Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP020488 | Enterococcus faecium strain CFSAN059071 chromosome, complete genome | 1 crisprs | DEDDh,cas2,RT,DinG,cas3,cas14j,csa3 | 0 | 0 | 12 | 0 |
CP020489 | Enterococcus faecium strain CFSAN059071 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | cas14j,RT,DEDDh | 0 | 0 | 3 | 0 |
CP020491 | Enterococcus faecium strain CFSAN059071 plasmid unnamed3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP020490 | Enterococcus faecium strain CFSAN059071 plasmid unnamed2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP020488_1 | 2405034-2405143 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP020488_1
|
1 spacers
spacers of CP020488_1
>1.1|2405060|58|CP020488|CRISPRCasFinder CCTATTCACTTCGTTCATAGTGATTCTACTCGCTTTGCTCGAAAGGAAACTCCTTTCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP020488_1
The CRISPR arrays of CP020488_1 >merge|CP020488|1|2405034-2405143|CRISPRCasFinder CTTTGCTCAACCAGTATTATTCATCACCTATTCACTTCGTTCATAGTGATTCTACTCGCTTTGCTCGAAAGGAAACTCCTTTCGCTTTGCTCAACCAGTATTGTTCATCA >CP020488|1|1|2405034-2405143|CRISPRCasFinder CTTTGCTCAACCAGTATTATTCATCA CCTATTCACTTCGTTCATAGTGATTCTACTCGCTTTGCTCGAAAGGAAACTCCTTTCG CTTTGCTCAACCAGTATTGTTCATCA
>CP020488.1|AWV62342.1|2404457_2404961_-|50S-ribosomal-protein-L10 MSEAIIAKKAAIVDEVSEKFTAAASVVVVDYRGLTVDEVTRLRKQLRDANVEMKVIKNSILSRAAKKAGLEGMDEVFTGPTAVAFSNEDVVAPAKIMDEFAKEAKALEIKGGIIEGKVSSLEEITALAKLPNREGLLSMLLSVLQAPVRNVAYAVKAVADKEDGDAA >CP020488.1|AWV62341.1|2404036_2404405_-|50S-ribosomal-protein-L7/L12 MALNIENIVAELKEATILELNDLVKAIEEEFGVSAAAPVAVAAAGGAAAAEEQTEFTVELTAAGDQKVKVIKAVREATGLGLKEAKAVVDGAPAPVKEGVSKEEAEELKAKLEEVGASVTVK >CP020488.1|AWV62340.1|2403241_2403931_-|TVP38/TMEM64-family-protein MKKKIIRLILISLGIILILVVGYRLYLEYQTDIQLFLNPRASKAELLAHIRSHGTFASILLIVLTAVMCAVPGIPTSVVGVIAGLSFGPLTGAIINILGNALGNITAIFLMHRLKFLDKKTETNHWVQAIRQMKHPKIGVMLGYMIPVIPSSMVNFAADAMKLPLQQIILSIVIGVIPSSVLYACGGEALFHGYNKTAVTLVASVTVLVGLVVFIYKDRKKKQGKQKHK >CP020488.1|AWV62339.1|2401957_2403160_-|MFS-transporter MKSNEKKPLTTSLILLLSITCGVVVANMYYIQPIGTKVAASLSVSTSAVGILTMLTQLGYALGLLFLVPLGDVVDRPKLIIRMAALSAVSLLAAFFAPSFTLFACASFLIGLLSIVPQIIIPYGAVLAGPKARGKVMGTLLSGLLVGILLSRTVSGIVASLFSWRMIYLFALCAVGILTLLLYWKMPRSVQQSSTAVSYLDSLKSLPHLVASQRLLREAAVSGFFMFGTFSIFWSTLIFYISSPAYNWGTFEAGILAIFGLSGAVAAPIVGRLADSYSERKIVYMGLVMQTISFIALLVGGSHLAILLLAIILLDVGNQFGQVANQTRVQGLGEAASNRNNTVFMFMYFIGGAAGSLLGTTMWQQYGWLGVTVSGLVFQGCAFFFQTVVFKGKRNLENKK >CP020488.1|AWV62338.1|2400234_2401767_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSILTLNNITQQFGDKILYEGVDLQLNAGEHLGLIGQNGAGKSTLIKIITGEILPDDGQIHWQKNIHKGYLDQYVEVDETLTIEEFLKTAYAKEYEKEEKIAFLYQTYSETFDDSLLEKAGKLQTELDQGVFYQIDTLVAEMSSGLGIDVLGLDSLLKNLSGGQRSKVILAKLLLENPDVLILDEPTNHLDDQHIQWLTQFLQDFDGAYIVISHDQEFLDQITTHIADIEFGKITKYTGHLKQALKQKEQNRESYLRQYHAQQKQIEKTEAYIRKYKAGSRSTMAKSRQKQLDKIERLTPPASASKAVFDFPFSPIVTTLAVETTDLVIGYDRPLLAPINLTIRFGENIAIRGFNGIGKSTLLKTLIGEIEKISGDFHFPDNTKINYFSQDLYWENPLETPLQYLSSQFPKATIKELRRQLAKAGLVNQLASEPLTTLSGGEQTKVKLAQLTMNQGNLLILDEPTNHIDQETKESLQDGIQKFPGTVIIVSHEQEFYQDLVQRVIEIEPK >CP020488.1|AWV62337.1|2399299_2400001_-|glucosamine-6-phosphate-deaminase MEIIRVKNAEEGGKKAFEIIKEGMNKGAKVLGLATGSTPVTLYKEMTSSDLDFSEMTSVNLDEYVGLGGSDEQSYRHFMDVQLFDKKPFKETFVPDGKAEDLEAACKKYDQIIDAHPIDIQILGIGQNGHIGFNEPGASFDGTTSVVDLTESTINANKRFFDKAEDVPTKAVSMGIGSIMKSKEIVLMAFGESKADAIKGMIEGPVTNHLPASVLQNHDNVVVIIDEEAASKL >CP020488.1|AWV62336.1|2398332_2399046_-|MgtC/SapB-family-protein MNDMVLTIPEIILRLGIAMLFGGAIGFERQYKNRPAGMRTHILVCMGACIIALIQVEIASGALRDALEYPQLAGTIRSDEARLIAQVVSGVGFLGAGTIIVTKQSVTGLTTAASLWAIAGLGIAIGMGYYSIAIISFIGIAIALTVVKRVIHVPTTKKLEIQFIHRKETKDFLTDYFEEKNIVIEDVNFDVKFVDDYRVYKNIYTIDLPKGLTYADVIEELSVHKNITKLHLVSIAQ >CP020488.1|AWV62335.1|2396884_2398024_-|AI-2E-family-transporter MQSRFKQSKLFFWTVELVLTIIGVYFILQMPNIFSPILKMLSAVFLPLLVAGFIYYMFDPIVVFLEKHRIPRVFGFLLTFLVVIILVVLTVMNVVPQLMEQTIQLTQSLPMYADETSKWLNELAQREEFKNFNLEEQLASANLSLSNLFNIILVSLSASVSKIISFMMQFFILLFTVPFILLFMFKDGHKFIDALSHFFPKAIRKELRQTVKELNETLSAYISSTILDALIIGVMSFLAMRIFDQPYSLLLAVICGITNIIPYVGPFIGAVPAIIVGLFISPFQALYMALSILVIQQLDGNLIKPLLFGKSMNIHPLTIILVLIGAGSVAGILGMLICIPVYAVIKTIILNIRKIYLLRRMEHVSEKLDSPKVLEETSE >CP020488.1|AWV62334.1|2395830_2396796_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-beta MSETYYEAINWNEIEDIIDKSTWEKLTEQFWLDTRIPLSNDLDDWRTLSQLEKDTVGHVFGGLTLLDTVQSESGMDQLRKDVRTPHEEAVLNNIQFMESVHAKSYSSIFSTLNTKKEIEEIFDWTNTNPYLQKKAERINEIYKHGTPLEKKIASVFLETFLFYSGFYTPLYYLGNNKLANVAEIIKLIIRDESVHGTYIGYKFQLGFNELPEAEQETLKDWMYNLLYELYENEERYTEELYDPIGWTEEVKTFLRYNANKALMNLGMDPLFPDTANDVNPIVMNGISTGTSNHDFFSQVGNGYLLGHVEAMKDDDYLIGLE >CP020488.1|AWV62333.1|2393621_2395781_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-alpha MSLKNLQDVSYFKLNNEINRPVNGQIPLNKDKEALVAFFEENVKPNTMTFLSIMEKINYLIDQEYIEAEFIQLYSPSFIEKLYQFLDEQHFSFKSFMAAYKFYSQYALKTNDGSAYLETYEDRVAFNALYFANGDEELALALADEMIHQRYQPATPSFLNAGRKRRGELVSCFLTQVTDDMNSIGRSINSALQLSRIGGGVGITLSNLREAGAPIKGYEGAASGVVPVMKLFEDSFSYSNQLGQRQGAGVVYLNVFHPDIIAFLSAKKENADEKIRVKTLSLGVIVPDKFYELTRKNEDMYLFSPYSVEKEYGVPFSYVNITAEYDHLVANPNIRKQKIKARDLENEISKLQQESGYPYVINIDTANRENPIDGKIIMSNLCSEILQVQTPSVINGKQEYEVLGTDISCNLGSTNIVNLMQSPNFGQSVRTMTRALTFITDASDIDVVPPIQNGNKLNHTIGLGAMGLHTYLAKEQMEYGSEDSLDFTNIYFMLLNYWTLVESNNIARERKQVFHNFEKSAYADGTYFEKYVTGEFQPKSEKVKALFEGIFIPTAEDWNALKQAVMKDGLYHQNRLAVAPNGSISYINDTSASIHPITRMIEERQEKKIGKIYYPAPYLSNETIPYYTSAYDMDMRKVIDVYAMAQQHVDQGMSLTLFMRSEIPEGIYEWKTTTKQTTRDLNILRHYAFHKGIKSIYYVRTFTDDAEEIGSNQCESCVI >CP020488.1|AWV62343.1|2405370_2406060_-|50S-ribosomal-protein-L1 MAKKSKKMQDALKKVDSSKVYPVAEAVALAKETNIAKFDATVEVAYRLNVDPKKADQQIRGAVVLPNGTGKTQTVLVFAKGDKAKEAEAAGADFVGDDDMVQKIQNGWFDFDVVVATPDMMATVGRLGRVLGPKGLMPNPKTGTVTMDVTKAVNEVKAGKVTYRVDKAGNIHVPIGKVSFDDEKLVENFAAIHDVLLKAKPSAAKGQYMKNVTITTTFGPGIHVDQASF >CP020488.1|AWV62344.1|2406163_2406586_-|50S-ribosomal-protein-L11 MAKKVEKIVKLQIPAGKATPAPPVGPALGQAGINIMGFTKEFNARTADQAGLIIPVVISVYEDRSFTFVTKTPPAAVLLKKAAKIEKGSGEPNKNKVAKVSSDQVREIAELKMEDLNAANVEAAMRMVEGTARSMGITVE >CP020488.1|AWV62345.1|2406928_2407597_+|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-beta MKDLRYRSVFDIIGPVMIGPSSSHTAGAARIGKIIRSIFGEQPDSVDIYLYESFAKTYRGHGTDIALVGGLLGMEPDDERLADSLKLAYEAGMEVLFVPKSEKAEHPNSVKMLLKKGTRKLSVTGISIGGGNIQISELNGFKISLSMGTPTLIVVHQDVPGMIAKVTSILSETNTNIGTMTVTRESKGENAIMIIEVDDPQVEETVKRLKQLPNIDSVNYFD >CP020488.1|AWV62346.1|2407609_2408482_+|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-alpha MFLSIEELVDQAKAYPSVAELMIAVEMEMSGRSRSHIIEIMEKNLSVMEQSINEGKEGVTSVTGITGGDAKKLDDYLNEADFLSGETILKAVRNAVAVNEVNAKMGLICATPTAGSAGVVPGVLMAVRDRLDLTHEQQLEFLFTAGAFGLVIANNASISGAEGGCQAEVGSASAMAAAALVCAKNGTPHQAAQAVAITLKNMMGLICDPVAGLVEVPCVKRNALGSSQAFISADMALAGIESVIPPDEVVAAMYQVGRQMPSIFKETAEGGLAVTPTAKRLAEEILNKRA >CP020488.1|AWV62347.1|2408572_2409592_-|lactate-oxidase MEAGAFGYIRGGSEDEWTMKENTTSFNTKKIMPRILRGIDSADLHTSVFGIELDTPIIQAPSAAQGLAHEKGEADTAKGVAAAGSIFSISTYANTTIKDAADAAPGAPQFFQLYMSKDDRFNEFILNKAVEAGAKAIILTADSTLGGYREEDVINQFQFPLPMPNLAAYSEQSASGNGEGKGIAEIYAAAKQGLTPDDIKTIKEITHLPVIVKGIQSPEDAVIAISAGADGIWVSNHGGRQLDGGPASFEVLPKIAEVVNKRVPVIFDSGVRRGEHVFKALASGADLVAIGRPVIYGLNLGGAEGVTSVFEHLNKELSITMQLAGTKTIDEVKYTKLMD >CP020488.1|AWV62348.1|2409764_2410652_-|alpha/beta-fold-hydrolase MTEPIKNLCKRATAAALVLISLFALSGCQTTKINTTEVSDKEKTAESSKVIEKTTIPTLFFHGYSGTENSFKGMLRRLEKNQQAVKELVLTVGTDGQIQATGDLSGKADNPMVQVLFEDNKNNEWNQAEWIKTCLLYLKENYGIDKVNIVGHSMGGVSALRYLGTYGQDTSLPQVQTLTAIGAPFNDFVDDSAQSLTDELAKGPAVVSNRYQDYQQMIGNIPITTRFFLIAGQLDETDLSDGTVPLNSALAVYALLKQRGNEIEEKVVTGENASHSMLHENQEVDQLVSRFIWKE >CP020488.1|AWV62349.1|2410728_2411274_-|transcription-termination/antitermination-protein-NusG MESFEKNWYVLHTYSGYENKVKANIESRAQSMKMADFIFRVVVPEEKETEVKNGKEKEIVHKTFPGYVLVEMIMTDASWYVVRNTPGVTGFVGSHGAGSKPAPLLPEEVNHILRSIGMSLRQNDLEVEVGEVVKIIEGAFAGLEGQVTEVDGEKEKLKVNIDMFGRETSTELDFDQVDKID >CP020488.1|AWV62350.1|2411374_2411545_-|preprotein-translocase-subunit-SecE MKFLKSVKDEIKQVTWPSRKQLRKDTLVVIETSIIFGLMFYVMDTAIQSLFGWILK >CP020488.1|AWV62351.1|2411568_2411721_-|50S-ribosomal-protein-L33 MAKKKAALACSVCGSRNYTKSVSEGKSGERLEINKFCKYCNQYTLHKETK >CP020488.1|AWV62352.1|2411882_2412527_+|CBS-domain-containing-protein MLLKTLVYKKKDLTTVTETSTLEEALKILETSGYRCVPILDSSGNIFRGNIYKMHIYRHKANGGDMTLPVTHLLKNATKFIYLDTSFFKVFFTIKELPYIAVLDSENHFYGILTHSTLLNMLSQSWSVEQGSYVLTIASTGKQGDLAAIAKIISKHSSIASCITLDIEKDEYIRRTLITLPANTEAKVCETIVNHLEKKNYKVVEIENLQNQEA |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
518277 : 585240
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP020488|518277:585240|DBSCAN-SWA CATGACAGACAACAGCAAAACACGCGTTGTCGTAGGGATGAGCGGCGGTGTCGACTCATCTGTAACAGCACTTTTGTTAAAGGAACAAGGATACGACGTGATCGGAATATTCATGAAAAATTGGGATGACACGGACGAAAACGGTGTATGCACGGCCACGGAAGATTATAAGGATGTAGCGAAAGTAGCTGCTCAAATCGGGATTCCTTATTACTCTGTGAATTTTGAAAAAGAATATTGGGATCGTGTATTTGAATATTTCCTAGCCGAATACCGCGCAGGACGTACACCTAACCCAGACGTGATGTGCAACAAAGAAATCAAATTCAAAGCATTCTTGGATTATGCAATGGATCTTGGCGCCGATTATGTAGCTACTGGACATTATGCGCAAGTCACTCGCGATGAAAACGGCGTGGTCCACATGCTTCGTGGAGTAGACAATAATAAAGATCAAACTTACTTCCTTAGCCAATTATCACAAGAACAGCTTTCAAAAACGATGTTCCCTCTAGGCGGCATGGAAAAATCAGAAGTACGGGCAATTGCTGAACGCGCAGGCCTTGCGACTGCTAAGAAAAAAGATTCAACGGGAATCTGCTTTATTGGTGAAAAGAACTTCAAACAATTTTTGAGCAACTATCTGCCAGCAAAAAAAGGAAATATGGTCACTCTTGATGGTGAAGTCAAAGGACAACATGCTGGCTTGATGTATTATACGATTGGTCAACGTCAAGGACTAGGGATCGGTGGCGGAGGAGATTCGCAAGAACCCTGGTTTGTTGTAGGAAAAGATCTAGCGACAAACACATTATATGTGGGGCAAGGGTTCCATCATCCTGCATTGTATGCCACAAGCTTGGATGCAAGTGAAATCCACTTTACGACGAATGAACCAATGCCAAAAGAATTCAAGTGTACAGCGAAATTCCGTTATCGTCAGCAAGACGTTCCTGTGACAGTTCGCTTATTGGATGATAATCGTGCAGAAGTCGTATTCGACGAACCTGTACGTGCAATCACTCCTGGACAAGCAGTTGTATTTTATGATGGAATGGAATGTCTGGGTGGTGGTTTGATCGACCACGCATATCAAGAAACAAAAGTTTTACAATACGTTTAAGCGATATTAAATGAATCAAAACAGCTATGGCTAACAAAAGAAACACCTTTTCTTTTGGATAGCATAGCTGTTTTTTTGCAATAAAATTAATTTTTATTCATTTTATACTTGAAATACTTGTGTAAAAAGTTCATAATATCCAATAATATGAATAAAGTTGCTTTTTGTTAAGCAAGAGCAGTTGCAAAATAGAAGGGAATCTTTTGCAAGTGATTTGTTCAATTTTATAAGTGAGGGTGATGGAAATGGAAAAGAAATCGACGGGTATTAGCAAATGGGGACTGGTTGCTCTGGTTGTCAGTTCGTCAATCGGAAGCGGTGTGTTTGGGATCACAAGTGATCTGGCTAGTTCTGCAGCTCCAGGGCCAGCGATCCTTTCATGGATAATCGTTGGGATTGGTATTTTAGCTTTGGTATTATCGCTGAATCATTTAGGAGAAAAGCGTCCAGATCTAGATGGTGGTATTTTCGGTTACGCGGAAGCTTCATTTGGTAAATTAGGTGGCTTCATCAGTGGTTGGGGTTACTGGTTGTCTGCGTGGCTGGGAAATGTTGCTTTTGCAACGATGCTGATGAGCGCCATGGGAGAATTTTTCCCGATATTCAAAGGTGGACAAAATGTTCCTTCTATTTTATTTGCAAGTATTTTTATTTGGGGTCTGACTTTATTAGTAAACAATGGAGTTGAAGGAGCGAGCGTCATCAATACAATCGTGACGATCTGTAAATTAGTGCCATTATTCCTATTTTTAATATTTGTATTTATCGCATTTAAAGTGAATATATTCACTGCTGATTTTTGGGGTAACGTATCTGATAATCTAGTGAATGGAACAGGGCAGCAAGGAACGATCTGGTTGCAGATTAAAGGTTGTTTGATGGTTATGATGTGGGTCTTTGTAGGGATCGAAGGCGCAAGTGTTTTAGCCAACCGCGCGAAGAAACGTTCAGAAGCCCAGCAAGCATCGATCATTGGTCTGCTTTGTTTATTGTTTATCTATATCCTTGCTTCGATCTTGCCATACGGCGTCTTATCTCAAGAAGAGTTAGCAACTATTTCACAACCTGCTATGGCAAATATTTTAAAAGGAATCGTGGGAAATTGGGGAGCAGCGCTGATCAATATCGGCTTGATTATTTCGATCATTGGTTCTTGGTTGTCTTGGACGATGCTCCCAGCAGAAACAACGATGTTGATGGCTCGAGACGGTCTGTTGCCGAAAGGTTGGGGAAAAACGAATAAAAAAAATGCCCCAACTTATTCGTTAGTTGTTACTGCAATCTTGACTAATCTATTCTTATTGACTTTCTTAGTTACTGATTATGCCTATCAATTTGCCTATTCTTTATGTACAGCGGCAATTTTGATTTGTTATCTACTTGTCGGGATCTATCAAGTCCAGTTTTCTTTAAAAGAAGGAATCAAAAAACAAGTAGTGATCGGTGGGATTGCTGTAGTTTTTGAATTGATGGGCATCATTTTAGCAGGATTTTCTTATGTCCTTTTATGTAGTATTGCCTATCTTCCTGGTTTTTGCTTCTACTGGATCGCTTGTCGTGAAACCAAACATCAAATTACGGGAAAAGAAAAAGTAATGATTGGGCTGATTTGTGTGGCCGCACTGCTTTCAATCGGGTTGCTTGCTGTAGGCTGGATCAAGATATAAGGGGGAAAGAAACATGAAAATCGCAAATTTCGGTGTAGAAGAATGGCTAAATAAATGGGAAAAGAAAGCGGTATATGATATTGCACAAAGCTCGATCGAAGCATTGACATTAGACGAACTCGTTGGCTTAGATGGGACTAGCGTAAGTAAATTTTTCGAAAAACGCAAAAACGAACCATTGGACTATGGCTGGATCGAAGGATCAGATGTTTTCAAACAAGAAGTCGCTTCTCTTTATCAAACCGTCGATCCGGAAAACATCTTACAAACGAATGGAGCGACTGGTGCTAATCTTTTAGCTCTATACGCGTTAGTGGAAGCAGGAGACCATGTTGTTTCGATGCTTCCTACTTATCAGCAATTATATGACATCCCCAAATCTTTAGGTGCCGCTGTTGACTTTGTTCATTTGAAGGAAGAAGAAGATTGGCAGTTTGATTTAGAACAGCTAGAAGCCTTAGTCAAACCTGAAACAAAAATCATCTGTTTGAATAGTGCAAACAATCCTACAGGCACATTGCTAGATCGGAAAACTTTAGAAAAAATCGCAGAAATTGCTCGTACAGTAGATGCATATGTATTGATAGATGAAGTATATGCGCCTTTAACGGATAAAGGTGAATTCTTGTCGATCGTAGATGTCTATGAAAAAGGTATAGCAACCAATTCCCTATCCAAAACCTACTCCATTCCAGGTATTCGTATTGGCTGGACAGCTACTGGACCTGAGTTGGCAGAAGTTTTTCGAAAGTATCGAGACTACACGATGATTTGCGGCGGAGTCCTGTCAGATGATCTTGCTGTACATGCATTGAAGAATAAAGAAAAAATATTGGCGCGAAACAAAAAGATCATTACAGAGAACCTTGTGATTTTAAAACAATGGGTAGCCAATGAACCGAAAGTTGAACTTGTCGCTCCCAATTACGTCTCTACTTCTTTCATTAAATTAGCCATCGAAGAAGATGACCAGACATTTTGTATCAATTTATTAGAAGAAACAGGAGTACTATTAGTACCAGGAAGTGCCTTTGATTTACCGAAGCATGCCCGACTAGGTTACTGTTGTAAAAAAGAAACCTTGGAAAAGGGATTATTCCTCTTATCTGAGTTCTTGAAAAAACAGGCCTAAACAAAAACACTGCAAGGACAGTCTGTGACAACTGTTCAAGCAGTGTTTTTCATTTACGCTTATTGTCTATGAGAAGGAGAGTGCCCTGAAGCTATGGAGACTCCTGAAGCTTTTTCTTCTGCAGTTTCTTGCTGATGGATCTCTTGTGTATTGTGTCGTACAAGCAAGAAGTTGACCAAAACAAGAAGAGAAGTCGAAAGAAAGACGCCGCGATAACCAAATGCACTGGAAACACTGGAGCCGATCATAGGCCCTACTACGTTACCAGTTGCTTGGAAAGATTGGTTATAACTGAAGATCCGTCCAGCAGCTTGATGAGGCGAATATTTTGTGATCAATGCTTGGACAGCAGGGAGCAGACAAGCATCAGAGATACCAATCAAAAAACGTAAGGCAGCTAATTGCCAAACATTCGTGACGAATGCCATTGGGATATAAACCAGAATCGCAAAACCCAAACCAATCGCAAGTATTCTTTCACTCCCAATCTTGTCACCTAAGCGACCAAATCTTGGAGCGGCTATCAAAGTGGCAATCCCAGGTATCGAAGCAATGATTCCGCTGATCAACGTAACATTCCCATGTCCATGCAGCAATTGGCGAATGTACAGACTGATGATTGGACTAATGGAATTGTTGGATGCTTGGATGATCATCGTTGTGACGAACATACCGATGACGACGTGTGGATATTTCAAGTCTTTGAAAATCTGTTTGGCAGAAACCATGTTTTCTTTTTTCACTGGGACAAATTTTTCATGGACGAAAAACAGACTCAACAAGAAGACGAAAAATAAGATGATCCCTGTAATGAAAAAGGTAGGGCGATAGCCAAACGCTGAAGCAGAGATCCCGCCAAGAAGCGGTCCAAGTAATGTTCCTGTAACAGAACCAGTTGCTAAGGTTCCAAGAACTTGACCACTTTTTTCTTTTGGCGTCCCAGTTGCGACAAGGGCAGTGGCATTACTGATATAACCAGAAAAAATCCCTTGAAGCAGACGCAATGCGACTAATTGATACACACTAGTCACGCAACCCATCAAAGAAATGACGATTGCCATTCCTAATGAAGCACGCA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58 | Streptococcus_phage(15.38%) | transposase,protease,tRNA,integrase | attL 513830:513849|attR 592089:592108 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
727719 : 736191
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020488|727719:736191|DBSCAN-SWA TGTGAACGGACTATTTATTACAATCGAGGGGCCTGATGGTGCAGGAAAAACCAGCATCTTGAATGAACTTTACCCTCTTTTGAAAGAAGTAGCAAAAACAGAAATCATTCAAACAAGAGAACCAGGAGGCATTCCGATTGCTGAAGAGATCCGAGCAGTGATCCTTGATCCAAAAAATGATCGGATGGATGAACGTACGGAAGCACTGCTTTATGCAGCAGCAAGAAGACAACATCTAGTCGAAAAGGTTCTGCCTGCTCTGGCAAAAGGGAAAATCGTTTTATGCGATAGATTTGTCGACAGTTCTCTTGCTTATCAAGGTGCAGGCCGACGCATCGGCGTTACCGAGATTGCTCGGTTGAATGAGTTTGCTACAGAAGGTACTACGCCGGATTTTACCCTTTATCTTGACGTAGATTCAGACACCGGATTAAGAAGAATCAAGAAAAACAGACAAAATCAAATCGACCGTTTAGATTCGGAAGGTTTGGAATTCCACCAGCGTGTACGTCATGCTTACTTAAAGCTGGCAGAAGAGAATCCGGAAAGAATCCACAAAGTTGATGCAAGAAAAAGCTTTGAAGAAGTGCTGCAAACAAGTTATCATACAATTATTGAACAGTATCCGCAATTTTTTGAAAACTAGGAAGGTGAACGTTTATGAAAATTATTTTAGCGATTATCCAAGACAAAGACAGCAACCGTTTATCAAATGAATTGATTGATGCAAATATCCGTGCCACAAAACTATCATCGACAGGCGGCTTCCTTAAGGCTGGAAACAGTACGTTTATCGTGGGTATTGAAGATGACCGTGTAGAAGAAGCATTGGAAATCATCAAAAAAACGTGTGAATCAAGAAAGCAATTTGTATCTACACCTGTTACACTGGATATTTCGATGGATGGGGGCGTCCCTTATCCAGTAGAAGTAGAAGTAGGCGGTGCCACAGTCTTCGTCTTACCTGTTGAAGGATTCCATCAATTTTAGGAGGAGCTGAGCTATGAATCAAGAAATAAACTTGGCTCAAATGCAACCGATCGTGTATCAGCAGCTTCAACGGAGTTTTGAGCATGGGCGTATCGCTCATGCTTATCTTTTTGAAGGGGAGAAAGGAACAGGAAAACATGAAGTAGGTATATGGCTTGCACAGCACCTGTTCTGTACCCAAATGAAAGACAATCTGCCTTGTGGAAAATGCAACAATTGTCAGCGGATCGAAAAGAAAGAACATCCAGATGTTTTGGTTATTGAACCGGAAGGACAAACCATCAAAGTCGATCAGATCAGACGTTTGCAGACGGAATTCAGTCGCAGCGGTTACGAATCAAGAAAAAAAGTTTTTTTGATCAAAGAAGCTGAAAAAATGAATAGCAGTGCGGCAAACAGTTTGTTGAAATTCTTGGAAGAGCCCCCTGGAGATTTTTTAGCGGTGTTAGAAACAGATGCAGTAGGAAGAATTCTCCCTACTATTCAATCTCGTTGTCAAGTTCTGCATTTTCAAGAACTTTCGAAAGAAGCACTGATCCATCGATTGCAAGAAGAGCAGATTCCATTGGAAAAAGCAAAACTTTTGGCTTTCTTAACAAACAGTTTAGGAAAAGCAGTTGAAATCTCTCAAGATGAATGGTTTAATGATGCTAAGGACTTGATTTATCAATGGTTCGTTTACTTGCAAAAGCAAGATACTCAAGCCTTTATCTATGTCCAAAAAAAATTGGTAAAATCATTTAAAGAAAAAACACAACAGTTTACAGGATTATCTGTCTTGATGTTTTATTATCAGGAAGCACAGCGTCAAGCAGTAGCAAACGGCGAATATGGCAAAGTGAAACAGATAAACCAGATAATTGAACGGATATTGATCGCAGAGCAGAAACTACGCAGCAATGTCAGTTTTCAGGCTGTTGCGGAACAGTTCGTTTTGCATACGATTTTTTAGCTTGCCGCAAAGGATGATGATCAAGGAGGATGGAAATGGTAGAAGTAGTAGGTGTCCGATATAGAGATGCAGGTCATATCTATTATTTTGCACCAGGAGACTCTGAATATGTTTATAGTGACAAGGTATTAGTCGAATCTCAGCAATCCTTACATATTGCTACTGTTGTCCTTCCTAAAAAAGAGATTGATCCCAATGACCTTCCTGAAGCTATCCGTCCGATCTTGCATAAAGCGTCACAAGCTGAATTAGAAAAAGACAAAAAAAACAAAAAAGATGCTTATGATGCATTGAAAATCGCAAAAGAAAAAGTGCAGTTGCGTGAGTTGGAAATGAAAATGGTCAAAGCCGAATACACATTTGATCGAAATAAATTGATTTTTTCTTTCACAGCGGACGGGCGAATTGACTTTAGAGAATTGGTAAAAGATCTGGCCGCTGTATTTCGTACTCGTATTGAGCTTCGACAAATTGGTGTCCGCGATGAAGCAAAGATAATAGGCGGAATTGGTCCATGTGGGCGTCCATTATGCTGTTCTTCTTTTTTAGGCGATTTCGTGCCTGTATCAATCAAAATGGCAAAAGATCAAAGTTTATCTTTGAATCCAACAAAAATTTCCGGTTTATGCGGACGCTTGATGTGCTGTCTGCAATATGAGAGCGAAGAATACGAGACAGCGAAAAAAGAACTCCCTGACTTTGGAAAAGTAATTGCTACACCTGATGGTAAAGGGAAAGTCGTAGGGTTGAATCTGCTTAGCCGTATCGTTAGTATTCGGCTGACTGGACGGGAAAATCCTGTCGAATATGAATGGGATGAATTGAAAGAATTTATCCAAGTAGGTGAGATGAATGGATAAGAGATCATTATACGACGGATTGAATCAATTAGAATCAGAGTTGAGAAATACATTAACAGAACTTGTTGAAATGAAGCATGCTTTGCATGAGATCGTAGAAAAAAATACAACTTTGGAGATGGAAAATCAACGTCTGCGGGAACACCTGCGGGAATTGAACCAAGTTGCACAAGCTCCAGCTGAAAATGTGAAGCAGGAACTTTCTAAGTCTCGTATGAATCTTGAAAAAATTTATGAAGAAGGATTCCATGTCTGCTACGATTTATATGGATCAAGAAGGGACAATGACGAGCCTTGTGCGTTTTGTCTAGAAGTGATCTATCGCGAAAGCGGTCGATGACCAATAACAAGAGGAGACTGGAGCGGAGAAATACTGCTCCAGTCTTTTTATTAAGGAGATTGTGACAGATGTATAATCAAAAAAGTTTCAAGGGAAATCCGGTATATGGGGATTTATATCTTGTACCGACGCCAATTGGAAATTTAGAAGATATGAGCTACAGAAGTGTTCGTATGCTGCAAGAATCCGATCTTATCGCAAGTGAGGATACGCGTAATACACAAAAGTTATTGAATCATTTTGAAATCCATACACCCCAAAAAAGTTTACATGAACATAATTATAAAGAACGTGTCCCTCAATTGATTGCTTTGTTAAAAGAAGGAAAAACGATTGCTCAAGTCAGTGACGCAGGAATGCCTTCCATCAGCGATCCTGGACATGAGCTAGTTTTAGCCTGCATAAAAGAAGGGATTTCTGTGATCTCTATCCCAGGACCTACAGCTGGGATGACGGCTTTGATTGCTTCAGGGCTAGTGCCTCAACCATTTTTATTTTATGGCTTCCTTCCACGTAAGAAAAAAGAACAGAAAGAAACATTGAAAAAGCTAAAAGAACAGACAGTTACGCTGATTTTTTATGAGTCACCTTATCGGATCACTGCTACATTGACGAATTTCTTAGAAATTTTTGGAAATCGCCAAGTCGTTTTGTGTCGGGAATTGACAAAGGTCCATGAAGAATACCTTAGAGGAAGTACGGAAGAGCTACTCGCTTATATCGAAGAACATCCAGTAAAGGGTGAATGTTGTCTGCTTGTAGAAGGGAATTTGTTCGAAATGCCAGTGACGGAAGTTGATGAAGAGTTGGGAACGTTAAAGGAACAAGTAGAAGCAAAGATCGCTTCAGGCGAAAAACCAAATGCTGCTATCAAAGCAGTAGCGCTGAAAAATGGGCTGAAAAAACAAGAAGTCTACCGTCAGTACCATGAATTAGACTGAGATAGTATAAGTTGTCTATAATGAAAGACTAATGAGGAAATCAGCTACTAACTTTTCAAATCTCTTGAACGCGAACGAATGTTCTTGTATAATGAATAAGAGGTGAGGATGATGGAGCTGCAATTTCCTTTACATAATGATACATCAAGAAAAATCATTCATATTGATATGGATGCTTTTTTCGCTTCGGTTGAAGAACGAGATCATCCTGAGTTTCGCGGACATCCATTAGTAATTGCCAGACACCCCAGTGACACTGGTGGGCGTGGAGTAGTGACTACAGCAAATTATGAAGCAAGAAAATTCGGAATTCATTCAGCAATGAGTGCACAAAAAGCGTATGAGCTTTGTCCGCAAGCCATCTTTAAGCCTGGCGACCATCATAAATACAGCGATATTTCCAAACAAGTACGGGAAGTATTCTATCGTTATACAGATATTGTGGAACCAGTTAGTATCGATGAAGCGTATCTTGATGTGACCGAAAATAAAATCAATTGCAAGTCAGCCATCAAAATCGCCCGAATGATCCAAGCAGATATTTGGGAGAGTGTCCAGCTAACATGTTCTGCGGGAGTAAGTTACAATAAGTTTTTGGCCAAATTAGCATCAGACTATCAAAAACCTAGAGGAATCACGGTAGTTGCCCCTCAAGACGCTGTGCCATTTTTAAAAGCTTTGCCAATTGAAAAATTTCATGGGGTAGGGAAGAAAACTGTACCTAGAATGCATGAGCTAGGGATTTATACAGGAAAAGACCTATATGAATGCACAGAAATGATGTTGATTCGAAATTTTGGAAAAATGGGCTATTCTCTTTATCGTAAAGTCAGAGGAATCCATGATTCTCCAGTAAACGTTACAAGAGAGCGAAAATCTGTGGGAAAAGAGCATACTTATGGGCAGCCGTTGCAAAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020488|727719:736191|729695_730520_+|AWV60762.1|DBSCAN-SWA MVEVVGVRYRDAGHIYYFAPGDSEYVYSDKVLVESQQSLHIATVVLPKKEIDPNDLPEAIRPILHKASQAELEKDKKNKKDAYDALKIAKEKVQLRELEMKMVKAEYTFDRNKLIFSFTADGRIDFRELVKDLAAVFRTRIELRQIGVRDEAKIIGGIGPCGRPLCCSSFLGDFVPVSIKMAKDQSLSLNPTKISGLCGRLMCCLQYESEEYETAKKELPDFGKVIATPDGKGKVVGLNLLSRIVSIRLTGRENPVEYEWDELKEFIQVGEMNG >CP020488|727719:736191|733084_733687_-|AWV60766.1|DBSCAN-SWA MRNPKPKEWLAKDYSQNYIADYKPFNFVDGEGVRNSLYVSGCLFACEGCFNKAAQNFRYGKPFTPELEEQIIADLRNDYVQGLTLLGGEPFLNTDVCLQVVRRIRKEFGTTKDIWSWTGYTFDELLQDSEDKLELLSQIDILVDGRFELSKRDLKLQFRGSSNQRIIDVQKSLESNQVVIWEKCTDATETYEQIKKQDLI >CP020488|727719:736191|728721_729660_+|AWV60761.1|DBSCAN-SWA MNQEINLAQMQPIVYQQLQRSFEHGRIAHAYLFEGEKGTGKHEVGIWLAQHLFCTQMKDNLPCGKCNNCQRIEKKEHPDVLVIEPEGQTIKVDQIRRLQTEFSRSGYESRKKVFLIKEAEKMNSSAANSLLKFLEEPPGDFLAVLETDAVGRILPTIQSRCQVLHFQELSKEALIHRLQEEQIPLEKAKLLAFLTNSLGKAVEISQDEWFNDAKDLIYQWFVYLQKQDTQAFIYVQKKLVKSFKEKTQQFTGLSVLMFYYQEAQRQAVANGEYGKVKQINQIIERILIAEQKLRSNVSFQAVAEQFVLHTIF >CP020488|727719:736191|727719_728364_+|AWV60759.1|DBSCAN-SWA MNGLFITIEGPDGAGKTSILNELYPLLKEVAKTEIIQTREPGGIPIAEEIRAVILDPKNDRMDERTEALLYAAARRQHLVEKVLPALAKGKIVLCDRFVDSSLAYQGAGRRIGVTEIARLNEFATEGTTPDFTLYLDVDSDTGLRRIKKNRQNQIDRLDSEGLEFHQRVRHAYLKLAEENPERIHKVDARKSFEEVLQTSYHTIIEQYPQFFEN >CP020488|727719:736191|734001_736191_-|AWV60767.1|DBSCAN-SWA MKVNYEEKTVVTQQPETSQMKVIKRDGRHVDFDEQKINEALIKAEKKIHGSLSPLTYEKIQMIADLVVQEIKSRFAENVKIYEIQNIVEHILLEKNEYELAEEYINYRTKRDFARSKATDINFSIEKLINKDQTVVNENANKDSNVFNTQRDLTAGIVGKSIGLKMLPPHIANAHQKGDIHYHDLDYHPYTPMTNCCLIDFKGMLNNGFKIGNAEVESPKSIQTATAQISQIIANVASSQYGGCSADRTDELLAPFAELNYKKHLKDAEEWIDSPERQKEYAKAKTKKDIFDAMQSLEYEINTLFTSNGQTPFTSLGFGLGENWFEREIQKAILQIRINGLGSEKRTAIFPKLIFTLKKGVNLNPEDPNYDIKQLALECATKRMYPDILNYDKIVELTGSFKVPMGCRSFLQGWKDENGQEVNVGRMNLGVVTLNLPRIAIESKGDQNKFWQLLSDRLEIMKDALLYRVERCKEAIPANAPILYMYGAFGKRLSRTDSVNELFKNRRATVSLGYIGLYEVASAFFGGEWETNPEAKAFTLDIVKELKANADAWGDEYGYHFSVYSTPSESLTDRFCRLDTEKFGIIENITDKEYYTNSFHYDVRKNPTPFEKLEFEKDYPKYCSGGFIHYCEYPMLQQNPKALEAVWDFAYDKIGYLGTNTPIDHCYQCGFEGDFKPTERGFECPECGNHDPKTCDVVKRTCGYLGNPQARPMVHGRHKEISSRVKHMK >CP020488|727719:736191|731909_733031_+|AWV60765.1|DBSCAN-SWA MMELQFPLHNDTSRKIIHIDMDAFFASVEERDHPEFRGHPLVIARHPSDTGGRGVVTTANYEARKFGIHSAMSAQKAYELCPQAIFKPGDHHKYSDISKQVREVFYRYTDIVEPVSIDEAYLDVTENKINCKSAIKIARMIQADIWESVQLTCSAGVSYNKFLAKLASDYQKPRGITVVAPQDAVPFLKALPIEKFHGVGKKTVPRMHELGIYTGKDLYECTEMMLIRNFGKMGYSLYRKVRGIHDSPVNVTRERKSVGKEHTYGQPLQTEEAVLTQLRQLAEKVEEALRRVQKHGKTVVLKVRYTDYSTVTKRVTLPEYIYKKEALFYQASLIWEEILGVEKGIRLLGITLTNLDPMTYENIVLPLWENQEI >CP020488|727719:736191|730928_731801_+|AWV60764.1|DBSCAN-SWA MYNQKSFKGNPVYGDLYLVPTPIGNLEDMSYRSVRMLQESDLIASEDTRNTQKLLNHFEIHTPQKSLHEHNYKERVPQLIALLKEGKTIAQVSDAGMPSISDPGHELVLACIKEGISVISIPGPTAGMTALIASGLVPQPFLFYGFLPRKKKEQKETLKKLKEQTVTLIFYESPYRITATLTNFLEIFGNRQVVLCRELTKVHEEYLRGSTEELLAYIEEHPVKGECCLLVEGNLFEMPVTEVDEELGTLKEQVEAKIASGEKPNAAIKAVALKNGLKKQEVYRQYHELD >CP020488|727719:736191|728378_728708_+|AWV60760.1|DBSCAN-SWA MKIILAIIQDKDSNRLSNELIDANIRATKLSSTGGFLKAGNSTFIVGIEDDRVEEALEIIKKTCESRKQFVSTPVTLDISMDGGVPYPVEVEVGGATVFVLPVEGFHQF >CP020488|727719:736191|730512_730860_+|AWV60763.1|DBSCAN-SWA MDKRSLYDGLNQLESELRNTLTELVEMKHALHEIVEKNTTLEMENQRLREHLRELNQVAQAPAENVKQELSKSRMNLEKIYEEGFHVCYDLYGSRRDNDEPCAFCLEVIYRESGR |
9 | Streptococcus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
789200 : 886714
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP020488|789200:886714|DBSCAN-SWA AATGAAAATGAAAGAAACCTTGCAATTAGGAAAAACAAAATTCCCTATGCGTGGTAATTTGCCAAACCGAGAAGGCGAGTGGCAAAAAGAATGGGAAGAAAATCGAATCTACCAAAAAAGACAAGAGTTGAACGAAGGAAAACCTAGCTTTGTTCTTCATGATGGACCTCCATATGCCAATGGTAATATCCATTTAGGACATTCATTGAATAAAATCAGTAAAGACATTATCATTCGTTCAAAATCAATGTCTGGCTATCGTGCACCATATGTTCCAGGATGGGATACACATGGATTGCCGATTGAACAAGTATTGGCTAATAAAGGCGTGAAACGTAAAGAAATGTCCATGGCAGAATACTTGGAAAAATGTCGTGAATATGCACTTTCCCAAGTAGATAAGCAACGAGCAGATTTCAAACGCCTAGGAGTTGCAGGAGATTGGGAACATCCTTATGTTACATTAGATCCTTCTTATGAAGCTGCACAAGTACGCGTATTTGGTAAAATGGCTGAAAAAGGCTATATTTACAAAGGATTGAAACCAATTTACTGGTCTCCGTCAAGTGAGTCTTCTTTAGCGGAAGCTGAAATTGAATATAAAGATGTAAAATCTCCATCTATTTTTGTAGCTTTCAATGTCAAAGACGGCAAAGATATTCTTGATGAAGATACAGCTTTTGTCATTTGGACGACAACACCATGGACATTGCCAGCAAACCAAGGTATTGCTGTAAATCCAAAATTTACGTATGTATTGGTGGAAGCCGATGGCCGTAAGTTTGTCGTAGCGAAAGATTTGCTAGAAACAGTCCAATCAGAAATCGGTTGGGAAAATGTAACAGTTCTAAAAGAATTTGCTGGACAAGAAATGGAATATATGACTGCAAGTCATCCATTCTATGAACGTGAATCACTTGTGATTTTAGGCGATCATGTTACTTTAGACGCTGGTACTGGATTAGTCCATACTGCTCCAGGACATGGGGAAGATGACTATATCGCTGGTAGCAAATATAAACTATCTGTAGTGTCACCTGTAGACTCAAAAGGATTGTTTACAGAAGAAGCACCTGGATTTGAAGGTATCTTTTATGACAAAGCAAATCCTATGATCACTGATCTATTAAAAGAAAAAGGAGCTTTGCTGAAGCTAGATTTCTTTACTCATAGTTATCCTCACGATTGGCGGACGAAAAAGCCTGTGATCTATCGGGCAACTCCACAATGGTTTGCATCTATCGATAAATTCCGTCAGAATATTTTGGATGAAGTAGAAAAAGTAGAGTGGGTTATCCCATGGGGTAAAACACGTTTGTATAATATGATCCGTGACCGCGGCGATTGGGTAATTTCCCGTCAGCGTGCATGGGGAGTACCACTTCCGATTTTCTATGCTGAAAATGGAGAAGCAATCATCACACCAGAAACAATCGAACATGTGGCAAAATTATTTGCTGAACATGGATCAATTATCTGGTTTGAAAAAGAAGCGAAAGAACTTCTTCCTGAAGGATTTACCCACCCAGGTTCTCCTAATGGCGAATTTACAAAAGAAAAAGATATCATGGATGTCTGGTTTGATTCTGGTTCTTCTCATGAAGCTGTTTTACGTCAGCGACCAGAATTATCATTCCCAGCAGATATGTATTTAGAAGGATCAGACCAATATCGTGGCTGGTTCAACTCAAGTATCACGACTAGTGTGGCTATCAATGGTGTAGCACCATACAAATCAGTTATTTCTCAAGGATTTGCTTTAGATGGTGAAGGCCGTAAGATGAGTAAATCTTTAGGAAACATCATTGCACCAGAAAAAGTGATCAAACAATTTGGTGCAGATATCCTTCGCTTATGGGTATCTAGTGTAGATTATGAAGCAGATGTTCGTGTTTCTATGGATATCTTAAGTCAAGTGGCAGAAGTATATCGTAAAATCAGAAATACGATGCGTTTCTTATTAGCGAATACAGAAGATTTCGATCCTAAAAAAGATACTGTTTCGTACAATGATTTACGTTCTGTAGACAAATATATGACCGTTCGATTGAACCAAGTAATCAAAGAAATCCGAGAAGAAGGGTACGACAAATATAACTTCATGCATATTTACCGTACAGTTATGAACTTCTTGACGGTTGATCTATCGTCATTCTACCTGGATTTTGCTAAAGATGTAGTTTATATTGAAGCAGAAGATGATTATCAACGTCGTTGCATGCAAACTGTTTTCTATCAAACAGCTGTAGCTTTGACAAAATTATTGACTCCTATCATTCCGCATACAGCAGAAGAAATCTGGTCATTCCTGAAAGAAGAAGAGGAGTACGTTCAGTTAAGCGAGTTTCCTGGTTATGAAGAGTTTGCAAACCAAGAAGAATTGATGGATACCTGGACTGCTTTCATGGACTTCCGTGATAATGTCTTAAAAGCATTGGAAGAAGCAAGAAACAGCAAATTGATTGGTAAATCTTTGGAAGCAAAACTAACTGTTTATCCAAAACAACAAGTTCGTGAAATGTTAAAAGCTTTGGATGCAGATATTGCACAATTATTGATCGTTTCACCAGACTACTTTGAAGTTATGGCAGCAGATGAACAAGTGCCAGATAACGCTATGGTATTTGATGATGTTGCTATTACAGTGGAAAAAGCAGACGGGGAAACTTGCGATCGCTGTCGCCAAGTTCGTAAAGATGTAGGAGTAGATGAAAAACTTCCTCATCTATGCGGTCGTTGTGCAAAAATCGTTGAAGACTTCTATCCTGAAGCTGTAGCTGAAGGATTCGAAGAAAAGTAAAAGGGAAAAGGGGGTGTGACATGTTCTTTGTCACACCCCCTTTTGTTATCAATCGTTTAATTTTCCACGTTCACGATACCAGTTATCTGGTTGCCAGATCCATTCGAATCCGTCTTTTTCAAGTAGTTCGAAAGCTGCTTTAGGTCCCATTGATCCAGCTTTGTAGTTGGGAAAATCCGGTTGTGTTTGGTCCCAAGCTTTTCGAATGACATCCACGATATGCCAAGATTGAGCGACTTCTTCCCAATGAGAGAAGTTCGTTCCATCACCATTCAACGCATCTAATAGTAATTTTTCGTAAGCTTCTGGGCTATTTTCAACCATTTCTGCACTATTTCTAAATTCCAATTTGATTGGTTCCGTTTCAAATCCTTGCCCTACTTCTTTCCCATTCAAGGATAAAGAAAATCCTTCAGTTGGCTGAATATAGATCGTTAGAACATTAGGTGGAAGTGTCGTATCGTCACATGGTTCATCGACAGATGTTTTGAATACATTAACAGGAACTTGTTTGAATACGATGTTGATCCGAGTCCCTTTTTCAGTCAAACGTTTGCCTGTACGTACATAGAAAGGAACACCTGACCAACGGAAGTTATCGATAGTGAATTTGCCTGCGACGAATGTTTCAGTCTCTGATTGAGCATCCACTTTGTCTTCTTCGCGATAGCCCTTGAATTGTACACCATCCAATTCACCTTGAGCATATTGCCCGCGAACGAAGTTTTCTAACACTTCTTCTTCGTTATAAATGCGGATAGCTTTCAATGCTTTGATCTTTTCTGTACGGATTTCTTTTTCGGAAAATGCTACTGGCGGTTCCATTGCAAGTAATGCTACAACCTGTAAAATATGATTTTGCACCATGTCTTTAAGTGCGCCACTATGATCGTAGTAGCCCCCGCGATCTTCTACACCGAGGTTTTCGCCAAAAGTAATTTGGATATTGTCGATATAGCGATTGTTCCATTGAGCCTCAAAAATATTATTGGCAAAACGGATAGCTGAGATGTTTTGGATCATTTCTTTTCCTAAATAATGATCAATCCTGAAAATATCTTGTTCTGGGAATACTTCTCTGATTTGCTGGTTCAATTCAAAAGCAGACTGGTAATCAGAACCGAACGGTTTTTCTATGATCAAACGATTGAAGCCATTTTTTGTCATAATATTTTGTGATTTCAAATGAGAAACGATCGTTCCAAAAAATTGAGGTGCCATAGCCAAATAATAGACACGGTTACCGTTTAATTGATAGTGTCCATCTAATCGGTCAGACAATTCTTTTAATGTCTGATAATGCGTTGAATCATTTACATCATGGGATTGATAGTAAAAATGGCTTGCAAAGGTAGTTGCTTCTTCATCTGAAGGATTCAATGCACGGATTGTTTCTTTGACAACTTCACGGTAGTGCTCATCGCTCCAGGGACGGCGAGCGGTTCCGATTACAGCAAAATGCTCGCCTAAATTTCCTTTTCTGTAAAGGCGGAACAAAGACGGGTACAATTTACGCTGGGCTAGGTCACCTGTACCGCCGAATATCGTAAACAATACATTTTTTTCATTAGACATGTGGATACACTCCTTTATATTTTATCGACAAAAATCGTGCTGGCCGCCTTAAAGCTGACGGGGATTTTCTTTCTATCATTTTGGATAGTGATCGGTCCTTCATAAGCTGCGATGTCAACGATCTCATATTCTTCGTTGATATTCAGGTCAATAGTGACTAAGTAATCCAACAATTCTTTTTCATCAAGCACTCGTGCGATACGCACTTTTGTACCGACAGGATAGGACTCCAATGTTTGTCGGCGTTCTTCATGGACAACTTCCTCTTTTTTAGGAATCGATCCTCCATGAGGACAATGTTCAGGATGATTCAAATAGTTTTCTAAATGATCTGCAAGATGTTCCGAAGTCACATGTTCCAATACTTCAGCATCATCATGGACTTCATTCCAGCTATAGTCTAAATGTTCAACTAAAAAAACTTCCCATAAGCGATGTTTGCGAATCAGACTGCTAGCTTTTTGCAGTCCGCTTGCAGTCAATTGTACACCTTGATAAGGGGAATGTTCTACAAGCTCTTCTTTCACAAGTTTAGAAATCATTTCACTGACAGATGCAGCTGAGACATCTAGACTAGATACGATTTGTTTATTGTTGACTTTCGTTGTATCTCCACCTAGTTCTA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>CP020488|789200:886714|837834_838329_+|AWV60882.1|DBSCAN-SWA MADIVQLKEDGVAKYLKTHVEAIDGKEALVQTDGDQAIAGHKNFSGSVTINNKRVLTTDDNRYEVVNLVVTNGNTGTAKLYREGKTVSIYFVALNGKSSGGNDSVILTVPEGYRTPISFEQLVGSIDRSTLNSAQLSIGADGAIKWRRNSSYGSAYSFVITYSI >CP020488|789200:886714|837385_837835_+|AWV60881.1|DBSCAN-SWA MTDIVKIKQSGVQVYPQTHWNAIEGKPTTVKGDKGDPGQAATITIGTVSSGSTASVTNVGTSSAARFNFVLPKGDKGDPGINATTTAVATTTANGLMSSTDKTKLDGIAAGAQKNPGNATTTTAGLMSATDKVKLDGLANITFEKVGTV |
112 | uncultured_Caudovirales_phage(13.95%) | capsid,portal,head,tRNA,terminase,integrase,transposase,protease,tail,plate,holin | attL 782472:782487|attR 823273:823288 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1162062 : 1171605
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP020488|1162062:1171605|DBSCAN-SWA TTCAATAAGTTGAGTGTACGAACTGGTACTTCAAGGAGATGTCCTCATATCCTTGGCGGGCCAGTTCTTTGTCTGTTAATGATCGATGAAGAATATGACTTTTGGAGACTGACCAAATACCTTTTCTTGTATTTGACCATTCATACGCTTTCGCTTTATCGATCCCTAAACGAATCAGATTTTTTCTTTTGGTTCTTGGATTCTTCCATTGTTTCCAAATATATTGTCTGATTCTTCGCTTCAACCAACCGTTTAACTCCCTCATGAATTCTTTCATCTCACCAATTCCATAGTAGTTGATCCAACCAGTCATTAGTTGCTTGATTTCTTTTAAAATAAGTTGGATACTTCTTCCACGGTTTCTTTTAGTGAGTTGTTTGAGCTTGCTTTTCACACGCTGTTTTGCTTTTGCGTGAGGGCGAATTTTAATACCTTTCTTTGTTGGCAGAATGCAGAATCCAAGAAACTTTCGTTTCAATGGACTTCCTACCGCACTCTTTTCTCGATTTACCGTCAACTTTAGTTGTTCTTCGAGAAATTGAATGGATTTCTTCATCACACGCTGTCCTGCTCGTTTGCTTCTAACATAGATATTGCAGTCATCGGCGTATCGAACAAATTTATGTCCTAGATTTTCTAGCACTTGATCAAATTCGTTCAGGTAGATGTTACTTAACAGGGGAGAGAGATTGCCTCCTTGGGGCGTTCCTTCTTCAGTTGTTGTGATGAGTCCATTTTCCATTACACCACTCATTAAGTATTGACGGATCAGTTTTAGGACTTGTTTGTCCTTTACTTTCCGCTCAATGAAATACATCAGCTTATCGTGATTTACGGTGTCAAAGTAGGCTTTCATATCAATGTCCACCACATATCGGTAACCTTGTTCATAATAAGATTTTGCTTTCTTCACTGCGTCATGTGCGCTGCGATTTGGGCGAAACCCATAACTATTATCTGAGAATTCTGGTTCAAATAGCGGTTGTAACACTTGATTGATTGCCTGTTGAAGCATACGATCAATAACCGTGGGAATTCCTAGTTTTCTTACACCGCCGTTTGGTTTCGGTATTTCTACTCGCAAAACAGGCTGAGGTTTATAGTTCCCTTGGCGTAAATTGGATAGTAATTCCTCGCGGTGCTCTTTCAAGTAAGGAAGCAGTTGATCGACGGTCATCCCATCTGCACCAGCCGCCCCTTTATTTCTGACTACTTGAAGATACGCTTGATTGAGATTATTCCGATCTAGAATTCTCCCAAACAGATTTTCTACACCATCTTGTTTCCTCTGTTCACCGCAAGAAGTGCTGCGCACTTCATCATACCCTTCGTGTTCCACACTAGCTCTTTGATGATAGCCAAGTTTTCTTGTTTTCTGCGGTCGTCGCATCTTCTCACACCTCCTAAATTATTCAAGATTCTTATTGTTCAGTCCTTCGTAACGGTCAGTGTCGTTACTACTATGACCTCGGCTGACTTCTCATGATTCACCATCATGTCGCCATGATCGTTGTGCTGGTTTGTTTTCATTCAACGCCCACAACACCCTCATGAGATCTCCCCCGGTAAGAGTGAAAACTTTCCTCCCATGTAACTGCTAGATTTACTGTATAGGTTTCGGGCAGTATTGGACTTTGTCTTGTGATGAAGACTTATCCGACCTAATTCAGCCTTGTATCTAGTTTCTGTTCGTCAGTTCAGGAGTTTGCGTCCGACTTCCTTCAGCCACAACCTCACGATTGCCGCCTTGTCTTTCGCTAACAGTTCCTACTGCCAAGCCTGTAGTGGACTTTCACCACCAAGTTTTCACCCATGCAGGGCGCACACCAAAAAAGAAGCAGATCCGTTAGCGGTTCTGCTTCTTTTAGTTTATTATATTTTCTTATCAATAATAGGAACCTGATTTTAAAAGCGGCTACCTCTTTACCGTGCCTCTTTACATACAAAAAATAGAGGAATTAAGCGTAAATGGCTTGGCTATTATAACTAAAATGCTGGTTATGGAGATGTTGCAGCAAGTTTTCGAGAAAAGCGTATTCCATCTCTTGTCCATTGAATAAGATCTGGATACGATAATGATTTTTGAAACGCTTCTGTTCATGAATCTGACTGATTGAAAGTTCGCCTTTGTGTTCTGTCTGATAAAGAAAAGTCCTTTTACGGCATTCAGCACAGCGCTTGGTTGCTCGGCGGATTTTTCGGAATGTATAAAAACTAGTATCTTTATTGCATAAATAAACGTCTTTGATCGACAGCAAATCATTATATAGACAGGAACGTTCTTCAGCTGTTAATTCTGATAAAAAAAGCTGACCTTGTTTTATTGCATCTTCCATCGGCAAGTGCCTCCTCGAACCCATTATCCAAATTTTTAGTTAATTCTAATATACCATCATTAAGTATAAATGTAAACGCTTGTTGATGGTATAAGATTTTCGTTTCTGATAAAACACGAACATTAAAAGAATCTAATGCCTTAAATGTACATATTTTTGTTGATTTATAAAAAGATGATTGCTAAAATTTAAAGTGAAAAAACGAACAAAAAACGATGTATTTGCTTTTAATGTAAATAAAAAGGAGAGACGTACATGGAGAAGAAAGAACTTTTGTATGAAGGAAAAGCCAAAAAAATATATCTTACTTCTGATGAGAACTTGATTTGGATAGAATATTTAGATCAAGCAACTGCGTTGAATGGCGCGAGGAAAGACCAGATAAGTGGAAAAGGAGAATTGAATAATCAAATCACAAGTGCAATTTTCCGTTATCTGACTCAAAGAGGAATAAAAAATCATTTTATTGAACAATTGTCTAAAACCGAACAATTAGCAAAAAAAGTACAAATTATCCCTCTGGAAGTGGTTATCCGAAATATTGCAGCAGGAAGTTTCTCAAAACGTCTAGGTGTTCCCGAAGGTAAAGAATTCATCAAACCAATCATTGAATTCTACTATAAGGATGACCAGTTGGATGATCCATTTATCAATGAAGAGCATATCTATTTCTTACAACTTGCAAAGCCGGAAGAAATCAGTGAGCTGAAAGCCCAAGCGTTGGCTATTAATGAAATTTTGACCGAATTATTTGCTAAGGTCGGTTTGGTTTTAGTAGATTTCAAGCTAGAATTTGGCCGGTCGAATGGACAAATTTTGCTTGCGGATGAAGTAACACCGGATACTTGCCGATTATGGGATGAACGTACGAATGAACATATGGACAAAGACGTTTACCGCAGAGATCTAGGTGATTTGATCCCAGTCTATCAAGAAGTATATAACCGTCTATCGGAACTAACTGAAGAAAAGGAGCGAGTATGATGTATTTCGTAAAAGTATATGTAACCTATAAAGATTCAGTGTTAGATCCTCAAGGGGAGGCAGTAAAAAAAGCAGTCCATCGTATGGGATATGAAACAATCGAAGATATCCGAATAGGAAAATACTTTGAGATACAACTTGCTGATGCAGAAGAACCAATCGATACAGTGATTGAAACGATTTGTGACAAGCTGCTTGCAAATGTAAATATGGAAACATACCGATATGAAATCAAAAAAATGGAGGAAGTATAACATGAAATTTGCGGTCATCGTTTTTCCAGGTTCAAATTGTGACGCAGATATGTTATGGGCAGTTCGCGAGATCATGGGCGCTGATGCCGAATTTGTACGGCATGATGAGTCCTCTTTAGAAGGATTTGATGGGGTTTTACTGCCGGGAGGATTCTCCTATGGTGACTATTTGAGATGCGGTGCGATTGCTCGGTTTTCTACAATCATGGAAGAAGTGATTCGTTTTGCTGAAGAAGGGAAACCAGTATTCGGTACATGCAATGGATTCCAGATATTGACAGAAGCAGGACTTTTGCCAGGTGTACTGAGACGAAATGAGTCTTTGCATTTTATTTGCAAAACTGTACCATTGAAAGTCAACCCCAAGACGGCCTTTACTTCAGAGTATGAAGCCGACGAAATAATCTATCTTCCAGTTGCTCATGGGGAAGGAAATTATTTCTGTGACGAAGAAACACTTCAAGAACTAAAAAAAAATAATCAGATTGCCTTTACTTATAATGACAACATCAACGGCAGCGTGGAAAACATTGCAGGGATTACGAACAAAGCAGGGAATGTGTTAGGAATGATGCCTCATCCAGAACGTGCAGTAGAAGACTTGCTAGGATCAGAAGATGGGAAACGGTTCTTTGCTTCCATTTTAAAAAACTTCGGAAAGGTGACCGTATAGATGAAAACATTGAAAGAACCGACAGCTGAAGAGATCAAGAAAAAAAGAATCTATGCCGAATGGGGATTGACTGATGAAGAATATCGAATGATCGAAGAAGATATCTTAGGAAGAATGCCTAATTATACGGAAACTGGACTGTTTTCTGTTATGTGGAGCGAACATTGTTCCTATAAAAATTCTAAACCGGTTCTACGCAAATTTCCTACTAGTGGACCTCATGTGTTGCAAGGCCCTGGAGAAGGCGCAGGCATCGTCGACATCGGTGATGGACTAGCAGTTGTCTTCAAAGCAGAAAGTCACAATCATCCTTCAGCCGTGGAGCCTTATGAAGGAGCTGCGACAGGAGTTGGCGGAATCATCAGAGATATTTTCAGCATGGGGGCTCGTCCAATTGCGTTGCTAGATTCATTGAGGTTCGGCGAATTAGATAATCCAAGAACGAAATATTTACTAGAAGAAGTAGTTGCAGGTATCGGCGGATACGGCAATTGTATCGGCATACCGACTGTAGGCGGCGAAATTGCATTTGATCCTTGTTATGAAGGAAACCCATTAGTCAATGCAATGTGCGTAGGTTTGATTGAACACAAACATATCCAGAAAGGGCAAGCCGCTGGCGTCGGTAATTCGATCATGTATGTAGGTGCAAAAACAGGTCGCGACGGTATCCACGGAGCAACTTTTGCCTCAGAAGAATTTAATCAAGAAGAAGAACAGCAACGTTCTGCTGTACAAGTAGGCGATCCTTTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP020488|1162062:1171605|1164652_1165381_+|AWV61184.1|DBSCAN-SWA MEKKELLYEGKAKKIYLTSDENLIWIEYLDQATALNGARKDQISGKGELNNQITSAIFRYLTQRGIKNHFIEQLSKTEQLAKKVQIIPLEVVIRNIAAGSFSKRLGVPEGKEFIKPIIEFYYKDDQLDDPFINEEHIYFLQLAKPEEISELKAQALAINEILTELFAKVGLVLVDFKLEFGRSNGQILLADEVTPDTCRLWDERTNEHMDKDVYRRDLGDLIPVYQEVYNRLSELTEEKERV >CP020488|1162062:1171605|1163818_1164007_-|AWV61182.1|DBSCAN-SWA MYVKRHGKEVAAFKIRFLLLIRKYNKLKEAEPLTDLLLFWCAPCMGENLVVKVHYRLGSRNC >CP020488|1162062:1171605|1162062_1163451_-|AWV61181.1|DBSCAN-SWA MRRPQKTRKLGYHQRASVEHEGYDEVRSTSCGEQRKQDGVENLFGRILDRNNLNQAYLQVVRNKGAAGADGMTVDQLLPYLKEHREELLSNLRQGNYKPQPVLRVEIPKPNGGVRKLGIPTVIDRMLQQAINQVLQPLFEPEFSDNSYGFRPNRSAHDAVKKAKSYYEQGYRYVVDIDMKAYFDTVNHDKLMYFIERKVKDKQVLKLIRQYLMSGVMENGLITTTEEGTPQGGNLSPLLSNIYLNEFDQVLENLGHKFVRYADDCNIYVRSKRAGQRVMKKSIQFLEEQLKLTVNREKSAVGSPLKRKFLGFCILPTKKGIKIRPHAKAKQRVKSKLKQLTKRNRGRSIQLILKEIKQLMTGWINYYGIGEMKEFMRELNGWLKRRIRQYIWKQWKNPRTKRKNLIRLGIDKAKAYEWSNTRKGIWSVSKSHILHRSLTDKELARQGYEDISLKYQFVHSTY >CP020488|1162062:1171605|1166308_1168531_+|AWV61187.1|DBSCAN-SWA MKTLKEPTAEEIKKKRIYAEWGLTDEEYRMIEEDILGRMPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTSGPHVLQGPGEGAGIVDIGDGLAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGELDNPRTKYLLEEVVAGIGGYGNCIGIPTVGGEIAFDPCYEGNPLVNAMCVGLIEHKHIQKGQAAGVGNSIMYVGAKTGRDGIHGATFASEEFNQEEEQQRSAVQVGDPFMEKLLLEACLELILHHSDSLIGIQDMGAAGLVSSSAEMASKAGSGLILTLDEVPQRETGMTPYEMMLSESQERMLICVKSGEEEKIQELFQKYDLDAVTIGKVTDDGQYRLYHQGEEVANLPVDALAEDAPVYHKEMKEPARIVEFQQLAPYQPVIEEPGQVLLDLLQQPTIASKRSIYETYDSQVQTNTVVRPGSDAAVMRVRGTNKALAMTTDCNARYLYLDPKIGGQIAVAEAARNIIASGGKPLAITDCLNYGSPDKPEVFWELSTSADGIAAACETLGTPVISGNVSLYNETDGQAIYPTPMIGMVGLIEDHKHITTQEFKKSGDLIYILGKTFADFDGSELQKMQLGRIEGVIRNFDLSIEKRNQELVLTAIQNGLIESAHDCSEGGLAIALAESAFKHQLGISVQFELSSAQLFAETQSRFVLTVAPENKTRFEEMMGDAAVLAGKVTDEAIIEISATDGQIKIETAVARKCWEDAIVCLMK >CP020488|1162062:1171605|1164019_1164397_-|AWV61183.1|DBSCAN-SWA MEDAIKQGQLFLSELTAEERSCLYNDLLSIKDVYLCNKDTSFYTFRKIRRATKRCAECRKRTFLYQTEHKGELSISQIHEQKRFKNHYRIQILFNGQEMEYAFLENLLQHLHNQHFSYNSQAIYA >CP020488|1162062:1171605|1165380_1165635_+|AWV61185.1|DBSCAN-SWA MYFVKVYVTYKDSVLDPQGEAVKKAVHRMGYETIEDIRIGKYFEIQLADAEEPIDTVIETICDKLLANVNMETYRYEIKKMEEV >CP020488|1162062:1171605|1169986_1171030_+|AWV62802.1|DBSCAN-SWA MANAYAKAGVDVEAGYEVVERIKKHVKKTERLGMMGAIGGFGGCFDLSVFQLKEPVLVSGTDGVGTKLAVAIEADKHDTIGIDCVAMCVNDILAQGAEPLYFLDYLATGKNDPLRLENVVKGVADGCVQGNMALIGGETAEMPGMYSGNDYDLAGFAVGIAEKSQLLTGETINPGDVLLGIASSGIHSNGYSLVRKIFFEQQQFSLSSKLPELKKTLGEELLEPTKIYVSSLLPLIKEKKIKGAAHITGGGFVENIPRMLPESMAAQIKLGSWPILPIFGCLQKYGEIPEMEMYEIFNMGIGMVLAVQESKVKEIVHEIEQAGEKVYEIGKVIAKEKHRVVFIGEER >CP020488|1162062:1171605|1171026_1171605_+|AWV61189.1|DBSCAN-SWA MRIAVFASGNGSNFQALADYLSKKGLESSIDWLFCDQPEAYVLKRATALSVPADCFSPKEFDSKKEYEEAILHKLKEKKIDLIVLAGYMRIIGPVLLKNYDKRIINIHPSLLPAFPGLHGIRDAFEAGVKETGVTIHYIDQGVDTGPIIRQEKVRIEQEDTFDSLEEKIHRVEHRIYPEVISEIIENGGYLK >CP020488|1162062:1171605|1168515_1169955_+|AWV61188.1|DBSCAN-SWA MSYEVKSLNEECGIFGVWGHPDAASVAYFGLHSLQHRGQEGAGIVSNDRGKLKGHRDLGLLSEVFKDQRKLQQLTGEAAIGHVRYATAGNGSVDNIQPFLFKFHDQSIGLAHNGNLINARSLRKELEENGAIFHSNSDTEILMHLIRRSEETDFLNKLKSALNEVKGGFAYLLMTETAMIAALDPNGFRPLAIGQMKNGAYVIASETCALEVIGARFIRDVQPGEIVIINDEGIQIDCFTKDTQLSICSMEYIYFARPDSNIAGINVHTARKNMGRNLAKESPVKADMVVGVPNSSLSAASGYAEASGIPYEIGLVKNQYIARTFIQPTPELREQGVRMKLSAVRGVVEGKKVIMVDDSIVRGTTSRRIVHLLKEAGAKEVHVRIASPPLKYPCFYGIDIQTRKELIAANHTIDEIKECIGADSLGFLSEEGLIESIGLEKDAPYSGLCMAYFNGDYPTPLYDYEEKYQESLKEKVSFF >CP020488|1162062:1171605|1165636_1166308_+|AWV61186.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDADMLWAVREIMGADAEFVRHDESSLEGFDGVLLPGGFSYGDYLRCGAIARFSTIMEEVIRFAEEGKPVFGTCNGFQILTEAGLLPGVLRRNESLHFICKTVPLKVNPKTAFTSEYEADEIIYLPVAHGEGNYFCDEETLQELKKNNQIAFTYNDNINGSVENIAGITNKAGNVLGMMPHPERAVEDLLGSEDGKRFFASILKNFGKVTV |
10 | unidentified_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1332946 : 1400740
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP020488|1332946:1400740|DBSCAN-SWA 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MEKIIRILSISDKWMTKKELAKRIGSSESTFVRYIEEIKIRWGTDVTIQSSQKLGYRLEHLNVPAYLNVLMEMSQSSTNSRLLNEIIVNPGKTIEYYCEKISISRSSFTRKLKQCNQILESYLLKVIVDQGFQLTSLKSELQLRIFVTFFFLSYYGRRTLPFPIEKKKIKEIMVKNNCQMNLFQEESPYEQSFFIMYFVVHLMRESQGTPFEWKAGDSYVQLINIDKKDFLILKNLLGKLKYSSYIKVVNYFVNTIFSEFSEKEKNEISEQIRKNMSYCSFSSADCKEKNEEYVVQLLTQIYFFSRIFPYDTTHLTIRATYFAQQMQHRQIRLYAGFRAELQFYSTLLNQNLIYYLSSYIFWMLIGNPEIHHYTSDKKILIISDLSLRHSQYIEEYISDILAVHKIHSETTAITEDQLSKYNLLEYDLIVTNQPILNAHVPHILIDDSVSFANEEELIRLFEL |
59 | Streptococcus_phage(33.33%) | tail,transposase,integrase | attL 1370285:1370301|attR 1395317:1395333 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1447410 : 1490095
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP020488|1447410:1490095|DBSCAN-SWA 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51 | Streptococcus_phage(23.08%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1497945 : 1544784
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP020488|1497945:1544784|DBSCAN-SWA 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43 | Streptococcus_phage(44.44%) | transposase,integrase | attL 1493135:1493150|attR 1502856:1502871 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1648979 : 1771182
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP020488|1648979:1771182|DBSCAN-SWA 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110 | Streptococcus_phage(35.14%) | tRNA,protease,transposase,integrase | attL 1661540:1661557|attR 1685026:1685043 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1776885 : 1947900
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP020488|1776885:1947900|DBSCAN-SWA 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184 | Streptococcus_phage(21.13%) | capsid,portal,head,transposase,integrase,terminase,tRNA,protease,tail,holin | attL 1769805:1769864|attR 1932428:1933941 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1984043 : 2047655
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP020488|1984043:2047655|DBSCAN-SWA 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60 | Bacillus_phage(28.57%) | holin,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2524698 : 2646058
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP020488|2524698:2646058|DBSCAN-SWA 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112 | Enterococcus_phage(22.86%) | portal,head,tRNA,transposase,terminase,integrase,protease,tail,plate,holin | attL 2575779:2575794|attR 2614728:2614743 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
2753151 : 2770047
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >CP020488|2753151:2770047|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >CP020488|2753151:2770047|2758286_2759471_+|AWV62658.1|DBSCAN-SWA MAQRNLDYRLLKDRRNEYGVSQNKLATACGLSRPYLNQIENGGVTASIKTMRKIFDQLESFNPDLPLTLLFDYVRIRFPTTDARKIIQEILHLKFEYMLHEDYAFYSYQEQYVMGDIVVMLSHEEDKGVLLELKGRGCRQFETFLLAQKRSWYDFFEDCLKAGGVMKRLDLAINDRVGLLDIPELTKKCQKEECISLFRTFKSYRSGELLKADEKDGMGNTLYIGSLKSEVYFCLYEKDYEQYIKLGIPLDQTETKNRFEIRLKNDRAFHAIQDLLKGRSIESTTFSIINRYLRFADKVEGKRRTNWPLNEQWGRFIGRNRKEIQLTSEPKPYTIERTLNWLGRQVAPTWKMAKELDRLNRTTYIQDMVQNARLSDRHKKILEQQSMAIENLII >CP020488|2753151:2770047|2760350_2762261_+|AWV62660.1|DBSCAN-SWA 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>CP020488|2753151:2770047|2757040_2757748_+|AWV62656.1|DBSCAN-SWA MLNSKAYIPQSRERIFLIGHSRDACTEQVFPIIGPSSTSDQNIRNLVNINPSNRGMGGQVYGSDGVAPTLTGDEGIKIALPARDGISVAGLLPGKFEQGNRVYEVTGTAPTLSTKQGGTKIMIRKNETEYQEVKPEDSVNLAFPNSTSRRGRLGKQSVHTLLTGDQQAIVTDQYQIRKLTPRECWRLQGFPDWAFDRDSQVNSDSQLYKQAGNSVTVPVIFDIARRLKELDVHGL >CP020488|2753151:2770047|2762601_2763105_+|AWV62662.1|DBSCAN-SWA MEQMRVYIANLGKYNEGELVGAWFTPPVDFDEVKERIGLNDEYEEYAIHDYELPFEIDEYTPIEEINRLCGLAEELEGTPVGEVASEIQHAFFNSFEEMVEHVDDIIYYPDCDDMSDVAYFLIVEAGDFGEVPEHLKTYIDFDACGRDLEIGGNYLVTSRGVFEYPY >CP020488|2753151:2770047|2768112_2769117_+|AWV62666.1|DBSCAN-SWA MNLKKVGVISLTFLTISFMGILMCVGLLFGEDSEGNGSSGTSPGGTSVSEEVLKHRAMVEKYAKESDITEYIPILLAIIQVESGGTMEDVMQSSESAGLPPNSLSTEASIKQGCLYFASLVKRSKELGCDQDSIIQAYNYGGGYLDHVGKNGKKHSFALAESFSKEKSGGQKVDYPNPIAIKENGGWRYNYGNMFYCLLVKQYLTTTQFDDKIVQEIFDEAFKYEGTAYVFGGSSPETGFDCSGLTQWCYAKVDLKLPRVAQDQYDAMTHIDLKDAKPGDLVFFHSTYDAGTYVTHVGIYAGENRMFHAGDPVGWTNLTENYWRQHLIGAGRYK >CP020488|2753151:2770047|2769135_2770047_+|AWV62667.1|DBSCAN-SWA MKIKIERNQKEKSPKKKKERVVSVGKHRKMVLALWLLLSCSLAFGVYKNFTAIDQHTTHEKVVIKEKVVNTSGVESFTEDFAKEYFSWKNNKEAIEKRMSNLEQYLTENGLALIQDMVRADIPTSSEVQSVKILDVEKHSEEFVVSFLVEQHITEGKKTQSISSAYRVTIFEDENRNHLVTSLPTMIGKPDKAKYEAKQVENDSEIDAKTTEEITDFLETFFKLYPSASEKELEYYVENGAMRPINIDLKFSELENPVYLQNGKNFLVSTKIKYLDNVSKTTSYFQYKLVLQKNGNWKIVDVK >CP020488|2753151:2770047|2753151_2753466_+|AWV62650.1|DBSCAN-SWA MELKFVVPDMAETFGKLSYAGEGEIITEGYGRNTTVIGRSYHLYSSKQRADDIEVVVAAEAGEKDFDQDQPLKAVNPHLVAKGYEIENRGFTDYVLYVDDLVKA >CP020488|2753151:2770047|2763540_2765988_+|AWV62664.1|DBSCAN-SWA MYPIKYIENNLVFNQEGECFAYYELIPYNYSFLSPEQKYQVHDNFRQLIAQNREGKIHALQIATESSIRATQERSKKEITGRLTEVAKQRIDLQTEALVSMIGDSQIDYRFFIGFKLIATDEEVNLKNLKKSFFSGFQEFVYGVNHHLMGDFVSLSNEEIRRYTKLEKLMESKLARRFKVRRVTPSDLMYLIEHIYGEKGTPFEEYEFQLPKKKLKSETLVKRYDLLRPSRCLIEEKPRYLCMEHENHESYVAYLTINTIVGEMEFPSSELFYYQQQQFTFPIDTSMNVEIVTNKKALATVRNKKKELKDLDNHAYQSDNETNSNVLDALDSVDELETTLDQSKESMYKLSYVVRVSAESVDELKRRCDEVLDFYDDTNVKLVRPFGDMMGLHEEFLPSSKRYMNDYIQYVTSDFLAGLGFGATQMLGELEGIYFGYNVDTGRNVYLKPALASQGVKDSVTNALAAAFLGSLGGGKSFSNNLLVYYAVLFGGQAVIVDPKGERGGWKETLPEIADEINILNLTSKPKNQGLLDPYVIMEKKKDSESLAIDILTFLTGISSRDGEKFPVLRKAIRTVTQSNQRGLLQVINELRKEGSPVAENIADHIESFTDYDFAHLLFSDGSITQSISLDRQLNIIQVADLVLPDAETTFEEYTTMELLSVSMLIVISTFALDFIHSNREIFKIVDLDEAWSFLQVAQGKTLSNKLVRAGRAMNAGVYFVTQNSDDLLDERLKNNIGLKFAFRSTDIHEIKKTLEFFGLDREDESNQKRLRDLENGQCLMQDLYGRVGVVQVHPVFEELFHAFDTRPPVQERME >CP020488|2753151:2770047|2763164_2763554_+|AWV62663.1|DBSCAN-SWA MKKIKSYTSIWAVEKVIYAINDFQLPFPVTFNQMAWFVLSLLFVIVFAHVPPLSMIEGAFLKYLGIPVAVTWFMSQKTFDGKKPLGFLRSFISYHLRFKVTFAGKKVKEQKKRWDEPITLVRSVNYVPD >CP020488|2753151:2770047|2765992_2768116_+|AWV62665.1|DBSCAN-SWA MKKKLFRIVGIVFISILTLIVLLSLVGTVAEATGLVDDTVEAGNLYSKYSLNNYQLDFFVDSSWDWLPWNWGDGLGKSVMYGLYAITNFIWTVSLYLSNATGYVVQEAYKLDFISDTAESIGKNIQTLAGITENGLQTSGFYFGFLLLMILALGVYVAYTGLLKRETTKAVRAVINFVMIFLLSGSFIAYAPTYITKINDFSSDVSEAALTLGTEIVVPNSESQGKDSVDLIRDSLFSIQVQQPWLLLQFDDSNIEEIGEDRVNKILSVSPDENKGKDREEAVKAEIEDNDNANLSITKTMNRLGTVVFLVLFNIGISFFVFLLTGIMLFSQILFIIFAMFLPISFLLSMLPTYESLGKKAIIRLFNTIMMRAGVTLVITTAFSISTMFFNISATYPFFMVAFLQIVTFAGIYFKLGDIMSMFNLQSNDSQSMGRRVMRKPQMLMNRKLRQLNRNVGRALAFGGGAAVGNKLAKEQSKSKFKPSGSSLRKNSRLPNDHEILSDLTKENPVSNNKKQSRMNLAGRKIGKVLDTQALVKDKTKQVKDQVRNTPTNLKYNLHKGIEKSKKAPEEFKRGLFQEKADRVDLREKQRQRRNAKMDEKRKILSEATNRQGKRRANIPIDKAAQPQKDMMLKKEAPKRIVRANLNPEIKRKLTSQEIISKGKSQSASKKNSFQQVKQRSTLPKQTNQKVQKRMNHRPKSRSGEKK >CP020488|2753151:2770047|2755698_2756373_+|AWV62654.1|DBSCAN-SWA MESNDSYLEYAKANKDKFISYIIKGKSPEVGRDAVFMAGSPGAGKSEVAIGLAENYDNHVIIDADYFRTQFPDYNGKNSSLFQKASSWLVEQAFRYVLDHGYSFILDATFAILSAEKNISRALKKHFRVTIFYVYQDPKIAWKFTQEREIAEGRHVPKKAFINAFFKSRENIAKVKSKHPDVLLHIIIKDYTNNISEVHYATDNLELFLPLGYSRKDLEVQLHD >CP020488|2753151:2770047|2753853_2754198_+|AWV62652.1|DBSCAN-SWA MKIMEINVEHILDCLDQYGKGELTEEQLVKALTSDEKMFLIIHQGLLGENSDSEEDSDVLDWLGEEESFFIVVEVNENLCRQAESILEEIGVEMPDAIEGFLNQLVETKQLPSS >CP020488|2753151:2770047|2754280_2755621_+|AWV62653.1|DBSCAN-SWA MYKGHRIRAGDQHLVYHFVLGWLLALFIGWMSVFYFQEFRQFDISKLSLSTIEIVWSIKDLVCLLGSLAFSGAMILLYIHFFLDHWRSLWHRQKLARMILENHWYEVKQTQSEGFFKDLNSSRTRETISYFPKICYRMKDGLLSIRVQISLGKYQDQLLKLEKKLESGLYCELVEKELKDSYVEYTLLYDMIANRIGIDEVVAENGTLRLMKNQVWAYDSLPHMLIAGGTGGGKTYFLLTIIEALLKSDAELFILDPKNADLADLGTVMPHVYSQKEEISACVEDFYERMMARSKAMKEMSNYKTGENYAYLGLPPNFLIFDEYVAYMEMLTTKESAVILNKLKQIVMLGRQSGFFLILACQRPDAKYLGDGIRDQFNFRVALGRMSELGYSMMFGEVEKNFFMKHIKGRGYVDTGGSVISEFYTPLVPKGYDFLDSISKLEKMND >CP020488|2753151:2770047|2756605_2757040_+|AWV62655.1|DBSCAN-SWA MRFLDLFAGIGGFRLGMEQASHHCIGFCEIDKFARRSYKAIHDTSKEVEMHDITSVSDEFIQSLGPVDILCGGFPCQAFSIAGKRQRFSDTRGTLFFEIARFTTLLRPKLLFLENVRGLLNHEGGATFETILRTLDGLGYDVEW >CP020488|2753151:2770047|2759467_2759605_+|AWV62659.1|DBSCAN-SWA MKRGIVMGIVKDIFLVFGGSMLGVTVMCLMNASAAADRAMEKKGK >CP020488|2753151:2770047|2757737_2758028_+|AWV62657.1|DBSCAN-SWA MVYDELIGEIYWVIGKIQSDPELEEQLRRLKFDIRKNGVKVAGDPYLMNEETDARIEINQVIAEFERIADQAKEPDIRQYLLEMKAELEVNGITDE |
18 | Streptococcus_phage(92.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
2691 : 55756
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP020489|2691:55756|DBSCAN-SWA CATGCCCAATTTTACTACAGAAATTATGGAAACACTAATCAATAAAGGTGATTTAGATGAATTATTTCGATGTCATTTAGAATTAGCTGTTAATTCATTATTGCAGGCTGAATTAACAGCTTTTCTTGATTATGAAAAATATGATCGTGCTGGGTTCAATTCAGGTAATTCCCGTAATGGGAATTATTCACGTTCATTCAGAACAGAGTATGGAGAATTAAATTTGGTAATTCCTAGAGATAGAAATGGTAAGTTTTCTCAACAAACTTTACCTGCTTATAAAAGAACCAATGACTCTTTAGAAACCACTATTATTCAGCTATTTCAAAAAGGAATTACTATGTCTGAAATCTCTGAATTGATTGAAAAAATGTACGGGCATCACTATACGCCACAAACCATTTCAAATATGACTAAAATAGTTTCTGAAGATATTATTGCCTTTAAAGAAAGGTCCTTAGAATCCAGATACTCTGTCATTTTTATGGATGCTACTCACATTCCTTTAAAAAGACAAACTGTTTCAAAAGAAGCAGTTTATATTGTAATTGGCATTCGATTAGATGGAACCAAAGAGGTTCTTGGGTTTAGTCTTGCTCCAACTGAATCTGCTTATGTTTGGAAAGAGATTCTTCAAGACCTAAAAGACCGTGGTTTAAAAGAGGTTTTATTAGTCGTAACTGATGGTTTAAGTGGCATTAACGATAGTATTCATAGTGTTTATCCAAATGCTCAATTTCAACAATGTTGTGTCCATATATCTAGAAATATCGCTCATAAGGTTCGTGTTAGTGATCGACAAGAAATCTGTAGCGATTTCAAATTAGTTTATCAAGCAAGTTCAAAAGAAGAAGCAAATAATCAAATAAGGTTTATGATAGATAAATGGAAAAAGCAGTATCCACGAGTGGTTAAATTGCTCATGAATCCTGCTATATTAACCTTTTATAATTTCCCTCCGTCAATCAGAAGAACTATTTATTCAACTAATTTGATTGAAGGTTTTAACAAACAATTAAAGAAATATACCAAAAGAAAAGAGCAATTTCCTAATGAAGAATCTCTGGAGAGATTTCTAGTATCTCAATTCAACAACTATAATCAAAAGTTTCTATGCCGAGTTCATAAAGGTTTTAAAGAAATACATGATACATTAGAATCAATGTTTTAACTTGATCAACAGAATGGGCTTTTCCATTTACACAAAATTATTGACGCTCCCGACAAAATTATGATCTTGCGTAAAGTTATAAAATATTAATAAAAATATTTTATTAATGAAAAGCTTGGTAGCACGGTTATTCATATGCTAATTTATTTCACTTTATAGTAAGGGGAGTTCTTAGTATATTGTTCAAACTTAAATTTCATATAATTTAATTATGTAAATTAGCTATTCTAAGAACTTCTACGGATAACTGCCCGTCTAAAATTTAAATAAGAGCTTAGAATCTTCATATAAGTAAGGTTAATTTTTTTGTACAAAAAAGTCGGAATATTCTGAGTTACTGAAATGATATAAAATCATAAACTAAATCCCTTGATTTTATTGACTTTCAAAAGTTTATATATATAAGTTAATGATTATGGTAAAATATATACATAATCATTAACTCAGAATATTTTTAAGAAGGGAAACAATAGTGAGCTATAATGTACAACCGTTAAGGACAAATGAAGAGATACAAGATTTTCAGTTTTGGCTAAGAAGAACAAGTAATCCGGAAAGAGATAGTTTTTTATTTTTGTTTGGAATCAATAATGGGTTACGTATGTCAGATATTATAGGATTAAAAGTTGGAGATATACGAGGCAAAAGTAAGCCTATTATTGTTGAACATAAAACAGGTAAGCGAAAACCGATTTTTATAGATAATTTGAGAGAAGAAATTTTATTATATACTGAAGGTAAAGAAGAAAATGATTGGTTATTTCCGAGTCGGCAACAAGGTCGACATATAACAAGGGATCGTGTCTATCAGATATATGCAGATATAGCAGAAAAATTAGGACGAGATGATATAGGAACACATACATTAAGAAAAACTTTTGGGTATCACTACTACAAGAAAACTAGAGACATTGCTACCTTAATGTTTATTTTTAATCATAGCTCGCAAGCAATTACAAAAAGGTACATTGGTATAACTGAAGATGAAATAGGAGCATCACTTCGTGGATTTAAACTAGGTGTATAATTTAAAAATTTTTATAAACAGTAAAGACAAAGATTAAAAGCTATTTTTATCTAGAACGATTTTATTTCATAAAGTTCGCGGAATAAAAGCTGGGGTTACTGGTACTTGGTATAGGTTCGTGTTATATAAACTAAGTAATTAAATAACATTTTTAGGTTGGAAAAGGATGAAATTAAAAAAAGAGAATCAATACGGTCTCAAAAACGCAAACGCTGCGGAATAAGAAAAATACTGATAACTCAACGTTTAGCAGACTATCTAATAGGGATAGTCTGCTTTTTTCGTTTTTGACCATACTTTTGACCTTCTGCAAACTTCCTTGCTTTTCCTCTGTAGAACTCATGAAATCTGCAAAACGAATTGCCGTTTCCTCTGTCTGCTTTTTCGCGATATGGGTGTATATATCATCCATAGTGGTTTTAATATCTGTATGTCCAAGTCGAACATACACTTCTTTGACAGACGCACCAGATTCAAAGAGCAGACTACAATGGGTATGACGAAAACCATGAAGTGTGATATGTTTTAAGTTATTCTCTTTAATGATGATTTTCAAATTGTGATTTACATAGTCTAAATAAAGGGGCTTATTTTCTTCTGATGAAAACAAAAGTTGTTCACCATCTTTTATAGGTTTGATTCTCATTTTTAGATATTATGCCCGCACGTATTCATCACATTTCTATTGTGAATCGCTTTATTCGACCGACATTTGACTTTTATCATAATATACTCGGTTTAAAATTACTAATGAAAACAATTAATCAAGACGATCATACCATGTATCACCTGTTTTTTTCAGATAATCACCACCGTGTGGGAACTGAACTGACTTTTTTTGAAGTACAAGAAGGGAACAACCAGTTTTTTGGAACCAATACGATTGAACGAACGATACTAAAAGTTCCTTCCGAAGCATCATTGCATTTTTGGGAAATATATTTTGAAACACAAGGCGTTTGCCATTATGGAATCGAATCATTTTCTGGACGACCTATCTTACGTTTTGAAGGGCCAGATGCAACACGATTAGCTTTAGTTCCCTTACGCGAATTTGAAGATATTGATGATTATTTCCCGTATGTCACAGACCAGATCCCTACAGAGCATGCCATTTTAGGAATTGATGCCATTCAACTACGCGTACAATATTCCGATGCGACTGAACGAGAGTTATTGTCGGTAGGCTGGTAGCACAAAGAATACGTCAGTTTCTTTTCGGGTCATCAACGAGTGACAATCTTAGAAAATCAAGACACTCAGTTCTATCAAGAAGTTCAGATTATTCAAGATCGTGAGAATCCAGTTGCCATTGAAGGGATTGGTAGCGTCCATCATGTTGCGTTTGGCGTAGAAAATAAATCTGATTTACAACGCATCGACAAACAATTACAAGAGCGCAATTTTATAAATTCAGGAATAAAAGATCGTGAATTTTTTGTATCACTTTATTATCGTGACCCAAATCAATTATTGATTGAAATTGCTACAGGGGAAGGAAACCTAGATGCAAAAGCGTATGAAAATCAAAGTCCACGCTTTGAAGAAATTCCTTTATTTTTACCGCAGTACTTAAATTTCATTCGTGAACAAGTGGAGCAATAATTAGCTAATCAAATCCATGACGAAGAGTAAGAGGTTGACTCATAAGTCAAAAAATAAAGAAAAACGCATCAAATCCATTCTAAAGAATGTTGATTTGATGCGGTTCCTATTTTTATAAACTATCATTTTCGACTAATAAAACTACTTATGAGTCAGCCTCTCTTTTTTTCTTGATTTTTATACCTCTTTCTAGGTAAACTAAACATCTGCCAAAAATACCGTGTCTCATTGAAACATTCTCAACTATTTCAAAATAAAGGGGAGTACCAAATGAACGAGTATATTGAAATTATCCACGCAAGAGAAACAACTTAAAAATGTCAGTCTCAAAATTCCCAAAAATAAAATTAGTATTTTTACCAGCGTATCTGGTTCAGGAAAATCATCGATTGTTTTTGATACTATTACCCAAGAAGCTGGTCGTCAACTGAATGACACCTATGATAGTTTTACCCGTTTATTTTTACCTAAATACAGTCGTCCAGAGGTTGATGAGATTGATAATCTTTCTACGGCGATTGTGGTCAATCAAAAGAAGATTGGTGGCAGTGCGCGCTCAACGTTAGGGACGATTACTAACATCAATGCGTTATTTCGTGTGTTGTTTTCATGTTTTGCAACACCTAGTTTAGGATATGCAAATGCTTATTCATTTAATGATCCTAGTGGAATGTGTTCTGTCTGTCAGGGAATCGGTAAGACGATTGCATTTTTAATAGGATTGCTTTATTTTTCGGCTATTGATAATGCTGATTTTGTATTTTCTGATCCATTTACCGCAGAAGTTTTGTCTGGAATTGAGGAACAGGCAAAGAATCATGGTTATTTTGTATTGGTGCATAATGTTAATTCAGCAGAAGATGTTAAAACTATTCAGAGAAATTGGCGTTTTGAGGGGTTCATTGTTGTTGGTGTACGTGTAAAAGAATTTTTGGAATTAAATAACGTTTTTGATGGTCCTGTTGTTTATATTGATACGCATCTTTCAAAAGAGACATTAAGAGAACTTGAACAACAAATGAATCGTTTATTTGTAAATACAAATGATTACCAAGCTAGTACATTGGCAGTGGAACATTTGATTCATTATGGTCATGAGAAAATAGCGTTTCTTTCTTTTGACTACATTGTAGGTGAACCAAGTGTTATTCAAGAACGACATCAAGCTTATATCGATACATTAAAGAAATATCATTT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50 | Bacillus_phage(28.57%) | transposase,integrase | attL 13431:13448|attR 56559:56576 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
69251 : 110507
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020489|69251:110507|DBSCAN-SWA 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35 | Streptococcus_phage(45.45%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
146867 : 181964
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP020489|146867:181964|DBSCAN-SWA TTTAAGCTGGGATTCCCAATAATACCTTGATTTCAGTACAGACCGAAAACCCGAAGAGAGTGCCTTCTTTTCGGGTTTTCTTATATAATCCTCGAATGGCTTCCATGCCTTTAATCGTGGTAGAGGCAGTGCGTAAACTTCGATAGAATTTATTGCGTCTCTTTACTGGACGATGGTCTTGTTCAATCAAATTATTCAGGTATTTAATGGTACGATGTTCTGTCCCTTGATAAAAGCCGTATTCTTTTAGTTTCTTAAAGGCACTTGTAATAGAGGGGGCTTTATCTGTGACTACAACCTTCGGTTCATCAAACTGCTTCACTAACCGCTTAAGAAAAGCATAGGCTGCTTGTGTGTCCCGTTTTTTACGTAACCAAATATCCAAGGTTAAACCATCTGCATCGATGGCTCGATACAAATAATGCCATTTTCCTTTAATTTTGATGTACGTTTCATCCATTTTCCATGAATAAAAGGATTTTTTATTTTTCTTTTTCCAAATTTGATAGAGTAGTTTGCCATATTCTTGCACCCAACGATAAATCGTCGTATGAGAAACGTTAATGCCACGATCATATAAGATTTCTTGAACTTCACGATAGCTAAGGTTATAACGAAGATAGTAGCCCACGGCTACAATAATCACATCCTGATGAAATTGCTTTCCTTTAAAATGACTCATCGTCATTCCTCCTGCTATCTTTTTCTATTATTCTACCTTATCTGATAGTAGATTTAAAACTTTGCAACAGAACCGGATTGCAAGGTCGTAGCAACATTAACCTGTATGTTGCAGCGGCGACTAATAGTATAACCTAAAGCAATCGCCGCCAACTCCTTACCGGCTCTTATTTCCTCTCGTACAAATAACAGAACCTCTTCTTTGTCAACTCCCAGCAAGTCCGCCGCAACGTCATTGTCAGTTATTAAAGAAATTTCTTGAGAACGCGTATATGCCAAACTTTTAAAATCTTGGAAAGGATTGTCCGAGAAATTACTTTTCTTTAATGTTTCCATAGGGATTAATAACATCAAGCTAATTGCTTCTGCATCAATATATTCTAAATAAGCTTGTGGTTGCTGCTGTTTGAAATCATTCAGTTCCGGACAAAGAGCTGCTGCTTTTTTCGGTGAAAGAGCCGTTGCCTTTAGCTGTAGCCGCTGCTTACTAAGCAGAGAATCTTCTATCGGTGTAAAGAAATGATGGGCATTTTTTTCGAATTTTGGCGCAGTTAAATAATAGCCGCTATTGGTTTGCGCCCGTAAGGTGCCGTTGTCCACCAGTTTTTGTAACGCGCCTCTTAAGGTAGTTCGATTAACATTAAACATTTCTGATAGGTCCCGTTCCGAAGGCAGTTTTGTTCCGGGGGTTAAATGATGTTCATGAATATAAGCAATAATTTTGTCAATCAGGTCATAAGCCAACAGATTAATCAATTTGGGCATAGATTTTCATCTCCTTTCCTTGATGAACATTTTTAGTATAGATGGCGGCGAATTCAGGCAAAACCACTACTTCAGTGTATTCAACCGCTTGTTCATTTGTCGTAACCGCAGTGATAGCAAGGCTGATTACCGGACGATTTAAGCTGGTTTTTAACAAACGGGCTTCTTTATTGCTCACTTTTGAGCTGGAAATTGTCTGATAGATATTTTCAATTTGATAATGATAAGCAGCCAATGTGGAATAAAATGAAAAAATTTGGAAATCAAAAGCTTGAAGATCAGGTATGAGATTTAATGGAATATAAGTGTCTTCAATAGAAATTGGCTCACCGTCGCCGCTTCTTAAACGAACCAAATGAAATACTTCTTCAGTTGGTTCCAGCTGTAAAGCTTTCCCGACAATGTGTCCAGCCGGTTTTATTTCTGAAGCTAAAATTAAGCTGCTAGGCTGAATCCCTTCCCGTTCCAACAATTCAGACAAACCATGAAATTTGATTTGCAAATGTTCATGGATATTTTTTTTAACAAAAGTTCCTTTGCCATGTATTTTTAGTAGGTACTCTTTATTTACTAATTGTTGAATGGCTTTTTTTACGGCTGAACGATTCATTTCATAAATTTGAACAAAATCACGTTCTGAAGGAATAGCTTGCGCGTATTTATATTTTTCTTGTTCAATGTCTTGTATTAATTTGTTCGTTAGTTCTTCAGTATTCATACGTTACACTCCAGAGTCTATTTTTGTTTATTATACATGAAAAAAGGATTTTGGTACAAATAAAAATAAAAGTGGTTAAAAACTATTGACAGCGTTTTCTATAAGTGGTACATTAAAAACGTTAACAGGTGGTATATAAAAAAGGTTAAGTGGTTTGTTAATGTGCCGGCATTTGCAAATATATTTTTCAAATTATTGACTTGGAGGTTTTTAACTATGTTAGGTTTTAGCGAAGAACGTTTTCTATCAGTATTAAATGGTGCAGTAAAAAATATCGAGACAATCAATCAGGTGGCAGATGCAATCAGTGAGAAGGGATTTAAAAATCTTTATTTGGTAGGCTCTGGTGGAACATATGCCACAATCAGCCCGCTAGCTTATCTGTTAAGCACTCATTCAGAGCTTGATTATTATCATGAAATAGCCGCAGAGGTGGTTTGTTCACAGCCGAAAAAGATTAATAAAGATACAGTGTTAATCACATCTTCATTAACCGGTACGACTCAAGAAACCGTTGATGTTGTTAAGTATGCCAATAGTCAAGGTGCAACGACGATTGCGTTTGTAGGAAATGCTGCTACACCACTCGGGGAAATCGTGGATTATGCGATTGAAAATGATGCTGACAACGATACATTAGTAGAAGAACTTCAGTTACAGTTTTTTGCTTTGGGTGCACGCCTGATGAAAAATAACGGTGAGTTTCCTGAATATGATGAATTTATTCAAACATTACAAAAAATGCCGGAAGTATTACTAAGTGTTCGGCAACAAAATGATCAGAAAGCACTTGAATTTGCAGAAAAACATAAAAATACGGAATTTCATATGTTTGTTGGAGCCGGGAATACTTATGGGGCTGCCTATGAATATGCTATGTGCGTACTGGAAGAAATGCAATGGATTGCCACCAAGTCGATCCATGCAGCCGAATTTTTCCATGGGACTATTGAAATGACTGATAAATCTATGAGTTTTGTGTTATTAAAAGGTGAAGATCAAACGCGTCCGCTAGTCGATCGCGTAGAGCGTTTTGTAAATAAATATAGCGATGTTGTGACGGTTTTTGACACTGCGGATTTCGAATTAGCAGGTGTACCAAGCGCTATGCGTCAGTATGTAGCGCCAATGGTTATGGCAACGGCCTTAGAACGAGTGAGTGCTCATTTTGAAAAGGTGCGGGATCATTCACTAGATATTCGTCGTTATTATCGGACTGTGGAATATTAAGGTAAGAGCTATGAGGAAAATTGTAATTGCGACGCATTCCATGATGGCTAAAGGCTTAAAGGATACTTTAGAATTTATTATTGGTCCTCAAAAATCACTTTTAGCAATAACTGCGTATATAGATAGTGACTACTCCATTAACCAGGAAATAGAGCAGCTATTTTCCGACTTAGCGCCTGATGACGAATTAATTGTGACGGTAGATTTACTGGGAGGAAGCGTGTCTAACGCTTTCTCCGAACAAATCGGTAAAGACAATTTTTATTTAATCAGCGGTGTAAATCTGCCGCTGCTTTTAGAGCTTTGCTTATCAGGTGAACAGGACACGAAAAAACTAATCCAAAAAGCTATGAATAGCGGGAATGAAGGGATAGTTTTGGTGAACGAGTTGCTAGAGAAAACAGAAGAGGATGATTTTTAATGATTAAATTATTACGAGTAGATGAACGTTTTGTTCATGGGCAAGTTGCTTTTGCCTGGACAAATAACTTAGGTGCAAATTGTATTTTCGTTGCAAGTAATGAAATCGCTACCAATAATCTGCGCAAAAAAACACTAAAAATGGCTGTTCCTACAGGGACAAAATTTGTGGTGAAGGATATGACAGAGGCCATCTCTGTTTTAAATGGAGAAAAAATCAAGAAATACCAAGTATTTTTAATTGTCGGGACGGTGGAGGATGCCTACGAAATTACTCAGCACGTACCTGAGATTAAAGAAGTGAATTTAGGAAATTTAAAGAAAAACGAGAATCGGAAAATGATTACTAGTTCCGTTTACTTGAATGAACAAGAACTGGACTTGGTGAAAAAAATGACTGAAAACGGGATAACAGTTCAATGTCAGGCTGTACCAACGGACAAAAAAATCAATCCTTTGCATGACTAAAAGAGGAGGGGAAGAATATGATACAAGCAATATTAATCGCACTGGTAGCTTTTTTGGCGTCTATTGATGAATACACATTTGGTGCATCGATGATGGGTAGACCGCTATTTACAGCGCCTTTTGTCGGTTTGATTTTGGGAGATTTAGAGTCAGGAATTATTATTGGTGCCACCTTGGAATCCATGTTCATGGGCTCAATTATGGTAGGGAGTGCGACGCCCCCTGAAGTTTATGCTTCCAGTGTTTTAGGTACAGCAATTGCGATTCAATCGGGTCAAGGAGTAGGAACTGCCGTTGCGTTGACTTTACCTTTGTCCATCTTTCTTCAGATGTGGCGTAACTTCGCCTATGCAATGCCAATTACGTATTTTAACAACAAAATGGATGAGGCATTAGTCAATCATGATTTCAAAAAAGCACAAAAATATCATTATGTGGCTCAACCTTTAATCGTTGGGGTTCCATCGGCCATTTTAGTTTTTGTAGCTACTTATTTTGGTGTGTCTACAATCAATGCGATGATCAAGTTGATTCCTCAGGTTGTATTGGACAGCTTTGATGTTGCGGCCGGTGTGCTTTCTTGTGTTGGGCTAGCGTTATTAATTAAAATGATGGCGAATAAAGCGATGATGCCTTATCTTTTCTTAGGATTTGTCGGCGTAATGTATCTGAAAATGGATGTTGTCGGTGTGGCTGTCGTCGGACTTTGCTTAGCGTT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MKQILRSKMIFDGEQPPFKGYIVINEGIIEKVENNWNYSDLLNENTELIAYDDQFVMPAIHDNHVFFSGYLAMNAGIDLSDTSSANEAVERIKAVMNHKKADEPIYAHGWDAALWKTDPSEELLNEINHFGPITAIDKNRSHCWMNAIAKQTYGFTEKETSAESRVLLIKEMLANKKLLAEVYAEFEALLLSKGVISMKEIVFDDAEFLSNIPQRKILSNLYVQAVQEPLQHELLYEYKEKVFPEKVRFGGVKIMVDGVVADRSGDIYGVYQSGVASPEIDYEAIKAEVAAFNEVEIPCCLTTEGDKAGYKAASILVEFGKRLPEGVFNSISDLEMVTQKTAEKMNEGQVVAEVYPQILGLNQTLEEAYMSTVIKNESSPQSCVKVQPHQKHNVLRCEPNCHAFLSEERGQEQ >CP020489|146867:181964|174814_176107_-|AWV63021.1|transposase|DBSCAN-SWA MSHTQLIKDTLNILDLNIYFEENCLTKEKYKGQICLIYKGTLLYKPEECSHCLCVVPSRIIRWGTTTVRLLLNDVSEYRTYLELKKQRFKCKSCQRTFVADTSVAEKHCFISQKVRWSVIARLKENTSMTEIARQKNISTSSVYRVMKRFYRPLNPFKQTLPKVLCFDEFKSVRSVASAMSFIMMDGQSHALLDIVENRRLPYLERYFSRFSLATREAVQLIVIDMYAPYVSLVKKLFPNAQLIIDRFHIVQHIGRTFLNHRVKETTVRLKGNSHSQRGLGKKLKRYWKLLQKEEAKLNYEKRVWRASFKDYLTESEIADRLLAACPNLRQGYQLYQDILYAVKKRDQSLFEDCLTRDISGLPETYTTTLRTFKKFLPQIQNALHYSYSNGPLECLNNHIKVLKRNAYGFRNFYNFKLRIMIRHSKTFLT >CP020489|146867:181964|164479_165292_+|AWV63010.1|DBSCAN-SWA 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>CP020489|146867:181964|156537_157275_-|AWV63002.1|DBSCAN-SWA MLISCGARLAPFDIRELRELMSEDELELDKIGDRKTALFVIISDTDDTFNFVVSIMYSQLFNLLCDKADDVYGGRLPVHVRCLLDEFANIGLIPKFEKLIATIRSREISASIILQAQSQLKAIYKDHADTIVGNCDSTLFLGGKEKTTVKELSETLGKETIDLYNTSETRSNQKSFGLNYQKTGKELMSQDEITVMDGGKCIYQLRGARPFLSDKFDITKHKNYKLLEDYDKKNLFDVEEYLKQR >CP020489|146867:181964|169182_169815_+|AWV63013.1|DBSCAN-SWA MTMGVIFDMDGVLIDSETFYFERRMNFFQELEIDPGSNQIDDYVGKTEAAIWETLVPEDKSLREELYPKYVDYRKTHPIDFAKALRKEVKPLLDFLKKRDIPLALASSSPAVEIESMLIQCELTEYFSFVISGESLKQSKPHPEIYLKAKQQLDCDFFIAVEDSTIGIKSAKAANIYTAALKQPMQIDQSEADIQIESLQELEQIVLEKG |
35 | Streptococcus_phage(36.36%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
0 : 2672
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP020490|0:2672|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP020490|0:2672|811_1006_-|AWV63063.1|DBSCAN-SWA MSKEPMSAWMQLALSIIKLISNFVALDNRAKVLTTQCLVILTCSLLVVIVFLLLALFVVHLLFF >CP020490|0:2672|1471_1747_-|AWV63064.1|DBSCAN-SWA MALLPTNKDKKKIGAEDISIKDDINVELGERKYTAKERKPVQVDPPVLKTIRDLSYAKDIPMYEIVKLAMDAYVDTLNDEERIIYNRRSKD >CP020490|0:2672|1718_2672_-|AWV63065.1|DBSCAN-SWA MENLRTAFKTSDKLGKVVMLTGRKGGIGKTTDNDLLAIVSSQLFEKDVLLIDYDQQRNTTSNIGSTYQITSFDRSMSAAIKKGDWVSGITQVSPHLYIMAGSPGSEELNEYLSEKYPDRRKRSLAFIKPLEELRKNFDYIFIDCPPSTDNVVRAFLTAADYIIAMQELKRYAMEGTEDFINKVLVPIVTNFEESHLQIIGILPVLFSVRRSSQHANYQKTIDKYGESNIFKSIVKGSDRLEMYGENGIQLNDYVDRRWWAIFADIFTELEERIEYYEQHGDIEGFDYTPKYADSMANHILPLGKEIKLNGIITNEQR >CP020490|0:2672|50_401_+|AWV63062.1|DBSCAN-SWA MIDYNDRGRLKWAGFYLSDHTEKIDADNEQRANQNLAKEQMTTEEVAEVLNAAVIKNRSVCIQKEERNAEGYYPEDIVSKILGSDELGIYVGKNKVHYDEIRHIEFYQDNKWGRLE |
4 | Enterococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
6819 : 14865
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020490|6819:14865|DBSCAN-SWA AATGACGATGAATCATTTTAAAGGAAAGCAATTTCAGCAGGATGTGATTATTGTAGCCGTGGGCTACTATCTTCGTTATAACCTTAGCTATCGTGAAGTTCAAGAAATCTTATATGATCGTGGCATTAACGTTTCTCATACGACGATTTATCGTTGGGTGCAAGAATATGGCAAACTACTCTATCAAATTTGGAAAAAGAAAAATAAAAAATCCTTTTATTCATGGAAAATGGATGAAACGTACATCAAAATTAAAGGAAAATGGCATTATTTGTATCGAGCCATCGATGCAGATGGTTTAACCTTGGATATTTGGTTACGTAAAAAACGGGACACACAAGCAGCCTATGCTTTTCTTAAGCGGTTAGTGAAGCAGTTTGATGAACCGAAGGTTGTAGTCACAGATAAAGCCCCCTCTATTACAAGTGCCTTTAAGAAACTAAAAGAATACGGCTTTTATCAAGGGACAGAACATCGTACCATTAAATACCTGAATAATTTGATTGAACAAGACCATCGTCCAGTAAAGAGACGCAATAAATTCTATCGAAGTTTACGCACTGCCTCTACCACGATTAAAGGCATGGAAGCCATTCGAGGATTATATAAGAAAACCCGAAAAGAAGGCACTCTCTTCGGGTTTTCGGTCTGTACTGAAATCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCATCGATAACATACGAGATAAAAAGGCAAGTTTAAAATCACTAAAAGATACATGGCTTGATTTATCAGAAGATAATCCATACAGCCAATTCTTAATTACTGTAATGGCTGGTGTTAACCAATTAGAGCGAGATCTTATTCGGATGAGACAACGTGAAGGGATTGAATTGGCTAAGAAAGAAGGAAAGTTTAAAGGTCGATTAAAGAAGTATCATAAAAATCACGCAGGAATGAATTATGCGGTAAAGCTATATAAAGAAGGAAATATGACTGTAAATCAAATTTGTGAAATTACTAATGTATCTAGGGCTTCATTATACAGGAAATTATCAGAAGTGAATAATTAGCCATTCTGTATTCCGCTAATGGGCAATATTTTTAAAGAAGAAAAGGAAACTATAAAATATTAACAGCCTCCTAGCGATGCCGAAAAGCCCTTTGATAAAAAAAGAATCATCATCTTAAGAAATTCTTAGTCATTTATTATGTAAATGCTTATAAATTCGGCCCTATAATCAGTCAAGTCCATAATCCTGTGTAAAATACTATACAATGTTTTACCGGTCTCTCATTGATCAAACTTAATATATTTTCTTGTAGAACTGAGCCATTCGTCATGAAGGTCCATAAGGACAGCTCCAATTAATCGATTGGCAGACGTTCGGTTGGGAAAAATCCGAATAATCTTTTCTCTTCTGCGGACTTCCTGGTTCAGTCGTTCAAGAAGGTTGGTGCTTTTTAGCCGATTATGACTATTTCCGATAACCGTGTATTGAAAGGCATCTTCGAAGCCATTATCCAATATTTCGCAGGCTTTTGTATATTTAGGCTGGTCGATATATTCACCGACTAAGGCATTCTTAGCTGTTCGAGCGAGTTCAATATCCGTAAACTTAAAGATCGCTTTTACTGCTTCTCTAAACGGTTTTGAATTCTTTTTTGGAATGGAACTGAAGATGTTTCTTAAAAAATGGACCTGGCATCTCTGCCAACTTGCGTTGGTAAATGACTTACGAATCGCAGACACTAGGCCTTTATGGGCATCAGAAATGATGAGTTCTGTCCCCTTTAGGCCGCGTTCTTTTAAGTATTCAAAGAAGATGGACCATGTGTCATCACTTTCTTCATTTTGAATCATGAAGCCAATGATTTCACGGTCGCCACCTTCTGTTATCCCGATCGCAATATGGCAGCTTTTAGAAAGCACTCGATGGTCCTCACGGACTTTTATGTAGAGAACATCAGTCATCAGATAAGGATAATTCGTACCTGAGAGTGAACGGTTCTGCCATTCGTTGACCATCGGGTCTAACTGCTCAGTCAGGCTAGAAACAAAAGATTTCGATACAGATTTTCCACATAGCTCTTCAACAATCTTTGAAACTTTACGTGTCGAAACGCCCGAAACATACATCTCAAGCATTGAAGCGAGCAGTGCCTTTTCATTTCGCTGATAACGCTCAAACACCGTCGGTGAAAATTCACCATCACGTGTTCTAGGCACTTTTAATTCGAGTGTACCCACACGAGTCGTAAAGTCTCGCTCATAATAGCCATTTCTTTGACTCTGACGACTTTCTGAACGTTCATAGTCATCGGCTTGAATATATTCTGTTCGTTGATTTTCCATCAATTGGTTGAAAACAGTGGTTAAAATATTTTTAGAAACATCATCTTTTACCGAATGTTCAATAATACTTTGAACCTCTTCGTTGTTCAGTGTAAAATGTACTTGGGTCATGTAACGTCCTCCTGGGTATGTTTTTGTGGTTAAAAACATTGTACCGTAAAAGGGCTGTTACATGGCCTTTTATCTTTTACACAATTATATGGACTTTATCCTATAATCTGATAAATTATTAAGGGCAAACTTATGTGAAAGGGTGATAACTATGAGCGATAAAATACTTATTGTGGATGATGAACATGAAATTGCCGATTTGGTTGAATTATACTTAAAAAACGAGAATTATACGGTTTTCAAATACTATACCGCCAAAGAAGCATTGGAATGTATAGACAAGTCTGAGATTGACCTTGCCATATTGGACATCATGCTTCCCGGCACAAGCGGCCTTACTATCTGTCAAAAAATAAGGGACAAGCACACCTATCCGATTATCATGCTGACCGGGAAAGATACAGAGGTAGATAAAATTACAGGGTTAACAATCGGCGCGGATGATTATATAACGAAGCCCTTTCGCCCACTGGAGTTAATTGCTCGGGTAAAGGCCCAGTTGCGCCGATACAAAAAATTCAGTGGAGTAAAGGAGCAGAACGAAAATGTTATCGTCCACTCCGGCCTTGTCATTAATGTTAACACCCATGAGTGTTATCTGAACGAGAAGCAGTTATCCCTTACTCCCACCGAGTTTTCAATACTGCGAATCCTCTGTGAAAACAAGGGGAATGTGGTTAGCTCCGAGCTGCTATTTCATGAGATATGGGGCGACGAATATTTCAGCAAGAGCAACAACACCATCACCGTGCATATCCGGCATTTGCGCGAAAAAATGAACGACACCATTGATAATCCGAAATATATAAAAACGGTATGGGGGGTTGGTTATAAAATTGAAAAATAAAAAAAACGACTATTCCAAACTAGAACGAAAACTTTACATGTATATCGTTGCAATTGTTGTGGTAGCAATTGTATTCGTGTTGTATATTCGTTCAATGATCCGAGGGAAACTTGGGGATTGGATCTTAAGTATTTTGGAAAACAAATATGACTTAAATCACCTGGACGCGATGAAATTATATCAATATTCCATACGGAACAATATAGATATCTTTATTTATGTGGCGATTGTCATTAGTATTCTTATTCTATGTCGCGTCATGCTTTCAAAATTCGCAAAATACTTTGACGAGATAAATACCGGCATTGATGTACTTATTCAGAACGAAGATAAACAAATTGAGCTTTCTGCGGAAATGGATGTTATGGAACAAAAGCTCAACACATTAAAACGGACTCTGGAAAAGCGAGAGCAGGATGCAAAGCTGGCCGAACAAAGAAAAAATGACGTTGTTATGTACTTGGCGCACGATATTAAAACGCCCCTTACATCCATTATCGGTTATTTGAGCCTGCTTGACGAGGCTCCAGACATGCCGGTAGATCAAAAGGCAAAGTATGTGCATATCACGTTGGACAAAGCGTATCGACTCGAACAGCTAATCGACGAGTTTTTTGAGATTACACGGTATAACCTACAAACGATAACGCTAACAAAAACGCACATAGACCTATACTATATGCTGGTGCAGATGACCGATGAATTTTATCCTCAGCTTTCCGCACATGGAAAACAGGCGGTTATTCACGCCCCCGAGGATCTGACCGTGTCCGGCGACCCTGATAAACTCGCGAGAGTCTTTAACAACATTTTGAAAAACGCCGCTGCATACAGTGAGGATAACAGCATCATTGACATTACCGCGGGCCTCTCCGGGGATGTGGTGTCAATCGAATTCAAGAACACTGGAAGCATCCCAAAAGATAAGCTAGCTGCCATATTTGAAAAGTTCTATAGGCTGGACAATGCTCGTTCTTCCGATACGGGTGGCGCGGGACTTGGATTGGCGATTGCAAAAGAAATTATTGTTCAGCATGGAGGGCAGATTTACGCGGAAAGCAATGATAACTATACGACGTTTAGGGTAGAGCTTCCAGCGATGCCAGACTTGGTTGATAAAAGGAGGTCCTAAGAGATGTATATAATTTTTTAGGAAAATCTCAAGGTTATCTTTACTTTTTCTTAGGAAATTAACAATTTAATATTAAGAAACGGCTCGTTCTTACACGGTAGACTTAATACCGTAAGAACGAGCCGTTTTCGTTCTTCAGAGAAAGATTTGACAAGATTACCATTGGCATCCCCGTTTTATTTGGTGCCTTTCACAGAAAGGGTTGGTCTTAATTATGAATAACATCGGCATTACTGTTTATGGATGTGAGCAGGATGAGGCAGATGCATTCCATGCTCTTTCGCCTCGCTTTGGCGTTATGGCAACGATAATTAACGCCAACGTGTCGGAATCCAACGCCAAATCCGCGCCTTTCAATCAATGTATCAGTGTGGGACATAAATCAGAGATTTCCGCCTCTATTCTTCTTGCGCTGAAGAGAGCCGGTGTGAAATATATTTCTACCCGAAGCATCGGCTGCAATCATATAGATACAACTGCTGCTAAGAGAATGGGCATCACTGTCGACAATGTGGCGTACTCGCCGGATAGCGTTGCCGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020490|6819:14865|9450_10146_+|AWV63071.1|DBSCAN-SWA MSDKILIVDDEHEIADLVELYLKNENYTVFKYYTAKEALECIDKSEIDLAILDIMLPGTSGLTICQKIRDKHTYPIIMLTGKDTEVDKITGLTIGADDYITKPFRPLELIARVKAQLRRYKKFSGVKEQNENVIVHSGLVINVNTHECYLNEKQLSLTPTEFSILRILCENKGNVVSSELLFHEIWGDEYFSKSNNTITVHIRHLREKMNDTIDNPKYIKTVWGVGYKIEK >CP020490|6819:14865|6819_7506_+|AWV63069.1|transposase|DBSCAN-SWA MTMNHFKGKQFQQDVIIVAVGYYLRYNLSYREVQEILYDRGINVSHTTIYRWVQEYGKLLYQIWKKKNKKSFYSWKMDETYIKIKGKWHYLYRAIDADGLTLDIWLRKKRDTQAAYAFLKRLVKQFDEPKVVVTDKAPSITSAFKKLKEYGFYQGTEHRTIKYLNNLIEQDHRPVKRRNKFYRSLRTASTTIKGMEAIRGLYKKTRKEGTLFGFSVCTEIKVLLGIPA >CP020490|6819:14865|8126_9299_-|AWV63070.1|transposase|DBSCAN-SWA MTQVHFTLNNEEVQSIIEHSVKDDVSKNILTTVFNQLMENQRTEYIQADDYERSESRQSQRNGYYERDFTTRVGTLELKVPRTRDGEFSPTVFERYQRNEKALLASMLEMYVSGVSTRKVSKIVEELCGKSVSKSFVSSLTEQLDPMVNEWQNRSLSGTNYPYLMTDVLYIKVREDHRVLSKSCHIAIGITEGGDREIIGFMIQNEESDDTWSIFFEYLKERGLKGTELIISDAHKGLVSAIRKSFTNASWQRCQVHFLRNIFSSIPKKNSKPFREAVKAIFKFTDIELARTAKNALVGEYIDQPKYTKACEILDNGFEDAFQYTVIGNSHNRLKSTNLLERLNQEVRRREKIIRIFPNRTSANRLIGAVLMDLHDEWLSSTRKYIKFDQ >CP020490|6819:14865|14178_14865_-|AWV63076.1|transposase|DBSCAN-SWA MTMNHFKGKQFQQDVIIVAVGYYLRYNLSYREVQEILYDRGINVSHTTIYRWVQEYGKLLYQIWKKKNKKSFYSWKMDETYIKIKGKWHYLYRAIDADGLTLDIWLRKKRDTQAAYAFLKRLVKQFDEPKVVVTDKAPSITSAFKKLKEYGFYQGTEHRTIKYLNNLIEQDHRPVKRRNKFYRSLRTASTTIKGMEAIRGLYKKTRKEGTLFGFSVCTEIKVLLGIPA >CP020490|6819:14865|11492_12461_+|AWV63073.1|DBSCAN-SWA MNNIGITVYGCEQDEADAFHALSPRFGVMATIINANVSESNAKSAPFNQCISVGHKSEISASILLALKRAGVKYISTRSIGCNHIDTTAAKRMGITVDNVAYSPDSVADYTMMLILMAVRNVKSIVRSVEKHDFRLDSDRGKVLSDMTVGVVGTGQIGKAVIERLRGFGCKVLAYSRSRSIEVNYVPFDELLQNSDIVTLHVPLNTDTHYIISHEQIQRMKQGAFLINTGRGPLVDTYELVKALENGKLGGAALDVLEGEEEFFYSDCTQKPIDNQFLLKLQRMPNVIITPHTAYYTEQALRDTVEKTIKNCLDFERRQEHE >CP020490|6819:14865|12453_13485_+|AWV63074.1|DBSCAN-SWA MNRIKVAILFGGCSEEHDVSVKSAIEIAANINKEKYEPLYIGITKSGVWKMCEKPCAEWENDNCYSAVLSPDKKMHGLLVKKNHEYEINHVDVAFSALHGKSGEDGSIQGLFELSGIPFVGCDIQSSAICMDKSLTYIVAKNAGIATPAFWVINKDDRPVAATFTYPVFVKPARSGSSFGVKKVNSADELDYAIESARQYDSKILIEQAVSGCEVGCAVLGNSAALVVGEVDQIRLQYGIFRIHQEVEPEKGSENAVITVPADLSAEERGRIQETAKKIYKALGCRGLARVDMFLQDNGRIVLNEVNTLPGFTSYSRYPRMMAAAGIALPELIDRLIVLALKG >CP020490|6819:14865|13490_14099_+|AWV63075.1|DBSCAN-SWA MEIGFTFLDEIVHGVRWDAKYATWDNFTGKPVDGYEVNRIVGTYELAESLLKAKELAATQGYGLLLWDGYRPKRAVNCFMQWAAQPENNLTKESYYPNIDRTEMISKGYVASKSSHSRGSAIDLTLYRLDTGELVPMGSRFDFMDERSHHAANGISCNEAQNRRRLRSIMENSGFEAYSLEWWHYVLRDEPYPNSYFDFPVK >CP020490|6819:14865|10123_11278_+|AWV63072.1|DBSCAN-SWA MVIKLKNKKNDYSKLERKLYMYIVAIVVVAIVFVLYIRSMIRGKLGDWILSILENKYDLNHLDAMKLYQYSIRNNIDIFIYVAIVISILILCRVMLSKFAKYFDEINTGIDVLIQNEDKQIELSAEMDVMEQKLNTLKRTLEKREQDAKLAEQRKNDVVMYLAHDIKTPLTSIIGYLSLLDEAPDMPVDQKAKYVHITLDKAYRLEQLIDEFFEITRYNLQTITLTKTHIDLYYMLVQMTDEFYPQLSAHGKQAVIHAPEDLTVSGDPDKLARVFNNILKNAAAYSEDNSIIDITAGLSGDVVSIEFKNTGSIPKDKLAAIFEKFYRLDNARSSDTGGAGLGLAIAKEIIVQHGGQIYAESNDNYTTFRVELPAMPDLVDKRRS |
8 | Streptococcus_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
20235 : 47988
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP020490|20235:47988|DBSCAN-SWA AATGGCTAAAATTGGTTATGCACGTGTCAGTAGCAAAGAACAGAACTTAGATCGGCAATTACAAGCGTTACAGGGCGTTTCTAAGGTCTTTTCAGACAAATTAAGCGGTCAATCGGTCGAACGCCCACAATTACAAGCTATGCTTAACTATATTCGTGAAGGGGATATTGTTATTGTTACTGAATTAGATCGATTAGGACGAAATAATAAAGAATTAACAGAATTGATGAATCAAATTCAAATTAAGGGGGCAACCCTGGAAGTCTTAAATTTACCCTCAATGAATGGTATTGAAGATGAAAATTTAAGGCGTTTGATTAATAGCCTTGTCATTGAATTGTACAAGTATCAAGCAGAATCAGAACGAAAAAAAATTAAGGAACGTCAGGCACAAGGAATCGAAATTGCTAAGAAAAAAGGCAAATTCAAAGGTCGTCAGCATAAATTTAAAGAAAATGATCCACGTTTAAAGCATGCTTTCGATTTGTTTTTGAATGGTTTATCCGATAAAGAAGTTGAAGAACAAACTGGAATCAATCGCCGAACGTTTAGAAGGTATCGAGCAAGATATAACGTGACAGTCGATCAAAGAAAAAACAATGAAAAGAGGGATAGTTAATGAGTACGGTTATTTTAGCTGAAAAACCAAGCCAGGCATTAGCCTACGCAAGTGCTTTAAAACAAAGCACCAAAAAAGACGGTTATTTTGAGATCAAAGACCCACTATTTACAGATGAAACGTTTATCACCTTTGGTTTTGGGCATTTAGTGGAATTAGCAGAACCAGGTCATTATGACGAAAAGTGGCAAAATTGGAAACTTGAATCTTTGCCGATTTTTCCTGATCGATACGATTTTGAAGTTGCAAAAGATAAGGGAAAGCAGTTTAAAATTGTTGCAGAACTTCTCAAAAAGGCAAATACAATTATTGTTGCAACAGATAGCGACAGAGAAGGTGAAAATATCGCCTGGTCGATTATCCATAAAGCAAATGCCTTTTCAAAAGATAAAACATTTAAAAGACTATGGATCAATAGCTTAGAAAAAGATGTAATCCGAAGCGGTTTTCAAAATTTGCAACCTGGAATGAATTACTATCCCTTTTATCAAGAAGCGCAAACACGCCAAATTGCCGATTGGTTGATCGGCATGAACGCAAGCCCTTTGTATACGTTAAATTTACAACAGAAGGGCGTACAAGGTACATTTTCACTAGGACGTGTTCAAACGCCCACCTTATACCTTATTTTTCAGCGCCAGGAAGCCATAGAGAATTTTAAAAAAGAACCTTTTTTCGAGGTGGAAGCTAGTATAAAAGTAAACCAAGGGTCGTTTAAGGGCGTTCTAAGCCCCACACAGCGTTTTAAAACCCAAGAGGAGCTTTTAGCTTTTGTTTCTTCTAAACAAGCTAAAATAGGCAATCAAGAGGGGATAATTGCTGATGTTCAAACCAAAGAGAAGAAAACGAATAGTCCGAGTTTGTTTTCTTTAAGTAGTTTGCAATCAAAAGTCAATCAGCTTTATAAAGCGACAGCGAGCCAAACTTTAAAAGCTATTTCTTTTTTAATAACTTAAAAATAAACTTAATGTAACAGCAAGCACAGTCAAGGTATACACCTTTGACAAAAAATAGCACATTCTCTATCGAAAATTTTTGCTTATTTTTTAAATTATTTTGGGAAATTTTCCCAATCCCTTTTTCTAACTCAAAAAATATAATCACTCAAAATTTAAAAGGGCGCACTTATACATCATTTTAAAAAATTGATGTAACGTGCTAAGTTCAAAACAAAGGGCGCACTTATACACGATTTTCAATCTTGTATATTTCTAACGAAAAGCGTGCGCCAAAAAACCCCCTTCGTCAATTTTGACAGGGGGCTTTTTGATGTAAAAATTTCTATCGAAATTTAAAAATTCGCTTCACTCATGTTATAAAGACTTAAAATAAAATAACTCTTTAAAATCTTTTGCTAGTTGTTCTTCAATATTTTTTATTCGGTGCATCTTCCAAGTAAAGTATAACACACTAGACTTATTTACTACGTTTCATAAGTCATTAATGCGTGTGCTCTGCGAGGCTAGTTTTTGTGCAAGCACAAAAAATGGACTGAATAAATCAGTCCATAAGTTCAAAACCAAATTCAAAATCAAAACCACAAGCAACCAAAAAATGTGGTTGTTATACGTTCATAAATTTTATGATCACTTACGTGTATAAAATTAAATTCACTTTCAAAATCTAAAAACTAAATCCAATCATCTACCCTATGAATTATATCTTGAAATTCATTCATAAATAGTGAAGCATGGTAACCATCACATACAGAATGATGAAGTTGCAGAGCAACTGGTATATAAATTTTATTATTCTCACTATAAAATTTACCTATCGTAATAATAGGCAATAAAAAGCTGCTATTGTTACCAATATTTAAATTAAATGAACTAAAATCAATCCAAGGAATCATTGAAATCGGTATGGTGTTTTCAGGTATCGGTTTTTTAGGAAACATTTCTTCTTTATCTTTATATTCAAGCAAGTCATTTTTATAATTATTATAAAAAGAAATGAAGTTTTTATCAGATTCAGTCCAAATGTTAGTAAATTTTTCAGTTTGCTTATTAAAAACTGTATACAAAGGATTTAACTTATCCCAATAACCTAATTTATTCTCACTATTAATTCCTGTTCTAAACACTTTATTTTTATTTACAACTTCCATAATTGCATAAATTAAAGAGGGATAAATTTCATATCCTTTCTTTTTTATCATATCTTTAAACAAAGTAATATCAATTTCTTTAGTAATGCTATAAGTAGTTTGCTGATTAAAATAGTGTTCAAAATATTCTTTTCTATCCCAATTTTCTAATTCAATAATATTAAAAGTCATATATAACTTCCTCCTAAATTTTAAATTTTTATATTTAGGAGGAATAATCCTCTGATTTTTTCATACGTTATGTCACCTCGTAAATATTAATTATACTGAATTAGCAATTTTTATCAAATAAAACTTATTTTACTTCCAAAACCTAAATTCACGTTGCCAAAAATCAATCTGCTTTTGCAATTGTTTTTCGTTCGCTTTTAAAGTCGATTTCATTAATTCCGTTAAATCAATTGGAGATATTTCTCTAATCAATTTTTTAAATTTAGTCTTAGTATTCTTACTTAGCTTTCCCCACATACTTTCTTCATGCAACAAAGTATAAACCATAGCTTGCTCATTAATTTTTTCTAAAGTAGCCCACGCAGGTTTCAAGATGTGTAAATCATTAAAACAATCATTCCAGTAATCAACCATATCTCTTTTTAATTCAACTTCTACACGCCATAAATGTTCAGACACAACTTCAACATCTGCGTTATCTTTACGTTCTTGTTTTTTATTATAAATTCTAATAAATCTATCACTATCACGGACACCAAAATATTTTGTTTCTGGCTTGCCATTACGACCATAAAAAACAGTTTTCTTAACTGCTTTATCAGTCATTGCATAGTAATCGCTCAAATCATCTTCAAAATCAAAAGCTAAGTCTAATCTTGTAAAACCGTCATCTTCCATGTAGTCGATAATATTTTGTTTTAACCAAATCATTTCTTCATGTGTGAGTTTATTGGGATTAAATTCAACACGCATATTACGTCTATCCCAAGTATCTGCTTTTACTTTGTCATATTCGATATAAACTTTTTCTTGAAGTGCCTTAGCTTTAAACTTTGTTTGAAGTATATCCCAAAGTCGTATTTGTGGCTCTACACTCATAAAGTCAGATAGCTTTTTAGCATTAGTTTTGTTCAAATTTCCAACGATTGTCATGGCATCAAAACTTAATGCGGGTTGAGATTTTCCCAAAGTTTGACCACTTAACCGGCTATTACTTAACCGGCTATTAGAGACGGCCGGTTTTTTTAGTGAGATTTCTGCAGCTAATTTTTCATCAATTTTCTTCATTTTTTATCGCTCCTAAAATAATTTTTGGAACGAAAAAAGGACGAGTGGAATCGCAAAATAAATTTCGCCTGTATCCATTCGTCCATTTTGTTTTGTATTCAAAATCAAAAATTGATATACTAATCATCGAATGAATAACAAGTGTGGTTTGTTATTCCGGGCGAGAACGTTGGTAGCGTTGCTCGTCTTTTTTTATGTCTTTTTTTCGTTAAAACTATTTTAAAACTAAATATATCTTAAAGCAAATAAATTCAAGGGGCTAAAAGCGCCCCTTAAAAACCCCTTGCCTCTGAAAAGTTTTGTGTTTCCTTTCCGTCGGTTTCAAAAGCTAATTTACTCAAAAAAATAGATCAAGGGTAAATGCACTCACTGCGTTCGCCCTTGAGCTATTTTATTTCGCAAATTTTAACGCATTTGCCGACGAAAAGATAAAACACATAAAAATATACGCAGATATATTTAAAACGTCTTAGAACGCAAAATTTTACGTTTAAAAGCTATGCAAGGACTGTATGAAGCAAAATTATTGAGTTATCCAAGAACAGATACACCATTTATTACAGAGAACGAATTTGCTTATTTAAAAGCGAATTTTGGCAAATATAGCGGTTTTTTAGGACTTGATCTTGAAATGGTTCAAACAGAGCCTAGAAAGCGTTATGTGGACGGTAGTAAGGTACAGGAACACCACGCCATTATCCCAACAAAACAAGTACCTACCGAATCTGCATTAGCGAAAATGGACGATTTACAACGAAAAATTTATGCTTTAGTCGTTAAAACGACCGTTGCCATGTTTTTACCTGATTACTTGTATGAAGAAACCAAGATACAAACGAAAGTAGCTGATTTGCTGTTTCAATCGATCGGAAAGACACCAAAGCAAGAAGGGTGGAAAATTCTTTTCAAACAACAAACCAAAGAAGAAAAAGAGGACGTTCAAACGTTACCACTCGTTATCATTGGCGAACGTGCCGAAGTTGGTGTTAAGAGTGTTGAAAAAGAAACGCAACCGCCAAAAGCTTTTACAGAGGG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30 | Streptococcus_phage(70.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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