Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029664 | Staphylococcus aureus strain AR_0226 chromosome, complete genome | 11 crisprs | csa3,DEDDh,cas3,DinG | 13 | 4 | 12 | 1 |
CP029665 | Staphylococcus aureus strain AR_0226 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | csa3,WYL | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029664_1 | 308975-309168 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029664_1
|
3 spacers
spacers of CP029664_1
>1.1|308998|33|CP029664|CRT CAGAAGCTGACAGAAAGTCAGCTTACAATAATG >1.2|309054|36|CP029664|CRT TAGAGAATTTCAAAAAGAAATTCTACAGACAATGCA >1.3|309113|33|CP029664|CRT CAGAAGGTGACGAAAAGTCAGCATACAATAATG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029664_1
The CRISPR arrays of CP029664_1 >merge|CP029664|1|308975-309168|CRT TACAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGACAGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAGAATTTCAAAAAGAAATTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGAACGGGGCCCCAACACAGAAGGTGACGAAAAGTCAGCATACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACA >CP029664|1|1|308975-309168|CRT TACAAGTTGGCGGGGCCCCAACA CAGAAGCTGACAGAAAGTCAGCTTACAATAATG TGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACA TAGAGAATTTCAAAAAGAAATTCTACAGACAATGCA AGTTGGGGAACGGGGCCCCAACA CAGAAGGTGACGAAAAGTCAGCATACAATAATG TGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACA
>CP029664.1|AWQ75846.1|307810_308833_+|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-A MVEQIKDKLGRPIRDLRLSVTDRCNFRCDYCMPKEVFGDDFVFLPKNELLTFDEMARIAKVYAELGVKKIRITGGEPLMRRDLDVLIAKLNQIDGIEDIGLTTNGLLLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDDTLFQSINNRNIKATTILEQIDYATSIGLNVKVNVVIQKGINDDQIIPMLEYFKDKHIEIRFIEFMDVGNDNGWDFSKVVTKDEMLTMIEQHFEIDPVEPKYFGEVAKYYRHKDNGVQFGLITSVSQSFCSTCTRARLSSDGKFYGCLFATVDGFNVKAFIRSGVTDEELKEQFKALWQIRDDRYSDERTAQTVANRQRKKINMNYIGG >CP029664.1|AWQ75903.1|307191_307791_+|putative-molybdenum-cofactor-guanylyltransferase MKAIILAGGHSVRFGKPKAFAEVNGETFYSRVIKTLESTNMFNEIIISTNAQLATQFKYPNVVIDDENHNDKGPLAGIYTIMKQHPEEELFFVVSVDTPMITGKAVSTLYQFLVSHLIENHLDVAAFKEDGRFIPTIAFYSPNALGAITKALHSDNYSFKNVYHELSTDYLDVRDVDAPSYWYKNINYQHDLDALIQKL >CP029664.1|AWQ74950.1|306951_307185_+|molybdopterin-converting-factor,-subunit-1 MKVLYFAEIKDILQKAQEDIVLEQALTVQQFEDLLFERYPQINNKKFQVAVNEEFVQKSDFIQPNDTVALIPPVSGG >CP029664.1|AWQ75935.1|306499_306946_+|molybdopterin-synthase-catalytic-subunit MKQFEIVTEPIQTEQYREFTINEYQGAVVVFTGHVREWTKGVKTEYLEYEAYIPMAEKKLAQIGDEINEKWPGTITSIVHRIGPLQISDIAVLIAVSSPHRKDAYRANEYAIERIKEIVPIWKKEIWEDGSKWQGHQKGNYEEAKREE >CP029664.1|AWQ73343.1|306000_306486_+|molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-protein-B MILQIVGYKKSGKTTLMRHIVSFLKSHGYTVATIKHHGHGKEDIQLQDSDVDHMKHFEAGADQSIVQGFQYQQTVTRVDNQNLTQIIEKSVTIDTNIVLVEGFKNADFEKVVVYRNEEELQVLQQLSNVCYSINVREHEDFTAFEQWLLNKIKNDCDTQLT >CP029664.1|AWQ73427.1|304744_306004_+|molybdopterin-molybdenumtransferase MVVEKRNPIPVKEAIQRIVNQQSSMPAITVALEKSLNHILAEDIVATYDIPRFDKSPYDGFAIRSVDSQGASGQNRIEFKVIDHIGAGSVSDKLVGDHEAVRIMTGAQIPNGADAVVMFEQTIELEDTFTIRKPFSKNENISLKGEETKTGDVVLKKGQVINPGAIAVLATYGYAEVKVIKQPSVAVIATGSELLDVNDVLEDGKIRNSNGPMIRALAEKLGLEVGIYKTQKDDLDSGIQVVKEAMEKHDIVITTGGVSVGDFDYLPEIYKAVKAEVLFNKVAMRPGSVTTVAFVDGKYLFGLSGNPSACFTGFELFVKPAVKHMCGALEVFPQIIKATLMEDFTKANPFTRFIRAKATLTSAGATVVPSGFNKSGAVVAIAHANCMVMLPGGSRGFKAGHTVDIILTESDAAEEELLL >CP029664.1|AWQ73410.1|304187_304682_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-C MTEFTHINQQGHAKMVDVSDKQITKRTAVAHSSITVNETIFKQISNNTNTKGNVLNTAQIAGIMAAKNTSTLIPMCHPLPLTGIDVHFSWDETNAPLYTLNIQTTVSTTGKTGVEMEALTAASATALTIYDMTKAVDKGMIIGETYLESKSGGKSGDFQRQSNQ >CP029664.1|AWQ74588.1|303679_304186_+|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-B MGEHQNVKLNRTVKAAVLTVSDTRDFDTDKGGQCVRQLLQADDVEVSDAHYTIVKDEKVAITTQVKKWLEEDIDVIITTGGTGIAQRDVTIEAVKPLLTKEIDGFGELFRYLSYVEDVGTRALLSRAVAGTVNNKLIFSIPGSTGAVKLALEKLIKPELNHLIHELTK >CP029664.1|AWQ75108.1|302644_303649_+|thiF-family-protein MSQERYSRQILFKQIGEIGQSKINQKCALIIGMGALGTHVAEGLVRAGIAKLIIVDRDYIEFSNLQRQTLFTEEDALKMMPKVVAAKKHLLALRSDVDIDDYIAHVDYYFLETHGQDVDVIIDATDNFETRQLINDFAYKYRIPWIYGGVVQSTYTEAAFIPGKTPCFNCLVPQLPALNLTCDTVGVIQPAVTMATSLQLRDAMKVLTEQPIDTKITYGDIWEGSHYSFGFSKMQRSDCTTCGDVPSYPYLNKNEQRYATLCGRDTVQYENASITHDILVQFLKQHQLNYRSNSYMVMFEFKGHRIVAFKGGRFLIHGMTRTSDATHLMNLLFG >CP029664.1|AWQ73618.1|301869_302475_+|ABC-transporter-family-protein MLKINVKYQLKNTLIRINIDDTEPKIYAVRGPSGIGKTTVLNMIAGLRKADEAIIEVNGQLLTDTAKNVNVKIQQRRIGYLFQDYQLFPNMTVYKNITFMAEPSEHIDQLIQTLNIDHLMKQYPMTLSGGEAQRVALARALSTKPDLILLDEPFSSLDDTTKDESITLVKRIFNEWQIPIIFVTHSNYEAEQMAHEIITIG >CP029664.1|AWQ75843.1|309523_309874_+|HTH-type-transcriptional-regulator-SarV MSNKVQRFIEAERELSQLKHWLKTTHKISIEEFVVLFKVYEAEKISGKELRDTLHFEMLWDTSKIDVIIRKIYKKELISKLRSETDERQVFYFYSTSQKKLLDKITKEIEVLSVTN >CP029664.1|AWQ75458.1|309975_311187_-|sugar-(and-other)-transporter-family-protein MTNQGSLNKSPIFTKSFTINFLVNFIVYLCMYLLLVVIAGYSKQAFDASDSLAGLVVGLFIVGSLIGRFATGKFVNQIGPKRLLFIGLIALIITQLLYFIDGSLAFLIFVRLINGIATAVVTTATGTIAAYVTPVNRKSEGISLFSLSLVLGTAIGPFLGMLLITKYAIDLLFIICVILGILGLIISLFIKVDFEVTNNKTETNVIDKPRFSIHQFIAKEAIPVAVIMLLIGVTYASILTYLQAFALERHLVTAASYFFICYAIASLITRPIAGRLMDDKNENIIVYPAFIMLFLSFVCLISSYQSWLILLAGACLGLGYGNLSSAMQSIAIKVSPPIKYGIATSTFYVGLDAGVGFGPSFLGLFTHMFSYSEIFGFMAALAIITMLVYFLIHGRHVTRNAMN >CP029664.1|AWQ74437.1|311179_311620_-|winged-helix-DNA-binding-domain-protein MLSQEFFNSFITIYRPYLKLAEPILEKHNIYYGQWLILRDIAKHQPTTLIEISHRRAIEKPTARKTLKALIENDLITVENSLEDKRQKFLTLTPKGHELYEIVCLDVQKLQQAVVAKTNISQDQMQETINVMNQIHEILLREAHND >CP029664.1|AWQ73395.1|311781_312546_+|glyoxalase-like-domain-protein MILKFDHIIHYIDQLDRFSFPGDVIKLHSGGYHHKYGTFNKLGYINENYIELLDVENNEKLKKMAKTIEGGVAFATQIVQEKYEQGFKNICLRTNDIEAVKNKLQSEQVEVVGPIQMERDTHKDGKVKWQLLYIMNQDDDEIKPPFFIQWEESDSMRTKKLQKYFQKQFSIETVIVKSKNRSQTVSNWLKWFDMDIVEENDHYTDLILKNDDIYFRIEDGKVSKYHSVIIKDAQATSPYSIFIRGAIYRFEPLV >CP029664.1|AWQ74963.1|312586_312706_+|hypothetical-protein MTSTMERIVNILFNRDDLIKMKKIDNINVKKISITRKLK >CP029664.1|AWQ73910.1|313177_314443_+|glycine-glycyltransferase MEKMHITNQEHDAFVKSHPNGDLLQLTKWAETKKLTGWYARRIAVGRDGEVQGVAQLLFKKVPKLPYTLCYISRGFVVDYSNKEALNALLDSAKEIAKAEKAYAIKIDPDVEVDKGTDALQNLKALGFKHKGFKEGLSKDYIQPRMTMITPIDKNDDELLNSFERRNRSKVRLALKRGTTVERSDREGLKTFAELMKITGERDGFLTRDISYFENIYDALHEDGDAELFLVKLDPKENIAKVNQELNELHAEIAKWQQKMKTSEKQAKKAQNMINDAQNKIAKNEDLKRDLEALEKEHPEGIYLSGALLMFAGSKSYYLYGASSNEFRDFLPNHHMQYTMMKYAREHGATTYDFGGTDNDPDKDSEHYGLWAFKKVWGTYLSEKIGEFDYVLNQPLYQLIEQVKPRLTKAKIKISRKLKRK >CP029664.1|AWQ75459.1|314559_317727_+|swarming-motility-protein-SwrC MIKKLLQFSLGNKFAIFLMVVLVVLGGVYASAKLKLELLPNVQNPVISVTTTMPGATPQSTQDEISSKIDNQVRSLAYVKNVKTQSIQNASIVTVEYENNTDMDKAEEQLKKEIDKIKFKDEVGQPELRRNSMDAFPVLAYSFSNKENDLKKVTKVLNEQLIPKLQTVDGVQNAQLNGQTNREITLKFKQNELEKYGLTADDVENYLKTATRTTPLGLFQFGDKDKSIVVDGQYQSVDAFKNINIPLTLAGGQGQSQSQSDNKQNSAMSDVNQASPQQNSKASAPNNISGMPTAKLGDLADITVGDVRTSISKTNGKDAVNLQITKAQDANTVQVAKDVQRKIDTFVDENKDFNVTKTMDTAKPVEKSLYTMVEKASLGTIVAIIVILLFLRNIRTTAISIISIPLSLLMALIALKLSDVSLNILTLGALTVAIGRVIDDSIVVVENIYRRLTDSEEQLKGENLIISATTEVFKPIMSSTLVTIIVFLPLVFVSGSVGEMFRPFALAIAFSLLASLLVSITLVPALAATLFKKGVKRRNKQHQEGLGVVSTTYKKVLHWSLNHKWIVIILSTLILVATIVFGGPRLGTSFISAGDDKFLAITYTPKPGETEQAVLNHAKDVEKYLKQKKHVKTIQYSVGGSSPVDPTGSTNSMAIMVEYDNDTPNFDVEADKVIKHADGFKHPGEWKNQDLGTGAGNKSVEVTVKGPSMDAIKSTVKDIEQKMKQVKGLANVKSDLSQTYDQYEIKVDQNKAAENGISASQLAMHLNENLPEKTVTTVKENGKTVDVKVKQNKQTDWSEDKLNNITLKKPTGGTIKLGDIATLVKTTTPSKLTQEQGDYATTVSAKVTNKDVGGTTRQVMSKINNLDKPNNVKVNIGGASDDINNAMTQLAFAMLAAIIIVYLILVITFKGGLAPFTILFSLPFTVIGVIIALLITGETISVPSLIGMLMLIGIVVTNAIVLIDRVINNEQQGMEMKEALIEAGGTRIRPILMTAIATIGALVPLLFGQDSSILISKGLAATVIGGLISSTLLTLVVVPVIYEILFTLKKRFTKR >CP029664.1|AWQ74127.1|317913_318231_-|putative-membrane-protein MQFYLILLAILYLIVSFISIFKMEVVFTRILRIIMGVLLLFVLALTTMSFPKENWWVFIVLLLLVGNVEVTGFKMLKKDLKGVNILNLMSLFIFVIYFILTIVLF >CP029664.1|AWQ75982.1|318475_318640_-|hypothetical-protein MSLENQLAELKYDYVRLQGDIEKRESLNLDTSALVRQLKDIENEIRNVRAQMQD >CP029664.1|AWQ74337.1|318772_319681_+|membrane-transport-family-protein MTEQFTMIILLIALGYFLKRINFIKATDSQVIATLVLNVTLPSLVIVNLNSAELKLSFSILPILMIIYGIVAKMIAVWFFRKYDNHMRGSVGMMTGAMNIGLFAYPLIEVIWPKTGLIYFVMADIGGAFVMFGITYFVGSYFSEGSDQFDFKYLGKKLLQSVPLVTYIVMFILNISHIHLPHVAIDFFSILSHANMPLSMILLGVMLNFTLERKYIPATIKYLCLHYGLALVAGLLVYVLLPVSDDMIKTTLLVTWMFPVGVAIISYGIQFKYRTLTFIGMTTNLTIIISIIILYVYQAVFV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029664_2 | 432923-433073 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029664_2
|
2 spacers
spacers of CP029664_2
>2.1|432951|38|CP029664|CRISPRCasFinder GAAAAATAGAGGAACACAGTTGGATGCTACGCATCAAC >2.2|433017|29|CP029664|CRISPRCasFinder TAAAAGTAGGAGCGCCTGCGCTAAGCGCA |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029664_2
The CRISPR arrays of CP029664_2 >merge|CP029664|2|432923-433073|CRISPRCasFinder TAGAAAGAAGCCCCTAACAACTAAAGTTGAAAAATAGAGGAACACAGTTGGATGCTACGCATCAACTGCATAAGAGCCCCTAACAACTAAAGTTTAAAAGTAGGAGCGCCTGCGCTAAGCGCATGCATAAGAGCCCCTAACAACTAAAGTT >CP029664|2|1|432923-433073|CRISPRCasFinder TAGAAAGAAGCCCCTAACAACTAAAGTT GAAAAATAGAGGAACACAGTTGGATGCTACGCATCAAC TGCATAAGAGCCCCTAACAACTAAAGTT TAAAAGTAGGAGCGCCTGCGCTAAGCGCA TGCATAAGAGCCCCTAACAACTAAAGTT
>CP029664.1|AWQ75352.1|431858_432062_+|resolvase,-N-terminal-domain-protein MIVYQRKINIDTLKEFGCGCVYSERISGVKRTELVKCLDYLRESDTLVVYQLDRLGRTTKLLIELSQ >CP029664.1|AWQ73388.1|430663_431800_+|SAP-domain-protein MSVNARDLLVLHTNVNRLVGEEIFANKCLANNDVQIMNSIKKLIEAELLTTTNDFEVSIYKKTRPELQSILKSFGIKTTGNKPDLIKRIDDNFHIINNLDLPYVYIPTKKGEEILKKTEYLTSFIQSYGEISLERAYYLVENYIDENCDDKVAEIYKFEFQRKYDNGEFDFNHGYNFELNMLIDHYKRDVKDYDNARKYSNIYLYFGLRDFLKKLMSNYSYYDSKGNIDLNEIQNDLNRFINSSASGMYERLIYNENLSNNIMFELFKKDTQDYSDLEEQLIEKFINYVVSNVKKESRSNTLIELSKILENGYTIDKEEFKKEDDYLSKYIFTDIDYLKKLESKINVAIDIRSGEIHLVLDDDSLDILIQNQKYGNEF >CP029664.1|AWQ75280.1|428720_429578_+|cof-like-hydrolase-family-protein MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINQLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQITNLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAEHFLAE >CP029664.1|AWQ73673.1|427870_428653_+|ABC-transporter-family-protein MLIQLDQIGRMKQGKTILKKISWQIAKGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATSGTVNLFGKMPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEIRNEAHQLLKLVGMFAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLSILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITANFSKILLLKDGQSIQQGAVEDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE >CP029664.1|AWQ73934.1|425833_427639_+|glutamine-fructose-6-phosphate-transaminase MCGIVGYIGYDNAKELLLKGLEKLEYRGYDSAGIAVVNDDNTTVFKEKGRIAELRKVADSSDFDGPVGIGHTRWATHGVPNHENSHPHQSSNGRFTLVHNGVIENYEELKGEYLQGVSFISETDTEVIVQLVEYFSNQGLSTEEAFTKVVSLLHGSYALGLLDAEDKDTIYVAKNKSPLLLGVGEGFNVIASDALAMLQVTSEYKEIHDHEIVIVKKDEVIIKDADGNVVERDSYIAEIDASDAEKGVYAHYMLKEIHEQPAVMRRIIQEYQDAEGNLKIDQDIINDVKEADRIYVIAAGTSYHAGLVGKEFLEKWAGVPTEVHVASEFVYNMPLLSEKPLFVYISQSGETADSRAVLVETNKLGHKSLTITNVAGSTLSREADHTLLLHAGPEIAVASTKAYTAQIAVLSILSQIVAKEHGREADIDLLRELAKVTTAIEAIVDDAPIMEQIATDFLETTRNAFFIGRTIDYNVSLEGALKLKEISYIQAEGFAGGELKHGTIALIEEGTPVVGLATQEKVNLSIRGNVKEVVARGAHPCIISMEGLEKEGDTYVIPHVHELLTPLVSVVALQLISYYAALHRDLDVDKPRNLAKSVTVE >CP029664.1|AWQ75854.1|423614_425153_-|PTS-system-mannitol-specific-EIICB-component MSQTEEKKGIGRRVQAFGSFLSSMIMPNIGAFIAWGFIAAIFIDNGWLPNKDLATLAGPMITYLIPLLIAFSGGRLIYDLRGGIIAATATMGVIVALPDTPMLLGAMIMGPLVGWLMKKTDQLIQPRTPQGFEMLFNNFSAGILGFIMTIAGFKILAPLMKFIMHILSVAVEALVHAHLLPLVSILVEPAKIVFLNNAINHGVFTPLGADQAAKAGQSILYTIESNPGPGLGILLAYMIFGKGTAKATSYGAGIIHFLGGIHEIYFPYVLMRPLLFIAVILGGMTGVATYQATGFGFKSPASPGSFIVYCLNAPRGEFLHMLLGVFLAALVSFVVAALIMKFTREPKQDLEAATAQMENTKGKKSSVASKLVSSDKNVNTEENASGNVSETSSSDDDPEALLDNYNTEDVDAHNYNNINHVIFACDAGMGSSAMGASMLRNKFKKAGINDITVTNTAINQLPKDAQLVITQKKLTDRAIKQTPNAIHISVDNFLNSPRYEELLNNLKKDDQA >CP029664.1|AWQ75542.1|421447_423580_-|PRD-domain-protein MLLSTREKEMIALLIKYHGQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVEAYLTSFSLTLERANKKGLRIAGTDSDLNDLKQSIAQHQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELDLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLGQIYDVTFNQAEIAFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVNKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFIVLHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLDQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIDSPYLTVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFQETHDKSSNMIDKDDVHVETKDVDGNTSFENEQTSYLTSVFEKHLSDEKSEQLLHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDVINDPTSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMILITVLEEPLTLPSIQNDNQTIKYMISMFISDNDFMASLVSDLSEFLSLKLESIDTFMENPQELETLLRNKFLERIKKQFI >CP029664.1|AWQ74496.1|421001_421436_-|mannitol-specific-phosphotransferase-enzyme-IIA-component MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA >CP029664.1|AWQ75584.1|419895_421002_-|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKAVHFGAGNIGRGFIGYILADNNVKVTFADVNEEIINALAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFAPFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVLDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFAGKATVLDAVEDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAAYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTADQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS >CP029664.1|AWQ73496.1|417576_419577_+|LPXTG-cell-wall-anchor-domain-protein MDNGDVDDALTQGKAAIDAIQVDATVKPKANQAIEVKAEDTKESIDQSDQLTAEEKTEALAMIKQITDQAKQGITDATTTAEVEKAKAQGLEAFDNIQIDSTEKQKAIEELETALDQIEAGVNVNADATTEEKEAFTNALEDILSKATEDISDQTTNAEIATVKNSALEQLKAQRINPEVKKNALEAIREVVNKQIEIIKNADADASAKEIARTDLGRYFDRFADKLDKTQTNAEVAELQNVTIPAIEAIVPQNDPDANDTNNGIDNNDATANSNANATPENTGQPNVSETTANGKADASPTTPNNSDAATGETTATSATDDANDKPQANNNSSVDASTNSPTMDNDVTSKPEVESTNNGTTDKPVTETDNATPAESTTNNNSTTTATNENAPTGSTATAPTTASTEAASSADSKDNASVNDSKQNAEVNNSAESQSTNDKVAQPKSENKAKAEKDGSDSTNQSMVESTTETLPSADITEPNVPSNTSKDKEESTTNQTDAGQLKSETNVASNEADKSPSKADTEVSNKPSTSASSEAKEKMTSTNVSQKDDTATADTNDTQKSVGSAANNKATQNDGANASPATVSNGSNSANQDMLNVTNTDDHQAKTKSAQQGKVNKAKQQAKTLPDTGMSHNDDLPYAELALGAGMAFLIRRFTKKDQQTEE >CP029664.1|AWQ75766.1|433090_434182_-|putative-membrane-protein MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYAQTIAIYSQFGQKPPVDAYLKVIAVLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKNKKVVTEPKNTKVENDKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >CP029664.1|AWQ75363.1|434447_435428_-|cadmium,-cobalt-and-zinc/H(+)-K(+)-antiporter MSHSHHHHDHMHSHVTTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALVAFIYAEKNATTTKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH >CP029664.1|AWQ74615.1|435429_435750_-|HTH-type-transcriptional-repressor-CzrA MSEQYSEINTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL >CP029664.1|AWQ73392.1|435901_436567_+|NADH(P)-binding-family-protein MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFDGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNHQEFQIISGDQDIKDALTQFENETD >CP029664.1|AWQ73322.1|437001_437940_+|mannose-6-phosphate-isomerase,-class-I MPLFLQPILKTKLWGGQRLSEFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGTSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIVIGTLAESREEVANHVQHGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDITYRLYDFNRQDNQYNDRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYV >CP029664.1|AWQ74439.1|437970_438201_+|putative-membrane-protein MKQFLYIALVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQISASLKFSALLINVLPLCGTFVASN >CP029664.1|AWQ76000.1|438872_440246_+|EVE-domain-protein MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRISNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVQKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD >CP029664.1|AWQ75206.1|440703_441117_+|hypothetical-protein MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYQFATLKGEVGQQFFKQHPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIKLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD >CP029664.1|AWQ73554.1|441316_441760_+|DNA-protection-during-starvation-protein-1 MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLENAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS >CP029664.1|AWQ74646.1|441880_442591_-|purine-nucleoside-phosphorylase MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGTYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKAKNVADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNDAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029664_3 | 667946-668024 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029664_3
|
1 spacers
spacers of CP029664_3
>3.1|667969|33|CP029664|CRISPRCasFinder CAGAAGCTGACGAAAAGTCAGCTTACGATAATG |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029664_3
The CRISPR arrays of CP029664_3 >merge|CP029664|3|667946-668024|CRISPRCasFinder TGCAGGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGACGAAAAGTCAGCTTACGATAATGTGCAGGTTGGCGGGGCCCCAACA >CP029664|3|2|667946-668024|CRISPRCasFinder TGCAGGTTGGCGGGGCCCCAACA CAGAAGCTGACGAAAAGTCAGCTTACGATAATG TGCAGGTTGGCGGGGCCCCAACA
>CP029664.1|AWQ73595.1|666692_667679_-|hypothetical-protein MNDQWYKHLIGARTIKTGIAIFLTAVFCMALDLTPIYAILTAVVTIEPTAKASLIKGYRRLPATVIGAGFAVLFTYLFGDQSPFTYALSATFTILFCTKLKLQVGTNVAVLTSLAMIPGIHDAYIFNFLSRTLTAIIGLVTSGLINFMVFPPKYYGQVEEKLSKTDALMYKLFYNRCQELILSRLQSDKSEKAYKNIFNLNNQVETLISYQRDELSYHKKKECDWKLLNQLTKRAYTNRLFITHLSNIIYLPKNTRVNFSGDEKMALLKISSSIKDIFYDGSFKREDDSVETLRSTIKALEISGENQIKSHILYEVLMIYRLLDSRYA >CP029664.1|AWQ75251.1|665750_666203_+|hypothetical-protein MQHEKMNDERNLTMKPTKVILKDASYLHSKTSITFILKDVVIEEDNKIYYFDTSATFEDQEVKFEFALFDSDMDNLKHMDCDNPVTEIYFIEPDLHFTIIDFNQELLCIYIDFDSGLRHSNMATESGISLRINVAKSDFTKFINELASLH >CP029664.1|AWQ75677.1|664833_665565_+|cobB/CobQ-like-glutamine-amidotransferase-domain-protein MHELTIYHFMSDKLNLYSDIGNIIALRQRAKKRNIKVNVVEINETEGITFDECDIFFIGGGSDREQALATKELSKIKTPLKEAIEDGMPGLTICGGYQFLGKKYITPDGTELEGLGILDFYTESKTNRLTGDIVIESDTFGTIVGFENHGGRTYHDFGTLGHVTFGYGNNDEDKKEGIHYKNLLGTYLHGPILPKNYEITDYLLEKACERKGIPFEPKEIDNEAEIQAKQVLIDRANRQKKSR >CP029664.1|AWQ75008.1|663518_664832_+|hypothetical-protein MRQWTAIHLAKLARKASRAVGKRGTDLPGQIARKVDTDILRKLAEQVDDIVFISGTNGKTTTSNLIGHTLKANNIQIIHNNEGANMAAGITSAFIMQSTPKTKIAVIEIDEGSIPRVLKEVTPSMMVFTNFFRDQMDRFGEIDIMVNNIAETISNKGIKLLLNADDPFVSRLKIASDTIVYYGMKAHAHEFEQSTMNESRYCPNCGRLLQYDYIHYNQIGHYHCQCGFKREQAKYEISSFDVAPFLYLNINDEKYDMKIAGDFNAYNALAAYTVLRELGLNEQTIKNGFETYTSDNGRMQYFKKERKEAMINLAKNPAGMNASLSVGEQLEGEKVYVISLNDNAADGRDTSWIYDADFEKLSKQQIEAIIVTGTRAEELQLRLKLAEVEVPIIVERDIYKATAKTMDYKGFTVAIPNYTSLAPMLEQLNRSFEGGQS >CP029664.1|AWQ74548.1|662726_663227_-|ferritin MLSKNLLEALNDQMNHEYFAAHAYMAMAAYCDKESYEGFANFFIQQAKEERFHGQKIYNYINDRGAHAEFRAVSAPKIDFSSILETFKDSLSQEQEVTRRFYNLSEIARQDKDYATISFLNWFLDEQVEEESMFETHINYLTRIGDDSNALYLYEKELGARTFDEE >CP029664.1|AWQ74227.1|661783_662338_-|exonuclease-family-protein MIQDAFVALDFETANGKRTSICSVGMVKVIDSQITETFHTLVNPQDYFSQQNIKIHGIQPEDVENAPTFDYVFPYMMQFIADLPVVAHNAAFDMNVLHQSIQNIGLPTPNLTYFCSYQLAKRTVDSYRYGLKHMMEFYQLDFHGHHDALNDAKACAMITFRLLKNYENLTYVTNIYGKNLKDKG >CP029664.1|AWQ75014.1|660645_661716_+|impB/mucB/samB-family-protein MTERRIIHIDMDYFFAQVEMRDNPKLKGKPVIVGGKASSRGVVSTASYEARKYGVHSAMPMSQAHKLCPNGYFVTSNFGAYRETSAQIMSIFRSYTDKVEPMSLDEAYLDITELVRPDLPASKIAQYIRKDILEQTHLTASAGVSYNKFLAKLASGMNKPDGMTVIDYQNVHDILMTLDIGDFPGVGKASKKVMHDNGIFNGRDLYEKTEFELIRLFGKRGRGLYNKARGIDHSEVKSSRVRKSVGTERTFATDVNDDEEILRKVWELSGKTAERLNKLQKSAKTVTVKIKTYQFETLSKQMSLRDSVSSEEDIYNIAYLLYNDLKDPDVPIRLIGVTVGNLEQSTYKNMTIYDFI >CP029664.1|AWQ75494.1|659868_660399_+|hypothetical-protein MHKIDLTTNNFQMRRFIILQLVIALFVILFTYKWALGVTAVVDQNIIINLVYGFAGFIILLILHELIHRALFLLFKKDSKPMFNIKKDRILFQTADACFNKWQFSIIMLSPLILLSTGLLILIKVFGYSSLIFMFSMHTAYCFIDILLVALTISSSFKYVQQDEDSIYLYHQKPTQ >CP029664.1|AWQ73667.1|658337_659699_+|23S-rRNA-(uracil-5-)-methyltransferase-RumA MQAIAKNDIKTGTVVDLTHEGHGVVKIDRFPIFIPQALINEQIEYKIIKVKKNFAIGKLLNINTRSENRVAPPCIYYERCGGCQLQHLSYEAQLEMKKEQVINLFQRKAHFDNSKINDTVGMTDPWRYRNKSQIPVGKNEQNEVIMGFYRQRSHDIIDMESCLIQDSQHQEVMNEVKSILKDLNVSIYQEQLKKGLMRHLVVRTGYHTDEMMIIFVTNGKKWPQKNAVVEKILDAFPNVTSIKQNINDSHSNVIMGRQSITLYGKDTIIDQLTDSTFKISDQSFYQINSEQTEKLYNKAIEYAQLTGNEVVLDTYCGIGTIGLYMAPLAKHVYGVEVVPSAIEDAQQNATINQCNNTTFVCGKAEEVILQWKAQGIKPDVVMVDPPRKGCDETFIQTLLTLEPKRIVYISCNPATQQRDALLLAEKYQLEEVTPVDMFPQTTHVETVALFNLK >CP029664.1|AWQ74765.1|657309_658257_+|diacylglycerol-kinase MRKRARIIYNPTSGKELFKRELPDALIKLEKAGYETSAYATEKIGDATLEAERAMHENYDVLIAAGGDGTLNEVVNGIAEKPNRPKLGVIPMGTVNDFGRALHIPNDIMGALDVIIEGHSTKVDIGKMNNRYFINLAAGGQLTQVSYETPSKLKSIVGPFAYYIKGFEMLPQMKAVDLRIEYDGNVFQGEALLFFLGLTNSMAGFEKLVPDAKLDDGYFTLIIVEKSNLAELGHIMTLASRGEHTKHPKVIYEKAKAINISSFTDLQLNVDGEYGGKLPANFLNLERHIDVFAPNDIVNEELINNDHVDDNLIEE >CP029664.1|AWQ75004.1|668206_668965_+|methionine-aminopeptidase,-type-I MIVKTEEELQALKEIGYICAKVRNTMQAATKPGITTKELDNIAKELFEEYGAISAPIHDENFPGQTCISVNEEVAHGIPSKRVIREGDLVNIDVSALKNGYYADTGISFVVGESDDPMKQKVCDVATMAFENAIAKVKPGTKLSNIGKAVHNTARQNDLKVIKNLTGHGVGLSLHEAPAHVLNYFDPKDKTLLTEGMVLAIEPFISSNASFVTEGKNEWAFETSDKSFVAQIEHTVIVTKDGPILTTKIEEE >CP029664.1|AWQ75693.1|669181_669568_+|hypothetical-protein MNYVERYIEQFLRATVRNNIKHYLLMLDEKMKNLDDYMRYLITKKEQLSKLIDSLMLTLENKYIDIAEAFQIQCAREINNQEIENIKSELNKVEAYYAQIETQIQQTSTEKIATEKTSYLINYMNAVA >CP029664.1|AWQ75268.1|669582_670284_+|hypothetical-protein MTHKYISTQMLIIFTALMIIANFYYIFFEKIGFLLVLLLGCVLVYVGYLYFHKIRGLLAFWIGALLIAFTLLSNKYTIIILFVFLLLLIVRYLIHKFKPKKVVATDEVMTSPSFIKQKWFGEQRTPVYVYKWEDVQIQHGIGDLHIDLTKAANIKENNTIVVRHILGKVQVILPVNYNINLHVAAFYGSTYVNEKSYKVENNNIHIEEMMKPDNYTVNIYVSTFIGDVEVIYR >CP029664.1|AWQ75154.1|670280_671324_+|sensor-protein-VraS MNHYIRTIGSMLILVYSMLAAFLFIDKVFVNIIYFQGMFYTQIFGIPVFLFLNLIIILLCIIVGSVLAYKINQQNDWIKTQIERSMEGETVGINDQNIEIYSETLDLYHTLVPLNQELHKLRLKTQNLTNENYNINDVKVKKIIEDERQRLARELHDSVSQQLFAASMMLSAIKETKLEPPLDQQIPILEKMVQDSQLEMRALLLHLRPLGLKDKSLGEGIKDLVIDLQKKVPMKVVHEIQDFKVPKGIEDHLFRITQEAISNTLRHSNGTKVTVELFNKDDYLLLRIQDNGKGFNVDEKLEQSYGLKNMRERALEIGATFHIVSLPDSGTRIEVKAPLNKEDSYDD >CP029664.1|AWQ74985.1|671313_671943_+|response-regulator MTIKVLFVDDHEMVRIGISSYLSTQSDIEVVGEGASGKEAIAKAHELKPDLILMDLLMDDMDGVEATTQIKKDLPQIKVLMLTSFIEDKEVYRALDAGVDSYILKTTSAKDIADAVRKTSRGESVFEPEVLVKMRNRMKKRAELYEMLTEREMEILLLIAKGYSNQEIASASHITIKTVKTHVSNILSKLEVQDRTQAVIYAFQHNLIQ >CP029664.1|AWQ74012.1|672058_673276_-|yihY-family-inner-membrane-domain-protein MSKKDHSSSKYLNSVKEAQEESKKKNKSNPKIDVDRTYIEPQQFQSKKPKKDDQVFFLSRLNKPAKYKKDSNFLSYLIYRIGKDDASGLAAQMTYHFVLAMFPMLLFLLTLLPFFNIKQSQITNMLSNAPAETSTLIKSVIGDITQNSSGGLLSIGLILAIWSASNGMTAIMNSFNVAYDVEDSRNGIVLKLLSVVFTVVMGVVFVVALALPTLGSVISHFLFGPLGFDEQVKWIFNLIRIVLPIIIIFIIFIVLYSVAPNVKTKLKSVLPGAVFTSIIWLAGSFGFGWYISNFGNYSKTYGSIAGIIILLLWLYITSFIIIVGAEINAIIHQRSVIKGKTPEEAALEHDDNNKNHYNENTRYEYDEDSNATHQRTYHVDEHPSDTYPEDDKNIKDKIVDKLKKD >CP029664.1|AWQ74836.1|673553_673829_-|hypothetical-protein MENKFVPGILIGAVIGGAISLADKSTRQALVQSVKDAKNGNRTRKPSKVSKIKDEVLYWKDVVEEIRRNNPELERSLKDAKETFVNRKNQR >CP029664.1|AWQ74828.1|673835_674300_-|low-molecular-weight-protein-tyrosine-phosphatase-PtpA MVDVAFVCLGNICRSPMAEAIMRQRLKDRNIHDIKVHSRGTGSWNLGEPPHEGTQKILNKHNIPFDGMISELFEATDDFDYIVAMDQSNVDNIKSINPNLKGQLFKLLEFSNMEESDVPDPYYTNNFEGVYDMVLSSCDNLIDYIVKDANLKEG >CP029664.1|AWQ73669.1|674446_674647_+|hypothetical-protein MTNEEKVLAIREKLNIVNQGLLDPEKYKNANEEELTDIYDFVQSRERLSPSEVTAIADALGQLRHE >CP029664.1|AWQ74855.1|674658_675906_+|thermophilic-metalloprotease-family-protein MTNYKEKLQQYAELLVKVGMNVQPKQPVFIRSSVETLELTHLIVEEAYHCGASDVRVVYSDPTLKRLKFENESVEHFANHEIKSYDVEARMDYVKRGAANLALISEDPDLMDGIDSQKLQAFQQQNARAFKGYMESVQKNQFPWVVAAFPSKAWAKRVYPELSVEEAYIKFIDEVFDIVRIDGNDPVENWRQHIANLSVYAQKLQQKNYHALHYVSEGTDLTVGLAKNHIWEDATSYVNGKEQAFIANIPTEEVFTAPDRNRVDGYVTNKLPLSYNGTIIDQFKLMFKDGEIIDFSAGKGEAVLKDLINTDEGSRRLGEVALVPDDSPISNRNTIFYNTLFDENAACHLAIGSAYAFNIQGGTEMTVEEKIASGLNDSNVHVDFMIGSSDLTIYGIFEDDSKELVFENGNWASTF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029664_4 | 1744983-1745291 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029664_4
|
4 spacers
spacers of CP029664_4
>4.1|1745013|53|CP029664|CRT TTGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCGCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACC >4.2|1745096|26|CP029664|CRT TCGCCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCG >4.3|1745152|28|CP029664|CRT GCTAATTTCTCTGTGTCGGGGCTCCACC >4.4|1745210|26|CP029664|CRT CCGCCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCG >4.5|1745236|33|CP029664|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTTCCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029664_4
The CRISPR arrays of CP029664_4 >merge|CP029664|4|1744983-1745291|CRT,CRISPRCasFinder CCAAATTGAAATTATCCTACTGCTGTCTTTTTGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCGCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACCCCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGAGGAGCTAATTTCTCTGTGTCGGGGCTCCACCCCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTTCCACCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCG >CP029664|4|2|1744983-1745265|CRT CCAAATTGAAATTATCCTACTGCTGTCTTT TTGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCGCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACC CCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTT TCGCCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCG CCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGAGGA GCTAATTTCTCTGTGTCGGGGCTCCACC CCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTT CCGCCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCG CCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTT >CP029664|4|3|1745213-1745291|CRISPRCasFinder CCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCG CCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTTCCA CCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCG
>CP029664.1|AWQ74276.1|1743983_1744913_+|glycerophosphoryl-diester-phosphodiesterase-family-protein MTNSSKSFTKFMAASAVFTMGFLSVPTAGAEQTNQIANKPQAIQWHTNLTNERFTTIAHRGASGYAPEHTFQAYDKSHNELKASYIEIDLQRTKDGHLVAMHDETVNRTTNGHGKVEDYTLDELKQLDAGSWFNKKYPKYARASYKNAKVPTLDEILERYGPNANYYIETKSPDVYPGMEEQLLASLKKHHLLNNNKLKNGHVMIQSFSDESLKKIHRQNKHVPLVKLVDKGELQQFNDQRLKEIRSYAIGLGPDYTDLTEQNTHHLKDLGFIVHPYTVNEKADMLRLNKYGVDGVFTNFADKYKEVIK >CP029664.1|AWQ74259.1|1742362_1743742_+|argininosuccinate-lyase MSNKAWGGRFEVQPEEWVDDFNASITFDQTLIDQDIEGSIAHATMLANQGIISQQDSEQIIQGLKSIQHDYHQDQIQFSASLEDIHLNIEHELIKRIGDAGGKLHTGRSRNDQVATDMHLYTKKQVQDIIALIKSLQSVIVDIASNNVDTIMPSYTHLQRAQPISFAHHIMTYFWMLQRDQQRFEDSLKRIDINPLGAAALSGTTYPIDRHETTALLNFGSLYENSLDAVSDRDYIIETLHNISLTMVHLSRFAEEIIFWSTDEAKFITLSDAFSTGSSIMPQKKNPDMAELIRGKVGRTTGHLMSMLMTLKGLPLAYNKDMQEDKEGLFDAVHTIKGSLRIFEGMIQTMTINKERLNQTVKEDFSNATELADYLVTKNIPFRTAHEIVGKIVLECIQQGHYLLDVPLATYQQHHSSIDADIYDYLQPENCLKRRQSYGSTGQSSVKQQLDVAKQLLSQ >CP029664.1|AWQ75182.1|1741167_1742373_+|argininosuccinate-synthase MKEKIVLAYSGGLDTSVAVQWLIDKGYDVVACCLDVGEGKDLDIVYKKALDMGAVECHIIDATKEFSDEYVSYAIKGNLMYENAYPLVSALSRPLIAKKLVEIAEKTNSVGIAHGCTGKGNDQVRFEVAIKALNPSLKAFAPVREWAWSREEEIDYAIKHNIPVSINHDSPYSIDQNLWGRANECGILEDPYAAPPEDAFDLTNALEETPDTADEIILTFDKGIPVQIDGKTYELDDLILTLNALAGKHGIGRIDHVENRLVGIKSREIYEAPAAEVILKAHKALETITLTKDVAHFKPIIEKQFAEQLYNGLWFSPLTDSLKLFIDSTQQYVSGDVRIKLFKGNAIVNGRKSPYTLYDEKLATYTKEDAFNQDAAVGFIDIYGLPTQVNAMLHGGYSNEQ >CP029664.1|AWQ75272.1|1739485_1740817_-|glucose-6-phosphate-isomerase MTHIQLDFSKTLEFFGEHELKQQQEIVKSIHKTIHEGTGAGSDFLGWVDLPVDYDKEEFSRIVEASKRIKENSDVLVVIGIGGSYLGARAAIEMLTSSFRNSNEYPEIVFVGNHLSSTYTKELVDYLADKDFSVNVISKSGTTTEPAVAFRLFKQLVEERYGKEEAQKRIFATTDKEKGALKQLATNEGYETFIVPDDVGGRYSVLTAVGLLPIATAGINIEAMMIGAAKAREELSSDKLEENIAYQYATIRNILYAKGYTTEMLINYEPSMQYFNEWWKQLFGESEGKDFKGIYPSSANYTTDLHSLGQYVQEGRRFLFETVVKVNHPKYDITIEKDSDDLDGLNYLAGKTIDEVNTKAFEGTLLAHTDGGVPNMVVNIPQLDEETFGYVVYFFELACAMSGYQLGVNPFNQPGVEAYKQNMFALLGKPGFEDLKKELEERL >CP029664.1|AWQ75039.1|1738585_1739161_-|hypothetical-protein MSFHQVEEWFEIFRQFGYLPGFILLYIRAIIPVFPLALYILINIQAYGPILGILISWLGLISGTFTVYLICKRLVNTERMQRIKQRTAVQRLISFIDRQGLIPLFILLCFPFTPNTLINFVASLSHIRPKYYFIVLASSKLVSTIILGYLGKEITTILTHPLRGILMLVVLVVFWIVGKKLEQHFMGSKKE >CP029664.1|AWQ75441.1|1738056_1738581_-|signal-peptidase-I MKKVVKYLISLILAIIIVLFVQTFVIVGHVIPNNDMSPTLNKGDRVIVNKIKVTFNQLNNGDIITYRRGNEIYTSRIIAKPGQSMAFRQGQLYRDDRPVDASYAKNRKIKDFSLRNFKELDGDIIPPNNFVVLNDQDNNKHDSRQFGLIDKKDIIGNVSLRYYPFSKWTVQFKS >CP029664.1|AWQ73607.1|1737465_1738041_-|signal-peptidase-I MKKEILEWIISIAVAFVILFIVGKFIVTPYTIKGESMDPTLKDGERVAVNIVGYKTGGLEKGNVVVFHANKNDDYVKRVIGVPGDKVEYKNDTLYVNGKKQDEPYLNYNLKHKQGDYITGTFQVKDLPNANPKSNVIPKGKYLVLGDNREVSKDSRAFGLIDEDQIVGKVSFRFWPFSEFKHNFNPENTKN >CP029664.1|AWQ75327.1|1733829_1737306_-|helicase-exonuclease-AddAB,-AddB-subunit MTLHAYLGRAGTGKSTKMLTEIKQKMKADPLGDPIILIAPTQSTFQLEQAFVNDPELNGSLRTEVLHFERLSHRIFQEVGSYSEQKLSKAATEMMIYNIVQEQQKYLKLYQSQAKYYGFSEKLTEQIQDFKKYAVTPEHLEHFIADKNMQTRTKNKLEDIALIYREFEQRIQNEFITGEDSLQYFIDCMPKSEWLKRADIYIDGFHNFSTIEYLIIKGLIKYAKSVTIILTTDGNHDQFSLFRKPSEVLRHIEEIANELNISIERQYFNQLYRFNNQDLKHLEQEFDALQINRVACQGHINILESATMREEINEIARRIIVDIRDKQLRYQDIAILYRDESYAYLFDSILPLYNIPYNIDTKRSMTHHPVMEMIRSLIEVIQSNWQVNPMLRLLKTDVLTASYLKSAYLVDLLENFVLERGIYGKRWLDDELFNVEHFSKMGRKAHKLTEDERNTFEQVVKLKKDVIDKILHFEKQMSQAETVKDFATAFYESMEYFELPNQLMTERDELDLNGNHEKAEEIDQIWNGLIQILDDLVLVFGDEPMSMERFLEVFDIGLEQLEFVMIPQTLDQVSIGTMDLAKVDNKQHVYLVGMNDGTMPQPVTASSLITDEEKKYFEQQANVELSPTSDILQMDEAFVCYVAMTRAKGDVTFSYSLMGSSGDDKEISPFLNQIQSLFNQLEITNIPQYHEVNPLSLMQHAKQTKITLFEALRAWLYDEIVADSWLDAYQVIRDSDHLNQGLDYLMSALTFDNETVKLGETLSKDLYGKEINASVSRFEGYQQCPFKHYASHGLKLNERTKYELQNFDLGDIFHSVLKYISERINGDFKQLDLKKIRQLTNEALEEILPKVQFNLLNSSAYYRYLSRRIGAIVETTLSALKYQGTYSKFMPKHFETSFRRKPRTNDELIAQTLTTTQGIPINIRGQIDRIDTYTKNDTSFVNIIDYKSSEGSATLDLTKVYYGMQMQMMTYMDIVLQNKQRLGLTDIVKPGGLLYFHVHEPRIKFKSWSDIDEDKLEQDLIKKFKLSGLVNADQTVIDALDIRLEPKFTSDIVPVGLNKDGSLSKRGSQVADEATIYKFIQHNKENFIETASNIMDGHTEVAPLKYKQKLPCAFCSYQSVCHVDGMIDSKRYRTVDETINPIEAIQNININDEFGGEQ >CP029664.1|AWQ74442.1|1730175_1733829_-|helicase-exonuclease-AddAB,-AddA-subunit MTIPEKPQGVIWTDAQWQSIYATGQDVLVAAAAGSGKTAVLVERIIQKILRDGIDVDRLLVVTFTNLSAREMKHRVDQRIQEASIADPANAHLKNQRIKIHQAQISTLHSFCLKLIQQHYDVLNIDPNFRTSSEAENILLLEQTIDEVIEQHYDILDPAFIELTEQLSSDRSDDQFRMIIKQLYFFSVANPNPKNWLDQLVTPYEEEAQQAQLIQLLTDLSKVFITAAYDALNKAYDLFSMMDSVDKHLAVIEDERRLMGRVLEGGFIDIPYLTGHEFGARLPNVTAKIKEANEMMVDALEDAKLQYKKYKSLIDKVKSDYFSREADDLKADMQQLAPRVKYLARIVKDVMSEFNRKKRSKNILDFSDYEHFALQILTNEDGSPSEIAESYRQHFQEILVDEYQDTNRVQEKILSCIKTGDEHNGNLFMVGDVKQSIYKFRQADPSLFIEKYQRFTIDGDGTGRRIDLSQNFRSRKEVLSTTNYIFKHMMDEQVGEVKYDEAAQLYYGAPYDESDHPVNLKVLVEADQEHSDLTGSEQEAHFIVEQVKDILEHQKVYDMKTGSYRSATYKDIVILERSFGQARNLQQAFKNEDIPFHVNSREGYFEQTEVRLVLSFLRAIDNPLQDIYLVGLMRSVIYQFKEDELAQIRILSPNDDYFYQSIVNYINDEAADAILVDKLKMFLSDIQSYQQYSKDHPVYQLIDKFYNDHYVIQYFSGLIGGRGRRANLYGLFNKAIEFENSSFRGLYQFIRFIDELIERGKDFGEENVVGPNDNVVRMMTIHSSKGLEFPFVIYSGLSKDFNKRDLKQPVILNQQFGLGMDYFDVDKEMAFPSLASVAYRAVAEKELVSEEMRLVYVALTRAKEQLYLIGRVKNDKSLLELEQLSISGEHIAVNERLTSPNPFHLIYSILSKHQSASIPDDLKFEKDIAQIEDSSRPNVNISIVYFEDVSTETILDNDEYRSVNQLETMQNGNEDVKAQIKHQLDYRYPYVNDTKKPSKQSVSELKRQYETEESGTSYERVRQYRIGFSTYERPKFLSEQGKRKANEIGTLMHTVMQHLPFKKERISEVELHQYIDGLIDKHIIEADAKKDIRMDEIMTFINSELYSIIAEAEQVYRELPFVVNQALVDQLPQGDEDVSIIQGMIDLIFVKDGVHYFVDYKTDAFNRRRGMTDEEIGTQLKNKYKIQMKYYQNTLQTILNKEVKGYLYFFKFGTLQL >CP029664.1|AWQ73484.1|1729107_1730010_-|fumarylacetoacetate-(FAA)-hydrolase-family-protein MKFLSFKYNDKTSYGVKVKREDAVWDLTQVFADFAEGDFHPKTLLAGLQQNHTLDFQEQVRKAVVAAEDSGKAEDYKISFNDIEFLPPVTPPNNVIAFGRNYKDHANELNHEVEKLYVFTKAASSLTGDNATIPNHKDITDQLDYEGELGIVIGKSGEKIPKALALDYVYGYTIINDITDRKAQSEQDQAFLSKSLTGGCPMGPYIVTKDELPLPENVNIVTKVNNEIRQDGNTGEMILKIDELIEEISKYVALHPGDIIATGTPAGVGAGMQPPKFLQPGDEVKVTIDNIGTLTTYIAK >CP029664.1|AWQ73755.1|1745415_1746660_-|NAD-specific-glutamate-dehydrogenase MTENNNLVTSTQGIIKEALHKLGFDEGMYDLIKEPLRMLQVRIPVRMDDGTVKTFTGYRAQHNDAVGPTKGGVRFHPDVDEEEVKALSMWMTLKCGIVNLPYGGGKGGIVCDPRQMSIHEVERLSRGYVRAISQFVGPNKDIPAPDVFTNSQIMAWMMDEYSALDKFNSPGFITGKPIVLGGSHGRDRSTALGVVIAIEQAAKRRNMQIEGAKVVIQGFGNAGSFLAKFLYDLGAKIVGISDAYGALHDPNGLDIDYLLDRRDSFGTVTNLFEETISNKELFELDCDILVPAAISNQITEDNAHDIKASIVVEAANGPTTPEATRILTERGILLVPDVLASAGGVTVSYFEWVQNNQGYYWSEEEVDEKLREKLEAAFDTIYELSQNRKIDMRLAAYIIGIKRTAEAARYRGWA >CP029664.1|AWQ75789.1|1746768_1747959_-|ornithine--oxo-acid-transaminase MTKSEKIIELTNHYGAHNYLPLPIVISEAEGVWVKDPEGNKYMDMLSAYSAVNQGHRHPKIIQALKDQADKVTLVSRAFHSDNLGEWYEKICKLAGKDKALPMNTGAEAVETALKAARRWAYDVKGIEPNKAEIIAFNGNFHGRTMAPVSLSSEAEYQRGYGPLLDGFRKVDFGDVDALKAAINENTAAVLVEPIQGEAGINIPPEGYLKAIRELCDEHNVLFIADEIQAGLGRSGKLFATDWDNVKPDVYILGKALGGGVFPISVVLADKEVLDVFTPGSHGSTFGGNPLACAASIAALDVIVDEDLPGRSLELGDYFKEQLKQIDHPSIKEVRGRGLFIGVELNESARPYCEALKEEGLLCKETHDTVIRFAPPLIITKEELDLALEKIRHVFQ >CP029664.1|AWQ74472.1|1748266_1749394_-|flavin-oxidoreductase-/-NADH-oxidase-family-protein MKSKYEPLFDKVELPNGVELRNRFVLAPLTHISSNDDGTISDVELPYIEKRSQDVGITINAASNVSDVGKAFPGQPSIAHDSNIEGLKRLATAMKKNGAKALVQIHHGGAQALPELTPDGDVVAPSPISLKSFGQKQEHSAREMTNEEIEQAIKDFGEATRRAIEAGFDGVEIHGANHYLIHQFVSPYYNRRNDVWANQYKFPVAVIEEVLKAKEAYGNKDFIVGYRLSPEEAESPGITMEITEELVNKISHMPIDYIHVSMMDTHATTREGKYAGQERLPLIHKWINGRMPLIGIGSIFTADEALDAVENVGVDLVAIGRELLLDYQFVEKIKDGREDEIINYFDPEREDNHHLTPNLWHQFNEGFYPLPRKDK >CP029664.1|AWQ75295.1|1749755_1750133_-|S1-RNA-binding-domain-protein MNNYKIGQHIKVRVTGIQPYGAFVETPNHTEGLIHISEIMDDYVHNLKKFLSEGQIVKAKILSIDDEGKLNLSLKDNDYFKNYERKKEKQSVLDEIRETEKYGFQTLKERLPIWIKQSKRAIRND >CP029664.1|AWQ74184.1|1750548_1751142_-|cyclophilin-type-peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase/CLD-family-protein MANYPQLNKEVQQGEIKVVMHTNKGDMTFKLFPNIAPKTVENFVTHAKNGYYDGITFHRVINDFMIQGGDPTATGMGGESIYGGAFEDEFSLNAFNLYGALSMANSGPNTNGSQFFIVQMKEVPQNMLSQLADGGWPQPIVDAYGEKGGTPWLDQKHTVFGQIIDGETTLEDIANTKVGPQDKPLHDVVIESIDVEE >CP029664.1|AWQ73852.1|1751205_1751589_+|kinase-associated-B-family-protein MKLYRFSHKTGSYGVTIVEENGDDVLVKVEQVIKHPKQGDLHNPTETEGVFFHDRKALSHFEKRYTKRSQLRDFNVDVLRYEDSLQQAITDLETKLKAQQTKHAEMSLASLARLKEDYSLQYKENFK >CP029664.1|AWQ73355.1|1751719_1754125_+|na(+)/H(+)-antiporter-subunit-A1 MSLLHIAVILPLIFALIIPILYRFFKRIHLGWFVLPVPIVIFIYMLTLIKTTMSGNTVMKTLNWMPHFGMNFDLYLDGLGLLFSLLISGIGSLVVLYSIGYLSKSEQLGNFYCYLLLFMGAMLGVVLSDNVIILYLFWELTSFSSFLLISFWRERQASIYGAQKSLIITVFGGLSLLGGIILLAIPTQSFSIQYMIQHASEIQNSPFFIFAMILIMIGAFTKSAQFPFYIWLPDAMEAPTPVSAYLHSATMVKAGLYLIARMTPIFAASQGWVWTVTLVGLITLFWASLNATKQQDLKGILAFSTVSQLGMIMAMLGIGAISYHYQGDDSKIYAAAFTAAIFHLINHATFKGALFMITGAVDHSTGTRDVKKLGGLLTIMPISFTITVITALSMAGVPPFNGFLSKESFLETTFTASQANLFSVDTLGYLFPIIGIVGSVFTFVYSIKFIMHIFFGQYKPEQLPKKAHEVSILMLLSPAILATLVIVFGLFPGILTNSIIEPATSSINHTVIDDVEFHMFHGLTPAFLSTLVIYILGILLIVTFSYWVKLLQRQPGKLTFNYWYNRSANVIPNYSEKMTNSYVTDYSRNNLVIIFGALILLTFVTIFSVPFNINFKDVSPIRIFEVCIVILLLSAAFLILFAKSRLFSIIMLSAVGYAVSVLFIFFKAPDLALTQFVVESISTALFLLCFYHLPNLNRYNEKRSFQLTNALIAGGVGLSVIIIGLIAYGNRHFESISKFYQEHVYDLAHGKNMVNVILVDFRGMDTLFESSVLGIAGLAVYTMIKLRKKRQTQGNEVKNHE >CP029664.1|AWQ75837.1|1754117_1754546_+|na(+)/H(+)-antiporter-subunit-B MNRQQNDLILQFAAVIIFFMVMVFGFSLFLAGHYTPGGGFVGGLLFASSLVIITIAFDIETMRKIFPLDFKILIGIGLVFCIATPIASWFLGKNFFTHVTFDIPLFILEPVHMTTAVFFDFGVLCAVVGTVMTIIISIGENE >CP029664.1|AWQ73920.1|1754632_1754887_+|na(+)/H(+)-antiporter-subunit-C MGTTLLTHAANLFLITMGGLKHGTVPIYEANVKSYVDPIPQALILTAIVIAFATTAFFLVLAFRTYKELGTDNVESMKGVPEDD >CP029664.1|AWQ75270.1|1754879_1756376_+|na(+)/H(+)-antiporter-subunit-D MIESNMLVLTLVIPVITAILLVFIGKRPIIKRYVALGGTLLTLVAAIINLANVVKHGPIRVELGSWKAPYSIVFVLDIFSALLIITSIIITAIVILYSYQTIGIERERYYYYFSVLFMLIGIIGAFTTGDIFNLFVYFEVFLMSSYFLLVIGSTKIQLQETIKYVLVNVVSSSFFVMGVAILYSVVGTLNLADISNKLANLSAHDSGLVNIVFILFIFVFATKAGVFPMFVWLPSAYYAPPIPIIAFFGALLTKVGVYAIARTLSLFFSDNVSFSHYVILFLALLTIIFGCVGAVAYANIKKIILYNVMIAVGVILVGVAMMTESGMIGAIYYTLHDMLVKLALFLLIGIMIKITGTADLRQFGGLIKRYPVLGWSFFIAALSLAGIPPLSGFYGKFFIVQSTFERGFYLSGVIVLLSSLVVLYSVIRIFLQGFFGQPKGYDLNNKVDVKYLTTIAIVAVVITVLYGLSADYLYPMVKAGAETFYNPSTYVKAVLGGK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029664_5 | 1807994-1808075 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029664_5
|
1 spacers
spacers of CP029664_5
>5.1|1808018|34|CP029664|CRISPRCasFinder ATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029664_5
The CRISPR arrays of CP029664_5 >merge|CP029664|5|1807994-1808075|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGGG >CP029664|5|4|1807994-1808075|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGG ATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT TTCTACAGACAATGCAAGTTGGGG
>CP029664.1|AWQ74677.1|1807050_1807437_-|toprim-domain-protein MAIVNKVIIVEGKSDKKRVQQVIAEPVNIICTHGTMSIDKLDDMIESLYDKQVFVLADSDDEGDRIRNWFKRYLSESEHIFIDKTYCQVANCPKQYLAHVLSKHGFTCKKETPLLPNINNERLVLVNE >CP029664.1|AWQ74856.1|1806761_1807058_-|thioredoxin-family-protein MNNSLDIKDVTTFYEEDKHLIFGYTPTCGTCKVSERMLDIANEILQLPLLKIDLNFYPQFCKDMQIMSTPILLLMNKDKEVKRIYAFKSVTDLLENLK >CP029664.1|AWQ74051.1|1805486_1806512_-|methionine-import-ATP-binding-protein-MetN-2 MIELKEVVKEYRTKNKEVLAVDHVNLSIRAGSIYGVIGFSGAGKSTLIRMFNHLEAPTSGEVIIDGDHIGQLSKNGLRAKRQKVSMIFQHFNLLWSRTVLKNIMFPLEIAGVPRRRAKQKALELVELVGLKGREKAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPTVLLCDEATSALDPQTTDEILDLLLKIREQQNLTIVLITHEMHVIRRICDEVAVMESGKVIEQGPVTQVFENPQHTVTKRFVKDDLNDDFETSLTELEPLEKDAYIVRLVFAGSTTTEPIVSSLSTAYDIKINILEANIKNTKNGTVGFLVLHIPYISSVDFGKFEKELIERQVKMEVLRHG >CP029664.1|AWQ75956.1|1804798_1805452_-|methionine-import-system-permease-protein-MetP MPNIQWPEVWTAIVETLYMTVVSTIFAFILGLILGVLLFLSAKGKSIGARLFYSIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSLILGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTWTVIRKVLLPEAMPALVSGITVTAIALVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWLTNKLDKR >CP029664.1|AWQ74394.1|1803959_1804781_-|NLPA-lipofamily-protein MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGNKSGSDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYELDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGDVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFLPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK >CP029664.1|AWQ75762.1|1802596_1803817_+|phage-integrase-family-protein MWLEKFKNKNKETKYRYYEKYKDPLTAKWRRVSVVLNKNGKQSQKEAQRLLNERIEEKLNDKKPTTLKSLTFHVACDEWFQNYIKTSGSKRTTIKTKLSKLNTLKKFVDEDILINKITLSYAQQVFDEMDSKGYVYQVNKDALSIFKNVFEYTRRIYKLQDLEFLKDITLNKRIKSYDEVKAKRNKYLELNEIESIIKDINTKAQKMHSGIHKRFYLFVALMTEFQALNGMRIGEMLAIQNEDIDFDNKSLNINGTIHWFHDESGGFGVKDTTKTESSYRTIGLSSRSCEILKKAILENKKDSKWNDGYLNRNFVFTNHKGNPMQTERFNKILREAAKDVGIDKEVSSHILRHSHISLLSQQGVSLKAIMDRVGHSDHRTTLSIYSHVTEQMDKDMMNKLEQVKLG >CP029664.1|AWQ74902.1|1801780_1802509_+|toxin-beta-grasp-domain-protein MKKLIVIILINIITLSVSNSASAQGDIGIDNLRNFYTKKDFVDLKDVKDNDTPIANQLQFSNVSYDLISESKDFNKFSNFKGKKLDVFGISYNGQCNNKYIYGGVTATNEYLDKPRNIPINIWINGNHKTISTNKVSTNKKFVTAQEIDVKLRKYLQEEYNIYGHNGTKKGEEYGHKSKFYSGFNIGKVTFHLNNNDTFSYDLFYTGDDGLPKSFLKIYEDNKTVESEKFHLDVDISYKETI >CP029664.1|AWQ73613.1|1801028_1801757_+|toxin-beta-grasp-domain-protein MNKIFRVLTVSLFFFTFLIKNNLAYADVGVINLRNFYTNYQPETLQGVSSGNFSTSHQLEYIDGKYTLYSQFHNEYEAKRLKDHKVDIFGISYSGLCNTKYMYGGITLANQNLDKPRNIPINLWVNGKQNTISTDEVSTQKKEVTAQEIDIKLRKYLQNEYNIYGFNKTKKGQEYGYQSKFNSGFNKGKITFHLNNETSFTYDLFYTGTGQAESFLKIYNDNKTIDAENFHLDVEISYEKTE >CP029664.1|AWQ74279.1|1800553_1801012_+|hypothetical-protein MYLYEKMVIENKEIPIDDGKSLGNFEGLYDNGVILINKNLSETRKAEVLYEELAHHKLTYGNILDQSKWINRKFENYARRHGFISAVPLREIVEAYNYGVRNLYELSEYLQLSEKYILEAIEQYKKIYGIGTHYGEYSITFEPLRVFKYKEI >CP029664.1|AWQ73816.1|1800209_1800542_+|helix-turn-helix-family-protein MRTNDEIITIIKTSMKEQNMSLSELARRVGVAKSAVSRYLNLTREFPLNRAEDFAKVLGIKTEYLLGFAEREESTKQDTIAAHLDGDFTEEELIEIRKYAELVRKAHRNQ >CP029664.1|AWQ73382.1|1808178_1809057_-|hypothetical-protein MLNIQDVSHLSKKEQKAYNRFVESVENGNLPVLPCIEMDLKEMQEETLNQSKIGGMPFLKYFKDIPLDENNVPMVLLAQINLDDLPEQQELFPVKEGILQFWISSEDQMYGMSENLKGNNINSRLVYIKEPITDLSLENIQAHLKSLDADNEDIPFSGAFSIEFRLSKQTITCTDYKYDEDVLALWNKVNPSFALKSMFGGYDELMEPVCNTFTAKEPFNQLGGYPYFDQIDPRTNDQELKMYDRVLLQIDSTRDGNSSIIWGDLGIANILVKSTDLEAMKFDDYMYSWDCS >CP029664.1|AWQ75550.1|1809058_1809172_-|hypothetical-protein MKEKLLGTIIWSIATFYYSRMMEIMNLAILKIKIGGS >CP029664.1|AWQ74224.1|1809235_1809616_-|glycine-cleavage-system-H-protein MAVPNELKYSKEHEWVKVEGNVAIIGITEYAQSELGDIVFVELPETDDEINEGDTFGSVESVKTVSELYAPISGKVVEVNEELEDSPEFVNESPYEKAWMVKVEISDESQIEALLTAEKYSEMIGE >CP029664.1|AWQ73403.1|1809773_1810130_-|transcriptional-regulator,-Spx/MgsR-family-protein MIKFYQYKNCTTCKKAAKFLDEYGVSYEPIDIVQHTPTINEFKTIIANTGVEINKLFNTHGAKYRELDLKNKLQTLSDDEKLELLSSDGMLVKRPLAVMGDKITLGFKEDQYKETWLA >CP029664.1|AWQ74974.1|1810273_1810594_+|thioredoxin-family-protein MQSIKSNESFKSVINSDTPVIVKFEAGWCPDCRAMDLWIDPIVEQYNDYQWYTVNRDELEDVVVENEVMGIPSLLVFKNGDKIAHLHSANAKSPEQVESFLAETFK >CP029664.1|AWQ74374.1|1810743_1811283_-|nitroreductase-family-protein MELQQAIANRRSVKKFKRDMHIDDALLYQAIEKAADAPNHGMREPWRVVHVPKDRLGDMSKDISKFAFPNELDKQQCHYDAVTKLGGMLLLILKTDPRQRQNDENYFAFGAYAQNLMLLLYEAGIGTCWKSPLYIYDPKVRKTLGIKKDEVLAGFLYLTDLEGDMPKAPRKNRNLITLY >CP029664.1|AWQ75574.1|1811365_1812082_-|3-dehydroquinate-dehydratase MTHVEVVATIAPQLSIEETLIQKINHRIDAIDVLELRIDQIENVTVDQVAEMITKLKVMQDSFKLLVTYRTKLQGGYGQFTNDSYLNLISDLANINGIDMIDIEWQADIDIEKHQRIITHLQQYNKEVVISHHNFESTPPLDELQFIFFKMQKFNPEYVKLAVMPHNKNDVLNLLQAMSTFSDTMDCKVVGISMSKLGLISRTAQGVFGGALTYGCIGVPQAPGQIDVTDLKAQVTLY >CP029664.1|AWQ74045.1|1812229_1812652_+|peroxiredoxin,-Ohr-subfamily-protein MAIHYETKATNVGGRKGHVYTDDRALDIDIVPPAQADGKATNPEQLFAAGYASCFNGAFDLILKQNKVRDAHPEVTLTVRLEDDSDSESPKLSVSIDATIKNVISQEEAEKYLQMAHEFCPYSKATQGNINVDLNVNVVD >CP029664.1|AWQ73751.1|1813050_1813545_+|acetyltransferase-domain-protein MIEIKTLTNNDFNEYKRLVSTVNEEFTQDSHYSQTMTDTLIHDILNQGSPKCIVFGCYENETLIATAALEQIRYVGKEHKSLIKYNFVTNNDKSINSELINFIINYARQNNYESLLTSIVSNNIGAKVFYSALGFDILGFEKNAIKIGNTYFDEHWLFYDLINK >CP029664.1|AWQ73316.1|1813699_1814317_+|lysE-type-translocator-family-protein MVTAIIHGFILAIGLILPLGAQNVFIFNQGANQPKYRYVLPAIITAGLSDSLLIIIAVVGVSIIIMSLPVLQAIIYIVGLIFLMYMAWTIWHDKPSTDGETQIMSPMKQVSFALSVSLLNPHAILDTIGVIGSSAALYSGSNKIAFTIACISVSWLWFFLLAILGKMVGSIDKTGKLLTIINKISSIIIIIVALMILQKLIQLLF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029664_6 | 1843962-1844054 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029664_6
|
1 spacers
spacers of CP029664_6
>6.1|1843995|27|CP029664|CRISPRCasFinder CTCCTCCCAATTTCTACAGGCAATGCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029664_6
The CRISPR arrays of CP029664_6 >merge|CP029664|6|1843962-1844054|CRISPRCasFinder AGTTGGGGTGGGGCCCCAACATAGTGAAATTGGCTCCTCCCAATTTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGG >CP029664|6|5|1843962-1844054|CRISPRCasFinder AGTTGGGGTGGGGCCCCAACATAGTGAAATTGG CTCCTCCCAATTTCTACAGGCAATGCA AGTTGGGGTGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGG
>CP029664.1|AWQ73335.1|1842518_1843532_-|glycolytic-operon-regulator MKDLLQAQQKLIPDLIDKMYKRFSILTTISKNQPVGRRSLSEHMDMTERVLRSETDMLKKQDLIKVKPTGMEITAEGEQLISQLKGYFDIYADDNRLSEGIKNKFQIKEVHVVPGDADNSQSVKTELGRQAGQLLEGILQEDAIVAVTGGSTMACVSEAIHLLPYNVFFVPARGGLGENVVFQANTIAASMAQQAGGYYTTMYVPDNVSETTYNTLLLEPSVINTLDKIKQANVILHGIGDALKMAHRRQSPEKVIEQLQHHQAVGEAFGYYFDTQGQIVHKVKTIGLQLEDLESKDFIFAVAGGKSKGEAIKAYLTIAPKNTVLITDEAAAKIILE >CP029664.1|AWQ75888.1|1841455_1842466_-|glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase,-type-I MAVKVAINGFGRIGRLAFRRIQEVEGLEVVAVNDLTDDDMLAHLLKYDTMQGRFTGEVEVVDGGFRVNGKEVKSFSEPDASKLPWKDLNIDVVLECTGFYTDKDKAQAHIEAGAKKVLISAPATGDLKTIVFNTNHQELDGSETVVSGASCTTNSLAPVAKVLNDDFGLVEGLMTTIHAYTGDQNTQDAPHRKGDKRRARAAAENIIPNSTGAAKAIGKVIPEIDGKLDGGAQRVPVATGSLTELTVVLEKQDVTVEQVNEAMKNASNESFGYTEDEIVSSDVVGMTYGSLFDATQTRVMSVGDRQLVKVAAWYDNEMSYTAQLVRTLAYLAELSK >CP029664.1|AWQ75146.1|1840126_1841317_-|phosphoglycerate-kinase MAKKIVSDLDLKGKTVLVRADFNVPLKDGEITNDNRIVQALPTIQYIIEQGGKIVLFSHLGKVKEESDKAKLTLRPVAEDLSKKLDKEVVFVPETRGEKLEAAIKDLKEGDVLLVENTRYEDLDGKKESKNDPELGKYWASLGDVFVNDAFGTAHREHASNVGISTHLETAAGFLMDKEIKFIGGVVNDPHKPVVAILGGAKVSDKINVIKNLVNIADKIIIGGGMAYTFLKAQGKEIGISLLEEDKIDFAKDLLEKHGDKIVLPVDTKVAKEFSNDAKITVVPSDSIPADQEGMDIGPNTVKLFADELEGAHTVVWNGPMGVFEFSNFAQGTIGVCKAIANLKDAITIIGGGDSAAAAISLGFENDFTHISTGGGASLEYLEGKELPGIKAINNK >CP029664.1|AWQ73502.1|1839243_1840005_-|triose-phosphate-isomerase MRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTAVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGETSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHETDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETDEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSEDQLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGASLKVEDFVQLLEGAK >CP029664.1|AWQ74908.1|1837723_1839241_-|2,3-bisphosphoglycerate-independent-phosphoglycerate-mutase MAKKPTALIILDGFANRESEHGNAVKLANKPNFDRYYNKYPTTQIEASGLDVGLPEGQMGNSEVGHMNIGAGRIVYQSLTRINKSIEDGDFFENDVLNNAIAHVNSHDSALHIFGLLSDGGVHSHYKHLFALLELAKKQGVEKVYVHAFLDGRDVDQKSALKYIEETEAKFNELGIGQFASVSGRYYAMDRDKRWEREEKAYNAIRNFDAPTYATAKEGVEASYNEGLTDEFVVPFIVENQNDGVNDGDAVIFYNFRPDRAAQLSEIFANRAFEGFKVEQVKDLFYATFTKYNDNIDAAIVFEKVDLNNTIGEIAQNNNLTQLRIAETEKYPHVTYFMSGGRNEEFKGERRRLIDSPKVATYDLKPEMSAYEVKDALLEELNKGDLDLIILNFANPDMVGHSGMLEPTIKAIEAVDECLGEVVDKILDMDGYAIITADHGNSDQVLTDDDQPMTTHTTNPVPVIVTKEGVTLRETGRLGDLAPTLLDLLNVEQPEDMTGESLIKH >CP029664.1|AWQ74519.1|1836289_1837594_-|phosphopyruvate-hydratase MPIITDVYAREVLDSRGNPTVEVEVLTESGAFGRALVPSGASTGEHEAVELRDGDKSRYLGKGVTKAVENVNEIIAPEIIEGEFSVLDQVSIDKMMIALDGTPNKGKLGANAILGVSIAVARAAADLLGQPLYKYLGGFNGKQLPVPMMNIVNGGSHSDAPIAFQEFMILPVGATTFKESLRWGTEIFHNLKSILSKRGLETAVGDEGGFAPKFEGTEDAVETIIQAIEAAGYKPGEEVFLGFDCASSEFYENGVYDYSKFEGEHGAKRTAAEQVDYLEQLVDKYPIITIEDGMDENDWDGWKQLTERIGDRVQLVGDDLFVTNTEILAKGIENGIGNSILIKVNQIGTLTETFDAIEMAQKAGYTAVVSHRSGETEDTTIADIAVATNAGQIKTGSLSRTDRIAKYNQLLRIEDELFETAKYDGIKSFYNLDK >CP029664.1|AWQ74751.1|1835491_1835950_-|putative-membrane-protein MADRTNKEIKTGRFIATASIVFSILLIIHYFVSLDNATAKALLNLTNQNTSDKAIDYILNSFRFTGIMYILAYLAGFITFWNRHTYVWWFMFAVYVSNSLFTLINLSITIQAIKAAHGAYLTLPILIVIIGSVALAIYMLVVSIKRKSTFNR >CP029664.1|AWQ74002.1|1835191_1835425_-|preprotein-translocase,-SecG-subunit MHTFLIVLLIIDCIALITVVLLQEGKSSGLSGAISGGAEQLFGKQKQRGVDLFLNRLTIILSILFFVLMICISYLGM >CP029664.1|AWQ73596.1|1834335_1835076_-|carboxylesterase MQIKLPKPFFFEEGKRAVLLLHGFTGNSSDVRQLGRFLQKKGYTSYAPQYEGHAAPPDEILKSSPFVWFKDALDGYDYLVEQGYDEIVVAGLSLGGDFALKLSLNRDVKGIVTMCAPMGGKTEGAIYEGFLEYARNFKKYEGKDQETIDNEMDHFKPTETLKELSEALDTIKEQVDEVLDPILVIQAENDNMIDPQSANYIYDHVDSDDKNIKWYSESGHVITIDKEKEQVFEDIYQFLESLDWSE >CP029664.1|AWQ74326.1|1831929_1834302_-|ribonuclease-R MNLKQSIEEIINQPEYEPMSVSDFQDALGLSSADSFRDLIKVLVELEQSGLIERTKTDRYQKKHSYRGQSKLIKGTLSQNKKGFAFLRPEDEDMEDIFIPPTKINRALDGDTVIVEIHQSKGEHKGKIEGEVKSIEKHSVTQVVGTYSEARHFGFVIPDDKRIMQDIFIPKGQSLGAVDGHKVLVQITKYADGSDNPEGHISAILGHKNDPGVDILSIIYQHGIEIEFPDEVLQEAEAVPDHIENTEIKGRHDLRDELTITIDGADAKDLDDAISVKKLANGNTQLTVSIADVSYYVTEGSALDKEAYDRATSVYLVDRVIPMIPHRLSNGICSLNPNVDRLTLSCRMEIDASGRVVKHEIFDSVIHSDYRMTYDAVNQIITEKDPNIREQYNEITPMLDLAQDLSNRLIQMRKRRGEIDFDISEAKVLVNEDGIPTDVQLRQRGEGERLIESFMLIANETVAEHFSKLDVPFIYRVHEQPKSDRLRQFFDFITNFGIMIKGTGEDIHPTTLQKVQEEVEGRPEQMVISTMMLRSMQQAHYDDVNLGHFGLSAEYYTHFTSPIRRYPDLTVHRLIRKYLIEKSMDNKEVKRWEDKLPELAEHTSKRERRAIEAERDTDELKKAEYMIQHIGDEFEGIVSSVANFGMFIELPNTIEGMVHIANMTDDYYRFEERQMALIGERQAKVFRIGDTVKVKVTHVDVDERLIDFQIVGMPLPKNDRSQRPARGKTIQAKTRGKSLDKSKSDDKGRKKKGKQRKGKNQRNNDKSGNSKHKPFYKDKSVKKKARRKKK >CP029664.1|AWQ74835.1|1844291_1844921_-|hypothetical-protein MSNQNYDYNKNEDGSKKKMSTTAKVVSIATVLLLLGGLVFAIFAYVDHSNKAKERMLNEQKQEQKEKRQKENAEKERKKKQQEEKEQNELDSQANQYQQLPQQNQYQYVPPQQQAPTKQRPAKEENDDKASKDESKDKDDKASQDKSDDNQKKTDDNKQPAQPKPQPQQPTPKPNNNQQNNQSNQQAKPQAPQQNSQSTTNKQNNANDK >CP029664.1|AWQ74526.1|1845622_1846525_+|NAD-dependent-epimerase/dehydratase-family-protein MKQYLITGGTGMVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQNIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKALFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGIILSNEGGALQTMKLPYEYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINNESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLIKE >CP029664.1|AWQ75273.1|1846767_1847355_-|ATP-dependent-Clp-endopeptidase,-proteolytic-subunit-ClpP MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >CP029664.1|AWQ75780.1|1847928_1848873_-|sporulation-Regulator-WhiA-C-terminal-domain-protein MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >CP029664.1|AWQ74919.1|1848982_1849978_-|hypothetical-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >CP029664.1|AWQ74728.1|1849974_1850886_-|hypothetical-protein MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >CP029664.1|AWQ74595.1|1851707_1852643_-|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >CP029664.1|AWQ75695.1|1852709_1854149_-|tetratricopeptide-repeat-family-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDMEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYHNELFVSENDVMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >CP029664.1|AWQ74823.1|1854156_1854438_-|bacterial-transferase-hexapeptide-family-protein MLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >CP029664.1|AWQ74291.1|1854649_1855489_-|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPSEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGSVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029664_7 | 1851122-1851346 | Unclear |
NA
Consensus repeat of CP029664_7
|
3 spacers
spacers of CP029664_7
>7.1|1851138|42|CP029664|PILER-CR GAATTTCGAAAAGAAATTCTACAGGCAATGCGAGTTGGGGTG >7.2|1851196|40|CP029664|PILER-CR GAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGC >7.3|1851252|40|CP029664|PILER-CR AGCTGACGAAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGC >7.4|1851291|26|CP029664|CRISPRCasFinder CGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029664_7
The CRISPR arrays of CP029664_7 >merge|CP029664|7|1851122-1851346|PILER-CR,CRISPRCasFinder GGGGCCCCAACACAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAGGCAATGCGAGTTGGGGTGTGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGACGAAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG >CP029664|7|1|1851122-1851307|PILER-CR GGGGCCCCAACACAGA GAATTTCGAAAAGAAATTCTACAGGCAATGCGAGTTGGGGTG TGGGCCCCAACATAGA GAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGC GGGGCCCCAACACAGA AGCTGACGAAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGC GGGGCCCCAACACAGA >CP029664|7|6|1851261-1851346|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG CGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCGG AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG
>CP029664.1|AWQ74728.1|1849974_1850886_-|hypothetical-protein MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >CP029664.1|AWQ74919.1|1848982_1849978_-|hypothetical-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >CP029664.1|AWQ75780.1|1847928_1848873_-|sporulation-Regulator-WhiA-C-terminal-domain-protein MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >CP029664.1|AWQ75273.1|1846767_1847355_-|ATP-dependent-Clp-endopeptidase,-proteolytic-subunit-ClpP MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >CP029664.1|AWQ74526.1|1845622_1846525_+|NAD-dependent-epimerase/dehydratase-family-protein MKQYLITGGTGMVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQNIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKALFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGIILSNEGGALQTMKLPYEYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINNESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLIKE >CP029664.1|AWQ74835.1|1844291_1844921_-|hypothetical-protein MSNQNYDYNKNEDGSKKKMSTTAKVVSIATVLLLLGGLVFAIFAYVDHSNKAKERMLNEQKQEQKEKRQKENAEKERKKKQQEEKEQNELDSQANQYQQLPQQNQYQYVPPQQQAPTKQRPAKEENDDKASKDESKDKDDKASQDKSDDNQKKTDDNKQPAQPKPQPQQPTPKPNNNQQNNQSNQQAKPQAPQQNSQSTTNKQNNANDK >CP029664.1|AWQ73335.1|1842518_1843532_-|glycolytic-operon-regulator MKDLLQAQQKLIPDLIDKMYKRFSILTTISKNQPVGRRSLSEHMDMTERVLRSETDMLKKQDLIKVKPTGMEITAEGEQLISQLKGYFDIYADDNRLSEGIKNKFQIKEVHVVPGDADNSQSVKTELGRQAGQLLEGILQEDAIVAVTGGSTMACVSEAIHLLPYNVFFVPARGGLGENVVFQANTIAASMAQQAGGYYTTMYVPDNVSETTYNTLLLEPSVINTLDKIKQANVILHGIGDALKMAHRRQSPEKVIEQLQHHQAVGEAFGYYFDTQGQIVHKVKTIGLQLEDLESKDFIFAVAGGKSKGEAIKAYLTIAPKNTVLITDEAAAKIILE >CP029664.1|AWQ75888.1|1841455_1842466_-|glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase,-type-I MAVKVAINGFGRIGRLAFRRIQEVEGLEVVAVNDLTDDDMLAHLLKYDTMQGRFTGEVEVVDGGFRVNGKEVKSFSEPDASKLPWKDLNIDVVLECTGFYTDKDKAQAHIEAGAKKVLISAPATGDLKTIVFNTNHQELDGSETVVSGASCTTNSLAPVAKVLNDDFGLVEGLMTTIHAYTGDQNTQDAPHRKGDKRRARAAAENIIPNSTGAAKAIGKVIPEIDGKLDGGAQRVPVATGSLTELTVVLEKQDVTVEQVNEAMKNASNESFGYTEDEIVSSDVVGMTYGSLFDATQTRVMSVGDRQLVKVAAWYDNEMSYTAQLVRTLAYLAELSK >CP029664.1|AWQ75146.1|1840126_1841317_-|phosphoglycerate-kinase MAKKIVSDLDLKGKTVLVRADFNVPLKDGEITNDNRIVQALPTIQYIIEQGGKIVLFSHLGKVKEESDKAKLTLRPVAEDLSKKLDKEVVFVPETRGEKLEAAIKDLKEGDVLLVENTRYEDLDGKKESKNDPELGKYWASLGDVFVNDAFGTAHREHASNVGISTHLETAAGFLMDKEIKFIGGVVNDPHKPVVAILGGAKVSDKINVIKNLVNIADKIIIGGGMAYTFLKAQGKEIGISLLEEDKIDFAKDLLEKHGDKIVLPVDTKVAKEFSNDAKITVVPSDSIPADQEGMDIGPNTVKLFADELEGAHTVVWNGPMGVFEFSNFAQGTIGVCKAIANLKDAITIIGGGDSAAAAISLGFENDFTHISTGGGASLEYLEGKELPGIKAINNK >CP029664.1|AWQ73502.1|1839243_1840005_-|triose-phosphate-isomerase MRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTAVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGETSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHETDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETDEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSEDQLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGASLKVEDFVQLLEGAK >CP029664.1|AWQ74595.1|1851707_1852643_-|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >CP029664.1|AWQ75695.1|1852709_1854149_-|tetratricopeptide-repeat-family-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDMEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYHNELFVSENDVMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >CP029664.1|AWQ74823.1|1854156_1854438_-|bacterial-transferase-hexapeptide-family-protein MLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >CP029664.1|AWQ74291.1|1854649_1855489_-|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPSEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGSVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >CP029664.1|AWQ75583.1|1855494_1856427_-|HPr(Ser)-kinase/phosphatase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >CP029664.1|AWQ75682.1|1857088_1859935_-|excinuclease-ABC-subunit-A MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNIDLSEHDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIEVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGVDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDK >CP029664.1|AWQ75423.1|1859942_1861928_-|excinuclease-ABC-subunit-B MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVEGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >CP029664.1|AWQ74080.1|1862196_1862433_-|hypothetical-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >CP029664.1|AWQ75150.1|1862429_1863080_-|HD-containing-hydrolase-like-enzyme-family-protein MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENE >CP029664.1|AWQ73434.1|1863253_1864093_-|staphyloxanthin-biosynthesis-protein,-putative MKKSLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQHGTQVKTPVQHNYVSNVQAQTQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKAVKSPVRKASQAKKVVKQPVQQASKKVVVKQAPKQAVTKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTPEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP029664_8 | 1950648-1950746 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029664_8
|
1 spacers
spacers of CP029664_8
>8.1|1950678|39|CP029664|CRISPRCasFinder ATGCAGTTGGTGCGTTAGCATCCAACTGTATTCCTTTGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029664_8
The CRISPR arrays of CP029664_8 >merge|CP029664|8|1950648-1950746|CRISPRCasFinder CCCCTTTTAATTTATTAATTAGGGGCTCTTATGCAGTTGGTGCGTTAGCATCCAACTGTATTCCTTTGTCCCCTTTTAATTTATTAATTAGGGGCTCTT >CP029664|8|7|1950648-1950746|CRISPRCasFinder CCCCTTTTAATTTATTAATTAGGGGCTCTT ATGCAGTTGGTGCGTTAGCATCCAACTGTATTCCTTTGT CCCCTTTTAATTTATTAATTAGGGGCTCTT
>CP029664.1|AWQ73756.1|1949409_1950624_-|major-Facilitator-Superfamily-protein MFAALLQIKNYKLFVANMFLLGMGIAVTVPYLVLFATKDLGMTTNQYGLLLASAAISQFTVNSIIARFSDTHHFNRKIIIILALLMGALGFSIYFFVDTIWLFILLYAIFQGLFAPAMPQLYASARESINVSSSKDRAQFANTVLRSMFSLGFLFGPFIGAQLIGLKGYAGLFGGTISIILFTLVLQVFFYKDLNIKHPISTQQHVEKIAPNMFKDKTLLLPFIAFILLHIGQWMYTMNMPLFVTDYLKENEQHVGYLASLCAGLEVPFMIILGVLSSRLQTRTLLIYGAIFGGLFYFSIGVFKNFYMMLAGQVFLAIFLAVLLGIGISYFQDILPDFPGYASTLFSNAMVIGQLGGNLLGGAMSHWVGLENVFFVSAASIMLGMILIFFTKNQKITKEDVIST >CP029664.1|AWQ73331.1|1948924_1949413_-|hypothetical-protein MTIILWLLIIAAFMLAFVGLIKPIIPSVLVLWVGFLIYQFGFHNQHLSWVFYVSMALLTILILCADFLANKYFVNRFGGSKFGEYAALIGVVIGCFVLPPFGIIIIPFILVFIVELIQGYSFERAVKVSIGSIVAFLTSSIAQAIIMFIMIVWFFIDALLIN >CP029664.1|AWQ73378.1|1948136_1948826_+|hypothetical-protein MKSTAQLTKENNVKSLRLSNTDREIFENYMTYMRSDFRVNPHDTELIINRILKQLLSAEQHGLLALDFFNHDPKAHAIKELKAMPNETFKNIFKYIYQHIVLLIGIVSFLKGFLGFFMEKNGSNLYFVSFPFSVVVGFFIVFLFIWFSFKTIQLQCFNNSNWIWIFTYLAIILLIVGFFYVFFIPQSLLAFGPYIQVSNWVFIIFSFIVMPIGLRIERNISKKHSHTFL >CP029664.1|AWQ74470.1|1947566_1947884_-|acetyltransferase-family-protein MICSRLEHTNDKIYIYENEGQLIAFIWGHFSNEKSMVNIELLYVEPQFRKLGIATQLKIALEKWAKTMNAKRISNTIHKNNLPMISLNKDLGYQVSHVKMYKDID >CP029664.1|AWQ74789.1|1947104_1947500_-|putative-lipoprotein MKKLIISIMAVMLFLTGCGKSQEKATLEKDIDNLQKENKELKDKKEKLQQEKEKLADKQKDLEKEVKDLKPSKEDNKDDKKDEDKNKDKDKDKEASQDKQSKDQTKSSDKDNHKKPTSADKDQKANDKHQS >CP029664.1|AWQ74549.1|1946667_1946967_-|hypothetical-protein MHEQDFRILEGQDITLPELGRELENITGHTIADSTGEIKRVIAHLPNFESDTDTFVATYRLNHQQDFIDATFTALKSDRARLKEVPVHVELISYISKSK >CP029664.1|AWQ74859.1|1946045_1946588_-|acetyltransferase-family-protein MIYCETERLILRDWHEDDLLPFQKMNANYDVRKYFPSLLSYRRSELDMRTMDAVIKDYGIGLFAVEDKESHQWIGFIGLNYIPETSDYPFKELPLYEIGWRLLPEFWGKGLATEGAKATLKLAEEHQIYDVYSFTAEANKASQRVMEKIGMTVYDHFELPNLSKYHLLKRQVRYYINLRK >CP029664.1|AWQ74636.1|1945383_1945950_+|putative-lysine-decarboxylase-family-protein MKRIAVYCGASKGHDPSYVQKAYDLGKYFAEQGYELVFGAGSIGIMGAIQDGVLDHGGKAIGVMPKMLDEHEITSQRLTELILVDSMHERKNKMAELADAFVMAPGGAGSLEEFFEMYSWAQIGIHEKPIAIYNINGFFNPLQTMIDHMIEEGFIDPKYRALAPLCDTKESLIESILNFKPLGTRSYD >CP029664.1|AWQ75699.1|1944923_1945382_+|hypothetical-protein MTHIIIDGDACPVVDSIIDLTTETGIFVTIIRSFSHFSNQLYPPHVSTLYVDDGPDAVDYKIVQLSTKDDIVVTQDYGLASLLVDKVLIVMHHNGKIYNSKNIQQLLDKRYMNAQIRKQGGRHKGPPPFTKQDQKVFEQSLLKVIHRIKELD >CP029664.1|AWQ73795.1|1944237_1944921_+|hypothetical-protein MDKKKVIKFMINVLPIVLVPLIVERKRIKQHPDVQKVTDATSKVASKTSAAISNTASDVKEYVGDKKQDFENKRELKKFAREHDPAYIEKKGEKLAKQNRKDADKMNKILQKNIEKRHKEEQKAREKNEIQRIKDMKKSQKYEEKAGLTPNKLDEKTEKKGDKLAEKNRKEIAKMNKKLQKNIEKRHKEEQKRQQEADKARIKSFKKYKDYVAKSASQQNKENNTEA >CP029664.1|AWQ74199.1|1950830_1951697_-|bacterial-regulatory-helix-turn-helix,-lysR-family-protein MKIEDYRLLITLDETKTLRKAAEILYISQPAVTQRLKAIENAFGVDIFIRTKKQLITTTEGTMIIEHARDMLKRERLFFDKMQAHIGEVNGTISIGCSSLIGQTLLPEVLSLYNAQFPNVEIQVQVGSTEQIKANHRDYHVMITRGNKVMNLANTHLFNDDHYFIFPKNRRDDVTKLPFIEFQADPIYINQIKEWYNDNLEQDYHATITVDQVATCKEMLISGVGVTILPEIMMKNISKEQFEFEKVEIDNEPLIRSTFMSYDPSMLQLPQVDSFVNLMASFVEQPKA >CP029664.1|AWQ75623.1|1951812_1952457_-|hypothetical-protein MKVKYIDKRHWRRLIDREYTEVKVNNNRFKGIIGLVTMKKVRDPLEVTVVGQNIIVADDNYKWLQILPEKKRYSITVMFDNKGNPLEYYFDINIKNITQKGNARTVDLCLDVLALPSGEYELVDEDDLMFALESEQITKKQFHEAYMIAHQIMAELENDFKGFQKKIMYCFNKINAKAQKNHQKPQNKTNIEKSKQIKPKQYNQTKNHQQQKKN >CP029664.1|AWQ73402.1|1952601_1952718_-|hypothetical-protein MLQLFLMKIALNDFENDKSVLFIFLKNHFYEEMCVLSN >CP029664.1|AWQ73583.1|1952809_1953283_-|hypothetical-protein MKSAEQWIDELQLESHPEGGFYRETIREVLKDGRRAPFSSIYFLLTDDNISHFHRIDADEVWYYHAGDSLTIHMINPDGEYTTATLGTDIQNGDVLQYVVPKGTIFASSIEISNTFSLVGCMCQPAFEFKQFELFKQSELITQYPHLKSVIEKYALK >CP029664.1|AWQ75488.1|1953282_1953999_-|DNA-binding-regulatory,-YebC/PmpR-family-protein MGRKWNNIKEKKAQKDKNTSRIYAKFGKEIYVAAKSGEPNPESNQALRLVLERAKTYSVPNHIIEKAIDKAKGAGDENFDHLRYEGFGPSGSMLIVDALTNNVNRTASDVRAAFGKNGGNMGVSGSVAYMFDHVATFGIEGKSVDEILETLMEQDVDVNDVIDDNGLTIVYAEPDQFAVVQDALRAAGVEEFKVAEFEMLPQTDIELSEADQVTFEKLIDALEDLEDVQNVFHNVDLK >CP029664.1|AWQ74539.1|1954188_1954548_-|putative-transcriptional-regulator MNTEKLETLLGFYKQYKALSEYIDKKYKLSLNDLAVLDLTMKHCKDEKVLMQSFLKTAMDELDLSRTKLLVSIRRLIEKERLSKVRSSKDERKIYIYLNNDDISKFNALFEDVEQFLNI >CP029664.1|AWQ75412.1|1954863_1956843_-|bacterial-regulatory-helix-turn-helix,-AraC-family-protein MAKSCLHILTNNEYATTRCQDGIVLFWPIDGEIELQKFRKSKIIEDDIYIINHLDVFSIKNNKKTIMLYLSSDWFAELGFTFFNYHYTAKLIKSSYNLKCLLLKLTYRYLDNQPLNDADIRKLQDIIKIIAKEASMDKKIAQNQYRYAYYGDLRDELEYIYQNVNQRLTLKSVADKLFVSKSNLSSQFHLLMGMGFKKYIDTLKIGKSIEILLTTDSTISNISEHLGFSSSSTYSKMFKSYMDITPNEYRNLSKYNKCLMLKPEPLVGKMVQEVKEIILNYIEHYKNHLTDVIHIDEDKFETPKLFQTVIQINTYTEMKLVFLEGIFKTLLNKNSQVVFFIMPSILKSKNTMSEEEKFTIIKTIIESDLKIAFNINNIETTYFVEEAFMSVFRQISPNELSNHNNYEVHFVFDLSLMEIRTIYRMILKLHNIMLNVKLGLNITCLFEKPSVFKSLVSQIKRLKFDSLIIDNANLSSPYLMGESDELLLKNILHFKNLKQVINELDIEQEKLIFLNVENHKLLNNKERDLSNSAPLIYKTLSALYHNFDGFGLNIFDNHQAFNAMHLYDKNGFKTTLGLILEKFIEYVSKPKYENSYYSIFDIENYYCLVIYDWRVIESETIMSNFEDSQVYINFKNNVLNDKYLIVIETLDKIVATLII >CP029664.1|AWQ74128.1|1957539_1958184_-|inhibitor-of-apoptosis-promoting-Bax1-family-protein MSQNTNHSYYHQNQHAQSISKVWLYFMYYWIIFGIGCYLGQFLPLSWRQPLSFGLLIIILATLVFERARRFGLIISHIYAVVIGLLSYATFTTYLQNLGPDIFYKNIALAIFAFIAFGIIGYFFVGDASSIGKYLFVTLITLIIASLIGIFLQNPIFYTIITVVSLLLFLLYTLYDFNRLKRGDYSPREMGFNLFINLLNIIKDILYLANMFRR >CP029664.1|AWQ75043.1|1958544_1959342_+|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase-sle1 MKKLAFAITATSGAAAFLTHHDAQASTQHTVQSGESLWSIAQKYNTSVESIKQNNQLDNNLVFPGQVISVGGSDAQNTSNTSPQAGSASSHTVQAGESLNIIASRYGVSVDQLMAANNLRGYLIMPNQTLQIPNGGSGGTTPTATTGSNGNASSFNHQNLYTAGQCTWYVFDRRAQAGSPISTYWSDAKYWAGNAANDGYQVNNTPSVGSIMQSTPGPYGHVAYVERVNGDGSILISEMNYTYGPYNMNYRTIPASEVSSYAFIH >CP029664.1|AWQ73830.1|1959929_1960937_-|phosphate-transporter-family-protein MSYIIIVTIAVVIFSLIFDFINGFHDTANAVATAVSTRALTPKTAILMAAVMNFIGALTFTGVAGTITKDIVDPFKLENGLVVVLAAILAAIIWNLATWFYGIPSSSSHALIGSIAGAAIASEGSFGVLHYQGFTKIIIVLIVSPIIAFCVGFLMYSIFKVIFKNANLTRANRNFRFFQIFTAALQSFSHGTNDAQKSMGIITLALIVANVQNDGSVEPQLWVKFACATAMGLGTAIGGWKIIKTVGGNIMKIRPANGAAADLSSALTIFVASSLHFPLSTTHVVSSSILGVGASNRAKGVKWSTAQRMIITWVITLPISALLAGLLFYILNLFF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP029664_9 | 2027003-2027095 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029664_9
|
1 spacers
spacers of CP029664_9
>9.1|2027035|29|CP029664|CRISPRCasFinder CGATTAGAGGCTTTTATGCAGTTGTGCCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029664_9
The CRISPR arrays of CP029664_9 >merge|CP029664|9|2027003-2027095|CRISPRCasFinder TAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCATCTTTAGCGATTAGAGGCTTTTATGCAGTTGTGCCTTAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCACCTTTAG >CP029664|9|8|2027003-2027095|CRISPRCasFinder TAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCATCTTTAG CGATTAGAGGCTTTTATGCAGTTGTGCCT TAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCACCTTTAG
>CP029664.1|AWQ75987.1|2026046_2026934_-|periplasmic-binding-family-protein MKKSLIAFILIFMLVLSGCGMKDNDKQGSNDNGSSKSPYHRIVSLMPSNTEILYELGLGKYIVGVSTVDDYPKDVKKGKKQFDALNLNKEELLKAKPDLILAHESQKATANKVLSSLEKQGIKVVYVKDAQSIDETYNTFKQIGKLTHHDKQAEQLVEETKDNIDKVIDSIPAHHKKSKVFIEVSSKPEIYTAGKHTFFNDMLEKLEAQNVYSDINGWNPVTKESIIKKNPDILISTEAKTRSDYMDIIKKRGGFNKINAVKNTRIEVVNGDEVSRPGPRIDEGLKELRDAIYRK >CP029664.1|AWQ74248.1|2024948_2025935_-|fecCD-transport-family-protein MNVIIDERKENAMTFNKVLLSWIVILIITTSIYLFWQLGDINDVFNQSILINVRLPRLLEALLTGMILTVAGLIFQTVLNNALADSFTLGLASGATFGSGLALFLGLTTLWIPVFSITFSLITLITVLVITSVLSQGYPVRILILSGLMIGALFNSLLYFLILLKPRKLNTIANYLFGGFGDAEYSNVSIIAITFIIALFGIFIILNQLKLLQLGELKSQSLGLNVQLITYIALCIASMITAINVAYVGIIGFIGMVIPQLIRKWQWKQSLGRQLALNIVTGGQIMVMADFIGSHILSPVQIPASIIIALIGIPVLFYMLISQSKRLH >CP029664.1|AWQ74125.1|2024174_2024894_-|HAD-hydrolase,-IA,-variant-3-family-protein MDLNQIKAVVFDLEGTLLDRVKSREKFIEEQYERFHDYLIHVQLADFKKAFIELDDDEDNDKPDLYKEIIKRFHVDRLTWKDLFNDFEMHFYRYVFPYYDTLYTLEKLSQKGFQIGVIANGKSKIKQFRLHSLGLMHVINYLSTSETVGFRKPHPKIFEDMIDQLGVLPEQIMYVGDDALNDVAPARAMGMVSVWYKQEDAEIEPLEEEVDFTITTVEELLTILPIKNDNKGENYGSIY >CP029664.1|AWQ75122.1|2023390_2024191_-|alpha/beta-hydrolase-fold-family-protein MDLFTRKDGTSIHYSTLGEGYPIVLIHTVLDNYSVFNKLAAELAKSFQVVLIDLRGHGYSDKPRHIEIKDFSDDIVELLKYLYIEEVAFVCHEMGGIIGADISVRYPEFTSSLTLVNPTSIEGELPEERLFRKYAHIIRNWDPEKQDKFLNKRKYYRPRKMNRFLKHVVDTNEISTKEEIQAVKEVFKNADISQTYRNVVVPTKIIAGEFGERTTRLEAKEVADLIQNADFEVYQESSAFPFVEEQERFVEDTAAFINKHHDEKHV >CP029664.1|AWQ73315.1|2022748_2023255_-|hypothetical-protein MKKLLTASIIACSVVMGVGLVNTSAEAASGNSIDTVKQLIKGDQSLENVKIGESIKDVLTKYKNPMYSYNEDGTEHYYEFHTKKGMLLVTTDGKKNNGKVTHISMMYNDANGPTYQAVKNYVGKAVTHTEYSKVAGNFGYIEKGKTTYQFASAPKDKNIKLYRIDLEK >CP029664.1|AWQ73943.1|2021870_2022587_-|putative-membrane-protein MRINDKILLENIEDYFNHKGLSPHLIDDIKEKVITDIKNSEKKDQDYIEYKRKSPAQIILMIQRNLFALQMNPVIFFIINFILISYLYDKQYVQFQAITGMSLFYCLVIFPMTIVVYLRVSQKNYLRSNKIEMIMGTIIAIISLLLIILQAFNITWGVIPITNFGHQFFFFIGIILVIAGIFYKRLEFSGIGLLFCQKTVDAMIHNPQSAQIFSLIIWILLVVLVIYFTIRLSSRTRL >CP029664.1|AWQ73716.1|2020913_2021702_-|alpha/beta-hydrolase-fold-family-protein MNKVTINPQIQLTYQIEGKGDPIILLHGLDGNLAGFEDLQHQLASSYKVLTYDLRGHGKSSKSESYDLNDHVEDLKILMEKLNIHEAHILGHDLGGVVAKLFTDKYAYRVKSLTTIASKKDDLIHSFTQLLIQYQDDIAGFNKSEAYILLFSKLFRNQEKTMKWYQKQRIYSIKSEDDSAVAIRSLILHKDEPMYLKKRTCVPTLLINGEHDPLIKDKNHFKLEAHFLNVTKKIFEHSGHAPHIEEPEAFMNYYLKFLKSVS >CP029664.1|AWQ74742.1|2020288_2020663_+|transcriptional-regulator-SarA MAITKINDCFELLSMVTYADKLKSLIKKEFSISFEEFAVLTYISENKEKEYYLKDIINHLNYKQPQVVKAVKILSQEDYFDKKRNEHDERTVLILVNAQQRKKIESLLSRVNKRITEANNEIEL >CP029664.1|AWQ73523.1|2018780_2019341_+|hypothetical-protein MTHCHLIKAIGVLLLIVGIVIMNQFNKNNLLLTDQKYLLFWLLLGFIFGFFPPIQTTINSALASHTHSPAFASLVSFTIGSIALLILTAIFNRSLKLKTSHLKFGKLKPIYFTGGILGMAFVTANIILMPHMGAALTTLIGMFGQILMGILIDHFGLFGSPKIAMTSRKTIGLLCILTGIILLRLF >CP029664.1|AWQ74697.1|2018219_2018573_+|integrase-core-domain-protein MKPLLPKSITMDRGKEFALFEEIEDELNCSIYFSDLGCPYQRGSIENANGLLRQYYPKGTDFANITQKSLDEAVKQINARPRMIFDYKSSEEMLKYHVSTQNCEPILNDCVRHEPVN >CP029664.1|AWQ74625.1|2027312_2027948_-|hhH-GPD-superbase-excision-DNA-repair-family-protein MLGTDELYKVLYEHLGPQFWWPADNDIEMMLGAILVQNTRWRNAEIALNQIKEHTHFNPNHILELPIETLQSLIHSSGFYKSKSLTIKTLLTWLARHHFNYQEINERYKGGLRKELLSLKGIGSETADVLLVYIFGRIEFIPDSYTRKIYDKLGYENTKNYDQLKKVVTLPNHFTNQDANEFHALLDVFGKHYFRDKDIKNYDFLEPYFKK >CP029664.1|AWQ74993.1|2028335_2029997_-|arginine--tRNA-ligase MNIIDQVKQTLVEEIAASINKAGLADEIPDIKIEVPKDTKNGDYATNIAMVLTKIAKRNPREIAQAIVDNLDTEKAHVKQIDIAGPGFINFYLDNQYLTAIIPEAIEKGDQFGHVNESKGQNVLLEYVSANPTGDLHIGHARNAAVGDALANILTAAGYNVTREYYINDAGNQITNLARSIETRFFEALGDNSYSMPEDGYNGKDIIEIGKDLAEKHPEIKDYSEEARLKEFRKLGVEYEMAKLKNDLAEFNTHFDNWFSETSLYEKGEILEVLAKMKELGYTYEADGATWLRTTDFKDDKDRVLIKNDGTYTYFLPDIAYHFDKVKRGNDILIDLFGADHHGYINRLKASLETFGVDSNRLEIQIMQMVRLMENGKEVKMSKRTGNAITLREIMDEVGVDAARYFLTMRSPDSHFDFDMELAKEQSQDNPVYYAQYAHARICSILKQAKEQGIEVTAANDFTTITNEKAIELLKKVADFEPTIESAAEHRSAHRITNYIQDLASHFHKFYNAEKVLTDDIEKTKAHVAMIEAVRITLKNALAMVGVSAPESM >CP029664.1|AWQ75289.1|2029993_2030410_-|hypothetical-protein MDKKVSIQTKQVLKQHNEKEKFEFTTEGTWQQRQSNFIRYVEQIEDATVNVTIKVDDDSVKLIRKGDINMNLHFVEGQTTTTFYDISAGRIPLEVKTLRILHFVSGDGGKLKIHYELYQDNEKMGSYQYEINYKEIGE >CP029664.1|AWQ73683.1|2030684_2031695_-|alcohol-dehydrogenase MRAAVVTKDHKVSIEDKKLRALKPGEALVQTEYCGVCHTDLHVKNADFGDVTGVTLGHEGIGKVIEVAEDVESLKIGDRVSIAWMFESCGRCEYCTTGRETLCRSVKNAGYTVDGAMAEQVIVTADYAVKVPEKLDPAAASSITCAGVTTYKAVKVSNVKPGQWLGVFGIGGLGNLALQYAKNVMGAKIVAFDINDDKLAFAKELGADAIINSKDVDPVAEVMKLTDNKGLDATVVTSVAKTPFNQAVDVVKAGARVVAVGLPVDKMNLDIPRLVLDGIEVVGSLVGTRQDLREAFEFAAENKVTPKVQLRKLEEINDIFEEMENGTITGRMVIKF >CP029664.1|AWQ73645.1|2032193_2032700_-|ywhD-family-protein MSEKKGFNFNIIKNDPLDGHKGTNIGSISLDNIAPVFIDVANKEAFIDIGGMHARAKVEKGVKWITDKAAVEGDEAKEYWLCWVTTERNEQGPYYAGLTACYLLVNKAIRRGYKSMPEHVNMMDKSMKHHIIIDQIGDENKAILKDFLMNHDEGMWKHSSDALHQAFN >CP029664.1|AWQ73956.1|2032742_2034038_-|HD-domain-protein MTNAYVDLKLVEEKVFKDPIHRYIHVEDQLIWDLIKTKEFQRLRRIRQLGTLYLSFHTAEHSRFGHSLGVYEIVRRLIDESFIGHDAWDNKDRPLALCAALLHDLGHGPFSHSFEKIFNTDHEAYTQAIITGDTEVNAVLRKVAPEFPREVAEVINKTHHNKLVISMISSQIDADRMDYLQRDAYFTGVSYGAFDMERILRLMRPSKDEVLIKESGMHAVENFIMSRYQMYWQIYFHPVSRGGEVLLNNCLKRAKQLYNEGYEFKLHPHDFIPFFEETVTIEQYVELDEAVVTYYLEKWTKEDDAILSDLASRFINRDLFKYIPFDGSIITISELQELFEAGGINPDYYFVSEAFSDLPYDYDRPGSNRKPIHLLRQDGTIREISNQSLVIHSITGINRQDYKLYYPREMVAKIKDKTIREAIENLINELN >CP029664.1|AWQ75999.1|2034077_2034554_-|acetyltransferase-domain-protein MFKVRQATEKDVVQIRDVATKAWFNTYLNIYAATTVNHLLEASYNEHHLKKRLQEQLFLVVEEGNDIVGFANFIYGEELYLSAHYVKPESQHTGYGTALLNEGLSRFEDKFEGVYLEVDNKNEEAVAYYKEQGFTILRSYEPEMYGEKLDLALMYKAF >CP029664.1|AWQ74512.1|2034722_2035259_-|putative-NAD(P)H-dependent-FMN-containing-oxidoreductase-YwqN MITVLFGGSRPNGNTAQLTKFALQDLEYQWIDVTQHQFKPIRDVRHTAETITSYDDDYLPILDKILASDTIIFASPVYWYSISAPLKAFIEHWSETLQDKRYPNFKAQMAEKDFRVILVGGDCPKIKAKPAITQMKYSLDFLGATLNGYIIGTAEKPGDIMKDNYALARATEWNSILQ >CP029664.1|AWQ73329.1|2035469_2036408_-|protein-IolS MKQFVNLGKSDVEVFPIALGTNAVGGHNLYPNLDEEQGKDVVRQAINHGINLLDTAYIYGPERSEELVGEVVKEYPREQIKIATKGSHEFDENQEVHQNNQPEYLKQQVENSLKRLQTDYIDLYYIHFPDNNTPKDQAVAALQELKEQGKIKAIGVSNFTLDQLKEANKDGYVDVVQLEYNLLHRENEAVLQYCVDHQITFIPYFPLASGILAGKYDENTKFSDHRTTRRDFKPGVFEENVRRVKALESIAAAHQTSIANIVLAFYLTRPAIDVIIPGAKRAEQVVENIKAADIVLSDDEIQYIDELFPIED >CP029664.1|AWQ75071.1|2036677_2037301_-|tandem-five-TM-family-protein MLCESKIINKNPKYRIIKYNDEYLMVDIISTWISLFFPFINWFIPKEYVKISREEFENLNIVKPAKKNVFWPVAGSSALLGVALRKYTHLLDIQLDKKLVIAICCITFIGILIFYVRLIKKSSLNIYNTKNKRSKIFLIPTLKNVCFTLFGYILFGGLTMLFLDALLSMSYQNIIVYFVWIAVIMGFFLVNIALIIDKNIHVILKNQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP029664_10 | 2270059-2270160 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029664_10
|
1 spacers
spacers of CP029664_10
>10.1|2270083|54|CP029664|CRISPRCasFinder TAGCTTTGATTTAAAAACTGATTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029664_10
The CRISPR arrays of CP029664_10 >merge|CP029664|10|2270059-2270160|CRISPRCasFinder CAAATTTAATACTCAATTCATATATAGCTTTGATTTAAAAACTGATTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTTCAAATTTAATACTCAATTCATAAA >CP029664|10|9|2270059-2270160|CRISPRCasFinder CAAATTTAATACTCAATTCATATA TAGCTTTGATTTAAAAACTGATTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTT CAAATTTAATACTCAATTCATAAA
>CP029664.1|AWQ75224.1|2269085_2270042_+|hypothetical-protein MLTKEFAQRVELSEKQVRKIVQHLEERGYQLSKTEYRGREATDFKEEDIELFKDIADKVKQTNSYDLAFDELEKEKDFLQVIVKNDDKNLPTNQNVAQLVEDLRLEIQKMREERHLLGQMMNQVHQQQQELKELQNQLTSKIDSNSESLKAIQTSQEAIQEAQASQAKALAESTNKVEKNAVTEDKADSKDSKVAGVNTSTDAKTDTKAENAGDGTATKVDKEDQISATEAIEKASVEQSKNDNAAETSNKEATVDAEAQHDAEQQVAEAHAEASKQATSNDSLEAKAENDSTASQSEMSEPKPQEEKKGFFARLFNL >CP029664.1|AWQ73431.1|2268305_2268968_+|hypothetical-protein MEFKTIQSVKDPHYNEALKLYDTKLNLSLTEDKRIIKRSLENNKTENDYVFIVGLENDVVVSLATAHYEATTNSAFLIYLFAKDLPNHDELMTQTLHQIEHELNLLSNLVHSRSINFLMMEVPKEPADLTQDNGLIIEHRRQFLYEHQFERQTEIDYIHPTNDGHTKKVDLFLKKNIKLTKDIYGTSVKSNYILKYVFANGIAREIIYALLEEMDLRKPF >CP029664.1|AWQ74486.1|2267755_2268163_+|hypothetical-protein MADITVVNDTGELYNVINQKKSEGYLESELTIISKSKLHLNDLHDSEISLISTSGTFSDRMTKLLTGEDGEHAVLSRYNLAPDELEKYKQLILDDKMLVVAVRDKSSHQEVHENNSAYEEIDITHFAEASKGPKA >CP029664.1|AWQ75658.1|2266664_2267243_-|xanthine-phosphoribosyltransferase MELLGQKVKEDGVVIDEKILKVDGFLNHQIDAKLMNEVGRTFYEQFKDKGITKILTIEASGIAPAIMAALHFDVPCLFAKKAKPSTLTDGYYETSIHSFTKNKTSTVIVSKEFLSEEDTVLIIDDFLANGDASLGLYDIAQQANAKTAGIGIVVEKSFQNGHQRLEEAGLTVSSLCKVASLEGNKVTLVGEE >CP029664.1|AWQ74744.1|2265396_2266665_-|xanthine-permease-family-protein MKNLILSVQHLLAMYAGAILVPIIVGTSLKFTPEQIAYLVTVDIFMCGVATFLQANKVTGTGLPIVLGCTFTAVAPMILIGQTKGIDVLYGSLFLSGILVIIIAPFFSHLVKFFPPVVTGSVVTIIGINLMPVAMNYLAGGQGAKDYGDVKNILLGLMTLIIILLLQRFTTGFIKSIAILIGLVLGTIGAGLLGMVDINQVNHAGWLGIPVPFRFSGFSFDVTSTLVFFIVAIVSLIESTGVYHALSEITGKKLERKDFRKGYTAEGLAIVLGSIFNSFPYTAYSQNVGLVSLSGAKKNNVIYGMVVLLLICGCIPKLGALANIIPLPVLGGAMIAMFGMVMAYGVSILGHIDFKNQNNLLIIAVSVGLGTGISAVPQAFKGLGEQFAWLTQNGIVLGAISAIILNFFFNGIKYKQTEENVK >CP029664.1|AWQ73823.1|2263892_2265359_-|inosine-5'-monophosphate-dehydrogenase MWESKFAKESLTFDDVLLIPAQSDILPKDVDLSVQLSDKVKLNIPVISAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVIHKNMGVEEQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEESVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKIVDVMTQENLITAPVNTTLEEAEKILQKHKIEKLPLVKDGRLEGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEHGRLLVAAAIGISKDTDIRAQKLVEAGVDVLVIDTAHGHSKGVIDQVKHIKKTYPEITLVAGNVATAEATKDLFEAGADIVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATEARKHGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEIFQGRQYKVYRGMGSLGAMEKGSNDRYFQEDKAPKKFVPEGIEGRTAYKGALQDTIYQLMGGVRAGMGYTGSHDLRELREEAQFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSF >CP029664.1|AWQ74821.1|2262326_2263868_-|GMP-synthase MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISIEEIKKMNPKGIILSGGPNSVYEEGSFTIDPEIYNLGIPVLGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIINAKSDELFAGLPAEQTVWMSHSDKVIEIPEGFEVIADSPSTDYAAIEDKKRRIYGVQFHPEVRHTEYGNDLLNNFVRRVCDCRGQWTMENFIEIEIEKIRQRVGDRRVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVNAKDRFMNKLKGVSDPEQKRKIIGNEFVYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMEFELIEPINTLFKDEVRKLGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLEIVRESDAILRQVIREEGLEREIWQYFTVLPNIQSVGVMGDYRTYDHTVGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPSTIEWE >CP029664.1|AWQ73803.1|2261677_2262214_+|hypothetical-protein MHNNNEFNKKLKDFIGSDKRMALVKGYVNEYKLTTVLRALNNSDYTKGTIHTRSIGNLKQIVDNRIIPKNITQNTIFKLSNLTLEVNLYERNTIYHGDFAIYYPVESALIIETDTPRLINHINNNPVQKIFIITTNDWSFNTLELEKIVDETIIYDLKQEDPKQYEILYKNKHGKLPY >CP029664.1|AWQ75315.1|2260580_2261285_+|pemK-like-family-protein MSKNINQANSKLNTSNKKLKQAYSKSDSKNMKVIYMPHWLEFYSIAIHSDVTSNKKRYYKSYSRGTVVYVKLGSNIGSEFSGNHFCVILDNKDNKGKETVTIVPLSSKGNKNYLKLNESVLNLTATDLKKQIIDISSKVQALAQKYREIDIKLSTEDKKLLSNLNQKANELYRVIGVYSKHKGKDTYVNISAITTISKRRISKINDSDPTGTIIISEDDMNEIEKQLKIKFFSN >CP029664.1|AWQ74246.1|2259909_2260182_+|transposase-family-protein MTKERRTFSSEFKLQMVRLYKNGKLKNEIIRKYDLKPSIISNSIKQHQNTGPFNHQDNLKSDEKELIKLRKEVQHLKMEHDVLKQILKLI >CP029664.1|AWQ75426.1|2271018_2272407_+|L-cystine-uptake-protein-TcyP MNAFLTLINIIVLVIFIVILHMMARKHISFAKRVFTALGIGIVFGVLLHLIYGTHSNVITSTSDWFNIVGQGYVALLQMIVMPLIFISIVAAFTKIQIGEKFAKIGSLIFIFLIGTVTIAAIVGVVYALVFGLDASTINLGNAEQARGSEIAKQAKDLTAHTLPQQILELLPKNPFLDFTGQRATSTIAVVIFASFIGFAYLRVARKQPDHGELLKRAIDAIYSLVMAIVTFVLRLTPYGVLAIMANTLSTSDFGAIWTLGKFLIASYAALITMYIIHLIILSLLGISPIRYVKKTLEVLIFAFTSRSSAGALPLNVQTQTRRLGVPEGIANFAATFGLSIGQNGCAGIYPAMLAIMVAPVANVEIDLQFIVTLIAVVIISSFGVAGVGGGATFASILVLSTLNLPVALAGVLISVEPLIDMGRTALNVNDSMLAGTGTAKLTKHWDKDTFDSNDNAALTSH >CP029664.1|AWQ73873.1|2272487_2273243_-|NADPH-dependent-oxidoreductase MSEHVYNLVKKHHSVRKFKNKPLSEDVVKKLVEAGQSASTSSFLQAYSIIGIDDEKIKENLREVSGQPYVVENGYLFVFVIDYYRHHLVDQHAETDMENAYGSTEGLLVGAIDAALVAENIAVTAEDMGYGIVFLGSLRNDVERVREILDLPDYVFPVFGMAVGEPADDENGAAKPRLPFDHVFHHNKYHADKETQYAQMADYDQTISEYYDQRTNGNRKETWSQQIEMFLGNKARLDMLEQLQKSGLIQR >CP029664.1|AWQ74968.1|2273734_2274304_+|peroxiredoxin MSLINKEILPFTAQAFDPKKDQFKEVTQEDLKGSWSVVCFYPADFSFVCPTELEDLQNQYEELQKLGVNVFSVSTDTHFVHKAWHDHSDAISKITYTMIGDPSQTITRNFDVLDEATGLAQRGTFIIDPDGVVQASEINADGIGRDASTLAHKIKAAQYVRKNPGEVCPAKWEEGAKTLQPGLDLVGKI >CP029664.1|AWQ75788.1|2274319_2275843_+|alkyl-hydroperoxide-reductase-subunit-F MLNADLKQQLKQLLELMEGNVEFVASLGSDDKSKELKDLLTEITDMSPRLSLSEKSLKRTPSFSVNRPGEETGVTFAGIPLGHEFNSLVLAILQVSGRAPKEKQSIIDQIKKLEGSFHFETFISLTCQKCPDVVQALNLMSVINPNITHSMIDGAVFREESENIMAVPAVFLNGEEFGNGRMTIQDILSKLGSTADASEFENKEPYDVLIVGGGPASGSAAIYTARKGLRTGIVADRIGGQVNDTAGIENFITVKETTGSEFSSNLAAHIDQYDIDAMTGIRATDIEKTDEAIKVTLENGAVLESKTVIIATGAGWRKLNIPGEEQLINKGVAFCPHCDGPLFENKDVAVIGGGNSGVEAAIDLAGIVNHVTLFEFASELKADNVLQDRLRSLSNVDIKTNAKTTEVVGEDHVTGIRYEDMNTGEEHLLNLDGIFVQIGLLPNTSWLNDAVELNERGEIVIDRNNNTNVPGIFAAGDVTDQKNKQIIISMGAGANAALNAFDYIIRN >CP029664.1|AWQ74074.1|2275957_2276215_+|hypothetical-protein MLKVCTSRKQINMKNDIEKEKYVNEIIMLLRTIPTSKLVQPIMQLFIDKAILNNVQNDALLIEKATHARNHLRLWSLQGHRDIPN >CP029664.1|AWQ73718.1|2276287_2276914_+|hypothetical-protein MKKRLLLSTFLASTLILTGCASDQSDNEDHHTSTGIHAPKSAKKLETKDIFNSDKKNSDISDAEMKQAIEKYLSVNSDILDNKYIMQHKLDKQIDSQTKVTEKQAETLSHLSNLAVKNDLHFKKFVTENNIPKEYKKPVELMMNYFKALNSTIANVDEDIEKLSYQPQNKINVVDVPTKYAGDVNKKQQDKIKDFLKSKGIKSDVIDK >CP029664.1|AWQ73467.1|2277168_2277552_+|putative-membrane-protein MKVRITFIILAILSTIVCLFLAAMHPTGPNTVTFEQPYLFTLNIIIMVLVALPSLVLAIYDYMSFRISSAILQFLGAISWFFLSLILSLTQFTPFTLASFITSIILFTSTIITLAIGGKSVEKNDSP >CP029664.1|AWQ74209.1|2277617_2278199_-|histidine-phosphatase-super-family-protein MTIYLVRHGESKSNYDNKHFRSYFCGQLDVPLTDTGTKSADDLCDYFKEKQIKHVYVSDLLRTQQTFEHIFPYDIASTTTPLLRERSLGVFEGEYKDEISANPKYDKYFNDPNFKDFRHSFSQKAPEGESYEDVYQRVEHFMNHVVNEDTQKDDIVIVAHQVVIRCLMVYFNKVSRAEAVDLKVENCKPYIIE >CP029664.1|AWQ75612.1|2278624_2278876_-|transglycosylase-associated-family-protein MFGFIGMLIVGGLIGWAAGAIMGKDIPGGILGNIIAGIIGSWVGGKLFGQWGPELGSIYILPALIGSIILIAIVTLILRAMRK >CP029664.1|AWQ73973.1|2279175_2279439_+|hypothetical-protein MNMHILYNLRTKHNLEIDELAQQLNEKYGTKYEAHQIWEWENHHHEPKFKDAMHLADFFDAPYEMFLESKVKEYQKHLEEVDIRMDK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP029664_11 | 2746853-2747026 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029664_11
|
2 spacers
spacers of CP029664_11
>11.1|2746906|17|CP029664|PILER-CR AAGAATTTCGAAAAGAA >11.2|2746976|16|CP029664|PILER-CR TCAGCTTACAATAATG >11.3|2746971|32|CP029664|CRISPRCasFinder GGCCCCAACATAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029664_11
The CRISPR arrays of CP029664_11 >merge|CP029664|11|2746853-2747026|PILER-CR,CRISPRCasFinder TTGGCGAGGCCCCAACATAAAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACAAAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGGTTACAATAATGTGCAAGTTGGGGT >CP029664|11|2|2746853-2746997|PILER-CR TTGGCGAGGCCCCAACATAAAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCA AGTTGGCGGGGCCCCAA CAAAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCC CAACATAGAAGCTGGC GGAAAG >CP029664|11|10|2746947-2747026|CRISPRCasFinder TTACAATAATGTGCAAGTTGGCGG GGCCCCAACATAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGG TTACAATAATGTGCAAGTTGGGGT
>CP029664.1|AWQ74049.1|2744709_2746755_+|lipase-1 MMKSQNKYSIRKFSVGASSILIATLLFLSGGQAQAAEKQVNMGNSQEDTVTAQSIGDQQTRENANYQRENGVDEQQHTENLTKNLHNDKTISEENHRKTDDLNKDQLKDDKKSSLNNKNIQRDTTKNNNANPSDVNQGLEQAINDGKQSKVASQQQSKEADNSQDSNANNNLPSQSRIKEAPSLNKLDQTSQREIVNETEIEKVQPQQNNQANDKITNYNFNNEQEVKPQKDEKTLSVSDLKNNQKSPVEPTKDNDKKNGLNLLKSSAVATLPNKGTKELTAKAKDDQTNKVAKQGQYKNQDPIVLVHGFNGFTDDINPSVLAHYWGGNKMNIRQDLEENGYKAYEASISAFGSNYDRAVELYYYIKGGRVDYGAAHAAKYGHERYGKTYEGIYKDWKPGQKVHLVGHSMGGQTIRQLEELLRNGNREEIEYQKKHGGEISPLFKGNHDNMISSITTLGTPHNGTHASDLAGNEALVRQIVFDIGKMFGNKNSRVDFGLAQWGLKQKPNESYIDYVKRVKQSNLWKSKDNGFYDLTREGATDLNRKTSLNPNIVYKTYTGEATHKALNSDRQKADLNMFFPFVITGNLIGKATEKEWRENDGLVSVISSQHPFNQAYTKATDKIQKGIWQVTPTKHDWDHVDFVGQDSSDTVRTREELQDFWHHLADDLVKTEKLTDTKQA >CP029664.1|AWQ74570.1|2743872_2743992_+|hypothetical-protein MNRYNEVMKGKNGEKAKELCLSLLPINIIVVFTFFVFIL >CP029664.1|AWQ75721.1|2742987_2743620_+|phosphoribosyl-ATP-diphosphatase MTKYKIDFSKGLVPAILQDNQTKQVLMLGYMNQEAFDKTIEDGVVCFYSRSKQRLWTKGETSGHTQRVKDIHVDCDNDTILIDVIPNGPTCHTGSQSCFNTEVPFSVQTLAQTVQDSAQSNNEKSYTKYLLTEGIEKITKKYGEEAFEVVIEAIKGDKKAFVSEVADELYHLFVLMHALGVDFSEIEAELARRHHKRNNFKGERQNIEQW >CP029664.1|AWQ75001.1|2742232_2742991_+|imidazoleglycerol-phosphate-synthase,-cyclase-subunit MIKKRIIPCLDVKDGRVVKGIQFKGLRDIGNPVDLAMYYNEAGADELVFLDISKTEEGHSLMLEVIEQTASRLFIPLTVGGGIQSLDDITQLLNHGADKVSLNSSALKNPQLIKQASDKFGRQCICIAIDSYYDPERKAHYCCTTGGKKMTNIKVYDWVQQVEQLGAGELLVTSMGHDGMKQGFDIEHLANIKSLVNIPIIASGGGGNAQHFVELFDQTDVSAGLAASILHDRETTVQSIKEVIRQGGIAVR >CP029664.1|AWQ74497.1|2741531_2742236_+|1-(5-phosphoribosyl)-5-[(5--phosphoribosylamino)methylideneamino]imidazole-4--carboxamide-isomerase MIELWPAIDLIGSTSVRLTEGKYDSEEKMSRSAEESIAYYSQFECVNRIHIVDLIGAKAQHAREFDYIKSLRRLTTKDIEVGGGIRTKSQIMDYFAAGINYCIVGTKGIQDTDWLKEMAHTFPGRIYLSVDAYGEDIKVNGWEEDTELNLFSFVRRLSDIPLGGIIYTDIAKDGKMSGPNFELTGQLVKATTIPVIASGGIRHQQDIQRLASLNVHAAIIGKAAHQASFWEGLK >CP029664.1|AWQ73768.1|2740960_2741539_+|imidazole-glycerol-phosphate-synthase,-glutamine-amidotransferase-subunit MIVIVDYGLGNISNVKRAIEHLGYEVVVSNTSKIIDQAETIILPGVGHFKDAMSEIKRLNLNAILAKNTDKKMIGICLGMQLMYEHSDEGDASGLGFIPGNISRIQTEYPVPHLGWNNLVSKHPMLNQDVYFVHSYQAPMSENVIAYAQYGADIPAIVQFNNYIGIQFHPEKSGTYGLQILRQAIQGGFIND >CP029664.1|AWQ74261.1|2740385_2740964_+|imidazoleglycerol-phosphate-dehydratase-family-protein MIYQKQRNTAETQLNISISDDQSPSHINTGVGFLNHMLTLFTFHSGLSLNIEAQGDIDVDDHHVTEDIGIVIGQLLLEMIKDKKHFVRYGTMYIPMDETLARVVVDISGRPYLSFNASLSKEKVGTFDTELVEEFFRAVVINARLTTHIDLIRGGNTHHEIEAIFKAFSRALGIALTATDDQRVPSSKGVIE >CP029664.1|AWQ74485.1|2739403_2740417_+|aminotransferase-class-I-and-II-family-protein MIYIDKNESPVTPLDEKTMTSIISATPYNLYPDAAYEQFKEAYAKFYGLSPEQIIAGNGSDELIQKLMLIMPEGPALTLNPDFFMYQAYAAQVNREIAFVDAGSDLTFDLETILTKIDEVQPSFFIMSNPHNPSGKQFDTAFLTAIADKMKALNGYFVIDEAYLDYGTAYDVELAPHILRMRTLSKAFGIAGLRLGVLISTAGTIKHIQKIEHPYPLNVFTLNIATYIFRHREETRQFLTMQRQLAEQLKQIFDTHVADKMSVFPSNANFVLTKGSAAQQLGQYVYEQGFKPRFYDEPVMKGYVRYSIATASQLKQLEEIVKEWSAKYDLSKTTKHS >CP029664.1|AWQ73846.1|2738137_2739388_+|histidinol-dehydrogenase MLNAQQFLNQFSLEAPLDESLYPIIRDICQEVKVHGDKALKMYNLTFDHTKTDHLEISHEQIKAAFDTLDEKTKQALQQSYERIKAYQESIKQTNQQLEESVECYEIYHPLESVGIYVPGGKASYPSTVLMTATLAQVAGVENIVVVTPPQPNGVSQEVLAACYITQVDQVFQVGGAQSIAALTYGTETIPKVDKIVGPGNQFVAYAKKYLFGQVGIDQIAGPTEIALIIDETADLDAIVYDVFAQAEHDELARTYAISEDAQVLKDLESRIAKALPNVDRYDIVSKSIANQHYLIHASNFDEACHVMNTIAPEHASIQTVNPQPYIEKVKYVGALFIGHYSPEVIGDYVAGPSHVLPTNRTARFTNGLSVNDFLTRNTVIHLSKDTFEQIADSAQHIAHVEALYNHQQSILIRQS >CP029664.1|AWQ75848.1|2737530_2738145_+|ATP-phosphoribosyltransferase MLRIAIAKGRLMDSLINYLDVIEYTTLSETLKNRERQLLLSVDNIECILVKGSDVPIYVEQGMADIGIVGSDILDERQYNVNNLLNMPFGACHFAVAAKPETTNYRKIATSYVHTAETYFKSKGIDVELIKLNGSVELAGVVDMVDGIVDIVQTGTTLKANGLVEKQHISDINARLITNKAAYFKKSQLIEQFIRSLEVSIANA >CP029664.1|AWQ74604.1|2747201_2748254_-|acyltransferase-family-protein MKKIRLELVYLRAIICAIIIITHLLTQITLKHENMEGGSLVLQFYIRNIVIFGTPCFIILSQLLTTLNYQKVTYRYLTTRVKYILIPYILMGLFYSYSESLLTDSSFNKQFIENVLLGQWYGYFIVVIMQFFILSYIIFKINYNLFNSKILLLLSFILQQSFLYYFTNNTAFHDTVLHYYPLSENTIIFGWIFYFFLGAYMGYNYERVLNFLERYLVIMIVLAVATYFVFIALANGDYWNVTSFSYSLTPYNSIMFIVILGICTHFKTMLFNTIQMISAFSFFIYLLHPIILDSLFAYTNIFEDNTMVFLAISLLFILGLCIGVGMILREFYIFRFIIGKQPYKLNINAY >CP029664.1|AWQ75546.1|2748240_2749113_-|intercellular-adhesin-biosynthesis-polysaccharide-N-deacetylase MKYRKFIILVLSILIILPVSTLDGHHIANADDDSPKKLKYKENSALALNYHRVRKANFLNNFIYFFSSSKEIKNYSVSQSQFESQIKWLKSHDAKFLTLKEFLYYKKKGKFPKRSVWINFDDMDETIYENAYPILKKYKIPATGFIITGHVGEENFHNLDMISKKELKEMYKTGLWEFETHTHDLHNLSKNNKSKLMKASEATIIKDLNKSEKYLTKNFKKSQKTIAYPYGLMNDDKLPVIKKAGLKYGFSLEEKAVTPNSNDYYIPRILISDDAFEHLIKRWDGFHEKD >CP029664.1|AWQ73631.1|2749109_2749415_-|intracellular-adhesion-protein-D MVKPRQREYPTLKSSLNIVRETALIAISCVFWIYCLVVLLVYIGTIFEIHDESINTIRVALNIENTEILDIFETMGIFAIIIFVFFTISILIQKWQRGRES >CP029664.1|AWQ73604.1|2749378_2750491_-|poly-beta-1,6-N-acetyl-D-glucosamine-synthase MDELEGITFLLACYNESETIEDTLSNVLALKYEKKEIIIINDGSSDNTAELIYKIKENNDFIFVDLQENRGKANALNQGIKQASYDYVMCLDADTIVDQDAPYYMIENFKHDPKLGAVTGNPRIRNKSSILGKIQTIEYASLIGCIKRSQTLAGAVNTISGVFTLFKKSAVVDVGYWDTDMITEDIAVSWKLHLRGYRIKYEPLAMCWMLVPETLGGLWKQRVRWAQGGHEVLLRDFFSTMKTKRFPLYILMFEQIISILWVYIVLLYLGYLFITANFLDYTFMTYSFSIFLLSSFTMTFINVIQFTVALFIDSRYEKKNMAGLIFVSWYPTVYWIINAAVVLVAFPKALKRKKGGYATWSSPDRGNTQR >CP029664.1|AWQ73863.1|2750780_2751341_+|biofilm-operon-icaADBC-HTH-type-negative-transcriptional-regulator-IcaR MKDKIIDNAITLFSEKGYDGTTLDDIAKSVNIKKASLYYHFDSKKSIYEQSVKCCFDYLNNIIMMNQNKSNYSIDALYQFLFEFIFDIEERYIRMYVQLSNTPEEFSGNIYGQIQDLNQSLSKEIAKFYDESKIKMTKEDFQNLILLFLESWYLKASFSQKFGAVEESKSQFKDEVYSLLNIFLKK >CP029664.1|AWQ75959.1|2752188_2752851_+|membrane-protein-CapA1 MKEKFDLVKLLNILKKNIKLLLILPAICLVVSAALTFFVMPDKYTASTQILVNMKKSSSDLAFQNVQSSLQSVNTYTEIIKSPRILDKVSREFDGQYSTAELNSFLKVTNQTNSQIITVSVTTGNKSESDKIVNKISKVFAHDMPKIMSVDNVTILSSAHDNAVKVSPIVSVNLVISIIVGIVLAILIIFLKELLDKRIKTEEDVESQLGLPILGSIQKF >CP029664.1|AWQ73408.1|2752867_2753560_+|capsular-exopolysaccharide-family-domain-protein MTNTRRSTSSLIVHEQPKSPISEKFRGIRSNIMFANPDSAVQSIVITSEAPGAGKSTIAANLAVAYAQAGYKTLIVDGDMRKPTQHYIFNLPNNEGLSSLLLNWSTYQDSIISTEIQDLDVLTSGPIPPNPSELITSRAFANLYDTLLMNYNFVIIDTPPVNTVTDAQLFSKFTGNVVYVVNSENNNRDEVKKGKELIEATGAKLLGVVLNRMPKDKSASYYAYYGTDES >CP029664.1|AWQ75474.1|2753556_2754324_+|PHP-domain-protein MIDIHNHILVDIDDGPKTIEKSIALLKQAKDEGVTSIVATPHHLHPRYDNTFQQVLVKLAELRTHPEVQALDIKLFPGQEIRITDSILKGLDNGSIQGINRSKYLLIEFPTGEVPHYTKQLFFEIQSRGYIPIIAHPERNRSIAKNPEILYELVANGALSQLTSSSLVGGFGKNIQKLSLQFIECNLAHFVASDAHSCDQRPFLMQELFHNHKLKKYSNDIEALLRNASSVINDNFVYLDRPTKPGKVKSFLKWF >CP029664.1|AWQ74258.1|2754558_2755059_+|acetyltransferase-domain-protein MVLRKVIMQDLDQIIALENIGFSPEEAATREALKLRIEQIQETFIVAEKNDEVIGYINGPVIKERYISDDLFKNVSTNNSEGGYISVLGLVVAPNYQGQGIAGRLLNYFETLAKNHHRHGVTLTCRESLISFYEKYGYRNEGVSESCHGGIKWYNLVKNIKKDDEV >CP029664.1|AWQ75269.1|2755061_2755538_+|peptide-methionine-sulfoxide-reductase-family-protein MAVVYVAGGCLWGVEAFFATIPGIIHTEAGRANGRSSKLDGPYDGYAECVKLHFDDRMLTITDIMNYLFEIIDPYSVNQQGNDIGQKYRTGLYSCVDDHLIEARQFIERRKDRDQIAVEVLPLSNYIKSAEEHQQHLEKYPEDMHMCHISKDLLNKYK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029664_1 | 1.2|309054|36|CP029664|CRT | 309054-309089 | 36 | CP029664.1 | 1527283-1527318 | 0 | 1.0 |
CP029664_5 | 5.1|1808018|34|CP029664|CRISPRCasFinder | 1808018-1808051 | 34 | CP029664.1 | 1228333-1228366 | 0 | 1.0 |
CP029664_5 | 5.1|1808018|34|CP029664|CRISPRCasFinder | 1808018-1808051 | 34 | CP029664.1 | 1319084-1319117 | 0 | 1.0 |
CP029664_7 | 7.1|1851138|42|CP029664|PILER-CR | 1851138-1851179 | 42 | CP029664.1 | 1228234-1228275 | 0 | 1.0 |
CP029664_7 | 7.1|1851138|42|CP029664|PILER-CR | 1851138-1851179 | 42 | CP029664.1 | 1319175-1319216 | 0 | 1.0 |
CP029664_7 | 7.1|1851138|42|CP029664|PILER-CR | 1851138-1851179 | 42 | CP029664.1 | 1601591-1601632 | 0 | 1.0 |
CP029664_11 | 11.1|2746906|17|CP029664|PILER-CR | 2746906-2746922 | 17 | CP029664.1 | 1856685-1856701 | 0 | 1.0 |
CP029664_11 | 11.1|2746906|17|CP029664|PILER-CR | 2746906-2746922 | 17 | CP029664.1 | 1856740-1856756 | 0 | 1.0 |
CP029664_11 | 11.1|2746906|17|CP029664|PILER-CR | 2746906-2746922 | 17 | CP029664.1 | 2390556-2390572 | 0 | 1.0 |
CP029664_11 | 11.2|2746976|16|CP029664|PILER-CR | 2746976-2746991 | 16 | CP029664.1 | 31636-31651 | 0 | 1.0 |
CP029664_11 | 11.2|2746976|16|CP029664|PILER-CR | 2746976-2746991 | 16 | CP029664.1 | 657064-657079 | 0 | 1.0 |
CP029664_11 | 11.2|2746976|16|CP029664|PILER-CR | 2746976-2746991 | 16 | CP029664.1 | 657122-657137 | 0 | 1.0 |
CP029664_11 | 11.2|2746976|16|CP029664|PILER-CR | 2746976-2746991 | 16 | CP029664.1 | 1228305-1228320 | 0 | 1.0 |
CP029664_11 | 11.2|2746976|16|CP029664|PILER-CR | 2746976-2746991 | 16 | CP029664.1 | 1314733-1314748 | 0 | 1.0 |
CP029664_11 | 11.2|2746976|16|CP029664|PILER-CR | 2746976-2746991 | 16 | CP029664.1 | 1319130-1319145 | 0 | 1.0 |
CP029664_11 | 11.2|2746976|16|CP029664|PILER-CR | 2746976-2746991 | 16 | CP029664.1 | 1527230-1527245 | 0 | 1.0 |
CP029664_11 | 11.2|2746976|16|CP029664|PILER-CR | 2746976-2746991 | 16 | CP029664.1 | 1627858-1627873 | 0 | 1.0 |
CP029664_11 | 11.2|2746976|16|CP029664|PILER-CR | 2746976-2746991 | 16 | CP029664.1 | 1807721-1807736 | 0 | 1.0 |
CP029664_11 | 11.2|2746976|16|CP029664|PILER-CR | 2746976-2746991 | 16 | CP029664.1 | 2308781-2308796 | 0 | 1.0 |
CP029664_1 | 1.2|309054|36|CP029664|CRT | 309054-309089 | 36 | CP029664.1 | 824599-824634 | 1 | 0.972 |
CP029664_3 | 3.1|667969|33|CP029664|CRISPRCasFinder | 667969-668001 | 33 | CP029664.1 | 31619-31651 | 1 | 0.97 |
CP029664_3 | 3.1|667969|33|CP029664|CRISPRCasFinder | 667969-668001 | 33 | CP029664.1 | 1003055-1003087 | 1 | 0.97 |
CP029664_3 | 3.1|667969|33|CP029664|CRISPRCasFinder | 667969-668001 | 33 | CP029664.1 | 1319130-1319162 | 1 | 0.97 |
CP029664_3 | 3.1|667969|33|CP029664|CRISPRCasFinder | 667969-668001 | 33 | CP029664.1 | 1527230-1527262 | 1 | 0.97 |
CP029664_7 | 7.1|1851138|42|CP029664|PILER-CR | 1851138-1851179 | 42 | CP029664.1 | 116028-116069 | 1 | 0.976 |
CP029664_7 | 7.1|1851138|42|CP029664|PILER-CR | 1851138-1851179 | 42 | CP029664.1 | 666575-666616 | 1 | 0.976 |
CP029664_7 | 7.1|1851138|42|CP029664|PILER-CR | 1851138-1851179 | 42 | CP029664.1 | 1003117-1003158 | 1 | 0.976 |
CP029664_7 | 7.1|1851138|42|CP029664|PILER-CR | 1851138-1851179 | 42 | CP029664.1 | 1843930-1843971 | 1 | 0.976 |
CP029664_7 | 7.4|1851291|26|CP029664|CRISPRCasFinder | 1851291-1851316 | 26 | CP029664.1 | 1888354-1888379 | 1 | 0.962 |
CP029664_11 | 11.2|2746976|16|CP029664|PILER-CR | 2746976-2746991 | 16 | CP029664.1 | 218237-218252 | 1 | 0.938 |
CP029664_11 | 11.2|2746976|16|CP029664|PILER-CR | 2746976-2746991 | 16 | CP029664.1 | 824488-824503 | 1 | 0.938 |
CP029664_11 | 11.2|2746976|16|CP029664|PILER-CR | 2746976-2746991 | 16 | CP029664.1 | 1003072-1003087 | 1 | 0.938 |
CP029664_11 | 11.2|2746976|16|CP029664|PILER-CR | 2746976-2746991 | 16 | CP029664.1 | 1273077-1273092 | 1 | 0.938 |
CP029664_11 | 11.2|2746976|16|CP029664|PILER-CR | 2746976-2746991 | 16 | CP029664.1 | 1531198-1531213 | 1 | 0.938 |
CP029664_1 | 1.1|308998|33|CP029664|CRT | 308998-309030 | 33 | CP029664.1 | 31619-31651 | 2 | 0.939 |
CP029664_1 | 1.1|308998|33|CP029664|CRT | 308998-309030 | 33 | CP029664.1 | 1319130-1319162 | 2 | 0.939 |
CP029664_1 | 1.1|308998|33|CP029664|CRT | 308998-309030 | 33 | CP029664.1 | 1527230-1527262 | 2 | 0.939 |
CP029664_1 | 1.2|309054|36|CP029664|CRT | 309054-309089 | 36 | CP029664.1 | 657163-657198 | 2 | 0.944 |
CP029664_1 | 1.2|309054|36|CP029664|CRT | 309054-309089 | 36 | CP029664.1 | 1003113-1003148 | 2 | 0.944 |
CP029664_1 | 1.3|309113|33|CP029664|CRT | 309113-309145 | 33 | CP029664.1 | 31619-31651 | 2 | 0.939 |
CP029664_1 | 1.3|309113|33|CP029664|CRT | 309113-309145 | 33 | CP029664.1 | 1228288-1228320 | 2 | 0.939 |
CP029664_1 | 1.3|309113|33|CP029664|CRT | 309113-309145 | 33 | CP029664.1 | 1319130-1319162 | 2 | 0.939 |
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48. spacer 7.3|1851252|40|CP029664|PILER-CR matches to position: 1531187-1531226, mismatch: 2, identity: 0.95
agctgacgaaaagtcagcttacaataatgtgcaagttggc CRISPR spacer agctggcgaaaagtcagcttacaaaaatgtgcaagttggc Protospacer *****.****************** ***************
49. spacer 7.4|1851291|26|CP029664|CRISPRCasFinder matches to position: 1888298-1888323, mismatch: 2, identity: 0.923
cggggccccaacacagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacatagaagcaggcgg Protospacer *************.****** *****
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029664_4 | 4.1|1745013|53|CP029664|CRT | 1745013-1745065 | 53 | MG543995 | Staphylococcus phage UPMK_1, partial genome | 76246-76298 | 4 | 0.925 |
CP029664_4 | 4.2|1745096|26|CP029664|CRT | 1745096-1745121 | 26 | NZ_CP022541 | Antarctobacter heliothermus strain SMS3 plasmid pSMS3-1, complete sequence | 333735-333760 | 5 | 0.808 |
CP029664_7 | 7.4|1851291|26|CP029664|CRISPRCasFinder | 1851291-1851316 | 26 | NZ_CP022541 | Antarctobacter heliothermus strain SMS3 plasmid pSMS3-1, complete sequence | 333735-333760 | 5 | 0.808 |
CP029664_7 | 7.4|1851291|26|CP029664|CRISPRCasFinder | 1851291-1851316 | 26 | NZ_CP034332 | Tabrizicola piscis strain K13M18 plasmid unnamed4, complete sequence | 3359-3384 | 5 | 0.808 |
CP029664_7 | 7.4|1851291|26|CP029664|CRISPRCasFinder | 1851291-1851316 | 26 | NZ_CP022605 | Ochrobactrum quorumnocens strain A44 plasmid unnamed1, complete sequence | 715511-715536 | 5 | 0.808 |
CP029664_3 | 3.1|667969|33|CP029664|CRISPRCasFinder | 667969-668001 | 33 | NC_021536 | Synechococcus phage S-IOM18 genomic sequence | 159745-159777 | 10 | 0.697 |
1. spacer 4.1|1745013|53|CP029664|CRT matches to MG543995 (Staphylococcus phage UPMK_1, partial genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.925
ttgggagtgggacagaaatgatattttcgcaaaatttatttcgtcgtcccacc CRISPR spacer aagggagtgggacagaaatgatagtttctcaaaatttatttcgtcgtcccacc Protospacer ********************* **** ************************
2. spacer 4.2|1745096|26|CP029664|CRT matches to NZ_CP022541 (Antarctobacter heliothermus strain SMS3 plasmid pSMS3-1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
tcgccagcttctgtgttggggccccg CRISPR spacer acgccagcttctgtgttgaggcctta Protospacer *****************.****...
3. spacer 7.4|1851291|26|CP029664|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022541 (Antarctobacter heliothermus strain SMS3 plasmid pSMS3-1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
cggggccccaacacagaagctggcgg CRISPR spacer taaggcctcaacacagaagctggcgt Protospacer ...****.*****************
4. spacer 7.4|1851291|26|CP029664|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP034332 (Tabrizicola piscis strain K13M18 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
cggggccccaacacagaagctggcgg CRISPR spacer gtaggcccagacacagaagctggcgg Protospacer .***** .****************
5. spacer 7.4|1851291|26|CP029664|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022605 (Ochrobactrum quorumnocens strain A44 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
cggggccccaacacagaagctggcgg CRISPR spacer tcagggccaaacacagaagctggcgg Protospacer . .** ** *****************
6. spacer 3.1|667969|33|CP029664|CRISPRCasFinder matches to NC_021536 (Synechococcus phage S-IOM18 genomic sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
cagaagctgacgaaaagtcagcttacgataatg CRISPR spacer aggtgcttgacgaaaactcaccttacgataaaa Protospacer .* . .********* *** ********** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
554862 : 613101
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP029664|554862:613101|DBSCAN-SWA 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76 | Staphylococcus_phage(97.1%) | head,portal,capsid,holin,terminase,integrase,protease,tail | attL 568729:568746|attR 593660:593677 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
702479 : 819570
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP029664|702479:819570|DBSCAN-SWA 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>CP029664|702479:819570|791807_791951_-|AWQ74364.1|DBSCAN-SWA MTAIENSTLIHFQEGIQLEVDEPFSLVSKKCHESLALKHFIENTISN |
105 | Staphylococcus_phage(86.76%) | bacteriocin,tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
945032 : 954075
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP029664|945032:954075|DBSCAN-SWA CATGAATGAGCGTATGGTTGATCAATCAATGCATAGTGAAGAAACTGATTTCGAATTGTCGCTTAGACCTACGAGATTACGACAATATATTGGTCAAAATTCAATAAAAAGTAATTTAGAAGTATTTATTAAAGCGGCTAAACTTCGTCATGAACCATTAGATCATGTATTGCTTTTTGGCCCCCCTGGATTAGGTAAGACAACATTATCTAATATCATTGCCAATGAAATGGAAGTTAATATACGTACAGTATCAGGGCCTTCATTAGAAAGACCTGGTGATTTGGCTGCAATTTTATCAGGACTTCAACCTGGAGATGTTTTGTTTATTGATGAAATACACAGACTGAGTAGTGTTGTTGAAGAAGTGTTATACCCTGCAATGGAAGATTTCTTTTTAGATATTATCATTGGTAAAGGCGATGAGGCTAGAAGTATCCGTATCGACTTACCTCCATTCACTTTGGTAGGTGCAACAACGCGAGCTGGCAGCTTAACAGGTCCACTAAGGGATCGATTTGGTGTGCACTTAAGATTAGAATATTATAACGAATCAGATTTAAAAGAAATCATTATTAGAACAGCTGAGGTTTTAGGCACAGGTATTGATGAAGAAAGTGCCATTGAACTTGCTAAACGTTCTAGAGGGACTCCAAGAGTAGCAAATCGACTATTGAAGCGGGTAAGAGACTTCCAGCAAGTGAATGAAGATGAACAAATATACATTGAAACAACGAAGCACGCATTAGGTTTACTTCAAGTTGATCAACACGGACTAGATTACATTGATCATAAAATGATGAACTGTATTATTAAGCAGTATAATGGCGGACCTGTTGGTTTAGATACGATTGCCGTAACAATTGGTGAAGAACGTATTACAATTGAGGACGTTTATGAGCCATTTCTTATTCAGAAAGGCTTTTTAGAACGTACGCCACGTGGCAGAAAAGCAACACCATTAGCTTATGAACATTTTGCAAAGTCGAATGAGGAGAGAGAATAACGTGAATATTGAAGAATTTGACTATGACTTACCAGAATCATTAATTGCTCAAACGCCTTTAAAAGATCGTGATCATAGTCGTTTATTAGTCATGGATAGAGAAACTGGTGAAATGAAACATTTACATTTCAAAGATATCATTGAGTATTTTAGACCTGGTGATACATTAGTGCTTAACGATACGCGAGTAATGCCAGCTAGACTTTTTGGTTTAAAAGAAGAAACTGGTGCAAAAGTTGAAATGTTAATGTTAACTCAAATTGAAGGTAATGATTGGGAAGTCTTACTGAAACCAGCTAAGCGTATTAAAGTTGGTAATAAATTGAATTTTGGTAATGGCAAAATTATAGCTGAATGCATAAAAGAAATGGATCAAGGTGGACGCATCATGCGTTTACATTATGAAGGTATTTTACAAGAAAGATTAGATGAATTAGGGGAAATGCCACTGCCACCATACATCAAAGAACGTTTAGATGATCCAGATCGTTATCAAACAGTTTACGCTAAAGAAAGTGGTTCAGCGGCAGCACCAACAGCAGGATTACATTTTACTGATGAGTTATTAATTGAAATTAAAAATAAAGGTGTTAATATCGCATTTGTTACATTACATGTTGGGTTAGGTACGTTTAGACCGGTGAGCGTAGACGATGTGAATGACCACGAAATGCATAGTGAATATTATCAAATGACACAAGAAACAGCTGATTTATTAAATGATACTAAGTCCAAAGGACATCGCATTATATCAGTTGGTACAACTTCAACACGTACACTTGAAACAATTCGACGCGATCATGATAAATTTGTTGAAACGAGTGGCTGGACTAATATATTTATTTATCCAGGATTTGATTTTAAAGCAATTGATGGCCAGATTACTAATTTTCATTTACCAAAATCAACATTAGTTATGCTAGTATCAGCGTTTAGTAGTCGTGAAAATGTTCTGAATGCTTATAAAACGGCAGTAAATTTAGAATATAGATTCTTTAGTTTTGGCGATGCAATGTTAATTATATAAAAAGAATGTGAGGATTTTGAATATGCCTGCAGTAACATACGAACACATTAAAACTTGTAAACAATCAGGTGCGCGTTTAGGTATCGTGCACACACCACACGGTTCATTTGAAACACCTATGTTTATGCCAGTTGGTACTAAAGCAACCGTTAAAACAATGAGTCCAGAAGAGTTAAGACAAATTGAAGCAAAAATCATTTTGGGCAACACATATCATTTGTGGTTACAACCCGGAAATGATATTATCAAACACGCTGGGGGATTACATAAATTCATGAATTGGGATGGTCCGATTCTTACAGATTCAGGCGGTTTCCAAGTGTTTAGTTTAAGTAATTTACGTAAAATTACAGAAGAAGGCGTGGAATTTAGACATCATACTAATGGGTCTAAATTATTTTTGAGTCCTGAGAAATCAATGCAAATTCAAAATGATTTAGGATCTGATATTATGATGGCATTTGATGAATGTCCACCGATGCCTGCTGAATATGATTATGTAAAAAAATCTATTGAACGTACAACACGTTGGGCGAAAAGATGTCTAGATGCACACCAAAGACCTGAAGATCAAGCATTGTTCGGCATTATACAAGGTGGCGAATATGAAGATTTAAGAGAACAAAGTGCAAAGGATTTAGTAGAATTAGATTTTCCTGGTTATGCAATCGGCGGTTTGTCAGTTGGTGAACCTAAACCGGTTATGTATAAAATGGTTGAACATACAGAGCAGTTTATGCCTAAAGATAAACCAAGATATTTAATGGGTGTAGGATCTCCAGATGCGTTAATCGAATGTAGTATTCGCGGCATGGATATGTTTGATTGTGTCTTACCGACACGTATTGCCAGAAATGGTACTTGTATGACATCGCAAGGTCGTTTAGTTATTAAAAATGCAAAATTTGCAGATGATTTAAGACCGTTAGATGAGAATTGTGACTGTTATACATGTCAAAACTATTCAAGAGCGTATATACGTCATTTAATCAAGGCAGAGGAAACTTTTGGTATTCGTCTTACTACTATTCATAATTTACATTTTCTGCTAAAATTAATGGAAGATATAAGACAAGCCATTCGAGAAGATCGTCTTTTAGATTTCAAAGAAGAATTCTTCGAGCAATATGGATTAAATGTTGAGAACCCAAAAAACTTTTAAGCAAGAGGAGCGTATAAAATGCAATTTTCATTACTAATATATATAGTCGTAATTTTTGCGGTTATGTATTTCTTGATGATCAGACCACAACAAAAACGTGCGAAACAGCATCGTGAGTTGATTAATAACATTCAATCTGGTCAAAGAATTACAACTATTGGTGGTATTAAAGGTACTGTTAAAGCAGTAGATGAAACAACTGTTGTTATTACAGTTAATGGTCATGGTACTGAATTAACTTTCGAAAAACCTGCTATTAAACAAGTTGACCCTTCATAATGAGAAGTGGTATTAAAAAGGATGAAACGAATAGCGTTTCATCCTTTTTAAGTTATAAGTAGTATGTAGAATAGCTTATTTTTATTCCAAAAAAAGAAATTGTGATACATAATAATTGTTAAATTTAAATTAAATATATCTATGACTATTTTTACTCCCTGCTCTAGTATGTTAATATGTATAAGGCTAATAAATTTTGTAAGAAAGATTTAACTTGCGTTATAAAATAGTATTCAAGTATTCTAAATACATACGTAAATAATGAGGTGTTCATGTGAAGAAAAGTAGTAGAATAATTGCGTTCTTGCTTTTAGTCGTATTGTTGTTTGCCGGAATGGCTGCAACTTATAAAAGTGTTATAAAGAATGTCAATTTAGGACTTGATTTGCAAGGTGGATTTGAGGTGCTTTATCAAGTCGATCCTTTAAATAAAGGCGACAAAATAGATAAAAAAGCCTTACAATCAACAGCGCAAACATTAGAAAATCGTGTTAACGTTTTAGGTGTTTCGGAACCTAAAATTCAAGTTGAAGAACCTAATAGAATTAGAGTACAACTTGCTGGTGTAACAGACCAGAATGAAGCACGTAAAATTTTATCTTCTCAAGCTAATTTAACAATTCGCGATGCAGAAGATAAAGTAAAATTAAGCGGTTCTGATATTAAACAGGGATCTGCCAAACAAGAATTTAAACAGGAAACAAACCAGCCTACAGTTACTTTTAAAGTAAAAGACAAAAACAAATTTAAAAAAGTAACGGAAGAAATCTCTAAGAAACGTGATAATGTCATGGTTGTTTGGTTAGATTTCAAAAAAGGTGACAGCTATAAAAAAGAAGCACAAAAGAAAAACCCTAAATTTATTTCTGCAGCAAGTGTTGATCAACCAATCAATTCTGATAGCGTAGAAATCTCGGGTGGATTTAAAGGACAAGAAGGCGTTAAAAAAGCAAAACAAATCGCCGAATTGTTAAATGCAGGTTCTTTACCAGTTGACTTGAAAGAAATTTATTCAAACTCAGTAGGTGCCCAATTTGGTCAAGATGCATTAGATAAAACTGTGTTTGCATCGTTTATTGGTGTAGCATTAATTTATTTATTCATGCTTGGATTCTACCGATTACCTGGTTTAGTAGCGATTATTGCATTGACAACTTATATCTATCTAACGTTAGTAGCATTTAATTTCATTTCCGGGGTTCTAACTTTACCAGGATTAGCGGCGTTGGTATTAGGTGTAGGTATGGCTGTAGATGCCAATATTATCATGTATGAGCGTATTAAGGATGAACTTCGAATAGGTAGAACGATAAAGCAAGCCTTTTCTAAAGCAAACAAAAGTTCATTCCTAACAATTTTTGATTCTAACTTAACAACAGTTATCGCCGCAGCAGTATTATTCTTCTTCGGTGAAAGTTCAGTTAAAGGTTTCGCGACAATGTTATTATTAGGTATTCTAATGATCTTTGTTACAGCCGTGTTCTTATCAAGATTCTTATTATCATTACTTGTTTCATCAAATATAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP029664|945032:954075|948244_948505_+|AWQ75121.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >CP029664|945032:954075|953556_954075_+|AWQ75949.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >CP029664|945032:954075|951261_953535_+|AWQ73528.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDALQLSDMTKTIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTATTILVITLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDVEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKKGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKQVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQIIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >CP029664|945032:954075|947086_948226_+|AWQ75148.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >CP029664|945032:954075|946038_947064_+|AWQ75955.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLIEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSSRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >CP029664|945032:954075|945032_946037_+|AWQ73323.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE >CP029664|945032:954075|948779_951059_+|AWQ75076.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1023212 : 1031524
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP029664|1023212:1031524|DBSCAN-SWA TTTGCGAATAGATCAATCGATCATTAATGAAATAAAAGATAAAACCGACATTTTAGACTTGGTAAGTGAATATGTAAAATTAGAAAAGAGAGGACGCAATTATATAGGTTTGTGTCCTTTTCATGATGAAAAGACACCTTCATTTACAGTTTCTGAAGATAAACAAATTTGTCATTGTTTTGGTTGTAAAAAAGGTGGCAATGTTTTTCAATTTACTCAAGAAATTAAAGACATATCATTTGTTGAAGCGGTTAAAGAATTAGGTGATAGAGTTAATGTTGCTGTAGATATTGAGGCAACACAATCTAACTCAAATGTTCAAATTGCTTCTGATGATTTACAAATGATTGAAATGCATGAGTTAATACAAGAATTTTATTATTACGCTTTAACAAAGACAGTCGAAGGCGAACAAGCATTAACGTACTTACAAGAACGTGGTTTTACAGATGCGCTTATTAAAGAGCGAGGCATTGGCTTTGCACCCGATAGCTCACATTTTTGTCATGATTTTCTTCAAAAAAAGGGTTACGATATTGAATTAGCATATGAAGCCGGATTATTATCACGTAACGAAGAAAATTTCAGTTATTACGATAGATTTCGAAATCGTATTATGTTTCCTTTGAAAAATGCGCAAGGAAGAATTGTTGGATATTCAGGTCGAACATATACCGGTCAAGAACCAAAATACTTAAATAGTCCTGAAACACCTATCTTTCAAAAAAGAAAGTTGTTATACAACTTAGATAAAGCGCGTAAATCAATTAGAAAATTAGATGAAATCGTATTACTAGAAGGTTTTATGGATGTTATAAAATCTGATACTGCTGGCTTGAAAAACGTTGTTGCAACAATGGGTACACAGTTGTCAGATGAACATATTACTTTTATACGAAAGTTAACATCAAATATAACATTAATGTTTGATGGGGATTTTGCGGGTAGTGAAGCAACACTTAAAACAGGTCAAAATTTGTTACAGCAAGGGCTAAATGTATTTGTTATACAATTGCCATCAGGCATGGATCCGGATGAATACATTGGTAAGTATGGCAACGATGCATTTACTGCTTTTGTAAAAAATGACAAAAAGTCATTTGCACATTATAAAGTGAGTATATTAAAAGATGAAATTGCACATAATGACCTTTCATATGAACGTTATTTGAAAGAACTAAGTCATGATATTTCGCTTATGAAATCATCGATTTTGCAACAAAAGGCTTTAAATGATGTTGCACCATTTTTCAATGTTAGTCCTGAGCAATTAGCTAACGAAATACAATTCAATCAAGCACCAGCCAATTATTATCCAGAAGATGAGTATGGCGGTTACATTGAACCTGAGCCAATTGGTATGGCACAATTTGACAATTTGAGCCGTCAAGAAAAAGCGGAGCGAGCATTTTTAAAACATTTAATGAGAGATAAAGATACATTTTTAAATTATTATGAAAGTGTTGATAAGGATAACTTCACAAATCAGCATTTTAAATATGTATTCGAAGTCTTACATGATTTTTATGCGGAAAATGATCAATATAATATCAGTGATGCTGTGCAGTATGTTAATTCAAATGAGTTGAGAGAAACACTAATTAGCTTAGAACAATATAATTTGAATGACGAACCATATGAAAATGAAATTGATGATTATGTCAATGTTATTAATGAAAAAGGACAAGAAACAATTGAGTCATTGAATCATAAATTAAGGGAAGCTACAAGGATTGGCGATGTAGAATTACAAAAATACTATTTACAGCAAATTGTTGCTAAGAATAAAGAACGCATGTAGCATGTGATTTTAAAGAATAATACGAATAATGATTATGTCAAAATGTATAAGGGTAAATGATAGTTACCGCATTTAAACAACACTATTGAAAAATAAATATTGGGATTAGTTCCAATTTGTAAAATAAAATTAAAAATATGGATGAATTAATTAAGAATTTAGTTTAAAATAGCAATATTGAATAAATTTCGAATGTTCATATTTAAAATCGGGAGGCCGTTTCATGTCTGATAACACAGTTAAAATTAAAAAACAAACAATTGATCCGACATTAACATTAGAAGATGTTAAGAAGCAATTAATTGAAAAAGGTAAAAAAGAGGGTCATTTAAGTCATGAAGAAATTGCTGAAAAACTTCAGAATTTTGATATCGACTCTGATCAAATGGATGATTTCTTTGATCAATTAAATGATAATGATATTTCACTAGTTAATGAAAAAGATAGTTCAGATACTGACGAGAAACTGAATCCAAGTGATCTTAGTGCCCCTCCAGGTGTTAAAATAAATGACCCAGTTCGTATGTACCTTAAAGAAATTGGGCGTGTTAACTTATTAAGTGCACAAGAAGAAATCGAATTAGCCAAACGTATTGAACAAGGTGATGAAGTAGCAAAATCAAGACTTGCAGAAGCGAACTTACGTTTAGTTGTAAGTATTGCTAAAAGATACGTAGGTCGTGGTATGTTATTCCTTGATTTAATCCAAGAAGGTAATATGGGTCTTATTAAAGCTGTTGAAAAATTTGACTTTAACAAAGGATTTAAGTTTTCAACATATGCAACATGGTGGATTAGACAAGCAATCACTCGTGCAATTGCTGACCAAGCACGTACGATTCGTATCCCTGTGCATATGGTAGAAACAATTAATAAATTAATTCGTGTTCAACGTCAATTATTACAGGACTTAGGTCGAGATCCAGCACCAGAAGAAATTGGTGAAGAAATGGATTTACCAGCAGAAAAAGTTCGTGAAATTTTAAAAATTGCGCAAGAACCTGTTTCATTAGAAACACCAATTGGTGAAGAAGATGATAGTCATTTAGGAGACTTTATTGAGGATCAGGAAGCACAAAGTCCTTCAGATCATGCTGCTTATGAATTATTAAAAGAGCAATTAGAAGATGTGCTTGATACATTAACTGATAGAGAAGAAAATGTATTACGATTAAGATTTGGTCTTGATGACGGCAGAACAAGAACACTTGAAGAAGTTGGTAAAGTTTTCGGTGTTACACGTGAACGTATTCGACAAATTGAAGCAAAAGCACTTAGAAAATTAAGACATCCAAGTCGTAGTAAACGTTTGAAAGACTTTATGGATTAATTTATATCAATTTTAATGATTGATACCAAGACATGAATAAGCGCTTATTTATTTTTAGATTAAGATTTAACTTGAGTGAGGTTGGTACATTGAATAATGTTCAACCTCTTTTTTCATAAAGGAGAATAAAATGATTTCGTTAAATAACCGATTAACGACGGTAAGTCGATTTTTAAAACAAGGTACAATCGCGGATATTGGCTCAGATCATGCTTATTTGCCAATCTATGCAATTCAAAACCATTTATGCGAATGCGGTATTGCTGGAGAAGTTATTCAAGGCCCTTTTCAAGCTGCTGTGAAAAATGTAGCTGCAAACCAATTAGTAGATAGAATTGATGTACGTTTAGGGGATGGCTTAAGTGTTATTCAACCTGAGGACGTAATCGATAATATCACAATTTGTGGTATGGGCGGACCACTTATTGCTAAAATTTTAAAAGATGGGCAAGATAAGTTAAGTCAACATCCAAGGTTGATTTTACAAAGTAATATCCAAACTGAAAATTTAAGACAAACATTACAACAATTGAATTATGAAATAATTGATGAAATAATAATGGAAGAAAAAGGCCATATTTATGAAATTGTTGTAGCAGAATATTCTACAGAATTAATAGAGCTATCATCTGATGAATTGAAATTCGGACCAAAATTGCTGAACAACAAAAATGAATATTTTATAAAAAAATGGCAAAGAGAGTTAGAAGCACTTTATCATATTAAATCGAAACTCAATACTGAACAACATCATCAACGTTTAGCTCAAATTAATGACGAAATTGCTGTAATTGAAAGGGTGTTATAGTAATGAAAATAGCTGATTTAATGACATTGTTAGATCATCATGTGCCATTTAGTACTGCTGAATCTTGGGATAATGTAGGATTGTTAATAGGTGATGAAGATGTTGAAGTTACTGGTGTTTTAACAGCATTAGACTGTACGTTGGAAGTAGTAAATGAAGCAATCGAAAAAGGTTATAATACTATTATTAGTCATCATCCTCTAATCTTTAAAGGCGTAACATCATTAAAAGCTAATGGTTATGGTTTGATCATTAGAAAACTAATTCAACATGACATTAATTTAATAGCGATGCATACAAATTTAGATGTAAATCCGTATGGTGTCAATATGATGTTGGCGAAGGCGATGGGTTTGAAGAACATTTCAATAATAAATAATCAACAAGATGTATACTATAAAGTTCAAACATATATACCTAAGGATAATGTTGGACCATTTAAAGATAAGCTTAGTGAAAATGGATTAGCGCAAGAAGGTAATTATGAATATTGTTTCTTTGAAAGTGAAGGAAGAGGGCAATTCAAACCAGTTGGTGAAGCTAATCCAACAATAGGACAAATTGATAAAATTGAATATGTAGATGAAGTTAAAATTGAATTTATGATAGATGCATATCAAAAGTCAAGGGCTGAGCAATTAATTAAACAATACCATCCATATGAAACACCGGTATTTGATTTTATTGAGATAAAACAAACATCCCTTTATGGACTTGGCGTTATGGCAGAAGTGGATAATCAAATGACATTGGAAGATTTCGCAGCTGATATTAAATCTAAATTAAATATCCCAAGTGTCCGTTTTGTTGGTGAGTCTAATCAGAAAATTAAACGTATTGCAATTATTGGTGGTTCAGGTATTGGATATGAATATCAAGCTGTCCAACAAGGCGCAGATGTCTTTGTTACAGGTGATATTAAACATCATGATGCCTTAGATGCTAAAATTCATGGTGTGAATTTAATTGATATTAATCATTACAGCGAATATGTGATGAAAGAAGGTTTAAAAGCGTTACTAATGAATTGGTTCAATACAGAAAAAATAAATTTAGATGTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP029664|1023212:1031524|1028366_1029713_+|AWQ75790.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFYLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >CP029664|1023212:1031524|1030738_1031524_+|AWQ74513.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >CP029664|1023212:1031524|1029722_1030613_+|AWQ74896.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >CP029664|1023212:1031524|1026472_1027150_+|AWQ74676.1|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCECGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIQPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTELIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL >CP029664|1023212:1031524|1027152_1028253_+|AWQ75736.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFSTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPYGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDAYQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKALLMNWFNTEKINLDVEASTINTDPFQYI >CP029664|1023212:1031524|1023212_1025012_+|AWQ73567.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQNLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKALNDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYNLNDEPYENEIDDYVNVINEKGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >CP029664|1023212:1031524|1025235_1026342_+|AWQ74685.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD |
7 | Caulobacter_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1087412 : 1174593
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP029664|1087412:1174593|DBSCAN-SWA AGTGACGACAGTTTTAATTTTATTAAGTATTGCTTTAATTACCTTTATGCAATACTATTTCACACAAGAAACCGAAAATGCCATAAGAGAAGATGCTAGACGTATAAGTTCACTGGTCGAACAATCACATAATAAAGAAGAAGCAATAAAATATAGTCAAACATTAATTGAAAATCCTGGTGGGTTGATGATTATAAATAATAAACATCGTCAATCAACGGCTTCACTTTCTAATATTAAAAAGCAAATGTTGAATGAAGTAGTCAACAACGACCATTTTGACGATGTGTTTGATAAAGGTAAATCTGTTACTCGAAATGTAACGATTAAAGAAAAGGGCTCATCTCAAACATATATTTTGTTAGGCTATCCAACAAAAGCACAGAAGAATAGTCATAGCAAATATAGTGGAGTCTTTATATATAAAGACTTGAAATCAATCGAAGATACAAATAATGCTATTACGATTATCACCATAATTACGGCTGTTATTTTCTTAACAATTACAACAGTCTTTGCGTTTTTCTTATCGTCAAGAATTACAAAACCTTTAAGACGTTTAAGAGACCAAGCTACACGTGTATCTGAAGGGGATTACTCTTATAAACCTTCTGTCACAACGAAAGATGAAATTGGTCAATTATCGCAGGCATTTAATCAGATGAGTACAGAAATCGAAGAGCATGTCGACGCATTATCCACATCTAAAAATATTAGAGACAGCTTAATTAACTCTATGGTAGAAGGTGTCCTAGGTATTAATGAGAGTCGACAAATTATCTTATCTAATAAGATGGCGAATGATATTATGGACAATATTGATGAAGATGCTAAAGCTTTCTTATTAAGACAAATAGAAGATACTTTTAAATCAAAACAAACTGAAATGCGCGATTTAGAAATGAATGCACGATTCTTTGTTGTGACCACAAGCTATATCGACAAGATTGAACAGGGAGGTAAAAGTGGTGTTGTTGTGACAGTTCGTGATATGACTAATGAGCACAATCTAGATCAAATGAAGAAAGATTTCATTGCTAATGTATCACATGAATTACGTACACCGATATCATTACTTCAAGGTTATACTGAATCAATTGTAGATGGTATTGTTACAGAACCGGATGAAATAAAAGAATCGCTTGCCATTGTCCTTGATGAATCGAAACGTTTAAATCGTTTAGTTAATGAATTGTTAAATGTCGCACGCATGGATGCTGAAGGGTTATCCGTAAATAAAGAAGTTCAGCCTATTGCAGCGTTACTAGATAAGATGAAAATTAAGTATCGCCAACAAGCTGATGATTTAGGTCTAAATATGACTTTTAATTATTGTAAGAAGCGTGTTTGGAGTTATGATATGGATCGCATGGACCAAGTACTAACGAACTTAATTGATAATGCATCACGTTATACGAAACCTGGAGATGAAATTGCAATTACTTGTGATGAAAATGAAAGCGAAGATATTTTATACATTAAAGATACAGGTACAGGCATTGCACCAGAACATTTACAACAAGTATTTGATCGTTTTTATAAAGTTGATGCAGCGAGAACGCGAGGTAAACAAGGTACCGGTTTAGGTTTGTTCATTTGTAAAATGATTATCGAAGAGCATGGTGGTTCCATAGATGTTAAAAGCGAATTAGGGAAAGGCACAACATTTATTATTAAACTACCAAAACCAGAATAAAATTGAATATAGTTATTTCAGAACGCATGTTATTGATTAGAGACTCTAATTTATAGCATGCGTTTTTTGATTGATGTGGGGAATTTTGTATGTGGATTAGAACTTAGGGTTTTTGCGAATATCAACTATTAAATATATTACTAATTTATACAAAAATATAAAGTTTGATAAAGTTATTTATTTGATTATAAAAATAGGGTAAAATATAGATATATTGTATTAATTAAATTATTCGAGGTGTCATATGAAAAAATTCATTGGATCAGTTTTAGCTACGACATTAATTTTAGGGGGATGTTCCACGATGGAAAATGAATCAAAAAAAGACACAAAAACAGAAACAAAATCTGTACCAGAAGAAATGGAAGCTTCAAAATATGTAGGCCAAGGCTTTCAACCGCCTGCAGAAAAAAATGCGATTGAATTTGCGAAGAAGCATCGTAAAGAATTTGAAAAAGTAGGTGAACAATTCTTTAAAGATAACTTTGGACTAAAAGTTAAAGCTACAAATGTTGTAGGTAAAGATGATGGTGTAGAAGTTTATGTGCATTGTGAAGATCATGGCATTGTATTTAATGCAAGTCTACCTTTGTACAAAGATGCCATCCATCAAAAAGGATCAATGCGCAGTAATGACAATGGTGATGATATGAGTATGATGGTGGGTACAGTGCTGAGTGGCTTTGAATATCGAGCGCAAAAAGAAAAGTATGATAACTTATATAAATTCTTCAAAGAAAATGAAAAGAAATATCAATATACAGGCTTTACAAAAGAGGCAATTAACAAGACACAAAATGTCGGATATAAAAATGAATATTTTTATATTACATACTCTTCTAGAAGTTTAAAAGAATATCGAAAGTATTATGAACCACTGATTCGAAAAAATGATAAAGAATTTAAAGAAGGAATGGAACGAGCAAGAAAAGAAGTGAATTACGCTGCAAATACAGATGCTGTTGCTACACTTTTTTCTACTAAGAAAAACTTTACTAAAGACAATACAGTAGATGATGTAATCGAACTAAGTGATAAATTATATAATTTAAAAAATAAACCAGATAAATCTACAATCACAATACAAATAGGGAAACCCACTATTAATACTAAGAAAGCCTTTTATGATGATAATCGTCCAATAGAATATGGGGTGCACAGTAAAGATGAATAAAATTAATGATAGGGATTTAACAGAATTAAGTAGTTACTGGGTTTATCAAAATATTGATATAAAAAAAGAATTTAAAGTTAATGGAAAAAGGTTTAAACAAGTAGACAGTTATAATGATGATAAGAATAGTAATTTGAATGGTGCTGCTGATATTAAAATATATGAGTTATTAGATGATAAAAGTAAACCAACTGGTCAACAGACAATAATTTATCAAGGAACATCTAATGAGGCAATTAATCCAAATAATCCATTAAAATCATCGGGGTTTGGAGATGATTGGCTCCAAAATGCTAAATTAATGAATAATGATAATGAAAGCACAGATTATTTAAAGCAAACAGATCAATTATCAAATCAATATAAAATAAAGTTAGAAGATGCAGATAGATTATCAAATAGTGATTTTTTAAAAAAATATAGAATGGAATCAAGTAACTTCAAAAACAAAACCATTGTGGCGGATGGCGGTAATTCGGAAGGCGGTGCAGGAGCAAAATATCAAGGAGCGAAACATCCGAATGAAAAAGTTGTTGCTACTGACTCAGCAATGATTCCTTATGCTGCTTGGCAGAAATTTGCTAGACCACGCTTTGATAATATGATTAGTTTTAATAGTACCAACGATTTATTAACATGGTTACAAGATCCATTCATCAAAGATATGCCAGGAAAACGCGTTAACATTAATGATGGTGTGCCCAGGTTAGATACTTTAATAGACAGCCATGTAGGTTATAAAAGGAAGTTAAATAGAAAAGATAACACATACGATACTGTACCACTAATCAAAATAAAGTCGGTAAAAGATACAGAAATTAAAAATGGAAAAAAGTAAAAAAGACTATTAACATAACATTAGATATGGATGGGCGAATTCCAATAAATGTTTGGACAGGAGATTCGATTGCACGTTCTGGAAGAGGAACTTTAATTAAACTTAATTTAGAAAATCTTGATGCGTTGAGTAAACTGATTACTGGTGAAACAAGTGGTATGTTAGCAGAATGCGTAATCTTTTTAAATGAAAGTTTTAACATCTCAGAAAATGAAAATAAAAATTTTGCAGATAGAAAGAAACAATTATCAGAAGGATTTAAGGATAAGATTAACTTATTTCAGTTAGAAGAAATGGAAAGAACTTTAATTAGTAAAATAAACTCACTTGAAGAAGTTGCAGATGAAACAATAGAAAGTATTAGTGCTGTTAAACACTTATTACCTGATTTTGCATTGGATGCATTAAAAGAAAGAATTAATGAGTTGTTTAAAGGTATAAAATCTTTTATAGAAAAAGTGTATGATAGTATAGATAATGAAATTTTAGAAATTTTCAAAAATATAGATCACGACTTCAGAGATGGAGTATCTGAAGAAATGATGAAACATTTGAAAGTAGTGAAACAGAATATAGACCAAATAAAAAATCAAAATGATATTTATGGTAGGCAAATTGCAGATATTAGAAGTATTATGAAACAACAAGATGCAACAATTTTAGATGGAAATTTTCAAATTAATTGTAGCGGCGAAAATATGGTACAGGGTCTAGTTATACCTTCTAATTATTTAGGAAGAAAAATGAAAATATTAAAAGACCATATCGATGATGGTATTAAAAAAATAGCAGACTATGTTCAAGGTATATATGATGAATATGCATCGAAAATTGTCGATGTAATAAAATATTTGATTAATACAATTCCCAAAATACGTAAGAATTTAAGACATGCAATTGAAATGTTAAATGTAAAAAAGAAAGAATTTTTGTCCCTGATTCCTAATGTAACTTGTAATTATATTAAAACTAAATTAGAAGAATTAGATAATACTTTAGGCAAATGGGAGCCTTTTCTTAATGATTTAAAAGCAGTGTCACCAATTTTAGATAACCATTTAGATGATATTGTTAAGAACATGAAGCCTTTGATTGTACAAATGATATTTGAACCATCACATTATGATGATATGTTTATTTCAAGAAAAGCTTTAACGCCAGTGTTCTCAAGCGTTTTATAAAGCTTGTAAAAAATATAAGGGCAAAAAAAGGGCGGATTTAAGCTAACTTGGAATGTTTTCGAGTTTTTGAGTTAGTTCTCTATCCATTTTTTCAGTTACATGAGTATATAT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104 | Staphylococcus_phage(83.12%) | head,portal,capsid,tRNA,holin,terminase,integrase,protease,tail | attL 1092318:1092338|attR 1138211:1138231 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1236369 : 1262050
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP029664|1236369:1262050|DBSCAN-SWA 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24 | Lactococcus_phage(18.18%) | protease,lysis,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1355185 : 1361229
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP029664|1355185:1361229|DBSCAN-SWA ATTATGCTTCTTTTACTTCTACTTGATATTTACCTTCACGCTCTTTAAAGAACTTGTCCCGCCAATTGCCAACATGTGGCACTGTGGTACTTCTACACCAAGGATGCATAGGTGGCGCATTCACACCTGGTATCATATCTTTAACTTTAAATATTTTTCCGTTAAGTGAATGACATAATTTAGATGTTTTACTATCTATTTTGGCAACATATTTATATTCGCCATCTTCACCAAGTTCTTTTAAATATGTTAACTTTTGTGCTTCTGCATTTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCGTATAAAAATAGCACCACTTTCTCTTTATCTGTCTAAAAAGGATGCTATTTATCTTTTGAATTTGAATTCTTTTTCGCTTTTTCTATACTTTCAAATTCTTCAACTAATTCTTTAAAAGATTCACTCAATTCTTTTGCAGTTACATTTCCATCTAATTGTGAATCTAACATAATTAAAATCATCTCACTTTATATTTAATCATATTTATACTATAAAGTTTTTTCAATAATTTTTCAATATGGCTATCATTAATGATATTAATATGCGTAAAATATTTAGCACAAAATTTACTCACTATTTTACCATGAAACCTATTTGACTTGGTAATAAATTTTACTTGTCCCTTATTAGTAACGATTGTCATTGATTTTATTGATGGATGCTTAAAAAATGTAAATAAATCATATTCTGAAAATCCTGACTGTCCAGGATGGTTATGTAACATAACAATTGAATTCGGTTTACTGTTAAATAATAATTCGGTTGCTTGTTACCCTGGCACAAAAGATACACTATCTTGATTGACATATACTTTTGTAAATTTACCATCTTTTAACAAATAAGCTACTTCATTGCTATCATTGTTTTCCATGAGATATACCTCCGTTTATAGTCTGTCGACTGATATTCCATACTTGCTTTTAAAATGTCATCAGCACGTTTTGGGCAATAAAAAATAACCTTCACATTTGAAGGTTAAAATTTTTAAAGTAAACTTTCTTTATCCCCATGCTACGAGTTCAGATTCAGGAAATAGCCCTTTACTAGTATTTATGTATATTCTGTCTATGGCATGAATAAAATAATTATCTCTTGTATTTTTTTCTAAACTAGATTTTTCAGCATTGATAACTTCAAGACTATCTATATCCATTTGAATAATACCAGGCTTAATATTTTCATCATTATTAGGAAAATATTTATATGTAACACTTTTATCATTAATTTCTTTTATTTTTAATATTAGCAATCATTTCCACCTCTAATTAATTAAAATACTATAATTATATTTTATTTCTGTAAGTTTATGTGCCTCTATATAGTGTAAATTATACTTATTCATTAGATAGTGTTCAAGAGCTTCATGTTTCTACATTATTATATCCATTTTTTTAATATTTTTCCCTTCTCTTAAACGTTGCCAACTTTGAGCCATATAAAAGTCAGGATCAAATTGTTTAAATCCACTTTCTAATAAATACTTATTTTCAAATATATGTTCATAAACTCTTTGAATTAAATTTTTATTTATATTAGTATTTTTAGCAATTTTAGAAATCTCTATCTGTTTATCTCGATTTCTAACTGAATTATAATAAATTTGAGCATGTCTGTTCCTTTTGATACCGTATTCATCACTTTTATTATTAAGTGCACCTGATTCAATAAAACAACCTTCTACTTGATATTTACCTTCACGCTCTTTAAAGAACTTGTCTCGCCAATTGCCGACATGTGGCACTGTGGTACTTCTACACCAAGGATGCATAGGTGGCGCATTCACACCTGGTATCATATCTTTAACTTTAAATATTTTTCCGTTGAGTGAATGACATAATTTAGATGTTTTACTATCTATTTTGGCAACATATTTATATTCGCCATCTTCACCAAGTTCTTTTAAATATGTTAACTTTTGTGACTCTTCTTTTTCAACGAATAATGAAAAAAGCATATAAAAATAGCATCGCTTTCTCTTTATCTGTGTAGAAAGGATGCTTTAATACCATGCTATTTTATAATTTTCGGGAAATTCTTGCTTCTCGATAAAGTCTCTTACTACAGAAAAAGACTTATTACGATATAACATAAAATATTCTTCATTTTCTATTTCAGATAATGAGAAATCTATAACCTCTGCATCTTTTTTATTAAAAGTTACTGAACCTTTACCGTTACTTATATCATCTTCAGGTATATATTCATATATTATAACCTGTTCATCTTCTTTCAATTTTATTAATGTAAGCATTTAATCCACCTTCTTTTTTATAAAAATTGAATAATCGTATTTTTTTGATACAATTTTATGTGCATAATCATAGTTGAAATTATACTTATTCATCAAATAATGTTCAAGCGCCTCATGACGCAGCAGTATTAAATCTTGTTTTTTATTGTTTTTCCTTCTCTTAAACGTTGCCAACTTACTGCGATATTATATTCTGGATAATAACTTAAAATCGAATAATTCACTTTGAACATAACAACTCACTCCTTGTATAGTGGTGAAGCAAGTATTATTATTAAATTGTAGGAGGGAAAGTCCCTCCTGACTGATTAACGCTCGAATGTCCATTCAATCTTTATAAAGTAGAGATTTATTAAGATTAACAATTTGGTACATTTGAGCTTTTTTATTTCCTTCACTCGCACCTTCTTAAACTTATATGTTCATTATACAAATATAAAAAGCTATAACAATTTAATGAAAATGCCCCCTTCGAAGTCGACATTGAAAAAATGAAAACTTTGAAGGGAGCATTTCAAGACGATCCATTCCAATCTTTTTTATCATTTAAAACTTAACACTTATTTTCCCTTATTCGATGCTAATTTCGTGCAATAAATTCTAAATGAAACGACATACTCCTTTTTCACAAATTGGAATCTACTATTTTTGTATTTTAATTATTATAATATCCATTCACCATATGATTTTTATTAATAGTTAAATCAAATAAACATAGCTTGATTAATTTATACATTAGTTAAATTACAAAACTTTATTGGCATATTCATATAATTTTTCTGTTGTATTCAGGGTTAGATTATCTACTTCGCGTTTGCCCTGTCTTAATTGTGAAAGTACGTATTGAGAAACTCCAGTTTTTTTAGAAATTTCATATCCTGTTAAATTACTTTCAATTAATTCAATTATTTTTTTCTTGTATTCTGACATTTTTTCATCTCCATATCTGTACAATGTTTTCTGCTTTTTTTCGAAATTCTGTGAACTTAACGTATTTTTTATCTATAAATGATTTTATTATTTTTCTATTCATTAATGGCTATCATCACTTCATAATAGTTAAATTTTATATTTTCAATTTTTGTTTCTACATATTAACGACTTTTCATCATCAATTACTTTGTCAAAGATAAACGATTTGTCTTGTATACCTTACGCCTTTTACAAAACTTCAATGTTTAGTATTCATTGAAGTTTACAGCCACTTCTAAAGTTTAACCTTTTATGTATTTTTATTAGATTAGTGTCTTTCAATATTCAAACTACTAACTCCAGTAGTCTATTAAATTTGAGATATTGAGATATCTTTAGAATTTAATTTTTCCGGAGTCATATAGACTTCTCAAATACTATACATTTATTTCATAATTTTGAACCCTAATATTACTAAAATAATTATAAACGTCCCTATTAAAAATTCTATTTTCTCTTTTTTATTTGTTTTTCGCACTTTAATAGTCATCTTCATTTTACTAATGGTGAGAAAGTAATATTTTATTCAAAGAATATGACTTCATATTAAATCAAACCTCACATTCTTATTAGATTGCAAATTCAATAGTCCTACCAGAATTGAAATCAAAACATTCAAACTATTTTATCGTTTTAACTTCCTCGACCATTTTCACCTCCTTATAATCTATATAAATTATGTTTACCACACGATTCTTTACACTCGAAAAATTAATTTTGTTAAGAAACATTTAGCCATGTAACTTTGTAATAAAAACATTTTCAAATAAATGTACCAAAAACTTTCATGAAATAAAGTATACTTTTCAAATCTATTAATTTTAGAATCATAAAACCAAATGCTATATTACAATATAATTATCACAAATCATCATATATGCCAATTACACAATTTAATATAAAAAATTGTCAATGAAAAATTATGTGCATAAACATTATTACAAAATATGTATAGTATAGAATACTGCATTAAAGTTAACTTATTTACTGTGTTCAGCCTTTTATATCATCGCTTAAAGATCATTCAAGATTTAATGGCAATGATAATTTCATAATATGCATTTTTGATTATTTAACCATGTACAATTTCTAAAACTAAGAGATTATCTTATTGAGGTGGACAAAACGTGGACAGACAACCATGAAATCATTAGAAATTTAATTTCTTGTCCACCTAACCTAACAAAATATTTTTGTTAACATTCTGTTTTATTTTCTAATGTTCTTTGATATTCATATAACTTGATTATCGTTTTAAATTTAGCTTCTTTTATTTTAGTTTTACCTACCTTTAAATCAGTAACTGTTTGACGTGGTACACCTGAGTTTTTTGAAATACTATATGGTGTATTGTTAGTTAATAACTTTTCTATTTCACTTATAATAGTTTCAATCTCATTCATTATTAATCACACTCTCTTTCTATTTATAATTATAATAATCCTAATGCAGTAACTACGTTTAGCAATACATTGTTTTTTTCTAGTTGCCAAACTAGTTAATTCATAAACTAATACCTAATAGTATTGGCGTTTTTTTTATATATTGATAAAATTTCTTGTCTCCATCTATTCTATATTATATTATTTGATAATTTTTTATTTATATTCACATTAAGTTATCCATATTTAATATACTTTAAAATTAGATGACTTAAAAGGCTCACTCCATGATATTTCAAAAATATGGCCTTATTTTAATCTTCAATCATTATTTCTAATTGTTTTTGGTAATTATAGAGTTTTTCCGCTGTTTCTAAAGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP029664|1355185:1361229|1356568_1357153_-|AWQ73456.1|head|DBSCAN-SWA MLFSLFVEKEESQKLTYLKELGEDGEYKYVAKIDSKTSKLCHSLNGKIFKVKDMIPGVNAPPMHPWCRSTTVPHVGNWRDKFFKEREGKYQVEGCFIESGALNNKSDEYGIKRNRHAQIYYNSVRNRDKQIEISKIAKNTNINKNLIQRVYEHIFENKYLLESGFKQFDPDFYMAQSWQRLREGKNIKKMDIIM >CP029664|1355185:1361229|1355656_1355773_-|AWQ74323.1|DBSCAN-SWA MSKFCAKYFTHINIINDSHIEKLLKKLYSINMIKYKVR >CP029664|1355185:1361229|1355185_1355320_-|AWQ74928.1|DBSCAN-SWA MIPGVNAPPMHPWCRSTTVPHVGNWRDKFFKEREGKYQVEVKEA >CP029664|1355185:1361229|1359618_1359825_-|AWQ75229.1|DBSCAN-SWA MNEIETIISEIEKLLTNNTPYSISKNSGVPRQTVTDLKVGKTKIKEAKFKTIIKLYEYQRTLENKTEC >CP029664|1355185:1361229|1356199_1356448_-|AWQ73782.1|DBSCAN-SWA MLILKIKEINDKSVTYKYFPNNDENIKPGIIQMDIDSLEVINAEKSSLEKNTRDNYFIHAIDRIYINTSKGLFPESELVAWG >CP029664|1355185:1361229|1355522_1355648_-|AWQ73936.1|DBSCAN-SWA MLDSQLDGNVTAKELSESFKELVEEFESIEKAKKNSNSKDK >CP029664|1355185:1361229|1361031_1361229_-|AWQ74703.1|DBSCAN-SWA MNCYDEIFNTIKELIENKEISSYQINKDTGISYGNINAMRRRERRIENLSLKNAKILYEYAKKVL >CP029664|1355185:1361229|1360118_1360331_-|AWQ75354.1|DBSCAN-SWA MNQFKEIYNTIEKLLNDKSISNYRINQDTDVSYGGISELRSGKRKVNNLTLETAEKLYNYQKQLEIMIED >CP029664|1355185:1361229|1357198_1357450_-|AWQ74618.1|DBSCAN-SWA MLTLIKLKEDEQVIIYEYIPEDDISNGKGSVTFNKKDAEVIDFSLSEIENEEYFMLYRNKSFSVVRDFIEKQEFPENYKIAWY >CP029664|1355185:1361229|1358194_1358380_-|AWQ75524.1|DBSCAN-SWA MSEYKKKIIELIESNLTGYEISKKTGVSQYVLSQLRQGKREVDNLTLNTTEKLYEYANKVL |
10 | Staphylococcus_phage(66.67%) | head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1617895 : 1626368
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP029664|1617895:1626368|DBSCAN-SWA CTTATTTTACAATTTTAGCAATAACACTTGGATATAACTCATATTCCAATTTTTTTACTTTCTCTTCTAATTGTTCTTTTGAATCGTCCGGTCTAATATCACATTTTCTCTGTTCAATAATTTCTCCCGTATCCATACCACTATCAACATAATGTACTGTCGAACCAGTAATAGTATCGCCACTATGATATGCTTGGCCTATTGCGTCAATCCCCTTATATTTCGGCAATAGAGATGGATGTATATTCAATATTTTACCTTCAAATGAAGCTAATAAGTCTGGACCAATTAGACGCATGTAGCCAGCTAGAATAATCCACTCTACCTTATCTTCATTTAATAATGTTACTAAATGTTGTTCATACGCTGCTTTTGAATCAAATTGTTTTGGTTCATTAATATAAACAGGAATATCGTGCTTTTTTGCTCTATCTATACAAAACGCATTTTGATGATCCGTATATAGCGCCGTAACTTCAATATTTTCAAGTTTTCCTGATTCAACATGCTCAACTATATTTTCAAAGTTACTTCCTGAACCTGATGCAAAAATCGCAATTTTAACCATTGTTATACCCCCAACAATTCAATTGCAGTTGACTCATTTTTCACAATATGACCAATTTGATAGGCTTCCACATTTTGTTCTGCTAAAATCTTCAAAGCGCGTGATACATCTTTTTCATCAACGATAACCGTATAGCCAATACCCATATTAAAAATGTTATACATTTCATTTGTGTCTATATTGCCTTGTTGTTGTAACCAATCAAATATTTTTGGTGTTGGAAATGATGTAGTATCAATTCTAGCAGCATATCCGGCTGGCAATGCACGTGGAATATTTTCATAAAAACCTCCACCAGTAATATGATTCATTGCCTTAATAGAAACTTCTTTTTTCAAAGCAAGTACAGGTTTGACATATAATTTAGTTGGTTCTAAAAAGACATCGATAAATGGACGATTATCGAAGTTTGATGCCAAATCAATGCCTGATTCATTAATTAATTTGCGCACTAAACTGTATCCATTTGAATGAATGCCACTTGACGCAAGCCCTATAACAACTTGTCCCTCTTTCACTTCTGAACCATCTACATAGTCATCCTTTTCAACTGCTCCAACAGCAAATCCAGCTACATCATATTCGCCTTCGTGATACATTTCACCCATTTCAGCAGTCTCTCCACCGATAAGTGCAGTATTCGTTTCAACACATGCATCACTAATACCTTTAACAATTTGTTCAATAACTTCAGGAACAACTTTGTTTGTAGCAATGTAATCTAAAAAATATAATGGTTCTGCACCTGTCGTTAAAATATCATTAACACACATTGCGACTGCATCGATACCTATCGAATCATGTTTACCATAGTCGATAGCTAGTTTTAATTTCGTACCTACTCCGTCTGTTCCAGAAACTAAAACTGGCGCTGTCATATTTAATTGTGATAAATCAAATGTAGCACCGAATCCACCTAAACCACCGATAACTTCTTTACGCATCGTACGTTTAACATGACTAGACATTCTTTCTACAGCTTCATAACCAGCATGAATATTTACACCAGATTGTTCATATGCTTTAGACATTTAAATTTCCCTCGCTATCAAAAAAGTGTTTGTTTTTAGAAATATATTGCTTTTGTCGATGACTTAAATGCGCTTTATAATTTGCTTCATAATCATATAACCCTGCAGGATAATCTCCAGTGAAACTTTCTACACATAAGCCACTATATGGCGCGTCATAATCTAAACCAATTGATTCAATTAACCCATCTACAGATAGATATGCTAATGAATCAGCGCCAATATAATCTTTAATTTCTTCAGGTGATTTGCTTGCAGAAATTAATTCTGCCGTAGTTGAAACATCGATTCCGTAAAAACTTGGAAACATAAATTCCGGTGATGCTATACGCACATGCACTTTATTTGCACCAGAATCTTTTAACATTTTCACAATGCGTCGAATTGTCGTACCGCGAACAATGGAATCATCAACAAGAATGATATTTTTCCCATCTACTATATCTTTTACCGCAGATAACTTCACTCTCACACCTTGCTCACGTAATTCTTGAGTTGGTTGAATAAATGTTCTTGCAACATATTGATTTTTAACTAGTCCCATTTCATATGGCAAACCTATTTCTTCAGCATAACCACTCGCAGCTGATAGCGATGAATTGGGTACACCGATGACCATATCAGCATTTACAGGGCTTTCTTGGGCTAATTTTTTACCAGAAGCTTTACGTACTGCATGGACATTTTTACCAGCTATTGTTGAGTCTGGTCTAGCAAAATAAATATATTCCATCGCAGAAATTGCAGTTGTCGTATGATGTGTATAAGATTTAACTGTAATACCTTTATCGTTAATCACGACATATTCACCTGCATGAATATCTTGAACAAATTCTGCACCTAACACATCTATTGCACATGTTTCACTTGCAAGGATGTATGTCCCATCTTTCATTTTACCTACAACAAGTGGTCTGATAGCATTTGGATCTACTGCGCCATATAACGCATCTTTAGTTAAAATCGCAAATGTAAAACCGCCTTTAACTTTTCGCAAACTTTCTTTCAACGCTTCCTCAAAAGTAGGAGCTTTACTTCGACGTATCAAATGCATAATGACTTCAGTATCAGAAGACGAATGGAAGATAGCACCTTGTTTTTCTAAATTCTGACGCAATGATTTAGCATTAATGAGGTTACCATTATGACAAATACCTACACTCATATCATAAAAGTGATACAGAAACGGTTGAATATTTTCAATACCTTTATTACCTGAAGTAGCATAACGGACGTGACCAATTGCATGTTGATATCCTTTTAATCGTTCCATTTGATCATCTTTAATCGCTTCAGTTAGTAAGCCTAATCCTCGCTCGCCTTTTAATTCATTTTGATCAGAAACAACTATACCTGCACCTTCTTGACCACGATGTTGCAAACTATGAAGTCCCATATATGTTAGTTGCGCTGCTTCAGGATGATTCCAAATACCAAACACGCCACATTCTTCGTTTAATCCTGAGTAGTTAAACATTGAGCAATTGCCCCTTCCCATATTTGTTTAATATCTGAAACATTTTCACTAATCTCTGTATATGGTGTTGTTACCTTGAAATTATCACTATCTGTTAAAAGTCCAATTTCTATTGCATTATCAATATTTAAAGTTTTACCTGATTTAACAGAAACAACATATCGGCCTTGCGTCTCACTAAACAATTGTGCATTTGTTATATCTATTGAAGATTTTAATCCTAAACCGTAATGCGCACTTAGTTTAGCTAAGGTAATCAGTAAGCCACCTTTACCAACTGTTTGAACATGTGATAATAGTCCTTCACGAATAGCGGTCTTGATTGATTCACCTTTTTCAACTTCTGAACTCAAATCTAATGACTCAAATTCATGATTAACTTTGCCATAAATTAACTTTTCAAGTTGACTACCACCAAAGTCGTCCTTAGTATCACCGATTAAATATAATTTATCTCCAACTTGAGGTTCAAAATCATTTAAATAATTTACATTTTCAATCAAACCTACCATTCCAACAACTGGTGTTGGGAAAATAGAAGTACCTTTCGTTTCGTTATATAAAGATACATTACCAGAAACTACTGGTGTCTTAAGAATGTCGCATGCTTCTGCCATACCTTTCGTTGAATCTATCAACTGTTGATAGATTTCTTTCTTTTCAGGAGAACCATAATTTAAACAATCTGTCATTGCTAATGGTGTTGCACCCACGGCAATTAAATTTCGATAAGCTTCAGCTACTACCATCTTTCCACCTTCATATGGATTGTTATATACATAACGCGCTTCACCATCAATTGTTGAAGCAATTGCCTTATTTGTGCCTTCCACACGTACTACCGATGCTTGAAGTCCTGGCTTAATTATCGTATTGGCACCAACTTGTTGGTCGTATTGATCATATAAATAGTGTTTAGATGCTATAGTCGGATGCTTAAGTAATTTAAAGAAAGTATCTTTAACATCGATGTGTGTATAATCATTTTTAGAAGTATTATAATCTTTTTCTTCTCCTTCTAAAATATATACAGGTGCTTCATCAGCTAGTGGTTCAACTGGAATGTCAGCATAAACTTCGTCATCATATGTTAAAACAAAACGATTTGTATCTGTAACTTCACCTATAACAGCACTATCCAATTCGTGCTTATCAAATAAATCTAAGAATTTTTGTTCAGTACCTTTTTCAACAACTAGTAACATACGTTCTTGAGTTTCTGAAAGCATCATTTCATAAGGAGAAATACCTGGCTCACGTGTTGGCACTTGTTCTAATCTCAAATGTAACCCACTACCACCTTTTGCCGCCATTTCAGACGATGAAGATGTTAAACCAGCAGCACCCATATCTTGAATACCAACTAATTCATCAAATGTAATTGCTTCAAGTGTTGCTTCCATTAATTTTTTACCTACAAATGGATCACCGATTTGTACAGAAGGTCGTTTACTTTCGCTTTCTTCCGTCAATTCTTCAGATGCAAAAGTAGCACCATGAATACCATCTCGACCAGTTTTCAAACCAACATAAATGACCGAATTACCTACACCTTTTGCTGTGCCTTTTTGAATCATGTCGTGATTGATAACACCAACACACATTGCATTAACAAGTGGATTGCCATCATAACGTTCATCAAATTCGATTTCACCAGCAGTTGTTGGAATACCAATGCAGTTACCATAACCTCCGATACCCTTTACAACACCTTTAAGTAATCTTTGGTTTTGTTTATTATCTAATTCTCCAAATCTAAGACTGTTTAACAAATTAATAGGTCTAGCCCCAATAGAGACAATGTCACGAATGATTCCACCAACGCCTGTAGCAGCCCCTTGATATGGTTCAATTGCTGATGGATGATTGTGAGACTCTACTTTAAATACTACGGCTTGATTATCACCTATATCGACTACCCCTGCACCTTCACCAGGCCCCATAAGCACATGGTCACCTGACGTAGGAAATTGCTTTAAAAACGGTTTAGAATGTTTATAAGAGCAATGTTCACTCCACATAACAGAAAAGATACCTGTTTCTGTAAAGTTAGGTTGTCTGCCTAAAATATCGCAAACTTTTTCATATTCTTGATCACTTAATCCCATATCTTGATATACTTTTTCAAGTTTAATTTCTTCAACGCTTGGTTCGATAAATTTAGACATGTTGTTCCCTCCAACTTTTTACCATCGCTTCAAATAATTTCACACCACTATCAGTACCTAACAACGTTTCTAAAGCTCTTTCAGGATGTGGCATCATGCCACATACATTGCCTTTTTCGTTAACAATTCCTGCAATATCATCATATGAACCGTTCGGATTATTCACATATTTCAGAATAATTTGATTGTTAGCTTTTAATTGTTGATATATTTCATCAGTACAATAATAATGACCTTCACCGTGAGCTACAGGATATATAACTTTTTCACCTTGTTCATAAAGATTTGTAAATGCCGTTTGATTATTCACTATTTCTAACTCTTCATTTCTACTAATAAATAAATGTGAATCGTTATGCAATAATGCACCAGGTAATAAGCCTATTTCAGTTAAAATTTGAAACCCATTACAAACACCTAATACTGGCTTACCTTCAGCTGCAAGACGTTTAACTTCCGAAATAATCGGCGCTACACTAGCCATTGCCCCAGATCTTAAGTAATCCCCGAATGAAAATCCACCAGGAATAAGTACGCCATCAAATCCACTTAGTGATGTTTCTCTATAATCTACATATTCCGCTTCAACACCACTTTTAATAGCAGCATTAAACATGTCTCTATCACAATTCGAACCTGGAAAAACAAGAACCGCAAATTTCATTTTATGCATTCTCCTTTTCATCATCTAACACTTTATAGCTATATTCTTCAATCACTGTATTTGCAAACAATTTTTCACTTAGAGTTGTAATAATGTTGTGTACCTTTTCATCACTAACCTCATCCACTGTCATATATAATACTTTTCCTACACGAATATCATTCACTTGTGCATAACCTAAGTCATGTACAGCTCGAGTAAGCGTTTGTCCTTGCGTATCTAATACTTGTGGTTGTAATGTGATATGTAGTTCAATTGTTTTCATTATTTTAAATCCTCCAATTTGTTTAAAAATATTTGATATGTTTCAATCAGTGATCCAGTGTTATTTCTATATACATCTTTATCAAAGTTTGCATTGGTAGCTTTATCCCAAATTCGACATGTATCTGGAGATATTTCATCCGCTAACAAAATTTGACCAGTCTCAGTCTTTCCAAATTCGATTTTAAAATCTACTAATTTTAAATTCATAGCATCCATTAATTGTTTCAACACATTATTAATCTTTAATGCTTTGGATTTTAGTATTTCAATATCTTCATCTGATGCTATATTGAGCAATTTAACATGGTCATCCGTTATCAACGGATCATTTAACGCATCATTTTTATAGAAAAATTCTACAAGTGGTTCTCTAAAAACTTCACCATTTTCAAAACCTAAACGCTTTGTAATAGATCCACTAGCAATATTACGAACAACTACTTCTAATGGAATTATTTTCACAGGCTTAACTAATTGTTCTGTTTCAGATAATTGTTTAATAAAGTGACTTTCTATTCCATTTTCTTGTAAATATTTAAATATAATAGAAGTAATTTGATTATTTAATCGCCCCTTACCTGCCATTGTGTCTTTCTTAGCCCCGTTTCCAGCAGTAACTTCATCTTTATATTCAACTCTTAATTCATTTTCTTGATTTGTTGAGAAAATGCGCTTCGCTTTTCCTTCATATAATAATGTCATGCTTTAATTACTCCCCTCAAATTTAGCGTACATATCTTGTTCAGTTTGGTTTACATCATTCGTTAGTACAGTCATATGCCCCATTTTTCTGCTATCTTTACGCTCAGACTTACCATAAATATGTAAGTGCCACTCTGGATGTTCATTAAATTCATTTTCCAATAAATCTAAATCTTTACCTAGTAAGTTCATCATGACTGCTGGCTTTAATAATTCAATTGAATTTGGTAATGATTGTCCGGTAACTGCTAAAATATGAGTATCAAATTGTGAATAATCACATGCTTCAATTGAATAATGTCCGGAATTGTGAGGCCTTGGTGCTATCTCGTTCACATACAATTGGTTGTTACTATCTATAAAAAATTCAACTGTAAATGTTCCAATGAAATGAATCGATTGGATAATTTTATTAACTTGCTCTTTCGCCTCAGCTGTTTTATCTATTCTCGCTGGAACAATTGTTTTGAAAAGTATTTGATTTCTATGCTCATTTTCTTGTAATGGGAAAAAAGTGATTTGATTGTTGTTTCCTCTTGTAACAGTAAGAGATACTTCTTTCTTGATATTCAAATATTTTTCAGCTACGCATTCACTAGTTTCAATTAATTTAAAACCTTCTTGTAAGTCTTTTTCGTTGTTAATTAAAACTTGACCTTTGCCATCGTAGCCACCAAATCTAGTTTTTACAATAAAAGGATATCCTAATGTTTCAATTGCTTTGTCAATATCTGTAGATTCTTTTACTGAAATGAACGGGACAACTTTGGTACCAGCACTTTTTAATGTTTCTTTTTCAGTTAAGCGATCTTGTAATAACTGTATAGCTTGGTAACCTTGCGGAATATTGTACTTTTCACATAATAGTTTTAATTGTTGGGCTGAAATGTTTTCAAATTCATAAGTAATCACATCACATTTTTGTCCTAATTGATTGAGTGCCTTTTCATCGTCATACTTGGCTTGTATAAATTCGTGTGCAACGTATCTACATGGACAATCTTCAGAAGGATCCAATACAACCACTTTATAACCCATTTTTTGAGCTGATTGTGCCATCATCTTTCCAAGCTGACCACCACCAATAATGCCAATAGTCGCACCAAACTTTAATTTATTGAAGTTCATTTTGCATGTCCTCCACTTTTTGAATTAACGAAGATTCATACTGATTTAGTTTTTCAACTAAAGAAGGATTTTGAATACTTAACATTCTTGCTGCAAGTATACCTGCGTTTTTAGCACCTGCTGCACCAATTGCAGTCGTTGCAACCGGAATACCTCCTGGCATTTGAACAATTGATAATAAAGAATCTATACCCTTTAAACTTTTTGTTTCAATCGGCACTCCAATAACTGGTAGCGTCGTTAATGATGCAACCATACCTGGTAAATGTGCCGCACCGCCAGCGCCTGCAATGATAATGTTTATACCTCTTTCTCTCGCTTCAGAAGCAAATTGAACCATCATTTTTGGCGTACGATGTGCGGATACTACTTGTTTTTCGTACGGAATTTCAAAATAATCCAACATGTTACAACTCTCTTGCATAATTTTCCAATCGGAAGAACTGCCCATAATGACTGCTACTTTCAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP029664|1617895:1626368|1624066_1624771_-|AWQ74281.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIASDEDIEILKSKALKINNVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >CP029664|1617895:1626368|1623130_1623802_-|AWQ75822.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >CP029664|1617895:1626368|1623803_1624067_-|AWQ73597.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >CP029664|1617895:1626368|1618464_1619493_-|AWQ75018.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDVSRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >CP029664|1617895:1626368|1619485_1620970_-|AWQ74056.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >CP029664|1617895:1626368|1620948_1623138_-|AWQ75591.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGDHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >CP029664|1617895:1626368|1617895_1618462_-|AWQ74500.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRKCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >CP029664|1617895:1626368|1624774_1625899_-|AWQ75308.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVVVLDPSEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITFFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >CP029664|1617895:1626368|1625885_1626368_-|AWQ74266.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGINIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1790684 : 1806512
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP029664|1790684:1806512|DBSCAN-SWA 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21 | Staphylococcus_phage(64.71%) | terminase,capsid,integrase | attL 1790005:1790021|attR 1803960:1803976 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1885164 : 1899895
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP029664|1885164:1899895|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP029664|1885164:1899895|1889633_1891739_-|AWQ75993.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >CP029664|1885164:1899895|1896402_1897320_+|AWQ75259.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >CP029664|1885164:1899895|1892900_1893767_+|AWQ73527.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >CP029664|1885164:1899895|1897943_1898486_-|AWQ75733.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLRESGFFRHLKVMPYAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >CP029664|1885164:1899895|1888544_1889516_-|AWQ75107.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >CP029664|1885164:1899895|1885164_1885926_-|AWQ73872.1|DBSCAN-SWA MIQVENLTKTINNQMILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFENGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMNIQIEHIRNQRICLYFKD >CP029664|1885164:1899895|1886865_1887837_-|AWQ73859.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >CP029664|1885164:1899895|1893786_1894287_+|AWQ73599.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >CP029664|1885164:1899895|1894627_1896133_+|AWQ73525.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAISPLIIKAMKGIR >CP029664|1885164:1899895|1885922_1886879_-|AWQ75652.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >CP029664|1885164:1899895|1891701_1892100_-|AWQ75372.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >CP029664|1885164:1899895|1898836_1899895_-|AWQ75877.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEYFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE |
12 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1911867 : 1919687
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP029664|1911867:1919687|DBSCAN-SWA ATTATAACATCTCCAAAATCTTGGTTTTTGCGTAAAATTCATTCACTTCATCTTTTGGCTTAGAATCAATTGTAATACCTGCTCCGACTCCATAAATCGCTTGTCCATATTTATACTCAATAGTGCGAATCGGAATATTAAAAATCATTTTATCATCTTCAGTTGGAAGTAATAGTCCAATTGCTCCGCAGTATATACCACGAGGTGAACTTTCTAATTGTTTAATATATTTCATTGTATTCAGTTTCGGTGCACCTGTAATCGAACCACAAGGAAATAACGATGTTAAAATTTGAGTTAAGTCTGTATTATTTTTTAAAGTTCCACTTACCATCGAAGTCATTTGAAATACAGTTTTATATGCCTCAATAAAAAATAGTTTATACACCTTAATTGAGCCACTCTGTGATATTCTCCCTATATCGTTTCTTAGTAAATCAACAATCATGACATTTTCTGCACGATCTTTCGAAGAAGTTTGCAATGTTTTATAATACTGTTGATCTTCAGCTTCCGTTTTACCTCTAGGCATTGTCCCTTTCATCGGTTTGCTTATGATAACGTTATCGACATTGTTAAATTGTCCTTTTTGAAAAAATAATTCTGGTGAGATAGACGCTACTTGGATTTCATCAGTTTGTAATAACGCAGTATAATTACCATTACTAAATTGAGTTAATCGTTCATATAAAGTACTAATAGGATAATAAATGTTATCCGTTAAGCGCGCCGTATAGTTCACTTGATACGTTTCGCCTTCAACAATTGCTTGTTGGACACGTTTAATATTAGTCATCATAACCTCAGAAGATTCAACAAATGAAAAATGATACTTTGATACATAAGAAGTTTGATGTTCATATGTTGAATTTATGCTTTCCGCTTTTTCAAAACTATAAGCTGCTGCATAAATATCATCTTTAGCTAATGAATGTGTACACATAGCATGATTAAAATACTTTGCCGCTTCGTAACTTAAATATAACGAGACATATCTACCTTGTCGTTGCTGCGCTTGTGCAAAGTGTATCACTTCTCCCACATCAGCCAACTTAGTAGCAACATACTTCTTTATAAATCCCTTTAATTGAATATGGTATTGCTTATATTCATTTTCAGTTAAATAGTAGCGATAATTATATTCTATTCTCACAGTAATCACCTACCTTCGATAAAAATAATTCAACTTGTCGATAACCGTATTCACTCAAAATAGATTCAGGATGATATTGCACACCAAAAACCGGAAATCTAATATGCTCAAATGCCATAATAATCGCTTCATCGTTTTTTGCTGTAATCTTTAAGCAATTTGGAAAAGTCGCTCCGTCAGCAATTAATGAATGATAACGCATTACATTGAAATTTTGAGGCAGTCCTTGAAAAATACCTTCATTGGTATGGCGTAACTGTGTAGTATGTCCGTGTACAGGATGATAGCCGTGAATGATATTTCCACCAAAATAAGACACGATACATTGAAATCCTAAACATACACCTAGTATAGGTACACGCTGATAAAATTGTTCTAACACTTCATTCAAGATAGGATAATCATCCGGATTACCCGGCCCAGGCGAAATAACAATTGCTTTTGGCTTCATATTAATGACGTCTTCTATCAGCAGATTATCAATACCAACAACTTGAACTGTTAGTTTCGTTTGAGTCTTAATATAGTCTATTAAATTATATGTAAATGAATCATTATTATCTATGACTAGAATCATTGTATACTCCGTTCTAAATGTGTTTTATTTTTATAATATGTATTGGATGTAGCTAAAACTTTAAAAGCATTGTCATTATCCTGACCTTGATTTTAACTAATATATGGTATATTCTATTCATCGTACATAAATGAATATCAGAGGTTCCTAGCTGAAACCCTCTATAAAAAACTAGACATTGAAATTTCAAACATTCGTTGGTAAACCTTTAATATATATTATAGGAGCAACCCATTTCTTTCGTCTATCTTTTATGGAGATAGGCTTTTTTTATTTTATAAATTAAAAACGGGCTTATCAATGCCATTAACCTCTTTATTAATATTATTAATGATAGGAGCAATTACAAAATGGAAAGTGTATTAAATAATGAAAAAGCCATCGTTGTCTTTAGTGGTGGTCAAGACAGTACAACATGTCTCTTTTATGCAAAAAAACATTTCAAAGAAGTTGAACTCGTAACGTTTAATTATGGCCAAAGACATGATACTGAAATTGAAGTCGCAAAACAAATTGCACAAGATCAAGGAATGAAACATCACGTTTTAGATATGTCATTATTATCACAACTTACTCCAAACGCATTAACACAACATGATATGGAAATTACTAATAATGAAGATGGTATACCTAATACATTTGTTCCAGCTAGAAATTTACTTTTCTTGTCGTTTGCAGGCGCTCTAGCTTATCAAATTGGGGCTAAGCATATTATTACAGGCGTATGTGAAACAGACTTTTCAGGCTACCCAGACTGTCGCGATAGTTTTATAAAATCAATGAACGTAACATTAAGCCTAGCTATGGACAAAGATTTTGTCATTCATACTCCTTTAATGTGGTTAAACAAAGCAGAAACGTGGAAATTAAGTGATGAACTCGAAGTTTTAGATTATATTCGTACAAAAACATTAACATGCTATAACGGTATCATTGGGGATGGCTGTGGTGAATGTCCAGCTTGTCATTTACGTCAACGTGGACTAAATCAATATCTTGAAAGTAAAGGAGCGCTTTAAAATGTTACAACAAATCTATCCTAGTACAACGCATCCATATCAATTCGAATTAAATAAAGATTTTAATTTTTCGGCTGCACATCACATTCCATGTGAAGAAGCAGGTATTTGTCAAAATGTCCATGGTCATACTTACTTTGTTAATTTAACAATTGTCGGTGATAAACTAGATGACACTGGCTTCTTAGTGAACTTTAGCCATTTGAAAAAGATGATACACGGTAAATTTGACCATCAACTGTTAAATAACTTACCTGCTTTTAAAAACAAAATCCCTTCAACTGAAATCGTAGCGGAAACAATTTATCAAATTGTTAAAGAAAATTTGGCATCGCTCGAACACCAACCAAAATGTATTCAAGTATTTGTAAGAGAAACACCAACAAGTTATGTCGTATTTAGACCAAAGGAACAGGTGTAACTAATGGCTAAAATTCCTGTACTCGAAATATTCGGTCCAACCATTCAGGGTGAAGGTCGAGTAATCGGTAGAAAAACGATGTTTGTGAGAACAGCTGGATGTGATTATCGCTGTAGCTGGTGTGATTCTGCATTTACTTGGGATGGTAGTGCTAAAGGCGATATAAAACTCATGACCGCTGAAGAAATTTATGATGAATTAAAACGAATTGGTGGCGATTTATTTAACCACGTTACAATTTCTGGTGGTAACCCAGCATTAATTAAAGGTATCCAAGAGTTAGTTGACTTATTTCAAGATAAAGGTATTTTCAGCGCACTGGAGACACAAGGCAGTAAATTCCAACCTTGGATGACACAAATTGATGATTTAACGATTAGTCCAAAACCACCAAGTTCAACTATGACACCTGATTTAAAAAAGTTAGATGAAGTGATTACACAATGCGTACCTTCATCATTAAACTTAAAAGTAGTTGTATTCGACGATAAAGATTATGATTTTGCCAAAATGATACACCACCGTTATCCAGATATTCCCTTCTATTTACAAGTTGGTAACCCATATTTATCAGACAGCGTAGATAATCATACCGAAAAGTTGTTAGAACGCTACGAGCAGTTGGTGGATTTAGTTATGCAAAGTAATGATATGAATCACGTTTATGTGTTACCACAACTTCATACATTACTTTGGAGCAATAAAAAAGGTGTATAAAGGATAACTTATTTTACTTTTTGCAAGTCATATCTAATGAATAACAATATATTAATTGATATAATAGTTGATTGAAGTATAACGAACAGGAGTCCATCATGATTGTATATATATTAATTAATATTGCTATCGTCGTACTTATAACTGGATTCAATTTATATAGGCATCAAATGCAACATTTATCATTAAGTGCAATGTTGTTATCTATTACGATAAACGCCTTTATAAATACATTCATAATTGATAAATATAACTTTATTACTCTGTGTACTATAACGATGTTTATCATTTGGACGATACTACAGTTTTACATTGATAAAAAATTAAAACCTGTATACATTACAGACCAAAAATTTATTGCTATCATATTAACGATTGTTGTCAGTTTAACGCAACGTGTTACCGACTTTTCAAGTACACAATCAATATATATGTCTATTCCATTTTTAGCCCCTGCCATTTTCATCATTGGTGGTATTATGTTGTTTATTTCAACATTTAATAGCTTAGATGAAACTGCTGAAAATAATAACAAAATAAAGAAACTAATGATTAAAGGACTTATCATTATTAACATTTCATTTATCGTTATGATGGTTTTAACACCATATTGGTACTTGTATTTAATCGTCTATCTTATTTTCTTGTTGTTTTTATTGTGGCAAAAGGTTTATAAATTTTAATACCAAAACTATTAAACACTTCTGATATTCTTAGTTCAAAATATCAGAAGTGTTTTATAGTGTTATCTAGTTCAGATAAATATTTCCTTACTTAAAAAAACGCCCTCCTCTTATTTTGACCCCTATTTATTTAAATCAGACAATTATTTTCATTTTCAAATTATTCTTTCTTCAATATTAGTTAAGCGATATTTAAACGAAGTTAAGAATTAGTTAATGGCATATTATTTGCCTTCATTTTAAACTTAACTTATCAAATTGAAGAAATGAGGAGTTAGCATGAATACAAAATATTTTTTAGCAGCTGGTGCTGTTATCACAACATTAGCTTTAGGTGCTTGTGGTAATTCTAATTCACAAGATCAAGGTAACAAAACTGAACAAAAAACAAAGTCAGAAGATAGCAATGTTAAAACTGATAAAACAAAAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP029664|1911867:1919687|1918631_1919687_+|AWQ74877.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCNEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENEDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >CP029664|1911867:1919687|1914616_1915036_+|AWQ75769.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >CP029664|1911867:1919687|1916715_1917156_+|AWQ73869.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAAGAVITTLALGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >CP029664|1911867:1919687|1913946_1914615_+|AWQ75432.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >CP029664|1911867:1919687|1917497_1917971_+|AWQ74096.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >CP029664|1911867:1919687|1911867_1913019_-|AWQ75690.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHAMCTHSLAKDDIYAAAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKYHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKNNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >CP029664|1911867:1919687|1915851_1916436_+|AWQ75880.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >CP029664|1911867:1919687|1913002_1913596_-|AWQ74345.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHIRFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >CP029664|1911867:1919687|1917945_1918632_+|AWQ73501.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >CP029664|1911867:1919687|1915039_1915753_+|AWQ74623.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV |
10 | Pandoravirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
2625064 : 2668579
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >CP029664|2625064:2668579|DBSCAN-SWA 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>CP029664|2625064:2668579|2652077_2652407_+|AWQ75803.1|DBSCAN-SWA MARTYNVIKYVIKKNKDDLKIHGLRLYEFNIKDEKAINISQPIFVNRATLIEKIQNGEAFTHAFRVNHNTYYAGQLISLSLNKNGYINNNFEASRDIIRNIEVSILDYE >CP029664|2625064:2668579|2646866_2647871_-|AWQ74341.1|DBSCAN-SWA MIIDPICDLSSYIRVADEESLTITHAAETHIHANFVSGIRDVAIKLNASIYVSGESDDMLGYKNMPNHTHFVQHNDDIYVGNIKLKVLHTPGHTPESISFLLTDEGAGAQVPMGLFSGDFIFVGDIGRPDLLEKAVKVEGLSEIGAKQMFKSIESIKDLPDYIQIWPGHGAGSPCGKSLGAIPTSTLGYEKQTNWAFSENNEATFIDKLISDQPAPPHHFAQMKKINQFGMNLYQPYTVYPATSTNRLTFDLRSKEAYHGGHIEGTINIPYDKNFINQIGWYLNYNQEINLIGDYHLVSKATHNILYNLLDMIMCLDISYHKLKFKHNLFIVKT >CP029664|2625064:2668579|2643030_2644080_+|AWQ74188.1|DBSCAN-SWA MIPTLEEIIDKYGNLVDYLKFDVTVEVYEDLLLLRSLSDLNEHQKMDRVSFIKKHLNSNFDYLLDDTEFRSINKIYSNLNIMTHINSQNNNFKRNPFINEEQLKSLLAIKKVDAHMSYDSNITSKALAEINKTQKRLVTKIDTLYNQSKKENEYVRLGEKISYTKLENHWKYLYNEIQFYNLNNQLISYVALEQEYAWAFLNELFYLIELYLKAFKGQKKTDYEFGKKLNEFIQSYVIILLIDIRLPVVRLYIIRDIVDTCEGEKDNYKRITLIEESIKKYRYVKDQIKRFKNGLEESLLNATLSIEQNMLKVKIDYYKAYCFPREKTKHNNIEYNVSLFFKALDALKK >CP029664|2625064:2668579|2636311_2636623_-|AWQ75647.1|DBSCAN-SWA MKINRYITRGINESIPLDLQILLWHMVEKKDNQPHTDYLHIFKLQEDENILSITHEQEQPTYKLEYHYTNYEKNQNALPKKVYVIREDDVDAFYYVMLLPEEY >CP029664|2625064:2668579|2654242_2654425_+|AWQ74297.1|DBSCAN-SWA MIHFNMNSTKVFLYNSHYWGQSKIKIDNFFNKIDTLILKQGKKIELLKQRKQGLLQKMFV >CP029664|2625064:2668579|2652483_2652843_-|AWQ74637.1|DBSCAN-SWA MENTNSNMHKNDNSYVLSALSYLSIFFAPVILPLFVWILADEPTSEHGKKAFINHIMTWVSFFIGRLAFIFSKEVFDKPLDHQLLIFSILLIITIIFFLIALILYILNINRGIKILLKK >CP029664|2625064:2668579|2667904_2668579_+|AWQ75104.1|transposase|DBSCAN-SWA MNYFRYKQFNKDVITVAVGYYLRYTLSYRDISEILRERGVNVHHSTVYRWVQEYAPILYQIWKKKHKKAYYKWRIDETYIKIKGKWSYLYRAIDAEGHTLDIWLRKQRDNHSAYAFIKRLIKQFGKPQKVITDQAPSTKVAMAKVIKAFKLKPDCHCTSKYLNNLIEQDHRHIKVRKTRYQSINTAKNTLKGIECIYALYKKNRRSLQIYGFSPCHEISIMLAS >CP029664|2625064:2668579|2658267_2658618_-|AWQ75522.1|DBSCAN-SWA MKTTTQELKQYMTRLFQLSNNETWECETLEEAAENILPKRFINDSPLAHLILETYTYYNNELHELSIYPFLMYSNNQLISIGYLDHFDMDFLYLTDTKNTIIDERHLLKEGGNNHE >CP029664|2625064:2668579|2639231_2640581_-|AWQ74123.1|DBSCAN-SWA MKQVIGYLRQSTMKQQSLAAQKQAIEAIAEKHHIQHINFYSDKQSGRKDNRSGYRQITQLIQQGQCDILCCYRLNRLHRNLKNALKLIKLCQTYHVHILSVHDGYFDMDQAFDRLKLNIFISLAELESDNIGEQVRNGLQEKAKQGRLITTHAPFGYEYHNGTFIINQNESPTVKAVFNYYIKGHGYKKIAQLLEEDNTYINRQPYQVRNIIINPNYCGRVNNQYGQFDNMFPSIVSTSIYEQAQRLRLQKQTKQTPSDNQLKQKIKCPCCNATLTNMTIRKKNHTLRYYVCPKNMNASRFVCDFKGINAQTLEDKVLEVCRDFYQNQRIYTKIKSAIDKRIKRQRNIEKHHTLTQEQLIEKLAQGIIDAETFREQTQSLRQQPQRTTSINGHQIQHIIQNIIQKRFTLNILYPYIETIHITKDKNLIGIYFKNEPLNIVNQTMQSSIA >CP029664|2625064:2668579|2627567_2627933_-|AWQ75160.1|DBSCAN-SWA MRKQRDNHSAYAFIKRLIKQFGKPQKVITDQAPSTKVAMAKVIKAFKLKPDCYCTSKYLNNLIEQDHCHIKIRKTRYQNINTAKNTLKGIECIYALYKKNRRSLQIYGFSPCHEISIMLAS >CP029664|2625064:2668579|2655730_2656858_+|AWQ74591.1|DBSCAN-SWA MKTRAAVLHEMGAKKPYKESKPLKIEYLELDNPSEHEVLIKIHAAGLCHSDLSVINGNRPRPLPMALGHEASGEVIKVGKAVTRVSEGDHVVCTFIPSCGKCIPCKEGRPALCENGAISNEKGEMLEGGMRLSNDEGKVYHHLGISGFAEYSVVSENSIVKIDKKIPFERAAAFGCAIITGIGAVVNTAQIRSGSNVAVVGLGGIGLNAIIGAKLAGANEIIALDINEDKFELAKQFGATATFNSSDKDIDEQIKEYIPGGVEYAFETAGVVPAMKVAYQITKRGGTTVTTGLPNPKDNFSFPQVTLAAEERTIKGSYVGSCVPDRDIPRFVNLYNQGRLNIDSLISEVITLDEINEGFDRLSNGEVGRIIMKMH >CP029664|2625064:2668579|2627995_2628241_-|AWQ74020.1|transposase|DBSCAN-SWA MNYFRYKQFNKDVITVAVGYYLRYALSYRDISEILRERGVNVHHSTVYRWVQEYAPILYQIWKKKHKKLITNGVLMRRTSK >CP029664|2625064:2668579|2637581_2639210_-|AWQ74026.1|DBSCAN-SWA MQQLKTKRVGIYVRVSTEMQSTEGYSIDGQINQIKEYCDFHHFEVKDIYADRGISGKSMNRPELQRMLKDAKEGNIDCVMVYKTNRLARNTSDLLKIVEDLHKQNVEFFSLSERMEVNTSSGKLMLQILASFSEFERNNIVENVFMGQTRRAQEGYYQGNLPLGYDKIPDSKHELMINQHEANIVKYIFECYAKGHGYRKIANALNHKGYVTKKGKPFSISSITYILANPFYIGKIQFAKYKDWSEKRRKGLNDKPVIAEGKHSPIINQDLWDKVQMRKKQVSQKPQVHGKGTNLLTGIIHCPQCGAPMAASNTTNTLKDGTKKRIRYYSCSNFRNKGSKVCSANSVRADVIEDYVMKQILEIVKSDKVIQRVVTHVNQENQVDGAALHHDIAYKQQQYDEVQIKINNLIKTIEDNPDLTSVIRPSIQKYEKQLNDITNQINQLKNQQNEDKTLFDAKEISKLLQHIFHDIKHIEKSRLKALYLSVIDRIDIKKDGNHKKQFYVTLKLNNEIIKQLFNNKQLDEVHLSTSSLFLPQTLYLTI >CP029664|2625064:2668579|2653413_2654223_-|AWQ73992.1|integrase|DBSCAN-SWA MKRASYSVETKYKAVEMKAAGFPTKEIMKELNIRNRTQVKNWWRWYRNGESYRFSQHVGKQYTYGYRKITALINQCYTSPINHKRVQRVMQKHHLNCRVRPKKTTRIGKPYYKTDNLLQRQFKASCPMEVLTTDITYLPFGHSMLYLSSIMDIYNGEIVAYKIDDKQDQRLVNDTLNQIDIPEGCILHSDQGSVYTSYAYYQLCEEKGIIRSMSRKGTPADNAPIESFHSSLKSETFYINNQLNNSNHIVIDIVENTLKTIIIIEFNKN >CP029664|2625064:2668579|2648123_2648495_+|AWQ74411.1|DBSCAN-SWA MKTNILNLDNELENTEYVEGKPYVQYGIKYERNQALRNEAIKIHGTTCKVCGFDFKAKYGDLGEGFIEIHHLKPMFSIKREIKVNPQKDLVPLCSNCHKMIHRNTKKPLTIKELTKIVNYNSK >CP029664|2625064:2668579|2630816_2632823_-|AWQ74791.1|DBSCAN-SWA MKKIKIVPLILIVVVVGFGIYFYASKDKEINNTIDAIEDKNFKQVYKDSSYISKSDNGEVEMTERPIKIYNSLGVKDINIQDRKIKKVSKNKKRVDAQYKIKTNYGNIDRNVQFNFVKEDGMWKLDWDHSVIIPGMQKDQSIHIENLKSERGKILDRNNVELANTGTAYEIGIVPKNVSKKDYKAIAKELSISEDYIKQQMDQNWVQDDTFVPLKTVKKMDEYLSDFAKKFHLTTNETESRNYPLGKATSHLLGYVGPINSEELKQKEYKGYKDDAVIGKKGLEKLYDKKLQHEDGYRVTIVDDNSNTIAHTLIEKKKKDGKDIQLTIDAKVQKSIYNNMKNDYGSGTAIHPQTGELLALVSTPSYDVYPFMYGMSNEEYNKLTEDKKEPLLNKFQITTSPGSTQKILTAMIGLNNKTLDDKTSYKIDGKGWQKDKSWGGYNVTRYEVVNGNIDLKQAIESSDNIFFARVALELGSKKFEKGMKKLGVGEDIPSDYPFYNAQISNKNLDNEILLADSGYGQGEILINPVQILSIYSALENNGNINAPHLLKDTKNKVWKKNIISKENINLLTDGMQQVVNKTHKEDIYRSYANLIGKSGTAELKMKQGETGRQIGWFISYDKDNPNMMMAINVKDVQDKGMASYNAKISGKVYDELYENGNKKYDIDE >CP029664|2625064:2668579|2630342_2630771_+|AWQ74198.1|DBSCAN-SWA MKYDDFIVGETFKTKSLHITEEEIIQFATTFDPQYMHIDKEKAEQSRFKGIIASGMHTLSISFKLWVEEGKYGEEVVAGTQMNNVKFIKPVYPGNTLYVIAEITNKKSIKKENGLVTVSLSTYNENEEIVFKGEVTALINNS >CP029664|2625064:2668579|2635790_2636297_-|AWQ75662.1|DBSCAN-SWA MNTIKSTIHTEAIFSDDEQHRYLLKKTWDEKKAACTVITMYPHLDGVLSLDLTTVLILNQLANSERYGAVYLVNLFSNIRTPENLKHIKNPYDEHTDIHLMKAISESDTVILAYGAYAKRPVVIDRVEQVMEMLKPHKKKVKKLINPVTNEIMHPLNPKARQKWILKS >CP029664|2625064:2668579|2667708_2667861_-|AWQ75305.1|DBSCAN-SWA MQQNLYFAIIIKLIAFVLVFPGLLTLWLAVLSDTGAAILVILNSLRLLKK >CP029664|2625064:2668579|2662510_2663200_-|AWQ74920.1|DBSCAN-SWA MYEENIYIKNSEYEFDNNLKQLASYLNIPVSIVRPYKEDLTLYQYKKGQVIYHSTDQIKFVYFLVNGCILHESSNITGDNYLRLSKDENIFPMNFIFNETPAPYEICTALTDCKILTLPKDLLEYLCRKHNEIFESLFKKLNETIQFQVEYIMALRANSAKERIERILQILCLSIGDDNGEFYELKQIMTVQLISNLSGLNRKTTGEIIRELKIENIIYQDKRNWIIKK >CP029664|2625064:2668579|2660525_2661455_-|AWQ73764.1|DBSCAN-SWA MSKIVVALGGNALGQSPKEQLDLLKSTSKSLVSLIDKGYEIVISHGNGPQVGSINLGLNYAAEHKQGPPFPFPECGAMSQAYIGYQMQESLQNELHSMGIDKQVVTLVTQVQVASDDSAFNNPTKPIGLFYTKEQADKFTKEKGYTFVEDSGRGYRRVVPSPQPISIVELDSIETLITHGTLVIAAGGGGIPVIKENEVYTGVDAVIDKDKTSALLAAHLQSDQLIILTAVDHVYINYGKENQRGLDEVSVDEMKKHISDGQFAKGSMLPKVEAALQFLEKNTKGSVLITSLAGLGDALDGKIGTLIKN >CP029664|2625064:2668579|2644752_2646243_+|AWQ73371.1|DBSCAN-SWA MHRESKYIEYKKSRKGLSNDIWSTYSAFANTEGGTIYLGIEEKKIEDKKVFVSVGVEDPEKMIEDFWNALYGRSKVSQNILSNKDVKIVNIENKACIEIHVPEAPYSKKPIYVDNKKDLVYKRVDDADRIATEEEYKFMIVNSQDDIDTELLDNYDMSDLNHESIENYRKLLLKNTNDERYANMSQLDLMIDLGAYRKDRSSKDKQYKMTTACLLFFGKYNAISDRFPGFQLDYFKKTNYLDTDWKDRISSGDLGNEDLNVYSFFEKVLIKLTDNIEESFSLNDGLTRQNYARDLKVAIREALVNTLMHAYYDTKQSIKIVNCEDFIEFYNPGNMRINKEDFIHGGHSKDRNSILSTLFRRVGYSEKAGSGGPRIFDVVNRHKLKTPEIELTDMDTNVVLWKQDLMKEFEKYPELDKKVIKYIIDYGSISKGEALKMENMTEYQFRNILKKLKDDNLIKKEGEGPATKYVLIESKEADILRTKKVIKSLESFFRNK >CP029664|2625064:2668579|2655420_2655549_-|AWQ75332.1|DBSCAN-SWA MKIKKYIKEILDKIYEDFMNNDAITTLLNNDLQTIINQYLSK >CP029664|2625064:2668579|2626564_2627380_-|AWQ74018.1|DBSCAN-SWA MHYIKFIESKDNTKLYMKVNDIQDAKANIIIAHGVAEHLDRYDEITAYLNEAGFSVIRYDQRGHGRSEGKRAFYSNSNEIVEDLDAIINYVKSNFEGKVYLIGHSMGGYTVTLYGTKHPNTVNGIITSGALTRYNNKLFGNPDRNISPDTYIENNLSEGVCSDLEVMEKYKLDDLNAKQISMGLVFSIMDGVRYLKDNAQQFTDNILILHGKEDGLVSYVDSLQLYQEIGSAHKSLHIYDRLEHEIFNESSYNRTIFNEVIEWLETELTYN |
49 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase,integrase | attL 2627505:2627524|attR 2667845:2667864 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029664.1|AWQ73872.1|1885164_1885926_-|ABC-transporter-family-protein |
1885164_1885926_-
Protein sequences of CP029664.1|AWQ73872.1|1885164_1885926_-|ABC-transporter-family-protein>CP029664.1|AWQ73872.1|1885164_1885926_-|ABC-transporter-family-protein MIQVENLTKTINNQMILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFENGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMNIQIEHIRNQRICLYFKD |
253 aa aa | NA | NA | NA | 1885164-1899895 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 4.4|1745210|26|CP029664|CRT matches to CP029664 position: 1888354-1888379, mismatch: 2 ccgccagcctctgtgttggggccccg CRISPR spacer ccgcctgcttctgtgttggggccccg Protospacer ***** **.***************** 2. spacer 7.4|1851291|26|CP029664|CRISPRCasFinder matches to CP029664 position: 1888379-1888354, mismatch: 1 cggggccccaacacagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacacagaagcaggcgg Protospacer ******************** ***** 3. spacer 7.4|1851291|26|CP029664|CRISPRCasFinder matches to CP029664 position: 1888323-1888298, mismatch: 2 cggggccccaacacagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacatagaagcaggcgg Protospacer *************.****** ***** |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
19250 : 26884
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP029665|19250:26884|DBSCAN-SWA TTTGAAAATAGGTTATGCAAGAGTTTCAACTGGATTACAAAATTTGAATTTACAGGAGGATCGATTAAATACATATGGTTGTGAAAAGATATTTAATGACCATATGAGTGGTTCAAAAAGTAAGCGACCTGGTTTAGATAAAGCAATTGAATTTGCGAGGTCAGGAGATACGATTGTTGTTTGGAGATTAGATAGACTAGGACGGAACATGGAGGATTTAATCACGTTAGTTAATGAACTTAACGAACGAGGTGTGAGTTTTCATAGTTTAGAAGAAAATATAACGATGGATAAATCAAGTTCTACAGGACAATTATTATTTCATTTATTCGCAGCATTTGCAGAGTTTGAACGTAATTTAATTTTAGAGCGATCATCAGCCGGTCGAATTGCAGCACGTGCTAGAGGCCGATATGGAGGTAGACCTGAAAAATTAAATAAACAAGATTTAAACTTACTTAAGACACTTTATGATAATGGTACGCCAATTAAAACAATTGCAGAGCAGTGGCAAGTTTCACGTACAACTATTTATCGTTATCTCAATAAATTAGAGGCAAAAGAGAATAAAAACAAGTAGAGCAACTAATCTAGCTTACTATAATGAATCTACTAAATAATTTTATATATCATTAACATACAAAGACTTTGATTCAATGTCACTCGATGTAAAAGAGACGTTCTGACAGCGTCTAAAATCTCATAATATTTTCCTGTTATGAGATTTTAATAATAACACAAGAAAAAAGCGTACAAATTCGTACGCTTTTTTAATATAATACCTGTTTCACTAATGAACGTTTTAAGTATCTTCATCATTAACTGAAACTACAGTAATAATACTCGTCAACAATATTAGTATAGTTAAAATAGAAAGACTTAGGACTGGCATAACCGAACTAAAATTATATTTGAAATATAAAAGTGCTAATGAAGAGAGAAATGTAAAAATAATAAATACCAAAGACCATTTTTCTAATTTATTCATTGGCTTCACCTCTTTGAACTTTTATATAATCATAGGAGATATTTTTACTACGATTTATAAAAAATAAGAAGATAATCATTATTAAAGAAACGATTAATATAATGTTGAATCCTATAGTATCACCTAATTCGTTTACACCTTTGCCTAATATCGGAGATACAAAGCTTTGTATTAATAATGAAAGAGATGCCCATATAGTAAATGAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATTTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCTGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAAGCTTATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGAAAATGGAGCTATTTATATCGTGCCATTGATGCAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGTTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGCCATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACCGTCATATTAAAGTAAGAAAGACAAGGTATCAAAGTATCAATACAGCAAAGAATACTTTAAAAGGTATTGAGTGTATTTACGCTCTATATAAAAAGAACCGCAGGTCTCTTCAGATCTACGGATTTTCGCCATGCCACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCAGCATTTGTTTTAATATTTGTTCCAAAGAGCCATCATGGCTTTGACAGAGCTCTTCTTCTATGCAAATGCTTTTAATCCGATCCACACGAAAATTCCTATATTCATTTCTTAGCCTGCAAAACCGATTAAGTACCAGTTCTGTTCATAAAACCCCAGTGATATAGGCTCTATCATTCTGCTTTCCGGTTCTTGCCCTCCTGATGCAGGATATTGAATTGATATTACCCTTTTATTGCAGATTGCAGTCTGAATTGCTGCAATAACGTTATCCGCCAATGTATTTTTCTGTCCAGATGTGCTGTACACGTTAATACTGTTCTCCAACTCCTGTGCATAGTTTTTTTCACCATGCTTCAAAATAGATTTGATTTTATACATAGCTGAATCAAAATCCTTTATAAATGATTCATCTCCATGGCAATTTAAAAATTTCCCTGCTGTAATCAATGCACCCACTTCCGCCGCTGTAAACATTACCGGCAGAAGTAGGAAGCCCTCTACAAGAAAATATCCTTTTCCGGCCTCAGATCCAATTGGTATTCCGGCTTCTTCAAGTGTCCGGATATCTCTGTAAACTGTCCTTAAGCTTATATTAAATCGCTGTGCAATTTCTTTGGCAGGAATTATTTTTTTGATTGCAGCTGAATAAGAATAGAGGTTACTCTGTTAATCCTGTTCAAATTTTATTCCTCCTCTGTGACTTCCATAAAAAGTATATCCTATGCGTTCTTAAGCTAGCTGCTGTTAGTGCTTCTCATTGCACCCTGGTTATAAAAGCCATACTCACAAACCTCTTCACCAAAACTCTTTACATCTCTAATATAGAACTCTATCTAGCGAACTTTTAGAAAAGATATAAAACATCAGAGTATGGACAGTTGCGGATGTACTTCAGAAAAGATTAGATGTCTAAAAAGCTTGTAGTTAAAGCTTTTTAGACATCTAAATCTAGGTACTAAAACAATTCATCCAGTAAAATATAATATTTTATTTTCTCCCAATCAGGCTTGATCCCCAGTAAGTCAAAAAATAGCTCGACATACTGTTCTTCCCCGATATCCTCCCTGATCGACCGGACGCAGAAGGCAATGTCATACCACTTGTCCGCCCTGCCGCTTCTCCCAAGATCAATAAAGCCACTTACTTTGCCATCTTTCACAAAGATGTTGCTGTCTCCCAGGTCGCCGTGGGAAAAGACAAGTTCCTCTTCGGGCTTTTCCGTCTTTAAAAAATCATACAGCTCGCGCGGATCTTTAAATGGAGTGTCTTCTTCCCAGTTTTCGCAATCCACATCGGCCAGATCGTTATTCAGTAAGTAATCCAATTCGGCTAAGCGGCTGTCTAAGCTATTCGTATAGGGACAATCCGATATGTCGATGGAGTGAAAGAGCCTGATGCACTCCGCATACAGCTCGATAATCTTTTCAGGGCTTTGTTCATCTTCATACTCTTCCGAGCAAAGGACGCCATCGGCCTCACTCATGAGCAGATTGCTCCAGCCATCATGCCGTTCAAAGTGCAGGACCTTTGGAACAGGCAGCTTTCCTTCCAGCCATAGCATCATGTCCTTTTCCCGTTCCACATCATAGGTGGTCCCTTTATACCGGCTGTCCGTCATTTTTAAATATAGGTTTTCATTTTCTCCCACCAGCTTATATACCTTAGCAGGAGACATTCCTTCCGTATCTTTTACGCAGCGGTATTTTTCGATCAGTTTTTTCAATTCCGGTGATATTCTCATTTTAGCCATTTATTATTTCCTTCCTCTTTTCTACAGTATTTAAAGATACCCCAAGAAGCTAATTATAACAAGACGAACTCCAATTCACTGTTCCTTGCATTCTAAAACCTTAAATACCAGAAAACAGCTTTTTCAAAGTTGGCGTATAACATAGTATCGACGGAGCCGATTTTGAAACCACAATTATGATAGAATTTACAAGCTATAAGGTTATTGTCCTGGGTTTCAAGCATTAGTCCATGCAAGTTTTTATGCTTTGCCCATTCTATAGATATATTGATAAGCGCGCTGCCTATGCCTTGCCCCCTGAAATCCTTACATACGGCGATATCTTCTATATAAGCGTACCGGTTCCAATTTTTTCGCAGTTTAACTTTTCCGACGCATTTATCGTCTTGGTAGCTTTTTAAATATGGCGCTTCATAGAGTAATTCTGTAAAGGTCCAATTCTCGTTTTCATACCTCGGTATAATCTTACCTATCACCTCAAATGGTTCGCTGGGTTTATCGATATCTTTCAGGTGCCCTGCTTTCATTTCTGTAATCACTGTTCCCGCCTCTCTTCTATATCAGCGGCATATGTGCTATCCAGGCAGCCGGTTTTACCAGTGTATTTTTTATACATGTCCCTGGTATATTTTGTTATATTCCTATCATACTCCGGATAGGCATAATGAAGCCTTTCCGCCACCTCACCGGATACCGCCCTGAACAATTGATGGCATAGAAATAATGCTTCCCATATGTTTTCATAGGAATCCATCCGGTAGGTGGACAAAAGTTTCTCCCACAAATCCTCGGATATATACCTTTCAATAAACTTATAGTTCTTGCCTACACTTCATTTAAAGCCTGTTTCGATGCCGACCTTCCATGATATCATTCTCAGCAGCTCATGGCGAACAATCTGATTAAAATGATCAATAGCAAATAAAATTTCCTTACGGCACAATCCTTTAATAACATAAGGTGTTACATTCCAAAATTCATTGCAGCAATCATCATACTCCCTTGCGCTTGGCTTTCTTACATGATAATCTATATCAGTCGGAACTATGTCCCTTTTAATTCTACAATCTTTATCAATTAGAACCTTTATTAATTTATCGCCCTTTAGGTAATTATCTAACTCTTCCAAGGGCAATAAGGTAAGATCAATTTTATTGTAATCATCAAATAGCTATAATAGATTTAGAGGTAAAGAAATTAAATACATTGAAGAGCAGAAAGATTTTACAAAAGAGTATTTTAATAAAAATGATGGTTCTGTTGCAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP029665|19250:26884|25945_26884_-|AWQ76036.1|DBSCAN-SWA MPEVKNLNNIIEINNLTKQYGSQIAVNNLSITVESGQIYGFLGRNGAGKTTTIRMLLGLIKPTKGNIKIFEKEFESNKTEILKNIGAMVETPGFYSNLTAKENLTINAKILGIQKENAIEEVLEIVGLASEKVKLFKNYSLGMKQRLGIARALLHNPELLILDEPTNGLDPIGIKEIRKLIKDLAQSRNITILISSHILSEIEQLVDKVGIIHNGVLLEEIMYEDLKKKNRQFISISVSDEEKVACLLETNFGIYDYKIKENGEFKIYSHIDRQQEINRLLVLNNIDVFQMRVIEDNLETYFEDLVGGGTIG >CP029665|19250:26884|25215_25905_-|AWQ76016.1|DBSCAN-SWA MFLISILGTCVAPFMVVVASFISMRTKVPTPNIVFKQLFEEVSLYHMLIIGPPLYGVIIAYLFGREYIEDTLKNLLIIPISRESFLVSKIILLFLWIQTLSVIAWLLTLMLGMLLHFQGLSQSLIIDSFFTFVIGGVLLWILSPPIIILSIYFKNYVPTIVLTIIITLINLMTANSEHRGLFPWAAVGDISRGTLPNTYPFLLSLIIIIVTSIFSVIILFSYFKKTDIS >CP029665|19250:26884|22188_22983_-|AWQ76031.1|DBSCAN-SWA MAKMRISPELKKLIEKYRCVKDTEGMSPAKVYKLVGENENLYLKMTDSRYKGTTYDVEREKDMMLWLEGKLPVPKVLHFERHDGWSNLLMSEADGVLCSEEYEDEQSPEKIIELYAECIRLFHSIDISDCPYTNSLDSRLAELDYLLNNDLADVDCENWEEDTPFKDPRELYDFLKTEKPEEELVFSHGDLGDSNIFVKDGKVSGFIDLGRSGRADKWYDIAFCVRSIREDIGEEQYVELFFDLLGIKPDWEKIKYYILLDELF >CP029665|19250:26884|24998_25202_-|AWQ76013.1|DBSCAN-SWA MGFIEQIKAFILGVVEGLTEFAPVSSTGHMIIVDDMWLNTADDLGSASATTFKVVIQLGGSVAKLNL >CP029665|19250:26884|21341_21707_-|AWQ76012.1|DBSCAN-SWA MFTAAEVGALITAGKFLNCHGDESFIKDFDSAMYKIKSILKHGEKNYAQELENSINVYSTSGQKNTLADNVIAAIQTAICNKRVISIQYPASGGQEPESRMIEPISLGFYEQNWYLIGFAG >CP029665|19250:26884|24294_24969_-|AWQ76024.1|DBSCAN-SWA MNYFRYKQFNKDVITVAVGYYLRYALSYRDISEILRERGVNVHHSTIYRWVQEYAPILYQIWKKKHKKAYYKWRIDETYIKIKGKWSYLYRAIDTEGHTLDIWLRKQRDNHSAYAFIKRLIKQFGKPQKVITDQAPSTKVAMVKVIKAFKLKPDCHCTSKYLNNLIEQDHRHIKVRKTRYQSINTAKNTLKGIECIYALYKKNRRSLQIYGFSPCHEISIMLAS >CP029665|19250:26884|23075_23522_-|AWQ76025.1|DBSCAN-SWA MITEMKAGHLKDIDKPSEPFEVIGKIIPRYENENWTFTELLYEAPYLKSYQDDKCVGKVKLRKNWNRYAYIEDIAVCKDFRGQGIGSALINISIEWAKHKNLHGLMLETQDNNLIACKFYHNCGFKIGSVDTMLYANFEKAVFWYLRF >CP029665|19250:26884|20498_21173_+|AWQ76022.1|DBSCAN-SWA MNYFRYKQFNKDVITVAVGYYLRYALSYRDISEILRERGVNVHHSTVYRWVQEYAPILYQIWKKKHKKAYYKWRIDETYIKIKGKWSYLYRAIDAEGHTLDIWLRKQRDNHSAYAFIKRLIKQFGKPQKVITDQAPSTKVAMVKVIKAFKLKPDCHCTSKYLNNLIEQDHRHIKVRKTRYQSINTAKNTLKGIECIYALYKKNRRSLQIYGFSPCHEISIMLAS >CP029665|19250:26884|19250_19829_+|AWQ76008.1|DBSCAN-SWA MKIGYARVSTGLQNLNLQEDRLNTYGCEKIFNDHMSGSKSKRPGLDKAIEFARSGDTIVVWRLDRLGRNMEDLITLVNELNERGVSFHSLEENITMDKSSSTGQLLFHLFAAFAEFERNLILERSSAGRIAARARGRYGGRPEKLNKQDLNLLKTLYDNGTPIKTIAEQWQVSRTTIYRYLNKLEAKENKNK |
9 | Staphylococcus_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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