Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP020035 | Vibrio parahaemolyticus strain 20130629002S01 chromosome II, complete sequence | 1 crisprs | DEDDh,WYL,csa3,cas3 | 0 | 0 | 2 | 0 |
CP020034 | Vibrio parahaemolyticus strain 20130629002S01 chromosome I, complete sequence | 0 crisprs | DEDDh,WYL,DinG,cas3,csx1,csa3 | 0 | 0 | 4 | 0 |
CP020037 | Vibrio parahaemolyticus strain 20130629002S01 plasmid pVPGX2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 2 | 0 |
CP020036 | Vibrio parahaemolyticus strain 20130629002S01 plasmid pVPGX1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP020035_1 | 54224-54321 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP020035_1
|
1 spacers
spacers of CP020035_1
>1.1|54249|48|CP020035|CRISPRCasFinder TTTGAAACCGCGCAATTAAAGAATCCAGAAAAACAAGATCGCAATCAA |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP020035_1
The CRISPR arrays of CP020035_1 >merge|CP020035|1|54224-54321|CRISPRCasFinder TATTTTTAAAATGCCTTTTCAAAAATTTGAAACCGCGCAATTAAAGAATCCAGAAAAACAAGATCGCAATCAATATTTTTAAAACGCCTTTTCAAAAA >CP020035|1|1|54224-54321|CRISPRCasFinder TATTTTTAAAATGCCTTTTCAAAAA TTTGAAACCGCGCAATTAAAGAATCCAGAAAAACAAGATCGCAATCAA TATTTTTAAAACGCCTTTTCAAAAA
>CP020035.1|AWG85543.1|53382_54165_-|transcriptional-regulator MEKSTQPEAVSSVLKVFHILQALGEQKAIGVSELSQRLMMSKATTYRFLQTMKSLGYVSQEGEADKYSLTLKLFELGAKSLEYVDLIELADKEMRHISEQTNEALHLGALDENAIIYIHKIDSGYNLRMQSRIGRRNPLYSTAIGKVLLSERDESFVRDVLSDVEFIKHTEKTLENTDQVLEELAKVRDFHYAEDNEEQEPGLRCIAAPIYDRFGQIIAGLSISFPTIRFDEERMEYYVGLLHQAGKNISEQLGYHDYPA >CP020035.1|AWG85542.1|51430_53299_-|histidine-kinase MGTSVTPNIFDFLIKIDPFDKLPEPVVESIANSVKVKYLVRGETIGFSALCDQRYLYIIRTGAIEQRTPNGELRARLGQDDQFGFTFLDPLENAEDGYQAEAIEDSLLYLIPHSELKLVSEEHPEFADYFAAQANVRLSSAVKYVCRKEEKGLFFRNVGEIASENIAIVDVNDSIRSVAQTMCGKQRSSCAVVMKEGEIIGLVTDRDMTKSVVAQDMDTNQPIADVMTPNPVLIEDDAKVIQAISLMLQYNIRCLPVVHGKQVKGLLTTTHLVHNHRTQSLFLIEKIKYASSLNALAALKEERQTIFQALVESGVSAEIQGRVMSMIMDAFTRRIIQLNEELLGPPPCDYAWLVAGSHARNEVHMLSDQDSAIVLSDDATEEHKLYFTHLAMRVCNGLAACGYPLCDGKYMAASPKWCQPIRRWKEYYQKWVASPEYNKLLSISVFLEVRAIHGNREFVDQIQQHLHDCIQKSPSFIPALVRDAIDTQPPLGIFNNLVLEKGGENSNTLNIKKYALNLIIDLARIFSLAAGGSLTGTEERFRYAAQHGTLSKDSVENIIGAYRFITQVRFRHQLNAILAGTTPDNHIAPDDFSSFERKHLKDAFKIISELQDVAKLKFVKGA >CP020035.1|AWG85541.1|50717_51428_-|DNA-polymerase-III-subunit-epsilon MIKRWFKRWETPLSPEQKRQAIHVVDDWPIVLKDYLQRPLVDDSTTLKDLSFVALDFETTGVDAQGDKILSIGVVDLTLDGIDIASSKEWYICHGQFIKPETAQINGLTPQDLAKGLPLDEGMNRLLERITGKVVLAHGCCIEKAFIHAYFSSRYQVEDFPAYFIDTLQIEKQFSYAGKSGAHSSYQLDDLRRYYHLPGYLSHSAASDALACAELFLVQSKKLTALPDVTLRQLMR >CP020035.1|AWG85540.1|49847_50717_+|LysR-family-transcriptional-regulator MANWEGVSEFVAVAETNSFTGAAAKLKTSVAQISRRVSALEERLAVKLLHRTTRKVSLSEAGQLYYQQCKHLVEGLELAELAVTQMQTEPRGLLRVTAPVTYGEMNLAPLLHQFLEKYPRVDLDLVLTNQKLDLIEQGVDVAIRLGRLQDSSMIAKRLSSRQTYVCASPMYLERFGEPHTLSELGRHQCLVGSVDYWHFKENKRDKSLRVSGRIKCNSGFALVDAAKRGLGLVQLPDYYVQEALDSGELVEVLTDYRDDREGIWALYPQSRNLSPKVRLLIDFLAQELA >CP020035.1|AWG85539.1|48960_49767_+|N-hydroxyarylamine-O-acetyltransferase MNKTDLNAYLTKLGLPSELPADLESLHKIHVAQHRCLPFENFDISLQRGISVEIEDIIQKTVYHSRGGYCFELNGLMLDVLKTLGFEARSLLGRVHVMGTPTGRSHQITLVMLDEQAWIVDVGFGSNTPRAPLPFILNQVIQTDLQTFRFVEDAQFGYFLQVLSTDGTDTWNNLYSFDLEFVFAGDIACGNFFTSTSPHSRFTSARVAAKATESGLVTLLNYTLKYTSEGEQTELELEPGQAYLDALKEHFGIELDAQYGDLRPLPDA >CP020035.1|AWG85538.1|47518_48667_-|S-(hydroxymethyl)glutathione-dehydrogenase MTLEIKPGQTHIKSKAMVAWAAGEPLKMEEVDVQLPKAGEVLVRIVATGVCHTDAFTLSGDDPEGIFPSILGHEGGGIVEMVGEGVTSVEVGDHVIPLYTAECGECKFCKSGKTNLCQAVRETQGKGLMPDGTSRFSINGETIFHYMGCSTFSEYTVLPEISLAKVNKQAPLEEVCLLGCGVTTGMGAVLNTAKVEKGDTVAIFGLGGIGLSAIIGARMAGASRIIGIDINESKFDLAKQLGATDVINPQKFDKPIQEVIVEMTDGGVDYSFECIGNVNVMRQALECCHKGWGESVIIGVAGAGQEISTRPFQLVTGRVWRGSAFGGVKGRSELPEIVNRYMAGEFGLQEFITHTMGLEDVNKAFDLMHEGKSIRTVIHMDK >CP020035.1|AWG85537.1|46617_47457_-|S-formylglutathione-hydrolase MTIENVSQTKVFGGWHKQYTHDSKALNCTMRFAIFLPPNATKSNPVPALYWLSGLTCTDENFMQKAGAFRMAAELGIAIIAPDTSPRGEGVADDASYDLGQGAGFYLNATQAPWSLHYHMYDYVTQELPAIIEANFPVSDVKSISGHSMGGHGALTIGLKNPTLYRSISAFSPISNPMQCPWGQKAFTAYLGTDIESWKQYDASELLKKEKSPLPILVDQGDADGFLSEQLKPEVLLAAAKQHGSELNLRMQSGYDHSYYFISSFIDNHLNFHAKYLFA >CP020035.1|AWG85536.1|45710_46172_-|oxidoreductase MKKIVSLSLLLFAPFLSANSITFSSPQQPSVTLKLEELQSLPTTSYTTDLPWIQQSSEFLGVKLSTLLTHVYGSIPEQVDIGSLNNYHSTLSRKDIVRYQPILAYQQDHHYIKVRNKGPYWVIYPLSQYPELDHNEYHAQMVWQVNEMKIKQK >CP020035.1|AWG85535.1|44619_45711_-|diguanylate-cyclase MKLSEAYPIKQKNYSTTSKMLLLVFATSLLLANVILLQQTRVLAQSFTDEQKQATWFLFQLSKELSELVSEARRLDENVLKIEGAELQYELAWSRFDLLINSKDVYTFFSRNHIQQYFLQLFNEFKELEPLLVEAKTGDSQAAAQFYRATQTLYLNLVEFVNQNFRLTSQVYETQKDESQRLMKAQYMLFATFVLSILSLTYFFYRESHFHRKLALSDPLTGLGNRNALFVTLKNNTRNRTAFSLCLLDLNGFKNVNDTYGHQAGDTVLCEIAKRLKDMNIDSFSTYRMGGDEFAVVIESSDVDAEEAKKHIHSVFDTPVLNANNVSSLSTSIGVAHYPSDSDNVDFLISIADKRMYKMKFQR >CP020035.1|AWG85534.1|44205_44595_-|hypothetical-protein MQILLLLAVIAAGVLAWVFIPSHETIGQKTLEQALNDDYSLVGHRIYSTDPDAGNRFGYFVLATGQSIEEQEPFLVTSDQFIRMEQTGDNTLSVTVNGRIYQYHNDLWVPKSDGKLQHFLVSATTNYVR >CP020035.1|AWG85544.1|54420_55182_+|2-deoxy-D-gluconate-3-dehydrogenase MILDSFNLEGKVAIVTGCDTGLGQGMALGLAKAGCDIVGVNISEPTETIEKVEAEGRKFVDIRANLMKLDDIPTIVDRAVTELGRIDILVNNAGIIRRNDAIEFSEQDWDDVMNINVKSVFFMSQAVAKQFIAQGEGGKIINIASMLSFQGGIRVPSYTASKSGVMGVTRLMANEWASHGINVNAIAPGYMATNNTAALRADEQRNKEIVDRIPAARWGTPEDLAGPCVFLASKAADYINGYTIAVDGGWLAR >CP020035.1|AWG85545.1|55203_55725_+|permease MDTTILAQALGFISFGLGFSVFYQKNDRHLKILMLIFNLNHLLHFLLLGSMVSALSALLSALRTTTAIFVSSKRVAAVFIVISLVSGFWVAEQWRDLWPIIGTVIGTYSVFCLSGIRMRIGFLLGASCWLTNNILVGSIGGTLLEMTVIVMNLLTIYRLHRQQSESMINQSSY >CP020035.1|AWG85546.1|55732_56053_+|cupin MFVFNQDIPMEDLGEGISRKVLAHSDNMMSVEVHFEEGAIGAMHSHPHEQLTYVLSGEFEFTIGDEKKIVKTGDTMYKEPNIEHGCVCLKAGVLIDTFTPMRKDFV >CP020035.1|AWG85547.1|56093_56729_+|hypothetical-protein MKIALMMENSQAAKNAMVAGELNSVAGGLGHDVFNVGMTDENDHHLTYIHLGIMASILLNSKAVDFVVTGCGTGQGALMSCNLHPGVVCGYCLEPSDAFLFNQINNGNAISLAFAKGFGWAGELNVRYIFEKAFTGKRGEGYPIERAAPQQANAAILNNVKSAVAKDVVEGLRAIDQELVKTAVGSTQFQECFFAHCQVPEIAEYVKSLLD >CP020035.1|AWG85548.1|56806_57718_+|pectin-acetylesterase MHVAPITSLQTWFSEHLVLPLWSEPQIPSHLVQSYQERNPNELLPDRAVFEITHPEIVVFEPEQSNGIGILLMPGGGYQRVSVDKEGVDSARVLNQAGFTVFVMTYRMPNEGHEFGAWTPLADAQRAMRLVRQLPLASHLSSIGVLGFSAGGHVAASLATSHALDIYPLQDEADRVSAKPDFCALMYPVISMNTDIAHMGSRAELLANLERESDLLRFSLEKQVTSDMPPCFLLHASDDTAVSVENSIVFWQALRQHEIATEMHLFEQGKHGFGIRDAQGLPVAAWPQLLSAWLQNLTEKARR >CP020035.1|AWG85549.1|57816_58746_+|ketodeoxygluconokinase MNPISRVAIIGECMVELKKHDGVLQQGFGGDTLNTAVYLSRLTKQHGVETSYVTGLGHDPFSREMLTAWREEGINTDMVYLSEDKLPGIYAIETAEDGERSFFYWRNDAAAKYWLRERALLSLVKDLCQHQMIYLSGISLAIISDDCRQMLIELLTMCRKEGVKIAFDNNFRPKLWPNIEQARDFYSKILSVTDMAFLTFDDEVMLWGDKHEDEAISRTKNFGVKEIIVKRGADDCFVVTQDQQHTVAALKVDAVVDTTAAGDSFSAGYLAKRILGGDVAESALAGHKVAGTVIQHRGAIIPSQAMPTI >CP020035.1|AWG85550.1|58757_59381_+|ketohydroxyglutarate-aldolase MKDLNQQLSEIKVVPVIAIKDAGKAVKLAQVLIENGLPCAEVTFRTEDAALAIKNMREAYPEMLIGAGTVLTSAQVDEAIDAGVDFIVSPGFNPTTVKYCQQRNVTIVPGVNNPSLVEQAMEMGLRTLKFFPAEPSGGVAMLKALSAVYPVKFMPTGGVSPSNVKDYLSISSVLACGGTWMVPGDLIDNEQWDELAKLVREVAGIIE >CP020035.1|AWG85551.1|59565_61305_-|transporter MTLLDSMIVMIYLLFIGIAAWLFRRFSTSSNDFLQGGGTMMWWMAGATAFMTQFSAWTFTGAAAKAYEDGISVMFIFWGNALGFFVAAAFFARRYRRLRVETAMEVIRVRFGHTSEQLFTWLSFPLTLIACAIWMNGLASFFSAVFAIEMSTTILAMGVIVTLIAVSGGAWTVSVTNVIQLILLIAITLVIGYTALQRFDSPSEVFAYTTPIYGEQIRMPSLFVMWAIAMLLQQTMSNNHTLSCYRFLTTANDKDATKAAFVAGVLFVFAPVLWFMPAWFVAAQNIDLLAIYPALDQSANNAAYLYYIQHYMPQGLLGLVMVALVAATIAPLSSAHNRNAGIVVKSLYQVWFNPNATSCQQLMVGKIATVVSGVLATVTALLLASVESYSLFDMMIVFAAFIQMPINIPSLLALVSLKTPNWSGWATVMVGCAVSLFMMFIFDVQWLSSLPLTPRESKDLSVVATLAVHLLVTGGFFLSTRVFYAKESPSIQQSRTALAIQLATPISDEEQSPINHKQGLYVGSITALAGMLLILAGVVLAGSSQSIFVAIGCIVLLFSLFLLQPTQHSKRAWQKQKTK >CP020035.1|AWG85552.1|61434_62112_+|porin MKVRYITSALLLAMTSGLAAAASVDIRHEYVPDRDGDEHRDRIYVSHRFDNQIGFSVEAKWNYKDGHMGNAGHETGVSYRWKATDNFSLTPGINIDASPSGASVFKYNLTGAYKINDEWDVAARIRHGYKNTDDSRYNQLNLYANRKFEWGKLGVEAEYKDIHGGEGGWKDKGHDQLIDFKGEYTKLESGVIPFFAIAAITHKGDGSEFKDEYVPRFRVGLKYNF >CP020035.1|AWG85553.1|62127_64356_+|exopolygalacturonate-lyase MKKHTLALCLAAILAPAAHAAEIKVEDLTWKAITFGQSTDMNFGSTILPEKVGVNQVTVNGDVVAAGKLASTFTIESRGGKLANSHEGLTFYYTELPTDVNFTLSADVVLEQLGPETGATPNRQEGAGLMVRDILGAERLVPQPEGHEEFPSASNMVMNLMRSHTRTNDGMTNINASFREGVYQPWGTPGNRLSRVDYLEGVPYGTAETYRMTLTRTNDGFKVSYRNGEKFVEQAVKGANANIVEMQNSDSQYVGFFASRNAKMTVSNVDLQLAAADTVDAPKYAAKQGELVFQIASSPRSATKEYPVQARANYSGEFEVLHNGKVVAKQTVTAGELFSQWLTLGSGANQMEVRFTAIDGPNKETQAHRYSVDVVSLPDPMTLYVAPNGSDKGNGSQAQPLDFATAVELLPAGGTIILKDGDYQGMEIPLTASGSVDKLKHLRAEGDNVRFVSELRHEANYWHYQGIEVAGAQFIVHGSHNTFEKMVTHGAPDTGFVITSPENIGRALWASYNQVIESESYNNMDPSQINADGFAAKMRIGDGNTFIRCLSHHNIDDGWDLFNKVEDGANGAVTILDSISFSNGRTLDVANKGGTIGNGFKLGGEGIPVPHVVKNSLSFNNNMDGFTDNFNPGALVLSDNVSIDNKRFNYLFRKSPYSGEIEQGTFTNNRSYRFHVSSKYDDVINSAKSTGNALVENGTTYTSDGKAVDSKTLAPLKQASVIDTQQAIPGKQEAMQLKQLIH |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
725026 : 769923
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP020035|725026:769923|DBSCAN-SWA GCTAACCCGAGATGGTAAGCGGTGGTTCCGGCACTTCAAGGAAGCAAGCAATGACGCGATAGAGTTCTCCTTCCGCAACGGTAATTTCCCCATCTGATTCAATCGCGATTCGACAAGCTTTGACGAACATTCGTCTGTCTTTGGGTTTCAGTTGCAGCAACAACTCTAATGCGGCGCGACTTAAATGCCAATTGCTGTTAGCTGGTTCTAACTTCACTTCAGGAAAGCCTAAATGGGCGAGGGCACAATGGTAGGCGCGCTGAGCTTTGTCTGCTTGAGAGTGGCTGACCCATGCCAGTTCTCGCAATAGCCAGAACACACTTTCCTCTAATTGCTTCAACGTCTTGTGTTGTTTGATGAACCCAAAAGAGGCGAGTAGCTGCTTTTCTAGTAAGTTGATGACACACCATTCGGCTAGCGAGTATTGATTATCCGTCTCTGAGAGCTCACGTAGCACTTTACATAGGCTGATTTTCTGGGCTTCACTCAGCGATTTAAGTGCCGGCAGAGCGAGTTCGAGTAACGGGAAACGCAGATGAAGTGGTAAGTCATAATCTAGCCAGGGAAGCAATGTAGATTGCGATGCGAGTGGAACGTACGACTTAATCATTTCGCGCTGAATATCGCTGCCATCAAAAATGAGGGCGAATGCGACAAATCGGGCGCTATATGGTTCACGTGCGATATCAACTAACTCTGGTGGTAATTGACTGATCAACTGTTGGCCTGTCTCACTCAATTGCTCCGATGGTGAGGCAGATTGCGAAGCAGGAGAGCCGCCACCTACGGCAAAGCCATTGACTTGCTCGTTACCAAACGCCGTGTTTTGAGCATGAGAATGTTGAGCGTAGCTTCCGTCCCAATTGGGTTCGATTCTTCGAATTCTTTCGTCCAATGGTGGGTGTGTCGCGAACAAACCAGAGAAACTGGACAACTTACTCTGTCCAAACATCATGTGGCTCATTTCATCACTGGCTTTCGTGTTTAAGGTAGAGCCTTGAACGTTGCTGCCAATCTTCTTTAACGCTCCCGCAATCCCTTGATCGTTGCGAGTGAACTGCACCGCACTGGCGTCTGCTAAAAACTCGCGTTGGCGCGAAATCGCTGCTTTGATCATGTTGCCGAACAAGGTTCCTAACCAACCCAGCACCAAGCAGACAATCGCAATTAGTATGATGACAGCGAAGCCTTTGTTTGAATCAGAAGAACTACGTGATACGTGACGAGTGCTGTTGGAGTTATCCAAGATCAGATGACCAAAATGAGCAATGCAGGTAATGCCAAATAACGCACCAATCAGACGAGTATTCAACCGCATATCACCATTTAAGATGTGGCTGAACTCATGGGCAATTACACCTTGAAGTTCGTCACGGCTAAACGCATCTAGTGCTCCTTGCGTTACCCCGATGACGGCATCATCAATGCTCATGCCTGCAGCAAACGCGTTGATGCCGTGCTCTTCCGTCATCACATAAACTGGTGGCACGGGAATCCCCGACGCGATGGACATTTCTTCCACAACATTGAGTAACTGGCGGTGTTTCGCATTTGACGTGTCTGTCGAAATCAACTTGCCGCCGATACTTTCTGCAACGCCACGTCCACCATTGGCGTTTAGCTCACTAAGACGAATGAATGAGCTGATGCTGACAACCAATAGCACGCCCACAAAGCTCAACAAACAATAACTGATGATGGATTGAGTGGTGAACGGTTCGCCAGTGAAATAGAAGTAGATGCCAATCGAAATGACACTCACTAGCCCTGTGATGGCTAAAACGGCCAAAGTGAATAGCATCACCAAAAGTCCAGTTCGCTGGCGCGCAGTGTCTTGATGATGAAAAAAGTCCATTAGAACGCAACCTTCGGCGCTTCTTGGATTGCTTCTGTGTCTGCAAACTCAAGTAACTTACCGTCTTGGAAACCAAATGTGTTCGCGAAGATAACGGGTGGGAATGTTTGCTTGTAAGTGTTGTAGCTGGTCACGGCATCATTAAATGCTTGGCGGGCAAACGCGACTTTGTTTTCGGTACTGGTTAGCTCTTCTTGGAGTTGGCTCATCGTCTCGTTTGCTTTCAATTCAGGGTAGGCTTCTACCACAACGTTCAGTTTGCCTAGAGCGTTTTGTAACATGCCTTCTGCTTGGCTAAGCTGGCTAATTGCAGCATTACTATCTGGCGCATCACTGGCGGCTTTTAAACCTGCTATTGCTTGGTTACGAGCTTGGATAACGCGTTCAAACGTTTCCTTCTCATGAGCCATGTAACCTTTAGCGGTGTTTACTAAATTCGGAATTAGGTCGTATCGGCGTTTCAGTTGAACTTCGATTTGAGCGAAGCTGTTTTTAAAGCGATTTCGTAGAGTAACGAGCTTGTTGTAAATACTGATTGCGTAAACCACAACCAGCAGAACAATAACAATAAAGACAATCAGTGCAGTCATAGTGAGTTCCATTTTGTGAATGTATCAGTGTTTTATATAAGTAGTTGAGATATTAAGCAAATTAGACTTACTTATAATGTGGGGTATTTTTAAATATGGCACGTATTGCGTAAGAAATATGAGAGCCATTTAGGATAAAAACAAAGGGAAAGGATTCTCAAGGAGCGCAAAATAAAAAGGCCCGGCGTGAAAGCCGAGCCTTGTAGAATGTAGAAATTCTAATCCGTGATTAAGCTGTCATCGGAACAAGTACCATAGTACCGATGATTACCGTCAATAGGCCAGCAAGCACAGGCACTGAAGTGCGTTTTACAACTTCAAATGGGCTGATGTTCGCCATACCTGATGTCGCAACGATTACGCCAGATACTGGCGAGATGGTACGACCTAGGTTTGATGCTTGAAGCATAGGGATGATTAGGAACGCAGGGTTGATGCCCATTTTCGCCGCTAGAGACGGCGCAAGTTCTACAAACGCATAGAAAGGCGCGTTACCAGAACCAGTAGCAATAGCCGCTGCAACGGTTAGACCTGTTAGGATCAGCATTAGTGCAACGCCACCCGCTCCTGCGTTATCGGCAAGGTGAAGTAGGTTATCGATAGCACCAATAGACATCAGACCTTGTGCAAATACGCCTGCCGCAACCAACAACATCACAACGCCTTTAAATGCATCGGCCATGCCTGCGTAGCATGAGTCCAAATCTTCAAGCGCTTTTTTGCCGTCAAACTTGTTCACGACATAATGGATAAGTGCGCCAAGGAAAATAGAACCCACAACGATGGTGTAGATATCTAGACTAAGACCAGGAATCGTACGACCATTAAATAGGAACACACCGATGATTGGTAAGAATGGCAGTGCTGCGTAAAACGCTGGTGCATCTGCTTTAATTTCTGATACGTCGATTTTTTCCATCGGCGTATTTTCTTTCTTATCTAGGTATTTGTTCCAGAAGAAAGCTGCTGCCGCCATTACGACGATTGCACAAATCGAAACAGGAAGAACAGTTTGTACCGCAAACACATCTAGCGCCAAGCCAGACTTTTCTGCAGCGATAACGACGTCACCTGAAGTAGGAGAAAGAATAATAGCAGCAGGAGATGCACACACTGCCACAGCAGCAGGGCGAGAGATACCCATCGCAACCATCATTGGGAATAGGGTTGCCATCAATAGAACGCCAAGACCTGTTGCAGAGCTCACCGCTAGAGACATCAAACACGCCACAATGTAAGCCGCTACCAAAAGGACATAAGGAGACTTGATAACAGAAAGCGGTTTAGAGAACTGTTTCACGACAACGTTGTTCGCGCCGATGTGAGTCATGTAAGAAGCGAAACCACATAGCAACATGATTTGCATACCAAGGCCGCCGCCACGGTATTGCAGCATGTATTTCACGTATTCTAGCGAGTCTGTCACTATGTTACCGGTTGAGGTGATGCTTGATGGCAGAACGTCATGGCCCAAAAAGCCAGTCATAAGAAGCAAACTGATACCAGCGGTTAAAAGTACGCCAGCTGCCTTGTAACCTTTGACAATGAAATAGCCCACCGCAATGGTTACTACCAAGCCAATTAAGAGCTCTAGCATAGGGGTCTCCAGATGTTATGAAAAAAAGAAAGATTCTGTTTCAATTTATGACAAGGAATTTACAGAATTCTTAACTGTGGCACGAGGCTAATCTGGGACTTGCATGATCTAAAACAAATAATAATTTAATAATTAAATCCGACAGATTCTCTCGTTTCAATTTCGTTTTGTAGGTGTTATGCGCTGGTTTTTTGAGTTTTAATGGAAGGAAAATATAAGCAGATTGGTGAATGAAATGCTGATGGAATAATTAAAAGTAATCAAAAAACATTATTCGATTTAGATCACATTTGTAACGGCTAAAATAAACAAAAAGCCCCGACTAAGCGGGGCTTATTCAGCAACTTAATGCATTATGCGTAACGACGGATCATCAAGTTCCAACTGCGTTGTTGACGCTCAAACTCAGTTTTAAGTTGTTGATACTTCAATTTCGATACAGAGCACTCGTATTTCTTCACTACGTTCGCAGTTTTTTCACCGAGCAACTCTTTGCGTGCTTCGTAGTATTCCTGCATATGGTGAACCAATGCATCAAACTCTTGCTGAAGTTGATCGAGAACTGTTTGCGCATTGGGTTTGGACTCAAGTTTCTCTTTCGCTTTTTTCAACAACTGGGTTGCTCGCGCTTTTTCAATTCGGAAAGTTGATGTAGTGCGAAGCTTGGACGTCAGCCCCAACCAAGAACAAGACTTGATCAGCCATTTAGTTGGATCGTAGTGCCACCAATAAACACCATTGCGGTAGTCATTCTCAAAGATGTGGTGAAAATTGTGGTAACCCTCGCCAAAGGTAAAGAAGGCTAAGACACCGTTATCGCGGGCCGTATTTTTGTCCGTAAAAGTTTGCTTGCCCCAAACATGCGCCAAAGAGTTAATAAAGAAGGTTGTGTGATGGCTCAAGAACAGGCGAGCTGCGCCAACAACCAGCAGCATTCCCCAAACATCCCCATAGATAA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44 | Shigella_phage(22.22%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
783029 : 843937
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020035|783029:843937|DBSCAN-SWA 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50 | Vibrio_phage(50.0%) | transposase,integrase | attL 823466:823480|attR 842331:842345 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
559159 : 576339
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP020034|559159:576339|DBSCAN-SWA 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MTTNYIFVTGGVVSSLGKGIAAASLAAILEARGLKVTMMKLDPYINVDPGTMSPTQHGEVFVTEDGAETDLDLGHYERFIRTKMTKRNNFTAGRVYADVLRKERRGDYLGATIQVIPHITNAIKDRVIAGSEGHDIAIVEVGGTVGDIESLPFMEAIRQLAVELGRERAMFMHLTLVPYLAAAGEVKTKPTQHSVKELLSIGIQPDILVCRSDRMIPANERKKIALFCNVPEKAVISMKDVDSIYKIPQLVKSQGLDDLVCTRFGIDAPEADLSEWEQVIYEEANPTGEVTIGMVGKYIELPDAYKSVNEALKHAGLKNRLNVTIKYVDSQDIETKGVELLEGLDAILVPGGFGDRGVEGKIRAAQYARENKVPYLGICLGMQVALIEYARNVAGMEGAHSTEFNKDTKYPVVGLITEWVDETGNVEERTESSDLGGTMRLGSQLCHLEKGTKARELYGSATIHERHRHRYEVNNVLRPQIEKAGLKVSGLSADKKLVEMIENPAHPWFVAAQFHPEFTSTPRDGHPLFAGFVKAAGQYSRGEFEK >CP020034|559159:576339|562872_563577_+|AWG82853.1|DBSCAN-SWA MSENVSSHIAIVPAAGVGSRMKADRPKQYLLIDGKTVLEHTVEKLLAHPQIAKVVVAVTEGDPYYPELSIALHPDVIRVAGGKERADSVLSGLNYVSAQLPCEWVLVHDAARPCVTLNDIDRLIDVCCAHPTGGILASPVRDTMKRANKENNIDHTVDREALWHALTPQMFKTQQLTRALADALQQGVAITDEASALEWLGETPALVQGSANNIKITQPEDLALAEFYLSRERG >CP020034|559159:576339|565936_566563_+|AWG82857.1|DBSCAN-SWA 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MSDILSSLAYLTGKPVASAKIKAQPEHFQVREDLGFAFTGEGEHLMVRIRKTGENTSFVANELAKACGVKSKDVSWAGLKDRHAVTEQWLSVHLPKGETPDFSTFLAQYPSIEILATDRHNKKLRPGDLIGNEFVVTLSEVTDVADVEQRLEKVKQVGVPNYFGSQRFGNDGNNLDEARRWGRENVRTRNQNKRSMYLSAARSWIFNRIVSARLENGVFDKFIDGDIAQTSQGLLAVDANNLADMQNKLALSDVEITAALAGDNALPTQADALALEQPFIDEEPDLMALIRGNRMRHDRREIALKPKDLAWNVEGNNITLTFSLDAGSFATSIVRELVNEVKVEREY >CP020034|559159:576339|562664_562871_+|AWG82852.1|DBSCAN-SWA MSDYYTVKDEIEVQQQVNSKLQARNNEMFAEIDDLKQGLDAIEERARHELGLVKEGETFYRIVGEENP >CP020034|559159:576339|566577_567501_+|AWG82858.1|DBSCAN-SWA MSKLLRHIGISFVLAAGLVGCAAHSPAPVSSLKKDYSSVERGSYRGSYYEVKKGDTLYFIAYVTDKDVNDLVRYNELSQPYTIYPGQKLKLWAPKYVAPKYGQKVEPVVVPVVTTTPPPVVKPTTTTKPVTSSKNSSQKPTTTPTKVAQKEPPKKVEQTKAKEYVGSKDNQSTKPKPPTTTVQNDKVSKWLWPTKGRVIKNFSAGEQGNKGIDIAGQRGQPIVSTAAGTVVYSGNALRGYGNLIIVKHNDNYLSAYAHNDKLLVTEGQSVKSGQKIATMGSSGAKSVKLHFEIRYQGKSVNPKRYLP >CP020034|559159:576339|565160_565937_+|AWG82856.1|DBSCAN-SWA MELDSLNTKPLRILISNDDGVHAQGIHALADELRSIAEVIIVAPDRNRSGASNSLTLEQPLRVSEIAPNTYSVQGTPTDCVHFALNELMKDDLPDLVLSGINHGANLGDDVLYSGTVAAAMEGHFLGVQAIAFSLVGKRHFESAAKIARQLVEQHLAAPIPTNRLLNVNVPDLPLESLGEIEVTRLGARHHAENMIKQKDPRGHDIYWLGPPGKEQDAGEGTDFYAIEHGRVSITPLQVDLTAHESLRAMDSWLKEEK >CP020034|559159:576339|573146_573614_+|AWG82863.1|DBSCAN-SWA MYQKRQAPTLSSKEAAIQLLSRRDHGLYELHQKLAMKGYEEADIEAAINFCLEHNYLDDLRYAKSQVRQHVYKGHGERRIRQELNQKRVAESVIEQAMAEEPQDWFELAKLAAEKKFKGIKAKDQKEYAKQVRFLQYRGYSFDQISYALSFEDED |
15 | uncultured_Mediterranean_phage(18.18%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1402425 : 1433269
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020034|1402425:1433269|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020034|1402425:1433269|1419180_1419588_+|AWG83692.1|DBSCAN-SWA MSINIKWDGDCRFKVSTEGGFTFNVDATSEKAPCPTEVLLSALGSCSATDVVLLLQDQGFEVQGLENTVTFALTESEPRLYKSANLHFTVNGSGFKESDILRVAQEAVEKHCHVCLMLSPTIDITCSAEVGKNCT >CP020034|1402425:1433269|1409614_1410301_+|AWG83679.1|DBSCAN-SWA MDKLDVNTVQINIINNYKLSAFPEDRINTLISELNVHYGKINNYIEMEMAADKINLEFADAYIKLNEIFRLSPKRINHDPYSGDFMLGMDIINSILALLQSSSGDIKTRQKVKDLGWDLVERLFGYDFDQTVKNGLFYRWLDSKKLITKSGLYMNNWDVFLDKTNEPKRIPFEPSENDLNAFYEENKDRIYELMVAEKNGFSELKDPFSDKQIQDFYHYYCSLDELKI >CP020034|1402425:1433269|1412130_1412253_+|AWG83682.1|DBSCAN-SWA MAFLVWVWLSVYGGQMKCRGRVLHTLIGRYNLKEKICLKN >CP020034|1402425:1433269|1433116_1433269_+|AWG83712.1|integrase|DBSCAN-SWA MEELQKDLDEWMDYYNNHRTHQGKMCCGRTPIETLEDGKSIWAEKNLAQI >CP020034|1402425:1433269|1424677_1424917_-|AWG83699.1|DBSCAN-SWA MIDKKDKLVKLIKEGNPEWEIYLDDIFKDLRALSKSESSTSIIVDAEQVEFETLLKKAIEEGLESQVATSEDIENGNKS >CP020034|1402425:1433269|1411628_1412102_+|AWG83681.1|DBSCAN-SWA 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>CP020034|1402425:1433269|1417001_1417712_+|AWG83689.1|DBSCAN-SWA MEHRVKKVRAYSTAMISRLIIADRKLALLNPLLNDSDLIHKWDHSYGSHGLELMRITMYLDIVRELAAISFDRGNTSPSIFNILELISSKPLLEALKRDYCKPTTITWVNDVDPESRAFWEERHKERDLGDKSQRFDEHYHKAKKLFSELKGKDLHHKMRNVRNKLVAHYEMRQDGTEPRLADPKDFNLKWGDVESYFEELKPIIVELVLLISNEAYALDLFREDHERISRDFWKL >CP020034|1402425:1433269|1418727_1419012_+|AWG83691.1|DBSCAN-SWA MKLSELQSHIKEFDYAPEQSGHYFLKLIEEVGELSESIRKGKSGQPTLDELKGSIAEELYDVLYYVCALANIHGVNLEKTHELKEVLNKVKYNR >CP020034|1402425:1433269|1416014_1416254_+|AWG83687.1|DBSCAN-SWA MVGFSVSETDLFVESQLCNIVFSKDFFGVVSPLSTELHVPSGFSDRRFETAPELIFSKHIKLALAKQQLTSNQSFRFGN >CP020034|1402425:1433269|1424035_1424542_+|AWG83698.1|DBSCAN-SWA MEIKEISTTSGLIEQLHALLTDCIESGASVGFLAPADAQEVKLYWSSVEADLKSGARKLFLAYDNENVIGAVQLSLCSKANGSHRGEVEKLMVHTGARGNGVSKKLMSLMENVACELGLSLLVLDTRLGDVASSLYRSIGYTEAGQIPQFARSSTGELEGTVYFFKLL >CP020034|1402425:1433269|1405740_1406016_+|AWG83673.1|DBSCAN-SWA MSKVTLKGFILVPESELESVKSELVNHKRLTLEESGCITFNVTQNSKNPLRFDVYEEFTDKMAFAHHQQRVKASLWSKVTVNVERHYEVFE >CP020034|1402425:1433269|1429928_1430819_+|AWG83708.1|DBSCAN-SWA MVVIESSVGAGGVNKKKDVKIVQILLNSQAKAEKLITDGLCGSKTIGAIFSYQRTIMPGWKPDGRVDPNGRTFRELLMYVPKEEKEKLSSSLIVRNKNVEIESRNKLSTTDYSVSYKSSLPSDKRLVSSYSINVIRLALAQAGMKCAVISSTLRFPEEQASIMYRNARIDLKKQKQLYGKNGDAVLDVYSSNSKKDKHEVIRLMKEKIELLARDGKKVSKHCTTVEDYKKYNVIDIGVNSTRTANSEFFSVKKFTAVLKALTEDGYINKFIDETGKSNKCWHIEVVPNAKKITRFD >CP020034|1402425:1433269|1425435_1426200_+|AWG83700.1|DBSCAN-SWA MIINKNWDLDIAFEVINDRYYPGGLQSGSQRNRQIETWGQLVGKTRALEQLDSLIASCGSINKMSQSVRMSSGSIKKLRTFFESLPDELEIVEDNVQHRFIEGEVCSLEEDLTHEFKEVKGNNPAKSIQNLIDEYVVAFLNGSGGSIFWGICDDGKVKSLHLSTAQKDEINKVVNAKIGTIQPAIDPTKIRVRFHSVIKTENGYVFEVNVPKSNTVGLFFNSSGDTWVRVNGCKQKLKGLALQDYILERMQKNN >CP020034|1402425:1433269|1422042_1422459_+|AWG83695.1|DBSCAN-SWA MPVRMDEYLEKVIKNRFSVSLMSNSKWRKVFTILDVPELMLKQCYWKFVHNDDEFLDWFTKSDELMEKYVGDYGPGPFAYKRIEWLEIPKVGKPSGYENVPFKHWHQDIDGALSILNSVGQFDIELTGRGLRIYGFRE >CP020034|1402425:1433269|1413123_1413369_+|AWG83684.1|DBSCAN-SWA MSELSVVRATHLTGHILEIEFSDSHISIVDFAPFIFGNGHPDYDVYKDVSHFLKFDLLDGNLNWDDYTMIFPIGDLYQNKL >CP020034|1402425:1433269|1428710_1428830_+|AWG83705.1|DBSCAN-SWA MRITEELNEAGYACCVNYVADIMKEKGIRARNGKGFKYS >CP020034|1402425:1433269|1405250_1405376_+|AWG83672.1|DBSCAN-SWA MFFGAVTFGFSESNFFAETLLVEFVDTKADLLAARTFSLVW >CP020034|1402425:1433269|1429012_1429318_+|AWG83707.1|transposase|DBSCAN-SWA MTVELITNALKMAFESRKPPKGVIIHSDRGVKYQDFMRNHGGVPSMSRQGNCWDNAVMESFYSRLKVELIYAEDYQTSKKPEWASSNTSRYFTIAEEDTQR >CP020034|1402425:1433269|1428842_1429016_+|AWG83706.1|integrase|DBSCAN-SWA MTNVADNLLRRDFESDTPNQKWVTDITYIWVKSRWLFLVTVMDLHSRRIVGWSLGQP >CP020034|1402425:1433269|1411015_1411495_+|AWG83680.1|DBSCAN-SWA MYTNKNVYTEVGKYYPFIEQVNGQLRVGLQSGGQYKIPVGNAQLRIDSNKAWDISTSETPLDLAPTFANFKPAYLDNLSDDQKAMVAASYESAMEVSAQAMSPFTVTTGEKAEKIVKEMLAGKSLKYRTVGLNQAASSTGVYDLDMSLQNALIDCGIEL >CP020034|1402425:1433269|1428213_1428522_+|AWG83704.1|transposase|DBSCAN-SWA MAKHRNPAYTEEFRKEAVRLASLPGRTAVSVAKELGISAQQIRNWKRQFTRLSDKQFNTLDGVDYSKKESEELRALRRENKRLKDEMEFLKKVSAYFAKQQE >CP020034|1402425:1433269|1404347_1404989_+|AWG83671.1|DBSCAN-SWA MIIDETKLRDAARDYCKFWDEYDSKFSEYISGVHYSNSSRIDKLRECLCEYGIQRNVQPNDNELQNDIGMGCGDGYNPKKHQVILEVLDTFEHTNDWVSDIYCLEEMLYSRLKNEVRLLSLASKVLWQKVRGSYLVYDNDARKALKVRDKDISNFYIKWNALYQENYRSIVNALEAVIDDSPFMFYRYDDFRQDWFYRRIFDTYLINLTREQK >CP020034|1402425:1433269|1407178_1407595_+|AWG83676.1|DBSCAN-SWA MKQNIVHIALVVKDYDEAIDFYVNKLKFELIEDTYQPEQDKRWVVVAPPNSHGVTLLLAKASKPEQHDFIGNQAGGRVFLFLNTDDFWRDFERMKSIGINFVREPAEQDYGTVAVFEDLYGNLWDLLQLNPAHPMAKR >CP020034|1402425:1433269|1416400_1416847_+|AWG83688.1|DBSCAN-SWA MKDKIYVEAFNSHRHYDQMANKALTIFVAVIAGTVALQLKFLTTEFEKEAYLYLALSVTNLIVVLGCLRAYRSFDSYATIALNVASAIETNDKRFKGEVVGFAYVFKHIDNFKWLSSTGTSKTFKWLATLGTISILFNFVLGACLYIG >CP020034|1402425:1433269|1407669_1408491_+|AWG83677.1|DBSCAN-SWA MQRLGHCVLRPLTGRYAYSPFWSKLYVQIWCFRVEVKMKLDAVLWDYDGTLVNSVPKNIDITKAILSDVAPHLTGDFLPKYLRDEESYHKANHSAKNWQELYVDYYGLTHEEMLIAGGMWAEHQEKNTTEVMLFEGIKDVVTKFSHLPHGICSQNSQNNIRRLLKNNSMAAPFKAVVGYNDVSNRHQKPDALGGLKCIELIFGHTNSQCLMYIGDHEADVKFARNLQTVLGGEARVIAVAAAYSRSEPESWECKPDYTARTVDDLFDIIGKYA >CP020034|1402425:1433269|1403706_1404102_-|AWG83670.1|DBSCAN-SWA MKPLGTNNAVENELTTPKSAFGKPISQCGLSTKSLKPHEFTTPEKTLFQRVSRLLYQQTQRAEFQQKSSAQLTQKSPHQRTNQPLKRCQFWIFTTLINTEIERQYDNFSFELLSLDLAIWLRFSSCKLTPR >CP020034|1402425:1433269|1406713_1407016_+|AWG83675.1|DBSCAN-SWA MKNEILAICLGVLMVGCSSSPKPVDTRTDMEKLQAFDQKIHDAVVLTGEHCGVSYDDLTLKFYAQVSTRNNDEWLSILRAFDNNREEEALELINQLPCPE >CP020034|1402425:1433269|1422589_1423249_+|AWG83696.1|DBSCAN-SWA MNKQAKVILWSLFVVLLMPILAYIYKFGLGLWDKPDEWSDLGGYVGGIYAPILSIVTLVVISIQIFIQHQQYQHSLIQHQEEQIKEYLAALEQALDVEVGEISSRDFLVSLCRDVSKDTIKLIPAELVMDFNQCNHRLYSMWCEVMKCLAVLENISNQNVYNKVVFASNKNKVIAYLNPQTCRMLDRFHFIFLCKCEEINVHIDTQGLKYYYSDLRNGG >CP020034|1402425:1433269|1426402_1427020_+|AWG83702.1|DBSCAN-SWA MDCFGDKAREQMVRRYDISAVAHVKLLNNQKKHSCTGRVLTDSYYCFEYKGKNNGQDIGAFYCGEPTAKKFLALTGGDDVPLFNPLKSDSLSVSGNSSSVGGAKRKVDPATKQLLNAINLLVVCWDTAPYGKLAKIKQDRTKYSYRPPFESEVEYVNLVIGHDYQGRNLQQMIERLRKDNPTLKNYEFGLLTSVLESADIESNFG >CP020034|1402425:1433269|1402425_1403346_+|AWG83669.1|transposase|DBSCAN-SWA MPKPRYKTTNWKQYNKSLINRGSLTFWIDEEAIAEWKQNKQGKRGRPRRFSDLAITTALMVKRVFSMPLRALQGFLDSVFKLANIPLVCPHYTCISRRAKEVEVSFKTKTRGAIQHLAIDATGLKVYGEGEWKVKKHGTDGKRRVWRKLHIAVDTSTHEIVAAELSLSNVTDAEVLPNLLKQTRRKIIEISGDGAYDTRNCHDAIRIKRAVPLIPPREGAAFWEQGHPRNLAVGCQKLYGSNKKWKKRYGYHKRSLSETAMYRVKQLLGGKLSLRNYNAQVGETYAMIKALNKLTGLGMPETQYIV >CP020034|1402425:1433269|1414065_1414521_+|AWG83685.1|DBSCAN-SWA MIKQLDVNEKSVVELSERCFDELRQVYRPTELAVSNKNSAKSEWSCFGFHVDEVLVGVVEAKQVGSEFQLSSLAVAPSFRQKGVARKLVDFVVTQFKRINSVSVWCVEQTGNVAVFKALGFNVVQRFDSDFFILSDGSKAVEVHLKQKVTA >CP020034|1402425:1433269|1421410_1421890_+|AWG83694.1|DBSCAN-SWA MKTWKVLISEQQCEGPIQSGDFDCNGGGFPSFTFVDTEKADRPQSEYKYLMIDTLAWDSYWKTDESTYIPQDLNDLPEYRQEESSGSARKISRLYCAIGKSFKMFAPSFEDTPEGAKLRIAQGRHRVNIITSLKIPAFPAAVPLSKISELTHLGIIHKA >CP020034|1402425:1433269|1419733_1420711_+|AWG83693.1|DBSCAN-SWA MNKELLKIDYENQKPKAVRFKQTVSEQLHDLLDKDLVTLGTPLESRIKSLTSIQEKLDRKKKVIQSVTELDDFVGIRIIVLFRSDIEKVCNIVKNNFEIIDIEDVSKRLSDDQFGYQSTHYTIKLPQEWLSLPTLSDLNQLKAEVQIRTLAQHIWAVASHKLQYKQEQSVPVPLRRSINRVSALLETVDLEFERVLIERHDYREESLQTVDDNSGFDVLVLEAICDKLLPAENKDAGHEDYSRLLEQLIEYGFDNASKLETLIDEHIDEALAEDRERVSEELVEQNEYVDQERLSRGVFFTHAGLIRGCLSAELGENYEPIIADD >CP020034|1402425:1433269|1412237_1412591_+|AWG83683.1|DBSCAN-SWA MSKELTVGDLQECIRGLPDDMPMTFGSSKYSKRPLIFYRFKARGEDLLQIELNEIDNDTWEDEDSELHLRITVGHLREELNRFWKPTDRVVFGSTLDAIPLFSHKPQVVLSFELDQD >CP020034|1402425:1433269|1406170_1406575_+|AWG83674.1|DBSCAN-SWA MTKRLELELDIYYEEISDLEDLKSAIADCVIENELEFTSRTGVLCSQADVRASYLEGSLDVEHIEFSTPNIFDDNQEFIQNVSGTINVSFEYDAYYGCKDMDNGDLIDDAWGFELSGEKLKFCLEIPEERYDEI >CP020034|1402425:1433269|1432236_1432623_+|AWG83710.1|DBSCAN-SWA MLHTSNPIIKRKAGLLNLAEELGNVSRACKVMGVSRDTFYRYQGLVETGGIDALINQSRRTPNLKNRVDSETEQAVLKYAIDFLAHGQVRTSNELRKLGVFISPSGVCSTWFRHDLENFKKRLRKTGS >CP020034|1402425:1433269|1426242_1426365_+|AWG83701.1|DBSCAN-SWA MRCIWCLRWYAGTSVLRCSHLNAALAKSDIRTICSMLSLC >CP020034|1402425:1433269|1431488_1431785_+|AWG83709.1|DBSCAN-SWA MFEVREAIDEDYEFLFELKKAAEYEPVKAVFGWDENVQKAIHRNEWNEAKPTIIEIEGVPVGSYLVQAHPEHLYFCRFFLLPSCQGKGIGSQVLKTVI >CP020034|1402425:1433269|1415130_1415769_+|AWG83686.1|DBSCAN-SWA MGKFDDDLDELGEKSPIIGKVLFLITALGFLVGVVTNVETVVQWVSKQFRIDVVSYKDFNWVEKGTGIDSDTLSFNYEIPEKWIHGMFATINSFSYTPDKLELRGFKVYISTYSSDFFQVESNHNVSEATLNIQGGQHFSVSETPSYIIEGSANDKNDDDKQYWFKSVSVPYDGTEYKITCTFSSAKDKEKYKELCNYIFSSIIINVWEPYS >CP020034|1402425:1433269|1427207_1427369_-|AWG83703.1|DBSCAN-SWA MLNCRGNCQAEMLLGNEPESDFKPVKQEAYHHDLTMKQPANIGMFYGPSDSRT |
44 | Escherichia_phage(50.0%) | transposase,integrase | attL 1421540:1421554|attR 1434760:1434774 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1913081 : 1922488
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP020034|1913081:1922488|DBSCAN-SWA ACTAAGCTGACTCGTAGAAATACTCAAAATTAGTACTCATCACGTCAGCTTTGGCCTTGTAGACTTTCTCAATGTCGTATAGGTCATACACCGTCCAGTTCTGCGGAGAGTGATAACTTTCTAACGTTTCTAAGCGAGATAGTCCGATACGTTCGATAAGTCCACGTCGGTACTCTTTCGAATTCCCCGATTTGTTCCCGTTGCATTCGTAGCACTGGCCATGGGCATTGTCTTCATTGAATCTAAGTTCAGGGGCTGCGCCTACAGAACGAAAGTGGCCGCAACACAGAGGCAAGTAGCGTCCACAGCTAGCACACGGTTTTCCGCTATCGCGTAACACGATAAAACGGTTAAATTGTTCTTGAGCTTTTTGAACTCGATACCCGTATTTCTTAATTTTCATTTGTCAGCCACAGCCCCATAAATCCAGTAAAAAGAGCCGTTAGGTAGATGAGAAACACACTATCGAAATGGAAGCCACGCCCAGCGAAGAGAAAGCAGAATTGCAAGAATGCTGACGATACCACTGCTATCGCACTAACCACCGTAAATAAGGCAAATAACAGACGTATCATGCGAACTCCATAAAGCGATATACGGCGTTTTGCATCTCTTGCTCGTCGTTAAATACTTGAAAAAGTGATTGGTTCCATATGACGTTAAAACAACCTTTGTAAATTTTTTCGAATTGTTCTTGGTCTGCGTTCTCAAAAGCGATAGACCAAGGCCGTTTTACTGTTCCTCCATTGGGGAGCATTTCTAAATCAAAATAACCAGCTTCGATCATCACTTGGTATCGGTAGTTCTCAATACACTTGTAAGCCTCTGGGTCGCAGTGACTTTCTCGCTGTTTTTTTATTTTCGATAAGACGATGTTGGCAATCTCAATACCATGTGTTTCATACATGTCTTCTCGTCCAGCCAACTGACAGAATTGCTTCGCAGTTTCATGTGCTATGTAATACTCTGGTTCGCTGATTAGGCTTACGTCGGGAGACCAATACTCGAATCCTAGGTGTATCAACGCAAAAAATTTACGGTGGTGCTCCAAAACACGGGCTTTCGCTTTAGACTTAGGCTTAATAGCCACAACGCGTCCACGCATCGTAGCAGCCTTTTCGCGCATTTCAGGTGTTGCGTACTGAATATAACCACCAGTACCAATTGCACCGATGATCTCTGTCGTTTCTTTTTTCGCCTTCACAGTTGAACAACTACGCACGTTTCAACTCCTTAAAGTGAATTCTTGGTTTCGCCAACTTTTGAGCCTTTTTGGCTTTCTCTATCATCAAGTCGACACGAAATTGAGTGTTCTCAGAGTCATCATCGTTAGCCGCGATCATCTGCTCATAATCTTTGAGAGAAATGCCATAATCATTCGCTATGTCGTTTAACATCTGATTCGCTAACTCACGCGCTTTGCGCCACTCTCCACAATTGTGAAAGTGCTTGTAGATATCCTCATATTGTTCACTAGCAACTTTTTGATTTGCCATATTCAGGCGTTGCAACTTACCCTCGATAAACGGCAGATCAGATGGAATGCCCCACTTTTTAGAACCGGCATACCAAAACTTCGGTAGGTAGTAGATCATATCTCCCCCTGCAATCGCTCTCGGATTTGTCGTTGTTGCTGGATGAATTTCTTTAACTTTTCAATATCCGCTTGGAAACTGACAATAGCTTTATCGCCACCAGGAATGTTCCATTGTTGATGCTGCATAATGTTCTGCTGCAAACCTGCTACTTTAGATTCAGCTAGACGTATCTCGTTCTCAATTTGGGCTGTACAGTCAAGCTGAACTGGTGACTCTAGGTTTTTATTGCATCGTCCCTTGTTCTGCTCTTTGGCTAACCAAGAATTGATAAATCTAGGGATTCCACTTTTGGTCTTGCGTCTGGTGGGATTAGATTTCAACCAACCAAGCATGTTTCGAAATTCCTGATAAACATCTACAGACGGATACAGCTTTCTGAACTCGAATATGTCCTCCATGTACACGGAATAAATCTCACCACGACGATTCGTTGGAAATTCAAATTCAGATTCAGGTTTTCTGGTTTCAAGCAATTCATCATTGCTTGGAATAAGATCTTTTAAAGGATCAATGGTTGGTTCTATGACTGGTTCTGTTACCCAATTTTGGGTACCTTTCAAATCCGTTTTTGGGTACCTTTCAAGTCCAATTTTGGGTACCTTCGGAAGGTGTCCATTTTCGGGTACCTTCTCTTCAGGGCTCGTAGTTCTTGATGATTTTGGGACTTGATGCTTCACATCGTCTTCTATGCCTAACAATTCCCATACAACAACCTGATTCGTTGACCCCTTTCTTTTCCCAGAATCTCGAATGATCCCAAGCTCTTGCATTGCCTTTAAGTTCGAACGAATTGTTTTGATGTTTAAGCGAGTATCGAGCTCTATACGCTCCGCACTCGGATATGCTCTGTGATACTCATCAGCTCGATCGGCAAGAGATAGAAGAATTAACTTCATCGTGGCCTTGATATCTTGTCGCCACGCCCAATCTGTAGCTCGTCTACTCATATTCTTGACTTCCAGCGCAACGCTGCGCTTTTCTTATACGCCTAGAGGTAAAACCAACAACCCTCTCACCAATCGTTAAGCGTTTGACTTTTATGGCGATCAAACTCGCGCTGCTTTTCCAGCAATATATTCGTAAGCCCCTGATAACAATCAACGGTCTTTCCCGCCACGACTAACTCTTTAACCGTAAACTCTCCATCTCTGATGACGACTTGAACTGGAGCAGTGATTGTTACGATTTCAGACACGGGAATTAATGATTTATCAATTACGCCTTTTTTCATTTGTCCATCCCATAAACTCGAATCGCAGCTAACTTGCTCGCGATAACTCGTGCAGCTGCTTCAATAGCAGCTGATTTAATAGCTTTCGCTTCTTTGTTGTCGATCATTTGGTCATCTGCGAGTGCTCGGCAAATCTCGACATTCGCTTCACCAAGTGCAGCCATCTCTTTGATCTGGATTTCGCTAAGCTCTTCCGCGTCAAGTTCGAGTTCCGCCATAGGAACAAACAAACCACCGCGTTGGCCTGCGCGATATTGAGCCAGAAAGTAGGTACCAGCGTGGATTTCCATTGCTTCTAGATCTTCATCATCGAAAAAACGGCAACCGTTTCGTTCATAGAGCTTGTTGTTGAAGGTGGTTTCAGACATACCAATTGCGCCAGCTAAAGCACCTCGACCTCCCTTGGTCTTCTTGATGATTTCTTTGACCACTTCTTTTTTCGAGTCAAATTTCACTAACATAATCAATAACTCCTTGTAGTTATGCAGTTTTCTTTGGTGCTGTATTATCTGGAAATACATCTTGGAACTTACATTTAGCACCCAAAGAGCAGAGAGCATTAATTATCTGCCAGCATGTTTTTAGATTCGGGCTACGCCCTTTTTCATATCGATTAACTGTTGCTTGATAAACACCTAGCTCATCAGCAAGTTGCTGCTGAGTTATTCCTAAATTGGTACGGTAATCTTTAATTCGGTTCATATGTCCTCCGTCACATGAGGACACTTATACCAATTTGGAATTCTACATGCAATCGATATATTCCATAACGGTTGTTTTTAAAAAATACCGCAGTGGCATAATTAGCGAATGAAAACAAATTGGAATGAACTGGTTAAATCCAGGATGAAGACCTCAGGCATAACCCAATCAGATCTTGCTGAATTAATGGGAGTGGCTCAGGGAACTATTGCTCGCTACTTAAACGAGAAGCGAGAACCAAGCCTTGATACGATTGCCGAAATGATGAAGCACGTCGGACTTAGTCAAATGACTTTGCTTTCTGACGGCTCTGTTACACCTGATGGTTTTGCTAATGTAAAATCAATAGATGACCAACCTGAAACCAAAGGGCTATTCCCTTTAATCAGTTCGGTGCAGGCGGGACAATGGAGAGAAGCTTGCGAACCGTATAACGTTAAAGACGCACAAATGCTGGCAACAACTGAGAAAGCGAGTTCAAGTTCATTTTGGCTAACAGTTGAAGGCGATTCGATGACCGCACCGCCCGGTTCACCACTTAGTTTCCCTACGGGTGTTCGCGTTCTAGTCGATCCTGAGGTTGAAGCGGTTAATAAGTCACTGGTTGTTGCCAAGCTTGATGATGTTAACGAAGCCACATTCAAACAACTCATCATTGACGCTGGACAGAAGTTTCTCAGTCCGTTAAACCCATCATTCCCCAAACTGCCAATTAATGGTAACTGTAAGATTGTAGGTGTAGTGGTTGATGCTAAGATTAACGTCAAACTTACCTGAGCATAGAATCTACACAGAGTAATCCCCCCACCAATTTGATGATAACCGCCCTAGTGGCGGTTTTTTATTGTCTAAAATCTGCCCCCCATATTTCAGAATTCATCCTACCATCAAAAATAATTCCATTTTGGCATTTACATTTAAATACCATTATGGAATATTAATTATACCAAGGCGATGCCTTGAAGCTCTTTAAAACTATTGGAAACCCAAAATAAACTGATACGCCCCGCTTTCGATGGCGTGAAACACTTAAACGGACGAGCGAGACCACTAGGTGGTACAAAACGTTTGAGAGCACCTATCAGCAAAGGGCTGATAGATGAGTAACGAAAGTAAATCTACGGTCACCCGACATAGTGAGGTGACTAGACCTATCCCATAGGTGCTCTAGTAGTAACGGGCTTTGGCTTTCTTATGAGAGCCATTTTGAAATGCTCTTAACGGTCGGTCGATTTTGATAGTGACAACCGACTGAGCCTTGATAAATCGCGTTAGGGGCATTTCAAAATTGCGGTATCGGACCGATCTTTAAGATCTGTGTATTAATTTTTATCCGGTACCGCAATTTACCCTAGTACACACACGTCCCAACAAGCATAAGACTTTCTTTAGAGGTATTAAAGAGCGCACCCATTGCAACCTCTCTCCCACCTAGCCAGCTCTGGCTTATGCGTGCTCTGTTTAATGTC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP020034|1913081:1922488|1913081_1913483_-|AWG84139.1|DBSCAN-SWA MKIKKYGYRVQKAQEQFNRFIVLRDSGKPCASCGRYLPLCCGHFRSVGAAPELRFNEDNAHGQCYECNGNKSGNSKEYRRGLIERIGLSRLETLESYHSPQNWTVYDLYDIEKVYKAKADVMSTNFEYFYESA >CP020034|1913081:1922488|1914671_1915625_-|AWG84142.1|DBSCAN-SWA MSRRATDWAWRQDIKATMKLILLSLADRADEYHRAYPSAERIELDTRLNIKTIRSNLKAMQELGIIRDSGKRKGSTNQVVVWELLGIEDDVKHQVPKSSRTTSPEEKVPENGHLPKVPKIGLERYPKTDLKGTQNWVTEPVIEPTIDPLKDLIPSNDELLETRKPESEFEFPTNRRGEIYSVYMEDIFEFRKLYPSVDVYQEFRNMLGWLKSNPTRRKTKSGIPRFINSWLAKEQNKGRCNKNLESPVQLDCTAQIENEIRLAESKVAGLQQNIMQHQQWNIPGGDKAIVSFQADIEKLKKFIQQQRQIRERLQGEI >CP020034|1913081:1922488|1917552_1917699_-|AWG84147.1|DBSCAN-SWA MLIGALKRFVPPSGLARPFKCFTPSKAGRISLFWVSNSFKELQGIALV >CP020034|1913081:1922488|1918290_1921455_+|AWG84149.1|DBSCAN-SWA MADKYFKLTCNKKVSHKAVKESGDLEPVIHYIKAATQELAKSEAVCKVEATHPLCTENENSGYSDFFKGVKAEKISEEDYNAAIIELEAKGFDEGEFIHSDEQQINVPDTPYPTLGQDGYYDTKDPQVEDSSFIYSSETDSMKAAKVFILRVGHSQYAYGFRFKFGDFDKHEKMNLDRTEEKRDDAIDKAVERLEKFLDYQDEFGPEDQKTFVSATMKHDFYHAFQEPSELFITALSQHPDAKNALEAHSDYLEIVEGHFADIWPLDKSPNQAIEHVNSMVTIGVLYDLEAFTESLKPYLPAVLTEKTKESMKHIEDVIDKPAANESIIEPKCWKAALPVTDELHVVIAIRDCGDEGWQYAVEGNQKAERAFGDANDFGFEFATTRKEAIKMAGQAIIDALYKYDSSLSLAKIFMKSPYIQEFEENCIEVMDGEDLPPNECSPIENAVRERLARRPTARMTEGEVKLAMDALQPHITAQTDIEELVETINGLEKCGVLFNESEAEYLVARCTVTKNNMQHKPAHNLENEYECFIAEIFSRISDGSPYLTTEQYEEAGEKLAAVVDELTNWHNGEREHNGKYLTFVKDKTLENIRNIDFDDASEVSKSFLNIRTLRAVFRENIELIESMEPASNTLISEVEHPSLLLAIAERLAHESHAVTPEHAYTHLLKIITKDTDINALADYIKQLKNPVIIWHSTESVNLVMKFTGQPKTDGNNELSSGNNEQKEAPKLPEQCQKKPTDGNGKPKVTENAPLPESANDEHLADSDNNISDTDVPQNIVEQEPANDPEIPDVDLDESNSNMGIWNQSFKTDLNFTKQDPSTGRLSINAQYRQMKATEIFGPRGKGWGVDVKREWIEDGLPIFANGTYTGVNESVHNMEVELWYIHPNSGERCTLTAFGETERFYWSHNYSRMIKNGECRKKSLTDATGKALSMLGICGDVYMGEYDDENIINRSQMTKTTDNALKQLEFDAKATQQALDKAKSYTDKFSTAPSLAEIKRLQKLAETALDAIPTHDKASKAKKDKALSRIAEQAESAIKDFNADIKDKDQANG >CP020034|1913081:1922488|1922299_1922488_+|AWG84151.1|DBSCAN-SWA MSNSYKEELNERLINVVNTKCNILGCDNCDLKWDGGCSATDLEAKIIEIEIKEMNSDTSSND >CP020034|1913081:1922488|1914294_1914675_-|AWG84141.1|DBSCAN-SWA MIYYLPKFWYAGSKKWGIPSDLPFIEGKLQRLNMANQKVASEQYEDIYKHFHNCGEWRKARELANQMLNDIANDYGISLKDYEQMIAANDDDSENTQFRVDLMIEKAKKAQKLAKPRIHFKELKRA >CP020034|1913081:1922488|1921447_1921975_+|AWG84150.1|DBSCAN-SWA MADKTESMNNINQQVFDLLELAKQEEWDEQTIADNLAGIECSIDDKLMAYRRYMDKLETAAKLADAEKKVYAEQAKPYGDRAKSLKDERSRMTYPLLNLFQMLNIEKMKGAYGTFYIKNNPAKLRYEETHLPEKYLIREVRFVPDEDAIRKALDDGEELDFAWYESQPQQVVLRK >CP020034|1913081:1922488|1916719_1917388_+|AWG84146.1|DBSCAN-SWA MKTNWNELVKSRMKTSGITQSDLAELMGVAQGTIARYLNEKREPSLDTIAEMMKHVGLSQMTLLSDGSVTPDGFANVKSIDDQPETKGLFPLISSVQAGQWREACEPYNVKDAQMLATTEKASSSSFWLTVEGDSMTAPPGSPLSFPTGVRVLVDPEVEAVNKSLVVAKLDDVNEATFKQLIIDAGQKFLSPLNPSFPKLPINGNCKIVGVVVDAKINVKLT >CP020034|1913081:1922488|1915905_1916370_-|AWG84144.1|DBSCAN-SWA MLVKFDSKKEVVKEIIKKTKGGRGALAGAIGMSETTFNNKLYERNGCRFFDDEDLEAMEIHAGTYFLAQYRAGQRGGLFVPMAELELDAEELSEIQIKEMAALGEANVEICRALADDQMIDNKEAKAIKSAAIEAAARVIASKLAAIRVYGMDK >CP020034|1913081:1922488|1915690_1915909_-|AWG84143.1|DBSCAN-SWA MKKGVIDKSLIPVSEIVTITAPVQVVIRDGEFTVKELVVAGKTVDCYQGLTNILLEKQREFDRHKSQTLNDW >CP020034|1913081:1922488|1917778_1917892_-|AWG84148.1|DBSCAN-SWA MPLTRFIKAQSVVTIKIDRPLRAFQNGSHKKAKARYY >CP020034|1913081:1922488|1913651_1914302_-|AWG84140.1|DBSCAN-SWA MRSCSTVKAKKETTEIIGAIGTGGYIQYATPEMREKAATMRGRVVAIKPKSKAKARVLEHHRKFFALIHLGFEYWSPDVSLISEPEYYIAHETAKQFCQLAGREDMYETHGIEIANIVLSKIKKQRESHCDPEAYKCIENYRYQVMIEAGYFDLEMLPNGGTVKRPWSIAFENADQEQFEKIYKGCFNVIWNQSLFQVFNDEQEMQNAVYRFMEFA >CP020034|1913081:1922488|1916389_1916611_-|AWG84145.1|DBSCAN-SWA MNRIKDYRTNLGITQQQLADELGVYQATVNRYEKGRSPNLKTCWQIINALCSLGAKCKFQDVFPDNTAPKKTA |
13 | Vibrio_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2650745 : 2657447
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP020034|2650745:2657447|DBSCAN-SWA ATTAGGAATCAATTTCAGATAGTACATTAATCATTTCAAGTGCGCTTAGTGCAGCCTCTGCACCTTTATTACCAGCCTTGGTTCCTGCGCGTTCAATCGCTTGATCGATAGTATCAACAGTCAGCACACCGAATGCGACTGGAAGACTGTATTCCAGAGACACTTGTGCTAGGCCCTTGTTACATTCACTACAAACATAATCAAAGTGTGGTGTACCGCCACGGATTACTGTACCTAGAGATACGATCGCATCGTATTTACCAGTTTTAGCAACACGTTGAGCTACTAGAGGTAGTTCTACGGCACCTGGACAACGAACAACAGTGATGTTGTCTTCGCTTACTTGTCCGTGACGCTTTAGTGTATCGATCGCACCAGAAAGTAAGCTTTCGTTAATAAAACTGTTGAAGCGAGAAATAACGATAGCAATTTTTGCATTTGGCGCTGGGAAGCCACCCTCGATCACTTTCATAAGCTTTCCTTTAACTCTATTTATAAGTGAAATTTGTTCATCAAGTGAGAATCGCCGGATTCTAGCACAAATTTGTGAGCAATATCTAATGGAAATTGGCCGCGTGTCACGAGTTCCTAGTCCACACCAAAATAGGTGTGCATGGGACTAGGAACTTATCGTTCACTTCTTATTCGCAAACGTATTCAACCACGTTCAGGCCGAAACCGCCCAATGCATGGTATTTTTTGTTGGTCGAAGACAGAAGACGCATATCGTGAACACCAAGGTCAGCGAGAATTTGCGACCCCACTCCCACGCGGCGAGACGTGCCCTGCTTTTTCGCTAAAGTCGGTGCTTCACCTTTATCTTGCGCTTCGAACATCTTCACGCGGTGAATGAGCAACTCGGTTGATTCTTCATTGCCAAGAACAACCAGAACACCGCCTTCTTCACCGATACGCTTCATCGCCTTATCCAGCGTCCAGCTGCGCTCTGCATTGCGGTCACTGCGTAATACATCGGTAAATACGTCTTGTAGATGCACACGAACCAGCGGCGCTTCGCCGGCCAAATCACCTTTACACATCGCGTAATGCACTTGATTATCGATGGTGTCTTTGTAAGTCACCAAAGTGAACTCACCGTGTTCAGTTGGCAGTTTGCATTCTGCTACACGCTCAATGGTCGTTTCTGTGTTGTTGCGGTATTCGATAAGGTCCGCAATAGTGCCTAACTTCAAGCCGTGTTTTTCAGCAAAGATTTCAAGATCAGGGCGGCGAGCCATGGTGCCGTCGTCGTTTAGGATCTCAACAATCACAGAAGCAGGCTCAAGCCCCGCAAGGCGAGCTAAATCACAACCCGCTTCGGTGTGACCAGCGCGAGTCAATACACCACCATCTTGCGCAGCAAGAGGGAAAATATGACCCGGTTGAACCAAGTCCGCCGCTTTTGCGTTTGGCGCAACCGCAGCTTGAACGGTACGTGCGCGGTCAGCCGCTGAAATACCCGTGGTGACGCCTTCAGCAGCTTCAATAGAAACGGTAAAGTTAGTGGTGTACTGCGCGTTGTTGTCTTGCACCATTGGCGGCAAGCCGAGATTTTCACAACGCGCTTTAGTCATGGTAAGACAGATCAAGCCACGACCGTAAGTCGCCATAAAGTTGATCGCTTCCGGCGTAATATGCTCGGCAGCCATGATCAAGTCACCTTCATTCTCACGGTCTTCATCATCCATTAGGATGACCATTTTGCCTGCGCGAATATCATCAATAATTTCTTGTGGTGTACTGATTGGCATATTCTGTTTCCCGTTATTCTAAAATTTACTTTCCGACAGCAATGCGTGAAATCTTATTGCAATGGTAATGACATCAACAGTTTGAGCCTTGCACAATGCAAGTCAATTGCCCTAACGATGTTCTGTGAATCCGGTCTGTTATGGCAATTATCGCAACGTGGCTGAGCGCTTACGCAAAGCCATTTTGTTGTAAGAAATCCATGGTGATGCGAGATTCAGGCTGCTCTTCTTGCTGACCTTGCAGCAAGCGTTCCATGTAACGCGCCAACACATCCACTTCTAAATTCACTTTGCGGCCCACTTGGAACTGGTCAATGGTGGTTTCTTCACTGGTGTGAGGCACAATCGTCAGTTTGAATGCATTTTTACGCAAATCATTCACCGTTAAGCTGATACCATCAACGGTGATAGAGCCTTTTTCTGCCACGTACTTGCTGATCTCAGCAGGCATCGCGACCCAAAACTCTATCGCACGACCAACTTGATTGCGCTCCACAATTTCACCCACGCCGTCCACGTGTCCAGATACAATGTGTCCGCCAAAACGTGTCGTCGGCAGCATGGCTTTTTCTAAGTTAACCTTTTCGCCTACTTGGTAGTTTGCAAAACCGGTTTTTTTCAAGGTCTCGAGAGACAAATCCGCGCTGTAGTAATTGCTGCCAAAGTCAATCACCGTTAAGCACACACCGTTAGTTGCGATGCTGTCACCTAACTTTACGTCAGACATGTCTAACTTACCTACTTCTACCGTAACGGTAATGTCTTCGCCTTTTGGCGTAATCGCAGTTAATTTACCAACTGCTTCTACAATTCCTGTAAACATAGTGCTTCTTTTCTAAATTTCTTTACGTACAAGGGTGGCGGTAATACGGATATCTCTGCCCACCATTCGCACATCAGTAATATTTAAATCGATGACCTGCGCCATCTCCGTCAATCCCAGCGCGCCAATTAAACCTCGTCCATCGCTTCCCATTAGTTTCGGAGCGAGATAGACAATCAACTCATCTACAAGGTTAGCTTTGATTAGAGAACTCGCGAGCGTCGCGCCAGCTTCCACCCATAAATGGTTGATATTATGCTGAGTCGCGACCGCTTTTAGGGTCGCAGCTAAATCAATTTTTCCGCTTTGGTCTAATTGTGGACAAACATCGCCTTCGCTGCTGACAATAATTCGCTCACCTTCGGTACTGAACAGTTTAAGGTCATCACTCAGTTTCTGTTGACGGTCGAGTATTACCCTTGCTGGTTGGCGAACTTCCGTCAGCTCATAGTGCGCTTGAACACTCTGCGGCAAATCATCCCAACGAACGTTGAGAGAGGCGTTATCATCCATCACTGTTTTGCTTGTAGACAGAATGCCACCGCTTTGCGCTCGATAACGCTGCACGTCTTGGCGAGCCTGTGGGGAGGTGATCCATTGGCTCTTGCCATTACTTAGCGCACTCTGTCCATCTAAGCTTGCTGCCATTTTTAATTGGATAAATGGCATGCCTGTTTGCATGAATTTAATGAAGCCACGATTGAGCTCAATCGCATCGTTTTCTAACAGTCCAACCTGAACTTCAACTCCGGCTTCACGTAGCATTTGGATGCCACGTCCAGCCACTTTTGGATTCGGATCTTCCATCGCACACACTACTCGCGCCACTTTGGCTTTTATCAACCCTTCAGCACAAGGTGGCGTGCGTCCATAGTGGGAGCACGGTTCAAGGGTAACGTATGCCGTTGCACCTTCAGCTTTATCACCAGCCATGCGCATCGCGTGCACTTCAGCATGGGGCTCTCCAGCACGATGATGATAACCCTCACCAATGATCACGCCATCACGAACAATTACGCAACCGACGTTCGGGTTTGGAGCCGTCGTATAAATGCCGCGTCGAGCTAACTTGAGCGCACGCGACATCATTGAAAAATCTTGAGGAGAAAATGGAGACGCAGAAGTGTGTTGAGGCATGATTTAATCAGTCTTCAAGGCGGGCAATTTCTTCGCCGAATTCACGAATATCTTCAAAGCTACGATAAACCGATGCAAAACGGATGTAAGCCACTTTGTCGAGCTCTTTAAGCTGATCCATAACCAAGTTACCAATCATTTGGCTCGGTACTTCACGCTCACCAGTTGCGCGGAGTTGCGACTTAATCATACTGATTGCAAGCTCGATAGAGTCGGCACTTACCGGACGTTTCTCTAATGCGCGCTGAATGCCACCGACCATTTTATCTTCATCGAATGGTTCACGATTGCCATTCGACTTAATGACTTTAGGCATGACCAATTCTGCCGTTTCAAACGTAGTAAAACGTTCACTACAGGCTAAACACTGGCGGCGGCGACGGACTTGATGACCATCCGCAACCAATCGGGAATCAATTACTTTTGTATCGTTCTCTGAACAAAAAGGACAATGCATATCACCTCCAAATAACGTGCCATTGGGGCCGTCCCAAAAGCCAGACTAGTGTAGCGGAATTGATATGTGAGAGAAAACAAAAAGGGGCACTAGTGCCCCTTTTTCAATCAATATCGAGTCGAATCTGTTAACTGCGTGCTAAGTAGTTCGCTTTGCCGACCCATTTGTAGCTTGTTAATTCTTCCAAACCCATCGGGCCACGTGCATGTAGCTTTTGAGTTGAGACGGCCACTTCAGCCCCCAAGCCAAACTGAGCACCGTCAGTAAAGCGCGTTGCCGCATTCACATAAACTGCAGCCGAGCCCACCGAATTGATGAACAACTCCGAGTTAATCAAGCTGTTGGTCATGATTGCATCTGAGTGACTCGCATTGTGAACTCGCATGTGATCAATCGCATCTTTCACGTCAGCGACAACTTTTACACCTAACGTGTAGCTTAGCCATTCGGTATCAAAATCACCTTCTACGGCATCGCGAATTTGCGTAGCTTGAGCCATTAGCGCTTTCGCTTTTGGTTCTGCTACAAACGTCACTTTGTCACTCATTCGCTCGACAATCATTGGCAAGAATTTCGCCGCCACTTTCTCGTGAACAAGCAGTGTGTCTAGCGAGTTACATGCCGAAGGACGTTGAACTTTCGAGTTTTCAACCACGTTTAGCGATTTCTCTAGGTCCGCGGATTCATCAACAAAAATGTGACTGATACCAAAACCGCCGATGATCACTGGAATTGTGCTGTTCTCTTTACACATTTTGTGCAGACCAGCTCCACCACGTGGGATGATCATATCAACGTAGTCATCCAGTTTAAGCAGTTGAGAAACCAGGTCGCGATCTGGTTTTTCAATGTACTGTACTGAAGCGGCTGGCAAGTTTGCTTTTGCAAGGGCTGATTGGATAACTTTCACAAGTTCCATGTTAGAGAAAAACGTCTCTTTACCACCGCGTAGGATGCTGGCGTTACCCGTTTTCAGGCACAGTGCGGCAATGTCGATGGTCACATTTGGACGCGCTTCATAAATCACACCCACAACACCAAGTGGTACACGGCGGCGAGAGAGAGACATGCCGTTTTCTAGCACTTTACTGTCGATTTCGCTGCCCACAGGATCGTTTAGGCTGATCACATTGCGAACATCATTTGCAATGCCCGTTAAGCGTTCTTCATTCAACAGTAGACGGTCTAGCAGCGCATCGGTCAGACCAGCTTCGCGACCAAGTTCGATGTCTTTTGCGTTTGCTGCCAAAATCACATCTGAGTTTGCTTCTAGCTCATCTGCGATGATCGCTAGAGCTTGGTTCTTTTGAGCAGTTGACGCTGTCGCCAATTCGAAAGCTGCATCTTTAGCAGCTTTACCCATATTCGTTAAATCCACGTTGCTTCCCTCAATTTCTATTCTTGAATGACGACAAGATCATCGCGATGAATCACTTCTGAGCCGTAGTCATGACCCAAAATAGAGATGATGTCTTTACTGTGTTTGCCAGTAATTTTTGCCAAGTCTTCACTTGAGTAGGCGCTAATACCACGCGCAACCAGTTTGCCATGAGAATTTGTTACGCGAGCAACTTCACCACGGGCAAAATCACCGCTCACCTTGATGACCCCTTTTGCTAGCAAGCTGCTGCCTTTACCAACAACCGCATTTACCGCACCATCATCGATGATAATGTCACCCGATGCTGCAGGACCTGCGAGGATCCAACGCTTACGGTTTTCCAATGCTTCTGAACAAGGTAGGAAACGCGTACCTTGAGGCTCCGTGCTCAACGAGTCAAAAATTACGTTTGGCGCGCTACCTGCTGCGATAATAACTTCAATACCCGCGCGACGTGCGATGTCGGCCGCTTGAAGTTTCGTTGCCATACCACCCGTACCGAGTGTTGTACCGCTGCCGCCAGCAATTTTACGCAACGTGTCATCAATGGTTTTAACTTCTTTGATCAGCTCTGCATTCGGATCTTTGCGTGGGTCTGCAGTAAACAGACCTTTTTGGTCTGTCAGTAGCAATAACTTATCTGCACCACACAAAATACCCACTAAAGCCGATAGGTTGTCATTGTCGCCGACTTTGATTTCACTGGTGGCTACTGCATCATTTTCGTTCACGATTGGAATAATATCGTTCGCCACAAGCGCATTGATGGTGTCACGCGCATTAAGAAAACGCTCACGATCATCCAAGTCAGCACGAGTCAGTAGCATTTGACCAATCTTAATACCGTAAATACCAAACAAAGACTCCCATGTTTGAATCAAACGACTCTGACCCACAGCAGCAAGCAACTGTTTGCTCGCCATCTCGTTGGGCAGTGCGGGGTATCCAAGATGCTCACGGCCTGCTGCAATTGCACCAGACGAAACCATTACCACTGAATGGCCTTGTTTCTTAAGCTCAGCACACTGACGCGCTAGCTCAACCATGTGAGCGCGATCTAGTGCCAATGTGCCGCCTGTCAGCACACTTGTACCCAGTTTCACAACGACGGTTTGTGGTTGCGAAACAACTGCGTTTTGTTGATTCGTTGTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP020034|2650745:2657447|2650745_2651216_-|AWG84802.1|DBSCAN-SWA MKVIEGGFPAPNAKIAIVISRFNSFINESLLSGAIDTLKRHGQVSEDNITVVRCPGAVELPLVAQRVAKTGKYDAIVSLGTVIRGGTPHFDYVCSECNKGLAQVSLEYSLPVAFGVLTVDTIDQAIERAGTKAGNKGAEAALSALEMINVLSEIDS >CP020034|2650745:2657447|2656307_2657447_-|AWG84808.1|DBSCAN-SWA MTTNQQNAVVSQPQTVVVKLGTSVLTGGTLALDRAHMVELARQCAELKKQGHSVVMVSSGAIAAGREHLGYPALPNEMASKQLLAAVGQSRLIQTWESLFGIYGIKIGQMLLTRADLDDRERFLNARDTINALVANDIIPIVNENDAVATSEIKVGDNDNLSALVGILCGADKLLLLTDQKGLFTADPRKDPNAELIKEVKTIDDTLRKIAGGSGTTLGTGGMATKLQAADIARRAGIEVIIAAGSAPNVIFDSLSTEPQGTRFLPCSEALENRKRWILAGPAASGDIIIDDGAVNAVVGKGSSLLAKGVIKVSGDFARGEVARVTNSHGKLVARGISAYSSEDLAKITGKHSKDIISILGHDYGSEVIHRDDLVVIQE >CP020034|2650745:2657447|2654462_2654912_-|AWG84806.1|DBSCAN-SWA MHCPFCSENDTKVIDSRLVADGHQVRRRRQCLACSERFTTFETAELVMPKVIKSNGNREPFDEDKMVGGIQRALEKRPVSADSIELAISMIKSQLRATGEREVPSQMIGNLVMDQLKELDKVAYIRFASVYRSFEDIREFGEEIARLED >CP020034|2650745:2657447|2651385_2652495_-|AWG84803.1|DBSCAN-SWA MPISTPQEIIDDIRAGKMVILMDDEDRENEGDLIMAAEHITPEAINFMATYGRGLICLTMTKARCENLGLPPMVQDNNAQYTTNFTVSIEAAEGVTTGISAADRARTVQAAVAPNAKAADLVQPGHIFPLAAQDGGVLTRAGHTEAGCDLARLAGLEPASVIVEILNDDGTMARRPDLEIFAEKHGLKLGTIADLIEYRNNTETTIERVAECKLPTEHGEFTLVTYKDTIDNQVHYAMCKGDLAGEAPLVRVHLQDVFTDVLRSDRNAERSWTLDKAMKRIGEEGGVLVVLGNEESTELLIHRVKMFEAQDKGEAPTLAKKQGTSRRVGVGSQILADLGVHDMRLLSSTNKKYHALGGFGLNVVEYVCE >CP020034|2650745:2657447|2653330_2654455_-|AWG84805.1|DBSCAN-SWA MPQHTSASPFSPQDFSMMSRALKLARRGIYTTAPNPNVGCVIVRDGVIIGEGYHHRAGEPHAEVHAMRMAGDKAEGATAYVTLEPCSHYGRTPPCAEGLIKAKVARVVCAMEDPNPKVAGRGIQMLREAGVEVQVGLLENDAIELNRGFIKFMQTGMPFIQLKMAASLDGQSALSNGKSQWITSPQARQDVQRYRAQSGGILSTSKTVMDDNASLNVRWDDLPQSVQAHYELTEVRQPARVILDRQQKLSDDLKLFSTEGERIIVSSEGDVCPQLDQSGKIDLAATLKAVATQHNINHLWVEAGATLASSLIKANLVDELIVYLAPKLMGSDGRGLIGALGLTEMAQVIDLNITDVRMVGRDIRITATLVRKEI >CP020034|2650745:2657447|2652664_2653318_-|AWG84804.1|DBSCAN-SWA MFTGIVEAVGKLTAITPKGEDITVTVEVGKLDMSDVKLGDSIATNGVCLTVIDFGSNYYSADLSLETLKKTGFANYQVGEKVNLEKAMLPTTRFGGHIVSGHVDGVGEIVERNQVGRAIEFWVAMPAEISKYVAEKGSITVDGISLTVNDLRKNAFKLTIVPHTSEETTIDQFQVGRKVNLEVDVLARYMERLLQGQQEEQPESRITMDFLQQNGFA >CP020034|2650745:2657447|2655039_2656275_-|AWG84807.1|DBSCAN-SWA MGKAAKDAAFELATASTAQKNQALAIIADELEANSDVILAANAKDIELGREAGLTDALLDRLLLNEERLTGIANDVRNVISLNDPVGSEIDSKVLENGMSLSRRRVPLGVVGVIYEARPNVTIDIAALCLKTGNASILRGGKETFFSNMELVKVIQSALAKANLPAASVQYIEKPDRDLVSQLLKLDDYVDMIIPRGGAGLHKMCKENSTIPVIIGGFGISHIFVDESADLEKSLNVVENSKVQRPSACNSLDTLLVHEKVAAKFLPMIVERMSDKVTFVAEPKAKALMAQATQIRDAVEGDFDTEWLSYTLGVKVVADVKDAIDHMRVHNASHSDAIMTNSLINSELFINSVGSAAVYVNAATRFTDGAQFGLGAEVAVSTQKLHARGPMGLEELTSYKWVGKANYLARS |
7 | Staphylococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
2662 : 23108
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP020037|2662:23108|DBSCAN-SWA GGTGAAAGGCATTACCGAAGCGATACGCGATCCGCAATATTCCGATGTGTCCGCCGTCATGGGGGCGCAAATGTCCAAAACCGACGGCGTGTTATTGAATGCGATTGGCTGGCGTATGGACGACGACCCCGGTCCGGTGCTGTATATCGGCCCGACTCGGAAGAACATCGAATCCATATCAAAGGATCGTTTCACCAAGTTAATCAAGTCCGTGGCCAGTCTTTACGATGCGTTGGCCAAGGGCAAGCGGGAAACCATACACGAAAAATTTATCAATGGTCAGCGGATTGGTTTCGGTTGGGCGGGTTCCGCCACCGAACTGGCGTCACACCCAGCCCGGGACGTGTTAATCGACGAACGGGACCGCATGGGGAACGACGTCGGCGGCGAAGGGGACCCGAAAACCCTTGCCGATGCGCGAACCAGTAACTTTATTGACGGGAATGTGACAACGGTCAGCACACCGACCACAGGAACGGTAGACGTGGAGAGCGACGGCAAACTAGAACGTTGGACAGTATCGAGCGAAGTCCATTCGCCGATCTGGAAGCTATGGCAGGAAGGCACCCGCCACGAATGGGCGTGGCCTTGCCCGGATTGCCATGAATACCATATCCCTAAGTTTAAGTTTTTATCGATCCCGGAAGGGGCGACCCCACAAAAGGCGCTGAAAGACGCTCGTTTAGTCTGTCCACAGTGTGGCGTGGCTATCGAGGAAAGCGCCAAAAAGTGGATGAATGATCATGGTGTCTTTGTGGCCCCGGGTCAGTCATTGAACAGCTTTACCGAAGACGGCGTCCTGATCGAGCAGGACGGCCAAGAACACCTTGTCGAGTTCGGTCACTACCTGTCACCGTCGGACGGCAACCCGTCGGCGTCGTTTTGGGTGTCCGGCTTATGTAGTCCGTGGCGGTCCTTTGGCCAGCGGGCTAAGGCTTACGTAGCCGCGATCCGAAGCGGAGAGCCGGGTCGAATCCAAGCCGCCGTTAATACGGGCTTTGGTGAACTCTATTCCGTCGCTGGGGACGCGCCGGACTGGTCCGTCGTGGCGGACTTACGTCGGCCTTATGCTTTCGGTGAAGTACCGCGCGGTGTTCAGCGGATCATTATTGGCGTGGACGTACAGGGCGATCGCTTGCCCTATGTGGTGCGTGGTTATGGTTATAACTACACGTCATGGTTGATTGAACACGGCGAACTTTGGGGAGACACCACACAGGAACCTGTCTGGAATGAACTCGCCGATCTGCTTAATCAGCGGTTTAACGGAATGCCCGTTCACCGGATGCTGGTTGACTCGGGCTATAAACCGGGGGGCAAGTCGAACCCGGTTCACATGGTCTATAAGTTTTGTCGCCGCTTTTATGGTTGGGCTATTCCAACCAAGGGCCGACAGACGCAGGACAAGCCCTATAAGTTCGCGGATGTGGATCAGAAAGGCCACGAAAAGCAGCCGCTTAAGCTGATGTTGATTCATACAGACCACTTTAAAAGCTGGGTCCATAACCGGATTGAATGGCCTGTCGATCACAGTGGGGCGTGGTTCATTTCGCAAGACAGCAGCGACGACTATTGTCAGCAAGTGACCGCCGAGGCCCGCATGGTGACACAAGCGGGTAAGGTGGTTTGGATGAAGATTCGCACCGATAACCACTATTTTGACTGTGAAGTCTTGGCCACCGCAGGGGCGCACTTAGAACAGGTTCACCGCTTGCCGAAATTGGGCGACGAAGAGGAAGAAAGCGCGGCCCCGGTTGCGCCGCCAGTACCGCCGACGCCGTCAGAGCGTCAGGCAAAACCGAAACCAGACAAAGCCCCCGAGCCGGAGCAGTTTGCCCCCGTGGTTCAGTCACGAAGGCAGCGAAAGCGCCGTCGCGGGGTGGTGAGTGAATGCAAGTTATGAAGCGAAGCGACATTCAGGCGGAATTAACCGCCATAAACAACGCCATAAACACCATTTTAGCCACCGGGCAAAGCGTCACGATTACTACGCCCGGCGGTACCCGTCAGGTGTCTATGGCCAGTATTTCCACGCTTTATAAGCGCAAAGAGAAATTGGAACGCATGTTAAGAGGCGGTCCGAGATTTAGGCGAGGTATTCCAGTATGACAATGAACGCGATCGATCGGGTGGTGAACTTTTTTAACCCGGTTGCAGGACGGGAACGGTTAGCCGCCCGGCTACAGACGTCCGCCGCGTCGTCGTTTGCTGGGGCGTCCAAGAAACGCCCGGCGCTTAAGTCGTGGTTTACGTCCAAGAAGGACGCCGACGGCGACTTAAACCCGGAGTTAGCCACGTTGCGATCTCGTTCTCGGGATTTAGAACGTAACAACCCGATCGCCCACGGCGCCATTGAAACCAAAACCCGCTACGTGATCGGGACCGGGCTTCGTCCCGAACCGTCTATCGACGCGGAGTTCTTGGGGTTGTCAATGGAGCAAGCCGAACAGCTACAGGCGCAAATCTTGCGCGAGTTTAACCTCGTGGCGGAGAGCATCGAAGCGGACGCAGCAAGGCGTAAAACGTTTTATCAGAAGCAAGGCGAGATCTTCCATTCGAGCCGGGTTAATGGTGACGCCTTCCTGTTGTTGCCGTTCTTCCAGCGGGGCGACTTTCCTTACTCGACCAAGTTTCAGAGCATCGAGGCGGATCGGGTGTGCAACCCGGGCAACAAACCCGACAGCGACCACTTATCCGCCGGGTTCGAAACAGACAAGTACGGCGGGCTTAAGGCTATCCATGTGCTGAAAACTCACCCGAGCAAGCGCAAGCTGAAGCGGGCGGCGGATAACTGGCAGCGGGTGACAGTGTTCGGCGGCAATGGCCGCCGTAATGTCCTGATCCATGCCAACCATGACCGCCGAGCGAGTCAAACGCGCGGTATACCGGATTTAGCCCCGGTGATCGAGGTGTTAAAACAAGCCGGGCGTTATATCGACGCCGAGCTTATGGCCTCGGTGATCAGCAGTAAATTTACCGTGTTTATTAAGAGCGACGGCGGCGGGGGTGGGGTTGACCCATACGCCCCGGGCGCGACGAACTTTGGTACCCCGACGGAAGAGGTCGGGGATTATGACGACACCCCGCGCGATCTGCGCCTTGGTGACGGTCTGGTCATGGAGTTGGACGAGGGCGAGAGCATCGAAACCGCCAACCCGGGCCGACCTAACGCCCAGTTTGACCCGTTTGTCATGGCCATGTGGAAGATGATAGGCGGCGCCCTTGGTGTGCCGTTTGAAATATTGGTGAAGCATTTCACCGCCAGCTACAGCGCCAGCCGCGCGGCCTTGTTGCAATTTACCCATTACGTCCTAACGGACCGGGCCGACTTTGTAATCGACATCGCCCAGCCCTTCTATGACGCAGTGATCGCCGAGGCGGTCGCCCGTGGGCGTTTGCACATGCCAGGATTTTTTAAAGATCCACTCATTCGCAAGGCTTACACCCGCTGTATGTGGCATGGTCCGGCAATGGGCGAGATAGACGAACTCAAAGCGGCCAACGCCGCCGAGAAGCGTCTCAACATTGGCATAACAACCCACGAACGCGAGTCCCGTAAGTTAACGGGCGAACGTTGGGATCAGGTCAATGAACAGCGAAAAATTGAAGAGGGGAAAAGGTGGAAACCTTCGGAACCTGTCACCAATAGCGAACCCGGCGAATAAGCCGGGTTTTTTATGCAAGGGGAAACCATGCCCAACATTCGAATAATGAATTTTATCGCCGGGCAATCGTGGGCCATGTTGCCCGAGTCCTTCACCAATCTGGTGGACATTGCACAGCGTGAATTTGAAAAGGGAACCTTAAGCGCCGCGATCGAAGAAGCGGTCGCCGGGCGAGAAGGTCGCCCGCTAAATAACACCCGCACTGTGGAGAACCGCGACGGCGTCGCCGTGATCCCGGTTAATGGGGTCATTTCCCGTTATGCGACCTTCTTTCACGACATTTGCGGCGGCACGTCTACCGAAGTCTTGGCGAAGGACTTCACCACCGCACTGGATAACCCGGGCGTTAAGGCGATCCTCTTCGACGTAGATTCACCCGGCGGGGCGTCCAAAGGCTTACACGAACTGGGCGAAATGATTTACCAAGCCCGTGGCAAAAAGCCGATCAAGGCATACGTAGGCGGGGAAGGGTGTTCGGCGGCGTACTGGATAGCGTCGGCGTGTGACGAAGTCATTATCGACGCCACCGCGACCTTGGGGTCGGTCGGTACCGTTGGAACGATCACCCTTCGTAAAAGCCGCGACGACGTCGAGGTCTTGGAATTTGTGTCGTCACAGTCGCCGAATAAGCGCCTTGATGTGAAATCCGAAGAAGGTAAGGCGGCGATTCAAACCCGGCTTGATGAATTGACCGACGTCTTTTTAGAGCGTGTCGCCCGCAACCGGGGCATGACCACCGACGCGGTGATCAACGACTTTAAGCAAGGCGGCACCCTGATCGGCCAGAACGCGGTTAACGCGGGGATGGCGGACCGTCTCGGCAGCCTCGAAGGCGTGGTCGCGGAGTTGTCCGGCGGTCGTGTCACAAGTCAGCGCCACAGCGCCGAACAATCAACCCAAACAACTGAAGCGGCGGCGCGTTCCGTCCAAATTGAAAACCAAGGAGCAGATGACATGCCACTAACGATTAAAGAGGGGGCGACCGCGTCCGCTGTCGCTGAAGCCCTGAAGGCACAACACCCGGAAGCGTTCGAAGCGATCAGCAAAGGCGGCTATGACGAGGGTCACGCCGCTGGGAAGCTGGAAGGCATTACCGAAGGGAAGACAAGCGAAACCGAACGCGTGAAAAGCGTGTTTGAACAGTCGATGCCGGGTCACGAAGACCTGATCAAGACGTTAGCCCTTGATGGTTCGACGACGGGCGAACAGGCCGCCGTCAAGGTGCTGGCCGCAGAGCGTCAAGCGTCCGCTGATTTCCTCAGTGCATCGAGTAAGGACGCGCCCAACGACGTGACCGACGTTGCCGAAGGTCAGGAAAAAACCAAGATGACCGCG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28 | Aeromonas_phage(48.0%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
29604 : 38011
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020037|29604:38011|DBSCAN-SWA 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TCTTAATGCAAGTTCCGTTTCATTTGACCGCTGGCGTTAAGTACGTGGCGGATTTTATGGAGTTCCGGGCCGACGGTTCGGTCCATGTGATCGATACAAAAGGGGTTAAGACCGACGTTTACAAGCTGAAGAAAAAGCAAGTCGAAGAGCTTTACCCGGTAGTGATTGAAGAGGTTTAGAGGTGCTTAAGAACAGACAGAGCATAAACGAGCTTTTCGAAATGTGGGCGCGCTGGTGCCTGTCTGGCAGCGACGGGGCGCCCGCGAGTGAGTCGTTAATGCAAAAGCTAATCGAGAATAAGGGCGTGATGTGTTTCGGCAGCGGCAAAGGTGCCCCGGTCGTGGATTGTATCGAAGCACGTATCGAGGCGGCAGTGATGAAAATCGCCGCCCGGGACAAAGTCACCGCCCAAGTGCTACGCCGTGAATATTTTTCAATCGAAGACAACGAACCATTAACACAAGTTCGCAAGGCCCACAGCTTGGGGATCAGCTTAAGGACCTACGAACGCCGACTAAACAATGGCCGCGCCTTTGTTTTAAGTGACATTGGCCTTAAGGAGATTAAACGACCATGAGCCAGATCAGAGAGATAAACACGCACAAAGTCGATAACGACGAGCCTATCCGAATTTTTGCCACCGGGGAACGTAGCCCGGGCAACGCTCAAAATGACTATGTGATCGGTGAAGTTATCGAAGAGACGATCACCAACTGCTTAGGGGTTGTGTCGTTTCAGAAAGGCAACCCAGCTACCGAAGGCCATAACGGGGTAACAATGGAAGCCCTGTTAGCGGTTTGTCTCGATCGCCTTCATTGCTTCCAGTGCGGGCCGTACCCGAGCCAGCACAACGAGATCGCCGCTATGAACATCGAGCGAGCTATCGAGGCCCTTAAGGACCGAGCCAGAGAACAGAAAGAAATCACGAAAGCACGAATTAACGAAATGGAGCCGACAAAATGAAAACACTTGAAGAGTTGAACTTATCCCCGCTGGTGGCCGTGGTTGATATTGAAACCGCATCGAAAAAGCCAACCGCCGCGATCCTATCGGTGGGGTGTGTGTTGGTTGATGTGTTTAAAGGCGTCGAGGTCGCCCGCTTTTATTCTCGCTGTGATATGGACAGCCAGTTAGGCCGCGATCAGGACGCGGATACATTGGATTGGTGGGACAATATCCGAAAGGACCACCCGGAAGCCTACGACGAGGCGTTTTGTATTGAGATTGAGCGTTCGCCGTTGGATATGGTGTTAAGTGGTTTGGATTGTTTCTTAGCGACACATTTCGGTGAAGATAAGCGCCAAGTTATGGGGAACGGCCAGAGTTCGACAACGTTATCTTGGCCAATGCCTACGAGCAAATGGGCTTAAGCAGCCTTGGCACTATGGCGGAAACCAGAGTCTTAGAACGGTCGTTTTAATGGGCCGCTTGTTGTTGGGTATCGATCCTAAGTATGACTTGGAGTTCGAAGGCGTTCGCCACCATGCCTTATATGACGCATTACACGAAGCCCGTTACCTGTTGGCCGTGTTTGGTGAATTGTTTAAAGCGATTAAAGACAGCCAGCAAATTAAAGCCGCTGCAAAGCAGTTAGACAAACTTATCAACAATCAGATTGTGACCATGCAATCCGCCTATATCGAAGCGACCTACGGTAAAGGACCCGAAGCGGGTATCAAGTGGATTGCTAATTCGCTGTTTGGTCCCGGCTTTATCCCGAGCGACGAAGAGGTCGAGAAGTACGAGAAAAGCGCCCAACTGTTTTATAACGCCAATTGTTCCGACCCACTCGGCCCGTGTGCAGTATGCGAACGTCCTTCAGGTTGGGCGGGTGCTGGTGTGGTGGCTTGCTGTGAAGAGCATTTAGAGCAAGGAAAGAAAGCACGAAATAACGAAAGCAAGGCCGAGGCATGTTAAAGCCGTCCGCCGCTACAACACTGATAAACGACACTCGGGCCGCTGGTGCTGGCTCGGGTGCCTTCCATGTCCGTGACTTGTCCGGGGACAGTCTGGCGCTTGTGTATGTGTCTGTTAATCCGCTGGTGGCTACAATGGCCGCCAAGGTGCTGGACAGTATCGAGACAATCGCCAACCCGAACACCCCGTCCGGGGAGAAATGCCAGACTGTCGAGCAAGTCCGCCTTGATTTAATCCAGTTCACTAACCGGGTGATGATTCAAGAACACCAAGAAAAATAGGAGGGTTAACCCATGCAGACGTTAACCGTCACCCTTTCCGACGCTGTTATCAAGCGTCACATGAAAGATCCGCACGTTTACCAACTCAAAGACCCACGCTATCCGCTTTATCTTCGCTATAACACCGCCAGAACGGGCGGAAGCTGGTTATTAGTCCATTATGCTAAGGGAAAACAAGTTCGCCGTAAGGTTGGCGCGTTCCCGGTGACAACTTCGAAAGTCATGTTTAGCCGTTTGCCGGAAATCAAAGCCGAATTGGTCATTAATCCACTGTCTGACAAGGTCAGCGTGGGCCAGTTCGAGCGCGTGGCCGATGTGTTGAACTGTACCAAGATCGCGCCAGTAAGGACCGCAACTTAAGCAAGCCCCGTAAAACGAACATCAAATCGGTGGTTAACCGTCATTTGTGCCGATGCTGGGGGACGTGGCAATCGAACACCTCGATCACCGCGCCTTAGATACAAAATTGATGTGCCATTACAGGAACGTTATTCCCTGTCGAATGTACGCGGGATCTTTGCTGTGTTAAAGGTCGCTTTCAACAGGCCAAAATGTTAAACCTTGTCGAATGGACCCGGTGCCGGCTGAAGTTCGGCGACTTCATTAACGCCACCATTTCGCCAAAAGACGCCGCAATCCGACCGGAGCATGTGCCGAGCATTGTTCAGAGTTTAACCAGCATGACAGAGCGTCCCAAGTGCTGGTTGTGCTGATGTTGGCCCACGGTACCCGGATCGGCGAAACCCGCTTAACCCGTTGGGACCATATCGACTTTGACAGCCGAGAATGGTTTATCCCAAGCGAACACACCAAAACCAAGCAAGCCCATCGAATCCCGTTAACCGATAGCATGGTCGAATACCTGAAGCAGTACCAAGAGAGCCAACGCCACTATAACGGGGTGTTTCTGTTCCCGGCCAATCGAAAAGGGCAAGCCATGAGCGCCGACAGAGCAAGCCAGAAAGTGAAAGCCGTCAGCGTGGGAAGTGGTCAGCCCATGATCTGCGAAAAGTCGCCCGGACGGTGTGGCCGATTTAGGGGTCGATTATATGGTCGGGAATTGCTGTTAAACCACGCCTTATCAAAGCTGGATAAGACCTATATTCACACCTTCGCCGAGAGCCAGAAACGCCAAGCCTTAACCCAGTATCACGACTGGCTAAACGCCACGGCCTTTTTTTTGACTCGAAGAACGCCGCCAACCCAGTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020037|29604:38011|30546_31176_-|AWG87357.1|DBSCAN-SWA MATPNHHASQTDPHFRDQTSTPDWLFQAFNAEFDFDLDAAATDESAKCPIYFTPETNGLAQPWDGAVIPFKKITVWVNPPYSDIGPWMLKAKEEQAKGVTTVLLVPHDNRTDWWPWDIASEIRDIVGYYEERTYKSGKRKGQTYKKWVSGGIKFINAKTREEIPHELNKPICAVVFDPYHVGPCVYKPITKRELMERGQAIINQQPKAA >CP020037|29604:38011|33041_33620_+|AWG87363.1|DBSCAN-SWA MWFKHMASLSESPFVLNLEAEFGLVGFARYVKVMEQCAKAGTNQTAHSWLEWEQVLSGKREALGAFFDFCHRYGGLVVESGDDAVTVEVVDLSLSGTPGNPSHVFPPNTLFTFSDQWANWLVEAANLSRRMINAKGSDRVFRRWLASNVSVGEVLDVLETAKEQDQAVESLGALHELIAKYRKRKLQDAERC >CP020037|29604:38011|34258_34450_+|AWG87365.1|DBSCAN-SWA MIEFIRKNVAELLRKKGYSESQAIRGGNVAADRYVAGGPFNGSAVDVCLKAAIQQLGKPEGRK >CP020037|29604:38011|36813_37161_+|AWG87372.1|integrase|DBSCAN-SWA MQTLTVTLSDAVIKRHMKDPHVYQLKDPRYPLYLRYNTARTGGSWLLVHYAKGKQVRRKVGAFPVTTSKVMFSRLPEIKAELVINPLSDKVSVGQFERVADVLNCTKIAPVRTAT >CP020037|29604:38011|33613_34021_+|AWG87364.1|DBSCAN-SWA MLIIALIGGTEDRRESIARQIAKLNPTQSSVLNMRYPTEPKARADRLRDMICYQNSGFDDKIMILPSVQFEQEAKVLRNMAAVFMVVEGPVNTRVMIRPGDVYVTDHKDGHRHFLNPIAAYSEACQKYRAAGRAA >CP020037|29604:38011|37513_38011_+|AWG87373.1|integrase|DBSCAN-SWA MLAHGTRIGETRLTRWDHIDFDSREWFIPSEHTKTKQAHRIPLTDSMVEYLKQYQESQRHYNGVFLFPANRKGQAMSADRASQKVKAVSVGSGQPMICEKSPGRCGRFRGRLYGRELLLNHALSKLDKTYIHTFAESQKRQALTQYHDWLNATAFFLTRRTPPTQ >CP020037|29604:38011|31941_32166_-|AWG87360.1|DBSCAN-SWA MLIDQTVKTPKTNDLFALLVNGQIWVRRIRPELDGSFTICAGDSNRWPDQTVADTEALAKIDIVGRVCRIMRDV >CP020037|29604:38011|31544_31814_-|AWG87359.1|DBSCAN-SWA MNGQHQLTAIHTEQHSPAVVAHQRKTEIYKNLRQTTAIASAMEALATKALEEGESGPMIIEQLADISSKLATDLNRASAIMAELLNTDA >CP020037|29604:38011|35176_35566_+|AWG87368.1|DBSCAN-SWA MSQIREINTHKVDNDEPIRIFATGERSPGNAQNDYVIGEVIEETITNCLGVVSFQKGNPATEGHNGVTMEALLAVCLDRLHCFQCGPYPSQHNEIAAMNIERAIEALKDRAREQKEITKARINEMEPTK >CP020037|29604:38011|36513_36801_+|AWG87371.1|DBSCAN-SWA MLKPSAATTLINDTRAAGAGSGAFHVRDLSGDSLALVYVSVNPLVATMAAKVLDSIETIANPNTPSGEKCQTVEQVRLDLIQFTNRVMIQEHQEK >CP020037|29604:38011|29604_30252_-|AWG87356.1|DBSCAN-SWA MGYKVSFVSQKGGPGKSTLARALGTCYAAAGWNVKIGDLDINQSTTFEWLQRRLQNEINPYVAVEVFGTAGQALRVADDYDLFIFDGAPMASQATSEISKASDLIVIPTGLSVDDLKPSVVLAHTLVQKHNVEPHRIAFALNRATGSDSEYSEAQDYLRQTPYFLIEGRIEDKPSYRKALDMGRSILEIPYKSPRKKADEVIQNIINRLEELTEE >CP020037|29604:38011|32159_32594_-|AWG87361.1|DBSCAN-SWA MPELKQKIARRIRQARNEKGWTIDETSRQLGITISRFSNWEQAIRTPKHEQIVQLANLFGKNPAWIAGYIDNQGETANSLDYVTASLQYLPTNKGEVNLVEQVSNSTAFKIDYLKERGLTENKVSLVKLIDDSMSPNWTKATKC >CP020037|29604:38011|34784_35180_+|AWG87367.1|DBSCAN-SWA MLKNRQSINELFEMWARWCLSGSDGAPASESLMQKLIENKGVMCFGSGKGAPVVDCIEARIEAAVMKIAARDKVTAQVLRREYFSIEDNEPLTQVRKAHSLGISLRTYERRLNNGRAFVLSDIGLKEIKRP >CP020037|29604:38011|34446_34782_+|AWG87366.1|DBSCAN-SWA MTGLRHSFRPRSRGAKYGNKKVTVDGITFDSKKEARYYCDLKVRVKAGEVITFLMQVPFHLTAGVKYVADFMEFRADGSVHVIDTKGVKTDVYKLKKKQVEELYPVVIEEV >CP020037|29604:38011|32832_33042_+|AWG87362.1|DBSCAN-SWA MDFPNWVDSVGGVEKAAEILKESPRAVYSWYRLERAPRLASALNIVLRTKGSVDYNGIYGPVAKAKVAA >CP020037|29604:38011|31179_31542_-|AWG87358.1|DBSCAN-SWA MEAIKGNDVICLPGQNLTKPERRVLLGLADGETPTELKIALDADNMSLRHLELNLMAKLGAKTKTHVVSRGFVLGVLVSRALCLVLAFSMATDFDNNWSRIRVRSRTRTEYSRTARNEGV >CP020037|29604:38011|36022_36520_+|AWG87370.1|DBSCAN-SWA MGRLLLGIDPKYDLEFEGVRHHALYDALHEARYLLAVFGELFKAIKDSQQIKAAAKQLDKLINNQIVTMQSAYIEATYGKGPEAGIKWIANSLFGPGFIPSDEEVEKYEKSAQLFYNANCSDPLGPCAVCERPSGWAGAGVVACCEEHLEQGKKARNNESKAEAC >CP020037|29604:38011|35562_35973_+|AWG87369.1|DBSCAN-SWA MKTLEELNLSPLVAVVDIETASKKPTAAILSVGCVLVDVFKGVEVARFYSRCDMDSQLGRDQDADTLDWWDNIRKDHPEAYDEAFCIEIERSPLDMVLSGLDCFLATHFGEDKRQVMGNGQSSTTLSWPMPTSKWA |
18 | Aeromonas_phage(50.0%) | integrase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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