Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP020487 | Enterococcus faecium strain CFSAN059070 plasmid unnamed3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP020484 | Enterococcus faecium strain CFSAN059070 chromosome, complete genome | 1 crisprs | DEDDh,cas2,RT,DinG,cas3,cas14j,csa3 | 0 | 0 | 11 | 0 |
CP020485 | Enterococcus faecium strain CFSAN059070 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | cas14j,RT,DEDDh | 0 | 0 | 3 | 0 |
CP020486 | Enterococcus faecium strain CFSAN059070 plasmid unnamed2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP020484_1 | 2401986-2402095 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP020484_1
|
1 spacers
spacers of CP020484_1
>1.1|2402012|58|CP020484|CRISPRCasFinder CCTATTCACTTCGTTCATAGTGATTCTACTCGCTTTGCTCGAAAGGAAACTCCTTTCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP020484_1
The CRISPR arrays of CP020484_1 >merge|CP020484|1|2401986-2402095|CRISPRCasFinder CTTTGCTCAACCAGTATTATTCATCACCTATTCACTTCGTTCATAGTGATTCTACTCGCTTTGCTCGAAAGGAAACTCCTTTCGCTTTGCTCAACCAGTATTGTTCATCA >CP020484|1|1|2401986-2402095|CRISPRCasFinder CTTTGCTCAACCAGTATTATTCATCA CCTATTCACTTCGTTCATAGTGATTCTACTCGCTTTGCTCGAAAGGAAACTCCTTTCG CTTTGCTCAACCAGTATTGTTCATCA
>CP020484.1|AWV59321.1|2401409_2401913_-|50S-ribosomal-protein-L10 MSEAIIAKKAAIVDEVSEKFTAAASVVVVDYRGLTVDEVTRLRKQLRDANVEMKVIKNSILSRAAKKAGLEGMDEVFTGPTAVAFSNEDVVAPAKIMDEFAKEAKALEIKGGIIEGKVSSLEEITALAKLPNREGLLSMLLSVLQAPVRNVAYAVKAVADKEDGDAA >CP020484.1|AWV59320.1|2400988_2401357_-|50S-ribosomal-protein-L7/L12 MALNIENIVAELKEATILELNDLVKAIEEEFGVSAAAPVAVAAAGGAAAAEEQTEFTVELTAAGDQKVKVIKAVREATGLGLKEAKAVVDGAPAPVKEGVSKEEAEELKAKLEEVGASVTVK >CP020484.1|AWV59319.1|2400193_2400883_-|TVP38/TMEM64-family-protein MKKKIIRLILISLGIILILVVGYRLYLEYQTDIQLFLNPRASKAELLAHIRSHGTFASILLIVLTAVMCAVPGIPTSVVGVIAGLSFGPLTGAIINILGNALGNITAIFLMHRLKFLDKKTETNHWVQAIRQMKHPKIGVMLGYMIPVIPSSMVNFAADAMKLPLQQIILSIVIGVIPSSVLYACGGEALFHGYNKTAVTLVASVTVLVGLVVFIYKDRKKKQGKQKHK >CP020484.1|AWV59318.1|2398909_2400112_-|MFS-transporter MKSNEKKPLTTSLILLLSITCGVVVANMYYIQPIGTKVAASLSVSTSAVGILTMLTQLGYALGLLFLVPLGDVVDRPKLIIRMAALSAVSLLAAFFAPSFTLFACASFLIGLLSIVPQIIIPYGAVLAGPKARGKVMGTLLSGLLVGILLSRTVSGIVASLFSWRMIYLFALCAVGILTLLLYWKMPRSVQQSSTAVSYLDSLKSLPHLVASQRLLREAAVSGFFMFGTFSIFWSTLIFYISSPAYNWGTFEAGILAIFGLSGAVAAPIVGRLADSYSERKIVYMGLVMQTISFIALLVGGSHLAILLLAIILLDVGNQFGQVANQTRVQGLGEAASNRNNTVFMFMYFIGGAAGSLLGTTMWQQYGWLGVTVSGLVFQGCAFFFQTVVFKGKRNLENKK >CP020484.1|AWV59317.1|2397186_2398719_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSILTLNNITQQFGDKILYEGVDLQLNAGEHLGLIGQNGAGKSTLIKIITGEILPDDGQIHWQKNIHKGYLDQYVEVDETLTIEEFLKTAYAKEYEKEEKIAFLYQTYSETFDDSLLEKAGKLQTELDQGVFYQIDTLVAEMSSGLGIDVLGLDSLLKNLSGGQRSKVILAKLLLENPDVLILDEPTNHLDDQHIQWLTQFLQDFDGAYIVISHDQEFLDQITTHIADIEFGKITKYTGHLKQALKQKEQNRESYLRQYHAQQKQIEKTEAYIRKYKAGSRSTMAKSRQKQLDKIERLTPPASASKAVFDFPFSPIVTTLAVETTDLVIGYDRPLLAPINLTIRFGENIAIRGFNGIGKSTLLKTLIGEIEKISGDFHFPDNTKINYFSQDLYWENPLETPLQYLSSQFPKATIKELRRQLAKAGLVNQLASEPLTTLSGGEQTKVKLAQLTMNQGNLLILDEPTNHIDQETKESLQDGIQKFPGTVIIVSHEQEFYQDLVQRVIEIEPK >CP020484.1|AWV59316.1|2396251_2396953_-|glucosamine-6-phosphate-deaminase MEIIRVKNAEEGGKKAFEIIKEGMNKGAKVLGLATGSTPVTLYKEMTSSDLDFSEMTSVNLDEYVGLGGSDEQSYRHFMDVQLFDKKPFKETFVPDGKAEDLEAACKKYDQIIDAHPIDIQILGIGQNGHIGFNEPGASFDGTTSVVDLTESTINANKRFFDKAEDVPTKAVSMGIGSIMKSKEIVLMAFGESKADAIKGMIEGPVTNHLPASVLQNHDNVVVIIDEEAASKL >CP020484.1|AWV59315.1|2395284_2395998_-|MgtC/SapB-family-protein MNDMVLTIPEIILRLGIAMLFGGAIGFERQYKNRPAGMRTHILVCMGACIIALIQVEIASGALRDALEYPQLAGTIRSDEARLIAQVVSGVGFLGAGTIIVTKQSVTGLTTAASLWAIAGLGIAIGMGYYSIAIISFIGIAIALTVVKRVIHVPTTKKLEIQFIHRKETKDFLTDYFEEKNIVIEDVNFDVKFVDDYRVYKNIYTIDLPKGLTYADVIEELSVHKNITKLHLVSIAQ >CP020484.1|AWV59314.1|2393836_2394976_-|AI-2E-family-transporter MQSRFKQSKLFFWTVELVLTIIGVYFILQMPNIFSPILKMLSAVFLPLLVAGFIYYMFDPIVVFLEKHRIPRVFGFLLTFLVVIILVVLTVMNVVPQLMEQTIQLTQSLPMYADETSKWLNELAQREEFKNFNLEEQLASANLSLSNLFNIILVSLSASVSKIISFMMQFFILLFTVPFILLFMFKDGHKFIDALSHFFPKAIRKELRQTVKELNETLSAYISSTILDALIIGVMSFLAMRIFDQPYSLLLAVICGITNIIPYVGPFIGAVPAIIVGLFISPFQALYMALSILVIQQLDGNLIKPLLFGKSMNIHPLTIILVLIGAGSVAGILGMLICIPVYAVIKTIILNIRKIYLLRRMEHVSEKLDSPKVLEETSE >CP020484.1|AWV59313.1|2392782_2393748_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-beta MSETYYEAINWNEIEDIIDKSTWEKLTEQFWLDTRIPLSNDLDDWRTLSQLEKDTVGHVFGGLTLLDTVQSESGMDQLRKDVRTPHEEAVLNNIQFMESVHAKSYSSIFSTLNTKKEIEEIFDWTNTNPYLQKKAERINEIYKHGTPLEKKIASVFLETFLFYSGFYTPLYYLGNNKLANVAEIIKLIIRDESVHGTYIGYKFQLGFNELPEAEQETLKDWMYNLLYELYENEERYTEELYDPIGWTEEVKTFLRYNANKALMNLGMDPLFPDTANDVNPIVMNGISTGTSNHDFFSQVGNGYLLGHVEAMKDDDYLIGLE >CP020484.1|AWV59312.1|2390573_2392733_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-alpha MSLKNLQDVSYFKLNNEINRPVNGQIPLNKDKEALVAFFEENVKPNTMTFLSIMEKINYLIDQEYIEAEFIQLYSPSFIEKLYQFLDEQHFSFKSFMAAYKFYSQYALKTNDGSAYLETYEDRVAFNALYFANGDEELALALADEMIHQRYQPATPSFLNAGRKRRGELVSCFLTQVTDDMNSIGRSINSALQLSRIGGGVGITLSNLREAGAPIKGYEGAASGVVPVMKLFEDSFSYSNQLGQRQGAGVVYLNVFHPDIIAFLSAKKENADEKIRVKTLSLGVIVPDKFYELTRKNEDMYLFSPYSVEKEYGVPFSYVNITAEYDHLVANPNIRKQKIKARDLENEISKLQQESGYPYVINIDTANRENPIDGKIIMSNLCSEILQVQTPSVINGKQEYEVLGTDISCNLGSTNIVNLMQSPNFGQSVRTMTRALTFITDASDIDVVPPIQNGNKLNHTIGLGAMGLHTYLAKEQMEYGSEDSLDFTNIYFMLLNYWTLVESNNIARERKQVFHNFEKSAYADGTYFEKYVTGEFQPKSEKVKALFEGIFIPTAEDWNALKQAVMKDGLYHQNRLAVAPNGSISYINDTSASIHPITRMIEERQEKKIGKIYYPAPYLSNETIPYYTSAYDMDMRKVIDVYAMAQQHVDQGMSLTLFMRSEIPEGIYEWKTTTKQTTRDLNILRHYAFHKGIKSIYYVRTFTDDAEEIGSNQCESCVI >CP020484.1|AWV59322.1|2402322_2403012_-|50S-ribosomal-protein-L1 MAKKSKKMQDALKKVDSSKVYPVAEAVALAKETNIAKFDATVEVAYRLNVDPKKADQQIRGAVVLPNGTGKTQTVLVFAKGDKAKEAEAAGADFVGDDDMVQKIQNGWFDFDVVVATPDMMATVGRLGRVLGPKGLMPNPKTGTVTMDVTKAVNEVKAGKVTYRVDKAGNIHVPIGKVSFDDEKLVENFAAIHDVLLKAKPSAAKGQYMKNVTITTTFGPGIHVDQASF >CP020484.1|AWV59323.1|2403115_2403538_-|50S-ribosomal-protein-L11 MAKKVEKIVKLQIPAGKATPAPPVGPALGQAGINIMGFTKEFNARTADQAGLIIPVVISVYEDRSFTFVTKTPPAAVLLKKAAKIEKGSGEPNKNKVAKVSSDQVREIAELKMEDLNAANVEAAMRMVEGTARSMGITVE >CP020484.1|AWV59324.1|2403880_2404549_+|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-beta MKDLRYRSVFDIIGPVMIGPSSSHTAGAARIGKIIRSIFGEQPDSVDIYLYESFAKTYRGHGTDIALVGGLLGMEPDDERLADSLKLAYEAGMEVLFVPKSEKAEHPNSVKMLLKKGTRKLSVTGISIGGGNIQISELNGFKISLSMGTPTLIVVHQDVPGMIAKVTSILSETNTNIGTMTVTRESKGENAIMIIEVDDPQVEETVKRLKQLPNIDSVNYFD >CP020484.1|AWV59325.1|2404561_2405434_+|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-alpha MFLSIEELVDQAKAYPSVAELMIAVEMEMSGRSRSHIIEIMEKNLSVMEQSINEGKEGVTSVTGITGGDAKKLDDYLNEADFLSGETILKAVRNAVAVNEVNAKMGLICATPTAGSAGVVPGVLMAVRDRLDLTHEQQLEFLFTAGAFGLVIANNASISGAEGGCQAEVGSASAMAAAALVCAKNGTPHQAAQAVAITLKNMMGLICDPVAGLVEVPCVKRNALGSSQAFISADMALAGIESVIPPDEVVAAMYQVGRQMPSIFKETAEGGLAVTPTAKRLAEEILNKRA >CP020484.1|AWV59326.1|2405524_2406544_-|lactate-oxidase MEAGAFGYIRGGSEDEWTMKENTTSFNTKKIMPRILRGIDSADLHTSVFGIELDTPIIQAPSAAQGLAHEKGEADTAKGVAAAGSIFSISTYANTTIKDAADAAPGAPQFFQLYMSKDDRFNEFILNKAVEAGAKAIILTADSTLGGYREEDVINQFQFPLPMPNLAAYSEQSASGNGEGKGIAEIYAAAKQGLTPDDIKTIKEITHLPVIVKGIQSPEDAVIAISAGADGIWVSNHGGRQLDGGPASFEVLPKIAEVVNKRVPVIFDSGVRRGEHVFKALASGADLVAIGRPVIYGLNLGGAEGVTSVFEHLNKELSITMQLAGTKTIDEVKYTKLMD >CP020484.1|AWV59327.1|2406716_2407604_-|alpha/beta-fold-hydrolase MTEPIKNLCKRATAAALVLISLFALSGCQTTKINTTEVSDKEKTAESSKVIEKTTIPTLFFHGYSGTENSFKGMLRRLEKNQQAVKELVLTVGTDGQIQATGDLSGKADNPMVQVLFEDNKNNEWNQAEWIKTCLLYLKENYGIDKVNIVGHSMGGVSALRYLGTYGQDTSLPQVQTLTAIGAPFNDFVDDSAQSLTDELAKGPAVVSNRYQDYQQMIGNIPITTRFFLIAGQLDETDLSDGTVPLNSALAVYALLKQRGNEIEEKVVTGENASHSMLHENQEVDQLVSRFIWKE >CP020484.1|AWV59328.1|2407680_2408226_-|transcription-termination/antitermination-protein-NusG MESFEKNWYVLHTYSGYENKVKANIESRAQSMKMADFIFRVVVPEEKETEVKNGKEKEIVHKTFPGYVLVEMIMTDASWYVVRNTPGVTGFVGSHGAGSKPAPLLPEEVNHILRSIGMSLRQNDLEVEVGEVVKIIEGAFAGLEGQVTEVDGEKEKLKVNIDMFGRETSTELDFDQVDKID >CP020484.1|AWV59329.1|2408326_2408497_-|preprotein-translocase-subunit-SecE MKFLKSVKDEIKQVTWPSRKQLRKDTLVVIETSIIFGLMFYVMDTAIQSLFGWILK >CP020484.1|AWV59330.1|2408520_2408673_-|50S-ribosomal-protein-L33 MAKKKAALACSVCGSRNYTKSVSEGKSGERLEINKFCKYCNQYTLHKETK >CP020484.1|AWV59331.1|2408834_2409479_+|CBS-domain-containing-protein MLLKTLVYKKKDLTTVTETSTLEEALKILETSGYRCVPILDSSGNIFRGNIYKMHIYRHKANGGDMTLPVTHLLKNATKFIYLDTSFFKVFFTIKELPYIAVLDSENHFYGILTHSTLLNMLSQSWSVEQGSYVLTIASTGKQGDLAAIAKIISKHSSIASCITLDIEKDEYIRRTLITLPANTEAKVCETIVNHLEKKNYKVVEIENLQNQEA |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
516753 : 583716
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP020484|516753:583716|DBSCAN-SWA CATGACAGACAACAGCAAAACACGCGTTGTCGTAGGGATGAGCGGCGGTGTCGACTCATCTGTAACAGCACTTTTGTTAAAGGAACAAGGATACGACGTGATCGGAATATTCATGAAAAATTGGGATGACACGGACGAAAACGGTGTATGCACGGCCACGGAAGATTATAAGGATGTAGCGAAAGTAGCTGCTCAAATCGGGATTCCTTATTACTCTGTGAATTTTGAAAAAGAATATTGGGATCGTGTATTTGAATATTTCCTAGCCGAATACCGCGCAGGACGTACACCTAACCCAGACGTGATGTGCAACAAAGAAATCAAATTCAAAGCATTCTTGGATTATGCAATGGATCTTGGCGCCGATTATGTAGCTACTGGACATTATGCGCAAGTCACTCGCGATGAAAACGGCGTGGTCCACATGCTTCGTGGAGTAGACAATAATAAAGATCAAACTTACTTCCTTAGCCAATTATCACAAGAACAGCTTTCAAAAACGATGTTCCCTCTAGGCGGCATGGAAAAATCAGAAGTACGGGCAATTGCTGAACGCGCAGGCCTTGCGACTGCTAAGAAAAAAGATTCAACGGGAATCTGCTTTATTGGTGAAAAGAACTTCAAACAATTTTTGAGCAACTATCTGCCAGCAAAAAAAGGAAATATGGTCACTCTTGATGGTGAAGTCAAAGGACAACATGCTGGCTTGATGTATTATACGATTGGTCAACGTCAAGGACTAGGGATCGGTGGCGGAGGAGATTCGCAAGAACCCTGGTTTGTTGTAGGAAAAGATCTAGCGACAAACACATTATATGTGGGGCAAGGGTTCCATCATCCTGCATTGTATGCCACAAGCTTGGATGCAAGTGAAATCCACTTTACGACGAATGAACCAATGCCAAAAGAATTCAAGTGTACAGCGAAATTCCGTTATCGTCAGCAAGACGTTCCTGTGACAGTTCGCTTATTGGATGATAATCGTGCAGAAGTCGTATTCGACGAACCTGTACGTGCAATCACTCCTGGACAAGCAGTTGTATTTTATGATGGAATGGAATGTCTGGGTGGTGGTTTGATCGACCACGCATATCAAGAAACAAAAGTTTTACAATACGTTTAAGCGATATTAAATGAATCAAAACAGCTATGGCTAACAAAAGAAACACCTTTTCTTTTGGATAGCATAGCTGTTTTTTTGCAATAAAATTAATTTTTATTCATTTTATACTTGAAATACTTGTGTAAAAAGTTCATAATATCCAATAATATGAATAAAGTTGCTTTTTGTTAAGCAAGAGCAGTTGCAAAATAGAAGGGAATCTTTTGCAAGTGATTTGTTCAATTTTATAAGTGAGGGTGATGGAAATGGAAAAGAAATCGACGGGTATTAGCAAATGGGGACTGGTTGCTCTGGTTGTCAGTTCGTCAATCGGAAGCGGTGTGTTTGGGATCACAAGTGATCTGGCTAGTTCTGCAGCTCCAGGGCCAGCGATCCTTTCATGGATAATCGTTGGGATTGGTATTTTAGCTTTGGTATTATCGCTGAATCATTTAGGAGAAAAGCGTCCAGATCTAGATGGTGGTATTTTCGGTTACGCGGAAGCTTCATTTGGTAAATTAGGTGGCTTCATCAGTGGTTGGGGTTACTGGTTGTCTGCGTGGCTGGGAAATGTTGCTTTTGCAACGATGCTGATGAGCGCCATGGGAGAATTTTTCCCGATATTCAAAGGTGGACAAAATGTTCCTTCTATTTTATTTGCAAGTATTTTTATTTGGGGTCTGACTTTATTAGTAAACAATGGAGTTGAAGGAGCGAGCGTCATCAATACAATCGTGACGATCTGTAAATTAGTGCCATTATTCCTATTTTTAATATTTGTATTTATCGCATTTAAAGTGAATATATTCACTGCTGATTTTTGGGGTAACGTATCTGATAATCTAGTGAATGGAACAGGGCAGCAAGGAACGATCTGGTTGCAGATTAAAGGTTGTTTGATGGTTATGATGTGGGTCTTTGTAGGGATCGAAGGCGCAAGTGTTTTAGCCAACCGCGCGAAGAAACGTTCAGAAGCCCAGCAAGCATCGATCATTGGTCTGCTTTGTTTATTGTTTATCTATATCCTTGCTTCGATCTTGCCATACGGCGTCTTATCTCAAGAAGAGTTAGCAACTATTTCACAACCTGCTATGGCAAATATTTTAAAAGGAATCGTGGGAAATTGGGGAGCAGCGCTGATCAATATCGGCTTGATTATTTCGATCATTGGTTCTTGGTTGTCTTGGACGATGCTCCCAGCAGAAACAACGATGTTGATGGCTCGAGACGGTCTGTTGCCGAAAGGTTGGGGAAAAACGAATAAAAAAAATGCCCCAACTTATTCGTTAGTTGTTACTGCAATCTTGACTAATCTATTCTTATTGACTTTCTTAGTTACTGATTATGCCTATCAATTTGCCTATTCTTTATGTACAGCGGCAATTTTGATTTGTTATCTACTTGTCGGGATCTATCAAGTCCAGTTTTCTTTAAAAGAAGGAATCAAAAAACAAGTAGTGATCGGTGGGATTGCTGTAGTTTTTGAATTGATGGGCATCATTTTAGCAGGATTTTCTTATGTCCTTTTATGTAGTATTGCCTATCTTCCTGGTTTTTGCTTCTACTGGATCGCTTGTCGTGAAACCAAACATCAAATTACGGGAAAAGAAAAAGTAATGATTGGGCTGATTTGTGTGGCCGCACTGCTTTCAATCGGGTTGCTTGCTGTAGGCTGGATCAAGATATAAGGGGGAAAGAAACATGAAAATCGCAAATTTCGGTGTAGAAGAATGGCTAAATAAATGGGAAAAGAAAGCGGTATATGATATTGCACAAAGCTCGATCGAAGCATTGACATTAGACGAACTCGTTGGCTTAGATGGGACTAGCGTAAGTAAATTTTTCGAAAAACGCAAAAACGAACCATTGGACTATGGCTGGATCGAAGGATCAGATGTTTTCAAACAAGAAGTCGCTTCTCTTTATCAAACCGTCGATCCGGAAAACATCTTACAAACGAATGGAGCGACTGGTGCTAATCTTTTAGCTCTATACGCGTTAGTGGAAGCAGGAGACCATGTTGTTTCGATGCTTCCTACTTATCAGCAATTATATGACATCCCCAAATCTTTAGGTGCCGCTGTTGACTTTGTTCATTTGAAGGAAGAAGAAGATTGGCAGTTTGATTTAGAACAGCTAGAAGCCTTAGTCAAACCTGAAACAAAAATCATCTGTTTGAATAGTGCAAACAATCCTACAGGCACATTGCTAGATCGGAAAACTTTAGAAAAAATCGCAGAAATTGCTCGTACAGTAGATGCATATGTATTGATAGATGAAGTATATGCGCCTTTAACGGATAAAGGTGAATTCTTGTCGATCGTAGATGTCTATGAAAAAGGTATAGCAACCAATTCCCTATCCAAAACCTACTCCATTCCAGGTATTCGTATTGGCTGGACAGCTACTGGACCTGAGTTGGCAGAAGTTTTTCGAAAGTATCGAGACTACACGATGATTTGCGGCGGAGTCCTGTCAGATGATCTTGCTGTACATGCATTGAAGAATAAAGAAAAAATATTGGCGCGAAACAAAAAGATCATTACAGAGAACCTTGTGATTTTAAAACAATGGGTAGCCAATGAACCGAAAGTTGAACTTGTCGCTCCCAATTACGTCTCTACTTCTTTCATTAAATTAGCCATCGAAGAAGATGACCAGACATTTTGTATCAATTTATTAGAAGAAACAGGAGTACTATTAGTACCAGGAAGTGCCTTTGATTTACCGAAGCATGCCCGACTAGGTTACTGTTGTAAAAAAGAAACCTTGGAAAAGGGATTATTCCTCTTATCTGAGTTCTTGAAAAAACAGGCCTAAACAAAAACACTGCAAGGACAGTCTGTGACAACTGTTCAAGCAGTGTTTTTCATTTACGCTTATTGTCTATGAGAAGGAGAGTGCCCTGAAGCTATGGAGACTCCTGAAGCTTTTTCTTCTGCAGTTTCTTGCTGATGGATCTCTTGTGTATTGTGTCGTACAAGCAAGAAGTTGACCAAAACAAGAAGAGAAGTCGAAAGAAAGACGCCGCGATAACCAAATGCACTGGAAACACTGGAGCCGATCATAGGCCCTACTACGTTACCAGTTGCTTGGAAAGATTGGTTATAACTGAAGATCCGTCCAGCAGCTTGATGAGGCGAATATTTTGTGATCAATGCTTGGACAGCAGGGAGCAGACAAGCATCAGAGATACCAATCAAAAAACGTAAGGCAGCTAATTGCCAAACATTCGTGACGAATGCCATTGGGATATAAACCAGAATCGCAAAACCCAAACCAATCGCAAGTATTCTTTCACTCCCAATCTTGTCACCTAAGCGACCAAATCTTGGAGCGGCTATCAAAGTGGCAATCCCAGGTATCGAAGCAATGATTCCGCTGATCAACGTAACATTCCCATGTCCATGCAGCAATTGGCGAATGTACAGACTGATGATTGGACTAATGGAATTGTTGGATGCTTGGATGATCATCGTTGTGACGAACATACCGATGACGACGTGTGGATATTTCAAGTCTTTGAAAATCTGTTTGGCAGAAACCATGTTTTCTTTTTTCACTGGGACAAATTTTTCATGGACGAAAAACAGACTCAACAAGAAGACGAAAAATAAGATGATCCCTGTAATGAAAAAGGTAGGGCGATAGCCAAACGCTGAAGCAGAGATCCCGCCAAGAAGCGGTCCAAGTAATGTTCCTGTAACAGAACCAGTTGCTAAGGTTCCAAGAACTTGACCACTTTTTTCTTTTGGCGTCCCAGTTGCGACAAGGGCAGTGGCATTACTGATATAACCAGAAAAAATCCCTTGAAGCAGACGCAATGCGACTAATTGATACACACTAGTCACGCAACCCATCAAAGAAATGACGATTGCCATTCCTAATGAAGCACGCA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>CP020484|516753:583716|525457_526405_-|AWV57565.1|DBSCAN-SWA MKVSIVVPCFNEEKTVPLFFDEVEKFKGAHEFEYLFIDDGSKDGTLAAIKKLASAYPYVRFVSFSRNFGKEAALYAGLQASTGDLVTVMDVDLQDPPELLPEMINRITTSDIDCVGTRRSTREGEPAIRSFFAKKFYQLINKISDTEMVDGARDFRLMTRQMVDAVLELTEYNRFSKGLFSWVGFKTEYISYENRERVAGETSWSFWKLFNYSIDGIVNFSDAPLTIASFIGALSCVGSGIAILFIILRALLFGDPTSGWPSMVSIFLFIGGIQLLCLGIIGKYIGKIFLETKQRPVYIIRETEKVKPNELKPHQ |
58 | Streptococcus_phage(15.38%) | transposase,integrase,protease,tRNA | attL 512306:512325|attR 590565:590584 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
726195 : 734667
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020484|726195:734667|DBSCAN-SWA TGTGAACGGACTATTTATTACAATCGAGGGGCCTGATGGTGCAGGAAAAACCAGCATCTTGAATGAACTTTACCCTCTTTTGAAAGAAGTAGCAAAAACAGAAATCATTCAAACAAGAGAACCAGGAGGCATTCCGATTGCTGAAGAGATCCGAGCAGTGATCCTTGATCCAAAAAATGATCGGATGGATGAACGTACGGAAGCACTGCTTTATGCAGCAGCAAGAAGACAACATCTAGTCGAAAAGGTTCTGCCTGCTCTGGCAAAAGGGAAAATCGTTTTATGCGATAGATTTGTCGACAGTTCTCTTGCTTATCAAGGTGCAGGCCGACGCATCGGCGTTACCGAGATTGCTCGGTTGAATGAGTTTGCTACAGAAGGTACTACGCCGGATTTTACCCTTTATCTTGACGTAGATTCAGACACCGGATTAAGAAGAATCAAGAAAAACAGACAAAATCAAATCGACCGTTTAGATTCGGAAGGTTTGGAATTCCACCAGCGTGTACGTCATGCTTACTTAAAGCTGGCAGAAGAGAATCCGGAAAGAATCCACAAAGTTGATGCAAGAAAAAGCTTTGAAGAAGTGCTGCAAACAAGTTATCATACAATTATTGAACAGTATCCGCAATTTTTTGAAAACTAGGAAGGTGAACGTTTATGAAAATTATTTTAGCGATTATCCAAGACAAAGACAGCAACCGTTTATCAAATGAATTGATTGATGCAAATATCCGTGCCACAAAACTATCATCGACAGGCGGCTTCCTTAAGGCTGGAAACAGTACGTTTATCGTGGGTATTGAAGATGACCGTGTAGAAGAAGCATTGGAAATCATCAAAAAAACGTGTGAATCAAGAAAGCAATTTGTATCTACACCTGTTACACTGGATATTTCGATGGATGGGGGCGTCCCTTATCCAGTAGAAGTAGAAGTAGGCGGTGCCACAGTCTTCGTCTTACCTGTTGAAGGATTCCATCAATTTTAGGAGGAGCTGAGCTATGAATCAAGAAATAAACTTGGCTCAAATGCAACCGATCGTGTATCAGCAGCTTCAACGGAGTTTTGAGCATGGGCGTATCGCTCATGCTTATCTTTTTGAAGGGGAGAAAGGAACAGGAAAACATGAAGTAGGTATATGGCTTGCACAGCACCTGTTCTGTACCCAAATGAAAGACAATCTGCCTTGTGGAAAATGCAACAATTGTCAGCGGATCGAAAAGAAAGAACATCCAGATGTTTTGGTTATTGAACCGGAAGGACAAACCATCAAAGTCGATCAGATCAGACGTTTGCAGACGGAATTCAGTCGCAGCGGTTACGAATCAAGAAAAAAAGTTTTTTTGATCAAAGAAGCTGAAAAAATGAATAGCAGTGCGGCAAACAGTTTGTTGAAATTCTTGGAAGAGCCCCCTGGAGATTTTTTAGCGGTGTTAGAAACAGATGCAGTAGGAAGAATTCTCCCTACTATTCAATCTCGTTGTCAAGTTCTGCATTTTCAAGAACTTTCGAAAGAAGCACTGATCCATCGATTGCAAGAAGAGCAGATTCCATTGGAAAAAGCAAAACTTTTGGCTTTCTTAACAAACAGTTTAGGAAAAGCAGTTGAAATCTCTCAAGATGAATGGTTTAATGATGCTAAGGACTTGATTTATCAATGGTTCGTTTACTTGCAAAAGCAAGATACTCAAGCCTTTATCTATGTCCAAAAAAAATTGGTAAAATCATTTAAAGAAAAAACACAACAGTTTACAGGATTATCTGTCTTGATGTTTTATTATCAGGAAGCACAGCGTCAAGCAGTAGCAAACGGCGAATATGGCAAAGTGAAACAGATAAACCAGATAATTGAACGGATATTGATCGCAGAGCAGAAACTACGCAGCAATGTCAGTTTTCAGGCTGTTGCGGAACAGTTCGTTTTGCATACGATTTTTTAGCTTGCCGCAAAGGATGATGATCAAGGAGGATGGAAATGGTAGAAGTAGTAGGTGTCCGATATAGAGATGCAGGTCATATCTATTATTTTGCACCAGGAGACTCTGAATATGTTTATAGTGACAAGGTATTAGTCGAATCTCAGCAATCCTTACATATTGCTACTGTTGTCCTTCCTAAAAAAGAGATTGATCCCAATGACCTTCCTGAAGCTATCCGTCCGATCTTGCATAAAGCGTCACAAGCTGAATTAGAAAAAGACAAAAAAAACAAAAAAGATGCTTATGATGCATTGAAAATCGCAAAAGAAAAAGTGCAGTTGCGTGAGTTGGAAATGAAAATGGTCAAAGCCGAATACACATTTGATCGAAATAAATTGATTTTTTCTTTCACAGCGGACGGGCGAATTGACTTTAGAGAATTGGTAAAAGATCTGGCCGCTGTATTTCGTACTCGTATTGAGCTTCGACAAATTGGTGTCCGCGATGAAGCAAAGATAATAGGCGGAATTGGTCCATGTGGGCGTCCATTATGCTGTTCTTCTTTTTTAGGCGATTTCGTGCCTGTATCAATCAAAATGGCAAAAGATCAAAGTTTATCTTTGAATCCAACAAAAATTTCCGGTTTATGCGGACGCTTGATGTGCTGTCTGCAATATGAGAGCGAAGAATACGAGACAGCGAAAAAAGAACTCCCTGACTTTGGAAAAGTAATTGCTACACCTGATGGTAAAGGGAAAGTCGTAGGGTTGAATCTGCTTAGCCGTATCGTTAGTATTCGGCTGACTGGACGGGAAAATCCTGTCGAATATGAATGGGATGAATTGAAAGAATTTATCCAAGTAGGTGAGATGAATGGATAAGAGATCATTATACGACGGATTGAATCAATTAGAATCAGAGTTGAGAAATACATTAACAGAACTTGTTGAAATGAAGCATGCTTTGCATGAGATCGTAGAAAAAAATACAACTTTGGAGATGGAAAATCAACGTCTGCGGGAACACCTGCGGGAATTGAACCAAGTTGCACAAGCTCCAGCTGAAAATGTGAAGCAGGAACTTTCTAAGTCTCGTATGAATCTTGAAAAAATTTATGAAGAAGGATTCCATGTCTGCTACGATTTATATGGATCAAGAAGGGACAATGACGAGCCTTGTGCGTTTTGTCTAGAAGTGATCTATCGCGAAAGCGGTCGATGACCAATAACAAGAGGAGACTGGAGCGGAGAAATACTGCTCCAGTCTTTTTATTAAGGAGATTGTGACAGATGTATAATCAAAAAAGTTTCAAGGGAAATCCGGTATATGGGGATTTATATCTTGTACCGACGCCAATTGGAAATTTAGAAGATATGAGCTACAGAAGTGTTCGTATGCTGCAAGAATCCGATCTTATCGCAAGTGAGGATACGCGTAATACACAAAAGTTATTGAATCATTTTGAAATCCATACACCCCAAAAAAGTTTACATGAACATAATTATAAAGAACGTGTCCCTCAATTGATTGCTTTGTTAAAAGAAGGAAAAACGATTGCTCAAGTCAGTGACGCAGGAATGCCTTCCATCAGCGATCCTGGACATGAGCTAGTTTTAGCCTGCATAAAAGAAGGGATTTCTGTGATCTCTATCCCAGGACCTACAGCTGGGATGACGGCTTTGATTGCTTCAGGGCTAGTGCCTCAACCATTTTTATTTTATGGCTTCCTTCCACGTAAGAAAAAAGAACAGAAAGAAACATTGAAAAAGCTAAAAGAACAGACAGTTACGCTGATTTTTTATGAGTCACCTTATCGGATCACTGCTACATTGACGAATTTCTTAGAAATTTTTGGAAATCGCCAAGTCGTTTTGTGTCGGGAATTGACAAAGGTCCATGAAGAATACCTTAGAGGAAGTACGGAAGAGCTACTCGCTTATATCGAAGAACATCCAGTAAAGGGTGAATGTTGTCTGCTTGTAGAAGGGAATTTGTTCGAAATGCCAGTGACGGAAGTTGATGAAGAGTTGGGAACGTTAAAGGAACAAGTAGAAGCAAAGATCGCTTCAGGCGAAAAACCAAATGCTGCTATCAAAGCAGTAGCGCTGAAAAATGGGCTGAAAAAACAAGAAGTCTACCGTCAGTACCATGAATTAGACTGAGATAGTATAAGTTGTCTATAATGAAAGACTAATGAGGAAATCAGCTACTAACTTTTCAAATCTCTTGAACGCGAACGAATGTTCTTGTATAATGAATAAGAGGTGAGGATGATGGAGCTGCAATTTCCTTTACATAATGATACATCAAGAAAAATCATTCATATTGATATGGATGCTTTTTTCGCTTCGGTTGAAGAACGAGATCATCCTGAGTTTCGCGGACATCCATTAGTAATTGCCAGACACCCCAGTGACACTGGTGGGCGTGGAGTAGTGACTACAGCAAATTATGAAGCAAGAAAATTCGGAATTCATTCAGCAATGAGTGCACAAAAAGCGTATGAGCTTTGTCCGCAAGCCATCTTTAAGCCTGGCGACCATCATAAATACAGCGATATTTCCAAACAAGTACGGGAAGTATTCTATCGTTATACAGATATTGTGGAACCAGTTAGTATCGATGAAGCGTATCTTGATGTGACCGAAAATAAAATCAATTGCAAGTCAGCCATCAAAATCGCCCGAATGATCCAAGCAGATATTTGGGAGAGTGTCCAGCTAACATGTTCTGCGGGAGTAAGTTACAATAAGTTTTTGGCCAAATTAGCATCAGACTATCAAAAACCTAGAGGAATCACGGTAGTTGCCCCTCAAGACGCTGTGCCATTTTTAAAAGCTTTGCCAATTGAAAAATTTCATGGGGTAGGGAAGAAAACTGTACCTAGAATGCATGAGCTAGGGATTTATACAGGAAAAGACCTATATGAATGCACAGAAATGATGTTGATTCGAAATTTTGGAAAAATGGGCTATTCTCTTTATCGTAAAGTCAGAGGAATCCATGATTCTCCAGTAAACGTTACAAGAGAGCGAAAATCTGTGGGAAAAGAGCATACTTATGGGCAGCCGTTGCAAAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020484|726195:734667|729404_730277_+|AWV57749.1|DBSCAN-SWA MYNQKSFKGNPVYGDLYLVPTPIGNLEDMSYRSVRMLQESDLIASEDTRNTQKLLNHFEIHTPQKSLHEHNYKERVPQLIALLKEGKTIAQVSDAGMPSISDPGHELVLACIKEGISVISIPGPTAGMTALIASGLVPQPFLFYGFLPRKKKEQKETLKKLKEQTVTLIFYESPYRITATLTNFLEIFGNRQVVLCRELTKVHEEYLRGSTEELLAYIEEHPVKGECCLLVEGNLFEMPVTEVDEELGTLKEQVEAKIASGEKPNAAIKAVALKNGLKKQEVYRQYHELD >CP020484|726195:734667|728988_729336_+|AWV57748.1|DBSCAN-SWA MDKRSLYDGLNQLESELRNTLTELVEMKHALHEIVEKNTTLEMENQRLREHLRELNQVAQAPAENVKQELSKSRMNLEKIYEEGFHVCYDLYGSRRDNDEPCAFCLEVIYRESGR >CP020484|726195:734667|731560_732163_-|AWV57751.1|DBSCAN-SWA MRNPKPKEWLAKDYSQNYIADYKPFNFVDGEGVRNSLYVSGCLFACEGCFNKAAQNFRYGKPFTPELEEQIIADLRNDYVQGLTLLGGEPFLNTDVCLQVVRRIRKEFGTTKDIWSWTGYTFDELLQDSEDKLELLSQIDILVDGRFELSKRDLKLQFRGSSNQRIIDVQKSLESNQVVIWEKCTDATETYEQIKKQDLI >CP020484|726195:734667|727197_728136_+|AWV57746.1|DBSCAN-SWA MNQEINLAQMQPIVYQQLQRSFEHGRIAHAYLFEGEKGTGKHEVGIWLAQHLFCTQMKDNLPCGKCNNCQRIEKKEHPDVLVIEPEGQTIKVDQIRRLQTEFSRSGYESRKKVFLIKEAEKMNSSAANSLLKFLEEPPGDFLAVLETDAVGRILPTIQSRCQVLHFQELSKEALIHRLQEEQIPLEKAKLLAFLTNSLGKAVEISQDEWFNDAKDLIYQWFVYLQKQDTQAFIYVQKKLVKSFKEKTQQFTGLSVLMFYYQEAQRQAVANGEYGKVKQINQIIERILIAEQKLRSNVSFQAVAEQFVLHTIF >CP020484|726195:734667|728171_728996_+|AWV57747.1|DBSCAN-SWA MVEVVGVRYRDAGHIYYFAPGDSEYVYSDKVLVESQQSLHIATVVLPKKEIDPNDLPEAIRPILHKASQAELEKDKKNKKDAYDALKIAKEKVQLRELEMKMVKAEYTFDRNKLIFSFTADGRIDFRELVKDLAAVFRTRIELRQIGVRDEAKIIGGIGPCGRPLCCSSFLGDFVPVSIKMAKDQSLSLNPTKISGLCGRLMCCLQYESEEYETAKKELPDFGKVIATPDGKGKVVGLNLLSRIVSIRLTGRENPVEYEWDELKEFIQVGEMNG >CP020484|726195:734667|732477_734667_-|AWV57752.1|DBSCAN-SWA MKVNYEEKTVVTQQPETSQMKVIKRDGRHVDFDEQKINEALIKAEKKIHGSLSPLTYEKIQMIADLVVQEIKSRFAENVKIYEIQNIVEHILLEKNEYELAEEYINYRTKRDFARSKATDINFSIEKLINKDQTVVNENANKDSNVFNTQRDLTAGIVGKSIGLKMLPPHIANAHQKGDIHYHDLDYHPYTPMTNCCLIDFKGMLNNGFKIGNAEVESPKSIQTATAQISQIIANVASSQYGGCSADRTDELLAPFAELNYKKHLKDAEEWIDSPERQKEYAKAKTKKDIFDAMQSLEYEINTLFTSNGQTPFTSLGFGLGENWFEREIQKAILQIRINGLGSEKRTAIFPKLIFTLKKGVNLNPEDPNYDIKQLALECATKRMYPDILNYDKIVELTGSFKVPMGCRSFLQGWKDENGQEVNVGRMNLGVVTLNLPRIAIESKGDQNKFWQLLSDRLEIMKDALLYRVERCKEAIPANAPILYMYGAFGKRLSRTDSVNELFKNRRATVSLGYIGLYEVASAFFGGEWETNPEAKAFTLDIVKELKANADAWGDEYGYHFSVYSTPSESLTDRFCRLDTEKFGIIENITDKEYYTNSFHYDVRKNPTPFEKLEFEKDYPKYCSGGFIHYCEYPMLQQNPKALEAVWDFAYDKIGYLGTNTPIDHCYQCGFEGDFKPTERGFECPECGNHDPKTCDVVKRTCGYLGNPQARPMVHGRHKEISSRVKHMK >CP020484|726195:734667|726854_727184_+|AWV57745.1|DBSCAN-SWA MKIILAIIQDKDSNRLSNELIDANIRATKLSSTGGFLKAGNSTFIVGIEDDRVEEALEIIKKTCESRKQFVSTPVTLDISMDGGVPYPVEVEVGGATVFVLPVEGFHQF >CP020484|726195:734667|730385_731507_+|AWV57750.1|DBSCAN-SWA MMELQFPLHNDTSRKIIHIDMDAFFASVEERDHPEFRGHPLVIARHPSDTGGRGVVTTANYEARKFGIHSAMSAQKAYELCPQAIFKPGDHHKYSDISKQVREVFYRYTDIVEPVSIDEAYLDVTENKINCKSAIKIARMIQADIWESVQLTCSAGVSYNKFLAKLASDYQKPRGITVVAPQDAVPFLKALPIEKFHGVGKKTVPRMHELGIYTGKDLYECTEMMLIRNFGKMGYSLYRKVRGIHDSPVNVTRERKSVGKEHTYGQPLQTEEAVLTQLRQLAEKVEEALRRVQKHGKTVVLKVRYTDYSTVTKRVTLPEYIYKKEALFYQASLIWEEILGVEKGIRLLGITLTNLDPMTYENIVLPLWENQEI >CP020484|726195:734667|726195_726840_+|AWV57744.1|DBSCAN-SWA MNGLFITIEGPDGAGKTSILNELYPLLKEVAKTEIIQTREPGGIPIAEEIRAVILDPKNDRMDERTEALLYAAARRQHLVEKVLPALAKGKIVLCDRFVDSSLAYQGAGRRIGVTEIARLNEFATEGTTPDFTLYLDVDSDTGLRRIKKNRQNQIDRLDSEGLEFHQRVRHAYLKLAEENPERIHKVDARKSFEEVLQTSYHTIIEQYPQFFEN |
9 | Streptococcus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
787676 : 885190
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP020484|787676:885190|DBSCAN-SWA AATGAAAATGAAAGAAACCTTGCAATTAGGAAAAACAAAATTCCCTATGCGTGGTAATTTGCCAAACCGAGAAGGCGAGTGGCAAAAAGAATGGGAAGAAAATCGAATCTACCAAAAAAGACAAGAGTTGAACGAAGGAAAACCTAGCTTTGTTCTTCATGATGGACCTCCATATGCCAATGGTAATATCCATTTAGGACATTCATTGAATAAAATCAGTAAAGACATTATCATTCGTTCAAAATCAATGTCTGGCTATCGTGCACCATATGTTCCAGGATGGGATACACATGGATTGCCGATTGAACAAGTATTGGCTAATAAAGGCGTGAAACGTAAAGAAATGTCCATGGCAGAATACTTGGAAAAATGTCGTGAATATGCACTTTCCCAAGTAGATAAGCAACGAGCAGATTTCAAACGCCTAGGAGTTGCAGGAGATTGGGAACATCCTTATGTTACATTAGATCCTTCTTATGAAGCTGCACAAGTACGCGTATTTGGTAAAATGGCTGAAAAAGGCTATATTTACAAAGGATTGAAACCAATTTACTGGTCTCCGTCAAGTGAGTCTTCTTTAGCGGAAGCTGAAATTGAATATAAAGATGTAAAATCTCCATCTATTTTTGTAGCTTTCAATGTCAAAGACGGCAAAGATATTCTTGATGAAGATACAGCTTTTGTCATTTGGACGACAACACCATGGACATTGCCAGCAAACCAAGGTATTGCTGTAAATCCAAAATTTACGTATGTATTGGTGGAAGCCGATGGCCGTAAGTTTGTCGTAGCGAAAGATTTGCTAGAAACAGTCCAATCAGAAATCGGTTGGGAAAATGTAACAGTTCTAAAAGAATTTGCTGGACAAGAAATGGAATATATGACTGCAAGTCATCCATTCTATGAACGTGAATCACTTGTGATTTTAGGCGATCATGTTACTTTAGACGCTGGTACTGGATTAGTCCATACTGCTCCAGGACATGGGGAAGATGACTATATCGCTGGTAGCAAATATAAACTATCTGTAGTGTCACCTGTAGACTCAAAAGGATTGTTTACAGAAGAAGCACCTGGATTTGAAGGTATCTTTTATGACAAAGCAAATCCTATGATCACTGATCTATTAAAAGAAAAAGGAGCTTTGCTGAAGCTAGATTTCTTTACTCATAGTTATCCTCACGATTGGCGGACGAAAAAGCCTGTGATCTATCGGGCAACTCCACAATGGTTTGCATCTATCGATAAATTCCGTCAGAATATTTTGGATGAAGTAGAAAAAGTAGAGTGGGTTATCCCATGGGGTAAAACACGTTTGTATAATATGATCCGTGACCGCGGCGATTGGGTAATTTCCCGTCAGCGTGCATGGGGAGTACCACTTCCGATTTTCTATGCTGAAAATGGAGAAGCAATCATCACACCAGAAACAATCGAACATGTGGCAAAATTATTTGCTGAACATGGATCAATTATCTGGTTTGAAAAAGAAGCGAAAGAACTTCTTCCTGAAGGATTTACCCACCCAGGTTCTCCTAATGGCGAATTTACAAAAGAAAAAGATATCATGGATGTCTGGTTTGATTCTGGTTCTTCTCATGAAGCTGTTTTACGTCAGCGACCAGAATTATCATTCCCAGCAGATATGTATTTAGAAGGATCAGACCAATATCGTGGCTGGTTCAACTCAAGTATCACGACTAGTGTGGCTATCAATGGTGTAGCACCATACAAATCAGTTATTTCTCAAGGATTTGCTTTAGATGGTGAAGGCCGTAAGATGAGTAAATCTTTAGGAAACATCATTGCACCAGAAAAAGTGATCAAACAATTTGGTGCAGATATCCTTCGCTTATGGGTATCTAGTGTAGATTATGAAGCAGATGTTCGTGTTTCTATGGATATCTTAAGTCAAGTGGCAGAAGTATATCGTAAAATCAGAAATACGATGCGTTTCTTATTAGCGAATACAGAAGATTTCGATCCTAAAAAAGATACTGTTTCGTACAATGATTTACGTTCTGTAGACAAATATATGACCGTTCGATTGAACCAAGTAATCAAAGAAATCCGAGAAGAAGGGTACGACAAATATAACTTCATGCATATTTACCGTACAGTTATGAACTTCTTGACGGTTGATCTATCGTCATTCTACCTGGATTTTGCTAAAGATGTAGTTTATATTGAAGCAGAAGATGATTATCAACGTCGTTGCATGCAAACTGTTTTCTATCAAACAGCTGTAGCTTTGACAAAATTATTGACTCCTATCATTCCGCATACAGCAGAAGAAATCTGGTCATTCCTGAAAGAAGAAGAGGAGTACGTTCAGTTAAGCGAGTTTCCTGGTTATGAAGAGTTTGCAAACCAAGAAGAATTGATGGATACCTGGACTGCTTTCATGGACTTCCGTGATAATGTCTTAAAAGCATTGGAAGAAGCAAGAAACAGCAAATTGATTGGTAAATCTTTGGAAGCAAAACTAACTGTTTATCCAAAACAACAAGTTCGTGAAATGTTAAAAGCTTTGGATGCAGATATTGCACAATTATTGATCGTTTCACCAGACTACTTTGAAGTTATGGCAGCAGATGAACAAGTGCCAGATAACGCTATGGTATTTGATGATGTTGCTATTACAGTGGAAAAAGCAGACGGGGAAACTTGCGATCGCTGTCGCCAAGTTCGTAAAGATGTAGGAGTAGATGAAAAACTTCCTCATCTATGCGGTCGTTGTGCAAAAATCGTTGAAGACTTCTATCCTGAAGCTGTAGCTGAAGGATTCGAAGAAAAGTAAAAGGGAAAAGGGGGTGTGACATGTTCTTTGTCACACCCCCTTTTGTTATCAATCGTTTAATTTTCCACGTTCACGATACCAGTTATCTGGTTGCCAGATCCATTCGAATCCGTCTTTTTCAAGTAGTTCGAAAGCTGCTTTAGGTCCCATTGATCCAGCTTTGTAGTTGGGAAAATCCGGTTGTGTTTGGTCCCAAGCTTTTCGAATGACATCCACGATATGCCAAGATTGAGCGACTTCTTCCCAATGAGAGAAGTTCGTTCCATCACCATTCAACGCATCTAATAGTAATTTTTCGTAAGCTTCTGGGCTATTTTCAACCATTTCTGCACTATTTCTAAATTCCAATTTGATTGGTTCCGTTTCAAATCCTTGCCCTACTTCTTTCCCATTCAAGGATAAAGAAAATCCTTCAGTTGGCTGAATATAGATCGTTAGAACATTAGGTGGAAGTGTCGTATCGTCACATGGTTCATCGACAGATGTTTTGAATACATTAACAGGAACTTGTTTGAATACGATGTTGATCCGAGTCCCTTTTTCAGTCAAACGTTTGCCTGTACGTACATAGAAAGGAACACCTGACCAACGGAAGTTATCGATAGTGAATTTGCCTGCGACGAATGTTTCAGTCTCTGATTGAGCATCCACTTTGTCTTCTTCGCGATAGCCCTTGAATTGTACACCATCCAATTCACCTTGAGCATATTGCCCGCGAACGAAGTTTTCTAACACTTCTTCTTCGTTATAAATGCGGATAGCTTTCAATGCTTTGATCTTTTCTGTACGGATTTCTTTTTCGGAAAATGCTACTGGCGGTTCCATTGCAAGTAATGCTACAACCTGTAAAATATGATTTTGCACCATGTCTTTAAGTGCGCCACTATGATCGTAGTAGCCCCCGCGATCTTCTACACCGAGGTTTTCGCCAAAAGTAATTTGGATATTGTCGATATAGCGATTGTTCCATTGAGCCTCAAAAATATTATTGGCAAAACGGATAGCTGAGATGTTTTGGATCATTTCTTTTCCTAAATAATGATCAATCCTGAAAATATCTTGTTCTGGGAATACTTCTCTGATTTGCTGGTTCAATTCAAAAGCAGACTGGTAATCAGAACCGAACGGTTTTTCTATGATCAAACGATTGAAGCCATTTTTTGTCATAATATTTTGTGATTTCAAATGAGAAACGATCGTTCCAAAAAATTGAGGTGCCATAGCCAAATAATAGACACGGTTACCGTTTAATTGATAGTGTCCATCTAATCGGTCAGACAATTCTTTTAATGTCTGATAATGCGTTGAATCATTTACATCATGGGATTGATAGTAAAAATGGCTTGCAAAGGTAGTTGCTTCTTCATCTGAAGGATTCAATGCACGGATTGTTTCTTTGACAACTTCACGGTAGTGCTCATCGCTCCAGGGACGGCGAGCGGTTCCGATTACAGCAAAATGCTCGCCTAAATTTCCTTTTCTGTAAAGGCGGAACAAAGACGGGTACAATTTACGCTGGGCTAGGTCACCTGTACCGCCGAATATCGTAAACAATACATTTTTTTCATTAGACATGTGGATACACTCCTTTATATTTTATCGACAAAAATCGTGCTGGCCGCCTTAAAGCTGACGGGGATTTTCTTTCTATCATTTTGGATAGTGATCGGTCCTTCATAAGCTGCGATGTCAACGATCTCATATTCTTCGTTGATATTCAGGTCAATAGTGACTAAGTAATCCAACAATTCTTTTTCATCAAGCACTCGTGCGATACGCACTTTTGTACCGACAGGATAGGACTCCAATGTTTGTCGGCGTTCTTCATGGACAACTTCCTCTTTTTTAGGAATCGATCCTCCATGAGGACAATGTTCAGGATGATTCAAATAGTTTTCTAAATGATCTGCAAGATGTTCCGAAGTCACATGTTCCAATACTTCAGCATCATCATGGACTTCATTCCAGCTATAGTCTAAATGTTCAACTAAAAAAACTTCCCATAAGCGATGTTTGCGAATCAGACTGCTAGCTTTTTGCAGTCCGCTTGCAGTCAATTGTACACCTTGATAAGGGGAATGTTCTACAAGCTCTTCTTTCACAAGTTTAGAAATCATTTCACTGACAGATGCAGCTGAGACATCTAGACTAGATACGATTTGTTTATTGTTGACTTTCGTTGTATCTCCACCTAGTTCTA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112 | uncultured_Caudovirales_phage(13.95%) | portal,terminase,holin,protease,transposase,head,tRNA,tail,plate,integrase,capsid | attL 780948:780963|attR 821749:821764 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1160537 : 1170080
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP020484|1160537:1170080|DBSCAN-SWA TTCAATAAGTTGAGTGTACGAACTGGTACTTCAAGGAGATGTCCTCATATCCTTGGCGGGCCAGTTCTTTGTCTGTTAATGATCGATGAAGAATATGACTTTTGGAGACTGACCAAATACCTTTTCTTGTATTTGACCATTCATACGCTTTCGCTTTATCGATCCCTAAACGAATCAGATTTTTTCTTTTGGTTCTTGGATTCTTCCATTGTTTCCAAATATATTGTCTGATTCTTCGCTTCAACCAACCGTTTAACTCCCTCATGAATTCTTTCATCTCACCAATTCCATAGTAGTTGATCCAACCAGTCATTAGTTGCTTGATTTCTTTTAAAATAAGTTGGATACTTCTTCCACGGTTTCTTTTAGTGAGTTGTTTGAGCTTGCTTTTCACACGCTGTTTTGCTTTTGCGTGAGGGCGAATTTTAATACCTTTCTTTGTTGGCAGAATGCAGAATCCAAGAAACTTTCGTTTCAATGGACTTCCTACCGCACTCTTTTCTCGATTTACCGTCAACTTTAGTTGTTCTTCGAGAAATTGAATGGATTTCTTCATCACACGCTGTCCTGCTCGTTTGCTTCTAACATAGATATTGCAGTCATCGGCGTATCGAACAAATTTATGTCCTAGATTTTCTAGCACTTGATCAAATTCGTTCAGGTAGATGTTACTTAACAGGGGAGAGAGATTGCCTCCTTGGGGCGTTCCTTCTTCAGTTGTTGTGATGAGTCCATTTTCCATTACACCACTCATTAAGTATTGACGGATCAGTTTTAGGACTTGTTTGTCCTTTACTTTCCGCTCAATGAAATACATCAGCTTATCGTGATTTACGGTGTCAAAGTAGGCTTTCATATCAATGTCCACCACATATCGGTAACCTTGTTCATAATAAGATTTTGCTTTCTTCACTGCGTCATGTGCGCTGCGATTTGGGCGAAACCCATAACTATTATCTGAGAATTCTGGTTCAAATAGCGGTTGTAACACTTGATTGATTGCCTGTTGAAGCATACGATCAATAACCGTGGGAATTCCTAGTTTTCTTACACCGCCGTTTGGTTTCGGTATTTCTACTCGCAAAACAGGCTGAGGTTTATAGTTCCCTTGGCGTAAATTGGATAGTAATTCCTCGCGGTGCTCTTTCAAGTAAGGAAGCAGTTGATCGACGGTCATCCCATCTGCACCAGCCGCCCCTTTATTTCTGACTACTTGAAGATACGCTTGATTGAGATTATTCCGATCTAGAATTCTCCCAAACAGATTTTCTACACCATCTTGTTTCCTCTGTTCACCGCAAGAAGTGCTGCGCACTTCATCATACCCTTCGTGTTCCACACTAGCTCTTTGATGATAGCCAAGTTTTCTTGTTTTCTGCGGTCGTCGCATCTTCTCACACCTCCTAAATTATTCAAGATTCTTATTGTTCAGTCCTTCGTAACGGTCAGTGTCGTTACTACTATGACCTCGGCTGACTTCTCATGATTCACCATCATGTCGCCATGATCGTTGTGCTGGTTTGTTTTCATTCAACGCCCACAACACCCTCATGAGATCTCCCCCGGTAAGAGTGAAAACTTTCCTCCCATGTAACTGCTAGATTTACTGTATAGGTTTCGGGCAGTATTGGACTTTGTCTTGTGATGAAGACTTATCCGACCTAATTCAGCCTTGTATCTAGTTTCTGTTCGTCAGTTCAGGAGTTTGCGTCCGACTTCCTTCAGCCACAACCTCACGATTGCCGCCTTGTCTTTCGCTAACAGTTCCTACTGCCAAGCCTGTAGTGGACTTTCACCACCAAGTTTTCACCCATGCAGGGCGCACACCAAAAAAGAAGCAGATCCGTTAGCGGTTCTGCTTCTTTTAGTTTATTATATTTTCTTATCAATAATAGGAACCTGATTTTAAAAGCGGCTACCTCTTTACCGTGCCTCTTTACATACAAAAAATAGAGGAATTAAGCGTAAATGGCTTGGCTATTATAACTAAAATGCTGGTTATGGAGATGTTGCAGCAAGTTTTCGAGAAAAGCGTATTCCATCTCTTGTCCATTGAATAAGATCTGGATACGATAATGATTTTTGAAACGCTTCTGTTCATGAATCTGACTGATTGAAAGTTCGCCTTTGTGTTCTGTCTGATAAAGAAAAGTCCTTTTACGGCATTCAGCACAGCGCTTGGTTGCTCGGCGGATTTTTCGGAATGTATAAAAACTAGTATCTTTATTGCATAAATAAACGTCTTTGATCGACAGCAAATCATTATATAGACAGGAACGTTCTTCAGCTGTTAATTCTGATAAAAAAAGCTGACCTTGTTTTATTGCATCTTCCATCGGCAAGTGCCTCCTCGAACCCATTATCCAAATTTTTAGTTAATTCTAATATACCATCATTAAGTATAAATGTAAACGCTTGTTGATGGTATAAGATTTTCGTTTCTGATAAAACACGAACATTAAAAGAATCTAATGCCTTAAATGTACATATTTTTGTTGATTTATAAAAAGATGATTGCTAAAATTTAAAGTGAAAAAACGAACAAAAAACGATGTATTTGCTTTTAATGTAAATAAAAAGGAGAGACGTACATGGAGAAGAAAGAACTTTTGTATGAAGGAAAAGCCAAAAAAATATATCTTACTTCTGATGAGAACTTGATTTGGATAGAATATTTAGATCAAGCAACTGCGTTGAATGGCGCGAGGAAAGACCAGATAAGTGGAAAAGGAGAATTGAATAATCAAATCACAAGTGCAATTTTCCGTTATCTGACTCAAAGAGGAATAAAAAATCATTTTATTGAACAATTGTCTAAAACCGAACAATTAGCAAAAAAAGTACAAATTATCCCTCTGGAAGTGGTTATCCGAAATATTGCAGCAGGAAGTTTCTCAAAACGTCTAGGTGTTCCCGAAGGTAAAGAATTCATCAAACCAATCATTGAATTCTACTATAAGGATGACCAGTTGGATGATCCATTTATCAATGAAGAGCATATCTATTTCTTACAACTTGCAAAGCCGGAAGAAATCAGTGAGCTGAAAGCCCAAGCGTTGGCTATTAATGAAATTTTGACCGAATTATTTGCTAAGGTCGGTTTGGTTTTAGTAGATTTCAAGCTAGAATTTGGCCGGTCGAATGGACAAATTTTGCTTGCGGATGAAGTAACACCGGATACTTGCCGATTATGGGATGAACGTACGAATGAACATATGGACAAAGACGTTTACCGCAGAGATCTAGGTGATTTGATCCCAGTCTATCAAGAAGTATATAACCGTCTATCGGAACTAACTGAAGAAAAGGAGCGAGTATGATGTATTTCGTAAAAGTATATGTAACCTATAAAGATTCAGTGTTAGATCCTCAAGGGGAGGCAGTAAAAAAAGCAGTCCATCGTATGGGATATGAAACAATCGAAGATATCCGAATAGGAAAATACTTTGAGATACAACTTGCTGATGCAGAAGAACCAATCGATACAGTGATTGAAACGATTTGTGACAAGCTGCTTGCAAATGTAAATATGGAAACATACCGATATGAAATCAAAAAAATGGAGGAAGTATAACATGAAATTTGCGGTCATCGTTTTTCCAGGTTCAAATTGTGACGCAGATATGTTATGGGCAGTTCGCGAGATCATGGGCGCTGATGCCGAATTTGTACGGCATGATGAGTCCTCTTTAGAAGGATTTGATGGGGTTTTACTGCCGGGAGGATTCTCCTATGGTGACTATTTGAGATGCGGTGCGATTGCTCGGTTTTCTACAATCATGGAAGAAGTGATTCGTTTTGCTGAAGAAGGGAAACCAGTATTCGGTACATGCAATGGATTCCAGATATTGACAGAAGCAGGACTTTTGCCAGGTGTACTGAGACGAAATGAGTCTTTGCATTTTATTTGCAAAACTGTACCATTGAAAGTCAACCCCAAGACGGCCTTTACTTCAGAGTATGAAGCCGACGAAATAATCTATCTTCCAGTTGCTCATGGGGAAGGAAATTATTTCTGTGACGAAGAAACACTTCAAGAACTAAAAAAAAATAATCAGATTGCCTTTACTTATAATGACAACATCAACGGCAGCGTGGAAAACATTGCAGGGATTACGAACAAAGCAGGGAATGTGTTAGGAATGATGCCTCATCCAGAACGTGCAGTAGAAGACTTGCTAGGATCAGAAGATGGGAAACGGTTCTTTGCTTCCATTTTAAAAAACTTCGGAAAGGTGACCGTATAGATGAAAACATTGAAAGAACCGACAGCTGAAGAGATCAAGAAAAAAAGAATCTATGCCGAATGGGGATTGACTGATGAAGAATATCGAATGATCGAAGAAGATATCTTAGGAAGAATGCCTAATTATACGGAAACTGGACTGTTTTCTGTTATGTGGAGCGAACATTGTTCCTATAAAAATTCTAAACCGGTTCTACGCAAATTTCCTACTAGTGGACCTCATGTGTTGCAAGGCCCTGGAGAAGGCGCAGGCATCGTCGACATCGGTGATGGACTAGCAGTTGTCTTCAAAGCAGAAAGTCACAATCATCCTTCAGCCGTGGAGCCTTATGAAGGAGCTGCGACAGGAGTTGGCGGAATCATCAGAGATATTTTCAGCATGGGGGCTCGTCCAATTGCGTTGCTAGATTCATTGAGGTTCGGCGAATTAGATAATCCAAGAACGAAATATTTACTAGAAGAAGTAGTTGCAGGTATCGGCGGATACGGCAATTGTATCGGCATACCGACTGTAGGCGGCGAAATTGCATTTGATCCTTGTTATGAAGGAAACCCATTAGTCAATGCAATGTGCGTAGGTTTGATTGAACACAAACATATCCAGAAAGGGCAAGCCGCTGGCGTCGGTAATTCGATCATGTATGTAGGTGCAAAAACAGGTCGCGACGGTATCCACGGAGCAACTTTTGCCTCAGAAGAATTTAATCAAGAAGAAGAACAGCAACGTTCTGCTGTACAAGTAGGCGATCCTTTTATGGAAAAGCTGCTGCTTGAAGCGTGTTTGGAATTAATCTTGCATCATTCGGATTCTCTAATAGGTATACAGGATATGGGAGCAGCAGGACTTGTTTCATCTAGTGCGGAAATGGCTTCAAAAGCTGGCTCAGGACTTATATTGACATTAGATGAAGTCCCACAAAGAGAAACTGGGATGACACCTTATGAAATGATGTTATCGGAATCACAAGAACGGATGTTGATTTGTGTTAAATCAGGAGAGGAAGAAAAAATCCAAGAACTATTTCAGAAGTATGATCTAGATGCAGTCACTATCGGTAAAGTAACAGACGACGGGCAATATCGGCTATATCATCAAGGAGAAGAAGTAGCAAATCTGCCAGTCGATGCATTAGCTGAAGATGCACCAGTTTATCATAAAGAAATGAAAGAACCAGCTCGAATCGTAGAATTTCAGCAGTTAGCTCCTTATCAGCCAGTTATCGAAGAACCTGGACAAGTATTGCTTGATCTGCTGCAGCAACCGACGATTGCTTCAAAACGTTCAATCTACGAAACTTATGATTCACAAGTACAAACCAATACAGTTGTCCGTCCAGGAAGCGATGCTGCTGTGATGAGGGTTAGAGGGACGAATAAAGCGTTAGCTATGACCACAGACTGCAACGCGCGCTATCTGTATTTGGATCCAAAAATCGGAGGACAAATAGCAGTGGCAGAAGCTGCTAGAAATATTATTGCTAGCGGTGGTAAGCCCTTGGCGATCACCGACTGCCTGAACTATGGTTCTCCTGATAAACCAGAAGTTTTTTGGGAATTATCGACTTCAGCTGACGGAATTGCTGCTGCGTGTGAAACGTTAGGAACTCCTGTTATTTCAGGAAATGTCTCTTTATATAATGAAACGGATGGTCAAGCAATCTATCCAACACCAATGATTGGTATGGTCGGATTGATTGAGGATCATAAACATATCACTACTCAGGAATTCAAAAAATCAGGGGATCTAATCTATATATTAGGTAAGACGTTTGCAGATTTTGATGGCAGTGAATTACAAAAGATGCAGCTTGGAAGAATCGAAGGTGTGATCCGAAACTTTGATCTATCCATTGAAAAGAGAAACCAAGAGTTAGTATTGACAGCCATCCAAAACGGATTGATTGAAAGTGCTCATGACTGTTCAGAAGGTGGCTTGGCAATTGCACTGGCAGAATCAGCTTTCAAACATCAGCTAGGGATATCTGTACAGTTTGAATTGTCCTCTGCTCAATTATTTGCAGAAACTCAATCAAGATTTGTGTTGACAGTCGCACCGGAAAATAAGACACGATTCGAAGAAATGATGGGAGATGCTGCTGTTTTAGCAGGTAAGGTGACGGATGAAGCGATAATCGAAATTTCAGCAACTGACGGTCAGATCAAAATAGAAACTGCAGTAGCAAGAAAGTGCTGGGAGGATGCAATCGTATGTCTTATGAAGTGAAGAGTTTAAATGAAGAATGCGGGATCTTCGGTGTTTGGGGTCATCCAGACGCCGCTAGTGTGGCATACTTCGGGCTCCATAGTCTTCAGCATCGAGGACAAGAAGGTGCAGGTATCGTGTCCAATGATCGAGGAAAGCTTAAGGGGCATCGAGATTTGGGGCTGCTTTCTGAGGTATTCAAAGATCAAAGAAAATTGCAGCAGTTAACAGGAGAAGCTGCAATCGGACATGTACGTTATGCAACAGCAGGCAATGGAAGTGTGGACAATATTCAGCCTTTTCTATTCAAATTTCATGATCAGTCGATCGGCTTAGCGCATAATGGTAACTTGATCAATGCTCGTTCCCTTAGAAAAGAGTTAGAGGAAAATGGGGCGATCTTCCATTCTAACTCCGATACGGAGATATTGATGCATTTGATCCGACGAAGTGAAGAAACAGATTTTTTAAATAAATTAAAAAGTGCTTTGAATGAAGTCAAAGGTGGCTTTGCCTATTTATTAATGACAGAAACGGCAATGATTGCCGCTTTGGACCCAAATGGTTTTCGTCCATTAGCAATCGGACAAATGAAAAACGGAGCATACGTGATTGCCTCGGAAACTTGTGCATTAGAAGTTATTGGGGCACGTTTTATAAGAGATGTCCAGCCTGGTGAGATAGTGATCATCAATGACGAAGGAATCCAGATTGATTGCTTTACGAAGGACACGCAGCTTTCTATTTGTTCGATGGAATATATCTATTTTGCCAGACCAGATTCAAACATCGCAGGGATCAATGTGCATACTGCACGGAAAAATATGGGACGGAATTTAGCGAAAGAATCGCCAGTAAAAGCAGATATGGTCGTTGGCGTACCTAATTCTTCTTTGTCAGCCGCAAGCGGTTATGCGGAAGCTAGTGGAATCCCTTATGAAATCGGATTAGTAAAAAATCAATACATTGCCCGAACATTTATCCAGCCAACGCCTGAGCTAAGAGAGCAAGGTGTTCGAATGAAATTATCTGCTGTACGAGGAGTAGTGGAAGGTAAAAAGGTGATTATGGTCGATGATTCAATTGTTCGGGGTACGACAAGCAGACGGATCGTCCATCTTTTGAAAGAAGCAGGGGCAAAAGAAGTCCATGTGAGGATTGCTTCTCCTCCTTTGAAATATCCATGTTTTTACGGGATTGATATTCAAACGCGTAAAGAACTCATTGCGGCAAATCACACGATTGATGAAATCAAAGAATGTATCGGTGCAGATTCTTTAGGTTTTTTAAGTGAAGAGGGTCTGATCGAATCGATCGGTCTGGAAAAAGATGCTCCGTATTCAGGATTGTGTATGGCTTATTTCAACGGAGATTATCCGACGCCGTTATATGACTATGAAGAAAAATATCAGGAATCACTAAAAGAAAAAGTATCGTTCTTTTAAAAGCAGACCAAGAAGGGAGTATATGAATTCAATGGCAAATGCATACGCAAAAGCTGGCGTAGATGTCGAAGCTGGATATGAAGTAGTAGAACGGATCAAGAAGCATGTCAAAAAAACGGAACGTTTAGGTATGATGGGCGCTATAGGAGGATTCGGCGGTTGTTTTGATTTATCGGTCTTTCAATTAAAAGAGCCAGTCCTTGTCTCGGGGACCGATGGCGTGGGGACGAAATTAGCAGTGGCAATCGAAGCAGACAAACACGATACAATCGGGATCGACTGCGTAGCGATGTGTGTCAATGATATCTTAGCACAAGGCGCAGAGCCGTTATATTTCTTAGACTACTTAGCAACGGGGAAAAATGATCCGTTACGTTTGGAAAATGTAGTAAAAGGTGTAGCAGATGGATGTGTTCAAGGAAATATGGCGCTGATTGGCGGAGAAACAGCTGAAATGCCTGGTATGTACTCAGGTAATGATTATGATCTAGCCGGATTTGCTGTAGGGATAGCTGAAAAATCTCAATTATTGACAGGAGAAACGATCAACCCAGGAGATGTGTTGCTTGGAATAGCATCTAGCGGGATTCATTCAAATGGGTACTCTCTTGTTCGCAAAATTTTCTTTGAGCAGCAGCAGTTTTCTTTATCATCAAAACTGCCAGAATTGAAAAAAACACTTGGCGAAGAATTGCTTGAGCCAACGAAAATCTATGTTTCTTCCTTGCTTCCGCTGATCAAAGAAAAGAAAATAAAAGGAGCTGCACATATCACTGGTGGAGGGTTTGTAGAAAATATCCCGCGAATGTTACCAGAATCTATGGCTGCACAAATCAAACTTGGCTCATGGCCGATTCTTCCAATATTCGGCTGTTTACAAAAATATGGTGAAATTCCTGAGATGGAGATGTATGAAATCTTCAATATGGGCATCGGTATGGTCCTGGCAGTCCAAGAATCGAAAGTAAAAGAAATAGTACACGAAATTGAGCAAGCTGGCGAAAAAGTTTATGAAATCGGGAAAGTGATCGCCAAAGAAAAACATCGTGTGGTGTTTATAGGAGAAGAACGATGAGAATCGCTGTTTTTGCTTCTGGAAACGGAAGCAACTTTCAAGCGCTAGCCGATTATCTATCGAAAAAAGGATTGGAATCTTCGATTGACTGGTTGTTTTGTGATCAGCCTGAAGCATATGTTTTGAAACGTGCAACTGCGTTGAGTGTACCGGCAGATTGTTTTTCACCTAAAGAATTTGATTCAAAAAAAGAGTATGAAGAAGCAATTTTGCATAAATTGAAAGAAAAAAAGATCGATTTGATCGTATTAGCTGGATATATGCGAATCATTGGACCGGTATTGCTGAAAAATTATGATAAAAGAATCATCAATATCCATCCGTCTCTTTTACCTGCCTTCCCTGGTTTGCATGGCATACGTGATGCCTTTGAAGCTGGAGTAAAAGAAACGGGTGTCACAATTCATTATATCGACCAAGGTGTAGATACTGGACCAATCATCCGGCAGGAAAAAGTGAGAATTGAACAGGAGGACACGTTCGATTCTTTAGAAGAAAAAATCCATAGAGTAGAGCATCGAATCTATCCAGAAGTGATTAGTGAAATTATTGAAAATGGAGGCTATCTGAAATGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP020484|1160537:1170080|1160537_1161926_-|AWV58164.1|DBSCAN-SWA MRRPQKTRKLGYHQRASVEHEGYDEVRSTSCGEQRKQDGVENLFGRILDRNNLNQAYLQVVRNKGAAGADGMTVDQLLPYLKEHREELLSNLRQGNYKPQPVLRVEIPKPNGGVRKLGIPTVIDRMLQQAINQVLQPLFEPEFSDNSYGFRPNRSAHDAVKKAKSYYEQGYRYVVDIDMKAYFDTVNHDKLMYFIERKVKDKQVLKLIRQYLMSGVMENGLITTTEEGTPQGGNLSPLLSNIYLNEFDQVLENLGHKFVRYADDCNIYVRSKRAGQRVMKKSIQFLEEQLKLTVNREKSAVGSPLKRKFLGFCILPTKKGIKIRPHAKAKQRVKSKLKQLTKRNRGRSIQLILKEIKQLMTGWINYYGIGEMKEFMRELNGWLKRRIRQYIWKQWKNPRTKRKNLIRLGIDKAKAYEWSNTRKGIWSVSKSHILHRSLTDKELARQGYEDISLKYQFVHSTY >CP020484|1160537:1170080|1162293_1162482_-|AWV58165.1|DBSCAN-SWA MYVKRHGKEVAAFKIRFLLLIRKYNKLKEAEPLTDLLLFWCAPCMGENLVVKVHYRLGSRNC >CP020484|1160537:1170080|1166990_1168430_+|AWV58171.1|DBSCAN-SWA MSYEVKSLNEECGIFGVWGHPDAASVAYFGLHSLQHRGQEGAGIVSNDRGKLKGHRDLGLLSEVFKDQRKLQQLTGEAAIGHVRYATAGNGSVDNIQPFLFKFHDQSIGLAHNGNLINARSLRKELEENGAIFHSNSDTEILMHLIRRSEETDFLNKLKSALNEVKGGFAYLLMTETAMIAALDPNGFRPLAIGQMKNGAYVIASETCALEVIGARFIRDVQPGEIVIINDEGIQIDCFTKDTQLSICSMEYIYFARPDSNIAGINVHTARKNMGRNLAKESPVKADMVVGVPNSSLSAASGYAEASGIPYEIGLVKNQYIARTFIQPTPELREQGVRMKLSAVRGVVEGKKVIMVDDSIVRGTTSRRIVHLLKEAGAKEVHVRIASPPLKYPCFYGIDIQTRKELIAANHTIDEIKECIGADSLGFLSEEGLIESIGLEKDAPYSGLCMAYFNGDYPTPLYDYEEKYQESLKEKVSFF >CP020484|1160537:1170080|1169501_1170080_+|AWV58172.1|DBSCAN-SWA MRIAVFASGNGSNFQALADYLSKKGLESSIDWLFCDQPEAYVLKRATALSVPADCFSPKEFDSKKEYEEAILHKLKEKKIDLIVLAGYMRIIGPVLLKNYDKRIINIHPSLLPAFPGLHGIRDAFEAGVKETGVTIHYIDQGVDTGPIIRQEKVRIEQEDTFDSLEEKIHRVEHRIYPEVISEIIENGGYLK >CP020484|1160537:1170080|1162494_1162872_-|AWV58166.1|DBSCAN-SWA MEDAIKQGQLFLSELTAEERSCLYNDLLSIKDVYLCNKDTSFYTFRKIRRATKRCAECRKRTFLYQTEHKGELSISQIHEQKRFKNHYRIQILFNGQEMEYAFLENLLQHLHNQHFSYNSQAIYA >CP020484|1160537:1170080|1163127_1163856_+|AWV58167.1|DBSCAN-SWA MEKKELLYEGKAKKIYLTSDENLIWIEYLDQATALNGARKDQISGKGELNNQITSAIFRYLTQRGIKNHFIEQLSKTEQLAKKVQIIPLEVVIRNIAAGSFSKRLGVPEGKEFIKPIIEFYYKDDQLDDPFINEEHIYFLQLAKPEEISELKAQALAINEILTELFAKVGLVLVDFKLEFGRSNGQILLADEVTPDTCRLWDERTNEHMDKDVYRRDLGDLIPVYQEVYNRLSELTEEKERV >CP020484|1160537:1170080|1163855_1164110_+|AWV58168.1|DBSCAN-SWA MYFVKVYVTYKDSVLDPQGEAVKKAVHRMGYETIEDIRIGKYFEIQLADAEEPIDTVIETICDKLLANVNMETYRYEIKKMEEV >CP020484|1160537:1170080|1164783_1167006_+|AWV58170.1|DBSCAN-SWA MKTLKEPTAEEIKKKRIYAEWGLTDEEYRMIEEDILGRMPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTSGPHVLQGPGEGAGIVDIGDGLAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGELDNPRTKYLLEEVVAGIGGYGNCIGIPTVGGEIAFDPCYEGNPLVNAMCVGLIEHKHIQKGQAAGVGNSIMYVGAKTGRDGIHGATFASEEFNQEEEQQRSAVQVGDPFMEKLLLEACLELILHHSDSLIGIQDMGAAGLVSSSAEMASKAGSGLILTLDEVPQRETGMTPYEMMLSESQERMLICVKSGEEEKIQELFQKYDLDAVTIGKVTDDGQYRLYHQGEEVANLPVDALAEDAPVYHKEMKEPARIVEFQQLAPYQPVIEEPGQVLLDLLQQPTIASKRSIYETYDSQVQTNTVVRPGSDAAVMRVRGTNKALAMTTDCNARYLYLDPKIGGQIAVAEAARNIIASGGKPLAITDCLNYGSPDKPEVFWELSTSADGIAAACETLGTPVISGNVSLYNETDGQAIYPTPMIGMVGLIEDHKHITTQEFKKSGDLIYILGKTFADFDGSELQKMQLGRIEGVIRNFDLSIEKRNQELVLTAIQNGLIESAHDCSEGGLAIALAESAFKHQLGISVQFELSSAQLFAETQSRFVLTVAPENKTRFEEMMGDAAVLAGKVTDEAIIEISATDGQIKIETAVARKCWEDAIVCLMK >CP020484|1160537:1170080|1164111_1164783_+|AWV58169.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDADMLWAVREIMGADAEFVRHDESSLEGFDGVLLPGGFSYGDYLRCGAIARFSTIMEEVIRFAEEGKPVFGTCNGFQILTEAGLLPGVLRRNESLHFICKTVPLKVNPKTAFTSEYEADEIIYLPVAHGEGNYFCDEETLQELKKNNQIAFTYNDNINGSVENIAGITNKAGNVLGMMPHPERAVEDLLGSEDGKRFFASILKNFGKVTV >CP020484|1160537:1170080|1168461_1169505_+|AWV59782.1|DBSCAN-SWA MANAYAKAGVDVEAGYEVVERIKKHVKKTERLGMMGAIGGFGGCFDLSVFQLKEPVLVSGTDGVGTKLAVAIEADKHDTIGIDCVAMCVNDILAQGAEPLYFLDYLATGKNDPLRLENVVKGVADGCVQGNMALIGGETAEMPGMYSGNDYDLAGFAVGIAEKSQLLTGETINPGDVLLGIASSGIHSNGYSLVRKIFFEQQQFSLSSKLPELKKTLGEELLEPTKIYVSSLLPLIKEKKIKGAAHITGGGFVENIPRMLPESMAAQIKLGSWPILPIFGCLQKYGEIPEMEMYEIFNMGIGMVLAVQESKVKEIVHEIEQAGEKVYEIGKVIAKEKHRVVFIGEER |
10 | unidentified_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1331421 : 1399215
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP020484|1331421:1399215|DBSCAN-SWA AATGACTTATACCCATCTTACACCAAACGAGCTTGTAATGATAGAAGCATATTTTCATCAAGAAACTCCGGTTGCTATCGTTGCGAAGCAGCTTAAACGTGGACGCCAAACAATTTACAATGTCTATAACTTTCTCAAATGTGGTGGAACAGCACTTGAATACTTTGAACAATACAAAGAAAATAAGCGACGTTGTGGGAGAACCGAAATCATTTTTCCTGCTGAGGAAAAAGAATACATTGAAAAAAGATCAACTGAAGGTTGGACCCCAGACGTCATTATTGGCCGTGCAGAGCGAACCTTCTCTTGTTCAGTAAGTACCCTCTATCGCCGGTTTAAGACGGGAGAATTCAATGTTTTACATTTACCGATGCAAGGAAAACGAAAACCAAATGGTTATAAGGAAAAACGTGGAAAACAGGCATTCAAAAGAAATATTTCTGAACGTAAAAAAGATTATGTCGTTTTCGAAGAAGAGTTTGGACATTTAGAGGGTGATACGATTGTCGGCATCCACCATAAAAGTGCCGTCATCACACTCGTTGAGCGACTTTCAAAAGCCATTATCGCCTTGAAACCAGAAGGCCGTAAGGCAGTTGATATTGAAAATTCGATTAATGAATGGCTTCAATCCGTACCCAAAAATCTTTTCAAATCAATTACCTTTGATTGTGGAAAAGAATTCTCTAATTGGAAAAGTATTAGTAATACGAATGATATTGATATTTATTTCGCAGACCCAGGAACGCCTTCCCAACGGGGATTAAATGAACATTCAAACGGACTCCTCCGAAAAGATGGACTACCAAAAGAAATGGAATTCAACCAAGTCAATCAAGGATTCATCTCATCCGTTGCGTCCAAAAGAAACCATATCCCTAGAAAATCACTAAATTACCAAACACCATTAGAAGTTTTTTTGAGTTACGTAAATGGAAAGTTTTGTCTCGCTTAATTTGACAAATAATATATAATAAAAAATAGGAGAAAAAGTAGAAAAGAAGGTGTTTGTTATTTGGGAAGTAGTTAAATCGAGAGTACAAGAAATGAATGAACATTTCTCAGTGTCATTCGCAGAAAATCCAAGTAAGTATTTTCGACGTCTTGTTTTTCTGCTCATCTTATCATTGCTGTTAACAGTTGCAATGTTTTTATTGCCGGAAAAAATCCGAGAAGAGCAAGTAAATAGTCTCGTTTATTCGTCCATACCAACCAGCAAATTGAAACCTTTTGATTACAGCAAAGCTGATCAGAAAATCAAACAAAGCCGGGCGATATCGGTGATGTTCAGCAAACCGAACGGGAAAACCTATCAGGACATGCTTGATGTTTTTAATGATCCTGAGCTTATGGAAGAATTGAATCGACCGATCTTTTATTATCCGATCGTTTATGATGTACATGAACTGGAACAAAAATATAACATACGAACGGATGAAGTGACATTTATTTTCTTTGATGGAGGAAAAGAAGCAAATCGGATAACTGCGGGTAAGGGAGGAATAACTGATTTTGATAAGGAGTTGATCCCTGAACTGAATCGACTTCCGTTAGCCAATATCAAACAATTAGAAGAAGAATTGGATAGAACGGGAGTAACTTCCCAAAATTCCGAGATTGCTAATTGAGACATTGGCGCGATGAAACGGTGGGTCTATATAGCGCTATTTTTAATTATCAGAACAAGTGATGTTTGATCTTCAAAATAACAAATAAAAAATTAAAAAATATAGTTGACGAAATTCAAAAATTCGATTAGACTTAAATCAATTCTTAAGGAAAGGGTGACCTGTAATGAACTTATCAAAACGTATTTCAGCAGAAAACAAAAAAAATTGGCGCAGCTGGCGTAGATAAGTTGTATTAATGGTGAGACTTTCCCATAGATACAACTTTTTAGAGTGCATTTCTAAAGCTTGTATCTATGCTAGACATGAACATTGACTGCCGCATAGATTAGAATCTATGCGGTTTTTTGTGTAAAGACAATGACCGCTTTGGCCATTGTCTTTTTTTGTAGACTGGATACTTGCCTGATTATAATAAATAAAAAGATTGACTTTGCAGGAGGAAAAAAATGAAAAACAAACGATTAATAACAGTTGTAGTAATTATTTTAGTTTATTTAGCAGGTGCATTTATTTATGGAAAAGCCTCAGGCGAAAAAGAAAGTACTTCGACGAACCAGACAAAAAAAACAACAGTTGTTGGGGTATTGCAATACGTGAGCCATCCGGCATTAGATGAGATTTATCGAGGAATCAAAGATGGTCTGAAAGAAGAAGGATTAAAAGAAGGAGAAAATCTTGAGATCAAATTTCAAAATGGACAAGCCGATCAGAGCAAGCTAGCCACAATGAGTCAACAGCTAGTACAATCTGATCCAGATGCCTTGATTGGAATCGCAACACCTGCCGCTCAATCATTAGCAAACACGACTTCATCGATCCCAGTTGTGTTAGGTGCTGTAACGGATCCTGTGGGGGCTGGATTAGTCGCTTCTTTAGAGAAACCTGGTGGTAATGTAACAGGTGTTTCTGATCAGCCGCCTGTTACTTCACAAATCAAGCTTGCTTCTGATTTGTTGCCAAATGCAAAAAAAGTCGGAATCTTGTATGCTTCTTCAGAGGATAATTCAAAATACCAAGTAGCACAAGCAGAAGAAGCTGCAAAAAAAGAAGGGTTAGAATCAGTAAAATATGCGGTGCCTTCCACTAATGAGATTGCACAAACGGTTCAAGTGATGAGCCGACAAGTCGATTTTATCTATGTTCCATTAGATAATACCATTGCCAATGCGATGCAAACAGTGGTAAAAGAAGCAAACAAAGCAAATATCCCCGTCATTCCATCTGTGGATACAATGGTGGAACAAGGTGGACTAGCAACAATCGGGATCAATCAATATCAATTAGGGCTTCAAAGCGGTAAGATGGCGGCAGAACTTGCGAGTGGAAAAGAAAAACCGGAAACGACGCCTGTTTATACATTTGATCAAGGGGATACAGTGATCAATCAATCTCAAGCTGATCGCTTAGGAATCATTGTTCCCCAATCGATGAAGGAAAAAGCCAAAATCATTACAGATGACTCGCAGCAAGAAACATCTAAGGAGGATGACAAATGATCGTATCAGCTATTTCACAAGGCATGCTTTGGGCAATATTAGGATTAGGGATTTTCATGACTTATCGGATCTTAGACTTTCCTGATATGACGACAGAAGGGTCCTTCCCATTAGGTGCTGCTGTCTGTGTGACAGCTATTACTCATGGGGTAGCGCCGATTGTAGCTACATTATTAGGCGTAGGTGCTGGCATGATAGCAGGACTCGTTACGGGGTTACTTTATACAAAAGGAAAGATACCGGTTATTTTAGCAGGGATTTTAGTGATGTCAGGATTGAACTCAGTTATTTTGTTTGTGATGCGAACACCAAATCTTTCTTTATTGAATCATCCGATTCTACAAGACAGCTTCCATCGCTTTGGGTTACCTGATTACTTTGACACAGTCCTTCTTGGCTTCATCTCTTTGGGCATCTTGATTGCTGTACTGCTATTCTTCTTCAATACAGATTTGGGTCAAGGCTATATTGCGACAGGAGACAACGAAACGATGGCTCGGTCGTTAGGGATAAAAACCGATCGTATGAAAATTTTAGGTTTAACTTTGTCGAACGGTGTCATTGCATTATCCGGTGCGCTGATTGCCCAGAACGACGGATATGCAGATGTAAATAAAGGGATTGGCGTAATCGTCATCGGTCTTGCTTCCATCATCATCGGTGAAGTGATCTTCCAAGAATTGACGCTAGCAGAAAGATTGATTGCTATTGTTGTCGGCAGTATCATTTATCAGCTATTGATTTTAGTAGTAATCAAACTAGGGTTTGACACGACTTATCTGAAGTTGTTCTCCGCTATCATCTTAGCTATTTGTCTGATGATCCCGCAATTGAAGAAAGCACTGAACTTAAAAACGGGTTTTGAGAAGGAGGCATAGTAATGACTGATATATTGACAATCAAAAATGGCAGAAAAGTCGTAAACAATGGAATGAATGAAGAGAAAGTACTATTGGATGAAATTAACCTTACAATCAGAGAAGGGGACTTCATCACTGTCCTTGGCGGGAATGGTGCTGGAAAAAGCACACTGTTCAATACGATCGCTGGTACGCTTCAACTCAGTCAAGGATCGATCTCTTTTAAAGATCAGCTGATCACAAAAGATTCAGAAGAAAAAAGAGCACGATTCCTTTCTCGAGTTTTCCAAGACCCCAAGATGGGAACGGCTCCTCGGATGACAGTAGCAGAAAATTTGCTACTTGCACAAAAAAGAGGTCAAAAACGGAAATTCCGTTTACGTAACTTGAAAAATCAAAAAGAAGATTTTTTCAGACTATGTCAAGAAGTCGGTAATGGCCTAGAGCAACACTTGGATACTCCAGCGGGTGAATTATCTGGTGGTCAACGCCAAGCATTAAGCTTGCTGATGGCGACGATCACAGCTCCTGAGTTACTATTATTAGATGAACATACTGCAGCTTTAGATCCTAAAACAGCTAAAGCATTAATGCGATTAACAAATCAGCGGATCAATGAACAAAAATTGACTTGTCTCATGATCACGCATCGAATGGAAGACGCCTTGAAATACGGAAATCGTCTGATCGTACTCCAAAAAGGGAAAATCGTTCAAGATATTTCTGAAAAAGAAAAGCAACATTTGACAATGGGCGACCTTTTGCAGTTCTTTGAAGAAGTAGTGGATTGATTTCGACAGAAAAATTCCTTTCAGTAGAAGGACTTGAAAACTCATTGACATCTTCCTTTGATTCATCCTATACTTAAAACAATAAACAATTAAACATATTTGGGTGTTTTGTAGGATCACGTAGTCAATGATTTTAACAATTAAATAGAATATTCTTTGCTCTGACAAGTAAACGATGAGAAAAGAATTTGCTACTTTGCCACCTAGACGTTTCGTACTTTT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59 | Streptococcus_phage(33.33%) | tail,transposase,integrase | attL 1368760:1368776|attR 1393792:1393808 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1445886 : 1488571
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP020484|1445886:1488571|DBSCAN-SWA 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51 | Streptococcus_phage(23.08%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1496421 : 1543259
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP020484|1496421:1543259|DBSCAN-SWA 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43 | Streptococcus_phage(44.44%) | transposase,integrase | attL 1491611:1491626|attR 1501332:1501347 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1647454 : 1769657
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP020484|1647454:1769657|DBSCAN-SWA 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110 | Streptococcus_phage(35.14%) | transposase,tRNA,protease,integrase | attL 1660015:1660032|attR 1683501:1683518 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1775360 : 1946375
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP020484|1775360:1946375|DBSCAN-SWA 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184 | Streptococcus_phage(21.13%) | portal,transposase,holin,protease,terminase,head,tRNA,tail,integrase,capsid | attL 1768280:1768339|attR 1930903:1932416 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2521649 : 2643009
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP020484|2521649:2643009|DBSCAN-SWA 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MFDFNEYLSISKQIESDDKYNSKESYRRTAVSRAYYSAFKKSDEYLKENYDIIYNGSSGKGSHQTVWNLFSTVKELNTLGIHNSGYRMLEKRKCADYIPNETITKTDMALMNREAEKIINKLT |
112 | Enterococcus_phage(22.86%) | portal,transposase,holin,terminase,protease,tRNA,head,tail,plate,integrase | attL 2572730:2572745|attR 2611679:2611694 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2750102 : 2766998
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP020484|2750102:2766998|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP020484|2750102:2766998|2750804_2751149_+|AWV59630.1|DBSCAN-SWA MKIMEINVEHILDCLDQYGKGELTEEQLVKALTSDEKMFLIIHQGLLGENSDSEEDSDVLDWLGEEESFFIVVEVNENLCRQAESILEEIGVEMPDAIEGFLNQLVETKQLPSS >CP020484|2750102:2766998|2750102_2750417_+|AWV59628.1|DBSCAN-SWA MELKFVVPDMAETFGKLSYAGEGEIITEGYGRNTTVIGRSYHLYSSKQRADDIEVVVAAEAGEKDFDQDQPLKAVNPHLVAKGYEIENRGFTDYVLYVDDLVKA >CP020484|2750102:2766998|2753556_2753991_+|AWV59633.1|DBSCAN-SWA MRFLDLFAGIGGFRLGMEQASHHCIGFCEIDKFARRSYKAIHDTSKEVEMHDITSVSDEFIQSLGPVDILCGGFPCQAFSIAGKRQRFSDTRGTLFFEIARFTTLLRPKLLFLENVRGLLNHEGGATFETILRTLDGLGYDVEW >CP020484|2750102:2766998|2752649_2753324_+|AWV59632.1|DBSCAN-SWA MESNDSYLEYAKANKDKFISYIIKGKSPEVGRDAVFMAGSPGAGKSEVAIGLAENYDNHVIIDADYFRTQFPDYNGKNSSLFQKASSWLVEQAFRYVLDHGYSFILDATFAILSAEKNISRALKKHFRVTIFYVYQDPKIAWKFTQEREIAEGRHVPKKAFINAFFKSRENIAKVKSKHPDVLLHIIIKDYTNNISEVHYATDNLELFLPLGYSRKDLEVQLHD >CP020484|2750102:2766998|2766086_2766998_+|AWV59645.1|DBSCAN-SWA MKIKIERNQKEKSPKKKKERVVSVGKHRKMVLALWLLLSCSLAFGVYKNFTAIDQHTTHEKVVIKEKVVNTSGVESFTEDFAKEYFSWKNNKEAIEKRMSNLEQYLTENGLALIQDMVRADIPTSSEVQSVKILDVEKHSEEFVVSFLVEQHITEGKKTQSISSAYRVTIFEDENRNHLVTSLPTMIGKPDKAKYEAKQVENDSEIDAKTTEEITDFLETFFKLYPSASEKELEYYVENGAMRPINIDLKFSELENPVYLQNGKNFLVSTKIKYLDNVSKTTSYFQYKLVLQKNGNWKIVDVK >CP020484|2750102:2766998|2765063_2766068_+|AWV59644.1|DBSCAN-SWA MNLKKVGVISLTFLTISFMGILMCVGLLFGEDSEGNGSSGTSPGGTSVSEEVLKHRAMVEKYAKESDITEYIPILLAIIQVESGGTMEDVMQSSESAGLPPNSLSTEASIKQGCLYFASLVKRSKELGCDQDSIIQAYNYGGGYLDHVGKNGKKHSFALAESFSKEKSGGQKVDYPNPIAIKENGGWRYNYGNMFYCLLVKQYLTTTQFDDKIVQEIFDEAFKYEGTAYVFGGSSPETGFDCSGLTQWCYAKVDLKLPRVAQDQYDAMTHIDLKDAKPGDLVFFHSTYDAGTYVTHVGIYAGENRMFHAGDPVGWTNLTENYWRQHLIGAGRYK >CP020484|2750102:2766998|2750429_2750804_+|AWV59629.1|DBSCAN-SWA MRLTEGIVVDSGLTFGKLRFSALRREVRKQNEDGTIGNEVKERTYNLKSSAQGRMIQVSIPANVPLREFAYDAEVELVNPIVDTVANYVFREGTTVNWFIKADDLVLKRQPNQGNPTNQNERKK >CP020484|2750102:2766998|2760491_2762939_+|AWV59642.1|DBSCAN-SWA MYPIKYIENNLVFNQEGECFAYYELIPYNYSFLSPEQKYQVHDNFRQLIAQNREGKIHALQIATESSIRATQERSKKEITGRLTEVAKQRIDLQTEALVSMIGDSQIDYRFFIGFKLIATDEEVNLKNLKKSFFSGFQEFVYGVNHHLMGDFVSLSNEEIRRYTKLEKLMESKLARRFKVRRVTPSDLMYLIEHIYGEKGTPFEEYEFQLPKKKLKSETLVKRYDLLRPSRCLIEEKPRYLCMEHENHESYVAYLTINTIVGEMEFPSSELFYYQQQQFTFPIDTSMNVEIVTNKKALATVRNKKKELKDLDNHAYQSDNETNSNVLDALDSVDELETTLDQSKESMYKLSYVVRVSAESVDELKRRCDEVLDFYDDTNVKLVRPFGDMMGLHEEFLPSSKRYMNDYIQYVTSDFLAGLGFGATQMLGELEGIYFGYNVDTGRNVYLKPALASQGVKDSVTNALAAAFLGSLGGGKSFSNNLLVYYAVLFGGQAVIVDPKGERGGWKETLPEIADEINILNLTSKPKNQGLLDPYVIMEKKKDSESLAIDILTFLTGISSRDGEKFPVLRKAIRTVTQSNQRGLLQVINELRKEGSPVAENIADHIESFTDYDFAHLLFSDGSITQSISLDRQLNIIQVADLVLPDAETTFEEYTTMELLSVSMLIVISTFALDFIHSNREIFKIVDLDEAWSFLQVAQGKTLSNKLVRAGRAMNAGVYFVTQNSDDLLDERLKNNIGLKFAFRSTDIHEIKKTLEFFGLDREDESNQKRLRDLENGQCLMQDLYGRVGVVQVHPVFEELFHAFDTRPPVQERME >CP020484|2750102:2766998|2753991_2754699_+|AWV59634.1|DBSCAN-SWA MLNSKAYIPQSRERIFLIGHSRDACTEQVFPIIGPSSTSDQNIRNLVNINPSNRGMGGQVYGSDGVAPTLTGDEGIKIALPARDGISVAGLLPGKFEQGNRVYEVTGTAPTLSTKQGGTKIMIRKNETEYQEVKPEDSVNLAFPNSTSRRGRLGKQSVHTLLTGDQQAIVTDQYQIRKLTPRECWRLQGFPDWAFDRDSQVNSDSQLYKQAGNSVTVPVIFDIARRLKELDVHGL >CP020484|2750102:2766998|2760115_2760505_+|AWV59641.1|DBSCAN-SWA MKKIKSYTSIWAVEKVIYAINDFQLPFPVTFNQMAWFVLSLLFVIVFAHVPPLSMIEGAFLKYLGIPVAVTWFMSQKTFDGKKPLGFLRSFISYHLRFKVTFAGKKVKEQKKRWDEPITLVRSVNYVPD >CP020484|2750102:2766998|2759552_2760056_+|AWV59640.1|DBSCAN-SWA MEQMRVYIANLGKYNEGELVGAWFTPPVDFDEVKERIGLNDEYEEYAIHDYELPFEIDEYTPIEEINRLCGLAEELEGTPVGEVASEIQHAFFNSFEEMVEHVDDIIYYPDCDDMSDVAYFLIVEAGDFGEVPEHLKTYIDFDACGRDLEIGGNYLVTSRGVFEYPY >CP020484|2750102:2766998|2757301_2759212_+|AWV59638.1|DBSCAN-SWA MPKNKNETLCVEDLRHAEYYEMQNTFDDLYAKSKNGDIFTHLMDIILSRENILLAYRNIKANAGSKTAGTDGTIIKDIGKLPAETVVKKVRYIVAGSPHGYRPKPVRRKEIPKPNGKTRPLGIPCMWDRLIQQCIKQVLEPICEAKFSENSYGFRPNRSVENAIKATYNRLQISQLHYVIEFDIKGFFDNVNHSKLIKQIWAMGIRDKHLIFILKRILKAPIKMTNGTITYPEKGTPQGGIISPLLANIVLNELDHWVESQWQENPVTKNYVVHINKSGSPCKSNAYKEMKKTKLKEMYMVRYADDFRVFCRYKESAEKAKIAITQWIEQRLKLEVSQEKTRIVNVRKRYSDFLGFKIKMIPRRKKLVVKSHISDKQFKNQKDKLVSQAKKIASPSKGKTELEETRLYNSMVLGMQNYYQIATNVNLDCMKLNRAVMAIFTNRLGTNKRGRLRKTGRQLTTKEATRYGKSKMLRYVAGEGEPIFPVGYIQHRKPMAKVYLANCYTLEGRKFIHTNLSVDKLLMYQLMKLSLENRTIEYADNRISLFSAQHGKCAITLEEFQQANEIHCHHIVPTGAGGNDDYKNLILVKEAVHRLIHAKTEETIQKYIALLKLNKVQLIRLNKYRVLAGNQELNLI >CP020484|2750102:2766998|2762943_2765067_+|AWV59643.1|DBSCAN-SWA MKKKLFRIVGIVFISILTLIVLLSLVGTVAEATGLVDDTVEAGNLYSKYSLNNYQLDFFVDSSWDWLPWNWGDGLGKSVMYGLYAITNFIWTVSLYLSNATGYVVQEAYKLDFISDTAESIGKNIQTLAGITENGLQTSGFYFGFLLLMILALGVYVAYTGLLKRETTKAVRAVINFVMIFLLSGSFIAYAPTYITKINDFSSDVSEAALTLGTEIVVPNSESQGKDSVDLIRDSLFSIQVQQPWLLLQFDDSNIEEIGEDRVNKILSVSPDENKGKDREEAVKAEIEDNDNANLSITKTMNRLGTVVFLVLFNIGISFFVFLLTGIMLFSQILFIIFAMFLPISFLLSMLPTYESLGKKAIIRLFNTIMMRAGVTLVITTAFSISTMFFNISATYPFFMVAFLQIVTFAGIYFKLGDIMSMFNLQSNDSQSMGRRVMRKPQMLMNRKLRQLNRNVGRALAFGGGAAVGNKLAKEQSKSKFKPSGSSLRKNSRLPNDHEILSDLTKENPVSNNKKQSRMNLAGRKIGKVLDTQALVKDKTKQVKDQVRNTPTNLKYNLHKGIEKSKKAPEEFKRGLFQEKADRVDLREKQRQRRNAKMDEKRKILSEATNRQGKRRANIPIDKAAQPQKDMMLKKEAPKRIVRANLNPEIKRKLTSQEIISKGKSQSASKKNSFQQVKQRSTLPKQTNQKVQKRMNHRPKSRSGEKK >CP020484|2750102:2766998|2756418_2756556_+|AWV59637.1|DBSCAN-SWA MKRGIVMGIVKDIFLVFGGSMLGVTVMCLMNASAAADRAMEKKGK >CP020484|2750102:2766998|2755237_2756422_+|AWV59636.1|DBSCAN-SWA MAQRNLDYRLLKDRRNEYGVSQNKLATACGLSRPYLNQIENGGVTASIKTMRKIFDQLESFNPDLPLTLLFDYVRIRFPTTDARKIIQEILHLKFEYMLHEDYAFYSYQEQYVMGDIVVMLSHEEDKGVLLELKGRGCRQFETFLLAQKRSWYDFFEDCLKAGGVMKRLDLAINDRVGLLDIPELTKKCQKEECISLFRTFKSYRSGELLKADEKDGMGNTLYIGSLKSEVYFCLYEKDYEQYIKLGIPLDQTETKNRFEIRLKNDRAFHAIQDLLKGRSIESTTFSIINRYLRFADKVEGKRRTNWPLNEQWGRFIGRNRKEIQLTSEPKPYTIERTLNWLGRQVAPTWKMAKELDRLNRTTYIQDMVQNARLSDRHKKILEQQSMAIENLII >CP020484|2750102:2766998|2759315_2759540_+|AWV59639.1|DBSCAN-SWA MSGTYLSIYQWFLTNAQSLVLLAIVVIGLFLGFKREFSKLIGFLVIALIAVGLVFNASGVKDVLLSLFNRIVGA >CP020484|2750102:2766998|2754688_2754979_+|AWV59635.1|DBSCAN-SWA MVYDELIGEIYWVIGKIQSDPELEEQLRRLKFDIRKNGVKVAGDPYLMNEETDARIEINQVIAEFERIADQAKEPDIRQYLLEMKAELEVNGITDE >CP020484|2750102:2766998|2751231_2752572_+|AWV59631.1|DBSCAN-SWA MYKGHRIRAGDQHLVYHFVLGWLLALFIGWMSVFYFQEFRQFDISKLSLSTIEIVWSIKDLVCLLGSLAFSGAMILLYIHFFLDHWRSLWHRQKLARMILENHWYEVKQTQSEGFFKDLNSSRTRETISYFPKICYRMKDGLLSIRVQISLGKYQDQLLKLEKKLESGLYCELVEKELKDSYVEYTLLYDMIANRIGIDEVVAENGTLRLMKNQVWAYDSLPHMLIAGGTGGGKTYFLLTIIEALLKSDAELFILDPKNADLADLGTVMPHVYSQKEEISACVEDFYERMMARSKAMKEMSNYKTGENYAYLGLPPNFLIFDEYVAYMEMLTTKESAVILNKLKQIVMLGRQSGFFLILACQRPDAKYLGDGIRDQFNFRVALGRMSELGYSMMFGEVEKNFFMKHIKGRGYVDTGGSVISEFYTPLVPKGYDFLDSISKLEKMND |
18 | Streptococcus_phage(92.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
2691 : 55756
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP020485|2691:55756|DBSCAN-SWA CATGCCCAATTTTACTACAGAAATTATGGAAACACTAATCAATAAAGGTGATTTAGATGAATTATTTCGATGTCATTTAGAATTAGCTGTTAATTCATTATTGCAGGCTGAATTAACAGCTTTTCTTGATTATGAAAAATATGATCGTGCTGGGTTCAATTCAGGTAATTCCCGTAATGGGAATTATTCACGTTCATTCAGAACAGAGTATGGAGAATTAAATTTGGTAATTCCTAGAGATAGAAATGGTAAGTTTTCTCAACAAACTTTACCTGCTTATAAAAGAACCAATGACTCTTTAGAAACCACTATTATTCAGCTATTTCAAAAAGGAATTACTATGTCTGAAATCTCTGAATTGATTGAAAAAATGTACGGGCATCACTATACGCCACAAACCATTTCAAATATGACTAAAATAGTTTCTGAAGATATTATTGCCTTTAAAGAAAGGTCCTTAGAATCCAGATACTCTGTCATTTTTATGGATGCTACTCACATTCCTTTAAAAAGACAAACTGTTTCAAAAGAAGCAGTTTATATTGTAATTGGCATTCGATTAGATGGAACCAAAGAGGTTCTTGGGTTTAGTCTTGCTCCAACTGAATCTGCTTATGTTTGGAAAGAGATTCTTCAAGACCTAAAAGACCGTGGTTTAAAAGAGGTTTTATTAGTCGTAACTGATGGTTTAAGTGGCATTAACGATAGTATTCATAGTGTTTATCCAAATGCTCAATTTCAACAATGTTGTGTCCATATATCTAGAAATATCGCTCATAAGGTTCGTGTTAGTGATCGACAAGAAATCTGTAGCGATTTCAAATTAGTTTATCAAGCAAGTTCAAAAGAAGAAGCAAATAATCAAATAAGGTTTATGATAGATAAATGGAAAAAGCAGTATCCACGAGTGGTTAAATTGCTCATGAATCCTGCTATATTAACCTTTTATAATTTCCCTCCGTCAATCAGAAGAACTATTTATTCAACTAATTTGATTGAAGGTTTTAACAAACAATTAAAGAAATATACCAAAAGAAAAGAGCAATTTCCTAATGAAGAATCTCTGGAGAGATTTCTAGTATCTCAATTCAACAACTATAATCAAAAGTTTCTATGCCGAGTTCATAAAGGTTTTAAAGAAATACATGATACATTAGAATCAATGTTTTAACTTGATCAACAGAATGGGCTTTTCCATTTACACAAAATTATTGACGCTCCCGACAAAATTATGATCTTGCGTAAAGTTATAAAATATTAATAAAAATATTTTATTAATGAAAAGCTTGGTAGCACGGTTATTCATATGCTAATTTATTTCACTTTATAGTAAGGGGAGTTCTTAGTATATTGTTCAAACTTAAATTTCATATAATTTAATTATGTAAATTAGCTATTCTAAGAACTTCTACGGATAACTGCCCGTCTAAAATTTAAATAAGAGCTTAGAATCTTCATATAAGTAAGGTTAATTTTTTTGTACAAAAAAGTCGGAATATTCTGAGTTACTGAAATGATATAAAATCATAAACTAAATCCCTTGATTTTATTGACTTTCAAAAGTTTATATATATAAGTTAATGATTATGGTAAAATATATACATAATCATTAACTCAGAATATTTTTAAGAAGGGAAACAATAGTGAGCTATAATGTACAACCGTTAAGGACAAATGAAGAGATACAAGATTTTCAGTTTTGGCTAAGAAGAACAAGTAATCCGGAAAGAGATAGTTTTTTATTTTTGTTTGGAATCAATAATGGGTTACGTATGTCAGATATTATAGGATTAAAAGTTGGAGATATACGAGGCAAAAGTAAGCCTATTATTGTTGAACATAAAACAGGTAAGCGAAAACCGATTTTTATAGATAATTTGAGAGAAGAAATTTTATTATATACTGAAGGTAAAGAAGAAAATGATTGGTTATTTCCGAGTCGGCAACAAGGTCGACATATAACAAGGGATCGTGTCTATCAGATATATGCAGATATAGCAGAAAAATTAGGACGAGATGATATAGGAACACATACATTAAGAAAAACTTTTGGGTATCACTACTACAAGAAAACTAGAGACATTGCTACCTTAATGTTTATTTTTAATCATAGCTCGCAAGCAATTACAAAAAGGTACATTGGTATAACTGAAGATGAAATAGGAGCATCACTTCGTGGATTTAAACTAGGTGTATAATTTAAAAATTTTTATAAACAGTAAAGACAAAGATTAAAAGCTATTTTTATCTAGAACGATTTTATTTCATAAAGTTCGCGGAATAAAAGCTGGGGTTACTGGTACTTGGTATAGGTTCGTGTTATATAAACTAAGTAATTAAATAACATTTTTAGGTTGGAAAAGGATGAAATTAAAAAAAGAGAATCAATACGGTCTCAAAAACGCAAACGCTGCGGAATAAGAAAAATACTGATAACTCAACGTTTAGCAGACTATCTAATAGGGATAGTCTGCTTTTTTCGTTTTTGACCATACTTTTGACCTTCTGCAAACTTCCTTGCTTTTCCTCTGTAGAACTCATGAAATCTGCAAAACGAATTGCCGTTTCCTCTGTCTGCTTTTTCGCGATATGGGTGTATATATCATCCATAGTGGTTTTAATATCTGTATGTCCAAGTCGAACATACACTTCTTTGACAGACGCACCAGATTCAAAGAGCAGACTACAATGGGTATGACGAAAACCATGAAGTGTGATATGTTTTAAGTTATTCTCTTTAATGATGATTTTCAAATTGTGATTTACATAGTCTAAATAAAGGGGCTTATTTTCTTCTGATGAAAACAAAAGTTGTTCACCATCTTTTATAGGTTTGATTCTCATTTTTAGATATTATGCCCGCACGTATTCATCACATTTCTATTGTGAATCGCTTTATTCGACCGACATTTGACTTTTATCATAATATACTCGGTTTAAAATTACTAATGAAAACAATTAATCAAGACGATCATACCATGTATCACCTGTTTTTTTCAGATAATCACCACCGTGTGGGAACTGAACTGACTTTTTTTGAAGTACAAGAAGGGAACAACCAGTTTTTTGGAACCAATACGATTGAACGAACGATACTAAAAGTTCCTTCCGAAGCATCATTGCATTTTTGGGAAATATATTTTGAAACACAAGGCGTTTGCCATTATGGAATCGAATCATTTTCTGGACGACCTATCTTACGTTTTGAAGGGCCAGATGCAACACGATTAGCTTTAGTTCCCTTACGCGAATTTGAAGATATTGATGATTATTTCCCGTATGTCACAGACCAGATCCCTACAGAGCATGCCATTTTAGGAATTGATGCCATTCAACTACGCGTACAATATTCCGATGCGACTGAACGAGAGTTATTGTCGGTAGGCTGGTAGCACAAAGAATACGTCAGTTTCTTTTCGGGTCATCAACGAGTGACAATCTTAGAAAATCAAGACACTCAGTTCTATCAAGAAGTTCAGATTATTCAAGATCGTGAGAATCCAGTTGCCATTGAAGGGATTGGTAGCGTCCATCATGTTGCGTTTGGCGTAGAAAATAAATCTGATTTACAACGCATCGACAAACAATTACAAGAGCGCAATTTTATAAATTCAGGAATAAAAGATCGTGAATTTTTTGTATCACTTTATTATCGTGACCCAAATCAATTATTGATTGAAATTGCTACAGGGGAAGGAAACCTAGATGCAAAAGCGTATGAAAATCAAAGTCCACGCTTTGAAGAAATTCCTTTATTTTTACCGCAGTACTTAAATTTCATTCGTGAACAAGTGGAGCAATAATTAGCTAATCAAATCCATGACGAAGAGTAAGAGGTTGACTCATAAGTCAAAAAATAAAGAAAAACGCATCAAATCCATTCTAAAGAATGTTGATTTGATGCGGTTCCTATTTTTATAAACTATCATTTTCGACTAATAAAACTACTTATGAGTCAGCCTCTCTTTTTTTCTTGATTTTTATACCTCTTTCTAGGTAAACTAAACATCTGCCAAAAATACCGTGTCTCATTGAAACATTCTCAACTATTTCAAAATAAAGGGGAGTACCAAATGAACGAGTATATTGAAATTATCCACGCAAGAGAAACAACTTAAAAATGTCAGTCTCAAAATTCCCAAAAATAAAATTAGTATTTTTACCAGCGTATCTGGTTCAGGAAAATCATCGATTGTTTTTGATACTATTACCCAAGAAGCTGGTCGTCAACTGAATGACACCTATGATAGTTTTACCCGTTTATTTTTACCTAAATACAGTCGTCCAGAGGTTGATGAGATTGATAATCTTTCTACGGCGATTGTGGTCAATCAAAAGAAGATTGGTGGCAGTGCGCGCTCAACGTTAGGGACGATTACTAACATCAATGCGTTATTTCGTGTGTTGTTTTCATGTTTTGCAACACCTAGTTTAGGATATGCAAATGCTTATTCATTTAATGATCCTAGTGGAATGTGTTCTGTCTGTCAGGGAATCGGTAAGACGATTGCATTTTTAATAGGATTGCTTTATTTTTCGGCTATTGATAATGCTGATTTTGTATTTTCTGATCCATTTACCGCAGAAGTTTTGTCTGGAATTGAGGAACAGGCAAAGAATCATGGTTATTTTGTATTGGTGCATAATGTTAATTCAGCAGAAGATGTTAAAACTATTCAGAGAAATTGGCGTTTTGAGGGGTTCATTGTTGTTGGTGTACGTGTAAAAGAATTTTTGGAATTAAATAACGTTTTTGATGGTCCTGTTGTTTATATTGATACGCATCTTTCAAAAGAGACATTAAGAGAACTTGAACAACAAATGAATCGTTTATTTGTAAATACAAATGATTACCAAGCTAGTACATTGGCAGTGGAACATTTGATTCATTATGGTCATGAGAAAATAGCGTTTCTTTCTTTTGACTACATTGTAGGTGAACCAAGTGTTATTCAAGAACGACATCAAGCTTATATCGATACATTAAAGAAATATCATTT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50 | Bacillus_phage(28.57%) | integrase,transposase | attL 13431:13448|attR 56559:56576 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
69251 : 110507
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020485|69251:110507|DBSCAN-SWA 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MEQLKAYKFRIYPTEEQEIFFAKSFGCVRKVYNLMLDDRKKAYEEVKNDSSKKMTFPTPAKYKKEFPFLKEIDSLALANAQLNLDKAYKNFFRDKSVGFPRFKSKKNPVQSYTTNNQNGTVALIDSKFIKVPKLKSLVRIKLHRQPKGIIKSATISRHSSGKYYISLLCKEEIIELPKTNSTIGIDLGIMDFAILSDGQKIDNNKFTSKMEKKLKREQRKLSRRALLAKNKGTNLFEAKNYQKQKRKVARLHEKVMNQRTDFLNKLSTEMIKNHDIICIEDLNTKGMLRNHKLAKSISDVSWSKFVTKLQYKADWYGRKIIKVDKWFPSSQICSECGHKDGKKSLEIREWTCPVCHTHHDRDINASINILTEGLRLHSMGLA >CP020485|69251:110507|80814_81087_-|AWV59909.1|DBSCAN-SWA MNNYSVMIKNSAKADLKKIKQSNLKPQFEKVIQTLKEDPYLPTQSFEKLKPTHEGRYSRRLNRQHRVVYKVDEDEHVVEIYSARTHYESQ >CP020485|69251:110507|101722_102394_+|AWV59927.1|DBSCAN-SWA MKKWLFGFLGVTLIVFCSVFGYVSYQKHEGEVFKQNIEKKMPVDQINAHAKSYKEDATNVNNDMSLGQMLSIQKEAIEMGVNKQVFAQIQIPALGLALPIFKGANQYTLSLGAATYFYEDAEMGKGNYVLAGHNMEMPGVLFSDIQKLSLGEVMDLVSNDGVYRYKVTRKFIVPGYFKLIDGVPEENSFLSLPKKGEKPLLTLFTCVYTSQGKERYVVQGELQ >CP020485|69251:110507|106300_108412_+|AWV59932.1|DBSCAN-SWA MEGIMENKIHCTTGRVITLVLFLFLLLFARGTAVQALEKVDPSQIKENNNLVLYHDSDSLRNIEVTGINGFKILDEYSTKKQKVLAWPKVKDLKSTSKIVAHYQKVGTYLGKEIDCDVTFSNFVAHAGVNQDGLAKTINGKKYYNYLLFDKNIYRGFFMQSINVMNAKLEFKYAGTKTKVALSEPQPEIQSKMRSMRAAGIDLNDTFLSIYSLNGQYQQRVSWYNDNNESVGERNIDMREFVGYEKMGSLPYFVTTDTACAEYKAPALSTNNLTSKVVGGRAEKAYSSNDHFTDVVGADTYHRSGVTYTLQGASPTFMIGANTNSMMFSFDTALLWTPQPSKPTKEVFNKANTEEAAHNIDKKVIPQGSDVYYHIHQKFDALTVNTMNKYKSFKITDTFDSKNFDMVSDGKNYDGALWYVEANGTWKKADTGGKLTVSGNTVTYTASDSFLANAANYGRDYILQLHMRAKNDAKGIAPNVATVTFNNDPNKGTQKTNTVENYFSLKPNKKVEQDGKDVDGRNDGKKGTPTAPLNAGSEVQYLVTQKWHTKGVDIASDHYKQFSIQDPVEDRLTYKEGSARVIDMSTGKDITSEGTLTYDSNSRTLKWEASADFLSKNLLDGREIQLIFTAKTPLNEELDIDNQAKVSVESIEKATNVVTIGVKPNLPQIIVPKTGSNHLVLTVIGSILFLTLASLGYVVLKLK >CP020485|69251:110507|71159_72536_-|AWV59900.1|DBSCAN-SWA MIKNAFAYVTRKSLKSLIIILVILSMSTLSLISLSIKDATDRASKETFANITNSFSMEINRQVNPGTPRGGGNVKGEDIKKISQTDSIDSYVKRINSVADLVDYDIIETQETLANQSPERAKNFKRTVMLTGVNDSTKETKFVSEAYKLVEGKHLENEDKNKILMHKDLAEKNNLKVGDKIKIKSNLFDADNEKGADETVEVEIKGLFDGHNSGVVSAAQELYENTLITDIHTAAKVYGNTEDTAVYQDATFFVKGDKNLDSVIKDLGKLDINWREYNLIKSSSNYPALQQSISGIYSISNKLFFGSLIFAGVVVSLLLFLWMNARKKEIAVLLSLGISKLEIFGQFLIEMVFISIPAFVGSYFLAQYTADKLGNNILNKVTGDIAKQIAKQSASSQLGGGAEAEGFNKTLSSLDINVLPKFMIYVVIFMSLVLLVSLIISSFNILRRNPKELLIDNN >CP020485|69251:110507|91659_91914_-|AWV59917.1|DBSCAN-SWA MGKELKVRKIGNSVGVILPSSLGLKSGDIIQAKQEGNLFILDTTQIAKEHDRKLIEESFQDFEKGLTVSEIEMVKAFGKYGWSE >CP020485|69251:110507|81086_81350_-|AWV59910.1|DBSCAN-SWA MAKTVLNPSSARKNFYKLLKDVNENHTEIEIISERSENNAVLIGLDDWKAIKETLLLEQIGTLGVVRKREKDDSGFTNVDEIDWDNL >CP020485|69251:110507|97958_98291_+|AWV59922.1|DBSCAN-SWA MSYTGILSLKDICHYGKRCTATEKITKKLSTGQSKTVVQCKKYIIQKDKVSEEMIYYIGKQKQIILKDPIPLKELYPTIKHVYDQNGVLIGRRKNGVLRCTAKGMGRLIG >CP020485|69251:110507|80408_80738_-|AWV59908.1|DBSCAN-SWA MITKTRKQGNSIMLTVPKDFNVPNGVEVEAKLVENGILYEFVEPQKEFYDFSEDILSDIIAEGYDKDEILVEFKNRKNKMHSSFRDIAEDTLTNSKVMTKEELATEIGL >CP020485|69251:110507|91341_91659_-|AWV59916.1|DBSCAN-SWA MKEYTLVYSKSFQTSLETIIEEWENELALSPASIKRFVGAIQKALELTKNFPTMHEEVSEIYGMDIPTYRIVIGKSYALFYRIDHEKKEILVGRIFQSKQMKLGF >CP020485|69251:110507|94548_94743_-|AWV59920.1|DBSCAN-SWA MMGFFLRFYIIELTGRLTVFFGNFAIKPFAEVTAHYICKWLDCKNKIKKVFHYISSSPCQIRPG >CP020485|69251:110507|83672_85922_-|AWV59912.1|DBSCAN-SWA 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>CP020485|69251:110507|76525_76876_-|AWV59905.1|DBSCAN-SWA MSINANGKNETFKPSDYTLEAKKEYVYEYLGLKFKLSDKFRNYIADKKIAMLDDQSPIDKELKYAILTFEKMTEEQKNAVIEKMGDGYKNWQNELERIGTIGIFEKNTSEEKNLKL >CP020485|69251:110507|106021_106270_+|AWV59931.1|DBSCAN-SWA MKIIRILVFNLSFLAATILCCGLIFSQLSIYPRYQRLFIHFLNIQCASMPLEVIKKLLINPIFMVSLVLLTGLVTWVLGKKE >CP020485|69251:110507|101453_101663_+|AWV59926.1|DBSCAN-SWA MNYEEIENRKKVSKEMEEKLLKTMKQKHLKRLSVAQYINDMQLTGKEKACLLGSMKNFEQLRRTYRIHF >CP020485|69251:110507|101147_101387_+|AWV59925.1|DBSCAN-SWA MARPVLEAMDMDTLTKGRYVQLLARGYSPKEVFKALSKGTDMEKERLRKEFDYWRTHNGIKDLKPARPVIKRKKKITQD >CP020485|69251:110507|104435_105191_+|AWV59929.1|DBSCAN-SWA MIIRKPPKRRVMHKLMIFFWLLSAVAVYLIPVVETNVAKFQQQQRILAIENLEKTDSSLDVAKIELGDPVGVLTIPSISLKLPIYDGTSDKILENGVGITEGTGDITGGNGKNPLIAGHSGLYKDNLFDDLPSVKKGQKFFIKVNEEQHAYQIYRIEEVKAEELQKNYLDYLMPEKDQDRITLMTCTPKGVNSHRFLVYGERVSFSKEDLKLQKKAKNRKSISLDWRLALLFAFFCVPIIFIYKKIRRRSE >CP020485|69251:110507|82494_83670_-|AWV59911.1|DBSCAN-SWA 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MNKRKWLFVCVAALFSTVAYSQLSFADSSDSSTTQTIDNSITAPSETDSSENTTEETADSNISFTESTNPTSESSSETSEKPQDVEDTQVIKQAIHIQKIISSNQINNQGSQVAQQEGINGAKFIVYDITNILEEMSQDDNEKNQSVEIIESKLKDRAKKLSYDQLKKVAEGETKTIDDQEGVIEFSIEVPANKKQAYYIVNESSPENISNSEDIVLLTPVSNEKGEFLTDVWLYPKSEKSEPKEEIKKVVSTGVKKNFFENCWEFFAQLFFDN >CP020485|69251:110507|98909_99251_+|AWV59923.1|DBSCAN-SWA MKNYDPNIRLGTHTIKVSFQRWDYKGFVTFRRGGNCKGLDVLALDEDDLYDQTLTDNPIGFGLLPEDDEGNEWFKMTLMNDNGDELSVEDTWSYLSDYIVSFEIIEFVADKEE |
35 | Streptococcus_phage(45.45%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
146867 : 181964
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP020485|146867:181964|DBSCAN-SWA TTTAAGCTGGGATTCCCAATAATACCTTGATTTCAGTACAGACCGAAAACCCGAAGAGAGTGCCTTCTTTTCGGGTTTTCTTATATAATCCTCGAATGGCTTCCATGCCTTTAATCGTGGTAGAGGCAGTGCGTAAACTTCGATAGAATTTATTGCGTCTCTTTACTGGACGATGGTCTTGTTCAATCAAATTATTCAGGTATTTAATGGTACGATGTTCTGTCCCTTGATAAAAGCCGTATTCTTTTAGTTTCTTAAAGGCACTTGTAATAGAGGGGGCTTTATCTGTGACTACAACCTTCGGTTCATCAAACTGCTTCACTAACCGCTTAAGAAAAGCATAGGCTGCTTGTGTGTCCCGTTTTTTACGTAACCAAATATCCAAGGTTAAACCATCTGCATCGATGGCTCGATACAAATAATGCCATTTTCCTTTAATTTTGATGTACGTTTCATCCATTTTCCATGAATAAAAGGATTTTTTATTTTTCTTTTTCCAAATTTGATAGAGTAGTTTGCCATATTCTTGCACCCAACGATAAATCGTCGTATGAGAAACGTTAATGCCACGATCATATAAGATTTCTTGAACTTCACGATAGCTAAGGTTATAACGAAGATAGTAGCCCACGGCTACAATAATCACATCCTGATGAAATTGCTTTCCTTTAAAATGACTCATCGTCATTCCTCCTGCTATCTTTTTCTATTATTCTACCTTATCTGATAGTAGATTTAAAACTTTGCAACAGAACCGGATTGCAAGGTCGTAGCAACATTAACCTGTATGTTGCAGCGGCGACTAATAGTATAACCTAAAGCAATCGCCGCCAACTCCTTACCGGCTCTTATTTCCTCTCGTACAAATAACAGAACCTCTTCTTTGTCAACTCCCAGCAAGTCCGCCGCAACGTCATTGTCAGTTATTAAAGAAATTTCTTGAGAACGCGTATATGCCAAACTTTTAAAATCTTGGAAAGGATTGTCCGAGAAATTACTTTTCTTTAATGTTTCCATAGGGATTAATAACATCAAGCTAATTGCTTCTGCATCAATATATTCTAAATAAGCTTGTGGTTGCTGCTGTTTGAAATCATTCAGTTCCGGACAAAGAGCTGCTGCTTTTTTCGGTGAAAGAGCCGTTGCCTTTAGCTGTAGCCGCTGCTTACTAAGCAGAGAATCTTCTATCGGTGTAAAGAAATGATGGGCATTTTTTTCGAATTTTGGCGCAGTTAAATAATAGCCGCTATTGGTTTGCGCCCGTAAGGTGCCGTTGTCCACCAGTTTTTGTAACGCGCCTCTTAAGGTAGTTCGATTAACATTAAACATTTCTGATAGGTCCCGTTCCGAAGGCAGTTTTGTTCCGGGGGTTAAATGATGTTCATGAATATAAGCAATAATTTTGTCAATCAGGTCATAAGCCAACAGATTAATCAATTTGGGCATAGATTTTCATCTCCTTTCCTTGATGAACATTTTTAGTATAGATGGCGGCGAATTCAGGCAAAACCACTACTTCAGTGTATTCAACCGCTTGTTCATTTGTCGTAACCGCAGTGATAGCAAGGCTGATTACCGGACGATTTAAGCTGGTTTTTAACAAACGGGCTTCTTTATTGCTCACTTTTGAGCTGGAAATTGTCTGATAGATATTTTCAATTTGATAATGATAAGCAGCCAATGTGGAATAAAATGAAAAAATTTGGAAATCAAAAGCTTGAAGATCAGGTATGAGATTTAATGGAATATAAGTGTCTTCAATAGAAATTGGCTCACCGTCGCCGCTTCTTAAACGAACCAAATGAAATACTTCTTCAGTTGGTTCCAGCTGTAAAGCTTTCCCGACAATGTGTCCAGCCGGTTTTATTTCTGAAGCTAAAATTAAGCTGCTAGGCTGAATCCCTTCCCGTTCCAACAATTCAGACAAACCATGAAATTTGATTTGCAAATGTTCATGGATATTTTTTTTAACAAAAGTTCCTTTGCCATGTATTTTTAGTAGGTACTCTTTATTTACTAATTGTTGAATGGCTTTTTTTACGGCTGAACGATTCATTTCATAAATTTGAACAAAATCACGTTCTGAAGGAATAGCTTGCGCGTATTTATATTTTTCTTGTTCAATGTCTTGTATTAATTTGTTCGTTAGTTCTTCAGTATTCATACGTTACACTCCAGAGTCTATTTTTGTTTATTATACATGAAAAAAGGATTTTGGTACAAATAAAAATAAAAGTGGTTAAAAACTATTGACAGCGTTTTCTATAAGTGGTACATTAAAAACGTTAACAGGTGGTATATAAAAAAGGTTAAGTGGTTTGTTAATGTGCCGGCATTTGCAAATATATTTTTCAAATTATTGACTTGGAGGTTTTTAACTATGTTAGGTTTTAGCGAAGAACGTTTTCTATCAGTATTAAATGGTGCAGTAAAAAATATCGAGACAATCAATCAGGTGGCAGATGCAATCAGTGAGAAGGGATTTAAAAATCTTTATTTGGTAGGCTCTGGTGGAACATATGCCACAATCAGCCCGCTAGCTTATCTGTTAAGCACTCATTCAGAGCTTGATTATTATCATGAAATAGCCGCAGAGGTGGTTTGTTCACAGCCGAAAAAGATTAATAAAGATACAGTGTTAATCACATCTTCATTAACCGGTACGACTCAAGAAACCGTTGATGTTGTTAAGTATGCCAATAGTCAAGGTGCAACGACGATTGCGTTTGTAGGAAATGCTGCTACACCACTCGGGGAAATCGTGGATTATGCGATTGAAAATGATGCTGACAACGATACATTAGTAGAAGAACTTCAGTTACAGTTTTTTGCTTTGGGTGCACGCCTGATGAAAAATAACGGTGAGTTTCCTGAATATGATGAATTTATTCAAACATTACAAAAAATGCCGGAAGTATTACTAAGTGTTCGGCAACAAAATGATCAGAAAGCACTTGAATTTGCAGAAAAACATAAAAATACGGAATTTCATATGTTTGTTGGAGCCGGGAATACTTATGGGGCTGCCTATGAATATGCTATGTGCGTACTGGAAGAAATGCAATGGATTGCCACCAAGTCGATCCATGCAGCCGAATTTTTCCATGGGACTATTGAAATGACTGATAAATCTATGAGTTTTGTGTTATTAAAAGGTGAAGATCAAACGCGTCCGCTAGTCGATCGCGTAGAGCGTTTTGTAAATAAATATAGCGATGTTGTGACGGTTTTTGACACTGCGGATTTCGAATTAGCAGGTGTACCAAGCGCTATGCGTCAGTATGTAGCGCCAATGGTTATGGCAACGGCCTTAGAACGAGTGAGTGCTCATTTTGAAAAGGTGCGGGATCATTCACTAGATATTCGTCGTTATTATCGGACTGTGGAATATTAAGGTAAGAGCTATGAGGAAAATTGTAATTGCGACGCATTCCATGATGGCTAAAGGCTTAAAGGATACTTTAGAATTTATTATTGGTCCTCAAAAATCACTTTTAGCAATAACTGCGTATATAGATAGTGACTACTCCATTAACCAGGAAATAGAGCAGCTATTTTCCGACTTAGCGCCTGATGACGAATTAATTGTGACGGTAGATTTACTGGGAGGAAGCGTGTCTAACGCTTTCTCCGAACAAATCGGTAAAGACAATTTTTATTTAATCAGCGGTGTAAATCTGCCGCTGCTTTTAGAGCTTTGCTTATCAGGTGAACAGGACACGAAAAAACTAATCCAAAAAGCTATGAATAGCGGGAATGAAGGGATAGTTTTGGTGAACGAGTTGCTAGAGAAAACAGAAGAGGATGATTTTTAATGATTAAATTATTACGAGTAGATGAACGTTTTGTTCATGGGCAAGTTGCTTTTGCCTGGACAAATAACTTAGGTGCAAATTGTATTTTCGTTGCAAGTAATGAAATCGCTACCAATAATCTGCGCAAAAAAACACTAAAAATGGCTGTTCCTACAGGGACAAAATTTGTGGTGAAGGATATGACAGAGGCCATCTCTGTTTTAAATGGAGAAAAAATCAAGAAATACCAAGTATTTTTAATTGTCGGGACGGTGGAGGATGCCTACGAAATTACTCAGCACGTACCTGAGATTAAAGAAGTGAATTTAGGAAATTTAAAGAAAAACGAGAATCGGAAAATGATTACTAGTTCCGTTTACTTGAATGAACAAGAACTGGACTTGGTGAAAAAAATGACTGAAAACGGGATAACAGTTCAATGTCAGGCTGTACCAACGGACAAAAAAATCAATCCTTTGCATGACTAAAAGAGGAGGGGAAGAATATGATACAAGCAATATTAATCGCACTGGTAGCTTTTTTGGCGTCTATTGATGAATACACATTTGGTGCATCGATGATGGGTAGACCGCTATTTACAGCGCCTTTTGTCGGTTTGATTTTGGGAGATTTAGAGTCAGGAATTATTATTGGTGCCACCTTGGAATCCATGTTCATGGGCTCAATTATGGTAGGGAGTGCGACGCCCCCTGAAGTTTATGCTTCCAGTGTTTTAGGTACAGCAATTGCGATTCAATCGGGTCAAGGAGTAGGAACTGCCGTTGCGTTGACTTTACCTTTGTCCATCTTTCTTCAGATGTGGCGTAACTTCGCCTATGCAATGCCAATTACGTATTTTAACAACAAAATGGATGAGGCATTAGTCAATCATGATTTCAAAAAAGCACAAAAATATCATTATGTGGCTCAACCTTTAATCGTTGGGGTTCCATCGGCCATTTTAGTTTTTGTAGCTACTTATTTTGGTGTGTCTACAATCAATGCGATGATCAAGTTGATTCCTCAGGTTGTATTGGACAGCTTTGATGTTGCGGCCGGTGTGCTTTCTTGTGTTGGGCTAGCGTTATTAATTAAAATGATGGCGAATAAAGCGATGATGCCTTATCTTTTCTTAGGATTTGTCGGCGTAATGTATCTGAAAATGGATGTTGTCGGTGTGGCTGTCGTCGGACTTTGCTTAGCGTT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>CP020485|146867:181964|154683_155085_-|AWV59982.1|DBSCAN-SWA MSDKFSKKISSDIKEDFKAIFKTASIELAGERKQLIMDKYGEDKKVATACKILDEGFEDAMQVMVLPENIRQRLRTTNVLERLNEEVRRRERVVRIFPNCDSVIRIIGALLMEKDDEWTSAPRKYLEFDRNEI >CP020485|146867:181964|174541_174736_-|AWV60002.1|DBSCAN-SWA MYKLNEIVPVQLGNEKSAPEKGKPAAAKLAMRIKRENGSEVLIYNGINNYILQAILKELLSNAL >CP020485|146867:181964|159261_160170_+|AWV59987.1|transposase|DBSCAN-SWA MRSSKYTEHYTDTFITFKEIMRTVSNIYHNCVPDKIKNRRNTDQLKQRDTVIIACVIWGIINGYTSQRATYRAVCSVLFPNGDFPSRSRFTRLSSNLAYTIKIIRYFFIKKLTKGELVGIIDSFPSPLCKPVRNRQAKLLNQIAKVGYNSTKKSYFYGLKIHMIVTKTGFPITYSITNPGVHDVKVLETLSEEANLPNILGDKGYISHKIHEKLALKGITISVPPRKNMDKSEKLDHSLLGKQRKTVETVFFSLEKLGCQNFNSRSVKGLESRFESILLAYSVLLSRAQRRFEGTLRYSLGY >CP020485|146867:181964|172549_174097_-|AWV60000.1|transposase|DBSCAN-SWA 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MSHTQLIKDTLNILDLNIYFEENCLTKEKYKGQICLIYKGTLLYKPEECSHCLCVVPSRIIRWGTTTVRLLLNDVSEYRTYLELKKQRFKCKSCQRTFVADTSVAEKHCFISQKVRWSVIARLKENTSMTEIARQKNISTSSVYRVMKRFYRPLNPFKQTLPKVLCFDEFKSVRSVASAMSFIMMDGQSHALLDIVENRRLPYLERYFSRFSLATREAVQLIVIDMYAPYVSLVKKLFPNAQLIIDRFHIVQHIGRTFLNHRVKETTVRLKGNSHSQRGLGKKLKRYWKLLQKEEAKLNYEKRVWRASFKDYLTESEIADRLLAACPNLRQGYQLYQDILYAVKKRDQSLFEDCLTRDISGLPETYTTTLRTFKKFLPQIQNALHYSYSNGPLECLNNHIKVLKRNAYGFRNFYNFKLRIMIRHSKTFLT >CP020485|146867:181964|151911_152721_+|AWV59981.1|DBSCAN-SWA MVKESVIGKKELRSIFWRSFFMQSSWSFDKMMAYGQMNGIERSLRKIYPNDDDYYTALQRHTETFNITPHIAPFVMSLSVTMEEENAKNPEFDTDAINKIKTGLMGPLSGIGDSFFWGTFRVIAAGIGISFAQQGNILGMILYFTLYTAIHFIFKWLATKYGYVLGTKFIDDTEDNHMIDKLSHGASILGLTVIGAMIGTMVTLNTSLKFTVGGAETSLQSIFDQIFPGLLPLGITFLCVWLYSKGHKTITIILGIFVLCFLGTLGGIF >CP020485|146867:181964|150680_151148_+|AWV59979.1|DBSCAN-SWA MIKLLRVDERFVHGQVAFAWTNNLGANCIFVASNEIATNNLRKKTLKMAVPTGTKFVVKDMTEAISVLNGEKIKKYQVFLIVGTVEDAYEITQHVPEIKEVNLGNLKKNENRKMITSSVYLNEQELDLVKKMTENGITVQCQAVPTDKKINPLHD >CP020485|146867:181964|163692_164466_+|AWV59991.1|DBSCAN-SWA MLVQSIGLGLIGVFCILDSRLLGRMNFERPLIVSTLVGLVLGDMEKGLIVGASLELMSLGLVNIGAASPPDMNMASIIATAFAILSNANAEAALTIAIPISVLGQILGILMRTILSNLTHVADRFIEQGKFSQARRIHILYGSGLYALMYFIPIFLAIYFGTNLVSQIVDAIPEWLTNGLTVASKILPAYGFALLLQTMLTKKMVPFLLLGFLITAYSGLGIIGIAAFACIVAFVMVQVQGKNSNGNQNEPDPLDDL >CP020485|146867:181964|156537_157275_-|AWV59984.1|DBSCAN-SWA MLISCGARLAPFDIRELRELMSEDELELDKIGDRKTALFVIISDTDDTFNFVVSIMYSQLFNLLCDKADDVYGGRLPVHVRCLLDEFANIGLIPKFEKLIATIRSREISASIILQAQSQLKAIYKDHADTIVGNCDSTLFLGGKEKTTVKELSETLGKETIDLYNTSETRSNQKSFGLNYQKTGKELMSQDEITVMDGGKCIYQLRGARPFLSDKFDITKHKNYKLLEDYDKKNLFDVEEYLKQR >CP020485|146867:181964|169182_169815_+|AWV59995.1|DBSCAN-SWA MTMGVIFDMDGVLIDSETFYFERRMNFFQELEIDPGSNQIDDYVGKTEAAIWETLVPEDKSLREELYPKYVDYRKTHPIDFAKALRKEVKPLLDFLKKRDIPLALASSSPAVEIESMLIQCELTEYFSFVISGESLKQSKPHPEIYLKAKQQLDCDFFIAVEDSTIGIKSAKAANIYTAALKQPMQIDQSEADIQIESLQELEQIVLEKG |
35 | Streptococcus_phage(36.36%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
0 : 2672
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP020486|0:2672|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP020486|0:2672|811_1006_-|AWV60046.1|DBSCAN-SWA MSKEPMSAWMQLALSIIKLISNFVALDNRAKVLTTQCLVILTCSLLVVIVFLLLALFVVHLLFF >CP020486|0:2672|1471_1747_-|AWV60047.1|DBSCAN-SWA MALLPTNKDKKKIGAEDISIKDDINVELGERKYTAKERKPVQVDPPVLKTIRDLSYAKDIPMYEIVKLAMDAYVDTLNDEERIIYNRRSKD >CP020486|0:2672|1718_2672_-|AWV60048.1|DBSCAN-SWA MENLRTAFKTSDKLGKVVMLTGRKGGIGKTTDNDLLAIVSSQLFEKDVLLIDYDQQRNTTSNIGSTYQITSFDRSMSAAIKKGDWVSGITQVSPHLYIMAGSPGSEELNEYLSEKYPDRRKRSLAFIKPLEELRKNFDYIFIDCPPSTDNVVRAFLTAADYIIAMQELKRYAMEGTEDFINKVLVPIVTNFEESHLQIIGILPVLFSVRRSSQHANYQKTIDKYGESNIFKSIVKGSDRLEMYGENGIQLNDYVDRRWWAIFADIFTELEERIEYYEQHGDIEGFDYTPKYADSMANHILPLGKEIKLNGIITNEQR >CP020486|0:2672|50_401_+|AWV60045.1|DBSCAN-SWA MIDYNDRGRLKWAGFYLSDHTEKIDADNEQRANQNLAKEQMTTEEVAEVLNAAVIKNRSVCIQKEERNAEGYYPEDIVSKILGSDELGIYVGKNKVHYDEIRHIEFYQDNKWGRLE |
4 | Enterococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
6819 : 14865
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020486|6819:14865|DBSCAN-SWA AATGACGATGAATCATTTTAAAGGAAAGCAATTTCAGCAGGATGTGATTATTGTAGCCGTGGGCTACTATCTTCGTTATAACCTTAGCTATCGTGAAGTTCAAGAAATCTTATATGATCGTGGCATTAACGTTTCTCATACGACGATTTATCGTTGGGTGCAAGAATATGGCAAACTACTCTATCAAATTTGGAAAAAGAAAAATAAAAAATCCTTTTATTCATGGAAAATGGATGAAACGTACATCAAAATTAAAGGAAAATGGCATTATTTGTATCGAGCCATCGATGCAGATGGTTTAACCTTGGATATTTGGTTACGTAAAAAACGGGACACACAAGCAGCCTATGCTTTTCTTAAGCGGTTAGTGAAGCAGTTTGATGAACCGAAGGTTGTAGTCACAGATAAAGCCCCCTCTATTACAAGTGCCTTTAAGAAACTAAAAGAATACGGCTTTTATCAAGGGACAGAACATCGTACCATTAAATACCTGAATAATTTGATTGAACAAGACCATCGTCCAGTAAAGAGACGCAATAAATTCTATCGAAGTTTACGCACTGCCTCTACCACGATTAAAGGCATGGAAGCCATTCGAGGATTATATAAGAAAACCCGAAAAGAAGGCACTCTCTTCGGGTTTTCGGTCTGTACTGAAATCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCATCGATAACATACGAGATAAAAAGGCAAGTTTAAAATCACTAAAAGATACATGGCTTGATTTATCAGAAGATAATCCATACAGCCAATTCTTAATTACTGTAATGGCTGGTGTTAACCAATTAGAGCGAGATCTTATTCGGATGAGACAACGTGAAGGGATTGAATTGGCTAAGAAAGAAGGAAAGTTTAAAGGTCGATTAAAGAAGTATCATAAAAATCACGCAGGAATGAATTATGCGGTAAAGCTATATAAAGAAGGAAATATGACTGTAAATCAAATTTGTGAAATTACTAATGTATCTAGGGCTTCATTATACAGGAAATTATCAGAAGTGAATAATTAGCCATTCTGTATTCCGCTAATGGGCAATATTTTTAAAGAAGAAAAGGAAACTATAAAATATTAACAGCCTCCTAGCGATGCCGAAAAGCCCTTTGATAAAAAAAGAATCATCATCTTAAGAAATTCTTAGTCATTTATTATGTAAATGCTTATAAATTCGGCCCTATAATCAGTCAAGTCCATAATCCTGTGTAAAATACTATACAATGTTTTACCGGTCTCTCATTGATCAAACTTAATATATTTTCTTGTAGAACTGAGCCATTCGTCATGAAGGTCCATAAGGACAGCTCCAATTAATCGATTGGCAGACGTTCGGTTGGGAAAAATCCGAATAATCTTTTCTCTTCTGCGGACTTCCTGGTTCAGTCGTTCAAGAAGGTTGGTGCTTTTTAGCCGATTATGACTATTTCCGATAACCGTGTATTGAAAGGCATCTTCGAAGCCATTATCCAATATTTCGCAGGCTTTTGTATATTTAGGCTGGTCGATATATTCACCGACTAAGGCATTCTTAGCTGTTCGAGCGAGTTCAATATCCGTAAACTTAAAGATCGCTTTTACTGCTTCTCTAAACGGTTTTGAATTCTTTTTTGGAATGGAACTGAAGATGTTTCTTAAAAAATGGACCTGGCATCTCTGCCAACTTGCGTTGGTAAATGACTTACGAATCGCAGACACTAGGCCTTTATGGGCATCAGAAATGATGAGTTCTGTCCCCTTTAGGCCGCGTTCTTTTAAGTATTCAAAGAAGATGGACCATGTGTCATCACTTTCTTCATTTTGAATCATGAAGCCAATGATTTCACGGTCGCCACCTTCTGTTATCCCGATCGCAATATGGCAGCTTTTAGAAAGCACTCGATGGTCCTCACGGACTTTTATGTAGAGAACATCAGTCATCAGATAAGGATAATTCGTACCTGAGAGTGAACGGTTCTGCCATTCGTTGACCATCGGGTCTAACTGCTCAGTCAGGCTAGAAACAAAAGATTTCGATACAGATTTTCCACATAGCTCTTCAACAATCTTTGAAACTTTACGTGTCGAAACGCCCGAAACATACATCTCAAGCATTGAAGCGAGCAGTGCCTTTTCATTTCGCTGATAACGCTCAAACACCGTCGGTGAAAATTCACCATCACGTGTTCTAGGCACTTTTAATTCGAGTGTACCCACACGAGTCGTAAAGTCTCGCTCATAATAGCCATTTCTTTGACTCTGACGACTTTCTGAACGTTCATAGTCATCGGCTTGAATATATTCTGTTCGTTGATTTTCCATCAATTGGTTGAAAACAGTGGTTAAAATATTTTTAGAAACATCATCTTTTACCGAATGTTCAATAATACTTTGAACCTCTTCGTTGTTCAGTGTAAAATGTACTTGGGTCATGTAACGTCCTCCTGGGTATGTTTTTGTGGTTAAAAACATTGTACCGTAAAAGGGCTGTTACATGGCCTTTTATCTTTTACACAATTATATGGACTTTATCCTATAATCTGATAAATTATTAAGGGCAAACTTATGTGAAAGGGTGATAACTATGAGCGATAAAATACTTATTGTGGATGATGAACATGAAATTGCCGATTTGGTTGAATTATACTTAAAAAACGAGAATTATACGGTTTTCAAATACTATACCGCCAAAGAAGCATTGGAATGTATAGACAAGTCTGAGATTGACCTTGCCATATTGGACATCATGCTTCCCGGCACAAGCGGCCTTACTATCTGTCAAAAAATAAGGGACAAGCACACCTATCCGATTATCATGCTGACCGGGAAAGATACAGAGGTAGATAAAATTACAGGGTTAACAATCGGCGCGGATGATTATATAACGAAGCCCTTTCGCCCACTGGAGTTAATTGCTCGGGTAAAGGCCCAGTTGCGCCGATACAAAAAATTCAGTGGAGTAAAGGAGCAGAACGAAAATGTTATCGTCCACTCCGGCCTTGTCATTAATGTTAACACCCATGAGTGTTATCTGAACGAGAAGCAGTTATCCCTTACTCCCACCGAGTTTTCAATACTGCGAATCCTCTGTGAAAACAAGGGGAATGTGGTTAGCTCCGAGCTGCTATTTCATGAGATATGGGGCGACGAATATTTCAGCAAGAGCAACAACACCATCACCGTGCATATCCGGCATTTGCGCGAAAAAATGAACGACACCATTGATAATCCGAAATATATAAAAACGGTATGGGGGGTTGGTTATAAAATTGAAAAATAAAAAAAACGACTATTCCAAACTAGAACGAAAACTTTACATGTATATCGTTGCAATTGTTGTGGTAGCAATTGTATTCGTGTTGTATATTCGTTCAATGATCCGAGGGAAACTTGGGGATTGGATCTTAAGTATTTTGGAAAACAAATATGACTTAAATCACCTGGACGCGATGAAATTATATCAATATTCCATACGGAACAATATAGATATCTTTATTTATGTGGCGATTGTCATTAGTATTCTTATTCTATGTCGCGTCATGCTTTCAAAATTCGCAAAATACTTTGACGAGATAAATACCGGCATTGATGTACTTATTCAGAACGAAGATAAACAAATTGAGCTTTCTGCGGAAATGGATGTTATGGAACAAAAGCTCAACACATTAAAACGGACTCTGGAAAAGCGAGAGCAGGATGCAAAGCTGGCCGAACAAAGAAAAAATGACGTTGTTATGTACTTGGCGCACGATATTAAAACGCCCCTTACATCCATTATCGGTTATTTGAGCCTGCTTGACGAGGCTCCAGACATGCCGGTAGATCAAAAGGCAAAGTATGTGCATATCACGTTGGACAAAGCGTATCGACTCGAACAGCTAATCGACGAGTTTTTTGAGATTACACGGTATAACCTACAAACGATAACGCTAACAAAAACGCACATAGACCTATACTATATGCTGGTGCAGATGACCGATGAATTTTATCCTCAGCTTTCCGCACATGGAAAACAGGCGGTTATTCACGCCCCCGAGGATCTGACCGTGTCCGGCGACCCTGATAAACTCGCGAGAGTCTTTAACAACATTTTGAAAAACGCCGCTGCATACAGTGAGGATAACAGCATCATTGACATTACCGCGGGCCTCTCCGGGGATGTGGTGTCAATCGAATTCAAGAACACTGGAAGCATCCCAAAAGATAAGCTAGCTGCCATATTTGAAAAGTTCTATAGGCTGGACAATGCTCGTTCTTCCGATACGGGTGGCGCGGGACTTGGATTGGCGATTGCAAAAGAAATTATTGTTCAGCATGGAGGGCAGATTTACGCGGAAAGCAATGATAACTATACGACGTTTAGGGTAGAGCTTCCAGCGATGCCAGACTTGGTTGATAAAAGGAGGTCCTAAGAGATGTATATAATTTTTTAGGAAAATCTCAAGGTTATCTTTACTTTTTCTTAGGAAATTAACAATTTAATATTAAGAAACGGCTCGTTCTTACACGGTAGACTTAATACCGTAAGAACGAGCCGTTTTCGTTCTTCAGAGAAAGATTTGACAAGATTACCATTGGCATCCCCGTTTTATTTGGTGCCTTTCACAGAAAGGGTTGGTCTTAATTATGAATAACATCGGCATTACTGTTTATGGATGTGAGCAGGATGAGGCAGATGCATTCCATGCTCTTTCGCCTCGCTTTGGCGTTATGGCAACGATAATTAACGCCAACGTGTCGGAATCCAACGCCAAATCCGCGCCTTTCAATCAATGTATCAGTGTGGGACATAAATCAGAGATTTCCGCCTCTATTCTTCTTGCGCTGAAGAGAGCCGGTGTGAAATATATTTCTACCCGAAGCATCGGCTGCAATCATATAGATACAACTGCTGCTAAGAGAATGGGCATCACTGTCGACAATGTGGCGTACTCGCCGGATAGCGTTGCCGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020486|6819:14865|9450_10146_+|AWV60054.1|DBSCAN-SWA MSDKILIVDDEHEIADLVELYLKNENYTVFKYYTAKEALECIDKSEIDLAILDIMLPGTSGLTICQKIRDKHTYPIIMLTGKDTEVDKITGLTIGADDYITKPFRPLELIARVKAQLRRYKKFSGVKEQNENVIVHSGLVINVNTHECYLNEKQLSLTPTEFSILRILCENKGNVVSSELLFHEIWGDEYFSKSNNTITVHIRHLREKMNDTIDNPKYIKTVWGVGYKIEK >CP020486|6819:14865|14178_14865_-|AWV60059.1|transposase|DBSCAN-SWA MTMNHFKGKQFQQDVIIVAVGYYLRYNLSYREVQEILYDRGINVSHTTIYRWVQEYGKLLYQIWKKKNKKSFYSWKMDETYIKIKGKWHYLYRAIDADGLTLDIWLRKKRDTQAAYAFLKRLVKQFDEPKVVVTDKAPSITSAFKKLKEYGFYQGTEHRTIKYLNNLIEQDHRPVKRRNKFYRSLRTASTTIKGMEAIRGLYKKTRKEGTLFGFSVCTEIKVLLGIPA >CP020486|6819:14865|11492_12461_+|AWV60056.1|DBSCAN-SWA MNNIGITVYGCEQDEADAFHALSPRFGVMATIINANVSESNAKSAPFNQCISVGHKSEISASILLALKRAGVKYISTRSIGCNHIDTTAAKRMGITVDNVAYSPDSVADYTMMLILMAVRNVKSIVRSVEKHDFRLDSDRGKVLSDMTVGVVGTGQIGKAVIERLRGFGCKVLAYSRSRSIEVNYVPFDELLQNSDIVTLHVPLNTDTHYIISHEQIQRMKQGAFLINTGRGPLVDTYELVKALENGKLGGAALDVLEGEEEFFYSDCTQKPIDNQFLLKLQRMPNVIITPHTAYYTEQALRDTVEKTIKNCLDFERRQEHE >CP020486|6819:14865|12453_13485_+|AWV60057.1|DBSCAN-SWA MNRIKVAILFGGCSEEHDVSVKSAIEIAANINKEKYEPLYIGITKSGVWKMCEKPCAEWENDNCYSAVLSPDKKMHGLLVKKNHEYEINHVDVAFSALHGKSGEDGSIQGLFELSGIPFVGCDIQSSAICMDKSLTYIVAKNAGIATPAFWVINKDDRPVAATFTYPVFVKPARSGSSFGVKKVNSADELDYAIESARQYDSKILIEQAVSGCEVGCAVLGNSAALVVGEVDQIRLQYGIFRIHQEVEPEKGSENAVITVPADLSAEERGRIQETAKKIYKALGCRGLARVDMFLQDNGRIVLNEVNTLPGFTSYSRYPRMMAAAGIALPELIDRLIVLALKG >CP020486|6819:14865|6819_7506_+|AWV60052.1|transposase|DBSCAN-SWA MTMNHFKGKQFQQDVIIVAVGYYLRYNLSYREVQEILYDRGINVSHTTIYRWVQEYGKLLYQIWKKKNKKSFYSWKMDETYIKIKGKWHYLYRAIDADGLTLDIWLRKKRDTQAAYAFLKRLVKQFDEPKVVVTDKAPSITSAFKKLKEYGFYQGTEHRTIKYLNNLIEQDHRPVKRRNKFYRSLRTASTTIKGMEAIRGLYKKTRKEGTLFGFSVCTEIKVLLGIPA >CP020486|6819:14865|13490_14099_+|AWV60058.1|DBSCAN-SWA MEIGFTFLDEIVHGVRWDAKYATWDNFTGKPVDGYEVNRIVGTYELAESLLKAKELAATQGYGLLLWDGYRPKRAVNCFMQWAAQPENNLTKESYYPNIDRTEMISKGYVASKSSHSRGSAIDLTLYRLDTGELVPMGSRFDFMDERSHHAANGISCNEAQNRRRLRSIMENSGFEAYSLEWWHYVLRDEPYPNSYFDFPVK >CP020486|6819:14865|10123_11278_+|AWV60055.1|DBSCAN-SWA MVIKLKNKKNDYSKLERKLYMYIVAIVVVAIVFVLYIRSMIRGKLGDWILSILENKYDLNHLDAMKLYQYSIRNNIDIFIYVAIVISILILCRVMLSKFAKYFDEINTGIDVLIQNEDKQIELSAEMDVMEQKLNTLKRTLEKREQDAKLAEQRKNDVVMYLAHDIKTPLTSIIGYLSLLDEAPDMPVDQKAKYVHITLDKAYRLEQLIDEFFEITRYNLQTITLTKTHIDLYYMLVQMTDEFYPQLSAHGKQAVIHAPEDLTVSGDPDKLARVFNNILKNAAAYSEDNSIIDITAGLSGDVVSIEFKNTGSIPKDKLAAIFEKFYRLDNARSSDTGGAGLGLAIAKEIIVQHGGQIYAESNDNYTTFRVELPAMPDLVDKRRS >CP020486|6819:14865|8126_9299_-|AWV60053.1|transposase|DBSCAN-SWA MTQVHFTLNNEEVQSIIEHSVKDDVSKNILTTVFNQLMENQRTEYIQADDYERSESRQSQRNGYYERDFTTRVGTLELKVPRTRDGEFSPTVFERYQRNEKALLASMLEMYVSGVSTRKVSKIVEELCGKSVSKSFVSSLTEQLDPMVNEWQNRSLSGTNYPYLMTDVLYIKVREDHRVLSKSCHIAIGITEGGDREIIGFMIQNEESDDTWSIFFEYLKERGLKGTELIISDAHKGLVSAIRKSFTNASWQRCQVHFLRNIFSSIPKKNSKPFREAVKAIFKFTDIELARTAKNALVGEYIDQPKYTKACEILDNGFEDAFQYTVIGNSHNRLKSTNLLERLNQEVRRREKIIRIFPNRTSANRLIGAVLMDLHDEWLSSTRKYIKFDQ |
8 | Streptococcus_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
20235 : 47988
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP020486|20235:47988|DBSCAN-SWA AATGGCTAAAATTGGTTATGCACGTGTCAGTAGCAAAGAACAGAACTTAGATCGGCAATTACAAGCGTTACAGGGCGTTTCTAAGGTCTTTTCAGACAAATTAAGCGGTCAATCGGTCGAACGCCCACAATTACAAGCTATGCTTAACTATATTCGTGAAGGGGATATTGTTATTGTTACTGAATTAGATCGATTAGGACGAAATAATAAAGAATTAACAGAATTGATGAATCAAATTCAAATTAAGGGGGCAACCCTGGAAGTCTTAAATTTACCCTCAATGAATGGTATTGAAGATGAAAATTTAAGGCGTTTGATTAATAGCCTTGTCATTGAATTGTACAAGTATCAAGCAGAATCAGAACGAAAAAAAATTAAGGAACGTCAGGCACAAGGAATCGAAATTGCTAAGAAAAAAGGCAAATTCAAAGGTCGTCAGCATAAATTTAAAGAAAATGATCCACGTTTAAAGCATGCTTTCGATTTGTTTTTGAATGGTTTATCCGATAAAGAAGTTGAAGAACAAACTGGAATCAATCGCCGAACGTTTAGAAGGTATCGAGCAAGATATAACGTGACAGTCGATCAAAGAAAAAACAATGAAAAGAGGGATAGTTAATGAGTACGGTTATTTTAGCTGAAAAACCAAGCCAGGCATTAGCCTACGCAAGTGCTTTAAAACAAAGCACCAAAAAAGACGGTTATTTTGAGATCAAAGACCCACTATTTACAGATGAAACGTTTATCACCTTTGGTTTTGGGCATTTAGTGGAATTAGCAGAACCAGGTCATTATGACGAAAAGTGGCAAAATTGGAAACTTGAATCTTTGCCGATTTTTCCTGATCGATACGATTTTGAAGTTGCAAAAGATAAGGGAAAGCAGTTTAAAATTGTTGCAGAACTTCTCAAAAAGGCAAATACAATTATTGTTGCAACAGATAGCGACAGAGAAGGTGAAAATATCGCCTGGTCGATTATCCATAAAGCAAATGCCTTTTCAAAAGATAAAACATTTAAAAGACTATGGATCAATAGCTTAGAAAAAGATGTAATCCGAAGCGGTTTTCAAAATTTGCAACCTGGAATGAATTACTATCCCTTTTATCAAGAAGCGCAAACACGCCAAATTGCCGATTGGTTGATCGGCATGAACGCAAGCCCTTTGTATACGTTAAATTTACAACAGAAGGGCGTACAAGGTACATTTTCACTAGGACGTGTTCAAACGCCCACCTTATACCTTATTTTTCAGCGCCAGGAAGCCATAGAGAATTTTAAAAAAGAACCTTTTTTCGAGGTGGAAGCTAGTATAAAAGTAAACCAAGGGTCGTTTAAGGGCGTTCTAAGCCCCACACAGCGTTTTAAAACCCAAGAGGAGCTTTTAGCTTTTGTTTCTTCTAAACAAGCTAAAATAGGCAATCAAGAGGGGATAATTGCTGATGTTCAAACCAAAGAGAAGAAAACGAATAGTCCGAGTTTGTTTTCTTTAAGTAGTTTGCAATCAAAAGTCAATCAGCTTTATAAAGCGACAGCGAGCCAAACTTTAAAAGCTATTTCTTTTTTAATAACTTAAAAATAAACTTAATGTAACAGCAAGCACAGTCAAGGTATACACCTTTGACAAAAAATAGCACATTCTCTATCGAAAATTTTTGCTTATTTTTTAAATTATTTTGGGAAATTTTCCCAATCCCTTTTTCTAACTCAAAAAATATAATCACTCAAAATTTAAAAGGGCGCACTTATACATCATTTTAAAAAATTGATGTAACGTGCTAAGTTCAAAACAAAGGGCGCACTTATACACGATTTTCAATCTTGTATATTTCTAACGAAAAGCGTGCGCCAAAAAACCCCCTTCGTCAATTTTGACAGGGGGCTTTTTGATGTAAAAATTTCTATCGAAATTTAAAAATTCGCTTCACTCATGTTATAAAGACTTAAAATAAAATAACTCTTTAAAATCTTTTGCTAGTTGTTCTTCAATATTTTTTATTCGGTGCATCTTCCAAGTAAAGTATAACACACTAGACTTATTTACTACGTTTCATAAGTCATTAATGCGTGTGCTCTGCGAGGCTAGTTTTTGTGCAAGCACAAAAAATGGACTGAATAAATCAGTCCATAAGTTCAAAACCAAATTCAAAATCAAAACCACAAGCAACCAAAAAATGTGGTTGTTATACGTTCATAAATTTTATGATCACTTACGTGTATAAAATTAAATTCACTTTCAAAATCTAAAAACTAAATCCAATCATCTACCCTATGAATTATATCTTGAAATTCATTCATAAATAGTGAAGCATGGTAACCATCACATACAGAATGATGAAGTTGCAGAGCAACTGGTATATAAATTTTATTATTCTCACTATAAAATTTACCTATCGTAATAATAGGCAATAAAAAGCTGCTATTGTTACCAATATTTAAATTAAATGAACTAAAATCAATCCAAGGAATCATTGAAATCGGTATGGTGTTTTCAGGTATCGGTTTTTTAGGAAACATTTCTTCTTTATCTTTATATTCAAGCAAGTCATTTTTATAATTATTATAAAAAGAAATGAAGTTTTTATCAGATTCAGTCCAAATGTTAGTAAATTTTTCAGTTTGCTTATTAAAAACTGTATACAAAGGATTTAACTTATCCCAATAACCTAATTTATTCTCACTATTAATTCCTGTTCTAAACACTTTATTTTTATTTACAACTTCCATAATTGCATAAATTAAAGAGGGATAAATTTCATATCCTTTCTTTTTTATCATATCTTTAAACAAAGTAATATCAATTTCTTTAGTAATGCTATAAGTAGTTTGCTGATTAAAATAGTGTTCAAAATATTCTTTTCTATCCCAATTTTCTAATTCAATAATATTAAAAGTCATATATAACTTCCTCCTAAATTTTAAATTTTTATATTTAGGAGGAATAATCCTCTGATTTTTTCATACGTTATGTCACCTCGTAAATATTAATTATACTGAATTAGCAATTTTTATCAAATAAAACTTATTTTACTTCCAAAACCTAAATTCACGTTGCCAAAAATCAATCTGCTTTTGCAATTGTTTTTCGTTCGCTTTTAAAGTCGATTTCATTAATTCCGTTAAATCAATTGGAGATATTTCTCTAATCAATTTTTTAAATTTAGTCTTAGTATTCTTACTTAGCTTTCCCCACATACTTTCTTCATGCAACAAAGTATAAACCATAGCTTGCTCATTAATTTTTTCTAAAGTAGCCCACGCAGGTTTCAAGATGTGTAAATCATTAAAACAATCATTCCAGTAATCAACCATATCTCTTTTTAATTCAACTTCTACACGCCATAAATGTTCAGACACAACTTCAACATCTGCGTTATCTTTACGTTCTTGTTTTTTATTATAAATTCTAATAAATCTATCACTATCACGGACACCAAAATATTTTGTTTCTGGCTTGCCATTACGACCATAAAAAACAGTTTTCTTAACTGCTTTATCAGTCATTGCATAGTAATCGCTCAAATCATCTTCAAAATCAAAAGCTAAGTCTAATCTTGTAAAACCGTCATCTTCCATGTAGTCGATAATATTTTGTTTTAACCAAATCATTTCTTCATGTGTGAGTTTATTGGGATTAAATTCAACACGCATATTACGTCTATCCCAAGTATCTGCTTTTACTTTGTCATATTCGATATAAACTTTTTCTTGAAGTGCCTTAGCTTTAAACTTTGTTTGAAGTATATCCCAAAGTCGTATTTGTGGCTCTACACTCATAAAGTCAGATAGCTTTTTAGCATTAGTTTTGTTCAAATTTCCAACGATTGTCATGGCATCAAAACTTAATGCGGGTTGAGATTTTCCCAAAGTTTGACCACTTAACCGGCTATTACTTAACCGGCTATTAGAGACGGCCGGTTTTTTTAGTGAGATTTCTGCAGCTAATTTTTCATCAATTTTCTTCATTTTTTATCGCTCCTAAAATAATTTTTGGAACGAAAAAAGGACGAGTGGAATCGCAAAATAAATTTCGCCTGTATCCATTCGTCCATTTTGTTTTGTATTCAAAATCAAAAATTGATATACTAATCATCGAATGAATAACAAGTGTGGTTTGTTATTCCGGGCGAGAACGTTGGTAGCGTTGCTCGTCTTTTTTTATGTCTTTTTTTCGTTAAAACTATTTTAAAACTAAATATATCTTAAAGCAAATAAATTCAAGGGGCTAAAAGCGCCCCTTAAAAACCCCTTGCCTCTGAAAAGTTTTGTGTTTCCTTTCCGTCGGTTTCAAAAGCTAATTTACTCAAAAAAATAGATCAAGGGTAAATGCACTCACTGCGTTCGCCCTTGAGCTATTTTATTTCGCAAATTTTAACGCATTTGCCGACGAAAAGATAAAACACATAAAAATATACGCAGATATATTTAAAACGTCTTAGAACGCAAAATTTTACGTTTAAAAGCTATGCAAGGACTGTATGAAGCAAAATTATTGAGTTATCCAAGAACAGATACACCATTTATTACAGAGAACGAATTTGCTTATTTAAAAGCGAATTTTGGCAAATATAGCGGTTTTTTAGGACTTGATCTTGAAATGGTTCAAACAGAGCCTAGAAAGCGTTATGTGGACGGTAGTAAGGTACAGGAACACCACGCCATTATCCCAACAAAACAAGTACCTACCGAATCTGCATTAGCGAAAATGGACGATTTACAACGAAAAATTTATGCTTTAGTCGTTAAAACGACCGTTGCCATGTTTTTACCTGATTACTTGTATGAAGAAACCAAGATACAAACGAAAGTAGCTGATTTGCTGTTTCAATCGATCGGAAAGACACCAAAGCAAGAAGGGTGGAAAATTCTTTTCAAACAACAAACCAAAGAAGAAAAAGAGGACGTTCAAACGTTACCACTCGTTATCATTGGCGAACGTGCCGAAGTTGGTGTTAAGAGTGTTGAAAAAGAAACGCAACCGCCAAAAGCTTTTACAGAGGG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30 | Streptococcus_phage(70.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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