Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029654 | Staphylococcus aureus strain AR_0469 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP029655 | Staphylococcus aureus strain AR_0469 chromosome, complete genome | 8 crisprs | csa3,WYL,RT,DEDDh,cas3,DinG | 8 | 2 | 8 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP029655_1 | 141627-141729 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029655_1
|
1 spacers
spacers of CP029655_1
>1.1|141651|55|CP029655|CRISPRCasFinder TAGCTTTGATTTAAAAACTGATTTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029655_1
The CRISPR arrays of CP029655_1 >merge|CP029655|1|141627-141729|CRISPRCasFinder CAAATTTAATACTCAATTCATATATAGCTTTGATTTAAAAACTGATTTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTTCAAATTTAATACTCAATTCATAAA >CP029655|1|1|141627-141729|CRISPRCasFinder CAAATTTAATACTCAATTCATATA TAGCTTTGATTTAAAAACTGATTTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTT CAAATTTAATACTCAATTCATAAA
>CP029655.1|AWQ97572.1|140653_141610_+|hypothetical-protein MLTKEFAQRVELSEKQVRKIVQHLEERGYQLSKTEYRGREATDFKEEDIELFKDIADKVKQTNSYDLAFDELEKEKDFLQVIVKNDDKNLPTNQNVAQLVEDLRLEIQKMREERHLLGQMMNQVHQQQQELKELQNQLTSKIDSNSESLKAIQTSQEAIQEAQASQAKVLAESTNKVEKNAVTEDKADSKDSKVAGVNTSTDAKTDTKAENAGDGTATKVDKEDQISATEAIEKASVEQSKNENAAETSNKEATVDADAQHDAEQQVAEAHAEASKQATSNDSLEAKAENDSTASQSEMSEPKPQEEKKGFFARLFNL >CP029655.1|AWQ97225.1|139873_140536_+|hypothetical-protein MEFKTIQSVKDPHYNEALKLYDTKLNLSLTEDKRIIKRSLENNKTENDYVFIVGLENDVVVSLATAHYEATTNSAFLIYLFAKDLPNHDELMTQTLHQIEHELNLLSNLVHSRSINFLMMEVPKEPADLTQDNGLIIEHRRQFLYEHQFERQTEIDYIHPTNDGHTKKVDLFLKKNIKLTKDIYGTSVKSNYILKYVFANGIAREIIYALLEEMDLRKPF >CP029655.1|AWQ96441.1|139323_139731_+|hypothetical-protein MADITVVNDTGELYNVINQKKSEGYLESELTIISKSKLHLNDLHDSEISLISTSGTFSDRMTKLLTGEDGEHAVLSRYNLAPDELEKYKQLILDDKMLVVAVRDKSSHKEVQEHNSAYEEIDITHFAEASKGPKA >CP029655.1|AWQ98321.1|138232_138811_-|xanthine-phosphoribosyltransferase MELLGQKVKEDGVVIDEKILKVDGFLNHQIDAKLMNEVGRTFYEQFKDKGITKILTIEASGIAPAIMAALHFDVPCLFAKKAKPSTLTDGYYETSIHSFTKNKTSTVIVSKEFLSEEDTVLIIDDFLANGDASLGLYDIAQQANAKTAGIGIVVEKSFQNGHQRLEEAGLTVSSLCKVASLEGNKVTLVVEE >CP029655.1|AWQ98311.1|136964_138233_-|xanthine-permease-family-protein MKNLILSVQHLLAMYAGAILVPIIVGTSLKFTPEQIAYLVTVDIFMCGVATFLQANKVTGTGLPIVLGCTFTAVAPMILIGQTKGIDVLYGSLFLSGILVIIIAPFFSHLVKFFPPVVTGSVVTIIGINLMPVAMNYLAGGQGAKDYGDVKNILLGLMTLIIILVLQRFTTGFIKSIAILIGLVLGTIGAGLLGMVDINQVNHAGWLGIPVPFRFSGFSFDVTSTLVFFIVAIVSLIESTGVYHALSEITGKKLERKDFRKGYTAEGLAIVLGSIFNSFPYTAYSQNVGLVSLSGAKKNNVIYGMVVLLLICGCIPKLGALANIIPLPVLGGAMIAMFGMVMAYGVSILGHIDFKNQNNLLIIAVSVGLGTGISAVPQAFKGLGEQFAWLTQNGIVLGAISAIILNFFFNGIKYKQTEENVK >CP029655.1|AWQ97867.1|135460_136927_-|inosine-5'-monophosphate-dehydrogenase MWESKFAKESLTFDDVLLIPAQSDILPKDVDLSVQLSDKVKLNIPVISAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVIHKNMGVEEQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEESVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKIVDVMTQENLITAPVNTTLEEAEKILQKHKIEKLPLVKDGRLEGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEHGRLLVAAAIGISKDTDIRAQKLVEAGVDVLVIDTAHGHSKGVIDQVKHIKKTYPEITLVAGNVATAEATKDLFEAGADIVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATEARKHGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEIFQGRQYKVYRGMGSLGAMEKGSNDRYFQEDKAPKKFVPEGIEGRTAYKGALQDTIYQLMGGVRAGMGYTGSHDLRELREEAQFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSF >CP029655.1|AWQ95964.1|133894_135436_-|GMP-synthase MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISIEEIKKMNPKGIILSGGPNSVYEEGSFTIDPEIYNLGIPVLGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIINAKSDELFAGLPAEQTVWMSHSDKVIEIPEGFEVIADSPSTDYAAIEDKKRRIYGVQFHPEVRHTEYGNDLLNNFVRRVCDCKGQWTMENFIEIEIEKIRQRVGDRRVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVNAKDRFMNKLKGVSDPEQKRKIIGNEFVYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMEFELIEPINTLFKDEVRKLGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLEIVRESDAILRQVIREEGLEREIWQYFTVLPNIQSVGVMGDYRTYDHTVGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPSTIEWE >CP029655.1|AWQ97775.1|133245_133782_+|hypothetical-protein MHNKNEFNKKLKDFIGSDKRMALVKGYINEYKLTTVLRALNNSDYTKGTIHTRSIGNLKQIVDNRIIPKNITQNKIFKLSNLTLEVNLYERNTIYHGDFAIYYPVESALIIETDTPRLINHINNNPVQKIFIITTNDWSFNTLELEKIVDETIIYDLKQEDPKQYEILYKNKHGKLPY >CP029655.1|AWQ95948.1|132149_132854_+|pemK-like-family-protein MSKNINQANSKLNTSNKKLKQAYSKSDSKNMKVIYMPHWLEFYSIAIHSDVTSNKKRYYKSFSRGTVVYVKLGSNIGSEFSGNHFCVILDNKDNKGKETVTIVPLSSKGNKNYLKLNESVLNLTATDLKKQIIDISSKVQALTQKYRDIDIKLSTEDKKLLSNLNQKANELYRVIGVYSKHKGKDTYVNISAITTISKRRISKINDSDPTGTIIISEDDMNEIEKQLKIKFFSN >CP029655.1|AWQ97663.1|131478_131751_+|transposase-family-protein MTKERRTFSSEFKLQMVRLYKNGKLKNEIIRKYDLKPSIISNSIKQHQNTGPFNHQDNLKSDEKELIKLRKEVQHLKMEHDVLKQILKLI >CP029655.1|AWQ97071.1|142587_143976_+|L-cystine-uptake-protein-TcyP MNAFLTLINIIVLVIFIVILHMMARKHISFAKRVFTALGIGIVFGVLLHLVYGTHSNVITSTSDWFNIVGQGYVALLQMIVMPLIFISIVAAFTKIQIGEKFAKIGSLIFIFLIGTVTIAAIVGVVYALVFGLDASTINLGNAEQARGSEIAKQAKDLTAHTLPQQILELLPKNPFLDFTGQRATSTIAVVIFASFIGFAYLRVARKQPDHGELLKRAIDAIYSLVMAIVTFVLRLTPYGVLAIMANTLSTSDFGAIWTLGKFLIASYAALITMYIIHLIILSLLGISPIRYVKKTLEVLIFAFTSRSSAGALPLNVQTQTRRLGVPEGIANFAATFGLSIGQNGCAGIYPAMLAIMVAPVANVEIDLQFIVTLIAVVIISSFGVAGVGGGATFASILVLSTLNLPVALAGVLISVEPLIDMGRTALNVNDSMLAGTGTAKLTKHWDKDTFESNDNAALTSH >CP029655.1|AWQ97562.1|144055_144811_-|NADPH-dependent-oxidoreductase MSDYVYNLVKKHHSVRKFKNKPLSEDVVKKLVEAGQSASTSSFLQAYSIIGIDDEKIKENLREVSGQPYVVENGYLFVFVIDYYRHHLVDQHAETDMENAYGSTEGLLVGAIDAALVAENIAVTAEDMGYGIVFLGSLRNDVERVREILDLPDYVFPVFGMAVGEPADDENGAAKPRLPFDHVFHHNKYHADKETQYAQMADYDQTISEYYDQRTNGNRKETWSQQIEMFLGNKARLDMLEQLQKSGLIQR >CP029655.1|AWQ97581.1|145302_145872_+|peroxiredoxin MSLINKEILPFTAQAFDPKKDQFKEVTQEDLKGSWSVVCFYPADFSFVCPTELEDLQNQYEELQKLGVNVFSVSTDTHFVHKAWHDHSDAISKITYTMIGDPSQTITRNFDVLDEATGLAQRGTFIIDPDGVVQASEINADGIGRDASTLAHKIKAAQYVRKNPGEVCPAKWEEGAKTLQPGLDLVGKI >CP029655.1|AWQ96923.1|145887_147411_+|alkyl-hydroperoxide-reductase-subunit-F MLNADLKQQLKQLLELMEGNVEFVASLGSDEKSKELKELLTEISDMSPRLSLSEKSLKRTPSFSVNRPGEETGVTFAGIPLGHEFNSLVLAILQVSGRAPKEKQSIIDQIKNLEGSFHFETFISLTCQKCPDVVQALNLMSVINPNITHSMIDGAVFREESENIMAVPAVFLNGEEFGNGRMTIQDILSKLGSTADASEFENKEPYDVLIVGGGPASGSAAIYTARKGLRTGIVADRIGGQVNDTAGIENFITVKETTGSEFSSNLAAHIDQYDIDAMTGIRATDIEKTDEAIKVTLENGAVLESKTVIIATGAGWRKLNIPGEEQLINKGVAFCPHCDGPLFENKDVAVIGGGNSGVEAAIDLAGIVNHVTLFEFASELKADNVLQDRLRSLSNVDIKTNAKTTEVVGEDHVTGIRYEDMSTGEEHLLNLDGIFVQIGLLPNTSWLKDAVELNERGEIVIDRNNNTNVPGIFAAGDVTDQKNKQIIISMGAGANAALNAFDYIIRN >CP029655.1|AWQ97526.1|147590_147782_+|hypothetical-protein MNEIIMLLRTIPTSKLIQPIMQLFIDNAILNIVQNDALLIEKATHARNHLRLWSLQGHRDIPN >CP029655.1|AWQ95935.1|147854_148481_+|hypothetical-protein MKKRLLLSTFLASALILTGCASDQSDNEDHHTSTGIHAPKSAKKLETKDIFNSDKKNSDISDAEMKQAIEKYLSVNSDILDNKYIMQHKLDKQIDSQTKVTEKQAETLSHLSNLAVKNDLHFKKFVTENNIPKEYKKPVELMMNYFKALNSTIANVDEDIEKLSYQPQNKINVVDVPTKYAGDVNKKQQDKIKDFLKSKGIKSDVIDK >CP029655.1|AWQ95838.1|148750_149134_+|putative-membrane-protein MKVRITFIILAILSTIVCLFLAAMHPTGPNTVTFEQPYLFTLNIILMVLVALPSLVLAIYDYMSFRISSAILQFLGAISWFFLSLILSLTQFTPFTLASFITSIILFISAIITLAIGGKSVDKNDSH >CP029655.1|AWQ96691.1|149199_149781_-|histidine-phosphatase-super-family-protein MTIYLVRHGESKSNYDNKHFRSYFCGQLDVPLTDTGTKSADDLCDYFKEKQIKHVYVSDLLRTQQTFEHIFPYDIASTTTPLLRERSLGVFEGEYKDEISANPKYEKYFNDPNFKDFRHSFSQKAPEGESYEDVYQRVEHFMNHVVNEDTQKDDIVIVAHQVVIRCLMVYFNKVSREEAVDLKVENCKPYIIE >CP029655.1|AWQ96595.1|150206_150458_-|transglycosylase-associated-family-protein MFGFIGMLIVGGLIGWAAGAIMGKDIPGGILGNIIAGIIGSWVGGKLFGQWGPELGSIYILPALIGSIILIAIVTLILRAMRK >CP029655.1|AWQ96371.1|150757_151021_+|hypothetical-protein MNMHILYNLRTKHNLEIDELAQQLNEKYGTKYEAHQIWEWENHHHEPKFKDAMHLADFFDAPYEMFLESKVKEYQKHLEEVDIRMDK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP029655_3 | 917275-917353 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029655_3
|
1 spacers
spacers of CP029655_3
>3.1|917298|33|CP029655|CRISPRCasFinder CAGTAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029655_3
The CRISPR arrays of CP029655_3 >merge|CP029655|3|917275-917353|CRISPRCasFinder TGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGTAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGAGCCCCAACA >CP029655|3|2|917275-917353|CRISPRCasFinder TGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACA CAGTAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATG TGCAAGTTGGCGGAGCCCCAACA
>CP029655.1|AWQ97853.1|916328_916715_+|gtrA-like-family-protein MKLTQTHAEILKFIIVGGINTLNYYVVYLLLLKLLHIEYMISHITGFLVAFVISYYLNCYFVYRVKPTWRKFISFPITQIVNVSLQTVLLYVFVSWLNLPAEIAPFAGLVITIPITFVLSKWILKDSN >CP029655.1|AWQ96473.1|914918_916061_-|glycerate-kinase-family-protein MQLQKIVIAPDSFKESMTAQQVGNIIKQAFTNVYGNTLHYDIIPMADGGEGTTDALMHATGATKYTVIVNDPLMRPIEACYARADEQQIAIIEMAAASGLDLLEKEERNPLYTSSYGTGELIKDALNHGAKTIILGIGGSATNDGGTGMLSALGVKFTDVNGDLLQMNGANLAHIAQIDITNLDSRLKEVTFKVACDVSNPLLGENGATYIYGPQKGADAKMIPKLDFAMSHYHDKIKMCTGKSVNQIPGSGAAGGMGAALLAFCETTLTKGIDVVFDITDFHQRIKDADLVITGEGRMDYQTIFGKTPVGVALAAKQYHIPVIAICGSLGENYQHVYDFGIDSAYSIISSPSTLEDVLQNSEQNLLNTATDIARILKLQ >CP029655.1|AWQ96524.1|914199_914859_-|putative-membrane-protein MKRTDKYRDSYQYDNQNQNHRRQSEDASYRQQYAKGDPEEHPERYYNGRDYRREQILEEENEKSRRSKKWLYIIIAILLIIVAIFVTRALLNNDSDKVSNDPKVSQNYKKQVENQDGQINQQVDNAKENIKNNQKTDDIIKNLQNQIDNLKQQEQNKADSKLTQFYQDQINKLTEANNALKNNASQGKIESMLNDINTKFDSIKSKLESLFKDDNGGAN >CP029655.1|AWQ95903.1|912806_914018_-|drug-resistance-transporter,-Bcr/CflA-subfamily-protein MQSTKTKTKHFSFLLLITLGVMTAFGPLTIDMYVPSLPKVQGDFGSTTSEIQLTLSFTMIGLALGQFIFGPLSDAFGRKRIAVSILIIFILVSGLSMFVDQLPLFLTLRFIQGLTGGGVIVIAKASAGDKFSGNALAKFLASLMVVNGIITILAPLAGGLALSVATWRSIFTILTIVALIILIGVASQLPKTSKDELKQVNFSSVIKDFGSLLKKPAFIIPMLLQGLTYVMLFSYSSASPFITQKLYNMTPQQFSIMFAVNGVGLIIVSQVVALLVEKLHRHILLIILTIIQVVGVALIILTLTFHLPLWVLLIAFFLNVCPVTSIGPLGFTMAMEERTGGSGNASSLLGLFQFILGGAVAPLVGLKGEFNTSPYMIIIFITAILLVSLQIIYFKMIKKQHVA >CP029655.1|AWQ98047.1|912210_912684_+|gyrI-like-small-molecule-binding-domain-protein MEYQLQQLASLTLVGIKETYENGRQAQQHIAGFWQRCYQEGVIADLQLKNNGDLAGILGLCIPELDGKMSYMIAVTGDNSADIAKYDVITLASSKYMVFEAQGAVPKAVQQKMEEVHHYIHQYQANTVKSAPFFELYQDGDTTSEKYITEIWMPVKG >CP029655.1|AWQ97064.1|911441_912098_-|peptidase-C39-family-protein MNRKILPVKPISQLFPIPMVMGCEGVSAAMMLQYNNQHIPATEIMRHWPTHPNNPHKGYVGHHLFIKLGNYHQTIFPEAYVPFLQKYNPNIVDGTGKSLEDLKGIIDQGQPVLIYHTNLGSKPLLRVFRFDNKPAKQVSNIHVTLLIGYDDYYYYYIDPLWSHIRRGLVLPAIIPNRKQIIKIRKEKMEYSFNSPGRKCIYVQPHSYTIENQQQNKHT >CP029655.1|AWQ97617.1|910572_911379_+|phosphoesterase-family-protein MKIGTIADLHIDRHNKKTSEDYLEALVEIVKYKKLDILLIAGDISNHYQLTHQFITQLTKQLDIPVKFVPGNHDLWEVESMTTQDIWNNYKSMSQCLVGKPFIVNEEWAIIGHTGWYDYSFAAQRFSLEHLQKGKHYGATWQDKERISWGISDQNLSKIAAEQVKKDILEVGNRRVILVTHVVTHPDFIVPMPHRIFDFYNAFIGTSDFNPLYAMFDIPYSIMGHVHFRKSVMDDGRCYLCPCLGYPRQWRSEDIYQEINETIQIIEI >CP029655.1|AWQ96263.1|908877_910287_-|amino-acid-permease-family-protein MARKLHRELNNRHIQLIAIGGAIGTGLFLGSGQTISLTGPSLLFTYMIIGVVLFAFMRALGELLLSNTRFNSFVDIANEYLGPFGGFVIGWTYWLCWIVSSMSDLTAMGQYFAFWYPQVPNWITVLFIVLILISFNLLGARLFGELEFWFSIIKVVTIIAMVIVGLVLIFFSFKTHYGHASFTNLISHGGMFPGGTFGFLMSFQIAVYSFIGIELIGVTAGETKDPEKTLPKAINNVPIRILLFYIGGLLVIMSVIPWNDIDPNSSPFVKLFTLIGVPFAAGVVNFVVLTAAASATNSGIYSNSRILFGLSQQGLGPKVLNKTNSHGVPYLSILVSSIALLIAALLNYIFPNAIQLFIYVTTLSTVLFLVVWAMIIVAYLMYLKKHPEAHKNSKFKLIGGKPIAYIILAFFFFVFILLFFSDETRAAIYISPFWFIFLFFFYKKYKTNAEKLAYEQRQNDSGHFRYDNQ >CP029655.1|AWQ97053.1|906661_908740_-|sodium/hydrogen-exchanger-family-protein MALLEAFLIFIFAVIISSVINNRFPQIPTAFIQIALGVVIFIIPIQVDFQFNSEVFMFAVIAPLLFVEGTHVSRTKLLEYRKPILLMSMALVFATVVGVGYFIHWIWPALPMPAAFAIAAILCPTDAVAVSAITRGKLLPKGSMTILEGESLLNDAAGIISFKIAVTALVTGTFSLFQAVEQFIISTILGVLIGAIIGFVVVRIRIDLTANKGLKDNNTLTFIQLLTPFVVYFLAEEVHASGIIAVVIAGLIHGLERDRLIRAQTELQMNYHQIWNTFSYALNGFVFVVLGFMIPTVVIDIFQTEPDNFSFLIVITILIAIAIYACRFVWVYFWYKDFYFPKNIQSYLDEEHDSHETPPSRVRYAFIMTMCGIHGTISLSMALTLPFIITKGQAFEYRNDLLFIASFMVLISLILAQIVLPLITPSAEDTTFKGMTYQSAKIFIVQKVIQHFKNESKKDKNDTNYRPVLNQYYGELLFLLNSEPNNQNTKELKRLEDIAKVIETSTLERLIDKGKATYQDINNYRNIVELTETHRTASFVEKFANFFKMLWLRLKAMKHYKALNKESKKQEFENSFKDVQKIMRIVNHNIILRLKEEQNSTNVLEVSLVINHYYDMSRSLKWRAQRRKERQENSNQIIPQAMFHNHKLEALYLQRHLLDELIRKNKINNIVAAQIRENINYNEIVLSLQSKH >CP029655.1|AWQ95981.1|904691_906521_+|amino-acid-permease-family-protein MFNQFKRLIIGQPKKNRELKDEKISKFKGLAILSSDALSSVAYGPEQILITLSVVGAVATWYTLPIAGAVLILLAALIMSYRQIIYAYPKGGGAYMVSKTNLGEKWGLLAGGSLLVDYILTVAVSISSGADAFVAAFPSLYGHKVLIACLLVLFILILNLRGLTESATVLSYPVYLFIIGLVILIFIGTFRVATGDIQPHMHASVGTAVPGVTLFLLLKAFSSGASSLTGVEAISNAVTNFREPSANNAVKTLIAMGSILAFLLVGIVGLAYVYGIMPQTETTVLSQLAMQIFGDNAAFYFVQATTVMILVLAANTGFTAFPMLAASMSKDKYMPRMFTVRGDRLGYSNSIIILGVLAIILIIVFDGMTEDLIPLYAVGVFIPFTLAQFGMVIKWIHERPKNWLSKLSVNLLGGIVTFIVFMILLITKFSQVWPILIFLPFVVIFFLKINKHYRDIAEQLRSDIDVLNVDVVDRNLAIVPITSITTAVDKSIYYAQMLANNDVIAVHVSFGDEDEKAFQEKWKRHFPDVRLVILHSEYRSIIRPISRFIDKINRKANDQNYMITVVIPEFITKKRWHNLLHNQTSLRMKLYLIYQKNVNVCTIPFKLKK >CP029655.1|AWQ97151.1|917658_919422_+|recF/RecN/SMC-N-terminal-domain-protein MNNQTNWIKILSGFASDSKWKIMLSILLSIISVFSGLVPYWAVFKIILMMINNAYTINSIMVYIFIALITYISQVCCFGASTMLSHITAYEILSEIRKKLAQKLMRLPLGVVESKKIGELKNIFVDKVETIELPLAHMIPEVIGNLLLSAAIFLYIMLIDWRMASALLVTIPISIFAFKKVMSGFNETYAEQMKSNNYMNSAIVEFIEGIEVIKTFNQSQSSYKKYKDAVDNYKIHTLNWFKNTWGYMNLGASVLPSTFLGILPVGMYLISINQLNYAEFFLCIVLSLGVVAPIKNFTNYVNHLKSIQYALTEVNQILSLEELVLSTKFKKPQHYEIAFNNVGFSYNKDKDDLVFKHLSFTVPENNFTAIVGASGSGKSTIAKLISRYWDVTSGEITIGGINIKDIESKQLNDLVGFVGQDNFLLNLTFKENIKLGNPEATDEAVEKAAKLAQCHEFIEKLPDGYDTNVGTVGDKLSGGEKQRVTIARMILKDAPIIVLDEATAYVDPDNEQKIQEALNVLTQDKTLIVIAHRLSTIQHADQIIVLGKQQILEKGSHHLLLKLNGNYKKMWDTHMHTKDWGINTGHN >CP029655.1|AWQ97854.1|919446_921180_+|ABC-transporter-transmembrane-region-family-protein MFQITFKILNWIRPYKARMILGFSMSFLNAIFIALPIFLAAKIFNNVLSHKPIYMKDILNVVIIMVLLVIGRFITAYFKSKSHESIAYEMSAKERLDIGDKLKNVRLGYFNSHHSNELTTIVTTDLTFLENFAMKMVDIVVNGYILITVLILSLLVVSWQVSLLACIGVLLSFFAIQLLERKSRQNAPAYHNVQNQLVEKVLEVIRGIQVIKSFAKENTSLKSFNQAVNESKRINTKIEMQYIPFNLLHLLSLKVVSIMIVLVACLLYMNHSIDLPTLIMISIFSFVIFDSVENINSAAHVLEMIDMTIDDIEKIKNAPELDENGKNLTIKNENIAFQNVNFSYDDKQVIKNVNFEIPTQTSTAIIGPSGSGKSTLCHLLLRFYDIDDGNIRIDGVDIKDMTLSTLMSKISAVFQKVYLFNDTIENNILFGNPGATKEEIIRAAKQACCHDFIMSLPEGYQTMLNEKGSNLSGGEKQRISIARAILKDAPIIILDEATASIDPENEQLIQTAINELSKGKTVITIAHKLETIKNADQIIVLNEGEIIQKGSHDELIRKPGMYQDFIRIKSKSAGWKL >CP029655.1|AWQ98270.1|921632_922319_+|dethiobiotin-synthase MRIFITSTNTDVGKTYVTKHLYHALKTRGHRVCVFKPFQTEERQDGTFPDLEVFKNECDLSYDITSLYTFKQPVSPHLAFKMTDQIFLNKQRVLDKVKVLDKEFDFILIEGAGGIAVPIYEGTDDFYMTKDLINDCADCVISVLPSKLGAISDAVVHQDYVNKNVSASNFLIMNRYTDSYIEKDNQITIGKLTNKTVYTFEEHATYENFSEAFLKQLIGVKNELHTTT >CP029655.1|AWQ97738.1|922296_923655_+|adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate-transaminase MNYTQQLKQKDSEYVWHPFTQMGVYSKEEAIIIEKGKGSYLYDTNGNKYLDGYASLWVNVHGHNNKYLNKVIKKQLNKIAHSTLLGSSNIPSIELAEKLIEITPSNLRKVFYSDTGSASVEIAIKMAYQYWKNIDREKYAKKNKFITLNHGYHGDTIGAVSVGGIKTFHKIFKDLIFENIQVESPSFYRSNYDTENEIMTAILTNIEQILIERNDEIAGFILEPLIQGATGLFVHPKGFLKEVEKLCKKYDVLLICDEVAVGFGRTGKMFACNHEDVQPDIMCLGKAITGGYLPLAATLTSQKIYNTFLSDSHGVNTFFHGHTYTGNQIVCTVALENIRLYEKRKLLSHIETTSSTLEKQLHALKRHRNVGDVRGRGLMFGVELVTDKDSKTPLEIEKVERIVRKCKENGLMIRNLENVITFVPVLSMSNKEVKTMVRIFKKAVHNILDRKC >CP029655.1|AWQ96250.1|923656_924664_+|biotin-synthase MNLAKRILQGEQLTKETVLKIYEDTNIDTLDLLNEAYILRKHYFGKKVKLNMILNAKSGICPENCGYCGQSRDIKQKQRYALIPEEQIIDGAKVAHDNHIGTYCIVMSGRGPSDKEVDHISNTVRTIKSQHPQLKICACLGLTNDEQAKKLKSAGVDRYNHNINTSENYHDNVVTTHSYKDRTDTIELMKANNISPCSGVICGMGESNQDIVDMAFALKEMDADSIPINFLHPIKGTKFGSMDDLTPMKCLRIVALFRLINPTKEIRIAGGREVNLRSLQPLALKAANSIFVGDYLITGGQPNQLDYDMINDLGFEIDYDTCENKENKNDVSRAN >CP029655.1|AWQ95956.1|924644_925757_+|aminotransferase-class-V-family-protein MFQEQIDLLQQKGLYRSLKSVGYIDRQYIEVENKRCTNYTSNDYLGLGQIAFDKDDFERFMRKYSYHLSSSRLISGSSTAYEEIETMLAGWLGYSACTILNSGYDANLALFNIFKNTNCVVFSDQENHASIIDGIKLSGLEKVIYKHLDIADLEKRLEKYPNQNIPKIIISDSVFSTNGDVVDIGQLVSLKHKYNATLILDVSHSFGIENYSNYQGVDILTSSLSKACGAYGGVILSSNDVKDMLINHGRPLIYSSSLPIYNLYFIKRNIEKLINADDRRTKLNSLSKYFNQKLKALNVNYNSSNSPIKFIEFDDIEAAENIHQTLLKHHVFTSYLRYPTVTKPMLRISLSYFHTEQDIDRLFEILHQED >CP029655.1|AWQ97466.1|925767_926460_+|6-carboxyhexanoate--CoA-ligase-family-protein MYSIKMRSSNQDVHISGAETICEFDKIEQTVQRFYNKGFFHENGQPDFLNIKIQKIMEPIQQIKALQIIEDDKANLQHLTQECGVTEQALNQGMTYIKNETVYTGAIILSAISGKRLDSFGQRGIRATHFSFEDINNKGDLNERVTDALAIASCINAHPYVKGELCVSDDLTYTTGYFAAAKIGYHRLFDIKPVNTRYGGRIIFVDDCIDLNHYISFLESTPKQVVYETV >CP029655.1|AWQ95933.1|926470_926938_+|queT-transporter-family-protein MTSKDITQISVIAAILTILAVLKIPSIIPGLDFQLSAPAALLILAFFGIKKYFLGGLLSSVLLLIFGVFNPINVIISIIFRVIAIAVVYLLKINVLSLVLSSVLGSLVSRLLLSIILNLPVWVVLLNAIPGVIFTLIVAIPLYLTLRKRMAVLLR >CP029655.1|AWQ96194.1|926989_927967_-|gamma-hemolysin-component-B MKMNKLVKSSVATSMALLLLSGTANAEGKITPVSVKKVDDKVTLYKTTATADSDKFKISQILTFNFIKDKSYDKDTLVLKATGNINSGFVKPNPNDYDFSKLYWGAKYNVSISSQSNDSVNVVDYAPKNQNEEFQVQNTLGYTFGGDISISNGLSGGLNGNTAFSETINYKQESYRTTLSRNTNYKNVGWGVEAHKIMNNGWGPYGRDSFHPTYGNELFLAGRQSSAYAGQNFIAQHQMPLLSRSNFNPEFLSVLSHRQDGAKKSKITVTYQREMDLYQIRWNGFYWAGANYKNFKTRTFKSTYEIDWENHKVKLLDTKETENNK >CP029655.1|AWQ97780.1|927968_928916_-|gamma-hemolysin-component-C MLKNKILATTLSVSLLAPLANPLLENAKAANDTEDIGKGSDIEIIKRTEDKTSNKWGVTQNIQFDFVKDKKYNKDALILKMQGFISSRTTYYNYKKTNHVKAMRWPFQYNIGLKTNDKYVSLINYLPKNKIESTNVSQTLGYNIGGNFQSAPSLGGNGSFNYSKSISYTQQNYVSEVEQQNSKSVLWGVKANSFATESGQKSAFDSDLFVGYKPHSKDPRDYFVPDSELPPLVQSGFNPSFIATVSHEKGSSDTSEFEITYGRNMDVTHAIKRSTHYGNSYLDGHRVHNAFVNRNYTVKYEVNWKTHEIKVKGQN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029655_4 | 1082061-1082141 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029655_4
|
1 spacers
spacers of CP029655_4
>4.1|1082086|31|CP029655|CRISPRCasFinder AGCTGACAGAAAGTCAGCTTACAATAATGTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029655_4
The CRISPR arrays of CP029655_4 >merge|CP029655|4|1082061-1082141|CRISPRCasFinder CAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGACAGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGA >CP029655|4|3|1082061-1082141|CRISPRCasFinder CAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGA AGCTGACAGAAAGTCAGCTTACAATAATGTG CAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGA
>CP029655.1|AWQ97605.1|1080894_1081917_+|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-A MVEQIKDKLGRPIRDLRLSVTDRCNFRCDYCMPKEVFGDDFVFLPKNELLTFDEMARIAKVYAELGVKKIRITGGEPLMRRDLDVLIAKLNQIDGIEDIGLTTNGLLLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDDTLFQSINNRNIKATTILEQIDYATSIGLNVKVNVVIQKGINDDQIIPMLEYFKDKHIEIRFIEFMDVGNDNGWDFSKVVTKDEMLTMIEQHFEIDPVEPKYFGEVAKYYRHKDNGVQFGLITSVSQSFCSTCTRARLSSDGKFYGCLFATVDGFNVKAFIRSGVTDEELKEQFKALWQIRDDRYSDERTAQTVANRQRKKINMNYIGG >CP029655.1|AWQ98123.1|1080275_1080875_+|putative-molybdenum-cofactor-guanylyltransferase MKAIILAGGHSVRFGKPKAFAEVNGETFYSRVIKTLESTNMFNEIIISTNAQLATQFKYPNVVIDDENHNDKGPLAGIYTIMKQHPEEELFFVVSVDTPMITGKAVSTLYQFLVSHLIENHLDVAAFKEDGRFIPTIAFYSPNALGAITKALHSDNYSFKNIYHELSTDYLDVRDVDAPSYWYKNINYQHDLDALIQKL >CP029655.1|AWQ97894.1|1080035_1080269_+|molybdopterin-converting-factor,-subunit-1 MKVLYFAEIKDILQKAQEDIVLEQALTVQQFEDLLFERYPQINNKKFQVAVNEEFVQKSDFIQPNDTVALIPPVSGG >CP029655.1|AWQ97665.1|1079583_1080030_+|molybdopterin-synthase-catalytic-subunit MKQFEIVIEPIQTEQYREFTINEYQGAVVVFTGHVREWTKGVKTEYLEYEAYIPMAEKKLAQIGDEINEKWPGTITSIVHRIGPLQISDIAVLIAVSSPHRKDAYRANEYAIERIKEIVPIWKKEIWEDGSKWQGHQKGNYEEAKREE >CP029655.1|AWQ96551.1|1079084_1079570_+|molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-protein-B MILQIVGYKKSGKTTLMRHIVSFLKTHGYTVATIKHHGHAKEDIQLQDSDVDHMKHFEAGADQSIVQGFQYQQTVTRVDNQNLTQIIEKSVTIDTNIVLVEGFKNADFEKVVVYRDEEELQVLQQLSNVCYSINVREHEDFTAFEQWLLNKIKNDCDTQLT >CP029655.1|AWQ96216.1|1077828_1079088_+|molybdopterin-molybdenumtransferase MVVEKRNPIPVKEAIQRIVNQQSSMPAITVALEKSLNHILAEDIVATYDIPRFDKSPYDGFAIRSVDSQGASGQNRIEFKVIDHIGAGSVSDKLVGDHEAVRIMTGAQIPNGADAVVMFEQTIELEDTFTIRKPFSKNENISLKGEETKTGDVVLKKGQVINPGAIAVLATYGYAEVKVIKQPSVAVIATGSELLDVNDVLEDGKIRNSNGPMIRALAEKLGLEVGIYKTQKDDLDSGIQVVKEAMEKHDIVITTGGVSVGDFDYLPEIYKAVKAEVLFNKVAMRPGSVTTVAFADGKYLFGLSGNPSACFTGFELFVKPAVKHMCGALEVFPQIIKATLMEDFTKANPFTRFIRAKATLTSAGATVVPSGFNKSGAVVAIAHANCMVMLPGGSRGFKAGHTVDIILTESDAAEEELLL >CP029655.1|AWQ95807.1|1077271_1077766_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-C MTEFTHINQQGHAKMVDVSDKQITKRTAVAHSSITVNETIFKQISNNTNTKGNVLNTAQIAGIMAAKNTSTIIPMCHPLPLTGIDVHFSWDETNAPLYTLNIQTTVSTTGKTGVEMEALTAASATALTIYDMTKAVDKGMIIGETYLESKSGGKSGDFQRQSGQ >CP029655.1|AWQ97819.1|1076763_1077270_+|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-B MGEHQNVKLNRTVKAAVLTVSDTRDFVTDKGGQCVRQLLQADDVEVSDAHYTIVKDEKVAITTQVKKWLEEDIDVIITTGGTGIAQRDVTIEAVKPLLTKEIEGFGELFRYLSYVEDVGTRALLSRAVAGTVNNKLIFSIPGSTGAVKLALEKLIKPELNHLIHELTK >CP029655.1|AWQ96181.1|1075728_1076733_+|thiF-family-protein MSQERYSRQILFKQIGEIGQSKINQKCALIIGMGALGTHVAEGLVRAGIAKLIIVDRDYIEFSNLQRQTLFTEEDALKMMPKVVAAKKHLLALRSDVDIDGCIAHVDYYFLETHGQDVDVIIDATDNFETRQLINDFAYKHRIPWIYGGVVQSTYTEAAFIPGKTPCFNCLVPQLPALNLTCDTVGVIQPAVTMATSLQLRDAMKVLTEQPIDTKITYGDIWEGSHYSFGFSKMQRSDCTTCGDVPSYPYLNKNEQRYATLCGRDTVQYENASITHDILVQFLKQHQLNYRSNSYMVMFEFKGHRIVAFKGGRFLIHGMTRTSDATHLMNLLFG >CP029655.1|AWQ98029.1|1074953_1075559_+|ABC-transporter-family-protein MLKINVKYQLKNTLIRINIDDTEPKIYAVRGPSGIGKTTVLNMIAGLRKADEAIIEVNGQLLTDTTKNVNVKIQQRRIGYLFQDYQLFPNMTVYKNITFMAEPSKHIDQLIQTLNINHLMKQYPMTLSGGEAQRVALARALSTKPDLILLDEPFSSLDDTTKDESITLVKRIFNEWQIPIIFVTHSNYEAEQMAHEIITIG >CP029655.1|AWQ97187.1|1082493_1082844_+|HTH-type-transcriptional-regulator-SarV MSNKVQRFIEAERELSQLKHWLKTTHKISIEEFVVLFKVYEAEKISGKELRDTLHFEMLWDTSKIDVIIRKIYKKELISKLRSETDERQVFYFYSTSQKKLLDKITKEIEVLSVTN >CP029655.1|AWQ97231.1|1082945_1084157_-|major-Facilitator-Superfamily-protein MTNQGSLNKSPIFTKSFTINFFVNFIVYLCMYLLLVVIAGYSKQAFDASDSLAGLVVGLFIVGSLIGRFATGKFVNQIGPKRLLFIGLIALIITQLLYFIDGSLAFLIFVRLINGIATAVVTTATGTIAAYVTPVNRKSEGISLFSLSLVLGTAIGPFLGMLLITKYAIDLLFIICVILGILGLIISLFIKVDFEVTNNKTETDVINKPRFSIHQFIAKEAIPVAVIMLLIGVTYASILTYLQAFALERHLVTAASYFFICYAIASLITRPIAGRLMDDKNENIIVYPAFIMLFLSFVCLISSYQSWLILLAGACLGLGYGNLSSAMQSIAIKVSPPIKYGIATSTFYVGLDAGVGFGPSFLGLFTHMFSYSEIFGFMAALAIITMLVYFLIHGRHVTRNAMN >CP029655.1|AWQ97903.1|1084149_1084590_-|marR-family-protein MLSQEFFNSFITIYRPYLKLAEPILEKHNIYYGQWLILRDIAKHQPTTLIEISHRRAIEKPTARKTLKALIENDLITVENSLEDKRQKFLTLTPKGHELYEIVCLDVQKLQQAVVAKTNISQDQMQETINVMNQIHEILLKEAHND >CP029655.1|AWQ97586.1|1084751_1085516_+|glyoxalase-like-domain-protein MILKFDHIIHYIDQLDRFSFPGDVIKLHSGGYHHKYGTFNKLGYINENYIELLDVENNEKLKKMAKTIEGGVAFATQIVQEKYEQGFKNICLRTNDIEAVKNKLQSEQVEVVGPIQMERDTHKDGKVKWQLLYIMNQDDDEIKPPFFIQWEESDSMRTKKLQKYFQKQFSIETVIVKSKNRSQTVSNWLKWFDMDIVEENDHYTDLILKNDDIYFRIEDGKVSKYHSVIIKDAQATSPYSIFIRGAIYRFEPLV >CP029655.1|AWQ97021.1|1086147_1087413_+|glycine-glycyltransferase MEKMHITNQEHDAFVKSHPNGDLLQLTKWAETKKLTGWYARRIAVGRDGEVQGVAQLLFKKVPKLPYTLCYISRGFVVDYSNKEALNALLDSAKEIAKAEKAYAIKIDPDVEVDKGTDALQNLKALGFKHKGFKEGLSKDYIQPRMTMITPIDKNDDELLNSFERRNRSKVRLALKRGTTVERSDREGLKTFAELMKITGERDGFLTRDISYFENIYDALHEDGDAELFLVKLDPKENIAKVNQELNELHAEIAKWQQKMETSEKQAKKAQNMINDAQNKIAKNEDLKRDLEALEKEHPEGIYLSGALLMFAGSKSYYLYGASSNEFRDFLPNHHMQYTMMKYAREHGATTYDFGGTDNDPDKDSEHYGLWAFKKVWGTYLSEKIGEFDYILNQPLYQLIEQVKPRLTKAKIKISRKLKRK >CP029655.1|AWQ96908.1|1087529_1090697_+|swarming-motility-protein-SwrC MIKKLLQFSLGNKFAIFLMVVLVVLGGVYASAKLKLELLPNVQNPVISVTTTMPGATPQSTQDEISSKIDNQVRSLAYVKNVKTQSIQNASIVTVEYENNTDMDKAEEQLKKEIDKIKFKDEVGQPELRRNSMDAFPVLAYSFSNKENDLKKVTKVLNEQLIPKLQTVDGVQNAQLNGQTNREITLKFKQNELEKYGLTADDVENYLKTATRTTPLGLFQFGDKDKSIVVDGQYQSVDAFKNINIPLTLAGGQGQSQSQSDNKQNSAMSDVNQASPQQNSKASAPNNISGMPTAKLGDLADITVGDVRTSISKTNGKDAVNLQITKAQDANTVQVAKDVQRKIDTFVDENKDFNVTKTMDTAKPVEKSLYTMVEKASLGTIVAIIVILLFLRNIRTTAISIISIPLSLLMALIALKLSDVSLNILTLGALTVAIGRVIDDSIVVVENIYRRLTDSEEQLKGENLIISATTEVFKPIMSSTLVTIIVFLPLVFVSGSVGEMFRPFALAIAFSLLASLLVSITLVPALAATLFKKGVKRRNKQHQEGLGVVSTTYKKVLHWSLNHKWIVIILSTLILVATIVFGGPRLGTSFISAGDDKFLAITYTPKPGETEQAVLNHAKDVEKYLKQKKHVKTIQYSVGGSSPVDPTGSTNSMAIMVEYDNDTPNFDVEADKVIKHVDGFKHPGEWKNQDLGTGAGNKSVEVTVKGPSMDAIKSTVKDIEQKMKQVKGLANVKSDLSQTYDQYEIKVDQNKAAENGISASQLAMHLNENLPEKTVTTVKENGKTVDVKVKQNKQTDWSEDKLNNITLKKPTGGTIKLGDIATLVKTTTPSKLTQEQGDYATTVSAKVTNKDVGGTTRQVMSKINNLDKPNNVKVNIGGASDDINNAMTQLAFAMLAAIIIVYLILVITFKGGLAPFTILFSLPFTVIGVIIALLITGETISVPSLIGMLMLIGIVVTNAIVLIDRVINNEQQGMEMKEALIEAGGTRIRPILMTAIATIGALVPLLFGQDSSILISKGLAATVIGGLISSTLLTLVVVPVIYEILFTLKKRFTKR >CP029655.1|AWQ96628.1|1090880_1091198_-|putative-membrane-protein MQFYLILLAILYLIVSFISIFKMEVVFTRILRIIMGVLLLFVLALTTMSFPKENWWVFIVLLLLVGNVEVTGFKMLKKDLKGVNILNLMSLFIFVIYFILTIVLF >CP029655.1|AWQ97601.1|1091442_1091607_-|hypothetical-protein MSLENQLAELKYDYVRLQGDLEKRESLNLDTSALVRQLKDIENEIRNVRAQMQD >CP029655.1|AWQ96090.1|1091739_1092648_+|membrane-transport-family-protein MTEQFTMIILLIALGYFLKRINFIKATDSQVIATLVLNVTLPSLVIVNLNSAELKLSFSILPILMIIYGIVAKMIAVWFFRKYDNHMRGSVGMMTGAMNIGLFAYPLIEVIWPKTGLIYFGMADIGGAFVMFGITYFVGSYFSEGSDQFDFKYLGKKLLQSVPLVTYIVMFILNINHIHLPHVAIDFFSILSHANMPLSMILLGVMLNFTLERKYIPATIKYLCLHYGLALVAGLLVHVLLPVSDDMIKTTLLVTWMFPVGVAIISYGIQFKYRTLPFIGMTTNLTIIISIIILYVYQAVFV >CP029655.1|AWQ95873.1|1093054_1093186_+|putative-nitrogen-regulation-protein-NIFR3 MYGAYLINEYHQDFKSIANFKVLKRMINVMMCYCVLFLEPRIS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP029655_6 | 1202420-1202501 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029655_6
|
1 spacers
spacers of CP029655_6
>6.1|1202445|32|CP029655|CRISPRCasFinder AAAAGTAGGAGCGCCTGCGCTAAGCGCATGCA |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029655_6
The CRISPR arrays of CP029655_6 >merge|CP029655|6|1202420-1202501|CRISPRCasFinder AAGAAGCCCCTAACAACTAAAGTTGAAAAGTAGGAGCGCCTGCGCTAAGCGCATGCATAAGAGCCCCTAACAACTAAAGTTG >CP029655|6|5|1202420-1202501|CRISPRCasFinder AAGAAGCCCCTAACAACTAAAGTTG AAAAGTAGGAGCGCCTGCGCTAAGCGCATGCA TAAGAGCCCCTAACAACTAAAGTTG
>CP029655.1|AWQ97287.1|1201293_1201464_-|hypothetical-protein MSPKDTTRFETKPDHQAQFDWKESINFKTKDNQRIPLYIGVLLLYYSRFIIMHNNE >CP029655.1|AWQ97152.1|1201142_1201301_-|hypothetical-protein MSKSSDALFNSLTQSFELIEGVYNELVTDNLKIVMYKPRKESTSGRINRRFK >CP029655.1|AWQ97858.1|1199627_1200485_+|cof-like-hydrolase-family-protein MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINQLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQITNLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTLDVTAYTNEEDGAAKYLAKHFLAD >CP029655.1|AWQ97038.1|1198777_1199560_+|ABC-transporter-family-protein MLIQLDQIGRMKQGKTILKNISWQIAKGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATTGGVNLFGKMPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEVRNEAHHLLKLVGISAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLNILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITGNFTKILLLKDGESVQQGLIDDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE >CP029655.1|AWQ97625.1|1196740_1198546_+|glutamine-fructose-6-phosphate-transaminase MCGIVGYIGYDNAKELLLKGLEKLEYRGYDSAGIAVVNDDNTTVFKEKGRIAELRKVADSSDFDGPVGIGHTRWATHGVPNHENSHPHQSSNGRFTLVHNGVIENYEELKGEYLQGVSFISETDTEVIVQLVEYFSNQGLSTEEAFTKVVSLLHGSYALGLLDAEDKDTIYVAKNKSPLLLGVGEGFNVIASDALAMLQVTSEYKEIHDHEIVIVKKDEVIIKDADGNVVERDSYIAEIDASDAEKGVYAHYMLKEIHEQPAVMRRIIQEYQDAEGNLKIDQDIINDVKEADRIYVIAAGTSYHAGLVGKEFLEKWAGVPTEVHVASEFVYNMPLLSEKPLFVYISQSGETADSRAVLVETNKLGHKSLTITNVAGSTLSREADHTLLLHAGPEIAVASTKAYTAQIAVLSILSQIVAKEHGREADIDLLRELAKVTTAIEAIVDDAPIMEQIATDFLETTRNAFFIGRTIDYNVSLEGALKLKEISYIQAEGFAGGELKHGTIALIEDGTPVVALATQENVNLSIRGNVKEVVARGAHPCIISMEGLEKEGDTYVIPHVHELLTPLVSVVALQLISYYAALHRDLDVDKPRNLAKSVTVE >CP029655.1|AWQ97460.1|1194521_1196060_-|PTS-system-mannitol-specific-EIICB-component MSQTEEKKGIGRRVQAFGSFLSSMIMPNIGAFIAWGFIAAIFIDNGWLPNKDLATLAGPMITYLIPLLIAFSGGRLIYDLRGGIIAATATMGVIVALPDTPMLLGAMIMGPLVGWLMKKTDQLIQPRTPQGFEMLFNNFSAGILGFIMTIAGFKILAPLMKFIMHILSVAVEALVHAHLLPLVSILVEPAKIVFLNNAINHGVFTPLGADQAAKAGQSILYTIESNPGPGLGILLAYMIFGKGTAKATSYGAGIIHFLGGIHEIYFPYVLMRPLLFIAVILGGMTGVATYQATGFGFKSPASPGSFIVYCLNAPRGEFLHMLLGVFLAALVSFVVAALIMKFTREPKQDLEAATAQMENTKGKKSSVASKLVSSDKNVNTEENASGNVSETSSSDDDPEALLDNYNTEDVDAHNYNNINHVIFACDAGMGSSAMGASMLRNKFKKAGINDITVTNTAINQLPKDAQLVITQKKLTDRAIKQTPNAIHISVDNFLNSPRYEELLNNLKKDDQA >CP029655.1|AWQ96180.1|1192354_1194487_-|PRD-domain-protein MLLSTREKEMIALLIKYHSQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVEAYLTSFSLTLERANKKGLRIAGADSDLNDLKQSIAQHQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELDLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLGQIYDVTFNQAEIAFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVNKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFIVLHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLEQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIDSPYLTVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFQETHDKSSNMIDKDDVHVETKDVDGNTSFENEQTSYLTSVFEKHLSDEKSEQLLHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDVINDPTSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMILITVLEEPLTLPSIQNDNQTIKYMISMFIPDNDFMASLVSDLSEFLSLKLESIDTFMENPQELETLLRNKFLERIKKQFI >CP029655.1|AWQ96179.1|1191908_1192343_-|mannitol-specific-phosphotransferase-enzyme-IIA-component MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA >CP029655.1|AWQ97118.1|1190802_1191909_-|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKAVHFGAGNIGRGFIGYILADNNVKVTFADVNEEIINALAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFAPFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVLDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFAGKATVLDAVKDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAGYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTADQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS >CP029655.1|AWQ96258.1|1183038_1190484_+|sasC/Mrp/FmtB-intercellular-aggregation-domain-protein MNLFRQQKFSIRKFNVGIFSALIATVTFISTNPTTASAAEQNQPAQNQPAQPADANTQPNANAGAQANPAAQPANQGGQANPAGGAAQPAGQGNQADPNNAAQAQPGNQAAPANQAGQGNNQATPNNNATPANQTQPANAPAAAQPAAPVAANAQTQDPNASNTGEGSINTTLTFDDPAISTDENRQDPTVTVTDKVNGYSLINNGKIGFVNSELRRSDMFDKNNPQNYQAKGNVAALGRVNANDSTDHGNFNGITKTVNVKPDSELIINFTTMQTNSKQGATNLVIKDAKKNTELATVNVAKTGTAHLFKVPTDADRLDLQFIPDNTAVADASRITTNKDGYKYYSFIDNVGLFSGSHLYVKNRDLAPKATNNKEYTINTEIGNNGNFGASLKADQFKYEVTLPQGVTYVNDSLTTTFPNGNEDSTVLKNMTVNYDQTANKVTFTSQGVTTARGTHTKEVLFPDKSLKLSYKVNVANIDTPKNIDFNEKLTYRTASDVVINNAQPEVTLTADPFSVAVEMNKDALQQQVNSQVDNSHYTTASIAEYNKLKQQADTILNEDANHVETANRASQADIDGLVTKLQAALIDNQAAIAELDTKAQEKVTAAQQSKKVTQDEVAALVTKINNDKNNAIAEINKQITSQGVTTEKDNGIAVLEQDVITPTVKPQAKQDIIQAVTTRKQQIKKSNASLQDEKDVANDKIGKIETKAIKDIDAATTNAQVEAIKTKAINDINQTTPATTAKAAALEEFDEVVQAQIDQAPLNPDTTNEEVAEAIERINAAKVSGVKAIEATTTAQDLERVKNEEIFKIENITDSTQTKMDAYKEVRQAATARKAQNATVSNATDEEVAEANAAVDAAQTEGLHDIQVVKSQQEVADTKAKVLDKINAIQTQAKVKPAADTEVENAYNTRKQEIQNSNASTTEEKEAAYTELDAKKQEARTNLDAANTNSDVTTAKDNGIAAINQVQAATTKKSDAKAEIAQKASERKTAIEAMNDSTTEEQQAAKDKVDQAVVTANADIDNATANTDVDNAKTTNEATIAAITPDANVKPAAKQAIADKVQAQETAIDANNGSTTEEKEAAKQQVQTEKTAADAAIDAAHSNVEVEAAKNAEIAKIEAIQPATTTKDNAKQAIATKANERKTAIAQTQDITAEEIAAANADVDNAVTQANSNIEAANSQNDVDQAKTTGETSIDQVTPTVNKKATARNEITAILNNKLQEIQATPDATDEEKQAADAEANTENGKANQAISAATTNAQVDEAKANAEAAINAVTPKVVKKQAAKDEIDQLQATQTNVINNDQNATNEEKEAAIQQLATAVTDAKNNITAATDDNGVDTAKDAGKNSIQSTQPATAVKSNAKNEVDQAVTTQNQAIDNTTGATTEEKNAAKDLVLKAKEKAYQDILNAQTTNDVTQIKDQAVADIQGITADTTIKDVAKDELATKANEQKALIAQTADATTEEKEQANQQVDAQLTQGNQNIENAQSIDDVNTAKDNAIQAIDPIQASTDVKTNARAELLTEMQNKITEILNNNETTNEEKGNDIGPVRAAYEEGLNNINAATTTGDVTTAKDTAVQKVQQLHANPVKKPAGKKELDQAAADKKTQIEQTPNASQQEINDAKQEVDTELNQAKTNVDQSSTNEYVDNAVKEGKAKINAVKTFSEYKKDALAKIEDAYNAKVNEADNSNASTSSEIAEAKQKLAELKQTADQNVNQATSKDDIEVQIHNDLDNINDYTIPTGKKESATTDLYAYADQKKNNISADTNATQDEKQQAIKQVDQNVQTALENINNGVDNGDVDDALTQGKAAIDTIQVDATVKPKANQAIEAKAEDTKESIDHSDQLTAEEKTEALAMIKQITDQAKQGITDATTTAEVEKAKAQGLEAFDNIQIDSTEKQKAIEELETALDQIEAGVNVDADATTEEKEAFTNALEDILSKATEDISDQTTNAEIATVKNSALEQLKAQRINPVVKKNALEAIREVVNKQIEIIKNADADASAKEIARTDLGRYFDRFADKLDKTQTNTEVAELQNVTIPAIEAIVPQNDPDANDTNNGTDNNDATANSNANATPENTGQPNVSETTDNGKADASPTTPNNSDAATGETTVTSATDDAKDKPQANNNSSADASTNSPTMDNDVTSKPEVESTNNGTTDKPVTETDNATPAESTTNNNSTTTATNENAPTGSTATAPTTASTEAASSADSKDNASVNDSKQNAEVNNSAESQSTNGKVAQPKSENKAKAEKDGRDSTNQSMVESTTETLPSADITEPNVPSNTSKDKEESTTNQTDAGQLKSETNVASNEADKSPSKADTEVSNKPSTSASSEAKDKMTSTNVSQKDDTATADTNDTQKSVGPVANNKAKDMQTNDTQKSVGSAANNKATQNDGANASPATVSNGSHSMHQDMLNVTKPEENKANAKSDQQGKVNKPKQQAKTLPDTGMSHNDDLPYAELALGAGMAFLIRRFTKKDQQTEE >CP029655.1|AWQ96906.1|1202517_1203609_-|putative-membrane-protein MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYAQTIAIYSQFGQKPPVDAYLKVIAVLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKDKKVVTEPKNTKVENGKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >CP029655.1|AWQ96557.1|1203874_1204852_-|cadmium,-cobalt-and-zinc/H(+)-K(+)-antiporter MSHSHHHDHMHSHVTTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALVAFIYAEKNATTTKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH >CP029655.1|AWQ97013.1|1204853_1205174_-|HTH-type-transcriptional-repressor-CzrA MSEQYSEINTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL >CP029655.1|AWQ96321.1|1205325_1205991_+|NADH(P)-binding-family-protein MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFDGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNHQEFQIISGEQDIKDALTQFEIEKD >CP029655.1|AWQ97459.1|1206426_1207365_+|mannose-6-phosphate-isomerase,-class-I MPLFLQPILKTKLWGGQRLSEFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGTSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIVIGTLAESREEVANHVQHGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDITYRLYDFNRQDNQYNDRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYV >CP029655.1|AWQ97964.1|1207395_1207626_+|putative-membrane-protein MKQFLYIALVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQISASLKFSALLINVLPLCGTFVASN >CP029655.1|AWQ97189.1|1208297_1209671_+|EVE-domain-protein MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRMSNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVKKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD >CP029655.1|AWQ98012.1|1210127_1210541_+|hypothetical-protein MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYQFATLKGEVGQQFFKQHPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIKLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD >CP029655.1|AWQ97259.1|1210740_1211184_+|DNA-protection-during-starvation-protein-1 MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLENAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS >CP029655.1|AWQ95795.1|1211304_1212015_-|purine-nucleoside-phosphorylase MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGTYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKAKNVADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNDAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029655_7 | 1331497-1331578 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029655_7
|
1 spacers
spacers of CP029655_7
>7.1|1331521|34|CP029655|CRISPRCasFinder CCAACACAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029655_7
The CRISPR arrays of CP029655_7 >merge|CP029655|7|1331497-1331578|CRISPRCasFinder ACAATGCAAGTTGGGGTGGGGGCCCCAACACAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGTAAGTTGGGGTGGGGGCC >CP029655|7|6|1331497-1331578|CRISPRCasFinder ACAATGCAAGTTGGGGTGGGGGCC CCAACACAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAA ACAATGTAAGTTGGGGTGGGGGCC
>CP029655.1|AWQ96196.1|1330047_1331355_-|ktr-system-potassium-uptake-protein-B MNKVHKPLYFYLMLFFSTTIIGALLLYLPFTGKKPISFLDALFIASSAFTVTGLSPVDIGSQFNILGEIVILLLIQIGGLGIVTVTLLTLVFLNRKISMKNRFLIMVTWNIDEPGGVIKLIKHLAIYSLVTELIGMICLCLSFIPKFGIGKGLFLSLFTSVSAFNNAGFALFKNNLIDYSSDPIVIITISILIIFGGIGHFVVIDFINCKKLSKLSLHSKLVLTTTSILIIIGAITFFLLEQFNTMQHMGLVEKIGNSFFQSVTTRTAGFNSIDIASINKSTALMLMLLMFIGGAPLSAAGGIKITTFAVAFIFVLNYIRKENNVSVFNKEISDKHIKLSIVTINISFLFISIITFILSIINPNISLIKLLFEVVSAFGTVGLSMNLTTEYHGITKIIIIFVMLCGKVGLLTLLRTFIPPKSPKNYRYTKGQIYL >CP029655.1|AWQ98208.1|1327891_1329508_+|chaperonin-GroL MVKQLKFSEDARQAMLRGVDQLANAVKVTIGPKGRNVVLDKEFTAPLITNDGVTIAKEIELEDPYENMGAKLVQEVANKTNEIAGDGTTTATVLAQAMIQEGLKNVTSGANPVGLRQGIDKAVKVAVEALHENSQKVENKNEIAQVGAISAADEEIGRYISEAMEKVGNDGVITIEESNGLNTELEVVEGMQFDRGYQSPYMVTDSDKMVAELERPYILVTDKKISSFQDILPLLEQVVQSNRPILIVADEVEGDALTNIVLNRMRGTFTAVAVKAPGFGDRRKAMLEDLAILTGAQVITDDLGLDLKDASIDMLGTASKVEVTKDNTTVVDGDGDENSIDARVSQLKSQIEETESDFDREKLQERLAKLAGGVAVIKVGAASETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTALVNVYQKVSEIEAEGDIETGVNIVLKALTAPVRQIAENAGLEGSVIVERLKNAEPGVGFNAATNEWVNMLEAGIVDPTKVTRSALQHAASVAAMFLTTEAVVASIPEKNNDQPNMGGMPGMM >CP029655.1|AWQ98368.1|1327531_1327816_+|10-kDa-chaperonin MLKPIGNRVIIEKKEQEQTTKSGIVLTDSAKEKSNEGVIVAVGTGRLLNDGTRVTPEVKEGDRVVFQQYAGTEVKRDNETYLVLNEEDILAVIE >CP029655.1|AWQ95860.1|1326613_1327357_-|CAAX-protease-self-immunity-family-protein MTRLWASLLTVIIYILSQFLPLLIVKKLPFVQYSGIELTKAVIYIQLVLFLIAATTIILINLKIKNPTKLELEVKEPKKYIIPWALLGFALVMIYQMVVSIVLTQIYGGQQVSPNTEKLIIIARKIPIFIFFVSIIGPLLEEYVFRKVIFGELFNAIKGNRIVAFIIATTVSSLIFALAHNDFKFIPVYFGMGVIFSLAYVWTKRLAVPIIIHMLQNGFVVIFQLLNPEALKKATEQANFIYHIFIP >CP029655.1|AWQ95940.1|1325407_1326589_+|putative-sdrH-protein MSYHWFKKMLLSTSILILSSSSLGLATHTVEAKDNLNGEKPTTNLNHNITSPSVNSEMNNNETGTPHESNQTGNEGTGSNSRDANPDSNNVKPDSNNQNPSTDSKPDPNNQNPSPNPKPDPDNPKPKPDPKPDPDKPKPNPDPKPDPDKPKPNPNPKPDPNKPNPNPSPDPDQPGDSNHSGGSKNGGTWNPNASDGSNQGQWQPNGNQGNSQNPTGNDFVSQRFLALANGAYKYNPYILNQINKLGKDYGEVTDEDIYNIIRKQNFSGNAYLNGLQQQSNYFRFQYFNPLKSERYYRNLDEQVLALITGEIGSMPDLKKPEDKPDSKQRSFEPHEKDDFTVVKKQEDNKKSASTAYSKSWLAIVCSMMVVFSIMLFLFVKRNKKKNKNESQRR >CP029655.1|AWQ97166.1|1324584_1325211_-|nitroreductase-family-protein MGLFKKDKKAMTFDNAMEERRSIYNLKDSISISDDELESMIAHAVKHVPSSFNSQSTRIVLLLNDNNNKFWDNTKAILKEVMGENRDFEPTEQKIDNFKHSYGTILFYEDQDVVSGLQEQMPNYYDNFAIWSTQTNAMHQFAIWTALATKGIGASLQHYNPLVDEMTSKEFNIPKSWKLIAQMPFGDIREAAGEKTFNPVEDRFVIKK >CP029655.1|AWQ97089.1|1323434_1324220_-|hydrolase,-carbon-nitrogen-family MKVQIYQLPIIFGDSSKNETQITQWFEKNMNAEVDVVVLPEMWNNGYDLEHLNEKADNNLGQSFSFIKHLAEKYKVDIVAGSVSNIRNYQIFNTAFSVNKSGQLINEYDKVHLVPMLREHEFLTAGENVAEPFQLSDGTYVTQLICYDLRFPELLRYPARSGAKIAFYVAQWPMSRLQHWHSLLKARAIENNMFVIGTNSTGFDGNTEYAGHSIVINPNGDLVGELNESADILTVDLNLNEVEQQRENIPVFKSIKLDLYK >CP029655.1|AWQ97133.1|1322700_1322835_+|delta-hemolysin-domain-protein MSCLILRIFILIKEGVISMAQDIISTIGDLVKWIIDTVNKFTKK >CP029655.1|AWQ95816.1|1321901_1322465_-|accessory-gene-regulator-protein-B MNYFDNKIDQFATYLQKRNNLDHIQFLQVRLGMQIIVGNFFKILVTYSISIFLSVFLFTLVTHLSYMLIRYNAHGAHAKSSILCYIQSILTFVFVPYFLINIDINFTYLLALSIIGLISVVIYAPAATKKQPIPIKLVKRKKYLSIIMYLLVLILSLIIHPFYAQFMLLGILVESITLLPIFFPKED >CP029655.1|AWQ98159.1|1321755_1321899_-|cyclic-lactone-autoinducer-peptide-family-protein MNTLVNMFFDFIIKLAKAIGIVGGVNACSSLFDEPKVPAELTNLYDK >CP029655.1|AWQ97119.1|1331798_1333022_-|putative-succinyl-diaminopimelate-desuccinylase MTTFSEKEKIQLLADIVELQTENNNEIDVCNYLKDLFDKYDIKSEILKVNEHRANIVAEIGNGSPILALSGHMDVVDAGNQDNWTYPPFQLTEKAGKLYGRGTTDMKGGLMALVITLIELKEQNQLPQGTIRLLATAGEEKEQEGAKLLADKGYLDDVDGLIIAEPTGSGIYYAHKGSMSCKVTATGKAVHSSVPFIGDNAIDTLLEFYNQFKEKYSELKKHDTKHELDVAPMFKSLIGKEISEEDANYASGLTAVCSIINGGKQFNSVPDEASLEFNVRPVPEYDNDFIESFFQNIINDVDSNKLSLDIPSNHRPVTSDKNSKLITTIKDVASSYVEQDEIFVSALVGATDASSFLGDNKDNVDLAIFGPGNPLMAHQIDEYIEKDMYLKYIDIFKEASIQYLKEK >CP029655.1|AWQ97999.1|1333457_1334513_+|hypothetical-protein MKNKKRVLIASSLSCAILLLSAATTQANSAHKDSQDQNKKEHVDKSQQKDKRNVTNKDKNSTVPDDIGKNGKITKRTETVYDEKTNILQNLQFDFIDDPTYDKNVLLVKKQGSIHSNLKFESHKEEKNSNWLKYPSEYHVDFQVKRNRKTEILDQLPKNKISTAKVDSTFSYSSGGKFDSTKGIGRTSSNSYSKTISYNQQNYDTIASGKNNNWHVHWSVIANDLKYGGEVKNRNDELLFYRNTRIATVENPELSFASKYRYPALVRSGFNPEFLTYLSNEKSNEKTQFEVTYTRNQDILKNRPGIHYAPPILEKNKDGQRLIVTYEVDWKNKTVKVVDKYSDDNKPYKEG >CP029655.1|AWQ98154.1|1334534_1335551_+|gamma-hemolysin-component-B MIKQLYKNITICSLAISTALTVFPATSYAKINSEIKAVSEKNLDGDTKMYTRTATTSDSQKNITQSLQFNFLTEPNYDKETVFIKAKGTIGSGLRILDPNGYWNSTLRWPGSYSVSIQNVDDNNNTNVTDFAPKNQDESREVKYTYGYKTGGDFSINRGGLTGNITKESNYSETISYQQPSYRTLLDQSTSHKGVGWKVEAHLINNMGHDHTRQLTNDSDNRTKSEIFSLTRNGNLWAKDNFTPKDKMPVTVSEGFNPEFLAVMSHDKKDKGKSQFVVHYKRSMDEFKIDWNRHGFWGYWSGENHVDKKEEKLSALYEVDWKTHDVKFVKVLNDNEKK >CP029655.1|AWQ96309.1|1335788_1336781_-|sphingomyelin-phosphodiesterase MVKKTKSNSLKKVATLALANLLLVGALTDNSAKAESKKDDTDLKLVSHNVYMLSTVLYPNWGQYKRADLIGQSSYIKNNDVVIFNEAFDNGASDKLLSNVKKEYPYQTPVLGRSQSGWDKTEGSYSSTVAEDGGVAIVSKYPIKEKIQHVFKSGCGFDNDSNKGFVYTKIEKNGKNIHVIGTHTQSEDSRCGAGHDRKIRAEQMKEISDFVKKKNIPKDETVYIGGDLNVNKGTPEFKDMLKNLNVNDVLYAGHNSTWDPQSNSIAKYNYPNGKPEHLDYIFTDKDHKQPKQLVNEVVTEKPKPWDVYAFPYYYVYNDFSDHYPIKAYSK >CP029655.1|AWQ96521.1|1337169_1338600_+|protein-map MKFKSLITTTLALGVIASTGANFNTNEASAAAKPLDKSSSTLHHGHSNIQIPYTITVNGTSQNILSSLTFNKNQNISYKDIENKVKSVLYFNRGISDIDLRLSKQAEYTVHFKNGTKRVIDLKSGIYTADLINTSDIKAISVNVDTKKQPKDKAKANVQVPYTITVNGTSQNILSNLTFNKNQNISYKDLEGKVKSVLESNRGITDVDLRLSKQAKYTVNFKNGTKKVIDLKSGIYTANLINSSDIKSININVDTKKHIENKAKRNYQVPYSINLNGTSTNILSNLSFSNKPWTNYKNLTSQIKSVLKHDRGISEQDLKYAKKAYYTVYFKNGGKRILQLNSKNYTANLVHAKDVKRIEITVKTGTKAKADRYVPYTIAVNGTSTPILSKLKISNKQLISYKYLNDKVKSVLKSERGISDLDLKFAKQAKYTVYFKNGKKQVVNLKSDIFTPNLFSAKDIKKIDIDVKQYTKSKKK >CP029655.1|AWQ96726.1|1338614_1338905_+|MAP-domain-protein MKFPVTINKFENIVSNEFVFYNASKITINDLSIKLKSAMANDQGITKHDIGLAERAVYKVYFKNGSSKYVDLKTEYKDERVFKATDIKKVDIELKF >CP029655.1|AWQ98358.1|1339183_1340470_-|aminotransferase-class-I-and-II-family-protein MNPLAQSLNEQLQQSNATAFTMLSDLGQNMFYPKGILSQSAEAKSTTYNATIGMATNKDGKMFASSLDAMFNDLTPDEIFPYAPPQGIEELRDLWQQKMLRDNPELSIDNMSLPIVTNALTHGLSLVGDLFVNQGDTILLPEHNWGNYKLVFNTRNGANLQTYPIFDKDGHYTTDSLVEALQSYNKDKVIMILNYPNNPTGYTPTHKEVTTIVDAIKALADKGTKVIAVVDDAYYGLFYEDVYTQSLFTALSNLNSNAILPVRLDGATKEFFAWGFRVGFMTFGTSDQTTKEVLEAKVKGLIRSNISSGPLPTQSAVKHVLKNNKQFDKEIEQNIQTLKERYEVTKEVAYADQYHSHWQAYDFNSGYFMAIKVHDVDPEELRKHLIEKYSIGVIALNATDIRIAFSCVEKEDIPHVFDSIAKAIDDLR >CP029655.1|AWQ97552.1|1341009_1341186_+|putative-membrane-protein MKHLTKIFVVLAIILFIIGYYLQATNHESQGIKLLLAAIMFMICAFISRSNDRRKNSK >CP029655.1|AWQ96898.1|1341443_1341824_+|bacterial-regulatory,-gntR-family-protein MKIILKNNSDFPIYEQIKQQVKQNILKGHVAPGEHLPSMRELAKDLQVSLITTKRAYEDLEKDGFVTTIRGKGTFVKEQDSSILKEKQFFTIENLVKELVNEAQAIEMSLEELQDILTFIYEEESS >CP029655.1|AWQ95912.1|1341820_1342717_+|AAA-domain-protein MNAIELSNVNYSSDQFNLKNISFKVPQGFVTGFIGRNGAGKTTIIRLIMDLYQPQTGVIRVLEEDMALNPIELKNSIGFVYSENYFNERWTTKQLEKMIAPFYRKWDHQVFEFYLEKFDLPINKSIKTFSTGMKMKLSLAVAFSHHAELYIFDEPTSGLDPLARNELLEIIQQELIDENKTIFMSTHIISDLEKIADYIIHLSDGEVILNGSKEQLLQRYQVVSGATEDLDDELASLLIYEEHKRTGFIGLTEHAQVFKEILGHKVNITTPSIENLMVYLEKRKPKYHENIKLMEEGF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP029655_8 | 1765256-1765340 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029655_8
|
1 spacers
spacers of CP029655_8
>8.1|1765282|33|CP029655|CRISPRCasFinder TGGGCCCCAACACAGAGAAATTGGATTCCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029655_8
The CRISPR arrays of CP029655_8 >merge|CP029655|8|1765256-1765340|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTGTGGGCCCCAACACAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTG >CP029655|8|7|1765256-1765340|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTG TGGGCCCCAACACAGAGAAATTGGATTCCCAAT TTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTG
>CP029655.1|AWQ97910.1|1763259_1765083_+|GTP-binding-protein-LepA MDNEQRLKRRENIRNFSIIAHIDHGKSTLADRILENTKSVETRDMQDQLLDSMDLERERGITIKLNAVRLKYEAKDGNTYTFHLIDTPGHVDFTYEVSRSLAACEGAILVVDAAQGIEAQTLANVYLALDNELELLPVINKIDLPAAEPERVKQEIEDMIGLDQDDVVLASAKSNIGIEEILEKIVEVVPAPDGDPEAPLKALIFDSEYDPYRGVISSIRIVDGVVKAGDKIRMMATGKEFEVTEVGINTPKQLPVDELTVGDVGYIIASIKNVDDSRVGDTITLASRPASEPLQGYKKMNPMVYCGLFPIDNKNYNDLREALEKLQLNDASLEFEPESSQALGFGYRTGFLGMLHMEIIQERIEREFGIELIATAPSVIYQCILRDGSEVTVDNPAQMPDRDKIDKIFEPYVRATMMVPNDYVGAVMELCQRKRGQFINMDYLDDIRVNIVYELPLAEVVFDFFDQLKSNTKGYASFDYEFIENKESNLVKMDILLNGDKVDALSFIVHRDFAYERGKALVEKLKTLIPRQQFEVPVQAAIGQKIVARTNIKSMGKNVLAKCYGGDISRKRKLLEKQKAGKAKMKAVGNVEIPQDAFLAVLKMDDE >CP029655.1|AWQ97774.1|1762662_1762914_-|ribosomal-protein-S20 MANIKSAIKRVKTTEKAEARNISQKSAMRTAVKNAKTAVSNNADNKNELVSLAVKLVDKAAQSNLIHSNKADRIKSQLMTANK >CP029655.1|AWQ96512.1|1761643_1762618_+|DNA-polymerase-III,-delta-subunit MSDNIVAIYGDVPELVEKQSAEIISQFLKSDRDDFNFVKYNLYETEIAPIVEETLTLPFFSDKKAILVKNAYIFTGEKAPKDMAHNVDQLIEFIEKYDGENLIVFEIYQNKLDERKKLTKTLKKHARLKKIEQMSEEEIKKWIQSKLNENFKDIKRDALDLFIELTGINFNIVSQEIEKLILFLGDRPTINKQDVNQIINRSLEQNVFLLTEYIQKRKKEQAIHLVKDLITMKEEPIKLLALITSNYRLFYQCKILSQKGYSGQQIAKTIGVHPYRVKLALGQVRHYQLDELLNIVDACAETDYKLKSSYMDKQLILELFILSL >CP029655.1|AWQ98351.1|1759406_1761587_+|DNA-internalization-related-competence-protein-ComEC/Rec2 MIVGVLWNSSKVLSTFLFILLLYITYRKNKIVYAPISLFLIIFSSWYLHYSQQAIFNYINYIERNSQFNERAQVIQIQRQGSDTYKGRLSLKNEIYPFFLTDKKNFDLKKIESRNCIVKGQFKVNENKFVTLKLQSIVVQSCLESNRSNLIEKHKQFIMNRIYDSGIKFPDRIMALITGDVKEINEQFKERVKEIGIYHLLAVSGSHIAAIVFLIYQPLKRLNLPLFVIKGITIIVLTLYAQYTNYAPSAVRAIIMTTLVLLITKQIKIKGIQLLAFAFIIMFILNPLVVYDIGFQFSFIISFFIMLLFPFLQQLSKLQSLFIITFIAQLASFIVAIPNFHQLQWVGFLSNLIFVPYYSIILFPLSILFFITSHFIVGLTPLNYLVDLSFNFHDWLLDLFTRIKQSHFSVPKFNDWIFIIFIISVYYIFWLLAKRKYILVTFWTIIILTLLITFPTNSHHKITMLNVGQGDSILYEGGKNQNVLIDTGGKVIDDTKQPSYSISKYHILPTLNERGINELEYLILTHPHNDHIGEVEYIISHIKIKHIVIYNKGYSSNTLMLLSKLSHKYNIKLMDVRQVSSFKLGDSSFLFFDSFIPNSRDKNEYSIITMITYQNKKVLLMGDASKNNESLLLKKYNLPEIDILKVGHHGSKTSSSKEFIEMIKPKISLISSGKNNMYHLPNIEVVKRLQRIRSRIYNSQQNGQVTIDLDDNLKVDSNSYGNASGL >CP029655.1|AWQ96597.1|1758919_1759381_+|comE-operon-protein-2 MERIKWEEYFMAQSHLLALRSTCQRLSVGATIVKDNRIIAGGYNGSVAGEVHCIDEGCLIEDGHCIRTIHAEMNALLQCAKQGVSTEGATIYVTHFPCLNCTKSIIQAGIKRIYYAEDYHNHEYATKLLKQSGIEFKKIPFSPEYVAKYLTKG >CP029655.1|AWQ98192.1|1758150_1758828_+|competence-ComEA-helix-hairpin-helix-repeat-region-domain-protein MYQFLLRYKDFLTQWKLYIISAVVLIMVLIGFIFWRQDDYTSRNFENKDTALKQSTSENNSLSKLEDVQVKDGDNSKNKGPVYVDVKGAVKHPNVYKMTSKDRVVDLLDKAQLLDDADVSRINLSEKLTDQKMIFIPHKGQKNVEPQIEVNSVHVKNGNTNNTKVNLNTASVSELMSVPGVGQAKANAIVEYRNQQGAFQEIDDLKKVKGFGSKTFDKLKSYFTI >CP029655.1|AWQ97566.1|1757385_1758102_+|methyltransferase-type-12 MSQYAEMSLVYDQLTQDQPYEKWFEIVKNHCKDESNILDIGCGTGSLTVQLEALGNVTGMDLSVDMLTVAAQKSANVNWLEGDMTSFDLQQQFDIITIFCDSLNYLQDETAVIETFINVYHHLTDSGVFIFDVHTVYKMMTLFNNQSYIDDKGDIFLAWDAVQGDLPLSVYHDMTFFIRHEDETYSRFDESHFQRTFDEKTYLSWLAQVGFKHVETFTDFNIDEHNEDTERLFFIAKK >CP029655.1|AWQ96510.1|1757029_1757383_+|ribosomal-silencing-factor-RsfS MNSQELLAIAVDAIDNKKGEDTISLEMKGISDMTDYFVVTHGNNERQVQAIARAVKEVANEQNIEVKRMEGYNEARWILIDLADVVVHVFHKDERNYYNIEKLYQDAPLESYGQVAY >CP029655.1|AWQ98212.1|1756444_1757029_+|HD-domain-protein MNIEKAKRLAKEKLPEKRYNHSLRVAETAIKLAEIYDGDTSKVELAGVLHDFCKYDDLGKMYQIVRQYELGNDLLSYGSEILHGPVCAAIMEHEYGINDEEVLMAIKYHTTGRQQMTKTEKLIFIADYIEPGRTIPGVDDIRDMAYNQGSLDKTIYEISKRTVLFLIQKDITVYNKTIDCLNYYNYSDERIKDD >CP029655.1|AWQ97340.1|1755885_1756455_+|nicotinate-(nicotinamide)-nucleotide-adenylyltransferase MKKIVLYGGQFNPIHTAHMIVASEVFHELQPDEFYFLPSFMSPLKKHNNFIDVQHRLTMIQMIIDELGFGDICDDEIKRGGQSYTYDTIKAFKEQHKDSELYFVIGTDQYNQLEKWYQIEYLKEMVTFVVVNRDKNSQNVENAMIAIQIPRVDISSTMIRQRVSEGKSIQVLVPKSVENYIKGEGLYEH >CP029655.1|AWQ97888.1|1765648_1766773_+|radical-SAM-superfamily-protein MTVQSAYIHIPFCVRICTYCDFNKYFIQNQPVDEYLDALITEMSTAKYRNLKTMYVGGGTPTALSINQLERLLKAIRDTFTITGEYTFEANPDELTKEKVQLLEKYGVNRISMGVQTFKPELLSVLGRTHNTEDIYTSVLNAKNAGIKSISLDLMYHLPKQTIEDFEQSLDLALDMDIQHISSYGLILEPKTQFYNMYRKGLLKLPNEDLGADMYQLLMSKIEQSPFHQYEISNFALDGHESEHNKVYWFNEEYYGFGAGASGYVDGVRYTNINPVNHYIKAINKESKAILVSNKPSLTERMEEEMFLGLRLNEGVSSSRFKKKFDQSIESVFGQTINNLKEKELIVEKNDAIALTKRGKVIGNEVFEAFLIND >CP029655.1|AWQ97426.1|1766873_1767851_+|heat-inducible-transcription-repressor-HrcA MITDRQLSILNAIVEDYVDFGQPVGSKTLIERHNLNVSPATIRNEMKQLEDLNYIEKTHSSSGRSPSQLGFRYYVNRLLEQTSHQKTNKLRRLNQLLVENQYDVSSALTYFADELSNISQYTTLVVHPNHKQDIINNVHLIRANPNLVIMVIVFSSGHVEHVHLASDIPFSNDKLNTISNFVTNKLTEFNQNLQDDIVSFVQSEQEEIFINKLINTMNNHISNQSNSIYMGGKVKLIDALNESNVSSIQPILQYIESNRIAELLQDISSPNINVKIGNEIDDSLSDISIVTSQYHFDETLKGQIAVIGPTAMHYQNVIQLLNRIW >CP029655.1|AWQ96696.1|1767882_1768509_+|protein-GrpE MTNKDESVEKNTESTVEETNIKQNIDDSVEQAEESKGHLQDEAIEETSDENVIEEIDPKDQKINELQQLADENEEKYLRLYAEFENYKRRIQKENEINKTYQAQRVLTDILPAIDNIERALQIEGDDETFKSLQKGVQMVHESLINALKDNGLEVIKTEGEAFDPNIHQAVVQDDNPDFESGEITQELQKGYKLKDRVLRPSMVKVNQ >CP029655.1|AWQ96812.1|1768577_1770410_+|chaperone-protein-DnaK MSKIIGIDLGTTNSCVTVLEGDEPKVIQNPEGSRTTPSVVAFKNGETQVGEVAKRQAITNPNTVQSIKRHMGTDYKVDIEGKSYTPQEISAMILQNLKNTAESYLGEKVDKAVITVPAYFNDAERQATKDAGKIAGLEVERIINEPTAAALAYGLDKTDKDEKVLVFDLGGGTFDVSILELGDGVFEVLSTAGDNKLGGDDFDQVIIDYLVAEFKKENGVDLSQDKMALQRLKDAAEKAKKDLSGVSQTQISLPFISAGENGPLHLEVNLTRSKFEELSDSLIRRTMEPTRQAMKDAGLTNSDIDEVILVGGSTRIPAVQEAVKKEIGKEPNKGVNPDEVVAMGAAIQGGVITGDVKDVVLLDVTPLSLGIEILGGRMNTLIERNTTIPTSKSQIYSTAVDNQPSVDVHVLQGERPMAADNKTLGRFQLTDIPPAERGKPQIEVTFDIDKNGIVNVTAKDLGTNKEQRITIQSSSSLSDEEIDRMVKDAEVNAEADKKRREEVDLRNEADSLVFQVEKTLTDLGENIGEEDKKSAEEKKDALKTALEGQDIEDIKSKKEELEKVIQELSAKVYEQAAQQQQQAQGANAGQNNDSTVEDAEFKEVKDDDKK >CP029655.1|AWQ97416.1|1770545_1771685_+|chaperone-protein-DnaJ MAKRDYYEVLGISKDASKDEIKKAYRKLSKKYHPDINKEEGADEKFKEISEAYEVLSDDNKRASYDQFGHDGPQGFGGQGFNGSDFGGFSGFGGGGFEDIFSSFFGGGRQRDPNAPQKGDDLQYTMTLTFEEAVFGTTKEISIRKDVTCETCHGDGAKPGTSKKTCSYCNGAGHVAVEQNTILGRVRTEQVCPKCNGSGQEFEEACPTCHGKGTENKTVKLEVKVPEGVDNEQQIRLAGEGSPGVNGGPAGDLYVVFRVKPSETFKRDGDDIYYKLNVSFPQAALGDEIKIPTLNNEVMLTIPAGTQTGKQFRLKEKGIKNVHGYGYGDLYVDIKVVTPTKLTDRQKELMKEFAQLNGEEINEQPSNFKDRAKRFFKGE >CP029655.1|AWQ98242.1|1771688_1772627_+|ribosomal-protein-L11-methyltransferase MNWTELSIIINHEAVELATNILENHGSNGVVIEDSDDLINQPEDKYGEIYALKKEDYPDKGVRLKAYFNEMTYDDKLRQQIKDELLNLDELDQHNIQFSEQIIAETDWENEWKNYFHPFRASKKFTIVPSWETYAKEADEELCIELDPGMAFGTGDHPTTSMCLKAIETYVLPQHSVIDVGTGSGILSIASHLIGVKRIKALDIDEMAVSVAKENFRRNHCETLIEAVPGNLLKDETEKFDIVIANILAHIIDEMIEDAYNTLNEGGYFITSGIIKEKYEGIQSHMERVGFKIISEQHDNGWVCLVGQKVSE >CP029655.1|AWQ96072.1|1772628_1773381_+|ribosomal-RNA-small-subunit-methyltransferase-E MQRYFIDQNADVSQRFFITKKEDIHHITNVMRYDVGSKIILTFNDQTVYLCEIADITSDKIAVDLKEKQNINTELPVDVTICSGLIKADKYEWLLQKATELGASSFIAVSMERSIVKLNEAKVVKKIERWQKIIKEAAEQSYRLVIPSIQFESNLKLICDTIDNYDYILIAYEEEAKDGELSNFKQTLQQFKAQDKVLMIFGPEGGLSENEISLFSNTSTVVGLGPRILRAETAPLYALSAISYEKELMG >CP029655.1|AWQ96740.1|1773387_1774734_+|threonylcarbamoyladenosine-tRNA-methylthiotransferase-MtaB MSTVAFHTLGCKVNHYETEAIWQLFKEANYERVDFEANADVFVINTCTVTNTGDKKSRQIIRRAIRQNPDAVICVTGCYAQTSSAEIMEIPGVDVVVGTQDRHKLLGYIDEFRKERQPINGVGNIMKNRKYEELDVPYFTDRTRASLKIQEGCNNFCTFCIIPWARGLMRSRDPEKVVEQATQLVNSGYKEIVLTGIHTGGYGQDLKDYNLAQLLRDLETINGLERIRISSIEASQLTDEVIDVLERSTKVVRHLHIPLQSGSDTVLKRMRRKYTMDRFSERLTKLHKALPDLAVTSDVIVGFPGETEAEFQETYDFIVKHKFSELHVFPYSPRIGTPAARMDDQIDEEIKNERVHKLITLSNQLGKLYASKFDQDVLEVIPEEQGDTEGTLVGYADNYMKVQFEGDESLIGQIVKVKITQANYPLNEGQAIKVVDFATNKSDREVLV >CP029655.1|AWQ97880.1|1775026_1775203_+|ribosomal-protein-S21 MSKTVVRKNESLEDALRRFKRSVSKSGTIQEVRKREFYEKPSVKRKKKSEAARKRKFK >CP029655.1|AWQ96879.1|1775422_1776130_+|putative-membrane-bound-serine-protease MSYNNFLQMTTILESTAGDTWVEQVSNIIVQPIFTLILTCLTFLGFVYQLYSKKINAAGIIATLSLLILFLGFLIQGNVNMHSILIFSIGVILVVIELFVVGAVIGIIGMILITISITTLGDNLLFMLANVIVALILTIVEWVILVKIFNRKIPFLDKVILKDSTNSESGYNSHDNRSHLVGKTAQTVTDLRPAGIIFCENERIDAVSDGNFILRNKTVKILEVEGTRVVVREVD |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP029655_9 | 2554263-2554344 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029655_9
|
1 spacers
spacers of CP029655_9
>9.1|2554287|34|CP029655|CRISPRCasFinder ATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCTCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029655_9
The CRISPR arrays of CP029655_9 >merge|CP029655|9|2554263-2554344|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCTCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGGG >CP029655|9|8|2554263-2554344|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGG ATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCTCAAT TTCTACAGACAATGCAAGTTGGGG
>CP029655.1|AWQ97112.1|2553264_2553651_-|toprim-domain-protein MAIVNKVIIVEGKSDKKRVQQVIAEPVNIICTHGTMSIDKLDDMIESLYDKQVFVLADSDDEGDRIRNWFKRYLSESEHIFIDKTYCQVANCPKQYLAHVLSKHGFTCKKETPLLPNINNERLVLVNE >CP029655.1|AWQ98264.1|2552975_2553272_-|thioredoxin-family-protein MNNSLDIKDVTTFYEEDKHLIFGYTPTCGTCKVSERMLDIANEILQLPLLKIDLNFYPQFCKDMQIMSTPILLLMNKDKEVKRIYAFKSVTDLLENLK >CP029655.1|AWQ98065.1|2551700_2552726_-|methionine-import-ATP-binding-protein-MetN-2 MIELKEVVKEYRTKNKEVLAVDHVNLSIRAGSIYGVIGFSGAGKSTLIRMFNHLEAPTSGEVIIDGDHIGQLSKNGLRAKRQKVSMIFQHFNLLWSRTVLKNIMFPLEIAGVPRRRAKQKALELVELVGLKGREKAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPTVLLCDEATSALDPQTTDEILDLLLKIREQQNLTIVLITHEMHVIRRICDEVAVMESGKVIEHGPVTQVFENPQHTVTKRFVKEDLNDDFETSLTELEPLEKDAYIVRLVFAGSTTTEPIVSSLSTAYDIKINILEANIKNTKNGTVGFLVLHIPYISSVDFGKFEKELIERQVKMEVLRHG >CP029655.1|AWQ97759.1|2551012_2551666_-|methionine-import-system-permease-protein-MetP MPNIQWPEVWTAIVETLYMTVVSTIFAFILGLILGVLLFLSAKGKSIGARLFYSIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSLILGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTWIVIRKVLLPEAMPALVSGITVTAIALVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWLTNKLDKR >CP029655.1|AWQ96822.1|2550173_2550995_-|NLPA-lipofamily-protein MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGNKSGSDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYDLDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGDVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFLPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK >CP029655.1|AWQ96673.1|2549625_2549820_-|hypothetical-protein MADESKFEQAKGNVKETVGNVTDNKNLENEGKEDKASGKAKEFVENAKEKATDFIDKVKGNKGE >CP029655.1|AWQ96425.1|2548540_2549392_+|hypothetical-protein MQQFKWINILKGFAMGTSDLVPGVSGGTIALLLGIYNQFIASISGIFSRRFWPSFTFLIPIIIGMLLAMGSLSNLFNYLLSQHHIPTMFFFGGLIIGIVPYLLKISNYKTSFTTKHYMMVIAGIAILIVITLMNNGDKHAGETLTLSTGLIIKYFIAGMCASSAMLLPGISGSFMLLVFGVYGTVMLAISEVVKLNFTGLPILLAVGFGVLAGFIISSKIIQYFLTHHKLMTFALIIGFVVGSLFAVFPGLPTNIVMWFVSLVVFIIGFIVSLTLGRITAENE >CP029655.1|AWQ96152.1|2547451_2548213_-|feS-assembly-ATPase-SufC MASTLEIKDLHVSIEDKEILKGVNLTINTDEIHAIMGPNGTGKSTLSSAIMGHPSYEVTKGEVLLDGVNILELEVDERAKAGLFLAMQYPSEITGVTNADFMRSAINAKREEGQEINLMQFIKKLDKNMDFLDIDKDMAQRYLNEGFSGGEKKRNEILQLMMLEPKFAILDEIDSGLDIDALKVVSKGINQMRGENFGALMITHYQRLLNYITPDKVHVMYAGKVVKSGGPELAKRLEEEGYEWVKEEFGSAE >CP029655.1|AWQ96067.1|2546046_2547354_-|feS-assembly-protein-SufD MTTDILNISEEQLVDYSKAHNEPSWMTELRKKALKLTETLEMPKPDKTKLRKWDFDSFKQHDVKGDVYQSLSQLPESVREIIDVDHSKNLVIQHNNTIAYTQVDDNASKDGVIVEGLADALMNHSDLVQKHFMKDAVTVDEHRITALHTALVNGGVFVYVPKNVVVEHPVQYVVLHDDKNASFYNHVIIVTEESAEVTYVENYLSNASGEGNQLNIISEVIAGANSNITYGSVDYMDKGFTGHIIRRGITEADASINWALGLMNEGSQIIDNTTNLFGDRSTSSLKSVVVGTGEQKINLTSKIVQYGKETDGYILKHGVMKEHASSVFNGIGYIKHGGTKSIANQESRVLMLSEHARGDANPILLIDEDDVQAGHAASVGRVDPDQLYYLMSRGISQREAERLVIHGFLDPVVRELPIEDVKRQLREVIERKVSK >CP029655.1|AWQ96051.1|2544690_2545932_-|putative-cysteine-desulfurase MAEHSFDVNEVIKDFPILDQKVNGKRLAYLDSTATSQTPMQVLNVLEDYYKRYNSNVHRGVHTLGSLATDGYENARETVRRFINAKYFEEIIFTRGTTASINLVAHSYGDANVEEGDEIVVTEMEHHANIVPWQQLAKRKNATLKFIPMTADGELNIEDIKQTINDKTKIVAIAHISNVLGTINDVKTIAEIAHQHGAIISVDGAQAAPHMKLDMQEMNADFYSFSGHKMLGPTGIGVLFGKRELLQKMEPIEFGGDMIDFVSKYDATWADLPTKFEAGTPLIAQAIGLAEAIRYLERIGFDAIHKYEQELTIYAYEQMSAIEGIEIYGPPKDRRAGVITFNLQDVHPHDVATAVDTEGVAVRAGHHCAQPLMKWLNVSSTARASFYIYNTKEDIDQLINALKQTKEFFSYEF >CP029655.1|AWQ96030.1|2554447_2555326_-|hypothetical-protein MLNIQDVSHLSKKEQKAYNRFVESVENGNLPVLPCIEMDLKEMQEETLSQSKIGGMPFLKSFKDIPLDENNVPMVLLAQINLNDLPEQQELFPVNEGILQFWISSEDQMYGMSENLKGNNINSRLVYIKEPITDLSLENIQVHLKSLDADNEDIPFSGAFSIEFRLSKQTITCTDYKYDEDVLALWNKVNPSFALKSMFGGYDELMEPVCNTFTAKEPFNQLGGYPYFDQIDPRTNDQELKMYDRVLLQIDSTRDGNSSIIWGDLGIANILVKSTDLEAMKFDDYMYSWDCS >CP029655.1|AWQ97646.1|2555327_2555441_-|hypothetical-protein MKENLLGTIIWSIATFYYSRMMKIMNLAILKIKIGGS >CP029655.1|AWQ96108.1|2555504_2555885_-|glycine-cleavage-system-H-protein MAVPNELKYSKEHEWVKVEGNVATIGITEYAQSELGDIVFVELPETDDEINEGDTFGSVESVKTVSELYAPISGKVVEVNEELEDSPEFVNESPYEKAWMVKVEISDESQLEALLTAEKYSEMIGE >CP029655.1|AWQ96342.1|2556042_2556399_-|transcriptional-regulator,-Spx/MgsR-family-protein MIKFYQYKNCTTCKKAAKFLDEYGVSYEPIDIVQHTPTINEFKTIIANTGVEINKLFNTHGAKYRELDLKNKLQTLSDDEKLELLSSDGMLVKRPLAVMGDKITLGFKEDQYKETWLA >CP029655.1|AWQ96689.1|2556542_2556863_+|thioredoxin-family-protein MQAIKSNESFKSIINSDTPVIVKFEAGWCPDCRAMDLWIDPIVEQYNDYQWYTVNRDELEDVVVENEVMGIPSLLVFKNGDKIAHLHSANAKSPEQVESFLAETFK >CP029655.1|AWQ97900.1|2557013_2557553_-|nitroreductase-family-protein MELQQAIANRRSVKKFKRDMHIDDALLYQAIEKAADAPNHGMREPWRVVHVPKDRLGDMSKDISKFAFPNELDKQQCHYDAVTKLGGMLLLILKTDPRQRQNDENYFAFGAYAQNLMLLLYEAGIGTCWKSPLYIYDPKVRKTLGIKKDEVLAGFLYLTDLEEDMPKAPRKNRNLITLY >CP029655.1|AWQ97143.1|2557635_2558352_-|3-dehydroquinate-dehydratase MTHVEVVATIAPQLSIEETLIQKINHRIDAIDVLELRIDQIENVTVDQVAEMITKLKVMQDSFKLLVTYRTKLQGGYGQFINDLYLNLISDLANINGIDMIDIEWQADIDIEKHQRIIKHLQQYNKEVVISHHNFESTPPLDELQFIFFKMQKFNPEYVKLAVMPHNKNDVLNLLQAMSTFSDTMDCKVVGISMSKLGLISRTAQGVFGGALTYGCIGEPQAPGQIDVTDLKAQVTLY >CP029655.1|AWQ96099.1|2558499_2558922_+|peroxiredoxin,-Ohr-subfamily-protein MAIHYETKATNVGGRKGHVYTDDRALDIDIVPPAQADGKATNPEQLFAAGYASCFNGAFDLILKQNKVRDAHPEVTLTVRLEDDSDSESPKLSVSIDATIKNVISQEEAEKYLQMAHEFCPYSKATQGNINVDLNVNVVD >CP029655.1|AWQ96502.1|2559320_2559815_+|acetyltransferase-domain-protein MIEIKTLTNNDFNEYKRLVSTVNEEFTQDSHYSQTMTDTLIHDILNQGSPKCIVFGCYENETLIATAALEQIRYVGKEHKSLIKYNFVTNNDKSINSELINFIINYARQNNYESLLTSIVSNNIGAKVFYSALGFDILGFEKNAIKIGNAYFDEHWLFYDLINK >CP029655.1|AWQ96793.1|2559969_2560587_+|lysE-type-translocator-family-protein MVTAIIHGFILAIGLILPLGAQNVFIFNQGANQPKYRYVLPAIITAGLSDSLLIIIAVVGVSIIIMSLPVLQAIIYIVGLIFLMYMAWTIWHDKPSTDGEAQIISPMKQVSFALSVSLLNPHAILDTIGVIGSSAALYSGSNKIAFTIACISVSWLWFFLLAILGKMVGSIDKTGKLLTIINKISSIIIIIVALMILQKLIQLLF |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP029655_10 | 2603004-2603082 | Unclear |
NA
Consensus repeat of CP029655_10
|
1 spacers
spacers of CP029655_10
>10.1|2603028|31|CP029655|CRISPRCasFinder GGCAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAG |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029655_10
The CRISPR arrays of CP029655_10 >merge|CP029655|10|2603004-2603082|CRISPRCasFinder AGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAGGCAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACA >CP029655|10|9|2603004-2603082|CRISPRCasFinder AGAATTTCGAAAAGAAATTCTACA GGCAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAG AGAATTTCGAAAAGAAATTCTACA
>CP029655.1|AWQ98025.1|2601812_2602745_-|HPr(Ser)-kinase/phosphatase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >CP029655.1|AWQ98176.1|2600967_2601807_-|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPSEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >CP029655.1|AWQ97247.1|2600474_2600756_-|bacterial-transferase-hexapeptide-family-protein MLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >CP029655.1|AWQ96080.1|2599027_2600467_-|tetratricopeptide-repeat-family-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYQNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >CP029655.1|AWQ96376.1|2598025_2598961_-|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >CP029655.1|AWQ96195.1|2597535_2597679_+|hypothetical-protein MQVGVWAPTKRISKRNSTGNASWGVGPNTEAYDKSAYDNVQVGVVQR >CP029655.1|AWQ97011.1|2596228_2597140_-|hypothetical-protein MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >CP029655.1|AWQ97095.1|2595236_2596232_-|hypothetical-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >CP029655.1|AWQ96000.1|2594181_2595126_-|sporulation-Regulator-WhiA-C-terminal-domain-protein MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >CP029655.1|AWQ97244.1|2593030_2593618_-|ATP-dependent-Clp-endopeptidase,-proteolytic-subunit-ClpP MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >CP029655.1|AWQ96992.1|2603408_2606255_-|excinuclease-ABC-subunit-A MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNIDLSEQDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIDVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGIDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDK >CP029655.1|AWQ98089.1|2606262_2608248_-|excinuclease-ABC-subunit-B MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVDGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >CP029655.1|AWQ98397.1|2608516_2608753_-|hypothetical-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >CP029655.1|AWQ96576.1|2608749_2609400_-|HD-containing-hydrolase-like-enzyme-family-protein MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENE >CP029655.1|AWQ96588.1|2609573_2610413_-|staphyloxanthin-biosynthesis-protein,-putative MKKTLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQHGTQVKTPVQHNYVSNVQAQTQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKAVKSPVRKASQAKKVVKQPVQQASKKVVVKQAPKQAVAKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTPEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH >CP029655.1|AWQ97918.1|2610821_2611814_-|peptide-chain-release-factor-2 MAEPNFWDNQTKAQDIIDKNNALKAIVNGYKTLQAEVDDMDATWDLLQEEFDEEMKEDLEQEVINFKAKVDEYELQLLLDGPHDANNAILELHPGAGGTESQDWANMLFRMYQRYCEKKGFKVETVDYLPGDEAGIKSVTLLIKGHNAYGYLKAEKGVHRLVRISPFDSSGRRHTSFASCDVIPDFNNDEIEIEINPDDITVDTFRASGAGGQHINKTESAIRITHHPSGIVVNNQNERSQIKNREAAMKMLKSKLYQLKLEEQAREMAEIRGEQKEIGWGSQIRSYVFHPYSMVKDHRTNEETGKVDAVMDGDIGPFIESYLRQTMSHD >CP029655.1|AWQ96314.1|2612246_2614778_-|preprotein-translocase,-SecA-subunit MGFLSKILDGNNKEIKQLGKLADKVIALEEKTAILTDEEIRNKTKQFQTELADIDNVKKQNDYLDKILPEAYALVREGSKRVFNMTPYKVQIMGGIAIHKGDIAEMRTGEGKTLTATMPTYLNALAGRGVHVITVNEYLSSVQSEEMAELYNFLGLTVGLNLNSKTTEEKREAYAQDITYSTNNELGFDYLRDNMVNYSEDRVMRPLHFAIIDEVDSILIDEARTPLIISGEAEKSTSLYTQANVFAKMLKQDEDYKYDEKTKAVHLTEQGADKAERMFKVENLYDVQNVDVISHINTALRAHVTLQRDVDYMVVDGEVLIVDQFTGRTMPGRRFSEGLHQAIEAKEGVQIQNESKTMASITFQNYFRMYNKLAGMTGTAKTEEEEFRNIYNMTVTQIPTNKPVQRNDKSDLIYISQKGKFDAVVEDVVEKHKAGQPVLLGTVAVETSEYISNLLKKRGIRHDVLNAKNHEREAEIVAGAGQKGAVTIATNMAGRGTDIKLGEGVEELGGLAVIGTERHESRRIDDQLRGRSGRQGDKGDSRFYLSLQDELMIRFGSERLQKMMSRLGLDDSTPIESKMVSRAVESAQKRVEGNNFDARKRILEYDEVLRKQREIIYNERNSIIDEEDSSQVVDAMLRSTLQRSINYYINTADDEPEYQPFIDYINDIFLQEGDITEDDIKGKDAEDIFEVVWAKIEAAYQSQKDILEEQMNEFERMILLRSIDSHWTDHIDTMDQLRQGIHLRSYAQQNPLRDYQNEGHELFDIMMQNIEEDTCKFILKSVVQVEDNIEREKTTEFGEAKHVSAEDGKEKVKPKPIVKGDQVGRNDDCPCGSGKKFKNCHGK >CP029655.1|AWQ96328.1|2615191_2615764_-|ribosomal-subunit-interface-protein MIRFEIHGDNLTITDAIRNYIEEKIGKLERYFNDVPNAVAHVKVKTYSNSATKIEVTIPLKNVTLRAEERNDDLYAGIDLINNKLERQVRKYKTRINRKSRDRGDQEVFVAELQEMQETQVDNDAYDDNEIEIIRSKEFSLKPMDSEEAVLQMNLLGHDFFVFTDRETDGTSIVYRRKDGKYGLIQTSEQ >CP029655.1|AWQ96443.1|2615824_2616499_-|putative-amidophosphoribosyltransferase,-ComFC MNNCLSCGAKLYENITIYNLFKKPNRLCDRCKENWDNIKLDIKARRCSRCLKHLNQDEAYCLDCKFLSAHFNLMEQLYCQFQYDGLMKEMIHQYKFLKDYYLCELLAHLIEIPQTSYDYIVPIPSSPAHDLSRTFNPVEAVLKAKGIRFDKILKMSNRPKQSHLTKKERLADENPFIIDTELDLNGKEILLVDDIYTTGLTIHRAGCKLYAKNIRKFKVFAFAR >CP029655.1|AWQ96730.1|2616491_2617445_-|type-III-restriction-enzyme,-res-subunit MRQTILLYAVTGAGKTEMMFQGIQYARRQGDNIAIVSPRVDVVVEISKRIKDAFLNEDIDILHQQSSQQFEGHFVVCTVHQLYRFKQHFDTIFIDEVDAFPLSMDKSLQQALKSSSKVEHATIYMTATPPKQLLSEIPHENIIKLPARFHKKSLPVPKYRYFKLNNNKIQKMLYRILQDQINNQRYTLVFFNNIETMIKTFSVYKQKITKLTYVHSEDVFRFEKVEQLRNGHFDVIFTTTILERGFTMANLDVVVIDAHQYTQEALIQIAGRVGRKLECPAGKVLFFHEGVSMNMIQAKKEIQRMNKLALKRGWIDE |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029655_7 | 7.1|1331521|34|CP029655|CRISPRCasFinder | 1331521-1331554 | 34 | CP029655.1 | 2247007-2247040 | 0 | 1.0 |
CP029655_7 | 7.1|1331521|34|CP029655|CRISPRCasFinder | 1331521-1331554 | 34 | CP029655.1 | 2603050-2603083 | 0 | 1.0 |
CP029655_3 | 3.1|917298|33|CP029655|CRISPRCasFinder | 917298-917330 | 33 | CP029655.1 | 2553974-2554006 | 1 | 0.97 |
CP029655_3 | 3.1|917298|33|CP029655|CRISPRCasFinder | 917298-917330 | 33 | CP029655.1 | 2590193-2590225 | 1 | 0.97 |
CP029655_4 | 4.1|1082086|31|CP029655|CRISPRCasFinder | 1082086-1082116 | 31 | CP029655.1 | 2590253-2590283 | 1 | 0.968 |
CP029655_4 | 4.1|1082086|31|CP029655|CRISPRCasFinder | 1082086-1082116 | 31 | CP029655.1 | 2590309-2590339 | 1 | 0.968 |
CP029655_7 | 7.1|1331521|34|CP029655|CRISPRCasFinder | 1331521-1331554 | 34 | CP029655.1 | 1638596-1638629 | 1 | 0.971 |
CP029655_8 | 8.1|1765282|33|CP029655|CRISPRCasFinder | 1765282-1765314 | 33 | CP029655.1 | 2035265-2035297 | 1 | 0.97 |
CP029655_8 | 8.1|1765282|33|CP029655|CRISPRCasFinder | 1765282-1765314 | 33 | CP029655.1 | 2597492-2597524 | 1 | 0.97 |
CP029655_9 | 9.1|2554287|34|CP029655|CRISPRCasFinder | 2554287-2554320 | 34 | CP029655.1 | 2035265-2035298 | 1 | 0.971 |
CP029655_10 | 10.1|2603028|31|CP029655|CRISPRCasFinder | 2603028-2603058 | 31 | CP029655.1 | 1730827-1730857 | 1 | 0.968 |
CP029655_2 | 2.1|842129|46|CP029655|PILER-CR | 842129-842174 | 46 | CP029655.1 | 838479-838524 | 2 | 0.957 |
CP029655_2 | 2.2|842192|37|CP029655|PILER-CR | 842192-842228 | 37 | CP029655.1 | 838542-838578 | 2 | 0.946 |
CP029655_3 | 3.1|917298|33|CP029655|CRISPRCasFinder | 917298-917330 | 33 | CP029655.1 | 1307553-1307585 | 2 | 0.939 |
CP029655_3 | 3.1|917298|33|CP029655|CRISPRCasFinder | 917298-917330 | 33 | CP029655.1 | 2590249-2590281 | 2 | 0.939 |
CP029655_3 | 3.1|917298|33|CP029655|CRISPRCasFinder | 917298-917330 | 33 | CP029655.1 | 2590305-2590337 | 2 | 0.939 |
CP029655_4 | 4.1|1082086|31|CP029655|CRISPRCasFinder | 1082086-1082116 | 31 | CP029655.1 | 180435-180465 | 2 | 0.935 |
CP029655_4 | 4.1|1082086|31|CP029655|CRISPRCasFinder | 1082086-1082116 | 31 | CP029655.1 | 475160-475190 | 2 | 0.935 |
CP029655_4 | 4.1|1082086|31|CP029655|CRISPRCasFinder | 1082086-1082116 | 31 | CP029655.1 | 1092887-1092917 | 2 | 0.935 |
CP029655_4 | 4.1|1082086|31|CP029655|CRISPRCasFinder | 1082086-1082116 | 31 | CP029655.1 | 1391161-1391191 | 2 | 0.935 |
CP029655_4 | 4.1|1082086|31|CP029655|CRISPRCasFinder | 1082086-1082116 | 31 | CP029655.1 | 1750646-1750676 | 2 | 0.935 |
CP029655_4 | 4.1|1082086|31|CP029655|CRISPRCasFinder | 1082086-1082116 | 31 | CP029655.1 | 1946760-1946790 | 2 | 0.935 |
CP029655_4 | 4.1|1082086|31|CP029655|CRISPRCasFinder | 1082086-1082116 | 31 | CP029655.1 | 1946876-1946906 | 2 | 0.935 |
CP029655_4 | 4.1|1082086|31|CP029655|CRISPRCasFinder | 1082086-1082116 | 31 | CP029655.1 | 2035309-2035339 | 2 | 0.935 |
CP029655_4 | 4.1|1082086|31|CP029655|CRISPRCasFinder | 1082086-1082116 | 31 | CP029655.1 | 2241409-2241439 | 2 | 0.935 |
CP029655_4 | 4.1|1082086|31|CP029655|CRISPRCasFinder | 1082086-1082116 | 31 | CP029655.1 | 2343933-2343963 | 2 | 0.935 |
CP029655_4 | 4.1|1082086|31|CP029655|CRISPRCasFinder | 1082086-1082116 | 31 | CP029655.1 | 2553978-2554008 | 2 | 0.935 |
CP029655_4 | 4.1|1082086|31|CP029655|CRISPRCasFinder | 1082086-1082116 | 31 | CP029655.1 | 2590197-2590227 | 2 | 0.935 |
CP029655_4 | 4.1|1082086|31|CP029655|CRISPRCasFinder | 1082086-1082116 | 31 | CP029655.1 | 2770712-2770742 | 2 | 0.935 |
CP029655_7 | 7.1|1331521|34|CP029655|CRISPRCasFinder | 1331521-1331554 | 34 | CP029655.1 | 643943-643976 | 2 | 0.941 |
CP029655_7 | 7.1|1331521|34|CP029655|CRISPRCasFinder | 1331521-1331554 | 34 | CP029655.1 | 2030891-2030924 | 2 | 0.941 |
1. spacer 7.1|1331521|34|CP029655|CRISPRCasFinder matches to position: 2247007-2247040, mismatch: 0, identity: 1.0
ccaacacagagaatttcgaaaagaaattctacaa CRISPR spacer ccaacacagagaatttcgaaaagaaattctacaa Protospacer **********************************
2. spacer 7.1|1331521|34|CP029655|CRISPRCasFinder matches to position: 2603050-2603083, mismatch: 0, identity: 1.0
ccaacacagagaatttcgaaaagaaattctacaa CRISPR spacer ccaacacagagaatttcgaaaagaaattctacaa Protospacer **********************************
3. spacer 3.1|917298|33|CP029655|CRISPRCasFinder matches to position: 2553974-2554006, mismatch: 1, identity: 0.97
cagtagctggcggaaagtcagcttacaataatg CRISPR spacer cagaagctggcggaaagtcagcttacaataatg Protospacer *** *****************************
4. spacer 3.1|917298|33|CP029655|CRISPRCasFinder matches to position: 2590193-2590225, mismatch: 1, identity: 0.97
cagtagctggcggaaagtcagcttacaataatg CRISPR spacer cagaagctggcggaaagtcagcttacaataatg Protospacer *** *****************************
5. spacer 4.1|1082086|31|CP029655|CRISPRCasFinder matches to position: 2590253-2590283, mismatch: 1, identity: 0.968
agctgacagaaagtcagcttacaataatgtg CRISPR spacer agctgacggaaagtcagcttacaataatgtg Protospacer *******.***********************
6. spacer 4.1|1082086|31|CP029655|CRISPRCasFinder matches to position: 2590309-2590339, mismatch: 1, identity: 0.968
agctgacagaaagtcagcttacaataatgtg CRISPR spacer agctgacggaaagtcagcttacaataatgtg Protospacer *******.***********************
7. spacer 7.1|1331521|34|CP029655|CRISPRCasFinder matches to position: 1638596-1638629, mismatch: 1, identity: 0.971
ccaacacagagaatttcgaaaagaaattctacaa CRISPR spacer ccaacacaaagaatttcgaaaagaaattctacaa Protospacer ********.*************************
8. spacer 8.1|1765282|33|CP029655|CRISPRCasFinder matches to position: 2035265-2035297, mismatch: 1, identity: 0.97
tgggccccaacacagagaaattggattcccaat CRISPR spacer tgggccccaacaaagagaaattggattcccaat Protospacer ************ ********************
9. spacer 8.1|1765282|33|CP029655|CRISPRCasFinder matches to position: 2597492-2597524, mismatch: 1, identity: 0.97
tgggccccaacacagagaaattggattcccaat CRISPR spacer tgggccccaacacagagaaattggatttccaat Protospacer ***************************.*****
10. spacer 9.1|2554287|34|CP029655|CRISPRCasFinder matches to position: 2035265-2035298, mismatch: 1, identity: 0.971
atgggccccaacaaagagaaattggattctcaat CRISPR spacer atgggccccaacaaagagaaattggattcccaat Protospacer *****************************.****
11. spacer 10.1|2603028|31|CP029655|CRISPRCasFinder matches to position: 1730827-1730857, mismatch: 1, identity: 0.968
ggcaatgcaagttggcggggccccaacacag CRISPR spacer ggcaatggaagttggcggggccccaacacag Protospacer ******* ***********************
12. spacer 2.1|842129|46|CP029655|PILER-CR matches to position: 838479-838524, mismatch: 2, identity: 0.957
acaaagataaacctaattatcaatttggtggacacaacagtgttga CRISPR spacer acaaagataaacctaattatcaattcggtggacacaatagtgttga Protospacer *************************.***********.********
13. spacer 2.2|842192|37|CP029655|PILER-CR matches to position: 838542-838578, mismatch: 2, identity: 0.946
ttccaaaagtaagtggtcaaaatgaaggtcaacaaac CRISPR spacer ttccaaaagtaagcggccaaaatgaaggtcaacaaac Protospacer *************.**.********************
14. spacer 3.1|917298|33|CP029655|CRISPRCasFinder matches to position: 1307553-1307585, mismatch: 2, identity: 0.939
cagtagctggcggaaagtcagcttacaataatg CRISPR spacer cagaggctggcggaaagtcagcttacaataatg Protospacer *** .****************************
15. spacer 3.1|917298|33|CP029655|CRISPRCasFinder matches to position: 2590249-2590281, mismatch: 2, identity: 0.939
cagtagctggcggaaagtcagcttacaataatg CRISPR spacer cagaagctgacggaaagtcagcttacaataatg Protospacer *** *****.***********************
16. spacer 3.1|917298|33|CP029655|CRISPRCasFinder matches to position: 2590305-2590337, mismatch: 2, identity: 0.939
cagtagctggcggaaagtcagcttacaataatg CRISPR spacer cagaagctgacggaaagtcagcttacaataatg Protospacer *** *****.***********************
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agctgacagaaagtcagcttacaataatgtg CRISPR spacer agctggcggaaagtcagcttacaataatgtg Protospacer *****.*.***********************
19. spacer 4.1|1082086|31|CP029655|CRISPRCasFinder matches to position: 1092887-1092917, mismatch: 2, identity: 0.935
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21. spacer 4.1|1082086|31|CP029655|CRISPRCasFinder matches to position: 1750646-1750676, mismatch: 2, identity: 0.935
agctgacagaaagtcagcttacaataatgtg CRISPR spacer agctggcggaaagtcagcttacaataatgtg Protospacer *****.*.***********************
22. spacer 4.1|1082086|31|CP029655|CRISPRCasFinder matches to position: 1946760-1946790, mismatch: 2, identity: 0.935
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23. spacer 4.1|1082086|31|CP029655|CRISPRCasFinder matches to position: 1946876-1946906, mismatch: 2, identity: 0.935
agctgacagaaagtcagcttacaataatgtg CRISPR spacer agctgacgaaaagtcagcttacaataatgtg Protospacer *******..**********************
24. spacer 4.1|1082086|31|CP029655|CRISPRCasFinder matches to position: 2035309-2035339, mismatch: 2, identity: 0.935
agctgacagaaagtcagcttacaataatgtg CRISPR spacer agctgacgaaaagtcagcttacaataatgtg Protospacer *******..**********************
25. spacer 4.1|1082086|31|CP029655|CRISPRCasFinder matches to position: 2241409-2241439, mismatch: 2, identity: 0.935
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26. spacer 4.1|1082086|31|CP029655|CRISPRCasFinder matches to position: 2343933-2343963, mismatch: 2, identity: 0.935
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27. spacer 4.1|1082086|31|CP029655|CRISPRCasFinder matches to position: 2553978-2554008, mismatch: 2, identity: 0.935
agctgacagaaagtcagcttacaataatgtg CRISPR spacer agctggcggaaagtcagcttacaataatgtg Protospacer *****.*.***********************
28. spacer 4.1|1082086|31|CP029655|CRISPRCasFinder matches to position: 2590197-2590227, mismatch: 2, identity: 0.935
agctgacagaaagtcagcttacaataatgtg CRISPR spacer agctggcggaaagtcagcttacaataatgtg Protospacer *****.*.***********************
29. spacer 4.1|1082086|31|CP029655|CRISPRCasFinder matches to position: 2770712-2770742, mismatch: 2, identity: 0.935
agctgacagaaagtcagcttacaataatgtg CRISPR spacer agctgacgaaaagtcagcttacaataatgtg Protospacer *******..**********************
30. spacer 7.1|1331521|34|CP029655|CRISPRCasFinder matches to position: 643943-643976, mismatch: 2, identity: 0.941
ccaacacagagaatttcgaaaagaaattctacaa CRISPR spacer ccaacaaaaagaatttcgaaaagaaattctacaa Protospacer ****** *.*************************
31. spacer 7.1|1331521|34|CP029655|CRISPRCasFinder matches to position: 2030891-2030924, mismatch: 2, identity: 0.941
ccaacacagagaatttcgaaaagaaattctacaa CRISPR spacer ccaacacagagaatttcgataagaaattccacaa Protospacer ******************* *********.****
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029655_5 | 5.1|1190121|34|CP029655|CRISPRCasFinder | 1190121-1190154 | 34 | JN882286 | Cronobacter phage vB_CsaP_GAP52, complete genome | 23034-23067 | 8 | 0.765 |
CP029655_5 | 5.1|1190121|34|CP029655|CRISPRCasFinder | 1190121-1190154 | 34 | CP030544 | Staphylococcus aureus strain ER04166.3 plasmid unnamed2, complete sequence | 7567-7600 | 8 | 0.765 |
CP029655_6 | 6.1|1202445|32|CP029655|CRISPRCasFinder | 1202445-1202476 | 32 | NC_016587 | Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p4, complete sequence | 41454-41485 | 9 | 0.719 |
CP029655_6 | 6.1|1202445|32|CP029655|CRISPRCasFinder | 1202445-1202476 | 32 | NZ_CP020399 | Burkholderia multivorans strain FDAARGOS_246 plasmid unnamed, complete sequence | 296489-296520 | 10 | 0.688 |
1. spacer 5.1|1190121|34|CP029655|CRISPRCasFinder matches to JN882286 (Cronobacter phage vB_CsaP_GAP52, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
cccagttgcaaacaataaagctaaagatatgcaa CRISPR spacer agcatataaaagctataaagctaaagatatgcaa Protospacer ** *. **.* ********************
2. spacer 5.1|1190121|34|CP029655|CRISPRCasFinder matches to CP030544 (Staphylococcus aureus strain ER04166.3 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
cccagttgcaaacaataaagctaaagatatgcaa CRISPR spacer tactgtttataacaataaagctaaagttattcaa Protospacer . * *** **************** *** ***
3. spacer 6.1|1202445|32|CP029655|CRISPRCasFinder matches to NC_016587 (Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aaaagtaggagcgcctgcgctaagcgcatgca CRISPR spacer tggaggtggagcgcctgcgcaaggcgcatgag Protospacer ..** ************* *.******* .
4. spacer 6.1|1202445|32|CP029655|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020399 (Burkholderia multivorans strain FDAARGOS_246 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aaaagtaggagcgcctgcgctaagcgcatgca CRISPR spacer tcgaagccgagcgcctgcgcgtagcgcatgcg Protospacer .*. ************ *********.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
468314 : 527557
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP029655|468314:527557|DBSCAN-SWA TATGAAAGAAAATTTTTGGAGTGAATTACCACGTCCATTTTTTATTTTGGCGCCAATGGAAGACGTTACAGATATCGTCTTTCGACACGTTGTAAGTGAAGCAGCTAGACCGGATGTGTTTTTCACTGAATTTACAAATACTGAAAGCTTTTGCCACCCTGAAGGCATACATAGTGTGCGCGGACGCTTAACTTTTAGCGAAGATGAACACCCGATGGTCGCTCATATATGGGGAGATAAGCCAGAACAGTTCCGTGAAACGAGTATTCAACTAGCTAAAATGGGCTTTAAAGGCATTGACTTAAATATGGGATGTCCTGTAGCAAATGTTGCTAAAAAGGGTAAGGGTTCCGGCTTAATCTTAAGACCGGATGTCGCTGCCGAAATTATTCAAGCAACTAAAGCAGGTGGGCTTCCGGTAAGTGTTAAAACACGCCTTGGCTACTATGAAATCGATGAATGGAAAGATTGGTTGAAGCACGTCTTCGAACAAGATATTGCCAATTTATCTATTCATCTTCGTACACGTAAAGAAATGAGTAAAGTAGATGCACATTGGGAATTAATCGAAGCTATTAAAAATTTACGTGACGAAATTGCACCAAATACATTGTTAACAATTAACGGTGATATTCCCGATAGAAAAACAGGACTTGAACTGGCAGAAAAATATGGCATCGATGGTGTCATGATTGGTAGAGGCATTTTCCATAATCCATTCGCTTTTGAAAAAGAACCACGCGAACACACAAGCAAGGAACTATTAGATCTATTGAGATTGCATTTATCATTGTTTAACAAATATGAAAAAGATGAAATACGACAATTCAAGAGCTTGCGTAGATTCTTTAAAATCTATGTGCGTGGCATAAGAGGCGCTAGCGAACTTCGCCATCAATTGATGAACACACAATCAATTGCAGAAGCACGAGCACTTCTAGATGAATTTGAAGCCCAAATGGACGAAGACGTTAAAATAGAATTATAGTATGAGTAATAAAGTTTATGGATGATATTTCCCAATTTAACACGGATTGAACACTTTCTACTTAGGTATTATCTTGGTTTTCCTGATAGGATAACTCCCGATGATGCCTTTTTACTTATGTCACTTATCCTTTTGGAAATGGTGCAAAATTAAAAATACATCAGGATATCGTTTAACTCAGAAAAAAACTCCAATCAAAAAAAATGTTTACAACACATTATGAAATTAAAATTGCTCTTAGTGTTCAACAGACAAAGTTATTGAAATTACTATTGGAGGTACATACCAAGCTATCATTTTGAGTACACGTGGTTTGAATATCTGGCAAGAAATGGAAATTGGTAATGTCAGTCATAAAGTCGCTAAACGTGCTCAAATACCATTAATTATTTTTAAATAATTTAGAGGATGAGGTATAAACCTTTAAAAAACAGCAGTGAGATGATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTTCTATTTTCATAATCATTCTTATTGAATGACTTCATCGTGATCATTTAAAACAGTAACAACTTTTTCAATCTTATACTATTTAGAGCTAAAAATTCACGACATATAAACACAACACTGACACGTCATTTAAATACTTAATCTTTTATAGTAAAAGATTTTTCATTAAAAATTTATTGTTTTCTGTACTTTATTATATTAATCCTTTTAGCATGCCGTACCAATACATTTTAGGTAATAAATCTTTCTTAAATATATACATACTTCTACGTTCTTTGGCCTGATTAAACGGCATTGTTTCTTTAGTATTTTTATTATAATCAAACTCTGCAAGTATTAACCTATTATATCCAGTAACAATAGGGCATGAAGTATAACCATCATAATGATGCGTTAACATTTGATTATTCATCACTTGCAATAAATTATTAGCGACGATAGGTGCTTGCTTACGAATAGCTGCGCCTGTTTTTGAAGTAGGTACATTTGAAGCATCACCAAGTGCAAATACATTAGAGTAGCTTTTATGCTGTAATGTGGTTGGGTTAACATCTACCCAACCCTCACTATCTGAAAGTGTACTTTCTTTTACTACATCTAAGGGACCCATAGGTGGTGTTACATGTAACATATCATAACTTATTGTTTTTCTATCGTATGCTTTGATATGTTCGAATGTAGCCACTTTTTTGTCACCGTCGATTTCAACAAGGTTATAATTATAATTGACTGTTATATTTCTTTCTTCAACAATCCTTTCTAATTCTTTATTATATTTTCCTACGTCAAATAAAGCATCTTTTGGCGTTGCATATATCACATTAGCGTTAGAACGGATTTTATGTTTCCTAAAATAATCTTCAGCTAAATACATAATTTTCATAGGCGCACCTCCACACTTTATAGGAGTGTTTGGATGCGTAAAAATGGCATTTCCTTGTTTAAAATTAGAAATTTGGTTCCAAGTTTCGTTAACATAGTCAGGTGAATAGTTAGAGCAAACACCATTTTTACCTATATTTTCTTTTAGTCCTTTAATTGAAGACCAATTAATCTGTAATCCTGGAGCTACTACTAAAAAATCATAATAAACGACTGTATTATCTCCTAAAATAACGCTATTATTTTCAGGTTGAAAACTTGAAACAGCCTGTTTTATCCAGTTAGCACCTTCAGGTATAACACTTTCCATATCTTTACGAGAACTTTTCAAACTAGATACCCCTGCACCAACCAACGTCCATAATGGTTGATAGTAATGATGGTCTGCTGGGTCTATAATTGCTATTTTCTCTTTTAAGTTTTGATTTTTTCTTAATAGTCTTGATGCTACGGTAACACCTGCTGTACCGCCACCAATAATAACAATTTGATAATGCTTATTCATTTTTTCCACATCCTTAAATTATTTTAATGATTCTGGAAAATCTTGATAGCCTTCTCTAATATTCACCACATTTTCAAAACCTTTGCTTTCCAATATACCCACTGCAATTGAACTTCTAACACCTGACTGACAATGTACATATATTTTATCCTCTTTATTAAAAGGAATATTTTCATTTAATAATTTACCATGTGGAATATTAACTGCTTGATCTAAGTGTCCATTATTCCACTCTTCATCATTACGTACGTCTAATACATGTTCTTCTTTACCTGTCATATCAGCGCTATGAACGGACTGGGTTGAAATGCCTGATTTTGGCAAACGATAGCCTGCTACCTTATCAAACCCAATTAATTGTAAAGTGTGTTTCGCTTTCTCAACAGTAGATTTATCTCCAATTAAATCTATATCTTTTTCAAAATCTAAGTACCAACCAATTTGATTAATAAAGTTTTTGTTGTATGGTATATTGATTGTTCCTTTTGTGTGGCCACCGTGAAAGGCCTCTTTGCTACGAAGATCAAATGCTACTCTCTTATTATCTAAACTAGGATAAACATCATATGATTGATATAAATTCATACCAAACTGATTAACTTGTTTCATTTGTGCAAAATGATGCGGTGGTGCTGGTTGATTTGATGTTAATGATTCAATAAATTTAGTCTCATCAATTTCATTAAATGCCCAGTTATTAATTTTCTCATAACCTATTGTAGATATAGGTATGGCACCTAATGCTTTACCACAAGGGCTTCCAGCACCATGACCCGGCCAGATTTGAACATAGTCTGGTAAATTTTTAATATTTTGAACGGACTCATACATTTGTTTCGCGCTAATTTCTGTAGAACCCTTTATTTGAACAGATTTTTCTAATAAATCAGGTCTACCTATATCACCAACAAAAATAAAGTCACCACTAAATAATCCCATCGGAACACTTGAACCACCACCTAAATCAGTGAGTAAAAAGCTAATACTTTCAGGCGTGTGTCCTGGAGTATGCAGAACTTCTAATTTAACATTGCCTACTTGAATGATATCTCCATGTTTAACAAATTGTGTTTTTGATGGCATATTTTTATACCCTAATGCATCTTCACCTTCGCCAGACACATATATATTTGCATTTAAGCGTTTAGCCACATCACGAATTCCTGAAGCAAAATCAGCATGAATATGTGTTTCTGTAGCTTGTGTAATTGTTAAACCTTCAGAATCTGCAACTTCTATATATTTCGATAAATCACGAACAGGGTCTATTATTATTGCCTCTCCTGTACGTTGACAACCCACTAAATATGATGCTTGAGATAAATGATTATCGTAAAACTGTTTAAAAAACATGATAACAACTCCTTTTATTAATAGATTTAATTAGATAAATAAATTATGATTCGCATTTTCAGTAGCACCAATATAAGTGCCTACACCACCGTACTCAACTTCATCTCTAAGTTCTTCTTTCTGAATACCCATGACATCCATACTCATCGTACAAGCGATTAATTTGATATTTTGCTCAATAGCTTGATTGATAAGTGTTGGTAATGAATCAACATTTTTCTTTTTCATTACGTAGCGCATCATCATATTTCCTAAACCAAACATATTCATTTTGGAAAGAGGCATTCGTATATTCTTTTGGGGCAACATTAAATCAAACATTTTTGCAATACCTTGCTTTTTAACATTAACTGTTTGCACTTTTTTTAATGCATTAAGCCCCCAAAAAGTAAAGAAGATAGTTACATCTTTTCCAGCAGCTCTAGCGCCATTTGCAATAATCAATGCTGCTACAGCTTTGTCTAATTCTCCACTAAATAATACAATTGTAGTACCTTTAGCAGAATAATTTATATCTAAATCTTTTGCTTTTTCTTTTTGAATAATCGCATTAATTCCATTGTTATTTTCATCAAGCTTAACTAAAGTATGCCTTGTTTGTTTCACCCAACTTTTAATATCACTAGGGAATCCAGGGTCTGTGACTTTGACTTCAATTTGGTCACCTACTTCAATATTCTTCATTTCTTGACTAATTTTTACAATTGGCCCTGGACATTGAAAACCACGATAGTTAAATTGTTTACGATCTGCTTTAATTTCTATACTTTTATATTCTTCTTGTGTATCATAACTATCG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56 | Staphylococcus_phage(46.15%) | integrase,transposase,tRNA | attL 521481:521535|attR 526827:526881 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1397902 : 1476602
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP029655|1397902:1476602|DBSCAN-SWA 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87 | Staphylococcus_phage(62.5%) | capsid,transposase,head,terminase,portal,tRNA,tail,integrase,protease,holin | attL 1393061:1393078|attR 1420166:1420183 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1514412 : 1576622
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP029655|1514412:1576622|DBSCAN-SWA 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62 | Staphylococcus_phage(92.0%) | tRNA,integrase,transposase,protease | attL 1516450:1516466|attR 1551660:1551676 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1706626 : 1715669
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP029655|1706626:1715669|DBSCAN-SWA CATGAATGAGCGTATGGTTGATCAATCAATGCATAGTGAAGAAACTGATTTCGAATTGTCGCTTAGACCTACGAGATTACGACAATATATTGGTCAAAATTCAATAAAAAGTAATTTAGAAGTATTTATTAAAGCGGCTAAACTTCGTCATGAACCATTAGATCATGTATTGCTTTTTGGCCCCCCTGGATTAGGTAAGACAACATTATCTAATATCATTGCCAATGAAATGGAAGTTAATATACGTACAGTATCAGGGCCTTCATTAGAAAGACCTGGTGATTTGGCTGCAATTTTATCAGGACTTCAACCTGGAGATGTATTGTTTATTGATGAAATACACAGACTGAGTAGTGTTGTTGAAGAAGTGTTATACCCTGCAATGGAAGATTTCTTTTTAGATATTATCATTGGTAAAGGCGATGAGGCTAGAAGTATCCGTATCGACTTACCTCCATTCACTTTGGTAGGTGCAACAACGCGAGCTGGCAGCTTAACAGGTCCACTAAGGGATCGATTTGGTGTGCACTTAAGATTAGAATATTATAATGAATCAGATTTAAAAGAAATCATTATTAGAACAGCTGAGGTTTTAGGCACAGGTATTGATGAAGAAAGTGCCATTGAACTTGCTAAACGTTCTAGAGGGACTCCAAGAGTAGCAAATCGACTATTGAAGCGGGTAAGAGACTTCCAGCAAGTGAATGAAGATGAACAAATATACATTGAAACAACGAAGCACGCATTAGGTTTACTTCAAGTTGATCAACACGGACTAGATTACATTGATCATAAAATGATGAACTGTATTATTAAGCAGTATAATGGTGGACCTGTTGGTTTAGATACGATTGCCGTAACAATTGGTGAAGAACGTATTACAATTGAGGACGTTTATGAGCCATTTCTTATTCAGAAAGGCTTTTTAGAACGTACGCCACGTGGCAGAAAAGCAACACCATTAGCTTATGAACATTTTGCAAAGTCGAATGAGGAGAGAGGATAACGTGAATATTGAAGAATTTGACTATGACTTACCAGAATCATTAATTGCTCAAACGCCTTTAAAAGATCGTGATCATAGTCGTTTATTAGTCATGGATAGAGAAACTGGTGAAATGAAACATTTACATTTCAAAGATATCATTGAGTATTTTAGACCTGGTGATACATTAGTGCTTAACGATACGCGAGTAATGCCAGCTAGACTTTTTGGTTTAAAAGAAGAAACTGGTGCAAAAGTTGAAATGTTAATGTTAACTCAAATTGAAGGTAATGATTGGGAAGTCTTACTGAAACCAGCTAAGCGTATTAAAGTTGGTAATAAATTGAATTTTGGTAATGGCAAAATTATAGCTGAGTGCATAAAAGAAATGGATCAAGGTGGACGCATCATGCGTTTACATTATGAAGGTATTTTACAAGAAAGATTAGATGAATTAGGGGAAATGCCACTGCCACCATACATCAAAGAACGTTTAGATGATCCAGATCGTTATCAAACAGTTTACGCTAAAGAAAGTGGTTCAGCGGCAGCACCAACAGCAGGATTACATTTTACTGATGAGTTATTAACTGAAATTAAAAATAAAGGCGTTAATATCGCATTTGTTACATTACATGTTGGGTTAGGTACGTTTAGACCGGTGAGCGTCGATGATGTGAATGACCACGAAATGCATAGTGAATATTATCAAATGACACAAGAAACAGCTGATTTATTAAATGATACTAAGTCCAAAGGACATCGCATTATATCAGTTGGTACAACTTCAACACGTACACTTGAAACAATTCGACGCGATCATGATAAATTTGTTGAAACGAGTGGCTGGACTAATATATTTATTTATCCAGGATTTGATTTTAAAGCAATTGATGGCCAGATTACTAATTTTCATTTACCAAAATCAACATTAGTTATGCTAGTATCAGCGTTTAGTACTCGTGAAAATGTTCTGAATGCTTATAAAACAGCAGTAAATTTAGAATATAGATTCTTTAGTTTTGGCGATGCAATGTTAATTATATAAAAAGAATGTGAGGATTTTGAATATGCCTGCAGTAACATACGAACACATTAAAACTTGTAAACAATCAGGTGCGCGTTTAGGTATCGTGCACACACCACACGGTTCATTTGAAACACCTATGTTTATGCCAGTTGGTACTAAAGCAACCGTTAAAACAATGAGTCCAGAAGAGTTAAGACAAATTGAAGCAAAAATCATTTTGGGCAACACATATCATTTGTGGTTACAACCCGGAAATGATATTATCAAACACGCTGGGGGATTACATAAATTCATGAATTGGGATGGTCCGATTCTTACAGATTCAGGCGGTTTCCAAGTGTTTAGTTTAAGTAATTTACGTAAAATTACAGAAGAAGGCGTGGAATTTAGACATCATACTAATGGGTCTAAATTATTTTTGAGTCCTGAGAAATCAATGCAAATTCAAAATGATTTAGGATCTGATATTATGATGGCATTTGATGAATGTCCACCGATGCCTGCTGAATATGATTATGTAAAAAAATCTATTGAACGTACAACACGTTGGGCGAAAAGATGTCTAGATGCACACCAAAGACCTGAAGATCAAGCATTGTTCGGCATTATACAAGGTGGCGAATATGAAGATTTAAGAGAACAAAGTGCAAAGGATTTAGTAGAATTAGATTTTCCTGGTTATGCAATCGGCGGTTTGTCAGTTGGTGAACCTAAACCGGTTATGTATAAAATGGTTGAACATACAGAGCAGTTTATGCCTAAAGATAAACCAAGATATTTAATGGGTGTAGGATCTCCAGATGCGTTAATCGAATGTAGTATTCGCGGCATGGATATGTTTGATTGTGTCTTACCGACACGTATTGCCAGAAATGGTACTTGTATGACATCGCAAGGTCGTTTAGTTATTAAAAATGCAAAATTTGCAGATGATTTAAGACCGTTAGATGAGAATTGTGACTGTTATACATGTCAAAACTATTCAAGAGCGTATATACGTCATTTAATCAAGGCAGAGGAAACTTTTGGTATTCGTCTTACTACTATTCATAATTTACATTTTCTGCTAAAATTAATGGAAGATATAAGACAAGCCATTCGAGAAGATCGTCTTTTAGATTTCAAAGAAGAATTCTTCGAGCAATATGGATTAAATGTTGAGAACCCAAAAAACTTTTAAGCAAGAGGAGCGTATAAAATGCAATTTTCATTACTAATATATATAGTCGTAATTTTTGCGGTTATGTATTTCTTGATGATCAGACCACAACAAAAACGTGCGAAACAGCATCGTGAGTTGATTAATAACATTCAATCTGGTCAAAGAATTACAACTATTGGTGGTATTAAAGGTACTGTTAAAGCAGTAGATGAAACAACTGTTGTTATTACAGTTAATGGTCATGGTACTGAATTAACTTTCGAAAAACCTGCTATTAAACAAGTTGACCCTTCATAACGAGAAGTGGTATTAAAAAGGATGAAACGAATAGCGTTTCATCCTTTTTAAGTTATAAGTAGTATGTAGAATAGCTTATTTTTATTCCAAAAAAAGAAATTGTGATACATAATAATTGTTAAATTTAAATTAAATATATCTATGACTATTTTTACTCCCTGCTCTAGTATGTTAATATGTATAAGGCTAATAAATTTTGTAAGAAAGATTTAACTTGCGTTATAAAATAGTATTCAAGTATTCTAAATACATACGTAAATAATGAGGTGTTCATGTGAAGAAAAGTAGTAGAATAATTGCGTTCTTGCTTTTAGTCGTATTGTTGTTTGCCGGAATGGCTGCAACTTATAAAAGTGTTATAAAGAATGTCAATTTAGGACTTGATTTGCAAGGTGGATTTGAGGTGCTTTATCAAGTCGATCCTTTAAATAAAGGCGACAAAATAGATAAAAAAGCCTTACAATCAACAGCGCAAACATTAGAAAATCGTGTTAACGTTTTAGGTGTTTCGGAACCTAAAATTCAAGTTGAAGAACCTAATAGAATTAGAGTTCAACTTGCTGGTGTAACAGACCAGAATGAAGCACGTAAAATTTTATCTTCTCAAGCTAATTTAACAATTCGCGATGCAGAAGATAAAGTAAAATTAAGCGGTTCTGATATTAAACAGGGATCTGCCAAACAAGAATTTAAACAGGAAACAAACCAGCCTACAGTTACTTTTAAAGTAAAAGACAAAAACAAATTTAAAAAAGTAACGGAAGAAATCTCTAAGAAACGTGATAATGTCATGGTTGTTTGGTTAGATTTCAAAAAAGGTGACAGCTATAAAAAAGAAGCACAAAAGAAAAACCCTAAATTTATTTCTGCAGCAAGTGTTGATCAACCAATCAATTCTGATAGCGTAGAAATCTCGGGTGGATTTAAAGGACAAGAAGGCGTTAAAAAAGCAAAACAAATCGCCGAATTGTTAAATGCAGGTTCTTTACCAGTTGACTTGAAAGAAATTTATTCAAACTCAGTAGGTGCCCAATTTGGTCAAGATGCATTAGATAAAACTGTGTTTGCATCGTTTATTGGTGTAGCATTAATTTATTTATTCATGCTTGGATTCTACCGATTACCTGGTTTAGTAGCGATTATTGCATTGACAACTTATATCTATCTAACGTTAGTAGCATTTAATTTCATTTCCGGGGTTCTAACTTTACCAGGATTAGCGGCGTTGGTATTAGGTGTAGGTATGGCTGTAGATGCCAATATTATCATGTATGAGCGTATTAAGGATGAACTTCGAATAGGTAGAACGATAAAGCAAGCCTTTTCTAAAGCAAACAAAAGTTCATTCCTAACAATTTTTGATTCTAACTTAACAACAGTTATCGCCGCAGCAGTATTATTCTTCTTCGGTGAAAGTTCAGTTAAAGGTTTCGCGACAATGTTATTATTAGGTATTCTAATGATCTTTGTTACAGCCGTGTTCTTATCAAGATTCTTATTATCATTACTTGTTTCATCAAATATAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP029655|1706626:1715669|1708680_1709820_+|AWQ97946.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >CP029655|1706626:1715669|1712855_1715129_+|AWQ98193.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDVNHDALQLSDMTKAIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKKGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >CP029655|1706626:1715669|1715150_1715669_+|AWQ97000.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >CP029655|1706626:1715669|1709838_1710099_+|AWQ98131.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >CP029655|1706626:1715669|1710373_1712653_+|AWQ97321.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >CP029655|1706626:1715669|1707632_1708658_+|AWQ97752.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >CP029655|1706626:1715669|1706626_1707631_+|AWQ98214.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERG |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2333979 : 2342452
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP029655|2333979:2342452|DBSCAN-SWA CTTATTTTACAATTTTAGCAATAACACTTGGATATAACTCATATTCCAATTTTTTTACTTTCTCTTCTAATTGTTCTTTTGAATCGTCCGGTCTAATATCACATTGTCTCTGTTCAATAATTTCTCCCGTATCCATACCACAATCAACATAATGTACTGTCGAACCAGTAATAGTATCGCCACTATGATATGCTTGGCCTATTGCGTCAATCCCCTTATATTTCGGCAATAGAGATGGATGTATATTCAATATTTTACCTTCAAATGAAGCTAATAAATCTGGACCAATTAGACGCATGTAGCCAGCTAAAATAATCCACTCTACCTTATCTTTATTTAATAATGTTACTAAATGTTGTTCATACGCTGCTTTTGAATCAAATTGTTTTGGTTCATTAATATAAACAGGAATATCGTGCTTTTTTGCTCTATCTATACAAAACGCATTTTGATGATCCGTATATAGCGCCGTAACTTCAATATTTTCAAGTTTTCCTGATTCAACATGCTCAACTATATTTTCAAAGTTACTTCCTGAACCTGATGCAAAAATCGCAATTTTAACCATTGTTATACCCCCAACAATTCAATTGCAGTTGACTCATTTTTCACAATATGACCAATTTGATAAGCTTCCACATTTTGTTCTGCTAAAATCTTCAAAGCGCGTGATGCATCTTTTTCATCAACGATAACCGTATAGCCAATACCCATGTTAAAAATGTTATACATTTCATTTGTGTCTATATTGCCTTGTTGTTGTAACCAATCAAATATTTTTGGCGTTGGAAATGATGTAGTATCAATTCTAGCAGCATATCCGGCTGGCAATGCACGTGGAATATTTTCATAAAAACCTCCACCAGTAATATGATTCATTGCCTTAATAGAAACTTCTTTTTTTAAAGCAAGTACAGGTTTGACATATAATTTAGTTGGTTCTAAAAAGACATCTATAAATGGACGATTATCGAAGTTTGATGCCAAATCAATGCCTGATTCATTAATTAATTTGCGCACTAAACTGTATCCATTTGAATGAATGCCACTTGACGCAAGTCCTATAACAACTTGTCCCTCTTTCACTTCTGAACCATCTACATAGTCATCCTTTTCAACTGCTCCAACAGCAAATCCGGCTACATCATATTCACCTTCGTGATACATTTCACCCATTTCAGCAGTCTCTCCACCGATAAGTGCAGTATTCGTTTCAACGCATGCATCACTAATACCTTTAACAATTTGTTCAATAACTTCAGGAACAACTTTATTTGTAGCGATGTAATCTAAAAAATACAATGGTTCTGCACCTGTCGTTAAAATATCATTAACACACATTGCAACTGCATCGATACCTATCGAATCATGTTTCCCATAGTCGATAGCTAGTTTTAATTTCGTACCTACTCCGTCTGTTCCAGAAACTAAAACTGGCGCTGTCATATTTAATTGTGATAAATCAAATGTAGCACCGAATCCACCTAAACCACCGATAACTTCTTTACGCATCGTACGTTTAACATGACTAGACATTCTTTCTACAGCTTCATAACCAGCATGAATATTTACACCAGATTGTTCATATGCTTTAGACATTTAAATTTCCCTCGCTATCAAAAAAGTGTTTGTTTTTAGAAATATATTGCTTTTGTCGATGACTTAAATGTGCTTTATAATTTGCTTCATAATCATATAACCCTGCAGGATAATCTCCAGTGAAACTTTCTACACATAAGCCACTATATGGCGCGTCATAATCTAAACCAATTGATTCAATTAACCCATCTACAGATAGATATGCTAATGAATCAGCGCCAATATAATCTTTAATTTCTTCAGGTGATTTGCTTGCAGAAATTAATTCTGCCGTAGTTGAAACATCGATTCCATAAAAACTTGGGAACATAAATTCCGGTGATGCTATACGCACATGCACTTTATTTGCACCAGAATCTTTTAACATTTTCACAATGCGTCGAATTGTCGTACCGCGAACAATGGAATCATCAACAAGAATGATATTTTTCCCATCTACTATATCTTTTACCGCAGATAACTTCACTCTCACACCTTGCTCACGTAATTCTTGAGTTGGTTGAATAAATGTTCTTGCAACATATTGATTTTTAACTAGTCCCATTTCATATGGCAAACCTATTTCTTCAGCATAACCACTCGCAGCTGATAGCGATGAATTGGGTACACCGATGACCATATCAGCATTTACAGGGCTTTCTTGGGCTAATTTTTTACCAGAAGCTTTACGTACTGCATGGACATTTTTACCAGCTATTGTTGAGTCTGGTCTAGCAAAATAAATATATTCCATCGCAGAAATTGCAGTTGTCGTATGATGTGTATAAGATTTAACTGTAATACCTTTATCGTTAATCACGACATATTCACCTGCATGAATATCTTGAACAAATTCTGCACCTAACACATCTATTGCACATGTTTCACTTGCAAGGATGTATGTACCATCTTTCATTTTACCTACAACAAGTGGTCTGATAGCATTTGGATCTACTGCGCCATATAACGCATCTTTAGTTAATATCGCAAATGTAAAACCGCCTTTAACTTTTCGCAAACTTTCTTTCAATGCTTCCTCAAAAGTAGGAGCTTTACTTCGACGTATCAAATGCATAATGACTTCAGTATCTGAAGACGAATGGAAGATAGCACCTTGTTTTTCTAAATTCTGACGCAATGATTTAGCATTAATGAGGTTACCATTATGACAAATACCTACACTCATATCATAAAAGTGATACAGAAACGGTTGAATATTTTCAATACCTTTATTACCTGAAGTAGCATAACGGACGTGACCAATTGCATGTTGATATCCTTTTAATCGTTCCATTTGATCATCGTTAATCGCTTCAGTTAGTAAGCCTAATCCTCGCTCGCCTTTTAATTCATTTTGATCAGAAACAACTATACCTGCACCTTCTTGACCACGATGTTGCAAACTATGAAGTCCCATATATGTTAGTTGCGCTGCTTCAGGATGATTCCAAATACCAAACACGCCACATTCTTCGTTTAATCCTGAGTAGTTAAACATTGAGCAATTGCCCCTTCCCATATTTGTTTAATATCTGAAACATTTTCACTAATCTCTGTATATGGTGTTGTTACTTTGAAATTATCACTATCTGTTAAAAGTCCAATTTCTATTGCATTATCAATATTTAAAGTTTTACCTGATTTAACAGAAACAACATATCGGCCTTGTGTCTCACTAAACAATTGTGCATTTGTTATATCTATTGAAGATTTTAATCCTAAACCGTAATGCGCACTTAGTTTAGCTAAGGTAATCAGTAAGCCACCTTTACCAACTGTTTGAACATGTGATAATAGTCCTTCACGAATAGCGGTCTTGATTGATTCACCTTTTTCAACTTCTGAACTCAAATCTAATGACTCAAATTCATGATTAACTTTGCCATAAATTAACTTTTCAAGTTGACTACCACCAAAGTCGTCCTTAGTATCACCGATTAAATATAATTTATCTCCAACTTGAGGTTCAAAATCATTTAAATAATTTACATTTTCAATCAAACCTACCATTCCAACAACTGGTGTTGGGAAAATAGAAGTACCTTTCGTTTCGTTATATAAAGATACATTTCCAGAAACTACTGGTGTCTTAAGAATGTCGCATGCTTCTGCCATACCTTTCGTTGAATCTATCAACTGTTGATAGATTTCTTTCTTTTCAGGAGAACCATAATTTAAACAATCTGTCATTGCTAATGGTGTTGCACCCACGGCAATTAAATTTCGATAAGCTTCAGCTACTACCATCTTTCCACCTTCATATGGATTGTTATATACATAACGCGCTTCACCATCAATTGTTGAAGCAATTGCCTTATTTGTGCCTTCCACACGTACTACCGATGCTTGAAGTCCTGGCTTAATTATCGTATTGGCACCAACTTGTTGGTCGTATTGATCATATAAATAGTGTTTAGATGCTATAGTCGGATGCTTAAGTAATTTAAAGAAAGTATCTTTAACATCGATGTGTGTATAATCATTTTTAGAAGTATTATAATCTTTTTCTTCTCCTTCTAAAATATATACAGGTGCTTCATCAGCTAGTGGTTCAACTGGAATGTCAGCATAAACTTCATCATCATATGTTAAAACAAAACGATTTGTATCTGTAACTTCACCTATAACAGCACTATCCAATTCGTGCTTATCAAATAAATCTAAGAATTTTTGTTCATTACCTTTTTCAACAACTAGTAACATACGTTCTTGAGTTTCTGAAAGCATCATTTCATAAGGAGAAATACCTGGCTCACGTGTTGGCACTTGTTCTAATCTCAAATGTAACCCACTACCACCTTTTGCCGCCATTTCAGACGATGAAGATGTTAAACCAGCAGCACCCATATCTTGAATACCAACTAATTCATCAAATGTAATTGCTTCAAGTGTTGCTTCCATTAATTTTTTACCTACAAATGGATCACCGATTTGTACAGAAGGTCGTTTACTTTCGCTTTCTTCCGTCAATTCTTCAGATGCAAAAGTAGCACCATGAATACCATCTCGACCAGTTTTCAAACCAACATAAATGACCGAATTACCTACACCTTTTGCTGTGCCTTTTTGAATCATGTCGTGATTGATAACACCAACACACATTGCATTAACAAGTGGATTGCCATCATAACGTTCATCAAATTCGATTTCACCAGCAGTTGTTGGAATACCAATGCAGTTACCATAACCTCCGATACCCTTTACAACCCCTTTAAGTAATCTTTGGTTTTGTTTATTATCTAATTCTCCAAATCTAAGACTGTTTAACAAATTAATAGGTCTAGCCCCAATAGAAACAATGTCACGAATGATTCCACCAACGCCTGTAGCAGCCCCTTGATATGGTTCAATTGCTGATGGATGATTGTGAGACTCTACTTTAAATACTACGGCTTGATTATCACCTATATCGACTACCCCTGCACCTTCACCTGGACCCATAAGCACATGCTCACCTGACGTAGGAAATTGCTTTAAAAACGGTTTAGAATGTTTATAAGAGCAATGTTCACTCCACATAACAGAAAAGATACCTGTTTCTGTAAAGTTAGGTTGTCTGCCTAAAATATCGCAAACTTTTTCATATTCTTGATCACTTAATCCCATATCTTGATATACTTTTTCAAGTTTAATTTCTTCAACGCTTGGTTCGATAAATTTAGACATGTTGTTCCCTCCAACTTTTTACCATCGCTTCAAATAATTTCACACCACTATCAGTACCTAACAACGTTTCTAAAGCTCTTTCAGGATGTGGCATCATGCCACATACATTGCCTTTTTCGTTAACAATTCCTGCAATATCATCATATGAACCGTTCGGATTATTCACATATTTCAGAATAATTTGATTGTTAGCTTTTAATTGTTGATATATTTCATCAGTACAATAATAATGACCTTCACCGTGAGCTACAGGATATATAACTTTTTCACCTTGCTCATAAAGATTTGTAAATGCCGTTTGATTATTCACTATTTCTAACTCTTCATTTCTACTAATAAATAAATGTGAATCGTTATGCAATAATGCACCAGGTAATAAGCCTATTTCAGTTAAAATTTGAAACCCATTACAAACACCTAATACTGGCTTACCTTCAGTTGCAAGACGTTTAACTTCCGAAATAATCGGCGCTACACTAGCCATTGCCCCAGATCTTAAGTAATCCCCGAATGAAAATCCACCAGGAATAAGTACGCCATCAAATCCACTTAGTGATGTTTCTCTATAATCTACATATTCCGCTTCAACACCACTTTTAATAGCAGCATTAAACATGTCTCTATCACAATTCGAACCTGGAAAAACAAGAACCGCAAATTTCATTTTATGCATTCTCCTTTTCATCATCTAACACTTTATAGCTATATTCTTCAATCACTGTATTTGCAAACAATTTTTCACTTAGAGTTGTAATAATGTTGTGTACCTTTTCATCACTAACCTCATCCACTGTCATATATAATACTTTTCCTACACGAATATCATTCACTTGTGCATAACCTAAGTCATGTACAGCTCGAGTAAGCGTTTGTCCTTGCGTATCTAATACTTGTGGTTGTAATGTGATATGTAGTTCAATTGTTTTCATTATTTTAAATCCTCCAATTTGTTTAAAAATATTTGATATGTTTCAATCAGTGATCCAGTGTTATTTCTATATACATCTTTATCAAAGTTTGCATTGGTAGCTTTATCCCAAATTCGACATGTATCTGGAGATATTTCATCCGCTAACAAAATTTGACCAGTCTCAGTCTTTCCAAATTCGATTTTAAAATCTACTAATTTTAAATTCATAGCATCCATTAATTGTTTCAACACATTATTAATCTTTAATGCTTTGGATTTTAGTATTTCAATATCTTCATCTGATGCTATATTGAGCAATTTAACATGGTCATCCGTTATCAACGGATCATTTAACGCATCATTTTTATAGAAAAATTCTACAAGTGGTTCTCTAAAAACTTCACCATTTTCAAAACCTAAACGCTTTGTAATAGATCCACTAGCAATATTACGAACAACTACTTCTAATGGAATTATTTTCACAGGCTTAACTAATTGTTCTGTTTCAGATAATTGTTTAATAAAGTGACTTTCTATTCCATTTTCTTGTAAATATTTAAATATAATAGAAGTAATTTGATTATTTAATCGCCCCTTACCTGCCATTGTGTCTTTCTTAGCCCCGTTTCCAGCAGTAACTTCATCTTTATATTCAACTCTTAATTCATTTTCTTGATTTGTTGAGAAAATGCGCTTCGCTTTTCCTTCATATAATAATGTCATGCTTTAATTACTCCCCTCAAATTTAGCGTACATATCTTGTTCAGTTTGGTTTACATCATTCGTTAGTACAGTCATATGCCCCATTTTTCTGCTATCTTTACGCCCAGACTTACCATAAATATGTAAGTGCCACTCTGGATGTTCATTAAATTCATTTTCCAATAAATCTAAGTCTTTACCTAGTAAGTTCATCATGACTGCAGGCTTTAATAATTCAATTGAATTTGGTAATGATTGTCCGGTAACTGCTAAAATATGAGTATCAAATTGTGAATAATCACATGCTTCAATTGAATAATGTCCGGAATTGTGAGGCCTTGGTGCAATCTCGTTCACATACAATTGGTTGTTACTATCTATAAAAAATTCCACTGTAAATGTTCCAATGAAATGAATCGATTGGATAATTTTATTAACTTGCTCTTTCGCCTCAGCTGTTTTATCTATTCTCGCTGGAACAATTGTTTTGAAAAGTATTTGATTTCTATGCTCATTTTCTTGTAATGGGAAAAAAGTGATTTGATTGTTGTTTCCTCTTGTAACAGTAAGAGATACTTCTTTCTTGATATTCAAATATTTTTCAGCTACGCATTCACTAGTTTCAATTAATTTAAAACCTTCTTGTAAGTCTTTTTCGTTGTTAATTAAAACTTGACCTTTGCCATCGTAGCCACCAAATCTAGTTTTTACAATAAAAGGATATCCTAATGTTTCAATTGCTTTGTCAATATCTGTAGATTCTTTTACTGAAATGAACGGGACAACTTTGGTACCAGCACTTTTTAATGTTTCTTTTTCAGTTAAGCGGTCTTGTAATAACTGTATAGCTTGGTAACCTTGCGGAATATTGTACTTTTCACATAATAGTTTTAATTGTTGGGCTGAAATGTTTTCAAATTCATAAGTAATCACATCACATTTTTGTCCTAATTGATTGAGTGCCTTTTCATCGTCATACTTGGCTTGTATAAATTCGTGTGCAACGTATCTACATGGACAATCTTCAGAAGGATCCAATACAACCACTTTATAACCCATTTTTTGAGCTGATTGTGCCATCATCTTTCCAAGCTGACCACCACCAATAATGCCAATAGTCGCACCAAACTTTAATTTATTGAAGTTCATTTTGCATGTCCTCCACTTTTTGAATTAACGAAGATTCATACTGATTTAGTTTTTCAACTAAAGAAGGATTTTGAATACTTAACATTCTTGCTGCAAGTATACCTGCGTTTTTAGCACCTGCTGCACCAATTGCAGTCGTTGCAACCGGAATACCTCCTGGCATTTGAACAATTGATAATAAAGAATCTATACTCTTTAAACTTTTTGTTTCAATCGGCACACCAATAACTGGTAGCGTCGTTAATGATGCAACCATACCTGGTAAATGTGCCGCACCGCCAGCGCCTGCAATGATAATGTTTATACCTCTTTCTCTCGCTTCAGAAGCAAATTGAACCATCATTTTTGGCGTACGATGTGCGGATACTACTTGTTTTTCGTACGGAATTTCAAAATAATCCAACATGTTACAACTCTCTTGCATAATTTTCCAATCGGAAGAACTGCCCATAATGACTGCTACTTTCAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP029655|2333979:2342452|2337032_2339222_-|AWQ97103.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGNEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >CP029655|2333979:2342452|2334548_2335577_-|AWQ96422.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >CP029655|2333979:2342452|2335569_2337054_-|AWQ97537.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAINDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >CP029655|2333979:2342452|2339214_2339886_-|AWQ97673.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLATEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >CP029655|2333979:2342452|2339887_2340151_-|AWQ98410.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >CP029655|2333979:2342452|2333979_2334546_-|AWQ97200.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNKDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDCGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >CP029655|2333979:2342452|2340150_2340855_-|AWQ98417.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIASDEDIEILKSKALKINNVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >CP029655|2333979:2342452|2340858_2341983_-|AWQ97367.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVVVLDPSEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITFFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSGRKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >CP029655|2333979:2342452|2341969_2342452_-|AWQ96717.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGINIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKSIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2489008 : 2545932
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP029655|2489008:2545932|DBSCAN-SWA ATTAGGCGGCCAGTCCATTATTGGGCTTGGTTGTCTTCTTTTTTTCTCCTTTGTATAAGCTGAAAATCATCATTATACGTGCTTTAAAGTTGTTGAAATTTCTGTAACCAAAAGAAATTCGCTTGATTAATTTTATCTTATTATTAATTCCTTCTATAGCACCATTATTAAATGCTGGGTAATAAATTGTATTTCTTAACATCCTTTGATGTTTTCTATAATATTTAACCACTTTCCATACACCTTTACTCACAGACTTTTTACTAACTGAATTTAAACGATTAATAAATTTAGGCCAATTACATAACCTTAGATCTTTTCTTAATCCTTGGACAAGTTCGTAGGAGCGTCGTAGTATATCGTCTTTTGAAAGCATGAATTCTACAATGTCAGATGAGCGTTTATAAGCCTTAAAAGATTTATTCCATCTGTATTTACTAAATATGGTTTTACTAGTATCCATCAATAGAACTTTCCAGTTATTCTTAAAAATTGTATAATTAGGTCCTTTTTTATTACGGTATTCATTCATAACTTGTACACGATACTTATTAAGTTCCCTATTTAAATGTTGAACGATATGGAATCTGTCAAAAATAATAGCTGCATTAGGAAATAGGTCGCGAAATAATCGGACATAGGGTTCATACATGTCAATAGTAACCGTCTTAACTTGTTGTCGATTTTTTAAATCGAATCGCTCGAAATAGGCACGCAAGAATCTTGTAGTTCTATTTTCTAAAATATCTATAACATCATGAGTATCATTATCTATAAAAATGAAACTCATTGATCCAGTTACATTTTTAACGCTTTTAAATTCATCCATAGCGATGTGTTCTGGCAAACAATTAAACGGTTTAATTCGTAATGAATTAGCCGCTTTAGTTCTAATACGACTTACAGTAGATGGAGAGATACAGTTATCTTCTGCAGTATCAATCTCTGTTTTAACTTTAGTAGCTTCTTCTATAACTTTTTGAGTAACACATCTTGAGATAAAACACGACTCATCAACAATTGACGTTTTAGCAGTAAAAGTGCCATTGCATTCTAAGCATTTAAAACGTTGTTTAGCTAAGTTGAGGTATGTGTTATACCCTTGAGTTTTAAGTAAAGTAATACGAGAAACACGCTTACCATGTTTATGAATTTGTCCTTCATTTTTAACTCCACAACAATAACAGGCCGAAGGCTTATACGTTAGTACAGCATTAACCACTGTTGCTTTTTTTCCTTTGATAATGACGTCAATTTCTTGGTTTATATATTTTATATTTTCATCTTTTATTCTTAGTAATTCTAAGGTATCATTACACATAGGCGCACTTGTCTCCTTTAGTTTGGGTTTGGTCACTTTAAATTATAGAGGCAATTGCGCTTTTTGTGTATTAAAAAAAGCAGGAAGTTTTACCTTCCCACCATAAAAGATGAAGAACCTTCATTAAAGATAAAAACCCCTAACTAGATTACAGGTCCATGCTTGAATTGCATGATTCCCATTTTCAATCTAGCTAAGGGTTTTATTAATGTTCAGTATCTTGAATGGTTGGCTTAATCTTCACATCTTGAAGTTTATTGTCGTCATCTATCACATCAGACGGATGAACTTCTTCGATTAACTTTTTAACCTCTTGTTTAGACAAATGTCTTAATACAAAGTAAGGACAACCAAAGTTACAATATTCAAATATGTAATCTTGAATATTTGAAAAACGTTTACTCATCTCTGCTTTTTTATTAGAATCTTTGTAAAAGCCTTTTAATCGTAATTGATCGTAACCATAGTCACCAACAATGTAATCATATTTGTCTAAAATATCTGAATACCTAGCAATAAATTGTTCTTCATTAAAACATTCGCGATAATTTTCTATTAATTCAAAGTAATGTTGATCTACTTTTATCAAATTCTTCACCTATCTATGACAATGAAAGGCTCAGTTTATACTTTTAGTGTTTCATAAAAATAATGATTACTTCTATGACACGTTCGTTTTGTACAAACTAAGCCTTTATGCCTTATTAATTGTTAAATATTAACTATTTAACTGTGCCTCACCTTGGCGTTGCTTTTCTTTAGCAGCTTCATTTACTTGCTCATCCGCATGATAAGAACTACGTACTAAAGGTCCAGCTTGGCAATGTTTAAACCCTTTATCCATTGCCACTTTTCTTAATTTACCAAACTCTAAAGGCGTGTAATATTTTTGAACCTTTAAATGTTTACGTGAAGGTTGTAAATATTGACCAATCGTTAAAATATCTACATCATTCGCACGTAAATCATCCATCGTTTCATAAATTTCTTCTATAGTTTCACCTAATCCAACCATAATACTTGATTTAGTTGGGATATCTGGTTGTAATTCTTTTGAACGACGTAAAAACTCTAATGTTCTGTCGTAAGTCGCACGCGCACGAACTCTCGGTGTTAAGCGACGAACAGTTTCAATATTATGGTTTAAAATGTCAGGTCTTGACGCCATTAATGTTTCTAACGCATCATAGTCCCCGCCCATATCTGATGGTAAAATTTCAATCGTTGTAAATGGATTTCTTTCTCTAACTTTACGTACTGTCTCAGCATAAACATTTGAACCAGCATCTCTTAAATCATCACGCGCAACAGCAGTGATAACAACGTGTTTCAAATTCATTAATTCAACTGATTCAGCTACACGTTCAGGCTCATTTAAATCAAGTTCATTAGGTAAACCTGTCTTAACCGCACAAAAACGACAAGCTCTTGTACATACGGCACCTAAAATCATAAATGTCGCTGTACGACGTGCACCCCAACATTCATGTATATTAGGACATTTAGCTTCTTCACATACAGTATTAAGATTTTTTTCCCTCATCATCTTCTTAAGTCCTGTATAGTTTTCGTTGGTATTTAATTTTATTTTCAACCAATCCGGTTTACGTAATATTTCCTCGTTTTTTGTCGCCATAACAACACATACCCTCCTGTTAAGTGTATCTTTAAACATTATATCGAAATTCATGACAAATGAAAATCCAATAATCTTACTTTTTAATATTCCAATAATTTTTCTTTAAATATATCTCTTAAAAACTCTGGCATTAAATACTCTTTTGGTAATTCTTTCAGTGTTGGGAAATAACGACCGAACGTATACATGTCTATCGTACCTAATACATATTCTTTGTCGTCTTCGATTTCTTCTCCATTCAGATAGTAACGCCCTGTAGAATGAATGTACCCTAAATTATAAAGAATATATCCTCCAAATATATTCCCTCTGAAACCCAAACCTTGTGCATGTTCATACATATATTCTTGTTTATTACTTTTAGTTATAATCTCTTTTAATTTCACACCAGAAAGTCTAACCCTTACCATATTAATCGGATGCGGTAACATTTGATGAATGTCATATTCTGTCACTTCATCTTTTACAATATCTTTAACGAGTAAGCCAGCATTGATGATGGCACATTGTGCATGTGTATACTCACAAACACTTTGAGCTAATAAGTATGCAGCTTCAGTTATGTGATTCATACTACGCTTAAGCACTACTGGATGTTGAATTACTGAATTGGACATTAACGTTTTTCCTTCTTCTTCAAATGAAGTTTCAACTTCAGGTAATGTTTCTAAAGGAATAATCTTTGCAGTTTTATGTACTACTTTATGTGCCTCAAAAGTTAAATTAACCTCTCCAAGATAATTACCATACTTTCCAGCTGCCGCCATCAGTACACCATTATTGATCTCACCATGTTCAAAATAATGATGCGTATGACTACCAAAAATGACATCAATTTCAGGCAATTCTTGGCATAATGTTTCATCGAAGAAAATGCCACAATGACTTAGCACGATTATTACATCAAATTTACCTCGTTGATGTTTAATTTCTTCTTTTATAGATTCAAGTGGATCGGTAACAATCCAATCTAGTGCACGATAAAATGGGGTAAAAGGTGCTGTCGCTGCAACGAATAGTATTTTCACACCGTCCATATCCTTAATATAAGAAGAAACGATATTATTTGGTAAATGACCTGATTCATCTATAACATTGCTACATGTCACTATAAATTTTGCTTCGTCGTAAAGGTGATTTAAAGCTTCGTGTGAAATGGTCATCCCTTCATTATTACCGATTGTTGCAACATCACATTTTGCTTCATTTAGTAATGCCACATTCTTTTTACCTAAAGTTGCTTCAGTTATAGGTGCGGATAAATCTACATGATCACCTAGATCAACATATAAAGAAGGATGATTAAGTCGTGGCCGTTGTTCTGCCATATATACTTTAATGCGTTCGTATTCATGTAAATGACTATGAATATCGTTCGTATGATAAATTGTAAGCCTCAAATTGACGTCCTCCTTTTAAAGTTGTATTAAATCAACGCTCGAATAATTAAATATATACCCATTAACAACATTACTGTTCTCAATAATGTTACTACCGTATCTGACTTAATTGATTGATTCACTTTGACACCGATTTTCGCACCAAAATAACTAGAAATAATTAAAATGATTGCATAACCCCAAGCTACGTGACCTTGAGCAATGTGCCCTATAGAACTCATGACACTTGAAAAGAAAATCATCATCATACTTGTTCCAACAGCTACATGAGGTGGAAATCTAAATACAATAAGCATTAGTGGCGTCATTAGTGCGCCACCTCCAATACCAAATAAACCTGTCAATATACCAATTAAAAACGTTGTAATAAAAGCAAACAATGGTGGCACACTATAATGATATGTTTTACCTTTAGCGTCTACATAAGTCTTTTCATACTTGGGTTTATCGAAAATTTTAAACGGTTTAATCTTATTTCTTACCATTAATAAAATGGCTACGAAAATTAAAAAGATACCAAAATATAAATTAAATGACTCAAATGTTAAATATCTACTAATGAAGGACCCAAGCAATGAACCTGGTAATAGTCCAAATAAAAAGATGGAACCATTTTTAATATCAACTTGTTTTGTTTTTA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80 | Staphylococcus_phage(76.81%) | capsid,head,terminase,portal,tail,integrase,transposase,holin | attL 2513180:2513196|attR 2547829:2547845 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2633177 : 2645895
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP029655|2633177:2645895|DBSCAN-SWA 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ATTTCACTTACAACAGATCCAGCAATGAAAGTTGATATTGATGGCGAAATTTCATTAGAAACACCTATTGATATTGAGGTTATACCAAATGCTATTCAGTTACTTACTGTCAATGATTTGTAAGCATCCGGAATGATCTTGACCCGATATTATATTAGGTTTGGAGTGTAATCATAAGATTCAACGCACCTTATATTCGTTTTTATTAGCTTTAAGCTATTACCCTGTTTCAAAAACAGACATATAATTTTGGCGCATGCCACTAAAATGATTGATGTTGTATTTTAAATCATAGTGGTTTATGCGTCTTTTTCAAATTCTATAAAAAATCGGATGACGTGTAATCTGCCATAGATTAACACATTCATCCGATTTATAATAATGAGATAGACTAACATTTATTGAGAGCGGGACGGAAATGATAAAGAACGACTAATGATTGATTATGTAGCGATTCTTTATCATTAGTCAAAGCTAATGTGTACTTAAAAATAGGAGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCGCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGGCGTTCCAATTTCTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGGGAATCCAATTTCTCTATGTTGGGGCCCCGCAGTCAACTACTGCCAATATAGTGTTGTAGTGTCTAAGACATAAAAGTTCATCTCAGTCACAATTACTTTATAGCCTATCCATCATCTTTTCTACATGAAATTTTTCAAGTGATATATTTTATTTCTCAATATTATCTAAAAAATACTGTTCTACATCTTTCCAGCTATTTACGCGTTCAAATCGATCATCATTAATATTATGCACTGCTGTAAACATAATCGGTGTACCAGTAAAAATTTCAAGCTGTCTAGGATTGTCATCTATTAAATAATCAGCTTTAACGATGTTTTTTCTACCACAAAAAACAAAATGCTGAGGATCTAAAAATGGAAAGAACTCTAGTAACCATTCATATTTATCACTAAATGATGTTGGTACATCCATTGCTGCTGTAGCAATATATACATCATAATGTTCAGTTAATTTTTTCACAACTTCTTGTGCATGTGGCATCACTTTAAGATGTCTGAAGAAGCCTGGTTCTCTCAATACTTCTGTAATTAATCCATCATGTTCAGGAATAACATGTTTAAGTTTTTGACCATTCAAAGCTTCCATTTTAATACCTAAATCCGCTCTAAAATTGACAGCATCAATGATTTCTCCTAATGTATCTGCCAATACTTCATCCATATCAATCGCGATTGATTTACGGGTCATTTTAATCTTCTCCTCAAAATATCAGTATTGATTCAGTATAGCAAAAAAGCAATTGATACAAAACAATATCATCTATTGTTGCTTTTTACACTGAATACTCTCACCTCATCATTCACACTGCATTGAGCTTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAGGGGCCCCAACACAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTGAGAAAATATCATTTCTGTCCCACTCCCCACTTACTATTCGTATTTAAAATTTGATAAAACTTCTAACATTTTATCATTTTGTTCTTTAAAACCAATTGTAATTCTAACACCAGTTGGAAATGGTCGCGTAATACACCCTACATTTAAAAGTGCTTCATAAAGTTCATTTACCCGCTTTGTTTTTACAAATATAAAATTCGTTTGACTTGGCAAGAAATACTCACTTTGAGGTAATTGATAAAATCTTTCGCGTTCAACACTATTTTTATGTGTTACCTCTTTTAAATATTGTTGATCTTCAAGTGCTGCAACTGCTGCGTATTCAGATATACGTGTCACATTAAATGGTGGTCTAATGATGTTCCATTTTTCAATCGCATGTTCACTTGCTACCACATATCCTACACGTAAACCCGCTAATCCATACGCCTTTGAAAATGTACGTAATAAGAAAGCATTGTCATATTTTTGTTGCAAAGCAAGTGTATCCGGGTAGTCCTCTGCTGTCACAAATTCAAAATAAGCTTCATCTATAATTACTGGTACATGTGGAGGTACTTGAGATAAAAACGAATCTAAGCTCTCATGATTAAAATATGTACCTGTAGGATTATTTGGATTACATAACCATACCAATGACGTATCTTCATTAACTTCTTTTAAAATACCTTCTAAATCGAAGCCACCATCTTTTAAAGGTACTTGTATCACATTAGCTGATTCAACAATCGCATTGTGATAATATTGACCGAATGTCGCTTCACTTGTAACAATAGTATCCCCTGGCGTTAATACTGCTCTAGAAATCATTAATATAACTTCATCTAATCCCGCACCAAATAAAATGCGTGATTGATCTACATTTAAATGTTTACTAATCGCCGCTTTTAATGTCGGTGATCCTGTTTCAGGATAATAATATAACTCATCTAAATGTGCTGATATCGCTTCTTTAACTTTAGGCGATGGTCCATACAAATTTTCATTTGATGCAAGTTTATATAAATCTCCTTCAATGCCATACTTTTCTTTCAATGCCCTTGGAGATAAACCAGGCTGATATGCTGATAGTTGATTAAGTTGTTCTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP029655|2633177:2645895|2634523_2635495_-|AWQ97217.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >CP029655|2633177:2645895|2635612_2637718_-|AWQ98377.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSISFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >CP029655|2633177:2645895|2639765_2640266_+|AWQ97331.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >CP029655|2633177:2645895|2633177_2634149_-|AWQ97065.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >CP029655|2633177:2645895|2644836_2645895_-|AWQ97559.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEYFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >CP029655|2633177:2645895|2642381_2643299_+|AWQ97885.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMSHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >CP029655|2633177:2645895|2637680_2638079_-|AWQ96700.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >CP029655|2633177:2645895|2643955_2644498_-|AWQ96104.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >CP029655|2633177:2645895|2638879_2639746_+|AWQ96325.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFLYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSSREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFVLFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >CP029655|2633177:2645895|2640606_2642112_+|AWQ97435.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR |
10 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2657866 : 2665687
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP029655|2657866:2665687|DBSCAN-SWA ATTATAACATCTCCAAAATCTTGGTTTTTGCGTAAAATTCATTTACTTCATCTTTTGGCTTAGAATCAATTGTAATACCTGCTCCGACTCCATAAATCGCTTGTCCATATTTATACTCAATAGTACGAATCGGAATATTAAAAATCATTTTATCATCTTCAGTTGGAAGTAATAGTCCAATTGCTCCGCAGTATATACCACGAGGTGAACTTTCAAATTGTTTAATATATTTCATTGTATTCAGTTTCGGTGCACCTGTAATCGAACCACAAGGAAATAACGATGTTAAAATTTGAGTTAAGTCTGTATTAGTTTTTAAAGTTCCACTTACCATCGAAGTCATTTGAAATACAGTTTTATATGCCTCAATAAAAAATAGTTTATACACCTTAATTGAGCCACTCTGTGATATTCTCCCTATATCGTTTCTTAGCAAATCAACAATCATGACATTTTCTGCACGATCTTTCGAAGAAGTTTGCAATGTTTTATAATACTGTTGATCTTCAGCTTCCGTTTTACCTCTAGGCATTGTCCCTTTCATCGGTTTGCTTATGATAACGTTATCGACATTGTTAAATTGTCCTTTTTGAAAAAATAATTCTGGTGAGATAGACGCTACTTGGATTTCATCAGTTTGTAATAACGCAGTATAATTACCATTACTAAATTGAGTTAATCGTTCATATAAAGTACTAATAGGATAATAAATGTTATCCGTTAAGCGCGCCGTATAGTTCACTTGATACGTTTCACCTTCAACAATTGCTTGTTGGACACGTTTAATATTAGTCATCATAACCTCAGAAGATTCAACAAATGAAAAATGATGCTTTGATACATAAGAAGTTTGATGTTCATATGTTGAATTTATGCTTTCCGCTTTTTCAAAACTATAAGCTACTGCATAAATATCATCTTTAGCTAATGAATGTGTACACATAACATGATTAAAATACTTTGCCGCTTCGTAACTTAAATATAACGAGACATATCTACCTTGTCGTTGCTGCGCTTGTGCAAAGTGTATCACTTCTCCCACATCAGCCAACTTAGTAGCAACATACTTCTTTATAAATCCCTTTAATTGAATATGGTATTGCTTATATTCATTTTCAGTTAAATAGTAGCGATAATTATATTCTATTCTCACAGTAATCACCTACCTTCGATAAAAATAATTCAACTTGTCGATAACCGTATTCACTCAAAATAGATTCAGGATGATATTGCACACCAAAAACCGGAAATCTAATATGCTCAAATGCCATAATAATCGCTTCATCGTTTTTTGCTGTAATCTTTAAGCAATTTGGAAAAGTCGCTCCGTCAGCAATTAATGAATGATAACGCATTACATTGAAATTTTGAGGCAGTCCTTGAAAAATACCTTCATTGGTATGGCGTAACTGTGTAGTATGTCCGTGTACAGGATGATAGCCGTGAATGATATTTCCACCAAAATAAGACACGATACATTGAAATCCTAAACATACACCTAGTATAGGTACACGCTGATAAAATTGTTCTAACACTTCATTCAAGATAGGATAATCATCCGGATTACCCGGCCCAGGCGAAATAACAATTGCTTTTGGCTTCATATTAATGACGTCTTCTATCAGCAGATTATCAATACCAACAACTTGAACTGTTAGTTTCGTTTGAGTCTTAATATAGTCTATTAAATTATATGTAAATGAATCATTATTATCTATGACTAGAATCATTGTATACTCCGTTCTAAATGTGTTTTATTTTTATAATATGTATTGGATGTAGCTAAAACTTTAAAAGCATTGTCATTATCCTGACCTTGATTTTAACTAATATATGGTATATTCTATTCATCGTACATAAATGAATATCAGAGGTTTCTAGCTGAAACCCTCTATAAAAAACTAGACATTGAAATTTCAAACATTCGTTGGTAAACCTTTAATATATATTATAGGAGCAACCCATTTCTTTCGTCTATCTTTTATGGAGATAGGCTTTTTTTATTTTATAAATTAAAAACGGGCTTATCAATGCCATTAACCTCTTTATTAATATTATTAATGATAGGAGCAATTACAAAATGGAAAGTGTATTAAATAATGAAAAAGCCATCGTTGTCTTTAGTGGTGGTCAAGACAGTACAACATGTCTCTTTTATGCAAAAAAACATTTCAAAGAAGTTGAACTCGTAACGTTTAATTATGGCCAAAGACATGATACTGAAATTGAAGTCGCAAAACAAATTGCACAAGATCAAGGAATGAAACATCACGTTTTAGATATGTCATTATTATCACAACTTACTCCAAACGCATTAACACAACATGATATGGAAATTACTAATAATGAAGATGGTATACCTAATACATTTGTTCCAGCTAGAAATTTACTTTTCTTGTCGTTTGCAGGCGCTCTAGCTTATCAAATTGGGGCTAAGCATATTATTACAGGCGTATGTGAAACAGACTTTTCAGGCTACCCAGACTGTCGCGATAGTTTTATAAAATCAATGAACGTAACATTAAGCCTAGCTATGGACAAAGATTTTGTCATTCATACTCCTTTAATGTGGTTAAACAAAGCAGAAACGTGGAAATTAAGTGATGAACTCGAAGTTTTAGATTATATTCGTACAAAAACATTAACATGCTATAACGGTATCATTGGGGATGGCTGTGGTGAATGTCCAGCTTGTCATTTACGTCAACGTGGACTAAATCAATATCTTGAAAGTAAAGGAGCGCTTTAAAATGTTACAACAAATCTATCCTAGTACAACGCATCCATATCAATTCGAATTAAATAAAGATTTTAATTTTTCGGCTGCACATCACATTCCTTGTGAAGAAGCAGGTATTTGTCAAAATGTCCATGGTCATACTTACTTTGTTAATTTAACAATTGTCGGTGATAAACTAGATGACACTGGCTTCTTAGTGAACTTTAGCCATTTGAAAAAGATGATACACGGTAAATTTGACCATCAACTGTTAAATAACTTACCTGCTTTTAAAAACAAAATCCCTTCAACTGAAATCGTAGCGGAAACAATTTATCAAATTGTTAAAGAAAATTTGGCATCGCTCGAACACCAACCAAAATGTATTCAAGTATTTGTAAGAGAAACACCAACAAGTTATGTTGTATTTAGACCAAAGGAACAGGTGTAACTAATGGCTAAAATTCCTGTACTCGAAATATTCGGTCCAACCATTCAGGGTGAAGGTCGAGTAATCGGTAGAAAAACGATGTTTGTGAGAACAGCTGGATGTGATTATCGCTGTAGCTGGTGTGATTCTGCATTTACTTGGGATGGTAGTGCTAAAGGCGATATAAAACTCATGACCGCTGAAGAAATTTATGATGAATTAAAACGAATTGGTGGCGATTTATTTAATCACGTTACAATTTCTGGTGGTAACCCAGCATTAATTAAAGGTATCCAAGAGTTAGTTGACTTATTTCAAGATAAAGGTATTTTCAGCGCACTGGAGACACAAGGCAGTAAATTCCAACCTTGGATGACACAAATTGATGATTTAACGATTAGTCCAAAACCACCAAGTTCAACTATGACACCTGATTTAAAAAAGTTAGATGAAGTGATTACACAATGCGTACCTTCCTCATTAAACTTAAAAGTAGTTGTATTCGACGATAAAGATTATGATTTTGCCAAAATGATACACCACCGTTATCCAGATATTCCCTTCTATTTACAAGTTGGTAACCCATATTTATCAGACAGCGTAGATAATCATACCGAAAAGTTGTTAGAACGCTACGAGCAGTTGGTGGATTTAGTTATGCAAAGTAATGATATGAATCACGTTTATGTGTTACCACAACTTCATACATTACTTTGGAGTAATAAAAAAGGTGTATAAAGGATAACTTATTTTACTTTTTACAAGTCATATCTAATGAATAACAATATATTAATTGATATAATAGTTGATTGAAGTATAACGAACAGGAGTCCATCATGATTTTATATATATTAATTAATATTGCTATCGTCGTACTTATAACTGGATTCAATTTATATAGGCATCAAATGCAACATTTATCATTAAGTGCAATGTTGTTATCTATTACGATAAACGCCTTTATAAATACATTCATAATTGATAAATATAACTTTATTACTCTGTGTACTATAACGATGTTTATCATTTGGACGATACTACAGTTTTACATTGATAAAAAATTAAAACCTGTATACATTACAGACCAAAAATTTATTGCTATCATATTAACGATTGTTGTCAGTTTAACGCAACGTGTTACCGACTTTTCAAGTACACAATCAATATATATGTCTATTCCATTTTTAGCCCCTGCAATTTTCATCATTGGTGGTATTATGTTGTTTATTTCAACATTTAATAGCTTAGATGAAACTGCTGAAAATAATAACAAAATAAAGAAACTAATGATTAAAGGACTTATCATTATTAACATTTCATTTATCGTTATGATGGTTTTAACACCATATTGGTACTTGTATTTAATCGTCTATCTTATTTTCTTGTTGTTTTTATTGTGGCAAAAGGTTTATAAATTTTAATACCAAAACTATAAAACACTTCTGATATTCTTAGTTCAAAATATCAGAAGTGTTTTATAGTGTTATCTAGTTCAGATAAATATTTTCTCACCTAAAAAAATGCCCTCCTCTTATTTTGACTCCTATTTATTTAAATCAGACAATTATTTTCATTTTCAAATTATTCTTTCTTCAATATTAGTTAAGCGATATTTAAACGAAGTTAAGAATTAGTTAATGGCATATTATTTGCCTTCATTTTAAACTTAACTTATCAAATTGAAGAAATGAGGAGTTAGCATGAATACAAAATATTTTTTAGCAGTTGGTGCTGTTGCCTCTGTATTAACTTTAGGCGCTTGTGGTAATTCTAATTCACAAGATCAAGGTAACAAAACTGAACAAAAAACAAAGTCAGAAGATAGCAATGTTAAAACTGATAAAACAAAAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP029655|2657866:2665687|2657866_2659018_-|AWQ95853.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQFESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >CP029655|2657866:2665687|2659001_2659595_-|AWQ98277.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHIRFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >CP029655|2657866:2665687|2664631_2665687_+|AWQ96287.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >CP029655|2657866:2665687|2663945_2664632_+|AWQ98370.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >CP029655|2657866:2665687|2661038_2661752_+|AWQ96896.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >CP029655|2657866:2665687|2659945_2660614_+|AWQ97278.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >CP029655|2657866:2665687|2661850_2662435_+|AWQ96228.1|DBSCAN-SWA MILYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >CP029655|2657866:2665687|2660615_2661035_+|AWQ96192.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >CP029655|2657866:2665687|2662714_2663155_+|AWQ97870.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAVASVLTLGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >CP029655|2657866:2665687|2663497_2663971_+|AWQ98237.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG |
10 | Pandoravirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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