTGCCAAAATATGCTGGCATAACAATGGAAACACAGGGTTTAGTAGATGCGATTAACCATGACGGATTTGGTGATATTGTACTTCGACCAGAAAAACCTTTTACATCTAGAACAGCTTTTCGTTTCACAGTGGAGAGCTGATAAATTTTAATTAAAGAGTTCTAAATGAAGGAGTGTAGAGAATGAATTGGCAAGAAGAATATCAAAAATGGGTTGCTAATGACAAATTAGATAGCACATTAAGAAAACAATTAACGAATATGGAAGCAAATGAAAAAGAACTTGAGGATAGTTTTTATCGTAATATGGAATTTGGAACGGCTGGGATGCGTGGTGTACTAGGCGCTGGAACAAACCGCATGAATATCTATACTATTCGTAAGGCTTCTCTAGGTTTGGCGCAATTTGTGGCGGAGAACGGGGAAGAGGCTAAAAAACGTGGGATAGTTATTGCGTATGATCCTCGTCATATGTCGCGTGAATTTGCTTTTGAATCGGCGGCGGTATTAGGGCATCATGGTGTGAAAAGCTATGTTTTTGATGCGCTTCGACCAACACCGGAACTTTCCTTTGCAGTACGTCATTTAAATGCGTTTGGTGGGATTGTTATTACAGCTAGCCATAACCCACCAGAATACAATGGCTACAAGATTTATGGTGAAGATGGCGGACAAATGCCTCCAACAGGGGCAAGTGCTGTAATTGAATACATAAACGCGGTAGAGGATATTTTTTCTGTAGAAGTAGCGAACCAAGAGCTATTAATTGAAAATGGTTTACTTGAGGTAATCAGTGAAAAAGTAGACCGTCCATATTTGGAAAAATTAAAAGAGGTTATTGTCAATAAAGAGCTTGTTCAAGAACGAGGGGAGGATTTGAAAATTGTTTTCACGCCCCTTCATGGTACTGGCGGAATTCTTGGCGTTCCTGCGCTTGAAAGTGTTGGCTTTACGAATATTGTTAAGGTTGACGAGCAATTTGTGAATGATCCCGATTTTGGAACGGTAAAATCGCCTAACCCGGAAAACCGCGAAGCCTTTTTACTTGCGATTGAATATGGTAAGAAGTTTGGTGGCGACATTTTAGTCGGAACAGATCCGGATGCTGACCGTTTAGGCGTGGCAGTTCGTAATCTTGACGGCGAATATGAAGTGTTATCTGGAAACCAAATTGGCGCGATTATTTTACATTATTTATTAAAACAAAAGAAAGCGCAAAATGAATTGCCAGCTAATGCAGCGGTATTAAAATCTATTGTAACAAGTAATCTTGGAACAGAAATCGCGAAACATTACGGTGCGGAAATGATTGAAGTATTAACTGGTTTCAAATTTATTGCAGAACAAATTAAGCACTTTGAAGAAACTGGCAAGCATACGTTTGAATTTGGTTATGAAGAAAGTAATGGTTATATGGTTAAGCCGTTTACGCGTGATAAAGATGCGATTCAAGCGGTGCTTGCGATTGCGGAAGTGGCGCTCGTTAGCAAAGTAGAAGGTGGAAGTTTACTAGAAGATTTAGAGCAAATTTATGCTGAGTTTGGCTATTACAAAGAAGATCTAGTTTCCTTAACTTTAAGCGGTAAGGATGGTTCTCGGCGCATCAAAGAAATTACAAGTAATTTTCGCGAGCAACTACCAACAAGTATGGGTGGATTCCCCGTGGAACGTGCGGAAGATTATTTAAGAAGCGAAACAACTTGGATTGCTACCGGAAAAACGGAAGCGATTCATTTGCCAACAGCAGATGTCATTAAATGTTATTTTGAAGATGGTTCATGGTTCTGTTTACGTCCATCCGGCACAGAACCGAAAATCAAATTCTACTTTAGTATTCGTGGTGAAAGTAAAGAAGAAAGTGCAACAAAATTAGAAAAAGTGAAAGCTGATTTGATGCAACATATCGAAGCTTAAAAAGAAAAATCCCGGAAACTCGCTTTAGAGACTTTTCCGGGATTTTCTAGTGAGAAGTGTGCTAAAATGGAAGATAGATATTATTTGTGCGAAAGGATGAGGCAGATATGGCTTCTAAACAATTAAAATTAGTAATCATTACTGGGATGTCTGGAGCAGGAAAAACAGTCGCAATGCAGTCTTTAGAAGATCTCGGTTATTTTTGTGTAGATAATTTACCGCCAAGTTTACTTCCAAAGTTCTGGGAGCTAATGAAAGAAAGCGATAAAATGGATAAAATCGCGCTCGTAATGGATCTTCGCGGCCGTGAGTTTTTCGATTCCATTGAACCAGCGCTAGATGAGCTAGATAATACCAATTTTATAACAACGAAAATCCTCTTTTTAGAGGCTGATGATAAGGTACTTGTTTCGCGTTATAAAGAAACGCGCCGCCACCATCCACTGGAGCCTAATGGGTCTGTGCTAGACGGGATTAATGCAGAGCGCGAACTGCTTAGTGATTTAAAAGGCCGTTCGCAGTTAGTTATTAATACATCGAATATGGCGCCACGTGAGTTACGCGAGCGAATTAACAATGAATTCCAAACCGAAGATAAAGATATATTCAATGTGCAATTGATGTCATTTGGTTTCAAATACGGCATTCCGATTGATGCTGATTTAGTGTTTGATGTGCGCTTTTTACCGAATCCGCATTACATTGACAAAATGCGTCCGTTGACAGGACTTGATGAAGATGTGTATGAATATGTGATGAAATGGCCAGAAACGCAGACCTTTTTAGATAAGTTAGTAGATCTATTAATGTTTACACTTCCTTTTTACAAACGAGAAGGAAAAACACAATTAGTTATTGCCATTGGATGTACTGGAGGACAGCATCGTTCAGTAGCTTTGACAGAGTTCGTTGGTAAGGCAATTCAACAAAAATATGAAACAACGATTTCACACCGAGATATGAAACGTAGAAAGGGCCGTTAATATGAAAAAGGAAATGAAACCTAAAGTAGTAGTAATCGGTGGCGGGACCGGTCTTCCAGTCATTTTAAAAGGGCTTAAAAAGAAGGATATTCATTTAACGGCCATTGTGACCGTAGCGGACGATGGTGGTAGTTCTGGTAAAATTCGCGAGCAAATGGATGTGCTTCCCCCAGGTGATATACGCAATGTCATGCTAGCTTTATCCAATGTTGATCCACGGGTTGTCGATTTATTTCAATATCGTTTTGCGGTAGATGGTGATTTATCGGGGCATGTTATTGGAAATTTGATTTTAACGGCTTTATCGCAATTGAATGATAGTTATGTTGATGCGATTAATGTGCTAGCAACGGTGCTGAAAATCCGCGGCAAAGTTATTCCAGCAACGGATCAACCACTCATCTTAAATGCCGAAATGGAAGATGGTTCTATTGTGCACGGTGAATCGCTTATCCCGTTACAAGGAAAGCATATTAATCGTGTGTATATTGAACCAGAAAATGTAAAACCATATCCGACAGCAGTCGAAGCAGTGAAAGAGGCTGATTTGATTGTTATTGGTCCAGGGAGTTTATACACAAGTATTTTACCAAATCTATTACTTACGGAATTAGCTGATGAAATTATAGCAAGCAAGGCTCCGAAAGTATACATTACGAACATTTTAACGCAAATTGGCGAAACCGACTTTTTCTCAGATGCGGATCATATTAAAGTTATCCATGAGCATGTGGGAAAATCTTTTATAGATAAAACGTTAATTAATACGACGACTGTTCCGAAAGAACTTTTATTCCCAGAGGATGTTGCGCAAGTAGAGCATAATGCCAAAGGAATGGAAGAGCTTGGCGTAGAAGCCATTTATCAAGATTTTCTTTCTACAGAGGATGGCCTTGTGCGCCATGCCGCTGAAAAGGTGGCGGACGCGCTTTTAGCGATGTTACCTAACCAAACTATTGAAAAGGAGTGAGTAAGCCATGTCATTTGCATCGGAAACCAAGAAAGAATTAACCCATATGGACGTAAGTGATAGCGATGCAAAAGTGGAACTCGCAGCTTTTATTCGAATGAATGGTGCCATCTCGTTTTCGAATCAATTAGTGATAATGGATGTCCAAACCGAGAATGCAGCCATAGCTAGACGAATGTATCAATTACTGAAAGACTTATACGAAGTGCCAATAGAACTTCTTGTACGTCGCAAAATGAAGTTGAAAAAAAATAATGTTTATATAGTTCGCTTGAAGTCAGGTACACGGGGGATTTTGGAAGATTTACGGATACTAGAGCCACCGATGACGTTTACGAAATCGATTGATAGGGGATTTGTTAAGAAGAGAAGCGCTAAACGTGCTTATTTGCGTGGAGCCTTTTTGGCAAGTGGGTCAGTTAATAATCCGGAAACTTCTTCTTATCATTTAGAAATTTTCTCTGTTTATGAGGAGCACAATGAGGCGATTTGCGCTTTGATGAATCAATTCGATCTCAATGCGCGAACGCTTGAACGGAAAAATGGTTTTATTACCTATTTGAAAGAAGCAGAAAAAATCACGGAATTCTTGAGTATTATCGGAGCAACTAGCGCGCTTCTTCATTTTGAGGATGTTCGGATTATGCGTGATATGCGGAATTCGGTGAACAGGCTAGTGAACTGTGAAACGGCGAATCTCAACAAGACAATTAATGCGGCTGTTAGGCAAATCGATAATATCAAGTATATCCAATCAACCGTTGGGCTAGAAGCTTTACCAGAACGACTGCGTGAGATTGCAGCGCTTCGTATAGCTAATGAAGATGTTACCTTAAAAGAGCTAGGCGAAATGCTGACAACAGGTCAAGTAAGTAAATCAGGTATTAATCATCGTCTCCGGAAACTAGATCAGATTGCAGAGCGCCTTAGAAGCGGGGAAACACCAGCACAAGTAGGACTGAAAATCAGTAATAGTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP028333|773940:781785|779837_780806_+|AVS33906.1|DBSCAN-SWA MKKEMKPKVVVIGGGTGLPVILKGLKKKDIHLTAIVTVADDGGSSGKIREQMDVLPPGDIRNVMLALSNVDPRVVDLFQYRFAVDGDLSGHVIGNLILTALSQLNDSYVDAINVLATVLKIRGKVIPATDQPLILNAEMEDGSIVHGESLIPLQGKHINRVYIEPENVKPYPTAVEAVKEADLIVIGPGSLYTSILPNLLLTELADEIIASKAPKVYITNILTQIGETDFFSDADHIKVIHEHVGKSFIDKTLINTTTVPKELLFPEDVAQVEHNAKGMEELGVEAIYQDFLSTEDGLVRHAAEKVADALLAMLPNQTIEKE >CP028333|773940:781785|780813_781785_+|AVS33907.1|DBSCAN-SWA MSFASETKKELTHMDVSDSDAKVELAAFIRMNGAISFSNQLVIMDVQTENAAIARRMYQLLKDLYEVPIELLVRRKMKLKKNNVYIVRLKSGTRGILEDLRILEPPMTFTKSIDRGFVKKRSAKRAYLRGAFLASGSVNNPETSSYHLEIFSVYEEHNEAICALMNQFDLNARTLERKNGFITYLKEAEKITEFLSIIGATSALLHFEDVRIMRDMRNSVNRLVNCETANLNKTINAAVRQIDNIKYIQSTVGLEALPERLREIAALRIANEDVTLKELGEMLTTGQVSKSGINHRLRKLDQIAERLRSGETPAQVGLKISNS >CP028333|773940:781785|773940_774900_+|AVS33901.1|DBSCAN-SWA MASEEKIYDVIIIGAGPAGMTAALYTSRADLDTLMIERGVPGGQMVNTAEVENYPGFDSILGPDLSDKMLSGAKQFGAEYAYGDIKEVVDGKEFKTVTAGSKTYKARAIIIATGAEHRKLGAAGEEELSGRGVSYCAVCDGAFFKNRELIVVGGGDSAVEEGTYLTRYADKVTIVHRRDKLRAQQILQDRAFKDEKVDFIWNSTVEEIVGDGKKVTGAKLVSTVDGSESIMPVDGVFIYVGLVPLTKAFLNLGITDDEGYIVTDEEMRTNLPGIFAAGDVRAKSLRQIVTATGDGGLAGQNAQKYVEELKESLEAEAAK >CP028333|773940:781785|778960_779836_+|AVS33905.1|DBSCAN-SWA MASKQLKLVIITGMSGAGKTVAMQSLEDLGYFCVDNLPPSLLPKFWELMKESDKMDKIALVMDLRGREFFDSIEPALDELDNTNFITTKILFLEADDKVLVSRYKETRRHHPLEPNGSVLDGINAERELLSDLKGRSQLVINTSNMAPRELRERINNEFQTEDKDIFNVQLMSFGFKYGIPIDADLVFDVRFLPNPHYIDKMRPLTGLDEDVYEYVMKWPETQTFLDKLVDLLMFTLPFYKREGKTQLVIAIGCTGGQHRSVALTEFVGKAIQQKYETTISHRDMKRRKGR >CP028333|773940:781785|776019_777081_+|AVS33903.1|DBSCAN-SWA MIFIEVMKERFGEFEGETVWKWTMVNDHGMRMSVLNYGAIVTSLETKDKFGDFANISLGFTNLDDYLAHSPYFGATLGPVAGRITNGQFSLDGKQFQLIQNEGANHRHGGKFNFSKKLWDVSVEKSLDQIVMTFEYCWADGENGYPGNIDAKMTYTLNNKNEWLLDYEAKSDQPTIYNPSNHIYFNLSGEAGSTVLQHQLWVNSDSFLPIDEEFLPIGEKRLAENTIFDLRAGREVAEITQSQDQQVKLVGAGLDHAFILKHENSRPDAVLFDPKSGRRLEMETKADSVLIYTANSLDGSFEIGERTVPKYAGITMETQGLVDAINHDGFGDIVLRPEKPFTSRTAFRFTVES >CP028333|773940:781785|775019_776003_+|AVS33902.1|DBSCAN-SWA MSIVVLGGAGYIGSHAVDELITRGYEVVVIDNLRTGHKESIHTKAKFYEGDIRDKAFLSSVFEKEKVDGVIHFAASSLVGESMEVPLVYLNNNVYGTQIVLEVMEQFGVKHIVFSSSAATYGEPERVPITEDMPTNPESTYGETKLIMEKMMKWCDKAYDMKYVALRYFNVAGAKADGSIGEDHKPESHLVPIILQVALGQREKLAIYGDDYNTPDGTCIRDYVQVEDLIDAHIKALEYLKNGGESNIFNLGSSNGFSVKEMLEAARTVTGKEIPAEVVPRRAGDPGTLIASSDKAREILGWEPTYTDVKDIIATAWKWHVSHPNGY >CP028333|773940:781785|777122_778853_+|AVS33904.1|DBSCAN-SWA MNWQEEYQKWVANDKLDSTLRKQLTNMEANEKELEDSFYRNMEFGTAGMRGVLGAGTNRMNIYTIRKASLGLAQFVAENGEEAKKRGIVIAYDPRHMSREFAFESAAVLGHHGVKSYVFDALRPTPELSFAVRHLNAFGGIVITASHNPPEYNGYKIYGEDGGQMPPTGASAVIEYINAVEDIFSVEVANQELLIENGLLEVISEKVDRPYLEKLKEVIVNKELVQERGEDLKIVFTPLHGTGGILGVPALESVGFTNIVKVDEQFVNDPDFGTVKSPNPENREAFLLAIEYGKKFGGDILVGTDPDADRLGVAVRNLDGEYEVLSGNQIGAIILHYLLKQKKAQNELPANAAVLKSIVTSNLGTEIAKHYGAEMIEVLTGFKFIAEQIKHFEETGKHTFEFGYEESNGYMVKPFTRDKDAIQAVLAIAEVALVSKVEGGSLLEDLEQIYAEFGYYKEDLVSLTLSGKDGSRRIKEITSNFREQLPTSMGGFPVERAEDYLRSETTWIATGKTEAIHLPTADVIKCYFEDGSWFCLRPSGTEPKIKFYFSIRGESKEESATKLEKVKADLMQHIEA |
7 | Streptococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1506991 : 1515277
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP028333|1506991:1515277|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP028333|1506991:1515277|1512218_1513646_+|AVS34582.1|DBSCAN-SWA MLAEVKGLNEECGIFGIWDHPNAAEITYYGLHSLQHRGQEGAGIVSTDGETLKGHRNLGLLADVFKHGELDDLKGKAAIGHVRYATAGQKNLGNVQPFLFHFHSSSLALAHNGNLVNAKSLRRELEEEGAIFQTSSDTEVLAHLIKRSHTGDFVEDLKVALNKVKGGFAYMLLTEDTMYAALDPNGFRPLSIGRIGDSYVVASETCAFETVGAEFVRDVEPGELIIINDDGLRIEKFTENVTHSICSMEYIYFARPDSNIAGINVHSARKRSGKRLAKEAFIDADVVTGVPDSSISAAIGYAEEAGLPYELGLIKNRYVARTFIQPSQELREQGVRMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSKRIVQLLREAGAAEVHVRIASPPLAYPCFYGIDIQTRNELIASNYSVDEICRIIGADSLEYLSEEGLVDSIGRPYPNEPYGGLCMAYFNGDYPTPLYDYEAEYLASLEAEK >CP028333|1506991:1515277|1508364_1509078_+|AVS34578.1|DBSCAN-SWA MTNELVYEGKAKRLFKTEEAGVLRVAYKDDATALNGVRKESFAGKGELNNQITSLIFSHLARAGIESHFIRAISETEQLVKEVSIIPLEVVVRNVMAGSLAKRLGKEEGELIPNAIVEFYYKDDALDDPFINDDHVLYLELATTSEMDIIRQAARSINKVLQELFNQMNITLIDFKLEFGRDATGNILLADEISPDTCRLWDKETNQKLDKDVFRRNIGNLTDVYTEVLNRLKQVQN >CP028333|1506991:1515277|1510014_1512234_+|AVS34581.1|DBSCAN-SWA MPNMEPTTKEIKEQKIYQEMGLTDSEYELVCSILGREPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTEGKQVLQGPGEGAGIVDIGDGLGVAFKVESHNHPSYVEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPIAMLNSLRFGELDTPHAKYLVSEVVAGIAGYGNSIGIPTVGGEIQFDPCYTKNPLVNAMCVGLIEAKDIQKGQAKGIGNPVMYVGAKTGRDGIHGATFASVEFSEEGEQQRSAVQVGDPFMEKLLLEACLDVIRDHSDILVGIQDMGAAGLVSSSSEMASKAGAGLELIMDDVPQRELNMTPYEMLLSESQERMLLCVKKGHVEEIQALFERYGLEAVVIGQVTDDKMYKIIHHGEVVANVPVDALAEDAPVYHKPSKEPARYQAFQEEESFVPVMEDVVGVWKELLAQPTIASKRHIYEQYDYQVRTDTAVVPGSDAAIVRVRGTEKAIAMTTDCNSRYLYLDPEVGGAIAVAEAARNIVCSGGKPLAITDGLNFGNPEKPEIFWEIEKAADGISAACLELDTPVISGNVSLYNETDGTGIYPTPVIGMVGLVEDLAHITTQDFKNSGDVIFLIGETKAEYSGSELQKLQQGKISGRAPELDLTTEKKYQQLLLTAIQEGLVASSHDLAEGGFGVALAEATFKAGLGADVEVPFELNQLFSESQSRFLVSVKPENEAAFAQLMELEKVYRLGVVTEDDTIRVKHKEDQVTAKTTELRSIWEGAIPCLLK >CP028333|1506991:1515277|1509338_1510022_+|AVS34580.1|DBSCAN-SWA MKFAVIQFPGSNCDLDMLHAIRDSLGEEAEYVWHAETSLAGFDAVLLPGGFSYGDYLRTGAIAKFSSIMPEVLRFAEMGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALIRNNNLHFICKTVPLRVANASTMVTGLYKEGEIIQVPVAHGEGNYYCDDETLLKLKDNNQIVFTYDSVNPNGSRADIAGIVNERGNVLGMMPHPERAVEEIIGGTDGLRLFESVVKAWKEEQVNA >CP028333|1506991:1515277|1514710_1515277_+|AVS34584.1|DBSCAN-SWA MNIAIFTSGNGSNFQALVDDAFIKPHVKLLVCDKPNAYVLERANTHQIPVFLFEAKNYPDKEAFETEILLELRGLEIDLLVLAGYMRLIGPTLLAEFPEQIVNLHPSLLPEFKGKDAIGQAIQANVSETGVTAHFVDAGMDTGPIIDQVKVPIEHAETVDTLAGKIHQVEHIFYPKVIRGLIQNGGND >CP028333|1506991:1515277|1513664_1514714_+|AVS34583.1|DBSCAN-SWA MAENAYSKAGVDVEAGYQVVERIKKHVARTERLGAMGALGSFGGMFDLSSLHLKEPVLVSGTDGVGTKLLLAIEADKHDTIGIDCVAMCVNDILAQGAEPLFFLDYIATGKTDPVKMEQIVKGVADGCEQAGAALIGGETAEMPDMYGAEDYDLAGFTVGAVEKQKLITEGAVKEGDTLIGIPSSGIHSNGYSLVRKIFFKDNELTLDAEISELDVPLVEELLKPTRIYVKPVLEVLKEVDVHGITHVTGGGFVENLPRMLTNDLAVKVELGSWPVLPIFDVMKKYGQLSELEMYEIFNMGIGMVLAVAKADVERTLEVLVQNGEAAYVIGEVTTRENDAVIFTGGTKG >CP028333|1506991:1515277|1506991_1508284_+|AVS34577.1|DBSCAN-SWA MLERYTRKEMGNIWTEQNRYQAWLEVEILACEAWAELGDIPKEDVAKIRANAKFDVDRIHEIELETRHDVVAFTRSVSESLGAERKWVHYGLTSTDVVDTANSYLLKQANEILRKDLENFIAIIGEKAKEHKYTVTMGRTHGVHAEPTTFGLKLALWYEEMKRNLERFNFAADGVEFGKISGAVGTYANIDPFVEAYVCEKLGTTPAPISTQTLQRDRHAEYLATLALIATSVEKFAVEVRALQKSEVREVEEFFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENVTGLARVIRGHMVTAYENVPLWHERDISHSSAERIILPDSTILLDYILNRFGNIVKNLTVFPENMKRNMDRTLGLIYSQRVLLALIDKGLAREAAYDVVQPRAMEAWEKQVPFRELVEQDATIIENLSAEEIADCFDYNYHLKNVDLIFDRLGL >CP028333|1506991:1515277|1509089_1509335_+|AVS34579.1|DBSCAN-SWA MYNVKVYVTLKKSVLDPQGVAVKDAAKSMGYEEVEDVRIGKFMELKVAKSDRDIHEVLNEMCDKLLTNPVMEDYRYEIEEA |
8 | Prochlorococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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