Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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CP027349 | Lactobacillus plantarum strain b-2 chromosome, complete genome | 0 crisprs | csa3,DinG,cas3,DEDDh | 0 | 0 | 6 | 0 |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
473003 : 577039
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP027349|473003:577039|DBSCAN-SWA 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102 | Lactobacillus_phage(78.33%) | protease,capsid,tRNA,tail,transposase,portal,lysis,integrase,terminase | attL 495005:495020|attR 527433:527448 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
595488 : 604112
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP027349|595488:604112|DBSCAN-SWA CATGTATCGGGCACTATATCGGGTTTGGCGTCCCCAACGCTTTGATGAGATTGTCGGGCAACAGATGATTACCCAGACACTAAAAAATGCCATTATGACCCACCAGACGAGTCATGCGTATCTGTTTACCGGTCCCCGGGGAACTGGGAAAACGTCGGCAGCAAAGATTTTTGCCAAGGCAATTAACTGTCACCATCTTGTTGATGGGGAACCTTGCAATGAATGTGAGACTTGTACGGCGATTACCAAGGGGCAACTAAATGATGTCATCGAAATTGATGCGGCTTCTAATAATGGCGTGGAAGAGATTCGTGATATTCGGGACAAAGCGAAGTATGCTCCAACGCAAGCGGATTATAAAGTCTACATTATTGATGAAGTTCATATGTTATCGACTGGCGCGTTTAATGCGTTGCTCAAAACGCTAGAAGAACCCCCGGCTAACGTTATATTTATCTTAGCGACAACGGAGCCCCATAAGATTCCATTAACGATTATTTCACGGACGCAACGGTTTGATTTTCGGCGGATTACAGCTAAGGATAGCTACGATCGGATGGTGTACATCCTCAATGAGAAGGATGTGACCTATGATGAAAAAGCGCTACGCGTCATTGCAGCGGCTGCTGAAGGTGGAATGCGGGATGCTTTAAGTATTCTGGATCAAGTAATTTCGTTTGGAGATAACACGGTTACGTTGGATGATGCGTTAATGGTGACGGGAAGTGTGACCAAGCAGTTGCTGGCTAACTATGTCAGTGAGGTCACCGACCATGATACGAAGCCGGCACTAGAGACGATGCGACAAATCTTACAAGAAGGTAAAGATGCGAACCGTTTCATTGAAGATTTGATCAGTTATACGCGTGACGTGTTACTCTATCAACAGGCCCCTGAAATGGTCGATAGTGTGGCGATGGGCGAGGATGATCAACAATTTGAAGCATTTGCCAAGCAAATCGATGCTGAAGTCCTGTATCAAATGGTCAAGACGTTGAACGATATTCAACAACAAATGCGGTTCACGACGCACCCCGACGTTTATTTAGAAGTGTTGACGGTCAAGTTAGCTCAGTTGGATGGTCAAGCGGCCGTTCAACCGGTAGCTGCGGCAACGGTCAATCCTGAAGATCCCACTGTGCATAAACTGGCACAACAAGTTGAACAGTTGCAAAGCGAGGTCAAAACGTTACGTTCTCAAGGTGGTAGTGTCACTAAACCCGCACCGGCTAAGCCGCGGTCGAGTAATGGCCCGGTTGTTAAGAAGGTTAATGTCAGTCAGATTTATCCTATTCTGGGAGCGGCAACGAAGAATGATCTCATTAAGGTGCGCGATGTTTGGACTGATTTGATGAACATTTTGAGTGTGACGCAGCGGGCCCTAATGCACGTGGCCCAACCAGTTGCGGCCAGTTCAGAAGGTGTTGTGGTTGCGTTTGACTATGCGTTTGTTTATCAAAAAGCGATTGATGACCAGACCTTGATCGATGCACTCGGAAATGGTTTGGATCGGCTGATGGGACAGGCACCCAAGATTGTCTGTGTGCCTAAAGAACAGTGGCCACAAATTCGTAAGGATTATTTGGCCACTCATCAGCCAGGAGGTGCAACATCAGAGCAACAAGCACCGGCCAAAGAACCGGTCGTTGAAGAAGCTAAGAATATGTTCGGTGATTTAGTTGAAGTACAGCCGGACTAAAGACGAAAGGAACTGATAATTATGATGCGTGGAATGGGTAATATGCAAAGTATGATGAAACAAATGAAGAAGATGCAGGCGCAAATGACAGCCGAACAAGCGGCTTTAAATGAACAAACCTTCACGGGTGCGGCGCCAGACGACATGGTCAAAGTCACTTTTACTGGTGATAAGAAGATGAAGGATATTACGATTAACCCTGATGCTGTTGATCCTGATGATGTGGATATGTTACAGGACTTAGTCGTTGCTGCGGTGAACGACGCGTTGACTAAGGTCGATGAACAGACACAAAGTACGATGGGAAAATATACTAAGGGATTACAGTAAAAACGAGGTAAGTACATGCAGTATCCAGAACCAATTGCTAAGTTGATTGATAGTTATATGAAGTTGCCCGGCATTGGTGGCAAGACTGCGACACGGCTGGCGTTTTATACAATTGATATGAACGGTGATGACGTCACCGAGTTCGCTAAGTCGCTGATTGCGGCCAAACGGGACCTGCATTTTTGTAGTATTTGCGGTAATATCACCGAAGATGATCCGTGTGTGATTTGTAAGGATAAGTCGCGTGATCAAAGCACCGTTCTGGTTGTTGAAGAGGCCAAGGATGTCATGGCAATGGAAAAGATTAAGGAATACAACGGGCTGTATCACGTCTTACATGGGGTATTGTCACCCATTGATGGCAAAGGTCCGGAAGATATCAACATTGCCAGTTTATTGAAACGGCTACAGCAAAATGAAGCCATCAAGGAAGTCATTATTGCCACCAATGCCACGCCTGAAGGTGAAGCAACAGCGATGTACATCTCGCGGTTAGTTAAGCCGGCGGGGATCAAAGTGACCCGATTGGCGCACGGCTTGTCGGTTGGTAGTGATATTCAATATGCGGATGAAATGACCTTATTCAAAGCAGTTGAAGGTCGCCAAGAAATGTAATTGGAGGTGCCACCATGTTTAAACGTAAACAGAAGATCAAGCATCCCAAGGAAGTTTTTGATGAACAGTTATTGTCGACCCTGAATGCCGCTAAGTTGGACTGGGACCGTGCGAAGCAGAACCAAGAAGCGGTCTATGATAATAATACGAGTGAACTAGTTACGCAGACCGCCTTAGCGCGTGCTAAGTATTTATATCTGTATCGTGAAGCACGTTTACGTCAAGTTCATGGGCAGACGATTCAGCGCTCGGTCATTGATAAATAGACTGTTAGTGATTTAAGAGATAACTTGTTTCAAAATAAAGACGCACGTCGTTGATTTTTGTAAATCTACGGCGTGCGTTTTTGATTTAAAACCCTAGCATTATTTTACCAGTTAATCTGTCATGCATTGTGATTAAGACATGCTAGGTGCGGCAATTGGAATAGAAGATGTGTATCTACTAATGAATAACAAACTAAAATCGGTATTTATCAATCGTGGGTAGTACTACCTAATAACTTTTTAGCAATTCACCGAATAAATCATCAAAACCACAATTGGTAGTAGCCGACCCACGTAAAAATCGTGAAAAAGTACCCTCACTAGTGGTAACCGTATTAGACAGGTACTCAAAAATCAAGTACAATTGCTACATATAAGAAAATAGATGGGATTGGGAATGTTGACAGGAAAATTAGTTACTTTTGAAGGGCCAGACGGTGCCGGCAAAACGTCAGCTTTAAACGCGATTGTGGCCAAATTACAGCCACAATTAGGGGATCGCTTAGTTGTGACGCGTGAACCGGGCGGGAATCAAATCTCAGAAGCAATTCGAAAAATCATTTTAGACCGTCATAATACGGCGATGGACGACCGTACGGAAGCGTTACTCTATGCGGCAGCACGGCGACAACATATCGTCCAAACCATTCAACCAGCATTGCAGAACGACCAACTTGTCTTGTGTGATCGCTACATCGATAGCTCGGTCGCTTATCAGGGGGCCGGTCGTGGTATTGGGGAACAAGCGGTTTATGATATGAATCAGTTCGCGACCGCGGGGTTAACCGCAGATTTAACGTTGTATTTTGACGTAGATGCTGCCGTTGGATTAAACCGCATTCAACAACATCGCCAAAATGAAATTAATCGCTTGGACGTGGAAGCCTTAAGTTTTCATCACCGGGTGCAAGCAGCGTATTTGAGATTACTGGCTGATCATCCTGACCGTATCAAGCGCGTCGATGCAAGTCAGCCATTGGACCAAGTTGTGACGCAGGCCTTAGAGATTATGGCGTTACAGTTACCGACTTATGTGGCATCCAAGGGAGGGGAAGACCAATGAAATTAATTATTGCAATCGTTCAAGATAAGGACAGTAACCGGTTGAGCAGCCAGTTCATTGAAGCCAATGTTCGGGCCACGAAGCTCTCAACGACGGGGGGCTTCCTACGTTCAGGTAATACCACTTTTATGATCGGTATTGATGATGACCGTGTGGATGAAGTTTTAGCCATGATTAAAGAAACGAGTCATGCGCGGGAACAGTTTATGACACCACCAGTCAATCTAGACGTGACGATGGATGGCGCAGCTGCCTATCCAGTTGAAGTTCAAGTCGGTGGCGCCACGGTCTTTGTTCTACCAATTGAATAATTTCACCAATTTTAATGAAGGATGATTATTAATGGCAACAACCGAGTCATTTGCGCAAACGTTAGCGGCGAAACAGCCCCGCTTATTAGCGGCATTTAAACACATCATCGCCCAGAACCATCTGGCCCACGCGTACTTATTCGCGGGGATGGAAGGCGCTGGACAACCAGAACTGGCCCATTGGATTGCGCAACGGTTGTTCTGCCTGCATATTAATGATGGTGAACCAGATGGCACTTGTGAGGAGTGCGTCCGGATTGCTAATGGGTCGCACCCTGATATTGTGACAGTGGCTCCCGAGGGTCAGCGAATTCACGTTGATCAGGTTCGTTACTTAAAAGCTGAATTCTCTAAGAGTGCGGTCGAAGGTAACCGGAAACTGTTCATCATTAATGATGCGGAGAAGATGACAGCGAGTGCTGCCAATAGCTTATTGAAGTTTATTGAGGAGCCAAGTGGTAACGTCACGGCCTTGTTATTAACGACTAATAAGCAACTGATGCTACCAACGATTATTTCACGAACCCAGGTGATCGAATTCCCACCATTAAATGCGCAGGCGTTACAGCAGACGTTTGAACAGGCCGGGATTGCGCCAAACCAAGCGCAGATGTTACGGGGCCTGACAAATAGCGTGACCCAGGCGCAGGCGTTGCTAGCGGATGATTGGTTACCACAAGCTGCGCAAGCATTGTGGCGGTGGTTTGACCAGGCTG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP027349|595488:604112|602192_602978_+|AXI11793.1|DBSCAN-SWA MATLGANASLYSEQHRITYYECDRTGRATLTTLIDIAVLASEDQSDALGLTTEMVQSHGVGWVVTQYAIDITRMPRQDEVVTIAVRGSAYNPYFAYREFWIRDADGQQLAYITSIWVMMSQTTRRIVKILPELVAPYQSEVVKRIPRLPRPISFEATDTTITKPYHVRFFDIDPNRHVNNAHYFDWLVDTLPATFLLQHDLVHVDVRYENEVKYGQTVTAHANILPSEVADQVTTSHLIEVDDEKCCEVTIQWRTLPEPIQ >CP027349|595488:604112|603116_604112_+|AXI11794.1|DBSCAN-SWA MSILVLGGAGYIGSHMVDRLVEHGTDVVVVDNLVTGHRAAVNSAAKFYQGDLRDADFLNHVFDTEDIEAVVHFAAFSIVPESMSKPLKYFDNNTGGMITLLETMQAHDVKQIVFSSTAATYGTPKQIPIKETDPQLPINPYGASKLMMEQIMHWADVAYGIKFVALRYFNVAGAKPDGSIGEDHGPETHLVPIILQVAQGKRDELKIFGDDYNTPDGTNVRDYVHVVDLADAHILALKYLAAGNDSNAFNLGSSTGFSNKQMLAAAREVTGQPIPAKLAPRRPGDPDSLVAASDKARDVLGWQPNYDNVNDIIETAWAWTQKHPNGYDDRD >CP027349|595488:604112|601292_602189_+|AXI11792.1|DBSCAN-SWA METQQSFADHAGIGTLYLVPTPIGNLQDMTYRAVATLKTVDLIAAEDTRNTQKLLNHFEITTKQISFHEHNTQERIPQLIEKLQTGVNLAQVSDAGMPSISDPGKELVAACIAANIPVVPLPGANAGLTALIASGLVPQPFYFYGFLPRKKNEQKADLAKLARRHETVVLYESPFRVAKTLTLLATVCEGTRPIVACRELTKRYEEFARGTLAEMVTWAQDHQLKGEFVLLIGGNPDKDEPETTDELAQLPVKAQVEALIAAGDKPNVAIKTIAKRRNIPRQSVYNQFHELNTNDEES >CP027349|595488:604112|595488_597186_+|AXI11784.1|DBSCAN-SWA MYRALYRVWRPQRFDEIVGQQMITQTLKNAIMTHQTSHAYLFTGPRGTGKTSAAKIFAKAINCHHLVDGEPCNECETCTAITKGQLNDVIEIDAASNNGVEEIRDIRDKAKYAPTQADYKVYIIDEVHMLSTGAFNALLKTLEEPPANVIFILATTEPHKIPLTIISRTQRFDFRRITAKDSYDRMVYILNEKDVTYDEKALRVIAAAAEGGMRDALSILDQVISFGDNTVTLDDALMVTGSVTKQLLANYVSEVTDHDTKPALETMRQILQEGKDANRFIEDLISYTRDVLLYQQAPEMVDSVAMGEDDQQFEAFAKQIDAEVLYQMVKTLNDIQQQMRFTTHPDVYLEVLTVKLAQLDGQAAVQPVAAATVNPEDPTVHKLAQQVEQLQSEVKTLRSQGGSVTKPAPAKPRSSNGPVVKKVNVSQIYPILGAATKNDLIKVRDVWTDLMNILSVTQRALMHVAQPVAASSEGVVVAFDYAFVYQKAIDDQTLIDALGNGLDRLMGQAPKIVCVPKEQWPQIRKDYLATHQPGGATSEQQAPAKEPVVEEAKNMFGDLVEVQPD >CP027349|595488:604112|598794_599460_+|AXI11788.1|DBSCAN-SWA MLTGKLVTFEGPDGAGKTSALNAIVAKLQPQLGDRLVVTREPGGNQISEAIRKIILDRHNTAMDDRTEALLYAAARRQHIVQTIQPALQNDQLVLCDRYIDSSVAYQGAGRGIGEQAVYDMNQFATAGLTADLTLYFDVDAAVGLNRIQQHRQNEINRLDVEALSFHHRVQAAYLRLLADHPDRIKRVDASQPLDQVVTQALEIMALQLPTYVASKGGEDQ >CP027349|595488:604112|598145_598397_+|AXI11787.1|DBSCAN-SWA MFKRKQKIKHPKEVFDEQLLSTLNAAKLDWDRAKQNQEAVYDNNTSELVTQTALARAKYLYLYREARLRQVHGQTIQRSVIDK >CP027349|595488:604112|600846_601194_+|AXI11791.1|DBSCAN-SWA MDKRDLYDSFGEMEQQMQQMLDKMAKLRADMTTVLEKNAELVIENEHLREHMVEIENELPKKAASTTTLSKSRQNLEKLYDEGFHVCNQFYGKRRDDDESCVFCLEVIYGERERA >CP027349|595488:604112|599456_599771_+|AXI11789.1|DBSCAN-SWA MKLIIAIVQDKDSNRLSSQFIEANVRATKLSTTGGFLRSGNTTFMIGIDDDRVDEVLAMIKETSHAREQFMTPPVNLDVTMDGAAAYPVEVQVGGATVFVLPIE >CP027349|595488:604112|599802_600822_+|AXI11790.1|DBSCAN-SWA MATTESFAQTLAAKQPRLLAAFKHIIAQNHLAHAYLFAGMEGAGQPELAHWIAQRLFCLHINDGEPDGTCEECVRIANGSHPDIVTVAPEGQRIHVDQVRYLKAEFSKSAVEGNRKLFIINDAEKMTASAANSLLKFIEEPSGNVTALLLTTNKQLMLPTIISRTQVIEFPPLNAQALQQTFEQAGIAPNQAQMLRGLTNSVTQAQALLADDWLPQAAQALWRWFDQAVKGDPRSFVAVQVNLVGLAKDADHQLVMLDLIAALFQDLLQLHFEVATTALTFGQYQKELAGLTAEVSDEQLIAATELALTAKRQLASNISFQNVLEGLTLKLWPIFQTNA >CP027349|595488:604112|597531_598131_+|AXI11786.1|DBSCAN-SWA MQYPEPIAKLIDSYMKLPGIGGKTATRLAFYTIDMNGDDVTEFAKSLIAAKRDLHFCSICGNITEDDPCVICKDKSRDQSTVLVVEEAKDVMAMEKIKEYNGLYHVLHGVLSPIDGKGPEDINIASLLKRLQQNEAIKEVIIATNATPEGEATAMYISRLVKPAGIKVTRLAHGLSVGSDIQYADEMTLFKAVEGRQEM >CP027349|595488:604112|597207_597516_+|AXI11785.1|DBSCAN-SWA MMRGMGNMQSMMKQMKKMQAQMTAEQAALNEQTFTGAAPDDMVKVTFTGDKKMKDITINPDAVDPDDVDMLQDLVVAAVNDALTKVDEQTQSTMGKYTKGLQ |
11 | Streptococcus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1022013 : 1111644
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP027349|1022013:1111644|DBSCAN-SWA GATGGCTGAAGAACGAATTAATGCCGAACAAGTGCAACACGTGGCGAGCTTAGCCAAATTGGAGTTTACACCAGACCAATTAGCGATGTTCACACCGCAACTAGAAAAAATTATCGGCATGTTCGAAGAATTAAGCACAGTTGATACCACGGGTGTACCCGTTACGTCACGGATGAGTGATCATACGAATACGCTACGTGAAGACGTGGCAGTTAAGAGTGATGAAGCACTCCGGGAAGCATTGCTGAAGAATGCCCCAGAAACGGCCAATGGCTTGATCAAAGTGCCAGCAATTATTGATGAAAGTGGGGACGGTGAATAATGACTTATTTCGACCAAGATCTAACTAGTCTGCACGCTGACTTGGTAGCCAAGAAGATCAGTGCCACGGAACTAGCGAAGGCCACTTTTGCGAATATGAATCAGGTTGACCCTAAGCTAGGGGCGTTCTTGAATTTAAATGAAGAACAGGCCTTACAACAGGCGGCTGCTTTGGATCAGGATGGCATCGACGCGAACAACGTTTTTGCTGGGATTCCGATGGCAGTCAAGGATAATATTGTGACGAAGGGCCTAACGACGACGGCGGCTTCCAAAATGTTGGAAAACTTCGTGCCGGTCTATAATGCCACGGTGGTTGACAAACTATTAGCAAGCAACGCGTTGATCGTTGGTAAGACCAACATGGATGAATTTGCCATGGGAGGGTCAACTGAAACGTCGGCGTTCCATGTCACTCGTAATCCTTGGGACATCAGTCGAGTGCCCGGTGGGTCTTCAGGTGGCTCAGCTGTCGCAGTGGCTTCTGGACAAGTGCCAGTGGCACTCGGTTCTGATACGGGTGGTTCGATTCGGCAACCATCATCATTTAACGGAATTGTCGGCATGAAACCAACGTACGGTCGGGTCTCGCGCTGGGGGCTGATTGCCTTTGGATCTTCATTAGATCAAATTGGCCCAATGACACGGACGGTCAAGGATAACGCGGCCGCTTTGAATATGATTGCAGGTAACGATGTGCATGATACTACGTCATCCAAACAAACTGTACCAGACTTTACGGCCGGTTTGACGGGTGATATCAAGGGTATGAAGATCGGGTTACCAAAAGAATACATGGGCGAGGGGATCGACCCTAAAGTTCGTGAAGTCATTCAACAAGCAGTCAAGCAGTTTGAAGACTTAGGTGCTACGGTTGAAGAAGTCTCCTTACCAAACAGTCGCTACGGTGTGGCTGCTTACTACATCATTGCATCTTCAGAAGCTTCTTCAAACTTACAACGGTTTGACGGGATTCGTTACGGTTTCCGGGCTGACGATGTTAAGAATTTGGAAGATGTCTATGTCCGTAGTCGTTCCGAGGGCTTTGGTGATGAAGTTAAGCGCCGGATTATGTTAGGGACCTTCTCCTTGTCAGCTGGTTATTACGATGCGTACTTCCACAAAGCTGGTCAAGTTCGGACGATGATTATCAATGACTTTAATAAGGTCTTTGAAGACTACGATTTGATTATGGGACCAGTTGCACCAACGCCAGCCTTTAAGTTGGGTGACGAATTATCTGATCCAATTACGATGTATATGAACGATGTCTTGACGATTCCAGTCAACTTGGCTGGGTTACCAGGAATGTCAGTACCAGCTGGGTTTGCAGACGGGTTACCAGTTGGCTTGCAATTAATTGGTAAGGCGTTTGATGAAAGCACAATGTATCGAGCGGGCTATGCCTTTGAACAAGCAACGCAAGTTTACAAGCAAACCCCGAAAGTCGGAGGTGCTAACTAATGAATTTTGTAACCACGATTGGTTTGGAAGTCCACGTTGAATTAAAAACGAACTCAAAAATCTTTAGTCCTTCACCCGTGCAATTTGGTTCCGAACCAAATGCCAACACGAACGTGATCGACTGGGGGTATCCGGGGGTATTGCCAACGCCTAACAAGGGCGTGGTCGAAGCTGGGATTAAAGCAGCAACGGCTTTACATGCTGAAATCGAACATCACACGTACTTTGACCGGAAGAACTATTTTTACCCGGATAACCCGAAGGCCTACCAAATTACGCAACATGAAAAACCAATTGCGCATGATGGTTGGATTGAAATCGAAGTTGATGGTAAAAAGAAAAAAATCGGTATCGAAGAGATGCATATTGAAGAAGATGCCGGGAAAAACACCCATGAAAACGACTATTCCTATGTCGATTTGAACCGGCAAGGGACACCGCTAATTGAAATTGTTTCTAAGCCTGACATTGCCTCCCCAGAAGAAGCTTATGCTTACTGTGAAGCGTTGCGGCAACGGATCCAATTTACGGGCGTTTCGGACGTTAAGATGGAAGAAGGTTCAATGCGGGTCGATGTTAACATTTCAATTCGGCCGGCCGGTTCCGACAAGTATGGTGTGAAGACCGAAATGAAGAACTTGAACTCCTTCAACTACGTGCGCAAGTCGTTAGAATATGAAGAACAACGCCAACAACAAGTTCTCATGGCGGGTGGCAAGATCCAACAAGAAACGCGGCGTTTTGATGAAACAACGGGCCAAACGATCTTGATGCGGGTCAAGGAAGGTAGCGATGATTACCGTTACTTCCCAGAACCTGATATTCCAGCAGTCGATATCGATGATGACTGGATTGCATCCGTTAAGAAGACCATTCCAGAAATGCCTGGTTCGCGGCGTGAACGTTACATCAATGAATTTGGTTTAACTGCTTATGATGCGGGTGTGTTGACCCAAACTAAGGAAATGTCTGACTTCTTTGATGCAACCGTTGCTGAAGGTGCGGATCCTAAATTAGCTTCAAACTACTTGCAAGGGGACGTTAACGCGTACTTGAACGAGCATAAAGTTGATTTGTTAGCGACTGACTTAACGCCAACTAACTTAGCTGGGATGATCAAGATGATTTCAGATGAAACCATCTCAAGTAAGATTGCTAAGAAGGTCTTTAAGGCCATTATGGCGGGCTCAGAGCCTGTCCAATGGGTCAACGACAAGGGCTTAGTCCAATTGTCTGATCCGGCGAAGTTACAACCAATCGTTGACGACGTATTGGATAATAATCAACAATCAATTGATGACTTTAAGAACGGGAAAGACCGGGCCGTTGGGTTCCTCGTGGGTCAAATCATGAAGAAGACACGTGGTCAAGCTAACCCGAAAGTCGTCAACCAACTATTAATGACATCATTAAAAGCACGGTAGAAGCGTTGGTCGATAAGGTGTTGAGCCTCGATTGATGCATGTCCAGCGTTGGGGTAGAGATGAGACGCTGAACGCTTGACCGTGTGAGCGGAGGAATAGGAAACATGCGTAAACGGGCACGACTTATTTATAACCCGACTTCTGGACGTGAGGCATTGGCCCACGATTTAGTTGAAATTCTTGGTATCTTTGAACAAGCTGGTTATGAGACCAGTGCGTTCGCAACGACGCCCGCCCCTAATTCGGCGGCTGATGAAGCGCGACGTTGTGCCAAGGACGGGTTTGAGCTGATTGTAGCAGCTGGTGGTGATGGGACCATCAATCAAGTAGTAAACGGGTTAGCCGGGTTAAAGCGGCGACCTAAGATGGCTATTATTCCGGCGGGTACGACCAACGATTATGCCCGGGCACTGCGGATTCCGCGCAATGATCCGGTTGCGGCGGCCAAGGTAGTCCTAAAGAACCAGACGGTTAAGATGGATATCGGCCAGGCTGGTGAACAGTATTTCATTAACATTGCGGCTGGGGGCATGTTAACGGAGCTGACCTATGACGTGCCATCACAATTGAAATCGATTTTTGGGTACGCGGCATACTTAGCCAAGGGTGCTGAGTTATTACCACGAGTAAAACCAGTTGAGATGGATTTGAAATATGATGGTGGTCATTATCAGGGCAAGGCTTCGATGTTTTTCTTAGCGCTGACTAATTCAGTTGGTGGCTTTGAGCAGTTAGTGCCGGACGCGTCATTAGATGATGGTAAATTTACCATGATTATTGTGAAGACGAGCAACCTTGCCAAAATGCTTCACTTAATGACATTAGTGCTCAATGGTGGCAAGCATATCAATGATCCAAGCATTATTTATGTGAAGACGAGCAAGGTCGTCGCCAAACCAGCTGACAAGGATCGCTTAATGATCAACTTGGATGGGGAGTACGGTGGTGATGCACCGATGACGTTCCGGAATTTGAAGCAACATATCGAAATGTTTGCCGATACGGATCGGATCCCCGATGAGGCAATCACGGATACGGATCCAGAGTTGGAAGACGCTGAGCGACACTTTGTCTCAGCCGTTGATCAGTTGCCAGCTGCAACTGAGGACGACGAAAAAACAGAATAACTTGCTTAAATTACCGTTTACCGATACAATGGTGGACGGTAATTTTTTTTAAAGTGTTGCCGTCACAGGGACCTGATTGAGCATTGCCTAACGATTTAATCGTTTGTCGGTTTAGCAATGATTTGTCAGTGGTGCAAAGCATGAGACAGCTCAAATTCGCGCGTTTTGACACTCACAGTAAGCAATTTGAATAGCATGTTTAATCAGTAAATGTTAACGACACTGCCAAGTGTGGCAGTATTAATGGCCATATCACTCGCTGCCCGGAGCAGTGGCTACCAGGCAGTAACTAAAAAATAATAAGTCACTAACAAAGAAAGCAAGAGGAAACAAATGAAAGTTAATTTACCAGTGCACAAGGGTGAAGTTTTAGACGTCACTATCATGGATTTAACCTATCAGGGTATGGGTGTTGCTAAAGTCGATAATTACCCAATCTTTATCGAAAATGCATTGCCAGAAGAAAAAATTACGGTCAAGGTCACGAAGACGACGAAGAACTTTGCGTTTGGTGATGTGGAAAAGATTAACCAAGTGAGTCCTCACCGGGTTAATCCTAAAGGGCGCGTTTATCGTCAAACCGGGATTGCACCACTACAACACTTGGAATACAGTGAACAATTGAAGTTTAAACAGCACCAGGTGGCCGAATTATTTGCAAAGG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88 | Lactobacillus_phage(66.04%) | protease,capsid,tRNA,tail,head,transposase,portal,integrase,terminase,holin | attL 1029755:1029770|attR 1079477:1079492 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1283133 : 1292981
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP027349|1283133:1292981|DBSCAN-SWA TGTGGCACGTGACGGGACCGTCACAGAGACAAATGATTTAAAATTGCACGCATTAGGGGAGATTATCGGGATGAACGAACACGAAGCATATGTAACGACATTTTATTGGCTCGCGGATTGTTGGTTGGAAACTAGCTATCTGGGACTTGAGGATGAATTTGACGACGATGAAATCGATGACGCCGTCAAGTCACTACTAAATCGGATGCAAGCCGGGGCAATTTATGAGGTAACGGCGGATGATCCAATGTGGCAAGCATGGAAGCGGGCAGTTAGGGCCGTGCTTACGCCCAATGATCATGCTGAACATGAAGTTGATGAGACCGACGGAGAGGATGAATTAGTGCTGCCAGCTGGGGTACGACCAGAACGTCAATTAGAAGAAGTTCAAGCCTATGCAGCGATGAACGCGTTTTTGCAGGCACAAAATCAGGAATATCTGCAAGAAATTGGTAAACGGGCGGCCACTCAGGTCAGTGGTGCCGGGTGGCAAGTGTGGCGTGCACATCGCCAGAGCATGCATCCGGAGTTTGCCGCCCCGCTGACGTTGACTGCTGAACAATTACCAGCCGTGATGTGGGCCTTTTTCGATAAGTACCAGGATACTGAGGACTCTTTTGAGATTTTTGAATTGGTTAACCAGCTTGAACAATGGCAAAAAAGTGCTGATCGAGATTTGGACGCGCAATGGTCACAGCTTGTGGCGAAAAGTCAGATTGATCCGGCCGCAATTACGCTCATGCAGGGCTTGTCGTTAGCTATTGAGTTCTTTGATCAGTTTGAGTGGGACGGTGATTTGACTGCCAAGGCAACTTTGCAGAATAAATTGATGCAACGCACGCTCGATGACACGCTCAATGATGAGACGACAGCCAACTGGGCGGATGCCTGGCAACACTGGGATTTAGCAGATCCGTTGACAACTGAACAGTGGGCCCGACGGTTTGATCCGGCGGACGACTATGAAGAAGATGAAGACGAGAGTGAAGAAGATGACGCGGCTCGGCCAGCTTGGCAACTTGGTGCGAGTTATAGTACCGTTTTGATTGCAATGCGCTTAGTCGCTTACGGTGTACTGCGGCCTGAGAGTGTGCCTGGTATGGCAACTGTGAAGATGGCGAACCGTGCACTGGCAGCTACCGTCAGTATTGGTATCGTGTTAGTTGCTTGGCTGGTCACAGCTATTCTGATTACAATTGTAATTTGGGGATGGCGGTGGCTGCGTAAGCTGATTTTTTAGTGCAGCTGAACGGCCAACTGAATCACAATAGTGCCGATTGACTAGGCTGAAGTTTGTGAATCTAGTAGTTGAAGCTGAAAGGACGGGGTGTCAGTGGTAGTGCTTCATGATGGTTCGTAACTCGGACAGAAAGTCGGCATCTAAATGGGGCGATTGTCCTAATTGTAATGGTGCCAATGGCTGATATAACGTTGGTATGTCTGGCCTTAACGGCTGGTTATTGAAGTATTGCTGACCATGGATTTTGACGGTCGCTTTGAGCGTGCCAATCGTCATGACGGCCACGGCGGTATTTAAAAAGACGTCACCATTGAGACTAGTATATCCAGTGGAAGAACGCCCAACTAAAGTAACGTGCGGGTTACGTTTTAGCGCCATGATGGTCACCTCCGCGGCACTCGCTGTCTGGTTACCAATAATGGTATAAATATGACGAAAGTGGGCCGCCGTTGGTTGCGAAAAGTTAAAGTCATCTTGACCGAGTCCACCAGTGATTCGGCCATGGTACATCATACGTGGCCGGTTGCGATGATGGTTCGTGATGCCGATGTAGAGGGTGCCGTCTGGAATGATGGCGGCCAGGCCAGCAATCATCGGTGCCGAACTACCACCAGTATTTGCTGCGAAGTTTAAGATTAAATCGGCTGTCGGCTTAGTTTGTTTAATCAGGTGCTGGAGTTGTGTCCAATACTGTTTTTGTAATTGGTGCTGACTGCTGTAAAATGCTGGCACATTGATGATGGTGAGGCCGGCACTCATTGTCTTGGTCGGACGGGTGGCATGTTCGACTTGGCGGAGATTGGCGACGGCGAATGAATGTAAATTTGCAGCGCGCAGAATTTGATTGAGTTGGGTCAGTGACGTGATTTTGCGACCATGATCAGTCGCATGCAACATGGCTTGCCATTGCGTGCGATGGTTGATAATGCCATATTTTGACATGTAGGTGATAGCCGGCATAGCGTTGAAGGACGCACGGAGCCGATTAGAAGCGGAAAGACCAAACGTTAGGACTATCGAAATTAGACCTACCAGTCCGTAACGGCATTTATTCGTTATCATGATAAGCCATCCTTACTTTTCGTGACTAGATTAGCATGTATTGGTTAGCTAAATTGTAGGCGTGGCGTCAAAATTTCGCAACGAAAAGCATATCTTAACTGATGCGTCTTTGAAATAATGGTTCCTGTTAAAATACCCATCTACATTGGCCGTCTTAACGGCTAAGTAGATGGGTATTTGTTGTATCATGAAATTGTTGACGATTGTGCCAGATCGGCTTCTAACTGGGTTAAGAAGATCGTCACCAAGTCTTTTTCCACCTGGTTCAGTGAATGCTCGGCTGGAAAGGCAATGAAATAATTCAGGGACATTAACGCTTGGGGCAAAGGTAAGATGTTATAGCGTTCTGGATCAGGCTGGGTATGCACACTGTCTGGTAAAAAGGTAATACCCAGTCCAGCAGTGGCTAGTTTGGTGATGGTGGCGGTATTCGTGCTCTCAATTACGATATTCGGTGTCACGTTGTGCTTTTGTAATAAGTAGTCAACTTGGCGTCGAATCGATGACCCGTGGGGAGACAAGACTAGAGGCGCTTGTAGCAGGTCGTTAAGGGGTAGCGCTCCCGGATTAATGAAGGCCTGATGGGGTTGGTACCAGTTGACGGTGTTCGGGATAATCGCGTAGTACCCGTCCCGACCGCGGTCATAACTTTCAAGCCCCGGCGCGATGGTTTCCGGATTTTGACCAATTAAGAAGTCCAGCTCACCGTGGAGCACGCGCTGTTCGTTGCGACTAGCGATATCTTCGGTTAATTCGATCTTAGTGGCCGGGTGGGCTTTCAAAAAAGCAGGTAAAAATAGGGGCAATAAGTAATAGCCGAGGCTAGATAAGACGCCCAGCCGAATTACTTGCTGGTTGGCATGTGTGTATTGCCTAATTTGCTTATTAAAGTAATCCTTCTCGTTTTCGAGCGCCGTCAAATATTGATAATAAGTCCGCCCAGCCGTGGTCAGTCGCAGTGGCGTGACTTCACGATTGATGATGGTGACGCCCAATTCTTTTTCAACATTGCGGATGCTTTGGGTGAGGTAAGGTTGTGAAATGTAGAGATCTTTAGCCGCCCGGGTAAAATTGCCGTGCTTGAGCAACACATCTAAAAACCGTCGCATTTCGCTGGAATCTGATTTTGGCATAAAGCGCCTTCCTCTCGCATTGTGATTAGGTGAGTATTCGTTTGATTGCTGATTTGGTCATGTTGAGTTAGTTGCATCGCCATAAGGACGTTCAAAACATGTTCAATAAGTTCTGTCAACATCCTGGCGATAGTGGCTAAATAGCATTATGACCAACCATTTTAACATGATTAATTTTAACGCGAATCGTCGACATAGTAAATTTGTTATCGGGGTATAGATAAATAAACATTTCACAAGCGGAGCGCTTTCACGTACACTAATCAGTATTAAGAGTGGCCAATCATTCAATAGCTACTCGTCGAAAACGACTGTTTAAATCATCCTGAAAGGATCTGAAATTATGAAATTTGTTGGGATTGTTGGGACGAATGCAACCAAATCGACCAACCGGCAGTTACTGCAATATATGCAACGGCATTTTCAGCAACAAGCCACGATTGAAATTTTTGAAATAAAAGATTTACCGGCTTTTAATGAACCGGAAGACCGAACAGCACCAGTAGCAATTCAACAGCTCAGTGATAAGATCACCGCAGCAGATGGCGTGATCTTTGCCACGCCGGAGTATGATCATTCAATTCCGGCCGTACTAAAAAGTGCAATCGAATGGCTGTCATATACCACGCGGCCGTTAATTAATAAACCAGTTATGATTGTTGGGGCCTCGAACGGCTCACTGGGAACCTCACGCGCTCAAGCGCACTTACGCCAGATTTTAGAAGCGCCGGAATTAAAAGCACTGGTGATGCCAAATATTGAATACTTACTAGGCCGTTCACTACAAGCTTTTGATGATCAGGGCGACCTGACTTATCCGGATAAAGTTCAGGAATTAGACAATGCGTTTGGCGAATTCATTGATTTTGTGGATTTAACGAATAAAATCATGCCGTCGAGTCAGTTTTTCGAAAAGAGTAAGCAGTTCTCGTGGCGGCAAGTGACTGGGGAGGAATAAACATGAAATTTGTTGGAATTGTTGGAACGAATGCTCAGCATTCGTACAATCGGATGTTGCTGGAATTTATGCAACGACATTTTGCGACACAAGCCGAAATCGAAATTTTAGAATTGACTGATGTCCCGATGTTTGATGAATCGAATGATCAAACTGACAGTACCATCATTCAAAACTTTGCCACTAAAATTGCGACGGCTGACGGGGTTATCATTGCCTCACCGGAACACAATCATTCCGTGCCTTCCGCGTTGAAAAGCATTATTGAATGGTTATCATTCAAAATTCACCCATTAGATGGTCAAGCAGTAATGATTGTTGGGGCTTCATACAGTGTCCAAGGATCGTCACGCGCGCAACTACACCTGCGCCAGATTTTAGACGCTCCCGGTGTTAACGCCAGTGTCATGCCCGGTTCAGAATTCTTATTAGGTCGTGCCCAAACGGCTTTTGACGATCAAGGTAATTTAAAGGTGCAAGGGACGGTTGATTTTCTGGACAGTTGTTTTGCAAAGTTTCAGAAGTTTGCGACCATCGTCGCCGAGATGCGGGCACCAGAAGCGCTTAGCTTTGCCCCGGGTACTTATCAGGTGACGGCCACTGGACA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP027349|1283133:1292981|1283133_1284372_+|AXI12374.1|DBSCAN-SWA MARDGTVTETNDLKLHALGEIIGMNEHEAYVTTFYWLADCWLETSYLGLEDEFDDDEIDDAVKSLLNRMQAGAIYEVTADDPMWQAWKRAVRAVLTPNDHAEHEVDETDGEDELVLPAGVRPERQLEEVQAYAAMNAFLQAQNQEYLQEIGKRAATQVSGAGWQVWRAHRQSMHPEFAAPLTLTAEQLPAVMWAFFDKYQDTEDSFEIFELVNQLEQWQKSADRDLDAQWSQLVAKSQIDPAAITLMQGLSLAIEFFDQFEWDGDLTAKATLQNKLMQRTLDDTLNDETTANWADAWQHWDLADPLTTEQWARRFDPADDYEEDEDESEEDDAARPAWQLGASYSTVLIAMRLVAYGVLRPESVPGMATVKMANRALAATVSIGIVLVAWLVTAILITIVIWGWRWLRKLIF >CP027349|1283133:1292981|1284462_1285434_-|AXI12375.1|DBSCAN-SWA MITNKCRYGLVGLISIVLTFGLSASNRLRASFNAMPAITYMSKYGIINHRTQWQAMLHATDHGRKITSLTQLNQILRAANLHSFAVANLRQVEHATRPTKTMSAGLTIINVPAFYSSQHQLQKQYWTQLQHLIKQTKPTADLILNFAANTGGSSAPMIAGLAAIIPDGTLYIGITNHHRNRPRMMYHGRITGGLGQDDFNFSQPTAAHFRHIYTIIGNQTASAAEVTIMALKRNPHVTLVGRSSTGYTSLNGDVFLNTAVAVMTIGTLKATVKIHGQQYFNNQPLRPDIPTLYQPLAPLQLGQSPHLDADFLSELRTIMKHYH >CP027349|1283133:1292981|1285619_1286567_-|AXI12376.1|DBSCAN-SWA MPKSDSSEMRRFLDVLLKHGNFTRAAKDLYISQPYLTQSIRNVEKELGVTIINREVTPLRLTTAGRTYYQYLTALENEKDYFNKQIRQYTHANQQVIRLGVLSSLGYYLLPLFLPAFLKAHPATKIELTEDIASRNEQRVLHGELDFLIGQNPETIAPGLESYDRGRDGYYAIIPNTVNWYQPHQAFINPGALPLNDLLQAPLVLSPHGSSIRRQVDYLLQKHNVTPNIVIESTNTATITKLATAGLGITFLPDSVHTQPDPERYNILPLPQALMSLNYFIAFPAEHSLNQVEKDLVTIFLTQLEADLAQSSTIS >CP027349|1283133:1292981|1291220_1291358_+|AXI12381.1|DBSCAN-SWA MATDQSGQVSKAVTLPQTSENHQSLLIAILGLALLLLMLVWLPAK >CP027349|1283133:1292981|1287527_1289966_+|AXI12378.1|DBSCAN-SWA MKFVGIVGTNAQHSYNRMLLEFMQRHFATQAEIEILELTDVPMFDESNDQTDSTIIQNFATKIATADGVIIASPEHNHSVPSALKSIIEWLSFKIHPLDGQAVMIVGASYSVQGSSRAQLHLRQILDAPGVNASVMPGSEFLLGRAQTAFDDQGNLKVQGTVDFLDSCFAKFQKFATIVAEMRAPEALSFAPGTYQVTATGHNGELPMRVTLSADRIENIEIDTSSETQGIADVAFERIPKEIIAGQTLAVDAISGASITSHGVIDGVARAVKEAGANPDDLKKRRATKQVAQPAVKEVTTDVVVVGAGGAGLTAAAKVLQAGHQAVVLEKFPAVGGNTVRAGGPMNAADPDWQRQFAALPGEKQTLKDLSERDESTIAPEYRADFRKLKQQIDAYLTANTNQKGTLFDSTLLHRIQTYLGGQRTDLNGQEIHGQYDLVKELTDNALDSVKWLQSIGVKFDESQVTMPVGAIWRRGHKPMGDLGFAYIKTLRAFVEQQGGTIMTETPVKELLVTDGQVRGVIATNAAHEKVIVHADAVILASGGFAANTKMLQKYNTYWTAIDDDVKTTNSPAMTGDGIRLGTSVGAALVGMGFSQMMPVSDPETGELFSGLQVPPANFVMVNQQGKRFVNEYGSRDELTQAAIDNGSLFYLIADDEIKKTAYNTTQAKIDQQVANGTLFRADTLTDLAQQIGMDPAALTKTIADYNRYVDAGEDPEFHKTAFDLKVAVAPFYATPRKPATHHTMGGLKIDPDAHVLNTDGQIIDGLYAAGEVAGGIHAGNRLGGNSLSDIFTFGRIAAAHAVAEHVDPVTA >CP027349|1283133:1292981|1286910_1287525_+|AXI12377.1|DBSCAN-SWA MKFVGIVGTNATKSTNRQLLQYMQRHFQQQATIEIFEIKDLPAFNEPEDRTAPVAIQQLSDKITAADGVIFATPEYDHSIPAVLKSAIEWLSYTTRPLINKPVMIVGASNGSLGTSRAQAHLRQILEAPELKALVMPNIEYLLGRSLQAFDDQGDLTYPDKVQELDNAFGEFIDFVDLTNKIMPSSQFFEKSKQFSWRQVTGEE >CP027349|1283133:1292981|1290684_1291125_-|AXI12380.1|DBSCAN-SWA MAQIYIASPFFSPEQVTRVTQLEEALAKNPTVTDFYSPRLHQDAQAEQFTKAWATEIFHRDMAQIAAAQVIVTVLDFEAKNLDSGTAYELGVATMRDLPIIALQEKDEAVNLMITESLHWYTKQVSDFETYDFQQLPKGDFIGEIL >CP027349|1283133:1292981|1291985_1292981_+|AXI12382.1|DBSCAN-SWA MQNPRLTIIVPCYNEEAVLPKSAHILDGILTDLIQHKQVNAASKLLFVDDGSQDKTWKLIKSLEKQYSTVTGLKFSRNFGHQNALMAGMQVASPTAEIVITIDADLQDDPQVIPEMVARYRAGSDIVLGVRKDRSSDSLFKRWTADGFYRLMKRIGVQLVPNHADFRLLSQRAVQALLTYEETNLFLRGIVPRLGFPTTKLYYHRQPRFAGVSKYPLRKMVAFAFDGITSFSIAPIKVILLFGMVISGGSLMMMLYALIQGLLGTATSGWSSLMTSLWFLGGMQLIGISIVGEYVGKIFAEVKHRPRYIIETDDYTATQQPAIVNSQRVHG >CP027349|1283133:1292981|1290053_1290614_+|AXI12379.1|DBSCAN-SWA MQKPMPVAVTNIADNITHQPAYMTIVLNDHKYSTARKKTPFILKALNEGAAAHGRLTITPSRLSLADERGTVFQTLAPIPTVITDVELGLYRSIVRQLGNGVRMKARYTLAVTLTSDTATYQMLNTDLSVLKPLLAWITDFHLHLADSLQLATSDIDWPNLTADQFEALTKGTPYFAWQQTIGAHW |
9 | Lactobacillus_phage(87.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2135325 : 2174263
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP027349|2135325:2174263|DBSCAN-SWA 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44 | Lactobacillus_phage(81.48%) | capsid,tail,portal,integrase,terminase,holin | attL 2132915:2132931|attR 2174487:2174503 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2365646 : 2374160
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP027349|2365646:2374160|DBSCAN-SWA CTTAAATTGCTCCTTCATTAATGAGTGTCTGTAATACATCTGGATAAAATTGGTGTTCACAATCATGAATCCGGGTCGCCAGGCTGGCTAGCGTATCGTCTGGTGCAACCGGAACGACCCGCTGGGCAATAATTTGCCCGGTATCGATTCCGGCATCGATATAGTGAATGGTAACGCCCGTCTCAGTCACACCAGCGGCAAAAGCATCCTCGATGCCGTGACGACCAGGAAACTTTGGTAACAATGCTGGGTGAATATTGATGATTTTATGAGCATACGCATTCAAGAGGGTCGGACCAATAATGCGCATGTACCCGGCCAATAATACCAGTTCAATTTGCCGTGCTTGCAAGGCCGTCAAAATGATTGCTTCCGCGGCCGCTTTATTCGCATAATCATGAAAATCAACAATTAATATCGGTACGTTAGCTGCCCGGGCCTTGTCAATTACCGGCGCTGTCGGCTGATCACACACAAGTAACCCAATCACTACCGGTAATTGTCGTTCAATAATCGCTTGGTGGAGTGCAACAAAGTTGGTGCCGTTACCCGAAGCAAATACTGCAATTTTATTAGGCATGCTCAGCCTCCTCAAAAACAACGGGTGTCGTACCAGTTTGGACTGTTCCAACTCGATAATAGGACTGAGCGTTGGCCGTCAAATTAGCCGTCACAGCTGCCACTTGGTCGGAGTGAACGATCAGAACCATTCCCAAGCCCAAGTTAAAGGTCGACCGAAGATCCATAGCAGTCAGCCCACCGAGTTCGGCCAATAACGTCATAATCGGCGGTGCCGGCCATTGACCCAATTCAAGGTGCGCACTCAAGCCCGCCGGTAACGCTCTGGCGACGTTCTCAATCAAGCCGCCCCCGGTAATGTGGGCGATACTCGTCACTAATTTCTGCTGTAATAATGGTTGAACTGCATCAACGTAAATGGTCGTTGGTCGTAAAAGTTCCGTTTGTAAATCATGACCAAGTTCGTCAAAAACCGTGGTCAATTGGTAGTCGTGTTGTTTGAATAAAATATCACGAACTAGACTAAACCCATTCGAGTGGAGGCCATTAGACGGCAACCCAATCAAGACGTCCCCAGCCCGAACATTTGCCGGTGATAACAGGTCCGCGCGGTTCGCAATTCCGACCGCAAAACCAGCGAGGTCGTAATGGTCCTGACCATACATATCGGGCATCTCCGCAGTCTCGCCACCAATCAACGCTGTATGGGCCTGCTGACAGCCCGCGACGACGCCAGTCAAAATGGCTTTGACCCGTTTCTGATCCGTATGTCCAAGACCTAAGTAATCTAAAAAGAACTGGGGGGTCGCGCCTTGTGCCAAAATATCATTCACACACATTGCGACCAAGTCAATTCCAATCGTGGTATGTTGATCAGCAGCGATTGCGACTAAGAGCTTAGTCCCCACACCATCCGTCCCCGCTACTAACACGGGATCGTTGGCAGTTGCATCCGGACTAAGTGGAAACGCCCCCCCAAACGCGCCTAATTGCTGATTGCCACTCATTTGTTTGACCGTCTTTAAGACGTCGTAACCAGCGTTGATATCAACGCCAGCCCGCTTATACGCATCGCTCACTTGATCACCCCTTCATGATTGGCTTGTAATTGCGCAATTTCCGCATCATACTCGGCTTGGTAATCATACAGGGCCGTTGGATAATCCCCATTAAAGTAGGCCATACATAGTCCACCATACGGTTCAGTGGTTGACAAGCCAACTGCATCAACGACGCCCTGTTCACTGAGAAAACCAAGTGAGTCCGCACCAAACGTCTGACACATCTCCGGAATCGTTTGCTGAGCCGCAATCAATTCATTAGTCGATTGAATATCGATACCGTAAAAACATGGATAGCGTAATGGTGGCGATGCAATTCGTAAATGAACTGACTTTGCACCCGCATCTTTCAATAATTTGACGATCCGCCGACTGGTGGTACCACGTACAATCGAATCATCGATTAAGACGACTCGTTTACCAGCGACAACACCTTTGACTGCTGAAAGCTTCATCCGAACCCCCTGTTCTCGCAATGCTTGGGTCGGCTGAATAAAGGTCCGTGACGAATATTGATTTTTAATTAATCCCATCTCGTAAGGCAGGCCACTCGCTTCCGCATAGCCGGTCGCCGCTGATAAAGATGAATTGGGTACCCCGACAACAATGTCGGCGTCCACGGGCTGTTCAACAGCGAGCTGAGCACCCATTCGTTTACGTGCAGAATGGACGTTGACGCCGTGAATATCAGAATCTGGACGTGCAAAGTAGATAAACTCCATTGAACAAATCGCCAACTGTGTATCAGTCGTATAATGGTCGATCGTCAAACCATTATCATCGATCGTTAACAATTCTCCCGGCTGAACATCTTGAACAAACGTCGCACCAATCGTATCAAGCGCGCAAGTTTCACTACAAACGACGTACCCGCCCGTGGGTAACTGACCGACGACTAATGGTCGTAACCCGTTAGGATCCAAAGCGGCAATCAAACAATCATTCGTTAGTAGTAAGTAAGCAAAGCCTCCGTGGACTTGACGTAAAGCATCCTTAACCTGTTCCGTTAACGTTGCTGCGGGGCTGCGTCGAATCAGATGCATTAAAATCTCACTATCAGAACTAGCATGAAAAATGGCACCATGCTGTTCCAACCGTCGCCGCAGTGTCACCGCATTCGTCAAATTGCCGTTATGTGCGAGTGCAAACTGTGAGTCGCTAAAATTAAAACTCAAGGGTTGAATGTTTTCCAATCCATGATTACCAGCCGTGGCATAACGTACATGGCCGACTGCAGCTTGACCCGTCAAACGTGCCAACCGCCGTGGGTCCCGAAAGACATCAGCCAACAACCCTAGTCCGCGTTCCGTCTGCAGTTTGCCGTGATCATTCGCCGTGATACCGGCTCCTTCTTGCCCCCGGTGTTGTAACGCATGGAGCCCAAAGTACGTTAATTGGGCGGCGTCCGGCGAGCCCCAAACCCCAAAGACGCCACATTCTTCATTCAGACTTCTTACTTCAGTAGGCATGGTAAGGCCCCTTCCCACAACTGTTTGGCGAAACTAACCTTAATATCAAACGCCTGATCAGCAGTTTGAACGTGTAGCCGATCCGTTGCAGTTGTTCGTCCTAAATAGGTCACATATGGTTCCATTAAACTTTCAAACGCGGCTTGCTGTGCTGGTGTCACCGAGATAACAAATCGTGACTGCGTTTCCGCAAAGAAGTTGGCAGCGGGCAAGTCACTGGCCAGTTCCACCCCGATATTTTGTGGAAAACATGATTCGGCAATCGTCGTAATCAAGCCACCTTCAGAAACATCGTGGGCACTAGCAACTAGTCCTTTTTGAATCGCAGTTAACAATAGACGCTGATTACGATTTTCAGTCACAAGGTCAAAATCAAACAGCTCGCCACTGATCGTTCCCGTCAACATCTTTTGCAGCTCACTACCATTGAAATCGGCTTCTGTGGTACCTAACACGTAGACTGCATCGCCAGCGTGTTTAAAATCGCTAGTCGTAATATCTTTCTGATGCTTAATTAACCCGACCATCCCAATCATTGGGGTGGGATAGATGGCTTCCCCGTTCGATTCATTGTTCAACGAGACATTGCCAGAAATCACGGGCGTATTGAATAATTGGCATGCACGAGCGATGCCCATCGCCGATTCGTCCAAATCGTAAAATTGTTCAGGTTTCTCTGGATTACCATAGTTCAAGCAATCAGTGATGCCTAAAGGTTGCCCACCGGAAGCGACAATGTTTCGAGCAGCTTCCGCAACGGCGATTTCCCCACCGACACGGGGGTTTAAGTATAAGTATCGCCCGTTAACATCGGTGGTGACCGCCAACGCCTTATCCGTATGTCGAATCCGTATGACCCCCGCATCGGAACCCGGCTTGACGACCGTATTCGTTTGGACCTGCGAGTCATACGTTCCATATAACGACGCTTTGGAAGCAATCGTTGGCTGTTGGAGCATCTTCTTCAATGTGCCAGTTGCATCAACTAGTCGTGGCATAAATTGATGATGGCTCTGATGGTTCAAGCGCGTTGGTCGTTTCTTTTCGCGTTCATAGACCGGCGCTTTGGTCGCAAGTGCATCGACGGGAACATCTGCAACTAACTTACCATGATGGAATAATTGATACTGGTGGCCGGCTGTCACTTTACCAATTGTGACAGCATCAAGACCGTACTTTTCAAAGACTTGATAAATTTCTGCTTCGGCACCAGCTTTGACACATAGTAACATCCGCTCCTGTGATTCAGAGAGCATCAGTTCAAACGGCGTCATGCCAGTTTCACGTTGTGGTACCAAGTCAAGATTCAGTGACAACCCACTGCCTGCTTTGGACGCCATTTCGGCTGAGGAGGAAACTAGGCCCGCCGCGCCCATATCTTGAATCCCGATTAAAACATCACGATGTTCATGAATAACCTCGAGACACGCCTCCATCAATAATTTTTCCATAAAGGGATCACCAACTTGAACCGCGGAACGCTGGGTTTCATTGGCGTCATTAAATTCAGCAGAGGCAAAGGACGCACCGTTAATGCCGTCACGCCCCGTTTTTGCGCCGACATAAATAACGGCGTTGCCAATTCCTGTTGCTTGGCCCTTCTGAATATCAGCTTGATCCAAGATTCCAACACACATGGCGTTCACCAACGGGTTCTTCTGATAACTCGCATCAAATACCGTATCACCACCGATTGTCGGAATTCCAATACAGTTGCCATAACCGCCAATGCCGGCGACTACTTGCGAAATCAAGTATTTCGTATGAGCATCAGTCGGTTCCCCAAAGCGAAGACTGTCCAGCAGCGCAATCGGCCGGGCCCCCATCGAAAAGATGTCCCGAATGATACCACCCACACCCGTTGCCGCACCCTCATAAGGTTCAACTGCAGACGGATGATTATGACTTTCAGCTTTAAAGACCACGGCCTGACCATCACCGATGTCGATAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP027349|2365646:2374160|2372560_2373691_-|AXI13370.1|DBSCAN-SWA MNANFKEALLPPATIGIVGGGQLGQMMTLSAKAMGYRVGVLDPTPKAPAAQVADFQIVAAYDDQAALLDLARRSDVLTYEFENVDENALIAAQAYAKLPQGTALLHITGDRLNEKQFLHDHGIPVTSFAPVTDLQSLNYALNRVGTPAILKTAAGGYDGHGQTDLDTAVVTKAASALLTQPCILEARQKFRTEVSMMVTRSAAGVVTTFPLVENQHQHHILHTTIAPANVQPSVHSAARKIAVSIAESLELRGVLGIEFFVLPDDTLLVNELAPRPHNSGHYTIEACNISQFEAHIRSICGLPIPAITQTSPAVMRNLLGDDLTVARQQLVEHPEWHFHDYGKAAIKPQRKMGHVTVLNHDIDAALASVANLKGEQ >CP027349|2365646:2374160|2367239_2368694_-|AXI13365.1|DBSCAN-SWA MPTEVRSLNEECGVFGVWGSPDAAQLTYFGLHALQHRGQEGAGITANDHGKLQTERGLGLLADVFRDPRRLARLTGQAAVGHVRYATAGNHGLENIQPLSFNFSDSQFALAHNGNLTNAVTLRRRLEQHGAIFHASSDSEILMHLIRRSPAATLTEQVKDALRQVHGGFAYLLLTNDCLIAALDPNGLRPLVVGQLPTGGYVVCSETCALDTIGATFVQDVQPGELLTIDDNGLTIDHYTTDTQLAICSMEFIYFARPDSDIHGVNVHSARKRMGAQLAVEQPVDADIVVGVPNSSLSAATGYAEASGLPYEMGLIKNQYSSRTFIQPTQALREQGVRMKLSAVKGVVAGKRVVLIDDSIVRGTTSRRIVKLLKDAGAKSVHLRIASPPLRYPCFYGIDIQSTNELIAAQQTIPEMCQTFGADSLGFLSEQGVVDAVGLSTTEPYGGLCMAYFNGDYPTALYDYQAEYDAEIAQLQANHEGVIK >CP027349|2365646:2374160|2371826_2372558_-|AXI13369.1|DBSCAN-SWA MTAAIEKQALLYTGKAKAMYATNDPEILWVEYLDQATALNGKRKVPIDQKGRLNNRIASLIFKDLANHGIANHFIEQPSDYVQLVRRVTMIPLETVVRNAASGSFERKFAVPHLTKFAEPVLEFFYKSDQLDDPFINDSQIHALNVATPAIVAEIKRQALQVNQRLTAIFAAMGVQLVDFKIEFGLTTTGKVLLADEISPDSCRLVDLKTGASLDKDVFRKDLGDLTSVYQEVLTRLATVEEA >CP027349|2365646:2374160|2365646_2366225_-|AXI13363.1|DBSCAN-SWA MPNKIAVFASGNGTNFVALHQAIIERQLPVVIGLLVCDQPTAPVIDKARAANVPILIVDFHDYANKAAAEAIILTALQARQIELVLLAGYMRIIGPTLLNAYAHKIINIHPALLPKFPGRHGIEDAFAAGVTETGVTIHYIDAGIDTGQIIAQRVVPVAPDDTLASLATRIHDCEHQFYPDVLQTLINEGAI >CP027349|2365646:2374160|2371570_2371825_-|AXI13368.1|DBSCAN-SWA MYLVKIYVTYKQSILDPKGEAIHDALHRLGYTNVDAVELGKYFEVKIHADDRPVAAEIDEMCDRLLANVNMETYRYEITEMEAL >CP027349|2365646:2374160|2373674_2374160_-|AXI13371.1|DBSCAN-SWA MMAKVGLIMGSISDWPTMQLAAEQLTALGVSYERHVISAHRMPQTLQSYGEEAASRGIQVIIAGAGGAAHLPGMLAANTLLPVIGVPIKTHTLNGVDSLLSIVQMPAGVPVATMAIGDAGAKNGALMAAQIIGLREPQVQHAIGEFRARQRQEAEQSERQF >CP027349|2365646:2374160|2370890_2371571_-|AXI13367.1|DBSCAN-SWA MMKFAVPVFPGSNCDHDMVNALRDILHVTADLIPATATSLAGYDAVVLPGGFSYGDYLRSGAIARFAPIMPAVIAFANAGKPVIGICNGFQVLTEAGLLPGALQANRSAKFICQDSPLRIANHETIFTTAYGSTDQISLPIAHGEGNYYCDEATLAQLRANHQIIFEYVENPNGSTANIAGITNEAGNVLGMMPHPERAVEMILGSTDGLGIFQSVIASQEEVTHA >CP027349|2365646:2374160|2368678_2370898_-|AXI13366.1|DBSCAN-SWA MLKKQPLSPTDVRDSKVYRDWGLTDAEYQLLTDKVLQRLPNETETGLFSGMWSEHCSYKNSKPVLKKFWTQGEQVLEGPGEGAGIIDIGDGQAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGEPTDAHTKYLISQVVAGIGGYGNCIGIPTIGGDTVFDASYQKNPLVNAMCVGILDQADIQKGQATGIGNAVIYVGAKTGRDGINGASFASAEFNDANETQRSAVQVGDPFMEKLLMEACLEVIHEHRDVLIGIQDMGAAGLVSSSAEMASKAGSGLSLNLDLVPQRETGMTPFELMLSESQERMLLCVKAGAEAEIYQVFEKYGLDAVTIGKVTAGHQYQLFHHGKLVADVPVDALATKAPVYEREKKRPTRLNHQSHHQFMPRLVDATGTLKKMLQQPTIASKASLYGTYDSQVQTNTVVKPGSDAGVIRIRHTDKALAVTTDVNGRYLYLNPRVGGEIAVAEAARNIVASGGQPLGITDCLNYGNPEKPEQFYDLDESAMGIARACQLFNTPVISGNVSLNNESNGEAIYPTPMIGMVGLIKHQKDITTSDFKHAGDAVYVLGTTEADFNGSELQKMLTGTISGELFDFDLVTENRNQRLLLTAIQKGLVASAHDVSEGGLITTIAESCFPQNIGVELASDLPAANFFAETQSRFVISVTPAQQAAFESLMEPYVTYLGRTTATDRLHVQTADQAFDIKVSFAKQLWEGALPCLLK >CP027349|2365646:2374160|2366217_2367243_-|AXI13364.1|DBSCAN-SWA MSDAYKRAGVDINAGYDVLKTVKQMSGNQQLGAFGGAFPLSPDATANDPVLVAGTDGVGTKLLVAIAADQHTTIGIDLVAMCVNDILAQGATPQFFLDYLGLGHTDQKRVKAILTGVVAGCQQAHTALIGGETAEMPDMYGQDHYDLAGFAVGIANRADLLSPANVRAGDVLIGLPSNGLHSNGFSLVRDILFKQHDYQLTTVFDELGHDLQTELLRPTTIYVDAVQPLLQQKLVTSIAHITGGGLIENVARALPAGLSAHLELGQWPAPPIMTLLAELGGLTAMDLRSTFNLGLGMVLIVHSDQVAAVTANLTANAQSYYRVGTVQTGTTPVVFEEAEHA |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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