Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP030108 | Acinetobacter baumannii strain DA33382 plasmid pDA33382-2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP030107 | Acinetobacter baumannii strain DA33382 plasmid pDA33382-2-2, complete sequence | 1 crisprs | NA | 0 | 2 | 0 | 0 |
CP030109 | Acinetobacter baumannii strain DA33382 plasmid pDA33382-85, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP030106 | Acinetobacter baumannii strain DA33382 chromosome, complete genome | 0 crisprs | DEDDh,csa3,cas3,WYL,cas6f,cas7f,cas5f,cas8f,cas3f,cas1 | 0 | 0 | 7 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP030107_1 | 359-483 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP030107_1
|
2 spacers
spacers of CP030107_1
>1.1|382|32|CP030107|CRISPRCasFinder TATGTGGACACTTACCTTGCAAGATTTTTTCA >1.2|437|24|CP030107|CRISPRCasFinder GTACTGACAAAAAAAATATTGTCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP030107_1
The CRISPR arrays of CP030107_1 >merge|CP030107|1|359-483|CRISPRCasFinder ATATGTGGACACTTACCTTGCAATATGTGGACACTTACCTTGCAAGATTTTTTCAATATGTGGACACTTACCTTGCAAGTACTGACAAAAAAAATATTGTCCATAAAACAGCATTTACCTTGCAA >CP030107|1|1|359-483|CRISPRCasFinder ATATGTGGACACTTACCTTGCAA TATGTGGACACTTACCTTGCAAGATTTTTTCA ATATGTGGACACTTACCTTGCAA GTACTGACAAAAAAAATATTGTCC ATAAAACAGCATTTACCTTGCAA
>CP030107.1|AXB17573.1|572_1514_+|replication-initiation-protein MKDLIVKDNALINASYNLDLVEQRLILLSIIEARESGKGINANDPLTIHAESYINHFNVHRNTAYQALKDACKDLFARQFSYQEQRGKGIANITSRWVSQIAYIDNTASVELIFAPAIIPLITRLEEQFTSYELQQIKGLSTAYAIRLYELLIAWRSTGKTPIIETQELRRKLGVLDGEYKMIADFKKRVFEPSIKQINEHTDITVKSEQHKTGRSITGFSFRFKQKAQPKLEQKTDPKRDPNTPDFFVEMTDAQRHLFGNKLAHDARVQSEYSHLIGTGSYEDFAKLLADMLAEEQHFKMFYPLLVEHGYKA |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP030107_1 | 1.1|382|32|CP030107|CRISPRCasFinder | 382-413 | 32 | NZ_CP030107 | Acinetobacter baumannii strain DA33382 plasmid pDA33382-2-2, complete sequence | 382-413 | 0 | 1.0 |
CP030107_1 | 1.2|437|24|CP030107|CRISPRCasFinder | 437-460 | 24 | NZ_CP030107 | Acinetobacter baumannii strain DA33382 plasmid pDA33382-2-2, complete sequence | 437-460 | 0 | 1.0 |
CP030107_1 | 1.2|437|24|CP030107|CRISPRCasFinder | 437-460 | 24 | NZ_CP025885 | Escherichia coli strain 503440 plasmid p503440_68, complete sequence | 59591-59614 | 3 | 0.875 |
CP030107_1 | 1.2|437|24|CP030107|CRISPRCasFinder | 437-460 | 24 | NZ_CP037863 | Citrobacter sp. LY-1 plasmid unnamed2, complete sequence | 79717-79740 | 3 | 0.875 |
CP030107_1 | 1.2|437|24|CP030107|CRISPRCasFinder | 437-460 | 24 | NZ_CP012835 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Cerro str. CFSAN001588 plasmid pCFSAN001588_002, complete sequence | 27552-27575 | 3 | 0.875 |
CP030107_1 | 1.2|437|24|CP030107|CRISPRCasFinder | 437-460 | 24 | NZ_CP024882 | Citrobacter freundii strain AR_0022 plasmid unitig_1_pilon, complete sequence | 20053-20076 | 3 | 0.875 |
CP030107_1 | 1.2|437|24|CP030107|CRISPRCasFinder | 437-460 | 24 | NZ_CP024977 | Escherichia coli strain CV839-15 plasmid pCV839-15-p3, complete sequence | 7765-7788 | 3 | 0.875 |
CP030107_1 | 1.1|382|32|CP030107|CRISPRCasFinder | 382-413 | 32 | NZ_CP030107 | Acinetobacter baumannii strain DA33382 plasmid pDA33382-2-2, complete sequence | 360-391 | 5 | 0.844 |
CP030107_1 | 1.1|382|32|CP030107|CRISPRCasFinder | 382-413 | 32 | NZ_CP030107 | Acinetobacter baumannii strain DA33382 plasmid pDA33382-2-2, complete sequence | 415-446 | 7 | 0.781 |
1. spacer 1.1|382|32|CP030107|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP030107 (Acinetobacter baumannii strain DA33382 plasmid pDA33382-2-2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tatgtggacacttaccttgcaagattttttca CRISPR spacer tatgtggacacttaccttgcaagattttttca Protospacer ********************************
2. spacer 1.2|437|24|CP030107|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP030107 (Acinetobacter baumannii strain DA33382 plasmid pDA33382-2-2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtactgacaaaaaaaatattgtcc CRISPR spacer gtactgacaaaaaaaatattgtcc Protospacer ************************
3. spacer 1.2|437|24|CP030107|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP025885 (Escherichia coli strain 503440 plasmid p503440_68, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.875
gtactgacaaaaaaaatattgtcc CRISPR spacer tttctgataaaaaaaatattgtcc Protospacer * ****.****************
4. spacer 1.2|437|24|CP030107|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP037863 (Citrobacter sp. LY-1 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.875
gtactgacaaaaaaaatattgtcc CRISPR spacer tttctgataaaaaaaatattgtcc Protospacer * ****.****************
5. spacer 1.2|437|24|CP030107|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012835 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Cerro str. CFSAN001588 plasmid pCFSAN001588_002, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.875
gtactgacaaaaaaaatattgtcc CRISPR spacer tttctgataaaaaaaatattgtcc Protospacer * ****.****************
6. spacer 1.2|437|24|CP030107|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024882 (Citrobacter freundii strain AR_0022 plasmid unitig_1_pilon, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.875
gtactgacaaaaaaaatattgtcc CRISPR spacer tttctgataaaaaaaatattgtcc Protospacer * ****.****************
7. spacer 1.2|437|24|CP030107|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024977 (Escherichia coli strain CV839-15 plasmid pCV839-15-p3, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.875
gtactgacaaaaaaaatattgtcc CRISPR spacer tttctgataaaaaaaatattgtcc Protospacer * ****.****************
8. spacer 1.1|382|32|CP030107|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP030107 (Acinetobacter baumannii strain DA33382 plasmid pDA33382-2-2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
tatgtggacacttaccttgcaagattttttca CRISPR spacer tatgtggacacttaccttgcaatatgtggaca Protospacer ********************** ** * **
9. spacer 1.1|382|32|CP030107|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP030107 (Acinetobacter baumannii strain DA33382 plasmid pDA33382-2-2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
tatgtggacacttaccttgcaagattttttca CRISPR spacer tatgtggacacttaccttgcaagtactgacaa Protospacer *********************** .* . *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation |
---|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
122295 : 136881
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP030106|122295:136881|DBSCAN-SWA 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25 | Acinetobacter_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
273863 : 285533
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP030106|273863:285533|DBSCAN-SWA 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ATTCGTGTTGCTGCACGTGATGTATGGGAAAACACAGTCTGGAACTATACAAATCAGATTACTCAAAGTACTTCTGAAGCTTAATTTAAATTAATTCATAGCACCCGAAATGGGTGCTATATTTTTGTAGGACGTAAAAACGACTTAATTTTTTTGCACTAAAATTCTTTTATTTTTACTAACATCGTGACACCACTCACTTACACCTTTAGAGCCATCTAAAGTTGCTTCAGTAAATTTAATATTAAATTTGGTATTTGACCAATTACTAAAACACGTATTTGAGTTGGAGTTATTTTTATAAGCTAATTTGTTGAAGTTGATTTGACCTGCTTGTGTACTATCAATACCATTTACAATCGATCCAAAAGTAGATCGGTTATCTTTATGATTAATAACAGAAATACTAACTGGGTTTTTAGGGTTCTTATAAAACTTCAGTGTTATTTGTATTCCAGCTCCCTTATTATTTTCTGTAGTAATATTTTTAAAAGTTAAGTTTTCTAAATGCGATTTATTGTTATTTGGCTCAATAGCAATACCGCTCGCAGGTCCAGTACCGGAGGTATTCTTAATTGTTAGATTGTTTGCATTCAAATTTTTAGCTGTAATTACGGAGACGCCTTGTCTTCTATTATCATTCATGATGATATTTGATAAGACAATATCAGAGTTTGAAAAGTTGTTGTTGTTCCCTAAGTAGATTGCATCCCCCCACATTTTTGAAATTTTCATATTTGAAATCCTAATATTTTGAGAATCACGAATATCAATGCCCATTCCCCATTCGCCATATTTATTCAAATGCGAATATTTGTCACCGATAAGTTCGCCTCCCGTGATTGTTACGTTTTTTACATTAGAAATATCAAATACTTTATAGGCTCCGCTTTTATTTGGAATGACATTCAATCTCGTATTTTCTGACATAGTTATAACAGAACCATTTTGGGGCTTAATTGATTTAAGAGCATCAACTTTGTAGTCACCAGGAGGAATTGTTACATTCTTATTATTTTTCAGTGCTGTATTAAGTTCATCTGTAATGTCTGAATTTAACTCAAAACTTTGTGCATAGGAGGACATTGAGCAAAATACAGATGTAATAAGAATTAGATACTTAGGATTCATGTCAGCGATCTATCAACTTGATGGAATTATATCTTTACAAATACATTGTGAAGATTCTATTTGAAAATTGTTTTAGCTCAACCAAAAGTTATCAGCCCTAGCTTGGAATAAGTTAGGGCTTTTTATTATCTAATTTTTCTGGAGAAATAAATGGAACCAGTTTCCACTAGCGGTTTTACAGCACTTTTAAAATTATATGGGATTGCAATCATGGTGACTTTAGCAGTCGGTTTGGTTGCAGCAGTTGTATTGATGACACGTATGCCACGCTCACCACAAGAGTGGGCAGTGGGCTTGATCTGTACGGTTGTATCAAGTTTAGCTGGCGGTTCATTCATTATTGTGAAGTGGGGGCTTCATGAATGGGTTACTGATGTATGGGGAATGATTGCACTTGGTGGGTTCTTCTTTGTTTGTGGTTTACCCGGTTGGGCTTTAGTCCGGTGGATCTTTAACTTCATTGATAAGCAGGAAGGTAAAACGATTGTTGAAGTGATCAAAGAATTTAAGAAAGCCAAAGATGATATACGGAATAGTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP030106|273863:285533|275722_276205_+|AXB14146.1|DBSCAN-SWA MARLNKRVKLYIVRSLATYETPSETARGVQEEFGIEVTKQQCEAYDPTKKTGQDLSEEFKAEFYRVRKEMNDNLSAIPIANIAYRLKRLQRFIDLEQFKENPVIVPSLMEQAAKEVGGLYTNRKEITGAGDGPLQSENITQVVATPEQIRQVLDELKGKY >CP030106|273863:285533|279852_280041_+|AXB14150.1|DBSCAN-SWA MSKFKAGDVVELNSGGPVMTILEVKNNGWVVCEWFDKNHTYNKKEFLESNIDTYEMLEAFTI >CP030106|273863:285533|282947_283946_+|AXB14155.1|DBSCAN-SWA MIGTIYGSARYGQLVTPIDADDSTLQVELNTASQIFSGTLEDAQADQTLCKVGDEYFNYQVATLNGSGLYTLSDVLRGRFDDAQSHNAGEPFVRLDKAIFKYPYNDGLVEKQIFLKFTSFNGLERKEQALDEVTAYSYTLSGGRPAGVKGLSLQSPFVGTTFKVQWQTSTGADGYRVQVWSNGAMIRQVDTTNTDYSYSIEEAKQDGLGRAYTIRVASKNGDQVSTFAELSISNPVPPVLLNVYTAATVDSITVNWAPSEVPDLKEYAVWLSATPNFDPTQVPPSWTGRETTTTFGGLQPTTPYYIRVAARDVWENTVWNYTNQITQSTSEA >CP030106|273863:285533|274630_274975_+|AXB14145.1|DBSCAN-SWA MNENAELIKYIDVAESVYERVYENNQISNSLVVNLNRVMDEIKKQAKEKNLKLKYPSIDFEYCLSLPLADRDVKVDLSLIPHFEYRDECILWLTNFIGKISVPQKMNRQRLNSR >CP030106|273863:285533|281985_282456_+|AXB14153.1|DBSCAN-SWA MSLTPQAIPGMRARLHMPEEILSLPVAGNTVLSDGEVVVQSTDGKTVTAVTGATNTKFGVVVLQHVGKSGKNALGKEAYQAKDCAPIMQIGSIWVKPTAPVIDINAKVYVRIANPTAQAPLGSLSSAALDSTELPNASWETITGPDGLAILRLRGA >CP030106|273863:285533|273863_274322_+|AXB14144.1|DBSCAN-SWA MPRYLAIADTVYKKIKNEKLFTEDMIENLNCLISLIRQAIKGTEFKLKHDYINFEECLTKPLADCTVKLDLSLMPNFKNEDEFVLWLAGFIEKITIGGKPKFPPISQMIPKDFVFTKETFPVTPTPKKEENAEMIINYFKSEDYLKKTKISS >CP030106|273863:285533|280767_281967_+|AXB14152.1|DBSCAN-SWA MKDIYRFKVGDFAPSESTRSFTPEGYLKCVNVRLGKAPQVRQYYAYEFPNLEGFSADQTINVYTPAEELFKPNPIKSWDGADATDYHPPKNEINAANWKEYHIGYCENVRQEGEYLVGDLLIKDKDSIDLIQNNERLEMSLGYGATLVLEQGLAPDGTVYQAKFINFIGNHVALVKYGRCGGDCRIGDKQQTPPKGNKTMEVIVNGIRFNIGDNTPLADALKQQQEQLENMKAAKLKVGDKQFSIGDELGAIQAVVDQLHTDKTTLEQKVGDLEKNQMTPEKLEQAAAERTAVIADAKALVPTVKTEGCTCEQIKRDVIAAKAGDALVTALLGSVSVGDAKPDQIDTTFRALSAVKGTHPSNPVGDALHKQQNIQAGDGKPEDGEPKPNNKKEAWKQSF >CP030106|273863:285533|285143_285533_+|AXB14157.1|DBSCAN-SWA MEPVSTSGFTALLKLYGIAIMVTLAVGLVAAVVLMTRMPRSPQEWAVGLICTVVSSLAGGSFIIVKWGLHEWVTDVWGMIALGGFFFVCGLPGWALVRWIFNFIDKQEGKTIVEVIKEFKKAKDDIRNS >CP030106|273863:285533|278960_279773_+|AXB14149.1|head|DBSCAN-SWA MSAIIQMLKPHLQQAKKSKKGRKASKPRPVKVNRRVELYYTRQLLAISKYCQEKTKELVIPTVGQNIGDAWFSDMMTSFREKLTKYVVEISRPLATKVVTDTQKEVDKQIAEHTKTIIGVDLTPFYRAADIQDEVDLNITSNVSLIKSIPQQYADKLENLVTNALQTGQTNEDLAKEIKALGQSTDFRARLIASDQMGKINGQINKARQLSMGVETYTWQTAKDERVRPDHQHKQGQTFRWDSPPAGGHPGQPIRCRCTALPNYEDILIT >CP030106|273863:285533|277681_279016_+|AXB14148.1|DBSCAN-SWA MAETKKPDAIGDAGAYTNFVSNIGTSRDKASHGHFVQKEIPDDQLEAVYQHWLAKRIVNRPASDMLRAGWFYEGIQDRDLIKLEEACKAFQLNQILLSSLILSRLYGVVYVLLGTVDGGNLEQPFDLKKLGVGRLEFFTVLKKKYIKPDTTTYLSPKVCGGLLKQPEFYKLQMDGKAPQRIHHSRLIKFCHADVVNEEPQSILQEVYEDLLDHAAVKKGSASLVHESKIDVIKTPGLVDKIKEDMKAVAERFLSVGLLKGLNGMIVLDAEEDYDSKTYNFAGLPDMMREFSIQTAGAADIPYTILFGQSPAGMNATGEHDTRNYYDSIATKQTWMLKPFMMQILDVICQTTFGRVFPNLDIVFNPLWQLDAKVRSEVEKANSERDAKYLEMGIITEPQIARQLLIDGVYSVIDEAHIKELEIMVKLNVGDHSDAETSPPAGEEE >CP030106|273863:285533|284006_284993_-|AXB14156.1|DBSCAN-SWA MNPKYLILITSVFCSMSSYAQSFELNSDITDELNTALKNNKNVTIPPGDYKVDALKSIKPQNGSVITMSENTRLNVIPNKSGAYKVFDISNVKNVTITGGELIGDKYSHLNKYGEWGMGIDIRDSQNIRISNMKISKMWGDAIYLGNNNNFSNSDIVLSNIIMNDNRRQGVSVITAKNLNANNLTIKNTSGTGPASGIAIEPNNNKSHLENLTFKNITTENNKGAGIQITLKFYKNPKNPVSISVINHKDNRSTFGSIVNGIDSTQAGQINFNKLAYKNNSNSNTCFSNWSNTKFNIKFTEATLDGSKGVSEWCHDVSKNKRILVQKN >CP030106|273863:285533|282459_282951_+|AXB14154.1|DBSCAN-SWA MSKQLEQMKIRLSAVAHGVQIAVGDAFNLDNFAKLLLKLESIDEMTPQLAEAQAYAKYLPIEGLEGAVIGSASVLQRKKGVGRGKRFSGQGNDVPLAEVMYDSQASNGYQGGNEEPGNVNAPSIFEPPLDLTDGKNKYWLLFLVGLIGAAVTSGLALIIRPMK >CP030106|273863:285533|276182_277673_+|AXB14147.1|DBSCAN-SWA MNSKVNTKLLEMQLERELCEKEHLFFTRRFFLPRMGFKFSVNWHHEYIADKIDEVIAGKVKNLVINVPPGSGKTELLTNLIARGIARNARSRFLYLSFSQSLVEDVSATARNIVKSEDFQNLWPVKISTSTDAKSSWKTTVDGYDAGHVYSASMGEQVTGRRAGTLANEGFTGAIILDDPLKPEDAFSQTARRKAKSDTPIILIMQRLHVEDPTNFVLTGNVPGEWEQISIPALIDDEYISKLPEHIQRKIPRDVERDEKGRQSYWPLKESLLSLLQLEKGGEDKDGATVSRYTFASQYMQNPKKLGGDLVKAEWFGRYEELPLLKWRAIWADTAQKTKEHNDFSVFLCAGLGYDNNLYIIDVKRGKWEAPELLKEAKAFINKHKDSNTKIGKLRYMAVEDKSSGTGLIQSISRQTTLPIRAIQRDTDKLTRTMDVVFYVEERRVWLPAEAPWLLNYIEEIEGLTADMSHDHDDQWDPTIDAINDSLAKKPTVFDD >CP030106|273863:285533|280081_280714_+|AXB14151.1|DBSCAN-SWA MAKTPQTREELKKHLRENLAFLNVSNKSFDEGLHAEAKRLATTIRVLVHDTLKSKSLLEQLGVKNDLKFLNTSYEYSPTNLMPHTGLVMMRMTSNGTSYLAPLHDGPPDRYTQPGLEFSQWWDQLVIDDKSGGVFTRKNLILFMANQDGGAHVDPSLDSSYAALKRDNSVGWVYSDGISEHPITDIELHSVRQIAYELIETLKPLDINSL |
14 | Acinetobacter_phage(30.0%) | head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1441950 : 1462858
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP030106|1441950:1462858|DBSCAN-SWA CTCATTTCTCATTAATTGATACCAACATAGAGATACTTTGCATGTGTAAAGGCATAGGTTTGTCGTGTGTTATCTTGACCTCAAGCTCATGCAACTCTTGCCAACCAACAAATGAATCTAGTACATAGCCAGTGTAAGGCAAGTTTACGAACGCTGATTGATTGTAATACTTGGTAGAAAGTTCCTGCCCGTTGATATATCCACCAACCGATGCATTCAAAAAGATAGCCATTTCGTGCACCTGAATCTTATGAAACATTGCAGTTGTTGGTACTTGGCTAAAGTCTGGTGGCAATAGGTCGATTTCAGCTTTAAACGGTTGGCCAAGGTGTATTGTTTGGGTTAGATCAGTGTTAGATAGCTTGATGTTGGTGCCATCAGTTGTGTAAGTTGAATAGAAATATCCATCCGCATTATTAAAATTAATCAGTGGATTATCTAAAACCTGAATATCAAGATTTAAAATAGACCCAACGCCATTAGTAACATTGATATCAAATTCACAATTGCTCTGTGCAGACTCGCTAAACTCTTCCAAAACTGTAGAACCATTGCGATTAGTAAGCATGAAACACTGGTCCTCACCTAAGCCCGTTGGCAAGGCGCAGATAGACAATACCTGACCACCAAAATCGTGCTGAGCCCAAGCATTCATTTCCTGATCACGGTTTAGTGTGATACTTGAGACTGCACCATCACCCATAACAATCCATACAATAGAGTTTGGTGTTTGCTGAAAGGTTAATTCTTTTATGCCTGCATGGTTTTCAGGTATGTGCGGGGCAATTTGCGATAATTCAGGCGAGACAAGGCCATCAACTTCATATCGGTATGACATTGCACGTAAGCGCTCACCACCACGTTGTACAAAAAGCAGTTCATTACCCACGCGGCAAGGCTTAACATTCGCCTGAACACCATAAGAAGTGTGCTCATCAATCTGTGCTGAAGCTGGTGTCAATGGACCCTGCGAGTTAATTAAGAACTCAGCACCACCAGTTAATGCAACTACACCACCACGCTGTGATAGGTGCAAAATATTGTCAGATTGAGCTGAGCTTGAAGCAATGCTAAACGCATCTGCATCTTGAGTTGTCTCTAAGAAGTTGCCATCGTCACCAATTCGGCTAAACCACATCTGATTAGGACTTGTTTTTGTATTGGCAAATACTAAGCGCTGTTTAAAGAAGCACACTGCCTTTGGATAGCCTGCCTCAGCACTAAATGCGATACTTTTTAAAACCCAAGATTTAGCAATTGCCTGAACATCGGATGTAAGTTTTACCAGAACTTCACCATTCACACGGGATGGATCCACATATTCCGTGATTTTCACTTGGCCGCCATTAATTTCAACAATTGACCCAACACTTGCAGGTGTAAAAACGTTTGCTGCTTCGTTAGTTACTTCTTCCCATTCTGGTGTAGTTGCAGAAGGCTCTACTCCCTTATTGTCTGCGGTTGCTCGCCAAGTCTTACTATTGTGAATAACCCGGTCACCAGTTAAGTAAGTCTCAGTATTTGACCAGTTTGGGAATGATGAAGCAGTTAAGGAAATAACTTTCCCAACTTCTGTACCGGATGGAGATAAAGCTACGTTTGGAGTGCTGCCCAACTCATCATTAGGGTTCACACCAAAGGTAAAAGCCGCAAATTGCCAGTTAGTAAAGTCAGCAGAACAAAGTAAACGCTGTACAGGTGTATCACCTTGAACGAAATACATGCGGTATTTAGTGTGCGCATACTGTACTTCACGCACTTTTTGGGCCGTGTTGTAAGGTGTCACAGTTTCATAAACAACTGCATACGTTCTTGGGTTGTAAACCTTGAGGAAAGACACACCAAGGATAAGCAAATAGGTGTTTTCTGAGTTTGCAATAAACGGAATTAAACGTAATGCACCTGCAAAAATAGAACGGAACTTTGTGCCTGGTCGTTTCTTTGCTCCACCTTCAACCAAAGGCAATGCATTAAGCAATTTTTTGGCACCGTTTGCATATTGCTGAATGTCTGTGCGCGTCCAAAGTAACGGGCTTAACTCACCAGAACTCAGGTTATTTTTTAGGATCCACTGTCTCATTAGAAGCGCTCCCAATAGTAACTTGATTCTGCGTATTGAACGTCTTGGCTTGGTCGCTCCTGACCATTCACGGTACGTGCTTGCTTAATCAAAAACTGGAATTGTGCTTCTGCAGATTGACCAGCCGCATCACTTCCTGTGATTGGCTTGCAAAGCTTAGATGCCATTTTGTACGTCATGGCTTCAACTAACATTGCATCCCAAGTCTGCTCGTTGTCGTTGTCAAAAACATATTCAAGATAGACTACTTCGGTGTCGGCCAAGATATATCGGTTCTCGACTTCATAACGTTCAGTGTTAGCCGAAATAATCAGAACGTAATCACTAGGTAGTGGGAATGCATGAGCATAGCCAAAACTTGGATAGGTGGAGATTGGAGATAAGATTTGCCGTTTTTTGGCGCACGACCAAGGATGTGAGCGCAGTATTGATAAACGTGTAGTGTCATAAATATTACGGCACGTTTGAGCTAATTTTGAGTCTTCCTCAAAACTTGCAATTTGCTGCCCACCAATCATGCTCAATGCGTTATTGCAAATGGTGACTTTAGATACAGACATAAGAAAACCCCGAAGCTTTTTGGATAGTTTCTTCGGGGTTTTGATGTGTTTTGTTGGGTGTTAAATCATTCTTCCAAATACTTTTCTACCAACTCATCAATATCACGAGCGCGCTTGCTTAATGCTTGCTTAGTATCATTTGGAATTCTTGGGTCAAGCCCCATGCCACGCATAAAGTTCGCTACTGATTCTAACTGTCCAAGTAGCTCCTCTTTTAACTCTTCAACATTACTCATTGTTATTCCTTTCGCTACATTTACTTTGTTAAAAAAAGCACCCCACCGCCTGCCCTAACAGTGGGGTGAAAGCACTTACACTAAGTAATCGATAGCAACTACTTTTTGCTCGTTTGCACGACCAGCCGCAAATGAATGAACACCACCTACTTGTGAAATGTTCTTTTTGTCCGGACGTTTTGAAATGTCGAAGCCAGTAATATCAGCATCACCAAAATGAACGGCTGAGCTTGTATACATCACCGTACGTTTTTCGGTAGCACCACCAGCGCCATTGTTAAGTTTTTCGTAAGGGATCCAGTTCACACCTAACCACTTACCAGCTACAGCACCTTCTTGAAGCATCTTCACTGCCATAAAATCAGCAGATGTTAAGGTAGTATCACCTAAGATATCTTCAAGCATTGAAGCGGTGTAAATGATGTTCAGCGTTTCACCGTTATGCTCATCACATTCGTTTGCACGGAAGATTGACTTAGCTTTGATGATTTGCTGTTTCAAAGTCCCGAAACCCGAAAGAATGACCTGACCAGCCGGCAAGTTCACAGTAGCAGTAGACTTCACACCAGCATCGTTTACAGTTGTACGTGTTACGCCACCAACAAGCGCTTGATAAATGATGTCATCGATTTTGCGGTTACGCGCATTAATCAAGTTCTTCATGTATTTATCTGTTGGTACAGCTTTAAGTTTTGGTAAATCACGGCTTTCAATTGGGATGAACAAGTCATAATCTGCCATTAATGCAGTACGTACACCTGCATCTGGAATGGTCCAAGTGGTATCACCGAAACGGTTACCAGATGGAGACATTTCAACCTGCCCCATATCATTGATAGTGAATGATTCACCCTGAATTTTTCCACGGTTTACAGCAGTCTTCAGCAATCGAGACTCATTTTGCATTGCTGCAATTTCATAAGTATCGTGATACTGAATTACAAACGCTGCCGTGATTTTATTTTCATTCGCCATTGGTTAGCCCCCTAGCCATATGTCTTTTGGTAATAACTTTGAACTTGGGCATAAACACGCTTATGGTCAGGATGACTTTCATTCATGTACGCCTCTGATGCTGTCAATTCTTGAATGTTCTCGGCACCGCTTTGTTGGGTGTTTTGAGGCGGCATATCTTCTTGTAATGCCTTGCCAAAGTAGGCAGCAAGACGAATACCGAATGTTGGAGAGTCAACGTCTGCAACTTGAAGCCCAGCCGCTTGAATTGCTTGATTAGCGAAACGTAAGTTTGCTTCGTAATCGTTACCCCAATCCTGTTGAAGTGCTTCTACTTGCACGGCTGTGTGCTGGTCATAAGCCTTCATCACCACCGACATTTGCTCATTAGTTAGCCCAGCTTGATGAGCACTTTCTAAAAAAGCCTTGTTATCTTCATTAGATTTGAATGCATCGAAATCAAAGCCTTCCAGCTCCACTTTGTAATCATCCGCAGACTCAGGAATATTTGGCTTGGTTTCTGTTTCAGCTTCTGGCTGTTTCTGCTCTTGAGTTTGGCTCTCAACTGGTGGCGTTGCTGTATCCACAGGTGTTGTTTGAGTTTGTTCAGTTGCTTGAACGTTTTCTGTGTTTGTCTCTTGTTGTTCATTAAGCATCGTTCTCTACCTCACTGTAATTTGGGTCATTTGCTTTGTTGATTTCATTGATGATTCCAGCCACAACGCTTTGTTGACCAAGCTTGTAATTGGTTTCACGGTCTGTATTTGAGAAGGCATTGCGGCAATACTTTTGGGTCAGATGCTCAAGAATGCGTTGCCCGTTCAGATCCAGATCAAACACGACTCGGTATGTCTCTGGTGTTGCTGGGCGCAATGCTCTGTGTTGAACAAAAGTTCCAACTTCTTCGGGCTTCTGTTCCTTGTTGCGGAGGCTTTCTTCAAGCTGCTGAATGCGTGAAATGGCTTTATCTAATTCCTCTTGTGACTTAGCCAATTGAATGGTGGTATCTAAGTGCAATCGGTTCTCAGCCCAATATTTTTCTTCCCAATCCTCACCACTAACTTTGTAAGCTATGGCAAATGCAGCAGCCACGATAAAGGCCAGAACTGCAATTACAAAAAGGACATTAATCATTGTCGTGTCTCACTAGTTAATTCAGACTCAAGGCCC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP030106|1441950:1462858|1461551_1461842_+|AXB15238.1|DBSCAN-SWA MGIMQFSITLEGDTPPQILLGQNLGGAIVTKLEQVKQELVSAAELAKVYNLSVTTIREKLVSINQGTEGKHMYDPERARQILTKKDANKRGRKRAN >CP030106|1441950:1462858|1455210_1455393_-|AXB15223.1|DBSCAN-SWA MQVLMKKSDAIQAFKTKVGVAKAIGISKQAVSLWGDMVPEGSASKLLLVNPNIPHTIKAA >CP030106|1441950:1462858|1448784_1449108_-|AXB15209.1|DBSCAN-SWA MAAKREIKTPGVTAEPIQEETVEPTLPKTTAEQAEESLDAINSGESEGEKEPTQEELLRQELGQMRAQLAELKKSTQPEMKNASGETQPKKRIPVLTEKGWSTKEAD >CP030106|1441950:1462858|1451259_1451916_-|AXB15217.1|DBSCAN-SWA MKRLNVLVACEYSGRVRDAFAALGHNAMSCDLLPTEAPGNHYQGDVRDVLYKGWDLVVAHPPCTFLSVAGNRWFNVERYGQKAITRLKDREQAIAFFKLFTDLECEMVAIENPIGCMSKTYQKPSQVIHPYMFGDPERKATCLWLKGLPALQATNVVEPTIVKYKNGKGTDSPWHLDTLKLPAEERRKARSLTFQGIADAMALQWGGDVRHLAMREAV >CP030106|1441950:1462858|1461031_1461334_+|AXB15236.1|DBSCAN-SWA MKMNAPIKLEMKVYAVNKDGQQAIVTMSLPLGQYPTRSTLEKIFKDAEGHLPDDFRVMNKSEFFNAYLQEEYGTTEKFATPGSREFTDDVIEMDESGAEG 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MSSLQERMHQAKKHYESTRNKKLKNTEMAEFCKVSKASVGQWFNGPTKELDGSNLTLAAEFLGVNHKWLAGERAPMLLDKKSDANVVFNNDEISKIPVLDYVQAGLFNSVGYDGVNPIGETYTTYKSAKEKSVFSLTVQGDSMLPDFKPGDLLTIDTALMPQPGSFVVAQNGDYEATFKKYRVIGYDDFGREIFELVPLNPDYPTLSSLNHNISIIGVMVLHMRKYK >CP030106|1441950:1462858|1451912_1452317_-|AXB15218.1|DBSCAN-SWA MRVDSTAFTDNPRARARFLETKKKAKEFLRQRRGYKRPDFNRMILDLRNLGWSHEKIAYVLDVSGGSTVSSWSTGSIPEYIHGEQFIMLWQEQTGLQRVPREGEWQTYKYDIGQLDLLETLDVFAAQLDEELQQ >CP030106|1441950:1462858|1450459_1450645_-|AXB15214.1|DBSCAN-SWA MSDCYGGGGAYFIDIDADTENKLLDADPDCEPQLDVGYAESLEEALEFIDQLPSLKGASHA >CP030106|1441950:1462858|1459721_1460330_+|AXB15233.1|DBSCAN-SWA MNILQRSEDWHSERCGKVTASRVKDLYAKPNKGKALNALGLTILAERLTGVQKEIFTNTAMQWGIDNEPYAIAAYENETGNFVVGTGLIDHPFIEMFGASPDGLVLVEGQIEVKCPDTTTHLNTLLTKQVPDEYIPQITCQLACTRREWCDFVSYDPRLPEELQIIIIRVFAKDLAIEALEQDVRKFNKAIDDAIKTLKVAA >CP030106|1441950:1462858|1444028_1444589_-|AXB15203.1|DBSCAN-SWA MSVSKVTICNNALSMIGGQQIASFEEDSKLAQTCRNIYDTTRLSILRSHPWSCAKKRQILSPISTYPSFGYAHAFPLPSDYVLIISANTERYEVENRYILADTEVVYLEYVFDNDNEQTWDAMLVEAMTYKMASKLCKPITGSDAAGQSAEAQFQFLIKQARTVNGQERPSQDVQYAESSYYWERF >CP030106|1441950:1462858|1445811_1446435_-|AXB15205.1|DBSCAN-SWA MLNEQQETNTENVQATEQTQTTPVDTATPPVESQTQEQKQPEAETETKPNIPESADDYKVELEGFDFDAFKSNEDNKAFLESAHQAGLTNEQMSVVMKAYDQHTAVQVEALQQDWGNDYEANLRFANQAIQAAGLQVADVDSPTFGIRLAAYFGKALQEDMPPQNTQQSGAENIQELTASEAYMNESHPDHKRVYAQVQSYYQKTYG >CP030106|1441950:1462858|1456205_1456697_+|AXB15225.1|DBSCAN-SWA MNLVTYLLIFFVVIFLLFILVRFLNNRSNKLSKRKDNINILAFNDNQSAFEYSIKYMDNSIVKDRPVLALSSQKILKPSEPIMIKVAGDPPFFAHASTQFVGDYTINEGDLLAVIPIQKVENTTSYMKGDERKEWQFLIVSVVSPKYHTIKNMWSIKKDFLRQ >CP030106|1441950:1462858|1453954_1454827_-|AXB15221.1|DBSCAN-SWA MARARNIKPSFFTNDDLGEINPLARLLFIGMWTIADYKGCFEYKPKRLKVQILPYDNCDIEQLVNDLEKSGFISIYSVRGRKYIKAINFTKHQNPHKNEREGGSEIPDIDEADIEEEEKSLKNNEWANIENNLEQDGTDRADSLNLIPDSLNLIPSTPEPKIGKTVDEMFTEFWEIYPNKKSGPKAAKEKFKKINFKKHSFELIMTSLEKHIQSLDWIKEGGKFIPHATTWINQERWNADIGSTQQTSGLNSNYGYQSSQQQTISEQAKWDEFLNQNQIWDVTPKKAVTD >CP030106|1441950:1462858|1452334_1452754_-|AXB15219.1|DBSCAN-SWA MRITEQQLEAIQNKRNIAQKGTLQRDKRKSDVRVLGRLKQGAMNKTERKYNDYLESKRMKGEILWFKFDCINLRLAEKTFYKPDFFVLTSDFELQVHEVKGHWEDDALVKIKVAAELYPFSFKSVHWNTKNNAWDVRHF >CP030106|1441950:1462858|1456891_1457083_+|AXB15226.1|DBSCAN-SWA MNQKSQTSQILYRHPTKAEQAPSVFAQHVADIKDWAKLFALFFPFLMGAILIALIAAKYWGAN >CP030106|1441950:1462858|1450710_1450890_-|AXB15215.1|DBSCAN-SWA MSNKKDTPDGATHFFTSLGGQTRFFKIESGNLMCWYEELGAWKHPAASNWLMKNIKVIP >CP030106|1441950:1462858|1457279_1457600_+|AXB15228.1|DBSCAN-SWA MGIKKLVTITVEAQIEIELPDEFQELSAEDIEGINACGYDITKSDDLYKYAAELVLNGGQNGTWDVFGHVVPWWKKGMTGISDNSTFFNLRDLHIEECEVEEPSHG >CP030106|1441950:1462858|1461838_1462858_-|AXB15239.1|integrase|DBSCAN-SWA MKLPKPIKRGQTYRITVTYENKRYSCTRDTEKECEQWAAMKLLELKSGKVQEEKGIKTPYPFKMLCEKYYAEKGIKLRSKHVIRNKLDNLERIVGELASKSIYDFKPSDIARWRNKRVLEVKNGTVLYEFSIFSSIFTYAQKELFLIESNVWQNVIKPEKGKSRSQRITFDDQEKILQQAKWDKNNPPRFVKHYVCWAMLFALETAMRQGEILGMRREDIKDGFVHLPMTKNGESRNVPLSKEAKRLISILPSNSDILLPVKAETFKRTWIKIRDAADLKHINFHDTRHEAITRMVRERKLPVEVLAKITGHKTIGILINTYYNPNAQDLVEMFNSSES >CP030106|1441950:1462858|1444900_1445800_-|AXB15204.1|DBSCAN-SWA MANENKITAAFVIQYHDTYEIAAMQNESRLLKTAVNRGKIQGESFTINDMGQVEMSPSGNRFGDTTWTIPDAGVRTALMADYDLFIPIESRDLPKLKAVPTDKYMKNLINARNRKIDDIIYQALVGGVTRTTVNDAGVKSTATVNLPAGQVILSGFGTLKQQIIKAKSIFRANECDEHNGETLNIIYTASMLEDILGDTTLTSADFMAVKMLQEGAVAGKWLGVNWIPYEKLNNGAGGATEKRTVMYTSSAVHFGDADITGFDISKRPDKKNISQVGGVHSFAAGRANEQKVVAIDYLV >CP030106|1441950:1462858|1457592_1458348_+|AXB15229.1|DBSCAN-SWA MDNYKIKVKDEAESKEAQELLKQLGFQEEGFTGIGLPCYLATWNGGYADYYFGSLSEGRKREELTLPQLRDLVVLKRNDVKDATHNNFRTNTPYLKQGENEYYMLNGEWVLSNCPNDLEPINKPQDPALISGADAIDALKAKKEVEYCGEGINDSWLSAETLPVVYFLTDSFRFRIKPQTIKLELELPKPFEPNLDENYWFIDSTEEKGYRLTRFDNDENDQDVMQFGAWRTEVEIKQVVEQLRKIRGTNS >CP030106|1441950:1462858|1458730_1458958_+|AXB15231.1|DBSCAN-SWA MSKRALLHKSKLEDFKSWLIENQIQYRDGKGDFQVLQVEVKDRFYPIYDRLQGAHFTTQRELIPLVKRYIASVKN >CP030106|1441950:1462858|1454866_1455202_-|AXB15222.1|DBSCAN-SWA MAEKLTASVTFKCTEEMKIKLERIARSRKLNGSSELMRIAAMDIIFEVEEMLNCLQMPIDLTTVTEDTRNTSDFELMPSPPLRDVTPKHTGTKKAQLREQLNLICHSTAKQ >CP030106|1441950:1462858|1448554_1448785_-|AXB15208.1|DBSCAN-SWA MCGGGLGKILSSVTDMVGLTDTKGASKGFDAEAADAAAKNQAQLDANAATAERRKRNASTVLASATDNQKKTTLGG >CP030106|1441950:1462858|1460326_1460644_+|AXB15234.1|DBSCAN-SWA MNDLEINGYKIFENYDEAVYAAKSKEDVYDFFVENYGPTEECQGETKEQFIENLIEIDVGSEFAQRMRTYISDDTGEVSESSHYEQYKEVASKDEGTEVIAYLVW >CP030106|1441950:1462858|1446909_1448553_-|AXB15207.1|head,tail|DBSCAN-SWA MSELVARLCKRLSELKAARNRLEPHWSECYRYAAPERQQSFIGDDVTDTRKTQRAELLDSTLSEATQLLVSSIISGTTPANALWFKAVPNGVDDPAELTDGEKWLDEVCQFIWRNIHGANYDSEIFDLVLDCVVAGWGVMYADVDRHAGGGYVFQTWDIGQCYLASTRQDQKVDTLYREYEMTMAALVNEYGENKVSEKVRNTYKSKPDCKVKVLWVVEPRKTGYIKGDRQLMPKEMPFASYHVEVDEKIILRETGYNEFPFVIPRFRKIPHSVYGTGQVSIALPDAKTANKLMRDTLRSAEISTLGMYAGVDDGTFNPRTVRLGGGKIIVVNDVNSLKRIDDGKGYQVGVDLLAHLQGAIRKKMMADQLQPADGPAMTATEVHVRVDLIRQQLGPLYGRWQAELLTPLLERTFGLAYRAGVIGEAPEEMQGRNLSFKFISALARSQQLEEVTAIERFLQGLSSVAELDPSILDNVDMDAVAQVSGMGLGVPTAILRTQDQIDAIRKQRQEAQQQAAQQEQEQALAQPLANAVGKGLESELTSETRQ >CP030106|1441950:1462858|1457082_1457280_+|AXB15227.1|DBSCAN-SWA MNSKALCLQANPNLYCKPIGAGMFQFYQIFEGQYFFANSAKTEKAAWDLALKKLEQERVQVEGVK >CP030106|1441950:1462858|1458344_1458731_+|AXB15230.1|DBSCAN-SWA MNMLANISFDAAVFTSLEVMNVDVVDGVIQFSLSIQNAEHIYIVASVKGIEKNDTFEYGEGLDYQDWKDVNYTRMTVDSSSRPHVDDFDYVDAVEGMPFALTSTQIQKLNEYLEELAREEKINELRGG >CP030106|1441950:1462858|1449574_1449811_-|AXB15211.1|DBSCAN-SWA MNQEFLNWAKKNLNYTGVDAFEAGKQSRQAEIDANELKLIKLSEAIYACGDLREYSDDELLGFYKALKAILEGKNHGY >CP030106|1441950:1462858|1441950_1444029_-|AXB15202.1|DBSCAN-SWA MRQWILKNNLSSGELSPLLWTRTDIQQYANGAKKLLNALPLVEGGAKKRPGTKFRSIFAGALRLIPFIANSENTYLLILGVSFLKVYNPRTYAVVYETVTPYNTAQKVREVQYAHTKYRMYFVQGDTPVQRLLCSADFTNWQFAAFTFGVNPNDELGSTPNVALSPSGTEVGKVISLTASSFPNWSNTETYLTGDRVIHNSKTWRATADNKGVEPSATTPEWEEVTNEAANVFTPASVGSIVEINGGQVKITEYVDPSRVNGEVLVKLTSDVQAIAKSWVLKSIAFSAEAGYPKAVCFFKQRLVFANTKTSPNQMWFSRIGDDGNFLETTQDADAFSIASSSAQSDNILHLSQRGGVVALTGGAEFLINSQGPLTPASAQIDEHTSYGVQANVKPCRVGNELLFVQRGGERLRAMSYRYEVDGLVSPELSQIAPHIPENHAGIKELTFQQTPNSIVWIVMGDGAVSSITLNRDQEMNAWAQHDFGGQVLSICALPTGLGEDQCFMLTNRNGSTVLEEFSESAQSNCEFDINVTNGVGSILNLDIQVLDNPLINFNNADGYFYSTYTTDGTNIKLSNTDLTQTIHLGQPFKAEIDLLPPDFSQVPTTAMFHKIQVHEMAIFLNASVGGYINGQELSTKYYNQSAFVNLPYTGYVLDSFVGWQELHELEVKITHDKPMPLHMQSISMLVSINEK >CP030106|1441950:1462858|1450882_1451263_-|AXB15216.1|DBSCAN-SWA MKPEQFIREYGVENVKTLIEDYEKDQFAFKSFDPAADCCFDAGLCMGQEKAWWDICIYDLKRLVESVELISLFGSIKIAKDKVKMADFNGFLLVSVPIENGLADVYIHKVEQAIRDHESIYGGGDE >CP030106|1441950:1462858|1449807_1450131_-|AXB15212.1|DBSCAN-SWA MDKCREEFEKQKYWIGLFRADVDFDMTLGKFGRYVSNGSRRIDAMYLESFNEKWEAWANAWQHQQAKVEELEKRIDKALKIQDEFDDQDDVRLMMYAVEQALKGEGK >CP030106|1441950:1462858|1449381_1449585_-|AXB15210.1|DBSCAN-SWA MGIDEQIKMLESGDYVLVPKEPTQRMLNAGHVVMNPIKGSDVHPGTNQKRRECYKAMLRAYQEYGDQ >CP030106|1441950:1462858|1458967_1459741_+|AXB15232.1|DBSCAN-SWA MNVPVQNNIVQAQMHKVALAFDMVDVDPEQLKKTLTDTVFKGANDVQLVSLLIVANQYKLNPFTKEIYAFPAKGGGIVPVVGVDGWARIINDNPVCDGIQFEQDDESCTCKIFRKDRNHPTVVTEYLSECQGNSEPWKKYPKRMLRHKALIQCARVAFGFSGIYDEDEARRIDDCQTSTVKTVSSDVPQGYEAYEQQHLDTMRALAMEGTEALQTGYAELPQGDCKKYFWTKHSASLKEAAQHADQPQGQVYEHSPA |
38 | Acinetobacter_phage(42.11%) | head,tail,integrase | attL 1446818:1446833|attR 1468777:1468792 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1496128 : 1551765
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP030106|1496128:1551765|DBSCAN-SWA ATTACACGAGCGATGTGTCTTTCACCATATCAACAACTGTAATGACATTGCCATTAACTTTAAAATGAATATCAAAATTCGAAAATTTCATTTTATAGACTCGTTCAGGGTCTTCTTGATAGGCAGGTCTAGGATCTAATGATAATACTTGTTCTAATTCATCAAGATATTGTGCATTAATTTCTTTATTTTTAAAAAGAGACTGCTGGGTAGACAATGCATTTTCAGACCATAAGACCGATTTTCGTTCTGGTTCGGCCTGCGCATAACCACTTTGAGCATCAACGATTGCATCTGAATATTGAATATAAGGCTTAATATCTAAAATTGGCGTGCCATTTAATAAATCACTGCCAGTAACATAAACTCTTAATGATTTACCGACTTTTTCAACCTTGTTTAAACGTACTACAGATAAGCCTATAGGCGCCGGACGATACATACTACGTGTTGCAAACACACCTATTTTTTCATTGCCCCCTAGACGTGGTGGGCGAACTTGAGGCCGAAACTTAGTTGCAGTCTCCTGATTTTTATTGTCATGAAACTGCCAGATGAGCCAAAGATGACTAAATTGTTCGATTCCCTCAAAAGCTAATAAGTCATTATAAGGTTCTACCATTTCGATATAAGACTCGATATTGACCAAATTAGGCTGACGTGGAATACCAAATTTTTCTCGAAAAGGTGAGCACATGTGCCCGACTATTGGGAGGGTGACAGAATTCATCATCACTTTTTCTTATAAACACAATTAAATATATTCAGTTTATCGGGAATGAAATTAGATTAGAATAGCAACCTGTTTTCTTTTAATCGTGATCGAGACCTTTAATGGCTGCTTTTAACGTTGAACGCATTACTCATGTGCACCACTGGAATGACACCCTTTTCAGTTTTAAAACTACACGCGACGCTAGCTTACGTTTTAAAAATGGTCAGTTCGTGATGATCGGACTTGAAGTGAATGGCAAACCGTTAATGCGTGCATATTCGATTGCAAGTGCGAACTACGAAGAAGAGTTAGAATTCTTCTCGATTAAAGTACAAGACGGTCCTTTAACTTCGATTTTGCAAAAAGTACAAGTTGGCGACGAAATTTTAGTTTCTAAAAAACCAACAGGTACATTGGTTCATGATGACCTTTTACCTGGTAAAAACTTGTATCTATTATCTTCTGGTACTGGTCTTGCTCCATTCTTGTCAATTATTCGTGACCCAGAAACTTACGAACGCTTTGAAAAAGTAATCGTGGTTCACGGTACACGTTATATTTCTGAATTAGCTTATCAAGACCTAATCTTGAACGAATTACCAAACAATGAGTTCTTTGAAGAATTAGGTATTAAAGACAAACTTGTTTACTACCCTACCGTTACTCGTGAACCTTTCCATACTCAAGGCCGTGTAACAACTGCAATTGAAACTGGTGCTTTATTTGAAAAAATTGGTTTACCACGTTTCAACCGTGAAACTGACCGCGCAATGCTTTGTGGTAGCCCTGCATTCTTGAAAGATGTTGCTGCGTTACTTGACCAACACGGTTTAGTTGAATCACCTCGTATGGGTGAAATGGGCGACTATGTCATTGAACGTGCGTTCGTAGAAAAATAAGATTTTTTCTAATTAAAAAACCGAGGCAAAGTCCTCGGTTTTTTATTTCTGTTTTTACAACTTAATCGTACCGTCGATACAAGTAACAGCAGCTCCACCCACTAAAATTTTATCTTGATGTAATTCAAGTTGAAGCTGTCCTTCACGCCCTAAAGCTTGCCCCTGAGAAGAAAGCACCACATCATTTTGCGCAGGCAAAATACCATGGTAACGAATGAAAGATGCCACGCTACCATTACCGCTACCACAAACAGGATCTTCGTAAACTCCATATGCCGGAGCAAATGAACGAACTTCTATGCGCTTTTGCTCATTACTTTCTTCATAAAATCCATAAATTGTAGAGCCTGTTACTTTCATATCTAAACTAAATTGCTTTAAAGCGTTTAGATCAGGCTGACTTGCCAAAACAGCCTCAGCATTAACAGCTTGCAATACAACCCAGCGGGCTCCGACATCTACCAATGCGGCATTCCATTGAGTATTGATTTTACATTTTAAAAACTCGGCCAATTTCTCGGTTTGTAGTGCATCTAATGGTGTAATTTTAGGTTTAGGTAACTCAAAGGAAATATGATTTGAGTCATTCACAGTCAGCGTTACTAAACCAGCAGCGCACTGCTGTACCAGCTGACCTTCTTTCGCTTTAATTAGGCCTGCCTCAAGCAAAGCATAGGCTGTACCAATGGTAGGGTGTCCTGCAAACGGCAACTCACTTTGTGGAGTAAAGATTCGAACCTGATAGTCAGCTTGTGAATCAGTGGCTGGCAATACAAATGTGGTTTCAGAAAGATTGGTCCAGTTCGCAATGGCTTGCATCTGCTCAGACGTTAAGGTACTGGCGTCCATAATGACCGCAACAGGGTTTCCTTTAAATGCTTGTGAAGTAAAAACATCAACTTGTTTAAATGCAACAACAGACATAGACCACTCCTACTGATTTTGTAATTTAAAATATGGCTTTAAATCCTCACCATTTTTTGATCTTACTGTTTTATTTTTAATGGTCACAGTATCAGTTAATATGAAAAATAATAGACACAGTTTTTAAAACTCAATCCTCCATTAAAAGCATTAATCTAAATTAATCACAATGTTTGAGATAAATATGAGATCACTATAAAGTGTATCCATTGCTTTTGCTTTTTAATAAATTGATATGTACAAATATAAAAAAGTGAGTGATGACCTTACTCTTCAAATTCAGAATGGCAGGCAACCTGTGGGTTCTCGGTTGCCATCAATTCGAGACTGTGCCCAACATTATCAAGTTAGTATTAACACCGTAAAAGAAGCTTATCGGAAGCTTGAAGACCAAGGTTTAATTTCTGTTCGTCCACAGTCTGGCTACTATGTTTGTCATGCACCTTCAAACTTGCCAGATCTTGAGGAGCGTTATATCAGTGAAGAAAAAGTGCCCCTTTCAGGAATTAGCTGTTTTCTCGCGCAAATTGTTAAAAAGCAGATGGACCCCGACTATGTCAATTTGGCCCTAGCTTGCCCATCTGGTGAAAACTTCTACCCGATTGAACGCTTAAAACGTTTAACTGCTCAGGTTTTACGAACACAGCCGGATATTTTTAAAAGCTATACTTTACCGCCCGGCTCTATACGTTTACGTACTCAAATTGCGAGGCGAAGTTTACAGCTTGGTATGTTTCTATCCGCAGATAACATTGTGCTGACTCATGGCACTATGGAGGCTTTAAATCTTGCAATTATGGCAACCACCCAAGCAGGTGACAGCATAGCGCTTGAGATTCCTACTTTTCATAACTTATATCCACTTCTTCAGAATTTAGGACGAAAAATTGTAGAAGTGCCGACTTCGCCGCATACAGGGATGTGTCTAGACGCACTTGAAGAACTCTTAAAATCTCAAAGCGTACAAGCCATATTAACTATTCCAACAGGACATAATCCTCTTGGTTTTAGCATGCTTGAAAACAACCGACGTCGTTTAGCCGAACTCGCTAATCAATTCCAAATTCCTGTTATTGAAGATGCGATGTATGCCGAATTACAACTCACCGAACCTCTACTACCCAACATTAAGGCATTTGACCAAAATGGATGGGTTTTGGTTTGTGGCAGCTACACAAAAACTGTGGCACCCGACTATCGAATTGGTTGGCTAGAAGCTGGACGCTTCCGTAATATTGCCCAGCAGCTTAAATTTACAACCACTGTTGCCGAGCCAGCTTTACTCACAGAAACGTTAGGACTTTTTTTAGAAAATGGTGGATATGATCTACATTTACGTCAGCTCAAAAAACGCTATCAACAACAAATTGACACCATCAAATCTTATATTTGCCGTTATTTTCCAGTCGGTACTCGAGTCAGTCGTCCACAAGCGGGATTTATTTTATGGTTAGAGCTACCCGAATCAATTGATACCCTAGAACTGTTTCATCAGGCCATGGATGAAAAAATCTTATGTATGCCGGGAATTTTGTGCTCGGCTGATAAACGTTTTAGTCATTGTTTACGTATTGCAGCTTGTTTTGAGTTAAATCCTAAAATGTTAAATGCTTTGATGCGTTTAGGAGAGTTAGCAAAAAATATGCTACCTGTACAAAAAGATATAGATCAAATCCCTACTAATTCAGTAGGTTGAATCGAAAATATAGAGTTAATAAAATAAAACCATATATTTTTTATGCCTTTTATTTTATGAAAACCGAACTTCTCTCTCCCGCAGGTTCACTTAAAAACATGCGCTATGCATTTGCCTATGGTGCAGATGCCGTATATGCAGGACAACCACGTTATAGCTTACGTGTACGTAATAATGCTTTTGACCATGAAAATTTAAAAATCGGAATTGATGAAGCGCATGCTTTGGGTAAAAAGTTTTATGTTGTGGCGAATATTCAGCCCCATAACAGCAAATTAAAAAACTTTATTCGTGATCTTGAGCCGATTGTGGCTATGCAGCCAGATGCTTTGATTATGTCTGATCCCGGCTTAATTATGATGGTGCGTGAGCATTTTCCAGAAATGCAAATTCATCTATCGGTTCAAGCCAACGCTATTAACTGGGCCACTGTTAAATTTTGGAAAGACTACGGCCTAAGTCGTGTGATTTTATCTCGTGAATTATCTTTAGAAGAAATAGAAGAAATCCAGCAACACGTACCAGATATTGAACTCGAAGTTTTTGTACATGGCGCTCTATGCATGGCCTACTCAGGCCGCTGTTTACTTTCTGGATATATGAACAAGCGTGATGCCAACCAAGGTGCTTGTACCAATGCTTGCCGTTGGGACTATAAACTGCATGAAGCTCAAGAAGATTTAAACGGCGATGTAATTCCAGTCACTCAACTAAATACACCAGAAAAGTCTTGCTGCTCATCAGGACAATCAGAAACAACCTCGGT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>CP030106|1496128:1551765|1538707_1538926_-|AXB15313.1|DBSCAN-SWA MSCMLTLEEIEIKRQELERHLEDVMSVELKKWQSENKLCVSDVNIRLANVNSLGGTKHNVVTGVSVDLDYKP |
62 | Acinetobacter_phage(86.84%) | transposase,terminase,head,capsid,tRNA,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1555071 : 1680527
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP030106|1555071:1680527|DBSCAN-SWA TTCATATAGTTTTACAGTGTATGTTTTCATTTGAACCTCCATTTTGTCTTAATCTTTTATCATGACCTAATAAATAAAATCTAGCGCAACTCACCATAATTGCGACCTGAGCTTTAGATTGGTTTGTTTCTTGAGCAACCTTCAACAATCCTTTATTTTCAACCTTATTTTTAATTAAACAAATTAATGCAAACTTAGTTGTAAAATCTGTTTTATCAGAATTTAATAGACTTCGTAAAAGTGCTTGAATTTGATCCGCCTCATAATCACTGATCTCACATCGAATATAAGATTTACTTTTTTGTACTTCTTTGCCAGCTTCACGCATCAACCAGTAAATTTGATTGATATGAAGCCCATCTGGCAAATCACCCCCTTTCATTCTAACTGTTTCACACCATGCGCCAAACTGCTCTAACCAACCGTCAATAGTATATTTAGACCAATCCATTTGTTGTGTTTTTAAAACTGCACTCATTTTTCACCTACCAATTGCTCAATTTGTTTAATCGCCACGCCTGCTTTCACTTGCTCTGTGCTGAACCGTAAAACTGTAAAACCCATCATTGCTGCGGAGTTGTATTTCTCCATATCCCCTAAATAGCCCTTGCCTCTTGTGTGACGTCCATTGCTGAATGCACCGCCTTCCACTTCAACTAGGATCATGTATCCTTCAATTCGAAAGTCAGCCTTCCAACGACGCTCGGGATGGAATCTAAACTCCTGCTCATAAGCGATCTTCATCACATCTAGCTGACGGCAAAGCATTGCTTCGCCCTTGCTAACACCTTGTCTATGCTTCAATGGCACGCTAGAACGCGCCACTGGTTTTGATCTAATGCGTTGTGAGTCTTTGAATGTGGTCATTTGTCACGCTCCCAAAACTTTGGTTGTCCTAGTCTTTTCCATTCTTCATAGTGAGCTGGGCAAACATGCACATCATCAACAAAGTTGCCGTCTTCATCCTTCATTGGCACTTGCTCTGCAATCTTGTATGCATGAACATTGCAAAGCACACCATCACAAGTTTTTCCATTAACTGGATAATCGCAAAGCCAACTGCCTTCTTTCAGAATCGTTTCAGAGCAAACATTGCAGCAATATGGCGCAATGAACTTTGGTGACAAGGTAGTCCAGACATAATGATTTCTTTGGTCTAGGTAAGTTATTGGCATCCTTCCCCCTTGAGCGCTTGCTCTAACTGCGCTGCACAGTGGTAACACCCTTCTTCATAACCTTCTGTCCAATGAGTGGTTTTATCAAAAGCAATTTCATTCCATGATTCGATTAGTTTTAGTGCCGCATCCACCCGCTTTTGCAGCTCGTCACTTTTCTGGACTTCTTTCACATACATTTCATCAAGCGTTTCCGATACAAATATGTATTCACTTAATTGCTTTTGCAGCTCCTCCACTTTCGCTTGCTGGTGCTGCCATGCATTGGCCCATGCTTCCCACTTTTCGTTAAATGACTCCAAGTACATTGCATCAATTCTTCTTGAACCATTTGAAACATATCTTCCAAATTTCCCAAGAGTCATATCAAAGTCGACATCTGCTCTAAATAGCCCAATCCAGTACTTTTGCTTCTCAAACTCTTCTCTACACTTATCCATTCTTCACCCCAATCTATTGAGCTTGTCAGCCTCGTTAATGTGCGCCTCAGTTACTTTGCAGTTAGGCGAAATGTGGTTTTCTGGCTTGTCTAGGATTTCTAATTCCCTTGAATTCGAGGGTTTATCAATGCGGTGGCCTGCTTCAATGTCATCTTCTGACGCAGGTTTTAACGCAGCCAGGCTTACTAAGCTCCATCGGCCTTGTGATTCAACTACAGCATCACCGTCTTCAATCTGAATAAATTTCATTAAGCAAGGTGGCAGTAAACGGCAATATGGCTTTGAAGTATCAAAGACAACCCAGTCACCACGTTCAAACTCTTTAAAATCACGCATGGCTGGCTCCTTTTAAACTTGGCAATTGATCAATAAACTCCAAAGCTTCTTCAAGGCTCTCTGCATACCCAACATCGAGTTGTGGCTCACAATCAGGGTCCGCATCTAAGAGTTTGTTTTCAGTATCGGCGTCTATGTCAATAAAGTAAGCACCACCACCACCATAACAATCAGACATGTATTCCCAATGAACTTCTGCGGGAATCCCTTTCTTCTTGAGTTCTGATCTAATTTTTCTACTACTCACGGAATCACCTTTATATTTTTCATAAGCCAATTAGAAGCTGCCGGATGTTTCCAAGCGCCTAGTTCTTCGTACCAACACATTAGATTGCCGCTTTCTATTTTGAAGAATCTTGTTTGACCACCCAACGAAGTAAAGAAGTGTGTAGCGCCATCTGGAGTGTCTTTTTTATTACTCATCCCCGCCTCCGTATATTGATTCGTGGTCTTTGATTGCTTGCTTCAAACGATCTGATTTGTAACCATCTGGAACATATGCTTTTGCACCTTGTAAGCCACCAAGCTTCTTGACCAAATCCAAAGACTCTATGAGGCGATTGACCACATCACGCTCAAATACACGTTCGCCATGGTGAGGCTTGATTTCATCTGTAAAATCAATTTCACCTTCATGAACCACCAAATACTTAGCAGTGTTGACAAATGACATTGATATTCTGAAAGTGTTAGGCCCAAACTCACGAATAAACTGTTCTGGTTTCATACCGCCTCCTTGTAACGTTTAGTAATGGCTTCCTGCTTAAGCTGGTCTAGCATTTTCAGCTTTCTTAATTTCTCGTATAGGTTCGCTGCTGCTCTTGTTTCTTCATTACGAGTACCGAGGTTGTACGCTCTGCGCAGCTTCATCATTGAGGTGTAATCTACAAATTCGTTCATGCTTTCAGCTCCCCTTTAACATTCAGGATGTCTTTTGCGTATTGCGTAGCCTTGTAGGTTGCATATGAATCTTTTTCTAGGTACCCACTTTTGATTAGCTCTTGGACATAGCATTGAATAGTGTTGTTAGGTGCATCTAACACATAGTCACGTAAATCCTTCATTGTGAAAGGCTCAGTCGCATGCGTTGCGAACAACAAAATGTCAAAAATGTTTTGGAACGCGATTACTCTTTGTTTTGGATTCACGCCGCACCTCTCTCTTCCACTGGGAATGACATCCCAACGAAACGGCAAATATCTAAACGGTCTTGAACATTCACAGATCCACGCTTGCCATGACGGTTTTTGGCAATAATTAACTCGGTTACACCAGTTGGCGCATTAGTCTCTTTTTCGAGGATTGGATGAACCATGATGATTTGGTCTGCATCCTGTTCAATCTGTCCAGAATCCTTAAGATCACTTGCTACTGGCTTGTGTCCTTCTGCTCCACGGTTAAGTTGAGCCAATGCAATTACTGGACAATCAAACTCTTTAGCCATGGCTTTTAAATCACGGCTAATTGATGCAACTTCCTGAACACGGTCTTTTTTAGATGGGTCACGAATTAAGCCCAAGTAGTCCACAATGATGCAGCCTAGAGCCTTGTATTTGCGTTTTGCTTTACGCGCATAGCTTTGGATTTCAGAAATTGTTGGCTTCTGCTTCTCTTCAATAAAAATTGGAAGGTTGCGGAACTGAGCTATCGTGGCAGTAAGCTTTTCAAACATCCCGTCATAAATTTCCCCATTGTGCAGATTGTTATATGGGATATGCCCTAATGCTGAGATCATGCGGTTGGTTAGGGTTGGCGTATCCATCTCAGCAGAGATAAATAAAACAGGAATGTTGTAGCGCTTAGCAGTTTGCATTGCACACATCTGCGCGAGTGTTGACTTGCCACTACCCGGACGACCACCAATTACGCAAAAATGTCCTTTCTCGATTGTGCCAAGAAGGTTATCAAGATGAGGAATATTGAACTGGACACCTATGAAGCCCTTTTGTTCCTTCTGGGCAATCTTTTTCTCAAATCGCTCAAGTGTCTTTTCTAAAGCTTGGTTAAAATCAAAGCCTGTTTGCTTTTGCTCAATTGAATTACTAGACGAACTAAATAAATTCTCAGCAGCTAAGTAAACATCAGTAATGGTCAAATCTTTAGCGCACTCTGCAATCGAGAGACCAATATTTTCAACTTCACGATGCTGCTTAAGTTTATTCAACTCAGCAACAAAATATTCCAGGTGGTGTACGCTACCAACTGCACTGTTAAGTTCAATTAAATACTCTTCTCCACCAATGTCATTGAGAAGATTTCGCTCTTGTAGATGCTTGCAGACAAATACTGAGTCATATGGCTTATCAGCATTAGCAAGCTCAACAATTGCCTTGTAAATAATCTTGTGACGACCAGCGTAAAAATGTTCTTCGGTAAGATCATTTGCGACAACCTCTAGGGAATGGCTCACTGTCATCAATGCGACTAGCACACTCTGCTCAATTGTCATATTTTGAATGTTTGTACTCATTACCAGTCTCCATATTGCAATTGGGCATTAGAGAAATCAGGAGCTACCACAGAGCTGTTGACCTGAAACCAATACTCGTTTTCCCATTGTTTTTGGTTTAACCAAGTGCTAGGTGATGGAATGAACTCACCATCCTGCTTTGTCCAAGAGACATCAGATTTTTGTTTTTCAAGAATTGAAAGAAGTGTTTCAATCGCAAAACTTCCTTCATGCTTTGTGAAAGTTTTATAAGTGCCAGACTTGTCTGATTTACGTTTACAAGTTGGATATGCAGACCAGAACTTCTCAAAGTTTTCTGAGTAACCCACCCCTTGTTTTTCTTTGTTTTTATTATTGTTATTGTGTGGCGAATTTTTAGTATGGTTTGATACTAAATTTTCGTATGGTTCCGTACTATTTTTTAGCATAGCTAAATTTTCGCTAGGCGAATTTTTAGTATGGTTTTCAGTGGTAATTATCTGGTCAGTTAGAGACCATTCATTAATTTGTTTGTCAGTTTCAAGGCGGATAATTACACCCATCTCTTCCAAAATTAATAGGCCTTTTTGTACAGTATCCTTGTTGTATCCAGTTGCTTTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP030106|1555071:1680527|1576210_1576663_+|AXB15370.1|DBSCAN-SWA MKSIGEWFDEYSESHQNPINKKIHWVCVPAILFSIIGIIAHFSALLTALLVVLTLIFYARLDLVLAVAMAALLVVMAWLIYVLPVGVGFYIALFVFAWIGQFYGHKVEGKKPSFFKDLQFLLIGPVWCMDAYLAKILPHWKSRQKKLIAQ >CP030106|1555071:1680527|1665721_1666306_+|AXB15464.1|DBSCAN-SWA MLLMIDNYDSFTYNIVQYFGELNQEVKVVRNDQITLEDIERWQPKYLVIGPGPCSPSEAGISIPAINHFAGKIPLLGVCLGHQSIGQAFGGKIVRAKTVMHGRLSDMYHSNKGIFSNLPSPFSATRYHSLVIDQETLPDCLEVTCWTNEADGSMEEIMGVKHKTLPVEGVQFHPESILSQHGHQIFKNFLDIYA >CP030106|1555071:1680527|1592295_1592679_+|AXB15384.1|DBSCAN-SWA MSKQDYENGLKVRTEVMGEAFVKRAQENTVPFTQPLQDWINEHAWGSTWQREGVLPRKYRSLITLAMLTALKSPTELKGHVRGALNNGCTVEEIQETLLHSLPYCGAPATQEAFRAALEVIQEYQQQ >CP030106|1555071:1680527|1555933_1556245_-|AXB15338.1|DBSCAN-SWA MPITYLDQRNHYVWTTLSPKFIAPYCCNVCSETILKEGSWLCDYPVNGKTCDGVLCNVHAYKIAEQVPMKDEDGNFVDDVHVCPAHYEEWKRLGQPKFWERDK >CP030106|1555071:1680527|1646955_1648383_-|AXB15429.1|terminase|DBSCAN-SWA 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MRYAARRKQDISVSTTPLEVVIPLEQPVKIYSAKELAAMPLSVMNAAIEAQERFYQLEELTHMGGQAIAVRRLMEDGHKLIQVKEKSRIRYKINNEFIPPRIIRQLEMRGLVKLGAVTDV >CP030106|1555071:1680527|1673327_1674134_+|AXB15467.1|DBSCAN-SWA MINIQNTILGKIVDRKHEELAARLKQRNLQDVEELAKAATPVRGFANALQHKRPGVIAEIKKASPSKGIIRADFNPAEIAQQYEQAGAACLSVLTDVDFFQGADENIAIARNHCALPALRKDFLVDPYNVVEARALHADCILLIVACLSDQQLEEMSKTAFEHQLDVLVEVHDEEELERALKLSEQCLLGVNNRNLKTFDVDLNTTIRLKKLLPASRLLITESGIATPDDVRMMQEHDIHSFLVGESFMKQPRPDQAFTALFGQPQTV >CP030106|1555071:1680527|1577833_1578658_-|AXB15373.1|DBSCAN-SWA MHREQADYLHLRELGGLELLKAHYHQTQFSKHTHEGYCIGVIEEGAQSFFRTGQLHVAPKGDIILVNADEIHTGSSAVESGWRYRAIYPTPEMLAEVSQDFFEQGHGAPWFPQAVIQDLGLSQQLCLLFDLLEQKDNFLLKETMYLSTLACLMVRHGKSRHTFCELPEAYSKVLKVKDLLADMPEKNFSLQELADMVGLSAWHFLRQFKKHVGLPPHAWLVQARLQKARQLLKQGVQIVMVAQQCGFSDQSHFNRHFKKAMGVTPTQYVASLNL >CP030106|1555071:1680527|1639957_1640371_-|AXB15420.1|DBSCAN-SWA MQVLMALAYHFTGHDMGLRDEIQADIAEAFNEDLADAVQTFTCDRVVSTNWNPKTNTSENVIEHYEGRGVLFGSYNQYEIQTLGVLATDKKATVLQNEVTKEPMIDDEWSTAQGTYRIMHIKQDPISASWKCQLRKV >CP030106|1555071:1680527|1619398_1619788_-|AXB15404.1|DBSCAN-SWA MEPLSTSSITAFLKFYGVAIAVTLSISLVAAVVLMTRMPRSPQEWAVGLICTVVSSLCGGSFIIVKWGLHEWVTDIWGMIAIGGFFFVCGLPGWAIVRWTFNFIDKQEGKTIFEVIKAFKKAKDEIKNS >CP030106|1555071:1680527|1556688_1557021_-|AXB15340.1|DBSCAN-SWA MRDFKEFERGDWVVFDTSKPYCRLLPPCLMKFIQIEDGDAVVESQGRWSLVSLAALKPASEDDIEAGHRIDKPSNSRELEILDKPENHISPNCKVTEAHINEADKLNRLG >CP030106|1555071:1680527|1638804_1639203_-|AXB15418.1|DBSCAN-SWA MPMTLEQARQAIVDRMMAFTGISQERIHYPNAPGFLAPAKGLWCRLTIKWGPSFIAGLADTPCTRRTGNILIQCFARPDTGDQAITILSVALLSHFEYFRIGHLECFQGQTIDAGKDADFLQYNVTIGFTVN >CP030106|1555071:1680527|1665001_1665337_+|AXB15462.1|DBSCAN-SWA MKYQIQPTQVPDDLNSCWFHPDIELHDTIGEHAEFYTKEQWAQLQKNLGVSIKIENLDYWDIEEIPEDNLSDWSNWKPQPPQEGLFLIAAFDSENGPVLWWANPKAESKEE >CP030106|1555071:1680527|1674849_1675833_-|AXB15469.1|DBSCAN-SWA MQHLQWWTDFVAWQADALPMVLVTVVRADGSTPREVGATMLLRFNLQQQWQQSDTIGGGHLEFQAIDIAKAMLKESETCVRRIERFNLSARLGQCCGGVMWLLFEKILPAEIASDLSGSLQAWRAGKHIWRNVSYQYASTWQTMDMEQQPSFEFHSGSSEEWQFSQQIQPNTMQVLICGAGHVAEAIVRCLLPIGVRVKWIDPRDDIFPSDLLEQAYCITTDTLDAEIEHFDRSGAVLILTHDHQLDLQLCFTALKPTAKPFAYVGMIGSKSKRAIFEKRMQVRGYTSETLQRLVCPIGIDGISSKQPAMIAIAVVAQLLQVFDVKK >CP030106|1555071:1680527|1562692_1563007_-|AXB15352.1|DBSCAN-SWA MKLENIVIIENRLFQYSTQIYFENFPFDGDEFYVPVGDYTKPIGFLKFKQIAKPGCFELSELVSLDYPSPNPQFSLSGVLYSRQKAIEAHQSICAYQQAVNRLP >CP030106|1555071:1680527|1657484_1657736_-|AXB15447.1|DBSCAN-SWA MNDAQLIDKLGGVTAVARLLGIAPSSVSGWKAIPLDRKIRLAVIAEDLGLTTRKELFPDNYQDIWIELRPQTTKSKNLGSLTA >CP030106|1555071:1680527|1602089_1603328_+|AXB15390.1|tRNA|DBSCAN-SWA 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MNFNQLQIALWTLVRKEVRRFLRIWPQTLLPPAITMSLYFVIFGNLVGSRIGEMGGVSYMQFIVPGLIMMAVITNSYANVSSSFFSVKFQKSIEELIMSPVPLHIILWGYVIGGICRGVLVGAIVTAMSMFFTDLFIHNWFVTIYTVLITSVLFSLGGFINAVYAKSFDDISIIPTFVLTPLTYLGGVFYAISALGPFWQKLSLINPIVYMVNAFRFGILGHSDVNVSFSLIIVTLCCAVLYGIAYYLLARGSGMRE >CP030106|1555071:1680527|1639204_1639573_-|AXB15419.1|DBSCAN-SWA MGWKGKKPSSFSLDVSKAAEDHVKHIVMDTVQSLVNLSPVDTGAYRASHMVSVGSGDYGIRGPETNAIQDAAIQAVKFKLGNLVYIQNNQPYAERLENGWSDQAPLGIYSTTFTYITQKYGG >CP030106|1555071:1680527|1607350_1607551_-|AXB15394.1|DBSCAN-SWA MSQQSVEKKSVPWLLMGLGLLIPFLIIGILFLAAKSDAQNKKQYEQQRLEMEKRIAEKEAANSDKK >CP030106|1555071:1680527|1592717_1593254_-|AXB15385.1|DBSCAN-SWA MALNIPESLATLEANCGLFAVWMVLQHHGVQIDVAELIKVCRYDDEGTYTIALAVALKKLGFEVSFHSDHDPNISSSERMSYKEAKVLRIPTGPALSYQDIQTETQNGKMVIVYYDTLEGVGNQSLIYSIDQNEICFFDSFEPMSAAVFENQRKAEGICRQTVVIGDRNLNIHSTKLN >CP030106|1555071:1680527|1605650_1606277_+|AXB15392.1|DBSCAN-SWA MTTITLPALPYGYDDLAPHISKETLEYHHDKHHNTYVVNLNNLIKGTDLEGKTLEEIIKATAGDASKAGIFNNAAQVWNHTFYWNSMKPNGGGKPTGAIAAKIDEAFGSYEKFAEEFTAAATTQFGSGWAWLVADEVNGKLSITKTSNADTPLAHGQIAVLTIDVWEHAYYIDFRNLRPKYIATFLENLVNWDYANAKLAGQPAGVEK >CP030106|1555071:1680527|1674143_1674839_+|AXB15468.1|DBSCAN-SWA MSNKDSSLSKEQQKLLKQFKKQISNPHSSKIANQPESKKSQAESEELEDTHLFKQAVAGVKPINNSNIADVKTPRAKKVDAQTLAKRAAAEGGRDTEHAELSDTQAALNPVASQATLSYRIATLQHKVFEDLKAGKMRWFEAVDLHGCTIEQARDAVLQIIQMAKDENQNVIKIVHGKGPEAVLKTYVNGWLRQHRDVLAFVSAPENQGGTGAVLVLLKRAEKNPKFEQKK >CP030106|1555071:1680527|1662994_1663954_+|AXB15458.1|DBSCAN-SWA MTNLITAQEAFAALQKGKNILCRPSGDMLDFADLSEFPATVFAMSGYEYCIKPELIELAGITFTKPLTIDEYEEGQDVFVITTYSPSIYVVNFKTTALIDSINCGFVQRDAENAKLQLKALSKALGFEVSDDLSVIRLGDEKKKQRGKKSKAEKSIEVISAEIQPTIVITEQTNVTTSEDLLVPETNEPKVDPEYQQTLDTLLQRVKESKTPAEVNAVYRYTRTWDDEQMKPILLATHKRLEELEKEKASANEPPSLMVQIQTAPDLTTPDALEIDVAARDPQIQSRLMDFVKKRRFELENPAVSQPEADPDYLLVDGF >CP030106|1555071:1680527|1660607_1661048_+|AXB15453.1|DBSCAN-SWA 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146 | Acinetobacter_phage(80.43%) | integrase,terminase,head,capsid,tRNA,tail | attL 1563495:1563550|attR 1660410:1660465 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2269892 : 2333499
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP030106|2269892:2333499|DBSCAN-SWA 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73 | uncultured_Caudovirales_phage(28.57%) | integrase,plate,terminase,portal,holin,capsid,tRNA,tail | attL 2275423:2275438|attR 2322040:2322055 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
3100146 : 3153103
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP030106|3100146:3153103|DBSCAN-SWA 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>CP030106|3100146:3153103|3133656_3135054_-|AXB16696.1|DBSCAN-SWA MKKMLMALSLTGALLGGTAAWAEETVTTPTSEVTATSTSEAPATIAAAPAAEETLAAPTPTAKLDTGDTSWILISTALVLLMTIPGLALFYGGMVRKKNVLSTMMFSLSAAILVSLLWVIAGYSIAFSGTGAYFGDLSKAMLNGVAFDALSGTIPESLFVIFQMTFAIITVAILSGSIADRMKYSAFMAFIAIWVLVVYAPITHWVWAADGWLFKAGALDFAGGTVVHINSGVAGLVAAYMLGKRIGLGRESMAPHNLTLTVIGASLLWVGWFGFNGGSALGAGARASMAILVTQVAAAAAAFSWLVVERMIRGKASVLGGASGAVAGLVVITPAAGFVGVGGALVMGLIGGVVCFWGITALKRLLKADDALDAFGLHAVGGIVGAILTGVFYSDEIIKAANVALAPTFAGQLWVQVEGVLATMVYSGIATFIILKVIDLIIGLRVNSDDERMGLDLSQHGERIE >CP030106|3100146:3153103|3144609_3144993_-|AXB16707.1|DBSCAN-SWA MASPVFGPYCRQDRTARPRNAGGVRRDAPAQGVPGRFAVVQRDRHTAQLTNGGATMFNIALSRLLNAAYGPTRCLASVGAWVFGFYGCLILAMAMAAGQVAESFPVYGKPLALATGLVILRRLARRH >CP030106|3100146:3153103|3124700_3125771_-|AXB16686.1|DBSCAN-SWA MLARRIVAKYVTKTTALAMFGTTIVLSVLQILFTYLGELGELKPDYNAWQAFIYVLWGAPRYLYEILPISALIGAVIGLGALASNSELIVMRSVGISLWRIVGWVMRSALLLIVLSFALSEWVVPYTNEKAQSVKSHRSVAALGEVKGYWSREGQRFIYIDYANSQGNLRDIQVVDFNKDYHLQSLINAEQGKFIQDGQWTLQKASQMDILTDGNSILNNHDQQSLGLALQPKYVHMVTLDPEDLSPSQLISFMRYMDEYSQVPKTYQLAFWQKVASPFSLITLVLVACSFIFGPLRQQSMGFRLVIALFIGLGFYYLQDFLGYASLVYAPSPAWFVLMPIILMFGAGSYLLYRAR |
55 | Escherichia_phage(13.33%) | integrase,transposase,tRNA | attL 3103053:3103112|attR 3155356:3156175 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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