Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP028471 | Staphylococcus aureus strain IT4-R plasmid pIT4-R, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 1 | 0 |
CP028470 | Staphylococcus aureus strain IT4-R chromosome, complete genome | 9 crisprs | cas3,DEDDh,RT,DinG,csa3,WYL | 5 | 0 | 11 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
15704 : 24615
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP028471|15704:24615|DBSCAN-SWA CTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATGGAAATCAGCTTTTTTGATATTTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCGAGTGAAACCCAAAATAGCCTTCATAAATCCAAAAACAGACTCTACATCAATTTTTCTTTGACTATAGATTTTTTTCGTTTCTGGTTCAGAAAGCTTTTGATTAATTTGGGCTTTAAAGTATTCCCAATTATAATTCTTCATGATTTTCTTATTGGATTTCGAATTTGGCTTCATGCATTGTTGCCTCAAAGAACATGCTGAACAGTCATCGCATTCATATAGTTTGAAGTCACGTTTAAAACCATATCTATCATTACGGTTTGCATATCTTTTAAAACCTATTCTTTTGTTATTAGGACATATAAATTCATCATTAAGTTCGTCATATTTCCAGTTTTGAGTGTTAAAAATGTCACTTTTAAACTTTCTCGTTTTATCTTTAATAAACATACCATACGTAATAAGTGGCGTTTTATTAAAATCATCTATAATAGCCATATAGTTTTGCTCACTACCATAACCTGCATCAGCTACAATATACTCCGGTAAATAACCGAAGGTATTTTGAATCATTGTTAAAAATGGAATTAAAGTTCTAGTATCTGTCGGGTTTTGAAATAGGTCATAGGATAAAACAAATTGAGAATTTGTCGCTATTTGTAAATTGTATCCTGGCTTAAGTTGGCCATTTTTCATATGGTCTTCCTTCATTCTCATAAAAGTTGCATCATGATCAGTTTTAGAAAAGCTATTTCTATCTTTAAGAATCGATTTTTGTTCTTCATATTTACTTTTTCTTTCGGAATAATCATCAAATTTCTTTTTGAACTTCTTAATCTCAGTTCTTTTTTTACGGGTCTGTTTTCTAATTTGAGTACAATCTTCATTCTGAATAGAATGATTTAAATCTTCGATTTCTTTATCTAAATGACTACCAATTAAATCTATTTCTTCTATTGTTAAATCGCTATCTCCATCTTCTTTTATCTCTGGTATTATTTTTTCTTCAACTAAGTCACGATATAATGCTTTTGAATTTTCGTTCAATTTCGATTCGTGATTTTGAATACTTTTCTTCCACACAAATGTATACCTATTGGCATTAGCTTCTACTTTTGTACCATCAATAAAAATTGAATTATCATCAATAAGATTTTGCTTTAAACATTGACTATGAAACTGAATAAATAAAGATTCAATTAATGCATCAGTATTAGGATTTACTCTAAAACGATTAATAGTTTTATAAGAAGGTGTTTGATTTTGAGCTAACCACATCATTCGAATACTGTCATGAAGTAATTTCTCTATTCTACGACCAGAAAATACAGATTGAGTGTATGCATATAAGATAATTTTTAACATCATTTTTGGATGATAGGATGTTGCGCCACGATGATGTCTGAATTCATCGAATTCGCTATCAGGTATCGTTTCAACAATTTCATTAACATATCGTGAAATATCATTTTGAGGAATTCTAACAGAAGTTTCTATTGGTAGTGTAAGTTGGATCATGTTATAATTTTTATACATAAGGCACCTCGTTAATTTAGTTTAGTGGTATTTATTAAATTATACGAAAGTGTCTTATTTTTTTAAAGTATTTCAAAGTAAAATTACATGTTAATACGTAGTATTAATGGCGAGACTCCTGAGGGAGCAGTGCCAGTCGAAGACCAAGGCTGAGACGGCACCCTAGGAAGGGATCCGTCATCAAAAATTCTATTTATAGAATTTTACAGTAATGTGCCAGACGGGCAAAGCGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGCTTTTTAGGGATTTATGTCCCAGCCTCTCCGTAAATTGCACACATATAGTACCTATTTATCCTTCACTCTCATCAGTCGCAAACTATTTAATGCTACCAAAATAGTGGCTCCCATATCGGAAAGAATCGCAATCCAAAGGGTTAGCCAGCCTGGAATAACCAATAGTAAGGCAATTATCTTAATTCCGATGGCAAACGTGATGTTCGCTTTGATGATATTTAGCGTTTTCCTGCTAAGTCTTACTGCAAATGGAAGCTTACTTAAATCATCTCCCATTAATGCAATATCAGCTGTCTCGATGGCAGTATCTGTTCCAGCACCGCCCATTGCAATGCCAACAGTGGATGCAGCAAGTGCAGGAGCATCATTGACGCCATCGCCAATCATAGCTACATTACCATGCTCGGCTTTCATTTTTTTAATATAGTCCAACTTATCCTGTGGCATCAATTCGGACTGAATATCAGAAACGCCTACATGAGCACCGATTGCTTCTGCGGTACCTTGATTATCACCTGTCAGCATAATTGTTTGCTTGATTCCTAACTGATGAAGTTTTTGAATCACATTTTTACTTGTTTCGCGGACCTCATCTGCTACAGCAATCACGCCGAGGATTGTTTGGTCCGTTCCAATAATCATGGCCGTTTTCCCTTGGTTTTGTAAAACTTTCACTTTATTTTCAAACTCAAGGCTAAAATCGGAAACATTTAATTCTTTAAAAAGCCTTGGACTGCCAATGTAATAGGTTGTTCCATCTATATTCCCTTGAATGCCCCGACCTGTAATAGAAGTGAAGTCCTCCACTCTAACATCGGAATAAGTAATATTATCTTGCTCTGCTTTCTTCATTATTGCTGAAGCAAGTGGATGTTGTGATCGATATTCTAAAGCTGTAATAATGGAAAACAGCTCTTTTTCTTCCACTTGATCATTTAACACTTTAAAATCTGTTACCACTGGTACACCTTTTGTCAGTGTTCCTGTTTTATCAAATGCGATTGCCTTAATGGCTCCTAATTCCTCTAGATAGACACCGCCTTTAATCAACACACCTTTTTTAGCTGCATTTCCAATTGCCGAGACAATCGAGATTGGAGTAGAAATAACTAATGCACACGGACATCCAACTACAAGTACCGCTAATCCTTGATAAACCCAAGTATCCCAACTTCCACCAAAGAATAAAGGTGGAACGACTGCAACGAGCGCCGCAATAACCATAATGATCGGCGTATAATATTTCGCAAATTTATCTACGAATGCTTGCGCTGGAGCGCGCTCCCCTTGTGCTTCCTCAACCAGATGAATAATCTTGGAGATAGTTGTATCCTCTACGTATTTGGTGATTTTTACTTCAAGTAGTCCCTCTTCGTTAAGCGTACCTGCAAATACTTCATCATCTACCGTTTTGGCAACAGGGACAGATTCTCCTGTTATAGCAGCCTGGTTGACAGCCGACACACCATTTATAATGATCCCATCCATGGCAATTTTCTCCCCTGGTTTGACGATCATAATATCACCCACGGCAATATCGTCCACATGGATCATTATTTCCTGACCATTCCGCATAACAAGTGCTTCTTTTGGGGCAATATCCATCAATGAACGAATGGACTGTCTTGCTCTATCCATAGAAAAACGTTCAAGTGCTTCACTGATTGCAAAGAGAACGACAACAATGGATGCCTCTGCCCATTCACCAATGATGGCAGCTCCAATAACTGCTACGGTCATCAGGGTTTTCATGTCGAAATCAAAGCGTATCAAATTTTGAAAACCAACTTTAAATAGTGAATATCCGCCAATTACAATCGAACCTACAAATAACATGGAAGTTACAAGGTTATCTTCTCCATTTACAAAGTGAGAAAGGTAACCAAAAGCAATCAGTAATGTGGCAAACAGCAATGTGCTGTGTTTTTTATAAAACGGTATTTTCTCTTCTTTAGGAGCCTTAGTGTCTTCTTTGACCGCTTGCATCGATGAATTCGCTAGTTTTTCGGGAAATACCTTAAGATTCTCGAAAGCACCTGCTTTTTCAAGCTCTTGAACCGATGCATTTCCATATACATCAATTTTGGAAGCGCCAAAGTTCACTTTTGCATCCTGAACTCCAGCTAGTTGTTTTACATTTTTTTCAAACTTCCCAGCACAATTCGCACACGAGAAACCCTCCACACGGTAAACCTGTTTATCTTCTGTTAATGTTTTTGCTGAACTATCCAATACTAGCAACCTCCCTTTGATACAAGAAAGCTTTTTCTACAAGCTGTTTAACATGCTCATCATCTAGTGAATAATAGACTACTTTTCCTTCTTTACGGTATTTTGCTATACCTAAATTTTTCAATAATCTTAAATGATGGGATGCCGTAGCCGTTGAAGATTCAATGATATTAGCTACATCACAAACACATAACTCTCCCTCTAAAGACAAAACATAAGCAATTTTAACTCTTGTATCATCTGATAGAGCCTTAAAAACTTTCGCTACATCCATAGGATTCTGTTTAGCAAGGTCTTTTTTAGCCCTGTTTACCTTATCTTCATGAATATAGGTAACTTCACACATATCTTTTGTCATAATTATCCTCCTTATTCAAATGACTGTTTGTTTGATGATTATAATATATCCCACCATAAACAAATAGTCAAATGATTGTTTGAATGATATATAATTAATATTAAAAAGGATTGATTTCTAATGTTAGAAACCAATCCTTTCGGAGATTTTAACCAAATTTTAAAGTATCTTAAACATAACTGCCCCGTTAGTTTAAGTGCATCCTTTCACAATCTGTCTACAGATTAATAATTAAAACTACTCTTTATTATACAGATCTCCATATAATTTTTGAATTTGGTTCTGTAATTTTTTATTTTCTTTTTTTAATTCCATAACCCTTCTTTTTAAGGTTTTTATAAGGATTTCCTCCGAACGAGAACTTTTCTTGGGTTTTGAGACTACATTTGATGTTATTTGACGCTCACGAAGGGATTCGATTCTTTGCCTAATATCGTGTTCCTTATAAAGCCATGATTTAGAAACATTAGCTTCCTTTGCTATTGAATTAAAATTAATAGCTTTACCTTCAATCGAAAATTTAGAAATCGCTTTGTCTACTTTTTCCCTTGTCTTTTGTGATTTCTGCTTCGCCAAACGTACAATTTCTGTTGTATTTCTAACTTGTTTATCCATTGATAATTACCCCGTCAAACTTCCAATGATTTGTTCGGTTCTGTTGCAAAGTTAGAAATATAGTATAATAGTCAACAAAAATGAGGTGCAGAGGATGAATTATTTCAGATATAAGCAATTTGACAAAGATGTCATTACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTAAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTGAGAGAACGAGGCATCTATGTTCATCATTCAACAATTTATCGATGGGTACAGGAATATGCTCCTATTTTGTATCAAATTTGGAAGAAAAAGAATAAGCAAGCTTATTATAAATGGCATATAGATGAGACGTATATCAAAATTAAAGGGCAATGGAATTATTTATATCGCGCTATTGATGCAGATGGCCATACACTAGATATTTCGTTACGTAAGAAACGAGATAATCACTCAGCATATACGTTTATTAAACGTCTTATTAAACAATTTGGCAAACCTCAAATGATAATTACAAACCAAGCCCCTTCAACGAAGGTGGCAATGTCCAAAGTGATTAAAGATTTTAAACTTACCCCCAACTGTCATTGTACCTCTAAATATTTAAATAATCTCATTGAACAAGATCATCGTCATATCAAAGTAAGGAAAATAAGTTATCAAAGTATCAATACGGCAAAGAATACGATCAAAGGCATTGAATGTATTTATGGACTATATAAAAAGAACCGCAGATCTCTTCAGATCTACGGGTTTTCGCCATGCCGTGTAATTAGCATCATGCTAGCCAGTTAATACGAAGTATTATTTTAAACATAAGGTTAGACACTTATTTTTTAACTTTGCAACAGAACCTCCTATTTTTAGTAATATTTATAGCCCTAACAGTTAGATAAACTGCATTTATAAAACCCAAAATAGTATATGGAATTAAAATATATAAATTTTCTAATTGAACTAAGAAAGTTAACCCAACTAAAAATAAAACATTCAAAACGGTAGACATAATAAAAGCTATATCTAACTCATTTTTTTTATTCAAAATACATTCCTCCTTTTTTAAAATTTTACCATAGTTGCTTTATTGATGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACGCACAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTGTCTATGCGTAGACATGGAGACACTTCAGAATTATGGAGTGATTACATGAGTTTAACTATTTTTCTTTATTCAGTTTTAGGAAGTTTATTAGCAAATTATATCTACGAAAAATCTTCGAAAAGAAGTTCAGCTCATGATAACGAGTTTACCTATGATGAATGAAGTCATTGGAAATCCACTACTAGATAAATTTATGAAAGATTTAATTATTCAAATTTTAGCAATGATTTCAGAACAAGAAAGAAATGAAAGTAAACGTCGACAAGCTCAAGGGATTCAAGTCGCCAAAGAAAAAGGTATATATAAAGGGAGACCTATTCTGTATTCTCCCAATGCTAAAGACCCACAAAAGCGTTTAGTTTATTACCGAGTTGTTGAATTACTTGAACAGGGTAAATCTATAAGTACTATAGCTAAAGAAGTTGGTATTACACGTCAAACTATATATAGAATAAAAAATAGTAAATAAAATAACATAGACAATAATCTATATAGATGTTAATCTATTTAATGTCTAGGAGGTTTATTCATGTCTTATAAAGAACTATCAACAATATTAAAAATTTTATCAGATTCAAGTAGGTTAGAAATATTAGATTTACTTTCTTGTGGTGAGCTATGCGCTTGTGACTTATTAGAACACTTTCAATTCTCACAACCTACACTAAGTCATCATATGAAGTCATTAGTAGATAATGAATTAGTTACAACACGAAAAGACGGCAATAAACATTGGTATCAACTTAATCATGCTATTTTAGATGATATTATCCAAAACTTGAACATCATTAATACATCTAATCAAAGATGTGTATGTAAAAATGTGGAATCAGGTGACTGTTGATGACTATTTTAGCAATTGTAATTTTTCTTTTAACTTTAACCTTTGTGATTTGGCAACCAAAAGGTTTAGATATTGGTATTACAGCTTTAATTGGAGCTGTTGTTGCTATCATTACAGGAGTCGTAAGTCTTTCTGATGTATTAGAAGTAACAGGTATTGTTTGGAATGCAACTTTAACTTTTGTGGCTGTTATTCTTATTTCATTAATATTAGATGAAATTGGTTTTTTTGAATGGTCTGCGATACATATGGTCAAGGCTTCAAACGGTAATGGCTTAAAAATGTTTGTTTTTATTATGTTACTTGGAGCAATTGTAGCAGCATTTTTCGCAAATGATGGTGCAGCTTTAATCTTAACGCCTATTGTATTAGCGATGGTAAGGAATCTAGGATTTAATCAAAAAGTGATTTTCCCCTTTATTATTGCCAGTGGTTTTATTGCTGATACTACATCACTTCCCTTAATTGTAAGTAACTTAGTTAATATCGTTTCTGCAGATTACTTCGATATTGGATTTATTGAATATTTTAGCCGAATGATCATTCCTAATATATTCTCTCTGATTGCTAGTATTCTCGTTTTATGGTTATATTTCAGAAAATCCATACCTAAAACGTTCGATACAGAAAATCTATCAGATCCTAAAAGTGCAATTAAAGATTCTAAGTTATTTAAGCTTTCATGGATAGTATTAGCAGTACTACTCGTTGGATATCTTGTTAGCGAGTTTATCCAAATTCCTGTATCAATTATTGCTGGTATTATTGCTTTTATCTTTGTAATATTAGCTCGTAAATCTAAAGCAGTTCATACAAAACAAGTGATTAAAGGTGCACCATGGAATATCGTTGTATTCTCTATTGGTATGTATCTTGTTGTGTTTGGACTAAAAAATGTAGGTATTACAACGGTCCTTGGGGATGTTTTAACAAACATTTCAAATTATGGGTTATTTAGCAGCATCATGGGTATCGGCTTTATAGCTGCTTTCTTATCTTCGATTATGAACAACATGCCAACTGTTTTAATAGATGCAATAGCGATTGGCCAATCCAGTGCTACAGGAATATTAAAAGAAGGCATGGTTTATGCGAATGTCATAGGTTCTGATTTAGGACCTAAAATTACGCCAATTGGTTCTTTAGCAACATTATTGTGGCTACATGTCTTAACACAAAAAGGTGTGAAGATTTCGTGGGGAACATACTTTAAAACTGGAATTATCATCACTATTCCAGTCCTATTTGTAACACTCTTAGGTTTATACCTTACACTAATCATATTTTAAGAAAAGGGGCTTTAATTATGGATAAGAAAACAATTTATTTTATATGTACAGGAAACTCTTGTCGTAGCCAAATGGCTGAAGGTTGGGGAAAGGAAATATTGGGTGAAGGTTGGAATGTCTATTCTGCTGGTATTGAAACACATGGTGTTAATCCTAAAGCAATAGAAGCTATGAAAGAAGTAGATATTGATATATCAAACCATACGTCAGACTTGATTGATAATGATATTTTAAAACAATCAGATTTGGTCGTAACGTTATGTAGTGATGCAGACAATAATTGTCCTATTTTACCACCAAACGTTAAAAAAGAGCATTGGGGTTTTGATGATCCAGCAGGTAAAGAATGGTCAGAATTCCAACGTGTTAGAGACGAGATTAAATTAGCTATAGAAAAGTTTAAATTGAGATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP028471|15704:24615|20961_21636_+|AWQ27015.1|transposase|DBSCAN-SWA MNYFRYKQFDKDVITVAVGYYLRYALSYRDISEILRERGIYVHHSTIYRWVQEYAPILYQIWKKKNKQAYYKWHIDETYIKIKGQWNYLYRAIDADGHTLDISLRKKRDNHSAYTFIKRLIKQFGKPQMIITNQAPSTKVAMSKVIKDFKLTPNCHCTSKYLNNLIEQDHRHIKVRKISYQSINTAKNTIKGIECIYGLYKKNRRSLQIYGFSPCRVISIMLAS >CP028471|15704:24615|15704_17351_-|AWQ27011.1|transposase|DBSCAN-SWA MYKNYNMIQLTLPIETSVRIPQNDISRYVNEIVETIPDSEFDEFRHHRGATSYHPKMMLKIILYAYTQSVFSGRRIEKLLHDSIRMMWLAQNQTPSYKTINRFRVNPNTDALIESLFIQFHSQCLKQNLIDDNSIFIDGTKVEANANRYTFVWKKSIQNHESKLNENSKALYRDLVEEKIIPEIKEDGDSDLTIEEIDLIGSHLDKEIEDLNHSIQNEDCTQIRKQTRKKRTEIKKFKKKFDDYSERKSKYEEQKSILKDRNSFSKTDHDATFMRMKEDHMKNGQLKPGYNLQIATNSQFVLSYDLFQNPTDTRTLIPFLTMIQNTFGYLPEYIVADAGYGSEQNYMAIIDDFNKTPLITYGMFIKDKTRKFKSDIFNTQNWKYDELNDEFICPNNKRIGFKRYANRNDRYGFKRDFKLYECDDCSACSLRQQCMKPNSKSNKKIMKNYNWEYFKAQINQKLSEPETKKIYSQRKIDVESVFGFMKAILGFTRMSVRGINKVKRELGFVLMALNIRKIAAQRAVHYKINIKKADFHQIINRNQLFYIA >CP028471|15704:24615|20489_20867_-|AWQ27014.1|transposase|DBSCAN-SWA MDKQVRNTTEIVRLAKQKSQKTREKVDKAISKFSIEGKAINFNSIAKEANVSKSWLYKEHDIRQRIESLRERQITSNVVSKPKKSSRSEEILIKTLKRRVMELKKENKKLQNQIQKLYGDLYNKE >CP028471|15704:24615|21670_21883_-|AWQ27016.1|DBSCAN-SWA MNKKNELDIAFIMSTVLNVLFLVGLTFLVQLENLYILIPYTILGFINAVYLTVRAINITKNRRFCCKVKK >CP028471|15704:24615|22912_24202_+|AWQ27018.1|DBSCAN-SWA MTILAIVIFLLTLTFVIWQPKGLDIGITALIGAVVAIITGVVSLSDVLEVTGIVWNATLTFVAVILISLILDEIGFFEWSAIHMVKASNGNGLKMFVFIMLLGAIVAAFFANDGAALILTPIVLAMVRNLGFNQKVIFPFIIASGFIADTTSLPLIVSNLVNIVSADYFDIGFIEYFSRMIIPNIFSLIASILVLWLYFRKSIPKTFDTENLSDPKSAIKDSKLFKLSWIVLAVLLVGYLVSEFIQIPVSIIAGIIAFIFVILARKSKAVHTKQVIKGAPWNIVVFSIGMYLVVFGLKNVGITTVLGDVLTNISNYGLFSSIMGIGFIAAFLSSIMNNMPTVLIDAIAIGQSSATGILKEGMVYANVIGSDLGPKITPIGSLATLLWLHVLTQKGVKISWGTYFKTGIIITIPVLFVTLLGLYLTLIIF >CP028471|15704:24615|17713_19894_-|AWQ27012.1|DBSCAN-SWA MDSSAKTLTEDKQVYRVEGFSCANCAGKFEKNVKQLAGVQDAKVNFGASKIDVYGNASVQELEKAGAFENLKVFPEKLANSSMQAVKEDTKAPKEEKIPFYKKHSTLLFATLLIAFGYLSHFVNGEDNLVTSMLFVGSIVIGGYSLFKVGFQNLIRFDFDMKTLMTVAVIGAAIIGEWAEASIVVVLFAISEALERFSMDRARQSIRSLMDIAPKEALVMRNGQEIMIHVDDIAVGDIMIVKPGEKIAMDGIIINGVSAVNQAAITGESVPVAKTVDDEVFAGTLNEEGLLEVKITKYVEDTTISKIIHLVEEAQGERAPAQAFVDKFAKYYTPIIMVIAALVAVVPPLFFGGSWDTWVYQGLAVLVVGCPCALVISTPISIVSAIGNAAKKGVLIKGGVYLEELGAIKAIAFDKTGTLTKGVPVVTDFKVLNDQVEEKELFSIITALEYRSQHPLASAIMKKAEQDNITYSDVRVEDFTSITGRGIQGNIDGTTYYIGSPRLFKELNVSDFSLEFENKVKVLQNQGKTAMIIGTDQTILGVIAVADEVRETSKNVIQKLHQLGIKQTIMLTGDNQGTAEAIGAHVGVSDIQSELMPQDKLDYIKKMKAEHGNVAMIGDGVNDAPALAASTVGIAMGGAGTDTAIETADIALMGDDLSKLPFAVRLSRKTLNIIKANITFAIGIKIIALLLVIPGWLTLWIAILSDMGATILVALNSLRLMRVKDK >CP028471|15704:24615|24219_24615_+|AWQ27019.1|DBSCAN-SWA MDKKTIYFICTGNSCRSQMAEGWGKEILGEGWNVYSAGIETHGVNPKAIEAMKEVDIDISNHTSDLIDNDILKQSDLVVTLCSDADNNCPILPPNVKKEHWGFDDPAGKEWSEFQRVRDEIKLAIEKFKLR >CP028471|15704:24615|22598_22913_+|AWQ27017.1|DBSCAN-SWA MSYKELSTILKILSDSSRLEILDLLSCGELCACDLLEHFQFSQPTLSHHMKSLVDNELVTTRKDGNKHWYQLNHAILDDIIQNLNIINTSNQRCVCKNVESGDC >CP028471|15704:24615|19886_20252_-|AWQ27013.1|DBSCAN-SWA MTKDMCEVTYIHEDKVNRAKKDLAKQNPMDVAKVFKALSDDTRVKIAYVLSLEGELCVCDVANIIESSTATASHHLRLLKNLGIAKYRKEGKVVYYSLDDEHVKQLVEKAFLYQREVASIG |
9 | Staphylococcus_phage(57.14%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP028470_1 | 261358-261495 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP028470_1
|
2 spacers
spacers of CP028470_1
>1.1|261385|28|CP028470|CRISPRCasFinder GAATTTCGAAAAGAAATTCTACAGGCAA >1.2|261440|29|CP028470|CRISPRCasFinder AGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP028470_1
The CRISPR arrays of CP028470_1 >merge|CP028470|1|261358-261495|CRISPRCasFinder TGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAGGCAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGGGAGGGACATAAATAAA >CP028470|1|1|261358-261495|CRISPRCasFinder TGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGA GAATTTCGAAAAGAAATTCTACAGGCAA TGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGA AGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATG TGCAAGTTGGGGAGGGACATAAATAAA
>CP028470.1|AWQ24537.1|259799_261236_+|6-phospho-beta-glucosidase MTKLPQNFMWGGALAANQFEGGYDKGGKGLSVIDVMTSGAHGKARQITESIDPNHYYPNHEGIDFYHRYKEDIALFKEMGLKCLRTSIAWTRIFPNGDEDVPNEEGLAFYDRIFDELIAQGIEPVVTLSHFEMPLHLAKHYGGFRNREVVDYFVHFARVVFERYKDKVTYWMTFNEINNQMDTSNPIFLWTNSGVALTENDNPEEVLYQVAHHELLASALAVRLGKEINPKFKIGTMISHVPIYPYSCHPKDMMEAQIANRLRFFFPDVQVRGYYPSYAKKMLARKGYDFGWQEGDDSILQQGTVDYIGFSYYMSTAVKHDVDTTVENNIVNGGLNHSVENPHIATSDWGWAIDPDGLRYTLNVLYDRYQLPLFIVENGFGAVDEVVDGHIHDDYRIEYLKVHITAAIEAVDQDGVDLIGYTPWGIIDIVSFTTGEMKKRYGLIYVDRDNDGHGTMERLKKDSFYWYKQVIASNGDKL >CP028470.1|AWQ24536.1|258992_259784_+|PTS-glucose-transporter-subunit-IIABC MSNKYKDQAQDILTAVGGVENIVDVTYDTKGITIHMQHTIPSTANEVKQIVDVTSVAENDAQLVIKLNGNVDEVYQQLQRLIKDANVEEGANTDNINSQDTSYTPQAKVTTPILVKAPIAGRRILLKEVRDSIFREKMVGEGLAIKAHEESKVIAPFNGLISMIVPTKHAIGIRSEEGVDIVIHIGVNTVDLEGKGFKCFVKQNDRVEAGQTLLQFDQQYIQEQGYNSDVIVVISNSADLGKVELTMNEIITTEDVIFKIFKN >CP028470.1|AWQ24535.1|258139_258844_-|GntR-family-transcriptional-regulator MLKYEHIAKQLNAFIHHSNFKPGDKLPSVTQLKERYQVSKSTIIKALGLLEQDGLIYQAQGSGIYVRNIADANRINVFKTNGFSKSLGEHRMTSKVLVFKEIATPPKSVQDELQLNADDTVYYLERLRFVDDDVLCIEYSYYHKEIVKYLNDDIAKGSIFDYLESNMKLRIGFSDIFFNVDQLNSSEAALLQLSKGEPCLRYHQTFYTMTGKPFDSSDIVFHYRHAQFYIPSKK >CP028470.1|AWQ24534.1|255622_257914_+|nitric-oxide-reductase-large-subunit MSMQSSYKRLVKVLLTILVIVFSILLVGGWYIFKNEAPRPTKIVDQQGHTLVTKGELISGQAIYEKYGLTDYGSYLGNGSYLGPDYTAEALHHYLIGMRKYYAQDIYHKQLHKLNHAELAVVKDKVMKEIRINRYSEKEDQLVLTPGQVYGLKYLQDYYKKEFVNNPKQVGLNENMIKQFQNDDYMVAGNKVEHLSQFFFWGAWLSSTDRPGKTFSYTNNWPYDVDAGNTLPSAGILWTAISVTLLIAGLAFIIYIQKRYQFDMKPTYESERELPKIEVDRKITDSQRKVGKYLVVVMLLFLVQILLGELLAHYYVENKFFGIEIQRLFPFNIAKTWHVQLVIFWVATTWLAAGIYIVPKVLGKEPKKQGVLVDILFWALIIVVMGSMIGEWGHILGWIDSHWWLFGHFGWEYIELGKFWQILFIVGMVLWVIILCRGFLPAIRNKVQVNHDKRHLLTLLFVGAIAIPLFYLASLFIMPNSHVTFADYWRWWIVHLWVEGIFEAFAVVLIGFLMVNMKLTTIETTIRALYFQLILLLGTGIVGMGHHYYWQGDHSIWLALGSCFSALEVVPLCLLIWEAYTHYRLYKNSDIAFPYKGTFIFLASTGLWNAIGAGALGFLINTPAVNYFEHGTQWTAAHAHGSMAGVYGMFSIAIALYVFKNITKKEFWTPKVEKWIKISCWALNIGLAGMVFVTLMPVGYIQLKDALEHGYWHSRLTSFYEQPLVKAIMWGRMPWDIIFTVGVIILVVIFIRGYRHLKPKYRV >CP028470.1|AWQ24533.1|254580_255282_+|antiholin-like-protein-LrgB MINHLALNTPYFGILLSVIPFFLATILFEKTNRFFLFAPLFVSMVFGVAFLYLTGIPYKTYKIGGDIIYFFLEPATICFAIPLYKKREVLVKHWHRIIGGIGIGTVVALLIILTFAKLAQFANDVILSMLPQAATTAIALPVSAGIGGIKELTSLAVILNGVIIYALGNKFLKLFRITNPIARGLALGTSGHTLGVAPAKELGPVEESMASIALVLVGVVVVAVVPVFVAIFF >CP028470.1|AWQ24532.1|254144_254588_+|antiholin-like-murein-hydrolase-modulator-LrgA MVVKQQKDASKPAHFFHQVIVIALVLFVSKIIESFMPIPMPASVIGLVLLFVLLCTGAVKLGEVEKVGTTLTNNIGLLFVPAGISVVNSLGVISQAPFLIIGLIIVSTILLLICTGYVTQIIMKVTSRSKGDKVTKKIKIEEAQAHD >CP028470.1|AWQ24531.1|253291_254032_+|DNA-binding-response-regulator MKALIIDDEPLARNELTYLLNEIGGFEEINEAENVKETLEALLINQYDIIFLDVNLMDENGIELGAKIQKMKEPPAIIFATAHDQYAVQAFELNATDYILKPFGQKRIEQAVNKVRATKAKDDNSASAIANDMSANFDQSLPVEIDDKIHMLKQQNIIGIGTHNGITTIHTTNHKYETTEPLNRYEKRLNPAYFIRIHRSYIINTKHIKEVQQWFNYTYMVILTNGVKMQVGRSFMKDFKASIGLL >CP028470.1|AWQ24530.1|251549_253289_+|sensor-histidine-kinase MLLLERVGLIIILAYVLMNIPYFKNLMNRRRTWKARWQLCIIFSLFALMSNLTGIVIDHQHSLSGSVYFRLDDDVSLANTRVLTIGVAGLVGGPFVGLFVGVISGIFRVYMGGADAQVYLISSIFIGIIAGYFGLQAQRRKRYPSIAKSAMIGIVMEMIQMLSILTFSHDKAYAVDLISLIALPMIIVNSVGTAIFMSIIISTLKQEEQMKAVQTHDVLQLMNQTLPYFKEGLNRESAQQIAMIIKNLMKVSAVAITSKNEILSHVGAGSDHHIPTNEILTSLSKDVLKSGKLKEVHTKEEIGCSHPNCPLRAAIVIPLEMHGSIVGTLKMYFTNPNDLTFVERQLAEGLANIFSSQIELGEAETQSKLLKDAEIKSLQAQVSPHFFFNSINTISALVRINSEKARELLLELSYFFRANLQGSKQHTITLDKELSQVRAYLSLEQARYPGRFNININVEDKYRDVLVPPFLIQILVENAIKHAFTNRKQGNDIDVSVIKETATHVRIIVQDNGQGISKDKMHLLGETSVESESGTGSALENLNLRLKGLFGKSAALQFESTSSGTTFWCVLPYERQEEE >CP028470.1|AWQ24529.1|250614_251289_+|iron-sulfur-cluster-repair-di-iron-protein-ScdA MINKNDIVADVVTDYPKAADIFRSVGIDFCCGGQVSIEAAVLEKKNVDLNELLQRLNEVEQTNTPGSLNPKFLNVSSLIQYIQAAYHEPLREEFKNLTPYVTKLSKVHGPNHPYLVELKATYDTFKNGMLEHMQKEDDVDFPKLIKYEQGEVVDDINTVIDDLVSDHIATGQLLVKMSDLTSSYEPPIEACGTWRLVYQRLKALEVLTHEHVHLENHVLFKKVS >CP028470.1|AWQ24528.1|248749_250471_+|glycosyltransferase-family-2-protein MMKFSVIVPTYNSEKYITELLNSLAKQDFPKTEFEVVVVDDCSTDQTLQIVEKYRNKLNLKVSQLETNSGGPGKPRNVALKQAEGEFVLFVDSDDYINKETLKDAAAFIDEHHSDVLLIKMKGVNGRGVPQSMFKETAPEVTLLNSRIIYTLSPTKIYRTALLKDNDIYFPEELKSAEDQLFTMKAYLNANRISVLSDKAYYYATKREGEHMSSAYVSPEDFYEVMRLIAVEILNADLEEAHKDQILAEFLNRHFSFSRTNGFSLKVKLEDQPQWINALGDFIQAVPERVDALVMSKLRPLLHYARAKDIDNYRTVEESYRQGQYYRFDIVDGKLNIQFNEGEPYFEGIDIAKPKVKMTAFKFDNHKIVTELTLNEFMIGEGHYDVRLKLHSRNKKHTMYVPLTVNANKQYRFNIMLEDIKADLPKEKIWDVFLEVQIGTEVFEVRVGNQRNKYAYTAETSALIHLNNDFYRLTPYFTKDFNNISLYFTAITLTDSISMKLKGKNKIILTGLDRGYVFEEGMASVVLKDDMVMGMLSQTSENEVEILLSKDIKKRDFKNIVKLNTAHMTYSLK >CP028470.1|AWQ24538.1|261730_262492_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MSKEAGHTFLAKLGKTRLRPGGKEATDWLIQQGAFSQDKQVLEVACNMCTTSIYLAHTYGCHIQGVDINKKALEKAQENISAAGLESYIQVQQANAVKLPFDDNQFDIVLNEAMLTMLPIAIKEKALREYYRVLKPGGILLTHDIVIVNESHATHVVKSLSAAINVNVSPQTKLGWLDLYHQAGFNHVHYHTGPMSLMTPKGLIYDEGIVGTLKIINNALKKENRPMFCKMFKTMTKLRKDMNYITFVAKKEH >CP028470.1|AWQ24539.1|262742_263657_-|ribokinase MTNKVVILGSTNVDQFLTVERYAQPGETLHVEEAQKAFGGGKGANQAIATARMQADTTFITKIGTDGVADFILEDFKAAHIDTSYIIKTAEAKTGQAFITVNAEGQNTIYVYGGANMTMTPEDVINAKDAIINADFVVAQLEVPIPAIISAFEIAKSHGVTTVLNPAPAKALPNELLSLIDIIVPNETEAELLSGIKVTNEQSMKDNANYFLSLGIKTVLITLGKQGTYFATKNQSQHIEAYKVNAIDTTAAGDTFIGAFVSRLNKSQDNLADAIDFGNKASSLTVQKHGAQASIPLLEEVNQV >CP028470.1|AWQ24540.1|263684_264089_-|D-ribose-pyranase MKKTAVLNEHISKAIATIGHFDLLTINDAGMPIPNDHRRIDLAVTKNLPRFIDVLATVLEEMEIQKIYLAEEIKEHNPTQLQQIKQLISSEIEIIFIPHEEMKSNLAHPLNKGNIRTGETTPYSNIALESNVTF >CP028470.1|AWQ24541.1|264103_264985_-|ribose-transporter-RbsU MSIVALLIGLGPLIGWGFFPTVASKFGGKPVHQIIGATVGTLIFAIILAVVTSSGFPTGTNLLFALLSGAGWGFGQIITFKAFELVGSSRAMPVTTAFQLLGASLWGVFALGNWPGIGHKIIGFTALVVILIGARMTVWSERKEASNAKNLRRAVVLLLIGEFGYWLYSAAPQATSIDGLTAFLPQAMGMVIVAVIYGFMNMKAENPFRNKITWLQIISGFFFAFGALTYLISAQPNMNGLATGFILSQTSVVLATLTGIYFLKQHKTSKEMVITIIGLVLILVATSVTVFIK >CP028470.1|AWQ24542.1|265216_266215_-|LacI-family-transcriptional-regulator MKKVSIKDVAREAGVSVTTVSHILNHNDSRFSATTIKNVHAVSERLGYAPNKHAKQLRGSKIQTIGVILPSLTNPFFSALMQSIHDHKPSDVDLCFLTSTATDLYDNIKHLIDRGIDGLIIAQYISSPDALNNYLKKHHVPYVVLDQNDHQGYTDFVRTNEYQGGQLAAQHLIELGHNNMIVVAPYDMMANMSTRVAGFVDTLRANQLPEPQIVHTELSKRGGLTIVDDIMVQSATAIFAINDELAIGILRGLIEHGISIPKDISLIGYDDIDYAAYVSPPLTTVAQPITDIGKTSLTLLLQRLQHLDKSIDMIELPTTLKIRATTGYHLSN >CP028470.1|AWQ24543.1|266595_266988_+|hypothetical-protein MQFKLKEEEIISFLELKYPEKEFEYGRLLVGQHKRDDLDVYYFGDTFLMCTIISFKTFEIKETVELSYDAVNRIVLKDGWLFRKMRIETMQKVLKYGTSKLMLTDFQKENYNKYIQGQKQRVIFENGHFV >CP028470.1|AWQ24544.1|267115_268492_-|MFS-transporter MNNTQSSPRSNIIIAIMLSALTYWLFAQSFINIGPLVGQTYQTSPAVLNLSISLTSFATGIFMVAAGDIADKIGQLRMTYMGLIISMFASLLLIISDITALLIIGRILQGLSAAILLPSTVGVLNNQFKGEHLRRAISYLMISTVGGIGLAGVIGGLIATNFGWQTNFIISIVIAFIAILLLKGTPEKVSQHSHRHPFDYKGMSIFAVMIGSFTLLLTQGFEQGWFSTFSFICLSIFIITTLIFIIIERRHEVPFIDFSVLRNRPFIGAFLNNFVLNSGLGVTVVFFIYAQTHLGLSAAQSGLVTLPYAIVAVAMIRLGEKATLRFGGKLMLIIGPLFPVIGITIISMTQLSASQYVIAVIIGFVICAIGNGLVATPGLTIAIFSMPNEKVGLATGLYKMSGTLGGAFGIALSTTVFSMLQLNYAPSVAATVTFIVSIVLMILGSLSAYMIIPKTVKS >CP028470.1|AWQ24545.1|268725_269718_+|linear-amide-C-N-hydrolase MCTGFTIQTLNNQVLLGRTMDYDYPLDGSPAVTPRNYRWTSRTGTTGQTQYGFIGTGTDMEGFIYGDGVNEHGVAISTQYFRGYSSYGSTHKADAMNITQNEIVTWILGYTTSIEDMKQQASQIHVVAVYLNDIGEVPPLHYHVSDATGQSVEVSFKEGEVVIKDNPIGVLTNHPDLDWHYSNLRQYINISPYPATANLLEGVTIEPLGNEAGTFGLPGGFTSTERFVRMAFMKANIAQNNDKEMDLMNAFYLLDAVNIPIGIVRPHDADNHYTMYQTVINLTTRTLYIKYYGSNEIVALKLTDDLINRKDMTIFKPEKHITIRKLNDNQ >CP028470.1|AWQ24546.1|270043_270991_+|glycine-glycine-endopeptidase-LytM MKKLTAAAIATMGFATFTMAHQADAAETTNTQQAHTQMSAQSQDVSYGTYYTIDSNGDYHHTPDGNWNQAMFDNKEYSYTFVDAQGHTHYFYNCYPKNANANGSGQTYVNPATTGDNNDYTASQSQQHINQYGYQSNVGPDASYYSHSNNQAYNSHDGNGKVNYPNGTSNQNGGSASKATASGHAKDASWLTSRKQLQPYGQYHGGGAHYGVDYAMPENSPVYSLTDGTVVQAGWSNYGGGNQVTIKEANSNNYQWYMHNNRLTVSAGDKVKAGDQIAYSGSTGNSTAPHVHFQRMSGGIGNQYAVDPMSYLQSR >CP028470.1|AWQ24547.1|271042_271702_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIEINNLSKRYRNKQIFNHLTMSFDSNRLTVLLGDNGAGKSTLLRMIAGIEKANDGTINYFGEKWNQRQIQNHIGYVPQDIALFEHMTVAENIKFFKSLCKNPINDTTINEYLQQLNFDDTSAKVSTLSGGNKRKINILVGLLGKPRILILDEPTVGIDLKSRHDIHQLLNIMKSKCLIILTTHHLDEVEALADDIKLIGQDPFYQHVLEDKQWTYTYY |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP028470_2 | 606350-606437 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP028470_2
|
1 spacers
spacers of CP028470_2
>2.1|606380|28|CP028470|CRISPRCasFinder GGTGTGGGCCCCAACACAGAGAATTTCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP028470_2
The CRISPR arrays of CP028470_2 >merge|CP028470|2|606350-606437|CRISPRCasFinder AAAAGAAATTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTGTGGGCCCCAACACAGAGAATTTCAAAAAGAAATTCTACAGGCAATGTAAGTTGG >CP028470|2|2|606350-606437|CRISPRCasFinder AAAAGAAATTCTACAGGCAATGCAAGTTGG GGTGTGGGCCCCAACACAGAGAATTTCA AAAAGAAATTCTACAGGCAATGTAAGTTGG
>CP028470.1|AWQ24843.1|605259_606198_+|aldo/keto-reductase MKQFVNLGKSDVEVFPIALGTNAVGGHNLYPNLDEEQGKDVVRQAINHGINLLDTAYIYGPERSEELVGEVVKEYPREQIKIATKGSHEFDENQEVHQNNQPEYLKQQVENSLKRLQTDYIDLYYIHFPDDNTPKDQAVAALQELKEQGKIKAIGVSNFTLDQLKEANKDGYVDVVQLEYNLLHRENEAVLQYCVDHQITFIPYFPLASGILAGKYDENTKFSDHRTTRRDFKPGVFEENVRRVKALESIAAAHQTSIANIVLAFYLTRPAIDVIIPGAKLAEQVVENIKAADIVLSDDEIQYIDELFPIED >CP028470.1|AWQ24842.1|604179_604812_+|DUF443-domain-containing-protein MLCEVIAIYKNPKYRIIKYNDEYLMVNIINNWLVLFIPLLNWLTPKRYIKISQEELESLNTFKPAKNNAFWPALGSSVLFSVTFRKYMPLFNVRLEKTIVIAIFFVVFLGILFFYLNLNRRLALSVFTMNKEKSQKMILLPNLKHFFFIIFAYLYFGGFSFFTLYALITIDVQNIIIFICWGAVTMFFFFINIVPIGIKKAHVILLKKAE >CP028470.1|AWQ24841.1|603419_604040_+|DUF443-domain-containing-protein MLCESKIINKNPKYRIIKYNDEYLMIDIISTWISLFFPFINWFITKRYVKISREEFENLNIVKPAKKNVFWPVAGSSALLGVALRKYTHLLDVQLDKKLVIAICCITFIGILIFYVRLIKKSSLNIYNTKNKRSKIFLIPTLKNVCFTLFGYILFGGLTMLFLDALLSMSYQNIIVYFAWITAIMGFFLVNIALIIDKNIHVILKN >CP028470.1|AWQ24840.1|602737_603373_+|DUF443-domain-containing-protein MLLCESKVINKNPKYRIIKYESEYLMIDLASNWIVFFFPFINWLIPKTYVKITKNDYEKLNIVKPVKNKSIGWTIFAGIVLLGGTVRRNTYLFDFQLEKLIVWSSCFISFLGVIFFYCYLNKKLTLNVYKENKNNELKLRLLPSFKNMCFTIFYYLFTGFMSYGAFYLLVFENVQNLILYISWLFMTMLFMLMNMHSIIDKKVHIFLKSNK >CP028470.1|AWQ24839.1|601342_602737_+|transposase MSIDMYLDRSRNQASSVGNLSQTMNSNYDALEKAITQFINDDALKGKAYTSAKQFFSTVLIPLSTSMKTLSDLTKQACDNFVSRYTSEVDSISLKESELEEDIRSLSQQITRYENLTNNLKKHASDNQQAISSNQQIIQTLGQQKHELEEKLRKLREFNQKSPEIFKEVEEFQKIVQQGLTQAQNFWNFSTNQFNIPSGKELDWAKASHEKYLKVAMGKIEHKAEKETLNKADFAVIKAYAKEHPEDDIPKSIMKYINDNKDSIKRDIGLDITSTLLEQGGINASKFGVFINTAGGVKGPAGPNSFVEVKRTSGNVFIENGSKFAKGGKYLGKGVAGVGFGIGMYDDLANDDKTFGEALSHNGMTLAAGSVAAFGVAALVSNPVGWAVVGILTAGIIGSIVSDYLYQNNYFGIKDKVDWAGHKIDEGIDAVNKTAEKAVDSVGNTIGDATKSISNHINPMKWSW >CP028470.1|AWQ24838.1|600776_600878_+|hypothetical-protein MCQYLCLKSVELGVVIVMIYCLKVVALTVRLHN >CP028470.1|AWQ24837.1|600278_600719_-|Rrf2-family-transcriptional-regulator MNLEFNIAVHVLAFLTKHHSEKFNSSSLAELTCLNPVQLRRVTTQLVDLKMINTIRGKDGGYLANDQSADVSLATLYKHFVLEKKHHTRLFTGDEGSHCQIARNIATTMSHYQQDEQNIIINFYNGKTIKDVIEDIQKEDLCHENI >CP028470.1|AWQ24836.1|598969_600292_-|FAD-containing-oxidoreductase MKTYDLIVIGFGKAGKTLAKYAASTGQHVAVIEQSSKMYGGTCINIGCIPSKTLVHDGLEGKSFEASYNRKNDVVNALNNKNYHLLADDNNIDVLDFKAQFKSNTEVNLLDQHGDIADSITAPHIIINTGATSVIPNIKDLDQAKHVFDSTGLLNINYQPKHLVIVGGGYIALEFASMFANLGSKVTVLERGESFMPREDQDVVAHAITDLENKGIALHTNVETTELSSDDHHTTVRTNVGNFEADAVLLAIGRKPNTDLALENTDIELGDRGEIKVNAHLQTTVPHIYAAGDVKGGLQFTYISLDDYRIIKSALYGNQSRTTDNRGSVPYTVFIDPPLSRVGLTSKEAAAQHYDYTEHQLLVSAIPRHKINNDPRGLFKVVINNENNMILGATLYGKQSEELINIIKLAIDQNIPYTVLRDNIYTHPTMAESFNDLFNF >CP028470.1|AWQ24835.1|598576_598918_+|DUF1450-domain-containing-protein MKNTFLICDECQAVNIRTLQKKLEKLDPDAEIVIGCQSYCGPGRRKTFTFVNNRPLAALTEEELIEKVSQQLKKPRDSEEEERLRKRHEERKRRKEEQDRKLKEKLEKRKAQQ >CP028470.1|AWQ24834.1|597323_598400_+|phosphomevalonate-kinase MIQVKAPGKLYIAGEYAVTEPGYKSVLIALDRFVTATIEEADQYKGTIHSKALHHNPVTFSRDEDSIVISDPHAAKQLNYVVTAIEIFEQYAKSCDIAMKHFHLTIDSNLDDSNGHKYGLGSSAAVLVSVIKVLNEFYDMKLSNLYIYKLAVIANMKLQSLSSCGDIAVSVYSGWLAYSTFDHEWVKHQIEDTTVEEVLIKNWPGLHIEPLQAPENMEVLIGWTGSPASSPHFVSEVKRLKSDPSFYGDFLEDSHRCVEKLIHAFKTNNIKGVQKMVRQNRTIIQRMDKEATVDIETEKLKYLCDIAEKYHGASKTSGAGGGDCGITIINKDVDKEKIYDEWTKHGIKPLKFNIYHGQ >CP028470.1|AWQ24845.1|606695_607232_+|flavodoxin-family-protein MITVLFGGSRPNGNTAQLTKFALQDLEYQWIDVTQHQFKPIRDVRHTAETITSYDDDYLPILDKILASDTIIFASPVYWYSISAPLKAFIEHWSETLQDKRYPNFKAQMAEKDFRVILVGGDCPKIKAKPAITQMKYSLDFLGATLNGYIIGTAEKPGDIMKDNYALARATEWNSILQ >CP028470.1|AWQ24846.1|607400_607877_+|N-acetyltransferase MFKVRQATEKDVVQIRDVATKAWFNTYLNIYAATTVNHLLEASYNEHHLKKRLQEQLFLVVEEGNDIVGFANFIYGEELYLSAHYVKPESQHTGYGTALLNEGLSRFEDKFEGVYLEVDNKNEEAVAYYKEQGFTILRSYEPEMYGEKLDLALMYKAF >CP028470.1|AWQ24847.1|607916_609212_+|HD-domain-containing-protein MTNAYVDLKLVEEKVFKDPIHRYIHVEDQLIWDLIKTKEFQRLRRIRQLGTLYLSFHTAEHSRFGHSLGVYEIVRRLIDESFIGHDAWDNKDRPLALCAALLHDLGHGPFSHSFEKIFNTDHEAYTQAIITGDTEVNAVLRKVAPEFPREVAEVINKTHHNKLVISMISSQIDADRMDYLQRDAYFTGVSYGAFDMERILRLMRPSKDEVLIKESGMHAVENFIMSRYQMYWQIYFHPVSRGGEVLLNNCLKRAKQLYNEGYEFKLHPHDFIPFFEETVTIEQYVELDEAVVTYYLEKWTKEDDAILSDLASRFINRDLFKYIPFDGSIITISELQELFEAGGINPDYYFVSEAFSDLPYDYDRPGSNRKPIHLLRQDGTIREISNQSLVIHSITGINRQDYKLYYPREMVAKIKDKTIREAIENLINELN >CP028470.1|AWQ26927.1|609239_609761_+|hypothetical-protein MEVISLSEKKGFNFNIIKNDPLDGHKGTNIGSISLDNIAPVFIDVANKEAFIDIGGMHARAKVEKGVKWITDKAAVEGDEAKEYWLCWVTTERNEQGPYYAGLTACYLLVNKAIRRGYKSMPEHVNMMDKSMKHHIIIDQIGDENKAILKDFLMNHDEGMWKHSSDALHQAFN >CP028470.1|AWQ24848.1|610251_611487_+|IS21-family-transposase MRHDIYEGVLFYIMKGIKPNYAELGRQYNCDPRTVKKYYEAGKENELERLKKRQQNKKASKLDPFKEIINKKIELGCTAMAIFKYIEKKGYEGKYTILREYCKNKKQNETKKATIRVETNPGIAAQVDWKEDMVMHDKFGRTYQFNIFLYVLHYSKMKYITLTWDRKQDTLFECLKDAFEYTEGVPKEIWFDNMRTVVDRPRTQYKKVVFNNLFYQFSKDANFEPIACRPYRPQTKGSVESLAKFVEQRLRPYDYEFYDAVELIGLVNDLCHELNHLEISQATEQRPIDVFNYEEKEHLNSFNAKLLDTYIENECIRIVSKESMINFRKGKYSVPTKYIGEEVQVIFNNSTDELLIYYDGELIRRHNLSERKFNYIVEDMSEILKSDVFKHKDDKEILTYIENSLLLYDEI >CP028470.1|AWQ24849.1|611498_612266_+|AAA-family-ATPase MNTNHQKLLNNFEILKLKKFKDYYPNYIELLSKNEKSLTEILIDLTEKEIEYQSELKFKRAVNSARFPKIKYLHDFDFMFQPSINQQEILTLKSMHFLEDSINICFLGNSGVGKTHLAISLGIEACKQNIKTRFYTFKELIDLLTVSDSKGIINKTLKQLSRIELLIIDEIGYTPITKEQADLFYQLMSLRYEWKSTIITTNIPFSSWGESFSNKIVSAAIIDRLVHHSKVFKITGESYRLKDYKTEKSLNIRQS >CP028470.1|AWQ24850.1|612462_613473_+|zinc-dependent-alcohol-dehydrogenase MRAAVVTKDHKVSIEDKKIRALKPGEALVQTEYCGVCHTDLHVKNADFGDVTGVTLGHEGIGKVIEVAEDVESLKIGDRVSIAWMFESCGRCEYCTTGRETLCRSVKNAGYTVDGAMAEQVIVTADYAVKVPEKLDPAAASSITCAGVTTYKAVKVSNVKPGQWLGVFGIGGLGNLALQYAKNVMGAKIVAFDINDDKLAFAKELGADAIINSKDVDPVAEVMKLTDNKGLDATVVTSVAKTPFNQAVDVVKAGARVVAVGLPVDKMNLDIPRLVLDGIEVVGSLVGTRQDLREAFEFAAENKVTPKVQLRKLEEINDIFEEMENGTITGRMVIKF >CP028470.1|AWQ24851.1|613549_613657_+|hypothetical-protein MKDSENLVFFGFEVLFVFYKMAYIYEALIKYGIVN >CP028470.1|AWQ26928.1|613782_614166_+|DUF1934-domain-containing-protein MLKQHNEKEKFEFTTEGTWQQRQSNFIRYVEQIEDATVNVTIKVDDDSVKLIRKGDINMNLHFVEGQTTTTFYDISAGRIPLEVKTLRILHFVSGDGGKLKIHYELYQDNEKMGSYQYEINYKEIGE >CP028470.1|AWQ24852.1|614162_615824_+|arginine--tRNA-ligase MNIIDQVKQTLVEEIAASINKAGLADEIPDIKIEVPKDTKNGDYATNIAMVLTKIAKRNPREIAQAIVDNLDTEKAHVKQIDIAGPGFINFYLDNQYLTAIIPEAIEKGDQFGHVNESKGQNVLLEYVSANPTGDLHIGHARNAAVGDALANILTAAGYNVTREYYINDAGNQITNLARSIETRFFEALGDNSYSMPEDGYNGKDIIEIGKDLAEKHPEIKDYSEEARLKEFRKLGVEYEMAKLKNDLAEFNTHFDNWFSETSLYEKGEILEVLAKMKELGYTYEADGATWLRTTDFKDDKDRVLIKNDGTYTYFLPDIAYHFDKVKRGNDILIDLFGADHHGYINRLKASLETFGVDSNRLEIQIMQMVRLMENGKEVKMSKRTGNAITLREIMDEVGVDAARYFLTMRSPDSHFDFDMELAKEQSQDNPVYYAQYAHARICSILKQAKEQGIEVTAANDFTTITNEKAIELLKKVADFEPTIESAAEHRSAHRITNYIQDLASHFHKFYNAEKVLTDDIEKTKAHVAMIEAVRITLKNALAMVGVSAPESM |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP028470_3 | 890309-890393 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP028470_3
|
1 spacers
spacers of CP028470_3
>3.1|890336|31|CP028470|CRISPRCasFinder GCTCCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAATTTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP028470_3
The CRISPR arrays of CP028470_3 >merge|CP028470|3|890309-890393|CRISPRCasFinder TTTTCGAAATTCTCTGTGTTTGGGCCCGCTCCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAATTTCTTTTTGAAATTCTCTGTGTTTGGGCCC >CP028470|3|3|890309-890393|CRISPRCasFinder TTTTCGAAATTCTCTGTGTTTGGGCCC GCTCCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAATTTC TTTTTGAAATTCTCTGTGTTTGGGCCC
>CP028470.1|AWQ25119.1|889922_890231_+|metal-sulfur-cluster-assembly-factor MEEALKDSILGALEMVIDPELGIDIVNLGLVYKVNVDDEGVCTVDMTLTSMGCPMGPQIIDQVKTVLAEIPEIQDTEVNIVWSPPWTKDMMSRYAKIALGVS >CP028470.1|AWQ25118.1|888984_889809_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MQPHLICLDLDGTLLNDNKEISSYTKQVLNELQQRGHQIMIATGRPYRASQMYYHELNLTTPIVNFNGAYVHHPKDKNFKTCHEILDLGIAQNIIQGLQQYQVSNIIAEVKDYVFINNHDPRLFEGFSMGNPRIQTGNLLVHLKESPTSILIEAEESKIPEIKNMLTHFYADHIEHRRWGAPFPVIEIVKLGINKARGIEQVRQFLNIDRNNIIAFGDEDNDIEMIEYARHGVAMENGLQELKDVANNITFNNNEDGIGRYLNDFFNLNIRYYC >CP028470.1|AWQ25117.1|887616_888933_-|CoA-disulfide-reductase MPKIVVVGAVAGGATCASQIRRLDKESDIIIFEKDRDMSFANCALPYVIGEVVEDRKYALAYTPEKFYDRKQITVKTYHEVIAINDERQTVTVLNRKTNEQFEESYDKLILSPGASANSLGFESDITFTLRNLEDTDAIDQFIKANQVDKVLVVGAGYVSLEVLENLYERGLHPTLIHRSDKINKLMDTDMNQPILDELDKREIPYRLNEEIDAINGNEITFKSGKVEHYDMIIEGVGTHPNSKFIESSNIKLDRKGFIPVNDKFETNVPNIYAIGDIATSHYRHVDLTASVPLAWGAHRAASIVAEQIAGNDTIEFKGFLGNNIVKFFDYTFASVGVKPNELKQFDYKMVEVTQGAHANYYPGNSPLHLRVYYDTSNRQILRAAAVGKEGADKRIDVLSMAMMNQLTVDELTEFEVAYAPPYSHPKDLINMIGYKAK >CP028470.1|AWQ25116.1|887056_887446_+|hypothetical-protein MLHLHILSWVLAIILFIATYLNISKNQGGSPFFKPLHMILRLFMLLTLISGFWILIQSFMNGGANHMLLTLKMLCGVAVVGLMEVSIAKRKRHEQSHTMFWITIALIIITMVLGVILPLGPISKLFGIG >CP028470.1|AWQ25115.1|885829_886732_+|FAA-hydrolase-family-protein MKFLSFKYNDKTSYGVKVKREDAVWDLTQVFADFAEGDFHPKTLLAGLQQNHTLDFQEQVRKAVVAAEDSGKAEDYKISFNDIEFLPPVTPPNNVIAFGRNYKDHANELNHEVERLYVFTKAASSLTGDNATIPNHKDITDQLDYEGELGIVIGKSGEKIPKALALDYVYGYTIINDITDRKAQSEQDQAFLSKSLTGGCPMGPYIVTKDELPLPENVNIVTKVNNEIRQDGNTGEMILKIDELIEEISKYVALHPGDIIATGTPAGVGAGMQPPKFLQPGDEVKVTIDNIGTLTTYIAK >CP028470.1|AWQ25114.1|882012_885666_+|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddA MTIPEKPQGVIWTDAQWQSIYATGQDVLVAAAAGSGKTAVLVERIIQKILRDGIDVDRLLVVTFTNLSAREMKHRVDQRIQEASIADPANAHLKNQRIKIHQAQISTLHSFCLKLIQQHYDVLNIDPNFRTSSEAENILLLEQTIDEVIEQHYDILDPAFIELTEQLSSDRSDDQFRMIIKQLYFFSVANPNPTNWLDQLVTPYEEEAQQAQLIQLLTDLSKVFITAAYDALNKANDLFSMMDGVDKHLAVIEDERRLMGRVLEGGFIDIPYLTGHEFGARLPNVTAKIKEANEMMVDALEDAKLQYKKYKSLIDKVKSDYFSREADDLKADMQQLAPRVKYLARIVKDVMSEFNRKKRSKNILDFSDYEHFALQILTNEDGSPSEIAESYRQHFQEILVDEYQDTNRVQEKILSCIKTGAEHNGNLFMVGDVKQSIYKFRQADPSLFIEKYQRFTINGDGTGRRIDLSQNFRSRKEVLSTTNYIFKHMMDEQVGEVNYDESAQLYYGAPYDESDHPVNLKVLVEADQEHSDLTGSEQEAHFIVEQVKDILEHQKVYDMKTGSYRSATYKDIVILERSFGQARNLQQAFKNEDIPFHVNSREGYFEQTEVRLVLSFLRAIDNPLQDIYLVGLMRSVIYQFKEDELAQIRILSPNDDYFYQSIVNYINDEVADAILVDKLKMFLSDIQSYQQYSKDHPVYQLIDKFYNDHYVIQYFSGLIGGRGRRANLYGLFNKAIEFENSSFRGLYQFIRFIDELIERGKDFGEENVVGPNDNVVRMMTIHSSKGLEFPFVIYSGLSKDFNKRDLKQPVILNQQFGLGMDYFDVDKEMAFPSLASVAYKAVAEKELVSEEMRLVYVALTRAKEQLYLIGRVKNDKSLLELEQLSISGEHIAVNERLTSPNPFHLIYSILSKHQSASIPDDLKFEKDIAQVEDSSRPNVNISIIYFEDVSTETILDNNEYRSVNQLETMQNGNEDVKAQIKHQLDYQYPYVNDTKKPSKQSVSELKRQYETEESGTSYERVRQYRIGFSTYERPKFLSEQGKRKANEIGTLMHTVMQHLPFKKERISEVELHQYIDGLIDKHIIEADAKKDIRMDEIMTFINSELYSIIAEAEQVYRELPFVVNQALVDQLPQGDEDVSIIQGMIDLIFVKDGVHYFVDYKTDAFNRRRGMTDEEIGTQLKNKYKIQMKYYQNTLQTILNKEVKGYLYFFKFGTLQL >CP028470.1|AWQ25113.1|878535_882012_+|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddB MTLHAYLGRAGTGKSTKMLTEIKQKMKQDPLGDPIILIAPTQSTFQLEQAFVNDPELNGSLRTEVLHFERLSHRIFQEVGSYSEQKLSKAATEMMIYNIVQEQQKYLKLYQSQAKYYGFSEKLTEQIQDFKKYAVTPEHLEHFIADKNMQTRTKNKLEDIALIYREFEQRIQNEFITGEDSLQYFIDCMPKSEWLKRADIYIDGFHNFSTIEYLIIKGLIKYAKSVTIILTTDGNHDQFSLFRKPSEVLRHIEEIANELNISIERQYFKQLYRFNNQDLKHLEQEFDALQINRVACQGHINILESATMREEINEIARRIIVDIRDKQLRYQDIAILYRDESYAYLFDSILPLYNIPYNIDTKRSMTHHPVMEMIRSLIEVIQSNWQVNPMLRLLKTDVLTASYLKSAYLVDLLENFVLERGIYGKRWLDDELFNVEHFSKMGRKAHKLTEDERNTFKQVVKLKKDVIDKILHFEKQMSQAETVKDFATAFYESMEYFELPNQLMTERDELDLNGNHEKAEEIDQIWNGLIQILDDLVLVFGDEPMSMERFLEVFDIGLEQLEFVMIPQTLDQVSIGTMDLAKVDNKQHVYLVGMNDGTMPQPVTASSLITDEEKKYFEQQANVELSPTSDILQMDEAFVCYVAMTRAKGDVTFSYSLMGSSGDDKEISPFLNQIQSLFNQLEITNIPQYHEVNPLSLMQHAKQTKITLFEALRAWLDDEIVADSWLDAYQVIRDSDHLNQGLDYLMSALTFDNETVKLGETLSKDLYGKEINASVSRFEGYQQCPFKHYASHGLKLNERTKYELQNFDLGDIFHSVLKYISERINGDFKQLDLKKIRQLTNEALEQILPKVQFNLLNSSAYYRYLSRRIGAIVETTLSALKYQGTYSKFMPKHFETSFRRKPRTNDELIAQTLTTTQGIPINIRGQIDRIDTYTKNDTSFVNIIDYKSSEGSATLDLTKVYYGMQMQMMTYMDIVLQNKQRLGLTDIVKPGGLLYFHVHEPRIKFKSWADIDEDKLEQDLIKKFKLSGLVNADQTVIDALDIRLEPKFTSDIVPVGLNKDGSLSKRGSQVADEATIYKFIQHNKENFIETASNIMDGHTEVAPLKYKQKLPCAFCSYQSVCHVDGMIDSKRYRTVDETINPIEAIQNININDEFGGEQ >CP028470.1|AWQ25112.1|877800_878376_+|signal-peptidase-I MKKELLEWIISIAVAFVILFIVGKFIVTPYMIKGESMDPTLKDGERVAVNIIGYKTGGLEKGNVVVFHANKNDDYVKRVIGVPGDKVEYKNDTLYVNGKKQDEPYLNYNLKHKQGDYITGTFQVKDLPNANPKSNVIPKGKYLVLGDNREVSKDSRAFGLIDEDQIVGKVSFRFWPFSEFKHNFNPENTKN >CP028470.1|AWQ25111.1|877260_877785_+|signal-peptidase-I MKKVVKYLISLILAIIIVLFVQTFVIVGHVIPNNDMSPTLNKGDRVIVNKIKVTFNQLNNGDIITYRRGNEIYTSRIIAKPGQSMAFRQGQLYRDDRPVDASYAKNRKIKDFSLRNFKELDGDIIPPNNFVVLNDYDNNQHDSRQFGLIDKKDIIGNISLRYYPFSKWTIQFKS >CP028470.1|AWQ25110.1|876680_877256_+|TVP38/TMEM64-family-protein MSFHQVEEWFEIFRQFGYLPGFILLYIRAIIPVFPLALYILINIQAYGPILGILISWLGLISGTFTVYLICKRWVNTERMQRIKQRTAVQRLISFIDRQGLIPLFILLCFPFTPNTLINFVASLSHIRPKYYFIVLASSKLVSTIILGYLGKEITTILTQPLRGILMLVVLVVFWIVGKKLEQHFMGSKKE >CP028470.1|AWQ25120.1|890885_892700_+|acyltransferase MNKTKGFTKYKKMRYMPGLDGLRAIAVLGIIIYHLNKQWLTGGFLGVDTFFVISGYLITSLLLKEYDDTGIIKLKSFWIRRLKRLLPAVIVLLMVVGTATLLLKSDNIIRVKHDIIAAIFYVSNWWYIAKDVNYFEQFSFMPLKHLWSLAIEEQFYIFFPVILVTLLLTIKKRYKIGFIFWGVSIISLGLMMFIYSINGDHSRVYFGTDTRLQTLLLGVILAFLWPPFKLKNDPPKVVKYVIDSIGSLSFIILILLFFIINDETNWIYDGGFYLISILTLFIIASVVHPSTWIAKIFSNPVLVFIGKRSYSLYLWHFAVISFVHSYYVDGQIPVYVYFIDISLTIIFAELSYRFIETPFRKEGIKALNWRPSYIPQFIRMAIVVTLLIPFMLILVGAFNKYGKDIIGEKANSFDTTIEDNYLMRIAPIDNIHIDGLVSEKKKESSDVYNNIKPLLIGDSVMVDIGESFKSSVPKSRIDGKVGRQLYQTLPLVKANYSQYKKSSDQVVLELGTNGDFTVKQLDDLLNQFGKAKIYLVNTRVPRIYEANVNRLLADAAKRKSNVTLIDWYKRSQGHSEYFAPDGVHLEYKGVLALKDEILKALKKK >CP028470.1|AWQ25121.1|892903_895513_+|chaperone-protein-ClpB MDINKMTYAVQSALQQAVELSQQHKLQNIEIEAILSAALNESESLYKSILERANIEVDQLNKAYEDKLNTYASVEGDNIQYGQYISQQANQLITKAESYMKEYEDEYISMEHILRSAMDIDQTTKHYINNKVEVIKEIIKKVRGGNHVTSQNPEVNYEALAKYGRDLVEEVRQGKMDPVIGRDEEIRNTIRILSRKTKNNPVLIGEPGVGKTAIVEGLAQRIVKKDVPESLLDKTVFELDLSALVAGAKYRGEFEERLKAVLKEVKESDGRIILFIDEIHMLVGAGKTDGAMDAGNMLKPMLARGELHCIGATTLNEYREYIEKDSALERRFQKVAVSEPDVEDTISILRGLKERYEVYHGVRIQDRALVAAAELSDRYITDRFLPDKAIDLVDQACATIRTEMGSNPTELDQVNRRVMQLEIEESALKNESDNASKQRLQELQEELANEKEKQAALQSRVESEKEKIANLQEKRAQLDESRQALEDAQTNNNLEKAAELQYGTIPQLEKELRELEDNFQDEQGEDTDRMIREVVTDEEIGDIVSQWTGIPVSKLVETEREKLLHLSDILHKRVVGQDKAVDLVSDAVVRARAGIKDPNRPIGSFLFLGPTGVGKTELAKSLAASLFDSEKHMIRIDMSEYMEKHAVSRLIGAPPGYIGHDEGGQLTEAVRRNPYSVILLDEVEKAHTDVFNVLLQILDEGRLTDSKGRSVDFKNTIIIMTSNIGSQVLLENVKETGEITESTEKAVMTSLNAYFKPEILNRMDDIVLFKPLSIDDMSMIVDKILTQLNIRLLEQRISIEVSDDAKAWLGQEAYEPQYGARPLKRFVQRQIETPLARMMIKEGFPEGTTIKVNLNSDNNLTFNVEKIHE >CP028470.1|AWQ25122.1|895571_896441_-|LysR-family-transcriptional-regulator MNLDWYYTFVILAKTLNYRLASEEINLTIPSIHKQIKNLEQHLNVKLFETYKNQIILTEDGHTFLPIAQSFIEQYESGIKHIQLKKTMFQSKLNVVVSSYIATFIMPKFLKSFFNEHPFIDVSLHVKNENIEKDINNHTYDIGISRNQPKLREVHSEKVCEGKIVLIAPNKENNHLLTEASLFEKYKIISDNHPEYWSSLKNNILNIYEKAQFLSINDVHTSIKLIEMNQGISFLPIYITTDSDYNISVINTKILQAPISFTYIYSKKESPEILAFIRSFKKYIANEQL >CP028470.1|AWQ25123.1|896550_897696_+|2-isopropylmalate-synthase MIRIQDNTIRDGMQQSNVRKSIIVKKEVLQEINKISINSVEVGMCTTFEDEYNIHQYREILNNDKEIVVLTRLDENEINKILNLKIHNLAVKILLPISDLHIKEKLNFTSEYYNERINKCLNMIKVNQVAIDICFEDATRCSLEKLCEYMEMISKFPIRTVTFADTVGCSTPFEYGNIFKEFVKKYPNITFSAHCHNDLGLATANTFAAILNGAQQIETTFLGIGERAGNASIEEIIAILTKKQIVMTSLNLPDIYKTSMNISKILDIRLAENKPVIGKNIFKHESGIHQDGTNKNISMYQYILPSDLGLKNSKAVQFPISNISSKKILKNKFKSIVHPKDIEENISFYKLINKFIPEVVPEDTADLLQVIKGRSKDGNFK >CP028470.1|AWQ25124.1|897679_898321_+|Sua5/YciO/YrdC/YwlC-family-protein MEILNESVESFEKLYLQLQNSYPIIVPTDTNYNLCSLSNNKICIDRIFKYKKRSKDKPLSLFIDEPEDWKLYGENKNVELVDKLVNIFWPGPLNIILKNKTNYNYMLNNSDSIAIGCVQNKTMRNLISYIQSPIAITSANISGTADDILITENEAIKHMGNNVNYMLRSKNKSKYKSSSTIIKVTGNKIELLREGDIKFEEIKAKLGSGIQYE >CP028470.1|AWQ25125.1|898313_899435_+|MFS-transporter MNKLILGIYLYRILSRAYFYLPFLLIYFLAQNYSIMQLEILMATYGVAAFLFGLYKEKIFRIYQIKDAYKLIVSEVFKIIGLILLLYPSHFYILLVAQLLLGLSYSIMAGVDTSIIKMNIKNHKLIQNKSNGYMFLSLLISGIIGSYLYGINIKWPIYMTGLFSILTILVILLTLVENVDCNIKSESKRKRKKLLADEKFWVLHYSFLRALILGFFVGFIPINLYIDLKLNNVQFISVLTSYTIMGYISSRYLTRYLNYKFLSEICLVIFLIIYTFQNIIAITIAILFLGISSGLTRPQTINELSNSSNLAAILNYAETLYFIFNIAFLLIGGYLYSIGTIQYLMLFMSLLTFIYLLTLFYLRRDQHENQHRI >CP028470.1|AWQ25126.1|899412_899928_+|YbhB/YbcL-family-Raf-kinase-inhibitor-like-protein MKINTEFKGNNIPYEYAAGADISDLINGNPIKSFPFEITELPKDTKYLAWSLIDYDAIPVCGFAWIHWSVANVSVTRDSISIKPDLSRTKGDYVQGKNSFTSGLLADDFSEIENHYVGPTPPDQDHQYELTVYALDHSLNLKNGFYLNEFLKEVNQHKIDQTSINLIGRKI >CP028470.1|AWQ25127.1|900238_900673_+|MAP-domain-containing-protein MKLKSFITVTLALGMIATTGATVASNEVSAAEKDKQPATQKAKEMQNVPYTIAVDGIMAFNQSYLNLPKDSQLSYLDLGNKVKALLYDERGVTPEKIRNAKSAVYTITWKDSSKKEVDLKKDSYTANLFDSNSIKQIDINVKTK >CP028470.1|AWQ25128.1|900929_901115_-|DUF2929-domain-containing-protein MKHLVTFFWALLLMQMVNFVLNSLVGGDSLNLVNPIIMAVLFTIFTAIFAAVIKPPKDSSQ >CP028470.1|AWQ25129.1|901409_902351_+|3-oxoacyl-ACP-synthase-III MNVGIKGFGAYAPEKIIDNAYFEQFLDTSDEWISKMTGIKERHWADDDQDTSDLAYEASVKAIADAGIQPEDIDMIIVATATGDMPFPTVANMLQERLGTGKVASMDQLAACSGFMYSMITAKQYVQSGDYHNILVVGADKLSKITDLTDRSTAVLFGDGAGAVIIGEVSEGRGIISYEMGSDGTGGKHLYLDKDTGKLKMNGREVFKFAVRIMGDASTRVVEKANLTSDDIDLFIPHQANIRIMESARERLGISKDKMSVSVNKYGNTSAASIPLSIDQELKNGKLKDDDTIVLVGFGGGLTWGAMTIKWGK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP028470_4 | 1897690-1897779 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP028470_4
|
1 spacers
spacers of CP028470_4
>4.1|1897722|26|CP028470|CRISPRCasFinder CGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCACA |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP028470_4
The CRISPR arrays of CP028470_4 >merge|CP028470|4|1897690-1897779|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTT >CP028470|4|4|1897690-1897779|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTT CGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCACA CCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTT
>CP028470.1|AWQ26043.1|1896797_1897556_-|methionine-aminopeptidase MIVKTEEELQALKEIGYICAKVRNTMQAATKPGITTKELDNIAKELFEEYGAISAPIHDENFPGQTCISVNEEVAHGIPSKRVIREGDLVNIDVSALKNGYYADTGISFVVGESDDPMKQKVCDVATMAFENAIAKVKPGTKLSNIGKAVHNTARQNDLKVIKNLTGHGVGLSLHEAPAHVLNYFDPKDKTLLTEGMVLAIEPFISSNASFVTEGKNEWAFETSDKSFVAQIEHTVIVTKDGPILTTKIEEE >CP028470.1|AWQ26042.1|1896194_1896581_-|hypothetical-protein MNYVERYIEQFLRATVRNNIKHYLLMLDEKMKNLDDYMRYLITKKEQLSKLIDSLMLTLENKYIDIAEAFQIQCAREINNQEIENIKSELNKVEAYYAQIETQIQQTSTEKIATEKTSYLINYMNAVA >CP028470.1|AWQ26041.1|1895478_1896180_-|transporter MTHKYISTQMLIIFTALMIIANFYYIFFEKIGFLLVLLLGCVLVYVGYLYFHKIRGLLAFWIGALLIAFTLLSNKYTIIILFVFLLLLIVRYLIHKFKPKKVVATDEVMTSPSFIKQKWFGEQRTPVYVYKWEDVQIQHGIGDLHIDLTKAANIKENNTIVVRHILGKVQVILPVNYNINLHVAAFYGSTYVNEKSYKVENNNIHIEEMMKPDNYTVNIYVSTFIGDVEVIYR >CP028470.1|AWQ26040.1|1894438_1895482_-|two-component-sensor-histidine-kinase MNHYIRTIGSMLILVYSMLAAFLFIDKVFVNIIYFQGMFYTQIFGIPVFLFLNLIIILLCIIVGSVLAYKINQQNDWIKTQIERSMEGETVGINDQNIEIYSETLDLYHTLVPLNQELHKLRLKTQNLTNENYNINDVKVKKIIEDERQRLARELHDSVSQQLFAASMMLSAIKETKLEPPLDQQIPILEKMVQDSQLEMRALLLHLRPLGLKDKSLGEGIKDLVIDLQKKVPMKVVHEIQDFKVPKGIEDHLFRITQEAISNTLRHSNGTKVTVELFNKDDYLLLRIQDNGKGFNVDEKLEQSYGLKNMRERALEIGATFHIVSLPDSGIRIEVKAPLNKEDSYDD >CP028470.1|AWQ26039.1|1893819_1894449_-|DNA-binding-response-regulator MTIKVLFVDDHEMVRIGISSYLSTQSDIEVVGEGASGKEAIAKAHELKPDLILMDLLMEDMDGVEATTQIKKDLPQIKVLMLTSFIEDKEVYRALDAGVDSYILKTTSAKDIADAVRKTSRGESVFEPEVLVKMRNRMKKRAELYEMLTEREMEILLLIAKGYSNQEIASASHITIKTVKTHVSNILSKLEVQDRTQAVIYAFQHNLIQ >CP028470.1|AWQ26038.1|1892489_1893707_+|YihY/virulence-factor-BrkB-family-protein MSKKDHSSSKYLNSVKEAQEESKKKNKSNPKIDVDRTYIEPQQFQSKKPKKDDQVFFLSRLNKPAKYKKDSNFLSYLIYRIGKDDASGLAAQMTYHFVLAMFPMLLFLLTLLPFFNIKQSQITNMLSNAPAETSTLIKSVIGDITQNSSGGLLSIGLILAIWSASNGMTAIMNSFNVAYDVEDSRNGIVLKLLSVVFTVVMGVVFVVALALPTLGSVISHFLFGPLGFDEQVKWIFNLIRIVLPIIIIFIIFIVLYSVAPNVKTKLKSVLPGAVFTSIIWLAGSFGFGWYISNFGNYSKTYGSIAGIIILLLWLYITSFIIIVGAEINAIIHQRSVIKGKTPEEAALEHDDNNKNHYNENTRYEYDEDSNATHQRTYHVDEHPSDTYPEDDKNIKDKIVDKLKKD >CP028470.1|AWQ26037.1|1891936_1892212_+|hypothetical-protein MENKFVPGILIGAVIGGAISLADKSTRQALVQSVKDAKNGNRTRKPSKVSKIKDEVLYWKDVVEEIRRNNPELERSLKDAKETFVNRKNQR >CP028470.1|AWQ26036.1|1891465_1891930_+|protein-tyrosine-phosphatase MVDVAFVCLGNICRSPMAEAIMRQRLKDRNIHDIKVHSRGTGSWNLGEPPHEGTQKILNKHNIPFDGMISELFEATDDFDYIVAMDQSNVDNIKSINPNLKGQLFKLLEFSNMEESDVPDPYYTNNFEGVYDMVLSSCDNLIDYIVKDANLKEG >CP028470.1|AWQ26968.1|1891118_1891319_-|DUF1128-domain-containing-protein MTNEEKVLAIREKLNIVNQGLLDPEKYKNANEEELTDIYDFVQSRERLSPSEVTAIADALGQLRHD >CP028470.1|AWQ26035.1|1889859_1891116_-|aminopeptidase MGILTNYKEKLQQYAELLVKVGMNVQPKQPVFIRSSVETLELTHLIVEEAYHCGASDVRVVYSDPTLKRLKFENESVEHFANHELKSYDVEARMDYVKRGAANLALISEDPDLMDGIDSQKLQAFQQQNARAFKGYMESVQKNQFPWVVAAFPSKAWAKRVYPELSVEEAYIKFIDEVFDIVRIDGNDPVENWRQHIANLSVYAQKLQQKNYHALHYVSEGTDLTVGLAKNHIWEDATSYVNGKEQAFIANIPTEEVFTAPDRNRVDGYVTNKLPLSYNGTIIDQFKLMFKDGEIIDFSAEKGETVLKDLINTDEGSRRLGEVALVPDDSPISNRNTIFYNTLFDENAACHLAIGSAYAFNIQGGTEMTVEEKIASGLNDSNVHVDFMIGSSDLTIYGIFEDGSKELVFENGNWASTF >CP028470.1|AWQ26044.1|1898084_1899071_+|aromatic-acid-exporter-family-protein MNDQWYKHLIGARTIKTGIAIFLTAVFCMALDLTPIYAILTAVVTIEPTAKASLIKGYRRLPATVIGAGFAVLFTYLFGDQSPFTYALSATFTILFCTKLKLQVGTNVAVLTSLAMIPGIHDAYIFNFLSRTLTAIIGLVTSGLINFMVFPPKYYGQVEEKLSKTDALMYKLFYNRCQELILSRLQSDKSEKAYKNIFNLNNQVETLISYQRDELSYHKKKECDWKLLNQLTKRAYTNRLFITHLSNIIYLPKNTRVNFSGDEKMALLKISSSIKDIFYDGSFKREDDSVETLRSTIKALEISGENQIKSHILYEVLMIYRLLDSRYA >CP028470.1|AWQ26969.1|1899501_1899915_-|hypothetical-protein MKPTKVILRDASYLHSKTSITFILKDVVIEEDNKIYYFDTSATFEDQEVKFEFALFDSDMDNLKHMDYDNPVTEIYFIEPDLHFTIIDFNQELLCIYIDFDSGLRHSNMATESGISLRINVAKSDFTKFINELASLH >CP028470.1|AWQ26045.1|1899943_1900054_-|hypothetical-protein MDGNNQIDVCFFVLVNNYYTMSIYPRIINSNGDYAT >CP028470.1|AWQ26046.1|1900139_1900871_-|glutamine-amidotransferase MHELTIYHFMSDKLNLYSDIGNIIALRQRAKKRNIKVNVVEINETEGITFDECDIFFIGGGSDREQALATKELSKIKTPLKEAIEDGMPGLTICGGYQFLGKKYITPDGTELEGLGILDFYTESKTNRLTGDIVIESDTFGTIVGFENHGGRTYHDFGTLGHVTFGYGNNDEDKKEGIHYKNLLGTYLHGPILPKNYEITDYLLEKACERKGIPFEPKEIDNEAEIQAKQVLIDRANRQKKSR >CP028470.1|AWQ26047.1|1900872_1902186_-|DUF1727-domain-containing-protein MRQWTAIHLAKLARKASRAVGKRGTDLPGQIARKVDTDILRKLAEQVDDIVFISGTNGKTTTSNLIGHTLKANNIQIIHNNEGANMAAGITSAFIMQSTPKTKIAVIEIDEGSIPRVLKEVTPSMMVFTNFFRDQMDRFGEIDIMVNNIAETISNKGIKLLLNADDPFVSRLKIASDTIVYYGMKAHAHEFEQSTMNESRYCPNCGRLLQYDYIHYNQIGHYHCQCGFKREQAKYEISSFDVAPFLHLNINDEKYDMKIAGDFNAYNALAAYSVLRELGLNEQTIKNGFETYTSDNGRMQYFKKERKEAMINLAKNPAGMNASLSVGEQLEGEKVYVISLNDNAADGRDTSWIYDADFEKLSKQQIEAIIVTGTRAEELQLRLKLAEVEVPIIVERDIYKATAKTMDYKGFTVAIPNYTSLAPMLEQLNRSFEGGQS >CP028470.1|AWQ26048.1|1902477_1902978_+|non-heme-ferritin MLSKNLLEALNDQMNHEYFAAHAYMAMAAYCDKESYEGFANFFIQQAKEERFHGQKIYNYINDRGAHAEFRAVSAPKIDFSSILETFKDSLSQEQEVTRRFYNLSEIARQDKDYATISFLNWFLDEQVEEESMFETHINYLTRIGDDSNALYLYEKELGARTFDEE >CP028470.1|AWQ26049.1|1903059_1903152_-|hypothetical-protein MTKNTIISLENEKTQINDSENESSDLRKAK >CP028470.1|AWQ26050.1|1903367_1903922_+|DNA-polymerase-III-subunit-epsilon MIQDAFVALDFETANGKRTSICSVGMVKVIDSQITETFHTLVNPQDYFSQQNIKVHGIQPEDVENAPTFDYVFPYMMQFIADLPVVAHNAAFDMNVLHQSIQNIGLPTPNLTYFCSYQLAKRTVDSYRYGLKHMMEFYQLDFHGHHDALNDAKACAMITFRLLKNYENLTYVTNIYGKNLKDKG >CP028470.1|AWQ26051.1|1903989_1905060_-|DNA-polymerase-IV MTERRIIHIDMDYFFAQVEMRDNPKLKGKPVIVGGKASSRGVVSTASYEARKYGVHSAMPMSQAHKLCPNGYFVTSNFGAYRETSAQIMSIFRSYTDKVEPMSLDEAYLDITELVRPDLPASKIAQYIRKDILEQTHLTASAGVSYNKFLAKLASGMNKPDGLTVIDYQNVHDILMTLDIGDFPGVGKASKKVMHDNGIFNGRDLYEKTEFELIRLFGKRGRGLYNKARGIDHSEVKSSRVRKSVGTERTFATDVNDDEEILRKVWELSGKTAERLNKLQKSAKTVTVKIKTYQFETLSKQMSLRDSVSSEEDIYNIAYLLYNDLKDPDVPIRLIGVTVGNLEQSTYKNMTIYDFI >CP028470.1|AWQ26052.1|1905306_1905837_-|DUF3267-domain-containing-protein MHKIDLTTNNFQMRRFIILQLVIALFVILFTYKWALGVTAVVDQNIIINLVYGFAGFIILLILHELIHRALFLLFKKDSKPMFNIKKDRILFQTADACFNKWQFSIIMLSPLFLLSTGLLILIKVFGYSSLIFMFSMHTAYCFIDILLVALTISSSFKYVQQDEDSIYLYHQKPTQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP028470_5 | 2020515-2020603 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP028470_5
|
1 spacers
spacers of CP028470_5
>5.1|2020538|43|CP028470|CRISPRCasFinder ATTTATAACTTTATTATACATAATCGTTTTTCTTTTGCAATAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP028470_5
The CRISPR arrays of CP028470_5 >merge|CP028470|5|2020515-2020603|CRISPRCasFinder GTTTTTGACTGACTTCTCAATCAATTTATAACTTTATTATACATAATCGTTTTTCTTTTGCAATAGTTTTTCGACTGACTTCTCAATCA >CP028470|5|5|2020515-2020603|CRISPRCasFinder GTTTTTGACTGACTTCTCAATCA ATTTATAACTTTATTATACATAATCGTTTTTCTTTTGCAATAG TTTTTCGACTGACTTCTCAATCA
>CP028470.1|AWQ26190.1|2020278_2020497_-|XRE-family-transcriptional-regulator MTILANTRKFKEAMFLKGFNLSDLSRETGVGISYLSQIINGKKIPSPKLAKKMAEVLQVEVNELFEFEVKEA >CP028470.1|AWQ26189.1|2019956_2020274_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MFNINIDEDEARELLEQAINARVDELAKEKYFMTYKELSNYLNLSKPTIEELLINNGMKYYMVGSTYRFKKSDVDEFMEQLTAHMNIQNNDFKQVNIKKLLEARQ >CP028470.1|AWQ26188.1|2019804_2019960_-|pathogenicity-island-protein MKIYLTYICLVSLLTILLLAISNMYVAFSVYAWLITLGCNLTGEITTCENK >CP028470.1|AWQ26187.1|2019616_2019820_-|pathogenicity-island-protein MRKQVIITKTVVGWYNIKDTQHNLMLNIPPKVFEQYFPDVSKDVQVVCLEMDLSKITEIKNKKKVGS >CP028470.1|AWQ26186.1|2019231_2019615_-|pathogenicity-island-protein MEIKQKYQLSKVVKILEVVLYEEDKFQSDKDYHYQDKALYEYALKLVHNGLFNILAELDFEDEAFLILDEVTMTLSDVMKETQHVYRYSVIDEKGEHKHTTDRKGHVIGMLEWALDYIAGNIEVEEL >CP028470.1|AWQ26185.1|2018913_2019231_-|DUF1474-domain-containing-protein MNWEIKDLMCDIEAVKEKINDVAIKHAWFVEDRFVKNELETKREHINFSASYLEHRIQNEHTVELLHVYLKEFGELIQKFHEIEKASSENFGEVSDDAQKLKITE >CP028470.1|AWQ26184.1|2017980_2018850_-|mobile-element-associated-protein MNEIKLEYDTHVSVVHYESLDSRSFNSFSKINWSKLVNKLSVPIEANYKYARGVAVYGDIKNGANDQGEIIKKHRNDKNVIYRDVIVLDYDEINDLKQLHEAISSALSNVAWFWHTSYSHRTEQARIRLYIPLNERISADDYRKYTKVLANKIGHKVDEGSYQPSRCFALPVIQKGHIFIKRVNDCPIMNVDMLEQWSKEFEQSNASPNVIGYTRRDSEYWRELCFGTTEGNRNNALASLIGHLLRCHVNDYIVYSFALLWGQFACKPPMKEQEINATFQSILNKHYNN >CP028470.1|AWQ26183.1|2016257_2017967_-|DUF927-domain-containing-protein METGKSDVLDKIEKINKKDSALQEIIPKGYEIEHHQCGIALNQLIPSKKEGEPDKKVFITSTIPQITERFEDIESNEVSFNMLFYDNKTPVNIAVSAEEISDSRQLLKLVNKKLDVTSSTSTKLVDYINASKRYNPPLNVKVATRLGHVKGYFIYPYQEVMKDSNIKLFSNDKGFQKLIDSFQSKGTLEGYSKKVFGQIKDLPMVMVMLYASLGSVLLREFGLQPFIVEISGSTSTGKTFTLNLVSSVWGTSDLITTWSSTQNSIESMASFLNSFPMFKDDTRNTHPKFVTSATYNFSSGESKSRSNINLTLNAKKEWRNILISTGESSIANMADEKAGVSARVVTLQDPPYPDNFDFTTLDKSFRENYGTLGLAFIKQYESKKDVYKNAFESYQRYFNQKGSNEIMQRLGRAFALLQVTGEVLNDIDGFEHDHFKIIEQAYDSMVKNNKTIDKPKQLLEELLQYLDANRNNIAGDGYSSVKNGDIKAIYKRDYLCILGQTVHDKLGHEMQTITGQWGKKGYLIKGEKDRLQKKVSHKNIKYRGFAINKEMLEELGFDFSNSHNPYSDY >CP028470.1|AWQ26182.1|2015565_2015946_-|hypothetical-protein MDKEQLKKYIYDYVKEYKEIPIYQLEDLFKEMNHDYIGRTSVTHDKDENIVFWSGWNKITMFALIELVKSEQLDLVYRGSFVMRYLLDGRVPNLPLAICYPEDGQQTDVPSWVPMVLRINKEEKIK >CP028470.1|AWQ26181.1|2014927_2015569_-|pathogenicity-island-protein MNIETIVNQFETRAGTLLRYYTGLLEHSKVQPCCFKLYNDPFDMAYVMMNGKLFGHVYIKDCKVRQSFELASPKHTEGLIRSIEGHYVGYELHDGKQLSISDMMASQLFEDEYFMYGLQTYAESNNSDVFEYLENGFDTDTLEGIQSSNTDVIANIEMLYQLATGINEPAPELVEGLRLVTEFVQDENATQEDYKALEHKLTELKSSYYSLNK >CP028470.1|AWQ26191.1|2020669_2021344_+|XRE-family-transcriptional-regulator MIRNRLSELLSERGLKISRVAKDVKIARSSLTSMAQNDSEMIRYDAIDKLCSYLHISPSEFFEHNPINFDFTFDEEPNYKINDVFEGFEVTANITHAFSIENFDFEILVDVELDNRQKLNFDLDVSYKETEKITNSQHRFIFTIKNEDENIGLKKYVDSLSAGLKNLLFKKINQKLSGYVSEIIVKNIDDIEELFPNKGEKSTTLHKEILQTDSRLSSDIFKEY >CP028470.1|AWQ26192.1|2021357_2022530_+|site-specific-integrase MASYEKRGNTWRYRISLGKDAETGKYKYISNSGFKRKSDAKHHAEMVERQLRNGDYIAPSTSTFKQVADDWISQYANEVKVSSVRAREKAINHAIERFNNKPIQTINKHEYQRFVNDISAQYSKNYVDSIIASTNMIFKYAYDMKLIRIMPSEGIKRPKKKISVEELEDTEIHKKFLEKDELFQFLEVAKNHHSPQNSFEVFCTLAYTGMRAGELLALKWSDIDFENNTINITKTYYNPNNNKKQFQILTPKTESSIGKISVDPHVIKLLKNYKTDVQDTWKNELYVDNNFVFTDVNGYPLVIKKLQLWIKAILKKTDITNKQISTHSFRHTHCALLIEAGVHIKEIQERLRHKDINTTMNIYAKITNSYKKDASQKFSKLMENVSKDLF >CP028470.1|AWQ26193.1|2022598_2024215_-|molecular-chaperone-GroEL MVKQLKFSEDARQAMLRGVDQLANAVKVTIGPKGRNVVLDKEFTAPLITNDGVTIAKEIELEDPYENMGAKLVQEVANKTNEIAGDGTTTATVLAQAMIQEGLKNVTSGANPVGLRQGIDKAVKVAVEALHENSQKVENKNEIAQVGAISAADEEIGRYISEAMEKVGNDGVITIEESNGLNTELEVVEGMQFDRGYQSPYMVTDSDKMVAELERPYILVTDKKISSFQDILPLLEQVVQSNRPILIVADEVEGDALTNIVLNRMRGTFTAVAVKAPGFGDRRKAMLEDLAILTGAQVITDDLGLDLKDASIDMLGTASKVEVTKDNTTVVDGDGDENSIDSRVSQLKSQIEETESDFDREKLQERLAKLAGGVAVIKVGAASETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTALVNVYQKVSEIEAEGDIETGVNIVLKALTAPVRQIAENAGLEGSVIVERLKNAEPGVGFNAATNEWVNMLEAGIVDPTKVTRSALQHAASVAAMFLTTEAVVASIPEKNNDQPNMGGMPGMM >CP028470.1|AWQ26194.1|2024290_2024575_-|co-chaperone-GroES MLKPIGNRVIIEKKEQEQTTKSGIVLTDSAKEKSNEGVIVAVGTGRLLNDGTRVTPEVKEGDRVVFQQYAGTEVKRDNETYLVLNEEDILAVIE >CP028470.1|AWQ26195.1|2024751_2025495_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MTRLWASLLTVIIYLLSQFLPAVIVNTTQFAQYSDLEQLKAGIYIQLVLFLIAATTIIFINFKIKDPTRLESEVKEPNKYIIPWALLGFALVMVYQFIVSIVLTQIYGGQQVSPNTEKIIIIARKIPIFIFFVSIIGPLLEEYVFRKVIFGELFNAIKGSRIVAFIIATTVSSLIFALAHNDFKFIPVYFGMGVIFSLAYVWTKRIAVPIIIHMLQNGFVVIFQLLNPEALKKATEQANFIYHIFIP >CP028470.1|AWQ26196.1|2025519_2026779_-|hypothetical-protein MSYHWFKKMLLSTSILILSSSSLGLATHTVEAKDNLNGEKPTTNLNHNITSPSVNSEMNNNETGTPHKSNQTGNEETGSNSRDANPDSNNVKPDSNNQNPSPDSKPDSNNQNPSPNPKPNPDNPKPKPDPKPDPDKPKPNPDPKPDPDNPKPNPDPKPDPDKPKPNPDPKPDPDKPKPNPNPKPDPNKPNPNPSPDPDQPGDSNHSGGSKNGGTWNPNASDGSNQGQWQPNGNQGNSQNTTGNDFVSQRFLALANGAYKYNPYILNQINKLGKDYGEVTDEDIYNIIRKQNFSGNAYLNGLQQQSNYFRFQYFNPLKSERYYRNLDEQVLALITGEIGSMPDLKKPEDKPDSKHRSFEPHEKDDFTVVKKQEDNKKSASTAYSKSWLAIVCSMMVVFSIMLFLFVKRNKKKNKNESQRR >CP028470.1|AWQ26197.1|2026975_2027602_+|nitroreductase-family-protein MGLFKKDKKAMTFDNAMEERRSIYNLKDSISISDDELESMIAHAVKHVPSSFNSQSTRIVLLLNDNNNKFWDNTKAILKEVMGENRDFEPTEQKIDNFKHSYGTILFYEDQDVVSGLQEQMPNYYDNFAIWSTQTNAMHQFAIWTALATKGIGASLQHYNPLVDEMTSNEFNIPKSWKLIAQMPFGDIREAAGEKTFNPVEDRFVIKK >CP028470.1|AWQ26198.1|2027871_2028657_+|carbon-nitrogen-family-hydrolase MKVQIYQLPIIFGDSSKNEIQITQWFEKNMNAEVDVVVLPEMWNNGYDLEHLNEKADNNLGQSFSFIKHLAEKYKVDIVAGSVSNIRNNQIFNTAFSVNKSGQLINEYDKVHLVPMLREHEFLTAGENVAEPFQLSNGTYVTQLICYDLRFPELLRYPARSGAKIAFYVAQWPMSRLQHWHSLLKARAIENNMFVIGTNSTGFDGNTEYAGHSIVINPNGDLVGELNESADILTVDLNLNEVEQQRENIPVFKSIKLDLYK >CP028470.1|AWQ26199.1|2029062_2029830_-|AAA-family-ATPase MNTNHQKLLNNFEILKLKKFKDYYPNYIELLSKNEKSLTEILIDLTEKEIEYQSELKFKRAVNSARFPKIKYLHDFDFMFQPSINQQEILTLKSMHFLEDSINICFLGNSGVGKTHLAISLGIEACKQNIKTRFYTFKELIDLLTVSDSKGIINKTLKQLSRIELLIIDEIGYTPITKEQADLFYQLMSLRYEWKSTIITTNIPFSSWGESFSNKIVSAAIIDRLVHHSKVFKITGESYRLKDYKTEKSLNIRQS >CP028470.1|AWQ26200.1|2029841_2031077_-|IS21-family-transposase MRHDIYEGVLFYIMKGIKPNYAELGRQYNCDPRTVKKYYEAGKENELERLKKRQQNKKASKLDPFKEIINKKIELGCTAMAIFKYIEKKGYEGKYTILREYCKNKKQNETKKATIRVETNPGIAAQVDWKEDMVMHDKFGRTYQFNIFLYVLHYSKMKYITLTWDRKQDTLFECLKDAFEYTEGVPKEIWFDNMRTVVDRPRTQYKKVVFNNLFYQFSKDANFEPIACRPYRPQTKGSVESLAKFVEQRLRPYDYEFYDAVELIGLVNDLCHELNHLEISQATEQRPIDVFNYEEKEHLNSFNAKLLDTYIENECIRIVSKESMINFRKGKYSVPTKYIGEEVQVIFNNSTDELLIYYDGELIRRHNLSERKFNYIVEDMSEILKSDVFKHKDDKEILTYIENSLLLYDEI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP028470_6 | 2152301-2152403 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP028470_6
|
1 spacers
spacers of CP028470_6
>6.1|2152338|29|CP028470|CRISPRCasFinder TGTTAGGGGCTCTTATGCAGTTGATGCGC |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP028470_6
The CRISPR arrays of CP028470_6 >merge|CP028470|6|2152301-2152403|CRISPRCasFinder AGCATCCAACTGTATTCCTCTATTTTTCAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCAGTTGATGCGCAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTCAACTTTAGT >CP028470|6|6|2152301-2152403|CRISPRCasFinder AGCATCCAACTGTATTCCTCTATTTTTCAACTTTAGT TGTTAGGGGCTCTTATGCAGTTGATGCGC AGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTCAACTTTAGT
>CP028470.1|AWQ26316.1|2151153_2152245_+|transcriptional-regulator MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYVQTIAIYSQFGQKPPVDAYLKVIAVLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKDKKVVTEPKNTKVENDKVATSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >CP028470.1|AWQ26315.1|2149907_2150888_+|cation-transporter MSHSHHHHDHMHSHVTTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALVAFIYAEKNATTTKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH >CP028470.1|AWQ26314.1|2149585_2149906_+|ArsR-family-transcriptional-regulator MSEQYSEIHTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL >CP028470.1|AWQ26313.1|2148768_2149434_-|NAD(P)-dependent-oxidoreductase MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFDGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNYQEFQIISGEQDIKDALTQFEIEKD >CP028470.1|AWQ26312.1|2147394_2148333_-|class-I-mannose-6-phosphate-isomerase MPLFLQPILKTKLWGGQRLSEFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGTSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIVIGTLAESREEVANHVQHGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDITYRLYDFNRQDNQYNDRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYV >CP028470.1|AWQ26311.1|2147133_2147364_-|hypothetical-protein MKQFLYIALVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQISASLKFSALLINVLPLCGTFVASN >CP028470.1|AWQ26310.1|2145086_2146460_-|EVE-domain-containing-protein MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRMSNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYEAIIEMSDNNGLKSPFEMVQKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD >CP028470.1|AWQ26309.1|2144217_2144631_-|thiol-disulfide-oxidoreductase-DCC-family-protein MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYRFATLKGEVGQQFFKQHPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIQLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD >CP028470.1|AWQ26308.1|2143575_2144019_-|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLEKAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS >CP028470.1|AWQ26307.1|2142743_2143454_+|purine-nucleoside-phosphorylase MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGTYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKAKNVADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNAAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE >CP028470.1|AWQ26317.1|2152759_2152864_-|hypothetical-protein MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISNQGHKK >CP028470.1|AWQ26976.1|2153540_2153699_+|integrase MRKSSDALFNLLTQSFELIEGVHNELVTDNLKTVMYKPRKERTNGRINRRFK >CP028470.1|AWQ26318.1|2154144_2154237_+|erm-Leader-peptide MTFGSIVAILCALFVIFFIPYMEKKDKKKK >CP028470.1|AWQ26319.1|2154357_2155215_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINRLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQIINLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQDETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAKHFLAD >CP028470.1|AWQ26320.1|2155282_2156065_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLIQLDQIGRMKQGKTILKNISWQIAKGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATTGGVNLFGEMPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQDGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEVRNEAHQLLKLVGISAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLNILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITGNFTKILLLKDGESVQQGLIDDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE >CP028470.1|AWQ26321.1|2156296_2158102_-|glutamine--fructose-6-phosphate-aminotransferase MCGIVGYIGYDNAKELLLKGLEKLEYRGYDSAGIAVVNDDNTTVFKEKGRIAELRKVADSSDFDGPVGIGHTRWATHGVPNHENSHPHQSSNGRFTLVHNGVIENYEELKGEYLQGVSFISETDTEVIVQLVEYFSNQGLSTEEAFTKVVSLLHGSYALGLLDAEDKDTIYVAKNKSPLLLGVGEGFNVIASDALAMLQVTSEYKEIHDHEIVIVKKDEVIIKDADGNVVERDSYIAEIDASDAEKGVYAHYMLKEIHEQPAVMRRIIQEYQDAEGNLKIDQDIINDVKEADRIYVIAAGTSYHAGLVGKEFLEKWAGVPTEVHVASEFVYNMPLLSEKPLFVYISQSGETADSRAVLVETNKLGHKSLTITNVAGSTLSREADHTLLLHAGPEIAVASTKAYTAQIAVLSILSQIVAKEHGREADIDLLRELAKVTTAIEAIVDDAPIMEQIATDFLETTRNAFFIGRTIDYNVSLEGALKLKEISYIQAEGFAGGELKHGTIALIEDGTPVVALATQENVNLSIRGNVKEVVARGAHPCIISMEGLEKEGDTYVIPHVHELLTPLVSVVALQLISYYAALHRDLDVDKPRNLAKSVTVE >CP028470.1|AWQ26322.1|2158782_2160321_+|PTS-mannitol-transporter-subunit-IICB MSQTEEKKGIGRRVQAFGSFLSSMIMPNIGAFIAWGFIAAIFIDNGWLPNKDLATLAGPMITYLIPLLIAFSGGRLIYDLRGGIIAATATMGVIVALPDTPMLLGAMIMGPLVGWLMKKTDQLIQPRTPQGFEMLFNNFSAGILGFIMTIAGFKILAPIMKFIMHILSVAVESLVHAHLLPLVSILVEPAKIVFLNNAINHGVFTPLGADQAAKAGQSILYTIESNPGPGLGILLAYMIFGKGTAKATSYGAGIIHFLGGIHEIYFPYVLMRPLLFIAVILGGMTGVATYQATGFGFKSPASPGSFIVYCLNAPRGEFLHMLLGVFLAALVSFVVATLIMKFTREPKQDLEAATAQMENTKGKKSSVASKLVSSDKNVNTEENASGNVSETSSSDDDPEALLDNYNTEDVDAHNYNNINHVIFACDAGMGSSAMGASMLRNKFKKAGINDITVTNTAINQLPKDAQLVITQKKLTDRAIKQTPNAIHISVDNFLNSPRYEELLNNLKKDDQA >CP028470.1|AWQ26323.1|2160355_2162488_+|PRD-domain-containing-protein MLLSTREKEMIALLIKYHGQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVESYLTSFSLTLERANKKGLRIAGADSDLNDLKQSIAQLQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELDLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLDQIYDVTFNQAEIAFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVNKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFIVLHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLEQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIDTPYLMVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFQETHDKSSNMNDKDDVHVETKDIDGNTSFENEQTSNLTSVFEKHLSDEKSEQLMHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDAIKDPTSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMILITVLEEPLTLPSIQNDNQTIKYMISMFIPDNDFMASLVSDLSEFLSLKLESIDTFMENPQELETLLRSKFLERIKKQFI >CP028470.1|AWQ26324.1|2162499_2162934_+|mannitol-specific-phosphotransferase-enzyme-IIA-component MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA >CP028470.1|AWQ26325.1|2162933_2164040_+|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKAVHFGAGNIGRGFIGYILADNNVKVTFADVNEEIINALAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFASFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVLDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFAGKATVLDAVKDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAGYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTGDQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP028470_7 | 2232553-2232677 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP028470_7
|
1 spacers
spacers of CP028470_7
>7.1|2232590|51|CP028470|CRISPRCasFinder ATGATTTCCCATGATTTTTTAGTATTTTCTTTTGAGTTACTCGAAAATTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP028470_7
The CRISPR arrays of CP028470_7 >merge|CP028470|7|2232553-2232677|CRISPRCasFinder CCTCTTTACTCGAAAGCTCACAAAACCCTTGATATCAATGATTTCCCATGATTTTTTAGTATTTTCTTTTGAGTTACTCGAAAATTATCCTCTTTACTCGAAAGCTCACAAAACGCTTGATATCA >CP028470|7|7|2232553-2232677|CRISPRCasFinder CCTCTTTACTCGAAAGCTCACAAAACCCTTGATATCA ATGATTTCCCATGATTTTTTAGTATTTTCTTTTGAGTTACTCGAAAATTAT CCTCTTTACTCGAAAGCTCACAAAACGCTTGATATCA
>CP028470.1|AWQ26376.1|2232307_2232487_-|hypothetical-protein MTEIVEFLSDGKLASRLEIQETMGLQKSYTSELIAELKKLEIIGSEGRGPGTRYYLIRD >CP028470.1|AWQ26375.1|2231475_2231658_-|hypothetical-protein MKDSIFWKKAFIPVYFIVAMLVFLLFRFYIKTDNFSMYLMIIFLICLGTASIIYNYKNNR >CP028470.1|AWQ26374.1|2229316_2230981_-|acetolactate-synthase-AlsS MTDKKYTAADMVIDTLKNNGVEYVFGIPGAKIDYLFNALIDDGPELIVTRHEQNAAMMAQGIGRLTGKPGVVLVTSGPGVSNLTTGLLTATSEGDPVLALGGQVKRNDLLRLTHQSIDNAALLKYSSKYSEEVQDPESLSEVMTNAIRIATSGKNGASFISIPQDVISSPAESKAISLCQKPNLGVPSEQDINDVIEAIKNASFPVLLAGMRSSSADETNAIRKLVERTNLPVVETFQGAGLISRELENHFFGRVGLFRNQVGDELLRKSDLVVTIGYDPIEYEASNWNKELDTQIINIDEVQAEITNYMQPKKELIGNIAKTIEMISDKVDEPFINQQHLDELEQLRAHIDQETGIKATHEEGILHPVEIIESMQKVLTDETTVTVDVGSHYIWMARNFRSYNPRHLLFSNGMQTLGVALPWAISAALVRPNTQVVSVAGDGGFLFSSQDLETAVRKNLNIIQLIWNDGKYNMVEFQEEMKYKRSSGVDFGPVDFVKYAESFGAKGLRVTNQEELEAAIKEGYETDGPVLIDIPVNYKDNIKLSTNMLPDVFN >CP028470.1|AWQ26373.1|2228575_2229280_-|acetolactate-decarboxylase MASVLYQHGTLGTLMAGLLKGTASINELLQHGDLGIATLTGSNGEVIFLDGKAYHANEHKEFVELKGDELTPYATVTKFVADTSYETKDKSSEAVFAEIKEKMLSENLFSAVKISGLFKKMHVRMMPAQEPPYTRLIDSARRQPEQTETYVKGSVVGFFTPELFHGIGSAGFHVHFANDDRNFGGHVLDFEVEDVKVEIQNIETFEQHFPIHDEDFTNANIDYKDISDEIREAE >CP028470.1|AWQ26372.1|2227771_2228197_+|MAP-domain-containing-protein MKLKSFVTATLALGLLSTVGAALPSHEASADSNNGYKEMTMDGYHTVPYTISVDGITALHRTYFVFPENKKVLYQEIDSKVKNELASQRGVTTEKINNAQTATYTLTLNDGNKKVVNLKKNDDAKNSIDPSTIKQIQIVVK >CP028470.1|AWQ26371.1|2226661_2227477_-|hydrolase MSKRLLLFDFDETYFKHNTNEEDLSHLREMEKLLEKLTNNNEVITAVLTGSTFQSVMDKMDQVNMTFKPLHIFSDLSSKMFTWNNGEYVESETYKKKVLSEPFLFEDIEDILRHISAQYNVEFIPQRAFEGNETHYNFYFHSTGNHNNDRRILEALVRYANDQNYTARFSRSNPLAGDPENAYDIDFTPSNAGKLYATQFLMKKYNIPVKSILGFGDSGNDEAYLSYLEHAYLMSNSRDEALKQKFRLTKYPYYQGITLHVKEFVEGKYDY >CP028470.1|AWQ26370.1|2224912_2226298_+|hypothetical-protein MTTYMLMYSIPEKAGGITSVMLNRSKLLAEKGYSCALLTLDDKNYDPLRAKLTNSGRLHKQVKIVNLYEELKMLYDVENTEIENKNMQTFEKLNLLNQEGFYIQKDEYEEKKYARYFKDNHYIMYKKWINGQLSHIDYFQNRKRFKRHVFQNKILRKEITFNDKNKMSEVKYLSNDGFCYLSYWYGDNENIVNIFYFDKNSKEVLNFKNNKAFHSYWLDKNLTSNDVLILDGIGTYHKVENMQNNDIKKIFTIHTNHFMSPYSYGAEIKPEFRNMLLNLKELDTLVVLTKEQKDDIIKQFGDYNNIKVIPNAISFEENLTQNIREKNSIIVLQRFVAMKNITHIISAINIVRKKVKDVKLHIYGTGTQKENYTKLIKKLKLQDNVFIHDYAFDIRALYTKTSLSVLTSDYEGLPMSLLEAMSYGVPVISYPINYGPKSIIQNNINGIITKKKDNINELAKK >CP028470.1|AWQ26369.1|2224624_2224903_+|hypothetical-protein MTLNEYNYNNELILKLNKIEVQKNNEKISEVFKDYEILKPKIVFNGSNPYLALNHIIVAEIENYSSLETFSKIYVDEDYYYNYGELIIKCKK >CP028470.1|AWQ26368.1|2222896_2223751_-|M23-family-peptidase MNKTNFGDYLNKSKSRKIYKIFDQNLKREFSYWHFRKLFKSYTRQSDVHELKVCTQNDGTMEQIWIDKANQFGVAVTWKDNSIIGFVMRPLINYDAIKNETTLKYAVPTTDCYEVFWGGDNELYNYHYLYPHQRYAIDLVIKENHKTYKNKGKVNTDYFYFGKDIIAPANGTVEKVANGVQDNSIGSTNESQFLGNYIVIKHAENEYSLIAHLQQYSIIVNEGQNVKYGDIIGKVGNSGNSTEPHIHFQVMNDKNIEACTSLKIRFINNRELIKGDVVCGLQGE >CP028470.1|AWQ26367.1|2220410_2222837_+|hyaluronate-lyase MTYRMKKWQKISTITLLMAGVITFNDSEFRSVDKHQIAVADTNVQTTDYEKLRNTWLNVNYGYNQYDENNDAMKKKFEATEKEATNLLSSMKTESDRKYLWENSKDLDTKSADMTRTYRNIEKIAEAMKHKNTKLNTPDNKNKVKDALEWLHKNAYGKEPTDKVKELTENFKNKTSRNTNLNWWDYEIGTPRALTNTLILLNGDISSDEKKKYTAPIKTFAPESDKILSSVGQPEQAKGGNLVDIAKVKLLESIIEEDTTMMKESIDAFNKVFTYVQSNATGKERNGFYKDGSYIDHQDVPYTGAYGVVLLEGISQMMPMIKETSFKDSNQNDTTLKSWIDEGFMPLIYKGEMMDLSRGRAISRENETSHSVSATVMKSLLRLSDAMDDSTKAKYKQIVKTSVKSDSSYKQNDYLSSYSDISKMKSLMEDSTISTNDLTQQLKIYNDMDRVTYHNKGLDFAFGLSMTSKNVARYESINNENLKGWHTGAGMSYLYNSDVKHYRDNFWATADMKRLAGTTTIENEEPKGTDVKKSSKTFVGGTKFDDQHASIGMDFENQDKTLTAKKSYFILNDKIVFLGTGIKSTDSSKNPVTTIENRKTNGYTLYTDDKQTTASDNQDTNSVFLESTNKPKNNIGYHFLNKSKITVKKESHTGKWSDINKSQKSEDKTDEYYEVTQKHSDKDNKYGYVLYPGITKDNFKSKASQVTVVKQDDDFHVVKDNESVWAGVNYSDSAKTFEINGTKVEVKAKGMFILKKKNDKTYECSFYNPESTNPASDIESKISMTGYSITNKDTSTTNESGVRFELTK >CP028470.1|AWQ26377.1|2233075_2233474_-|30S-ribosomal-protein-S9 MTLAQVEYRGTGRRKNSVARVRLVPGEGNITVNNRDVRKYLPFESLILDLNQPFDVTETKGNYDVLVNVHGGGFTGQAQAIRHGIARALLEADPEYRGSLKRAGLLTRDPRMKERKKPGLKAARRSPQFSKR >CP028470.1|AWQ26378.1|2233487_2233925_-|50S-ribosomal-protein-L13 MRQTFMANESNIERKWYVIDAEGQTLGRLSSEVASILRGKNKATYTPHVDTGDYVIVINASKIEFTGNKETDKVYYRHSNHPGGIKSITAGELRRTNPERLIENSIKGMLPSTRLGEKQGKKLFVYGGAEHPHAAQQPENYELRG >CP028470.1|AWQ26379.1|2234164_2234968_-|tRNA-pseudouridine(38-40)-synthase-TruA MRILVEIAYQGNNFLGFQIQQNGRTVQQQFEKLLQRMHKRHVRIHPSSRTDRGVHAIQQYFHFDTELNIPMSQWQYAMNRTLPDDIYVNNVVTVDDDFHCRYDCVGKRYRYKVYQAQHRDPFQSGLKTFIPETLDLDKMNRAAQQFIGTHDFTGFCSQKTEVESKVRTLYQSEIVKTDDGFDYIVTGSGFLYNMVRVLVAFLIEVGKGRHEVSDVPKLLESKNRKNVPFTAPAEGLYLEKIYLDENELLKDFGNDIKIHRKKSLQND >CP028470.1|AWQ26380.1|2234972_2235779_-|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT MKNKLIIGRYLPINSFVHHLDPRAKLMFVFLFIILIFFCHSPLTYLWVFALILFFMRLAKIQLWFLIKGLTPIFFFLIFTLMMHIFLTKGGYVLVEWHGITIETNGILEGLYISLRLIGIVMIATIMTLSTSPIDLTDAFERLLAPLKMFKLPVHQLSMIMSIALRFIPTLMDELDKIILAQKSRGSEISSGNIATRIKSFIPLLVPLFISAFQRAEELAVAMEVRGYDANVQRTSYRQLKWQLRDTLSLIMIIPFAIILFVLKYSGV >CP028470.1|AWQ26381.1|2235768_2236629_-|energy-coupling-factor-transporter-ATPase MTIRFDNVSYTYQKGTPYQHQAIHDVNTEFEQGKYYAIVGQTGSGKSTLIQNINALLKPTTGTVTVDDITITHKTKDKYIRPVRKRIGMVFQFPESQLFEDTVEREMIFGPKNFKMNLDEAKNYAHRLLMDLGFSRDVMSQSPFQMSGGQMRKIAIVSILAMNPDIIVVDEPTAGLDPQSKRQVMRLLKSLQTDENKAIILISHDMNEVARYADEVIVMKEGSIVSQTSPKELFKDKEKLADWHIGLPEIVQLQYDFEQKHQTKLKDIALTEEAFVSLYKEWQHEK >CP028470.1|AWQ26382.1|2236625_2237435_-|energy-coupling-factor-transporter-ATPase MEDKNSVIVFKNVSFQYQSDASFTLKDVSFNIPKGQWTSIVGHNGSGKSTIAKLMIGIEKVKSGEIFYNNQAITDDNFEKLRKDIGIVFQNPDNQFVGSIVKYDVAFGLENHAVPHDEMHRRVSEALKQVDMLERADYEPNALSGGQKQRVAIASVLALNPSVIILDEATSMLDPDARQNLLDLVRKVKSEHNITIISITHDLSEAMEADHVIVMNKGTVYKEGTAIEIFDHAEELTTIGLDLPFPIKINQMLGYQTSFLTYEGLVDQL >CP028470.1|AWQ26383.1|2237972_2238341_-|50S-ribosomal-protein-L17 MGYRKLGRTSDQRKAMLRDLATSLIISERIETTEARAKEVRSVVEKLITLGKKGDLASRRNAAKTLRNVEILNEDETTQTALQKLFGEIAERYTERQGGYTRILKQGPRRGDGAESVIIELV >CP028470.1|AWQ26384.1|2238357_2239302_-|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-alpha MIEIEKPRIETIEISEDAKFGKFVVEPLERGYGTTLGNSLRRILLSSLPGAAVKYIEIEGVLHEFSAVDNVVEDVSTIIMNIKQLALKIYSEEDKTLEIDVRDEGEVTASDITHDSDVEILNPELKIATVSKGGHLKIRLVANKGRGYALAEQNNTSDLPIGVIPVDSLYSPVERVNYTVENTRVGQSSDFDKLTLDVWTNGSITPQESVSLAAKIMTEHLNIFVGLTDEAQNAEIMIEKEEDQKEKVLEMSIEELDLSVRSYNCLKRAGINSVQELADKSEADMMKVRNLGRKSLEEVKYKLEDLGLGLRKED >CP028470.1|AWQ26385.1|2239376_2239766_-|30S-ribosomal-protein-S11 MARKQVSRKRRVKKNIENGVAHIRSTFNNTIVTITDEFGNALSWSSAGALGFKGSKKSTPFAAQMASETASKSAMEHGLKTVEVTVKGPGPGRESAIRALQSAGLEVTAIRDVTPVPHNGCRPPKRRRV >CP028470.1|AWQ26386.1|2239789_2240155_-|30S-ribosomal-protein-S13 MARIAGVDIPREKRVVISLTYIYGIGTSTAQKILEEANVSADTRVKDLTDDELGRIREVVDGYKVEGDLRRETNLNIKRLMEISSYRGIRHRRGLPVRGQKTKNNARTRKGPVKTVANKKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP028470_8 | 2489187-2489270 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP028470_8
|
1 spacers
spacers of CP028470_8
>8.1|2489212|34|CP028470|CRISPRCasFinder GCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP028470_8
The CRISPR arrays of CP028470_8 >merge|CP028470|8|2489187-2489270|CRISPRCasFinder ACAGACAATGCAAGTTGGGGTGTGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCCACAGACAATGCAAGTTGGGGTGGGA >CP028470|8|8|2489187-2489270|CRISPRCasFinder ACAGACAATGCAAGTTGGGGTGTGG GCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCC ACAGACAATGCAAGTTGGGGTGGGA
>CP028470.1|AWQ26644.1|2488171_2488921_+|hypothetical-protein MSNTNKHYIEEEYATEQSRFFKRDIGFIFLYIFLVNILPIIIVFLTFGLVAIFTQQAPWDFSFPISMNISYLLAVILSLAIFRRMHEDAFIPMIRSQIVASTKYKWHILISFTLSIVLFLLLNHFEIFALNVDSFTVFDIYPLIREYGSISLIAIFSLTIILNTLICQLIFRHILIQELSRLIPLKITIVLSVILETLYYYPYINTWWEFIPALILASSATYLYLKSNRNFMVSYFYQLAVILVLHIFM >CP028470.1|AWQ26643.1|2486399_2487977_-|FMN-binding-glutamate-synthase-family-protein MTFLTVMQFIVNIIIIGFLLTVIVIGLIWLIKDKRQSQHSVLRNYPLLARIRYISEKMGPELRQYLFSGDNEGKPFSRNDYKNIVLAGKYNSRMTSFGTTKDYQDGFYIQNTMFPMQRNEISVDNTTLLSTFIYKIANERLFSREEYRVPTKIDPYYLSDDHAIKLGEHLKYPFILKRIVGQSGMSYGALGKNAITALSKGLAKAGTWMNTGEGGLSEYHLKGNGDIIFQIGPGLFGVRDKEGNFSEGLFKEVAQLSNVRAFELKLAQGAKTRGGHMEAEKVNEEIAKIRNVEPYKTINSPNRYEFIHNAEDLIRFVDQLQQLGQKPVGFKIVVSKVSEIETLVRTMVELDKYPSFITIDGGEGGTGATFQELQDGVGLPLFTALPIVSGMLEKYGIRDKVKLAASGKLVTPDKIAIALGLGADFVNIARGMMISVGCIMSQQCHMNTCPVGVATTDAKKEKALIVGEKQYRVTNYVTSLHEGLFNIAAAVGVSSPTEITADHIVYRKIDGELQTIHDYKLKLIS >CP028470.1|AWQ26642.1|2485776_2486232_+|DUF1307-domain-containing-protein MKKLCSLIVVALVCIIALSACGKEQTKTYEGDVSGKHVLTSITYKDDKVLKQSTINTIKYDDLGMDKDEAKKLFAKSESIFKDLKGVKYKVDYKDKKAIEHLDIDYTEVDMKKLNKRLGVSTKENKDISFEKLEKQLKHRGLKEKDKMDDK >CP028470.1|AWQ26641.1|2485502_2485718_-|hypothetical-protein MMLFKNLNFVIFFGDMRFLKRISHKVFKIIKSENDKAVGNVVCSTADFFLSIIDGMLEEKNKSLCTIAYRY >CP028470.1|AWQ26640.1|2485160_2485418_-|type-II-toxin-antitoxin-system-Phd/YefM-family-antitoxin MIITSPTEARKDFYQLLKNVNNNHEPIYISGNNAENNAVIIGLEDWKSIQETIYLESTGTMDKVREREKDNSGTTNIDDIDWDNL >CP028470.1|AWQ26639.1|2484894_2485161_-|Txe/YoeB-family-addiction-module-toxin MSNYTVKIKNSAKSDLKKIKHSYLKKSFLEIVETLKNDPYKITQSFEKLEPKYLERYSRRINHQHRVVYTVDDRNKEVLILSAWSHYD >CP028470.1|AWQ26638.1|2483463_2484540_-|M42-family-peptidase MNQSVKLLKHLTDVNGIAGYEMQVKEAMRNYIEPVSDQIIEDNLGGIFGKKNAENGQYSIMISGHMDEVGFMVTKIDKHGFISFTPVGGWWNQVMLSQKVTITTDSGKEIRGIIGSKPPHVLTPEERKKPMEIKNMFIDIGVSSKGEAEEAGVEVGNMVTPYSEFEVLANNKYLTAKAFDNRYGCALAIEVLQRLKDENIGINLYSGATVQEEVGLRGAKVAANTIKPDLAIAVDVGIAYDTPGMSGQTSDSKLGGGPVVIMMDATSIAHQGLRKHIKDVAKKHNIEVQWDTTPGGGTDAGSIHVANEGIPTMTIGVTLRYMHSNVSVLNVDDYENSIRLVTEIVRSLNDETYKNIMW >CP028470.1|AWQ26637.1|2482455_2483118_-|methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein MLLEIKDLVYEASDRVILNHINLKVDKGETIAIIGPSGSGKSTFQKIICNLISPTSGTLYFKDKPYDDYEPEILRRHISYLMQQSDLFGETIEDNMIFPSLARNDKFDKKRAKQLIKDVGLGHYQLSSKIEHMSGGERQRIAIARQLMYTPDILLLDESTSALDIHNKEKIENIIFKLADQGVAIMWITHSDDQSMRHFQKRITIVDGQISNIEELNQHE >CP028470.1|AWQ26636.1|2481686_2482463_-|iron-export-ABC-transporter-permease-subunit-FetB MSNTALGLTALLLVIPIIISYKEGLHIIKDLIVATLRAVVQLIILGFLLHYIFKINDKWLLVLCVFVIIVNASWNTISRSSPVMHHVFWISFVAIFVGTALPLAGTIATGAIQFTANEVIPIGGMLANNGLIAINLAYQNLDRAFVQDGTNIESKLSLAATPKLASKGAIRESIRLAIVPTIDSVKTYGLVSIPGMMTGLIIGGVPPLQAIKFQLLVVFIHTTATIMSALIATYLSYGQFFNARHQLVARNTDVKSES >CP028470.1|AWQ26635.1|2480105_2481293_-|MFS-transporter MSIMRLFTFILSIFIVGMVEMMVAGIMNLMSQDLHVSEAVVGQLVTMYALTFAICGPILVKLTNRFSSRPVLLWTLLIFIIGNGIIAVAPNFSILVVGRIISSAAAALIIVKVLAITAMLSAPKNRGKMIGLVYTGFSGANVFGVPIGTVIGDLVGWRYTFLFLIIVSIIVGFLMMSYLPKDQEIQRGSVNHEAPSHENHVTSKILRPAEVAKYLIITFLVLIANSVTFVFINPLILSNGHDMSFVSLALLVNGIAGVIGTSLGGIFSDKITSKRWLMISVSIFIVMMLLMNLILPGSGLLLAGLFIWNIMQWSTNPAVQSGVIQHVEGDTSQVMSWNMSSLNAGIGVGGIIGGLVMTHVSVQAITYTSAIIGALGLIVVLTLKNNHYAKTFKSS >CP028470.1|AWQ26645.1|2489386_2490580_-|MFS-transporter MKGAMAWPFLRLYILTLMFFSANAILNVFIPLRGHDLGATNTVIGIVMGAYMLTAMVFRPWAGQIIARVGPIKVLRIILIINAIALIIYGFTGLEGYFVARVMQGVCTAFFSMSLQLGIIDALPEEHRSEGVSLYSLFSTIPNLIGPLVAVGIWNANNISLFAIVIIFIALTTTFFGYRVTFAEQEPDTSDKIEKMPFNAVTVFAQFFKNKELLNSGIIMIVASIVFGAVSTFVPLYTVSLGFANAGIFLTIQAIAVVAARFYLRKYIPSDGMWHPKYMVSVLSLLVIASFVVAFGPQVGAIIFYGSAILIGMTQAMVYPTLTSYLSFVLPKVGRNMLLGLFIACADLGISLGGALMGPISDLVGFKWMYLICGMLVIVIMIMSLLKKPTPRPANSL >CP028470.1|AWQ26646.1|2490591_2491341_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKIKDVEKSYQSAHVFKRRRTPIVKGVSFECPIGATIAIIGESGSGKSTLSRMILGIEKPDKGCVTLNDHPMHKKKVRRHQIGAVFQDYTSSLHPFQTVREILFEVMCQCDGQPKDVMEVQAITLLEEVGLSKAYMDKYPNMLSGGEAQRVAIARAICINPKYILFDEAISSLDMSIQTQILDLLIHLRETRQLSYIFITHDIQAATYLCDQLIIFKNGKIEEQIPTSALHKSDNAYTRELIEKQLSF >CP028470.1|AWQ26647.1|2491333_2492149_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MTLLTVKHLTITDTWTDQPLVSDVNFTLTKGETLGVIGESGSGKSITCKSIIGLNPERLGVTGDITFDGKPMLSLSEAQLKKYRGKDIAMVMQQGSRAFDPSTTVGKQMFETMKVHTSMSTQEIEKTLIEYMDYLSLKDPKRILKSYPYMLSGGMLQRLMIALALALKPKLIIADEPTTALDTITQYDVLEAFIDIKKHFDCAMIFISHDLTVINKIADRVVVMKNGQLIEHGTRESVLHHPKHVYTKYLLSTKKKINDHFKHVMRGDVHD >CP028470.1|AWQ26648.1|2492145_2493015_-|ABC-transporter-permease MIILKRLLQDKGAVVALGIIVLYVFLGLAAPLVTFYDPNHIDTANKFAGMSFQHLLGTDHLGRDILTRLIYAIRPSLLYVFVALFVSVLIGSILGFLSGYFQGFVDALIMRACDVMLAFPSYVVTLALIALFGMGAENIIMAFILTRWAWFCRVIRTSVMQYTASDHVRFAKTIGMNDMKIIHKHIMPLTLADIAIISSSSMCSMILQISGFSFLGLGVKAPTAEWGMMLNEARKVMFTHPEMMFAPGIAIVIIVMAFNFLSDALQIAIDPRISSKDKLRSVKKGVVQS >CP028470.1|AWQ26649.1|2493011_2493947_-|ABC-transporter-permease MFKFILKRIALMFPLVIVVSFMTFLLTYITNENPAVTILHAQGTPNVTPELIAETNEKYGFNDPLLIQYKNWLLEAMQFNFGTSYITGDPVAERIGPAFMNTLKLTIISSVMVMITSIILGVVSALKRGKFTDRAIRSVAFFLTALPSYWIASILIIYVSVKLNILPTSGLTGPESYILPVIVITIAYAGIYFRNVRRSMVEQLNEDYVLYLRASGVKSITLMLHVLRNALQVAVSIFCMSIPMIMGGLVVIEYIFAWPGLGQLSLKAILEHDFPVIQAYVLIVAVLFIIFNTLADIINALLNPRLREGAR >CP028470.1|AWQ26650.1|2493959_2495558_-|staphylopine-dependent-metal-ABC-transporter-substrate-binding-protein-CntA MRKLTKMSAMLLASGLILTGCGGNKGLEEKKENKQLTYTTVKDIGDMNPHVYGGSMSAESMIYEPLVRNTKDGIKPLLSKKWDVSEDGKTYTFHLRDDVKFHDGTPFDADAVKKNIDAVQENKKLHSWLKISTLIDNVKVKDKYTVELNLKEAYQPALAELAMPRPYVFVSPKDFKNGTTKDGVKKFDGTGPFKLGEHKKDESADFNKNDQYWGEKSKLNKVQAKVMPAGETAFLSMKKGETNFAFTDDRGTDSLDKDSLKQLKDTGDYQVKRSQPMNTKMLVVNSGKKDNAVSDKTVRQAIGHMVNRDKIAKEILDGQEKPATQLFAKNVTDINFDMPTRKYDLKKAESLLDEAGWKKGKDSDVRQKDGKNLEMAMYYDKGSSSQKEQAEYLQAEFKKMGIKLNINGETSDKIAERRTSGDYDLMFNQTWGLLYDPQSTIAAFKAKNGYESATSGIENKDKIYNSIDDAFKIQNGKERSDAYKNILKQIDDEGIFIPISHGSMTVVAPKDLEKVSFTQSQYELPFNEMQYK >CP028470.1|AWQ26651.1|2495700_2497002_-|staphylopine-biosynthesis-dehydrogenase MSKLLMIGTGPVAIQLANICYLKSDYEIDMVGRASTSEKSKRLYQAYKKEKQFEVKIQNEAHQHLEGNFEINRLYKDVKNVKGEYETVVMACTADAYYDTLQQLSLETLQSVKHVILISPTFGSQMIVEQFMSKFNKDIEVISFSTYLGDTRIVDKEAPNHVLTTGVKKKLYMGSTHSNSTMCQRISALAEQLKIQLEVVESPLHAETRNSSLYVHPPLFMNDFSLKAIFEGTDVPVYVYKLFPEGPITMTLIREMRLMWKEMMAILQAFRVPSVNLIQFMVKENYPVRPETLDEGDIEHFEILPDILQEYLLYVRYTAILIDPFSQPDENGHYFDFSAVPFKQVYKNEQDVVQIPRMPSEDYYRTAMIQHIGKMLGIKTPMIDQFLTRYEASCQAYKDMHQDQQLSSQFNTNLFEGDKALVTNFLEINRTLS >CP028470.1|AWQ26652.1|2496994_2497813_-|staphylopine-biosynthesis-enzyme-CntL MNNFNNEIKLILQQYLEKFEAHYERVLQDDQYIEALETLMDDYSEFILNPIYEQQFNAWRDVEEKAQLIKSLQYITAQCVKQVEVIRARRLLDGQASTTGYFDNIEHCIDEEFGQCSIASNDKLLLVGSGAYPMTLIQVAKETGASVIGIDIDPQAVDLGRRIVNVLAPNEDITITDQKVSELKDIKDVTHIIFSSTIPLKYSILEELYDLTNENVVVAMRFGDGIKAIFNYPSQETAEDKWQCVNKHMRPQQIFDIALYKKAAIKVGITDV >CP028470.1|AWQ26653.1|2497823_2498645_-|histidine-racemase-CntK MNRQVIEFSKYNPSGNMTILVHSKHDASEYASIANQLMAATHVCCEQVGFIESTQNDDGNDFHLVMSGNEFCGNATMSYIHHLQESHLLKDQQFKVKVSGCSDLVQCAIHDCQYYEVQMPQAHRVVPTTINMGNHSWKAIEIIYETYVHYVIPVKQVTTEIQHLVESYVRKQQWNHKYKTVGMMLFDEQRQFLQPLIYIPEIQSLIWENSCGSGTASIGVFNNYQRNDACKDFTVHQPGGSILVTSKRCHQLGYQTSIKGQVTTVATGKAYIE >CP028470.1|AWQ26654.1|2498731_2498926_+|hypothetical-protein MTRIEKSLLQAHFRSVNYCHYNFVEHRTLIYVSGSYAVGAKQATVFLYNCNFLEGEPNSFPSIR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP028470_9 | 2616818-2616899 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP028470_9
|
1 spacers
spacers of CP028470_9
>9.1|2616842|34|CP028470|CRISPRCasFinder ATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP028470_9
The CRISPR arrays of CP028470_9 >merge|CP028470|9|2616818-2616899|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGGG >CP028470|9|9|2616818-2616899|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGG ATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT TTCTACAGACAATGCAAGTTGGGG
>CP028470.1|AWQ26757.1|2616369_2616600_+|DUF896-domain-containing-protein MKILDRINELANKEKVQPLTVAEKQEQHALRQDYLSMIRGQVLTTFSTIKVVDPIGQDVTPDKVYDLRQQYGYIQN >CP028470.1|AWQ26756.1|2615649_2616150_+|hypothetical-protein MTSIFVFAYLNNTSDNMLFRQQMIYACLLANVRHSSIVCLNNTCRIVDIRCLNTKIGGIDVSETDESQGFERTHNILNINQSSLGVVTYITNKLKSTLKQHIIIACGKKRIDYRLSYNFYTTYYDNVEIKKIDCEYTYAMPIAILIRHMMSFDNDYFFAQLRHPVL >CP028470.1|AWQ26994.1|2614882_2615452_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MMESKSIDPRIVRTKQLLVDAFLKISREKKLSQITVKDITDIATLNRATFYAHFTDKEDLLDYTLSVTILKDLNDNLSISNVINEKVLRNIFISIASYIKDAAKSCELNSEAFCNKAHQRINNELEDIFAIMLENSYPEHQRDIIVNSASFLAAGISGLALHWFNTSQETADVFIDRNLPFLIHHIAHF >CP028470.1|AWQ26755.1|2614599_2614728_-|hypothetical-protein MDFKNEDKIKVYCNNMFEKLPISLSKNSEFCDILFFIVLSYR >CP028470.1|AWQ26754.1|2613417_2614473_-|PTS-transporter-subunit-IIC MTSIKTITPKDFIFRVLSGVAIGIVAGLVPNAILGEIFKYFMDYHPIFKTLLGVVVAIQFTVPALIGALVAMKFDLSPLAIAVVASAAYVGSGAAQFKNGAWMITGIGDLINTMITAAIAVLFILLIQHRVGSMALIVFPTVVGGISGAIGVLILPYTKMITTAIGNMVNGFTELQPIVMSILISMVFSLIIISPLSTVAIAFAIGITGLAAGSASIGISATEAVLIIGTSKVNRLGVPLSVFFGGVKMMIPNMVKYPILMLPILTTAIVSGLVSALVGIHGTKESAGFGFIGMVGPINAFKFMEVDSAWLSVLLIVVAFFVVPFVTAWLADIIYRKVFRLYTNDIFKFMG >CP028470.1|AWQ26753.1|2612108_2612810_-|transglycosylase MKKTIMASSLAVALGVTGYAASTGHEAHAAEVNVDQAHLVDLAHNHQDQLNAAPIKDGAYDIHFVKDGFQYNFTSNGTTWSWSYEAANGQTAGFSNVAGADYTTSYNQGSNVQSVSYNAQSSNSNVEAVSAPTYHNYSTSTTSSSVRLSNGNTAGATGSSAAQIMAQRTGVSASTWAAIIARESNGQVNAYNPSGASGLFQTMPGWGPTNTVDQQINAAVKAYKAQGLGAWGF >CP028470.1|AWQ26752.1|2609018_2610830_-|O-acetyltransferase-OatA MDTKDFKRLEKMYSPRYLPGLDGLRAFAVIGIIIYHLNAQWLSGGFLGVDTFFVISGYLITSLLISEYYRTQKIDLLEFWKRRLKRLIPAVLFLICVVLTFTLIFKPELIIQMKRDAIAAIFYVSNWWYISQNVDYFNQFAIEPLKHLWSLAIEEQFYLLFPLVITFLLHRFKPRNIIQTLFIVSLISLGLMIVIHFITGDNSRVYFGTDTRLQTLLLGCILAFIWPPFALKKDISKKIVVSLDIIGISGFAVLMTLFFIVGDQDQWIYNGGFYIISFATLFIIAIAVHPSSLFAKFLSMKPLLIIGKRSYSLYLWHYPIIVFVNSYYVQGQIPVYVYVIEIVLTALMAEISYRFIETPIRKKGFKAFAFLPKKKGQFARTVLVILLLVPSIVVLSGQFDALGKQHEAEKKEKKTEFKTTKKKVVKKDKQEDKQTANSKEDIKKSSPLLIGDSVMVDIGNVFTKKIPNAQIDGKVGRQLVDATPIVKSQYKDYAKKGQKVVVELGTNGAFTKDQLNELLDSFGKADIYLVSIRVPRDYEGRINKLIYEAAEKRSNVHLVDWYKASAGHPEYFAYDGIHLEYAGSKALTDLIVKTMETHATNKK >CP028470.1|AWQ26751.1|2607516_2608752_-|IS21-family-transposase MRHDIYEGVLFYIMKGIKPNYAELGRQYNCDPRTVKKYYEAGKENELERLKKRQQNKKASKLDPFKEIINKKIELGCTAMAIFKYIEKKGYEGKYTILREYCKNKKQNETKKATIRVETNPGIAAQVDWKEDMVMHDKFGRTYQFNIFLYVLHYSKMKYITLTWDRKQDTLFECLKDAFEYTEGVPKEIWFDNMRTVVDRPRTQYKKVVFNNLFYQFSKDANFEPIACRPYRPQTKGSVESLAKFVEQRLRPYDYEFYDAVELIGLVNDLCHELNHLEISQATEQRPIDVFNYEEKEHLNSFNAKLLDTYIENECIRIVSKESMINFRKGKYSVPTKYIGEEVQVIFNNSTDELLIYYDGELIRRHNLSERKFNYIVEDMSEILKSDVFKHKDDKEILTYIENSLLLYDEI >CP028470.1|AWQ26750.1|2606737_2607505_-|AAA-family-ATPase MNTNHQKLLNNFEILKLKKFKDYYPNYIELLSKNEKSLTEILIDLTEKEIEYQSELKFKRAVNSARFPKIKYLHDFDFMFQPSINQQEILTLKSMHFLEDSINICFLGNSGVGKTHLAISLGIEACKQNIKTRFYTFKELIDLLTVSDSKGIINKTLKQLSRIELLIIDEIGYTPITKEQADLFYQLMSLRYEWKSTIITTNIPFSSWGESFSNKIVSAAIIDRLVHHSKVFKITGESYRLKDYKTEKSLNIRQS >CP028470.1|AWQ26749.1|2605687_2606455_-|CHAP-domain-containing-protein MKKIVTATIATAGLATIAFAGHDAQAAEQNNNGYNSNDAQSYSYTYTIDAQGNYHYTWTGNWNPSQLTQNNTYYYNNYNTYSYNNASYNNYYNHSYQYNNYTNNSQTATNNYYTGGSGASYSTTSNNVHVTTTAAPSSNGRSISNGYASGSNLYTSGQCTYYVFDRVGGKIGSTWGNASNWASAAASSGYTVNNTPKAGAIMQTTQGYYGHVAYVEGVNSNGSVRVSEMNYGHGAGVVTSRTISANQAGSYNFIH >CP028470.1|AWQ26758.1|2617003_2617381_-|glyoxalase MIQSMWFNLHVQDLEKSAQFYKALGFKINRNPQMLDKMVGIQIGQTTVILIENKHFQNVSQQSLNTEPNEVMISLGVNTNEEVDQLVNKVKEAGGTVVQEPTVSQGFYGAMFKDLDGHHFNFLVC >CP028470.1|AWQ26759.1|2617397_2618219_-|NmrA/HSCARG-family-protein MKDILVIGATGKQGNAVVKQLLEDGWYVSALTRNKNNRKLSDIGHPHLSIVEGDLSDSDSLQSAMKGKYGLYSIQPIVKDDVSEELRQGMKIIEIAEQENIQHIVYSTAGGVNRNRTGPHFEVLAKIENRLMESNINATVIKPSFFMDNFLRIAKVEDERITLPEFINPNIKFTMISSIDIAKIASYIFAHPQSFTHQSIEIGSDEVTLSEAATIFSEVTGKSTVIEGEFVSSVAEKQWLEEKGYEVDFELMAEINPTRLSLSDWLKVQDYNK >CP028470.1|AWQ26760.1|2618237_2618537_-|DUF2316-domain-containing-protein MSLNKEQRRITAEELQAHFEASTLSVQMIAEKLNVTTEDVEKALAMKAPLGIFSHQLQRFIHLVWDVRNVINDNIKENGQTPEPYTYLKGEKEDYWFLR >CP028470.1|AWQ26761.1|2618667_2619225_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MRKDAKENRQRIEEIAHKLFDEEGVENISMNRIAKELGIGMGTLYRHFKDKSDLCYYVIQRDLDIFITHFKQIKDDYHSDYEVMQVSLDYLLQFKIDNKALLQCIEAGNNKLRFYQSAFYQELFNFYYDLFKSDDDIYKKFKTDMLLQALSTSVFAFQIEHRHISIEAYRNYLLNIYLDEVERND >CP028470.1|AWQ26762.1|2619217_2619922_+|KR-domain-containing-protein MTKIVLITGGNKGLGYASAEALKALGYKVYIGSRNDVRGQQASQKLGVHYVQLDVTSDYSVKNAYNMIAEKEGRLDILINNAGISGQFSAPSKLTPRDVEEVYQTNVFGIVRMMNTFVPLLEKSEQPVVVNVSSGLGSFGMVTNPETAESKVNSLAYCSSKSAVTMLTLQYAKGLPNMQINAADPGATNTDLVGDFSNNSKHVSEGIKPIIQLATIDADGPTGTFINGDGEMPW >CP028470.1|AWQ26763.1|2620019_2621030_+|amidohydrolase MKSITFEEHYVIEDIQKETMNAISADPKGVPMKVMLEGLEKKTGFTNADELSHHDERIQFMNNQDVQIQVLSYGNGSPSNLVGQKAIELCQKANDQLANYIAQYPNRFVGFATLPINEPEAAAREFERCINDLGFKGALIMGRAQDGFLDQDKYDIIFKTAENLDVPIYLHPAPVNSDIYQSYYKGNYPEVTAATFACFGYGWHIDVGIHAIHLVLSGIFDRYPKLNMIIGHWGEFIPFFLERMDEALFAEHLNHPVSYYFKNNFYITPSGMLTKPQFDLVKKEVGIDRILYAADYPYIEPEKLGVFLDELGLTDEEKEKISYTNGAKLLGLSSNN >CP028470.1|AWQ26764.1|2621049_2621880_+|alpha/beta-hydrolase METLELQGAKLRYHQVGQGPVLIFIPGANGTGDIFLPLAEQLKDHFTVVAVDRRDYGESELTEPLPDSASNPDSDYRVKRDAQDIAELAKSLSDEPVYILGSSSGSIVAMHVLKDYPEVVKKIAFHEPPINTFLPDSTYWKDKNDDIVHQILTEGLEKGMKTFGETLNIAPIDAKMMSQPADTEEGRIEQYKRTMFWSEFEIRQYTHSDITLDDFTKYNDKITLLNGTDSRGSFPQDVNFYINNETGIPIVDIPGGHLGYIQKPEGFADVLLNMWS >CP028470.1|AWQ26765.1|2622020_2623046_+|NADP-dependent-oxidoreductase MKAIQIKKYNKNRDVQIRDITIPEIKSTEVLVKVAYAAINPLENLTINGSVKLIQNYKMPQTIGNELTGTIVKVGSKVEDYKLGDKIYSRLPIDRIGAFAEYVSIESNAIAKLPKNLNLKTGAAVPLTGLTAYQAITEELKAIPGKTLFIPGGSGSFGQMAVPIAKSLGLKVIVSGSPRLKDQFLAKGVDQYIDYKTENYCEVLSDIDYVIDTLGPNEFDKELSVMKPGGTIVSLINAPNKAFAVKNNFSPFKKLLFGLAGKKFDKKAQKKSIDYRFIFVRSDGEQLKILNKIIEQNNIIPDIDDHIFTIDEIDKALDYTFNHHTNGKVLIRIDNSDNTIY >CP028470.1|AWQ26766.1|2623266_2624157_-|GTP-binding-protein MKIVIIGGFLGGGKTTVLNHLLAESLKESLKPAVIMNEFGKMSVDGALVSEDIPLSELTEGCICCAMKADVSEQLHQLYLKEQPDIVFIECSGIAEPVSVLDACLTPILAPFTTITHMIGVVDASMYKHIKSFPKDIQGLFYEQLAYCSVLFVNKIDSADVETTSKLLKDLEVINPEADIQVGMHGSVTLPISVRQMTVTSDNKHESLHKTINHQFVQSPVKCTKAEFIKRLACLPSHIYRLKGFMTFEDTAHTYLIQFTQGQYELTPVAFSKKVPEYLVLIGKGISKEDYQCLEQ >CP028470.1|AWQ26767.1|2624256_2625597_-|ferrous-iron-transporter-B MLEVKYDMRTGHYTPIPNEPHYLVISHADKLNATEKAKLRLLIIKQKLDISLAESVVSSPIASEHVIEQLTLFQHERRHLRPKISATFLAWLLIFLMFALPIGIAYQFSDWFQNQYVSAWIEYLTQTTLLNHDILQHILFGDYGVLSLGTYSLVWALPVVILISLSTAIIDQTGFKSWMIWAIEPSMLRIGLQGNDIVPLLEGFGCNAAAISQAAHQCHTCTKTQCMSLISFGSSCSYQIGATLSIFSVAGKSWLFMPYLILVLLGGILHNRIWLKKNNQQLSVPLPYDRQLHMPNIRQMLLQMWQNIQMFIVQALPIFITICLIVSILSLTPILNVLSQIFTPILSLLGISSELSPGILFSMIRKDGMLLFNLHQGALLQGMTATQLLLLVFFSSTFTACSVTMTMLLKHLGGQSALKLIGKQMLTSLSLVIGVGIIVKIVMLII |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP028470_1 | 1.1|261385|28|CP028470|CRISPRCasFinder | 261385-261412 | 28 | CP028470.1 | 377621-377648 | 0 | 1.0 |
CP028470_1 | 1.1|261385|28|CP028470|CRISPRCasFinder | 261385-261412 | 28 | CP028470.1 | 606342-606369 | 0 | 1.0 |
CP028470_1 | 1.1|261385|28|CP028470|CRISPRCasFinder | 261385-261412 | 28 | CP028470.1 | 778202-778229 | 0 | 1.0 |
CP028470_1 | 1.1|261385|28|CP028470|CRISPRCasFinder | 261385-261412 | 28 | CP028470.1 | 1015945-1015972 | 0 | 1.0 |
CP028470_1 | 1.1|261385|28|CP028470|CRISPRCasFinder | 261385-261412 | 28 | CP028470.1 | 1305875-1305902 | 0 | 1.0 |
CP028470_1 | 1.1|261385|28|CP028470|CRISPRCasFinder | 261385-261412 | 28 | CP028470.1 | 1380085-1380112 | 0 | 1.0 |
CP028470_1 | 1.1|261385|28|CP028470|CRISPRCasFinder | 261385-261412 | 28 | CP028470.1 | 1792663-1792690 | 0 | 1.0 |
CP028470_1 | 1.1|261385|28|CP028470|CRISPRCasFinder | 261385-261412 | 28 | CP028470.1 | 1899162-1899189 | 0 | 1.0 |
CP028470_1 | 1.1|261385|28|CP028470|CRISPRCasFinder | 261385-261412 | 28 | CP028470.1 | 2258855-2258882 | 0 | 1.0 |
CP028470_1 | 1.1|261385|28|CP028470|CRISPRCasFinder | 261385-261412 | 28 | CP028470.1 | 2616802-2616829 | 0 | 1.0 |
CP028470_1 | 1.2|261440|29|CP028470|CRISPRCasFinder | 261440-261468 | 29 | CP028470.1 | 261329-261357 | 0 | 1.0 |
CP028470_1 | 1.2|261440|29|CP028470|CRISPRCasFinder | 261440-261468 | 29 | CP028470.1 | 787181-787209 | 0 | 1.0 |
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CP028470_1 | 1.2|261440|29|CP028470|CRISPRCasFinder | 261440-261468 | 29 | CP028470.1 | 2453302-2453330 | 0 | 1.0 |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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DBSCAN-SWA_1 |
710789 : 718610
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP028470|710789:718610|DBSCAN-SWA ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTCACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTACGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTGTTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTGCGGTTTTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTTGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCGTGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAACGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAGTAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCAAGTGGAACAATAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCTATGACTGGGACTAAACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAGCCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGCGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGCTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAATATTTACTTATGTGCTCTACAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGGTAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCTGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTGTCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCGCCTAAAGTTAATACAGCGGCAACAGCACCAACTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACTCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGGCAAAATAAGAAGAGGGCGGTTTTTTAAGTAAGAAAATATTTATCTAAACTAGTTATCACTATAAAACACTTCTGATATATCGAACTAAGAATATCAGAAGTGTTTTATAGTTTTGGTATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTGTTATTATTTTCAGCAGTTTCATCTAAGTTATTAAATGTTGAAATAAACAACATAATACCACCAATGATGAAAATGGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGTGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATTGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATCGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTATGACGATAGCAATATTAATTAATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTACTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCCACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATTTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCATCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACACATTGTGTAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCTGGTGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGTGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTTAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGGTTAAATAAATCGCCACCAATACGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCCTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGGCCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACGACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGGCTAAAGTTCACTAAGAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACATGGAATGTGATGTGCAGCTGAAAAATTAAAATCTTTATTTAATTCGAATTGATATGGATGCGTTGTACTAGGATAGATTTGTTGTAACATTTTAAAGCGCTCCTTTACTTTCAAGATATTGATTTAGTCCACGTTGACGTAAATGACAAGCTGGACATTCACCACAGCCATCCCCAATGATACCGTTATAGCATGTTAATGTTTTTGTACGAATATAATCTAAAACTTCGAGTTCATCACTTAATTTCCACGTTTCTGCTTTGTTTAACCACATTAAAGGAGTATGAATGACAAAATCTTTGTCCATAGCTAGGCTTAATGTTACGTTCATTGATTTTATAAAACTATCGCGACAGTCTGGGTAGCCTGAAAAGTCTGTTTCACATACGCCTGTAATAATATGCTTAGCCCCAATTTGATAAGCTAGAGCGCCTGCAAACGACAAGAAAAGTAAATTTCTAGCTGGAACAAATGTATTAGGTATACCATCTTCATTATTAGTAATTTCCATATCATGTTGTGTTAATGCGTTTGGAGTAAGTTGTGATAATAATGACATATCTAAAACGTGATGTTTCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATGTTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAAGAGGTTAATGGCATTGATAAGCCCGTTTTTAATTTATAAAATAAAAAAAGCCTATCTCCATAAAAGATAGACGAAAGAAATGGGTTGCTCCTATAATATATATTAAAGGTTTACCAACGAATGTTTGAAATTTCAATGTCTAGTTTTTTATAGAGGGTTTCAGCTAGGAACCTCTGATATTCATTTATGTACGATGAATAGAATATACCATATATTAGTTAAAATCAAGGTCAGGATAATGACAATGCTTTTAAAGTTTTAGCTACATCCAATACATATTATAAAAATAAAACACATTTAGAACGGAGTATACAATGATTCTAGTCATAGATAATAATGATTCATTTACATATAATTTAATAGACTATATTAAGACTCAAACGAAACTAACAGTTCAAGTTGTTGGTATTGATAATCTGCTGATAGAAGACGTCATTAATATGAAGCCAAAAGCAATTGTTATTTCACCTGGGCCGGGTAATCCGGATGATTATCCTATCTTGAATGAAGTGTTAGAACAATTTTATCAGCGTGTACCTATACTAGGTGTATGTTTAGGATTTCAATGTATCGTGTCTTATTTTGGTGGAAATATCATTCACGGCTATCATCCTGTACACGGACATACTACACAGTTACGCCATACCAATGAAGGTATTTTTCAAGGACTGCCTCAAAATTTCAATGTAATGCGTTATCATTCATTAATTGCTGACGGAGCGACTTTTCCAAATTGCTTAAAGATTACAGCAAAAAACGATGCAGCGATTATTATGGCATTTGAGCATATTAGATTTCCGGTTTTTGGTGTGCAATATCATCCTGAATCTATTTTGAGTGAATACGGTTATCGACAAGTTGAATTATTTTTATCGAAGGTAGGTGATTACTGTGAGAATAGAATATAATTATCGCTACTATTTAACTGAAAATGAATATAAGCAATACCATATTCAATTAAAGGGATTTATAAAGAAGTATGTTGCTACTAAGTTGGCTGATGTGGGAGAAGTGATACACTTTGCACAAGCGCAGCAACGACAAGGTAGATATGTCTCGTTATATTTAAGTTACGAAGCGGCAAAGTATTTTAATCATGTTATGTGTACACATTCATTAGCTAAAGATGATATTTATGCAGTAGCTTATAGTTTTGAAAAAGCGGAAAGCATAAATTCAACATATGAACATCAAACTTCTTATGTATCAAAGCATCATTTTTCATTTGTTGAATCTTCTGAGGTTATGATGACTAATATTAAACGTGTCCAACAAGCAATTGTCGAAGGCGAAACGTATCAAGTGAACTATACGGCGCGCTTAACAGATAACATTTATTATCCTATTAGTACTTTATATGAACGATTAACTCAATTTAGTAATGGTAATTATACTGCGTTATTACAAACAGATGAAATCCAAGTAGCGTCTATCTCACCAGAATTATTTTTTCAAAAAGGACAATTTAACAATGTCGATAACGTTATCATAAGCAAACCGATGAAAGGGACAATGCCTAGAGGAAAAACGGAAGCTGAAGATCAACAGTATTATAAAACATTGCAAACTTCTTCGAAAGATCGTGCAGAAAATGTCATGATTGTTGATTTACTAAGAAACGATATAGGGAGAATATCACAGAGTGGCTCAATTAAGGTGTATAAACTATTTTTTATTGAGGCATATAAAACTGTATTTCAAATGACTTCGATGGTAAGTGGAACTTTAAAAAATAATACAGACTTAACTCAAATTTTAACATCGTTATTTCCTTGTGGTTCGATAACAGGTGCACCGAAACTGAATACAATGAAATATATTAAACAATTAGAAAGTTCACCTCGTGGTATATACTGCGGAGCAATTGGACTATTACTTCCAACTGAAGATGATAAAATGATTTTTAATATTCCAATTCGTACTATTGAGTATAAATATGGACAAGTGATTTATGGAGTCGGAGCAGGTATTACAATTGATTCTAAGCCAAAAGATGAAGTAAATGAATTTTACGCAAAAACCAAGATTTTGGAGATGTTATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP028470|710789:718610|717458_718610_+|AWQ24955.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKNNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQVIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >CP028470|710789:718610|711844_712531_-|AWQ24947.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >CP028470|710789:718610|714041_714626_-|AWQ24950.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVILITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNNLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >CP028470|710789:718610|710789_711845_-|AWQ24946.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >CP028470|710789:718610|715441_715861_-|AWQ24952.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >CP028470|710789:718610|712505_712979_-|AWQ24948.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIIVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >CP028470|710789:718610|714724_715438_-|AWQ24951.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVNLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPNIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >CP028470|710789:718610|715862_716531_-|AWQ24953.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >CP028470|710789:718610|716881_717475_+|AWQ24954.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDAAIIMAFEHIRFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >CP028470|710789:718610|713321_713762_-|AWQ24949.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAVAAVLTLGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
730583 : 744551
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP028470|730583:744551|DBSCAN-SWA TATGAAAGAACAACTTAATCAACTATCAGCATATCAGCCTGGTTTATCTCCAAGGGCATTGAAAGAAAAGTATGGCATTGAAGGAGATTTATATAAACTTGCATCAAATGAAAATTTGTATGGACCATCGCCAAAAGTTAAAGAAGCGATATCAGCACACTTAGATGAGTTATATTATTATCCTGAAACAGGATCACCGACATTAAAAGCGGCGATTAGTAAACATTTAAATGTAGATCAATCACGCATTTTATTTGGTGCGGGATTAGATGAAGTTATATTAATGATTTCTAGAGCTGTATTAACGCCAGGGGATACTATTGTTACAAGTGAAGCGACATTCGGTCAATATTATCACAATGCGATTGTTGAATCAGCTAATGTGATACAAGTACCTTTAAAAGATGGTGGCTTCGATTTAGAAGGTATTTTAAAAGAAGTTAATGAAGATACGTCATTGGTATGGTTATGTAATCCAAATAATCCTACAGGTACATATTTTAATCATGAGAGCTTAGATTCGTTTTTATCTCAAGTACCTCCACATGTACCAGTAATTATAGATGAAGCTTATTTTGAATTTGTGACAGCAGAGGACTACCCGGATACACTTGCTTTGCAACAAAAATATGACAATGCTTTCTTATTACGTACATTTTCAAAGGCGTATGGATTAGCGGGTTTACGTGTAGGATATGTGGTAGCAAGTGAACATGCGATTGAAAAATGGAACATCATTAGACCACCATTTAATGTGACACGTATATCTGAATACGCAGCAGTTGCAGCACTTGAAGATCAACAATATTTAAAAGAGGTAACACATAAAAATAGTGTTGAACGCGAAAGATTTTATCAATTACCTCAAAGTGAGCATTTCTTACCAAGTCAAACGAATTTTATATTTGTAAAAACAAAGCGGGTAAATGAACTTTATGAAGCGCTTTTAAATGTAGGGTGTATTACGCGACCATTTCCAACTGGTGTTAGAATTACAATTGGTTTTAAAGAACAAAATGATAAAATGCTAGAAGTTTTATCAAACTTTAAATACTAATAGAAAAGGGCACCACATGGTATGAATATGTGCCAAAATGCAGTGTGAATTATGAGGTGAGAGCATTTATTGTAAAAAGCAACAATAGATGATATTGTTTTGTATCAATTGCTTTTTTGCTATACTGAATTAATACTGATATTTTGAGGAGAAGATTAAAATGACCCGTAAATCAATCGCGATTGATATGGATGAAGTATTGGCAGATACATTAGGAGAAATCATTGATGCTGTCAATTTTAGAGCGGATTTAGGTATTAAAATGGAAGCTTTGAATGGTCAAAAACTTAAACATGTTATTCCTGAACATGATGGATTAATTACAGAAGTATTGAGAGAACCAGGCTTCTTCAGACATCTTAAAGTGATGCCGCATGCACAAGAAGTTGTAAAAAAATTAACTGAACATTATGATGTATATATTGCTACAGCAGCAATGGATGTACCAACATCATTTAGTGATAAATATGAATGGTTACTAGAGTTCTTTCCATTCTTAGATCCACAGCATTTTGTTTTTTGTGGTAGAAAAAACATTGTTAAAGCTGATTATTTAATAGATGACAATCCTAGACAGCTTGAAATTTTTACTGGTACACCGATTATGTTTACAGCAGTGCATAATATTAATGATGATCGATTTGAACGCGTAAATGGTTGGAAAGATGTAGAACAGTATTTTTTAGATAATATTGAGAAATAAAAATATATCACTTGAAGCATTTTATGTAGCAAAGATGATGGATATACTATTATGAAGTTGGGACTGGACGACGAAATAAATTTTGCGAAAATATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTCTATCTCATTATTATAAATCGGATGAATGTGTAAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGGATTTGAAAAAGGCGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAACATCAATCATTTTAGTGGCATGCGCCAAAATTATATGTCTGTTTTTGAAACAGGGTAATAGCTTAAAGCTAATAAAAACGAATATAAGGTGCGTTGAATCTTATGATTACACTCTAAACCTAATATAATATCCCGTTAAGATCATTCCGGATGCTTACAAATCATTGACAGTAAGTAACTGAATGGCATTTGGTATAACCTCAATATCAATAGGTGTTTCTAATGAAATTTCGCCATCAATATCAACTTTCATTGCTGGATCTGTTGTAAGTGAAATCTTTTTACCAGGTATATGCTCAATACCTTGAGTAATTTCATTCCAATTCATGCTATCACGCTTTTTAAAAATATCATTTAAAATACTGAAACTTTGTTCATTAAAAATGAAAGTGTTCAGTTCACCATCTTGAGGAGACAAATCAGTCAATGGTATACGACTACCACCAATGAATGGACCATTTGCTGTAAGTATCATGGTCGTTTCGCCAGAATATGTCTTATCATCAATTGATAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTAACAGTTGATCCAATATAACTTAATTTACCAAATATATCTTTTGACCCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATTAGACCTAAGCCAACAAAGTTGAGTGCATATTGATTATTTACTTTTATTACATCGTATGTACCAACTTGTGCAGAAATCATTTGTTCACTAGCTTGTTTATGATTAGGTGCAATATTTAGCGTTTTTGTAAAATCATTAAAAGTACCGCCTGGTAAAATGCCGATAGGGAGTTGAAGATTATGTGCCATAACACCATTTATAAGTTCGTTAACCGTGCCATCACCGCCAAGAATAAATAATATATCTACATCTTTTGCATAGTTTTTAGTTTTGATTTCTTGGCAATATTTAATAATGTCACCTTCGCTTTCACTCAATTGAATAGAAAGATGCTTACAAATTGAACTTAATGCTGTTGTAACTTCCCCAATACCTTGATTAATATTTTTTAATCCACTGTGTTCATGGTAAAAGAGGACACCATGTGTATATTTGTTTTCCATAGTTTAGCCTACTTTCTAAAAATTGGTTCATTAAATATATATACCCACTTTTAATTGCTAATACCAAAAATATGTTTTTAAATAGAGAAAATGGTAATAAATGAAATTAATCTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATAACTTGAATTTAATTAATGGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTAATTTAGGTCAACAATATTAACGAATACCTTTCATTGCTTTAATAATTAAAGGTGAGAATGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAAGAAAATAAAGTAATTTGTTTGACCTAGTGGTTCTATTAACTTAACTAATGTACCATTGATTGCTTGTGCAGAAGCGTTAGTTAAGTACCAAATACTCATCATTTGGGCATTAAATGCTTTAGGTGCTAACTTAACAGCAGCACTATTACCCGTTGGTGATAAGCATAGCTCACCGATAACACAAATAATGTACGATAAAATAACCCAGTTAACTGAGAAGTTTGATGAACCTGATGCATAACCTACAATACCAATTAGTATGTATGACGCACCTGCTAAGAACGTACCAATTGCAAATTTTACTGGCAGGCTAGGTTGTTTAGTTCCAAGCTTTTGCCATAAAAGTGAAATAATTGGAGCTAATAATAAAATAAATAATGGGTTAATTGATTGGAAGATCGCTTCACCAAAGTTTGTTTTCCAACCAAATAAGTTTAATTTCATATCTGAATGTTCAATTCCATAAATGTTTAATACATTAGACCCTTGTTCTTGAATAGCCCAGAACACCATTCCAAGAATAAATAATGGAATAAATGCTTTAACACGAGAACGTTCAGTATCAGTGACATCTTTACTTCTAATAATTAAAGTGAAGTAAATGATTGGTAATGCAATACCTAATACTAAAACAGTATTACTAACTAAGTTAAATGATAATGAGTTAGTTAATGCACCAATAACGATAATTAATACAATTGCTAAGACAACACTTCCGATAATAAGACCATACTTTTTCTTTTCAGCTGGTGTCAATGGGTTAGTAGGTTTCATACCAACGCTACCTAAGTTTTTGCGGTTGAAAAGTACATACCATACTAAACCTAATGCCATACCAACTGCTGCAATCAAGAATCCGCCGTGGAAGTTTTTAACATTAACAAAGTGTTGCAAAATAATAGGTGATAATAATGCACCCATATTAACTGACATATAGAAAATAACAAAACCTGCATCCATACGTCTATCATTTTCAGGATATAAACGGCCAACGATATTTGAAATATTTGGCTTCATTAAACCTGAACCAATAATGATGAAGAACATTGATGTGAATAAGCCGATTAATGCAAATGGTAAGCTTAAACAAATATGTCCGATAATAATAAAGACTGCACCTAATAAAGTAGCGCCTCTAGTACCTGTAATTCTGTCAGCAATCCATCCGCCTGGTATTGATGTCATATAGATTAATGAACCATAAACTGACATAATTGACATAGCTGTTGTTTTATCAATTCCAAGGCCATTATCTGTTACGGCAAAGTACATGTAGAAAATGAGTAGGGCACGCATGCCATAATAACTAAACCTTTCCCAGAACTCTACAAAGAAGAGTACACCTAGTCCTCGAGGATGCCCGAAAAATCCTGTTTGAGGTATGTCTTGAATTTGATTTCCATGGGAGTTTTGTTGTGTCATTTATACATCCCATCCTTTCTTCCCCTAATACAATAGTTTAAGTAAATTTGATTGTACCTTATCAACTAAATATTCCAATAAATCACAAAAAAATAAAAATATTGAGAATATTCTGTTATTAAGCGCGCACAATTAATTAGAGATAATATAAAAAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP028470|730583:744551|733921_735427_-|AWQ24969.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >CP028470|730583:744551|735764_736265_-|AWQ24970.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >CP028470|730583:744551|736284_737151_-|AWQ24971.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGKLSSQPLLLTRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >CP028470|730583:744551|741878_742850_+|AWQ24976.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGKILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDIFHLSDSQQNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSIGGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >CP028470|730583:744551|738312_740418_+|AWQ24974.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRVRRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMVIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >CP028470|730583:744551|743789_744551_+|AWQ24978.1|DBSCAN-SWA MIQVGNLTKTINNQMILDDISIEIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDEGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHEIVNDALDLLQLQDIRKRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMDIQIEHIKNQRICLYFKD >CP028470|730583:744551|732734_733652_-|AWQ24967.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSESEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMAHNLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKVNNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >CP028470|730583:744551|737535_737802_+|AWQ24972.1|DBSCAN-SWA MCLMYNETHNIVLVKQKRHNILCFVCKCFIYEEIKFKSNLTQKFNSHYQLIVIFLENVLSKWKISNDVNTTYSDFYTFNPYKLLFSQI >CP028470|730583:744551|742836_743793_+|AWQ24977.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIVVTFLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVSFSAVLLVILLVITIFLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >CP028470|730583:744551|730583_731639_+|AWQ24965.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEHFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKY >CP028470|730583:744551|731799_732342_+|AWQ24966.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNGWKDVEQYFLDNIEK >CP028470|730583:744551|733742_733844_+|AWQ24968.1|DBSCAN-SWA MVINEINLYRVGRENIVIAVYNEHIKFLFILIT >CP028470|730583:744551|737951_738350_+|AWQ24973.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >CP028470|730583:744551|740537_741509_+|AWQ24975.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK |
14 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
916768 : 971648
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP028470|916768:971648|DBSCAN-SWA 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54 | Lactococcus_phage(33.33%) | protease,transposase,holin,tRNA,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
991341 : 999814
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP028470|991341:999814|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP028470|991341:999814|991810_992935_+|AWQ25209.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVAVLDPAEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITYFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >CP028470|991341:999814|994571_996761_+|AWQ25213.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >CP028470|991341:999814|996739_998224_+|AWQ25214.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALRESLRKIKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >CP028470|991341:999814|992938_993643_+|AWQ25210.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETDQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHIKLLNIATDKDIETLKTKALEINQVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >CP028470|991341:999814|998216_999245_+|AWQ25215.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >CP028470|991341:999814|999247_999814_+|AWQ25216.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHGIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNKDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFAGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRKCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >CP028470|991341:999814|991341_991824_+|AWQ25208.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARESGIDIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNHYESSLIQKVEDMQNELQ >CP028470|991341:999814|993907_994579_+|AWQ25212.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEKLEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >CP028470|991341:999814|993642_993906_+|AWQ25211.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1259759 : 1266117
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP028470|1259759:1266117|DBSCAN-SWA TATGAATTGCTATGATGAAATATTCAATACAATCAAAGAATTGATAGAAAACAAAGAGATATCGAGTTATCAAATTAATAAAGATACTGGGATAAGTTACGGTAATATTAATGCTATGCGCCGTAGAGAAAGAAGAATAGAAAATTTAAGCTTAAAGAATGCAAAGATCTTATATGAATATGCGAAAAAGGTATTGTAATATAAGCATTGAGTTCAATAGGCATACAATAACTGCCCAAACTAGTGACTGAGTGGGTGCTTTTATAGTATTAAAAGTTTTCTAAAAGTGAAAGAAATCATGTTTAGTGATTTACTTATGTTTTTCAAAATAGTATAATAATTTTATACAATATATAGAGCTTCAGTATACCTTTTGAGTATATATGGAGTTCTTTCTTTTTATACAAGATGTATATGTATAAATGGAAATATTTAATACATTACATAAAAACCTTTAGGTGCACTTAGAGGGATGTTAATCATAAAAAAAGAGATTTTGAAAAATATAGGCTATTATACTTTAGAATTACAAATTATAAATCTTGCCAGTGGATATGGGAGTTCAACATGTCACTTACCCCAATTTGTGGAATGTTAAATAACTATAAAGAGGAAAGGAGAAAAAATGATAAGAATGGTTAAAGAAAAAGAACGAATAGCAAAATTAAATTTCGAATAGCTGTGACGAGCTTAATAATTCAAGTACTTAATTTTATCAAATCGTTCTTTTAAAAAGGTAAAGGGCAAAAGACCTTTACCACATTAAATAGGGAGGTGGTATTTATGACAAGAGAATTAAGGAAAAAATTAACTCTCTATCTTAACATTGCAACTTTAATATTATTTATTATTAATTTAACTAGAAAAAAATAAATTATTCTTTCATTTTGACAAAAATTATGAACCAGTTTAAAGAAATTTATAATACAATAGAAAAATTACTAAATGATAAATCAATATCTAATTATAGAATTAATCAAGACACTGATGTTTCTTATGGTGGTATAAGTGAATTAAGAAGCGGGAAAAGAAAAGTGAATAATTTAACTTTAGAAACAGCGGAAAAACTCTATAATTACCAAAAACAATTAGAAATAATGATTGAAGATTAAAATAAGGCCATATTTTTGAAATATCATGGAGTGAGCCTTTTAAGTCATCTAATTTTAAAGTATATTAAATATGGATAACTTAATGTGAATATAAATAAAAAATTATCAAATAATATAATATAGAATAGATGGAGACAAGAAATTTTATCAATATATAAAAAAAACGCCAATACTATTAGGTATTAGTTTATGAATTAACTAGTTTGGCAACTAGAAAAAAACAATGTATTGCTAAACGTAGTTACTGCATTAGGATTATTATAATTATAAATAGAAAGAGAGTGTGATTAATAATGAATGAGATTGAAACTATTATAAGTGAAATAGAAAAGTTATTAACTAACAATACACCATATAGTATTTCAAAAAACTCAGGTGTACCACGTCAAACAGTTACTGATTTAAAGGTAGGTAAAACTAAAATAAAAGAAGCTAAATTTAAAACGATAATCAAGTTATATGAATATCAAAGAACATTAGAAAATAAAACAGAATGTTAACAAAAATATTTTGTTAGGTTAGGTGGACAAGAAATTAAATTTCTAATGATTTCATGGTTGTCTGTCCACGTTTTGTCCACCTCAATAAGATAATCTCTTAGTTTTAGAAATTGTACATGGTTAAATAATCAAAAATGCATATTATGAAATTATCATTGCCATTAAATCTTGAATGATCTTTAAGCGATGATATAAAAGGCTGAACACAGTAAATAAGTTAACTTTAATGCAGTATTCTATACTATACATATTTTGTAATAATGTTTATGCACATAATTTTTCATTGACAATTTTTTATATTAAATTGTGTAATTGGCATATATGATGATTTGTGATAATTATATTGTAATATAGCATTTGGTTTTATGATTCTAAAATTAATAGATTTGAAAAGTATACTTTATTTCATGAAAGTTTTTGGTACATTTATTTGAAAATGTTTTTATTACAAAGTTACATGGCTAAATGTTTCTTAACAAAATTAATTTTTCGAGTGTAAAGAATCGTGTGGTAAACATAATTTATATAGATTATAAGGAGGTGAAAATGGTCGAGGAAGTTAAAACGATAAAATAGTTTGAATGTTTTGATTTCAATTCTGGTAGGACTATTGAATTTGCAATCTAATAAGAATGTGAGGTTTGATTTAATATGAAGTCATATTCTTTGAATAAAATATTACTTTCTCACCATTAGTAAAATGAAGATGACTATTAAAGTGCGAAAAACAAATAAAAAAGAGAAAATAGAATTTTTAATAGGGACGTTTATAATTATTTTAGTAATATTAGGGTTCAAAATTATGAAATAAATGTATAGTATTTGAGAAGTCTATATGACTCCGGAAAAATTAAATTCTAAAGATATCTCAATATCTCAAATTTAATAGACTACTGGAGTTAGTAGTTTGAATATTGAAAGACACTAATCTAATAAAAATACATAAAAGGTTAAACTTTAGAAGTGGCTGTAAACTTCAATGAATACTAAACATTGAAGTTTTGTAAAAGGCGTAAGGTATACAAAACAAATCGTTTATCTTTGACAAAGTAATTGATGATGAAAAGTCGTTAATATGTAGAAACAAAAATTGAAAATATAAAATTTAACTATTATGAAGTGATGATAGCCATTAATGAATAGAAAAATAATAAAATCATTTATAGATAAAAAATACGTTAAGTTCACAGAATTTCGAAAAAAAGCAGAAAACATTGTACAGATATGGAGATGAAAAAATGTCAGAATACAAGAAAAAAATAATTGAATTAATTGAAAGTAATTTAACAGGATATGAAATTTCTAAAAAAACTGGAGTTTCTCAATACGTACTTTCACAATTAAGACAGGGCAAACGCGAAGTAGATAATCTAACCCTGAATACAACAGAAAAATTATATGAATATGCCAATAAAGTTTTGTAATTTAACTAATGTATAAATTAATCAAGCTATGTTTATTTGATTTAACTATTAATAAAAATCATATGGTGAATGGATATTATAATAATTAAAATACAAAAATAGTAGATTCCAATTTGTGAAAAAGGAGTATGTCGTTTCATTTAGAATTTATTGCACGAAATTAGCATCGAATAAGGGAAAATAAGTGTTAAGTTTTAAATGATAAAAAAGATTGGAATGGATCGTCTTGAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCGACTTCGAAGGGGGCATTTTCATTAAATTGTTATAGCTTTTTATATTTGTATAATGAACATATAAGTTTAAGAAGGTGCGAGTGAAGGAAATAAAAAAGCTCAAATGTACCAAATTGTTAATCTTAATAAATCTCTACTTTATAAAGATTGAATGGACATTCGAGCGTTAATCAGTCAGGAGGGACTTTCCCTCCTACAATTTAATAATAATACTTGCTTCACCACTATACAAGGAGTGAGTTGTTATGTTCAAAGTGAATTATTCGATTTTAAGTTATTATCCAGAATATAATATCGCAGTAAGTTGGCAACGTTTAAGAGAAGGAAAAACAATAAAAAACAAGATTTAATACTGCTGCGTCATGAGGCGCTTGAACATTATTTGATGAATAAGTATAATTTCAACTATGATTATGCACATAAAATTGTATCAAAAAAATACGATTATTCAATTTTTATAAAAAAGAAGGTGGATTAAATGCTTACATTAATAAAATTGAAAGAAGATGAACAGGTTATAATATATGAATATATACCTGAAGATGATATAAGTAACGGTAAAGGTTCAGTAACTTTTAATAAAAAAGATGCAGAGGTTATAGATTTCTCATTATCTGAAATAGAAAATGAAGAATATTTTATGTTATATCGTAATAAGTCTTTTTCTGTAGTAAGAGACTTTATCGAGAAGCAAGAATTTCCCGAAAATTATAAAATAGCATGGTATTAAAGCATCCTTTCTACACAGATAAAGAGAAAGCGATGCTATTTTTATATGCTTTTTTCATTATTCGTTGAAAAAGAAGAGTCACAAAAGTTAACATATTTAAAAGAACTTGGTGAAGATGGCGAATATAAATATGTTGCCAAAATAGATAGTAAAACATCTAAATTATGTCATTCACTCAACGGAAAAATATTTAAAGTTAAAGATATGATACCAGGTGTGAATGCGCCACCTATGCATCCTTGGTGTAGAAGTGTCAATAGCGGTTTAAAAATGCTGTTTTATGGCGGTTTGAAAATGTCGTTTTTTAGCGGTTTAAGATTGTCGTATATTTAATGATTTTTCGGTTTTATAATCTTTTAATCGATATGATTCTCCAGTAATTTTAAATACTTTTGAATGGTGAACTAACCGATCAATTATAGCTGCTGATACAATCTTATTACTAAATGACTCTCCCCAACTCGAAAATGGAATATTAGTCGTAATTATTGTTGATTTCCACTCATACCTTAGTGACATTAACTGGTAGAATAAATCAGCTTGTTCTTTGGTGATGGGAGTATAACCAATTTCATCAATGATAAGTAACTCTATTCTGCTTAATTGCTTTAATGTTTTATTAATGATTCCTTTGGAATCTGAGACAGTTAATAAGTCTATTAATTCTTTGAAAGTATAGAATCTAGTCTTTATATTTTGCTTACATGCCTCTATTCCTAATGAGATTGCTAGGTGTGTTTTACCAACACCACTATTACCTAAGAAACAAATATTTATACTATCTTCTAAAAAATGCATAGATTTTAAAGTGAGTATTTCTTGTTGATTTATACTAGGTTGAAACATGAAATCAAAATCATGTAAATATTTTATTTTAGGGAAACGTGCTGAATTCACAGCACGTTTAAATTTTAATTCTGATTGATATTCTATTTCTTTTTCCGTTAAATCAATCAATATTTCAGTTAAAGATTTCTCATTTTTAGAAAGTAATTCAATATAGTTTGGATAATAATCTTTGAATTTTTTTAGTTTTAATATTTCAAAGTTATTAAGTAATTTTTGATGGTTCGTATTCATCGAAAGTCCTCCTAAATTTCGTCATACAGTAATAATGAATTTTCTATATACGTAAGAATTTCTTTGTCATCCTTATGTTTAAATACATCTGATTTTAATATTTCACTCATATCTTCAACGATATAATTAAATTTTCTTTCGGATAGATTATGCCGTCTTATTAATTCACCATCATAATAAATCAGCAATTCATCAGTAGAATTATTGAATATCACTTGTACTTCTTCACCAATGTATTTAGTAGGTACCGAGTATTTACCTTTTCTAAAGTTAATCATCGATTCTTTAGAAACGATTCTTATACACTCATTTTCGATGTAAGTATCTAGTAACTTGGCATTAAAAGAATTTAAATGTTCTTTTTCTTCATAATTGAAAACGTCGATAGGTCGTTGTTCTGTTGCTTGTGAAATTTCTAAGTGATTCAATTCGTGACATAAATCGTTTACTAGCCCAATAAGTTCTACAGCATCATAAAATTCATAATCGTATGGTCTTAAACGCTGTTCAACAAATTTAGCTAATGATTCAACAGACCCTTTTGTTTGAGGACGATAGGGTCTACAAGCAATAGGTTCAAAGTTGGCATCCTTACTAAATTGATAAAATAAATTATTAAAGACGACTTTTTTATATTGTGTTCTAGGTCGATCAACTACAGTTCTCATATTATCGAACCAGATTTCTTTTGGAACCCCTTCGGTGTATTCAAAAGCGTCTTTTAAACATTCAAATAAGGTATCTTGTTTTCTATCCCAAGTTAATGTGATATACTTCATTTTTGAATAGTGTAGAACGTAAAGAAAGATGTTGAATTGATAAGTTCTGCCAAACTTATCATGCATTACCATATCTTCTTTCCAGTCTACTTGAGCAGCTATACCGGGATTAGTTTCTACGCGTATAGTTGCTTTTTTAGTCTCATTTTGTTTTTTATTTTTACAGTATTCTCGTAGAATAGTATATTTACCTTCATAACCCTTTTTCTCTATATATTTAAAAATGGCCATAGCTGTACATCCTAATTCAATTTTTTTATTAATAATTTCTTTAAATGGATCTAGTTTTGATGCTTTCTTATTTTGTTGTCTTTTCTTCAATCGTTCTAATTCATTTTCTTTTCCTGCTTCATAATATTTTTTAACTGTTCTTGGATCACAATTATATTGTCGACCAAGCTCGGCATAATTTGGTTTAATACCTTTCATAATGTAAAATAGCACTCCTTCATAAATGTCATGTCTCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP028470|1259759:1266117|1260645_1260870_+|AWQ25458.1|DBSCAN-SWA MTKIMNQFKEIYNTIEKLLNDKSISNYRINQDTDVSYGGISELRSGKRKVNNLTLETAEKLYNYQKQLEIMIED >CP028470|1259759:1266117|1263305_1263410_+|AWQ25462.1|DBSCAN-SWA MFKVNYSILSYYPEYNIAVSWQRLREGKTIKNKI >CP028470|1259759:1266117|1263538_1263790_+|AWQ25464.1|DBSCAN-SWA MLTLIKLKEDEQVIIYEYIPEDDISNGKGSVTFNKKDAEVIDFSLSEIENEEYFMLYRNKSFSVVRDFIEKQEFPENYKIAWY >CP028470|1259759:1266117|1259759_1259957_+|AWQ25457.1|DBSCAN-SWA MNCYDEIFNTIKELIENKEISSYQINKDTGISYGNINAMRRRERRIENLSLKNAKILYEYAKKVL >CP028470|1259759:1266117|1262608_1262794_+|AWQ25461.1|DBSCAN-SWA MSEYKKKIIELIESNLTGYEISKKTGVSQYVLSQLRQGKREVDNLTLNTTEKLYEYANKVL >CP028470|1259759:1266117|1262070_1262181_+|AWQ25460.1|DBSCAN-SWA MKMTIKVRKTNKKEKIEFLIGTFIIILVILGFKIMK >CP028470|1259759:1266117|1261163_1261370_+|AWQ25459.1|DBSCAN-SWA MNEIETIISEIEKLLTNNTPYSISKNSGVPRQTVTDLKVGKTKIKEAKFKTIIKLYEYQRTLENKTEC >CP028470|1259759:1266117|1263364_1263538_+|AWQ25463.1|DBSCAN-SWA MATFKRRKNNKKQDLILLRHEALEHYLMNKYNFNYDYAHKIVSKKYDYSIFIKKKVD >CP028470|1259759:1266117|1264102_1264870_-|AWQ25465.1|DBSCAN-SWA MNTNHQKLLNNFEILKLKKFKDYYPNYIELLSKNEKSLTEILIDLTEKEIEYQSELKFKRAVNSARFPKIKYLHDFDFMFQPSINQQEILTLKSMHFLEDSINICFLGNSGVGKTHLAISLGIEACKQNIKTRFYTFKELIDLLTVSDSKGIINKTLKQLSRIELLIIDEIGYTPITKEQADLFYQLMSLRYEWKSTIITTNIPFSSWGESFSNKIVSAAIIDRLVHHSKVFKITGESYRLKDYKTEKSLNIRQS >CP028470|1259759:1266117|1264881_1266117_-|AWQ25466.1|transposase|DBSCAN-SWA MRHDIYEGVLFYIMKGIKPNYAELGRQYNCDPRTVKKYYEAGKENELERLKKRQQNKKASKLDPFKEIINKKIELGCTAMAIFKYIEKKGYEGKYTILREYCKNKKQNETKKATIRVETNPGIAAQVDWKEDMVMHDKFGRTYQFNIFLYVLHYSKMKYITLTWDRKQDTLFECLKDAFEYTEGVPKEIWFDNMRTVVDRPRTQYKKVVFNNLFYQFSKDANFEPIACRPYRPQTKGSVESLAKFVEQRLRPYDYEFYDAVELIGLVNDLCHELNHLEISQATEQRPIDVFNYEEKEHLNSFNAKLLDTYIENECIRIVSKESMINFRKGKYSVPTKYIGEEVQVIFNNSTDELLIYYDGELIRRHNLSERKFNYIVEDMSEILKSDVFKHKDDKEILTYIENSLLLYDEI |
10 | Staphylococcus_phage(66.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1549819 : 1558149
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP028470|1549819:1558149|DBSCAN-SWA ATTAATTACAACATTCTCGATTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCAATATCATGAGTAACTAAGATAATAGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTCGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCGAGCAATCATTACACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCATTATCTTTGCTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAATCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATTGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTCTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGCATTCAACTATACAACTCCTAGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAATAAGACAAAATAAAGAGATATGCCCCCTTCAAGTTTTATTTATCGCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATTTTATTGTTGCATAACCTTATTTTTTAATTCTGGGTCAAATTGCTGTTGTTTCAACATTTCAATTTCAAGTTTATATGGCGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGTGTTTCTAAGATTTTCGGAATATCTTTAAAACTATCATGATGCACAATGTAATTTAATGCATCAAAACCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCGCCACGGTCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTGATTCTGTCGACTCCAATGATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAGTCCTCTTTCACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAACATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATACGTGCTAACTCTTCAAACGAGCGACCAATCTCAGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCAGCTCCAACATGCGCACCTGGATGTAATACAATATCTTTAGCGCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGAACAACAATATTAGATAAGCCATATTTTTCCATCACTTCATGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTATTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATAAATGTTGTTTCACCATATTCATGCGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAATTGTTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGCTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAAAACAAAACCGCGATTTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTTATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGACCAGTTCGTCCGACTCTATGTGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCAATAACGTATTGGAATTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGTGGCGTTAAACCACCATGAATCATACCAACTTTAATACCAGCTTCATTTAGTGAACGTGCTAAATCATTTGCATTATCTCTACTATTACAGAAAATAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTCTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAAAAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTTAAAAATGGTTGTAACTGTTGTGGAATTGTAGCACTAAACACCGCAATATTTGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCAATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGATCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTTTAGCTAAGTCATTAATTCTAGTAGGGGTGCCTATAATCAATTGTGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCTTTCTCTATATCTGTACCACCAATAAAAACTTTAACTGAAACGCCAGCTTTAAATTGGCTTAAATGGTTCGCTGCATCGTATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACTACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCAATTAACTGCATTAATGGTAATAAAAATGCATGAGATTTCCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTCTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTATATGTTCATCTTTACTATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCGAAATTTCAAAATTTAGAAATCCCGAGATTTTAGTTTAAATATATTGAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTATATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAACGTTTTTAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAGTTCACACCATGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCGCCTTGTTGGACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCAATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACTTACCAACAAAACGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAATATCAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGGGATGTTTGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGATGGTATTGTTTAATTAATTGCTCAGCCCTTGACTTTTGATATGCATCTATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGCCCTCTTCCTTCACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGTGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATGGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACATCTTGTTGATTATTGATTATTGAAATGTTCTTCAAACCCATCGCCTTCGCCAACATCATATTGACACCATACGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATCGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATAATCAAACCATAACCATTAGCTTTTAATGATGTTACGCCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAACCTTTTTCGATTGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTTCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTACTAAATGGCACATGATGATCTAACAATGTCATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCGTCATTAATTTGAGCTAAACGTTGATGATGTTGTTCAGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTGTTCAGCAATTTTGGTCCGAATTTCAATTCATCAGATGATAGCTCTATTAATTGTGTAGAATATTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAATTTTCAGTTTGGATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCAATAAGTGGTCCGCCCATACCACAAATTGTGATATTATCGATTACGTCCTCGGGATGAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTCTATCTTCTAATTGATTTGCAGCTACATTTTTCACTGCAGCTTGAAAGGGGCCTTGAATAACTTCTCCTGCAATACCGCATTCGCATAAATGGTTTTGAATTGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTACCTTGTTTTAAAAATCGACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGTCTTTCAAACGTTTACTACGACTTGGATGTCTTAATTTTCTAAGTGCTTTTGCTTCAATTTGTCGAATACGTTCACGTGTAACACCGAAAACTTTACCAACTTCTTCAAGTGTTCTTGTTCTGCCGTCATCAAGACCAAATCTTAATCGTAATACATTTTCTTCTCTATCAGTTAATGTATCAAGCACATCTTCTAATTGCTCTTTTAATAATTCATAAGCAGCATGATCTGAAGGACTTTGTGCTTCCTGATCCTCAATAAAGTCTCCTAAATGACTATCATCTTCTTCACCAATTGGTGTTTCTAATGAAACAGGTTCTTGCGCAATTTTTAAAATTTCACGAACTTTTTCTGCTGGTAAATCCATTTCTTCACCAATTTCTTCTGGTGCTGGATCTCGACCTAAGTCCTGTAATAATTGACGTTGAACACGAATTAATTTATTAATTGTTTCTACCATATGCACAGGGATACGAATCGTACGTGCTTGGTCAGCAATTGCACGAGTGATTGCTTGTCTAATCCACCATGTTGCATATGTTGAAAACTTAAATCCTTTGTTAAAGTCAAATTTTTCAACAGCTTTAATAAGACCCATATTACCTTCTTGGATTAAATCAAGGAATAACATACCACGACCTACGTATCTTTTAGCAATACTTACAACTAAACGTAAGTTCGCTTCTGCAAGTCTTGATTTTGCTACTTCATCACCTTGTTCAATACGTTTGGCTAATTCGATTTCTTCTTGTGCACTTAATAAGTTAACACGCCCAATTTCTTTAAGGTACATACGAACTGGGTCATTTATTTTAACACCTGGAGGGGCACTAAGATCACTTGGATTCAGTTTCTCGTCAGTATCTGAACTATCTTTTTCATTAACTAGTGAAATATCATTATCATTTAATTGATCAAAGAAATCATCCATTTGATCAGAGTCGATATCAAAATTCTGAAGTTTTTCAGCAATTTCTTCATGACTTAAATGACCCTCTTTTTTACCTTTTTCAATTAATTGCTTCTTAACATCTTCTAATGTTAATGTCGGATCAATTGTTTGTTTTTTAATTTTAACTGTGTTATCAGACATGAAACGGCCTCCCGATTTTAAATATGAACATTCGAAATTTATTCAATATTGCTATTTTAAACTAAATTCTTAATTAATTCATCCATATTTTTAATTTTATTTTACAAATTGGAACTAATCCCAATATTTATTTTTCAATAGTGTTGTTTAAATGCGGTAACTATCATTTACCCTTATACATTTTGACATAATCATTATTCGTATTATTCTTTAAAATCACATGCTACATGCGTTCTTTATTCTTAGCAACAATTTGCTGTAAATAGTATTTTTGTAATTCTACATCGCCAATCCTTGTAGCTTCCCTTAATTTATGATTCAATGACTCAATTGTTTCTTGTCCTTTTTCATTAATAACATTGACATAATCATCAATTTCATTTTCATATGGTTCGTCATTCAAATTATATTGTTCTAAGCTAATTAGTGTTTCTCTCAACTCATTTGAATTAACATACTGTACAGCATCACTGATATTATATTGATCATTTTCCGCATAAAAATCATGTAAGACTTCGAATACATATTTAAAATGCTGATTTGTGAAGTTATCCTTATCAACACTTTCATAATAATTTAAAAATGTATCTTTATCTCTCATTAAATGTTTTAAAAATGCTCGCTCCGCTTTTTCTTGACGGCTCAAATTGTCAAATTGTGCCATACCAATTGGCTCAGGTTCAATGTAACCTCCATACTCATCATAACCGCCATACTCATCTTCTGGATAATAATTGGCTGGTGCTTGATTGAATTGTATTTCGTTAGCTAACTGCTCAGGACTAACATTGAAAAATGGCGCAACATCATTTATAGCCTTTTGTTGCAGAATTGATGACTTCATAAGTGAAATGTCATGACTCAGTTCTTTCAAATAACGTTCATATGAAAGGTCATTATGTGCAATTTCATCTTTTAATATACTTACTTTATAATGTGCAAATGACTTTTTGTCATTTTTCACAAAAGTAGTAAATGCGTCGTTGCCATACTTACCAATGTATTCATCCGGATCCATGCCAGATGGCAATTGTATAACAAATACATTTAGCCCTTGCTGTAACAAATGTTGACCTGTTTTAAGTGTTGCTTCACTACCCGCAAAATCCCCATCAAACATTAATGTTATATTTGATGTTAACTTTCGTATAAAGGTGATATGTTCATCTGACAACTGTGTACCCATTGTTGCAACAACGTTTTTCAAGCCAGCAGTATCAGATTTTATAACATCCATAAAACCTTCTAGTAATACAATTTCATCTAATTTTCTAATTGATTTACGTGCTTTATCTAAGTTATATAACAACTTTCTTTTTTGAAAGATAGGCGTTTCAGGACTATTTAAGTATTTTGGTTCTTGACCGGTATATGTTCGACCTGAATATCCAACAATTCTTCCTTGCGCATTTTTCAAAGGAAACATAATTCGATTTCGAAATCTATCGTAATAACTGAAATTTTCTTCGTTACGTGATAATAATCCGGCTTCATATGCTAATTCAATATCGTAACCCTTTTTTTGAAGAAAATCATGACAAAAATGTGAGCTGTCGGGTGCAAAGCCAATGCCTCGCTCTTTAATAAGCGCATCTGTAAAACCACGTTCTTGTAAGTATGTTAATGCTTGTTCGCCTTCGACTGTCTTTGTTAAAGCGTAATAATAAAATTCTTGTATTAACTCATGCATTTCAATCATTTGTAAATCATCAGAAGCAATTTGAACATTTGAGTTAGATTGTGTTGCCTCAATATCTACAGCAACATTAACTCTATCACCTAATTCTTTAACCGCTTCAACAAATGATATGTCTTTAATTTCTTGAGTAAATTGAAAAACATTGCCACCTTTTTTACAACCAAAACAATGACAAATTTGTTTATCTTCAGAAACTGTAAATGAAGGTGTCTTTTCATCATGAAAAGGACACAAACCTATATAATTGCGTCCTCTCTTTTCTAATTTTACATATTCACTTACCAAGTCTAAAATGTCGGTTTTATCTTTTATTTCATTAATGATCGATTGATCTATTCGCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP028470|1549819:1558149|1551630_1552977_-|AWQ25729.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIENRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >CP028470|1549819:1558149|1553090_1554191_-|AWQ25730.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFSTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPYGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDAYQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGKSNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI >CP028470|1549819:1558149|1550730_1551621_-|AWQ25728.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >CP028470|1549819:1558149|1554193_1554871_-|AWQ25731.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCECGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLEDRIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL >CP028470|1549819:1558149|1549819_1550605_-|AWQ25727.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >CP028470|1549819:1558149|1556331_1558149_-|AWQ25733.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTTFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKAINDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYNLNDEPYENEIDDYVNVINEKGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >CP028470|1549819:1558149|1555001_1556108_-|AWQ25732.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD |
7 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1627483 : 1636526
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP028470|1627483:1636526|DBSCAN-SWA ATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATACCGCCTAATTTTTCAACTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTTAAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAAGCCAATCCCCATTGAATAAGCTACAGGACAGCCAATGATAAAGCCACGCGCTTCAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATTGATATACTTTGCTGGAATCAATCGATCTTTTATCAGGTTGTTGATTGATTCGAATTAAACCATCTTCTTGTGTTACAAATTTTAAATCTAAGAAAACTTTCAACATGAATTTAAGTGTATCTGGTTTCACACTTAAATGTTGACACAATAACATACCCTCTTTCTGGATATTTGTTTCTTGTTTAGTTATTAATGCTTTATAACACTTTTTAAAAATATCCATATTAGGTATACCATCGAAGTAAATCGAATGATTATGTTGCAAAACTATATAAAGTTGAGAAAATTGCAGTTGTTGCAAGGAATTAGACAAGTCTTCCATTGACGTTGGTAAATCTCTTAATACTACTTTATCAGTTTGATGTTTAATTTCTTCACCATAATAATATTCATTCGCATTTACTTTATCACTTTTAGGATGAATAAGCACGACAATATTTTCATCATTTTCTGTAAAAGGTAAACTTTTTCGCTTACTTCTATAATCTAATATTTGCTGTTCATTCATCGCAATATCTTGAATAATTAATTGCGGTGATTGATTACCATTCCATTCGTTGATTTGAACAGATCCTAATATATTAATTGGCTGTTCATCTTGTAACTCAGGTTCTAAGTGACCATTTTGCCAAAATAGCGCGGCGATATTACTTTCACCAAGTGTCAATTTTAGATGATTTTTTTGTTGACCGATCGCCTTAACTGAAGAAACTGACAAATCATCCATTTCAAAAATAGGTCTAGAAAAATCTGTTCCGAAGGGTCTTAAACGATTCATATCACGAATATTTTTAATCGTTATATCATTTTCTGTTAATAATACGTCTACTGGCTTTACGGGATCTAACGAAGTTGTTTTAGATAATTCTTTCATCCATTTATTTAAACCTTCAGCTAACGATTCTATATTTTCAATATCCATCGTCATACCTGCAGCCATATGATGGCCGCCAAATTTAGCGATTAACTCTTGATGTGCTGATAGTATTTCAAACATCGACACTTGATCAATTGATCTGGCGGAACCTTTTGCATGATTTTGCTCCCTATCAATATTTAAAATTAATGTTGGCAAAGCAAATGTTTCGACAATTTTCGAAGCAACAATACCTAAGACACCTTCATGCCAATTTTCTTTTGCTAAAAGTAAAAATAAATCTCCCTTTTTAACTTTCGTTTCTGCCATAGCCATTGCTTCTTCTGTGATAGTTGCTACAATATCTTTTCTTTCACGGTTAAAATGTTCAACTTGTTCTGCTAAAAATGCAGCTTCTTCTTCGTCGTCAGTCATCAACAATTCGCAAGCTAATGATGCGTCATCTAAACGACCTACAGCATTAAGTCTAGGTCCAATAATAAAACCAATTGTTTCTTCATCAATATTGTCATTGTATCCCGCTTCTTTTAGCAACGCTTTAACAGAGGTCGGACATTGATCATTTAAGACTTTTAATCCTTGTTTCACTAATGATCGATTTTCATCAGTTAAGGATACTAAATCCGCAATGGTACCTATCGCAACTAATGCTTTAAAATAATCAGGTACATTTTCAATCAATGCTTGTGCTAATTTGTACGCAACACCTGCACCACACAATTGTTGGAACGGATAATTAAACGATGGATGCATTGGATGTACGATTGCATATGCTTCTGGTAATGTACTACCAATTTCATGATGATCAGTTACAATGACATCAACTCCTAAATCTTGAACCATTTTAATTTCATTATGACCTTGTATGCCATTATCAACAGTTATGATTAATGTTATGCCTTCATCATGAGCATTTCTAAATGCTAGTTCGTTTGGTCCATATCCTTCGGTAAAGCGGTTAGGAATATGCCATCCTACTTGTGCACCTAAAAGTTGTAATGTTGTCACTAAAATTGTAGTTGAGGTAACACCGTCGGCATCGTAATCACCATAAACTAGGATTTTCTCATCATTCGCTATCGCTCTTTTAATTCTTTCAATAGTCTTAGTCATATCGCTCAATTGCAGTGCATCATGATTGATATCTGTATCTGAGATGATGGCTTCTATTGTTTGTTCATCAATAATCGATTTACTTTCTAATATTTTTTTTACGATTGGCGTTAACTTTAATTTTGATGTTAATTCATCACTTATGTATTCAGCTGGTTTAGTTAATTTCCACTTATACTTCGGTTTAATCATATATATTTACGCCTCATTTCCAAAAGACATTATATCTAAAATTACTTTAAATAAAAAGCACTTATCTAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTATATATATTTTGTTAAATTTAAACAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAACTCTTTATTGTTTCACATACCGCTTAATTCATTTTAAACTAAAATCTTTTCATCGTTCGATTTCTTTTCTTTATATACAACTAATTTGTGTTTCGGCGATTTTTTCAGCTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACGTTACGATTGTATCATTAATTGAATAACCGACAATTGTTAATACAGCGGCGATAAATGTTAAATCTACTTCAATTCTAAATAAACTGAAAATCGCTACTATAATGAATACATCATGTAATAATGCCAATACAGATGAAAGACCCATGCGCCATTCAAATCGTAATGATACATAGATGATGATACCTATCGATGCATAGATTAATGCAAGCATTGCATTTTTTGCTAATTCCTGTCCAATAATTGGTGATACAGTATTAATTTGAGGTGTGTCACCGAATTTCGATTTAATATTATCACTCAATTTATTATCTTGAGCACGCGTTAAATCGTCTTTAAATTGAACAGTTGCTACTTTATTATCTTTACCATTGATTTGAATTTGATCCGCTTTAAGTCCACTATCTTTTACAACTTGCTCAACCTTTTGTTGAGTAATTGCTTGTTTAGATTGGAAATCTACACGTGTACCACTTGAGAAATCAATTCCTAAGTTTAACTTGAAGATATAAAGAATAACTAAACCGACAACTACAATTAAAATACTTACTCCAATTAATGGCTTAGCTAATTTAACAAAATTCCATTTCTCGAATGAAGTTTTAAGGTCATGAACATCTACACCTTCATTAATATCATGTCGTTTATTCTTTTTAACACCAAATAACCAAAATTGATTTTTGAATATATTTGATGAAACAAGTAATGATAATAAGAATCTTGATAAGAACACGGCTGTAACAAAGATCATTAGAATACCTAATAATAACATTGTCGCGAAACCTTTAACTGAACTTTCACCGAAGAAGAATAATACTGCTGCGGCGATAACTGTTGTTAAGTTAGAATCAAAAATTGTTAGGAACGAACTTTTGTTTGCTTTAGAAAAGGCTTGCTTTATCGTTCTACCTATTCGAAGTTCATCCTTAATACGCTCATACATGATAATATTGGCATCTACAGCCATACCTACACCTAATACCAACGCCGCTAATCCTGGTAAAGTTAGAACCCCGGAAATGAAATTAAATGCTACTAACGTTAGATAGATATAAGTTGTCAATGCAATAATCGCTACTAAACCAGGTAATCGGTAGAATCCAAGCATGAATAAATAAATTAATGCTACACCAATAAACGATGCAAACACAGTTTTATCTAATGCATCTTGACCAAATTGTGCACCTACTGAGTTTGAATAAATTTCTTTCAAGTCAACTGGTAAAGAACCTGCATTTAACAATTCGGCGATTTGTTTTGCTTTTTTAACGCCTTCTTGTCCTTTAAATCCACCAGAGATTTCTACGCTATCAGAATTGATTGGTTGATCAACACTTGCTGCAGAAATAAATTTAGGGTTTTTCTTTTGTGCTTCTTTTTTATAGCTGTCACCTTTTTTGAAATCTAACCAAACAACCATGACATTATCACGTTTCTTAGAGATTTCTTCCGTTACTTTTTTAAATTTGTTTTTGTCTTTTACTTTAAAAGTAACTGTAGGCTGGTTTGTTCCCTGTTTAAATTCTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCCTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGAACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCGGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAGGATCGACTTGATAAAGCACCTCAAATCCACCTTGCAAATCAAGTCCTAAATTGACATTCTTTATAACACTTTTATAAGTTGCAGCCATTCCGGCAAACAACAATACGACTAAAAGCAAGAACGCAATTATTCTACTACTTTTCTTCACATGAACACCTCATTATTTACGTATGTATTTAGAATACTTGAATACTATTTTATAACGCAAGTTAAATCTTTCTTACAAAATTTATTAGCCTTATACATATTAACATACTAGAGCAGGGAGTAAAAATAGTCATAGATATATTTAATTTAAATTTAACAATTATTATGTATCACAATTTCTTTTTTTGGAATAAAAATAAGCTATTCTACATACTACTTATAACTTAAAAAGGATGAAACGCTATTCGTTTCATCCTTTTTAATACCACTTCTCGTTATGAAGGGTCAACTTGTTTAATAGCAGGTTTTTCGAAAGTTAATTCAGTACCATGACCATTAACTGTAATAACAACAGTTGTTTCATCTACTGCTTTAACAGTACCTTTAATACCACCAATAGTTGTAATTCTTTGACCAGATTGAATGTTATTAATCAACTCACGATGCTGTTTCGCACGTTTTTGTTGTGGTCTAATCATCAAGAAATACATAACCGCAAAAATTACGACTATATATATTAGTAATGAAAATTGCATTTTATACGCTCCTCTTGCTTAAAAGTTTTTTGGGTTCTCAACATTTAATCCATATTGCTCGAAGAATTCTTCTTTGAAATCTAAAAGACGATCTTCTCGAATGGCTTGTCTTATATCTTCCATTAATTTTAGCAGAAAATGTAAATTATGAATAGTAGTAAGACGAATACCAAAAGTTTCCTCTGCCTTGATTAAATGACGTATATACGCTCTTGAATAGTTTTGACATGTATAACAGTCACAATTCTCATCTAACGGTCTTAAATCATCTGCAAATTTTGCATTTTTAATAACTAAACGACCTTGCGATGTCATACAAGTACCATTTCTGGCAATACGTGTCGGTAAGACACAATCAAACATATCCATGCCGCGAATACTACATTCGATTAACGCATCTGGAGATCCTACACCCATTAAATATCTTGGTTTATCTTTAGGCATAAACTGCTCTGTATGTTCAACCATTTTATACATAACCGGTTTAGGTTCACCAACTGACAAACCGCCGATTGCATAACCAGGAAAATCTAATTCTACTAAATCCTTTGCACTTTGTTCTCTTAAATCTTCATATTCGCCACCTTGTATAATGCCGAACAATGCTTGATCTTCAGGTCTTTGGTGTGCATCTAGACATCTTTTCGCCCAACGTGTTGTACGTTCAATAGATTTTTTTACATAATCATATTCAGCAGGCATTGGTGGACATTCATCAAATGCCATCATAATATCAGAACCTAAATCATTTTGAATTTGCATTGATTTCTCAGGACTCAAAAATAATTTAGACCCATTAGTATGATGTCTAAATTCCACGCCTTCTTCTGTAATTTTACGTAAATTACTTAAACTAAACACTTGGAAACCGCCTGAATCTGTTAGAATCGGACCATCCCAATTCATGAATTTATGTAATCCCCCAGCGTGTTTGATAATATCATTTCCGGGTTGTAACCACAAATGATATGTGTTGCCCAAAATGATTTTTGCTTCAATTTGTCTTAACTCTTCTGGACTCATTGTTTTAACGGTTGCTTTAGTACCAACTGGCATAAACATAGGTGTTTCAAATGAACCGTGTGGTGTGTGCACGATACCTAAACGCGCACCTGATTGTTTACAAGTTTTAATGTGTTCGTATGTTACTGCAGGCATATTCAAAATCCTCACATTCTTTTTATATAATTAACATTGCATCGCCAAAACTAAAGAATCTATATTCTAAATTTACTGCCGTTTTATAAGCATTCAGAACATTTTCACGAGTACTAAACGCTGATACTAGCATAACTAATGTTGATTTTGGTAAATGAAAATTAGTAATCTGGCCATCAATTGCTTTAAAATCAAATCCTGGATAAATAAATATATTAGTCCAGCCACTCGTTTCAACAAATTTATCATGATCGCGTCGAATTGTTTCAAGTGTACGTGTTGAAGTTGTACCAACTGATATAATGCGATGTCCTTTGGACTCAGTATCATTTAATAAATCAGCTGTTTCTTGTGTCATTTGATAATATTCACTATGCATTTCGTGGTCATTCACATCATCGACGCTCACCGGTCTAAACGTACCTAACCCAACATGTAATGTAACAAATGCGATATTAACACCTTTATTTTTAATTTCAGTTAATAACTCATCAGTAAAATGTAATCCTGCTGTTGGTGCTGCCGCTGAACCACTTTCTTTAGCGTAAACTGTTTGATAACGATCTGGATCATCTAAACGTTCTTTGATGTATGGTGGCAGTGGCATTTCCCCTAATTCATCTAATCTTTCTTGTAAAATACCTTCATAATGTAAACGCATGATGCGTCCACCTTGATCCATTTCTTTTATGCATTCAGCTATAATTTTGCCATTACCAAAATTCAATTTATTACCAACTTTAATACGCTTAGCTGGTTTCAGTAAGACTTCCCAATCATTACCTTCAATTTGAGTTAACATTAACATTTCAACTTTTGCACCAGTTTCTTCTTTTAAACCAAAAAGTCTAGCTGGCATTACTCGCGTATCGTTAAGCACTAATGTATCACCAGGTCTAAAATACTCAATGATATCTTTGAAATGTAAATGTTTCATTTCACCAGTTTCTCTATCCATGACTAATAAACGACTATGATCACGATCTTTTAAAGGCGTTTGAGCAATTAATGATTCTGGTAAGTCATAGTCAAATTCTTCAAAATTCACGTTATTCTCTCTCCTCATTCGACTTTGCAAAATGTTCATAAGCTAATGGTGTTGCTTTTCTGCCACGTGGCGTACGTTCTAAAAAGCCTTTCTGAATAAGAAATGGCTCATAAACGTCCTCAATTGTAATACGTTCTTCACCAATTGTTACGGCAATCGTATCTAAACCAACAGGTCCACCATTATACTGCTTAATAATACAGTTCATCATTTTATGATCAATGTAATCTAGTCCGTGTTGATCAACTTGAAGTAAACCTAATGCGTGCTTCGTTGTTTCAATGTATATTTGTTCATCTTCATTCACTTGCTGGAAGTCTCTTACCCGCTTCAATAGTCGATTTGCTACTCTTGGAGTCCCTCTAGAACGTTTAGCAAGTTCAATGGCACTTTCTTCATCAATACCTGTGCCTAAAACCTCAGCTGTTCTAATAATGATTTCTTTTAAATCTGATTCATTATAATATTCTAATCTTAAGTGCACACCAAATCGATCCCTTAGTGGACCTGTTAAGCTGCCAGCTCGCGTTGTTGCACCTACCAAAGTGAATGGAGGTAAGTCGATACGGATACTTCTAGCCTCATCGCCTTTACCAATGATAATATCTAAAAAGAAATCTTCCATTGCAGGGTATAACACTTCTTCAACAACACTACTCAGTCTGTGTATTTCATCAATAAACAAAACATCTCCAGGTTGAAGTCCTGATAAAATTGCAGCCAAATCACCAGGTCTTTCTAATGAAGGCCCTGATACTGTACGTATATTAACTTCCATTTCATTGGCAATGATATTAGATAATGTTGTCTTACCTAATCCAGGGGGGCCAAAAAGCAATACATGATCTAATGGTTCATGACGAAGTTTAGCCGCTTTAATAAATACTTCTAAATTACTTTTTATTGAATTTTGACCAATATATTGTCGTAATCTCGTAGGTCTAAGCGACAATTCGAAATCAGTTTCTTCACTATGCATTGATTGATCAACCATACGCTCATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP028470|1627483:1636526|1634494_1635520_-|AWQ25805.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNFEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTESKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >CP028470|1627483:1636526|1635521_1636526_-|AWQ25806.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE >CP028470|1627483:1636526|1633332_1634472_-|AWQ25804.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >CP028470|1627483:1636526|1628023_1630297_-|AWQ25801.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQTIEAIISDTDINHDALQLSDMTKTIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKKGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKHQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >CP028470|1627483:1636526|1633053_1633314_-|AWQ25803.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >CP028470|1627483:1636526|1630499_1632779_-|AWQ25802.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQGTNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >CP028470|1627483:1636526|1627483_1628002_-|AWQ25800.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1775383 : 1784387
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP028470|1775383:1784387|DBSCAN-SWA AATGGCACTATTAAAGAATTTTTTTATCGGATTATCTAATAATAGTTTTTTAAACAACGCAGCAAAAAAAGTGGGCCCACGTTTGGGCGCCAATAAAGTCGTTGCCGGAAATACAATTCCAGAGTTAATTAATACAATCGAATACTTAAATGACAAGAATATCGCTGTTACGGTAGACAATTTAGGGGAATTTGTCGGTACAGTTGAAGAAAGTAATCATGCTAAAGAACAAATTTTAACAATTATGGACGCGCTTCATCAACATGGCGTAAAGGCACATATGTCTGTTAAATTGAGTCAGTTAGGTGCAGAATTCGACTTAGAATTAGCTTACCAAAATTTAAGAGAGATTTTACTTAAAGCAAATACTTACAACAATATGCATATAAATATTGATACTGAAAAATATGCTAGCCTGCAACAAATTGTTCAAGTTTTAGATCGCTTAAAAGGCGAATTTAGAAATGTTGGTACTGTAATTCAAGCATATTTATACGATAGCCATGAATTAGTTGATAAGTACCAAGATTTACGATTACGTTTGGTTAAAGGTGCATATAAAGAAAACGAATCAATTGCATTTCAATCTAAGGAAGACGTAGATGCAAATTACATCAAAATAATTGAACAACGTTTGTTAAACGCACGCAATTTCACTTCAATTGCAACACATGACCATCGCATCATTAATCATGTAAAACAATTTATGAAAGAAAATCACATTGAAAAAGATCGTATGGAATTCCAAATGCTCTATGGTTTTAGATCAGAGTTAGCAGAAGAAATCGCAAATGAAGGCTATAATTTCACTATTTATGTACCTTATGGCGATGATTGGTTTGCGTATTTTATGAGAAGATTAGCAGAACGCCCACAAAACCTATCTCTTGCTGTAAAAGAATTTGTGAAACCTGCTGGCTTAAAAAGTGTTGGCATAATTGCAGCTTTAGGAGCTACAGTTATGTTAGGTTTAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCATGGCATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAATCATTTATAAATCTTTGATTATGAACTCACAACAGCGCTCTATGCTTTTATAGATTTTAATAAATTAGCCATTTCAATTGCACTTACTGCTGCTTCGGCACCTTTATTGCCAGCTTTCGTACCTGCTCTTTCCACAGCTTGTTCAATACTTTCAGTCGTTAAAATACCAAATATGACTGGTACATTAGTTTGATCATTTACTTTAGAAACACCTTTCGCGACTTCATTACAAACATAATCATAATGAGACGTAGCACCGCGAATTACGCATCCTAATGTAATTACTGCATCATAATTTCCTGATGAGGCTAATTTCTTAGCTACTAAAGGAATTTCAAACGCACCAGGAACAAATGCTACATCAATATTGTCTTCATTAACATCATGTCGAATCAAAGTATCTTTTGCACCTTCAAGTAATCTTCCAGTGATAAAATCATTAAATCGACTAACTACGATTGCAACTTTCAAATCTTTTCCAATTAATTTACCTTCAAAATTCATGTTAAAGTCCTCCTATATTAAATGACCCATTTTTATTTTTTTCGTTTCCATATAATCATGATTATGTACCGTTTCTGGTACGATAACTTCAATTCTTTCTGCAATATCAATGCCATATTGTTTTAATCCCTCAAATTTACTTGGATTATTACTTAATAAATTGATATGTTCGATGTTAAAATATTTTAAAATCTGTGCAGCAATATGATAATCTCGTAAATCTTCATCAAAACCTAATGCTAAATTTGCAGTTACTGTATCATATCCTTGCTCAATTAATTCATATGCGCGTAATTTGTTTAACAATCCTATGCCACGACCTTCTTGAGGTAGATAAATAATCATGCCACCATGTTCATTGATATACTTCATAGACGATTCAAGTTGAGCACCACAATCACAACGTTGACTATGGAAAATATCGCCTGTAAGGCACGCAGAATGTAAGCGTACATTTTCATGTTGTCGAATTGCACCTTTTGTCAGTACAACTATCTCTTCATCTGTGTATGTCGCTTTAAAACCATACATATCAAATGTTCCGAAATCTGTAGGCATTTTCACTTTTGCCTTAAATTCAATTTCTGGTTCTAATTTTTTACGATATTCAATTAAATCATCAATCGTAATCATCTTTAATTGATGTTTTTCTTTAAACTTTTGTAAATCTTGTCCTTTCGCCATCGTGCCGTCATCATTCATAATCTCACAAATGACACCAGCGGGCTTGGCACCAGTAAGTTTAGCTAAATCAACAGCCGCTTCTGTGTGTCCATTTCTAGCTAATACGCCTTTATCTTGTGCTACTAATGGAAATAAATGACCAGGACGATTAAAATCTTTAGCTTCACTACTAGGATCAATGAGCTTTTTGGCAGTCAATGTACGTTCATAAGCACTAATTCCTGTTGTTGTATCTACATGATCAATACTCACTGTAAATTGCGTACCAAAGATGTCGGAGTTATCATCAACCATTTGTACCAAATCCAAACGTTGTGCAATATCTTTAGACACTGGTGCGCATATTAATCCCCTTGCTTCTTTCGCCATAAAATTAATGGTATTATCGTTCATCCATTCAGTAACCGCTACTAAATCACCTTCATTTTCACGATTCTCATCATCTACTACAATAATTGTTTCTCCATTTTTTAAAGCCATTAAAGCACTGTCAATATTATCGAATTGCATGCTACCCCTCCTAAAAACCAAATGCTCTTAATTTATCTACAGATAATTGGTCTTTATCTTTATTTAAAATATTTTCAACATATTTAAACAAAACGTCTGTTTCTAAATGTACTTTATCTCCTAATTTTTTGGATGATAAAATCGTTGAACGCCTCGTTTCTGGAATAAGATGAATGTCAAAACTGTTATCATGCTTATCAAATACCGTTAGACTAACACCATCCACAGTAATAGACCCTTGCTTAACTAACTGATTATTAATATGTTGGCTACATTGAATCGTAATAATTTTGGCATTGGCTGTTTCATTTATTTTTGAAACTGTTCCTAGTTCATCTACATGACCGAGGACAAAATGTCCACCAAACCTACCGTTACCACTCATGGCACGCTCTAAATTTACTTCTGATTGTCGCTTAACATCTGCTAAATAGGTTTTATTTTCAGTGCCTTTAATTACTTGAACAGTAAAAGATGTCTGATTAAAATCAATCACTGTTAAACATGCACCATTAACACTGATGGAATCACCAATATGCATATCTGCCGTAATCTTATGTGCTTCAATTTCAATCGTCCTGACTGATTGACGAATTTGAACACTTTTAACGACACCTATTTCTTCAACGATGCCAGTAAACATGCATCATCACTTCTTTCGTAAAGTTAATTTAACATTTTGATTTAATAACTCGGAATGAACAATTTCAAATTGGTTCGCATCTGGTATCTCAATCACATCATTTGTTTGATAAAATTGATAATTTCCAGATCCGCCAATTAATTTCGGGGCATAATAGAGAATAAATTCATCTATATAATTAGATTGGAGAAATTCTGAAGTAGTGGTTGGACCTGCCTCGACTAGCAAAGTTCCAACTCCTCTTTTATATAAATTGTGAAGAATTGTTGTTAAATCACAAGACTCCAAGAAAATAATTTCAATATGTGTTTGCTTGGTTGTTAAATTTGGATTTTCAGTATATATCCAAATTGGTGTTGATTCATCTTGATAAATTTGCTGATTAAAATGAATATTCCCAGACTTAGACAATATTACTTTTATAGGGTTTTTTCCATCTTGAATACGTGTAGTATATTGTGGATCATCTAATTCAACTGTACGTCTTCCAGTTAACACTGCGTCGTGTCGATGTCTTAACTTATAGACATCTTGTTTAACCTCTTTGTTAGTAATCCATTGACTTTGTCCATTATCATTCGCTTGTTTACCATCTAAACTTGCAGATACTTTCACTGTAATTTGTGGCAGTTGCTTTGCTTTTGCTTTAAAAAAGTCTTGGTATAATTGTGATGCACGTTCATCATCAACGCATTCAACCTCAATACCGTGAGCCCGTAACGTCTCATCACCATGTGTGTCTAACGAATTGTCTTTTGTTGCGTAAACTACTTTAGTTATCTTACAATCAATAATTTTGTTAACACAGGGTGGTGTTGAACCAAAATGACTACATGGCTCTAACGTAATATAAATCGTCGCACCTTCAGCATTTTGTTGTGCCATATCAAGTGCTTGAACCTCCGCATGCTTGTCACCTTTTCTCAAGTGTGCACCAATACCAACAATCCTACCTTCTTTAACTACAACAGCGCCAACGGGTGGATTAACACCTGTTTGACCTTGTACCATATTTGCAAGTTGAATCGCATAATCCATAAATTGACTCAAATGATCACCTCTATAAACAAAAATCCTCACATCATGAATTAAGATGCAAGGAGAAAAATTTATCGTTAAATAAGCCTATTTGTACACATTTTTACAAATACGCTACATTATCTTTGTCGATAATTAACATTCTTTCTCCCATCCAGACTTTAACTGTCGGCTCTAGAATCTCACTAGATCAGCCACTAATATGAAACATATTAGCAGGTCGCAGGCTTTATTTACTGCCGGTTGGGAATTTCACCCTGCCCCGAAAGAATTATATATGAAATTGTTATAGATTATTTGAGTACGTAGTATGTCAACTACATTTAAAATGATACTATATGTTTTCTGAAAAAACAATTAATGACGGTTTTAATTTAATATAATCTGAGTACTATAGGCATCTCATTGATATGATTCTTACTAACAGACATTAAAATCAAACCTTCAATTCGTCTCTATAGAGCGTTCTCTTTATTATCTTCTAGTTACAAATTATTGATTGTCACTGCGCTGTTGTTGCTCATTCGATTCTAAAGCATCATATAATTGAGATACTGTATGCGCAACTTGTTCTACTATCATTTTCACACCATTTCGTAGTTTATTAACACCGTTTGTCATTTGACCTATCGCAATCATATTTGTTAATGTTCCAAACCTTGGACTAATAACTTGATTGGTTTCCGGTATGATTTGTATGCCTCCCATTGGGTGTGCTTGTACAATTTGTCTATTTTCAAGATTTTTAATTAATTGATCATCTTGATCCAATTCATTTAAATGACTTTTTGCACCTGTCGCGTTAATGACAACATTATATATGTCTACTGATTCTTGGTTTTTGTATGAAAAATAATACAACTTGCCATCATGTTTCACATCTTCTAAATCTTTTTTCAAAATTAAAGACTTATTTTCTATTAATTCAATAATTAGTTCAGCAGTTCTTGGAGGCATTGGATTTGAATTTAATTGAATCATCTTTGAGTATTTTTGATTAAATTGATGTTGATCTTCAATACTTAAGCTATTCCATATCCAATTTAAATTCTCTTTCAAATGTTCAATCATACTTTGGAAAATGCCCATTTCTGTTGGACGCGCTAAATCATACTTCAAATCTGCAATATGATTTCCTGTACGTCTATGTACTAATTTTTTAAAATCAATGTCATATTCAGCACATTCTTTTAAAAATAAAGAAACTAAAGTATCAAGCGGTGCATTGCCGAAATGATGTTTTTTAATGTCATTTAATTTGTCTTTAGTTAAGTACTTGAATGTCACGTCTATCATTGTACCTCTTACACTTGGTAAATGAGCAGAACGACTCGTCATAGTAATTGGTAATTTCGGATGATGAGCAGCAACATAACGGACAACATCTAAACTGGCAAGGCCTGTACCAATAATCGCAATATCGTCCAGTTCATTTACTTCGTCTAACGTATTATATGTTGGATAAGGCGTAGCGATATATCCTTTTTTACCCTTTAAGTTATATGGATCATGGTAGGCAAATGTACCACATGTTAAAAATACATAATCGTACGCTTGCCATGATTGTCCTGAATTTGTAGTACATATGTAATAAGTTAAATTCGTTTCATCGATATTAGAATTTGTATAAATCTCTTGAACTTTATTATAATTAGTTGATATATTTGGATATTTTTTCGTGAACATAGATAAATAAGATTTCATATAATGTCCGAATACAAATCTCGGTAAATATGCAGGTTCATCAAAATTAAAATCAGTTTGTTGTTTATACCACTTCCAAAATTCAGTCTCATCATCTAAATTTAAACTCATCTTTTTCGAAGGCATATTAATTAGCAGCTCAGAACTATCATTTTGAAATGGTACGCCCTGTCCCATATTTACTTTATCATCGTATAAATCTATATCTAATTGATTAAACTTCGGGTGCTTAACTAACTCTCTCAATACACTTACACCAGCAGTTCCCATGCCTATTATTGCTACACGCATATATCATCCATCCTTTTGTAATTCAAAATATTATATTTAAACTATTACCTATAATTATAGCAATTTGGTATTTCCAATAAAATTTATTAAGGTAAGCTATTATTTCACTTTCACAACCATTAAACCATTTAAAACTTTTCATTTAATATCAACCTCAGTGTTTGTGTTAAAATATTTTTACCGAGGTGAATTAAATTGAAATTTATAGCAAAGATATTAATCTCATTAGTAATTCTATTTATGATTTTTAGTCGTAAAAACAAAGCATCTTAATCAATACCCTTGATTACAAAATAAATTCAACTAAGGTGATTGGCCATACACTCAAGATATGGCAAATCACCTTTTTCATTACGTAAATTCAACCATCCTTTAGCAAAATTTTAACCATACATTTTCACAAGTAATAATTTTTAACAATGCTATTAGCATCACAGTGACAAATGACTAACGAAACATTAAAGCAATCATACATAGACATTCATCTATATAGATGATAATCTATTTAACGTCTAGGAGGTATGTTATGACGTATAAAGAACTAGCAACATATTTAAAAGTTTTGTCAGATTCAAGCAGATTAGAAATACTAGATTTACTTTCTTGTGGAGAGTTATGCGCTTGTGATTTGTTAGAACATTTTCAATTCTCTCAACCTACACTTAGCTATCATATGAAAGCATTAGTAAAAACCAACTTAGTTACGACACGAAAAATCGGAAATAAACATTTATATCAGCTTAATCATAATATTTTTGAGTCCGTAATTAATAACTTGTCAAAGGTTCATACCTCTAACCAACGATGTATTTGTCATAACCTTAAGACTGGTGAATGCTAATGATGACAACTTTAGCGACACTCATTTTTCTAGTAACTTTATTATTTGTATTATGGCAACCTAAAGGCCTAGATATTGGATTTACTGCATTAGCAGGTGCAATTGTTGCAATGATTACTGGTGTTGTAAGTTTGACTGATGTTTTTGAAGTAACAGGTATAGTCTGGAATGCCACTTTAACTTTTGTCTCAGTCATTCTTATTTCATTAATATTAGATAAAATTGGATTTTTTGAATGGTCAGCTATCCATATGCTTCATGCTTCAAAAGGCAATGGTTTAAAAATGTTCGTTTATATCATATTATTGGGTGCCGTGGTTGCTGCATTTTTCGCAAATGATGGCTCAGCGTTAATCTTAACGCCAATTGTATTAGCAATGGTAAAAAATATAGGTTTTAGTAAGCGGGCAATATTCCCTTTTATTATTGCGAGTGGTTTTATAGCTGATACAACTTCTTTACCTTTAATCGTGAGCAATTTGGTCAATATCATTTCTGCAGATTACTTTAACATTAGTTTCTCTCAGTATCTCAGTAGAATGATTATCCCTAATTTATTCTCATTATTAGGCAGCCTTCTAGTTTTGTGGTTATATTTTAGAAAAGCGATTCCTAAATCATTTGATGCAAATCACATAAAAAAACCTAAAGATGCCATTAATGATTTAAAGCTATTTAAAATTTCATGGATTGTTCTAGTTATATTACTTTTCGGCTATCTAATCAGTGAATTTACTAAAATTCCGGTATCAATTTTCACTGGGATCATAGCTTTTATATTTCTAATGTTGGCTCGTAAATCAAATGCTGTAAATATTAAGCAAGTCATTAAGGGCGCACCTTGGAATATAGTATTATTTTCAATTGGTATGTATATCGTCGTATTCGGCTTAAGAAATGCTGGCATTACTTTAATATTGGCTAAAATATTAGAATATATTTCCAATTACGGTCTATTTAGCACCATTTTGGGAATGGGCTTCATTTCAGCGTTTTTATCATCAATAATGAATAATATGCCTACAGTTTTAATAGATGCGATTGCTATTGGTCAATCAAATGTCCATGGCATGTTAAAAGAAGGCCTAATTTATGCGAATGTTATCGGTTCTGATTTAGGTCCAAAAATTACACCGATAGGCTCTTTAGCTACATTACTGTGGTTACATGTCTTAACACAAAAAGATGTTAAGATTTCTTGGGGCACATACTTTAAAACTGGTATCACCATTACAATTCCAGTACTATTTATCACACTTTTAGGATTATATCTAACACTTATCATATTTTAAGAAATTAGGAGATTGTTATGACTAAAAAAACAATTTATTTTATATGTACAGGCAACTCATGTCGAAGTCAAATGGCTGAAGGTTGGGCTAAACAAATCTTAGCGAAAGATTGGGATGTATATTCTGCGGGTATCGAAACACACGGTGTTAATCCCAAAGCGATAGAAGCTATGAAAGAAGTAGGCATTGATATATCAAATCATACATCAGATTTAATCGATAATAATATTATTAAAAATTCAAATTTAGTTGTTACATTATGTAGTGATGCAGACGTAAATTGCCCTACTTTACCAACAAATGTTAAGAAGGAACATTGGGGATTTGATGATCCTGCAGGCAAACCATGGTCAGAGTTCCAACGTGTGAGAGATGAAATTAAAGTCGCAATTGAAAATTTTAAATCACGATGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP028470|1775383:1784387|1778814_1779846_-|AWQ26963.1|DBSCAN-SWA MDYAIQLANMVQGQTGVNPPVGAVVVKEGRIVGIGAHLRKGDKHAEVQALDMAQQNAEGATIYITLEPCSHFGSTPPCVNKIIDCKITKVVYATKDNSLDTHGDETLRAHGIEVECVDDERASQLYQDFFKAKAKQLPQITVKVSASLDGKQANDNGQSQWITNKEVKQDVYKLRHRHDAVLTGRRTVELDDPQYTTRIQDGKNPIKVILSKSGNIHFNQQIYQDESTPIWIYTENPNLTTKQTHIEIIFLESCDLTTILHNLYKRGVGTLLVEAGPTTTSEFLQSNYIDEFILYYAPKLIGGSGNYQFYQTNDVIEIPDANQFEIVHSELLNQNVKLTLRKK >CP028470|1775383:1784387|1778175_1778808_-|AWQ25931.1|DBSCAN-SWA MFTGIVEEIGVVKSVQIRQSVRTIEIEAHKITADMHIGDSISVNGACLTVIDFNQTSFTVQVIKGTENKTYLADVKRQSEVNLERAMSGNGRFGGHFVLGHVDELGTVSKINETANAKIITIQCSQHINNQLVKQGSITVDGVSLTVFDKHDNSFDIHLIPETRRSTILSSKKLGDKVHLETDVLFKYVENILNKDKDQLSVDKLRAFGF >CP028470|1775383:1784387|1776983_1778165_-|AWQ25930.1|DBSCAN-SWA MQFDNIDSALMALKNGETIIVVDDENRENEGDLVAVTEWMNDNTINFMAKEARGLICAPVSKDIAQRLDLVQMVDDNSDIFGTQFTVSIDHVDTTTGISAYERTLTAKKLIDPSSEAKDFNRPGHLFPLVAQDKGVLARNGHTEAAVDLAKLTGAKPAGVICEIMNDDGTMAKGQDLQKFKEKHQLKMITIDDLIEYRKKLEPEIEFKAKVKMPTDFGTFDMYGFKATYTDEEIVVLTKGAIRQHENVRLHSACLTGDIFHSQRCDCGAQLESSMKYINEHGGMIIYLPQEGRGIGLLNKLRAYELIEQGYDTVTANLALGFDEDLRDYHIAAQILKYFNIEHINLLSNNPSKFEGLKQYGIDIAERIEVIVPETVHNHDYMETKKIKMGHLI >CP028470|1775383:1784387|1780338_1781841_-|AWQ25932.1|DBSCAN-SWA MRVAIIGMGTAGVSVLRELVKHPKFNQLDIDLYDDKVNMGQGVPFQNDSSELLINMPSKKMSLNLDDETEFWKWYKQQTDFNFDEPAYLPRFVFGHYMKSYLSMFTKKYPNISTNYNKVQEIYTNSNIDETNLTYYICTTNSGQSWQAYDYVFLTCGTFAYHDPYNLKGKKGYIATPYPTYNTLDEVNELDDIAIIGTGLASLDVVRYVAAHHPKLPITMTSRSAHLPSVRGTMIDVTFKYLTKDKLNDIKKHHFGNAPLDTLVSLFLKECAEYDIDFKKLVHRRTGNHIADLKYDLARPTEMGIFQSMIEHLKENLNWIWNSLSIEDQHQFNQKYSKMIQLNSNPMPPRTAELIIELIENKSLILKKDLEDVKHDGKLYYFSYKNQESVDIYNVVINATGAKSHLNELDQDDQLIKNLENRQIVQAHPMGGIQIIPETNQVISPRFGTLTNMIAIGQMTNGVNKLRNGVKMIVEQVAHTVSQLYDALESNEQQQRSDNQ >CP028470|1775383:1784387|1783991_1784387_+|AWQ25935.1|DBSCAN-SWA MTKKTIYFICTGNSCRSQMAEGWAKQILAKDWDVYSAGIETHGVNPKAIEAMKEVGIDISNHTSDLIDNNIIKNSNLVVTLCSDADVNCPTLPTNVKKEHWGFDDPAGKPWSEFQRVRDEIKVAIENFKSR >CP028470|1775383:1784387|1776506_1776971_-|AWQ25929.1|DBSCAN-SWA MNFEGKLIGKDLKVAIVVSRFNDFITGRLLEGAKDTLIRHDVNEDNIDVAFVPGAFEIPLVAKKLASSGNYDAVITLGCVIRGATSHYDYVCNEVAKGVSKVNDQTNVPVIFGILTTESIEQAVERAGTKAGNKGAEAAVSAIEMANLLKSIKA >CP028470|1775383:1784387|1782681_1783974_+|AWQ25934.1|DBSCAN-SWA MMTTLATLIFLVTLLFVLWQPKGLDIGFTALAGAIVAMITGVVSLTDVFEVTGIVWNATLTFVSVILISLILDKIGFFEWSAIHMLHASKGNGLKMFVYIILLGAVVAAFFANDGSALILTPIVLAMVKNIGFSKRAIFPFIIASGFIADTTSLPLIVSNLVNIISADYFNISFSQYLSRMIIPNLFSLLGSLLVLWLYFRKAIPKSFDANHIKKPKDAINDLKLFKISWIVLVILLFGYLISEFTKIPVSIFTGIIAFIFLMLARKSNAVNIKQVIKGAPWNIVLFSIGMYIVVFGLRNAGITLILAKILEYISNYGLFSTILGMGFISAFLSSIMNNMPTVLIDAIAIGQSNVHGMLKEGLIYANVIGSDLGPKITPIGSLATLLWLHVLTQKDVKISWGTYFKTGITITIPVLFITLLGLYLTLIIF >CP028470|1775383:1784387|1775383_1776385_+|AWQ25928.1|DBSCAN-SWA MALLKNFFIGLSNNSFLNNAAKKVGPRLGANKVVAGNTIPELINTIEYLNDKNIAVTVDNLGEFVGTVEESNHAKEQILTIMDALHQHGVKAHMSVKLSQLGAEFDLELAYQNLREILLKANTYNNMHINIDTEKYASLQQIVQVLDRLKGEFRNVGTVIQAYLYDSHELVDKYQDLRLRLVKGAYKENESIAFQSKEDVDANYIKIIEQRLLNARNFTSIATHDHRIINHVKQFMKENHIEKDRMEFQMLYGFRSELAEEIANEGYNFTIYVPYGDDWFAYFMRRLAERPQNLSLAVKEFVKPAGLKSVGIIAALGATVMLGLSTIKKLCRK >CP028470|1775383:1784387|1782367_1782682_+|AWQ25933.1|DBSCAN-SWA MTYKELATYLKVLSDSSRLEILDLLSCGELCACDLLEHFQFSQPTLSYHMKALVKTNLVTTRKIGNKHLYQLNHNIFESVINNLSKVHTSNQRCICHNLKTGEC |
9 | Staphylococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1794306 : 1813555
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP028470|1794306:1813555|DBSCAN-SWA AATGCAATATGTATATATTTTTATCGGTGGTGCTTTAGGCGCTTTATTACGTTACCTCATTTCTTTTCTGAATACTGACGGAGGTTTTCCAATCGGAACACTGATAGCCAATTTGACTGGTGCCTTTGTAATGGGATTGCTAACAGCCTTAACAATTGCATTTTTTTCAAACCATCCGACCCTAAAAAAAGCTATTACGACTGGTTTTCTTGGTGCATTAACGACTTTTTCAACATTTCAATTAGAATTAATACATATGTTTGATCATCAACAATTTATAACTTTACTACTATATGCTATAACAAGTTATGTCTTTGGTATTTTGTTATGTTACGTCGGTATAAAACTAGGTGGTGGTTTATCATGATATCAATCATTTTAGTCATGATTGGCGGCGGTTTGGGTGCAATTGCTAGAAGTGCCGTTACTGATTATTTTAATCATAAATTTACTTCCAAGTTACCTATCGCAACATTGATAGTAAATCTTGTTGGTAGTTTTTTAATTGGATTAACTATAGGCTTATCAATTTCAATCTCATGGTTCCCTGCGTTCTTTGTTACCGGTTTTTTAGGTGGCTTAACAACTTTCTCAACGTTAGCCAAGGAACTTACACTAATGATGATGCCAAAATTTAATATTAACCTTTTTCTCAATTATTCACTTTTACAATTCATCATTGGATTTATAGCTTGTTATATTGGCTATCATATTTAAAAATAAAATGCTTCATTCAGCAAATAGGCAAATTACGACACCTTCCTGAACGAAGCATTTTTTTATTTTCATGCAAATTTTTTAGCACCATAAAATGCCTACCAAATTTCAATAATCTTTGTTACCGTTTAAATAATGTGAATGTCAATAAATTCTCCAAACTAGTCGAAAATAAAACAGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTCCTAGGGTGCCGTCTCAGCCTCGGTCTTCGACTGGCACTGCTCCCTCAGGAGTCTCGCCATTAATACTACGTATTAACATGTAATTTTACTTTTACATACTTTAAAAAAATAAGACACTTTGCCCAACTTACACTACCAATAGAAACCTCTGTTAGAATTCCTCAAAATGATATTTCGCGATATGTTAATGAAATTGTTGAAACGATACCTGATAGCGAATTCGATGAATTCAGACATCATCGTGGCGCAACATCCTATCATCCAAAAATGATGTTAAAAATCATCTTATATGCATATACTCAATCTGTATTTTCTGGTCGAAGAATAGAGAAATTACTTCATGACAGTATTCGAATGATGTGGTTAGCCCAAGATCAAACACTTTCTTATAAAACTATTAATCGTTTTAGAGTGAATCCTAATACTGATGCGTTAATTGAATCTTTATTTATTCAGTTCTATAGTCAATGTTTAAAGCAAAATCTTATTGATAATAATTCAATTTTTATTGATGGTACAAAAGTAGAAGCTAATGCCAATAGATATACATTTGTGTGGAAGAAAAGTATTCAAAATCACGAATCGAAATTGAACGAAAATTCAAAAGCATTATATCGTGACTTAGTTGAAGAAAAAATAATACCAGAGATAAAAGAAGATGGAGATAGCGATTTAACAATAGAAGAAATAGATTTAATTGGTAGTCATTTAGATAAAGAAATCGAAGATTTAAATCATTCTATTGAGAACGAAGATTGTGCTCAAATTAGAAAACAGACCTGTAAAAAAGAACTGAGATTAAGAAGTTCAAAAAGAAATTTGATGATTATTCCGAAAGAAAAAATAAATATGAAGAACAAAAATCGATTCTTAAAGATAGAAATAGCTTTTCTAAAACTGATCATGATGCAACTTTTATGAGAATGAAGGAAGACCATATGAAAAATGGCCAACTTAAGCCAGGATACAATTTACAAATAGCGACAAATTCTCAATTTTTTATCCTATGACCTATTTCAAACCCCAACAGATACTAGAACTTTAATTCCATTTTTAACAATGATTCAAAATACCTTCGGTTATTTACCAGAGTATATTGTAGCTGATGCAGGTTATGGTAGTGAGCAAAACTATATGGCTATTATAGATGATTTTAATAAAACGCCACTTATTACGTATGGCATGTTTATTAAAGATAAAACTAGAAAGTTTAAAAGTGACATTTTTAACACTCAAAATTGGAAATATGACGAACTTAATGATGAATTTATATGTCCTAATAACAAAAGAATAGGTTTTAAAAGATATGCATACCGTAATGATAGATATGGTTTTAAACGTGACTTCAAGCTATAAGAATGTGATGACTGTTCATCATGTTCTTTGAGACATCAATGCATGAAGCCAAATTAGAAATCCAATAAGAAAATTATGAAGAATTATAATTGGGAATTCTTTAAAGCCCAAATTAATCAAAAGCTTTCTGAACCAGAAACGAAAAAAATCTATAGTCAAAGAAAAATTGATGTAGAGCCTGTTTTTGGATTTATGAAGGCTATTTTGGGTTTCACTCGAATGTCAGTTCGAGGAATAAATAAAGTTAAACGAGAGCTAGGTTTTGTATTAATGGCACTTAATATAAGGAAAATAGCAGCTCAACGAGCTGTACATTATAAAATACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAACTTTATGTCCCAGCCTGTGACAATTCATCTAACCTTTTCATCAGTTGAGCGATTTTAACCTAGCCTTCAAAAGTTTTTGGATCAGGTCCAATTCTCTTATCTTGATTTAAACCATCAATTCGTGTCATTTGTTCATCTGATAATTCGAAATCAAATATTTGGAAGTTTTCAGAGATTCTGTTTGGTGTTACCGATTTAGGGATTGTAACCACACCATGCTGCACATTCCATCTTAAAACAACTTGGGCAGGTGACTTTCCTAATTCTTGAGCAATGTCTTTAATTGCCTCATCATTTAAAATTTGTGCATTCATCAATGGTGACCAAGATTCCATCACGATATGTTGTGCTGCCAAATATAATTTCAATTTATGTTGCGTTAAATATGGATGATATTCAACCTGATTAATTACAGGTTTAATTGACACTTGTGCCAACAAAGCTTCCAAATGTTCAGGTTCAAAATTGCTGACACCTATATTTTTAACTTTATTATTTTTATATAAATCTTCCATACCTTTCCATGTATCAACCATTACGGCTTCGTTCGTACCTGGCCAATGTACTAGATACAAATCTAAGTATTTTAAACCTAATCTAGATAAACTAGCTTCGTAAGCAGCTGCTACATTTTCACGACCAAAATCCTCAAAATATAATTTTGAAGTAATAAATAAGTCTTCTCTAGCAATTCCAGTTGATTCTAATCCGGCACGAATGCCAGCACCTACTTGTTCTTCATTCCCATAAACTTTTGCGGTATCAATACTACGATATCCTTGTTCAATGGCATACTTAACACTTTCCATGCAATTTTCATCATTTTCCACACGAAATGTCCCTAAACCAATTTTTGGCATCGTGTTTCCATTATAAAATGTTTTAACCTCCATAAATATCGCCTCACCTTTTTGATGTATTATACCCTGTTATCATAACAAATCTGAGTTGAATACATGAGAAAAAACACTTAACTTATAGCAATCAATCACTAAAATGCTAGTAATATCTTTCAAATATTAATCAAAATGTAAAAGCAATTCTGTTTAATTTATGACAAACTAAAAAAGCCGAAGTAACAACATATAGTCATCACTTCAGCCTAACATTTAATTGAATGATTCAATTTTATCCATCATTTGTTGTAAGTCTTCCACGTTGTATTGAATACGACCATGGAATACAAATTTGTTAAAGAACTCGTCTAATTGTTCAGCACCGACAAGCACTTTGACAGCACTATTTTGATTATAATTTGAAATCGTTACATCGCCTTCATTTTTAGGATTAAAGTATAAAATTGAAGTTGGCGTATATTTGGCACCTAATTCTTTTTGTAAATCTTCAGCCAATTGTTTAATCGCCTCAATTTGATCTGAATAATTTACAAATGATAATGAACGTTTGTCATCATTTTGATCCATCACAATAGTTTGCGGTCTAGATTTATCTAAATCTAATGTATCAAATACTTGTTCCATTGGTGGTAAATCTTTAAATTGACCGCCACTTATACCATTATAAACATGACCTTTTAACAATTGAGAATCAATGATATAAAGTCCAGTTCTTGTTAAGACTATATGACTAATACGTTCAATATTATTAAAGCCATCCTTCGGTAAAAAGATATTTGCCATAATGTGCATATCTTCTGGTCGAATTCGTTTTTCTTTAACTAATCTTTCACGAATACCAATTAATCTCATGTCCGTTACATATTCACTATGATTTTTCGAGAACAATTTTAATGCGTCAATCTCACGATCTTTTGTACTAACCATGTGATTATAATCTTCTTGTTGTTTTGTAATTGTCTTTTTATTTTGAATACGCTCTTTCTCTAAAGCTTCTTCATGAGACTTTTTAATGTTTTGTTCTTGTTGTTCATACTTTTCTTCTGTTTGTCGCTTAACTTTTTTCTTACTACCTAAGGCAACTAAGAAAAGGACAAAAAAGATTAATGCAATGACTACTGCAATAATGAGTCCAATGACTATCGGTGAAGATAAATCCATCACAACAACGCTCCTTTTTAATATATGAATAACTTTAATTATAATAGAAAAGCTAAAGATTTTCGATACATATTATCATTTATATACCGAAAATCTTTTATTTAGCTATATTCAATTCATCTTATTATTTTACTGCGTCTTTTAATTCTTCCACTTTGTCTAATTTTTCCCATGGGAATAATACATCTGTACGTCCAAAATGACCATAAGCAGCAGTTTGTTTGTAAAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP028470|1794306:1813555|1809480_1810107_+|AWQ25959.1|DBSCAN-SWA MKFKAIVAITLSLSLLTACGANQHKENNSKSNNTNKKTQQTDNTTKSNTDKQMTPQEAEDIVRNDYKARGANENQTLNYKTNLERSNEHEYYVEHLVRDAVGTPLKRCAIVNRHNGTIINIFDDMSEKDKEEFEAFKKRSPKYNPGMSDQAEMDNESEDIQHHDIDNNKAIQNDIPDQKVDDKSDKNAVNKEEQHDNGTNNSEETKVK >CP028470|1794306:1813555|1813052_1813277_-|AWQ25966.1|transposase|DBSCAN-SWA MGKVLKILRSTYYDSIKRKDNKITKDDSNVERAVINIFNSNRKVFGTGRIKNNLNDKGLSVSRRKIGRIMKNII >CP028470|1794306:1813555|1797117_1797951_-|AWQ25949.1|DBSCAN-SWA MEVKTFYNGNTMPKIGLGTFRVENDENCMESVKYAIEQGYRSIDTAKVYGNEEQVGAGIRAGLESTGIAREDLFITSKLYFEDFGRENVAAAYEASLSRLGLKYLDLYLVHWPGTNEAVMVDTWKGMEDLYKNNKVKNIGVSNFEPEHLEALLAQVSIKPVINQVEYHPYLTQHKLKLYLAAQHIVMESWSPLMNAQILNDEAIKDIAQELGKSPAQVVLRWNVQHGVVTIPKSVTPNRISENFQIFDFELSDEQMTRIDGLNQDKRIGPDPKTFEG >CP028470|1794306:1813555|1812300_1812477_-|AWQ25964.1|DBSCAN-SWA MDRLKYSLKVGILALLLFCTLNYLVPMQSNAFSIIIYSAIFAVLLMLLVYIFLGILKK >CP028470|1794306:1813555|1802734_1803481_-|AWQ26964.1|DBSCAN-SWA 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>CP028470|1794306:1813555|1794306_1794672_+|AWQ25947.1|DBSCAN-SWA MQYVYIFIGGALGALLRYLISFLNTDGGFPIGTLIANLTGAFVMGLLTALTIAFFSNHPTLKKAITTGFLGALTTFSTFQLELIHMFDHQQFITLLLYAITSYVFGILLCYVGIKLGGGLS |
23 | Staphylococcus_phage(100.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1820525 : 1828188
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP028470|1820525:1828188|DBSCAN-SWA TATGACAAGAGAAAGAAGATCATTTAGTTCAGAGTTTAAGTTACAAATGGTTAGATTATATGAAAATGGTAAGCCTAGGAATGAAATTATACGCGAGTATGATTTAACACCTTCGGCGTTAGGAAAATGGAGAAAGCAACATCAAAACACGGGTACATTCAATCACCAAGATAACTTATCAGATGAAGAAAAAGAGCTGATTAAATTACGTAAAGAAGTTCAACATTTAAAAATGGAGAACGATATTTTAAAGCAAGCAGCGCTGATCATGGGACGAAAATAGAAGTCATTCAAAAGAATGCACATCAATATTCAGTATCAGCAATGTGTAAAGTCCTAAAAATACCAAGAAGTACTTATTATGATTCTATAAAAAGAAGAGATAATAAAAACACTAAAGATGATTCAAACGTAGAACGTGCTGTCATAAATATTTTTAATTCTAATAGAAAAGTCTTTGGTACAAGACGAATTAAAAATAATTTAAATGACAAGGGTCTTACTGTATCAAGGCGAAAGATAGCTCGTATCATGAAAAAACATAATCTAGTTTCTGTTTATACGAAAGCTAAATACAAAAATCATCCAAAAGAAACTAATGAAAAACGAATTAAAAATCATTTGAATCGCGCTTTTAATAGAGAACAACCAATGGAGACATTAGTAAGTGATTTGACATATGTAAAAGTCGGAGGAACATGGCATTACATATGTTTATTTATAGATCTATTTAATAGAGAAATTGTTGGTTACAGTGCAGGTAAAAATAAGGACGCAAATTTAGTATCAAAAGCAATCAGCAGAATAAATCATAATCTTGAACAAATCAAACTATTCCACACTGATAGAGGCAAAGAATTTGATAATCATTTGATAGATGAAGTCCTAGAAACATTTAAAATCAAACGTTCATTAAGTACCAAAGGTTGTCCTTATGATAACGCAGTTGCGGAAGCAACGATGAAAGCAATGAAAACCGAATTTGTAAAACAAATGCAATTTGAAAACTTAGAACAGTTAGAAACAGAATTATTTGATTATGTAAATTGGTACAACAATTTTAGACCACATTCTTCATTACAGTATTTGACGCCAGTGGCATTTAAAAATCTACACATGAAAACTGTCTAAAAAAATGTTGACATACCAATTTTATTAGAATATATGCTGATACACTACCTAATAATGAAATTTGTCTATCAGATGACGGATTGACGATTAATGAATTAGAAATGTTGGGTATTGATATAAACACAAAAACGAGAACTAAACTTATACAAAATATTTTAAATCAATTTAATTTAAAATTAGTTGATAAAGAAATTACAGCGGATGTTAAAAATGAGAGTTTTGCTCAGTCTAAACATAATTTAATTCAAGGCATATTGAAAATTTATGACCTTACTTTAACTACTAAATCTAACGTTACAAACATATTCTATGAAGAAGTATTTGAATTCTTATATGACCAAGAAATAAGAGGTTTAGCACAAGTTTCTGTTTCTGGAGAATCAGGTTTAAAATATTCTATTGATTATATTGTTTCTGAAACAAAATCACAACCAGAAAAACTAGTTAACTTTACAAACAACTTAAATTTCAACAAAATAACTAATGAAGCTTATATTTACCGTGATATCAAACCAAACAGACCATCCAGAAACAAATTAGAACCTATCATGTTGATAATTGTAAATGATGTAGATCATCCGATAAATGAAAGAGCACAAACTGTAGCAGAACATGAAAACCTTGAGATATTAAAATGGTCTAATAAATCAAAAATCATTGAAACTTTAACCTCATAAATTAGCAGTAGTCCCTTATTTATATTCTTTAATTTCCAAACCATATCGTGCAAATAGAAAAGCAGATAACTTTTTTATTTGCACGTTTTATTTTAGAACAAAAAAGAACAAGGTCAAAGAGTCAGAAAAACTTTTTCTTGATACGTATTTGACACTTGCTCTTTTAAGAAAACTAACAATTCATTGTATTTCCGTTAAATTAACGGAGAATTCGGATTACCTAGATAGATTTACCTCTAGAGTGTTAAAAAATTGTACATTCTTAAACAATCATAAATGTACGTTATTAAATTATCATTTCCACTGGAGAATCATGTCGACTAAAAGATTATAAAAGTAAAAATACATTTAAAAGCACGTCATTTTCAAACCGCCATAAAACAGCATTTTTAAACCGCTATTGACATAAAACATATTTAGAATAAATCATTTAGAAAAATTAAATAATTTAACCGGCAATAAACTAACTATTTACATGAATCTATAAAACACTTAGAACAAAAGTTCGAAAAACGCACTTTATGATTGTATAGTGATATCAAATATACTTATCAGTGAGTATTAAGAAATACTTCCATTTTAATACTCTTAGAATCAACAACTTTATTATCTCCGTAAATATTTAAAAACTTATATGGAACAAAAGGTACTAGTTCTTTTTTAGGAAATAAGTCAAACCAAAAACTTGTATTGTTCTTTTCAGTAAATTTTATATATCCAGATTCAAATGCAGAACCATCAAACTCGTATAGCTTTTTTTCTTTAGTGAGCCAGTGTCTTGCTTTGTAATCTAGTTCCTGAATAGTAACCATATTCTTATTTGTAGTTATTGTAAATCCAAGTGATTGTCTATTGTCGATTGTTACCTGTACAGTAATTAATTTATCTCTTTCATTTTCTGAACTATTAAATGTAAGACCACCATACATACAACAACCTCCAAAATTTTGGTTTATATCCGGTTCAGATTTAGGTATTATACATGTATAAAAATATGGAACGCCAAAAATGTCTACTTTTTTATCTTTATAATTGTTAGCTAATTCTGTATTTTCTAATTCAGTTTTAACCTCATTATAACTCTTATACTCAATTGGAAAAATTAAATCATGAGATAAAAACTGTCTAGAATTAATAACTCCTCTTCCTTCAACAGGTGGAGACGTATAAAGATTCATTACATTACCCATAGTTCCCTTATTATTTTTATAATCACTTACTTTATTTAGTTCGTCTAATTTAGGATCGGGTTGAGCATTCACATAATTCATATTATGAAAAACTATTTCTAGAATCAAAATAATAATTACAGTAGATAATTTCTTCATAAAACCTCCTCTAACTTATTCAGTCTATTTGACAATGAACCTTATTATAAATTCACGCTTATAGATAGTTCAGGTTGTAGTGTGTCGATAGCATTGTTTTAAAACTAAAAATTCACTAGCAGAATAAATTAAAATTCTATTTATCATTATTACTAATTACAACAAATAATTTTGAATCCGTATTCAAGATAATATATAAATTTCAAATTTTACTACAATTCAAATCATTTTCCTCTCATATAATGGTTTAATTTCATGATTCAGTTGATAATCATCAATCACTTAATCTTTATATAAAAATACATCAATATGATAATTAGATGAGCTAACTGTTCTATTATCACTATAAAATTGAAAAAACTCTGCTCCCACTGAACCTTTTACGTTATATAAATCATAATAAAATGATTGATCTTGATGATTATGAGAATGAAAGAAAATGCATCCTTTTTGTATGTTACCGGTATCTTTATTGTATATTTTATATAAATTTTCTAATTTAAATCGAACTTTAGTGTCTAATTCTTGTACTGTTACTTTAGCCTTTTTGGTTTTTATAACAAAACCTTCTTGTTGGACACCATCTTTAAATACATTAACGCCTATAACTTTCTCTTCATCTAATTGATTTCCATCATGTATCGTAACTCCTCCGTATAAGCATGATGTTTTTTCTTCAGTTAAGCCTACACATTTATTTCCAAAATACAGTCCATAAATATCTATATTTTTTCCTTTAAATTGATTTGCTAAATCTGATGAGTTAAACTCAACTTTCAAACTAGAAGTTTTAAGTACGGATATATCAATATTTTTTAATATTATAGTATTATTCAGTAGTTGATCTGTACTAATTTTATTTGACTCGTCTAATTGCCACGTTATATCAGTATAATAGCTTGTTAAATTAAATAACTTACTACTATCTAGATCAGATTTTTTCTTTAAATCTTTTTTGTCTACTTCAGCATTAACATAATTATTATTAATAAGACATAATAAAGTTATTATAATTGCAGCTATGTAGAACAATCTCATAAGCTTTTTAATATTTTTTATAATATTCTCTCCCTCAATTATTTTTTGGTTAAATGAACTTCTACATTAATAGATTTACTCTCAACTGTTTTATTATCATTATAAATTAGTAAATATTTAGTCGGATAAAATTTTTTACCAGATTCAGGCATCAAATCATACCAAAAAGAATGACCACTTCCTTCGATAAACTTTATATAGCCAGTCTCATAAGGCGAACTGTTAAATTCATATAAATTTTTATGCTTAAGTAAATAGTTTCTAACTTTATAATCTATTTCTTGTGCTGTTATGTTTTTCTTATTAGTAGGTATATCAAAAGATAATGAATTTCTCTCGTTTTCATAAACTTTAATTAAGATATTATGAGAGTTATCAGTTGAATTATTTTTATCTATTTGATTTCCATCATGCTCGGTCACACCGCCATACATACACGTTTTTTCAATTAATCTACCATCATTTAATTCCATATTATCCGATGAAAAATAGCATTGATTATAATAGTTTGTCCCAAACAAATCTACGTTTTTATTTTTATATTTATCCGAAAGGCTTTTATTATTAAATTCTGTTTTTAAAATTTTAGAACCACTTATTTTAAATAATAAATCATGTTGTAAAAACTTTTCTTGGGATTTAATGTTTGTTTCTGATACGTGTTTATCATCATACAAATACCTCATATTATCCATTAGACCAGTGAATTCACTCGCTTTATTCAATTGTTCTGGTTTAGGATTGCCATTTAACATAAATAGTAAGCTGCAAGACTTAACACATATGAAGATAAAGGCAAATAACTTCATTACAACAACTCCATATTTTAATTTTTTATAAATTTGATGTATTACAGGGAATATTTAACATACACATTAGCCCTAGAGACTTTAAAATTTAAATAGTTAATACATATATTAATTTCGTATAAATTCGCATTTTAGTGTTAAAACTAATTATCATTAGTTACTATCTACATATGATATTTCGACATCAAGATGAAATTTTTCAGATTCTATTATTTTATTATCTTCATAAATTTTCAAAAAACTTACAGGCAGTCCATCTCCTGTATAAAACAAATCATATGAAAATGATTTTTCATTATTTAAATGAAATAAAACTTTCCCATTATTAAAACCTGAATAAAATTTAGATTTATATCCATATTCTTTGCCTTTACCAGTGTTATTATGACCATAGATATTGTATTCTTCTTGAAGATATCTTCTTAATTTAACATCAATTTCTTGAGCTGTTACTAGTTTTTTATTAGTTGCTATTTTGTCAGTAGAAATTGTTTTATGTTTGCCATTAACCCAAAGATTAATAGGGATTTTTCTAGCAGAATTTAAGTATTGTCCTGATAAAGTGGCCCCTCCATACATGTATTTAGATTTACAAGGACCATTATAATCAATGCCAAAAATATCCAGTTTCTTTCCTTTAAATTTACTTATTTCGTCCCAATTATTAGATTCTGAGATCAAATCATTGGTACCTGTTGAAAATTCGAGTTGATTTGCAATAGGTAGGTTTTTATCTGTGACGCCTTTTAAATCTATATAATCATGTTTTGTATAGAAATTTCTTAAGTTACCTACACCAATATCACCTTGAGCATACGTATGATCTTTAATGTTAAAAAGTAATATAAAAACTAATATAAAACTATATTTAAATTTTTTCATGGCATTTCCTTTACTAAGTTATGATTGAAATACTTCAACTTTCGTCCTTATAAGATATTTCTACATCTAAATGGAATTTTTCAGTTTCGACAGTTTTGTTGTCATTATATATTTTTAAGAAACTTTCAGCTTGTCCTGTTCCAGTATCAAATAAGTCATAAGAAAATGATGAACCATCATTCAAATGAAATAATATTTTTCCTGCATTAAATCCAGAACTAAATTTTGACTTATTACCATATTTTCTTCCTTTATTTGTATCATTAAAGCCATAAATATTATATTCTTCTTGTAGATATCTTCTTAATTTAGTATCAATTTCTTGAGCTGTTACTAACTTTTTATTAGTTGATACTTTGTCAGTAGATATAGTTTGATGTTCTCCATTAACCCAAAGATTAATAGGAATACGTCTAGATTTCTCTAAATAATCACCTGCTAATGTAACTCCACCGTATATATATTTGTTTTTCAAACAATATCCACTATAACTTAGACCATATACATCTACAGCATGATTTTTGAATTTCTTTACATCATCAACGTTCTTAAATTCAGCTGTTACTGTCGAATTATCCATAGAAAAAACTAATTGATGCGAAAGATGATTATTTTCAGGATTAATACTTTGGTGGTCTTCAATTGGATAGCTACCATAATAGTTCCTAAGATTCAAAACTCCGACATCAGCGGTTGCGATATGATTTTGCGAATAGCAAAACAATAAAACAACAATGATAAGTATTCTTTTCATATTTTATTTCTCCTATATTTAAACTTCTCTATCTTTATTATCTTTTATTGTAAAAATAACCAATTCTTCTTAAATCATCATGATTCTATCCCACTTATATATTATTACTCGTTAATCTGGTTTTGTTATCTATACTAAAATAGAAAGCTTTTTATAGTAATAAAGTTAGATTTGAATCACTATTCGTTCTTCATCATTTACTAAGCTACTTTGTAAAAATATGTTAATATCTATAGTTCTTTATAGGATTGTAAGTTGATATCCATCAACTTTCAGATTGTTATGTAAATAAATAAACATCAATATGATAGTCTGATGAATCTATTGTTTTATTATCATTATAAATTTGCAAATATTGATCTGGTAAATTTCCTTTAATATAAAATAAATCATAATAAAATGATTCTTTATGCTCCGAATGAGAATGAAATTTAATATAACCTTTTTGTACATCACTAGTCATTCTGTCATACAATTTATATGCATTATTTAATTTTGTTCTTACTTTAATATCAAGTTCTTGTGCAGTAACTTTCTTTTTATCTGTAGTAACGATAAATGTATTAACATTTACATTATCCTTATACACAGCTACTCCTATATTTTTAGGCTCGCTTAATTTATTATTTTCATGAGGTGTTACCCCACCATATGTACAGGCAGTATCCACTTGATGCTCACCATGACAATGTGCTTTATAGTAAACACCATAAATATCAACAGTCTTTCCTAGAAATTCTTTAGAAATCGCTGATGAGCTAAATTCCACTTTTAAATCTTTAAATTCAGCAGATATTCCATCTAACCAATTAATACTTTTAAATAATAAATCGAAGTCTAAGAATTTTTCTGTAGTTGATACAATTGATTTTACTGTCGTAAATCGATTATTTATATAATCATCATTAATATTATGTAAAGCAATAGGGTCTACACTTGACTTCTTACACAAACTCTCTATTTTAGGATCTTCTTCATTTGCATATGCATTGTTTACACTACATATTGCAATTAAATTTAAAATTAATAATAATACATTTAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP028470|1820525:1828188|1826423_1827143_-|AWQ25982.1|DBSCAN-SWA MKRILIIVVLLFCYSQNHIATADVGVLNLRNYYGSYPIEDHQSINPENNHLSHQLVFSMDNSTVTAEFKNVDDVKKFKNHAVDVYGLSYSGYCLKNKYIYGGVTLAGDYLEKSRRIPINLWVNGEHQTISTDKVSTNKKLVTAQEIDTKLRRYLQEEYNIYGFNDTNKGRKYGNKSKFSSGFNAGKILFHLNDGSSFSYDLFDTGTGQAESFLKIYNDNKTVETEKFHLDVEISYKDES >CP028470|1820525:1828188|1822883_1823660_-|AWQ25978.1|DBSCAN-SWA MKKLSTVIIILILEIVFHNMNYVNAQPDPKLDELNKVSDYKNNKGTMGNVMNLYTSPPVEGRGVINSRQFLSHDLIFPIEYKSYNEVKTELENTELANNYKDKKVDIFGVPYFYTCIIPKSEPDINQNFGGCCMYGGLTFNSSENERDKLITVQVTIDNRQSLGFTITTNKNMVTIQELDYKARHWLTKEKKLYEFDGSAFESGYIKFTEKNNTSFWFDLFPKKELVPFVPYKFLNIYGDNKVVDSKSIKMEVFLNTH >CP028470|1820525:1828188|1827423_1828188_-|AWQ25983.1|DBSCAN-SWA MLNVLLLILNLIAICSVNNAYANEEDPKIESLCKKSSVDPIALHNINDDYINNRFTTVKSIVSTTEKFLDFDLLFKSINWLDGISAEFKDLKVEFSSSAISKEFLGKTVDIYGVYYKAHCHGEHQVDTACTYGGVTPHENNKLSEPKNIGVAVYKDNVNVNTFIVTTDKKKVTAQELDIKVRTKLNNAYKLYDRMTSDVQKGYIKFHSHSEHKESFYYDLFYIKGNLPDQYLQIYNDNKTIDSSDYHIDVYLFT >CP028470|1820525:1828188|1822480_1822666_+|AWQ25977.1|DBSCAN-SWA MTLALLRKLTIHCISVKLTENSDYLDRFTSRVLKNCTFLNNHKCTLLNYHFHWRIMSTKRL >CP028470|1820525:1828188|1824736_1825507_-|AWQ25980.1|DBSCAN-SWA MKLFAFIFICVKSCSLLFMLNGNPKPEQLNKASEFTGLMDNMRYLYDDKHVSETNIKSQEKFLQHDLLFKISGSKILKTEFNNKSLSDKYKNKNVDLFGTNYYNQCYFSSDNMELNDGRLIEKTCMYGGVTEHDGNQIDKNNSTDNSHNILIKVYENERNSLSFDIPTNKKNITAQEIDYKVRNYLLKHKNLYEFNSSPYETGYIKFIEGSGHSFWYDLMPESGKKFYPTKYLLIYNDNKTVESKSINVEVHLTKK >CP028470|1820525:1828188|1820525_1821654_+|AWQ25976.1|transposase|DBSCAN-SWA MTRERRSFSSEFKLQMVRLYENGKPRNEIIREYDLTPSALGKWRKQHQNTGTFNHQDNLSDEEKELIKLRKEVQHLKMENDIFKASSADHGTKIEVIQKNAHQYSVSAMCKVLKIPRSTYYDSIKRRDNKNTKDDSNVERAVINIFNSNRKVFGTRRIKNNLNDKGLTVSRRKIARIMKKHNLVSVYTKAKYKNHPKETNEKRIKNHLNRAFNREQPMETLVSDLTYVKVGGTWHYICLFIDLFNREIVGYSAGKNKDANLVSKAISRINHNLEQIKLFHTDRGKEFDNHLIDEVLETFKIKRSLSTKGCPYDNAVAEATMKAMKTEFVKQMQFENLEQLETELFDYVNWYNNFRPHSSLQYLTPVAFKNLHMKTV >CP028470|1820525:1828188|1825660_1826389_-|AWQ25981.1|DBSCAN-SWA MKKFKYSFILVFILLFNIKDHTYAQGDIGVGNLRNFYTKHDYIDLKGVTDKNLPIANQLEFSTGTNDLISESNNWDEISKFKGKKLDIFGIDYNGPCKSKYMYGGATLSGQYLNSARKIPINLWVNGKHKTISTDKIATNKKLVTAQEIDVKLRRYLQEEYNIYGHNNTGKGKEYGYKSKFYSGFNNGKVLFHLNNEKSFSYDLFYTGDGLPVSFLKIYEDNKIIESEKFHLDVEISYVDSN >CP028470|1820525:1828188|1823942_1824698_-|AWQ25979.1|DBSCAN-SWA MRLFYIAAIIITLLCLINNNYVNAEVDKKDLKKKSDLDSSKLFNLTSYYTDITWQLDESNKISTDQLLNNTIILKNIDISVLKTSSLKVEFNSSDLANQFKGKNIDIYGLYFGNKCVGLTEEKTSCLYGGVTIHDGNQLDEEKVIGVNVFKDGVQQEGFVIKTKKAKVTVQELDTKVRFKLENLYKIYNKDTGNIQKGCIFFHSHNHQDQSFYYDLYNVKGSVGAEFFQFYSDNRTVSSSNYHIDVFLYKD |
8 | Staphylococcus_phage(66.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1912228 : 2024575
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP028470|1912228:2024575|DBSCAN-SWA CTTACGCGTCCTCCTCATTCATGATTGTAGGCACTTTAAATTGTCCATCTTCTGTTTCTTTGGCATTTTTCAAAGCTAATTCTTGCGGAATACCTTTAATTGCTTTATCTTCACGTAAAACGTTTTGTAAATCTAAAACGTGATATGTAGGTTCAACGCCTTCTGTATCAGCGCTATCATTTTGTTTTGCAAAATCTAAAATGCTTTCTAATGTGTTGGCCATTTCTTCCGTTTCTTCAGGAGAAATTTGAAGTCTTGCAAGATTCGCGATATGCTCAACTTCTTCACGTGTTACTTTTGTCATTAATAAAAGCCTCCTTTAAGTCATTCATCACTAAATTGTATCAAATTTCCAATTAAAAATCTAAGTATTTATGAGGTACTACTTTAATTTCATATAAACTGTATAAACATTATCATTCATTTATCAAATCATTTTTTATAAAAACAACACCCTTTAATATTAGACAACCCAATTCAATATTATGATTATGCAATTTTAATTATAAAAATTTGCCCATATCCAAAAAATACGAAAGCGTTTTCTATATTGATATACAAGTATTTCAAAAAGAATAAATTTAATTTTCCTACTTTTCTAAACATTTATCTTTATGTATAATGTTTTCAAGTAACTAAATTATAAATTAAATAAAGGGAGTGTTTATCATGCTTACAATGGGGACAGCATTAAGTCAACAAGTAGATGCCAATTGGCAAACTTATATTATGATTGCCGTCTACTTTTTGATACTAATCGTTATTGGCTTTTACGGTTACAAGCAAGCAACTGGTAACCTAAGCGAGTACATGTTAGGTGGACGTAGTATTGGACCGTATATTACTGCATTATCAGCTGGAGCTTCAGATATGAGTGGATGGATGATTATGGGTCTACCTGGCTCTGTCTATAGCACTGGTCTATCAGCTATGTGGATTACAATCGGTTTAACATTAGGTGCTTATATAAATTACTTTGTTGTTGCTCCTAGACTTCGTGTTTATACCGAATTAGCTGGAGATGCAATCACATTACCAGATTTCTTTAAAAATAGACTAAACGATAAAAATAATGTTCTAAAGATTATTTCTGGATTAATTATCGTTATATTCTTTACTTTATATACACATTCTGGTTTCGTATCTGGTGGTAAATTATTTGAAAGTGCTTTTGGATTAGATTATCATTTCGGTTTAATATTAGTTGCTTTCATTGTCATTTTCTATACTTTCTTTGGTGGATATTTAGCTGTATCAATTACAGATTTCTTCCAAGGTGTCATTATGTTAATTGCGATGGTTATGGTCCCTATTGTTGCTATGATGAAGTTAAACGGCTGGGGAACGTTTCATGATGTAGCAGCTATGAAACCTACAAATTTAAATTTATTTAAAGGGTTATCATTTATAGGAATTATCTCTCTATTTTCATGGGGATTAGGTTATTTCGGTCAACCTCATATCATTGTAAGGTTTATGTCTATTAAATCACACAAGATGCTACCTAAAGCTAGACGTTTAGGTATTAGCTGGATGGCAGTTGGTTTGTTAGGCGCTGTGGCTGTTGGTTTAACAGGTATTGCATTCGTACCTGCTTATCATATTAAACTAGAAGATCCTGAGACATTATTCATCGTGATGAGTCAAGTACTCTTCCATCCTCTTGTAGGTGGTTTCTTACTTGCTGCGATTCTAGCTGCAATTATGAGCACGATTTCTTCACAATTACTTGTAACATCTAGTTCATTAACGGAAGACTTTTATAAATTAATTCGTGGTGAAGAAAAAGCTAAAACGCACCAAAAAGAATTTGTTATGATTGGACGTTTATCTGTATTAGCAGTAGCAATCGTTGCTATTGCAATTGCATGGAATCCAAATGACACAATACTAAACTTAGTAGGTAATGCTTGGGCCGGATTTGGTGCATCGTTCAGTCCACTTGTGCTATTTGCACTTTACTGGAAAGGTTTGACACGTGCCGGTGCTGTAAGTGGAATGGTTTCAGGTGCCTTAGTCGTTATCGTTTGGATTGCGTGGATTAAACCATTGGCACATATCAACGAAATATTCGGCTTATATGAAATTATTCCTGGATTTATTGTAAGTGTAATCGTTACATATGTTGTAAGTAAACTTACTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTCTGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTATAAATGTGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCTCGTGGTTGGTTACCATCTTTAATACGAATTTCATAGTTATCGATTTTATCGAAATATTTATTCGCTTGTTCAGTAACGTACTGTGTAATACCAATTGTTTCAGCTTGTCCATAGTAATCGATTGGTAAATCTACTACTAATCGTTGTGGCTTTTTATCAACAAATTTAACTTTCCCTACTGCTTGTGTGAAATTAGAAAAATATGATTGCAAATTATCATTAAATTGCTTGAAATTATTATTTAAATTTTCATCATAATCTGCTGCTGTTGAAGAAGGTAATAAAGCTGATTTTTCATTGATATTATGCCATTCATTAAGCTTTGTTTGACTCTTTTCTGCAGTCGCTTGAGTGATAAATTCACCTGGTGTGATTGAATCTTCACTTGATTGCTTATAAATTGCAAAATGAATTGGTATATCTTTTAAATCATCATTTTCACGTAACCTTGATAATATCTCACTAGCCATTTGTTTACCTTGCTTTTTAACTTCGCTATCATCTAGTTTTTTACTAAAAGTCGGTCCATCTTTTTCTTTTTTATAGTAATAAACACTATTCATAGCTAAACCAATCGTCATACCTTTAATATTCTTACCTTTTGTATCTCCACCACCATAAAAATCTTGCTCTAAAATGTTAGATAAATAGGCTGGTGATTTTTCTGCAATCTTTTCAGGATCTGTTTCACCTTCGTGTGATGGATTAAGTCCTAAATTTTCATTCGCTTTCTTGTCTTTTTTATCTTTTTCAGACATTTTATCGATTTCACGTTTTGTATACTTAGGATTTAAATAGGCATTAATTGTTTTCTTGTCCAAAAATTGACCATCTTGATACAAATATTTATCTGTTGGAAATACTTCTTTACTTAAGTTCAATAAACCATCTTCAAAGTCGCCGCCATTATAACTATTTGCCATGTTATCTTGTAAAAGTCCTCTTGCCTGGCTTTCTTTAAATGGTAACAATGTACGATAGTTATCACCTTGTACATTTTTATCCGTAGCAATTTCTTTTACTTGATTTGAACTATTGTTATGTTTTTGATTATCTTTTCCAGCCTGGTCATCCTTATGGTTACCACAAGCAGCGAGTATAAAGATAGCTGTAATCAATAATACTAATGTACGCTTCATCGACATACCCCTCTAACTATTTAATTCATTTTGCTTATCTACAAATTGTTGCTCTGTCCAAATTTCAATACCTAAACTTTGTGCTTTTGTTAATTTTGAACCTGCATCTTCACCAGCAATAACGACATCTGTATTTTTAGTAACGCTACTTGTAACTTTAGCACCTTGTGATGCAAGCCATTTAGATGCTTCATTGCGTGTCATTTGATGTAGCTTACCAGTTAGTACTATCGTTTTACCACTAAATTCAGGATGTCCTTCAATATCTGATGTTTTGATACCTTTATAAATCATATTAACATGTTTATCTTTTAATTTTTGAATTAAAGCACGAATATCTTCATTTTCTAAGTAAGTAACTACAGATTGTGCTACTTTATCACCTATATCATGAATTTCTACTAATTCCGCTTCAGTTACCGTTAGTAATCGATCTATCGTTTCATATTTTTCTGCTAACACTTGGCTCGCTTTAACACCTAAATGCCTAATACCTAGACCAAATAATAAATTTTCTAAAGAGTTGTCCTTAGCTTGTTGAATGGCAGCTAATAAATTATCAACTTTTTTCTGCCCCATTCTGTCTAAAGGTAATAAATCTTCTTCTGTTAAATAGAAAATATCAGCAACATCTTTAATTAATTCACTTTGATAAAGCTGTTGAATAATTTTAGTGCCTAAACCATCAATATTCATGGCTTGTCTTGATACAAAGTGAATCAATCCTTCAACAAGTTGCGCTTGACATTTTGGATTAATGCAACGAAGTGCTACTTCGCCTTCAATACGTACTAATTCATGTCCACAACTTGGACAATGGGTTGGCATATGATATGTGACAGCATCCTCAGGTCTACGTTCTGGAATACTACGTACAACTTCAGGTATGATGTCACCTGCTTTTTTCACTACAACACTATCACCAATTCGAATATCTCTGTCATGAATTAAATCCTCATTGTGCAAAGATGCTCTTGATACAGTTGTACCAGCTACTTTTACTGGTTCTAAAATAGCAGTAGGTGTGACTACACCTGTTCGTCCAATACTTAATTCAATATCTAATAATTTAGTTACTACTTCCTCAGCTGGAAATTTATAAGCAATGGCCCATCTAGGAGATTTTTGTGTGAATCCCATCTCATCCTGTTGATCTAAATCATTAACCTTAATAACAATCCCATCAATATCATAAGGTAATGACTCTCTTTGGCTTGTCCATTTTTCAATATACTCTAAAACACCATCGATATTATTTACACGCGCTCTATTTTTATTCGTTGTAAAACCTAATTTATCTAACTCATCTAATGCTTCACTTTGCGAACGCGCATTGAAATCAGTGAAATCATTGACACTATATATAAATACGCTTAGCTTTCGTTTTGCCGTTAATTTAGAATCTAACTGTCTTAATGATCCCGCAGCAGCGTTTCTTGGATTTGCAAATAACTGCTCATCATTTTTTTCTTTTTCTTCATTTAATCGTAAAAATGAACGTCTC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137 | Staphylococcus_phage(82.47%) | portal,terminase,tail,protease,coat,transposase,head,integrase,capsid,tRNA,holin | attL 1954966:1955025|attR 2031140:2033338 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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