Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029549 | Lactobacillus paracasei strain EG9 plasmid pEG9C, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP029548 | Lactobacillus paracasei strain EG9 plasmid pEG9B, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP029547 | Lactobacillus paracasei strain EG9 plasmid pEG9A, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
CP029546 | Lactobacillus paracasei strain EG9 chromosome, complete genome | 0 crisprs | DinG,WYL,DEDDh,csa3,cas3,csn2,cas2,cas9 | 0 | 0 | 15 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
4568 : 54937
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP029547|4568:54937|DBSCAN-SWA GTTATGCCGTGATTTGGTAGATTCGTTTGAAGAAGTTCAGCTGATTCTTGAAGCCAAAACAGGATCGTTTGAGTGACTTGATGAGGCGGTTAACCCCTTCGATCGGACCGTTGGAATAAGGGCTGGTGACAGCGGCGAGAACAGCGACTTTGTGTCGCTTAAGCGTCGCGATCGTCATGTCCATTGCCGTACCGTTTGGCTCGTAAGTAGCTAACAGGTTTGCCAGTTCCGCGGGATGTTTCTTCACCATCAAGGCATCATGAAGCGCTAAGTAGGTCTCGTAGGTTTGCTTGAGCTTGGGCTCAGTATCAAGTGCGATATCGATGGCCTCCTGTTGCGTGACGTATTCATTCAAACCAAACAGGAACTGTTTGTGTTTAGCGTCAGGCGCAGTTTGATGAAAAAGCCGCCAGTTTGTCTTCATGATCTTATAAGGACGGCTGTGTTTGTCATCAAGCTGTTTGAGCGCTTGGACGCGTACCTGATCAAGGGCACGAGCCGCAAGTTGAATGATATGGAACCGATCAATGACGACTTGGGCCTTGGGGAAAACCTCATGAATAATCGTCTGATAAGCTGCGTTCATGTCCATGGTGACCGTCTGGACCCGAGTGCGTTCAGCGAGTGAATAATGAGCGATGAAGAAGTTTTTAATCGTGCGGTTGCATCGATCACCAAGCAAGGCAATCAGACGATGTGAATCGGCATCAAGACAGATAAACGACATCATGCCATGAGTGGAACGGAACTCATCAAAACAGAGTCGCGTGGGTAGCCGGCGAGCCGGTCGGAGTTTGAGATTTTGGTCAATGATCCGTTGAACTGAGGAAGCTGAGATCCCGATAATACGGGCGATGGTTTTGACTGGCAACCGTTCATGCGCTAACTTCATGATTCGCTCTGTCATGTGAGCGGCGATCGTGTGGTTGGGTTGCACGAGTGGCGTCTTGGCACTGACTGTGTGGTAACAGCTATGACAGCGCCATCGTTGCTTGTGCAAGTCAATGACTGTCGGCATTTCAACCCCATTGAGGACGCGCACGTGGGCCGTGTAAAACCCGTTAGGGTGCAAGGCCTCAAAGCCACACAGTGGGCACCGAGTTAACCGGTAAGTCAGCTCGGCATCAATCACATGATACTGGCGGCGACGTACCCCGTTGCCGCGATATTCATGACGAACAAAGGCTACTTTGATATTATGGTCTGGTATTCCAAGGACGGACAGTGTAGGATCGTATTGGGACATTTACTCATAACCTCGCTTGCTTTTGGTTTCGACGCTAACAAGCATAGCATGGACACTGAGTAGGTGTCTTTTTGCGTTATCCAAAAAAGGCCTACACGTTCAGTGCTGATTATTTCTCAACACCAGAAAGTGTAGACCCACTTTTTCGTTGCTGTAAAGGCACAAATGGCTTTAATATGAGTAAAAGGAGGCGTGTACCATGCTTGTAGCAGTTTGGAATTTACTAACGATTGTTTTAGTATTGATCATCATTTGGTTAACCCGTAAGCAGAAAGTCACCACGCGATTGGGGCGGTACAATCGAACTTTTATGATCATTGTTGCGGTGATCCAAATCATTCTGATCATTGCGGGAATGCTGGTTACCAGACACTCGCTTTCGCTGCAAGCAGCCTCATTCACTTGTAGCATGGTACTACTGATAAGTATGTTGCTTGGTTTTAAAATGCGCTAATCTATAACCAGAAAGTGCCATCACTTTCTTGACTTAGTCAGGAGAAGTGATGGCACTTTTTGAATGGAGGACAAATGACCGTCAACAAAAATAATCAACGTTACCAAATCACCTTAACGCCAGAAGAGAAGCAGCAGCTTAAAGCACTTTGTCAGGTTACTAAGGAACGACCCTTAACATTGGTGCGCCGGTTGATTGCTACTGAGAAAAGACTTTATGATTCAGGCTTTTTACCGTCCTACAATTCAAAAATTGAAAAGTGAGGAGAGATTAAGGTGTTGTGGCTGATTCTCAAATGCAGTTTCTGGATATTACTAGGCTTTATCTTTTTGTGTGAGCTTGCAACTATTCGGATTAGCGGATTGTGTTCTCGTGAAGAGGAACGACAGGAAGCTCTTGAAAAGCATCTTCAACAAGCAAAAAGCGCGCCCTAGGGCGCGTTTTTATTAGGTATTAACGTACCTCCATTTTACCAAAGTTGTGCTCTGCTACGCAATTTAATGGTGTGTCACTGGACAACAAATGCCGCTACTGGGAAACGTGGTTCGATTCCACGAAGCGGCCTTGGCTAATGCCAAAATAATGAACGCCAAATGCCAGCTAATTGCAGGTGTTTTTTGCGTTAAAGAAAGGAGACTGAACATGGCTGAACCTGTAGGTATTTGGTTACATGATCGCAATTTGAAGTTGATTTCGAAAGATCATGATGCTCTTTCTTATCGAGTCCGAGCTTCATGGGTTAAGGATCATGCTGATTATCCAATTAAGCCTGGTATGACGGTGGTGATTGGCAATATTAAGCCGCCTAACCAGCTGAAAAATGTTTTGGTTCTAAAGGTGGTGTCAGCTGAATTAAAAAAAGACGGCAGTCTAGTGATTAGCGGAGAACGCATTAAGTCCGTCCCAAAAAACTTGATATAAGAGGTGATCATATGTTCAATTTGGTTCTTCAAACAAAAGACATCAAGGAAGCTAAGCGGCACAATGGTCTTCTTGAAATCAGATTCCCACCCCCAAAGGAGAAGGCATTGATGTTGAAGTTGCGTCATGCCGTATTAAGTATCGAAACGGGGTGGCCTATTCTGCCTGATACAACTTGTATTGGTGAGATTGTGCGGGTGTTACCAAGTAAAGATCGCGTGATCGTGGCTTATGTTCGCCCGCAAAACGGTTTTCAGCGATTTGTTGAGTCGCATTAAAAATAAGGAGGTGTCGTTATGGCAATTAGTAAGGCACAAATGAACAATCAGAAACAAATGTTAACGGAGATTTTGAAACAACAAAATCTCGCATATGAAGACTGGCTTTACCAAAGAATGACTGATGAGATTGAGAGCCATCGAAAACTGATTCTACAGGCACTCAAGAATCTCAATATGAAAGAAGGACATTAATATGCAAGGAAAAGTCATCGCTTTATTGAGCGCTATTTTAGGTTTTATTATTGCCATTGCCGGCGGCTATGCGGCAGTCAAGTTTGGCTTAATGGGTATTGCTCACATGACCAAGGATCAACAGAAAATCCGCGAGGCGCGTGATGGTATGACCAATGTTGCTATTGGGCTGATTGTAGTTATTTTCGCTTCTGCCGCAGTTGCTTGGTTACAAGGCTTGGCAGGTTAATTCGGTCTGAATAAGCCTCACTCTAAAAGAAAGGAGAAGGCCGTGTACGCTAAATTTGAATGTTCAAGAAAGTTGCGTCAATTTCTAAAGAAAAAGAGACAACTGTCTTTATCCGAAGCCGAAAAGATGATTAGTGCGGCTGACGATTATGCGATTCAACATCACTTCAAGGAAGATGTGAACTTCAAAATTATTGGTCAGGACGGCATTGAGTATGAAGATAATCTTCCAATTGGCACAGGACAAGGCTGGCTGCATAACCTTCTCTTGATTCTAGATCATGCCTACCAAACCGTCTTGAGTGATCAATCGCCTGAAGCATTTAAAGCATTTTCCGACCGAGTTAGACAGGAACTAACGATTGAGGAACAGCCAAAAGCAGTCCAAGAAACCTTGCCAGTAGTTGCTCGTCAAGAAAAGGCTCATCATCTCAAACCAATTGTCTCCAAAGAGGAAGAAGCATTACGTAAAGCGGAAAGCTCAGCGCCAGCTGCTGCAAAGCAAAAACCGCAAAAATCAAAGCCAGTCCTGTTACGGCGGCAGGCAAGAAAGAAACCAATGTGGCAATTTCCACAATTGAAGCGGCCAAAAATAAGGTTATCTGCACAAATTATAAAGCGCTTTGTGCTAGCAGCAGCAACGATTCTAGTCGTTGCTATTTTTATGCTCTTTTTGATGAGGCCAAAGCCTGTGCCGAGTTATCAAACGCTTATTCAGAATGCTTCTTACGTTCAAGCTGCGAAGCTTTATCCCAGCAAGCATCGCGATATTGAAGCCAGGTTAGTCAAGGACAATGATGAAAAATCGCTAGCTGCGTTTGTCCAAAAGTACCCATCAAATAATGGACGCTTCGATTTGGCTTATATGCAGAAGAAGTTTTCAACGGTCATTTCGGTAAGCCAAGATGCGGATCTAACGGCAGTTAGAAAGGTAAAACTAGCTATCAGTTATATTTACCAGAATCAACCAGAGAATGCTTTAACCATCAATTCAGAAATAAAGAGTCCACAACTGCAACAGCTGATCTTTCTCGCGTTGATTCATGAGGGAAAGTTGGATCAAGCGGCGACACTTGCGAAATCCATGAACAATAAAGATGCCGACAAAGTGCTTGAAGTTGGTAAGACCTATCAGGCTGCCTATGAGAAGGCTAAAGCGGACGCAAATAATTCAAAACTCTCTGAAACAGATCGGAAACAAGCACTCAAAGATCAGCACAACTGGTTAGCACTCAGAAAATCATTAGGAGGGAAGAGTCCCTATGAAGAATCAACAAACGAATAATAAGAAACGTCATATCATCATCACAACAACAGCCGTTGCGCTACTAGGAGCTGGTGGCCTTTGGGCTGCCACACAAGCACATAGTGATCAACAGTCCACTCACACCTCGTCTTACCAGAAAAAGATGCAGAAGCCTAAAGCATCCAAAGGTAGCCAAGCTAAGAAGGAGAAGGGCAAGAATACAGTCAACGATATTATTGACCAGGCCCTAGGAGAGAGTAGTACCTCAACTTCAAATGAAGATCATGCTTTCAAATCGGCAACCAACAATATCTTGGATAGTGATCCAATTGCGACTATTGCGAAAGCCTTAGATACGCCAGCAGCAAAAGCATCACTGGCGGCAGCAACGGCGGCAGTTGAACCACCAAAGACTTTAAATGACAATAGCGA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54 | Lactobacillus_phage(36.36%) | bacteriocin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
27183 : 85412
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP029546|27183:85412|DBSCAN-SWA 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MKTLNETTQQSTRAGRYGKDFGGQYIPETLMTELEKVTKAFNDLKDNPEFKAELNDLLVNYANRPSLLYYAKNMTEDLGGAKIYLKREDLNHTGAHKINNVIGQALLAKHLGKKRLIAETGAGQHGVATATIAALMGMDCEIFMGKEDTDRQKLNVYRMELLGAKVHPVTSGSMVLKDAVNATLQEWASRSDDTFYVLGSAVGPAPFPEMVKHFQSVISTESKQQLQAKEARLPDMVVACVGGGSNAIGSFAAYIDDPSVQLVGVEAAGKGVDTDRTAATIERGSVGIFHGMKSLFMQNEDGQIDPVYSISAGLDYPGVGPEHAALAQEGRAQYVGITDDEAVEAFTYIAKQEGIVAAIESCHAIAYVEKIAPQMAKDQIIICTLSGRGDKDVASIAKYKGVDVDE |
59 | unidentified_phage(22.22%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
328206 : 408972
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP029546|328206:408972|DBSCAN-SWA TATGTTGCAAAAGCTGAGAAACTCGAATTTTGTCGCGATAGTTTTGGCTGCCAGAGGAACGCTTCTGATATGCTGTCTATTGCTCTTCTGCTATTTACTATTTTCAACTTTGACAAATACGTTTTTAATTCCCACGAACGACCTTTTAGGGGATGTGGCTTCAATTTTAAAAGGAGAACTCTGGCGCGTTATAACGAGTACTGTGTACTTTTCTGAATGGACGCCCTTAATTAAGACTGTTCTTATAGTTTTGGTCCTTTGCCCCTTTATAGAATGGAAAATTGGCAGTCCTGCGCTTGTTATGAGCTTTTTTGCTTCTAGTTGGATCGGCATCTTGTTATTTTGCTTTGGACTTGGTGGTGTCATTCGGTCAACAGTTGGCATAAACACCTACGTTTATGCTTTTTATGGCGGAACACTGTCAGTCTATGCTTTATTTCCACTGGCAGTATTGGCGTTCTTGATAAAGAAACCTGCCTTTTCTTTGTTGGCAAAGTGCGTTTTAGTTGGCGGTCTTTTGTTGTACTTTACAGTGGGGTTTTGGCCGAATTCAGGTACACCAGAGCCTGCAGTCATTGTACAGATTAGTCAATTATGCGGTGTTCTTTCCGGCCTTTTCTGTGCCCTTATAGTCGTGGCGCTAAGAAATTGGAAGAAAGTTTCTTTCTTTTCTGCCAAACCGAGCAACTGATCTTATAAGACTTAAGAAAATTTGGTGCTAATGATGCTAATGAAAAGAAAACCCCAGTTTACAATTCAAGTGCAACACCCTGACGACTAGACCATAAAGGCCATGAAGACCTATTCTTGTTAGTGCTAGCTAAACAAGAAAGCAGGAATCTTCATGACCCACTCTCAGACTAACACCCACAAGCATTACCAACAACTCAGTTTTAGCGACCGTGCTACAATTCAGGCCCTTCAGGCTGCTGGTGACACCGCGACCGTGATTGCACAGAAGCTTCATCGCAGTAAAGCGACAATCTCACGAGAAATCACGCGTGGATCTGTAACTCAGCTCGACTCGAAGCGTCACTCGCATCAAGTCTATCTTGCGGAAACTGCCCAAGCCATGCACGACCGTAAACGCGATAGAACCGGTCACTACGCCTTTCTTAAGACCGGCCGTGCGTTCTTCAAGGCTCTCGCCAGGGAGCTTACTCGTAAGCCGCGCGTACACAGCGTTGATAGCTTCGTACACTTCTATCGCGACCAGGGCAAGGCTTGCCCTTCAACGACAACTGTCTATCGCTACATCGACGCCGGGCTGCTTGAGCTAGACAACATGACACTTCCCAAGAAGCTCCGACGCCGCATCAAAGGCTATAAGAACGCCCACAAGCGCAAGAATAAGAAGATATACGGCGACTCAATCGAGTTGCGTCCTGCGGCCGTGAATGACCGCACAGGCGTGGGACATTGGGAAGGCGACTTGGTCAAAGGTATTCGCTTAGCTGATGAGCCAGCATTAATGACGCTCACAGAACGGTACAGCCGGTCTGAGATCATCGTCAAGATTCCTGACTATCATGCGGGCACCTGCCTTAAAGCCTTGCAGGACACGATCGACGACTACGGAGCCAAGGAATTTGAGAGTATCACTTTTGACAATGGTTCCGAGTTTGCCAAGTTATCAGAGATTGTTGGAACCCAGATTTACTTCGCACATCCGTACTCGCCTTGGGAGCGTGGCACAAACGAGAACGCCAATGGACTGCTTAGGGAATTCTTCCCGAAAGGGAAGTCTCTCAGAGCAATTACCCTGGTTGAAATTCAAGCAGTCCAATCCGCACTGAACCATCGTCCCAGACGTATTCTGAACTATCTTCGCCCATGCGATTACTACCGATGCATGGCGTAACAGCCTAGACCACTATCAAGAATTCGTTATCATCGTTGCACTTGACTTGAAAATTGAGGTAATGAAAAGAAAACGGGTGAATTTTATGTTGCTAAAGTTGAGAAGACCCAATCTTTTATCCGTATTTTTGAATGCTAGAGGAACATTCCTTATCTGCTGCATATTGATAGTTTGTTATCTTTTATTTTCGTTTTTAACGAATGTTCTTTTAATACCATCAGCTAACTTTGTCGGGAGCATACCTTCAATTTTAAGAGGGGAACTTTGGCGAATTGTAACGAGCACAGTTTACCACTATGAATGGCCGCACTTAATGAAGAATATGCTTGCAGTGATGGTGCTTGGGCCATTTATCGAGTGGAAAATTGGCAGTACACCATTCGTCATTAGTTTTTTTGTTTCTAGCTGGCTTGGTGTCTTGCTGTTTTGCTTCGGATTCGGCGGGTTCATTCAATCAGCGTTTGGAATAGGCACCTATATTGAATCGTTTTACGGTGTGTCATTGTCTGGATATGCCTTATTTCCACTAGCTATATTGGCATTTTTAATCGAAAAACCCACATTTTCCTTTATGACGAAGATTGTTGCGTTTACATCGACTCTTTATTACGTCACAGTGGGATATTGGCCGAATCTAGCCATGTCAGATATTGAAAAAAATGTTCAGGTGGCGCATTCATGCGGCCTTCTTGTAGGCCTTTTCTGTGTATTGGTCATCTTGATAATAAAGCATCGGGAGAAGATGTTCTCTTTTTCAAGTCGATCAAAATGATTGATCACGCTGATGTGTTTGAAATCAGGAGGGCACGAACGCCTTGTAAATTGTTTGAGTTGTGGAAATGTTAAATTTTGAATTGATGATGAAGACGAATATGTCCCTCTTTGAGTTGACAATTCGTCTTATAAGTTAAGATTAAGGCAAAGTTGTCAAACCGCCCTCAGCCAATAAGAAAACTCTGATACAGTCATAGCAATCAAGCTAGGTGAAAGGGTGATCAAAATGAGTTTTTCGCTATTGATGCTGTTGTTTTTCCTAGTCGGTATCGTGGTATTCCTGGTAGGCTTAAAGCAAAGCATCGCGGCTGGACGCGGTTAGGCCTTGGTCTGTCTGTCCTAGCAGCAATTATGTTTGTAGCGGTTGTCTTCCTTCATTCCTGCTTCTAAGCTCGCTTTCTTGCAAAACGATTAACGTTTATATCATCAAACTCAAGGTTAGGTTGAGATGGTTTCGCTACTTTGTTAATCTATTCACGTAGACAACAACATAAGGGAGGGACCATGTTTTGAAAAAGTGGGTTAAAATCGCAGGGCTGTTGGCACTGATGAGTGTCGTGCTGGTTGGTTGCGGTAGCGGGGCGAGTTCAAAGTCGAGTTCGTCAAGCTCAAAAGCGAACAAAACAGCTAGCAGCAAGGTCACTAGCGGGGCTTCACAGCAGGCCTACACAGATCCGAAGACGATGAAGGGCAAGTATGACATCGTGATTGTCGGTGCTGGTGGCGCCGGGATGACGGCTGCCATCGAGGCGAAGCAGCAAGGGATGAATCCCGTCATTTTTGAAAAAATGCCTGTTGCTGGCGGGAATACGCTGAAAGCCTCTAGTGGTATGAATGCCAGTCAGACGAAAGTTGAAGCTGCCCAAGGGGTTAAGGACAGCAATGATCAGTTCTATGAAGAAACGCTAAAAGGTGGCGGCGGGACGAATGACAAAGCACTACTGCGCTATTTTGTCGACAACTCAGCCAGCGCCATTGATTGGCTCGACTCGATTGGGATTAAGCTGGACAAACTGACGATTTCCGGTGGGATGTCGGTCAAGCGCACGCATCGGCCACACGATGGTTCAGCCGTTGGCGGTTATCTCGTTGATGGGCTCGTGAAAGAAGTCAAAAAAGAAAAGATTCCGCTGTTTGTGAACTCAGATGTTACCAAGTTGAATGAAACAGATGGTAAAATCAGCGGGGTCACCGTCAAGATCAATCAAGACAAGACGAAAAAAATCGCAGCCAAGGCCGTGATTGTGACCACTGGCGGTTTCGGGGCAAGTAAGCAAATGATCAAGAAATATCGCCCTGATCTGGCTCATTACGTTACCACCAACCAAGCTGGCGCAACCGGTGATGGCATCAAGATGATCGAGAAAGTCGGCGGCTATGCGATCGATATGAATAAGATCCAAATTCACCCAACCGTTAACCAAAGCAAGCATATTCTCATTGGGGAAGCGACTCGCGGTGAAGGTGGCATTTTAGTTAACCAAAGCGGGAAGCGGTTCTATAACGAAATGAATACCCGTGACAAGGTTTCCGCTGCCATTAACAAGCAAAAAGGTAAGGATGCTTGGGTCGTGATTGATACAGGCGTCCGCCAACGGTCGAGTGCCATTGACTTTTATATCAAGGATAAGCTCGGTGTCGAAGGCAAAACCCTTGATGAACTCGCCAAGAAAATGAAGGTGCCAGCGGCCACGTTATCCAAGACGGTTTCAACTTGGAACGAAGCGGTCACCAACAAAAAGGATGCCGAGTTTGGTCGGACAACCGGCATGGATCACGGCCTCACCACCGGCCCATACTATGCTTTCAAAATCGCCCCAGGCATCCATTACACCATGGGCGGCGTGAAGATCAACACCAAGACTGAGGTGCTGACAAAGAAGCAACAACCAATCCCAGCACTATACGCAGCCGGTGAAGTCACCGGCGGCCTACACGGCGACAACCGAATCGGTGGCAATTCCGTCGCCGACATTGTGATCTTTGGTCGCCAAGCAGGAACGCAGGCGGCGGCTTACGTGAAAGCACAACAGTAACCTGAATGACTTAAAGGCGGTTCTCAGCAGATGAGAATCGCTTTTTTGATGCGCTGAAAATGGCGGTGTCCGCTCAACCCCCAAAATTCATATGCCCCATAATTGTTAGGCAGGCAAGCCTAGCCGTTATGGGGCTTTTTGTCACTTACCGAGGCCGAAACTTGAAGAATGATGAGCAAGGTGTACTTCGTTTCCCAAGTTAAGGAAAAAGGTTCTACTTTTCGGTATGTAAGCGCTTGCTTAGTATAGAAGCTGTAAGGAGGCAAAGCAATGCGAGAAAGATTGACGAATCTTCTGCGAACATTGTTGGACAGTTCGGCAAGTTCTTT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>CP029546|328206:408972|330313_330838_+|AWN85241.1|protease|DBSCAN-SWA MLRGELWRIVTSTVYHYEWPHLMKNMLAVMVLGPFIEWKIGSTPFVISFFVSSWLGVLLFCFGFGGFIQSAFGIGTYIESFYGVSLSGYALFPLAILAFLIEKPTFSFMTKIVAFTSTLYYVTVGYWPNLAMSDIEKNVQVAHSCGLLVGLFCVLVILIIKHREKMFSFSSRSK >CP029546|328206:408972|400987_401332_+|AWN82898.1|DBSCAN-SWA MSREIYDCAAGCPVQNTVDVIAGKWKSVILYHLFQGDATRFSTLNKAIPSITERMLALQLAQLEADNIIVKKAGYADGRATEYQLTALGQTLAPVIQAMAAWGEAYKVRRKALV >CP029546|328206:408972|389860_390874_-|AWN82888.1|DBSCAN-SWA MTDWQGYQKINEKYHLNGATIIVNPIEILSSWQNGAADFSMKRPFTLQTTSGLGSLSKQFTADNVLLLNAADKLDIEASLVDYVPNYRYADQVTLRQMLNMASGIPDYTELLLTDYAKRMPGASESHLSYPILEDLGHGDEITEVISLLNQHPLDFTPGEKGVYSNSNYLLLGFIISKITGDSLARFFEEHFFEPLAMTQTRLGTQYAEANSYDDLDVTAGKPVVLGRGAYQGGDGAVVSSLTDLAKWAQAVLRHDILSEKDWHEALTLTHDFYGMGWMHSKTPNWFSHAGHVFGYWTYFDVSFDKQLAQVTLNNMSPGDEARKTWQTEMAAWRETL >CP029546|328206:408972|407955_408972_+|AWN82905.1|transposase|DBSCAN-SWA 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MIKILLGLIVLINLGFVFYFIRDLLRHRSEVMSEPATTWALPFSSFIIFLLSTFGISDFAISTALYPKAKWVSIKKLPGTLNTQCVVPVAAMALSYITAITVDIKTLAVCIIAAVIGAYIGPRFVVKLPANTIKKFVTAGLIIAALMILAGKFNWIPANGTATSLSGWKLMLTAILLCIYGALNNIGIGSYALTMATVYAMGLNPSAAFPIMMGAATFSVSTSSIQFVKLADYSRKITLFTSTFGVLGVLVAVFFVKSLDTSMLQWLVIIVLLYSAISMALSLRQKGEA |
75 | Faecalibacterium_phage(19.05%) | protease,holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
414832 : 510764
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP029546|414832:510764|DBSCAN-SWA CATGACCCACTCTCAGACTAACACTCACAAGCATTACCAACAACTCAGTTTTAGCGACCGTGCTACAATTCAGGCCCTTCAGGCTGCTGGTGACACCGCGACCGTGATTGCACAGAAGCTTCATCGCAGTAAAGCGACAATCTCACGAGAAATCACGCGTGGATCTGTAACTCAGCTCGACTCGAAGCGTCACTCGCATCAAGTCTATCTTGCGGAAACTGCCCAAGCCATGCACGACCGTAAACGCGATAGAACCGGTCACTACGCCTTTCTTAAGACCGGCCGTGCGTTCTTCAAGGCTCTCTCCAGGGAGCTTACTCGTAAGCCGCGCGTACACAGCGTTGATAGCTTCGTACACTTCTATCGCGACCAGGGCAAGGCTTGCCCTTCAACGACAACTGTGTATCGCTACATCGACACCGGGCTGCTTGAGCTAGACAACATGACACTTCCCAAGAAGCTCCGACGCCGCATCAAAGGCTATAAGAACGCCCACAAGCGCAAGAATAAGAAGATATACGGCGACTCAATCGAGTTGCGTCCTGCGGCCGTGAATGACCGCACAGGCGTGGGACATTGGGAAGGCGACTTGGTCAAGGGTATTCGCTTAGCTGATGAGCCAGCATTAATGACGCTCACAGAACGGTACAGCCGGACTGAGATCATCGTCAAGATTCCTGACTATCATGCGGGCACCTGCCTTAAAGCCTTGCAGGACACGATCGACGACTACGGGGCCAAGGAATTTGAGAGTATCACTTTTGACAATGGTTCCGAGTTTGCCAAGTTATCAGAGATTGTTGGAACCAAGATTTACTTCGCACATCCGTACTCGCCTTGGGAGCGTGGCACAAACGAGAACGCCAATGGACTGCTTAGGGAATTCTTCCCGAAAGGGAAGTCTCTCAGAGCAGTTACCCTGGTTGAAATTCAAGCAGTCCAATCCGCACTGAACCATCGTCCCAGACGTATTCTGAACTATCTTCGCCCATGCGATTACTACCGATGCATGGCGTAACAGCCTAGACCACTATCAAGAATTCGTTATCATCGTTGCACTTGACTTGAAAATTGAGGTCCTTACTAAATACGGATTTGAAAAAGATGTTACTGCCATTGATCGTGCGACTGATCAAATTTGGACTGGCGATGGTGCTAAGCCTTTACAAGGCGTTGATTTCACCATTTACAACGTGACAGCCAATTATTGGGCATCGCCTAAGGATTATAAAGGCAGTTTTGATAGTGCTTCGGTTGCCGCAACCGGTACGACTAATGACGAGGGGCAACTAACCCAAGCATTGCCAACCCAATCAACAGATGCCAGCGGTAAGACTCGTGCTGCTGTCTATCTTTTCCATGAAACCAATCCGCGAGCTGGTTATAACACGTCTGCCGATTTCTGGTTAACCTTACCAGCCAAGGCAGCAGCCGACGGGAATGTCTATGTCTACCCAAAGAATGTTCAAAAGACCACCTATGAGCGCACTTTTGTTAAGAAAGATGCTGAGACTAAAGAAGTGCTTGAAGGAGCCGGCTTTAAGATTAGCAATAGTGATGGCAAGTTTTTGAAGTTGACAGATAAAGATGGTCAAAGCGTCAGCATCGGCGAAGGATTTATCGATGTATTGGCCAATAACTATCGATTGACGTGGGTTGCTGAAAGCGATGCTACTGTTTTCACGTCTGATAAGAGCGGTAAGTTTGGCTTAAATGGATTTGCTGATAACACCACAACTTACACGGCAGTTGAAACAAACGTGCCGGATGGTTATGATGCTGCTGCCAATACAGACTTTAAAGCTGATAATTCGTCTAGCGACATTCTAGATGCACCAAGCGGTATTCTGCCACACACTGGTGGTACTGGCACAGTCATTTTTGCGATTTTGGGCGTTGCCTTAATTGCATTTGGAGCAGTTGCCTATCGCAAGCGCCGCAATGGTTTCTAAAAAGTTAATAAGATAAATGAGTCAAGCAAGAGCGTCGATGGCGCTCTTGTTTTGATATGGCGAGGTAATCAGAGTGACAAAACGAACACGTCGACCTTTAGGCTTGATTGATATTGTGATTGGATGCCTTCTTTTAGCGGGTTTTGGTGTTTTATGCTATCCATTTGCAAGTGATGCTTACGTTTCTTACCAAAATCAGCAAGTCATCGACAGGTATCGACAACAAGAAGCGCGGAAGAATCAGATGGTGTTGCGGCGGGAATATAACGACTATCAGCAAAAAAATAAACAGTTGGCAGCAAGTCAGCAAGTGCCCGGCGTTGCCAGTTTTAATCATGCCGTTAATGATCAAGGAACCGCAAAAACAGCGGCCAAACGCAATCAGCAAATCTTGACTCGTCAGACAGTTGCTCAGTTGACGATTCCCAAAATTGGCCTTAGTCTGCCGGTTTTTGATCATACAAGCGATTGGCTTCTACAATTTGGCGCCTGTTTATTGGATGGTACAAGTTATCCAACTGGTGGTAAAAATACCCATGCTGTCATTTCAGCGCATCGTGGTGTGCCAAACGCTGAACTTTTTACCCGAGTACCAGCGTTAAAAAAAGGCGACAAGTTTTTTATTAGCATAGGCAATCATAAATTGGCTTACCAAGTCTTTAAGCGCCAGGTTATTGAGCCAAGTGATACCCGGCAGCTAAGAATTGTGCCGGGACAGGATCTTGTGACCTTAATGACCTGCACGCCTTATATGATTAATTCTCATCGATTGTTGATAACGGGTCGCCGAATTCCTTACGTTAAGGCAGATGACGAGGCCTCAAGTTGGGCGGTTTGGTGGAACAAATTAAAGCTAATAGTCGCACTTTTAGGCGCGGTGATCATTTTAGGCGTGATCGGTTTCGTAATGCGCAGTTTGATGCTTGGCCGAAAGCATTATTTGCTGGAAGTACCGGCTGAAGCCACACAGGTCGTGGTGAAACGAGGTCGACATATACATTCTTTTAAATCAGATCAAACTGGGGTGACTGACATCAGCCTGCCTGGTAATCATTATCGAGTCGCAATTGTCACGCCGCTTGGCCGGACTAAGTACAAGGCTTATGTCAAAAAAATTCAGGATAAAAAATTCACACTTAAACGATCTTGAGCGTACCTGTGTCATTAGATGACTCAGCAACTGGTCTATTTTTGGTATGGTGGGCTTTGACGGTGAGAGCATTCGCTACAGCAACTTGTGAATGATTTGGTATACTAAAGAAAACTTTAGTGATGCCAGATAGCAGCATATGAACGAGATCGGGTTCTGATCTGGGGAACGCGTTAAGGGGGCGAACGCTATGAAACAACTTGAGATCGCGCATTTGGACAAAGCTTTTGATCAGCAAGTTTTGTTTAAAGATGCCAGTTTCATGTTTAATCAAGGTAAAATATATGGCTTGTTAGGCCGTAACGGCTCCGGAAAGTCGACTTTATTTAATATGATTGTCCGCAACTTGCCACATGATCACGGGACGATTGCGGTTGATGCCGATGATGGTCGTGGGTTAATTACTGACTACGCAGATACAAGTGTGGGGATGGTATACACGCAACCGCACTTACCGGCGTTTATGACGGGGCTTGAATTTGTTAACTACTTTATGAGCATTAACCGAACGCGTCTTGAACAAGCACATTCGTCTGTGCAGGCGACCGATTTTTTCGAAATGGCTGGGTTGAGTCAGGCTGATGCGAATAAGCTTTTACGCGACTATTCTGAGGGAATGCGGAACAAGTTGCAGATTGTGGTATCGCTCATGCTAAGACCGCCAGTACTGTTGTTAGATGAACCATTGACAACAGTTGACGTGGTGGCGGCCCATGAGATGCAACAGTTGATTGTGGCGATGAAGGCGGAATCTGTGGTCATCTTTTCAACCCACATTATGCAGTTAGCCCAAGCTATTTGTGACGCTGTGGTGCTGTTGCATAACCAACAGTTGACAGAGCTTTCAGGCTTGGACATCCATAGTCAGGCGTTTGAGGATGCCGTGATCGCCCGGCTCAGTGACGAGGTGCGGGCCGATGGCTGAAGCGTGGCGTTACTACTGGTTTCAAGCGCAAGTTGATGCAACGACTATGGTGAATGGGCTGATTTATTTTATCCGGCGGCTCCCAATATTAGGTAAAAAGATACCGACTAAGTTATATCGTATGGGTGCCGTAAAAAGTTTGATTGCGATTATCATGAGCTGCTTAATGTTCATGATGAAGCCACTGATCGCAATGCTTTTACTAGCGATGGATTTCTTAGTAGCCAATGCCTACAACGATTTTATCCATCCGTTACCGACAACGTTCACATTTCGTACGATGGTGGCAGTGACGATCTATACGCTGGGTGGCCTACTGTTTCGGGGACTGGTCTTTCGTTATATTCCAGTTGATTTAAAAGCAATTAAATTAGCCGACTATTTTGTGCTCGATCGGCTTGCGTTGGCTCGTGGGCTGACGCGCATACAGCAAGTGATTGGCATCGTCCTTGGACCATTCTTACCGTTTTTTGGACTAACGATGATCACCCAAAATTATTGGATTTTATTCGTTGGTTTGGGCGTATCCGTTTTTAGTTGGTTCTGGCGCGGGTTTATCCCACGTTTGACTTGGTCGAACCACCGGCTGGGGATGATCGCACAAATTCTGTATTGGTGCGGGTTAGTGGGCGTGCCAATCGCGCTCGTGTTGAGCGGCAAGCTTACACCATTCGTGACTGGGTTGTTTTCGCCAATAGGCTTGATCATTTGCTGGATTGGGGTTTTCGGGTTGTGGTGGTATCAGCACCGCTTCTCGAATGATATCCCACTGTTAATGGCATCGATTCAACAGTCTGTCATAACTTTGAACAAGGTGGCGGCAACACAGAAGCAACAATTTTTGGCAACTGGTACCGCGATGCAGAAAAAATTGACCCTTGATACGACGGTTTCGGTCAAAGTGAACCAGCGACTTGGCAATAACTATCTCAACGCATTGCTATTTGCACGCTACCGCAGTCAGTTATGGAAA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93 | Lactobacillus_phage(52.63%) | integrase,transposase | attL 427121:427180|attR 493984:495369 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
630481 : 654158
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP029546|630481:654158|DBSCAN-SWA 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29 | Acinetobacter_phage(33.33%) | portal,tail,transposase,head,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
774774 : 841795
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP029546|774774:841795|DBSCAN-SWA 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>CP029546|774774:841795|803340_803670_+|AWN83267.1|DBSCAN-SWA MLITFDEFLARLKQLGAVYRDVAPRTAKYPYWIYTYTNTQRLVASTGTRLIVNEYQVSLYTKGVEDELLPFIKTFDDVPFQSFRGIPGDENDETITDLYTYIEVIADGQ >CP029546|774774:841795|795574_796024_+|AWN83258.1|DBSCAN-SWA MSREHKSRFEWLQDYLELDDEIRYLEWKIRKSNAEVDRWSEGDLSRLHVSGSDSRAAHVGEEVPELQTKLTECKAEQYDLLKLIDSFSGYENQILKMKYVQGMSLEDIADKLGYSYETIRAKHAELHRRLNWIDELEEQRRQLENRLDY >CP029546|774774:841795|835759_836800_-|AWN83299.1|DBSCAN-SWA MKQRLLLGGYTRHGGAGVYAGTFDNDEAHLPTPAPFITDLGSPTYLAVSDDNILYAVDAEGDQGGVAAYDLNVDPPRLINKVLQAGSSPAHISIDANRQLVYASNYHEGRINVYRIKNDHGLALTDEVKHTGNGPRPEQDSAHVHFAAVTPDFQRLAVVDLGNDTLTTYAVSDAGKLSDPVIFHTEPGFGPRHLAFNHNNPIAYLLGELSSQVSILNYDAATGQFKLIATLPTIPEDYTDHNGAAAIRLSSDQRFLYVSNRGHNSITVFAVSPDGRNLSELQQISTAGDFPRDFNFDLTEHFILVVNQNSSNGTLYSRDAKTGLLTEIQRDIPTPEAVNVLFLSAK >CP029546|774774:841795|816396_817371_+|AWN83281.1|DBSCAN-SWA 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80 | Lactobacillus_phage(90.0%) | portal,tail,terminase,integrase,holin,tRNA,transposase,head,capsid | attL 774344:774361|attR 849814:849831 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1319147 : 1326587
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP029546|1319147:1326587|DBSCAN-SWA ATCAATGACCAAATAGTAGTCGGCGGCGTTTTTTCTGGTAGGTGAAGCCTTCGCCCAAGGCCTCATGGACATCAAGGATGCTGATGAAGGCGTGCGGATCAATGGCCTCAATCAGCCGTTTTGTTTGGGCGATTTCAGTTGACGAAACGACAGCATAAACGACCTGCTTGCGATCGTGGGCGAACCCGCCTTCAGCATGTAAGAAAGTTGTCCCACGTTCCAATTCGTTCATAATGGCAGTGGCGATTTCTTGGCTTTTGTCAGAGACGATTAAAAGGCCCTTTGCCGCGTAAGCACCATCCAGCGTAAAGTTAACAATTTGTGAGAACACGTAGGCACCAAGCAGAGTGTACATCATGAGTTCGATGTTCAGATACGTCAACGAGATCGTTAGCACAGCGGCATCGAAAACCAACAAGGTTCGTCCCATTGGCACGCCGGTCTGTTGTTCAACTATCCGGGCAACAACATCCGTGCCGCCGGTGGTCCCGCCATGGCGGTAAATCAAGCCGCTGCCAAAACCACCAAACAGTCCAGCTAAAACCCCGGAGATAAAAAGATCATGATCGAGGTTGATGGTTAAAGGTACCCGTTGCCAGATCCACAGCCAAGCAGAAAGCATCAAGGTGCCAAAAACAGTGTAAGCTAGGGCGCGTTTGCCTAAAAATTTGTAACCAACGATGAGCAACGGAATATTCAGCAGAATTGTGCTGTATGCCGGATCGAGATGCCACCAATAGCGGATTAGCAGGGTAATCCCGGTGACGCCGCCTTCAGCCAAGTGATTCGCAATATTAATATAAACAAGCCCGAACCCATATAAAGCACAACCAAGAACAATCATTAAAAGATCCCAACAAGTACGCGTGGTGCGTGACATAGGCCGCCTCCCAAAAAAGAATTTAAGCTTATTCTAACAGAAATGTCATATTTCGGCTTAATTGTGGTAATGGTGGTTGCCGGTTTGGAAAAAGGAGTTTGAAATGCGACTAGATTTGACCCAGCCAGATTTTAAGGCAGCGATTCCGATTTTAAAAAAAATCGAAGCTGCTGGTTATGAAGCTTATTTTGTTGGCGGCAGTGTTCGTGATGCGATACTGGGGCTGCCGATTCACGATGTAGATATTGCCAGTTCGGCGTATCCGGCAGAAATTAAGCGAATTTTCAAGCGGACAGCCGATACCGGCATCGAGCATGGCACAGTGATGGTGCTTGATCACGGGACTGGCTATGAAGTGACAACTTTCCGAACCGAATCGCGCTATCAGGATTTTCGCCGGCCTGATCATGTGACTTTTGTGCGCTCCTTAGCAGAAGATTTAAAGCGTCGGGATTTCACTATCAACGCTTTAGCTGTTCGGCATGATGGCACGATCATTGATTTGTTTGACGGCCTGAAAGATTTGCAGCACCACCAGCTGCGGGCAGTGGGTAATCCTCATGAACGGTTTCATGAGGATGCTTTGCGAATGATGCGGGCAGTTCGATTCGAGAGCCAATTGGGGTTCGGCATTGAGCCAGCCACCAAAGCGGCAATCGCCGACAATGCCAAACTGTTAGTGCACATTTCTGTAGAACGAGTCGCCGCAGAATTTAATCGGTTGCTGACTGGGATTGATCGACGTGCTGGCTTGCAAGATTTTATTGAGACTCGCTTGTTTGCCTACGCCCCGAAAATGGCGGCTCATGAAACAGCCTTAACGCAATTTTCTCAGTTGCCTGATACGCAGCTGACCAGTTTGGCAAGCGGCTGGGCGGCATTGATTTTCCTTTTAAGAACACAGCCGCTGGTGATGCTAAAGGCCTGGAAGCAATCCAATGAGCTGATCACCTTGGTCACGCAAACTGTCAAGCTACTGCAGGTGATGCCGAATCCGACTGCTTGGGATCTTTACCAAGCTGGTGAAGCGGCCGTGACAACGGCTAGCGAGGTTCAAAAACTGCTGACGCCTGACTTTGATCAGCAGCAGCTAGCTGAGGCTTACGCGGCCTTACCGATTCATAGTAAAAAAGAATTAGCGCTGACCGGTGCAGATCTGATTAAAGCGGGGGTCCGTCCCGGGCCAGCGATGGGCAAAGCACTCAATCAAATCGAGCAGCGTGTCGTCGCTGGAGCTTTGCCAAATGAACTAAAAAAGTTGTTGCCGATCGCAACTGAAATGTCTCAAGATCGTTTGTGAGTGTGTTATGATGAGCATGTAAGCACATTCAACAACGTCAAACAGGACGATTGATCAGCTGGGCGGCTTTAAAATAGCATAGTTGGCCACCAGTGCGTTTCCAACCCGTTCTGCATGACAGTGAAGGGGGATTTCCAATGGCAGAACATGTTTTTGAGCAATTGATTTTTCATTTTCGTAATGGTGACGAATGGACTGTTGAGCATGATGAACTGGCGGACGTCTGGATCAGTCGAGTAACCACAAGTTACGGACGCATTCACGGCGGTCAGATTCAAGAGATTCATCCTTGCAAGAGCTTTAAGGTTGAGATTTTGCCTGAAGCTGACCACGTCAAGTCAAGCGATATCAACACCGGTTCGCTGGAGATGGGGATGTTTGGTCGCGCCACTAAGTATCAAGATATTGAAAAGATGGACTTGGTCTTCAATGCGGAAGACAAAAAGCGCGTTCAAATCTACTTCCCATTCAAGCAAAAGGATCCAAGCGGGCTTGATAACGAGTACCAGAGTAGCAAGCTTGCAGCAAACGGTCATCTTTATATTGTGATCGATGAAAAACATACCGTGGATGATGAATATCCGCGGATCTAATCGTGATCACGTACGGGTCGGCATTGATGTCGGCCTTTTCTTGTGCGCTGCTTCTTGCTAAGATGGACAACGATACGAGTGAAATGAGGGACAACATGCAGACGCTAACAGCGCAAGGCCTGAGTAAGGCATATGGTGACAAACAATTATTCAATCAGATTGATTTTTTAATTAACGAAGGCGAGCGAATTGGCTTAATTGGGGTGAATGGCGCTGGGAAAACCACGCTTATTCGCGCATTAGCCGGACTTGATTCAGTTGATGCTGGTGAAATTAAAACACCCAAGCAATATCGCATCAGCTATCTGGCTCAGATTCCCGATCTTGATCCTGACTTGGCGATTATGGATGCCATTTATCATGGTGACTCACCGGTTTTTCAAGCGATTCGCCAATATGAACAAGCACTAGCCGAATATACCAAGGATCCTATGAATCCGGAAAAAACTGCCGCTTATACAAAAGCAGATGCCCGCATGACGCAAGAAGATGCCTGGTCTGCAGAAACCGATATCAAAACAATTTTGACGCAGCTGCACATTGATGATTTGAGCATGCGTGTTGGCGATCTTTCCGGTGGTCAGCAAAAGCGTGTCGGTCTTGCCCAAGTGCTGATCGAATCGCCAGACTTATTGCTGTTGGACGAGCCGACGAACCACTTGGATTTCGATTCAATCGCGTGGCTTGAGAAGTATCTCAGCAATTATCGCGGCGCTTTGGTCGTGGTAACGCATGATCGTTATTTTCTTGATCGCGTGACGAACCGGATTTTTGAATTGGACCGCGGCCGTTTATTCCAGTATCAAGGCAACTATCAGGCTTATGTCGCCAAAAAGGCTGAGCAATTGGAGGCCGAAAAGTCGGCTAATCACAAGCAGGCCCAGCTTTACAAGCAGGAACTAGCTTGGATGCATGCTGGTGCCCAGGCACGTTCAACGAAACAACAAGCGCGCATCAACCGCTTTCAGACCTTGCAAGCTGCCAAAGATGCGGCACCGGAAGCAAACCAGCAGTTGGATCCCATTCAGATCGCCAGCGCCCGCTTAGGCAAAAAAGTCATCGAAATGCATCATGCCAGTTTGCAGTTTGACGATCAGCCGATTCTAAAAGACTTTAATTGGCTGGTTCAACCAGGCACTCGCATTGGGATTACCGGCAAAAACGGCGCTGGTAAGTCAACATTGCTGAATATTATTGCTGGCAAACAAAAATTGGACAGCGGATCTATTGAATTAGGCGAGACCGTTCATTTGGGCTACTACACCCAGATGAGTGCCAATTTGGATCCGAACAAACGCATCATCACCTACTTGCAGGAGGTTGGCGAAGAAGTCGTGCAAGCAGATGGTCAACGCGTGTCAGTAACCCAAATGCTGGAACAATTTCTTTTTCCGCGCAGTATGCATGGTACGCTGATTGGTCGCTTGTCAGGCGGCGAAAAACGCCGGCTTTATTTGTTACAGGTGCTCATGCGTCAACCTAATGTTTTGCTTTTGGACGAGCCAACCAATGATCTAGATATTGCCACCTTGACCGTACTCGAAGATTATCTGGATCAATTTCCAGGCACCGTCATCACCGTGTCACATGACCGTTACTTTTTGGACAAAGTGGCTGATCAATTGCTGATCTTCAATGGCAACGCGCGGATTGACCGAGCGGTAGGCGAATTCTCTGATTATCTGGCTCAGCAACAAACCAAGCAGCCGGCAGCCAAACCAAAAACATCAGCTACTGACGCTGTACCGAAAAAAGCCGCGCCAAAGAAGAAAACAAAACTGACATATGCTGAGCAGATAGAGTATGATAAACTCCAAAATGAGCTTGACGAGTTGGACGATAAACTCGCCAAAGTCAAGGCAGCTATGGCCGAAGTCAACGGTGAAGATTATGTCAAACTAGGTGACTTACAAGCCCAAATTGACAAGATCAACCAAACAATTGATAAAAAATTCGACCGATTTGCCGAACTGGATCAGTATGTTTGAACACACGCCCACTGGAGGGAAGAAGACAATGTTAGAGCAGCCATATCTTGATCTTGCCCAAAAAGTATTAGATGAAGGCCATTTCAAGCCTGATCGCACGCATACTGGCACGTACAGTATTTTTGGTCACCAAATGCGGTTTGACCTTAGCAAAGGGTTTCCTTTACTAACAACCAAAAAGGTGCCCTTTGGTCTCATTAAAAGCGAGTTACTTTGGTTCTTGCGTGGCGACACCAACATTCGTTTCCTATTGCAGCATAAAAATCACATCTGGGATGAATGGGCCTTTGAGAAGTGGGTTGCCAGCCCCGATTATCATGGTCCGGATATGACCGATTTTGGTCATCGCAGCCAGAAAGATCCTGAATTTGCCGCCAGTTATCGTGAACAGATGGCCAAGTTTGACGAACGTATTCTCACTGACGAGTCATTTGCAGCTAAATACGGTGATTTAGGATTGGTTTATGGCTCGCAATGGCGGGCGTGGCATACCAGTCGTGGTGACACCATCGACCAGCTGGGGGATGTGATTGAGCAGATTAAGACGCATCCATACTCGCGACGCTTGATCGTATCCGCTTGGAATCCAGAAGATGTGCCAACCATGGCGTTACCGCCTTGTCACACCCTCTTCCAGTTTTATGTCAATGATGGCAAACTTTCCTTGCAACTGTATCAGCGTTCTGCGGACATTTTCCTTGGCGTGCCGTTTAATATTGCCTCATATGCCTTGCTGACCCATCTTGTTGCCCATGAATGCGGGTTGCAAGTTGGGGACTTCATTCATACATTTGGCGATGCTCATTTGTATGTCAATCATTTGGACCAAATCAAAGAACAATTAACGCGGACGCCACGGCAGGCGCCAACCTTGGTCTTGAATCCAGATAAACACGATATTTTTGATTTTGATATGCAAGATATTAAATTGTTGAATTATGATCCTTATCCGGCCATTAAAGCACCAGTTGCCGTTTAAGCGAAGCACGTGCTTGGGCTGCCTTGTCGGCGAGAAAGCTTATTATTGGCGATATCGAAGCTGTTTAAGTGACGGTTCTGACTGATTGCAGTACCATCAGACGTATCAAAAACGAGGGGGATTTTAAATGGTAGCATTTTTGTGGGCGCAGGATCGGGATGGTGTAATCGGTAAAGACGGCCATTTGCCATGGCATTTGCCAGATGATTTGCATTATTTCCGGACTCAGACTGAAGGGAAAATGATGGTGGTTGGGCGTCGCACGTACGAAAGTTTTCCAAAACGGCCATTACCAGATCGTACGAACGTGGTTTTGACGCACCAGGCTGATTACCAGGCACCAGGCGCGATTGTCTTGCATCAGGTTGCTGAAGTGCTTGATTATGCGAAGGAACATGCAGATCAGGCATTAGTCATCGCCGGTGGTGCTCAAATCTTTAGCGCCTTTAAAGACATGGTTGATACCTTGCTCGTGACCCGTCTAGCTGGCAGTTTTGCAGGTGACACTAAAATGATTCCACTAGATTGGGATGCGTTTACTAAAACCTCAAGCCGAACTGTCGAAGATCAAAACCCCGCTTTGACGCATACTTATGAAGTTTGGCAAAAGCAAAAATGATCTGACGCGTTTAGCAGCTAAAGAAATTTTTTAAGGAACTTAAATAGTTATGTGGTAGATTGTAAAATTAATCCGAACGCTGTTCGGACAAAAAAGATCAGCTTCCTTTAAAATGGTGTTTACCACAAACCCATCTTTTAGGAGCTGATCTTTTGTCTAGTATAACCTATTCCGAACGAATTAAAATCGAAACCTTTTGTGAACTAGGGCTGTCCAATATCCAAATGGGCGTTCGGCTGAACCGATCACCGTCAACAATTTCTTATGAATTATCTCGATGTCAACCTTATCAGGCTGAATTAGCACAAACAGATGCCGAATACAAGCGATCACGATGTGGTCGGAAAACTAAGCTGAGCGATGAGTTAAAGCAAAAAATTCTCAACCATTTACGTCTAAGCTGGTCACCAGGAATGATTGCTCACGAATTTAAACTAGCTACTAAATCTATTTATAATTGGCTAAATCAGGGGAGAATTGGTTTCTCCTTGAATGATCTACCTGAACATGGCGTACGCCAACGGCGTAACGTTGACCAACGATCCAAATATAATCAATCTTTGGGGCGATCAATTGAACAGCGTCCCATGATGATTAATCAACGTAATCGCATCGGCGATTTTGAACTAGATACAGTCGTTGGTCCTCGTGGGCATAGTAAGGCAGTTTTATTAACTTTAATCGATCGAAAATCACGGTTCCTTTGGGCATACCGGTTAAAAGATCGGACGACAGCGACTGTTAATGAAGCACTAACTAAGTTCCTAACCACTTTTAATGGTCCGGTGCACAGCTTTACTGTGGACCGTGGCACTGAGTTTAGTGGGCTAGTATCACTTGAATCACAATATGGTATTAAGACCTATTACTGCCATGCTTATACGCCAGCTGAACGTGGTAGTAATGAACGCTTTAATCGGAATTTATGTTATTTTTATCCTAAAGGGACTCGTTTTGAGCACATTAGTGCTCAAGATTTAACGACGACGTTACTCCAAATTAACCAGCGACCGCTTAAAATACTCGACTGGCAAACACCGTATCAGGTTATGCTGACAAATTTGTCCAAAAATTCGGATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP029546|1319147:1326587|1322014_1323907_+|AWN83741.1|DBSCAN-SWA MQTLTAQGLSKAYGDKQLFNQIDFLINEGERIGLIGVNGAGKTTLIRALAGLDSVDAGEIKTPKQYRISYLAQIPDLDPDLAIMDAIYHGDSPVFQAIRQYEQALAEYTKDPMNPEKTAAYTKADARMTQEDAWSAETDIKTILTQLHIDDLSMRVGDLSGGQQKRVGLAQVLIESPDLLLLDEPTNHLDFDSIAWLEKYLSNYRGALVVVTHDRYFLDRVTNRIFELDRGRLFQYQGNYQAYVAKKAEQLEAEKSANHKQAQLYKQELAWMHAGAQARSTKQQARINRFQTLQAAKDAAPEANQQLDPIQIASARLGKKVIEMHHASLQFDDQPILKDFNWLVQPGTRIGITGKNGAGKSTLLNIIAGKQKLDSGSIELGETVHLGYYTQMSANLDPNKRIITYLQEVGEEVVQADGQRVSVTQMLEQFLFPRSMHGTLIGRLSGGEKRRLYLLQVLMRQPNVLLLDEPTNDLDIATLTVLEDYLDQFPGTVITVSHDRYFLDKVADQLLIFNGNARIDRAVGEFSDYLAQQQTKQPAAKPKTSATDAVPKKAAPKKKTKLTYAEQIEYDKLQNELDELDDKLAKVKAAMAEVNGEDYVKLGDLQAQIDKINQTIDKKFDRFAELDQYV >CP029546|1319147:1326587|1325544_1325631_-|AWN83744.1|DBSCAN-SWA MVNTILKEADLFCPNSVRINFTIYHITI >CP029546|1319147:1326587|1323935_1324886_+|AWN83742.1|DBSCAN-SWA MLEQPYLDLAQKVLDEGHFKPDRTHTGTYSIFGHQMRFDLSKGFPLLTTKKVPFGLIKSELLWFLRGDTNIRFLLQHKNHIWDEWAFEKWVASPDYHGPDMTDFGHRSQKDPEFAASYREQMAKFDERILTDESFAAKYGDLGLVYGSQWRAWHTSRGDTIDQLGDVIEQIKTHPYSRRLIVSAWNPEDVPTMALPPCHTLFQFYVNDGKLSLQLYQRSADIFLGVPFNIASYALLTHLVAHECGLQVGDFIHTFGDAHLYVNHLDQIKEQLTRTPRQAPTLVLNPDKHDIFDFDMQDIKLLNYDPYPAIKAPVAV >CP029546|1319147:1326587|1325013_1325505_+|AWN83743.1|DBSCAN-SWA MVAFLWAQDRDGVIGKDGHLPWHLPDDLHYFRTQTEGKMMVVGRRTYESFPKRPLPDRTNVVLTHQADYQAPGAIVLHQVAEVLDYAKEHADQALVIAGGAQIFSAFKDMVDTLLVTRLAGSFAGDTKMIPLDWDAFTKTSSRTVEDQNPALTHTYEVWQKQK >CP029546|1319147:1326587|1320129_1321326_+|AWN83739.1|DBSCAN-SWA MRLDLTQPDFKAAIPILKKIEAAGYEAYFVGGSVRDAILGLPIHDVDIASSAYPAEIKRIFKRTADTGIEHGTVMVLDHGTGYEVTTFRTESRYQDFRRPDHVTFVRSLAEDLKRRDFTINALAVRHDGTIIDLFDGLKDLQHHQLRAVGNPHERFHEDALRMMRAVRFESQLGFGIEPATKAAIADNAKLLVHISVERVAAEFNRLLTGIDRRAGLQDFIETRLFAYAPKMAAHETALTQFSQLPDTQLTSLASGWAALIFLLRTQPLVMLKAWKQSNELITLVTQTVKLLQVMPNPTAWDLYQAGEAAVTTASEVQKLLTPDFDQQQLAEAYAALPIHSKKELALTGADLIKAGVRPGPAMGKALNQIEQRVVAGALPNELKKLLPIATEMSQDRL >CP029546|1319147:1326587|1321463_1321919_+|AWN83740.1|DBSCAN-SWA MAEHVFEQLIFHFRNGDEWTVEHDELADVWISRVTTSYGRIHGGQIQEIHPCKSFKVEILPEADHVKSSDINTGSLEMGMFGRATKYQDIEKMDLVFNAEDKKRVQIYFPFKQKDPSGLDNEYQSSKLAANGHLYIVIDEKHTVDDEYPRI >CP029546|1319147:1326587|1319147_1320026_-|AWN83738.1|DBSCAN-SWA MSRTTRTCWDLLMIVLGCALYGFGLVYINIANHLAEGGVTGITLLIRYWWHLDPAYSTILLNIPLLIVGYKFLGKRALAYTVFGTLMLSAWLWIWQRVPLTINLDHDLFISGVLAGLFGGFGSGLIYRHGGTTGGTDVVARIVEQQTGVPMGRTLLVFDAAVLTISLTYLNIELMMYTLLGAYVFSQIVNFTLDGAYAAKGLLIVSDKSQEIATAIMNELERGTTFLHAEGGFAHDRKQVVYAVVSSTEIAQTKRLIEAIDPHAFISILDVHEALGEGFTYQKKRRRLLFGH >CP029546|1319147:1326587|1325657_1326587_+|AWN83745.1|transposase|DBSCAN-SWA MSSITYSERIKIETFCELGLSNIQMGVRLNRSPSTISYELSRCQPYQAELAQTDAEYKRSRCGRKTKLSDELKQKILNHLRLSWSPGMIAHEFKLATKSIYNWLNQGRIGFSLNDLPEHGVRQRRNVDQRSKYNQSLGRSIEQRPMMINQRNRIGDFELDTVVGPRGHSKAVLLTLIDRKSRFLWAYRLKDRTTATVNEALTKFLTTFNGPVHSFTVDRGTEFSGLVSLESQYGIKTYYCHAYTPAERGSNERFNRNLCYFYPKGTRFEHISAQDLTTTLLQINQRPLKILDWQTPYQVMLTNLSKNSD |
8 | unidentified_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1729419 : 1829012
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP029546|1729419:1829012|DBSCAN-SWA GCTAAGCGACTTTTTGTGAAGCTTGGTCATACAAGGAAAGCCATGCTACTGGTGCAAGATAGTCTAAGCGTGCTTGTACCCTTACGCGGTTGTAAAAGGTCTCGATGTAAGCGAAGACTTGCGCTCTCAGATCATTGATATCTTTAAATTGTATCTGATAAATGAGCTCTTTCTTCATGATGGCAAAGAAGCTTTCGCTCCAAGCGTTATCACCCGGTTTTCCCAATGCTGAGAAGCTACGTTGCCAATGATATTGGTTGACCAACTTTGTCACTGCTTTGGCCGTGTATTGGCTACCACGGTCACTATGAAAAATACACGTTTCTGGCAAAGCCCACCTTTGGTGGGCTTGTTTAAGTGTCGCTAAGACTAAATCCATGTCCATATGATTGGATATTTGATGAGCTAACACTAGGTTGCTGGTCAAATCCCTTATTTGGCAAATGTAAGCTTTTCCTTCTGATGTTGTCGTCTGTGTAATGTCACTTGATAAGGCTTCAAACGGCTTAAAAGATTGGTGTTTCACTAGATTGGGATAATCACCTTGACGAGCAAGGCGGCTATCGGTCAAACTCTTCGGATGACGACAACGTAGCGTTGAATACAGACCGGCATCAGCCATCAGACGGGCAACTCGGTGATAGGAAGCTTTATTACCATTTTTACGCAATAAACCGCAGATGCGTTTGGGCCCGTAAGTGCCCTGTCCTTGATCAAAAAAGTGTTTGATTCGTTGACGATATTGCCTTTCTTTGGCGTTTCGCTTTGGCAAAGCTCTCCGCCAAGCATAATAACCACTCGTTGATACGTCTAACAAACGCGCCCACCTTACCACAGAAACAGAGGTTTCCCTCAACATAAAAGCATACTTATCGCTGGGGGTTACTTCTGGAGACTGGCAAAGTAGGCGGCGGCTTTTTTTAACATATCACGCTCCAATGCTAATTCGGCATTTTCACGTTTTAAGGCACGGTTCTCAGCTTCTAAAGAAGCAAACGGCGTTTGCTTTCCATCTTCGGTATATAGCTTCCGCCAACGATACAGGGCACTTTCAGGAACACCAAGTTCGGAGGCAATGATTTTAACTGGTTTGGAAGAGTTAAAACTCAAACGTACCGCATTTTTCTTAAAATCTTGGTCGTAGCGATTGCGTGAATAGGTCATTTTGAGGACTCCTTTCGGATAAATCAATTCTCTTATGTTTCTGTCCGAAATTCTAGTACAGACCCGGAACCCAGATTTACTTCGCACATCCGTACTCGCCTTGGGAGCGTGGCACAAACGAGAACGCCAATGGACTGCTTAGGGAATTCTTCCCGAAAGGGAAGTCTCTCAGAGCAATTACCCTGGTTGAAATTCAAGCAGTCCAATCCGCACTGAACCATCGTCCCAGACGTATTCTGAACTATCTTCGCCCATGCGATTACTACCGATGCATGGCGTAACAGCCTAGACCACTATCAAGAATTCGTTATCATCGTTGCACTTGACTTGAAAATTGAGGCATTTTTTTGACTAACATACTGGTTGACATACCTGCTGCACAAACTAACATAATTGTCTTCTTACCCATTAGTTTTTCCTCGCTTTCAAAATTTCAAAGTTATTGTTCACCACAGAATGACTTTTTAATATCAGCATACTCGCTAGCTTAACGAGCCATATCAGAAGTCATTCGAATGACTATTCGTTCGAACGACTTTTATAATGCCAAGAAATCGCTTTCTTGTAAACGATTTCTTGAACTTTTTGAAATTTTGTCTCTACGCCTTATCGCAAAAGGCCGGCAACTGATAATGAAGACTTCAAATAGCGATAAGCAAAAAAAAGCCTTCCAGCAAGGCATATTAATTGCTGGAAAGCTTTATAATTTATATTTTAAGTCAACCAGTTAAGCATTTGTTACCGGTTTCTCCGCATCTTCCAATAACTGTCGGGATGGAATCAGACTTTCTGCATGATATTTCTTCACAAAAGCATCCACAGCAGCAGGATCCTGAGTTTGCTTGTCCAAAACAAGTTGTTCAACCGGAATTGGACGAAGATCAGAAATCTTCACATCAATGACAACCGGACCCTTACGATCTTTTGCCTTAGCAAATGCGGCTTTCAATTCGTCCAGATTGTGCACTTCAAATCCTTGAGCACCTAACGCTTCAGCTGCCTTACCATAATCGGCATCAATTAAATCAACCCCGGAGTGCGGCTGTTGCGTGTCATCCTGTTCAGCTTCAATAAAGCCCAAACTCTCATTCGTCAAAACAACGTTGATGATTGGCATATGATATTTGACCTGTGTCAGAATATCCTGCATGACCATGGCAAATCCACCATCACCAGAAATTGACCAAACTTGCCGATCAGGGAATTCCGCTTGCGCACCAATCGCTGCTGGCAAGGCATAACCCATTGTCGCATACCAGCCAGACGTCGTGAACACTTGATCATCATTGGTCTTCAGATAACGCATCCCATTGATGGTAACATTGCCAACGTCTACTTGGAAAATGGCATCTTTTTCGGCCATCTCATTGATCAATTTGAAGATTGGTTCAACGCGCAGTGGCGTGGAGCCATCATCTTCAAATGAAGTCATCCACTCGCGCCAATTTTCCTTGTTGGCCAGAGCAGCCCGATACCAAGCGCTTTCTGGCAATTGATCAGCCTTTTCGCTCAGTGCCTTGATGAACTTCTTAGCATCGGCCAAAACAGCTAAGTCAACCGTGTGACGACGGCCAAACTTGCTACCGTCAATATCAACCTGAATGTATTTAGCATTTGGTGCTATAAAGTATGGCTGGAATGGGAAATCCGATCCCAAGAACAAGACGGTGTCAGCACCGCGCGCAACTTCAACGCCAGGTTTAGAAGCCACACGGCCGGCCGAGCCCATGTTTGCCTTATAATCATCAGGCACGATTCCCTTAGCCAAGGCAGTCGTGATGATCGGAATATGCGTTTTTTCTGAGAAAGCGATGATCTCGTCGCGCGCACCCCGCGCGCCATTTCCAACATACAAGATTGGCTTCTTCGCATCTTTCAAGATATCCCAAGCTGCGGCAACCTGATCCGGGTCTGGATCAGGCAAAAGCGGCTTCTGGTACAGATTGGCTGATGATACATAATTGTCATCAATCTGGGTCCAACCTAAATCCTTTGGAATAGTCACAACGGCAACCCCGTTATGCTTATAAGCCTGACGAATCGCCTCGTCAACAACATGAGGCAATTGCTCAGCAGTCATGGCTGTACGGTTGTATACAGACACATCAGCAAACATTGGGTTCTCGTTCATTTCTTGGAAATAATTGGTGTTCATGGCAGCAGTTGGTACTTGCCCTACCAATGCCAAAACTGGCACATTATCATACTGTGCGTCATACAACCCATTCAGAAGATGAACAGCACCAGGACCGGCAGAACCAAACGTCGCCCCGATTCGACCCGTTACCTTAGCTTCACCTGCAGCAGCCAATGCGCCTACTTCTTCATGGCGAACCTGAACATAATTAATGGTGTGACGGCGATTGTACAGCGCATTCATGGTACTATCAAAGGAACCGCCCGGTAACCCATAAATATTATGGATACCCCAGTCTTCGAGCACCTTGATCATTGCGTCTGCGGCGTTTATTTTTTCTGTCATGACACTTGCCTCCAATATTATTACTTACATTTTGTAAGTTCTTTACGATTACGAGTATAACAATTTATTGATAACAATGCAAGCCCTTTCATCTGGTTTAAGCAACCTTAACGCCCAAATTGCGACCTTAGCGTATAAAACGCTTAAACTAGCAAGCGACGACACCATAACAGTCAAACAAGTGAACTAATACAGCATCACCACGCCATAACATGCTTGGTAAATCTTTTTCACAAATTAACTTCATGATGATCAGGATCATGGATCAAAAAACAGGACCGTCGAGGGACGGTCCTGTTCATCATCTTATTAGCTGTCAAGCATTACCGCTGCTGATATTGACGTTCTTGACCGATCACACCGGTCAAAACAAACTGACCATGATAATAAGTCGGATCACTACGATAATCTTCTGGATCATAAGGCACCTTATCGCTGAAAACAGCTTCGTATTCAGGAACGGTTAATTCCTGACGATCAGCCAACATTTTAGCGTGATTGGCTGCATGCAGTTGTGCGGCAAAATCCGGTTGCAAGATGCCGCTAAAAAATTCTGCCACGGCCCCGGAGCCATACGAGAATAAACCGATCCGGTCACCCGCTTTCAAGCTAGTATCATTGTCCAACAACGACAGCAGACCCAAATACAAAGAACCGGTATAAATATTGCCAACTCGCCGGCAGTACCGAGTGCTTGCCTCAAAGCGCCGTTGCAGTCGCTCGCCAGTGGCTTCATCTGTGTCCGGCAGAACAAGCTTTAAAGCTTTCTTGCCCATTTTGGTATACGGTAAATGGAATGTCATCGCAGCAAAATCACTTGCTGTGTGATGGCGTTGGGTCTGGTATCGTGACCAAATTGCTTGAAAAAAAGCTAAATATTGTTCCGTTGAATACTTTCCTTGTGCAATTGCTGTGTCTTGATAAACCGGCCGCCAAAAATCGTCAATAGATTCAGACCGATAAACCGAATCGTCTTCAATGGTCATGATGTGCGGCTCTGCTTTGATTAACATGGCAACCGCGCCCGCACCTTGTGTGACTTCTCCTGCTGTTGCCAAACCGTACCGGGCGATATCCGCAGCAATGACTAAAACGGTTTTATCTGGGTGAGCGGCGATGTAGTCACGCGCCATCATTAGTGCGGCAGTACCGCCATAACAAGCTTCCTTTAACTCAACGGCCCGCACCCACTCAGGGAGTGCCAATAAATCATGAATAAACAATGCAGACGATTTACTGGCATCAACACCACTTTCAGTACCAACCAAGACCATGCCCAAGCTAGCGCGAATCGCTGGCGTCAACAACTTTGTCGCTGCATTCGCACCCATCGTGACAATGTCTTGGCTAGAAG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>CP029546|1729419:1829012|1807687_1808080_-|AWN84208.1|DBSCAN-SWA MSNETKRDVLKKALDFLVMSGIERSTNYDMERYQYLSEYDSALPDDLPVIPEAQSDWIKQCKANDYSLSFALSDEITPIEVAKTFRVLGGYTDKNKDKWLKLQNTFARAWLLGVWRVEETGEIVKLEAEK >CP029546|1729419:1829012|1805969_1806188_-|AWN84202.1|DBSCAN-SWA MDSKRALAENLRKNIYDLNMTQAKYAKEIGIPITTLQYAVSGKGSVSLNTLDKIAFGAGIDPWELIWPHESK >CP029546|1729419:1829012|1813579_1813672_-|AWN84220.1|DBSCAN-SWA MIGYLLIAGGFGVIVGHCLGHSGNWRQWIE |
107 | Lactobacillus_phage(75.0%) | tail,portal,terminase,protease,holin,integrase,tRNA,transposase,head,capsid | attL 1763468:1763492|attR 1834602:1834626 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1873524 : 1922988
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP029546|1873524:1922988|DBSCAN-SWA GTTACGCCATGCATCGGTAGTAATCGCATGGGCGAAGATAGTTCAGAATACGTCTGGGACGATGGTTCAGTGCGGATTGGACTGCTTGAATTTCAACCAGGGTAACTGCTCTGAGAGACTTCCCTTTCGGGAAGAATTCCCTAAGCAGTCCATTGGCGTTCTCGTTTGTGCCACGCTCCCAAGGCGAGTACGGATGTGCGAAGTAAATCTGGGTTCCAACAATCTCTGATAACTTGGCAAACTCGGAACCATTGTCAAAAGTGATACTCTCAAATTCCTTGGCCCCGTAGTCGTCGATCGTGTCCTGCAAGGCTTTAAGGCAGGTGCCCGCATGATAGTCAGGAATCTTGACGATGATCTCAGTCCGGCTGTACCGTTCTGTGAGCGTCATTAATGCTGGCTCATCAGCTAAGCGAATACCTTTGACCAAGTCGCCTTCCCAATGTCCCACGCCTGTGCGGTCATTCACGGCCGCAGGACGCAACTCGATTGAGTCGCCGTACATCTTCTTATTCTTGCGCTTGTGGGCGTTCTTATAGCCTTTGATGCGGCGTCGGAGCTTCTTGGGAAGTGTCATGTTGTCTAGCTCAAGCAGCCCGGCGTCGATGTAGCGATAGACAGTTGTCGTTGAAGGGCAAGCCTTGCCCTGGTCGCGATAGAAGTGTACGAAGCTATCAACGCTGTGTACGCGCGGCTTACGAGTAAGCTCCCTGGCGAGAGCCTTGAAGAACGCACGGCCGGTCTTAAGAAAGGCGTAGTGACCGGTTCTATCGCGTTTACGGTCGTGCATGGCTTGGGCAGTTTCCGCAAGATAGACTTGATGCGAGTGACGCTTCGAGTCGAGCTGAGTTACAGATCCACGCGTGATTTCTCGTGAGATTGTCGCTTTACTGCGATGAAGCTTCTGTGCAATCACGGTCGCGGTGTCACCAGCAGCCTGAAGGGCCTGAATTGTAGCACGGTCGCTAAAACTGAGTTGTTGGTAATGCTTGTGGGTGTTAGTCTGAGAGTGGGTCATGAAGATTCCTGCTTTCTTGTTTAGCTAGCACTAACAAGAATAGGTCTTCATGGCCTTTATGGTCTAGTCGTCAGGGTGTTGCACTTGAATTGTAAACTGGGGTATTTCTTTTGACGTCAATCAAGGCGTATTTGTGTCGATTGTTGGTCCATCCGGATCAGGAAAATCGACACTGCTCTACTGTATTTCTAGTCTATTACCACCTTCTAAAGGCAAAATCCTGATTAAAGGAAAATCACCATACGAGTGGCGTGCTTCAAAGTTGGCAAAATTTCGTCGGAAAGAGATAGGTTTTATTTTTCAGGACTTTCAGTTAGTCAGCTCTTTATCTGCTTATGACAATTTACTGCTTCCGGGTATTCTAAATGGTCAGAAAATTAAACCGCCAATGGTTGACGCATTAGCAGCGAAACTCGAATTGACAGCCGAGTTACACCAGTCGATTGACGCGCTTTCTGGCGGAGAACAACAGCGCGTCGCCATTGCGCGAACTGTGCTTGCTGACCCAGATATCATTTTTCTAGATGAACCGACAAGTGCACTAGACACGCATTCACGTCAGTTAGTCATGAAGCTATTTCAAGAACTGGTCAATCAAGGCAAGACTTTGATCATGGTCACCCATGATTTAGAACTCGCTGGGGAAACTTCACGGTCGATTGTGCTACGAGATGGCCGAATTGAAAGGGAGATTCAAATGCCCGCGGCTGAAACTGTGCGTATCTGAATCATTGGCAGGCAGTTTCTGTTTAGCTAATGATTGAAGTGATATTACAATTTTCCAGTTCATTTCCACGTCCTCTTCGCATCAACAATGAAACAGCGTCCCTCAGCCTTTTTAAGGCATGAGAGGCGCTGTTTGTGTTAGACCTTTCTGTTCATTTGTAACCACTCGCTGCGTAATAAGGAGTATTCATTTTCATCATGGAAACCATCTGCTAGTTTTTCCCCGGCGCGATGAGTGCCATCGTGATGAAAACCGGCCTTTTTGGCGACGGCATTGCTTGGTGCATTGTCGACAGCAGCGCGAATGATCACTTTGTTGACCCCGTACTCTTCAAAACCGATCTGGCACATTGCTTTCACCGCCCGATGCATCAGCCCGTGACCACGCACAGCTTGTTTAAGCCAGTAACCAATATCACCACTTTCATCACTCGGGCGAAAATGATTGAAGCTGATCATCCCAACCGGCTCATCCCGATACCATAAAACCAAGTTCATTGACTCCTCACGGCCAAAATGATCATTGACGCTCCGCAAAAATGCTGCTTCCTCGGCCTCCGTTTTTAATCCATTCGCCCAAGGTAAAAATCGACCGATATCATCGCGTTCTTGATCGATAATTGCAAAGAGCGGTGCTGAATCCAGCCGCGGACGCGGTAATGCCAACTTAAAATCGTCATCAATCACATAACTTAACATGCTAAACACCTTCATCTCGCGTTTATTGCGCTAACACCCAATGCGCCGGTGCTGCTTCGACCAGTGAGGCAGTCGGATCAAGCGCCTGCCGGTCAAAGTGCAACACCGGTTTTTGCTGCTCAAGCATTGGATCAGCCTGCGGAACCGATGACAGCAGCGTCTGCGTGTAAGGATGCAGCGGATGGTGATAAATTGCATCTGTATCGCCCGCCTCAACGATGCGACCTTGATACATGACCACAATTTTATCACTAATGTAGTGAACCATCGATAGATCATGGGCAATAAAAAGATAGGTTAAGTGTTGTTCATACTGAATTTGCCGCAACAAATTGACAATCTGTGCCTGAATCGACACGTCCAACGCTGAAATCGGCTCATCAAGCACTAAAAACTTAGGCTGTACCGCCAAAGCTCGAGCAATGCCTATTCGTTGCCGTTGTCCACCAGAAAATTCATGGGGAAAACGATTAATCGCGTCTGCAGGTAAACCAACCTGCGTCAACAGTCGTAAAACTTGCGCAAGCCTTGCTTCCCTCGAGGTGGCCAAATGAAAATTGTCGATGCCTTCAGCAATGATATCGACCACTTTTTGCCGCGGATTCAAGGATTCGAACGGATCTTGAAACACCATCTGGACCTGACGGCGAAAGCCTTTGCGCGCCGCATGTGAAAAATGACGGATCGACTGACCGCCAAAAAGAACATCACCACCGGAAATCGGACCAATCCCAGCGATAGCGCGTCCAGTTGTTGTCTTACCTGACCCAGACTCGCCAACCAAACCGACTGTGGTTCCGGCATTGATCGTGAAGTTAATTTGATCAACGGCTTTGATTGCTTGCCGCCCTTTATAAAAAGTGACACTTAGATCGTTCATCGTCAATAACGGTTCTGTCAAACTGGCACACCTCCCGCTTGCTGGCTTTCAACTACTGGATCGTTTGTCTGTTCAGCATGCAACTGAGCAAATCGCGCCCAACGTTTCTGAATAGTGACTGGTGGCTGATAGTGTGGGGTTCGCGGATCTAATAACCACGAACGTACAAAATGTGTCGGCGATACTTGAAACAACGGCGGTTCTTTTTTAAAGTCGATTGGCATTGCGTAAGGATTGCGCGGAGCAAAAGCATCCCCCTTAATAGGTTGATGCAAATCAGGTGGCGTTCCCGGCAAGGTAAACAATTGGTCACGTTGATCATCTGAACTAGGAACGGCATCTAGCAATCCCCAAGTATAGGGATGCTGGGGATGATAGAAAATCTCGTTAGCTGTCCCCACTTCGACAATTTTGCCCGCATACATAATCGCCACACGATCCGCAATGTTGGCGACTACGCCTAAGTCATGGGTGATGAAAATGACACTCAAATCATGTTTGGCTTTTTGCGCTTTAATCAACGCCAAAATTTGTGCCTGCAACGTCACGTCCAACGCAGTGGTCGGTTCATCAGCAATCAGAACTTTGGGCTGCATCACCAGCGCCATGGCGATCATCGCGCGTTGACGCTGACCGCCAGAAAGTTCATGCGGATATTTGCGGGCAATCAAAGCTGGGTCAGCTAATCCGACATCTTCAATCGCCGCAAACACTGCCTGCTTCAAGGCCTGACCGTGAACATGGCGATGCACCTTCAAGCCTTCGCCAATCTGGCGGCCAATGCGCATCGTCGGATTCAAACCGCTAAGTGGATCTTGAAAAATCAGCCCCAGCTCTTGCCCGCGCAGATGGGTGTACTGACGCCGACTCGTCTGCAATAAATCCGTCTCGCCATACAGCATCTCGTCAGCAGTCACCACAGCATCCTTGCCCAACAACCCCAGCAAAGCATGGGTTGCCACCGACTTGCCTGATCCCGATTCGCCTACCAACGCTAACGTTTCGCCTTGACGCAAATTTAAATCCACGCCGTTAACAGCATAAACTTGTTCATTACCTTCATTAAAAATGACCTTTAAATTTTTAACTGTGACGATGTCCGTCATATGTTCACTTCCTTCAATCGCATTTTGAACTTAACAATGCCGCTAACCACTTACTTTTCATATAGAAATAGATCGACGATAATGCCGCCAAACAAATTGATCGCCGTTAGCACACTCATCTCTAAATTTGTCGGTGAGTGTTTGATAAACTGTGCAGTCAGATGGCCATGCGGTCGTTCAGTATGCCAAATCAATCTCATAGCCAGCAAGAACACCGTCACGCCTGCAAGAAGCCAAAAGGTTTGATGAAGCCCCCACAACAAGGCTAGCAGGAAATGGTTTTGGCGCAGTGCAAGGCCTGTTGTCACCAACAAAAGGCCAGCAAACGCACCTGCGACAATTTGCCAATGATGTTTCTGCATCACTCAAAAAACCTCCTTTTCTTCGCATTGATTTCAGGCACATACCAGTAGCTTTTGGGTGAGACAAAGGTCGTCTCTTACTGTCATGTGCGCTAAAATTAGCCTAGCTTTGGAATTTAGGGTCAAGCGCATCCCGCAAGCCGTCCCCGACAATGTTGAAAGCAAAAACAATTGCAACCAACACTAGAATCGGCACATAAAGCTGCATG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42 | Faecalibacterium_phage(33.33%) | tail,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1980508 : 2039999
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP029546|1980508:2039999|DBSCAN-SWA 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57 | unidentified_phage(21.43%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2195009 : 2282009
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP029546|2195009:2282009|DBSCAN-SWA TATGTCACTACAAAAACATGGACTTTCCATTATTGGTGCCTATTTAGTGGCGCTGATTGGTAACTTGCTGATTTTCCAAATCTTACCCGTTGGCCGACTCAGCTTAGGTCTTGCTACTGTGATCAGTGTGCTGGCGATGATTGCCGCTGGTTTCAGTGAGCGGCAGTTAGTCATTGCTAACGCCATCGAAGAACCTGGGGTTGCCGCCCCACAACAACGGGTTTTCTGGGGACTAATCGGTATTGTTGGCGTTTTGGTCGCTCAGCTTGTGGGTTCATGGCTAGAAACATTTTTATTCAAAATACCGCAAACTAGCAGCCTGATTCATCAGCAGCTGTCCAGTATGGCAACTAATCCGTGGTATTTCCTAGTGATCGGATTGGCTATTCCTGTGTTGGAAGAGCTAACCTATCGCAAAGTTCTATTCGGTAATCTTGTGAATGTCACCGGTATCTTTGGCGGTGCCTTGATCACTAGTCTCCTGTTTGCTTTAACGCAACCGGGTGGACACTGGTTAAGCGCCACATTGGTTGGACTTGTTCTTGCATATGATTATCGACACACTGGCGCAGTCAGCACGGCTATTATCGCCCGCCTTGGATCTTTGTGGGTGGTTTGGCTTTACTATCTCGCCCACACCCTATAATCGTAATCGAATATTAACCTTGACCCCTGCTTTCATCCCTTATAATAGAAATAATGATTTTGTGAAGGAGCAGTTCAAACATGGAGACCCGTTCTAATCGCCGCCAACAACAACAGAAGCCGAGGCGTTTTCGCTGGGGCAAATTGATCGGCCTAATCGTTGTGGTTGGTCTGTTCACAACAGGTGCGTATGCCTTGCGGTTATACAGTCAGGCAAAATATGCCATCAATAATACATATCATGCGACCAAACATGTCAGTACCGACATTGCTAACAAGAAGCCGTTCGCCGTTTTGCTACTAGGCGTCGATACTGGTGCTGAGGGTCGGATTGAAAAAGGCAACTCTGATACCATGATTGTTGCTGTCGTTAATCCTAAAACCAAGAAAACAACCATGGTCAGTATCCCGCGTGACACCGCTGCAGAGTTAATTGGCGCAAAGGAATTCAACATGCAGAAGATCAATGCCGCGTACAACGTTGGCGGTTCGGACATGGCGATCAACACTGTTTCCAAGCTGGTCAATGTCCCGATTTCTTACTACCTAACAATCAACATGGGTGCGCTTGAAAAAGTCGTCAATGCTGTCGGCGGTATTGATGTCGTCGTACCGTTTTCCTTTCAGGATCCATACACTGGCAACCAGAAGTTCACGAAAGGCCCCATGCATCTCAATGGCAATATGGCGCTGGCATATTCACGGATGCGTCACTCTGACCCAGAGGGCGATTATGGCCGACAGAAGCGGCAGCAACAAGTCATCAAGGCCATTCTCAAAAAAGCAATTTCTGTTGGATCACTTGGCAATTTTACCAAGCTCATGGACACTATCTCAAAAAATATTGCCACGAATATGAGTTTTGATGATATGCAAAGTATTTTCTTGAATTACCGTGACGCCGCCAAAACAGTTTCGACTGATCATTTGCAAGGTGTCAACGCATGGGTCGGTGATGGTGCTTACCAGATTGCTTCCGACGCTGAGATGCAACGAATCTCCAACAAACTTCGGACAGCTCTGGGGCTGCAAACCGAAACCATCAGCAATGAAGAGACAAAACAAAATGCGAAGAACACGCAGTTTGACTTTAAGGCAACCACGGACCAAAACTACATTATCTTTACCCCGTATGATTGATCATTCAAAAACACCCGCAGATTTCACTGTCCGCGGGTGTTTTTGCGCTTAAATTCAAGATTCAAGCAAGTTTCTTCTGGGGTCGTTCCCGATACCACCACCAGAAACCAAGAGCAAGAATGGCTATGATTGAAACGGTATAAGAAAGCAGCTCATTGTTTAACAGCCACTGACCAAGCCCGTATGGTATGACAGCCAATGCATATATCATGACCACCCAGCGTAATTTTGGCAGTAAGAGAACATTGCCCGCATTTTCCAGCGAAATGTGGTCAAATAACCACCTCGTCGCAAAATAGCCGATAATACTGATAACCATAGCGGCAATAAAGTAGGCAAAAAATAAGTTGTTGCCTGATAACCGGACTGGATTCGAACGCATCGTTGAATAGATCAGTCGATCTGCTGCAGTTGCCCCAAACCACGTACCGAACAGCCCGAAGACCCCCATCCAAAACGGTGACGCGAAAATCGTACCAATGGCGGTGCCGATTGTATACATGAAACTAACAACCGCTATATTCATGAGCAAAACACCTAAAAGATTCATCCCACTCAATCCGACATACATAGCAGGAATGGCAACATAATAACCTATGATGGTGATCCCTGAGCCAAGCATCATCACACCAAGAAGACTCAGAAAACCATACCAATAACGTGTTGCAAATACCCTTCTTCGGCGAAACCCACTACTGAAAATGGCTGCATTAAAACCACTCGCTTGGTCAATACTGGCTATTGCTAAACCGACTATTAGCGGAATCAAATACGAGACAACCGTGAAAAAGCGACCACTAATAAGGTCAGACAAAAGTTGCCCTTTTTGATTTGGAATAAAAAGATGACGCTGGTCTTCCCGATACTCTTCATAACTTTTATTGTTATAAAAAGTAAGGTGATTTTTCTTGGCCTCTTGTTTACTTTCTTCAAACTGCGCTAAGTCCATGACGTATTTTTGCTCGTTATGATAATTTTGTATGCTTTGACCCAAATTCACCGCTGACAGCAACAGTGCAAAGACTACCATCACCCGCAACAAAACTTTATGTCGCGATCTTACCAGTTTCAATAAACGATCTTCACCCATTTATTTCACCTCCGCGTTTTTGGCGCGAAACTCAACTTTAAATAAATCAGATAGCGATAACGGCAAACTCTCATTCAGCACGGGTTCTTCGGCGGCAATCGCGGCCTTGACTTCAGGTGTGAAATGCGGGAAAACCGCTTCGATCACGCGTCCACGAATGGTCAGAATCCGACCTTGTTCCCTGATCACATCAGGAATCGCCTTGGTTTTGAAAACTAACTGCAGCTTGATCGCCTGCTGTCTGACGTCCTCTAGCGTCAAGTCCTGACTGATCCGACCGGCTTTAACGAACAAAACGCGATCTGACAAGCCGTCTAATTCGACTAGATTATGTGAGGCGATGAGAAAGGTTCGTTTACCATCAGCAACAGCATCTACCACCAAATTGACAATCCGCTCGCGAATCAGCAAATCCAACCCATCAAATGGTTCATCCAGAAAAACATACGGTGCCCCGCTCGCCAGCGCCAACGCCACCATCACCAATGCCTGGTAACCTTTTGAAAGACTCTGAAAACGTTGTGATCCTTGCAGGCCGAACTTTTTGATCAGCGCCATAAACCGCGCTTGATCAAACGTCGCATAGAGCAATTGATAATCGCCGGCGATTTTATCCAGCCGGTATTTACGGAAGAAGAGATGTTGATTATCAAGGTAAAAAAGATTTTCGCGTTGTTCCGGATGGTCGGTCAAGTCCTGTTCATCCAACTCAATGGTGCCCCCGTCCGCACGATATTGATGCGTCACTGTTCGGAAGATGGTCGTTTTCCCAATACCGTTAGGCCCGACAAGCCCGACCACCTGCCCTAGTGATAAGGAAAATGTGATGTTATTCAGTACAGCCTGATCGGCAATCTTTTTTTGCAATTTTGTGATCGTTAAACTCATGCTTGTCCCTCCTTCTCATTGAGCCATGCCTGCAGAATGGGAATGCTGATCCCCAAACTCTGCGCTTCAACCACTAAGGCATCAAATTTAGGCCGAAATGCCGCAATATCTTTTGTATTGGCCTGCCTTAACGGTTCGGCAATGAACGAGCCGCGTCCTGGCTCAACATAGATCACGCCATCTGCTTCAAGCTGCTTATAGGCCTTTGCAATCGTGTTGGGATTGAGCTGCTCTTGTTTTGCCATCTCTCGCACCGATGGCAATTTGTCACCTGGCAGCAGCACGCCTTGCACCACTTGTGCTTTAATTTGCAACACAAGGCGCTCGTAGTAAGCCAAATGGGCATACGGATCAGTCGCCATGACCACGCCCCCTTTCGTATTATGTGTGCTATTATACGTAGTACACTTAAAAAGGCAAGCGAAAAGAGCAAGTCTTATCGAACGACTTGCTCTCACGTTTTTTCCAAACAAAAAACGCCGACTAGCGGCGTTTTCGACAAATTATGCTTCTGGTTCTTTTAGAGTCGGCCCGTAATGCTCCAAGAAATAAATGAGCGTCTGTAATTCTGTTGCTAGGTCAATGTTTTGCACGCGAACATAACTTGGTACAGAGATGCGAATCGGGGTGAAGTTCATGATGCCCTTGATCCCTGCTTTAACCAAATCATCCGTAATGTGTTGCGCAGCATCAATCGGCACCGTCAAAATCACAATTTCGATTTGCTGATCCTTGATCTGTTTGATCATTTCATCCATGGGATAGATTGGGACACCGCTTTGGATGGTACCAGCTAATTCGGGATTAATATCAAAGCCAGCACTAATCCGAATGTTGTTTGCCTGCCGAAAGTTGTAATTCAACAGCGCGTGACCAAGATTGCCGACACCGACTAACCCGACATTGGTTAACCGATCCTGATTCAGAATCTTTTTAAAGAAATTAAGTAGATCGACGACATCATAGCCGTAACCGCGTTTACCCAATGCACCAAAGTATGAAAAATCACGCCGAATAGTTGCCGAATCAACCTTCACTGCGTCCGACAATTCAGTCGAACTGATCTTGGTTGTTCCGGAATTGGCTAGAAAATTCAGATAACGGTAGTACACGGGCAGGCGTTTTGCCGTTGCTTTGGGGATGATTGTTTCCGCCATATAAGCAAGCCTCCTGTAGAAGTATTCCCACGCAGAACATGTGAACTGTCCAACATAGTATCTCTTGCTTATATTAGCTG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>CP029546|2195009:2282009|2202374_2202710_-|AWN84561.1|DBSCAN-SWA MAEKTIMLVCSAGMSTSMLVQRMKKAAEADGLDVDVFATAAADADNKLASEPVSVLMLGPQVRFMESQFAAKVAGTNIPMAVIDMRAYGMMDGEKVLRQALALIDEKASSK |
102 | Lactobacillus_phage(54.55%) | tail,portal,terminase,protease,holin,integrase,tRNA,transposase,head,capsid | attL 2214172:2214186|attR 2273539:2273553 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2307854 : 2368552
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP029546|2307854:2368552|DBSCAN-SWA GTCATTGTCTGCGCCACCGTGTTCCTTGAGGAGTGTCTTCCAAAATAATGCCTTGTGCGGCCAACTGATCACGAATTTGGTCGCTCTTAGCAAAGTCTTTCGCTGCCCGTGCCGCATCTCGAGCCTTCACCAAGGCATCAATGTCTGCATCCAGGTTCTTCTGATCAGCAAACACCACACCGAAGATTTGCAGCCAAGCATCGTATTCATTCAAAAGGTCATTGATACTTTCACTTTTGACCGTCTCTTCATTAGCATATTCATTAAGCAACTTTGCCAGATCGAATAAAACGGTGAGGCCATTTTGAACGTTGATATCATCATCCATAGCAGTCACGAAGCGATCCTTCAAGGTTTGCAGCTGCTTGGTAATTTGTGGATCAACGCCGGTTTCGGCCCCACGACGACGATAGGTCAAATTCTCACGAGCAATTTTTAGCCGATTGAGACTGTTGGCCGCATTTTTGAGGTTAGTTTCAGAATAGCGAATCGGCATCCGATATTGGGTACCCGCCATGAAAAAACGTAGAACTTGCGGATCAACTGTTTTGCGAATATCGTGCACAGTGATGAAGTTGCCAAGCGATTTGCTCATTTTCTCGTCGTCTTCACCAATCGTCACGAAGCCGTTATGCATCCAATACCGAACGAACTGCTTGTCGGTTTTAGCTTCGCTTTGGGCGATTTCATTCTCATGATGCGGAAATTCCAGATCCTGGCCGCCACCGTGAATGTCAAAAGTATCGCCTAACAGCTTGGTGCTCATGACTGAGCATTCAATGTGCCATCCTGGCCGTCCTTTGCCCCATGGTGACTCCCAACTGATCTCACCGGGTTTGGCGGCTTTCCACAAAGCAAAATCAATCGGATCTTCTTTTTTAGCTAATTCGTCTTGGGTAATATGTTGACTGGCACCTTCTTCAAGTTCATCCACATTCTGATGAGATAACTCCCCATAATGTTTAAACTTGCGGGCCCGGTAATAAACATCGCCGTCAACAGCATAAGCGTATTCTTTGTCGATCAAATCCTGCACAAAATCAATAATATCCGGGATCATTTGACTGGCGCGAGGATGAGCCGTTGCCGGTTCGATCCCCAGCGCCGTCGTGTCTTCCATGAACGCATCAATAAACCGTTGCGCCAAGTCCAGCGGAGCTTCACCGGTTTTATGAGCAGCATTGATAATCTTGTCATCAACATCGGTGAAGTTCGAAACATAGGTTACTTTATATCCGCGATATTCAAAATACCGGCGGATGGTATCAAACGCGATAGCACTGCGCGCGTTACCGATGTGGATGTAATTGTAAACAGTCGGGCCGCAGACATACATCCGGATTTCTCCCGGGTGCAACGGCGTGAATGTCTCTTTTTTCCGGGACATTGTATTGTATAACGTTAACATCGGCTCATTTCCTTCCTGTAGCGTCTTAACTGCATTTTACAGGAAACGACCGTGATTATAAAGGAACGGGGCGGGCGATTGCAACATTCTGTGCCGTGCCAAACGCCGCAATCTCCGCCTTGGCACTACGACCTTAATGCTTAGCAGACTATCTATCAAAAAATAAAAAGGAATGATTTTCCTAAATACGGCAATCATTCCTTTTGGAGCTGCGCATGACGTTCCTGTTTTTCAGCAGCCTTAATCAATTTTCCGCTTCGGATTCAGAATCCCCAACGGATCAAACAATCCTTTAATTTGATGCTGAATCTCATCAACATCAAAGCCTAATTCTTCATTGTTCCATTGGTTCTTGCTCATCCCCACCGCATGTTCACCGGAAATGGTGCCGCCGAGTGCCAATGCTTTGCGGAACATCAGACGAATGGCTTGGAGCGCTTCTTTGGGCGGTTCTTCCTCATCAGCCGGCCAGATGACGGTTGGATGCACATTACCATCGCCCGCATGACCTGCCGTGTAAATTTCGACATTTAAGTCCTGTGCGACTGACGCAATATAGTCCATCATTTCGGGCAGTTTAGACAACGGCACCGCCATGTCTTCCATAATATGTTCCTCAATTTTCAAGTCAAGTGCAACGATGATAACGAATTCTTGATAGTGGTCTAGGCTGTTACGCCATGCATCGGTAGTAATCGCATGGGCGAAGATAGTTCAGAATACGTCTGGGACGATGGTTCAGTGCGGATTGGACTGCTTGAATTTCAACCAGGGTAATTGCTCTGAGAGACTTCCCTTTCGGGAAGAATTCCCTAAGCAGTCCATTGGCGTTCTCGTTTGTGCCACGCTCCCAAGGCGAGTACGGATGTGCGAAGTAAATCTGGGTTCCAACAATCTCTGATAACTTGGCAAACTCGGAACCATTGTCAAAAGTGATACTCTCAAATTCCTTGGCCCCGTAGTCGTCGATCGTGTCCTGCAAGGCTTTAAGGCAGGTGCCCGCATGATAGTCAGGAATCTTGACGATGATCTCAGTCCGGCTGTACCGTTCTGTGAGCGTCATTAATGCTGGCTCATCAGCTAAGCGAATACCTTTGACCAAGTCGCCTTCCCAATGTCCCACGCCTGTGCGGTCATTCACGGCCGCAGGACGCAACTCGATTGAGTCGCCGTATATCTTCTTATTCTTGCGCTTGTGGGCGTTCTTATAGCCTTTGATGCGGCGTCGGAGCTTCTTGGGAAGTGTCATGTTGTCTAGCTCAAGCAGCCCGGCGTCGATGTAGCGATAGACAGTTGTCGTTGAAGGGCAAGCCTTGCCCTGGTCGCGATAGAAGTGTACGAAGCTATCAACGCTGTGTACGCGCGGCTTACGAGTAAGCTCCCTGGCGAGAGCCTTGAAGAACGCACGGCCGGTCTTAAGAAAGGCGTAGTGACCGGTTCTATCGCGTTTACGGTCGTGCATGGCTTGGGCAGTTTCCGCAAGATAGACTTGATGCGAGTGACGCTTCGAGTCGAGCTGAGTTACAGATCCACGCGTGATTTCTCGTGAGATTGTCGCTTTACTGCGATGAAGCTTCTGTGCAATCACGGTCGCGGTGTCACCAGCAGCCTGAAGGGCCTGAATTGTAGCACGGTCGCTAAAACTGAGTTGTTGGTAATGCTTGTGGGTGTTAGTCTGAGAGTGGGTCATGAAGATTCCTGCTTTCTTGTTTAGCTAGCACTAACAAGAATAGGTCTTCATGGCCTTTATGGTCTAGTCGTCAGGGTGTTGCACTTGAATTGTAAACTGGGGTTCCATAATATGTTGGCCGTTAGCGAAAACCGCCGGCAACATGTCCTGGCGTAACTTGATAATCGCCGCTGCTTCTTTGGGATCACTGGTGACCTTGATGTTTTTGGCATGATCGTCATTTAAAATCTGCTCCGCCATTTTCAGACTAGCTTCACCACCAGCATCTAACCGGAACAGGAGCATTGCCTCGGCGCCTTCAGCATAGTGAGTGCCTTCATAACGATCCAACGCAGCAACTGTCAGACCATCAAGTGCTTCAAGCATGACCGGATAGATACCGGAAAGCCGCAAATCCTCCACCCCTTTAGCCAATGCTGTCATGTTGTCAAAATAAGCAATTCCAACAACCGGCGTGCCAATTGGAATCGGGTTCAGTTTGACAGTGACTTCAGTGATGATGCCCAATGTGCCTTCCGAGCCGACGAATAAGTGCGTCAAATCGTAACTAAACGCATGCTTGTAAGTTCGGCCGCCAAGTTTGATTTCACGGCCGTCTGCCAAAACAACTTTAAGGCCAAGTACATTGTCGGTTGTCGCCCCATACTTCACGGTACTCATCCCACCAGCATTGGTTGCCGCATTGCCACCAATGCTTGAAATTGGCTTAGATCCAGGATCAGGTGCGTAAAAAAGACCTTGCGCACGCGCTGCCTTATCCAGGTCCCCGTTGATCACACCAGGCTCAACCACTGCCAACAGATCGCCTTTGCTAATCTCTTTAATCCGATTCATTCGCGCTGTCGACAAAATAAGACTGCCGTTTATGCCGTCAGAACCGATCACGGTGCTCGTATCTGCGCTTTGGGGAACCACTGGCATATGATATTGACGCGCGATTCTTAACACACCTTGAATATCTGCAACATCACTGACTGCAACATATGCCAGAATTTTCCCGGCAATCTCACGCTGGGCATTGCCATTGGCGCTATGTTCGCGCGCAATTTTATCATCAATGTGGATTTCGGCATGCGGGGCCGCGTCTTGCAAGGCTGCCAGAATTTCCGAGTTATCATAAGCTGTAAAAATTGCCATCACAAAAACCTCCTCAACACCTCTAAAGGCAGGTGGCAGCGTTGGCCATTCGCCTCTGAAGCGTCGACTTTATTATGGACTATTTTGGTAAAGATGGCTTAGTAAGACGCTCGGTGGTGTGCCTATTAAGACGCCGATTGACCCTGCGATGAGATTGACTGTCTTGCCTTTGTCTCAACAGCAATGGTTTCCTTGGGATGAACGGTAATAACAGCCTCTCCTAGCCAAGTCGTTTCTGGTGCCATGGCTGCCAAGCGATAAGGTTGACGTGGTTGGCCGCTGCCTGTTATTGGCGTTGGTGTGGCAACACAAATCGTCAAGACATCTGTGTCCACACCAGCGTCTGCTAAATGGCGAAAGCGGACCAAATTAATGGTCTGTTCTTGTGGTACCACCAGTGGTTCGCAGTTGCCGCGATAATCGAGTCGAACGACATGCCGGCCATGTGTGTCAAAACCAGATAAAACGGCCACCTTTGGACGACCAAGGACTTGAGTTCGCGGATCAAAACCGTCAAAGCTGGCGAAACGCGGCAATATGTAATAGAAGATCGGTGACGCCAGGGCCACAGGTTCCTTGCTTAGTAAATGCAGGCCGACTTTCCCGCCAAAACAGCCGGCTGCAGCTGATCCCGGCAAATATTGCAAGGCAAAAGTTGGTTTTGTGGTCAATGTGTCTAACGGTTCCTTGTCGTTATTGCGATTGTCACGCATCAGTGGTCACTCCTGTCAAAATTATGCTTGATATAATTAAAATGATACTCGC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>CP029546|2307854:2368552|2309934_2310951_-|AWN84678.1|transposase|DBSCAN-SWA MTHSQTNTHKHYQQLSFSDRATIQALQAAGDTATVIAQKLHRSKATISREITRGSVTQLDSKRHSHQVYLAETAQAMHDRKRDRTGHYAFLKTGRAFFKALARELTRKPRVHSVDSFVHFYRDQGKACPSTTTVYRYIDAGLLELDNMTLPKKLRRRIKGYKNAHKRKNKKIYGDSIELRPAAVNDRTGVGHWEGDLVKGIRLADEPALMTLTERYSRTEIIVKIPDYHAGTCLKALQDTIDDYGAKEFESITFDNGSEFAKLSEIVGTQIYFAHPYSPWERGTNENANGLLREFFPKGKSLRAITLVEIQAVQSALNHRPRRILNYLRPCDYYRCMA >CP029546|2307854:2368552|2334982_2337037_+|AWN84701.1|portal|DBSCAN-SWA 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>CP029546|2307854:2368552|2333942_2334821_+|AWN84700.1|DBSCAN-SWA MELQLQNLALSFKNKPNVIHDISLTMNGGSIVGIVAPNGTGKTTLLRLILNDLKPQAGKVLVDGKSYGSQKQSLALHRQMCLFPVQDDLYPDLSGKAHLEYYAKLWHNRSKSVKQIINVLDMRDYINQPVRTYSMGMKQRLCFGMVMAANTPIMLLDEFMNGLDTINVARMSRILRGLRAEGKLIITVSHLLNNLQGYADLIYFMRDGKIIKTIDQHEQQPLYVQVAEENASRLPRMPWEHYPNGMLVLPIQKLPGEHFNQLLLGLAAHHIPFKLGPLDLDTYFNEFYETDQ >CP029546|2307854:2368552|2346879_2348112_+|AWN85317.1|DBSCAN-SWA MDRHIFGATFSSLRSTNFRRFWIGQCISVMGTWIQRTTQTWLVYQMTKSAFLVGLLAAAQFVPIMALTLIAGTLIDRYPKRRILLMTQFGFLVLGAAMTIITFLKIVQYWQILVIALGYGILQSFDTPTRQSYVIELVGKKDLMNGISLNSSIFNLAKIAGPSLAGVLMVTIGVAPCFLVDTLSYIAIIIGLLMIHQQHPVASHTPRHIIADVKEGLAYIVHHDNVKLSAELMMIICTLNFNNNVIIPIYAQEVLGRGAQGYANLLSATGIGSLIAAFLMSYLARFGLRRDLYLLVALGTALVQSLMIFVHVYWLAMIFMVVIGFCNMVFLNQSNAAFQFSIPNELRGRIMSVYVLLNQGSTPIGSLYVGGLMDMAGGLWGFPSCGLLALLLTIPILLSHQTTVKHWLHA |
56 | Streptococcus_phage(25.0%) | portal,protease,bacteriocin,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
2371686 : 2417048
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >CP029546|2371686:2417048|DBSCAN-SWA 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46 | Indivirus(33.33%) | bacteriocin,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
2514435 : 2621345
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >CP029546|2514435:2621345|DBSCAN-SWA 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96 | Streptococcus_phage(29.03%) | tRNA,integrase,transposase | attL 2570501:2570515|attR 2624278:2624292 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
2656149 : 2720296
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >CP029546|2656149:2720296|DBSCAN-SWA 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56 | Acinetobacter_phage(16.67%) | protease,tRNA,holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
2858804 : 2873412
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >CP029546|2858804:2873412|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_15 >CP029546|2858804:2873412|2867438_2867780_+|AWN85178.1|DBSCAN-SWA MTKTAYRKAALVDVKHDRDKWTELGVLVKEHYLVRSMTPKDWFIIVKQREGYEIEVYPTFEMSDGFQFSHVNLLTRSSYGSISRIAYHELCSSASDTISSIDRMIDLAKDKRY >CP029546|2858804:2873412|2870681_2871866_+|AWN85183.1|portal|DBSCAN-SWA MSFFTNSATQPRDDNSDPFLDALVSMTSNDSGLYVGIGALRNSDVFTAVRVIASDLATNPIEYSDKRISVLLNKAPNDHMTAWAFKFALAANMLLNGNSFARVTKNPSGQVTGFELVPNSQMVVKQDNTTGIISYEYTPDSGRSQRLNASEVLHFKCFTQDGYKGLSPLYSLHDEVGVQKSGHALLKGFFNSGVQGTGILKVNKTQLDTKAKENIRNKFEAANSGDNALKTIILDNDMDYKQLEVNTDVLNLVNSSDWTTKQIAKAFGLPLDRLGIESEHSNAVQSNVMYLQNTLIQYFTCFTSEMDAKLSTGDNRFSFNTDKLFSADPATMQELAVKGLQGGVLTTNEARAKLNLPPIPGGDEIMASLNYTPLSNLTSYQNTRQRSDPENESR >CP029546|2858804:2873412|2860779_2860977_-|AWN85333.1|DBSCAN-SWA MFCCGLVNLLEEVHQVLEAETGAFERDGTPSMARWREEESMGWLRRGEQRISVDIVMPIGVPFGS >CP029546|2858804:2873412|2864231_2864507_+|AWN85174.1|DBSCAN-SWA MMKNVSNSTKTPDLGMASFNLSTAKGLLEALSDEFDIMEGSVTSYRNDRTEKNAAILAYGTNRSFYTWMALLRTIQEYVDSSLATIDEVNK 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19 | Lactobacillus_phage(25.0%) | portal,terminase,integrase,transposase,capsid | attL 2861148:2861167|attR 2875257:2875276 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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