Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP030141 | Mycoplasma anatis strain NCTC 10156 chromosome, complete genome | 0 crisprs | DEDDh | 0 | 0 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
181322 : 191875
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP030141|181322:191875|DBSCAN-SWA 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GGGCTTTAATTCTTAAAAGTGGTGATTTCCAAGGATTATTTAGAAGAATGCTTTGTGTGGCTTATGAAGACATTGGTATGGCTAATCCAAATGTTTCAATAAGAGTAAATTTAGCATTTGACGCAGTTGAAAAACTAGGTTTTCCTGAAGCTAATTTACCAATAGGTTTTGCAATTGTAGATTTAGCACTTAGTCCAAAAAGCAATTCAACTTATAAAGCATTTAGTTATGCACAAAATTTAATTGAAGACGGAAAAATTTACCCAATTCCAAATCACTTAAAAGACTCGCATTATAAAACAGCTTCTAAATTAGGTGATGGGATTGGATATAAATATCCACATGATTTCCCTAACAATCATGTAAAACAAAATTATTTACCTAAACAACTACTTAATACCAAAATTTATGAATTTGGAGCTAATTCTAACGAACAAAAAATTAAACAATACTGAGAACAAATTAAAAAATTTAACAGTCAGGAGTAATAATGCAATTAAAATTAGATGATATTAACACTTTAGAAGATTTAAAAATTTATAAAAATAAAGTGTATTCTGAAGGTGGTGAGATTTTTGAATTACAAACTAAAATCAAAACATGTGAACCATCAATGAAAAAAGAAGTTGGGATGCAACTTAGTAAATTAAGAAATGAATATGAAGAATTCTTTAAGCTCGCTGAAGAGAGAATTAAAGAAATAAATATTAATAACAAAATTAATAGCGAATTTATCGATGTTACTAAACCATTAAATAAAGTCGGCTCACTTCATCCTATTACCATTGTTGAAAATAGACTTAAAGATTGATTTAACCAACATGGATATTTCCAAAGTGAAGCTGGTGAAATTGTAAGTGATTTATATAATTTTGAAAGATTAAATATTCCTCAAGATCATCCTGCTAGAGCAATGCACGATTCACTTTATATTAATTCAACCACCTTACTTAGAACTCATAATACTGGTATTACAGCGGTAGAATTAGAAAGGTTCGCAAATAAAGAATTTTCAACTTATGCTATTGGAAAAGTTTATAGAAATGATGAAGATGATGCAACGCACTCTCACCAATTTACTCAAGTTGATTTTGTTAGTGTTGGTAAAGTTAGTTTTCCTAATTTAATTTGAACACTTAAATCACTTTTAAGTTATGTTTTTGAAGAGGAACTTGAAATCAGGCTTAGACCTAGCTATTTCCCTTTTACCGAGCCTTCAGTTGAAGTGGATATTTTCTACAAAAACAGATGAATTGAAGTTCTTGGAGCTGGAATGTTACATCCAAATGTTTTAAATTCTGCAGGTTATACAGATCCAAAATTAAATGGTTTTGCTGCTGGTGTTGGAATTGAAAGAATCACAATGATTAAATATGGTATCTCTGATATTAGAGATTTATACAAAAACGACTTAAGAATATTGGAGCAATTTAATAATGAAAGATAGTTGACTAAATATTTTACAATCTGAGGGTAAAAAAGAGTACTTTCAAAAAATTATTTCTAAACTTTCTCAAGCTGAAAAAGAAGGTGAAATTTATCCAGAACAAACAAAAATGTTTCGAGCTTTTGAGTTTTTTCAAGTTAATCAAACCAAAGTAGTTTTTTTAGGTCAAGACCCATATCCATCTAAAGGATTTGCTGATGGATTAGCTTTTAGTAGTATGAATCAAAAAGAAAGACCTAAAAGCTTACAAAATATTTTTCTTGAATTAAAAAAAGATTATCCAGAAGTTTTACTTAAATCAAATTCATTAGATAACTGAGCTAAACAAGGTGTTTTGCTATTAAACACCCAATTAACTGTATCTTCAGGAAAAGCAAACTCACATAAGAATTTTGGATGAGAAAACTTTATAATCCAAGTATTAAAAGAAGTTGATAAAGCTAATGAAAATGTAGTTTATGTTGCTTTAGGGAATAAAGCTTATGAAACATATTTAAAAGCAAATATTAAAATTAATAAAATGCTGCGTTTGTCTCATCCAAGTCCGCTTTCTTATAATAAAAGTTTCAAAGATGGACATTTATTTTTAAAAATAAACCAAAGATTAAAAGAGTTAAATCAACAAGAAATTGATTTTAGCACAAAATAAAGGAGTAATATGTTAATATCATTAAACAAACTTAAAGAATTACTACCAGAGATCAATTTAGATCCTTCAATTACTAAAGTTATTAATAGTTTAGGTTTTGAAGTTGAAAGCATTGAAAAATTTGCTGATATTGAAGGATTAAAATTCGGAATTATTCAAGATTTATATATAAATCCAAACGATAAGCGACTAACTGTAGCAACAGTTAAACACAAAGATGGTATTAGTACAATCCAAACTACAGATACGATCTTAAAGGTAGATGATTTAGTGGTATTTTTTCCTGTTGGTTCACGTAAAAATGATTTAATTTTTACAGAAAAAGAGCTTAAAGGAATTAAATCTGAAGGTATGTTTGCAGCACTAAGCGAATTAAATTATAAACATGACTTAATTGATAAAAATGGAGATCATATTTTAGTTTTACCTAAAAATTTCGCTACCTTGAGTGATGATCCAATAAAAAAATTAGGACTAGATGATTATATTATTGATATCAGTACTACAGCTAATAGAAATGATGCTAATTCTTACTTCACTTTAGCTAACGAAATTAGTGCCTATTATGATAAAGAATTTAATTTTAATTTTATTGATACTAAAGACTCTTTTGATTCAAAAATAACAGTAAACAAAAATTTAGCACATGAGTTAACATTTTTTGAAGTTAAAAAAACAAATGATATTCAAAGTGATTTAGAAACTAGATTATTTTTGGCTAAGCATGATATAGATGCTAATTTAGGTTTTTTTGTTAACCTAACCAATCTAACTTTATTATTTACTGGTGCAACATGTCATGTATATGATAGAGATAAAATAGGAAACAATATTTCTTGTGATTTATTTACTGGTAAAACACAAATATTAGGAAATAAAGATGTTGAAGTTAAAGATGTGTTAGCTATTTATGATGAAAATGGTGAAATTTCTCTAGCATCAGTAATGGGTCTAGAGAGAACTAAAGTAACCCAAAATAGTGTTAATTTAGCTTTTGAAATTGGAGTCTTTAATCCTTCACAAGTTAGACATAGCGCTAAAGAAATTAAAATGCAGTCAAACTCATCAAATCAAGCATCAAGAGTTATTACACCTGAAATTTTGGTTAGAGCAGTTAATTTTTTAAGAAAAAATTTAGCACAATTTGAATTATCTAACATAATAAACTTACCGTTAAATTTAACCAAAAAAGAAATTAAGATGGATTATGAAAAACTTGCACTATACGCTGGTGTTACAGTTGAAGAAGTAAAAGATAAATTTAGCAATACATTTTCGAAACTTTCAAAATTAGGATTTAAATTTGTAGATGATTTAGTTATTGTTCCTAACTACCGTTATGACATTGAATTCTTTGAAGACATAATTGAAGAAATATTTAGATTTTATTCTTACAATAATTTCGATCCAATTCAACCAAATATCAAACCTTTATTAACCAAAACTAGAGATAATCTCAAAAATCTGATTCAATCAAATGGATATCAAGAAGTTAGAACATTCTCACTAATTTCTAAGGCTAAAAATTTCATAAACCCATTTAATTTTGACTCTAACATTTCCCTTTTAACTTTTGTTTCAAAAGAAAGAGAACAAATTAGAAACAGTATTTCAGTTTCACTTCAAGAAGTAATAGAATACAATCAAAAAAGAAAAATTGACTTATTAAATATTTTTGAAATTGGAATGATAAATGACAATAAATTTGTTTGCGGATTTGCTTCAACAATTAAAACTTTTTTTGAGTTAAAACAAGATATTATAAATATCTTTAAGCTTGATAATGTTGAATTCATTCCATTTAAAGATAATGAAATGATTCATCCGAATGTTTCTGCAAAGATCTTATCTAATAATGAATTAATTGGTTGAATTGGTAAAATTCATCCAAAAGTTGATAACACAAATGCATTCTATGCTGAAATTATGTTAGATAATGCAGCGCAAAAAATCAAATTTACTGATATTAATTATGAACCACTTAAAACAATTGACTTAACTTTCACATTAGAGAAATATGAAAATATCACTAATAAAATAAATGAAATTAAAAACATAGCTAAGATTTTTGATGTTGTTCAAATTGATGAATACCATAAAGAAAATACTAAAAATGTAACCTTAAGAATTTATGCCAATGAACAGGAAATCGAATTAATTAATAATAAATACAATAAATAGGGGTGATTATGTACCAAAAAATAAAATTAAATGATATTGATGTGCAAAATGCTATTAATAATGAATTAATCAGACAAGAAAATCACATTGAATTAATAGCATCTGAAAATTATGCTTCAGAAAATGTACTTAAAGCTCAGGGCTCAGTTTTAACAAATAAATACGGTGAAGGCTATCCAGGAAAAAGATATTATGGTTCTTGTGAAAATGTCGATATTATTGAATCTTTAGCAATTGAAAGACTTAAAAAACTCTTTAATGTTCAATATGCTAATGTTCAACCTTACTCAGGTAGTGTAGCAAACGCTGCTGCAATAGCTTCAGTAGTACCTAGTGGTGGGAAAATTATGGGTCTTTCCCTTGATTGTGGAGGTCATTTAACTCACGGATACAAAATTAGCTTTAGCGGAATTTTTTACAATGCTGTATCTTATAAACTTGACAAAAACGGTTTATTAGATTATGATGAGATTCTTAAGCAAGCTCAAAATGAAAAACCTGATTTAATTATCGCTGGATATTCAGCATATCCAAGAATCATTGATTTTGCAAAATTTAGAGAAATATGTGACAAAGTTGGTGCAAAATTGATGGTTGATATCGCTCATATCGCTGGTTTAATTGTTGCTGGAGTTCATCCATCACCTGTTGGATATGCAGATATTATAACTTCAACTACACATAAAACACTTCGTGGTGCTCGTGGAGGAATAATTATGACTAACGATCCTGAAATAGCAAAAAAAGTTGATCGTTGAGTTTTCCCTGGTTACCAAGGTGGTCCTCTTTTTCACGCTATTGCTGGAAAGGCTGTGGGATTTTATGAAGCTTTACAACCTGGATTTAAAACTTATGGAGAGAATATTGTAAAAAACTCAAAAAGATTTGCTCAATATTTTATTAATAAAGGTGTAAAAGTAGTTTCTAATGGAACTGATAATCATTTATTCATGATTGATGTTAATTCAAGCTACAATATCACCGGACGTGATGCTGAAGTTATTCTTGAAAAGTTTAATATTACAATAAATAAAAATTCAATACCTTTTGATACTCTATCACCAACATTAGCTAGCGGAATTAGACTTGGTACAGCTGCTATGACTTCTAGAGATTTTGATAGATGAGAAGAATTAGCAGAGATAATTGATTATATTTTGTCTAACTATAACTTAATTACAAATAATGATCCAAGTGTGTTGTCAGAGGTAAATCAAATTAAAGAAAAAGTTAAAGAATTCACAACAGATTATCCAATAAAAAAACACTATTTTTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP030141|181322:191875|185588_186809_+|AWX69903.1|DBSCAN-SWA MYNIANELRPKTLDQIIGQENTVQLLKEVAKNKLATSFIFFGESGTGKTSAAVALANDMNLKYSYFNSTIESKNDLMNKINNSDILIIDEIHRLNKDKQDILLSYLEFDKIIVYATTTENPYFRVNPALRSRMQIVRFEKINEHTIAKALEKVVQTHFPYLDIGYEELLDLSRSGAGDYRSALNNLQMLAMINNKKTKVDKETIKKIIPNVSFYSDMESSAHYNNLSAFHKSLRGSDPDAALYYGALILKSGDFQGLFRRMLCVAYEDIGMANPNVSIRVNLAFDAVEKLGFPEANLPIGFAIVDLALSPKSNSTYKAFSYAQNLIEDGKIYPIPNHLKDSHYKTASKLGDGIGYKYPHDFPNNHVKQNYLPKQLLNTKIYEFGANSNEQKIKQYWEQIKKFNSQE >CP030141|181322:191875|187757_188417_+|AWX69905.1|DBSCAN-SWA MKDSWLNILQSEGKKEYFQKIISKLSQAEKEGEIYPEQTKMFRAFEFFQVNQTKVVFLGQDPYPSKGFADGLAFSSMNQKERPKSLQNIFLELKKDYPEVLLKSNSLDNWAKQGVLLLNTQLTVSSGKANSHKNFGWENFIIQVLKEVDKANENVVYVALGNKAYETYLKANIKINKMLRLSHPSPLSYNKSFKDGHLFLKINQRLKELNQQEIDFSTK >CP030141|181322:191875|181322_182699_+|AWX69899.1|DBSCAN-SWA MKKLKLVNQTNSNNLLVNAVFESNKPNFVRKEHGLFVVDKSSNNAYLYFDKDKFNYYEVKKMISKIFSLEENVDINLSSFLANNLKIEELIRLFTSVFYFDTFSLFKRSKKDKEKPKKEKTNNFNLIIENPEKYKELFNEVTIISQSINDCRNLQIMPENFLNSEQLAEKIVDDFKDIKNLHVRVLTKAQIRELNMGLLLSVNKGSTHEPRVVVVEYKNNPQSKEHNVYVGKGITFDTGGVNTKGYHMNGMKYDMSGSVIVAYAIKAIAQLKLKTNATAVMMITDNRLANDASLPENIYESMSGKWVEVTDTDAEGRLVLADGLFYGASELKATQLVDVATLTGSLSYALGSVYSGVWSTDDKKWELFNKAAQISHEKVWRMPLHDDFHKTNKESKVADLNNYSSSSKSDSNSAAMFLKEFTNNIPYIHCDVAFTAEVKGEPQGALISTLVEFAKLNN >CP030141|181322:191875|182714_183686_+|AWX69900.1|DBSCAN-SWA MLVGNEKIATELLEKYDSIVIFHHIRPDGDCLGSQFGLKELLETNYPNKKVYAIGDAKGNFSFLDIVHDPIPSDEILSKSLGVIVDANFKERIECREVLDKNLFPETLRIDHHPNDDDLDKNSKWVDSSYIAADEMIAQLAFVNNWKITKKAANLLYLGINTDSGRFLYDKTSARTFKLVAHLYENGLESDFIHSNLSKTSLNEIQFNSWLVSTLKVNGQVAYIKNSLEETLKFNKTPQSSIRVNSIGNIEGYPIWVQFTEEEDHKIRVELRSNGPLVNVVARKWNGGGHDRASGCILDSFDQIDALVADCNAEVIRYQSETK >CP030141|181322:191875|183780_184752_+|AWX69901.1|DBSCAN-SWA MKNDIKIRKQIQRKIWVQLNLGWIITLSIILGFLIVLGLLAWLIILFNKNQNPKYANINVIYYISSSFISWLNNGTISGVTFLIANNGLYFILPLALFFVSMQYKIRNTYIRRTLLMTTKEKNIKYIPLISSLIFFGFALSVFILLDLVTVIFSSINKEYSLNQNFFKNELINVIYFIMYYIFITGITYIITDLFRYKMDRKFVQKATYVIVFPVMFFAIVIPIVKAFLKFGSISFDYESTLNTQFATVLTIFDSIFYVLMNPFKLEFIQTSEFIKNIGNKNGFNFVTTEQAEIILWVFRGIWTSSMIGYLAYHHFKKGGKYE >CP030141|181322:191875|186811_187768_+|AWX69904.1|tRNA|DBSCAN-SWA MQLKLDDINTLEDLKIYKNKVYSEGGEIFELQTKIKTCEPSMKKEVGMQLSKLRNEYEEFFKLAEERIKEININNKINSEFIDVTKPLNKVGSLHPITIVENRLKDWFNQHGYFQSEAGEIVSDLYNFERLNIPQDHPARAMHDSLYINSTTLLRTHNTGITAVELERFANKEFSTYAIGKVYRNDEDDATHSHQFTQVDFVSVGKVSFPNLIWTLKSLLSYVFEEELEIRLRPSYFPFTEPSVEVDIFYKNRWIEVLGAGMLHPNVLNSAGYTDPKLNGFAAGVGIERITMIKYGISDIRDLYKNDLRILEQFNNER >CP030141|181322:191875|188426_190598_+|AWX69906.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLISLNKLKELLPEINLDPSITKVINSLGFEVESIEKFADIEGLKFGIIQDLYINPNDKRLTVATVKHKDGISTIQTTDTILKVDDLVVFFPVGSRKNDLIFTEKELKGIKSEGMFAALSELNYKHDLIDKNGDHILVLPKNFATLSDDPIKKLGLDDYIIDISTTANRNDANSYFTLANEISAYYDKEFNFNFIDTKDSFDSKITVNKNLAHELTFFEVKKTNDIQSDLETRLFLAKHDIDANLGFFVNLTNLTLLFTGATCHVYDRDKIGNNISCDLFTGKTQILGNKDVEVKDVLAIYDENGEISLASVMGLERTKVTQNSVNLAFEIGVFNPSQVRHSAKEIKMQSNSSNQASRVITPEILVRAVNFLRKNLAQFELSNIINLPLNLTKKEIKMDYEKLALYAGVTVEEVKDKFSNTFSKLSKLGFKFVDDLVIVPNYRYDIEFFEDIIEEIFRFYSYNNFDPIQPNIKPLLTKTRDNLKNLIQSNGYQEVRTFSLISKAKNFINPFNFDSNISLLTFVSKEREQIRNSISVSLQEVIEYNQKRKIDLLNIFEIGMINDNKFVCGFASTIKTFFELKQDIINIFKLDNVEFIPFKDNEMIHPNVSAKILSNNELIGWIGKIHPKVDNTNAFYAEIMLDNAAQKIKFTDINYEPLKTIDLTFTLEKYENITNKINEIKNIAKIFDVVQIDEYHKENTKNVTLRIYANEQEIELINNKYNK >CP030141|181322:191875|184744_185494_+|AWX69902.1|DBSCAN-SWA MSKTIIEIKDLHKEFKNSLLKKERIEVLKGINLNINEQQRIALVGKNGSGKTTLAKIIAGFSEITSGEINYNYDYLISPKEKIALQFQNEIELKKPTVKDLYKLLVLNFKDILDMDFIGKLYEILQIKSYLGMRYDRLSGGQRKKVDLFFVLYSKPKLLILDEFTAGLDADTKIKVREIIESYINKYNGTILLISHDSNEIRKLTNEIYVLRDGVISDHITNIQEKFVNDDELELFIRDITQSIKNVEL >CP030141|181322:191875|190606_191875_+|AWX69907.1|DBSCAN-SWA MYQKIKLNDIDVQNAINNELIRQENHIELIASENYASENVLKAQGSVLTNKYGEGYPGKRYYGSCENVDIIESLAIERLKKLFNVQYANVQPYSGSVANAAAIASVVPSGGKIMGLSLDCGGHLTHGYKISFSGIFYNAVSYKLDKNGLLDYDEILKQAQNEKPDLIIAGYSAYPRIIDFAKFREICDKVGAKLMVDIAHIAGLIVAGVHPSPVGYADIITSTTHKTLRGARGGIIMTNDPEIAKKVDRWVFPGYQGGPLFHAIAGKAVGFYEALQPGFKTYGENIVKNSKRFAQYFINKGVKVVSNGTDNHLFMIDVNSSYNITGRDAEVILEKFNITINKNSIPFDTLSPTLASGIRLGTAAMTSRDFDRWEELAEIIDYILSNYNLITNNDPSVLSEVNQIKEKVKEFTTDYPIKKHYF |
9 | Mycoplasma_phage(14.29%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
264700 : 275952
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP030141|264700:275952|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP030141|264700:275952|271045_271942_+|AWX69969.1|DBSCAN-SWA MSKIWESIKRSYVFIILGFVYIPLVVGAIFTFNKSSDKGTYLTSWSKFTFNNWTTIFNSGRDIALINSIILAALTSIIVITISLISVYAVYRSKSRVLRSSLSVTSNIPLINPDNITAIGLVLVFTLFFGVISSDDEGFFRVVIGHAVMTLPYAIFLMYPRSEKFNNNLFEASMDLGYSKIRSWFKTYFVYMIPSIIMTSVVCCVFSFDDFIITRTTSNTPTLGLKLYEGQFEAWALCFGVIALIIVIFGNAIYIGIKNKHIKRSKKTWLKKIIIKDKQKGNFENTVELNLRGGEMDV >CP030141|264700:275952|268832_270209_+|AWX69967.1|DBSCAN-SWA MAKKETKKNSIIELKEVVKEFGSKVVLDNVDLTITKGEFVTLLGPSGSGKTTILRLIGGFEWATRGEIKFNNRDIKDLPPYKRNLSTIFQDYALFPHLNVEGNIRYGLKLKRVPKKTINEKHISLLKKKIEIWTKKAELEMKKLDKIQEQYEKELETLKPKTLQYRKRQNWLDDSDFKYSYWENYVIQKTQAFENRYFKRKMTRDEMDQKISEMIDLVGLKGNETRSITQLSGGMKQRVALARSLVIEPEILLLDEPLSALDAKIRQKMQVLLRNIQQELGLTFIFVTHDQNEALALSDRIAIVRGGKIEQYDTPKQIYDYPKNIWVARFIGDSNIFDAKFIKGGNVKMLNSEFKTIHSEDEFPINSRVDALIRPEDIDITDKDVKSAKRIKGIIEDLTYRGSYYYIKVIVNDGHEIFVETAKKFEIGDTVYLSWTIDSIHLMAKDPKWDYESNVFKN >CP030141|264700:275952|266599_268411_-|AWX69966.1|DBSCAN-SWA MWRMFKMLPRRIKFLFFTGIFLILLNVAISLILPGFISQYVVLAVSSSETEIVSLKVFNKFIVASGTRNMMLTELTIISVILILLAFLTSFLSIVITTWGGERSSEFFRNKIFNKIQHLSLHDINKVTPESLITRISNDVAIFWELLISATNALIRAPLLIIGGIIFTIMTDPKLSLTIFLYLPILIVVLIIMIKINNPLLVKNQITIDKITKEVEENILGARLIKTFNLKEKQLRKFTEQNNKWLKLQTKINNVFAIGHPIFFVLINLVAVAIYALTAHTLFNSTTPDVQELANINVFLEYIFTISLGIILFSTFLFVFFRAKVSCARINEVLDFKNQDLKVEDGLSIEHTVDNITGLSVQFKNFNYKYFKDSEEYALYDINIDLKPGQTLGVIGPTGSGKSSLANLLINNYKYDTEENGHILVDNKEVNKINTSDLHKNIGIVYQDALLYSGTIKSNLLFAKQDATEDEINKALHNSCSIDFVQTFEDRTNHIVEQRAKNLSGGQKQRLSIARTLINNPKVLILDDSTSALDNITTKKLLTNIKQNYNCTTIIISQKISSIKHADQIIVLEKGRITGHGTHEELAEKNEWYKNTFTNQLEQ >CP030141|264700:275952|270192_271053_+|AWX69968.1|DBSCAN-SWA MFSKIKERLFNTDNKRGWLISPYLLIALLLIILPIILIIVSAFAPLKTPNGSTSDNWELLKTYSTWSIIFRSLRIGIVSSILCLVVGFPYAYFVSSSKSKIFKIYAISLILSPMAIFTIARIYSIRTLFLNIIDPNNVDSLNSEWFLVFGLFYLNLPLMIMPLYTVLKDMPRNIIEASSDMGYNTFKTVFKVIIPYSLKAILSGYSMIFLSTATTFLVSTKLLPDGTQNQMVGDLINITINPGNKYDLAKGSSLVIVVSFIFIGIYSIIIIAPKIIFRFKRGFTYE >CP030141|264700:275952|271934_273869_+|AWX69970.1|DBSCAN-SWA MSKNYFKKTIYRNTALIAGSILSAGILASAINYKISKKFKPSFYNYRASISKSNEEKIGQHFLYKQFNELTEFQNAILNNRAAAGIGTEYLATRLIIKGKISKIDYSKFLNLPNLKPQDYEEAIKVILKPSVFNHLKSYDKYLKYDENGNEINAHLWEYFFPYFVQDAIVAYNINKVNIADEYKKRDENGELVNEIDFAKILNSDNKDAFNMVDIMKTLRKVGYDKYIITDAIRDNMLYGSAYDTVLDKPESRTDENFTGEVTEQTYERLIKNFKDLIKDGSGFNINDTSHITFKGDGLEIVNTIVNPSDSTNVSIMYNGDGIDAYYSNDNAASTVDGETIRFVRPSKNVFLVDGVMFSASNSKENNENYMSYLTENVYQNVNLAYIEYLKLKKEYPNLPFKQLKNLAMIKGEEAVYKDWQTNKIAELIKSNSYFENNYLKVSNEIVELFNNEHFKLASKENKSTLDDFYVQVISNYFNEKLDSIIYDNSEEANNSWEKTLMFEILNKFSDELGYDQSIPLDKQYNSDFKSEWINKTASYLGFITITENEINSPEYNNFISDLISSKYLNLDNFDYVNYTTGVNLDMNIIYKNYFYNGDLTHDETVRKILWIDENDEIEYKGISPIEDYLNSKITFEYYKQTKS >CP030141|264700:275952|264700_266563_-|AWX69965.1|DBSCAN-SWA MRNSEFIINKKAKDKEFSAYKVFKQLLSYVQNERKRLIFGIFCSLFNAIFYVLGSIYIGYVFRNYFEVIFKSANPNLAIANFDIFHFSIDLIILGGSFILYGCFRYVESLIYIRISYNQSARMRQEVMEKLIKMPISYYDKQKAGDLISTIINDINNVSNTLMNTLNQFFSSFFNVVISISIMFMVSTILTLIAVPMSLILFGLSLLVIKRAQPYFVKVQDSFGKLNAFVEENIANMKVTNSFDREKLVFDQLKLITQEIKRTAYKGDLTARSVDPWFGFTSYSVNLVVAAIAVALYFAKVNVYGLSYFGSNQNGTASGGLIITFIALNWNFMGPFNTLLNINFSLQVGIASSNRIFKLLNLNPDKDHTEEIFLDKIVGEIEFKNVFFRYNKNSKKYQLNNASFTVKPGQTVAIVGPTGAGKTTIVNLLSKFYDYESGSITIDSHELRHIDTENLRNLVSVVLQDSFLFNDTIKWNLTMGNENVTDEQIIEAAKLTGAEHFINQFPEKYNTKIENNGTNLSQGQRQLLNITRAILANRNMLILDEATSNVDSQTEKVIQNSLLKLMENKTSFIIAHRLSTIKNADIILVVDNGYIIEKGTHQELLKQKGFYYNLYSSSFK >CP030141|264700:275952|274008_275952_+|AWX69971.1|DBSCAN-SWA MKILKRKAKIILYSLGLIATFTGFSASVIYKATNKFKPSFYNYKAAISKNNEKELSKSFLYKQFNEINEFQTAMINNHAALGIGTEFLATKLIRQGKLSKINYSKLLQMPDLKEENYEEAVRVILRDNVFLHLKSYDKYLQFDEHGNKINAHLWEYFFPYIIQDMVITYNINKIKINDNYKKIGQDGELLNEIDFNKVLNLNDDNKKFEIIDILKALKTVGYNKYMITDAFRDNMLYGSTYDVILGTEGQRTSENFTGEVSEETYVRLIENFKSLINDGTGYDFNDTKHITFKGEGLEIVNRLVDPSDPTNATIMYNGDAVDAYYSNDNSSQTVDGQTIRFIRPKQNIFLVDGIMFSSTNSPENNNYFTDVISNNIFQNLSLNYRSFLEIKHNSPSNNFEETKKQALIKSEEKIFRDFQYEKYSELFNNYLNKEESEKITNTTLFEINELHYKKYLQDNSLMKNYYLDVISELVNPIIKDFTTTRSNLNYSQLVENYKNPIELLILGILNKFSDYLNFDLTKTFELQNNDFDINKLKHIIVGYLSTANINTKDYNSENYNSIVNYKMSHNYLNLDNFDFINYATAVNADMLFIYKNYFIDDDFNLDNIAKDIFWVDDGINIQYQGLAPIEDYLNSKVVFEYYRQTKA |
7 | Mycoplasma_phage(71.43%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
483826 : 547750
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP030141|483826:547750|DBSCAN-SWA 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51 | Paenibacillus_phage(33.33%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
754513 : 760296
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP030141|754513:760296|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP030141|754513:760296|757152_758166_-|AWX70357.1|DBSCAN-SWA MNNEYYKKSNNPLNFVKNGQTGPLRAVNWNVINDEKDLEVWTRVTQNFWLPEKIPVSNDLKSWNQMDKKWQQLVTRTFTGLTLLDTIQATLGDTAQIPNALTDHEQVIYANFAFMVGVHARSYGTIFSTLNTSEEIEEAHEWVINNEKLQARAKFLIPFYTSDDPLKSKIAAALMPGFLLYGGFYLPFYLSARAQLPNTSDIIRLILRDKVLHNYYSGYKYRKKVEKLSPEKQQEYKKFVYDTLFKLIELEEEFLRDLYDGFGLADEAIAFSLYNAGKFLQNCGYDSPFTPEETKISPEVFAQLSARADENHDFFSGNGSSYVMGVTEETEDEDWEF >CP030141|754513:760296|758454_759324_+|AWX70358.1|DBSCAN-SWA MKQYLELLRNVKTNALRKSDRTGVGTISIFGTQTRYDLRDGFPLLTTKKMAWKAIVHELLWFLSGDTNIKYLVRNNVNIWNEWPYENYKKSKDFGGETFEEFVKKIKENDCFADKYGNLGPVYGKQWRDFNGVDQITELINEIKVKPFSRRLIVSAWNPSEVKDMALPPCHAFFQFYVNENKELSLQLYQRSADLFLGVPFNIASYSLLLMMIAQVCDLKVGEFVHTIGDAHIYLNHFEQVDTQLSREPLELPIVKLNPNIKNIFDFKFEDIELVNYKSHEKIKGKVAV >CP030141|754513:760296|759323_759815_+|AWX70359.1|DBSCAN-SWA MIKLIVALDKNNLIGKGNQMPWHIKEEFQHFKRTTIGHSLLFGKNTFLGLLKKLNGRKNIVLSENDIENSDLTIHNEEELIELFNRFKNSDEVLFIAGGKTIYEKYFDWADELIISRIHNEYDGNVYLNLDLSNYYLDKVESHEFFDVEIYKKINKEHFYEKR >CP030141|754513:760296|754513_756694_-|AWX70356.1|DBSCAN-SWA MANNTKFFKEADEYLAFNALTKLNEGKDSAKNDQIAVEKYMEIHVKPKTRKFNNVHERMKYLVDNDYYEAEIVNQVTKEQLEELYKIIAEFDHHFPSFMGAVKFYNAYCLKSFDGKEYLEDYSERVLMNALFLGYGNFDDIKNILVEILSGRFQPATPTFLNAGKKQRGEFVSCYLLRVEDNMESIARGISTSLQLSKRGGGVALCLTNLREFGAPIKNIENQATGVIPVMKILEDSFSYSNQLGQRQGVGAVYLNVHHPDILSYLDTKRENADEKIRIKSLAMGVVIPDITFELAKKNEQMALFSPYDVAKVYGKTMADISITKEYYNMLNNDKIRKTFISARKLFQTIAELHFESGYPYLLFDDTVNDRNPNQGRIVMSNLCSEIVQSSSETTYDVDLTVQKLGEDICCNLGSLNIDKMMNSGEHFENSIYYSIKSLDHVSRTSDLSCAPSIQNGNKNNNALGLGAMNLHGFLATNHIYYDSPEALDFTNIFFYIVAYYSFKSSNRLAKEYGKTYKNFSTSKYADGSYFDKYTKCPIDEYVPKTDRIKEIFKDKNIYIPTQNDWINLTEEIKKYGLANAHLLAIAPTGSISYLSSCTPSLQPVVSPVEVRKEGKIGRVYSTAYKLDEDNYKYYKDGAYELGPNPYIDIVAQAQKHIDQAISLTLFMNDTATTRDLNKAYIRAYKSKCASIYYVRIRQNVLEGSENIDWSEDQKLKNMECEACKI >CP030141|754513:760296|756706_757150_-|AWX70536.1|DBSCAN-SWA MEKEQVLSNKIPTGEMHVVYFSSTSENTKKFCDKLGITATRIPMDMEESININRDYVLISPTYSGGLGDFKGSVPRQVIKFLNNENNRKHCVAVIGSGNTNFGDTYALAGFVLSKKLEVPLLHIFELLGTQHDVEVVREKIKKLWNK >CP030141|754513:760296|759801_760296_+|AWX70360.1|DBSCAN-SWA MKKDNVLNWDGYFMALAKVSAMRSKDPSTKVGACIINNEKRVVALGYNGMPKGLDDEFPWNREGISPKETKYPYVVHAEMNAILNAYQKFENCLIYTTLFPCSSCAKTLAQSGIIEVIYEQDKYHNTEDGWIARKILKIAGIKTRKIDVDTSVLVNVGDNNYKG |
6 | Lactococcus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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