Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP021772 | Streptococcus agalactiae strain B111 chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas1,cas2,csn2,csm6,DEDDh,csa3,cas3,DinG | 3 | 15 | 6 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP021772_1 | 201795-202952 | TypeII |
II-A
Consensus repeat of CP021772_1
|
17 spacers
spacers of CP021772_1
>1.1|201831|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT GTGTAATAACCAACCATTAAAAAGCCATCT >1.2|201897|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT AGTTAAATTCACAATTTTGGTCTTTTTCGT >1.3|201963|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT CAATAGCATCTATGATGATGCCGTCTACTA >1.4|202029|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACTGATTAACTACAGCCTCTTCTTTTGTTT >1.5|202095|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGGATTTAAAGCATACGGTTTCAAATCGTC >1.6|202161|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAAGTATATTGTTTCATCATTTCCCACTT >1.7|202227|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGTTCCTAATTGAAAATCATGTAGCAATCT >1.8|202293|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GATGAGTCTGATTGAAGCGTTGGAAGTTTT >1.9|202359|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGAACGAACGGTTAAGCCTTTCAACGCTTC >1.10|202425|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CACTGACCACCTCTGAACAACCATTCATCA >1.11|202491|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATTCTGCTTTGAAATCAAGTTCCATTTCT >1.12|202557|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGCTCCAAACGGGCATTTTCAGCTTTTAGT >1.13|202623|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGAATAAATAAGCTACAAAAGATAGGATTG >1.14|202689|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTCCACTCGTCTAACCAGGCTATGAAGGT >1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCTCTAGTGGCTGAAATAACCACTACTGAG >1.16|202821|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAAAATTAATGACGCAATTGCTAAGTCAA >1.17|202887|30|CP021772|CRT ACAGACTTTAGATTTTTATGAAAAAAATGT |
csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP021772_1
The CRISPR arrays of CP021772_1 >merge|CP021772|1|201795-202952|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAACGTGTAATAACCAACCATTAAAAAGCCATCTGTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAACAGTTAAATTCACAATTTTGGTCTTTTTCGTGTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAACCAATAGCATCTATGATGATGCCGTCTACTAGTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAACACTGATTAACTACAGCCTCTTCTTTTGTTTGTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAACTGGATTTAAAGCATACGGTTTCAAATCGTCGTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAACAAAAGTATATTGTTTCATCATTTCCCACTTGTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAACAGTTCCTAATTGAAAATCATGTAGCAATCTGTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAACGATGAGTCTGATTGAAGCGTTGGAAGTTTTGTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAACGGAACGAACGGTTAAGCCTTTCAACGCTTCGTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAACCACTGACCACCTCTGAACAACCATTCATCAGTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAACAATTCTGCTTTGAAATCAAGTTCCATTTCTGTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAACTGCTCCAAACGGGCATTTTCAGCTTTTAGTGTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAACTGAATAAATAAGCTACAAAAGATAGGATTGGTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAACTTTCCACTCGTCTAACCAGGCTATGAAGGTGTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAACCCTCTAGTGGCTGAAATAACCACTACTGAGGTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAACAAAAAATTAATGACGCAATTGCTAAGTCAAGTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAACACAGACTTTAGATTTTTATGAAAAAAATGTGTTTTAGAGCTGTGCTGTTATTATGCTAGGACATCA >CP021772|1|1|201795-202886|CRISPRCasFinder GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC GTGTAATAACCAACCATTAAAAAGCCATCT GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC AGTTAAATTCACAATTTTGGTCTTTTTCGT GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC CAATAGCATCTATGATGATGCCGTCTACTA GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC ACTGATTAACTACAGCCTCTTCTTTTGTTT GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC TGGATTTAAAGCATACGGTTTCAAATCGTC GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC AAAAGTATATTGTTTCATCATTTCCCACTT GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC AGTTCCTAATTGAAAATCATGTAGCAATCT GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC GATGAGTCTGATTGAAGCGTTGGAAGTTTT GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC GGAACGAACGGTTAAGCCTTTCAACGCTTC GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC CACTGACCACCTCTGAACAACCATTCATCA GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC AATTCTGCTTTGAAATCAAGTTCCATTTCT GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC TGCTCCAAACGGGCATTTTCAGCTTTTAGT GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC TGAATAAATAAGCTACAAAAGATAGGATTG GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC TTTCCACTCGTCTAACCAGGCTATGAAGGT GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC CCTCTAGTGGCTGAAATAACCACTACTGAG GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC AAAAAATTAATGACGCAATTGCTAAGTCAA GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC >CP021772|1|1|201795-202952|CRT GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC GTGTAATAACCAACCATTAAAAAGCCATCT GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC AGTTAAATTCACAATTTTGGTCTTTTTCGT GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC CAATAGCATCTATGATGATGCCGTCTACTA GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC ACTGATTAACTACAGCCTCTTCTTTTGTTT GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC TGGATTTAAAGCATACGGTTTCAAATCGTC GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC AAAAGTATATTGTTTCATCATTTCCCACTT GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC AGTTCCTAATTGAAAATCATGTAGCAATCT GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC GATGAGTCTGATTGAAGCGTTGGAAGTTTT GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC GGAACGAACGGTTAAGCCTTTCAACGCTTC GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC CACTGACCACCTCTGAACAACCATTCATCA GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC AATTCTGCTTTGAAATCAAGTTCCATTTCT GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC TGCTCCAAACGGGCATTTTCAGCTTTTAGT GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC TGAATAAATAAGCTACAAAAGATAGGATTG GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC TTTCCACTCGTCTAACCAGGCTATGAAGGT GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC CCTCTAGTGGCTGAAATAACCACTACTGAG GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC AAAAAATTAATGACGCAATTGCTAAGTCAA GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC ACAGACTTTAGATTTTTATGAAAAAAATGT GTTTTAGAGCTGTGCTGTTATTATGCTAGGACATCA >CP021772|1|1|201993-202886|PILER-CR GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC ACTGATTAACTACAGCCTCTTCTTTTGTTT GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC TGGATTTAAAGCATACGGTTTCAAATCGTC GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC AAAAGTATATTGTTTCATCATTTCCCACTT GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC AGTTCCTAATTGAAAATCATGTAGCAATCT GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC GATGAGTCTGATTGAAGCGTTGGAAGTTTT GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC GGAACGAACGGTTAAGCCTTTCAACGCTTC GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC CACTGACCACCTCTGAACAACCATTCATCA GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC AATTCTGCTTTGAAATCAAGTTCCATTTCT GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC TGCTCCAAACGGGCATTTTCAGCTTTTAGT GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC TGAATAAATAAGCTACAAAAGATAGGATTG GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC TTTCCACTCGTCTAACCAGGCTATGAAGGT GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC CCTCTAGTGGCTGAAATAACCACTACTGAG GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC AAAAAATTAATGACGCAATTGCTAAGTCAA GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
>CP021772.1|AWZ33398.1|201028_201694_+|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2 MIKINFPILDEPLVLSNATILTIEDVSVYSSLVKHFYQYDVDEHLKLFDDKQKSLKATELMLVTDILGYDVNSAPILKLIHGDLENQFNEKPEVKSMVEKLAATITELIAFECLENELDLEYDEITILELIKALGVKIETQSDTIFEKCFEIIQVYHYLTKKNLLVFVNSGAYLTKDEVIKLCEYINLMQKSVLFLEPRRLYDLPQYVIDKDYFLIGENMV >CP021772.1|AWZ33397.1|200700_201042_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MSYRYMRMILMFDMPTETAEERKAYRKFRKFLLSEGFIMHQFSVYSKLLLNNTANNAMIGRLKVNNPKKGNITLLTVTEKQFARMVYLHGERNTSVANSDSRLVFLGDSYDQD >CP021772.1|AWZ33396.1|199834_200704_+|subtype-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MAGWRTVVVNTHSKLSYKNNHLIFKDSYQTEMIHLSEIDILIMETTDIVLSTMLIKRLVDENILVIFCDDKRLPTAMLMPYYARHDSSLQLSRQMSWIEDVKADVWTSIIAQKILNQSFYLGECSFFEKSQSIMNLYHDLEPFDPSNREGHAARIYFNTLFGNDFSREQDNPINAGLDYGYSLLLSMFAREVVKCGCMTQFGLKHANQFNQFNLASDIMEPFRPIVDRIIYENRQSDFVKMKRELFSMFSETYSYNGKEMYLSNIVSDYTKKVIKSLNSDGNGIPEFRI >CP021772.1|AWZ33395.1|195720_199833_+|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MNKPYSIGLDIGTNSVGWSIITDDYKVPAKKMRVLGNTDKEYIKKNLIGALLFDGGNTAADRRLKRTARRRYTRRRNRILYLQEIFAEEMSKVDDSFFHRLEDSFLVEEDKRGSKYPIFATLQEEKDYHEKFSTIYHLRKELADKKEKADLRLIYIALAHIIKFRGHFLIEDDSFDVRNTDISKQYQDFLEIFNTTFENNDLLSQNVDVEAILTDKISKSAKKDRILAQYPNQKSTGIFAEFLKLIVGNQADFKKYFNLEDKTPLQFAKDSYDEDLENLLGQIGDEFADLFSAAKKLYDSVLLSGILTVIDLSTKAPLSASMIQRYDEHREDLKQLKQFVKASLPEKYQEIFADSSKDGYAGYIEGKTNQEAFYKYLSKLLTKQEDSENFLEKIKNEDFLRKQRTFDNGSIPHQVHLTELKAIIRRQSEYYPFLKENQDRIEKILTFRIPYYIGPLAREKSDFAWMTRKTDDSIRPWNFEDLVDKEKSAEAFIHRMTNNDFYLPEEKVLPKHSLIYEKFTVYNELTKVRYKNEQGETYFFDSNIKQEIFDGVFKEHRKVSKKKLLDFLAKEYEEFRIVDVIGLDKENKAFNASLGTYHDLEKILDKDFLDNPDNESILEDIVQTLTLFEDREMIKKRLENYKDLFTESQLKKLYRRHYTGWGRLSAKLINGIRDKESQKTILDYLIDDGRSNRNFMQLINDDGLSFKSIISKAQAGSHSDNLKEVVGELAGSPAIKKGILQSLKIVDELVKVMGYEPEQIVVEMARENQTTNQGRRNSRQRYKLLDDGVKNLASDLNGNILKEYPTDNQALQNERLFLYYLQNGRDMYTGEALDIDNLSQYDIDHIIPQAFIKDDSIDNRVLVSSAKNRGKSDDVPSLEIVKDCKVFWKKLLDAKLMSQRKYDNLTKAERGGLTSDDKARFIQRQLVETRQITKHVARILDERFNNELDSKGRRIRKVKIVTLKSNLVSNFRKEFGFYKIREVNNYHHAHDAYLNAVVAKAILTKYPQLEPEFVYGDYPKYNSYKTRKSATEKLFFYSNIMNFFKTKVTLADGTVVVKDDIEVNNDTGEIVWDKKKHFATVRKVLSYPQNNIVKKTEIQTGGFSKESILAHGNSDKLIPRKTKDIYLDPKKYGGFDSPIVAYSVLVVADIKKGKAQKLKTVTELLGITIMERSRFEKNPSAFLESKGYLNIRADKLIILPKYSLFELENGRRRLLASAGELQKGNELALPTQFMKFLYLASRYNESKGKPEEIEKKQEFVNQHVSYFDDILQLINDFSKRVILADANLEKINKLYQDNKENISVDELANNIINLFTFTSLGAPAAFKFFDKIVDRKRYTSTKEVLNSTLIHQSITGLYETRIDLGKLGED >CP021772.1|AWZ35198.1|194676_195333_+|TIGR01906-family-membrane-protein MKDKLLVVLTWIWIISLATLATIYIAWLIYPIEIQFLKLEKVVYLKAETIYYNFNKLMIYLTHPFISDLNMPSFPSSEDGLKHFADVKYLFTLAHGLFVILTFPVIYFLRRGWKQKSIFLYEGFFKIAIMLPIFIVVCAFLLGFDQFFTLFHEVLFPGDSTWQFNPLTDPVIWILPETFFLHCFIIFLLIYETITIILLIIGRKHLKLRKYKNKMQAL >CP021772.1|AWZ33394.1|193916_194687_+|TIGR01457-family-HAD-type-hydrolase MAYKGYLIDLDGTIYKGKSRIPAGERFIERLQEKGIPYMLVTNNTTRTPESVQEMLRGFNVETPLETIYTATMATVDYMNDMNRGKTAYVIGEEGLKKAIADAGYVEDTKNPAYVVVGLDWNVTYDKLATATLAIQNGALFIGTNPDLNIPTERGLLPGAGSLNALLEAATRIKPVFIGKPNAIIMNKALEILNIPRNQAVMVGDNYLTDIMAGINNDIDTLLVTTGFTTVEEVPDLPIQPSYVLASLDEWTFNEG >CP021772.1|AWZ33393.1|193178_193916_+|acyl-[acyl-carrier-protein]-thioesterase MGLLYRETYEVPFYESDTNHYMKLPQLLALALQISAKQSLKLGIGDDIVFKRYGLVWVVTDYIIDIERLPKHAEKIVIETEAKAHNKLLCYRYFYIYGEDGQKIITISSAFVLMDFKTRKIHPVLDDITSIYQSQRIKKVIRGPKYHPIGDSKVKQYHVRYFDLDMNGHVNNSKYLEWMYDVLDLDFLSSHIPKKIDLKYIKEIQYGTDIKSHWYQDGLVTRHDIIGGDAIHAQARIEWQEKKED >CP021772.1|AWZ33392.1|192044_193175_+|coproporphyrinogen-III-oxidase MLKKPTSAYVHIPFCTQICYYCDFSKVFIKNQPVDAYLQALIREFRSYDITELRTLYIGGGTPTSISAVQLDYLLTELSRDLNLNTLEEFTIEANPGDLTVDKIEVLQKSAVNRVSLGVQTFNDKHLKRIGRSHNEAQIYSTIDALKTAGFQNISIDLIYALPGQTMDDVRSNVAKALSLNIPHLSLYSLILEHHTVFMNKMRRGKLHLPTEDLEAEMFEYIISEMERNGFEHYEISNFTKPGFESRHNLMYWDNVEYYGVGAGASGYLDGIRYRNRGPIQHYLKGVSEGNARLSEEVLSKNEMMEEELFLGLRKKEGVSIGKFEQKFGTSFEKRYGQIVQELQSDGLLKENNGFIQMTKKGLFLGDTVAEKFIVE >CP021772.1|AWZ33391.1|191572_191953_+|hypothetical-protein MRLWHQDIIELLPRQQLLGQHRECCALRGNGWGRKHETVDYVFRYSPYRLFAYHQLVMEEMMERGYRVSKEWLIAEYRGMKCPRYDTLNPVDLETPIYPEHNQDYLQECLWNLKAKGIDLPINKIK >CP021772.1|AWZ33390.1|191176_191548_+|hypothetical-protein MTKEAELLWAKHKYLVLSKSQKIYLDIRQTLKSPNCTVLDVQSLIDQAVLLEESPSQVTNAYMHIWGYFKNKAERQEKEEFLTLLEKYRKTGYQRRKLLAFLKQLLAKYPNSYLQNSSIFEEE >CP021772.1|AWZ33399.1|203206_203377_+|hypothetical-protein MKGYNSNLMVKGLGCSTLYLIISLTALVLLVIAGVFFVINTCKLTRKAVENLSIIN >CP021772.1|AWZ33400.1|203509_203926_+|nucleoside-diphosphate-kinase MEQTFFMIKPDGVKRGFIGEVISRIERRGFSIDRLEVRYADADILKRHYAELTDRPFFPTLVDYMTSGPVIIGVISGEEVISTWRTMMGSTNPKDALPGTIRGDFAQAPSPNQATCNIVHGSDSPESATREIAIWFNN >CP021772.1|AWZ33401.1|204061_205894_+|elongation-factor-4 MNIEDLKKRQEKIRNFSIIAHIDHGKSTLADRILEKTETVSSREMQAQLLDSMDLERERGITIKLNAIELNYTAKDGETYIFHLIDTPGHVDFTYEVSRSLAACEGAILVVDAAQGIEAQTLANVYLALDNDLEILPVINKIDLPAADPERVRAEVEDVIGLDASEAVLASAKAGIGIEEILEQIVEKVPAPTGEVDAPLQALIFDSVYDAYRGVILQVRIVNGMVKPGDKIQMMSNGKTFDVTEVGIFTPKAVGRDFLATGDVGYIAASIKTVADTRVGDTITLANNPAIEPLHGYKQMNPMVFAGLYPIESNKYNDLREALEKLQLNDASLQFEPETSQALGFGFRCGFLGLLHMDVIQERLEREFNIDLIMTAPSVVYHVNTTDGEMLEVSNPSEFPDPTRVDSIEEPYVKAQIMVPQEFVGAVMELAQRKRGDFVTMDYIDDNRVNVIYQIPLAEIVFDFFDKLKSSTRGYASFDYEISEYRRSQLVKMDILLNGDKVDALSFIVHKEFAYERGKLIVDKLKKIIPRQQFEVPIQAAIGQKIVARSDIKALRKNVLAKCYGGDVSRKRKLLEKQKAGKKRMKAIGSVEVPQEAFLSVLSMDDDDKK >CP021772.1|AWZ33402.1|206140_206608_+|hypothetical-protein MKGQKIIALAGLVLSCHFALTACHTQEHKNSHHIKTKQVAKKKANKKKVSVKESHKKRKGVAGVDFPTDDGFLLTKDSKILSHTDSGIVVAHGNHSHFIFYSDLKGSKFSYLIPQILFQKMLMATWSDMVIISTIFQKQVYLSKSKYKQVELFHV >CP021772.1|AWZ35199.1|206514_208674_+|internalin MVRHGDHFHYIPKASLSQQKQVQASRAVSRLGNQSNSHYRVNSSKIAGLHYPTSNGFLFNGRGIKGTTPTGILVEHHNHLHFISFADLRKGGWGSIADRYQPQKKADSKKQSPSSKKPRTENTLPKDIKDKLAYLARELHLDISRIRVLKTLNGEIGFEYPHDDHTHVIMAKDIDLSKPIPNPHHDDEDHHKGHHHDESDHKHEEHEHTKSNKLSDEDQKKLIYLAEKLGLNPNQIEVLTSEDGSIIFKYPHDDHSHTIASKDIEIGKPIPDGHHDHSHAKDKVGMATLKQIGFDDEIIQDILHADAPTPFPSNETNPEKMRQWLATVTKINIGQRTNPFQRFGLSLMPNIEVLGIGFTPINDMTPVLQFKKLKQLWMTNTGITDYSFLDKMPLLEGLDISQNGIKDLSFLTKYKQLSLIAAANNGITSLKPLAELPNLQFLVLSHNNISDLTPLSNLTKLQELHLDHNNVKNLSALSGKKDLKVLDLSNNKSADLSTLKTTSLETLLLNETNTSNLSFLKQNPKVSNLTINNAKLASLDGIEESDEIVKVEAEGNQIKSLVLKNKQGSLKFLNVTNNQLTSLEGVNNYTSLETLSVSKNKLESLDIKTPNKTVTNLDFSHNNVPTSQLKLNEKNIPEAVAKNFPAVVEGSMVGNGSLAEKAAMASKEDKQVSDNTNHQKNTEKSAQANADSKKENPKTHDEHHDHEETDHAHVGHHHH >CP021772.1|AWZ35200.1|208821_209433_+|phosphohydrolase MVHHKLKNDPSGHDWFHIVRVRNLAVELAHKEGANTFICQMAALLHDIIDDKICQDSKQASYELTQWLYSQDLAIAEVEHILDILENISFKAGTGLTMKTLEGQIVQDADRLDAMGAIGIARTMAYSGSKGRLIHDPNLKPRENLTLEEYRNGQDTAIMHFYEKLLKLKDLMNTKQGKMLAQKRHDFLELYLAEFYAEWNGKR >CP021772.1|AWZ33403.1|209441_209906_+|N-acetyltransferase MIRRAKEKDLPDIAELLKQILMLHHEVRPDIFHTRGSKFSKEQLKEMLIDESKPIFVYESDEGKVVAHLFLQLQEKRDLPRKSFKTLYIDDLCIDEEVRGQQIGQKLMDFARQYAKKHGCYNITLNVWNDNQRAVSFYEKLGFKPQQTQMEEIL >CP021772.1|AWZ33404.1|209905_210340_+|peptide-methionine-(R)-S-oxide-reductase MKETQEELRQRIGHTAYQVTQNSATEHAFTGKYDDFFEEGIYVDIVSGEVLFSSLDKFQSGCGWPAFSKPIENRMVTNHQDHSHGMHRIEVRSRQADSHLGHVFNDGPVDAGGLRYCINSAALDFIPYDQMAKRGYGDYLSLFD >CP021772.1|AWZ33405.1|210491_213284_+|haloacid-dehalogenase MASTNNVSDTNTRFAKEELEEVFEELGTTQGGLSDEEVAVRQKKYGLNLLSEVKQESIILLFLKNFTSLMAILLWVGGFVAIVSNSLELGLAIWMVNVINGIFSFIQEYRASQATQALEKMLPSYSRVLRKSSEEKILSEQLVPGDIVLIEEGDRISADGRLIKTTDLQVNQSALTGESNPIYKDSNVENDQSKTLIECDNMVFAGTTVSSGSATMVVTAIGMQTQFGQIADLTQGMKSEKSPLQRELDRLTKQISIISITVGIIFFLAATFFVKEPVSKSFIFALGMIVAFIPEGLLPTVTLSLAMAVQRMAKEHALVKKLSSVETLGATSVICSDKTGTLTQNEMTVNHLWQNGKSYQVTGLGYAPEGQILFEGDNICFGNSDRGDLEKLIRFAHLCSNAQVLPPNDDRSTYTVLGDPTEACLNVLLEKSGINIQENRKFAPRLKELPFDSVRKRMTTIHSLGGDEKDKKISITKGAPKEILDLSDYVLSDGKVIPLNKEERNKIQLANDTFAKDGLRVLAVSYCDIEGFSKEQWTQENLEQHMVFIGLIAMSDPPREGVREAIDKCHAASIRIIMVTGDYGLTALSIAKNIGIIRNDDAKVISGLELSEMTDSQLKKELSGEVVFARVAPEQKYRVVTILQEMGEVVAVTGDGVNDAPALKKSDIGVAMGVTGTDVAKESADMILTDDHFASIVHAVEEGRAVYQNIKKFLTYIFNSNTPEAVPSAFFLFSKGFIPLPLTVMQILAVDLGTDMLPALGLGVEPPETDVMNRPPRRLTDRLLDKGLLIKSFLWYGTIESVLAMGGFFWAHYLRYGNFTFFVANGIPYREATTMTLGAIIFSQIGMVMNSRTSYQSIKALSIFGNKLINFGIIMEILAFLVLVYVPLFHNLFNTASLGLSHWLYLISCPFIMIGLDEVRKLFSSRKNKR >CP021772.1|AWZ33406.1|213283_214387_+|hypothetical-protein MSNIITYLKNNSNLTFDELALNDVDILCLNEFGYISFEKLINTTEMKSVLVCELYHEYLQTMAKSYSFMFTSQRHDLCQLMMTSKRFKNLTLSYYRAEISLEFEKQFAAMVFTIPNINYHQVVFRGTDANLIGWKEDFKLTYMREISAHRSAIKYLNTILPYFDKVVLSGHSKGGNLALYAAMFTKPDLKAKIDLIWLIDSPGLQKTLLPTTEYKTTKQKCIRLLPEESIVGMMLYSDIEPLIISSNARGILQHDVTTWEIQEPAILKTGTGLSLKSICFEKTFQQWMAELKSQERKLFFDLLFDSFLSSGVSSLDDFNLASRAKMMKAFHSFRELDDDKKRLFNKSLKLLVTIFWGAYHDNSRETK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP021772_1 | 1.1|201831|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT | 201831-201860 | 30 | CP021772.1 | 761570-761599 | 1 | 0.967 |
CP021772_2 | 2.4|1268541|30|CP021772|CRT | 1268541-1268570 | 30 | CP021772.1 | 1268649-1268678 | 1 | 0.967 |
CP021772_2 | 2.5|1268589|18|CP021772|CRT | 1268589-1268606 | 18 | CP021772.1 | 1268265-1268282 | 2 | 0.889 |
1. spacer 1.1|201831|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 761570-761599, mismatch: 1, identity: 0.967
gtgtaataaccaaccattaaaaagccatct CRISPR spacer gtgtaataaccaaccattaaaaaaccatct Protospacer ***********************.******
2. spacer 2.4|1268541|30|CP021772|CRT matches to position: 1268649-1268678, mismatch: 1, identity: 0.967
ttagcttctggtttggcctctggcttaacg CRISPR spacer ttagcctctggtttggcctctggcttaacg Protospacer *****.************************
3. spacer 2.5|1268589|18|CP021772|CRT matches to position: 1268265-1268282, mismatch: 2, identity: 0.889
ttagcttctggtttagcc CRISPR spacer ttggtttctggtttagcc Protospacer **.*.*************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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CP021772_1 | 1.10|202425|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202425-202454 | 30 | MK448742 | Streptococcus phage Javan37, complete genome | 7600-7629 | 0 | 1.0 |
CP021772_1 | 1.10|202425|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202425-202454 | 30 | MK448669 | Streptococcus phage Javan11, complete genome | 5382-5411 | 0 | 1.0 |
CP021772_1 | 1.12|202557|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202557-202586 | 30 | MK448824 | Streptococcus phage Javan637, complete genome | 5989-6018 | 0 | 1.0 |
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CP021772_1 | 1.12|202557|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202557-202586 | 30 | MK449003 | Streptococcus phage Javan648, complete genome | 5989-6018 | 0 | 1.0 |
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CP021772_1 | 1.16|202821|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202821-202850 | 30 | MK448829 | Streptococcus phage Javan7, complete genome | 33775-33804 | 0 | 1.0 |
CP021772_1 | 1.16|202821|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202821-202850 | 30 | MH853355 | Streptococcus phage LF1, complete genome | 24641-24670 | 0 | 1.0 |
CP021772_1 | 1.16|202821|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202821-202850 | 30 | MK448837 | Streptococcus phage Javan10, complete genome | 32310-32339 | 0 | 1.0 |
CP021772_1 | 1.16|202821|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202821-202850 | 30 | MH853358 | Streptococcus phage LF4, complete genome | 24641-24670 | 0 | 1.0 |
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CP021772_1 | 1.17|202887|30|CP021772|CRT | 202887-202916 | 30 | MK448971 | Streptococcus phage Javan52, complete genome | 16521-16550 | 0 | 1.0 |
CP021772_1 | 1.17|202887|30|CP021772|CRT | 202887-202916 | 30 | MK448829 | Streptococcus phage Javan7, complete genome | 13428-13457 | 0 | 1.0 |
CP021772_1 | 1.17|202887|30|CP021772|CRT | 202887-202916 | 30 | MK448956 | Streptococcus phage Javan48, complete genome | 15492-15521 | 0 | 1.0 |
CP021772_1 | 1.17|202887|30|CP021772|CRT | 202887-202916 | 30 | MH853355 | Streptococcus phage LF1, complete genome | 4285-4314 | 0 | 1.0 |
CP021772_1 | 1.17|202887|30|CP021772|CRT | 202887-202916 | 30 | JX409895 | Streptococcus phage JX01, complete genome | 1688-1717 | 0 | 1.0 |
CP021772_1 | 1.17|202887|30|CP021772|CRT | 202887-202916 | 30 | MH853356 | Streptococcus phage LF2, partial genome | 2505-2534 | 0 | 1.0 |
CP021772_1 | 1.17|202887|30|CP021772|CRT | 202887-202916 | 30 | MH853358 | Streptococcus phage LF4, complete genome | 4285-4314 | 0 | 1.0 |
CP021772_1 | 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202755-202784 | 30 | MK448796 | Streptococcus phage Javan53, complete genome | 19159-19188 | 1 | 0.967 |
CP021772_1 | 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202755-202784 | 30 | MK448971 | Streptococcus phage Javan52, complete genome | 17418-17447 | 1 | 0.967 |
CP021772_1 | 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202755-202784 | 30 | MK448829 | Streptococcus phage Javan7, complete genome | 14267-14296 | 1 | 0.967 |
CP021772_1 | 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202755-202784 | 30 | MK448736 | Streptococcus phage Javan35, complete genome | 14735-14764 | 1 | 0.967 |
CP021772_1 | 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202755-202784 | 30 | MK448781 | Streptococcus phage Javan5, complete genome | 16757-16786 | 1 | 0.967 |
CP021772_1 | 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202755-202784 | 30 | MH853355 | Streptococcus phage LF1, complete genome | 5124-5153 | 1 | 0.967 |
CP021772_1 | 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202755-202784 | 30 | MK448938 | Streptococcus phage Javan44, complete genome | 14736-14765 | 1 | 0.967 |
CP021772_1 | 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202755-202784 | 30 | MK448911 | Streptococcus phage Javan34, complete genome | 14735-14764 | 1 | 0.967 |
CP021772_1 | 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202755-202784 | 30 | MK448837 | Streptococcus phage Javan10, complete genome | 12793-12822 | 1 | 0.967 |
CP021772_1 | 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202755-202784 | 30 | MK448742 | Streptococcus phage Javan37, complete genome | 14571-14600 | 1 | 0.967 |
CP021772_1 | 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202755-202784 | 30 | MH853358 | Streptococcus phage LF4, complete genome | 5124-5153 | 1 | 0.967 |
CP021772_1 | 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202755-202784 | 30 | MK448851 | Streptococcus phage Javan14, complete genome | 16677-16706 | 1 | 0.967 |
CP021772_1 | 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202755-202784 | 30 | MK448916 | Streptococcus phage Javan36, complete genome | 14735-14764 | 1 | 0.967 |
CP021772_1 | 1.17|202887|30|CP021772|CRT | 202887-202916 | 30 | MK448837 | Streptococcus phage Javan10, complete genome | 11954-11983 | 1 | 0.967 |
CP021772_1 | 1.17|202887|30|CP021772|CRT | 202887-202916 | 30 | MK448742 | Streptococcus phage Javan37, complete genome | 13668-13697 | 1 | 0.967 |
CP021772_1 | 1.17|202887|30|CP021772|CRT | 202887-202916 | 30 | MK448851 | Streptococcus phage Javan14, complete genome | 15844-15873 | 1 | 0.967 |
CP021772_1 | 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202755-202784 | 30 | MH853356 | Streptococcus phage LF2, partial genome | 1608-1637 | 2 | 0.933 |
CP021772_1 | 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202755-202784 | 30 | MK448749 | Streptococcus phage Javan39, complete genome | 16392-16421 | 2 | 0.933 |
CP021772_1 | 1.17|202887|30|CP021772|CRT | 202887-202916 | 30 | MK448763 | Streptococcus phage Javan451, complete genome | 11204-11233 | 2 | 0.933 |
CP021772_1 | 1.17|202887|30|CP021772|CRT | 202887-202916 | 30 | MK448736 | Streptococcus phage Javan35, complete genome | 13896-13925 | 2 | 0.933 |
CP021772_1 | 1.17|202887|30|CP021772|CRT | 202887-202916 | 30 | MK448781 | Streptococcus phage Javan5, complete genome | 15918-15947 | 2 | 0.933 |
CP021772_1 | 1.17|202887|30|CP021772|CRT | 202887-202916 | 30 | MK448938 | Streptococcus phage Javan44, complete genome | 13897-13926 | 2 | 0.933 |
CP021772_1 | 1.17|202887|30|CP021772|CRT | 202887-202916 | 30 | MK448911 | Streptococcus phage Javan34, complete genome | 13896-13925 | 2 | 0.933 |
CP021772_1 | 1.17|202887|30|CP021772|CRT | 202887-202916 | 30 | MK448916 | Streptococcus phage Javan36, complete genome | 13896-13925 | 2 | 0.933 |
CP021772_1 | 1.12|202557|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202557-202586 | 30 | MK448854 | Streptococcus phage Javan146, complete genome | 6144-6173 | 4 | 0.867 |
CP021772_1 | 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202755-202784 | 30 | MK448859 | Streptococcus phage Javan170, complete genome | 16943-16972 | 4 | 0.867 |
CP021772_1 | 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202755-202784 | 30 | MK448672 | Streptococcus phage Javan117, complete genome | 12055-12084 | 4 | 0.867 |
CP021772_1 | 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202755-202784 | 30 | MK448676 | Streptococcus phage Javan131, complete genome | 19463-19492 | 4 | 0.867 |
CP021772_1 | 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202755-202784 | 30 | MK448688 | Streptococcus phage Javan161, complete genome | 16896-16925 | 4 | 0.867 |
CP021772_2 | 2.6|1268625|30|CP021772|CRT | 1268625-1268654 | 30 | NC_018503 | Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p07, complete sequence | 5567-5596 | 4 | 0.867 |
CP021772_1 | 1.4|202029|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202029-202058 | 30 | MN693238 | Marine virus AFVG_25M402, complete genome | 22954-22983 | 5 | 0.833 |
CP021772_1 | 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202755-202784 | 30 | MK448686 | Streptococcus phage Javan157, complete genome | 16207-16236 | 5 | 0.833 |
CP021772_1 | 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202755-202784 | 30 | MK448854 | Streptococcus phage Javan146, complete genome | 16962-16991 | 5 | 0.833 |
CP021772_2 | 2.6|1268625|30|CP021772|CRT | 1268625-1268654 | 30 | KC206276 | Escherichia phage EC1-UPM, complete genome | 22907-22936 | 5 | 0.833 |
CP021772_2 | 2.6|1268625|30|CP021772|CRT | 1268625-1268654 | 30 | KF562340 | Escherichia phage vB_EcoP_PhAPEC7, complete genome | 23106-23135 | 5 | 0.833 |
CP021772_2 | 2.6|1268625|30|CP021772|CRT | 1268625-1268654 | 30 | KF192075 | Escherichia phage vB_EcoP_PhAPEC5, complete genome | 22744-22773 | 5 | 0.833 |
CP021772_2 | 2.6|1268625|30|CP021772|CRT | 1268625-1268654 | 30 | MG208881 | Escherichia phage St11Ph5, complete genome | 24690-24719 | 5 | 0.833 |
CP021772_2 | 2.6|1268625|30|CP021772|CRT | 1268625-1268654 | 30 | HQ259105 | Escherichia phage vB_EcoP_G7C, complete genome | 23924-23953 | 5 | 0.833 |
CP021772_2 | 2.6|1268625|30|CP021772|CRT | 1268625-1268654 | 30 | KF620435 | Shigella phage pSb-1, complete genome | 48997-49026 | 5 | 0.833 |
CP021772_2 | 2.6|1268625|30|CP021772|CRT | 1268625-1268654 | 30 | NC_019423 | Enterobacter phage IME11, complete genome | 38504-38533 | 5 | 0.833 |
CP021772_2 | 2.6|1268625|30|CP021772|CRT | 1268625-1268654 | 30 | MN855733 | Siphoviridae sp. isolate 355, complete genome | 42082-42111 | 5 | 0.833 |
CP021772_2 | 2.6|1268625|30|CP021772|CRT | 1268625-1268654 | 30 | MH733496 | Escherichia phage PGN829.1, complete genome | 71462-71491 | 5 | 0.833 |
CP021772_2 | 2.6|1268625|30|CP021772|CRT | 1268625-1268654 | 30 | MH358458 | Escherichia phage phi G17, complete genome | 37666-37695 | 5 | 0.833 |
CP021772_1 | 1.6|202161|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202161-202190 | 30 | NC_048682 | Raoultella phage Ro1, complete genome | 119592-119621 | 6 | 0.8 |
CP021772_1 | 1.7|202227|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202227-202256 | 30 | NZ_CP023400 | Pseudoalteromonas spongiae strain SAO4-4 plasmid pl, complete sequence | 47765-47794 | 6 | 0.8 |
CP021772_1 | 1.17|202887|30|CP021772|CRT | 202887-202916 | 30 | KJ019094 | Synechococcus phage ACG-2014e isolate Syn7803US33, complete genome | 122098-122127 | 6 | 0.8 |
CP021772_1 | 1.17|202887|30|CP021772|CRT | 202887-202916 | 30 | KJ019156 | Synechococcus phage ACG-2014e isolate Syn7803C2, complete genome | 122189-122218 | 6 | 0.8 |
CP021772_1 | 1.17|202887|30|CP021772|CRT | 202887-202916 | 30 | KJ019054 | Synechococcus phage ACG-2014e isolate Syn7803C85, complete genome | 122189-122218 | 6 | 0.8 |
CP021772_1 | 1.17|202887|30|CP021772|CRT | 202887-202916 | 30 | NZ_AP019696 | Absiella argi strain N6H1-5 plasmid pABar1, complete sequence | 1576-1605 | 6 | 0.8 |
CP021772_1 | 1.2|201897|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT | 201897-201926 | 30 | NZ_CP022047 | Staphylococcus sciuri strain FDAARGOS_285 plasmid unnamed1, complete sequence | 84065-84094 | 7 | 0.767 |
CP021772_1 | 1.4|202029|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202029-202058 | 30 | MN855723 | Bacteriophage sp. isolate 72, complete genome | 18576-18605 | 7 | 0.767 |
CP021772_1 | 1.5|202095|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202095-202124 | 30 | NZ_CP010358 | Acinetobacter johnsonii XBB1 plasmid pXBB1-8, complete sequence | 37977-38006 | 7 | 0.767 |
CP021772_1 | 1.6|202161|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202161-202190 | 30 | NC_010625 | Paraburkholderia phymatum STM815 plasmid pBPHY01, complete sequence | 367986-368015 | 7 | 0.767 |
CP021772_1 | 1.8|202293|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202293-202322 | 30 | NC_022650 | Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_4, complete sequence | 23480-23509 | 7 | 0.767 |
CP021772_1 | 1.8|202293|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202293-202322 | 30 | LC532225 | Enterobacter hormaechei subsp. xiangfangensis A2483 plasmid pA2483imp-1 DNA, complete sequence | 27398-27427 | 7 | 0.767 |
CP021772_1 | 1.8|202293|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202293-202322 | 30 | LC532227 | Enterobacter hormaechei subsp. xiangfangensis A2504 plasmid pA2504imp-1 DNA, complete sequence | 48484-48513 | 7 | 0.767 |
CP021772_1 | 1.8|202293|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202293-202322 | 30 | NZ_AP023201 | Escherichia coli strain TUM18780 plasmid pMTY18780-4, complete sequence | 26884-26913 | 7 | 0.767 |
CP021772_1 | 1.8|202293|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202293-202322 | 30 | NC_023907 | Escherichia coli strain HS102707 plasmid pHS102707, complete sequence | 29491-29520 | 7 | 0.767 |
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CP021772_2 | 2.6|1268625|30|CP021772|CRT | 1268625-1268654 | 30 | NZ_CP026426 | Acinetobacter sp. ACNIH1 plasmid pACI-df08, complete sequence | 224626-224655 | 7 | 0.767 |
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CP021772_1 | 1.2|201897|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT | 201897-201926 | 30 | KT962245 | Cellulophaga phage phi4:1_13, complete genome | 119777-119806 | 8 | 0.733 |
CP021772_1 | 1.2|201897|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT | 201897-201926 | 30 | KC821632 | Cellulophaga phage phi4:1, complete genome | 119777-119806 | 8 | 0.733 |
CP021772_1 | 1.2|201897|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT | 201897-201926 | 30 | NC_021798 | Cellulophaga phage phi17:2, complete genome | 120254-120283 | 8 | 0.733 |
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CP021772_1 | 1.17|202887|30|CP021772|CRT | 202887-202916 | 30 | NC_013092 | Francisella philomiragia subsp. philomiragia ATCC 25017 plasmid pF243, complete sequence | 971-1000 | 8 | 0.733 |
CP021772_1 | 1.17|202887|30|CP021772|CRT | 202887-202916 | 30 | NZ_CP013966 | Aeromonas hydrophila strain D4 plasmid pAhD4-1, complete sequence | 62828-62857 | 8 | 0.733 |
CP021772_2 | 2.4|1268541|30|CP021772|CRT | 1268541-1268570 | 30 | MG711465 | Faecalibacterium phage FP_Brigit, complete genome | 26100-26129 | 8 | 0.733 |
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CP021772_1 | 1.11|202491|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202491-202520 | 30 | MH622943 | Myoviridae sp. isolate ctbc_4, complete genome | 65086-65115 | 9 | 0.7 |
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CP021772_1 | 1.4|202029|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 202029-202058 | 30 | MT362618 | Microcystis phage MaeS, complete genome | 9398-9427 | 10 | 0.667 |
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CP021772_2 | 2.6|1268625|30|CP021772|CRT | 1268625-1268654 | 30 | NC_019526 | Enterobacteria phage vB_KleM-RaK2, complete genome | 222236-222265 | 10 | 0.667 |
CP021772_2 | 2.6|1268625|30|CP021772|CRT | 1268625-1268654 | 30 | AB897757 | Klebsiella phage K64-1 DNA, complete genome | 221613-221642 | 10 | 0.667 |
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31. spacer 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH853358 (Streptococcus phage LF4, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
cctctagtggctgaaataaccactactgag CRISPR spacer gctctagtggctgaaataaccactactgag Protospacer *****************************
32. spacer 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448851 (Streptococcus phage Javan14, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
cctctagtggctgaaataaccactactgag CRISPR spacer gctctagtggctgaaataaccactactgag Protospacer *****************************
33. spacer 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448916 (Streptococcus phage Javan36, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
cctctagtggctgaaataaccactactgag CRISPR spacer gctctagtggctgaaataaccactactgag Protospacer *****************************
34. spacer 1.17|202887|30|CP021772|CRT matches to MK448837 (Streptococcus phage Javan10, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
acagactttagatttttatgaaaaaaatgt CRISPR spacer acagactttagatttttacgaaaaaaatgt Protospacer ******************.***********
35. spacer 1.17|202887|30|CP021772|CRT matches to MK448742 (Streptococcus phage Javan37, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
acagactttagatttttatgaaaaaaatgt CRISPR spacer acagactttagatttttacgaaaaaaatgt Protospacer ******************.***********
36. spacer 1.17|202887|30|CP021772|CRT matches to MK448851 (Streptococcus phage Javan14, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
acagactttagatttttatgaaaaaaatgt CRISPR spacer acagactttagatttttacgaaaaaaatgt Protospacer ******************.***********
37. spacer 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH853356 (Streptococcus phage LF2, partial genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
cctctagtggctgaaataaccactactgag CRISPR spacer gctctagtggctgaaataaccactattgag Protospacer ************************.****
38. spacer 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448749 (Streptococcus phage Javan39, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
cctctagtggctgaaataaccactactgag CRISPR spacer gctctagtggctgaaataaccactattgag Protospacer ************************.****
39. spacer 1.17|202887|30|CP021772|CRT matches to MK448763 (Streptococcus phage Javan451, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
acagactttagatttttatgaaaaaaatgt CRISPR spacer acagactttagatttttatgaaaaaaagga Protospacer *************************** *
40. spacer 1.17|202887|30|CP021772|CRT matches to MK448736 (Streptococcus phage Javan35, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
acagactttagatttttatgaaaaaaatgt- CRISPR spacer acagactttagatttttacg-aaaaaatgtc Protospacer ******************.* *********
41. spacer 1.17|202887|30|CP021772|CRT matches to MK448781 (Streptococcus phage Javan5, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
acagactttagatttttatgaaaaaaatgt- CRISPR spacer acagactttagatttttacg-aaaaaatgtc Protospacer ******************.* *********
42. spacer 1.17|202887|30|CP021772|CRT matches to MK448938 (Streptococcus phage Javan44, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
acagactttagatttttatgaaaaaaatgt- CRISPR spacer acagactttagatttttacg-aaaaaatgtc Protospacer ******************.* *********
43. spacer 1.17|202887|30|CP021772|CRT matches to MK448911 (Streptococcus phage Javan34, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
acagactttagatttttatgaaaaaaatgt- CRISPR spacer acagactttagatttttacg-aaaaaatgtc Protospacer ******************.* *********
44. spacer 1.17|202887|30|CP021772|CRT matches to MK448916 (Streptococcus phage Javan36, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
acagactttagatttttatgaaaaaaatgt- CRISPR spacer acagactttagatttttacg-aaaaaatgtc Protospacer ******************.* *********
45. spacer 1.12|202557|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448854 (Streptococcus phage Javan146, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
tgctccaaacgggcattttcagcttttagt CRISPR spacer tgctccaaacgagcattttctgcttttaag Protospacer ***********.******** *******.
46. spacer 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448859 (Streptococcus phage Javan170, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
cctctagtggctgaaataaccactactgag CRISPR spacer gccctagtggttgaaataaccactattgag Protospacer *.*******.**************.****
47. spacer 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448672 (Streptococcus phage Javan117, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
cctctagtggctgaaataaccactactgag CRISPR spacer gccctagtggttgaaataaccactattgag Protospacer *.*******.**************.****
48. spacer 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448676 (Streptococcus phage Javan131, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
cctctagtggctgaaataaccactactgag CRISPR spacer gccctagtggttgaaataaccactattgag Protospacer *.*******.**************.****
49. spacer 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448688 (Streptococcus phage Javan161, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
cctctagtggctgaaataaccactactgag CRISPR spacer gccctagtggttgaaataaccactattgag Protospacer *.*******.**************.****
50. spacer 2.6|1268625|30|CP021772|CRT matches to NC_018503 (Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p07, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
ttagcctctggtttagcttctggcttagcc CRISPR spacer ttagtctctggtttagtttctggcttagtt Protospacer ****.***********.***********..
51. spacer 1.4|202029|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693238 (Marine virus AFVG_25M402, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
actg-attaactacagcctcttcttttgttt CRISPR spacer -ctgcattaactatagcctctccttttgtaa Protospacer *** ********.*******.*******
52. spacer 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448686 (Streptococcus phage Javan157, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
cctctagtggctgaaataaccactactgag CRISPR spacer gccatagtggttgaaataaccactattgag Protospacer *. ******.**************.****
53. spacer 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448854 (Streptococcus phage Javan146, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
cctctagtggctgaaataaccactactgag CRISPR spacer gccatagtggttgaaataaccactattgag Protospacer *. ******.**************.****
54. spacer 2.6|1268625|30|CP021772|CRT matches to KC206276 (Escherichia phage EC1-UPM, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
ttagcctctggtttagcttctggcttagcc--- CRISPR spacer ttagcctctgctttagcttct---ttagtcagt Protospacer ********** ********** ****.*
55. spacer 2.6|1268625|30|CP021772|CRT matches to KF562340 (Escherichia phage vB_EcoP_PhAPEC7, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
ttagcctctggtttagcttctggcttagcc--- CRISPR spacer ttagcctctgctttagcttct---ttagtcagt Protospacer ********** ********** ****.*
56. spacer 2.6|1268625|30|CP021772|CRT matches to KF192075 (Escherichia phage vB_EcoP_PhAPEC5, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
ttagcctctggtttagcttctggcttagcc--- CRISPR spacer ttagcctctgctttagcttct---ttagtcagt Protospacer ********** ********** ****.*
57. spacer 2.6|1268625|30|CP021772|CRT matches to MG208881 (Escherichia phage St11Ph5, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
ttagcctctggtttagcttctggcttagcc--- CRISPR spacer ttagcctctgctttagcttct---ttagtcagt Protospacer ********** ********** ****.*
58. spacer 2.6|1268625|30|CP021772|CRT matches to HQ259105 (Escherichia phage vB_EcoP_G7C, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
ttagcctctggtttagcttctggcttagcc--- CRISPR spacer ttagcctctgctttagcttct---ttagtcagt Protospacer ********** ********** ****.*
59. spacer 2.6|1268625|30|CP021772|CRT matches to KF620435 (Shigella phage pSb-1, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
ttagcctctggtttagcttctggcttagcc--- CRISPR spacer ttagcctctgctttagcttct---ttagtcagt Protospacer ********** ********** ****.*
60. spacer 2.6|1268625|30|CP021772|CRT matches to NC_019423 (Enterobacter phage IME11, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
ttagcctctggtttagcttctggcttagcc--- CRISPR spacer ttagcctctgctttagcttct---ttagtcagt Protospacer ********** ********** ****.*
61. spacer 2.6|1268625|30|CP021772|CRT matches to MN855733 (Siphoviridae sp. isolate 355, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
ttagcctctggtttagcttctggcttagcc--- CRISPR spacer ttagcctctgctttagcttct---ttagtcaat Protospacer ********** ********** ****.*
62. spacer 2.6|1268625|30|CP021772|CRT matches to MH733496 (Escherichia phage PGN829.1, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
ttagcctctggtttagcttctggcttagcc--- CRISPR spacer ttagcctctgctttagcttct---ttagtcagt Protospacer ********** ********** ****.*
63. spacer 2.6|1268625|30|CP021772|CRT matches to MH358458 (Escherichia phage phi G17, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
ttagcctctggtttagcttctggcttagcc--- CRISPR spacer ttagcctctgctttagcttct---ttagtcagt Protospacer ********** ********** ****.*
64. spacer 1.6|202161|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_048682 (Raoultella phage Ro1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
aaaagtatattgtttcatcatttcccactt CRISPR spacer tatgatatattgtttcatcatttccacctt Protospacer * ..******************** ***
65. spacer 1.7|202227|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP023400 (Pseudoalteromonas spongiae strain SAO4-4 plasmid pl, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
agttcctaattgaaaatcatgtagcaatct CRISPR spacer acttagtaattgaaaatcatgaaccaatca Protospacer * ** *************** * *****
66. spacer 1.17|202887|30|CP021772|CRT matches to KJ019094 (Synechococcus phage ACG-2014e isolate Syn7803US33, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
acagactttagatttttatgaaaaaaatgt CRISPR spacer tgagattgtagatttttatgaaaaaactct Protospacer ***.* ****************** * *
67. spacer 1.17|202887|30|CP021772|CRT matches to KJ019156 (Synechococcus phage ACG-2014e isolate Syn7803C2, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
acagactttagatttttatgaaaaaaatgt CRISPR spacer tgagattgtagatttttatgaaaaaactct Protospacer ***.* ****************** * *
68. spacer 1.17|202887|30|CP021772|CRT matches to KJ019054 (Synechococcus phage ACG-2014e isolate Syn7803C85, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
acagactttagatttttatgaaaaaaatgt CRISPR spacer tgagattgtagatttttatgaaaaaactct Protospacer ***.* ****************** * *
69. spacer 1.17|202887|30|CP021772|CRT matches to NZ_AP019696 (Absiella argi strain N6H1-5 plasmid pABar1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
---acagactttagatttttatgaaaaaaatgt CRISPR spacer ttcacag---ttagatttttatgataaaaattg Protospacer **** ************** ******
70. spacer 1.2|201897|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022047 (Staphylococcus sciuri strain FDAARGOS_285 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
agttaaattcacaattttggtctttttcgt CRISPR spacer aaataaattctccattttggtctttttgca Protospacer *. ******* * **************
71. spacer 1.4|202029|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN855723 (Bacteriophage sp. isolate 72, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
actgattaactacagcctcttcttttgttt CRISPR spacer actgattaaatgcagcctcttctgcctgtt Protospacer ********* *.*********** .. **
72. spacer 1.5|202095|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP010358 (Acinetobacter johnsonii XBB1 plasmid pXBB1-8, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tggatttaaagcatacggtttcaaatcgtc CRISPR spacer agcatttaaagcatgcagtttcaaatggaa Protospacer * ***********.*.********* *
73. spacer 1.6|202161|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_010625 (Paraburkholderia phymatum STM815 plasmid pBPHY01, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aaaagtatattgtttcatcatttcccactt CRISPR spacer tgcaggatatcgtttcatcatttcccccgt Protospacer . ** ****.*************** * *
74. spacer 1.8|202293|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_022650 (Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gatgagtctgattgaagcgttggaagtttt CRISPR spacer gccaagtctgatggaagcgttggaagatcc Protospacer * ..******** ************* *..
75. spacer 1.8|202293|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LC532225 (Enterobacter hormaechei subsp. xiangfangensis A2483 plasmid pA2483imp-1 DNA, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gatgagtctgattgaagcgttggaagtttt CRISPR spacer gccaagtctgatggaagcgttggaagatcc Protospacer * ..******** ************* *..
76. spacer 1.8|202293|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LC532227 (Enterobacter hormaechei subsp. xiangfangensis A2504 plasmid pA2504imp-1 DNA, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gatgagtctgattgaagcgttggaagtttt CRISPR spacer gccaagtctgatggaagcgttggaagatcc Protospacer * ..******** ************* *..
77. spacer 1.8|202293|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_AP023201 (Escherichia coli strain TUM18780 plasmid pMTY18780-4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gatgagtctgattgaagcgttggaagtttt CRISPR spacer gccaagtctgatggaagcgttggaagatcc Protospacer * ..******** ************* *..
78. spacer 1.8|202293|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_023907 (Escherichia coli strain HS102707 plasmid pHS102707, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gatgagtctgattgaagcgttggaagtttt CRISPR spacer gccaagtctgatggaagcgttggaagatcc Protospacer * ..******** ************* *..
79. spacer 1.8|202293|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT774382 (CrAssphage cr10_1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gatgagtctgattgaagcgttggaagtttt CRISPR spacer tatgagtctcattgtagcgttggagttcat Protospacer ******** **** *********. *. *
80. spacer 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KP342511 (Enterococcus faecium isolate N12-493 plasmid pEfm12493, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cctctagtggctgaaataaccactactgag CRISPR spacer ttgccagtgggtcaaataaccactactgaa Protospacer .. *.***** * ****************.
81. spacer 1.17|202887|30|CP021772|CRT matches to NZ_CP038792 (Escherichia coli strain PF9285 plasmid pDW54_1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
acagactttagatttttatgaaaaaaatgt CRISPR spacer cgttaatttagattttcatcaaaaaaatgt Protospacer * **********.** **********
82. spacer 1.17|202887|30|CP021772|CRT matches to MN693374 (Marine virus AFVG_25M38, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
acagactttagatttttatgaaaaaaatgt CRISPR spacer tctccttttaaaattttatgaaaaaaatgt Protospacer * .****.* *****************
83. spacer 1.17|202887|30|CP021772|CRT matches to NZ_CP044458 (Acinetobacter indicus strain B18 plasmid pB18-3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
acagactttagatttttatgaaaaaaatgt CRISPR spacer gtaagcgttagatttttaataaaaaaatgt Protospacer ..*..* *********** **********
84. spacer 1.17|202887|30|CP021772|CRT matches to NZ_CP006909 (Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
acagactttagatttttatgaaaaaaatgt CRISPR spacer aatgtatatagatttttatgaaaataatga Protospacer * * * **************** ****
85. spacer 1.17|202887|30|CP021772|CRT matches to NZ_CP013684 (Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
acagactttagatttttatgaaaaaaatgt CRISPR spacer aatgtatatagatttttatgaaaataatga Protospacer * * * **************** ****
86. spacer 1.17|202887|30|CP021772|CRT matches to NC_010379 (Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
acagactttagatttttatgaaaaaaatgt CRISPR spacer aatgtatatagatttttatgaaaataatga Protospacer * * * **************** ****
87. spacer 1.17|202887|30|CP021772|CRT matches to NC_010418 (Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
acagactttagatttttatgaaaaaaatgt CRISPR spacer aatgtatatagatttttatgaaaataatga Protospacer * * * **************** ****
88. spacer 1.17|202887|30|CP021772|CRT matches to NZ_CP039144 (Acinetobacter sp. 10FS3-1 plasmid p10FS3-1-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
acagactttagatttttatgaaaaaaatgt CRISPR spacer gtaagcgttagatttttaataaaaaaatgt Protospacer ..*..* *********** **********
89. spacer 2.4|1268541|30|CP021772|CRT matches to NZ_CP054364 (Escherichia coli strain SCU-171 plasmid pSCU-171-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ttagcttctggtttggcctctggcttaacg CRISPR spacer tccacttctggtttggccgctggcgtaaaa Protospacer *. .************** ***** *** .
90. spacer 2.4|1268541|30|CP021772|CRT matches to NZ_CP051689 (Escherichia coli strain SCU-387 plasmid pSCU-387-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ttagcttctggtttggcctctggcttaacg CRISPR spacer tccacttctggtttggccgctggcgtaaaa Protospacer *. .************** ***** *** .
91. spacer 2.4|1268541|30|CP021772|CRT matches to NZ_CP012377 (Escherichia coli strain GE3 isolate human faeces plasmid pGE3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ttagcttctggtttggcctctggcttaacg CRISPR spacer tccacttctggtttggccgctggcgtaaaa Protospacer *. .************** ***** *** .
92. spacer 2.4|1268541|30|CP021772|CRT matches to NZ_CP040454 (Escherichia coli strain UPEC132 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ttagcttctggtttggcctctggcttaacg CRISPR spacer tccacttctggtttggccgctggcgtaaaa Protospacer *. .************** ***** *** .
93. spacer 2.6|1268625|30|CP021772|CRT matches to MH616814 (Microviridae sp. isolate ctjj954, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ttagcctctggtttagcttctggcttagcc CRISPR spacer atagcctctggttttgcttctggtctgctc Protospacer ************* ********..*. .*
94. spacer 2.6|1268625|30|CP021772|CRT matches to AP013378 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G14, isolate: uvMED-CGR-U-MedDCM-OCT-S23-C32) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ttagcctctggtttagcttctggcttagcc CRISPR spacer tttatctctggtttaacttctggctttact Protospacer ** ..**********.********** .*.
95. spacer 2.6|1268625|30|CP021772|CRT matches to NZ_CP026426 (Acinetobacter sp. ACNIH1 plasmid pACI-df08, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ttagcctctggtttagcttctggcttagcc CRISPR spacer tttacagatggtttagcttctagcttagca Protospacer ** .* *************.*******
96. spacer 1.2|201897|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT matches to KT962247 (Cellulophaga phage phi17:2_18, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
agttaaattcacaattttggtctttttcgt CRISPR spacer tttcctcttcacaaatttggtcttcttcgt Protospacer *. ******* *********.*****
97. spacer 1.2|201897|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT matches to KT962246 (Cellulophaga phage phi4:1_18, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
agttaaattcacaattttggtctttttcgt CRISPR spacer tttcctcttcacaaatttggtcttcttcgt Protospacer *. ******* *********.*****
98. spacer 1.2|201897|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT matches to KT962245 (Cellulophaga phage phi4:1_13, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
agttaaattcacaattttggtctttttcgt CRISPR spacer tttcctcttcacaaatttggtcttcttcgt Protospacer *. ******* *********.*****
99. spacer 1.2|201897|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT matches to KC821632 (Cellulophaga phage phi4:1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
agttaaattcacaattttggtctttttcgt CRISPR spacer tttcctcttcacaaatttggtcttcttcgt Protospacer *. ******* *********.*****
100. spacer 1.2|201897|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_021798 (Cellulophaga phage phi17:2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
agttaaattcacaattttggtctttttcgt CRISPR spacer tttcctcttcacaaatttggtcttcttcgt Protospacer *. ******* *********.*****
101. spacer 1.10|202425|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693626 (Marine virus AFVG_250M1005, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
cactgaccacctctgaacaaccattcatca CRISPR spacer aactgaccacctctcaacgaccatcacgcg Protospacer ************* ***.*****. *.
102. spacer 1.13|202623|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG592483 (Vibrio phage 1.110.O._10N.261.52.C1, partial genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgaataaataagctacaaaagataggattg CRISPR spacer ctaataactaagctacaaaagatacgtgaa Protospacer . ***** **************** * .
103. spacer 1.13|202623|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP015253 (Bacillus thuringiensis Bt18247 plasmid p113275, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgaataaataagctacaaaagataggattg CRISPR spacer gaaataaataagctataaatgatagtttaa Protospacer .*************.*** ***** * .
104. spacer 1.13|202623|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693118 (Marine virus AFVG_25M91, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgaataaataagctacaaaagataggattg CRISPR spacer tttgtaaataagttacaaaagatagtttac Protospacer * .********.************ *
105. spacer 1.15|202755|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448673 (Streptococcus phage Javan119, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
cctctagtggctgaaataaccactactgag CRISPR spacer tcaatagtggttgaaataaccactagggca Protospacer .* ******.************** * .
106. spacer 1.16|202821|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN698241 (Pelagibacter phage HTVC027P, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaaaaattaatgacgcaattgctaagtcaa CRISPR spacer gtattggtaatgacccaattgctaagttaa Protospacer . * . ******* ************.**
107. spacer 1.17|202887|30|CP021772|CRT matches to NZ_CP009443 (Francisella philomiragia strain O#319-036 [FSC 153] plasmid pFPJ_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
acagactttagatttttatgaaaaaaatgt CRISPR spacer gtgaattttagatttttaagaaacaaatga Protospacer ....*.************ **** *****
108. spacer 1.17|202887|30|CP021772|CRT matches to NC_013092 (Francisella philomiragia subsp. philomiragia ATCC 25017 plasmid pF243, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
acagactttagatttttatgaaaaaaatgt CRISPR spacer gtgaattttagatttttaagaaacaaatga Protospacer ....*.************ **** *****
109. spacer 1.17|202887|30|CP021772|CRT matches to NZ_CP013966 (Aeromonas hydrophila strain D4 plasmid pAhD4-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
acagactttagatttttatgaaaaaaatgt CRISPR spacer ctatggtttggatttttatgaacaaaatgg Protospacer .* . ***.************ ******
110. spacer 2.4|1268541|30|CP021772|CRT matches to MG711465 (Faecalibacterium phage FP_Brigit, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ttagcttctggtttggcctctggcttaacg CRISPR spacer ttgcggaagggtttggcctctggcttatcg Protospacer **. ****************** **
111. spacer 1.11|202491|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_021529 (Vibrio phage nt-1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aattctgctttgaaatcaagttccatttct CRISPR spacer aattctgcgttgaaatcaagtgtaagaaac Protospacer ******** ************ . * .
112. spacer 1.11|202491|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH622943 (Myoviridae sp. isolate ctbc_4, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aattctgctttgaaatcaagttccatttct CRISPR spacer tgccactctttgaaatcagcttccatttct Protospacer ... . ***********. **********
113. spacer 1.12|202557|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_017076 (Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tgctccaaacgggcattttcagcttttagt CRISPR spacer cactacaaacgggcattttcagccatgcac Protospacer ..** ******************. * ..
114. spacer 1.17|202887|30|CP021772|CRT matches to CP054320 (Escherichia coli strain SCU-390 plasmid pSCU-390-2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
acagactttagatttttatgaaaaaaatgt CRISPR spacer tcttgtcggagatttttatgaaaaaaaagt Protospacer * ... ****************** **
115. spacer 1.4|202029|30|CP021772|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT362618 (Microcystis phage MaeS, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.667
actgattaactacagcctcttcttttgttt CRISPR spacer ttacggcaactaaagcctcttcttttgtaa Protospacer . . .***** ***************
116. spacer 2.6|1268625|30|CP021772|CRT matches to KP942676 (Pectobacterium carotovorum plasmid Drgb1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.667
ttagcctctggtttagcttctggcttagcc CRISPR spacer cactactctggtttatcttctggctttaaa Protospacer . ********** ********** .
117. spacer 2.6|1268625|30|CP021772|CRT matches to NC_019526 (Enterobacteria phage vB_KleM-RaK2, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.667
ttagcctctggtttagcttctggcttagcc CRISPR spacer aagaattctggtttagcttctgggttatga Protospacer .. .***************** ***
118. spacer 2.6|1268625|30|CP021772|CRT matches to AB897757 (Klebsiella phage K64-1 DNA, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.667
ttagcctctggtttagcttctggcttagcc CRISPR spacer aagaattctggtttagcttctgggttatga Protospacer .. .***************** ***
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
455002 : 532572
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP021772|455002:532572|DBSCAN-SWA TTTATGCATATAAGTTTTTTAGCGTTTGAATATCAACTTCTTGAATGCCATAATGCGAACCTTTTGACTGCATAACGGAATGTTGTTGATCATTATGTCCTAGACCTAAAGCGTGTCCTAATTCATGTTCGGCTGTATTAACAATCCTAGTATGGTCATAACCAAACTGTTTATTCTTAAGGTAAAATGTGTTTAATTTAACTGTTACCTTTGAAATACGATTAGTTAAAGCATTTTTCTCGGTTTCAGCTACACCCGCAGCTTGTGTTTTAGCATCTGAGTAATCCTTAGCAATAATATCAGCATTAGGATTGTCTGTTGTTTGTAACACAAAAGCACCTGTTGCATTCCAATTGGAGATTGCTTGCTTGTAAGCAGAGACCAACTCAGAATCTCTAGTTGCTATATAGATAGTTGCCTGATTTTTATCCCATCTGGTATTTTCTGAATGATGAACACTATCCGTAGCTAGATTAGTAAAGGAATTTTTGAGCTGATTAGTGTCAGCAAAATTTAAAAATGTTTTTCCTGTCTGAATAATGTCACTAAGTTGATTAGCAAATTCTGATTGACTGTGATTCGCATAGTAATACAAGCCAAATAAAATAATCGCAATAACAAGAACTGTCTTGAATATTCCCCAAATGATATTCCAAATCAATCTAAAGATAAACTTTGGAATAGCAAATATCATTCTAAATAGTGTTCTCATTTTTTATCTCACCTTCTGTGTCTAATTTCCCAAAACTTAATGATTTAGTATAACAAGACTTTACTTGGATTTCAACGATTTAGCTAATACTACGAAAGGCGCTCTTCTTTGACATAATCAATAGGGAGCCATTCTAAGACTTTTTCTAATTGCTGATTCCAGTAATACCATTCATGTTTACCATGATCATTGAAATAGTCAATAGTTAAACCTAATTGACGAAGTTCATCAATTGCGACTTCATTAGCTTCAAAAAGAAAATCTTCATAACCACACCATGCATAAAATTTAGTCTTCATATCAAAAGACTCAACGCAACGCCTTAGTGAATGACGCTCTATGTTATCAGTGTTATTCAAATCACCAAAAATTCCCGACCAATAGTTAATGTTATCGTTGCCATTATTGAATAATAAATCAAAGTCAAAAGAAAGTGCACCTGACAAAGAGGCAGCATGAGAAAAACGATTAGTCAGTAGAGCTATTTTATATGCTCCATATCCCCCCATAGATAATCCAGCAATGAAATTTTTCTCTCTCTTATCAGACATATTAGGAAAGAAACGTTTCAAAACTTTTGGTAACTCGATAGCTATTGCATCAAAATAATCCAACCCATACTTTGTGTTGGTATACCATGCTAAGTCTGTTGATGGCATCACGACGATAAGATTAGTATGACGTAAAAGACGCTCTATATTTGTGCGTTTTTGCCAAGAATTCTCATTTCCCCCCATTCCATGGAGAAGATACAAAACAGGAATGTCACAATCATCAATTTTATCATCAGATATCTCAAAAGCATCTGGGTAAATAACATTGACTTGACGTTCCGTTCCTAGTACCTTAGAGTGATATTCAATATTAAAAAATGCCATAAAAACCTCCATTCTAGCAAGAAAGGCTACCAAAATTTGGTAACCTCTTAACACTATCAACGAACTTCCATAACCACAGGAAGGATTGCTGGGCGACGTTTCGTTTGGTCAAATAAGAACTTGCTGACCTCATCACGCACTTTCCCTTTAAGTTCACCCCAGTCAAATGTATCTTTGCTTAAGTAATCTTCTACCGTTGTATTAACTAATTCTGCGCTCTCACGCAAAATATCTCTGCTTTTTTTCACATACACAAAACCACGCGTATTAACACGAGCTTTAGAAATGATTTTCTTTTCTTTTTTGCTGACAGTTATAACAACAATAAAAATTCCATCTTCAGATAATACCTTGCGGTCACGAAGTACAATATTACCAACGTCACCAATAGCATTTCCATCAATCATAACATCTCCAGCAGGAACAGATCCACTATGGAAGAAGCCATCTTTTTCAAGAACCATGATGTCACCACGCTTCACAATATAAATATCATCTGCTGACATTCCTACCTCTTGAGCTAAGCCCGCATGTGCTGACAAATCCCTATACTCTCCTTGAATTGGGAAAAGGTATTTAGGTTTCAATAGATTCATTAATAATTGTAATTCGCGACCATTTGCATGACCTGATACGCGCAAATTCTGTGTTATCAATTTAACTGAGCCACCAGCTTTATAAATCAGATTTTCAACACGCGCTACAACTGCCTCTTTTGCAATACTTGGTGTTGTTACGATAAATACTAAATCACCATCTTTAATTTGAACATAACGATGACGTCCGATTGCCATTTTTTGGAGACCATTTATCGGCTCTCCCATACGTCCAGTTTCAAGGATTAATAATTCGTTATCTTCGTAACGTGTCATATCTTTAGGTTTGATAATCATATTTTCATCAGCAATATGAATGCGTTTCATACGAATGGCCGTACGAACAATATTTTCAATATCAAAACCAGTCAAAACTACTCGACGACCGTTTTCTGCCGCTGCATCAAAGACTTGTTGAATACGAATGAGATTACTTGCAACTGCTGCTACGATGACTCTACCTTCTGCGTCTTCAATAACGCTCTTAATTTCATCACCGACCTCATATTCGCTAGCAACTTGGTCATTGCTTGTAGCATTTGCAGAATCTGATAAAAGTGCTAAAACACCATCACGACCAATTTCAGCTAAACGTGCCAGATCTGTTTGGTAATATTTCCTTGCAGCTTGATCAAATTTAAAGTCACCTGTGTAAACGATATTTCCCTCTTTTGTCCCAATAACGATTCCCATTGACTCTGGAATTGAATGAGTCGTTTTAAAGAACGAAATCACCGCATCTTGAAATTCAATTTCCGTTTCACTATCAATCACATGGAAATTATTGAATTTCTTGACTGCTGTACTATTTTTAACGAATAACTTAGCTAATTCAATTGTGAGAGGTGAACCAAACACAGGTGCTTTGACTTCGGCGATAATATAAGGCAATGCACCAATAGCATCCGCATGTCCATGGGTTAAGAAAATCCCCTGAACACGTTTTTTATTTTCAATTAAGTAATCAAGATTTGGAATAACAACATCAACACCCAGTTGTTCATTTTCAGGATATTTGAGTCCAGCATCCAAAACAAAGATAGAATCATTGACTTCTACTACATATAGGTTTTTTCCGTTTTCACGAACACCTCCAAGAGCCATGATTTTTATGTCGCTCATAATGAGTTTTCTCCTTAAATTTTGTTAATTCTTTTTTATAAAGCAGACAAGAAATTGTCCAATTATTATCATTAGTAATTGATTTATCGGTAACTTTTCTTGGGTTTGAAGAAAAACCTTATTAATCAATAATAGGAATATGAATTAAAGAGTGTGTCCTTACTTTCATTCCATTTGTACTTACGGCCCTTGTCTCTACAAGTCGATTTACAGCATTATTAGTATATCATATTTTGAAAATAATTTCTTGCAAAGTGTATAGAAAAAGAAGTGAAACACTCCCATTTCACTTCTTTTTAATCAAATAATTGATAATAGTCAGCTATAGCCATCTCGTTTTTTTGTGCCTGATTTAAATCTCTGACAATCTTGCCATCTTTCATTACTAATATACGATTTCCATATTTGAGAGCATCTTCCATATGATGTGTAATCATTAAGGCAGTCAACGAATCTTGTTTGATAAACTCATCAGTCAAGCCCATAAGCGAAACACTTGTTCTAGGATCAAGCGCTGCTGTGTGTTCGTCCAATAATAACAGATTTGGTTTTTTCAAAGTTGCCATTAATAAACTAAGTGCTTGTCTTTGTCCACCTGATAATAAACCTGTAGGTGTCTCTAAATGGCGATCAAGTCCATTACCAGTTCTAGCAATCAATTTTTGAAATTCTTCGGTATAGTTAGTAATCTTTCTAGGAACTAACGGTCTCTTTTCACCTCGAAATTTAGCAACTAATAAATTTTCAGCAACTGTCATCCTAGGTGCTGTTCCCATTTTCGGATCTTGAAATACCCGTGATAAATATTTAGCTCGTTTTTCTGCTGGTAAAATAGTAACATCTTGTCCCATGATGTAAATATTTCCACCGCTTAACATCAAGGTACCTGCAATTACATTAAAAAGCGTTGATTTTCCAGCTCCATTTCCACCCAATATTGTAATGAAGTCATGTTCATAAATACTCAAATTAACATGGTCTAATATCGTTTTCATTTCTGCTAAACCATTACTGACTTGTACGGTTGCTTCTTTTAACTCTATGATTTTCATCACCATTATAAGCGTACTCCTTTCAAAATCTTCGTTTTTAGGACAGGAACCATTAAACAAATTCCAAGCACTATTGCACTAAATAATTTTAGGTAATTCGTATTAAATCCTAAGGCGATTACTGCCGTTATTAAAAATTGATAAAGAATAGAACCCACCACTATAGCAATTAAACGTTCAAAGAGAGTTAAACCAGTAGAGTAAAGTACCTCTCCAATAATAATACTAGCTAACCCAATAACAATAACACCTATACCTTTTGATACATCAGCATATCCATCTTGTTGACTTACTAAAGCTCCTGATAAAGCAATTAAGCCATTTGATACAATTAAGCCAAGCATTTCCATTTTGTCGGTATCAATGCCGAAGCTCTTTGCCATATCAGGGTTGTCTCCTGTTGCAATATAAGCTTGCCCCAAGCGTGTATAGAGAAAATAAATTAAGGCAGAAATCACCAAGAGAATAGCTATCAAACCTAATACGAGAAGATTTAAATCATTTGAAAACGGAAGAAAATCTTTCAATGTTTGAATCTCATTTAAACCTAGATTTGCTCTTTTCATAACCATTAGCATAATGGAGTGGCATGAGGTCATTACTAAAATTCCTGCTAAAATCGTCGGTATCTTTCCTTTAG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60 | Enterobacteria_phage(23.08%) | tRNA,tail,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
814497 : 825231
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP021772|814497:825231|DBSCAN-SWA TATGAAACTCATTTCATGGAATATTGATTCCCTCAATGCGGCATTAACAAGTGAATCAACACGTGCTTTAATGTCACGCCAAGTTATTGACACTTTAGTTGCTGAAGATGCCGACATCATTGCGATTCAAGAAACTAAACTGTCTGCCAAAGGACCTACTAAAAAACATTTGGAAGTACTTGAAACTTACTTCCCAGAATATGATTTGGTTTGGCGATCATCAGTCGAACCTGCTCGTAAGGGCTATGCTGGTACAATGTTCTTATATCGTAAAGGGTTAAATCCTATTGTTAGCTTCCCTGAAATCGATGCTCCTACTACAATGGATAATGAAGGTCGCATTATTACTCTCGAATTGGAAAACTGCTATATCACACAGGTCTATACTCCAAATGCAGGTGATGGCCTAAAGCGCTTAGCTGACCGTCAAATATGGGATATTAAATATGCTGAGTATTTAGCAACATTGGATAGTCAAAAACCTGTTCTAGCAACAGGTGACTATAACGTAGCCCACAAGGAAATAGACCTAGCTAATCCTAGCAGTAATCGTCGTTCTGCTGGATTCACAGATGAAGAGCGCCAAGGCTTTACAAATCTACTAGCCAAAGGTTTTACAGATACTTTTCGTTACCTTCATGGCGATGTTCCAAATGTTTATAGCTGGTGGGCACAACGAAGTCGTACATCCAAAATCAACAATACAGGGTGGAGAATTGATTATTGGCTAACAAGTAACCGTGTCGCAGATAAAATTACCAAGTCAGAAATGATTCATTCTGGTGATCGTCAAGATCATACACCAATTATTTTGGAGATTGAACTATAAACCCCAAAAAAGATGATTGAGTTATAACTCAATCATCTTTTTATACTAAGTTGAGGTCTTTATACTTAGTACGGTAGCCAATCTGAAGAATTTTATTATCTTTAACTAGCAATGGACGCTTAATAAGCATCCCATCCGATGCCAATAAGTCCAAAGCTTGGTCAAGAGTTAAATCATCAAATTTATCTTTTAAGCCTAATTCTCTGTAAGAATTTCCTGAAGTATTGAAAAACTTTTTAAGGTCATAAGGCGAATTCTCTAACAATTCTTTTAATAACGAAGCTTTGGGAGGATTGCTTTTTATATCAATCGCTTCAAAAGTCAAGCCGAGTTCAGTTAACTCTTTTTTTGCTGAACGACAAGTGGTACATTTGGGGTATTCATAAAACGTATACATATTATTTCTCCTTTTCGTATTCTAATAACCAAGATTTTCTTTCTAAGCCACCAGCATAACCAGTTAATTGACCATATCTTCCTAAAACACGGTGACAAGGTATGATTAGAGAAATAGGATTTTTACCTATTGCTCCTCCAACAGCCTGTGCAGATTGACAATTTAGCTCTTTCGCTAATTCTCCATAAGTTTTTGTATCTCCAAAAGGGATTTTCTGTAATTCCTGCCATACTCTCGTCTGAAATGCTGTCCCTCTCAATGATAATGGAATACTAGGTAAATTTTGCTGTGAAAAATAAGCATCTAACCACTTCTTACCAAGTAAAGTATAGGAATTTGACATATTAACAATTTCCTCTTGGTTGACTGCTAGCATATCATATTTTTGCCCAACAAAATAAAGCCCTGATAAACCTAGATTGTCTGCTAGAAGGCGAATTTCTCCAAGAGGGGACTGATAGAATTCTTGATATAACATATGATAAGCATAACTTAAAAAGCCATGAAAAGCAATTCATGACTTTTTTTAGTTCTTTATTGTTTTTTTGCAATTAAACGTACACGGACGATATTCTCATCACCTTCAAATTCTTCAATTAAAGTAGAAATCTTGTTATTATCCGTTTCATCTAAATCTATTAGTGTGTAGGCATAGTCACCCTTTGAACGGTTAATAATGTTATCAATATTTATACCTAACTCTGATACAGCAGTTGAAATTTTAGCCACAATGTTAGGAACATTCTTGTTAATTAAAGTAATACGAAATGGTGCGGTTTGAATTTGATGTACATTGGGGAAATTAACTGAATTAGTGATTTCTCCTGTCTCCATAAAACAACGAATGGTTTGACTTGCCATAATAGCACAATTTAGCTCTGCCTCATCTGTTGATCCGCCTACATGAGGAAAGACTGTAATTCCTTTTTGGTTTAATAATTCTTTGTCTCCAAAATCAGTAATATAGCGCTTGACAACACCAGTTTCTATCGCTTCAAATAGCTCTTGGTTATTGACTAATTCTGCACGAGCAAAGTTGATAATCGTAGTTCCTTTTTTCATGATTGAAAAAGCTTCCGCATCAAAAGTATGCTTAGTTTCATTTGTTAAGGGAACATGAATTGTGATATAGTCACAAGTTTCAAAAATATCCTTAATCTCTTTAACCCTTTGAACATGGCTTGAAATATTCCAAGCTGTTTCAATTGAAACATAGGGATCATAACCAAGAACTGTCATTCCTAAGCGTCTAGCATCATTCGCAATTCTAGCTCCAATGGCACCAAGGCCGATAACTCCCAATTTTTTTCCTGCAATTTCATTACCAGCAAAAGCTTTCTTTCCTGCTTCAATTTGTTTGGGAATATCTGTTCCAGTTAGAGTATTAACCCATCGGTTAGCTCCTAAATAATCACGAGCTGAAAGCAATAAGGCAGCAATGACTGCTTCTTTTACAGCATTAGCATTTGCACCTGGGGTATTAAAGACGACTATTCCCTGTGCACTTGCCTCTTCAATAGGAATATTATTTGTTCCTGCACCCGCCCTAGCAATAGCTTTGAGGTTACTTGGGAAATCCTGATTATGCAAATTTTGACTACGAATAATATAGGCATCAGGATTTTCTGACATATCCCCATCAATCTGGAAACGATTCCCTAACTCTTGTAAACCAATTTGATTAATATTATTAAATGTTTTGACACTAAAAACCATTCTTTTTCACTAAGGTTATCTCTTTAGTCATCATTGACTAAAATAACCCCTTTCTTTTTTTCTTACATGGGATTTCTTTCATCAATCTCACGATAGATGCTCGTTTCTCCCTTTTCTTTTATCTTCTGATAAGCCAATCGTACCCCATCTAGAGGTACTTTACCACAATATTGATAGCCTAATTTATTTAGAATATGCTGCATAGTGACATTTTTTTCATGAGTATCGCAACGAAAATCAGGTCCTTTATGACCTTCAATTAACCCTTGAAGGAATGTCTGTGCTAGTCCTCTACCACGAAATTGATTTGAAATAGCAATACGATGAAATGTTAGATAGCGATGGTTATCATGGAGCCATTTTCCCTCATAAATAGCATCATAAACCTCTTCATGACCATCAATGACAGCCGCATAAGTCGCTAGCATCCCATCTTCAATACCAACCCAAGCATAACCGTTCAAGATATCATCAATAATATCGTTACGATTAGGGTATCCATCTTCTTTTTGCCATTGATCACTTCCTGTTTTAGCAATTTCGGCACGCGCTTCCTCAATAAGAAGCATAATTTGGTCAATTTCATTTGGAAAAGCTAATCTGATTTGCATTATATTACCCACTTTTATATATTATAGACTATAATAACGGTTTAATTTTCTTTCGTGATAACATTTACTATGCATTTTCTGCTTCAAATGTTTTCATAAAATCAATTAATTCGATGACACCTTGTTTAGGAAAGGCATTATAAAGGCTAGCCCTCATACCACCTACCGAACGATGTCCTTTAATATTTTTAAATCCACGTTCTGTCGCTTCCTTTACAAATTTTTCATCTAAATCTTTATTAATAGTTATGAAAGGAATGTTACATAGAGAACGACTCTTTTTATCTCTGACAGGATTACTATAAAATTCTGAGGAATCAATATAATCATAGAGAAGTCCTGATTTTTCACGGTTAGCTTTCTCCATAGCATCAACACCACCTAGACTTTTCACCCATTCAAAGACTAATTTAGCAATGTAAATACTGTAAGCAGGCGGCGTATTATAAAGAGAACCAGCATCTGACTGAATCTTATAATCCAACATTGATGATAAAGTTGGTTCCTCATTAATCATATCTTCACGGATAATAACTACCGTTACACCAGCAGGTCCAATATTTTTTTGAGCTCCTGCATAAATCATTGCAAAATCTTCTACTTTATATTTTACAGCTAAGATATTAGAAGACATATCCGCAATAACAGGCACTCCATTAGTTTTAGGAATATCATAAAGCGATGTTCCTTCAATGGTATTATTTGTTGTCACATGAACATAGGCAGCTTTAGGATCAATCTCTTTTTCATCAAACTCTGGAATATAATCATAAACTGATTCTTCTGATGAGGCTAATAGAATTGGTTCAAAAGGAATTGTTTTTGATAGTTTTACAGCCTCTGTATAAGCTTTTTTCCCCCACGAACCAGCAACATGATAGTAAGCTTTACGCCCTCTGGCAATATTCAAGGGAATCATACTAAACTGTAAGGATGCACCACCTTGTAAAAAGATTACTTTATAATTATCCGGAATTCCCATCAAATCTCTTAAGTAACGCTCAGCACCTTTGATAATATCATCAAACTCTTTGGAGCGGTGCGATACCTCCAAAACACTCATACTGGACCCTTGATAATTAAGGAGTTCAGATTGGGCTTTTACAAGCACTGGTTTTGGTAAGACTGCAGGACCTGCAGAAAAATTATAAATTGTCATATAACACCTCCATATAATTGTGTAAGATTATAGCACAGTATTTTGAATATTGTAAAGATTTTTTTGATTAATTTTGCTTTTTATTCGTGATATAATGGTAAAGGCGAACAATCAAGTTTAAAGGAGTAATTTATGATTTTGAGGGAATTTTGTGCAGAGAATTTAACAGACTTAACCAGATTAGATAAAGCTATTATTTCACGTGTCGAGCTTTGTGATAACCTTGCTGTCGGAGGCACTACTCCTAGCTATGGTGTTATCAAAGAAGCTAATCAATATTTACATGAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP021772|814497:825231|818116_819208_-|AWZ33945.1|DBSCAN-SWA MTIYNFSAGPAVLPKPVLVKAQSELLNYQGSSMSVLEVSHRSKEFDDIIKGAERYLRDLMGIPDNYKVIFLQGGASLQFSMIPLNIARGRKAYYHVAGSWGKKAYTEAVKLSKTIPFEPILLASSEESVYDYIPEFDEKEIDPKAAYVHVTTNNTIEGTSLYDIPKTNGVPVIADMSSNILAVKYKVEDFAMIYAGAQKNIGPAGVTVVIIREDMINEEPTLSSMLDYKIQSDAGSLYNTPPAYSIYIAKLVFEWVKSLGGVDAMEKANREKSGLLYDYIDSSEFYSNPVRDKKSRSLCNIPFITINKDLDEKFVKEATERGFKNIKGHRSVGGMRASLYNAFPKQGVIELIDFMKTFEAENA >CP021772|814497:825231|820245_821109_-|AWZ35227.1|DBSCAN-SWA MQVQKSFKSNTHYGTLYLVPTPIGNLDDMTFRAIRILREVDFICAEDTRNTGLLLKHFDITTKQISFHEHNAYDKISGLIDLLKEGRSLAQVSDAGMPSISDPGHDLVKAAIEGDIPVVSIPGASAGITALIASGLAPQPHIFYGFLPRKQGQQITFFETKKDYPETQIFYESPFRVSDTLKHMKEIYGDRQVVLVRELTKLYEEYQRGTISQLLGHIEKVPLKGECLIIVDGKRDTERVKDSSQQDPLVLVKEYIANGDKTNQAIKKVAKELNLNRQELYASFHDL >CP021772|814497:825231|821114_821441_-|AWZ33949.1|DBSCAN-SWA MDKKDLFDAFDDFSQNLLVGLSEIETMKKQIQKLLEENTVLRIENGKLRERLSVIEAETETAVKNSKQGRELLEGIYNDGFHICNTFYGQRRENDEECAFCIELLYRD >CP021772|814497:825231|824466_825231_-|AWZ33954.1|DBSCAN-SWA MALLEVKNLSKHFGGLTAVGDVSMKLHKGELIGLIGPNGAGKTTLFNLLTGVYLPSKGTISLDGKILNGRKPAKIASLGLGRTFQNIRLFKNMTVLDNVLVGLSNHHLSHPIASFLRLPKYYHSEKALRKKALELLEIFGLKAYQDALAKNLPYGKQRRLEIVRALATEPKILFLDEPAAGMNPQETAELTQLISQIKSDFDITIMLIEHDMNLVMQVTERIYVLEYGRLIAHGTPEEIKNNKRVIEAYLGGEL >CP021772|814497:825231|821471_822335_-|AWZ33950.1|DBSCAN-SWA MDLKRTQPKLLEKFNTILQSDRMSHAYLFSGNFASLDMALYLAQSQFCEKRQSGLPCQKCRACRLIANGEFSDVKIIEPQGQLIKTETIKELTKDFSRSGFEGKSQVFIIKDCEKMHVNAANSLLKFIEEPQSSSYVILLTNDENNVLPTIKSRTQIFRFPKQLDMLVHQAEQAGLLKSQASLLAQVADDPKHLEILLANKKLLDYLNLSQQFVTTLAKDRQTAYLEVSRLTSQVVDKNDQAFVFQWLTIMLAKEGQLYDLENTYRAQQMWKSNVSFQNSLEYMVLS >CP021772|814497:825231|820019_820124_-|AWZ33947.1|DBSCAN-SWA MNTIANWILFLRAGYKRWYALIPVLSGFTKHERT >CP021772|814497:825231|823078_823738_-|AWZ33952.1|DBSCAN-SWA MPVKDFMTKKLVYVSPDTTVAEAADLLREHHLRRLPVVENDQLVGLVTEGTMAEAQPSKATSLSIYEMNYLLNKTKIRDIMIKDIVTVSQYASLEDAIYLMMSRKIGVLPVVDNGQLYGIVTDRDVFKAFLEIAGYGQEGYRLVILADEGIGVLSKVLNRLSSANLSVKRLVIIERKAGKKAVEIQLEGYADKDVLKQELVFDDVIVETLEKTVKKPLS >CP021772|814497:825231|819340_819976_+|AWZ33946.1|DBSCAN-SWA MILREFCAENLTDLTRLDKAIISRVELCDNLAVGGTTPSYGVIKEANQYLHEKGISVAVMIRPRGGNFVYNDLELRIMEEDILRAVELESDALVLGILTSNNHIDTEAIEQLLPATQGLPLVFHMAFDVIPKSDQKKAIDQLVALGFTRILLHGSSNGEPIIENIKHIKALVEYANNRIEIMVGGGVTAENYQYICQETGVRQAHGTRITQ >CP021772|814497:825231|815723_816200_-|AWZ33942.1|DBSCAN-SWA MLYQEFYQSPLGEIRLLADNLGLSGLYFVGQKYDMLAVNQEEIVNMSNSYTLLGKKWLDAYFSQQNLPSIPLSLRGTAFQTRVWQELQKIPFGDTKTYGELAKELNCQSAQAVGGAIGKNPISLIIPCHRVLGRYGQLTGYAGGLERKSWLLEYEKEK >CP021772|814497:825231|814497_815325_+|AWZ33940.1|DBSCAN-SWA MKLISWNIDSLNAALTSESTRALMSRQVIDTLVAEDADIIAIQETKLSAKGPTKKHLEVLETYFPEYDLVWRSSVEPARKGYAGTMFLYRKGLNPIVSFPEIDAPTTMDNEGRIITLELENCYITQVYTPNAGDGLKRLADRQIWDIKYAEYLATLDSQKPVLATGDYNVAHKEIDLANPSSNRRSAGFTDEERQGFTNLLAKGFTDTFRYLHGDVPNVYSWWAQRSRTSKINNTGWRIDYWLTSNRVADKITKSEMIHSGDRQDHTPIILEIEL >CP021772|814497:825231|816256_817438_-|AWZ33943.1|DBSCAN-SWA MVFSVKTFNNINQIGLQELGNRFQIDGDMSENPDAYIIRSQNLHNQDFPSNLKAIARAGAGTNNIPIEEASAQGIVVFNTPGANANAVKEAVIAALLLSARDYLGANRWVNTLTGTDIPKQIEAGKKAFAGNEIAGKKLGVIGLGAIGARIANDARRLGMTVLGYDPYVSIETAWNISSHVQRVKEIKDIFETCDYITIHVPLTNETKHTFDAEAFSIMKKGTTIINFARAELVNNQELFEAIETGVVKRYITDFGDKELLNQKGITVFPHVGGSTDEAELNCAIMASQTIRCFMETGEITNSVNFPNVHQIQTAPFRITLINKNVPNIVAKISTAVSELGINIDNIINRSKGDYAYTLIDLDETDNNKISTLIEEFEGDENIVRVRLIAKKQ >CP021772|814497:825231|815365_815722_-|AWZ33941.1|DBSCAN-SWA MYTFYEYPKCTTCRSAKKELTELGLTFEAIDIKSNPPKASLLKELLENSPYDLKKFFNTSGNSYRELGLKDKFDDLTLDQALDLLASDGMLIKRPLLVKDNKILQIGYRTKYKDLNLV >CP021772|814497:825231|822354_822990_-|AWZ33951.1|DBSCAN-SWA MKKGLMISFEGPDGAGKTTVLEAVVPLLREKLSQDILTTREPGGVTISEEIRHIILDVKHTQMDKKTELLLYMAARRQHLVEKVLPALEEGKIVLMDRFIDSSVAYQGSGRGLDKSHIKWLNDYATDSHKPDLTLYFDVPSEVGLERIQKSVQREINRLDLEQLDMHQRVRQGYLELADLEPNRIVTIDASQQLDEVIAETFSIILDRINQ >CP021772|814497:825231|817500_818049_-|AWZ33944.1|DBSCAN-SWA MQIRLAFPNEIDQIMLLIEEARAEIAKTGSDQWQKEDGYPNRNDIIDDILNGYAWVGIEDGMLATYAAVIDGHEEVYDAIYEGKWLHDNHRYLTFHRIAISNQFRGRGLAQTFLQGLIEGHKGPDFRCDTHEKNVTMQHILNKLGYQYCGKVPLDGVRLAYQKIKEKGETSIYREIDERNPM >CP021772|814497:825231|823756_824467_-|AWZ33953.1|DBSCAN-SWA MTMLKVENLSIHYGVIQAVNDVSFEVNQGEVITLIGANGAGKTSILRTISGLVRPSQGSISFMGKPIHKLAARKIVGNGLAQVPEGRHVFSSLSVMENLEMGAFLQKDREQNQKMLKKVFDRFPRLEERKNQDAATLSGGEQQMLAMGRALMSRPKLLLLDEPSMGLAPIFIQEIFNIIEDIKKQGTTVLLVEQNANKALTIADKAYVLETGKVVLSGTGKELLVSDQVRKAYLGG >CP021772|814497:825231|820108_820270_+|AWZ33948.1|DBSCAN-SWA MQWYSKELKLKILRKLEVSYFFIPIGKSEIIKGCQSFLWQPFYIITYKSWKLA |
16 | Streptococcus_phage(84.62%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1343618 : 1353110
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP021772|1343618:1353110|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP021772|1343618:1353110|1352182_1352368_-|AWZ34476.1|DBSCAN-SWA MLITSTQAKAIRRKQADKQLTSKSASAEIGVTEVTYRKVRNGGEVKNGIYQKVMEWLAEDY >CP021772|1343618:1353110|1343618_1343996_-|AWZ34462.1|DBSCAN-SWA MSKKNAIRKLKEFHRWQRIANSLDLSYNERYQFDIKYHPTRREHLEISRECALEELDAIKYAINQLSKIDYRKILIECYLISEKKTQQDIIAELNKSQSWYYETKKRALLEFAQSYRNGVLITTA >CP021772|1343618:1353110|1345405_1345579_-|AWZ34464.1|DBSCAN-SWA MKIKLFYQKHKESLDDFEYRINQFTLSVSVIDIKFSEATYGNYEDMSTTTSLLVLYR >CP021772|1343618:1353110|1347531_1348389_-|AWZ34467.1|DBSCAN-SWA MAIYEARGFSSYLYPYKGQLEPFDYIAQFKPMKTPEAIDIEEYKRTQAPYCLSGKVTPEKNGSYKRNNASLVYRDLIFLDYDEIETDVNLPKIVSKTLWEYSYIIYPTIKHTPEKPRYRLVVKPSDTMDKTTYKQVVKEIANKIGLPFDLASLTWSQLQGLPVTTGDPEDYQRYVNRGLDYPVPKAPNRQVTTTYTSRPRSQRSITMRVIDTLFNGFGDEGGRNVALTKFVGLLFNKWVDCDLETAYELVQIANSVTTKPLPIDEIDKTFRSILDTELRKRGIKP >CP021772|1343618:1353110|1352522_1353110_+|AWZ34477.1|DBSCAN-SWA MNRLKELRANQKKTQQDMSEFLNMSRRGYQKIENGESQIKPDKAQALADYFNVSVGYLLGYSDDKKDPMLTSFELARKDDTGEYFDLQDMVTLMDISMLKNVDTRDKILSNLKEYYDYYGIRMKEEHEIKDSEKFNAFLAEFQEDTNDYIIMLLTGIVKLRDDIRFTLLDILAMEGEKLETVKNVVKFISDNGDN >CP021772|1343618:1353110|1349414_1349747_-|AWZ34471.1|DBSCAN-SWA MKYRVETNPFSKDRYTPEQREMLKKRQLSKDKAEAYFARLYNHHIARVIIANVMAEYTTTFRKSATTFEEAWGALGYKQTTEIVFRAVNGLPCSEKDTGELETYLSEVSA >CP021772|1343618:1353110|1344690_1345149_-|AWZ35245.1|DBSCAN-SWA MTGSYEQPVIDATYHNDDQGGHANQLVLEYAEDRKLNKVFKRICDSFKDYYNQPEDMTDEELDDVAQETELLKEVESTDKKRVVPLFDNSQEKADKQDIFMAFISDHNQLAEHVSMNYKKMTQEDLGAVLESISQGFNYLYDMAIEGELLVK >CP021772|1343618:1353110|1346125_1347520_-|AWZ34466.1|DBSCAN-SWA MKDYQNKLSQATQPAFAPAFRTRKGRGDKEYVISSPYNVGKVFEFYENIFTGIKYNEFEKTIEITKTLPWSKEKGLWTNEQTSLCIAFIDDKYRFTPRKEHIEVAITALAKKNSYHPIKQRIESQKWDGKARGERYFIDLLGCADNSYNREIAKVWLTGLIARIYLRKVKFEVVPILIDKRQGTGKSTVTKRLLPSYHTDSEIKFGKNDSDYQKIQANAIIELGELKGMSKAEIETVKSFISSDSDTYREPYERKATPHPRHCVFIGTANKKSFLKDSGTERRFFPIECGINDVEKHPMEVEEDYFLQILAEAKVWFNNYEPLTPSKELMNQLADIQEDYKVEDVDKEIIDQLLNEFQIVEGWDSLSQYEQRQYVLKQLGEPLDNAQSYSDYPSAQTNCLLQVTSPNHIAYLGFNQKPTQGGKALISQKIRDHLDNDDGWKKGENPARKRLFKGGTPVSYYERV >CP021772|1343618:1353110|1349823_1350330_-|AWZ34472.1|DBSCAN-SWA MRTLFQSTQKTERECAFCVLKNQNNMIKKKRNPRVLFKNVAYKLSEIEGKTLTEIASFLGFGNSEVCRSTLYNWKRRKWLTFDLKNGHYRNVEVLHEVTLEKMANKELKEQGLIYKASIYYEQVVSTSEIIEDIKTKTQDRIKAIHLQQKALERIPSELFAELYTNMN >CP021772|1343618:1353110|1350418_1350592_-|AWZ34473.1|DBSCAN-SWA MTDKRAVGRPPKGEQPNNIKITVRISQGLDEKVQAYADNHGLTKPEAIRKALEDLSD >CP021772|1343618:1353110|1349196_1349418_-|AWZ34470.1|DBSCAN-SWA MRSIEELNEIANDILVDYEGLCGQLMDILNVLDLAAQEYSKETTSAIINTSCRALKCLISDHDKMTHKYRKEL >CP021772|1343618:1353110|1349002_1349194_-|AWZ34469.1|DBSCAN-SWA MQELNFTLTQTLILFIVLGLIGLLLSRSKPLIEIDLPEDTQAPKPRQNANYGAYIQAQNHYYN >CP021772|1343618:1353110|1350690_1351329_-|AWZ34474.1|DBSCAN-SWA MNIIKQVKSSFGELEIDFYLDRNRNIFVTIEQLAQGFGYKSRNAIEKMIERQPYLKEKRFSVTDKLSATDGKQYETRLFNKRGIFEIGMLSKTEKGKIFRQWIYDHIEELERENANFKLIRELEKSNHKELTQAIKDWEHFNQWSYKAISDLLLKSVTGQTAKQLKQSRVGYEIALDCLSADELTRYRKLEQKVIVLLELNAEYNDIKKLVL >CP021772|1343618:1353110|1348389_1348662_-|AWZ34468.1|DBSCAN-SWA MNVFSQDYEAKLLEQNLTAFNRFLEVYQQPKPRVLGLITAEQVKEELNIKGKTLKRWENAGLKRYQPPLEDTRKHYYKVSDILIFLGVDV >CP021772|1343618:1353110|1345575_1345833_-|AWZ34465.1|DBSCAN-SWA MNPNYTNHGIKKMHYHYDDLPNDQLYRLELPNGQCGYDFISKINFNTKSKPGDCDFTRPELIRRGYRWVFDCGFAIPVEKGEQTQ >CP021772|1343618:1353110|1351564_1352167_-|AWZ34475.1|DBSCAN-SWA MRTETWNGYDIRFVEHQGEWWAVLADICHALDLKPKRVKERLVDEVVSTDHVADSLGRQQEMLIVNEFGIYDTIFSSRKPEAKSFKFWVFETIKQLRQATGLEGFEVFRMLDKEHQKEAMARLTNSLDRVSKKDLIKANTITNKAVSNKFGYSKMVKKSEMTPDMLVAREMILDDTVELMGIKEKFGLNISVSESIYNKN >CP021772|1343618:1353110|1344129_1344618_-|AWZ34463.1|DBSCAN-SWA MLELAIESIIKPMKKQEKTRVTGTINDQSITIDLDNLIVHYEGQEFLLETIPGTYGGKRYFFLCPDCERRCRKLFKASHAFACGTCQKLHQATLNRSKTDCQYYWQLAFKECLKVDSKAKHKHGYYSYDDFPKRPKYMRMTKYLYHWKRFHYYMDKGDKYWL |
17 | Streptococcus_phage(81.82%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1367744 : 1374918
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP021772|1367744:1374918|DBSCAN-SWA ACTAGTAGCCCCAAGCCGATAAACCTTGAGCACGATAAGCTTTAATAGCTGAATTAACTTGATCCTGAACTGTAGCTGTTGAACCCCAACCTGGCATCGTTTGGAAAAGTCCTGAAGCTCCTGAGGCATTAGCAACGTTAGGATTACCATTTGATTCACGGGCAATAATATGTTCCCAAGTAGACTGAGGAACTCCCGTTGCAGCAGCCATTTGTGCTGCTGCTGCTGAGCCAATAGCCCCTGCAGTATTTCCATTGCTCAATACTTGGCCACTCGGCTGGTGTTGAGCAGGTCTATAAGTTGTCTCAGTAACAGCATAAGCTTGTTGTGCTTGACTGGTAGCAGGGGTATTTTCTGTTACAACTGCTTGTTCTACAGCTGCCTCTTCACTCGCAGTAACTTGTTGCTGAGAATTAGCTTCTGTAGATTGAGAACTTGGTTTTGGAGCCTGTTTTACACCTTCTACTTTTGATTTAGATGTTGCCTTATTCATTTTTGATTTTTTGGCTACGCGAACTTTATCTGCTTTTGACAAAGATTCAGTAGTAACTTGTGAACTTTTAAAGATGACCGTTACAGCCAAAATACATGAAAAAAGGGCTACTAAAGTGATAGCTCCGTAAGCTAAATGTTGTTTTTTTACATTCATTTTTGATAATTTTCTTCTTTTATTCATGTTACCTATATTATACTTTATTTGTTACTTAACAATTGAATAGATGTTAAAAATATTACAAAGAGATTTAATTTTAAGTAAATCTCTTTGTTTTATCAACTTTTATTAATACCAACCGTTACTATTCCAAAATGATAGCGCTGCCGACCAAGATCCGTAACGAGAAGCCACATAATTGTCCGCTACTTTTTCTTGATTTTCAGGAGATAAGTCGCCATTTAGGTAAGATTGAGACAGTTGATATCTTCCATAATATTGTCCATTCTGTGCAGTATAACTACCATTTGATTCACGACGAGCTATTTCTTCTTTTGCGGCTGAATCACTTGAACTCAAATTTGATGAAGAATTCATTGAATTTTCAATTGTTGGTTGAGATTTTGCTTCTGCTTGACTAGTTGTAGAATTATCCAATTTTAAAACATCACCTATACTGATAACGTCAGCGTTACTGATACTATTGAGAGACACTAACTCTTGTACCGTAGTTTTATGATTTTTAGCAATAGCTGATAAGGTATCACCTGATTTCACGGTATAAGATGCTGCGCTTACTGAAAGTGGTAAAGCTAATGAAGCACCCACTAAAAGACCTGCCACTCCTAATTTAAATGGTTTTGATTTTTTAACCGAGGTTATTGACATAATATATGCTCTCTTTCATTAATTGATACGCGTACTATCATACCTTGTAAATATTACTAATTGTTTTGCCTTAGATGAAATTTATTACAAATAAATTGTAAATTAATAAAGAAAAGGCCTCCAAAAAATAATTTTTAGTTTTCTTTAAGTAAAGTTGTTGAGCTTTTCACATTATATAAATGAAAAGGCTAAGACCATAAACTGATCTTAACCTTTTAATTTTTTAATAGAAACAAACTCAAACCCAATAATAACATAAGTAATATACTAAAAGTATCCCGAACAGTCCACTTCAATAAACGGTACTTACTACGATTGGCTCCGCCTTGATAACCTCTTGCTTCCATAGCAATTGCCAACGCATCTGCTCTTTTAAAACTAGAAGCAAATAATGGAATCAAAATAGGGATAATGGACTTAACCTTATGAATTAGGTTTCCCTCTCCAAAATCAACTCCACGAGCTCTTTGAGCATTCATGATACGTGTTGTATCATCCATTAAAGTAGGAACGAAACGTAAGCTAAGGGATAACATCAAACCAATCTCGTGTGCTGGTACTCTCAGTACTTCCAATGGTTTTAACAAAGATTCAACAGCATCTGCTAAACTTAACGGAGTAGTAGTTAAGGTAAGTAATGTCGAAAAGAAGATAATTAAAACAAATCTCATAAAAATAAGTGCTGCTTGTTGTAACCCAAGGCTAGTGATGCTAAAAATCCAAAACGAGAAGATAACCTGCCCGCCTTGTGCAAACAGCATCTGGAATAGGGTGGTAAATAAAATAATACCAACCATCGGTTTAATACCATTGAAAAAATAGGAAAATTTTATCTGAGATAAACCCACAATAACCAACGTAAAAATGAATACGATCACATTTGTCACTACATTATTTGCCCAAAAAACAATAATGATAAAAAGTAACATGGCTAGTAACTTACTTCGAGGATCTAATTTATGAATGAGAGAATTACCTGGTATGTAACGTCCCAAAATCAATTTATCCATGCTTAATAGCCTCCACAAATTCGTTAATAGTAATTGGTAAACTAGGTAAATTTAATCCCTTATGAGATAGTCTTTGAGCAAACTTGGTGATTTTGGGAACTCCTAATTGTTTACTTTCTAAAAGTTCTACTTCTTGAAAAATCTGTTTTGGTTGTCCTGATAAGGTTACTTTCCCTGCTTCTAAAACATACACATAGTCAGCATAATCCGCTACATCGTCCATTAAGTGAGTCACTAAGACGATAGTCATTCCTTTTTTATGAAGATTTTTAAAAAGAGTCATTAATTCTTTTCTTCCCTTAGGATCAAGTCCAGCTGTTGGCTCATCCAGTACTAGTACTTTGGGTTCCATCGCTAAAATACCAGCTATAGCAACCCGCCTCATCTGCCCTCCAGAAAGTTCAAATGGATTTTTATCGAATAAATCCTCACTAATACCAACTAACCTTAATTTTTCTTCAGCCAGCCTTTCAGCTTCAATCTGAGAAATACCAAAATTTTGTGGTCCAAAAGCAACATCCTTTAAAACTGTCTCTTCAAAAAGCTGACTTTCTGGAAATTGAAAAACTAAACCAACTTTTTGCCTTATAAATTTGATTTCTTTGTTCTTGTCCCCTGCTTTAATAGAAAAATCATCGACAATTACCTCACCTTTTGTAGGAATATGTAAACCATTCAAAAGTTGCATAATAGTTGATTTTCCAGAACCTGTGTGCCCAATGAATGCGGTATAGGAAGCATCTTCAATTTTCAGATTAACGTCAAAAAGGGCACGCCCTTCAAAAGGAGTGCCGGCTTGATAGGTATAACTTACATTTTTAAATTCAATTCCCATAATTGTTCTTCTAATTCCTTCTCTGTAAGATACTCTGTCCCTATATCAAGACCATTAGCAGCCAGTGCTGCCATTAACCTACTTGTAAAGGGAACATCTAAACCTAAACTAATCAAACGATTTCCACGACCAAATAACGCTTTTGGAGTGGATGTTGACTCAACTTTACCATTTTTCATAACGATGACACGATCACTCAATGCAACTTCATCTAAGTCGTGTGTAATTGAAATAACAGTAAGATTATATTTTTGACGAATAGCTCGTATCGTTCTTATCAGTTCCAATCGTCCCTCAGGATCAAGCATACTAGTCGCCTCATCCAAGATGATAACTTGTGGACGCATAGCTACAGCTCCTGCAATGGCTACACGCTGCTTTTGCCCTCCAGATAAACGTGCAGGCTCCCTCATTTTAAATTCAGACATGCCTACCAAATCAAGTGCTTGGCCCACTCTTTCTTTCATGTCTTTCAAAGGAATACCTTTATTTTCCAAACCAAAGGCGACGTCATCTTCAACAGTTGCCCCTACAAATTGGTTATCAGGATTTTGAAATACCATGCCAATCTTGTGACGTAACTCCCAGACATTATCTTCGGTTAACTCTTGTCCATCAATGATAATCTGGCCTGACTCCGCCTCTAAAAGCCCATCTATTAAACGAACAGTAGTGGATTTCCCAGAACCATTATGACCGATAATAGATAGCCATTCTCCTTGTTTCACATGAAACGATACATTCTCCAATTGATAATGTGTTTGATTACTATCATATTTAAAAAAGAGATTATTAACAGTAATAATATTTGTCATTATTTAAAAGTATCCTTAAATAAGAAGCCTGCACCTTTAAAATAGTCGTAGCCTGAATACAAGGTAAAGAATAAAGCAATGTATAACATGATGTTACCAAGTGTCATCCAATGTACTAACAAAAAAATAACTGCAAACATTTGAGTAGCCGTCTTTATTTTCCCTGGCATAGCTGCAGCAAGTACTGTTCCACCTGTTTCAACTAAAAGTAAACGCAAACCTGTAACTGCTAACTCTCTACAAATGATAATAGCTGAAACCCAAGCCGGTGCTAAGCCTAGTCCAACTAACATGATAAAAGCACTCATAACTAGCATTTTATCAGCTAATGGGTCTGCAAATTTCCCAAAATTTGTTACTACTTGCCATTTACGTGCTAGATAACCGTCTAGGTAATCGGTCAAGCTTGCAATAGCAAATACAATAGCTGCAACAATATGCCAAGTTGTACTTGTTGTTACTGAAGTTAATACTATAAATAACGGAATCATTAAAATTCTGACTACAGTTAATAGATTCGGAATATTTTCTTTCTTCACCATAAATTCTCCTTTTGGAAACATAGTATTCCTATATTATGTTATTTCAAAACTAGTAAAAGACTTTTGACATACCAACTTTATAGATGTCTAAGCTTCCTTATTATATCAAAATTTCAGATTATTTACGAAGATTTTGGAAAAATAACGAAGTCAGATGTGTCAGCATTATCTAAGAAATCCTTACCAATCGTAATGACATCTTCCAAGTCTAATTCTTCAACGATAGATGGCAAATCTAAATACATCGTTTTTCCATCATATAAATAGGTGACGAATTGCATTGCGAGATTTTCAATAGAATCTAAGCTCCTTAAAAAATCGCCATAGAGCTCTCTCTTAACGTTTTGTAAGTGGCTTTCGGTAAGATCAGATGATTGCAAAGCATTTTTTAGCAATAACCTCAACTGAGTTGAAAAAGCAATTGGCTCTGTCGTATCTAAAGAAATAATAACGCACTCAAAATCTGGATGAACTTCAATTTCTATATCAAAAGAGTCATCAATTTGACCAGATTCGTACCAGTCTTGATTAATTGTAGAAGTCCATCCTAAAAGCATTGCAAAAAATAGCTGTAATCCGATTTTCTCTTTTAGGTAAGAACCATGTCTCATATGACTTGATTTTCGATAACCAATAGCTAATTTAGGTTTTGTCACTGTCATATGGCAAGAGTTGTTTTTTATAACAGGTTCAAGACTAATAGAATCTCGGTCAATATTCTGTGAGTAATTTGTTAAATGAGAATTTTTTTGAAGGTAAGTTATAATTTCTTGTGGACTAAATTGTCCAACAAGAACTAAATTCATATTAGACAACTGATAAAAGTCTTTGTGATTTTCTTGTAAATCGGTTAAGGTTATTTGAGAGATTGATTGGTAATCTCCAGCGATATCAAATGCTAATGGAGAGTTGGGGTAAAGGTTCGATAACACTCCTTGATAAAGCCTATATTCTGGGTCATCTTGATACATTTCAATTTCTTGTTTGATAATGTCTTTTTCTTTAGTAATTGACTCTTCTGTAAAGTTTGTTGTCAATACAAAGTCAAGTAGTATATCTAAGCAGTTTGTAATGTGACTTATAGTTGAAAAATAAAAACTAGTTTTATCAAAAGTTGTAAAGGCATTACTCTCGGCGCCATATTTAGTAAATTGAGTTGCAGCGTCTTGTCCTTTATCCAGTTCAAATAATTTATGTTCTAAGAAGTGAGCAATTCCTGCCGGATAATGTTCTACACAACCATTCCTCGTATATCTTGTATGGAGTGATCCAAAATTTGCTGTCAATACTCCAACAGTTTCCTTAAATGATGGTTTTGGAATAAGGTATACATTTAGCCCGCTCTCTAATGTTAACTTATATACTTCCTCCTGAAGGTTCTGATAAGTTATTTTATTAACTGTCATCCTAGTTTCCTTCCAAAAAATAAAAAGCTTGTAATTTTAATTTTGTTGCTACGCTGACAATATCTGATTTTGTTACATCGTCCACTTTGTCAATGAATAGTGCTGAAGTATGAAACTGATCTAAATAATGTTCATGATAAATGTGGTCAACTATGACCTTAGGATTATCAGAAGCTAAAACATAGTTCATTTTCAATATATCTTTTGTTTGTTTCAATAATGTAGAAGAGAACCTGCCCATCTTAATATTATTGAATTGCTTATTAATAAGCTTCAAAAAACGCTCACGATTCTCTTTATCAATACCTGCATATATCGTAAAGAGACCTGTAAAGCTGTCAAATTGACTACCTATAGTATAGGCTAAACCTTGCTTTTCTCGAATTTCTGTAAACAACAAGGAATGGGCAAAAGCACCAAATAAACCGTTAAATACTATTAAAGCAAAATAATCTTCATCTTTATAAGTTATTGGAAGATGATAAGCCAATTGCATAATAGATTGATTAACGTCCTTATCTTCTACTTGACTTCTCGTGATATTTTCATAAGTCTGCGTATAATCAAAAGCTAATACTTTGTGACGTGGCTCAAATGCCATACGATTAAATGCCTGAATCATTCGATAGTCATCAAAATCTCCTACGACAAAAATATCTAATTGATCTTCCTTAAGCATCTTCTGAAATTCTTGATAAGCTGTAAATGAATTTTCTGATTCCACTAAAGATGCTGTACCATACTTAGGTAAACGAAGTGTCTTATTATTGTAGAATAAAGATTTTAGTGCTAAGTCACTGCTATAAAAATTATCTTCAATATCGGCCTCTAAATATTGAATAAGGTTTTTCTTCTCAGTATCAAAAATAGATGTTTGATACTGTTCTAAAGAAATTAAAGGAGAAAACAGCATATCCTCCAAGAATGTAATAATTTGTTCAACGATATTTTCTTGTTCTAAAGTAAAGGTATTTTTAACAAATACAATATCAATATCAACAATGTGAACAAGACCCTTAGTAGAAATCTTAGTTGATAAACTAGCACCATATAAGGAAGCTAACTTTTCTCGAAATTCTTGTACCTTAGGGTACTTAGCATTTGCAGTAACTAACATTTGAGCAACGAGCGATCTACGTGCTACTGTTTTATTATTAAAATCACCTGAAAATCGAAAAGTAAGATGATTAGTCTTAAATTGTTGGTTTTTAATTAAATGTAGAGAAACGCCTTCAACTATTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP021772|1367744:1374918|1368524_1369064_-|AWZ34490.1|DBSCAN-SWA MSITSVKKSKPFKLGVAGLLVGASLALPLSVSAASYTVKSGDTLSAIAKNHKTTVQELVSLNSISNADVISIGDVLKLDNSTTSQAEAKSQPTIENSMNSSSNLSSSDSAAKEEIARRESNGSYTAQNGQYYGRYQLSQSYLNGDLSPENQEKVADNYVASRYGSWSAALSFWNSNGWY >CP021772|1367744:1374918|1373673_1374918_-|AWZ34496.1|DBSCAN-SWA MKIVEGVSLHLIKNQQFKTNHLTFRFSGDFNNKTVARRSLVAQMLVTANAKYPKVQEFREKLASLYGASLSTKISTKGLVHIVDIDIVFVKNTFTLEQENIVEQIITFLEDMLFSPLISLEQYQTSIFDTEKKNLIQYLEADIEDNFYSSDLALKSLFYNNKTLRLPKYGTASLVESENSFTAYQEFQKMLKEDQLDIFVVGDFDDYRMIQAFNRMAFEPRHKVLAFDYTQTYENITRSQVEDKDVNQSIMQLAYHLPITYKDEDYFALIVFNGLFGAFAHSLLFTEIREKQGLAYTIGSQFDSFTGLFTIYAGIDKENRERFLKLINKQFNNIKMGRFSSTLLKQTKDILKMNYVLASDNPKVIVDHIYHEHYLDQFHTSALFIDKVDDVTKSDIVSVATKLKLQAFYFLEGN >CP021772|1367744:1374918|1370066_1370909_-|AWZ34492.1|DBSCAN-SWA MGIEFKNVSYTYQAGTPFEGRALFDVNLKIEDASYTAFIGHTGSGKSTIMQLLNGLHIPTKGEVIVDDFSIKAGDKNKEIKFIRQKVGLVFQFPESQLFEETVLKDVAFGPQNFGISQIEAERLAEEKLRLVGISEDLFDKNPFELSGGQMRRVAIAGILAMEPKVLVLDEPTAGLDPKGRKELMTLFKNLHKKGMTIVLVTHLMDDVADYADYVYVLEAGKVTLSGQPKQIFQEVELLESKQLGVPKITKFAQRLSHKGLNLPSLPITINEFVEAIKHG >CP021772|1367744:1374918|1369279_1370074_-|AWZ34491.1|DBSCAN-SWA MDKLILGRYIPGNSLIHKLDPRSKLLAMLLFIIIVFWANNVVTNVIVFIFTLVIVGLSQIKFSYFFNGIKPMVGIILFTTLFQMLFAQGGQVIFSFWIFSITSLGLQQAALIFMRFVLIIFFSTLLTLTTTPLSLADAVESLLKPLEVLRVPAHEIGLMLSLSLRFVPTLMDDTTRIMNAQRARGVDFGEGNLIHKVKSIIPILIPLFASSFKRADALAIAMEARGYQGGANRSKYRLLKWTVRDTFSILLMLLLGLSLFLLKN >CP021772|1367744:1374918|1367744_1368419_-|AWZ34489.1|DBSCAN-SWA MNKRRKLSKMNVKKQHLAYGAITLVALFSCILAVTVIFKSSQVTTESLSKADKVRVAKKSKMNKATSKSKVEGVKQAPKPSSQSTEANSQQQVTASEEAAVEQAVVTENTPATSQAQQAYAVTETTYRPAQHQPSGQVLSNGNTAGAIGSAAAAQMAAATGVPQSTWEHIIARESNGNPNVANASGASGLFQTMPGWGSTATVQDQVNSAIKAYRAQGLSAWGY >CP021772|1367744:1374918|1372388_1373672_-|AWZ34495.1|DBSCAN-SWA MTVNKITYQNLQEEVYKLTLESGLNVYLIPKPSFKETVGVLTANFGSLHTRYTRNGCVEHYPAGIAHFLEHKLFELDKGQDAATQFTKYGAESNAFTTFDKTSFYFSTISHITNCLDILLDFVLTTNFTEESITKEKDIIKQEIEMYQDDPEYRLYQGVLSNLYPNSPLAFDIAGDYQSISQITLTDLQENHKDFYQLSNMNLVLVGQFSPQEIITYLQKNSHLTNYSQNIDRDSISLEPVIKNNSCHMTVTKPKLAIGYRKSSHMRHGSYLKEKIGLQLFFAMLLGWTSTINQDWYESGQIDDSFDIEIEVHPDFECVIISLDTTEPIAFSTQLRLLLKNALQSSDLTESHLQNVKRELYGDFLRSLDSIENLAMQFVTYLYDGKTMYLDLPSIVEELDLEDVITIGKDFLDNADTSDFVIFPKSS >CP021772|1367744:1374918|1370884_1371724_-|AWZ34493.1|DBSCAN-SWA MTNIITVNNLFFKYDSNQTHYQLENVSFHVKQGEWLSIIGHNGSGKSTTVRLIDGLLEAESGQIIIDGQELTEDNVWELRHKIGMVFQNPDNQFVGATVEDDVAFGLENKGIPLKDMKERVGQALDLVGMSEFKMREPARLSGGQKQRVAIAGAVAMRPQVIILDEATSMLDPEGRLELIRTIRAIRQKYNLTVISITHDLDEVALSDRVIVMKNGKVESTSTPKALFGRGNRLISLGLDVPFTSRLMAALAANGLDIGTEYLTEKELEEQLWELNLKM >CP021772|1367744:1374918|1371723_1372266_-|AWZ34494.1|DBSCAN-SWA MVKKENIPNLLTVVRILMIPLFIVLTSVTTSTTWHIVAAIVFAIASLTDYLDGYLARKWQVVTNFGKFADPLADKMLVMSAFIMLVGLGLAPAWVSAIIICRELAVTGLRLLLVETGGTVLAAAMPGKIKTATQMFAVIFLLVHWMTLGNIMLYIALFFTLYSGYDYFKGAGFLFKDTFK |
8 | Staphylococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1434948 : 1447013
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP021772|1434948:1447013|DBSCAN-SWA TATGAATAAACGTATTTTTGTTGAGAAAAAGGCTGACTTTGACATTAAATCGGCTAGTCTTGTGAAAGAGTTGACGCATAATCTACAACTGACTTCTTTGAAGGATTTGCGTATTGTGCAGGTCTATGATGTCTTCAATTTGGCTGAGGATTTGCTGGCGCGTGCTGAGAAGCATATTTTCTCTGAGCAGGTGACAGACTGTCTTTTGACGGAAACTGAAATCACTGCGGAGCTTGATAAGGTTGCCTTCTTTGCCATTGAGGCGCTTCCTGGTCAATTTGACCAACGTGCTGCTAGTTCGCAAGAATCTTTGCTATTGCTTGGAAGTGACAGTCAGGTTAAGGTCAATACAGCCCAGCTTTACTTGGTCAATAAGGATATTGCAGAAGCAGAGCTTGAAGCCGTTAAGAACTATCTTTTGAATCCTGTTGATTCACGTTTCAAGGACATTACCTTGCCGCTTGAAGAGCAGGCTTTCTCTGTGTCTGATAAGACAATCCCTAGTCTTGATTTCTTTGAAACTTATAAGGCTGACGATTTTGCGGCCTATAAGGCAGAGCAGGGCTTGGCTATGGAGGTCGATGATCTTCTCTTCATCCAAGATTATTTCAAATCAATCGGGCGTGTGCCAACTGAGACTGAGTTGAAAGTTTTGGATACTTACTGGTCAGACCACTGCCGTCACACAACCTTTGAAACTGAGTTGAAAAACATCGACTTTTCAGCTTCTAAATTCCAAAAACAATTGCAGGCGACTTATGACAAATATATCGCCATGCGTGATGAACTTGGTCGTTCTGAAAAGCCGCAGACACTTATGGATATGGCGACTATCTTTGGTCGTTATGAACGTGCCAATGGACGACTGGATGATATGGAAGTCTCAGATGAAATCAATGCCTGCTCAGTTGAAATTGAAGTAGATGTTGATGGTGTAAAAGAGCCTTGGCTCCTCATGTTTAAGAATGAGACTCACAATCACCCAACAGAAATTGAGCCATTTGGTGGCGCAGCAACTTGTATCGGTGGTGCCATTCGTGACCCGTTGTCAGGACGTTCATACGTTTATCAGGCTATGCGTATTTCAGGCGCAGGCGATATTACGACTCCGATTGCGGAAACACGTGCTGGTAAATTGCCGCAACAGGTTATTTCTAAAACTGCGGCGCACGGCTATTCTTCATATGGTAACCAGATTGGGCTTGCGACAACTTATGTGCGTGAGTACTTTCACCCTGGCTTTGTAGCCAAACGCATGGAGCTTGGAGCTGTGGTTGGTGCTGCACCTAAGGAAAATGTGGTTCGTGAAAAACCAGAAGCAGGCGATGTGGTCATCTTGCTCGGTGGTAAAACAGGTCGTGACGGTGTCGGCGGTGCGACAGGTTCATCTAAGGTTCAAACGGTTGAATCTGTGGAAACAGCTGGCGCAGAGGTACAAAAAGGGAATGCCATCGAAGAACGTAAGATTCAACGCCTTTTCCGTAATGGTAATGTCACTCGCCTAATCAAGAAATCAAATGACTTCGGTGCAGGTGGTGTCTGTGTTGCCATCGGTGAATTGGCTGACGGTCTTGAAATCGATTTGGACAAGGTACCGCTTAAATACCAAGGTCTTAATGGTACTGAAATTGCAATCTCAGAATCACAAGAGCGTATGTCAGTCGTTGTTCGTCCTAGTGACGTGGATACCTTCATCGCAGCCTGCAACAAGGAAAATATCGATGCCGTTGTGGTTGCTACTATTACTGCAAAACCAAACCTTGTCATGACTTGGGATGGTGAAACAATTGTTGACTTGGAACGCCGTTTCCTTGATACCAACGGTGTCCGTGTCGTTGTTGATGCTAAAGTCGTTGACAAAGACTTGACAGTTCCAGAGGTACGCACAACATCAGCAGAGACACTTGAAGCGGATACGCTTAAGGTCTTGTCTGACCTCAACCACGCTAGTCAAAAAGGTCTCCAAACTATCTTTGACTCATCTGTTGGTCGCTCAACCGTTAACCACCCAATCGGTGGCCGTTACCAAATCACACCAACAGAAAGCTCTGTTCAAAAATTGCCAGTTCAACACGGTGTCACAACAACTGCATCTGTTATGGCTCAAGGTTACAATCCTTATATTGCAGAATGGTCACCTTACCACGGTGCTGCCTATGCTGTCATTGAAGCGACAGCTCGCTTGGTAGCAACGGGTGCTGACTGGTCTCGTGCACGTTTCTCTTACCAAGAGTATTTCGAGCGTATGGATAAACAGGCAGAGCGTTTTGGTCAGCCAGTATCAGCTCTTCTTGGTTCTATTGAGGCTCAGATTCAACTTGGATTGCCATCAATCGGCGGTAAGGACTCTATGTCTGGTACTTTCGAAGAATTGACAGTACCGCCAACCTTGGTAGCTTTCGGTGTGACAACAGCGGACAGCCGCAAGGTTCTCTCTCCTGAGTTTAAAGCGGCTGGTGAGAATATCTACTACATTCCAGGTCAAGCTATTTCAGAAGATATTGATTTTGACCTTATCAAGGCTAACTTTAGCCAGTTCGAGACTATTCAAGCTCAACATAAGATTACTGCTGCTTCAGCTGTTAAATACGGTGGTGTCCTAGAAAGTCTTGCTCTCATGACTTTTGGTAACCGTATCGGGGCCTCTGTTGAAATTGCAGAGCTTGACAGTAGCTTGACAGCTCAACTCGGAGGCTTTGTCTTTACATCAGCTGAGGAAATTGCTGACTCGGTGAAAATCGGTCAAACTCAGGCAGCCTTTACACTTACTGTCAATGGAAATGACCTTGCTGGGGCAAGCCTTCTATCAGTCTTCGAAGGCAAATTGGAAGAGGTTTACCCAACAGAGTTTGAACAGGCAGACGCTCTTGAAGAAGTTCCTGCTGTGGTATCAGATACTGTTATCAAGGCTAAGGAAACAATTGAAAAACCAGTGGTTTACATTCCAGTCTTCCCTGGTACCAACTCAGAATATGATTCAGCTAAGGCCTTTGAACAGGTTGGAGCTAGTGTCAACTTGGTAGCATTTGTAACCTTGAATGAGGCTGCTATTGCTGACTCAGTTGACACAATGGTCGCTAATATTGCTAAGGCAAATATCATCTTCTTTGCTGGAGGATTCTCAGCAGCGGATGAACCAGATGGGTCTGCTAAGTTTATCGTCAATATCTTGCTTAACAAGAAGGTTCGCGCAGCTATTGACAGCTTCATCGAAAAAGGTGGCCTTATCATCGGTATCTGTAATGGTTTCCAAGCCCTTGTTAAATCAGGTCTTCTTCCATACGGAAACTTCGAGGAAGCTGGTGAGACAAGTCCAACCCTCTTCTATAACGATGCCAACCAGCACGTTGCCAAGATGGTTGAGACTCGTATCGCAAATACCAACTCACCTTGGTTGGTAGGAGTTGAGGTCGGCGATATTCATGCCATCCCAGTTTCACACGGTGAAGGTAAATTTGTTGTCAGCGCTTCTGAATTTGCAGAGCTAAGAGACAATGGTCAAATCTGGAGCCAATATGTGGACTTTGACGGACAACCATCTATGGATTCTAAATACAATCCAAATGGCTCTGTCAATGCCATCGAAGGGATTACCAGCAAGAATGGTCAAATCATCGGTAAGATGGGGCACTCAGAACGCTGGGAAGACGGCCTCTTCCAAAATATCCCTGGTAACAAAGACCAAGCCTTGTTTGCTAGTGCAGTAAAATATTTTACAGGAAAATAATTTTTTCAAATTTTTTCATAAAACAGATAAGGAAACAAGAGCGAAGCGAGCTTAACTGTATCTTTCTGTCGTAGTGGTATTTGGGAGCCGTTGAGGCTAAGACTCAATGATTAGCTTGAAAATAGCTTGATAGATTTTCTATTTTGATGTTGGCATTGGTGACGATAGATCCAAAATTGAGAAAATCATCAAAGCTACTTAAGATGAGATACAAAAAGAATTAGGAAAAAAGAATGACATACGAAGTAAAATCTCTAAATGAAGAATGTGGAGTCTTTGGTATCTGGGGGCATCCTCAGGCAGCTCAAGTCACTTACTTTGGGCTTCATAGCCTTCAACATCGCGGTCAAGAAGGTGCTGGTATTGTTTCGAATGATAATGGGAAACTCTATGGTTATCGAAATGTTGGGCTCCTTTCTGAAGTTTTTAAGAATCAATCTGAATTAGATAATTTAACTGGGAATGCGGCTATTGGACATGTTCGGTATGCTACTGCAGGTTCTGCAGATATTCGCAATATTCAGCCTTTTCTTTATAAATTTCATGACGGGCAATTTGCTTTATGCCATAATGGTAATTTGACAAATGCTATTTCTTTAAGGAAAGAATTAGAAAAGCAAGGTGCAATTTTCAATGCCTCCTCAGATACTGAAATTTTGATGCACTTGATTCGTCGAAGCCATAACCCAAGTTTTATGGGGAAGGTAAAAGAAGCTTTAAGCACTGTAAAGGGAGGCTTCGCCTATCTACTGATGACAGAAGATAAATTAATTGCTGCTCTTGACCCTAATGCCTTTCGTCCTTTGTCAATTGGACAAATGCAAAATGGTGCTTGGGTTATTTCCAGTGAGACCTGTGCTTTTGAGGTGGTAGGCGCAAAATGGGTTAGAGATGTTGAACCTGGCGAAGTTATCCTTATAGACGATAGTGGTATTCAATGTGATCGTTATACTGATGAAACGCAACTGGCAATTTGTTCGATGGAATATGTCTATTTTGCAAGGCCGGATTCAACTATACATGGTGTTAATGTTCATACGGCTCGAAAAAATATGGGAAAGCGTCTTGCACAAGAATTTAAACAGGATGCTGATATTGTAATTGGTGTCCCAAATTCGTCCTTATCGGCTGCTATGGGCTTTGCTGAAGAATCCGGATTACCAAATGAGATGGGTCTTGTAAAAAATCAGTATACGCAGCGAACCTTTATTCAACCGACACAAGAATTAAGGGAACAAGGTGTTCGAATGAAACTATCAGCGGTATCTGGTGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP021772|1434948:1447013|1438907_1440362_+|AWZ34539.1|DBSCAN-SWA MTYEVKSLNEECGVFGIWGHPQAAQVTYFGLHSLQHRGQEGAGIVSNDNGKLYGYRNVGLLSEVFKNQSELDNLTGNAAIGHVRYATAGSADIRNIQPFLYKFHDGQFALCHNGNLTNAISLRKELEKQGAIFNASSDTEILMHLIRRSHNPSFMGKVKEALSTVKGGFAYLLMTEDKLIAALDPNAFRPLSIGQMQNGAWVISSETCAFEVVGAKWVRDVEPGEVILIDDSGIQCDRYTDETQLAICSMEYVYFARPDSTIHGVNVHTARKNMGKRLAQEFKQDADIVIGVPNSSLSAAMGFAEESGLPNEMGLVKNQYTQRTFIQPTQELREQGVRMKLSAVSGVVKGKRVVMIDDSIVRGTTSRRIVGLLREAGASEVHVAIASPELKYPCFYGIDIQTRRELISANHAADEVCDIIGADSLTYLSLDGLIESIGLETKAPNGGLCVAYFDGHYPTPLYDYEEEYLRSLEEKTSFYIQKVK >CP021772|1434948:1447013|1442922_1444470_+|AWZ34543.1|DBSCAN-SWA MTKRALISVSDKSGIIDFAKELKNLGWDIISTGGTKVALDDAGVETIAIDDVTGFPEMMDGRVKTLHPNIHGGLLARRDADSHLQAAKDNNIELIDLVVVNLYPFKETILRPDVTYDLAVENIDIGGPSMLRSAAKNHASVTVVVDSADYATVLGELADASQTTFKTRQRLAAKAFRHTAAYDALIAEYFTAQVGEAKPEKLTITYDLKQAMRYGENPQQDADFYQKALPTDYSIASAKQLNGKELSFNNIRDADAAIRIIRDFKDSPTVVALKHMNPCGIGQADDIETAWDYAYEADPVSIFGGIVVLNREVDAATAEKMHPIFLEIIIAPSYSEEALAILTNKKKNLRILELPFDAQAASEVEAEYTGVVGGLLVQNQDVVAENPSDWQVVTDRQPTEQEATALEFAWKAIKYVKSNGIIITNDHMTLGLGAGQTNRVGSVKIAIEQAKDHLDGAVLASDAFFPFADNIEEIAAAGIKAIIQPGGSVRDQESIDAANKHGLTMIFTGVRHFRH >CP021772|1434948:1447013|1444662_1445562_+|AWZ34544.1|DBSCAN-SWA MNKWLVKASSLVVLGGMVLSAGSRVLADTYVRPIDNGRITTGFNGYPGHCGVDYAVPTGTIIRAVADGTVKFAGAGANFSWMTDLAGNCVMIQHADGMHSGYAHMSRVVARTGEKVKQGDIIGYVGATGMATGPHLHFEFLPANPNFQNGFHGRINPTSLIANVATFSGKTQASAPSIKPLQSAPVQNQSSKLKVYRVDELQKVNGVWLVKNNTLTPTGFDWNDNGIPASEIDEVDANGNLTADQVLQKGGYFIFNPKTLKTVEKPIQGTAGLTWAKTRFANGSSVWLRVDNSQELLYK >CP021772|1434948:1447013|1434948_1438674_+|AWZ34538.1|DBSCAN-SWA MNKRIFVEKKADFDIKSASLVKELTHNLQLTSLKDLRIVQVYDVFNLAEDLLARAEKHIFSEQVTDCLLTETEITAELDKVAFFAIEALPGQFDQRAASSQESLLLLGSDSQVKVNTAQLYLVNKDIAEAELEAVKNYLLNPVDSRFKDITLPLEEQAFSVSDKTIPSLDFFETYKADDFAAYKAEQGLAMEVDDLLFIQDYFKSIGRVPTETELKVLDTYWSDHCRHTTFETELKNIDFSASKFQKQLQATYDKYIAMRDELGRSEKPQTLMDMATIFGRYERANGRLDDMEVSDEINACSVEIEVDVDGVKEPWLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGAIRDPLSGRSYVYQAMRISGAGDITTPIAETRAGKLPQQVISKTAAHGYSSYGNQIGLATTYVREYFHPGFVAKRMELGAVVGAAPKENVVREKPEAGDVVILLGGKTGRDGVGGATGSSKVQTVESVETAGAEVQKGNAIEERKIQRLFRNGNVTRLIKKSNDFGAGGVCVAIGELADGLEIDLDKVPLKYQGLNGTEIAISESQERMSVVVRPSDVDTFIAACNKENIDAVVVATITAKPNLVMTWDGETIVDLERRFLDTNGVRVVVDAKVVDKDLTVPEVRTTSAETLEADTLKVLSDLNHASQKGLQTIFDSSVGRSTVNHPIGGRYQITPTESSVQKLPVQHGVTTTASVMAQGYNPYIAEWSPYHGAAYAVIEATARLVATGADWSRARFSYQEYFERMDKQAERFGQPVSALLGSIEAQIQLGLPSIGGKDSMSGTFEELTVPPTLVAFGVTTADSRKVLSPEFKAAGENIYYIPGQAISEDIDFDLIKANFSQFETIQAQHKITAASAVKYGGVLESLALMTFGNRIGASVEIAELDSSLTAQLGGFVFTSAEEIADSVKIGQTQAAFTLTVNGNDLAGASLLSVFEGKLEEVYPTEFEQADALEEVPAVVSDTVIKAKETIEKPVVYIPVFPGTNSEYDSAKAFEQVGASVNLVAFVTLNEAAIADSVDTMVANIAKANIIFFAGGFSAADEPDGSAKFIVNILLNKKVRAAIDSFIEKGGLIIGICNGFQALVKSGLLPYGNFEEAGETSPTLFYNDANQHVAKMVETRIANTNSPWLVGVEVGDIHAIPVSHGEGKFVVSASEFAELRDNGQIWSQYVDFDGQPSMDSKYNPNGSVNAIEGITSKNGQIIGKMGHSERWEDGLFQNIPGNKDQALFASAVKYFTGK >CP021772|1434948:1447013|1441579_1442128_+|AWZ34541.1|DBSCAN-SWA MKIAVFASANGSNFQVIAEQFPVSFVFSDHRDAYVLERAQNLAIPSFAFELKEFENKAAYEQAVVDLLDKHEIDLVCLAGYMKIVGETLLSAYEGRIINIHPTYLPEFPGAYGIKDAWEAGVDQSGVTIHWVDSGVDTGQVIQQVHVPRLADDSLESFETRIHETEYQLYPAVLDSLGIKRK >CP021772|1434948:1447013|1445708_1447013_+|AWZ34545.1|DBSCAN-SWA MKMNKKVLLTSTMAASLLSVASVQAQETDTTWTARTVSEVKADLVKQDNKSSYTVKYGDTLSVISEAMSIDMNVLAKINNIADINLIYPETTLTVTYDQKSHTATSMKIETPATNAAGQTTATVDLKTNQVSVADQKVSLNTISEGMTPEAATTIVSPMKTYSSAPALKSKEVLAQEQAVSQAAANEQVSPAPVKSITSEVPAAKEEVKPTQTSVSQSTTVSPASVAAETPAPVAKVAPVRTVAAPRVASVKVVTPKVETGASPEHVSAPAVPVTTTSPATDSKLQATEVKSVPVAQKAPTATPVAQPASTTNAVAAHPENAGLQPHVAAYKEKVASTYGVNEFSTYRAGDPGDHGKGLAVDFIVGTNQALGNKVAQYSTQNMAANNISYVIWQQKFYSNTNSIYGPANTWNAMPDRGGVTANHYDHVHVSFNK >CP021772|1434948:1447013|1442150_1442903_+|AWZ34542.1|DBSCAN-SWA MKLVKNLEIVESIFGDWDETIIWSCVQGIMGEVFVDSLDQPKSSLAKLGRKSSFGFLAGQPTLFLLEVCSGEDIILVPQHKGWSDLIESTYGQNAHSFKRYATKKDTLFERSRLEKFVTQLPNGFELRAIDEKVYNSCLEKEWSQDLVANYATYQYYKKQGIGYVVYYQGNIIAGASSYSTYKNGIEIEVDTHPDFRRRGLATIVAAQLILTCLDKGIYPSWDAHTRTSLNLSEKLGYEFSHEYIAYEID >CP021772|1434948:1447013|1440389_1441412_+|AWZ34540.1|DBSCAN-SWA MSEKNAYAKSGVDVEAGYEVVERIKKHVARTERAGVMGALGGFGGMFDLSQTGVKEPVLISGTDGVGTKLMLAIKYDKHDTIGQDCVAMCVNDIIAAGAEPLYFLDYVATGKNEPAKLEQVVAGVAEGCVQAGAALIGGETAEMPGMYGEDDYDLAGFAVGVAEKSQIIDGSKVKEGDILLGLASSGIHSNGYSLVRRVFADYTGDEVLPELEGKQLKDVLLEPTRIYVKAALPLIKEELVNGIAHITGGGFIENVPRMFADDLAAEIDEDKVPVLPIFKALEKYGDIKHEEMFEIFNMGVGLMLAVSPENVNRVKELLDEPVYEIGRIIKKADASVVIK |
8 | Synechococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1993638 : 2075979
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP021772|1993638:2075979|DBSCAN-SWA 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MFDKYIFDTYYEQIVKTVKGFIFNNKDNTDLSTYMVPEPNGFIEFDNFELYKINYEIINNCELNLEIIVIANVIVRQYIKGEMEVDTKTKFVSVYAEVELDSGIKNFRIYNTEFKSDQYKKSRNLKLSKDWVPYIRKKDFDAIAEKFLRKYYPQALTQPTPVPVETIVSEMGLSIHQEKLTIDNSVFGKMVFKDTDVEVIEDEQLVSKHFNKGSILVDKDVVFKRNVGSYNNTVIHECVHWELHKVFHEVKMVLDKDHSQVSSWTEENLADSSMWTSLDWMEWQANGIAPRILMPKVQTRIKIRELFQTLTLVNPDISRSELVQEVVDNLATFFEVSRQAAKIRMIDLGFKEANGVYNYLDDRYMHNFAFELEAFDKGSSYTITSNDLCFEYCFNESFRQIIDRNKFIYVDNHLCLKDKKFIYMTKDGPIMTDYAYEHMDECCLIFKVKSKNFTSISNETYYDYVLNRGVTKESEIKADFVDILQNPSLMDQLPPLDMMKLGKKISELLKELPFEFSGTLRSHRKRKNCTQPFLAKLVGITERTLRDYETLEDNLPRLELTLSFCFALKLRPELSDDMIKKAGHQLTISPPHQVYKMLLSTSYYKPLGEINSILQAAEMKTL >CP021772|1993638:2075979|2046993_2047467_+|AWZ35113.1|terminase|DBSCAN-SWA MAIRGRKPKPTNLKILEGNPGKRPLPTNEVKAKQKAPRCPQWLEDDAKKEWKRMGKILEQMGILTEMDMTAFAGYCQAYARWKEAEEFLSKHGSIIKTPNGYLQQVPQVSISQTNLKIMLKFCEQFGLTPSARNRLATMDADVGTGDEMEDLLGGIL >CP021772|1993638:2075979|2035333_2035657_-|AWZ35100.1|DBSCAN-SWA MSKMKQLNELINEMEGTAKYYLRLVDEFKKILSTEEETTTTSKEPKHRPQKELKLEDVRSVLATKAKDGYKNEVRALLNKYGAESLSALATEHYAAVLEEAGGIGHD >CP021772|1993638:2075979|2066549_2067791_+|AWZ35270.1|DBSCAN-SWA MSVKKIRVNKQKHKKRVCAYIRVSTTNGSQLDSLENQKQYFENLYSIRDDIDFMGIYHDRGISGSKDNRPNFQAMIEDCRRGKIDVIHTKSIARFARNTVTVLEISRELKAIGVDIFFEEQNIHTLSSEGEVMLSVLASIAEDELRSMSGNQRWAFQKKFQRGELVINTKRFLGYDVDENGELIINPEEAVIVKEIFSLYLEGNGTHRIAKQLNEKGVATVTGAKWHDTTIRQMLSNEKYKGSALLQKYFHDGVNGPKKLNQGEFEQYLIEDNHEAIISKEDWQRVQDKLNSRRWQQGKNKTYKFTGLLKCQHCSSTLKRQVSYKKKIVWCCSKYIKEGKVACQGMRVPEVDISNWEITSPVTVIERDGNGEKYYSYSGQESADQRSSSGQEENQGSRILSSVHRPRRTAIKL >CP021772|1993638:2075979|2046735_2046945_+|AWZ35112.1|DBSCAN-SWA MNDKILNRIKSTYPEGTRVRLVQMDDPRPVPVGTLGTVLDVDDIGSLIVSWDNGQSLNVLYGIDSVEKI >CP021772|1993638:2075979|2003224_2003404_+|AWZ35078.1|DBSCAN-SWA MSQEKLKSKLDQAKGGAKEGFGKITGDKELEAKGFIEKTIAKGKELADDAKDAVKEKLK >CP021772|1993638:2075979|2069266_2069740_+|AWZ35272.1|DBSCAN-SWA MNIQRIDHIALTVPDVEEASQFFQKAFNAKILYDGHSPNQPAVEGPIAEAIFGMPEGSSWTHRRLIQIADSIPLELFQYQATGQREASRTFDIGLQHFALQVENLPQAVRKFEEAGGTIYPAFNHITGELGAVSTVNGWVYGKTPWGTVIELVNFPT >CP021772|1993638:2075979|2069792_2070101_+|AWZ35132.1|DBSCAN-SWA METIEIFKALANEHRLQIIKWLKTPKDYFVNEGHPEIDVETVGVCVGEIQKKLGLTQSTTSHYLTILQKSNLVMATRIGKWTYYRRNEATLSQLCHLINEEL |
76 | Streptococcus_phage(89.58%) | terminase,transposase,integrase,portal,holin,capsid,tail,head | attL 1993666:1993680|attR 2003760:2003774 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||
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CP021772.1|AWZ34726.1|1631320_1631647_+|replication-initiation-factor |
1631320_1631647_+
Protein sequences of CP021772.1|AWZ34726.1|1631320_1631647_+|replication-initiation-factor>CP021772.1|AWZ34726.1|1631320_1631647_+|replication-initiation-factor MEYDDDYYYIPKILFKDDFYSCLTATDVLVYSVLRGKQIEAVEKGWIDAEGNIYLNYNINDLAKMFSCGRGKMIDIMRRLEECNLIERQRVDIFYGNSLPYMTYINEV |
108 aa aa |
63
gnl|BL_ORD_ID|63 information
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NA | NA | No | NA |