Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022905 | Staphylococcus aureus strain 628 chromosome, complete genome | 10 crisprs | cas3,DEDDh,csa3,DinG,RT,WYL | 10 | 3 | 9 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022905_1 | 170181-170265 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022905_1
|
1 spacers
spacers of CP022905_1
>1.1|170207|33|CP022905|CRISPRCasFinder TGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022905_1
The CRISPR arrays of CP022905_1 >merge|CP022905|1|170181-170265|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTGTGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTG >CP022905|1|1|170181-170265|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTG TGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT TTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTG
>CP022905.1|AXJ65609.1|169072_170032_+|Cadmium,-cobalt-and-zinc/H(+)-K(+)-antiporter MNGKKANTINRYKYFHHVNHQKIQQSSKKTLWASLIITLLFTVIEFVGGLVSNSLALLSDSFHMLSDVLALGLSMLAIYFASKKPTARYTFGYLRFEILVAFLNGLALIVISIWILYEAIVRIIYPQPIESGIMFMIASIGLLVNIILTIILVRSLKQEDNINIQSALWHFMGDLLNSIGVIVAVVLIYFTGWRIIDPIISIVISLIILRGGYKITRNAWLILMESVPQHLDTDQIMADIKNIDGILDVHEFHLWSITTEHYSLSAHVVLDKKYEGDDYQAIDQVSSLLKEKYGIAHSTLQIENLQLNPLDEPYFDKLT >CP022905.1|AXJ65608.1|166938_168426_+|Putative-aldehyde-dehydrogenase-AldA MAVNVRDYIAENYGLFINGEFVKGSSDETIEVTNPATGETLSHITRAKDKDVDHAVKVAQEAFESWSLTSKSERAQMLRDIGDKLMAQKDKIAMIETLNNGKPIRETTAIDIPFAARHFHYFASVIETEEGTVNDIDKDTMSIVRHEPIGVVGAVVAWNFPMLLAAWKIAPAIAAGNTIVIQPSSSTPLSLLEVAKIFQEVLPKGVVNILTGKGSESGNAIFNHDGVDKLSFTGSTDVGYQVAEAAAKHLVPATLELGGKSANIILDDANLDLAVEGIQLGILFNQGEVCSAGSRLLVHEKIYDQLVPRLQEAFSNIKVGDPQDEATQMGSQTGKDQLDKIQSYIDAAKESDAQILAGGHRLTENGLDKGFFFEPTLIAVPDNHHKLAQEEIFGPVLTVIKVKDDQEAIDIANDSEYGLAGGVFSQNITRALNIAKAVRTGRIWINTYNQVPEGAPFGGYKKSGIGRETYKGALSNYQQVKNIYIDTSNALKGLY >CP022905.1|AXJ65607.1|166128_166512_-|Inner-membrane-protein-YbaN MRLILIVIGLIFTALGIAGAVLPLLPTTPFLLVAVFCFARSSDRFYNWLINQKIYKEYVENFYLHRGYTLQQKIKILISLYIVIGFSIYMVDVLAVRVGLIIMVIIQTAVLFTFVKTLPKSNHKIEE >CP022905.1|AXJ65606.1|165795_166122_-|Heme-oxygenase-(staphylobilin-producing)-2 MFMAENRLQLQKGSAEETIERFYNRQGIETIEGFQQMFVTKTLNTEDTDEVKILTIWESEDSFNNWLNSDVFKEAHKNVRLKSDDDGQQSPILSNKVFKYDIGYHYQK >CP022905.1|AXJ65605.1|164585_165731_+|UDP-N-acetylglucosamine-2-epimerase MKKIMVIFGTRPEAIKMAPLVKEIDHNGNFEANIVITAQHRDMLDSVLSIFDIQADHDLNIMQDQQTLADLTANALAKLDSIINEEQPDMILVHGDTTTTFVGSLAAFYHQIPVGHVEAGLRTHQKYSPFPEELNRVMVSNIAELNFAPTVIAAKNLLFENKDKERIFITGNTVIDALSTTVQNDFVSTIINKHKGKKVILLTAHRRENIGEPMHQIFKAVRDLADEYKDVVFIYPMHRNPKVRAIAEKYLSGRNRIELIEPLDAIEFHNFTNQSYLVLTDSGGIQEEAPTFGKPVLVLRNHTERPEGVEAGTSRVIGTDYDNIVRNVKQLIEDDEAYQRMSQANNPYGDGQASRRICEAIEYYFGLRSDKPDEFVPLRHK >CP022905.1|AXJ65604.1|163246_164509_+|UDP-N-acetyl-D-glucosamine-6-dehydrogenase MKLTVVGLGYIGLPTSIMFAKHGVDVLGVDINQQTIDKLQSGQISIEEPGLQEVYEEVLSSGKLKVSTTPEASDVFIIAVPTPNNDDQYRSCDISLVMRALDSILPFLEKGNTIIVESTIAPKTMDDFVKPVIENLGFTIGEDICLVHCPERVLPGKILEELVHNNRIIGGVTKACIEAGKYVYRTFVQGEMIETDARTAEMSKLMENTYRDVNIALANELTKICNNLNINVLDVIEMANKHPRVNIHQPGPGVGGHCLAVDPYFIIAKDPENAKLIQTGREINNSMPAYVVDTTKQIIKALSGNKVTVFGLTYKGDVDDIRESPAFDIYELLNQEPDIEVCAYDPHVELDFVEHDMSHAVKDASLVLILSDHSEFKNLSDSHFDKMKHKVIFDTKNVVKSSFEDVSYYNYGNIFNFIDK >CP022905.1|AXJ65603.1|162305_163193_+|UDP-glucose-4-epimerase MRKNILITGVHGYIGNALKDKLIEQGHQVDQINVRNQLWKSTSFKDYDVLIHTAALVHNNSPQARLSDYMQVNMLLTKQLAQKAKAEDVKQFIFMSTMAVYGKEGQVGKSDQIDTQTPMNPTTNYGISKKFAEQALQELISDSFKVAIVRPPMIYGAHCPGNFQRLMQLSKRLPIIPNINNQRSALYIKHLTAFIDQLISLEVTGVYHPQDSFYFDTSSVMYEIRRQSHRKTVLINMPSVLNKYFNKLSVFRKLFGNLTYSNTLYENNNALEVIPGKMSLVIADIMDETTTKDKA >CP022905.1|AXJ65602.1|161748_162306_+|putative-sugar-transferase-EpsL MKRLFDVVSSIYGLVVLSPILLITALLIKMESPGPAIFKQKRPTINNELFNIYKFRSMKIDTPNVATDLMDSTSYITKTGKVIRKTSIDELPQLLNVLKGEMSIVGPRPALYNQYELIEKRTKANVHTIRPGVTGLAQVMGRDDITDDQKVAYDHYYLTHQSMMLDMYIIYKTIKNIVTSEGVHH >CP022905.1|AXJ65601.1|160532_161738_+|putative-glycosyl-transferase MSEKKILILCQYFYPEYVSSATLPTQLAEDLIANHINVDVMCGWPYEYSNHKQVSKTEMHRGIRIRRLKYSRFNNKSKVGRIINFFSLFSKFVINIPKMLKYDQILVYSNPPILPLIPDVLHRLLKKKYSFVVYDIAPDNAIKTGATRPGSMIDKLMRYINRHVYKNAENVIVLGTEMKNYLLNHRISKNADNIHVIPNWYDMRQLQDNRIYNDTFKAYREQYDKILLYSGNMGQLQDMETLISFLKLNKDQPQTLTILCGHGKKFADVKTAIEDHRIENVKMFEFLTGTDYADVLKIADVCIASLIKEGVGLGVPSKNYGYLAAKKPLVLIMDKQSDIVQHVEQYDAGIQIDNGDAHAIYNFINTHSSKELHEMGERAHQLFKDKYTREINTMKYYNLLK >CP022905.1|AXJ65600.1|159326_160532_+|hypothetical-protein MVKKVFIMDSVKTIIGTLLIALGLQFLAYPIINQRVGNEAFGSILTIYTIITITSVVLGNTLNNIRLINMNLYKSNHYYWKFVSILLISILIESIALIIVFLYFFNLNTIDIIFLILLNILMCLRIYLNVFFRMTLKYNQILYIALIQFLGLLIGLFLYYLIQNWIVCFITSELFATIYTLVKLRGLTIGEYQSEDNNVVKDYVMLLSTNSLNNLNLYLDRLILLPIIGGTAVTISFLSTFIGKMLATFLYPINNVVLSYISVNESDNIKKQYLKTNLFAIAALCLVMIICYPITLIIVSLLYNIDSSLYSKFIILGNIGVLFNAVSIMIQTLNTKHASITLQANYMTLHTITFIFITILMTIAFGLNGFFWTTLFSNIIKYVILNIIGLKSKFINKKDVD >CP022905.1|AXJ65610.1|170326_170530_-|hypothetical-protein MDKESVVASLARNKKIAVETMAGQRYIIERILHTNDEKHIHILKPKDVVLDVDSIKEIDENHLNDAT >CP022905.1|AXJ65611.1|170708_171221_+|hypothetical-protein MTLFLLEANNLDFASTKEELEAKAASLSTKTIPTLIEVQATENLTHGYFIVEANDEAEAKQFLTEADISIQLVKEVRLVGKDLDEVKNGDAHVDYLVTWNIPEGITMDQYLARKKKNSVHYEEVPEVEFKRTYVCEDMSKCICLYNAPDEEAVRRARKAVDTPIDGIEKL >CP022905.1|AXJ65612.1|171562_172303_+|Bicarbonate-transport-ATP-binding-protein-CmpD MIKIQQLQHHFGSHKVIHNFNLDISKGEIVTFIGKSGCGKSTLLNVIGGFIHPSSGRVIIDNEIKQQPSPDCLMLFQHHNLLPWKTINDNIRIGFQQKISDEEINAQLKLVDLEDRGKHFPEQLSGGMKQRVALCRAHVHKPNVILMDEPLGALDAFTRYKLQDQLVQLKHKTQSTIILVTHDIDEAIYLSDRIVLLGEGCNIISQYEITASHPRSRNDSHLLKIRNEIMETFALNHHQVEPEYYL >CP022905.1|AXJ65613.1|172316_173288_+|Bicarbonate-transport-ATP-binding-protein-CmpC MKRLSIIVIIGIFIITGCDWQRTSKEPSKNAQNQQVIKIGYLPITHSANLMMTKKLLSQYNHPKYKLELVKFNNWPDLMDALNSGRIDGASTLIELAMKSKQKGSNIKAVALGHHEGNVIMGQKGMHLNEFNNGDDYHFGIPHRYSTHYLLLEELRKQLKIKPGHFSYHEMSPAEMPAALSEHRITGYSVAEPFGALGEKLGKGKTLKHGDDVIPDAYCCVLVLRGELLDQHKDVAQAFVQDYKKSGFKMNDRKQSVDIMTHHFKQSRDVLTQSAAWTSYGDLTIKPSGYQEITTLVKQHHLFNPPAYDDFVEPSLYKEASRS >CP022905.1|AXJ65614.1|173284_174046_+|Putative-aliphatic-sulfonates-transport-permease-protein-SsuC MTRPTNNKFILPIITFIIFLGIWEMVIIIGHYQPVLLPGPALVGKSIWTFIVTGEIFQHLAISLWRFVAGFVVALLVAIPLGFLLGRNRWLYNTIEPLFQLIRPISPIAWAPFVVLWFGIGSLPAIAIIFIAAFFPIVFNTIKGVRDIEPQYLKIAANLNLTGWSLYRNILFPGAFKQIMAGIHMAVGTSWIFLVSGEMIGAQSGLGFLIVDARNMLNLEDVLAAIFFIGLFGFIIDRFISYIEQFILRRFGE >CP022905.1|AXJ65615.1|174055_175090_+|hypothetical-protein MMTLETLIKEQLDPHLVEVDEGTYYPRTFIQQLFVDGYFGEAALRKNAEVIEAVSQSCLTTGFCLWCQLAFSTYLENATQPHLNNDLQQQLLSGEILGATGLSNPMKSFNDLEKLNLEHTYVDGQLVVSGRMPAVSNIQEDHYFGAISKHESSDEFVMFILRANQDGITLVEKTNFLGVNGSATYQITLNQVVVPQSQIITHDAKQFAATIRPQFIAYQIPIGLGSIKSSLELIDAFSNAQNGINQYLEYDVEAFKKRYRQLREEYYAILDDGNLTSHLSELISLKKDIGYLLLDVNQASVVNGGSRAYTPYSPQVRKLKEGFFFAALTPTLRHLGKLEAELKG >CP022905.1|AXJ65616.1|175306_175666_+|hypothetical-protein MNTIDTHTKEQQFSNLVRSYRKEYVGKGPNSIRVSFKDNWAIAHMTGVLSKVESFYLNDKRNESMLHYTRTEKIKQMYKEIDVNEMESLVGAKFVKLFTDIDLNDDEVISIFVFDKSIE >CP022905.1|AXJ65617.1|175689_176865_+|Formate-dehydrogenase MLFANFALNLTIIQGGGMSNGAVFFVIFLKQATCNTYFKEVKIYHLGEMDMKIVALFPEAVEGQENQLLNTKKAIGLKTFLEERGHEFIILADNGEDLDKHLPDMDVIISAPFYPAYMTRERIEKAPNLKLAITAGVGSDHVDLAAASEHNIGVVEVTGSNTVSVAEHAVMDLLILLRNYEEGHRQSVEGEWNLSQVGNHAHELQHKTIGIFGFGRIGQLVAERLAPFNVTLQHYDPINQQDHKLSKFVSFDELVSSSDAITIHAPLTPETDNLFDKDVLSRMKKHSYLVNTARGKIVNRDALVEALASEHLQGYAGDVWYPQPAPADHPWRTMPRNAMTVHYSGMTLEAQKRIEDGVKDILERFFNHEPFQDKDIIVASGRIASKSYTAK >CP022905.1|AXJ65618.1|177250_178501_+|putative-transporter MKRLSTTLKVRLISNFLQLIITTAFIPFIALYLTDMLSQSIVGIYLVGLVVLKFPLSIISGYLIEIFPKKLLVLIYQATMVIMLVFMGVFGSHQLWQIIGFCVAYAIFTIVWGLQFPVMDTLIMDAITEDVEHYIYKISYWMTNLSVAIGALLGGLMYGYSMLLLFLIAACIFLIVLFILYIWLPQDRNQVKQSDDKRHASRYQKLQIMNIFRSYKLVLKDRNYMLLISGFSIIMMGEFSISSYIAIRLKDQFETISIGSYDITGAKMLAILLMINTVVVILLTYSISKVVLKIDFKKALITGLLIYIVGYSGLTYLNQFGLLVVFMIIATVGEIIYSPIVSEQRFKIIPKAKRGTYSAVNALGIHFSETLARLGIVLGVFLTSLQMGLYMFIVLTIGASMLVAGVFGGQKQVNTN >CP022905.1|AXJ65619.1|178947_186123_+|Gramicidin-S-synthase-2 MIMGNLRFQQEYFRIYKNNTESTTHRNAYWVKLAKNVEATKMMYALSTIVQQHASIRHFFDVTTDDNLTMILHEFLPFIEIKQVPSSSANYDLEAFFKQELSTYHFNDSPLFKVKLFQFADAAYILLDFHVSIFDDSQIDIFLDDLCNAYRGNTVINNTRQHAHINRNDDKDNQDASHIALDSNYFRLENNSDIHIDSYFPIKHPFEQALYQTYLIDDMTSIDMASLAVSVYLANHIMSQQHDVTLGIHVPSHLPNDLHGNIVPLTLTIDAKDVCQRFTTDFNKCVLQNMSQLQCAKSSLSLETIFHCYHHMMSCCNDVIEDVHQIHDAHTSLADIEIFPHQHGFKIIYNSAAYDLLSIETLSDLVRNIYLQITEENGNKRTTVDELNLMTERDIQLYDDINLSLPEIDDAQTVVTLFEQQVEATPNHVAVQFDGVFITYQTLNARANDLAHRLRNQYGVEPNDRVAVIAEKSIEMIIAMIGVLKAGGAYVPIDPNYPSDRQEYILKDATPKVVITYQALYENGKQNINHIDLNKIAWKNIDNLSKCNTLEDHAYVIYTSGTTGNPKGTLIPHRGIVRLVHRNHYVPLNEETTILLSGTIAFDAATFEIYGALLNGGKLIVAKKEQLLNPIAVEQLINENDVNTMWLTSSLFNQIASERIEVLVPLKYLLIGGEVLNAKWVDLLNQKPKHPQIINGYGPTENTTFTTTYNIPNKVPNRIPIGKPILGTHVYIMQGERRCGVGIPGELCTSGFGLAAGYLNQPELTADKFIKDSNINQLMYRSGDIVRLLPDGNIDYLYRKDKQVKIRGFRIELSEVEHALERIQGINKAVVIVQNHDQDQYIVAYYEAMHTLSHNKIKSQLRMTLPEYMIPVNFMHIEQIPITINGKLDKKALPIMDYVDTDAYVAPSTDTEHLLCQIFADILHVNQVGIHDNFFELGGHSLKATLVVNRIEASTGKRLQIGDLLQKPTVFELAQAIAKVQEQNYEVIPEAIVKDDYVLSSAQKRMYLLWKSNHKDTVYNVPFLWRLSSGLNVAQLQQAVQHLIARHEILRTQYIVVDDEVRQRIVADVVADFEEVNTHFTDEQEIMRQFVAPFNLEKPSQIRVRYIRSPLHAYLFIDTHHIINDGMSNIQLMNDLNALYQHKLLLPLKLQYKDYSEWMSHRDMTKHRQYWLSQFKDEVPILSLPTDYVRPNIKTTNGAMMSFTMNQQMRQLLQKYVEKHQITDFMFFMSVVMTLLSRYARKDDVVVGSVMSARMHKGTEQMLGMFANTLVYRGQPSPDKMWTQFLQEVKEMSLEAYEHQEYPFECLVNDLDQSHDASRNPLFDVMLVLQNNETNHAHFGHSKLTHIQPKSVTAKFDLSFIIEEDRDDYTINIEYNTDLYHSETVRHMGNQCMIMIDYILKHQDTLQICDIPNGTEELLNWVNTHVNDRMLNVPGNKSIISYFNEVVSRQGNHVALVMNDLTMTYETLRNYVDAIAHMLLSNGVGNGQRVALFTERSFEMIAAMLATVKVGASYIPIDIDFPNKRQGAILEDAKVTAVMSYGVEIETTLPVIQLENAKGFVESKENEQYDDLHGNQLENTAMLDNEMYAIYTSGTTGMPKGVAIRQRNLLNLVHAWSTELQLGDNEVFLQHANIVFDASVMEIYCCLLNGHTLVIPDREERVNPEQLQQLINKHRVTVASIPLQMCSIMEDFYIEKLITGGATSTASFVKYIEKHCGTYFNAYGPSESTVITSYWSHHCGDLIPETIPIGKPLSNIQVYIMSDGLLCGIGMPGELCIAGDSLAIGYINRPELMADKWQNNPFGKGKLYHSGDLARYTSDGQIEFLGRIDKQVKVNGYRIELDEIENVILAIRGISDCVVTVSHFDTHDILNAYYVGEQQVEQDLKQYLNDQLPKYMIPKTITHIDCMPLTTNDKVDTTRLPNPSPIQQSNKVYSEPSNEIEQTFVDVFGEVLKQNDVGVDDDFFELGGNSLEAMLVVSHLKRFGHHISMQTLYQYKTVRQIVNYMYQNQQSLVALPDNLSELQKIVMSRYNLGILEDSLSHRPLGNTLLTGATGFLGAYLIEALQGYSHRIYCFIRADNEEIAWYKLMTNLNDYFSEETVEMMLSNIEVIVGDFECMDDVVLPENMDTIIHAGARTDHFGDDDEFEKVNVQGTVDVIRLAQQHHARLIYVSTISVGTYFDIDTEDVTFSEADVYKGQLLTSPYTRSKFYSELKVLEAVNNGLDGRIVRVGNLTSPYNGRWHMRNIKTNRFSMVMNDLLQLDCIGVSMAEMPVDFSFVDTTARQIVALAQVNTPQIIYHVLSPNKMPVKSLLECVKRKEIELVSDESFNEILQKQDMYETIGLTSVDREQQLAMIDTTLTLKIMNHISEKWPTITNNWLYHWAQYIKTIFNK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022905_2 | 429971-430072 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022905_2
|
1 spacers
spacers of CP022905_2
>2.1|429994|56|CP022905|CRISPRCasFinder AAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022905_2
The CRISPR arrays of CP022905_2 >merge|CP022905|2|429971-430072|CRISPRCasFinder TTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTATATATGAATTGAGTATTAAATTTG >CP022905|2|2|429971-430072|CRISPRCasFinder TTATGAATTGAGTATTAAATTTG AAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTAT ATATGAATTGAGTATTAAATTTG
>CP022905.1|AXJ65846.1|427722_429111_-|L-cystine-uptake-protein-TcyP MNAFLTLINIIVLVIFIVILHMMARKHISFAKRVFTALGIGIVFGVLLHLVYGTHSNVITSTSDWFNIVGQGYVALLQMIVMPLIFISIVAAFTKIQIGEKFAKIGSLIFIFLIGTVTIAAIVGVVYALVFGLDASTINLGNAEQARGSEIAKQAKDLTAHTLPQQILELLPKNPFLDFTGQRATSTIAVVIFASFIGFAYLRVARKQPDHGELLKRAIDAIYSLVMAIVTFVLRLTPYGVLAIMANTLSTSDFGAIWTLGKFLIASYAALITMYIIHLIILSLLGISPIRYVKKTLEVLIFAFTSRSSAGALPLNVQTQTRRLGVPEGIANFAATFGLSIGQNGCAGIYPAMLAIMVAPVANVEIDLQFIVTLIAVVIISSFGVAGVGGGATFASILVLSTLNLPVALAGVLISVEPLIDMGRTALNVNDSMLAGTGTAKLTKHWDKDTFESNDNAALTSH >CP022905.1|AXJ65845.1|426887_427643_+|NADPH-dependent-oxidoreductase MSDYVYNLVKKHHSVRKFKNKPLSEDVVKKLVEAGQSASTSSFLQAYSIIGIDDEKIKENLREVSGQPYVVENGYLFVFVIDYYRHHLVDQHAETDMENAYGSTEGLLVGAIDAALVAENIAVTAEDMGYGIVFLGSLRNDVERVREILDLPDYVFPVFGMAVGEPADDENGAAKPRLPFDHVFHHNKYHADKETQYAQMADYDQTISEYYDQRTNGNRKETWSQQIEMFLGNKARLDMLEQLQKSGLIQR >CP022905.1|AXJ65844.1|425826_426396_-|Alkyl-hydroperoxide-reductase-subunit-C MSLINKEILPFTAQAFDPKKDQFKEVTQEDLKGSWSVVCFYPADFSFVCPTELEDLQNQYEELQKLGVNVFSVSTDTHFVHKAWHDHSDAISKITYTMIGDPSQTITRNFDVLDEATGLAQRGTFIIDPDGVVQASEINADGIGRDASTLAHKIKAAQYVRKNPGEVCPAKWEEGAKTLQPGLDLVGKI >CP022905.1|AXJ65843.1|424287_425811_-|Alkyl-hydroperoxide-reductase-subunit-F MLNADLKQQLKQLLELMEGNVEFVASLGSDEKSKELKELLTEISDMSPRLSLSEKSLKRTPSFSVNRPGEETGVTFAGIPLGHEFNSLVLAILQVSGRAPKEKQSIIDQIKNLEGSFHFETFISLTCQKCPDVVQALNLMSVINPNITHSMIDGAVFREESENIMAVPAVFLNGEEFGNGRMTIQDILSKLGSTADASEFENKEPYDVLIVGGGPASGSAAIYTARKGLRTGIVADRIGGQVNDTAGIENFITVKETTGSEFSSNLAAHIDQYDIDAMTGIRATDIEKTDEAIKVTLENGAVLESKTVIIATGAGWRKLNIPGEEQLINKGVAFCPHCDGPLFENKDVAVIGGGNSGVEAAIDLAGIVNHVTLFEFASELKADNVLQDRLRSLSNVDIKTNAKTTEVVGEDHVTGIRYEDMSTGEEHLLNLDGIFVQIGLLPNTSWLKDAVELNERGEIVIDRNNNTNVPGIFAAGDVTDQKNKQIIISMGAGANAALNAFDYIIRN >CP022905.1|AXJ65842.1|423916_424162_-|hypothetical-protein MYLSQTNQYENDIEKEKYVNEIIMLLRTIPTSKLIQPIMQLFIDNAILNIVQNDALLIEKATHARNHLRLWSLQGHRDIPN >CP022905.1|AXJ65841.1|423217_423844_-|hypothetical-protein MKKRLLLSTFLASALILTGCASDQSDNEDHHTSTGIHAPKSAKKLETKDIFNSDKKNSDISDAEMKQAIEKYLSVNSDILDNKYIMQHKLDKQIDSQTKVTEKQAETLSHLSNLAVKNDLHFKKFVTENNIPKEYKKPVELMMNYFKALNSTIANVDEDIEKLSYQPQNKINVVDVPTKYAGDVNKKQQDKIKDFLKSKGIKSDVIDK >CP022905.1|AXJ65840.1|423009_423105_+|hypothetical-protein MRQLMGDFGIDREFKAIKKASNSNMLLDAKW >CP022905.1|AXJ65839.1|422564_422951_-|hypothetical-protein MMKVRITFIILAILSTIVCLFLAAMHPTGPNTVTFEQPYLFTLNIILMVLVALPSLVLAIYDYMSFRISSAILQFLGAISWFFLSLILSLTQFTPFTLASFITSIILFISAIITLAIGGKSVDKNDSH >CP022905.1|AXJ65838.1|421917_422499_+|2,3-bisphosphoglycerate-dependent-phosphoglycerate-mutase MTIYLVRHGESKSNYDNKHFRSYFCGQLDVPLTDTGTKSADDLCDYFKEKQIKHVYVSDLLRTQQTFEHIFPYDIASTTTPLLRERSLGVFEGEYKDEISANPKYEKYFNDPNFKDFRHSFSQKAPEGESYEDVYQRVEHFMNHVVNEDTQKDDIVIVAHQVVIRCLMVYFNKVSREEAVDLKVENCKPYIIE >CP022905.1|AXJ65837.1|421240_421492_+|Transglycosylase-associated-protein MFGFIGMLIVGGLIGWAAGAIMGKDIPGGILGNIIAGIIGSWVGGKLFGQWGPELGSIYILPALIGSIILIAIVTLILRAMRK >CP022905.1|AXJ65847.1|430088_431045_-|hypothetical-protein MLTKEFAQRVELSEKQVRKIVQHLEERGYQLSKTEYRGREATDFKEEDIELFKDIADKVKQTNSYDLAFDELEKEKDFLQVIVKNDDKNLPTNQNVAQLVEDLRLEIQKMREERHLLGQMMNQVHQQQQELKELQNQLTSKIDSNSESLKAIQTSQEAIQEAQASQAKVLAESTNKVEKNAVTEDKADSKDSKVAGVNTSTDAKTDTKAENAGDGTATKVDKEDQISATEAIEKASVEQSKNENAAETSNKEATVDADAQHDAEQQVAEAHAEASKQATSNDSLEAKAENDSTASQSEMSEPKPQEEKKGFFARLFNL >CP022905.1|AXJ65848.1|431162_431825_-|hypothetical-protein MEFKTIQSVKDPHYNEALKLYDTKLNLSLTEDKRIIKRSLENNKTENDYVFIVGLENDVVVSLATAHYEATTNSAFLIYLFAKDLPNHDELMTQTLHQIEHELNLLSNLVHSRSINFLMMEVPKEPADLTQDNGLIIEHRRQFLYEHQFERQTEIDYIHPTNDGHTKKVDLFLKKNIKLTKDIYGTSVKSNYILKYVFANGIAREIIYALLEEMDLRKPF >CP022905.1|AXJ65849.1|431967_432375_-|hypothetical-protein MADITVVNDTGELYNVINQKKSEGYLESELTIISKSKLHLNDLHDSEISLISTSGTFSDRMTKLLTGEDGEHAVLSRYNLAPDELEKYKQLILDDKMLVVAVRDKSSHKEVQEHNSAYEEIDITHFAEASKGPKA >CP022905.1|AXJ65850.1|432887_433466_+|Xanthine-phosphoribosyltransferase MELLGQKVKEDGVVIDEKILKVDGFLNHQIDAKLMNEVGRTFYEQFKDKGITKILTIEASGIAPAIMAALHFDVPCLFAKKAKPSTLTDGYYETSIHSFTKNKTSTVIVSKEFLSEEDTVLIIDDFLANGDASLGLYDIAQQANAKTAGIGIVVEKSFQNGHQRLEEAGLTVSSLCKVASLEGNKVTLVGEE >CP022905.1|AXJ65851.1|433465_434734_+|Uric-acid-permease-PucK MKNLILSVQHLLAMYAGAILVPIIVGTSLKFTPEQIAYLVTVDIFMCGVATFLQANKVTGTGLPIVLGCTFTAVAPMILIGQTKGIDVLYGSLFLSGILVIIIAPFFSHLVKFFPPVVTGSVVTIIGINLMPVAMNYLAGGQGAKDYGDVKNILLGLMTLIIILVLQRFTTGFIKSIAILIGLVLGTIGAGLLGMVDINQVNHAGWLGIPVPFRFSGFSFDVTSTLVFFIVAIVSLIESTGVYHALSEITGKKLERKDFRKGYTAEGLAIVLGSIFNSFPYTAYSQNVGLVSLSGAKKNNVIYGMVVLLLICGCIPKLGALANIIPLPVLGGAMIAMFGMVMAYGVSILGHIDFKNQNNLLIIAVSVGLGTGISAVPQAFKGLGEQFAWLTQNGIVLGAISAIILNFFFNGIKYKQTEENVK >CP022905.1|AXJ65852.1|434771_436238_+|Inosine-5'-monophosphate-dehydrogenase MWESKFAKESLTFDDVLLIPAQSDILPKDVDLSVQLSDKVKLNIPVISAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVIHKNMGVEEQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEESVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKIVDVMTQENLITAPVNTTLEEAEKILQKHKIEKLPLVKDGRLEGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEHGRLLVAAAIGISKDTDIRAQKLVEAGVDVLVIDTAHGHSKGVIDQVKHIKKTYPEITLVAGNVATAEATKDLFEAGADIVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATEARKHGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEIFQGRQYKVYRGMGSLGAMEKGSNDRYFQEDKAPKKFVPEGIEGRTAYKGALQDTIYQLMGGVRAGMGYTGSHDLRELREEAQFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSF >CP022905.1|AXJ65853.1|436262_437804_+|GMP-synthase-[glutamine-hydrolyzing] MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISIEEIKKMNPKGIILSGGPNSVYEEGSFTIDPEIYNLGIPVLGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIINAKSDELFAGLPAEQTVWMSHSDKVIEIPEGFEVIADSPSTDYAAIEDKKRRIYGVQFHPEVRHTEYGNDLLNNFVRRVCDCKGQWTMENFIEIEIEKIRQRVGDRRVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVNAKDRFMNKLKGVSDPEQKRKIIGNEFVYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMEFELIEPINTLFKDEVRKLGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLEIVRESDAILRQVIREEGLEREIWQYFTVLPNIQSVGVMGDYRTYDHTVGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPSTIEWE >CP022905.1|AXJ65854.1|437916_438453_-|hypothetical-protein MHNKNEFNKKLKDFIGSDKRMALVKGYINEYKLTTVLRALNNSDYTKGTIHTRSIGNLKQIVDNRIIPKNITQNKIFKLSNLTLEVNLYERNTIYHGDFAIYYPVESALIIETDTPRLINHINNNPVQKIFIITTNDWSFNTLELEKIVDETIIYDLKQEDPKQYEILYKNKHGKLPY >CP022905.1|AXJ65855.1|438844_439549_-|PemK-like-protein MSKNINQANSKLNTSNKKLKQAYSKSDSKNMKVIYMPHWLEFYSIAIHSDVTSNKKRYYKSFSRGTVVYVKLGSNIGSEFSGNHFCVILDNKDNKGKETVTIVPLSSKGNKNYLKLNESVLNLTATDLKKQIIDISSKVQALTQKYRDIDIKLSTEDKKLLSNLNQKANELYRVIGVYSKHKGKDTYVNISAITTISKRRISKINDSDPTGTIIISEDDMNEIEKQLKIKFFSN >CP022905.1|AXJ65856.1|439947_440220_-|Transposase MTKERRTFSSEFKLQMVRLYKNGKLKNEIIRKYDLKPSIISNSIKQHQNTGPFNHQDNLKSDEKELIKLRKEVQHLKMEHDVLKQILKLI |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022905_3 | 787356-787438 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022905_3
|
1 spacers
spacers of CP022905_3
>3.1|787383|29|CP022905|CRISPRCasFinder CGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGAACG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022905_3
The CRISPR arrays of CP022905_3 >merge|CP022905|3|787356-787438|CRISPRCasFinder CCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGAACGCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGG >CP022905|3|3|787356-787438|CRISPRCasFinder CCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGG CGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGAACG CCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGG
>CP022905.1|AXJ66162.1|786664_787207_+|Putative-5'(3')-deoxyribonucleotidase MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >CP022905.1|AXJ66161.1|785267_786326_+|Histidinol-phosphate-aminotransferase MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEYFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >CP022905.1|AXJ66160.1|783513_785028_+|Choline-transport-system-permease-protein-OpuBB MTNFFDILSERKGQLFSTMIEHIQISFIALLIATAIAVPLGILLTKTKTISEIVMNIAAILQTIPSLALLGLMIPLFGIGRVPAIIALVVYALLPILRNTYTGIKEVDPSLIEAAKGIGMKPFRRLTKVELPIAMPVIMAGVRTAMVLIIGTATLAALIGAGGLGDLILLGIDRNNASLILLGAIPAALLAIIFDLILRFMAKLSYKKLLMTLGVIVMIIILAIAIPMFAQKGDKITLAGKLGSEPSIITNMYKILIEEETKNTVEVKDGMGKTAFLFNALKSDDIDGYLEFTGTVLGELTKEPLKSKEEKKVYEQAKQSLEKKYQMTMLKPMKYNNTYALAVKRDFAKQHNIRTIGDLNKVKDQLKPGFTLEFNDRPDGYKAVQKAYNLNLDNIRTMEPKLRYQAINKGNINLIDAYSTDAELKQYDMVVLKDDKHVFPPYQGAPLFKESFLKKHPEIKKPLNKLENKISDEDMQMMNYKVTVKNEDPYTVAKDYLKAKGLIK >CP022905.1|AXJ66159.1|782543_783521_+|Choline-transport-ATP-binding-protein-OpuBA MIKFKNVTKRYGKHVAVDNISFNINEGEFFVLIGPSGCGKTTTLKMINRLIHLSEGYIYFKDKPISDYPVYEMRWDIGYVLQQIALFPHMTIKENIAQVPQMKKWKEKDIDKRVDELLDMVGLEPEKYKNRKPDELSGGQRQRVGVIRALAADPPVILMDEPFSALDPISREKLQDDLIELQTKIKKTIIFVTHDIQEAMKLGDKICLLNEGHIEQIDTPEGFKNNPQSEFVKQFMGSHLEDDAPCVEENAIIRDLDIMKPIDEVTSMSAYPIVYDNQPIEVLYQHLSESERVIVMQEDSVGQYVIDRKDIFKYLSQKKEVAQHD >CP022905.1|AXJ66158.1|780540_782322_+|ATP-dependent-DNA-helicase-RecQ MMQQTLSHYFGYETFRPGQEEIISKVLDHRNVLGVLPTGGGKSICYQVPGLLLGGTTIVISPLISLMKDQVDQLKAMGIQAAFLNSSLTQKEQQRIEKALSNGEIQFLYVAPERFENRYFLNMLQRIKIHLVAFDEAHCISKWGHDFRPSYQNVISKVFTLPQDFTIIALTATATVEVQQDIREKLNIAQTDQIKTSTKRRNLIFKVNPTYQRQKFILDYIKTHDEDAGIIYCSTRKQVEELQEALESQKIESVIYHAGLSNKEREEAQNDFLFDRVKVVVATNAFGMGIDKSNVRFVIHYNMPGDLESYYQEAGRAGRDGLKSECILLFSERDINLHEYFITVSQADDDYKDKMGEKLTKMIQYTKTKKCLEATIVHYFEPNEKLEECEQCSNCVQQDKSYNMTQEAKMIISCIARMKQQESYSVIIQVLRGESTDYIKYKGYDQISTHGLMKGYTTSELSHLIDELRFKGFLNENDEILMCDTSIKKLLSNEVEVFTTPFKQKATEKVFINTVEGVDRVLFSQLVEVRKKLSDKLTIAPVSIFSDYTLEEFAKRKPASKQDMINIDGVGSYKLKHYCPAFLETIQNYKAKV >CP022905.1|AXJ66157.1|778651_780529_+|putative-ABC-transporter-ATP-binding-protein-YjjK MEAYKIEHLNKSYADKTIFDNLDLSISEGEKIGLVGINGTGKSTLLKVIGGIDDDFTANVMHPNQYRIRYSSQKQDLNEDMTVFDAVLSSDTTTLRIIKQYEQAVQAYADDQSDKLFKRMIDAQDAMDQHDAWDYNAEIKTILSKLGIHDTTKYIKELSGGQQKRVVLAKTLIEQPDLLLLDEPTNHLDFESISWLINYVKQYPHTVLFVTHDRYFLNEVSTRIIELNRGKLASYPGNYESYIEMRAEREVTLQKQQQKQRALYKEELAWMRAGAKARTTKQQARINRFNDLENEVNQQYKDDKGELNLAYSRLGKQVFELEDLSKAINDKVLFEHLTEIIQKGERIGVVGPNGAGKTTLLNILSGEDQQFEGKLKTGQTVKVAYFKQTDETLDRDIRMIDYLREESEVAKEKDGTSVSITQLLERFLFPSATHGKKVYKLSGGEQKRLYLLRLLVHQPNVLLLDEPTNDLDTETLTILEDYIHTFGGTVITVSHDRYFLNKVAQSYWFIHDGQMEKIIGTFEDYESYKKSLDKNKSTLKQQSKSYTTVRKKNGLSYKEKLEYEQLMKRIEQAEVRMEEIDVLMIEASADYGKIKELNEEKEQLEIQYDLDITRWSELEEIKEQQ >CP022905.1|AXJ66156.1|776435_778376_+|Lipoteichoic-acid-synthase MSSQKKKISLFAFFLLTVITITLKTYFSYYVDFSLGVKGLVQNLILLMNPYSLVALVLSVFLFFKGKKAFWFMFIGGFLLTFLLYANVVYFRFFSDFLTFSTLNQVGNVESMGGAVSASFKWYDFVYFIDTLVYLFILIFKTKWLDTKAFSKKFVPVVMAASVALFFLNLAFAETDRPELLTRTFDHKYLVKYLGPYNFTVYDGVKTIENNQQKALASEDDLTKVLNYTKQRQTEPNPEYYGVAKKKNIIKIHLESFQTFLINKKVNGKEVTPFLNKLSSGKEQFTYFPNFFHQTGQGKTSDSEFTMDNSLYGLPQGSAFSLKGDNTYQSLPAILDQKQGYKSDVMHGDYKTFWNRDQVYKHFGIDKFYDATYYDMSDKNVVNLGLKDKIFFKDSANYQAKMKSPFYSHLITLTNHYPFTLDEKDATIEKSNTGDATVDGYIQTARYLDEALEEYINDLKKKGLYDNSVIMIYGDHYGISENHNNAMEKLLGEKITPAKFTDLNRTGFWIKIPGKSGGINNEYAGQVDVMPTILHLAGIDTKNYLMFGTDLFSKGHNQVVPFRNGDFITKDYKYVNGKIYSNKNNELITTQPADFEKNKKQVEKDLEMSDNVLNGDLFRFYKNPDFKKVNPSKYKYETGPKANSKK >CP022905.1|AXJ66155.1|774957_775962_+|KipI-antagonist MSIIIEKSGLFSSFQDFGRRGYEHDGVIPCGALDTLAHEIANRLVANDKNEATLEMTNKMATIRFTKPTLIALAGGNVKAYTEHMTISPYKLYLLDKGDVLKFRETSYTSRVYLAVGGGFELDAWLGSNSTDFNVKIGGFKGRTLQDGDEIKLKRDYTARHHKLFENLAHTKQTDWGIDGYALSFNYMSDVFHVVKNKGTEDFKEDAIQRFVKHDYKVTSKANRMGMMLEGEKIKAFYEDMPPYQTVKKGTIQIKRDGTPIILLNDHYTLGSYPQIGTIASYHLTKLAQKPQGSRLKFQFIDILTAEKNLVKYSNWLNQLFHGIEYRMQLEMMK >CP022905.1|AXJ66154.1|774263_774974_+|Kinase-A-inhibitor MKIYSQGDQAIVVAIEKEVSKSLTEDLLTLRSYLIEQNYPFIIEIVPSESDMMIVYDARDMIKHHNIQSPFLYMKALIESIHLNIKHDFNQQDLIEIPIVYGSKYGPDIESLLKHYKIKLETFIELHSKTQYFVSMMGYSPGFPYLTGLNKKLYINHTSKQKKFIPAGSVVLEGKKCGIVTTDTINDWLVIGYTPLSLFNPKESDFARLKLGDNIKFRPINENELEVGAFKDVNHN >CP022905.1|AXJ66153.1|773295_773904_+|hypothetical-protein MQLFETMKIDNGYIPRLTYHTNRIKCSSERLNFKFDEHAWRNELNDVTTKYHSGQYRLKIVLNAESKFETIVSPLPEKSSFTAKFQVLPKVVNPTFIKNKTTERKHLAHNHETDLILLTSEDGKVLEFDIGNIVIEEDGKWYTPSYKDDFLKGCMRDYLIDSDKLVEKDFNKNELIYKYHNNEIRLFLINSLREVADVHLCL >CP022905.1|AXJ66163.1|788085_789003_-|Putative-lipid-kinase MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMSHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >CP022905.1|AXJ66164.1|789381_790986_+|Transposase-DDE-domain-protein MYQNYTINQLCLPIDLEIKLEENDFAHAIVQFVDSIPDEVFLPYYQSMGRPQYHPRMLLSIILCAYIQGVYSGRQIQNMLIDSIRMRYLSQEQFPNFRTINRFRVHPIMNDILDHSFVQFRELLVQSGLISGSALYIDGTKIEADANKYSFVWKKSILKYKDSLDQKALENYQQMVETKILPELIDDLKDELSIEEIERIRQSLEEKENQLIEAIDQTETVEERKLLRKEKSEVHKQKKRFDDFAQRKMSYEEQLVIMGVRNSFSKTDHDATFMRMKEDHMLNGQLKPGYNIQLATENQFALAYDCYPNPTDTRTFIPFLEKIESKIGLPENIVADAGYASEENYCYVLDETESTPIIPHQGYLKEKKRAHKQNQFHRDNWTYNELDDYYICPNQKRVVFSHYSQRKDRNGFIRNFKIYECEDCTGCPLREKCTKAKEGKNRRLNINPTWEYIKIKANEKIESKETASYYAQRKIDVETVFGNIKQNMKFKRFHVRGAEKIFKEMGLVFLAHNFRKLVTRVRKYEGKTIIQNQI >CP022905.1|AXJ66165.1|791112_792618_-|Di-/tripeptide-transporter MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >CP022905.1|AXJ66166.1|792958_793459_-|NADPH-dependent-7-cyano-7-deazaguanine-reductase MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >CP022905.1|AXJ66167.1|793478_794345_-|EamA-like-transporter-family-protein MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFLYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSSREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFVLFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >CP022905.1|AXJ66168.1|795145_795544_+|ribonucleotide-reductase-stimulatory-protein MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >CP022905.1|AXJ66169.1|795506_797612_+|Ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-alpha-2 MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSISFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >CP022905.1|AXJ66170.1|797729_798701_+|Ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-beta MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >CP022905.1|AXJ66171.1|799033_800047_+|Fe(3+)-dicitrate-transport-system-permease-protein-FecD MIMIIINLKGEKFVMKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >CP022905.1|AXJ66172.1|800033_800990_+|Iron-uptake-system-permease-protein-FeuC MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022905_4 | 830143-830221 | Unclear |
NA
Consensus repeat of CP022905_4
|
1 spacers
spacers of CP022905_4
>4.1|830167|31|CP022905|CRISPRCasFinder CTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGCC |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022905_4
The CRISPR arrays of CP022905_4 >merge|CP022905|4|830143-830221|CRISPRCasFinder TGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCT >CP022905|4|4|830143-830221|CRISPRCasFinder TGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCT CTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGCC TGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCT
>CP022905.1|AXJ66197.1|826969_829816_+|UvrABC-system-protein-A MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNIDLSEQDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIDVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGIDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYGKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDK >CP022905.1|AXJ66196.1|824976_826962_+|UvrABC-system-protein-B MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVDGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >CP022905.1|AXJ66195.1|824471_824708_+|hypothetical-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >CP022905.1|AXJ66194.1|823824_824475_+|5'-deoxynucleotidase-YfbR MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENE >CP022905.1|AXJ66193.1|822811_823651_+|Secretory-antigen-SsaA-precursor MKKTLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQHGTQVKTPVQHNYVSNVQAQTQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKAVKSPVRKASQAKKVVKQPVQQASKKVVVKQAPKQAVAKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTPEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH >CP022905.1|AXJ66192.1|821410_822403_+|Peptide-chain-release-factor-2 MAEPNFWDNQTKAQDIIDKNNALKAIVNGYKTLQAEVDDMDATWDLLQEEFDEEMKEDLEQEVINFKAKVDEYELQLLLDGPHDANNAILELHPGAGGTESQDWANMLFRMYQRYCEKKGFKVETVDYLPGDEAGIKSVTLLIKGHNAYGYLKAEKGVHRLVRISPFDSSGRRHTSFASCDVIPDFNNDEIEIEINPDDITVDTFRASGAGGQHINKTESAIRITHHPSGIVVNNQNERSQIKNREAAMKMLKSKLYQLKLEEQAREMAEIRGEQKEIGWGSQIRSYVFHPYSMVKDHRTNEETGKVDAVMDGDIGPFIESYLRQTMSHD >CP022905.1|AXJ66191.1|818446_820978_+|preprotein-translocase-subunit-SecA MGFLSKILDGNNKEIKQLGKLADKVIALEEKTAILTDEEIRNKTKQFQTELADIDNVKKQNDYLDKILPEAYALVREGSKRVFNMTPYKVQIMGGIAIHKGDIAEMRTGEGKTLTATMPTYLNALAGRGVHVITVNEYLSSVQSEEMAELYNFLGLTVGLNLNSKTTEEKREAYAQDITYSTNNELGFDYLRDNMVNYSEDRVMRPLHFAIIDEVDSILIDEARTPLIISGEAEKSTSLYTQANVFAKMLKQDEDYKYDEKTKAVHLTEQGADKAERMFKVENLYDVQNVDVISHINTALRAHVTLQRDVDYMVVDGEVLIVDQFTGRTMPGRRFSEGLHQAIEAKEGVQIQNESKTMASITFQNYFRMYNKLAGMTGTAKTEEEEFRNIYNMTVTQIPTNKPVQRNDKSDLIYISQKGKFDAVVEDVVEKHKAGQPVLLGTVAVETSEYISNLLKKRGIRHDVLNAKNHEREAEIVAGAGQKGAVTIATNMAGRGTDIKLGEGVEELGGLAVIGTERHESRRIDDQLRGRSGRQGDKGDSRFYLSLQDELMIRFGSERLQKMMSRLGLDDSTPIESKMVSRAVESAQKRVEGNNFDARKRILEYDEVLRKQREIIYNERNSIIDEEDSSQVVDAMLRSTLQRSINYYINTADDEPEYQPFIDYINDIFLQEGDITEDDIKGKDAEDIFEVVWAKIEAAYQSQKDILEEQMNEFERMILLRSIDSHWTDHIDTMDQLRQGIHLRSYAQQNPLRDYQNEGHELFDIMMQNIEEDTCKFILKSVVQVEDNIEREKTTEFGEAKHVSAEDGKEKVKPKPIVKGDQVGRNDDCPCGSGKKFKNCHGK >CP022905.1|AXJ66190.1|817460_818033_+|Putative-sigma-54-modulation-protein MIRFEIHGDNLTITDAIRNYIEEKIGKLERYFNDVPNAVAHVKVKTYSNSATKIEVTIPLKNVTLRAEERNDDLYAGIDLINNKLERQVRKYKTRINRKSRDRGDQEVFVAELQEMQETQVDNDAYDDNEIEIIRSKEFSLKPMDSEEAVLQMNLLGHDFFVFTDRETDGTSIVYRRKDGKYGLIQTSEQ >CP022905.1|AXJ66189.1|816725_817400_+|DNA-utilization-protein-GntX MNNCLSCGAKLYENITIYNLFKKPNRLCDRCKENWDNIKLDIKARRCSRCLKHLNQDEAYCLDCKFLSAHFNLMEQLYCQFQYDGLMKEMIHQYKFLKDYYLCELLAHLIEIPQTSYDYIVPIPSSPAHDLSRTFNPVEAVLKAKGIRFDKILKMSNRPKQSHLTKKERLADENPFIIDTELDLNGKEILLVDDIYTTGLTIHRAGCKLYAKNIRKFKVFAFAR >CP022905.1|AXJ66188.1|815650_816733_+|UvrABC-system-protein-B MDNVTRYKITESSQSSSQAYYHLSFELSEQQSYASEHIVRAIRMRQTILLYAVTGAGKTEMMFQGIQYARRQGDNIAIVSPRVDVVVEISKRMKDAFLNEDIDILHQQSSQQFEGHFVVCTVHQLYRFKQHFDTIFIDEVDAFPLSMDKSLQQALKSSSKVEHATIYMTATPPKQLLSEIPHENIIKLPARFHKKSLPVPKYRYFKLNNNKIQKMLYRILQDQINNQRYTLVFFNNIETMIKTFSVYKQKITKLTYVHSEDVFRFEKVEQLRNGHFDVIFTTTILERGFTMANLDVVVIDAHQYTQEALIQIAGRVGRKLECPAGKVLFFHEGVSMNMIQAKKEIQRMNKLALKRGWIDE >CP022905.1|AXJ66198.1|830479_831412_+|HPr-kinase/phosphorylase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >CP022905.1|AXJ66199.1|831417_832257_+|Prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPSEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >CP022905.1|AXJ66200.1|832264_832750_+|Maltose-O-acetyltransferase MRKFLSKTHHHTNPLWRVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >CP022905.1|AXJ66201.1|832757_834197_+|Anaphase-promoting-complex,-cyclosome,-subunit-3 MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYQNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >CP022905.1|AXJ66202.1|834263_835199_+|Thioredoxin-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >CP022905.1|AXJ66203.1|836084_836996_+|glmZ(sRNA)-inactivating-NTPase MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >CP022905.1|AXJ66204.1|836992_837988_+|Gluconeogenesis-factor MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >CP022905.1|AXJ66205.1|838098_839043_+|Putative-sporulation-transcription-regulator-WhiA MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >CP022905.1|AXJ66206.1|839606_840194_+|ATP-dependent-Clp-protease-proteolytic-subunit MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >CP022905.1|AXJ66207.1|840436_841306_-|Epimerase-family-protein MVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQNIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKVLFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGMILSNGGGALQTMKLPYKYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINNESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLIKE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP022905_5 | 835598-835867 | Unclear |
NA
Consensus repeat of CP022905_5
|
4 spacers
spacers of CP022905_5
>5.1|835634|22|CP022905|CRT CCTGTAGAATTTCTTTTCGAAA >5.2|835692|23|CP022905|CRT TCTGTAGAAATTGGAAATCCAAT >5.3|835751|22|CP022905|CRT CCTGTAGAATTTCTTTTCGAAA >5.4|835809|23|CP022905|CRT TCTGTAGAAATTGGAAATCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022905_5
The CRISPR arrays of CP022905_5 >merge|CP022905|5|835598-835867|CRT GCTTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTTTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGGAAATCCAATTTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGGAAATCCAATTTCTCTGTGTTGGGGCCCCTGACTAGAGTTGAAAAA >CP022905|5|1|835598-835867|CRT GCTTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATTG CCTGTAGAATTTCTTTTCGAAA TTCTCTTTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTG TCTGTAGAAATTGGAAATCCAAT TTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATTG CCTGTAGAATTTCTTTTCGAAA TTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTG TCTGTAGAAATTGGAAATCCAAT TTCTCTGTGTTGGGGCCCCTGACTAGAGTTGAAAAA
>CP022905.1|AXJ66202.1|834263_835199_+|Thioredoxin-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >CP022905.1|AXJ66201.1|832757_834197_+|Anaphase-promoting-complex,-cyclosome,-subunit-3 MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYQNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >CP022905.1|AXJ66200.1|832264_832750_+|Maltose-O-acetyltransferase MRKFLSKTHHHTNPLWRVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >CP022905.1|AXJ66199.1|831417_832257_+|Prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPSEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >CP022905.1|AXJ66198.1|830479_831412_+|HPr-kinase/phosphorylase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >CP022905.1|AXJ66197.1|826969_829816_+|UvrABC-system-protein-A MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNIDLSEQDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIDVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGIDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYGKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDK >CP022905.1|AXJ66196.1|824976_826962_+|UvrABC-system-protein-B MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVDGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >CP022905.1|AXJ66195.1|824471_824708_+|hypothetical-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >CP022905.1|AXJ66194.1|823824_824475_+|5'-deoxynucleotidase-YfbR MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENE >CP022905.1|AXJ66193.1|822811_823651_+|Secretory-antigen-SsaA-precursor MKKTLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQHGTQVKTPVQHNYVSNVQAQTQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKAVKSPVRKASQAKKVVKQPVQQASKKVVVKQAPKQAVAKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTPEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH >CP022905.1|AXJ66203.1|836084_836996_+|glmZ(sRNA)-inactivating-NTPase MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >CP022905.1|AXJ66204.1|836992_837988_+|Gluconeogenesis-factor MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >CP022905.1|AXJ66205.1|838098_839043_+|Putative-sporulation-transcription-regulator-WhiA MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >CP022905.1|AXJ66206.1|839606_840194_+|ATP-dependent-Clp-protease-proteolytic-subunit MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >CP022905.1|AXJ66207.1|840436_841306_-|Epimerase-family-protein MVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQNIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKVLFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGMILSNGGGALQTMKLPYKYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINNESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLIKE >CP022905.1|AXJ66208.1|842041_842671_+|hypothetical-protein MSNQNYDYNKNEDGSKKKMSTTAKVVSIATVLLLLGGLVFAIFAYVDHSNKAKERMLNEQKQEQKEKRQKENAEKERKKKQQEEKEQNELDSQANQYQQLPQQNQYQYVPPQQQAPTKQRPAKEENDDKASKDESKDKDDNASQDKSDDNQKKTDDNKQPAQPKPQPQQPTPKPNNNQQNNQSNQQAKPQAPQQNSQSTTNKQNNANDK >CP022905.1|AXJ66209.1|843371_844385_+|Central-glycolytic-genes-regulator MKDLLQAQQKLIPDLIDKMYKRFSILTTISKNQPVGRRSLSEHMDMTERVLRSETDMLKKQDLIKVKPTGMEITAEGEQLISQLKGYFDIYADDNRLSEGIKNKFQIKEVHVVPGDADNSQSVKTELGRQAGQLLEGILQEDAIVAVTGGSTMACVSEAIHLLPYNVFFVPARGGLGENVVFQANTIAASMAQQAGGYYTTMYVPDNVSETTYNTLLLEPSVINTLDKIKQANVILHGIGDALKMAHRRQSPEKVIEQLQHHQAVGEAFGYYFDTQGQIVHKVKTIGLQLEDLESKDFIFAVAGGKSKGEAIKAYLTIAPKNTVLITDEAAAKIILE >CP022905.1|AXJ66210.1|844437_845448_+|Glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase-1 MAVKVAINGFGRIGRLAFRRIQEVEGLEVVAVNDLTDDDMLAHLLKYDTMQGRFTGEVEVVDGGFRVNGKEVKSFSEPDASKLPWKDLNIDVVLECTGFYTDKDKAQAHIEAGAKKVLISAPATGDLKTIVFNTNHQELDGSETVVSGASCTTNSLAPVAKVLNDDFGLVEGLMTTIHAYTGDQNTQDAPHRKGDKRRARAAAENIIPNSTGAAKAIGKVIPEIDGKLDGGAQRVPVATGSLTELTVVLEKQDVTVEQVNEAMKNASNESFGYTEDEIVSSDVVGMTYGSLFDATQTRVMSVGDRQLVKVAAWYDNEMSYTAQLVRTLAYLAELSK >CP022905.1|AXJ66211.1|845586_846777_+|Phosphoglycerate-kinase MAKKIVSDLDLKGKTVLVRADFNVPLKDGEITNDNRIVQALPTIQYIIEQGGKIVLFSHLGKVKEESDKAKLTLRPVAEDLSKKLDKEVVFVPETRGEKLEAAIKDLKEGDVLLVENTRYEDLDGKKESKNDPELGKYWASLGDVFVNDAFGTAHREHASNVGISTHLETAAGFLMDKEIKFIGGVVNDPHKPVVAILGGAKVSDKINVIKNLVNIADKIIIGGGMAYTFLKAQGKEIGISLLEEDKIDFAKDLLEKHGDKIVLPVDTKVAKEFSNDAKITVVPSDSIPADQEGMDIGPNTVKLFADELEGAHTVVWNGPMGVFEFSNFAQGTIGVCKAIANLKDAITIIGGGDSAAAAISLGFENDFTHISTGGGASLEYLEGKELPGIKAINNK >CP022905.1|AXJ66212.1|846898_847660_+|Triosephosphate-isomerase MRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTAVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGETSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHETDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETEEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSEDQLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGASLKVEDFVQLLEGAK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022905_6 | 897427-897508 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022905_6
|
1 spacers
spacers of CP022905_6
>6.1|897451|34|CP022905|CRISPRCasFinder ATTGAGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022905_6
The CRISPR arrays of CP022905_6 >merge|CP022905|6|897427-897508|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGAGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCATCCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA >CP022905|6|5|897427-897508|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAA ATTGAGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCAT CCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA
>CP022905.1|AXJ66275.1|896444_897323_+|hypothetical-protein MLNIQDVSHLSKKEQKAYNRFVESVENGNLPVLPCIEMDLKEMQEETLSQSKIGGMPFLKSFKDIPLDENNVPMVLLAQINLNDLPEQQELFPVNEGILQFWISSEDQMYGMSENLKGNNINSRLVYIKEPITDLSLENIQVHLKSLDADNEDIPFSGAFSIEFRLSKQTITCTDYKYDEDVLALWNKVNPSFALKSMFGGYDELMEPVCNTFTAKEPFNQLGGYPYFDQIDPRTNDQELKMYDRVLLQIDSTRDGNSSIIWGDLGIANILVKSTDLEAMKFDDYMYSWDCS >CP022905.1|AXJ66274.1|896329_896443_+|hypothetical-protein MKENLLGTIIWSIATFYYSRMMKIMNLAILKIKIGGS >CP022905.1|AXJ66273.1|895885_896266_+|Glycine-cleavage-system-H-protein MAVPNELKYSKEHEWVKVEGNVATIGITEYAQSELGDIVFVELPETDDEINEGDTFGSVESVKTVSELYAPISGKVVEVNEELEDSPEFVNESPYEKAWMVKVEISDESQLEALLTAEKYSEMIGE >CP022905.1|AXJ66272.1|895371_895728_+|Regulatory-protein-MgsR MIKFYQYKNCTTCKKAAKFLDEYGVSYEPIDIVQHTPTINEFKTIIANTGVEINKLFNTHGAKYRELDLKNKLQTLSDDEKLELLSSDGMLVKRPLAVMGDKITLGFKEDQYKETWLA >CP022905.1|AXJ66271.1|894907_895228_-|Thioredoxin-like-protein-YdbP MQAIKSNESFKSIINSDTPVIVKFEAGWCPDCRAMDLWIDPIVEQYNDYQWYTVNRDELEDVVVENEVMGIPSLLVFKNGDKIAHLHSANAKSPEQVESFLAETFK >CP022905.1|AXJ66270.1|894217_894757_+|putative-oxidoreductase MELQQAIANRRSVKKFKRDMHIDDALLYQAIEKAADAPNHGMREPWRVVHVPKDRLGDMSKDISKFAFPNELDKQQCHYDAVTKLGGMLLLILKTDPRQRQNDENYFAFGAYAQNLMLLLYEAGIGTCWKSPLYIYDPKVRKTLGIKKDEVLAGFLYLTDLEEDMPKAPRKNRNLITLY >CP022905.1|AXJ66269.1|893418_894135_+|3-dehydroquinate-dehydratase MTHVEVVATIAPQLSIEETLIQKINHRIDAIDVLELRIDQIENVTVDQVAEMITKLKVMQDSFKLLVTYRTKLQGGYGQFINDLYLNLISDLANINGIDMIDIEWQADIDIEKHQRIIKHLQQYNKEVVISHHNFESTPPLDELQFIFFKMQKFNPEYVKLAVMPHNKNDVLNLLQAMSTFSDTMDCKVVGISMSKLGLISRTAQGVFGGALTYGCIGEPQAPGQIDVTDLKAQVTLY >CP022905.1|AXJ66268.1|892848_893271_-|Organic-hydroperoxide-resistance-protein-like-protein MAIHYETKATNVGGRKGHVYTDDRALDIDIVPPAQADGKATNPEQLFAAGYASCFNGAFDLILKQNKVRDAHPEVTLTVRLEDDSDSESPKLSVSIDATIKNVISQEEAEKYLQMAHEFCPYSKATQGNINVDLNVNVVD >CP022905.1|AXJ66267.1|891955_892450_-|hypothetical-protein MIEIKTLTNNDFNEYKRLVSTVNEEFTQDSHYSQTMTDTLIHDILNQGSPKCIVFGCYENETLIATAALEQIRYVGKEHKSLIKYNFVTNNDKSINSELINFIINYARQNNYESLLTSIVSNNIGAKVFYSALGFDILGFEKNAIKIGNTYFDEHWLFYDLINK >CP022905.1|AXJ66266.1|891183_891801_-|Arginine-exporter-protein-ArgO MVTAIIHGFILAIGLILPLGAQNVFIFNQGANQPKYRYVLPAIITAGLSDSLLIIIAVVGVSIIIMSLPVLQAIIYIVGLIFLMYMAWTIWHDKPSTDGEAQIISPMKQVSFALSVSLLNPHAILDTIGVIGSSAALYSGSNKIAFTIACISVSWLWFFLLAILGKMVGSIDKTGKLLTIINKISSIIIIIVALMILQKLIQLLF >CP022905.1|AXJ66276.1|898115_898505_+|Ribonuclease-M5 MMAIVNKVIIVEGKSDKKRVQQVIAEPVNIICTHGTMSIDKLDDMIESLYDKQVFVLADSDDEGDRIRNWFKRYLSESEHIFIDKTYCQVANCPKQYLAHVLSKHGFTCKKETPLLPNINNERLVLVNE >CP022905.1|AXJ66277.1|898497_898794_+|Thioredoxin MNNSLDIKDVTTFYEEDKHLIFGYTPTCGTCKVSERMLDIANEILQLPLLKIDLNFYPQFCKDMQIMSTPILLLMNKDKEVKRIYAFKSVTDLLENLK >CP022905.1|AXJ66278.1|899043_900069_+|Methionine-import-ATP-binding-protein-MetN-2 MIELKEVVKEYRTKNKEVLAVDHVNLSIRAGSIYGVIGFSGAGKSTLIRMFNHLEAPTSGEVIIDGDHIGQLSKNGLRAKRQKVSMIFQHFNLLWSRTVLKNIMFPLEIAGVPRRRAKQKALELVELVGLKGREKAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPTVLLCDEATSALDPQTTDEILDLLLKIREQQNLTIVLITHEMHVIRRICDEVAVMESGKVIEHGPVTQVFENPQHTVTKRFVKEDLNDDFETSLTELEPLEKDAYIVRLVFAGSTTTEPIVSSLSTAYDIKINILEANIKNTKNGTVGFLVLHIPYISSVDFGKFEKELIERQVKMEVLRHG >CP022905.1|AXJ66279.1|900061_900757_+|Methionine-import-system-permease-protein-MetP MGKSFSEIINEMITMPNIQWPEVWTAIVETLYMTVVSTIFAFILGLILGVLLFLSAKGKSIGARLFYSIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSLILGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTWIVIRKVLLPEAMPALVSGITVTAIALVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWLTNKLDKR >CP022905.1|AXJ66280.1|900774_901596_+|Methionine-binding-lipoprotein-MetQ-precursor MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGNKSGSDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYDLDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGDVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFLPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK >CP022905.1|AXJ66281.1|901949_902144_+|CsbD-like-protein MADESKFEQAKGNVKETVGNVTDNKNLENEGKEDKASGKAKEFVENAKEKATDFIDKVKGNKGE >CP022905.1|AXJ66282.1|902377_903229_-|hypothetical-protein MQQFKWINILKGFAMGTSDLVPGVSGGTIALLLGIYNQFIASISGIFSRRFWPSFTFLIPIIIGMLLAMGSLSNLFNYLLSQHHIPTMFFFGGLIIGIVPYLLKISNYKTSFTTKHYMMVIAGIAILIVITLMNNGDKHAGETLTLSTGLIIKYFIAGMCASSAMLLPGISGSFMLLVFGVYGTVMLAISEVVKLNFTGLPILLAVGFGVLAGFIISSKIIQYFLTHHKLMTFALIIGFVVGSLFAVFPGLPTNIVMWFVSLVVFIIGFIVSLTLGRITAENE >CP022905.1|AXJ66283.1|903556_904318_+|YurY MASTLEIKDLHVSIEDKEILKGVNLTINTDEIHAIMGPNGTGKSTLSSAIMGHPSYEVTKGEVLLDGVNILELEVDERAKAGLFLAMQYPSEITGVTNADFMRSAINAKREEGQEINLMQFIKKLDKNMDFLDIDKDMAQRYLNEGFSGGEKKRNEILQLMMLEPKFAILDEIDSGLDIDALKVVSKGINQMRGENFGALMITHYQRLLNYITPDKVHVMYAGKVVKSGGPELAKRLEEEGYEWVKEEFGSAE >CP022905.1|AXJ66284.1|904415_905723_+|FeS-cluster-assembly-protein-SufB MTTDILNISEEQLVDYSKAHNEPSWMTELRKKALKLTETLEMPKPDKTKLRKWDFDSFKQHDVKGDVYQSLSQLPESVREIIDVDHSKNLVIQHNNTIAYTQVDDNASKDGVIVEGLADALMNHSDLVQKHFMKDAVTVDEHRITALHTALVNGGVFVYVPKNVVVEHPVQYVVLHDDKNASFYNHVIIVTEESAEVTYVENYLSNASGEGNQLNIISEVIAGANSNITYGSVDYMDKGFTGHIIRRGITEADASINWALGLMNEGSQIIDNTTNLFGDRSTSSLKSVVVGTGEQKINLTSKIVQYGKETDGYILKHGVMKEHASSVFNGIGYIKHGGTKSIANQESRVLMLSEHARGDANPILLIDEDDVQAGHAASVGRVDPDQLYYLMSRGISQREAERLVIHGFLDPVVRELPIEDVKRQLREVIERKVSK >CP022905.1|AXJ66285.1|905837_907079_+|putative-cysteine-desulfurase MAEHSFDVNEVIKDFPILDQKVNGKRLAYLDSTATSQTPMQVLNVLEDYYKRYNSNVHRGVHTLGSLATDGYENARETVRRFINAKYFEEIIFTRGTTASINLVAHSYGDANVEEGDEIVVTEMEHHANIVPWQQLAKRKNATLKFIPMTADGELNIEDIKQTINDKTKIVAIAHISNVLGTINDVKTIAEIAHQHGAIISVDGAQAAPHMKLDMQEMNADFYSFSGHKMLGPTGIGVLFGKRELLQKMEPIEFGGDMIDFVSKYDATWADLPTKFEAGTPLIAQAIGLAEAIRYLERIGFDAIHKYEQELTIYAYEQMSAIEGIEIYGPPKDRRAGVITFNLQDVHPHDVATAVDTEGVAVRAGHHCAQPLMKWLNVSSTARASFYIYNTKEDIDQLINALKQTKEFFSYEF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP022905_7 | 984211-984292 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022905_7
|
1 spacers
spacers of CP022905_7
>7.1|984235|34|CP022905|CRISPRCasFinder CCAACACAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022905_7
The CRISPR arrays of CP022905_7 >merge|CP022905|7|984211-984292|CRISPRCasFinder ACAATGCAAGTTGGGGTGGGGGCCCCAACACAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGTAAGTTGGGGTGGGGGCC >CP022905|7|6|984211-984292|CRISPRCasFinder ACAATGCAAGTTGGGGTGGGGGCC CCAACACAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAA ACAATGTAAGTTGGGGTGGGGGCC
>CP022905.1|AXJ66349.1|982761_984069_-|Ktr-system-potassium-uptake-protein-B MNKVHKPLYFYLMLFFSTTIIGALLLYLPFTGKKPISFLDALFIASSAFTVTGLSPVDIGSQFNILGEIVILLLIQIGGLGIVTVTLLTLVFLNRKISMKNRFLIMVTWNIDEPGGVIKLIKHLAIYSLVTELIGMICLCLSFIPKFGIGKGLFLSLFTSVSAFNNAGFALFKNNLIDYSSDPIVIITISILIIFGGIGHFVVIDFINCKKLSKLSLHSKLVLTTTSILIIIGAITFFLLEQFNTMQHMGLVEKIGNSFFQSVTTRTAGFNSIDIASINKSTALMLMLLMFIGGAPLSAAGGIKITTFAVAFIFVLNYIRKENNVSVFNKEISDKHIKLSIVTINISFLFISIITFILSIINPNISLIKLLFEVVSAFGTVGLSMNLTTEYHGITKIIIIFVMLCGKVGLLTLLRTFIPPKSPKNYRYTKGQIYL >CP022905.1|AXJ66348.1|981364_982684_+|Transposase MCNDTLELLRIKDENIKYINQEIDVIIKGKKATVVNAVLTYKPSACYCCGVKNEGQIHKHGKRVSRITLLKTQGYNTYLNLAKQRFKCLECNGTFTAKTSIVDESCFISRCVTQKVIEEATKVKTEIDTAEDNCISPSTVSRIRTKAANSLRIKPFNCLPEHIAMDEFKSVKNVTGSMSFIFIDNDTHDVIDILENRTTRFLRAYFERFDLKNRQQVKTVTIDMYEPYVRLFRDLFPNAAIIFDRFHIVQHLNRELNKYRVQVMNEYRNKKGPNYTIFKNNWKVLLMDTSKTIFSKYRWNKSFKAYKRSSDIVEFMLSKDDILRRSYELVQGLRKDLRLCNWPKFINRLNSVSKKSVSKGVWKVVKYYRKHQRMLRNTIYYPAFNNGAIEGINNKIKLIKRISFGYRNFNNFKARIMMIFSLYKGEKKKTTKPNNGLAA >CP022905.1|AXJ66347.1|979085_980702_+|60-kDa-chaperonin MVKQLKFSEDARQAMLRGVDQLANAVKVTIGPKGRNVVLDKEFTAPLITNDGVTIAKEIELEDPYENMGAKLVQEVANKTNEIAGDGTTTATVLAQAMIQEGLKNVTSGANPVGLRQGIDKAVKVAVEALHENSQKVENKNEIAQVGAISAADEEIGRYISEAMEKVGNDGVITIEESNGLNTELEVVEGMQFDRGYQSPYMVTDSDKMVAELERPYILVTDKKISSFQDILPLLEQVVQSNRPILIVADEVEGDALTNIVLNRMRGTFTAVAVKAPGFGDRRKAMLEDLAILTGAQVITDDLGLDLKDASIDMLGTASKVEVTKDNTTVVDGDGDENSIDARVSQLKSQIEETESDFDREKLQERLAKLAGGVAVIKVGAASETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTALVNVYQKVSEIEAEGDIETGVNIVLKALTAPVRQIAENAGLEGSVIVERLKNAEPGVGFNAATNEWVNMLEAGIVDPTKVTRSALQHAASVAAMFLTTEAVVASIPEKNNDQPNMGGMPGMM >CP022905.1|AXJ66346.1|978725_979010_+|10-kDa-chaperonin MLKPIGNRVIIEKKEQEQTTKSGIVLTDSAKEKSNEGVIVAVGTGRLLNDGTRVTPEVKEGDRVVFQQYAGTEVKRDNETYLVLNEEDILAVIE >CP022905.1|AXJ66345.1|977807_978551_-|CAAX-amino-terminal-protease-self--immunity MTRLWASLLTVIIYILSQFLPLLIVKKLPFVQYSGIELTKAVIYIQLVLFLIAATTIILINLKIKNPTKLELEVKEPKKYIIPWALLGFALVMIYQMVVSIVLTQIYGGQQVSPNTEKLIIIARKIPIFIFFVSIIGPLLEEYVFRKVIFGELFNAIKGNRIVAFIIATTVSSLIFALAHNDFKFIPVYFGMGVIFSLAYVWTKRLAVPIIIHMLQNGFVVIFQLLNPEALKKATEQANFIYHIFIP >CP022905.1|AXJ66344.1|976574_977783_+|hypothetical-protein MSYHWFKKMLLSTSILILSSSSLGLATHTVEAKDNLNGEKPTTNLNHNITSPSVNSEMNNNETGTPHESNQTGNEGTGSNSRDANPDSNNVKPDSNNQNPSTDSKPDPNNQNPSPNPKPDPDNPKPKPDPKPDPDKPKPNLDPKPDPDNPKPKPDPDKPKPNPNPKPDPNKPNPNPSPDPDQPGDSNHSGGSKNGGTWNPNASDGSNQGQWQPNGNQGNSQNPTGNDFVSQRFLALANGAYKYNPYILNQINKLGKDYGEVTDEDIYNIIRKQNFSGNAYLNGLQQQSNYFRFQYFNPLKSERYYRNLDEQVLALITGEIGSMPDLKKPEDKPDSKQRSFEPHEKDDFTVVKKQEDNKKSASTAYSKSWLAIVCSMMVVFSIMLFLFVKRNKKKNKNESQRR >CP022905.1|AXJ66343.1|975751_976378_-|Nitroreductase-family-protein MGLFKKDKKAMTFDNAMEERRSIYNLKDSISISDDELESMIAHAVKHVPSSFNSQSTRIVLLLNDNNNKFWDNTKAILKEVMGENRDFEPTEQKIDNFKHSYGTILFYEDQDVVSGLQEQMPNYYDNFAIWSTQTNAMHQFAIWTALATKGIGASLQHYNPLVDEMTSKEFNIPKSWKLIAQMPFGDIREAAGEKTFNPVEDRFVIKK >CP022905.1|AXJ66342.1|974605_975391_-|2-oxoglutaramate-amidase MKVQIYQLPIIFGDSSKNETQITQWFEKNMNAEVDVVVLPEMWNNGYDLEHLNEKADNNLGQSFSFIKHLAEKYKVDIVAGSVSNIRNYQIFNTAFSVNKSGQLINEYDKVHLVPMLREHEFLTAGENVAEPFQLSDGTYVTQLICYDLRFPELLRYPARSGAKIAFYVAQWPMSRLQHWHSLLKARAIENNMFVIGTNSTGFDGNTEYAGHSIVINPNGDLVGELNESADILTVDLNLNEVEQQRENIPVFKSIKLDLYK >CP022905.1|AXJ66341.1|973871_974006_+|Delta-hemolysin MSCLILRIFILIKEGVISMAQDIISTIGDLVKWIIDTVNKFTKK >CP022905.1|AXJ66340.1|973072_973690_-|Accessory-gene-regulator-protein-B MIKDCTKSYNNSEESGVKLNYFDNKIDQFATYLQKRNNLDHIQFLQVRLGMQIIVGNFFKILVTYSISIFLSVFLFTLVTHLSYMLIRYNAHGAHAKSSILCYIQSILTFVFVPYFLINIDINFTYLLALSIIGLISVVIYAPAATKKQPIPIKLVKRKKYLSIIMYLLVLILSLIIHPFYAQFMLLGILVESITLLPIFFPKED >CP022905.1|AXJ66350.1|984512_985736_-|putative-succinyl-diaminopimelate-desuccinylase MTTFSEKEKIQLLADIVELQTENNNEIDVCNYLKDLFDKYDIKSEILKVNEHRANIVAEIGNGSPILALSGHMDVVDAGNQDNWTYPPFQLTEKAGKLYGRGTTDMKGGLMALVITLIELKEQNQLPQGTIRLLATAGEEKEQEGAKLLADKGYLDDVDGLIIAEPTGSGIYYAHKGSMSCKVTATGKAVHSSVPFIGDNAIDTLLEFYNQFKEKYSELKKHDTKHELDVAPMFKSLIGKEISEEDANYASGLTAVCSIINGGKQFNSVPDEASLEFNVRPVPEYDNDFIESFFQNIINDVDSNKLSLDIPSNHRPVTSDKNSKLITTIKDVASSYVEQDEIFVSALVGATDASSFLGDNKDNVDLAIFGPGNPLMAHQIDEYIEKDMYLKYIDIFKEASIQYLKEK >CP022905.1|AXJ66351.1|986074_987247_+|Transposase,-Mutator-family MTQVHFTLKSEEIQSIIEYSVKDDVSKNILTTVFNQLMENQRTEYIQAKEYERTENRQSQRNGYYERSFTTRVGTLELKVPRTRDGHFSPTVFERYQRNEKALMASMLEMYVSGVSTRKVSKIVEELCGKSVSKSFVSSLTEQLEPMVNEWQNRLLSEKNYPYLMTDVLYIKVREENRVLSKSCHIAIGITKDGDREIIGFMIQSGESEETWTTFFEYLKERGLQGTELVISDAHKGLVSAIRKSFTNVSWQRCQVHFLRNIFTTIPKKNSKSFREAVKGIFKFTDINLAREAKNRLIHDYIDQPKYSKACASLDDGFEDAFQYTVQGNSHNRLKSTNLIERLNQEVRRREKIIRIFPNQTSANRLIGAVLMDLHDEWIYSSRKYINFDK >CP022905.1|AXJ66352.1|987503_988559_+|putative-leukocidin-like-protein-2-precursor MKNKKRVLIASSLSCAILLLSAATTQANSAHKDSQDQNKKEHVDKSQQKDKRNVTNKDKNSTVPDDIGKNGKITKRTETVYDEKTNILQNLQFDFIDDPTYDKNVLLVKKQGSIHSNLKFESHKEEKNSNWLKYPSEYHVDFQVKRNRKTEILDQLPKNKISTAKVDSTFSYSSGGKFDSTKGIGRTSSNSYSKTISYNQQNYDTIASGKNNNWHVHWSVIANDLKYGGEVKNRNDELLFYRNTRIATVENPELSFASKYRYPALVRSGFNPEFLTYLSNEKSNEKTQFEVTYTRNQDILKNRPGIHYAPPILEKNKDGQRLIVTYEVDWKNKTVKVVDKYSDDNKPYKEG >CP022905.1|AXJ66353.1|988580_989597_+|putative-leukocidin-like-protein-1-precursor MIKQLYKNITICSLAISTALTVFPATSYAKINSEIKAVSEKNLDGDTKMYTRTATTSDSQKNITQSLQFNFLTEPNYDKETVFIKAKGTIGSGLRILDPNGYWNSTLRWPGSYSVSIQNVDDNNNTNVTDFAPKNQDESREVKYTYGYKTGGDFSINRGGLTGNITKESNYSETISYQQPSYRTLLDQSTSHKGVGWKVEAHLINNMGHDHTRQLTNDSDNRTKSEIFSLTRNGNLWAKDNFTPKDKMPVTVSEGFNPEFLAVMSHDKKDKGKSQFVVHYKRSMDEFKIDWNRHGFWGYWSGENHVDKKEEKLSALYEVDWKTHDVKFVKVLNDNEKK >CP022905.1|AXJ66354.1|989834_990659_-|Phospholipase-C-precursor MYPNWGQYKRADLIGQSSYIKNNDVVIFNEAFDNGASDKLLSNVKKEYPYQTPVLGRSQSGWDKTEGSYSSTVAEDGGVAIVSKYPIKEKIQHVFKSGCGFDNDSNKGFVYTKIEKNGKNVHVIGTHTQSEDSRCGAGHDRKIRAEQMKEISDFVKKKNIPKDETVYIGGDLNVNKGTPEFKDMLKNLNVNDVLYAGHNSTWDPQSNSIAKYNYPNGKPEHLDYIFTDKDHKQPKQLVNEVVTEKPKPWDVYAFPYYYVYNDFSDHYPIKAYSK >CP022905.1|AXJ66355.1|990715_991753_-|Tyrosine-recombinase-XerC MKTRCYDGKKWQYEFKYEGKRYRKKGFRTKREANSAGLDKLNELRSGFNIDNYITLEEYFENWIKTYKQPVVKENTYRHYRNALQHIQKHKIGKMELSKINRQVYQKFINDYSKEHAKETIRKTNGAIRSALDDALYDGLIFKNPAYKVNYKAGKPTKSEQEKFISVTEYEILKDHVRKKRTRSSLALFIMICTGCRVSGARNIKIEHINQVKNTIFIDERKTDTSPRYISIAKSDMKHIMDVISTFAISYDGYIFKEAGSIINLHAINNALKSACRVNNIPIITSHALRHTHCSYLLAKGVSIHYISKRLGHKNIAITTSVYSHLLEEKFNEEDKKTTKILESM >CP022905.1|AXJ66356.1|991946_992651_-|PemK-like-protein MERNSTKKSSKDKILKAVNNFEEVCNSGKFKFKYLDDWLFTKSIIFKNETTLTNQKNFKVYPRGTIVYAKLGVNIGSEFSGNHFCVVLNKNDNKRNELITIVPLTSKDTKFSLKLQENLILKALEKMKTDHKTLRFDLDRIKEMHARSTKVKNLNPAIEKELDEIENNYMQLAKIIERYERFVGKQTYAIPSQVITISKKRISTLNDYDPTGHISFNEETLKIIEDFMKANILS >CP022905.1|AXJ66357.1|992790_992958_-|hypothetical-protein MKITNCKIKKETIVYEVLTSGNQPFTYELPKDLSSHNARKYLEFISQKIDGDRLN >CP022905.1|AXJ66358.1|993027_993213_-|hypothetical-protein MSTYKEIEHLHINTGGKELTQEQIEEAKAFIDSQEFKDMIREAKESHQRVMESKITDRTKL >CP022905.1|AXJ66359.1|993209_993356_-|hypothetical-protein MDFKEVDINIEEWEMVEIPFYTEEELTYRLNNGLPITKSELEEQESKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP022905_8 | 1420896-1420980 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022905_8
|
1 spacers
spacers of CP022905_8
>8.1|1420922|33|CP022905|CRISPRCasFinder TGGGCCCCAACACAGAGAAATTGGATTCCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022905_8
The CRISPR arrays of CP022905_8 >merge|CP022905|8|1420896-1420980|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTGTGGGCCCCAACACAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTG >CP022905|8|7|1420896-1420980|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTG TGGGCCCCAACACAGAGAAATTGGATTCCCAAT TTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTG
>CP022905.1|AXJ66758.1|1418899_1420723_+|Elongation-factor-4 MDNEQRLKRRENIRNFSIIAHIDHGKSTLADRILENTKSVETRDMQDQLLDSMDLERERGITIKLNAVRLKYEAKDGNTYTFHLIDTPGHVDFTYEVSRSLAACEGAILVVDAAQGIEAQTLANVYLALDNELELLPVINKIDLPAAEPERVKQEIEDMIGLDQDDVVLASAKSNIGIEEILEKIVEVVPAPDGDPEAPLKALIFDSEYDPYRGVISSIRIVDGVVKAGDKIRMMATGKEFEVTEVGINTPKQLPVDELTVGDVGYIIASIKNVDDSRVGDTITLASRPASEPLQGYKKMNPMVYCGLFPIDNKNYNDLREALEKLQLNDASLEFEPESSQALGFGYRTGFLGMLHMEIIQERIEREFGIELIATAPSVIYQCILRDGSEVTVDNPAQMPDRDKIDKIFEPYVRATMMVPNDYVGAVMELCQRKRGQFINMDYLDDIRVNIVYELPLAEVVFDFFDQLKSNTKGYASFDYEFIENKESNLVKMDILLNGDKVDALSFIVHRDFAYERGKALVEKLKTLIPRQQFEVPVQAAIGQKIVARTNIKSMGKNVLAKCYGGDISRKRKLLEKQKAGKAKMKAVGNVEIPQDAFLAVLKMDDE >CP022905.1|AXJ66757.1|1418302_1418554_-|30S-ribosomal-protein-S20 MANIKSAIKRVKTTEKAEARNISQKSAMRTAVKNAKTAVSNNADNKNELVSLAVKLVDKAAQSNLIHSNKADRIKSQLMTANK >CP022905.1|AXJ66756.1|1417283_1418258_+|DNA-polymerase-III-subunit-delta MSDNIVAIYGDVPELVEKQSAEIISQFLKSDRDDFNFVKYNLYETEIAPIVEETLTLPFFSDKKAILVKNAYIFTGEKAPKDMAHNVDQLIEFIEKYDGENLIVFEIYQNKLDERKKLTKTLKKHARLKKIEQMSEEEIKKWIQSKLNENFKDIKRDALDLFIELTGINFNIVSQEIEKLILFLGDRPTINKQDVNQIINRSLEQNVFLLTEYIQKRKKEQAIHLVKDLITMKEEPIKLLALITSNYRLFYQCKILSQKGYSGQQIAKTIGVHPYRVKLALGQVRHYQLDELLNIVDACAETDYKLKSSYMDKQLILELFILSL >CP022905.1|AXJ66755.1|1415025_1417227_+|ComEC-family-competence-protein MLYVALSMIVGVLWNSSKVLSTFLFILLLYITYRKNKIVYAPISLFLIIFSSWYLHYSQQAIFNYINYIERNSQFNERAQVIQIQRQGSDTYKGRLSLKNEIYPFFLTDKKNFDLKKIESRNCIVKGQFKVNENKFVTLKLQSIVVQSCLESNRSNLIEKHKQFIMNRIYDSGIKFPDRIMALITGDVKEINEQFKERVKEIGIYHLLAVSGSHIAAIVFLIYQPLKRLNLPLFVIKGITINVLTLYAQYTNYAPSAVRAIIMTTLVLLITKQIKIKGIQLLAFAFIIMFILNPLVVYDIGFQFSFIISFFIMLLFPFLQQLSKLQSLFIITFIAQLASFIVAIPNFHQLQWVGFLSNLIFVPYYSIILFPLSILFFITSHFIVGLTPLNYLVDLSFNFHDWLLDLFTRIKQSHFSVPKFNDWIFIIFIISVYYIFWLLAKRKYILVTFWTIIILTLLITFPTNSHHKITMLNVGQGDSILYEGGKNQNVLIDTGGKVIDDTKQPSYSISKYHILPTLNERGINELEYLILTHPHNDHIGEVEYIISHIKIKHIVIYNKGYSSNTLMLLSKLSHKYNIKLMDVRQVSSFKLGDSSFLFFDSFIPNSRDKNEYSIITMITYQNKKVLLMGDASKNNESLLLKKYNLPEIDILKVGHHGSKTSSSKEFIEMIKPKISLISSGKNNMYHLPNIEVVKRLQRIRSRIYNSQQNGQVTIDLDDNLKVDSNSYGNASGL >CP022905.1|AXJ66754.1|1414589_1415021_+|tRNA-specific-adenosine-deaminase MAQSHLLALRSTCQRLSVGATIVKDNRIIAGGYNGSVAGEVHCIDEGCLIEDGHCIRTIHAEMNALLQCAKQGVSTEGATIYVTHFPCLNCTKSIIQAGIKRIYYAEDYHNHEYATKLLKQSGIEFKKIPFSPEYVAKYLTKG >CP022905.1|AXJ66753.1|1413790_1414468_+|ComE-operon-protein-1 MYQFLLRYKDFLTQWKLYIISAVVLIMVLIGFIFWRQDDYTSRNFENKDTALKQSTSENNSLSKLEDVQVKDGDNSKNKGPVYVDVKGAVKHPNVYKMTSKDRVVDLLDKAQLLDDADVSRINLSEKLTDQKMIFIPHKGQKNVEPQIEVNSVHVKNGNTNNTKVNLNTASVSELMSVPGVGQAKANAIVEYRNQQGAFQEIDDLKKVKGFGSKTFDKLKSYFTI >CP022905.1|AXJ66752.1|1413025_1413742_+|dTDP-3-amino-3,6-dideoxy-alpha-D-glucopyranose-N,N-dimethyltransferase MSQYAEMSLVYDQLTQDQPYEKWFEIVKNHCKDESNILDIGCGTGSLTVQLEALGNVTGMDLSVDMLTVAAQKSANVNWLEGDMTSFDLQQQFDIITIFCDSLNYLQDETAVIETFINVYHHLTDSGVFIFDVHTVYKMMTLFNNQSYIDDKGDIFLAWDAVQGDLPLSVYHDMTFFIRHEDETYSRFDESHFQRTFDEKTYLSWLAQVGFKHVETFTDFNIDEHNEDTERLFFIAKK >CP022905.1|AXJ66751.1|1412669_1413023_+|Ribosomal-silencing-factor-RsfS MNSQELLAIAVDAIDNKKGEDTISLEMKGISDMTDYFVVTHGNNERQVQAIARAVKEVANEQNIEVKRMEGYNEARWILIDLADVVVHVFHKDERNYYNIEKLYQDAPLESYGQVAY >CP022905.1|AXJ66750.1|1412084_1412669_+|putative-nicotinate-nucleotide-adenylyltransferase MNIEKAKRLAKEKLPEKRYNHSLRVAETAIKLAEIYDGDTSKVELAGVLHDFCKYDDLGKMYQIVRQYELGNDLLSYGSEILHGPVCAAIMEHEYGINDEEVLMAIKYHTTGRQQMTKTEKLIFIADYIEPGRTIPGVDDIRDMAYNQGSLDKTIYEISKRTVLFLIQKDITVYNKTIDCLNYYNYSDERIKDD >CP022905.1|AXJ66749.1|1411525_1412095_+|putative-nicotinate-nucleotide-adenylyltransferase MKKIVLYGGQFNPIHTAHMIVASEVFHELQPDEFYFLPSFMSPLKKHNNFIDVQHRLTMIQMIIDELGFGDICDDEIKRGGQSYTYDTIKAFKEQHKDSELYFVIGTDQYNQLEKWYQIEYLKEMVTFVVVNRDKNSQNVENAMIAIQIPRVDISSTMIRQRVSEGKSIQVLVPKSVENYIKGEGLYEH >CP022905.1|AXJ66759.1|1421255_1422413_+|Oxygen-independent-coproporphyrinogen-III-oxidase-1 MDKQSEKRGIKMTVQSAYIHIPFCVRICTYCDFNKYFIQNQPVDEYLDALITEMSTAKYRNLKTMYVGGGTPTALSINQLERLLKAIRDTFTITGEYTFEANPDELTKEKVQLLEKYGVNRISMGVQTFKPELLSVLGRTHNTEDIYTSVLNAKNAGIKSISLDLMYHLPKQTIEDFEQSLDLALDMDIQHISSYGLILEPKTQFYNMYRKGLLKLPNEDLGADMYQLLMSKIEQSPFHQYEISNFALDGHESEHNKVYWFNEEYYGFGAGASGYVDGVRYTNINPVNHYIKAINKESKAILVSNKPSLTERMEEEMFLGLRLNEGVSSSRFKKKFDQSIESVFGQTINNLKEKELIVEKNDAIALTKRGKVIGNEVFEAFLIND >CP022905.1|AXJ66760.1|1422513_1423491_+|Heat-inducible-transcription-repressor-HrcA MITDRQLSILNAIVEDYVDFGQPVGSKTLIERHNLNVSPATIRNEMKQLEDLNYIEKTHSSSGRSPSQLGFRYYVNRLLEQTSHQKTNKLRRLNQLLVENQYDVSSALTYFADELSNISQYTTLVVHPNHKQDIINNVHLIRANPNLVIMVIVFSSGHVEHVHLASDIPFSNDKLNTISNFVTNKLTEFNQNLQDDIVSFVQSEQEEIFINKLINTMNNHISNQSNSIYMGGKVKLIDALNESNVSSIQPILQYIESNRIAELLQDISSPNINVKIGNEIDDSLSDISIVTSQYHFDETLKGQIAVIGPTAMHYQNVIQLLNRIW >CP022905.1|AXJ66761.1|1423522_1424149_+|heat-shock-protein-GrpE MTNKDESVEKNTESTVEETNIKQNIDDSVEQAEESKGHLQDEAIEETSDENVIEEIDPKDQKINELQQLADENEEKYLRLYAEFENYKRRIQKENEINKTYQAQRVLTDILPAIDNIERALQIEGDDETFKSLQKGVQMVHESLINALKDNGLEVIKTEGEAFDPNIHQAVVQDDNPDFESGEITQELQKGYKLKDRVLRPSMVKVNQ >CP022905.1|AXJ66762.1|1424217_1426050_+|Chaperone-protein-DnaK MSKIIGIDLGTTNSCVTVLEGDEPKVIQNPEGSRTTPSVVAFKNGETQVGEVAKRQAITNPNTVQSIKRHMGTDYKVDIEGKSYTPQEISAMILQNLKNTAESYLGEKVDKAVITVPAYFNDAERQATKDAGKIAGLEVERIINEPTAAALAYGLDKTDKDEKVLVFDLGGGTFDVSILELGDGVFEVLSTAGDNKLGGDDFDQVIIDYLVAEFKKENGVDLSQDKMALQRLKDAAEKAKKDLSGVSQTQISLPFISAGENGPLHLEVNLTRSKFEELSDSLIRRTMEPTRQAMKDAGLTNSDIDEVILVGGSTRIPAVQEAVKKEIGKEPNKGVNPDEVVAMGAAIQGGVITGDVKDVVLLDVTPLSLGIEILGGRMNTLIERNTTIPTSKSQIYSTAVDNQPSVDVHVLQGERPMAADNKTLGRFQLTDIPPAERGKPQIEVTFDIDKNGIVNVTAKDLGTNKEQRITIQSSSSLSDEEIDRMVKDAEVNAEADKKRREEVDLRNEADSLVFQVEKTLTDLGENIGEEDKKSAEEKKDALKTALEGQDIEDIKSKKEELEKVIQELSAKVYEQAAQQQQQAQGANAGQNNDSTVEDAEFKEVKDDDKK >CP022905.1|AXJ66763.1|1426185_1427325_+|Chaperone-protein-DnaJ MAKRDYYEVLGISKDASKDEIKKAYRKLSKKYHPDINKEEGADEKFKEISEAYEVLSDDNKRASYDQFGHDGPQGFGGQGFNGSDFGGFSGFGGGGFEDIFSSFFGGGRQRDPNAPQKGDDLQYTMTLTFEEAVFGTTKEISIRKDVTCETCHGDGAKPGTSKKTCSYCNGAGHVAVEQNTILGRVRTEQVCPKCNGSGQEFEEACPTCHGKGTENKTVKLEVKVPEGVDNEQQIRLAGEGSPGVNGGPAGDLYVVFRVKPSETFKRDGDDIYYKLNVSFPQAALGDEIKIPTLNNEVMLTIPAGTQTGKQFRLKEKGIKNVHGYGYGDLYVDIKVVTPTKLTDRQKELMKEFAQLNGEEINEQPSNFKDRAKRFFKGE >CP022905.1|AXJ66764.1|1427328_1428267_+|Ribosomal-protein-L11-methyltransferase MNWTELSIIINHEAVELATNILENHGSNGVVIEDSDDLINQPEDKYGEIYALKKEDYPDKGVRLKAYFNEMTYDDKLRQQIKDELLNLDELDQHNIQFSEQIIAETDWENEWKNYFHPFRASKKFTIVPSWETYAKEADEELCIELDPGMAFGTGDHPTTSMCLKAIETYVLPQHSVIDVGTGSGILSIASHLIGVKRIKALDIDEMAVSVAKENFRRNHCETLIEAVPGNLLKDETEKFDIVIANILAHIIDEMIEDAYNTLNEGGYFITSGIIKEKYEGIQSHMERVGFKIISEQHDNGWVCLVGQKVSE >CP022905.1|AXJ66765.1|1428268_1429021_+|Ribosomal-RNA-small-subunit-methyltransferase-E MQRYFIDQNADVSQRFFITKKEDIHHITNVMRYDVGSKIILTFNDQTVYLCEIADITSDKIAVDLKEKQNINTELPVDVTICSGLIKADKYEWLLQKATELGASSFIAVSMERSIVKLNEAKVVKKIERWQKIIKEAAEQSYRLVIPSIQFESNLKLICDTIDNYDYILIAYEEEAKDGKLSNFKQTLQQFKAQDKVLMIFGPEGGLSENEISLFSNTSTVVGLGPRILRAETAPLYALSAISYEKELMG >CP022905.1|AXJ66766.1|1429027_1430374_+|Threonylcarbamoyladenosine-tRNA-methylthiotransferase-MtaB MSTVAFHTLGCKVNHYETEAIWQLFKEANYERVDFEANADVFVINTCTVTNTGDKKSRQIIRRAIRQNPDAVICVTGCYAQTSSAEIMEIPGVDVVVGTQDRHKLLGYIDEFRKERQPINGVGNIMKNRKYEELDVPYFTDRTRASLKIQEGCNNFCTFCIIPWARGLMRSRDPEKVVEQATQLVNSGYKEIVLTGIHTGGYGQDLKDYNLAQLLRDLETINGLERIRISSIEASQLTDEVIDVLERSTKVVRHLHIPLQSGSDTVLKRMRRKYTMDRFSERLTKLHKALPDLAVTSDVIVGFPGETEAEFQETYDFIVKHKFSELHVFPYSPRIGTPAARMDDQIDEEIKNERVHKLITLSNQLGKLYASKFDQDVLEVIPEEQGDTEGTLVGYADNYMKVQFEGDESLIGQIVKVKITQANYPLNEGQAIKVVDFATNKSDREVLV >CP022905.1|AXJ66767.1|1430666_1430843_+|30S-ribosomal-protein-S21 MSKTVVRKNESLEDALRRFKRSVSKSGTIQEVRKREFYEKPSVKRKKKSEAARKRKFK >CP022905.1|AXJ66768.1|1431062_1431770_+|hypothetical-protein MSYNNFLQMTTILESTAGDTWVEQVSNIIVQPIFTLILTCLTFLGFVYQLYSKKINAAGIIATLSLLILFLGFLIQGNVNMHSILIFSIGVILVVIELFVVGAVIGIIGMILITISITTLGDNLLFMLANVIVALILTIVEWVILVKIFNRKIPFLDKVILKDSTNSESGYNSHDNRSHLVGKTAQTVTDLRPAGIIFCENERIDAVSDGNFILRNKTVKILEVEGTRVVVREVD |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP022905_9 | 2292165-2292245 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022905_9
|
1 spacers
spacers of CP022905_9
>9.1|2292189|33|CP022905|CRISPRCasFinder ATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTT |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022905_9
The CRISPR arrays of CP022905_9 >merge|CP022905|9|2292165-2292245|CRISPRCasFinder CAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTCAACTTTAGTTGTTAGGGGCTTCT >CP022905|9|8|2292165-2292245|CRISPRCasFinder CAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTT ATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTT CAACTTTAGTTGTTAGGGGCTTCT
>CP022905.1|AXJ67575.1|2291056_2292148_+|hypothetical-protein MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYAQTIAIYSQFGQKPPVDAYLKVIAVLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKDKKVVTEPKNTKVENGKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >CP022905.1|AXJ67574.1|2289813_2290791_+|Cadmium,-cobalt-and-zinc/H(+)-K(+)-antiporter MSHSHHHDHMHSHVTTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALVAFIYAEKNATTTKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH >CP022905.1|AXJ67573.1|2289491_2289812_+|HTH-type-transcriptional-repressor-CzrA MSEQYSEINTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL >CP022905.1|AXJ67572.1|2288674_2289340_-|putative-sugar-epimerase-YhfK MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFDGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNHQEFQIISGEQDIKDALTQFEIEKD >CP022905.1|AXJ67571.1|2287300_2288239_-|putative-mannose-6-phosphate-isomerase-GmuF MPLFLQPILKTKLWGGQRLSEFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGTSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIVIGTLAESREEVANHVQHGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDITYRLYDFNRQDNQYNDRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYV >CP022905.1|AXJ67570.1|2287039_2287270_-|hypothetical-protein MKQFLYIALVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQISASLKFSALLINVLPLCGTFVASN >CP022905.1|AXJ67569.1|2284994_2286368_-|EVE-domain-protein MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRMSNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVKKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD >CP022905.1|AXJ67568.1|2284124_2284538_-|hypothetical-protein MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYQFATLKGEVGQQFFKQHPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIKLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD >CP022905.1|AXJ67567.1|2283481_2283925_-|General-stress-protein-20U MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLENAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS >CP022905.1|AXJ67566.1|2282650_2283361_+|Purine-nucleoside-phosphorylase-DeoD-type-1 MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGTYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKAKNVADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNDAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE >CP022905.1|AXJ67576.1|2294180_2295038_-|Putative-phosphatase-YwpJ MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINQLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQITNLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAKHFLAD >CP022905.1|AXJ67577.1|2295105_2295888_-|putative-ABC-transporter-ATP-binding-protein-YlmA MLIQLDQIGRMKQGKTILKNISWQIAKGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATTGGVNLFGKMPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEVRNEAHHLLKLVGISAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLNILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITGNFTKILLLKDGESVQQGLIDDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE >CP022905.1|AXJ67578.1|2296119_2297925_-|Glutamine--fructose-6-phosphate-aminotransferase-[isomerizing] MCGIVGYIGYDNAKELLLKGLEKLEYRGYDSAGIAVVNDDNTTVFKEKGRIAELRKVADSSDFDGPVGIGHTRWATHGVPNHENSHPHQSSNGRFTLVHNGVIENYEELKGEYLQGVSFISETDTEVIVQLVEYFSNQGLSTEEAFTKVVSLLHGSYALGLLDAEDKDTIYVAKNKSPLLLGVGEGFNVIASDALAMLQVTSEYKEIHDHEIVIVKKDEVIIKDADGNVVERDSYIAEIDASDAEKGVYAHYMLKEIHEQPAVMRRIIQEYQDAEGNLKIDQDIINDVKEADRIYVIAAGTSYHAGLVGKEFLEKWAGVPTEVHVASEFVYNMPLLSEKPLFVYISQSGETADSRAVLVETNKLGHKSLTITNVAGSTLSREADHTLLLHAGPEIAVASTKAYTAQIAVLSILSQIVAKEHGREADIDLLRELAKVTTAIEVIVDDAPIMEQIATDFLETTRNAFFIGRTIDYNVSLEGALKLKEISYIQAEGFAGGELKHGTIALIEDGTPVVALATQENVNLSIRGNVKEVVARGAHPCIISMEGLEKEGDTYVIPHVHELLTPLVSVVALQLISYYAALHRDLDVDKPRNLAKSVTVE >CP022905.1|AXJ67579.1|2298605_2300144_+|PTS-system-mannitol-specific-EIICB-component MSQTEEKKGIGRRVQAFGSFLSSMIMPNIGAFIAWGFIAAIFIDNGWLPNKDLATLAGPMITYLIPLLIAFSGGRLIYDLRGGIIAATATMGVIVALPDTPMLLGAMIMGPLVGWLMKKTDQLIQPRTPQGFEMLFNNFSAGILGFIMTIAGFKILAPLMKFIMHILSVAVEALVHAHLLPLVSILVEPAKIVFLNNAINHGVFTPLGADQAAKAGQSILYTIESNPGPGLGILLAYMIFGKGTAKATSYGAGIIHFLGGIHEIYFPYVLMRPLLFIAVILGGMTGVATYQATGFGFKSPASPGSFIVYCLNAPRGEFLHMLLGVFLAALVSFVVAALIMKFTREPKQDLEAATAQMENTKGKKSSVASKLVSSDKNVNTEENASGNVSETSSSDDDPEALLDNYNTEDVDAHNYNNINHVIFACDAGMGSSAMGASMLRNKFKKAGINDITVTNTAINQLPKDAQLVITQKKLTDRAIKQTPNAIHISVDNFLNSPRYEELLNNLKKDDQA >CP022905.1|AXJ67580.1|2300178_2302311_+|Transcriptional-regulator-MtlR MLLSTREKEMIALLIKYHSQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVEAYLTSFSLTLERANKKGLRIAGADSDLNDLKQSIAQHQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELDLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLGQIYDVTFNQAEIAFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVNKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFIVLHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLEQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIDSPYLTVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFQETHDKSSNMIDKDDVHVETKDVDGNTSFENEQTSYLTSVFEKHLSDEKSEQLLHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDVINDPTSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMILITVLEEPLTLPSIQNDNQTIKYMISMFIPDNDFMASLVSDLSEFLSLKLESIDTFMENPQELETLLRNKFLERIKKQFI >CP022905.1|AXJ67581.1|2302322_2302757_+|Mannitol-specific-phosphotransferase-enzyme-IIA-component MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA >CP022905.1|AXJ67582.1|2302756_2303863_+|Mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKAVHFGAGNIGRGFIGYILADNNVKVTFADVNEEIINALAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFAPFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVLDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFAGKATVLDAVKDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAGYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTADQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS >CP022905.1|AXJ67583.1|2304181_2311627_-|Extracellular-matrix-binding-protein-ebh-precursor MNLFRQQKFSIRKFNVGIFSALIATVTFISTNPTTASAAEQNQPAQNQPAQPADANTQPNANAGAQANPAAQPANQGGQANPAGGAAQPAGQGNQADPNNAAQAQPGNQAAPANQAGQGNNQATPNNNATPANQTQPANAPAAAQPAAPVAANAQTQDPNASNTGEGSINTTLTFDDPAISTDENRQDPTVTVTDKVNGYSLINNGKIGFVNSELRRSDMFDKNNPQNYQAKGNVAALGRVNANDSTDHGNFNGITKTVNVKPDSELIINFTTMQTNSKQGATNLVIKDAKKNTELATVNVAKTGTAHLFKVPTDADRLDLQFIPDNTAVADASRITTNKDGYKYYSFIDNVGLFSGSHLYVKNRDLAPKATNNKEYTINTEIGNNGNFGASLKADQFKYEVTLPQGVTYVNDSLTTTFPNGNEDSTVLKNMTVNYDQTANKVTFTSQGVTTARGTHTKEVLFPDKSLKLSYKVNVANIDTPKNIDFNEKLTYRTASDVVINNAQPEVTLTADPFSVAVEMNKDALQQQVNSQVDNSHYTTASIAEYNKLKQQADTILNEDANHVETANRASQADIDGLVTKLQAALIDNQAAIAELDTKAQEKVTAAQQSKKVTQDEVAALVTKINNDKNNAIAEINKQTTSQGVTTEKDNGIAVLEQDVITPTVKPQAKQDIIQAVTTRKQQIKKSNASLQDEKDVANDKIGKIETKAIKDIDAATTNAQVEAIKTKAINDINQTTPATTAKAAALEEFDEVVQAQIDQAPLNPDTTNEEVAEAIERINAAKVSGVKAIEATTTAQDLERVKNEEIFKIENITDSTQTKMDAYKEVRQAATARKAQNATVSNATDEEVAEANAAVDAAQTEGLHDIQVVKSQQEVADTKAKVLDKINAIQTQAKVKPAADTEVENAYNTRKQEIQNSNASTTEEKEAAYTELDAKKQEARTNLDAANTNSDVTTAKDNGIAAINQVQAATTKKSDAKAEIAQKASERKTAIEAMNDSTTEEQQAAKDKVDQAVVTANADIDNATANTDVDNAKTTNEATIAAITPDANVKPAAKQAIADKVQAQETAIDANNGSTTEEKEAAKQQVQTEKTAADAAIDAAHSNVEVEAAKNAEIAKIEAIQPATTTKDNAKQAIATKANERKTAIAQTQDITAEEIAAANADVDNAVTQANSNIEAANSQNDVDQAKTTGETSIDQVTPTVNKKATARNEITAILNNKLQEIQATPDATDEEKQAADAEANTENGKANQAISAATTNAQVDEAKANAEAAINAVTPKVVKKQAAKDEIDQLQATQTNVINNDQNATNEEKEAAIQQLATAVTDAKNNITAATDDNGVDTAKDAGKNSIQSTQPATAVKSNAKNEVDQAVTTQNQAIDNTTGATTEEKNAAKDLVLKAKEKAYQDILNAQTTNDVTQIKDQAVADIQGITADTTIKDVAKDELATKANEQKALIAQTADATTEEKEQANQQVDAQLTQGNQNIENAQSIDDVNTAKDNAIQAIDPIQASTDVKTNARAELLTEMQNKITEILNNNETTNEEKGNDIGPVRAAYEEGLNNINAATTTGDVTTAKDTAVQKVQQLHANPVKKPAGKKELDQAAADKKTQIEQTPNASQQEINDAKQEVDTELNQAKTNVDQSSTNEYVDNAVKEGKAKINAVKTFSEYKKDALAKIEDAYNAKVNEADNSNASTSSEIAEAKQKLAELKQTADQNVNQATSKDDIEVQIHNDLDNINDYTIPTGKKESATTDLYAYADQKKNNISADTNATQDEKQQAIKQVDQNVQTALENINNGVDNGDVDDALTQGKAAIDTIQVDATVKPKANQAIEAKAEDTKESIDHSDQLTAEEKTEALAMIKQITDQAKQGITDATTTAEVEKAKAQGLEAFDNIQIDSTEKQKAIEELETALDQIEAGVNVDADATTEEKEAFTNALEDILSKATEDISDQTTNAEIATVKNSALEQLKAQRINPVVKKNALEAIREVVNKQIEIIKNADADASAKEIARTDLGRYFDRFADKLDKTQTNTEVAELQNVTIPAIEAIVPQNDPDANDTNNGTDNNDATANSNANATPENTGQPNVSETTDNGKADASPTTPNNSDAATGETTVTSATDDAKDKPQANNNSSADASTNSPTMDNDVTSKPEVESTNNGTTDKPVTETDNATPAESTTNNNSTTTATNENAPTGSTATAPTTASTEAASSADSKDNASVNDSKQNAEVNNSAESQSTNGKVAQPKSENKAKAEKDGRDSTNQSMVESTTETLPSADITEPNVPSNTSKDKEESTTNQTDAGQLKSETNVASNEADKSPSKADTEVSNKPSTSASSEAKDKMTSTNVSQKDDTATADTNDTQKSVGPVANNKAKDMQTNDTQKSVGSAANNKATQNDGANASPATVSNGSHSMHQDMLNVTKPEENKANAKSDQQGKVNKPKQQAKTLPDTGMSHNDDLPYAELALGAGMAFLIRRFTKKDQQTEE >CP022905.1|AXJ67584.1|2311904_2313260_-|Phosphoglucosamine-mutase MGKYFGTDGVRGVANQELTPELAFKLGRYGGYVLAHNKGEKHPRVLVGRDTRVSGEMLESALIAGLISIGAEVMRLGIISTPGVAYLTRDMGAELGVMISASHNPVADNGIKFFGSDGFKLSDEQENEIEALLDQENPELPRPVGNDIVHYSDYFEGAQKYLSYLKSTVDVNFEGLKIVLDGANGSTSSLAPFLFGDLEADTETIGCSPDGYNINEKCGSTHPEKLAEKVVETESDFGLAFDGDGDRIIAVDENGQIVDGDQIMFIIGQEMHKNQELNNDMIVSTVMSNLGFYKALEQEGIKSNKTKVGDRYVVEEMRRGNYNLGGEQSGHIVMMDYNTTGDGLLTGIQLASVIKMTGKSLSELAGQMKKYPQSLINVRVTDKYRVEENVDVKEVMTKVEVEMNGEGRILVRPSGTEPLVRVMVEAATDEDAERFAQQIADVVQDKMGLDK >CP022905.1|AXJ67585.1|2313286_2314219_-|YbbR-like-protein MLESKWGLRFIAFLLALFFFLSVNNVFGNIFNTGNLGQKSSKTIQDVPVEILYNTKDLHLTKAPETVNVTISGPQSKIIKIENPEDLRVVIDLSNAKAGKYQEKYQVKGLADDIHYSVKPKLANITLENKVTKKMTVQPDVSQSDIDPLYKITKQEVSPQTVKVTGGEEQLNDIAYLKATFKTNKKINGDTKDVAEVTAFDKKLNKLNVSIQPNEVNLQVKVEPFSKKVKVNVKQKGSLADDKELSSIDLEDKEIEIFGSRDDLQNISEVDAEVDLDGISESTEKTVKINLPEHVTKAQPSETKAYINVK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022905_11 | 2412529-2412609 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022905_11
|
1 spacers
spacers of CP022905_11
>11.1|2412554|31|CP022905|CRISPRCasFinder CACATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022905_11
The CRISPR arrays of CP022905_11 >merge|CP022905|11|2412529-2412609|CRISPRCasFinder TCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTG >CP022905|11|10|2412529-2412609|CRISPRCasFinder TCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTG CACATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCT TCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTG
>CP022905.1|AXJ67684.1|2411825_2412176_-|HTH-type-transcriptional-regulator-SarV MSNKVQRFIEAERELSQLKHWLKTTHKISIEEFVVLFKVYEAEKISGKELRDTLHFEMLWDTSKIDVIIRKIYKKELISKLRSETDERQVFYFYSTSQKKLLDKITKEIEVLSVTN >CP022905.1|AXJ67683.1|2410512_2411724_+|major-facilitator-superfamily-transporter MTNQGSLNKSPIFTKSFTINFFVNFIVYLCMYLLLVVIAGYSKQAFDASDSLAGLVVGLFIVGSLIGRFATGKFVNQIGPKRLLFIGLIALIITQLLYFIDGSLAFLIFVRLINGIATAVVTTATGTIAAYVTPVNRKSEGISLFSLSLVLGTAIGPFLGMLLITKYAIDLLFIICVILGILGLIISLFIKVDFEVTNNKTETDVINKPRFSIHQFIAKEAIPVAVIMLLIGVTYASILTYLQAFALERHLVTAASYFFICYAIASLITRPIAGRLMDDKNENIIVYPAFIMLFLSFVCLISSYQSWLILLAGACLGLGYGNLSSAMQSIAIKVSPPIKYGIATSTFYVGLDAGVGFGPSFLGLFTHMFSYSEIFGFMAALAIITMLVYFLIHGRHVTRNAMN >CP022905.1|AXJ67682.1|2410079_2410520_+|putative-HTH-type-transcriptional-regulator MLSQEFFNSFITIYRPYLKLAEPILEKHNIYYGQWLILRDIAKHQPTTLIEISHRRAIEKPTARKTLKALIENDLITVENSLEDKRQKFLTLTPKGHELYEIVCLDVQKLQQAVVAKTNISQDQMQETINVMNQIHEILLKEAHND >CP022905.1|AXJ67681.1|2409153_2409918_-|hypothetical-protein MILKFDHIIHYIDQLDRFSFPGDVIKLHSGGYHHKYGTFNKLGYINENYIELLDVENNEKLKKMAKTIEGGVAFATQIVQEKYEQGFKNICLRTNDIEAVKNKLQSEQVEVVGPIQMERDTHKDGKVKWQLLYIMNQDDDEIKPPFFIQWEESDSMRTKKLQKYFQKQFSIETVIVKSKNRSQTVSNWLKWFDMDIVEENDHYTDLILKNDDIYFRIEDGKVSKYHSVIIKDAQATSPYSIFIRGAIYRFEPLV >CP022905.1|AXJ67680.1|2408910_2409162_+|hypothetical-protein MRTIILSLFIIMNIVAIIMTLSQPLTVNYFSLRVILIFFTFILSIFFILIKSSRLNNILTILSIVLVIIHMGILAHSTYVYLY >CP022905.1|AXJ67679.1|2407256_2408522_-|Lipid-II:glycine-glycyltransferase MEKMHITNQEHDAFVKSHPNGDLLQLTKWAETKKLTGWYARRIAVGRDGEVQGVAQLLFKKVPKLPYTLCYISRGFVVDYSNKEALNALLDSAKEIAKAEKAYAIKIDPDVEVDKGTDALQNLKALGFKHKGFKEGLSKDYIQPRMTMITPIDKNDDELLNSFERRNRSKVRLALKRGTTVERSDREGLKTFAELMKITGERDGFLTRDISYFENIYDALHEDGDAELFLVKLDPKENIAKVNQELNELHAEIAKWQQKMETSEKQAKKAQNMINDAQNKIAKNEDLKRDLEALEKEHPEGIYLSGALLMFAGSKSYYLYGASSNEFRDFLPNHHMQYTMMKYAREHGATTYDFGGTDNDPDKDSEHYGLWAFKKVWGTYLSEKIGEFDYILNQPLYQLIEQVKPRLTKAKIKISRKLKRK >CP022905.1|AXJ67678.1|2403972_2407140_-|Swarming-motility-protein-SwrC MIKKLLQFSLGNKFAIFLMVVLVVLGGVYASAKLKLELLPNVQNPVISVTTTMPGATPQSTQDEISSKIDNQVRSLAYVKNVKTQSIQNASIVTVEYENNTDMDKAEEQLKKEIDKIKFKDEVGQPELRRNSMDAFPVLAYSFSNKENDLKKVTKVLNEQLIPKLQTVDGVQNAQLNGQTNREITLKFKQNELEKYGLTADDVENYLKTATRTTPLGLFQFGDKDKSIVVDGQYQSVDAFKNINIPLTLAGGQGQSQSQSDNKQNSAMSDVNQASPQQNSKASAPNNISGMPTAKLGDLADITVGDVRTSISKTNGKDAVNLQITKAQDANTVQVAKDVQRKIDTFVDENKDFNVTKTMDTAKPVEKSLYTMVEKASLGTIVAIIVILLFLRNIRTTAISIISIPLSLLMALIALKLSDVSLNILTLGALTVAIGRVIDDSIVVVENIYRRLTDSEEQLKGENLIISATTEVFKPIMSSTLVTIIVFLPLVFVSGSVGEMFRPFALAIAFSLLASLLVSITLVPALAATLFKKGVKRRNKQHQEGLGVVSTTYKKVLHWSLNHKWIVIILSTLILVATIVFGGPRLGTSFISAGDDKFLAITYTPKPGETEQAVLNHAKDVEKYLKQKKHVKTIQYSVGGSSPVDPTGSTNSMAIMVEYDNDTPNFDVEADKVIKHVDGFKHPGEWKNQDLGTGAGNKSVEVTVKGPSMDAIKSTVKDIEQKMKQVKGLANVKSDLSQTYDQYEIKVDQNKAAENGISASQLAMHLNENLPEKTVTTVKENGKTVDVKVKQNKQTDWSEDKLNNITLKKPTGGTIKLGDIATLVKTTTPSKLTQEQGDYATTVSAKVTNKDVGGTTRQVMSKINNLDKPNNVKVNIGGASDDINNAMTQLAFAMLAAIIIVYLILVITFKGGLAPFTILFSLPFTVIGVIIALLITGETISVPSLIGMLMLIGIVVTNAIVLIDRVINNEQQGMEMKEALIEAGGTRIRPILMTAIATIGALVPLLFGQDSSILISKGLAATVIGGLISSTLLTLVVVPVIYEILFTLKKRFTKR >CP022905.1|AXJ67677.1|2403471_2403789_+|hypothetical-protein MQFYLILLAILYLIVSFISIFKMEVVFTRILRIIMGVLLLFVLALTTMSFPKDNWWVFIVLLLLVGNVEVTGFKMLKKDLKGVNILNLMSLFIFVIYFILTIVLF >CP022905.1|AXJ67676.1|2403062_2403227_+|hypothetical-protein MSLENQLAELKYDYVRLQGDLEKRESLNLDTSALVRQLKDIENEIRNVRAQMQD >CP022905.1|AXJ67675.1|2402021_2402930_-|Membrane-transport-protein MTEQFTMIILLIALGYFLKRINFIKATDSQVIATLVLNVTLPSLVIVNLNSAELKLSFSILPILMIIYGIVAKMIAVWFFRKYDNHMRGSVGMMTGAMNIGLFAYPLIEVIWPKTGLIYFGMADIGGAFVMFGITYFVGSYFSEGSDQFDFKYLGKKLLQSVPLVTYIVMFILNINHIHLPHVAIDFFSILSHANMPLSMILLGVMLNFTLERKYIPATIKYLCLHYGLALVAGLLVHVLLPVSDDMIKTTLLVTWMFPVGVAIISYGIQFKYRTLPFIGMTTNLTIIISIIILYVYQAVFV >CP022905.1|AXJ67685.1|2412752_2413775_-|Cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase MVEQIKDKLGRPIRDLRLSVTDRCNFRCDYCMPKEVFGDDFVFLPKNELLTFDEMARIAKVYAELGVKKIRITGGEPLMRRDLDVLIAKLNQIDGIEDIGLTTNGLLLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDDTLFQSINNRNIKATTILEQIDYATSIGLNVKVNVVIQKGINDDQIIPMLEYFKDKHIEIRFIEFMDVGNDNGWDFSKVVTKDEMLTMIEQHFEIDPVEPKYFGEVAKYYRHKDNGVQFGLITSVSQSFCSTCTRARLSSDGKFYGCLFATVDGFNVKAFIRSGVTDEELKEQFKALWQIRDDRYSDERTAQTVANRQRKKINMNYIGG >CP022905.1|AXJ67686.1|2413794_2414394_-|putative-molybdenum-cofactor-guanylyltransferase MKAIILAGGHSVRFGKPKAFAEVNGETFYSRVIKTLESTNMFNEIIISTNAQLATQFKYPNVVIDDENHNDKGPLAGIYTIMKQHPEEELFFVVSVDTPMITGKAVSTLYQFLVSHLIENHLDVAAFKEDGRFIPTIAFYSPNALGAITKALHSDNYSFKNIYHELSTDYLDVRDVDAPSYWYKNINYQHDLDALIQKL >CP022905.1|AXJ67687.1|2414400_2414634_-|Molybdopterin-synthase-sulfur-carrier-subunit MKVLYFAEIKDILQKAQEDIVLEQALTVQQFEDLLFERYPQINNKKFQVAVNEEFVQKSDFIQPNDTVALIPPVSGG >CP022905.1|AXJ67688.1|2414639_2415086_-|Molybdopterin-synthase-catalytic-subunit MKQFEIVIEPIQTEQYREFTINEYQGAVVVFTGHVREWTKGVKTEYLEYEAYIPMAEKKLAQIGDEINEKWPGTITSIVHRIGPLQISDIAVLIAVSSPHRKDAYRANEYAIERIKEIVPIWKKEIWEDGSKWQGHQKGNYEEAKREE >CP022905.1|AXJ67689.1|2415099_2415585_-|Molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-adapter-protein MILQIVGYKKSGKTTLMRHIVSFLKTHGYTVATIKHHGHAKEDIQLQDSDVDHMKHFEAGADQSIVQGFQYQQTVTRVDNQNLTQIIEKSVTIDTNIVLVEGFKNADFEKVVVYRDEEELQVLQQLSNVCYSINVREHEDFTAFEQWLLNKIKNDCDTQLT >CP022905.1|AXJ67690.1|2415581_2416841_-|Molybdopterin-molybdenumtransferase MVVEKRNPIPVKEAIQRIVNQQSSMPAITVALEKSLNHILAEDIVATYDIPRFDKSPYDGFAIRSVDSQGASGQNRIEFKVIDHIGAGSVSDKLVGDHEAVRIMTGAQIPNGADAVVMFEQTIELEDTFTIRKPFSKNENISLKGEETKTGDVVLKKGQVINPGAIAVLATYGYAEVKVIKQPSVAVIATGSELLDVNDVLEDGKIRNSNGPMIRALAEKLGLEVGIYKTQKDDLDSGIQVVKEAMEKHDIVITTGGVSVGDFDYLPEIYKAVKAEVLFNKVAMRPGSVTTVAFADGKYLFGLSGNPSACFTGFELFVKPAVKHMCGALEVFPQIIKATLMEDFTKANPFTRFIRAKATLTSAGATVVPSGFNKSGAVVAIAHANCMVMLPGGSRGFKAGHTVDIILTESDAAEEELLL >CP022905.1|AXJ67691.1|2416903_2417398_+|Cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase-accessory-protein MTEFTHINQQGHAKMVDVSDKQITKRTAVAHSSITVNETIFKQISNNTNTKGNVLNTAQIAGIMAAKNTSTIIPMCHPLPLTGIDVHFSWDETNAPLYTLNIQTTVSTTGKTGVEMEALTAASATALTIYDMTKAVDKGMIIGETYLESKSGGKSGDFQRQSGQ >CP022905.1|AXJ67692.1|2417399_2417906_-|Molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-B MGEHQNVKLNRTVKAAVLTVSDTRDFVTDKGGQCVRQLLQADDVEVSDAHYTIVKDEKVAITTQVKKWLEEDIDVIITTGGTGIAQRDVTIEAVKPLLTKEIEGFGELFRYLSYVEDVGTRALLSRAVAGTVNNKLIFSIPGSTGAVKLALEKLIKPELNHLIHELTK >CP022905.1|AXJ67693.1|2417936_2418941_-|Molybdopterin-synthase-adenylyltransferase MSQERYSRQILFKQIGEIGQSKINQKCALIIGMGALGTHVAEGLVRAGIAKLIIVDRDYIEFSNLQRQTLFTEEDALKMMPKVVAAKKHLLALRSDVDIDGCIAHVDYYFLETHGQDVDVIIDATDNFETRQLINDFAYKHRIPWIYGGVVQSTYTEAAFIPGKTPCFNCLVPQLPALNLTCDTVGVIQPAVTMATSLQLRDAMKVLTEQPIDTKITYGDIWEGSHYSFGFSKMQRSDCTTCGDVPSYPYLNKNEQRYATLCGRDTVQYENASITHDILVQFLKQHQLNYRSNSYMVMFEFKGHRIVAFKGGRFLIHGMTRTSDATHLMNLLFG >CP022905.1|AXJ67694.1|2419110_2419716_-|Sulfate/thiosulfate-import-ATP-binding-protein-CysA MLKINVKYQLKNTLIRINIDDTEPKIYAVRGPSGIGKTTVLNMIAGLRKADEAIIEVNGQLLTDTTKNVNVKIQQRRIGYLFQDYQLFPNMTVYKNITFMAEPSKHIDQLIQTLNINHLMKQYPMTLSGGEAQRVALARALSTKPDLILLDEPFSSLDDTTKDESITLVKRIFNEWQIPIIFVTHSNYEAEQMAHEIITIG |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022905_1 | 1.1|170207|33|CP022905|CRISPRCasFinder | 170207-170239 | 33 | CP022905.1 | 1693617-1693649 | 0 | 1.0 |
CP022905_4 | 4.1|830167|31|CP022905|CRISPRCasFinder | 830167-830197 | 31 | CP022905.1 | 295083-295113 | 0 | 1.0 |
CP022905_5 | 5.1|835634|22|CP022905|CRT | 835634-835655 | 22 | CP022905.1 | 170168-170189 | 0 | 1.0 |
CP022905_5 | 5.1|835634|22|CP022905|CRT | 835634-835655 | 22 | CP022905.1 | 295008-295029 | 0 | 1.0 |
CP022905_5 | 5.1|835634|22|CP022905|CRT | 835634-835655 | 22 | CP022905.1 | 295118-295139 | 0 | 1.0 |
CP022905_5 | 5.1|835634|22|CP022905|CRT | 835634-835655 | 22 | CP022905.1 | 660644-660665 | 0 | 1.0 |
CP022905_5 | 5.1|835634|22|CP022905|CRT | 835634-835655 | 22 | CP022905.1 | 786397-786418 | 0 | 1.0 |
CP022905_5 | 5.1|835634|22|CP022905|CRT | 835634-835655 | 22 | CP022905.1 | 897500-897521 | 0 | 1.0 |
CP022905_5 | 5.1|835634|22|CP022905|CRT | 835634-835655 | 22 | CP022905.1 | 1086559-1086580 | 0 | 1.0 |
CP022905_5 | 5.1|835634|22|CP022905|CRT | 835634-835655 | 22 | CP022905.1 | 1406349-1406370 | 0 | 1.0 |
CP022905_5 | 5.1|835634|22|CP022905|CRT | 835634-835655 | 22 | CP022905.1 | 1420883-1420904 | 0 | 1.0 |
CP022905_5 | 5.1|835634|22|CP022905|CRT | 835634-835655 | 22 | CP022905.1 | 1693725-1693746 | 0 | 1.0 |
CP022905_5 | 5.3|835751|22|CP022905|CRT | 835751-835772 | 22 | CP022905.1 | 170168-170189 | 0 | 1.0 |
CP022905_5 | 5.3|835751|22|CP022905|CRT | 835751-835772 | 22 | CP022905.1 | 295008-295029 | 0 | 1.0 |
CP022905_5 | 5.3|835751|22|CP022905|CRT | 835751-835772 | 22 | CP022905.1 | 295118-295139 | 0 | 1.0 |
CP022905_5 | 5.3|835751|22|CP022905|CRT | 835751-835772 | 22 | CP022905.1 | 660644-660665 | 0 | 1.0 |
CP022905_5 | 5.3|835751|22|CP022905|CRT | 835751-835772 | 22 | CP022905.1 | 786397-786418 | 0 | 1.0 |
CP022905_5 | 5.3|835751|22|CP022905|CRT | 835751-835772 | 22 | CP022905.1 | 897500-897521 | 0 | 1.0 |
CP022905_5 | 5.3|835751|22|CP022905|CRT | 835751-835772 | 22 | CP022905.1 | 1086559-1086580 | 0 | 1.0 |
CP022905_5 | 5.3|835751|22|CP022905|CRT | 835751-835772 | 22 | CP022905.1 | 1406349-1406370 | 0 | 1.0 |
CP022905_5 | 5.3|835751|22|CP022905|CRT | 835751-835772 | 22 | CP022905.1 | 1420883-1420904 | 0 | 1.0 |
CP022905_5 | 5.3|835751|22|CP022905|CRT | 835751-835772 | 22 | CP022905.1 | 1693725-1693746 | 0 | 1.0 |
CP022905_7 | 7.1|984235|34|CP022905|CRISPRCasFinder | 984235-984268 | 34 | CP022905.1 | 830142-830175 | 0 | 1.0 |
CP022905_7 | 7.1|984235|34|CP022905|CRISPRCasFinder | 984235-984268 | 34 | CP022905.1 | 1906633-1906666 | 0 | 1.0 |
CP022905_4 | 4.1|830167|31|CP022905|CRISPRCasFinder | 830167-830197 | 31 | CP022905.1 | 295028-295058 | 1 | 0.968 |
CP022905_4 | 4.1|830167|31|CP022905|CRISPRCasFinder | 830167-830197 | 31 | CP022905.1 | 1386468-1386498 | 1 | 0.968 |
CP022905_5 | 5.1|835634|22|CP022905|CRT | 835634-835655 | 22 | CP022905.1 | 1386389-1386410 | 1 | 0.955 |
CP022905_5 | 5.1|835634|22|CP022905|CRT | 835634-835655 | 22 | CP022905.1 | 1386622-1386643 | 1 | 0.955 |
CP022905_5 | 5.1|835634|22|CP022905|CRT | 835634-835655 | 22 | CP022905.1 | 2176840-2176861 | 1 | 0.955 |
CP022905_5 | 5.2|835692|23|CP022905|CRT | 835692-835714 | 23 | CP022905.1 | 787347-787369 | 1 | 0.957 |
CP022905_5 | 5.2|835692|23|CP022905|CRT | 835692-835714 | 23 | CP022905.1 | 787625-787647 | 1 | 0.957 |
CP022905_5 | 5.2|835692|23|CP022905|CRT | 835692-835714 | 23 | CP022905.1 | 1086500-1086522 | 1 | 0.957 |
CP022905_5 | 5.2|835692|23|CP022905|CRT | 835692-835714 | 23 | CP022905.1 | 1693608-1693630 | 1 | 0.957 |
CP022905_5 | 5.2|835692|23|CP022905|CRT | 835692-835714 | 23 | CP022905.1 | 2401700-2401722 | 1 | 0.957 |
CP022905_5 | 5.3|835751|22|CP022905|CRT | 835751-835772 | 22 | CP022905.1 | 1386389-1386410 | 1 | 0.955 |
CP022905_5 | 5.3|835751|22|CP022905|CRT | 835751-835772 | 22 | CP022905.1 | 1386622-1386643 | 1 | 0.955 |
CP022905_5 | 5.3|835751|22|CP022905|CRT | 835751-835772 | 22 | CP022905.1 | 2176840-2176861 | 1 | 0.955 |
CP022905_5 | 5.4|835809|23|CP022905|CRT | 835809-835831 | 23 | CP022905.1 | 787347-787369 | 1 | 0.957 |
CP022905_5 | 5.4|835809|23|CP022905|CRT | 835809-835831 | 23 | CP022905.1 | 787625-787647 | 1 | 0.957 |
CP022905_5 | 5.4|835809|23|CP022905|CRT | 835809-835831 | 23 | CP022905.1 | 1086500-1086522 | 1 | 0.957 |
CP022905_5 | 5.4|835809|23|CP022905|CRT | 835809-835831 | 23 | CP022905.1 | 1693608-1693630 | 1 | 0.957 |
CP022905_5 | 5.4|835809|23|CP022905|CRT | 835809-835831 | 23 | CP022905.1 | 2401700-2401722 | 1 | 0.957 |
CP022905_6 | 6.1|897451|34|CP022905|CRISPRCasFinder | 897451-897484 | 34 | CP022905.1 | 1693617-1693650 | 1 | 0.971 |
CP022905_7 | 7.1|984235|34|CP022905|CRISPRCasFinder | 984235-984268 | 34 | CP022905.1 | 1294349-1294382 | 1 | 0.971 |
CP022905_8 | 8.1|1420922|33|CP022905|CRISPRCasFinder | 1420922-1420954 | 33 | CP022905.1 | 1693617-1693649 | 1 | 0.97 |
CP022905_11 | 11.1|2412554|31|CP022905|CRISPRCasFinder | 2412554-2412584 | 31 | CP022905.1 | 842886-842916 | 1 | 0.968 |
CP022905_1 | 1.1|170207|33|CP022905|CRISPRCasFinder | 170207-170239 | 33 | CP022905.1 | 1605295-1605327 | 2 | 0.939 |
CP022905_5 | 5.2|835692|23|CP022905|CRT | 835692-835714 | 23 | CP022905.1 | 984189-984211 | 2 | 0.913 |
CP022905_5 | 5.2|835692|23|CP022905|CRT | 835692-835714 | 23 | CP022905.1 | 1605314-1605336 | 2 | 0.913 |
CP022905_5 | 5.4|835809|23|CP022905|CRT | 835809-835831 | 23 | CP022905.1 | 984189-984211 | 2 | 0.913 |
CP022905_5 | 5.4|835809|23|CP022905|CRT | 835809-835831 | 23 | CP022905.1 | 1605314-1605336 | 2 | 0.913 |
CP022905_7 | 7.1|984235|34|CP022905|CRISPRCasFinder | 984235-984268 | 34 | CP022905.1 | 1689243-1689276 | 2 | 0.941 |
CP022905_7 | 7.1|984235|34|CP022905|CRISPRCasFinder | 984235-984268 | 34 | CP022905.1 | 2870555-2870588 | 2 | 0.941 |
CP022905_11 | 11.1|2412554|31|CP022905|CRISPRCasFinder | 2412554-2412584 | 31 | CP022905.1 | 70386-70416 | 2 | 0.935 |
CP022905_11 | 11.1|2412554|31|CP022905|CRISPRCasFinder | 2412554-2412584 | 31 | CP022905.1 | 374957-374987 | 2 | 0.935 |
CP022905_11 | 11.1|2412554|31|CP022905|CRISPRCasFinder | 2412554-2412584 | 31 | CP022905.1 | 660699-660729 | 2 | 0.935 |
CP022905_11 | 11.1|2412554|31|CP022905|CRISPRCasFinder | 2412554-2412584 | 31 | CP022905.1 | 897762-897792 | 2 | 0.935 |
CP022905_11 | 11.1|2412554|31|CP022905|CRISPRCasFinder | 2412554-2412584 | 31 | CP022905.1 | 1087898-1087928 | 2 | 0.935 |
CP022905_11 | 11.1|2412554|31|CP022905|CRISPRCasFinder | 2412554-2412584 | 31 | CP022905.1 | 1406286-1406316 | 2 | 0.935 |
CP022905_11 | 11.1|2412554|31|CP022905|CRISPRCasFinder | 2412554-2412584 | 31 | CP022905.1 | 1605253-1605283 | 2 | 0.935 |
CP022905_11 | 11.1|2412554|31|CP022905|CRISPRCasFinder | 2412554-2412584 | 31 | CP022905.1 | 1693661-1693691 | 2 | 0.935 |
CP022905_11 | 11.1|2412554|31|CP022905|CRISPRCasFinder | 2412554-2412584 | 31 | CP022905.1 | 1899703-1899733 | 2 | 0.935 |
CP022905_11 | 11.1|2412554|31|CP022905|CRISPRCasFinder | 2412554-2412584 | 31 | CP022905.1 | 2401753-2401783 | 2 | 0.935 |
CP022905_11 | 11.1|2412554|31|CP022905|CRISPRCasFinder | 2412554-2412584 | 31 | CP022905.1 | 2577298-2577328 | 2 | 0.935 |
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attgagaatccaatttctctttgttggggcccat CRISPR spacer attgggaatccaatttctctttgttggggcccat Protospacer ****.*****************************
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45. spacer 8.1|1420922|33|CP022905|CRISPRCasFinder matches to position: 1693617-1693649, mismatch: 1, identity: 0.97
tgggccccaacacagagaaattggattcccaat CRISPR spacer tgggccccaacaaagagaaattggattcccaat Protospacer ************ ********************
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50. spacer 5.4|835809|23|CP022905|CRT matches to position: 984189-984211, mismatch: 2, identity: 0.913
tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer tctgttgaaattgggaatccaat Protospacer ***** ********.********
51. spacer 5.4|835809|23|CP022905|CRT matches to position: 1605314-1605336, mismatch: 2, identity: 0.913
tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer tctgtagaaattgggaatacaat Protospacer **************.*** ****
52. spacer 7.1|984235|34|CP022905|CRISPRCasFinder matches to position: 1689243-1689276, mismatch: 2, identity: 0.941
ccaacacagagaatttcgaaaagaaattctacaa CRISPR spacer ccaacacagagaatttcgataagaaattccacaa Protospacer ******************* *********.****
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ccaacacagagaatttcgaaaagaaattctacaa CRISPR spacer ccaacaaaaagaatttcgaaaagaaattctacaa Protospacer ****** *.*************************
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62. spacer 11.1|2412554|31|CP022905|CRISPRCasFinder matches to position: 1899703-1899733, mismatch: 2, identity: 0.935
cacattattgtaagctgactttctgtcagct CRISPR spacer cacattattgtaagctgacttttcgtcagct Protospacer **********************..*******
63. spacer 11.1|2412554|31|CP022905|CRISPRCasFinder matches to position: 2401753-2401783, mismatch: 2, identity: 0.935
cacattattgtaagctgactttctgtcagct CRISPR spacer cacattattgtaagctgacttttcgtcagct Protospacer **********************..*******
64. spacer 11.1|2412554|31|CP022905|CRISPRCasFinder matches to position: 2577298-2577328, mismatch: 2, identity: 0.935
cacattattgtaagctgactttctgtcagct CRISPR spacer cacattattgtaagctgactttccgccagct Protospacer ***********************.*.*****
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022905_5 | 5.2|835692|23|CP022905|CRT | 835692-835714 | 23 | AP014226 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S44-C3, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 28490-28512 | 3 | 0.87 |
CP022905_5 | 5.2|835692|23|CP022905|CRT | 835692-835714 | 23 | AP014225 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S41-C89, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 24653-24675 | 3 | 0.87 |
CP022905_5 | 5.4|835809|23|CP022905|CRT | 835809-835831 | 23 | AP014226 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S44-C3, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 28490-28512 | 3 | 0.87 |
CP022905_5 | 5.4|835809|23|CP022905|CRT | 835809-835831 | 23 | AP014225 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S41-C89, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 24653-24675 | 3 | 0.87 |
CP022905_10 | 10.1|2304512|34|CP022905|CRISPRCasFinder | 2304512-2304545 | 34 | JN882286 | Cronobacter phage vB_CsaP_GAP52, complete genome | 23034-23067 | 8 | 0.765 |
CP022905_10 | 10.1|2304512|34|CP022905|CRISPRCasFinder | 2304512-2304545 | 34 | CP030544 | Staphylococcus aureus strain ER04166.3 plasmid unnamed2, complete sequence | 7567-7600 | 8 | 0.765 |
1. spacer 5.2|835692|23|CP022905|CRT matches to AP014226 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S44-C3, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer actgtagaaaatggaaatccaac Protospacer ********* ***********.
2. spacer 5.2|835692|23|CP022905|CRT matches to AP014225 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S41-C89, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer actgtagaaaatggaaatccaac Protospacer ********* ***********.
3. spacer 5.4|835809|23|CP022905|CRT matches to AP014226 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S44-C3, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer actgtagaaaatggaaatccaac Protospacer ********* ***********.
4. spacer 5.4|835809|23|CP022905|CRT matches to AP014225 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S41-C89, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer actgtagaaaatggaaatccaac Protospacer ********* ***********.
5. spacer 10.1|2304512|34|CP022905|CRISPRCasFinder matches to JN882286 (Cronobacter phage vB_CsaP_GAP52, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ttgcatatctttagctttattgtttgcaactggg CRISPR spacer ttgcatatctttagctttatagcttttatatgct Protospacer ******************** *.** .* **
6. spacer 10.1|2304512|34|CP022905|CRISPRCasFinder matches to CP030544 (Staphylococcus aureus strain ER04166.3 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ttgcatatctttagctttattgtttgcaactggg CRISPR spacer ttgaataactttagctttattgttataaacagta Protospacer *** *** **************** *** * .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
398446 : 415700
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP022905|398446:415700|DBSCAN-SWA ATTAAAAGAATGGAATGATTTTACTCGCGTAAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCTTTGCACAATAAAGCCATTCAGGATGAATGCCACTATTAAGTATCTCTTGGAATTCTTGAAAATCTTTAGACCAATCAATATTTAAATTCATTCCTTACCACCTCACAACCATTATAGAACATGCGTTCGCTTTTGTGAAGTGTATTTTTAAAAATATCATAGAAAATTTCAAATGAATTAATGTCAAAAATGATATGAAGAGTAGTTTGAATTATTATTGTAAAAAGTAATGGCGCATGATATAATTCTTTATTGTGAGTAATGAAAATTATTCCTTGCTTATCTGTTTTAAGATTGATAAGCCGTATAGACCACAAGGAGGTGCAAATATAAAATGAGAACATATGAAGTTATGTACATCGTACGCCCAAACATTGAGGAAGATGCTAAAAAAGCGTTAGTTGAACGTTTCAACGGTATCTTAGCTACTGAAGGTGCAGAAGTTTTAGAAGCAAAAGACTGGGGTAAACGTCGCCTAGCTTATGAAATCAATGATTTCAAAGATGGCTTCTACAACATCGTACGTGTTAAATCTGATAACAACAAAGCTACTGACGAATTCCAACGTCTAGCTAAAATCAGTGACGATATCATTCGTTACATGGTTATTCGTGAAGACGAAGACAAGTAATAATTAGAGGGGGCGTTTAAATGCTAAATAGAGTTGTATTAGTAGGTCGTTTAACGAAAGATCCGGAATACAGAACCACTCCCTCAGGTGTGAGTGTAGCGACATTCACTCTTGCAGTAAATCGTACGTTCACGAATGCTCAAGGGGAGCGCGAAGCAGATTTTATTAACTGTGTTGTTTTTAGAAGACAAGCAGATAATGTAAATAACTATTTATCTAAAGGTAGTTTAGCTGGTGTAGATGGTCGCTTACAATCCCGTAATTATGAAAATCAAGAAGGTCGTCGTGTGTTTGTTACTGAAGTTGTGTGTGATAGCGTTCAATTCCTTGAACCTAAAAATGCGCAACAAAATGGTGGCCAACGTCAACAAAATGAATTCCAAGATTACGGTCAAGGATTCGGTGGTCAACAATCAGGACAAAACAATTCGTACAATAATTCATCAAACACGAAACAATCTGATAATCCATTTGCAAATGCAAACGGACCGATTGATATAAGTGATGATGACTTACCATTCTAATAAAAATTAACGAAATTAAAGCGAAAAAATTATCAAAGGAGGCACACAATCATGGCAGGTGGACCAAGAAGAGGCGGACGTCGTCGTAAAAAAGTATGCTATTTCACAGCAAATGGTATTACACATATCGACTACAAAGACACTGAATTATTAAAACGTTTTATCTCAGAACGCGGTAAAATTTTACCACGTCGTGTAACTGGTACTTCAGCTAAATATCAACGTATGTTGACTACAGCTATCAAACGTTCTCGTCATATGGCATTATTACCATATGTTAAAGAAGAACAATAATATATAACGTATAACAAAACCCTTTAGCAATCAGGCTAGAGGGTTGTTTTTGTGTTTATTTTTATAAAAATTTCGCAATTTTTTCGCAGAGTGTGAAAAGTTTGATGATTAAAATTAAAAAAACGGACAAATAATTGTCCGTCTTTGCGAGATATTAATCTCATATAATAGTTTGGTGAGGACTCGCCTCTATATATGTAAATGATAACTGATTATTATTTGTACGTCAATCTAATTGATTAGCTTATTTTTAATTTCATTATCTACTAATTTCATACTATCAAAATCGAGTTTCATTCTACCAGAAGGATCTTCAGCGTTAATTTTTAAAATTCTTAATTTGCTAATAGTTACTACATTCTGTGTGCAGGCAAATGTATTTTTATCAAATTTTTTATATTTATTAATAACTTCTCTAAGGTTATTAACTTTTGATTTTCTATCGTTTACATCAATTAGCAAATAATTAAACAAAGCAGAAAAATTTTTCGGGTCATTGTATAAATTAAATGATTCTACTATGTTTTTACTTTTATTAATTACTTCTCTTTCTGTAGGGAAGCGTGTTTTAATTGCAAAATCATCTAAATAATCTATAGTGTTTTGTTCCAAAGTGTTTTGTAAATTATTTTTATTAATAATTTCTATAACCGTAAAAATTACGTGATTTATAACGTCTAAATCAAATTCGATATTATCAACTGTCTTGTTCAAAATTGATAATGATGTTTTAAATACAATATTTTGTAATGGTAAATAGTGTTTTTTATTTTTTGAACTTAATGGTACAACTGTTACTAAAGAATTATATGGACTATCATTTTTGTTTAATACTATTCCAAAATGTCTGCCAGAAAATTCATGCCCAATATTGATGCCAAAATCTAAATATATAATAGATCCCCTTGAGAATTTTTTGTATTTTTTGTTTATATTGTTATTATGCTCCATATTAAACCAATATGATGTTGTCTCTAACCAATTTGGTAAAAATTTAAACTTTTTATTATCTGTGTTATATAACAGAATAAATACTCACAGCTTTATTTATTCTGTTATCCATCTAACTCCCTATCCCCTCTAATTTATTCATCATATCTTTTGCCATCTTATCAGTAACATGTGTGTATATCTCTAAGGTGGTTTTATAGTCCGAGTGACCTACACGCTCTTGTATCGCTTTTAGGTTAATTCCTAATTGCGCAAGTGTAGATATGTGTGTGTGACGTAATGTGTGCGTTGTCACACGCTTGTTAATTGAACTTATATCAGTAGCTTCTTTAATAATATTATTCACCTTATTTAAGTCAATAGGGCTACCAGCAGTGTTAGTAAATATATAACCTCTATCTATGAATTTATCATTCCACTGATTCTCTTTTTTATTTTCTAGCATGAGTTTTTTAAGTAAATTAATACTTTGAGCTGTGAGGCCTATTGTTCGATAACTCTTACTCGTCTTAGTCGTTTCTTTCACTCCAAATGCTCCAGTTACTACATCTGTAACCCAGTTAATTGTGCCATCAATCTCTAGTGTTTTATTCTCCACGTCTACATTGTCTGTCTTGATTGCTAGGAGTTCGCCAATGCGCATTCCATTGTTAATTTGAAATTCTACTAATGCTTTTACCATTTCATAGTTACGTTTACGCGTAGCATGACGCTTATGTTTAATTAGATAGTCGAAGCACTCTAGTAACTCCTTTACTTCGCTATCTTCTAAATAGTTATTACGTTTAGCTTGAAACTCGTTTCTGGTTTGGGCTTTCTTAGGTATATCTATTTTATCTAACACACTAATATCGTGCAGATCATAATATTTAAACGCATATTTGAAAACGGAACGAATAACAATAACAAGAGATTGAACATGGCCAATACTATGTGATTTAGCCCATTCATTAATGATGTTTTGTAAGTAGGTGTGCGTAATCTTGCTGATGAGTACTTTGCTATCAATAGCATTTTTAACTGTATTAGTATTACTTTTCTTTTCTTTAATAGTGGTTGGTTTCGAGCCTGAATGTGTCTTGTAATGCTCTAACCATTCATCGCACGCATCATGGAACGTTAAGTTTTCAAGTTGTTTCGTACTGTAATGTTTCAAACGTTGCTCAATTATTTTATTTAATTCTAATTGAGCGTCCTTTTGGCTACGTACATTATTCTTGTTACGTGTAACTGATACTGTTTTATACTTGCCAGTTAAAGGGTCTGTATAGCGCTCTAAATAGCGATAGGCCGTACTATTGTTTTTGGTGATTTCACGAACCCACATTTGTCATCCCTCCTTTAGATATTCTGTTTTTAAAATGTCTGAAATAAACAAGTAACTATCAAGTGTAGTACAAAATAGGCAAAGTTACGTATGTTTATAGGATTGTACGGTAGTAATATTTGTAGTATTAGCTTTAAGTATTTATTTTAGCGTGCTTTGTTCAGTTCTTTTTATCTAACTTATCATCTATATAATCGCTTAATTTTACTAATTGTTCCCAGTTTTCATTTTTATCTCTTAAAGTTTTTGTGTTCTCTTTTATAATAACTGATTTATTTTCGAAATAATTATTTAAAATTTTATCGATGTTATTTTTATCGTTATCCGTTAATCTAATGCCTTTGTAAAATTTATAATTATTAATATCTTGCAGATGAAAGTGCAAATCATTAATGCTAATGTTAAAAATTGTGAAACTCTTTTCGTTATTGTCATCAAAAGATATGAATTCTCTAGAATATGGTATATCCATCATTCTATCTATAATTTCCATTTTATTTGTTACATTAGAAACTTTGTTTAACTTAACTTTATTTTTCGTTATCTTAGCTATTTCATCAACATAAAAATTATACTCCTCATTAGTGTCTTTTATGTTCATTAAGTAACTTTCGATAAGTTTATTGCTTGGAAAAGATTTAACACCATTTTCAATGCCACTTATATGCCCTTGAGAATACTGCATTTGTTTACTTATTTCGCTTGCTGTCTTCCCTTTTTGTTTTCGGATAGACTTTAAAAATCTGCCTAATTCTTTTTTTAATTCATCATTTGATTCAACCATTGGCGACACCTCCGTATTTTTAATGATAAACCATGCATAAAAATAATACAATATTATTCTTGACATTCCTAAAAGAAGGTGCGATACTCTATTTATGCATAAAGGAATAAAAATAAATGCATATATTCTTAAGGTGAGGGGTGATTTTATGTTTATGACTGTAAAAGAAGTTGCTCAATTGTTACGTATAAGTGAACGCCATACTTATAAACTTCTTCAAAAAAACGTTATACCACATACTAAAATTGGCGGAAAGATATTAGTTAACAAAGAAAGGTTATTAGAAACTTTAGAAAAAAAGGAGGTTAAATAAATGCCTAGAACAAAGTTACAAGATTTTCCATCAAAAGAAAATACAGTTACAGAACCGGAACAAGTTGTAGTAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP022905|398446:415700|404775_405645_+|AXJ65818.1|DBSCAN-SWA MNEIKLEYDTHVSVVHYESLDSRSFNSFSKPKWSKLVNKLSVPIEANYKYARGVAIYGDMKDDTDENGNEYKKYRKDENVIYRDVLVLDYDDIPKLRILHDAITETLKGVSWMYHTTFNHRTESPRVRLYIALNEHISADEYRKYTKVLESKIGHPVDEGSYQPSRAMALPVKKSNDSIYIFKYNDAPILSVETLEEWSKELKSQYKESNKFKYPKRRDNEFWKSIAFGVSTGNRNQMLTSLIGVLLNRRVPDPLVYAYCFMWNENCNPPLSSREFNATFESIYKREHR >CP022905|398446:415700|398446_398638_-|AXJ65805.1|DBSCAN-SWA MNLNIDWSKDFQEFQEILNSGIHPEWLYCAKANLVLEPAYTGEGKQFFSTQDIIYASKIIPFF >CP022905|398446:415700|399198_399702_+|AXJ65807.1|DBSCAN-SWA MLNRVVLVGRLTKDPEYRTTPSGVSVATFTLAVNRTFTNAQGEREADFINCVVFRRQADNVNNYLSKGSLAGVDGRLQSRNYENQEGRRVFVTEVVCDSVQFLEPKNAQQNGGQRQQNEFQDYGQGFGGQQSGQNNSYNNSSNTKQSDNPFANANGPIDISDDDLPF >CP022905|398446:415700|407892_408534_+|AXJ65822.1|DBSCAN-SWA 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MWVREITKNNSTAYRYLERYTDPLTGKYKTVSVTRNKNNVRSQKDAQLELNKIIEQRLKHYSTKQLENLTFHDACDEWLEHYKTHSGSKPTTIKEKKSNTNTVKNAIDSKVLISKITHTYLQNIINEWAKSHSIGHVQSLVIVIRSVFKYAFKYYDLHDISVLDKIDIPKKAQTRNEFQAKRNNYLEDSEVKELLECFDYLIKHKRHATRKRNYEMVKALVEFQINNGMRIGELLAIKTDNVDVENKTLEIDGTINWVTDVVTGAFGVKETTKTSKSYRTIGLTAQSINLLKKLMLENKKENQWNDKFIDRGYIFTNTAGSPIDLNKVNNIIKEATDISSINKRVTTHTLRHTHISTLAQLGINLKAIQERVGHSDYKTTLEIYTHVTDKMAKDMMNKLEGIGS >CP022905|398446:415700|412036_413005_+|AXJ65828.1|DBSCAN-SWA MKPFESHNKQLKILRRRGMEVPSSAKRDLENENYYNIINGYKDLFLELDVNGNFLVPDKYKQGTHFKEVFSLYKLDRKFRNVLLEYLLVFETHIKSRISYYFSEKYREPHSYLYFKNYSSDTSKTDSIVKMVATFSSVMSNRKNKPLKHYINTHNGVPLWILVNYLTLGNVSKMYSNLDDDLRLEVAKDYKRKLERDYKTRVQITPSDVDSILQQAHMFRNVCAHEERLYDYKIDRAKSRANIFANYNKIYDKEYVPTMNGSYVFDLLISLCLFLNKHDYIKLVKNMDKLISNYSHSFYTITIDDLYTKMNFPDQTKILDML |
27 | Staphylococcus_phage(76.19%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
765475 : 773296
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP022905|765475:773296|DBSCAN-SWA ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTTACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTACGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTGTTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTGCGGTTTTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTTGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCGTGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAACGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAGTAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCGAGTGGGACAACAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCGATGACTGGTACTAAACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAGCCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGCGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTTACTTATGTGCTCTACAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTATATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGGTAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCTGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCGCCTAAAGTTAATACAGAGGCAACAGCACCAACTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACTCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGTCAAAATAAGAGGAGGGCATTTTTTTAGGTGAGAAAATATTTATCTGAACTAGATAACACTATAAAACACTTCTGATATTTTGAACTAAGAATATCAGAAGTGTTTTATAGTTTTGGTATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTGTTATTATTTTCAGCAGTTTCATCTAAGCTATTAAATGTTGAAATAAACAACATAATACCACCAATGATGAAAATTGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATCGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATAAAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTACTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCCACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACGCATTGTGTAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCAGGTGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGTGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGATTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCCTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACAACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGGCTAAAGTTCACTAAGAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACAAGGAATGTGATGTGCAGCCGAAAAATTAAAATCTTTATTTAATTCGAATTGATATGGATGCGTTGTACTAGGATAGATTTGTTGTAACATTTTAAAGCGCTCCTTTACTTTCAAGATATTGATTTAGTCCACGTTGACGTAAATGACAAGCTGGACATTCACCACAGCCATCCCCAATGATACCGTTATAGCATGTTAATGTTTTTGTACGAATATAATCTAAAACTTCGAGTTCATCACTTAATTTCCACGTTTCTGCTTTGTTTAACCACATTAAAGGAGTATGAATGACAAAATCTTTGTCCATAGCTAGGCTTAATGTTACGTTCATTGATTTTATAAAACTATCGCGACAGTCTGGGTAGCCTGAAAAGTCTGTTTCACATACGCCTGTAATAATATGCTTAGCCCCAATTTGATAAGCTAGAGCGCCTGCAAACGACAAGAAAAGTAAATTTCTAGCTGGAACAAATGTATTAGGTATACCATCTTCATTATTAGTAATTTCCATATCATGTTGTGTTAATGCGTTTGGAGTAAGTTGTGATAATAATGACATATCTAAAACGTGATGTTTCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATGTTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAAGAGGTTAATGGCATTGATAAGCCCGTTTTTAATTTATAAAATAAAAAAAGCCTATCTCCATAAAAGATAGACGAAAGAAATGGGTTGCTCCTATAATATATATTAAAGGTTTACCAACGAATGTTTGAAATTTCAATGTCTAGTTTTTTATAGAGGGTTTCAGCTAGAAACCTCTGATATTCATTTATGTACGATGAATAGAATATACCATATATTAGTTAAAATCAAGGTCAGGATAATGACAATGCTTTTAAAGTTTTAGCTACATCCAATACATATTATAAAAATAAAACACATTTAGAACGGAGTATACAATGATTCTAGTCATAGATAATAATGATTCATTTACATATAATTTAATAGACTATATTAAGACTCAAACGAAACTAACAGTTCAAGTTGTTGGTATTGATAATCTGCTGATAGAAGACGTCATTAATATGAAGCCAAAAGCAATTGTTATTTCGCCTGGGCCGGGTAATCCGGATGATTATCCTATCTTGAATGAAGTGTTAGAACAATTTTATCAGCGTGTACCTATACTAGGTGTATGTTTAGGATTTCAATGTATCGTGTCTTATTTTGGTGGAAATATCATTCACGGCTATCATCCTGTACACGGACATACTACACAGTTACGCCATACCAATGAAGGTATTTTTCAAGGACTGCCTCAAAATTTCAATGTAATGCGTTATCATTCATTAATTGCTGACGGAGCGACTTTTCCAAATTGCTTAAAGATTACAGCAAAAAACGATGAAGCGATTATTATGGCATTTGAGCATATTAGATTTCCGGTTTTTGGTGTGCAATATCATCCTGAATCTATTTTGAGTGAATACGGTTATCGACAAGTTGAATTATTTTTATCGAAGGTAGGTGATTACTGTGAGAATAGAATATAATTATCGCTACTATTTAACTGAAAATGAATATAAGCAATACCATATTCAATTAAAGGGATTTATAAAGAAGTATGTTGCTACTAAGTTGGCTGATGTGGGAGAAGTGATACACTTTGCACAAGCGCAGCAACGACAAGGTAGATATGTCTCGTTATATTTAAGTTACGAAGCGGCAAAGTATTTTAATCATGTTATGTGTACACATTCATTAGCTAAAGATGATATTTATGCAGTAGCTTATAGTTTTGAAAAAGCGGAAAGCATAAATTCAACATATGAACATCAAACTTCTTATGTATCAAAGCATCATTTTTCATTTGTTGAATCTTCTGAGGTTATGATGACTAATATTAAACGTGTCCAACAAGCAATTGTTGAAGGTGAAACGTATCAAGTGAACTATACGGCGCGCTTAACGGATAACATTTATTATCCTATTAGTACTTTATATGAACGATTAACTCAATTTAGTAATGGTAATTATACTGCGTTATTACAAACTGATGAAATCCAAGTAGCGTCTATCTCACCAGAATTATTTTTTCAAAAAGGACAATTTAACAATGTCGATAACGTTATCATAAGCAAACCGATGAAAGGGACAATGCCTAGAGGTAAAACGGAAGCTGAAGATCAACAGTATTATAAAACATTGCAAACTTCTTCGAAAGATCGTGCAGAAAATGTCATGATTGTTGATTTGCTAAGAAACGATATAGGGAGAATATCACAGAGTGGCTCAATTAAGGTGTATAAACTATTTTTTATTGAGGCATATAAAACTGTATTTCAAATGACTTCGATGGTAAGTGGAACTTTAAAAACTAATACAGACTTAACTCAAATTTTAACATCGTTATTTCCTTGTGGTTCGATTACAGGTGCACCGAAACTGAATACAATGAAATATATTAAACAATTTGAAAGTTCACCTCGTGGTATATACTGCGGAGCAATTGGACTATTACTTCCAACTGAAGATGATAAAATGATTTTTAATATTCCGATTCGTACTATTGAGTATAAATATGGACAAGCGATTTATGGAGTCGGAGCAGGTATTACAATTGATTCTAAGCCAAAAGATGAAGTAAATGAATTTTACGCAAAAACCAAGATTTTGGAGATGTTATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP022905|765475:773296|771567_772161_+|AXJ66151.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHIRFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >CP022905|765475:773296|767191_767665_-|AXJ66145.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >CP022905|765475:773296|769410_770124_-|AXJ66148.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >CP022905|765475:773296|770548_771217_-|AXJ66150.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >CP022905|765475:773296|768007_768448_-|AXJ66146.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAVASVLTLGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >CP022905|765475:773296|766530_767217_-|AXJ66144.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >CP022905|765475:773296|768727_769312_-|AXJ66147.1|DBSCAN-SWA MILYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >CP022905|765475:773296|765475_766531_-|AXJ66143.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >CP022905|765475:773296|772144_773296_+|AXJ66152.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQFESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >CP022905|765475:773296|770127_770547_-|AXJ66149.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
788085 : 801748
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP022905|788085:801748|DBSCAN-SWA CTTACAAATCATTGACAGTAAGTAACTGAATAGCATTTGGTATAACCTCAATATCAATAGGTGTTTCTAATGAAATTTCGCCATCAATATCAACTTTCATTGCTGGATCTGTTGTAAGTGAAATCTTTTTACCAGGTATATGCTCAATACCTTGAGTAATTTCATTCCAATTCATGCTATCACGCTTTTTAAAAATATCATTTAAAATACTGAAACTTTGTTCATTAAAAATGAAAGTGTTCAGTTCACCATCTTGAGGAGACAAATCAGTCAATGGTATACGACTACCACCAATGAATGGACCATTTGCTGTTAGTATCATGGTCGTTTCGCCAGAATATGTCTTATCATCTATTGATAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATGAGACCTAAGCCAACAAAGTTGAGTGCATATTGATTATTTATTTTAATTACATCGTATGTACCAACTTGTGCAGAAATCATTTGTTCACTAGCTTGTTTATGATTAGGTGCTATATTTAGCGTTTTTGTAAAATCATTAAAAGTACCGCCTGGTAAAATGCCAATAGGGAGTTGAAGGTCATGTGACATAACACCATTTATAAGTTCGTTAACCGTGCCATCACCGCCAAGAATAAATAATATATCTACATCTTTTGCATAGTTTTTAGTTTTGATTTCTTGGCAATATTTAATAATGTCACCTTCGTTTTCACTCAATTGAATAGAAAGATGCTTACAAATTGAACTTAATGCTGTTGTAACTTCCCCAATACCTTGATTAATATTTTTTAATCCACTGTGTTCATGGTAAAAGAGGACACCATGTGTATATTTATTTTCCATAGTTTAGCCTACTTTCTAAAAATTGGTTCATTAAATATATATACCCACTTTTAATTGTTAATACCAAAAATATGTTTTTAAATAGAGAAAATGGTAATAACTGACATTGATGTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAACGAGCATATTAAGCTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAAGGGGCTGACCCAAAAGTAGCTCCTATATGAAAAATAGAGGTCTTTCCATTTAGATAGTAGTGGAAAGACCTCTATTTATCTTTTGAAAGTGAATACAAAAATAAAGCACACTCTGCTATAATATAGGTGATTAATCCATTTGAGAGAGGTGCTTTATCATGTATCAAAATTATACCATAAACCAACTTTGTTTGCCTATAGATCTTGAAATTAAATTAGAAGAAAATGATTTTGCTCATGCCATTGTGCAGTTTGTTGACTCTATTCCCGATGAAGTCTTTCTTCCTTATTATCAATCTATGGGTAGACCCCAATATCATCCTCGTATGCTACTTTCCATTATTCTTTGTGCCTATATTCAAGGGGTTTATTCGGGCCGCCAAATACAAAATATGCTGATAGATAGTATTCGGATGCGCTACTTATCTCAAGAGCAATTCCCTAACTTTCGTACTATTAATCGTTTTCGCGTTCATCCGATTATGAACGATATTCTAGATCATTCATTTGTTCAATTTCGTGAGCTACTGGTTCAAAGTGGCTTAATCAGTGGCAGTGCTCTATACATTGATGGTACAAAAATTGAAGCGGATGCGAATAAATACTCTTTCGTTTGGAAAAAAAGTATTTTAAAGTATAAGGATAGCCTTGATCAAAAAGCCCTTGAAAACTACCAACAAATGGTGGAAACAAAAATCTTACCTGAGTTAATAGATGATTTAAAGGATGAACTTTCTATAGAAGAGATTGAAAGGATTCGTCAATCTTTGGAAGAAAAGGAAAATCAATTAATTGAAGCGATTGACCAAACCGAAACAGTAGAAGAACGAAAATTACTTCGTAAAGAAAAATCTGAAGTTCATAAGCAGAAGAAGCGATTCGATGATTTTGCCCAAAGAAAAATGAGCTACGAAGAACAATTAGTGATTATGGGTGTACGCAATAGTTTCTCAAAGACGGATCATGACGCTACTTTTATGCGAATGAAAGAAGATCACATGCTTAATGGCCAACTAAAACCAGGTTATAATATTCAACTTGCGACAGAAAATCAATTTGCTCTTGCTTATGATTGTTATCCAAATCCAACAGATACACGAACATTTATCCCATTTCTTGAAAAGATTGAATCAAAAATAGGTTTACCAGAAAATATTGTCGCAGATGCCGGTTATGCAAGTGAAGAAAATTATTGTTATGTGTTAGACGAAACAGAATCCACCCCCATCATTCCGCATCAAGGTTACTTAAAAGAGAAGAAACGCGCCCATAAACAAAATCAGTTTCATCGAGATAATTGGACTTACAACGAGTTGGATGATTACTATATTTGTCCCAATCAGAAAAGAGTAGTGTTCTCACATTATTCACAACGTAAAGATAGAAATGGATTTATTCGAAACTTCAAAATCTATGAATGTGAAGATTGTACAGGATGTCCATTGAGAGAGAAATGTACCAAAGCAAAAGAAGGAAAAAATCGACGTTTGAATATTAATCCAACCTGGGAATATATAAAAATAAAAGCGAATGAAAAGATAGAAAGCAAAGAAACAGCCTCATACTATGCGCAGCGAAAGATAGATGTCGAAACAGTTTTTGGAAACATTAAACAAAATATGAAATTTAAAAGATTCCATGTCCGAGGAGCTGAAAAAATTTTTAAGGAAATGGGACTTGTATTTCTTGCGCACAATTTTAGGAAATTAGTAACTAGAGTAAGGAAATATGAGGGAAAAACAATCATACAAAACCAAATATAGGGGGAAAATCCTCTATATTTCATCCAAAAAAAACAAAAATCGAAGACATCTTTCACGGGTGCCTTCGATTTTTTGGTTCAAAAGGGACTAATGGGTCAGCCCCTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGAATGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAATTTGTTTGACCTAGTGGTTCTATTAACTTAACTAAAGTACCATTGATTGCTTGTGCAGAAGCGTTAGTTAAGTACCAAATACTCATCATTTGGGCATTAAATGCTTTAGGTGCTAACTTAACAGCAGCACTATTACCCGTTGGTGATAAGCATAGCTCACCGATAACACAAATAATGTACGATAAAATAACCCAGTTAACTGAGAAGTTTGATGAACCTGATGCATAACCTACAATACCAATTAGTATGTATGACGCACCTGCTAAGAACGTACCAATTGCAAATTTTACTGGCAGGCTAGGTTGTTTAGTTCCAAGCTTTTGCCATAAAAGTGAAATAATTGGAGCTAATAATAAAATAAATAATGGGTTAATTGATTGGAAGATCGCTTCACCAAAGTTTGTTTTCCAACCAAATAAGTTTAATTTCATATCTGAATGTTCAATTCCATATATGTTTAATACATTAGACCCTTGTTCTTGAATAGCCCAGAACACCATTCCAAGAATAAATAATGGAATAAATGCTTTAACACGAGAACGTTCAGTATCAGTGACATCTTTACTTCTAATAATTAAAGTGAAGTAAATGATTGGTAATGCAATACCTAATACTAAAACAGTATTACTAACTAAGTTAAATGATAATGAGTTAGTTAATGCACCAATAACGATAATTAATACAATTGCTAAGACAACACTTCCGATAATAAGACCATACTTTTTCTTTTCAGCTGGTGTCAATGGGTTAGTAGGTTTCATACCAACGCTACCTAAGTTTTTGCGGTTGAAAAGTACATACCATACTAAACCTAATGCCATACCAACTGCTGCAATCAAGAATCCGCCGTGGAAGTTTTTAACATTAACAAAGTGTTGCAAAATAATAGGTGATAATAATGCACCCATATTAACTGACATATAGAAAATAACAAAACCTGCATCCATACGTCTATCATTTTCAGGATATAAACGGCCAACGATATTTGAAATGTTTGGCTTCATTAAACCTGAACCAATAATGATGAAGAACATTGATGTGAATAAGCCGATTAATGCAAATGGTAAGCTTAAACAAATATGTCCGATAATAATAAAGACTGCACCTAATAAAGTAGCGCCTCTAGTGCCTGTAATTCTGTCAGCAATCCATCCGCCTGGTATTGATGTCATATAGATTAATGAACCATAAACTGACATAATTGACATAGCTGTTGTTTTATCAATTCCAAGGCCATTATCTGTTACGGCAAAGTACATGTAGAAAATGAGTAGGGCACGCATGCCATAATAACTAAACCTTTCCCAGAACTCTACAAAGAAGAGTACGCCTAGTCCTCGAGGATGCCCGAAAAATCCTGTTTGAGGTATGTCTTGAATTTGATTTCCATGGGAGTTTTGTTGTGTCATGTATACATCCCATCCTTTCTTCCCCTAATACAATAGTTTAAGTAAATTTGATTGTGCCTTATCAACTAAATATTCCAACAAATCACAAAAAAATAAAAATATTGAGAATATTCTGTTATTAAGCGCGCACAATTAATTAGAGATAATATAAAAATATACTTATTGACGTTAAAGTGCAATAGGTTTCTATAAAAATGTTGTTTAATTCGTGTACTAATATTCTTTTGGTGTACTTTGGTATAAAATGTTATTTTAATGTAACCTATTATGTATGCTAAATGAAAAACACACCAATAAGTTAGGAAAATCAACTTATTGGTGTGTTTATTAAATGATACATTTAACGATTATCTATTTTTTCGGGATATAAATCATGATTCATCAAACGATGCTCAGCCATTTTTTCATATTTAGAATTTGGACGTCCATAGTTTGTATAAGGATCAATAGAAATTCCACCACGTGG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP022905|788085:801748|799033_800047_+|AXJ66171.1|DBSCAN-SWA MIMIIINLKGEKFVMKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >CP022905|788085:801748|788085_789003_-|AXJ66163.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMSHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >CP022905|788085:801748|791112_792618_-|AXJ66165.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >CP022905|788085:801748|792958_793459_-|AXJ66166.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >CP022905|788085:801748|795506_797612_+|AXJ66169.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSISFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >CP022905|788085:801748|797729_798701_+|AXJ66170.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >CP022905|788085:801748|793478_794345_-|AXJ66167.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFLYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSSREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFVLFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >CP022905|788085:801748|795145_795544_+|AXJ66168.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >CP022905|788085:801748|800033_800990_+|AXJ66172.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >CP022905|788085:801748|789381_790986_+|AXJ66164.1|DBSCAN-SWA MYQNYTINQLCLPIDLEIKLEENDFAHAIVQFVDSIPDEVFLPYYQSMGRPQYHPRMLLSIILCAYIQGVYSGRQIQNMLIDSIRMRYLSQEQFPNFRTINRFRVHPIMNDILDHSFVQFRELLVQSGLISGSALYIDGTKIEADANKYSFVWKKSILKYKDSLDQKALENYQQMVETKILPELIDDLKDELSIEEIERIRQSLEEKENQLIEAIDQTETVEERKLLRKEKSEVHKQKKRFDDFAQRKMSYEEQLVIMGVRNSFSKTDHDATFMRMKEDHMLNGQLKPGYNIQLATENQFALAYDCYPNPTDTRTFIPFLEKIESKIGLPENIVADAGYASEENYCYVLDETESTPIIPHQGYLKEKKRAHKQNQFHRDNWTYNELDDYYICPNQKRVVFSHYSQRKDRNGFIRNFKIYECEDCTGCPLREKCTKAKEGKNRRLNINPTWEYIKIKANEKIESKETASYYAQRKIDVETVFGNIKQNMKFKRFHVRGAEKIFKEMGLVFLAHNFRKLVTRVRKYEGKTIIQNQI >CP022905|788085:801748|800986_801748_+|AXJ66173.1|DBSCAN-SWA MIQVENLTKTINNQMILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDNGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMNIQIEHIRNQRICLYFKD |
11 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
852600 : 869562
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP022905|852600:869562|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP022905|852600:869562|866911_867208_+|AXJ66239.1|DBSCAN-SWA MGLKLKEYINDSNRKLDKETVRKHLVDILNYTVEENSFLDQMTVGKRLYSNQYKNSPSVSLTVNHKIKINEVTSDFSYKFSDNETQTFNLSNELGVVA >CP022905|852600:869562|858180_858408_+|AXJ66223.1|DBSCAN-SWA MTKLTYPMLYITRKEKGDTQKKVASKLGISPQRYQLKESGKAIFNLNECQILSEMYDMPIDELFSSKIKVEGSRQ >CP022905|852600:869562|867953_868304_+|AXJ66241.1|DBSCAN-SWA MNNIGIIITIIGTILTVFNTISAIRWRRRNYNYRKQIDYYKNELEEANQKYIKNLNNKKELTEFINNFVKLSYSTIMSCISFLYTLDFITKSLTKNNEYISQEKLEKLLQRQIKSV >CP022905|852600:869562|852600_854973_+|AXJ66218.1|DBSCAN-SWA 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MKLLKTKNCLYYRNGDNKLSEYQLLTQFNPAFINKKIKMCEFQIESMYHMSASTTTCDEIMGVVSVSYPIEKLVIKIIETKAGLQNYKNRSINNTALLKKVLNHYTEKEQKQVVKYMRSNGRYKPYNVIERLQVDLYQASIKQRSERQKQRNTAIENSKIARVNAYHQSSYVKVV >CP022905|852600:869562|854994_855459_+|AXJ66219.1|DBSCAN-SWA MAKKKSPGTLAENRKARHDYNIEDTIEAGIVLQGTEIKSIRRGSANLKDSYAQVKNGEMYLNNMHIAPYEEGNRFNHDPLRSRKLLLHKREIFKLGEQTREIGYSIVPLKLYLKHGHCKVLLGVARGKKKYDKRQALKEKAVKRDVARDMKARY >CP022905|852600:869562|856021_857128_-|AXJ66220.1|integrase|DBSCAN-SWA MSYNLNLSHNIYKDAKLGTYYFRITYYDKSNTRKYITRKGFKQRKDAVKKCNEMMDELEGVGHLNRLPFDKLVEEYIDWYSARRKTSSVKALKTHTNNHLLPYFKSMDVFKMTTQDVMKFQNKKLKEGHSGDYLKKMHVYLVSLLNHAMKFHELKQNVASLVGNFEIESQKRLNYWTLEQFNQFYEALATQQQKLFFKLLFYSGARKGEIRALTWRDINFDDDFIHINKTDYHGEVTAPKTKSAIRDIYLPTHMMYDIKDYLIWYKENNIYKDDYVLFGTFYKAYSESTIDRWFTNALKVLDEQLPNGQNFPRIVIHELRHSHASMLVNLGASVMIIAQRLGHSDTTEVYNRYGHLYPSTQKEIVKYL >CP022905|852600:869562|867207_867648_+|AXJ66240.1|DBSCAN-SWA MASIGFKTYNFNHISYSKNKELDIENVDTFEVNSDFSAKVAFENEEAYIIMDCQIGNNKPNCPFIINMQLTGVFDIEYENDVEDKNSLKILLTQNAIAILYPYIRSLVSDLTSKANMFDTFIMPVVNVAKMMEENNRIEIVGLDKK >CP022905|852600:869562|868389_869562_+|AXJ66242.1|DBSCAN-SWA MTQVHFTLKSEEIQSIIEYSVKDDVSKNILTTVFNQLMENQRTEYIQAKEYERTENRQSQRNGYYERSFTTRVGTLELKVPRTRDGHFSPTVFERYQRNEKALMASMLEMYVSGVSTRKVSKIVEELCGKSVSKSFVSSLTEQLEPMVNEWQNRLLSEKNYPYLMTDVLYIKVREENRVLSKSCHIAIGITKDGDREIIGFMIQSGESEETWTTFFEYLKERGLQGTELVISDAHKGLVSAIRKSFTNVSWQRCQVHFLRNIFTTIPKKNSKSFREAVKGIFKFTDINLAREAKNRLIHDYIDQPKYSKACASLDDGFEDAFQYTVQGNSHNRLKSTNLIERLNQEVRRREKIIRIFPNQTSANRLIGAVLMDLHDEWIYSSRKYINFDK >CP022905|852600:869562|861293_862097_+|AXJ66229.1|DBSCAN-SWA MTGYHVAKHLLSKNIEVIPLNNHKKPTVSFADIDITDEFVEYHSNIYHQTNVLGVLTRGVWCIDIDVDHEDGKNGFDSLKQIPYYEELVTNAQNTLVQTTASGGKHIIFKKHDNIEYGQKIGYLPSVDIKAHPNNYFVLAGSQTAKGIYTHNGVNVTEYQGEFEKRIFSKAGNYKQQVLEPYSIRRALPNYSFSHVRVGKGGEGKRAYQRIIDGQSEYRNNDLYKAVSYAIQCNVDIEPLRVLIGDNKNGDVFTERDWEATVRSASR >CP022905|852600:869562|857938_858145_+|AXJ66222.1|DBSCAN-SWA MNNKVSNYRRYIGLTQNQMANNLKISVTAYRNKERGITPFKDSEKVFIKNKLIENGIKDITIDDIFFN >CP022905|852600:869562|865534_866104_+|AXJ66237.1|DBSCAN-SWA MSELTAKQARFVNEYIRTLNVTQSAIKAGYSANSAHVTGCRLLKKPHIKQYIQEQKDKIIDENVLTAKELLHVLTNAAVGDETETKEVVVKRGEYKENPQSGKVQLVYNEHVELIEVPIKPSDRLKARDMLGKYHKLFTDKHDINGNVPIFINIGEWDGDDEELDKAVKDVSNANPNHTVIVDDIPLED >CP022905|852600:869562|859501_861118_+|AXJ66228.1|DBSCAN-SWA MDEVSLYKKHFEFHSKLDYVSTINLSRIKEISKRINFASISTDRQVFNNKGNAYHREKDNVAGDYISNLTLDYTIKPKEIGLVYGTVNIKTVDKNGEEEKQSTFKTSHFHNYARFIADLISDRVIYSKQLDCFIIVKNNQYEVIDNTNFALTYPVDNKYYIDDFLDVMLELYREHLNVTHNFKIYPYCIAGNDWVYDCQNLTLTEQKLKSDELYSIKYDVDIKDINLEIPRNFFDLVTDNKKSKNNLMLTHAYTMYRKMKLIQAEKWFLLKDFGRSGKGLFMATFEKLMTVNKVNFDSLISGGFESANEWMNFYGADIAHANETGEITKQMMRILRKIATGETISGRGIGRNAFTFKNNAVLILDTNESVDTGEITANTTRTVKISLKDRPINETDEERYQIFKPYWDFIQPNGNTSVNASVSFLITSLEYLKENGREFKFKDVTLKYYFNEDELTETQITMIRLLSKQGFILAGDETLQRLIERDYSSLRYKNAKEDMRKIGISINNQKKIDGVNTKVHKVGNIELFNMALELISEH >CP022905|852600:869562|864397_864616_+|AXJ66234.1|DBSCAN-SWA METKYELNNTKKVANAFGLNEADTNLLINAVDLDIKNNMQEISSELQQSEQSKQKQYGTTLQNLAKQNRIIK >CP022905|852600:869562|863448_863790_+|AXJ66232.1|DBSCAN-SWA MQSIAEKETYHLPTEHLQVFNVIKNTSNKYITKTKILNQLGYEYNSSNERWLRRVINSLVYDYGYPIGCSYKPSERGYYIFTTEQEKQQAMRSIKKLADGSMKRYEALKRIKV >CP022905|852600:869562|866318_866891_+|AXJ66238.1|DBSCAN-SWA MCTTIDIRGYHGTDRSCYDNLEINKEFPVNKLPSDLGNGLYLFIDRKNKVGEAIKNAKNYLDRWKPKYEKKIIAQIDIKVKENRLMDLDDHDNQYEFNSFVEENEETIYNELDKLINNNTKSRGNIDGLIIEIMIREYNLEIDAIQKETYTQFDKSKKRKRSNIPNGKELCIRQNDIIKNKCIYNENVVT >CP022905|852600:869562|862357_862999_+|AXJ66231.1|DBSCAN-SWA MNIETIVNQFETRAGTLLRYYTGLLEHSKVQPCCFKLYNDPFDMVYVMMNSKLFGHVYIKDCKVRQSFELASPKHTEGLIRSIEGHYVGYELHDGKHLSISDMMASHLFEDEYFMYGLQTYAESNNSDVFEYLENGFDTDTLEGIQSSNTDVIANIEMLYQLATGINEPEPELVEGLKLVTEFIQDENATQEDYKALERKLNDLKASYYSLSK >CP022905|852600:869562|859133_859457_+|AXJ66227.1|DBSCAN-SWA MNWEIRNLMCNIEIVKEKLEDVATTHTWFVDGRFTKRSLKTKEEVVNYGLAYNEHRIHNEQVTELMLTYLEELDGLMNKFHEIEKASLSTDQSESNANVQSIYLNKY >CP022905|852600:869562|865196_865538_+|AXJ66236.1|DBSCAN-SWA MDKKQIKDFVCDYHKRTRSDVLIDDEINTDEFFSIGDENSNEWMADDNIDDHIVKNHLEMIVDQVANDKEFYIFDSLIQGRSFKDISNVLECSEQSVRLWYETLLDKIVEVIE >CP022905|852600:869562|858404_858578_+|AXJ66224.1|DBSCAN-SWA MKMYLTYICLVSLLTILLLAISNMYVAFSVYGMMVTYGFNLTGEITTCENKLLLQKQ >CP022905|852600:869562|857133_857718_-|AXJ66221.1|DBSCAN-SWA MEEFGEKFTHKAHKSIVSKWEKGLTKPSNERLKEIAKLGNISVHQLIYGDFLGLLESIANEEIKFILDTNMCANNSFLANELSSSVSRFIFSYYERGKENFNENLFRKLLQHYLQLELDLGNRDLESLTYFAYQRTINAQELVVDYYEDSKAKEFLKDESIDEFLTTISNKYFDLLEYIDDYRVKHDLEKISEE >CP022905|852600:869562|863801_864380_+|AXJ66233.1|DBSCAN-SWA MKTESYFKEYNQFVIDQQKAIQELEQERNALESKIKIDKSTYKQLIMDGQDDKADNLYQATDADEKKLKALNKRLETKKSVSKEVKYQKTIELLKHQSELSSLYESEKQSALGKLKKVVDAYNEIIDEIEDINDRYEDEHQQYASIYSQEQLYDDKEAREALNGYFRENIFTSYINGNDLPYEHNNKLFLKR >CP022905|852600:869562|858544_858748_+|AXJ66225.1|DBSCAN-SWA MRKQVIITKTVVGWYNIKDTQHNLMLNIPPKVFEQYFPDVSKDVQVACLEMDLSKITEIKNKKKVGS >CP022905|852600:869562|858749_859133_+|AXJ66226.1|DBSCAN-SWA MEIKQKYQLSKVVKILEVVLYEEDKFKSDKDYHYQDKAFYEYALKLVHNGLFNILAELDFEDEAFLILDEVTMTLSDVMKETQHVYRYSVIDEKGEHKHTTDRKGHVIGMLEWALDYIVGNIEVEEL >CP022905|852600:869562|862083_862356_+|AXJ66230.1|DBSCAN-SWA MQAVKEDYNLDEQAQRIGLITGISNEIYYCSISYLSTVYLEYIDNTWTAWRESYIPKLNKRTSYKVIASGSFELVLARLKSYLNYIKRSK |
25 | Staphylococcus_phage(81.25%) | integrase | attL 853972:853987|attR 861370:861385 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
986074 : 1033464
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP022905|986074:1033464|DBSCAN-SWA CATGACCCAAGTACATTTTACACTGAAAAGCGAAGAGATTCAAAGCATTATTGAATATTCTGTAAAGGATGACGTTTCTAAAAATATTTTAACAACGGTATTTAATCAACTAATGGAAAATCAACGAACAGAATATATTCAAGCAAAAGAATATGAACGAACAGAAAACCGACAAAGTCAACGAAATGGCTATTATGAGCGCAGCTTTACGACACGTGTAGGCACGCTAGAATTAAAAGTACCCAGAACACGTGATGGCCATTTTTCACCCACAGTGTTTGAACGTTATCAACGAAACGAAAAAGCCCTCATGGCTTCAATGTTGGAAATGTATGTATCAGGCGTTTCAACTCGTAAAGTATCAAAAATTGTGGAAGAACTTTGTGGTAAATCCGTCTCTAAGTCCTTCGTTTCTAGCTTAACAGAACAGCTAGAACCTATGGTTAACGAGTGGCAGAATCGTTTATTATCAGAAAAAAATTATCCTTACTTAATGACCGATGTACTCTATATAAAAGTACGAGAAGAAAATCGAGTACTCTCAAAAAGCTGTCATATAGCGATTGGAATAACCAAAGATGGCGACCGTGAAATTATCGGCTTCATGATTCAAAGTGGCGAAAGCGAAGAGACCTGGACAACATTTTTTGAATACCTAAAAGAACGCGGTTTACAAGGTACGGAACTCGTTATTTCTGATGCGCACAAAGGATTAGTCTCTGCCATTAGAAAATCCTTCACCAACGTAAGTTGGCAAAGATGCCAAGTTCACTTCCTAAGAAATATCTTTACCACCATTCCTAAAAAAAATTCAAAATCTTTCAGAGAAGCTGTTAAAGGAATTTTTAAGTTCACAGATATTAACTTAGCGCGTGAGGCTAAAAATCGATTGATTCATGATTATATCGATCAACCAAAATATTCAAAAGCTTGCGCATCATTGGATGATGGATTCGAAGACGCCTTTCAATATACCGTACAAGGAAATTCCCACAATCGACTAAAGAGTACCAATCTAATTGAACGACTGAATCAAGAAGTACGCAGAAGAGAAAAGATTATTCGCATCTTCCCCAATCAAACATCAGCCAATCGCTTAATTGGAGCCGTTCTTATGGACCTACATGATGAATGGATTTATTCTTCAAGAAAATACATCAATTTTGATAAGTAGAAATGGTAAAAACATTGTATAGCATTTTACACAGGAGTCTGGACTTGACTAAATCGATGGTTATTAACTACTAAATAAAAATATTTGCTAAATTAATGACTTTGTACACACATTATTTTTAAAGAGGATAAAGTATTTAATAATATTAACAAAATCATTTAATAAATAGTTAAATATATATTCTCTATTTTTGTGATATTATTCACATGTCGATACATATCAACAAATATCAATCATACGAAAGAAGGTTATAACAATGAAAAATAAAAAACGTGTTTTAATAGCGTCATCATTATCATGTGCAATTTTATTGTTATCAGCAGCAACGACTCAAGCAAATTCAGCTCATAAAGACTCGCAAGATCAAAATAAGAAAGAACATGTTGATAAGTCTCAACAAAAAGACAAACGTAATGTTACTAATAAAGATAAAAATTCAACAGTACCTGATGATATTGGGAAAAACGGTAAAATCACAAAACGAACTGAAACAGTATATGATGAGAAAACAAATATACTCCAAAATTTACAATTCGACTTTATCGATGATCCAACTTATGACAAGAATGTATTACTTGTTAAAAAACAAGGCTCAATTCATTCAAATTTAAAGTTTGAATCTCATAAAGAAGAAAAAAATTCAAATTGGTTAAAGTATCCAAGTGAGTACCATGTAGATTTTCAAGTAAAAAGAAATCGTAAAACTGAAATATTAGACCAATTGCCGAAAAATAAAATTTCAACTGCGAAAGTAGACAGTACATTTTCATATAGCTCAGGTGGTAAATTCGATTCAACGAAAGGTATTGGACGAACTTCATCAAATAGCTACTCCAAAACGATTAGTTATAATCAGCAAAATTATGACACAATTGCCAGCGGTAAAAATAATAACTGGCATGTACACTGGTCAGTTATTGCGAATGACTTGAAGTATGGTGGAGAAGTGAAAAATAGAAATGATGAATTATTATTCTATAGAAATACGAGAATTGCTACTGTAGAAAACCCTGAACTAAGCTTTGCTTCAAAATATAGATACCCAGCATTAGTAAGAAGTGGCTTTAATCCAGAATTTTTAACTTATTTATCTAATGAAAAGTCAAATGAGAAAACGCAATTTGAAGTAACATACACACGAAATCAAGATATTTTGAAAAACAGACCTGGAATACATTATGCACCTCCAATTTTAGAAAAAAATAAAGATGGTCAAAGGTTAATTGTCACTTATGAAGTTGATTGGAAAAATAAAACAGTTAAAGTCGTTGATAAATATTCTGATGACAATAAACCTTATAAAGAAGGATAATATTGAAAGGGCGGATTACTAATGATTAAACAATTATACAAAAACATCACAATTTGTAGTTTAGCAATATCTACTGCATTAACTGTATTTCCGGCAACTTCTTATGCAAAAATTAATTCTGAAATTAAAGCTGTTTCTGAGAAGAATCTTGATGGTGATACTAAAATGTATACACGTACAGCTACAACAAGTGATAGTCAAAAAAATATTACTCAAAGCTTACAATTTAATTTCTTAACTGAACCTAATTATGATAAAGAAACAGTATTTATTAAAGCAAAAGGTACAATTGGTAGTGGTTTGAGAATTTTAGACCCAAATGGTTATTGGAATAGTACATTAAGATGGCCTGGATCTTATTCAGTTTCAATTCAAAATGTTGATGACAACAACAATACAAATGTGACTGACTTTGCACCAAAAAATCAGGATGAATCAAGAGAAGTTAAATATACGTATGGTTATAAAACAGGTGGAGATTTTTCGATTAATCGTGGAGGCTTAACAGGAAATATTACAAAAGAGAGTAATTATTCAGAGACGATTAGTTATCAACAACCATCATATCGTACATTACTTGATCAATCTACGTCACATAAAGGTGTAGGTTGGAAAGTAGAAGCACATTTGATAAATAATATGGGACATGACCATACGAGACAATTAACTAATGATAGTGATAATAGAACTAAAAGTGAAATCTTTTCTTTAACACGAAATGGAAATTTATGGGCGAAAGATAATTTCACACCTAAAGACAAAATGCCTGTAACTGTGTCTGAAGGGTTTAATCCAGAATTTTTAGCTGTTATGTCACATGATAAAAAAGACAAAGGTAAATCACAATTTGTTGTTCATTATAAAAGATCAATGGATGAGTTTAAAATAGATTGGAATCGCCATGGTTTCTGGGGCTATTGGTCTGGTGAAAACCATGTAGATAAAAAAGAAGAAAAATTATCAGCATTATATGAAGTTGATTGGAAGACACATGATGTGAAGTTTGTAAAAGTACTTAATGATAATGAAAAGAAATAAGTAATAAAAGTTGCCTGCTACATAGAATGTAGTAGGTAACTTTTATTTATATTTGAGTAGATAGATTTATTATGATGTGCAGTGTATGAATCTTGTTTGAGTGTAGAGTAAAGACTTGTATTAATGAAAAATTAAAGTTGTTAAGATGATTTTATTAAAATGTAAGTCAATTCAAATTTTAACAATATAACTCGCTTCGTCCTTTTAGAACGAAGCGAGTTATTAGTTAGTTGAGCACTATTTACTATAGGCTTTGATTGGGTAATGATCTGAAAAATCATTGTAAACGTAGTAATATGGGAACGCATATACATCCCATGGCTTAGGTTTTTCAGTCACAACTTCATTGACTAATTGTTTTGGTTGTTTATGATCTTTATCTGTAAATATATAGTCTAAATGTTCTGGTTTACCATTAGGGTAATTATATTTCGCAATTGAATTTGATTGAGGGTCCCATGTGCTATTATGACCTGCATATAGAACATCATTTACATTCAAGTTTTTAAGCATATCTTTGAACTCTGGAGTGCCTTTATTAACATTAAGGTCGCCACCTATATATACCGTTTCATCTTTAGGGATATTTTTCTTTTTAACAAAGTCACTGATTTCTTTCATTTGTTCAGCTCTAATTTTTCGATCATGTCCAGCACCACAACGTGAATCTTCAGATTGTGTATGTGTACCGATAACGTGAACGTTCTTACCATTTTTCTCTATTTTTGTATAAACAAAGCCTTTGTTGCTATCATTATCGAATCCACAACCGCTTTTGAAAACATGCTGGATTTTTTCTTTAATAGGATATTTACTTACAATCGCTACGCCACCATCTTCAGCAACAGTTGATGAGTAGCTACCTTCAGTTTTGTCCCAACCTGATTGAGAACGACCGAGTACAGGTGTTTGGTAAGGATATTCTTTTTTCACATTACTTAATAATTTGTCTGATGCACCATTATCAAATGCTTCATTGAATATTACGACATCATTATTTTTAATATAAGAAGATTGTCCGATTAAATCAGCGCGTTTATATTGTCCCCAGTTTGGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACGGATGTAGTTATTGCTATATTTTTATGACCTAATCTTTTAGAAATGTAATGTATAGATACACCTTTTGCTAGTAAATAAGAACAATGAGTGTGTCTTAATGCGTGCGATGTAATAATTGGTATATTATTGACTCTACAGGCTGATTTCAAAGCATTATTGATAGCATGAAGGTTAATTATAGATCCGGCTTCTTTGAAAATGTAACCATCATAGCTAATTGCAAATGTACTTATGACGTCCATAATGTGTTTCATATCAGATTTAGCGATACTGATATATCTA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67 | Staphylococcus_phage(98.51%) | capsid,protease,portal,tail,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1166681 : 1232375
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP022905|1166681:1232375|DBSCAN-SWA ATTAAATCAATAAACCTATCTTTTCATCTAATTCGCTATAATCTATTGTACTAATATAGTTTTCATGAAGAAGATTTTTATTATGTTCATTTATTTCTTTTTTTGAGTCATTTAAAATAAAAATAAACTCATTTTGCCTGTGTCTTTTTATTTTTTTTGCTTGCATAGCATCCGTTATTTTCGACTTAATAATCATAGAATTATTAGGGTTAGAAAAAACATTGATAAATTTTTCTTTTTGATTTTTCTTAGCGCTAATAAAAAAGTCGAAATTATGAACAACACCACTGCTTCCTATAATAGGTATATCTCTTCCGTAATAAATGTTATGTTCATCCAATTTGTTTGCAACATCTTCTGTAAATATGTTCTGTGACTTAGGATTAGAAAGTAAGTACATATCATTAACAAATATAAGGCACTGTAATAAATTATGTTTCGATTTATTAAAATTTTTAAAGTTAGTTTGAACAAAAATTTCGTGAGTTTTATCGTTATATTTAATACCGTAAGCTGAAAGGTGCTCTTCAAAAATCTTTTTACGTTTTTTAAATTTATTTATAGAAACACCGTTATTTTCTAAACCAAATATAGTATAGCCGTCATCAGTCAGTGTAATCATGTCTCTGGACTGATCGTATAAAGCGTATATTTTTAAATTATCTAAAGAATTATCTTTAAAAGGGGTATCTATTTTTACTGAATTGTTTGATAAATTAGAAAACTCTAAAATCTGATTATACCAATCAAGATATTCTTTTTTTAATTTTTTAGCATCAAACGTAGTCATATTATCCCTCCTTTATTCAAGGTCTTTTATATTTTTTTACTCTAAAAACGACATATACACATTATACAAGTTATAGATGTCGGGGAAATCTTTCAAGTTAATTTCATAAGCAAACCTATCCTTTTTATCACACTTATCATTATATATGTGAATATGACTTTTCGGAGCGATTGTTCCATCTGGATTATCGTGAGTACCACCGTTAATATCTATTCTAACTAGGGTGTGATAGGTATCTTTGAAAATGATTGAAATTGAAAACCTATCTTTTTCTATGTTATCCCTTTTTATTGTTAAGAAGTACTTTATTCCTAACTTAAAACTTATTATTTCTTGCCTTTCATTTATTCGACTAGCAACTATTGTTTTTTATTCATTTACATCGATATGAGTTTCTGGATATTTTAATTCATTTATTAATAATTTTACGTGCTCATCGTCAAGACTATTTAAATCAAGTTTAGCCATGTCTGTTCCTCCTTTAACGTTGTATAGGCATTAATTTTTAATACTTTCTTATTTGAAAAAAGCAAAAAAAGATAGGTGAGATGCATACACAACCAAAAGTGTATATCATCAATTTAGTACCTCGCAATATAATTTTATACAATGTATAATAAGATTTAAAGATGTAGTTCATCAACATTTTCATAGGGGATTTTTAAAATTAAGTATTGAAAAATAAAATATTTATATTATAATATAAATAAGTCAACGACCATGCGTGGACAGTAAAACGAAGTACATGCGAATGTAGTAGCCGTTTACTATGAGACTAGGCATTATAATTGAATATCATAGTATAAATTGCCATGAGAGTAGAAGCTTCAGTTTATGAAGACTTCGAAATCATGGTTTTTTATTTTTAAAGTGAAATTTTAGTTCATAGTAAATATATATATGTTTTTAATTCGGCTAAATCATAGCATTAAATTTTTTAGATGAAGCTAGCGATATTACGAAATGATATATAGAAGATTTCAGTTATAACAGTATACGAAGTAATCCTCTCCGTTTAACGGACAATAGTTAATAATCAGTTAATTTTAAATTCAATTATAGATTATTTTTGATAATACAAACATTATTTTTTAAGATTTGATTAAAGTTCGTTTTGATTTTTATAGCGAAAAAGTTGAGCATCGGCAATTTTATCATATTGTTCGAGTATAAAGGGAACTATTTAAATGTAATGAAGGTTGCGCCAAAATGACCGGTTTTCAGCATCATAAATGAATAAATTGTATCATTTTTAATATTTTATAGCATTTTATTTTTTTAATGAACAGTTAATTTTATAAATAAGTGAAATAATCTATAATAAATTTGTATTAAAAATTTATATAGAAAGAAAGTGAAACTTATGTTTAAGAAAAAAATGTTAGCTGCAACTTTGTCAGTAGGACTGATTGCGCCTTTAGCATCTCCGATTCAAGAATCTAGAGCTAATACTAATATAGAGAATATTGGTGATGGTGCTGAAGTAATCAAACGTACGGAGGATGTAAGTAGTAAGAAATGGGGCGTTACTCAAAATGTTCAATTCGACTTTGTAAAAGATAAAAAATATAACAAAGATGCTTTAATTGTTAAAATGCAAGGTTTTATTAATTCCAGAACTTCATTTTCAGATGTGAAGGGTAGTGGATATGAATTGACTAAACGAATGATTTGGCCATTCCAATATAATATAGGACTGACGACTAAAGATCCAAATGTTAGCTTAATCAATTACCTTCCTAAAAACAAAATAGAAACTACTGATGTTGGTCAAACATTAGGATATAACATTGGAGGTAATTTCCAGTCAGCACCATCTATAGGTGGCAATGGCTCATTTAATTATTCTAAAACAATTAGTTATACCCAAAAGAGTTATGTCAGTGAAGTAGACAAGCAAAACTCAAAATCAGTTAAATGGGGTGTTAAAGCAAACGAATTTGTTACGCCTGATGGTAAAAAATCTGCGCATGATAGATATTTATTCGTACAAAGTCCAAATGGTCCAACAGGTTCAGCAAGAGAATATTTTGCTCCTGATAATCAATTGCCACCTTTAGTTCAAAGTGGCTTTAATCCATCATTTATCACTACACTATCACATGAAAAAGGTTCAAGTGATACGAGTGAATTTGAAATTTCATATGGTAGAAACTTAGATATTACATATGCGACTTTATTCCCTAGAACTGGTATTTACGCAGAAAGAAAGCATAATGCATTTGTAAATAGAAACTTTGTAGTTAGATATGAAGTTAATTGGAAAACACACGAAATTAAAGTGAAAGGACATAATTAATATGAAAATGAAAAAATTAGTCAAATCATCAGTTGCTTCATCAATTGCACTGCTTTTGCTATCGAATACAGTTGATGCAGCTCAACATATCACACCTGTAAGCGAGAAAAAAGTAGATGACAAAATCACTTTATACAAAACAACAGCAACATCTGATAATGATAAATTGAATATTTCTCAAATTTTAACGTTTAATTTCATTAAGGATAAAAGTTATGACAAAGATACATTAGTACTTAAGGCAGCCGGAAACATTAATTCAGGTTATAAAAAGCCTAATCCAAAAGATTACAATTACTCACAGTTTTATTGGGGCGGTAAGTATAATGTTTCGGTTAGTTCAGAATCAAATGATGCTGTAAATGTTGTTGACTATGCACCTAAAAATCAAAATGAAGAATTCCAAGTTCAACAAACATTAGGTTATTCTTATGGCGGAGATATTAATATATCTAATGGCTTATCAGGTGGATTGAATGGATCAAAATCATTTTCAGAAACAATAAATTATAAACAAGAAAGTTACAGAACTACGATTGATAGAAAAACAAATCATAAATCAATTGGCTGGGGTGTTGAGGCGCACAAAATTATGAATAATGGTTGGGGACCATATGGTAGAGATAGTTATGACCCAACATATGGTAATGAACTGTTTTTAGGTGGTAGACAAAGTAGTTCAAATGCTGGACAAAATTTCTTGCCAACACATCAAATGCCTTTATTGGCGCGTGGTAACTTTAACCCAGAATTTATAAGCGTACTTTCTCATAAACAAAATGATACAAAAAAATCTAAAATCAAAGTAACTTACCAAAGAGAAATGGATAGATATACTAATCAATGGAATCGACTACACTGGATTGGTAATAACTACAAAAATCAAAATACAGTAACGTTTACATCTACTTATGAAGTTGACTGGCAAAACCATACTGTTAAATTAATCGGTACGGATTCTAAAGAAACTAATCCTGGAGTATAGAATTGTATATGATTAAATAATCAACAAAGTGCAATTATTTCAATTATCAAACGGAATTAAAGAACTAACATAATTTTTATTTACACACATGATAATTTTTAGTTAGGGAAATGTAGATTACTTTGCTAAATAGCAGGGTGCTAAATTTACGAAAGTAGAATTATTTAGAAACTTCCAACATATAAAAAATTATTAAAAAAATGGAACCACGTCTTAATCGGCGTGGTTCGTTTTGTAGATATAGCATCTATGATTGTATGACGGTGAAAGTTCATTACAAACTTGGTATTGGTAAATTTATCATTTTAAGTATCGGTGATTTAATTGAAATAGAAACTATTATCGAAGAAACATTATATAACACGATAATTATACGTTACTAAACTTTTCTTCAAGTTGTTTTTTGTTTTCAAATGAAAATACCTCTACATTATATTGAGACAACATTGTTGATACTGCTTCGCTAATATCATCTTGTTGTTCTGTAATGATATTAAGTCTAGCATTAGAATCAAAATTTTTATTTCTATGTATTTCAACATCATTCCAATCGAAAAGGACATTTTTTGCATTGTTTTTATCGATTCGTTTAATTGTTTTAACATACTCTGTAGCTTCTCCTGGAAATACTGCTTCGAAACTATGGATTAACTTAGATTTCCCCTCTACCTTAAATTCGGGAAATATATTAGGATAAATCTTTCTGTTTGATAGAAAATATTGCATCACTTCGTCTTTAAATAAGGACTTAATATTTTCTTTCTTTAATATTCCCAAATAACTGATCTCGGAAATAGCCAAAACATAATCATGAATAGCTTGAGATAAGTTTATTCTATTTGTATAAAAGTTTATGTGCTTATTTTCGATGACTAGACTGTAGTTTTGTACAATATTATTGAGAAGTTGATACTTTTTTTGTTTTT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60 | Staphylococcus_phage(94.12%) | protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1362266 : 1371309
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP022905|1362266:1371309|DBSCAN-SWA CATGAATGAGCGTATGGTTGATCAATCAATGCATAGTGAAGAAACTGATTTCGAATTGTCGCTTAGACCTACGAGATTACGACAATATATTGGTCAAAATTCAATAAAAAGTAATTTAGAAGTATTTATTAAAGCGGCTAAACTTCGTCATGAACCATTAGATCATGTATTGCTTTTTGGCCCCCCTGGATTAGGTAAGACAACATTATCTAATATCATTGCCAATGAAATGGAAGTTAATATACGTACAGTATCAGGGCCTTCATTAGAAAGACCTGGTGATTTGGCTGCAATTTTATCAGGACTTCAACCTGGAGATGTATTGTTTATTGATGAAATACACAGACTGAGTAGTGTTGTTGAAGAAGTGTTATACCCTGCAATGGAAGATTTCTTTTTAGATATTATCATTGGTAAAGGCGATGAGGCTAGAAGTATCCGTATCGACTTACCTCCATTCACTTTGGTAGGTGCAACAACGCGAGCTGGCAGCTTAACAGGTCCACTAAGGGATCGATTTGGTGTGCACTTAAGATTAGAATATTATAATGAATCAGATTTAAAAGAAATCATTATTAGAACAGCTGAGGTTTTAGGCACAGGTATTGATGAAGAAAGTGCCATTGAACTTGCTAAACGTTCTAGAGGGACTCCAAGAGTAGCAAATCGACTATTGAAGCGGGTAAGAGACTTCCAGCAAGTGAATGAAGATGAACAAATATACATTGAAACAACGAAGCACGCATTAGGTTTACTTCAAGTTGATCAACACGGACTAGATTACATTGATCATAAAATGATGAACTGTATTATTAAGCAGTATAATGGTGGACCTGTTGGTTTAGATACGATTGCCGTAACAATTGGTGAAGAACGTATTACAATTGAGGACGTTTATGAGCCATTTCTTATTCAGAAAGGCTTTTTAGAACGTACGCCACGTGGCAGAAAAGCAACACCATTAGCTTATGAACATTTTGCAAAGTCGAATGAGGAGAGAGGATAACGTGAATATTGAAGAATTTGACTATGACTTACCAGAATCATTAATTGCTCAAACGCCTTTAAAAGATCGTGATCATAGTCGTTTATTAGTCATGGATAGAGAAACTGGTGAAATGAAACATTTACATTTCAAAGATATCATTGAGTATTTTAGACCTGGTGATACATTAGTGCTTAACGATACGCGAGTAATGCCAGCTAGACTTTTTGGTTTAAAAGAAGAAACTGGTGCAAAAGTTGAAATGTTAATGTTAACTCAAATTGAAGGTAATGATTGGGAAGTCTTACTGAAACCAGCTAAGCGTATTAAAGTTGGTAATAAATTGAATTTTGGTAATGGCAAAATTATAGCTGAGTGCATAAAAGAAATGGATCAAGGTGGACGCATCATGCGTTTACATTATGAAGGTATTTTACAAGAAAGATTAGATGAATTAGGGGAAATGCCACTGCCACCATACATCAAAGAACGTTTAGATGATCCAGATCGTTATCAAACAGTTTACGCTAAAGAAAGTGGTTCAGCGGCAGCACCAACAGCAGGATTACATTTTACTGATGAGTTATTAACTGAAATTAAAAATAAAGGCGTTAATATCGCATTTGTTACATTACATGTTGGGTTAGGTACGTTTAGACCGGTGAGCGTCGATGATGTGAATGACCACGAAATGCATAGTGAATATTATCAAATGACACAAGAAACAGCTGATTTATTAAATGATACTAAGTCCAAAGGACATCGCATTATATCAGTTGGTACAACTTCAACACGTACACTTGAAACAATTCGACGCGATCATGATAAATTTGTTGAAACGAGTGGCTGGACTAATATATTTATTTATCCAGGATTTGATTTTAAAGCAATTGATGGCCAGATTACTAATTTTCATTTACCAAAATCAACATTAGTTATGCTAGTATCAGCGTTTAGTACTCGTGAAAATGTTCTGAATGCTTATAAAACAGCAGTAAATTTAGAATATAGATTCTTTAGTTTTGGCGATGCAATGTTAATTATATAAAAAGAATGTGAGGATTTTGAATATGCCTGCAGTAACATACGAACACATTAAAACTTGTAAACAATCAGGTGCGCGTTTAGGTATCGTGCACACACCACACGGTTCATTTGAAACACCTATGTTTATGCCAGTTGGTACTAAAGCAACCGTTAAAACAATGAGTCCAGAAGAGTTAAGACAAATTGAAGCAAAAATCATTTTGGGCAACACATATCATTTGTGGTTACAACCCGGAAATGATATTATCAAACACGCTGGGGGATTACATAAATTCATGAATTGGGATGGTCCGATTCTTACAGATTCAGGCGGTTTCCAAGTGTTTAGTTTAAGTAATTTACGTAAAATTACAGAAGAAGGCGTGGAATTTAGACATCATACTAATGGGTCTAAATTATTTTTGAGTCCTGAGAAATCAATGCAAATTCAAAATGATTTAGGATCTGATATTATGATGGCATTTGATGAATGTCCACCGATGCCTGCTGAATATGATTATGTAAAAAAATCTATTGAACGTACAACACGTTGGGCGAAAAGATGTCTAGATGCACACCAAAGACCTGAAGATCAAGCATTGTTCGGCATTATACAAGGTGGCGAATATGAAGATTTAAGAGAACAAAGTGCAAAGGATTTAGTAGAATTAGATTTTCCTGGTTATGCAATCGGCGGTTTGTCAGTTGGTGAACCTAAACCGGTTATGTATAAAATGGTTGAACATACAGAGCAGTTTATGCCTAAAGATAAACCAAGATATTTAATGGGTGTAGGATCTCCAGATGCGTTAATCGAATGTAGTATTCGCGGCATGGATATGTTTGATTGTGTCTTACCGACACGTATTGCCAGAAATGGTACTTGTATGACATCGCAAGGTCGTTTAGTTATTAAAAATGCAAAATTTGCAGATGATTTAAGACCGTTAGATGAGAATTGTGACTGTTATACATGTCAAAACTATTCAAGAGCGTATATACGTCATTTAATCAAGGCAGAGGAAACTTTTGGTATTCGTCTTACTACTATTCATAATTTACATTTTCTGCTAAAATTAATGGAAGATATAAGACAAGCCATTCGAGAAGATCGTCTTTTAGATTTCAAAGAAGAATTCTTCGAGCAATATGGATTAAATGTTGAGAACCCAAAAAACTTTTAAGCAAGAGGAGCGTATAAAATGCAATTTTCATTACTAATATATATAGTCGTAATTTTTGCGGTTATGTATTTCTTGATGATCAGACCACAACAAAAACGTGCGAAACAGCATCGTGAGTTGATTAATAACATTCAATCTGGTCAAAGAATTACAACTATTGGTGGTATTAAAGGTACTGTTAAAGCAGTAGATGAAACAACTGTTGTTATTACAGTTAATGGTCATGGTACTGAATTAACTTTCGAAAAACCTGCTATTAAACAAGTTGACCCTTCATAACGAGAAGTGGTATTAAAAAGGATGAAACGAATAGCGTTTCATCCTTTTTAAGTTATAAGTAGTATGTAGAATAGCTTATTTTTATTCCAAAAAAAGAAATTGTGATACATAATAATTGTTAAATTTAAATTAAATATATCTATGACTATTTTTACTCCCTGCTCTAGTATGTTAATATGTATAAGGCTAATAAATTTTGTAAGAAAGATTTAACTTGCGTTATAAAATAGTATTCAAGTATTCTAAATACATACGTAAATAATGAGGTGTTCATGTGAAGAAAAGTAGTAGAATAATTGCGTTCTTGCTTTTAGTCGTATTGTTGTTTGCCGGAATGGCTGCAACTTATAAAAGTGTTATAAAGAATGTCAATTTAGGACTTGATTTGCAAGGTGGATTTGAGGTGCTTTATCAAGTCGATCCTTTAAATAAAGGCGACAAAATAGATAAAAAAGCCTTACAATCAACAGCGCAAACATTAGAAAATCGTGTTAACGTTTTAGGTGTTTCGGAACCTAAAATTCAAGTTGAAGAACCTAATAGAATTAGAGTTCAACTTGCTGGTGTAACAGACCAGAATGAAGCACGTAAAATTTTATCTTCTCAAGCTAATTTAACAATTCGCGATGCAGAAGATAAAGTAAAATTAAGCGGTTCTGATATTAAACAGGGATCTGCCAAACAAGAATTTAAACAGGAAACAAACCAGCCTACAGTTACTTTTAAAGTAAAAGACAAAAACAAATTTAAAAAAGTAACGGAAGAAATCTCTAAGAAACGTGATAATGTCATGGTTGTTTGGTTAGATTTCAAAAAAGGTGACAGCTATAAAAAAGAAGCACAAAAGAAAAACCCTAAATTTATTTCTGCAGCAAGTGTTGATCAACCAATCAATTCTGATAGCGTAGAAATCTCGGGTGGATTTAAAGGACAAGAAGGCGTTAAAAAAGCAAAACAAATCGCCGAATTGTTAAATGCAGGTTCTTTACCAGTTGACTTGAAAGAAATTTATTCAAACTCAGTAGGTGCCCAATTTGGTCAAGATGCATTAGATAAAACTGTGTTTGCATCGTTTATTGGTGTAGCATTAATTTATTTATTCATGCTTGGATTCTACCGATTACCTGGTTTAGTAGCGATTATTGCATTGACAACTTATATCTATCTAACGTTAGTAGCATTTAATTTCATTTCCGGGGTTCTAACTTTACCAGGATTAGCGGCGTTGGTATTAGGTGTAGGTATGGCTGTAGATGCCAATATTATCATGTATGAGCGTATTAAGGATGAACTTCGAATAGGTAGAACGATAAAGCAAGCCTTTTCTAAAGCAAACAAAAGTTCATTCCTAACAATTTTTGATTCTAACTTAACAACAGTTATCGCCGCAGCAGTATTATTCTTCTTCGGTGAAAGTTCAGTTAAAGGTTTCGCGACAATGTTATTATTAGGTATTCTAATGATCTTTGTTACAGCCGTGTTCTTATCAAGATTCTTATTATCATTACTTGTTTCATCAAATATATTCAAAAATCAATTTTGGTTATTTGGTGTTAAAAAGAATAAACGACATGATATTAATGAAGGTGTAGATGTTCATGACCTTAAAACTTCATTCGAGAAATGGAATTTTGTTAAATTAGCTAAGCCATTAATTGGAGTAAGTATTTTAATTGTAGTTGTCGGTTTAGTTATTCTTTATATCTTCAAGTTAAACTTAGGAATTGATTTCTCAAGTGGTACACGTGTAGATTTCCAATCTAAACAAGCAATTACTCAACAAAAGGTTGAGCAAGTTGTAAAAGATAGTGGACTTAAAGCGGATCAAATTCAAATCAATGGTAAAGATAATAAAGTAGCAACTGTTCAATTTAAAGACGATTTAACGCGTGCTCAAGATAATAAATTGAGTGATAATATTAAATCGAAATTCGGTGACACACCTCAAATTAATACTGTATCACCAATTATTGGACAGGAATTAGCAAAAAATGCAATGCTTGCATTAATCTATGCATCGATAGGTATCATCATCTATGTATCATTACGATTTGAATGGCGCATGGGTCTTTCATCTGTATTGGCATTATTACATGATGTATTCATTATAGTAGCGATTTTCAGTTTATTTAGAATTGAAGTAGATTTAACATTTATCGCCGCTGTATTAACAATTGTCGGTTATTCAATTAATGATACAATCGTAACGTTTGACCGTGTACGTGAAAACTTACAAAAGGTTAAAGTGATTACGACAACAGAACAAATTGATGATATCGTTAATAGATCAATTAGACAGACAATGACACGTTCAATTAATACAGTATTAACAGTTATTGTAGTAGTAGTTGCTATACTATTCTTCGGTGCTCCTACGATATTCAACTTTACTTTAGCATTATTTATCGGATTGATTTCTGGTGTATTCTCTTCAATCTTCATTGCCGTTCCGCTATGGGGAATAATGAAAAAACGTCAGTTGAAAAAATCGCCGAAACACAAATTAGTTGTATATAAAGAAAAGAAATCGAACGATGAAAAGATTTTAGTTTAAAATGAATTAAGCGGTATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTTTAAAAAATGGTATAATTAAAGTCTTGATTATTTAGATAAGTGCTTTTTATTTAAAGTAATTTTAGATATAATGTCTTTTGGAAATGAGGCGTAAATATATATGATTAAACCGAAGTATAAGTGGAAATTAACTAAACCAGCTGAATACATAAGTGATGAATTAACATCAAAATTAAAGTTAACGCCAATCGTAAAAAAAATATTAGAAAGTAAATCGATTATTGATGAACAAGCAATTGAATCCATCATTTCAGACACAGATGTCAATCATGATGCATTGCAATTGAGCGATATGACTAAGGCTATTGAAAGAATTAAAAGAGCGATAGCGAATGATGAGAAAATCCTAGTTTATGGTGATTACGATGCCGACGGTGTTACCTCAACTACAATTTTAGTGACAACATTACAACTTTTAGGTGCACAAGTAGGATGGCATATTCCTAACCGCTTTACCGAAGGATATGGACCAAACGAACTAGCATTTAGAAATGCTCATGATGAAGGCATAACATTAATCATAACTGTTGATAATGGCATACAAGGTCATAATGAAATTAAAATGGTTCAAGATTTAGGAGTTGATGTCATTGTAACTGATCATCATGAAATTGGTAGTACATTACCAGAAGCATATGCAATCGTACATCCAATGCATCCATCGTTTAATTATCCGTTCCAACAATTGTGTGGTGCAGGTGTTGCATACAAATTAGCACAAGCATTGATTGAAAATGTACCTGATTATTTTAAAGCATTAGTTGCGATAGGTACCATTGCGGATTTAGTATCCTTAACTGATGAAAATCGATCATTAGTGAAACAAGGATTAAAAGTCTTAAATGATCAATGTCCGACCTCTGTTAAAGCATTGCTAAAAGAAGCGGGATACAATGACAATATTGATGAAGAAACAATTGGTTTTATTATTGGACCTAGACTTAATGCTGTAGGTCGTTTAGATGACGCATCATTAGCTTGCGAATTGTTGATGACTGACGACGAAGAAGAAGCTGCATTTTTAGCAGAACAAGTTGAACATTTTAACCGTGAAAGAAAAGATATTGTAGCAACTATCACAGAAGAAGCAATGGCTATGGCAGAAACGAAAGTTAAAAAGGGAGATTTATTTTTACTTTTAGCAAAAGAAAATTGGCATGAAGGTGTCTTAGGTATTGTTGCTTCGAAAATTGTCGAAACATTTGCTTTGCCAACATTAATTTTAAATATTGATAGGGAGCAAAATCATGCAAAAGGTTCCGCCAGATCAATTGATCAAGTGTCGATGTTTGAAATACTATCAGCACATCAAGAGTTAATCGCTAAATTTGGCGGCCATCATATGGCTGCAGGTATGACGATGGATATTGAAAATATAGAATCGTTAGCTGAAGGTTTAAATAAATGGATGAAAGAATTATCTAAAACAACTTCGTTAGATCCCGTAAAGCCAGTAGACGTATTATTAACAGAAAATGATATAACGATTAAAAATATTCGTGATATGAATCGTTTAAGACCCTTCGGAACAGATTTTTCTAGACCTATTTTTGAAATGGATGATTTATCAGTTTCTTCAGTTAAGGCGATCGGTCAACAAAAAAATCATCTAAAATTGACACTTGGTGAAAGTAATATCGCCGCGCTATTTTGGCAAAATGGACACTTAGAACCTGAGTTACAAGATGAACAGCCAATTAATATATTAGGATCTGTTCAAATCAACGAATGGAATGGTAATCAATCACCGCAATTAATTATTCAAGATATTGCGATGAATGAACAGCAAATATTAGATTATAGAAGTAAGCGAAAAAGTTTACCTTTTACAGAAAATGATGAAAATATTGTCGTGCTTATTCATCCTAAAAGTGATAAAGTAAATGCGAATGAATATTATTATGGTGAAGAAATTAAACAACAAACTGATAAAGTAGTATTAAGAGATTTACCAACGTCAATGGAAGACTTGTCTAATTCCTTGCAACAACTGCAATTTTCTCAACTTTATATAGTTTTGCAACATAATCATTCGATTTACTTCGATGGTATACCTAATATGGATATTTTTAAAAAGTGTTATAAAGCATTAATAACTAAACAAGAAACAAATATCCAGAAAGAGGGTATGTTATTGTGTCAACATTTAAGTGTGAAACCAGATACACTTAAATTCATGTTGAAAGTTTTCTTAGACTTAAAATTTGTAACACAAGAAGATGGTTTAATTCGAATCAATCAACAACCTGATAAAAGATCGATTGATTCCAGCAAAGTATATCAATTAAGACAACAACGTATGGATGTTGAAAAGCAATTATTATATCAAGATTTTTCAGAAATAAAAAATTGGATAAAGTCACAATTGTCGTGAGCAATTTAGGAGGAAATATTAATGGATTTAAAGCAATACGTATCAGAAGTTCAAGATTGGCCGAAACCAGGTGTTAGTTTCAAGGATATTACTACAATTATGGATAATGGTGAAGCATATGGCTATGCAACAGATAAAATTGTAGAATACGCAAAAGACAGAGATGTTGATATCGTTGTAGGACCTGAAGCGCGTGGCTTTATCATTGGCTGTCCTGTAGCTTATTCAATGGGGATTGGCTTTGCACCTGTTAGAAAAGAAGGGAAATTACCTCGTGAAGTCATTCGTTATGAGTATGACCTAGAATATGGTACAAATGTTTTAACAATGCACAAAGATGCAATTAAACCAGGTCAACGTGTGTTAATTACAGATGATTTATTAGCTACTGGTGGTACGATTGAAGCAGCAATAAAATTAGTTGAAAAATTAGGCGGTATCGTAGTAGGTATTGCATTTATAATTGAATTGAAATATTTAAATGGTATTGAAAAAATTAAAGATTACGATGTTATGAGTTTAATCTCATACGACGAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP022905|1362266:1371309|1366013_1368293_+|AXJ66707.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >CP022905|1362266:1371309|1363272_1364298_+|AXJ66704.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >CP022905|1362266:1371309|1368495_1370769_+|AXJ66708.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDVNHDALQLSDMTKAIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKKGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >CP022905|1362266:1371309|1362266_1363271_+|AXJ66703.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERG >CP022905|1362266:1371309|1370790_1371309_+|AXJ66709.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >CP022905|1362266:1371309|1365478_1365739_+|AXJ66706.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >CP022905|1362266:1371309|1364320_1365460_+|AXJ66705.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1939823 : 1985535
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP022905|1939823:1985535|DBSCAN-SWA TCTAACTGATTTCTCCCCATAAGTCACCTAATATCTGATTAGGTGGGGCAGAACCATTCCATGTTCTAATAGGCAAGTAATAACGTTGCCCCTCCCATGTATATCCTACCCAAACATGACCATCTTGTAACATCACTTCTGTATAATCACAATATCCACCAGGTTGGAACTGATAACCCACTGGACAAGATAAGAATGGCCCCACTTTTCTTACTGTGATTGGTTGATTGCCGTTTGTGAATCTAGCACTTTCTTCCATGTAGTAAGTACCATATTTATTACGTTTCCATGCACTTGCAACTGGTTTAACTGTATTACTTGAAGCGCTTGACTCATTAGAGACAGTGGCAACCGGTATTTTACCATCCATGTACGCCCTAATCTGCTTGATAAAGTAGTCTTTAAGTTGCAACCGCTTGTCTTCTGGCAATAGACCGCGAGTTACTGGGTCAAAACCAGTGTGTAAAACCGAACTTCTATGAGGGCATGATGTTGAAGTAAATTCATTGTGCAATCTGATTGTATTTCTGTTTGCTGGTAATCCCCATTTTTTCAACAATCTAGCGCATTCTTGGAAAGTTGCCTGTTCATTTTTTAAGAATGTCGCGTTATCTGCGCCCATTGATTGACATACTTCAATACCGTAATAATATTTATTACCTATTTGATTAGCGGTATGCCAACCTACTTGTGATTCATCTAAGGCTTGCCAAACTGTGTTGCCTGATACGTAACTATGCGCAATGCCCGCTTCTAATCTTGATAAAGGTGCATTTACTAATCCGTTACGATATGCTTCAGCAGTCGCCCCTTTGCTTCCTGCGTCGTTGTGTATAACTATACCTTTAGGGTTACTACCACGCTTAGGTAGGTCATAACCTTTAACCACATCTTTGATGATTTTAAGTTCTACTGCTTTAGGTTGTGGCTTAGCTGTTTCTTTTTTAGGTGCTTGTGTAGGAGATTGAACTGATCGTGGCGCTGTCTCACTTTTAAAATTCGGACGGATAAACCACATAGGGAAATCATAAGCATGTTGTCGTCTTGTAACTTTTTCCCAACCCCAGCCGGGTTGTTCGATTCCGTCAGTCCAGCCACCGCCTAGCCAATTCTGCTCATATACAATGATGTAATCTAAAGTTGCTTCAATTACCCATGCAACGTGACCATATCCAGCACCGTAGTTGCTACCGAATACCACCATGTCGCCAGGTTGTGCTAAGAAGTCCGGTGTATTTTGGTATACAGTAGCTAGTCCATCAAAATTGTTTGCAAATGGTATATCTTTTGCACCTAAACCTTTTAGAAGTAATCCAAACAAAACTTTCCAACCAGCATTGGCATAATCAAAGCATTGAAATCCATACCATAAGTCCACATTGAATTGTTTTCCCTCAGAAGTTTTCAACCATTCTATAAACTCTTTTTTAGTTAATTTTGCTTGCATCGTCGCCACCTCCATGATGATACTCATTCACGTCAAAACCAACATCGTTAGAGGCGTCTGTAAACGGCTGTGATGTATCATATTCTTTCGGTGCTTTTGTACTTAATTCTGGCGTTAAATTACTGTCTTGAGATGTTTTCCAAGTAACCTGTTGTTCTTCTTTGCTACTATCTCTAGGCGCTTGATATGTCTGTGCTATAGATGAATCTGAGACGCCTTTTGACGTTGGATCAGTAATAACACCAATACCTGTGAGTAGCGTGAGAATAGCACCTATAATCGCGCTAGCTTGATTTAATTGAGTTGATAAATCTAATCCGAATAAGTCTGTAATTTGCTTGATAAATAGCAACAATGCTCCAACTAAACCAGTTAGTACTGCTTTGTTTTTGAATCTCAATTTCCAGTTAATATCCATTTGTTTGCTCCTTTTATCCAAAATAAAAAAACGACTAAAAATTAGTCGTTTAAAATTATTCAATGGTCAATGTCGGAGATCCTGAATAAACATCACTTATAGTGACATACAACATCCCTGAAGGATTACTAAAGTTGATATTTTTACTTGCAACTCCGCTATTGACTCCTGATATTCCTAAATCACTTGAACCTAAATTAGTTTGCGAAACCCTCATTATACCGCTACGTACATTTTCTATTGTCACCTGATAACTTTTATTAGGTTCAACTCCATTTATTGTCCATTTTGCTGTTGATTCTTCTATGCTATCCGGATATTTATTTTTAGGTAAGGGTTTTATTACAAAAGATGAAGGCTTTTTCCATACTTGGATATTTCCAGCATATACTTTTGTATATTCTTCGCCTTCGTAAATAAGTTTCTTTACATTTTTAAAATTACCTTCCATAAAAATCACCCCTTAATTAAGTAAAGTGTATTAGGGTCTTTTTGATATATATAGTTATATTCATTTTCTGTTCCTGTCCAAATTTTAACCGTCGGTTGAGATGCGCTTTTTAGTTGATATAAACTATCCGCTTGTTGTTTAGTAAAAGCTTGAGATGACAAAACATACCGCTCGTCATGATTATGATTTTTTGGAGCATATAAATCATTTAGTGTTTGTTTGAACCTCTCAAAATCTTCTGTACTAACTTTTGAGCCAATCTGTTGCAATACACTTTCTGAAATAGAGTTGTTTTGTATTGCTTCTGCTAATTCTCTTAGTGTATTCATAGATTCAGGCGCGCTATCAACTAGTTCAGCAATTTTTGAATCTGTATACGTTTTAGAGTCTTTGAGAGTTGCCTCTTTGTTTTTTTCAACTTCTTGCAATTTATCTTCTAACCCTTCAACATTTGCGATATTGATTTTATCCAATAACTCAGGTTCTGCTTTGATATCTGTATCTTTACCGTCAATTTGCCACATTTTAGTGTCAGGATTGATTGATACTACAGTACCGTTCTTACCGGGTGCACCTTGTTCTCCTTTTTTACCTGCTTCACCTTTTGCACCAGGTTGTCCCGGTTCGCCTTTATCACCTTTCGCACCTTTAAATCTACTTTCATTCTTTTCGATGTAAGAAATAACATCTTTATCTATTTTCTCTTTAAAGTCTTTGCTCAATAAATCTGTCGCGTTATCTTTTAAGATTCTCGTAATAGCATCATCTACCAATTTAACATCGATTTCTTTTGCTACAGCAGATTCAATACCACTATCAACGATATTGAAAGAAAAGTTCGCGACATGTATTTTTTCTTCTTCTTTCTCTAAAAACAGCTTACAACGAACATAACCAGCGTGTTTGATAACCTTTTTAGGTATCTTGTAGGTAATGAATCCTTTTACAACATCGTCGATAATAAGGGGCTCATTTTTGAATATAGAGCCATCTTCCATAAACAAATGTAATCTAGGTGTTAAGCCATGTGCTTTTAGATCGATACGACCTTGTTTGTCATTGATACCTATTCTTATAGATGCTGTATTTTCATCTTCAGTGTAAAATCGACAGCCAATGTCACCTAAGTCAACACCATCATTTTTTATTCTCGTTTCAACATCTTTTATTTTGTACATTTACACACCTCTTTATTTATATTTATCCCTTGTGAAGTAGATACCTTTTAAGCCGATTTGTTTATATAACTTAGCGATTGTACTTGCTTGATGTTGGCACCACTCTATAGCAGTAGCGTATTGGTGGGTAGCTGGATTCTTAGGATTCCATCTAATTCGGTACAATGTGTTTTGACCTTTATTGATGTAATCCTTTCTTACGAAGCTAGCACCGCCCATGATTGCTTTTGCTGGAGATGTCCAACCTTTATTTTTAGCAAACGTCATTGCATAATCAGGGTCGTTGTCGAATGCACCAATACCGAAGTAATTATATGCACCGTATCTACCATTAGCGAAGTTACTTGTTCCGTATCCACTTTCTAAGAAAGCGTGCGCGATCAAATAAATTTCGTTAATGTTGTTTTTCTTACAAGCTTCCGCGAATGCTTTGCCTTGTCCGTCGAGCGTTCCTTTTCCTTTAAGTATTTTGTTAAGCGCACTAACTGAAATGCCTTGATACTTGCCTAAATTAAGCATTTGATAGCATTGCGTGTTACTTTCCCATATTCGCTTAACATTCATTGCCGAGCTCGTTTGTGCTCGTGTTGCATTAGCCCAGCCCCATGTATGAGATTTTTTCGGGTTACCCCTAGACATTTGTCTATCCAGTGCTTGCTGGAATGTGAATGGACTTGTTTCAGTAACGATGCTTGGTTTTTCGTCTGATGGAGTAGGGCCTCGTGTGGACGCACTATCAACTGATGTTTTATCACTAATTCTTATTGTTGTTTTTGTCGTTACTTCTTTTATATTTTCTCGTGTCAATATATCTCGTTTAATGTATGTCTCAAGCATTTTCTTTTTAACTTGCTCATACTTTGCGTTATCCGGTATACCTTGCTTAATCAAGTCGTAATTAATTAAATCTTTCATACTACGCCAAATATTAGGGTCTACCTTTAACGTCGTTTCAGATAAGTTTTTATCAATCCCTGACAATAACCAAACACCACGTATTAACGCTTGTATTTGATTCAATAAGAATTGTCGTTTGCTATCTGTTTGACCACCACATACTTCAATAACTAGCCAATTAGGGTGACGCGGGTCATCAAAATTGGTTGGTCTAGCAAGCCATGTAGCCTCTCTATCGACATATAAATGCGGTATTTCATAATCGCTTATAAACTTATTTCTTTGCGTATACAGTTCGTCTACAGAACGCATATGCATTGATTCTTTTATATATAATCCTTGAATATCTGAGCGTTCATCACCCATTACAACTATATGATCAATGAAGTGCTCTTCTTTATCTAAAACATTGCTGTAAGCAGTGTATTTTACTGTTTTAACTTCTTTAAATTGCGGTTTCTTCGCTTCGCCAGTAATTGTTGAGTCATTGGCTTTTGATGCTGAACTTGTATCAGTACTACTAGGTTTGCTAGTATCTTTTGAATATGGAGGTCTGACAAAGCCTGTAACACTTACATAAGGGTGTCTTACTAAACTTCCCGGAGAACC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP022905|1939823:1985535|1973488_1974163_-|AXJ67263.1|DBSCAN-SWA MPKITSYITQDDGTTTVVISGVELGNKETLLLDNGFDVEVDVNVIDPFQITGKQRRKIFALVKDIEEHTGQPMDYMRHMFIEFVRTYYGYDERISLSNCTRTQASQIIEATLDWTFYNDIPLSYKTSNLLKQDKSFLYWSTVNRNCVICGKPHADLAHYEAVGRGMNRNKMNHYDKHVLALCREHHNEQHAIGVKSFDDKYQLHDSWIKVDERLNKMLKGEKNE >CP022905|1939823:1985535|1974163_1974715_-|AXJ67264.1|DBSCAN-SWA MNELWKDVVGYEGIYEVSSKGRVRTHKNKVTWSNRYQKWRHWKQRYLKDKTPNGRDVRVTLWKNGKRKDFLVHRLVAFAFIPMIEGKNCINHIDGNPKNNNVENLEWCNHLENNRHAFETGLMHTNMAVKLINHLGIEYEFISMSRAGKFLGRSHSYISDKIKNNHKDVTDIHGNKYKFEKLI >CP022905|1939823:1985535|1978468_1978678_+|AXJ67275.1|DBSCAN-SWA MKACLYLSNDKFVEIDNLEKVIKSGHRGTVEISKEKIKSSLFTNGSYTFVGDKIVAIASAKIEFIEFID >CP022905|1939823:1985535|1969683_1969869_-|AXJ67255.1|DBSCAN-SWA MQQQAYINATIDIRIPTEVDYQHFDDVDDEKDMLAKRLDDNPDELLKYDNITIRHAYIEVE >CP022905|1939823:1985535|1939823_1941269_-|AXJ67215.1|DBSCAN-SWA 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>CP022905|1939823:1985535|1969873_1970278_-|AXJ67256.1|DBSCAN-SWA MSKYNAKKVEYKGIVFDSKVECEYYQYLESNMNGANYDRIELQPKFELQPKFGKQRPITYIADFSLWKEGKLVEVIDVKGKATEVANIKAKIFRYQYRDVNLTWICKAPKYTGQEWMVYEDLVKVRRKRKREMK >CP022905|1939823:1985535|1945339_1945639_-|AXJ67220.1|DBSCAN-SWA MFGFTKRHEHEWRIRRLEENDKTMLSTLNEIKLGQKTQEQVNIKLDKTLDAIQRERQIDEKNKKENDKNIRDMKMWILGLIGTIFSTIVIALLRTIFGI >CP022905|1939823:1985535|1945856_1946234_-|AXJ67222.1|DBSCAN-SWA MKITVNDKNEVIGFVNTGGLRNSLDVDDNNVPIKFKEEFEPRKFVFTNGEIKYNSNFEKEDVPNASNQQSASDLSDEELRGMVASMQMQMTQVNMLTMQLTQQNAMLTQQLTELKTNKTNTEGDV >CP022905|1939823:1985535|1961588_1962551_-|AXJ67239.1|DBSCAN-SWA MPNNKKDLTIKNQNDIDEYIDNLISKAEKPIEQLFANRLKEIKQIIADMFEKYQSDDVYVTWTEFNKYNRLNKELTRIGTMLTDDYRQVAKMIQKSQEDAYIEKFLMSLYLYETASQTSMQFDFPSKEVITSAIEQPIEFIRLVPTLQKHRDEVLKKIRLHITQGIMSGEGYSKIAKAIRDDIGMSKAQSLRVARTEAGRAMSQAGLDSALVAQKNGLQMYKYWQATKDTRTRDTHRHLDGAKKRIDEPFKSSGCVGQAPKLFVGVNSAKENINCRCKLMYYIDEDDLPSTTRARKDDGTTEVIPQMTYREWEKYKRKRK >CP022905|1939823:1985535|1976351_1976513_-|AXJ67269.1|DBSCAN-SWA MSNIYKSYLVAVLCFTVLAIVLMPLLYFTTAWSIAGFASIATFIFYKEYFYGE >CP022905|1939823:1985535|1969095_1969338_-|AXJ67253.1|DBSCAN-SWA MTDNARKEYLNQFFGSKRYLYQDNERVAHIHVVNGAYYFHGHIVPDWQGVKKTFDTAEELGIYIKQHGLEYEEQKQLTLF >CP022905|1939823:1985535|1970274_1970700_-|AXJ67257.1|DBSCAN-SWA MEVHYSSKTNEWTTPQHLFDDLNEEFSFTLDPCSTDENAKCRKYYTVKDNGLIQDWSEDIVFMNPPYGRSIKRWVKKAYEESLKGATVVCLIPARTDTTYWHDYIFNKADDIRFLRGRLKFGDSKNSAPFPSAIIVYRGAQ >CP022905|1939823:1985535|1955709_1955994_-|AXJ67228.1|DBSCAN-SWA MLALTPAEWRDWLIGGQDRYLDQRQLLIEQAQANGLVQASKRLTSMIRDIEKQRYEIREPGSYARVQKARLEEEKRRRELFKEGTRKFLESKGG >CP022905|1939823:1985535|1945679_1945856_-|AXJ67221.1|DBSCAN-SWA MMKMIYPTFKDIKTFYVWGCYKNEQIKWYVDMGVIDKEEYALITGEKYPEAKDEKSQV >CP022905|1939823:1985535|1976505_1976634_-|AXJ67270.1|DBSCAN-SWA MPPHIQQMLYEIQLKAGIPQKLMEMQGLINDETTKEEKKENE >CP022905|1939823:1985535|1979693_1980017_+|AXJ67279.1|DBSCAN-SWA MRTSAEIGKLIKQLRKENNVNLTDFATKIGVNKSTLSRYENGSRKIPMEDIAEIANALKVTPEYLLLKNRQTENEVQHRAAHLEGELTDDEWQRVLDYADYIRSKRK >CP022905|1939823:1985535|1956038_1956545_-|AXJ67229.1|DBSCAN-SWA MTEFNPITTLKINDGEKDYEVEAKVTFAFDRKAEKFSEDSEDGRKGAMPGFNVIFNGLLESRNKAILQFWECATAYLKNPPTREQLEKAIDDFITENEDTLPLLQGALDKLNNSGFFKRESRSYWMTLNKAPNMAKSEDKEMTKAGIEMMKENYKEIMGAEPYTITQK >CP022905|1939823:1985535|1963939_1965148_-|AXJ67241.1|DBSCAN-SWA MINEMLNPKQQEVWNCFINDKPKVLIASGAKRAGKTYVFILLFLMHIATYKDKGLNFIIGGATQASIRRNILDDMELILGRELTLDKSNAVKIFGNKVYVFDGQNSDAWKKARGFTSAGAFLNEGTALHNMFIKEVFSRCSYKGARILIDTNPENPMHPVKKDYIDKSGQRLSNGRLNIKAFQFTLFDNTFLDEEYIESIIASTPTGMFTDRDIYGKWVSAEGVVYKDFKEKVHYITEEEFKTKQIKRKYAGVDWGYEHYGSIMVVAEDFDGNKYVIEEHAHRHKEIDDWVAIAKGVIKRHGDILFYCDTARPEHIERFRREKIKARYADKAVIAGIEVISRLFKLNKIFIIKEKVSLFKEEIYNYVWKDNADEPVKLNDDTLDALRYAVYTANKPSGTGFN >CP022905|1939823:1985535|1974725_1975151_-|AXJ67265.1|DBSCAN-SWA 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MNIMQFKSLLKSMYEETKQSDPIVANVYIETGWAVNRLLDNNELSPFDDYDRVEKKIMNEINWKKTHIKEC >CP022905|1939823:1985535|1967803_1968040_-|AXJ67249.1|DBSCAN-SWA MNNREKIEQSVISASAYNGNDTEGLLKEIEDVYKKAQAFDEILEGMTNAIQHSVKEGIELDEAVGIMAGQVVYKYEEE >CP022905|1939823:1985535|1982914_1983088_-|AXJ67283.1|DBSCAN-SWA MAVPKRRTSKTRKNKRRTHFKISVPGMTECPNCGEYKLSHRVCKNCGSYNGEEVAAK >CP022905|1939823:1985535|1941742_1942138_-|AXJ67217.1|DBSCAN-SWA MEGNFKNVKKLIYEGEEYTKVYAGNIQVWKKPSSFVIKPLPKNKYPDSIEESTAKWTINGVEPNKSYQVTIENVRSGIMRVSQTNLGSSDLGISGVNSGVASKNINFSNPSGMLYVTISDVYSGSPTLTIE >CP022905|1939823:1985535|1979281_1979530_-|AXJ67278.1|DBSCAN-SWA MYEFNVKRMKAERIAKGISISDMAKKLGMTPGTYSKKENGHIRINVDDLAKVIEVLELPQDKCGIFFTYRVSKMSTEQKQTS >CP022905|1939823:1985535|1977843_1978029_-|AXJ67274.1|DBSCAN-SWA MLNLKELREEKGITRYQLAKLTELQNSTIQSIETEVKNPGFLTVKKICDALQVDIANVKEK >CP022905|1939823:1985535|1980525_1981206_+|AXJ67281.1|DBSCAN-SWA 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MYPSQPTQTEIFDAIVRTNNKPETLEEMIVRYIKQHLEKLPEISIGQEYYEQRPDIVKEPKPVDATGAVDPLKPDDRMITNFHANLVDQKVSYIVGKPIAFKHTDDEVVKRIDEVLGNRFDDKLHSVLTGASNKGIEWLHPYLDEEGEFKLFRVPAEQGIPIWTDKEHEELEAFIRMYKLENETKVEYWDKVTVNYYVYENGSLIPDYSNNLENSKTHFSTGSWGKIPFIPFKNNDLEISDIFMYKTLIDAYNRRLSDLSNTFKDSNELTYVLKNYDDQELPEFKRLLRYYGAIKVSDNGGVDTIQVEVPVENSKKYLDELYRKIMLFGQAVDFSSDKFGSAPSGVALEFLYTNLNLKADKLARKAKVAIQELLWFVFEHFDIKGEHNDVDISFNYNKVANTELQVQTAQQSMGIVSHETVLENHPFVEDLQAELERIEQEQMEYNKQLPNLDDGGADSAQQQERSNNKESE >CP022905|1939823:1985535|1966722_1966959_-|AXJ67246.1|DBSCAN-SWA MFNTPKMKFPKKYTEIIKKYKNKTPEEKAKIEDDFIKEINDKDSEFYSPMMANMNEHELRAMLRMMPSLIDTGDGNDD |
72 | Staphylococcus_phage(75.36%) | portal,head,tail,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2748062 : 2758416
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP022905|2748062:2758416|DBSCAN-SWA CATGTATCAAAATTATACCATAAACCAACTTTGTTTGCCTATAGATCTTGAAATTAAATTAGAAGAAAATGATTTTGCTCATGCCATTGTGCAGTTTGTTGACTCTATTCCCGATGAAGTCTTTCTTCCTTATTATCAATCTATGGGTAGACCCCAATATCATCCTCGTATGCTACTTTCCATTATTCTTTGTGCCTATATTCAAGGGGTTTATTCGGGCCGCCAAATACAAAATATGCTGATAGATAGTATTCGGATGCGCTACTTATCTCAAGAGCAATTCCCTAACTTTCGTACTATTAATCGTTTTCGCGTTCATCCGATTATGAACGATATTCTAGATCATTCATTTGTTCAATTTCGTGAGCTACTGGTTCAAAGTGGCTTAATCAGTGGCAGTGCTCTATACATTGATGGTACAAAAATTGAAGCGGATGCGAATAAATACTCTTTCGTTTGGAAAAAAAGTATTTTAAAGTATAAGGATAGCCTTGATCAAAAAGCCCTTGAAAACTACCAACAAATGGTGGAAACAAAAATCTTACCTGAGTTAATAGATGATTTAAAGGATGAACTTTCTATAGAAGAGATTGAAAGGATTCGTCAATCTTTGGAAGAAAAGGAAAATCAATTAATTGAAGCGATTGACCAAACCGAAACAGTAGAAGAACGAAAATTACTTCGTAAAGAAAAATCTGAAGTTCATAAGCAGAAGAAGCGATTCGATGATTTTGCCCAAAGAAAAATGAGCTACGAAGAACAATTAGTGATTATGGGTGTACGCAATAGTTTCTCAAAGACGGATCATGACGCTACTTTTATGCGAATGAAAGAAGATCACATGCTTAATGGCCAACTAAAACCAGGTTATAATATTCAACTTGCGACAGAAAATCAATTTGCTCTTGCTTATGATTGTTATCCAAATCCAACAGATACACGAACATTTATCCCATTTCTTGAAAAGATTGAATCAAAAATAGGTTTACCAGAAAATATTGTCGCAGATGCCGGTTATGCAAGTGAAGAAAATTATTGTTATGTGTTAGACGAAACAGAATCCACCCCCATCATTCCGCATCAAGGTTACTTAAAAGAGAAGAAACGCGCCCATAAACAAAATCAGTTTCATCGAGATAATTGGACTTACAACGAGTTGGATGATTACTATATTTGTCCCAATCAGAAAAGAGTAGTGTTCTCACATTATTCACAACGTAAAGATAGAAATGGATTTATTCGAAACTTCAAAATCTATGAATGTGAAGATTGTACAGGATGTCCATTGAGAGAGAAATGTACCAAAGCAAAAGAAGGAAAAAATCGACGTTTGAATATTAATCCAACCTGGGAATATATAAAAATAAAAGCGAATGAAAAGATAGAAAGCAAAGAAACAGCCTCATACTATGCGCAGCGAAAGATAGATGTCGAAACAGTTTTTGGAAACATTAAACAAAATATGAAATTTAAAAGATTCCATGTCCGAGGAGCTGAAAAAATTTTTAAGGAAATGGGACTTGTATTTCTTGCGCACAATTTTAGGAAATTAGTAACTAGAGTAAGGAAATATGAGGGAAAAACAATCATACAAAACCAAATATAGGGGGAAAATCCTCTATATTTCATCCAAAAAAAACAAAAATCGAAGACATCTTTCACGGGTGCCTTCGATTTTTTGGTTCAAAAGGGACTAATGGGTCAGCCCCCTCAAAATTACCAGAGATTAAGCTCAGCCAGATATAAGGACTCCAGCCTTACTTTCTACGCAACAACGCCACACACTCCACATGCCTTGAGTGGGCAAAAAAGATGTCGCACCCCACTGGTATCCCCTTGGCGGAAGCCCATATTTCTGAAACAGTCGCCTGGATAGGCTATTTTTCATTGATTTGGTGCCTGCTTTTGCGTTACAATCCAAGTAATTGTAAGCAATAAAGCCTTCAAAAGCATGTTGTCCTCTTGAAGGCTTTATTCGGTACAACTTTAAAATTGGTTTACTTATCTTTATCTTCCTCTCTAAGATACTTAACTAGCCCCGGATAATTGCTTATCCTTACAGTTCGGATCAATTAGAATTAGCCGAAAACGGCGGCGAAGAAACGAACCACCGAGAAGCACCGCCGCATTGCCGAGCTTGATACCCTCATTGAACGACTGTATGCGGACCGGAAAAGGCGCGGTTGACCGCCTTGCCCTCAAAGGCTTAGGGGCATATCAACTATATATTGGGGCCGAGTGCCGTTACTTTAACACCGCCGCTAGCCATGAGCTTATGCTTCCTTTAGGACACTGTCCCAACAGACACTTTTTAAAGTATGCTGCACTAATCCTTATTTTTCACAGCATAGCGCAATGACAGACAGCCATGTTCTGCATTCTCTGTTCCCTGCAATTCCAAATTAACTTTTTCAGATAACAGAAGGTTATCAAATAGTTGTTTTTCTTTATTACCTACAAAACATGGTGATATCACAAGACTGATTTCATCAATAAGTCCGTTTTCTAATAATTTGTTGGTTAATCCACCGCCACTGTCTGTCCGCATGTATTTACACCCATATTGCTCATGCAGGATCTGAAAGGCTTTTTCATAGTCCACATGATCATTTCCTGACACAATATATGGGTAATGCCTTTCCTCCAAATAATTCAAATATTCCTTCGGAGTGGCAGTTGATACCAGAATGACAATTTCCTTCAGATATCCAAGATTTCTTAAGCAATGAAGACTTCTCAAGATACCTCTGCTGTCAGGTATGACTCCTATTGGTCTGGGGTCCTCCGGGCTTGTTATGATTTTCTCAAAATCAGCCTCTGTTTCAGCAGGATATTTTTCAAATGCAGTAAAAACAGTATTGGACCCAAACAGCACCGCATCCGAATGAATTCCCCCGGCAACCTGGTAGTAAACTTCCGGATTATCAAAGCCTTTAATGCGGCCATCAAGGCTAATTTGTGTGTGCATAATTATCTTTGGTTTCATATTTTTCAATCCTCCTTTTTGATAGTAGAATATCATAATACACTGACAGCTGTATGTCAGCAGGGGATATGAAACCTTACAAAAAATACATAACAGACCAATCGCTTTCTCTAAATCAAGTTTAGGCAGTGATTCGTAATTTGTGCCAGGTGTTTACGGGTTATGCATTTTAATTCATCAGGTTGGACTATTTCAATGCCTGATCCATATTCAATCAGCTGCTTGCTCAATATCTCAAAGGAATCTGTCTGGAATTCGATTTCCATTTTACTTCCCAAATCGGTTTCTTCAAGGAAGCCGAGAGAATACCTGTTCTTGATAGAATTGTATGTCTCCCCTTTTTCAGCTCTAAGAATTACATTATATAGTTTTTTATATGAAAGCATTTGTTTTAATATTTGTTCCAAAGAGCCATCATGGCTTTGACAGAGCTCTTCTTCTATGCAAATGCTTTTAATCCGATCCACACGAAAATTCCTATATTCATTTCTTAGCCTGCAAAACCGATTAAGTACCAGTTCTGTTCATAAAACCCCAGTGATATAGGCTCTATCATTCTGCTTTCCGGTTCTTGCCCTCCTGATGCAGGATATTGAATTGATATTACCCTTTTATTGCAGATTGCAGTCTGAATTGCTGCAATAACGTTATCCGCCAATGTATTTTTCTGTCCAGATGTGCTGTACACGTTAATACTGTTCTCCAACTCCTGTGCATAGTTTTTTTCACCATGCTTCAAAATAGATTTGATTTTATACATAGCTGAATCAAAATCCTTTATAAATGATTCATCTCCATGGCAATTTAAAAATTTCCCTGCTGTAATCAATGCACCCACTTCCGCCGCTGTAAACATTACCGGCGGAAGTAGGAAGCCCTCTACAAGAAAATATCCTTTTCCGGCCTCAGATCCAATTGGTATTCCGGCTTCTTCAAGTGTCCGGATATCTCTGTAAACTGTCCTTAAGCTTATATTAAATCGCTGTGCAATTTCTTTGGCAGGAATTATTTTTTTTGATTGCAGCTGAATAAGAATAGAGGTTACTCTGTTAATCCTGTTCAAATTTTATTCCTCCTCTGTGACTTCCATAAAAAGTATATCCTATGCGTTCTTAAGCTAGCTGCTGTTAGTGCTTCTCATTGCACCCTGGTTATAAAAGCCATACTCACAAACCTCTTCACCAAAACTCTTTACATCTCTAATATAGAACTCTATCTAGCGAACTTTTAGAAAAGATATAAAACATCAGAGTATGGACAGTTGCGGATGTACTTCAGAAAAGATTAGATGTCTAAAAAGCTTGTAGTTAAAGCTTTTTAGACATCTAAATCTAGGTACTAAAACAATTCATCCAGTAAAATATAATATTTTATTTTCTCCCAATCAGGCTTGATCCCCAGTAAGTCAAAAAATAGCTCGACATACTGTTCTTCCCCGATATCCTCCCTGATCGACCGGACGCAGAAGGCAATGTCATACCACTTGTCCGCCCTGCCGCTTCTCCCAAGATCAATAAAGCCACTTACTTTGCCATCTTTCACAAAGATGTTGCTGTCTCCCAGGTCGCCGTGGGAAAAGACAAGTTCCTCTTCGGGCTTTTCCGTCTTTAAAAAATCATACAGCTCGCGCGGATCTTTAAATGGAGTGTCTTCTTCCCAGTTTTCGCAATCCACATCGGCCAGATCGTTATTCAGTAAGTAATCCAATTCGGCTAAGCGGCTGTCTAAGCTATTCGTATAGGGACAATCCGATATGTCGATGGAGTGAAAGAGCCTGATGCACTCCGCATACAGCTCGATAATCTTTTCAGGGCTTTGTTCATCTTCATACTCTTCCGAGCAAAGGACGCCATCGGCCTCACTCATGAGCAGATTGCTCCAGCCATCATGCCGTTCAAAGTGCAGGACCTTTGGAACAGGCAGCTTTCCTTCCAGCCATAGCATCATGTCCTTTTCCCGTTCCACATCATAGGTGGTCCCTTTATACCGGCTGTCCGTCATTTTTAAATATAGGTTTTCATTTTCTCCCACCAGCTTATATACCTTAGCAGGAGACATTCCTTCCGTATCTTTTACGCAGCGGTATTTTTCGATCAGTTTTTTCAATTCCGGTGATATTCTCATTTTAGCCATTTATTATTTCCTTCCTCTTTTCTACAGTATTTAAAGATACCCCAAGAAGCTAATTATAACAAGACGAACTCCAATTCACTGTTCCTTGCATTCTAAAACCTTAAATACCAGAAAACAGCTTTTTCAAAGTTGTTTTCAAAGTTGGCGTATAACATAGTATCGACGGAGCCGATTTTGAAACCACAATTATGATAGAATTTACAAGCTATAAGGTTATTGTCCTGGGTTTCAAGCATTAGTCCATGCAAGTTTTTATGCTTTGCCCATTCTATAGATATATTGATAAGCGCGCTGCCTATGCCTTGCCCCCTGAAATCCTTACATACGGCGATATCTTCTATATAAGCGTACCGGTTCCAATTTTTTCGCAGTTTAACTTTTCCGACGCATTTATCGTCTTGGTAGTAAAGATATATTATCTTATCAGTATTGTCAATATATTCAAGGCAATCTGCCTCCTCATCCTCTTCATCCTCTTCGTCTTGGTAGCTTTTTAAATATGGCGCTTCATAGAGTAATTCTGTAAAGGTCCAATTCTCGTTTTCATACCTCGGTATAATCTTACCTATCACCTCAAATGGTTCGCTGGGTTTATCGATATCTTTCAGGTGCCCTGCTTTCATTTCTGTAATCACTGTTCCCGCCTCTCTTCTATATCAGCGGCATATGTGCTATCCAGGCAGCCGGTTTTACCAGTGTATTTTTTATACATGTCCCTGGTATATTTTGTTATATTCCTATCATACTCCGGATAGGCATAATGAAGCCTTTCCGCCACCTCACCGGATACCGCCCTGAACAATTGATGGCATAGAAATAATGCTTCCCATATGTTTTCATAGGAATCCATCCGGTAGGTGGACAAAAGTTTCTCCCACAAATCCTCGGATATATACCTTTCAATAAACTTATAGTTCTTGCCTACACTTAATTTAAAGCCTGTTTCGATGCCGACCTTCCATGATATCATTCTCAGCAGCTCATGGCGAACAATCTGATTAAAATGATCAATAGCAAATAAAATTTCCTTACGGCACAATCCTTTAATAACATAAGGTGTTACATTCCAAAATTCATTGCAGCAATCATCATACTCCCTTGCGCTTGGCTTTCTTACATGATAATCTATATCAGTCGGAACTATGTCCCTTTTAATTCTACAATCTTTATCAATTAGAACCTTTATTAATTTATCGCCCTTTAGGTAATTATCTAACTCTTCCAAGGGCAATAAGGTAAGATCAATTTTATTGTAATCATCAAATAGCATAAGATAGGAAAATCCCTTTTCTTCAGGTGGGAATAATTCCATATCCTCCGGCTTTTGCATCATTATTATATTCCCAAATTGATTAAGCCAGTCATCATTAGATATAAACGGTTCTATATCACTTACAAAATATGTAATATCATAATCCTGAAATTCATCTTTAGGTATATTAATATTTGCGCGTGACCCCTCAAGGGTCACAATTCGAATACGTTCATCCTGTTCTGCTAAAGAAAGTACTAAATCCATCATTTCTTTTTCTGATCTCATTTACATACTCCTCGTTTATTTTTTCTATATTATTACATCTTCTTTTTTGCCGATACAATCAGCATCATTGGGCGTCGCATTTCATCCGCCATCCCCGGAATATCCATCATGTTCTCTGGCGGCTGTGGCTCCACAATCTGATTTATTATAAAACTATTTGAAAGCAGTGTATTTAGATATGTGGTCAGTGTTCTATGATATTTTGTAACCTTTTCTTCCAAAAACATAGCTGTCCGTTTGCCCTCATAATAATAATTGTCCACCGGGAAATGCAGTATTTCTCCTTTTTCGTTATAATACCAGTCTTGTGTTCCATGAGCAGTAAAAACAGGATGTTCAACTGTAAAAACTAAATTGCCACCAGCCTTCAGCATCCTATATATCTTTTTTATTAAATTCTCATAGTCTGCTACATAATGAAACGCAAGCGAACTTAGTATTACATCAAAGCTCTCCTCTGGGAAATCCACATCTTCTATGGCACAGCATTCATATTCAATCTGTGGAAAATGGGTTTTTCCTTTTGCTACTTCGAGCATTTTATGAGAAATATCAACACCTACTACAGAGGAAGCACCGTTTTCCATCGCATATATACAGTGCCATCCATAGCCGCATCCTAAATCAAGCACACGCTTACCCTTAAAATCAGGTAGCATCTTTTTCAAAGTCTCCCATTCTCCCGCACCAGCCAGTCCTTTCTGCGAGCGACTCATTTGACTGTATTTTTGAAAAAATATATTATCATCATATTTGTTTTCTTTCATCTGAACTCTCCTCGTTTAAAAAGTTATTTATCTCCGATACAATTTCATTCACTTCATTATAAAGCTTCTCGGTCATGTCGTAGCATTCAAAAAGTGAGATACCGAGTACTTCAAAAATATGATTTACCTTCTCGGTATATTTTTCAGGTTTATGTTCAAAAGTTTCAAGCAGTTTTATAGCTTTCTTTTCGTTGATACAATAAGCATTATTACATGCAAATAACACTTGATTTAAACATGAAACTATACGAAAAACATGACCCGCAATATAATATTTATCGTCTGTTCCCGAATTTGCTTTTACAAACATTAAAGAGAACCCTGCTTCAAACATAAAAAAGTTAACTAAACTTTTCTGCAAAGCATTGGGATAAGTTTCTGCCTGTTTTTTTAATTCGCATAAGCTTTCATTCTTAGCATATAGTATTTTGCTAATCGCTAATTCTCCTCGATACATTGCACTAATATAACCATGGGGATGCCCAGTCTGATAATTGGCAGTAACAATTCCGTGCTCTGTATCTTTCATTATTTGTTCCACACGTTTAATATCACGTAAAATTAAATCCACATGATACCCGTTTATGACTAACCATCCGCCGCCATTAATCCAATCACCCCATGCTCCGGGAGGTACAACAAGGTTATTTCTATGCTCATCATCCAGCTTTGTAGCGAATTGATTAATAGTATTTATGTCAAATGATTCTGAATTGTAATAGATGCCGATATCTATATCCGAATCCTCTGTATGGGTGCCCCTTGCACGTGAACCACCTAAAACAATACCTTCTATATAAGACAGAGAGGATAATTTCTCTGCTACTGATTTAATAATATTATCTACCATCAAGCATGCTCCTTTTATCGATTCACTGCTGTAAAAATTCCAAGCCAAATCTTTTGCTTCTACTCAACATATTTATAATTTTTTTAATTTCACAAAAGATAGTTAAAACTTATCAATTGTCTTTTTATACCTCTGCTGATTAGATGAAGTCTTTTCAATAGCCTTTAAATTACCATTCATTTTGCTAACATGGTTTAAAAATAACGTTCCAAGCAGAAGTCGATCCTTTCTGGGTATCCTATTCCCCACATATCCCTTGAATAAATCTTTAACAAGAAAAACTTCGCCATCATTTAGATTTTCAGTTTCTCTAATAGCTTCTTCCAATAGCTCATTTACATCAATCATGTTGTCCACTCCTTATTAATAATGGGGCTGACCCATTAGTCCCTTTTGAACCAAAAAATCGAAGGCACCCGTGAAAGATGTCTTCGATTTTTGTTTTTTTTGGATGAAATATAGAGGATTTTCCCCCTATATTTGGTTTTGTATGATTGTTTTTCCCTCATATTTCCTTACTCTAGTTACTAATTTCCTAAAATTGTGCGCAAGAAATACAAGTCCCATTTCCTTAAAAATTTTTTCAGCTCCTCGGACATGGAATCTTTTAAATTTCATATTTTGTTTAATGTTTCCAAAAACTGTTTCGACATCTATCTTTCGCTGCGCATAGTATGAGGCTGTTTCTTTGCTTTCTATCTTTTCATTCGCTTTTATTTTTATATATTCCCAGGTTGGATTAATATTCAAACGTCGATTTTTTCCTTCTTTTGCTTTGGTACATTTCTCTCTCAATGGACATCCTGTACAATCTTCACATTCATAGATTTTGAAGTTTCGAATAAATCCATTTCTATCTTTACGTTGTGAATAATGTGAGAACACTACTCTTTTCTGATTGGGACAAATATAGTAATCATCCAACTCGTTGTAAGTCCAATTATCTCGATGAAACTGATTTTGTTTATGGGCGCGTTTCTTCTCTTTTAAGTAACCTTGATGCGGAATGATGGGGGTGGATTCTGTTTCGTCTAACACATAACAATAATTTTCTTCACTTGCATAACCGGCATCTGCGACAATATTTTCTGGTAAACCTATTTTTGATTCAATCTTTTCAAGAAATGGGATAAATGTTCGTGTATCTGTTGGATTTGGATAACAATCATAAGCAAGAGCAAATTGATTTTCTGTCGCAAGTTGAATATTATAACCTGGTTTTAGTTGGCCATTAAGCATGTGATCTTCTTTCATTCGCATAAAAGTAGCGTCATGATCCGTCTTTGAGAAACTATTGCGTACACCCATAATCACTAATTGTTCTTCGTAGCTCATTTTTCTTTGGGCAAAATCATCGAATCGCTTCTTCTGCTTATGAACTTCAGATTTTTCTTTACGAAGTAATTTTCGTTCTTCTACTGTTTCGGTTTGGTCAATCGCTTCAATTAATTGATTTTCCTTTTCTTCCAAAGATTGACGAATCCTTTCAATCTCTTCTATAGAAAGTTCATCCTTTAAATCATCTATTAACTCAGGTAAGATTTTTGTTTCCACCATTTGTTGGTAGTTTTCAAGGGCTTTTTGATCAAGGCTATCCTTATACTTTAAAATACTTTTTTTCCAAACGAAAGAGTATTTATTCGCATCCGCTTCAATTTTTGTACCATCAATGTATAGAGCACTGCCACTGATTAAGCCACTTTGAACCAGTAGCTCACGAAATTGAACAAATGAATGATCTAGAATATCGTTCATAATCGGATGAACGCGAAAACGATTAATAGTACGAAAGTTAGGGAATTGCTCTTGAGATAAGTAGCGCATCCGAATACTATCTATCAGCATATTTTGTATTTGGCGGCCCGAATAAACCCCTTGAATATAGGCACAAAGAATAATGGAAAGTAGCATACGAGGATGATATTGGGGTCTACCCATAGATTGATAATAAGGAAGAAAGACTTCATCGGGAATAGAGTCAACAAACTGCACAATGGCATGAGCAAAATCATTTTCTTCTAATTTAATTTCAAGATCTATAGGCAAACAAAGTTGGTTTATGGTATAATTTTGATACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP022905|2748062:2758416|2753811_2754720_-|AXJ68003.1|DBSCAN-SWA MRSEKEMMDLVLSLAEQDERIRIVTLEGSRANINIPKDEFQDYDITYFVSDIEPFISNDDWLNQFGNIIMMQKPEDMELFPPEEKGFSYLMLFDDYNKIDLTLLPLEELDNYLKGDKLIKVLIDKDCRIKRDIVPTDIDYHVRKPSAREYDDCCNEFWNVTPYVIKGLCRKEILFAIDHFNQIVRHELLRMISWKVGIETGFKLSVGKNYKFIERYISEDLWEKLLSTYRMDSYENIWEALFLCHQLFRAVSGEVAERLHYAYPEYDRNITKYTRDMYKKYTGKTGCLDSTYAADIEERREQ >CP022905|2748062:2758416|2756811_2758416_-|AXJ68007.1|DBSCAN-SWA MYQNYTINQLCLPIDLEIKLEENDFAHAIVQFVDSIPDEVFLPYYQSMGRPQYHPRMLLSIILCAYIQGVYSGRQIQNMLIDSIRMRYLSQEQFPNFRTINRFRVHPIMNDILDHSFVQFRELLVQSGLISGSALYIDGTKIEADANKYSFVWKKSILKYKDSLDQKALENYQQMVETKILPELIDDLKDELSIEEIERIRQSLEEKENQLIEAIDQTETVEERKLLRKEKSEVHKQKKRFDDFAQRKMSYEEQLVIMGVRNSFSKTDHDATFMRMKEDHMLNGQLKPGYNIQLATENQFALAYDCYPNPTDTRTFIPFLEKIESKIGLPENIVADAGYASEENYCYVLDETESTPIIPHQGYLKEKKRAHKQNQFHRDNWTYNELDDYYICPNQKRVVFSHYSQRKDRNGFIRNFKIYECEDCTGCPLREKCTKAKEGKNRRLNINPTWEYIKIKANEKIESKETASYYAQRKIDVETVFGNIKQNMKFKRFHVRGAEKIFKEMGLVFLAHNFRKLVTRVRKYEGKTIIQNQI >CP022905|2748062:2758416|2753272_2753815_-|AXJ68002.1|DBSCAN-SWA MITEMKAGHLKDIDKPSEPFEVIGKIIPRYENENWTFTELLYEAPYLKSYQDEEDEEDEEADCLEYIDNTDKIIYLYYQDDKCVGKVKLRKNWNRYAYIEDIAVCKDFRGQGIGSALINISIEWAKHKNLHGLMLETQDNNLIACKFYHNCGFKIGSVDTMLYANFENNFEKAVFWYLRF >CP022905|2748062:2758416|2751157_2751514_-|AXJ67999.1|DBSCAN-SWA MDRIKSICIEEELCQSHDGSLEQILKQMLSYKKLYNVILRAEKGETYNSIKNRYSLGFLEETDLGSKMEIEFQTDSFEILSKQLIEYGSGIEIVQPDELKCITRKHLAQITNHCLNLI >CP022905|2748062:2758416|2751537_2752110_-|AXJ68000.1|DBSCAN-SWA MNRINRVTSILIQLQSKKIIPAKEIAQRFNISLRTVYRDIRTLEEAGIPIGSEAGKGYFLVEGFLLPPVMFTAAEVGALITAGKFLNCHGDESFIKDFDSAMYKIKSILKHGEKNYAQELENSINVYSTSGQKNTLADNVIAAIQTAICNKRVISIQYPASGGQEPESRMIEPISLGFYEQNWYLIGFAG >CP022905|2748062:2758416|2754752_2755487_-|AXJ68004.1|DBSCAN-SWA MKENKYDDNIFFQKYSQMSRSQKGLAGAGEWETLKKMLPDFKGKRVLDLGCGYGWHCIYAMENGASSVVGVDISHKMLEVAKGKTHFPQIEYECCAIEDVDFPEESFDVILSSLAFHYVADYENLIKKIYRMLKAGGNLVFTVEHPVFTAHGTQDWYYNEKGEILHFPVDNYYYEGKRTAMFLEEKVTKYHRTLTTYLNTLLSNSFIINQIVEPQPPENMMDIPGMADEMRRPMMLIVSAKKKM >CP022905|2748062:2758416|2755467_2756337_-|AXJ68005.1|DBSCAN-SWA MVDNIIKSVAEKLSSLSYIEGIVLGGSRARGTHTEDSDIDIGIYYNSESFDINTINQFATKLDDEHRNNLVVPPGAWGDWINGGGWLVINGYHVDLILRDIKRVEQIMKDTEHGIVTANYQTGHPHGYISAMYRGELAISKILYAKNESLCELKKQAETYPNALQKSLVNFFMFEAGFSLMFVKANSGTDDKYYIAGHVFRIVSCLNQVLFACNNAYCINEKKAIKLLETFEHKPEKYTEKVNHIFEVLGISLFECYDMTEKLYNEVNEIVSEINNFLNEESSDERKQI >CP022905|2748062:2758416|2752385_2753180_-|AXJ68001.1|DBSCAN-SWA MAKMRISPELKKLIEKYRCVKDTEGMSPAKVYKLVGENENLYLKMTDSRYKGTTYDVEREKDMMLWLEGKLPVPKVLHFERHDGWSNLLMSEADGVLCSEEYEDEQSPEKIIELYAECIRLFHSIDISDCPYTNSLDSRLAELDYLLNNDLADVDCENWEEDTPFKDPRELYDFLKTEKPEEELVFSHGDLGDSNIFVKDGKVSGFIDLGRSGRADKWYDIAFCVRSIREDIGEEQYVELFFDLLGIKPDWEKIKYYILLDELF >CP022905|2748062:2758416|2750387_2751047_-|AXJ67998.1|DBSCAN-SWA MKPKIIMHTQISLDGRIKGFDNPEVYYQVAGGIHSDAVLFGSNTVFTAFEKYPAETEADFEKIITSPEDPRPIGVIPDSRGILRSLHCLRNLGYLKEIVILVSTATPKEYLNYLEERHYPYIVSGNDHVDYEKAFQILHEQYGCKYMRTDSGGGLTNKLLENGLIDEISLVISPCFVGNKEKQLFDNLLLSEKVNLELQGTENAEHGCLSLRYAVKNKD >CP022905|2748062:2758416|2756439_2756685_-|AXJ68006.1|DBSCAN-SWA MIDVNELLEEAIRETENLNDGEVFLVKDLFKGYVGNRIPRKDRLLLGTLFLNHVSKMNGNLKAIEKTSSNQQRYKKTIDKF >CP022905|2748062:2758416|2748062_2749667_+|AXJ67997.1|DBSCAN-SWA MYQNYTINQLCLPIDLEIKLEENDFAHAIVQFVDSIPDEVFLPYYQSMGRPQYHPRMLLSIILCAYIQGVYSGRQIQNMLIDSIRMRYLSQEQFPNFRTINRFRVHPIMNDILDHSFVQFRELLVQSGLISGSALYIDGTKIEADANKYSFVWKKSILKYKDSLDQKALENYQQMVETKILPELIDDLKDELSIEEIERIRQSLEEKENQLIEAIDQTETVEERKLLRKEKSEVHKQKKRFDDFAQRKMSYEEQLVIMGVRNSFSKTDHDATFMRMKEDHMLNGQLKPGYNIQLATENQFALAYDCYPNPTDTRTFIPFLEKIESKIGLPENIVADAGYASEENYCYVLDETESTPIIPHQGYLKEKKRAHKQNQFHRDNWTYNELDDYYICPNQKRVVFSHYSQRKDRNGFIRNFKIYECEDCTGCPLREKCTKAKEGKNRRLNINPTWEYIKIKANEKIESKETASYYAQRKIDVETVFGNIKQNMKFKRFHVRGAEKIFKEMGLVFLAHNFRKLVTRVRKYEGKTIIQNQI |
11 | Streptococcus_phage(80.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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