Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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CP017636 | Vibrio vulnificus Env1 chromosome II, complete sequence | 0 crisprs | cas3,csa3,DEDDh,WYL | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP017635 | Vibrio vulnificus Env1 chromosome I, complete sequence | 0 crisprs | csx1,cas3,DinG,WYL,PD-DExK,DEDDh,csa3 | 0 | 0 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
687622 : 734385
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP017635|687622:734385|DBSCAN-SWA GCTATCTGCCATTCCACATACAGCCATCTCTAAGCATTGAATTTAGAATAACTACCATCTTTCTGACGCAGGCAATGAGCGCTACTTTTTTGGGTTTTCCAGCAGCCAAAAGTCGTTGATATGTTTCTTTAAATACAGGGTTACATTGCATCGCTGACATCATGGCCATGTATAAAACAGTCCTTACTTGCATCCGTCCACCTTTGATCATTCTCTTGCCTTTGAAACTGCCACTTTCACGCGTAATGGGTGCAACCCCGATTAAAGAGGCTGCTTGTTTGTTGGTGATGTAACCGAGCTCAGGAACGTTACTAATAAGTGACGCTGCGGCGATTTTCCCGATACCAGGGACGCTCTGCAGTATCTCGTTTTTAGCTTGGTAGTCAGGGCAAGTTTCTATGAGTTTTTCGATTCTGTTTTCTACTTTTGCAATCTGATTTTTGAGAGCAGTTAAGATAGGTTTGATTGAAGAAGCAAGTGATTGAGGAAGGATTTGATGTCGATTCTTTTCCATCGTTTGCATTGATAGTAATTGGTTTCGTCTAGTGACTAAGTCGCTCATTAAACGTATGTTTTCACTTTTTAATTGCGTGAGTTTTGGTTTGATTGCTTCGGCGTAGTGGGCGATAAGCGCCGCATCTAGACGGTCGTTTTTCGCTTTGTTGCCAAGAGCACCAGAAAACTTTTTGATGTGTAATGGGTTAGCGATGACATAAGGCAGATTGGCTTTTTCACACGCTAAGATGAATGGCATCTCCAATCGACCGGTTGCTTCAATAACAATCCGTTCTGGATGATATTTAGCAATAGTGCGAACGGCTTGTTTGATGCCTTTTTCATCATTTGTGACATTAAAATAGATATCGAGAGGGCGGATATAGATATCAAGTTGTGTCTTACCTGTATCAACGCCGACATTAATGTTTTGAAGTGTATTTGTATTCATAATAAGCTAACTCTTGCTTGCGAAATGCGGGCTCGAGACCCAGAAGACTATTCGAGTGTGATGCTTGGAGTTCTATCTGATGTTCGTTCTTGTTATCGGTCTCTCAATAGAGGAGCCAGCGTTCAATCGAACTATCAGATAGAGAACTTTAGTTGCAGCTAAAGTCTGGGTCTCACCTTACCCTGATTCGTTAGTTATTATCCATACAAGGCGTTTAAGCGGGATTCATGCCGCGTGGCATTTTTGGTATGCGGTGAGTTTTGGTGGTGAAAGTGGTCTGCGGAAGCTTGGTTTAGGCGGCACTCACCCCTTAACGCAGCGTTAGGTTTCTTAACTCTAGATATGCTTCAAGTTATTGAGTACACTAGATTAGTCTTTGAATTGTTGGGTTTTGGGCAAAAACTATGGATATATCGGTTAGAAATTTTGGCACAATAGCCAGAGCTGATGTCAAAATTGGAGGGTTAACAGTCATCGCTGGTGAAAATGACACCGGGAAAAGCACTGTTGGTAAGATTCTATTTTCTTTAGTTAAAGCTAGTGCGAGATATGAAGAAGATCTCAAAGAAGACAAAGAATATAAGATAGTCAGTTTAGCTGAAAAAATTTATTTTACTATACGACGAAACGTTAACTTAAACCGAACTCCTTTGTTGAGAGAACTTTACCACCCAAGGAAGTTTTACGATCAAATAAGAATTTATCAAGAAGAAGCTATATATGAGAGAAAGTCAGGCTTAGTTACGTTGGTAGAAAATAATGATATTGATCATAAAACGTATCGTTATATAGATAATATCCTTGATGATATTCGTGAAGTCTACAACGAAGATGAAGATAGGAAAAGTATCATAGCTAAGGCTGTGAAAAAAGCATTTTATTCTGAGTTTAAAGGGGAAATTTTCCCTAAAGGAAAACCTCATGTTAAATCATGCTCAGTTAATATTAAAGATGGTCGTTCCGAATTGATAAATATCCAATGGAACAAAGAAGGTATCGATACGTTTGACTACTTTGACGATCTTGGCTTTGAAGATGCTACATTTGTAGATACTCCATCAATTATTCAGTTTCATAATTTTACGGATATAGCTAAAACATTATTTGATGTTTCAAATTCTATCGGCGGATTCACTGTTCCTTTGCACATAAAAGATCTTTCCACGAAAATAAAAGAATCAATATACACATATAATCTTTTCGACAATGTGCATCACATTAACCATAACTTGAGTAATACATATAAAGGTCGATTATATTATGACAAGAACTCTTCTGAGTTTTTGCTAGATAGAGGTAACTATAAAGTCAACTCTTCCAATGTTGCTTCTGGAATCAAGTCGTTAGGTATCTTTGATATACTTGTACAATCTGGACACGCAAGCCACAACTCGCTACTCATTTTGGACGAACCTGAAATTAACTTGCATCCTAAGTGGCAGATTGAATATGCTCGAAATATTATTGAGTTGATTAAGCTTGGGGCTAATATAATCGTTACTACACACAGTCCTTATATACTCGAAGCTTTAAAAGGGTTTTGTAACAAAAATTACTTGGAGCACCACTTCTATCTAGCACAGAAAAATGAAGATGCCTCGCAGTTAATTGAAGTGACTAACAATATAGAACATGCAATTCATGAGTTGTCTTTTCCTCTATTTCAATTGAATGAGGAATTATATGACGACTTCTAATGAAAAATTAATTTATGATAAACTATTAGAAATTTATCCGAATCAATTGATTCCGATTACTGAACTAAGCTTGAACGATAGTGCGAACAAAATGTTTGTCGAATCGACTGTTACTGGATTTAATTTTGATAGTGTTCTTAATTGCCATCCTGATTGTGCAAAAAAAGAAAAGTCTCCTGATGCTTTATTTTATGTAGACGAAAAGCTATATTTCGTTGAATTTAAAGAAGGCGGTTCCAAGAAAGAGGATATCCGACTTAAAATTCATGAGGCTGTCGCAACAATATATAATTTTTCTCTTCAACAAAATTTAGGGATATCTAGAAAGGATTTTTTTGAAATGGATATCCGATATGCTGTTATCTACAGAGAAAATAAAATAAACCCTAATCCAACCTTTGCCAGCATGTTGGAAATGACCTCAAAGAAATACCATTTAAAAAACTTAGAGGGTTATATTGTAAAGAAAACTCGTGTTGCAGGACATCCTGTCAGTATATTTAATGTGCTAAAAAGTGTTTCCGGTGGGAGTGTCGCTTCAATTCTTATACATAAAGATGGCGAGGCTCCAATACAGGTACCAGCCTAAACCTAACAATCTGTTTAAGAGTGATTCGCAACGCTTGGCATTTCTGCTATGCGTTGCTTTTTGCGTTTTAGGTGGTTTGCAGAAACATCGGTATTTCGTTGCTCACACCTTAACAGGGCGTTATGTTTAGTCGCGTAAAATCAGTTGGTTGCATCTTTTCTTTGCTTTTTCAGCTTTCTAATTTTGGTCTTGTCGGCAAGTTACGTTTAGTGCTCGCTGTTTTCTGGACTCCAATTCGTGGGCGCTAAAAATTCAGAGTGTTGCCTCATTTAAGTTCAGTGCGTTTTTGAGTCGAATGACGCGATCTTAGTTTCAAAGTTTGAGCTCCCGCTTTCGGTTTTCCACGCTAAAACTCAATATCAGTAAATTCAAATTTATTAGTAAATTCAGTTTTTTAGCGTCTGGTTTTGGTTTTCAAAGATAAGTTGAGTTAAGCTTTGGTATCGTAAAACTTAACCGTTCGAGCCTTAAACATAACAAGGCGTTTAAGCGGGATTCATGCCGCGTGGCATTTTTGGTATGCGGTGATTTTTGGTGATGAAAGTGGTCTGCGGAAAGTTGGTTTGAGCGGCACTCACCCCTTAACGCAGCGTTATGAGTAATTGAATATGATACAACCTTTAGGATTAATAAGTGTACTTCTCGACGCTTCAGCAGACTTGAGTAGTCGAGATGACGCGGCAATGGATCTGAGTCAGTACCCATGCGTAGATTCAGTCAGTGCTTTGCTGATAGTAGCCACATCTAAAACAGAATCAGAAATTTTAGTTGCAAGTTGTGGGGAGTCTCTGGGAAAAATATGCGAGAAACTTGGTAAAATTGATATTGTTCAGTCATCGGATTTACATCCAATAGCTTTGTCTGAGTTCAATTCAATATTGTCTCGTTCTAAAAATAACTCATAACAAACAATTTAAGAGTGATTCAGCACGCTTGGCATTTTGGGTTTGAGTTTAGCTTAGTGATTACGGTCGTCAAATAAAGTGTCGTGGTCGCGTGCTTCACACCTTAATTGGGCGTTATGTTTAGTCACGTAAAATCAGTTGGTTGCATCTTTTCTTTGTTCCTTCGTATTTCTTATTTTGCTCTTGTCGGCAGGTTAACTTCAGTGGTCGCTGTTTTCTGGACTCCAATTCGTGGGCGCTAAAAGTTCAGAGAGTTGCCTCATTGAAATGCAGAGTGTAGGCGAGGTGAGTGAAGTGATTTTGATTTCAAAGTTAAAGCCCGGCTTTTCGGTTTCTTACGTTGAAATTCAAAGTCAGTACAGTCAAATTTATGAGTTAATTCAGCTTTTTAGCGTCTGCTTTTGGTTTGCAAAGGTAAGTCGAGTTAAGCTCTTGGTATCGCAAACTCAACCCTTTGAGCCTTAAACATAACAAGGCGTTTAAGAGGGATTCATGCCGCGTGGCATTTTTAGTTTGCGGTGATTTTTGTGGTGAAAGTGGTCTGCAGAAACTTGGTTTAGGCGGCATTCACCCCTTAACGCGGCGTTATGCTTAATCAAACAAAATCAGTGGTTTATGGTTTTTCTATGTTCCCTCGGCTTTTCAGTTCGGTGTTTGTCGGCAAGTTGGCTTTTTTGAGCGCTGTTTTTCGGACACTTATTCTTTGGCGCTGAAAACTATGAGTATTGCCTCAATCAATTTTCGGGTAAGCGCGAGGTTAGGGCGGTTGGCTCAATCAGAAATTTGATCTTAGGATTTTGAGTTTTGACTGCCAAAGTTCAAAGTCTGATTTTCAAAATTATGAGTCGTTTCGGTTTTCTAAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP017635|687622:734385|712982_713252_+|AVW98988.1|DBSCAN-SWA MSSSQRLLSWTDDAWDDYLYWQTQDKKTLKRINKLINDVKRSPFEGIGKPEPLKENLSGFWSRRIDDTNRLVYAVDDQAITIISCRYHY >CP017635|687622:734385|694501_695002_-|AVW98966.1|DBSCAN-SWA MNRIPTERKEAILKKLLPPYSMSVSQVAKEEGISTATLYHWRQQLRRSGAAVPNSHTSSEQWSAQTKLAIVAETYSMTENELSQYCREKGLFPEQVQGWRSECMQGFMSAKEREAEAKKQAKADKLEIKELKKELRFKEKALAETAALLVLRKKLRAFYGEEPEED >CP017635|687622:734385|698003_698498_+|AVW98970.1|DBSCAN-SWA MSDGKSLNARIPAYRKAFASGELQKTYQSLVGIVQNLRTEFDKHYKGEYSVANVLHGYIDFTYFYLQNDFLKKHKLKLAIVLNHQEVRFELWLLGQTKDVQISYWEKLQGIKWVNQDAMPEWSIFEITMLASPDFDDTKVLSESIRSVFSELSMEIFNTLKACE >CP017635|687622:734385|690250_690853_+|AVW98963.1|DBSCAN-SWA MTTSNEKLIYDKLLEIYPNQLIPITELSLNDSANKMFVESTVTGFNFDSVLNCHPDCAKKEKSPDALFYVDEKLYFVEFKEGGSKKEDIRLKIHEAVATIYNFSLQQNLGISRKDFFEMDIRYAVIYRENKINPNPTFASMLEMTSKKYHLKNLEGYIVKKTRVAGHPVSIFNVLKSVSGGSVASILIHKDGEAPIQVPA >CP017635|687622:734385|728442_728706_+|AVW99004.1|DBSCAN-SWA 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>CP017635|687622:734385|709494_709890_+|AVW98984.1|DBSCAN-SWA MKWFLAFWLVLTSCFSVSLYANDAVLQQAYQSQQSDLQVQGFGQVAKVLPDDNDGSRHQKFILKLNSGQTLLVAHNIDLAPRIPNLKVGDSVEFYGEYEWNKKGGVLHWTHKDPQNRHAHGWLKHNGQVYE >CP017635|687622:734385|696079_696595_+|AVW98968.1|DBSCAN-SWA MQQVLETERLILRPFEHSDAEQVSVLAGDKRIAEMTANIPHPYKVSDAISWIETHEIGFASGESIVYAIVRKESLELIGAVSLRSSKDGQGILGYWLGVDFWGQGYATEASKALIEYAKESHGLRELKVMHLVGNDRSKSVIDKLGVTYVENQTLRMQGGEREVCVYISAV >CP017635|687622:734385|719706_720129_+|AVW98996.1|DBSCAN-SWA MFPEGKLNYPEWDESVSDRAIISEFYDQLLKRYPEVREDIEFNEGLLHLDMASLQRVAEKLCKERKLAELESCFLWVNSLFCRSRNELLNAINVSFLECFQYSPYLSKQEFKNAMPPELYQGYEEIMSYIEELGKQSISQ >CP017635|687622:734385|704170_704404_+|AVW98978.1|DBSCAN-SWA MLTPKLITVFYWLTLFVVVFTGIMGMNSGYQGITTTGVFLGIGSILVGVLVARIWFELMIVLFKINDNLQALRDNKE >CP017635|687622:734385|723567_723984_+|AVW98999.1|DBSCAN-SWA MDFKKLRDIGNELDIKIPSEYTNFMLNYPLLSDSEEQGYLEETILRNADLIILNNKYFREDIEDAIRSSGNLDFVWKSSFFVVGSDGCGNYYFLETSKSPAPVYFFDHELLGYEYLASDINGLLKHFIDVSNEVKSWK 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55 | Vibrio_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
743916 : 792183
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP017635|743916:792183|DBSCAN-SWA 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52 | Diadromus_pulchellus_ascovirus(100.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1809156 : 1816210
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP017635|1809156:1816210|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP017635|1809156:1816210|1811371_1811710_-|AVW99881.1|DBSCAN-SWA MPKIIVLPHEDLCPEGAVLEANSGDTVLDVALKNGIAIEHACEKSCACTTCHVIIREGFDSLEESDELEDDMLDKAWGLEPESRLGCQAKVADEDLVVEIPKYTLNHASEDH >CP017635|1809156:1816210|1813596_1814112_-|AVW99883.1|DBSCAN-SWA MNHFELFGLPPQFSLDGSLLSSQFRELQKRFHPDNFATASERDRLLAVQKAAQINDAYQVLKNPISRAEYLLSQNGLEIRGEQQTMQDPVFLMEQMELREELEEIPQSSDAESALAAFDARVSKMYKQHLATIEQELNDAQWPQAADRVRKLKFIAKLKNEIELVEEKLFG >CP017635|1809156:1816210|1814172_1814496_-|AVW99884.1|DBSCAN-SWA MAVTLTDSAANRVRAFLDNRGKGIGLRLGVKTTGCSGMAYVLEFVDELNEEDEVFEHSGVKVIIDKKSLVYLDGTQLDYVKEGLNEGFEFNNPNAKSECGCGESFNV >CP017635|1809156:1816210|1811096_1811291_-|AVW99880.1|DBSCAN-SWA MKWTDSRDIAIELCERFPDMDPKTVRFTDLHQWILEIEDFDDEPNHSNEKILEAVILCWLDEWE >CP017635|1809156:1816210|1809645_1810944_-|AVW99879.1|DBSCAN-SWA MSTQMSVFLSHEVAAPQWGDKALVSFNEQGALIHTGESTDLTKIQRAARKFDVQGIKNVFLDGDGWDVEAIWAFHQGYRNPKKYSQVEWVALEEKAQAELEARIKATEFTRDIINKPAEEVAPRQLATMAAEFIRSVAPEGTVTARIVKDKDLLAEGWEGIYAVGRGSDRTSAMLQLDFNPTGDANAPVWACLVGKGITFDSGGYSIKASNFMDSMKADMGGSGTITGGLGLAIMRGLNKRVKLILCCAENMISGRALKLGDVITYKNGKTVEIMNTDAEGRLVLADGLIYASEQNPELIIDCATLTGAAKNALGNDYHALLTFDQALAQEALKSAAEEKEGLWPLPLAEFHREMLPSNFADLSNIGGGDYSPGASTAAAFLSYFVQDYQTGWLHFDCSGTYRKAASDKWSAGATGMGVCTLANLLVAQANK >CP017635|1809156:1816210|1809156_1809582_-|AVW99878.1|DBSCAN-SWA MALERTFSIIKPDAVERNLIGEIYHRIEKAGLRIIAAKMVHLNDEQASGFYAEHEGKEFFPALKEFMTSGPIMVQVLEGENAIARYRELMGKTNPEEAACGTIRADYALSMRHNSVHGSDSPASAAREVAFFFPESEICPR >CP017635|1809156:1816210|1811721_1813575_-|AVW99882.1|DBSCAN-SWA MALLQIAEPGQSSAPHEHKRAAGIDLGTTNSLVASVRSGTADTLKDAQGRSLLPSIVNYANDEAIVGYAAKALSESQPQDTIISVKRLLGRSLTDIQTRYPSLPYRFKASENGLPVLETTQGDKNPIEVSADILKVLAKRAEESLGGELSGVVITVPAYFDDAQRAGTKDAAKLAGLHVLRLLNEPTAAAIAYGLDSGQEGVIAVYDLGGGTFDISILRLSKGVFEVLATGGDSALGGDDFDHLLADFLAEQAGLEMPLSAEKNRTLLNIATTTKIAFSEQDSVEVDIFGWKGIVTREQFEELIRPLVKKTLMSCRRALKDADVDADEVLEVVMVGGSTRTLLVREMVGEFFGRTPLTNINPDEVVAIGAGIQADILAGNKPDSEMLLLDVIPLSLGIETMGGLVEKIIPRNTTIPVARAQEFTTFKDGQTAMSVHIVQGEREMVDDCRSLARFSLKGIPPMAAGAAHIRVTYQVDADGLLSVTAMEKSTGVQSEIQVKPSYGLSDDEVANMLRDSMTYAKEDMQARALAEQRVEADRVIEGLIAAMQADGDELLSEAEKATLLQAIESLIELRNGNEANAIEQGIKDTDKASQDFASRRMDKSIRAALAGQSIDTI >CP017635|1809156:1816210|1814995_1816210_-|AVW99886.1|DBSCAN-SWA MKLPIYLDYSATCPVDPRVAEKMVQYMTMDGTFGNPASRSHRYGWQAEEAVDTAREQIAELLNADPREIVFTSGATESDNLAIKGAAHFYSKQGKHVITSKTEHKAVLDTCRQLEREGFEVTYLEPESNGLISLSKLEAAMRDDTVLVSIMHVNNEIGVIQDIEAIGELCRSRKIIFHVDAAQSAGKVAIDVQKLKVDLISLSAHKIYGPKGIGALYVRRKPRIRLEAQMHGGGHERGFRSGTLPTHQIVGMGEAFRIAKLDMEKDYQHALALRNRLLDGVKDMEAVTINGDLEQRVPHNLNISFAFVEGESLLMSLKDLAVSSGSACTSASLEPSYVLRALGLNDELAHSSIRFSFGRFTTEEEIDYAIEQIRVAVEKLRDMSPLWDMYKEGIDLNTVEWAHH >CP017635|1809156:1816210|1814568_1814952_-|AVW99885.1|DBSCAN-SWA MAYSEKVIDHYENPRNVGSFDKEDPSVGSGMVGAPACGDVMKLQIKVTPEGIIEDAKFKTYGCGSAIASSSLVTEWVKGKSIEEAASIKNSEIAEELELPPVKVHCSILAEDAIKAAVADYKKKHQL |
9 | Powai_lake_megavirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2979431 : 2994679
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP017635|2979431:2994679|DBSCAN-SWA 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14 | uncultured_Mediterranean_phage(22.22%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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