Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022608 | Staphylococcus aureus strain FORC_061 plasmid pFORC61_2, complete sequence | 0 crisprs | csa3,RT | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP022607 | Staphylococcus aureus strain FORC_061 chromosome, complete genome | 8 crisprs | cas3,DEDDh,DinG,csa3,WYL | 4 | 3 | 7 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022607_1 | 233280-233370 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022607_1
|
1 spacers
spacers of CP022607_1
>1.1|233313|25|CP022607|CRISPRCasFinder TTTCTTTTCGAAATTCTCTTTGTTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022607_1
The CRISPR arrays of CP022607_1 >merge|CP022607|1|233280-233370|CRISPRCasFinder GGGCCCACACCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTTTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAA >CP022607|1|1|233280-233370|CRISPRCasFinder GGGCCCACACCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA TTTCTTTTCGAAATTCTCTTTGTTG GGGCCCACACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAA
>CP022607.1|AXH26755.1|231046_232741_+|CDP-Glycerol:Poly(glycerophosphate)-glycerophosphotransferase MTKTKQAIHIDNIYWERVQLYIEGHSEGVDLTSGQFVLRNLTETKTLEANEMKIDGNTFICRFNVAILDDGYYLPMDKYLFVYHDQLEYIGQLNPNIIDQAYAALNEEQIEEYNELTTQNGKVNYLLAYDAKVFRKGGVSQHTVYTITPEIASDVNEFVFDIEITLPQEKSGVIATSAHWLHKQGHKASFESRSFLFKAIFNITKLLHIKRSKTILFTSDSRPNLSGNFKYVYDELLRQKVDFDYDIKTVFKANITDRRKWRDKFRLPYLLGKADYIFVDDFHPLIYTVRFRPSQEIIQVWHAVGAFKTVGFSRTGKKGGPFIDSLNHRSYTKAYVSSETDIPFYAEAFGIREENVVPTGVPRTDVLFDETYATQIKQEMEDELPIIKGKKVILFAPTFRGNGHGTAHYPFFKIDFERLARYCEKNNAVVLFKMHPFVKNRLNISREHRQYFIDVSDYREVNDILFVTDLLISDYSSLIYEYAVFKKPMIFYAFDLEDYITTRDFYEPYESFVPGKIVQSFDALMDALDNEDYEVEKVVPFLDKHFKYQDGRSSERLVKDLFRR >CP022607.1|AXH26754.1|229999_231025_+|Xylitol-dehydrogenase MINQVYQLVAPRQFDVTYNNVDIYGNHVIVRPLYLSICAADQRYYTGRRDENVLRKKLPMSLVHEAVGEVVFDSKGVFEKGTKVVMVPNTPTEQHHIIAENYLASSYFRSSGYDGFMQDYVVMAHDRIVPLPNDIDLSTISYTELVSVSYHAIQRFERKSIPLKTSFGIWGDGNLGYITAILLRKLYPEAKTYVFGKTDYKLSHFSFVDDIFTVNQIPDDLKIDHAFECVGGKGSQVALQQIVEHISPEGSIALLGVSELPVEVNTRLVLEKGLTLIGSSRSGSKDFEQVVDLYRKYPDIVEKLALLKGHEINVCTMQDIVQAFEKDLSTSWGKTVLKWTI >CP022607.1|AXH26753.1|229290_230007_+|ribitol-5-phosphate-cytidylyltransferase MIYAGILAGGIGSRMGNVPLPKQFLDIDNKPILIHTIEKFILVSEFNEIIIATPAQWISHTQDILKKYNITDQRVKVVAGGTDRNETIMNIIDHIRNVNGINNDDVIVTHDAVRPFLTQRIIKENIEVAAKYGAVDTVIEAIDTIVMSKDKQNIHSIPVRNEMYQGQTPQSFNIKLLQDSYRALSSEQKEILSDACKIIVESGHAVKLVRGELYNIKVTTPYDLKVANAIIQGDIADD >CP022607.1|AXH26752.1|227719_228763_+|Galactitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKALKLYGVEDLRYEDNEKPVIESANDVIIKVRATGICGSDTSRYKKMGPYIKGMPFGHEFSGVVDAIGSDVTHVNVGDKVTGCPAIACYQCGYCLKGEYARCEKLFVIGSYEPGSFAEYVKLPAQNVLKVPDNVDYIEAAMVEPSAVVAHGFYKSNIQPGMTVAVMGCGSIGLLAIQWARIFGAAHIIAIDIDAHKLDIATSLGAHQTINSKEENLEKFIENHYANQIDLAIESSGAKVTIGQILTLPKKGGEVVLLGIPYDDIEIDRVHFEKILRNELTVCGSWNCLSSNFPGKEWTATLHYMKTKDINVKPIISHFLPLEKGPETFDKLVNKKERFDKVMFTIY >CP022607.1|AXH26751.1|226492_227548_+|Galactitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKALVKTREGHGNLELLDKEVATPLDDKVKIKVHYAGICGTDIHTYEGHYKVNFPVTLGHEFSGEIVEVGADVKDFKVGDRVTSETTFYVCNECEYCKSKDYNLCNHRKGIGTQVDGAFTNYVIAREESLHHIPDEVSYQSAAMTEPLACAHHGVSKIQVNSGDVAVVMGPGPIGLLVAQVLKSKGATVVVTGLDNDKVRLDKAEALHMDYVVNLQQTDLKTYINGITDGYGADVVVECSGAVPAARQGLDILRKKGFYSQIGIFKDAEIPFDMEKVIQKEITVVGSRSQKPADWEPSLQLMADGLVNAEALVTKIYDISKWDEAYQHLKSGEGIKALLKPLDLDENEGEN >CP022607.1|AXH26750.1|225215_226475_+|PTS-system-galactitol-specific-IIC-component MSYFTDFVRGFLDLGATVILPVVIFLLGLFFRQKIGAAFRSGLTIGVAFVGIFLVIDLLVKNLGPAAQAMVKNLGVSLNVIDVGWPATSSIAWASSIAAFIIPLGIIVNVVLLVTKVTKTMNVDIWNFWHYTFTAAMVYAVSGSIWQALLAAVIFQVICLKVADWTAPMMSEFFDLPGVSIATGSTISYAPGIYLVKLLQKVPGLNKLDADPETIQKRFGAFGESIFVGLILGLGIGVLAGYKPGDIINLGMSMAAVMVLMPRMVKILMEGLMPVSESARTWLNKRFGEREIYIGLDAAVALGHPAVISTALILVPITVLLAVILPGNQVLPFGDLATIPFVVAFIVGAARGNIIHSVIVGTIMIAISLYIATDVAPIFTDMAKGTNVQMPKGSSEISSIDQGGNIVNYLIFKLFSLFN >CP022607.1|AXH26749.1|224710_224989_+|PTS-system-galactitol-specific-IIB-component MKQVLVACGAGIATSTVVNNAIEEMAKEHNIKVDIKQIKITEVGPYEDTADLLVTTAMTKKEYKFPVINARNFLTGIGIEETKQQILTELQK >CP022607.1|AXH26748.1|224220_224688_+|PTS-system-galactitol-specific-IIA-component MGQQLVHKENIMLNLSATDKESVLSQMSDVLFQNGFVKSTFKDAVIDREKEFATGLPTHLCSVAIPHTDVEHINHRTIGVAVLEKEVPFIEMGTLDQQTEVKIVFMLAMDKVDDQLKLLQQLMQIFQSEEKLEQILRTKDETILATLINDYLEYN >CP022607.1|AXH26747.1|222139_224236_+|Transcriptional-antiterminator MNGDNQQILREIVLNPTIHGKELESIFGLSRRQLGYRIQKINLWLEQEGYPKLERTSQGNFIVSSEIMTLFKRDVSEQQMLNGNNVIFSIETRRYYLMLMLFSKENAMSLNHFSIDLQVSKNTVIHDINHVKEQLEDHGLSLKYSRKHGYEIVGDEFEVRRFFIKLIDQRLNHDITKSEVLKALNLTFEDIAYQKDKIKQVEQFLKSRFIDKSLSSLPYVLCVIRRRIQSGHVMNPLNINYQYLRDTKEYQATEIMTQHEPDLPEAEKLYLTLHLLSTSVQWTDLQESDSISNLTMAIAQMIHHFEQITFINIEDKEKLSQQLLLHLTPAFYRIKYNLTDRDELINPLQGNYQSLFHMVKQSCQSLTEYFGKSLPDNEIAYLTMLFGGSLRRQDENFDGKIKAIIVCTQGTSVSQMMLYELRNLFPEIIFLDAISLRTFENYTLDYDIVFSPMFVLTHKKLFITKVALSENEQRKLRKEVMKYINKESADIDKEINKLMALIERTTTVNDITELRDGLEDFIANYNSISTINGSIVTQNKTLDLADLIPARHVKRIHHVENIDEAIAKASDVLVANHFIDIKYIHEMQQVFDDSYMVIMQNIAIPHAYSEKHVHKTAMSMLILQEPIYMSDGTAIHIIVPIAAVDKVTHLRALLQLRDVAQDNDAIKRIIQSRKNSDVNEILKNYSNKEARENGWDSN >CP022607.1|AXH26746.1|220866_221802_+|Inosine-uridine-preferring-nucleoside-hydrolase MKRKIIMDCDPGHDDAIALILAGAIDSPLEILAVTTVAGNQSVDKNTTNALNVLDIMGRQDIAVAKGADRPLIKPAAFASEIHGESGLDGPKLPSTPSRQAVAMPASDVIINKVMTSDTPVTIVATGPLTNVATALIREPRIAEHIESITLMGGGTFGNWTPTAEFNIWVDAEAAKRVFESGITINVFGLDVTHQVLADNHVIERFESINNPVAQFVVELLQFFKKTYKTHFNMDGGPIHDACTILYLLQPELFTMVPVNIDIEHQSPLTYGTMAVDLNHVTGKPANAYFATAVDVEEVWNLIDHKLRTYE >CP022607.1|AXH26756.1|233791_234961_+|CDP-glycerol:poly(glycerophosphate)-glycerophosphotransferase MIKTTIKKLIEHSIYTTFKLLSKLPNKNLIYFESFHGKQYSDNPKALYEYLTEHSDAQLIWGVKKGYEHIFQQHNVPYVTKFSMKWFLAMPRAKAWMINTRTPDWLYKSPRTTYLQTWHGTPLKKIGLDISNVKMLGTNTQNYQDGFKKESQRWDYLVSPNPYSTSIFQHAFHVSRDKILETGYPRNDKLSHKRNDTEYINGIKTRLNIPLDKKVIMYAPTWRDDEAIREGSYQFNVNFDIEALRQALDDDYVILLRMHYLVVTRIDEHDDFVKDVSDYEDISDLYLISDALVTDYSSVMFDFGVLKRPQIFYAYDLDKYGDELRGFYMDYKKELPGPIVENQTALIDALKQIDETTNEYIEARTVFYQKFCSLEDGHASQRICQTIFK >CP022607.1|AXH26757.1|235236_235953_+|2-C-methyl-D-erythritol-4-phosphate-cytidylyltransferase MKYAGILAGGIGSRMGNVPLPKQFLDLDNKPILIHTLEKFILINDFEKIIIATPQQWMTHTKDTLRKFKISDERIEVIQGGSDRNDTIMNIVKHIESTNGINDDDVIVTHDAVRPFLTHRIIKENIQAALEYGAVDTVIDAIDTIVTSKDNQTIDAIPVRNEMYQGQTPQSFNINLLKESYAQLSDEQKSILSDACKIIVETNKPVRLVKGELYNIKVTTPYDLKVANAIIRGGIADD >CP022607.1|AXH26758.1|235945_236971_+|Xylitol-dehydrogenase MINQVYQLVAPRQFEVTYNNVDIYSDYVIVRPLYMSICAADQRYYTGSRDENVLSQKLPMSLIHEGVGEVVFDSKGVFNKGTKVVMVPNTPTETDDVIAENYLKSSYFRSSGHDGFMQDFVLLNHDRAVPLPDDIDLSIISYTELVTVSLHAIRRFEKKSISNKNTFGIWGDGNLGYITAILLRKLYPESKIYVFGKTDYKLSHFSFVDDVFFINKIPEGLTFDHAFECVGGRGSQSAINQMIDYISPEGSIALLGVSEFPVEVNTRLVLEKGLTLIGSSRSGSKDFQDVVDLYIQYPDIVDKLALLKGQEFEIATINDLTEAFEADLSTSWGKTVLKWIM >CP022607.1|AXH26759.1|236992_238681_+|Putative-polyribitolphosphotransferase MVKSKIYIDKIYWERVQLFVEGHSENLDLEDSNFVLRNLTETRTMKANDVKIDGNQFVCRFNVAILDNGYYLPEDKYLLVNEQELDYIAQLNPDVINDAYQNLKPEQEEEYNELETQNGKINFLLQTYLKEFRKGGISKKTVYTVTPEISSDVNEFVLDVVVTTPEVKSIYIVRKYKELRKYFRKQSFNTRQFIFKAIFNTTKFFHLKKGNTVLFTSDSRPTMSGNFEYIYNEMLRQNLDKKYDIHTVFKANITDRRGIIDKFRLPYLLGKADYIFVDDFHPLIYTVRFRRSQEVIQVWHAVGAFKTVGFSRTGKKGGPFIDSLNHRSYTKAYVSSETDIPFYAEAFGIKEKNVVPTGVPRTDVLFDEAYATQIKQEMEDELPIIKGKKVILFAPTFRGSGHGTAHYPFFKIDLERLARYCEKNNAVVLFKMHPFVKNRLNIADKHKQYFVDVSDFREVNDILFITDLLISDYSSLIYEYAVFKKPMIFYAFDLEDYITTRDFYEPYESFVPGKIVQSFDALMDALDNEDYEGEKVIPFLDKHFKYQDGRSSERLVRNLFGS >CP022607.1|AXH26760.1|238713_240435_+|putative-glycosyl-transferase MMKFSVIVPTYNSEKYITELLNSLAKQDFPKTEFEVVVVDDCSTDQTLQIVEKYRNKLNLKVSQLETNSGGPGKPRNVALKQAEGEFVLFVDSDDYINKETLKDAAAFIDEHHSDVLLIKMKGVNGRGVPQSMFKETAPEVTLLNSRIIYTLSPTKIYRTTLLKDNDIYFPEELKSAEDQLFTMKAYLNANRISVLSDKAYYYATKREGEHMSSAYVSPEDFYEVMRLIAVEILNADLEEAHKDQILAEFLNRHFSFSRTNGFSLKVKLEDQPQWINALGDFIQAVPERVDALVMSKLRPLLHYARAKDIDNYRTVEESYRQGQYYRFDIVDGKLNIQFNEGEPYFEGIDIAKPKVKMTAFKFDNHKIVTELTLNEFMIGEGHYDVRLKLHSRNKKHTMYVPLSVNANKQYRFNIMLEDIKAYLPKEKIWDVFLEVQIGTEVFEVRVGNQRNKYAYTAETSALIHLNNDFYRLTPYFTKDFNNISLYFTAITLTDSISLKLKGKNKIILTGLDRGYVFEEGMASVVLKDDMIMGMLSQTSENEVEILLSKDIKKRDFKNIVKLNTAHMTYSLK >CP022607.1|AXH26761.1|240578_241253_+|Nitric-oxide-dependent-regulator-DnrN-or-NorA MINKNDIVADVVTDYPKAADIFRSVGIDFCCGGQVSIEAASLEKKNVDLNELLQRLNDVEQTNTPGSLNPKFLNVSSLIQYIQAAYHEPLREEFKNLTPYVTKLSKVHGPNHPYLVELKETYDTFKNGMLEHMQKEDDVDFPKLIKYEQGEVVDDINTVIDDLVSDHIATGQLLVKMSDLTSSYEPPIEACGTWRLVYQRLKALEVLTHEHVHLENHVLFKKVS >CP022607.1|AXH26762.1|241511_243251_+|Autolysis-histidine-kinase-LytS MLLLERVGLIIILAYVLMNIPYFKNLMNRRRTWKARWQLCIIFSLFALMSNLTGIVIDHQHSLSGSVYFRLDDDVSLANTRVLTIGVAGLVGGPFVGLFVGVISGIFRVYMGGADAQVYLISSIFIGIIAGYFGLQAQRRKRYPSIAKSAMIGIVMEMIQMLSILTFSHDKAYAVDLISLIALPMIIVNSVGTAIFMSIIISTLKQEEQMKAVQTHDVLQLMNQTLPYFKEGLNRESAQQIAMIIKNLMKVSAVAITSKNEILSHVGAGSDHHIPTNEILTSLSKDVLKSGKLKEVHTKEEIGCSHPNCPLRAAIVIPLEMHGSIVGTLKMYFTNPNDLTFVERQLAEGLANIFSSQIELGEAETQSKLLKDAEIKSLQAQVSPHFFFNSINTISALVRINSEKARELLLELSYFFRANLQGSKQHTITLDKELSQVRAYLSLEQARYPGRFNININVEDKYRDVLVPPFLIQILVENAIKHAFTNRKQGNDIDVSVIKETATHVRIIVQDNGQGISKDKMHLLGETSVESESGTGSALENLNLRLKGLFGKSAALQFESTSSGTTFWCVLPYERQEEE >CP022607.1|AXH26763.1|243253_243994_+|Autolysis-response-regulater-LytR MKALIIDDEPLARNELTYLLNEIGGFEEINEAENVKETLEALLINQYDIIFLDVNLMDENGIELGAKIQKMKEPPAIIFATAHDQYAVQAFELNATDYILKPFGQKRIEQAVNKVRATKAKDDNSASAIANDMSANFDQSLPVEIDDKIHMLKQQNIIGIGTHNGITTIHTTNHKYETTEPLNRYEKRLNPAYFIRIHRSYIINTKHIKEVQQWFNYTYMVILTNGVKMQVGRSFMKDFKASIGLL >CP022607.1|AXH26764.1|244112_244550_+|Antiholin-like-protein-LrgA MKQQKDASKPAHFFHQVIVIALVLFVSKIIESFMPIPMPASVIGLVLLFVLLCTGAVKLGEVEKVGTTLTNNIGLLFVPAGISVVNSLGVISQAPFLIIGLIIVSTILLLICTGYVTQIIMKVTSRSKGDKVTKKIKIEEAQAHD >CP022607.1|AXH26765.1|244542_245244_+|LrgA-associated-membrane-protein-LrgB MINHLALNTPYFGILLSVIPFFLATILFEKTNRFFLFAPLFVSMVFGVAFLYLTGIPYKTYKIGGDIIYFFLEPATICFAIPLYKKREVLVKHWHRIIGGIGIGTVVALLIILTFAKLAQFANDVILSMLPQAATTAIALPVSAGIGGIKELTSLAVILNGVIIYALGNKFLKLFRITNPIARGLALGTSGHTLGVAPAKELGPVEESMASIALVLVGVVVVAVVPVFVAIFF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022607_2 | 376696-376797 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022607_2
|
1 spacers
spacers of CP022607_2
>2.1|376719|56|CP022607|CRISPRCasFinder AAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022607_2
The CRISPR arrays of CP022607_2 >merge|CP022607|2|376696-376797|CRISPRCasFinder TTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTATATATGAATTGAGTATTAAATTTG >CP022607|2|2|376696-376797|CRISPRCasFinder TTATGAATTGAGTATTAAATTTG AAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTAT ATATGAATTGAGTATTAAATTTG
>CP022607.1|AXH26900.1|374447_375836_-|L-cystine-uptake-protein-TcyP MNAFLTLINIIVLVIFIVILHMMARKHISFAKRVFTALGIGIVFGVLLHLVYGTHSNVITSTSDWFNIVGQGYVALLQMIVMPLIFISIVAAFTKIQIGEKFAKIGSLIFIFLIGTVTIAAIVGVVYALVFGLDASTINLGNAEQARGSEIAKQAKDLTAHTLPQQILELLPKNPFLDFTGQRATSTIAVVIFASFIGFAYLRVARKQPDHGELLKSAIDAIYSLVMAIVTFVLRLTPYGVLAIMANTLSTSDFGAIWTLGKFLIASYAALITMYIIHLVILSLLGISPIRYVKKTLEVLIFAFTSRSSAGALPLNVQTQTRRLGVPEGIANFAATFGLSIGQNGCAGIYPAMLAIMVAPVANVEIDLQFIVTLIAVVIISSFGVAGVGGGATFASILVLSTLNLPVALAGVLISVEPLIDMGRTALNVNDSMLAGTGTAKLTKHWDKDTFESNDNAALTSH >CP022607.1|AXH26899.1|373612_374368_+|Nitroreductase MSEHVYNLVKKHHSVRKFKNKPLSEDVVKKLVEAGQSASTSSFLQAYSIIGIDDEKIKENLREVSGQPYVVENGYLFVFVIDYYRHHLVDQHAETDMENAYGSTEGLLVGAIDAALVAENIAVTAEDMGYGIVFLGSLRNDVERVREILDLPDYVFPVFGMAVGEPADDENGAAKPRLPFDHVFHHNKYHADKETQYAQMADYDQTISEYYDQRTNGNRKETWSQQIEMFLGNKARLDMLEQLQKSGLIQR >CP022607.1|AXH26898.1|372551_373121_-|Alkyl-hydroperoxide-reductase-protein-C MSLINKEILPFTAQAFDPKKDQFKEVTQEDLKGSWSVVCFYPADFSFVCPTELEDLQNQYEELQKLGVNVFSVSTDTHFVHKAWHDHSDAISKITYTMIGDPSQTITRNFDVLDEATGLAQRGTFIIDPDGVVQASEINADGIGRDASTLAHKIKAAQYVRKNPGEVCPAKWEEGAKTLQPGLDLVGKI >CP022607.1|AXH26897.1|371012_372536_-|Alkyl-hydroperoxide-reductase-protein-F MLNADLKQQLKQLLELMEGNVEFVASLGSDEKSKELKELLTEISDMSPRLSLSEKSLKRTPSFSVNRPGEETGVTFAGIPLGHEFNSLVLAILQVSGRAPKEKQSIIDQIKNLEGSFHFETFISLTCQKCPDVVQALNLMSVINPNITHSMIDGAVFREESENIMAVPAVFLNGEEFGNGRMTIQDILSKLGSTADASEFENKEPYDVLIVGGGPASGSAAIYTARKGLRTGIVADRIGGQVNDTAGIENFITVKETTGSEFSSNLAAHIDQYDIDAMTGIRATDIEKTDEAIKVTLENGAVLESKTVIIATGAGWRKLNIPGEEQLINKGVAFCPHCDGPLFENKDVAVIGGGNSGVEAAIDLAGIVNHVTLFEFASELKADNVLQDRLRSLSNVDIKTNAKTTEVVGEDHVTGIRYEDMSTGEEHLLNLDGIFVQIGLLPNTSWLKDAVELNERGEIVIDRNNNTNVPGIFAAGDVTDQKNKQIIISMGAGANAALNAFDYIIRN >CP022607.1|AXH26896.1|369278_370898_-|hypothetical-protein MLDVHFIYPGKLQNACEYFNLSTSKEGFEVTIHALRPENIHKIYHDMDNSEQRFIETLISKGNPVTIVNSRDVNMLKLTNHLGFVYQLNEDEFFVNNFFLRYINSEVLDNAYGEFESLDTINHMNLNEEVLRVRQHTRLNDVTLEHALLLKTNDELKTICRQYGIKGFSNKNKQNLVELIMTAFFNNNHIIEQVFSNATLFEFDILSSILESDDNYRLNNELTKFEKLQLINFDNFLTIHFYYYYDFEYDCLILPNDVRKHIENFVNQVGNGYFEKAVNQFVDEQTIENSLAEFKNALELSFMEDEVDLDMLLEDDDFEDFGTTDSLRSDAITQLISEIKKGLIDKKDILPLRIILGSVNLYGILSTNHLLYLLQRFYDATFSKEELQYSLDTLAGTELYYVEDDFVFHPVLFDVVESEASGIDISDDGYYVPASVEELIYYDRHHYLKSDQAIKEFTSYLRKQINMKNDIEKEKYVNEIIMLLRTIPTSKLIQPIMQLFIDNAILNNVQNDALLIEKATHARNHLRLWSLQGHRDIPN >CP022607.1|AXH26895.1|368579_369206_-|hypothetical-protein MKKRLLLSTFLASALILTGCASDQSDNEDHHTSTGIHAPKSAKKLETKDIFNSDKKNSDISDAEMKQAIEKYLSVNSDILDNKYIMQHKLDKQIDSQTKVTEKQAETLSHLSNLAVKNDLHFKKFVTENNIPKEYKKPVELMMNYFKALNSTIANVDEDIEKLSYQPQNKINVVDVPTKYAGDVNKKQQDKIKDFLKSKGIKSDVIDK >CP022607.1|AXH26894.1|367039_368359_+|Mobile-element-protein MCNDTLELLRIKDENIKYINQEIDVIIKGKKATVVNAVLTYKPSACYCCGVKNEGQIHKHGKRVSRITLLKTQGYNTYLNLAKQRFKCLECNGTFTAKTSIVDESCFISRCVTQKVIEEATKVKTEIDTAEDNCISPSTVSRIRTKAANSLRIKPFNCLPEHIAMDEFKSVKNVTGSMSFIFIDNDTHDVIDILENRTTRFLRAYFERFDLKNRQQVKTVTIDMYEPYVRLFRDLFPNAAIIFDRFHIVQHLNRELNKYRVQVMNEYRNKKGPNYTIFKNNWKVLLMDTSKTIFSKYRWNKSFKAYKRSSDIVEFMLSKDDILRHSYELVQGLRKDLRLCNWPKFINRLNSVSKKSVSKGVWKVVKYYRKHQRMLRNTIYYPAFNNGAIEGINNKIKLIKRISFGYRNFNNFKARIMMIFSLYKGEKKKTTKPNNGLAA >CP022607.1|AXH26893.1|366419_366803_-|hypothetical-protein MKVRITFIILSILSTIVCLFLAAMHPTGPSTVTFEQPYLFTLNIIIMVLVALPSLVLAIYDYMSFRISSAILQFLGAISWFFLSLILSLTQFTPFTLASFITSIILFTSTIITLAIGGKSVDKNDSH >CP022607.1|AXH26892.1|365772_366354_+|phosphoglycerate-mutase MTIYLVRHGESKSNYDNKHFRSYFCGQLDVPLTDTGTKSADDLCDYFKEKQIKHVYVSDLLRTQQTFEHIFPYDIASTTTPLLRERSLGVFEGEYKDEISANPKYEKYFNDPNFKDFRHSFSQKAPEGESYEDVYQRVEHFMNHVVNEDTQQDDIVIVAHQVVIRCLMVYFNNVSREEAVDLKVENCKPYIIE >CP022607.1|AXH26891.1|365385_365595_-|hypothetical-protein MTTQSFIFMNIILLDGATQRHPFFICQILAFLFPTSPHVNLLLFNPILPTFLNIIIHIDHFHANKKDDN >CP022607.1|AXH26901.1|376813_377770_-|hypothetical-protein MLTKEFAQRVELSEKQVRKIVQHLEERGYQLSKTEYRGREATDFKEEDIELFKDIADKVKQTNSYDLAFDELEKEKDFLQVIVKNDDKNLPTNQNVAQLVEDLRLEIQKMREERHLLGQMMNQVHQQQQELKELQNQLTSKIDSNSESLKAIQTSQEAIQEAQASQAKVLAESTNKVEKNAVTEDKADSKDSKVAGVTTSTDAKTDTKAENAGDGTATKVDKEDQISATEAIEKASVEQSKNENAAETSNKEATVDADAQHDAEQQVAEAHAEASKQATSNDSLEAKAENDSTASQSEMSEPKPQEEKKGFFARLFNL >CP022607.1|AXH26902.1|377887_378550_-|hypothetical-protein MEFKTIQSVKDPHYNEALKLYDTKLNLSLTEDKRIIKRSLENNKTENDYVFIVGLENDVVVSLATAHYEATTNSAFLIYLFAKDLPNHDELMTQTLHQIEHELNLLSNLVHSRSINFLMMEVPKEPADLTQDNGLIIEHRRQFLYEHQFERQTEIDYIHPTNDGHTKKVDLFLKKNIKLTKDIYGTSVKSNYILKYVFANGIAREIIYALLEEMDLRKPF >CP022607.1|AXH26903.1|378692_379100_-|hypothetical-protein MADITVVNDTGELYNVINQKKSEGYLESELTIISKSKLHLNDLHDSEISLISTSGTFSDRMTKLLTGEDGEHAVLSRYNLAPDELEKYKQLILDDKMLVVAVRDKSSHKEVQEHNSAYEEIDITHFAEASKGPKA >CP022607.1|AXH26904.1|379612_380191_+|Xanthine-phosphoribosyltransferase MELLGQKVKEDGVVIDEKILKVDGFLNHQIDAKLMNEVGRTFYEQFKDKGITKILTIEASGIAPAIMAALHFDVPCLFAKKAKPSTLTDGYYETSIHSFTKNKTSTVIVSKEFLSEEDTVLIIDDFLANGDASLGLYDIAQQANAKTAGIGIVVEKSFQNGHQRLEEAGLTVSSLCKVASLEGNKVTLVGEE >CP022607.1|AXH26905.1|380190_381459_+|Xanthine-permease MKNLILSVQHLLAMYAGAILVPIIVGTSLKFTPEQIAYLVTVDIFMCGVATFLQANKVTGTGLPIVLGCTFTAVAPMILIGQTKGIDVLYGSLFLSGILVIIIAPFFSHLVKFFPPVVTGSVVTIIGINLMPVAMNYLAGGQGAKDYGDVKNILLGLMTLIIILVLQRFTTGFIKSIAILIGLVLGTIGAGLLGMVDINQVNHAGWLGIPVPFRFSGFSFDVTSTLVFFIVAIVSLIESTGVYHALSEITGKKLERKDFRKGYTAEGLAIVLGSIFNSFPYTAYSQNVGLVSLSGAKKNNVIYGMVVLLIICGCIPKLGALANIIPLPVLGGAMIAMFGMVMAYGVSILGHIDFKNQNNLLIIAVSVGLGTGISAVPQAFKGLGEQFAWLTQNGIVLGAISAIILNFFFNGIKYKQTEENVK >CP022607.1|AXH26906.1|381496_382963_+|Inosine-5'-monophosphate-dehydrogenase MWESKFAKESLTFDDVLLIPAQSDILPKDVDLSVQLSDKVKLNIPVISAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVIHKNMGVEEQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEESVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKIVDVMTQENLITAPVNTTLEEAEKILQKHKIEKLPLVKDGRLEGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEHGRLLVAAAIGISKDTDIRAQKLVEAGVDVLVIDTAHGHSKGVIDQVKHIKKTYPEITLVAGNVATAEATKDLFEAGADIVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATEARKHGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEIFQGRQYKVYRGMGSLGAMEKGSNDRYFQEDKAPKKFVPEGIEGRTAYKGALQDTIYQLMGGVRAGMGYTGSHDLRELREEAQFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSF >CP022607.1|AXH26907.1|382987_384529_+|GMP-synthase MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISIEEIKKMNPKGIILSGGPNSVYEEGSFTIDPEIYNLGIPVLGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIINAKSDELFAGLPAEQTVWMSHSDKVIEIPEGFEVIADSPSTDYAAIEDKKRRIYGVQFHPEVRHTEYGNDLLNNFVRRVCDCKGQWTMENFIEIEIEKIRQRVGDRRVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVNAKDRFMNKLKGVSDPEQKRKIIGNEFVYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMEFELIEPINTLFKDEVRKLGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLEIVRESDAILRQVIREEGLEREIWQYFTVLPNIQSVGVMGDYRTYDHTVGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPSTIEWE >CP022607.1|AXH26908.1|385040_386147_+|hypothetical-protein MDKSLEINLKELESIMYKEKVIDVKEYDNLKVTFETLNDAPKSEIPTPFTIEQMLYKLETKNLYFPEIKSKEKCVELLHSVGYYNLKHFMYNEFGKDEPKNFDEVYILYKFDRYLLKQLFSLVNMLETHIRNIILEVYMLEIEYNNKPSTLFYLDKDLYFEKVNDEYKYSAKKLKEFNRLQNVFWRAIEKKKSNDNVKHNIKKYNIIPAWVLFQNFSFGDLSTFYRTTLPTYRNKVSKRIENLIEKNTGISIKLPEKLLCAWLNSIRFLRNRIAHTDIIYGINFTNTCAKHHSDEEMYVNIEKYKYQQRLVTFLLAMKKIFMSMPENNIIEWNETLTKIENKCSEHNFIKLSRLGVIENNLSYFKITK >CP022607.1|AXH26909.1|386941_387334_-|Genomic-island-nu-Sa-alpha2 MLEDNGDIRLLYQSIEELASVLGQSQFETKTVSLIFVQMDLRYSVFEKVQTDFMKYLAHKNSDEIKYIDLIKIIENALPEDKELSINVINSIIIGFANNYYPILQSLVPEIQSSYGITINKNFNIDSIDF >CP022607.1|AXH26910.1|387355_387502_-|Genomic-island-nu-Sa-alpha2 MKPLLKWSEVPANSVGDAVKRGAINAGLSKGDAGIISTVVKEAIAWLF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022607_3 | 776731-776808 | Unclear |
NA
Consensus repeat of CP022607_3
|
1 spacers
spacers of CP022607_3
>3.1|776754|32|CP022607|CRISPRCasFinder ACTTGCATTGTTTGTAGAATTTCTTTTCGAAA |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022607_3
The CRISPR arrays of CP022607_3 >merge|CP022607|3|776731-776808|CRISPRCasFinder TTCTTTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGTTTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTTTATGTTGGGGCCCCGCCA >CP022607|3|3|776731-776808|CRISPRCasFinder TTCTTTATGTTGGGGCCCCGCCA ACTTGCATTGTTTGTAGAATTTCTTTTCGAAA TTCTTTATGTTGGGGCCCCGCCA
>CP022607.1|AXH27255.1|773595_776442_+|Excinuclease-ABC-subunit-A MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNIDLSEQDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIEVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGVDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDK >CP022607.1|AXH27254.1|771602_773588_+|Excinuclease-ABC-subunit-B MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIEEIVEGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYRTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQIRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >CP022607.1|AXH27253.1|771097_771334_+|hypothetical-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >CP022607.1|AXH27252.1|770450_771101_+|Nucleotidase-YfbR MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENE >CP022607.1|AXH27251.1|769437_770277_+|LysM-domain-protein MKKTLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQHGTQVKTPVQHNYVSNVQAQTQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKAVKTPVRKASQAKKVVKQPVQQASKKVVVKQAPKQAVAKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTPEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH >CP022607.1|AXH27250.1|768036_769029_+|Peptide-chain-release-factor-2 MAEPNFWDNQTKAQDIIDKNNALKAIVNGYKTLQAEVDDMDATWDLLQEEFDEEMKEDLEQEVINFKAKVDEYELQLLLDGPHDANNAILELHPGAGGTESQDWANMLFRMYQRYCEKKGFKVETVDYLPGDEAGIKSVTLLIKGHNAYGYLKAEKGVHRLVRISPFDSSGRRHTSFASCDVIPDFNNDEIEIEINPDDITVDTFRASGAGGQHINKTESAIRITHHPSGIVVNNQNERSQIKNREAAMKMLKSKLYQLKLEEQAREMAEIRGEQKEIGWGSQIRSYVFHPYSMVKDHRTNEETGKVDAVMDGDIGPFIESYLRQTMSHD >CP022607.1|AXH27249.1|765072_767604_+|Protein-export-cytoplasm-protein-SecA-ATPase-RNA-helicase MGFLSKILDGNNKEIKQLGKLADKVIALEEKTAILTDEEIRNKTKQFQTELADIDNVKKQNDYLDKILPEAYALVREGSKRVFNMTPYKVQIMGGIAIHKGDIAEMRTGEGKTLTATMPTYLNALAGRGVHVITVNEYLSSVQSEEMAELYNFLGLTVGLNLNSKTTEEKREAYAQDITYSTNNELGFDYLRDNMVNYSEDRVMRPLHFAIIDEVDSILIDEARTPLIISGEAEKSTSLYTQANVFAKMLKQDEDYKYDEKTKAVHLTEQGADKTERMFKVENLYDVQNVDVISHINTALRAHVTLQRDVDYMVVDGEVLIVDQFTGRTMPGRRFSEGLHQAIEAKEGVQIQNESKTMASITFQNYFRMYNKLAGMTGTAKTEEEEFRNIYNMTVTQIPTNKPVQRNDKSDLIYISQKGKFDAVVEDVVEKHKAGQPVLLGTVAVETSEYISNLLKKRGIRHDVLNAKNHEREAEIVAGAGQKGAVTIATNMAGRGTDIKLGEGVEELGGLAVIGTERHESRRIDDQLRGRSGRQGDKGDSRFYLSLQDELMIRFGSERLQKMMSRLGLDDSTPIESKMVSRAVESAQKRVEGNNFDARKRILEYDEVLRKQREIIYNERNSIIDEEDSSQVVDAMLRSTLQRSINYYINTADDEPEYQPFIDYINDIFLQEGDITEDDIKGKDAEDIFEVVWAKIEAAYQSQKDILEEQMNEFERMILLRSIDSHWTDHIDTMDQLRQGIHLRSYAQQNPLRDYQNEGHELFDIMMQNIEEDTCKFILKSVVQVEDNIEREKTTEFGEAKHVSAEDGKEKVKPKPIVKGDQVGRNDDCPCGSGKKFKNCHGK >CP022607.1|AXH27248.1|764087_764660_+|Ribosomal-subunit-interface-protein MIRFEIHGDNLTITDAIRNYIEEKIGKLERYFNDVPNAVAHVKVKTYSNSATKIEVTIPLKNVTLRAEERNDDLYAGIDLINNKLERQVRKYKTRINRKSRDRGDQEVFVAELQEMQETQVDNDAYDDNEIEIIRSKEFSLKPMDSEEAVLQMNLLGHDFFVFTDRETDGTSIVYRRKDGKYGLIQTSEQ >CP022607.1|AXH27247.1|763352_764027_+|Competence-protein-F MNNCLSCGAKLYENITIYNLFKKPNRLCDRCKENWDNIKLDIKARRCSRCLKHLNQDEAYCLDCKFLSAHFNLMEQLYCQFQYDGLMKEMIHQYKFLKDYYLCELLAHLIEIPQTSYDYIVPIPSSPAHDLSRTFNPVEAVLKAKGIRFDKILKMSNRPKQSHLTKKERLADENPFIIDTELDLNGKEILLVDDIYTTGLTIHRAGCKLYAKNIRKFKVFAFAR >CP022607.1|AXH27246.1|762421_763360_+|ComF-operon-protein-A MLYAVTGAGKTEMMFQGIQYARIQGDNIAIVSPRVDVVVEISKRIKDAFLNEDIDILHQQSRQQFEGHFVVCTVHQLYRFKQHFDTIFIDEVDAFPLSMDKNLQQALKSSSKVEHAIIYMTATPPKQLLSEIPHENIIKLPARFHKKSLPVPKYRYFKLNNKKIQKMLYRILQDQINNQRYTLVFFNNIETMIKTFSVYKQKITKLTYVHSEDVFRFEKVEQLRNGHFDVIFTTTILERGFTMANLDVVVIDAHQYTQEALIQIAGRVGRKLECPTGKVLFFHEGVSMNMIQAKKEIQRMNKLALKRGWIDE >CP022607.1|AXH27256.1|777047_777980_+|HPr-kinase/phosphorylase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >CP022607.1|AXH27257.1|777985_778825_+|Prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYVENPSEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >CP022607.1|AXH27258.1|779036_779318_+|acetyltransferase MLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLVGANSIILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >CP022607.1|AXH27259.1|779325_780765_+|TPR-domain-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNNYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYQNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPPNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >CP022607.1|AXH27260.1|780831_781767_+|Thioredoxin-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGTFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLKDQA >CP022607.1|AXH27261.1|782093_782336_-|hypothetical-protein MDFQFLQAMQVGVWAPTQRISKRNSTGNASWGVGPNTEAYEKSAYNNVQVGGAPTKRNWIPNFYRQCELGWDNDKEILFL >CP022607.1|AXH27262.1|782591_783503_+|putative-ATP-binding-protein MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >CP022607.1|AXH27263.1|783499_784495_+|2-phospho-L-lactate-transferase-like-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >CP022607.1|AXH27264.1|784605_785550_+|Cytoplasmic-hypothetical-protein MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >CP022607.1|AXH27265.1|786113_786701_+|ATP-dependent-Clp-protease-proteolytic-subunit MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022607_4 | 1070394-1070486 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022607_4
|
1 spacers
spacers of CP022607_4
>4.1|1070419|43|CP022607|CRISPRCasFinder AACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCATCACTGCATAAAAGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022607_4
The CRISPR arrays of CP022607_4 >merge|CP022607|4|1070394-1070486|CRISPRCasFinder TCATAATGATTAAAAATCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCATCACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGG >CP022607|4|4|1070394-1070486|CRISPRCasFinder TCATAATGATTAAAAATCAAAGAGG AACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCATCACTGCATAAAAGC CTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGG
>CP022607.1|AXH27538.1|1067640_1070043_+|Phenylalanyl-tRNA-synthetase-beta-chain MLISNEWLKEYVTIDDSVSNLAERITRTGIEVDDLIDYTKDIKNLVVGFVKSKEKHPDADKLNVCQVDIGEDEPVQIVCGAPNVDAGQYVIVAKVGGRLPGGIKIKRAKLRGERSEGMICSLQEIGISSNYIPKSFESGIYVFSEAQVPGTDALQALYLDDQVMEFDLTPNRADALSMIGTAYEVAALYNTKMTKPDTTSNELELSANNELTVTIENEDKVPYYSARVVHDVTIEPSPIWMQARLIKAGIRPINNVVDISNYVLLEYGQPLHMFDQDAIGSQQIVVRQANEGEKMTTLDGTERELLTSDIVITNGQTPIALAGVMGGDFSEVKEQTSNIVIEGAIFDPVSIRHTSRRLNLRSESSSRFEKGIATEFVDEAVDRACYLLQTYANGKVLKDRVSSGELGAFITPIDITADKINRTIGFDLSQNDIVTIFNQLGFDTEINDDVITVQVPSRRKDITIKEDLIEEVARIYGYDDIPSTLPVFEKVTSGQLTDRQYKTRMVKEVLEGAGLDQAITYSLVSKEDATAFSMQQRQTIDLLMPMSEAHASLRQSLLPHLIEAASYNVARKNKDVKLFEIGNVFFANGEGELPDQVEYLSGILTGDYVVNQWQGKKETVDFYLAKGIVDRVSEKLNLEFSYRRADIDGLHPGRTAEILLENKVVGFIGELHPTLAADNDLKRTYVFELNFDALMAVSVGYINYQPIPRFPGMSRDIALEVDQNIPAADLLSTIHAHGGNILKDTLVFDVYQGEHLEKGKKSIAIRLNYLDTEETLTDERVSKVQAEIEAALIEHGAVIR >CP022607.1|AXH27537.1|1066582_1067641_+|Phenylalanyl-tRNA-synthetase-alpha-chain MSEQQTMSELKQQALVDINEANDERALQEVKVKYLGKKGSVSGLMKLMKDLPNEEKPAFGQKVNELRQTIQNELDERQQMLVKEKLNKQLAEETIDVSLPGRHIEIGSKHPLTRTIEEIEDLFLGLGYEIVNGYEVEQDHYNFEMLNLPKSHPARDMQDSFYITDEILLRTHTSPVQARTMESRHGQGPVKIICPGKVYRRDSDDATHSHQFTQIEGLVVDKNVKMSDLKGTLELLAKKLFGADREIRLRPSYFPFTEPSVEVDVSCFKCKGKGCNVCKHTGWIEILGAGMVHPNVLEMAGFDSSEYSGFAFGMGPDRIAMLKYGIEDIRHFYTNDVRFLDQFKAVEDRGDM >CP022607.1|AXH27536.1|1065462_1066203_+|rRNA-methylase MEQITSAQNNRIKQANKLKKKRERDKTGLALIEGVHLIEEAYQSGIVITQLFAIEPARLDQQIIAYAQEVFEINMKVAESLSGTVTPQGFFAIIEKPHYDISKAQQVLLIDRVQDPGNLGTLIRTADAAGMDAVIMEKGTTDPYQDKVLRASQGSVFHLPVMIQDLDTFITQFNGPVYGTALENAVAYKEVTSSDSFALLLGNEGEGVNPELLAHTTQNLIIPIYGKAESLNVAIAGSILLYHLKG >CP022607.1|AXH27535.1|1064755_1065079_+|Heme-degrading-monooxygenase-IsdI MKFMAENRLTLTKGTAKDIIERFYTRHGIETLEGFDGMFVTQTLEQEDFDEVKILTVWKSKQAFTDWLKSDVFKAAHKHVRSKNEDESSPIINNKVITYDIGYSYMK >CP022607.1|AXH27534.1|1064002_1064737_+|NPQTN-specific-sortase-B MRMKRFLTIVQILLVVIIIIFGYKIVQTYIEDKQERANYEKLQQKFQMLMSKHQAHVRPQFESLEKINKDIVGWIKLSGTSLNYPVLQGKTNHDYLNLDFEREHRRKGSIFMDFRNELKNLNHNTILYGHHVGDNTMFDVLEDYLKQSFYEKHKIIEFDNKYGKYQLQVFSAYKTTTKDNYIRTDFENDQDYQQFLDETKRKSVINSDVNVTVKDRIMTLSTCEDAYSETTKRIVVVAKIIKVS >CP022607.1|AXH27533.1|1062975_1063941_+|heme-ABC-transporter-permease MIKNKKKLLFLCLLVILIATAYISFVTGTIKLSFNDLFTKFTTGSNEAVDSIIDLRLPRILIALMVGAMLAVSGALLQAALQNPLAEANIIGVSSGALIMRALCMLFIPQLYFYLPLLSFIGGLIPFLIIILLHSKFRFNAVSMILVGVALFVLLNGVLEILTQNPLMKIPQGLTMKIWSDVYILAVSALLGLILTLLLSPKLNLLNLDDIQARSIGFNIDRYRWLTGLLAVFLASATVAIVGQLAFLGIIVPHVVRKLVGGNYRVLIPFSTVIGAWLLLVADLLGRVIQPPLEIPANAILMIVGGPMLICLICQSQRNRI >CP022607.1|AXH27532.1|1062216_1062963_+|Heme-transporter-IsdDEF-(lipoprotein-IsdE) MTLDKLDLPIVGKPTSYKTLPNRYKDVPEIGQPMEPNVEAVKKLKPTHVLSVSTIKDEMQPFYKQLNMKGYFYDFDSLKGMQKSITQLGDQFNRKAQAKELNDHLNSVKQKIENKAAKQKKHPKVLILMGVPGSYLVATDKSYIGDLVKIAGGENVIKVKDRQYISSNTENLLNINPDIILRLPHGMPEEVKKMFQKEFKQNDIWKHFKAVKNNHVYDLEEVPFGITANVDADKAMTQLYDLFYKDKK >CP022607.1|AXH27531.1|1061011_1062088_+|Heme-transporter-IsdDEF-(membrane-component-IsdD) MRNVKQIATKSIIAIISLGILTYTTMIGSVLADEIKYPLAKFNQPEAKDKTELTTSIFDEKIKENKALELLIFNQENKNVTEEQKLVDEKAQLISDMTGKIYLQVKLKGQIDKEQLVFQNDKNEEFPFVIKDEKDDTIVRILIEQHMDKINMHVKTLAEKKNLDNKEMVYSIHFKEKKVQHDDAKEVPSKHQNQENNQDQLKKDIDDKKDSQKSDTKERRTSLFTEKGLNDIPVQKDKVQQDSNKKIENERPKASGTLKVENSPSTIKKVENNHKEQPKHKDEKSKKEKKKVVEKEKALPAFNRDDDSKNSSQLSSDIKELDEPNHKKQYILFAAGIVLATILLISAHLYSRKRGNQV >CP022607.1|AXH27530.1|1060328_1061012_+|NPQTN-cell-wall-anchored-protein-IsdC MKNILKVFNTTILALIIIIATFSNSANAADSGTLNYEVYKYNTNDTSIANDYFNKPAKYIKKNGKLYVQITVNHSHWITGMSIEGHKENIISKNTAKDERTSEFEVSKLNGKIDGKIDVYIDEKVNGKPFKYDHHYNITYKFNGPTDVAGANAPGKDDKNSASGSDKGSDGTTTGQSESNSSNKDKVENPQTNAGTPAYIYAIPVASLALLIAITLFVRKKSKGNVE >CP022607.1|AXH27529.1|1059067_1060120_-|Cell-surface-protein-IsdA MTKHYLNSKYQSEQRSSAMKKITMGTASIILGSLVYIGADSQQVNAATEATNATNNQSTQVSQATSQPINFQVQKDGSSEKSHMDDYMQHPGKVIKQNNKYYFQTVLNNASFWKEYKFYNANNQELATTVVNDNKKADTRTINVAVEPGYKSLTTKVHIVVPQINYNHRYTTHLEFEKAIPTLADAAKPNNVKPVQPKPAQPKTPTEQTKPVQPKVEKVKPTVTTTSKVEDNHSTKVVSTDTTKDQTKTQTAHTVKTAQTAQEQNKVQTPVKDVATAKSESNNQAVSDNKSQQTNKVTKHNETPKQASKAKELPKTGLTSVDNFISTVAFATLALLGSLSLLLFKRKESK >CP022607.1|AXH27540.1|1071785_1072052_+|Z-ring-associated-protein MAQFKNKVNVSINDQLFTIVGEDNPEHIRYVAHLVDDKIKELGYKAAGLDTSRKAILTAVNIMHEKVLLEEENRRLKQQIHKLQQREQ >CP022607.1|AXH27541.1|1072052_1072574_+|Colicin-V-production-protein MVIDFIIIIFFVYFVIVGFRRGFWLSMIHLSATIVSLWIASQFYKSIVERLIVFIPYPKTTAFNTTFAFHFNHLQNRFGAIVAFLMITLFCKFILYLIIVTFDKIIAYQNIHIFSRAMGMIVGVFMTIIVLHFTLYLLALYPNEALQHQLKISIVSHSLIFHIPYLSAFTINL >CP022607.1|AXH27542.1|1072646_1074359_+|DNA-polymerase-X-family MTKKDVIKLLEQIATYMELKGENTFKISAYRKAAQSLELDERPLDEISDVTELKGIGKGVAEVINDYRETGESQYLQQLQEEVPEGLIPLLKIQGLGSKKIAKLYKELNIVDKASLQVACENGKVSELSGFAKKTEQNILEAVKQLGAKKDRYPIDQMRRLNQEIIDYIDTLNYIDQYSSAGSFRRFKEMSKDLDFIISTDNPKAVQQQLLNIPNKVKEVAVGNTKVSLELAYDDETIGVDFRLIEPSAFYHTLQHFTGSKEHNIRIRQLAKARDEKVSEYGIEQADGTLIQYDSEAKIYEHFNVNFIPPAMREDGSEFDKDLSNIITIDDINGDIHMHTTYSDGAFSIRDMVEANIAKGYKFMVITDHSQSLRVANGLQVERLLRQNEEIKALDKEYSEIDIYSGTEMDILPDGSLDYDDEILAQLDYVIGAIHQSFNQSEEQIMERLANACRNPYVRHIAHPTGRIIGRRDGYKPNIEQLMALAEETNTVLEINANPHRLDLNADIVRKYPNVKLTINTDAHHTNHLDFMNYGVATAQKGFVTKDRVINALSREAFKDFIENNIKLKK >CP022607.1|AXH27543.1|1074368_1076717_+|Recombination-inhibitory-protein-MutS2 MRQKTLDVLEFEKIKSLVANETISDLGLEKVNQMMPATNFETVVFQMEETDEIAQIYNKHRLPSLSGLSKVSAFIHRADIGGVLNVSELNLIKRLIQVQNQFKTFYNQLVEEDEGVKYPILDDKMNQLPVLTDLFQQINETCDTYDLYDNASYELQGIRSKISSTNQRIRQNLDRIVKSQANQKKLSDAIVTVRNERNVIPVKAEYRQDFNGIVHDQSASGQTLYIEPSSVVEMNNQISRLRHDEAIEKERILTQLTGYVAADKDALLVAEQVMGQLDFLIAKARYSRSIKGTKPIFKEERTVYLPKAYHPLLNRETVVANTIEFMEDIETVIITGPNTGGKTVTLKTLGLIIVMAQSGLLIPTLDGSQLSVFKNVYCDIGDEQSIEQSLSTFSSHMTNIVEILKHADKHSLVLFDELGAGTDPSEGAALAMSILDHVRKIGSLVMATTHYPELKAYSYNREGVMNASVEFDVDTLSPTYKLLMGVPGRSNAFDISKKLGLSLNIINKAKTMIGTDEKEINEMIESLERNYKRVETQRLELDRLVKEAEQVHDDLSKQYQQFQNYEKSLIEEAKEKANQKIKAATKEADDIIKDLRQLREQKGADVKEHELIDKKKRLDDHYEAKSIKQNVQKQKYDKIVAGDEVKVLSYGQKGEVLEIVNDEEAIVQMGIIKMKLPIEDLEKKQKEKVKPTKMVTRQNRQTIKTELDLRGYRYEDALIELDQYLDQAVLSNYEQVYIIHGKGTGALQKGVQQHLKKHKSVSDFRGGMPSEGGFGVTVATLK >CP022607.1|AXH27544.1|1076889_1077204_+|Thioredoxin MAIVKVTDADFDSKVESGVQLVDFWATWCGPCKMIAPVLEELAADYEGKADILKLDVDENPSTAAKYEVMSIPTLIVFKDGQPVDKVVGFQPKENLAEVLDKHL >CP022607.1|AXH27545.1|1077356_1078676_+|Mobile-element-protein MCNDTLELLRIKDENIKYINQEIDVIIKGKKATVVNAVLTYKPSACYCCGVKNEGQIHKHGKRVSRITLLKTQGYNTYLNLAKQRFKCLECNGTFTAKTSIVDESCFISRCVTQKVIEEATKVKTEIDTAEDNCISPSTVSRIRTKAANSLRIKPFNCLPEHIAMDEFKSVKNVTGSMSFIFIDNDTHDVIDILENRTTRFLRAYFERFDLKNRQQVKTVTIDMYEPYVRLFRDLFPNAAIIFDRFHIVQHLNRELNKYRVQVMNEYRNKKGPNYTIFKNNWKVLLMDTSKTIFSKYRWNKPFKAYKRSSDIVEFMLSKDDILRHSYELVQGLRKDLRLCNWPKFINRLNSVSKKSVSKGVWKVVKYYRKHQRMLRNTIYYPAFNNGAIEGINNKIKLIKRISFGYRNFNNFKARIMMIFSLYKGEKKKTTKPNNGLAA >CP022607.1|AXH27546.1|1079048_1080830_+|Excinuclease-ABC-subunit-C MEDYKQRIKNKLNVVPMEPGCYLMKDRNDQVIYVGKAKKLRNRLRSYFTGAHDAKTTRLVGEIRRFEFIVTSSETESLLLELNLIKQYQPRYNILLKDDKSYPFIKITKEKYPRLLVTRTVKQGTGKYFGPYPNAYSAQETKKLLDRIYPYRKCDKMPDKLCLYYHIGQCLGPCVYDVDLSKYAQMTKEITDFLNGEDKTILKSLEERMLTASESLDFERAKEYRDLIQHIQNLTNKQKIMSSDKTIRDVFGYCVDKGWMCIQVFFIRQGNMIKRDTTMIPLQQTEEEEFYTFIGQFYSLNQHILPKEVHVPRNLDKEMIQSVVDTKIVQPARGPKKDMVDLAAHNAKVSLNNKFELISRDESRTIKAIEELGTQMGIQTPIRIEAFDNSNIQGVDPVSAMVTFVDGKPDKKNYRKYKIKTVKGPDDYKSMREVVRRRYSRVLNEGLPLPDLIIVDGGKGHMNGVIDVLQNELGLDIPVAGLQKNDKHQTSELLYGASAEIVPLKKNSQAFYLLHRIQDEVHRFAITFHRQTRQKTGLKSILDDIDGIGNKRKTLLLRSFGSIKKMKEATLEDFKNIGIPENVAKNLHEQLHK >CP022607.1|AXH27547.1|1081153_1081768_+|Succinate-dehydrogenase-cytochrome-b558-subunit MAQSKNEFYLRRIHSLLGIIPIGAFLVVHLLVNHQATQGAEAFNKASNFMESLPFLIIVEFLFIYIPLLYHGLFGIHIAFTAKENVGHYSIFRNWMFFFQRVSGILTFIFIGIHLWQTRLQKAFYGKEVNYDLMHETLQHPGWAIFYIICIIAVVFHFANGLWSFLVTWGGLQSPKSQRVFTWVSLIVFLVISYIGVTAIIAFM >CP022607.1|AXH27548.1|1081819_1083586_+|Succinate-dehydrogenase-flavoprotein-subunit MAEKHLIVVGGGLAGLMSTIKAAEKGAHVDLFSVVPVKRSHSVCAQGGINGAVNTKGEGDSPWIHFDDTVYGGDFLANQPPVKAMTEAAPKIIHLLDRMGVMFNRTNEGLLDFRRFGGTLHHRTAYAGATTGQQLLYALDEQVRAFEVDGLVTKYEGWEFLGIVKGDDDSARGIVAQNMTTAEIETFGSDAVIMATGGPGIIFGKTTNSMINTGSAASIVYQQGAIYANGEFIQIHPTAIPGDDKLRLMSESARGEGGRIWTYKDGKPWYFLEEKYPDYGNLVPRDIATREIFDVCINQKLGINGENMVYLDLSHKDPHELDVKLGGIIEIYEKFTGDDPRKVPMKIFPAVHYSMGGLYVDYDQMTNIKGLFAAGECDFSQHGGNRLGANSLLSAIYGGTVAGPNAIDYISNIDRSYTDMDESIFEKRKAEEQERFDKLLAMRGTENAYKLHRELGEIMTANVTVVRENEKLLETDKKIVELMKRYEDIDMEDTQTWSNQAVFFTRQLWNMLVLARVITIGAYNRNESRGAHYKPEFPERNDEEWLKTTMASFQGAFEKPQFTYDDVDVSLIPPRKRDYTSKSKGGKK >CP022607.1|AXH27549.1|1083585_1084401_+|Succinate-dehydrogenase-iron-sulfur-protein MTEQSVKNTPQHETQSKPKQKTVKLIIKRQDTSDSKPYEETFEIPYRENLNVIACLMEIRRNPVNIKGEKTTPVVWDMNCLEEVCGACSMVINGRARQSCSAIVDQLEQPIRLEPMNTFPVIRDLQVDRSRMFDNLKRMKAWIPIDGTYDLGPGPRMPEKKRQTAYELSKCMTCGVCLEVCPNVTENNKFVGAQAISQVRLFNLHPTGSMTKDERLNALMGTGGLQQCGNSQNCVNACPKGIPLTTSIAAMNRETTFHMFKSFFGSDHEVE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022607_5 | 1094769-1094854 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022607_5
|
1 spacers
spacers of CP022607_5
>5.1|1094799|26|CP022607|CRISPRCasFinder CGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022607_5
The CRISPR arrays of CP022607_5 >merge|CP022607|5|1094769-1094854|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG >CP022607|5|5|1094769-1094854|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG CGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGG AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG
>CP022607.1|AXH27562.1|1094387_1094585_+|hypothetical-protein MTELNNIINSLQSLFESESGYKISKNSGVPYQTVQDLRNGKTKLEDARFRTIIKLYSYYVSLKEH >CP022607.1|AXH27561.1|1092625_1093585_-|Alpha-hemolysin-precursor MKTRIVSSVTTTLLLGSILMNPVANAADSDINIKTGTTDIGSNTTVKTGDLVTYDKENGMHKKVFYSFIDDKNHNKKLLVIRTKGTIAGQYRVYSEEGANKSGLAWPSAFKVQLQLPDNEVAQISDYYPRNSIDTKEYMSTLTYGFNGNVTGDDTGKIGGLIGANVSIGHTLKYVQPDFKTILESPTDKKVGWKVIFNNMVNQNWGPYDRDSWNPVYGNQLFMKTRNGSMKAAENFLDPNKASSLLSSGFSPDFATVITMDRKASKQQTNIDVIYERVRDDYQLHWTSTNWKGTNTKDKWTDRSSERYKIDWEKEEMTN >CP022607.1|AXH27560.1|1091915_1092149_-|hypothetical-protein MVFNDWEINVVYSGEHEVVANEKSLFVIDEFYDVAIAIYYLDGKLKVAHVNYGSDFTIDVANKVFELNIQNPNVDEH >CP022607.1|AXH27559.1|1091108_1091294_-|hypothetical-protein MNKHINKKAAKLLEDYKKVQQRKSKETDRGCLKSVIMLIVLFFLIIFGIVACSTNVNFFFQ >CP022607.1|AXH27558.1|1090218_1090569_+|hypothetical-protein MKFKKYILTGTLALLLSSTGIATIEGNKADASSLDKYLTESQFHDKRIAEELRTLLNKSNVYALAAGSLNPYYKRTIMMNEYRAKAALKKNDFVSMADAKVALEKIYKEIDEIINR >CP022607.1|AXH27557.1|1089567_1090065_+|Extracellular-fibrinogen-binding-protein-Efb MKNKLIAKSLLTIAAIGITTTTIASTADASEGYGPREKKPVSINHNIVEYNDGTFKYQSRPKFNSTPKYIKFKHDYNILEFNDGTFEYGARPQFNKPAAKTDATIKKEQKLIQAQNLVREFEKTHTVSAHRKAQKAVNLVSFEYKVKKMVLQERIDNVLKQGLVK >CP022607.1|AXH27556.1|1088786_1089293_+|hypothetical-protein MIIKILTILLLLCILSYLVTNRKKPFLFLKTLFMGVVFIFIGYISLAISAVIIYGIIQFITIDFGSFFLMGIILILISSIFQLFIVRLLFRKKNVDLTEVVVLEHLIQWFLVYFAIYQAVNEKMDINDINIDNFQSVFFDVSNLNLVILPTLIISWVTIFNYRMRSYK >CP022607.1|AXH27555.1|1087718_1088114_-|hypothetical-protein MKKNITKVIIASTVIATGLLTHSNDAKAFFSYEWKGLEIAKKLADDEKKDEERADRLIKDAEKERTYTGKTVEDLYVIAKKLGKGNTIAVVRIIDGGKNGYYTFDITRPLEEHRKNIKVVAKGEIDSITWY >CP022607.1|AXH27554.1|1087020_1087350_+|Hypothetical-protein MKKNFIGKSILSIAAISLTVSTFAGESHAQTKNAETVKKYNEYQTKFKKQVNKKVVDAQKAVNLFKRTRTVATHRKAQRAVNLIHFQHSYEKKKLQRQIDLVLKYNTLK >CP022607.1|AXH27553.1|1086659_1086827_+|hypothetical-protein MKRIVILENVIVDDPIWLNHVDYLVKSVLLKSIKLRFQEVRKFEILVKIMIRIHI >CP022607.1|AXH27563.1|1095029_1095746_-|hypothetical-protein MCKNITKNIILTTTLLLLGTVLPQNQKPVFSFYSEAKAYSIGQDETNINELIKYYTQPHFSFSNKWLYQYDNGNIYVELKRYSWSAHISLWGAESWGNINQLKDRYVDVFGLKDKDTDQLWWSYRETFTGGVTPAAKPSDKTYNLFVQYKDKLQTIIGAHKIYQGNKPVLTLKEIDFRAREALIKNKILYNENRNKGKLKITGGGNNYTIDLSKRLHSDLANVYVKNPNKITVDVLFD >CP022607.1|AXH27564.1|1095853_1096579_-|hypothetical-protein MNNNITKKIILSTTLLLLGTASTQFPNTPINSSSEAKAYYINQNETNVNELTKYYSQKYLTFSNSTLWQKDNGTIHATLLQFSWYSHIQVYGPESWGNINQLRNKSVDIFGIKDHETIDSFALSQETFTGGVTPAATSNDKHYKLNVTYKDKAETFTGGFPVYEGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKSKKLYNNSYNKGQIKITGADNNYTIDLSKRLPSTDANRYVKKPQNAKIEVILEKSN >CP022607.1|AXH27565.1|1096673_1097399_-|hypothetical-protein MKKNIMNKLVLSTALLLLGTTSTQLPKTPISFSSEAKAYNISENETNINELIKYYTQPHLSLSNKWLWQKPNGSIHATLQTWVWYSHIQVFGSESWGNINQLRNKYVDIFGTKDEDTVEGYWTYDETFTGGVTPAATSSDKHYRLFLKYSDKQQTIIGGHEFYKGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKNKKLYNGEFNKGQIKITADGNNYTIDLSKKLKLTDTNRYVKNPKNAQIEVILEKSN >CP022607.1|AXH27566.1|1097836_1098838_+|Ornithine-carbamoyltransferase MKNLRNRSFLTLLDFSRQEVEFLLTLSEDLKRAKYIGTEKPMLKNKNIALLFEKDSTRTRCAFEVAAHDQGANVTYLGPTGSQMGKKETTKDTARVLGGMYDGIEYRGFSQRTVETLAEYSGVPVWNGLTDEDHPTQVLADFLTAKEVLKKDYADINFTYVGDGRNNVANALMQGAAIMGMNFHLVCPKELNPTDELLNRCKNIAAENGGNILITDDIDQGVKGSDVIYTDVWVSMGEPDEVWKERLELLKPYQVNKEMMDKTGNPNVIFEHCLPSFHNADTKIGQQIFEKYGIREMEVTDEVFESKASVVFQEAENRMHTIKAVMVATLGEF >CP022607.1|AXH27567.1|1098860_1099793_+|Carbamate-kinase MAKIVVALGGNALGKSPQEQLELVKNTAKSLVGLITKGHEIVISHGNGPQVGSINLGLNYAAEHNQGPAFPFAECGAMSQAYIGYQLQESLQNELHSIGMDKQVVTLVTQVEVDENDPAFNNPSKPIGLFYNKEEAEQIQKEKGFIFVEDAGRGYRRVVPSPQPISIIELESIKTLIKNDTLVIAAGGGGIPVIREQHDGFKGIDAVIDKDKTSALLGANIQCDQLIILTAIDYVYINFNTENQQPLKTTNVDELKRYIDENQFAKGSMLPKIEAAISFIENNPKGSVLITSLNELDAALEGKVGTVIKK >CP022607.1|AXH27568.1|1099964_1101521_+|C4-dicarboxylate-anaerobic-carrier MENTINESEKKKRFKLKMPGAFMILFILTVVAVIATWVIPAGAYSKLSYEPSSQELKIVNPHNQVKKVPGTQQELDKMGVKIKIEQFKSGAINKPVSIPNTYERLKQHPAGPEQITSSMVEGTIEAVDIMVFILVLGGLIGVVQASGSFESGLLALTKKTKGHEFMLIVFVSILMIIGGTLCGIEEEAVAFYPILVPIFIALGYDSIVSVGAIFLASSVGSTFSTINPFSVVIASNAAGTTFTDGLYWRIGACIVGAIFVISYLYWYCKKIKKDPKASYSYEDKDAFEQQWSVLKDDDSAHFTLRKKIILTLFVLPFPIMVWGVMTQGWWFPVMASAFLIFTIIIMFIAGTGKSGLGEKGTVDAFVNGASSLVGVSLIIGLARGINLVLNEGMISDTILHFSSSLVQHMSGPLFIIVLLFIFFCLGFIVPSSSGLAVLSMPIFAPLADTVGIPRFVIVTTYQFGQYAMLFLAPTGLVMATLQMLNMRYSHWFRFVWPVVAFVLIFGGGLLITQVLIYS >CP022607.1|AXH27569.1|1101827_1102055_+|hypothetical-protein MTHLTKVLDTLTGICVVLLFSKYFVAYANMVFDWNLRWYLLENIPHLPIILFILMFIFGVPSEMIKDRQRKNNGV >CP022607.1|AXH27570.1|1102359_1103307_-|putative-permease MRLQKAPLVTSGLVLGLLGLGNLLKDLSLTLNAVCGIFAFLIWIHLLCTMIKYFNNVKEQLNSPLVSSVFTTFFMSGFLGTTYLNTFFSNITFINSLITPIWILCLVGIMTHMIIFSIKYLKDFSLENVYPSWTVLFIGIAIAGLTAPVSGYFFIGQLTVIYGFVATCIVLPIVFKRLKAFPLQTSIKPNTSTICAPFSLVAAAYVIAFPKANAFIVIIFLLLAQIFYFYIIIQLPKLLKEPFSPVFSAFTFPLVISATALKNSLPVLMFPDIWKGLLFIEVLLATVIVLRVFIGYLHFFLKKENQDKFLRNASQ >CP022607.1|AXH27571.1|1103555_1103744_+|hypothetical-protein MRNQIQKLLDSDLSSLHISKQTGVPQSTIHRMRKNERSLDNMSLKNAELLYKFANSIFSNEN >CP022607.1|AXH27572.1|1104111_1104993_+|Mobile-element-protein MYKNYSMTQLTLLIETSVRIPQNDISRYVNEIVETIPDSEFDEFRHHRGATSYHPKMILKIILYAYTQSVFSGRKIEKLLHDSIRMMWLAQNQTPSYKTINRFRVNSNTDALIESLFIQFHSQCLKQNLIDNNSIFIDGTKVEANANRYTFVWKKSIQNHESKLNENSKALYRDLVEEKIIPEIKEDGDSDLTIEEIDLIGSHLDKEIEDLNHSIDNEDCAQIRKQTRKKRTEIKKFKKKFDDYSERKSKYEEQKSILKDRNSFSKTDHDATFMRMKEDHMKNGNLSQDTIYK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP022607_6 | 1858365-1858446 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022607_6
|
1 spacers
spacers of CP022607_6
>6.1|1858391|30|CP022607|CRISPRCasFinder TGGAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022607_6
The CRISPR arrays of CP022607_6 >merge|CP022607|6|1858365-1858446|CRISPRCasFinder TGCAAGTTGGCGGGGCCACAACATAGTGGAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACATTGCAAGTTGGCGAGGCCACAACATAG >CP022607|6|6|1858365-1858446|CRISPRCasFinder TGCAAGTTGGCGGGGCCACAACATAG TGGAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAT TGCAAGTTGGCGAGGCCACAACATAG
>CP022607.1|AXH28237.1|1857669_1858065_-|Hypothetical-protein MLGKYWIQLLIATVIISLISIKAFPLAIGALYLPVIFKVIKLQLNLSKGLIDDVNAQTFIKSNQSGIVISVICCLLITGILYYTLDGFYASLTGVLGTLVALNPYTTIVSAVLYILTAIATVEATKTKYRN >CP022607.1|AXH28236.1|1856088_1857474_-|Fumarate-hydratase-class-II MSVRIEHDTFGEIEVPADKYWGAQTERSKRNFPVGKERMPIEVVYGFAQLKRAAALANFDLGKLSEAKKDAIVYACDQILSGELDEHFPLVVWQTGSGTQSNMNVNEVVSYVANMYLKDHQSYESIHPNDDVNKSQSSNDTFPTAMHVALYQEVETKLEPALKLLRNTLKEKEDKFDSIIKIGRTHLQDATPIKLGQEISGWRYMLDRCEIMLSESKKHILNLAIGGTAVGTGINAHPEFGDKVAHYISENTGYPFVSSENKFHALTAHDEVVQLHGTLKALAGDLMKIANDVRWLASGPRAGLAEISIPENEPGSSIMPGKVNPTQCEMLTMVAVQVMGNDTVVGFASSQGNFELNVYKPVIMHNTLQSIYLLADGMETFNNNCAVGIEPIEENIDNYLNQSLMLVTALNPHIGYEKAAQIAKKAHKEGLTLKESAIQTGYVTEEQFEAWIKPEDMVDPH >CP022607.1|AXH28235.1|1854814_1855636_+|hypothetical-protein MKFKIPENFNDLSLRDIFQQLKVPKKDLHHLNMSKDITINDKPARLMDKVHTGDDVFVPTIDEKSNYVPSYRYAQIKYEDDDMAIVMKPKGVKTHPNDLKESNTLMNHVIYTIDSDYVEPIHRLDQETVGLLIVAKNPLMKKILDRMLEDNDITRIYKANVKALLPLKPQTIDMPIGKDKFHSNKRRVSPTGQRAITHILTSKMIKEAVCQLEIKLDTGRTHQIRVHLAEIGHPVIGDPLYGDSTLRQLELESYKIEFVHPLTKEVISVSLDD >CP022607.1|AXH28234.1|1853539_1854652_-|Nitrate/nitrite-sensor-protein MEQRTRLALLKEIAEFLNEETEMYSMTQGALKYLIEGSNFTTGWIFFINSVGEHELVSHVALPQSLTADHCHYIKDGSCWCVKAFNQRRLMKASNIVNCSRINLASKAFPSQNDNITHHATVPLKSGQEQFGILNVASPNTEIYSDEDLELLESVAFQLGSAIKRIYLTDREKEAAKINERNRLARDLHDSVNQMLFSVKLTAHAAYGMSNESIAKQAFKTIEETSQNAVNEMRALIWQLKPVGLEQGLIHALTAYSKLMHIQLNVNVEGLIDLSNEIEENIYRALQECINNVKKHADTNKMDLTLKQMNDILYIDVIDYGQGFEIDNVQIASSHGINNIKQRVKLLRGRVTFHSQPTKGTQIQFTIPIK >CP022607.1|AXH28233.1|1852894_1853518_-|Two-component-response-regulator-like-protein MNKVILVDDHYIVRQGLRFLLSTIENIEVLQDFADGETFLEYLKEHEHPDIVLLDLVMPGMNGIEITEYIKAHYPDIKVLVLTSYVDDEHVISAINKGADGYEMKDVEPQQLIETIRRVMNGEKMIHPKAQDVFETVSQKPHYTNKLSKREIEVLREMVKGKTNKEIAETLFVSEKTIKTHVSHIFSKLQVSDRTQAAIYAMENKLI >CP022607.1|AXH28232.1|1852074_1852539_-|helix-turn-helix-domain-protein-binds-to-mecA-promoter-region MDRQSFTDLIQTKFKMVRIEAGYTQDTMAQTIGLSKKTLVQIEKERVLPNWTTCISICALFRDSEVLNSTFGCDPLEIVQTISRNHCAYPNHAPTSDIYWNNIETRNGYILQSNKVSNIYRVLNPDNQPIFGTSKMREAETYFNRNAKEELVHI >CP022607.1|AXH28231.1|1850771_1851896_-|Hypothetical-protein MNALFIIIFMIVVGAIIGGITNVIAIRMLFHPFKPYYIFKFRVPFTPGLIPKRREEIATKIGQVIEEHLLTETLINEKLKSEQSQQAIESMIQQQLQKLTKDQLSIKQITSQIDIDLEQVLQTNGNQYIESQLNNYYTKHQNQTIASLLPNQLVTFLDQHVDNATDLLCDRARNYLSSAKGTQDINDMLDTFFNEKGKLIGMLQMFMTKESIADRIQQELIRLTSHPKARTIVTSLITNEYQTFKDKPLNELLDASQFNEIAENLSVYITTYASKQANKPVVTLMPQFVDYLEGQLSSKLANLIIEQLSIHLSTIMKKVDLRGLIEEQINTFDLDYIEKLIIEIANKELKLIMSLGFILGGIIGFFQGLVAIFV >CP022607.1|AXH28230.1|1850358_1850703_-|Hypothetical-protein MAVNLYDYANQLEQALRESEEYKAIKEAFANVKANEESKKLFDEFRETQINFQQKQMQGEEIAEEDLQKAQEQAQAIEKDENISALMNAEQKMSQVFQEINQIIVKPLDEIYAD >CP022607.1|AXH28229.1|1848280_1849477_-|DNA-double-strand-break-repair-protein-Mre11 MVKFIHCSDLHLDSPFKSKSHISPKIFEDVQKSAYESFKNIVDIALQQDVDFVIIAGDLFDSENRTLRAEIFLKQQFERLQNEQIFVYVCHGNHDPLSSKISSNWPDNVSVFSNKVETYEAITKSGETIYIHGFSYENRASYENKIDEYPSSQGQKGIHIGVLHGTYSKSSVNERYTEFILEDLNSKLYHYWALGHIHERQQLSDMPVINYSGNIQGRHFNEQGEKGCLLIEGDHLKLKTKLYPTQYIRFEEATIETDKTSKQGLYEVIQNFKEQVREEGKAFYRLTLVINSETLISPQDLLQVEEMITDYEENENQFVYIDELKVQYAQNDESPLVNEFSAELLVDQTVFDKAMSDLYLNPRASKFLDDYGTFDHTALVNRAEEILKAEMRGEQNDN >CP022607.1|AXH28228.1|1845354_1848291_-|DNA-double-strand-break-repair-Rad50-ATPase MIIKSLEIYGYGQFVQRKIEFNKNFTEIFGENEAGKSTIQAFIHSILFGFPTKKSKEPRLEPRLGNQYGGKLVLILDDGLEIEVERIKGSAQGDVKVYLPNGAVRDDAWLQKKLNYISKKTYQGIFSFDVLGLQDIHRNLNEKQLQDYLLQAGALGSTEFTSMREVINRKKDELYKKSGKNPIINQQIEQLKQLESQIREEEAKLETYHRLVDDRDKSSRRLENLKHNLNQLSKMHEEKQKEVALHDHSQEWKSLEQQLNIEPITFPEKGVDRYEKARAHKQSLERDIGLRNERLAQLKEEATQLEPVKQSDIDAFISLNQQENEIKNKEFELTAIEKDIANKQRDKDELQANIGWSETHHDVDSSEAMKSYVSEQIKNKQEQAAYIKQLERSLEENKIEDNAVHSELDSVEEKIVPEETFEKKKEYSQQVIELNEKENLYSKLKERFEIEQQEKQKRQKLLRTTFILLTLVGIGLTAFSFISNNVLFGIIFAVLTLVFVIGIIMSKSKEVDYSEAITDEIEEIKAQLAILDENYDLDFDLDEQYRIRDYWQQALKNKDILEEKRQHIEGRLNDAKGRHDELQSTVENVKDELYLSSKISNDLIVDSISTMANIKALDQHISDLNQQRQQLVQELDTFYNHAEAVTKSQFVYFNKLSLFHDVQQWLKSAEDTNEKWRINAENTKLVTNELNHLNAQLEENNKEITALFDFINVGTEEDFYQHHEDYQTYTSNLSRFNDLTKYLENQNYSYELSSSLSEKTTAQLEEEDHLLATQVDEYNEQYLEMQAQVSDLSAQINHMETDTTLANLRHEYHSLKNQLNDIAKDWASLSYLQSLVDEHIKQIKDKRLPQVINEAVEILKHLTDGRYTMINYNEDSITVKHVNGQLYDPVELSQSTKELLYVALRISLIKVLRPYYPFPLIVDDAFVHFDKKRTEKMLNYLRSLSEHYQVLYFTCVKDNIVPSKEVITLNKIEEGGKR >CP022607.1|AXH28238.1|1858898_1859051_-|Hypothetical-protein MSKDKDPKLNYHEEENSMVTDFEDLKELGKEMEQISDQNDQEKNSEEDSQ >CP022607.1|AXH28239.1|1859075_1859675_-|Hypothetical-protein MAMNFKVFDNSQLVAEYAADIIRKQFNNNPTTIAGFHLDTDQAPVLDELKKNVEKHAVDFSQINILDYDDKKSYFEGLGVPAGQVYPIAYEKDAIELIADKIKTKENKGKLTLQVVSIDEQGKLNVSIRQGLMEAREIFLVVTGANKRDVVEKLYQENGKTSFEPADLKAHRMVNVILDKEAAAGLPEDVKAYFTSRFA >CP022607.1|AXH28240.1|1859832_1860303_-|tRNA-(cytidine(34)-2'-O)-methyltransferase MTNHIVLYQPEIPANTGNIARTCAGTNTHLHLIKPLGFRTDDKMLKRAGLDYWEFVNITYHDSIEAFFEATNGEYYLLTKFGKKTYSDFDFSNHDKDFYFIFGKETTGLPDWVKEKYQDTALRIPMSEHIRSLNLSNTAALLIYEALRQQDFPGLN >CP022607.1|AXH28241.1|1860307_1861435_-|Epoxyqueuosine-(oQ)-reductase-QueG MDTKQLKQDIIDYAYTIGIDSIGFTTADPFDELKQKLEAYHANGYASGFEESDIALRTEPKLSLPTARSIIAIAVGYPNKLKGAPKSVRGDRRGLFARASWGQDYHTIMRKRLDMLASFIESKVPDVEIKSMVDTGVLSDRAVAERAGLGFVGRNGFVINPKLGTWTYLGEMLVSIPFEPDDPLLDSCGDCTICVDRCPTSALVGNGQLNSQKCISFLTQTKGYMPDQYRYKIGNRLYGCDTCQQVCPKNRGINTEQDDIILEPEILKPRLVPLLRMSNKEFKQTYGHLAGAWRGKKPIQRNAILALAHFNEVDAIPELKKVAITDERPMIRATAYWAIGQILGEEARDFINANYDQEDAEVQNEMIKGLDTRRE >CP022607.1|AXH28242.1|1861585_1862314_-|Glutamate-transport-ATP-binding-protein MPVIKINNLNKVFGDNEVLKDINLEINQGEVVAIIGPSGSGKSTLLRCMNLLEVPTKGQVIFEGNDLTEKGTQVDKLRQKMGMVFQNFNLFPHKKVVDNIILAPKLLKKDNNDELHKEALSLLDKVGLKEKADVYPNQLSGGQKQRVAIARALAMHPDVILFDEPTSALDPEVVGDVLKVMKDLAKEGMTMVVVTHEMGFAKDVSDKVIFMADGVVVESGTPVEIFEQPQHERTQNFLARVL >CP022607.1|AXH28243.1|1862300_1863758_-|Glutamate-ABC-transporter MKCLIRFILVLGLLISSAMVYINPTAHAEQDQTWEKIKERGELRVGLSADYAPMEFEHTVNGKTEYAGVDIDLAKKIAKDNNLKLKIVNMSFDSLLGALKTGKIDIIISGMTSTPERKKQVDFSDSYMMTKNIMLVKKDKVNEYKDIKDFNNKKVGAQKGTEQEKIAQTEIENASITSLSRLPDVILALKSGKVEGAVVEKPVAEAYLKQNPKLGISNVKFNGEEKDTVIAVPKDSPKLLSQINKTIKEVKDKGLIDKYMTNAANAMNDDSGFISKYGSFFLKGIKITILISLIGVALGSILGAFVALMKLSKIKIISWIASIYIEILRGTPMLVQVFIVFFGITAALGLDISALVCGTIALVINSSAYIAEIIRAGINAVDKGQMEAARSLGLNYRQTMKSVIMPQAIKNILPALGNEFVTLIKESSIVSTIGVGEIMFNAQVVQGISFDPFTPLIVAAALYFVLTFVLTRIMNMIEGRLNASD >CP022607.1|AXH28244.1|1864015_1865077_-|membrane-protein MSNANNADNKQFFSKILNSIGAGVVIALVPNALLGEVLKIFKSGNEILELTYQLVILIQSFMAFIIGVLAAHQFKFNGAGAAIVGTSAMIGSGAVVYSNNSFMLKGIGDIINTSLVVIIACLIYMVLQNKLGSFELIILPVLVPIVSGGIGLITLPYIRKITQAIGNVIHSFTDLNPLLMSILISVAFSLLMVTPISLVAIATAISLNGLGSGAANLGIVAACVTFLFGSLRVNSIGVNAVLLIGAAKMMIPVYLKNLIISIPLTINGIITGIIAYVLQVKGTPLSAGFGYTGLVGPINAFNRMSGDPTMNIILLALGYFVIPFVSAFIVHELCKKFIPIYSNDIYKFEVPKQ >CP022607.1|AXH28245.1|1874023_1874470_-|Peroxide-stress-regulator-PerR MSVEIESIEHELEESIASLRQAGVRITPQRQAILRYLISSHTHPTADEIYQALSPDFPNISVATIYNNLRVFKDIGIVKELTYGDSSSRFDFNTHNHYHIICEQCGKIVDFQYPQLNEIERLAQHMTDFDVTHHRMEIYGVCKECQDK >CP022607.1|AXH28246.1|1874566_1875517_-|Phosphoglycerate-dehydrogenase-related-dehydrogenase MKVVGLNRMREVETELQQRFSDLDFKFYKKASEIPESDLADLDILVGYDGGINEAFLQRCPNLKWIAWFATGVNTLPLDYIADHGILLTNGKGVQAKQLSEYILAFILDDYKKMKLSYDNQRQHIYDSKITGKRLSGQTVLFLGTGAIATRTAKLAKAFNMNLIGLSKSGQNKDEFDEIYTIESLESTLPNADIIINALPETQETIHLLKKKHFELMKDEALFINIGRGSIVKEAVLIEVLKSKVIRHAYLDVFENEPLKPNHELYELENVTITAHITGNDYEAKYDLLDIFKNNLVNFLNKNGLIENEVDAKKGY >CP022607.1|AXH28247.1|1875522_1875978_-|Thiol-peroxidase MLQKGEQFPIFKLENQDGTVITNDTLKGKKAIIYFYPRDNTPTCTTEACDFRDNLEMFNDLDVAVYGISGDSKKKHQNFIEKHGLNFDLLVDEDFKLAKETGVYQLKKSFGKESMGIVRTTFIIDEQGKVLDVIEKVKVKTQIEELKNILG |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP022607_7 | 1900056-1900136 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022607_7
|
1 spacers
spacers of CP022607_7
>7.1|1900081|31|CP022607|CRISPRCasFinder CACATTATCGTAAGCTGACTTTTCGTCAGCT |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022607_7
The CRISPR arrays of CP022607_7 >merge|CP022607|7|1900056-1900136|CRISPRCasFinder TCTATGTTGGGGCCCCGCCAACCTGCACATTATCGTAAGCTGACTTTTCGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACCTG >CP022607|7|7|1900056-1900136|CRISPRCasFinder TCTATGTTGGGGCCCCGCCAACCTG CACATTATCGTAAGCTGACTTTTCGTCAGCT TCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACCTG
>CP022607.1|AXH28272.1|1899118_1899877_-|Methionine-aminopeptidase MIVKTEEELQALKEIGYICAKVRNTMQAATKPGITTKELDNIAKELFEEYGAISAPIHDENFPGQTCISVNEEVAHGIPSKRVIREGDLVNIDVSALKNGYYADTGISFVVGESDDPMKQKVCDVATMAFENAIAKVKPGTKLSNIGKAVHNTARQNDLKVIKNLTGHGVGLSLHEAPAHVLNYFDPKDKTLLTEGMVLAIEPFISSNASFVTEGKNEWAFETSDKSFVAQIEHTVIVTKDGPILTTKIEEE >CP022607.1|AXH28271.1|1898515_1898902_-|hypothetical-protein MNYVERYIEQFLRATVRNNIKHYLLMLDEKMKNLDDYMRYLITKKEQLSKLIDSLMLTLENKYIDIAEAFQIQCAREINNQEIENIKSELNKVEAYYAQIETQIQQTSTEKIATEKTSYLINYMNAVA >CP022607.1|AXH28270.1|1897799_1898501_-|Transporter-associated-with-VraSR MTHKYISTQMLIIFTALMIIANFYYIFFEKIGFLLVLLLGCVLVYVGYLYFHKIRGLLAFWIGALLIAFTLLSNKYTIIILFVFLLLLIVRYLIHKFKPKKVVATDEVMTSPSFIKQKWFGEQRTPVYVYKWEDVQIQHGIGDLHIDLTKAANIKENNTIVVRHILGKVQVILPVNYNINLHVAAFYGSTYVNEKSYKVENNNIHIEEMMKPDNYTVNIYVSTFIGDVEVIYR >CP022607.1|AXH28269.1|1896759_1897803_-|Sensor-histidine-kinase-VraS MNHYIRTIGSMLILVYSMLAAFLFIDKVFVNIIYFQGMFYTQIFGIPVFLFLNLIIILLCIIVGSVLAYKINQQNDWIKTQIERSMEGETVGINDQNIEIYSETLDLYHTLVPLNQELHKLRLKTQNLTNENYNINDVKVKKIIEDERQRLARELHDSVSQQLFAASMMLSAIKETKLEPPLDQQIPILEKMVQDSQLEMRALLLHLRPLGLKDKSLGEGIKDLVIDLQKKVPMKVVHEIQDFKVPKGIEDHLFRITQEAISNTLRHSNGTKVTVELFNKDDYLLLRIQDNGKGFNVDEKLEQSYGLKNMRERALEIGATFHIVSLPDSGTRIEVKAPLNKEDSYDD >CP022607.1|AXH28268.1|1896140_1896770_-|Two-component-transcriptional-regulator-VraR MTIKVLFVDDHEMVRIGISSYLSTQSDIEVVGEGASGKEAIAKAHELKPDLILMDLLMDDMDGVEATTQIKKDLPQIKVLMLTSFIEDKEVYRALDAGVDSYILKTTSAKDIADAVRKTSRGESVFEPEVLVKMRNRMKKRAELYEMLTEREMEILLLIAKGYSNQEIASASHITIKTVKTHVSNILSKLEVQDRTQAVIYAFQHNLIQ >CP022607.1|AXH28267.1|1894811_1896029_+|Inner-membrane-protein-YihY MSKKDHSSSKYLNSVKEAQEESKKKNKSNPKIDVDRTYIEPQQFQSKKPKKDDQVFFLSRLNKPAKYKKDSNFLSYLIYRIGKDDASGLAAQMTYHFVLAMFPMLLFLLTLLPFFNIKQSQITNMLSNAPAETSTLIKSVIGDITQNSSGGLLSIGLILAIWSASNGMTAIMNSFNVAYDVEDSRNGIVLKLLSVVFTVVMGVVFVVALALPTLGSVISHFLFGPLGFDEQVKWIFNLIRIVLPIIIIFIVFIVLYSVAPNVKTKLKSVLPGAVFTSIIWLAGSFGFGWYISNFGNYSKTYGSIAGIIILLLWLYITSFIIIVGAEINAIIHQRSVIKGKTPEEAALEHDDNNKNHYNENTRYEYDEDSNATHQRTYHVDEHPSDTYPEDDKNIKDKIVDKLKKD >CP022607.1|AXH28266.1|1894258_1894534_+|hypothetical-protein MENKFVPGILIGAVIGGAISLADKSTRQALVQSVKDAKNGNRTRKPSKVSKIKDEVLYWKDVVEEIRRNNPELERSLKDAKETFVNRKNQR >CP022607.1|AXH28265.1|1893787_1894252_+|Low-molecular-weight-protein-tyrosine-phosphatase MVDVAFVCLGNICRSPMAEAIMRQRLKDRNIHDIKVHSRGTGSWNLGEPPHEGTQKILNKHNIPFDGMISELFEATDDFDYIVAMDQSNVDNIKSINPNLKGQLFKLLEFSNMEESDVPDPYYTNNFEGVYDMVLSSCDNLIDYIVKDANLKEG >CP022607.1|AXH28264.1|1893440_1893641_-|H-YfkK MTNEEKVLAIREKLNIVNQGLLDPEKYKNANEEELTDIYDFVQSRERLSPSEVTAIADALGQLRHD >CP022607.1|AXH28263.1|1892181_1893429_-|Aminopeptidase-S MTNYKEKLQQYAELLVKVGMNVQPKQPVFIRSSVETLELTHLIVEEAYHCGASDVRVVYSDPTLKRLKFENESVEHFANHELKSYDVEARMDYVKRGAANLALISEDPDLMDGIDSQKLQAFQQQNARAFKGYMESVQKNQFPWVVAAFPSKAWAKRVYPELSVEEAYIKFIDEVFDIVRIDGNDPVENWRQHIANLSVYAQKLQQKNYHALHYVSEGTDLTVGLAKNHIWEDATSYVNGKEQAFIANIPTEEVFTAPDRNRVDGYVTNKLPLSYNGTIIDQFKLMFKDGEIIDFSAEKGEAVLKDLINTDEGSRRLGEVALVPDDSPISNRNTIFYNTLFDENAACHLAIGSAYAFNIQGGTEMTVEEKIASGLNDSNVHVDFMIGSSDLTIYGIFEDGSKELVFENGNWASTF >CP022607.1|AXH28273.1|1900404_1901391_+|Integral-membrane-protein MNDQWYKHLIGARTIKTGIAIFLTAVFCMALDLTPIYAILTAVVTIEPTAKASLIKGYRRLPATVIGAGFAVLFTYLFGDQSPFTYALSATFTILFCTKLKLQVGTNVAVLTSLAMIPGIHDAYIFNFLSRTLTAIIGLVTSGLINFMVFPPKYYGQVEEKLSKTDALMYKLFYNRCQELILSRLQSDKSEKAYKNIFNLNNQVETLISYQRDELSYHKKKECDWKLLNQLTKRAYTNRLFITHLSNIIYLPKNTRVNFSGDEKMALLKISSSIKDIFYDGSFKREDDSVETLRSTIKALEISGENQIKSHLLYEVLMIYRLLDSRYA >CP022607.1|AXH28274.1|1901821_1902274_-|Hypothetical-protein MQHEKMNDERNLTMKPTKVILRDASYLHSKTSITFILKDVVIEEDNKIYYFDTSATFEDQEVKFEFALFDSDMDNLKHMDYDNPVTEIYFIEPDLHFTIIDFNQELLCIYIDFDSGLRHSNMATESGISLRINVAKSDFTKFINELASLY >CP022607.1|AXH28275.1|1902459_1903191_-|Putative-amidotransferase-similar-to-cobyric-acid-synthase MHELTIYHFMSDKLNLYSDIGNIIALRQRAKKRNIKVNVVEINETEGITFDECDIFFIGGGSDREQALATKELSKIKTPLKEAIEDGMPGLTICGGYQFLGKKYITPDGTELEGLGILDFYTESKTNRLTGDIIIESDTFGTIVGFENHGGRTFHDFGTLGHVTFGYGNNDEDKKEGIHYKNLLGTYLHGPILPKNYEITDYLLEKACERKGIPFEPKEIDNEAEIQAKQVLIDRANRQKKSR >CP022607.1|AXH28276.1|1903192_1904506_-|putative-amino-acid-ligase-found-clustered-with-an-amidotransferase MRQWTAIHLAKLARKASRAVGKRGTDLPGQIARKVDTDILRKLAEQVDDIVFISGTNGKTTTSNLIGHTLKANNIQIIHNNEGANMAAGITSAFIMQSTPKTKIAVIEIDEGSIPRVLKEVTPSMMVFTNFFRDQMDRFGEIDIMVNNIAETISNKGIKLLLNADDPFVSRLKIASDTIVYYGMKAHAHEFEQSTMNESRYCPNCGRLLQYDYIHYNQIGHYHCQCGFKREQAKYEISSFDVAPFLHLNINDEKYDMKIAGDFNAYNALAAYSVLRELGLNEQTIKNGFETYTSDNGRMQYFKKERKEAMINLAKNPAGMNASLSVGEQLEGEKVYVISLNDNAADGRDTSWIYDADFEKLSKQQIEAIIVTGTRAEELQLRLKLAEVEVPIIVERDIYKATAKTMDYKGFTVAIPNYTSLAPMLEQLNRSFEGGQS >CP022607.1|AXH28277.1|1904797_1905298_+|Ferritin-like-protein-2 MLSKNLLEALNDQMNHEYFAAHAYMAMAAYCDKESYEGFANFFIQQAKEERFHGQKIYNYINDRGAHAEFRAVSAPKIDFSSILETFKDSLSQEQEVTRRFYNLSEIARQDKDYATISFLNWFLDEQVEEESMFETHINYLTRIGDDSNALYLYEKELGARTFDEE >CP022607.1|AXH28278.1|1905687_1906242_+|DNA-polymerase-III-polC-type MIQDAFVALDFETANGKRTSICSVGMVKVIDSQITETFHTLVNPQDYFSQQNIKVHGIQPEDVENAPTFDYVFPYMMQFIADLPVVAHNAAFDMNVLHQSIQNIGLPTPNLTYFCSYQLAKRTVDSYRYGLKHMMEFYQLDFHGHHDALNDAKACAMITFRLLKNYENLTYVTNIYGKNLKDKG >CP022607.1|AXH28279.1|1906308_1907379_-|DNA-polymerase-IV MTERRIIHIDMDYFFAQVEMRDNPKLKGKPVIVGGKASSRGVVSTASYEARKYGVYSAMPMSQAHKLCPNGYFVTSNFGAYRETSAQIMSIFRSYTDKVEPMSLDEAYLDITELVRPDLPASKIAQYIRKDILEKTHLTASAGVSYNKFLAKLASGMNKPDGMTVIDYQNVHDILMTLDIGEFPGVGKASKKVMHDNGIFNGRDLYEKTEFELIRLFGKRGRGLYNKARGIDHSEVKSSRVRKSVGTERTFATDVNDDEEILRKVWELSGKTAERLNKLQKSAKTVTVKIKTYQFETLSKQMSLRDSVSSEEDIYNIAYLLYNDLKDPDVPIRLIGVTVGNLEQSTYKNMTIYDFI >CP022607.1|AXH28280.1|1907625_1908156_-|Hypothetical-protein MHKIDLTTNNFQMRRFIILQLVIALFVILFTYKWALGVTAVVDQNIIINLVYGFAGFIILLILHELIHRALFLLFKKDSKPMFNIKKDRILFQTADACFNKWQFSIIMLSPLILLSTGLLILIKVFGYSSLIFMFSMHTAYCFIDILLVALTISSSFKYVQQDEDSIYLYHQKPTQ >CP022607.1|AXH28281.1|1908325_1909687_-|RNA-methyltransferase MQAIAKNDIKTGTVVDLTHEGHGVVKIDRFPIFIPQALINEQIEYKIIKVKKNFAIGKLLNINTRSENRVAPPCIYYERCGGCQLQHLSYEAQLEMKKEQVINLFQRKAHFDNSKINDTVGMTDPWRYRNKSQIPVGKNEQNEVIMGFYRQRSHDIIDMESCLIQDSQHQEVMNEVKSILKDLNVSIYQEQLKKGLMRHLVVRTGYHTDEMMIIFVTNGKKWPQKNAVVEKILDAFPNVTSIKQNINDSHSNVIMGRQSITLYGKDTIIDQLTDSTFKISDQSFYQINSEQTEKLYNKAIEYAQLTGNEVVLDTYCGIGTIGLYMAPHAKHVYGVEVVPSSIEDAQQNATINQCNNTTFVCGKAEEVILQWKAQGIKPDVVMVDPPRKGCDETFIQTLLTLEPKRIVYISCNPATQQRDALLLAEKYQLEEVTPVDMFPQTTHVETVALFNLK >CP022607.1|AXH28282.1|1909767_1910715_-|Transcription-regulator MRKRARIIYNPTSGKEQFKRELPDALIKLEKAGYETSAYATEKIGDATLEAERAMHENYDILIAAGGDGTLNEVVNGIAEKPNRPKLGVIPMGTVNDFGRALHIPNDIMGALDVIIEGHSTKVDIGKMNNRYFINLAAGGQLTQVSYETPSKLKSIVGPFAYYIKGFEMLPQMKAVDLRIEYDGNVFQGEALLFFLGLTNSMAGFEKLVPDAKLDDGYFTLIIVEKSNLAELGHIMTLASRGEHTKHPKVIYEKAKAINISSFTDLQLNVDGEYGGKLPANFLNLERHIDVFAPNDIVNEELINNDHVDDNLIEE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022607_8 | 2403214-2403311 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022607_8
|
1 spacers
spacers of CP022607_8
>8.1|2403243|40|CP022607|CRISPRCasFinder TTATGCATTAGTAGCGAAGCTATCTAATGCGTTCCTTTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022607_8
The CRISPR arrays of CP022607_8 >merge|CP022607|8|2403214-2403311|CRISPRCasFinder TTTCTGCGAATTTTATGAGCTAGAAAGGCTTATGCATTAGTAGCGAAGCTATCTAATGCGTTCCTTTATTTTCTGCGAATTTTATGAGCTAGAAAGGC >CP022607|8|8|2403214-2403311|CRISPRCasFinder TTTCTGCGAATTTTATGAGCTAGAAAGGC TTATGCATTAGTAGCGAAGCTATCTAATGCGTTCCTTTAT TTTCTGCGAATTTTATGAGCTAGAAAGGC
>CP022607.1|AXH28772.1|2402207_2403074_-|Cobalt-zinc-cadmium-resistance-protein MSHNENLKLAQRGAYLSLIVYIILSIVKYVTGFVFNSAAVRADALNNMTDIIVSLAVIIGLKISIKPADRNHPYGHLKSENISSLLVSFVIMFVGIQVVIQNAPRLFKEDDVVPNAITIIVSLISGLVMLIVFAVNQRLAKRTKSSSLNSAAKDNLSDSLVSIGTAIGLIFTQIGFPIVDIILATLLGLLIVYTGFGIFKEAIFMLSDGFNETELEAYRNDILEVDEVQEVKSIKGRYHGSSVFIDVTIVVDANLSLVEAHQICDNVEHHLHKKGISSVYVHPEPDHL >CP022607.1|AXH28771.1|2401194_2401881_-|Phosphoglycerate-mutase MPKLILCRHGQSEWNAKNLFTGWEDVNLSEQGINEATRAGEKVRENNIAIDVAFTSLLTRALDTTHYILTESKQQWIPVYKSWRLNERHYGGLQGLNKDDARKEFGEEQVHIWRRSYDVKPPAETEEQREAYLADRRYNHLDKRMMPYSESLKDTLVRVIPFWTDHISQYLLDGQTVLVSAHGNSIRALIKYLEDVSDEDIINYEIKTGAPLVYELTDDLEVIDKYYL >CP022607.1|AXH28770.1|2399323_2400763_-|hypothetical-protein MSKKQKLTMIITMLMGGFFGLLNETLLVTALPSIMKDFEISYTQVQWLTTAFLLTNGIVIPLSALVIQRYTTRQVFLVGISIFFLGTLLGGLSPHFATLLVARIIQALGAGIMMPLMMTTILDVFQPHERGKYMGIFGLVIGLAPAIGPTLSGYLVEYFNWRSLFHVVAPIAAVTFLIGFKTIKNVGTTIKVPIDFISVIFSVLGFGGLLYGTSSISEKGFDNPIVLVSMIGGVVLVALFVLRQYRLSTPLLNFAVFKNKQFTVGIIIMGVTMVSMIGSETILPIFVQNLLHRSALDSGLTLLPGAIVMAFMSMTSGALYEKFGPRKLALVGMAIVVITTAYFVVMDEQTSTIMLATVYAIRMVGIALGLIPVMTHTMNQLKPEMNAHGSSMTNTVQQIAGSIGTAALITILSHASKNFSPTMSDYNGMNKIDMMNQIKVDTMLHGYHAGFLFALLITVVSFFCSFMLQGKKKEVDSRQ >CP022607.1|AXH28769.1|2398423_2399203_-|L-Cystine-ABC-transporter-periplasmic-cystine-binding-protein MKRLLFVMIAFVFILAACGNNSSKDKEANKDSKTINVGTEGTYAPFSFHDKDGKLTGYDIDVIKAVAKEEGLKLKFNETSWDSMFAGLDAGRFDVIANQVGINPDREKKYKFSKPYTFSSAVLVIRENEKDIKDFDDVKGKKLAQTFTSNYGKLAKDKGADITKVDGFNQSMDLLLSKRVDGTFNDSLSYLDYKKQKPNAKIKAIKGNAEQSRSAFAFSKKADDETVQKFNDGLKKIEENGELAKIGKKWFGQDVSKSK >CP022607.1|AXH28768.1|2397723_2398443_-|L-Cystine-ABC-transporter-permease MFLNLNSEQQHALDAAKQAFGPMLEGLVKYSIPITLVTFVLGLIIALFTALMRISTSKILRSISRVYVSIIRGTPMIVQLFIIFYGIPELGRLLTNDADNQWTLAPVVAAIIGLSLNVGAYASEIIRGGIISIPKGQTEAAYSIGMTYGQTIQRIILPQAIRVSIPALGNTFLSLIKDTSLLGFILVAEMFRKAQEVASTTYEYLTIYVLVALMYWVVCFIISIIQGIYESYIERGYRS >CP022607.1|AXH28767.1|2396995_2397727_-|Molybdenum-transport-ATP-binding-protein-ModC MIQLNNIHKSFNDVEVIKGIDLSVEQGEVVTLIGRSGSGKTTLLRMINALEIPTEGTVYVNGKTYTSKDKKSQIEVRKQSGMVFQSYNLFPHKTALENVMEGLITVKKLKKDEARGKSLELLEKVGLTHVKDQRPHALSGGQQQRVAIARALAMNPKVMLFDEPTSALDPELVNDVLKVIKDLANEGMTMVIVTHEMRFAKEVSNNIVFIHEGMIGEQGAPEEMFNRPKTEELRRFLNVINEE >CP022607.1|AXH28766.1|2395648_2396899_+|FmhA-protein-of-FemAB-family MNFVTLTSDEFNAFTTKHFSHYTQSAIHYNHRVDLKGDVHLVGVKDDNGQVIAGCLLTEARTLKFFKYFYTHRGPVMDYTNQSLVAFFFKALTSYLKKHNCLYVLVDPYLIENLRNADGEIVKSYDNRAFVRTMDTLGYKHQGFPVGYDSMSQIRWLSVLDLKDKTEDQLLKEMDYQTRRNIKKTYDIGVKTKTLTIDETQTFFDLFHMAEEKHGFKFRELPYFEEMQKLYDDHAMLKLAYIDLNEYLKTLQLKQQQLTAELSGVEEALKESPNSKKNKTKRTQLEQQLNSNKRKIDNTIEQIEQDGAVLNLASALFIYNEHEVYYLSSGSNPKYNAYMGAYHLQWEMIKFAKAHHIDRYNFYGITGDFSESSEDYGVQQFKKGFNAHVEEYIGDFIKPIKPMFYKIQQYLNHKRR >CP022607.1|AXH28765.1|2395031_2395394_-|Hypothetical-protein MKRFVATVLLLLVFISGCGNDKYVKEIDEAVKIQNQKQEQLAKKGNGDRVDHFERKDANIYVYDKDKIIILAYKPLSNDDEVHYYAYDFSDKRVSYKQDFDSRRYYQQHDADYHEENMTN >CP022607.1|AXH28764.1|2394413_2395013_-|Protein-disulfide-isomerase-related-to-DsbA MTKKLLTLFIVSMLILTACGKKESATTSSKNGKPLVVIYGDYKCPFCKELDEKVMPKLRKNYIDNHKVEYQFVNLAFLGKDSIVGSRASHAVLMYAPKSFLDFQKQLFAAQQDENKEWLTKELLDKHIKQLHLDKETENKIIKDYKTKDSKSWKAAEKDKKIAKDNHIKTTPTAFINGEKVEDPYDYESYEKLLKDKIK >CP022607.1|AXH28763.1|2393889_2394141_-|YefM-protein-(antitoxin-to-YoeB) MIIKNYSYARQNLKALMTKVNDDSDMVTVTSTDDKNVVIMSESDYNSMMETLYLQQNPNNAEHLAQSIADLERGKTITKDIDV >CP022607.1|AXH28773.1|2403826_2405137_+|IgG-binding-protein-SBI MKNKYISKLLVGAATITLATMISNGEAKASENTQQTSTKHQTTQNNYVTDQQKAFYQVLHLKGITEEQRNQYIKTLREHPERAQEVFSESLKDSKNPDRRVAQQNAFYNVLKNDNLTEQEKNNYIAQIKENPDKSQQVWVESVQSSKAKERQNIENADKAIKDFQDNKAPHDKSAAYEANSKLPKDLRDKNNRFVEKVSIEKAIVRHDERVKSANDAITKLQKNDSIENRRLAQREVNKAPMDVKEHLQKQLDALVAQKDAEKKVAPKVEAPQIQSPQIEKPKAESPKVEVPQIQSPKVEVPQSKLLGYYQSLKDSFNYGYKYLTDTYKSYKEKYDTAKYYTDKYFKYKGTIDKTVLSVFGNGYKSYIQPLKVEDQKNYVSKSYAQVRNYVTETLNTGKVLYAFYQNPKVVKAAITTAETASSIKNTLSNLLSFWK >CP022607.1|AXH28774.1|2405671_2406601_+|Gamma-hemolysin-component-A MIKNKILTATLAVGLIAPLANPFIEISKAENKIEDIGQGAEIIKRTQDITSKRLAITQNIQFDFVKDKKYNKDALVVKMQGFISSRTTYSDLKKYPYIKRMIWPFQYNISLKTKDSNVDLINYLPKNKIDSADVSQKLGYNIGGNFQSAPSIGGSGSFNYSKTISYNQKNYVTEVESQNSKGVKWGVKANSFVTPNGQVSAYDQYLFAQDPTGPAARDYFVPDNQLPPLIQSGFNPSFITTLSHERGKGDKSEFEITYGRNMDATYAYVTRHRLAVDRKHDAFKNRNVTVKYEVNWKTHEVKIKSITPK >CP022607.1|AXH28775.1|2407167_2408115_+|Gamma-hemolysin-component-C MLKNKILATTLSVSLLAPLANPLLENAKAANDTEDIGKGSDIEIIKRTEDKTSNKWGVTQNIQFDFVKDKKYNKDALILKMQGFISSRTTYYNYKKTNHVKAMRWPFQYNIGLKTNDKYVSLINYLPKNKIESTNVSQTLGYNIGGNFQSAPSLGGNGSFNYSKSISYTQQNYVSEVEQQNSKSVLWGVKANSFATESGQKSAFDSDLFVGYKPHSKDPRDYFVPDSELPPLVQSGFNPSFIATVSHEKGSSDTSEFEITYGRNMDVTHAIKRSTHYGNSYLDGHRVHNAFVNRNYTVKYEVNWKTHEIKVKGQN >CP022607.1|AXH28776.1|2408116_2409094_+|Gamma-hemolysin-component-B MKMNKLVKSSVATSMALLLLSGTANAEGKITPVSVKKVDDKVTLYKTTATADSDKFKISQILTFNFIKDKSYDKDTLVLKATGNINSGFVKPNPNDYDFSKLYWGAKYNVSISSQSNDSVNVVDYAPKNQNEEFQVQNTLGYTFGGDISISNGLSGGLNGNTAFSETINYKQESYRTTLSRNTNYKNVGWGVEAHKIMNNGWGPYGRDSFHPTYGNELFLAGRQSSAYAGQNFIAQHQMPLLSRSNFNPEFLSVLSHRQDGAKKSKITVTYQREMDLYQIRWNGFYWAGANYKNFKTRTFKSTYEIDWENHKVKLLDTKETENNK >CP022607.1|AXH28777.1|2409145_2409613_-|hypothetical-protein MTSKDITQISVIAAILTILAVLKIPSIIPGLDFQLSAPAALLILAFFGIKKYFLGGLLSSLLLLIFGVFNPINVIISIIFRVIAIAVVYLLKINVLSLVLASVLGSLVSRLLLSIILNLPVWVVLLNAIPGVIFTLIVAIPLYLTMRKRMAVLLR >CP022607.1|AXH28778.1|2409623_2410316_-|Pimeloyl-CoA-synthase MYSIKMRSSNQDVHISGAETICEFDKIEQTVQRFYNKGFFHENGQPDFLNIKIQKIMEPIQQIKALQIIEDDKANLQHLTQECGVTEQALNQGMTYIKNETVYTGAIILSAISGKRLDSFGQRGIRATHFSFEDINNKGDLNERVTDALAIASCINAHPYVKGELCVSDDLTYTTGYFASAKIGYHRLFDIKPVNTRYGGRIIFVDNRIDLNHYISFLESTPKQVVYETV >CP022607.1|AXH28779.1|2410326_2411439_-|8-amino-7-oxononanoate-synthase MFQEQIDLLQQKGLYRSLKSVGYIDRQYIEVENKRCTNYTSNDYLGLGQIAFDKDDFERFMRKYSYHLSSSRLISGSSTAYEEIETMLAGWLGYSACTILNSGYDANLALFNIFKNTNCVVFSDQENHASIIDGIKLSGLEKVIYKHLDIADLEKRLAEYPNQNIQKIIISDSVFSTNGDVVDIGQLVSLKHKYNATLILDVSHSFGIENYSNYQGIDILTSSLSKACGAYGGVILSSNDVKDMLINHGRPLIYSSSLPIYNLYFIKRNIEKLINADDRRTKLNSLSKYFNQKLKALNVNYNSSNSPIKFIEFDDIEAAENIHQTLLKHHVFTSYLRYPTVTKPMLRISLSYFHTEQDIDRLFEILHQED >CP022607.1|AXH28780.1|2411419_2412427_-|Biotin-synthase MNLAKRILQGEQLTKETVLKIYEDTNIDTLDLLNEAYILRKHYFGKKVKLNMILNAKSGICPENCGYCGQSRDIKQKQRYALIPEEQIIDGAKVAHDNHIGTYCIVMSGRGPSDKEVDHISNTVRTIKSQHPQLKICACLGLTNDEQAKKLKSAGVDRYNHNINTSENYHDNVVTTHSYKDRTDTIELMKANNISPCSGVICGMGESNQDIVDMAFALKEMDADSIPINFLHPIKGTKFGSMDDLTPMKCLRIVALFRLINPTKEIRIAGGREVNLRSLQPLALKAANSIFVGDYLITGGQPNQLDYDMINDLGFEIDYDTCENKENKNDVSRAN >CP022607.1|AXH28781.1|2412428_2413787_-|Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate-aminotransferase MNYTQQLKQKDSEYVWHPFTQMGVYSKEEAIIIEKGKGSYLYDTNGNKYLDGYASLWVNVHGHNNKYLNKVIKKQLNKIAHSTLLGSSNIPSIELAEKLIEITPSNLRKVFYSDTGSASVEIAIKMAYQYWKNIDREKYAKKNKFITLNHGYHGDTIGAVSVGGIKTFHKIFKDLIFENIQVESPSFYRSNYDTENEMMTAILTNIEQILIERNDEIAGFILEPLIQGATGLFVHPKGFLKEVEKLCKKYDVLLICDEVAVGFGRTGKMFACNHEDVQPDIMCLGKAITGGYLPLAATLTSQKIYNAFLSDSHGVNTFFHGHTYTGNQIVCTVALENIRLYEKRKLLSHIESTSSTLEKQLHALKRHRNVGDVRGRGLMFGVELVTDKDSKTPLEIEKVERIVRKCKENGLMIRNLENVITFVPVLSMSNKEVKTMVRIFKKAVHNILDRKC >CP022607.1|AXH28782.1|2413764_2414451_-|Dethiobiotin-synthetase MRIFITSTNTDVGKTYVTKHLYHALKTRGHRVCIFKPFQTEERQDGTFPDLEVFKNECDLSYDITSLYTFKQPVSPHLAFKMTDQIFLNKQRVLNKVKVLDKEFDFILIEGAGGIAVPIYEGTDDFYMTKDLINDCADCVISVLPSKLGAISDAIVHQDYVNQNVSASNFLIMNRYTDSYIEKDNQITIGKLTNKTVYTFEEHATYENFSEAFLKQLIGVKNELHTTT |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022607_1 | 1.1|233313|25|CP022607|CRISPRCasFinder | 233313-233337 | 25 | CP022607.1 | 129559-129583 | 1 | 0.96 |
CP022607_1 | 1.1|233313|25|CP022607|CRISPRCasFinder | 233313-233337 | 25 | CP022607.1 | 335291-335315 | 1 | 0.96 |
CP022607_1 | 1.1|233313|25|CP022607|CRISPRCasFinder | 233313-233337 | 25 | CP022607.1 | 611576-611600 | 1 | 0.96 |
CP022607_1 | 1.1|233313|25|CP022607|CRISPRCasFinder | 233313-233337 | 25 | CP022607.1 | 782266-782290 | 1 | 0.96 |
CP022607_1 | 1.1|233313|25|CP022607|CRISPRCasFinder | 233313-233337 | 25 | CP022607.1 | 992838-992862 | 1 | 0.96 |
CP022607_1 | 1.1|233313|25|CP022607|CRISPRCasFinder | 233313-233337 | 25 | CP022607.1 | 1304553-1304577 | 1 | 0.96 |
CP022607_1 | 1.1|233313|25|CP022607|CRISPRCasFinder | 233313-233337 | 25 | CP022607.1 | 1393141-1393165 | 1 | 0.96 |
CP022607_1 | 1.1|233313|25|CP022607|CRISPRCasFinder | 233313-233337 | 25 | CP022607.1 | 1572281-1572305 | 1 | 0.96 |
CP022607_1 | 1.1|233313|25|CP022607|CRISPRCasFinder | 233313-233337 | 25 | CP022607.1 | 1749717-1749741 | 1 | 0.96 |
CP022607_1 | 1.1|233313|25|CP022607|CRISPRCasFinder | 233313-233337 | 25 | CP022607.1 | 1901494-1901518 | 1 | 0.96 |
CP022607_1 | 1.1|233313|25|CP022607|CRISPRCasFinder | 233313-233337 | 25 | CP022607.1 | 2242455-2242479 | 1 | 0.96 |
CP022607_1 | 1.1|233313|25|CP022607|CRISPRCasFinder | 233313-233337 | 25 | CP022607.1 | 2578284-2578308 | 1 | 0.96 |
CP022607_3 | 3.1|776754|32|CP022607|CRISPRCasFinder | 776754-776785 | 32 | CP022607.1 | 335303-335334 | 1 | 0.969 |
CP022607_3 | 3.1|776754|32|CP022607|CRISPRCasFinder | 776754-776785 | 32 | CP022607.1 | 1749729-1749760 | 1 | 0.969 |
CP022607_5 | 5.1|1094799|26|CP022607|CRISPRCasFinder | 1094799-1094824 | 26 | CP022607.1 | 1304717-1304742 | 1 | 0.962 |
CP022607_7 | 7.1|1900081|31|CP022607|CRISPRCasFinder | 1900081-1900111 | 31 | CP022607.1 | 335186-335216 | 1 | 0.968 |
CP022607_7 | 7.1|1900081|31|CP022607|CRISPRCasFinder | 1900081-1900111 | 31 | CP022607.1 | 611643-611673 | 1 | 0.968 |
CP022607_7 | 7.1|1900081|31|CP022607|CRISPRCasFinder | 1900081-1900111 | 31 | CP022607.1 | 992765-992795 | 1 | 0.968 |
CP022607_7 | 7.1|1900081|31|CP022607|CRISPRCasFinder | 1900081-1900111 | 31 | CP022607.1 | 1094760-1094790 | 1 | 0.968 |
CP022607_7 | 7.1|1900081|31|CP022607|CRISPRCasFinder | 1900081-1900111 | 31 | CP022607.1 | 1304620-1304650 | 1 | 0.968 |
CP022607_7 | 7.1|1900081|31|CP022607|CRISPRCasFinder | 1900081-1900111 | 31 | CP022607.1 | 1572208-1572238 | 1 | 0.968 |
CP022607_7 | 7.1|1900081|31|CP022607|CRISPRCasFinder | 1900081-1900111 | 31 | CP022607.1 | 2242499-2242529 | 1 | 0.968 |
CP022607_7 | 7.1|1900081|31|CP022607|CRISPRCasFinder | 1900081-1900111 | 31 | CP022607.1 | 2527902-2527932 | 1 | 0.968 |
CP022607_1 | 1.1|233313|25|CP022607|CRISPRCasFinder | 233313-233337 | 25 | CP022607.1 | 789407-789431 | 2 | 0.92 |
CP022607_1 | 1.1|233313|25|CP022607|CRISPRCasFinder | 233313-233337 | 25 | CP022607.1 | 1309043-1309067 | 2 | 0.92 |
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CP022607_3 | 3.1|776754|32|CP022607|CRISPRCasFinder | 776754-776785 | 32 | CP022607.1 | 1910824-1910855 | 2 | 0.938 |
CP022607_3 | 3.1|776754|32|CP022607|CRISPRCasFinder | 776754-776785 | 32 | CP022607.1 | 2578296-2578327 | 2 | 0.938 |
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cggggccccaacatagaagctggcgg CRISPR spacer cgggggcccaacataaaagctggcgg Protospacer ***** *********.**********
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34. spacer 7.1|1900081|31|CP022607|CRISPRCasFinder matches to position: 2253302-2253332, mismatch: 2, identity: 0.935
cacattatcgtaagctgacttttcgtcagct CRISPR spacer cacattattgtatgctgacttttcgtcagct Protospacer ********.*** ******************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022607_1 | 1.1|233313|25|CP022607|CRISPRCasFinder | 233313-233337 | 25 | LC371242 | Escherichia phage EcS1 DNA, complete sequence | 15447-15471 | 2 | 0.92 |
CP022607_7 | 7.1|1900081|31|CP022607|CRISPRCasFinder | 1900081-1900111 | 31 | NC_021536 | Synechococcus phage S-IOM18 genomic sequence | 159749-159779 | 8 | 0.742 |
CP022607_7 | 7.1|1900081|31|CP022607|CRISPRCasFinder | 1900081-1900111 | 31 | LN846932 | Carnobacterium maltaromaticum strain LMA28 LMA_pa plamid, complete genome | 10622-10652 | 8 | 0.742 |
CP022607_3 | 3.1|776754|32|CP022607|CRISPRCasFinder | 776754-776785 | 32 | MN693281 | Marine virus AFVG_25M371, complete genome | 6448-6479 | 9 | 0.719 |
1. spacer 1.1|233313|25|CP022607|CRISPRCasFinder matches to LC371242 (Escherichia phage EcS1 DNA, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
tttcttttcgaaattctctttgttg CRISPR spacer tttctttacgaaattctttttgttg Protospacer ******* *********.*******
2. spacer 7.1|1900081|31|CP022607|CRISPRCasFinder matches to NC_021536 (Synechococcus phage S-IOM18 genomic sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
cacattatcgtaagctgacttttcgtcagct CRISPR spacer aattttatcgtaaggtgagttttcgtcaagc Protospacer *. ********** *** *********. .
3. spacer 7.1|1900081|31|CP022607|CRISPRCasFinder matches to LN846932 (Carnobacterium maltaromaticum strain LMA28 LMA_pa plamid, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
cacattatcgtaagctgacttttcgtcagct CRISPR spacer taatttatcgtaatctgatttttcgtcttca Protospacer .* ********* ****.******** *
4. spacer 3.1|776754|32|CP022607|CRISPRCasFinder matches to MN693281 (Marine virus AFVG_25M371, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
acttgcattgtttgtagaatttcttttcgaaa CRISPR spacer ttttgcattgtttgtaggatttcttctaagtg Protospacer .***************.*******.* .. .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
714248 : 722068
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP022607|714248:722068|DBSCAN-SWA ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTTACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTACGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTGTTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTGCGGTTTTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTTGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCGTGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAACGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAGTAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCGAGTGGGACAACAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCGATGACTGGTACTAAACCTTTAAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAGCCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGCGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGGTAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCAGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGATTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCGCCTAAAATTAATACAGAGGCAACAGCACCAACTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACTCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGTCAAAATAAGAGGAGGGCGGTTTTTTAAGTAAGGAAATATTTATCTAAACTAGTTATCACTAAAAAACACTTCTGATATTTTGAACTAAGAATATCAGAAGTGTTTTTTAGTTTTGGTATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTATTATTATTTTCAGCAGTTTCATCTAAGCTATTAAATGTTGAAATAAACAACATAATACCACCAATGATGAAAATGGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATCGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTGTTACTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCCACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACGCATTGTGTAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCAGGTGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGTGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGATTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCCTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACAACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGGCTAAAGTTCACTAAGAAGCCAGTGTTATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACAAGGAATGTGATGTGCAGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP022607|714248:722068|716779_717220_-|AXH27205.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAVASVLILGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >CP022607|714248:722068|717499_718084_-|AXH27206.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >CP022607|714248:722068|715303_715972_-|AXH27203.1|DBSCAN-SWA MDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >CP022607|714248:722068|719320_719989_-|AXH27209.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >CP022607|714248:722068|718182_718896_-|AXH27207.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >CP022607|714248:722068|714248_715304_-|AXH27202.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >CP022607|714248:722068|715964_716438_-|AXH27204.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >CP022607|714248:722068|720916_722068_+|AXH27211.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKERAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGTIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >CP022607|714248:722068|720339_720933_+|AXH27210.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHIRFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >CP022607|714248:722068|718899_719319_-|AXH27208.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDNTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
734038 : 748379
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP022607|734038:748379|DBSCAN-SWA TATGAAAGAACAACTTAATCAACTATCAGCATATCAGCCTGGTTTATCTCCAAGGGCATTGAAAGAAAAGTATGGCATTGAAGGAGATTTATATAAACTTGCATCAAATGAAAATTTGTATGGACCATCGCCTAAAGTTAAAGAAGCGATATCAGCACACTTAGATGAGTTATATTATTATCCTGAAACAGGATCACCGACATTAAAAGCGGCGATTAGTAAACATTTAAATGTAGATCAATCACGCATTTTATTTGGTGCGGGATTAGATGAAGTTATATTAATGATTTCTAGAGCTGTATTAACGCCAGGGGATACTATTGTTACAAGTGAAGCGACATTCGGTCAATATTATCACAATGCGATTGTTGAATCAGCTAATGTGATACAAGTACCTTTAAAAGATGGTGGCTTCGATTTAGAAGGTATTTTAAAAGAAGTTAATGAAGATACGTCATTGGTATGGTTATGTAATCCAAATAATCCTACAGGTACATATTTTAATCATGAGAGCTTAGATTCGTTTTTATCTCAAGTACCTCCACATGTACCAGTAATTATAGATGAAGCTTATTTTGAATTTGTGACAGCAGAGGACTACCCGGATACACTTGCTTTGCAACAAAAATATGACAATGCTTTCTTATTACGTACATTTTCAAAGGCGTATGGATTAGCGGGTTTACGTGTAGGATATGTGGTAGCAAGTGAACATGCGATTGAAAAATGGAACATCATTAGACCACCATTTAATGTGACACGTATATCTGAATACGCAGCAGTTGCAGCACTTGAAGATCAACAATATTTAAAAGAGGTAACACATAAAAATAGTGTTGAACGCGAAAGATTTTATCAATTACCTCAAAGTGAGTATTTCTTGCCAAGTCAAACGAATTTTATATTTGTAAAAACAAAGCGGGTAAATGAACTTTATGAAGCACTTTTAAATGTAGGGTGTATTACGCGACCATTTCCAACTGGTGTTAGAATTACAATTGGTTTTAAAGAACAAAATGATAAAATGTTAGAAGTTTTATCAAACTTTAAATACGAATAGTAAGTGGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCGCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACCCCGGCAAGGTTGACTAGAATTGAAAAAAGCTTGTTACAAGCGCATTTTCGTTCAGTCAACTACTGCCAATATAACTTTGTAGAGCATTGAACATTGATTTATGTCTCAAGCTCAATGCAGTGTGAATGATGAGGTGAGAGTATTCAGTGTAAAAAGCAACAATAGATGATATTGTTTTGTATCAATTGCTTTTTTGCTATACTGAATCAATACTGATATTTTGAGGAGAAGATTAAAATGACCCGTAAATCAATCGCGATTGATATGGATGAAGTATTGGCAGATACATTAGGAGAAATCATTGATGCTGTCAATTTTAGAGCGGATTTAGGTATTAAAATGGAAGCTTTGAATGGTCAAAAACTTAAACATGTTATTCCTGAACATGATGGATTAATTACAGAAGTATTGAGAGAACCAGGCTTCTTCAGACATCTTAAAGTGATGCCGTATGCACAAGAAGTTGTGAAAAAATTAACTGAACATTATGATGTATATATTGCTACAGCAGCAATGGATGTACCAACATCATTTAGTGATAAATATGAATGGTTACTAGAGTTCTTTCCATTTTTAGATCCTCAGCATTTTGTTTTTTGTGGTAGAAAAAACATCGTTAAAGCTGATTATTTAATAGATGACAATCCTAGACAGCTTGAAATTTTTACTGGTACACCGATTATGTTTACAGCAGTGCATAATATTAATGATGATCGATTTGAACGCGTAAATAGCTGGAAAGATGTAGAACAGTATTTTTTAGATAATATTGAGAAATAAAATATATCACTTGAAAAATTTCATGTAGAAAAGATGATGGATAGGCTATAAAGTAATTGTGACTGAGATGAACTTTTATGTCTTAGACACTACAACACTATATTGGCAGTAGTTGACTGCGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGAACGCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACATAAAGAAATACTTTTTCTTTAGAAATTAGTATTTCTTATGCATGAGTGTAACTCATGCATTCATATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTCTATCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAACATCAATCATTTTAGTGGCATGCGCCAAAATTATATGTCTGTTTTTGAAACAGGGTAATAGCTTAAAGCTAATAAAAACGAATATAAGGTGCGTTGAATCTTATGATTACACTCCAAACCTAATATAATATCGGGTTAAGATCATTCCGGATGCTTACAAATCATTGACAGTAAGTAACTGAATGGCATTTGGTATAACCTCAATATCAATAGGTGTTTCTAATGAAATTTCGCCATCAATATCAACTTTCATTGCTGGATCTGTTGTAAGTGAAATCTTTTTACCAGGTATATGCTCAATACCTTGAGTAATTTCATTCCAATTCATGCTATCACGCTTTTTAAAAATATCATTTAAAATACTGAAACTTTGTTCATTAAAAATGAAAGTGTTCAGTTCACCATCTTGAGGAGACAAATCAGTCAATGGTATACGACTACCACCAATGAATGGACCATTTGCTGTTAGTATCATGGTCGTTTCGCCAGAATATGTCTTATCATCTATTGATAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATGAGACCTAAGCCAACAAAGTTGAGTGCATATTGATTATTTATTTTAATTACATCGTATTTACCAACTTGTGCAGAAATCATTTGTTCACTAGCTTGTTTATGATTAGGTGCTATATTTAGCGTTTTTGTAAAATCATTAAAAGTACCGCCTGGTAAAATGCCAATAGGGAGTTGAAGGTCATGTGTCATAACACCGTTTATAAGTTCGTTAACCGTGCCATCACCGCCAAGAATAAATAATATATCTACATCTTTTGCATAGTTTTTAGTTTTGATTTCTTGGCAATATTTAATAATGTCACCTTCGTTTTCACTCAATTGAATAGAAAGATGCTTACAAATTGAACTTAATGCTGTTGTAACTTCCCCAATACCTTGATTAATATTTTTTAATCCACTGTGTTCATGGTAAAAGAGGACACCATGTGTATATTTATTTTCCATAGTTTAGCCTACTTTCTAAAAATTGGTTCATTAAATATATATACCCACTTTTAATTGTTAATACCAAAAATATGTTTTAAATAGAGAAAATGGTAATAACTGACATTGATGTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAACGAGCATATTAAGCTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTAATTTAGGCCAACAATATTAACGAATACCTTTCATTGCTTTAATAATTAAAGGTGAGAATGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAATTTGTTTGACCTAGTGGTTCTATTAACTTAACTAAAGTACCATTGATTGCTTGTGCAGAAGCGTTAGTTAAGTACCAAATACTCATCATTTGGGCATTAAATGCTTTAGGTGCTAACTTAACAGCAGCACTATTACCCGTTGGTGATAAGCATAGCTCACCGATAACACAAATAATGTACGATAAAATAACCCAGTTAACTGAAAAGTTTGATGAACCTGATGCATAACCTACAATACCAATTAGTATGTATGACGCACCTGCTAAGAACGTACCAATTGCAAATTTCACTGGCAGGCTAGGTTGTTTAGTTCCAAGCTTTTGCCATAAAAGTGAAATAATTGGAGCTAATAATAAAATAAATAATGGGTTAATTGATTGGAAGATCGCTTCACCAAAGTTTGTTTTCCAACCAAATAAGTTTAATTTCATATCTGAATGTTCAATTCCATAAATGTTTAATACATTAGACCCTTGTTCTTGAATAGCCCAGAACACCATTCCAAGAATAAATAATGGAATAAATGCTTTAACACGAGAACGTTCAGTATCAGTGACATCTTTACTTCTAATAATTAAAGTGAAGTAAATGATTGGTAATGCAATACCTAATACTAAAACAGTATTACTAACTAAGTTAAATGATAATGAATTAGTTAATGCACCAATAACGATAATTAATACAATTGCTAAGACAACACTTCCGATAATAAGACCATACTTTTTCTTTTCAGCTGGTGTCAATGGGTTAGTAGGTTTCATACCAACGCTACCTAAGTTTTTGCGGTTGAAAAGTACATACCATACTAAACCTAATGCCATACCAACTGCTGCAATCAAGAATCCGCCGTGGAAGTTTTTAACATTAACAAAGTGTTGCAAAATAATAGGTGATAATAATGCACCCATATTAACTGACATATAGAAAATAACAAAACCTGCATCCATACGTCTATCATTTTCAGGATATAAACGGCCAACGATATTTGAAATGTTTGGCTTCATTAAACCTGAACCAATAATGATGAAGAACATTGATGTGAATAAGCCGATTAATGCAAATGGTAAGCTTAAACAAATATGTCCGATAATAATAAAGACTGCACCTAATAAAGTAGCACCTCTAGTACCTGTAATTCTGTCAGCAATCCATCCGCCTGGTATTGATGTCATATAGATTAATGAACCATAAACTGAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP022607|734038:748379|737743_739249_-|AXH27223.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >CP022607|734038:748379|739589_740090_-|AXH27224.1|DBSCAN-SWA MAHGRQKDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >CP022607|734038:748379|744360_745332_+|AXH27228.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >CP022607|734038:748379|742137_744243_+|AXH27227.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >CP022607|734038:748379|741776_742175_+|AXH27226.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >CP022607|734038:748379|740109_740976_-|AXH27225.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNIVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >CP022607|734038:748379|746664_747621_+|AXH27230.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >CP022607|734038:748379|747617_748379_+|AXH27231.1|DBSCAN-SWA MIQVENLTKTINNQMILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDNGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMNIQIEHIRNQRICLYFKD >CP022607|734038:748379|735391_735934_+|AXH27221.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPYAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >CP022607|734038:748379|736557_737475_-|AXH27222.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGKYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >CP022607|734038:748379|734038_735097_+|AXH27220.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEYFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >CP022607|734038:748379|745706_746678_+|AXH27229.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ |
12 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
994254 : 1002664
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP022607|994254:1002664|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP022607|994254:1002664|1002097_1002664_+|AXH27474.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNKDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >CP022607|994254:1002664|995788_996493_+|AXH27468.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIASDEDIEILKSKALKINNVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >CP022607|994254:1002664|999589_1001074_+|AXH27472.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >CP022607|994254:1002664|994254_994674_+|AXH27466.1|DBSCAN-SWA MLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGINIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >CP022607|994254:1002664|996492_996756_+|AXH27469.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >CP022607|994254:1002664|1001066_1002095_+|AXH27473.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >CP022607|994254:1002664|994660_995785_+|AXH27467.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVVVLDPSEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITFFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >CP022607|994254:1002664|997421_999611_+|AXH27471.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGDHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >CP022607|994254:1002664|996757_997429_+|AXH27470.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIMNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1543753 : 1552083
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP022607|1543753:1552083|DBSCAN-SWA ATTAATTACAACATTCTCGATTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCGATATCATGAGTAACTAAGATAATGGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTTGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCGAGCAATCATTACACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCATTATCTTTGCTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAACCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATTGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTTTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGCATTCAACTATACAACTCCTAGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAATTAGACAAAATAAAGAGATATGCCCCCTTCAAGTTTTATTTATCGCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATTTTATTGTTGCATAACCTTATTTTTTAATTCTGGGTCAAATTGCTGTTGTTTTAACATTTCAATTTCAAGTTTATATGGCGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGTGTTTCTAAGATTTTCGGAATATCTTTAAAACTATCATGATGCACAATGTAATTTAATGCATCAAAACCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCGCCACGGTCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTGATTCTGTCGACTCCAATAATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAGTCCTCTTTCACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAACATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATACGTGCTAACTCTTCAAACGAGCGACCAATCTCTGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCAGCTCCAACATGCGCACCTGGATGTAATACAATATCTTTAGCGCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGAACAACAATATTAGATAAGCCATATTTTTCCATCACTTCATGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTGTTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATAAATGTTGTTTCACCATATTCATACGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAATTGTTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGTTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAATACAAAACCGCGATCTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTAATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGACCAGTTCGTCCAACTCTATGCGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCAATAACGTATTGGAATTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGTGGCGTTAAACCACCATGAATCATACCAACTTTAATACCAGCTTCATTTAGTGAACGTGCTAAATCATTTGCATTATCTCTACTATTACAGAAAATAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTTTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAAAAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTTAAAAATGGTTGTAACTGTTGTGGAATTGTAGCACTAAACACCGCAATATTTGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCAATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGATCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTTTAGCTAAGTCATTAATTCTAGTAGGGGTGCCTATAATCAATTGTGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCTTTCTCTATATCTGTACCACCAATAAAAACTTTAACTGAAACACCAGCTTTAAATTGGCTTAAATGGTTCGCTGCATCGTATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACTACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCAATTAACTGCATTAATGGTAATAAAAATGCATGAGATTTCCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTCTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTATATGTTCATCTTTACTATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCAAAATTTCAAAATTTAGAAATCCCGAGATTTTAGTTTAAATATATTGAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTATATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAACGTTTTTAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAATTCACACCATGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCGCCTTGTTGGACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCAATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACTCACCAACAAAACGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAATATCAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGGGATGTTTGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGATGGTATTGTTTAATTAATTGCTCAGCCCTTGACTTTTGATATGCATCTATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGCCCTCTTCCTTCACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGCGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATGGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACATCTTGTTGATTATTTATTATTGAAATGTTCTTCAAACCCATCGCCTTCGCCAACATCATATTGACACCATACGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATCGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATGATCAAACCATAACCATTAGCTTTTAATGATGTTACGCCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAACCTTTTTCGATTGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTTCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTACTAAATGGCACATGATGATCTAACAATGTCATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCGTCATTAATTTGAGCTAAACGTTGATGATGTTGTTCAGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTGTTCAGCAATTTTGGTCCGAATTTCAATCCATCAGATGATAGCTCTATTAATTGTGTAGAATATTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAATTTTCAGTTTGGATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCAATAAGTGGTCCGCCCATACCACATATTGTGATATTATCGATTACGTCCTCAGGATGAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTCTATCTACTAATTGGTTTGCAGCTACATTTTTCACAGCAGCTTGAAAAGGGCCTTGAATAACTTCTCCTGCAATACCGTAATCGCATAAATGGTTTTGAATTGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTACCTTGTTTTAAAAATCGACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGTCTTTCAAACGTTTACTACGACTTGGATGTCTTAATTTTCTAAGTGCTTTTGCTTCGATTTGTCGAATACGTTCACGTGTAACACCGAAAACTTTACCAACTTCTTCAAGTGTTCTTGTTCTGCCGTCATCAAGACCAAATCTTAATCGTAATACATTTTCTTCTCTATCAGTTAATGTATCAAGCACATCTTCTAATTGCTCTTTTAATAATTCATAAGCAGCATGATCTGAAGGACTTTGTGCTTCCTGATCCTCAATAAAGTCTCCTAAATGACTATCATCTTCTTCACCAATTGGTGTTTCTAATGAAACAGGTTCTTGCGCAATTTTTAAAATTTCACGAACTTTTTCTGCTGGTAAATCCATTTCTTCACCAATTTCTTCTGGTGCTGGATCTCGACCTAAGTCCTGTAATAATTGACGTTGAACACGAATTAATTTATTAATTGTTTCTACCATATGCACAGGGATACGAATCGTACGTGCTTGGTCAGCAATTGCACGAGTGATTGCTTGTCTAATCCACCATGTTGCATATGTTGAAAACTTAAATCCTTTGTTAAAGTCAAATTTTTCAACAGCTTTAATAAGACCCATATTACCTTCTTGGATTAAATCAAGGAATAACATACCACGACCTACGTATCTTTTAGCAATACTTACAACTAAACGTAAGTTCGCTTCTGCAAGTCTTGATTTTGCTACTTCATCACCTTGTTCAATACGTTTGGCTAATTCGATTTCTTCTTGTGCACTTAATAAGTTAACACGCCCAATTTCTTTAAGGTACATACGAACTGGGTCATTTATTTTAACACCTGGAGGGGCACTAAGATCACTTGGATTCAGTTTCTCGTCAGTATCTGAACTATCTTTTTCATTAACTAGTGAAATATCATTATCATTTAATTGATCAAAGAAATCATCCATTTGATCAGAGTCGATATCAAAATTCTGAAGTTTTTCAGCAATTTCTTCATGACTTAAATGACCCTCTTTTTTACCTTTTTCAATTAATTGCTTCTTAACATCTTCTAATGTTAATGTCGGATCAATTGTTTGTTTTTTAATTTTAACTGTGTTATCAGACATGAAACGGCCTCCCGATTTTAAATATGAACATTCGAAATTTATTCAATATTGCTATTTTAAACTAAATTCTTAATTAATTCATCCATATTTTTAATTTTATTTTACAAATTGGAACTAATCCCAATATTTATTTTTCAATATTGTTGTTTAAATGCGGTAACTATCATTTACCCTTATACATTTTGACATAATCATTATTCGTATTATTCTTTAAAACCACATGCTACATGCGTTCTTTATTCTTAGCAACAATTTGCTGTAAATAGTATTTTTGTAATTCTACATCGCCAATCCTTGTAGCTTCCCTTAATTTATGATTCAATGACTCAATTGTTTCTTGTCCTTTTTCATTAATAACATTGACATAATCATCAATTTCATTTTCATATGGTTCGTCATTCAAATTATATTGTTCTAAGCTAATTAGTGTTTCTCTCAACTCATTTGAATTAACATACTGCACAGCATCACTGATATTATATTGATCATTTTCCGCATAAAAATCATGTAAGACTTCGAATACATATTTAAAATGCTGATTTGTGAAGTTATCCTTATCAACACTTTCATAATAATTTAAAAATGTATCTTTATCTCTCATTAAATGTTTTAAAAATGCTCGCTCCGCTTTTTCTTGACGGCTCAAATTGTCAAATTGTGCCATACCAATTGGCTCAGGTTCAATATAACCGCCATACTCATCATAACCGCCATACTCATCTTCTGGATAATAATTGGCTGGTGCTTGATTGAATTGTATTTCGTTAGCTAACTGCTCAGGACTAACATTGAAAAATGGCGCAACATCATTTATAGCCTTTTGTTGCAGAATTGATGACTTCATAAGTGAAATGTCATGACTCAGTTCTTTCAAATAACGTTCATATGAAAGGTCATTATGTGCAATTTCATCTTTTAATATACTCACTTTATAATGTGCAAATGACTTTTTGTCATTTTTTACAAAAGCAGTAAATGCATCGTTGCCATACTTACCAATGTATTCATCCGGATCCATGCCTGATGGCAATTGTATAACAAATACATTTAGCCCTTGCTGTAACAAATGTTGACCTGTTTTAAGTGTTGCTTCACTACCCGCAAAATCCCCATCAAACATTAATGTTATATTTGATGTTAACTTTCGTATAAAAGTAATATGTTCATCTGACAACTGTGTCCCCATTGTTGCAACAACGTTTTTCAAGCCAGCAGTATCAGATTTTATAACATCCATAAAACCTTCTAGTAATACGATTTCATCTAATTTTCTAATTGATTTACGCGCTTTATCTAAGTTGTATAACAACTTTCTTTTTTGAAAGATAGGTGTTTCAGGACTATTTAGGTATTTTGGTTCTTGACCGGTATATGTTCGACCTGAATATCCAACAATTCTTCCTTGCGCATTTTTCAAAGGAAACATAATACGATTTCGAAATCTATCGTAATAACTGAAATTTTCTTCGTTACGTGATAATAATCCGGCTTCATATGCTAATTCAATATCGTAACCCTTTTTTTGAAGAAAATCATGACAAAAATGTGAGCTATCGGGTGCAAAGCCAATGCCTCGCTCTTTAATAAGCGCATCTGTAAAACCACGTTCTTGTAAGTATGTTAATGCTTGTTCGCCTTCGACTGTCTTTGTTAAAGCGTAATAATAAAATTCTTGTATTAACTCATGCATTTCAATCATTTGTAAATCATCAGAAGCAATTTGAACATTTGAGTTAGATTGTGTTGCCTCAATATCTACAGCAACATTAACTCTATCACCTAATTCTTTAACCGCTTCAACAAATGATATGTCTTTAATTTCTTGAGTAAATTGAAAAACATTGCCACCTTTTTTACAACCAAAACAATGACAGATTTGTTTATCTTCAGAAACTGTAAATGAAGGTGTCTTTTCATCATGAAAAGGACACAAACCTATATAATTGCGTCCTCTCTTTTCTAGTTTTACATATTCACTTACCAAGTCTAAAATGTCGGTTTTATCTTTTATTTCATTAATGATCGATTGATCTATTCGCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP022607|1543753:1552083|1545564_1546911_-|AXH27954.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >CP022607|1543753:1552083|1543753_1544539_-|AXH27952.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >CP022607|1543753:1552083|1544664_1545555_-|AXH27953.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAYEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >CP022607|1543753:1552083|1550265_1552083_-|AXH27958.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKAINDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYNLNDEPYENEIDDYVNVINEKGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >CP022607|1543753:1552083|1547024_1548125_-|AXH27955.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFSTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPYGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDAYQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI >CP022607|1543753:1552083|1548935_1550042_-|AXH27957.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD >CP022607|1543753:1552083|1548127_1548805_-|AXH27956.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCDYGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTQLIELSSDGLKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL |
7 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1619862 : 1628902
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP022607|1619862:1628902|DBSCAN-SWA ATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATACCGCCTAATTTTTCAACTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTTAAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAAGCCAATCCCCATTGAATAAGCTACAGGACAGCCAATGATAAAGCCACGCGCTTCAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACTATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATTGATATACTTTGCTGGAATCAATCGATCTTTTATCAGGTTGTTGATTGATTCGAATTAAACCATCTTCTTGTGTTACAAATTTTAAGTCTAAGAAAACTTTCAACATGAATTTAAGTGTATCTGGTTTCACACTTAAATGTTGACACAATAACATACCCTCTTTCTGGATATTTGTTTCTTGTTTAGTTATTAATGCTTTATAACACTTTTTAAAAATATCCATATTAGGTATACCATCGAAGTAAATCGAATGATTATGTTGCAAAACTATATAAAGTTGAGAAAATTGCAGTTGTTGCAAGGAATTAGACAAGTCTTCCATTGACGTTGGTAAATCTCTTAATACTACTTTATCAGTTTGTTGTTTAATTTCTTCACCATAATAATATTCATTCGCATTTACTTTATCACTTTTAGGATGAATAAGCATGACAATATTTTCATCATTTTCTGTAAAAGGTAAACTTTTTCGCTTACTTCTATAATCTAATATTTGCTGTTCATTCATCGCAATATCTTGAATAATTAATTGCGGTGATTGATTACCATTCCATTCGTTGATTTGAACAGATCCTAATATATTAATTGGCTGTTCATCTTGTAACTCAGGTTCTAAGTGACCATTTTGCCAAAATAGCGCGGCGATATTACTTTCACCAAGTGTCAATTTTAGATGATTTTTTTGTTGACCTATCGCCTTAACTGAAGAAACTGATAAATCATCCATTTCAAAAATAGGTCTAGAAAAATCTGTTCCGAAGGGTCTTAAACGATTCATATCACGAATATTTTTAATCGTTATATCATTTTCTGTTAATAATACATCTACTTGCTTTACGGGATCTAACGAAGTTGTTTTAGATAATTCTTTCATCCATTTATTTAAACCTTCAGCTAACGATTCTATATTTTCAATATCCATCGTCATACCTGCAGCCATATGATGGCCGCCAAATTTAGCGATTAACTCTTGATGTGCTGATAGTATTTCAAACATCGACACTTGATCAATTGATCTGGCGGAACCTTTTGCATGATTTTGCTCCCTATCAATATTTAAAATTAATGTTGGCAAAGCAAATGTTTCGACAATTTTCGAAGCAACAATACCTAAGACACCTTCATGCCAATTTTCTTTTGCTAAAAGTAAAAATAAATCTCCCTTTTTAACTTTCGTTTCTGCCATAGCCATTGCTTCTTCTGTGATAGTTGCTACAATATCTTTTCTTTCACGGTTAAAATGTTCAACTTGTTCTGCTAAAAATGCAGCTTCTTCTTCGTCAGTCATCAACAATTCGCAAGCTAATGATGCGTCATCTAAACGACCTACAGCATTAAGTCTAGGTCCAATAATAAAACCAATTGTTTCTTCATCAATATTGTCATTGTATCCCGCTTCTTTTAGCAATGCTTTAACAGAGGTCGGACATTGATCATTCAAGACTTTTAATCCTTGTTTCACTAATGATCGATTTTCATCAGTTAAGGATACTAAATCCGCAATGGTACCTATCGCAACTAATGCTTTAAAATAATCAGGTACATTTTCAATCAATGCTTGTGCTAATTTATACGCAACACCTGCACCACACAATTGTTGGAACGGATAATTAAACGATGGATGCATTGGATGTACGATTGCATATGCTTCTGGTAATGTACTACCAATTTCATGATGATCAGTTACAATGACATCAACTCCTAAATCTTGAACCATTTTAATTTCATTATGACCTTGTATGCCATTATCAACAGTTATGATTAATGTTATGCCTTCATCATGAGCATTTCTAAATGCTAGTTCGTTTGGTCCATATCCTTCGGTAAAGCGGTTAGGAATATGCCATCCTACTTGTGCACCTAAAAGTTGTAATGTTGTCACTAAAATTGTAGTTGAGGTAACACCGTCGGCATCGTAATCACCATAAACTAGGATTTTCTCATCATTCGCTATCGCTCTTTTAATTCTTTCAATAGTCTTAGTCATATCGCTCAATTGCAGTGCATCATGATTGATATCTGTATCTGAAATGATGGATTCTATTGCTTGTTCATCAATAATCGATTTACTTTCTAATATTTTTTTTACGATTGGCGTTAACTTTAATTTTGATGTTAATTCATCACTTATGTATTCAGCTGGTTTAGTTAATTTCCACTTATACTTCGGTTTAATCATATATATTTACGCCTCATTTCCAAAAGACATTATATCTAAAATTACTTTAAATAAAAAGCACTTATCTAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTATATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAACTCTTTATTGTTTCACATACCGCTTAATTCATTTTAAACTAAAATCTTTTCATCGTTCGATTTCTTTTCTTTATATACAACTAATTTGTGTTTCGGCGATTTTTTCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGCGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACGTTACGATTGTATCATTAATTGAATAACCGACAATTGTTAATACAGCGGCGATAAATGTTAAATCTACTTCAATTCTAAATAAACTGAAAATCGCTACTATAATGAATACATCATGTAATAATGCCAATACAGATGAAAGACCCATGCGCCATTCAAATCGTAATGATACATAGATGATGATACCTATCGATGCATAGATTAATGCAAGCATTGCATTTTTTGCTAATTCCTGTCCAATAATTGGTGATACAGTATTAATTTGAGGTGTGTCACCGAATTTCGATTTAATATTATCACTCAATTTATTATCTTGAGCACGCGTTAAATCGTCTTTAAATTGAACAGTTGCTACTTTATTATCTTTACCATTGATTTGAATTTGATCCGCTTTAAGTCCACTATCTTTTACAACTTGCTCAACCTTTTGTTGAGTAATTGCTTGTTTAGATTGGAAATCTACACGTGTACCACTTGAGAAATCAATTCCTAAGTTTAACTTGAAGATATAAAGAATAACTAAACCGACAACTACAATTAAAATACTTACTCCAATTAATGGCTTAGCTAATTTAACAAAATTCCATTTCTCGAATGAAGTTTTAAGGTCATGAACATCTACACCTTCATTAATATCATGTCGTTTATTCTTTTTAACACCAAATAACCAAAATTGATTTTTGAATATATTTGATGAAACAAGTAATGATAATAAGAATCTTGATAAGAACACGGCTGTAACAAAGATCATTAGAATACCTAATAATAACATTGTCGCGAAACCTTTAACTGAACTTTCACCGAAGAAGAATAATACTGCTGCGGCGATAACTGTTGTTAAGTTAGAATCAAAAATTGTTAGGAATGAACTTTTGTTTGCTTTAGAAAAGGCTTGCTTTATCGTTCTACCTATTCGAAGTTCATCCTTAATACGCTCATACATGATAATATTGGCATCTACAGCCATACCTACACCTAATACCAACGCCGCTAATCCTGGTAAAGTTAGAACCCCGGAAATGAAATTAAATGCTACTAACGTTAGATAGATATAAGTTGTCAATGCAATAATCGCTACTAAACCAGGTAATCGGTAGAATCCAAGCATGAATAAATAAATTAATGCTACACCAATAAACGATGCAAACACAGTTTTATCTAATGCATCTTGACCAAATTGGGCACCTACTGAGTTTGAATAAATTTCTTTCAAGTCAACTGGTAAAGAACCTGCATTTAACAATTCGGCGATTTGTTTTGCTTTTTTAACGCCTTCTTGTCCTTTAAATCCACCCGAGATTTCTACGCTATCAGAATTGATTGGTTGATCAACACTTGCTGCAGAAATAAATTTAGGGTTTTTCTTTTGTGCTTCTTTTTTATAGCTGTCACCTTTTTTGAAATCTAACCAAACAACCATGACATTATCACGTTTCTTAGAGATTTCTTCCGTTACTTTTTTAAATTTGTTTTTGTCTTTTACTTTAAAAGTAACTGTAGGCTGGTTTGTTTCCTGTTTAAATTCTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAGGATCGACTTGATAAAGCACCTCAAATCCACCTTGCAAATCAAGTCCTAAATTGACATTCTTTATAACACTTTTATAAGTTGCAGCCATTCCGGCAAACAACAATACGACTAAAAGCAAGAACGCAATTATTCTACTACTTTTCTTCACATGAACACCTCATTATTTACGTATGTATTTAGAATACTTGAATACTATTTTATAACGCAAGTTAAATCTTTCTTACAAAATTTATTAGCCTTATACATATTAACATACTAGAGCAGGGAGTAAAAATAGTCATAGATATATTTAATTTAAATTTAACAATTATTATGTATCACAATTTCTTTTTCTGGAATAAAAATAAGCTATTCTACATACTACTTATAACTTAAAAAGGATGAAACGCTATTCGTTTCATCCTTTTTAATACCACTTCTCATTATGAAGGGTCAACTTGTTTAATAGCAGGTTTTTCGAAAGTTAATTCAGTACCATGACCATTAACTGTAATAACAACAGTTGTTTCATCTACTGCTTTAACAGTACCTTTAATACCACCAATAGTTGTAATTCTTTGACCAGATTGAATGTTATTAATCAACTCACGATGCTGTTTCGCACGTTTTTGTTGTGGTCTGATCATCAAGAAATACATAACCGCAAAAATTACGACTATATATATTAGTAATGAAAATTGCATTTTATACGCTCCTCTTGCTTAAAAGTTTTTTGGGTTCTCAACATTTAATCCATATTGCTCGAAGAATTCTTCTTTGAAATCTAAAAGACGATCTTCTCGAATGGCTTGTCTTATATCTTCCATTAATTTTAGCAGAAAATGTAAATTATGAATAGTAGTAAGACGAATACCAAAAGTTTCCTCTGCCTTGATTAAATGACGTATATACGCTCTTGAATAGTTTTGACATGTATAACAGTCACAATTCTCATCTAACGGTCTTAAATCATCTGCAAATTTTGCATTTTTAATAACTAAACGACCTTGCGATGTCATACAAGTACCATTTCTGGCAATACGTGTCGGTAAGACACAATCAAACATATCCATGCCGCGAATACTACATTCGATTAACGCATCTGGAGATCCTACACCCATTAAATATCTTGGTTTATCTTTAGGCATAAACTGCTCTGTATGTTCAACCATTTTATACATAACCGGTTTAGGTTCACCAACTGACAAACCGCCGATTGCATAACCAGGAAAATCTAATTCTACTAAATCCTTTGCACTTTGTTCTCTTAAATCTTCATATTCGCCACCTTGTATAATGCCGAACAATGCTTGATCTTCAGGTCTTTGTTGTGCATCTAGACATCTTTTCGCCCAACGTGTTGTACGTTCAATAGATTTTTTTACATAATCATATTCAGCAGGCATCGGTGGACATTCATCAAATGCCATCATAATATCAGATCCTAAATCATTTTGAATTTGCATTGATTTCTCAGGACTCAAAAATAATTTAGACCCATTAGTATGATGTCTAAATTCCACGCCTTCTTCTGTAATTTTACGTAAATTACTTAAACTAAACACTTGGAAACCGCCTGAATCTGTAAGAATCGGACCATCCCAATTCATGAATTTATGTAATCCCCCAGCGTGTTTGATAATATCATTTCCGGGTTGTAACCACAAATGATATGTGTTGCCCAAAATGATTTTTGCTTCAATTTGTCTTAACTCTTCTGGACTCATTGTTTTAACGGTTGCTTTAGTACCAACTGGCATAAACATAGGTGTTTCAAATGAACCGTGTGGTGTGTGCACGATACCTAAACGCGCACCTGATTGTTTACAAGTTTTAATGTGTTCATATGTTACTGCAGGCATATTCAAAATCCTCACATTCTTTTTATATAATTAACATTGCATCGCCAAAACTAAAGAATCTATATTCTAAATTTACTGCCGTTTTATAAGCATTCAGAACATTTTCACGAGTACTAAACGCTGATACTAGCATAACTAATGTTGATTTTGGTAAATGAAAATTAGTAATCTGGCCATCAATTGCTTTAAAATCAAATCCTGGATAAATAAATATATTAGTCCAGCCACTCGTTTCAACAAATTTATCATGATCGCGTCGAATTGTTTCAAGTGTACGTGTTGAAGTTGTACCAACTGATATAATGCGATGTCCTTTGGACTTAGTATCATTTAATAAATCAGCTGTTTCTTGTGTCATTTGATAATATTCACTATGCATTTCGTGGTCATTCACATCATCGACGCTCACCGGTCTAAACGTACCTAACCCAACATGTAATGTAACAAATGCGATATTAACACCTTTATTTTTAATTTCAGTTAATAACTCATCAGTAAAATGTAATCCTGCTGTTGGTGCTGCCGCTGAACCACTTTCTTTAGCGTAAACTGTTTGATAACGATCTGGATCATCTAAACGTTCTTTGATGTATGGTGGCAGTGGCATTTCCCCTAATTCATCTAATCTTTCTTGTAAAATACCTTCATAATGTAAACGCATGATGCGTCCACCTTGATCCATTTCTTTTATGCATTCAGCTATAATTTTGCCATTACCAAAATTCAATTTATTACCAACTTTAATACGCTTAGCTGGTTTCAGTAAGACTTCCCAATCATTACCTTCAATTTGAGTTAGCATTAACATTTCAACTTTTGCACCAGTTTCTTCTTTTAAACCAAAAAGTCTAGCTGGCATTACTCGCGTATCGTTAAGCACTAATGTATCACCAGGTCTAAAATACTCAATGATATCTTTGAAATGTAAATGTTTCATTTCACCAGTTTCTCTATCCATGACTAATAAACGACTATGATCACGATCTTTTAAAGGCGTTTGAGCAATTAATGATTCTGGTAAGTCATAGTCAAATTCTTCAATATTCACGTTATTCTCTCTCCTCATTCGACTTTGCAAAATGTTCATAAGCTAATGGTGTTGCTTTTCTGCCACGTGGCGTACGTTCTAAAAAGCCTTTCTGAATAAGAAATGGCTCATAAACGTCCTCAATTGTAATACGCTCTTCACCAATTGTTACGGCAATCGTATCTAAACCAACAGGTCCACCATTATACTGCTTAATAATACAGTTCATCATTTTATGATCAATGTAATCTAGTCCGTGTTGATCAACTTGAAGTAAACCTAATGCGTGCTTCGTTGTTTCAATGTATATTTGTTCATCTTCATTCACTTGCTGGAAGTCTCTTACCCGCTTCAATAGTCGATTTGCTACTCTTGGAGTCCCTCTAGAACGTTTAGCAAGTTCAATGGCACTTTCTTCATCAATACCTGTGCCTAAAACCTCAGCTGTTCTAATAATGATTTCTTTTAAATCTGATTCATTATAATATTCTAATCTTAAGTGCACACCAAATCGATCCCTTAGTGGACCTGTTAAGCTGCCAGCTCGCGTTGTTGCACCTACCAAAGTGAATGGAGGTAAGTCGATACGGATACTTCTAGCCTCATCGCCTTTACCAATGATAATATCTAAAAAGAAATCTTCCATTGCAGGGTATAACACTTCTTCAACAACACTACTCAGTCTGTGTATTTCATCAATAAACAAAACATCTCCAGGTTGAAGTCCTGATAAAATTGCAGCCAAATCACCAGGTCTTTCTAATGAAGGCCCTGATACTGTACGTATATTAACTTCCATTTCATTGGCAATGATATTAGATAATGTTGTCTTACCTAATCCAGGGGGGCCAAAAAGCAATACATGATCTAATGGTTCATGACGAAGTTTAGCCGCTTTAATAAATACTTCTAAATTACTTTTTATTGAATTTTGACCAATATATTGTCGTAATCTCGTAGGTCTAAGCGACAATTCGAAATCAGTTTCTTCACTATGCATTGATTGATCAACCATACGCTCATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP022607|1619862:1628902|1619862_1620381_-|AXH28028.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >CP022607|1619862:1628902|1625429_1625690_-|AXH28031.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >CP022607|1619862:1628902|1622875_1625155_-|AXH28030.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >CP022607|1619862:1628902|1627897_1628902_-|AXH28034.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE >CP022607|1619862:1628902|1626870_1627896_-|AXH28033.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >CP022607|1619862:1628902|1625708_1626848_-|AXH28032.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAQQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >CP022607|1619862:1628902|1620402_1622673_-|AXH28029.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDALQLSDMTKTIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKKGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKQVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVMLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1754707 : 1821797
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP022607|1754707:1821797|DBSCAN-SWA ATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATTCTTTCAATGGTAAATCCATTCCTTCAGAACCTGTATTTGGAAGTTCTTTTTCAACTTTGCGCGATTCATGTGTCTCTTCTTTTTTAATAGGCGTACAAACTTTTGGAGCTGGCTGAATTTCTTTTGGTGATACTTTCGTCTCTTCAGCTGGTAATTTAATTGCTAAAATTTCATCAACAATGAATTGCGTGTGTTGTTTGATGTCATTTAATGTCGCATCTTCATCAATCATTCTATTGCCATCTGCAACATATTGATCAATTAATACTTTTACTTTAGCTAATTGTTCTGGTGTTGCGATCGCTTTGAATTTCGCATATGTTTGTTGAGCAATGTTATCAATTCGCAGTAAGCTATTTTCTTTTTCAGTAATTACTGCTTCTATATCGCTTAATGCAACATTAAATCGTTTTAAAACTGCATCAACATCAGCATTAGTGCGTGCTGTTTTTAATTCTTCATCCATTTGTAATTTTAAAGCAGTTATAGCTTTTAATGCATCAGCCTTATTACGATTACTTACTTTTCGATAATTTTGCACTAAAGCAGTGACGCGTGCAAGATCATCATTAATCGTTTTTTCAGCATCTGGCTTTTTAATAGGATGTACATCTAAATCATGTATTGTTTGTAGATTTAATGATGCTGTTTTATCAACTTGTGCATTGCTACGATCTTGATCAATTTGTCCAATAGCAGTGTCATAAATATTTTGTAACTGTGCTAATATACTATTTCTTTCTTCTACCGTTGCTTGAATATTCGCTTCAATTGCTTGTTTTTTATCGTTGAATAATGTTGTCAATTGTTCTCGAGCAGACGCCTTTCTGTTAATAACAGGTTCGATTTCACGAATTTCGTTTTTCTCATCATGCAATAAATATGCCACATCAGCATTAGTCACTGCACTAGCAATTTGTTGTTTAGCTTTAATTAACTCTTTTTCAACTTGTGCTATTGCAATATTTTGTTCTTCATCTGTCGCTTCGTTATTTGCTTTAATTAAATTAATTTTATTTGTAGCGATATTTTGAATTTGTTGTAATGCTGTTGCTTTAACTGTTGTCGCTGGTTTAATTTTTGAAATAATATTTTGAGCATTTATACTATCTTGATTAACTTGGGCAGTCTTATCTGCATGATTGATCTGATCAATAGCCTGATTAAGTGCTTGTTCTACTAAATGTTTAGCAGCTAGTCTTTCTTCTTCAGTTGATAAATCGCTTTGATCGATTAGTGCATTTTGAGCTTCGGCTTTTACACCAACAGATTGACGCGCTGCTGGTTTAACTTGAACTTTAGGTAAAATCACTTTGATGTTGTCGTTGCCATCAGTCTCAGTTCGATCCACTTCTGCATTCGTTTTGTTTTGTGCAATGTCATTTTTAATTGTATTTACAATTTTATTTAAAGTATCAATAGCAACATCTCTTTCATCTTGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCTATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCAGTAACAGCAGCATCTTGATTTGTATTTTCTATTTCTTGTTGCGCTTGTTTGAGTGTGTCGCTAATTAATTGATTCGCTTCATCTAATTCATCAACTGTTGCATGTGGTGTATCTTTTATTGATTCTACTTGATTTTCTGCACTTGCTTTTATTGCTTGTTGTGCTTCAGGCTTAATTACAATATGAGGTTGTACACCTTTTAGTGTAGCAATGCCATTTGTTTCAACACGTTTCACATCATTATTCGTTACTGCTTGATTGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGATTTTATCTAGTGCTACTTGTCTTTCTTCTGCTGTTGCTTCTTTATCCTGATTAATCTTAGCACGTAATTCATTCGCTTTTTGATTGATTTTTTCACGTGCAGCTGGTTTAACTTTTGTTTCAGGTTGAATAATTTTAATCGCTGATACACCATTTGTTGCTGCTTGATTCACCTGACTATTCGTTTGAGCTTGGTCAATAGCTGCAAGTGCTTTTTCTTTTTCTTTTGCTAATGCTTGTGAAGCAACTTCTTTCTCATTATCTGTTGAATCAAGACTATTATCAATTTGCTGTTGCTTTTCTTTAACAGCTTTTTCAATATCTGCAATTGCCTTTGGTTTAATTACTACTTCAGCTTCAACATTATCTATAGCTTTTAGCGCTTGATTTGTAGTTGTGTCTACCTGATCATTTGTTTGGTTTTGATTAATTTGATTAAATGCTTGATCTTTAAGTTGATTGATTTGATTAACAGCAGCCTGCTTTTCTTCATCAGTTGCATTAGGTGTTTGTTTAACCGCTTCAATACGCTTCGCCACTTCAGCAGTGATTTTATCTCGCGCTGCTTGTTTTTTTACTACGTCAACTTGAACAGCATCGATATTATTCTCTGCTACTGTCGCAGCTTGGTCTACTTCTGCATTTGTGTTAGCTTGTTTAATACTTTCAATAGCTTGTTGTCTGTCTAGATTTAAAGTATTGATCGCAGCATTTTTCTCATCATTCGTTGCATCTGGTGTAGCATTGATTTCAGCTAATTTAGCATTATAATGCTGATTGATTTGTGCTAATGCTGCAGGTTTTTTAACAATATTTGGCTGAATCGCATTAATTGCTTTTGTACCTAATTGTTGCGCTTGATCTACTTCCGCATTTGTATCAGCTTGATTTATATTATTAATTGCCGTTGCTAACTCTTGATCCACTTGATTTAAAGCCACTTGCTTTTCTTCAGTTGTTGCATTTGTGTTTTGATTAATTTCTTGCTTTTTAGCAGTTGCTAAATCATTTAATACACCTGTAGCAGTTTGTTTCTTCGTTACATGCGGTTGAACTGCGCCGATTTGATTGACTGCATCGTCTCTAATACTATTGACCATCGCAGTAGTAGACGTCACACCAATATCAGTTAATGCTCTATTTTTAAGTGTATTGACACGATTTATCGCTTCTTGTTTCTCTTCTCGAGTCGCGCCAGGTGTAGCATTGATATTTGTTATCGCCTCTCGCGCTTTATCATTTACAACATTGCGAGCATCCGTTTTAACTTGTGTTGCCGGTTGAATCACAACTATATTTTGTGTGCCCTGATCTTTTGCTTGTGCAACTTCTTGATTCGTATCTGCTGCATTAATATTTTGCTTCGCTGTGGCTACAGCTTGATCAAGTAATTGTTGTGCTGCTTGTTGTTCTTCGAGCGTCGCATCATTATTATTAAATATCGTATTATGTTGCGTTTCCGCACTTTTATCGATGGCATTTTTTGCATCTGTTTTTACTTTTGTAGCTGGTGTAATTGCTTGTATTCCTTGAATCGCATTTGTCTTTACTTGTTCAACATCAGCATTGGTATTAGCGTTTAAAATGTTTGTGTTTGCTGCAGTTACAGCAGCATTCACTTTGTCAATTGCTGCTTGTCTTTCTTCTTGAGTCGCATCAGGATTAGCATTGATTTCTGCGATATGTTGTTGTGCATCATGTGATACAGCATCCCTTGCAGCTTGCTTAACAACAGTTACAGGAGCAATTGGATTAATGGCATTTAGACCATCTCCTTTGGCGTTATCAACATCAGCATTTGTTGTTGCTTGATTGATTTGTTCTAAAGCATGGTTGGTTGCTTGAGTTAATTCGTTCAATGCTGCATTTTTCTCTTCCTGAGTTGCTTCTCTATTACTATTTATTTGTTGTCTTTTCGTTGCTGTTGCTTGGTTAATTGCATCTCTTGCAGCTTGTTTATGTGTCACTTGAGGAACAACTGCTCCAATAGTATTGATGCCATTATTTTTAGCTATTTCAACGTCAGCATTTGTAGTAGCATTCGTAACATTATCAATAGCATCTGTTTCATCCGTAGCTAATTGATTTAGTGCATCTTGAATCTCGTCTTCAGTAGCATCTGGTGTTGCATTGATAATTTCCCTTTGTTTCGTTGCTTTATCACGTATTGCTTTTTTAGCATTTGGTTTAACAACCGGTGTTGCAGTATCCCCACTTAAGGTCTGTATACCTTGATCTTTGATTCTAGTAACGCCATCATCAGTCGTTTGGTCACCAATATTACCAATTATTTCATTTTTATGTTCCTCGATAACTTGTATTGCTGCTTGTTTTTCTTCATCTGTCAATTCATCATTTTGATTAACTAAATCTTCCATTTGGTCAACTTTTTTATTAACTGCATTTTCAGCATCAACACTTCGAATTAACGTATGTTGCATTTGATTAGTTAATGAATCAATATCTGCTTGAGAAACTCTTTTATTTAATGGTACATTGTTACGATTTTCATCTAAAATCGTTTGTGCACGTCTTTTAAGATCATTAAAGATATCTAATGATGCAAATGTATAATCAGCTTGTTGAATGCGTCTATCAACCTCGGCTTGTAATGCATCTTTATTCATGATGATATCGATTGTATATGGATTTGTCCTTACAGTATGACTTTCAGCAGGTGAATTAATAAAATCTTGTGTATATGTTTTATATGTTAATGTATCATTAAATGTTACTGTTCTTGGTGTCGGTACATTATTAACACGCAACTTATACTTTAAATCCAATATTTTATCAGGCATTAATCGTGCCGGCGAGTTACCTGAACCT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67 | Staphylococcus_phage(92.45%) | protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1944862 : 2007451
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP022607|1944862:2007451|DBSCAN-SWA 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85 | Staphylococcus_phage(94.2%) | protease,integrase,tail,capsid,terminase,holin,portal,transposase | attL 1981487:1981504|attR 2005438:2005455 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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