Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022375 | Francisella sp. 14-2155 chromosome, complete genome | 0 crisprs | csa3,DEDDh,PD-DExK,RT,cas3 | 0 | 0 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
79849 : 89991
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP022375|79849:89991|DBSCAN-SWA TATGAAAAATATCAGAAACTTTTCGATAATTGCACATATTGACCATGGAAAATCAACTCTTTCAGACAGATTTATACAAGTCTGTAATGGTCTAAGTGAGCGTGAAATGAAGGAGCAGGTGCTTGATTCTATGGATATAGAAAGAGAGCGTGGGATTACGATTAAAGCCCAGTCTGTGACTCTTGATTATACAGCCAGAGATGGACAAATCTATCAGCTTAATTTTATTGATACGCCGGGGCATGTTGATTTCTCTTATGAAGTATCACGCTCATTAGCTGCTTGTGAAGGAGCCCTACTTGTAGTAGATGCAGCTCAAGGTGTAGAAGCGCAGACAGTAGCAAACTGTTATACAGCGATTGAGCAAAATCTAGAGGTTATACCAATATTAAATAAAATTGACCTACCTTCCGCAGAGCCAGATAGAGTAGCGCAAGAAATTGAAGAAATAATCGGTATCGACGCTACAGATGCGACGACATGTAGTGCAAAAACAGGTATAGGTGTAGAGGATGTTCTAGAAACAATAGTTGCAAAAGTCCCAGCACCACAAGGGAGTGTAGATGATAAGTTACAGGCGTTGATTATCGACTCATGGTTTGACAACTATCTAGGAGTTGTATCTTTAGTTAGAATTAGAAATGGAATCGTCAAAAAAGGCGAGAAAATAAAAGTTATGTCAACGGCAGTTTCTTATCAAGTTGATAGGCTTGGGGTATTTACGCCAAAAATGAAAGATTTAGATCATCTCAAAGCAGGAGAGGTTGGTTTTATTGTTGCTGGAATTAAGGATATTCATGGCGCCCCAGTCGGTGATACGCTAACACATGCACATAATCCAACTGATAAACCCGTACCTGGCTTTAAAAAGGTTCAACCTCAAGTTTATGCTGGGATGTTTACCATAAGCTCAGATGATTATCCTGATTTTAGAGAGGCTCTAGAAAAACTAAGTTTAAATGATGCCTCATTATTTTTTGAACCAGAGGTATCACAAGCTTTAGGTTTTGGCTTTAGATGTGGTTTCTTGGGTATGTTACATATGGAGATTATCCAAGAGAGATTAGAAAGAGAGTATAACCTTGATTTAATTACCTCAGCGCCAACAGTTGTTTATAAAGCTATTAAAAAAGATGGTGAAATTATAGAGGTTGATAATCCATCTAAGTTACCAGAACCAGGAGCAATAGCTGAGATACAAGAGCCGATTGTAAGAGCAAATATTCTCGTGCCAAAAGATTATGTTGGTAGTGTAATTACTATCTGTGTTGAGAAAAGAGGTTCCCAGGTTGATATGAATTATGTTGGGAACCAGGTTTCGATAACTTATGATCTACCAATGATAGAAGTAGTCTCTGATTTCTTTGATACGCTTAAGTCAGTAACCAAAGGCTATGGCTCGCTAGACTATGAATTAATTCGCTATGAGCCTGCAGACATGGTACGCTTAGATGTGCTTATAAATGGTGACAAGGTTGATGCTTTAGCAAGTATTGTGCATAGAGATCAAGCAAAATATAAGGGTAGAGAGCTGGTTGAGCGTCTAAAGGAGCTTATTCCTAGACAAATGTTTGAAGTGGCAATTCAAGCAGCAATCGGCAGCACTATTATCGCTAGAAGCACTGTTAAGGCTTTGCGTAAGAATGTCTTGGCAAAATGTTATGGTGGCGATGTTTCACGTAAGAAAAAACTTTTAGAGAAGCAAAAAGAGGGTAAAAAGAGAATGAAAAATATTGGTTCTGTTGAAATTCCTCAAGAAGCCTTTTTATCCGTACTTAAAAAATAAAACTTATAGATTTATTATGCAAAATAAAAAAGTAATAGTAGGTATATCTGGTGGTGTAGATTCATCAGTTTCGGCTTTGCTCTTGAAACAGCAAGGTTATGATGTCACTGGTGTTTTTATGAAAAACTGGGAAGAAGATGATACCGATGAATTTTGCTCAGCAGAGCAAGATATTGCTGATGCTCAAGCTGTCTGTGACTCTATCGGCATACCTTTTAAAAAGATTAATTTTGCTGCTGAATATTGGGATAATGTTTTTGAGTATTTTCTAACAGAGTATAAAGCTGGTAGAACACCTAACCCTGACATACTTTGCAATAAGGAAATAAAGTTTAAAGCATTTTTAAATTATGTGCATTTATTAGGTGGTGATTATATCGCTACGGGACATTATGCTCGCACAAGATTGGCTAATGATGGTTCAGTACAGTTAGTTAAGGGCTTAGATGATAATAAAGATCAAACATATTTTTTATATACCCTAGGTCAAGAGCAGCTTAAGCAAACTATATTTCCAATTGGTGATATAGAAAAATCTTATGTTCGTGAACTAGCTAGACAAAATAATCTTGTAACTTTTGATAAGAAAGATAGTACTGGAATTTGTTTTATTGGTGAGCGTAAATTTAAAGAATTCTTGTCTAAGTATTTACCTGCTCAAAAGGGTGAAATTCACGACGAAAATGGCATCAAGGTAGGCATGCATGATGGACTGATGTATTATACAATCGGGCAAAGACAAGGGCTAGGTATAGGAGGAGTAAAGGATCGTCCAGAAGTACCATGGTTTGTTGCAAAAAAAGATCTTGAAAATAATGTCTTGGTTGCTGTGCAAGGCCATGATCATCCAATGCTGTTTAAGCAATCACTACAAGCTATAGAGCTAAGTTGGGTAGCAGGAGTAGCTCCTGCAGATAAATTTAGATGTAAGGCAAAAGTTCGTTATAGACAAAAAGATCAAGATTGTGAGGTAGAAGTAAATCATGATAACTCAGTTAAAGTAACTTTTGATCAGCCACAAAGAGCAATCACACCAGGACAGTCAGTAGTCTTTTACACTGATGATGTTTGCCTAGGTGGAGGTGTAATTATTTAAAAATTATTTTACTTTTTTATTTATTGTCACTTGCTAGAGTTGTTTTTGGAATAGCGGTAGTAATTAACTTGTGTAGCTGTAGTAACTTTTGTAGGAATTCCTATGCTACTACCACTTGTTAGAGTAGCTTTTTTGACTTCGCGTTGTTCATCTGCTTTTGTTATTAGATCTTTATCTAGTGCTGCAACACTGCTTGCAACCTCTTGATGAGTATAGCCAGTATCTTTTTTACTGTTGTCAACAACATCTTTTAGATAGTCGTCAACTTTCTTTTTGACATTTGTTTGGTTACTGATAACATCTCTTTGCATAAACTGGGCTTCATGGACAGTGTCGATAGTCATGTGTGTATATAAGTACTCTGGATCAACAATGAAAGGTCTAAGCTCGGTACTATACTCTTTCTCTAAACCAGGAAAACCAACGGTATATGCAACTTTTATACGCTTGTTACCATCTTTATCAGTAACAACCATTGCTACAAGATTTGAATCTATTTCATACTCTTTTCTAACAAGATGGTATTGCTGTTTTCTATCAAGGACAATTTGTCGAATAGGAGTTGCATATACTTTTTTAGTTTTAATCGGTTTATTAACTGTGGTAATACCAGCTTTTTGTAGCTCTTCAATAGCGGAGCTCCCGTAGTTACCTTTAGCGAGTCGAAGGTCTATTTCTATCATCTTAGCTAAAACATATTCTCTAAATTCGCGCGCTTGTTTTAATGTGAATGCAAGGCAAGTGCCGGTATCATCCTTCTGGAAACAACCATTTCTCTTATCAATTAGCACGAAAAGTTTTTGTGTCTTATCATAATATAGTTGATAATCAGGTGAGTTTTCGCCATGACCTAAATAAACAAACTCGTCATTTGATAGCATGCCACATGATGCTATAATTATGCTCATTAGTAATATTAAAGAGGTTTTTTTGAATATATTGCGCATACTAAATTCCCTGATTTGACAATAATTACAGGACATAATTTTTGCGTAATGCTGCTAAAAAGTAAAGCCTTGATTATATAAAACAATCAAAAATCACCTCTTAGCATTTTCCTGCAGCAGTTTTTTATACTTTTTTTCTATCATCTTGCGTTTTAGTGAACCAAGGTGATCAAAAAAGGTTATACCATTAAGGTGATCTATCTCATGTTGGATACAACGCGCTAGAAAGCCATCTTTTTCAACTTCAATTTCAGCACCAAATTCATTAAGTGCCTTTATCTTGATTGTAGTGGCCCTATTTACTTTTGCAGAAACACCGGGGAATGAAAGACAGCCTTCTTCATCAATTATTTTGCCACTTTTCTCAATTATTTCAGGGTTGATGATAGTAATTATTTCAGGGTTTTGCTCTTCTAAATTATCATACATAATGAAGAATCTTTTTTTGATACCAACTTGTATCGCTGCAAGTCCGACACCACCAGCTTCGAGCATTAGTTCACGCATCTCAGCTATGGTTGCACGAAAATCATCAGTGATTTCCTCTTTTGTTACTTCTTTAGCAACCTCTTTAAGTATAGGGTGAGGATACTGTAGTATTTCTAAAGACATATTTATACTCCTTGTTCTAATATATCTTTTTTTATCTTTGCCATAGTTAGAGCAGCTTGGACAGAGTATTTACCCTTATGGCCTTTTTTGCCACCAACTCTTTCTAAGGCTTGCTCTTTATTATGGGTAGTTAATATACCAAAAATTACTGGCAAATTATATTGATGCATAACTTTTTGTGTGCCATAGCTTACTTGATCACAAACATAATCATAGTGGTCTGTCTCGCCACGGATTACACAGCCTAGTAGTACTATTGCATCAAACTCTTTAGTTTCTGCTAGTAGTTTTGCTGCATATGGAAGTTCAACTGCACCAGGGACTTTTTTGATACAAATTTGACTATCTTTTAAGCCTTGAACGTACGCCTCTTCTAGAGCACCTTCAAGCATTTTATCTGTTATTAAAGAATTAAATTCACTTACAACGATTGCTAGTTTTCTCATAATTTATGCCTATATTCCTTTAATTGTATGTTTCATTTTATCTTTTTTAGTCATTAAATAACTTTTGTTGTGAGAGTTGACAAAAGCTTCACAAGCTACAGCTTCTGCTTGTA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ATCAACTTAAACGTGAGAAGTTTAATAATATCGCTATTATCGACTATACTAAGCCACTTGACTTTTTAACAGCAGTGTCACAGAAACTAGGTAATAGTGTTTATTATAAGGCTCTCTCACAAACTAGCTTTAGTCTAAAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP022375|79849:89991|86546_87614_-|AXH29158.1|DBSCAN-SWA MKNFDKYYMQQALTLANRGRLTVSPNPMVGCIVVKNGAIVSEGWHAMAGKAHAEIYAIAKAGIQARNSTMYVTLEPCCHKGRTGPCTDAIINAGIKKVIIATLDPNPKVAGKGVDKLRNAGIAVEVGLLEKQAQELNKIFFHYQKTKKPFVYAKWAMSLDGKIAVNGNDSKKISSHQAFVHTHQLRNICDAILIGKQTLIDDNPRLDVRISINKIKNPTRFILFNHLTAINHQWQVLDQNHAKTIFVCAKISAQVAAKLNQLGIEYWLLPQSRDQVCLGSLLEKLGNMGITSLLVEGGNKTLHSFINQKLVNEFYTYLAPVIIAGYNSKQQLRFNQVSLSSDVIINSCFKENSNV >CP022375|79849:89991|89067_89991_+|AXH29160.1|DBSCAN-SWA MENNISNATLEKLAQAYIKDIKSKRRWRFVTRTIIALIVLLLIVPGLFSSSKELAPHIALVKVNGVIAEDAEANAERINQSLDDAYANKLVKGVIVEINSPGGSPVQSDEIYAHMQYLQHKYPNIPLYTVCTDVCASGGYYIATGAKDIYANKMTIVGSIGVVGSGFGFTGLMDKVGIERRIYTSGENKDFLDPFSPQKPEQTAQFKKLLDETHQVFIAAVEKSRGDRLKDISMTTTFSGEPFSGIQAQQMGLIDGFASVDQLKREKFNNIAIIDYTKPLDFLTAVSQKLGNSVYYKALSQTSFSLK >CP022375|79849:89991|79849_81634_+|AXH29152.1|DBSCAN-SWA MKNIRNFSIIAHIDHGKSTLSDRFIQVCNGLSEREMKEQVLDSMDIERERGITIKAQSVTLDYTARDGQIYQLNFIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGALLVVDAAQGVEAQTVANCYTAIEQNLEVIPILNKIDLPSAEPDRVAQEIEEIIGIDATDATTCSAKTGIGVEDVLETIVAKVPAPQGSVDDKLQALIIDSWFDNYLGVVSLVRIRNGIVKKGEKIKVMSTAVSYQVDRLGVFTPKMKDLDHLKAGEVGFIVAGIKDIHGAPVGDTLTHAHNPTDKPVPGFKKVQPQVYAGMFTISSDDYPDFREALEKLSLNDASLFFEPEVSQALGFGFRCGFLGMLHMEIIQERLEREYNLDLITSAPTVVYKAIKKDGEIIEVDNPSKLPEPGAIAEIQEPIVRANILVPKDYVGSVITICVEKRGSQVDMNYVGNQVSITYDLPMIEVVSDFFDTLKSVTKGYGSLDYELIRYEPADMVRLDVLINGDKVDALASIVHRDQAKYKGRELVERLKELIPRQMFEVAIQAAIGSTIIARSTVKALRKNVLAKCYGGDVSRKKKLLEKQKEGKKRMKNIGSVEIPQEAFLSVLKK >CP022375|79849:89991|84744_85956_-|AXH29156.1|DBSCAN-SWA MFKQIKHNVENAIQALKQGKPVVVLDDYDRENEGDLILPGEKTTEANIAFMLEHTSGIICLAMDSKKAQQLNLTPMVAADKNNSTFATPFTVTIEAKEGVTTGVSAKDRAHTIQVASDANAKADDLARPGHIFPLIANDKGVLGRNGHTEATVDLMNLSGFNSVGVLCELMNKDGTMMKAPQLEAFAKKYDLPLLTIAELYQYRLATEILIEKAASSIIPFDHVGELEMTVYRDKFNGEEVVVLSKAYESKKPLVRMHSSCITGDLFGSLRCDCQAQLRKAMQMVSEEGGYLIYLDQEGRGIGLANKLKAYNLQMHQNMDTIEANVALGLPIDARKYDLAIQVLKYNKVDNCRLISNNPKKIAALETVGIQAEAVACEAFVNSHNKSYLMTKKDKMKHTIKGI >CP022375|79849:89991|81581_82730_+|AXH29153.1|tRNA|DBSCAN-SWA MVLLKFLKKPFYPYLKNKTYRFIMQNKKVIVGISGGVDSSVSALLLKQQGYDVTGVFMKNWEEDDTDEFCSAEQDIADAQAVCDSIGIPFKKINFAAEYWDNVFEYFLTEYKAGRTPNPDILCNKEIKFKAFLNYVHLLGGDYIATGHYARTRLANDGSVQLVKGLDDNKDQTYFLYTLGQEQLKQTIFPIGDIEKSYVRELARQNNLVTFDKKDSTGICFIGERKFKEFLSKYLPAQKGEIHDENGIKVGMHDGLMYYTIGQRQGLGIGGVKDRPEVPWFVAKKDLENNVLVAVQGHDHPMLFKQSLQAIELSWVAGVAPADKFRCKAKVRYRQKDQDCEVEVNHDNSVKVTFDQPQRAITPGQSVVFYTDDVCLGGGVII >CP022375|79849:89991|88625_88982_-|AXH29159.1|DBSCAN-SWA MAVTLETKAINLGLNNIQKHIFLCCDQQRQKCCAGDVSLKAWEYLKKRLQELNLSQNGHIYRTKTYCLRVCQNGPIAVVHPDNVWYHSCTAEVLEEIIQKHLIGGEIVEKYVFNKKLF >CP022375|79849:89991|85948_86554_-|AXH29157.1|DBSCAN-SWA MFSGIVQQLGTIKKITITDNLKTFCIKFDNSLLCNIGDSVAVNGTCLTVTQINKQNLTANFDAVPETLKKTNLDALKENHQVNIELAMRYGDHVGGHMVQGHVDETGQIKHIQDVGGAWFIEIFASKEFLKYLVTKGFVTIDGMSITVVNIFKDSFTVTLIPHTIEVTIAKNYTNGSIVNLEADATGKYIYKYIQGFKENV >CP022375|79849:89991|83770_84295_-|AXH29154.1|DBSCAN-SWA MNMSLEILQYPHPILKEVAKEVTKEEITDDFRATIAEMRELMLEAGGVGLAAIQVGIKKRFFIMYDNLEEQNPEIITIINPEIIEKSGKIIDEEGCLSFPGVSAKVNRATTIKIKALNEFGAEIEVEKDGFLARCIQHEIDHLNGITFFDHLGSLKRKMIEKKYKKLLQENAKR >CP022375|79849:89991|84291_84735_-|AXH29155.1|DBSCAN-SWA MRKLAIVVSEFNSLITDKMLEGALEEAYVQGLKDSQICIKKVPGAVELPYAAKLLAETKEFDAIVLLGCVIRGETDHYDYVCDQVSYGTQKVMHQYNLPVIFGILTTHNKEQALERVGGKKGHKGKYSVQAALTMAKIKKDILEQGV |
9 | Staphylococcus_phage(28.57%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
666463 : 725667
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP022375|666463:725667|DBSCAN-SWA 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53 | Paenibacillus_phage(13.33%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1420690 : 1429871
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP022375|1420690:1429871|DBSCAN-SWA 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ACCAATTAGTTTGCCATCTCTATAATCAACCGCACCCAAGAAAAGCTCAACATTATCAGGGCATTGTGAAATATCTATCTCAAAGTTCTTAACTGATTGATTTGGGTAACCAAGAGGCACTAGATATTTACATACACTTGCTTGATTTTTAAACTTAGCTTTAACTGTATCAAGTGTACCTTGGGTAATAGCTTTAGCAATCTCAACAAAATCTGTCTCTAGTAAGCTAAGCAAATTCATAGCTTCAGGGTCACCAAAACGCGCGTTATACTCAATCACTTTAGTATCATCCTTAGTTGCCATAAAGCCACCATAGAGGATACCTTGGTACGGTTCACCAAACTTATCTGCTAAAGCTTTGACAACTTGTTCATTGATATGTTTTGCTTTCTCAATATCAGCTGCAGATAAAAATGGTAGACTATGATTAGCATCAGAGTAAGTTCCCATACCGCCAGTATTTGGACCCTTGTCACCTTCGTGTGCACGCTTATGATCTTGCACTGCTGGCATATGGATAAAATTTTTACCATCAGTAAATGATATCAATGAGAATTCCTGACCAACAAGCTTCTCTTCGATAACAAACTCTTTACCTGCATCTACTAATGACTGACAATGTCTAATCGCCTCTTCAAGGCTATGCAAATGATCACCCCAGACAAGTACACCTTTTCCACCACACAAACCATCAGTTTTTATGACAAATTGGTTTTGATACTCTTTGAGAGTTTCTTCGACTCCATCCATTGTCGAAAACTTTTTAAAGAAAGGATTAGCGCCAATATCATAGTCACGAATCAAATCTCTAGTAAAACCTTTCGAAGTTTCAATTTGCGCTAATTTTTTGGTTGGTCCAACTACACCGATCCCTTCTGCCTTAAGAGCATCTGCTAGACCTACTTCAAGTGGTGCCTCAGGACCGATAATTGTGATATCAATATGCTGTGATTTTGCATACTCAAGCACTTGATCACAATTACAAATATCATCGATTTGATAGCCTTGCGCTAACTTTTTTATCCCAGGGTTAATCGCTGTGCTTATACAAAAAAGCTTATTTGCAATAGCGCTTTTGTTTACAGCTGCTGCTATCGCGTGCTCTCTACTTCCTGATCCTACTAAAAGAATATTCACTGGCTTCTCCATATTCAAATAATCTTTAACATTTTTAACAATACGTTGATTTATATTTTCTAAATCTCTAGGTACTTCAAACTTTTGCCCTGTTATCATTTCAAAAAGAGTTATATATTTTTGAGATAATTCTACAACTAACTCTTGTGGTGCTTGTGGTAGAACTTCATCATTATATGGATCACAATTTTTTGCAAACCATAATCTAAAAAATTCCTTATCGATATTTTCAGGTTCTTGACCTTTAGCAAATCTCTCAGCATAGCTGTCCTTTAGCCAAAATCTTGAGCTATCTGGAGTGTGAATCTCATCAATTAAAATAATCTCTCCAGTTTGCTCATCAATGCCAAACTCATACTTAGTATCTGCCAAGATTAAACCATGTTCTAAGGCTTTTTTTTGGCCAAACTCAAAAAGCTCTAGGGCTTTTTGTGAAGCAAAATCCCATTGCTGTTGAGTTAGCCAACCTTCTTTGACAATATCCGTTGCTGAGATTGGGCGATCATGATCTTGCTCTTTTGTTGTCGGGGTTAGAATATTATGCGGTAACTTTTGATTCTTCTTTAAACCATCTGGTAGGATATTGCCACAATAGTCACGACTACCGTTTTGATAATGTGTCCATAAAGAAGTCGAGGTTGAGCCTGTTATATAACCTCTGACTACAAACTCAATCGGTAGTACTTTTGCTTTTCTCGCGATAACAACATTTGGATCTGGAGAGGCTATAAAGTGGTTTTTGACAATATGCGCAGTTTCTTTGAACCACCACACTGATGATTGCGCAAGGATTTGTCCCTTAAATGGAATAAAACCTAATGACCTATCAAAAGCTGATTGTCTATCTGTAGATATCAAAATACTCTTATCATCAGTAAAGTACATATCTCTTACTTTACCTATATATTTATTCTTGATATCAAGATTAGTCGATTTTAGAACATTTTTTATATTATTGGCAATGATTTGTTTATCAAGCATTAGATAATTTCTACCTTCCCTGAGTTTGTGATTTTACCAATTTGATATAGTTTTGTATTAGTATGCTTTTTAGCTAAAGCTCGCATCTTGTCAAGCTGATCTTGGCTAGCAATTATAGTCATACCAATACCCATATTAAATGAGCGATACATTTCAAACTCACTAATATCGCCTATTCTCTGCATTAGCCTAAAAATAGTTGGTGTTTCAAAACTATTTTTAACAATTTCAGCGCCTAATCCTTGTGGTAATACGCGTGGAATATTTTCAATGAAGCCACCACCAGTGATATGTGCCATACCTTTAATATCAACGCCATTATCCAAGAAATCATGAATAATATTAGAGTAGTTAATATGTGGTTCAAGTAGCACATCACCAATAGTTCTACCCTCTAGCTCTGGGTAAGTATCTGTATGTTTGTTAGCTGCTACATCAAAAAATAGCTTACGTGCAAAAGAGTAGCCATTTGTATGTAACCCTGATGAGCTAAGACCAAAGATGATATCACCCTCTTTGATATTCTCACCATTAATAATCCTATTTCTATCAACTATACCAGTGATAACACCAACCATATCAATCTCACCAACTTGATATACTCCAGGCATCTCAGCGGTCTCACCACCTACTAACGAGACACCACACTCAGCACAAGCTTTTGACATCCCTTTAACAAGCTCTTCCATAATCGCAGGATCAAGCTTATCATGCGCAACATAGTCTAGGAATGTAATTGGTTTAGCGCCCATTACAACAATGTCATTTGTCGCAGCTGAGAAAAGATCATAACCAAGATTCTCAAACTTGCCACACATTACCGCAACTTTTGTCTTAGTACCAACACCATCTATAGACTGTACTAGTACAGGGTCTTGATAGTTGTTGATGATATTCTTTAGTGAGTACAAAGAACCAAAGCTACCTAAGCCTGTCAAAACATCTTGGGTAAAAGTCTTTTTGACATGATCCTTCATTCTTTCTACAGCTTGATTGCCAGCTTCTATATTTACACCAGCATCTTCATATTTTAGGCCTGCCATTTTATTTCCTTATTCAAAAAATAACCTTGCGATTATTTGTCATTCCGGAATTGATCCGGAATCTCTTAATTTATGTCCACAACTCATCAGATCCTGAATCAAGTTCAGGATGACGGTTGTGGGGTCTAGGATGACCCATTCTTTTTATTTTCATTTTATTTAGATACATCTACTACCTATTCAACTCTTGAGCACATTGAAAAGTATTATATAAAAGCTCGGTAATTGTCATTGGCCCCACCCCTCCAGGTACTGGGGTAATCGCTGCGACCTTATCTTTGACAGCAGCAAAATCAACATCACCAACTATCTTACCATCAACATGGTTAATACCAACATCGATAACTACAGCACCCTCTTTGACCATATCAGCGGTGATAAAGTTAGGTTTACCCACTGCAACAATTAGGATATCTGCTTTTGTAGTATGAGATTTAAGATCAGTTGTAAATCTATGACAAGTTGTCACAGTAGCTTTAGCATTTAGTAGTAACTGTGATACTGGTTTACCAACAACATTACTTGCACCAACAACTACCGCATAGGCACCTTCTGTTTTTATACTATACTCTCTTAGCATAGTCATAATACCTTTAGGTGTACAAGATTCTAGGCATTTTTTATCTCTAAGCTGCAATCTACCGACGTTTGTAGGATGAAAACCATCAACATCTTTTTCTGGTTTTATACTATATATCACATTGTTTTTGTTTATATGTGCTGGTAGTGGTAGCTGCAATAAAATTGCATGAACACTAGAGTCATTATTTAGCTGATTAATCAGCTCCAAAAGCTCTAACTCTGTCGTATGCTCTGGCAGTGTAATCACTTGTGAATCTATCCCAACTTGCGCACAGGCTTTTTCTTTTGAGGCAACATATGTCTTACTTGCTGGATCATTACCAACAATTATTGCCACAAGTTTTGGAGTTATTGCTGTATTATGCTTATATTCTTGAACTTGATTTGCTAATCTCTCTTTGAGGTCTTTTGAGAGAGCCTTACCATCGATTAAAATCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP022375|1420690:1429871|1429022_1429871_-|AXH30332.1|DBSCAN-SWA MILIDGKALSKDLKERLANQVQEYKHNTAITPKLVAIIVGNDPASKTYVASKEKACAQVGIDSQVITLPEHTTELELLELINQLNNDSSVHAILLQLPLPAHINKNNVIYSIKPEKDVDGFHPTNVGRLQLRDKKCLESCTPKGIMTMLREYSIKTEGAYAVVVGASNVVGKPVSQLLLNAKATVTTCHRFTTDLKSHTTKADILIVAVGKPNFITADMVKEGAVVIDVGINHVDGKIVGDVDFAAVKDKVAAITPVPGGVGPMTITELLYNTFQCAQELNR >CP022375|1420690:1429871|1422795_1423149_+|AXH30326.1|DBSCAN-SWA MQTTKIGNQAEEQACKFLKSQGLQILTQNFKALPYGEIDIIVTDKETLVFIEVKYRSKTTFATAEEMITFNKRKKLINTANIFLKRNPQYYNYDCRFDVIAINNNDVNWIKDAFGIN >CP022375|1420690:1429871|1424906_1425491_-|AXH30329.1|DBSCAN-SWA MSKLNLVILGSTRGTNMQAIIDAIASKQLNAQISLVISNKQDAYILQRAAQHNIAAKFIAAKGLVREQYDQLVVAEIQKYNPDLILLIGFMRILSPIFIKAFKGRILNIHPSLLPNYAGLMDLAVHQAVIAAGDSVSGCTIHQVSEEVDGGDIVLQLKCGVTKDDTAESLKAKVQNLENIAWIEVIRNWKKTNL >CP022375|1420690:1429871|1425494_1427807_-|AXH30330.1|DBSCAN-SWA MLDKQIIANNIKNVLKSTNLDIKNKYIGKVRDMYFTDDKSILISTDRQSAFDRSLGFIPFKGQILAQSSVWWFKETAHIVKNHFIASPDPNVVIARKAKVLPIEFVVRGYITGSTSTSLWTHYQNGSRDYCGNILPDGLKKNQKLPHNILTPTTKEQDHDRPISATDIVKEGWLTQQQWDFASQKALELFEFGQKKALEHGLILADTKYEFGIDEQTGEIILIDEIHTPDSSRFWLKDSYAERFAKGQEPENIDKEFFRLWFAKNCDPYNDEVLPQAPQELVVELSQKYITLFEMITGQKFEVPRDLENINQRIVKNVKDYLNMEKPVNILLVGSGSREHAIAAAVNKSAIANKLFCISTAINPGIKKLAQGYQIDDICNCDQVLEYAKSQHIDITIIGPEAPLEVGLADALKAEGIGVVGPTKKLAQIETSKGFTRDLIRDYDIGANPFFKKFSTMDGVEETLKEYQNQFVIKTDGLCGGKGVLVWGDHLHSLEEAIRHCQSLVDAGKEFVIEEKLVGQEFSLISFTDGKNFIHMPAVQDHKRAHEGDKGPNTGGMGTYSDANHSLPFLSAADIEKAKHINEQVVKALADKFGEPYQGILYGGFMATKDDTKVIEYNARFGDPEAMNLLSLLETDFVEIAKAITQGTLDTVKAKFKNQASVCKYLVPLGYPNQSVKNFEIDISQCPDNVELFLGAVDYRDGKLIGTGSRAIAVLGLGDTIAEAEQKAENAVKNIYGKLFHRPDIGTKELINKRIKQMNLLRGDKYQELK >CP022375|1420690:1429871|1427806_1428850_-|AXH30331.1|DBSCAN-SWA MAGLKYEDAGVNIEAGNQAVERMKDHVKKTFTQDVLTGLGSFGSLYSLKNIINNYQDPVLVQSIDGVGTKTKVAVMCGKFENLGYDLFSAATNDIVVMGAKPITFLDYVAHDKLDPAIMEELVKGMSKACAECGVSLVGGETAEMPGVYQVGEIDMVGVITGIVDRNRIINGENIKEGDIIFGLSSSGLHTNGYSFARKLFFDVAANKHTDTYPELEGRTIGDVLLEPHINYSNIIHDFLDNGVDIKGMAHITGGGFIENIPRVLPQGLGAEIVKNSFETPTIFRLMQRIGDISEFEMYRSFNMGIGMTIIASQDQLDKMRALAKKHTNTKLYQIGKITNSGKVEII >CP022375|1420690:1429871|1420690_1422700_+|AXH30325.1|DBSCAN-SWA MNSIIEESDLPKLAEFKVDEVKPAIDYLFSQAETNLEKALQDQNPSWQTLLKLEEDDEKINQAFSTISHMNAVCNSKELRESYEYALAKLTDYYTKLGQNEDLYNLYKQIREDNLTTEQAQAVRKAIISFEQSGVNLDETKRKRLQQISQELAQLSTKFENNVLDATMDWLYTTDDEKELKGLTQNIIESAEAKAKQKNTAEKYALGIDIPTYLAVMQQADNRKLREKFYKAYCTKASKEADNKNFDNDEIIEKILKLRIEKSEILGFNNYAENSLFTKMAETPAQVLELLNKLLEKSLPQAKKDLNELRRFAEDAGLVDALQPWDTAYYSEKLKKAKFDFTEEELREYFPLEKALEGLFKILNHIYALEIKENTDYTKYIAEQQTFGFYKNDVYIGSIICDFFARDNKRSGAWMDGSRTAFVTSKGSKQKPVAYVNCNFLPPSKDGANLTHNDVVTLFHEFGHALHHILSQVTIPSISGTHGVEWDAVELPSQFMENFCWCEEGLVLISGSRDGKTLSNKQINKLVDTRHFHSALVMVRQIEFGIFDMNIHHKKLTTAAEVQKELDNIRAKINLLRVPSYNKFQNGFSHIFAGGYAAGYYSYKWAEILSSDVFSRFEQEGILSNKVGNDLLENIISKGSSRDAMDNFVAFMGRKPNEEALLRHSGINN >CP022375|1420690:1429871|1424309_1424801_-|AXH30328.1|DBSCAN-SWA MSVDVGVIMGSKSDWSTMKECCDILDNLGIGYECEVVSAHRTPDKMFTYAETAKDRGLKVIIAGAGGAAHLPGMVAAKTALPVLGVPVKSSTLNGQDSLLSIVQMPAGIPVATFAIGVAGAKNAALFAASILQHTDANIAKALAEFRAEQTQFVLDNPDPREY >CP022375|1420690:1429871|1423209_1424307_-|AXH30327.1|DBSCAN-SWA MRIGIIGAGQLARMLSLAGTPLGLEFHCLGKAGDCAEEVVKTVTDIELTKVNDVVAWAKQFDVITFENENISHELIKAINHEVNVYPSAKAIAISQDRLLEKSFMQDHNIATAKFVNIDILAKLQSAVVEHGLPAILKTRRFGYDGKGQFVIESQEDITKAWDALKDAPDGLIYEAFVDFDYEVSQICTADFKGNIAFYPLAKNTHKQGIIVESEAPFENAILAEKAQQIAKILVKEFAYVGTLAIEFFVKGDELIVNEIAPRVHNSGHWSIDGAVTSQFENHVRAIAGLILGDTTSRKTVMLNCIGTMPAIKDLAALDRVKIHSYNKAPRKGRKVGHLNLNLNDETDEYQLLQARKLIALSAEI |
8 | Prochlorococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1797923 : 1816616
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP022375|1797923:1816616|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP022375|1797923:1816616|1801900_1802650_-|AXH30651.1|transposase|DBSCAN-SWA MHSVKELSFKHTNWVSFQQPHYGTRRLVKLLNRLGFLVGRKLIKSAMEFMGIKALYPKKKTTTINKQHNKYPYLLNAFKNGLNQVVIDKANKVWSADITYIRLENGYAYLAAIIDWYSKKILAWKLSNTMDTLLTTSVLNEALLKYEKPDIFNSDQGVQYTAKEHIKILSDRNIQISMDAKGRSIDNIVIERFWRTLKYENVYPSSYRTMNEAKLGIKEYIEIYNNERMHSSIGYMTPDEAYSGILKVA >CP022375|1797923:1816616|1804403_1804970_+|AXH30654.1|DBSCAN-SWA MYLNYFIILIILNIHELVLANVIVVDKFELKNRSKQDNTIFLNSKDFCSNAVEPCENESSNNCIFIRETIEKPLSRINYYLTIPIISKSIKDLTILYKYDSNSDSLPKYINICLSLVRGEKDETYYSQATYNWFPSTELYLAESPGYILVNRKSNQKDYDDGEFLKIQTQQIADGWSPTHYKKKLTII >CP022375|1797923:1816616|1809180_1809933_+|AXH30657.1|DBSCAN-SWA MKSFLKKIWNILMWARMTAFQLYSFAVIGGCSILINIFAFFKLPLSWRMAVCYVWTYLYWIGMLVFLQVFIRITGRVNIDKDYPCIYVSKHQSMLETFMFYGLLGKCHFIMKQELFDAPIFGPAMKNLGSIAIDRDKPRESLKKVVSDGKQSLADGINVVIFPEGTRVNVGEYPEFQRSAMKLAADANVYIIPVAHNFGRFFPRRWGQVIKPGIARMDFGKRIDPRDFDSKTLTSYCHKVITKKTKEFNG 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17 | Paenibacillus_phage(28.57%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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