Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP022717 | Staphylococcus aureus strain 27 chromosome, complete genome | 7 crisprs | cas3,DEDDh,DinG,csa3,WYL | 2 | 2 | 9 | 0 |
1. CP022717
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP022717_1 | 526213-526302 | Unclear |
NA
Consensus repeat of CP022717_1
|
1 spacers
spacers of CP022717_1
>1.1|526244|28|CP022717|CRISPRCasFinder ACGAAAAGTCAGCTTACGATAAAGTGCA |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022717_1
The CRISPR arrays of CP022717_1 >merge|CP022717|1|526213-526302|CRISPRCasFinder AGTTGGGGTGTGGGCCCCAACACAGAAGCTGACGAAAAGTCAGCTTACGATAAAGTGCAAGTTGGGGTGTGGGCCCCAACATAGAAGCTG >CP022717|1|1|526213-526302|CRISPRCasFinder AGTTGGGGTGTGGGCCCCAACACAGAAGCTG ACGAAAAGTCAGCTTACGATAAAGTGCA AGTTGGGGTGTGGGCCCCAACATAGAAGCTG
>CP022717.1|AXJ22260.1|523896_525990_+|ATP-dependent-zinc-metalloprotease-FtsH MQKAFRNVLVIVIIGVIIFGLFSYLNGNGNMPKQLTYNQFTEKLEKGDLKTLEIQPQQNVYMVSGKTKNDEDYSSTILYNNEKELQKITDAAKKQNGVKLTIKEEEKQSVFVSILSTLIPVVVIALLFIFFLSQAQGGGSGGRMMNFGKSKAKMYDNNKRRVRFSDVAGADEEKQELIEIVDFLKDNKKFKEMGSRIPKGVLLVGPPGTGKTLLARAVAGEAGAPFFSISGSDFVEMFVGVGASRVRDLFDNAKKNAPCIIFIDEIDAVGRQRGAGVGGGHDEREQTLNQLLVEMDGFGENEGIIMIAATNRPDILDPALLRPGRFDRQIQVGRPDVKGREAILHVHAKNKPLDETVDLKAISQRTPGFSGADLENLLNEASLIAVREGKKKIDMRDIEEATDRVIAGPAKKSRVISKKERNIVAHHEAGHTIIGMVLDEAEVVHKVTIVPRGQAGGYAMMLPKQDRFLMTEQELLDKICGLLGGRVSEDINFNEVSTGASNDFERATQIARSMVTQYGMSKKLGPLQFGHSNGQVFLGKDMQGEPNYSSQIAYEIDKEVQRIVKEQYERCKQILLEHKEQLILIAETLLTEETLVAEQIQSLFYEGKLPEIDYDAAKVVKDEDSEFNDGKFGKSYEEIRKEQLEDGQRDESEDRKEEKDIAEDKKEADKSDEKDEPAHRQAPNIEKPYDPNHPDNK >CP022717.1|AXJ22259.1|523099_523639_+|Hypoxanthine-guanine-phosphoribosyltransferase MHNDLKEVLLTEEDIQNICKELGAQLTKDYQGKPLVCVGILKGSAMFMSDLIKRIDTHLSIDFMDVSSYHGGTESTGEVQIIKDLGSSIENKDVLIIEDILETGTTLKSITELLQSRRVNSLEIVTLLDKPNRRKADIEAKYVGKKIPDEFVVGYGLDYRELYRNLPYIGTLKPEVYSN >CP022717.1|AXJ22258.1|521799_523095_+|tRNA(Ile)-lysidine-synthase MQLNSNGWHVDDHIVVAVSTGIDSMCLLYQLLKDYKDSYRKLTCLHVNHGVRSASIEEARFLEAYCERHHIDLHIKKLDLSHSLNRNNSIQNEARIKRYEWFDEMMNVLEADVLLTAHHLDDQLETIMYRIFNGKSTRNKLGFDELSKRKGYQIYRPLLAVSKKEIKQFQERYHIPYFEDESNKDNKYVRNDIRNRIIPAIDENNQLKVSHLLKLKQWHDEQYDILQYSAKQFIQEFVKFDEQSKYLEVSRQSFNDLPNSLKMVVLDCLLSKYYELFNISAKTYEEWFKQFSSKKAQFSINLTDKWIIQIAYGKLIIMAKNNGDTYFRVQTIEKPGNYIFNKYRLEIHSNLPKCLFPLSVRTRQSGDTFKLNGRDGYKKVNRLFIDCKVQQWVRDQMPIVLDKQQRIIAVGDLYQQQTIKQWIIISKNGDE >CP022717.1|AXJ22257.1|521218_521620_+|General-stress-protein-13 MSIEVGNKLKGKVTGIKKFGAFVELPEGKSGLVHISEVADNYVENVEEHLSVGDEVDVKVLSIADDGKISLSIKKAKDRPRRQHTSKPSHQKPVQKAEDFEKKLSNFLKDSEDKLTSIKRQTESRRGGKGSRR >CP022717.1|AXJ22256.1|520721_521114_+|Cell-division-protein-DivIC MKNKVEHIENQYTSQENKKKQRQKMKMRVVRRRITVFAGVLLAIIVVLSILLVVQKHRNDIDAQERKAKEAQFQKQQNEEIALKEKLNNLNDKDYIEKIARDDYYLSNKGEVIFRLPEDKDSSSSKSSKK >CP022717.1|AXJ22255.1|520440_520704_+|Heat-shock-protein-15 MRLDKYLKVSRLIKRRTLAKEVSDQGRITINGNVAKAGSDVKVEDVLTIRFGQKLVTVKVTALNEHASKDNAKGMYEIIEERRLEEA >CP022717.1|AXJ22254.1|519250_520444_+|Nucleoside-triphosphate-pyrophosphohydrolase/pyrophosphatase-MazG MAHTITIVGLGNYGIDDLPLGIYKFLKTQNKVYARTLDHPVIESLQDELTFQSFDHVYETHDQFEDVYNDIVAQLVEAANEKDIVYAVPGHPRVAETTTVKLLALAKDNTDIDVKVLGGKSFIDDVFEAVNVDPNDGFTLLDATSLQEVTLNVRTHTLITQVYSAMVAANLKITLMERYPDDYPVQIVTGARSDGADNVVTCPLYELDHDENAFNNLTSVFVPKITTPTYLYHDFDFATEVIDTLVDEDKGCPWDKVQTHETLKRYLLEETFELFEAIDNEDDWHMIEELGDILLQVLLHTSIGKKEGYIDIKEVITSLNAKMIRRHPHIFGDANAETIDDLKEIWSKAKDAEGKQPRVKFEKVFAEHFLNLYEKTKDKSFDEAALKQWLEKGESNT >CP022717.1|AXJ22253.1|517724_519251_+|putative-cell-division-protein-YtgP MKHKEAFNGVVVLTAALIVIKILSAVYRIPYQNILGDTGLYAYQQVYPIVALGMILSMNAIPSAITQNIGKYHSDEAYAKAVAYIQLVGILLFIAIFVFANNIAYMMGDSHLTPMIQAASLSFIFIGMLGVLRGYYQSANNMTVPAISQVIEQVIRVGIIIVTIVIFVDRGWTIYEAGTIAILASTIGFLGSSIYLVAHRPFKFKMVNNTAKIVWKQFALSVLIFAISQLIVILWQVIDSVTIIKSLQAIRVPFDVAITEKGVYDRGASFIQMGLIVTTTFSFALIPLLSDAIKMNNQVLMNRYANASLKITILISTAAGIGLINLLPLMNGVFFKTNDLTLTLSVYMITVICVSLIMMDMALLQAQHAVRPIFVGMMAGLVIKFILNIILIRLSGIIGASISTVVSLIIFGTIIHIAVTRKYHLHAMRRFFINVVLGMVFMSIVVQCVLNIVTTHGRITGLIELLCAAVLGIIALFFYIFRFNVLTYKELTYLPFGSKLYQIKKGRR >CP022717.1|AXJ22252.1|514228_517735_+|Transcription-repair-coupling-factor MTILTTLIKEDNHFQDLNQVFGQANTLVTGLSPSAKVTMIAEKYAQSNQQLLLITNNLYQADKLETDLLQFVDAEELYKYPVQDIMTEEFSTQSPQLMSERIRTLTALAQGKKGLFIVPLNGLKKWLTPVEMWQNHQMTLRVGEDIDVDQFLNKLVNMGYKRESVVSHIGEFSLRGGIIDIFPLIGEPIRIELFDTEIDSIRDFDVETQRSKDNIEEVDITTASDYIITEEVISHLKEELKTAYENTRPKIDKSVRNDLKETYESFKLFESTYFDHQILRRLVAFMYETPSTIIDYFQKDAIIAVDEFNRIKETEESLTVESDTFISNIIESGNGFIGQSFIKYDDFETLIEGYPVTYFSLFATTMPIKLNHIIKFSCKPVQQFYGQYDIMRSEFQRYVNQNYHIVVLVETETKVERMQAMLSEMHIPSITKLHRSMSSGQAVIIEGSLSEGFELPDMGLVVITERELFKSKQKKQRKRTKAISNAEKIKSYQDLNVGDYIVHVHHGVGRYLGVETLEVGQTHRDYIKLQYKGTDQLFVPVDQMDQVQKYVASEDKTPKLNKLGGSEWKKTKAKVQQSVEDIAEELIDLYKEREMAEGYQYGEDTAEQTTFELDFPYELTPDQAKSIDEIKDDMQKSRPMDRLLCGDVGYGKTEVAVRAAFKAVMEGKQVAFLVPTTILAQQHYETLIERMQDFPVEIQLMSRFRTPKEIKQTKEGLKTGFVDIVVGTHKLLSKDIQYKDLGLLIVDEEQRFGVRHKERIKTLKHNVDVLTLTATPIPRTLHMSMLGVRDLSVIETPPENRFPVQTYVLEQNMSFIKEALERELSRDGQVFYLYNKVQSIYEKREQLQMLMPDANIAVAHGQMTERDLEETMLSFINNEYDILVTTTIIETGVDVPNANTLIIEDADRFGLSQLYQLRGRVGRSSRIGYAYFLHPANKVLTETAEDRLQAIKEFTELGSGFKIAMRDLNIRGAGNLLGKQQHGFIDTVGFDLYSQMLEEAVNEKRGIKEPESEVPEVEVDLNLDAYLPTEYIANEQAKIEIYKKLRKTETFDQIIDIKDELIDRFNDYPVEVARLLDIVEIKVHALHSGITLIKDKGKIIDIHLSVKATENIDGEVLFKATQPLGRTMKVGVQNNAMTITLTKQNQWLDSLKFLVKCIEESMRISDEA >CP022717.1|AXJ22251.1|513656_514229_+|Peptidyl-tRNA-hydrolase MKCIVGLGNIGKRFELTRHNIGFEVVDYILEKNNFSLDKQKFKGAYTIERMNGDKVLFIEPMTMMNLSGEAVAPIMDYYNVNPEDLIVLYDDLDLEQGQVRLRQKGSAGGHNGMKSIIKMLGTDQFKRIRIGVGRPTNGMTVPDYVLQRFSNDEMVTMEKVIEHAARAIEKFVETSRFDHVMNEFNGEVK >CP022717.1|AXJ22261.1|526635_527517_+|33-kDa-chaperonin MTHDYIVKALAFDGEIRAYAALTTETVQEAQTRHYTWPTASAAMGRTMTATAMMGAMLKGDQKLTVTVDGQGPIGRIIADANAKGEVRAYVDHPQTHFPLNEQGKLDVRRAVGTNGSIMVVKDVGMKDYFSGASPIVSGELGEDFTYYYATSEQTPSSVGLGVLVNPDNTIKAAGGFIIQVMPGAKDETISKLEKAISEMTPVSKLIEQGLTPEGLLNEILGKDHVQILEKMPVQFECNCSHEKFLNAIKGLGEAEIQNMIKEDHGAEAVCHFCGNKYKYTEEELNVLLESLV >CP022717.1|AXJ22262.1|527695_528628_+|Cysteine-synthase MAQKPVDNITQIIGGTPVVKLRNVVDDNAADVYVKLDYQNPGGSVKDRIALAMIEKAEREGKIKPGDTIVEPTSGNTGIGLAFVCAAKGYKAVFTMPETMSQERRNLLKAYGAELVLTPGSEAMKGAIKKAKELKEEHGYFEPQQFENPANPEVHELTTGPELLQQFEGKTIDAFLAGVGTGGTLSGVGKVLKKEYPNIEVVAIEPEASPVLSGGEPGPHKLQGLGAGFIPGTLNTEIYDSIIKVGNDTAMEMSRRVAKEEGILAGISSGAAIYAAIQKAKELGKGKTVVTVLPSNGERYLSTPLYSFDD >CP022717.1|AXJ22263.1|528843_529647_+|Dihydropteroate-synthase MTKTKIMGILNVTPDSFSDGGKFNNVESAVTRVKAMMDEGADIIDVGGASTRPGHEMISLEEELNRVLPVVEAIVGFDVKISVDTFRSEVAEACLKLGVDIINDQWAGLYDHRMFQVVAKYDAEIVLMHNGNGNRDEPVVEEMLTSLLAQAHQAKIAGISSNKIWLDPGIGFAKTRNEEAEVMARLDELVATEYPVLLATSRKRFTKEMMGYDTTPVERDEVTAATTAYGIMKGVRAVRVHNVELNAKLAKGIDFLKENENARHNLS >CP022717.1|AXJ22264.1|529624_529990_+|Dihydroneopterin-aldolase MQDTIFLKGMRFYGYHGALSAENEIGQIFKVDVTLKVDLAEAGRTDNVIDTVHYGEVFEEVKSIMEGKAVNLLEHLAERIANRINSQYNRVMETKVRITKENPPIPGHYDGVGIEIVRENK >CP022717.1|AXJ22265.1|529986_530463_+|2-amino-4-hydroxy-6--hydroxymethyldihydropteridine-pyrophosphokinase MIQAYLGLGSNIGDRESQLNDAIKILNEYDGINVFNISPIYETAPVGYTEQPNFLNLCVEIQTTLTVLQLLECCLKTEECLHRVRKERWGPRTLDVDILLYGEEMIDLPKLSVPHPRMNERAFVLIPLNDIAANVIEPRSKLKVKDLVFVDDSVKRYK >CP022717.1|AXJ22266.1|531001_532489_+|Lysine--tRNA-ligase MSEEMNDQMLVRRQKLQELYDLGIDPFGSKFDRSGLSSDLKEEWDQYSKEELVEKEADSHVAIAGRLMTKRGKGKAGFAHVQDLAGQIQIYVRKDQVGDDEFDLWKNADLGDIVGVEGVMFKTNTGELSVKAKKFTLLTKSLRPLPDKFHGLQDIEQRYRQRYLDLITNEDSTRTFINRSKIIQEMRNYLNNKGFLEVETPMMHQIAGGAAARPFVTHHNALDATLYMRIAIELHLKRLIVGGLEKVYEIGRVFRNEGVSTRHNPEFTMIELYEAYADYHDIMDLTESMVRHIANEVLGSAKVQYNGETIDLESAWTRLHIVDAVKEATGVDFYEIKSDEEAKALAKEHGIEIKDTMKYGHILNEFFEQKVEETLIQPTFIYGHPTEISPLAKKNPEDPRFTDRFELFIVGREHANAFTELNDPIDQKGRFEAQLVEKAQGNDEAHEMDEDYIEALEYGMPPTGGLGIGIDRLVMLLTDSPSIRDVLLFPYMRQK >CP022717.1|AXJ22267.1|545038_546421_-|HTH-type-transcriptional-regulatory-protein-GabR MKNTLYHQLYEKLKKQIIEGQFKEGDKFYSKRQLSKHLSISQTTVEHAYQLLLDEGYIYSRPRSGYFVSEIESLTILNNQPIPSLFDDDSYKPKASDEAYDYAFNLDEIDTKHFPIELFRKYSKDLYDTNHLNQLRRGHFQGELHLRFQLAFYLFTNRGVICDPNQIIIGSSTEQLVNQLVDLLYTSTFIIEKPSYPPIKNILDKKQVEYEQIEVEDNGINVDEVIKSQKNIVYITPSHQFPTGYVMDLKKRTQLIQWAQEKEERFIIEDDYDSEFRYFGKPIPAIQGLYSRGEKVIYISTFSKSIFPSCRVAYMVLPYSIMKKYHSQNHIEGNTVPVHMQNLIATFISSGGFERHLNKMRRIYRRKLTYILNRLKPYKEQLDIQGAETGMHFTITVKNGLTLQECLDRANKVKLKLQVYNFDDDQDYKKTPKFILGFGGIDDDALKPHVDALIKSLIIK >CP022717.1|AXJ22268.1|546524_547412_+|Pyridoxal-biosynthesis-lyase-PdxS MSKIIGSDRVKRGMAEMQKGGVIMDVVNAEQARIAEEAGAVAVMALERVPSDIRAAGGVARMANPKIVEEVMNAVSIPVMAKARIGHITEARVLEAMGVDYIDESEVLTPADEEYHLRKDQFTVPFVCGCRNLGEAARRIGEGAAMLRTKGEPGTGNIVEAVRHMRQVNSEVSRLTVMNDDEIMTFAKDIGAPYEILKQIKDNGRLPVVNFAAGGVATPQDAALMMELGADGVFVGSGIFKSEDPEKFAKAIVQATTHYQDYELIGRLASELGTAMKGLDINQLSLEERMQERGW >CP022717.1|AXJ22269.1|547415_547976_+|Glutamine-amidotransferase-subunit-PdxT MKIGVLALQGAVREHIRHIELSGHEGIAVKKVEQLEEIEGLILPGGESTTLRRLMNLYGFKEALQNSTLPMFGTCAGLIVLAQDIVGEEGYLNKLNITVQRNSFGRQVDSFETELDIKGIATDIEGVFIRAPHIEKVGQGVDILCKVNEKIVAVQQGKYLGVSFHPELTDDYRVTDYFINHIVKKA >CP022717.1|AXJ22270.1|548183_549398_-|Nucleoside-permease-NupC MHILIGIIGIIFFLALAFLFSSDRKNIRWKYVGILLAIQLIFAFILLKTTMGIKVIGGISNGFNYLLLKAADGVNFVFGGIQYIDPKQPPFFFSVLLPIVFISAIIGILQYTKILPLIINVLGFLISKINGMGRLESYNAVAAAILGQSEVFISIKKQLPYIPKQRLYTLTASAMSTVSASIIGAYFTLIEPKYVVTAVVLNLFGGFIIASIINPYKVNEEDDKLLVEETEERQQSFFEMLGEYILDGFKVAVIVGAMLIGYIAIIALLNGIVSNIFSTVSGGAISWDFQTLIGFVFAPFAFLVGVPWQDAVQAGSVMATKLLSNEFVAMQALGKLSDLSEHAKGVTSVFLVSFANFSSIGIISGAIKSLNDKKGDTVARFGLKLLFGATLVSFISAAIAGFFI |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP022717_2 | 1042738-1042834 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022717_2
|
1 spacers
spacers of CP022717_2
>2.1|1042772|29|CP022717|CRISPRCasFinder TAAAAGAGGGATACTTGCGCTGAGCGCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022717_2
The CRISPR arrays of CP022717_2 >merge|CP022717|2|1042738-1042834|CRISPRCasFinder GCATAAAAGCCCCTAACAACTAAAAGTTGTAAGGTAAAAGAGGGATACTTGCGCTGAGCGCATGCATAAAAGCCCCTAACAACTAAAAGTTGTAAGG >CP022717|2|2|1042738-1042834|CRISPRCasFinder GCATAAAAGCCCCTAACAACTAAAAGTTGTAAGG TAAAAGAGGGATACTTGCGCTGAGCGCAT GCATAAAAGCCCCTAACAACTAAAAGTTGTAAGG
>CP022717.1|AXJ22729.1|1041684_1042260_-|Putative-HMP/thiamine-permease-protein-YkoE MSKGLKLSEILVTVLISVVFAVIYNLWWFVYNGVQATGLHLEQLTNGVWFMAAIVCYLIIPKPGIALLAEFAAGAGETIIMGRFDIPTIVYAFIQGLACELVFAIFKYQSRSVMVAMLAGFCTAIAAFPIDYFYGYLNEVAGWNLTLFIVFRLISGAVVAGVLSYLLVKALDKTGVTKLFRPAAKEDYDNL >CP022717.1|AXJ22728.1|1040268_1041669_-|Putative-HMP/thiamine-import-ATP-binding-protein-YkoD MLKVSDLRLKYPSGQRKIFDHLNITIQDKEKVLLLGPSGCGKSTLLNVLSGIVPNLIELPMKYDELIVDPLSGVIFQDPDSQFCMPKVYEELAFVLENRQVPREDMDALIINALNMVNLNVTPETYIKDLSGGMKQKLAIVETILQQSKTLFLDEPTAMLDVQATEDLWTKLIELWENQTVVIVEHKVKHIWNHVDRVILMDYNGNIIADECPEIILQKYVHLLSEYGVWHPRAWEFAPSRVDFPTANSHLLQFKNGRIIRGKSTLLSFSDLEIGLGEWITITGANGSGKTTLLESIMQLIKYQGDVYFENQRLTKIKHAAKHMYLVYQNPELQFITNSVYDEINIHFNHLSKDQSDDETMQLLKLLDLENVKDQHPYELSIGQKRRLSVATALSSKADIIFLDEPTFGLDSHNTFQLIKLFQKRINLGQSIVMVTHDDEIIERYPSRRLKISDGALLDCDGDTNV >CP022717.1|AXJ22727.1|1039469_1040276_-|Putative-HMP/thiamine-permease-protein-YkoC MYEQWKVRQSFVDDVNIITKLFLGIILFFFIIFVHNFDFMLYITILMLVFLLMFNGTQFKITAIFITISIGFALLSSLFMILYGNGSHTILKFGFIHITTESLVRGLHVSLRTIAISFFGILIALTSQVVMIFYSLMQHLKVKSKVAYAFMAAIRMIPLMISSLIQLRRSLKMRYQMIDASNYRGLKRFKHLIIPLLSQNIRKAHQLSVAMESKGFRDGPRTYYYNVPFSYKDVIFIIVLIAIITLAYYCSINLPITGIDDVRLGRVG >CP022717.1|AXJ22726.1|1037956_1039204_+|Phosphoribosylamine--glycine-ligase MNVLVIGAGGREHALAYKLNQSNLVKQVFVIPGNEAMTPIAEVHTEISESDHQGILDFAKQQDVDWVVIGPEQPLIDGLADILRANGFKVFGPNKQAAQIEGSKLFAKKIMEKYNIPTADYKEVERKKDALTYIENCELPVVVKKDGLAAGKGVIIADTIEAARSAIEIMYGDEEEGTVVFETFLEGEEFSLMTFVNGDLAVPFDCIAQDHKRAFDHDEGPNTGGMGAYCPVPHISDDVLKLTNETIAQPIAKAMLNEGYQFFGVLYIGAILTKDGPKVIEFNARFGDPEAQVLLSRMESDLMQHIIDLDEGKRTEFKWKNESIVGVMLASKGYPDAYEKGHKVSGFDLNENYFVSGLKKQGDTFVTSGGRVILAIGKGDNVHDAQRDAYEKVSQIQSDHLFYRHDIANKALQLK >CP022717.1|AXJ22725.1|1036456_1037935_+|Bifunctional-purine-biosynthesis-protein-PurH MKKAILSVSNKTGIVEFAKALTQLNYELYSTGGTKRILDEANVPVRSVSDLTHFPEIMDGRVKTLHPAVHGGILADRNKPQHLNELSEQHIDLIDMVVVNLYPFQQTVANPDVTMDEAIENIDIGGPTMLRAAAKNYKHVTTIVHPADYQEVLTRLRNDSLDESYRQSLMIKVFEHTAEYDEAIVRFFKGDKETLRYGENPQQSAYFVRTSNAKHTIAGAKQLHGKQLSYNNIKDADATLALVKKFDTPAAVAVKHMNPCGVGIGDTIEQAFQHAYEADSQSIFGGIVALNRAVTPELAEQLHSIFLEVIIAPKFTDEALDILKQKKNVRLLEIDMTIDSNEEEFVSVSGGYLVQDKDNYVVPKEEMKVVTEVAPTDEQWEAMLLGWKVVPSVKSNAIILSNNKQTVGIGAGQMNRVGAAKIALERAIEINDHVALVSDGFFPMGDTVELAAQHGIKAIIQPGGSIKDQDSIDMANKHGIAMVVTGTRHFKH >CP022717.1|AXJ22724.1|1035875_1036442_+|Phosphoribosylglycinamide-formyltransferase MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKKFDSKAAYEQHLVTLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >CP022717.1|AXJ22723.1|1034844_1035873_+|Phosphoribosylformylglycinamidine-cyclo-ligase MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVEEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIELASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDVSRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >CP022717.1|AXJ22722.1|1033367_1034852_+|Amidophosphoribosyltransferase-precursor MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >CP022717.1|AXJ22721.1|1031199_1033389_+|Phosphoribosylformylglycinamidine-synthase-2 MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKNYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGVLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >CP022717.1|AXJ22720.1|1030535_1031207_+|Phosphoribosylformylglycinamidine-synthase-1 MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >CP022717.1|AXJ22730.1|1042843_1042978_-|hypothetical-protein MSNENQNKKAAEKAKEVEEKLKDKKEEKTEDINQTKQDIQDTLN >CP022717.1|AXJ22731.1|1043129_1044425_+|hypothetical-protein MSFLRKHAEIIFSYLIGIVSLFTGLIILINLPLIKQLNGGKKVDTHVHNVWEFLNAFFSEIIKVMSRFIGNFPIVSAIVIIIFGILVMLIGHTLLRTIKYDYDISIFFLVIGIMYFIITLILMTQVYGFFAVIFIIPFTIHIGYIVYKDELNQENVKNHFMWIIVSYGISYLITQIALYGRIDANEIESIDILSVNAFFIIMWLLGQMAIWNFLFLRRALPLTKQELGEEEPELSRTSKGNVTNQTKIHLKQLQDKTTEYARKTRRSVDLDKIRAKRDKFKKKVNDIIDIQEDDIPDWMRKPKWVKPMYVELFCGVVIFLFTFLEFNNRNALFVSGDWKLSQTQYVIEWVTLLILLFIIIAYIATTLTFHLKGKFYYLQLFMGSILFFKLLTEFINIMIHGLLLSVFITPTLLLMLLAIIISYSLQLRERP >CP022717.1|AXJ22732.1|1044849_1046055_+|Ribosomal-RNA-large-subunit-methyltransferase-I MKIATLNKGKETKYFNGYPLIEEEDIYSQDHLKEEDIYSQDHLKEGDIFQIVTDKSQFVATAYVGRQHKGLGWVLTYDKAQEINTAFFVKLFKTALAERDYYFNIDGTNAFRLFNAEGDGVGGLTIDNYDGHLLIQWYSKGIYKFKYAILEAVRKVFDYKSIYEKVRFKDSEYSGGFVEGDAPEFPIVIEENFTFYNVDLEDGLMTGIFLDQKEVRKKLRDQYAKERHVLNLFSYTGAFSVIAASEASSTTSVDLANRSRSLTEENFGLNAIDPKSQYIYVMDTFDFYKYAARHGHSYDTIVIDPPSFARNKKRTFSVQKDYDKLINGALNILSSEGTLLLCTNASVYPLKQFKNTIKKTLEESGVDYELTEVMGLPKDFKTHPHYKPSKYLKAVFVNIRH >CP022717.1|AXJ22733.1|1046108_1046651_+|hypothetical-protein MGFKNNLTSNLTNKIGNSVFKIENINEKGAMPTTIKELNERRQRAEAIVKRKSLMSSTMSVVPIPGLDFGVDLKLMKDIIEDVNKIYGLDHKQVNSLGDDVKERVMSAAAIQGSQFIGKRISSAFLKIVIRDVAKRTAAKQTKWFPVVGQAVSASISYYFMNKIGKDHIQKCENVIKNVM >CP022717.1|AXJ22734.1|1046804_1047071_+|Phosphocarrier-protein-HPr MEQNSYVIIDETGIHARPATMLVQTASKFDSDIQLEYNGKKVNLKSIMGVMSLGVGKDAEITIYADGSDESDAIQAISDVLSKEGLTK >CP022717.1|AXJ22735.1|1047073_1048792_+|Phosphoenolpyruvate-protein-phosphotransferase MSKLIKGIAASDGVAIAKAYLLVEPDLTFDKNEKVTDVEGEVAKFNGAIEASKVELTKIRNNAEVQLGADKAAIFDAHLLVLDDPELIQPIQDKIKNENANAATALTDVTTQFVTIFESMDNEYMKERAADIRDVSKRVLSHILGVELPNPSMIDESVVIVGNDLTPSDTAQLNKEFVQGFATNIGGRTSHSAIMSRSLEIPAIVGTKSITQEVKQGDMIIVDGLNGDVIVNPTEDELIAYQDKRERYFADKKELQKLRDADTVTVDGVHAELAANIGTPNDLPGVIENGAQGIGLYRTEFLYMGRDQMPTEEEQFEAYKEVLEAMNGKRVVVRTLDIGGDKELSYLNLPEEMNPFLGYRAIRLCLAQQDIFRPQLRALLRASVYGKLNIMFPMVATINEFREAKAILLEEKENLKNEGHDISDDIELGIMVEIPATAALADVFAKEVDFFSIGTNDLIQYTLAADRMSERVSYLYQPYNPSILRLVKQVIEASHKEGKWTGMCGEMAGDETAIPLLLGLGLDEFSMSATSILKARRQINGLSKNEMTELANRAVDCATQEEVIELVNNYVK >CP022717.1|AXJ22736.1|1049027_1049261_-|glutaredoxin-3 MSEIIVYTQNDCPPCTFVKNYLNEHQIDFEERNINNQQYRNEMIDFDAFSTPFILLNGNPMYHVDLDEINKVLNIQD >CP022717.1|AXJ22737.1|1049458_1050820_+|Putative-cytochrome-bd-menaquinol-oxidase-subunit-I MDTVEISRFLTAMTLAVHIIFATIGVGMPLMFAIAEFLGIRKNDFQYIAMAKRWAKAYTITVAVGVVTGTIIGLQLSLIWPTFMEMGGHVIALPLFMETFAFFFEAIFLSIYLYTWDRFKNKWTHFLISIPVIIGGSFSAFFITSVNSFMNTPAGFELKNGKMVNVQPIEAMFNPSFIVRSFHVITTAGMTMAFVIASIAAFKLLRNRQPKDTVYHKKALKMSMIVGFFSTLLSMLAGDLSAKFLHKFQPEKLAAYEWHFDTSSHAKLLLFGVLDEKTQQVKGAIELPGLLSFLADNSVKTKVQGLNDFPKSLHPPMIVHYFFDLMVTMGILCFVISGVYVLTLMFKKLRKFSTHKWMLYGILLTGPASMLAIEFGWFLTEMGRQPWIVRGYMRVAEAATQAGGITFVTILFGVLYIILMYTCAYVLIRMFKNKPAYEDVNRLAKKQGGEIEK >CP022717.1|AXJ22738.1|1050816_1051836_+|Putative-cytochrome-bd-menaquinol-oxidase-subunit-II MIYAFIGITVLWLFLFCYIIIASIDFGAGFFALHSKLTGDEKKINHLISRYLNPVWEVTNVFFVFFFVGFVGFFPESIKYLGTVLLIPGSIALIMISLRNSFYAFENYGQDTKLAWMIMYGVSGLLIPASLSTALTITEGGYINVRNNVIDLDWVQLLLSPFAWSVVFLAIISVLYISSGFLTYYAKKANDEPAYNLTRQWHIFLGPPMIIICLFVFLSLRIQNSEHFYSAVFDYWWMFAISFLFFALASLLTFFKKKHGLAFVFVILQMMFAFFGYGISKLPYLLYPFVKITDAYVNPEMGWTLVIVFILGLLLLLPSLILLLRLFVFDKEYVEGKKS >CP022717.1|AXJ22739.1|1051968_1052631_+|Ktr-system-potassium-uptake-protein-A MGKEYVVIGLGRFGGSIVRELNALDMDVMAIDHDENRVNEYSDIATHAVVADTTDEAVMKSLGIRNFDHVIVAIGENIQSSTLTTLILKELGVKKVTAKAQNDYHAKILNKIGADTVVHPERDMGRRIAHNVASASVLDYLELADEHSIVELKATEKMAGQSIIDLDIRAQYGINIIAIKRGKEFIISPNPNINLEIGDILIMIGHDNDLNRFEKNIATR |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP022717_3 | 1764157-1764239 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022717_3
|
1 spacers
spacers of CP022717_3
>3.1|1764182|33|CP022717|CRISPRCasFinder CAGAAGGTGACGTAATGTCAACTTACTATAATG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022717_3
The CRISPR arrays of CP022717_3 >merge|CP022717|3|1764157-1764239|CRISPRCasFinder TGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACACAGAAGGTGACGTAATGTCAACTTACTATAATGTGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACA >CP022717|3|3|1764157-1764239|CRISPRCasFinder TGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACA CAGAAGGTGACGTAATGTCAACTTACTATAATG TGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACA
>CP022717.1|AXJ23382.1|1762938_1763880_-|Bifunctional-oligoribonuclease-and-PAP-phosphatase-NrnA MISTLNEIMKCIEDNDTIIIHRHVRPDPDAYGSQLGLKYYIQQKFPQKQVFAVGEAESSLSFIGELDNIDDKTYQDALVIVCDTANAPRIDDERYSTGSKLIKIDHHPAVDQYGDINLVNTNASSTSEIIYDLISHFNDEAIVNKDIASVLYLGIVGDTGRFLFNNTSEHTMEIAGKLIGHDIDHNALLNKMMEKDPKMLPFQGYVLQHFELMDDGFCQVKITEDVLEQFGIQPNEASQFVNTIADIKGLKIWVFAVDEGSEIRCRLRSKGQLIINDIAQDFGGGGHPNASGVSVNSWDEFEQLATALRTKLN >CP022717.1|AXJ23381.1|1759720_1762918_-|DNA-polymerase-III-subunit-alpha MVAYLNIHTAYDLLNSSLKIEDAVRLAVSENVEALAITDTNVLYGFPKFYDACIANNIKPIFGMTIYVTNGLNTIETVVLAKDNNGLKDLYQLSSKIKMNSMENVSFELLQQFSSNLIIIFKNVADEHRDIVQVFDSHEDTYLDHQSVLVQGIKHVWIQNVCYQTRQDADTISALAAIRDNTKLDLIHDQEDFGAHFLTEKEIKQLDINQEYLTQVDVIAQKCNAELKYHQSLLPQYQTPNDESAKKYLWRVLVTQLKKLELNYDVYLERLKYEYKVITNMGFEDYFLIVSDLIHYAKTNDVMVGPGRGSSAGSLVSYLLGITTIDPIKFNLLFERFLNPERVTMPDIDIDFEDTRRERVIQYVQEKYGELHVSGIVTFGHLLARAVARDVGRIMGFDEVTLNEISSLIPHKLGITLDEAYQIDDFKKFVHRNHRHERWFSICKKLEGLPRHTSTHAAGIIINDHPLYEYAPLTKGDTGLLTQWTMTEAERIGLLKIDFLGLRNLSIIHQILTQVKKDLGINIDIEKIPFDNQKVFELLSQGDTTGIFQLESDGVRSVLKKLKPEHFEDIVAVTSLYRPGPMEEIPTYITRRHDPSKVQYLHPHLEPILKNTYGVIIYQEQIMQIASTFANFSYGEADILRRAMSKKNRAVLESERQHFIEGAKQNGYHEDISKQIFDLILKFADYGFPRAHAVSYSKIAYIMSFLKVHYPNYFYANILSNVIGSEKKTAQMIEEAKKQGITILPPNINESHWFYKPSQEGIYLSIGTIKGVGYQSVKVIVDERYQNGKFKDFFDFARRIPKRVKTRKLLEALILVGAFDAFGKTRSTLLQAIDQVLDGDLNIEQDGFLFDILTPKQMYEDKEELPDALISQYEKEYLGFYVSQHPVDKKFVAKQYLTIFKLSNAQNNKPILVQFDKVKQIRTKNGQNMAFVTLNDGIETLDGVIFPNQFKKYEELLSHNDLFIVSGKFDHRKQQRQLIINEIQTLATFEEQKLAFAKQIIIRNKSQIDMFEEMIKATKENANDVVLSFYDETIKQMTTLGYINQKDSMFNNFIQSFNPSDIRLI >CP022717.1|AXJ23380.1|1758039_1759269_-|NAD-dependent-malic-enzyme MSLRDEALEMHKRNQGKLEVKPNVKVTNKEELSLAYSPGVAEPCKDIYEDKRKVYDYTIKGNTVAVITDGTAVLGLGNIGPEASIPVMEGKAVLFKSFAGINGVPIALNTTDTEEIIKTVKLLEPNYGGINLEDISAPRCFEIEERLKKETNIPVFHDDQHGTAIVTIAGLVNALRVVNKDIAKIKVVLNGAGAAGIAIVKLLYAYGVRNMVMCDSRGAIFEGRSYGMNPTKDVVAKWTNKDKIEGSLEEVVKDADVFIGVSVANALSQDMVKSMADNPIIFAMANPNPEIIPDDAKAAGARVVGTGRSDYPNQINNVLAFPGIFRGALEVEATHINEEMKKAAVEAIADLIDSSELNEDYCIPGPFDKRVAPSVARNVAKAAMESGVARIEVDPQDVYDKTMKLTDLQ >CP022717.1|AXJ23379.1|1756987_1757845_-|Acetyl-coenzyme-A-carboxylase-carboxyl-transferase-subunit-beta MFKDFFNRTKKKKYLTVQDSKNNDVPAGIMTKCPKCKKIMYTKELAENLNVCFNCDHHIALTAYKRIEAISDEGSFTEFDKGMTSANPLDFPSYLEKIEKDQQKTGLKEAVVTGTAQLDGMKFGVAVMDSRFRMGSMGSVIGEKICRIIDYCTENRLPFILFSASGGARMQEGIISLMQMGKTSVSLKRHSDAGLLYISYLTHPTTGGVSASFASVGDINLSEPKALIGFAGRRVIEQTINEKLPDDFQTAEFLLEHGQLDKVVHRNDMRQTLSEILKIHQEVTK >CP022717.1|AXJ23378.1|1756043_1756988_-|Acetyl-coenzyme-A-carboxylase-carboxyl-transferase-subunit-alpha MLDFEKPLFEIRNKIESLKESQDKNDVDLQEEIDMLEASLERETKKIYTNLKPWDRVQIARLQERPTTLDYIPYIFDSFMELHGDRNFRDDPAMIGGIGFLNGRAVTVIGQQRGKDTKDNIYRNFGMAHPEGYRKALRLMKQAEKFNRPIFTFIDTKGAYPGKAAEERGQSESIATNLIEMASLKVPVIAIVIGEGGSGGALGIGIANKVLMLENSTYSVISPEGAAALLWKDSNLAKIAAETMKITAHDIKQLGIIDDVISEPLGGAHKDIEQQALAIKSAFVEQLDSLESLSRDEIANDRFEKFRNIGSYIE >CP022717.1|AXJ23377.1|1754806_1755775_-|6-phosphofructokinase MKKIAVLTSGGDSPGMNAAVRAVVRTAIYNEIEVYGVYHGYQGLLNDDIHKLELGSVGDTIQRGGTFLYSARCPEFKEQEVRKVAIENLRKRGIEGLVVIGGDGSYRGAQRISEECKEIQTIGIPGTIDNDINGTDFTIGFDTALNTIIGLVDKIRDTASSHARTFIIEAMGRDCGDLALWAGLSVGAETIVVPEVKTDIKEIADKIEQGIKRGKKHSIVLVAEGCMTVQDCQKELSQYINVDNRVSVLGHVQRGGSPTGADRVLASRLGGYAVDLLMQGETAKGVGIKNNKIVATSFDEIFDGKDHKFDYSLYELANKLSI >CP022717.1|AXJ23376.1|1753027_1754785_-|Pyruvate-kinase MRKTKIVCTIGPASESEEMIEKLINAGMNVARLNFSHGSHEEHKGRIDTIRKVAKRLDKIVAILLDTKGPEIRTHNMKDGIIELERGNEVIVSMNEVEGTPEKFSVTYENLINDVQVGSYILLDDGLIELQVKDIDHAKKEVKCDILNSGELKNKKGVNLPGVRVSLPGITEKDAEDIRFGIKENVDFIAASFVRRPSDVLEIREILEEQKANISVFPKIENQEGIDNIAEILEVSDGLMVARGDMGVEIPPEKVPMVQKDLIRQCNKLGKPVITATQMLDSMQRNPRATRAEASDVANAIYDGTDAVMLSGETAAGLYPEEAVKTMRNIAVSAEAAQDYKKLLSDRTKLVETSLVNAIGISVAHTALNLNVKAIVAATESGSTARTISKYRPHSDIIAVTPSEETARQCSIVWGVQPVVKKGRKSTDALLNNAVATAVETGRVTNGDLIIITAGVPTGETGTTNMMKIHLVGDEIANGQGIGRGSVVGTTLVAETVKDLEGKDLSDKVIVTNSIDETFVPYVEKALGLITEENGITSPSAIVGLEKGIPTVVGVEKAVKNISNNMLVTIDAAQGKIFEGYANVL >CP022717.1|AXJ23375.1|1751316_1752678_+|D-serine/D-alanine/glycine-transporter MAEKLQRELSNRHIQLIAIGGAIGTGLFLGAGQTIALTGPSILLTYIIIGFMLFMFMRGLGEIIIQNTEFKSFADVTNTYIGPFAGFVTGWTYWFCWIITGMAEVTAVAKYVSFWFPEIPNWISALFCVLLLMSFNLLSARLFGELEFWFSIIKIATIIGLIVVGFVMILFAFKTQFGHASFTNLYEHGIFAKGASGFFMSFQMALFSFVGIEMIGVTAGETKDPVKTIPKAINSVPIRILIFYVGALAVIMSIIPWQQVDPDNSPFVKLFALIGIPFAAGLINFVVLTAAASSCNSGIFSNSRMLFGLSSQQQAPPNFSKTNKYGVPHVAIFASSALLLVAALLNYIFPDATKVFTYVTTISTVLFLVVWGLIIIAYINYSRKNPDLHKNATYKLLGGKYMGYLIFVFFIFVFGLLFINVDTRRAIYFIPIWFILLAFMYLRYKRIAAKSNK >CP022717.1|AXJ23374.1|1749847_1750969_-|Citrate-synthase-2 MAELQRGLEGVIAAETKISSIIESQLTYAGYDIDDLAENAQFEEVIFLLWNYRLPNEEELAHLKGKLNQYMTLNPRVYTHFEEYVTDHVHPMTALRTSLSYIAHFDPDAENESDENRYERAMRIQAKVASLVTAFARVRQDKEPLKPNPDLSYAANFLYMLRGELPTDIEVEAFNKALILHADHELNASAFTARCAVSSLSDMYSGIVAAVGSLKGPLHGGANEQVMTMLSEIGSIENVDAYLDEKFANKDKVMGFGHRVYKDGDPRAKYLREMSRQITKDAGREELFEMSVKMEKRMAEEKGLIPNVDFYSASVYHCMEIPHDLFTPIFAVSRSAGWIAHILEQYKDNRIMRPRAKYIGETNRKYIPLEERK >CP022717.1|AXJ23373.1|1748530_1749799_-|Isocitrate-dehydrogenase-[NADP] MTAEKITQGTEGLNVPNEPIIPFIIGDGIGPDIWKAASRVIDAAVEKAYNGEKRIEWKEVLAGQKAFDTTGEWLPQETLDTIKEYLIAVKGPLTTPIGGGIRSLNVALRQELDLFTCLRPVRWFKGVPSPVKRPQDVDMVIFRENTEDIYAGIEFKEGTTEVKKVIDFLQNEMGATNIRFPETSGIGIKPVSKEGTERLVRAAIQYAIDNNRKSVTLVHKGNIMKFTEGSFKQWGYDLALTEFGDQVFTWQQYDEIVENEGRDAANAAQEKAEKEGKIIIKDSIADIFLQQILTRPAEHDVVATMNLNGDYISDALAAQVGGIGIAPGANINYETGHAIFEATHGTAPKYAGLNKVNPSSVILSSVLMLEHLGWQEAADKITDSIEDTIASKVVTYDFARLMDGAEEVSTSAFADELIKNLK >CP022717.1|AXJ23383.1|1764282_1765581_-|Cobalt-dependent-inorganic-pyrophosphatase MTKHEQILDYIESLSIGSKISVRKIAKFLNVSEGTAYRAIKDADKMGMVATIDRVGTVRIEKRNRNEIEHLTFNEIVNIIDGQVLGGNKGITKMVSKFAIGAMELKDILKYIGPKTLLIVGNREDVQIEALKRGTAILITGGFKPSNKVINFANEHDLPVLSSSYDTFLVANIINKALFNQKIRKDILIVQDIMTPLDDLSVLFDTMKIADYKRMANRTGHTRFPVVNESYKLVGIVTSREMINTKDDDEIDKVMTRNPIYVNAMSTVASCAHMMIWEGIELIPVVSSNKKTVGVINRQDVLKSMQLLGRQPQMGETINDQIAKYITMNQDGITVEVSPLLINHYGTVSKAAFVSIIEETIQYEMRKFKKGNVMIENLNIVYIKTVPIESHITVRFGILDVGRNFAKIEVNMHSQNDKVASALVICQMFDEV >CP022717.1|AXJ23384.1|1765785_1766199_+|Stress-response-protein-NhaX MYKNILLGVDTQLKNEKALKEVSKLAGEGTVVTVLNAISEQDAQASIKAGVHLNKLTEERSKRLEKTRKALEDYGIDYDQIIVRGNAKEELLKHANSGKYEIVVLSNRKAEDKKKFVLGSVSHKVAKRATIPVLIVK >CP022717.1|AXJ23385.1|1766586_1767276_-|metal-dependent-hydrolase MKLSFHGQSTIYLEGNNKKVIVDPFISNNPKCDLNIETVQVDYIVLTHGHFDHFGDVVELAKNTGATVIGSAEMADYLSSYHGVENVHGMNIGGKANFDFGSVKFVQAFHSSSFTHENGIPVYLGMPMGIVFEVEGKTIYHTGDTGLFSDMSLIAKRHPVDVCFVPIGDNFTMGIDDASYAINEFIKPKISVPIHYDTFPLIEQDPQQFKDAVNVGDVQILKPGESVQF >CP022717.1|AXJ23386.1|1767450_1768506_+|putative-peptidase MTKISKIIDELNNQQADAAWITTPLNVYYFTGYRSEPHERLFALLIKKDGKQVLFCPKMEVEEVKASPFTGEIVGYLDTENPFSLYPQTINKLLIESEHLTVARQKQLISGFNVNSFGDIDLTIKQLRNIKSEDEISKIRKAAELADKCIEIGVSYLKEGVTEREVVNHIEQTIKQYGVNEMSFDTMVLFGDHAASPHGTPGDRRLKSNEYVLFDLGVIYEHYCSDMTRTIKFGEPNKEAQEIYNIVLEAETSAIQAIKPGIPLKDIDHIARNIISEKGYGEYFPHRLGHGLGLQEHEYQDVSSTNSNLLEAGMVITIEPGIYVPGVAGVRIEDDILVTNEGFEVLTHYEK >CP022717.1|AXJ23387.1|1768820_1769939_-|Alanine-dehydrogenase-2 MKIGIPREIKNNENRVGLSPSGVHALVESGHTVLVETNAGSGSFFEDVDYKEAGAEIVAEQAKVWDVDMVIKVKEPLESEYPYFKEGLVLFTYLHLANEDKLTQALIDRKVISIAYETVQLPDRSLPLLSPMSEVAGRMSAQVGAEFLQKLNGGMGILLGGVPGVPKGKVTIIGGGQAGTNAAKIALGLGADVTILDVNPKRLQQLDDLFGGRVHTIMSNPLNIELYVKQSDLVIGAVLIPGAKAPRLVTEDMIKQMKNGSVIIDIAIDQGGIFETTDKITTHDDPTYIKHGVVHYAVANMPGAVPRTSTLALNNATLPYALMLANKGYREAFKSNQPLSLGLNTYKGHVTNKGVAEAFEMEYKSVEEALQL >CP022717.1|AXJ23388.1|1770079_1770580_+|Putative-universal-stress-protein MITYKNILIAVDGSHEAEWAFNRAVGVAKRNDAKLTIVNVIDSRTYSSYEVYDAQFTEKSKHFAEELLNGYKEVATNAGVKDVETRLEFGSPKSIIPKKLAHEINADLIMSGTSGLNAVERFIVGSVSESIVRHAPCDVLVVRTEELPADFQPQVATTQLREKYQN >CP022717.1|AXJ23389.1|1770825_1772028_-|Acetate-kinase MSKLILAINAGSSSLKFQLIRMPEEELVTKGLVERIGLKDSIFTIEVNGEKVKTVQDIKDHVEAVDIMLDAFKAHNIINDINDIDGTGHRVVHGGEKFPESVAITDEVEKEIEELSELAPLHNPANLMGIRAFRKLLPNIPHVAIFDTAFHQTMPEKAYLYSLPYHYYKDYGIRKYGFHGTSHKFVSQRAAEMLDKPIEDLRIISCHIGNGASIAAIDGGKSIDTSMGFTPLAGVTMGTRSGNIDPALIPFIMEKTGKTAEQVLEILNKESGLLGLSGTSSDLRDLSEEAESGKARSQMALDVFASKIHKYIGSYAARMHGVDVIVFTAGIGENSVEIRAKVLEGLEFMGVYWDPKKNENLLRGKEGFINYPHSPVKVVVIPTDEESMIARDVMTFGGLK >CP022717.1|AXJ23390.1|1772115_1773063_-|N-6-DNA-Methylase MAEQQTIMERLFHTLDEKAKTLNNENGQSFIENLGLAMEQVYTNERGLLEQSTLQDRRKAFQFAYLSLMQEEKIQANHQITPDSIGLILGFLVERFMNNQEELHIVDIASGAGHLSATVKEVLPEIAVMHHLIEVDPVLSRVSVHLANFLEIPFDVYPQDAIMPLPLEEADIVIGDFPVGYYPIDERSKEFKLGFEEGHSYSHYLLIEQAINALKDAGYAFLVVPSNIFTGEHVKQLEKYIATETEMQAFLNLPPTLFKNEKARKSILILQKKKSGETKPVEVLLANIPDFKNPSQFQGFMTELNQWMDTNRPKK >CP022717.1|AXJ23391.1|1773185_1773680_-|putative-thiol-peroxidase MTEITFKGGPIHLKGQQINEGDFAPDFTVLDNDLNQVTLADYAGKKKLISVVPSIDTGVCDQQTRKFNSEASKEEGIVLTISADLPFAQKRWCASAGLDNVITLSDHRDLSFGENYGVVMEELRLLARAVFVLDADNKVVYKEIVSEGTDFPDFDAALAAYKNI >CP022717.1|AXJ23392.1|1773777_1774548_-|hypothetical-protein MDLNLTMIIIIILFGFIAAFIDSVVGGGGLISTPALLAIGLPPSVALGTNKLASSFGSLTSTIKFIRSGKVDLYVVAKLFGFVFLASACGAYIATMVPSQILKPLIIIALSSVFIFTLLKKDWGNTRTFTQFTFKKAILFAALFILIGFYDGFVGGGTGSFMLFVLLVFGFDFLSAAGNAKVLNFASNIGALVLFMVLGQVDYVIGLIMASSMIAGSYTGAHFAIKQGVGYVKVLFIIITAILILKNAFDYIQQFL |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| CP022717_4 | 2090129-2090208 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022717_4
|
1 spacers
spacers of CP022717_4
>4.1|2090152|34|CP022717|CRISPRCasFinder TTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022717_4
The CRISPR arrays of CP022717_4 >merge|CP022717|4|2090129-2090208|CRISPRCasFinder GGCCCCACCCCAACTTACATTGTTTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCCACCCCAACTTGCATTGT >CP022717|4|4|2090129-2090208|CRISPRCasFinder GGCCCCACCCCAACTTACATTGT TTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGG GGCCCCACCCCAACTTGCATTGT
>CP022717.1|AXJ23696.1|2088514_2089717_-|5-aminolevulinate-synthase MYKTLFFDKIAELKEKGSYRIFTEINRIANKYPLAKGEDGKEVVVFCSNDYLGMSQNQEVINVMSDALKEYGAGAGGSRNIGGSHKYFKLLENEIAKWHKKDSALVFPTGYSSNDAALQGLLRIFPEMIVFSDSKNHASIINALRSVKNKIEIFEHNNVKHLNELLNQYDINIPKLIVFESVYSMDGDIAPIVEIVELAKEYNSLTFLDEVHAIGMYGEEGRGYSDVVGVQEDIDIIQSTMAKGIGIIGGYITGDQLLIDVIRSYSSGFIFTTALPPVIAAGCLTSIKIVRSNDKLREELQDKTKYLKEKFKENGIEVLKQSKTHILPVIIGDSKKCEEAAKLLLDKFNIYVQAINSPTVEIGTERFRINVTPNHTKEQMDLLVSSIVYVFDFLNIRRSV >CP022717.1|AXJ23695.1|2087642_2088512_-|EamA-like-transporter-family-protein MNYLMYLFCMFIWGLNFIAVKIQGDSLPLEVALLYRSLIAFSLFGVMFIFIFKKLKLNNTNWFTIIGFGLCNFTISYLLLYYGTFYSSAAIVTLIFSMKAILTPIFISMVFKRKISNRIYIGGGLGVVSVVVILYPDLNSLTNEFIIGVAFALLGTIITSIGDVLSLYNSESKVHPVLSNTIGMLSAVIFLLIYTSFKGYRYSFPLELNFWFGLLYLSILASFLAWFFYLKLINNIGAAESGYMVAMFPAIGGIASVIMGETHLSINLVVGIILACMGAYLALYKPKPS >CP022717.1|AXJ23694.1|2085921_2087145_+|putative-succinyl-diaminopimelate-desuccinylase MTTFSEKEKIQLLADIVELQTENNNEIDVCNYLKDLFDKYDIKSEILKVNEHRANIVAEIGNGSPILALSGHMDVVDAGNQDNWTYPPFQLTEKDGKLYGRGTTDMKGGLMALVITLIELKEQNQLPQGTIRLLATAGEEKEQEGAKLLADKGYLDDVDGLIIAEPTGSGIYYAHKGSMSCKVTATGKAVHSSVPFIGDNAIDTLLEFYNQFKEKYSELKKHDTKHELDVAPMFKSLIGKEISEEDANYASGLTAVCSIINGGKQFNSVPDEASLEFNVRPVPEYDNDFIESFFQNIINNVNSNKLSLDIPSNHRPVTSDKNSKLITTIKDVASSYVNKDDIFVSALVGATDASSFLGDNKDNVDLAIFGPGNPLMAHQIDEYIEKDMYLKYIDIFKEASIQYLKEK >CP022717.1|AXJ23693.1|2084430_2085486_-|putative-leukocidin-like-protein-2-precursor MKNKKRVLIASSLSCAILLLSAATTQANSAHKDSQDQNKKEHVDKSQQKDKRNVTNKDKNSTVPDDIGKNGKITKRTETVYDEKTNILQNLQFDFIDDPTYDKNVLLVKKQGSIHSNLKFESHKEEKNSNWLKYPSEYHVDFQVKRNPKTEILDQLPKNKISTAKVDSTFSYSSGGKFDSTKGIGRTSSNSYSKTISYNQQNYDTIASGKNNNWHVHWSVIANDLKYGGEVKNRNDELLFYRNTRIATVENPELSFASKYRYPALVRSGFNPEFLTYLSNEKSNEKTQFEVTYTRNQDILKNRPGIHYAPPILEKNKDGQRLIVTYEVDWKNKTVKVVDKYSDDNKPYKEG >CP022717.1|AXJ23692.1|2083392_2084409_-|putative-leukocidin-like-protein-1-precursor MIKQLYKNITICSLAISTALTVFPATSYAKINSEIKAVSEKNLDGDTKMYTRTATTSDSQKNITQSLQFNFLTESNYDKETVFIKAKGTIGSGLRILEPNGYWNSTLRWPGSYSVSIQNVDDNNNTNVTDFAPKNQDESREVKYTYGYKTGGDFSINRGGLTGNITKESNYSETISYQQPSYRTLLDQSTSHKGVGWKVEAHLINNMGHDHTRQLTNDSDNRTKSEIFSLTRNGNLWAKDNFTPKDKMPVTVSEGFNPEFLAVMSHDKKDKGKSQFVVHYKRSMDEFKIDWNRHGFWGYWSGENHVDKKEEKLSALYEVDWKTHDVKFVKVLNDNEKK >CP022717.1|AXJ23691.1|2082055_2082880_+|Phospholipase-C-precursor MYPNWGQYKRADLIGQSSYIKNNDVVIFNEAFDNGASDKLLSNVKKEYPYQTPVLGRSQSGWDKTEGSYSSTVAEDGGVAIVSKYPIKEKIQHVFKSGCGFDNDSNKGFVYTKIEKNGKNVHVIGTHTQSEDSRCGAGHDRKIRAEQMKEISDFVKKKNIPKNETVYIGGDLNVNKGTPEFKDMLKNLNVNDVLYAGHNSTWDPQSNSIAKYNYPNGKPEHLDYIFTDKDHKQPKQLVNEVVTEKPKPWDVYAFPYYYVYNDFSDHYPIKAYSK >CP022717.1|AXJ23690.1|2080961_2081999_+|Tyrosine-recombinase-XerC MKTRCYDGKKWQYEFKHEGKRYRKKGFRTKREANSAGLDKLNELRSGFNIDNYITLAEYFENWIKTYKQPVVKENTYRHYRNALQHIQKHKIGKMELSKINRQVYQKFINDYSKEHAKETIRKTNGAIRSALDDALYDGLIFKNPAYKVNYKAGKPTKSEQEKFISVTEYEILKDHVRKKRTRSSLALFIMICTGCRVSGARNIKIEHINQVKNTIFIDERKTDTSPRYISIAKSDMKHIMDVISTFAISYDGYIFKEAGFIINLQAINNALKSACRVNNIPIITSHALRHTHCSYLLAKGVSIHYISKRLGHKNIAITTSVYSHLLEEKFNEEDKKTTKILESM >CP022717.1|AXJ23689.1|2080239_2080854_-|hypothetical-protein MTQFLGALLLTGVLGYIPYKYLTMIGLVSEKNKIINTPVLLIFSIETCLIWFYTFIIFNNVDLKNLSLLQLLTGLKANIWFLIIFVLTVLVFNPLIVKFIIWLINETRKFMNLDCISLLDKRDKLFNNNGKPVFIVIKDFENRIIEEGELKTYNSAGSDFDLLEVERQDFKVSDLPSNDELYIKHTLVDLKQQIKLDLYLMNEY >CP022717.1|AXJ23688.1|2080117_2080243_+|hypothetical-protein MADKNKKQEATRSNPINKSFEKPGASENLKSTLSEKAKKKD >CP022717.1|AXJ23687.1|2079878_2080061_+|hypothetical-protein MKIKNCKIKKETIVYEVLTSGNQPFTYELPKDLSSHNARKYLEFISQKIDGDKLTKEDSL >CP022717.1|AXJ23697.1|2090348_2091656_+|Ktr-system-potassium-uptake-protein-B MNKVHKPLYFYLMLFFSTTIIGALLLYLPFTGKKPISFLDALFIASSAFTVTGLSPVDIGSQFNILGEIVILLLIQIGGLGIVTVTLLTLVFLNRKISMKNRFLIMVTWNIDEPGGVIKLIKHLAIYSLVTELIGMICLCLSFIPKFGIGKGLFLSLFTSVSAFNNAGFALFKNNLIDYSSDPIVIITISILIIFGGIGHFVVIDFINCKKLSKLSLHSKLVLTTTSILIIIGAITFFLLEQFNTMQNMGLVEKIGNSFFQSVTTRTAGFNSIDIASINKSTALMLMLLMFIGGAPLSASGGIKITTFAVAFIFVLNYIRKENNVSVFNKEISDKHIKLSIVTINISFLFISIITFILSIINPNISLIKLLFEVVSAFGTVGLSMNLTTEYHGITKIIIIFVMLCGKVGLLTLLRTFIPPKSPKNYRYTKGQIYL >CP022717.1|AXJ23698.1|2092227_2092854_-|hypothetical-protein MTVKVISLSELLTGDKQEVKRKIPSVLNILNSFETISISGSESAHDVDLFLKNKSIAFDRQNLSRTHLVFSQFKSKQILVGYFTISNKPLVFTKRMLDKISNTLKKKLYQKGKTHSGNDNLIIQGYLIAQIGKNYSEEALATKSINGNDLLTLAYEKVLEGANIFGGSYIWIDYEDVDRLREFYRKFGFTEIKDHTSENNLKMAILKI >CP022717.1|AXJ23699.1|2092850_2093030_-|hypothetical-protein MATISITTDYKFTKKSAQKLIDAMEINENKSNVNKTNIKATKIKSTCEIENLLKDYRSN >CP022717.1|AXJ23700.1|2093573_2095190_-|60-kDa-chaperonin MVKQLKFSEDARQAMLRGVDQLANAVKVTIGPKGRNVVLDKEFTAPLITNDGVTIAKEIELEDPYENMGAKLVQEVANKTNEIAGDGTTTATVLAQAMIQEGLKNVTSGANPVGLRQGIDKAVKVAVEALHENSQKVENKNEIAQVGAISAADEEIGRYISEAMEKVGNDGVITIEESNGLNTELEVVEGMQFDRGYQSPYMVTDSDKMVAELERPYILVTDKKISSFQDILPLLEQVVQSNRPILIVADEVEGDALTNIVLNRMRGTFTAVAVKAPGFGDRRKAMLEDLAILTGAQVITDDLGLDLKDASIDMLGTASKVEVTKDNTTVVDGDGDENSIDARVSQLKSQIEETESDFDREKLQERLAKLAGGVAVIKVGAASETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTALVNVYQKVSEIKAEGDIETGVNIVLKALTAPVRQIAENAGLEGSVIVERLKNAEPGVGFNAATNEWVNMLEAGIVDPTKVTRSALQHAASVAAMFLTTEAVVASIPEKNNDQPNMGGMPGMM >CP022717.1|AXJ23701.1|2095265_2095550_-|10-kDa-chaperonin MLKPIGNRVIIEKKEQEQTTKSGIVLTDSAKEKSNEGVIVAVGTGRLLNDGTRVTPEVKKGDRVVFQQYAGTEVKRDNETYLVLNEEDILAVIE >CP022717.1|AXJ23702.1|2095724_2096468_+|CAAX-amino-terminal-protease-self--immunity MTRLWASLLTVIIYILSQFLPLLIVTKLPFVQYSGIELTKAVIYIQLVLFLIAATTIILINLKIKNPTKLELEVKEPKKYIIPWALLGFALVMIYQMVVSIVYTQIFGTQQTSPNTERLIVIARKIPLFIFFVSIVGPLLEEYVFRKVIFGELFNAIKGNRIVAFAIATTVSSLIFALAHNDYKFIPIYFGMGVIFSLAYVWTKRLAVPIIIHMLQNGFVVIFQLLNPEALKKATEQANFIYHIFIP >CP022717.1|AXJ23703.1|2096492_2097641_-|hypothetical-protein MSYHWFKKMLLSTSILILSSSSLGLATHTVEAKDNLNGEKPTTNLNHNVTSPSVNSEINNNETGTPHESNQTGNEGTNSNSRDANPDSNNVKPDSNNQNPSSDSKPDPNNPNPGPNPKPDPDKPKPNPDPDPKPDPDKPKPNPNPKPDPNKPNPNPSPDPNQPGDSNHSGGSKNGGTWNPNASDGSNQGQWQPNGNQGNSQNPTGNDFVSQRFLALANGAYKYNPYILNQINQLGKEFGEVTDEDIYNIIRKQNFSGNAYLNGLQQQSNYFRFQYFNPLKSERYYRNLDEQVLALITGEIGSMPDLKKPEDKPDSKQRSFEPHEKDDFTVVKKQEDNKKSASTAYSKSWLAIVCSMMVVFSIMLFLFVKRNKKKNKNESQRR >CP022717.1|AXJ23704.1|2097837_2098464_+|Nitroreductase-family-protein MGLFKKDKKAMTFDNAMEERRSIYNLKDSISISDDELESMIAHAVKHVPSSFNSQSTRIVLLLNDNNNKFWDNTKAILKEVMGENRDFEPTEQKIDNFKHSYGTILFYEDQDVVSGLQEQMPNYYDNFAIWSTQTNAMHQFAIWTALATKGIGASLQHYNPLVDEITSNEFNIPKSWKLIAQMPFGDIREAAGEKTFNPVEDRFVIKK >CP022717.1|AXJ23705.1|2098697_2099483_+|2-oxoglutaramate-amidase MKVQIYQLPIIFGDSSKNETQITQWFEKNMNDEVDVVVLPEMWNNGYDLEHLNEKADNNLGQSFSFIKHLAEKYKVDIVAGSVSNIRNNQIFNTAFSVNKSGQLINEYDKVHLVPMLREHEFLTAGENVAEPFQLSDGTYVTQLICYDLRFPELLRYPARSGAKIAFYVAQWPMSRLQHWHSLLKARAIENNMFVIGTNSTGFDGNTEYAGHSIVINPNGDLVGELNESADILTVDLNLNEVEQQRENIPVFKSIKLDLYK >CP022717.1|AXJ23706.1|2100397_2101015_+|Accessory-gene-regulator-protein-B MIKDCTKSYNDSEESGVKLNYFDNKIDQFATYLQKRNNLDHIQFLQVRLGMQVLAVNIGKLIVMYTIAYILNIFLFTLITNLTFYLIRRHAHGAHAPSSFWCYVESIFLFTLLPLILVNYHINFLIMTIMTVIAIGMIIRYAPAATKKKPIPVRLIKRKRNYAIIVSLIFFIITLIIKEPFAQFMQLGIIIEAITLLPIFFVRRT |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| CP022717_5 | 2218633-2218718 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022717_5
|
1 spacers
spacers of CP022717_5
>5.1|2218662|28|CP022717|CRISPRCasFinder TGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTATTTTT |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022717_5
The CRISPR arrays of CP022717_5 >merge|CP022717|5|2218633-2218718|CRISPRCasFinder CAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTATTTTTCAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCA >CP022717|5|5|2218633-2218718|CRISPRCasFinder CAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCA TGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTATTTTT CAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCA
>CP022717.1|AXJ23815.1|2217524_2218616_+|hypothetical-protein MFTYFKSALKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYVQNIVIYSQFGQKPPGDVYLKVIAVLLIAAIVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGIYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKDNKVVTEPKNTKVETDKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >CP022717.1|AXJ23814.1|2216281_2217259_+|Cadmium,-cobalt-and-zinc/H(+)-K(+)-antiporter MSHSHHHDHMHSHVTTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALIAFIYAEKNATATKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH >CP022717.1|AXJ23813.1|2215959_2216280_+|HTH-type-transcriptional-repressor-CzrA MSEQYSEINTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIYHANHPKESGL >CP022717.1|AXJ23812.1|2215142_2215808_-|putative-sugar-epimerase-YhfK MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSIIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFEGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNHQEFQVISGEQDIKDALTQFENETD >CP022717.1|AXJ23811.1|2213769_2214708_-|putative-mannose-6-phosphate-isomerase-GmuF MPLFLQPILKTKLWGGQRLSEFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGKSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIVIGTLAESREEVANHVQRGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDITYRLYDFNRQDNQYNDRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYA >CP022717.1|AXJ23810.1|2213508_2213739_-|hypothetical-protein MKQFLYIALVCSVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQISASLKFSALLINVLPLCGTFVASN >CP022717.1|AXJ23809.1|2211461_2212835_-|EVE-domain-protein MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRMSNMKETLFNQINAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVQKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD >CP022717.1|AXJ23808.1|2210590_2211004_-|hypothetical-protein MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYQFATLKGEVGQQFFKQHPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIQLITSLPNRTKLLGIGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD >CP022717.1|AXJ23807.1|2209947_2210391_-|General-stress-protein-20U MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLEKAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS >CP022717.1|AXJ23806.1|2209116_2209827_+|Purine-nucleoside-phosphorylase-DeoD-type-1 MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGTYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKAKNVADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNDAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE >CP022717.1|AXJ23816.1|2219933_2221061_-|SAP-domain-protein MSVNARDLLVLHNNVNRLVGEEIFANKCLANNDVQIMNSIKKLIEAELLTTTNDFEVSIYKKTRPELQSILKSFGIKTTGNKPDLIKRIDDNFHIINNLDLPYVYIPTKKGEEILKKTEYLTSFIYSYKISLERAYYMVENYIDENCDDKVAEIYKFEFQRKYDNGEFDFNHGYNFELNMLIDHYKRDVKDYDNARKYSNFYLYFGLRDFLKKLMSNYSYYDSKGNIDLNEIQNDLNRFINSSASGMYERLIYNENLSNNIMFELFKKDTQDYSDLEEQLIEKFINYVVSYVKKESRSNTLIELSKMLEKGYTIDKEKFKKEDEYLSRYIITDINYLKNLESKIGVAIDSRNGEIHLVLDDDSLDKLIKNQKNRQ >CP022717.1|AXJ23817.1|2222109_2222967_-|Putative-phosphatase-YwpJ MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINRLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPEDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQIINLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAKHFLAD >CP022717.1|AXJ23818.1|2223034_2223817_-|putative-ABC-transporter-ATP-binding-protein-YlmA MLIQLDQVGRMKQGKTILKNISWQINGGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNVYEPPTTGDVNLFGKMPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEIRNEAHQLLKLVGMSAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLSILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITGNFTKILLLKDGESVQQGLIDDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE >CP022717.1|AXJ23819.1|2224048_2225854_-|Glutamine--fructose-6-phosphate-aminotransferase-[isomerizing] MCGIVGYIGYDNAKELLLKGLEKLEYRGYDSAGIAVVNDDNTTVFKEKGRIAELRKVADSSDFDGPVGIGHTRWATHGVPNHENSHPHQSSNGRFTLVHNGVIENYEELKSEYLQGVSFISETDTEVIVQLVEYFSNQGLSTEEAFTKVVSLLHGSYALGLLDAEDKDTIYVAKNKSPLLLGVGEGFNVIASDALAMLQVTSEYKEIHDHEIVIVKKDEVIIKDADGNVVERDSYIAEIDASDAEKGVYAHYMLKEIHEQPAVMRRIIQEYQDAEGNLKIDQDIINDVKEADRIYVIAAGTSYHAGLVGKEFLEKWAGVPTEVHVASEFVYNMPLLSEKPLFVYISQSGETADSRAVLVETNKLGHKSLTITNVAGSTLSREADHTLLLHAGPEIAVASTKAYTAQIAVLSILSQIVAKEHGREADIDLLRELAKVTTAIEAIVDDAPIMEQIATDFLETTRNAFFIGRTIDYNVSLEGALKLKEISYIQAEGFAGGELKHGTIALIEEGTPVVGLATQEKVNLSIRGNVKEVVARGAHPCIISMEGLEKEGDTYVIPHVHELLTPLVSVVALQLISYYAALHRDLDVDKPRNLAKSVTVE >CP022717.1|AXJ23820.1|2226534_2228073_+|PTS-system-mannitol-specific-EIICB-component MSQTEEKKGIGRRVQAFGSFLSSMIMPNIGAFIAWGFIAAIFIDNGWLPNKDLATLAGPMITYLIPLLIAFSGGRLIYDLRGGIIAATATMGVIVALPDTPMLLGAMIMGPLVGWLMKKTDQLIQPRTPQGFEMLFNNFSAGILGFIMTIVGFKVLAPIMKFIMYILSVAVESLVHAHLLPVVSILVEPAKILFLNNAINHGVFTPLGTDQAAKVGQSILYTIESNPGPGLGILLAYMIFGKGTAKATSYGAGIIHFLGGIHEIYFPYVLMRPLLFIAVILGGMTGVATYQATGFGFKTPASPGSFIVYCLNAPRGEFLHMLLGVFLAALVSFVVAALIMKFTREPKQDLEAATAQMENTKGKKSSVASKLVSSDKNVNTEENASGNVSETSSSDDDPEALLDNYNTEDVDAHNYNNINHVIFACDAGMGSSAMGASMLRNKFKKAGINDITVTNTAINQLPKDAQLVITQKKLTDRAIKQTPNAIHISVDNFLNSPRYEELLNNLKKDDQA >CP022717.1|AXJ23821.1|2228107_2230240_+|Transcriptional-regulator-MtlR MLLSTREKEMIALLIKYHGQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVEAYLTSFSLTLERANKKGLRIAGEDSDLNDLKQSIAQHQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELDLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLGQIYDVTFNQAEIAFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVKKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFIVLHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLEQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIDSPYLTVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFQETHDKSSNMIDKDDVHIETKDIDGNTSFENEQTSNLTSVFEKHLSDEKSEQLMHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDVINDPTSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMILITVLEEPLALPSIQNDNQTIKYMISMFIPDNDFMASLVSDLSEFLSLKLESIDTFMENPQELETLLRNKFLERIKKQFI >CP022717.1|AXJ23822.1|2230251_2230686_+|Mannitol-specific-phosphotransferase-enzyme-IIA-component MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA >CP022717.1|AXJ23823.1|2230685_2231792_+|Mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKAVHFGAGNIGRGFIGYILADNNVKVTFADVNEEIINALAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFAPFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVLDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFADKATVLDAVKDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAGYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTADQETVEKNNYIKEHGLKVFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS >CP022717.1|AXJ23824.1|2232110_2239544_-|Extracellular-matrix-binding-protein-ebh-precursor MNLFRQQKFSIRKFNVGIFSALIATVTFISTNPTTASAAEQNQPAQNQPAQPADANTQPNANAGAQANPTAQPAAPANQGQPAAQPANQGGQANPAGGAAQPNTQPAGQGNQADPNNAAQAQPGNQAAPANQAGQGNNQATPNNNATPANQTQPANAPAAAQPAANAQTQDPNASNTGEGSINTTLTFDDPAISTDENRQDPTVTVTDKVNGYSLINNGKIGFVNSELRRSDMFDKNNPQNYQARGNVAALGRVNANDSTDHGNFNGISKTVNVKPDSELIINFTTMQTNSKQGATNLVIKDAKKNTELATVNVAKTGTAHLFKVPTDADRLDLQFIPDNTAVADASRITTNKDGYKYYSFIDNVGLFSGSHLYVKNRDLAPKATNNKEFTINTEIGNNGNFGASLKADQFKYEVTLPQGVTYVNDSLTTTFPNGNEDSTVLKNMTVNYDQNANKVTFTSQGVTTARGTHTKEVLFPDKSLKLSYKVNVANIDTPKNIDFNEKLTYRTASDVVINNAQPEVTLTADPFSVAVEMNKDALQQQVNSQVDNSHYTTASIAEYNKLKQQADNILNEDANHVETANRASQAAIDGLVTKLQAALIDNQAAIAELDAKAQEKVTAAQQSKKVTQDEVAALVTKINNDKNNAIAEINKQTTSQGVTTEKDNGIAVLEQDVITPTVKPQAKQDIIQAVTTRKQQIKKSNASLQDEKDVANDKIGKIETKAIKDIDAATTNAQVEAIKTKAINDINQTALATTAKAAALEEFDEVVQAQIDQAPLNPDTTNEEVAEAIERINAAKVSDVKAIEATTTAQDLERVKNEEISKIENITDSTQTKMDAYNDVKQAATARKAQNATVSNATNEEVAEADAAVEAAQKQGLHDIQVVKSKQEVADTKSKVLDKINAIQTQAKVKPAADTEVENAYNTRKQEIQNSNASTTEEKQAAYTELDTKKQEARTNLDAANTNSDVTTAKDNSIAAINQVQAATTKKSDAKAEIAQKASERKTAIEAMNDSTTEEQQAAKDKVDQAVVTANTDIDNAAANTDVDNAKTTNEATIAAITPDANVKPTAKQAIADKVQAQETAIDAYNGATTEEKAAAKQQVQTEKTTADAAIDGAHSNAEVEAAKNAEIAKIEAIQPATTTKDDAKQAITTKANERKAAIAQTQDITAEEIAAANADVDNAVTQANSNIEAANSQNDVDQAKTTGETSIDQVTPTVNKKATARNEITTILNNKLQAIQATPDATDEEKQAADAEANTENGKANQAISAATTNAQVDEAKANAEVAINAVTPKVVKKQAAKDEIDQLQVAQTSVINNDQNATNEEKEAAIQQLATAVTDAKNNITAATDDNGVDQAKDAGKNSIQSTQPATAVKSNAKNEVDQAVTTQNQAIDNTTGATTEEKNAAKDLVLKAKEKAYQDILNAQTTNDVTQIKDQAVADVQGITADTTIKDVAKDELATKANEQKALIAQTADATTEEKEQANQQVDAQLTQGNQNIENAQSIDDVNTAKDNAIQAIDPIQASTDVKTNARAELLTEMQNKITEILSDNTTTNEEKGKDIEPVRATYEEGLNNINTANTTGDVTTAKDTAVQKVQQLHANPVKKPAGKTALDQAAADRKTQIEQTPNASQQEINDAKQEVDATLNQAKTNVDQSSTNEYVDNAVKEGKAKINAVKTFSEYKKDALAKIEAAYNSKVNEADNSNASTSSEIAEAKQKLAELKQTADQNVNQATSKDDIEVQIHNDLDNINDYTIPTGKKETATTDLYAYADQKKNNISADTNATQDEKQQAIKQVDQNVQTALESINNGVDNGDVDDALTQGKAAIDAIQVDATVKPKANQAIEAKAEDTKESIDHSDQLTAEEKTEALAMIKQITDQAKKGINDATTTAEVEKAKAQGLEAFDNIQIDSTEKQKAIEELETALDQIEAGVNVDADATTEEKEAFTNALEDILSKATEDISDQTTNAEIATVKNSALEQLKAQRINPEVKKNALEAIREVVNKQIEIIKNADASAKEIARTDLGRYFDRFADNLDKTQTNAEVAELQNVTIPAIEAIVPQNDPDANDTNNGTDNNDATANSNANATPENTGQPNVSETTDNGKADASPTTPNNSDAATGETTATSTNNPSTDDANNKPTANNNSSVDASTDNSATGNGTIDKPEVESTNNGTTDKPATETDNVTPAESTTNNNSTTATNENAPTGSTATAPTTASTEAASSADSKDNAFVNDSKQNAEVNNSAESQSTNGMVVQPKSENKAKAEKDGRDSTNQSMVESTTETLPSADITEPKVPSNTSKDKEESTTNQTDAGHLKSETNVASNEVDKSEGNVDTDVSNKPSTSKPSEAKDKATSTEDSQKADMATADTKDNQAAIGATADVNNKATQNDGANASPATVSNGSNSTNQDMLNVTKTEENKANVKSAQQGKVNKPKQQAKTLPDTGMSHNDDLPYAELALGAGMAFLIRRFTKKDQQTEE >CP022717.1|AXJ23825.1|2239821_2241177_-|Phosphoglucosamine-mutase MGKYFGTDGVRGVANQELTPELAFKLGRYGGYVLAHNKGEKHPRVLVGRDTRVSGEMLESALIAGLISIGAEVMRLGIISTPGVAYLTRDMGAELGVMISASHNPVADNGIKFFGSDGFKLSDEQENEIEALLDQENPELPRPVGNDIVHYSDYFEGAQKYLSYLKSTVDVNFEGLKIVLDGANGSTSSLAPFLFGDLEADTETIGCSPDGYNINEKCGSTHPEKLAEKVVETESDFGLAFDGDGDRIIAVDENGQIVDGDQIMFIIGQEMHKNQELNNDMIVSTVMSNLGFYKALEQEGIKSNKTKVGDRYVVEEMRRGNYNLGGEQSGHIVMMDYNTTGDGLLTGIQLASVIKMTGKSLSELAGQMKKYPQSLINVRVTDKYRVEENVDVKEVMTKVEVEMNGEGRILVRPSGTEPLVRVMVEAATDEDAERFAQQIADVVQDKMGLDK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP022717_6 | 2335961-2336049 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022717_6
|
1 spacers
spacers of CP022717_6
>6.1|2335991|29|CP022717|CRISPRCasFinder ACTTTTGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022717_6
The CRISPR arrays of CP022717_6 >merge|CP022717|6|2335961-2336049|CRISPRCasFinder GTTCCCCAACTTGCACATTATTGTATGCTGACTTTTGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGTTCCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTG >CP022717|6|6|2335961-2336049|CRISPRCasFinder GTTCCCCAACTTGCACATTATTGTATGCTG ACTTTTGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCC GTTCCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTG
>CP022717.1|AXJ23923.1|2335299_2335650_-|HTH-type-transcriptional-regulator-SarV MSNKVQRFIEAERELSQLKHWLKTTHKISIEEFVVLFKVYEAEKISGKELRDTLHFEMLWDTSKIDVIIRKIYKKELISKLRSETDERQVFYFYSTSQKKLLDKITKEIEVLSVTN >CP022717.1|AXJ23922.1|2333986_2335198_+|major-facilitator-superfamily-transporter MTNQGSLNKSPIFTKSFTINFLVNFIVYLCMYLLLVVIAGYSKQAFDASDSLAGLVVGLFIVGSLIGRFATGKFVNQIGPKRLLFIGLIALIITQLLYFIDGSLAFLIFVRLINGIATAVVTTATGTIAAYVTPVNRKSEGISLFSLSLVLGTAIGPFLGMLLITKYAIDLLFIICVILGILGLIISLFIKVDFEVTNNKTETNVIDKPSFSIHQFIAKEAIPVAVIMLLIGVTYASILTYLQAFALERHLVTAASYFFICYAIASLITRPIAGRLMDDKNENIIVYPAFIMLFLSFVCLISSYQSWLILLAGACLGLGYGNLSSAMQSIAIKVSPPIKYGIATSTFYVGLDAGVGFGPSFLGLFTHMFSYSEIFGFMAALAIITMLVYFLIHGRHVTRNAMN >CP022717.1|AXJ23921.1|2333553_2333994_+|putative-HTH-type-transcriptional-regulator MLSQEFFNSFITIYRPYLKLAEPILEKHNIYYGQWLILRDIAKYQPTTLIEISHRRAIEKPTARKTLKALIENDLITVENSLEDKRQKFLTLTPKGHELYEIVCLDVQKLQQAVVAKTNISQDQMQETINVMNQIHEILLKEAHND >CP022717.1|AXJ23920.1|2332625_2333390_-|hypothetical-protein MILKFDHIIHYIDQLDRFSFPGDVIKLHSGGYHHKYGTFNKLGYINENYIELLDVENNEKLKKMAKTIEGGVAFATQIVQEKYEQGFKNICLRTNDIEAVKNKLQSEQVEVVGPIQMERDTHKDGKVKWQLLYIMNQDDDEIKPPFFIQWEESDSMRTKKLQKYFQKQFSIETVIVKSKNRSQTVSNWLKWFDMDIVEENDHYTDLILKNDDIYFRIEDGKVSKYHSVIIKDAQATSPYSIFIRGAIYRFEPLV >CP022717.1|AXJ23919.1|2332382_2332634_+|hypothetical-protein MRTIILSLFIIMNIVAIIMTLSQPLTVNYFSLRVILIFFTFILSIFFILIKSSRLNNILTILSIVLAIIHMGILAHSTYVYLY >CP022717.1|AXJ23918.1|2330728_2331994_-|Lipid-II:glycine-glycyltransferase MEKMHITNQEHDAFVKSHPNGDLLQLTKWAETKKLTGWYARRIAVGRDGEIQGVAQLLFKKVPKLPYTLCYISRGFVVDYSNKEALNALLDSAKEIAKAEKAYAIKIDPDVEVDKGTDALQNLKALGFKHKGFKEGLSKDYIQPRMTMITPIDKNDDELLNSFERRNRSKVRLALKRGTTVERSDREGLKTFAELMKITGERDGFLTRDISYFENIYDALHEDGDAELFLVKLDPKENIAKVNQELNELHAEIAKWQQKMETSEKQAKKAQNMINDAQNKIAKNEDLKRDLEALEKEHPEGIYLSGALLMFAGSKSYYLYGASSNEFRDFLPNHHMQYTMMKYAREHGATTYDFGGTDNDPDKDSEHYGLWAFKKVWGTYLSEKIGEFDYVLNQPLYQLIEQVKPRLTKAKIKISRKLKRK >CP022717.1|AXJ23917.1|2327444_2330612_-|Swarming-motility-protein-SwrC MIKKLLQFSLGNKFAIFLMVVLVVLGGVYASAKLKLELLPNVQNPVISVTTTMPGATPQSTQDEISSKIDNQVRSLAYVKNVKTQSIQNASIVTVEYENNTDMDKAEEQLKKEIDKIKFKDEVGQPELRRNSMDAFPVLAYSFSNKENDLKKVTKVLNEQLIPKLQTVDGVQNAQLNGQTNREITLKFKQNELEKYGLTADDVENYLKTATRTTPLGLFQFGDKDKSIVVDGQYQSVDAFKNINIPLTLAGGQGQSQSQSDNKQNSAMSDVNQASPQQNSKASASNNISGMPTAKLGDLADITVGDVRTSISKTNGKDAVNLQITKAQDANTVQVAKDVQRKIDTFVDENKDFNVTKTMDTAKPVEKSLYTMIEKASLGTIVAIIVILLFLRNIRTTAISIISIPLSLLMALIALKLSDVSLNILTLGALTVAIGRVIDDSIVVVENIYRRLTDSEEQLKGENLIISATTEVFKPIMSSTLVTIIVFLPLVFVSGSVGEMFRPFALAIAFSLLASLLVSITLVPALAATLFKKGVKRRNKQHQEGLGVVSTTYKKVLHWSLNHKWIVIILSTLILLATIVFGGPRLGTSFISAGDDKFLAITYTPKPGETEQAVLNHAKDVEKYLKQKKHVKTIQYSVGGSSPVDPTGSTNSMAIMVEYDNDTPNFDVEADKVIKHADGFKHPGEWKNQDLGTGAGNKSVEVTVKGPSMDAIKSTVKDIEQKMKQVKGLANVKSDLSQTYDQYEIKVDQNKAAENGISASQLAMHLNENLPEKTVTTVKENGKTVDVKVKQNKQTDWSEDKLNNITLKKPTGGTIKLGDIATLVKTTTPSKLTQEQGDYATTVSAKVTNKDVGGTTRQVMSKINNLDKPNNVKVNIGGASDDINNAMTQLAFAMLAAIIIVYLILVITFKGGLAPFTILFSLPFTVIGVIIALLITGETISVPSLIGMLMLIGIVVTNAIVLIDRVINNEQQGMEMKEALIEAGGTRIRPILMTAIATIGALVPLLFGQDSSILISKGLAATVIGGLISSTLLTLVVVPVIYEILFTLKKRFTKR >CP022717.1|AXJ23916.1|2326940_2327258_+|hypothetical-protein MQFYLILLAILYLIVSFISIFKMEVIFTRILRIIMGVLLLFVLALTTMSFPKENWWVFIVLLLLVGNVEVTGFKMLKKDLKGVNILNLMSLFIFVIYFILTIVLF >CP022717.1|AXJ23915.1|2326541_2326706_+|hypothetical-protein MSLENQLAELKYDYVRLQGDLEKRESLNLDTSALVRQLKDIENEIRNVRAQMQD >CP022717.1|AXJ23914.1|2325500_2326409_-|Membrane-transport-protein MTEQFTMIILLIALGYFLKRINYIKATDSQVIATLVLNVTLPSLVIVNLNSAELKLSFSILPILMIIYGIVAKMIAVWFFRKYDNHMRGSVGMMTGAMNIGLFAYPLIEVIWPKTGLIYFGMADIGGAFVMFGITYFVGSYFSEGSDQFDFKYLGKKLLQSVPLVTYIVMFILNISHIHLPHVAIDFFSILSHANMPLSMILLGVMLNFTLERKYIPATIKYLCLHYGLALVAGLLVHVLLPVSDDMIKTTLLVTWMFPVGVAIISYGIQFKYRTLPFIGMTTNLTIIISIIILYVYQAVFV >CP022717.1|AXJ23924.1|2336231_2337254_-|Cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase MVEQIKDKLGRPIRDLRLSVTDRCNFRCDYCMPKEVFGDDFVFLPKNELLTFDEMARIAKVYAELGVKKIRITGGEPLMRRDLDVLIAKLNQIDGIEDIGLTTNGLLLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDDTLFQSINNRNIKATTILEQIDYATSIGLNVKVNVVIQKGINDDQIIPMLEYFKDKHIEIRFIEFMDVGNDNGWDFSKVVTKDEMLTMIEQHFEIDPVEPKYFGEVAKYYRHKDNGVQFGLITSVSQSFCSTCTRARLSSDGKFYGCLFATVDGFNVKAFIRSGVTDEELKEQFKALWQIRDDRYSDERTAQTVANRQRKKINMNYIGG >CP022717.1|AXJ23925.1|2337273_2337873_-|putative-molybdenum-cofactor-guanylyltransferase MKAIILAGGHSVRFGKPKAFAEVNGETFYSRVIKTLESTNMFNEIIISTNAQLATQFKYPNVVIDDENHNDKGPLAGIYTIMKQHPEEELFFVVSVDTPMITGKAVSTLYQFLVSHLIENHLDVAAFKEDGRFIPTIAFYSPNALGAITKALHSDNYSFKNVYHELSTDYLDVRDVDAPSYWYKNINYQHDLDALIQKL >CP022717.1|AXJ23926.1|2337879_2338113_-|Molybdopterin-synthase-sulfur-carrier-subunit MKVLYFAEIKDILQKAQEDIMLEQALTVQQFEDLLFERYPQINNKKFQVAVNEEFVQKSDFIQPNDTVALIPPVSGG >CP022717.1|AXJ23927.1|2338118_2338565_-|Molybdopterin-synthase-catalytic-subunit MKQFEIVTEPIQTEQYREFTINEYQGAVVVFTGHVREWTKGVKTEYLEYEAYIPMAEKKLAQIGDEINEKWPGTITSIVHRIGPLQISDIAVLIAVSSPHRKDAYRANEYAIERIKEIVPIWKKEIWEDGSKWQGHQKGNYEEAKREE >CP022717.1|AXJ23928.1|2338578_2339064_-|Molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-adapter-protein MILQIVGYKKSGKTTLMRYIVSFLKSHGYTVATIKHHGHGKEDIQLQDSDVDHMKHFEAGADQSIVQGFQYQQTVTRVDNQNLTQIIEKSVTIDTNIVLVEGFKNADFEKVVVYRNEEELQVLQQLSNVCYSINVREHEDFTAFEQWLLNKIKNDCDTQLT >CP022717.1|AXJ23929.1|2339060_2340320_-|Molybdopterin-molybdenumtransferase MVVEKRNPIPVKEAIQRIVNQQSSMPAITVALEKSLNHILAEDIVATYDIPRFDKSPYDGFAIRSVDSQGASGQNRIEFKVIDHIGAGSVSDKLVGDHEAVRIMTGAQIPNGADAVVMFEQTIELEDTFTIRKPFSKNENISLKGEETTTGDVVLKKGQVINPGAIAVLATYGYAEVKVIKQPSVAVIATGSELLDVNDVLEDGKIRNSNGPMIRALAEKLGLEVGIYKTQQDDLDSGIQVVKEAMEKHDIVITTGGVSVGDFDYLPEIYKAVKAEVLFNKVAMRPGSVTTVAFADGKYLFGLSGNPSACFTGFELFVKPAVKHMCGALEVFPQIIKATLMEDFTKANPFTRFIRAKATLTSAGATVVPSGFNKSGAVVAIAHANCMVMLPGGSRGFKAGHTVDIILTESDAAEEELLL >CP022717.1|AXJ23930.1|2340382_2340877_+|Cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase-accessory-protein MTEFTHINQQGHAKMVDVSDKQITKRTAVAHSSITVNETIYKQISNNTNTKGNVLNTAQIAGIMAAKNTSTIIPMCHPLPLTGIDVHFSWDETNAPLYTLNIQTTVSTTGKTGVEMEALTAASATALTIYDMTKAVDKGMIIGETYLESKSGGKSGDFQRQSGQ >CP022717.1|AXJ23931.1|2340878_2341385_-|Molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-B MGEHQNVKLNRTVKAAVLTVSDTRDFDTDKGGQCVRQLLQADDVEVSDAHYTIVKDEKLAITTQVKKWLEEDIDVIITTGGTGIAQRDVTIEAVKPLLTKEIEGFGELFRYLSYVEDVGTRALLSRAVAGTVNNKLIFSIPGSTGAVKLALEKLIKPELNHLIHELTK >CP022717.1|AXJ23932.1|2341415_2342420_-|Molybdopterin-synthase-adenylyltransferase MSQERYSRQILFKQIGEIGQSKINQKCALIIGMGALGTHVAEGLVRAGIAKLIIVDRDYIEFSNLQRQTLFTEEDALKMMPKVVAAKKHLLALRSDVDIDDYIAHVDYYFLETHGQDVDVIIDATDNFETRQLINDFAYKHRIPWIYGGVVQSTYTEAAFIPGKTPCFNCLVPQLPALNLTCDTVGVIQPAVTMATSLQLRDAMKVLTEQPIDTKITYGDIWEGSHYSFGFSKMQRSACTTCGDVPSYPYLNKNEQRYATLCGRDTVQYENASITHDILVQFLKQHQLNYRSNSYMVMFEFKGHRIVAFKGGRFLIHGMTRTSDATHLMNLLFG >CP022717.1|AXJ23933.1|2342588_2343194_-|Sulfate/thiosulfate-import-ATP-binding-protein-CysA MLKINLKYQLKNTLIRININDTEPKIYAVRGPSGIGKTTVLNMIAGLRKADEAIIEVNGQLLTDTAKNVNVKIQQRRIGYLFQDYQLFPNMTVYKNITFMAEPSEHIDQLIQTLNIDHLMKQYPMTLSGGEAQRVSLARALSTKPDLILLDEPFSSLDDTTKDESITLVKRIFNEWQIPIIFVTHSNYEAEQMAHEIITIG |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP022717_7 | 2485687-2485778 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022717_7
|
1 spacers
spacers of CP022717_7
>7.1|2485710|46|CP022717|CRISPRCasFinder TTTTATGAGCTAGAAAGGCTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCAAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022717_7
The CRISPR arrays of CP022717_7 >merge|CP022717|7|2485687-2485778|CRISPRCasFinder TGCGTTCCTTTATTTTCTGCGAATTTTATGAGCTAGAAAGGCTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCAACTGCGTTCCTTTATTTTCTGCGAA >CP022717|7|7|2485687-2485778|CRISPRCasFinder TGCGTTCCTTTATTTTCTGCGAA TTTTATGAGCTAGAAAGGCTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCAAC TGCGTTCCTTTATTTTCTGCGAA
>CP022717.1|AXJ24070.1|2484625_2485492_-|Ferrous-iron-efflux-pump-FieF MSHNENLKLAQRGAYLSLIVYIILSIVKYVTGFVFNSAAVRADALNNMTDIIVSLAVIIGLKISIKPADRNHPYGHLKSENISSLLVSFVIMFVGIQVVIQNALRLFKEDDVVPNAITIIVSLISGLVMLIVFAVNQRLAKRTKSSSLNSAAKDNLSDSLVSIGTAIGLIFTQIGFPIVDIILATLLGLLIVYTGFGIFKEAIFMLSDGFNETELEAYRNDILEVDEVQEVKSIKGRYHGSSVFIDVTIVVDANLSLVEAHQICDNVEHHLHKKGISSVYVHPEPDHL >CP022717.1|AXJ24069.1|2483612_2484299_-|2,3-bisphosphoglycerate-dependent-phosphoglycerate-mutase MPKLILCRHGQSEWNAKNLFTGWEDVNLSEQGINEATRAGEKVRENNIAIDVAFTSLLTRALDTTHYILTESKQQWIPVYKSWRLNERHYGGLQGLNKDDARKEFGEEQVHIWRRSYDVKPPAETEEQREAYLADRRYNHLDKRMMPYSESLKDTLVRVIPFWTDHISQYLLDGQTVLVSAHGNSIRALIKYLEDVSDEDIINYEIKTGAPLVYELTDDLEVIDKYYL >CP022717.1|AXJ24068.1|2483354_2483459_+|hypothetical-protein MKLDLQTARRNLNSPNIKTRKRALKIIKQHKRAK >CP022717.1|AXJ24067.1|2481741_2483181_-|Multidrug-export-protein-EmrB MSKKQKLTMIITMLMGGFFGLLNETLLVTALPSIMKDFEISYTQVQWLTTAFLLTNGIVIPLSALVIQRYTTRQVFLVGITIFFLGTLLGGLSPHFATLLVARIIQALGAGIMMPLMMTTILDVFQPHERGKYMGIFGLVIGLAPAIGPTLSGYLVEYFNWRSLFHVVAPIAAVTFLIGFKTIKNVGTTIKVPIDFISVIFSVLGFGGLLYGTSSISEKGFDNPIVLVSMIGGIALVALFVLRQYRLSTPLLNFAVFKNKQFTVGIIIMGVTMVSMIGSETILPIFVQNLLHRSALDSGLTLLPGAIVMAFMSMTSGALYEKFGPRKLALVGMAIVVITTAYFVVMDEQTSTIMLATVYAIRMVGIALGLIPVMTHTMNQLKPEMNAHGSSMTNTVQQIAGSIGTAALITILSHASKNFSPTMSDYNGMNKIDMMNQIKVDTMLHGYHAGFLFALLITVVSFFCSFMLQGKKKEVDSRQ >CP022717.1|AXJ24066.1|2480841_2481621_-|putative-amino-acid-ABC-transporter-binding-protein-precursor MKRLLFVMIAFVFILAACGNNSSKDKEASKDSKTINVGTEGTYAPFSFHDKDGKLTGYDIDVIKAVAKEEGLKLKFNETSWDSMFAGLDAGRFDVIANQVGINPDREKKYKFSKPYTFSSAVLVIRENEKDIKDFDDVKGKKLAQTFTSNYGKLAKDKGADITKVDGFNQSMDLLLSKRVDGTFNDSLSYLDYKKQKPNAKIKAIKGNAEQSRSAFAFSKKVDDETVQKFNDGLKKIEENGELAKIGKKWFGQDVSKSK >CP022717.1|AXJ24065.1|2480141_2480870_-|L-cystine-transport-system-permease-protein-TcyB MVKMFLNLNSEQQHALDAAKQAFGPMLEGLVKYSIPITLVTFVLGLIIALFTALMRISTSKILRSISRVYVSIIRGTPMIVQLFIIFYGIPELGRLLTNDADNQWTLAPVVAAIIGLSLNVGAYASEIIRGGIISIPKGQTEAAYSIGMTYGQTIQRIILPQAIRVSIPALGNTFLSLIKDTSLLGFILVAEMFRKAQEVASTTYEYLTIYVLVALMYWVVCFIISIIQGIYESYIERGYRS >CP022717.1|AXJ24064.1|2479413_2480145_-|L-cystine-import-ATP-binding-protein-TcyC MIQLNNIHKSFNDVEVIKGIDLSVEQGEVVTLIGRSGSGKTTLLRMINALEIPTEGTVYVNGKTYTSKDKKSQIEVRKQSGMVFQSYNLFPHKTALENVMEGLITVKKLKKDEARGKSLELLEKVGLTHVKDQRPHALSGGQQQRVAIARALAMNPKVMLFDEPTSALDPELVNDVLKVIKDLANEGMTMVIVTHEMRFAKEVSNNIVFIHEGMIGEQGAPEEMFNRPKTEELKRFLNVINEE >CP022717.1|AXJ24063.1|2478066_2479317_+|Aminoacyltransferase-FemA MNFVTLTSDEFNAFTTKHFSHYTQSAIHYNHKVDLKGDVHLVGVKDDNGQVIAGCLLTEARTLKFFKYFYTHRGPVMDYTNQSLVAFFFKALTSYLKKQNCLYVLVDPYLIENLRNADGEIVKSYDNRAFVRTMDTLGYKHQGFPVGYDSMSQIRWLSVLDLKDKTEDQLLKEMDYQTRRNIKKTYDIGVKTKTLTIDETQTFFDLFHMAEEKHGFKFRELPYFEEMQKLYDDHAMLKLAYIDLNEYLKTLQLKQQQLTAELSGVEEALEESPNSKKNKTKRTQLEQQLNSNKRKIDNTIEQIEQDGAVLNLASALFIYNEHEVYYLSSGSNPKYNAYMGAYHLQWEMIKFAKAHHIDRYNFYGITGDFSESSEDYGVQQFKKGFNAHVEEYIGDFIKPIKPLLYKVKTYLNHKRR >CP022717.1|AXJ24062.1|2477449_2477812_-|hypothetical-protein MKRFVATVLLLLVFISGCGNDKYVKEIDEAVKIQNQKQEQLAKKGNGDRVDHFERKDANIYVYDKDKIIILAYKPLSNDDEVHYYAYNFSDKRVSYKQDFDSRRYYQQHDADYHEENMTN >CP022717.1|AXJ24061.1|2476831_2477431_-|Disulfide-bond-formation-protein-D-precursor MTKKLLTLFIVSMLILTACGKKESATTSSKNGKPLVVIYGDYKCPYCKELDEKVMPKLRKNYIDDHKVEYQFVNLAFLGKDSIVGSRASHAVLMYAPKSFLDFQKQLFAAQQDENKEWLTKELLDKHIKQLHLDKETENKIIKDYKTKDSKSWKAAEKDKKIAKDNHIKTTPTAFINGEKVEDPYDYESYEKLLKDKIK >CP022717.1|AXJ24071.1|2486188_2487499_+|Immunoglobulin-binding-protein-sbi-precursor MKNKYISKLLVGAATITLATMISNGEAKASENTQQTSTKHQTTQNNYVTDQQKAFYQVLHLKGITEEQRNQYIKTLREHPERAQEVFSESLKDSKNPDRRVAQQNAFYNVLKNDNLTEQEKNNYIAQIKENPDRSQQVWVESVQSSKAKERQNIENADKAIKDFQDNKAPHDKSAAYEANSKLPKDLRDKNNRFVEKVSIEKAIVRHDERVKSANDAISKLNEKDSIENRRLAQREVNKAPMDVQKHLQKQLDALVAQKDAEKKVAPKVEAPQIQSPQIEKPKAESPKVEVPQIQSPKVEVPQSKLLGYYQSLKDSFNYGYKYLTDTYKSYKEKYDTAKYYTDKYFKYKGTIDKTVLSVFGNGYKSYIQPLKVEDQKNYVSKSYAQVRNYVTETLNTGKVLYAFYQNPKVVKAAITTAETASSIKNIFSSFTSFFK >CP022717.1|AXJ24072.1|2487952_2488918_+|Gamma-hemolysin-component-A-precursor MNLKLNRKKVISMIKNKILTATLAVGLIAPLANPFIEISKAENKIEDIGQGAEIIKRTQDITSKRLAITQNIQFDFVKDKKYNKDALVVKMQGFISSRTTYSDLKKYPYIKRMIWPFQYNISLKTKDSNVDLINYLPKNKIDSADVSQKLGYNIGGNFQSAPSIGGSGSFNYSKTISYNQKNYVTEVESQNSKGVKWGVKANSFVTPNGQVSAYDQYLFAQDPTGPAARDYFVPDNQLPPLIQSGFNPSFITTLSHERGKGDKSEFEITYGRNMDATYAYVTRHRLAVDRKHDAFKNRNVTVKYEVNWKTHEVKIKSITPK >CP022717.1|AXJ24073.1|2489486_2490434_+|Gamma-hemolysin-component-C-precursor MLRNKILATTLSVSLLAPLANPLLENAKAANDTEDIGKGSDIEIIKRTEDKTSNKWGVTQNIQFDFVKDKKYNKDALILKMQGFISSRTTYYNYKKTNHVKAMRWPFQYNIGLKTNDKYVSLINYLPKNKIESTNVSQTLGYNIGGNFQSAPSLGGNGSFNYSKSISYTQQNYVSEVEQQNSKSVLWGVKANSFATESGQKSAFDSDLFVGYKPHSKDPRDYFVPDSELPPLVQSGFNPSFIATVSHEKGSSDTSEFEITYGRNMDVTHAIKRSTHYGNSYLDGHRVHNAFVNRNYTVKYEVNWKTHEIKVKGQN >CP022717.1|AXJ24074.1|2490435_2491413_+|Gamma-hemolysin-component-B-precursor MKMNKLVKSSVATSMALLLLSGTANAEGKITPVSVKKVDDKVTLYKTTATADSDKFKISQILTFNFIKDKSYDKDTLVLKATGNINSGFVKPNPNDYDFSKLYWGAKYNVSISSQSNDSVNVVDYAPKNQNEEFQVQNTLGYTFGGDISISNGLSGGLNGNTAFSETINYKQESYRTTLSRNTNYKNVGWGVEAHKIMNNGWGPYGRDSFHPTYGNELFLAGRQSSAYAGQNFIAQHQMPLLSRSNFNPEFLSVLSHRQDGAKKSKITVTYQREMDLYQIRWNGFYWAGANYKNFKTRTFKSTYEIDWENHKVKLLDTKETENNK >CP022717.1|AXJ24075.1|2491464_2491932_-|hypothetical-protein MTSKDITQISVIAAILTILAVLKIPSIIPGLDFQLSAPAALLILAFFGIKKYFLGGLLSSVLLLIFGVFNPINVIISIIFRVIAIAVVYLLKINVLSLVLASVLGSLVSRLLLSIILNLPVWVVLLNAIPGVIFTLIVAIPLYLTLRKRMAVLLR >CP022717.1|AXJ24076.1|2491942_2492635_-|6-carboxyhexanoate--CoA-ligase MYSIKMRSSNQDVHISGAETICEFDKIEQTVQRFYNKGFFHENGQPDFLNIKIQKIMEPIQQIKALQIIEDDKANLQKLTQECGVTEQALNQGMTYIKNETVYTGAIILSAISGKRLDSFGQRGIRATHFSFEDINNKGDLNERVTDALAIASCINAHPYVKGELCVSDDLTYTTGYFASAKIGYHRLFDIKPVNTRYGGRIIFVDDRIDLHHYISFLESTPKQVVYETV >CP022717.1|AXJ24077.1|2492645_2493761_-|8-amino-7-oxononanoate-synthase/2-amino-3-ketobutyrate-coenzyme-A-ligase MMFQEQIDLLQQKGLYRSLKSVGYIDRQYIEVENKRCTNYTSNDYLGLGQIAFDKDDFERFMRKYSYHLSSSRLISGSSTAYEEIETMLAGWLGYSACTILNSGYDANLALFNIFKNTNCVVFSDQENHASIIDGIKLSGLEKVIYKHLDIADLEKRLAEYPNQNIQKIIISDSVFSTNGDLVDIGQLVSLKHKYNATLILDVSHSFGIENYSNYQGIDILTSSLSKACGAYGGVILSSNDVKDMLINHGRPLIYSSSLPIYNLYFIKRNIEKLINADDRRTKLNSLSKYFNQKLKALNVNYNSSNSPIKFIEFDDIEAAENIHQTLLKHHVFTSYLRYPTVTKPMLRISLSYFHTEQDVDRLFEILHQED >CP022717.1|AXJ24078.1|2493738_2494746_-|Biotin-synthase MNLAKRILQGEQLTKETVLKIYEDTNIDTLDLLNEAYILRKHYFGKKVKLNMILNAKSGICPENCGYCGQSRDIKQKQRYALIPEEQIIDGAKVAHDNHIGTYCIVMSGRGPSDKEVDHISNTVRTIKSQHPQLKICACLGLTNDEQAKKLKSAGVDRYNHNINTSENYHDNVVTTHSYKDRTDTIELMKANNISPCSGVICGMGESNQDIVDMAFALKEMDADSIPINFLHPIKGTKFGSMDDLTPMKCLRIVALFRLINPTKEIRIAGGREVNLRSLQPLALKAANSIFVGDYLITGGQPNQLDYDMINDLGFEIDYDTCENKENKNDVSRAN >CP022717.1|AXJ24079.1|2494747_2496106_-|L-Lysine-8-amino-7-oxononanoate-aminotransferase MNYTQQLKQKDSEYVWHPFTQMGVYSKEEAIIIEKGKGSYLYDTNGNKYLDGYASLWVNVHGHNNKYLNKVIKKQLNKIAHSTLLGSSNIPSIELAEKLIEITPSNLRKVFYSDTGSASVEIAIKMAYQYWKNIDREKYAKKNKFITLNHGYHGDTIGAVSVGGIKTFHKIFKDLIFENIQVESPSFYRSNYDTENEMMTAILTNIEQILIERNDEIAGFILEPLIQGATGLFVHPKGFLKEVEKLCKKYDVLLICDEVAVGFGRTGKMFACNHEDVQPDIMCLGKAITGGYLPLAATLTSQKIYDAFLSDSHGVNTFFHGHTYTGNQIVCTVALENIRLYEKRNLLSHIETTSSTLEKQLHALKRHRNVGDVRGRGLMFGVELVTDKDSKTPLEIEKVERIVRNCKENGLMIRNLENVITFVPVLSMSNKEVKTMVRIFKKAVHNILDRKC >CP022717.1|AXJ24080.1|2496083_2496770_-|ATP-dependent-dethiobiotin-synthetase-BioD-1 MRIFITSTNTDVGKTYVTKHLYNALKTRGHRVCVFKPFQTEERQDGTFPDLEVFKNECDLSYDITSLYTFKQPVSPHLAFKMANQIFLNKQCVLDKVKVLDKEFDFILIEGAGGIAVPIYEGTDDFYMTKDLINDCADCVISVLPSKLGAISDAIVHQDYVNQNVSASNFLIMNRYTDSYIEKDNQMTIGKLTNKTVYTFEEYATYENFSEAFLKQLIGVKNELHTTT |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP022717_4 | 4.1|2090152|34|CP022717|CRISPRCasFinder | 2090152-2090185 | 34 | CP022717.1 | 813415-813448 | 0 | 1.0 |
| CP022717_4 | 4.1|2090152|34|CP022717|CRISPRCasFinder | 2090152-2090185 | 34 | CP022717.1 | 857828-857861 | 0 | 1.0 |
| CP022717_1 | 1.1|526244|28|CP022717|CRISPRCasFinder | 526244-526271 | 28 | CP022717.1 | 641579-641606 | 1 | 0.964 |
| CP022717_1 | 1.1|526244|28|CP022717|CRISPRCasFinder | 526244-526271 | 28 | CP022717.1 | 813292-813319 | 1 | 0.964 |
| CP022717_1 | 1.1|526244|28|CP022717|CRISPRCasFinder | 526244-526271 | 28 | CP022717.1 | 1974989-1975016 | 1 | 0.964 |
| CP022717_4 | 4.1|2090152|34|CP022717|CRISPRCasFinder | 2090152-2090185 | 34 | CP022717.1 | 374711-374744 | 1 | 0.971 |
| CP022717_4 | 4.1|2090152|34|CP022717|CRISPRCasFinder | 2090152-2090185 | 34 | CP022717.1 | 767303-767336 | 1 | 0.971 |
| CP022717_4 | 4.1|2090152|34|CP022717|CRISPRCasFinder | 2090152-2090185 | 34 | CP022717.1 | 1124963-1124996 | 1 | 0.971 |
| CP022717_1 | 1.1|526244|28|CP022717|CRISPRCasFinder | 526244-526271 | 28 | CP022717.1 | 822391-822418 | 2 | 0.929 |
| CP022717_1 | 1.1|526244|28|CP022717|CRISPRCasFinder | 526244-526271 | 28 | CP022717.1 | 1214882-1214909 | 2 | 0.929 |
| CP022717_4 | 4.1|2090152|34|CP022717|CRISPRCasFinder | 2090152-2090185 | 34 | CP022717.1 | 861995-862028 | 2 | 0.941 |
| CP022717_4 | 4.1|2090152|34|CP022717|CRISPRCasFinder | 2090152-2090185 | 34 | CP022717.1 | 1379151-1379184 | 2 | 0.941 |
1. spacer 4.1|2090152|34|CP022717|CRISPRCasFinder matches to position: 813415-813448, mismatch: 0, identity: 1.0
ttgtagaatttcttttcgaaattctctgtgttgg CRISPR spacer ttgtagaatttcttttcgaaattctctgtgttgg Protospacer **********************************
2. spacer 4.1|2090152|34|CP022717|CRISPRCasFinder matches to position: 857828-857861, mismatch: 0, identity: 1.0
ttgtagaatttcttttcgaaattctctgtgttgg CRISPR spacer ttgtagaatttcttttcgaaattctctgtgttgg Protospacer **********************************
3. spacer 1.1|526244|28|CP022717|CRISPRCasFinder matches to position: 641579-641606, mismatch: 1, identity: 0.964
acgaaaagtcagcttacgataaagtgca CRISPR spacer acgaaaagtcagcttacgataatgtgca Protospacer ********************** *****
4. spacer 1.1|526244|28|CP022717|CRISPRCasFinder matches to position: 813292-813319, mismatch: 1, identity: 0.964
acgaaaagtcagcttacgataaagtgca CRISPR spacer acgaaaagtcagcttacgataatgtgca Protospacer ********************** *****
5. spacer 1.1|526244|28|CP022717|CRISPRCasFinder matches to position: 1974989-1975016, mismatch: 1, identity: 0.964
acgaaaagtcagcttacgataaagtgca CRISPR spacer acgaaaagtcagcttacgataatgtgca Protospacer ********************** *****
6. spacer 4.1|2090152|34|CP022717|CRISPRCasFinder matches to position: 374711-374744, mismatch: 1, identity: 0.971
ttgtagaatttcttttcgaaattctctgtgttgg CRISPR spacer ttgtagaatttcttttcgaaattctctttgttgg Protospacer *************************** ******
7. spacer 4.1|2090152|34|CP022717|CRISPRCasFinder matches to position: 767303-767336, mismatch: 1, identity: 0.971
ttgtagaatttcttttcgaaattctctgtgttgg CRISPR spacer ttgtagaatttcttttcgaaattctctttgttgg Protospacer *************************** ******
8. spacer 4.1|2090152|34|CP022717|CRISPRCasFinder matches to position: 1124963-1124996, mismatch: 1, identity: 0.971
ttgtagaatttcttttcgaaattctctgtgttgg CRISPR spacer ttgtagaatttcttttcgaaattatctgtgttgg Protospacer *********************** **********
9. spacer 1.1|526244|28|CP022717|CRISPRCasFinder matches to position: 822391-822418, mismatch: 2, identity: 0.929
acgaaaagtcagcttacgataaagtgca CRISPR spacer acgaaaagtcagcttacaataatgtgca Protospacer *****************.**** *****
10. spacer 1.1|526244|28|CP022717|CRISPRCasFinder matches to position: 1214882-1214909, mismatch: 2, identity: 0.929
acgaaaagtcagcttacgataaagtgca CRISPR spacer acgaaaagtcagcttacaataatgtgca Protospacer *****************.**** *****
11. spacer 4.1|2090152|34|CP022717|CRISPRCasFinder matches to position: 861995-862028, mismatch: 2, identity: 0.941
ttgtagaatttcttttcgaaattctctgtgttgg CRISPR spacer ttgtagaatttcttttcgaaatcctctatgttgg Protospacer **********************.****.******
12. spacer 4.1|2090152|34|CP022717|CRISPRCasFinder matches to position: 1379151-1379184, mismatch: 2, identity: 0.941
ttgtagaatttcttttcgaaattctctgtgttgg CRISPR spacer ttgtgggatttcttttcgaaattctctgtgttgg Protospacer ****.*.***************************
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP022717_1 | 1.1|526244|28|CP022717|CRISPRCasFinder | 526244-526271 | 28 | NC_021536 | Synechococcus phage S-IOM18 genomic sequence | 159754-159781 | 5 | 0.821 |
| CP022717_1 | 1.1|526244|28|CP022717|CRISPRCasFinder | 526244-526271 | 28 | LN846932 | Carnobacterium maltaromaticum strain LMA28 LMA_pa plamid, complete genome | 10627-10654 | 6 | 0.786 |
| CP022717_2 | 2.1|1042772|29|CP022717|CRISPRCasFinder | 1042772-1042800 | 29 | NZ_CP015322 | Mesorhizobium amorphae CCNWGS0123 plasmid pM0123d, complete sequence | 703321-703349 | 6 | 0.793 |
| CP022717_1 | 1.1|526244|28|CP022717|CRISPRCasFinder | 526244-526271 | 28 | NZ_CP015319 | Mesorhizobium amorphae CCNWGS0123 plasmid pM0123a | 9464-9491 | 7 | 0.75 |
1. spacer 1.1|526244|28|CP022717|CRISPRCasFinder matches to NC_021536 (Synechococcus phage S-IOM18 genomic sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
acgaaaagtcagcttacgataaagtgca CRISPR spacer acgaaaactcaccttacgataaaattta Protospacer ******* *** ***********.* .*
2. spacer 1.1|526244|28|CP022717|CRISPRCasFinder matches to LN846932 (Carnobacterium maltaromaticum strain LMA28 LMA_pa plamid, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
acgaaaagtcagcttacgataaagtgca CRISPR spacer acgaaaaatcagattacgataaattagt Protospacer *******.**** ********** *.
3. spacer 2.1|1042772|29|CP022717|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP015322 (Mesorhizobium amorphae CCNWGS0123 plasmid pM0123d, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
taaaagagggatacttgcgctgagcgcat CRISPR spacer gatcaaagggttccttgcgctgagcgcat Protospacer * *.**** * ****************
4. spacer 1.1|526244|28|CP022717|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP015319 (Mesorhizobium amorphae CCNWGS0123 plasmid pM0123a) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
acgaaaagtcagcttacgataaagtgca CRISPR spacer tcgaaatgtcagcttacgaaaaagcttt Protospacer ***** ************ ****. .
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
310292 : 353163
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP022717|310292:353163|DBSCAN-SWA 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>CP022717|310292:353163|339363_339522_+|AXJ22095.1|DBSCAN-SWA MEQYGWTLTEVRKQPYVKLLEILNEENKEETEEKQSEQKVITGTDLRKLFGS >CP022717|310292:353163|317102_317465_+|AXJ22056.1|DBSCAN-SWA MAILEGIFEELKLLNKNLRVLNTELSTVDSSIVQEKVKEAPMPKDETAQLESVEEVKETSADLTKDYVLSVGKEFLKKADTSDKKEFRNKLNELGADKLSTIKEEHYEKIVDFMKARINA >CP022717|310292:353163|325100_325253_+|AXJ22075.1|DBSCAN-SWA MIKQILRLLFLLAMYELGKYVTEQVYIMMTANDDVEAPSDFEKIRAEVSW >CP022717|310292:353163|321244_321430_+|AXJ22060.1|DBSCAN-SWA MQHQAYINASVDIRIPTEVESVNYNQIDKEKENLADYLFNNPGELLKYNVINIKVLDLEVE >CP022717|310292:353163|316764_317088_+|AXJ22055.1|DBSCAN-SWA MTLQQKILSHFATYDNFNSDDVVEVFGISKTHAKSTLSRLKKKGKIELESWGIWRVVEPQLHLTVVERKKEILEEQFELLARLNEQSDDPREIEERIKLMIRLANQF >CP022717|310292:353163|323334_323862_+|AXJ22069.1|DBSCAN-SWA MTNILQVKLLSKDARMPERNHKTDAGYDIFSAETVVLEPQEKAVIKTDVAVSIPEGYVGLLTSRSGVSSKTHLVIETGKIDAGYHGNLGINIKNDAQVYLTTNEQCFDIQGEMENSFVNNAKKKPFTINDYYEIYKGDKLAQLVIVPIWTPELKQVEEFESVSERGAKGFGSSGV 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MSLEEIKLWLRIDYNFENDLIEGLIQSAKSELLLSGVPDYDKDDLEYPLFCTAIRYIIARDYESRGYSNDQSRSKVFNEKGLQKMILKLKKW >CP022717|310292:353163|321429_321831_+|AXJ22061.1|DBSCAN-SWA MARRKVIRVRIKGKLMTLREVSEKYHISPELLRYRYKHKMRGDELLCGRKDSKSKDEVEYMKSQIKDEEKEREKIRKKAILNLYQRNVRAEYEEERKRRLRPWLYDGTPQKHSRDPYWFDVTYNQMFKKWSEA >CP022717|310292:353163|313813_314257_+|AXJ22045.1|DBSCAN-SWA MEQITLTKEELKEIIAKEVRNAIKGEKPISSGAIFSKVRINNDDLEEINKKLNFAKDLSLGRLRKLNHPIPLKKYQHGFESIHQKAYVQDVHDHIRKLTLSIFGVTLNSDLSESEYNLAAKIYRDIKNYYLYIYEKRVSELTIDDFE >CP022717|310292:353163|310292_311498_-|AXJ22039.1|DBSCAN-SWA MWIEKFKNKNNETKYRYYEKYKDPYTDKWKRVSVVLNKNTKQSQKEAMFRLEEKIKEKLNNKSSSELKTLTFHTLLDEWFEYHTKTSGFKVTTLDNLKTRIKNIKKNSSQNLLLNKIDTKYMQTFINELSNIYSENQVKRQLGHMKEAIKYAVKFYNYPNEHILNSVTLPKKSKTIEDIEKEEAKMYNYLEMEQVIQIRDFILNDNNMQYRARILVAGAVEVQALTGMRIGELLALQVKDVDLKNKTIDINGTIHRIKCNAGFGHKDTTKTAGSRRKIAINSRIANVLKKIMLENKKMQQWEPSYVDRGFIFTTCQGNPMQGSRINKRLSSAAESLNINKKVTTHTLRHTHISLLAEMNISLKAIMKRVGHTDEKTTIKVYTHVTEKMDRELEQKLEKLVY >CP022717|310292:353163|322090_322333_+|AXJ22063.1|DBSCAN-SWA MTDSARKEYLNQFFGSKRYLYQDNERVAHIHVVNGTYYFHGHIVPGWQGVKKTFDTAEELETYIKQHGLEYEEQKQLTLF >CP022717|310292:353163|324488_324725_+|AXJ22073.1|DBSCAN-SWA MINIPKMKFPKKYTEIIKKYKNKTPEEKAKIEDDFIKEINDKDSEFYSPMMANMNEHELRAMLRMMPSLIDTGDDNDD >CP022717|310292:353163|313553_313766_+|AXJ22044.1|DBSCAN-SWA MTTSVADKPYLKIKSLIALKGTNQKEVAKAIGMSRSLLSIKINRINGRDFTTSEAKKLADHLNVKVDDFF >CP022717|310292:353163|322504_322657_+|AXJ22065.1|DBSCAN-SWA MDNREQIEQSVISASAYNGNDDRCFPIKGFYILNDDLTMTLIWKDGELVV >CP022717|310292:353163|324101_324296_+|AXJ22071.1|DBSCAN-SWA MTEVKIKTISGGVYFVKTAEPFEKYVERMTGFNGYIYASNIIKQPTYIKTDTIESITLIEERGK >CP022717|310292:353163|314271_314421_+|AXJ22046.1|DBSCAN-SWA MKLLRRLFNKKHENLIDVWHGNQWLKVKESKLKKYKVVSDREGKKYLIK >CP022717|310292:353163|325320_325521_+|AXJ22076.1|DBSCAN-SWA MWIVISIVLSIFLLILLSSISHKMKTIEALEYMNAYLFKQLVKNNGVEGLEDYENEVERIRKRFKS |
67 | Staphylococcus_phage(88.06%) | lysis,capsid,portal,tail,terminase,holin,head,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
745697 : 753517
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP022717|745697:753517|DBSCAN-SWA ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTTACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTTCGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTATTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTGCGGTTTTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTTGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCATGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAATGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACATCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAATAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCGAGTGGGACAACAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCGATGACTGGTACTAAACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAACCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACTCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGTGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTACAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGGTAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCAGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCGCCTAAAATTAATACAGAGGCAACAGCACCAACTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACTCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGTCAAAATAAGAGGAGGACGGTTTTTTAAGTAAGAAAATATTTATCTAAACTAGTTATAACTATAAAACACTTCTGATATATCGAACTAAGAATATCAGAAGTGTTTTATAGTTTTGATATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTGTTATTATTTTCAGCAGTTTCATCTAAGTTATTAAATGTTGAAATAAACAACATAATACCACCAATGATGAAAATGGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATAGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATTCTTTATACACCTTTTTTATTACTCCAAAGTAATGTGTGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCTAGCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACGCATTGTGCAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCAGGCGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGTGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGGTTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCCTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACGACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGGCTGAAGTTCACTAAAAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACACGGAATGTGATGTGCAGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP022717|745697:753517|751788_752382_+|AXJ22460.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDIINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHITYPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGEYCENRI >CP022717|745697:753517|748228_748669_-|AXJ22455.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAVASVLILGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >CP022717|745697:753517|745697_746753_-|AXJ22452.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >CP022717|745697:753517|746752_747439_-|AXJ22453.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPDVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >CP022717|745697:753517|750769_751438_-|AXJ22459.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGIKHHILDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >CP022717|745697:753517|750348_750768_-|AXJ22458.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPNTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >CP022717|745697:753517|752365_753517_+|AXJ22461.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >CP022717|745697:753517|748948_749533_-|AXJ22456.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNNLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >CP022717|745697:753517|749631_750345_-|AXJ22457.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVIAQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLLDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >CP022717|745697:753517|747413_747887_-|AXJ22454.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVSSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
765489 : 779682
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP022717|765489:779682|DBSCAN-SWA TATGAAAGAACAACTTAATCAACTATCAGCATATCAGCCTGGTTTATCTCCAAGGGCATTGAAAGAAAAGTATGGCATTGAAGGAGATTTATATAAACTTGCATCAAATGAAAATTTGTATGGACCATCGCCTAAAGTTAAAGAAGCGATATCAGCACACTTAGATGAGTTATATTATTATCCTGAAACAGGATCACCGACATTAAAAGCGGCGATTAGTAAACATTTAAATGTAGATCAATCACGCATTTTATTTGGTGCGGGATTAGATGAAGTTATATTAATGATTTCTAGAGCAGTATTAACGCCAGGGGATACTATTGTTACAAGTGAAGCGACATTCGGTCAATATTATCACAATGCGATTGTTGAATCAGCTAATGTGATACAAGTACCTTTAAAAGATGGTGGCTTCGATTTAGAAGGCATTTTAAAAGAAGTTAATGAAGATACGTCATTGGTATGGTTATGTAATCCAAATAATCCTACAGGTACATATTTTAATCATGAGAGCTTAGATTCGTTTTTATCTCAAGTACCTCCACATGTACCAGTAATTATAGATGAAGCTTATTTTGAATTTGTGACAGCAGAGGACTACCCGGATACACTTGCTTTGCAACAAAAATATGACAATGCATTCTTATTACGTACATTTTCAAAGGCGTATGGATTAGCGGGTTTACGTGTAGGATATGTGGTAGCAAGCGAACATGCGATTGAAAAATGGAACATCATTAGACCACCATTTAATGTGACACGTATATCTGAATACGCAGCAGTTGCAGCACTTGAAGATCAACAATATTTAAAAGAGGTAACACATAAAAATAGTGTTGAACGCGAAAGATTTTATCAATTACCTCAAAGTAAGCATTTCTTACCAAGTCAAACGAATTTTATATTTGTAAAAACAAAGCGGGTAAATGAACTTTATGAAGCACTTTTAAATGTAGGGTGTATTACGCGACCATTTCCAACTGGTGTTAGAATTACAATTGGTTTTAAAGAACAAAATGATAAAATGTTAGAAGTTTTATCAAACTTTAAATACGAATAGTAAGTGTTGTCACATTGTATAAAAATGTGCCAAAATGCAGTGTGAATTATGAGGTGAGAGTATTCAGTGTAAAAAGCAACAATAGATGATATTGTTTTGTATCAATTGCTTTTTTGCTATACTGAATCAATACTGATATTTTGAGGAGAAGATTAAAATGACCCGTAAATCAATCGCGATTGATATGGATGAAGTATTGGCAGATACATTAGGAGAAATCATTGATGCTGTCAATTTTAGAGCGGATTTAGGTATTAAAATGGAAGCTTTGAATGGTCAAAAACTTAAACATGTTATTCCTGAACATGATGGATTAATTACAGAAGTATTGAGAGAACCAGGCTTCTTCAGACATCTTAAAGTGATGCCGCATGCACAAGAAGTTGTGAAAAAATTAACTGAACATTATGATGTATATATTGCTACAGCAGCAATGGATGTACCAACATCATTTAGTGATAAATATGAATGGTTACTAGAGTTCTTTCCATTTTTAGATCCTCAGCATTTTGTTTTTTGTGGTAGAAAAAACATCGTTAAAGCTGATTATTTAATAGATGACAATCCTAGACAGCTTGAAATTTTTACTGGTACACCGATTATGTTTACAGCAGTGCATAATATTAATGATGATCGATTTGAACGCGTAAATAGCTGGAAAGATGTAGAACAGTATTTTTTAGATAATATTGAGAAATAAAAATAAATCACTTGAAGCATTTCATGTAGCAAATAAAATGCATATACTGGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACAAAGAAGCTGACGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCGAGTTGGGGCGGGCCCCAACATAAAGAAATACTTTTTCTTTAGAAATTAGTATTTCTTATGCATGAGTGTAACTCATGCAATCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAACCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCTGTCCCACTCTCAGTAAATGTTAGTCTATCTCATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGGCACATAAACCACTATGATTAAAAGTATAATATCAATCATTTTAGTGGCATGCGCCAAAATTATATGTCTGTTTTTGAAACAGAGTAATAGCTTAAAGCTAATAACAACGAATATAATGTACGTTGAATCTTATGATTACACTTTAAACCTAATATAATATCCCGTTAAGATCATTCCGGATGCTTACAGATCATTGACAGTAAGTAACTGAATGGCATTTGGTATAACCTCAATATCAATAGGTGTTTCTAATGAAATTTCGCCATCAATATCAACTTTCATTGCTGGATCTGTTGTAAGTGAAATCTTTTTACCAGGTATATGCTCAATACCTTGAGTAATTTCATTCCAATTCATGCTATCACGCTTTTTAAAAATATCATTTAAAATACTGAAACTTTGTTCATTAAAAATGAAAGTGTTCAGTTCACCATCTTGAGGAGACAAATCAGTCAATGGTATACGACTACCACCAATGAATGGACCATTTGCTGATAGTATCATGGTCGTTTCGCCAGAATATGTCTTATCATCAATTGTTAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATTAGACCTAAGCCAACAAAGTTGAGTGCATATTGATTATTTATTTTAATTACATCGTATGTACCAACTTGTGCAGAAATCATTTGTTCACTAGCTTGTTTATGATTAGGTGCTATATTTAGCGTCTTTGTAAAATCATTAAAAGTACCGCCTGGTAAAATTCCAATAGGGAGTTGAAGGTCATGTGTCATAACACCATTTATAAGTTCGTTAACCGTGCCATCACCGCCAAGAATAAATAATATATCTACATCTTTTGCATAGTTTTTAGTTTTGATTTCTTGGCAATATTTAATAATGTCACCTTCGTTTTCACTCAATTGAATAGAAAGATGTTTACAGATTGAACTTAATGCTGTTGTAACTTCCCCAATACCTTGATTAATATTTTTTAATCCACTGTGTTCATGGTAAAAGAGGACACCATGTGTATATTTATTTTCCATAGTTTAGCCTACTTTCTAAAAATTGGTTCATTAAATATATATACCCACTTTTAATTGTTAATACCAAAAATATGTTTTTAAATAGAGAAAATGGTAATAACTGACATTAATGTCTATAGTGAAATGTGAAAATATAATTACTAATTATATTGTTTAGTTGTCTATAACGAGCATATTAAGTTTTCATTTATACTGATATTTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGAATGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAATTTGTTTGACCTAGTGGTTCTATTAACTTAACTAAAGTACCATTGATTGCTTGTGCAGAAGCGTTAGTTAAGTACCAAATACTCATCATTTGGGCATTAAATGCTTTAGGTGCTAACTTAACAGCAGCACTATTACCCGTTGGTGATAAGCAAAGCTCACCGATAACACAAATAATGTACGATAAAATAACCCAGTTAACTGAGAAGTTTGATGAACCTGATGCATAACCTACAATACCAATTAGTATGTATGACGCACCTGCTAAGAACGTACCAATTGCAAATTTTACTGGCAGGCTAGGTTGTTTAGTTCCAAGCTTTTGCCATAAAAGTGAAATAATTGGAGCTAATAATAAAATAAATAATGGGTTAATTGATTGGAAGATCGCTTCACCAAAGTTTGTTTTCCAACCAAATAAGTTTAATTTCATATCTGAATGTTCAATACCATAAATATTTAATACATTAGACCCTTGTTCTTGAATAGCCCAGAACACCATTCCAAGAATAAATAATGGAATAAATGCTTTAACACGAGAACGTTCAGTATCAGTGACATCTTTACTTCTAATAATTAAAGTGAAGTAAATGATTGGTAATGCAATACCTAATACTAAAACAGTATTACTAACTAAGTTAAATGATAATGAGTTAGTTAATGCACCAATAACGATAATTAATACAATTGCTAAAACAACACTTCCGATAATAAGACCATACTTTTTCTTTTCAGCTGGTGTCAATGGGTTAGTAGGTTTCATACCAACGCTACCTAAGTTTTTGCGGTTGAAAAGTACATACCATACTAAACCTAATGCCATACCAACTGCTGCAATCAAGAATCCACCGTGGAAGTTTTTAACATTAACAAAGTGTTGCAAAATAATAGGTGATAATAATGCACCCATATTAACTGACATATAGAAAATAACAAAACCTGCATCCATACGTCTATCATTTTCAGGATATAAACGGCCAACGATATTTGAAATGTTTGGCTTCATTAAACCTGAACCAATAATGATGAAGAACATTGATGTGAATAAGCCGATTAATGCAAATGGTAAGCTTAAACAAATATGTCCGATAATAATAAATACGGCACCTAATAAAGTAGCGCCTCTAGTGCCCGTAATTCTGTCAGCAATCCATCCGCCTGGTATTGATGTCATATAGATTAATGAACCATAAACTGACATAATTGACATAGCTGTTGTTTTATCAATTCCAAGGCCATTATCTGTTACGGCAAAGTACATATAGAAAATGAGTAGGGCACGCATGCCATAATAACTAAACCTTTCCCAGAACTCTACAAAGAAGAGTACGCCTAGTCCTC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP022717|765489:779682|773445_775551_+|AXJ22477.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >CP022717|765489:779682|773084_773483_+|AXJ22476.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVNEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >CP022717|765489:779682|765489_766548_+|AXJ22470.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSKHFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >CP022717|765489:779682|769052_770558_-|AXJ22473.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >CP022717|765489:779682|771417_772284_-|AXJ22475.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >CP022717|765489:779682|777967_778924_+|AXJ22480.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >CP022717|765489:779682|767853_768771_-|AXJ22472.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLTIDDKTYSGETTMILSANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >CP022717|765489:779682|775668_776640_+|AXJ22478.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >CP022717|765489:779682|778920_779682_+|AXJ22481.1|DBSCAN-SWA MIQVGNLTKTINNQMILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDNGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMDIQIEHIRNQRICLYFKD >CP022717|765489:779682|776967_777978_+|AXJ22479.1|DBSCAN-SWA MIMIIINLKGEKFVMKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRMMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQ >CP022717|765489:779682|770897_771398_-|AXJ22474.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQNNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >CP022717|765489:779682|766705_767248_+|AXJ22471.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK |
12 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1027969 : 1036442
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP022717|1027969:1036442|DBSCAN-SWA AGTGAAAGTAGCAGTCATTATGGGCAGTTCTTCCGATTGGAAAATTATGCAAGAGAGTTGTAACATGTTGGATTATTTTGAAATTCCGTACGAAAAACAAGTAGTATCCGCACATCGTACGCCAAAAATGATGGTTCAATTTGCTTCTGAAGCGAGAAAAAGAGGTATAGACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGATTGAAACAAAAAGTTTAAAGGGTATAGATTCTTTATTATCAATTGTTCAAATGCCAGGAGGTATTCCGGTTGCAACGACTGCAATTGGTGCAGCAGGTGCTAAAAACGCAGGTATACTTGCAGCAAGAATGTTAAGTATTCAAAATTCTTCTTTAGTTGAAAAACTAAATCAGTATGAATCTTCGTTAATTCAAAAAGTGGAGGACATGCAAAATGAACTTCAATAAATTAAAGTTTGGTGCGACTATTGGCATTATTGGTGGTGGTCAGCTTGGAAAGATGATGGCACAATCAGCTCAAAAAATGGGTTGTAAAGTGGCTGTTTTGGATCCTTCTGAAGATTGTCCATGTAGATACGTTGCACACGAATTTATACAAGCCAAGTATGACGATGAAAAGGCACTCAATCAATTAGGACAAAAATGTGATGTGATTACTTATGAATTTGAAAACATTTCAGCCCAACAATTAAAACTATTATGTGAAAAGTACAATATTCCGCAAGGTTACCAAGCTATACAGTTATTACAAGACCGCTTAACTGAAAAAGAAACATTAAAAAGTGCTGGTACCAAGGTTGTCCCATTCATTTCAGTAAAAGAATCTACAGATATTGACAAAGCAATTGAAACATTAGGATATCCTTTTATTGTAAAAACTAGATTTGGTGGCTACGATGGCAAAGGTCAAGTTTTAATTAACAACGAAAAAGACTTACAAGAAGGTTTTAAATTAATTGAAACTAGTGAATGCGTAGCTGAAAAATTTTTGAATATCAAGAAAGAAGTATCACTTACTGTTACAAGAGGAAACAACAATCAAATCACTTTTTTCCCATTACAAGAAAATGAGCATAGAAATCAAATACTTTTCAAAACAATTGTTCCAGCGAGAATAGATAAAATAGCAGAGGCGAAAGAGCAAGTTAATAAAATTATCCAATCGATTCATTTCATTGGAACATTTACAGTTGAATTTTTTATAGATAGTAACAACCAATTGTATGTGAACGAGATTGCACCAAGGCCTCACAATTCCGGACATTATTCAATTGAGGCATGTGATTATTCACAATTTGATACTCATATTTTAGCAGTTACCGGACAATCATTACCAAATTCAATTGAATTATTAAAACCTGCAGTCATGATGAACTTACTAGGTAAAGACTTAGATTTATTGGAAAATGAATTTAATGAACATCCAGAGTGGCACTTACATATTTATGGTAAGTCTGAGCGTAAAGATAGCAGAAAAATGGGGCATATGACTGTACTAACGAATGATGTAAACCAAACTGAACAAGATATGTACGCTAAATTTGAGGGGAGTAATTAAAGCATGACATTATTATATGAAGGAAAAGCGAAGCGCATTTTCTCAACAAATCAAGAAAATGAATTAAGAGTTGAATATAAAGATGAAGTTACTGCTGGAAACGGGGCTAAGAAAGACACGATGGCAGGTAAGGGGCGATTAAATAATCAAATTACTTCTATTATATTTAAATATTTACAAGAAAATGGAATAGAAAGTCACTTTATTAAGCAATTATCTGAAACAGAACAATTAGTTAAGCCTGTGAAAATAATTCCATTAGAAGTAGTTGTCCGTAATATTGCTAGTGGATCTATTACAAAGCGTTTAGGTTTTGAAAATGGTGAAGTTTTTAGAGAACCACTTGTGGAATTTTTCTATAAAAATGATGCGTTAAATGATCCATTGATAACGGATGACCATGTTAAATTGCTCAATATAGCATCAGATGAAGATATTGAAATACTAAAATCCAAAGCATTAAAGATTAATATTGTGTTGAAACAATTAATGGATGCTATGAATTTAAAATTAGTAGATTTTAAAATCGAATTTGGAAAGACTGAGACTGGTCAAATTTTGTTAGCGGATGAAATATCTCCAGATACATGTCGAATTTGGGATAAAGCTACCAATGCAAACTTTGATAAAGATGTATATAGAAATAACACTGGATCACTGATTGAAACATATCAAATATTTTTAAACAAATTGGAGGATTTAAAATAATGAAAACAATTGAACTACATATCACATTACAACCACAAGTATTAGATACGCAAGGACAAACGCTTACTCGAGCTGTACATGACTTAGGTTATGCACAAGTGAATGATATTCGTGTAGGAAAAGTATTATATATGACAGTGGATGAGGTTAGTGATGAAAAGGTACACAACATTATTACAACTCTAAGTGAAAAATTGTTTGCAAATACAGTGATTGAAGAATATAGCTATAAAGTTTTAGAAGATGAAAAGGAGAATGCATAAAATGAAATTTGCGGTTCTTGTTTTTCCAGGTTCGAATTGTGATAGAGACATGTTTAATGCTGCTATTAAAAGTGGTGTTGAAGCGGAATATGTAGATTATAGAGAAACATCACTAAGTGGATTTGATGGCGTACTTATTCCTGGTGGATTTTCATTCGGGGATTACTTAAGATCTGGGGCAATGGCTAGTGTAGCGCCGATTATTTCTGAAGTTAAACGTCTTGCAGCTGAAGGTAAGCCAGTATTAGGTGTTTGTAATGGGTTTCAAATTTTAACTGAAATAGGCTTATTACCTGGTGCATTATTGCATAACGATTCACATTTATTTATTAGTAGAAATGAAGAGTTAGAAATAGTGAATAATCAAACGGCATTTACAAATCTTTATGAACAAGGTGAAAAAGTTATATATCCTGTAGCTCACGGTGAAGGCCATTATTATTGTACTGATGAAATATATCAACAATTAAAAGCTAACAATCAAATTATTCTGAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGTATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGATGGTAAAAAGTTGGAGGGAACAACATGTCTAAATTTATCGAACCAAGCGTTGAAGAAATTAAACTTGAAAAAGTATATCAAGATATGGGATTAAGTGATCAAGAATATGAAAAAGTTTGCGATATTTTAGGCAGACAACCTAACTTTACAGAAACAGGTATCTTTTCTGTTATGTGGAGTGAACATTGCTCTTATAAACATTCTAAACCGTTTTTAAAGCAATTTCCTACGTCAGGTGAGCATGTGCTTATGGGGCCAGGTGAAGGTGCAGGGGTAGTCGATATAGGTGATAATCAAGCCGTAGTATTTAAAGTAGAGTCTCACAATCATCCATCAGCAATTGAACCATATCAAGGGGCTGCTACAGGCGTTGGTGGAATCATTCGTGACATTGTCTCTATTGGAGCTAGACCTATTAATTTGTTAAACAGTCTTAGATTTGGAGAATTAGATAATAAACAAAACCAAAGATTACTTAAAGGGGTTGTAAAGGGTATCGGAGGTTATGGTAACTGCATTGGTATTCCAACAACTGCCGGTGAAATCGAATTTGATGAACGTTATGATGGCAATCCACTTGTTAATGCAATGTGTGTTGGTGTTATCAATCACGACATGATTCAAAAAGGCACAGCAAAAGGTGTAGGTAATTCGGTCATTTATGTTGGTTTGAAAACTGGTCGAGATGGTATTCATGGTGCTACTTTTGCATCTGAAGAATTGACGGAAGAAAGCGAAAGTAAACGACCTTCTGTACAAATCGGTGATCCATTTGTAGGTAAAAAATTAATGGAAGCAACACTTGAAGCAATTACATTTGATGAATTAGTTGGTATTCAAGATATGGGTGCTGCTGGTTTAACATCTTCATCATCTGAAATGGCGGCAAAAGGTGGTAGTGGTTTACATTTGAGATTAGAACAAGTGCCAACACGTGAGCCAGGTATTTCTCCTTATGAAATGATGCTTTCAGAAACTCAAGAACGTATGTTACTAGTTGTTGAAAAAGGTACTGAACAAAAATTCTTAGATTTATTTGATAAGCACGAATTAGATAGTGCTGTTATAGGTGAAGTTACAGATACAAATCGTTTTGTTTTAACATATGATGACGAAGTTTATGCTGACATTCCAGTTGAACCACTAGCTGATGAAGCACCTGTATATATTTTAGAAGGAGAAGAAAAAAATTATAATACTTCTAAAAATGATTATACACACATCGATGTTAAAGATACTTTCTTTAAATTACTTAAGCATCCGACTATAGCATCTAAACACTATTTATATGATCAATACGACCAACAAGTTGGTGCCAATACGATAATTAAGCCTGGACTTCAAGCATCGGTAGTACGTGTGGAAGGCACAAATAAGGCAATTGCTTCAACAATTGATGGTGAAGCGCGTTATGTATATAACAATCCATATGAAGGTGGAAAGATGGTAGTAGCTGAAGCTTATCGAAATTTAATTGCCGTGGGTGCAACACCATTAGCAATGACAGATTGTTTAAATTATGGTTCTCCTGAAAAGAAAGAAATCTATCAACAGTTGATAGATTCAACGAAAGGTATGGCAGAAGCATGTGACATTCTTAAGACACCAGTAGTTTCTGGTAATGTATCTTTATATAACGAAACGAAAGGTACTTCTATTTTCCCAACACCAGTTGTTGGAATGGTAGGTTTGATTGAAAATGTAAATTATTTAAATGATTTTGAACCTCAAGTTGGAGATAAATTATATTTAATCGGTGATACTAAGGACGACTTTGGTGGTAGTCAACTTGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP022717|1027969:1036442|1028438_1029563_+|AXJ22717.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGCKVAVLDPSEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKFLNIKKEVSLTVTRGNNNQITFFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKIAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >CP022717|1027969:1036442|1033367_1034852_+|AXJ22722.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >CP022717|1027969:1036442|1027969_1028452_+|AXJ22716.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARKRGIDIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNSSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >CP022717|1027969:1036442|1031199_1033389_+|AXJ22721.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKNYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGVLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >CP022717|1027969:1036442|1030535_1031207_+|AXJ22720.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >CP022717|1027969:1036442|1035875_1036442_+|AXJ22724.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKKFDSKAAYEQHLVTLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >CP022717|1027969:1036442|1034844_1035873_+|AXJ22723.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVEEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIELASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDVSRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >CP022717|1027969:1036442|1030270_1030534_+|AXJ22719.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLEDEKENA >CP022717|1027969:1036442|1029566_1030271_+|AXJ22718.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIASDEDIEILKSKALKINIVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1297916 : 1329360
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP022717|1297916:1329360|DBSCAN-SWA ATCAAAAAATATCACGTATATATTTCTCGAAATTTTCTTTTGCAGTATTATTCATTTTCTCAGTGACATGACTATAAATGTTGCTTGTTATGAATTCACTTTTATGACCTAATCGCTCCTGAATTACTTTCATAGGCACATTACTTTCTAGTAACAATGTTGCATGCGTATGTCTTAATTTATGTATACTTAGTTCATTGCCCTTTCCTAATATTTTACCTGTTACATATTTCATTGTATTGTGGGTGGTAGAACGTGGAAGTGGGTCTCCAAATTCATTACAAAACATAAAATCATAATCAGTATAATATAATTCACTATTTGCTATTTTGTTTGCATTTTGAAGTGTTCTCAACTTGAATAGTTCCTTTGCTAATTTGTCACTTATAAATATGATTCTATTTTCCTTATTTTTGGTAGTGCCAAATTTTTTTCTTTTTTGATCATACGACTTTGTAATTGATAATGTTTTAAGCTTTTTGTCATAATCATTCCAATTGAGTGCGTTTGCCTCACCGATTCGTATACCTGTTTCTATAAGTGTTCTAAATAAGAAATATTGATAAATATCCCGCTTTTTAACCATTTCTAAAAAAAGATTAATTTTATCGCTAGGTAAATATTTAGCTTTAACCTTTTCTTTTAAATTTTTATGTTGTAATGAAATACCATCACATGGATTAAAATAAATGATTCTATCATATTTAGCACGTTCCATTGCACGTTTCATCAAATGATGTGTTTTTGAGAGCGTTGATTTACTGTAGCCACGTTGAATTAAAGTGTTTATGAATTTTTGGTGCATCGATGGTGTAATATTTTTAATGTTTATATTAGGGTCATAGATGTCTAATAATCGTTTTTTTGAATATAATTCAATATTATAGGTGCTATCGTTAACCTTATCTTTTCGCCAAGTCTCTAAGTAATAGTCGAGCCATTTTTCAAGTGTATAATTCATGTTTTCCTTATAACCATTTTTAATATTTAACTCAACTTCTAAAGCTGCTTTTTTTGCTTCCGCTTTTGTTCTAAACCCAGATTTACTTATAATTTTTTTGTTCCCAATGAATCTTTATATTGAACTTTATACCGCCATTTATTGCCTCTTTTTTCAAATGATGCCATATTGGTTACCTCCCTAAAATAAATGAAAGGGCAGGAATTCTGCCCAATTAAATTATTTGTCTAAGTGGTCGATTGCGTATTGTGCTTCTGAAGGTGTAAATCGTCCTCCGTATTCTGAAATTAATTGATCATAAATTTCTCTAGTAGACATATTCAAACTTTTGGCATATGTTTTAGCACTTTCTAATGCGTTTTTATTATAGTCAGCTTTTAAATGATCTATTGCGTATTGCGCATCATCTTTAGAAAATTTGTTTCCGTATTCTGATGTTAATTGATGATATATGTCTTTTTTTGATGAATGTAAGTATTCTGAATAAAACTCAGCTTGTTTTAAAGCTGCTTTTTGGTCACGTGTTATACTGTCATCTATGCTAGAACTAAAGCTTGTAGTTGAACTATCAGATGTTCCTTTTGTAATCGTGTCAAACCATTCTTGATAATTACCATTTGCTTGTTCTTTTGCTTTTTCGTGATTCTCTTCATCTTTATCATTGGTACTGTAAGATTTATCGCTTTCACTACTTGAATCTAAATTCGCTACATAAGGTTTAATCATCTGAACTTGTCCAATATAAGTTATACTAGCTAAAGCAATAACCGCTATAACTACAGTAATAATTGTCCTAACTAAAGACGGCCATTTGCTGAATTTCCACATTAAAAATAAACCTAAAGGAAATAGGAATAAAAGTGATAAAACAATACACCACTCTTGTTTGTACCATGATGTTGATTCTTGTTGCATTTAAACGCCTCCTAAATAATTTCTTGATGAATACTTAACACATCGGTTTTGAACATATTGAGAAAATGTAAATCTGAGTACTTAACTTTATAGAAGTATATTGTTAGTAAGATGTCTGTTACAGGCACTTTAAAATAAGCGCTTAACTGAGGTATGGTTTTGCAGTCATGTAGATATATCGCTTGTTTAATTTGATTTAAGGGGATTAATAATTCAAAATCATGACAATGACAGTGATATAAAGACATGGGTTCTTTAATTTCACTCGTTGATGTAGATGATGATAAATTCTTATTAATATATAAATCATTACCTATAATCAGACATTCTAATTTATCCGGCATCTCAATATATTTAATCTTTATATCATCCATCAACTCCTTGTATTGATGCATAATTTCACTCCTTTATTAAATTTTGATTTATATTTCGGTTGTTATCATCTCCAATTAACAGAAGTTTAATTTAATTGGTTCTTCATCTTTTATGGTGGGAAGGTAAAACTTCCTGCTTTTTTTAATACACAAAAAGCGCAATTGCCTCTATAATTTAAAGTGACCAAACCCAAACTAAAGGAGACAAGTGCGCCTATGTGTAATGATACCTTAGAATTACTAAGAATAAAAGATGAAAATATAAATTATATAAACCAAGAAATTGACGTCATTATCAAAGGAAAAAAAGCAACAGTGGTTAATGCTGTACTAACGTATAAGCCTTCGGCCTGTTATTGTTGTGGTGTTAAAAATGAAGGACAAATTCATAAACATGGTAAGCGTGTTTCTCGTATTACTTTACTTAAAACTCAAGGGTATAACACATACCTCAACTTAGCTAAACAACGTTTTAAATGCTTAGAATGCAATGGCACTTTTACTGCTAAAACATCAATTGTTGATGAGTCGTGTTTTATCTCAAGATGTGTTACTCAAAAAGTTATAGAAGAAGCTACTAAAGTTAAAACAGAGATTGATACTGCAGAAGACAACTGTATCTCTCCATCTACTGTAAGTCGTATTAGAACTAAAGCGGCTAATTCATTGCGAATTAAACCGTTTAATTGTTTGCCAGAACACATCGCTATGGATGAATTTAAAAGCGTTAAAAATGTAACTGGGTCAATGAGTTTCATTTTTATAGATAATGATACTCATGATGTTATAGATATTTTAGAAAATAGAACTACAAGATTCTTGCGTGCCTATTTCGAGCGATTCGATTTAAAAAATCGACAACAAGTTAAGACGGTTACTATTGACATGTATGAACCCTATGTCCGATTATTTCGCGACCTATTTCCTAATGCGGCTATTATTTTTGACAGATTCCATATCGTTCAACATTTAAATAGAGAACTTAATAAGTATCGTGTACAAGTTATGAATGAATACCGTAATAAAAAAGGACCTAATTATACAATTTTTAAGAATAACTGGAAAGTTCTATTGATGGATACTAGTAAAACCATATTTAGTAAATACAGATGGAATAAATCTTTTAAGGCTTATAAACGCTCATCTGACATTGTAGAATTCATGCTTTCAAAAGACGATATACTACGACACTCCTACGAACTTGTCCAAGGATTACGAAAAGACCTAAGGTTATGTAATTGGCCTAAATTTATTAATCGTTTAAATTCAGTTAGTAAAAAGTCTGTGAGTAAGGGTGTATGGAAAGTGGTTAAATATTATAGAAAACATCAAAGGATGTTAAGAAATACAATTTATTACCCAGCATTTAATAATGGTGCTATAGAAGGAATTAATAATAAGATAAAATTAATCAAGCGAATTTCTTTTGGTTACAGAAATTTCAACAACTTTAAAGCACGTATAATGATGATTTTCAGCTTGTACAAAGGAGAAAAAAAGAAGACAACCAAGCCCAATAATGGACTGGCCGCCTAATAATAAAAACTCTAAAAGTTGTAATTTAAAATAGTTCTTTAAATTATATACCCACCACATTTGGTGGAGAACCGTTTAATTATGCATAATTTGATATATAAAAAAAGAAAGACGTAGTAATACTAATACAATGATTAGTAAAATGAGCGTCTTTCTTTATTTATCGCTATTTGAATTTGTATTTCTTTTAATTTTAATATATTCGATGAAGTTCACGATTTCTTTCATCTCTTCATCTGTGACATCATCTTTTATATGTGCTGCGATGATTTGTTCATTTTGATTTAAATGACGTTCCTCATCAGTAGGACGTTTAGGTGATACATCATAACCCAACAGCCAAGCTTCGCTAACATCTAGAACTTTAGATAAAACATAAAGTTTCTTTTGTCCAGGGCTAGTTTTACCATTTACATATTGGCTTAAATCGGTTTTGGTTATTTTAGCACCGTTATCACTTAGTAATTTAGATTTATTTATAATGTCTATTTGTTTCATTTGTTTATCTAACATTGCTTTCTTCAATCTAGAACTAAATGATTCTTTCATTTTAAGAAACCTCCAATGCAACTTATAGATAAATTATAGACAATTTTGAACAAAAGTTCAATAACTACATTCAAAAAATATGAACAAAAGTATTGCGTATTAATTTTTAATGTGATAAATTAAGTTCATAAAGTTCAAAAAAATTGAACTAAAAAGGAGGGATATTTATGCGTTTTGATTATTCAAGTTTAAATGGGAAAATAGTTGAGAAATTTGGTAGCAGATATAGCTTTGCTCATGCAATGCAATTGTCGGAAAGGAGTATATCGTTAAAACTTAATAATAAAGTTGGTTGGAAAGACAGAGAAATATTTAAAGCTGTAAACTTGTTAGAAATTAAAGAGTCAGAGATTCCAATTTATTTTTTTAACACAGAAGTTCAATAGAATTGAATTATAAAGGAGTGAACAACATGTTAAATATTCAACTGAATGAAGCAATAATTAACGAATTAGTACAAAAGAAAGTTGATGAAATTTTAAGTACCTACAAGAGGCAAGTTGCAACCGTTGATATTAAAGATTTAGTGGAGATTACAGGTTTAAGTAAAGCAACGCTAATACAAAAGATAGTCTATGAACCTGAAATTGTAGCAGTGACAAGACGAGTAGGCACAAGAGTGTTATACCTTTATCCGCAAGTATTAGATGCTTATCAAACGCTAA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>CP022717|1297916:1329360|1304965_1305232_+|AXJ22975.1|DBSCAN-SWA MKNDANEKMFVLYQQLFDEFKKTNENCLLEIEQTSTSQIIINFLHYHDSYKTNNKLLQILEVYPESHERMKNYIISVMRGQILVKKGV >CP022717|1297916:1329360|1300381_1301701_+|AXJ22964.1|DBSCAN-SWA MCNDTLELLRIKDENINYINQEIDVIIKGKKATVVNAVLTYKPSACYCCGVKNEGQIHKHGKRVSRITLLKTQGYNTYLNLAKQRFKCLECNGTFTAKTSIVDESCFISRCVTQKVIEEATKVKTEIDTAEDNCISPSTVSRIRTKAANSLRIKPFNCLPEHIAMDEFKSVKNVTGSMSFIFIDNDTHDVIDILENRTTRFLRAYFERFDLKNRQQVKTVTIDMYEPYVRLFRDLFPNAAIIFDRFHIVQHLNRELNKYRVQVMNEYRNKKGPNYTIFKNNWKVLLMDTSKTIFSKYRWNKSFKAYKRSSDIVEFMLSKDDILRHSYELVQGLRKDLRLCNWPKFINRLNSVSKKSVSKGVWKVVKYYRKHQRMLRNTIYYPAFNNGAIEGINNKIKLIKRISFGYRNFNNFKARIMMIFSLYKGEKKKTTKPNNGLAA >CP022717|1297916:1329360|1306483_1306795_+|AXJ22977.1|DBSCAN-SWA MNRSKRYTEEILNDTRWTTREGDVLEPITMEEEHIQNTLNLLYKNRDQLWLGCRNFKLIDVYENGEDFFQKVIRKSTIWNSLINALDKPATKFNFEYEGGHID >CP022717|1297916:1329360|1321207_1322377_+|AXJ22994.1|capsid|DBSCAN-SWA 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MQFSYSRVDLFKRCPYHFKLRYIDKLTELPNYEANSPLIVGHALHTGIEKGKDAMLNEYFNAFPIVTDDVINEAIKLEHNLEKAETWLAKIDTNINFYNDYEFIHEFQINKPEFIGFVDLIVKRKATNDIAIIDFKYSNAVDKYKESPQLQIYKHYLEEEGYNIISMGYLFLPKSNIRQKKDESIIQFRNRLHQTMKKLKVTFIKIEPQEMDIIYFLNECREISNAIRNKTFDWLENPKDECFACNPRFAPEYLEQLRNEEGELIMTLPKNIRREKKIDERPDFWIYGDSYVGKSTFVDQFDDLLFLNTDGNTDNTTSPVVYIKDEVTKEGRITKRKFAWEQFLEIISELETDTESGFKAIAIDLFEDLREHCRIYVFDKNGWEHESDGGYGKGWAMVKTEFNNAIKRLKNLGYQIIYISKEVKSETTLKGGAIRTNFIPNIDDKTANFTTGTVDLTVRAFINGDGERLLQLSKQRNVFGGGRFNFLNDTCELNKNEFVQELVAAQKASHAKVTSKTKKQVEPISTEIIEEKPKTKRGRKKKESVEVEEAVEQVPPGEEETEEVIEEPKRKTRKRKSSTKEVVEEAKEENETEDEPKRTRRSRRKNAE >CP022717|1297916:1329360|1323006_1323345_+|AXJ22997.1|DBSCAN-SWA MSVKSRIFEALEPLNINIAHGYSDDMTLPKIITNVISHRAIRLSDRKHYRHVKYQISYFDKVPRDVEDDEILISIMNALENANLVTNEWTEIVEPDEDTEETIFHYILEVCI >CP022717|1297916:1329360|1297916_1298876_-|AXJ22961.1|DBSCAN-SWA MNYTLEKWLDYYLETWRKDKVNDSTYNIELYSKKRLLDIYDPNINIKNITPSMHQKFINTLIQRGYSKSTLSKTHHLMKRAMERAKYDRIIYFNPCDGISLQHKNLKEKVKAKYLPSDKINLFLEMVKKRDIYQYFLFRTLIETGIRIGEANALNWNDYDKKLKTLSITKSYDQKRKKFGTTKNKENRIIFISDKLAKELFKLRTLQNANKIANSELYYTDYDFMFCNEFGDPLPRSTTHNTMKYVTGKILGKGNELSIHKLRHTHATLLLESNVPMKVIQERLGHKSEFITSNIYSHVTEKMNNTAKENFEKYIRDIF >CP022717|1297916:1329360|1324498_1324849_+|AXJ23000.1|DBSCAN-SWA MSIFKTKLKTFESSITGTKTSYNVNTAFWLYLEEDFGIKQGDLSNLYETENNLTTAKVVVCILKANKFETTLEEVLENTNEIELAQFIIDFQTALYDVDDNQTKEAKNKSEGKSDQ >CP022717|1297916:1329360|1308926_1309133_+|AXJ22980.1|DBSCAN-SWA MRRELNTTEQHFATTRSEAQRIIEEARDEEKSNLTSQTIDCKNNKYGEFYVVTLKFTFNTPKDIMAYE |
42 | Bacillus_phage(29.63%) | portal,protease,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
1613848 : 1622160
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP022717|1613848:1622160|DBSCAN-SWA ATTAATTACAACATTCTCGATTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCAATATCATGAGTAACTAAGATAATAGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTTGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCTAGCAATCATTACACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCATTATCTTTGCTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAATCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATTGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTTTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGCATTCAACTATACAACTCCTAGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAATTAGACAAAATAAAGAGATATGCCCTCTTCAAGTTTTATTTATCGCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATTTTATTGTTGCATAACCTTATTTTTTAAATCTGGGTCGAATTGCTGTTGTTTTAACATTTCAATTTCAAGTTTATATGGCGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGTGTTTCTAAGATTTTCGGAATATCTTTAAAACTATTATGATGCACAATGTAATTTAATGCATCAAAACCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCGCCACGGTCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTAATTCTGTCGACTCCAATGATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAATCCTCTTTCACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAACATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATACGTGCTAACTCTTCAAACGAGCGACCAATCTCTGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCTGCTCCAACATGCGCACCTGGATGTAATACAATATCTTTAGCGCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGAACAACAATATTAGATAAGCCATATTTTTCCATCACTTCATGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTGTTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATAAATGTTGTTTCACCATATTCATGCGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAATTGTTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGTTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAAAACAAAACCGCGATCTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTAATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGGCCAGTTCGGCCGACTCTATGTGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCTATAACGTATTGGAATTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGTGGCGTTAAACCACCATGAATCATACCAACTTTAATACCAGCTTCATTTAGTGAACGTGCTAAATCATTTGCATTATCTCTACTATTACAGAAAATAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTCTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAAAAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTTAAAAATGGTTGTAACTGTTGTGGAATTGTAGCACTAAACACCGCAATATTTGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCAATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGATCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTTTAGCTAAGTCATTAATTCTAGTAGGGGTACCTATAATCAATTGTGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCTTTCTCTATATCTGTACCACCAATAAAAACTTTAACTGAAACACCAGCTTTAAATTGGCTTAAATGGTTCGCTGCATCGTATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACTACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCAATTAACTGCATTAATGGTAATAAAAATGCATGAGATTTCCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTCTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTATATGTTCATCTTTACTATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCGAAATTTCAAAATTTAGAAATCCCGAGATTTTAGTTTAAATATATTGAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTATATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAACGTTTTTAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAGTTCACACCATGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCGCCTTGTTGAACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCAATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACTCACCAACAAAACGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAATATCAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGGGATGTTTGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGATGGTATTGTTTAATTAATTGCTCAGCCCTTGGCTTTTGACATGCATCTATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGCCCTCTTCCTTCACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGTGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATGGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACATCTTGTTGATTATTTATTATTGAAATGTTCTTCAATCCCATCGCCTTCGCCAACATCATATTGACACCATGAGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATCGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATAATTAAACCATAACCATTAGCTTTTAATGATGTTACACCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAACCTTTTTCGATTGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTTCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTACTAAATGGCACATGATGATCTAACAATGTCATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCGTCATTAATTTGAGCTAAACGTTGATGATGTTGTTCAGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTGTTCAGCAATTTTGGTCCGAATTTCAATTCATCAGATGATAGCTCTATTAATTGCATAGAATATTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAATTTTCAGTTTGGATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCAATAAGTGGTCCGCCCATACCACAAATTGTGATATTATCGATTACGTCCTCAGGATGAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTCTTTCTACTAATTGATTTGCAGCTACATTTTTCACAGCAGCTTGAAAAGGGCCTTGAATAACTTCTCCTGCAATACCGTAATCGCATAAATGGTTTTGAATTGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTACCTTGTTTTAAAAATCGACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGTCTTTCAAACGTTTACTACGACTTGGATGTCTTAATTTTCTAAGTGCTTTTGCTTCGATTTGTCGAATACGTTCACGTGTAACACCGAAAACTTTACCAACTTCTTCAAGTGTTCTTGTTCTGCCGTCATCAAGACCAAATCTTAATCGTAATACATTTTCTTCTCTATCAGTTAATGTATCAAGCACATCTTCTAATTGCTCTTTTAATAATTCATAAGCAGCATGATCTGAAGGACTTTGTGCTTCCTGATCCTCAATAAAGTCTCCTAAATGACTATCATCTTCTTCACCAATTGGTGTTTCTAATGAAACAGGTTCTTGCGCAATTTTTAAAATTTCACGAACTTTTTCTGCTGGTAAATCCATTTCTTCACCAATTTCTTCTGGTGCTGGATCTCGACCTAAGTCCTGTAATAATTGACGTTGAACACGAATTAATTTATTAATTGTTTCTACCATATGCACAGGGATACGAATCGTACGTGCTTGGTCAGCAATTGCACGAGTGATTGCTTGTCTAATCCACCATGTTGCATATGTTGAAAACTTAAATCCTTTGTTAAAGTCAAATTTTTCAACAGCTTTAATAAGACCCATATTACCTTCTTGGATTAAATCAAGGAATAACATACCACGACCTACGTATCTTTTAGCAATACTTACAACTAAACGTAAGTTCGCTTCTGCAAGTCTTGATTTTGCTACTTCATCACCTTGTTCAATACGTTTGGCTAATTCGATTTCTTCTTGTGCACTTAATAAGTTAACACGCCCAATTTCTTTAAGATACATACGAACTGGGTCATTTATTTTAACACCTGGAGGGGCACTAAGATCACTTGGATTCAGTTTCTCGTCAGTATCTGAACTATCTTTTTCATTAACTAGTGAAATATCATTATCATTTAATTGATCAAAGAAATCATCCATTTGATCAGAGTCGATATCGAAATTCTGAAGTTTTTCAGCAATTTCTTCATGACTTAAATGACCCTCTTTTTTACCTTTTTCAATTAATTGCTTCTTAACATCTTCTAATGTTAATGTCGGATCAATTGTTTGTTTTTTAATTTTAACTGTGTTATCAGACATGAAACGGCCTCCCGATTTTAAATATGAACATTCGAAATTTATTCAATATTGCTATTTTAAACTAAATTCTTAATTAATTCATCCATATTTTTAATTTTATTTTACAAATAGGAACTAATCCCAATATTTATTTTTCAATAGTGTTGTTTAAATGCGGTAACTTTCATTTACCCTTATACATTTTGACATAATCATTATTCGTATTATTCTTTAAAATCACATGCTACATACGTTCCTTATTTTTAGCAACAATTTGCTGTAAATAGTATTTCTGTAATTCTACATCGCCAATCCTTGTTGCTTCCCTTAATTTATGATTCAATGACTCAATTGTTTCTTGTCCGTTTTCATTAATAACATTGACATAATCATCAATTTCATTTTCATATGGTTCATCATTCAAACTATATTGTTCTAAGCTAATTAGTGTTTCTCTCAACTCATTTGAATTAACATACTGCACAGCATCACTGATATTATATTGATCATTTTCCGCATAAAAATCATGTAAGACTTCGAATACATATTTAAAATGCTGATTTGTGAAGTTATCCTTATCAACACTTTCATAATAATTTAAAAATGTATCTTTATCTCTCATTAAATGTTTTAAAAATGCTCGCTCCGCTTTTTCTTGACGGCTCAAATTGTCAAATTGTGCCATACCAATTGGCTCAGGTTCAATGTAACCGCCATACTCATCTTCTGGATAATAATTGGCTGGTGCTTGATTGAATTGTATTTCGTTAGCTAACTGCTCAGGACTAACATTGAAAAATGGCGCAACATCATTTATAGCCTTTTGTTGTAGAATTGATGACTTCATAAGTGAAATGTCATGACTCAGTTCTTTCAAATAACGTTCATATGAAAGGTCATTATGTGCAATTTCATCTTTTAATATACTCACTTTATAATGTGCAAATGACTTTTTATCATTTTTTACAAAAGTAGTAAATGCGTCGTTGCCATACTTACCAATGTATTCATCAGGATCCATGCCAGATGGCAATTGTATAACAAATACATTTAGCCCTTGCTGTAACAAATGTTGACCTGTTTTAAGTGTTGCTTCACTACCCGCAAAATCCCCATCAAACATTAATGTTATATTTGATGTTAACTTTCGTATAAAGGTAATATGTTCATCTGACAACTGTGTACCCATTGTTGCAACAACATTTTTCAAGCCAGCAGTATCAGATTTTATAACATCCATAAAACCTTCTAGTAATACAATTTCATCTAATTTTCTAATTGATTTACGTGCTTTATCTAAGTTATATAACAACTTTCTTTTTTGAAAGATAGGTGTTTCAGGACTATTTAGGTATTTTGGTTCTTGACTGGTATATGTTCGACCTGAATATCCAACAATTCTTCCTTGCGCATTTTTCAAAGGAAACATAATACGATTTCGAAATCTATCGTAATAACTGAAGTTTTCTTCGTTACGTGATAATAATCCGGCTTCATATGCTAATTCAATATCGTAACCCTTTTTTTGAAGAAAATCATGACAAAAATGTGAGCTATCGGGTGCAAAGCCAATGCCTCGCTCTTTAATAAGCGCATCTGTAAAACCACGTTCTTGTAAGTATGTTAATGCTTGTTCGCCTTCGACTGTCTTTGTTAAAGCGTAATAATAAAATTCTTGTATTAACTCATGCATTTCAATCATTTGTAAATCATCAGAAGCAATTTGAACATTTGAGTTAGATTGTGTTGTCTCAATATCTACAGCAACATTAACTCTATCACCTAATTCTTTAACCGCTTCAACAAATGATATGTCTTTAATTTCTTGAGTAAATTGAAAAACATTGCCACCTTTTTTACAACCAAAACAATGACAGATTTGTTTATCTTCAGAAACTGTAAATGAAGGTGTCTTTTCATCATGAAAAGGACACAAACCTATATAATTGCGTCCTCTCTTTTCTAATTTTACATATTCACTTACCAAGTCTAAAATGTCGGTTTTATCTTTTATTTCATTAATGATCGATTGATCTATTCGCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP022717|1613848:1622160|1619030_1620137_-|AXJ23253.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD >CP022717|1613848:1622160|1615659_1617006_-|AXJ23250.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >CP022717|1613848:1622160|1617119_1618220_-|AXJ23251.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFSTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPHGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDACQKPRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI >CP022717|1613848:1622160|1613848_1614634_-|AXJ23248.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >CP022717|1613848:1622160|1618222_1618900_-|AXJ23252.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCDYGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVERIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSMQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL >CP022717|1613848:1622160|1614759_1615650_-|AXJ23249.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHNSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPDLKNKVMQQ >CP022717|1613848:1622160|1620360_1622160_-|AXJ23254.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIETTQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTSQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTTFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKAINDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYSLNDEPYENEIDDYVNVINENGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM |
7 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
1691632 : 1700675
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP022717|1691632:1700675|DBSCAN-SWA TTTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATGCCGCCTAATTTTTCGACTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTTAAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAAGCCAATCCCCATTGAATAAGCTACAGGACAGCCAATGATAAAGCCACGCGCTTCAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATTGATACACTTTGCTGGAATCAATCGATCTTTTATCAGGTTGTTGATTGATTCGAATTAAACCATCTTCTTGTGTTACAAAATTTAAGTCTAAGAAAACTTTTAACATGAATTTAAGTGTATCTGGTTTCACACTTAAATGTTGACACAATAACATACCCTCTTTCTGGATATTTGTTTCTTGTTTAGTTATTAATGCTTTATAACACTTTTTAAAAACATCCATATTAGGTATACCATCGAAGTAAATCGAATGATTATGTTGCAAAACTATATAAAGTTGAGAAAATTGCAGTTGTTGCAGGGAATTAGACAAATCTTCCATCGACGTAGGTAAATCTCTTAATACTACTTTATCAGTTTGTTGTTTAATTTCTTCACCATAATAATATTCATTCGCATTTACTTTATCACTTTTAGGATGAATAAGCACGACAATATTTTCATCATTTTCTGTAAAAGGTAAACTTTTTCGCTTACTTCTATAATCTAATATTTGCTGTTCGTTCATCGCAATATCTTGAATAATTAATTGCGGTGATTGATTACCATTCCATTCGTTGATTTGAACAGAACCTAATATATTAATTGGTTGTTCATCTTGTAACTCAGGTTCTAAGTGTCCATTTTGCCAAAATAGTGCGGCGATATTACTTTCACCAAGTGTCAATTTTAGATGATTTTTTTGTTGACCTATCGCCTTAACTGAAGAAACTGATAAATCATCCATTTCAAAAATAGGTCTAGAAAAATCTGTTCCGAAGGGTCTTAAACGATTCATATCACGAATATTTTTAATCGTTATATCATTTTCTGTTAATAATACATCTACTGGCTTTACGGGATCTAACGAAGTTGTTTCAGATAATTCTTTCATCCATTTATTTAAACCTTCAGCTAACGATTCTATATTTTCAATATCCATCGTCATACCTGCAGCCATATGATGGCCGCCAAATTTAGCGATTAACTCTTGGTGTGCTGATAGTATTTCAAACATCGACACTTGATCAATTGATCTGGCGGAACCTTTTGCATGATTTTGCTCCCTATCAATATTTAAAATTAATGTTGGCAAAGCAAACGTTTCGACAATTTTCGAAGCAACAATACCTAAGACACCTTCATGCCAATTTTCTTTTGCTAAAAGTAAAAATAAATCTCCATTTTTAACTTTCATTTCTGCCATTGCCATTGCTTCTTCTGTGATAGTTGCTACAATATCTTTTCTTTCACGGTTAAAATGTTCAACTTGTTCTGCTAAAAATGCAGCTTCTTCTTCGTCGTCAGTCATCAACAATTCGCAAGCTAATGATGCGTCATCTAAACGACCTACAGCATTAAGTCTAGGTCCAATAATAAAACCAATTGTTTCTTCATCAATATTGTCATTGTATCCCGCTTCTTTTAGCAATGCTTTAACAGAGGTCGGACATTGATCATTTAAGACTTTTAATCCTTGTTTCACTAATGATCGATTTTCATCAGTTAAGGATACTAAATCCGCAATGGTACCTATCGCAACTAATGCTTTAAAATAATCAGGTACATTTTCAATCAATGCTTGTGCTAATTTGTACGCAACACCTGCACCACACAATTGTTGGAACGGATAATTAAACGATGGATGCATTGGATGTACGATTGCATATGCTTCTGGTAATGTACTACCAATTTCATGATGATCAGTTACAATGACATCAACTCCTAAATCTTGAACCATTTTAATTTCATTATGACCTTGTATGCCATTATCAACAGTTATGATTAATGTTATGCCTTCATCATGAGCATTTCTAAATGCTAGTTCGTTTGGTCCATATCCTTCGGTAAAGCGGTTAGGAATATGCCATCCTACTTGTGCACCTAAAAGTTGTAATGTTGTCACTAAAATTGTAGTTGAGGTAACACCGTCGGCATCGTAATCACCATAAACTAGGATTTTCTCACCATTCGCTATCGCTCTTTTAATTCTTTCTATAGTCTTAGTCATATCACTCAATTGCAATGCATCATGATTGATATCTGTATCTGAAATGATGGATTCAATTGCTTGTTCATCAATAATCGATTTACTTTCTAATATTTTTTTTACGATTGGCGTTAACTTTAATTTTGATGTTAATTCATCACTTATGTATTCAGCTGGTTTAGTTAATTTCCACTTATACTTCGGTTTAATCATATATATTTACGCCTCATTTCCAAAAGACATTATATCTAAAATTACATTAAATAAAAAGCACTTATCTAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTATATATATTTTGTTAAATTTAAACAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAACTCTTTATTGTTTCACATACCGCTTAATTCATTTTAAACTAAAATCTTTTCATCGTTCGATTTCTTTTCTTTATATACAACTAATTTGTGTTTCGGCGATTTTTTCAACTGACGTTTTTTCATCATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACGTTACGATTGTATCATTAATTGAATAACCGACAATAGTTAATACAGCGGCGATAAATGTTAAATCTACTTCAATTCTAAATAAACTGAAAATCGCTACTATAATGAATACATCATGTAATAATGCCAATACAGATGAAAGACCCATGCGCCATTCAAATCGTAATGATACATAGATGATGATACCTATCGATGCATAGATTAATGCAAGCATTGCATTTTTTGCTAATTCCTGTCCAATAATTGGTGATACAGTGTTAATTTGAGGTGTGTCACCGAATTTCGATTTAATATTATCACTCAATTTATTATCTTGAGCACGCGTTAAATCATCTTTAAATTGAACAGTTGCTACTTTATTATCTTTACCATTGATTTGAATTTGATCCGCTTTAAGTCCACTATCTTTTACAACTTGCTCAACCTTTTGTTGAGTAATTGCTTGTTTAGATTGGAAATCTACACGTGTACCACTTGAGAAATCAATTCCTAGGTTTAACTTGAAGATATAAAGAATAACTAAACCGACAACTACAATTAAAATACTTACTCCAATTAATGGCTTAGCTAATTTAACAAAATTCCATTTCTCGAATGAAGTTTTAAGATCATGAACATCTACACCTTCATTAATATCATGTCGTTTATTCTTTTTAACACCAAATAACATAAATTGATTTTTGAATATATTTGATGAAACAAGTAATGATAATAAGAATCTTGATAAGAACACGGCTGTAACAAAGATCATTAGAATACCTAATAATAACATTGTCGCGAAACCTTTAACTGAACTTTCACCGAAGAAGAATAATACTGCTGCGGCGATAACTGTTGTTAAGTTAGAATCAAAAATTGTTAAGAACGAACTTTTGTTTGCTTTAGTAAAGGCTTGCTTTATCGTTCTACCTATTCGAAGTTCATCCTTAATACGCTCATACATGATAATATTGGCATCTACAGCCATACCTACACCTAATACCAACGCCGCTAATCCTGGTAAAGTTAGAACCCCAGAAATGAAATTAAACGCTACTAACGTTAGATAGATATAAGTTGTCAATGCAATAATCGCTACTAAACCAGGTAAGCGGTAGAATCCAAGCATGAATAAATAAATTAATGCTACACCAATAAACGATGCAAACACAGTTTTATCTAATGCATCTTGACCAAATTGGGCACCTACTGAGTTTGAATAAATTTCTTTCAAGTCAACTGGTAAAGAACCTGCATTTAACAATTCGGCGATTTGTTTTGCTTTTTTAACGCCTTCTTGTCCTTTAAATCCACCAGAGATTTCTACGCTATCAGAATTGATTGGTTGATCAACACTTGCTGCAGAAATAAATTTAGGGTTTTTCTTTTGTGCTTCTTTTTTATAGCTGTCACCTTTTTTGAAATCTAACCAAACAACCATGACATTATCACGTTTCTTAGAGATTTCTTCCGTTACTTTTTTAAATTTGTTTTTGTCTTTTACTTTAAAAGTAACTGTAGGCTGGTTTGTTTCCTGTTTAAATTCTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGAACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCGGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAGGATCGACTTGATAAAGCACCTCAAATCCACCTTGCAAATCAAGTCCTAAATTGACATTCTTTATAACACTTTTATAAGTTGCAGCCATTCCGGCAAACAACAATACGACTAAAAGCAAGAACGCAATTATTCTACTACTTTTCTTCACATGAACACCTCATTATTTACGTATGTATTTAGAATACTTGAATACTATTTTATAACGCAAGTTAAATCTTTCTTACAAAATTTATTAGCCTTATACATATTAACATACTAGAGCAGGGAGTAAAAATAGTCATAGATATATTTAATTTAAATTTAACAATTATTATGTATCACAATTTCTTTTTTTGGAATAAAAATAAGCTATTCTACATACTACTTATAACTTAAAAAGGATGAAACGCTATTCGTTTCATCCTTTTTAATACCACTTCTTGTTATGAAGGGTCAACTTGTTTAATAGCAGGTTTTTCGAAAGTTAATTCAGTACCATGACCATTAACTGTAATAACAACAGTTGTTTCATCTACTGCTTTAACAGTACCTTTAATACCACCAATAGTTGTAATTCTTTGACCAGATTGAATGTTATTAATCAACTCACGATGCTGTTTCGCACGTTTTTGTTGTGGTCTGATCATCAAGAAATACATAACCGCAAAAATTACGACTATATAAATTAGTAATGAAAATTGCATTTTATACGCTCCTCTTGCTTAAAAGTTTTTTGGGTTCTCAACATTTAATCCATATTGCTCGAAGAATTCTTCTTTGAAATCTAAAAGACGATCTTCTCGAATGGCTTGTCTTATATCTTCCATTAATTTTAGCAGAAAATGTAAATTATGAATAGTAGTAAGACGAATACCAAAAGTTTCCTCTGCCTTGATTAAATGACGTATATACGCTCTTGAGTAGTTTTGACATGTATAACAGTCACAATTCTCATCTAACGGTCTTAAATCATCTGCAAATTTTGCATTTTTAATAACTAAACGACCTTGCGATGTCATACAAGTACCATTTCTGGCAATACGTGTCGGTAAGACACAATCAAACATATCCATGCCGCGAATACTACATTCGATTAACGCATCTGGAGATCCTACACCCATTAAATATCTTGGTTTATCTTTAGGCATAAACTGCTCTGTATGTTCAACCATTTTATACATAACCGGTTTAGGTTCACCAACTGACAAACCGCCGATTGCATAACCAGGAAAATCTAATTCTACTAAATCCTTTGCACTTTGTTCTCTTAAATCTTCATATTCGCCACCTTGTATAATGCCGAACAATGCTTGATCTTCAGGTCTTTGGTGTGCATCTAGACATCTTTTCGCCCAACGTGTTGTACGTTCAATAGATTTTTTTACATAATCATATTCAGCAGGCATCGGTGGACATTCATCAAATGCCATCATAATATCAGAACCTAAATCATTTTGAATTTGCATTGATTTCTCAGGACTCAAAAATAATTTAGACCCATTAGTATGATGTCTAAATTCCACGCCTTCTTCTGTAATTTTACGTAAATTACTTAAACTAAACACTTGGAAACCACCTGAATCTGTTAGAATCGGACCATCCCAATTCATGAATTTATGTAATCCCCCAGCGTGTTTGATAATATCATTTCCGGGTTGTAACCACAAATGATATGTGTTGCCCAAAATGATTTTTGCTTCAATTTGTCTTAACTCTTCTGGACTCATTGTTTTAACGGTTGCTTTAGTACCAACTGGCATAAACATAGGTGTTTCAAATGAACCGTGTGGTGTGTGCACGATACCTAAACGCGCACCTGATTGTTTACAAGTTTTAATGTGTTCGTATGTTACTGCAGGCATATTCAAAATCCTCACATTCTTTTTATATAATTAACATTGCATCGCCAAAACTAAAGAATCTATATTCTAAATTTACTGCCGTTTTATAAGCATTCAGAACATTTTCACGAGTACTAAACGCTGATACTAGCATAACTAATGTTGATTTTGGTAAATGAAAATTAGTAATCTGGCCATCAATTGCTTTAAAATCAAATCCTGGATAAATAAATATATTAGTCCAGCCACTCGTTTCAACAAATTTATCATAATCGCGTCGAATTGTTTCAAGTGTACGTGTTGAAGTTGTACCAACTGATATAATGCGATGTCCTTTGGACTTAGTATCATTTAATAAATCAGCTGTTTCTTGTGTCATTTGATAATATTCACTATGCATTTCGTGGTCATTCACATCGTCGACGCTCACCGGTCTAAACGTACCTAATCCAACATGTAATGTAACAAATGCGATATTAACACCTTTATTTTTAATTTCAGTTAATAACTCATCAGTAAAATGTAATCCTGCTGTTGGTGCTGCCGCTGAACCACTTTCTTTAGCGTAAACTGTTTGATAACGATCTGGATCATCTAAACGTTCTTTGATGTATGGTGGCAGTGGCATTTCCCCTAATTCATCTAATCTTTCTTGTAAAATACCATCATAATGTAAACGCATGATGCGTCCACCTTGATCCATTTCTTTTATGCATTCAGCTATAATTTTGCCATTACCAAAATTCAATTTATTACCAACTTTAATACGCTTAGCTGGTTTCAGTAAGACTTCCCAATCATTACCTTCAATTTGGGTTAACATTAACATTTCAACTTTTGCACCAGTTTCTTCTTTCAAACCAAAAAGTCTAGCTGGCATTACTCGCGTATCGTTAAGCACTAATGTATCACCAGGTCTAAAATACTCAATGATATCTTTGAAATGTAAATGTTTCATTTCACCAGTTTCTCTATCCATGACTAATAAACGACTATGATCACGATCTTTTAAAGGCGTTTGAGCAATTAATGATTCTGGTAAGTCATAGTCAAATTCTTCAATATTCACGTTATTCTCTCTCCTCATTCGACTTTGCAAAATGTTCATAAGCTAATGGTGTTGCTTTTCTGCCACGTGGCGTACGTTCTAAAAAGCCTTTCTGAATAAGAAATGGCTCATAAACGTCCTCAATTGTAATACGTTCTTCGCCAATTGTTACAGCAATCGTATCTAAACCAACAGGTCCACCATTATACTGCTTAATAATACAGTTCATCATTTTATGATCAATGTAATCTAGTCCGTGTTGATCAACTTGAAGTAAACCTAATGCGTGCTTTGTTGTTTCAATGTATATTTGTTCATCTTCATTCACTTGCTGGAAGTCTCTTACCCGTTTCAATAGTCGATTTGCTACTCTTGGAGTCCCTCTAGAACGTTTAGCAAGTTCAATGGCACTTTCTTCATCAATACCTGTGCCTAAAACCTCAGCTGTTCTAATAATGATTTCTTTTAAATCTGATTCATTATAATATTCTAATCTTAAGTGCACACCAAATCGATCCCTTAGTGGACCTGTTAAGCTACCAGCTCGCGTTGTTGCACCTACCAAAGTGAATGGAGGTAAGTCGATTCGGATACTTCTAGCCTCATCGCCTTTACCAATGATAATATCTAAAAAGAAATCTTCCATTGCAGGGTATAACACTTCTTCAACAACACTACTCAGTCTGTGTATTTCATCAATAAACAAAACATCTCCAGGTTGAAGTCCTGATAAAATTGCAGCCAAATCACCAGGTCTTTCTAATGAAGGCCCTGATACTGTACGTATATTAACTTCCATTTCATTGGCAATGATATTAGATAATGTTGTCTTACCTAATCCGGGGGGGCCAAAAAGCAATACATGATCTAATGGTTCATGACGAAGTTTAGCCGCTTTAATAAATACTTCTAAATTACTTTTTATTGAATTTTGACCAATATATTGTCGTAATCTCGTAGGTCTAAGCGACAATTCGAAATCAGTTTCTTCACTATGCATTGATTGATCAACCATACGCTCATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP022717|1691632:1700675|1699670_1700675_-|AXJ23329.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE >CP022717|1691632:1700675|1698643_1699669_-|AXJ23328.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYDGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDYDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >CP022717|1691632:1700675|1694648_1696928_-|AXJ23325.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFTKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFMLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGMMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >CP022717|1691632:1700675|1697202_1697463_-|AXJ23326.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >CP022717|1691632:1700675|1692172_1694446_-|AXJ23324.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDALQLSDMTKTIERIKRAIANGEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAEMKVKNGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSETTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDVFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLNFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >CP022717|1691632:1700675|1697481_1698621_-|AXJ23327.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >CP022717|1691632:1700675|1691632_1692151_-|AXJ23323.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_8 |
1829509 : 1891616
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP022717|1829509:1891616|DBSCAN-SWA ATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCTGCACCTGTAATCAGTGCAAATTCTTTCAATGGTAAATCCATTCCTTCAGAACCTGTATTTGGAAGTTCTTTTTCAACTTTGCGCGATTCATGTGTCTCTTCTTTTTTAATAGGCGTACAAACTTTTGGAGCTGACTGAATTACTTTTGGTGATACTTTCGTCGCTTCAGCTGGTAATTTAATTGCTAAAATTTCATCAACAATGAATTGCGTATGTTGTTTGATATCATTTAATGTCGCATCTTCATCAATCATTCTATTGCCATCTGCAACATATTGATCAATTAATGCTTTTACTTTAGCTAATTGTTCTGGTGTTGCGATCGCTTTAAATTTCGCATATGTTTGTTGAGCAATGTTATCAATGCGCAGTAAGCTATTTTCTTTTTCAGTAATTACTGCTTCTATATCGCCTAATGCAACATTAAATCGTTTTAAAACTGCATCAACATCAGCATTAGTGCGTGCTGTTTTTAATTCTTCATCCATTTGTAATTTTAAAGCAGTTATAGCTTTTAATGCATCAGCCTTATTACGATCACTTACTTTTCGATAATTTTGCACTAAAGCAGTGACGCGTGCAAGATTATCATTAATCGTTTTTTCAGCATCTGGCTTTTTAATAGGATGTACATCTAAATCATGTATTGTTTGTAGATTTAATGATGCTGTTTTATCAACTTGTGCATTGCTACGATCTTGATCAATTTGTCCAATAGCAGTGTCATAAATATTTTGTAACTGTGCTAATATACTATTTCTTTCTTCTACCGTTGCTTGAATATTCGCTTCAATTGCTTGTTTTTTATCGTTGAATAATGTTGTCAATTGTTCTCGAGCAGACGCCTTTCTGTTAATAACAGCTTCGATTTCACGAATTTCGTTTTTCTCATCATGCAATAAATATGCCACATCAGCATTAGTCACTGCACTAGCAATTTGTTGTTTAGCTTTAATTAACTCTTTTTCAACTTGTGCAATTGCAGTATTTTGTTCTTCATCTGTCGCTTCGTTATTTGCTTTAATTAAATTAATTTTATTTGTAGCGATATTTTGAATTTGTTGTAATGCTGTTGCTTTAACTGTTGTCGCTGGTTTAATTTTTGAAATAATATTTTGAGCATCGATACTATTTTGATTAACTTGCGCAGTTTTGTCTGCATGATTGATCTGATCAATAGCCTGATTAAGTGCTTGTTCTACTAAATGTTTAGCAGCTAATCTTTCTTCTTCGGTAGATAAATCACTTTGATCAATAAGTGCATTTTGAGCTTCAGCTTTTGCGCTGACAGATTGACGCGCTGCTGGTTTAACTTGAACTTTAGGTAAAATCACTTTGATGTTGTTGTTACCATCAGCCTCAGTTTGATCCACTTCTGCATTCGTTTTGTTTTGTGCAATATCATTTTTAATTGCATTAACAATTTTATTTAACGCATCAATAGCAACATTTCGTTCATCTTGCGTAGTATCTAGCGTATTTCGGATTGCATCAAGTTGGTTATTATTACTTTCATCAATGTTATCCAACGCTGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCTATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCAGTAACAGCAGCATCTTGATTTGTATTTTCTATTTCTTGTTGCGCTTGTTTGAGTGTGTCGCTAATTAATTGATTCGCTTCATCTAATTCATCAACTGTTGCATGTGGTGTATCTTTTATTGATTCTACTTGATTTTCTGCACTTGCTTTTATTGCTTGTTGTGCTTCAGGCTTAATTACAATATGAGGTTGTACACCTTTTAGTGTAGCAATGCCATTTGTTTCAACACGTTTCACATCATTATTCGTTACTGCTTGATTGATGTTTTGTAATGCAAGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCAGCTTGCTCAATTTCTTGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCACCAGCTCTAACAATATGTTCAGGCGTTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTAGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGATTTTATCTAGTGCTACTTGTCTTTCTTCTGCTGTTGCTTCTTTATCCTGATTAATCTTCGCACGTAATTCATTCGCTTTTTGATTGATTTTTTCACGTGCAGCTGGTTTAACTTTAGTTTCAGGTTGAATAATTTTAATTGCTGATACACCATTTGTTGCTGCTTGATTCACCTGACTGTTCGTTTGAGCTTGGTCAATAGCTGCAAGTGCTTTTTCTTTTTCTTTAGTTAATGCTTGTGAAGCAACTTCTTTCTCATTATCTGTTGAATCAAGACTATTATCAATTTGCTGTTGCTTTTCTTTAACAGCTTTTTCAATATCTGCAATTGCCTTTGGTTTAATTACTACTTCGGCTTCAACATTATCTATAGCATTTACCGCTTGATTTGTAGTTACGTCTACTTGATCATTTGTTTGGTTTTGATTAATTTGATTAAATGCTTGATCTTTAAGTTGATTGATTTGATTAACAGCAGCCTGCTTTTCTTCATCAGTTGCATTAGGTGTTTGTTTAACCGCTTCAATACGCTTCGCCACTTCAGCAGTGATTTTATCTCGCGCTGCTTGTTTTTTTACTACGTCAACTTGAACAGCATCGATATTATTCTCTGCCACTGTCGCAGCTTGGTCTACTTCCGCATTTGTGTTAGCTTGTTTAATACTTTCAATAGCTTGTTGTCTGTCTTGATTTAAAGTATTAATCGCAGCATTTTTCTCATCATTCGTTGCATCTGGTGTAGCATTGATTTCAGCTAATTTAGTATTATAATGCTGATTGATTTGTGCTAGTGCTGCAGGTTTTTTAACAATATTTGGCTGAATCGCATTAATTGCTTTTGTACCTAATTGTTGCGCTTGATCTACTTCCGCATTTGTATCAGCTTGATTTATATTATTAATTGCCGTTGCTAACTCTTGATCCACTTGATTTAAAGCCGCTTGCTTTTCTTCAGTTGTTGCATTTGTGGTTTGATTAATTTCTTGCTTTTTAGCAGTTGCTAAATCATTTAATACACCTGTAGCAGTTTGTTTCTTCGTTACATGCGGTTGAACTGCGCCGATTTGATTGACTGCATCGTCTCTAATACTATTGACCATCGCAGTAGTAGACGTCACACCAATATCAGTTAATGCTCTATTTTTAAGTGTATTGACACGATTTATCGCTTCTTGTTTCTCTTCTCGAGTCGCGCCAGGTGTAGCATTGATATTTGTTATCGCCTCTCGCGCTTTATCATTTACAGCATTGCGAGCATCCGTTTTAACTTGTGTTGCCGGTTGAATCACAACTATATTTTGTGTGCCCTGATCTTTTGCTTGTGCAACTTCTTGATTCGTATCTGCTGCATTAATATTTTGCTTCGCTGTGGCTACAGCTTGATCAAGTAATTGTTGTGCTGCTTGTTGTTCTTCGAGCGTCGCATCATTATTATTAAATATCGTATTATGTTGCGTTTCCGCACTTTTATCGATGGCATTTTTTGCATCTGTTTTTACTTTTGTAGCTGGTGTAATTGCTTGTATTCCTTGAATCGCATTTGTCTTCACTTGTTCAACATTAGCATTGGTATTAGCGTTTAAAATGTTTGTGTTTGCTGCAGTTACAGCAGCATTCACTTTGTCAATTGCTGCTTGTCTTTCTTCTTGAGTCGCATCAGGATTAGCATTGATCTCTGCGATATGTTGTTGTGCATCATGTGATATGGCATCCCTTGCAGCTTGCTTAACAACAGTTACAGGAGCAATTGGATTAATGGCATTTAGACCATCTCCTTTGGCGTTATCAACATCAGCATTTGTTGTTGCTTGATTGATTTGTTCTAAAGCATGGTTGGTTGCTTGAGTTAATTCGTTCAATGCTGCATCTTTCTCTTCCTGAGTTGCTTCTCTATTACTATTTATTTGTTGTCTTTTCGTTGCTGTTGCTTGGTTAATTGCATCTCTTGCAGCTTTTTTATGAGTTACTTGAGGAACAACTGCTCCAATAGTATTGATGCCATTATTTTTAGCTGTTTCTACGTCAGCATTTGTAGTAGCATTCGTAACATTATCAATAGCGTCTGTTTCATCCGTAGCTAATTGATTTATTGCATCTTGAATCTCGTCTTCAGTAGCATCTGGTGTTGCATTGATAATCGCTCTTTGTTTCGTTGCTTTATCACGTATTGCTTTTTTAGCATTTGGTTTAACAACCGGTGTTGCAGTATCCCCACTTAAGGTCTGTATACCTTGATCTTTGATTCTAGTAACGCCAGCATCAGTCGTTTGATCACCAATATCACCAATAATATTGCCTTTATGTTCCTCTATAACTTGTATTGCTGCTTGTTTTTCTTCATCTGTCAGTTCATCATTTTGATTAACTAAATCTTCCATTTGATCAGCTTTTTGGTTTACTGCATTTTCAGCATCAACACTTCGAATTAAAGTATGTTGCATCTGATTAGTTAATGTATCAATATCTGCTTGAGATACTCTTTTATTTAATGGTACATTGTTACGATTTTCAGCTAAAATTGTTTGTGCACGTCTTTTAAGATCATTAAAGATATCTAATGATGCAAATGTATAATCAGCTTGTTGAATAAGTCTATCAACTTCACCTTGCAATGCGTCTTTATTCATTATGATATCGATTGTATACGGATTTGTACTTACAGTATGACTTTCAGCAGGTGAATTAATAAAATCTTGTGTATACGTTTTATATGTTAATGTATCGTTAAATGTTACTGTTCTTGGTGTCGGTACATTATTAACACGCAACTTAAACTTTAAATCCAATATTTTATCAGGCATTAGTCGTGCCGGTGAATTCGTTGTGCCA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58 | Staphylococcus_phage(95.74%) | protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_9 |
2040880 : 2085486
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP022717|2040880:2085486|DBSCAN-SWA AATGATGGTGAAAAAAACAAAATCCAATTCACTAAAAAAAGTTGCAACACTTGCATTAGCAAATTTATTATTAGTTGGTGCACTTACTGACAATAGTGCCAAAGCCGAATCTAAGAAAGATGATACTGATTTGAAGTTAGTTAGTCATAACGTTTATATGTTATCGACCGTTTTGTATCCAAACTGGAGACTTTTAACATAAAATTACTTATCATTCAAAAAGTAAAACAGCATAATATCAAGGTTTATAACTTTATCATTATCAATAATACCTCATATAAAATAAAATTTTAGGGACTTTTTAGGGACTTTAAATTTAAAATTACAAGTTTAATAGAAACATCAAAATAATCACATGTTTGTGTGGAATGTACACCCCAAAAGCTAGACTGAAAAATCTATTTTTTGAGGTGTATTTTTATAGGTAAATATAATAAATTAGAGTAGACAACTCAGAATTCCAATTTTATAATAATATTGCTTGACATATCAAACTAGATAGTACTATTTTGAATATATTATTATAATCAAAAATTCATTGTAAACTTTTAAACAAAAGGAAGTAATAAAAACGTGAAATTTAAAACAACTAAAGAATGTAAAAGTAATAATATCTTTAAAAGAAGTCAAGAAATTAATAATAGTGAAAGTGAAAAGGGTTGTTTATGGGGCATTAGCATGTTGATTCTACTTTTCTTATTGATTCTGTTTGGAATAACTGCTTGTTCATCAAGCATTCACTTTATTAATTAGATTTTTTTACTTGGAGGTATCATGTGAAGAACCATACAAATATAATTAATATCTTATTAGTTATAGTCAACTCATTAACTCATTTTCTAACTCTAAACACCTCATTTTTTAATAATTCAGCATCGGATTTCTGTTTTATCATAGGGGCTATATTTTTCTTGATCGGAATTTTTGTTGCAATATACGGTATGAAGCGAGCAACATATTGGTTAAACTTATTGATTTTATTTACCAATATTTTTTATTTTCTACACTTCTGTGTTTTACTTTTGTTAAAATATATAGGATTTAAATTATTTATTTATGAAGGGTGTGTATTGTTATTTACCTAATTTATAGTCTAATTGTCTATTTCATCTGCATTATAAATTTTTTCATAATGGCCGCACCATTCTTAATGACTAATGCTGATTATGTATGGACGCCTATGACTACAGTTACGTTATTTATTTTGAGTTTGATTATTTTCTTGATATTTATAAAAACAAAAGATGTCGTTCATTTAACAATTTTCATATTAAACTTACTTTTTTCAATACTTTATTGTTTACCTATACTGTTTTATTTATGAACACTTTTATATTATCTAGAAAATTAAAACCACCCTTTTACGGGTGGTTTTTTAATATTTACTTTTTAGTGCTTCGTCAATTTCATTATAAATCTTTTGAAGTTGATATTTTGCTTCTGACATTTTCTTAAAGTCTTTTGACTTAAGAGCATACATTGCTTTTTGACCTGAAATTTTTATAGTTCGCTTATAATAAGTGTTTAAACTTCCAGTAGCTAATTCATTAACATTTAGTTCATCTAATAACGATTTTAATTCATTAGCTAACTTTTCGTTTTGATATTCATTCGATGTTGGCAAGCTTGTGCTAGCTTGTGCCTCATTTTTATCTAGATTAGTTACTAGTGGTGATGCTAAAACGATTGCTAAAGTTCCCGCAAGTATAGATTTTCTAATTTTCATTTTTTATTCTCCTTAGTAATTAGTACTAATTTATTTTAATGACTAACTAAAAAAAAGTACATTAATTATTCATTAACTATATAGATCTTCTTATTAAATGAAAATTAATAAATTATCAAATTGACATACCTTATTGTATTTATAGAAAAACAAAAAAAGTAAGCACCGAAATGCTTACCTACTTCCCATAAACAATATAACACATATACATTGATTTGGAAAGCGCAAAAATAAATTTAATATACTAGCCCGAAGGGGAGCAATACATAAAAAATGAAAGGCGCTCCTTGAAAACGCCCAAGGTAATATTAACATAAAATGGCTACTATTGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTATTCTATAATAAATTAATTAACTTCATATGAAACTTTACACACTTTTTTTCAAAGTGCGCTAAAATTACCAAAACTGCTTATTCTATTACCTGCCTTGTCTACCTCTCTTGTCGCTATATAACAACGTTGTCCATTATTAGCAATATAAGTAATCCATCTATAGCCATTAATGCAATATGCGCCGTCATATTTGATCGTTGCGTTATTGGGTAATACACCTGTAATTCTTGAATTAGTTGAATAGCCATCCCTCACGTTATTACCTTTAACATTGGCAACTGTGTAATAACCAGTCTCTTTTTTATACGGTACATTGTTTTTATCGAGTGTATAACCTGCTGGCACTGGTGAATTCTTTTCATTTTTAGCTGGTGTTTTAACATTACTGATACCTGATACACACTTCCAATAAAAATAACCACACCATTTAAGATGCGGTGTAGCGACTGTAATATTTCTATGTTGTTGAGATATATGTATCGAGTGAAGGGCAAAAAGGATATCAATTGCAGGATAAGTGTTAGGTTACTAGGCCACTTAACAGGCTATATAGTTCACTCCTACTATATACACTTAATTATAACATAAAAAGCACCCCGTAAACTATTATACGGGAATGCTAAAGTCATATATACTACGGGGGAGTAGTATGAAAACTATGCTCTCTATCATAAGAAAAAAACACCCAGTGACATGCTTGGGTGAACAAGGATAGATGTAAATAGTTGATGCATGTGTAACACATCATAGCAAAAAACTAGCCCGAAAGCTAGCTATAACATACAATCTAAAAAGACGTCCTTTGAATACGTCTAGAAAGATTATAACATAAAAAAATAGGCAAGTACCGAAGTACCTGCCTAAAAAAGGATTATCCACTTTTTCATCCTAACTGATTTCTCCCCATAAGTCACCTAATATCTGATTAGGTGGGGAAGAACCATTCGTGCATGAATGAGAATTTGATGAAAGATAATTTTCACTACACATATTCAATCAAGACATTGCTTTCTATAATAAACAACTATTTTGTTTTATTTCTTTTCTATAACAACCTTTGTAATTAAGTTGAATCCAGGGTTTTTAATATGCTCTGATAAATCTGGGACAACAAAACCTTTTTCTGTTATAGGGAAAGACTTCGTTTCTTCTTTTTTCTTATTCTTATCATAATAAGTGACTTCGATCTTTGCGCTTGGATCTAATTCAACTACTCTAAACTCTTTATATGCTGTCGCATCTAATGCCCATTCGACATAGTATTCAATTTTTTCTTTTGTAAGTGTAGTCCCAGGTTTAATAGGAAACTCGACATAATGAGGGGATAGCAATTCATTTCCTTTACCATCAACTCCAGTCACATTTACCATCAAATACGGGCCTGTTGGTTCAAAATAACTCGCGTCATCGCCTTTTTTATATTTTCCTTTGTCGAATGAACTTGATGCACTTACCTCATTAGTAATTGAAGAAAATGAGAATAATAACAATAAAACAGTTAAAAATAATAAACTTCTTTTGAGCATGGCGCTTCCTCCAAATATAATATATTTGTTTTTATTTATCTCTTTTTATAGCTAACACCCTTATTTAAGATGATAAATATCAACAACTTCATTTTATATTGAGAAAATATTAAAAATCAATAAAATATTAAAAGAAACTAAACTTACATTAAAAAATAATTAACAAATATTTAACATTTTAACCTAAGAATTAAAACACTTCTTTCACAATCAATCTCTCATGCCATATCCACTCATTATGATTGTTCCAATAAATGCGACACCAACCATCTATAATTTCAAACACATATATTAATGTTCCAGGCGCGTATACAGCCTGTCCAACATCGAATCTATAGTTAGTACGATTATCACCGTATCTAGTGGCTGAAGTAGCACCTAAGCCGTCGATTTTCGCATTAAAATAAGCACCTTTTGACCATTTAAGGTTATAAGGCGCTTTACTTCCAACTGTTATTTTACTTGCAGATTTACCGACTGCTTTTTGAGCAGGTGGTTTAACTTTATTTGTGATCTTATTCATTAAGCCCTCACTTTTATACTTAGGTCTAATAAAGTGAGTACAGCCGTAATAATTATCCCAACGTAACTTTGCAGGCGTATTTGCGTTACCGTCATAGTTCTGTTCCAAAATTAAAAATTGATTTGTATTACCACCATTAAACACTAAACCAATATGACCGTATTGTTTATATATTCCTTTGGTAAATACAGCCACATCACCTATTTGTGGAACAAACGATGGTGTGTTTTCATATACTGTTGCCATGTTTTTAAAATCGTTATTGATTGCATCTTTTGCATTTCCCCACATTCTAATTTCTAACAACCAATAAATGTAATCAACTGCTAAATCTGCACATTGGTAACCATACCAACCGTCAAAATCAATATATCTACCTTGATACCAACGTAACCTTGCTCTTGCTTCACTGTATGTTTTCATTATTTTACCTCCTAGTATTTTCTTCTTGGTTCTTCATATTCTAAAGCTTGGTGGCTATCACCTATACCTTTAGTAGTCGGGTCTTGAATCACACCAGTTAATACTAAAAATCCTAATATAGCGTTTAAACCGTCTGTTAATTGCTCTGTATAAACTTGAATATCATACCCAATAGCTTTGGCGATGTTTTGAGCAAATAAAAAGATAGCTGACAATATCGCTACCCAAAATGATTTTTGTTTCATTCTAATTTTCCAATTAATCATATTCTTATCTCCTTTTATCCAAAATAAAAAGACGACTAATAAGCCGTCTATTTGATATTTATATTATGGTGTGTT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66 | Staphylococcus_phage(86.15%) | capsid,portal,tail,holin,terminase,head,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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