Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029559 | Streptococcus sobrinus strain NIDR 6715-15 chromosome, complete genome | 2 crisprs | DEDDh,cas3,csa3,cas8e,cse2gr11,cas7,cas5,cas6e,cas1,csm6,DinG | 0 | 5 | 6 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP029559_1 | 448565-448648 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029559_1
|
1 spacers
spacers of CP029559_1
>1.1|448594|26|CP029559|CRISPRCasFinder TTTCATTTCCAACTTTTGACAGTCTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029559_1
The CRISPR arrays of CP029559_1 >merge|CP029559|1|448565-448648|CRISPRCasFinder CCAGGCTGTTTTGACACTTGCTAGGCAAGTTTCATTTCCAACTTTTGACAGTCTCCCAGACTGTTTTGACACTTGCTAGGCAAG >CP029559|1|1|448565-448648|CRISPRCasFinder CCAGGCTGTTTTGACACTTGCTAGGCAAG TTTCATTTCCAACTTTTGACAGTCTC CCAGACTGTTTTGACACTTGCTAGGCAAG
>CP029559.1|AWN61106.1|448111_448330_+|hypothetical-protein MARASSLATLLFHFQNSIDFDNEMSLKRADASKLLTRYKVVKHHKGLKRSGRPFLPEPENKKVRQEIGRRRQ >CP029559.1|AWN61105.1|446840_447956_+|5-methyltetrahydropteroyltriglutamate---homocysteine-S-methyltransferase MTKKYFEHVGSFLRPVELKEAREAFEAGKLSQEELTAVENRLITDLVDKQVAIGLEKITDGEFRRAYWHLDNFWGFDGVEHEHFGQGYLFHGEETGDDTAVLRGKLGFTKENHPFIAHYDFYKKLADERGVEAKITIPAPAQFLAELNRGKNAATVAEFYPSRQDFLRAIAEVYREEILALYETGARTVQLDDCTWGMLIDEDFWHTMAGAGFKKEDVIEEYLYVNNNAIKDLPSDLTINTHVCRGNFHSTYAAKGAYDDVAEAFFGRENARAYFLEYDNERSGGFEPLAAFKGLDKVAVLGLITTKDGQLEDKETIIQRIHEAAEILPLDQLWLATQCGFASTQEGNILTEEDQWKKLTLVKEIIDEVWG >CP029559.1|AWN61104.1|445916_446117_+|hypothetical-protein MGALLVYLIFFLPMLMISYCFSIFQHFRVKAIAKRGQELRLWARSLGIEENRGSRGVILYTHYINF >CP029559.1|AWN61103.1|444473_445916_+|Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln)-amidotransferase-subunit-GatB MNFETIIGLEVHVELNTNSKIFSPSSAHFGENPNANTNVIDWSFPGVLPVMNKGVIDAGIKAALALNMDIHQTMHFDRKNYFYPDNPKAYQISQFDEPIGYNGWLEAQLDDGSIKKIRIERAHLEEDAGKNTHADDGYSYVDLNRQGVPLIEIVSEADMRSPEEAYAYLTTLKEIIQYTGISDVKMEEGSMRVDANISLRPYGQEEFGTKTELKNLNSFSNVRKGLEYEVERQAKILRSGGVIRQETRRYDEANKGTILMRVKEGAADYRYFPEPDLPIFEISDDWIEEMRDSLPEFAKDRRARYVSQYGLSDYDANQLTASKATSDFFEAAVGLGGDAKQVSNWLQGEVAQFLNSENKNLEDIQLTPDNLVEMLGLIEDSTISSKIAKKVFVHLAKNGDGARDYVEKAGLVQISDPEILIPIIHQVFADNEAAVADFKSGKRNADKAFTGFLMKATKGQANPQVALKLLAQELAKLKEE >CP029559.1|AWN61102.1|443007_444474_+|Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln)-amidotransferase-subunit-GatA MSFNDKTIEELHDLLVKKEISATELTQATLEDINAREETIGSFITVAQEEALAQAKSLDEQGIDADNVLSGIPLAVKDNISTKGILTTAASKMLYNYEPIFDATAVANAKQKGMIVVGKTNMDEFAMGGSTETSYFKKTKNAWDQSKVPGGSSGGSATAVASGQVRLSLGSDTGGSIRQPAAFNGVVGLKPTYGTVSRFGLIAFGSSLDQIGPFAQTVKENAQVLNAIASEDKKDSTSAPVRISDYTSKIGQDIKGMRIALPKEYLGKGIDPQIKDNVLAAAKQFEKLGAVVEEVSLPHSKYGVAVYYIIASSEASSNLQRFDGVRYGFRADDANSLEDIYVKTRSQGFGDEVKRRIMLGTFSLSSGYYDAYFKKAGQVRTLIIQDFEKVFADYDLILGPTSPTVAFGLDTLNHDPVAMYLADLLTIPVNLAGLPGISLPSGFVDGLPVGLQLIGPKYGEETIYQAAAAFEAVTDYHKQRPKIFGGDH >CP029559.1|AWN61101.1|442705_443008_+|Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln)-amidotransferase-subunit-GatC MKISEEEVRHVATLSKLAFSDEETTEFATTLTKIVDMVELLNEVDTTGVAITTTMADRRTVLRPDVAEEGTDRDQLFKNVPEAKDYYIKVPAILDDGGDA >CP029559.1|AWN61100.1|441763_442540_-|conjugal-transfer-protein-TraX MKKSIGLNTNQLKYIALSFMVLDSAFFAFPGLPAWLHLITRFVAPLFAYLTLEGFFHTRNRKRHLLRLWSVAILMQIGDFLSQLLLGKEHLINDNIFLTLALGYSFLYFWQKARDHDRPILNSVLGSLIFLAGLFLSLIGLPFGAMVITLEGGIPILTLMLIFWAFYGHRRKQLIVFGIWSVISFLILGPDMNVSAAPSFSVWFEMFCYNSDCMSFLFLPFLFLYNGQKGSSKPIHKWFFYIFYPLHLWILHLLAFFL >CP029559.1|AWN61099.1|440526_441546_-|IS30-family-transposase MSTTNCTTKQPYCHLSEVERGKIEAFLSEGVKPAEIARRLGRSRSTISREIKRGTTKQVKQVNGKKIYFDYYFADLAQRRYVEGRQGIDYLKLEKVSEHFLKAFEEAMKASPKVHSVDSFVYAYKEEHPSETVPSTKTLYNYSHQGLLAIKAIDLPKAVRLRKKTKKRSSTQKHLGVSIEERPETINDRSVFGHWEIDSVLGTQKAGEPSILTLVERKTRYAITAYLTGKTAATVNEAVKELMGLYPIKSITADNGSEFAALNELEGVQIYYAHAYSSYERGTNENFNGLLREFVPKGKSLKTLTAEDLAKATLAINQRPRRLLNYQTAKTLFGLAQTA >CP029559.1|AWN61098.1|436661_437363_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MAYIEMKHSYKRYQMGETEIIANNDISFEINKGELVIILGASGAGKSTVLNILGGMDSNDEGQVLIDGNNIAAFNQKQLTAYRRSDVGFVFQFYNLVPNLTAKENVELASEIVDDAKDAALTLHEVGLGSRLNNFPAQLSGGEQQRVAIARALAKNPKLLLCDEPTGALDYQTGKQILKLLQNMSHQKGTTVIIVTHNASLAPIADRVIYLHDAKVNAINTNDWPQDIDTLEY >CP029559.1|AWN61097.1|435983_436541_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MTQKRHTQSKAKIKAAITELLLENNDFSSITIRQITEKANINRSTFYLHYQDKYDLIDKLMHEITDNLRKELNTNSATVKEGLIHSLTYLQSQQEFIKLIIGIAPVNFSQKTRHFISKLIETTPALFYDILNPDLPLPKDYMLTTYAASIESIYTHWVSTDNQASPEEVANMILTVRRFYQKNDD >CP029559.1|AWN61107.1|449388_450264_+|DUF3114-domain-containing-protein MPKIGSAAFWSGWKEVKNDKDPCRALRFVLDQLDLPQDLSGDLTENQALVAKFSPDLAPHDRFWSDLARQVRLVMKGKDFQEKTEFNRQLHQLRYVISSQQAQYVRQHYRKSGRTDQEALFAYLRANHLRPSLWDNARLHNKRQIKDGTFCFPDEQESYNIKVLLQFRTEFIIDGQGNFLNEVDAEKVTANGIINGASFNYGNTTKSHFRLDVCPVGPHDPAFRNQATKGYRSPNRTGRVRLARFWQERRTADFDRSLYNKNGGYAKDGQALISLIKQEKKAFKKALRARK >CP029559.1|AWN61108.1|450332_451088_-|3-oxoacyl-ACP-reductase-FabG MFQLTNQIAVVTGGAKGIGRGIASVLHQQGAKVIILDKDQAAGQATAKNLGADFYSFNVTDSQGIAQTFQMIAEKYGRLDILCSNIGIYPQAKIADMSEAEWDLIQTVNLKGTFLVVKAAAKIMRHQGYGRIVLTSSITGPITGYPGWAHYGSTKAGQLGFMRSAALEYAKAGITINAVQPGNVLTEGLKTQGESYLNEMKKTVPTHTLGAPEDIGTAVAFLASKEAHYITGQTIVVDGGQILPESFDAIL >CP029559.1|AWN61109.1|451627_452353_+|immunity-protein MEPLKEDEKKVLAIIALVFGGIALVTSWMPFINNASAVLAIIAFILGVIAFFINLKKKKVLSLLSIMIAVISFIIVLMTQASYVSTIDKALGSNDKPTSEKQEKKESSSISDSDDDKETYKVGEKITFKGKVEYTITSVEWTDERNEFEDKQPKKVLKVTYNVKNLSDDDYVIGSDFELYANGSKMESYPNENTFETISAGRSYQGATEHFAVNDDKKLELEIKPYLSFRGTPAIIPLESE >CP029559.1|AWN61110.1|453187_453502_-|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MTKENYQLRFLPLFEKDLNAIVDYISQSLQNPRAAHRLLSAVEGAINDRLARPLAFPAYPSIHKRRHPYYYIRVKNLIIFYVVIGNTMEVRKILYSKRNFDDFL >CP029559.1|AWN61111.1|453494_453755_-|prevent-host-death-family-protein MINIRPVSDLRNKFPEIEETVIKSNDPVFLTKNGYGTMVLMSLEQYDDLTSNLEKKLDEADLVAEESSVRYNKDGLFKRVRSRIDD >CP029559.1|AWN61112.1|453892_453991_+|type-I-toxin-antitoxin-system-Fst-family-toxin MWKDLFLSIVAPTFVGIVLGLFSKWLNGKDDD >CP029559.1|AWN61113.1|454207_454735_+|YqeG-family-HAD-IIIA-type-phosphatase MSIEDYLPTFAVEAVYDLKPESLRKHGISAVLVDLDNTLIAWDNPDGTPELREWLDDMTEADIPVVVVSNNKHERVKRAVDPFHVDFISRAMKPFTRGINKAIERYNFNRDEVVLVGDQLMTDIRACHRAGIRSILVKPLVTSDAWNTKFNRARERRVLKKMTQKYGPIEYQKEI >CP029559.1|AWN61114.1|454734_455853_+|ribosome-biogenesis-GTPase-YqeH MEELYCIGCGAKIQSRDKEAPGYTPQSSIEKSQETGELYCQRCFRLRHYNEIVDVAISDDDFLKLLHEVGDSQALVVNVVDIFDFNGSVIPGLSRFVAGNDVLLVGNKKDILPKSVKDGKVTQWLTERAHEEGLRPVDVLLTSAQNGQAIKELIARIEELRAGRDVYVVGVTNVGKSTLINAIIKEITGNQEIITTSRFPGTTLDKIEIPLDDGSYIFDTPGIIHRHQMAHYLSAKDLKYVSPKKEIKPKTYQLNPSQTLFLGGLGRFDFLQGDKQGFTAYFDNNLKLHRTKLQGADDFYDRHAGGLLTPPSAKELANFPKLVRHEFTITSKTDLVFSGLGWVRILAKPDSPVVVVGWAPEGVGVMVRKALI >CP029559.1|AWN61115.1|455868_456240_+|6-O-methylguanine-DNA-methyltransferase MTQSSFIAPEKYAEAIRQIPYGKVVTLADLRAYLGQDDSAPFFSGVATLIVAWSEGDDPMPYWRVLKSGGEVNAKYPGGLEAQRELLEAEGHRIIQKGKTKLRYYVKDYQEKSYLFDVKKNLM >CP029559.1|AWN61116.1|456286_456598_+|ribosome-assembly-RNA-binding-protein-YhbY MTLTSKQRAFLNSQAHAMKPIVQVGKNGLNDQIKTSVRNALDARELIKIKLLQNTDENIHEVAEILEEEIGAQSVAKTGRVLTLYKQSAKKENRKLSQKVKEI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP029559_2 | 852543-853243 | TypeI-E |
I-C,I-E,II-B
Consensus repeat of CP029559_2
|
11 spacers
spacers of CP029559_2
>2.1|852572|32|CP029559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGTTCCTGTACAATTTCTGTACGTGTTTTC >2.2|852633|32|CP029559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCAGGGGAGATGAGGCGTGTTAAATGCGAGGT >2.3|852694|32|CP029559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGAATACCATCCACCTGAGTAGTAGCGAGAGG >2.4|852755|32|CP029559|CRISPRCasFinder,CRT GCTTTATCAAATGCTGCTGAGCAGTCTAGGCA >2.5|852816|33|CP029559|CRISPRCasFinder,CRT CAAAGGCCTTGTCAGGTAGGTATTTATCGGTGA >2.6|852878|32|CP029559|CRISPRCasFinder,CRT GGTCTATCTGGTCAAGGTTCTTGACAGAAGTA >2.7|852939|32|CP029559|CRISPRCasFinder,CRT GCCGGCAAAAGCTATTCATTCCTTTTAAATTT >2.8|853000|32|CP029559|CRISPRCasFinder,CRT GAGTTTACTTATCTCTGGTTGGTTAACAAGTA >2.9|853061|32|CP029559|CRISPRCasFinder,CRT GGTATTTTGACTGCTAGGTTTCATGGCTCGTC >2.10|853122|32|CP029559|CRISPRCasFinder,CRT ATTTCCTCTCGGCCAAAGCAGTGAAACGGTTA >2.11|853183|32|CP029559|CRISPRCasFinder,CRT GGTTTTGGGGATGCTAACTGGTACGAATACTA >2.12|852879|31|CP029559|PILER-CR GTCTATCTGGTCAAGGTTCTTGACAGAAGTA >2.13|852940|31|CP029559|PILER-CR CCGGCAAAAGCTATTCATTCCTTTTAAATTT >2.14|853001|31|CP029559|PILER-CR AGTTTACTTATCTCTGGTTGGTTAACAAGTA >2.15|853062|31|CP029559|PILER-CR GTATTTTGACTGCTAGGTTTCATGGCTCGTC >2.16|853123|31|CP029559|PILER-CR TTTCCTCTCGGCCAAAGCAGTGAAACGGTTA |
DEDDh,cas1,cas6e,cas5,cas7,cse2gr11,cas8e |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029559_2
The CRISPR arrays of CP029559_2 >merge|CP029559|2|852543-853243|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCTAAAGTTCCTGTACAATTTCTGTACGTGTTTTCGTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCTGCAGGGGAGATGAGGCGTGTTAAATGCGAGGTGTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCTAGAATACCATCCACCTGAGTAGTAGCGAGAGGGTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCTGCTTTATCAAATGCTGCTGAGCAGTCTAGGCAGTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCTCAAAGGCCTTGTCAGGTAGGTATTTATCGGTGAGTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCTGGTCTATCTGGTCAAGGTTCTTGACAGAAGTAGTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCCGCCGGCAAAAGCTATTCATTCCTTTTAAATTTGTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCTGAGTTTACTTATCTCTGGTTGGTTAACAAGTAGTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCTGGTATTTTGACTGCTAGGTTTCATGGCTCGTCGTTTTACCCGCACACGCGAGGGTGATCCTATTTCCTCTCGGCCAAAGCAGTGAAACGGTTAGTTTTACCCGCACATGCGGGGGTGATCCTGGTTTTGGGGATGCTAACTGGTACGAATACTAGTTTTACCCGCACAGGCGGGTGTGGCATA >CP029559|2|1|852543-852754|PILER-CR GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCT AAAGTTCCTGTACAATTTCTGTACGTGTTTTC GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCT GCAGGGGAGATGAGGCGTGTTAAATGCGAGGT GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCT AGAATACCATCCACCTGAGTAGTAGCGAGAGG GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCTGCTTTATCAAATGCTGCTGAGCAGTCTAGGCAGTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCTCAAAGGCCTTGTCAGGTAGGTATTTATCGGTGAGTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCTG GTCTATCTGGTCAAGGTTCTTGACAGAAGTA GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCCG CCGGCAAAAGCTATTCATTCCTTTTAAATTT GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCTG AGTTTACTTATCTCTGGTTGGTTAACAAGTA GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCTG GTATTTTGACTGCTAGGTTTCATGGCTCGTC GTTTTACCCGCACACGCGAGGGTGATCCTA TTTCCTCTCGGCCAAAGCAGTGAAACGGTTA >CP029559|2|2|852543-853243|CRISPRCasFinder GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCT AAAGTTCCTGTACAATTTCTGTACGTGTTTTC GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCT GCAGGGGAGATGAGGCGTGTTAAATGCGAGGT GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCT AGAATACCATCCACCTGAGTAGTAGCGAGAGG GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCT GCTTTATCAAATGCTGCTGAGCAGTCTAGGCA GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCT CAAAGGCCTTGTCAGGTAGGTATTTATCGGTGA GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCT GGTCTATCTGGTCAAGGTTCTTGACAGAAGTA GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCC GCCGGCAAAAGCTATTCATTCCTTTTAAATTT GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCT GAGTTTACTTATCTCTGGTTGGTTAACAAGTA GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCT GGTATTTTGACTGCTAGGTTTCATGGCTCGTC GTTTTACCCGCACACGCGAGGGTGATCCT ATTTCCTCTCGGCCAAAGCAGTGAAACGGTTA GTTTTACCCGCACATGCGGGGGTGATCCT GGTTTTGGGGATGCTAACTGGTACGAATACTA GTTTTACCCGCACAGGCGGGTGTGGCATA >CP029559|2|1|852543-853243|CRT GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCT AAAGTTCCTGTACAATTTCTGTACGTGTTTTC GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCT GCAGGGGAGATGAGGCGTGTTAAATGCGAGGT GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCT AGAATACCATCCACCTGAGTAGTAGCGAGAGG GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCT GCTTTATCAAATGCTGCTGAGCAGTCTAGGCA GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCT CAAAGGCCTTGTCAGGTAGGTATTTATCGGTGA GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCT GGTCTATCTGGTCAAGGTTCTTGACAGAAGTA GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCC GCCGGCAAAAGCTATTCATTCCTTTTAAATTT GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCT GAGTTTACTTATCTCTGGTTGGTTAACAAGTA GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCT GGTATTTTGACTGCTAGGTTTCATGGCTCGTC GTTTTACCCGCACACGCGAGGGTGATCCT ATTTCCTCTCGGCCAAAGCAGTGAAACGGTTA GTTTTACCCGCACATGCGGGGGTGATCCT GGTTTTGGGGATGCTAACTGGTACGAATACTA GTTTTACCCGCACAGGCGGGTGTGGCATA >CP029559|2|2|852849-853183|PILER-CR AAAGTTCCTGTACAATTTCTGTACGTGTTTTC GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCT GCAGGGGAGATGAGGCGTGTTAAATGCGAGGT GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCT AGAATACCATCCACCTGAGTAGTAGCGAGAGG GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCTGCTTTATCAAATGCTGCTGAGCAGTCTAGGCAGTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCTCAAAGGCCTTGTCAGGTAGGTATTTATCGGTGAGTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCTG GTCTATCTGGTCAAGGTTCTTGACAGAAGTA GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCCG CCGGCAAAAGCTATTCATTCCTTTTAAATTT GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCTG AGTTTACTTATCTCTGGTTGGTTAACAAGTA GTTTTACCCGCACACGCGGGGGTGATCCTG GTATTTTGACTGCTAGGTTTCATGGCTCGTC GTTTTACCCGCACACGCGAGGGTGATCCTA TTTCCTCTCGGCCAAAGCAGTGAAACGGTTA GTTTTACCCGCACATGCGGGGGTGATCCTG
>CP029559.1|AWN61447.1|851616_852519_+|type-I-E-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MPFTVITVKNAPPSLRGDLTKWMQEIATGVYVGNFNTKVREQLWNRVENSVGHGEATISYSFRNEIGYQFATINAQREVVDYDGIPLVLLPSQAKDVGKNVALGFSNAAKFRKIKRYTSSSQSHVQSTVPYAVIDIETDGLDENEHTIIEIAAVKVSGLQIEDFDYLIKYDKVLPKNIVSLTGISQELLNQNGKDIQVVLQEFLNFIGDFDLVGYGVGFDIKFINNELRKLGYPLLENKVHDLMKYVKNEKLFLDNYKLQTALKVYGIEGEVPHRALPDSRLIYQLSTKVNKFLKRINQK >CP029559.1|AWN61446.1|850673_851615_+|type-I-E-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKEKFGAKKTSLKELPKISDRVSFIYVEHAKINRVDSAITVADSKGIVRIPAAMLGVLLLGPGTDISHRAVELIGDTGTSMIWVGEHGVRQYAHGRSLAHSTRFLEKQAKLVSNSRSRLRVARKMYQMRFPNEDVSGLTMQQLRGREGARIRKVYSLQAKKYNIPWTKRDYNPENFEDGTPVNQALSAANVALYGLVHSIIVALGASPGLGFVHTGHDLSFVYDVADLYKAETTIPIAFEIAANCQPGDDIGKITRLKVRDSFVDGKLMIQIVKDLQNLLDIEESEELVVDILALWDDKERLVKHGVSYREDS >CP029559.1|AWN61445.1|850026_850677_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas6/Cse3/CasE MYISRVEIDKNNRRKIKDLKNIESYHGWVEQSFPKEIEQNIRTRKLWRVDQLQGHYYLIIISLEKPDLKLLEKYGVRNSAQTKSYDTFLNSLKEGEVMRFRVVLNPVISLPSRDGNHKRGVVKPHTTIKHQMNYLLNRSEKNGFLLEKDDFSIVERGYEVFNKGNSKPIRLIKAIYEGILTIDDADLFRKTLTEGIGKKKAYGFGMMTAIPLGDEK >CP029559.1|AWN61444.1|849295_850021_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas5/CasD MKTILLKLAGPLQSWGTSSHFETRHTDFYPSKSAIIGLIAASLGYRRDEEQRLQRLNELDFAVRIDQQGNILRDYHIAQKYKSKGEFERTYVTNRYYLEDAIFIVAISHEDDELMSAIEKGLKNPYFQTFMGRRSLPLNADFIVETTSDSALESLKRLKWQAAEWFMSKHSHETSITLEIYADSFLSDKESNRLRQDRVISFSQKARKFGFRYEVRDLVDVSNPMAKKGETQHDIFSSIGD >CP029559.1|AWN61443.1|848206_849286_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cse4/CasC MTNNQHLFLDIHAIQTLPPSNINRDDTGSPKTAQYGGVRRARVSSQSWKRAIREYFSDNGQQSNVGVRTKDIVRYVADKIIGLDQSISLEDALQKADKVLNGAGVKTKDFKAKALFFLSDVQAKKLAQAAINDVSDKKELHEVLTSSPAIDIALFGRMVADDPSLNEDASSQVAHAISTHAVQTEFDFYTAVDDLAPEDNAGAGMLGTIEFNSSTLYRYANVAVHELLKQLGDKESLVNSLSLFIEAFAKSLPTGKATSFANQTLPQALVVTLRNDRPISLVSAFEKPVKSSEGYVTKSIEKLSDEFVKVEKFVNKPVLTFYVSLEDVEKLKNVGGIEKNSLSELLSDFSEELSNFIQE >CP029559.1|AWN61442.1|847620_848217_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse2/CasB MSEQRKARVAEVTRKILIKLSKQKDTSSGKALLARLRQSIGKPVSETVAVWPILFEDLPEEFLGHDGYTSAEEQAILTTLQLYALHQQSLSHSVFIGEENKYQNIGNSFRQLRQGEDTTAIDRRFNVMITASTFEELVYHLRHLITLLKSKSPETKVDYARLSEDLYWFLRDYQERVRLSWARDYYKRNFKGEKDNDK >CP029559.1|AWN61441.1|845934_847608_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse1/CasA MSRFNLLDEPWLSVVVDDKGSTKEVSLLDLFINAHQYKDLAGDTKTQDFAVLRVLLAVLHTVFSRFDADGNPYDYLEIDERFRQIEEVEEDDIDKYEEDLYDTWTNLWEQGKFPEIISQYLEKWRDRFYLFDDDYPFFQVKMKVLQKKFDLSNKLGELTGKTMNRLISESGNKAALFSPRADLDNNKEKLSEPEIVRWLLTYHSSTEVGGRLKSLGSTTSSGWLFRKGGIYFKGTNLFETLLMNCILPYKEYNNLKHTQKPCWEYEYLEIIQNYFDEVEPDNIASLYTTWSKGVDIDAKLNLPYFKCNIIKLPSINCEDYFLEPMTLWKYQDKIGKFIPKEHTINQSLWRSFGLLTENSSGKNYRTPGVINWFREIKNEIAKDKLVSICAVGVEMKSDANHTISDEITDYLFINEFVLADLEEGGWIPRINDTVEETKKVISRTYKRYIDDIKEIRKARSDLFTSQKVEELYFKIDQPFRQWLASLQPNDEKDTRVLEWREILDELVREEAELTLHSGGPRDYIGIVKRDPNKDSSEFINIATAYNKFNYCLNQNLK >CP029559.1|AWN61440.1|838207_842872_+|glucosyltransferase MEKKLHYKLHKVKKHWVTIAVASIGLVSLVGAGTVSAEDKVANDTTAQATVGVDTGQGQATTNDANTNTTDTDTSDQSANTNQDQAGSNQSNNQDQAKQDTANTDQNQADNSQTDNNQATDQATSPATDGTSVQRRDAANVATAADQEGQTDPSEQEKSAALSLDNVKLIDGKYYYIQADGSYKKNFAITVNGQMLYFDSDTGALSSTSTYSFSQGTTNLVDDFSSHNKAYDSTAKSFELVNGYLTANSWYRPVDILRNGQTWEASNENDLRPVLMSWWPDKDTQVAYVNYMNKYLSANETEVTNETSQVDLNKEAQSIQTKIEQKITSDNSTQWLRTAMEAFVAAQPKWNMSTENFNKGDHLQGGALLYTNSDLTPWANSDYRLLNRTPTQQDGTKKYFTEGGEGGYEFLLSNDVDNSNPVVQAEQLNQLHYLMNWGDIVLGDKDANFDGVRVDAVDNVNADLLQVYSNYFKDNYKVTDSEANALAHISILEAWSLNDNQYNEDTNGTALSIDNSSRLTSLAVLTKQPGQRLDLSNLISESVNKERANDTAYGDTIPTYSFVRAHDSEVQTVIAKIVKEKIDTNSDGYTFTLDQLKDAFKIYNEDMAKVNKTYTHYNIPAAYALLLSNMESVPRVYYGDLYTDDGQYMAKKSPYYDAIATMLQGRIAYVSGGQSEEVHKVNGNNQILSSVRYGQDLMSADDTQGTDLSRTSGMVTLVSNDPNLNLGSDSLTVNVGKAHANQAYRPLILGTKDGVQSYLKDSDTNIVKYTDANGNLTFTADDIKGYSTVDMSGYLAVWVPVGAKDGQDVRVAADTNQKADGKSLKTSAALDSQVIYEGFSNFQDFANNDADYTNKKIAENADFFKKLGITSFEMAPQYVSATDGSFLDSIIENGYAFSDRYDLAMSKNNKYGSKDDLANALKALHANGIQAIADWVPDQIYQLPGEEVVTAKRTNSYGKPTFDAFINNTLYAANTKSSGSDYQAQYGGAFLDELKAKYPDMFSVNMISTGKPIDSSTKIKQWEAKYFNGTNVLGKGAGYVLSDDATGKYFTVNENGDFLPASFTGDQNAKTGFYYDGTGMTYYSTSGNKAVDSFVYEGGHYYYFDKDGHMVTGSYKAVDGNDYYFLPNGIQMRDAIYQDDKGNSYYYGRTGILYKGDNWYPFTDPKNSNKTVFRYFDANNVMAIGYKDMYGQTYYFDENGYQAKGELLTDAKGTHYFDEDNGAMAKNKFVNVGDDWYYMDGNGNAVKGQYPVDNQILYFNPETGVQVKGQFITDAQGRISYYDGNSGALKSSGFFTPNGSDWYYAENGYVYKGFKQVAENQDQWYYFDQTTGKQAKGAAKVDGRDLYFNPDSGVQVKGDFATDESGNTSFYHGDNGDKVVGGFFTTGNNAWYYADNNGNLVKGFQEIDGKWYHFDEVTGQQAKGAALVNGQQLYFDVDSGIQVKGDFVTDGQGNTSYYDVNSGDKKVNGFFTTGDNAWYYADGQGNLAKGRKSIDNQDLYFDPATGKQVKGQLVSIDGRNYYFDSDSGNMAKNRFVRIGDQWIYFGNDGAATNL >CP029559.1|AWN61439.1|837175_837769_+|restriction-endonuclease-subunit-S MKLIEDYLANPVKKLPLGQVARAFKGKAVSGKADPGRISYINLSDMTEFGIDYDHLKTFDDEQDKLQKYLLETGDVLVASKGTVKKVAVFEGQDFPIVASSNITVLRPIEELNGFYLKLFLESDLGQALIDTADKGKAVLNISTAQLLEIPVPQIPLVKQNYLVQYAYKGQADYERKLARAQQEWEHIKQEVAKNLF >CP029559.1|AWN61438.1|836386_836890_+|thiol-peroxidase MPTFFGEPVTIAIDKQFQVGDIAPDFTLMASDLSQKSLSDFAGKKKVLSIVPSIDTGVCSTQTRIFNKELSELADTVVITVSADLPFAQEKWCGVQGLDEAIMLSDYYDNHFGQAYGVLMEEWHLLARAVLVLDEKNKITYTQYLDNINSEPDYQAAIAAVKALKSL >CP029559.1|AWN61448.1|853377_854733_+|divalent-metal-cation-transporter MESPKNNYRANKASLSEVNQSVAVPETASFWRTLKAFIGPGALVAVGYMDPGNWITSVVGGASYKYLLLSVVLISSLMAMQLQQMAGKLGIVTRQDLAQATANHLPVWLRYILFVIIELALMATDLAEVIGSGIALHLLFGWPLMLSIFVTILDVFLLLGLMKLGFRKIEAVVSTLIMTILLIFVYLTVISQPSISGIFKGFVPSASIFDLQQTGANSKLTLALGIIGATVMPHNLYLHSSISQTRRVDYDNPESIRRAVRFMTWDSNIQLSLAFIVNSLLLILGAALFYGHASEISAFAQMYNALADPKIAGSVASGLLSTLFAVALLTSGQNSTITGTLTGQIVMEGFVHLRLPQWFIRLVTRLLALLPVILAALIWGSREKVLDQLIVYSQVFLSLALPFSIFPLIYFTSSKKLMGEHKNAIWNTALAYGVAVILTILNIKLIIDLFQ >CP029559.1|AWN61449.1|854911_859021_+|glucosyl-transferase MEKNLRYKLHKVKKQWVAIGVTTVTLSFLAGGQVVAADTNNNDGTSVQVNKMVPSDPKFDAQAQNGQLAQAMFKAANQADQTATSQVSPATDGRVDNQATPAANQPAANVANQDVANQAANAGDLNRQSAADTSTDGKALPQTKDQPGHLETVDGKTYYVDANGQRLKNYSTVIDGKTYYFDGQTGQAQTDLPKTGQDNQQNVPDSYVANNQAYSNEASSFEAVDNYLTADSWYRPRKILKNGQSWQASSEGDLRPILMTWWPDAATKAAYANFWAKEGLISGSYRQNSANLDAATQNIQVAIEKKIAAEGNTNWLRDKMSQFVKLQNQWNSASEDKTDYPNQDHLQGGALLFSNSDATPQANSDWRLLNRNPTNQTGQQKYFKTNYAGYELLLANDVDNSNPIVQAEQLNQFHYLMNWGEIVMNDKDANFDGVRVDAVDNVDADLLQIQRDYYKARYGTDQNEKNAIDHLSILEAWSGNDNDYVKDQNNFSLSIDNDQRSYMLAAFANPANKRGNYLGQLATVGLKNRTGNNNSDPVPNYVFIRAHDSEVQTRIAKIIREKLGKTNADGLTNLTLDDLNKAFDIYNQDMNSVDKQYYPNNLPMAYAWMLQNKDTVTRVYYGDMYTDNGQYMETKTPFYNAIEALLKGRIKYVAGGQAVGYNQWNRVLTSVRYGKGANSINDAGDATTRNSGMALLINNQPNFRANSNITLNMGAAHRNQAYRPLLLSTQNGTATYLNDSDVNSSQYKYTDGQGRLTFNASEFRGVSNVQVSGMIQVWVPVGAAADQDVRTAPSTSATRDGNIYHQSDALDSQVIYEGFSNFQAFAQNPDQYTNAVIAKNADLFKSWGITQFEMAPQYVSSEDGTFLDSVIFNGYAFSDRYDLAMSKNNKYGSKQDLANAIKGLHAAGIKVLADWVPDQMYNLPGKEVVTATRVDEYGRTRSGATINKTPYVVNTKTYGDYQEQYGGKFLNDLQKLYPSLFTTKQISTGKPIDPSVKITNWSAKYFNGSNILGRGAKYVLSEGNKYLNLTGGKLFLPTVLNNTYGQPQASSKGFVSKADGIHYLDENGQEVKNQFKEIAGSWYYFDANGKMATGQTKVGDDTYLFMPNGKQLKEGILYDGNKAYYYDNNGRTWTNKGFVEFRVNGQDKWRYFNGDGSIAIGLVTLDNRTLYFDAYGYQVKGQTVTINGKSYTFDADQGDLEKTDNQDNPNPAPDNQGGWESLGDNQWGYRRNGKLLTGHQTIDGHQVFFQDNGVQVKGGTAKDASGVLRFYDRDQGRQAGKGWYSTSDNNWVYVDDSGKVLTGLQDINGQTVYFDENGIQAKGKGVWDNNGGLRYFEADSGNMIRDRWKNVDGTWYYFNRDGLASYYRW >CP029559.1|AWN61450.1|859326_863853_+|glucosyltransferase MERKLHYKLHKVKKQWVTIAVASAGLASIVGAGSVGQTVSADDLAQDQSSASEQKAASDQKQEEVASDAANTASAKVTSEKEVSQASDTTSESSQVQSQDQASAKQASDLAPATKAAPQAESQAGTSTASSEAAPAASSQEVAKSTTGSVSQNEEAAALSLANIKKIDGKFYYVMADGSYKKNFAITVDGQMLYFDAKTGALSSTSTYSFSQGLTPIVSDFSVNNKAFDSSEKSFELVDGYLTAESWYRPAKILENGKTWVDSKETDLRPVLMSWWPNKDTQVAYLNYMSKALGGKEEFTTETSQLTLNTAAELIQAKIEARVSKEQGTKWLREAMAAFVATQSRWNKDSEQYDKADHLQGGALLYTNNNLTEWANSNWRLLNRTPTRQDGKTHYSKADKYGGYEFLLANDVDNSNPVVQAEMLNQIHYLMNWGEIVMGDKNANFDGIRVDAVDNVNADTLQLYTNYFNSVYGVNKSEAQALAHISVLEAWSYNDNDYNQDTNGAALAMDNGLRFSLLYTLTRPINERTPGMSTLIKSEYGLTDRTKNDKYGDTQPSYVFVRAHDSEVQTVIAQIIKEKIDPTTDGFTFTLDQLKQAFEIYNKDMNSVNKHYTHYNIPAAYAVMLSNMESVTRVYYGDLFTDDGQYMASKSPYYDAINTLLRARIRYAAGGQIMEHNSYKPSAAMKAAHPDAGNVLGNSEVLVSVRFGQDVMSADDMTGGKLAKTSGMFTLISNNPELELDVNEEIKVNVGKIHAGQAYRPLLLTTDKGLQKYLNDSDTKLTKVADKDGFITFKGSEIKGYKQVEVNGYLSVWVPVGAKADQDIRVAPSTAAKGEKAKTYTASQALESQLIYEGFSNFQDFVQKDSQYTNKKIAENTDLFKAWGVTSFEMAPQYVSATDGTFLDSIIENGYAFTDRYDLAMSKNNKYGSKEDLANALKALHAAGIQAIADWVPDQIYQLPGKEVVTASRVDNYGRVKVDQPLVEKLYLANTKSSGKDFQAKYGGEFLAELQKKYPEMFTTKMISTGKTIDPSVKLKEWSAKYFNGTNVLDRGTDYVLSDEGTGKYFTVNENGDFLPASLTGNKDAKTGFYNDGKGIVYYTTAGNKAKSAFVTEAGNTYYFDYTGHMVTGPNVINTKFYYFLPNGVMLKDAIKQDEKGRSVYYGKTGVMYKGGRDNEWFAMTDSKGQMRFRHFDNYGFMSMGLVTIHGNVQYYDEEGFQVKGEFVTDKDGQTRYFDQGSGNLVKGQFLNKDGNWYYLDDQGLVAKGAQTIKGQKLYFDTKTGVQVKGDFVTDKDGNTFFYSGDTGDLILGQFFSTGNNAWFYADENGHVAKGAKTIRGQKLYFDTKTGQQAKGRFIRDDKGVRYYDADTGTLVTNAFLETKAGSNQWYYMGADGYAVKGNQTIKNQHMHFDAETGQQAKGIIVTDANGRKYFYDTFTGSRVVNQFVLVNGNWYFFGYDGAAVTGFHDIKGQHLYFNSDGTQAKGTTVKIGNRSYTFDAHTGELTSVHYG >CP029559.1|AWN61451.1|864101_864422_+|hypothetical-protein MKSPIKKILFTSALVAAIFAAGSSVSALGVTETNRYGRAENPNLHRTFYDYNVHNMDINGNPIQEQGTDFSQYYWRGDESGSTTSYDENTHVTTTITYTVRYWEAK >CP029559.1|AWN61452.1|864583_864814_+|DUF1858-domain-containing-protein MTNTIDLSRPVAEILEEHPELKDILLELGFKPLANPLMLKTLGRTTSLKAGSKLAKIPLEKIKQTLEFNGYEVKGD >CP029559.1|AWN61453.1|864815_866225_+|DUF438-domain-containing-protein MAEERIEILKDILLDLHQGSSPEAVQERFDRTFKGVSALEISLMEHELMSDEKSGVTFEDVMDLCDVHANLFKNAVQGVEVADSDQPGHPVYVFKQENLALRGALLRIRRLLENLAQPENEEFQTDILKGLKNQIRLLGQFRRHYQRKEELFFPIMESYGHDSPPRVMWGVDDEIRQLFKDFQTKVEELPALEISIVRQSFEAFADEFEQMIFKEESILLMILLEIFTQDDWLKIAEESEAVGYAIVKPEEVWIPKRESFEPNQPSPADSNQLERDSKVVDEQTSKQSQANNPRPLDWDATNKQEQIIETPAGQFTLTFEPRKEALDRQVPQKFTNGYLSLDQANLILDHLPLEVTFVNKDDIFQYYNNSVSAKDMIFKRVPSQIGRNVELCHPPRVLDKVKKVFELLKTGQKDKVTMWFKSQKKGKFVYVTYAAVRDQAGEFQGVLEYVQDIQPFFDLEGDSQRDIID >CP029559.1|AWN61454.1|866300_867185_+|tRNA-pseudouridine(55)-synthase-TruB MINGIINLKKEAGMTSHDAVFKLRKILGEKKIGHGGTLDPDVTGVLPIAVGKATRVLEYMTESGKVYEGQITLGYSTTTEDASGELVRETPVTQEQLTEEAVDQAMATFLGEITQVPPMYSAIKVNGRRLYDYARAGEEVERPHRQVTISEFARISPLSFENGLCRFDFRVACSKGTYVRTLAVDLGVELGLASHMSALRRTASAGLVLEKSFSLAEIADQLERGEADFLLPLEYGVLDLPRVELEKAQKTEISFGRFIRLDSQEAILAAFYEDRVQAILERRGYLYKPRKVLI >CP029559.1|AWN61455.1|867187_868108_+|bifunctional-riboflavin-kinase/FAD-synthetase MMKIIEIDSYQAIEQEEATVLVLGYFDALHRGHKVLFDKAREIAKRDQLKIAVLTFFESPKLAFARFEPDLLKHITYPEKRYAKFADYGVDYLYLTNFTTAFSQISSDDFIKDYLGQLKAKAVVVGFDYKFGHNRTDADYLARNFSGPVYTVAEVSQDGQKISSTRIRHLIAQGDVAKVNQLLGYEFSTRGIVVHGDARGRTIGFPTANLATLDRTFLPADGVYVTDVLLKGQRYRAMTSIGKNVTFGGTELRLEANIFDFSGDIYGEELEIIWLNKIREMVKFNGIDDLVDQLHQDQKIAKEWTL >CP029559.1|AWN61456.1|868347_868761_+|transcriptional-regulator-Spx MITLFLSPSCTSCRKARSWLTNHEVAFQEHNIITSPLSADELRAVLALTENGTEDIISTRSKVFQKLDLDVDDLSISELIDLIAKNPSLLRRPIILDKKRMQIGFNEDEIRAFLPRHYREQELRQATIRAELESDHD >CP029559.1|AWN61457.1|868753_869032_+|hypothetical-protein MTKNYSYPLDASWSTEEIASVLYFLNQVEAAYESKAKTETLLEAYRSFKRVVPSKMQEKQIDREFEKSSGYSSYRAVQAARINAGGWVSLER |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029559_1 | 1.1|448594|26|CP029559|CRISPRCasFinder | 448594-448619 | 26 | NZ_CP053834 | Arcobacter cloacae strain LMG 26153 plasmid pACLO, complete sequence | 159084-159109 | 6 | 0.769 |
CP029559_2 | 2.11|853183|32|CP029559|CRISPRCasFinder,CRT | 853183-853214 | 32 | MN694191 | Marine virus AFVG_250M444, complete genome | 25897-25928 | 8 | 0.75 |
CP029559_2 | 2.11|853183|32|CP029559|CRISPRCasFinder,CRT | 853183-853214 | 32 | MN694065 | Marine virus AFVG_250M443, complete genome | 30835-30866 | 8 | 0.75 |
CP029559_2 | 2.3|852694|32|CP029559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 852694-852725 | 32 | NC_031062 | Erwinia phage vB_EamP_Frozen, complete genome | 17077-17108 | 9 | 0.719 |
CP029559_2 | 2.3|852694|32|CP029559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 852694-852725 | 32 | KX098391 | Erwinia phage vB_EamP_Gutmeister, complete genome | 13100-13131 | 9 | 0.719 |
CP029559_2 | 2.3|852694|32|CP029559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 852694-852725 | 32 | KX098390 | Erwinia phage vB_EamP_Rexella, complete genome | 16892-16923 | 9 | 0.719 |
CP029559_2 | 2.3|852694|32|CP029559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 852694-852725 | 32 | KF806588 | Erwinia phage Ea9-2, complete genome | 17499-17530 | 9 | 0.719 |
CP029559_2 | 2.12|852879|31|CP029559|PILER-CR | 852879-852909 | 31 | NC_008043 | Ruegeria sp. TM1040 megaplasmid, complete sequence | 336350-336380 | 9 | 0.71 |
CP029559_2 | 2.6|852878|32|CP029559|CRISPRCasFinder,CRT | 852878-852909 | 32 | NC_008043 | Ruegeria sp. TM1040 megaplasmid, complete sequence | 336350-336381 | 10 | 0.688 |
CP029559_2 | 2.11|853183|32|CP029559|CRISPRCasFinder,CRT | 853183-853214 | 32 | LC494302 | Escherichia phage SP27 DNA, complete genome | 312993-313024 | 10 | 0.688 |
CP029559_2 | 2.11|853183|32|CP029559|CRISPRCasFinder,CRT | 853183-853214 | 32 | MK817115 | Escherichia phage vB_EcoM_phAPEC6, complete genome | 163545-163576 | 10 | 0.688 |
CP029559_2 | 2.11|853183|32|CP029559|CRISPRCasFinder,CRT | 853183-853214 | 32 | NC_027364 | Escherichia phage PBECO 4, complete genome | 317674-317705 | 10 | 0.688 |
CP029559_2 | 2.11|853183|32|CP029559|CRISPRCasFinder,CRT | 853183-853214 | 32 | MH383160 | Escherichia phage UB, complete genome | 30812-30843 | 10 | 0.688 |
CP029559_2 | 2.11|853183|32|CP029559|CRISPRCasFinder,CRT | 853183-853214 | 32 | MK327931 | Escherichia phage vB_EcoM_G17, complete genome | 188849-188880 | 10 | 0.688 |
CP029559_2 | 2.11|853183|32|CP029559|CRISPRCasFinder,CRT | 853183-853214 | 32 | LT603033 | Escherichia phage vB_Eco_slurp01 genome assembly, chromosome: I | 254502-254533 | 10 | 0.688 |
CP029559_2 | 2.11|853183|32|CP029559|CRISPRCasFinder,CRT | 853183-853214 | 32 | KM507819 | Escherichia phage 121Q, complete genome | 313629-313660 | 10 | 0.688 |
1. spacer 1.1|448594|26|CP029559|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053834 (Arcobacter cloacae strain LMG 26153 plasmid pACLO, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.769
tttcatttccaacttttgacagtctc CRISPR spacer tttcatttacaacttttgacatctct Protospacer ******** ************ ....
2. spacer 2.11|853183|32|CP029559|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694191 (Marine virus AFVG_250M444, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ggttttggggatgctaactggtacgaatacta CRISPR spacer tatacttgggatgataactggtacgaagacga Protospacer .* .* ****** ************* ** *
3. spacer 2.11|853183|32|CP029559|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694065 (Marine virus AFVG_250M443, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ggttttggggatgctaactggtacgaatacta CRISPR spacer tatacttgggatgataactggtacgaagacga Protospacer .* .* ****** ************* ** *
4. spacer 2.3|852694|32|CP029559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_031062 (Erwinia phage vB_EamP_Frozen, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
agaataccatccacctgagtagtagcgagagg CRISPR spacer cacgtaccatccacctgagcagtagggatatc Protospacer . .***************.***** ** *
5. spacer 2.3|852694|32|CP029559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX098391 (Erwinia phage vB_EamP_Gutmeister, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
agaataccatccacctgagtagtagcgagagg CRISPR spacer cacgtaccatccacctgagcagtagggatatc Protospacer . .***************.***** ** *
6. spacer 2.3|852694|32|CP029559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX098390 (Erwinia phage vB_EamP_Rexella, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
agaataccatccacctgagtagtagcgagagg CRISPR spacer cacgtaccatccacctgagcagtagggatatc Protospacer . .***************.***** ** *
7. spacer 2.3|852694|32|CP029559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KF806588 (Erwinia phage Ea9-2, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
agaataccatccacctgagtagtagcgagagg CRISPR spacer cacgtaccatccacctgagcagtagggatatc Protospacer . .***************.***** ** *
8. spacer 2.12|852879|31|CP029559|PILER-CR matches to NC_008043 (Ruegeria sp. TM1040 megaplasmid, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
gtctatctggtcaaggttcttgacagaagta CRISPR spacer aattatctgatcaaggttcatgacagcccaa Protospacer . .******.********* ****** *
9. spacer 2.6|852878|32|CP029559|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_008043 (Ruegeria sp. TM1040 megaplasmid, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ggtctatctggtcaaggttcttgacagaagta CRISPR spacer caattatctgatcaaggttcatgacagcccaa Protospacer . .******.********* ****** *
10. spacer 2.11|853183|32|CP029559|CRISPRCasFinder,CRT matches to LC494302 (Escherichia phage SP27 DNA, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ggttttggggatgctaactggtacgaatacta CRISPR spacer gacccgatggatgctaactggtatgaaaactt Protospacer *.... . ***************.*** ***
11. spacer 2.11|853183|32|CP029559|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK817115 (Escherichia phage vB_EcoM_phAPEC6, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ggttttggggatgctaactggtacgaatacta CRISPR spacer gacccgatggatgctaactggtatgaaaactt Protospacer *.... . ***************.*** ***
12. spacer 2.11|853183|32|CP029559|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_027364 (Escherichia phage PBECO 4, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ggttttggggatgctaactggtacgaatacta CRISPR spacer gacccgatggatgctaactggtatgaaaactt Protospacer *.... . ***************.*** ***
13. spacer 2.11|853183|32|CP029559|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH383160 (Escherichia phage UB, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ggttttggggatgctaactggtacgaatacta CRISPR spacer gacccgatggatgctaactggtatgaaaactt Protospacer *.... . ***************.*** ***
14. spacer 2.11|853183|32|CP029559|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK327931 (Escherichia phage vB_EcoM_G17, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ggttttggggatgctaactggtacgaatacta CRISPR spacer gacccgatggatgctaactggtatgaaaactt Protospacer *.... . ***************.*** ***
15. spacer 2.11|853183|32|CP029559|CRISPRCasFinder,CRT matches to LT603033 (Escherichia phage vB_Eco_slurp01 genome assembly, chromosome: I) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ggttttggggatgctaactggtacgaatacta CRISPR spacer gacccgatggatgctaactggtatgaaaactt Protospacer *.... . ***************.*** ***
16. spacer 2.11|853183|32|CP029559|CRISPRCasFinder,CRT matches to KM507819 (Escherichia phage 121Q, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ggttttggggatgctaactggtacgaatacta CRISPR spacer gacccgatggatgctaactggtatgaaaactt Protospacer *.... . ***************.*** ***
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
487537 : 496421
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP029559|487537:496421|DBSCAN-SWA TATGACTGTTTACAATTTCTCAGCAGGACCTGCTACCTTGCCTAAGCCCGTTCTGGAACAAGCTCGCGATGAGCTGCTTGATTATCAAGGCTCCGGAATGTCCGTGCTGGAAATGTCCCATCGCTCTCCAGAATTTGACAAGATTATTAAAGATGCGGAAAAACTCTTGCGGGAGCTGATGGCCATCCCTGATAACTACAAGGTACTATTCCTGCCAGGTGGGGGTTCTCTCCAATTTACCATGGTTCCCCTCAATCTTGCTCAAGGCAAGAAGGCCTATTATCTAGTCGGCGGTTCTTGGGGTAAGAAGGCCTATAATGCAGCGGTGCTCCTGTCTAAGACCGTTCCTTTTGAGCCAATTCTCCTAGCTTCCTCAGAGGATACGGTCTATGACCATATTCCTGATTTTGACCCAGCCAGCATTGATAAGGATGCGGCCTATGTCCACATCACAACCAACAATACCATTGAAGGGACCTCTATCTATGACCTGCCCGACACCAATGGTGTGCCAATCGTGGCCGACATGTCTTCTAACATTCTGGCAGCCCGCTATAATGTCGAAGACTTTGCCCTCATTTATGCTGGAGCTCAAAAGAATATTGGCCCAGCAGGAGTGACCGTGGTTATTGTCAGAGAGGATTTCCTCAATGACCAACCTCAGCTATCAGCCATGCTGGACTATCGGATTCAAGCAGATTCCGGTTCCCTCTACAATACGCCACCAGCTTATAATATCTATATCGCTAAATTGGTCTTTGAATGGGTGAAAAACACTATCGGCGGTGTCGATAAGATGGCCCAAATCAATCGTGAAAAATCTGGCCTGCTCTACGATTATATTGAGCAATCAGATTTCTACACCAGCCCTGTCAAGAAGGTCGAGGATCGCTCCGTTACCAATATTCCATTTGTGGCCCCAAGTAAGGATTTGGATGCTGAATTTGTCGCAGAAGCTGATAAATTAGGTTTCAAGAATATCAAGGGTCACCGCAGCGTTGGTGGCATGCGGGCTAGTCTCTACAATGCCTTCCCAAGACAAGGCGTTTTGGACCTGATTGACTTTATGAAGGACTTTGAAGCCCGCCATCAATAAAAGTAGGAGTACCACCTTCACTTATATCTAAGGAGAATCATGGAAATTCGCTTAGCCTTTCCCAATGAAGTGGAAAGCATCATGACCATCATTGAAGGTGCCAAAAACTACCTGGCTCAATCCGGTAGTGACCAGTGGCAGTCTGACTATCCCAATAAAGAGACCATTTTTGAGGATGTTCTCCAAGGACGGGGCTGGGTTGGCCTTGAAGATGGTCAACTGTTGGCCTACGCTGCTGTGATTGATGACCATGAACCAGCCTATGATGCCATCTACGATGGCAAGTGGGGGCACAATAATCACCGCTATATCACCTTTCATCGCCTGGCCCTAGCCGAATCTGCCCGAGGTCAAGGTCTGGCTCAGACCTTCTTGCAGGGGCTGATTGAAGGCCACGATGGCCCTGATTTTCGCTGTGATACCCATGAGAAAAACAAGGCTATGCAGCACATCTTAGAAAAGTTGGGCTTTCATTACTGTGGCAAGGTCGTCTATGAAGGTGAACGTCTGGCCTATCAAAAGATTAAGTCAAAGGCTGAAAGAGGCTTCTATCAAGAAGTGGACGAGGCTGACCACCACGCCATCTAATCAGGCAGAAATAGCTATCCAATTCCAAATGAGGATAGCTATTTTCATAGAATTCTAGATAAGCATCAAAACTGAAAGTCTATTTAAGAAAAATCAATTGTTTTTGGAATTAAGTCTAACGAAGTGAGGAAAACCTGATATTTTCGCCGTAGTGGCGTTATTAGCAACAAAAGTCTTGTTGCTAATAACGGATTTTTTGAGACCTTAGGCTCAAAAAATAGGAATGGAACGCCAATGGCGGTCGCTTCCGTCCGCACTACCTCAGAAAATATCAAAAAATAACTTTTGATTTTTAATAAGTGTAGAATTTTTCAATTAAAAAGGAGAAAATATGGTTTATAGTGTCAAAACCTTTAACAATATTAATCAACTGGGCCTCAAGGAATTGGGCAATAAGTTTCAGGTAGACGGTGATTTGGCAGAAAATCCCGATGCCTTTATTATCCGCAGTCAAAATCTGCACGGCATGGAGTTTCCAGCCAACCTAAAAGCCATCGCTCGAGCCGGGGCAGGCACCAATAATATCCCCGTTGCGGATGCGACCGAAAATGGGGTCGTGGTTTTCAATACCCCAGGTGCCAATGCCAATGCCGTCAAAGAAGCTGTTGTCGCTGCCATGTTGCTATCTGCCAGGGATTATATCTCTGCCAATGCCTGGGTCAATACCCTTTCTGGTGACGAAGTTCCCAAACAAGTTGAAGCAGGTAAGAAGCAGTTTGCTGGTAGTGAAATTCGTGGCAAAACCCTTGGTGTCATCGGTCTTGGTGCCATCGGAGCTCGGATTGCCAACGATGCCCGCCGTCTAGGTATGTCCGTCATGGGTTATGACCCCTATGTCTCTATTGAAGCCGCTTGGAATATTTCCCATCATGTCAAGCGAGTTCAGGACATCAAGGAAATCTTTGCCAATGCCGACTACATTACCATCCATGTTCCTCTGACAGATGCCACTCGTGAGACCTTCAATGCCGATGCCTTTGCTCTCATGAATAAGGGAACGACCCTGATCAATTTTGCTCGGGGCGAGCTGGTCAATCACCAGGACCTATTTGAAGCCATTGAAACGGGCGTGGTCAAACGCTATATCACCGACTTTGGTGATGAAGACCTCCTCAATAAGGAAGGGATTACGGTTTTCCCTCACCTCGGTGGTTCGACCGCAGAAGCAGAGCTCAACTGTGCCAAGATGGCCAGTCAAGAAATTCGCCAGTTCATGGAAACCGGTGAAATTACCAACTCAGTCAATTTTCCAAATATGCACCAGGCCCTGGAAGCCCCTTACCGTATCACCCTGATTAATCGCAATGTCCCAAATATTGTGGCCTGGATTTCAACAGCGGTTTCTGAGGCCAATATTAATATTGCCAATATCCTTAACCGCTCCAAGGGCGACTACGCCTATACCCTCTTGGACCTAGACGAAAGCGACCGTGACAAGATTGATGAGCTGGTGGCCACCTTTGAAGCTAGTGAAAGTATCATCAAGGTGCGTCTGATTCAAAAGCCCTGAATAAACAGACCAAGCAGCATCCCCTAAAGATGCTGTTTTTTGATACAATAGGGATAATTTATTAGGAGGTATTAGGATGGATAAACAATCATTAAAAGCTTATCAAAAATCATTGGGAGATCGGTTTTACGCCCTCAGTTTTAAAGGTCAAGGAACCGGTTTTCTTGGAGCAAGCATTTTATATGTGGACGGTGAAACGGGTATTGAATATCTTTTTGTTGGGATGGGAGGCGGTAGTCTGACTCCACTGCTCAATCCTGATGGCAGTCCTAAAATCAATGAAAGATGGCGTAATGGCGAGCTATGATTGACAAGCAAATCTACCAGTCCCCTCTTGGCCCCATTTCTCTTCTAGCTGATGACCAGGACCTGCTGGGCTGCTGGTTTCTCGGTCAAAAATACTTTGAGCGAGGCTTTGAAAAGGAGCCTCTGGCGGAGGAGAACTCGTCAGTTTTAACCCAGGCTAAGTCCTGGCTTGATGCCTATTTTGCTGGTCAAAATCCTCAGCCTGCTGATTTTCTAGCTCCAAGAGGGACCACTTTTCAGAAGCAAGTCTGGCAGGTTCTAAGAGAAATTCCGACCGGTTCCAGTCTGACCTATGGACAGATAGCAGGGCGTGTAAACTGTCGCTCCGCCCAAGCTGTGGGCTCAGCTGTCGGCAAGAATCCCCTTAGTATCTTTATCCCCTGCCACCGAGTCCTAGGTTCTCAAGGCCAGCTGACTGGTTATGCTGGTGGTCTGGACAAGAAAGTCTGGTTGCTGGAGCACGAGGGCCATGTTATTAAATTGAGAAATAAGGAAGGAAAGAAAAATGATTACTTTTTACCATTATCCTAAATGCACAACCTGCCAAAGAGCCAAAAAGGAGCTGGATGACTTAGGCATTTCCTACCAGGCCATTGACCTCAAGGAAAATCCACCGACTGCTCAAACTCTGGGAGAGCTCCTAGACTCATCCGATTACAAGCTCAAACAACTCTTTAACACCAGTGGTAACAGCTATCGGACCTTGGGTCTCAAGGATAAATTTGCCAGCCTAACTAGAGAAGAAGCACTGGACCTCCTAGCAGCTGATGGCATGCTGATCAAGCGTCCCCTCCTGGTCAAGGATGGTAAACTCCTGCAAGTCGGGCATAGGAAGTCTTATAAGAAACTGGATTTAAATTAAAAAATCTGAATCATTGAAGATAGACAACATTTCCCATTAGTTAGGCTGAACTATCTGGGCTAGTCTTAAGTTTTATGCTATCATGATGATAAAGTAATTTTTAGGAGAAATGTGATGCTGGGAAAATCACTTGAACTCGGCGAGCTGTATAAAGAACTAAGAATCGCTAGGGGGTTAAAACAAAGAGATGTGGCTAGAGATAATCTCTCAGTTTCTCAATTATCTAAGTTTGAGAACGGACAAACCATGTTGGCAGCTGATAAGCTTCTCATAGCCATTCAGGGTATTCATATGACTTTTTCAGAGTTTAGTTATGCTTTAACTCAATATCAAGAATCTGATTTATTTAAGATTGGTCAGAGACTAGTAGAGCTTCAGGCAAAAAAAGATGTTGAGAGCTTGAAGGATATTTTAGTTAGTTATCAAGATGAAGAAACCTATGAGGTCTATAACCGGCTTAATAAATTAGTGATTAAGTCTATAATTTATAGTTTGGACTCTAGTTTTGAAATAGCTAATGACGAAAAAGAATTTCTAACTACTTATCTCTATTCCATAGAGGAGTGGACGGAGTATGAACTCTATCTTTTTGGTAATACTTTATTTATCTTATCGGACGATGATTTGATTTTTCTAGGTAAAGCATTTGTCAATCGAGATAAACTTTATACAGAACTTCCAGAACATAAAAAAAGGGCGGAGCTTGTATTGATAAATCTGATTTTAATTTTGGTTGAGCATCGTAATATTTACTATTCAGTTTACTTTATTGAAAAGCTTGAGGGGTTGCTAACTTATCAAAACATGTTTGCGAGAATATTTTTGAACTATTTAAAGAAGGTTATCAGTTATATTAAAGGGGAAAAATCTGATTTGTTAGAGGTTGAGAACTATATTAGTTTAGTTGAACAACTAGATAATCCGACTCTTGTCATGTTTTTAAGGACAAATTTGCAACAAATTGTGATAGATAAATGAGAGTTATAAATATGTACAAGGGCATCTAATTACGAAAAGTAGTTGATGCTTTTTTTGCTTCCGAAAACCACTAGCAAAAAATTAAATTAGATAAGAGTTATTTTTATTAGCGATTTTAGTCGGTTTCGCTCCGTAGGTGCGAAACAAATAAACTACCCGCTATGCGGGTGCGCATCGATAGTTATACACAAAAAAACTCCAAACGAGTTACAATAAAGGTGTTCAAGCCGATTGTAAAACGAGAGGAGGAGAAAAATTATCCAGAAGATGATTTTTGCCGAAACCTTGAAATAAAAAGTTGAGGGGCCAAAAAAGCACATAGTTTATCACATACAAAGTGGATGTGTAAGTACCACATCGTCTTTACCCCTAAGTATAGACGAAAAGTTATCTACAATCAATATAAGAGCAGTCTAGGAGAAATATTTCATAGGTTATGCGATTATAAAGGTGTAGACATTATCGAAGGTCATCTGATGCCAGATCATGTTCATATGTTAGTAAGTATCCCACAAAGGATAAGTGTTTCAAGCTTTATGGGATACTTGAAAGGTAAAAGTGCTCTCATGATGTTTGACAAACACGCCAACCTTAACTATAAATTTGGGAATCGGCATTTCTGGGCAGAGGGCTATTATGTGAGTACGGTCGGACTCAATGAAGCCACTATTAAAAAATATATTCAAGAGCAAGAAAAACATGATATTGCACTTGATAAATTGAGCGTCAAGGAATATGAAGCCCCCTTTAGGGGTGATGGCAAGTAATACGAATGCCTCTTTAAGAGGCAAGTGACGCGTCAAGAGCAGTGAGGCTTGAACAAAGTGAAAGCCAGCGTCTTTAGGCGCTGGCTAGCTTTTGGGGCTTATAGCCCCTGTGCAAACCACCCGTTTGACGGGGGGTTATGATTGCTACATTACAAAAATAATGGTAACAAAGCGATAGGCAGACAACATAGAAATTGTATAAATCTTTTAAACATAGTTTGGCCTCCTTTACTTATAGTCTACATGTAAATTTTTGTAAAAGAGAAAATTCGCATATATGAAATCAAAAAAAAAAAAGAAAAATCATATTTGCGAATTTGTAGAAAGTAACAAAATAGATGTTATATTGTCAGTGTAAGATATTTAATTAAAGTTTTACATATTAAATTTATTAATTATTATAAGTAAGTTACGATGCTAGCTAATGCTGTACTGATAATAATTTTAGAAAGAGGAACATTATGTCAGAAGAAATTTTGAGCTTACAAACACTGCCTATTGAAGAAGATTTCGAAGAAATCAATGAAGTTGATGGTATGAGGGGTGTTAGTACACTGAGTGGTGGCGGATGTCACAACTGGAGTACGTTTAGTATTGGAGCTTGTGGATAATTACTTTCAGTTCAAGCAACTTTTATATTTTGGTCTTAATATGACCATTCTTAATGATTTTATAATATTTTCGAGTTATAGAATTGATAGCCACTTCCAATATGATTGCGATTTTTGGAAGTGGTTTTATTTAGGAGAAAATGAAAATAATATATGCAAGAGAAGATTTTAAAATTACAAACTTTGTCTGTTGAAGACTTCGAAGAAATCAATGAGGTTGATGGCAAGAGACGAGTACTCAGCACTGTAAGTATTGGTTGTGCCGGTAGTTGTGTACGTAGTACTATTAGTGTTTATCGCTGTTAGAATAATTTAATATTATTCCGAATTTTTCGAAATAGGGAGTCCCTATTTGAGATACTAGTCTTAGTTTAGCTCCCTATTCCTAAAAATTCGAAGTAGTATTTATTCAGAAATTGAAAAGAAAGTAGTGAGTGTATTCTTAATTGTAAAATATAAAGAAAAAATCGTTACTTTTTATATTTATATCAGTATAAAAATTTAGAGTACTTCAGATATAGTCGCTTTTGCTCTATTTAAATTATTTTGAGGAGTTATTATGACTGTTAAAGAATTTTGGAGAGATATTCCAAAAGTAAAAATGATGATGTTGTTATTAGCTATGATTTTGGCAGGATGTGATGGTATAGTAATGTCACAAGTGGTTTCTTCTGTGACCAAGTTTAATTCTTCCTCTTCTTACCAAGAAATTTTAGTCTTGTTTGCATATGGGGTTATTTTTTATTTACTGGTACAGGTAGCTAGTATGATTGTAAATTTTTTGAATAATAATATCATTAAGCAGTTAAATGAAAAGTATAAGATGTCTGTTATGAAAGCATTCAGTAGCAATAGTAATCTAAAAATGGATTCTGGTGATGTAATTTCAATATTAACGGTTGATCTACCTCTGATAGAAGAAAAATATTTCGCTATTATTTTGGGAAGTGCGTATTATTTCTTTATGGGACTGATATCTTTGCTTTATTTGGTTTATCTGAGCCCTGTTATCTCATTATTGTTTATTATCTGTTCATTGTTCCCGATGATACCCTCCTTGGTTTTTGTCAATGTTTTAGGAAAAGCCACGGATAAATATACATCCAACAATAATAAATTCATTAAAAATATAAAAGATTTCTCTCAAGGGTATTATGAAATATCTACTTATCATGCATTTTCTACCTTCTTAAGTCGTACACAGCAGGCAACTAATGATATGGAAAGTAGCTCTGAGCAGCTGAGAAATAAGCATGCTTTTGTAGGATTCTTATCGGCAATGCTGTCTTGGTTAGGTTACTTGATTCCTATTAGTATAGCCCTGTTTTTGGTTGTCAAAGGACAGCTTGAGGCTGGTGCTGTCATAGCTCTTTTTTTGGCTAGTGATAGAGTTATTCCTCCTCTTAGAAGCTTATCAGAGAATATTAGATTGATTAAATCCACTAAGGTAACTAGAGAAAAAATCGAAAAGGTCATTTCAGAGGTTAACAAGAAAGATGAAACTCCAGTGCTTGTGTTTAATAATGCAGATATTGTGTTCGAAAAAGTTTCATTTGGATTTGATAAAACTTTGTTTAGAGATGCAACCTTCACAATTCCTTTTGGAAGTAAGGTTTTAATAACGGGTGTGTCTGGCAGTGGTAAAACTACTTTATTAAATCTCATACAAGGGAACTTATCTACATCAGAAGGGAGAATTTTCTTAAGTAATGGGATGAAACAAATGCCAATCAGCTCTTCGCTTATGTCAAGAATCCAACAGAACCCCTATTACTTTGAACTTAGTCTAAGGGATAATCTTTTAATGGGCCTAAAAGATGTTGATGATACTTTTCTAGTTTCTGTGTTGGATAAGTTAGGATTGATAGAAGAGTTAGGCGATGATTGTTTGGAAAGAAAGTATGGAGAACAGGGTGAACAGTTATCAGGAGGTCAAAAACAACGAATTGAAATTGCGAGAGCGTTGATACATAATCGACGAATATTACTGGTAGATGAAGCGACATCGTCAGTAGATGTGCAGTCTGCTAAAAAAATTAGGGACTTGTTCCAGAAGTTAGATGTAACTGTCTTAGAGGTTGCACACCACTATGACAGCGAAATTAGTAATAATTACAGTCATCATTTAACAATTGAAAATAATACAATATACCTTGAGAGTTTATAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP029559|487537:496421|491033_491567_+|AWN61150.1|DBSCAN-SWA MIDKQIYQSPLGPISLLADDQDLLGCWFLGQKYFERGFEKEPLAEENSSVLTQAKSWLDAYFAGQNPQPADFLAPRGTTFQKQVWQVLREIPTGSSLTYGQIAGRVNCRSAQAVGSAVGKNPLSIFIPCHRVLGSQGQLTGYAGGLDKKVWLLEHEGHVIKLRNKEGKKNDYFLPLS >CP029559|487537:496421|487537_488632_+|AWN61146.1|DBSCAN-SWA MTVYNFSAGPATLPKPVLEQARDELLDYQGSGMSVLEMSHRSPEFDKIIKDAEKLLRELMAIPDNYKVLFLPGGGSLQFTMVPLNLAQGKKAYYLVGGSWGKKAYNAAVLLSKTVPFEPILLASSEDTVYDHIPDFDPASIDKDAAYVHITTNNTIEGTSIYDLPDTNGVPIVADMSSNILAARYNVEDFALIYAGAQKNIGPAGVTVVIVREDFLNDQPQLSAMLDYRIQADSGSLYNTPPAYNIYIAKLVFEWVKNTIGGVDKMAQINREKSGLLYDYIEQSDFYTSPVKKVEDRSVTNIPFVAPSKDLDAEFVAEADKLGFKNIKGHRSVGGMRASLYNAFPRQGVLDLIDFMKDFEARHQ >CP029559|487537:496421|491541_491898_+|AWN61151.1|DBSCAN-SWA MITFYHYPKCTTCQRAKKELDDLGISYQAIDLKENPPTAQTLGELLDSSDYKLKQLFNTSGNSYRTLGLKDKFASLTREEALDLLAADGMLIKRPLLVKDGKLLQVGHRKSYKKLDLN >CP029559|487537:496421|488671_489220_+|AWN61147.1|DBSCAN-SWA MEIRLAFPNEVESIMTIIEGAKNYLAQSGSDQWQSDYPNKETIFEDVLQGRGWVGLEDGQLLAYAAVIDDHEPAYDAIYDGKWGHNNHRYITFHRLALAESARGQGLAQTFLQGLIEGHDGPDFRCDTHEKNKAMQHILEKLGFHYCGKVVYEGERLAYQKIKSKAERGFYQEVDEADHHAI >CP029559|487537:496421|493217_493643_+|AWN61153.1|transposase|DBSCAN-SWA MCKYHIVFTPKYRRKVIYNQYKSSLGEIFHRLCDYKGVDIIEGHLMPDHVHMLVSIPQRISVSSFMGYLKGKSALMMFDKHANLNYKFGNRHFWAEGYYVSTVGLNEATIKKYIQEQEKHDIALDKLSVKEYEAPFRGDGK >CP029559|487537:496421|494813_496421_+|AWN61154.1|DBSCAN-SWA MTVKEFWRDIPKVKMMMLLLAMILAGCDGIVMSQVVSSVTKFNSSSSYQEILVLFAYGVIFYLLVQVASMIVNFLNNNIIKQLNEKYKMSVMKAFSSNSNLKMDSGDVISILTVDLPLIEEKYFAIILGSAYYFFMGLISLLYLVYLSPVISLLFIICSLFPMIPSLVFVNVLGKATDKYTSNNNKFIKNIKDFSQGYYEISTYHAFSTFLSRTQQATNDMESSSEQLRNKHAFVGFLSAMLSWLGYLIPISIALFLVVKGQLEAGAVIALFLASDRVIPPLRSLSENIRLIKSTKVTREKIEKVISEVNKKDETPVLVFNNADIVFEKVSFGFDKTLFRDATFTIPFGSKVLITGVSGSGKTTLLNLIQGNLSTSEGRIFLSNGMKQMPISSSLMSRIQQNPYYFELSLRDNLLMGLKDVDDTFLVSVLDKLGLIEELGDDCLERKYGEQGEQLSGGQKQRIEIARALIHNRRILLVDEATSSVDVQSAKKIRDLFQKLDVTVLEVAHHYDSEISNNYSHHLTIENNTIYLESL >CP029559|487537:496421|489551_490730_+|AWN61148.1|DBSCAN-SWA MVYSVKTFNNINQLGLKELGNKFQVDGDLAENPDAFIIRSQNLHGMEFPANLKAIARAGAGTNNIPVADATENGVVVFNTPGANANAVKEAVVAAMLLSARDYISANAWVNTLSGDEVPKQVEAGKKQFAGSEIRGKTLGVIGLGAIGARIANDARRLGMSVMGYDPYVSIEAAWNISHHVKRVQDIKEIFANADYITIHVPLTDATRETFNADAFALMNKGTTLINFARGELVNHQDLFEAIETGVVKRYITDFGDEDLLNKEGITVFPHLGGSTAEAELNCAKMASQEIRQFMETGEITNSVNFPNMHQALEAPYRITLINRNVPNIVAWISTAVSEANINIANILNRSKGDYAYTLLDLDESDRDKIDELVATFEASESIIKVRLIQKP >CP029559|487537:496421|490806_491037_+|AWN61149.1|DBSCAN-SWA MDKQSLKAYQKSLGDRFYALSFKGQGTGFLGASILYVDGETGIEYLFVGMGGGSLTPLLNPDGSPKINERWRNGEL >CP029559|487537:496421|492012_492876_+|AWN61152.1|DBSCAN-SWA MLGKSLELGELYKELRIARGLKQRDVARDNLSVSQLSKFENGQTMLAADKLLIAIQGIHMTFSEFSYALTQYQESDLFKIGQRLVELQAKKDVESLKDILVSYQDEETYEVYNRLNKLVIKSIIYSLDSSFEIANDEKEFLTTYLYSIEEWTEYELYLFGNTLFILSDDDLIFLGKAFVNRDKLYTELPEHKKRAELVLINLILILVEHRNIYYSVYFIEKLEGLLTYQNMFARIFLNYLKKVISYIKGEKSDLLEVENYISLVEQLDNPTLVMFLRTNLQQIVIDK |
9 | Streptococcus_phage(71.43%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
636709 : 698858
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP029559|636709:698858|DBSCAN-SWA 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53 | Tupanvirus(28.57%) | protease,holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
956043 : 1005917
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP029559|956043:1005917|DBSCAN-SWA 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57 | Lactococcus_phage(11.11%) | bacteriocin,protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1256648 : 1264044
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP029559|1256648:1264044|DBSCAN-SWA 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AAGATTTCTTCTCAAATTTAGACTTGACATGACGCAAAGCTTTTTCAGCTCAGCTGCTCAATCCGATTTTATTTTTATGGTAAACCTTATAGCTTTCAGAAATCTTAATTATTTTTGGTGAAGTCTCTCATTAGCTCAGGCTAGAATCTTAAAGCTACTTCTCCAACCTTAGTAGTCCGTAATTTCTGGGCGGTCATGAATGCGGGATTGTCTTCCCTGGCGGGCTTGAAGGACTACTTCGACATCCGCCAAGGACAGACCTGTTTCGACTAGGGTGACAGCTAGGTGATAGAGGAGGTCAGCTGTTTCGTTGGCGATTTCTTCCTTATTTCCATTCTTGGCGGCGATGACAACTTCGGTTGCTTCTTCTCCAACCTTCTTGAGAATCTTGTCCAGCCCCTTGTCAAAGAGATAATTGGTATAGGAGCCTTCCTTGGGATTGGCCTTGCGGTCCTGAGCTTCTTGGTAAAGTGTTTCTAACATAGCTTCCTCCTTATGAAATATAGCTGTCCTAATAAGTAGACCCTACCAAAGTTGATAAAAATGCTAAGCATGGGCCTAAGAATTTCTGCTGGACACCACTAATGGAATTTGTGACTTTATAAAATATCATTAAAAAAGCAAGAATAGGCACCGGTATGACAGGCGGCACCGATTTGCTCAACGGCTACTAGGAGCGTATCGCAATCACAGTCGGTCTTGATAGACTTGACCTTTTGGAAATGACCACTGGTCTCGCCCTTGTGCCAGATTTCCTGACGGGAGCGACTCCAATAGTGCATTTCTTTGGTTTTCAGGGTCAGGTCATAGCTCTCCTGGTTCATATAAGCCAACATGAGAACTTGCCCTGTTTGGTAATCGGTCACAATGACGGGAATGAGCCCGCCTTGCTTGGCAAAATCCAGCTTGATTTCTGTCATAGTCTGACCTCCAATCCAGCTTGAGCCATGACTTCCTTGGTCTCCGCAATAGAAATTTCCCCATAGTGGAAGATGGAGGCAGCCAAGGCTCCCGTTGCAGGGGTTTCCTCAAAAACCTGAACCATATCAGCTACAGACCCAGCACCACCTGAGGCAATAATGGGAACATTGACTAGGTTAGCTACAGCATTCAGCATGGACAAATCAAAGCCCGACTTGGTACCATCCTTATCCATAGAGGTCAGAAGGATTTCGCCTGCTCCTAGTTGCACGGCCTCCTGAACCCAATCCAACAAGTCACGGCCAGTATCCTTGCGACCCCCAGCCACGTAGACATGCCAGTTGCCGTCTTCCTGCTTCTTGGCATCAACAGCTAGGACCACGCACTGACTGCCGAATTTCTGGGAACAGGCCTTAATCAGCTGGGGATTAGCTAGAGCAGAGGAATTGACCGCCACCTTGTCGGCACCCGCCTTGAGCATGCGGTTCATGTCCTCAACTGAGCGAATGCCACCACCGACCGTAAAGGGGATAAAGACCTGATCTGCCACCCGCTTGACCATTTCCACGGTCGTATCGCGTTTTTCATGAGTGGCCGTAATGTCCAGAAAGACCAGCTCATCACAGCCAGCCTGATAATAGGCCTGAGCTGAATCAACAGGGTCACCGACATCGGTCAGATTAACAAAATTGACTCCCTTGACGACCCGCCCATCCTTGACATCCAGACAGGGAATAATTCTTTTTTTCAGCATAGCTAACCTCCGAAAGCTTTGAGCTCGGCTAGGCTAATATTGCCACTGTAGTAGGCCTTACCAACGATGGCAGCTGGCAGACCAATCTTGGCCAGCTCCTCCAAATCCGAGAGCTGGGCAATGCCACCAGAGGCAATAACTTGGGCTGATGTCAACTTGGTCATCAGGGCTTGATAGTGCTGGAGATTGGGACCAGCTAGAGTACCATCCCGATCAACATCGGTATAAACAAAGAGTCTAACGCCGATTTTTTCCATGGCCAGAGCTAGGTCCAGATAGTTGACCTGGCTGGTTTCCAACCAACCTTCGGTGGCCACCAAGCCTGACTTGGCATCAATCCCAACGACAATGCGGTCTGCTCCAAATTTTTCCAAAGCAGCTTGGACGAAATCGGGACTCTTAACTGCCATGGACCCGATAATCACACGGTCAATGCCTACTTCCAAATAATCCTCAATCTGTTCCAGAGTGCGAATGCCACCCCCGACCTCGACACCCAGACCAGTAGTCTCTTTTATCTGGGCGATCAGGTCACGATTGCTGGCCTTGCCCTCCAAGGCACCATCCAAATCTACCACATGGATAAAGCGGATGCCAGCTTCCTTGAAAAGTCGAGCCTGGCCAAGAACATCGGGATTGACCACCGTCTGCTGGGCAAAATCCCCTTTAAAAAGGCGGACGGCTTGACCATTCTTTATATCAATGGCGGGTAGAATTTGCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP029559|1256648:1264044|1262246_1262567_-|AWN61798.1|DBSCAN-SWA MTEIKLDFAKQGGLIPVIVTDYQTGQVLMLAYMNQESYDLTLKTKEMHYWSRSRQEIWHKGETSGHFQKVKSIKTDCDCDTLLVAVEQIGAACHTGAYSCFFNDIL >CP029559|1256648:1264044|1263324_1264044_-|AWN61800.1|DBSCAN-SWA MQILPAIDIKNGQAVRLFKGDFAQQTVVNPDVLGQARLFKEAGIRFIHVVDLDGALEGKASNRDLIAQIKETTGLGVEVGGGIRTLEQIEDYLEVGIDRVIIGSMAVKSPDFVQAALEKFGADRIVVGIDAKSGLVATEGWLETSQVNYLDLALAMEKIGVRLFVYTDVDRDGTLAGPNLQHYQALMTKLTSAQVIASGGIAQLSDLEELAKIGLPAAIVGKAYYSGNISLAELKAFGG >CP029559|1256648:1264044|1258611_1260765_+|AWN61795.1|DBSCAN-SWA MKKYLSPLKKMGKIINTRLGFVLVLLFFYWIKSLWAYSVDFNLDLENTAQTIVAIFNPLPLGLLLLGLPLYFKKSKIFYPLEILIYLILNILIISNAIYFREFTDFITVNTLMASSKSAAGLGDTAGNLVELTDLFFLIDLLVFIPLLFFKKMKSDKRPFNKRASFAVTALSVLLFSANLFAAETIRPQLLTRGFANYYVVRGIGLPAFMTYSANQTYQAHRERSVATADDLKTVEAYVKKNYTAPNSKYFGIAKGRNVIVIHLESFQQFLLDYKLKSDDKEYEVTPFLNSLYHSKSSIAFSNFFNQVKNGKTSDAETMMENSLYGLNNGSYMVNYGGDNTAYATPSILAQKGGYTSAVFHGNTGSFWNRNNTYKQWGYNYFFDSTYFEKQDDSNSFQYGLNDKYLFKDSIKYLEQMQQPFYAKFITVSNHYPYTSLNGDKKELGFPLADTKDDTVNGYFATANYLDSALKSFFDYLKSSGLYDNSIIVLYGDHYGISNDRNTSLAPLLGKDAETWSDYDNAMMQKVPYIINIPGYTDGFISDTYGGEIDSLPTLLHLLGIDTKGYLQMGQDLLSPQNDNLVPLRTSGYFISPTYTSYGGKVYYTQTGQEITAPNAQTKADLDKLKDAAAAQLSNSDAIQTGDLLRFATIPGLSKTDSSQYNYNGALKQMEKISKNKGDKSTSLYHKKGDQSTEDLYQAKSYEEIHGSSDSSSSSSK >CP029559|1256648:1264044|1261029_1261647_-|AWN61796.1|protease|DBSCAN-SWA MLVINQLLSAFLQLGLVILLSLVWYFIRQHKIQGYFSWLGLKSSKSLPWKPMLGIFLAYFLLAFLPYLWFYQTGSLQLSDFRAQVFHQLGWSWQTVLVILVWSVFQTSLSEEIFFRGFLGKRLMARLGFVKGNSLQALLFGSLHTLALAKYNLLAAFLVFLLTAGMAYALGWLMAKKADGSIIYGWLIHALTNFFSSFLLLSLLF >CP029559|1256648:1264044|1261815_1262130_-|AWN61797.1|DBSCAN-SWA MLETLYQEAQDRKANPKEGSYTNYLFDKGLDKILKKVGEEATEVVIAAKNGNKEEIANETADLLYHLAVTLVETGLSLADVEVVLQARQGRQSRIHDRPEITDY >CP029559|1256648:1264044|1256648_1257326_-|AWN61793.1|DBSCAN-SWA MKIVVPVMPRSLDEVNQLDVAKYDHADIIEWRADFLPKDDIINVAPAIFEKFPGREIIFTLRTQSEGGQISLSDEEYVSLIKEVSSLYHPDYIDFEYYSHQDIFSQMLDFPNLILSYHNFEETPDNLMGILSELTTLTPRVVKVALMPQSEQDVLDLMNFTRGFKVLNPEQDYVTMAMGKLGQVSRLASDLMGSSWTFASVDEGSAPGQIGLADMFKVREILDAD >CP029559|1256648:1264044|1257333_1258494_-|AWN61794.1|DBSCAN-SWA MNKLIVAALVEKKINRGIQLLQGQDFNDFSMSDQVLGLYNAKQKFLGTAYLSKQNKGIGWLVSRKSVQLDKPFFINLFEKARAKRQTYENDDLTTAYRLFNQDGDGLGGLTIDRYGDYALFSWYNAYIYSLKDSIVAAFRLVYPELGGGYEKIRFKGLDYQSAHLYGQEAPETFTILENGVSYSVFLNDGLMTGIFLDQHEVRASLIDGLAMGKTVLNTFSYTAAFSLAAAMGGAFETTSVDLAKRSRELSQAHFLANGLSMDQHKLIVMDVFDYYKYAKRKGLTYDLIIIDPPSFARNKKQTFSVAKDYHKLVSQALEIINPGGHIIASTNASNLSVGQFKKQLEKGFAGYKHHYLNLKQLPADFAVNQADQSSNYLKVYTIKVE >CP029559|1256648:1264044|1262563_1263322_-|AWN61799.1|DBSCAN-SWA MLKKRIIPCLDVKDGRVVKGVNFVNLTDVGDPVDSAQAYYQAGCDELVFLDITATHEKRDTTVEMVKRVADQVFIPFTVGGGIRSVEDMNRMLKAGADKVAVNSSALANPQLIKACSQKFGSQCVVLAVDAKKQEDGNWHVYVAGGRKDTGRDLLDWVQEAVQLGAGEILLTSMDKDGTKSGFDLSMLNAVANLVNVPIIASGGAGSVADMVQVFEETPATGALAASIFHYGEISIAETKEVMAQAGLEVRL |
8 | Streptococcus_phage(50.0%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1433609 : 1497103
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP029559|1433609:1497103|DBSCAN-SWA 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55 | Streptococcus_phage(38.46%) | bacteriocin,protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2120968 : 2129420
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP029559|2120968:2129420|DBSCAN-SWA ATTACATACCCCAGGCAGACATACCTTGAGCATTGTAAGCATTGATTGCTGAGTTAACTTGGTCTTGAACCGTTGCTGTTGACCCCCAACCTGGCATGGTTTGGAAGAGACCTGAAGCACCTGATCCGTTGGCAACATTTGGATTCCCATTTGATTCGCGAGCAATGATATATTCCCAAGTTGATTGACTGACACCAGTCGCTGCAGCCATTTGAGCAGCAGCATCTGAACCAACAGCACCAGCAGAGTTGCCGTTACCCAGAGCTTGAGGCCCATGGTTGGTACTAGCTGCTGCGGTTGCCGTTGTTGTCTCAGCGCCAGCCTTGCTTGCAGCAACCTGTGGTTGAGCTTGCTCTGAAGTTGAGTCCATTCCTTCAAACTGGGGAGTGGCAGTTTCGGTAGGGGCGGTTGCTGTTGAAGCTGGTGTTTCGGCTGCTTTAACCTCAGCCTGACCCTTATTATCTGTATTATCGTCTGCCGAAGAAACTTCTTCCGCAAAAGAAGATTCTGAAATTGAAATTTTTGTGTGTTGTGAGAGGAAACCAAAGACTAGGGCCGTGAAGGTCGTCAAAATTGTAATGACGAATAACTTATCAGATGTTCGGTTTTCTTTTCTCTTACGCATACCGTACTCCTTTTTTATAAACTATTATCAGTTTAACTTAGTTTTATTACTAACTAATTGTTTTAATATTAAAATTATTACAATTTTATGTAGATTTAAGCAAAAAAGCCCTAAAATCTAGATTTTGGGCTTAATTCTTATTTAGTTTAATTTTTTCTTAGTACCAACCGTTGGCATTCCAATAATCAAGAGCGGCTGACCATGAGCCATAACGGCTATTAACGTAATCATCAGCTGTTTTTTCTTGGTTTTCTTCAGAAAGGTCATTGTTCAAGTAGTCTCTTGTCAATTGGTAACGACCATAGTAAGAACCATTTTCGGCTGAGTAGTTACCACCTGATTCCCGTTGAGCAATTTCTTCCTTAGCTGCAGCATCTGCAGAGCTGAGGTTTGAAGAATAGCCAGATGATGCCGGAGCTGCATCTTGAGCACTGGTATCTTCCTGAGCTGGTGCTTCATCTTCCTGTGGAGCTTGGCTATCTGCTACTGATGTATCTTCTGCAGCTGGTGCCTCACTTGTTGCTGTGGCATCTTGGGTATAGTCTACAGATGCTTCACTTGTTGTTGAAGCATCAGCCACTTCTTCTGGCTGAACAGCCGTTGTATCTGCACTAGCTGTTGCTGTGTCTGTAGCAGTCGCATCATTTTCAACGTCTTGGGCAGCACCCATAGCTGATGAAACGGTTCCACCAACTTCAATTGTTTGGCCCGCCACGATAAAGTCTGGGTTAGCAATATCATTGGTCTGAGTCAAGTTATCAACAGTTGTATTATGGTTTTCAGCAATTTCTGAAAGAGTATCTCCTGCTTGAACAGTATAAGTTTCAGCGTGGACAACATTTGCAGCTGCCGTCGCACCAAAAGCTGCCGCTGCTGACAAGCCTGCCAAAGCTAATTTTTTAGAATTAAGAGTATCTTTCAAAATTGATTTTTTAGACATATAGAAATATGCTCCTTTTCTGAGATAGTATGTTATATATACTACACTCTTTTTGTTACCTCCAGTTTGGTCTTAGATTAAAAATGTTACAGATACTTTTAATCTTTATAAAAAGGGCATAAGCTAAAAACCAGTACATCCATGATTTTCCTTCACTCTTTAGTTTCAAGGTGTCAATGAAGGATTTTCGGTAGTCACCATCTTGCGTGCCACTCTTTCCTTACTTAAGGTTCCTTTCAAGCTATCATTGAGTTTGAAAGGAATCTGTCACAGGATGAAAGAGTTCGCTGTTTTTTTCACTCTCTCCTGCATAGTTGATTTTTTTAGACAGGATGGGAGAGTGCTTGGTCTATCTCTTGTTTAACAAAGAATAGGGATGTCTGATCAATCACTGCATCAGAATCAAATAAGCATATAAAATTTTGAATTTAGCAACTATTGTTCCAAAAACCTTTAAGAGCTTTTGAGTAGGAAGAGAAGACAGCCGACTACAAGGAGAGTTAAGATAGCTAATCCATCTGACCAGCCCCAGTTTAGTTGACGATATTTGGTCCGTCCATCTCCGCCTTGGTAACCCCGTGCTTCCATAGCAATAGCCAGGGCATCAGCCCGCTTGAAGCTCGAGGCAAAGAGGGGAATCAGAATGGGGACAATGGATTTGACCTTTTGAATGAGGTTTCCTTGGCCAAAATCCACTCCCCGAGCTTGTTGAGCCTTCATAATCCGTGTGGTGTCATCCATCAAGGTTGGGACAAACCGCAGACTCAAAGACAGCATGAGACCAATTTCATGGACAGGAATCTTGAGTGGTTTTAGGGGCTTAAGCAGGGACTCAACCGCATCCGCCAGACTTAAAGGGGTTGTGGTTAGGGTCAAGAGGGTCGAAAAGCAAATGATCAGGACAAAGCGCATGAAAATCAGGGAAGCCTGTCCCAGGCCATAATCCGTTACTTGCAAAATCCCCATCTGCCAGACCAGCTTTCCTTGGTGGTTGAAAATGATTTGGAAGGCCGTCGTAAAGAGGATAATAACAAACATGGACCTGAGGCCATTGAGGAAGAAGCTCAATTTAACCCGGGAAAGCAGGATTAAAAAGAGGGTGAAGGCGGCCAGAAGTATGTTGGTAACTAGGTTGTTGGCCCAAAAGACAATCACGATAAAGAGAAACATAGCTATGAGCTTACTTCTGGGGTCCAAACGGTGAATCAGAGAGGAGCCCGGCACGTAGCGTCCTAAGATTAATTTATCCATGCAGCCCCTCCACAAATTCAGCAATCGTTATGGGCAGACAATCCATAGCCAAACCACGCTCCCGCATTTTTTGGGCAAACTTGGTAATTTTAGGCACGCCCAGCTGCTTGCTTTCCAAAAATTCGACTCTCTGGAAGACCTCTCTTGGTTGGCCAGAAGCCACCAGATGACCTGCTTCCAAAACATAGACCTGATTAGCATAATTGGCCACATCATCCATGAGGTGGGTTACTAGGACGATGGTCTGTCCCTGCTGATGGAGTTTGGCAAAGAGTTCCATCAGTTCTCGCCGTCCCTTGGGGTCAAGACCGGCCGTCGGTTCATCCAAAACGAGGATTTCTGGCTCCATGGCCAGAATACCAGCGATAGCTACCCGTCGCATTTGACCACCGGATAAGTCAAAGGGATTTTTTTCAAAAAGATCTGCTGTCAGCCCAACTAAGGCCAATTTTTCACGAGCAATTTTTTCAGCCTCCTCCTTAGAGAGACCAAAGTTTTTCGGACCAAAGGCCACATCCTTAAGGACAGTTTCTTCAAAGAGTTGGCTCTCTGGGAATTGAAAAACCAGACCAACCTTTTTTCGGACACCTTTGATTTCCTTATTTTTGGAGTTGGGATTAATCACCAAGTCATCAACGGTTACCGTGCCCTGACTAGGCAGATTGAGACCGTTGAGCAATTGCATGATGGTTGACTTGCCACTTCCTGTATGACCGATAAAGGCCGTGTAGGAGCCGTCCTTTATTTCCAGACTAATATCAAAAAGGGCACGCCCTTCAAATGGCGTTCCCGCTTGATAGGTAAAGCTTACGTTTTTGAGACTAATGCCCATAACTCATCTCCTAGTTGGCTTTCATTTAGATAGGCTTGATTGAACGTAAGTCCCTTATCTTCCAAAGCTTTGATAAGCCGAGAAGTAAAGGGAATATCCAAACCTAAGTTTTTAAGGTCGTCCCCTCGTCCTAGTAAGGCTTCCGGCGTTGAACTCGACTCTATCTGACCGGCCTTCATAACTAAGACACGGTCACTCATGGCGACCTCATCCAAATCATGGGTAATGGAAATCAGGGTCAGGCCGTACGTGTCCCGCACCGCCTGAATGGTCGCCATCAGCTCCAAACGACCTTCTGGATCTAGCATACTGGTTGCTTCATCCAAAATGAGAATGTCTGGTCGCATGGCAATGATACCAGCAATGGCTACCCTTTGCTTTTGCCCACCAGAAAGTCTAGCTGGTTCTCGCTCAGCAAAGTCAGACATGCCAACTATGTCTAGAGCTTCTTGAACACGGACCTTCATCTCCTCATAGGGCAGGCCTTGGTTTTCCAGACCAAAGGCTACATCATCGGCCACAGTGGCTCCGACAAATTGGTTGTCAGGATTTTGGAAAACCATGCCAATCTTGCGTCGCAGATCCCAGACATTGTCCTCGGTCAGCACCTGACCAGCAATTTTAATTTGACCAGACTCGGCTTCTAAGAGGCCATCAATTAGACGGACGACCGTCGATTTACCTGAACCATTGTGACCAACAATGGACAACCATTCCCCTTGTTTCACGTGAAACGTCACGTCCTTAAGGATATCGTTCTGGTCCTCCTGGTATTTAAAATTTAACTTGTCAACTGAAATAATTTCTGTCATAGTTTATTTGAAGGTGTCTTTAAAGAGATAACCTGCTCCCTTGAAGTAGTCATAGCCCGAATAGATGGTAAAGAAGAGGGCGATGTAGAGCAGGATGGTTCCTAGCAAGCTGAGGTGACAGAGGAGAAAAATAATGGAAAACATTTGCGTAACCGTTTTGATTTTCCCTGGCATAGCTGCCGCCAAAACAGTTCCTCCATTTTCAACTAAGAGTAGTCTTAGACCTGTAACAGCCAGTTCCCGACAGATGATGATGGCTACAACCCAAGCCGGTGCCATCTTCATGCCAACCAGCATGATAAAGGCTGACATAACTAACATCTTATCGGCCAGAGGATCGGCAAATTTACCGAAATTGGTAACCACCTTCCATTTGCGAGCCAGATAACCATCTAGATAGTCTGTAAAGCTAGCAAGGGCAAAGATAACCGCCGCTACGATATTCCAAACTAAATCAGTCGAAATTGAGGTCAAAATTAAGAAGACGGGTATCATAAAGATACGGATGATGGTCAGCAGGTTGGGGATATTTTCTTTTTTTATCATGGTAGCTTCCTTTACTTGATGGTGAGGGTGATATAGCTGGTGTTGTCCTTAGCTAAGCTTGATAAATCAAGGGTTTGGTCATTGATTTTCACAGTTACGTTATCAATACTTGTTAGGGTAATAACTGACTTGTCAGCCTTTGAATCAAGGGTTGCTTTGGTATCCTTGGTATTACCATCCAGAGTAACGCCCTTCTTATCTAAGTTTGAGTTGGTCACGCAGACAAGATTTTCCTGGTCAGAGTCCTGAGAAATTTCAACCGTCACCTGGTCGTTCTTATCAGCCAAGGTCACCGATATATTGGAGCCCTTGGTTGTAGACGAGAGTTTACTATCGCTGGCTGCTGAGGAATCCGCCTGGGCTTGTCCCTTCTCCTGATGAAGGGAGGAGCTAGGAAGGGATGCTTTTTTCATTTCATCGCTGACTTGAAGGTAGACAGCTGACCCTATTAGTCCAAGAACCAGAAGACTTAAAAGGGACATGATAACCAAGGGTAGGCGACGTTTAGGATTTTTTAGATACTCAAAACGGTCTGAGCGAGACCACTTGGTAAAGGGTTCGACAACTTTAGAGGCCTGCTCCTCCTCGGGTTCAGGAAGAGGTTCTTCCTTTTTCTTTTCTTCAACCTCCAGGCGAAAATCCGGATCTCCATAGCCCTCAAGAAGAGGCTCACTATCTAAGTCTAAAAATTCTGTATATGCCTTGAGGTAGGCATCAGCTTTTTCTCGAGTCAGAAATTGAAACTGATTATGCTCCATAACAGTAATATACTGCATAGGAATGTTCAGCTCTACCGACACCTCTTCAACTTTCAAATCCTTGGCAAGGCGAGCTCTCTGAAGATACTCACCAATGCTCACTTTTTTCATTGCAACACCTCAAGATAATGATTATCCTCTATTATAGCAAATTTCAGCCTATTTTTATAATTAGTTTGGAAAGATGGTGAACTCAGAGCTTACCATAGTCCCTAGCAAGTTCTGCCCCAGTTCCTCAAGGTCAGCTAATTGCAGGTCAGATAGGAGCTTAGGCAGGTCCAAATAAGATTCTTCATCAGTCTGGTAGCTTGCCAGCTGGCTGGCCAACTGCTCTATCGAATCTAGACTTCTCATAAATTCGCCGTAGATTTCCCTTGTCAGCAAATCCAAGTGTTCCTGATTAAAGTCAGCAGAAAGTCTAAAGTCTTTCAAAAGGGTCTTGATATTATTGGCCAGCTTAATGGGTTCTTGGGTATCCATGCTGAGAATAAGGAATTGAAAGCGAGAGGACACCTCAATTTCTATGTCAAAAGAGTCATCTATCAGACCCTGATCATACCAATCTTGGTAAGCCTGGCTGGTCCAACCGAGAATGATGGAAAAGAAGAGTCTCAGAACTAATTTTTGTTTGAGGACTGATTTGTTTGTTGCTGGTAACCGAAAACCAAGGGCTAATTTGGGGTTTGCCACATCAAAACGAATGGATTTTCGCTTGACAGGCTCTGTCAACTTCAAGGGGTTTTTGTCAATCGTTGTCAACTTAGTAGTAAAGTTTCTCTGATTTTCTTTGATAGTTGCAAGAGCTGTCTGATAATCAAAATTTCCGACCAAAAAGAGAGACAGATTGTCAGGTCTATAATAGGCCTTATGACTGTTTCTAAGCCATTTTAAAGTGATTTTCTTTAGGCTTTCTTGGCTTCCTGCAATGTCTTGAGTGAGTTTAGTATTTGGATACAAATTCGCTAAAATACCACTGTAAAGTTGGTAGTTAGGATCGTCAAGGTACATGTCAATCTCTTGGGCGATGATTTTTTTCTCCCGTTCCAGAGATTTTTTATCAATGTTGAGGGTCTTGACAAAGTTCAGTAGGAGCTGTAAAGCTTCCTGACTCTGACCAAGACTAGTATAATAATAGGCTGTCTTTTCAAAACTGGTAAAAGCATTGCTATCTGCCCCTAGCTCAGAAAATTTGAGGCTAGCATCCTGACCATCGGCCATTTCAAAAAGTTTATGCTCTAAAAAATGTGCCAGACCAGCAGGACTTTCTTGAACAGAACCATCTTCTGCTAGGAGCTCATCAAGAGCCCCAAAATTCACCTGAAGGAGGGCAGTCATTTCTTGAAAATCCTGTTTGGGTAGCAAATAAACTTGCAGGCCATTGTCTAGTCTAGTCTTATAGAAGGTTTCTTTGAGACTAGGGTAATCAATTTTTTCCAGCATCTCATTTTCCTCCTTCTAAATAGTAAAGGGCCTGTAAATGGATTTTTCTAGCCAGTTGCATAATATCTGCTTTGTTGACAGCAGCAATTCTGTCAGGCCACTTGGGAAGATTCTCATCATTTTTTGCTAAGTACTTTTGGTTATAGGCTCGCTCAATCAGAATTTTGGGCGAATCTTGAGCAAGATAATAGTCGTTCAGCAGAAGCTGCTTGGTTTGCTGTAGGAGATGACTGGAATAACGTCCCGCCTTTAAATTGTGCCATTCTTGGTTAATCATTCTCAGGGTTTTCTCTCGCTGCCTTTTGTCAATGCCGGCGTAAACTTGGAGTAAACCTGTGTAAGGGTAAACTTGACTGGAAATTGAATAGGCCAGGCCTTCTTTTTCCCTCACTTGTGTAAAGAGACGAGAGTGGGCAAAACCTCCCAGCAGACCATTTAGAACTAGGGCAATTGGATAATCAGGATGACTATATGTTAAAGGCAAGTGATAGCCTAGCTGTAAAATTGATTGTTGATCATCTTGACGATCAATCTTTTCTTGTGTAATATTGAGACGGTCTTGAGTGAAGTTGACAAACCTGTAAAGTTTCCTTGCTTGAAAGGGAAAGCGATTGATTTCCTCTAAAACTGAAGACGCTTCAAAATCACCCAAAAGAAAAATATCTATCTGATCTTCTTTGAGCATTCTTTGAAATTCCTGATAGGCAGTAAAGGAGTTTTCCTGTTCCACCAAATCTACTCTGGCATATTTAGAAACTTTCAGGTTGTCATCATGGTAAAAGAGGTCATAAAGCCCCAACTCACTTAGATAAAAAGAATCTTCCTTGTCAGCCTCAAGATAAGAGATTAGATTGGCCTTCTCCACATCAAATACCTTGGATTGAAATTGCTCCAAGGTGATTAGAGGCTTGTAAAGAATGGTGTAAAGCAAGTCAAAGATTTCATGCTGGAAGTCTGTTTTTTCAAGATAGGCTGGACTTATAAATTCAAGGTCAATATCAAGAATATGGGCTTTTCCCTTAGTTGACACCCTAGTTGACAAACTTGTTCCATAAAGCCTAGCTAGAGTCTTACGTAATTTTTGTGAAGATGGAAAATCGGCATTAGCTGTAGCTAACATTTGGGCCACCAAAACTCGCTTAGCTACTGTCTTTTTCAAGCGTTCTCCTGTGAAGCGAAAAGTTAGGTGATTGGTCTTAAATTTTTCAGTTTTAATCAGGTGTAGGTTGACACCATCAACAATTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP029559|2120968:2129420|2120968_2121592_-|AWN62517.1|DBSCAN-SWA MRKRKENRTSDKLFVITILTTFTALVFGFLSQHTKISISESSFAEEVSSADDNTDNKGQAEVKAAETPASTATAPTETATPQFEGMDSTSEQAQPQVAASKAGAETTTATAAASTNHGPQALGNGNSAGAVGSDAAAQMAAATGVSQSTWEYIIARESNGNPNVANGSGASGLFQTMPGWGSTATVQDQVNSAINAYNAQGMSAWGM >CP029559|2120968:2129420|2124590_2125427_-|AWN62521.1|DBSCAN-SWA MTEIISVDKLNFKYQEDQNDILKDVTFHVKQGEWLSIVGHNGSGKSTVVRLIDGLLEAESGQIKIAGQVLTEDNVWDLRRKIGMVFQNPDNQFVGATVADDVAFGLENQGLPYEEMKVRVQEALDIVGMSDFAEREPARLSGGQKQRVAIAGIIAMRPDILILDEATSMLDPEGRLELMATIQAVRDTYGLTLISITHDLDEVAMSDRVLVMKAGQIESSSTPEALLGRGDDLKNLGLDIPFTSRLIKALEDKGLTFNQAYLNESQLGDELWALVSKT >CP029559|2120968:2129420|2122985_2123783_-|AWN62519.1|DBSCAN-SWA MDKLILGRYVPGSSLIHRLDPRSKLIAMFLFIVIVFWANNLVTNILLAAFTLFLILLSRVKLSFFLNGLRSMFVIILFTTAFQIIFNHQGKLVWQMGILQVTDYGLGQASLIFMRFVLIICFSTLLTLTTTPLSLADAVESLLKPLKPLKIPVHEIGLMLSLSLRFVPTLMDDTTRIMKAQQARGVDFGQGNLIQKVKSIVPILIPLFASSFKRADALAIAMEARGYQGGDGRTKYRQLNWGWSDGLAILTLLVVGCLLFLLKSS >CP029559|2120968:2129420|2123775_2124615_-|AWN62520.1|DBSCAN-SWA MGISLKNVSFTYQAGTPFEGRALFDISLEIKDGSYTAFIGHTGSGKSTIMQLLNGLNLPSQGTVTVDDLVINPNSKNKEIKGVRKKVGLVFQFPESQLFEETVLKDVAFGPKNFGLSKEEAEKIAREKLALVGLTADLFEKNPFDLSGGQMRRVAIAGILAMEPEILVLDEPTAGLDPKGRRELMELFAKLHQQGQTIVLVTHLMDDVANYANQVYVLEAGHLVASGQPREVFQRVEFLESKQLGVPKITKFAQKMRERGLAMDCLPITIAEFVEGLHG >CP029559|2120968:2129420|2128172_2129420_-|AWN62525.1|DBSCAN-SWA MKIVDGVNLHLIKTEKFKTNHLTFRFTGERLKKTVAKRVLVAQMLATANADFPSSQKLRKTLARLYGTSLSTRVSTKGKAHILDIDLEFISPAYLEKTDFQHEIFDLLYTILYKPLITLEQFQSKVFDVEKANLISYLEADKEDSFYLSELGLYDLFYHDDNLKVSKYARVDLVEQENSFTAYQEFQRMLKEDQIDIFLLGDFEASSVLEEINRFPFQARKLYRFVNFTQDRLNITQEKIDRQDDQQSILQLGYHLPLTYSHPDYPIALVLNGLLGGFAHSRLFTQVREKEGLAYSISSQVYPYTGLLQVYAGIDKRQREKTLRMINQEWHNLKAGRYSSHLLQQTKQLLLNDYYLAQDSPKILIERAYNQKYLAKNDENLPKWPDRIAAVNKADIMQLARKIHLQALYYLEGGK >CP029559|2120968:2129420|2126902_2128171_-|AWN62524.1|DBSCAN-SWA MLEKIDYPSLKETFYKTRLDNGLQVYLLPKQDFQEMTALLQVNFGALDELLAEDGSVQESPAGLAHFLEHKLFEMADGQDASLKFSELGADSNAFTSFEKTAYYYTSLGQSQEALQLLLNFVKTLNIDKKSLEREKKIIAQEIDMYLDDPNYQLYSGILANLYPNTKLTQDIAGSQESLKKITLKWLRNSHKAYYRPDNLSLFLVGNFDYQTALATIKENQRNFTTKLTTIDKNPLKLTEPVKRKSIRFDVANPKLALGFRLPATNKSVLKQKLVLRLFFSIILGWTSQAYQDWYDQGLIDDSFDIEIEVSSRFQFLILSMDTQEPIKLANNIKTLLKDFRLSADFNQEHLDLLTREIYGEFMRSLDSIEQLASQLASYQTDEESYLDLPKLLSDLQLADLEELGQNLLGTMVSSEFTIFPN >CP029559|2120968:2129420|2125984_2126842_-|AWN62523.1|DBSCAN-SWA MKKVSIGEYLQRARLAKDLKVEEVSVELNIPMQYITVMEHNQFQFLTREKADAYLKAYTEFLDLDSEPLLEGYGDPDFRLEVEEKKKEEPLPEPEEEQASKVVEPFTKWSRSDRFEYLKNPKRRLPLVIMSLLSLLVLGLIGSAVYLQVSDEMKKASLPSSSLHQEKGQAQADSSAASDSKLSSTTKGSNISVTLADKNDQVTVEISQDSDQENLVCVTNSNLDKKGVTLDGNTKDTKATLDSKADKSVITLTSIDNVTVKINDQTLDLSSLAKDNTSYITLTIK >CP029559|2120968:2129420|2121749_2122532_-|AWN62518.1|DBSCAN-SWA MSKKSILKDTLNSKKLALAGLSAAAAFGATAAANVVHAETYTVQAGDTLSEIAENHNTTVDNLTQTNDIANPDFIVAGQTIEVGGTVSSAMGAAQDVENDATATDTATASADTTAVQPEEVADASTTSEASVDYTQDATATSEAPAAEDTSVADSQAPQEDEAPAQEDTSAQDAAPASSGYSSNLSSADAAAKEEIAQRESGGNYSAENGSYYGRYQLTRDYLNNDLSEENQEKTADDYVNSRYGSWSAALDYWNANGWY >CP029559|2120968:2129420|2125430_2125973_-|AWN62522.1|DBSCAN-SWA MIKKENIPNLLTIIRIFMIPVFLILTSISTDLVWNIVAAVIFALASFTDYLDGYLARKWKVVTNFGKFADPLADKMLVMSAFIMLVGMKMAPAWVVAIIICRELAVTGLRLLLVENGGTVLAAAMPGKIKTVTQMFSIIFLLCHLSLLGTILLYIALFFTIYSGYDYFKGAGYLFKDTFK |
9 | Staphylococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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