Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029669 | Staphylococcus aureus strain AR_0223 chromosome, complete genome | 9 crisprs | DEDDh,cas3,DinG,WYL,csa3 | 9 | 4 | 12 | 1 |
CP029668 | Staphylococcus aureus strain AR_0223 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029669_1 | 214865-214943 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029669_1
|
1 spacers
spacers of CP029669_1
>1.1|214888|33|CP029669|CRISPRCasFinder CAGAAGCTGACGAAAAGTCAGCTTACGATAATG |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029669_1
The CRISPR arrays of CP029669_1 >merge|CP029669|1|214865-214943|CRISPRCasFinder TGCAGGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGACGAAAAGTCAGCTTACGATAATGTGCAGGTTGGCGGGGCCCCAACA >CP029669|1|1|214865-214943|CRISPRCasFinder TGCAGGTTGGCGGGGCCCCAACA CAGAAGCTGACGAAAAGTCAGCTTACGATAATG TGCAGGTTGGCGGGGCCCCAACA
>CP029669.1|AWR11814.1|213611_214598_-|hypothetical-protein MNDQWYKHLIGARTIKTGIAIFLTAVFCMALDLTPIYAILTAVVTIEPTAKASLIKGYRRLPATVIGAGFAVLFTYLFGDQSPFTYALSATFTILFCTKLKLQVGTNVAVLTSLAMIPGIHDAYIFNFLSRTLTAIIGLVTSGLINFMVFPPKYYGQVEEKLSKTDALMYKLFYNRCQELILSRLQSDKSEKAYKNIFNLNNQVETLISYQRDELSYHKKKECDWKLLNQLTKRAYTNRLFITHLSNIIYLPKNTRVNFSGDEKMALLKISSSIKDIFYDGSFKREDDSVETLRSTIKALEISGENQIKSHILYEVLMIYRLLDSRYA >CP029669.1|AWR11928.1|212669_213122_+|hypothetical-protein MQHEKMNDERNLTMKPTKVILKDASYLHSKTSITFILKDVVIEEDNKIYYFDTSATFEDQEVKFEFALFDSDMDNLKHMDCDNPVTEIYFIEPDLHFTIIDFNQELLCIYIDFDSGLRHSNMATESGISLRINVAKSDFTKFINELASLH >CP029669.1|AWR09721.1|211752_212484_+|cobB/CobQ-like-glutamine-amidotransferase-domain-protein MHELTIYHFMSDKLNLYSDIGNIIALRQRAKKRNIKVNVVEINETEGITFDECDIFFIGGGSDREQALATKELSKIKTPLKEAIEDGMPGLTICGGYQFLGKKYITPDGTELEGLGILDFYTESKTNRLTGDIVIESDTFGTIVGFENHGGRTYHDFGTLGHVTFGYGNNDEDKKEGIHYKNLLGTYLHGPILPKNYEITDYLLEKACERKGIPFEPKEIDNEAEIQAKQVLIDRANRQKKSR >CP029669.1|AWR09638.1|210437_211751_+|hypothetical-protein MRQWTAIHLAKLARKASRAVGKRGTDLPGQIARKVDTDILRKLAEQVDDIVFISGTNGKTTTSNLIGHTLKANNIQIIHNNEGANMAAGITSAFIMQSTPKTKIAVIEIDEGSIPRVLKEVTPSMMVFTNFFRDQMDRFGEIDIMVNNIAETISNKGIKLLLNADDPFVSRLKIASDTIVYYGMKAHAHEFEQSTMNESRYCPNCGRLLQYDYIHYNQIGHYHCQCGFKREQAKYEISSFDVAPFLYLNINDEKYDMKIAGDFNAYNALAAYTVLRELGLNEQTIKNGFETYTSDNGRMQYFKKERKEAMINLAKNPAGMNASLSVGEQLEGEKVYVISLNDNAADGRDTSWIYDADFEKLSKQQIEAIIVTGTRAEELQLRLKLAEVEVPIIVERDIYKATAKTMDYKGFTVAIPNYTSLAPMLEQLNRSFEGGQS >CP029669.1|AWR11668.1|209645_210146_-|ferritin MLSKNLLEALNDQMNHEYFAAHAYMAMAAYCDKESYEGFANFFIQQAKEERFHGQKIYNYINDRGAHAEFRAVSAPKIDFSSILETFKDSLSQEQEVTRRFYNLSEIARQDKDYATISFLNWFLDEQVEEESMFETHINYLTRIGDDSNALYLYEKELGARTFDEE >CP029669.1|AWR10280.1|208702_209257_-|exonuclease-family-protein MIQDAFVALDFETANGKRTSICSVGMVKVIDSQITETFHTLVNPQDYFSQQNIKIHGIQPEDVENAPTFDYVFPYMMQFIADLPVVAHNAAFDMNVLHQSIQNIGLPTPNLTYFCSYQLAKRTVDSYRYGLKHMMEFYQLDFHGHHDALNDAKACAMITFRLLKNYENLTYVTNIYGKNLKDKG >CP029669.1|AWR10897.1|207564_208635_+|impB/mucB/samB-family-protein MTERRIIHIDMDYFFAQVEMRDNPKLKGKPVIVGGKASSRGVVSTASYEARKYGVHSAMPMSQAHKLCPNGYFVTSNFGAYRETSAQIMSIFRSYTDKVEPMSLDEAYLDITELVRPDLPASKIAQYIRKDILEQTHLTASAGVSYNKFLAKLASGMNKPDGMTVIDYQNVHDILMTLDIGDFPGVGKASKKVMHDNGIFNGRDLYEKTEFELIRLFGKRGRGLYNKARGIDHSEVKSSRVRKSVGTERTFATDVNDDEEILRKVWELSGKTAERLNKLQKSAKTVTVKIKTYQFETLSKQMSLRDSVSSEEDIYNIAYLLYNDLKDPDVPIRLIGVTVGNLEQSTYKNMTIYDFI >CP029669.1|AWR11117.1|206787_207318_+|hypothetical-protein MHKIDLTTNNFQMRRFIILQLVIALFVILFTYKWALGVTAVVDQNIIINLVYGFAGFIILLILHELIHRALFLLFKKDSKPMFNIKKDRILFQTADACFNKWQFSIIMLSPLILLSTGLLILIKVFGYSSLIFMFSMHTAYCFIDILLVALTISSSFKYVQQDEDSIYLYHQKPTQ >CP029669.1|AWR11782.1|205256_206618_+|23S-rRNA-(uracil-5-)-methyltransferase-RumA MQAIAKNDIKTGTVVDLTHEGHGVVKIDRFPIFIPQALINEQIEYKIIKVKKNFAIGKLLNINTRSENRVAPPCIYYERCGGCQLQHLSYEAQLEMKKEQVINLFQRKAHFDNSKINDTVGMTDPWRYRNKSQIPVGKNEQNEVIMGFYRQRSHDIIDMESCLIQDSQHQEVMNEVKSILKDLNVSIYQEQLKKGLMRHLVVRTGYHTDEMMIIFVTNGKKWPQKNAVVEKILDAFPNVTSIKQNINDSHSNVIMGRQSITLYGKDTIIDQLTDSTFKISDQSFYQINSEQTEKLYNKAIEYAQLTGNEVVLDTYCGIGTIGLYMAPLAKHVYGVEVVPSAIEDAQQNATINQCNNTTFVCGKAEEVILQWKAQGIKPDVVMVDPPRKGCDETFIQTLLTLEPKRIVYISCNPATQQRDALLLAEKYQLEEVTPVDMFPQTTHVETVALFNLK >CP029669.1|AWR10457.1|204228_205176_+|diacylglycerol-kinase MRKRARIIYNPTSGKELFKRELPDALIKLEKAGYETSAYATEKIGDATLEAERAMHENYDVLIAAGGDGTLNEVVNGIAEKPNRPKLGVIPMGTVNDFGRALHIPNDIMGALDVIIEGHSTKVDIGKMNNRYFINLAAGGQLTQVSYETPSKLKSIVGPFAYYIKGFEMLPQMKAVDLRIEYDGNVFQGEALLFFLGLTNSMAGFEKLVPDAKLDDGYFTLIIVEKSNLAELGHIMTLASRGEHTKHPKVIYEKAKAINISSFTDLQLNVDGEYGGKLPANFLNLERHIDVFAPNDIVNEELINNDHVDDNLIEE >CP029669.1|AWR09265.1|215125_215884_+|methionine-aminopeptidase,-type-I MIVKTEEELQALKEIGYICAKVRNTMQAATKPGITTKELDNIAKELFEEYGAISAPIHDENFPGQTCISVNEEVAHGIPSKRVIREGDLVNIDVSALKNGYYADTGISFVVGESDDPMKQKVCDVATMAFENAIAKVKPGTKLSNIGKAVHNTARQNDLKVIKNLTGHGVGLSLHEAPAHVLNYFDPKDKTLLTEGMVLAIEPFISSNASFVTEGKNEWAFETSDKSFVAQIEHTVIVTKDGPILTTKIEEE >CP029669.1|AWR10030.1|216100_216487_+|hypothetical-protein MNYVERYIEQFLRATVRNNIKHYLLMLDEKMKNLDDYMRYLITKKEQLSKLIDSLMLTLENKYIDIAEAFQIQCAREINNQEIENIKSELNKVEAYYAQIETQIQQTSTEKIATEKTSYLINYMNAVA >CP029669.1|AWR09575.1|216501_217203_+|hypothetical-protein MTHKYISTQTLIIFTALMIIANFYYIFFEKIGFLLVLLLGCVLVYVGYLYFHKIRGLLAFWIGALLIAFTLLSNKYTIIILFVFLLLLIVRYLIHKFKPKKVVATDEVMTSPSFIKQKWFGEQRTPVYVYKWEDVQIQHGIGDLHIDLTKAANIKENNTIVVRHILGKVQVILPVNYNINLHVAAFYGSTYVNEKSYKVENNNIHIEEMMKPDNYTVNIYVSTFIGDVEVIYR >CP029669.1|AWR09489.1|217199_218243_+|sensor-protein-VraS MNHYIRTIGSMLILVYSMLAAFLFIDKVFVNIIYFQGMFYTQIFGIPVFLFLNLIIILLCIIVGSVLAYKINQQNDWIKTQIERSMEGETVGINDQNIEIYSETLDLYHTLVPLNQELHKLRLKTQNLTNENYNINDVKVKKIIEDERQRLARELHDSVSQQLFAASMMLSAIKETKLEPPLDQQIPILEKMVQDSQLEMRALLLHLRPLGLKDKSLGEGIKDLVIDLQKKVPMKVVHEIQDFKVPKGIEDHLFRITQEAISNTLRHSNGTKVTVELFNKDDYLLLRIQDNGKGFNVDEKLEQSYGLKNMRERVLEIGATFHIVSLPDSGTRIEVKAPLNKEDSYDD >CP029669.1|AWR09850.1|218232_218862_+|response-regulator MTIKVLFVDDHEMVRIGISSYLSTQSDIEVVGEGASGKEAIAKAHELKPDLILMDLLMDDMDGVEATTQIKKDLPQIKVLMLTSFIEDKEVYRALDAGVDSYILKTTSAKDIADAVRKTSRGESVFEPEVLVKMRNRMKKRAELYEMLTEREMEILLLIAKGYSNQEIASASHITIKTVKTHVSNILSKLEVQDRTQAVIYAFQHNLIQ >CP029669.1|AWR11027.1|218977_220195_-|yihY-family-inner-membrane-domain-protein MSKKDHSSSKYLNSVKEAQEESKKKNKSNPKIDVDRTYIEPQQFQSKKPKKDDQVFFLSRLNKPAKYKKDSNFLSYLIYRIGKDDASGLAAQMTYHFVLAMFPMLLFLLTLLPFFNIKQSQITNMLSNAPAETSTLIKSVIGDITQNSSGGLLSIGLILAIWSASNGMTAIMNSFNVAYDVEDSRNGIVLKLLSVVFTVVMGVVFVVALALPTLGSVISHFLFGPLGFDEQVKWIFNLIRIVLPIIIIFIIFIVLYSVAPNVKTKLKSVLPGAVFTSIIWLAGSFGFGWYISNFGNYSKTYGSIAGIIILLLWLYITSFIIIVGAEINAIIHQRSVIKGKTPEEAALEHDDNNKNHYNENTRYEYDEDSNATHQRTYHVDEHPSDTYPEDDKNIKDKIVDKLKKD >CP029669.1|AWR10402.1|220472_220748_-|hypothetical-protein MENKFVPGILIGAVIGGAISLADKSTRQALVQSVKDAKNGNRTRKPSKVSKIKDEVLYWKDVVEEIRRNNPELERSLKDAKETFVNRKNQR >CP029669.1|AWR11029.1|220754_221219_-|low-molecular-weight-protein-tyrosine-phosphatase-PtpA MVDVAFVCLGNICRSPMAEAIMRQRLKDRNIHDIKVHSRGTGSWNLGEPPHEGTQKILNKHNIPFDGMISELFEATDDFDYIVAMDQSNVDNIKSINPNLKGQLFKLLEFSNMEESDVPDPYYTNNFEGVYDMVLSSCDNLIDYIVKDANLKEG >CP029669.1|AWR09942.1|221365_221566_+|hypothetical-protein MTNEEKVLAIREKLNIVNQGLLDPEKYKNANEEELTDIYDFVQSRERLSPSEVTAIADALGQLRHE >CP029669.1|AWR09639.1|221577_222825_+|thermophilic-metalloprotease-family-protein MTNYKEKLQQYAELLVKVGMNVQPKQPVFIRSSVETLELTHLIVEEAYHCGASDVRVVYSDPTLKRLKFENESVEHFANHEIKSYDVEARMDYVKRGAANLALISEDPDLMDGIDSQKLQAFQQQNARAFKGYMESVQKNQFPWVVAAFPSKAWAKRVYPELSVEEAYIKFIDEVFDIVRIDGNDPVENWRQHIANLSVYAQKLQQKNYHALHYVSEGTDLTVGLAKNHIWEDATSYVNGKEQAFIANIPTEEVFTAPDRNRVDGYVTNKLPLSYNGTIIDQFKLMFKDGEIIDFSAGKGEAVLKDLINTDEGSRRLGEVALVPDDSPISNRNTIFYNTLFDENAACHLAIGSAYAFNIQGGTEMTVEEKIASGLNDSNVHVDFMIGSSDLTIYGIFEDGSKELVFENGNWASTF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029669_2 | 1244133-1244441 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029669_2
|
4 spacers
spacers of CP029669_2
>2.1|1244163|53|CP029669|CRT TTGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCGCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACC >2.2|1244246|26|CP029669|CRT TCGCCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCG >2.3|1244302|28|CP029669|CRT GCTAATTTCTCTGTGTCGGGGCTCCACC >2.4|1244360|26|CP029669|CRT CCGCCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCG >2.5|1244386|33|CP029669|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTTCCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029669_2
The CRISPR arrays of CP029669_2 >merge|CP029669|2|1244133-1244441|CRT,CRISPRCasFinder CCAAATTGAAATTATCCTACTGCTGTCTTTTTGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCGCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACCCCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGAGGAGCTAATTTCTCTGTGTCGGGGCTCCACCCCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTTCCACCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCG >CP029669|2|1|1244133-1244415|CRT CCAAATTGAAATTATCCTACTGCTGTCTTT TTGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCGCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACC CCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTT TCGCCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCG CCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGAGGA GCTAATTTCTCTGTGTCGGGGCTCCACC CCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTT CCGCCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCG CCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTT >CP029669|2|2|1244363-1244441|CRISPRCasFinder CCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCG CCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTTCCA CCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCG
>CP029669.1|AWR10683.1|1243133_1244063_+|glycerophosphoryl-diester-phosphodiesterase-family-protein MTNSSKSFTKFMAASAVFTMGFLSVPTAGAEQTNQIANKPQAIQWHTNLTNERFTTIAHRGASGYAPEHTFQAYDKSHNELKASYIEIDLQRTKDGHLVAMHDETVNRTTNGHGKVEDYTLDELKQLDAGSWFNKKYPKYARASYKNAKVPTLDEILERYGPNANYYIETKSPDVYPGMEEQLLASLKKHHLLNNNKLKNGHVMIQSFSDESLKKIHRQNKHVPLVKLVDKGELQQFNDQRLKEIRSYAIGLGPDYTDLTEQNTHHLKDLGFIVHPYTVNEKADMLRLNKYGVDGVFTNFADKYKEVIK >CP029669.1|AWR11934.1|1241512_1242892_+|argininosuccinate-lyase MSNKAWGGRFEVQPEEWVDDFNASITFDQTLIDQDIEGSIAHATMLANQGIISQQDSEQIIQGLKSIQHDYHQDQIQFSASLEDIHLNIEHELIKRIGDAGGKLHTGRSRNDQVATDMHLYTKKQVQDIIALIKSLQSVIVDIASNNVDTIMPSYTHLQRAQPISFAHHIMTYFWMLQRDQQRFEDSLKRIDINPLGAAALSGTTYPIDRHETTALLNFGSLYENSLDAVSDRDYIIETLHNISLTMVHLSRFAEEIIFWSTDEAKFITLSDAFSTGSSIMPQKKNPDMAELIRGKVGRTTGHLMSMLMTLKGLPLAYNKDMQEDKEGLFDAVHTIKGSLRIFEGMIQTMTINKERLNQTVKEDFSNATELADYLVTKNIPFRTAHEIVGKIVLECIQQGHYLLDVPLATYQQHHSSIDADIYDYLQPENCLKRRQSYGSTGQSSVKQQLDVAKQLLSQ >CP029669.1|AWR10784.1|1240317_1241523_+|argininosuccinate-synthase MKEKIVLAYSGGLDTSVAVQWLIDKGYDVVACCLDVGEGKDLDIVYKKALDMGAVECHIIDATKEFSDEYVSYAIKGNLMYENAYPLVSALSRPLIAKKLVEIAEKTNSVGIAHGCTGKGNDQVRFEVAIKALNPSLKAFAPVREWAWSREEEIDYAIKHNIPVSINHDSPYSIDQNLWGRANECGILEDPYAAPPEDAFDLTNALEETPDTADEIILTFDKGIPVQIDGKTYELDDLILTLNALAGKHGIGRIDHVENRLVGIKSREIYEAPAAEVILKAHKALETITLTKDVAHFKPIIEKQFAEQLYNGLWFSPLTDSLKLFIDSTQQYVSGDVRIKLFKGNAIVNGRKSPYTLYDEKLATYTKEDAFNQDAAVGFIDIYGLPTQVNAMLHGGYSNEQ >CP029669.1|AWR09931.1|1238635_1239967_-|glucose-6-phosphate-isomerase MTHIQLDFSKTLEFFGEHELKQQQEIVKSIHKTIHEGTGAGSDFLGWVDLPVDYDKEEFSRIVEASKRIKENSDVLVVIGIGGSYLGARAAIEMLTSSFRNSNEYPEIVFVGNHLSSTYTKELVDYLADKDFSVNVISKSGTTTEPAVAFRLFKQLVEERYGKEEAQKRIFATTDKEKGALKQLATNEGYETFIVPDDVGGRYSVLTAVGLLPIATAGINIEAMMIGAAKAREELSSDKLEENIAYQYATIRNILYAKGYTTEMLINYEPSMQYFNEWWKQLFGESEGKDFKGIYPSSANYTTDLHSLGQYVQEGRRFLFETVVKVNHPKYDITIEKDSDDLDGLNYLAGKTIDEVNTKAFEGTLLAHTDGGVPNMVVNIPQLDEETFGYVVYFFELACAMSGYQLGVNPFNQPGVEAYKQNMFALLGKPGFEDLKKELEERL >CP029669.1|AWR09824.1|1237735_1238311_-|hypothetical-protein MSFHQVEEWFEIFRQFGYLPGFILLYIRAIIPVFPLALYILINIQAYGPILGILISWLGLISGTFTVYLICKRLVNTERMQRIKQRTAVQRLISFIDRQGLIPLFILLCFPFTPNTLINFVASLSHIRPKYYFIVLASSKLVSTIILGYLGKEITTILTHPLRGILMLVVLVVFWIVGKKLEQHFMGSKKE >CP029669.1|AWR10601.1|1237206_1237731_-|signal-peptidase-I MKKVVKYLISLILAIIIVLFVQTFVIVGHVIPNNDMSPTLNKGDRVIVNKIKVTFNQLNNGDIITYRRGNEIYTSRIIAKPGQSMAFRQGQLYRDDRPVDASYAKNRKIKDFSLRNFKELDGDIIPPNNFVVLNDQDNNKHDSRQFGLIDKKDIIGNVSLRYYPFSKWTVQFKS >CP029669.1|AWR09940.1|1236615_1237191_-|signal-peptidase-I MKKEILEWIISIAVAFVILFIVGKFIVTPYTIKGESMDPTLKDGERVAVNIVGYKTGGLEKGNVVVFHANKNDDYVKRVIGVPGDKVEYKNDTLYVNGKKQDEPYLNYNLKHKQGDYITGTFQVKDLPNANPKSNVIPKGKYLVLGDNREVSKDSRAFGLIDEDQIVGKVSFRFWPFSEFKHNFNPENTKN >CP029669.1|AWR11840.1|1232979_1236456_-|helicase-exonuclease-AddAB,-AddB-subunit MTLHAYLGRAGTGKSTKMLTEIKQKMKADPLGDPIILIAPTQSTFQLEQAFVNDPELNGSLRTEVLHFERLSHRIFQEVGSYSEQKLSKAATEMMIYNIVQEQQKYLKLYQSQAKYYGFSEKLTEQIQDFKKYAVTPEHLEHFIADKNMQTRTKNKLEDIALIYREFEQRIQNEFITGEDSLQYFIDCMPKSEWLKRADIYIDGFHNFSTIEYLIIKGLIKYAKSVTIILTTDGNHDQFSLFRKPSEVLRHIEEIANELNISIERQYFNQLYRFNNQDLKHLEQEFDALQINRVACQGHINILESATMREEINEIARRIIVDIRDKQLRYQDIAILYRDESYAYLFDSILPLYNIPYNIDTKRSMTHHPVMEMIRSLIEVIQSNWQVNPMLRLLKTDVLTASYLKSAYLVDLLENFVLERGIYGKRWLDDELFNVEHFSKMGRKAHKLTEDERNTFEQVVKLKKDVIDKILHFEKQMSQAETVKDFATAFYESMEYFELPNQLMTERDELDLNGNHEKAEEIDQIWNGLIQILDDLVLVFGDEPMSMERFLEVFDIGLEQLEFVMIPQTLDQVSIGTMDLAKVDNKQHVYLVGMNDGTMPQPVTASSLITDEEKKYFEQQANVELSPTSDILQMDEAFVCYVAMTRAKGDVTFSYSLMGSSGDDKEISPFLNQIQSLFNQLEITNIPQYHEVNPLSLMQHAKQTKITLFEALRAWLYDEIVADSWLDAYQVIRDSDHLNQGLDYLMSALTFDNETVKLGETLSKDLYGKEINASVSRFEGYQQCPFKHYASHGLKLNERTKYELQNFDLGDIFHSVLKYISERINGDFKQLDLKKIRQLTNEALEEILPKVQFNLLNSSAYYRYLSRRIGAIVETTLSALKYQGTYSKFMPKHFETSFRRKPRTNDELIAQTLTTTQGIPINIRGQIDRIDTYTKNDTSFVNIIDYKSSEGSATLDLTKVYYGMQMQMMTYMDIVLQNKQRLGLTDIVKPGGLLYFHVHEPRIKFKSWSDIDEDKLEQDLIKKFKLSGLVNADQTVIDALDIRLEPKFTSDIVPVGLNKDGSLSKRGSQVADEATIYKFIQHNKENFIETASNIMDGHTEVAPLKYKQKLPCAFCSYQSVCHVDGMIDSKRYRTVDETINPIEAIQNININDEFGGEQ >CP029669.1|AWR11061.1|1229325_1232979_-|helicase-exonuclease-AddAB,-AddA-subunit MTIPEKPQGVIWTDAQWQSIYATGQDVLVAAAAGSGKTAVLVERIIQKILRDGIDVDRLLVVTFTNLSAREMKHRVDQRIQEASIADPANAHLKNQRIKIHQAQISTLHSFCLKLIQQHYDVLNIDPNFRTSSEAENILLLEQTIDEVIEQHYDILDPAFIELTEQLSSDRSDDQFRMIIKQLYFFSVANPNPKNWLDQLVTPYEEEAQQAQLIQLLTDLSKVFITAAYDALNKAYDLFSMMDSVDKHLAVIEDERRLMGRVLEGGFIDIPYLTGHEFGARLPNVTAKIKEANEMMVDALEDAKLQYKKYKSLIDKVKSDYFSREADDLKADMQQLAPRVKYLARIVKDVMSEFNRKKRSKNILDFSDYEHFALQILTNEDGSPSEIAESYRQHFQEILVDEYQDTNRVQEKILSCIKTGDEHNGNLFMVGDVKQSIYKFRQADPSLFIEKYQRFTIDGDGTGRRIDLSQNFRSRKEVLSTTNYIFKHMMDEQVGEVKYDEAAQLYYGAPYDESDHPVNLKVLVEADQEHSDLTGSEQEAHFIVEQVKDILEHQKVYDMKTGSYRSATYKDIVILERSFGQARNLQQAFKNEDIPFHVNSREGYFEQTEVRLVLSFLRAIDNPLQDIYLVGLMRSVIYQFKEDELAQIRILSPNDDYFYQSIVNYINDEAADAILVDKLKMFLSDIQSYQQYSKDHPVYQLIDKFYNDHYVIQYFSGLIGGRGRRANLYGLFNKAIEFENSSFRGLYQFIRFIDELIERGKDFGEENVVGPNDNVVRMMTIHSSKGLEFPFVIYSGLSKDFNKRDLKQPVILNQQFGLGMDYFDVDKEMAFPSLASVAYRAVAEKELVSEEMRLVYVALTRAKEQLYLIGRVKNDKSLLELEQLSISGEHIAVNERLTSPNPFHLIYSILSKHQSASIPDDLKFEKDIAQIEDSSRPNVNISIVYFEDVSTETILDNDEYRSVNQLETMQNGNEDVKAQIKHQLDYRYPYVNDTKKPSKQSVSELKRQYETEESGTSYERVRQYRIGFSTYERPKFLSEQGKRKANEIGTLMHTVMQHLPFKKERISEVELHQYIDGLIDKHIIEADAKKDIRMDEIMTFINSELYSIIAEAEQVYRELPFVVNQALVDQLPQGDEDVSIIQGMIDLIFVKDGVHYFVDYKTDAFNRRRGMTDEEIGTQLKNKYKIQMKYYQNTLQTILNKEVKGYLYFFKFGTLQL >CP029669.1|AWR11237.1|1228257_1229160_-|fumarylacetoacetate-(FAA)-hydrolase-family-protein MKFLSFKYNDKTSYGVKVKREDAVWDLTQVFADFAEGDFHPKTLLAGLQQNHTLDFQEQVRKAVVAAEDSGKAEDYKISFNDIEFLPPVTPPNNVIAFGRNYKDHANELNHEVEKLYVFTKAASSLTGDNATIPNHKDITDQLDYEGELGIVIGKSGEKIPKALALDYVYGYTIINDITDRKAQSEQDQAFLSKSLTGGCPMGPYIVTKDELPLPENVNIVTKVNNEIRQDGNTGEMILKIDELIEEISKYVALHPGDIIATGTPAGVGAGMQPPKFLQPGDEVKVTIDNIGTLTTYIAK >CP029669.1|AWR10856.1|1244565_1245810_-|NAD-specific-glutamate-dehydrogenase MTENNNLVTSTQGIIKEALHKLGFDEGMYDLIKEPLRMLQVRIPVRMDDGTVKTFTGYRAQHNDAVGPTKGGVRFHPDVDEEEVKALSMWMTLKCGIVNLPYGGGKGGIVCDPRQMSIHEVERLSRGYVRAISQFVGPNKDIPAPDVFTNSQIMAWMMDEYSALDKFNSPGFITGKPIVLGGSHGRDRSTALGVVIAIEQAAKRRNMQIEGAKVVIQGFGNAGSFLAKFLYDLGAKIVGISDAYGALHDPNGLDIDYLLDRRDSFGTVTNLFEETISNKELFELDCDILVPAAISNQITEDNAHDIKASIVVEAANGPTTPEATRILTERGILLVPDVLASAGGVTVSYFEWVQNNQGYYWSEEEVDEKLREKLEAAFDTIYELSQNRKIDMRLAAYIIGIKRTAEAARYRGWA >CP029669.1|AWR11121.1|1245918_1247109_-|ornithine--oxo-acid-transaminase MTKSEKIIELTNHYGAHNYLPLPIVISEAEGVWVKDPEGNKYMDMLSAYSAVNQGHRHPKIIQALKDQADKVTLVSRAFHSDNLGEWYEKICKLAGKDKALPMNTGAEAVETALKAARRWAYDVKGIEPNKAEIIAFNGNFHGRTMAPVSLSSEAEYQRGYGPLLDGFRKVDFGDVDALKAAINENTAAVLVEPIQGEAGINIPPEGYLKAIRELCDEHNVLFIADEIQAGLGRSGKLFATDWDNVKPDVYILGKALGGGVFPISVVLADKEVLDVFTPGSHGSTFGGNPLACAASIAALDVIVDEDLPGRSLELGDYFKEQLKQIDHPSIKEVRGRGLFIGVELNESARPYCEALKEEGLLCKETHDTVIRFAPPLIITKEELDLALEKIRHVFQ >CP029669.1|AWR09905.1|1247416_1248544_-|flavin-oxidoreductase-/-NADH-oxidase-family-protein MKSKYEPLFDKVELPNGVELRNRFVLAPLTHISSNDDGTISDVELPYIEKRSQDVGITINAASNVSDVGKAFPGQPSIAHDSNIEGLKRLATAMKKNGAKALVQIHHGGAQALPELTPDGDVVAPSPISLKSFGQKQEHSAREMTNEEIEQAIKDFGEATRRAIEAGFDGVEIHGANHYLIHQFVSPYYNRRNDVWANQYKFPVAVIEEVLKAKEAYGNKDFIVGYRLSPEEAESPGITMEITEELVNKISHMPIDYIHVSMMDTHATTREGKYAGQERLPLIHKWINGRMPLIGIGSIFTADEALDAVENVGVDLVAIGRELLLDYQFVEKIKDGREDEIINYFDPEREDNHHLTPNLWHQFNEGFYPLPRKDK >CP029669.1|AWR09731.1|1248905_1249283_-|S1-RNA-binding-domain-protein MNNYKIGQHIKVRVTGIQPYGAFVETPNHTEGLIHISEIMDDYVHNLKKFLSEGQIVKAKILSIDDEGKLNLSLKDNDYFKNYERKKEKQSVLDEIRETEKYGFQTLKERLPIWIKQSKRAIRND >CP029669.1|AWR10222.1|1249698_1250292_-|cyclophilin-type-peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase/CLD-family-protein MANYPQLNKEVQQGEIKVVMHTNKGDMTFKLFPNIAPKTVENFVTHAKNGYYDGITFHRVINDFMIQGGDPTATGMGGESIYGGAFEDEFSLNAFNLYGALSMANSGPNTNGSQFFIVQMKEVPQNMLSQLADGGWPQPIVDAYGEKGGTPWLDQKHTVFGQIIDGETTLEDIANTKVGPQDKPLHDVVIESIDVEE >CP029669.1|AWR09429.1|1250355_1250739_+|kinase-associated-B-family-protein MKLYRFSHKTGSYGVTIVEENGDDVLVKVEQVIKHPKQGDLHNPTETEGVFFHDRKALSHFEKRYTKRSQLRDFNVDVLRYEDSLQQAITDLETKLKAQQTKHAEMSLASLARLKEDYSLQYKENFK >CP029669.1|AWR11470.1|1250869_1253275_+|na(+)/H(+)-antiporter-subunit-A1 MSLLHIAVILPLIFALIIPILYRFFKRIHLGWFVLPVPIVIFIYMLTLIKTTMSGNTVMKTLNWMPHFGMNFDLYLDGLGLLFSLLISGIGSLVVLYSIGYLSKSEQLGNFYCYLLLFMGAMLGVVLSDNVIILYLFWELTSFSSFLLISFWRERQASIYGAQKSLIITVFGGLSLLGGIILLAIPTQSFSIQYMIQHASEIQNSPFFIFAMILIMIGAFTKSAQFPFYIWLPDAMEAPTPVSAYLHSATMVKAGLYLIARMTPIFAASQGWVWTVTLVGLITLFWASLNATKQQDLKGILAFSTVSQLGMIMAMLGIGAISYHYQGDDSKIYAAAFTAAIFHLINHATFKGALFMITGAVDHSTGTRDVKKLGGLLTIMPISFTITVITALSMAGVPPFNGFLSKESFLETTFTASQANLFSVDTLGYLFPIIGIVGSVFTFVYSIKFIMHIFFGQYKPEQLPKKAHEVSILMLLSPAILATLVIVFGLFPGILTNSIIEPATSSINHTVIDDVEFHMFHGLTPAFLSTLVIYILGILLIVTFSYWVKLLQRQPGKLTFNYWYNRSANVIPNYSEKMTNSYVTDYSRNNLVIIFGALILLTFVTIFSVPFNINFKDVSPIRIFEVCIVILLLSAAFLILFAKSRLFSIIMLSAVGYAVSVLFIFFKAPDLALTQFVVESISTALFLLCFYHLPNLNRYNEKRSFQLTNALIAGGVGLSVIIIGLIAYGNRHFESISKFYQEHVYDLAHGKNMVNVILVDFRGMDTLFESSVLGIAGLAVYTMIKLRKKRQTQGNEVKNHE >CP029669.1|AWR09995.1|1253267_1253696_+|na(+)/H(+)-antiporter-subunit-B MNRQQNDLILQFAAVIIFFMVMVFGFSLFLAGHYTPGGGFVGGLLFASSLVIITIAFDIETMRKIFPLDFKILIGIGLVFCIATPIASWFLGKNFFTHVTFDIPLFILEPVHMTTAVFFDFGVLCAVVGTVMTIIISIGENE >CP029669.1|AWR11110.1|1253782_1254037_+|na(+)/H(+)-antiporter-subunit-C MGTTLLTHAANLFLITMGGLKHGTVPIYEANVKSYVDPIPQALILTAIVIAFATTAFFLVLAFRTYKELGTDNVESMKGVPEDD >CP029669.1|AWR11595.1|1254029_1255526_+|na(+)/H(+)-antiporter-subunit-D MIESNMLVLTLVIPVITAILLVFIGKRPIIKRYVALGGTLLTLVAAIINLANVVKHGPIRVELGSWKAPYSIVFVLDIFSALLIITSIIITAIVILYSYQTIGIERERYYYYFSVLFMLIGIIGAFTTGDIFNLFVYFEVFLMSSYFLLVIGSTKIQLQETIKYVLVNVVSSSFFVMGVAILYSVVGTLNLADISNKLANLSAHDSGLVNIVFILFIFVFATKAGVFPMFVWLPSAYYAPPIPIIAFFGALLTKVGVYAIARTLSLFFSDNVSFSHYVILFLALLTIIFGCVGAVAYANIKKIILYNVMIAVGVILVGVAMMTESGMIGAIYYTLHDMLVKLALFLLIGIMIKITGTADLRQFGGLIKRYPVLGWSFFIAALSLAGIPPLSGFYGKFFIVQSTFERGFYLSGVIVLLSSLVVLYSVIRIFLQGFFGQPKGYDLNNKVDVKYLTTIAIVAVVITVLYGLSADYLYPMVKAGAETFYNPSTYVKAVLGGK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029669_3 | 1307145-1307226 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029669_3
|
1 spacers
spacers of CP029669_3
>3.1|1307169|34|CP029669|CRISPRCasFinder ATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029669_3
The CRISPR arrays of CP029669_3 >merge|CP029669|3|1307145-1307226|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGGG >CP029669|3|3|1307145-1307226|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGG ATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT TTCTACAGACAATGCAAGTTGGGG
>CP029669.1|AWR10329.1|1306201_1306588_-|toprim-domain-protein MAIVNKVIIVEGKSDKKRVQQVIAEPVNIICTHGTMSIDKLDDMIESLYDKQVFVLADSDDEGDRIRNWFKRYLSESEHIFIDKTYCQVANCPKQYLAHVLSKHGFTCKKETPLLPNINNERLVLVNE >CP029669.1|AWR09347.1|1305912_1306209_-|thioredoxin-family-protein MNNSLDIKDVTTFYEEDKHLIFGYTPTCGTCKVSERMLDIANEILQLPLLKIDLNFYPQFCKDMQIMSTPILLLMNKDKEVKRIYAFKSVTDLLENLK >CP029669.1|AWR11492.1|1304637_1305663_-|methionine-import-ATP-binding-protein-MetN-2 MIELKEVVKEYRTKNKEVLAVDHVNLSIRAGSIYGVIGFSGAGKSTLIRMFNHLEAPTSGEVIIDGDHIGQLSKNGLRAKRQKVSMIFQHFNLLWSRTVLKNIMFPLEIAGVPRRRAKQKALELVELVGLKGREKAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPTVLLCDEATSALDPQTTDEILDLLLKIREQQNLTIVLITHEMHVIRRICDEVAVMESGKVIEQGPVTQVFENPQHTVTKRFVKDDLNDDFETSLTELEPLEKDAYIVRLVFAGSTTTEPIVSSLSTAYDIKINILEANIKNTKNGTVGFLVLHIPYISSVDFGKFEKELIERQVKMEVLRHG >CP029669.1|AWR11944.1|1303949_1304603_-|methionine-import-system-permease-protein-MetP MPNIQWPEVWTAIVETLYMTVVSTIFAFILGLILGVLLFLSAKGKSIGARLFYSIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSLILGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTWTVIRKVLLPEAMPALVSGITVTAIALVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWLTNKLDKR >CP029669.1|AWR11874.1|1303110_1303932_-|NLPA-lipofamily-protein MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGNKSGSDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYELDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGDVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFLPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK >CP029669.1|AWR10339.1|1301747_1302968_+|phage-integrase-family-protein MWLEKFKNKNKETKYRYYEKYKDPLTAKWRRVSVVLNKNGKQSQKEAQRLLNERIEEKLNDKKPTTLKSLTFHVACDEWFQNYIKTSGSKRTTIKTKLSKLNTLKKFVDEDILINKITLSYAQQVFDEMDSKGYVYQVNKDALSIFKNVFEYTRRIYKLQDLEFLKDITLNKRIKSYDEVKAKRNKYLELNEIESIIKDINTKAQKMHSGIHKRFYLFVALMTEFQALNGMRIGEMLAIQNEDIDFDNKSLNINGTIHWFHDESGGFGVKDTTKTESSYRTIGLSSRSCEILKKAILENKKDSKWNDGYLNRNFVFTNHKGNPMQTERFNKILREAAKDVGIDKEVSSHILRHSHISLLSQQGVSLKAIMDRVGHSDHRTTLSIYSHVTEQMDKDMMNKLEQVKLG >CP029669.1|AWR09883.1|1300931_1301660_+|toxin-beta-grasp-domain-protein MKKLIVIILINIITLSVSNSASAQGDIGIDNLRNFYTKKDFVDLKDVKDNDTPIANQLQFSNVSYDLISESKDFNKFSNFKGKKLDVFGISYNGQCNNKYIYGGVTATNEYLDKPRNIPINIWINGNHKTISTNKVSTNKKFVTAQEIDVKLRKYLQEEYNIYGHNGTKKGEEYGHKSKFYSGFNIGKVTFHLNNNDTFSYDLFYTGDDGLPKSFLKIYEDNKTVESEKFHLDVDISYKETI >CP029669.1|AWR10209.1|1300179_1300908_+|toxin-beta-grasp-domain-protein MNKIFRVLTVSLFFFTFLIKNNLAYADVGVINLRNFYTNYQPETLQGVSSGNFSTSHQLEYIDGKYTLYSQFHNEYEAKRLKDHKVDIFGISYSGLCNTKYMYGGITLANQNLDKPRNIPINLWVNGKQNTISTDEVSTQKKEVTAQEIDIKLRKYLQNEYNIYGFNKTKKGQEYGYQSKFNSGFNKGKITFHLNNETSFTYDLFYTGTGQAESFLKIYNDNKTIDAENFHLDVEISYEKTE >CP029669.1|AWR11465.1|1299704_1300163_+|hypothetical-protein MYLYEKMVIENKEIPIDDGKSLGNFEGLYDNGVILINKNLSETRKAEVLYEELAHHKLTYGNILDQSKWINRKFENYARRHGFISAVPLREIVEAYNYGVRNLYELSEYLQLSEKYILEAIEQYKKIYGIGTHYGEYSITFEPLRVFKYKEI >CP029669.1|AWR09292.1|1299360_1299693_+|helix-turn-helix-family-protein MRTNDEIITIIKTSMKEQNMSLSELARRVGVAKSAVSRYLNLTREFPLNRAEDFAKVLGIKTEYLLGFAEREESTKQDTIAAHLDGDFTEEELIEIRKYAELVRKAHRNQ >CP029669.1|AWR09555.1|1307329_1308208_-|hypothetical-protein MLNIQDVSHLSKKEQKAYNRFVESVENGNLPVLPCIEMDLKEMQEETLNQSKIGGMPFLKYFKDIPLDENNVPMVLLAQINLDDLPEQQELFPVKEGILQFWISSEDQMYGMSENLKGNNINSRLVYIKEPITDLSLENIQAHLKSLDADNEDIPFSGAFSIEFRLSKQTITCTDYKYDEDVLALWNKVNPSFALKSMFGGYDELMEPVCNTFTAKEPFNQLGGYPYFDQIDPRTNDQELKMYDRVLLQIDSTRDGNSSIIWDDLGIANILVKSTDLEAMKFDDYMYSWDCS >CP029669.1|AWR11773.1|1308209_1308323_-|hypothetical-protein MKEKLLGTIIWSIATFYYSRMMEIMNLAILKIKIGGS >CP029669.1|AWR09434.1|1308386_1308767_-|glycine-cleavage-system-H-protein MAVPNELKYSKEHEWVKVEGNVAIIGITEYAQSELGDIVFVELPETDDEINEGDTFGSVESVKTVSELYAPISGKVVEVNEELEDSPEFVNESPYEKAWMVKVEISDESQIEALLTAEKYSEMIGE >CP029669.1|AWR11645.1|1308924_1309281_-|transcriptional-regulator,-Spx/MgsR-family-protein MIKFYQYKNCTTCKKAAKFLDEYGVSYEPIDIVQHTPTINEFKTIIANTGVEINKLFNTHGAKYRELDLKNKLQTLSDDEKLELLSSDGMLVKRPLAVMGDKITLGFKEDQYKETWLA >CP029669.1|AWR09606.1|1309424_1309745_+|thioredoxin-family-protein MQSIKSNESFKSVINSDTPVIVKFEAGWCPDCRAMDLWIDPIVEQYNDYQWYTVNRDELEDVVVENEVMGIPSLLVFKNGDKIAHLHSANAKSPEQVESFLAETFK >CP029669.1|AWR09712.1|1309894_1310434_-|nitroreductase-family-protein MELQQAIANRRSVKKFKRDMHIDDALLYQAIEKAADAPNHGMREPWRVVHVPKDRLGDMSKDISKFAFPNELDKQQCHYDAVTKLGGMLLLILKTDPRQRQNDENYFAFGAYAQNLMLLLYEAGIGTCWKSPLYIYDPKVRKTLGIKKDEVLAGFLYLTDLEGDMPKAPRKNRNLITLY >CP029669.1|AWR11108.1|1310516_1311233_-|3-dehydroquinate-dehydratase MTHVEVVATIAPQLSIEETLIQKINHRIDAIDVLELRIDQIENVTVDQVAEMITKLKVMQDSFKLLVTYRTKLQGGYGQFTNDSYLNLISDLANINGIDMIDIEWQADIDIEKHQRIITHLQQYNKEVVISHHNFESTPPLDELQFIFFKMQKFNPEYVKLAVMPHNKNDVLNLLQAMSTFSDTMDCKVVGISMSKLGLISRTAQGVFGGALTYGCIGVPQAPGQIDVTDLKAQVTLY >CP029669.1|AWR09955.1|1311380_1311803_+|peroxiredoxin,-Ohr-subfamily-protein MAIHYETKATNVGGRKGHVYTDDRALDIDIVPPAQADGKATNPEQLFAAGYASCFNGAFDLILKQNKVRDAHPEVTLTVRLEDDSDSESPKLSVSIDATIKNVISQEEAEKYLQMAHEFCPYSKATQGNINVDLNVNVVD >CP029669.1|AWR11361.1|1312201_1312696_+|acetyltransferase-domain-protein MIEIKTLTNNDFNEYKRLVSTVNEEFTQDSHYSQTMTDTLIHDILNQGSPKCIVFGCYENETLIATAALEQIRYVGKEHKSLIKYNFVTNNDKSINSELINFIINYARQNNYESLLTSIVSNNIGAKVFYSALGFDILGFEKNAIKIGNTYFDEHWLFYDLINK >CP029669.1|AWR11288.1|1312850_1313468_+|lysE-type-translocator-family-protein MVTAIIHGFILAIGLILPLGAQNVFIFNQGANQPKYRYVLPAIITAGLSDSLLIIIAVVGVSIIIMSLPVLQAIIYIVGLIFLMYMAWTIWHDKPSTDGETQIMSPMKQVSFALSVSLLNPHAILDTIGVIGSSAALYSGSNKIAFTIACISVSWLWFFLLAILGKMVGSIDKTGKLLTIINKISSIIIIIVALMILQKLIQLLF |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029669_4 | 1350413-1350498 | Unclear |
NA
Consensus repeat of CP029669_4
|
1 spacers
spacers of CP029669_4
>4.1|1350443|26|CP029669|CRISPRCasFinder CGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029669_4
The CRISPR arrays of CP029669_4 >merge|CP029669|4|1350413-1350498|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG >CP029669|4|4|1350413-1350498|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG CGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCGG AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG
>CP029669.1|AWR11054.1|1349068_1349980_-|hypothetical-protein MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >CP029669.1|AWR11802.1|1348076_1349072_-|hypothetical-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >CP029669.1|AWR11198.1|1347022_1347967_-|sporulation-Regulator-WhiA-C-terminal-domain-protein MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >CP029669.1|AWR10658.1|1345861_1346449_-|ATP-dependent-Clp-endopeptidase,-proteolytic-subunit-ClpP MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >CP029669.1|AWR11659.1|1344716_1345619_+|NAD-dependent-epimerase/dehydratase-family-protein MKQYLITGGTGMVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQNIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKALFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGIILSNEGGALQTMKLPYEYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINNESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLIKE >CP029669.1|AWR11461.1|1343385_1344015_-|hypothetical-protein MSNQNYDYNKNEDGSKKKMSTTAKVVSIATVLLLLGGLVFAIFAYVDHSNKAKERMLNEQKQEQKEKRQKENAEKERKKKQQEEKEQNELDSQANQYQQLPQQNQYQYVPPQQQAPTKQRPAKEENDDKASKDESKDKDDKASQDKSDDNQKKTDDNKQPAQPKPQPQQPTPKPNNNQQNNQSNQQAKPQAPQQNSQSTTNKQNNANDK >CP029669.1|AWR10916.1|1341669_1342683_-|glycolytic-operon-regulator MKDLLQAQQKLIPDLIDKMYKRFSILTTISKNQPVGRRSLSEHMDMTERVLRSETDMLKKQDLIKVKPTGMEITAEGEQLISQLKGYFDIYADDNRLSEGIKNKFQIKEVHVVPGDADNSQSVKTELGRQAGQLLEGILQEDAIVAVTGGSTMACVSEAIHLLPYNVFFVPARGGLGENVVFQANTIAASMAQQAGGYYTTMYVPDNVSETTYNTLLLEPSVINTLDKIKQANVILHGIGDALKMAHRRQSPEKVIEQLQHHQAVGEAFGYYFDTQGQIVHKVKTIGLQLEDLESKDFIFAVAGGKSKGEAIKAYLTIAPKNTVLITDEAAAKIILE >CP029669.1|AWR09448.1|1340606_1341617_-|glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase,-type-I MAVKVAINGFGRIGRLAFRRIQEVEGLEVVAVNDLTDDDMLAHLLKYDTMQGRFTGEVEVVDGGFRVNGKEVKSFSEPDASKLPWKDLNIDVVLECTGFYTDKDKAQAHIEAGAKKVLISAPATGDLKTIVFNTNHQELDGSETVVSGASCTTNSLAPVAKVLNDDFGLVEGLMTTIHAYTGDQNTQDAPHRKGDKRRARAAAENIIPNSTGAAKAIGKVIPEIDGKLDGGAQRVPVATGSLTELTVVLEKQDVTVEQVNEAMKNASNESFGYTEDEIVSSDVVGMTYGSLFDATQTRVMSVGDRQLVKVAAWYDNEMSYTAQLVRTLAYLAELSK >CP029669.1|AWR10849.1|1339277_1340468_-|phosphoglycerate-kinase MAKKIVSDLDLKGKTVLVRADFNVPLKDGEITNDNRIVQALPTIQYIIEQGGKIVLFSHLGKVKEESDKAKLTLRPVAEDLSKKLDKEVVFVPETRGEKLEAAIKDLKEGDVLLVENTRYEDLDGKKESKNDPELGKYWASLGDVFVNDAFGTAHREHASNVGISTHLETAAGFLMDKEIKFIGGVVNDPHKPVVAILGGAKVSDKINVIKNLVNIADKIIIGGGMAYTFLKAQGKEIGISLLEEDKIDFAKDLLEKHGDKIVLPVDTKVAKEFSNDAKITVVPSDSIPADQEGMDIGPNTVKLFADELEGAHTVVWNGPMGVFEFSNFAQGTIGVCKAIANLKDAITIIGGGDSAAAAISLGFENDFTHISTGGGASLEYLEGKELPGIKAINNK >CP029669.1|AWR10129.1|1338394_1339156_-|triose-phosphate-isomerase MRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTAVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGETSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHETDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETDEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSEDQLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGASLKVEDFVQLLEGAK >CP029669.1|AWR09338.1|1350859_1351795_-|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >CP029669.1|AWR10003.1|1351861_1353301_-|tetratricopeptide-repeat-family-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDMEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYHNELFVSENDVMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >CP029669.1|AWR09483.1|1353308_1353590_-|bacterial-transferase-hexapeptide-family-protein MLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >CP029669.1|AWR11753.1|1353801_1354641_-|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPSEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGSVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >CP029669.1|AWR10992.1|1354646_1355579_-|HPr(Ser)-kinase/phosphatase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >CP029669.1|AWR11170.1|1356240_1359087_-|excinuclease-ABC-subunit-A MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNIDLSEHDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIEVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGVDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDK >CP029669.1|AWR10822.1|1359094_1361080_-|excinuclease-ABC-subunit-B MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVEGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >CP029669.1|AWR11392.1|1361348_1361585_-|hypothetical-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >CP029669.1|AWR09509.1|1361581_1362232_-|HD-containing-hydrolase-like-enzyme-family-protein MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENE >CP029669.1|AWR11102.1|1362405_1363245_-|staphyloxanthin-biosynthesis-protein,-putative MKKSLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQHGTQVKTPVQHNYVSNVQAQTQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKAVKSPVRKASQAKKVVKQPVQQASKKVVVKQAPKQAVTKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTPEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP029669_5 | 1526350-1526442 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029669_5
|
1 spacers
spacers of CP029669_5
>5.1|1526382|29|CP029669|CRISPRCasFinder CGATTAGAGGCTTTTATGCAGTTGTGCCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029669_5
The CRISPR arrays of CP029669_5 >merge|CP029669|5|1526350-1526442|CRISPRCasFinder TAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCATCTTTAGCGATTAGAGGCTTTTATGCAGTTGTGCCTTAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCACCTTTAG >CP029669|5|5|1526350-1526442|CRISPRCasFinder TAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCATCTTTAG CGATTAGAGGCTTTTATGCAGTTGTGCCT TAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCACCTTTAG
>CP029669.1|AWR09979.1|1525393_1526281_-|periplasmic-binding-family-protein MKKSLIAFILIFMLVLSGCGMKDNDKQGSNDNGSSKSPYHRIVSLMPSNTEILYELGLGKYIVGVSTVDDYPKDVKKGKKQFDALNLNKEELLKAKPDLILAHESQKATANKVLSSLEKQGIKVVYVKGAQSIDETYNTFKQIGKLTHHDKQAEQLVEETKDNIDKVIDSIPAHHKKSKVFIEVSSKPEIYTAGKHTFFNDMLEKLEAQNVYSDINGWNPVTKESIIKKNPDILISTEAKTRSDYMDIIKKRGGFNKINAVKNTRIEVVNGDEVSRPGPRIDEGLKELRDAIYRK >CP029669.1|AWR11906.1|1524295_1525282_-|fecCD-transport-family-protein MNVIIDERKENAMTFNKVLLSWIVILIITTSIYLFWQLGDINDVFNQSILINVRLPRLLEALLTGMILTVAGLIFQTVLNNALADSFTLGLASGATFGSGLALFLGLTTLWIPVFSITFSLITLITVLVITSVLSQGYPVRILILSGLMIGALFNSLLYFLILLKPRKLNTIANYLFGGFGDAEYSNVSIIAITFIIALFGIFIILNQLKLLQLGELKSQSLGLNVQLITYIALCIASMITAINVAYVGIIGFIGMVIPQLIRKWQWKQSLGRQLALNIVTGGQIMVMADFIGSHILSPVQIPASIIIALIGIPVLFYMLISQSKRLH >CP029669.1|AWR11345.1|1523521_1524241_-|HAD-hydrolase,-IA,-variant-1-family-protein MDLNQIKAVVFDLEGTLLDRVKSREKFIEEQYERFHDYLIHVQLADFKKAFIELDDDEDNDKPDLYKEIIKRFHVDRLTWKDLFNDFEMHFYRYVFPYYDTLYTLEKLSQKGFQIGVIANGKSKIKQFRLHSLGLMHVINYLSTSETVGFRKPHPKIFEDMIDQLGVLPEQIMYVGDDALNDVAPARAMGMVSVWYKQEDAEIEPLEEEVDFTITTVEELLTILPIKNDNKGENYGSIY >CP029669.1|AWR10771.1|1522737_1523538_-|alpha/beta-hydrolase-family-protein MDLFTRKDGTSIHYSTLGEGYPIVLIHTVLDNYSVFNKLAAELAKSFQVVLIDLRGHGYSDKPRHIEIKDFSDDIVELLKYLYIEEVAFVCHEMGGIIGADISVRYPEFTSSLTLVNPTSIEGELPEERLFRKYAHIIRNWDPEKQDKFLNKRKYYRPRKMNRFLKHVVDTNEISTKEEIQAVKEVFKNADISQTYRNVVVPTKIIAGEFGERTTRLEAKEVADLIQNADFEVYQESSAFPFVEEQERFVEDTAAFINKHHDEKHV >CP029669.1|AWR10565.1|1522095_1522602_-|hypothetical-protein MKKLLTASIIACSVVMGVGLVNTSAEAASGNSIDTVKQLIKGDQSLENVKIGESIKDVLTKYKNPMYSYNEDGTEHYYEFHTKKGMLLVTTDGKKNNGKVTHISMMYNDANGPTYQAVKNYVGKAVTHTEYSKVAGNFGYIEKGKTTYQFASAPKDKNIKLYRIDLEK >CP029669.1|AWR09381.1|1521217_1521934_-|putative-membrane-protein MRINDKILLENIEDYFNHKGLSPHLIDDIKEKVITDIKNSEKKDQDYIEYKRKSPAQIILMIQRNLFALQMNPVIFFIINFILISYLYDKQYVQFQAITGMSLFYCLVIFPMTIVVYLRVSQKNYLRSNKIEMIMGTIIAIISLLLIILQAFNITWGVIPITNFGHQFFFFIGIILVIAGIFYKRLEFSGIGLLFCQKTVDAMIHNPQSAQIFSLIIWILLVVLVIYFTIRLSSRTRL >CP029669.1|AWR11937.1|1520260_1521049_-|alpha/beta-hydrolase-family-protein MNKVTINPQIQLTYQIEGKGDPIILLHGLDGNLAGFEDLQHQLASSYKVLTYDLRGHGKSSKSESYDLNDHVEDLKILMEKLNIHEAHILGHDLGGVVAKLFTDKYAYRVKSLTTIASKKDDLIHSFTQLLIQYQDDIAGFNKSEAYILLFSKLFRNQEKTMKWYQKQRIYSIKSEDDSAVAIRSLILHKDEPMYLKKRTCVPTLLINGEHDPLIKDKNHFKLEAHFLNVTKKIFEHSGHAPHIEEPEAFMNYYLKFLKSVS >CP029669.1|AWR11471.1|1519635_1520010_+|transcriptional-regulator-SarA MAITKINDCFELLSMVTYADKLKSLIKKEFSISFEEFAVLTYISENKEKEYYLKDIINHLNYKQPQVVKAVKILSQEDYFDKKRNEHDERTVLILVNAQQRKKIESLLSRVNKRITEANNEIEL >CP029669.1|AWR11176.1|1518127_1518688_+|hypothetical-protein MTHCHLIKAIGVLLLIVGIVIMNQFNKNNLLLTDQKYLLFWLLLGFIFGFFPPIQTTINSALASHTHSPAFASLVSFTIGSIALLILTAIFNRSLKLKTSHLKFGKLKPIYFTGGILGMAFVTANIILMPHMGAALTTLIGMFGQILMGILIDHFGLFGSPKIAMTSRKTIGLLCILTGIILLRLF >CP029669.1|AWR09610.1|1517566_1517920_+|integrase-core-domain-protein MKPLLPKSITMDRGKEFALFEEIEDELNCSIYFSDLGCPYQRGSIENANGLLRQYYPKGTDFANITQKSLDEAVKQINARPRMIFDYKSSEEMLKYHVSTQNCEPILNDCVRHEPVN >CP029669.1|AWR11408.1|1526659_1527295_-|hhH-GPD-superbase-excision-DNA-repair-family-protein MLGTDELYKVLYEHLGPQFWWPADNDIEMMLGAILVQNTRWRNAEIALNQIKEHTHFNPNHILELPIETLQSLIHSSGFYKSKSLTIKTLLTWLARHHFNYQEINERYKGGLRKELLSLKGIGSETADVLLVYIFGRIEFIPDSYTRKIYDKLGYENTKNYDQLKKVVTLPNHFTNQDANEFHALLDVFGKHYFRDKDIKNYDFLEPYFKK >CP029669.1|AWR11571.1|1527682_1529344_-|arginine--tRNA-ligase MNIIDQVKQTLVEEIAASINKAGLADEIPDIKIEVPKDTKNGDYATNIAMVLTKIAKRNPREIAQAIVDNLDTEKAHVKQIDIAGPGFINFYLDNQYLTAIIPEAIEKGDQFGHVNESKGQNVLLEYVSANPTGDLHIGHARNAAVGDALANILTAAGYNVTREYYINDAGNQITNLARSIETRFFEALGDNSYSMPEDGYNGKDIIEIGKDLAEKHPEIKDYSEEARLKEFRKLGVEYEMAKLKNDLAEFNTHFDNWFSETSLYEKGEILEVLAKMKELGYTYEADGATWLRTTDFKDDKDRVLIKNDGTYTYFLPDIAYHFDKVKRGNDILIDLFGADHHGYINRLKASLETFGVDSNRLEIQIMQMVRLMENGKEVKMSKRTGNAITLREIMDEVGVDAARYFLTMRSPDSHFDFDMELAKEQSQDNPVYYAQYAHARICSILKQAKEQGIEVTAANDFTTITNEKAIELLKKVADFEPTIESAAEHRSAHRITNYIQDLASHFHKFYNAEKVLTDDIEKTKAHVAMIEAVRITLKNALAMVGVSAPESM >CP029669.1|AWR10584.1|1529340_1529757_-|hypothetical-protein MDKKVSIQTKQVLKQHNEKEKFEFTTEGTWQQRQSNFIRYVEQIEDATVNVTIKVDDDSVKLIRKGDINMNLHFVEGQTTTTFYDISAGRIPLEVKTLRILHFVSGDGGKLKIHYELYQDNEKMGSYQYEINYKEIGE >CP029669.1|AWR09881.1|1530031_1531042_-|alcohol-dehydrogenase MRAAVVTKDHKVSIEDKKLRALKPGEALVQTEYCGVCHTDLHVKNADFGDVTGVTLGHEGIGKVIEVAEDVESLKIGDRVSIAWMFESCGRCEYCTTGRETLCRSVKNAGYTVDGAMAEQVIVTADYAVKVPEKLDPAAASSITCAGVTTYKAVKVSNVKPGQWLGVFGIGGLGNLALQYAKNVMGAKIVAFDINDDKLAFAKELGADAIINSKDVDPVAEVMKLTDNKGLDATVVTSVAKTPFNQAVDVVKAGARVVAVGLPVDKMNLDIPRLVLDGIEVVGSLVGTRQDLREAFEFAAENKVTPKVQLRKLEEINDIFEEMENGTITGRMVIKF >CP029669.1|AWR09868.1|1531540_1532047_-|ywhD-family-protein MSEKKGFNFNIIKNDPLDGHKGTNIGSISLDNIAPVFIDVANKEAFIDIGGMHARAKVEKGVKWITDKAAVEGDEAKEYWLCWVTTERNEQGPYYAGLTACYLLVNKAIRRGYKSMPEHVNMMDKSMKHHIIIDQIGDENKAILKDFLMNHDEGMWKHSSDALHQAFN >CP029669.1|AWR11767.1|1532089_1533385_-|HD-domain-protein MTNAYVDLKLVEEKVFKDPIHRYIHVEDQLIWDLIKTKEFQRLRRIRQLGTLYLSFHTAEHSRFGHSLGVYEIVRRLIDESFIGHDAWDNKDRPLALCAALLHDLGHGPFSHSFEKIFNTDHEAYTQAIITGDTEVNAVLRKVAPEFPREVAEVINKTHHNKLVISMISSQIDADRMDYLQRDAYFTGVSYGAFDMERILRLMRPSKDEVLIKESGMHAVENFIMSRYQMYWQIYFHPVSRGGEVLLNNCLKRAKQLYNEGYEFKLHPHDFIPFFEETVTIEQYVELDEAVVTYYLEKWTKEDDAILSDLASRFINRDLFKYIPFDGSIITISELQELFEAGGINPDYYFVSEAFSDLPYDYDRPGSNRKPIHLLRQDGTIREISNQSLVIHSITGINRQDYKLYYPREMVAKIKDKTIREAIENLINELN >CP029669.1|AWR09491.1|1533424_1533901_-|acetyltransferase-family-protein MFKVRQATEKDVVQIRDVATKAWFNTYLNIYAATTVNHLLEASYNEHHLKKRLQEQLFLVVEEGNDIVGFANFIYGEELYLSAHYVKPESQHTGYGTALLNEGLSRFEDKFEGVYLEVDNKNEEAVAYYKEQGFTILRSYEPEMYGEKLDLALMYKAF >CP029669.1|AWR11268.1|1534069_1534606_-|putative-NAD(P)H-dependent-FMN-containing-oxidoreductase-YwqN MITVLFGGSRPNGNTAQLTKFALQDLEYQWIDVTQHQFKPIRDVRHTAETITSYDDDYLPILDKILASDTIIFASPVYWYSISAPLKAFIEHWSETLQDKRYPNFKAQMAEKDFRVILVGGDCPKIKAKPAITQMKYSLDFLGATLNGYIIGTAEKPGDIMKDNYALARATEWNSILQ >CP029669.1|AWR09395.1|1534816_1535755_-|protein-IolS MKQFVNLGKSDVEVFPIALGTNAVGGHNLYPNLDEEQGKDVVRQAINHGINLLDTAYIYGPERSEELVGEVVKEYPREQIKIATKGSHEFDENQEVHQNNQPEYLKQQVENSLKRLQTDYIDLYYIHFPDNNTPKDQAVAALQELKEQGKIKAIGVSNFTLDQLKEANKDGYVDVVQLEYNLLHRENEAVLQYCVDHQITFIPYFPLASGILAGKYDENTKFSDHRTTRRDFKPGVFEENVRRVKALESIAAAHQTSIANIVLAFYLTRPAIDVIIPGAKRAEQVVENIKAADIVLSDDEIQYIDELFPIED >CP029669.1|AWR09622.1|1536024_1536648_-|tandem-five-TM-family-protein MLCESKIINKNPKYRIIKYNDEYLMVDIISTWISLFFPFINWFIPKEYVKISREEFENLNIVKPAKKNVFWPVAGSSALLGVALRKYTHLLDIQLDKKLVIAICCITFIGILIFYVRLIKKSSLNIYNTKNKRSKIFLIPTLKNVCFTLFGYILFGGLTMLFLDALLSMSYQNIIVYFVWIAVIMGFFLVNIALIIDKNIHVILKNQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP029669_6 | 1770601-1770702 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029669_6
|
1 spacers
spacers of CP029669_6
>6.1|1770625|54|CP029669|CRISPRCasFinder TAGCTTTGATTTAAAAACTGATTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029669_6
The CRISPR arrays of CP029669_6 >merge|CP029669|6|1770601-1770702|CRISPRCasFinder CAAATTTAATACTCAATTCATATATAGCTTTGATTTAAAAACTGATTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTTCAAATTTAATACTCAATTCATAAA >CP029669|6|6|1770601-1770702|CRISPRCasFinder CAAATTTAATACTCAATTCATATA TAGCTTTGATTTAAAAACTGATTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTT CAAATTTAATACTCAATTCATAAA
>CP029669.1|AWR11784.1|1769627_1770584_+|hypothetical-protein MLTKEFAQRVELSEKQVRKIVQHLEERGYQLSKTEYRGREATDFKEEDIELFKDIADKVKQTNSYDLAFDELEKEKDFLQVIVKNDDKNLPTNQNVAQLVEDLRLEIQKMREERHLLGQMMNQVHQQQQELKELQNQLTSKIDSNSESLKAIQTSQEAIQEAQASQAKALAESTNKVEKNAVTEDKADSKDSKVAGVNTSTDAKTDTKAENAGDGTATKVDKEDQISATEAIEKASVEQSKNDNAAETSNKEATVDAEAQHDAEQQVAEAHAEASKQATSNDSLEAKAENDSTASQSEMSEPKPQEEKKGFFARLFNL >CP029669.1|AWR11950.1|1768847_1769510_+|hypothetical-protein MEFKTIQSVKDPHYNEALKLYDTKLNLSLTEDKRIIKRSLENNKTENDYVFIVGLENDVVVSLATAHYEATTNSAFLIYLFAKDLPNHDELMTQTLHQIEHELNLLSNLVHSRSINFLMMEVPKEPADLTQDNGLIIEHRRQFLYEHQFERQTEIDYIHPTNDGHTKKVDLFLKKNIKLTKDIYGTSVKSNYILKYVFANGIAREIIYALLEEMDLRKPF >CP029669.1|AWR10086.1|1768297_1768705_+|hypothetical-protein MADITVVNDTGELYNVINQKKSEGYLESELTIISKSKLHLNDLHDSEISLISTSGTFSDRMTKLLTGEDGEHAVLSRYNLAPDELEKYKQLILDDKMLVVAVRDKSSHQEVHENNSAYEEIDITHFAEASKGPKA >CP029669.1|AWR11204.1|1767206_1767785_-|xanthine-phosphoribosyltransferase MELLGQKVKEDGVVIDEKILKVDGFLNHQIDAKLMNEVGRTFYEQFKDKGITKILTIEASGIAPAIMAALHFDVPCLFAKKAKPSTLTDGYYETSIHSFTKNKTSTVIVSKEFLSEEDTVLIIDDFLANGDASLGLYDIAQQANAKTAGIGIVVEKSFQNGHQRLEEAGLTVSSLCKVASLEGNKVTLVGEE >CP029669.1|AWR11574.1|1765938_1767207_-|xanthine-permease-family-protein MKNLILSVQHLLAMYAGAILVPIIVGTSLKFTPEQIAYLVTVDIFMCGVATFLQANKVTGTGLPIVLGCTFTAVAPMILIGQTKGIDVLYGSLFLSGILVIIIAPFFSHLVKFFPPVVTGSVVTIIGINLMPVAMNYLAGGQGAKDYGDVKNILLGLMTLIIILLLQRFTTGFIKSIAILIGLVLGTIGAGLLGMVDINQVNHAGWLGIPVPFRFSGFSFDVTSTLVFFIVAIVSLIESTGVYHALSEITGKKLERKDFRKGYTAEGLAIVLGSIFNSFPYTAYSQNVGLVSLSGAKKNNVIYGMVVLLLICGCIPKLGALANIIPLPVLGGAMIAMFGMVMAYGVSILGHIDFKNQNNLLIIAVSVGLGTGISAVPQAFKGLGEQFAWLTQNGIVLGAISAIILNFFFNGIKYKQTEENVK >CP029669.1|AWR11425.1|1764434_1765901_-|inosine-5'-monophosphate-dehydrogenase MWESKFAKESLTFDDVLLIPAQSDILPKDVDLSVQLSDKVKLNIPVISAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVIHKNMGVEEQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEESVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKIVDVMTQENLITAPVNTTLEEAEKILQKHKIEKLPLVKDGRLEGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEHGRLLVAAAIGISKDTDIRAQKLVEAGVDVLVIDTAHGHSKGVIDQVKHIKKTYPEITLVAGNVATAEATKDLFEAGADIVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATEARKHGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEIFQGRQYKVYRGMGSLGAMEKGSNDRYFQEDKAPKKFVPEGIEGRTAYKGALQDTIYQLMGGVRAGMGYTGSHDLRELREEAQFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSF >CP029669.1|AWR10498.1|1762868_1764410_-|GMP-synthase MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISIEEIKKMNPKGIILSGGPNSVYEEGSFTIDPEIYNLGIPVLGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIINAKSDELFAGLPAEQTVWMSHSDKVIEIPEGFEVIADSPSTDYAAIEDKKRRIYGVQFHPEVRHTEYGNDLLNNFVRRVCDCRGQWTMENFIEIEIEKIRQRVGDRRVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVNAKDRFMNKLKGVSDPEQKRKIIGNEFVYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMEFELIEPINTLFKDEVRKLGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLEIVRESDAILRQVIREEGLEREIWQYFTVLPNIQSVGVMGDYRTYDHTVGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPSTIEWE >CP029669.1|AWR11722.1|1762219_1762756_+|hypothetical-protein MHNNNEFNKKLKDFIGSDKRMALVKGYVNEYKLTTVLRALNNSDYTKGTIHTRSIGNLKQIVDNRIIPKNITQNTIFKLSNLTLEVNLYERNTIYHGDFAIYYPVESALIIETDTPRLINHINNNPVQKIFIITTNDWSFNTLELEKIVDETIIYDLKQEDPKQYEILYKNKHGKLPY >CP029669.1|AWR11761.1|1761122_1761827_+|pemK-like-family-protein MSKNINQANSKLNTSNKKLKQAYSKSDSKNMKVIYMPHWLEFYSIAIHSDVTSNKKRYYKSYSRGTVVYVKLGSNIGSEFSGNHFCVILDNKDNKGKETVTIVPLSSKGNKNYLKLNESVLNLTATDLKKQIIDISSKVQALAQKYREIDIKLSTEDKKLLSNLNQKANELYRVIGVYSKHKGKDTYVNISAITTISKRRISKINDSDPTGTIIISEDDMNEIEKQLKIKFFSN >CP029669.1|AWR10895.1|1760451_1760724_+|transposase-family-protein MTKERRTFSSEFKLQMVRLYKNGKLKNEIIRKYDLKPSIISNSIKQHQNTGPFNHQDNLKSDEKELIKLRKEVQHLKMEHDVLKQILKLI >CP029669.1|AWR10346.1|1771560_1772949_+|L-cystine-uptake-protein-TcyP MNAFLTLINIIVLVIFIVILHMMARKHISFAKRVFTALGIGIVFGVLLHLIYGTHSNVITSTSDWFNIVGQGYVALLQMIVMPLIFISIVAAFTKIQIGEKFAKIGSLIFIFLIGTVTIAAIVGVVYALVFGLDASTINLGNAEQARGSEIAKQAKDLTAHTLPQQILELLPKNPFLDFTGQRATSTIAVVIFASFIGFAYLRVARKQPDHGELLKRAIDAIYSLVMAIVTFVLRLTPYGVLAIMANTLSTSDFGAIWTLGKFLIASYAALITMYIIHLIILSLLGISPIRYVKKTLEVLIFAFTSRSSAGALPLNVQTQTRRLGVPEGIANFAATFGLSIGQNGCAGIYPAMLAIMVAPVANVEIDLQFIVTLIAVVIISSFGVAGVGGGATFASILVLSTLNLPVALAGVLISVEPLIDMGRTALNVNDSMLAGTGTAKLTKHWDKDTFDSNDNAALTSH >CP029669.1|AWR11472.1|1773029_1773785_-|NADPH-dependent-oxidoreductase MSEHVYNLVKKHHSVRKFKNKPLSEDVVKKLVEAGQSASTSSFLQAYSIIGIDDEKIKENLREVSGQPYVVENGYLFVFVIDYYRHHLVDQHAETDMENAYGSTEGLLVGAIDAALVAENIAVTAEDMGYGIVFLGSLRNDVERVREILDLPDYVFPVFGMAVGEPADDENGAAKPRLPFDHVFHHNKYHADKETQYAQMADYDQTISEYYDQRTNGNRKETWSQQIEMFLGNKARLDMLEQLQKSGLIQR >CP029669.1|AWR09274.1|1774276_1774846_+|peroxiredoxin MSLINKEILPFTAQAFDPKKDQFKEVTQEDLKGSWSVVCFYPADFSFVCPTELEDLQNQYEELQKLGVNVFSVSTDTHFVHKAWHDHSDAISKITYTMIGDPSQTITRNFDVLDEATGLAQRGTFIIDPDGVVQASEINADGIGRDASTLAHKIKAAQYVRKNPGEVCPAKWEEGAKTLQPGLDLVGKI >CP029669.1|AWR10798.1|1774861_1776385_+|alkyl-hydroperoxide-reductase-subunit-F MLNADLKQQLKQLLELMEGNVEFVASLGSDDKSKELKDLLTEITDMSPRLSLSEKSLKRTPSFSVNRPGEETGVTFAGIPLGHEFNSLVLAILQVSGRAPKEKQSIIDQIKKLEGSFHFETFISLTCQKCPDVVQALNLMSVINPNITHSMIDGAVFREESENIMAVPAVFLNGEEFGNGRMTIQDILSKLGSTADASEFENKEPYDVLIVGGGPASGSAAIYTARKGLRTGIVADRIGGQVNDTAGIENFITVKETTGSEFSSNLAAHIDQYDIDAMTGIRATDIEKTDEAIKVTLENGAVLESKTVIIATGAGWRKLNIPGEEQLINKGVAFCPHCDGPLFENKDVAVIGGGNSGVEAAIDLAGIVNHVTLFEFASELKADNVLQDRLRSLSNVDIKTNAKTTEVVGEDHVTGIRYEDMNTGEEHLLNLDGIFVQIGLLPNTSWLNDAVELNERGEIVIDRNNNTNVPGIFAAGDVTDQKNKQIIISMGAGANAALNAFDYIIRN >CP029669.1|AWR11473.1|1776565_1776757_+|hypothetical-protein MNEIIMLLRTIPTSKLVQPIMQLFIDKAILNNVQNDALLIEKATHARNHLRLWSLQGHRDIPN >CP029669.1|AWR10254.1|1776829_1777456_+|hypothetical-protein MKKRLLLSTFLASTLILTGCASDQSDNEDHHTSTGIHAPKSAKKLETKDIFNSDKKNSDISDAEMKQAIEKYLSVNSDILDNKYIMQHKLDKQIDSQTKVTEKQAETLSHLSNLAVKNDLHFKKFVTENNIPKEYKKPVELMMNYFKALNSTIANVDEDIEKLSYQPQNKINVVDVPTKYAGDVNKKQQDKIKDFLKSKGIKSDVIDK >CP029669.1|AWR11033.1|1777710_1778094_+|putative-membrane-protein MKVRITFIILAILSTIVCLFLAAMHPTGPNTVTFEQPYLFTLNIIIMVLVALPSLVLAIYDYMSFRISSAILQFLGAISWFFLSLILSLTQFTPFTLASFITSIILFTSTIITLAIGGKSVEKNDSP >CP029669.1|AWR10451.1|1778159_1778741_-|histidine-phosphatase-super-family-protein MTIYLVRHGESKSNYDNKHFRSYFCGQLDVPLTDTGTKSADDLCDYFKEKQIKHVYVSDLLRTQQTFEHIFPYDIASTTTPLLRERSLGVFEGEYKDEISANPKYDKYFNDPNFKDFRHSFSQKAPEGESYEDVYQRVEHFMNHVVNEDTQKDDIVIVAHQVVIRCLMVYFNKVSRAEAVDLKVENCKPYIIE >CP029669.1|AWR09804.1|1779166_1779418_-|transglycosylase-associated-family-protein MFGFIGMLIVGGLIGWAAGAIMGKDIPGGILGNIIAGIIGSWVGGKLFGQWGPELGSIYILPALIGSIILIAIVTLILRAMRK >CP029669.1|AWR11935.1|1779717_1779981_+|hypothetical-protein MNMHILYNLRTKHNLEIDELAQQLNEKYGTKYEAHQIWEWENHHHEPKFKDAMHLADFFDAPYEMFLESKVKEYQKHLEEVDIRMDK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP029669_7 | 2287329-2287502 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029669_7
|
2 spacers
spacers of CP029669_7
>7.1|2287382|17|CP029669|PILER-CR AAGAATTTCGAAAAGAA >7.2|2287452|16|CP029669|PILER-CR TCAGCTTACAATAATG >7.3|2287447|32|CP029669|CRISPRCasFinder GGCCCCAACATAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029669_7
The CRISPR arrays of CP029669_7 >merge|CP029669|7|2287329-2287502|PILER-CR,CRISPRCasFinder TTGGCGAGGCCCCAACATAAAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACAAAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGGTTACAATAATGTGCAAGTTGGGGT >CP029669|7|1|2287329-2287473|PILER-CR TTGGCGAGGCCCCAACATAAAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCA AGTTGGCGGGGCCCCAA CAAAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCC CAACATAGAAGCTGGC GGAAAG >CP029669|7|7|2287423-2287502|CRISPRCasFinder TTACAATAATGTGCAAGTTGGCGG GGCCCCAACATAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGG TTACAATAATGTGCAAGTTGGGGT
>CP029669.1|AWR10712.1|2285185_2287231_+|lipase-1 MMKSQNKYSIRKFSVGASSILIATLLFLSGGQAQAAEKQVNMGNSQEDTVTAQSIGDQQTRENANYQRENGVDEQQHTENLTKNLHNDKTISEENHRKTDDLNKDQLKDDKKSSLNNKNIQRDTTKNNNANPSDVNQGLEQAINDGKQSKVASQQQSKEADNSQDSNANNNLPSQSRIKEAPSLNKLDQTSQREIVNETEIEKVQPQQNNQANDKITNYNFNNEQEVKPQKDEKTLSVSDLKNNQKSPVEPTKDNDKKNGLNLLKSSAVATLPNKGTKELTAKAKDDQTNKVAKQGQYKNQDPIVLVHGFNGFTDDINPSVLAHYWGGNKMNIRQDLEENGYKAYEASISAFGSNYDRAVELYYYIKGGRVDYGAAHAAKYGHERYGKTYEGIYKDWKPGQKVHLVGHSMGGQTIRQLEELLRNGNREEIEYQKKHGGEISPLFKGNHDNMISSITTLGTPHNGTHASDLAGNEALVRQIVFDIGKMFGNKNSRVDFGLAQWGLKQKPNESYIDYVKRVKQSNLWKSKDNGFYDLTREGATDLNRKTSLNPNIVYKTYTGEATHKALNSDRQKADLNMFFPFVITGNLIGKATEKEWRENDGLVSVISSQHPFNQAYTKATDKIQKGIWQVTPTKHDWDHVDFVGQDSSDTVRTREELQDFWHHLADDLVKTEKLTDTKQA >CP029669.1|AWR10427.1|2284348_2284468_+|hypothetical-protein MNRYNEVMKGKNGEKAKELCLSLLPINIIVVFTFFVFIL >CP029669.1|AWR09557.1|2283463_2284096_+|phosphoribosyl-ATP-diphosphatase MTKYKIDFSKGLVPAILQDNQTKQVLMLGYMNQEAFDKTIEDGVVCFYSRSKQRLWTKGETSGHTQRVKDIHVDCDNDTILIDVIPNGPTCHTGSQSCFNTEVPFSVQTLAQTVQDSAQSNNEKSYTKYLLTEGIEKITKKYGEEAFEVVIEAIKGDKKAFVSEVADELYHLFVLMHALGVDFSEIEAELARRHHKRNNFKGERQNIEQW >CP029669.1|AWR11854.1|2282708_2283467_+|imidazoleglycerol-phosphate-synthase,-cyclase-subunit MIKKRIIPCLDVKDGRVVKGIQFKGLRDIGNPVDLAMYYNEAGADELVFLDISKTEEGHSLMLEVIEQTASRLFIPLTVGGGIQSLDDITQLLNHGADKVSLNSSALKNPQLIKQASDKFGRQCICIAIDSYYDPERKAHYCCTTGGKKMTNIKVYDWVQQVEQLGAGELLVTSMGHDGMKQGFDIEHLANIKSLVNIPIIASGGGGNAQHFVELFDQTDVSAGLAASILHDRETTVQSIKEVIRQGGIAVR >CP029669.1|AWR11633.1|2282007_2282712_+|1-(5-phosphoribosyl)-5-[(5--phosphoribosylamino)methylideneamino]imidazole-4--carboxamide-isomerase MIELWPAIDLIGSTSVRLTEGKYDSEEKMSRSAEESIAYYSQFECVNRIHIVDLIGAKAQHAREFDYIKSLRRLTTKDIEVGGGIRTKSQIMDYFAAGINYCIVGTKGIQDTDWLKEMAHTFPGRIYLSVDAYGEDIKVNGWEEDTELNLFSFVRRLSDIPLGGIIYTDIAKDGKMSGPNFELTGQLVKATTIPVIASGGIRHQQDIQRLASLNVHAAIIGKAAHQASFWEGLK >CP029669.1|AWR11712.1|2281436_2282015_+|imidazole-glycerol-phosphate-synthase,-glutamine-amidotransferase-subunit MIVIVDYGLGNISNVKRAIEHLGYEVVVSNTSKIIDQAETIILPGVGHFKDAMSEIKRLNLNAILAKNTDKKMIGICLGMQLMYEHSDEGDASGLGFIPGNISRIQTEYPVPHLGWNNLVSKHPMLNQDVYFVHSYQAPMSENVIAYAQYGADIPAIVQFNNYIGIQFHPEKSGTYGLQILRQAIQGGFIND >CP029669.1|AWR11329.1|2280861_2281440_+|imidazoleglycerol-phosphate-dehydratase-family-protein MIYQKQRNTAETQLNISISDDQSPSHINTGVGFLNHMLTLFTFHSGLSLNIEAQGDIDVDDHHVTEDIGIVIGQLLLEMIKDKKHFVRYGTMYIPMDETLARVVVDISGRPYLSFNASLSKEKVGTFDTELVEEFFRAVVINARLTTHIDLIRGGNTHHEIEAIFKAFSRALGIALTATDDQRVPSSKGVIE >CP029669.1|AWR09295.1|2279879_2280893_+|aminotransferase-class-I-and-II-family-protein MIYIDKNESPVTPLDEKTMTSIISATPYNLYPDAAYEQFKEAYAKFYGLSPEQIIAGNGSDELIQKLMLIMPEGPALTLNPDFFMYQAYAAQVNREIAFVDAGSDLTFDLETILTKIDEVQPSFFIMSNPHNPSGKQFDTAFLTAIADKMKALNGYFVIDEAYLDYGTAYDVELAPHILRMRTLSKAFGIAGLRLGVLISTAGTIKHIQKIEHPYPLNVFTLNIATYIFRHREETRQFLTMQRQLAEQLKQIFDTHVADKMSVFPSNANFVLTKGSAAQQLGQYVYEQGFKPRFYDEPVMKGYVRYSIATASQLKQLEEIVKEWSAKYDLSKTTKHS >CP029669.1|AWR10155.1|2278613_2279864_+|histidinol-dehydrogenase MLNAQQFLNQFSLEAPLDESLYPIIRDICQEVKVHGDKALKMYNLTFDHTKTDHLEISHEQIKAAFDTLDEKTKQALQQSYERIKAYQESIKQTNQQLEESVECYEIYHPLESVGIYVPGGKASYPSTVLMTATLAQVAGVENIVVVTPPQPNGVSQEVLAACYITQVDQVFQVGGAQSIAALTYGTETIPKVDKIVGPGNQFVAYAKKYLFGQVGIDQIAGPTEIALIIDETADLDAIVYDVFAQAEHDELARTYAISEDAQVLKDLESRIAKALPNVDRYDIVSKSIANQHYLIHASNFDEACHVMNTIAPEHASIQTVNPQPYIEKVKYVGALFIGHYSPEVIGDYVAGPSHVLPTNRTARFTNGLSVNDFLTRNTVIHLSKDTFEQIADSAQHIAHVEALYNHQQSILIRQS >CP029669.1|AWR10462.1|2278006_2278621_+|ATP-phosphoribosyltransferase MLRIAIAKGRLMDSLINYLDVIEYTTLSETLKNRERQLLLSVDNIECILVKGSDVPIYVEQGMADIGIVGSDILDERQYNVNNLLNMPFGACHFAVAAKPETTNYRKIATSYVHTAETYFKSKGIDVELIKLNGSVELAGVVDMVDGIVDIVQTGTTLKANGLVEKQHISDINARLITNKAAYFKKSQLIEQFIRSLEVSIANA >CP029669.1|AWR10162.1|2287677_2288730_-|acyltransferase-family-protein MKKIRLELVYLRAIICAIIIITHLLTQITLKHENMEGGSLVLQFYIRNIVIFGTPCFIILSQLLTTLNYQKVTYRYLTTRVKYILIPYILMGLFYSYSESLLTDSSFNKQFIENVLLGQWYGYFIVVIMQFFILSYIIFKINYNLFNSKILLLLSFILQQSFLYYFTNNTAFHDTVLHYYPLSENTIIFGWIFYFFLGAYMGYNYERVLNFLERYLVIMIVLAVATYFVFIALANGDYWNVTSFSYSLTPYNSIMFIVILGICTHFKTMLFNTIQMISAFSFFIYLLHPIILDSLFAYTNIFEDNTMVFLAISLLFILGLCIGVGMILREFYIFRFIIGKQPYKLNINAY >CP029669.1|AWR11045.1|2288716_2289589_-|intercellular-adhesin-biosynthesis-polysaccharide-N-deacetylase MKYRKFIILVLSILIILPVSTLDGHHIANADDDSPKKLKYKENSALALNYHRVRKANFLNNFIYFFSSSKEIKNYSVSQSQFESQIKWLKSHDAKFLTLKEFLYYKKKGKFPKRSVWINFDDMDETIYENAYPILKKYKIPATGFIITGHVGEENFHNLDMISKKELKEMYKTGLWEFETHTHDLHNLSKNNKSKLMKASEATIIKDLNKSEKYLTKNFKKSQKTIAYPYGLMNDDKLPVIKKAGLKYGFSLEEKAVTPNSNDYYIPRILISDDAFEHLIKRWDGFHEKD >CP029669.1|AWR11136.1|2289854_2290967_-|poly-beta-1,6-N-acetyl-D-glucosamine-synthase MDELEGITFLLACYNESETIEDTLSNVLALKYEKKEIIIINDGSSDNTAELIYKIKENNDFIFVDLQENRGKANALNQGIKQASYDYVMCLDADTIVDQDAPYYMIENFKHDPKLGAVTGNPRIRNKSSILGKIQTIEYASLIGCIKRSQTLAGAVNTISGVFTLFKKSAVVDVGYWDTDMITEDIAVSWKLHLRGYRIKYEPLAMCWMLVPETLGGLWKQRVRWAQGGHEVLLRDFFSTMKTKRFPLYILMFEQIISILWVYIVLLYLGYLFITANFLDYTFMTYSFSIFLLSSFTMTFINVIQFTVALFIDSRYEKKNMAGLIFVSWYPTVYWIINAAVVLVAFPKALKRKKGGYATWSSPDRGNTQR >CP029669.1|AWR10749.1|2291256_2291817_+|biofilm-operon-icaADBC-HTH-type-negative-transcriptional-regulator-IcaR MKDKIIDNAITLFSEKGYDGTTLDDIAKSVNIKKASLYYHFDSKKSIYEQSVKCCFDYLNNIIMMNQNKSNYSIDALYQFLFEFIFDIEERYIRMYVQLSNTPEEFSGNIYGQIQDLNQSLSKEIAKFYDESKIKMTKEDFQNLILLFLESWYLKASFSQKFGAVEESKSQFKDEVYSLLNIFLKK >CP029669.1|AWR11600.1|2292664_2293327_+|membrane-protein-CapA1 MKEKFDLVKLLNILKKNIKLLLILPAICLVVSAALTFFVMPDKYTASTQILVNMKKSSSDLAFQNVQSSLQSVNTYTEIIKSPRILDKVSREFDGQYSTAELNSFLKVTNQTNSQIITVSVTTGNKSESDKIVNKISKVFAHDMPKIMSVDNVTILSSAHDNAVKVSPIVSVNLVISIIVGIVLAILIIFLKELLDKRIKTEEDVESQLGLPILGSIQKF >CP029669.1|AWR10171.1|2293343_2294036_+|capsular-exopolysaccharide-family-domain-protein MTNTRRSTSSLIVHEQPKSPISEKFRGIRSNIMFANPDSAVQSIVITSEAPGAGKSTIAANLAVAYAQAGYKTLIVDGDMRKPTQHYIFNLPNNEGLSSLLLNWSTYQDSIISTEIQDLDVLTSGPIPPNPSELITSRAFANLYDTLLMNYNFVIIDTPPVNTVTDAQLFSKFTGNVVYVVNSENNNRDEVKKGKELIEATGAKLLGVVLNRMPKDKSASYYAYYGTDES >CP029669.1|AWR10431.1|2294032_2294800_+|PHP-domain-protein MIDIHNHILVDIDDGPKTIEKSIALLKQAKDEGVTSIVATPHHLHPRYDNTFQQVLVKLAELRTHPEVQALDIKLFPGQEIRITDSILKGLDNGSIQGINRSKYLLIEFPTGEVPHYTKQLFFEIQSRGYIPIIAHPERNRSIAKNPEILYELVANGALSQLTSSSLVGGFGKNIQKLSLQFIECNLAHFVASDAHSCDQRPFLMQELFHNHKLKKYSNDIEALLRNASSVINDNFVYLDRPTKPGKVKSFLKWF >CP029669.1|AWR10786.1|2295034_2295535_+|acetyltransferase-domain-protein MVLRKVIMQDLDQIIALENIGFSPEEAATREALKLRIEQIQETFIVAEKNDEVIGYINGPVIKERYISDDLFKNVSTNNSEGGYISVLGLVVAPNYQGQGIAGRLLNYFETLAKNHHRHGVTLTCRESLISFYEKYGYRNEGVSESCHGGIKWYNLVKNIKKDDEV >CP029669.1|AWR10641.1|2295537_2296014_+|peptide-methionine-sulfoxide-reductase-family-protein MAVVYVAGGCLWGVEAFFATIPGIIHTEAGRANGRSSKLDGPYDGYAECVKLHFDDRMLTITDIMNYLFEIIDPYSVNQQGNDIGQKYRTGLYSCVDDHLIEARQFIERRKDRDQIAVEVLPLSNYIKSAEEHQQHLEKYPEDMHMCHISKDLLNKYK >CP029669.1|AWR10795.1|2296092_2296704_+|flavin-reductase-like-domain-protein MYTFDAQSLTARENYKLLIGSIIPRPIAFVTTLNQDASVNAAPFSFFNIVNNHPPMIAIAVQRAGGKRKDTALNIERTGDFVVHITDEDNVQDINETAAPLAYGDSELSRTELSLLTSTTIKTPGIKDAKMRFECKLSQMILLGDVLDGADLIIGEIVTYHIDDSIYEGDFKINPHALQAVSRLAGNDYAKLGGIFTIKRPEK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP029669_8 | 2728266-2728346 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029669_8
|
1 spacers
spacers of CP029669_8
>8.1|2728291|31|CP029669|CRISPRCasFinder AGGTGACGAAAAGTCAGCATACAATAATGTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029669_8
The CRISPR arrays of CP029669_8 >merge|CP029669|8|2728266-2728346|CRISPRCasFinder CAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGGTGACGAAAAGTCAGCATACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGA >CP029669|8|8|2728266-2728346|CRISPRCasFinder CAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGA AGGTGACGAAAAGTCAGCATACAATAATGTG CAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGA
>CP029669.1|AWR09982.1|2727099_2728122_+|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-A MVEQIKDKLGRPIRDLRLSVTDRCNFRCDYCMPKEVFGDDFVFLPKNELLTFDEMARIAKVYAELGVKKIRITGGEPLMRRDLDVLIAKLNQIDGIEDIGLTTNGLLLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDDTLFQSINNRNIKATTILEQIDYATSIGLNVKVNVVIQKGINDDQIIPMLEYFKDKHIEIRFIEFMDVGNDNGWDFSKVVTKDEMLTMIEQHFEIDPVEPKYFGEVAKYYRHKDNGVQFGLITSVSQSFCSTCTRARLSSDGKFYGCLFATVDGFNVKAFIRSGVTDEELKEQFKALWQIRDDRYSDERTAQTVANRQRKKINMNYIGG >CP029669.1|AWR10701.1|2726480_2727080_+|putative-molybdenum-cofactor-guanylyltransferase MKAIILAGGHSVRFGKPKAFAEVNGETFYSRVIKTLESTNMFNEIIISTNAQLATQFKYPNVVIDDENHNDKGPLAGIYTIMKQHPEEELFFVVSVDTPMITGKAVSTLYQFLVSHLIENHLDVAAFKEDGRFIPTIAFYSPNALGAITKALHSDNYSFKNVYHELSTDYLDVRDVDAPSYWYKNINYQHDLDALIQKL >CP029669.1|AWR10288.1|2726240_2726474_+|molybdopterin-converting-factor,-subunit-1 MKVLYFAEIKDILQKAQEDIVLEQALTVQQFEDLLFERYPQINNKKFQVAVNEEFVQKSDFIQPNDTVALIPPVSGG >CP029669.1|AWR10458.1|2725788_2726235_+|molybdopterin-synthase-catalytic-subunit MKQFEIVTEPIQTEQYREFTINEYQGAVVVFTGHVREWTKGVKTEYLEYEAYIPMAEKKLAQIGDEINEKWPGTITSIVHRIGPLQISDIAVLIAVSSPHRKDAYRANEYAIERIKEIVPIWKKEIWEDGSKWQGHQKGNYEEAKREE >CP029669.1|AWR10925.1|2725289_2725775_+|molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-protein-B MILQIVGYKKSGKTTLMRHIVSFLKSHGYTVATIKHHGHGKEDIQLQDSDVDHMKHFEAGADQSIVQGFQYQQTVTRVDNQNLTQIIEKSVTIDTNIVLVEGFKNADFEKVVVYRNEEELQVLQQLSNVCYSINVREHEDFTAFEQWLLNKIKNDCDTQLT >CP029669.1|AWR10203.1|2724033_2725293_+|molybdopterin-molybdenumtransferase MVVEKRNPIPVKEAIQRIVNQQSSMPAITVALEKSLNHILAEDIVATYDIPRFDKSPYDGFAIRSVDSQGASGQNRIEFKVIDHIGAGSVSDKLVGDHEAVRIMTGAQIPNGADAVVMFEQTIELEDTFTIRKPFSKNENISLKGEETKTGDVVLKKGQVINPGAIAVLATYGYAEVKVIKQPSVAVIATGSELLDVNDVLEDGKIRNSNGPMIRALAEKLGLEVGIYKTQKDDLDSGIQVVKEAMEKHDIVITTGGVSVGDFDYLPEIYKAVKAEVLFNKVAMRPGSVTTVAFVDGKYLFGLSGNPSACFTGFELFVKPAVKHMCGALEVFPQIIKATLMEDFTKANPFTRFIRAKATLTSAGATVVPSGFNKSGAVVAIAHANCMVMLPGGSRGFKAGHTVDIILTESDAAEEELLL >CP029669.1|AWR10271.1|2723476_2723971_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-C MTEFTHINQQGHAKMVDVSDKQITKRTAVAHSSITVNETIFKQISNNTNTKGNVLNTAQIAGIMAAKNTSTLIPMCHPLPLTGIDVHFSWDETNAPLYTLNIQTTVSTTGKTGVEMEALTAASATALTIYDMTKAVDKGMIIGETYLESKSGGKSGDFQRQSNQ >CP029669.1|AWR10731.1|2722968_2723475_+|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-B MGEHQNVKLNRTVKAAVLTVSDTRDFDTDKGGQCVRQLLQADDVEVSDAHYTIVKDEKVAITTQVKKWLEEDIDVIITTGGTGIAQRDVTIEAVKPLLTKEIDGFGELFRYLSYVEDVGTRALLSRAVAGTVNNKLIFSIPGSTGAVKLALEKLIKPELNHLIHELTK >CP029669.1|AWR09320.1|2721933_2722938_+|thiF-family-protein MSQERYSRQILFKQIGEIGQSKINQKCALIIGMGALGTHVAEGLVRAGIAKLIIVDRDYIEFSNLQRQTLFTEEDALKMMPKVVAAKKHLLALRSDVDIDDYIAHVDYYFLETHGQDVDVIIDATDNFETRQLINDFAYKYRIPWIYGGVVQSTYTEAAFIPGKTPCFNCLVPQLPALNLTCDTVGVIQPAVTMATSLQLRDAMKVLTEQPIDTKITYGDIWEGSHYSFGFSKMQRSDCTTCGDVPSYPYLNKNEQRYATLCGRDTVQYENASITHDILVQFLKQHQLNYRSNSYMVMFEFKGHRIVAFKGGRFLIHGMTRTSDATHLMNLLFG >CP029669.1|AWR09398.1|2721158_2721764_+|ABC-transporter-family-protein MLKINVKYQLKNTLIRINIDDTEPKIYAVRGPSGIGKTTVLNMIAGLRKADEAIIEVNGQLLTDTAKNVNVKIQQRRIGYLFQDYQLFPNMTVYKNITFMAEPSEHIDQLIQTLNIDHLMKQYPMTLSGGEAQRVALARALSTKPDLILLDEPFSSLDDTTKDESITLVKRIFNEWQIPIIFVTHSNYEAEQMAHEIITIG >CP029669.1|AWR11856.1|2728697_2729048_+|HTH-type-transcriptional-regulator-SarV MSNKVQRFIEAERELSQLKHWLKTTHKISIEEFVVLFKVYEAEKISGKELRDTLHFEMLWDTSKIDVIIRKIYKKELISKLRSETDERQVFYFYSTSQKKLLDKITKEIEVLSVTN >CP029669.1|AWR10055.1|2729149_2730361_-|sugar-(and-other)-transporter-family-protein MTNQGSLNKSPIFTKSFTINFLVNFIVYLCMYLLLVVIAGYSKQAFDASDSLAGLVVGLFIVGSLIGRFATGKFVNQIGPKRLLFIGLIALIITQLLYFIDGSLAFLIFVRLINGIATAVVTTATGTIAAYVTPVNRKSEGISLFSLSLVLGTAIGPFLGMLLITKYAIDLLFIICVILGILGLIISLFIKVDFEVTNNKTETNVIDKPRFSIHQFIAKEAIPVAVIMLLIGVTYASILTYLQAFALERHLVTAASYFFICYAIASLITRPIAGRLMDDKNENIIVYPAFIMLFLSFVCLISSYQSWLILLAGACLGLGYGNLSSAMQSIAIKVSPPIKYGIATSTFYVGLDAGVGFGPSFLGLFTHMFSYSEIFGFMAALAIITMLVYFLIHGRHVTRNAMN >CP029669.1|AWR11400.1|2730353_2730794_-|marR-family-protein MLSQEFFNSFITIYRPYLKLAEPILEKHNIYYGQWLILRDIAKHQPTTLIEISHRRAIEKPTARKTLKALIENDLITVENSLEDKRQKFLTLTPKGHELYEIVCLDVQKLQQAVVAKTNISQDQMQETINVMNQIHEILLREAHND >CP029669.1|AWR09323.1|2730955_2731720_+|glyoxalase-like-domain-protein MILKFDHIIHYIDQLDRFSFPGDVIKLHSGGYHHKYGTFNKLGYINENYIELLDVENNEKLKKMAKTIEGGVAFATQIVQEKYEQGFKNICLRTNDIEAVKNKLQSEQVEVVGPIQMERDTHKDGKVKWQLLYIMNQDDDEIKPPFFIQWEESDSMRTKKLQKYFQKQFSIETVIVKSKNRSQTVSNWLKWFDMDIVEENDHYTDLILKNDDIYFRIEDGKVSKYHSVIIKDAQATSPYSIFIRGAIYRFEPLV >CP029669.1|AWR11711.1|2732351_2733617_+|glycine-glycyltransferase MEKMHITNQEHDAFVKSHPNGDLLQLTKWAETKKLTGWYARRIAVGRDGEVQGVAQLLFKKVPKLPYTLCYISRGFVVDYSNKEALNALLDSAKEIAKAEKAYAIKIDPDVEVDKGTDALQNLKALGFKHKGFKEGLSKDYIQPRMTMITPIDKNDDELLNSFERRNRSKVRLALKRGTTVERSDREGLKTFAELMKITGERDGFLTRDISYFENIYDALHEDGDAELFLVKLDPKENIAKVNQELNELHAEIAKWQQKMKTSEKQAKKAQNMINDAQNKIAKNEDLKRDLEALEKEHPEGIYLSGALLMFAGSKSYYLYGASSNEFRDFLPNHHMQYTMMKYAREHGATTYDFGGTDNDPDKDSEHYGLWAFKKVWGTYLSEKIGEFDYVLNQPLYQLIEQVKPRLTKAKIKISRKLKRK >CP029669.1|AWR10512.1|2733733_2736901_+|swarming-motility-protein-SwrC MIKKLLQFSLGNKFAIFLMVVLVVLGGVYASAKLKLELLPNVQNPVISVTTTMPGATPQSTQDEISSKIDNQVRSLAYVKNVKTQSIQNASIVTVEYENNTDMDKAEEQLKKEIDKIKFKDEVGQPELRRNSMDAFPVLAYSFSNKENDLKKVTKVLNEQLIPKLQTVDGVQNAQLNGQTNREITLKFKQNELEKYGLTADDVENYLKTATRTTPLGLFQFGDKDKSIVVDGQYQSVDAFKNINIPLTLAGGQGQSQSQSDNKQNSAMSDVNQASPQQNSKASAPNNISGMPTAKLGDLADITVGDVRTSISKTNGKDAVNLQITKAQDANTVQVAKDVQRKIDTFVDENKDFNVTKTMDTAKPVEKSLYTMVEKASLGTIVAIIVILLFLRNIRTTAISIISIPLSLLMALIALKLSDVSLNILTLGALTVAIGRVIDDSIVVVENIYRRLTDSEEQLKGENLIISATTEVFKPIMSSTLVTIIVFLPLVFVSGSVGEMFRPFALAIAFSLLASLLVSITLVPALAATLFKKGVKRRNKQHQEGLGVVSTTYKKVLHWSLNHKWIVIILSTLILVATIVFGGPRLGTSFISAGDDKFLAITYTPKPGETEQAVLNHAKDVEKYLKQKKHVKTIQYSVGGSSPVDPTGSTNSMAIMVEYDNDTPNFDVEADKVIKHADGFKHPGEWKNQDLGTGAGNKSVEVTVKGPSMDAIKSTVKDIEQKMKQVKGLANVKSDLSQTYDQYEIKVDQNKAAENGISASQLAMHLNENLPEKTVTTVKENGKTVDVKVKQNKQTDWSEDKLNNITLKKPTGGTIKLGDIATLVKTTTPSKLTQEQGDYATTVSAKVTNKDVGGTTRQVMSKINNLDKPNNVKVNIGGASDDINNAMTQLAFAMLAAIIIVYLILVITFKGGLAPFTILFSLPFTVIGVIIALLITGETISVPSLIGMLMLIGIVVTNAIVLIDRVINNEQQGMEMKEALIEAGGTRIRPILMTAIATIGALVPLLFGQDSSILISKGLAATVIGGLISSTLLTLVVVPVIYEILFTLKKRFTKR >CP029669.1|AWR09951.1|2737087_2737405_-|putative-membrane-protein MQFYLILLAILYLIVSFISIFKMEVVFTRILRIIMGVLLLFVLALTTMSFPKENWWVFIVLLLLVGNVEVTGFKMLKKDLKGVNILNLMSLFIFVIYFILTIVLF >CP029669.1|AWR10240.1|2737649_2737814_-|hypothetical-protein MSLENQLAELKYDYVRLQGDIEKRESLNLDTSALVRQLKDIENEIRNVRAQMQD >CP029669.1|AWR09643.1|2737946_2738855_+|membrane-transport-family-protein MTEQFTMIILLIALGYFLKRINFIKATDSQVIATLVLNVTLPSLVIVNLNSAELKLSFSILPILMIIYGIVAKMIAVWFFRKYDNHMRGSVGMMTGAMNIGLFAYPLIEVIWPKTGLIYFVMADIGGAFVMFGITYFVGSYFSEGSDQFDFKYLGKKLLQSVPLVTYIVMFILNISHIHLPHVAIDFFSILSHANMPLSMILLGVMLNFTLERKYIPATIKYLCLHYGLALVAGLLVYVLLPVSDDMIKTTLLVTWMFPVGVAIISYGIQFKYRTLTFIGMTTNLTIIISIIILYVYQAVFV >CP029669.1|AWR10666.1|2739025_2739157_+|hypothetical-protein MYGAYLIYEYHQDFKSIANFKVLKRMINVMMCYCVLFLEPRIS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029669_9 | 2852114-2852204 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029669_9
|
1 spacers
spacers of CP029669_9
>9.1|2852139|41|CP029669|CRISPRCasFinder AAAAATAGAGGAACACAGTTGGATGCTACGCATCAACTGCA |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029669_9
The CRISPR arrays of CP029669_9 >merge|CP029669|9|2852114-2852204|CRISPRCasFinder AAGAAGCCCCTAACAACTAAAGTTGAAAAATAGAGGAACACAGTTGGATGCTACGCATCAACTGCATAAGAGCCCCTAACAACTAAAGTTG >CP029669|9|9|2852114-2852204|CRISPRCasFinder AAGAAGCCCCTAACAACTAAAGTTG AAAAATAGAGGAACACAGTTGGATGCTACGCATCAACTGCA TAAGAGCCCCTAACAACTAAAGTTG
>CP029669.1|AWR10468.1|2849850_2850987_+|SAP-domain-protein MSVNARDLLVLHTNVNRLVGEEIFANKCLANNDVQIMNSIKKLIEAELLTTTNDFEVSIYKKTRPELQSILKSFGIKTTGNKPDLIKRIDDNFHIINNLDLPYVYIPTKKGEEILKKTEYLTSFIQSYGEISLERAYYLVENYIDENCDDKVAEIYKFEFQRKYDNGEFDFNHGYNFELNMLIDHYKRDVKDYDNARKYSNIYLYFGLRDFLKKLMSNYSYYDSKGNIDLNEIQNDLNRFINSSASGMYERLIYNENLSNNIMFELFKKDTQDYSDLEEQLIEKFINYVVSNVKKESRSNTLIELSKILENGYTIDKEEFKKEDDYLSKYIFTDIDYLKKLESKINVAIDIRSGEIHLVLDDDSLDILIQNQKYGNEF >CP029669.1|AWR11269.1|2847907_2848765_+|cof-like-hydrolase-family-protein MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINQLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQITNLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAEHFLAE >CP029669.1|AWR11912.1|2847057_2847840_+|ABC-transporter-family-protein MLIQLDQIGRMKQGKTILKKISWQIAKGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATSGTVNLFGKMPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEIRNEAHQLLKLVGMFAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLSILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITANFSKILLLKDGQSIQQGAVEDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE >CP029669.1|AWR11519.1|2845020_2846826_+|glutamine-fructose-6-phosphate-transaminase MCGIVGYIGYDNAKELLLKGLEKLEYRGYDSAGIAVVNDDNTTVFKEKGRIAELRKVADSSDFDGPVGIGHTRWATHGVPNHENSHPHQSSNGRFTLVHNGVIENYEELKGEYLQGVSFISETDTEVIVQLVEYFSNQGLSTEEAFTKVVSLLHGSYALGLLDAEDKDTIYVAKNKSPLLLGVGEGFNVIASDALAMLQVTSEYKEIHDHEIVIVKKDEVIIKDADGNVVERDSYIAEIDASDAEKGVYAHYMLKEIHEQPAVMRRIIQEYQDAEGNLKIDQDIINDVKEADRIYVIAAGTSYHAGLVGKEFLEKWAGVPTEVHVASEFVYNMPLLSEKPLFVYISQSGETADSRAVLVETNKLGHKSLTITNVAGSTLSREADHTLLLHAGPEIAVASTKAYTAQIAVLSILSQIVAKEHGREADIDLLRELAKVTTAIEAIVDDAPIMEQIATDFLETTRNAFFIGRTIDYNVSLEGALKLKEISYIQAEGFAGGELKHGTIALIEEGTPVVGLATQEKVNLSIRGNVKEVVARGAHPCIISMEGLEKEGDTYVIPHVHELLTPLVSVVALQLISYYAALHRDLDVDKPRNLAKSVTVE >CP029669.1|AWR09515.1|2842801_2844340_-|PTS-system-mannitol-specific-EIICB-component MSQTEEKKGIGRRVQAFGSFLSSMIMPNIGAFIAWGFIAAIFIDNGWLPNKDLATLAGPMITYLIPLLIAFSGGRLIYDLRGGIIAATATMGVIVALPDTPMLLGAMIMGPLVGWLMKKTDQLIQPRTPQGFEMLFNNFSAGILGFIMTIAGFKILAPLMKFIMHILSVAVEALVHAHLLPLVSILVEPAKIVFLNNAINHGVFTPLGADQAAKAGQSILYTIESNPGPGLGILLAYMIFGKGTAKATSYGAGIIHFLGGIHEIYFPYVLMRPLLFIAVILGGMTGVATYQATGFGFKSPASPGSFIVYCLNAPRGEFLHMLLGVFLAALVSFVVAALIMKFTREPKQDLEAATAQMENTKGKKSSVASKLVSSDKNVNTEENASGNVSETSSSDDDPEALLDNYNTEDVDAHNYNNINHVIFACDAGMGSSAMGASMLRNKFKKAGINDITVTNTAINQLPKDAQLVITQKKLTDRAIKQTPNAIHISVDNFLNSPRYEELLNNLKKDDQA >CP029669.1|AWR10391.1|2840634_2842767_-|PTS-system,-Lactose/Cellobiose-specific-IIB-subunit MLLSTREKEMIALLIKYHGQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVEAYLTSFSLTLERANKKGLRIAGTDSDLNDLKQSIAQHQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELDLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLGQIYDVTFNQAEIAFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVNKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFIVLHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLDQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIDSPYLTVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFQETHDKSSNMIDKDDVHVETKDVDGNTSFENEQTSYLTSVFEKHLSDEKSEQLLHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDVINDPTSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMILITVLEEPLTLPSIQNDNQTIKYMISMFISDNDFMASLVSDLSEFLSLKLESIDTFMENPQELETLLRNKFLERIKKQFI >CP029669.1|AWR10630.1|2840188_2840623_-|mannitol-specific-phosphotransferase-enzyme-IIA-component MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA >CP029669.1|AWR09293.1|2839082_2840189_-|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKAVHFGAGNIGRGFIGYILADNNVKVTFADVNEEIINALAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFAPFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVLDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFAGKATVLDAVEDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAAYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTADQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS >CP029669.1|AWR10705.1|2836763_2838764_+|LPXTG-cell-wall-anchor-domain-protein MDNGDVDDALTQGKAAIDAIQVDATVKPKANQAIEVKAEDTKESIDQSDQLTAEEKTEALAMIKQITDQAKQGITDATTTAEVEKAKAQGLEAFDNIQIDSTEKQKAIEELETALDQIEAGVNVNADATTEEKEAFTNALEDILSKATEDISDQTTNAEIATVKNSALEQLKAQRINPEVKKNALEAIREVVNKQIEIIKNADADASAKEIARTDLGRYFDRFADKLDKTQTNAEVAELQNVTIPAIEAIVPQNDPDANDTNNGIDNNDATANSNANATPENTGQPNVSETTANGKADASPTTPNNSDAATGETTATSATDDANDKPQANNNSSVDASTNSPTMDNDVTSKPEVESTNNGTTDKPVTETDNATPAESTTNNNSTTTATNENAPTGSTATAPTTASTEAASSADSKDNASVNDSKQNAEVNNSAESQSTNDKVAQPKSENKAKAEKDGSDSTNQSMVESTTETLPSADITEPNVPSNTSKDKEESTTNQTDAGQLKSETNVASNEADKSPSKADTEVSNKPSTSASSEAKEKMTSTNVSQKDDTATADTNDTQKSVGSAANNKATQNDGANASPATVSNGSNSANQDMLNVTNTDDHQAKTKSAQQGKVNKAKQQAKTLPDTGMSHNDDLPYAELALGAGMAFLIRRFTKKDQQTEE >CP029669.1|AWR11834.1|2831327_2834636_+|sasC/Mrp/FmtB-intercellular-aggregation-domain-protein MNLFRQQKFSIRKFNVGIFSALIATVTFISTNPTTASAAEQNQPAQNQPAQPADANTQPNANAGAQANPTAQPAAPANQGQPAVQPANQGGQANPAGGAAQPNTQPAGQGNQADPNNAAQAQPGNQATPANQAGQGNNQATPNNNATPANQTQPANAPAAAQPAAPVAANAQTQDPNASNTGEGSINTTLTFDDPAISTDENRQDPTVTVTDKVNGYSLINNGKIGFVNSELRRSDMFDKNNPQNYQAKGNVAALGRVNANDSTDHGNFNGISKTVNVKPDSELIINFTTMQTNSKQGATNLVIKDAKKNTELATVNVAKTGTAHLFKVPTDADRLDLQFIPDNTAVADASRITTNKDGYKYYSFIDNVGLFSGSHLYVKNRDLAPKATNNKEYTINTEIGNNGNFGASLKADQFKYEVTLPQGVTYVNNSLTTTFPNGNEDSTVLKNMTVNYDQNANKVTFTSQGVTTARGTHTKEVLFPDKSLKLSYKVNVANIDTPKNIDFNEKLTYRTASDVVINNAQPEVTLTADPFSVAVEMNKDALQQQVNSQVDNSHYTTASIAEYNKLKQQADTILNEDANHVKTANRASQADIDGLVTKLQAALIDNQAAIAELDTKAQEKVTAAQQSKKVTQDEVAALVTKINNDKNNAIAEINKQTTAQGVTTEKDNGIAVLEQDVITPTVKPQAKQDIIQAVTTRKQQIKKSNASLQDEKDVANDKIGKIETKAIKDIDAATTNAQVEAIKTKAINDINQTTPATTAKAAALEEFDEVVQAQIDQAPLNPDTTNEEVAEAIERINAAKVSGVKAIEATTTAQDLERVKNEEISKIENITDSTQTKMDAYNEVKQAATARKAQNATVSNATNEEVAEADAAVDAAQKQGLHDIQVVKSKQEVADTKSKVLDKINAIQTQAKVKPAADTEVENAYNTRKQEIQNSNASTTEEKQAAYTELDTKKQEARTNLDAANTNSDVTTAKDNSIAAINQVQAATTKKSDAKAEIAQKASERKTAIEAMNDSTTEEQQAAKDKVDQAVVTANADIDNAAANNDVDNAKTTNEATIAAITPDANVKPAAKQAIADKVQAQETAIDGNNGSTTEEKAAAK >CP029669.1|AWR10503.1|2852220_2853312_-|putative-membrane-protein MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYAQTIAIYSQFGQKPPVDAYLKVIAVLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKNKKVVTEPKNTKVENDKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >CP029669.1|AWR11459.1|2853577_2854558_-|cadmium,-cobalt-and-zinc/H(+)-K(+)-antiporter MSHSHHHHDHMHSHVTTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALVAFIYAEKNATTTKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH >CP029669.1|AWR10415.1|2854559_2854880_-|HTH-type-transcriptional-repressor-CzrA 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>CP029669.1|AWR11109.1|2858002_2859376_+|EVE-domain-protein MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRISNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVQKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD >CP029669.1|AWR09506.1|2859833_2860247_+|hypothetical-protein MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYQFATLKGEVGQQFFKQHPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIKLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD >CP029669.1|AWR10555.1|2860446_2860890_+|DNA-protection-during-starvation-protein-1 MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLENAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS >CP029669.1|AWR11743.1|2861010_2861721_-|purine-nucleoside-phosphorylase MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGTYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKAKNVADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNDAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE |
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23. spacer 7.2|2287452|16|CP029669|PILER-CR matches to position: 371409-371424, mismatch: 1, identity: 0.938
tcagcttacaataatg CRISPR spacer tcagctttcaataatg Protospacer ******* ********
24. spacer 7.2|2287452|16|CP029669|PILER-CR matches to position: 549991-550006, mismatch: 1, identity: 0.938
tcagcttacaataatg CRISPR spacer tcagcttactataatg Protospacer ********* ******
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tcagcttacaataatg CRISPR spacer tcagcttacaacaatg Protospacer ***********.****
26. spacer 7.2|2287452|16|CP029669|PILER-CR matches to position: 1030351-1030366, mismatch: 1, identity: 0.938
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27. spacer 7.2|2287452|16|CP029669|PILER-CR matches to position: 2639084-2639099, mismatch: 1, identity: 0.938
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cagaagctgacgaaaagtcagcttacgataatg CRISPR spacer cagaagatgacgaaaagtcagcttacaataatg Protospacer ****** *******************.******
29. spacer 2.2|1244246|26|CP029669|CRT matches to position: 1809288-1809313, mismatch: 2, identity: 0.923
tcgccagcttctgtgttggggccccg CRISPR spacer tcgtcagcttctttgttggggccccg Protospacer ***.******** *************
30. spacer 2.4|1244360|26|CP029669|CRT matches to position: 1387507-1387532, mismatch: 2, identity: 0.923
ccgccagcctctgtgttggggccccg CRISPR spacer ccgcctgcttctgtgttggggccccg Protospacer ***** **.*****************
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ccaacttgcacactattgtaagctgactttcca CRISPR spacer ccaacttgcacattattgtaagctgacttacca Protospacer ************.**************** ***
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34. spacer 8.1|2728291|31|CP029669|CRISPRCasFinder matches to position: 818258-818288, mismatch: 2, identity: 0.935
aggtgacgaaaagtcagcatacaataatgtg CRISPR spacer agctgacgaaaagtcagcttacaataatgtg Protospacer ** *************** ************
35. spacer 8.1|2728291|31|CP029669|CRISPRCasFinder matches to position: 1026381-1026411, mismatch: 2, identity: 0.935
aggtgacgaaaagtcagcatacaataatgtg CRISPR spacer agctgacgaaaagtcagcttacaataatgtg Protospacer ** *************** ************
36. spacer 8.1|2728291|31|CP029669|CRISPRCasFinder matches to position: 1126997-1127027, mismatch: 2, identity: 0.935
aggtgacgaaaagtcagcatacaataatgtg CRISPR spacer agctgacgaaaagtcagcttacaataatgtg Protospacer ** *************** ************
37. spacer 8.1|2728291|31|CP029669|CRISPRCasFinder matches to position: 1350404-1350434, mismatch: 2, identity: 0.935
aggtgacgaaaagtcagcatacaataatgtg CRISPR spacer agctgacgaaaagtcagcttacaataatgtg Protospacer ** *************** ************
38. spacer 8.1|2728291|31|CP029669|CRISPRCasFinder matches to position: 1809266-1809296, mismatch: 2, identity: 0.935
aggtgacgaaaagtcagcatacaataatgtg CRISPR spacer agctgacgaaaagtcagcttacaataatgtg Protospacer ** *************** ************
39. spacer 8.1|2728291|31|CP029669|CRISPRCasFinder matches to position: 2452773-2452803, mismatch: 2, identity: 0.935
aggtgacgaaaagtcagcatacaataatgtg CRISPR spacer agctgacgaaaagtcagcttacaataatgtg Protospacer ** *************** ************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029669_2 | 2.1|1244163|53|CP029669|CRT | 1244163-1244215 | 53 | MG543995 | Staphylococcus phage UPMK_1, partial genome | 76246-76298 | 4 | 0.925 |
CP029669_2 | 2.2|1244246|26|CP029669|CRT | 1244246-1244271 | 26 | NZ_CP022541 | Antarctobacter heliothermus strain SMS3 plasmid pSMS3-1, complete sequence | 333735-333760 | 5 | 0.808 |
CP029669_4 | 4.1|1350443|26|CP029669|CRISPRCasFinder | 1350443-1350468 | 26 | NZ_CP022541 | Antarctobacter heliothermus strain SMS3 plasmid pSMS3-1, complete sequence | 333735-333760 | 5 | 0.808 |
CP029669_4 | 4.1|1350443|26|CP029669|CRISPRCasFinder | 1350443-1350468 | 26 | NZ_CP034332 | Tabrizicola piscis strain K13M18 plasmid unnamed4, complete sequence | 3359-3384 | 5 | 0.808 |
CP029669_4 | 4.1|1350443|26|CP029669|CRISPRCasFinder | 1350443-1350468 | 26 | NZ_CP022605 | Ochrobactrum quorumnocens strain A44 plasmid unnamed1, complete sequence | 715511-715536 | 5 | 0.808 |
CP029669_1 | 1.1|214888|33|CP029669|CRISPRCasFinder | 214888-214920 | 33 | NC_021536 | Synechococcus phage S-IOM18 genomic sequence | 159745-159777 | 10 | 0.697 |
1. spacer 2.1|1244163|53|CP029669|CRT matches to MG543995 (Staphylococcus phage UPMK_1, partial genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.925
ttgggagtgggacagaaatgatattttcgcaaaatttatttcgtcgtcccacc CRISPR spacer aagggagtgggacagaaatgatagtttctcaaaatttatttcgtcgtcccacc Protospacer ********************* **** ************************
2. spacer 2.2|1244246|26|CP029669|CRT matches to NZ_CP022541 (Antarctobacter heliothermus strain SMS3 plasmid pSMS3-1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
tcgccagcttctgtgttggggccccg CRISPR spacer acgccagcttctgtgttgaggcctta Protospacer *****************.****...
3. spacer 4.1|1350443|26|CP029669|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022541 (Antarctobacter heliothermus strain SMS3 plasmid pSMS3-1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
cggggccccaacacagaagctggcgg CRISPR spacer taaggcctcaacacagaagctggcgt Protospacer ...****.*****************
4. spacer 4.1|1350443|26|CP029669|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP034332 (Tabrizicola piscis strain K13M18 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
cggggccccaacacagaagctggcgg CRISPR spacer gtaggcccagacacagaagctggcgg Protospacer .***** .****************
5. spacer 4.1|1350443|26|CP029669|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022605 (Ochrobactrum quorumnocens strain A44 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
cggggccccaacacagaagctggcgg CRISPR spacer tcagggccaaacacagaagctggcgg Protospacer . .** ** *****************
6. spacer 1.1|214888|33|CP029669|CRISPRCasFinder matches to NC_021536 (Synechococcus phage S-IOM18 genomic sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
cagaagctgacgaaaagtcagcttacgataatg CRISPR spacer aggtgcttgacgaaaactcaccttacgataaaa Protospacer .* . .********* *** ********** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
101780 : 160019
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP029669|101780:160019|DBSCAN-SWA 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76 | Staphylococcus_phage(97.1%) | portal,head,holin,capsid,terminase,protease,integrase,tail | attL 115647:115664|attR 140578:140595 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
249398 : 366491
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP029669|249398:366491|DBSCAN-SWA TTTAAAGAACTATTTTTAAAATACAACTTTTAGAGTTTTTATTATTAGGCGGCCAGTCCATTATTGGGCTTGGTTGTCTTCTTTTTTCTCCTTTGTACAAGCTGAAAATCATCATTATACGTGCTTTAAAGTTGTTGAAATTTCTGTAACCAAAAGAAATTCGCTTGATTAATTTTATCTTATTATTAATTCCTTCTATAGCACCATTATTAAATGCTGGGTAATAAATTGTATTTCTTAACATCCTTTGATGTTTTCTATAATATTTAACCGCTTTCCATACACCCTTACTCACAGACTTTTTACTAACTGAATTTAAACGATTAATAAATTTAGGCCAATTACATAACCTTAGGTCTTTTCGTAATCCTTGGACAAGTTCGTAGGAGTGTCGTAGTATATCGTCTTTTGAAAGCATGAATTCTACAATGTCAGATGAGCGTTTATAAGCCTTAAAAGATTTATTCCATCTGTATTTACTAAATATGGTTTTACTAGTATCCATCAATAGGACTTTCCAGTTATTCTTAAAAATTGTATAATCAGGTCCTTTTTTATTACGGTATTCATTCATAACTTGTACACGATACTTATTAAGTTCTCTATTTAAATGTTGAACGATATGGAATCTGTCAAAAATAATAGCTGCATTAGGAAATAGGTCGCGAAATAATCGGACATAGGGTTCATACATGTCAATAGTAACCGTCTTAACTTGTTGTCGATTTTTTAAATCGAATCGCTCGAAATAGGCACGCAAGAATCTTGTAGTTCTATTTTCTAAAATATCTATAACATCATGAGTATCATTATCTATAAAAATGAAACTCATTGATCCAGTTACATTTTTAACGCTTTTAAATTCATCCATAGCGATGTGTTCTGGCAAACAATTAAAGGGTTTAATTCGTAATGAATTAGCCGCTTTAGTTCTAATACGACTTACAGTAGATGGAGAGATACAGTTATCTTCTGCAGTATCAATCTCTGTTTTAACTTTAGTAGCTTCTTCTATAACTTTTTGAGTAACACATCTTGAGATAAAACACGACTCATCAACAATTGACGTTTTAGCAGTAAAAGTGCCATTGCATTCTAAGCATTTAAAACGTTGTTTAGCTAAGTTGAGGTATGTGTTATACCCTTGAGTTTTAAGTAAAGTAATACGAGAAACACGCTTACCATGTTTATGAATTTGTCCTTCATTTTTAACTCCACAACAATAACAGGCCGAAGGCTTATACGTTAGTACAGCATTAACCACTGTTGCTTTTTTTCCTTTGATAATGACGTCAATTTCTTGGTTTATATATTTTATATTTTCATCTTTTATTCTTAGTAATTCTAAGGTATCATTACACATAGGCGCACTTGTCTCCTTTAGTTTGGGTTTGGTCACTTTAAATTATAGAGGCAATTGCGCTTTTTGTGTATTAAAAAAAGCAGGAAGTTTTACCTTCCCACCATAAAAGATGAAGAACCTGTTTAACTTCTTTTTTTGGTATTACATTAATGATAATGATTATATTATCTGGGGTTATATATTTGTTTCAACTTTTCTAATAATATATTTGTAAAAGTGCTATTTTATTGTGCTTTATACCAAGTCGATTCAATTTATCTATCTTAATAGTAATATGGCTATTTTAATATTTACAATTTATTACATTATTAGTCACAGGATGTAATTAGTAGTATTTTAAAATTAACATGACATTGATTAGTGAGTAGATTGTTTAAATTTGCTTTATTCAATTTGTGGATTGTTATATTTAGATTAAATTAGCCAACTAATCATTGTTAAAGTTAATTTTCTATAATATGATGAGTTTAATGTTCAAATTGGAGGTCGTTTATGAGTAACGCAAATAATGCTGATAATAAACAGTTTTTCAGTAAGATTTTAAATTCTATTGGTGCTGGTGTTGTTATTGCACTTGTTCCGAATGCTTTATTAGGTGAAGTATTAAAAATATTTAAAAGTGGTAATGAAATTTTAGAATTAACGTATCAGTTAGTGATACTAATTCAATCATTTATGGCATTTATTATTGGGGTTTTAGCTGCTCATCAATTTAAATTTAATGGTGCAGGTGCTGCTATAGTAGGTACATCAGCTATGATTGGTTCAGGTGCTGTTGTATATAGCAATAATAGTTTTATGTTAAAAGGTATAGGTGACATTATAAATACGAGTTTGGTTGTTATTATTGCATGTCTTATATATATGGTATTACAAAACAAACTTGGATCTTTTGAATTAATTATATTACCAGTTTTAGTACCTATCGTTAGTGGGGGTATCGGTCTAATCACATTACCTTACATTCGAAAAATTACTCAAGCAATTGGAAATGTAATTCATTCTTTTACAGACTTAAATCCGTTGTTAATGTCTATACTTATTAGTGTGGCATTTTCATTATTAATGGTAACACCAATATCGTTAGTAGCGATTGCAACTGCGATTAGTTTAAACGGACTAGGAAGTGGAGCAGCAAACCTAGGTATAGTGGCTGCCTGTGTTACTTTCTTATTTGGCTCATTGCGTGTCAATTCTATTGGTGTAAATGCAGTTTTACTCATAGGAGCTGCAAAAATGATGATCCCAGTTTACTTGAAAAATTTAATTATTTCGATACCATTGACTATAAATGGAATAATTACTGGAATCATTGCTTACGTTCTTCAGGTTAAAGGAACACCATTGTCTGCTGGATTTGGATATACAGGATTAGTTGGCCCAATAAATGCATTTAACCGAATGTCAGGTGATCCAACAATGAATATTATTTTATTAGCACTTGGTTATTTTGTCATACCATTTGTATCGGCATTTATTGTTCATGAATTGTGTAAAAAATTCATTCCTATATATTCTAATGATATTTATAAATTTGAAGTTCCAAAACAATAATTTATAGCTTGATGACAAGAATAAGTTTTAATATATGATAAATATAGGCGTTACTGTCAATAAGATATTGATAGTAGCGCTTTTTTGATTGATTTTAAAATGTGAGATTTGTTCACGTATAATAGCGGATTTTTTATGTACAGTCTTTTAAAAAGAAGCTTTTCTTTATATTGATAAAAATACATTTATAAAACACTATTGCATCAAAATGTATTAATATGTATAATTATGAATATTAATTAGGGAGGGCTGTATAAATGAAGTGTTTAATTAGGTTTATATTAGTATTAGGGTTGTTAATTAGCAGTGCTATGGTGTATATCAATCCCACAGCACATGCTGAACAAGATCAAACATGGGAGAAGATTAAAGAACGCGGTGAACTTAGAGTGGGTCTTTCTGCAGATTATGCACCAATGGAATTTGAGCATACAGTTAATGGTAAGACTGAGTATGCAGGTGTAGATATTGATTTAGCTAAAAAAATTGCGAAAGATAATAATTTAAAATTAAAAATCGTCAATATGTCATTTGATAGTTTGTTAGGAGCTCTTAAAACTGGAAAAATTGATATTATTATTTCCGGAATGACTTCAACGCCTGAACGTAAGAAGCAAGTTGATTTTTCAGATTCATATATGATGACTAAAAATATCATGCTTGTAAAGAAAGATAAAGTTAATGAATATAAAGATATCAAAGACTTTAATAATAAAAAAGTAGGGGCACAAAAGGGAACTGAACAAGAAAAAATCGCTCAAACCGAAATTGAAAATGCATCTATTACTTCATTAAGCCGTTTACCAGACGTTATATTAGCATTGAAAAGTGGAAAGGTTGAAGGTGCTGTAGTTGAAAAACCTGTAGCAGAAGCATATTTAAAACAAAATCCTAAATTAGGAATTTCCAATGTGAAATTTAATGAAGAAGAAAAAGATACAGTGATAGCAGTGCCAAAAGATTCACCAAAATTATTGTCACAAATTAATAAAACGATTAAGGAGGTTAAAGATAAAGGATTAATCGATAAATATATGACTAATGCTGCAAATGCGATGAATGATGACAGTGGTTTTATTTCTAAGTATGGTAGTTTTTTCTTGAAAGGAATTAAGATTACAATATTAATTTCACTTATCGGTGTTGCATTAGGTTCTATTTTAGGTGCATTCGTTGCGTTAATGAAATTAAGTAAAATAAAAATTATTTCATGGATTGCTTCTATCTATATCGAAATATTAAGAGGAACACCAATGTTAGTTCAAGTATTTATCGTATTCTTTGGTATAACTGCTGCATTAGGACTAGACATTTCAGCTCTTGTTTGTGGAACAATTGCATTAGTTATTAATTCCTCAGCTTACATTGCTGAAATTATTCGTGCAGGTATAAATGCTGTTGATAAAGGCCAAATGGAAGCCGCACGTAGTCTAGGTTTGAATTATAGACAAACGATGAAAAGTGTAATTATGCCACAAGCAATTAAAAATATTTTACCAGCTTTAGGTAATGAATTTGTCACTTTAATTAAAGAATCATCTATTGTGTCAACAATTGGAGTTGGCGAAATTATGTTTAATGCACAAGTGGTTCAAGGTATTTCATTTGACCCATTCACACCATTAATAGTGGCAGCAGCATTATACTTTGTCTTAACATTTGTACTTACACGCATTATGAACATGATTGAAGGGAGATTGAATGCCAGTGATTAAAATAAACAATCTTAATAAAGTTTTTGGAGATAATGAAGTTTTAAAAGATATCAATCTTGAAATCAATCAAGGGGAAGTAGTAGCAATAATAGGTCCATCTGGTAGTGGTAAAAGTACATTGTTAAGATGTATGAATTTATTAGAAGTACCTACTAAAGGTCAAGTGATTTTTGAAGGCAATGACTTAACGGAAAAAGGGACACAAGTAGATAAACTACGTCAAAAAATGGGTATGGTATTTCAAAACTTCAACCTATTTCCACATAAAAAAGTTGTCGATAATATTATTTTAGCTCCTAAATTATTAAAGAAAGATAATAACGATGAATTACATAAGGAAGCATTGTCGTTATTAGATAAAGTGGGAT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106 | Staphylococcus_phage(86.96%) | transposase,tRNA,protease,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
491952 : 500995
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP029669|491952:500995|DBSCAN-SWA 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TCAAAAATCAATTTTGGTTATTTGGTGTTAAAAAGAATAAACGACATGATATTAATGAAGGTGTAGATCTTCATGACCTTAAAACTTCATTCGAGAAATGGAATTTTGTTAAATTAGCTAAGCCATTAATTGGAGTAAGTATTTTAATTGTAGTTGTCGGTTTAGTTATTCTTTATATCTTCAAGTTAAACTTAGGAATTGATTTCTCAAGTGGTACACGCGTAGATTTCCAATCTAAACAAGCAATTACTCAACAAAAGGTAGAGCAAGTTGTAAAAGATAGTGGACTTAAAGCGGATCAAATTCAGATCAATGGTAAAGACAATAAAGTAGCAACTGTTCAATTTAAAGACGATTTAACGCGTGCTCAAGATAATAAATTGAGTGATAATATTAAATCGAAATTCGGTGACACACCTCAAATTAACACTGTATCACCAATTATTGGACAGGAATTAGCAAAAAATGCAATGCTTGCATTAATCTATGCATCGATAGGTATCATCATCTATGTATCATTACGATTTGAATGGCGCATGGGTCTTTCATCTGTATTGGCATTATTACATGATGTATTCATTATAGTAGCGATTTTCAGTTTATTTAGAATTGAAGTAGATTTAACATTTATCGCCGCTGTATTAACAATTGTCGGTTATTCAATTAATGATACAATCGTAACGTTTGACCGTGTACGTGAAAACTTACAAAAGGTTAAAGTGATTACGACAACAGAACAAATTGATGATATCGTTAATAGATCAATTAGACAGACAATGACACGTTCAATTAATACAGTATTAACAGTTATTGTAGTAGTAGTTGCTATACTATTCTTCGGTGCTCCTACGATATTCAACTTTACTTTAGCATTATTTATCGGATTGATTTCTGGTGTATTCTCTTCAATCTTCATTGCCGTTCCGCTATGGGGAATAATGAAAAAACGTCAGTTGAAAAAATCGCCGAAACACAAATTAGTTGTATATAAAGAAAAGAAATCGAACGATGAAAAGATTTTAGTTTAAAATGAATTAAGCGGTATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTTTAAAAAATGGTATAATTAAAGTCTTGATTATTTAGATAAGTGCTTTTTATTTAAAGTAATTTTAGATATAATGTCTTTTGGAAATGAGGCGTAAATATATATGATTAAACCGAAGTATAAGTGGAAATTAACTAAACCAGCTGAATACATAAGTGATGAATTAACATCAAAATTAAAGTTAACGCCAATCGTAAAAAAAATATTAGAAAGTAAATCGATTATTGATGAACAAGCAATAGAATCCATCATTTCAGATACAGATATCAATCATGATGCACTGCAATTGAGCGATATGACTAAGACTATTGAAAGAATTAAAAGAGCGATAGCGAATGATGAGAAAATCCTAGTTTATGGTGATTACGATGCCGACGGTGTTACCGCAACTACAATTTTAGTGATAACATTACAACTTTTAGGTGCACAAGTAGGATGGCATATTCCTAACCGCTTTACCGAAGGATATGGACCAAACGAACTAGCATTTAGAAATGCTCATGATGAAGGCATAACATTAATCATAACTGTTGATAATGGCATACAAGGTCATAATGAAATTAAAATGGTTCAAGATTTAGGAGTTGATGTCATTGTAACTGATCATCATGAAATTGGTAGTACATTACCAGAAGCATATGCAATCGTACATCCAATGCATCCATCGTTTAATTATCCGTTCCAACAATTGTGTGGTGCAGGTGTTGCATACAAATTAGCACAAGCATTGATTGAAAATGTACCTGATTATTTTAAAGCATTAGTTGCGATAGGTACCATTGCGGATTTAGTATCCTTAACTGATGAAAATCGATCATTAGTGAAACAAGGATTAAAAGTCTTAAATGATCAATGTCCGACCTCTGTTAAAGCATTGCTAAAAGAAGCGGGATACAATGACAATATTGATGAAGAAACAATTGGTTTTATTATTGGACCTAGACTTAATGCTGTAGGTCGTTTAGATGACGCATCATTAGCTTGCGAATTGTTGATGACTGACGTCGAAGAAGAAGCTGCATTTTTAGCAGAACAAGTTGAACATTTTAACCGTGAAAGAAAAGATATTGTAGCAACTATCACAGAAGAAGCAATGGCTATGGCAGAAACGAAAGTTAAAAAGGGAGATTTATTTTTACTTTTAGCAAAAGAAAATTGGCATGAAGGTGTCTTAGGTATTGTTGCTTCGAAAATTGTCGAAACATTTGCTTTGCCAACATTAATTTTAAATATTGATAGGGAGCAAAATCATGCAAAAGGCTCCGCCAGATCAATTGATCAAGTGTCGATGTTTGAAATACTATCAGCACATCAAGAGTTAATCGCTAAATTTGGCGGCCATCATATGGCTGCAGGTATGACGATGGATATTGAAAATATAGAATCGTTAGCTGAAGGTTTAAATAAATGGATGAAAGAATTATCTAAAACAACTTCGTTAGATCCCGTAAAGCAAGTAGATGTATTATTAACAGAAAATGATATAACGATTAAAAATATTCGTGATATGAATCGTTTAAGACCCTTCGGAACAGATTTTTCTAGACCTATTTTTGAAATGGATGATTTATCAGTTTCTTCAGTTAAGGCGATAGGTCAACAAAAAAATCATCTAAAATTGACACTTGGTGAAAGTAATATCGCCGCGCTATTTTGGCAAAATGGACACTTAGAACCTGAGTTACAAGATGAACAGCCAATTAATATATTAGGATCTGTTCAAATCAACGAATGGAATGGTAATCAATCACCGCAAATAATTATTCAAGATATTGCGATGAATGAACAGCAAATATTAGATTATAGAAGTAAGCGAAAAAGTTTACCTTTTACAGAAAATGATGAAAATATTGTCGTGCTTATTCATCCTAAAAGTGATAAAGTAAATGCGAATGAATATTATTATGGTGAAGAAATTAAACAACAAACTGATAAAGTAGTATTAAGAGATTTACCAACGTCAATGGAAGACTTGTCTAATTCCTTGCAACAACTGCAATTTTCTCAACTTTATATAGTTTTGCAACATAATCATTCGATTTACTTCGATGGTATACCTAATATGGATATTTTTAAAAAGTGTTATAAAGCATTAATAACTAAACAAGAAACAAATATCCAGAAAGAGGGTATGTTATTGTGTCAACATTTAAGTGTGAAACCAGATACACTTAAATTCATGTTGAAAGTTTTCTTAGACTTAAAATTTGTAACACAAGAAGATGGTTTAATTCGAATCAATCAACAACCTGATAAAAGATCGATTGATTCCAGCAAAGTATATCAATTAAGACAACAACGTATGGATGTTGAAAAGCAATTATTATATCAAGATTTTTCAGAAATAAAAAATTGGATAAAGTCACAATTGTCGTGAGCAATTTAGGAGGAAATATTAATGGATTTAAAGCAATACGTATCAGAAGTTCAAGATTGGCCGAAACCAGGTGTTAGTTTCAAGGATATTACTACAATTATGGATAATGGTGAAGCATATGGCTATGCAACAGATAAAATTGTAGAATACGCAAAAGACAGAGATGTTGATATCGTTGTAGGACCTGAAGCGCGTGGCTTTATCATTGGCTGTCCTGTAGCTTATTCAATGGGGATTGGCTTTGCACCTGTTAGAAAAGAAGGGAAATTACCTCGTGAAGTCATTCGTTATGAGTATGACCTAGAATATGGTACAAATGTTTTAACAATGCACAAAGATGCAATTAAACCAGGTCAACGTGTGTTAATTACAGATGATTTATTAGCTACTGGTGGTACGATTGAAGCAGCAATAAAATTAGTTGAAAAATTAGGCGGTATCGTAGTAGGTATTGCATTTATAATTGAATTGAAATATTTAAATGGTATTGAAAAAATTAAAGATTACGATGTTATGAGTTTAATCTCATACGACGAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP029669|491952:500995|491952_492957_+|AWR10668.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE >CP029669|491952:500995|494006_495146_+|AWR09605.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >CP029669|491952:500995|495164_495425_+|AWR09472.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >CP029669|491952:500995|495699_497979_+|AWR09601.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDLHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >CP029669|491952:500995|498181_500455_+|AWR11599.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDALQLSDMTKTIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTATTILVITLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDVEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKKGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKQVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQIIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >CP029669|491952:500995|492958_493984_+|AWR10438.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLIEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSSRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >CP029669|491952:500995|500476_500995_+|AWR09935.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
570131 : 578443
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP029669|570131:578443|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP029669|570131:578443|576641_577532_+|AWR10036.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >CP029669|570131:578443|572154_573261_+|AWR11028.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD >CP029669|570131:578443|574071_575172_+|AWR10521.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFSTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPYGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDAYQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKALLMNWFNTEKINLDVEASTINTDPFQYI >CP029669|570131:578443|577657_578443_+|AWR09838.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >CP029669|570131:578443|570131_571931_+|AWR10802.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQNLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKALNDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYNLNDEPYENEIDDYVNVINEKGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >CP029669|570131:578443|575285_576632_+|AWR11693.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFYLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >CP029669|570131:578443|573391_574069_+|AWR09748.1|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCECGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIQPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTELIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL |
7 | Caulobacter_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
668910 : 761180
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP029669|668910:761180|DBSCAN-SWA 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>CP029669|668910:761180|758876_759077_+|AWR11885.1|DBSCAN-SWA MKQGTVKWFNAEKGFGFIEVEGENDVFVHFSAINQDGYKSLEEGQAVEFEVVEGDRGPQAANVVKL >CP029669|668910:761180|736645_736867_+|AWR10056.1|DBSCAN-SWA MKNYSFYQFVMTVRGRHDDKGRLAEEIFDDLAFPKHDDDFNILSDYIETHGDFTLPMSVFDDLYEEYTEWLKF |
61 | Staphylococcus_phage(20.0%) | tRNA,head,transposase,protease,lysis | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
854315 : 860359
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP029669|854315:860359|DBSCAN-SWA ATTATGCTTCTTTTACTTCTACTTGATATTTACCTTCACGCTCTTTAAAGAACTTGTCCCGCCAATTGCCAACATGTGGCACTGTGGTACTTCTACACCAAGGATGCATAGGTGGCGCATTCACACCTGGTATCATATCTTTAACTTTAAATATTTTTCCGTTAAGTGAATGACATAATTTAGATGTTTTACTATCTATTTTGGCAACATATTTATATTCGCCATCTTCACCAAGTTCTTTTAAATATGTTAACTTTTGTGCTTCTGCATTTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCGTATAAAAATAGCACCACTTTCTCTTTATCTGTCTAAAAAGGATGCTATTTATCTTTTGAATTTGAATTCTTTTTCGCTTTTTCTATACTTTCAAATTCTTCAACTAATTCTTTAAAAGATTCACTCAATTCTTTTGCAGTTACATTTCCATCTAATTGTGAATCTAACATAATTAAAATCATCTCACTTTATATTTAATCATATTTATACTATAAAGTTTTTTCAATAATTTTTCAATATGGCTATCATTAATGATATTAATATGCGTAAAATATTTAGCACAAAATTTACTCACTATTTTACCATGAAACCTATTTGACTTGGTAATAAATTTTACTTGTCCCTTATTAGTAACGATTGTCATTGATTTTATTGATGGATGCTTAAAAAATGTAAATAAATCATATTCTGAAAATCCTGACTGTCCAGGATGGTTATGTAACATAACAATTGAATTCGGTTTACTGTTAAATAATAATTCGGTTGCTTGTTACCCTGGCACAAAAGATACACTATCTTGATTGACATATACTTTTGTAAATTTACCATCTTTTAACAAATAAGCTACTTCATTGCTATCATTGTTTTCCATGAGATATACCTCCGTTTATAGTCTGTCGACTGATATTCCATACTTGCTTTTAAAATGTCATCAGCACGTTTTGGGCAATAAAAAATAACCTTCACATTTGAAGGTTAAAATTTTTAAAGTAAACTTTCTTTATCCCCATGCTACGAGTTCAGATTCAGGAAATAGCCCTTTACTAGTATTTATGTATATTCTGTCTATGGCATGAATAAAATAATTATCTCTTGTATTTTTTTCTAAACTAGATTTTTCAGCATTGATAACTTCAAGACTATCTATATCCATTTGAATAATACCAGGCTTAATATTTTCATCATTATTAGGAAAATATTTATATGTAACACTTTTATCATTAATTTCTTTTATTTTTAATATTAGCAATCATTTCCACCTCTAATTAATTAAAATACTATAATTATATTTTATTTCTGTAAGTTTATGTGCCTCTATATAGTGTAAATTATACTTATTCATTAGATAGTGTTCAAGAGCTTCATGTTTCTACATTATTATATCCATTTTTTTAATATTTTTCCCTTCTCTTAAACGTTGCCAACTTTGAGCCATATAAAAGTCAGGATCAAATTGTTTAAATCCACTTTCTAATAAATACTTATTTTCAAATATATGTTCATAAACTCTTTGAATTAAATTTTTATTTATATTAGTATTTTTAGCAATTTTAGAAATCTCTATCTGTTTATCTCGATTTCTAACTGAATTATAATAAATTTGAGCATGTCTGTTCCTTTTGATACCGTATTCATCACTTTTATTATTAAGTGCACCTGATTCAATAAAACAACCTTCTACTTGATATTTACCTTCACGCTCTTTAAAGAACTTGTCTCGCCAATTGCCGACATGTGGCACTGTGGTACTTCTACACCAAGGATGCATAGGTGGCGCATTCACACCTGGTATCATATCTTTAACTTTAAATATTTTTCCGTTGAGTGAATGACATAATTTAGATGTTTTACTATCTATTTTGGCAACATATTTATATTCGCCATCTTCACCAAGTTCTTTTAAATATGTTAACTTTTGTGACTCTTCTTTTTCAACGAATAATGAAAAAAGCATATAAAAATAGCATCGCTTTCTCTTTATCTGTGTAGAAAGGATGCTTTAATACCATGCTATTTTATAATTTTCGGGAAATTCTTGCTTCTCGATAAAGTCTCTTACTACAGAAAAAGACTTATTACGATATAACATAAAATATTCTTCATTTTCTATTTCAGATAATGAGAAATCTATAACCTCTGCATCTTTTTTATTAAAAGTTACTGAACCTTTACCGTTACTTATATCATCTTCAGGTATATATTCATATATTATAACCTGTTCATCTTCTTTCAATTTTATTAATGTAAGCATTTAATCCACCTTCTTTTTTATAAAAATTGAATAATCGTATTTTTTTGATACAATTTTATGTGCATAATCATAGTTGAAATTATACTTATTCATCAAATAATGTTCAAGCGCCTCATGACGCAGCAGTATTAAATCTTGTTTTTTATTGTTTTTCCTTCTCTTAAACGTTGCCAACTTACTGCGATATTATATTCTGGATAATAACTTAAAATCGAATAATTCACTTTGAACATAACAACTCACTCCTTGTATAGTGGTGAAGCAAGTATTATTATTAAATTGTAGGAGGGAAAGTCCCTCCTGACTGATTAACGCTCGAATGTCCATTCAATCTTTATAAAGTAGAGATTTATTAAGATTAACAATTTGGTACATTTGAGCTTTTTTATTTCCTTCACTCGCACCTTCTTAAACTTATATGTTCATTATACAAATATAAAAAGCTATAACAATTTAATGAAAATGCCCCCTTCGAAGTCGACATTGAAAAAATGAAAACTTTGAAGGGAGCATTTCAAGACGATCCATTCCAATCTTTTTTATCATTTAAAACTTAACACTTATTTTCCCTTATTCGATGCTAATTTCGTGCAATAAATTCTAAATGAAACGACATACTCCTTTTTCACAAATTGGAATCTACTATTTTTGTATTTTAATTATTATAATATCCATTCACCATATGATTTTTATTAATAGTTAAATCAAATAAACATAGCTTGATTAATTTATACATTAGTTAAATTACAAAACTTTATTGGCATATTCATATAATTTTTCTGTTGTATTCAGGGTTAGATTATCTACTTCGCGTTTGCCCTGTCTTAATTGTGAAAGTACGTATTGAGAAACTCCAGTTTTTTTAGAAATTTCATATCCTGTTAAATTACTTTCAATTAATTCAATTATTTTTTTCTTGTATTCTGACATTTTTTCATCTCCATATCTGTACAATGTTTTCTGCTTTTTTTCGAAATTCTGTGAACTTAACGTATTTTTTATCTATAAATGATTTTATTATTTTTCTATTCATTAATGGCTATCATCACTTCATAATAGTTAAATTTTATATTTTCAATTTTTGTTTCTACATATTAACGACTTTTCATCATCAATTACTTTGTCAAAGATAAACGATTTGTCTTGTATACCTTACGCCTTTTACAAAACTTCAATGTTTAGTATTCATTGAAGTTTACAGCCACTTCTAAAGTTTAACCTTTTATGTATTTTTATTAGATTAGTGTCTTTCAATATTCAAACTACTAACTCCAGTAGTCTATTAAATTTGAGATATTGAGATATCTTTAGAATTTAATTTTTCCGGAGTCATATAGACTTCTCAAATACTATACATTTATTTCATAATTTTGAACCCTAATATTACTAAAATAATTATAAACGTCCCTATTAAAAATTCTATTTTCTCTTTTTTATTTGTTTTTCGCACTTTAATAGTCATCTTCATTTTACTAATGGTGAGAAAGTAATATTTTATTCAAAGAATATGACTTCATATTAAATCAAACCTCACATTCTTATTAGATTGCAAATTCAATAGTCCTACCAGAATTGAAATCAAAACATTCAAACTATTTTATCGTTTTAACTTCCTCGACCATTTTCACCTCCTTATAATCTATATAAATTATGTTTACCACACGATTCTTTACACTCGAAAAATTAATTTTGTTAAGAAACATTTAGCCATGTAACTTTGTAATAAAAACATTTTCAAATAAATGTACCAAAAACTTTCATGAAATAAAGTATACTTTTCAAATCTATTAATTTTAGAATCATAAAACCAAATGCTATATTACAATATAATTATCACAAATCATCATATATGCCAATTACACAATTTAATATAAAAAATTGTCAATGAAAAATTATGTGCATAAACATTATTACAAAATATGTATAGTATAGAATACTGCATTAAAGTTAACTTATTTACTGTGTTCAGCCTTTTATATCATCGCTTAAAGATCATTCAAGATTTAATGGCAATGATAATTTCATAATATGCATTTTTGATTATTTAACCATGTACAATTTCTAAAACTAAGAGATTATCTTATTGAGGTGGACAAAACGTGGACAGACAACCATGAAATCATTAGAAATTTAATTTCTTGTCCACCTAACCTAACAAAATATTTTTGTTAACATTCTGTTTTATTTTCTAATGTTCTTTGATATTCATATAACTTGATTATCGTTTTAAATTTAGCTTCTTTTATTTTAGTTTTACCTACCTTTAAATCAGTAACTGTTTGACGTGGTACACCTGAGTTTTTTGAAATACTATATGGTGTATTGTTAGTTAATAACTTTTCTATTTCACTTATAATAGTTTCAATCTCATTCATTATTAATCACACTCTCTTTCTATTTATAATTATAATAATCCTAATGCAGTAACTACGTTTAGCAATACATTGTTTTTTTCTAGTTGCCAAACTAGTTAATTCATAAACTAATACCTAATAGTATTGGCGTTTTTTTTATATATTGATAAAATTTCTTGTCTCCATCTATTCTATATTATATTATTTGATAATTTTTTATTTATATTCACATTAAGTTATCCATATTTAATATACTTTAAAATTAGATGACTTAAAAGGCTCACTCCATGATATTTCAAAAATATGGCCTTATTTTAATCTTCAATCATTATTTCTAATTGTTTTTGGTAATTATAGAGTTTTTCCGCTGTTTCTAAAGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP029669|854315:860359|856328_856580_-|AWR11282.1|DBSCAN-SWA MLTLIKLKEDEQVIIYEYIPEDDISNGKGSVTFNKKDAEVIDFSLSEIENEEYFMLYRNKSFSVVRDFIEKQEFPENYKIAWY >CP029669|854315:860359|859248_859461_-|AWR09620.1|DBSCAN-SWA MNQFKEIYNTIEKLLNDKSISNYRINQDTDVSYGGISELRSGKRKVNNLTLETAEKLYNYQKQLEIMIED >CP029669|854315:860359|858748_858955_-|AWR10981.1|DBSCAN-SWA MNEIETIISEIEKLLTNNTPYSISKNSGVPRQTVTDLKVGKTKIKEAKFKTIIKLYEYQRTLENKTEC >CP029669|854315:860359|854786_854903_-|AWR10178.1|DBSCAN-SWA MSKFCAKYFTHINIINDSHIEKLLKKLYSINMIKYKVR >CP029669|854315:860359|854315_854450_-|AWR10011.1|DBSCAN-SWA MIPGVNAPPMHPWCRSTTVPHVGNWRDKFFKEREGKYQVEVKEA >CP029669|854315:860359|854652_854778_-|AWR10423.1|DBSCAN-SWA MLDSQLDGNVTAKELSESFKELVEEFESIEKAKKNSNSKDK >CP029669|854315:860359|857324_857510_-|AWR10318.1|DBSCAN-SWA MSEYKKKIIELIESNLTGYEISKKTGVSQYVLSQLRQGKREVDNLTLNTTEKLYEYANKVL >CP029669|854315:860359|855698_856283_-|AWR10340.1|head|DBSCAN-SWA MLFSLFVEKEESQKLTYLKELGEDGEYKYVAKIDSKTSKLCHSLNGKIFKVKDMIPGVNAPPMHPWCRSTTVPHVGNWRDKFFKEREGKYQVEGCFIESGALNNKSDEYGIKRNRHAQIYYNSVRNRDKQIEISKIAKNTNINKNLIQRVYEHIFENKYLLESGFKQFDPDFYMAQSWQRLREGKNIKKMDIIM >CP029669|854315:860359|860161_860359_-|AWR09518.1|DBSCAN-SWA MNCYDEIFNTIKELIENKEISSYQINKDTGISYGNINAMRRRERRIENLSLKNAKILYEYAKKVL >CP029669|854315:860359|855329_855578_-|AWR09494.1|DBSCAN-SWA MLILKIKEINDKSVTYKYFPNNDENIKPGIIQMDIDSLEVINAEKSSLEKNTRDNYFIHAIDRIYINTSKGLFPESELVAWG |
10 | Staphylococcus_phage(66.67%) | head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1117047 : 1125520
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP029669|1117047:1125520|DBSCAN-SWA CTTATTTTACAATTTTAGCAATAACACTTGGATATAACTCATATTCCAATTTTTTTACTTTCTCTTCTAATTGTTCTTTTGAATCGTCCGGTCTAATATCACATTTTCTCTGTTCAATAATTTCTCCCGTATCCATACCACTATCAACATAATGTACTGTCGAACCAGTAATAGTATCGCCACTATGATATGCTTGGCCTATTGCGTCAATCCCCTTATATTTCGGCAATAGAGATGGATGTATATTCAATATTTTACCTTCAAATGAAGCTAATAAGTCTGGACCAATTAGACGCATGTAGCCAGCTAGAATAATCCACTCTACCTTATCTTCATTTAATAATGTTACTAAATGTTGTTCATACGCTGCTTTTGAATCAAATTGTTTTGGTTCATTAATATAAACAGGAATATCGTGCTTTTTTGCTCTATCTATACAAAACGCATTTTGATGATCCGTATATAGCGCCGTAACTTCAATATTTTCAAGTTTTCCTGATTCAACATGCTCAACTATATTTTCAAAGTTACTTCCTGAACCTGATGCAAAAATCGCAATTTTAACCATTGTTATACCCCCAACAATTCAATTGCAGTTGACTCATTTTTCACAATATGACCAATTTGATAGGCTTCCACATTTTGTTCTGCTAAAATCTTCAAAGCGCGTGATACATCTTTTTCATCAACGATAACCGTATAGCCAATACCCATATTAAAAATGTTATACATTTCATTTGTGTCTATATTGCCTTGTTGTTGTAACCAATCAAATATTTTTGGTGTTGGAAATGATGTAGTATCAATTCTAGCAGCATATCCGGCTGGCAATGCACGTGGAATATTTTCATAAAAACCTCCACCAGTAATATGATTCATTGCCTTAATAGAAACTTCTTTTTTCAAAGCAAGTACAGGTTTGACATATAATTTAGTTGGTTCTAAAAAGACATCGATAAATGGACGATTATCGAAGTTTGATGCCAAATCAATGCCTGATTCATTAATTAATTTGCGCACTAAACTGTATCCATTTGAATGAATGCCACTTGACGCAAGCCCTATAACAACTTGTCCCTCTTTCACTTCTGAACCATCTACATAGTCATCCTTTTCAACTGCTCCAACAGCAAATCCAGCTACATCATATTCGCCTTCGTGATACATTTCACCCATTTCAGCAGTCTCTCCACCGATAAGTGCAGTATTCGTTTCAACACATGCATCACTAATACCTTTAACAATTTGTTCAATAACTTCAGGAACAACTTTGTTTGTAGCAATGTAATCTAAAAAATATAATGGTTCTGCACCTGTCGTTAAAATATCATTAACACACATTGCGACTGCATCGATACCTATCGAATCATGTTTACCATAGTCGATAGCTAGTTTTAATTTCGTACCTACTCCGTCTGTTCCAGAAACTAAAACTGGCGCTGTCATATTTAATTGTGATAAATCAAATGTAGCACCGAATCCACCTAAACCACCGATAACTTCTTTACGCATCGTACGTTTAACATGACTAGACATTCTTTCTACAGCTTCATAACCAGCATGAATATTTACACCAGATTGTTCATATGCTTTAGACATTTAAATTTCCCTCGCTATCAAAAAAGTGTTTGTTTTTAGAAATATATTGCTTTTGTCGATGACTTAAATGCGCTTTATAATTTGCTTCATAATCATATAACCCTGCAGGATAATCTCCAGTGAAACTTTCTACACATAAGCCACTATATGGCGCGTCATAATCTAAACCAATTGATTCAATTAACCCATCTACAGATAGATATGCTAATGAATCAGCGCCAATATAATCTTTAATTTCTTCAGGTGATTTGCTTGCAGAAATTAATTCTGCCGTAGTTGAAACATCGATTCCGTAAAAACTTGGAAACATAAATTCCGGTGATGCTATACGCACATGCACTTTATTTGCACCAGAATCTTTTAACATTTTCACAATGCGTCGAATTGTCGTACCGCGAACAATGGAATCATCAACAAGAATGATATTTTTCCCATCTACTATATCTTTTACCGCAGATAACTTCACTCTCACACCTTGCTCACGTAATTCTTGAGTTGGTTGAATAAATGTTCTTGCAACATATTGATTTTTAACTAGTCCCATTTCATATGGCAAACCTATTTCTTCAGCATAACCACTCGCAGCTGATAGCGATGAATTGGGTACACCGATGACCATATCAGCATTTACAGGGCTTTCTTGGGCTAATTTTTTACCAGAAGCTTTACGTACTGCATGGACATTTTTACCAGCTATTGTTGAGTCTGGTCTAGCAAAATAAATATATTCCATCGCAGAAATTGCAGTTGTCGTATGATGTGTATAAGATTTAACTGTAATACCTTTATCGTTAATCACGACATATTCACCTGCATGAATATCTTGAACAAATTCTGCACCTAACACATCTATTGCACATGTTTCACTTGCAAGGATGTATGTCCCATCTTTCATTTTACCTACAACAAGTGGTCTGATAGCATTTGGATCTACTGCGCCATATAACGCATCTTTAGTTAAAATCGCAAATGTAAAACCGCCTTTAACTTTTCGCAAACTTTCTTTCAACGCTTCCTCAAAAGTAGGAGCTTTACTTCGACGTATCAAATGCATAATGACTTCAGTATCAGAAGACGAATGGAAGATAGCACCTTGTTTTTCTAAATTCTGACGCAATGATTTAGCATTAATGAGGTTACCATTATGACAAATACCTACACTCATATCATAAAAGTGATACAGAAACGGTTGAATATTTTCAATACCTTTATTACCTGAAGTAGCATAACGGACGTGACCAATTGCATGTTGATATCCTTTTAATCGTTCCATTTGATCATCTTTAATCGCTTCAGTTAGTAAGCCTAATCCTCGCTCGCCTTTTAATTCATTTTGATCAGAAACAACTATACCTGCACCTTCTTGACCACGATGTTGCAAACTATGAAGTCCCATATATGTTAGTTGCGCTGCTTCAGGATGATTCCAAATACCAAACACGCCACATTCTTCGTTTAATCCTGAGTAGTTAAACATTGAGCAATTGCCCCTTCCCATATTTGTTTAATATCTGAAACATTTTCACTAATCTCTGTATATGGTGTTGTTACCTTGAAATTATCACTATCTGTTAAAAGTCCAATTTCTATTGCATTATCAATATTTAAAGTTTTACCTGATTTAACAGAAACAACATATCGGCCTTGCGTCTCACTAAACAATTGTGCATTTGTTATATCTATTGAAGATTTTAATCCTAAACCGTAATGCGCACTTAGTTTAGCTAAGGTAATCAGTAAGCCACCTTTACCAACTGTTTGAACATGTGATAATAGTCCTTCACGAATAGCGGTCTTGATTGATTCACCTTTTTCAACTTCTGAACTCAAATCTAATGACTCAAATTCATGATTAACTTTGCCATAAATTAACTTTTCAAGTTGACTACCACCAAAGTCGTCCTTAGTATCACCGATTAAATATAATTTATCTCCAACTTGAGGTTCAAAATCATTTAAATAATTTACATTTTCAATCAAACCTACCATTCCAACAACTGGTGTTGGGAAAATAGAAGTACCTTTCGTTTCGTTATATAAAGATACATTACCAGAAACTACTGGTGTCTTAAGAATGTCGCATGCTTCTGCCATACCTTTCGTTGAATCTATCAACTGTTGATAGATTTCTTTCTTTTCAGGAGAACCATAATTTAAACAATCTGTCATTGCTAATGGTGTTGCACCCACGGCAATTAAATTTCGATAAGCTTCAGCTACTACCATCTTTCCACCTTCATATGGATTGTTATATACATAACGCGCTTCACCATCAATTGTTGAAGCAATTGCCTTATTTGTGCCTTCCACACGTACTACCGATGCTTGAAGTCCTGGCTTAATTATCGTATTGGCACCAACTTGTTGGTCGTATTGATCATATAAATAGTGTTTAGATGCTATAGTCGGATGCTTAAGTAATTTAAAGAAAGTATCTTTAACATCGATGTGTGTATAATCATTTTTAGAAGTATTATAATCTTTTTCTTCTCCTTCTAAAATATATACAGGTGCTTCATCAGCTAGTGGTTCAACTGGAATGTCAGCATAAACTTCGTCATCATATGTTAAAACAAAACGATTTGTATCTGTAACTTCACCTATAACAGCACTATCCAATTCGTGCTTATCAAATAAATCTAAGAATTTTTGTTCAGTACCTTTTTCAACAACTAGTAACATACGTTCTTGAGTTTCTGAAAGCATCATTTCATAAGGAGAAATACCTGGCTCACGTGTTGGCACTTGTTCTAATCTCAAATGTAACCCACTACCACCTTTTGCCGCCATTTCAGACGATGAAGATGTTAAACCAGCAGCACCCATATCTTGAATACCAACTAATTCATCAAATGTAATTGCTTCAAGTGTTGCTTCCATTAATTTTTTACCTACAAATGGATCACCGATTTGTACAGAAGGTCGTTTACTTTCGCTTTCTTCCGTCAATTCTTCAGATGCAAAAGTAGCACCATGAATACCATCTCGACCAGTTTTCAAACCAACATAAATGACCGAATTACCTACACCTTTTGCTGTGCCTTTTTGAATCATGTCGTGATTGATAACACCAACACACATTGCATTAACAAGTGGATTGCCATCATAACGTTCATCAAATTCGATTTCACCAGCAGTTGTTGGAATACCAATGCAGTTACCATAACCTCCGATACCCTTTACAACACCTTTAAGTAATCTTTGGTTTTGTTTATTATCTAATTCTCCAAATCTAAGACTGTTTAACAAATTAATAGGTCTAGCCCCAATAGAGACAATGTCACGAATGATTCCACCAACGCCTGTAGCAGCCCCTTGATATGGTTCAATTGCTGATGGATGATTGTGAGACTCTACTTTAAATACTACGGCTTGATTATCACCTATATCGACTACCCCTGCACCTTCACCAGGCCCCATAAGCACATGGTCACCTGACGTAGGAAATTGCTTTAAAAACGGTTTAGAATGTTTATAAGAGCAATGTTCACTCCACATAACAGAAAAGATACCTGTTTCTGTAAAGTTAGGTTGTCTGCCTAAAATATCGCAAACTTTTTCATATTCTTGATCACTTAATCCCATATCTTGATATACTTTTTCAAGTTTAATTTCTTCAACGCTTGGTTCGATAAATTTAGACATGTTGTTCCCTCCAACTTTTTACCATCGCTTCAAATAATTTCACACCACTATCAGTACCTAACAACGTTTCTAAAGCTCTTTCAGGATGTGGCATCATGCCACATACATTGCCTTTTTCGTTAACAATTCCTGCAATATCATCATATGAACCGTTCGGATTATTCACATATTTCAGAATAATTTGATTGTTAGCTTTTAATTGTTGATATATTTCATCAGTACAATAATAATGACCTTCACCGTGAGCTACAGGATATATAACTTTTTCACCTTGTTCATAAAGATTTGTAAATGCCGTTTGATTATTCACTATTTCTAACTCTTCATTTCTACTAATAAATAAATGTGAATCGTTATGCAATAATGCACCAGGTAATAAGCCTATTTCAGTTAAAATTTGAAACCCATTACAAACACCTAATACTGGCTTACCTTCAGCTGCAAGACGTTTAACTTCCGAAATAATCGGCGCTACACTAGCCATTGCCCCAGATCTTAAGTAATCCCCGAATGAAAATCCACCAGGAATAAGTACGCCATCAAATCCACTTAGTGATGTTTCTCTATAATCTACATATTCCGCTTCAACACCACTTTTAATAGCAGCATTAAACATGTCTCTATCACAATTCGAACCTGGAAAAACAAGAACCGCAAATTTCATTTTATGCATTCTCCTTTTCATCATCTAACACTTTATAGCTATATTCTTCAATCACTGTATTTGCAAACAATTTTTCACTTAGAGTTGTAATAATGTTGTGTACCTTTTCATCACTAACCTCATCCACTGTCATATATAATACTTTTCCTACACGAATATCATTCACTTGTGCATAACCTAAGTCATGTACAGCTCGAGTAAGCGTTTGTCCTTGCGTATCTAATACTTGTGGTTGTAATGTGATATGTAGTTCAATTGTTTTCATTATTTTAAATCCTCCAATTTGTTTAAAAATATTTGATATGTTTCAATCAGTGATCCAGTGTTATTTCTATATACATCTTTATCAAAGTTTGCATTGGTAGCTTTATCCCAAATTCGACATGTATCTGGAGATATTTCATCCGCTAACAAAATTTGACCAGTCTCAGTCTTTCCAAATTCGATTTTAAAATCTACTAATTTTAAATTCATAGCATCCATTAATTGTTTCAACACATTATTAATCTTTAATGCTTTGGATTTTAGTATTTCAATATCTTCATCTGATGCTATATTGAGCAATTTAACATGGTCATCCGTTATCAACGGATCATTTAACGCATCATTTTTATAGAAAAATTCTACAAGTGGTTCTCTAAAAACTTCACCATTTTCAAAACCTAAACGCTTTGTAATAGATCCACTAGCAATATTACGAACAACTACTTCTAATGGAATTATTTTCACAGGCTTAACTAATTGTTCTGTTTCAGATAATTGTTTAATAAAGTGACTTTCTATTCCATTTTCTTGTAAATATTTAAATATAATAGAAGTAATTTGATTATTTAATCGCCCCTTACCTGCCATTGTGTCTTTCTTAGCCCCGTTTCCAGCAGTAACTTCATCTTTATATTCAACTCTTAATTCATTTTCTTGATTTGTTGAGAAAATGCGCTTCGCTTTTCCTTCATATAATAATGTCATGCTTTAATTACTCCCCTCAAATTTAGCGTACATATCTTGTTCAGTTTGGTTTACATCATTCGTTAGTACAGTCATATGCCCCATTTTTCTGCTATCTTTACGCTCAGACTTACCATAAATATGTAAGTGCCACTCTGGATGTTCATTAAATTCATTTTCCAATAAATCTAAATCTTTACCTAGTAAGTTCATCATGACTGCTGGCTTTAATAATTCAATTGAATTTGGTAATGATTGTCCGGTAACTGCTAAAATATGAGTATCAAATTGTGAATAATCACATGCTTCAATTGAATAATGTCCGGAATTGTGAGGCCTTGGTGCTATCTCGTTCACATACAATTGGTTGTTACTATCTATAAAAAATTCAACTGTAAATGTTCCAATGAAATGAATCGATTGGATAATTTTATTAACTTGCTCTTTCGCCTCAGCTGTTTTATCTATTCTCGCTGGAACAATTGTTTTGAAAAGTATTTGATTTCTATGCTCATTTTCTTGTAATGGGAAAAAAGTGATTTGATTGTTGTTTCCTCTTGTAACAGTAAGAGATACTTCTTTCTTGATATTCAAATATTTTTCAGCTACGCATTCACTAGTTTCAATTAATTTAAAACCTTCTTGTAAGTCTTTTTCGTTGTTAATTAAAACTTGACCTTTGCCATCGTAGCCACCAAATCTAGTTTTTACAATAAAAGGATATCCTAATGTTTCAATTGCTTTGTCAATATCTGTAGATTCTTTTACTGAAATGAACGGGACAACTTTGGTACCAGCACTTTTTAATGTTTCTTTTTCAGTTAAGCGATCTTGTAATAACTGTATAGCTTGGTAACCTTGCGGAATATTGTACTTTTCACATAATAGTTTTAATTGTTGGGCTGAAATGTTTTCAAATTCATAAGTAATCACATCACATTTTTGTCCTAATTGATTGAGTGCCTTTTCATCGTCATACTTGGCTTGTATAAATTCGTGTGCAACGTATCTACATGGACAATCTTCAGAAGGATCCAATACAACCACTTTATAACCCATTTTTTGAGCTGATTGTGCCATCATCTTTCCAAGCTGACCACCACCAATAATGCCAATAGTCGCACCAAACTTTAATTTATTGAAGTTCATTTTGCATGTCCTCCACTTTTTGAATTAACGAAGATTCATACTGATTTAGTTTTTCAACTAAAGAAGGATTTTGAATACTTAACATTCTTGCTGCAAGTATACCTGCGTTTTTAGCACCTGCTGCACCAATTGCAGTCGTTGCAACCGGAATACCTCCTGGCATTTGAACAATTGATAATAAAGAATCTATACCCTTTAAACTTTTTGTTTCAATCGGCACTCCAATAACTGGTAGCGTCGTTAATGATGCAACCATACCTGGTAAATGTGCCGCACCGCCAGCGCCTGCAATGATAATGTTTATACCTCTTTCTCTCGCTTCAGAAGCAAATTGAACCATCATTTTTGGCGTACGATGTGCGGATACTACTTGTTTTTCGTACGGAATTTCAAAATAATCCAACATGTTACAACTCTCTTGCATAATTTTCCAATCGGAAGAACTGCCCATAATGACTGCTACTTTCAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP029669|1117047:1125520|1118637_1120122_-|AWR09956.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >CP029669|1117047:1125520|1122955_1123219_-|AWR11006.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >CP029669|1117047:1125520|1120100_1122290_-|AWR09328.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGDHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >CP029669|1117047:1125520|1117616_1118645_-|AWR11527.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDVSRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >CP029669|1117047:1125520|1117047_1117614_-|AWR11890.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRKCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >CP029669|1117047:1125520|1122282_1122954_-|AWR11086.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >CP029669|1117047:1125520|1123218_1123923_-|AWR09960.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIASDEDIEILKSKALKINNVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >CP029669|1117047:1125520|1123926_1125051_-|AWR09646.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVVVLDPSEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITFFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >CP029669|1117047:1125520|1125037_1125520_-|AWR10453.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGINIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1289834 : 1305663
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP029669|1289834:1305663|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP029669|1289834:1305663|1289834_1290389_+|AWR11320.1|DBSCAN-SWA MNKKLLTKTLIASALVLTTVGSGFHSSSNYNGINNVAKAEQTTDNELWKNVRDALKEANIIDKTDNENVKVTYKLANGGENSIEGTANLNELSNSNNKPINSDSVKSIDLSRKNPNGDRFDANDAWKKLTDKLKEKQIVKDGDTVTIHSKDEKDPKISAKVGEVYNDNKRLMLFKKDIDKITIN >CP029669|1289834:1305663|1303949_1304603_-|AWR11944.1|DBSCAN-SWA MPNIQWPEVWTAIVETLYMTVVSTIFAFILGLILGVLLFLSAKGKSIGARLFYSIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSLILGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTWTVIRKVLLPEAMPALVSGITVTAIALVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWLTNKLDKR >CP029669|1289834:1305663|1294171_1294516_-|AWR10234.1|DBSCAN-SWA MNRNRMKQIILEYIKNNDSTSFVEIENVFEEQGFKYKGNGAYTSGNHKNIIFWMGWNEEAFNIVADLKRDGLIEMQICPPMYYLIDGKGLRLPIVKNKNIKIDHWLPVTFSLVN >CP029669|1289834:1305663|1290623_1291592_-|AWR10291.1|DBSCAN-SWA 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MVSDFESNDKITEVELLMHYNPKVINSKIKAMRSQIESLYHLNMNHVITNDNDMLVSVSYPLDKLVLYIIEEKDKLEYYMKTAQDRLNLFKNIIKNYSENEQQDVMRYMLSSGKVKNEGVIERLKVDIYKVESRKRQERQNQREELHRIEFNKHLEQVKKELS >CP029669|1289834:1305663|1292695_1293754_-|AWR10710.1|capsid|DBSCAN-SWA MKEFKEQFGYQLSNFDDMDIKGYANLYQKDIGKDVSMIEQGLKQLSITETEVLLPEQINKKLLGVLNMNEVNQSSNTWVGTLTKQLVSSENNFNIQELPTARKEVFKELLVNCELPQSLREVITITDDEHVESIPSLTYIKDKLATNGIELSLNGSSKYFDRREGHIYTEVSDSVVHGSDRTLDDLLKEIFINECVAYETTLLLDKNNSSGLIDKGNQDLSLYNQGIKEVSNTSIYDGIKQAMKDIPQTFRRNVSIVMNTEHHDKLIKELAQMGLGGLAGDLSNLFNVTNVVVTDDAHDVFVGDFGHAIYAKYEPIMYNKKKQALKGIYQFALNYVFDIKIIPELLRIVNIK |
21 | Staphylococcus_phage(64.71%) | capsid,terminase,integrase | attL 1289155:1289171|attR 1303111:1303127 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1384317 : 1399048
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP029669|1384317:1399048|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP029669|1384317:1399048|1386018_1386990_-|AWR09986.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >CP029669|1384317:1399048|1395555_1396473_+|AWR11336.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >CP029669|1384317:1399048|1387697_1388669_-|AWR11449.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >CP029669|1384317:1399048|1385075_1386032_-|AWR10269.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >CP029669|1384317:1399048|1393780_1395286_+|AWR10110.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAISPLIIKAMKGIR >CP029669|1384317:1399048|1388786_1390892_-|AWR10787.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >CP029669|1384317:1399048|1397096_1397639_-|AWR11365.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLRESGFFRHLKVMPYAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >CP029669|1384317:1399048|1390854_1391253_-|AWR09340.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >CP029669|1384317:1399048|1392939_1393440_+|AWR10980.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >CP029669|1384317:1399048|1384317_1385079_-|AWR11644.1|DBSCAN-SWA MIQVENLTKTINNQMILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFENGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMNIQIEHIRNQRICLYFKD >CP029669|1384317:1399048|1397989_1399048_-|AWR09430.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEYFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >CP029669|1384317:1399048|1392053_1392920_+|AWR11601.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK |
12 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1411020 : 1418840
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP029669|1411020:1418840|DBSCAN-SWA ATTATAACATCTCCAAAATCTTGGTTTTTGCGTAAAATTCATTCACTTCATCTTTTGGCTTAGAATCAATTGTAATACCTGCTCCGACTCCATAAATCGCTTGTCCATATTTATACTCAATAGTGCGAATCGGAATATTAAAAATCATTTTATCATCTTCAGTTGGAAGTAATAGTCCAATTGCTCCGCAGTATATACCACGAGGTGAACTTTCTAATTGTTTAATATATTTCATTGTATTCAGTTTCGGTGCACCTGTAATCGAACCACAAGGAAATAACGATGTTAAAATTTGAGTTAAGTCTGTATTATTTTTTAAAGTTCCACTTACCATCGAAGTCATTTGAAATACAGTTTTATATGCCTCAATAAAAAATAGTTTATACACCTTAATTGAGCCACTCTGTGATATTCTCCCTATATCGTTTCTTAGTAAATCAACAATCATGACATTTTCTGCACGATCTTTCGAAGAAGTTTGCAATGTTTTATAATACTGTTGATCTTCAGCTTCCGTTTTACCTCTAGGCATTGTCCCTTTCATCGGTTTGCTTATGATAACGTTATCGACATTGTTAAATTGTCCTTTTTGAAAAAATAATTCTGGTGAGATAGACGCTACTTGGATTTCATCAGTTTGTAATAACGCAGTATAATTACCATTACTAAATTGAGTTAATCGTTCATATAAAGTACTAATAGGATAATAAATGTTATCCGTTAAGCGCGCCGTATAGTTCACTTGATACGTTTCGCCTTCAACAATTGCTTGTTGGACACGTTTAATATTAGTCATCATAACCTCAGAAGATTCAACAAATGAAAAATGATACTTTGATACATAAGAAGTTTGATGTTCATATGTTGAATTTATGCTTTCCGCTTTTTCAAAACTATAAGCTGCTGCATAAATATCATCTTTAGCTAATGAATGTGTACACATAGCATGATTAAAATACTTTGCCGCTTCGTAACTTAAATATAACGAGACATATCTACCTTGTCGTTGCTGCGCTTGTGCAAAGTGTATCACTTCTCCCACATCAGCCAACTTAGTAGCAACATACTTCTTTATAAATCCCTTTAATTGAATATGGTATTGCTTATATTCATTTTCAGTTAAATAGTAGCGATAATTATATTCTATTCTCACAGTAATCACCTACCTTCGATAAAAATAATTCAACTTGTCGATAACCGTATTCACTCAAAATAGATTCAGGATGATATTGCACACCAAAAACCGGAAATCTAATATGCTCAAATGCCATAATAATCGCTTCATCGTTTTTTGCTGTAATCTTTAAGCAATTTGGAAAAGTCGCTCCGTCAGCAATTAATGAATGATAACGCATTACATTGAAATTTTGAGGCAGTCCTTGAAAAATACCTTCATTGGTATGGCGTAACTGTGTAGTATGTCCGTGTACAGGATGATAGCCGTGAATGATATTTCCACCAAAATAAGACACGATACATTGAAATCCTAAACATACACCTAGTATAGGTACACGCTGATAAAATTGTTCTAACACTTCATTCAAGATAGGATAATCATCCGGATTACCCGGCCCAGGCGAAATAACAATTGCTTTTGGCTTCATATTAATGACGTCTTCTATCAGCAGATTATCAATACCAACAACTTGAACTGTTAGTTTCGTTTGAGTCTTAATATAGTCTATTAAATTATATGTAAATGAATCATTATTATCTATGACTAGAATCATTGTATACTCCGTTCTAAATGTGTTTTATTTTTATAATATGTATTGGATGTAGCTAAAACTTTAAAAGCATTGTCATTATCCTGACCTTGATTTTAACTAATATATGGTATATTCTATTCATCGTACATAAATGAATATCAGAGGTTCCTAGCTGAAACCCTCTATAAAAAACTAGACATTGAAATTTCAAACATTCGTTGGTAAACCTTTAATATATATTATAGGAGCAACCCATTTCTTTCGTCTATCTTTTATGGAGATAGGCTTTTTTTATTTTATAAATTAAAAACGGGCTTATCAATGCCATTAACCTCTTTATTAATATTATTAATGATAGGAGCAATTACAAAATGGAAAGTGTATTAAATAATGAAAAAGCCATCGTTGTCTTTAGTGGTGGTCAAGACAGTACAACATGTCTCTTTTATGCAAAAAAACATTTCAAAGAAGTTGAACTCGTAACGTTTAATTATGGCCAAAGACATGATACTGAAATTGAAGTCGCAAAACAAATTGCACAAGATCAAGGAATGAAACATCACGTTTTAGATATGTCATTATTATCACAACTTACTCCAAACGCATTAACACAACATGATATGGAAATTACTAATAATGAAGATGGTATACCTAATACATTTGTTCCAGCTAGAAATTTACTTTTCTTGTCGTTTGCAGGCGCTCTAGCTTATCAAATTGGGGCTAAGCATATTATTACAGGCGTATGTGAAACAGACTTTTCAGGCTACCCAGACTGTCGCGATAGTTTTATAAAATCAATGAACGTAACATTAAGCCTAGCTATGGACAAAGATTTTGTCATTCATACTCCTTTAATGTGGTTAAACAAAGCAGAAACGTGGAAATTAAGTGATGAACTCGAAGTTTTAGATTATATTCGTACAAAAACATTAACATGCTATAACGGTATCATTGGGGATGGCTGTGGTGAATGTCCAGCTTGTCATTTACGTCAACGTGGACTAAATCAATATCTTGAAAGTAAAGGAGCGCTTTAAAATGTTACAACAAATCTATCCTAGTACAACGCATCCATATCAATTCGAATTAAATAAAGATTTTAATTTTTCGGCTGCACATCACATTCCATGTGAAGAAGCAGGTATTTGTCAAAATGTCCATGGTCATACTTACTTTGTTAATTTAACAATTGTCGGTGATAAACTAGATGACACTGGCTTCTTAGTGAACTTTAGCCATTTGAAAAAGATGATACACGGTAAATTTGACCATCAACTGTTAAATAACTTACCTGCTTTTAAAAACAAAATCCCTTCAACTGAAATCGTAGCGGAAACAATTTATCAAATTGTTAAAGAAAATTTGGCATCGCTCGAACACCAACCAAAATGTATTCAAGTATTTGTAAGAGAAACACCAACAAGTTATGTCGTATTTAGACCAAAGGAACAGGTGTAACTAATGGCTAAAATTCCTGTACTCGAAATATTCGGTCCAACCATTCAGGGTGAAGGTCGAGTAATCGGTAGAAAAACGATGTTTGTGAGAACAGCTGGATGTGATTATCGCTGTAGCTGGTGTGATTCTGCATTTACTTGGGATGGTAGTGCTAAAGGCGATATAAAACTCATGACCGCTGAAGAAATTTATGATGAATTAAAACGAATTGGTGGCGATTTATTTAACCACGTTACAATTTCTGGTGGTAACCCAGCATTAATTAAAGGTATCCAAGAGTTAGTTGACTTATTTCAAGATAAAGGTATTTTCAGCGCACTGGAGACACAAGGCAGTAAATTCCAACCTTGGATGACACAAATTGATGATTTAACGATTAGTCCAAAACCACCAAGTTCAACTATGACACCTGATTTAAAAAAGTTAGATGAAGTGATTACACAATGCGTACCTTCATCATTAAACTTAAAAGTAGTTGTATTCGACGATAAAGATTATGATTTTGCCAAAATGATACACCACCGTTATCCAGATATTCCCTTCTATTTACAAGTTGGTAACCCATATTTATCAGACAGCGTAGATAATCATACCGAAAAGTTGTTAGAACGCTACGAGCAGTTGGTGGATTTAGTTATGCAAAGTAATGATATGAATCACGTTTATGTGTTACCACAACTTCATACATTACTTTGGAGCAATAAAAAAGGTGTATAAAGGATAACTTATTTTACTTTTTGCAAGTCATATCTAATGAATAACAATATATTAATTGATATAATAGTTGATTGAAGTATAACGAACAGGAGTCCATCATGATTGTATATATATTAATTAATATTGCTATCGTCGTACTTATAACTGGATTCAATTTATATAGGCATCAAATGCAACATTTATCATTAAGTGCAATGTTGTTATCTATTACGATAAACGCCTTTATAAATACATTCATAATTGATAAATATAACTTTATTACTCTGTGTACTATAACGATGTTTATCATTTGGACGATACTACAGTTTTACATTGATAAAAAATTAAAACCTGTATACATTACAGACCAAAAATTTATTGCTATCATATTAACGATTGTTGTCAGTTTAACGCAACGTGTTACCGACTTTTCAAGTACACAATCAATATATATGTCTATTCCATTTTTAGCCCCTGCCATTTTCATCATTGGTGGTATTATGTTGTTTATTTCAACATTTAATAGCTTAGATGAAACTGCTGAAAATAATAACAAAATAAAGAAACTAATGATTAAAGGACTTATCATTATTAACATTTCATTTATCGTTATGATGGTTTTAACACCATATTGGTACTTGTATTTAATCGTCTATCTTATTTTCTTGTTGTTTTTATTGTGGCAAAAGGTTTATAAATTTTAATACCAAAACTATTAAACACTTCTGATATTCTTAGTTCAAAATATCAGAAGTGTTTTATAGTGTTATCTAGTTCAGATAAATATTTCCTTACTTAAAAAAACGCCCTCCTCTTATTTTGACCCCTATTTATTTAAATCAGACAATTATTTTCATTTTCAAATTATTCTTTCTTCAATATTAGTTAAGCGATATTTAAACGAAGTTAAGAATTAGTTAATGGCATATTATTTGCCTTCATTTTAAACTTAACTTATCAAATTGAAGAAATGAGGAGTTAGCATGAATACAAAATATTTTTTAGCAGCTGGTGCTGTTATCACAACATTAGCTTTAGGTGCTTGTGGTAATTCTAATTCACAAGATCAAGGTAACAAAACTGAACAAAAAACAAAGTCAGAAGATAGCAATGTTAAAACTGATAAAACAAAAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP029669|1411020:1418840|1413099_1413768_+|AWR11188.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >CP029669|1411020:1418840|1417784_1418840_+|AWR10661.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCNEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENEDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >CP029669|1411020:1418840|1414192_1414906_+|AWR10248.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >CP029669|1411020:1418840|1415868_1416309_+|AWR09757.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAAGAVITTLALGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >CP029669|1411020:1418840|1413769_1414189_+|AWR10181.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >CP029669|1411020:1418840|1417098_1417785_+|AWR10642.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >CP029669|1411020:1418840|1416650_1417124_+|AWR10699.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >CP029669|1411020:1418840|1415004_1415589_+|AWR11436.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >CP029669|1411020:1418840|1411020_1412172_-|AWR10308.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHAMCTHSLAKDDIYAAAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKYHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKNNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >CP029669|1411020:1418840|1412155_1412749_-|AWR09310.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHIRFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI |
10 | Pandoravirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1830325 : 1871534
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP029669|1830325:1871534|DBSCAN-SWA ATTAAAACACTTCTTTCACAATCAATCTCTCATGCCATATCCACTCATTATGATTGTTCCAATAAATGCGACACCAACCATCTATAATTTCAAACACATATATTAATGTTCCAGGCGCGTATACAGCCTGTCCAACATCGAATCTATAGTTAGTACGATTATCACCGTATCTAGTGGCTGAAGTAGCACCTAAGCCGTCGATTTTCGCATTAAAATAAGCACCTTTTGACCATTTAAGGTTATAAGGCGCTTTACTTCCAACTGTTATTTTACTTGCAGATTTACCGACTGCTTTTTGAGCAGGTGGTTTAACTTTATTTGTGATCTTATTCATTAAGCCCTCACTTTTATACTTAGGTCTAATAAAGTGAGTACAGCCGTAATAATTATCCCAACGTAACTTTGCAGGCGTATTTGCGTTACCGTCATAGTTTTGTTCCAAAATTAAAAATTGATTTGTATTACCACCATTAAACACTAAACCAATATGACCGTATTGTTTATATATTCCTTTGGTAAATACAGCCACATCACCTATTTGTGGAACAAACGATGGTGTGTTTTCATATACTGTTGCCATGTTTTTAAAATCGTTATTGATTGCATCTTTTGCATTTCCCCACATTCTAATTTCTAACAACCAATAAATGTAATCAACTGCTAAATCTGCACATTGGTAACCATACCAACCGTCAAAATCAATATATCTACCTTGATACCAACGTAACCTTGCTCTTGCTTCACTGTATGTTTTCATTATTTCACCTCCTAGTATTTTCTTCTTGGTTCTTCATATTCTAAAGCTTGGTGGCTATCACCTATACCTTTAGTAGTCGGGTCTTGAATCACACCAGTTAATACTAAAAATCCTAATACAGCGTTTAAACCGTCTGTTAATTGCTCTGTATAAACTTGAATATCATACCCAATAGCTTTTGCGATGTTTTGAGCAAATAAAAAGATAGCTGACAATATCGCTACCCAAAATGATTTTTGTTTCATTCTAATTTTCCAATTAATCATATTCTTATCTCCTTTTACCCAAAATAAAAAGACGACTAATAAGCCGTCTATTTGATATTTATATTATGGTGTGTTAATTTATATATAGAAAAAGGGCAACATGCGCAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAACCAAACTGCAACATGGTACTAATTGTAATCATTAGGCGTCTCCTTTCTAAAGATTTCAGTAATGCCACCATAGGCACCACCTCCTTATACTCAGATAGCCACCATCTATCCAACTTGCTCACTTCTGCATATTACCATAATTACAACAATAAATAAAAAGTCAGTACCGAAGCACTGACTAAAACTTATTTACATTTACCGAACCAAAAACATGTCCAGAAACTATAACCAAAGATTAGTTTAAACATTTTATTCACCTCTCTTATATGCCCATAAGCATACGCAATAATGCTATAATTAGCGACCCAAATATTGTCCCAACTAAACCAAGCACCCACATTTTCATATCACGTATGTTCTTATCATTTTCTTTCTTATTCTTTTCATCTATTTCTCTTTCTTTTTGAATAGCATCTAAGGTTTTATCTAATTTAATGTTAACTTGCTCTTGGGTTTTTTGACCTAATTTAATTTCGTTGAGTGTGCTGAGCATTGTTTTATCATTCTCTTCTAACCTTCTGATGCGCCATTCATGTTCGTGTTTTTTGAACCACCCCAATTCAGTACACCCGCTTTCTAAAAGAATAAAGATTATGAGTATCTAACTCATAGCTTTTCATACTGTTTCAGTGTTAACTGTTACCTCTGGAGATAAATCTGATCTTTCAACTACTTCTTTAACTACTTTCACACGTTGTTTTTTGTTAGTTAATTGATATAACAAATTTAACGTCTCCGCAATTTTCTTAGCGTTTTCTTCAGATTTAAAATCTTGAGCATGGTTAACCATTTCAGAAGTTGTAAAACTTCCTGTGAAATCTTGATATACTACACGTTCTGTACCTTCTTTGTCGATTTGTACTAAAATAAACCTTTCTGTATTGTTGATAATTTCTTTTGCCATAATTAAATGACCTCCTTAAATTTTTGTATAAAAATAGTGCTAAGGATTACTCTTCCTCAGCACATTGTTGATTTTCTTTATTTTCTTGTATATACGCTTTTAACATCGCGTTTTCTTGTGTTAACCTCATAATTTCCTGTGATAAATAATGAATTGTATATTCAGGATTAGCTTGTAATCCTTGTTTGTTATCCTGCATTCTTTGACTCCTCCAATTTCTTGATTCTTAGTTGTTGTTCTTTGATAACAGGGATAAGATGAATCCATAGACGATCATACGCTATACCTTCAATTTCTCCTTTGTCATCATACGTGACAAACTCTTTTAATCCTAAATTCTCCACCTCTTCAGCAATCAAACCTACGTATCTATCAAGTTTATAGGTGTCTTCCGATAATTTTCTATCTTCTCTCAGCTCTCTAGCTAAAATTTCAGACTCAGCTTTATCAAACCACGTTCTAATAGGTAAGTTAAGAATAGCTTTTGAATGTTCCAGTTGTTCATCTCTATCGTTATATTGATTTTCGATAGATAACTTGTATTTACGCGCTGATGTCGAACGCCCAATTGTGCCAGCAGAAGTAATATGCAAATTAGCTGCGGCCGAATAAGTACGTCTATAAATTGAGTTAGAAGCTATCCTATCTCCTGCATCATCTGAACCTACAGACAGTAGGTCTGTACTCTGTATATGAATATACCTATTACCATCACGTCGTTTCAGCATATTAAATTTGCCATACCCTGCTTCGATTGTTGTATCTCCACCTGTTGCATATCGTCCATTAACAATTTGAACAAGACCTTTATTTCTTTCTTTAGAAAACCTGATACCCGCACCGTAATCATAGTTCTCATCAGAACCAAACATAATATAACCGTCACTCGAATAAGCATTATCTGCATTAGACAGCGTGAATGCAAATCGGTTTAATCCAGGCACTTTGTCTGTGTTTGGATATAAATACACCGGTGCCTGTTTGCTTTTGATATTCGATGAAGCGTAAGACTCCAGAACAACCCGATTATTATCTGACGTTAGTGCAACGACACCACCATAGGAATTGATTGTTATACCATTCATGCCACTATCACTGTAAGTTTTATCCCACCATTGAATCGTACCAGATGAACCACCGTCTTCACCTTCACCATCAATATAAGTCGAAATACCAAAATGTGACATATAAAGTGAACCGCCAGCGGTGTTATTTCTAAATCTTAGGTGACCGTCTTTCAGTCGCGTAAAAATATCGTCTGTTGAACGTTTCCCTCTCCAAGTACGTTGCACAATACCACCTAGTTCAATAGAATCATTCTGTATTTGAACATATCTGTTATTGTCACCGCCTTTAATTCCAATTCTATTAACATTGATATCAAGACCCTCTCTTGATAAATTAAGGCTGTTGACAATATCGGTTTTATCTACTTTATCTCGCATATTTTGGATAAGAAGGTTTATTTCTCTATTACCGTTAATATCAATTTTATCAGCATTTAATCTAATACCACGTGGCCCCACATTCAAAGCTTGAGCCACTCCGTTATCATCATATCTGATTGTTGTTCCATCTGTAACGTTTTGGACAATCTCGTTTAATATATTTGAAAGTGTACGATTGGTTGCATTAAACTCTTCTTTAGTAGTTCTTAATTTGATTTCCTTACCATTTTGTATAATTTGAGAACCATAGCGAGTCAGTGTTCTCCTCTGTGCATCTGTGCTTTCTTTGACCTTGTTGTCTGTATAAGCATTAGCTTTCTTTTCAGCGTTTCTAGCCTTTAGTTCTGCGTTTTGTTTTGCCTCTTCAAGTTTAGCTTGAGCATCTTGTATAGCGCGTTGCTCTTCTTCCGAAATTTTACCATCAGCATACGCTTGCGATTCCTTCTCTTTAAGATCATCTTGAGCATCAATGTATGATTTTAAAGCTTCTTGCGCTTCTTGATTTGCTTGTTCAATACTTGCTTTAATCTCAGGATTATTGGACAAATCACTTAACTGGTCATCAGTATATTGTTTTTGTTCTTCCAATCCGTTTCGATATTCGTTTAACGTAACTTTATCTTTGATTTCACCTTTTAAAGTCGTTCTCTCAGCTTCAGCAGTATCTAAACGTTCAACAATACCGTCTTTGTCTGTTTTATAGTCCGATGTTTTTACATAGTCACGTAATTGTTCTTTTGTGGATTCTCTAGCTGCTTCAATAGCTGATTTAACAACATTAGGTTCTCCGACTAACTGCAAATCTTCATTCACCGTTAAACCAAATTTTGTTGCTATTATTTCCAACGCTTCTTTATATTTTTCATCAGTGTATTGTGACTGTAATAATTTAAATCTATCTGAAATGGCGATTTTGACATCTTCTACATCTGTATAAACATCTTGTAATTTCTTTCTATACTCAAGAAATAAAGTTTTTGTATCTACCAACCGACCAATCGTTGCAGTTTCGGGTGTCATAGATTCTAAATTATTTTTAATTTGATTATAAACATCAATCACAGCGTCTAAACTTGCTTGTAAGTCCGCTTTCAAATCATTATCTACTAAGTACTCGCTATTCAGTAATTCTGTAGCTTCTGACAAAAGACTAGCGTGTTGTATAGATAAATTAATAAAAATATTGTTTAATTCACTGAATAGCGCTTTCTCTCTTGTTATACCACCTAATTTTTCAACATCATTTGGTGTTGCTTCAATCCATCGACCATTCCAATATCTACGCAAGACAGCAACATCAGGGTTACTTGTATCATACCAAAGCGTATCATTGACTGGATTTTCTGGCGG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69 | Staphylococcus_phage(88.24%) | holin,head,capsid,integrase,terminase,protease,portal,tail | attL 1855126:1855141|attR 1875585:1875600 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
2166530 : 2210045
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >CP029669|2166530:2210045|DBSCAN-SWA 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MQQLKTKRVGIYVRVSTEMQSTEGYSIDGQINQIKEYCDFHHFEVKDIYADRGISGKSMNRPELQRMLKDAKEGNIDCVMVYKTNRLARNTSDLLKIVEDLHKQNVEFFSLSERMEVNTSSGKLMLQILASFSEFERNNIVENVFMGQTRRAQEGYYQGNLPLGYDKIPDSKHELMINQHEANIVKYIFECYAKGHGYRKIANALNHKGYVTKKGKPFSISSITYILANPFYIGKIQFAKYKDWSEKRRKGLNDKPVIAEGKHSPIINQDLWDKVQMRKKQVSQKPQVHGKGTNLLTGIIHCPQCGAPMAASNTTNTLKDGTKKRIRYYSCSNFRNKGSKVCSANSVRADVIEDYVMKQILEIVKSDKVIQRVVTHVNQENQVDGAALHHDIAYKQQQYDEVQIKINNLIKTIEDNPDLTSVIRPSIQKYEKQLNDITNQINQLKNQQNEDKTLFDAKEISKLLQHIFHDIKHIEKSRLKALYLSVIDRIDIKKDGNHKKQFYVTLKLNNEIIKQLFNNKQLDEVHLSTSSLFLPQTLYLTI >CP029669|2166530:2210045|2169979_2170411_-|AWR11850.1|DBSCAN-SWA MFKNILLPYDFENDFSAIPDYLEKVTDEDSVVVIYHVVTENDLAISVKYYNKHKEDIIREKEKKLTPFLRELEKRDIQYKIDVDFGHIKDTILEKITSGDINNGEFDLVIMSNHRVDLNIKHVLGDVTHKIAKRSSVPVLIVK >CP029669|2166530:2210045|2204788_2206795_+|AWR09486.1|DBSCAN-SWA 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MHRESKYIEYKKSRKGLSNDIWSTYSAFANTEGGTIYLGIEEKKIEDKKVFVSVGVEDPEKMIEDFWNALYGRSKVSQNILSNKDVKIVNIENKACIEIHVPEAPYSKKPIYVDNKKDLVYKRVDDADRIATEEEYKFMIVNSQDDIDTELLDNYDMSDLNHESIENYRKLLLKNTNDERYANMSQLDLMIDLGAYRKDRSSKDKQYKMTTACLLFFGKYNAISDRFPGFQLDYFKKTNYLDTDWKDRISSGDLGNEDLNVYSFFEKVLIKLTDNIEESFSLNDGLTRQNYARDLKVAIREALVNTLMHAYYDTKQSIKIVNCEDFIEFYNPGNMRINKEDFIHGGHSKDRNSILSTLFRRVGYSEKAGSGGPRIFDVVNRHKLKTPEIELTDMDTNVVLWKQDLMKEFEKYPELDKKVIKYIIDYGSISKGEALKMENMTEYQFRNILKKLKDDNLIKKEGEGPATKYVLIESKEADILRTKKVIKSLESFFRNK >CP029669|2166530:2210045|2201314_2201821_+|AWR10833.1|DBSCAN-SWA MNTIKSTIHTEAIFSDDEQHRYLLKKTWDEKKAACTVITMYPHLDGVLSLDLTTVLILNQLANSERYGAVYLVNLFSNIRTPENLKHIKNPYDEHTDIHLMKAISESDTVILAYGAYAKRPVVIDRVEQVMEMLKPHKKKVKKLINPVTNEIMHPLNPKARQKWILKS >CP029669|2166530:2210045|2170912_2171359_+|AWR10439.1|DBSCAN-SWA MKKEKRLNLILTVIQQNQFNKKQQIVDYMARHFGVYYSLTTISRDLQELEIYKIPVENKKYIYKKINQTNQLSAKKQLEIFSDEIIEFITLNNYVLIKTSPGFAQSISYYIDQLQMKEILGIIGGNDTLMILTSSNEIAEFVCYQLFP >CP029669|2166530:2210045|2169461_2169707_-|AWR11349.1|transposase|DBSCAN-SWA MNYFRYKQFNKDVITVAVGYYLRYALSYRDISEILRERGVNVHHSTVYRWVQEYAPILYQIWKKKHKKLITNGVLMRRTSK >CP029669|2166530:2210045|2172948_2174370_+|AWR10396.1|DBSCAN-SWA MDENKLGKTSLIGLVIGSMIGGGAFNIISDMGGQAGGLAIIIGWIITAIGMISLAFVFQNLTNERPDLDGGIYSYAQTGFGDFIGFSSAWGYWFAAFLGNVAYATLLMSAVGNFFPIFKGGNTLPSIIIASILLWGVHFLILRGVETAAFINSIVTVAKLIPIFLVIICMIVVFNFSTFKSGFYGMTSGSVGVFSWGDTMAQVKSTMLVTVWVFTGIEGAVVFSGRAKSKKDVGTATVIGLISVLVIYFLMTVLAQGVIQQNQISKLANPSMAQVLEHIVGHWGSVLVNIGLIISVLGAWLGWTLLAGELPFIVAKDGLFPKWFAKENKNKAPVNALIITNILVQLFLISMLFTDSAYQFAFSLASSAILIPYTLSAFYQVKYTIQNKSKANLKQWIIGIIASIYTIWLVYAAGLDYLLLTMLLYIPGLLVYSYVQRDNNKHLTKLDYTLFIFIIVLAIIGIVRLITGNISVF >CP029669|2166530:2210045|2203702_2204689_-|AWR10150.1|DBSCAN-SWA MLSSFLMLSIISSLLTICVIFLVRMLYIKYTQNIMSHKIWLLVLVSTLIPLIPFYKISNFTFSKDMMNRNVSDTTSSVSHMLDGQQSSVTKDLAINVNQFETSNITYMILLIWVFGSLLCLFYMIKAFRQIDVIKSSSLESSYLNERLKVCQSKMQFYKKHITISYSSNIDNPMVFGLVKSQIVLPTVVVETMNDKEIEYIILHELSHVKSHDLIFNQLYVVFKMIFWFNPALYISKTMMDNDCEKVCDRNVLKILNRHEHIRYGESILKCSILKSQHINNVAAQYLLGFNSNIKERVKYIALYDSMPKPNRNKRIVAYIVCSISSFT >CP029669|2166530:2210045|2189740_2190745_+|AWR10777.1|DBSCAN-SWA MIIDPICDLSSYIRVADEESLTITHAAETHIHANFVSGIRDVAIKLNASIYVSGESDDMLGYKNMPNHTHFVQHNDDIYVGNIKLKVLHTPGHTPESISFLLTDEGAGAQVPMGLFSGDFIFVGDIGRPDLLEKAVKVEGLSEIGAKQMFKSIESIKDLPDYIQIWPGHGAGSPCGKSLGAIPTSTLGYEKQTNWAFSENNEATFIDKLISDQPAPPHHFAQMKKINQFGMNLYQPYTVYPATSTNRLTFDLRSKEAYHGGHIEGTINIPYDKNFINQIGWYLNYNQEINLIGDYHLVSKATHNILYNLLDMIMCLDISYHKLKFKHNLFIVKT >CP029669|2166530:2210045|2203470_2203731_-|AWR11302.1|DBSCAN-SWA MYVVYRASHETAKEALGDKELRAIAHELTKTVKDNMSVDWSKRDSAKAKMRVQVRRLLKKYGYPPDLQKMAVEQVVEQAELMASQQ >CP029669|2166530:2210045|2189116_2189488_-|AWR11624.1|DBSCAN-SWA MKTNILNLDNELENTEYVEGKPYVQYGIKYERNQALRNEAIKIHGTTCKVCGFDFKAKYGDLGEGFIEIHHLKPMFSIKREIKVNPQKDLVPLCSNCHKMIHRNTKKPLTIKELTKIVNYNSK >CP029669|2166530:2210045|2169033_2169399_-|AWR11424.1|DBSCAN-SWA MRKQRDNHSAYAFIKRLIKQFGKPQKVITDQAPSTKVAMAKVIKAFKLKPDCYCTSKYLNNLIEQDHCHIKIRKTRYQNINTAKNTLKGIECIYALYKKNRRSLQIYGFSPCHEISIMLAS |
49 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase,integrase | attL 2168974:2169033|attR 2210046:2210105 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029669.1|AWR11644.1|1384317_1385079_-|ABC-transporter-family-protein |
1384317_1385079_-
Protein sequences of CP029669.1|AWR11644.1|1384317_1385079_-|ABC-transporter-family-protein>CP029669.1|AWR11644.1|1384317_1385079_-|ABC-transporter-family-protein MIQVENLTKTINNQMILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFENGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMNIQIEHIRNQRICLYFKD |
253 aa aa | NA | NA | NA | 1384317-1399048 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.4|1244360|26|CP029669|CRT matches to CP029669 position: 1387507-1387532, mismatch: 2 ccgccagcctctgtgttggggccccg CRISPR spacer ccgcctgcttctgtgttggggccccg Protospacer ***** **.***************** 2. spacer 4.1|1350443|26|CP029669|CRISPRCasFinder matches to CP029669 position: 1387532-1387507, mismatch: 1 cggggccccaacacagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacacagaagcaggcgg Protospacer ******************** ***** 3. spacer 4.1|1350443|26|CP029669|CRISPRCasFinder matches to CP029669 position: 1387476-1387451, mismatch: 2 cggggccccaacacagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacatagaagcaggcgg Protospacer *************.****** ***** |