Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP029619 | Candidatus Cardinium hertigii strain cHgTN10 chromosome, complete genome | 0 crisprs | cas3 | 0 | 0 | 3 | 0 |
1. CP029619
Click the left colored region to show detailed information
0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
180104 : 260396
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP029619|180104:260396|DBSCAN-SWA TTTACCTATTACGTTGCCGCAGCACTTCATAGAGGAGCATACCTGCTGCTACCGATACATTTAAGGAAGCAATAGGACCCTGTATCGGAATAGATACTTGATGCAACGCATGGGTTAGGTGTTTAGCGGCTATTCCCATGGCCTCATCCCCTAAAATAAGCGCAACAGGGGAAGTTAAATCCACTTGGCATAATGGCTGTGCTGCTTTCTCATGACAAGCTATAATGGTTAAACCCGCTGCTTGTAAATAGGCTAATGTATGGCTTAGGTTAGCTGTGCGGCAAACCGGTAAGGTAGCCAATGCACCTGCTGATGTTTTCATAGCAACAGCGGTTATAGAAGCACTTCCTTGGGTTGGTAGTACCAATGCATGCACCCCCATACAGGCTGCTGTCCTGGCAATAGCGCCTACATTATGCACGTCTGATACACCATCTAATACGACGAGTAAGGGCAACTCCCCTTTTTCATAGGAAGCCTGCACCACATGCTCCACAACGGAAAAAACAATAGGAGATCTTATGGCTACAACACCTTGGTGATTCTTATTTATCCATTGCTTAAACTTTGCAACAGGTAAATAAGTATAAGGAATGGCATGCTGGCGTATAAGCGTATATAGCTCCTTTGTAAGTGGCGTTTGCCACTTACTGCTTTGTAAAAAAACTTTCTCAATCGGCTGTCCAGCTAATATAGACTCTATTACAGCCCTAGAACCAAAAATAAGATGCGTAAGATCTGTGGCTATATGTTTAAAGGAAGTCATTTCTTCTTGTTTCACTTAAATTAAAATACAACTACGATAATTTTAGTTTCTATTATTAAATATTATCTTGTAAACATGTCCCATTTCTTCTAAAAATTGTATGCATATCAGATGCTTTTTCTGAACAGAACATATACAACCGTAGGGGGTATAGTTGCTAACTTGGCTAAGGTACCAAGCCCATACATAACTCTCATCTAGAAGGTAAAGTTACGCTATACATAAATAATGTTTATAATGGATACAGCAAGCACCATAGTAGATGTTTTTCTATTATTTACTGCATAACCTTAGCATGTTTTGATTTCTTTACTATAACGAAAGCCAATAACAAAGGTTAAAATTTAAAAGGGACATAATTATTAAATCAAAAGGTTACGCCATGTTTGTTTTAAAGCTGCTTAGCAATAATCCCTTCACAAATGTGCTGCATTTCTGCTAGCCATTGCTGGGGAGCCTTATGGTTTTTCCCCCACGGTATATAAAAAGCTAAGGTTTCTTTAGCTATACGCTGTTGGTCAGATGGCTTACGGACAGATAACGTACGCATGTTATGCAATCGATCTGCCAGCTTTACTTGTACCACACGTATGTCTCTACATTGATGGAGTATATTTTTATTTTCTACCTTATCTAATTCCCAAGGATACCCATTGGTATTGTAGTGGGTAACCTGATCGACAATAGCAGCTACCTCAGCGCCATATATCAGCTCCAGCTGATGAAGCGTAACAGGTGTATCCTCTACGATATCATGCAACAAACCCGCTAAAATGGTAGCGGGATCCTGGGTAGCCTCCAATAGCAGCTTGGCTACTGCCATCGGATGGGTATAGTAGGGAGACCCTGATTTACGCCGTACTAAACCATGGGCCTTTTTAATAAAGGCAATGGTTTGCTGTATAAGCTCCTCCTTAAGCGTAGTTTGTGCCGTAAGTAAGGCTATTAGCTCCTGCTCTTGCGCCAAGCTTTCTGCTGTTTCAGCTAGGGCATTGGCTACCAGATCAGCAGGATCATATGTCTTAAAGCGCATAACTTTACGGCCGTCCAGCGGGAATACGTAAAGGCAACTTACCTGCGTTGGGCTTTCTATTATTTCCACATAGCCCCCGTGGGCTTCTACGATTTGTTTACTTTCTAGTTGATAAAACTGCGCTTCACTAGCAGGTAGGGTAATATTTGCGTTCATTGCTGTGATACGATAGCTGGGTTTTAAGTTTGGTAGGCTTGTATCCGTACTAAAACAGCAAGCCAGCGCAGGTAAAATTAAGGAAGGGAGATCAGCCGTGGTTTCTGCTGCCAAACCATACTGCAAGGTAGTAGCGGCGAGGGTTAAGGTTACGATATGATCAGTAGCTTGTTGGCCCTTGCTGATTGCCCATAGGTTGAGCAGCAGCAAGCACTCCAATAACGCGGGATCTACTACTATTTCAGCTACGTCTGTTTGTTTGCGAAATAAGAGCGCTAACGGTCCCCCTAAATCCAATATATACTGGTTTACTTTTAAGATAGTTGATTCAAGTGGGATGGGCTGTATTAATTTTTTATTAAGTTTTAGGCTCCGTTCTTCTTGGGCTCTCCATGCCAGACAATCGCTGAATTTTTGTAGTTTCTTGTTAAAGAGCGTTATTTCATTTTCTACTTTATGCGGATCATTCCTTGCAATAGGACACAAAGTTTCTTGCAGGTTAACTCCCATTGCTCGTAAGAGAGTACCTCCAGCAGTGGCATCCAATCTAGCCCAATGCGCTTGGCTATAGATGGCTTCTAAGGAAATCCTTTGTTCATAGGTTCTAGTAAGTTCGATAATTTTAAGTTTAGCGGTTGCTTTGTCTCGTAGGTATTTATACAAGACAAATCCTACTAGCGTGCTTGCTACAACTGCTGTCGCTAATACAAGTTCTATGACAGAAGCATGCCTAAAGCTTTCCCAAAATAAGTCCATAAAACGTATAGGAAGCAAGAATCTATGGATTAGTAAAGCACAAAGTAATAGCATACTACTGCATTCCACGGATAGTAATACAATAGATAGGCTTATGCTAGCTATAAGAAGCGCACAAACCATAGGGCTATAGTGTCCTAGTTTAGCAAATTGGAGGGGCGCTATAAAAAGCAGAAGAAACAATAGCATAGGCCATAGATCATGCAATAGCGGAATTCCTCCCTTTCGATAAGCATGCAGGGCTGGGTAGAGCGCTAGGATGGTTCCCAAGGCCATCACAGCCATATAGAGGTATACATAGGGAAGGAAATACTGCCTTTGGATAAAGCACAATGCGATAATGGCATTAAGGATGGTATAGCTGCCGACTGCTACAAAGGTGCGTTCTTGGGTAGGGAAAACACTTACACGATAGGAGCTGGTAAAAAGTGTTTTAAGCCGTTGCACCCGTTCCAACCACCAGCGTTTGGTGATTTGATTTTGTAGATCCCAGGCACTGCTATCTGGGATACCCACCCAGCCAGTATTGGCCTTTTTAGGTAGGATATAGTGGATGGTTGCTAAAATACATACACTGTAAAAAAATGCTTTAAGCCAATCTATTTCCCGTATAACTTTCTCCTGTATAAAAACATCATAAGTTGCTAGTGATGCACTTATCATTATGTTATACAGAACAGCAGACGTTCGTGGTATAAATCCAAAACAAGTCGTGATAAATAAAACGTTGATGGTAGGTACATAAATGTAAATAGCTTTAAATACTAACTGTACAACATTATCTGTATGGAACACAATAAATATAGAAATGGCACCTATTACGATAGAAATAATCCGTGCAGTTCTTAAAGAAGGTTTATTTTTTGAAGTGTTCGTTATAATAGGCCATATATCATTTGTGAATAAGGTCGAAGCAATATGCAAATACGAGTCAGCAGTGGACATTAATAGGGCAATAGTAGCTGTTACAAGCAATCCTTGCATACCAGGGAAATAGGAAAAATGCATAATATAGTTTAATAAATTCTGATTTTCAGGAATTTTATGGCCACTTATATGTAAAGCTACTGCAACAATTAAAAAAACTAGAGGAAAAATAATACGTGCAATAGCACTACGGAGGAAGACTTTAGCTGCTTGTTGAATGGAAGAAGACATGTAGATGCGTTGCGTATAGGCTGGATCAAAAAGGAATATGGAATACCAGGTAATATTGAGAAATAAGTCTGTTTTATTGGTAAAAATTTCGGTAAAATTAAACTGTGGCAATGCTATAAGTTTTTTCCAACCGTTTAACAGGTTGGGAGCATGATAGAGAAGTAGAAAGATTAATACGGGGAAACAAATACTAAAAAGAAAAAATTGATAAACATCTGTAAGTGCCACGGATCTAGCGCCACCAAATGTAGCGTAAATAATTACCAATAGTGACACCGCTATTGTATAGTAAGAAGCATATTCTGCTGCTTTAAAGAAGGAGCAGATCTTAATTACCATTAAGCCAACTTTGAACTGTGCTGATAAAATCATTATACTCATCATCATACCAAGCATAGCTGTAATTATTTGGATAACTGGTCCATAGATTTTACCCATAGACGCAGCTATGGAAAAATCACCAATGAACCTTTTCATCCTTATGATGATAAACCTGGAAGCCAAATAAAGGCCAAGCGGAAGGATTAAATCTATAATCAACATATAAATCCCTCTATGATAGTACATTTCTAATCTATGGCTTATAGTGGCCCCACCATACATAGTAGCTATCATTGAAACAACAATCACAAACGTAGGCATTCTTCTATCCCCCACAGCATAATCTCTAAAGGTAGAAATCCCTCTGCTGCAGTATAATCCAATAGCAAGTGTCGCAGCTAAGAATACGACGATAATCATTAAATCTATATCTATAGTCATAATATTATGTAGAATAAGTAAAATTGTGGGGTTCTAAAATCTTGTGGAAATACTCGGTTAAACTAGAATCTATTATCAATGATAATACTATACATCAAATATGCACTTCGAATGACATAAAATAGATAATAAAACAAATTTCTCAAATTATATTCGATACAAACTATAAACCAAAACAGACTGTTTTAAGTTGGCTAACCCAACAGTCTATTAGCCACTTCTTTCATCGTTCTTTTATACGACCAAGCCATGAGACTATCAAATAACACGCTGATTTGTTGCATAAATCGAAATAAAAAATACTATTCTATAGCACAAGCACAACATTCAGTTATTTGGAACCTATCAAATAAATCCTTAAACCCTACA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57 | Pseudomonas_phage(55.56%) | holin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
974829 : 982996
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP029619|974829:982996|DBSCAN-SWA 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TTATACTATTGGGCCAAGTTGTATACAGATCAATTAAAAGTTTCAAAGGATTATTCCACTTTAAACAAAGCCATTGCAATAGAACATGGTCCAAGTTGTAGTATACAAATACATTCTTAGTTTATACGTTTTTTGTAAGTTAATGGTTCTAAAATATTATTTTTGTAGTGTTAAATACATTTTAGTAACAATAAGATAAGTCATTCCTTCTTTTATAAAATTTTATTTTTCTATTAAAAAGACTCATCTTGTTAAGACAATTTCCTTAAGTTGACGCCATTGAGCGTTTTGGTTTATAGTTCGATTTGATTGCTGGTATTTACAATCTAGAATTATAAATGTATGCTTCAAAAGAAGTTTAATAATTGTGCCAAGAAAAAATTAGCTATGCGGGCTTATAATTTTACTTTAATAGAAGAAAAGTGGCAAAGTATATGGCAAAAACAGCAAGAAACCATACCACATGAGCCTTCCCACTATGCACGCAAGTATTATGTCTTAAACATGTTTCCTTACCCTTCAGGATCTGGACTTCATATTGGGCATTATACCGGTTATGTAGCTTCAGATATCATAGCCCGTTACTATAAACATAAGGGGTATCATGTTATGAATCCCATGGGGTTTGATTCCTTTGGTCTTCCTGCTGAGCAATATGCCATTCAAACAGGGCAACATCCTGCCATTACTACAGAAAAGAATATAAGCAAATACAAAAGGCAGTTCCGACAAATGGGCCTAGATTTTGATTGGGATAGACAAATAAATACCAGTGAACCAACTTATTATAAATGGACACAGTGGATATTTTTACAACTATTCAACGCTTGGTATAATAATACCACGCAAAAAGCTGAGCCTATAGAAACTTTGCTACAAGCTTTTACAAGCAATGGTAATCATACTGTAGAAGCTGCTTGTGATGAAGATACGCCTCTTTTCTCAGCTCAAGAGTGGAATGCTTTTACAGCATCAGAACAACAAGCAAAATTATTGCACTATCGGTTGGCTTACTTGAAGTATAGCATGGTAAATTGGTGCGAGACATTGGGAACTGTTCTAGCCAATGAAGAGGTAAAAAATGGGTTTTCTGAAATAGGAGGTTACCCCGTTACCAGAAAGAAAATGAAACAGTGGAGTTTACGAATGACTGCTTATGCAGAGCGGCTCCTGGAAGATTTAAGCAGCCTAGATTGGCCTCTTCCCACTAAAGAAATGCAACGCAATTGGATTGGTCGTTCTGAAGGGGCAGAAATTACTTTTAATGTACAAGGAGCATCCAATCAAACCATTAAAGTATTTACTACACGACCTGAAACCATTTTTGGAGCCTGTTTTATTGCACTAGCGCCTGAACATCCTTTTACAAGCTTTATAGCCAATACAACAGGAGATACCCTACTTATCGATTATATCCATAAAGCTAGAAATCAATCCGATCGAAACCGACTAGCAGCCCCCACCTCTTTAAGTGGTATGTTTCTGTCCGCTTATGCGATTCATCCATTTACAGGAGCTAGGCTCCCCATATGGGTAGCAGATTATGTACTCCCTAACTATGGAACTGCTGCTATAATGGGTGTTCCTGCACATAGCAGACAAGATTATCTTTTTGCACAATCTTTTAAGTTGCCATCCCTACCTGTTATAAAAAGTGATAACCCACTAGAAAGTGAGCCTTATGAAGGAACAGAGGGTAAATTGATTAACGCTAGTTTCTTAAATGGGCTATCTGTTCCAATGGCTTTTGCAAGCATTATACAGGAACTTGTAAGAAAGAAAATAGGAAAATATAAGATCAATTATAAAGTTCGTGATCCTATTTTTAGTAGACAGCGCTACTGGGGAGAACCTTTTCCAATATATTACAAGGAAGATGGATTGCCTTATGCACTTTCGGAAGATCAATTACCATTGGTTTTACCAGAAGTAAGTAGTTATCAGCCTAATAAATCTGGAGAACCACCCTTAAGCAATGCTTTAAACTGGACCACACCAGAAGGATATCCTTTAGAGCTAACAACCATGCCAGGGTGGGCAGGGTCTAGTTGGTATTTCTTGCGTTATATGGATGCCTATAATGCAAATGATCTTGTAAGTAAAGCAGAAGAGGAATATTGGAGCCCTGTAGATTGCTATATAGGTGGCGCAGAGCATGCAACAGCTCATCTGCTTTATGCACGTTTCTGGACCAAAGTACTCTATGATTTGGGACATATTCGTAGGAAGGAGCCATTCGACAAATTATTTCATCAGGGCATGATTCTGAATTTATCTGCATTGGCTTATAGGATAAAAGATAAAAATGAATTTGTAAGCTTTCATTTAAAAGAGTCCTATGATGTAGTTGGTATCCATGTCCCTATAAAGTTCGTATACAATCATATTTTGGACATTGAAGCATTAAAAAAATGGCGTCCTGAGTTTGCAGATGCTACTTTCATTTTGGAAGACGGTAAATATATATGTGGTAGTAAGATGGAAAAAATGTCCAAATCTAAACACAATGTAGTCAATCAGGAGCGTGTTATTGCCCAATATGGAGCAGATGCTTTACGACTTTATTTGATGTTTTTGGGACCGTTAGAAGAATCAAAACCATGGGATTTGGCTGGGATAGAAGGATGTAGTCGATTTCTCCATAAAGTATGGCGTTTTGTACACTATGCACAAGATAGTTGGACTACTACTGAGTGTATCAATGCTAAGGAGATAACTAAAACCATGCATCAAACTATTCAAAAAGTAACTGAAGCCATTCAGAGGTACTCATTCAATACGGCTATAAGTAGTTTAATGATTTGTTTGAATAAGCTGTCCGCACACAAAAAAGTAGAAAAATCTATTGTAGAAAATTTTATTTTACTTTTGGAGCCTTTTGCGCCTTATATTGCTACTGAGTTATGGGAAAGTATTGGAAAAGAAGAAGTTATTAAAACATTTCCCTTTCCAGATTGGGATAAGGATTCTTTAGTAGAAACAAATTATGCCTATCCTGTTGCTATTAATGGCAAAATACGTACTAAAATTATTTTTGATTGCCCTACACCGGATACAATAATAGAAAGAGCAGTATTAATGGATGCAGTAATTCAAAAATGGCTTTCTGGGAAAACAGTTAAAAAGGTAATAATCATCCCTAGAAAAATGATCAATATAGTAACATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP029619|974829:982996|974829_975696_+|AWN82121.1|DBSCAN-SWA MEKITPKVDLAFKKIFGVEENKDLLISLINATVSPEDQVVDVTLLNPYNPKDFRGAKLSILDIKAVGETGKRFNIEIQITDEADYDKRALYYWAKLYTDQLKVSEDYSTLNKAIGIHILNFISITDSSKYHNVFHITEKESGLPYFRDLELHTIELIKFSKDPKEDLDSLLKKVKNSLDIWTAFLTRHELLNKDNLPQPLANNSLKKALHVLDTMNFTDEERMAYEDHLKWLRIEANTLEKARREGMQIGKLAIAKAMLLKGYPMEDIVLLTGFPSSHIQDLIKEKDF >CP029619|974829:982996|977139_978078_+|AWN82123.1|DBSCAN-SWA MEKITPKVDLAFKKIFGVEENKDLLISLINATVSPEDQVVDVTLLNPYNPKDFRGAKLSILDIKAVGETGKRFNIEIQITDEADYDKRALYYWAKLYTDQLKVSEDYSTLNKAIGIHILNFISITDSSKYHNVFHITEKESGLPYFRDLELHTIELIKFSKDPKEDLDSLLKKVKNSLDIWTAFLTRHELLNKDNLPQPLANNSLKKALHVLDTMNFTDEERMAYEDHLKWLRIEANTLEKARREGMRIGEEQGMRIGEEQGMRIGEEQGMQKGKLAIAKAMLLKGYPMEDIVLLTGFPSSHIQDLIKEKGF >CP029619|974829:982996|978338_979301_+|AWN82124.1|DBSCAN-SWA MEKITPKVDLAFKKIFGVEENKDLLISLINATVSPEDQVVDVTLLNPYNPKDFRGAKLSILDIKAVGETGKRFNIEIQITDEADYDKRALYYWAKLYTDQLKVSEDYSTLNKAIGIHILNFISITDSSKYHNVFHITEKESGLPYFRDLELHTIELIKFSKDPKEDLDSLLKKVKNSLDIWTAFLTRHELLNKDNLPQPLANNSLKKALHVLDTMNFTDEERMAYEDHLKWLRIEANTLEKARREGMRIGEEQGMRIGEEQGMRIGEEKGMRIGEEQGMQKGKLAIAKAMLLKGYPMEDIVLLTGFPSSHIQDLIKEKDF >CP029619|974829:982996|980170_982996_+|AWN82126.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLQKKFNNCAKKKLAMRAYNFTLIEEKWQSIWQKQQETIPHEPSHYARKYYVLNMFPYPSGSGLHIGHYTGYVASDIIARYYKHKGYHVMNPMGFDSFGLPAEQYAIQTGQHPAITTEKNISKYKRQFRQMGLDFDWDRQINTSEPTYYKWTQWIFLQLFNAWYNNTTQKAEPIETLLQAFTSNGNHTVEAACDEDTPLFSAQEWNAFTASEQQAKLLHYRLAYLKYSMVNWCETLGTVLANEEVKNGFSEIGGYPVTRKKMKQWSLRMTAYAERLLEDLSSLDWPLPTKEMQRNWIGRSEGAEITFNVQGASNQTIKVFTTRPETIFGACFIALAPEHPFTSFIANTTGDTLLIDYIHKARNQSDRNRLAAPTSLSGMFLSAYAIHPFTGARLPIWVADYVLPNYGTAAIMGVPAHSRQDYLFAQSFKLPSLPVIKSDNPLESEPYEGTEGKLINASFLNGLSVPMAFASIIQELVRKKIGKYKINYKVRDPIFSRQRYWGEPFPIYYKEDGLPYALSEDQLPLVLPEVSSYQPNKSGEPPLSNALNWTTPEGYPLELTTMPGWAGSSWYFLRYMDAYNANDLVSKAEEEYWSPVDCYIGGAEHATAHLLYARFWTKVLYDLGHIRRKEPFDKLFHQGMILNLSALAYRIKDKNEFVSFHLKESYDVVGIHVPIKFVYNHILDIEALKKWRPEFADATFILEDGKYICGSKMEKMSKSKHNVVNQERVIAQYGADALRLYLMFLGPLEESKPWDLAGIEGCSRFLHKVWRFVHYAQDSWTTTECINAKEITKTMHQTIQKVTEAIQRYSFNTAISSLMICLNKLSAHKKVEKSIVENFILLLEPFAPYIATELWESIGKEEVIKTFPFPDWDKDSLVETNYAYPVAINGKIRTKIIFDCPTPDTIIERAVLMDAVIQKWLSGKTVKKVIIIPRKMINIVT >CP029619|974829:982996|975956_976871_+|AWN82122.1|DBSCAN-SWA MEKITPKVDLAFKKIFGVEENKDLLISLINATVSPEDQVVDVTLLNPYNPKDFRGAKLSILDIKAVGETGKRFNIEIQITDEADYDKRALYYWAKLYTDQLKVSEDYSTLNKAIGIHILNFISITDSSKYHNVFHITEKESGLPYFRDLELHTIELIKFSKDPKEDLDSLLKKVKNSLDIWTAFLTRHELLNKDNLPQPLANNSLKKALHVLDTMNFTDEERMAYEDHLKWLRIEANTLEKARREGMQIGEKQGMRIGEEQGMQKGKLAIAKAMLLKGYPMEDIVLLTGFPSSHIQDLIKEKGF >CP029619|974829:982996|979561_979948_+|AWN82125.1|DBSCAN-SWA MEKITPKVDLAFKKIFGVEENKDLLISLINATVSPEDQVVDVTLLNPYNPKDFRGAKLSILDIKAVGETGKRFNIEIQITDEADYDKRALYYWAKLYTDQLKVSKDYSTLNKAIAIEHGPSCSIQIHS |
6 | Wolbachia_phage(66.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1031195 : 1040470
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP029619|1031195:1040470|DBSCAN-SWA TTCAATGAGCGTGTGCGTGCAAGCAGAAATAGACATAGCGTTTATCCAGATCGCAGCTTTTGATCGATACCTTTACGCTATCTCCCAATCGGTAGCATTTTTTTGTGTATTTTCCTATAATCTGGAACTGTTTTGCTTCAAAGCGGTAGACATCATCTGTAAGATCTGCCAATCGCACGACCCCCTCACATCCATTGGTTACAATTTCTATGTAGAGGTTCCATTCCGTTATGCCACTAATAATGCCATCAAATGTCTCATTCTTTAGATTTTGTAGAAACTCTACTTGTTTATATTTTATAGAAGCTCTTTCTGCGCTAGCTGCGATGTATTCTCGTTCTACCGCATATTGACAGTTTGCTTCCTCCAATACCATCTGTTCGCATAGCCATTTACCCTTTAAGTAAAGTTTTAAAAGGCGATGTGCTACTATATCTGAGTATCTTCTAATAGGTGAGGTAAAGTGACTATAATGGGAGAAAGCCAATGCAAAGTGGGGATTTGGTTTGGTTGTATATAAAGCTTTTGCCATAGAGCGGATGGCGAGCGCTTGTATAATAGGCTCTTCTGGTTTGCCTCGGATAGCCTCTTCCAAATGATGCATTGTTTTAAATATAGGTCGGTTACCTGGTTTAATGGTATAGCCCAATTGCTGTACAAATAGAAAGAATTCGCTTAATTTGCTTGGATCTGGTTTATCATGTGTCCTATAAATAAAAACAGGTGCTATTTCGTTCTTTTTTTCATTCTTTTTGCTTTGAATTTTTTTTGCTACATAAGTAGCAACCTCTCGATTGGCTAGTAGCATAAACTCTTCAATAAGCTTATGGGTTTCTAAGGTTACTTTTGGTACAATCTGCAATGGCTTACCATTGGGATCGAGCGTAAAACGCAGTTCTCTGGTTTCAAAGTTTATGGCACCCTTTTTAAAACGTTTTGCCCGCAGTTGTTTGGCTAAAGCGTTTAATGCTACTAGCTCTTGATAGAACGCAGCTGTTTGGTTATCCAAGGTTGCTTGGGCTTCTTCGTAAGTAAATTGCTTATGGGATGTAATAACGGTTTCACCGAACCATTTATTATGCACTTTTCCCTGATCATCTAGTTCAAAAATAACGGAAAAAGCTAATTTAGCGCTACCTGGGTGTAAAGAGCAGAGTTCATTGGAAAGTAGTTCTGGTAGCATAGGGATACAACGGTCCACTAGGTATACAGAAGTATTACGCTTATAAGCCTCTTGATCAAGTAAAGTAGCTGGCAATACGTAGTAGCTTACATCCGCAATATGGATACCAACCTGATGATAGCCATTGGGCAATTTTTGATAGGAGAGTGCATCATCTAAATCTTTCGCATCAGCTGGATCTATTGTAAAAGTAGGTATGGCACGCAAGTCTCTTCTTTTGGTTATTTCTGTTTCAGGAATAGCAGTAGGGATAGTTTGTATACTGGCCAATACTTCCTCCGGGAATGTATTACATAGGCCAAATTCAGCCATAATGGCATGCATCTCTACCTCATGGAGGCCTGCCTGTCCCAGATGCTGCACAATAGTACCGGTTAGCTGGTTGTCTATACCATGGGAAGCAGTTAGTGCAATGACTGCTTTATCGTTTTCTTGTAAAGACATACCCTCCGTTTCTTCCAATAAAACTATATGCGTAACATGCCGTTGCGTGATGGTAGCTTGCGCTTGTTTACCAGTTGAAACCACACGTCCAATAACAGGGGTAGGGTTGCGTTCCATAATTTCCACTACCACACCCTCTGGCCGATGGCGGCGTTTGCTTGCGCACAAACGTACCTTTACCAAATCTTTATCTAGGGCAGATAGTAAATCTTTTTGAAATACCAATATATCTTTTGGTTGATCGGGAGCTATAATGTAAGCATATTCAGCTCGTACATAATCTACCCGTCCTATTACATAGGTAGATTGCTGCAACCATTGGTAGCGTCCTTTATTGATTTTTTTTACCTTACTATGGTGTATAAGATCTAACAAAGCTTTTTTTACGGCTGCTTTGTCCTTTTTTTCTGTAAGCTGTAGGAGGGTACAGAGCTGCTGAAAGGTATAGGATTTATCTGGAGCTTTTTTTAAAGCTTGTAAGATTTGTTCAGCCTGTTGTGCTGCTTCTTTTTTATTTGGCGTATTATGCATAATTCTAATCATGGTTATACCCTTTTAGGTATGAAAAAACATACCACATGCCAAGGCTTGTGCCCTTCTGGGAATAGGTGCCAGAGCCTGGGACTATATGCCAAATGTATATAAGCAGTTAGCCTAATATAGCATTAGCTTACTATAAGTAGAATGGGCTAGTTATAATTAACCTTGCAGGGCTAGAAATTCCACAAATTCCACTTAAAATAAAGGTAACGATATTATGCTATAAAAGCAGTAGGGAAACCATTGTAATAAAATAAATTATTCAAGAAACCATTATGCAAAACGATAGTAACGAAATGAGTACTATTAATCCGTGGAGTGGTTTCTTGTCAAATGAATAGGCAAAATAGGTACGCTACGCTTTGGATAGTTTGGCAGGTAACAAAGGGAAACTGCATGGGTTAATACGCTATGTTTTTGCTTACATATTTTTCCTTTGTAATTGCATGACAGAATCAACTGGTTTAAGTTACTGATCGATGCGTAGTATTGCAGTTTATTTATAATAAATTTCATTGTAAATGAGTGTAATTAAAGAGATTTTAGGCTACTATTGGCGTCAAACGGCATGGGAGGATTGGCGGAGTGCTGCTGCTACCCGCTTGCTGGTAGTAAGTTTATCTCCATTAACATAGCAATAATTTTAATTTTATAGGTGAGTAGGTTAACAATAAGTTGTTTTACAGCACGATGTATTGTATATTATCTGTATGCTTGATTATTGTGCCTAATTATTGTGCCTATTTAGCTGAGGTTGAGTTGTGGTTTGCTTTTTTAAGCAAAGTATATTATTTAAATATAGGCCCTTATGCAAAATAATTTTAAATAAAATATTAGTAAGATTATTATTTATTGTTAACCAGTGGAGTAGTTTTTTGTCAAATGAATAGGCAAAATAGGGGGAGCAACTGCGGCATCATATCGTAAATCAATTAAATACAGAAGATAAAAAAGCTATGCTCAATTAGTTGATTGTTATACCGAGCACTTTAAGCAGTTCGAGGTACTTTGTGATAATGATGCGGTCTTTTTTATTATTAAGGACCCAATGAAAAAAGCTGCTGTTATTGAAGCATTAAAAAACAATAAAACAATTACAGCGATTGCCTTATGCAACTATTGTCTTAGCGCTGAAAGTGCGGAAGTGTTACTTAAAGCATTTTAGCATACCAAGATTTGGCTATTTGTGGATAGTGTTGATTTTACTTAGTAGCAAACGTTTCTAAGGCCATCTCTGCTTCTTCTTCAGTAACTTCAGTGTAAATTGGCTTTAAGTTACCAGTTAATGACTTTTTATGTTTATAAGAAACATATTGCAAGCTGTTTCTAATTTGGTGCACAATACAGACTTGATGTTCAGTTTTAGGGTATACAGCAGCGATGGCTTCAGATATACCTGATAAATTAGCTGTACAAGTAATTAGCATATCGTTCATACCACGATTTTTGAGCTTTGTTAAGTTTCCTAACCAAAATTTATCTCCTTCATTTTTATTCATTCACAGTTTTAAAACATCTTTCATGCCTAATCTGTCTATACCTAACGTGACATAGACTGCCTTATTAGGAATATTGCGTAATCTGCTTAATCTGTTCTGTAGATAATCCAGTTAGTGAGCTAATAGCTTCTATAGGGTAACCATGCTGAAGCATAGCCTTAGCTATAGAAAGGGCTTTTGCCATTTCTCCCTCTGCTTTACCTTCTGCTTTACCCTCTGCTTTACCTTCGTTTCTAGCTTTCTCTAGCGTATTCGCTTCTATCCTTAACCATTTCAAGCGATCTTCATAAGCCATTCTTTCCTCAGCAGTGAAGTTTATCGTATCTAAAACATGCAACGCCTTTTTTAAGCTGTTGCTATTTAACGGTTGGGGCAAATTATCTTTGTTGAGTAAGTCATGTCGGGTAAGAAAAGCTATCCAAATGTCTAACGAATTCTTTATTTTTTTTAATAATGTTTCTAGGTCTTCCTTTGGATCGTTACTGAACTTAATCAGCTCTATGGTATGCAATTCCAGATCGGTAAAGTAGGGCAGTCCACTCTCTTGTTCTCTGATATGGAATACATTATGATACTTATTGCTATCTGTTATAGAAATAAAATTAAGAATATGAATTCCTATTGCTTTGTTTAAAGAGGAGTAAGTCTCAGAAGATTTTAATTGATCAGTATACAGCTTAGCCCAATAATATAAAGCGCGTTTATCATAATCTGCCTCATCTGTAATTTGAATTTCTATATTAAACCTTTTCCCTGTTTCTCCTATGGCTTTCACATCTAGTATGGATAGTTTATCACTTCTAAAATTTTTTGGGTTATAGGGATTTAATAGGGTAAGATCTACCACTTGGTCCTCCGAAGAAACAGTAGCATTTATTAATGCAATTAATAAATCCTTATTTTCTTCTACCCCAAAGATTTTTTTAAAGGCCAAATCTATTTTTGGCGTAATTTTTTCCATACTTTATTCTATTTTTTAGTTGTAAAGCGACAGCTTGTATAAGCGTAATACATGTTGTAAGATAATAGTTTTCTATAGAATGTAAGGGGAGTGTCTAAATGGTTTAGCCATTGCAATGGCTGGTACGTTTAATGGACAATATGCGTTCTATTGGGTTGGCAAGATTCGCTTGGTAGGGAAGAGGATATTTACAATACTTACTGACTGCTTGCTACAATGCATCAATGCTGTCTATAGTATTGCTGGTATTTCATTAGGAATATTGCGTAATCTGCTTAATCTGTTCTGTAGATAATCCAGTTAGTGAGCTAATAGCTTCTATAGGGTAACCATGCTGAAGCATAGCCTTAGCTATAGAAAAGGCTTTTGCCAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP029619|1031195:1040470|1033882_1033996_+|AWN82171.1|DBSCAN-SWA MSVIKEILGYYWRQTAWEDWRSAAATRLLVVSLSPLT >CP029619|1031195:1040470|1031195_1033364_-|AWN82170.1|DBSCAN-SWA MIRIMHNTPNKKEAAQQAEQILQALKKAPDKSYTFQQLCTLLQLTEKKDKAAVKKALLDLIHHSKVKKINKGRYQWLQQSTYVIGRVDYVRAEYAYIIAPDQPKDILVFQKDLLSALDKDLVKVRLCASKRRHRPEGVVVEIMERNPTPVIGRVVSTGKQAQATITQRHVTHIVLLEETEGMSLQENDKAVIALTASHGIDNQLTGTIVQHLGQAGLHEVEMHAIMAEFGLCNTFPEEVLASIQTIPTAIPETEITKRRDLRAIPTFTIDPADAKDLDDALSYQKLPNGYHQVGIHIADVSYYVLPATLLDQEAYKRNTSVYLVDRCIPMLPELLSNELCSLHPGSAKLAFSVIFELDDQGKVHNKWFGETVITSHKQFTYEEAQATLDNQTAAFYQELVALNALAKQLRAKRFKKGAINFETRELRFTLDPNGKPLQIVPKVTLETHKLIEEFMLLANREVATYVAKKIQSKKNEKKNEIAPVFIYRTHDKPDPSKLSEFFLFVQQLGYTIKPGNRPIFKTMHHLEEAIRGKPEEPIIQALAIRSMAKALYTTKPNPHFALAFSHYSHFTSPIRRYSDIVAHRLLKLYLKGKWLCEQMVLEEANCQYAVEREYIAASAERASIKYKQVEFLQNLKNETFDGIISGITEWNLYIEIVTNGCEGVVRLADLTDDVYRFEAKQFQIIGKYTKKCYRLGDSVKVSIKSCDLDKRYVYFCLHAHAH >CP029619|1031195:1040470|1038435_1039344_-|AWN82177.1|DBSCAN-SWA MEKITPKIDLAFKKIFGVEENKDLLIALINATVSPEDQVVDLTLLNPYNPKNFRSDKLSILDVKAIGETGKRFNIEIQITDEADYDKRALYYWAKLYTDQLKSSETYSSLNKAIGIHILNFISITDSNKYHNVFHIREQESGLPYFTDLELHTIELIKFSNDPKENLETLLKKIKNSLDIWIAFLTRHDLLNKDNLPQPLNSNSLKKALHVLDTINFTAEERMAYEDRLKWLRIEANTLEKARNEGKAEGKAEGKAEGKAEGEMAKAFSIAKAMLQHGYPIEAISSLTGLSTEQIKQITQYS >CP029619|1031195:1040470|1039597_1040470_-|AWN82178.1|DBSCAN-SWA MEKITPKIDLAFKKIFGVEENKDLLIALINATVSPEDQVVDLTLLNPYNPKNFRSDKLSILDVKAIGETGKRFNIEIQITDEADYDKRALYYWAKLYTDQLKSSETYSSLNKAIGIHILNFISITDSNKYHNVFHIREQESGLPYFTDLELHTIELIKFSNDPKEDLETLLKKIKNSLDIWIAFLTRHDLLNKDNLPQPLNSNSLKKALHVLDTINFTAEERMAYEDRLKWLRIEANTLEKARNEGKAEGEMAKALSIAKAMLQHGYPIEAISSLTGLSTEQIKQITQYS >CP029619|1031195:1040470|1036074_1036995_-|AWN82175.1|DBSCAN-SWA MEKITPKIDLAFKKIFGVEENKDLLIALINATVSPEDQVVDLTLLNPYNPKNFRSDKLSILDVKAIGETGKRFNIEIQITDEADYDKRALYYWAKLYTDQLKSSETYSSLNKAIGIHILNFISITDSNKYHNVFHIREQESGLPYFTDLELHTIELIKFSNDPKEDLETLLKKIKNSLDIWIAFLTRHDLLNKDNLPQPLNSNSLKKALHVLDTINFTAEERMAYEDRLKWLRIEANTLEKARNEGKAEGKAEGKAEGKAEGKAEGEMAKAFSIAKAMLQHGYPIEAISSLTGLSTEQIKQITQYS >CP029619|1031195:1040470|1034409_1034526_+|AWN82172.1|DBSCAN-SWA MKKAAVIEALKNNKTITAIALCNYCLSAESAEVLLKAF >CP029619|1031195:1040470|1034563_1034860_-|AWN82173.1|DBSCAN-SWA MNKNEGDKFWLGNLTKLKNRGMNDMLITCTANLSGISEAIAAVYPKTEHQVCIVHQIRNSLQYVSYKHKKSLTGNLKPIYTEVTEEEAEMALETFATK >CP029619|1031195:1040470|1034924_1035821_-|AWN82174.1|DBSCAN-SWA MEKITPKIDLAFKKIFGVEENKDLLIALINATVSSEDQVVDLTLLNPYNPKNFRSDKLSILDVKAIGETGKRFNIEIQITDEADYDKRALYYWAKLYTDQLKSSETYSSLNKAIGIHILNFISITDSNKYHNVFHIREQESGLPYFTDLELHTIELIKFSNDPKEDLETLLKKIKNSLDIWIAFLTRHDLLNKDNLPQPLNSNSLKKALHVLDTINFTAEERMAYEDRLKWLRIEANTLEKARNEGKAEGKAEGKAEGEMAKALSIAKAMLQHGYPIEAISSLTGLSTEQIKQITQYS >CP029619|1031195:1040470|1037249_1038182_-|AWN82176.1|DBSCAN-SWA MEKITPKIDLAFKKIFGVEENKDLLIALINATVSPEDQVVDLTLLNPYNPKNFRSDKLSILDVKAIGETGKRFNIEIQITDEADYDKRALYYWAKLYTDQLKSSETYSSLNKAIGIHILNFISITDSNKYHNVFHIREQESGLPYFTDLELHTIELIKFSNDPKENLETLLKKIKNSLDIWIAFLTRHDLLNKDNLPQPLNSNSLKKALHVLDTINFTAEERMAYEDRLKWLRIEANTLEKARNEGKAEGKAEGKAEGKAEGKAEGKAEGEMAKALSIAKAMLQHGYPIEAISSLTGLSTEQIKQITQYS |
9 | Wolbachia_phage(57.14%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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