Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029085 | Staphylococcus aureus strain AR462 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP029086 | Staphylococcus aureus strain AR462 chromosome, complete genome | 8 crisprs | cas3,DEDDh,csa3,RT,WYL | 5 | 1 | 5 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029086_1 | 180694-180778 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029086_1
|
1 spacers
spacers of CP029086_1
>1.1|180720|33|CP029086|CRISPRCasFinder ATTGGGAATCCAATTTCTCTGTGTTGGGGCCCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029086_1
The CRISPR arrays of CP029086_1 >merge|CP029086|1|180694-180778|CRISPRCasFinder CACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGGGAATCCAATTTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA >CP029086|1|1|180694-180778|CRISPRCasFinder CACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAA ATTGGGAATCCAATTTCTCTGTGTTGGGGCCCA CACCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA
>CP029086.1|AWE65348.1|179260_180385_-|hemN-C-terminal-domain-protein MTVQSAYIHIPFCVRICTYCDFNKYFIQNQPVDEYLDALITEMSTAKYRNLKTMYVGGGTPTALSINQLERLLKAIRDTFTITGEYTFEANPDELTKEKVQLLEKYGVNRISMGVQTFKPELLSVLGRTHNTEDIYTSVLNAKNAGIKSISLDLMYHLPKQTIEDFEQSLDLALDMDIQHISSYGLILEPKTQFYNMYRKGLLKLPNEDLGADMYQLLMSKIEQSPFHQYEISNFALDGHESEHNKVYWFNEEYYGFGAGASGYVDGVRYTNINPVNHYIKAINKESKAILVSNKPSLTERMEEEMFLGLRLNEGVSSSRFKKKFDQSIESVFGQTINNLKEKELIVEKNDAIALTKRGKVIGNEVFEAFLIND >CP029086.1|AWE63669.1|178182_179160_-|heat-inducible-transcription-repressor-HrcA MITDRQLSILNAIVEDYVDFGQPVGSKTLIERHNLNVSPATIRNEMKQLEDLNYIEKTHSSSGRSPSQLGFRYYVNRLLEQTSHQKTNKLRRLNQLLVENQYDVSSALTYFADELSNISQYTTLVVHPNHKQDIINNVHLIRANPNLVIMVIVFSSGHVEHVHLASDIPFSNDKLNTISNFVTNKLTEFNQNLQDDIVSFVQSEQEEIFINKLINTMNNHISNQSNSIYMGGKVKLIDALNESNVSSIQPILQYIESNRIAELLQDISSPNINVKIGNEIDDSLSDISIVTSQYHFDETLKGQIAVIGPTAMHYQNVIQLLNRIW >CP029086.1|AWE65402.1|177524_178151_-|protein-GrpE MTNKDESVEKNTESTVEETNIKQNIDDSVEQAEESKGHLQDEAIEETSDENVIEEIDPKDQKINELQQLADENEEKYLRLYAEFENYKRRIQKDNEINKTYQAQRVLTDILPAIDNIERALQIEGDDETFKSLQKGVQMVHESLINALKDNGLEVIKTEGEAFDPNIHQAVVQDDNPDFESGEITQELQKGYKLKDRVLRPSMVKVNQ >CP029086.1|AWE63662.1|175623_177456_-|chaperone-protein-DnaK MSKIIGIDLGTTNSCVTVLEGDEPKVIQNPEGSRTTPSVVAFKNGETQVGEVAKRQAITNPNTVQSIKRHMGTDYKVDIEGKSYTPQEISAMILQNLKNTAESYLGEKVDKAVITVPAYFNDAERQATKDAGKIAGLEVERIINEPTAAALAYGLDKTDKDEKVLVFDLGGGTFDVSILELGDGVFEVLSTAGDNKLGGDDFDQVIIDYLVAEFKKENGVDLSQDKMALQRLKDAAEKAKKDLSGVSQTQISLPFISAGENGPLHLEVNLTRSKFEELSDSLIRRTMEPTRQAMKDAGLTNSDIDEVILVGGSTRIPAVQEAVKKEIGKEPNKGVNPDEVVAMGAAIQGGVITGDVKDVVLLDVTPLSLGIEILGGRMNTLIERNTTIPTSKSQIYSTAVDNQPSVDVHVLQGERPMAADNKTLGRFQLTDIPPAERGKPQIEVTFDIDKNGIVNVTAKDLGTNKEQRITIQSSSSLSDEEIDRMVKDAEVNAEADKKRREEVDLRNEADSLVFQVEKTLTDLGENIGEEDKKSAEEKKDALKTALEGQDIEDIKSKKEELEKVIQELSAKVYEQAAQQQQQAQGANAGQNNDSTVEDAEFKEVKDDDKK >CP029086.1|AWE63141.1|174348_175488_-|chaperone-protein-DnaJ MAKRDYYEVLGISKDASKDEIKKAYRKLSKKYHPDINKEEGADEKFKEISEAYEVLSDDNKRASYDQFGHDGPQGFGGQGFNGSDFGGFSGFGGGGFEDIFSSFFGGGRQRDPNAPQKGDDLQYTMTLTFEEAVFGTTKEISIRKDVTCETCHGDGAKPGTSKKTCSYCNGAGHVAVEQNTILGRVRTEQVCPKCNGSGQEFEEACPTCHGKGTENKTVKLEVKVPEGVDNEQQIRLAGEGSPGVNGGPAGDLYVVFRVKPSETFKRDGDDIYYKLNVSFPQAALGDEIKIPTLNNEVMLTIPAGTQTGKQFRLKEKGIKNVHGYGYGDLYVDIKVVTPTKLTDRQKELMKEFAQLNGEEINEQPSNFKDRAKRFFKGE >CP029086.1|AWE63998.1|173406_174345_-|ribosomal-protein-L11-methyltransferase MNWTELSIIINHEAVELATNILENHGSNGVVIEDSDDLINQPEDKYGEIYALKKEDYPDKGVRLKAYFNEMTYDDKLRQQIKDELLNLDELDQHNIQFSEQIIAETDWENEWKNYFHPFRASKKFTIVPSWETYAKEADEELCIELDPGMAFGTGDHPTTSMCLKAIETYVLPQHSVIDVGTGSGILSIASHLIGVKRIKALDIDEMAVSVAKENFRRNHCETLIEAVPGNLLKDETEKFDIVIANILAHIIDEMIEDAYNTLNEGGYFITSGIIKEKYEGIQSHMERVGFKIISEQHDNGWVCLVGQKVSE >CP029086.1|AWE64238.1|172652_173405_-|ribosomal-RNA-small-subunit-methyltransferase-E MQRYFIDQNADVSQRFFITKKEDIHHITNVMRYDVGSKIILTFNDQTVYLCEIADITSDKIAVDLKEKQNINTELPVDVTICSGLIKADKYEWLLQKATELGASSFIAVSMERSIVKLNEAKVVKKIERWQKIIKEAAEQSYRLVIPSIQFESNLKLICDTIDNYDYILIAYEEEAKDGELSNFKQTLQQFKAQDKVLMIFGPEGGLSENEISLFSNTSTVVGLGPRILRAETAPLYALSAISYEKELMG >CP029086.1|AWE63846.1|171299_172646_-|threonylcarbamoyladenosine-tRNA-methylthiotransferase-MtaB MSTVAFHTLGCKVNHYETEAIWQLFKEANYERVDFEANADVFVINTCTVTNTGDKKSRQIIRRAIRQNPDAVICVTGCYAQTSSAEIMEIPGVDVVVGTQDRHKLLGYIDEFRKERQPINGVGNIMKNRKYEELDVPYFTDRTRASLKIQEGCNNFCTFCIIPWARGLMRSRDPEKVVEQATQLVNSGYKEIVLTGIHTGGYGQDLKDYNLAQLLRDLETINGLERIRISSIEASQLTDEVIDVLERSTKVVRHLHIPLQSGSDTVLKRMRRKYTMDRFSERLTKLHKALPDLAVTSDVIVGFPGETEAEFQETYDFIVKHKFSELHVFPYSPRIGTPAARMDDQIDEEIKNERVHKLITLSNQLGKLYASKFDQDVLEVIPEEQGDTEGTLVGYADNYMKVQFEGDESLIGQIVKVKITQANYPLNEGQAIKVVDFATNKSDREVLV >CP029086.1|AWE64768.1|170830_171007_-|ribosomal-protein-S21 MSKTVVRKNESLEDALRRFKRSVSKSGTIQEVRKREFYEKPSVKRKKKSEAARKRKFK >CP029086.1|AWE65107.1|169903_170587_-|putative-membrane-bound-serine-protease MTTILESTAGDTWVEQVSNIIVQPIFTLILTCLTFLGFVYQLYSKKINAAGIIATLSLLILFLGFLIQGNVNMHSILIFSIGVILVVIELFVVGAVIGIIGMILITISITTLGDNLLFMLANVIVALILTIVEWVILVKIFNRKIPFLDKVILKDSTNSESGYNSHDNRSHLVGKTAQTVTDLRPAGIIFCENERIDAVSDGNFILRNKTVKILEVEGTRVVVREVD >CP029086.1|AWE63178.1|180950_182774_-|GTP-binding-protein-LepA MDNEQRLKRRENIRNFSIIAHIDHGKSTLADRILENTKSVETRDMQDQLLDSMDLERERGITIKLNAVRLKYEAKDGNTYTFHLIDTPGHVDFTYEVSRSLAACEGAILVVDAAQGIEAQTLANVYLALDNELELLPVINKIDLPAAEPERVKQEIEDMIGLDQDDVVLASAKSNIGIEEILEKIVEVVPAPDGDPEAPLKALIFDSEYDPYRGVISSIRIVDGVVKAGDKIRMMATGKEFEVTEVGINTPKQLPVDELTVGDVGYIIASIKNVDDSRVGDTITLASRPASEPLQGYKKMNPMVYCGLFPIDNKNYNDLREALEKLQLNDASLEFEPESSQALGFGYRTGFLGMLHMEIIQERIEREFGIELIATAPSVIYQCILRDGSEVTVDNPAQMPDRDKIDKIFEPYVRATMMVPNDYVGAVMELCQRKRGQFINMDYLDDIRVNIVYELPLAEVVFDFFDQLKSNTKGYASFDYEFIENKESNLVKMDILLNGDKVDALSFIVHRDFAYERGKALVEKLKTLIPRQQFEVPVQAAIGQKIVARTNIKSMGKNVLAKCYGGDISRKRKLLEKQKAGKAKMKAVGNVEIPQDAFLAVLKMDDE >CP029086.1|AWE63688.1|183119_183371_+|ribosomal-protein-S20 MANIKSAIKRVKTTEKAEARNISQKSAMRTAVKNAKTAVSNNADNKNELVSLAVKLVDKAAQSNLIHSNKADRIKSQLMTANK >CP029086.1|AWE64458.1|183415_184390_-|DNA-polymerase-III,-delta-subunit MSDNIVAIYGDVPELVEKQSAEIISQFLKSDRDDFNFVKYNLYETEIAPIVEETLTLPFFSDKKAILVKNAYIFTGEKAPKDMAHNVDQLIEFIEKYDGENLIVFEIYQNKLDERKKLTKTLKKHARLKKIEQMSEEEIKKWIQSKLNENFKDIKRDALDLFIELTGINFNIVSQEIEKLILFLGDRPTINKQDVNQIINRSLEQNVFLLTEYIQKRKKEQAIHLVKDLITMKEEPIKLLALITSNYRLFYQCKILSQKGYSGQQIAKTIGVHPYRVKLALGQVRHYQLDELLNIVDACAETDYKLKSSYMDKQLILELFILSL >CP029086.1|AWE64622.1|184446_186627_-|DNA-internalization-related-competence-protein-ComEC/Rec2 MIVGVLWNSSKVLSTFLFILLLYITYRKNKIVYAPISLFLIIFSSWYLHYSQQAIFNYINYIERNSQFNERAQVIQIQRQGSDTYKGRLSLKNEIYPFFLTDKKNFDLKKIESRNCIVKGQFKVNENKFVTLKLQSIVVQSCLESNRSNLIEKHKQFIMNRIYDSGIKFPDRIMALITGDVKEINEQFKERVKEIGIYHLLAVSGSHIAAIVFLIYQPLKRLNLPLFVIKGITIIVLTLYAQYTNYAPSAVRAIIMTTLVLLITKQIKIKGIQLLAFAFIIMFILNPLVVYDIGFQFSFIISFFIMLLFPFLQQLSKLQSLFIITFIAQLASFIVAIPNFHQLQWVGFLSNLIFVPYYSIILFPLSILFFITSHFIVGLTPLNYLVDLSFNFHDWLLDLFTRIKQSHFSVPKFNDWIFIIFIISVYYIFWLLAKRKYILVTFWTIIILTLLITFPTNSHHKITMLNVGQGDSILYEGGKNQNVLIDTGGKVIDDTKQPSYSISKYHILPTLNERGINELEYLILTHPHNDHIGEVEYIISHIKIKHIVIYNKGYSSNTLMLLSKLSHKYNIKLMDVRQVSSFKLGDSSFLFFDSFIPNSRDKNEYSIITMITYQNKKVLLMGDASKNNESLLLKKYNLPEIDILKVGHHGSKTSSSKEFIEMIKPKISLISSGKNNMYHLPNIEVVKRLQRIRSRIYNSQQNGQVTIDLDDNLKVDSNSYGNASGL >CP029086.1|AWE64947.1|186652_187114_-|comE-operon-protein-2 MERIKWEEYFMAQSHLLALRSTCQRLSVGATIVKDNRIIAGGYNGSVAGEVHCIDEGCLIEDGHCIRTIHAEMNALLQCAKQGVSTEGATIYVTHFPCLNCTKSIIQAGIKRIYYAEDYHNHEYATKLLKQSGIEFKKIPFSPEYVAKYLTKG >CP029086.1|AWE64075.1|187205_187883_-|competence-ComEA-helix-hairpin-helix-repeat-region-domain-protein MYQFLLRYKDFLTQWKLYIISAVVLIMVLIGFIFWRQDDYTSRNFENKDTALKQSTSENNSLSKLEDVQVKDGDNSKNKGPVYVDVKGAVKHPNVYKMTSKDRVVDLLDKAQLLDDADVSRINLSEKLTDQKMIFIPHKGQKNVEPQIEVNSVHVKNGNTNNTKVNLNTASVSELMSVPGVGQAKANAIVEYRNQQGAFQEIDDLKKVKGFGSKTFDKLKSYFTI >CP029086.1|AWE63762.1|187931_188648_-|methyltransferase-type-12 MSQYAEMSLVYDQLTQDQPYEKWFEIVKNHCKDESNILDIGCGTGSLTVQLEALGNVTGMDLSVDMLTVAAQKSANVNWLEGDMTSFDLQQQFDIITIFCDSLNYLQDETAVIETFINVYHHLTDSGVFIFDVHTVYKMMTLFNNQSYIDDKGDIFLAWDAVQGDLPLSVYHDMTFFIRHEDETYSRFDESHFQRTFDEKTYLSWLAQVGFKHVETFTDFNIDEHNEDTERLFFIAKK >CP029086.1|AWE63486.1|188650_189004_-|ribosomal-silencing-factor-RsfS MNSQELLAIAVDAIDNKKGEDTISLEMKGISDMTDYFVVTHGNNERQVQAIARAVKEVANEQNIEVKRMEGYNEARWILIDLADVVVHVFHKDERNYYNIEKLYQDAPLESYGQVAY >CP029086.1|AWE65399.1|189004_189589_-|HD-domain-protein MNIEKAKRLAKEKLPEKRYNHSLRVAETAIKLAEIYDGDTSKVELAGVLHDFCKYDDLGKMYQIVRQYELGNDLLSYGSEILHGPVCAAIMEHEYGINDEEVLMAIKYHTTGRQQMTKTEKLIFIADYIEPGRTIPGVDDIRDMAYNQGSLDKTIYEISKRTVLFLIQKDITVYNKTIDCLNYYNYSDERIKDD >CP029086.1|AWE63191.1|189578_190148_-|nicotinate-(nicotinamide)-nucleotide-adenylyltransferase MKKIVLYGGQFNPIHTAHMIVASEVFHELQPDEFYFLPSFMSPLKKHNNFIDVQHRLTMIQMIIDELGFGDICDDEIKRGGQSYTYDTIKAFKEQHKDSELYFVIGTDQYNQLEKWYQIEYLKEMVTFVVVNRDKNSQNVENAMIAIQIPRVDISSTMIRQRVSEGKSIQVLVPKSVENYIKGEGLYEH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029086_2 | 606237-606318 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029086_2
|
1 spacers
spacers of CP029086_2
>2.1|606261|34|CP029086|CRISPRCasFinder TTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGG |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029086_2
The CRISPR arrays of CP029086_2 >merge|CP029086|2|606237-606318|CRISPRCasFinder GGCCCCCACCCCAACTTACATTGTTTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCCCACCCCAACTTGCATTGT >CP029086|2|2|606237-606318|CRISPRCasFinder GGCCCCCACCCCAACTTACATTGT TTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGG GGCCCCCACCCCAACTTGCATTGT
>CP029086.1|AWE64554.1|604792_606016_+|putative-succinyl-diaminopimelate-desuccinylase MTTFSEKEKIQLLADIVELQTENNNEIDVCNYLKDLFDKYDIKSEILKVNEHRANIVAEIGNGSPILALSGHMDVVDAGNQDNWTYPPFQLTEKAGKLYGRGTTDMKGGLMALVITLIELKEQNQLPQGTIRLLATAGEEKEQEGAKLLADKGYLDDVDGLIIAEPTGSGIYYAHKGSMSCKVTATGKAVHSSVPFIGDNAIDTLLEFYNQFKEKYSELKKHDTKHELDVAPMFKSLIGKEISEEDANYASGLTAVCSIINGGKQFNSVPDEASLEFNVRPVPEYDNDFIESFFQNIINDVDSNKLSLDIPSNHRPVTSDKNSKLITTIKDVASSYVEQDEIFVSALVGATDASSFLGDNKDNVDLAIFGPGNPLMAHQIDEYIEKDMYLKYIDIFKEASIQYLKEK >CP029086.1|AWE64961.1|603301_604357_-|hypothetical-protein MKNKKRVLIASSLSCAILLLSAATTQANSAHKDSQDQNKKEHVDKSQQKDKRNVTNKDKNSTVPDDIGKNGKITKRTETVYDEKTNILQNLQFDFIDDPTYDKNVLLVKKQGSIHSNLKFESHKEEKNSNWLKYPSEYHVDFQVKRNRKTEILDQLPKNKISTAKVDSTFSYSSGGKFDSTKGIGRTSSNSYSKTISYNQQNYDTIASGKNNNWHVHWSVIANDLKYGGEVKNRNDELLFYRNTRIATVENPELSFASKYRYPALVRSGFNPEFLTYLSNEKSNEKTQFEVTYTRNQDILKNRPGIHYAPPILEKNKDGQRLIVTYEVDWKNKTVKVVDKYSDDNKPYKEG >CP029086.1|AWE63505.1|602263_603280_-|gamma-hemolysin-component-B MIKQLYKNITICSLAISTALTVFPATSYAKINSEIKAVSEKNLDGDTKMYTRTATTSDSQKNITQSLQFNFLTEPNYDKETVFIKAKGTIGSGLRILDPNGYWNSTLRWPGSYSVSIQNVDDNNNTNVTDFAPKNQDESREVKYTYGYKTGGDFSINRGGLTGNITKESNYSETISYQQPSYRTLLDQSTSHKGVGWKVEAHLINNMGHDHTRQLTNDSDNRTKSEIFSLTRNGNLWAKDNFTPKDKMPVTVSEGFNPEFLAVMSHDKKDKGKSQFVVHYKRSMDEFKIDWNRHGFWGYWSGENHVDKKEEKLSALYEVDWKTHDVKFVKVLNDNEKK >CP029086.1|AWE63823.1|601201_602026_+|sphingomyelin-phosphodiesterase MYPNWGQYKRADLIGQSSYIKNNDVVIFNEAFDNGASDKLLSNVKKEYPYQTPVLGHSQSGWDKTEGSYSSTVAEDGGVAIVSKYPIKEKIQHVFKSGCGFDNDSNKGFVYTKIEKNGKNVHVIGTHTQSEDSRCGAGHDRKIRAEQMKEISDFVKKKNIPKDETVYIGGDLNVNKGTPEFKDMLKNLNVNDVLYAGHNSTWDPQSNSIAKYNYPNGKPEHLDYIFTDKDHKQPKQLVNEVLTEKPKPWDVYAFPYYYVYNDFSDHYPIKAYSK >CP029086.1|AWE63372.1|600107_601145_+|integrase MKTRCYDGKKWQYEFKHEGKRYRKKGFRTKREANSAGLDKLNELRSGFNIDNYITLEEYFENWIKTYKQPVVKENTYRHYRNALQHIQKHKIGKMELSKINRQVYQKFINDYSKEHAKETIRKTNGAIRSALDDALYDGLIFKNPAYKVNYKAGKPTKSEQEKFISVTEYEILKDHVRKKRTRSSLALFIMICTGCRVSGARNIKIEHINQVKNTIFIDERKTNTSPRYISIAKSDMKHIMDVISTFAISYDGYIFKEGGSIINLHAINNALKSACRVNNIPIITSHALRHTHCSYLLAKGVSIHYISKRLGHKNIAITTSVYSHLLEEKFNEEDKKTTKILESM >CP029086.1|AWE65321.1|599593_600049_+|putative-lipoprotein MLGLLLVSTLVLSACGNDENQEESKKEVKSKEKKIEKEKENKSKKDKEKEVATQQQPDNQTVEQPQSQEQSVQQPQQQIPQNSVPQQNVQVQQNKKQKVDLNNMPPTDFSTEGMSEQAQKQIEELSMQKDYHGLSQREYNDRVSEIINNDN >CP029086.1|AWE63034.1|599302_599485_+|hypothetical-protein MKITNCKIKRETVIYEVLTSGNQPFTYELPKDLSSHNARKYLEFISQKLDGDKLTKEDSL >CP029086.1|AWE63032.1|598757_599099_+|hypothetical-protein MIKKIFTKKHVFLVIEDENHNHSDAVFGKSILLSIYVGVNKKTNSKSGKFIYLDRSKRIVRQSDITKIESANENDVDFYNLLKKEKEIVYSKNIVDKYNLANYIIYYEVSTKE >CP029086.1|AWE65102.1|597819_598752_+|exonuclease-family-protein MKKYDIAVLDFETMNEHMNSPCEVAVSLIKDLSIVKVYSSYINPPNNRYNLKNAKIHKIPEDVILKAPKYPDIYQEILYLLKESHLIIAHNALFDISVLKNTNNYYDLPVPNFMYVDSINIFRSFHAISSFKLENLCSLYDIDKEKLHSAKFDVLALSKMLISLAKNNQHYSVLKLIHYMPKQYIRFSKYSNSPTKLFDSGFQKIHMKISEINKIEVESVIPILKDKNVVFTGNFDTEKQDLMILTRKKGAYIRSDVTAKTDILVEGVQDDKYKDVNGLVSKQRKAREYVGNGAKIQFLNEEDLINLIKE >CP029086.1|AWE64515.1|597090_597804_+|helix-turn-helix-family-protein MNKERNIIIAKNIRKFLNDSNMSQKKLAELINIKPSTLSDYLNLRSNPSHGVIQRIADVFEVGKSDIDTTYKDDNDITSIYNKLTPPRQENVLNYANEQLEEQNSKGDNVVDINSYKQEKTPVNVNGCVSAGVGERLHDETLFTEMVKGPIPTHDLALKVNGDSMEPMFKDGEIIFVEKTHNIKNGQIGIFIIEEEAYVKKVFVEDDRLTLVSLNKDYDDLHFYRNESVRLIGKVIL >CP029086.1|AWE64389.1|606459_607767_+|ktr-system-potassium-uptake-protein-B MNKVHKPLYFYLMLFFSTTIIGALLLYLPFTGKKPISFLDALFIASSAFTVTGLSPVDIGSQFNILGEIVILLLIQIGGLGIVTVTLLTLVFLNRKISMKNRFLIMVTWNIDEPGGVIKLIKHLAIYSLVTELIGMICLCLSFIPKFGIGKGLFLSLFTSVSAFNNAGFALFKNNLIDYSSDPIVIITISILIIFGGIGHFVVIDFINCKKLSKLSLHSKLVLTTTSILIIIGAITFFLLEQFNTMQHMGLVEKIGNSFFQSVTTRTAGFNSIDIASINKSTALMLMLLMFIGGAPLSAAGGIKITTFAVAFIFVLNYIRKENNVSVFNKEISDKHIKLSIVTINISFLFISIITFILSIINPNISLIKLLFEVVSAFGTVGLSMNLTTEYHGITKIIIIFVMLCGKVGLLTLLRTFIPPKSPKNYRYTKGQIYL >CP029086.1|AWE65082.1|608306_609923_-|chaperonin-GroL MVKQLKFSEDARQAMLRGVDQLANAVKVTIGPKGRNVVLDKEFTAPLITNDGVTIAKEIELEDPYENMGAKLVQEVANKTNEIAGDGTTTATVLAQAMIQEGLKNVTSGANPVGLRQGIDKAVKVAVEALHENSQKVENKNEIAQVGAISAADEEIGRYISEAMEKVGNDGVITIEESNGLNTELEVVEGMQFDRGYQSPYMVTDSDKMVAELERPYILVTDKKISSFQDILPLLEQVVQSNRPILIVADEVEGDALTNIVLNRMRGTFTAVAVKAPGFGDRRKAMLEDLAILTGAQVITDDLGLDLKDASIDMLGTASKVEVTKDNTTVVDGDGDENSIDARVSQLKSQIEETESDFDREKLQERLAKLAGGVAVIKVGAASETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTALVNVYQKVSEIEAEGDIETGVNIVLKALTAPVRQIAENAGLEGSVIVERLKNAEPGVGFNAATNEWVNMLEAGIVDPTKVTRSALQHAASVAAMFLTTEAVVASIPEKNNDQPNMGGMPGMM >CP029086.1|AWE64876.1|609998_610283_-|10-kDa-chaperonin MLKPIGNRVIIEKKEQEQTTKSGIVLTDSAKEKSNEGVIVAVGNGRLLNDGTRVTPEVKEGDRVVFQQYAGTEVKRDNETYLVLNEEDILAVIE >CP029086.1|AWE63754.1|610457_611201_+|CAAX-protease-self-immunity-family-protein MTRLWASLLTVIIYILSQFLPLLIVKKLPFVQYSGIELTKAVIYIQLVLFLIAATTIILINLKIKNPTKLELEVKEPKKYIIPWALLGFALVMIYQMVVSIVLTQIYGGQQVSPNTEKLIIIARKIPIFIFFVSIIGPLLEEYVFRKVIFGELFNAIKGNRIVAFIIATTVSSLIFALAHNDFKFIPVYFGMGVIFSLAYVWTKRLAVPIIIHMLQNGFVVIFQLLNPEALKKATEQANFIYHIFIP >CP029086.1|AWE64802.1|611225_612407_-|putative-sdrH-protein MSYHWFKKMLLSTSILILSSSSLGLATHTVEAKDNLNGEKPTTNLNHNITSPSVNSEMNNNETGTPHESNQTGNEGTGSNSRDANPDSNNVKPDSNNQNPSTDSKPDPNNQNPSPNPKPDPDNPKPKPDPKPDPDKPKPNPDPKPDPDKPKPNPNPKPDPNKPNPNPSPDPDQPGDSNHSGGSKNGGTWNPNASDGSNQGQWQPNGNQGNSQNPTGNDFVSQRFLALANGAYKYNPYILNQINKLGKDYGEVTDEDIYNIIRKQNFSGNAYLNGLQQQSNYFRFQYFNPLKSERYYRNLDEQVLALITGEIGSMPDLKKPEDKPDSKQRSFEPHEKDDFTVVKKQEDNKKSASTAYSKSWLAIVCSMMVVFSIMLFLFVKRNKKKNKNESQRR >CP029086.1|AWE64444.1|612603_613230_+|nitroreductase-family-protein MGLFKKDKKAMTFDNAMEERRSIYNLKDSISISDDELESMIAHAVKHVPSSFNSQSTRIVLLLNDNNNKFWDNTKAILKEVMGENRDFEPTEQKIDNFKHSYGTILFYEDQDVVSGLQEQMPNYYDNFAIWSTQTNAMHQFAIWTALATKGIGASLQHYNPLVDEMTSKEFNIPKSWKLIAQMPFGDIREAAGEKTFNPVEDRFVIKK >CP029086.1|AWE63213.1|613590_614376_+|hydrolase,-carbon-nitrogen-family MKVQIYQLPIIFGDSSKNETQITQWFEKNMNAEVDVVVLPEMWNNGYDLEHLNEKADNNLGQSFSFIKHLAEKYKVDIVAGSVSNIRNYQIFNTAFSVNKSGQLINEYDKVHLVPMLREHEFLTAGENVAEPFQLSDGTYVTQLICYDLRFPELLRYPARSGAKIAFYVAQWPMSRLQHWHSLLKARAIENNMFVIGTNSTGFDGNTEYAGHSIVINPNGDLVGELNESADILTVDLNLNEVEQQRENIPVFKSIKLDLYK >CP029086.1|AWE64142.1|614974_615109_-|delta-hemolysin-domain-protein MSCLILRIFILIKEGVISMAQDIISTIGDLVKWIIDTVNKFTKK >CP029086.1|AWE63165.1|615290_615908_+|accessory-gene-regulator-protein-B MIKDCTKSYNNSEESGVKLNYFDNKIDQFATYLQKRNNLDHIQFLQVRLGMQIIVGNFFKILVTYSISIFLSVFLFTLVTHLSYMLIRYNAHGAHAKSSILCYIQSILTFVFVPYFLINIDINFTYLLALSIIGLISVVIYAPAATKKQPIPIKLVKRKKYLSIIMYLLVLILSLIIHPFYAQFMLLGILVESITLLPIFFPKED >CP029086.1|AWE63888.1|615910_616054_+|cyclic-lactone-autoinducer-peptide-family-protein MNTLVNMFFDFIIKLAKAIGIVGGVNACSSLFDEPKVPAELTNLYDK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029086_3 | 734881-734961 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029086_3
|
1 spacers
spacers of CP029086_3
>3.1|734905|33|CP029086|CRISPRCasFinder ATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTT |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029086_3
The CRISPR arrays of CP029086_3 >merge|CP029086|3|734881-734961|CRISPRCasFinder CAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTCAACTTTAGTTGTTAGGGGCTTCT >CP029086|3|3|734881-734961|CRISPRCasFinder CAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTT ATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTT CAACTTTAGTTGTTAGGGGCTTCT
>CP029086.1|AWE64722.1|733772_734864_+|putative-membrane-protein MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYAQTIAIYSQFGQKPPVDAYLKVIAVLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKDKKVVTEPKNTKVENGKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >CP029086.1|AWE64571.1|732529_733507_+|cadmium,-cobalt-and-zinc/H(+)-K(+)-antiporter MSHSHHHDHMHSHVTTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALVAFIYAEKNATTTKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH >CP029086.1|AWE65487.1|732207_732528_+|HTH-type-transcriptional-repressor-CzrA MSEQYSEINTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL >CP029086.1|AWE63887.1|731390_732056_-|3-beta-hydroxysteroid-dehydrogenase/isomerase-family-protein MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFDGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNHQEFQIISGEQDIKDALTQFEIEKD >CP029086.1|AWE63244.1|730016_730955_-|mannose-6-phosphate-isomerase,-class-I MPLFLQPILKTKLWGGQRLSEFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGTSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIVIGTLAESREEVANHVQHGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDITYRLYDFNRQDNQYNDRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYV >CP029086.1|AWE63125.1|729755_729986_-|putative-membrane-protein MKQFLYIALVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQISASLKFSALLINVLPLCGTFVASN >CP029086.1|AWE63685.1|727710_729084_-|EVE-domain-protein MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRMSNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVKKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD >CP029086.1|AWE64872.1|726840_727254_-|hypothetical-protein MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYQFATLKGEVGQQFFKQHPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIKLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD >CP029086.1|AWE64814.1|726197_726641_-|DNA-protection-during-starvation-protein-1 MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLENAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS >CP029086.1|AWE63251.1|725366_726077_+|purine-nucleoside-phosphorylase MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGTYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKAKNVADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNDAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE >CP029086.1|AWE64073.1|735917_736088_+|hypothetical-protein MSPKDTTRFETKPDHQAQFDWKESINFKTKDNQRIPLYIGVLLLYYSRFIIMHNNE >CP029086.1|AWE65489.1|736080_736239_+|hypothetical-protein MSKSSDALFNSLTQSFELIEGVYNELVTDNLKIVMYKPRKESTSGRINRRFK >CP029086.1|AWE63710.1|736896_737754_-|HAD-hydrolase,-IIB-family-protein MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINQLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQITNLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAKHFLAD >CP029086.1|AWE64883.1|737821_738604_-|ABC-transporter-family-protein MLIQLDQIGRMKQGKTILKNISWQIAKGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATTGGVNLFGKMPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEVRNEAHHLLKLVGISAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLNILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITGNFTKILLLKDGESVQQGLIDDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE >CP029086.1|AWE64034.1|738835_740641_-|glutamine-fructose-6-phosphate-transaminase MCGIVGYIGYDNAKELLLKGLEKLEYRGYDSAGIAVVNDDNTTVFKEKGRIAELRKVADSSDFDGPVGIGHTRWATHGVPNHENSHPHQSSNGRFTLVHNGVIENYEELKGEYLQGVSFISETDTEVIVQLVEYFSNQGLSTEEAFTKVVSLLHGSYALGLLDAEDKDTIYVAKNKSPLLLGVGEGFNVIASDALAMLQVTSEYKEIHDHEIVIVKKDEVIIKDADGNVVERDSYIAEIDASDAEKGVYAHYMLKEIHEQPAVMRRIIQEYQDAEGNLKIDQDIINDVKEADRIYVIAAGTSYHAGLVGKEFLEKWAGVPTEVHVASEFVYNMPLLSEKPLFVYISQSGETADSRAVLVETNKLGHKSLTITNVAGSTLSREADHTLLLHAGPEIAVASTKAYTAQIAVLSILSQIVAKEHGREADIDLLRELAKVTTAIEAIVDDAPIMEQIATDFLETTRNAFFIGRTIDYNVSLEGALKLKEISYIQAEGFAGGELKHGTIALIEDGTPVVALATQENVNLSIRGNVKEVVARGAHPCIISMEGLEKEGDTYVIPHVHELLTPLVSVVALQLISYYAALHRDLDVDKPRNLAKSVTVE >CP029086.1|AWE63872.1|741321_742860_+|PTS-system-mannitol-specific-EIICB-component MSQTEEKKGIGRRVQAFGSFLSSMIMPNIGAFIAWGFIAAIFIDNGWLPNKDLATLAGPMITYLIPLLIAFSGGRLIYDLRGGIIAATATMGVIVALPDTPMLLGAMIMGPLVGWLMKKTDQLIQPRTPQGFEMLFNNFSAGILGFIMTIAGFKILAPLMKFIMHILSVAVEALVHAHLLPLVSILVEPAKIVFLNNAINHGVFTPLGADQAAKAGQSILYTIESNPGPGLGILLAYMIFGKGTAKATSYGAGIIHFLGGIHEIYFPYVLMRPLLFIAVILGGMTGVATYQATGFGFKSPASPGSFIVYCLNAPRGEFLHMLLGVFLAALVSFVVAALIMKFTREPKQDLEAATAQMENTKGKKSSVASKLVSSDKNVNTEENASGNVSETSSSDDDPEALLDNYNTEDVDAHNYNNINHVIFACDAGMGSSAMGASMLRNKFKKAGINDITVTNTAINQLPKDAQLVITQKKLTDRAIKQTPNAIHISVDNFLNSPRYEELLNNLKKDDQA >CP029086.1|AWE65490.1|742894_745027_+|phosphoenolpyruvate-dependent-sugar-phosphotransferase-system,-EIIA-2-family-protein MLLSTREKEMIALLIKYHSQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVEAYLTSFSLTLERANKKGLRIAGADSDLNDLKQSIAQHQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELDLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLGQIYDVTFNQAEIAFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVNKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFIVLHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLEQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIDSPYLTVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFQETHDKSSNMIDKDDVHVETKDVDGNTSFENEQTSYLTSVFEKHLSDEKSEQLLHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDVINDPTSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMILITVLEEPLTLPSIQNDNQTIKYMISMFIPDNDFMASLVSDLSEFLSLKLESIDTFMENPQELETLLRNKFLERIKKQFI >CP029086.1|AWE64945.1|745038_745473_+|mannitol-specific-phosphotransferase-enzyme-IIA-component MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA >CP029086.1|AWE63997.1|745472_746579_+|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKAVHFGAGNIGRGFIGYILADNNVKVTFADVNEEIINALAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFAPFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVLDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFAGKATVLDAVKDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAGYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTADQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS >CP029086.1|AWE63965.1|746897_754343_-|sasC/Mrp/FmtB-intercellular-aggregation-domain-protein MNLFRQQKFSIRKFNVGIFSALIATVTFISTNPTTASAAEQNQPAQNQPAQPADANTQPNANAGAQANPAAQPANQGGQANPAGGAAQPAGQGNQADPNNAAQAQPGNQAAPANQAGQGNNQATPNNNATPANQTQPANAPAAAQPAAPVAANAQTQDPNASNTGEGSINTTLTFDDPAISTDENRQDPTVTVTDKVNGYSLINNGKIGFVNSELRRSDMFDKNNPQNYQAKGNVAALGRVNANDSTDHGNFNGITKTVNVKPDSELIINFTTMQTNSKQGTTNLVIKDAKKNTELATVNVAKTGTAHLFKVPTDADRLDLQFIPDNTAVADASRITTNKDGYKYYSFIDNVGLFSGSHLYVKNRDLAPKATNNKEYTINTEIGNNGNFGASLKADQFKYEVTLPQGVTYVNDSLTTTFPNGNEDSTVLKNMTVNYDQTANKVTFTSQGVTTARGTHTKEVLFPDKSLKLSYKVNVANIDTPKNIDFNEKLTYRTASDVVINNAQPEVTLTADPFSVAVEMNKDALQQQVNSQVDNSHYTTASIAEYNKLKQQADTILNEDANHVETANRASQADIDGLVTKLQAALIDNQAAIAELDTKAQEKVTAAQQSKKVTQDEVAALVTKINNDKNNAIAEINKQTTSQGVTTEKDNGIAVLEQDVITPTVKPQAKQDIIQAVTTRKQQIKKSNASLQDEKDVANDKIGKIETKAIKDIDAATTNAQVEAIKTKAINDINQTTPATTAKAAALEEFDEVVQAQIDQAPLNPDTTNEEVAEAIERINAAKVSGVKAIEATTTAQDLERVKNEEIFKIENITDSTQTKMDAYKEVRQAATARKAQNATVSNATDEEVAEANAAVDAAQTEGLHDIQVVKSQQEVADTKAKVLDKINAIQTQAKVKPAADTEVENAYNTRKQEIQNSNASTTEEKEAAYTELDAKKQEARTNLDAANTNSDVTTAKDNGIAAINQVQAATTKKSDAKAEIAQKASERKTAIEAMNDSTTEEQQAAKDKVDQAVVTANADIDNATANTDVDNAKTTNEATIAAITPDANVKPAAKQAIADKVQAQETAIDANNGSTTEEKEAAKQQVQTEKTAADAAIDAAHSNVEVEAAKNAEIAKIEAIQPATTTKDNAKQAIATKANERKTAIAQTQDITAEEIAAANADVDNAVTQANSNIEAANSQNDVDQAKTTGETSIDQVTPTVNKKATARNEITAILNNKLQEIQATPDATDEEKQAADAEANTENGKANQAISAATTNAQVDEAKANAEAAINAVTPKVVKKQAAKDEIDQLQATQTNVINNDQNATNEEKEAAIQQLATAVTDAKNNITAATDDNGVDTAKDAGKNSIQSTQPATAVKSNAKNEVDQAVTTQNQAIDNTTGATTEEKNAAKDLVLKAKEKAYQDILNAQTTNDVTQIKDQAVADIQGITADTTIKDVAKDELATKANEQKALIAQTADATTEEKEQANQQVDAQLTQGNQNIENAQSIDDVNTAKDNAIQAIDPIQASTDVKTNARAELLTEMQNKITEILNNNETTNEEKGNDIGPVRAAYEEGLNNINAATTTGDVTTAKDTAVQKVQQLHANPVKKPAGKKELDQAAADKKTQIEQTPNASQQEINDAKQEVDTELNQAKTNVDQSSTNEYVDNAVKEGKAKINAVKTFSEYKKDALAKIEDAYNAKVNEADNSNASTSSEIAEAKQKLAELKQTADQNVNQATSKDDIEVQIHNDLDNINDYTIPTGKKESATTDLYAYADQKKNNISADTNATQDEKQQAIKQVDQNVQTALENINNGVDNGDVDDALTQGKAAIDTIQVDATVKPKANQAIEAKAEDTKESIDHSDQLTAEEKTEALAMIKQITDQAKQGITDATTTAEVEKAKAQGLEAFDNIQIDSTEKQKAIEELETALDQIEAGVNVDADATTEEKEAFTNALEDILSKATEDISDQTTNAEIATVKNSALEQLKAQRINPVVKKNALEAIREVVNKQIEIIKNADADASAKEIARTDLGRYFDRFADKLDKTQTNTEVAELQNVTIPAIEAIVPQNDPDANDTNNGTDNNDATANSNANATPENTGQPNVSETTDNGKADASPTTPNNSDAATGETTVTSATDDAKDKPQANNNSSADASTNSPTMDNDVTSKPEVESTNNGTTDKPVTETDNATPAESTTNNNSTTTATNENAPTGSTATAPTTASTEAASSADSKDNASVNDSKQNAEVNNSAESQSTNGKVAQPKSENKAKAEKDGRDSTNQSMVESTTETLPSADITEPNVPSNTSKDKEESTTNQTDAGQLKSETNVASNEADKSPSKADTEVSNKPSTSASSEAKDKMTSTNVSQKDDTATADTNDTQKSVGPVANNKAKDMQTNDTQKSVGSAANNKATQNDGANASPATVSNGSHSMHQDMLNVTKPEENKANAKSDQQGKVNKPKQQAKTLPDTGMSHNDDLPYAELALGAGMAFLIRRFTKKDQQTEE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029086_5 | 855245-855325 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029086_5
|
1 spacers
spacers of CP029086_5
>5.1|855270|31|CP029086|CRISPRCasFinder CACATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029086_5
The CRISPR arrays of CP029086_5 >merge|CP029086|5|855245-855325|CRISPRCasFinder TCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTG >CP029086|5|5|855245-855325|CRISPRCasFinder TCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTG CACATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCT TCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTG
>CP029086.1|AWE64704.1|854541_854892_-|HTH-type-transcriptional-regulator-SarV MSNKVQRFIEAERELSQLKHWLKTTHKISIEEFVVLFKVYEAEKISGKELRDTLHFEMLWDTSKIDVIIRKIYKKELISKLRSETDERQVFYFYSTSQKKLLDKITKEIEVLSVTN >CP029086.1|AWE63938.1|853318_854440_+|sugar-(and-other)-transporter-family-protein MYLLLVVIAGYSKQAFDASDSLAGLVVGLFIVGSLIGRFATGKFVNQIGPKRLLFIGLITLIITQLLYFIDGSLAFLIFVRLINGIATAVVTTATGTIAAYVTPVNRKSEGISLFSLSLVLGTAIGPFLGMLLITKYAIDLLFIICVILGILGLIISLFIKVDFEVTNNKTETDVINKPRFSIHQFIAKEAIPVAVIMLLIGVTYASILTYLQAFALERHLVTAASYFFICYAIASLITRPIAGRLMDDKNENIIVYPAFIMLFLSFVCLISSYQSWLILLAGACLGLGYGNLSSAMQSIAIKVSPPIKYGIATSTFYVGLDAGVGFGPSFLGLFTHMFSYSEIFGFMAALAIITMLVYFLIHGRHVTRNAMN >CP029086.1|AWE64292.1|852795_853236_+|marR-family-protein MLSQEFFNSFITIYRPYLKLAEPILEKHNIYYGQWLILRDIAKHQPTTLIEISHRRAIEKPTARKTLKALIENDLITVENSLEDKRQKFLTLTPKGHELYEIVCLDVQKLQQAVVAKTNISQDQMQETINVMNQIHEILLKEAHND >CP029086.1|AWE63714.1|851869_852634_-|glyoxalase-like-domain-protein MILKFDHIIHYIDQLDRFSFPGDVIKLHSGGYHHKYGTFNKLGYINENYIELLDVENNEKLKKMAKTIEGGVAFATQIVQEKYEQGFKNICLRTNDIEAVKNKLQSEQVEVVGPIQMERDTHKDGKVKWQLLYIMNQDDDEIKPPFFIQWEESDSMRTKKLQKYFQKQFSIETVIVKSKNRSQTVSNWLKWFDMDIVEENDHYTDLILKNDDIYFRIEDGKVSKYHSVIIKDAQATSPYSIFIRGAIYRFEPLV >CP029086.1|AWE63812.1|849972_851238_-|glycine-glycyltransferase MEKMHITNQEHDAFVKSHPNGDLLQLTKWAETKKLTGWYARRIAVGRDGEVQGVAQLLFKKVPKLPYTLCYISRGFVVDYSNKEALNALLDSAKEIAKAEKAYAIKIDPDVEVDKGTDALQNLKALGFKHKGFKEGLSKDYIQPRMTMITPIDKNDDELLNSFERRNRSKVRLALKRGTTVERSDREGLKTFAELMKITGERDGFLTRDISYFENIYDALHEDGDAELFLVKLDPKENIAKVNQELNELHAEIAKWQQKMETSEKQAKKAQNMINDAQNKIAKNEDLKRDLEALEKEHPEGIYLSGALLMFAGSKSYYLYGASSNEFRDFLPNHHMQYTMMKYAREHGATTYDFGGTDNDPDKDSEHYGLWAFKKVWGTYLSEKIGEFDYILNQPLYQLIEQVKPRLTKAKIKISRKLKRK >CP029086.1|AWE64371.1|846688_849802_-|swarming-motility-protein-SwrC MVVLVVLGGVYASAKLKLELLPNVQNPVISVTTTMPGATPQSTQDEISSKIDNQVRSLAYVKNVKTQSIQNASIVTVEYENNTDMDKAEEQLKKEIDKIKFKDEVGQPELRRNSMDAFPVLAYSFSNKENDLKKVTKVLNEQLIPKLQTVDGVQNAQLNGQTNREITLKFKQNELEKYGLTADDVENYLKTATRTTPLGLFQFGDKDKSIVVDGQYQSVDAFKNINIPLTLAGGQGQSQSQSDNKQNSAMSDVNQASPQQNSKASAPNNISGMPTAKLGDLADITVGDVRTSISKTNGKDAVNLQITKAQDANTVQVAKDVQRKIDTFVDENKDFNVTKTMDTAKPVEKSLYTMVEKASLGTIVAIIVILLFLRNIRTTAISIISIPLSLLMALIALKLSDVSLNILTLGALTVAIGRVIDDSIVVVENIYRRLTDSEEQLKGENLIISATTEVFKPIMSSTLVTIIVFLPLVFVSGSVGEMFRPFALAIAFSLLASLLVSITLVPALAATLFKKGVKRRNKQHQEGLGVVSTTYKKVLHWSLNHKWIVIILSTLILVATIVFGGPRLGTSFISAGDDKFLAITYTPKPGETEQAVLNHAKDVEKYLKQKKHVKTIQYSVGGSSPVDPTGSTNSMAIMVEYDNDTPNFDVEADKVIKHVDGFKHPGEWKNQDLGTGAGNKSVEVTVKGPSMDAIKSTVKDIEQKMKQVKGLANVKSDLSQTYDQYEIKVDQNKAAENGISASQLAMHLNENLPEKTVTTVKENGKTVDVKVKQNKQTDWSEDKLNNITLKKPTGGTIKLGDIATLVKTTTPSKLTQEQGDYATTVSAKVTNKDVGGTTRQVMSKINNLDKPNNVKVNIGGASDDINNAMTQLAFAMLAAIIIVYLILVITFKGGLAPFTILFSLPFTVIGVIIALLITGETISVPSLIGMLMLIGIVVTNAIVLIDRVINNEQQGMEMKEALIEAGGTRIRPILMTAIATIGALVPLLFGQDSSILISKGLAATVIGGLISSTLLTLVVVPVIYEILFTLKKRFTKR >CP029086.1|AWE64818.1|846187_846505_+|putative-membrane-protein MQFYLILLAILYLIVSFISIFKMEVVFTRILRIIMGVLLLFVLALTTMSFPKENWWVFIVLLLLVGNVEVTGFKMLKKDLKGVNILNLMSLFIFVIYFILTIVLF >CP029086.1|AWE65136.1|845778_845943_+|hypothetical-protein MSLENQLAELKYDYVRLQGDLEKRESLNLDTSALVRQLKDIENEIRNVRAQMQD >CP029086.1|AWE64504.1|844737_845646_-|membrane-transport-family-protein MTEQFTMIILLIALGYFLKRINFIKATDSQVIATLVLNVTLPSLVIVNLNSAELKLSFSILPILMIIYGIVAKMIAVWFFRKYDNHMRGSVGMMTGAMNIGLFAYPLIEVIWPKTGLIYFGMADIGGAFVMFGITYFVGSYFSEGSDQFDFKYLGKKLLQSVPLVTYIVMFILNINHIHLPHVAIDFFSILSHANMPLSMILLGVMLNFTLERKYIPATIKYLCLHYGLALVAGLLVHVLLPVSDDMIKTTLLVTWMFPVGVAIISYGIQFKYRTLPFIGMTTNLTIIISIIILYVYQAVFV >CP029086.1|AWE65518.1|844199_844331_-|putative-nitrogen-regulation-protein-NIFR3 MYGAYLINEYHQDFKSIANFKVLKRMINVMMCYCVLFLEPRIS >CP029086.1|AWE64443.1|855468_856398_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-A MPKEVFGDDFVFLPKNELLTFDEMARIAKVYAELGVKKIRITGGEPLMRRDLDVLIAKLNQIDGIEDIGLTTNGLLLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDDTLFQSINNRNIKATTILEQIDYATSIGLNVKVNVVIQKGINDDQIIPMLEYFKDKHIEIRFIEFMDVGNDNGWDFSKVVTKDEMLTMIEQHFEIDPVEPKYFGEVAKYYRHKDNGVQFGLITSVSQSFCSTCTRARLSSDGKFYGCLFATVDGFNVKAFIRSGVTDEELKEQFKALWQIRDDRYSDERTAQTVANRQRKKINMNYIGG >CP029086.1|AWE65444.1|856510_857110_-|putative-molybdenum-cofactor-guanylyltransferase MKAIILAGGHSVRFGKPKAFAEVNGETFYSRVIKTLESTNMFNEIIISTNAQLATQFKYPNVVIDDENHNDKGPLAGIYTIMKQHPEEELFFVVSVDTPMITGKAVSTLYQFLVSHLIENHLDVAAFKEDGRFIPTIAFYSSNALGAITKALHSDNYSFKNIYHELSTDYLDVRDVDAPSYWYKNINYQHDLDALIQKL >CP029086.1|AWE65314.1|857116_857350_-|molybdopterin-converting-factor,-subunit-1 MKVLYFAEIKDILQKAQEDIVLEQALTVQQFEDLLFERYPQINNKKFQVAVNEEFVQKSDFIQPNDTVALIPPVSGG >CP029086.1|AWE63555.1|857355_857802_-|molybdopterin-synthase-catalytic-subunit MKQFEIVIEPIQTEQYREFTINEYQGAVVVFTGHVREWTKGVKTEYLEYEAYIPMAEKKLAQIGDEINEKWPGTITSIVHRIGPLQISDIAVLIAVSSPHRKDAYRANEYAIERIKEIVPIWKKEIWEDGSKWQGHQKGNYEEAKREE >CP029086.1|AWE63276.1|857815_858301_-|molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-protein-B MILQIVGYKKSGKTTLMRHIVSFLKTHGYTVATIKHHGHAKEDIQLQDSDVDHMKHFEAGADQSIVQGFQYQQTVTRVDNQNLTQIIEKSVTIDTNIVLVEGFKNADFEKVVVYRDEEELQVLQQLSNVCYSINVREHEDFTAFEQWLLNKIKNDCDTQLT >CP029086.1|AWE64508.1|858297_859557_-|molybdopterin-molybdenumtransferase MVVEKRNPIPVKEAIQRIVNQQSSMPAITVALEKSLNHILAEDIVATYDIPRFDKSPYDGFAIRSVDSQGASGQNRIEFKVIDHIGAGSVSDKLVGDHEAVRIMTGAQIPNGADAVVMFEQTIELEDTFTIRKPFSKNENISLKGEETKTGDVVLKKGQVINPGAIAVLATYGYAEVKVIKQPSVAVIATGSELLDVNDVLEDGKIRNSNGPMIRALAEKLGLEVGIYKTQKDDLDSGIQVVKEAMEKHDIVITTGGVSVGDFDYLPEIYKAVKAEVLFNKVAMRPGSVTTVAFADGKYLFGLSGNPSACFTGFELFVKPAVKHMCGALEVFPQIIKATLMEDFTKANPFTRFIRAKATLTSAGATVVPSGFNKSGAVVAIAHANCMVMLPGGSRGFKAGHTVDIILTESDAAEEELLL >CP029086.1|AWE64616.1|859619_860114_+|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-C MTEFTHINQQGHAKMVDVSDKQITKRTAVAHSSITVNETIFKQISNNTNTKGNVLNTAQIAGIMAAKNTSTIIPMCHPLPLTGIDVHFSWDETNAPLYTLNIQTTVSTTGKTGVEMEALTAASATALTIYDMTKAVDKGMIIGETYLESKSGGKSGDFQRQSGQ >CP029086.1|AWE63884.1|860115_860622_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-B MGEHQNVKLNRTVKAAVLTVSDTRDFVTDKGGQCVRQLLQADDVEVSDAHYTIVKDEKVAITTQVKKWLEEDIDVIITTGGTGIAQRDVTIEAVKPLLTKEIEGFGELFRYLSYVEDVGTRALLSRAVAGTVNNKLIFSIPGSTGAVKLALEKLIKPELNHLIHELTK >CP029086.1|AWE63640.1|860652_861657_-|thiF-family-protein MSQERYSRQILFKQIGEIGQSKINQKCALIIGMGALGTHVAEGLVRAGIAKLIIVDRDYIEFSNLQRQTLFTEEDALKMMPKVVAAKKHLLALRSDVDIDGCIAHVDYYFLETHGQDVDVIIDATDNFETRQLINDFAYKHRIPWIYGGVVQSTYTEAAFIPGKTPCFNCLVPQLPALNLTCDTVGVIQPAVTMATSLQLRDAMKVLTEQPIDTKITYGDIWEGSHYSFGFSKMQRSDCTTCGDVPSYPYLNKNEQRYATLCGRDTVQYENASITHDILVQFLKQHQLNYRSNSYMVMFEFKGHRIVAFKGGRFLIHGMTRTSDATHLMNLLFG >CP029086.1|AWE64566.1|861826_862432_-|AAA-domain-protein MLKINVKYQLKNTLIRINIDDTEPKIYAVRGPSGIGKTTVLNMIAGLRKADEAIIEVNGQLLTDTTKNVNVKIQQRRIGYLFQDYQLFPNMTVYKNITFMAEPSKHIDQLIQTLNINHLMKQYPMTLSGGEAQRVALARALSTKPDLILLDEPFSSLDDTTKDESITLVKRIFNEWQIPIIFVTHSNYEAEQMAHEIITIG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029086_6 | 1737484-1737585 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029086_6
|
1 spacers
spacers of CP029086_6
>6.1|1737507|56|CP029086|CRISPRCasFinder AAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029086_6
The CRISPR arrays of CP029086_6 >merge|CP029086|6|1737484-1737585|CRISPRCasFinder TTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTATATATGAATTGAGTATTAAATTTG >CP029086|6|6|1737484-1737585|CRISPRCasFinder TTATGAATTGAGTATTAAATTTG AAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTAT ATATGAATTGAGTATTAAATTTG
>CP029086.1|AWE63771.1|1735236_1736625_-|L-cystine-uptake-protein-TcyP MNAFLTLINIIVLVIFIVILHMMARKHISFAKRVFTALGIGIVFGVLLHLVYGTHSNVITSTSDWFNIVGQGYVALLQMIVMPLIFISIVAAFTKIQIGEKFAKIGSLIFIFLIGTVTIAAIVGVVYALVFGLDASTINLGNAEQARGSEIAKQAKDLTAHTLPQQILELLPKNPFLDFTGQRATSTIAVVIFASFIGFAYLRVARKQPDHGELLKRAIDAIYSLVMAIVTFVLRLTPYGVLAIMANTLSTSDFGAIWTLGKFLIASYAALITMYIIHLIILSLLGISPIRYVKKTLEVLIFAFTSRSSAGALPLNVQTQTRRLGVPEGIANFAATFGLSIGQNGCAGIYPAMLAIMVAPVANVEIDLQFIVTLIAVVIISSFGVAGVGGGATFASILVLSTLNLPVALAGVLISVEPLIDMGRTALNVNDSMLAGTGTAKLTKHWDKDTFESNDNAALTSH >CP029086.1|AWE63785.1|1734401_1735157_+|NADPH-dependent-oxidoreductase MSDYVYNLVKKHHSVRKFKNKPLSEDVVKKLVEAGQSASTSSFLQAYSIIGIDDEKIKENLREVSGQPYVVENGYLFVFVIDYYRHHLVDQHAETDMENAYGSTEGLLVGAIDAALVAENIAVTAEDMGYGIVFLGSLRNDVERVREILDLPDYVFPVFGMAVGEPADDENGAAKPRLPFDHVFHHNKYHADKETQYAQMADYDQTISEYYDQRTNGNRKETWSQQIEMFLGNKARLDMLEQLQKSGLIQR >CP029086.1|AWE63457.1|1733340_1733910_-|peroxiredoxin MSLINKEILPFTAQAFDPKKDQFKEVTQEDLKGSWSVVCFYPADFSFVCPTELEDLQNQYEELQKLGVNVFSVSTDTHFVHKAWHDHSDAISKITYTMIGDPSQTITRNFDVLDEATGLAQRGTFIIDPDGVVQASEINADGIGRDASTLAHKIKAAQYVRKNPGEVCPAKWEEGAKTLQPGLDLVGKI >CP029086.1|AWE63157.1|1731801_1733325_-|alkyl-hydroperoxide-reductase-subunit-F MLNADLKQQLKQLLELMEGNVEFVASLGSDEKSKELKELLTEISDMSPRLSLSEKSLKRTPSFSVNRPGEETGVTFAGIPLGHEFNSLVLAILQVSGRAPKEKQSIIDQIKNLEGSFHFETFISLTCQKCPDVVQALNLMSVINPNITHSMIDGAVFREESENIMAVPAVFLNGEEFGNGRMTIQDILSKLGSTADASEFENKEPYDVLIVGGGPASGSAAIYTARKGLRTGIVADRIGGQVNDTAGIENFITVKETTGSEFSSNLAAHIDQYDIDAMTGIRATDIEKTDEAIKVTLENGAVLESKTVIIATGAGWRKLNIPGEEQLINKGVAFCPHCDGPLFENKDVAVIGGGNSGVEAAIDLAGIVNHVTLFEFASELKADNVLQDRLRSLSNVDIKTNAKTTEVVGEDHVTGIRYEDMSTGEEHLLNLDGIFVQIGLLPNTSWLKDAVELNERGEIVIDRNNNTNVPGIFAAGDVTDQKNKQIIISMGAGANAALNAFDYIIRN >CP029086.1|AWE63616.1|1731430_1731622_-|hypothetical-protein MNEIIMLLRTIPTSKLIQPIMQLFIDNAILNIVQNDALLIEKATHARNHLRLWSLQGHRDIPN >CP029086.1|AWE63077.1|1730731_1731358_-|hypothetical-protein MKKRLLLSTFLASALILTGCASDQSDNEDHHTSTGIHAPKSAKKLETKDIFNSDKKNSDISDAEMKQAIEKYLSVNSDILDNKYIMQHKLDKQIDSQTKVTEKQAETLSHLSNLAVKNDLHFKKFVTENNIPKEYKKPVELMMNYFKALNSTIANVDEDIEKLSYQPQNKINVVDVPTKYAGDVNKKQQDKIKDFLKSKGIKSDVIDK >CP029086.1|AWE63365.1|1730078_1730462_-|putative-membrane-protein MKVRITFIILAILSTIVCLFLAAMHPTGPNTVTFEQPYLFTLNIILMVLVALPSLVLAIYDYMSFRISSAILQFLGAISWFFLSLILSLTQFTPFTLASFITSIILFISAIITLAIGGKSVDKNDSH >CP029086.1|AWE64382.1|1729431_1730013_+|histidine-phosphatase-super-family-protein MTIYLVRHGESKSNYDNKHFRSYFCGQLDVPLTDTGTKSADDLCDYFKEKQIKHVYVSDLLRTQQTFEHIFPYDIASTTTPLLRERSLGVFEGEYKDEISANPKYEKYFNDPNFKDFRHSFSQKAPEGESYEDVYQRVEHFMNHVVNEDTQKDDIVIVAHQVVIRCLMVYFNKVSREEAVDLKVENCKPYIIE >CP029086.1|AWE63432.1|1728772_1729006_+|transglycosylase-associated-family-protein MLIVGGLIGWAAGAIMGKDIPGGILGNIIAGIIGSWVGGKLFGQWGPELGSIYILPALIGSIILIAIVTLILRAMRK >CP029086.1|AWE65010.1|1728191_1728455_-|hypothetical-protein MNMHILYNLRTKHNLEIDELAQQLNEKYGTKYEAHQIWEWENHHHEPKFKDAMHLADFFDAPYEMFLESKVKEYQKHLEEVDIRMDK >CP029086.1|AWE65498.1|1737601_1738558_-|hypothetical-protein MLTKEFAQRVELSEKQVRKIVQHLEERGYQLSKTEYRGREATDFKEEDIELFKDIADKVKQTNSYDLAFDELEKEKDFLQVIVKNDDKNLPTNQNVAQLVEDLRLEIQKMREERHLLGQMMNQVHQQQQELKELQNQLTSKIDSNSESLKAIQTSQEAIQEAQASQAKVLAESTNKVEKNAVTEDKADSKDSKVAGVNTSTDAKTDTKAENAGDGTATKVDKEDQISATEAIEKASVEQSKNENAAETSNKEATVDADAQHDAEQQVAEAHAEASKQATSNDSLEAKAENDSTASQSEMSEPKPQEEKKGFFARLFNL >CP029086.1|AWE64325.1|1738675_1739338_-|hypothetical-protein MEFKTIQSVKDPHYNEALKLYDTKLNLSLTEDKRIIKRSLENNKTENDYVFIVGLENDVVVSLATAHYEATTNSAFLIYLFAKDLPNHDELMTQTLHQIEHELNLLSNLVHSRSINFLMMEVPKEPADLTQDNGLIIEHRRQFLYEHQFERQTEIDYIHPTNDGHTKKVDLFLKKNIKLTKDIYGTSVKSNYILKYVFANGIAREIIYALLEEMDLRKPF >CP029086.1|AWE63954.1|1739480_1739888_-|hypothetical-protein MADITVVNDTGELYNVINQKKSEGYLESELTIISKSKLHLNDLHDSEISLISTSGTFSDRMTKLLTGEDGEHAVLSRYNLAPDELEKYKQLILDDKMLVVAVRDKSSHKEVQEHNSAYEEIDITHFAEASKGPKA >CP029086.1|AWE65400.1|1740400_1740979_+|xanthine-phosphoribosyltransferase MELLGQKVKEDGVVIDEKILKVDGFLNHQIDAKLMNEVGRTFYEQFKDKGITKILTIEASGIAPAIMAALHFDVPCLFAKKAKPSTLTDGYYETSIHSFTKNKTSTVIVSKEFLSEEDTVLIIDDFLANGDASLGLYDIAQQANAKTAGIGIVVEKSFQNGHQRLEEAGLTVSSLCKVASLEGNKVTLVGEE >CP029086.1|AWE64004.1|1740978_1742247_+|xanthine-permease-family-protein MKNLILSVQHLLAMYAGAILVPIIVGTSLKFTPEQIAYLVTVDIFMCGVATFLQANKVTGTGLPIVLGCTFTAVAPMILIGQTKGIDVLYGSLFLSGILVIIIAPFFSHLVKFFPPVVTGSVVTIIGINLMPVAMNYLAGGQGAKDYGDVKNILLGLMTLIIILVLQRFTTGFIKSIAILIGLVLGTIGAGLLGMVDINQVNHAGWLGIPVPFRFSGFSFDVTSTLVFFIVAIVSLIESTGVYHALSEITGKKLERKDFRKGYTAEGLAIVLGSIFNSFPYTAYSQNVGLVSLSGAKKNNVIYGMVVLLLICGCIPKLGALANIIPLPVLGGAMIAMFGMVMAYGVSILGHIDFKNQNNLLIIAVSVGLGTGISAVPQAFKGLGEQFAWLTQNGIVLGAISAIILNFFFNGIKYKQTEENVK >CP029086.1|AWE63942.1|1742284_1743751_+|inosine-5'-monophosphate-dehydrogenase MWESKFAKESLTFDDVLLIPAQSDILPKDVDLSVQLSDKVKLNIPVISAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVIHKNMGVEEQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEESVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKIVDVMTQENLITAPVNTTLEEAEKILQKHKIEKLPLVKDGRLEGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEHGRLLVAAAIGISKDTDIRAQKLVEAGVDVLVIDTAHGHSKGVIDQVKHIKKTYPEITLVAGNVATAEATKDLFEAGADIVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATEARKHGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEIFQGRQYKVYRGMGSLGAMEKGSNDRYFQEDKAPKKFVPEGIEGRTAYKGALQDTIYQLMGGVRAGMGYTGSHDLRELREEAQFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSF >CP029086.1|AWE64697.1|1743775_1745317_+|GMP-synthase MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISIEEIKKMNPKGIILSGGPNSVYEEGSFTIDPEIYNLGIPVLGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIINAKSDELFAGLPAEQTVWMSHSDKVIEIPEGFEVIADSPSTDYAAIEDKKRRIYGVQFHPEVRHTEYGNDLLNNFVRRVCDCKGQWTMENFIEIEIEKIRQRVGDRRVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVNAKDRFMNKLKGVSDPEQKRKIIGNEFVYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMEFELIEPINTLFKDEVRKLGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLEIVRESDAILRQVIREEGLEREIWQYFTVLPNIQSVGVMGDYRTYDHTVGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPSTIEWE >CP029086.1|AWE63065.1|1745429_1745906_-|hypothetical-protein MALVKGYINEYKLTTVLRALNNSDYTKGTIHTRSIGNLKQIVDNRIIPKNITQNKIFKLSNLTLEVNLYERNTIYHGDFAIYYPVESALIIETDTPRLINHINNNPVQKIFIITTNDWSFNTLELEKIVDETIIYDLKQEDPKQYEILYKNKHGKLPY >CP029086.1|AWE63901.1|1746357_1747062_-|pemK-like-family-protein MSKNINQANSKLNTSNKKLKQAYSKSDSKNMKVIYMPHWLEFYSIAIHSDVTSNKKRYYKSFSRGTVVYVKLGSNIGSEFSGNHFCVILDNKDNKGKETVTIVPLSSKGNKNYLKLNESVLNLTATDLKKQIIDISSKVQALTQKYRDIDIKLSTEDKKLLSNLNQKANELYRVIGVYSKHKGKDTYVNISAITTISKRRISKINDSDPTGTIIISEDDMNEIEKQLKIKFFSN >CP029086.1|AWE64938.1|1747460_1747688_-|putative-transposase MVRLYKNGKLKNEIIRKYDLKPSIISNSIKQHQNTGPFNHQDNLKSDEKELIKLRKEVQHLKMEHDVLKQILKLI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029086_7 | 2133590-2133668 | Unclear |
NA
Consensus repeat of CP029086_7
|
1 spacers
spacers of CP029086_7
>7.1|2133614|31|CP029086|CRISPRCasFinder CTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGTATTGCC |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029086_7
The CRISPR arrays of CP029086_7 >merge|CP029086|7|2133590-2133668|CRISPRCasFinder TGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGTATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCT >CP029086|7|7|2133590-2133668|CRISPRCasFinder TGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCT CTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGTATTGCC TGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCT
>CP029086.1|AWE64426.1|2130416_2133263_+|excinuclease-ABC-subunit-A MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNIDLSEQDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIDVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGIDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDK >CP029086.1|AWE63677.1|2128423_2130409_+|excinuclease-ABC-subunit-B MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVDGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >CP029086.1|AWE63080.1|2127918_2128155_+|hypothetical-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >CP029086.1|AWE65128.1|2127271_2127922_+|HD-containing-hydrolase-like-enzyme-family-protein MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENE >CP029086.1|AWE63438.1|2126258_2127098_+|staphyloxanthin-biosynthesis-protein,-putative MKKTLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQHGTQVKTPVQHNYVSNVQAQTQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKAVKSPVRKASQAKKVVKQPVQQASKKVVVKQAPKQAVAKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTPEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH >CP029086.1|AWE63173.1|2124857_2125850_+|peptide-chain-release-factor-2 MAEPNFWDNQTKAQDIIDKNNALKAIVNGYKTLQAEVDDMDATWDLLQEEFDEEMKEDLEQEVINFKAKVDEYELQLLLDGPHDANNAILELHPGAGGTESQDWANMLFRMYQRYCEKKGFKVETVDYLPGDEAGIKSVTLLIKGHNAYGYLKAEKGVHRLVRISPFDSSGRRHTSFASCDVIPDFNNDEIEIEINPDDITVDTFRASGAGGQHINKTESAIRITHHPSGIVVNNQNERSQIKNREAAMKMLKSKLYQLKLEEQAREMAEIRGEQKEIGWGSQIRSYVFHPYSMVKDHRTNEETGKVDAVMDGDIGPFIESYLRQTMSHD >CP029086.1|AWE65413.1|2121899_2124431_+|preprotein-translocase,-SecA-subunit MGFLSKILDGNNKEIKQLGKLADKVIALEEKTAILTDEEIRNKTKQFQTELADIDNVKKQNDYLDKILPEAYALVREGSKRVFNMTPYKVQIMGGIAIHKGDIAEMRTGEGKTLTATMPTYLNALAGRGVHVITVNEYLSSVQSEEMAELYNFLGLTVGLNLNSKTTEEKREAYAQDITYSTNNELGFDYLRDNMVNYSEDRVMRPLHFAIIDEVDSILIDEARTPLIISGEAEKSTSLYTQANVFAKMLKQDEDYKYDEKTKAVHLTEQGADKAERMFKVENLYDVQNVDVISHINTALRAHVTLQRDVDYMVVDGEVLIVDQFTGRTMPGRRFSEGLHQAIEAKEGVQIQNESKTMASITFQNYFRMYNKLAGMTGTAKTEEEEFRNIYNMTVTQIPTNKPVQRNDKSDLIYISQKGKFDAVVEDVVEKHKAGQPVLLGTVAVETSEYISNLLKKRGIRHDVLNAKNHEREAEIVAGAGQKGAVTIATNMAGRGTDIKLGEGVEELGGLAVIGTERHESRRIDDQLRGRSGRQGDKGDSRFYLSLQDELMIRFGSERLQKMMSRLGLDDSTPIESKMVSRAVESAQKRVEGNNFDARKRILEYDEVLRKQREIIYNERNSIIDEEDSSQVVDAMLRSTLQRSINYYINTADDEPEYQPFIDYINDIFLQEGDITEDDIKGKDAEDIFEVVWAKIEAAYQSQKDILEEQMNEFERMILLRSIDSHWTDHIDTMDQLRQGIHLRSYAQQNPLRDYQNEGHELFDIMMQNIEEDTCKFILKSVVQVEDNIEREKTTEFGEAKHVSAEDGKEKVKPKPIVKGDQVGRNDDCPCGSGKKFKNCHGK >CP029086.1|AWE65111.1|2120913_2121486_+|ribosomal-subunit-interface-protein MIRFEIHGDNLTITDAIRNYIEEKIGKLERYFNDVPNAVAHVKVKTYSNSATKIEVTIPLKNVTLRAEERNDDLYAGIDLINNKLERQVRKYKTRINRKSRDRGDQEVFVAELQEMQETQVDNDAYDDNEIEIIRSKEFSLKPMDSEEAVLQMNLLGHDFFVFTDRETDGTSIVYRRKDGKYGLIQTSEQ >CP029086.1|AWE65453.1|2120445_2120853_+|putative-amidophosphoribosyltransferase,-ComFC MIHQYKFLKDYYLCELLAHLIEIPQTSYDYIVPIPSSPAHDLSRTFNPVEAVLKAKGIRFDKILKMSNRPKQSHLTKKERLADENPFIIDTELDLNGKEILLVDDIYTTGLTIHRAGCKLYAKNIRKFKVFAFAR >CP029086.1|AWE63126.1|2119103_2120186_+|helicase-domain-protein MDNVTRYKITESSQSSSQAYYHLSFELSEQQSYASEHIVRAIRMRQTILLYAVTGAGKTEMMFQGIQYARRQGDNIAIVSPRVDVVVEISKRIKDAFLNEDIDILHQQSSQQFEGHFVVCTVHQLYRFKQHFDTIFIDEVDAFPLSMDKSLQQALKSSSKVEHATIYMTATPPKQLLSEIPHENIIKLPARFHKKSLPVPKYRYFKLNNNKIQKMLYRILQDQINNQRYTLVFFNNIETMIKTFSVYKQKITKLTYVHSEDVFRFEKVEQLRNGHFDVIFTTTILERGFTMANLDVVVIDAHQYTQEALIQIAGRVGRKLECPAGKVLFFHEGVSMNMIQAKKEIQRMNKLALKRGWIDE >CP029086.1|AWE63317.1|2133926_2134859_+|HPr(Ser)-kinase/phosphatase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >CP029086.1|AWE63335.1|2134864_2135704_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPSEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >CP029086.1|AWE64949.1|2135711_2136197_+|bacterial-transferase-hexapeptide-family-protein MRKFLSKTHHHTNPLWRVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >CP029086.1|AWE65514.1|2136204_2137644_+|tetratricopeptide-repeat-family-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYQNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >CP029086.1|AWE63856.1|2137710_2138646_+|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >CP029086.1|AWE64457.1|2139528_2140440_+|hypothetical-protein MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >CP029086.1|AWE63252.1|2140436_2141432_+|hypothetical-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >CP029086.1|AWE65259.1|2141542_2142487_+|sporulation-Regulator-WhiA-C-terminal-domain-protein MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >CP029086.1|AWE63733.1|2143050_2143638_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase,-proteolytic-subunit-ClpP MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >CP029086.1|AWE63670.1|2143880_2144750_-|NAD-dependent-epimerase/dehydratase-family-protein MVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQNIDVVINLAGATLKKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKVLFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGMILSNEGGALQTMKLPYKYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINNESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLIKE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029086_8 | 2182417-2182498 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029086_8
|
1 spacers
spacers of CP029086_8
>8.1|2182441|34|CP029086|CRISPRCasFinder ATTGAGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029086_8
The CRISPR arrays of CP029086_8 >merge|CP029086|8|2182417-2182498|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGAGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCATCCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA >CP029086|8|8|2182417-2182498|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAA ATTGAGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCAT CCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA
>CP029086.1|AWE63286.1|2181434_2182313_+|hypothetical-protein MLNIQDVSHLSKKEQKAYNRFVESVENGNLPVLPCIEMDLKEMQEETLSQSKIGGMPFLKSFKDIPLDENNVPMVLLAQINLNDLPEQQELFPVNEGILQFWISSEDQMYGMSENLKGNNINSRLVYIKEPITDLSLENIQVHLKSLDADNEDIPFSGAFSIEFRLSKQTITCTDYKYDEDVLALWNKVNPSFALKSMFGGYDELMEPVCNTFTAKEPFNQLGGYPYFDQIDPRTNDQELKMYDRVLLQIDSTRDGNSSIIWGDLGIANILVKSTDLEAMKFDDYMYSWDCS >CP029086.1|AWE63139.1|2181319_2181433_+|hypothetical-protein MKENLLGTIIWSIATFYYSRMMKIMNLAILKIKIGGS >CP029086.1|AWE63751.1|2180875_2181256_+|glycine-cleavage-system-H-protein MAVPNELKYSKEHEWVKVEGNVATIGITEYAQSELGDIVFVELPETDDEINEGDTFGSVESVKTVSELYAPISGKVVEVNEELEDSPEFVNESPYEKAWMVKVEISDESQLEALLTAEKYSEMIGE >CP029086.1|AWE63031.1|2180361_2180718_+|transcriptional-regulator,-Spx/MgsR-family-protein MIKFYQYKNCTTCKKAAKFLDEYGVSYEPIDIVQHTPTINEFKTIIANTGVEINKLFNTHGAKYRELDLKNKLQTLSDDEKLELLSSDGMLVKRPLAVMGDKITLGFKEDQYKETWLA >CP029086.1|AWE64138.1|2179897_2180218_-|thioredoxin-family-protein MQAIKSNESFKSIINSDTPVIVKFEAGWCPDCRAMDLWIDPIVEQYNDYQWYTVNRDELEDVVVENEVMGIPSLLVFKNGDKIAHLHSANAKSPEQVESFLAETFK >CP029086.1|AWE64400.1|2179207_2179747_+|nitroreductase-family-protein MELQQAIANRRSVKKFKRDMHIDDALLYQAIEKAADAPNHGMREPWRVVHVPKDRLGDMSKDISKFAFPNELDKQQCHYDAVTKLGGMLLLILKTDPRQRQNDENYFAFGAYAQNLMLLLYEAGIGTCWKSPLYIYDPKVRKTLGIKKDEVLAGFLYLTDLEEDMPKAPRKNRNLITLY >CP029086.1|AWE65365.1|2178408_2179125_+|3-dehydroquinate-dehydratase MTHVEVVATIAPQLSIEETLIQKINHRIDAIDVLELRIDQIENVTVDQVAEMITKLKVMQDSFKLLVTYRTKLQGGYGQFINDLYLNLISDLANINGIDMIDIEWQADIDIEKHQRIIKHLQQYNKEVVISHHNFESTPPLDELQFIFFKMQKFNPEYVKLAVMPHNKNDVLNLLQAMSTFSDTMDCKVVGISMSKLGLISRTAQGVFGGALTYGCIGESQAPGQIDVTDLKAQVTLY >CP029086.1|AWE65512.1|2177838_2178261_-|peroxiredoxin,-Ohr-subfamily-protein MAIHYETKATNVGGRKGHVYTDDRALDIDIVPPAQADGKATNPEQLFAAGYASCFNGAFDLILKQNKVRDAHPEVTLTVRLEDDSDSESPKLSVSIDATIKNVISQEEAEKYLQMAHEFCPYSKATQGNINVDLNVNVVD >CP029086.1|AWE65158.1|2176945_2177440_-|acetyltransferase-domain-protein MIEIKTLMNNDFNEYKRLVSTVNEEFTQDSHYSQTMTDTLIHDILNQGSPKCIVFGCYENETLIATAALEQIRYVGKEHKSLIKYNFVTNNDKSINSELINFIINYARQNNYESLLTSIVSNNIGAKVFYSALGFDILGFEKNAIKIGNTYFDEHWLFYDLINK >CP029086.1|AWE63199.1|2176173_2176791_-|lysE-type-translocator-family-protein MVTAIIHGFILAIGLILPLGAQNVFIFNQGANQPKYRYVLPAIITAGLSDSLLIIITVVGVSIIIMSLPVLQAIIYIVGLIFLMYMAWTIWHDKPSTDGEAQIISPMKQVSFALSVSLLNPHAILDTIGVIGSSAALYSGSNKIAFTIACISVSWLWFFLLAILGKMVGSIDKTGKLLTIINKISSIIIIIVALMILQKLIQLLF >CP029086.1|AWE63084.1|2183108_2183495_+|toprim-domain-protein MAIVNKVIIVEGKSDKKRVQQVIAEPVNIICTHGTMSIDKLDDMIESLYDKQVFVLADSDDEGDRIRNWFKRYLSESEHIFIDKTYCQVANCPKQYLAHVLSKHGFTCKKETPLLPNINNERLVLVNE >CP029086.1|AWE65427.1|2183487_2183784_+|thioredoxin-family-protein MNNSLDIKDVTTFYEEDKHLIFGYTPTCGTCKVSERMLDIANEILQLPLLKIDLNFYPQFCKDMQIMSTPILLLMNKDKEVKRIYAFKSVTDLLENLK >CP029086.1|AWE63903.1|2184033_2185059_+|methionine-import-ATP-binding-protein-MetN-2 MIELKEVVKEYRTKNKEVLAVDHVNLSIRAGSIYGVIGFSGAGKSTLIRMFNHLEAPTSGEVIIDGDHIGQLSKNGLRAKRQKVSMIFQHFNLLWSRTVLKNIMFPLEIAGVPRRRAKQKALELVELVGLKGREKAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPTVLLCDEATSALDPKTTDEILDLLLKIREQQNLTIVLITHEMHVIRRICDEVAVMESGKVIEHGPVTQVFENPQHTVTKRFVKEDLNDDFETSLTELEPLEKDAYIVRLVFAGSTTTEPIVSSLSTAYDIKINILEANIKNTKNGTVGFLVLHIPYISSVDFGKFEKELIERQVKMEVLRHG >CP029086.1|AWE64780.1|2185093_2185747_+|methionine-import-system-permease-protein-MetP MPNIQWPEVWTAIVETLYMTVVSTIFAFILGLILGVLLFLSAKGKSIGARLFYSIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSLILGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTWIVIRKVLLPEAMPALVSGITVTAITLVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWLTNKLDKR >CP029086.1|AWE63702.1|2185764_2186586_+|NLPA-lipofamily-protein MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGNKSGSDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYDLDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGDVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFLPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK >CP029086.1|AWE64544.1|2186939_2187134_+|hypothetical-protein MADESKFEQAKGNVKETVGNVTDNKNLENEGKEDKASGKAKEFVENAKEKATDFIDKVKGNKGE >CP029086.1|AWE64279.1|2187367_2188219_-|hypothetical-protein MQQFKWINILKGFAMGTSDLVPGVSGGTIALLLGIYNQFIASISGIFSRRFWPSFTFLIPIIIGMLLAMGSLSNLFNYLLSQHHIPTMFFFGGLIIGIVPYLLKISNYKTSFTTKHYMMVIAGIAILIVITLMNNGDKHAGETLTLSTGLIIKYFIAGMCASSAMLLPGISGSFMLLVFGVYGTVMLAISEVVKLNFTGLPILLAVGFGVLAGFIISSKIIQYFLTHHKLMTFALIIGFVVGSLFAVFPGLPTNIVMWFVSLVVFIIGFIVSLTLGRITAENE >CP029086.1|AWE65058.1|2188546_2189308_+|feS-assembly-ATPase-SufC MASTLEIKDLHVSIEDKEILKGVNLTINTDEIHAIMGPNGTGKSTLSSAIMGHPSYEVTKGEVLLDGVNILELEVDERAKAGLFLAMQYPSEITGVTNADFMRSAINAKREEGQEINLMQFIKKLDKNMDFLDIDKDMAQRYLNEGFSGGEKKRNEILQLMMLEPKFAILDEIDSGLDIDALKVVSKGINQMRGENFGALMITHYQRLLNYITPDKVHVMYAGKVVKSGGPELAKRLEEEGYEWVKEEFGSAE >CP029086.1|AWE65241.1|2189405_2190713_+|feS-assembly-protein-SufD MTTDILNISEEQLVDYSKAHNEPSWMTELRKKALKLTETLEMPKPDKTKLRKWDFDSFKQHDVKGDVYQSLSQLPESVREIIDVDHSKNLVIQHNNTIAYTQVDDNASKDGVIVEGLADALMNHSDLVQKHFMKDAVTVDEHRITALHTALVNGGVFVYVPKNVVVEHPVQYVVLHDDKNASFYNHVIIVTEESAEVTYVENYLSNASGEGNQLNIISEVIAGANSNITYGSVDYMDKGFTGHIIRRGITEADASINWALGLMNEGSQIIDNTTNLFGDRSTSSLKSVVVGTGEQKVNLTSKIVQYGKETDGYILKHGVMKEHASSVFNGIGYIKHGGTKSIANQESRVLMLSEHARGDANPILLIDEDDVQAGHAASVGRVDPDQLYYLMSRGISQREAERLVIHGFLDPVVRELPIEDVKRQLREVIERKVSK >CP029086.1|AWE63834.1|2190827_2192069_+|putative-cysteine-desulfurase MAEHSFDVNEVIKDFPILDQKVNGKRLAYLDSTATSQTPMQVLNVLEDYYKRYNSNVHRGVHTLGSLATDGYENARETVRRFINAKYFEEIIFTRGTTASINLVAHSYGDANVEEGDEIVVTEMEHHANIVPWQQLAKRKNATLKFIPMTADGELNIEDIKQTINDKTKIVAIAHISNVLGTINDVKTIAEIAHQHGAIISVDGAQAAPHMKLDMQEMNADFYSFSGHKMLGPTGIGVLFGKRELLQKMEPIEFGGDMIDFVSKYDATWADLPTKFEAGTPLIAQAIGLAEAIRYLERIGFDAIHKYEQELTIYAYEQMSAIEGIEIYGPPKDRRAGVITFNLQDVHPHDVATAVDTEGVAVRAGHHCAQPLMKWLNVSSTARASFYIYNTKEDIDQLINALKQTKEFFSYEF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029086_9 | 2447373-2447530 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029086_9
|
2 spacers
spacers of CP029086_9
>9.1|2447419|11|CP029086|PILER-CR ATACAAAAATG >9.2|2447476|11|CP029086|PILER-CR ATACAAAAATG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029086_9
The CRISPR arrays of CP029086_9 >merge|CP029086|9|2447373-2447530|PILER-CR TGCAAGTTGGGGTGGGGCCCAACACAGAAGCTGGCGAAAAGTCAGCATACAAAAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGAAAAGTCAGCATACAAAAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGCAAAGTCAGC >CP029086|9|1|2447373-2447530|PILER-CR TGCAAGTTGGGGTGGGGCCCAACACAGAAGCTGGCGAAAAGTCAGC ATACAAAAATG TGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGAAAAGTCAGCA TACAAAAATGT GCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGCAAAGTCAGC
>CP029086.1|AWE64720.1|2446545_2446896_+|complement-inhibitor MKFKKYILTGTLALLLSSTGIATIEGNKADASSLDKYLTESQFHDKRIAEELRTLLNKSNVYALAAGSLNPYYKRTIMMNEYRAKAALKKNDFVSMADAKVALEKIYKEIDEIINR >CP029086.1|AWE64685.1|2445898_2446396_+|fibrinogen-binding-protein MKNKLIAKSLLTIAAIGITTTTIASTADASEGYGPREKKPVSINHNIVEYNDGTFKYQSRPKFNSTPKYIKFKHDYNILEFNDGTFEYGARPQFNKPAAKTDATIKKEQKLIQAQNLVREFEKTHTVSAHRKAQKAVNLVSFEYKVKKMVLQERIDNVLKQGLVR >CP029086.1|AWE63562.1|2445132_2445639_+|putative-membrane-protein MIIKILTILLLLCILSYLVTNRKKPFLFLKTLFMGVVFIFIGYISLAISAVIIYGIIQFITIDFGSFFLMGIILILISSIFQLFIVRLLFRKKNVDLTEVVVLEHLIQWFLVYFAIYQAVNEKMDINDINIDNFQSVFFDVSNLNLVILPTLIISWVTIFNYRMRSYK >CP029086.1|AWE63804.1|2444061_2444463_-|FPRL1-inhibitory-protein MKKNITKTIIASTVIAAGLLTQTNDAKAFFSYEWKGLEIAKNLADQAKKDDERIDKLMKESDKNLTPYKAETVNDLYLIVKKLSQGDVKKAVVRIKDGGPRDYYTFDLTRPLEENRKNIKVVKNGEIDSIYWD >CP029086.1|AWE63849.1|2443854_2443971_+|putative-membrane-protein MAIVKRKSNVLTIIKIVTDIVATVLIIRALLNSRKDAK >CP029086.1|AWE64506.1|2443363_2443693_+|fibrinogen-binding-protein MKKNFIGKSILSIAAISLTVSTFAGESHAQTKNVEAAKKYDQYQTNFKKQVNKKVVDAQKAVNLFKRTRTVATHRKAQRAVNLIHFQHSYEKKKLQRQIDLVLKYNTLK >CP029086.1|AWE64992.1|2442370_2442874_+|phosphodiesterase,-MJ0936-family-protein MSKWIIVSDNHTESGVLYQIYEMHPDADVYLHLGDSEFAYDDTELSLFNRVKGNCDFYPEFENEAVAKYNDVKAFYTHGHLYQVNRTRDLLAEKGLELGCLFAFYGHTHVAKYEYINGVHVINPGSISQSRSSMEETYAEVIIDDQTLHGTINFKNRHHETISHTTF >CP029086.1|AWE65501.1|2441790_2442378_+|non-canonical-purine-NTP-pyrophosphatase,-RdgB/HAM1-family MKEIVIASNNQGKINDFKVIFPDYHVIGISELIPDFDVEETGSTFEENAILKSEAAAKALNKTVIADDSGLEVFALNGEPGIYSARYAGENKSDEANIEKLLNKLGNTTDRRAQFVCVISMSGPDMETKVFKGTVSGEIADGKYGENGFGYDPIFYVPKLDKTMAQLSKEQKGQISHRRNAINLLQAFLEGEKNV >CP029086.1|AWE65333.1|2440978_2441779_+|glutamate-racemase MNKPIGVIDSGVGGLTVAKEIMRQLPNETIYYLGDIGRCPYGPRPGEQVKQYTVEIARKLMEFDIKMLVIACNTATAVALEYLQKTLSIPVIGVIEPGARTAIMTTRNQNVLVLGTEGTIKSEAYRTHIKRINPHVEVHGVACPGFVPLVEQMRYSDPTITSIVIHQTLKRWRNSESDTVILGCTHYPLLYKPIYDYFGGKKTVISSGLETAREVSALLTFSNEHASYTEHPDHRFFATGDPTHITNIIKEWLNLSVNVERISVND >CP029086.1|AWE63474.1|2439927_2440743_+|succinate-dehydrogenase-and-fumarate-reductase-iron-sulfur-family-protein MTEQSVKNTPQHETQSKPKQKTVKLIIKRQDTSDSKPYEETFEIPYRENLNVIACLMEIRRNPVNIKGEKTTPVVWDMNCLEEVCGACSMVINGRARQSCSAIVDQLEQPIRLEPMNTFPVIRDLQVDRSRMFDNLKRMKAWIPIDGTYDLGPGPRMPEKKRQTAYELSKCMTCGVCLEVCPNVTENNKFVGAQAISQVRLFNLHPTGSMTKDERLNALMGTGGLQQCGNSQNCVNACPKGIPLTTSIAAMNRETTFHMFKSFFGSDHEVE >CP029086.1|AWE63796.1|2447717_2447903_-|putative-membrane-protein MNKHINKKATKLLEDYKKVQQRKSEETDRGCLKSVIMLIVLFFLIIFGIVACSTNVNFFFQ >CP029086.1|AWE64259.1|2448524_2448758_-|hypothetical-protein MVFNDWEINVVYSGEHEVVTNEKSLFVIDEFYDVAIAIYYLDGKLKVAHVNYGSDFTIDVANKVFELNIQNPNVDEH >CP029086.1|AWE64159.1|2449276_2450596_+|helix-turn-helix-domain-of-transposase-ISL3-family-protein MCNDTLELLRIKDENIKYINQEIDVIIKGKKATVVNAVLTYKPSACYCCGVKNEGQIHKHGKRVSRITLLKTQGYNTYLNLAKQRFKCLECNGTFTAKTSIVDESCFISRCVTQKVIEEATKVKTEIDTAEDNCISPSTVSRIRTKAANSLRIKPFNCLPEHIAMDEFKSVKNVTGSMSFIFIDNDTHDVIDILENRTTRFLRAYFERFDLKNRQQVKTVTIDMYEPYVRLFRDLFPNAAIIFDRFHIVQHLNRELNKYRVQVMNEYRNKKGPNYTIFKNNWKVLLMDTSKTIFSKYRWNKSFKAYKRSSDIVEFMLSKDDILRRSYELVQGLRKDLRLCNWPKFINRLNSVSKKSVSKGVWKVVKYYRKHQRMLRNTIYYPAFNNGAIEGINNKIKLIKRISFGYRNFNNFKARIMMIFSLYKGEKKKTTKPNNGLAA >CP029086.1|AWE64249.1|2450754_2451714_-|alpha-hemolysin MKTRIVSSVTTTLLLGSILMNPVANAADSDINIKTGTTDIGSNTTVKTGDLVTYDKENGMHKKVFYSFIDDKNHNKKLLVIRTKGTIAGQYRVYSEEGANKSGLAWPSAFKVQLQLPDNEVAQISDYYPRNSIDTKEYMSTLTYGFNGNVTGDDTGKIGGLIGANVSIGHTLKYVQPDFKTILESPTDKKVGWKVIFNNMVNQNWGPYDRDSWNPVYGNQLFMKTRNGSMKAAENFLDPNKASSLLSSGFSPDFATVITMDRKASKQQTNIDVIYERVRDDYQLHWTSTNWKGTNTKDKWTDRSSERYKIDWEKEEMTN >CP029086.1|AWE64287.1|2452516_2452714_+|hypothetical-protein MTELNNIINSLQSLFESESGYKISKNSGVPYQTVQDLRNGKTKLEDARFRTIIKLYSYYVSLKEH >CP029086.1|AWE64224.1|2453316_2454033_-|toxin-beta-grasp-domain-protein MSKNITKNIILTTTLLLLGTVLPQNQKPVFSFYSEAKAYSIGQDETNINELIKYYTQPHFSFSNKWLYQYDNGNIYVELKRYSWSAHISLWGAESWGNINQLKDRYVDVFGLKDKDTDQLWWSYRETFTGGVTPAAKPSDKTYNLFVQYKDKLQTIIGAHKIYQGNKPVLTLKEIDFRAREALIKNKILYTENRNKGKLKITGGGNNYTIDLSKRLHSDLANVYVKNPNKITVDVLFD >CP029086.1|AWE63086.1|2454140_2454866_-|toxin-beta-grasp-domain-protein MNNNITKKIILSTTLLLLGTAFTQFPNTPINSSSEAKAYYINQNETNVNELTKYYSQKYLTFSNSTLWQKDNGTIHATLLQFSWYSHIQVYGPESWGNINQLRNKSVDIFGIKDQETIDSFALSQETFTGGVTPAATSNDKHYKLNVTYKDKAETFTGGFPVYEGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKSKKLYNNSYNKGQIKITGTDNNYTIDLSKRLPSTDANRYVKKPQNAKIEVILEKSN >CP029086.1|AWE64343.1|2454960_2455686_-|toxin-beta-grasp-domain-protein MKKNIMNKLVLSTALLLLGTTSTQLPKTPISFSSEAKAYNISENETNINELIKYYTQPHFSLSGKWLWQKPNGSIHATLQTWVWYSHIQVFGSESWGNINQLRNKYVDIFGTKDEDTVEGYWTYDETFTGGVTPAATSSDKPYRLFLKYSDKQQTIIGGHEFYKGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKNKKLYNGEFNKGQIKITADGNNYTIDLSKKLKLTDTNRYVKNPKNAQIEVILEKSN >CP029086.1|AWE65410.1|2456123_2457125_+|ornithine-carbamoyltransferase MKNLRNRSFLTLLDFSRQEVEFLLTLSEDLKRAKYIGTEKPMLKNKNIALLFEKDSTRTRCAFEVAAHDQGANVTYLGPTGSQMGKKETTKDTARVLGGMYDGIEYRGFSQRTVETLAEYSGVPVWNGLTDEDHPTQVLADFLTAKEVLKKDYADINFTYVGDGRNNVANALMQGAAIMGMNFHLVCPKELNPTDELLNRCKNIAAENGGNILITDDIDQGVKGSDVIYTDVWVSMGEPDEVWKERLELLKPYQVNKEMMDKTGNPNVIFEHCLPSFHNADTKIGQQIFEKYGIREMEVTDEVFESKASVVFQEAENRMHTIKAVMVATLGEF >CP029086.1|AWE64916.1|2457147_2458080_+|carbamate-kinase MAKIVVALGGNALGKSPQEQLELVKNTAKSLVGLITKGHEIVISHGNGPQVGSINLGLNYAAEHNQGPAFPFAECGAMSQAYIGYQLQESLQNELHSIGMDKQVVTLVTQVEVDENDPAFNNPSKPIGLFYNKEEAEQIQKEKGFIFVEDAGRGYRRVVPSPQPISIIELESIKTLIKNDTLVIAAGGGGIPVIREQHDGFKGIDAVIDKDKTSALLGANIQCDQLIILTAIDYVYINFNTENQQPLKTTNVDELKRYIDENQFAKGSMLPKIEAAISFIENNPKGSVLITSLNELDAALEGKVGTVIKK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029086_2 | 2.1|606261|34|CP029086|CRISPRCasFinder | 606261-606294 | 34 | CP029086.1 | 2133589-2133622 | 0 | 1.0 |
CP029086_2 | 2.1|606261|34|CP029086|CRISPRCasFinder | 606261-606294 | 34 | CP029086.1 | 2447221-2447254 | 0 | 1.0 |
CP029086_1 | 1.1|180720|33|CP029086|CRISPRCasFinder | 180720-180752 | 33 | CP029086.1 | 2139148-2139180 | 1 | 0.97 |
CP029086_1 | 1.1|180720|33|CP029086|CRISPRCasFinder | 180720-180752 | 33 | CP029086.1 | 2660641-2660673 | 1 | 0.97 |
CP029086_2 | 2.1|606261|34|CP029086|CRISPRCasFinder | 606261-606294 | 34 | CP029086.1 | 300717-300750 | 1 | 0.971 |
CP029086_5 | 5.1|855270|31|CP029086|CRISPRCasFinder | 855270-855300 | 31 | CP029086.1 | 2146330-2146360 | 1 | 0.968 |
CP029086_5 | 5.1|855270|31|CP029086|CRISPRCasFinder | 855270-855300 | 31 | CP029086.1 | 2146386-2146416 | 1 | 0.968 |
CP029086_7 | 7.1|2133614|31|CP029086|CRISPRCasFinder | 2133614-2133644 | 31 | CP029086.1 | 1622416-1622446 | 1 | 0.968 |
CP029086_8 | 8.1|2182441|34|CP029086|CRISPRCasFinder | 2182441-2182474 | 34 | CP029086.1 | 2660640-2660673 | 1 | 0.971 |
CP029086_2 | 2.1|606261|34|CP029086|CRISPRCasFinder | 606261-606294 | 34 | CP029086.1 | 1295463-1295496 | 2 | 0.941 |
CP029086_2 | 2.1|606261|34|CP029086|CRISPRCasFinder | 606261-606294 | 34 | CP029086.1 | 2665014-2665047 | 2 | 0.941 |
CP029086_5 | 5.1|855270|31|CP029086|CRISPRCasFinder | 855270-855300 | 31 | CP029086.1 | 195358-195388 | 2 | 0.935 |
CP029086_5 | 5.1|855270|31|CP029086|CRISPRCasFinder | 855270-855300 | 31 | CP029086.1 | 503732-503762 | 2 | 0.935 |
CP029086_5 | 5.1|855270|31|CP029086|CRISPRCasFinder | 855270-855300 | 31 | CP029086.1 | 844469-844499 | 2 | 0.935 |
CP029086_5 | 5.1|855270|31|CP029086|CRISPRCasFinder | 855270-855300 | 31 | CP029086.1 | 1021274-1021304 | 2 | 0.935 |
CP029086_5 | 5.1|855270|31|CP029086|CRISPRCasFinder | 855270-855300 | 31 | CP029086.1 | 1400557-1400587 | 2 | 0.935 |
CP029086_5 | 5.1|855270|31|CP029086|CRISPRCasFinder | 855270-855300 | 31 | CP029086.1 | 1698747-1698777 | 2 | 0.935 |
CP029086_5 | 5.1|855270|31|CP029086|CRISPRCasFinder | 855270-855300 | 31 | CP029086.1 | 1965776-1965806 | 2 | 0.935 |
CP029086_5 | 5.1|855270|31|CP029086|CRISPRCasFinder | 855270-855300 | 31 | CP029086.1 | 2146442-2146472 | 2 | 0.935 |
CP029086_5 | 5.1|855270|31|CP029086|CRISPRCasFinder | 855270-855300 | 31 | CP029086.1 | 2182752-2182782 | 2 | 0.935 |
CP029086_5 | 5.1|855270|31|CP029086|CRISPRCasFinder | 855270-855300 | 31 | CP029086.1 | 2350230-2350260 | 2 | 0.935 |
CP029086_5 | 5.1|855270|31|CP029086|CRISPRCasFinder | 855270-855300 | 31 | CP029086.1 | 2452878-2452908 | 2 | 0.935 |
CP029086_5 | 5.1|855270|31|CP029086|CRISPRCasFinder | 855270-855300 | 31 | CP029086.1 | 2452991-2453021 | 2 | 0.935 |
CP029086_5 | 5.1|855270|31|CP029086|CRISPRCasFinder | 855270-855300 | 31 | CP029086.1 | 2660599-2660629 | 2 | 0.935 |
CP029086_5 | 5.1|855270|31|CP029086|CRISPRCasFinder | 855270-855300 | 31 | CP029086.1 | 2749032-2749062 | 2 | 0.935 |
CP029086_5 | 5.1|855270|31|CP029086|CRISPRCasFinder | 855270-855300 | 31 | CP029086.1 | 2749148-2749178 | 2 | 0.935 |
CP029086_7 | 7.1|2133614|31|CP029086|CRISPRCasFinder | 2133614-2133644 | 31 | CP029086.1 | 215176-215206 | 2 | 0.935 |
CP029086_7 | 7.1|2133614|31|CP029086|CRISPRCasFinder | 2133614-2133644 | 31 | CP029086.1 | 1622361-1622391 | 2 | 0.935 |
1. spacer 2.1|606261|34|CP029086|CRISPRCasFinder matches to position: 2133589-2133622, mismatch: 0, identity: 1.0
ttgtagaatttcttttcgaaattctctgtgttgg CRISPR spacer ttgtagaatttcttttcgaaattctctgtgttgg Protospacer **********************************
2. spacer 2.1|606261|34|CP029086|CRISPRCasFinder matches to position: 2447221-2447254, mismatch: 0, identity: 1.0
ttgtagaatttcttttcgaaattctctgtgttgg CRISPR spacer ttgtagaatttcttttcgaaattctctgtgttgg Protospacer **********************************
3. spacer 1.1|180720|33|CP029086|CRISPRCasFinder matches to position: 2139148-2139180, mismatch: 1, identity: 0.97
attgggaatccaatttctctgtgttggggccca CRISPR spacer attggaaatccaatttctctgtgttggggccca Protospacer *****.***************************
4. spacer 1.1|180720|33|CP029086|CRISPRCasFinder matches to position: 2660641-2660673, mismatch: 1, identity: 0.97
attgggaatccaatttctctgtgttggggccca CRISPR spacer attgggaatccaatttctctttgttggggccca Protospacer ******************** ************
5. spacer 2.1|606261|34|CP029086|CRISPRCasFinder matches to position: 300717-300750, mismatch: 1, identity: 0.971
ttgtagaatttcttttcgaaattctctgtgttgg CRISPR spacer ttgtagaatttcttttcgaaattctttgtgttgg Protospacer *************************.********
6. spacer 5.1|855270|31|CP029086|CRISPRCasFinder matches to position: 2146330-2146360, mismatch: 1, identity: 0.968
cacattattgtaagctgactttctgtcagct CRISPR spacer cacattattgtaagctgactttccgtcagct Protospacer ***********************.*******
7. spacer 5.1|855270|31|CP029086|CRISPRCasFinder matches to position: 2146386-2146416, mismatch: 1, identity: 0.968
cacattattgtaagctgactttctgtcagct CRISPR spacer cacattattgtaagctgactttccgtcagct Protospacer ***********************.*******
8. spacer 7.1|2133614|31|CP029086|CRISPRCasFinder matches to position: 1622416-1622446, mismatch: 1, identity: 0.968
ctgtgttggggccccgccaacttgtattgcc CRISPR spacer ctgtgttggggccccgccaacttgcattgcc Protospacer ************************.******
9. spacer 8.1|2182441|34|CP029086|CRISPRCasFinder matches to position: 2660640-2660673, mismatch: 1, identity: 0.971
attgagaatccaatttctctttgttggggcccat CRISPR spacer attgggaatccaatttctctttgttggggcccat Protospacer ****.*****************************
10. spacer 2.1|606261|34|CP029086|CRISPRCasFinder matches to position: 1295463-1295496, mismatch: 2, identity: 0.941
ttgtagaatttcttttcgaaattctctgtgttgg CRISPR spacer ttgtagaatttcttttcgaaattctttttgttgg Protospacer *************************.* ******
11. spacer 2.1|606261|34|CP029086|CRISPRCasFinder matches to position: 2665014-2665047, mismatch: 2, identity: 0.941
ttgtagaatttcttttcgaaattctctgtgttgg CRISPR spacer ttgtggaatttcttatcgaaattctctgtgttgg Protospacer ****.********* *******************
12. spacer 5.1|855270|31|CP029086|CRISPRCasFinder matches to position: 195358-195388, mismatch: 2, identity: 0.935
cacattattgtaagctgactttctgtcagct CRISPR spacer cacattattgtaagctgactttccgccagct Protospacer ***********************.*.*****
13. spacer 5.1|855270|31|CP029086|CRISPRCasFinder matches to position: 503732-503762, mismatch: 2, identity: 0.935
cacattattgtaagctgactttctgtcagct CRISPR spacer cacattattgtaagctgacttttcgtcagct Protospacer **********************..*******
14. spacer 5.1|855270|31|CP029086|CRISPRCasFinder matches to position: 844469-844499, mismatch: 2, identity: 0.935
cacattattgtaagctgactttctgtcagct CRISPR spacer cacattattgtaagctgacttttcgtcagct Protospacer **********************..*******
15. spacer 5.1|855270|31|CP029086|CRISPRCasFinder matches to position: 1021274-1021304, mismatch: 2, identity: 0.935
cacattattgtaagctgactttctgtcagct CRISPR spacer cacattattgtaagctgactttccgccagct Protospacer ***********************.*.*****
16. spacer 5.1|855270|31|CP029086|CRISPRCasFinder matches to position: 1400557-1400587, mismatch: 2, identity: 0.935
cacattattgtaagctgactttctgtcagct CRISPR spacer cacattattgtaagctgactttccgccagct Protospacer ***********************.*.*****
17. spacer 5.1|855270|31|CP029086|CRISPRCasFinder matches to position: 1698747-1698777, mismatch: 2, identity: 0.935
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20. spacer 5.1|855270|31|CP029086|CRISPRCasFinder matches to position: 2182752-2182782, mismatch: 2, identity: 0.935
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27. spacer 7.1|2133614|31|CP029086|CRISPRCasFinder matches to position: 215176-215206, mismatch: 2, identity: 0.935
ctgtgttggggccccgccaacttgtattgcc CRISPR spacer ctgtgttggggccccgccaacttccattgcc Protospacer *********************** .******
28. spacer 7.1|2133614|31|CP029086|CRISPRCasFinder matches to position: 1622361-1622391, mismatch: 2, identity: 0.935
ctgtgttggggccccgccaacttgtattgcc CRISPR spacer ctgtgttggggccccgccaacttgcattacc Protospacer ************************.***.**
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029086_4 | 4.1|747228|34|CP029086|CRISPRCasFinder | 747228-747261 | 34 | JN882286 | Cronobacter phage vB_CsaP_GAP52, complete genome | 23034-23067 | 8 | 0.765 |
CP029086_4 | 4.1|747228|34|CP029086|CRISPRCasFinder | 747228-747261 | 34 | CP030544 | Staphylococcus aureus strain ER04166.3 plasmid unnamed2, complete sequence | 7567-7600 | 8 | 0.765 |
1. spacer 4.1|747228|34|CP029086|CRISPRCasFinder matches to JN882286 (Cronobacter phage vB_CsaP_GAP52, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ttgcatatctttagctttattgtttgcaactggg CRISPR spacer ttgcatatctttagctttatagcttttatatgct Protospacer ******************** *.** .* **
2. spacer 4.1|747228|34|CP029086|CRISPRCasFinder matches to CP030544 (Staphylococcus aureus strain ER04166.3 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ttgcatatctttagctttattgtttgcaactggg CRISPR spacer ttgaataactttagctttattgttataaacagta Protospacer *** *** **************** *** * .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
353435 : 424171
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP029086|353435:424171|DBSCAN-SWA TTTATTTTTGTGAATGGAATTTCGCTTCCATACGATAAATACGTGACCCTTTATCCGAAAATTTCTTTTCATATTCTGTTAAAATATTACTGCCATCGTCTTCTTGATGTAAATTTAGATTTATTTTTGTAAAATACATTCCAAATTGAGACATACTTTCTAAACTGTAGGCAAATAGTCCTCTGTTATCAGTTTTAAAATGTAAATCTCCTTCATCATTTAAGATTTGTTGATACAACGCTAAAAACGTATGATACGTTAAACGTCGTTTTGCATGACGATTTTTTGGCCATGGATCTGAAAAGTTCAAATAAATACGCGAAACTTCGCCGTCTTTAAAATATTCATTTAATTCAATGGCGTCATTACAAATAATCTTTAAATTTGTTAAACCCATCTCTTTAACTTTATCCAATACTTTATAAACGATACTTTTCTCACGTTCCATTGAAATATAATTAATATGAGGATTTTGAGCAGCTAATGTTGTAATAAACTGCCCCATACCCGAACCAATTTCAATGTGTATCGGTTGCGTTTTATCAAACCATTCAGTCATTTTCCCTGCATGTTGACCTTCCATGTCAACCAATTCAGGATGATCTTTTAAATAATCTTCAGCCCATGGTTTGTATCGAACTCTCATATTTTATTCTCCTCTTAAATAAACATGTTACTATTCATAACTTCATTTAGGAATTTAAGCCAAGTGTTCATATCCTTATATCTTTTTTGCTCTTCATACCATTGAACAAGACCTATAGATTGAATTACCGTATACCATTTCATACGTTTATTTAAATTCAAGCTCTCTTGAACACCATATGTTTCAAGCCATTCAGACCATTGTTGTTGTGGAACATAGTTGTAAAGCAGCATTCCGATATCAATTGCCGGGTCTGCAATCATTGCACCTTCCCAATCAACTAAAAATAGTTCATCTCGATCGGATAATAACCAATTATTATGATTCACATCACCATGTACAACAGTGAAAAAACGCGAATCTAAACTCGGTATATGCTCTTCTAAATAGGTTAATGATTTTCTCACAATATGATGTGTTAAAACTTCTCTTGATAAAGAGGCATTAATTTTATTAAGCATAATCTCAGGAGTAATAGGTTCCATTTCCATACGCTTTAACATACTTAATAAAGGTCTAGAATTGTGTATCTTCTTTAATAAATGTGCAACTCTTGTTTGCTTCATTTCGTTTGAAGATAGTTCACGCCCATTTTTCCAATGTTGTGCTGTAACAACCTCGCCTGTTTCTATGCGTTTCGTCCATACTAATTTGGGCACAATACCTTCTGCTGATAATGCCGCAATAAATGGATTTGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAAAATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAATTTATAACACCATACTGGTACAAATATTATGTCCAGATAATTATTGTAAATCCTCAACCAATGCCTACATTACACGACTAATTTTAAATCGTAATGTCTGTCATTGACACCATACATTCTATAGTCACTTACTTGACATATAATGTTACCGTGTCTAAAACTACATGTTTTTGAATCTCTGTAGGCGATAAACTCTAGTTTTCAAAATAATTGCTATCCCATTTTCATGGTTAGCATAAATTTATGAACTGTAACATTTACGTACTTAGTAAAATATGATGCACATCATATTTGTAACTCATAGAAAATTTTATAATTTTTATCATTATATTTCAACTGAAAATGAGAAACAAAATGGCACTTTTTACTAATATGTATTTTCTAAACAACACTTTTAAGCTTCGTTTTAAATTATAACATAATTCACTTACGAAAGTTGATAAATTTAAGTAATTTAATCTAAAAATATGATGAAAGAATTTTAAATACTGTGTGACTCTATATACTTTTCAAATCCTTCTTGTAGTTGACGTGTAATTGGGCCAACTTTACCATCATTAATTGGTTCACCATCTAATTTAATAACAGGTGTAACCTCAGCTGAAGTACTTGAAACAATAACTTCATCTGCGTTTTTCAAGAAATCTACAGTAAACGTTTCTTCTTTAAATGGGATGTTATAGTCTTCGGCAATTTTTTTAATTACAATTCGTGTAATACCATTAAGAATATAGTTGTTAATCGGATGTGTATAAATCACACCGTCTTTAATTGCATAAGCATTACTTGAAGATCCTTCAGTTACAGTTTCACCTCGATGTTGAATTGCTTCAACTGCATTATATTTCACAGCATATTCTTTTGCTAATACATTTCCTAATAAGTTCAAGCTTTTAATGTCGCAACGTAACCATCGGATATCTTCAACGGTAACACCATTCACACCATTTTCTAAATGATCATAAGGACGATCATAACTCTTTGTATAAGCAACAATTGCTGGTTCTACTTCAGGTGTCGGGAAGCTATGATTCCTTTCAGCTACACCACGCGTTGCTTGAATATAAATTGCCCCAGTTTCAATTTGATTCATATCAACTAATTTACGAGATAGTTCAATTAATTCTTCTACAGAATAATTTAAATCTAAACCAATCTCATTGGCACTACGTAAAAATCTTTCATAATGTTCTGTTACTGTAAATAACTTACCATTATATACTCGAATGTATTCATAAATACCATCGCCAAATACGTATCCTCTGTCGTTGTATGAAACCTTTGCTTCACTTGGACTTACAAACTCACCATTTAAAAAAATTTTTTCCATATATTATTCCTCCACGCATAATGAATAAATTGCTTCTAAGTAAATACTAGTTGCGTTAAATAACTGTTTTTTAGTGATATATTCATTTTTCTGATGCATTAAATCTTCAGAATCACTAAACATTGCGCCAAATGCTACACCCTTGTCTAAGTTTCTCGCATAAGTACCGCCACCTATAGTATAAGGTTCAGTCATATCATTTGTTTGATTTCTATATGCAGTAACTAACTTTTGTACAAAAGGATCATTTTTATCAACATAATGTGGTGGTTGGACTTTACCTAATTTCACTTCAAAGCCATATTGTTGAATCTCATTTGCAAAACGATCCATAGCTTTTTCAAATTCAAATCCTTCTGGGTAGCGTAAGTTGATACCGAAAAGACCTGCGTTTTCATTATCATATGTAATAACACCAATGTTAGTTGTCACGTCACCCATGACATCTGTATGGAATTTCATTCCCATCTTTTCACCAAAATCTGAATTAAATAAGTAGCGATTACTAAATGCTACAAACGCTTGTGCATTATTATCAAGATTTAATGATGCTAAGAATTTTAGTAAGTAAAGACCCGCATTCACACCGATAGATGGATCCATACCATGAACCGCTTTACCTTCAACTGTTAAAACTAGAATGCCACTATCAACAGTACTATCACCTTGTAAATGATTTTGTTCTAAAAAGTACTCAAAGTCTTGAATAACATCTGTCATATTTTCTTTAACAAGCACTCTTGCTTTTGCATGATCAGGTACCATGTTGTAACGTTCACCAGATTTAAAAGTTATTAATTCATAATCAGGTTCATCTTGATCTTCAGTAAGTTTATTTTGAACTAAATCAAATGTTGTAATGCCTTTTTCACCATGAATACATGGAAATTCTGCATCTGGTGCAAAACCTAATGTTGGCATTTCTTCTGTTTTAAAATAGCGATCCGTACATTTCCAATCAGATTCTTCATCCGTACCAATAATCATATGAATACGTTTCTTCCAATCCACATTCATATCTTCTAATATCTTAATTGCATAATAAGCAGCAATTGTTGGACCTTTGTCATCAAGTGTACCTCTAGCTATGATAGCATCTTCTGTTACAACCGGCTCGAACGGATTACTATCCCATCCATCACCAGCAGGAACAACGTCAACATGACATAAGATACCTAATACGTCATTTCCTTTACCTGCCTCAATTCTTCCTGCAATATGATCCACATCATGTGTTGTAAATCCATCTCTATGTGCAATTTCATACATGTAGTCTAATGCCTTACGAGGACCTGGACCAACTGGTGCGTCTTCTGATGCTTTTGCATCATCTCTCACACTTTCAATTGCTAATAATCCTTTTAAGTCATTAATGATTTGATCTTCGTATTGTTGAACTTTTTCTTTCCACATTCGAAATCGACTTCCTTTTTTCTATAAGTTAAATTCTATTTTACATGAAAAGATATAAAAACTACAATAAGATGTCAGAAAATAATAAAAAGGAACAAAACGATGCTATTGATATGACACAAATCATAAATAGCTGCTTTGTTCCTTTTTTAATTTATATATTTAAAATACACATATTCAAGAGCTCGAGATATAAGTCAATGTACTAGGCACACAATTTAATATTGACAGTAATTAACCGAACGAAAATGCGCCCCGGGGCCCCAACACAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAGACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCCAATAGTCAGCTTTCAATAATGTGCAGTTTGGGGTAAGGGCCCCAACACAGAGAATTTCGAAAAGATAAAGAAATACGTTTTCTTTAGATATTAGTATTTCTTATGAATGAGTTTCACGCATGTATTCTTCTTTCTATATGCATATTAGCTATGACTAACGATAAAGAACCACTATATAATAAATCATAGTGGTTCTTTATCATTTCTGTCCTACTCACATCTTATTCTTTATCAGATAATGCATTTTTATTCTTTTTTAAATCTTCTTCAGTGACGATACGTAAATTATTATTTGGTGCTGCGCCACCTTCATCATCAAATTTACCTTTTTCAATACTTTCGTCAGTCTTATTGTCATATTCGGTAAATTTTGATTTTTCTTCTTCGAAAAATGCTTTTGG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66 | Staphylococcus_phage(91.67%) | tRNA,holin,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
558142 : 604357
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP029086|558142:604357|DBSCAN-SWA 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MIDTIKVNNKTIPWLYVERGFEIPSFNYVLKTENVDGRSGSIYKGRRLESYSFDIPLVVRNDYLSHNGIKTHDDVLNELVKFFNYEEQVKLQFKSKDWYWNAYFEGPIKLHKEFTIPVKFTIKVVLTDPYKYSVTGNKNTAISDQVSVVNSGTADTPLIVEARAIKPSSYFMITKNDEDYFMVGDDEVTKEVKDYMPPVYHSEFRDFKGWTKMITEDIPSNDLGGKVGGDFVISNLGEGYKATNFPDAKGWVGAGTKRGLPKAMTDFQITYKCIVEQKGKGAGRTAQHIYDSDGKLLASIGYENKYHDRKIGHIVVTLYNQKGDPKKIYDYQNKPIMYNLDRIVVYMRLRRVGNKFSIKTWKFDHIKDPDRRKPIDMDEKEWIDGGKFYQRPASIIAIYSAKYNGYKWMEMNGLGSFNTEILPKPKGARDVIIQKGDLVKIDMQAKSVVINEEPMLSEKSFGSNYFNVDSGYSELIIQPENVFDTTVKWQDRYL >CP029086|558142:604357|559270_559462_+|AWE64337.1|DBSCAN-SWA MAAPFLMTNADYVWTPMTTVTLFILSLIIFLIFIKTKDVVHLTIFILNLLFSILYCLPILFYL >CP029086|558142:604357|585050_585251_-|AWE64981.1|DBSCAN-SWA MWITMTIVFAILLLVCISINSDRAREIQALRYMNDYLLDEVVKTKGYNGLKEYRIELKRMNNDIKK >CP029086|558142:604357|578272_578557_-|AWE63911.1|head,tail|DBSCAN-SWA MTIDDLLVKFKSLERIDHNSEDEYLKQLLKMSYERIKNQCGVFELENLIGQELILIRARYAYQDLLEHFNDNYRPEIIDFSLSLMEVSEDEESV >CP029086|558142:604357|576210_576351_-|AWE64658.1|DBSCAN-SWA 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>CP029086|558142:604357|562809_563043_-|AWE63411.1|holin|DBSCAN-SWA MKQKSFWVAILSAIFLFAQNIAKAIGYDIQVYTEQLTDGLNAILGFLVLTGVIQDPTTKGIGDSHQALEYEEPRRKY >CP029086|558142:604357|560374_560671_-|AWE63883.1|DBSCAN-SWA MPAGYTLDKNNVPYKKETGYYTVANVKGNNVRDGYSTNSRITGVLPNNATIKYDGAYCINGYRWITYIANNGQRCYIATGEVDKAGNRISSFGNFSAL >CP029086|558142:604357|588257_588476_-|AWE63682.1|DBSCAN-SWA MDAFDKYYLFDHDGNKMFSVTPHFKDGRHLVVGLKHTKFNGRRWYLDDYELKTLIDNEQMELGHQTSLFEYI >CP029086|558142:604357|575622_575760_-|AWE64989.1|DBSCAN-SWA MMDLIENGKDANEVLKMPFHYVLSIYQNKNNDISEEKAEALIDAF >CP029086|558142:604357|589876_590362_-|AWE64547.1|DBSCAN-SWA MTAGTQQAMNFESHRLCTIKAKQELRIGTWSILPFDIEHDANEPVAFLLQSTLGYKVLYVTDTKYLKYKFNGITHMMLEVNYIYEQMQENIKNGSVHSTLANRIMESHFSLEHAIGMLKANDLTRLEEIHLIHLSSQNSNAKYIKSEIQKVTGAPVYFGGL >CP029086|558142:604357|581943_583329_-|AWE63129.1|DBSCAN-SWA MGRGGGKNGLISAISDFLSTPLHGVKEYHISIVANSEDQAKTSFDEIRTVLMDNKRNKTGKTPKAPYEVSKAKIINRATKSVIRYNTSNTKTKDGGREGCVIFDEIHYFFGPEMVNVKRGGLGKKKNRRTFYISTDGFVREGYIDAMKHKIASVLSGKVKNSRLFAFYCKLDDPKEVDDRQTWEKANPMLHKPLSEYAKTLLSTIEEEYNDLPFNRSNKPEFMTKRMNLPEVDLEKVIAPWKEILATNREIPNLDNQMCIGGLDFANIRDFASVGLLFRKNDDYIWLGHSFVRQGFLDDVKLEPPIKEWEKMGLLTIVDDDVIEIEYIVDWFLKAREKYGLEKVIADNYRTDIVRRAFEDAGIKLEVLRNPKAIHGLLAPRIDTMFAKHNVIYGDNPLMRWFTNNVAVKVKPDGNKEYIKKDENRRKTDGFMAFVHALYRADDIVDKDMSKALDALMSIDF |
64 | Staphylococcus_phage(96.88%) | integrase,head,holin,capsid,protease,tail,portal | attL 578172:578189|attR 602341:602358 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_3 |
2070824 : 2078645
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP029086|2070824:2078645|DBSCAN-SWA ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTTACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTACGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTGTTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTGCGGTTTTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTTGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCGTGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAACGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAGTAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCGAGTGGGACAACAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCGATGACTGGTACTAAACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAGCCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGCGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTTACTTATGTGCTCTACAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTATATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGGTAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCTGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCGCCTAAAGTTAATACAGAGGCAACAGCACCAACTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACTCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGTCAAAATAAGAGGAGGGCATTTTTTTAGGTGAGAAAATATTTATCTGAACTAGATAACACTATAAAACACTTCTGATATTTTGAACTAAGAATATCAGAAGTGTTTTATAGTTTTGGTATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTGTTATTATTTTCAGCAGTTTCATCTAAGCTATTAAATGTTGAAATAAACAACATAATACCACCAATGATGAAAATTGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATCGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATAAAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTACTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCCACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACGCATTGTGTAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCAGGTGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGTGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGATTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCCTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACAACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGGCTAAAGTTCACTAAGAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACAAGGAATGTGATGTGCAGCCGAAAAATTAAAATCTTTATTTAATTCGAATTGATATGGATGCGTTGTACTAGGATAGATTTGTTGTAACATTTTAAAGCGCTCCTTTACTTTCAAGATATTGATTTAGTCCACGTTGACGTAAATGACAAGCTGGACATTCACCACAGCCATCCCCAATGATACCGTTATAGCATGTTAATGTTTTTGTACGAATATAATCTAAAACTTCGAGTTCATCACTTAATTTCCACGTTTCTGCTTTGTTTAACCACATTAAAGGAGTATGAATGACAAAATCTTTGTCCATAGCTAGGCTTAATGTTACGTTCATTGATTTTATAAAACTATCGCGACAGTCTGGGTAGCCTGAAAAGTCTGTTTCACATACGCCTGTAATAATATGCTTAGCCCCAATTTGATAAGCTAGAGCGCCTGCAAACGACAAGAAAAGTAAATTTCTAGCTGGAACAAATGTATTAGGTATACCATCTTCATTATTAGTAATTTCCATATCATGTTGTGTTAATGCGTTTGGAGTAAGTTGTGATAATAATGACATATCTAAAACGTGATGTTTCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATGTTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAAGAGGTTAATGGCATTGATAAGCCCGTTTTTAATTTATAAAATAAAAAAAGCCTATCTCCATAAAAGATAGACGAAAGAAATGGGTTGCTCCTATAATATATATTAAAGGTTTACCAACGAATGTTTGAAATTTCAATGTCTAGTTTTTTATAGAGGGTTTCAGCTAGAAACCTCTGATATTCATTTATGTACGATGAATAGAATATACCATATATTAGTTAAAATCAAGGTCAGGATAATGACAATGCTTTTAAAGTTTTAGCTACATCCAATACATATTATAAAAATAAAACACATTTAGAACGGAGTATACAATGATTCTAGTCATAGATAATAATGATTCATTTACATATAATTTAATAGACTATATTAAGACTCAAACGAAACTAACAGTTCAAGTTGTTGGTATTGATAATCTGCTGATAGAAGACGTCATTAATATGAAGCCAAAAGCAATTGTTATTTCGCCTGGGCCGGGTAATCCGGATGATTATCCTATCTTGAATGAAGTGTTAGAACAATTTTATCAGCGTGTACCTATACTAGGTGTATGTTTAGGATTTCAATGTATCGTGTCTTATTTTGGTGGAAATATCATTCACGGCTATCATCCTGTACACGGACATACTACACAGTTACGCCATACCAATGAAGGTATTTTTCAAGGACTGCCTCAAAATTTCAATGTAATGCGTTATCATTCATTAATTGCTGACGGAGCGACTTTTCCAAATTGCTTAAAGATTACAGCAAAAAACGATGAAGCGATTATTATGGCATTTGAGCATATTAGATTTCCGGTTTTTGGTGTGCAATATCATCCTGAATCTATTTTGAGTGAATACGGTTATCGACAAGTTGAATTATTTTTATCGAAGGTAGGTGATTACTGTGAGAATAGAATATAATTATCGCTACTATTTAACTGAAAATGAATATAAGCAATACCATATTCAATTAAAGGGATTTATAAAGAAGTATGTTGCTACTAAGTTGGCTGATGTGGGAGAAGTGATACACTTTGCACAAGCGCAGCAACGACAAGGTAGATATGTCTCGTTATATTTAAGTTACGAAGCGGCAAAGTATTTTAATCATGTTATGTGTACACATTCATTAGCTAAAGATGATATTTATGCAGTAGCTTATAGTTTTGAAAAAGCGGAAAGCATAAATTCAACATATGAACATCAAACTTCTTATGTATCAAAGCATCATTTTTCATTTGTTGAATCTTCTGAGGTTATGATGACTAATATTAAACGTGTCCAACAAGCAATTGTTGAAGGTGAAACGTATCAAGTGAACTATACGGCGCGCTTAACGGATAACATTTATTATCCTATTAGTACTTTATATGAACGATTAACTCAATTTAGTAATGGTAATTATACTGCGTTATTACAAACTGATGAAATCCAAGTAGCGTCTATCTCACCAGAATTATTTTTTCAAAAAGGACAATTTAACAATGTCGATAACGTTATCATAAGCAAACCGATGAAAGGGACAATGCCTAGAGGTAAAACGGAAGCTGAAGATCAACAGTATTATAAAACATTGCAAACTTCTTCGAAAGATCGTGCAGAAAATGTCATGATTGTTGATTTGCTAAGAAACGATATAGGGAGAATATCACAGAGTGGCTCAATTAAGGTGTATAAACTATTTTTTATTGAGGCATATAAAACTGTATTTCAAATGACTTCGATGGTAAGTGGAACTTTAAAAACTAATACAGACTTAACTCAAATTTTAACATCGTTATTTCCTTGTGGTTCGATTACAGGTGCACCGAAACTGAATACAATGAAATATATTAAACAATTTGAAAGTTCACCTCGTGGTATATACTGCGGAGCAATTGGACTATTACTTCCAACTGAAGATGATAAAATGATTTTTAATATTCCGATTCGTACTATTGAGTATAAATATGGACAAGCGATTTATGGAGTCGGAGCAGGTATTACAATTGATTCTAAGCCAAAAGATGAAGTAAATGAATTTTACGCAAAAACCAAGATTTTGGAGATGTTATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP029086|2070824:2078645|2076916_2077510_+|AWE63443.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHIRFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >CP029086|2070824:2078645|2071879_2072548_-|AWE65255.1|DBSCAN-SWA MDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >CP029086|2070824:2078645|2075476_2075896_-|AWE63303.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >CP029086|2070824:2078645|2074759_2075473_-|AWE63430.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >CP029086|2070824:2078645|2077493_2078645_+|AWE64097.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQFESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >CP029086|2070824:2078645|2075897_2076566_-|AWE63817.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >CP029086|2070824:2078645|2073356_2073797_-|AWE65284.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAVASVLTLGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >CP029086|2070824:2078645|2074076_2074661_-|AWE63475.1|DBSCAN-SWA MILYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >CP029086|2070824:2078645|2072540_2073014_-|AWE63704.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >CP029086|2070824:2078645|2070824_2071772_-|AWE65463.1|DBSCAN-SWA MTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_4 |
2090616 : 2105201
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP029086|2090616:2105201|DBSCAN-SWA TATGAAAGAACAACTTAATCAACTATCAGCATATCAGCCTGGTTTATCTCCAAGGGCATTGAAAGAAAAGTATGGCATTGAAGGAGATTTATATAAACTTGCATCAAATGAAAATTTGTATGGACCATCGCCTAAAGTTAAAGAAGCGATATCAGCACATTTAGATGAGTTATATTATTATCCTGAAACAGGATCACCGACATTAAAAGCGGCGATTAGTAAACATTTAAATGTAGATCAATCACGCATTTTATTTGGTGCGGGATTAGATGAAGTTATATTAATGATTTCTAGAGCAGTATTAACGCCAGGGGATACTATTGTTACAAGTGAAGCGACATTCGGTCAATATTATCACAATGCGATTGTTGAATCAGCTAATGTGATACAAGTACCTTTAAAAGATGGTGGCTTCGATTTAGAAGGTATTTTAAAAGAAGTTAATGAAGATACGTCATTGGTATGGTTATGTAATCCAAATAATCCTACAGGTACATATTTTAATCATGAGAGCTTAGATTCGTTTTTATCTCAAGTACCTCCACATGTACCAGTAATTATAGATGAAGCTTATTTTGAATTTGTGACAGCAGAGGACTACCCGGATACACTTGCTTTGCAACAAAAATATGACAATGCTTTCTTATTACGTACATTTTCAAAGGCGTATGGATTAGCGGGTTTACGTGTAGGATATGTGGTAGCAAGTGAACATGCGATTGAAAAATGGAACATCATTAGACCACCATTTAATGTGACACGTATATCTGAATACGCAGCAGTTGCAGCACTTGAAGATCAACAATATTTAAAAGAGGTAACACATAAAAATAGTGTTGAACGCGAAAGATTTTATCAATTACCTCAAAGTGAGTATTTCTTGCCAAGTCAAACGAATTTTATATTTGTAAAAACAAAGCGGGTAAATGAACTTTATGAAGCACTTTTAAATGTAGGGTGTATTACGCGACCATTTCCAACTGGTGTTAGAATTACAATTGGTTTTAAAGAACAAAATGATAAAATGTTAGAAGTTTTATCAAATTTTAAATACGAATAGTAAGTGGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCTCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCCTGACTAGAATTGAAAAAAGCTTGTTACAAGCGCATTTTCGTTCAGTCAACTACTGCCAATATAACTTTGTAGAGCATTGAACATTGATTTATGTCTCAAGCTCAATGCAGTGTGAATGATGAGGTGAGAGTATTCAGTGTAAAAAGCAACAATAGATGATATTGTTTTGTATCAATTGCTTTTTTGCTATACTGAATCAATACTGATATTTTGAGGAGAAGATTAAAATGACCCGTAAATCAATCGCGATTGATATGGATGAAGTATTGGCAGATACATTAGGAGAAATCATTGATGCTGTCAATTTTAGAGCGGATTTAGGTATTAAAATGGAAGCTTTGAATGGTCAAAAACTTAAACATGTTATTCCTGAACATGATGGATTAATTACAGAAGTATTGAGAGAACCAGGCTTCTTCAGACATCTTAAAGTGATGCCACATGCACAAGAAGTTGTGAAAAAATTAACTGAACATTATGATGTATATATTGCTACAGCAGCAATGGATGTACCAACATCATTTAGTGATAAATATGAATGGTTACTAGAGTTCTTTCCATTTTTAGATCCTCAGCATTTTGTTTTTTGTGGTAGAAAAAACATCGTTAAAGCTGATTATTTAATAGATGACAATCCTAGACAGCTTGAAATTTTTACTGGTACACCGATTATGTTTACAGCAGTGCATAATATTAATGATGATCGATTTGAACGCGTAAATAGCTGGAAAGATGTAGAACAGTATTTTTTAGATAATATTGAGAAATAAAATATATCACTTGAAAAATTTCATGTAGAAAAGATGATGGATAGGCTATAAAGTAATTGTGACTGAGATGAACTTTTATGTCTTAGACACTACAACACTATATTGGCAGTAGTTGACTGCGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGAACGCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACATAAAGAAATACTTTTTCTTTAGAAATTAGTATTTCTTATGGGAGTGGGACATAAATCAATGTTCTATGCTCTACGAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGCGGGGCCCCAACACAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTGCGAAAATATCATTTCTGTCCCACTCCCTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTTTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTCTATCTCATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAACATCAATCATTTTAGTGGCATGCGCCAAAATTATATGTCTGTTTTTGAAACAGGGTAATAGCTTAAAGCTAATAAAAACGAATATAAGGTGCGTTGAATCTTATGATTACACTCCAAACCTAATATAATATCGGGTCAAGATCATTCCGGATGCTTACAAATCATTGACAGTAAGTAACTGAATAGCATTTGGTATAACCTCAATATCAATAGGTGTTTCTAATGAAATTTCGCCATCAATATCAACTTTCATTGCTGGATCTGTTGTAAGTGAAATCTTTTTACCAGGTATATGCTCAATACCTTGAGTAATTTCATTCCAATTCATGCTATCACGCTTTTTAAAAATATCATTTAAAATACTGAAACTTTGTTCATTAAAAATGAAAGTGTTCAGTTCACCATCTTGAGGAGACAAATCAGTCAATGGTATACGACTACCACCAATGAATGGACCATTTGCTGTTAGTATCATGGTCGTTTCGCCAGAATATGTCTTATCATCTATTGATAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATGAGACCTAAGCCAACAAAGTTGAGTGCATATTGATTATTTATTTTAATTACATCGTATGTACCAACTTGTGCAGAAATCATTTGTTCACTAGCTTGTTTATGATTAGGTGCTATATTTAGCGTTTTTGTAAAATCATTAAAAGTACCGCCTGGTAAAATGCCAATAGGGAGTTGAAGGTCATGTGACATAACACCATTTATAAGTTCGTTAACCGTGCCATCACCGCCAAGAATAAATAATATATCTACATCTTTTGCATAGTTTTTAGTTTTGATTTCTTGGCAATATTTAATAATGTCACCTTCGTTTTCACTCAATTGAATAGAAAGATGCTTACAAATTGAACTTAATGCTGTTGTAACTTCCCCAATACCTTGATTAATATTTTTTAATCCACTGTGTTCATGGTAAAAGAGGACACCATGTGTATATTTATTTTCCATAGTTTAGCCTACTTTCTAAAAATTGGTTCATTAAATATATATACCCACTTTTAATTGTTAATACCAAAAATATGTTTTTAAATAGAGAAAATGGTAATAACTGACATTGATGTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAACGAGCATATTAAGCTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGAATGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAATTTGTTTGACCTAGTGGTTCTATTAACTTAACTAAAGTACCATTGATTGCTTGTGCAGAAGCGTTAGTTAAGTACCAAATACTCATCATTTGGGCATTAAATGCTTTAGGTGCTAACTTAACAGCAGCACTATTACCCGTTGGTGATAAGCATAGCTCACCGATAACACAAATAATGTACGATAAAATAACCCAGTTAACTGAGAAGTTTGATGAACCTGATGCATAACCTACAATACCAATTAGTATGTATGACGCACCTGCTAAGAACGTACCAATTGCAAATTTTACTGGCAGGCTAGGTTGTTTAGTTCCAAGCTTTTGCCATAAAAGTGAAATAATTGGAGCTAATAATAAAATAAATAATGGGTTAATTGATTGGAAGATCGCTTCACCAAAGTTTGTTTTCCAACCAAATAAGTTTAATTTCATATCTGAATGTTCAATTCCATATATGTTTAATACATTAGACCCTTGTTCTTGAATAGCCCAGAACACCATTCCAAGAATAAATAATGGAATAAATGCTTTAACACGAGAACGTTCAGTATCAGTGACATCTTTACTTCTAATAATTAAAGTGAAGTAAATGATTGGTAATGCAATACCTAATACTAAAACAGTATTACTAACTAAGTTAAATGATAATGAGTTAGTTAATGCACCAATAACGATAATTAATACAATTGCTAAGACAACACTTCCGATAATAAGACCATACTTTTTCTTTTCAGCTGGTGTCAATGGGTTAGTAGGTTTCATACCAACGCTACCTAAGTTTTTGCGGTTGAAAAGTACATACCATACTAAACCTAATGCCATACCAACTGCTGCAATCAAGAATCCGCCGTGGAAGTTTTTAACATTAACAAAGTGTTGCAAAATAATAGGTGATAATAATGCACCCATATTAACTGACATATAGAAAATAACAAAACCTGCATCCATACGTCT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ATTCCTACTTCTGAGGATTGGAAGAAACTACAACAAGATGTTGAACAATATGGTTTATATCATGCATATAGATTAGCAATTGCTCCAACACAAAGTATTTCTTATGTTCAAAATGCAACAAGTTCTGTAATGCCAATCGTTGACCAAATTGAACGTCGTACTTATGGTAATGCGGAAACATTTTACCCTATGCCATTCTTATCACCACAAACAATGTGGTACTACAAATCAGCATTCAATACTGATCAGATGAAATTAATCGATTTAATTGCGACAATTCAAACGCATATTGACCAAGGTATCTCAACGATCCTTTATGTTAATTCTGAAATTTCTACACGTGAGTTAGCAAGATTATATGTATATGCGCACTATAAAGGATTAAAATCACTTTACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAATTGGAACACACAAGAAGATATGACGAATATGTTTTGGAGACAAAATATATCTCAAATGTGGGTTGAAACAGAATTTAAAGTATCAAAAGACATTGCAAGTTGGAAGACTTTATCTGAAGCTGAACAAGACACATTTAAAAAAGCATTAGCTGGTTTAACAGGCTTAGATACACATCAAGCAGATGATGGCATGCCTTTAGTTATGCTACATACGACTGACTTAAGGAAAAAAGCAGTTTATTCATTTATGGCGATGATGGAGCAAATACACGCGAAAAGCTATTCACATATTTTCACAACACTATTACCATCTAGTGAAACAAACTACCTATTAGATGAATGGGTTTTAGAGGAACCCCATTTAAAATATAAATCTGATAAAATTGTTGCTAATTATCACAAACTTTGGGGTAAAGAAGCTTCGATATACGACCAATATATGGCCAGAGTTACGAGTGTATTTTTAGAAACATTCTTATTCTTCTCAGGTTTCTATTATCCACTATATCTTGCTGGTCAAGGGAAAATGACGACATCAGGTGAAATCATTCGTAAAATTCTTTTAGATGAATCTATTCATGGTGTATTTACCGGTTTAGATGCACAGCATTTACGAAATGAACTATCTGAAAGTGAGAAACAAAAAGCAGATCAAGAAATGTATAAATTGCTAAATGACTTGTATTTAAATGAAGAGTCATACACAAAAATGTTATACGATGATCTTGGAATCACTGAAGATGTGCTAAACTATGTTAAATATAATGGAAACAAAGCACTTTCAAACTTAGGCTTTGAACCTTATTTTGAGGAACGTGAATTTAACCCAATCATTGAGAATGCCTTAGATACAACAACTAAAAACCATGACTTCTTCTCAGTAAAAGGTGATGGTTATGTATTAGCATTAAACGTAGAAGCATTACAAGATGATGACTTTGTATTTGACAACAAATAACAATTAAATTAAAAGACCTTCACATGTAAAGGGAAATAGCGATTCGTTTCGTCTTGTCTCCTACATGTTGAAGGTCTTTTCTCTATGCTTAAAAGCGTATGCATATTTTGAAAAAGTAAAAATTGTATTTAATGATGTCAATGAGGCTAGAAAGTATACAAGATATTGCATTACAAAAGGGTGTTCTATTTTACTTTAAGCAAACAAAATACACATTCCGAAAAATTAAATTTCAGTTTAATTGCAAATATCAATAAAATTGACACTAAATTATTTGAAAGGCTATTGAAATTATGGTCAAAAAACGCTACTATTAATGAGAAATATTATCAATGATAATGATTATCATTAATTTAAAGGGAGAAAAATTTGTAATGAAGTATTTATTAAAGGGAAATATTTTGCTTCTATTACTAATATTGTTGACAATTATTTCGTTGTTCATAGGTGTGAGTGAACTATCAATTAAAGATTTACTACATTTAACTGAATCACAGCGGAATATTTTATTCTCAAGCCGAATACCAAGGACGATGAGTATTTTAATTGCTGGAAGTTCGTTGGCTTTAGCAGGCTTGATAATGCAACAAATGATGCAAAATAAGTTTGTTAGTCCGACTACAGCTGGAACGATGGAATGGGCTAAACTAGGTATTTTAATTGCTTTATTGTTCTTTCCAACCGGTCATATTTTATTAAAACTAGTATTTGCTGTTATTTGCAGTATTTGCGGTACGTTTTTATTTGTTAAAATCATTGATTTTATAAAAGTGAAAGATGTCATTTTTGTACCGCTTTTAGGAATTATGATGGGTGGGATTGTTGCAAGTTTCACAACCTTCATCTCATTGCGCACGAATGCTGTTCAAAGCATTGGTAACTGGCTTAACGGGAACTTTGCCATTATCACAAGTGGACGCTATGAAATTTTATATTTAAGTATTCCTCTTTTAGCATTGACATATCTTTTTGCTAATCATTTCACGATTGTAGGAATGGGTAAAGACTTTACTAATAATTTAGGTTTGAGTTACGAAAAATTAATTAACATCGCATTGTTTATTACTGCAACTATTACAGCATTGGTAGTGGTGACTGTTGGAACATTACCGTTCTTAGGACTAGTAATACCAAATATTATTTCAATTTATCGAGGTGATCATTTGAAAAATGCTATCCCTCATACGATGATGTTAGGTGCCATCTTTGTATTATTTTCTGATATAGTTGGCAGAATTGTTGTTTATCCATATGAAATAAATATTGGTTTAACAATAGGTGTATTTGGAACAATCATTTTCCTTATCTTGCTTATGAAAGGTAGGAAAAATTATGCGCAACAATAATAAAAAAATAATGCTTTTAATTGCAGTAACGTTATTAATTAGTATGCTGTACTTATTTGTAGGTATTGATTTTGAAATATTTGAATATCAATTTTCAAGTCGTTTAAGAAAGTTCATATTAATTATTTTAGTAGGTGCTGCCATTGCAACTTCAGTGGTGATTTTTCAAGCGATTACAAATAACCGTCTATTGACACCATCAATAATGGGGTTAGATGCAGTTTATTTATTTATCAAAGTATTGCCAGTCTTTTTATTTGGAATTCAATCGGTATGGGTTACTAATGTATATTTGAACTTTATATTAACACTTATAACGATGGTGTTATTCGCACTAATCCTATTCCAAGGTATCTTTAAAATTGGACATTTTTCAATTTATTTTATCTTACTTATTGGTGTCCTTTTAGGAACATTTTTTAGAAGCATAACAGGTTTTATTCAACTGATTATGGATCCTGAGTCATTTTTAGCAATACAAAGTAGTATGTTTGCTAATTTTAATGCTTCTAATTCGAATTTAGTTACTTTCTCAGCAGTGCTATTAGTAATCTTATTAGTCATTACAATTTTACTATTGCCTTATTTAGATGTATTGCTTTTAGGTCGTGCTGAAGCAATTAATCTTGGGATATCGTATGAAAAATTAACGCGAATTCTACTTGTAATAGTCTCAGTTTTAGTTTCTGTGTCAACTGCATTAGTAGGACCAATTACATTTTTAGGTTTATTAACTGTAAATCTAGCGCATGAACTAATGAAGACGTATGAACATAAGTATATTTTAATTGCGACAATTTGCTTGAGTTGGATTAGTTTATTTAGTGCGCAATGGGTAGTTGAAAATGTGTTTGAAGCTACGACAGAAATGAGTATACTTATTGATTTGATTGGTGGAAGTTATTTCATTTATCTATTAGTTAGAAGGAGAAATGCGCAATGATTCAAGTTGAAAATTTAACTAAAACTATAAATAATCAAATGATATTGGAAGATATTAGCATAGATATCGAAAAAGGTAAATTGACTTCTTTAATTGGACCTAATGGTGCGGGTAAGAGTACTTTACTTTCAGCGATATGTAGGTTAATTCGTTTTGATAACGGTGAAGTGAAAATAGATGGACAGCTCATGTCTGATTATAAAAATAATGACTTGTCGAAAAAAATATCTATATTAAAACAAACAAACCATACTGAAATGAATATTACGGTAGAGCAGTTGGTAAACTTTGGACGATTCCCTTATTCTAAAGGTCGTTTGACGAAAGAGGATCATGATATTGTCAATGATGCGCTAGATTTGTTGCAACTACAAGATATCAGAAATCGTAATATTAAGTCATTATCTGGTGGACAACGTCAGCGTGCATACATTGCAATGACAATAGCACAAGATACTGAATATATTTTGCTAGATGAACCATTAAATAATTTAGATATGAAGCATGCTGTTCAAATTATGCAAACGTTAAAAATGTTAGCGCATAAAATGAATAAAGCGATTGTCATTGTGTTACATGATATTAACTTTGCGTCCTGTTATTCAGATCAGATTGTAGCATTGAAAAACGGACAACTAGTTAAGTCAGATTTGAAAGATAATGTCATTCAAAGTAGTGTTTTAAGTGATTTATATGACATGAATATTCAAATTGAACATATAAGAAATCAAAGGATTTGTTTATATTTTAAGGATTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP029086|2090616:2105201|2104439_2105201_+|AWE63446.1|DBSCAN-SWA MIQVENLTKTINNQMILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDNGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMNIQIEHIRNQRICLYFKD >CP029086|2090616:2105201|2094565_2096071_-|AWE64176.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >CP029086|2090616:2105201|2098959_2101065_+|AWE63970.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSISFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >CP029086|2090616:2105201|2096411_2096912_-|AWE64564.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >CP029086|2090616:2105201|2093378_2094296_-|AWE64474.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMSHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >CP029086|2090616:2105201|2101182_2102154_+|AWE63188.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >CP029086|2090616:2105201|2098598_2098997_+|AWE63177.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >CP029086|2090616:2105201|2092013_2092556_+|AWE65183.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >CP029086|2090616:2105201|2102528_2103500_+|AWE63630.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >CP029086|2090616:2105201|2096931_2097798_-|AWE63269.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFLYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSSREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFVLFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >CP029086|2090616:2105201|2103486_2104443_+|AWE63808.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >CP029086|2090616:2105201|2090616_2091675_+|AWE64879.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEYFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE |
12 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2351740 : 2360213
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP029086|2351740:2360213|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP029086|2351740:2360213|2354306_2354978_+|AWE63351.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLATEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >CP029086|2351740:2360213|2354041_2354305_+|AWE63091.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >CP029086|2351740:2360213|2359646_2360213_+|AWE64683.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNKDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDCGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >CP029086|2351740:2360213|2354970_2357160_+|AWE64079.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGNEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >CP029086|2351740:2360213|2352209_2353334_+|AWE63229.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVVVLDPSEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITFFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKSAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSGRKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >CP029086|2351740:2360213|2357138_2358623_+|AWE64243.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAINDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >CP029086|2351740:2360213|2353337_2354042_+|AWE63330.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIASDEDIEILKSKALKINNVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >CP029086|2351740:2360213|2358615_2359644_+|AWE64422.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >CP029086|2351740:2360213|2351740_2352223_+|AWE63035.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGINIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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