Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029478 | Gammaproteobacteria bacterium ESL0073 chromosome, complete genome | 0 crisprs | WYL,DEDDh,cas3 | 0 | 0 | 6 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
507060 : 517422
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP029478|507060:517422|DBSCAN-SWA TATGGCTATAAGCTTTAAAAAATATATTGATATTACCTCTGGTGTAGGAGGTGGGGCAGGAGTACGTGATAGAGATTTGATTACACGTATCTTTACTAGTAATCCTCTTATGCCTGCCAATTCATTTTTAGAACTAGATTCTGCTGATGATGTTGCTAGCTATTTTGGTAGTAATTCTGAAGAGTATAAAAGAGCAGTCTTTTATTTTGGCTGGGTAAGTAAAAATATTAGCCGTCCTAAAAAAATTAGTTTTGCTCGTTTTGTAGAAGAAGAGCAAGCACCTATGATTTTTGGCGTTAGTAAGGTTTATGTTTTAGATGCGATTAAAGCAGTTAACTCTGGTACGTTAGTATTATCAATTGGTGGTCAATCCCAAGAGTTAACAGGTTTAGACTTTTCTGCTGTAACTAGTTTTGCTGATGTGGCTGGTGTGGTTAAAACGGCTGTTAATGGTAAAGAAGGTGAGCAATTTACTGGTGCTAACGTAAGTTATGATGCAGTGACGTGCCGTTTTATTTTAACAGGTGGTAAAGCAGAAAATGCAGAGATTAGCGCTAGTGGTGAAGTAGCTGAACTATTAGGTTTAGCACAAGGTGCTATTAATTCTGACGGAGCATTAGTTCAGTCAGTTACTGATACATTAATTGCTTCCACAGATGCTTCTAATAATTTTGCATCATTCTTATTTGTGTCTGTACTTGCTGATGAGCAAATTAAAGAGGTTGCAGCATGGAATGATACCCAAAATGTTATGTATATGTATCTAGTGCCAGCCACTGATAAAAATGCAGAAACCTTATCAGGTATGTTACTTGGTTATTCAGGTACTACGCTTACCTTAGCGTCTCGCCAAGGTGAGTTTGATGAGATGATTCCGGGTATTATTTTAGCAGCTACTGATTATGCTAAACGTAATAGTGCGCAAAATTATATGTTCCAACAATTCCCAGAATTAAGTCCAAAAGTGGCTAGTACAGTTGAAGCTAATAAGTATGATGCTTTACGTGTTAACTATTATGGTCAAACTCAAACGGCTGGTCAAAACATTAGTTTTTATCAACGCGGTGTGATGATGGGGGGAGCAACTGATTTAGTAGACCAAAATATTTATGCTAATGAAGCATGGTTAAAAGATGCAGTGGCTGCACAGATTATGTCGCTCTTATTATCAGTATCTCGTGTACCTGCTAATAATAATGGTCGTGCGCAATTATTAGCGGTTATTCAAAGTAAGATTAATCAAGCCTTAGATAATGGCACTATTAGTGTTGGTAAAGCATTATCAACTGTACAAAAACTTTATATTTCGGAGATTACGGGTGATTCATTAGCTTGGCAGCAAGTACAGAATATTGGTTATTGGATTGATTGCCAAATGCAAACCTATGTCACTGAAGATGGTCGCACAGAATATAAGGCTGTATATACATTAATCTATTCTAAAGACGATGCCGTACGTAAAGTTGAAGGCACTCACACATTAATCTAAGAGGTTTTTAAGATGCAAGATATTTCAGGTTTTGGCCTACAGGTTCGTGTAGTGGCTTCAGAAACTTTTCCAGAAGGTTTTACTATTACTCAATTTGCTGATGATGGTGATCCATTTGATTTTCCAAGCATGCAAATCAAAGATAAGGCAATGGGTGTTAATGGCGATTTAATCACTTGGTCTAAAGCTAACCCTATTGAGATTACTGTTAATACTATTCCTAATGGTGAGGACGACGCTAATTTAGGTGTTTTACTGGAAGCAAATCGCGTAGCTAAGGGTAAAAAAGTGGTACGTGATGTGGTGACTATGACGGCAATTTATCCAGATGGTAAGAGTATTACTTTAAGTAATGGTGTTATTACCGATGGTATGCCAGCTAATGCAGTGGCTAGTGCAGGTCGTTTAAAAACTAAAGCTTATAAATTTGTTTTTGAAAATGTAACAGGTGCCTAAAAAATGATTGAGCCAAAAGAAATTACCATTGTTGATAGTAAAGGTATTGAACGTAAATATATTATTTCACGTATCCCTTATGCTTCTGGTGGACGAGAGATTTGTTCCCAGTTTATTCCTACTTCTATTCCTAAGCTGGGTAACTATCAATTAAATCATGAGCTGTTTTTAAAAATGATGAAATACGTGTCTGTGGTTACAGATAATGGTCAGTTACCTTTATCAACTTCAGCATTGATTGACAACCATGTACCTGATGTTAAAACAGGGTTGTTGTTAGAAAAAGAAATGTTGGAGTACAACTTTGGTTTTTTCGATCTTGGCAAGATCTCGGCTATCTTAGAAACATTAGGCAAGAATGCCAAACCGTTGATTACAAAAATATTGACGCAGTTGCAGGGATTCTCATTTCAGAAGGACGAGCAAGCCTCCGAGAATTAAAAGAGGTTTATAGCGTTGAGGATGTGATGCTAATGTGGGAAAGCATCGCAGTCCAACGTTATAACGAGTATCTTGCCGTTGAAAAAACAAAGAGGAAGATGTAAGTGTCAAATATTCTTTTAAATATGGTATTAACTTCCGATGAGAGTATTAAAGCTGCAGAAGAGTTATTTCAAGGGTTGGGAAAAGCTTTAGATAGTTTTACAAATAAAGTCGAAAAAGCTAATAAGTCTTCTAGTTTTTTAACAAGAGGGTTTGAGAAATTATCAAATACTACAAAGTCAGCTATTAAAAACTTTTTTTCTTTTGATAATGTAATAAAGCAAGTAAAGGATTCTATGCAGTTTGCTACTGAGGTTAACAGTATAGCAGAGACTATTGGAGCACCCACTGAGGAGGTTAGTGCATGGGTTGATGCAGTAGGTAATGTAACAGATTTCAAAAAAAGTATTGATAGTTTAGCAACCATTGATAAAGATGTTTTAAAAGGTTTAGGTTTTTCCATGCTTGATAGTACGGGTAAAACTAAGAACTTATTAGATATATTACCTGAGATAGCAAATCGAATGGAAAATATGAGTAAGTTAGATTCTTTTATCCTAGGAAAAAAAATAGGTCTAGGTGATGAGACTATTGCGTTACTTCAACAAGGAAATCAAGCTGTAGAGAAAACTATTCAAAGACAAAAAGAGTTGGGTACCGCGTCTTTTGAAAGTGCTTTTGCATTTCAAGAGTTTAATGATGCCATGAAAACCATAGACCACTTGATAAGAACAGTGGCTATGAAAATAGGAACTCTAATTCTTCCTGCATTAACTTCATTATTGAATAAAGTGGCGTCTTTTGTAGAGTTTCTCATTAATAATGAAGGAGTAATGATTGCTGTTATTAGTGGCATTGCAGCTGCATTAATAACAATATTATTACCAGCTATAGCAGCGATATTAACAGCAGCTAGTCCTATCATTTTTACTGCTGTAGCAATAGGTATAGCTGTAGCAGCAGTGGTAGCTTTACTTATAGGTGCATTTAAATTACTGAGAGCTACTTATCAATGGTTAGTCGCTATTGTTTCTCAGGGGATAGAAAAACTAATTGATGGGCATAGTAAGCTGGTAGCAAAGGTTGTAGGTTATATACAGGCTATTGTTGATATTTATAATTATTTAGCAGGTAAAGTAAAAGATACTGTAGAAAATATCGTAAATGCCTTTCGCTGGCTGGTTAGTAAAGCTACTGATGGTATAGAAGCTATTATTAATAGTTTTAATACATTGTGTGGTGTATTGAGTTTTGTAGTTGGTTTTTTTGAATATTGCTTTGGTGTTATTGCCTCAATAGTTGCATCTATTATTGTTCTTTTTACTGAAGGGCCTAAAGAAGCTATTCAATACTTATCAAATGCCCTTGCGAAAGTTTTTGATGGGTTTTTTGAGAAGTTTCCAAAAGTCAAACAAGCTTTTGATAGCTTGGGAGGAAAAGCAGCTAATTGGTGGGATAAAAATACTGCATGGCTTGGCTGGGATAGTGGTGTTGAGGAGGCTGGAAGAAAAGCTATTGAACCAACTCTGATTAAAGGTAGCAACGCTATTAGTTCTGCACAAAAAGCTAGTCAGGTATTAAGTGGTTCAAATAGTCAACCTGTCGTTACTAATAATCGACAAATCAGTTATCGAAATAACTTTAATATTACTTCTGATAATCCAGAAAGAGTGGGACGCATTGTGGATGAAAAAATGCGTGCTATGAGTCAGGATGCAGGTGAGTATTTTAATGATGGGAGATTAGCATAATGGCAGCAGTTATTTCTAAAGCTACCGATTTAGTAGCTGTGTTAAATGAAAATCTAAATCAAGTATTCGAAGGTGCTTATATTACTACTGCTAATGTTACAGAAGAGTCTCAAGTAATGTCACATGCAGTAGAAACGGGGGCAACAATTGTAGATGAAGTTGTGCTGCAACCTATTAGCATAACGTTAAATGTTACTTTAAATCCTAATAGCTATCGTTCTATTTATCAGGAAATTAAACAGGCTTATTTATCTCGTGCTTTGTTGACGGTACAAACTAAATCAGACTCTTATAGTTCGATGGTAATTGAAAAAATTCCCCATGATGAAGAACCTAATGTGTTTGATACGATTACTTTATCAATTTCTTTAAAGGAGGTGAAGTTTGTCGATACTCAGTATGAGGAATTTAAATTAGCTAAGGTAAAAAAACCAAGTAGTACCTCTGCTAAAAAAAGAGGCAATACTAATTGTCCAGTTTATGATACTAGTGCTGACAATGTATTACCCATATTAATAAGGCAAGCTACGACTAATGCTAAAGTTAATGCAGTAACGGGAAAAGTTTATTATGAATAAGGTTGAGTTAATAAGTTATCCCAATCAGCAGTTTTCAATTGATGTTGATAACAATCGTTATGATTTATCTATAAAGGATTGTGATGGTTTTATGGTGATAGATATTGTTTGTAATAATCAAATAATTGTAAAAGGACAACGCTTATTACCTGGCATTCCATTAATTCCTTATCTTTATCGTGAGCAGGGTAATTTCTTATTGGTTACTGAGAAAGAGGAGTTGGCTGATTGGCAAAAATTTAATATTAGTCAGTTTCTTTACTTTATTGCTAATAGTGAGTTAGCAGAGATAAGGAGTGACTGATGGCTGAATACGATCCTCGAGTATTAAGAGTAGGGGTACAAGTTGGTGATTTAGTAAATTGGTATCAAGACTTAACCCTTACTGTTTCTGGAAGTAAGAGTAGTAATGATAATCAGGCGGATTGTACGGTAAAGCTGACAAATTTATCAAAAGAAGTTCGCGATTATTTATTAAAGGAAACATCACCCTTTAATAAGAATGCCACTAAAAAACGAGTTGTGGTACAAGCAGGAAGAGAGTCAATAGGTGTGGTAAGGGTTTTTGAAGGAGATATTACTAAAAGCGCTATCAGCCAGCCACCTGATATTGAGTTAACGCTAACTGCTAAAGCTAATAACGCAATGAAAGGAAAAATGGTAACACAGGTATTTGCCGAACAAGCAAAGCTTTCAGAGATAGCTAAAAAGGTAGCAGAAGATTTAGAGCTTTCATTAGATTTTCAAGCTGCTGATAAAAATATTCGTAGTTATTCTTATACAGGACCAGCACTTAAACAAGTAACCAAACTAGCTGAGATGGGTAATGTAAATGCTTATATAGATGGTGATTTTTTAATTGTTAAAGATTCAGATAAGCCATTAATGGGAAAGCGAAAGATATTAAATGTTGAGAGTGGCATGGTGGGTATTCCTGAGTTAACAGAAAAAGGGGTTAAGGTTAAATTTTTATTTGATCCAGATACGACTTTAGGTAGTGAGTTAAAAATAGAAAGTGATCTTAATCCTGCTGTTGCCGGTGATTATATTATCTATAAGTTAGACTTTTCTCTTTCAAATCATAGTACAGATTTTTATTGGACTGCGGAGGCGAAAAGAAAATGATAAAGGATAGAGAACAATTACCTATTGTAAATACTCCTTCACAAAGCCAGAAGATAGTGCTGGTGGCTTATTAGGAACATTAAAATTAGCGCTTAATAAAACTTTGCAAAACTTAGATTGTTGTTTGCCAGCAAAAATTATTAGTTATGATCGAGTAAAAAATAGAGCCACTGTTGAACCTCTTTATAAAGTTACTACTACAGGTGGTGAAACTTTTTCTATGGCTCAAATAGCAGGTATTCCTACGCTTTTATTAGGTGGCGGTGATGCTTTTATTAGTTTTGATTTAAAGGAAGGAGATCTTGGTTGGATTATTGCTAATGATCAAGATATTTCTTTATTTTTGCAAAGCTATGAGTCAGCTCCTGGTAATACTAAGCGGATGCATTCTTTTTCAGATGCGGTATTTATTCCTGATTTGATGGAAGGGTATCAATTAGCTACTGAACCAATGGCTGGAGAAGCAGTTATTCAAAGTAGATTAGGTTCTACAGTAATAGGTCTTTCTACCGATAAAATCAGTATTCGTTGCCCTTCTACTGAGGCTGAATTAGTAGTGGTTGCTAATGTTGATTTGTTGGGCAAAGAGTCTACAGAAATACCTAAAAATGCATTAGCTAAATCTAATGGTCATTTATTTAAGTTAACAGAAAAAATCACTCTAGATCAGCAGGGCACAGCAAAGGGTATGTTTGTGGCGGTAGATTATGGAAGTTACATCTGTCCTGCTAATTCTTTAACAGAAATAGTGACAGCTATTGAAGGGTGGGATTCTATTAATAACCCAGAAGATGGTAAAAAACAAGCCCTTCAACAGGAGGGTAGTGTTGAAACCACAGCTAAAACCATTGTTATTCAAGGTAGTACTATTACTTTAGAAGGTGAGGTAATGGTAAAAGGTCCTCTTAGTATTCAGGGGGTAGTTAATATTAATGGTGAGGTTCGAGTTGAGGGCAATATAACAGCAAGTGGTCAGATTCAAGGTAATACATGATGAGAACATTAACAGTAGATAAGAATAATGATCTTTGCCTAAATACGTTAGGAAACTTAGCTATTAGTAGTGATCTGCAAGCCATATTATGTGCTTGTGAACATGCTGTAAAAGCTCAGTATGGTGAGATGATTTACGCAATAGATAGGGGTATTCCTTACAATATTTTGGCATGGGATAGGCAACCAAATTTAATTCAATTAGAGGCTTTTATAAGGCTTGCTATTACAAGTATAGAGGGTGTTGTAGGTATTAAAGAATTTATTATTAATAACGAAAATAATTTAATTACTTATAGCGTGGTTATTAAAACTAAATATGGAGAAGGTAGCTTAAATGAGTTACGAATATCTAACTGAGTCAGGTGTTATCGTTCCTGATACCAGTGATACCCGCAAGCAGGTAGTAACTGAGTGGAAACAAGCTTTAGGTCAGGATTTAATTACTGATGATGAAACACCTCAAGGGTTATTAATTAATGCTGAAACTGAGGCAAGACAATCAGTAGCTAGAGCAAATGCAGCTATTGCTAATCAGATTAATCCGAATATAGCAGAAGGTATTTTCCTTGACGCGATTTGGGCATTGACGGGTGGGCAACGTCTTAAGGCAAGTTATACCCAAGTCCAAGGGGTTATTTTAACAGGTGTTGCAGGTACAGTGATTGTAGAGGGTTCTCTAGCACAGGCCAGCGACTATCAATTTAAAACATTATCAACGGTTGTGTTAAATGCTTCTGGCAAAGCAGTGGTTAACTTTCAAGCAGTTGAGCTTGGTGTTGTTCCCTGTTTAGCCAATCAATTAAATAAAATAATTACCCCTATATTGGGCTGGGAAACGGTCAATAACCCTAGAGATGGCGTAATGGGTAAAGATGAAGAAAGTGATCTATCAGCTCGTCTTAGACGTAAAAGAACCTTAGCATTACAAGGTAGGGCTCTGCCTGAAGCAATTGTTTCGGATCTTTATAGTCTAGAAGGTGTTAAAAGTTTAGTATTTAGAGAAAATATTTCTAATACGTATCAAATAGTCGATGGTGTACCCTTCGAACTAAAACCTCACTCAATTTGGGTGTGCATTGAAGGTGGCAGCGATAATCAGATTGCACAAAGTTTACTAAATAGTAAAAGTTTGGGTGCTGGTTATAACGGACAGCAAAAACTAGAGGTGATAGAGCTAGTTAGTGGACAATCGTATGAAGTACAGTTTGATCGGCCAGAAAATGTTTTAATTTATATTAAAGTCACTGTTAAAGCCAGCAGTTCGACATTTGATCCTCAATTAGTTATTCCTAATGTAATTATGAACTATGCAAAAGGGGAACAAGCACAAGAACAAGGTTTTATGATTGGTAGTACTGTTTCTAGCTTTGAAATAGCTGCTGCGATTAATAAAGAATATCCTTCTCTTTTTATAAAAAAGATAGAAATATCGACCGATGCAATAAATTATTCTAGCCAAGAAATTGAGATTGCGCTAAATCAAATAGCAGAAACAAGCGAAGGATTGATCAGAGTGGTGTCTGAATGAATATACCAGAATTTGATTTTTCAGTCGATTTATTAAAGGTGATTCTCTGGCAGTATAACGATGCTGAAAAGATTCAGTCATTGCTTGAGCAGAAACAGTCTTGGTATAACTCAAATCAGGCAGGTTTTTGGCAAAAGTGGTACAGAGATGTATTTGATTTAACTACAGCTAACGATTTTGGATTGGCTGTTTGGGCCATTATCTTAGAAATTCCTCTTATTGCATGTTTTGATAAGAGTGAAGACGATGCACCTGCATTTGGTTTTGGCGGAAACTATCAAAACTTTGGTTCTGGTAATTTCTTTGCTACACAGGCCAATAATATTAAGTTAACAACGGAACAAAAAAGATTAATTATTAAATTAAGATATTTTCAGTTAGTTTCAAAAGGAACTATTCCAGAAATTAATTTATTTTTAAAAAGCTTATTTGACGAAGCCTATGTATTAGATACTTATAATATGCAATATGTAAGTTACGTAATTAATACAGAAATAAGTTCAGAGTTTCAATTTATTTTACAAACGTATGATTTATTACCGCGCCCAGCTGGTGTTGGTAAAAGAATTATTTATGGCAGAAATGACTTGTTTGGTTTTGAGCAACATTATCAAAATTTCAGTAACAGTGTCTTAGCGAATATAACAGATTATAAGGTGTAGAAATGACAAAATATTTTAAGAGTGAGTTTGCCGTTAACGGCGATAAAGTAGATATCCCTAATGAGATTCAATCCTCTGGAGAGGTAAGTTATCAAACTGGTTTTGGTATTGATTATCAACGTAAGTTAGGGGCTGATATATTAGCAAAACCTTTTCCAAGACAAGGGTTTAATGGGTTAGTGTCTGATATTACAGGAGCCATTCAGCAATATCAGCAAAATGGTTTTTTTGAATTCATTACACCAGAAATGAATGGTGGAGAGTCATTTGATTATACCATGGGTGCGACTGTTCGCTATGACATGTCAGAAACTAAAGATGGTTCAGATGTTCGGATTTTTACTTCGTTAATCAACAATAATAAAGGAAACCCTAAAGATAATGCTAAAGATTGGCGTGAGCAAGGTAAGCAGCAAGGTAGTGGTTATGGGTTTATATTTACTCATGTGTTATCAAGCACAACGTTAACAGAAGATCAAGCAGGTGTTGTCTTGATTGATGCAAGCGCTGGAAATATAGAAGTTAATTTACCTAACACAACATTAAATATTAGCTTTATTTTTAGACGAATAGACAACACTGAAAATACAGTAAAGATCAAAACATTAGGAACGGACAAAGTTAAATATAATCAAGCAATAAATGCAAATGGTTATTCATTTTTTAGCCTTTTTGGCGCAGGAGACTATTGGAGGATAATTTCTGACGGAATAGGTAATTGGTTTGATATAGAGCGGGCAGACAAAGCACCAATAGGTGGAACTAACTTTTTATCCTCTATAATTGCTCCCATTGGTGGTTATATTATAGCTAATGGTTCTATTTTAAATCGTACAGAATATCCTTATCTTTGGGATTATGCACAAAAATCAGGTTTGTTAGTTGAGGATAGTGACTTTAGTGGTAATGATGGTTGTTTTTCAAAAGGGGATGGAGTAACAACATTTCGCATACCAGATTTACGAGGGATATTTATGAGATCTTTTGACGATGGGCGTGGTGTTGATAATAGACGTATAGTTGGTAGTTGTCAAAAAGGAAGTATCTCAGTTATTGATACAGGAACTGGCGGTTCATGGTCTCCTGCTACTGCTCTAACTACTGATACAATGATACAGGCACAAGCTAAAGCAGGACTAGACGATTATAATATCGTTGACTTCCCTGATATTAAAATGGCTGGCGTAGGAGCTGTAGATTTAATTAAGTTACCAGGAGTAGGAGGGGCATACTTCTACACAGGTGTTATGCGCCCTAAAAATATAGCCTATCCAGTTTACTTAAAAATTATTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP029478|507060:517422|507060_508548_+|AWM79270.1|DBSCAN-SWA MAISFKKYIDITSGVGGGAGVRDRDLITRIFTSNPLMPANSFLELDSADDVASYFGSNSEEYKRAVFYFGWVSKNISRPKKISFARFVEEEQAPMIFGVSKVYVLDAIKAVNSGTLVLSIGGQSQELTGLDFSAVTSFADVAGVVKTAVNGKEGEQFTGANVSYDAVTCRFILTGGKAENAEISASGEVAELLGLAQGAINSDGALVQSVTDTLIASTDASNNFASFLFVSVLADEQIKEVAAWNDTQNVMYMYLVPATDKNAETLSGMLLGYSGTTLTLASRQGEFDEMIPGIILAATDYAKRNSAQNYMFQQFPELSPKVASTVEANKYDALRVNYYGQTQTAGQNISFYQRGVMMGGATDLVDQNIYANEAWLKDAVAAQIMSLLLSVSRVPANNNGRAQLLAVIQSKINQALDNGTISVGKALSTVQKLYISEITGDSLAWQQVQNIGYWIDCQMQTYVTEDGRTEYKAVYTLIYSKDDAVRKVEGTHTLI >CP029478|507060:517422|516129_517422_+|AWM79281.1|DBSCAN-SWA MTKYFKSEFAVNGDKVDIPNEIQSSGEVSYQTGFGIDYQRKLGADILAKPFPRQGFNGLVSDITGAIQQYQQNGFFEFITPEMNGGESFDYTMGATVRYDMSETKDGSDVRIFTSLINNNKGNPKDNAKDWREQGKQQGSGYGFIFTHVLSSTTLTEDQAGVVLIDASAGNIEVNLPNTTLNISFIFRRIDNTENTVKIKTLGTDKVKYNQAINANGYSFFSLFGAGDYWRIISDGIGNWFDIERADKAPIGGTNFLSSIIAPIGGYIIANGSILNRTEYPYLWDYAQKSGLLVEDSDFSGNDGCFSKGDGVTTFRIPDLRGIFMRSFDDGRGVDNRRIVGSCQKGSISVIDTGTGGSWSPATALTTDTMIQAQAKAGLDDYNIVDFPDIKMAGVGAVDLIKLPGVGGAYFYTGVMRPKNIAYPVYLKII >CP029478|507060:517422|508560_509004_+|AWM79271.1|DBSCAN-SWA MQDISGFGLQVRVVASETFPEGFTITQFADDGDPFDFPSMQIKDKAMGVNGDLITWSKANPIEITVNTIPNGEDDANLGVLLEANRVAKGKKVVRDVVTMTAIYPDGKSITLSNGVITDGMPANAVASAGRLKTKAYKFVFENVTGA >CP029478|507060:517422|509549_511238_+|AWM79273.1|DBSCAN-SWA MSNILLNMVLTSDESIKAAEELFQGLGKALDSFTNKVEKANKSSSFLTRGFEKLSNTTKSAIKNFFSFDNVIKQVKDSMQFATEVNSIAETIGAPTEEVSAWVDAVGNVTDFKKSIDSLATIDKDVLKGLGFSMLDSTGKTKNLLDILPEIANRMENMSKLDSFILGKKIGLGDETIALLQQGNQAVEKTIQRQKELGTASFESAFAFQEFNDAMKTIDHLIRTVAMKIGTLILPALTSLLNKVASFVEFLINNEGVMIAVISGIAAALITILLPAIAAILTAASPIIFTAVAIGIAVAAVVALLIGAFKLLRATYQWLVAIVSQGIEKLIDGHSKLVAKVVGYIQAIVDIYNYLAGKVKDTVENIVNAFRWLVSKATDGIEAIINSFNTLCGVLSFVVGFFEYCFGVIASIVASIIVLFTEGPKEAIQYLSNALAKVFDGFFEKFPKVKQAFDSLGGKAANWWDKNTAWLGWDSGVEEAGRKAIEPTLIKGSNAISSAQKASQVLSGSNSQPVVTNNRQISYRNNFNITSDNPERVGRIVDEKMRAMSQDAGEYFNDGRLA >CP029478|507060:517422|509007_509445_+|AWM79272.1|DBSCAN-SWA MIEPKEITIVDSKGIERKYIISRIPYASGGREICSQFIPTSIPKLGNYQLNHELFLKMMKYVSVVTDNGQLPLSTSALIDNHVPDVKTGLLLEKEMLEYNFGFFDLGKISAILETLGKNAKPLITKILTQLQGFSFQKDEQASEN >CP029478|507060:517422|511237_511816_+|AWM79274.1|DBSCAN-SWA MAAVISKATDLVAVLNENLNQVFEGAYITTANVTEESQVMSHAVETGATIVDEVVLQPISITLNVTLNPNSYRSIYQEIKQAYLSRALLTVQTKSDSYSSMVIEKIPHDEEPNVFDTITLSISLKEVKFVDTQYEEFKLAKVKKPSSTSAKKRGNTNCPVYDTSADNVLPILIRQATTNAKVNAVTGKVYYE >CP029478|507060:517422|514271_515465_+|AWM79279.1|DBSCAN-SWA MSYEYLTESGVIVPDTSDTRKQVVTEWKQALGQDLITDDETPQGLLINAETEARQSVARANAAIANQINPNIAEGIFLDAIWALTGGQRLKASYTQVQGVILTGVAGTVIVEGSLAQASDYQFKTLSTVVLNASGKAVVNFQAVELGVVPCLANQLNKIITPILGWETVNNPRDGVMGKDEESDLSARLRRKRTLALQGRALPEAIVSDLYSLEGVKSLVFRENISNTYQIVDGVPFELKPHSIWVCIEGGSDNQIAQSLLNSKSLGAGYNGQQKLEVIELVSGQSYEVQFDRPENVLIYIKVTVKASSSTFDPQLVIPNVIMNYAKGEQAQEQGFMIGSTVSSFEIAAAINKEYPSLFIKKIEISTDAINYSSQEIEIALNQIAETSEGLIRVVSE >CP029478|507060:517422|515461_516127_+|AWM79280.1|DBSCAN-SWA MNIPEFDFSVDLLKVILWQYNDAEKIQSLLEQKQSWYNSNQAGFWQKWYRDVFDLTTANDFGLAVWAIILEIPLIACFDKSEDDAPAFGFGGNYQNFGSGNFFATQANNIKLTTEQKRLIIKLRYFQLVSKGTIPEINLFLKSLFDEAYVLDTYNMQYVSYVINTEISSEFQFILQTYDLLPRPAGVGKRIIYGRNDLFGFEQHYQNFSNSVLANITDYKV >CP029478|507060:517422|511808_512120_+|AWM79275.1|DBSCAN-SWA MNKVELISYPNQQFSIDVDNNRYDLSIKDCDGFMVIDIVCNNQIIVKGQRLLPGIPLIPYLYREQGNFLLVTEKEELADWQKFNISQFLYFIANSELAEIRSD >CP029478|507060:517422|512119_512941_+|AWM79276.1|DBSCAN-SWA MAEYDPRVLRVGVQVGDLVNWYQDLTLTVSGSKSSNDNQADCTVKLTNLSKEVRDYLLKETSPFNKNATKKRVVVQAGRESIGVVRVFEGDITKSAISQPPDIELTLTAKANNAMKGKMVTQVFAEQAKLSEIAKKVAEDLELSLDFQAADKNIRSYSYTGPALKQVTKLAEMGNVNAYIDGDFLIVKDSDKPLMGKRKILNVESGMVGIPELTEKGVKVKFLFDPDTTLGSELKIESDLNPAVAGDYIIYKLDFSLSNHSTDFYWTAEAKRK >CP029478|507060:517422|513934_514294_+|AWM79278.1|DBSCAN-SWA MRTLTVDKNNDLCLNTLGNLAISSDLQAILCACEHAVKAQYGEMIYAIDRGIPYNILAWDRQPNLIQLEAFIRLAITSIEGVVGIKEFIINNENNLITYSVVIKTKYGEGSLNELRISN >CP029478|507060:517422|513044_513935_+|AWM79277.1|DBSCAN-SWA MQNLDCCLPAKIISYDRVKNRATVEPLYKVTTTGGETFSMAQIAGIPTLLLGGGDAFISFDLKEGDLGWIIANDQDISLFLQSYESAPGNTKRMHSFSDAVFIPDLMEGYQLATEPMAGEAVIQSRLGSTVIGLSTDKISIRCPSTEAELVVVANVDLLGKESTEIPKNALAKSNGHLFKLTEKITLDQQGTAKGMFVAVDYGSYICPANSLTEIVTAIEGWDSINNPEDGKKQALQQEGSVETTAKTIVIQGSTITLEGEVMVKGPLSIQGVVNINGEVRVEGNITASGQIQGNT |
12 | Burkholderia_phage(44.44%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_2 |
1019933 : 1028897
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP029478|1019933:1028897|DBSCAN-SWA CCTAGAATGGGACAGAATCATCAAAGTCTTCAAAAGTAGGCGGTGCCGCCTGTTGATTCTGTTGCGGCCTATTTTGCGGTGATTGTTGCTGATTGGCTTGCTGTTGTGGTTGATCTTGACGGCTATCTAGTAATTGCATAGTTCCACCCATATCAACAACGATCTCCGTTGTATATCGCTCTATCCCTTGCTGATCTGTCCACTTTCTTGTAACGAGCCTACCTTCTACATAAAGCTTTGAACCTTTATGAACATATTGGCCTACAATCTCGGCAATTTTCCCAAAGAAAACCACACGATGCCATTCAGTACGCCCTTGTGGCTCACCCGTGTTCTTATCTTTCCATGTGTCTGACGTAGCTAATGAAACCGTAGCCACTGCATTACCGTTAGGCATGTATCGCATTTCTGGCTCATTTCCGATATTACCTACAAGAATTACTTTATTGACCCCTTTAGCCATTCACCACCTCGCCAGTTTCAGTGTCTACATTCTCAAGCACGTTATAATCAACATCATCTAAAATGCTTTCGTTTTGCTGACTAACTCCAGCTTCTGCTAGTTCGTCATAACCTACAGCTTTTGACATCTCAACGCTGACAGGAAGATACTTAAATAAACGACGTATGACGGTCTTTTTAGCCATTTCCTCGTAATGAGTTGCCCATGGGCTATAATCTGTTTTACCAGCTTTAGATTGCGCTCTGATAGCGTCGATTTGCGCTCGGCTCATTACTTCAAATTGAACACCACCATCTTTTAGATTAGCTACTGCATAAACAAATGTTAATTTCCCTCTATCAGCCTCTTGGGATGGTTTATGTGTTAGATTAGGATGAAGCCCAAGCTCATAATCAAACTCGTCATACTCATAAACCGCATAAGCTGACAAACTCACCATCTGCCCTGATCTTCTAGCAAGATCAATCATGCCGCGATAACCGATAATAAATTGGCATTCAGTAATGCCTTTGTTTTTGTTTTTGAATGGCAACAGGTAAGCTTGCCCTAAACCTAAACTTGGCTCTAATCCAAGCTGAGCGCATTGCAATACTGCACCTATAAAACTAGCTGGGTCGCACTCTCGTAATGCTGGAACACGGTTTAGCTCTGTCATTGCTACGCGGGCCAAACGATCAGGGGTTATATGTTTTGGTACAGCCTTTGCGATCTGACTTTGAACATTAGCTTGTGCTAATAAATCTTTTAAAGTCTTTGGCTTATCGCTCTTTTGTTCTTTTTTCTCAAGAGGATTCATTGCAATTGATTCTTGCTGAGACATAGTGACTACTCCATATAATAAGGTAATTTAATTGTTTCGATGGCTGCCCAGTCATTTGAGGCTCTACATTCGTGATACGTTGCTATATCTTCTAAATATTCAGTTCTTCCAATCTCCTTAACCTCTTGGGCAAGCTCAAATAATCTAACTGGATAACGACCACAATTAAGCTTTGTACTGACTACTAAAAAAATAAAACTACTTAACTTGTCGTTATAAGCTGTTTCATACCCTTTCGTGTACCATGCATCCTGAACGTGATAGCGATAATTAAAAAAAGACTTTTCTATACGCTCAATATCGCCCGTTGTTTTAAGATCAACAATACAGCTATGTTCGCTAATAAGTTTATCCGGACGACATTTTGCAAGCTCTCCCGTCGTTTCCTCATTCCAAAAAATGCTTATTTCTGGATCACCTTCAGCCTCAATAAGCCACTTAGCATGAGGATGTGAAAAAAGGCTTTCACGCATAAGCAATAGTTTTTTATTGTCCTCTGCACTAAGCACAATCTTTTCTTTTGACGTATTTAAAAACTCCTCATAAGCTTGTTTTCCTTCTTTGGTTCGCCTATTAATATCATCAGGCATAACAACAAACTCATTCTTAAAATTATCAGGTTCTAAAATCAAAGAATGAAAAGCCGTACCAATATCGAGGGCTTCTTTTTTATCCTCATCATAAGGTGCGTTTACACTCCAAAGAAATAAAGCAGGGGACTTCCTGATTAAATCTAACTGGCTTTTACTTATACCGTCACTTTGCCTGTAATCTTGGTTTGATAAGTTTTTATATATTCCCGTTTTCATGGCATTTAAAATGCTCCTATGACGCCTCTAACTAACTTGATTAAATTTCTAAAAGATTTTGCAAGGCGACTTCCTTAATCTCTGGAAGTTCGTCATTAACTCCAAAGATTGAAACATCATAGAAATCCCAATTATCAACCCCGCCAATTTCTAATCGTTTCAGCTTTTCCTCTTTGCTTAAAAGCTCAAGCAGTCTAGATGCTGATATTTTCCTGTCGGTAGCTATAATGGGGACTTCAACAAAAGAGATAACTCGTTCTTTAATACCTCTTATTTCATCGTAAAGACGAACTATTTCTCGATCCGCTTTATCTTTTTTATCTAATGCATTGAGGTATTTTCTGTTTATTCTTGAAATTTGCTTAACAGCATTTGCATTTCTAGAAACAAGTCTTTTCCTTTGGTTGTTTAGAGCGTTAACTTCTTTTTTTCTCTCTTTTATTTCGGCTGCTAGCTTCTCATTCTCTTTATATTCAAAAGGCTTATCCATAATGTATTTAGCATGAATGAACATAATTTCTTCATCTGTTACCTCATCGAGTAAGCTGTGAATTATCTCGTTGGCATCATCACAAGTATGAGCGTGGTATGTATATCCGAAGTCATCAAGAAAAGATATGGTGGCGGCAATGATGACAATTAACCAATTAATAGTAAATCTAACAATCATAATCTTACTCATCGTCTTATATTTTTATGCGCGCGACTTCTTCAGGAGTCATGAGCGATGCATGGATACCTATGTTAATGCCTTTAAGCTAATAGCTATAAGTGGGTGGGTTATTCATTTAGCAAGTTACAAAGTAGCGCAGCCCAATTTGCCAGCATTGATGCTGCTTATTGTTTTGTTATTTCAGATTTTCAGGTACAGGAACAATATTAAATGAATAAATTAAGTGAAAGAAGCCTAAAAATACTAAGTACCGTTAATACTGATCTTCAAAAAGTAGTTAATCGCGCTATTGAGATTAGCGAAGTAGATTTTGGTGTTATACAAGGAAATAGAACCCAACAGCAACAAGACGAACTTTACGCCCAAGGAAGAATAAAACCAGGGCAAAAGGTTACATGGACAAGAAACAGCCGACATATACAACATCATTGCGTGGAATAACTCACCTAATCTTATTCAGCTAGAAGCCTATATGCGCCGTGAAATCCTAGCAAAACCAGATGTTATAGGGATTTCAGCGTTTGAAATAGAAGCCAATGCAAATGTTATTACTTATAGCATAACAATTAATACGAGTTACGGAGAGGTAACACTAAATGATTTACGATTATCAAAGTAAGTCGGGGGTTATAGTATGGCTTTGCGTTTACTACTATAACAACCAATACAACTTTAACTGAAGACCATTCTGGTGTTGTTTTAATCGATGCCAGTGCAGGGGATATAACAGTAACTTTGCCCAATACAGACAACAATATTGGATTTATTTTAAGACGTATCGATAACACAGTTTATAAAGTAAAAATACAGGCTAGCGGCACAGATAAAATAAAATATAACGTTTCTATTAATGCAAACGGTTATTCATTTTTCCATCTGTTCGGGGCAGGTGATTATTGGCGTGTAGTATCAGACGGACTAGGTAATTGGTTCGATATAGAAAGGAAAGATAACAACCCGATTGGGGGTGTTGAGTTTATAATTTCTACGCTTGTCCCAGTTGGCGGCTATGTTGTGGCTAACGGTACGCTTTTGAATAGAACAGATTATCCTTATCTTTGGGATTATGCTCAAAAATCAGGTGCGTTAGTTGCTGAAAGTGAAATAACGGAACATGAAGGGTGTTTTACTTCAGGGGATGGATCAACCACTTTCAGATTGCCTGATTTAAGAGGTAAATTTCTAAGGGCATTAGACAACGGTTTAGGCGTTGATGCTAACCGTACGGCAGGCTCTTACCAACAAGATGCTATTCAGAATATTACAGGAACCATAACTAATGGTGCGTCTGTTGATGGTTCATCAGGAGTATTTACTAATAGTGGCGCCGGTCGAACAGGGACGCAAGGCACGGCAGGAGGTGGTCGTTTAATTACATTCGATGCCTCGACGGTGGTACGGACGGCTGATGAAGTAAGGCCAAAAAATATAGCCTATCCCGTTTACATTAAAATCATTTAAGAGGTTAGTATGCAATATATTTATGATAAAGATAGCGTTCTCAGTGAAACAATATTTCCTGAAACCCCCGGCTTTGGGGTACAGATTCCTGTTAATGGTATTGAGATTAAAGAAGCTTTACCTGTAAAAACAGGTTATGTCTGGCTATATAAAAATGGTGAGATAACCCAAGTCAAAGATAATCGAGGGACATATTACCTCAAGGAAACGGGGGAAGCTTTTGAGTTTAATGAGTATAGTGACGTTCCAGATACGTTGACCAAAAAAGCCCCCACCACTTCTTATGACAAATGGGACGGTAAGAAATGGTTCAAGGATGAAGATGCAGAAAAGCAAGCATTAAAACTTCAAGCAGTAGCGCAACGTGATAATTATCTTGCTATAGCTAGCGAAAAAATAGCTCCTTTACAAGATGCTGTCGATATTGACGAAGCAACTGATGAAGAAATTAATTTATTAAGGAATTGGAAAAAGTATCGAGTATTACTTAACCGTATTGAAAAGCAAGAAGAGTTTCCATTGATTATAATTTGGCCTGAGATGCCTGCGTAAAGGGTATCGTCTTTATTTCGTTTGTCTTTTTTGTATAAATGATAGTATTATCTGGGATGTCTTTATTTACAAAAGACATTGCCCCAACAATTACATTGTTTCCTATGGATAAGTTTTGTCCGAAAATAAAACTATGTCCCATAATGCTAACATTATCCCCAATGGTGATACTGCCCTCTTTTGAATAGTCTGCAAATCCAATAGTAGTATTTTGATAAATTGAAAAATTAATACCTATTTTTTCGACTCTGCTAGTAATAACAATTCCTGTTAAATGATGTAGGGTAAAACCAAGCCCTACTTCTAGACAAACAGGTATTTCAATATTGAAATTTTTGTTTAATCTATGAGATAGCTTTTCGGCAGCCCTCACTTGTTTCTTTGTACCGTTGTGGTAGGCGAAATTTAGTAGCCGCCAGTAAAAAATGAAGTTATGTGGCCTTTTCCATGCTTGAGATATAGCTTCTTTCCATGAAAAATCTTTATGTAAAAATTCTATTTCCCATATTTTTTTTAGATTTCCCAGATCGTGGGTGAATAAAAATATAATAATATGAAAGTAATGTTTCATTTTGTTCTCACCATAACTTTTATGAATAGTAACCTAATTACAACGGAATAAAAAGCCCTATCTAGTAGGGCTAGTTTAGATTTACTTGAATTAACTTAATGATCTTGAGCTGGTATAACCACTTATAATATGATCGTGCAGCTTTGTACCAAAATCAGATTGCAACATTCTGCTAACTTCCAGTAGGTTATATTCCTTGTAGTATTTATAAATCCACTCCATGCTATTAATTAAGCAAGATAGATTGGTTTTATTTACGGCTACTTGTCTACTAGTCGCTATTTCTTTAGGGATATACTCACCCTCTAACGCTACCCTATGAACATACTCTACAGCTTGAGATAATTGATCTTGTGGTAAATCTTCGATAGAGGCAACATTAAAGCGCTGATGAATGATAGAGTAAGCCTCTGAGTAGGTAATAGCCTTTTTGCTTACCAGTAGATTAACAGCATCCCTTAATGGTGTTCTTTGATCTACTGTGGTTTTAGTTTCCTTTTTAACTTCGCCAGTAGTCCAATACTCGAACAATACATCAAAGCATTCAAGCTGGTACTGTTCTAGTTTTTCTCTTAGTTCTGGCTTAACTCGATTAGTGTCTATACCGAATAACCAACCGTTGATCATTGATAAAGGTAAACAAGTAATTTCTCTACTTTTACCGTCTTGAGCAAACGAGGTTATCATAACCGCAGTTGAATTTAATATCTTATGACGTTTAATTCTTTGTCTTTGCGCGTGCCAATCTAAACCTATATTTTCACAAATAGGGCGCATAGCTACGTAGGGTTTATTATCTTTAGTTAGAATTGCTAATTGCTGATTGTGAAAAGATACAGTTTGAATTTGATTAGACATATTAGTGTCTCCGTGTAATTGAAAGAGATCACCACATAATGCTGCTAAACACTAGGGTGGTGACTGTACACAGGTTAGCAGACTGGCTTTACACGGTAATACCAGCACATCATAAGATGTCCCATGCACAGCCACCATAAAATTTAGGCAATAAAAAACACCTATCTATGATGGTGCTATGCACCGTGTAATAATTTCAGCCTGCTAAAGCTGACCACATGATTTAATGTAGCGATCATATATTTACCTATTGAGTTTCGTTTGTCAAGTTCCTACAATGTGCGTAGCATTATTAAGGGTTTTGAAATGGGAAATAAAGATTTATCGTTAAGATTTGAAAGTATTAAGCCACTAAAAAGCGAAGATGCTTTTGTGCCTAAATCACAAAATACGCTGTATATAGTATTTCCAAAAAGCACTTCCAAAAACTTTGAACTAGTTTTAACAATGCTTAGTGATACCCGTATTGATGGAAAAATAAATTTAGACAATAAGTCTCTGATTGTTTCATCCTTTAATATTAATGATACCTATCAAGCTAATTTAGCAAATACTGTTATATCTTTTGTTTCTGGCTGGAAGGGTTCATTTTATATTTATAATGGAAGAAAAATAGAGCACCCTTACCAAATAACTAGGGTATTAGATTGTATAGCGCAGGCGAATAACTGTACAAATCATCTAGCTCATTGCATGGGTAACAGGTTTCCAGAAAGATATATTCTACCATGTAGACAATTGAACGCTTATTCCTTTCATTTTAATAAATTAATACCAGCGACTCTAGAAGAACAGTTACAAGCTTGTTCTGTCGAACATGGCGTAGATTGGTGTCCATATTTTGATATAAAGAATTTTAAAAAAATATGAATGAAGTAGAAATATTAGGCAGTATTGCAGATAGTCAAATATCAATACCGTTAGCCTTAGAAAGTGTCAGGGCTGGTTATCCAGTCGAAACCAATGCATACCTTGAAAGTATAAAGTTAACGGACTATGTAACCACCAATCCAGCCGCAACCTTTTATGCACGTAGTTCTGTAACTGTTGAGAGTATAGGTCTTAGTAAAAATGATATACTCATCATAGATAGATCAATAGAGCCTGAACACAATCATATTGTGGTAGCTATTTACCAGGGCGAACATGTTATTCGTCGAGTACATAGTAGAGACAATGTTCTATATCTAGTATCGCCTGATGAAACAGTAAATCCTGTGAGATTGGTTGATCCGCTTGAGCAAATATTCGGTGTAGTAGCTTACAATGTCCATTCGCTTAAAAGAACGCAATAAAAAGCCCTGCATGTGCAAGGCAAAGCGTTAAACAATAAAGATGATGCCGTAGCTCGTTTTCCATAACAATCAGGCGCTAAGGCCAAACTACGACATCCATAAAATTAAAGTATATAGACTAAAGTTTAATATGCAATCTAAAAATGCTCTGTAATTATCAGGATGTGATCAATTCAACTTTTTAGAAAACCTATATAAAAAAATAGTTTACGGGCAAAAAATATTGAGTATAAAGTATACAACTTTTTATTCTCAATAATGTTTAAACATAGCTACCTAAACACCTTAAAATCAAAGTCGATACTATCTGCCCATTCTTGCATCATTACACGCCGTTGATCTAAATAGGAAGCATGGTTATATGTCCCTCTGATCTTGTCAGTATCACCATGAGCTAGTTGTTTTTCTATCCAGTCGTGGTTATAACCTCTGCTATTTAATTCAGTTGATAGTAAATGCCTGAAGCCGTGACCAGTCTGCTTATCTCTGTAGCCTGCCATTTTTAGACATTTATTGATAGTCATATCACTAAAAGGTTTTTTTAAATCCCTACCAATAAATACATACTCATAATGAAATGATACAGGCTTTATTTCTTCTAATATTTTTAAAGCCTGATTAGGCAATGGCACTGTATGAGGTTTTCTAGTTTTAGTAAGATCGGCAGGTATAGTTATGCTTTTATTATCTGAGTCAATATAACCCCATTTACACATGCGAAGCTCCCCTGGTCTTAATCCTGTTAAAGTAAGAAGATAGATAGCAGCTTTAGAAAGAGCAGAGCATGGTGTTTGTTTTACATGTTCTAGCAGTTCTTTAAGGTTGTCAAAATTAACGCTTGGCATGTGCTTTGTTTTTGGTGCCTGAATTGCTACAACATCAAGATCAGTAGCAGGGTTTACATCAACAACACCTTTAGCTAAAGCAAATCTAAATATTTGATTAAGCCAAAGTCTCGTTTTCTTTGCTGGTTCGAACGCTTTTCGTTCTTCGAACTTTCTAACCAAAGAAACTAACTCAATCCTTTTTATTCCTTCGATTTCTCTATTCTTAAAGAAAGGTAATATATCCTTATCAAGATATAGCCGTATTTTATCCTTTGTTGATTCAGCCCACCGAGCAGAGTTAATTTCATACCATTCATTTGCTATTGATTCAAAGCTATTACTGACTGATCTTTCTTTTTCTATCTTTCTATTAAGTACGGGATCAATTCCTTTTTTTACTTGTAGCTTAACCTCTTGTTTAAGCTCTCTAGCATAAGCAAGTGATATAGTAGGGTAGTCACCTAGCGCTATTCGTTTTTCTTTACTATTATATATATATTTAACTCGCCATAACTTTGACCCATTGGGGAATATTTCAATATACAAACCTTCGCCATCAGATAATTTATAAGGCTTGTCTTTTGGTTTTGATTTGTTTATTTTAGTATCTGTTAGAGGGGCTACTTTTTTTGGCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP029478|1019933:1028897|1019933_1020395_-|AWM79683.1|DBSCAN-SWA MAKGVNKVILVGNIGNEPEMRYMPNGNAVATVSLATSDTWKDKNTGEPQGRTEWHRVVFFGKIAEIVGQYVHKGSKLYVEGRLVTRKWTDQQGIERYTTEIVVDMGGTMQLLDSRQDQPQQQANQQQSPQNRPQQNQQAAPPTFEDFDDSVPF >CP029478|1019933:1028897|1025371_1026139_-|AWM79691.1|DBSCAN-SWA MSNQIQTVSFHNQQLAILTKDNKPYVAMRPICENIGLDWHAQRQRIKRHKILNSTAVMITSFAQDGKSREITCLPLSMINGWLFGIDTNRVKPELREKLEQYQLECFDVLFEYWTTGEVKKETKTTVDQRTPLRDAVNLLVSKKAITYSEAYSIIHQRFNVASIEDLPQDQLSQAVEYVHRVALEGEYIPKEIATSRQVAVNKTNLSCLINSMEWIYKYYKEYNLLEVSRMLQSDFGTKLHDHIISGYTSSRSLS >CP029478|1019933:1028897|1021220_1022024_-|AWM79685.1|DBSCAN-SWA MKTGIYKNLSNQDYRQSDGISKSQLDLIRKSPALFLWSVNAPYDEDKKEALDIGTAFHSLILEPDNFKNEFVVMPDDINRRTKEGKQAYEEFLNTSKEKIVLSAEDNKKLLLMRESLFSHPHAKWLIEAEGDPEISIFWNEETTGELAKCRPDKLISEHSCIVDLKTTGDIERIEKSFFNYRYHVQDAWYTKGYETAYNDKLSSFIFLVVSTKLNCGRYPVRLFELAQEVKEIGRTEYLEDIATYHECRASNDWAAIETIKLPYYME >CP029478|1019933:1028897|1022064_1022694_-|AWM79686.1|DBSCAN-SWA MIVRFTINWLIVIIAATISFLDDFGYTYHAHTCDDANEIIHSLLDEVTDEEIMFIHAKYIMDKPFEYKENEKLAAEIKERKKEVNALNNQRKRLVSRNANAVKQISRINRKYLNALDKKDKADREIVRLYDEIRGIKERVISFVEVPIIATDRKISASRLLELLSKEEKLKRLEIGGVDNWDFYDVSIFGVNDELPEIKEVALQNLLEI >CP029478|1019933:1028897|1023432_1024158_+|AWM79688.1|DBSCAN-SWA MPNTDNNIGFILRRIDNTVYKVKIQASGTDKIKYNVSINANGYSFFHLFGAGDYWRVVSDGLGNWFDIERKDNNPIGGVEFIISTLVPVGGYVVANGTLLNRTDYPYLWDYAQKSGALVAESEITEHEGCFTSGDGSTTFRLPDLRGKFLRALDNGLGVDANRTAGSYQQDAIQNITGTITNGASVDGSSGVFTNSGAGRTGTQGTAGGGRLITFDASTVVRTADEVRPKNIAYPVYIKII >CP029478|1019933:1028897|1027005_1027434_+|AWM79693.1|DBSCAN-SWA MNEVEILGSIADSQISIPLALESVRAGYPVETNAYLESIKLTDYVTTNPAATFYARSSVTVESIGLSKNDILIIDRSIEPEHNHIVVAIYQGEHVIRRVHSRDNVLYLVSPDETVNPVRLVDPLEQIFGVVAYNVHSLKRTQ >CP029478|1019933:1028897|1027706_1028897_-|AWM79694.1|integrase|DBSCAN-SWA MPKKVAPLTDTKINKSKPKDKPYKLSDGEGLYIEIFPNGSKLWRVKYIYNSKEKRIALGDYPTISLAYARELKQEVKLQVKKGIDPVLNRKIEKERSVSNSFESIANEWYEINSARWAESTKDKIRLYLDKDILPFFKNREIEGIKRIELVSLVRKFEERKAFEPAKKTRLWLNQIFRFALAKGVVDVNPATDLDVVAIQAPKTKHMPSVNFDNLKELLEHVKQTPCSALSKAAIYLLTLTGLRPGELRMCKWGYIDSDNKSITIPADLTKTRKPHTVPLPNQALKILEEIKPVSFHYEYVFIGRDLKKPFSDMTINKCLKMAGYRDKQTGHGFRHLLSTELNSRGYNHDWIEKQLAHGDTDKIRGTYNHASYLDQRRVMMQEWADSIDFDFKVFR >CP029478|1019933:1028897|1022907_1023138_+|AWM79687.1|DBSCAN-SWA MNKLSERSLKILSTVNTDLQKVVNRAIEISEVDFGVIQGNRTQQQQDELYAQGRIKPGQKVTWTRNSRHIQHHCVE >CP029478|1019933:1028897|1026445_1027009_+|AWM79692.1|DBSCAN-SWA MGNKDLSLRFESIKPLKSEDAFVPKSQNTLYIVFPKSTSKNFELVLTMLSDTRIDGKINLDNKSLIVSSFNINDTYQANLANTVISFVSGWKGSFYIYNGRKIEHPYQITRVLDCIAQANNCTNHLAHCMGNRFPERYILPCRQLNAYSFHFNKLIPATLEEQLQACSVEHGVDWCPYFDIKNFKKI >CP029478|1019933:1028897|1024167_1024710_+|AWM79689.1|tail|DBSCAN-SWA MQYIYDKDSVLSETIFPETPGFGVQIPVNGIEIKEALPVKTGYVWLYKNGEITQVKDNRGTYYLKETGEAFEFNEYSDVPDTLTKKAPTTSYDKWDGKKWFKDEDAEKQALKLQAVAQRDNYLAIASEKIAPLQDAVDIDEATDEEINLLRNWKKYRVLLNRIEKQEEFPLIIIWPEMPA >CP029478|1019933:1028897|1024681_1025281_-|AWM79690.1|DBSCAN-SWA MKHYFHIIIFLFTHDLGNLKKIWEIEFLHKDFSWKEAISQAWKRPHNFIFYWRLLNFAYHNGTKKQVRAAEKLSHRLNKNFNIEIPVCLEVGLGFTLHHLTGIVITSRVEKIGINFSIYQNTTIGFADYSKEGSITIGDNVSIMGHSFIFGQNLSIGNNVIVGAMSFVNKDIPDNTIIYTKKTNEIKTIPFTQASQAKL >CP029478|1019933:1028897|1020387_1021215_-|AWM79684.1|DBSCAN-SWA MSQQESIAMNPLEKKEQKSDKPKTLKDLLAQANVQSQIAKAVPKHITPDRLARVAMTELNRVPALRECDPASFIGAVLQCAQLGLEPSLGLGQAYLLPFKNKNKGITECQFIIGYRGMIDLARRSGQMVSLSAYAVYEYDEFDYELGLHPNLTHKPSQEADRGKLTFVYAVANLKDGGVQFEVMSRAQIDAIRAQSKAGKTDYSPWATHYEEMAKKTVIRRLFKYLPVSVEMSKAVGYDELAEAGVSQQNESILDDVDYNVLENVDTETGEVVNG |
12 | Salmonella_phage(22.22%) | tail,integrase | attL 1022902:1022920|attR 1032644:1032662 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_3 |
1033536 : 1041704
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP029478|1033536:1041704|DBSCAN-SWA TATGACCGACAACAAACTAGCTAATAAAGTTGTCAATCGTCTAGGGCAGTTAAAAGCAGCTAGAAAACCCCATGAAAAAGTATGGAAAGAATGCTTTGATTACTCTTTTTCTGTTCGTGGGGTGGGAATTGATGACACCTTTTCGACTACTGACGATATACAACGCAAAAAATCACGGCTATTTGATTCTACTTTAACCAATGCCGCCAAAACACAAGCCAGCGCTATTATCAGTGGTTTAACCCCAGCTAATGCGTTATGGTTTGGTTTAACGGTTAATGAAGCAAACGAAGAAGAAGCAAGATGGCTCGATCAATCAGCTAACACAATATGGCGTAATATTCACAATGCTAACTTTGATTCAGCCGCTTATGAGGGCATGCTTGATCTGATGGCGGCTGGTTTGTTTGCTTTATACATCGACCAAGATCAAAAAGAGGGCAGCTTTAATTTTCAACTATGGCCCTTGGCTACTGTGTATTGTGTTAGCACTCGTGCCGATGGTGTGATTGATATTGTTTATCGTTGTTATGAACTAACAGCAGAGCAAGTTGTGAACACCTTTGAAGAAGCCAGCGAAAAGATAAAAAAGCAAGCTGAACGCGAACCCAATGCTAAATTAAAGCTAATCCATGCTATCTATCCTCGCAATGATGGCAAGGTTGGAGAAAAGGCCGACAAGATTCCTATTGCTTCGGTGCATGTATTAGAAAATGATAAAGAACTCTTAAGAGAATCAGGCTATAACGAAATGCCCGTTGTAGTGCCGCGCTGGATGCTGATTCCTCAATCCGTTTACGCTATTAGCCCTGTATCCGATGCATTGCCAGATGTAAAAACACTCAACGAAATTAAGAAGCTAGAACTAGCGAATGCTGATTTAGCCATTAGCGGCATGTGGATTGCCGAAGATGACGGCGTTTTAAACCCTCGCACTATTACCGTAGGGGCTAGAAAGATCATTGTTGCTAACTCAGTGGACAGCATGAAACCGCTACAAAGTGGCGCTAATTTCAACGTATCTTTTACCCAGTGCGAACAACTGCAGGCGGCTATTCGTAAAATCATGCTGGCAGATCAGCTACAGCCTAAAGATAGCCCAGCCATGACAGCGACCGAAGTTAATATGCGTCAGCAGTTAATCAGACAGCTATTAGGTCCTATCTATGGACGCATGCAATCTGAATACTCACAACCCTTAATTGATCGTTGTTTTGGTATCGCTTTTCGTGCTGGCATCTTAGGCGACCCACCCGAAACCTTACCTGATAAATTTATTGGTATTAAATACGTCAGCCCATTAGCCAGAGCGCAGAAGTTTGAAGAAGTCACTGCAATACAAAACTTTGTTGCTATGACCATGCAAAGCGCACAAGTAAATCAAGAGGTATTAGACAATATCGACTTTGATAAAGCCGCACGCTTTACAGGTGAAGCCTTAGGGGTGCCTTCTGAGATTATCAGGCCAGAGCAAGACGTTACTGAACTGAGACAATCCAGAGCCGAAGCACAACAAAAAGCGCAAGCTAATGCAATGGCTAATCAAGCACTACAAACAGGGACAGATGAATTTGCTAAAGCAGGCGGTCAAGGCATGGCACAACAGGCGGTAGAAAATGGCTAAAAAAGAAATCAATGAATTTGACTATAAGCGCTTATTTGAAGAAACCGCAAGTGGTCAAGAAGTGTTAGAGGAATTGATAGCACGCTTCTCGATGCCGCCCTCATTCGATGAGCATAACGCCACACTTAAAACCTACTACCGCGCAGGGCAACGCAGCGTTGTAGATTTTATTCTTTCACGTATTAATCGAGCTAATGGAGTAAATGAAGATGTTTAAAAGAAAATATATGTTAATGATGTTGGGTGCTGGTTGTTATCGTAACGAAATGCCAGATGATGGTGGCGAGGGTGCTGCTGGTTCAAGCAGTGAACCTAGTTCTATTTTAGCAGGGGCAGGTAGTCAGCAAGAACCAACACCACCAGATAGTACACCGCCTGCTGTGCCAGAGCCGAATCAGGATAATACTTATGATTGGCTACCTGAAAAATTCAGAGTCCAAACCAGTGATGGACTAGAAATAGACCCGATAGAATCCGCTAAAAAAATGGCGGCCTCTTACGATGGCCTATCTAAGCGACTCGGTACAGGTGATATTCCACCTAAAATGGAGTGTGCCCGAAGCTGGATCACGCTTAGTCACGATGGCAGATTATGGGTTACATGTACCGATTGAACCACGTGATTTGCCAAAGTTATTAGCTGAGCCACAAGGGGCGTATATGTCGAACTTAGTAGCGGCAAATAATCGCTTAAAAGATAAAGTGATTTATCGCGGCTTGCTCGACAGTATTCAGCGTAAAACGGAAAACTTAAGGGCGTATTCTTCGGTTTCTTTGCCTGCTAACCAAAAGATTCTCGCGGGCGGTACAGGGATTACAAAGGCAAAAATCATTAAAGCCAAAGCCCTTTTTCGTAAAAACGAGTGTGACGAAAAAATGGGCGAAAAACTATTTCTTGCTTACAACGCGGAAATGTTAGAAACCATTCTAAATGACACCACTTTAACCAGTGCGGACTTCTTAAAAGTTGAAATGCTACAAGATGGTGCGATTGCGACTAACTGGCTTGGCTTTACCTGGGTACCTTATGAAGCATTAGACATAACAGGTACCACGGCAACTACTGTGGCGTGGTGTTTTAGTGCTGCTCACTTTGGTACAGGCTACGACTACGAGGTTGATATTGGTGTTCGCCGTGATAAAAACAACGCCATTCAAATCTCTGTTAAATCGTCTTATGGTGCAGGTCGTGCGAATGAGAAGAAAGTGGTTACTGTAGAGTTTGAAGTGTAATTGTTCTACTTGGGGCGCTTGCGCCCCTGTCTAAGAGGTTATTATGTCAACTTCAAACTCACCTGTTTCGATTTGTTCTAATGCGCTCCTAAAATTAGGGGCGCAATCTATTAGTGACTTTACCGAAAACACCGATAGAGCAAAGCTAATGGCTAACATTTACGCCAGTATTCGGGATGATCTGTTAAGGGAACATGTTTGGAAGTTTGCTATTAAGCGAATGTTATTAGCGCCTGATGCAGATAGGCCAGCGTTTGGCTATACCCATGCTTATACGTTGCCAGCTGATTTTTTAAAAGCTATTACTATTAACGAACACTATTACCCTGATTACACCATCGAAAACGGCAAGATACTTACCAATGCTAACAGAGTTCAGCTTCGCTATGTCTATCAAAACGAAGATGTCACCACTTACGATGCTACCTTTATCAAGTTATTAACGTTAGCCATTAAAGCCGACATAGCCTATTCAGTCACTCAATCAACTAGTTTAGCTGAAGCGGCCAAGCAAGAGTTCATTTATGAATTACGTAAAGCTAAAGCGATTGATGGTCAACAAGTACTCCCTGAAACATTAGGCGTTTCAACATTACTAGAGGATAGACTACGTGGCTAAAGTTTCCTATATTCAAACCAACTTCACGGCAGGCGAATTATCCCCTCGTATGTTGGGGCGTGTTGATGTGTCTCGCTATCAAAATGGTGTTAAACGGTTAGAGAATGCAGTAATTGCCGTACAAGGTGGCGTTATGCGTACGTGGGGTACGGAATTTATTGCCGAAGTGAAAGACAGCGATAAACAAACCCGTTTAATTCCTTATGTATTCAACCGTGAGCAAGCCTATATTGTTGAGTTCGGGCATAAGTATTGCGCTATTTTTAAAGACGGAGACCTTACTGCAGAAATCGAAAGCCCCTACACCGAAGCCATGCTATTTAATATCAACTATGTGCAGGGCGCTGATACGATGTTTTTAGCACATTCCGATATACCGATTCACCGTTTACGCCGTGTTTCTGATAGTGAATGGACATTAGCCGAAGCGCCTTTTATTGTTAAACCTTACGACGAAATGGGCGAGTACCCCGATGTTGAATTAACTTTAAGCACTACACTAAAAGGCGAAGCTACCGCCACTTTAACCAATACAACAAATTTTAGCTGGTTAGCGGCTGATTTAGGGCGCACCCTGTCTTGTGGTACTGGTATTGCAGAGATTACAGCAATCACTAATGCTAGCGTAGTGAAAGTTAATATTATTACGCATTTTAAAGAGAATAAATTAGCGGCTAAAACTTGGCATTTAGAGGGTACCCCATTAACTACCATTAAGCCCACCAATGGTACCGAGGGGCAAACACCCGAAAAAGAAATAATGATAGGTGATACCGTTACTTTAACTTTAGGCGTAGCAGGGTTTAGAGCGTCCGATAAAGGCAAGTACATTAAATTCAATAAAGGATTATACGAAATTACGACCATCAACAGTGCTACAGTCGCTAAAAGTGAATGTAAAACTGCCCCTAGGTCCAAGGCTTCGGCGGTGTCTTGGGGTTGGTCGTTAATGTCGAGTGTATGGAGTGATCAATTTGGTTATCCTTGCGCTGTTACATTACACAACCAACGGTTATTTTGTGGCGGTACCAAAGAAAGACCTCAAACGATTTGGATGAGTCGAACCGCTGAGTATTTAAACTTTCAGTTATCAACCGAAGATGACGACGCGGCAGCCTTTACGATGTCGTCTGACCAGATCAATCCGATTGTTCATTTGACCCAAACAGAAACGCCGATTGTTTTAACCTATGGCGGCGAGTTTTCATTAAGTGGATCAGCCACCAAAGCGGCTATCACGCCTACCAATATCGACATTAAAAATAACTCCTCTTACGGTTGTAATGGGGTTAAGCCTGCCAGAGTAGGGAATGAACTATTTTACTTACAGCGCGCCTCTAAAAAACTCTATGCAATGGGGTTTAATGCAGCAGCCGATACCTTTGTATCGCAAGATGTAACGACGCTTTCAGAGCATATCACCCAAACAGGCATTGTTGATATGGCTTATCAGCAAGAACCCGACTCAATTCTATGGTTAGTCCGTAAAGATGGGCAATTAGCGACCTTAACCATAAACACCGACCAGGAGGTTATTGGTTGGTCGCGTCAATTAACGACAGGCGCTTATGAGTCGGTCGCTACAATACCGAGTGTTGATGGTTCTATTGATGAAGTCTGGACGATTGTAAGACGAGAAATAAACGGTCAATTCGTGCGCTATATCGAACGCTTTAAAGAGGGAGTTTATAGCCACTGCTCAGCCCTGTTTCAATTTGATGAGGGTACTAATACGTTAACAGGTTTAACCCATTTAGAGGGCTGCACAGTTGATGTAGTCGCTGACGATGTGGTTATGCAACAACGTACAGTAAAAAACGGAACGATTACACTCGAAAGAAAAGCCAAGCAAATTATCGTGGGCTTGCCTTATACCACCGAAATAGAACTATTACCGATTGAAATACAGGGCGGTTTAGGATCCTTGCAAGGTTCACCGAATCGCAGTGGCGAGTTAGTTTTAAGGGTACTCAATACATCAGGTTGTAAGATCAATGATGAAGTCGTTACCTCTAGGGAATTAGGTAAAGGAGTCCTAGACGAGCCGCCTATCAAGTTCACAGGAGATAAAGCCGTATATCGGCAAGGCTGGGATAGACCTATTGTGATTCAACAACAGCAACCTATGCCATTTCAATTATTAGCAGCTATTAGCAAAATCACGGTGAATAGCAATGGTTAAGATTAGACAGGCTTCAACAGTTAAAGATATTCAACAAATCATTATCTTGTGTAAAGCATTGCACAATGAAAGCGATTATTACCGATCACAACCATTCGATAAAGAGCAGTTAGAAGAAAGTTTAAGCAACGTAGTATTTAGTGAACATGGCCTAGCGTTGTTGGCGATAGATCACAATGAAATTGTGGGTTTCTTTATTGGCGGACTGACTTACGGATTATTCAATAAAGAGTTAATTGCTTTTGATTATTTGGTGTATGTGGCACCTACAAAACGCAATGCCAGAATTGCTATGCAGCTTATCAAAGCTTTTGAAAAGTGGGCTATTGATAAAGGCGCTAATCGTTTTAATGGCAAATATTAGAAGGCGCGGTAAAAATTGGAAAGTACAAATATTTAAAACTATAAATAATAACGGAGTTAGAGAATCTAAAACTAATAGGGCTTGTTTAGTTTAGATTATTGATCTGGCATTTACTCTATTCATGCTAGTCAACCTCTAATAATAAATTTAAATTACATGTCATCATAAAAAGTAGTTGCCCCCATTTTTATTAATTTATTTTGCTATTAAAATATCAAATCGATTTATAAAGTGATAGTCCTCCTATCTCCCGAAAGTAAATTAACCCCCTTAAAAAGATATTGTATACGATAATCTTTATCCATTAGCCACTCAAGATTAAGCAGATTAAGTTCTAAAGTCTTTACCATCGTCAGTCCATTTTTGGCTATAACATTGTTTACTTCACCTAGGCTCATACCTATTGAAATATATTTTTTGATGATGTCATCCACATTAACGATTAAAAGATTTTCTCTACGCCGTGGATAGCCATGATCATAGACATCTTTCATATCGGTGAAGAAAAAGATTGGCACTAAAAACGATGGGTAATGGCTTTATTATAGACACTAAACCCGATTATATAGATGAAGAAAAAAGGCGTTTTAAAAACGCCTTTTTATACATATAAATGCTTATTAGTGTTCGCCACAACCGCAACCATGATTACCACAACAGTCATCATCATCTTCAGTTATTGCCGCACCTTCTTCCATCGCTTCCATTTCAAGTTGTAGGCTAACTAAGTTAGTGGCTAAGGGGCGTAATACAAGGTTGGTGAACTCTTGGTCATCTTCGGCGACATCCGTACCAATAAATAATTGACCACCAATGTTTTGCACCCAAAGCTCTTTTCCTTCTAACATAATAGCAAAACGGCTACAGTTAGTTTGTTGAGTTTTGCCTTCAGCGTCTTCGAGTAATAAAGTAATAGTTTCGTTCATAATAGTCTCTTTAATTGTTTAGAGAAGGTGTTTAATTGCTTGTTCGAAGCGGTTTATACCTTCTTGTATATCGGTTTCTTCAATAATTAAGCTTGGTGCAAGGCGTATGACTTCAGGCCCTGCTTGTAATATCATCAGGCCATGTTGTGCGGCCGCTTTTATGATTTCTGAAGTACGAGTTTTCCATTGAGGGGTTAATACACAACCAATGAGTAACCCTTTGCCACGAATTTGTGAGAAAAGATCATAAGGTTTACCCATACGCTCTAATGCTTGTACAAATAGTTGGCGACGTTTTTCGACACCCTCTAGTACTGTAGGTGTATTAACAATGTCCATTACTTTATTAGCAACGGCGCAGGCCAATGGATTACCACCATAGGTTGTACCATGTGTTCCTGTTGAGAAATGCTTGGCAATGTGTTCTTTAGTTAGCATTGCACCGATAGGAAAACCACCGCCTAAGCATTTTGCATTACTCAAAATGTCAGGGATAACATTGTAGTGCATATAGGCAAAGAGTTTACCCGTACGCCCTAAGCCTGTTTGTACTTCGTCGAAAATGAGAAGTGCGTTGTATTTATCACATAGTGCACGTACACCTTCAAGATAAGCTTGTTCGGCAGGTAAAACACCACTTTCGCCCTGGATAGGTTCAAGGATGACGGCACAAGTCTTTTCAGAAATAGCGGCTTCCATTGCTGCTAAGTCGTTATAAGGAACATGGGAAATTCCTTCGATTTTAGGGCCAAATCCCTTGGAGTATTTTTCTTGTCCACCAGTGCTTACAGTAAAGTAGGTACGACCATGGAAACTATTAAGGGTCGAGATAATTTCAAATTTTTCTTCACCAAAATTATCGTAAGCGTAACGACGTGCTAGTTTAAGTGCTGCTTCGTTTGCTTCTGCACCCGAGTTACAGAAAAATGCACGATCTGCAAATGTAGCATCGGTGAGCTTTTTAGCCAGTTCAAGGGCAGGTTCATTAGTGAATAGATTGGAAACATGCCATAGCTTATTAGCTTGAGTATTTAATGCTTCTACTAGTGCAGGGTGTGCATGCCCTAATACATTAACTGCAATACCACCGGTGAAGTCAATGTACTCTCGACCCTCTTGGTCCCATACTTTTGAACCTTGTCCGCGTACTGGTATAAAGTTAGCGGGGGCATAAACAGGTACAATATAGTGGTCATAATCACTACGTGTTATGGTAGACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP029478|1033536:1041704|1033536_1035159_+|AWM79701.1|tail|DBSCAN-SWA MTDNKLANKVVNRLGQLKAARKPHEKVWKECFDYSFSVRGVGIDDTFSTTDDIQRKKSRLFDSTLTNAAKTQASAIISGLTPANALWFGLTVNEANEEEARWLDQSANTIWRNIHNANFDSAAYEGMLDLMAAGLFALYIDQDQKEGSFNFQLWPLATVYCVSTRADGVIDIVYRCYELTAEQVVNTFEEASEKIKKQAEREPNAKLKLIHAIYPRNDGKVGEKADKIPIASVHVLENDKELLRESGYNEMPVVVPRWMLIPQSVYAISPVSDALPDVKTLNEIKKLELANADLAISGMWIAEDDGVLNPRTITVGARKIIVANSVDSMKPLQSGANFNVSFTQCEQLQAAIRKIMLADQLQPKDSPAMTATEVNMRQQLIRQLLGPIYGRMQSEYSQPLIDRCFGIAFRAGILGDPPETLPDKFIGIKYVSPLARAQKFEEVTAIQNFVAMTMQSAQVNQEVLDNIDFDKAARFTGEALGVPSEIIRPEQDVTELRQSRAEAQQKAQANAMANQALQTGTDEFAKAGGQGMAQQAVENG >CP029478|1033536:1041704|1039185_1039557_+|AWM79707.1|DBSCAN-SWA MVKIRQASTVKDIQQIIILCKALHNESDYYRSQPFDKEQLEESLSNVVFSEHGLALLAIDHNEIVGFFIGGLTYGLFNKELIAFDYLVYVAPTKRNARIAMQLIKAFEKWAIDKGANRFNGKY >CP029478|1033536:1041704|1039781_1040051_-|AWM79708.1|DBSCAN-SWA MKDVYDHGYPRRRENLLIVNVDDIIKKYISIGMSLGEVNNVIAKNGLTMVKTLELNLLNLEWLMDKDYRIQYLFKGVNLLSGDRRTITL >CP029478|1033536:1041704|1040501_1041704_-|AWM79709.1|DBSCAN-SWA MSTITRSDYDHYIVPVYAPANFIPVRGQGSKVWDQEGREYIDFTGGIAVNVLGHAHPALVEALNTQANKLWHVSNLFTNEPALELAKKLTDATFADRAFFCNSGAEANEAALKLARRYAYDNFGEEKFEIISTLNSFHGRTYFTVSTGGQEKYSKGFGPKIEGISHVPYNDLAAMEAAISEKTCAVILEPIQGESGVLPAEQAYLEGVRALCDKYNALLIFDEVQTGLGRTGKLFAYMHYNVIPDILSNAKCLGGGFPIGAMLTKEHIAKHFSTGTHGTTYGGNPLACAVANKVMDIVNTPTVLEGVEKRRQLFVQALERMGKPYDLFSQIRGKGLLIGCVLTPQWKTRTSEIIKAAAQHGLMILQAGPEVIRLAPSLIIEETDIQEGINRFEQAIKHLL >CP029478|1033536:1041704|1037003_1039193_+|AWM79706.1|DBSCAN-SWA MAKVSYIQTNFTAGELSPRMLGRVDVSRYQNGVKRLENAVIAVQGGVMRTWGTEFIAEVKDSDKQTRLIPYVFNREQAYIVEFGHKYCAIFKDGDLTAEIESPYTEAMLFNINYVQGADTMFLAHSDIPIHRLRRVSDSEWTLAEAPFIVKPYDEMGEYPDVELTLSTTLKGEATATLTNTTNFSWLAADLGRTLSCGTGIAEITAITNASVVKVNIITHFKENKLAAKTWHLEGTPLTTIKPTNGTEGQTPEKEIMIGDTVTLTLGVAGFRASDKGKYIKFNKGLYEITTINSATVAKSECKTAPRSKASAVSWGWSLMSSVWSDQFGYPCAVTLHNQRLFCGGTKERPQTIWMSRTAEYLNFQLSTEDDDAAAFTMSSDQINPIVHLTQTETPIVLTYGGEFSLSGSATKAAITPTNIDIKNNSSYGCNGVKPARVGNELFYLQRASKKLYAMGFNAAADTFVSQDVTTLSEHITQTGIVDMAYQQEPDSILWLVRKDGQLATLTINTDQEVIGWSRQLTTGAYESVATIPSVDGSIDEVWTIVRREINGQFVRYIERFKEGVYSHCSALFQFDEGTNTLTGLTHLEGCTVDVVADDVVMQQRTVKNGTITLERKAKQIIVGLPYTTEIELLPIEIQGGLGSLQGSPNRSGELVLRVLNTSGCKINDEVVTSRELGKGVLDEPPIKFTGDKAVYRQGWDRPIVIQQQQPMPFQLLAAISKITVNSNG >CP029478|1033536:1041704|1035151_1035376_+|AWM79702.1|DBSCAN-SWA MAKKEINEFDYKRLFEETASGQEVLEELIARFSMPPSFDEHNATLKTYYRAGQRSVVDFILSRINRANGVNEDV >CP029478|1033536:1041704|1035741_1036392_+|AWM79704.1|DBSCAN-SWA MADYGLHVPIEPRDLPKLLAEPQGAYMSNLVAANNRLKDKVIYRGLLDSIQRKTENLRAYSSVSLPANQKILAGGTGITKAKIIKAKALFRKNECDEKMGEKLFLAYNAEMLETILNDTTLTSADFLKVEMLQDGAIATNWLGFTWVPYEALDITGTTATTVAWCFSAAHFGTGYDYEVDIGVRRDKNNAIQISVKSSYGAGRANEKKVVTVEFEV >CP029478|1033536:1041704|1035368_1035773_+|AWM79703.1|DBSCAN-SWA MFKRKYMLMMLGAGCYRNEMPDDGGEGAAGSSSEPSSILAGAGSQQEPTPPDSTPPAVPEPNQDNTYDWLPEKFRVQTSDGLEIDPIESAKKMAASYDGLSKRLGTGDIPPKMECARSWITLSHDGRLWVTCTD >CP029478|1033536:1041704|1036435_1037011_+|AWM79705.1|DBSCAN-SWA MSTSNSPVSICSNALLKLGAQSISDFTENTDRAKLMANIYASIRDDLLREHVWKFAIKRMLLAPDADRPAFGYTHAYTLPADFLKAITINEHYYPDYTIENGKILTNANRVQLRYVYQNEDVTTYDATFIKLLTLAIKADIAYSVTQSTSLAEAAKQEFIYELRKAKAIDGQQVLPETLGVSTLLEDRLRG |
9 | uncultured_Caudovirales_phage(85.71%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_4 |
1963615 : 1969562
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP029478|1963615:1969562|DBSCAN-SWA TTTATATACCAGACTTCCTTGCCTTACTATCAACTCTTTTAGCTAGTTCATTACGCTGTCTCTGTATTTCCTCTATGAGCGCATTTTTTTCACTTGATGATAAGCTTTTATCTGCACGGATTACCCCGCCCGCCAATAATCCCGCAGCACTGGCTTCTGGAACACCTTCCATTAAAGGGTTATCTTGAGCGTAGTTTTGCCACATTTGTTCCGTAGCTGATTGAGGAAGCTCTTGAAACGCTCCTTCTGAGACAAAACCTTTGGCGACATTACCCAGCGTTTGCCTACTGGATAAACCATTAGGTAACGGATACCCGCCCGCTAAAACCGTTTGAGGATCAAGAACTCCCATTTTTTGAGCGAGCTTACCGCCACCAAAACCGATAAGTCCTGTAGTGATATTGCTTTGATTCATTACTCCACTGCGTTAATTGCTCACGAGTTGGTTTTGGCATAATAGTACGACCAGTTCCAATTGGCTTGCTTCTTGTTATAGACCCGCTCCCACCAAATGCCCCTTGATTCTGCCTTAACAAATCATCTAATGATGCCACTTTCAACCTCCGTTAATGCGGGTTGTATTTCTGTTGAGTAGCTATAAAGTGCTGTTGTATTATTTTTTATTTTGAGTTCGGTTAGCATTTTTTCTAAACCCTTTATTACTTGAGGAGTAACATTACCACCCATTTCAGCAGTAGTATTGTCACCATCAATAATCACGCATAAAAAGAACTCTAAATCTTTGTTATTTAATGCTAACTCTGCATTTTGTGCAGCTTCTAAAGCTAATCCAAAAGCTGTGCCGTGTTTTGTCATATATCACCTCAATTTAATATATAACCAACCTATGTCCCTTTTATATGTTGTCAAGCAGAATAACTACCTAGCATAATAACCATTAACAAATGCTTTATTTTTTTTATAAGTTCTTTTTTTCTCAAATAATGAATATTGAAACGGTTTAATATCATCGTCAGATAACTCTAAAGCACTTCTCCATGAAGCGCCTCTTTGTACTCTTTTTTTACAGTATCCCAAGGCAGATTTTTATCATTCGCCCATTTAAATGCTTCTTTTGAGATACCGCCATATTCAATGATCTCATTTTTAGAACACCAAAAGGACGACATAAACTCACCTCCTCTTTACTTCCCAAACCTTGCTATTAAAATTGAATCAGCCAATGCTTGGCCATGCCCTTTTTTATCAAGTACTCTAATGGATGGATATAGCCTGATCGCCATGCTTCGTGCTTCGTCTTTATCTTTACCTATTAGTCCAGCTTTCTTTTTCCACAATTGGGGTGTGATCAATGTATAGGGGATCATCATTCCTTGAATTATTCCTTCAATAACACCCGCAGCATGTCCAAAGTTAAATGTACTTGCTACACCCTGTTGAGGCATTGAGTGAACCTTTTCTAAATAAGCATGACTTATTTTGTACTGAGATAAAAAAGCCATGACAGCCACGCCGTTAACCCGATTACTTTTACCTGTTTTTAATGTAGGCATGAGCAAGTGATCAATGTAGTTATTATCTTCGTCGAGGATAACAACTGATCCTGTACATCCTGGATCAATACCTAATATCAATTTTTTATCTGTCATTTTGCTTACTCCATTCTTTGCGCATATTTTCAATTAAGTAATCTGCTGCCTTTTGTCCTCGTTTCTTTCTTATTTCTTCCCTGAGCTGTTCTGTTTTAGAGCGTGTTGTGAAGCCCATACCTAACCAGTATCTAGCCTCGCATTCGGCTCTGTATTGTTCGCTTACTTTTGACCATTTCATTAAGCCACCCCTTTAATTGTCATAAGCCCTTGCTCAATCCAGTACATTTGTGTTTCTGCTAATGCGCGTAGTAAGTCACTTGATGGTATTTCTTTTCTGTGCGGCCCATCTAAATAGGTATGGCAGTGTTGACAGGCAAATACAGCCATTTGGTCAGGTGACTTCATACCAACCCACATGGACCATGTTTCTACAGATACGTTTTCAGGTTTAGCTAGCAATGGATTAAATTTTTTATTACTGGACTTGGTTTTTTTTGTATTATTTTTTTTAATATCTGTATCTGTATCTGTATCTGTATCTGTATCTGTATCTGTATCTGTATCTGTATCTGTATCTGTATCTGTATCTGTATCTGTATCTGTATCTGGGGGCGTTACTGTAACGTTACACTCCTGTTTCATCTTTTCTCTATGACGCTTAACACGTTCATTACTAGAGTCTGATACGAATTGTCTTTTATCCCAGTTAGTAGGATTATTGTCATTATCAATGAGATTTTTAGAGACTAAAATCGCTTTAGTTTTTAACCAATCTTCGTTACTGATACGTAACTGAAACGCTATTTGTTCGTCATGTAACGTTACATCGCCGTTACACTTTATGCATAAAAGCATGATATAACGACGCTGATCTGTTTCTGATAACATTTGTACTTTAGGGTCATTTATAAATTCACCGTACATACGAAACCATTGATTAGCCATTATGCAACCTCTCTTAATCTGTTAGCCCATAGCTCACTAATCCAGTTAAAGCCTTTAGGGGTGAATTTCATTTGTGTGTAAGCGTGTTCTGTGTCAGATACGCCTGTCTTAACAACAAAGCGACCAGCATCAATATGTTTTTGATAAGGAGTCATTGTTCTACCTGTGTAGTAAATAATTCCGTTTTCAATTAGGAATAACTTAAGTTTTGGCTCTTTGGCATTTAGTAACTTAGCGACCTGTCTAAAGTTGTAATTGCCTTCTGCTTTTACATAGTTGTCTACAAAGTCAACGGCTGGCTTTGCTATTTCTAGCTCTCTTGATAGAACTTGTTTTTCTTTCTCCGATTTAACAAGGAACTCAAGAGCTTCTATATAGTTGCTAGGTAAACGATTAACACCGCTCTCTAACTCATGCCATCTTTCAATAACACGCATTCTTAATTCAGCGCTGTAACCAGTAAGCAAGCATTCAACATGTTTTTTATCTAGCAAATACTCTGTTTGTTTGCGGTTCATAGTGTCGGTATAGATATGTCCAAAAATGGACGCATCTTTTTTTAACTCCAACATCATTTTTTCAATGTCACGTTTAACATGCTGATGTTGCTTATCAGTCAAGAATGCTATTTCTCTACTTGACATTGTTACGTTTTCGTTTAATATTAATTTGTTCATTTACTGGTTGCCTCTGGTAATTGGATAACCTAAAACCGCACCTCTAATGCGGTTTTTTTATTTCTTGTAAAAAGGAGTTAACTCTGTGAAAGATAAAAGTGCTCTTGATATGATTTATGATGCAGCATTTGATGCAGATAGGTATGTAGAGGGCGAAGAATTCCAGCTTATTGAAAAAGCTGTTACTCAAATCAAGCTTATCGAAATTAAAAATAAAGTAGGTGAGATCGAATTTTTTAAAGGCATTCAGGCACTGGAAAGAATTGGTTTCATCAAGAAGTGTCTGAGCATTGATAGTAATGGCTCCTATCATTTTACTGACAAAGTTAGAATAACCAGTTTTGGTAAATTTAAATATAATAATTAGTTCGAAGTATTTTTTGACCACTTTCAGACTCTCTTTTTAATAATCATCTTTGTTTTTTAAATCATCAGGCGAATTAAGCCCTTCTAAATACTTCTTAGCCCCATACATGAAGAAACCCATGTCATCTTTACTAAAGCACTGCATATCTTTAGGAACTATCTGCAAATCAAGCACAGCTAATATCTCTGCAAACTGTTGAAACTTCTCAGGCTTCATTCTGCTAATAGTCGATTCATCGCAACCTAACGCATGAGAAACAGCGGCATTTCCGATAGATGCAAGACGCTGCACGATCATTGAATAATTCTTGCGTGCTATTGCTTCTTGGTTATCTGATAATTTGCTCATCGTTAATTACTCAAGGATTTAATATGGTTTATGCTATTTGCGACGGGAAAGGTCGAACCTCAAAAGCCTTTAACTTCCCCTGTTCTTCAACAACATATATTTCTCTATTTTTTCTAATGGCTTTGGATACTGCACCCTGTGTTGTACCTAGTTTTTTAGCGGCCTCTCCTTGAGAGGTATCTTCAACATATTTTTTTAATGGGATTTTATTCATAAGAACTCCTACTTATATGTATTAATAATACCGACGGTATTTATATATGTCAATACCGTCGGGATTTGATTTAAATTACCGCAGGGAATATATTTGCCAAATGGAAAAGACTGATAATAGAAAAAAACAACTTACCCCTGAGCTTCTAGAAGAAAGCAAGAAGCTTAAGAGTATTTTTGAGTCAAAAAAGAAGGATTTAAAAATAAGCCAAGGCTCAATAGCTGACTTTATGGGAATAAATCAAAGCTCAGTTAGTCATTACTTAAATGGACTAAATCCTTTAAATGCAAACGCCGCTGCTAAATTTGCAAAAATATTACAGGTAGATATAAATGAGTTTAGCCCTCGCCTAGCTAAAGAAGTAAATAATTTAGTTTCTATCACAGTAAACAACCAGCCAAACACGATCGAAATTTCTACCTATGACGAAAACGATCCAGTGGAAAATGACGAAGTAGTAATACCAATCTTTAAAGATGTTCAATTAAGCGCTGGGTGTGGACGAGTAGCAATATCAGAACTTCAAGCAAGCTCTACTATCAGATTTAAAAAGAACATTTTAATCAAACAAGGTGTAAGCTTTAATTATGCTATATGCGTTACTGTTTCAGGAAATAGCATGGAGCCATTTATACAAGATGGTGCACTTGTAGGAATAGATATAGCCAATACTAATATAGTAGACGGAAAAATATACGCTGTTGTGATTGAGAATGATCTAGCAAGGGTTAAGCAATTGTATAGACTACCCAATAACAGGGTTAGATTACGTTCATTCAATCGTGACGAGTACGAAGATGAGGATTACAGCCTAGAAGATATTAGAGTTGTAGGTAAAGTATTTTGGTCATCAGTGCTATGGGATTAGCACAGGGTTTGATGATAGGAGATTGTAAAGCGGTTTAAATCGCATCAGATATGCTGTAGATGCTAGATATTTTTATTAAAATGGTATGATCTATGATTATGTTATTTATTAGCAAATACAAGAATATAAACTGTGGGAGAGCCTTATGATTAAGTTTCTCGGTAGCTCTAGCTATGTTGGGGCTAGCAAAGTATCCACTGTAACTGATGGCATGATGGCCTATACCCATATCGCACAATTAAATACAACTCTACACGAGCCAAGTTTTACCCAGTGTTATGTTAAGATCTACCAAGAAAATGATAGCAGAGATAGAGAAGATAAATCTATTTTAAACGAAATCGTTGGGTATATTATTGGTAAATCTCTAGGTCTTCCTGTTCCATCAGAAGCAGGCATAATAATGATAAAAGGCTCTCAACTATCCTCTCCTCCAGATTGGATAAATAAAGATGAAGAAATTATAGCTTGGTGGGTAAAAGATATGTACTCCCCATCCCTTAAGCAATATTATGATTATAGTAAGTTTGGGAATCACGACATTCTTCTAAATAAATTAGTAAAAGAATTGTTAGCCTCTGATTTAACTAGTCAAATTATTGCTTTTGATGACCTAATCGCAAATATCGATAGAAATCTAGGAAATATTTTAAAAACAAAAAATGGAAAATTTATTTTAATTGACCACGGCCTTTGTTTAACGCGCTCTGACTGGATAGCATCTGATTTAAAGCCAGAACTGACATATCCGAATAGAATACTTGAATTTATTTCCACCAATTTGAACTTACAAAAAAAACATAACATTATAGAGTCTAAAAGGCTATTGTTTAAACAAATAGAAACTGCTATAAATAATCTTAGAGAATTGCTGCAATGTTTCATTGAAGAAAATGATATTTATGCCATCGAAAATTTTATACGAAATCGTTACACCAGCGATCGCTTTGAGAAAAAAGTAGGAATACTTGTATGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP029478|1963615:1969562|1968731_1969562_+|AWM80519.1|DBSCAN-SWA MIKFLGSSSYVGASKVSTVTDGMMAYTHIAQLNTTLHEPSFTQCYVKIYQENDSRDREDKSILNEIVGYIIGKSLGLPVPSEAGIIMIKGSQLSSPPDWINKDEEIIAWWVKDMYSPSLKQYYDYSKFGNHDILLNKLVKELLASDLTSQIIAFDDLIANIDRNLGNILKTKNGKFILIDHGLCLTRSDWIASDLKPELTYPNRILEFISTNLNLQKKHNIIESKRLLFKQIETAINNLRELLQCFIEENDIYAIENFIRNRYTSDRFEKKVGILV >CP029478|1963615:1969562|1964759_1965224_-|AWM80512.1|DBSCAN-SWA MTDKKLILGIDPGCTGSVVILDEDNNYIDHLLMPTLKTGKSNRVNGVAVMAFLSQYKISHAYLEKVHSMPQQGVASTFNFGHAAGVIEGIIQGMMIPYTLITPQLWKKKAGLIGKDKDEARSMAIRLYPSIRVLDKKGHGQALADSILIARFGK >CP029478|1963615:1969562|1966111_1966789_-|AWM80514.1|DBSCAN-SWA MNKLILNENVTMSSREIAFLTDKQHQHVKRDIEKMMLELKKDASIFGHIYTDTMNRKQTEYLLDKKHVECLLTGYSAELRMRVIERWHELESGVNRLPSNYIEALEFLVKSEKEKQVLSRELEIAKPAVDFVDNYVKAEGNYNFRQVAKLLNAKEPKLKLFLIENGIIYYTGRTMTPYQKHIDAGRFVVKTGVSDTEHAYTQMKFTPKGFNWISELWANRLREVA >CP029478|1963615:1969562|1966874_1967156_+|AWM80515.1|DBSCAN-SWA MKDKSALDMIYDAAFDADRYVEGEEFQLIEKAVTQIKLIEIKNKVGEIEFFKGIQALERIGFIKKCLSIDSNGSYHFTDKVRITSFGKFKYNN >CP029478|1963615:1969562|1967532_1967718_-|AWM80517.1|DBSCAN-SWA MNKIPLKKYVEDTSQGEAAKKLGTTQGAVSKAIRKNREIYVVEEQGKLKAFEVRPFPSQIA >CP029478|1963615:1969562|1965213_1965405_-|AWM80513.1|DBSCAN-SWA MKWSKVSEQYRAECEARYWLGMGFTTRSKTEQLREEIRKKRGQKAADYLIENMRKEWSKQNDR >CP029478|1963615:1969562|1963615_1964029_-|AWM80510.1|DBSCAN-SWA MNQSNITTGLIGFGGGKLAQKMGVLDPQTVLAGGYPLPNGLSSRQTLGNVAKGFVSEGAFQELPQSATEQMWQNYAQDNPLMEGVPEASAAGLLAGGVIRADKSLSSSEKNALIEEIQRQRNELAKRVDSKARKSGI >CP029478|1963615:1969562|1967192_1967504_-|AWM80516.1|DBSCAN-SWA MSKLSDNQEAIARKNYSMIVQRLASIGNAAVSHALGCDESTISRMKPEKFQQFAEILAVLDLQIVPKDMQCFSKDDMGFFMYGAKKYLEGLNSPDDLKNKDDY >CP029478|1963615:1969562|1967818_1968586_+|AWM80518.1|DBSCAN-SWA MEKTDNRKKQLTPELLEESKKLKSIFESKKKDLKISQGSIADFMGINQSSVSHYLNGLNPLNANAAAKFAKILQVDINEFSPRLAKEVNNLVSITVNNQPNTIEISTYDENDPVENDEVVIPIFKDVQLSAGCGRVAISELQASSTIRFKKNILIKQGVSFNYAICVTVSGNSMEPFIQDGALVGIDIANTNIVDGKIYAVVIENDLARVKQLYRLPNNRVRLRSFNRDEYEDEDYSLEDIRVVGKVFWSSVLWD >CP029478|1963615:1969562|1964151_1964430_-|AWM80511.1|DBSCAN-SWA MTKHGTAFGLALEAAQNAELALNNKDLEFFLCVIIDGDNTTAEMGGNVTPQVIKGLEKMLTELKIKNNTTALYSYSTEIQPALTEVESGIIR |
10 | Pseudomonas_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_5 |
2229261 : 2238335
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP029478|2229261:2238335|DBSCAN-SWA ATTAGAACTTATAGCTCATATTTAATGTGCCTTGATATTCTTTATAGCTATTATCACCCCAGTTACCACTCACTTGAGCGCCCAGACTTAAACGATCTGTAATATGACCTTGTAAACCAATTTTAGCCTCTAAACGGCTATCAGGAATACCATCATGTAATTTAGTACCATTGAACTTTAAACTATTTTTAGCATTTGTATTTAACCAGTTCAATTCTAGATAAGGTTCTACCCTCGGTTTATCTATACCTCTTGCACTAATGCGGGCACCTAATCTTGTATCAAGTCCACTGGCATTATTGCTTGTAATATAGAGGTCATTAGCATCATGTTGGTTATCTGCATCATATTGTTTATAAGTAATCTGTGCTTGTGGCGTTAATAGGTACTCATAGGTGGCATCTTTGCCCAACGAAATACCATAACCCATTTCCATAGAACTAGTCCAAACGTTGCTATTATAACGTTTAGTACTACTCATTGAATCACCCTCTACCCTATTACGATACCAACCGTACTGCGTCCATGTATCAACATACAGTCCAAGGGCGCCATCATCATTTTGGAACCATGTACCATAAACACCTGTATTATAACCTTCTACCTTACCTGTAACTTTTGATCCTGTGGCACGAGAGCGGCTTTTTGTTTCATTATCACCATAACCGCCCATTACACCAAGATGGAAGTTACCTTCTAGTAAACGCCATACTGCCAAATCGCTACCAAACTCTATTTTATAGGTATGAGAGCGATTACTTAATTTGCCACCAACACTGTCATAACTACTATGCTGCATGTTAGTCTTAATCCAGAAATCTCTAGCCTCTGCCGTACTTTTTCCTCCAGTAAAGGTAGCTTGCCCCTCTCTGTCATAAAGTGTGTGGTTAAACATACTCGTTGCAGCAGTTTGGTTAGCTAAGTAAGCACCTACTGCTGGGTTAATTTGGTCAAGGTGTGTACCTAGCGCCCAATTACCATAGCTATTCTTGAAAAGTGAGTATTCATACATACCTGCCGTCACAGGTTGCCCTAGTACTAAATTGAGATTATTAGTCCCTCCAACAGTAACAACTTCTAAGCCGTCAGTTCCTATTGCTTGTGGATTAGCTGCATTAATTAATTTGACATATAGTTTAGAGTTTCCTGATGCATTGCCTGAAATATTGTACTGATCGGTTGTAAGATTTTGCACATCCGTACGAACTGAAAGGCTACCACCGTGACCAATGTAGTTACCATTAAAGTTGATATTAATTGGCTGATAATGGGTATAGTTATCTACTAGTGCAAATGAGCCTGAGTTTGTGATATCAACATTATTAAAGTTAGCCTCGGTTACAGAACCATCTATTGTTATAGTACCTGTATTATTTAACACGCCATTGACGGTACCATTACCAAAATTATTATTTACAATACCACCAGCATTAGTGATATCACGGACAGTCCACTCGCCATTATTATTCATAGCGGAAGCTGTTGTATTATTTGCCAAACTATCGAGATTAACATAACCTGTAATTTCTCCTTTATTATCAAAAATAGCTGAAGAATTACTCGTTGGATTGGCTATGGAAATAATACTGTCAATATCCGATGTTATTTCACCGTTATTAGTAACATGTACTGTGCTATTGACATCTTGAGCAGCAGAAATATCTATTGCCGTATTACCTGAGCTAATTTCACCGTAATTTATAATATCTGTTGCATTCAAACCAGATGTATAAATACCTTTAGCATTAGTATTAGAGGTTACTAGCATACCAACATTTGTAATATTAGCTGCTCCTGTATTGTTAGCATAAATAGCAGCTAAACCACTGGTTTCATTGACTGTAATTGTTCCTCTATTCAAAATAGTACTATTTTGAACGGCTAAAGCAGTAACTCCTGCATAGTTTGATGTGATTACCCCTGTATTATTAATGGTTGCATCTTCTGCTGAATCTACAGCAATACCTGAGTTAGTTTGCCCTGTAACATCAATTACTCCCCCTGTATTATTGATAGTAACTTTACCTGCATTACCAGTATTATTGTAGTTGCCATAATAAATACCTGAACCACTCTCATTAACAACTGAACCTGTATTGTTAATATTAGTAGTACTCCCCTCTGAGGCGAGGATGTTAATACTATTCGCTTTACCAGATCCAATATGTTTAACTGTGCCACTGTTATTAACTACTGTATCACCATCACCACGGCTAACAACATGTATACCGTTAGACCCTGTACCAGAAGCTGAAATATTGCCCTGATTGTCTATAAGTTGATGGCCATCAGTTAGCGTTGAGTCAAGTGGGTTGATCTTATCATTGTTTCCCGTAATTGCTACTGCACTTGTATAGTCACCAGAAGTGGTTACTGAACTGTTTTTATCTATAGTTATTTCTGCAATATAATTAGCCGTGACACCAATACCTGAGCTACCGACATCGCCTGTATTCGCTGTTTTTACATTAACCTGTGTATTAACTATATCCATATGGCCAGTGCCTGCCCCCGCCCAACCAGACTCTATTAATAATCCATTAGAGCGTCCACTCCCATTTGTAATATCAATAACAGAATCATTCACACTCATTGACACTTTCTGTGAAGGTTTTTGTTCCGCAGGAATACCTTCAAAACCTCCATAAATCCAACTATTGTTAGAACTGCTTTTAATATTAGAGTTAGAAATCTTTAAAAATAAATCAGGATTATTGGCTAACTCTGGCCTTTCTGGCCCAGGGCCAAAACCAATCATTTGCCCAGTACCATTTAAATTAACATTATCAATCACTAAATTAGAATAATTTGGTGAGGCATCTCGAATGACAGAGTTTTCTTCTATTCCATTTGTTGTACAGGTTTTTGTTCCTATTGTAGTATCAAGAGAGCAGTCCAGGGCATAAACACTTGATGACGTGGCTATAGTGATAGCTAAAAGGGACATTTTTTTCAAGCTTGGCTTATACATCAATAAAATCTCCATTTTTAAAGCGCTATAATATATCCATTGAGATCATTAGACTAAAGTTTATTGTGATATTCATCACTAATTAACAAATCTATGCATATTTTACAAAAAAGCATTATGCCTATTAATTGCTCGCTACTGACCATCAAACTTTCCTGTGCTTTAGCACAAAAAATGCTTGATCAACACTGAGTCACGATAAATTAAACTTTCTTATTATTTTGATAGGGTTACTTGAATAACAATGTACGTACAATTTGTTTTATTTGATTTTTTAGATAGCGCTATCCATAAAAATTATTTGTTCATTTAGCGCTCTTACTTCTTAAAGGCGCTCATAATCGGTAAAAGGCTAGCCTATTTTAAAATGGTAGCTCCACCATGCATCCTTACTAACACCCGGTAAGTCTGTGCGGCTTCCACCTGTGACACTACACCAGAGTTTAACTAACTTTTCACCATCGCCATGCTTTGGTTCTGCTCCCTGCTTCCATCCTACAATTGTTGGTTTAGGGACTTGGATCATGTCAGATATCCCTTGTAGCGATAAATTAAATTTATTTAAATCGCAAATGACTCGAAACCAATCCGTATCGCATCTTCTTGACATTTTATGTCCTCCATTAAATATTATTCGTTTTTAAATTATTTTCTCTTTGTTAAACTTGCACGATTCCAACGGTATAAGATATTTTCAGATATCTTATACTTACGCACTATTTCTGTTGTATTTCTACCATCAAACTCTTCTAAAATTTTTGCCTTGAGTTTTTCCATATAACGCTCTGGATTCATGGGAAAAACAATAGAAAGACCTCGCCAATTTTCATAAATATTAAATGTAATCTCTTCTGCCTTTTCTAGAGCCTTGCCCTCATCAATCCCTATCTTTTCTAACTCATACTGAATACTTTCTGCTAATTCGCTAAAAAGTTCATTTTTACGCTGCGCTTGAATTGAAGTCATTTCATATCCCTCACTATCGATAATTGATATTAGCGGCGTTTAATTCCCAACAAGGTTAAACAATTCTGCCTTGCACTTTTTATATCAATTCCCTGTTGTTTAATCCGCTCATTAACTCTTTGTTCTGCTTGCTGCTCAATCTTAACCAACAAACTATCATCATTGCTTTTATTCCATTTTGTAACCTCTTTCAGAGGCTTATTCTGAGAATAATTATCCCTGACTTTCACAAAATAGAATTCAAACCGTTTTTTCAATGGCATGCTTTCATAATTCGCATGCCTTAATTCAAAAAGTCCTGTTAATTCAGCTGTAACCTTTACCACAGGATGACTATAACGACCAATTAATGCCTCACACCATGCAAGATCCATATCGACCAACCCATCAACTCTCTGGCATAGCTCCATAGACTCTTTAAGTCTTGGTGGAAAATCGCACTCCATCACCATTCGCTTTAATCCCTGTACAACTTGTTCGTCCGTTAACAGCTTCACCCCTTCTAACCAAATACGCTTAGCTTGACGCTCGCTTTTACGTGTAGCATAGTATTTTTCATACCATGCAGGATAAGAGGCGTGGATGGTGGCAAAAATTTTATTAACATTTATCACCATCTCATCTGTCACTCTTTCTCTATCCTTTCCACCAGCTAAGGTCTGTACTTGTTTCTCTAATAATTCCATTGGATTTTTTAATACGTTGCTTACCTTTTCCATACTGCTGTTCTCGGTTAATCATATATTGATATGATTGCGCTAATGCGTGTTGCCACTGCTGTTGTGTTTTTTTAATATCTGGTTTACCGCACCAAAAACACCTAAACTCTTGCAGAACTTTACTTGGAAGTTGTTGTGCCTCATCCACAACCCCTAACTTCACCAAATACATTGGAAAACTGCTATCTGGCATCCATTCATCAAACATACCAAAACTGCCTAATCGATCACTTTCGTCATCATTAGAGAGAGAAGTTATATCTTTATCTTGTAGTTCATTTGCGTTTGTTTGTTTAACCAATCTTTTTTTGCTCTCTCGCCATGCTTTAGCTCTTTCAGCAGAGCCGTCTTCCTTAATAGGCTGGCGCTTACTCCATCCAATTAATTTATTATCTTTTACAACTTTGCCTTCCATTGCAGATAAAATTGCTCTAATTGATTGCGGACTAGTATCTAGCACATTCGCTAAATCTTCTTCGTTAACATGGATTGTCCCGCGCTCCTCAGCAATAGAAGCCATAACCAGCAAATGAACATATGCTGCTATTACAGTAGTAATCGGTTGCTTAGATCGCCGACTGATCGTTCTCCATTTAGGGTCATTCGACATATCGTGCCAAAGCCTTAACCATTGATTTGCCATTTCAACCAACCTCTTAATATCGATAAACCTATATATAATATAGGTACAACAGACAAATAAAATCACAGCCGTAATTGACTGATAAATAAAAGTAAATCATTTCAACTAATCAGAATAAACCCAATATCAATATCGGAATACCATTATTATAATTATAAATATTCCTATATGCAACTATATTTTACCTATTTTTATTTAAATACATAACACTTTAATTAACTGATCATTCGCTACTTGGATAATATATGGTCTAAACACAGTTTGATAAATATTTAGTACTTCAGCCCAATCATTACGCTCAATGGCTGCATAAAGGTAAACATCCGCTGTTTCTTCATCGCCAACTAAACCATTAACAGCTTGGGAAGCAACTTCTAACTCATAGTCTTTACCACTAACATGAGAACAATGACAAGTAGTTAATAATTTATGAAGCTGAATAGCGATATAGTCGTCTAAACTTTGTTTAGACGTTAAAGATGGATTATTATTCGACAGAATACGTGACATAGTTATCCCCTATATATAAATCAATAAAAATTATATAGGGATAAATTGATTTAGTAAATAGGTATGCCTATTATTTTATAGTAAAACTGAATACCAAAAAACTCGTCCTATGATTCTAATATCTTTTAAATCATAAATTTCGTCTTCATACTCATCACGATTGAAAGATCTAACTCTTACTTGTCCATTAGCAAGGCGGTAAAGTAGCTTTACTCTCAATAATTCATCATCAATCGCAATAGCATATATTTTGCCATCAACAATTGCGGTACTATCTGTATCAACCCCTACAGTAGAACCGTCTAAAATAACAGGCTCCATACTATTACCTTTAACAGTAACACAAACAATTTTAGCTGGATTAATACCTCTATTACGTAAAGTACTTTTGCCAAATCTTAATTTTGTTCTTGTACTAGCTTCAGCAATTGCAAATTTTCCAGAGCCAGCGGCTAATTCAACTTCTCTTAGAAAGGGTATTTCAACATCATCATCATCTAATGGTGTGTTATCATCCCACGTTTCAATAGGGAGCATTTGTGAATACGTTAATAAATTAGGATCTGTTGCACTTTCTCCATCATAAGCAGCATTATTATAATTTGTTTTTTGCTCAGACAATCTATTTTGTGCATTTGTATTCGTCATACTTCCCTGTCCTGTTTCTAACCAGAACGCATCTACCCCACATACCCTAGCGATAGAGCCTATGAAAGAGGTTGACTGAGATCTTCCTGTTTCAAGCTCAGAAAGAGAGGGTTGTGTAATACCTACTTTATTAGCGAGTTCTTTTTGACTTAACTTTGCAAACTTACGAGCTTGTTTTATACGATCTTTAAGCTGTTGCATATATGCCTTTTATCACAAATTGTTTGTTTTCCGATATAATTTTATATGATATCGAATAATAAGTCATCTATTTTATAAGCATACTGATATTTAACAGATTAAACTAATGACTAATCTGTTATACGGGGTTCTAGCCAAAAGCGCCAAAGAAGACAAAGACAACAGGTTGTAATAACAGTGACAATTAAAATGTAAGGAATATAGGCACTTTGAATACTAAGCATACTACAATAAAAATACTCTAAAAACACACCAACAATGTTTGTTGCAAGCAAAAGTATAGGCAGCGAAAATCGATTAAAATAAGCCATAGAGAACCCCGTTAAAACCACAGGAATTCCAGCCAAAAAAATACCTACTGATGCAGCTATAAAAGGAATCATCACAAGGTTTTGTGACATATTCAAAAATCCACCACCTTGTATAACACTCAGTATTTGTATAGGAAGCACTATAATAAAAGTAGCAAATAATAAGCCAACCACGACAAAAGTGGCTGTTGAATATAGATATTTTTTCACACTACATTGATCCTGTATAATTCTAATACTTTACTATAATACACTGAAAAGGCTATTAAATCTTTTCAATATTGTTATTCCCTAAAATCAACAATTAAGAAATATATTACTTAACATTACCAAAAACAAAAAAAATTCTTTATTAATCTTATAGTTATAAAATAAAGCTAATTAATTTAGAATAGCGATCTTTATTATTTCAAACAAATGTCCTACAGTAATACTAATGTTGCTGTTTAGCATAAAGGAACTATACTAAAAATGATCAAATTTTTTATACCATTTGGACTAACTATATGCTCTTCTATAGTCTATAGCGCCCCTTGTTATACAGATATAAAAGATGGTTGTAACGATGGTTCAATCCCTATTTTTGTAAAAACAGAAAATACTGATCAAAGGTTTTGTACCGAATACACAAATGAAGAAAAACAAAAAATAGTAAGGTGCTTTACAAAATTACCAGAACCAGAGAAACAAGACGATACACAGATAAAAGTAGCCGAACAACGCCAACCGATTAATCAGCAACTTATTTACACTAATCAGTCTCAACAAATCAATAATTACTATAATAATTCTAATGAAAACTACAATAGCAGCGATTCAGGCTATTGGGCTGGTTATTGGAATGGATACAATAACAACTATCAAGGAAATCATTACCCCAACAGACCACCTCCTCCACATAATCACCCTCCGAGAAAACCACCTGTAATAACTTACCCTTCAATGCCCATAGGGAAAAAAGTTAACTCTAAGAAATGGACATCAGGGGCTCCTCATCCCTCGCAAAATAGACCAAACAAGCCTAATTATTCTAATAGACCAAACAAACCTAACTATTCTAATAATCCTATGAGCCCCCCATCAAGAACAGTACCAAGCAGAAGATAGCTACCACCAAACATGAAGTGGTATTTTATCTAACATACCACTTTATTATGCTATAGCAAAAAGATCCTCCCTCCCTAATTCTGCATAATACCTCTAATATCAACACATTATATATTTAGAGGAATAACTATGCTAAAAGAGTTTCGATGCAAAAAGTGCCATAAGTTATTGGCAAAAATTAGTGATTATTCCGAGCTCGAAATAAAGTGTAATCGTTGCAAACAAATCAACTATTACGTTTTCTCCTCTAATCTGGAATATCAAAATGCCAAACAAAGATCCAACATTTTTACAGATGCTTTACACCGTAATATCTGAAAATACAACGGTAGGAGGAGCTGTGATGGCTTCAATAATAGCAACATTACGTATTTTATATGATGACAACAAGACAAGGCCAATGCGAATTATTCTAGAGGCATTAACTTGTGGAGCTTTATCACTATGCGTAACAGGAATTATTGAACTATTTCACCTCCCTACCAGTGCCGCTATAACAATAGGAGGAGCCATAGGCTTTATAGGTGTAACAGCATTAAGAGACTTTATTTTAAAAATAATCACCAATAGGATAGATAAAAAATGAACTTACCTAGAGGTATACGAAATAACAACCCTGGCAATATTCGCTGGGGAAGTGATTGGCAAGGTCTTATATCTGAAGAAGAGAGAACCGACAAATCATTTTGCCAATTCCAAGACCCTGTTTATGGGTTGCGTGCGATGGTGAAGATTATATTCACCTACCAAGAAAAATATGGACTAAACACAATTGAATCAATCCTCCATCGCTACGCCCCACCCAATGAAAACAATACACAAGGCTATATAATGAGGGTATCAGAAGCCATAGGAGCTCTCCCTAAACAGCCTCTCAAGCTCACGGATGGGACATTAAAAGAACTAATGCGGGCAATAACTGCTGTAGAAAATGGTCAAAACTATTACTACTACTATAAAACTGACCAATTAGAAAAAGCTATCCAATTAGCTAAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP029478|2229261:2238335|2233833_2234559_-|AWM80743.1|DBSCAN-SWA MANQWLRLWHDMSNDPKWRTISRRSKQPITTVIAAYVHLLVMASIAEERGTIHVNEEDLANVLDTSPQSIRAILSAMEGKVVKDNKLIGWSKRQPIKEDGSAERAKAWRESKKRLVKQTNANELQDKDITSLSNDDESDRLGSFGMFDEWMPDSSFPMYLVKLGVVDEAQQLPSKVLQEFRCFWCGKPDIKKTQQQWQHALAQSYQYMINREQQYGKGKQRIKKSNGIIRETSTDLSWWKG >CP029478|2229261:2238335|2232583_2232841_-|AWM80740.1|DBSCAN-SWA MSRRCDTDWFRVICDLNKFNLSLQGISDMIQVPKPTIVGWKQGAEPKHGDGEKLVKLWCSVTGGSRTDLPGVSKDAWWSYHFKIG >CP029478|2229261:2238335|2236028_2236439_-|AWM80746.1|DBSCAN-SWA MKKYLYSTATFVVVGLLFATFIIVLPIQILSVIQGGGFLNMSQNLVMIPFIAASVGIFLAGIPVVLTGFSMAYFNRFSLPILLLATNIVGVFLEYFYCSMLSIQSAYIPYILIVTVITTCCLCLLWRFWLEPRITD >CP029478|2229261:2238335|2233226_2233883_-|AWM80742.1|DBSCAN-SWA MELLEKQVQTLAGGKDRERVTDEMVINVNKIFATIHASYPAWYEKYYATRKSERQAKRIWLEGVKLLTDEQVVQGLKRMVMECDFPPRLKESMELCQRVDGLVDMDLAWCEALIGRYSHPVVKVTAELTGLFELRHANYESMPLKKRFEFYFVKVRDNYSQNKPLKEVTKWNKSNDDSLLVKIEQQAEQRVNERIKQQGIDIKSARQNCLTLLGIKRR >CP029478|2229261:2238335|2237601_2237922_+|AWM80749.1|holin|DBSCAN-SWA MPNKDPTFLQMLYTVISENTTVGGAVMASIIATLRILYDDNKTRPMRIILEALTCGALSLCVTGIIELFHLPTSAAITIGGAIGFIGVTALRDFILKIITNRIDKK >CP029478|2229261:2238335|2232876_2233197_-|AWM80741.1|DBSCAN-SWA MTSIQAQRKNELFSELAESIQYELEKIGIDEGKALEKAEEITFNIYENWRGLSIVFPMNPERYMEKLKAKILEEFDGRNTTEIVRKYKISENILYRWNRASLTKRK >CP029478|2229261:2238335|2234754_2235069_-|AWM80744.1|DBSCAN-SWA MSRILSNNNPSLTSKQSLDDYIAIQLHKLLTTCHCSHVSGKDYELEVASQAVNGLVGDEETADVYLYAAIERNDWAEVLNIYQTVFRPYIIQVANDQLIKVLCI >CP029478|2229261:2238335|2237465_2237654_+|AWM80748.1|DBSCAN-SWA MLKEFRCKKCHKLLAKISDYSELEIKCNRCKQINYYVFSSNLEYQNAKQRSNIFTDALHRNI >CP029478|2229261:2238335|2236700_2237336_+|AWM80747.1|DBSCAN-SWA MIKFFIPFGLTICSSIVYSAPCYTDIKDGCNDGSIPIFVKTENTDQRFCTEYTNEEKQKIVRCFTKLPEPEKQDDTQIKVAEQRQPINQQLIYTNQSQQINNYYNNSNENYNSSDSGYWAGYWNGYNNNYQGNHYPNRPPPPHNHPPRKPPVITYPSMPIGKKVNSKKWTSGAPHPSQNRPNKPNYSNRPNKPNYSNNPMSPPSRTVPSRR >CP029478|2229261:2238335|2229261_2232246_-|AWM80739.1|DBSCAN-SWA MEILLMYKPSLKKMSLLAITIATSSSVYALDCSLDTTIGTKTCTTNGIEENSVIRDASPNYSNLVIDNVNLNGTGQMIGFGPGPERPELANNPDLFLKISNSNIKSSSNNSWIYGGFEGIPAEQKPSQKVSMSVNDSVIDITNGSGRSNGLLIESGWAGAGTGHMDIVNTQVNVKTANTGDVGSSGIGVTANYIAEITIDKNSSVTTSGDYTSAVAITGNNDKINPLDSTLTDGHQLIDNQGNISASGTGSNGIHVVSRGDGDTVVNNSGTVKHIGSGKANSINILASEGSTTNINNTGSVVNESGSGIYYGNYNNTGNAGKVTINNTGGVIDVTGQTNSGIAVDSAEDATINNTGVITSNYAGVTALAVQNSTILNRGTITVNETSGLAAIYANNTGAANITNVGMLVTSNTNAKGIYTSGLNATDIINYGEISSGNTAIDISAAQDVNSTVHVTNNGEITSDIDSIISIANPTSNSSAIFDNKGEITGYVNLDSLANNTTASAMNNNGEWTVRDITNAGGIVNNNFGNGTVNGVLNNTGTITIDGSVTEANFNNVDITNSGSFALVDNYTHYQPININFNGNYIGHGGSLSVRTDVQNLTTDQYNISGNASGNSKLYVKLINAANPQAIGTDGLEVVTVGGTNNLNLVLGQPVTAGMYEYSLFKNSYGNWALGTHLDQINPAVGAYLANQTAATSMFNHTLYDREGQATFTGGKSTAEARDFWIKTNMQHSSYDSVGGKLSNRSHTYKIEFGSDLAVWRLLEGNFHLGVMGGYGDNETKSRSRATGSKVTGKVEGYNTGVYGTWFQNDDGALGLYVDTWTQYGWYRNRVEGDSMSSTKRYNSNVWTSSMEMGYGISLGKDATYEYLLTPQAQITYKQYDADNQHDANDLYITSNNASGLDTRLGARISARGIDKPRVEPYLELNWLNTNAKNSLKFNGTKLHDGIPDSRLEAKIGLQGHITDRLSLGAQVSGNWGDNSYKEYQGTLNMSYKF >CP029478|2229261:2238335|2237918_2238335_+|AWM80750.1|DBSCAN-SWA MNLPRGIRNNNPGNIRWGSDWQGLISEEERTDKSFCQFQDPVYGLRAMVKIIFTYQEKYGLNTIESILHRYAPPNENNTQGYIMRVSEAIGALPKQPLKLTDGTLKELMRAITAVENGQNYYYYYKTDQLEKAIQLAK >CP029478|2229261:2238335|2235144_2235918_-|AWM80745.1|DBSCAN-SWA MQQLKDRIKQARKFAKLSQKELANKVGITQPSLSELETGRSQSTSFIGSIARVCGVDAFWLETGQGSMTNTNAQNRLSEQKTNYNNAAYDGESATDPNLLTYSQMLPIETWDDNTPLDDDDVEIPFLREVELAAGSGKFAIAEASTRTKLRFGKSTLRNRGINPAKIVCVTVKGNSMEPVILDGSTVGVDTDSTAIVDGKIYAIAIDDELLRVKLLYRLANGQVRVRSFNRDEYEDEIYDLKDIRIIGRVFWYSVLL |
12 | uncultured_Caudovirales_phage(33.33%) | holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_6 |
2427334 : 2431339
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP029478|2427334:2431339|DBSCAN-SWA TATGAATAATCGTTATGACTCTCATGAGCCAAGAACGTATACCGTAGCCAGTGATAACTATATTGACCAAGTAGGTCAATCGCAAATCACGAAGGTGCTACGTAATACTTATACATTACTCGCTATGACCTTGGCATTCTCGGCATTAACATGTTATGCAGCTATGGCAATGAATGTACAACGTTTAAGTATCTGGGTTTTATTAATTGGTACTTACGGTTTAATGTTTTTAACCATGAAATTAAGAAACTCTATTTGGGGCTTGGTGAGCACATTCGCTTTCACTGGCTTTATGGGGTTCACACTAGCACCAACACTTAATATGTATTTGTACTTGCCAAATGGTGCAAGCATTATTACTTCAGCTTTAGGTTTAACTGCATTTGCATTTTTGGGATTATCTGCGTTTGTTTTAATTACACGCAAAGATATGAGCTTCTTAGGTAACTTTATTACTGTTGGTTGTTTCATATTACTTGGTGCTATGGTATTAAGCTTCTTCACTAATATTCCTGGCTTATACTTAGCGTTAAGTGCTGGTTTTATTTTATTCTCTTCAGCGGTTATTTTATACCAAACCAGTGAAATCATTAACGGTGGCGAAACCAACTATATTATGGCAACGATTACATTATTCGTTTCTATTTATAATATTTTTGTTAGTTTATTAAGTATCTTAGGTGTTGCTTCTAACGACTAAGTATTAATCATTAAAAGAGCCCGCTATGCGGGCTTTTTTGTATGGGTATTTATGAAGTTTACAATTGCTATTTATGCACCCCCTCAAACCCCTGCCGCAAGAAGAGCCTTACGCTTTTCTCAAGAAGTCTTAGCCTCCAAACATGAAATTGTGCGTTTATTTTTTATCACGATGGTATTTATAATGCCGTTAATAGTCTCGTTATTCCACAAGATGAGTTAGATATTCATAAAGAATGGCAATCATTTATTGAAGAAAATAAACTTGATGCTGTTGTTTGTATTGCTGCCGCATTAAGACGCGGGCAATTAGATGCGGCAGAAACTAAACGTTATAAAAAAGTAGCAACTTCTATCACGCCACCTTGGCAGTTAGCCGGTTTAGGGCAGCTACATGAGGCTATTCAAGAGAGTGATCGTTTTATTACCTTTGCAGGAGACGCTTAATGGCTAAATCAATGTTAATTATTTGCCAACAAGCCCCTTGGAGTAACGCCACAGTCAAAGAAACACTTGATTTAGCTTTGGCTGGAGGTGCTTTTGATTTACCGATTAGCTTATTATTTTTAGAAGATGGTGTTTTTCAACTCGTAAAAGATCAGCAACCTCAAACAATTGAGCAAAAAAATATTACATCTAACTTGCAAGCATTACCTTTATTTGGTATCACGGAAATTTTTGTTGTTGAACAACACTTATATGTGCGTGGTCTAAACCAACAACAATTATTAGAGCCTGTTAAACTAGTCCAACAAGAAGAGCTAAACTCGCTTTTAGTTCATTATGACACTGTGATTACTAGCTAATGAATACTTTACATTTACTAAATAAAAGCCCCTTTCTAGGTAATACATTTGATACGGTACTAGCGTTTATTCACGAACATGATGGTATCTTATTAACGGGTGATGCAGTCTATGCATTACAACCCAACACTGTTTTTTTAATGAAGATGAAACAATTACCCGTTACAATTTATGCATTAAATGAAGATATGGCAGCTAGAGCTATAGACTCAACGCTAGATAATATTAAAACTGTTGATTACTCAGCCTTTGTTAGGCTCTGCACTGAATATAAAAAGGTTGTTACTTGGTCATGAAACTCACGGTTAATCATCAAGATATTATGCTCGATGATGAGGGCTATCTAGTCAATTTACAAGATTGGTCACCCGCTGTAGCCAAAGCTCTGGCAGAGCGCGAGTCTATTACATTGACAGAATCGCACTGGCAAATTATAGAGCTGTTACGTGCTTTTTATCAGCAATATGCCCTTTCACCCTCTAATCGGCCACTGATTAAATATTTAAATCAACAACTACCCACACAACAGATCAATAGTTTGACATTAAACTTATTATTTAATGGTAGTCCTGCTAAACTAGCGGCTAAATTAGCTGGATTACCTAAACCCACAAATTGCTTATGATAAATAAAATGATACAGCCCAATATGATAGAACATCCTTTTGCTCAATATATTCGCATTTTGGGTAAAGGCCAAAACGGTTCACGCCATCTCACGTTAGAAGAGGCCGAAACCGCGATGTTAATGGTGCTAAATGATGAGGTTGAAGCAGTTCAACTGGGGGCTTTCTTATTATTATTACGCTATCAATTAGAAACAGCTGAAGAACTCGCTGGCTTTGCAAACGCTGTACGCAAAAAAATACAAACACCAAACATACCACTCGATATTGATTGGCCAACCTATGCCGGTAAAAAAAGACATTACCCTTGGTATTTATTGGCAGCCAAGCTATTAGCTGCTCAGGGCATAACTATTCTTATGCATGGAGCAGGAGCGCATACCGCAGAGCGTTTTTATACTGAACAGTTTCTATCCATGTTGGCGATTAAGCATTGTAAAAATTGGTATGAAGTAGAAACCACTTTAGAGGATCAGCATATTGCATTTATTAGCCTAGGAAGTTTCTCCCCTAAGCTTCAACAAATTATTGATCTAAAATCACTATTGGGTGTACGCTCACCCGTGCATTCTCTCGTCAGATTAATCAATCCATTACAAGCACGTTGCAGTTTGCAAAGTATTTTCCACCCTAATTATCAAGCAATTCACCAAGAAACTAGCCGATTATTAGGGGATACCTCCATCATTATTAAAGGTGAAGGCGGTGAAAATGAAGTCAGAGCAGATAATATCAATCTATTATTAGGTACTCAACAAGGTTTACCTTGGCAAGAAACATGGCCTGCCCTTTCAGAACAACGGTTATTAAAACCAAGCCAACTCACACCTGAACACTTCATGGCTGTCTGGCAAAAAAAAGTACACGATGAATACGCAGATTTAGTAATACCTGCTACTATAGCACTTGCTTTACGCGGCTTAGGCACCCCACAACAGGAAGCATTAAAAGAAGGTACGCGATTATGGCAATTGCACACAAATGATTAAGAACTGCCGCGATTAGGCACTAAGTATATTAAAAACGTAATATTGGAGTTGTTATGATTAGTAAATGTCTTTTTCCTGCCGCTGGGTATGGTACACGTTTTCTACCTGTTACCAAAGCAATGCCTAAAGAAATGCTCCCTATCGTTAATAAGCCTCTGATTCAATATGCAGTTGAAGAAGCCAAAGAAGCCAATTTAGGGCATATGGCTATTGTGACAGGTAGAGGAAAAAGAGCGTTAGAAGACCATTTTGATATTAGCTATGAATTAGAAAAACAAATTGCAGGTTCATCGAAAGAGTATTTATTAGACGGTATTCGCGATTTAATCGCACATTGTACTTTCTCTTATACCCGCCAAATTGAAATGAAAGGGTTGGGCCATGCGATACTCACAGGTAAACAACTGATAGGTGATGAACCCTTCGCCGTTGTATTGGCTGACGACTTATGCATAAATATTGATGGAGAAGGCGTTTTGAGCCAAATGGTGAAACTTTACAATCAGTTTCGCTGCTCTATTGTGGCTGTTGAGGAAGTACCTAAAGAAGAAATCAGTCGCTATGGTGTTATCGAAGGCAAAATGATCAGTGATGACTTATATACCGTTACTAATATGGTTGAGAAGCCTTCGCCAGAAGAAGCACCTTCAAACCTTGCCATTATAGGTCGCTATATTTTAACTCCCGACATTTTCAAAATACTAGAAAACACACCACCCGGTAAAAATGGGGAAATACAAATCACAGATGCGCTTTTAACACAGGCAAAACAAGGGTGTGTTATCGCTTATAAATTTAAAGGCCACCGCTTTGACTGTGGAAGTGCAGAAGGCTTTATTGAAGCCACTAACTTTTGTTATGAAAACTTTTATAAAAAGAATTGCTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP029478|2427334:2431339|2427334_2428033_+|AWM80906.1|protease|DBSCAN-SWA MNNRYDSHEPRTYTVASDNYIDQVGQSQITKVLRNTYTLLAMTLAFSALTCYAAMAMNVQRLSIWVLLIGTYGLMFLTMKLRNSIWGLVSTFAFTGFMGFTLAPTLNMYLYLPNGASIITSALGLTAFAFLGLSAFVLITRKDMSFLGNFITVGCFILLGAMVLSFFTNIPGLYLALSAGFILFSSAVILYQTSEIINGGETNYIMATITLFVSIYNIFVSLLSILGVASND >CP029478|2427334:2431339|2428478_2428838_+|AWM80907.1|DBSCAN-SWA MAKSMLIICQQAPWSNATVKETLDLALAGGAFDLPISLLFLEDGVFQLVKDQQPQTIEQKNITSNLQALPLFGITEIFVVEQHLYVRGLNQQQLLEPVKLVQQEELNSLLVHYDTVITS >CP029478|2427334:2431339|2429130_2429463_+|AWM80909.1|DBSCAN-SWA MKLTVNHQDIMLDDEGYLVNLQDWSPAVAKALAERESITLTESHWQIIELLRAFYQQYALSPSNRPLIKYLNQQLPTQQINSLTLNLLFNGSPAKLAAKLAGLPKPTNCL >CP029478|2427334:2431339|2429471_2430452_+|AWM80910.1|DBSCAN-SWA MIQPNMIEHPFAQYIRILGKGQNGSRHLTLEEAETAMLMVLNDEVEAVQLGAFLLLLRYQLETAEELAGFANAVRKKIQTPNIPLDIDWPTYAGKKRHYPWYLLAAKLLAAQGITILMHGAGAHTAERFYTEQFLSMLAIKHCKNWYEVETTLEDQHIAFISLGSFSPKLQQIIDLKSLLGVRSPVHSLVRLINPLQARCSLQSIFHPNYQAIHQETSRLLGDTSIIIKGEGGENEVRADNINLLLGTQQGLPWQETWPALSEQRLLKPSQLTPEHFMAVWQKKVHDEYADLVIPATIALALRGLGTPQQEALKEGTRLWQLHTND >CP029478|2427334:2431339|2428837_2429134_+|AWM80908.1|DBSCAN-SWA MNTLHLLNKSPFLGNTFDTVLAFIHEHDGILLTGDAVYALQPNTVFLMKMKQLPVTIYALNEDMAARAIDSTLDNIKTVDYSAFVRLCTEYKKVVTWS >CP029478|2427334:2431339|2430505_2431339_+|AWM80911.1|DBSCAN-SWA MISKCLFPAAGYGTRFLPVTKAMPKEMLPIVNKPLIQYAVEEAKEANLGHMAIVTGRGKRALEDHFDISYELEKQIAGSSKEYLLDGIRDLIAHCTFSYTRQIEMKGLGHAILTGKQLIGDEPFAVVLADDLCINIDGEGVLSQMVKLYNQFRCSIVAVEEVPKEEISRYGVIEGKMISDDLYTVTNMVEKPSPEEAPSNLAIIGRYILTPDIFKILENTPPGKNGEIQITDALLTQAKQGCVIAYKFKGHRFDCGSAEGFIEATNFCYENFYKKNC |
6 | uncultured_Caudovirales_phage(83.33%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|