Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP021644 | Glaesserella parasuis 29755 chromosome, complete genome | 2 crisprs | PD-DExK,DEDDh,WYL,cas3,cas2 | 7 | 3 | 11 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP021644_4 | 1287627-1287729 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP021644_4
|
1 spacers
spacers of CP021644_4
>4.1|1287666|25|CP021644|CRISPRCasFinder TGCGTGTGTCCGAAAAATATCAATG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP021644_4
The CRISPR arrays of CP021644_4 >merge|CP021644|4|1287627-1287729|CRISPRCasFinder AAATCAAAAATACGTGAAAAACGTTGATAACGGACACACTGCGTGTGTCCGAAAAATATCAATGAAATCAAAAATACGTGAAAAACATTGATAACGGACACAC >CP021644|4|3|1287627-1287729|CRISPRCasFinder AAATCAAAAATACGTGAAAAACGTTGATAACGGACACAC TGCGTGTGTCCGAAAAATATCAATG AAATCAAAAATACGTGAAAAACATTGATAACGGACACAC
>CP021644.1|AWY45680.1|1285820_1287461_-|DNA-methyltransferase MAENLANQQAFLNKLDADLWKAADKLRQQLDAANYKHIVLGLIFLKYVSDSFSAQQDIIKQRYTDPTSDFYLDPTAYSESELADILNAELEERDNYAQDNVFWVPQQARWDEIKVVARANIGDKIWDEKTFKGIANLIDDAFDAIEQDNPKLKNVIQRISPYKVEESILLGLIDLFSDTNFTRPTLDGKQISLAAKDILGHVYEYFLGQFALAEGKKGGQYFTPKSIVTLIIEMLEPYKGRIYDPAMGSGGFFVQTERFIREHQGNVSEVSIFGQEFNPTTWKLAAMNMAIRGIEFDFGKGNADTFSNPQHRDKKMDFVMANPPFNMKDWWNESLAQDPRWQYGIPPEGNANFAWLQHMIYHLSPNGRMALLLANGSMSSNTNNEGEIRKNILKADLVEAMIALPSQLFTNTQIPACIWILNKNKARKGEVLFIDARQLGYMKDRVLRDFTADDIAKVADTYHSWQQSADYQNIPAFCYTASLDEIAQNDFVLTPGRYVGAAEQEDDGVPFAEKMQELTALLQQQFKQSAELEAKIKANLGGLGYE >CP021644.1|AWY45679.1|1284451_1285828_-|restriction-endonuclease-subunit-S MSKLGDFVRVQGGYAFKSSELSDDKTGVPVIKIGNITGGSFVDLSNYQSVSFQLFEKTKSFATKDNDILIAMTGANVGKTSRVPVNSDAYLINQRVGRFLLKEDCPYTSDFIYYVVSSKQAYQYFSRVADGAAQPNISGKTIEDLEFPNIDSRCANKIGNILKSLDDKIQLNTQINQTLEQIAQTIFKSWFIDFDPVHAKANALASGQTAEQATQAAMAVISGKNTQELHRLQTANPEQYQQLWEITEAFPSGFDEEGVPRGWEQTTLSEVCSMKNGYAFKSSDWTEEGIPVIKIGSVKPMIVEVDGNGFVDEEHSVLHSEFLLTEGDIVVGLTGYVGEVGRIPQGRTAMLNQRVAKFIPNKLNEQQDYYSFVYCLVRDKSFKAFAETNAKGSAQANISTKELLNYSIILASPEIQMKFESLIKPLLDKILVNSGNNEYLSKVRDLLLPNLLSGEIHL >CP021644.1|AWY45678.1|1283816_1284455_-|hypothetical-protein MMKWLLSSIDKLPSLLVYQRHISEIENNICRNPVLSIELCKSLSEGICKTILTDKGVSIPDNFPNLVSTTLSHLNVDNHPDAEHIKELSKRLGGVLHYIATIRNDCNYASHGQDIEHKPVSSDLALFVTHTTNAILGFILHFYIVTGDYQRGERIRYEDYQEFNDYLDEVYESNMGKIISFSRALFDQDIEAYKEEFWEYQRIEYEGLQDTL >CP021644.1|AWY45677.1|1279972_1283137_-|restriction-endonuclease-subunit-R MLINENTIEQACLRFLQELGWDYTHGSTINADGENPWRLRTDEVVFRSVLREAVERLNPQLPSATVDEVVALVCKTDITDLTERNQQAYRYLREGVRVEYRENDEQKVEFARLIDFQQPSLNRFDVVNQLTILGRKGNRRPDVICYINGLPVVVLELKNPLKENADLPQAFNQLQTYKQEIGDLFVYNQALVISDGILAKVGSLTADLERFSPWRVVDEKNKQRISFEHELEGLVRGLLNPASLLDYIQNFIVFEQTSSGRLVKKIAAYHQFYGVNEAVDCTLWAASEQGNGKIGVMWHTQGSGKSLSMLFYAGKLLSQAELRNPTIVVVTDRNDLDGQLYATFSGGQALIRQQPVQADGREALREELAKRETGGVIFTTIQKFGLQEGEQAHPVLNERHNIIVISDEAHRSQYGFSQSMKLNELNRTGTYRVGYAKHLRDALPNASFIGFTGTPISLEDKDTQEVFGKYVSIYDITDAVEDGATVPIIYEARQIPIAQSAEFDNVVQEAQTLIDEDDESSYNFRLREKLMGTEGRLSRLAEDFVKHFEQRTALIDGKAMVVAMSRQICVKLYEKITALRPEWHSDDVNEGAIKIVMTGSASDPADIQKHIYSSQDKKLLERRFKDPDDPLEIVIVRDMWLTGFDAPCCNTMYIDKPMKGHNLMQAIARVNRVFRNKSRENGGLIVDYVGLTSELREATEQYTRSHGKGQMTHNIAEIKAKMLEYIDVVRGQFATPVNDQPFKLFDALKIEDELALFKQVMLGANHILALDHQTVADKTEKTPRRNAFLKAVRLAKKGFSLCGADGDVQQYQKELAFYDAVRAILAKREPNSTASSEERQLQLVALLNKAVDASGAINLFDLLNREQPNINILSEEFLEKIKNSQTKELWLLAVERYLRSQINEKGTGNLAVQKDFSERLKEALNKYHNQNLTIMQVLEELLNMSKEFAERLQRGEKLGLSPAEIAFYDALARNESAVRELGDDALKNLAKAITDKLRKSATIDWQYKEAVRAKMRNLVRVTLRLFKYPPDKCDEAIQFVLEQAEVIADELTTV >CP021644.1|AWY45676.1|1278843_1279938_-|histidinol-phosphate-transaminase MQFINIANEGVKTLAPYQAGKPIEELERELGISNIVKLASNENPFGFPESAKQAILKQLNDLTRYPDANGFELKATIEKKFGVQPNQITLGNGSNDLLELFAHTFASDKDEIIYSQYAFIVYPLVTKAINAVAREIPAKDWGHDLSAFEQAINDKTKLIYIANPNNPTGNFLSQQEIERFLDRVPVNVIVVLDEAYTEFTDPAERLNSFALVQKYPNLIVSRSLSKAYGLAGLRIGYAVSHPEIADLLNRVRQPFNCNSLALAAAIAVMQDDDFIAKVAENNRNEMQRYEAFFKANQLDYIPSKGNFITVDLKQPAQPIYQALLHEGVIVRPIAGYGMPNHLRVSIGLPEENDKFFMALRKVLI >CP021644.1|AWY45675.1|1278318_1278579_-|DinI-family-protein MQATIDIRLANLQKMDQGKFNRLLDIVAEQVEKAFPNAIVRVRPSVSNSDLSVFGLGKEGKQKVATFLEQLFEEGSAFDELQDEYY >CP021644.1|AWY45674.1|1278052_1278325_+|hypothetical-protein MRLTLAFPLDFQSLGVEQVWLVHRLDKVTSGLLILALNPTSASYFGELYGGEKADRVYLHAYQLDFYYHSQPISVRVLPSGQFWQKQNDQ >CP021644.1|AWY45673.1|1276471_1277875_+|asparagine--tRNA-ligase MSKFPTISEILSGKVAVGEEVAVRGWVRTRRDSKAGLSFLAVYDGSCFDPIQAIINNDLSNYQDEVLRLTAGCSVIVTGVIVESPAEGQAVELQAKSVEVVGWVEDPDTYPMAAKRHSIEYLREVAHLRPRTNLIGAVARVRHCLAQAIHRFFHEQGFYWVATPLITASDTEGAGEMFRVSTLDLENLPRGEDGKVDFSQDFFGRESFLTVSGQLNGETYACALSKVYTFGPTFRAENSNTTRHLAEFWMVEPEFAFATLADNAKLAEDMLKYVFRAVLEERKDDLKFFEKHVDNTVISRLENFINSDFAQIDYTDAIEVLLKSGKDFEFPVSWGIDLSSEHERFLAEEYFKSPVVVKNYPKDIKAFYMRLNDDGKTVAAMDVLAPGIGEIIGGSQREERLDVLDKRMVEMGLNPEDYWWYRDLRRYGTVPHSGFGLGFERLIVYVTGLQNIREVIPFPRAPRNANF >CP021644.1|AWY46674.1|1273915_1276258_+|TonB-dependent-receptor MNAEQLELDEISVMGKVPEGNSISFLKVSDAIIDGEKFKNRSATLGNALSSELGVHSTPFGGGASAPIIRGQEGVRVKILQNNADVVDMSNISPDHAITADTLLANQVEILRGASTLLYASSSPAGIVNIVDQRIPNKMPKKGYEVTLSSRFDTASKEKVYALGTTIGIGKHLALRLEGLDRQSQNYKVPQIKLGETLNYVPDTYHQSKVGTIGLSFIGEKGYLGASYNQRKDRYGLPGHNHKFDTCIAHIYDMRLQGKHSYTNLYPHLMSDEMVTENPHFHCGTDYDLDPSHSHDHPYGHDHDHTHIGPWVDLHSKRIDIKGEIKQPLPMLDKIQLSYAQTDYYHDEKDAGKSGDTINPNRVDKSKDFGKPVNIFKNQGKNARLEFFHTPIGGLTGMFGVQYQTLQSSANTPNNREVQWPLVDNRNKQISLFALEQYAWDNFAIELGLRTEKQNIHIDYDLAKIQKQQKFNERTYGKQVDPDLSDYDEKAISYTGAFNWFFHPDYQLSFTASHNERLPTPMELYYHGQHLATNSFEYGNKDLKKEISNNFELGLGYHTEKLDYKLSTYYNNFDNYIYNETLYRSNNLFMRRYNQAKATFYGLEGIINYRFTPDYQFSVFGDMVKGKLKQLPDIKGLNDVYGEPILNPDYDPEYDEPEDQYYRPYLGKEMIKQADRVSPRLPPIRLGARFNAQLTENLSGSVEWMKVFTQNKVSKLESSTKGYQLLNASLNYRRQIKGVEYTVSLTGNNLLNQAVYIHNSYHPYVPQMGRNFILGLDLSF >CP021644.1|AWY45672.1|1272143_1273643_-|exopolyphosphatase MSEMPSREFAAIDLGSNSFHMIVARIVNGSIQILSRIKRRVRLAEGLDEHRHLNQEAIDRGVACLALFAERLKGFSPENVKVVGTYTLRRALNNQDFLAQAQQVFPFPIEIISGQEEARLIYSGVSHTQPEKERKFVVDIGGGSTEMTIGDGFTPLRAESRHMGCVSFAKRFFPAGELTQARFEQAYQTAMEKIDDLAWEYRELGWQHVLGSSGTIKTVSKVLIANGYRDGLITEARLQTLIDRCLAFHSLKEIQLKGLLEERADVLVPGLAILLALFHTFHIQSMRYSDGALREGILYGVESGFQVGDIRQRTAKALAEQFNIDQHQAERIKDTALRLFDQVTAWKNKRQIQELREILQWASLLHEVGISINHNGAHRHSAYIIANLDLPGFDSEQQTLLATLMRYHLKGFKRHDLKIASRFQHPDILTLLRIFRLAVLLNRSRQATNIPMELNLSIQNSSWHLSFDKVFLAQNPLILADLLDEARYLQAVNLTIDFS >CP021644.1|AWY45681.1|1287902_1288874_+|IS110-family-transposase MNAPIYCGIDVAKRNFVIGFSHQKKTKTETNNAKGIQHTLDYLSQFNVALITLEATGGLEIPVAKALARAGYRVFIANPLKASEFAKSQTRAKTDAKDAVNLAFYGLTCELKGEVEHQLYVPLSEQEEQLEALVVRRRQLVDMRVAELNRLQQSHETQLDNIQQHIEMLDKLIAELDKDIDDQSKHFSDKADLISDIKGVGKNCVAVMMSSLPELGKLSSKRIASLVGVIPHSQESGQWKGKSFCYGGRAIVRNALYMAALSAIRFEPVFKAFYTRLVAKGKAKKVAIMACMRKLLTIMNALVRRNEKWDATRYLSTESVGQN >CP021644.1|AWY45682.1|1288912_1289995_-|phosphoserine-transaminase MTQVYNFSAGPAMMPTAVLEKAQTELLNWQNQHTSVMEVSHRGKLFMEMIAECEQNFRKLYNIPENYKILFLQGGARGQFAAIPMNLIGEKGKALYLTSGHWSATAAKEARNFCEIDEINILEQGDELKVGNLDFSEIAEQYDYVHYCPNETISGVEIFEEPKVGNAVLVADMSSNILARRIDISQFGLIYAGAQKNLGPAGITIVIVREDLIGKARKSTPSIWNYETQANNDSMINTPPTFAWYLCSLVFKHLLNIGGLAEVEKRNQAKAELLYRYLDNSNFYRNTVAKANRSLMNVTFTTGNDELNAKFVAEATACGLQALKGHKVLGGMRASIYNAMPIEGVQALIAFMQKFEAENK >CP021644.1|AWY45683.1|1290059_1290467_-|PIN-domain-nuclease MKILLDSHILLWLAWDKKENLSPQAVELLDDPTSEIYFSLASLWEIAIKSSLGKPDFDIDVEALEQGLIQVGCRMLAIELPHILKQAQYPFIHRDPFDRLLMAQAEVENVFFMTADTMILKYQKPYIIDVRSYKN >CP021644.1|AWY45684.1|1290463_1290727_-|prevent-host-death-protein MLNQSLESVNMHEAKTNFSRIVEDVKRFGKPIIIAKSGKPQVKIVPLDTIQNGSRFGFMKKQNMQIPEDFDRLYQNEIVAMFEGKEE >CP021644.1|AWY45685.1|1290790_1292116_-|Xaa-Pro-aminopeptidase MDLAYLQKLPQEEFHTRRQRLFEQMQDNSTLIVFTETEKRRNNDCDYLFRPDSYFWYLTGFAEPKSALVLLKKAGLCESLIFLRKKDPLMETWNGRRLGIEVAPQTLNVDQAYDIDDIQTILAEKWADLTACYYAINVQTWGDQIVFATFDAITASRKKAPTTLIDWQPILSEMRLFKSEAEIALLQQACQISAFGHLRAMKQTRPNRYEMEIEGEIQHEFSRFGSRFASYNQIIAGGDNACILHYNENDQVLKDGDLLLIDAGAEFAMYAGDITRTIPINGKFSTAQKEVYEIVLEALKEATKLLVPQSSIKLANDKAVRIMTEGMVRLGILKGNVDELIENKAYRQFYMHGLGHWLGLDVHDVGDYGNERDRPLEIGMVLTVEPGLYIPKDADVPEQYKGIGIRIEDNLLITEYGNKNLTSGVPKEIGEIEAVMGQATN >CP021644.1|AWY45686.1|1292588_1293365_+|nucleoside-triphosphate-pyrophosphohydrolase MATIQQFLDIVERLRDKETGCPWDIKQTFDTMLPNLLEETYEVAEAIYTKNRTALREELGDLLLQVVFLSQLAKEEGIFSFQDVLNDIHDKLIYRHPHVFGDTAATNSEEALQNWEAQKAKEKEAKQQTSILDDLPFALPALTRADKLQKRCAKVGFDWDNPQDVLAKVEEELTEVQEEIQQQQPEKLAEELGDLLFATVNLCRHHKIDSETALRNANVKFENRFRKIENYLISQGKKPQDCTLSELDFLWNEIKKVE >CP021644.1|AWY45687.1|1293464_1294190_+|DNA-binding-response-regulator MPKILLVDDDVDLTELLSESLSLEGFDIHTVHNGQDALTELEIQNYDLILLDVMMPILNGIETLKQIRQKYSTPVLMLSARDDEIDRVLGLELGADDYLPKPFNDRELVARIKAILRRSITQKPSIPVETTFVINDDDDRKLLQFGGVELHPGRQQAIYEGKDLDLTGTEFALLQILMRNPGQILLRELLSLEILGKRLTPYDRAIDMHISNLRKKLPERNDNLPWFKTLRGRGYLLVTEK >CP021644.1|AWY45688.1|1294258_1295635_+|two-component-sensor-histidine-kinase MLKLRNFRRYLAYQIFASFMVTIAIILALAILLPSLDTRRFKQIDDFQLGFLQHETKYVEQEYNLDEVFRHNLSVASINGFDIILFDHASQQLAGIREENNEAFHAFIYKAKNHLQPLQRRFGTMEFYGPFLASSHTRTYDLYFTKKVNPQRELINTLFDSPWIMLLLFLFVSSPVMIWLSYRIAKPVKELRLTANAVARGNLAINPKLETSGIEELRQVGASFNEMIVALERLTNYQHRLLSDISHELKTPLTRMQLALSLLLRRNGESSEITRIEGEITKLDTMIHDLLVLSRKQANHHLERKVFPIHKIWDDVLNDAKFELEQSGFDLVVSQRILHPERYFVNGNVVLLASAVENVIRNAKKYAQTTVKVMFYIDASDLYILVDDDGEGVPEDQYKEIFRPFYRVQEDRARQTGGTGLGLSIVANAIRQHHGSVRAEKSPLGGLRVKMQLPLWVE >CP021644.1|AWY45689.1|1295717_1296410_+|16S-rRNA-pseudouridine(516)-synthase MRLDKFIAENTGLTRSQASKALRAGQVTVNGVVEKNSATKISEQDEICFDGEPLAWVDEGQYFMLYKPQNCVCSHDDGDYPTVFQFFDYPLTTKLHCAGRLDADTTGLVLLTDDGQWSHRITSPKHHCEKTYLVTLADPVEDFYATQFAEGILLRGEKTLTKPATLEILDDYNVNLTISEGRYHQVKRMFAALGNKVVALHRWRIGNVVLDETLAEGEFRALTEDEVASF >CP021644.1|AWY45690.1|1296410_1297607_+|Bcr/CflA-family-drug-resistance-efflux-transporter MNKITKPNGFFVVIMGLLSMLPPLAIDMYLPSFLDIAQDLSVSQEKVQTTLAIFTFGFAIGQLFWGPIADSFGRKPIILLGLSGGAVAAFFLTQVLSIENFYLLRLLQGLFGAAPAVVLGALVRDIFDRNQFARLMSTIMIITMIAPLVAPILGGYVAKWLHWHAIFYILMVMGIVCVCLVATLIPETLSTENRMPLSFRQVLQNFATLISHKATLGYVLVGGMSFAGMFCFLTSGSLVYIGLYGVSSEYFGYFFMLNIAVMMVMTFINGRLVTKIGSEKMLRIGMSLQLLAGIWLIISATLQLGLWSMAIGVAFFVGMVSTIGSNASAAILDRYPQMAGTANAVAGTARFGIGSLVGAGLSHIPLTSERPMLYTMAACTVVGFIAYYFLSCRNQQLQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP021644_5 | 1657422-1657591 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP021644_5
|
2 spacers
spacers of CP021644_5
>5.1|1657457|36|CP021644|PILER-CR AAGGGTGAACCGGGTCCTAAAGGTGAACAAGGTATT >5.2|1657528|46|CP021644|PILER-CR GCAGGGAACAGCGGGTGCTCAGGGACCTAAGGGGGATAAAGGCGAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP021644_5
The CRISPR arrays of CP021644_5 >merge|CP021644|5|1657422-1657591|PILER-CR GCGGGTCCAGCGGGACCAAAGGGTGAACCGGGTCCTAAAGGTGAACAAGGTATTCCAGGACAAGCGGGTCCAGCAGGACCACGAGGACCGCAGGGAACAGCGGGTGCTCAGGGACCTAAGGGGGATAAAGGCGAACCAGGAGAAGCGGGTCCAGCAGGACCACGAGGCCC >CP021644|5|2|1657422-1657591|PILER-CR GCGGGTCCAGCGGGACCAAAGGGTGAACCGGGTCC TAAAGGTGAACAAGGTATTCCAGGACAAGCGGGTCC AGCAGGACCACGAGGACCGCAGGGAACAGCGGGTG CTCAGGGACCTAAGGGGGATAAAGGCGAACCAGGAGAAGCGGGTCC AGCAGGACCACGAGGCCC
>CP021644.1|AWY45999.1|1652739_1654524_-|fumarate-reductase-flavoprotein-subunit MQTVNVDVAIVGAGGGGLRAAIAAAEANPNLKIALISKVYPMRSHTVAAEGGAAAVAKEEDSYDKHFHDTVAGGDWLCEQDVVEYFVEHSPVEMTQLERWGCPWSRKADGDVNVRRFGGMKIERTWFAADKTGFHLLHTLFQTSIKYPQIIRFDEHFVVDILVDDGQVRGCVAMNMMEGTFVQINANAVVIATGGGCRAYRFNTNGGIVTGDGLSMAYRHGVPLRDMEFVQYHPTGLPNTGILMTEGCRGEGGILVNKDGYRYLQDYGLGPETPVGKPENKYMELGPRDKVSQAFWQEWRKGNTLKTAKGVDVVHLDLRHLGEKYLHERLPFICELAQAYEGVDPAKAPIPVRPVVHYTMGGIEVDQHAETCIKGLFAVGECASSGLHGANRLGSNSLAELVVFGKVAGEMAAKRAVEATARNQAVIDAQAKDVLERVYALARQEGEESWSQIRNEMGDSMEEGCGIYRTQESMEKTVAKIAELKERYKRIKVKDSSSVFNTDLLYKIELGYILDVAQSISSSAVERKESRGAHQRLDYVERDDVNYLKHTLAFYNADGAPTIKYSDVKITTSQPAKRVYGAEAEAQEKAAKKE >CP021644.1|AWY45998.1|1651962_1652733_-|succinate-dehydrogenase/fumarate-reductase-iron-sulfur-subunit MTNQSKMTVEVLRYNPEQDNEPYLSKYEVPYDSQTSLLDALGYIKDELEPELSYRWSCRMAICGSCGMMVNGKPKLACKTFLRDYSGYMRIEPLANFPIERDLVVDLSHFIESLESIKPYIIDNKAPELDGKPHPSAELAKSRTKQTPAQLEKYRTFSMCINCGLCYAACPQFGLNPEFVGPAALTLAHRYNLDNRDNGKAERMKIINGKNGVWSCTFVGYCSEVCPKHVGPASAVNQGKIESAKDYVFAMLKPQK >CP021644.1|AWY45997.1|1651557_1651950_-|fumarate-reductase-subunit-C MTTTASKRKKYVREVKPTWWKALDFYKFYVLRESTSVPTVWFCLVLFYGLVCLGNGTFATTFVGFLQNPVVVILNIITLGAVLLNSFTFFGMAPQMMNVIVKNERIDVKLVSRVFWGITAFVSLLALILV >CP021644.1|AWY45996.1|1651199_1651544_-|fumarate-reductase-subunit-D MDKLNPPRSNEPAVWLLFGAGGAISAIFFPVLVLILGFLLPFGLITPDNIIAFAHTWIGKLAILALLIFPMWCGMHRIHLGLHDFKVHVPAGGWIFYGLSALYSVLVIFAVINL >CP021644.1|AWY45995.1|1650125_1650881_+|sulfate-transporter-CysZ MLSFFSSFDSEIKAGFHYFIYGWRLMLQRQLMPFIIFPVIINAVLMISLIWLFFANVGGMLDSLLPSWLEWLSFILIPLAFLMILVAFYFAFTTLANFIAAPFNALLAEKVEQQLTGKNLMEMSFNEMLKDVPRMLKREWQKMWYSIPRLVALFLLGFIPVLGQTIIPILAFIFGAWLIAIQYCDYPFDNHKIQFQRMRNALAQYRTMNFTFGALVSIFTMLPFINLVVMPVAVCGATAMWVNEYKRALHD >CP021644.1|AWY45994.1|1649198_1650017_-|cell-division-protein-ZipA METHILFFILAGLLIAVLIGYSIWSARREKSRIFSNTFSTRPPSSPISNEITADIPTTLNPQGVVAQQPFNTETPADFIQSQQEVENSVKNIRISLQTQEISQPLYQETMPESPSEAYQQNQIQEQTVQVEQVETIEQTTEHNIITLYVVAPEGVQFQGNAIVQNLEMLGFHFGEYQIFHRHLDNPASPVLFSVANMMQPGVFDLARMEQFSTVGLVFFMHLPSVGNDLANLKLMIRTVESFAQSVGGFVLDEQHQIFNDESRQNYLLRVAN >CP021644.1|AWY45993.1|1647107_1649135_-|DNA-ligase-(NAD(+))-LigA MPHPIETQLEHLREKLREYEYHYHVLDNPLVPDAEYDRLMNELKNLEWQHPELITSDSPTQRVGAKPLDGFAQITHEIPMLSLDNAFSDDDLIGFLRRIEDRIAINSNQIEFCCEPKLDGLAVSILYVDGVLTQAATRGDGTTGEDITANIRTIRNIPLKLKTNNPPHRLEVRGEVFMPQQGFEQLNEKALAKGEKTFANPRNAAAGSLRQLDPKITSQRPLMLNAYNIGVYESDDELPTTHFDRLQWLKTLGIPVNAEITLATGSQALTAFYQKIQAKRSSLGYDIDGTVLKVNEITLQEQLGFISKAPRWAIAYKFPAQEEMTILNDVEFQVGRTGAITPVAKLEPVFVAGVTVSNATLHNGDEIERLGIAIGDTVIIRRAGDVIPQIVGVVAERRPDNAKKIAFPTACPVCNSAVVRVEGEAVARCTGGLFCGAQRKEALKHFVSRKAMDIDGVGEKLIEQLMERELIHTPADLFKLDHTTLMRLERMGEKSANNALQSIEKAKNTTLARFLFALGIRDVGESTAQNLANHFGTLDAIRQADLDTLKQVQDVGEVVANRLFQFWQEPHNVEVVEDLIAQGVKWQDVVPQEIADNPLKDKTVVLTGTLTQLTRDQAKALLQQLGCKVSGSVSSKTDYLIAGEKAGSKLAKAQELGVKILSEDELIGYFTTIVS >CP021644.1|AWY45992.1|1645220_1647050_+|DNA-helicase-RecQ MSVTPLAKAETVLHNVFGYQSFRQGQSEVIEAILSGKDCLVIMTTGGGKSLCYQVPALCFEGITLVISPLISLMKDQVDQLLINGVEAGYINSTQTIEEQQAVEQKAISGQLKLLYLSPEKVMTSNFFQFISLCKISLIAVDEAHCVSQWGHDFRPEYTLLGGLRKTFPNIPLVALTATADPTTRFDIIHHLKLEDPHTYLGSFDRPNIRYTVQEKFKPVDQLIKFISSQQGKSGIVYCNSRKKVEELTEKLSSHRFSVMGYHAGMTVQQRETVQNAFQRDNIQIVVATVAFGMGINKSNVRFVVHFDLPRSIEAYYQETGRAGRDDLPAEAVLFYDPADYGWLHKVLLEKPESEQRQIEQHKLQAIGAFAESQTCRRLVLLNYFGETRQVACQNCDICLDPPKKYDGLVDAQKVMSVIYRTGQRFGLHHIIAVLRGLNQQKIREYQHDTLSVYGIGKDKSQEYWISVTRQLIHLGFIRQNIVNHSALQLTEQARPILRGETALALASPRLSFSATTYVQKQQTSKRYDKDLFARLRFLRKQIADKENIPPYVVFNDATLQEMAEFMPTTADEMLSINGVGERKLERFGEAFLGLIREHLYHIESIVCD >CP021644.1|AWY45991.1|1644912_1645221_+|iron-donor-protein-CyaY MNLAEFHQAIEQVWEHIEEQLEEQGCDVDCETQGAVFTITFDDDSQIVINKQEAMLELWLASKLGGYHFAYRDGDWVSAEGRSFWTHLEEAVARHGETISFS >CP021644.1|AWY45990.1|1644200_1644830_+|repressor-LexA 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MSELAKDIIPISIEEELKNSYLDYAMSVIVGRALPDVRDGLKPVHRRVLFSMDQSGNVSSKPYVKSARVVGDVIGKYHPHGDSAVYDTIVRMAQPFSLRYMLVDGQGNFGSIDGDAPAAMRYTEVRMQKITQELLTDLDKETVDFSPNYDGKEMIPDVLPTKIPALLVNGSSGIAVGMATNIPPHNLNEVLNGCLAYIENEQITIEELMQHIPGPDFPTAAIINGRKGIEDAYRTGRGKVYVRAKASVETTSKGREQIVVTELPYQVNKKNLIEKIAELVRDKRIEGISSIEDYSDKKGISIVIEIKNNAVGEVVLNNLYALTQMQVTFGINMVALDHGQPKIFNLKQIIEAFVMHRREVVTRRTVFELRKARERAHILEGLAIALANIDPVIELIRNSKTADEAREGLLDRPWSLGNVAPMLEAAGVDASRPEDLASEFGVRDGQYYLSEDQARAILELRLHRLTGLEHEKIVDEYKELLVEISELLHILNSSERLMEVIREELEKIKAEFGDERRTEITAASGDINLEDLIAQEDVVVTLSHAGYVKYQPLSDYEAQRRGGKGKSATKMKEDDFIEKLLVANTHDTILCFSSCGRLYQLKVYQLPQASRGARGTPIVNILPLVKGENERITAILPVPNGEFSADKFIFMATASGTVKKVSLDAFSNVRSSGLIALKLREGDELIGVDITNGESEIMLFSAQGRVVRFAETAVRGMGRVATGVRGIKLATTEISVDDAEEVDIETVENEEAEEASSVNLTTDKVVSLVIPHTQGEILTVTQNGYGKRTALGEYPVKSRATKGVVSIKVNERNGKVVAAVQVEENDQIMLITDAGTLVRTRVNEVSLVGRNTQGVRIIRTAEDEHVVSLERICEIEDDGIENLSVEEA >CP021644.1|AWY46001.1|1661827_1662079_+|hypothetical-protein 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>CP021644.1|AWY46007.1|1669088_1669508_+|esterase MIWKKNTTIEQLNQLCQHSAISHLGIEFTAQQNDSLEATVPVDHRTTQPFGLLHGGISATLAETLGSAAALLCCEENQIPVGTELNISHLKAIKSGKATGRATPLHLGKESQVWQIEIRDDAQQLCAVARLSTKLLSQR |
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---|---|---|---|---|---|---|---|
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CP021644_2 | 2.3|1056523|38|CP021644|CRT | 1056523-1056560 | 38 | CP021644.1 | 1084675-1084712 | 0 | 1.0 |
CP021644_2 | 2.3|1056523|38|CP021644|CRT | 1056523-1056560 | 38 | CP021644.1 | 1657377-1657414 | 0 | 1.0 |
CP021644_2 | 2.3|1056523|38|CP021644|CRT | 1056523-1056560 | 38 | CP021644.1 | 1657611-1657648 | 0 | 1.0 |
CP021644_2 | 2.4|1056586|38|CP021644|CRT | 1056586-1056623 | 38 | CP021644.1 | 1657674-1657711 | 0 | 1.0 |
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CP021644_2 | 2.2|1056440|46|CP021644|PILER-CR | 1056440-1056485 | 46 | CP021644.1 | 1084575-1084620 | 1 | 0.978 |
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CP021644_2 | 2.5|1056649|38|CP021644|CRT | 1056649-1056686 | 38 | CP021644.1 | 1657737-1657774 | 1 | 0.974 |
CP021644_5 | 5.2|1657528|46|CP021644|PILER-CR | 1657528-1657573 | 46 | CP021644.1 | 1084575-1084620 | 1 | 0.978 |
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CP021644_2 | 2.1|1056369|36|CP021644|PILER-CR | 1056369-1056404 | 36 | CP021644.1 | 194028-194063 | 2 | 0.944 |
CP021644_2 | 2.1|1056369|36|CP021644|PILER-CR | 1056369-1056404 | 36 | CP021644.1 | 1215291-1215326 | 2 | 0.944 |
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CP021644_5 | 5.1|1657457|36|CP021644|PILER-CR | 1657457-1657492 | 36 | CP021644.1 | 194028-194063 | 2 | 0.944 |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CP021644_2 | 2.1|1056369|36|CP021644|PILER-CR | 1056369-1056404 | 36 | MT774380 | CrAssphage cr1_1, complete genome | 22-57 | 9 | 0.75 |
CP021644_2 | 2.1|1056369|36|CP021644|PILER-CR | 1056369-1056404 | 36 | MT774380 | CrAssphage cr1_1, complete genome | 99826-99861 | 9 | 0.75 |
CP021644_2 | 2.1|1056369|36|CP021644|PILER-CR | 1056369-1056404 | 36 | GU339467 | Mycobacterium phage RedRock, complete genome | 4988-5023 | 9 | 0.75 |
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CP021644_2 | 2.4|1056586|38|CP021644|CRT | 1056586-1056623 | 38 | MT774380 | CrAssphage cr1_1, complete genome | 20-57 | 9 | 0.763 |
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CP021644_5 | 5.1|1657457|36|CP021644|PILER-CR | 1657457-1657492 | 36 | MT774380 | CrAssphage cr1_1, complete genome | 99826-99861 | 9 | 0.75 |
CP021644_5 | 5.1|1657457|36|CP021644|PILER-CR | 1657457-1657492 | 36 | GU339467 | Mycobacterium phage RedRock, complete genome | 4988-5023 | 9 | 0.75 |
CP021644_2 | 2.1|1056369|36|CP021644|PILER-CR | 1056369-1056404 | 36 | MT774380 | CrAssphage cr1_1, complete genome | 1-30 | 12 | 0.667 |
CP021644_5 | 5.1|1657457|36|CP021644|PILER-CR | 1657457-1657492 | 36 | MT774380 | CrAssphage cr1_1, complete genome | 1-30 | 12 | 0.667 |
1. spacer 2.1|1056369|36|CP021644|PILER-CR matches to MT774376 (CrAssphage cr55_1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aagggtgaaccgggtcctaaaggtgaacaaggtatt CRISPR spacer aagggggaacctggtcctaaaggtgaaccgggagct Protospacer ***** ***** **************** .** ..*
2. spacer 5.1|1657457|36|CP021644|PILER-CR matches to MT774376 (CrAssphage cr55_1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
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3. spacer 2.1|1056369|36|CP021644|PILER-CR matches to MT774380 (CrAssphage cr1_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
aagggtgaaccgggtcctaaaggtgaacaaggtatt CRISPR spacer cagggagaacctggtcctaaaggtgaaccgggagaa Protospacer **** ***** **************** .** .
4. spacer 2.1|1056369|36|CP021644|PILER-CR matches to MT774380 (CrAssphage cr1_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
aagggtgaaccgggtcctaaaggtgaacaaggtatt CRISPR spacer ccgggagaacctggtcctaaaggtgaaccgggagct Protospacer *** ***** **************** .** ..*
5. spacer 2.1|1056369|36|CP021644|PILER-CR matches to GU339467 (Mycobacterium phage RedRock, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
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6. spacer 2.4|1056586|38|CP021644|CRT matches to MT774376 (CrAssphage cr55_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
aagggtgaaccgggtcctaaaggtgaacaaggtattcc CRISPR spacer aagggggaacctggtcctaaaggtgaaccgggagctga Protospacer ***** ***** **************** .** ..*
7. spacer 2.4|1056586|38|CP021644|CRT matches to MT774380 (CrAssphage cr1_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
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8. spacer 5.1|1657457|36|CP021644|PILER-CR matches to MT774380 (CrAssphage cr1_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
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9. spacer 5.1|1657457|36|CP021644|PILER-CR matches to MT774380 (CrAssphage cr1_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
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10. spacer 5.1|1657457|36|CP021644|PILER-CR matches to GU339467 (Mycobacterium phage RedRock, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
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11. spacer 2.1|1056369|36|CP021644|PILER-CR matches to MT774380 (CrAssphage cr1_1, complete genome) position: , mismatch: 12, identity: 0.667
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
578926 : 587307
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP021644|578926:587307|DBSCAN-SWA ACTAATGTTTGGTATCCGATTGACTTTGTGGTTGTAGATATTCTTCTCGATTCGGATCAACTTGTTTTGATTTACGAATCATTGGCTCAATAGTTGTACCTTGTACCAAAATAGAGAACATCACAACAGAATATGTCATCACCAGAATTAGATCTTTAACATCAATACCATTGGCATAAGCAGTTTTGGCTGGAATAGAAAGTGCCATTGCTAATGCCAAACCTCCACGTAATCCGCCCCAGCTCATGATTTTTAAGGTATATGGATTGTAAGTACGGAACTGTTGTAGCGCCTTATATGGTAACCATAAGCTGATATAGCGAGATGCTAGACAAATCGGAATTGTCAGAATCATCATCACAATACCGTAGATATTAAAATCGACGAGTAAGATCGCAAAACCGATAAGGAAGAAAAGCAGAGAATTTAAGAAATGGTCAATCATTTCCCAGAAGTGATCAAGATAACGTTGGCTCTGTTCAGAAAAGCCTGAACGACGGGTCCAGTTACCAATCATAATGCCTGCCACAATCATTGCCAACGCACCTGAAACGTGCAGAACATTGTTTGCAAACATAAAGCCTGCGGTTGGAATGGTCAAAGTTAATAAAATTTCTAAGCTACCATCATCGGTTGATGAAATTAAAATATGAGCAAGGAAGCCTAGCACAAATCCAAACAGGATACCGCCGATAGCTTCATGCAAAAAGAGGCTCATAATTCCACTAAAACTGGCTTCTTGACCACCAAATGCAACAGCAAACACAGTGACGAAGATAACTAAACCAACACCGTCATTGAAAAGCGACTCACCTTCTACTTGCATAGATAAACGCTTCGGTGCTCGTAAATTTTTGATGATCGCAAGTACAGCAATTGGGTCAGTTGGAGAAATCAGAGCACCAAAAACGATACAGTAAATCAAATCAATTTGTAGCCCAATTAAGTTGGCTACCCCATAGACGAAGAAACCAATAATCAAAGTTGAAGCTAAGGTTGAGAATAACGCAAAAATGGTAATTTCCCATTTTTGATCTTTAAGAACAGGGAGTTTAATTCCTAGTGAACCTGCAAAGAGTAGGAACCCTAAAATACCGTTAAGTAAGAAACTCTTGAAGTCGATCTGTTCCATGACTTCTGTTGCGACAGCATCAAGGTTAAACCAGCCGAAAGTTCCGAGTAACAGTAGTAAGAGAGAACCGATCATTGCTGCAGCTGTAATAGCAATGGTCGATTGGATTTTATCGCTGATTTTATGAGTAATGAAACCTAATAAAATAGAAAGTGCTGATAAAAAACAGATATAAGTATAAATACCCATGATGGTATCCTTATGGAGACAAAAAAGAAAGATCCTTGTTATAAATAGTCTGCAAATTAAACCAAATTTTTAATCTGATTGCAAAAAAATAAAAGATATTAAGTGAGCTATTTCACAAGTAACAATTTGAGAATTTTCCACTTTAACGGTATAATTAAGAGTAGTTTTTTGTAATTTTAGGGATCATAAAGATGATTGAAAAAATGCATGAGAAATCTGGTGGGTGGGTATTTAAAATCATTTTTGCATTAGTTTCTCTTTCGTTTGTATTAGGCGGTATTGGTGGTGGGTTGATGGCTACAGACAATTCCGTTGCCAAAGTCAATGGAGAAGAAATTTCTCAACAAGTATTTAGCCGAGCAAAAAATCAGCAGCAAAATATCCTAAATGCTCAATTAGGTGAGCGTTTTTGGGATTTAATGGACAATCCTATTTATGTCAAACAGTTCCACGAGAGTATTTTAAATGGTTTAGTTGATGACGAGCTTCTTCGTCAATACGCTAAGAGCCTTAAAATTGACGTTAGTGCCGATCAAATTAAATCAGAAATTGTAAACAGTCCTGCTTTCCAACAAGATGGTAAATTTAATAATAATTTATATCAGCAAGCATTACGTAATAATGGTTTAACGGCTGATGGTTATGCTGCAATTGTTTATGAAGGCATGCTATTTGCACAAATTCAAGAGGCTATTGTAAATAGTAGTTTTACCGTTCCTGCACAACAAGAACTATTAGCGAAATTATTGTTACAAAAACGTCAAGTACGTCTGGCGACCTATTCAATTGCAAAAGAGGTGAACAATCAAACCGCTTCTACAGAAGAAATGCAAGCCTATTATGAGGCAAATAAAGCGAATTTTGTTAATCCAGAAAAATTGACCGTAGAATATATTTCTATTGAACCAAAGGATTTGGCTAATAAAATTCAAGTTACTAACGAACAAATTGACACTTATTATCAAACAAACAAAGCTAAATATACGACAAAAGGCGAAGCGAAAATCGCACATATTCAAGTAGCCACTGAAGCTGAAGCAAATGAAATCGTACAAGCACTCGCTAAAGGTGAGGATTTTGCACAATTAGCAAAAGCAAAATCACAAGATAAATTATCTGCTGCTCAAGGTGGAGATTTAGGTTGGGCGAAAGCGGGCGTCTTCCCGAAAGCCTTTGAAGATGCGGCTAATATGTTAGACGCTGGAAAAACAAGCCAACCAATCAAGGTAGATAATGCTTTCCATATTATAAAAGTATTAGAACGTAATGTAGAAACTGTTGTGCCGTTAGAGAAAGTAAAAGCTCAAATTACGGATACAATTCGTAACGAGTTACTTTTAACGGAGTATTCAAACATCACCCGTGAAATGGCAAACGTAGCATTTGAAAATAGTGGCTCACTTGAAGCGGTTGCAAAAGTAGCGAATGTTCTAGTTCATAAAACAGATGCTTTCACACGTGAAACTGTACCTGCTGAACTTGATAACGAGAAAGTCCTACGCGTTTTATTCGACAGTGAAGTGCGCCAAAATGGGCAAAATTCAGAAGCTATTGATTTAAGTGATGCCACAAATACTAAAACGATGTTTGTTCGTGTAAGTCACTATCAAGCTGAAAACGTACAAACTTTTGACGAAGCAAAATCAGCAGTTGAACAAGCAGTGAAACAACAAAAAGCGCTCAAAGTCTTAGAAGAGAAAGCCACTACACAAGTTGCAGCATTGAATAAAGGCGAAACAGTAGAAGTCGCATTTGGTGCCTCTGAAGAACTTGTCTTTGCACAGGCACAAATCACTGAACCGGCTTTAGCACAAGCGGTCTTTTCAATGGCAAAACCTGCAGAAAAACCGACATATCAGACCGCTCGTAATACGAATGGTGACGTGGTTGTTATCGCTTTAGATAAAGTGAGCGATGGCACAGCTGACGAGTTTAAACCTTTACAAGCACAGTTTAACCAAGCAGAGCGAGTTGTGTTACGTAATGATTTACTCAAAGATTTACGTGAACGTGCAAAAATAGAAGTAAATCAAGACTTCCTTGACCAACTCGAAAGCAGCAAATAATATAAATGTGAATTTGGTTAAAAATTTGTAATTGACTTTATCTATAAATTTCCGCAAAATTCACGTAAATTTTTTAATCTTCAGGGCAGGGTGAAATTCCCGATCGGCAGTAAAGTCTGCGAGCGGCGGCGAAAGCCAAAGCAGGAACTGGTGAAATTCCAGTACCGACAGTGATAGTCTGGATGGAAGAAGAGCTAGAATGTCTACACTCGAACACTGTTCGAGTGCTTTTCTTATGCTTTTAACGCCTTGAGATCGTGAGATTTCAAGGCGTTTGTTTTTTCCTCTCCCGTTTACGGGAGAGGGAGGAGCCAATTCGGTAGAATTTGCGGAGGGAGAGGGTTTGCAATAAACTTCCCTCTCTCTGCTTTTCGTAAAGCCGTTACTTTGCTCAAAGCTGTCTCTCTCCCGTGAACGGGAGAGAATTATTCTTCTTCCTTGCCCTTCAATTTATGATTTAAAACCCAAAATGACACACTCTATTTTTATGGCTCGTGCCATTGAACTGGCTGAACTTGGTCGTGGCTGGACAAATCCTAATCCGTTGGTTGGTTGTGTGATTGTCAAGGACGGCAACATTGTTGCGGAAGGCTATCACCAACGCTACGGCGAATGGCACGCCGAACGTAAGGCGATTTTACATTGTCAGGAAGATTTAAGCGGAGCAACGGCTTACGTTACCCTTGAGCCTTGCTGTCACCACGGACGGACACCGCCCTGTTCTGATTTGTTGATTGAACGGGGGATTAAAACCGTCGTTATCGGCTCAAGTGACCCCAATCCTCTCGTGGCAGGCAAAGGTGTGGCACAACTTCGCCAAGCGGGGATTGAAGTGATTGAAAATGTGATGAAAGCCGAATGTGATGCGTTAAATCCAATTTTCTTTCACTATATTCAAACCAAACGCCCTTATGTGTTGATGAAATATGCGATGACCGCAGACGGTAAAATTGCCACCGCAACAGGCGAGGCCAAATGGATCACAGGGGAGCAAGCCAGAGCCAATGTGCAATGCACCCGACATCAATACAGTGCGATTATGGTTGGAGTAGATACCGTGTTGGCGGATAACCCGATGCTCAATAGCCGAATGCCAAATGCCAAACAGCCAGTACGGATTGTGTGCGATAGCCGGTTACGTACGCCATTAGAGTGTCAATTAGTCCAAACTGCCAAAACCTATCGCACGATAATTGCGACAGTTTCAGACGATTTGCAAAAAATCGCCCAATTCCAACCGCTTGGGGTGGAAGTACTGGTCTGTAAAGCAAAAGACAAGCGGATCGATTTAGCCGATCTTTTGCAAAAACTCGGCGACCAAGGCATTGACAGCTTATTGTTAGAAGGTGGTTCAAGTTTAAATTTCAGTGCGTTAAACGCTGGCATTGTAAACCGTGTGCATTGTTATATCGCCCCGAAATTAGTCGGTGGAGTTACCGCCAAAACGCCCATCGGTGGTGAAGGGATCGGCGTGTTGGCAAATGCGGTGCAATTGAAAAATGCAAAGATCCGCCAAATCGGCGAAGATCTTCTGATTGATTATGAAGTAGGAACACATTGATATGTTCACAGGTATTATTGAAGAAGTCGGCAAAGTCGCCAAAATCCACAAACAAGGGGAATTTGCCGTTTTAACCATCACGGGAAGCAAAATTTTTACGGATATGCACTTAGGCGACAGCATTGCGGTCAATGGTGTCTGTCTAACCGTAACCGAATTTGGTGCGAACCATTTTTCCGCAGATGTGATGTCGGAAACACTCGCTCGTACATCATTGGGCGAATTACAACCGAACAGCCCCGTTAATCTTGAACGTGCAATGGCGGCAAACGGACGTTTCGGCGGACATATTGTGTCGGGGCATATTGATGGCACAGGGGAAATTGTCAGCATTACCCCTGCGAATAATTCGGTCTGGTATCAGATTAAAACCACGGCAAAGCTGATGCGTTACATCATTGAAAAAGGCTCAATTACGATTGACGGAATAAGCCTGACGGTGGTTGATTGTGATGAAAACAGCTTCCGCGCATCGATTATTCCGCATACCTTAAGTGAAACGAATTTAGGCACGAAAAAAGTCGGTAGTATTGTGAATTTAGAGAACGATGTAATCGGAAAATATGTGGAAAAATTGCTGTCGCCGAAACAGAGCGAGCCACAGAGCAATATCACCGAAGAGTTTTTAAAGCGAGTGGGGTTTTAAATCCCCCTTAGCCCCCCTTTTTCAAAGGGGGGAATTATCAAAAAGGAAAGCAAAAAATTCCAGAATTTAAAGTAGGGACGCCACGCTTGGCGTCTGTAACAAGCGGTCAGATTTAAAGAAAAGGAAAGCAAATGTTTCAATTTTCAAGCGTAGAACAAGCCTTAGACGCATTACGTCAAGGCAAAATTATTATCGTCAGCGATGATGAAGACAGAGAAAACGAAGGGGATTTTATCTGTGCGGCGGAATTTGCCACTCCTGAAAATATCAACTTTATGGCAACTTATGGTAAGGGCTTGATTTGTATGCCAATTTCAACGGCGATAGCCAAAAAGCTCGACTTACCGCAGATGGTTTCTTACAACACCGATAACCACGAAACTGCCTTTACCGTTGCTATCGATCACATTGATACAGGCACGGGCATTTCGGCTTTTGAGCGTTCGCTTACTGCACTGAAAGTGGTGGACGACAACGCCAAACCAAGTGATTTTCGCCGTCCAGGGCATATGTTCCCCCTGCTTGCAAAAGACGGTGGCGTGTTGGTGCGTAACGGACACACAGAAGCAACGGTGGATCTGACTCGTTTAGCAGGGCTTAAACACGCAGGGCTGTGTTGTGAAATTATGGCAAACGACGGCACAATGATGAAAATGCCTGAACTACAAGCCTTTGCCACAAAACACAATATGCCGTTTATCACAATCGCCCAGCTTCAAGAATACCGCCGAGCAAAAGATTGTTTAATTGAGCAGATTTCTGTGGTCAAAATGCCTACCAAATATGGCGACTTTACCGCACATAGTTTTATCGAGAAAATCACAGGCAAAGAACACGTTGCCTTAGTGAAAGGGGATATTGGCAATGGAGAAGAGGTGCTGTGCCGTATTCACTCTGAATGTTTAACCGGCGATGCCTTTGGTTCACAACGTTGCGACTGCGGTCAGCAATTTGCCGCTGCAATGAGCCAAATTGAGCAAGAGGGTAGAGGCGTGTTGCTCTATTTACGTCAAGAGGGGCGAGGCATTGGCTTAATCAATAAACTGCGTGCTTATGAGTTGCAAGATAAAGGAATGGACACCGTCGAGGCAAATTTAGCTCTTGGCTTCGGTGAAGATGAACGTGAATACCATATCGGTGCACAGATGTTTCGCAGTTTAGGCGTAAAAACAATCCGCTTGCTAACCAATAACCCAGCGAAAATCGAGGGGTTACAGCAAGTTGGCTTAAATATCGTGGCACGAGAGCCGATTATGGTTGAACCGAATAAACACGATTTGGAATACCTTAAAGTTAAACAAGTTAAAATGAGACATCTGTTTAATTTCTAAACTTGTTAAATAACATTCATTTTACGGACACACGCAGTGTGTCCCTACGACAGTTTTATATCAATTTACATTCAATATAAGGAAAAGCAAAAATGGCAATTATCACAGGTAATTTAGTGGCAACAGGGTTAAAATTCGGCATTGTGTGTGCGAGATTTAACGATTTTATCAACGATAAACTGTTAAGCGGTGCGATTGACGCACTCGTTCGTCACGGTGCAAGCGAAAGCGATATTGATACCGCTTGGGTACCAGGCGCATTTGAAATTCCGTTGGTCGCGAAAAAAATGGCGGAAAGCGGTAAGTATGATGCGGTGATCTGCTTAGGTACAGTAATCCGTGGATCGACTACGCATTATGATTATGTGTGTAACGAAGCAGCAAAAGGCATTGGGGCAGTGAGTTTACAAACAGGTGTTCCAGTGATTTTTGGTGTATTAACCACTGAAAATATCGAACAAGCTATCGAACGTGCAGGCACAAAAGCAGGCAATAAAGGCTCTGAATGTGCGTTAGGTGCGATTGAGATGGTGAATGTGTTGAAGGGACTTTGATATTTTTATTCACTAGAGCCTTCTCCTTTTATGGTCACATTATGGCGATCGTCAAATAACACAATAAACTACTTTGGATAATACAATTTACCTTCGCCATATAAAAAGAGTTTATAACAACAACCCATCATCACTCAACTTCTCGTGGCGACTTTGCTCAAATAGACGCAATAAATCTGGTACATCCATCTTCTTGCGGGCATCGCCCGCCACATCAAAAGCCACCTGACCTTGATGCAACATTACAGTTCTATCCCCATAATCTAGGGCTTGTCGCATTGAGTGCGTCACCATTAACGTAGTGAGTTTTTGCTCTCTAACAATTTTATTCGTTAATTCTAACACGAAAGCGGTCGTTTTCGGGTCAAGTGCTGCAGTATGTTCATCAAGCAGTAAAATATTTGAAGGTTGCAACGATGCCATTAATAAACTAACCGCTTGGCGTTGCCCCCCTGATAATCTGCCCATTTGGTCAGTCAAGCGATTTTCCAAGCCTAATCCAAGTAAGGATAATTTCTCTTTGAATAGCTCTCTGACTTGGCGGTTCAGTGCAAAACCTAACCCTCGTTTTTGACCTCGTTGATAAGCTAAAGCCATATTTTCTTCAATGGTTAAGGTTTCGCAAGTTCCTGCCATTGGATCTTGGAAAACACGGGCAACTTGGTTAGCTCTTTGCCAGCTAGTCAATTTACTGACTTCTTTACCTTGAATAAAAATCTCACCGCTATCTATTGGATAATCGCCACTGATGGCATTAAGTAAGGTCGATTTTCCTGCCCCATTACTGCCAATTACCGATACAAATTCCCCTTCGGCAACATTCAGGCTCAATCCTCGTAGTACAGGATTTTCAATCACAGTGCCTTTATTGAACGTAATAAATAGATTATTCAACTCAATCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP021644|578926:587307|584650_585850_+|AWY45019.1|DBSCAN-SWA MFQFSSVEQALDALRQGKIIIVSDDEDRENEGDFICAAEFATPENINFMATYGKGLICMPISTAIAKKLDLPQMVSYNTDNHETAFTVAIDHIDTGTGISAFERSLTALKVVDDNAKPSDFRRPGHMFPLLAKDGGVLVRNGHTEATVDLTRLAGLKHAGLCCEIMANDGTMMKMPELQAFATKHNMPFITIAQLQEYRRAKDCLIEQISVVKMPTKYGDFTAHSFIEKITGKEHVALVKGDIGNGEEVLCRIHSECLTGDAFGSQRCDCGQQFAAAMSQIEQEGRGVLLYLRQEGRGIGLINKLRAYELQDKGMDTVEANLALGFGEDEREYHIGAQMFRSLGVKTIRLLTNNPAKIEGLQQVGLNIVAREPIMVEPNKHDLEYLKVKQVKMRHLFNF >CP021644|578926:587307|582781_583873_+|AWY45017.1|DBSCAN-SWA MTHSIFMARAIELAELGRGWTNPNPLVGCVIVKDGNIVAEGYHQRYGEWHAERKAILHCQEDLSGATAYVTLEPCCHHGRTPPCSDLLIERGIKTVVIGSSDPNPLVAGKGVAQLRQAGIEVIENVMKAECDALNPIFFHYIQTKRPYVLMKYAMTADGKIATATGEAKWITGEQARANVQCTRHQYSAIMVGVDTVLADNPMLNSRMPNAKQPVRIVCDSRLRTPLECQLVQTAKTYRTIIATVSDDLQKIAQFQPLGVEVLVCKAKDKRIDLADLLQKLGDQGIDSLLLEGGSSLNFSALNAGIVNRVHCYIAPKLVGGVTAKTPIGGEGIGVLANAVQLKNAKIRQIGEDLLIDYEVGTH >CP021644|578926:587307|585942_586404_+|AWY45020.1|DBSCAN-SWA MAIITGNLVATGLKFGIVCARFNDFINDKLLSGAIDALVRHGASESDIDTAWVPGAFEIPLVAKKMAESGKYDAVICLGTVIRGSTTHYDYVCNEAAKGIGAVSLQTGVPVIFGVLTTENIEQAIERAGTKAGNKGSECALGAIEMVNVLKGL >CP021644|578926:587307|580437_582312_+|AWY45016.1|DBSCAN-SWA MIEKMHEKSGGWVFKIIFALVSLSFVLGGIGGGLMATDNSVAKVNGEEISQQVFSRAKNQQQNILNAQLGERFWDLMDNPIYVKQFHESILNGLVDDELLRQYAKSLKIDVSADQIKSEIVNSPAFQQDGKFNNNLYQQALRNNGLTADGYAAIVYEGMLFAQIQEAIVNSSFTVPAQQELLAKLLLQKRQVRLATYSIAKEVNNQTASTEEMQAYYEANKANFVNPEKLTVEYISIEPKDLANKIQVTNEQIDTYYQTNKAKYTTKGEAKIAHIQVATEAEANEIVQALAKGEDFAQLAKAKSQDKLSAAQGGDLGWAKAGVFPKAFEDAANMLDAGKTSQPIKVDNAFHIIKVLERNVETVVPLEKVKAQITDTIRNELLLTEYSNITREMANVAFENSGSLEAVAKVANVLVHKTDAFTRETVPAELDNEKVLRVLFDSEVRQNGQNSEAIDLSDATNTKTMFVRVSHYQAENVQTFDEAKSAVEQAVKQQKALKVLEEKATTQVAALNKGETVEVAFGASEELVFAQAQITEPALAQAVFSMAKPAEKPTYQTARNTNGDVVVIALDKVSDGTADEFKPLQAQFNQAERVVLRNDLLKDLRERAKIEVNQDFLDQLESSK >CP021644|578926:587307|586515_587307_-|AWY45021.1|DBSCAN-SWA MIELNNLFITFNKGTVIENPVLRGLSLNVAEGEFVSVIGSNGAGKSTLLNAISGDYPIDSGEIFIQGKEVSKLTSWQRANQVARVFQDPMAGTCETLTIEENMALAYQRGQKRGLGFALNRQVRELFKEKLSLLGLGLENRLTDQMGRLSGGQRQAVSLLMASLQPSNILLLDEHTAALDPKTTAFVLELTNKIVREQKLTTLMVTHSMRQALDYGDRTVMLHQGQVAFDVAGDARKKMDVPDLLRLFEQSRHEKLSDDGLLL >CP021644|578926:587307|578926_580246_-|AWY45015.1|DBSCAN-SWA MGIYTYICFLSALSILLGFITHKISDKIQSTIAITAAAMIGSLLLLLLGTFGWFNLDAVATEVMEQIDFKSFLLNGILGFLLFAGSLGIKLPVLKDQKWEITIFALFSTLASTLIIGFFVYGVANLIGLQIDLIYCIVFGALISPTDPIAVLAIIKNLRAPKRLSMQVEGESLFNDGVGLVIFVTVFAVAFGGQEASFSGIMSLFLHEAIGGILFGFVLGFLAHILISSTDDGSLEILLTLTIPTAGFMFANNVLHVSGALAMIVAGIMIGNWTRRSGFSEQSQRYLDHFWEMIDHFLNSLLFFLIGFAILLVDFNIYGIVMMILTIPICLASRYISLWLPYKALQQFRTYNPYTLKIMSWGGLRGGLALAMALSIPAKTAYANGIDVKDLILVMTYSVVMFSILVQGTTIEPMIRKSKQVDPNREEYLQPQSQSDTKH >CP021644|578926:587307|583874_584519_+|AWY45018.1|DBSCAN-SWA MFTGIIEEVGKVAKIHKQGEFAVLTITGSKIFTDMHLGDSIAVNGVCLTVTEFGANHFSADVMSETLARTSLGELQPNSPVNLERAMAANGRFGGHIVSGHIDGTGEIVSITPANNSVWYQIKTTAKLMRYIIEKGSITIDGISLTVVDCDENSFRASIIPHTLSETNLGTKKVGSIVNLENDVIGKYVEKLLSPKQSEPQSNITEEFLKRVGF |
7 | Staphylococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
591740 : 672589
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP021644|591740:672589|DBSCAN-SWA 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84 | Mannheimia_phage(28.95%) | terminase,transposase,tail,portal,integrase,tRNA | attL 591662:591711|attR 628162:628211 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
753171 : 788769
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP021644|753171:788769|DBSCAN-SWA 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36 | Pseudomonas_phage(12.5%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
884922 : 895848
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP021644|884922:895848|DBSCAN-SWA TATGTGCGGCATTGTTGGGATTATCGGTCAAACCCCTGTAAATCAGGCGTTATATGACGGACTTACGTTATTACAACATCGGGGGCAAGATGCGGCAGGGATTGTCACTATTGACGATGAAAACCGCTTCCGCCTACGTAAAGCAAATGGATTAGTCAGCGATGTGTTTCGTCAAGAACATATGTTACGTTTGCAAGGAAATGTTGGCATAGGACATGTCCGTTATCCAACTGCAGGTTGCTCAAGTGTATCCGAAGCACAACCGTTTTATGTAAATTCCCCTTATGGTTTAACCCTAGTACATAACGGCAATCTCACCAACAATGCAGAGTTAAAACGCCTACTGTTCAACCTAGCCAAACGCCACGTTAATACAAACTCAGATTCAGAATCTTTACTCAATATATTTGCTTACTATCTCGATCAATATCCACACGAACCCCTAACGCCTGAAAATATCTTTGAAAGCGTTCGCAAAACTAACCAAGTGATTCGTGGGGCTTATGCTTGTTTAGCAATGATTATCGGACACGGAATGGTGGCATTTCGAGATCCACTCGGTATCCGATCGCTTGTACTCGGCAAACGAGAAATTGACGGCAAAACAGAATATATGTTTGCTTCAGAAAGTGTTGCACTTGATGTTGTTGGATTTGAATATGTTCGAGATGTACAAGCAGGCGAAGCCATTTATATTACCTTTGATGGACAATTCTACTCAGCAATCTGTGCCGATAACCCGAAATTGAACCCTTGTATCTTTGAATATGTCTATTTCGCTCGACCAGATTCTGTTATTGATGGCGTATCTGTTTACGCAGCAAGAGTACATATGGGGAAATTCTTAGGCGAAAAAATTGCGAAAGAGTGGACAGATATTCTGGCGGATATTGATGTGGTTATCCCGATTCCTGAAACTTCTACCGATATTGCCTTACAAATTGCAACAGTACTGAAAAAAACTTATCGCCAAGGGTTTGTGAAAAATCGCTACGTTGCTCGAACCTTTATTATGCCGGGGCAGGCACAACGAAAAAATTCAGTCCGTCGCAAGTTGAATGCCATTGCCTCTGAATTTAAAGGAAAAAATGTATTACTTGTTGATGATTCAATTGTTCGTGGCACTACCTCAGAGCAGATTGTTGAAATGGCTCGACAAGCGGGGGCAAATAAAGTCTATTTTGCCTCAGCTGCCCCTGAAGTACGTTATCCAAATGTATATGGTATTGATATGCCAACCTGTGAAGAACTGGTTGCTTATAATCGTAGCGTGGAACAAGTTGCTGAAATGATTGGTGTAGATCGCCTGATTTTCCAAGACTTATCGGCGCTCTTTAAGTCTGTTCAGTTAGAAAATCCAGATATTCACAACTTTGACGCTTCTGTTTTCACTGGGGAATATATAACAGGCGATGTGAGTTGCGAATACTTAAATGCGATAGCTCAAGCGCGCAATGATAAAGCCAAAACCGCCCAAGCGAAGCAGGCAGGTAATTTGGAAATTCATAATGAATAATCAAGAATGAGGCATAGCAGGCAAAAGTGTTGGTTTTAATTATTTCCCCTAATTATTAGGCGGCATAGTAGACAAAATGCCTTTAGTATTTGACGACTAAAGGCATTTTTCGTAGGGAAGTTAATTATGATTATTCATCTTTATCGATTCGGCTAAACACCGCACTTTGCTGATTTTTATATTTTGCATCTTTACGAGCATTATATGGATGTTCTGCGTAACCACTTAAAATTTCAAAGCTCAATGCACCAATTGCCATATTAGGACGTAATGCAAGCGGTAACTTTCCCGCATTAAAAAACTCAAGTACGATTTTGCCTTCCCAACCTGGATCGATACGATGGGCAGTAACGTGTACCATTAACCCAAGTCGAGCCAAAGAAGAACGACCATCAAGCCAGCCGACTATGTTGGCAGGTAGTTTCACTGATTCAAGCGTTGTTGCTAAAGCCAGTTCCCCAGGGTGTAGGAAAAAGGCTTCATCATCGGCAATCAGGATTTCATCACTCATTACACGATTAAGCTGTGCCGTCATTTCTTCACGTGGGCCGCTTAAATCAATATAAGGCGTTGAATGTTCACGAAACACACGGAAAGAATTACCCAAACGGACATCAATCGTCGCTCCACTGATTTTTTCATTTGATGGGCGAGGCGTTAGGCTGATAATCCCTTCATCAAGATAACGTTCAATATCTTTGTCACATAAACGCATAATTCCCCCTAATATATTAACTATGTCCTAATAGCTGTTTAATTTGTGCTTTCAAGATATTAATCGCAATACGGTTTTTACCACCTTTTGGAATAATAATATCCGCATACTGTTTAGATGGTTCAACAAATTGTAAGAACATCGGGCGAACCGTTTTACGATACTGATTTACGATAGATTCCATTGTTCTGCCACGCTCCTCCATATCACGCTGTAAACGACGGATAAAGCAGATATCTAAAGGGGCATCAACGAAAATAGACACATTAATTTCATCACGAATTTTTTCATCAGTAAGTAATAAAATACCTTCAAGAATGATGATTTTTTTAGGAGTGAAGTGGGTTACGGTTTTTTTGCGATTATGTTCTGCATAATCATATTCTGGAATATCAACAGTTTGCCCTTGTTTGAGGCTTTTAAGATGGGTAACTAACAGTTCGTGATCCATTGAGTTTGGGTGGTCGTAATTGGTTTTTACCCGTTCTTCCATTGCAAGATGGCTTTGATCTCGGTAATAAGCGTCTTCAGAAATAATACCAATATCATCTTGCCCCAATTCCGCTTGCAATTCTTTGTAAATAGTCGAAGCAATAAGACTTTTACCAGAAGCTGAAGCCCCTGCAATTGCAATAACAATACAAGATTCCTTTTGAGTGGTGTTTGACATAATTAAATCCTTGAACACACAACTGGAGAATTTAGGGAATTATATCGCAAAATCCGTAATCTTTTGAAGATAATTACCGAATTTTGGAGCCTGTACTAATTTTAGTAGTATTCATGCTTCATGTCAGTTCAGTATTCATTTAAACAAATGTATAGTAAACATGAATTACATCTAATTAAATGTAGGCTTACAATCTTCTTGCTTGCCAAAAACTTCTAGACCAATAAGGTGAATTAATATCTGAATAAATTACCCCACCTTTTGTTGAAGCGTGAAGAAACTGCCCATTTTTGACGTAAATGCCAACATGTCTGCCATTTGGCCCACGACCAGTTTTAAAAAAGACAAGATCACCCGTACGTAATTCACTCTTTGAGATTTGTATGCCTGCTTTTGCTTGATCTACTGTTATTCGAGGTAAATCAATACCAAATAACTCTCGGAAAGTAAGTTGCACAAAACCAGAGCAATCAATACCGCTTTTTGTTATACCGCCTAGACGGTAGCGTGTACCTTTCCACTCTCTTTGATGTTCGCTTAAACTGCTAATCACAAAAATGGAGTCTGAAAGCTGCCCTTTATGTTTATTTCCGCTTTTATCTTGAACTGTACTGGTTTTTGATACACAAGCGGACAATAAAAATGCACAAAGCAACATTGTGCATAAAGAAAAATGCTTTTTTATTAATTGATAGAACATTTTGATCCTTAAAAATATTCTGCGAAATACCAAGATTTCGCAGAATAATCATTTAGGCTTTTACCTTCGCATTTTCGACACGTTCACGCAATTTTTGTCCAGCTTTAAAAACCACAACTCGACGAGCAGACACTGCAACATCTTCGCCGGTTTTAGGATTACGACCTGGACGAGCTTTTTTATCACGAACAGTAAAATTGCCGAAGCCCGACAGTTTTACCTCTTCACCGCTCTCTAACGAGCGACGAATTTCTTCAAAAAAGTCCTCAACAAATTGTTTTGCGATACGTTTATCTAAACCACATCTTTCGACAAGGTTTTCTGCGATTTCAATTTTGGTAAGTGCCATAATTTATCCTTAAAATCTAATCTCTTAGATAAGTATTAAAACGTTGTGCAAGTGTTTCGAGAACAGCTTGAAGCACCGCATTAATTTCTTCCTCTTCAAGAGTTTTTTCAGTGTCTTGAATCGTTAAGCTGATCGCTAAACTTTTCTTACCTTCAGGTAAATTTGTGCCTTGGTAAACGTCAAATAAATTCACTGCCACAAGTTTAGCTCCACCTGCTTGTCTAGCCACATCAAGTAGATCACCTGCAGGTACATTGCTATCCACAACCACGGCAATATCACGTTTATTTGCAGGGAAACGTGAAATTTCTTTTGCATTTGGTACTGAACGCTCTGCAATCGCAGACCACAATAATTCAAAAGCAACAGGTTTACCTGACAATCCGAGTTTTTGAACAACTTTAGGGTGAATTGTGCCGATATAACCGATCTCTTGATCGTCGAGTAAAATAGCAGCAGATTGTCCAGGGTGGAACGCAGGATATGATTTTGCAACAAAACGTAAACGATTGCCAGCATTTGTTAGCGATAAAACACGCTCTAAATCCCCTTTTAGATCAAAGAAATCGACGTTTTCTGCTTTATGCTCCCAATGTGCCGGTCGTTTATCACCCACAATCACTGCACCTAAGACAAATTCTTGGCGTACGCCATTTTCTGCATTGGCATCTGGAATAAAGCGTAAACCACTTTCAAAAATACGCACTCGATTTTGCTGGCGGTTTTGGTTATAAGCAACGGTTTCAAGTAAGCCTGTTAAAAGCGACACACGCATTGCCGACATTTCACTTGAAATCGGATTTGGTAGAATTAACGCTTCTTGGCTTGGATGTAACAGCTCTTGCACTTTTGGATCAACAAAGCTATAAGTAATCACTTCTTGATAATCGCTATCGACCAAAGCCGTTCTCACACGAATAGCTTCTAAAATCTTCTCTGGGAAGCCTTTCATCTGTAAATGAGCAAGCGGTGCGTTATTTGGAATGCTGTTATAGCCGTAAATACGAGCTACTTCTTCCACAAGATCTTCTTCGATCTCAATATCAAAACGCCAGCTTGGTGATTGAACTGTCCAGCTCTCGTCTGCATAGCTTGGGTTTAAGCCTAAGCGAGCTAAAATATCGGTTACGGTTTCTGTTTCAATATGATGACCGAGTAAGCTATCTAATTTACTACGACGTAAAACCACTTGTTTTGACGTTGGTAAATGAGCCGAACTTACCGCTTCTACGATTTCACCAGCTTCACCGCCACAAATTTCAAGCAGTAACGTTGTCGCTCTTTCCATTGCTTTACGCGTTAATTCTGGATCAACGCCACGTTCAAAACGGTGAGATGCGTCTGTGTGTAAGCCATATTGTCTTGCACGACCTGTAATTGCAAGCGGTGCGAAGAATGCAGCTTCTAACACCACATCTTTGGTTTCGGCACTTACGCCACTCGCTTCACCACCAAAAATACCCGCCATTGCAAGCGGTCCGTTTTGGTCTGCAATTAACAAAGTATTTGGCTGAAGTTTTGCTGTCGTGCCATCAAGCAATACGAGTTCTTCACCCTCTTTTGCCATACGCACTTGAATTGCACCATTGATTTTTGCTGCATCAAAAGCGTGCATTGGCTGACCAAGTTCCAGTAAGCTCAGATTGGTAATATCCACAATCGGATCGATAGAACGAATACCACAACGGCGTAATTTTTCCTGTAACCATAATGGTGACTGAGCTTTGACATTCACATTTTTCACCACACGACCTAAATAGCGTGGGCAAGCTTCAGGGGCTTGAAGTTCAATCGTCACTTTATCTGCAATAGTTGCAGGCACAGCTTGAATTTCAGGTGCATTCACTGCTAATTGATTAACAACCCCAACTTCACGAGCGATCCCTGCAATGCTTAAACAGTCTGCACGGTTAGGCGTTAAGCTGATTTCAATCGCACGGTCGTTTAATTTGAGATAGTCACGGACATCTAAACCCACTGGTGCGTCCGCAGGTAACTCAATAATACCGCTATGATCTTCTTTAATCCCTAATTCTGAGAATGAACAAAGCATTCCCTCTGATGGCTGACCACGCAATTTGGTTTTCTTAATTTTAAAATCACCTGGTAACACAGCCCCTTCTGTTGCACAAGCCACTTTCAAACCTTGACGGCAGTTTGGTGCGCCACAAACAATGTCTAATAAACGTTCGCCACCCACATTCACTTTGGTGACACGCAATTTATCGGCATCAGGGTGTTGAGCACACTCAACCACTTCTCCGATCACAACACCGTTAAACTCACCTGCAACCGCTTCAACGGCATCAACTTCTAAACCTAACATAGTAATTTGGTCACATAGCTGTTCGGTGGTAATCGCTGGATTAACCCACTCACGCAACCAACTTTCGCTGAATTTCACTATTTCTATCCTATATTTGTAACGTTTTCTACAAATTTTACCGCTTGTTATGATGGACACACGCAGTGTGTCCCTACAAGAGAAAATAAGCCATTAGTATAGTAGCAACTGTGTTTACACACAAAAAAGTTATTCAATTTTGACCCACAGATTCTGTGGATAAGTAGCGTGTAGCGTCCCATTTTTCATTGCGTCTAACCAACGCATTCATAATGGTTAGCAGTTTACGCATACACGCCATAATAGCGACTTTCTTCGCTTTGCCTTTTGCAACCAATCGGGTGTAAAAGGCTTTAAAAACAGGTTCAAAGCGAATTGCCGATAGTGCTGCCATATATAAGGCATTACGAACAATCGCTCGACCACCATAGCAAAAGGATTTTCCTTTCCATTGACCGCTTTCCTGTGAATGCGGAATAACGCCAACGAGTGAGGCAATTCTTTTGCTGCTTAGCTTGCCTAATTCCGGCAGGCTTGACATCATCACGGCGACGCAATTTTTGCCAACGCCTTTGATGTCTGAGATAAGGTCAGCTTTATCACTAAAATGCTTACTTTGGTCGTCGATATCTTTATCAAGTTCGGCGATTAATTTATCAAGCATTTCAATGTGTTGTTGGATATTGTCCAACTGGGTTTCGTGGCTTTGTTGCAAACGATTTAGCTCTGCTACTCGCATATCCACAAGCTGACGACGGCGAACCACAAGGGCTTCCAGCTGTTCTTCTTGCTCAGAAAGCGGAACATACAACTGATGCTCTACTTCGCCTTTAAGCTCACAAGTGAGCCCATAGAAAGCGAGATTAACCGCATCTTTTGCATCGGTTTTGGCTCTCGTTTGAGATTTTGCAAACTCACTGGCTTTCAGTGGATTAGCAATAAATACACGATAACCTGCTCGAGCAAGGGCTTTTGCCACGGGGATTTCTAATCCACCCGTTGCTTCAAGCGTTATCAGAGCCACATTAAACTGGCTTAAATAGTCCAAGGTATGTTGAATACCTTTAGCGTTATTGGTTTCGGTTTTGGTCTTTTTCTGATGGGAAAAACCAATCACGAAATTGCGTTTAGCAACATCAATACCACAATAAATCGGAGCGTTCATCGGTAACCTGCCTTGTATTCGGGTTTATATTTCAACTGTTCGGTTTTGCTGATGAAGTTATCCACGCCTACGCTACAGAACGAGTTTTAGCTCTAGGGACACCCAAGCTGTGGATAACGTTATGGTTTATGTTGCTAGTTTACTATAATTTTAATATACAAGGGACACACTGCGTGTGTCCGCAAACTGCATATATCCGCAAAGTGATTAGATTACTTAAACTGCTTTAAGAAACGCAGATCATTTTCAAAGAATGAACGTAAATCGGTCACGTTATAACGCAACATCGTCAAACGCTCAACGCCCATTCCCACCGCAAAACCAGTGTATTCATCAGGATCAATGCCCACATTGCGAAGTACATTCGGGTGAACCATTCCGCAACCTAACACTTCAAGCCATTTACCGTTTTTACCCATTACGTCCACCTCTGCCGACGGCTCTGTAAATGGGAAATAAGACGGACGGAAACGCACTTGCAGATCTTCTTCAAAGAAAGCTCTTAAGAAATCGTGCAATAAGCCTTTTAACTCAGTAAAGTTCGCTTTTTTATCTACATAAAGCAGTTCAATTTGATGGAACATCGGCGTATGGGTTTGATCGTAGTCGTTACGATAAACACGCCCTGGTGCCATAATGCGAATAGGCGGTTGCATTTTTTCCATAGTACGAATTTGAACGCCTGATGTTTGTGTACGCAACAAACGCTCTGCATCAAACCAGAAAGTATCGTGATCTGCACGAGCAGGGTGATGTGCAGGGATATTTAACGCATCAAAGTTATAATAATCCGTTTCAATTTCAGGGCCTTTTTCTACACTAAAGCCAAGTTCTGAGAAGAATTTCACCACACGTTCAATTGTAATCGACACTGGGTGCAAACCACCTAACTCTGTTTTACAACCAGGTAAGCTCACATCAATACTCTCACTCGCTAATTTAGCATTGAGTTCTTCTGTTTCTAACTGCTCTTTTTTCCCATTTAACGCATCTTGTGCTTTCTGTTTTGCTTCATTAATTTTTGCACCCACCGCAGGACGTTCATCTGCTGGCACATCACGCAAGCCTTGCATTAACAAGGTAAAATGACCTTTCTTACCAAAATATTCAACACGCAATGCTTCAAGACTTGCAACATCACTGGCTTTTTCAACCGCTTGTAACGCTTCAGCAACGATATTTTCTAGGTTTTGCATACCTACCCTCTAATCAATTTCAACATAAATAAACTGAATGCCTCATTCATAGGCAAAACGCCTTGAATAATAATACTTCTAAGCGATATTGTAAATTTAAAAGTGAGGATTTTGTGGGGGTAACATTTTGATTTGTAACAGCTATCAAAGATAAACACTGTGATTATTTTACCATTTTTGCTAAAAAAACACCAAATATTACCGCTTGTTAAACATTAATCCGTGATCTTCTTGAAAACATACGGTAAAATTTACACCGATTTGCAAAAGTGCAAATCAACGCTGTTAAATTTTATTGGAGATATACCTATGGCAAAGAATAATATTTTAGGATTATTCGCACAGTCGCCACTCAAGCCATTACAAAAGCACTCAAAAAAAGTGACTGAATGTTGTGGATTACTAATCCCATTTTTTGAAGCGAGTTTTCAAAAAAATTGGGAAGTAGCGGAAGATATCCGTCGTCAAGTCATTGATTTAGAAAACCGCGCAGATACCCTTAAACGTGAAATTCGTTTAAAATCACCGCGTGGTTTATTTATGCCTGTTGAACGTACTGACTTACTTGAACTCGTTACACAGCTAGATAAATTAGCAAACTATGCTAAAGATATTTCTGGTCGTGCAATCGGTCGTCAATTAAACATTCCTGAAGAAATCCAACCTATTTTCCAACAATTCTTAACCCGTAGCCTTGATGCAACAGTTCACGTTGATAAAGTAATTAATGAAATGGATCACCTACTTGAAACAGGCTTCCGTGGTCGCGAATTAAATTTTGTGAACAATATGATTTTAGAGTTAGATGTTATCGAAGACGATACGGATCAACTTCAAATCGTACTACGCCGAGCAATGTTAGCGATTGAACAACAATACAATCCAATTGACATTATGTTCTTATACAAAATTATCGAATGGGTCGGAGTTCTTGCAGATCAAGCACAACGTATCGGTTCACGCATTGAGTTAATGTTAGCTCGTTCATAATCGAAAGAGGACTTAAATAATGGAACTGATTCAAGAATATGGCTCGATGATTGTCTTCATCACCGCAGTGTTTGGCTTCTTTATGGCATTTGGTATCGGTGCAAACGATGTTTCAAATGCAATGGGAACCTCTGTAGGTTCAGGCACTATCACTGCAAAACAGGCAATTTTAGTTGCAATGGTTTTTGAATTTGCTGGTGCTTATTTAGCAGGCGGTGAAGTAACTGAAACCATCAAAAGTGGCATCATTGATATTCACCAATTCTCTGGCAGACCAGACACCCTTGTACTAGGTATGATGTCGGCACTTTTTGCTGCAGGTACTTGGTTATTACTTGCCTCTAAAATGGGCTGGCCAGTATCCACTACTCACTCTATTATCGGTGCAATTATCGGTTTTGCGTTAGTCACCGTTGGTGCGGAAGCGGTTCATTGGGGTGATTTGTCTGGTATCGTAGGTAGCTGGTTTGTTACGCCTGTTGTATCGGGGATCATTGCTTATGCTATTTTTACTAGCACACAAAAACTGATTTTTGATACTGATAATCCGATGAAAAATGCTCAAAAATATGGTCCATTCTATATGGGTTTAACCACATTCATTTTGAGTATTGTTACAATGACAAAAGGCTTAAAACACGTTGGTTTACAGCTTACAATGACTGAAACCTTAGTGATTTCAAGTGCAATCTCAATTACGTCTATCATCACTTGTTTCTTCTACTTCCGTAGCCAATCTTTTGCTAACCGTGTACAAGGCGGTGCATTTGGTGGTGTAGAAAAAGTGTTCAGCATTTTAATGTTACTCACCGCTTGTTCAATGGCATTTGCTCACGGTTCAAACGACGTAGCTAATGCGATTGGGCCTTTATCTGCCGTAGTATCTATCGTTGAGAACGGCGGTGTGATTGAAGCGAAATCAATTCTCGCTCCTTGGATTTTACCATTAGGTGCAACGGGTATCGTTGCTGGTTTAGCGGTAATGGGTTACAAAGTAATGGGAACGATCGGAACTGGTATTACTGACCTAACCCCAAGCCGTGGTTTCTCAGCAGAATTTGCAACAGCAATGACCGTTGTTGTTGCCTCTGGTACAGGTTTACCTATTTCAACAACACAAACCTTAGTAGGTGCGGTATTAGGCGTAGGTTTTGCTCGTGGTATTGCAGCGTTAAACTTAACAGTTATTCGTAATATCGTTGCATCTTGGGTTGTAACCTTACCTGCTGGTGCATTCTTCTCAATTTTAATTTTCTATATTTTGAATGCAATTTTCTATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP021644|884922:895848|888009_888522_-|AWY45295.1|DBSCAN-SWA MFYQLIKKHFSLCTMLLCAFLLSACVSKTSTVQDKSGNKHKGQLSDSIFVISSLSEHQREWKGTRYRLGGITKSGIDCSGFVQLTFRELFGIDLPRITVDQAKAGIQISKSELRTGDLVFFKTGRGPNGRHVGIYVKNGQFLHASTKGGVIYSDINSPYWSRSFWQARRL >CP021644|884922:895848|888574_888871_-|AWY45296.1|DBSCAN-SWA MALTKIEIAENLVERCGLDKRIAKQFVEDFFEEIRRSLESGEEVKLSGFGNFTVRDKKARPGRNPKTGEDVAVSARRVVVFKAGQKLRERVENAKVKA >CP021644|884922:895848|892592_893576_-|AWY45299.1|tRNA|DBSCAN-SWA MQNLENIVAEALQAVEKASDVASLEALRVEYFGKKGHFTLLMQGLRDVPADERPAVGAKINEAKQKAQDALNGKKEQLETEELNAKLASESIDVSLPGCKTELGGLHPVSITIERVVKFFSELGFSVEKGPEIETDYYNFDALNIPAHHPARADHDTFWFDAERLLRTQTSGVQIRTMEKMQPPIRIMAPGRVYRNDYDQTHTPMFHQIELLYVDKKANFTELKGLLHDFLRAFFEEDLQVRFRPSYFPFTEPSAEVDVMGKNGKWLEVLGCGMVHPNVLRNVGIDPDEYTGFAVGMGVERLTMLRYNVTDLRSFFENDLRFLKQFK >CP021644|884922:895848|891408_892380_-|AWY45298.1|transposase|DBSCAN-SWA MNAPIYCGIDVAKRNFVIGFSHQKKTKTETNNAKGIQHTLDYLSQFNVALITLEATGGLEIPVAKALARAGYRVFIANPLKASEFAKSQTRAKTDAKDAVNLAFYGLTCELKGEVEHQLYVPLSEQEEQLEALVVRRRQLVDMRVAELNRLQQSHETQLDNIQQHIEMLDKLIAELDKDIDDQSKHFSDKADLISDIKGVGKNCVAVMMSSLPELGKLSSKRIASLVGVIPHSQESGQWKGKSFCYGGRAIVRNALYMAALSAIRFEPVFKAFYTRLVAKGKAKKVAIMACMRKLLTIMNALVRRNEKWDATRYLSTESVGQN >CP021644|884922:895848|894585_895848_+|AWY45301.1|DBSCAN-SWA MELIQEYGSMIVFITAVFGFFMAFGIGANDVSNAMGTSVGSGTITAKQAILVAMVFEFAGAYLAGGEVTETIKSGIIDIHQFSGRPDTLVLGMMSALFAAGTWLLLASKMGWPVSTTHSIIGAIIGFALVTVGAEAVHWGDLSGIVGSWFVTPVVSGIIAYAIFTSTQKLIFDTDNPMKNAQKYGPFYMGLTTFILSIVTMTKGLKHVGLQLTMTETLVISSAISITSIITCFFYFRSQSFANRVQGGAFGGVEKVFSILMLLTACSMAFAHGSNDVANAIGPLSAVVSIVENGGVIEAKSILAPWILPLGATGIVAGLAVMGYKVMGTIGTGITDLTPSRGFSAEFATAMTVVVASGTGLPISTTQTLVGAVLGVGFARGIAALNLTVIRNIVASWVVTLPAGAFFSILIFYILNAIFY >CP021644|884922:895848|888887_891275_-|AWY45297.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKFSESWLREWVNPAITTEQLCDQITMLGLEVDAVEAVAGEFNGVVIGEVVECAQHPDADKLRVTKVNVGGERLLDIVCGAPNCRQGLKVACATEGAVLPGDFKIKKTKLRGQPSEGMLCSFSELGIKEDHSGIIELPADAPVGLDVRDYLKLNDRAIEISLTPNRADCLSIAGIAREVGVVNQLAVNAPEIQAVPATIADKVTIELQAPEACPRYLGRVVKNVNVKAQSPLWLQEKLRRCGIRSIDPIVDITNLSLLELGQPMHAFDAAKINGAIQVRMAKEGEELVLLDGTTAKLQPNTLLIADQNGPLAMAGIFGGEASGVSAETKDVVLEAAFFAPLAITGRARQYGLHTDASHRFERGVDPELTRKAMERATTLLLEICGGEAGEIVEAVSSAHLPTSKQVVLRRSKLDSLLGHHIETETVTDILARLGLNPSYADESWTVQSPSWRFDIEIEEDLVEEVARIYGYNSIPNNAPLAHLQMKGFPEKILEAIRVRTALVDSDYQEVITYSFVDPKVQELLHPSQEALILPNPISSEMSAMRVSLLTGLLETVAYNQNRQQNRVRIFESGLRFIPDANAENGVRQEFVLGAVIVGDKRPAHWEHKAENVDFFDLKGDLERVLSLTNAGNRLRFVAKSYPAFHPGQSAAILLDDQEIGYIGTIHPKVVQKLGLSGKPVAFELLWSAIAERSVPNAKEISRFPANKRDIAVVVDSNVPAGDLLDVARQAGGAKLVAVNLFDVYQGTNLPEGKKSLAISLTIQDTEKTLEEEEINAVLQAVLETLAQRFNTYLRD >CP021644|884922:895848|886567_887152_-|AWY45293.1|DBSCAN-SWA MRLCDKDIERYLDEGIISLTPRPSNEKISGATIDVRLGNSFRVFREHSTPYIDLSGPREEMTAQLNRVMSDEILIADDEAFFLHPGELALATTLESVKLPANIVGWLDGRSSLARLGLMVHVTAHRIDPGWEGKIVLEFFNAGKLPLALRPNMAIGALSFEILSGYAEHPYNARKDAKYKNQQSAVFSRIDKDE >CP021644|884922:895848|887168_887822_-|AWY45294.1|DBSCAN-SWA MSNTTQKESCIVIAIAGASASGKSLIASTIYKELQAELGQDDIGIISEDAYYRDQSHLAMEERVKTNYDHPNSMDHELLVTHLKSLKQGQTVDIPEYDYAEHNRKKTVTHFTPKKIIILEGILLLTDEKIRDEINVSIFVDAPLDICFIRRLQRDMEERGRTMESIVNQYRKTVRPMFLQFVEPSKQYADIIIPKGGKNRIAINILKAQIKQLLGHS >CP021644|884922:895848|884922_886437_+|AWY45292.1|DBSCAN-SWA MCGIVGIIGQTPVNQALYDGLTLLQHRGQDAAGIVTIDDENRFRLRKANGLVSDVFRQEHMLRLQGNVGIGHVRYPTAGCSSVSEAQPFYVNSPYGLTLVHNGNLTNNAELKRLLFNLAKRHVNTNSDSESLLNIFAYYLDQYPHEPLTPENIFESVRKTNQVIRGAYACLAMIIGHGMVAFRDPLGIRSLVLGKREIDGKTEYMFASESVALDVVGFEYVRDVQAGEAIYITFDGQFYSAICADNPKLNPCIFEYVYFARPDSVIDGVSVYAARVHMGKFLGEKIAKEWTDILADIDVVIPIPETSTDIALQIATVLKKTYRQGFVKNRYVARTFIMPGQAQRKNSVRRKLNAIASEFKGKNVLLVDDSIVRGTTSEQIVEMARQAGANKVYFASAAPEVRYPNVYGIDMPTCEELVAYNRSVEQVAEMIGVDRLIFQDLSALFKSVQLENPDIHNFDASVFTGEYITGDVSCEYLNAIAQARNDKAKTAQAKQAGNLEIHNE >CP021644|884922:895848|893885_894566_+|AWY45300.1|DBSCAN-SWA MAKNNILGLFAQSPLKPLQKHSKKVTECCGLLIPFFEASFQKNWEVAEDIRRQVIDLENRADTLKREIRLKSPRGLFMPVERTDLLELVTQLDKLANYAKDISGRAIGRQLNIPEEIQPIFQQFLTRSLDATVHVDKVINEMDHLLETGFRGRELNFVNNMILELDVIEDDTDQLQIVLRRAMLAIEQQYNPIDIMFLYKIIEWVGVLADQAQRIGSRIELMLARS |
10 | Mollivirus(11.11%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
918676 : 1031764
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP021644|918676:1031764|DBSCAN-SWA 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141 | Mannheimia_phage(39.29%) | terminase,transposase,tail,tRNA,head,plate,bacteriocin,holin,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1036497 : 1042119
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP021644|1036497:1042119|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP021644|1036497:1042119|1037761_1038181_-|AWY45456.1|DBSCAN-SWA MNVAYTQLFNMAFSDEEDKQFFIEQFKYWKQNGENSSYHFGKDGFYTPIQSGLRHVHLVPVINILDKINWDKHWQTGQRRTSDTCLVYVEDGSDYLLITILPEPLAHKIAAQREENHRVIMKHFRHIAEQFFYYRNIVS >CP021644|1036497:1042119|1038177_1038375_-|AWY45457.1|DBSCAN-SWA MIILQAQPMAQVPHNAVFAVVETHQKPLREVPALSPQEYKVFANVERYAQQMTEESLMRAMVLIK >CP021644|1036497:1042119|1036497_1036959_-|AWY45453.1|DBSCAN-SWA MATDDIIKVKSAFNALLKNISKPRRRLLYQQIGRELARSQRRRITAQQNPDGSSYTPRKVQRKKRKGKIKQNAMFLKLKSARFMKLRTAGDNIELGYSGSDAHIAQIHQYGLKGRVVRSANWKVKYDQRELLGFTDEDIEMIENFVIKALAGQ >CP021644|1036497:1042119|1040623_1040827_-|AWY45462.1|DBSCAN-SWA MRKETATKFNTYLAGVAQDNGVDYNHIFTGKNFVSSNDDFVVENYAQVALLKNISMLASPDTTGVGG >CP021644|1036497:1042119|1038836_1039304_-|AWY45459.1|DBSCAN-SWA MFSIISGMIEKSFGKAMIIALLVAVCINAFLCYECKILQADNKAKQAEIALVRADNQSLANQLEQANQHILQYQKQVDKLHQQVLTKLTQAEKRTNEILLELENNQSWSYQPVPTGVSRLLNQRSDTVSNSKANSAPLPPNKAVPQPQVRDKNQR >CP021644|1036497:1042119|1041822_1042119_+|AWY45464.1|DBSCAN-SWA MTDIATNQAEQTALINMNTHREAQLKYWAGYSLTEIAKMLNIPVSTIASWKKREKWDEAPLFERVSGNIESRYMLLLQKDVKTGYDFKELDFLMHRRE >CP021644|1036497:1042119|1040839_1041655_-|AWY45463.1|capsid|DBSCAN-SWA MPKKSNWFVVATEGATVDGRQIERQWLSDIAETYDPKTYGARINLEHFHLFWFDPELAHSKCYGDVLAVKAEENDEGKLQLYAQIEPTDELVELVKSKQKVYTSIEVRTNFAKTGKAYLTGLAVTDTPASLGTQYLSFTTKNGEQQGEIFTTEAVECSLTFAEEPVSFFEKMKAMFSKEKADTAQHKADVEARFAEHEQAQLLLAEKFTELEDKLKQTEAEKMALCADFEKLSSDLTALQSRVDVIGSEPAHGYTPRPEITGGELNNERVF >CP021644|1036497:1042119|1036999_1037434_-|AWY45454.1|tail|DBSCAN-SWA MIKPDKLRDLLTKTIPYFAKKPEQLQIYYANGKIWATGATSLSYQYLYDLEIVVEDFPEHPDLLFVPVMEFIRLQQSELMTNPNKQDSITFEIDPNNNATHDIYIKIPLTERVIVKQEGDHYQVHHAEEPQPTEWQPLERLTIL >CP021644|1036497:1042119|1038433_1038628_-|AWY45458.1|DBSCAN-SWA MNKNAPYIREIVDRTKQVGGTRIVGKTKEEIQKNALLVLQQQLKQSNQNVRTQSPDQSRLLVVN >CP021644|1036497:1042119|1039796_1039934_-|AWY45461.1|DBSCAN-SWA MGILFGLFTLLMNWYYKDREIKLKEKALECYKINLKDILDDEQKS >CP021644|1036497:1042119|1037430_1037649_-|AWY45455.1|DBSCAN-SWA MKDQIDRANELAEKEREFALAKLRNKPTACSLTHCEDCDEPIPEARRQNVQGCTRCIDCQQIYEYKQKGYRK >CP021644|1036497:1042119|1039288_1039813_-|AWY45460.1|DBSCAN-SWA MNKNLKFGGAMVCGIGAIIGLVQLNHPEIRTSPKGLDIIGNTEGCRRDPYVCPANVLTVGIGSTEATSGKIERKIYSDKEIADRWAKDLAEAERCVNRYANGKKMPQGAFDALTSITFNAGCGTMRHSTLFKLANQGYSPAMCEQFSRWVYANGKKLRGLEIRREKEQALCLAL |
12 | Mannheimia_phage(100.0%) | tail,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1153769 : 1208105
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP021644|1153769:1208105|DBSCAN-SWA 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78 | Mannheimia_phage(67.39%) | terminase,tail,tRNA,integrase,bacteriocin,holin,capsid | attL 1156893:1156914|attR 1212884:1212905 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1239423 : 1254450
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP021644|1239423:1254450|DBSCAN-SWA 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11 | Bacillus_virus(11.11%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1813707 : 1883843
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP021644|1813707:1883843|DBSCAN-SWA 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>CP021644|1813707:1883843|1883531_1883843_+|AWY46185.1|head,tail|DBSCAN-SWA MVKPEIDLDEIKAHLRIEHDLDDELLTLYADTALEVAQNHIGKTWGESTTAETVQFTNGIKVGCLMFIGHLYANRETVSDVQLYEVPFAIKALWNPYREPAIY >CP021644|1813707:1883843|1859062_1859407_+|AWY46175.1|DBSCAN-SWA MIQRFQVGKRLSEMAIYNGVAYLAGQVPEDDSQDMYGQTKQVLAEIDKWLAQAGTNKSRILMAQVFVSNMIEFDEMNRAWDEWVAEGNAPPRAAVEAKLANPNWKVEIVVTATI |
55 | Bacillus_phage(12.5%) | transposase,tail,portal,tRNA,head,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2074088 : 2137903
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP021644|2074088:2137903|DBSCAN-SWA AATGAAAATTCTCGGTATTGAAACTTCTTGTGATGAAACTGGCGTGGCAATTTATGATGAAGCCAAGGGATTAGTCGCAAACCAACTTTATAGCCAAATCGAAATGCACGCTGACTACGGTGGCGTTGTGCCAGAGCTAGCTTCTCGTGATCATATCCGTAAAACATTGCCACTTATTCAAGAAGCATTAAAAGAAGCTAATCTCACCGCTTCGGATATTGATGGCGTTGCTTATACGGCAGGCCCAGGACTTGTTGGGGCGTTATTGGTCGGCTCAACCATTGCACGATCTTTAGCTTATGCGTGGAACGTTCCAGCTTTAGGGGTTCACCATATGGAAGGGCATTTGCTCGCACCAATGTTAGAAGAAAACGCCCCTGAGTTTCCTTTTGTCGCCTTACTTGTTTCGGGGGGACACACTCAGCTAGTCGATGTAAAAAATGTGGGTGAATATGAATTGTTGGGGGAATCTATTGATGATGCTGCGGGGGAAGCCTTTGATAAAACTGCAAAATTGCTCGGTTTAGATTACCCAGGGGGGGCAGCGTTAGCTAAACTTGCTGAAACTGGCACGCCAAATCGTTTTACCTTTCCACGTCCAATGACGGACCGCCCAGGCTTAGATTTCAGCTTTTCGGGCTTGAAAACCTTTGCGGCAAATACGATTAATGCGAATTTGAATGAGAAAGGCGAATTAGATCAACAGACCCGTTGCGATATTGCCTATGCGTTCCAACAAGCAGTGATTGAAACATTGATTATCAAATGCCGTAGAGCGTTGCAACAAACGGGCTATAAACGTTTAGTGATCGCAGGCGGTGTGAGTGCAAATAAACAACTTCGTCACGATTTATCCGAATTAATGAAGCAGATCGGCGGTGAAGTCTTTTACCCTCGCCCACAATTTTGTACCGATAATGGTGCAATGATTGCCTATGCAGGTTTCTTGCGTTTAAAAAATGGCGAACAGACGGATTTATCCGTGAGTGTCAAACCACGTTGGCCGATGGTTGAACTTTGTCCCATCGATGTATAGTAGACAAAGTATTATAAAGGGTAGATTAAGATATTGTAATATAAGGCTTTGAGCCACTTTTTTGAATTATCAGGACTATTCAAAGTATCTCGAAAGCCCCTAAAATAGCATTAAATCCACTACTATCACGTTATTTAAATATTATTGTGGATACGACCTTCTTTGATCGTGAACTTGGTATTTTAGTCCTGATGGATTTACTTTCTAAAAAAATGGTTTGCCATTGAGTTATCAAAACATAAAAAGATGTTTATTACAGGATAGCGTTCAATTTTGTCTATTATGCCTTTATTGATTCGCTCTAGAAAAAGCCGCCGCTTCCGCGATTAATGCATCACTTGGACGAATCCCCGTATAAAGCACAAATTGCTCAACCGCTTGTAAAGTCATCACTTCTGCACCAGAAATCACCTGTTTGCCTTGAGCTTTCGCATACTGAATCAAAGGCGTTTCTGCTGGCATTGCTACTACGTCAAAAGCCGTTTGAGCCTGTTGAATCATCATTTCAGGGAAAGCTAAGTCAAATTCTTCTTTTCCGCCCGTCATACCAATGGGGGTGACATTGACTAAAATATCCGCTGGTTGATTTTCAAGGCTATTGATATATTGATAGCCGTAAAGTCCAGCAAGATATTTTCCTGTTTCTTGATTACGGGCATAGATTTTTACATTCGTAAAACCTGAATGTTTAAATGCGGCAACAACGGCTTTTGCCATACCGCCGCTGCCTTGGACAATCACACAAGCGGTTGGATCGAGCTGATATTTTGCAATTAATTTCTCAATCGCAATATAGTCGGTGTTATAGGCTTTCAAATAGCCATTGGTATTGACAATCGTATTGACCGATTCAATCGCTTTTGCAGATGCATCAATTTCGTCTAAAAATGGCATACAGGCTTCTTTAAACGGCATAGACACCGCACAGCCCCGAATACCTAAGGCTCTCACGCCCTTAACAGCGTGTTCAATATCTTTGGTGGTAAATGCTTTATAAACAAAGTTTAAACCGAGTTTTTGATAAAGATAATTATGGAAATAAGTGCCGGTGTTGCCTGGTCTGCCCGATAGGGACATACAAAGTTGAGTATCTTTATTGATCATAAATTTGCCTTATTGAATAGAATAATAAGTGCCATTATGCTGTTTTAGATGTAAAACAACAAGGAAGTCGTGAAAAAACAAAAGCCCTGGGTTTCCCCAAGGCTTTCTTTTTGCATTAACGCATAAGCGAAAATTATTCGCCAAGACGCTCTTTGATACGTGCAGATTTACCTGAACGCTCACGTAAGTAGTAAAGTTTCGCTTTACGTACCGCACCTTTACGTTTAACAGCAATGCTGTCAATTACAGGTGAGTGAGTTTGGAATACACGCTCAACGCCTACGCCGTTTGAAACTTTGCGTAAGGTGAATGCTGAGTGCAAGCCACGGTTACGAATTGCAATAACCACGCCTTCGAACGCTTGCAAACGTTTTTTACTACCTTCTACTACCCATACCTTAACTTCTAATGTGTCACCTGGACGGAAGCTAGGTACGTTTTGTTTTAACTGTTCTTGTTCGATTTGTTTGATGATGTTACTCATTAAAAACATATATTTTTAGAAATTTAAACATATCTAAAGAGTATTGCATTTATCCCTATAAAGAATAATCATAATTGAAAATAAAATCCCAATTAAAACACCAACAAAATTGATTGTAATAACACCATAAATTTCACTCAAATGACCAATAAGAATTAACCCTAACGCACTGACTATTCTAACTATACTATTAAGTAACATATCATACTTCGCTCTAAAACGTGATAATAATTGGTGATGTAGAATAGCATCTATTTTTATTAATGTATGACGTATTGAAAATAATGACAAGCAAATTCCGAATGAATATAAAATAAAACTCTGAATTAGCTCACCGAACAAACATAAAAATACACTACCCATAAACAAAAATGGCATAAAATTCAATATTTTTGTTTTATTAGTTTCAATTAACTTGCCTGCTAATGATTGAGCGATTAACATAAAGAATAATAAAACCCCTAATAAAAACTCATATTCTTTAATAAGATCAAAATTATAAACAACGACCTGCCAATACTGAATAATAATCTGAAAATAGAGACTCAATATAACAAAAACAACCACCTCAAAGCGATATTTCTTGAATTTTTTATTCAAAATAGCAAAATCTAGCTTACTGATATATCGCTTTTTTTTTGCTAAACTTCGCTTGCATTTAGGTAAAAATCGCCAAGAAAGGAATAGAATGATTAACATAATAAACGAAGCTAGTCCAAAAACATATCCATTGATTATGCTATAAATCATGCCACCTAGAAGAGAAAAGATAGCCATAACGAAAAAATCATATTTTCCTAATTTACCAAATGCTTCTGATAAATTTCCATTAGGCTTATCAACAATATATTGTTCAACAAGATAAGCATTAGAGTTATTTTGAAAAATTGCTAAAGAAATAGCATTAAAAATTTCAGCAAGTAAAAAGATTTCAAAGCTTTGTATAATCCCTGCAATATAAAAAAGCAATAGCCATACAACAGCCAAAAATATTGCTATCAAATATAATTTTTTTCGTTCAACCCTATCAGAAACAATACCTATGACAAACCCCAAAAATAGAATAATAATCGCCTGTAGACTTTTAATAAGACCAATTTGGTATAAACTGATATTTGAAATTAGCATATATACGGTAGATGAAGCTCCAATAAGCATTCGAGCAGATGATGTACTTACATAACTAGCAATAATTTTTTCATAGTTATTCATAAACATCTCCCCCACAAAATTGACAATTTTTATTCTTAACAAGATCAATTTTTTCTAATTGGAAATCTTTATTATGTATACCTATTACCGCATTTAAACTAGTTATAGCATCGTAGTCTTCTGCAAAGAGCTTTATCATTTCTGAACCAAGCATAGCCCCTGAAAAGAAATTATTTACTACCGTGGAAGGAGCTTTCATATTAGCTTTTAAGTCATTTACTTTCTCATTTTTTATATTGTTTTCTAAATAAATAGATTTGTCGCAACATAAACAACAACTATTAGGTAATTTAGGTATATAAAACGGACCAATTACAGAAATATCATTTAAGTATCCTACATTAATCAAGGGTATCTTTTTAATACAACAGTATTCATTAATTAATTCGACACAATAATCATCATCTGCTGAGCAAATAACTAAATCAATATTATCTAGGTCATAAATTATTTTTTTATCCAATTTTTCTTTGATTACAAAAATATCACAATCATTTCTTAACTTACTAAGCTCTCGTTTTATTACATCTACTTTATAGCTATGAACATCTTTTTCTCTAAATAGAAATTGCCTATTTAGGTTAGATCTCTCTACAACATCATCATCAATAACAGTTATTTTTTTCACGCCAATTACACTAGAAAAATAAGAAACTATATTTCCAATCCCCCCAGCTCCAATAACTAGAATATGGCTGTTTGATATTTTATCCTGAACTTTTTTAATATCATAACCTAGCACGCTATAATATAAATGGTTTCTACTATACTGATCTTGGAAATCTATATGATAATGAGCGATAAAATTATTTGTTAATGCTATGGACAATACCTCTTCTGAAATATTGTTCTTTTTCATAAAATCACGTATCTCATAGAGTTCTTTTTCACTTATACAGAAATGACACAAATCAAGCATTCCTTGAAAAAATATTTCATCCGATACTATTTTCTGAATGCTTCCTATGCCAATAACAAATTCATCGTTATTAAAAAAATCTAAATACGTGTGGTTTGTAGTTTTATATTTCATATTTATCTCCTACTATTTAAGAAAGGGCTATTTAATAGCCCTCTTTTATATTAAAAAATTAGTTTACACGACGTCCACGCATAGTAGCCTCCCTATTAGTTTATAGATTAAATTTCATACCACATCTAGGT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57 | Acinetobacter_phage(17.65%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2145256 : 2249058
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP021644|2145256:2249058|DBSCAN-SWA 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MPPIELSQTQFEQHFGYASQQTVFAPGRVNIIGEHTDYNDGFVMPCAINYGMSVSFAKRDDSIWRVYAIDINETDAFDIKKEIPQSEDKWKNYVRGVVKYIQERCPEFIQGADIAMTSDVPMSSGLSSSAALEISIGKTCQVLGNLPISLAEIALIGQRAENKFVGANCGNMDQLTSALGQKDHLVMIDCRSLDISPTPVPQGYFIAIINSNVKHDLVTGEYNSRRQECEFAAQFFGVKALRDVSPEQFIERAAELQQLNELAYKRAKHVISENHRVLEAVEALKANDMQKLGVLMGESHDSMRDDFEITIPEIDYLVELAQVAIGKNGGARMTGGGFGGCIICLVPNEKVEALRKLIAENYQKQTGIQETFYVCTASDGVRVV >CP021644|2145256:2249058|2228700_2229138_+|AWY46502.1|DBSCAN-SWA MKQVQFYLLSQAQAGELSAQEALACDLAAKAWRQGKRVLIACETEEQAFSLDEALWAREADDFVPHNLSGEVTTYATPIEISWKGKRNAQRRDVLISLQTELPNFINSFNQIIDFVSVDETEKVQARERYKQYRQLGWQLSTEQV |
113 | Haemophilus_phage(78.57%) | transposase,tail,head,plate,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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