Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP031367 | Arcobacter trophiarum LMG 25534 chromosome, complete genome | 0 crisprs | csa3,cas4,DEDDh,PrimPol | 0 | 0 | 6 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
283132 : 293597
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP031367|283132:293597|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP031367|283132:293597|288133_289480_+|AXK48200.1|DBSCAN-SWA MCAIVGIYGNENAARLASIALFAMQHRGQEATGISSSCDGKIYTKKDRGLVSEVFNEEALTYLRGNMAIGHNRYATAGSDSVLDAQPVYAKYKLGQISIVHNGNLINKDEVRNDLIDKGAIFQTGMDTENLIHLIAKNTKDHLKDRIIEALNRTIGAYCFIVQSRSKQFVIRDRYGIRPLSLGKLKSGGYIVASETCAFDLVGAEFIRDIRPGEMLIFSEEDDIESVQLFEPEFRPCAFEYVYFARPDSVIDGKNVYTTRENMGKALAKNDANSKVKYDMVVPVPDSGVPAALGYAAASGVPFKYGIIRNHYIGRTFIEPTQEMRNLKVKMKLSPMSSIIAGKSLLVIDDSIVRGTTSKRIVKMLKEAGAKEVHFRVASPEIKFPCFYGIDTPTKEELISTQMTKDEVCKYIEADSLEYLSIEDLISAIGDDRHYALESFDGDYFVKA >CP031367|283132:293597|285885_286203_+|AXK48197.1|DBSCAN-SWA MGKYIELTSANFDATTKEGVSLVDFWAPWCGPCRMIAPVIDELAGDFEGKANICKVNTDEEQDLAVKYGIRSIPTIIFMKDGEVKDQLIGATSKQALTDKINSLL >CP031367|283132:293597|291542_293597_+|AXK48203.1|DBSCAN-SWA MSENLLISLNKSQKSAAEHIDGPLLILAGAGSGKTKTITTRLAYLISIGIDPKSILTLTFTNKAANEMRDRAFSLLDTNSLNTPPLLCTFHKFGLLFLKFYIGELDRKNNFIIIDSDDKRRVLKSINKEIPTALLGSEVSKYKNSIMTPSEVKAQAQGKLYSEIADIYQKYEEHLFKNNLVDFDDLLLLPYKILKNNQKLAELTSQKYQYIMVDEYQDTNELQYRLLRLLCSTHNNLCVVGDDDQSIYGWRGASIKNILNFNEHFKDAIIVKLEENYRSTDTILQHANALIEHNRDRLGKKLVGTKDKGNSIKVYESHDENDETRKIVDDIKSLINSGKNPKDIAILFRVNALSRSLEEGFNKASLSYKLVGGMKFYERTEIKDLIAYFRILTNLSDNFSIKRVINKPKRGIGQTTIDKLEESAQNQGIGIFELIQKATPEELSAIVGKKNARTIKVFEASILDLRELMAESKMRLLDSFEEAFDYRASYDNLPDGFERQANIDEFYGYIRDFFIQNPHLDLKDFLNEIALENQSDEYSGDAVSMMSIHASKGLEFKYIFIIGLEEGFFPIIGDGTDLEEERRLGYVAFTRAMDDLTLSFVHSRFYKGKRTQLNKSRFLIESGLVKGSLVIEKSSGFKKGDMVNHKIFGQGRVEKAVNAGKDYKLTINFGGQKRDILSSFVEKN >CP031367|283132:293597|290530_291427_-|AXK48202.1|DBSCAN-SWA MLNDFAKLETFLTVVREKSFSKASAKLGISQPAVTQQVKFIEDYLDVQIVDRKKNGIKLTKEGQILHGIALKIEKCINNAEKDLLKIMNKSTTFIFGASFIIGNYILPRFLNNLKENIHNDVSINVSVSHEAIDDLLDKKIDIALVENYIANDDIIYREWMEDEIVIFSNQKLPARAKPEDLLSYKWICRNPESNTGSIFKECLEKENYPDCDTFEVTSEVTSATTIVQTVLHSDKNATPAVSIVSRNAIESLLKSGALFESRIGNQKMLRKLYIAYRKDRKHDAFIENVVDYLLKIK >CP031367|283132:293597|286413_287343_+|AXK48198.1|DBSCAN-SWA MLDLAIIGGGPAGLTAGLYATRGGLSNVVMFEMGMPGGQITGSSEIENYPGQGEVMTGMDLMASWPEQCQKFGLKHEMAQVEKVTKSGDTFKILTSDKKEFEAKSVLMATGSVPRRAGFKGEDEFFGRGVSTCATCDGFFYRGKEVAVVGGGDSALEEAYYLSKMCKKVYLVHRRDTYRAAPSTIAHMKNADNIEEVTNVSVEEVFGDASGVLGLKVKCNKTGEIRDLPTPGVFVFVGRNVLNAPLKQEDGTFLCEMSPNGEVVVDLKMRTNIKGLYAAGDIRIDAAKQVVCAAGDGATAAVDIIEYLG >CP031367|283132:293597|283132_285688_-|AXK48196.1|tRNA|DBSCAN-SWA MDIRKEYLEFFKNKGHEVISSMPLVPDDPTLMFTNAGMVQFKDIFTGNIPAPKNKRATSCQLCIRAGGKHNDLENVGYTARHHTLFEMLGNFSFGDYFKEDAIAYAWEFVTVNLSLPIEKLWVTVHNSDDEAFNIWSKYISKDRILKFGDKDNFWSMGDTGACGPCSEIFYDQGEEHFNGPEDKMGGDGDRFLEIWNLVFMQYERTKSGELLALPKPSIDTGMGLERVIAIKEGVLNNFDSSNFKPIIETLEEVANKKATKENIGSYRVIADHLRATSFMLSQGILFGNEGRPYVLRRILRRAIRHGYLIGLRKPFMAKLVDTLVNIMGGHYVELKENSNYIKEQLTLEEERFFKTIDLGMSLFSEELSNTKDIFSGSVAFKLYDTYGFPLDLTQDMLKDRGLEVDLVKFEELMKNQKAMAKAAWKGSGDSANGGDFKTLIEKYGLNEFVGYTNISYSSKIVALLDENFSEVEALKNQKGWALLDKTPFYATSGGQNGDIGAIEFDSTNIMVLETSKFHNLNLSKIDVKDIGISKNQIVKAVVVNRYEIAKHHSATHLLQSALKMVLGDSVSQAGSYNDDLKLRFDFTYPKAMTPDQINEVEDLVNSMINRALVGVVEELPLEEAKKKGAIAMFGEKYGDIVRVISFGGDVSVEFCGGTHVKNSADIGSFYIIKESGVSAGIRRIEAVVGASAFKYTKEQINKLALLQTEFKSNDIISGVKKLKQEIKELKHELQNAQSKTSTPINEELINDTKLIVSVIENGDLKKIVDDSKNANEKVAILLLQAKDDKVLITAGSKNTPIKAGDWVKQIATILGGNGGGRADFATAGGKDTTKMEEAKEAAILWAKDNL >CP031367|283132:293597|287346_288120_+|AXK48199.1|DBSCAN-SWA MIKIGILGSTGRVGSLLIDDLKNDSEAILSCVHVFDKIEKVLPDDTVVTNDINILFDESDVIIDFSSPVATEELLSAVVEGGKRKALVIATTGLSKHQQNLLLEASKLVPILYATNMSLGVAVLNKLVALASKTLRDFDIEIVEQHHRYKVDSPSGTALTLAEHAANARELDLDNVRISGRDGQIGARTKDEIAVMALRGGDIVGRHTVGLYNDGEFLELNHTATARNTFSKGALKVAKWLVKKDANLYSINDALGL >CP031367|283132:293597|289479_290445_+|AXK48201.1|DBSCAN-SWA MSENLKEVLTIGRYFKKKFGQKVYKVPISISGFTCPNIDGTKAKGGCSFCENDSFSPNLQEKKTKFKLNPNTEHNPFLDNQLKQLEMQFLATKKRLQNKFKAKKFIVYFQSFTNTYAPLSTLKALYEKALSFDEVIGLSIGTRTDCVTDDILDYLYEKSKEKEIWIEYGIQSFFQTTLDKINRADSVENMTYWIERTKQKGLNVCGHLIYGLPDENQEMMLETFKKTINLKVDSIKFHPLYVVKNTLLTNEFKKGRFTPISEELYIDTVVKSIVNLPQNVSVQRITAGIDDDTLLSPLWCKDKHRQMRNIRLALEKEGYSY |
8 | Klosneuvirus(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
518047 : 551822
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP031367|518047:551822|DBSCAN-SWA TTTAATCAGTTAACACCTTGGGTTGAGTAACACTATCATTGTATCTTTTCTCAAATTCATTTGGACTTATAAAATCTAAAAAACTATGTCGTCTTTTTGCGTTATAAAACATTTCTATATATTCAAATATTTTATCTCTAGCTTCTGCTCTTGTATGAAATATAGTTTTTCTAACTAATTCTTTTTTTAATGTCTTAAAAAAACTCTCTGCTACTGCATTATCATAACAATTACCTCTACGGCTCATACTTGGGATAATATTATGATGCTTTAAAAATGTTTGGTATTCATAAGAACTATATTGGCTACCTTGATCTGAATGAAGAATTACTTTATGATTTTTAATTCTGTGAGTTGTTTTTTTCAAAGCTTTAATAATTAAAGATGTTGATTGTCTATGTCCTGTTGCCCAACCAATTATTTTTCTTGAATAAAGATCTATAACTGTAGCTAAATATAACCATCCTTCATAAGTTCTGATATATGTGATATCACTAACCCAAGATTCATTTGGTTTATATGTTAAAAAACATTGTTTTAAATGATTTGGATGTGCTTTATGAATTGAACCAGCCTTATGCTTTGGTTTTCTTTTATAATTTCCTATTCCACAAAGTTTTGCTTCTTTCATTAATCTTGCAACTCTTTTCTTATTTACATGTATATTTGAAGCCTTTAAATCTTTATGAATATTTCTATATCCATATATCCCATTTGACTCTCTATATGCTTTTTTTATCTCTTGTAAAATTTGTTGATTTTCAATCTCTAAATTTGAAATAGGTTGTTTTAACCATTTATAATACCCACTAGGATGAACTTTCAATACAGTACACATTCTTCTGATTGTGTACTGTATTTGATACTCCTTTATAAATGCGTACTTTAATTTGGGTTGTTTGCAAAGTACGCTGCGGCCTTTTTTAAAATATCCCTCTCTTCTGTAACTCTCTTTAATTCTTTTTGCAATCTTTTTATTTCAGCTGTTGTATCTTGAGTTTTTTTTATTTCTACTTCAGCTTCTGGTGATTTGTATTTTTTTATCCAGTTTCTCAAAGAATCATAATGGACACCTAACCTCTCAGCTGTTTCAACAACCCCATATCCATTTTCTATAACTTGTTTTACAGCATCTCTTCTAAACTCTTCACTATATTCTCTTCTTGCCATTTTTAATTCCTTCAATTGTTTACAATTTTCTCTAAATTGTTATTTTAATTAACTGAATAAATTTCTGTCTACTTTTTTGGGGTCATTCCATGTAGATATTTTTTTATTGATAATAAACATATATAAAAAATGTAAAATTATCATATATGGAGATTTGCCAATATCTTTTTTTATGAAATTGCTTTGTTTTAGAATAGAACTAAAATTTATATCTCTTAAAATAGAAAGAATAGGATTTTTTAATACATTGTTCATAGCAGTTTGGATAAAATTGTCAATACCCATAAAAATACCTTTTATAATTGATTTGTGGTGATGAAATTATATCAAAAAGTGTCTATTTATGGGCTTTTAAAAGCTTTTACATATAAGAAATTGATGATTTTTTATGTGCGAAAGTTAAGTTAATTATTTGTATCAAATCTAATATTCTAGAGAAAATATAGAGTCTGCTACATTTAATATTTGAGATTTAAAGTGCGATATTATAACTATTGTACAACTTTTTTTTAACTCTAAAATCAAATTTTCGATTTTTAATGCTAACTCTTCATTTAATGAAGCAGTTGGTTCATCAAGAAGTAAAACTTTTGGTTTTAGTATCAAAGCTCTTGCTAAAATCAATCTTTGCTGCTGACCACCTGATAGTAAATATGCACTATCATCTAATCTATTTTTTACTTCATCATACAAATGAACTTTTTTTAATACCTCTGTTATTAACTTTTTTGCATCATCTTTTTTTATTTTTTGAAGCTTTAGAGGAAAATATAAATTTTCAAAAATAGAGAATGGTAAAATATCTGGATGTTGGCTTACATATACAATTTTTTTTCTAAGATTTGGTAGTTCTTTATTTGATAAAGTTGTAATATCAATATCTTTATTATCATCATTAAAATATACTTTTCCAGTAAAACTTGCATTTTCATACTCTTTTATCATCTGATTTAACACAAGAAGCAAAGAGCTTTTTCCAATTCCACTTGGACCACTTATTGCTGTGATTGAGTTTTTTTCTATATTCAAGTTTAAATCTTTTAAGACCTGTTTGTCATCATAGTAAAGATTTAAATTCTCTATTTTTAAAATATTTTTACTCAAGTTTTTGGCTCCTTCTAATAGCAATTTTTTGTAAAATAAATGCAAAAATAAAAAGGCTAAGTGATACAAAAAGAAGTATCATAGCAGCTACATAACCTTTATTTAGTTCATAAATATCTTGATATTGTGAAGATACATAAAATATAAAAAATGGAATAGCTTCATATTTTTCCAAAAGTGAGTTTGGAATTCCTCCCATAGCAACAGCTCCTGTCATCATGATAACAGCAGTATCTTCAACAGCTCTTCCAATTGCCAAAACAACACTACTAAATAGCTGTTTACTTATATATGGAAGTTGTACCAAAAAAAGGTTTTGATACTTTGTAGCACCTAGATTTAATACAGAGTTTTTTATCTGATATGGAATTGAGTAAAGTGCTTGTTCTGTCATTTTAACAATATATGGAATAACTAAAATTGCTAAACATATTGATGATATTAGAAGACAAGTATATAAATCATCAAAAAACATTTTGTGTAAATATATAGTAACAGATAAGCCAAAAAGTCCAATAACAATAGATGGTACAAAAGCCAAAAGTTCATAAGAGAAGCTAAAAATCTCTTTAACCTTTTTTGATGCAAAAATTGCTATAAAAACTCCACTTAAAAATCCTAAAGGCAGAGCAAAAACTATAGCCAATAAAGATACAAAAAGTGAGCCAACAATTGCATTAAATATTCCATCAAAAACTCTTTGTTTTCCTAAAATTGCATCTAAAATTGGAACATTATCAAAAATAATCTCTAAAGAAAAACTACTAAAACCTTTGTAAAATACAAATGTAAAAAATATAGCAAGTATTAAAATAGAAAAAATAACTACTAAAAAAAACAGAGATATAACAATTTTTCTACTCATCTTGCCTCTTTATTTATAAGTTTTAAACTAACAACAGTTAGAAAAGAGAATACTAAAAGTAGTAATCCACACAAAAATATTGCTTTAAAAGCAGTTGATTCATAATCACTTGCATTTATTAGCGCAATATGAGAAGTTAAAGTTCTTGCACTATCTAAAATAGAGTTTGGAATTTGAAGACTATTTCCAGCAATCATCAAAGCTATCATAGTATCTCCAACAGCTCTTGCAAATCCTAAGATAATAGCACTAATTATCCCTTTTTTTGAAGTTTTTAATATTAAATCAAAAAATATATCCTCATTTGTTGCGCCCAAAGATTTTGCAGCCAAAATTGTTTTTTTTGAAGTTGAGTTAAATGTATTAAATAAAATTATTGTCATTGTAGGAAGAACTACAAAACTTAATACAAAAGATGCTGTAAGAATACTAAAACCTTGTCCATCTAAAATATCATTTAGCCAAGGAACTAACAAAAATATAGCTATAAAAGCATATAAAACTGTTGGAACTCCTGATATAAAAAGCATAAATTTATTTAATATATTTGAAATATTTTTTGGAATAAAAAATGCCATAAGTGATGCAAACGAAAAACTCATAATAGTTGCAATTAGTGTTGCAAGAATACTTATATAAATTGTTCCTAAAATCATTGGCATTAAACCATAAAGACTTTTTTGCTCAATCCACTCAAAAGCAAAAAACTGTAAAAAATTTCCAGAAGTAAGAAGTGGAAATGAAAAATAGATTAAAAAAAATAGTATAAATAGTACAAGTGAGCTTGTTATAAAAATTGATATAACAAGCCCAAAATTAAATAGATAATACATAAACTACTTTTGATAAGGAATTAATCCAAGTTTGCTAGTAATTTCTGCACCACTATTGCTTTTCATATAATCTATAAATGCTTTTGCTAGAGGTTTTGGCTCACCTTTTGTAACCATATATAAACCTCTTGAAATATGATATTCACTATTTAAGATTGTCTCATTGCTAGGGCATCTATTATCTATACAAATAGCTTTTACACTATCATCAACTGTACCAAATGAGATAAATCCAATACCATTTTTATCAGATAATACAGCTGTTTTCATTGCAGCATTTGAAGCAACAACTTTTGCATCTTGAGAAATTTGAGCATTTTTAATACCTTCATTTGTAAATACTTCCATTGTTCCACTTGAAGCATCTCTTACATAAAGATTGATTTTTCCACCTTTTAAACCTAAATCTTTAAAAGATTTTACTTTTCCAGTAAAAATATCAATTAACTGCTCTGTTGATAGATTTTTAATATCTGAATTGTTGTTTACAATAACAGCAATTCCGTCCATTGCAAAAACGAAGCTTTTTAAATCGCCTCTTTCAATCTCATCTTTTTTTGGAGCTCGACCAGCATTTGCAATATCAACTAAACCTTCAGTTACTTGCTTTATTCCAACACCAGTTCCACCACCAGCAATTGTCATTGTAATTTCAGGATATGCTTCCATAATATTTTTCATAGCTTCTTTTTCAGAAGCTATATGAGCAGTCCCACCAGCAATATTTAAAGTACCCTTTAAACCTTTAAATAGGTCTAAATCACTGTTTGCACTTAGCGAACAAACAAAAAGTGTACAGATTGATAGAATTATTTTTTTCATTCAATTTCCTTTTTTTAATAGAAATTGGATAATTGTACAAAGAAGAGATTTGGAAAATATCTTTGTTGCTTAAACCTTAAGCCTGAATATCCAAAATAGAAAAGGAGTATATCCAAACTATGATAAAATAGTTTAATATTTTTTAAAAGGTAAATTTATGCAAAAAGTAGTTGGAATTTTTGTTTTTGATGATATAGAAGTTTTAG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33 | Shigella_phage(57.14%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1337760 : 1350604
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP031367|1337760:1350604|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP031367|1337760:1350604|1337760_1339248_-|AXK49249.1|DBSCAN-SWA MESKINRITDILRRDDGISGAMHYTEQISWILFLKFLSDLEDSKYEDAQLDGENYTYILEEKYRWNIWATPKKDGKIDVLNAQSGDDLLDFVNKELFPYLKSFKSINENPKSIKYKIGAIFEFLDNRIANGHTLREILDIIDNMDFHSQSDLFQLSIIYEKLLKDMGSDGGNSGEFYTPRPLIKVITDVVNPQIGQTIYDPAVGSCGFLIEAYNHIRYEDVEKNIQRELSTDQLKFLNEDTFFGNEKTPLSYVMGVMNMILHGIESPNISKSNTLTKNIRGLEEKDRFDCILANPPFGGKEKEQIQSNFPIKSNATELLFLQHMMNHLKQGGRCGVVIPEGVLFQTNNAFASVKKELLEKFNIHTILSLPSGVFLPYSAVKTNVIFFDRAGSTSDIYYYEVNLASKLTKNKPIVLEHFYEFLECWKDRKITENSWIVNVNDIKDFDLSAKNPNKNEKIEHKSPIELVENIKLNNALINDLLDEVEDILIGKDIDE >CP031367|1337760:1350604|1348889_1349369_-|AXK49259.1|DBSCAN-SWA MEHNHEKKTLGSNITEFMTFELGKMKYAIELPKIKEILTYPDNITTLPNTSNWVKGLINSRGEVVPILDIRIKFNTGPAIYDVNTSIITVITEDKRMIGIVVDLVDDVQKIDTSMLAPVSEMGSGIPARYLKGYVRLHDNKMLVLMDIEKVVCKEELGD >CP031367|1337760:1350604|1348324_1348873_+|AXK49258.1|DBSCAN-SWA MKKIIFLFLSFTLFLFANESVQKNPVAVFDTTKGIIKVELKPNLAPKAVENFVALSKKGYYNGQIFHRVIKGFMIQGGDPTGTGAGGESIWNKDFEDEFAPNAVFDKPYILAMANRGKNTNGSQFFITTAPTYWLNGMHTIFGYVIDGKNIVKDIENVKTTGRNGGDKPLDDVKINKITIEE >CP031367|1337760:1350604|1346289_1346547_-|AXK49254.1|DBSCAN-SWA MNFKPLGERVLVERVEAENKTASGIIIPDNAKEKPANAKVIAIGTKVEDIKVGDTIIFEQYRGTEIKIDGNDYLVLNVENILGVM >CP031367|1337760:1350604|1346667_1347540_-|AXK49255.1|DBSCAN-SWA MKELLGEFEEFLLKNLPKIDSFHPHFEAAMQDMLIAGGKRFRPMLLLSIVKAKKPLLLENSLKVALAIEFLHTYSLIHDDLPAMDNASLRRGFPTLHIKYDEVTAILVGDALNSESFNLIATASLHNDIKIELIKLLGHNGGLNGMVIGQAIDCHFEKQKLELEKLEFLHLNKTAKLIAASLKMGAIIASCGEKIEEELYSFGLDLGLLFQIQDDIIDELESSEEAGKTTQNDSFKNSFVNLLGLEEAKKSADDLAQKCLERLEVFDDELKDSLKDLLVSYINRHKKYNS >CP031367|1337760:1350604|1344658_1346290_-|AXK49253.1|DBSCAN-SWA MSKEIIFSDNARNRLFAGVEKLADAVKVTMGPRGRNVLLQKSFGAPTITKDGVSVAREIELADTLENMGAQLVKEVASKTADEAGDGTTTATVLAHSIFKEGLRNVTAGANPISLKRGMDKACEAILVELKKASRVVENKTEIEQVATISANSDSAIGKMIAEAMEKVGKDGVITVEEAKGISDELDVVEGMQFDRGYLSPYFVTNPEKMTTEFDNPFILLYDKKISSLKELLPILEGVNKAGRPLLIVAEDVDGEALATLVVNRLRGALQIAAVKAPGFGDRRKAMLEDIAVLTGGTVISEEMGMKLETTDLSALGVASKIVIDKDNTTIVDGNGTKDAVLARVNQIKAEIANTTSDYDREKLQERLAKLSGGVAVIKVGAATETEMKEKKDRVDDALSATRAAVEEGIVIGGGAALIRAAAKVKLELKEDELIGANIVLRAIKAPLKQIALNAGYDAGVVANEVEKSSNDNLGFNAASGEYVDMFEAGIVDPAKVERVAMQNAVSVASLLLTTEATVTEVKEDKVPAMPDMSGMGGMPGMM >CP031367|1337760:1350604|1339435_1340491_-|AXK49250.1|DBSCAN-SWA MIITLPLTQSIETPKVLKKAISTNRALANLNGVARIIPNSAILINSLVLQEAKDSSAIENIITTHDELYRANLDIESVTNEAKEVQNYKEALLRGFALVKDTKLLLKKHIVDIQAILEQNDAGVRKQAGTNLKNSLTGEVIYTPPQDYETIQELLTNLENYINEPNDIDSLVNMAIIHHQFESIHPFYDGNGRTGRIINILYLILKDLLDIPVLYLSRYIITHKADYYRLLQEVRTQDKWEEWILYMLDAVEQTSLETIELINNISNLMTKTQDKISQELPKIYSKDLVEILFMHPYTKIDFLVDRLSVTRKTASKYLNELENIGILENIQIKNSKFFMNIELFNLLRKGI >CP031367|1337760:1350604|1342139_1344527_-|AXK49252.1|DBSCAN-SWA MAYSESDTRANLIDPKLEKSQWKSSNIVREYYFTDGRKLIGGKRGNRYFVDYLLVYKNTNLAIIEAKAQNKDPLDGLQQVINYAQKLKIDFVYSTNGTKIYEHSLISGKGDFIEDYPTPDELFYRKFGKLKEQEEKVITQSFYFEGNKKPRFYQQIAVQKAVETIANDKDRVLLTLATGTGKTYIAFQIVYRLFQSKWNKDKTNRRPKILILADRNVLKSQAMNEFNPMEKDLVDINGKDIKRRGGKVPTNGNVFFAIYQSIAENKNRNIESCEDENEDDVIAYYKQYPSNFFDLIIIDECHRGSSNDDSSWRDILNHFSSATHLGLTATPKRDDNGDTYKYFGEPVYEYSLKDGINDGFLTPYKVKRIQTNIDEYHFNPDDIITGELDKNIVTLQEFEKSVVIPKRTRLLAKTILENINPFDKTIIFCVNQKHAMDMKISIDRYKTIKDSNYCVRVTSDEGELGREFLEKFQNNDLDIPTILTSSKMLTTGVDAKNVRNVVLTAPIASMTEFKQIIGRGTRTYEGKDFFTIIDFVGATNLFYDKAWDDDPLSVDIKTTKIEDIEDDELNEENKIDEEKKEQNKKENSFNDDEFEAKTKEEKAKKEQVIIDIKGKKLKVINIETRYVGVDGKPLRSSEYLELLIGVLGRFYNDEQTLRDIWSNPKNRKELLEKLKDMNIDESQLEDLKDIFEAKNSDIYDVLAHLSFNCDIKTRDERAIAALNSKFIEKYQNEKAKDFIEFILEKYRKYGFKELEENKLSTLIEQSGFDRRELMTSFGDFKIRDEYFELQKEIYR >CP031367|1337760:1350604|1340487_1342143_-|AXK49251.1|DBSCAN-SWA MSKSMNKCYLCGKEFDDKDVKKHDEHIIQQSIGGNLTVNDILCSSCGSKLGNEVDVPFVKIFEDIATRLDIKQDRKGNNQSTKSVKGKMGNIDVVWKDFKVSPVKPFHLYTIDKRFVIIYANEQTAESYKSKKVKKEINENLLNQIFIKSKKLKWLNEVKILTLKDFQYQFSEFCRKPEVIICDDIDGLVKFPFNMDNKAFKKGLAKIAIGFASSFGVEREDIPLVLNIDKNTNEAKIHDKILAIPFYPLGVIDELIEVQKNEFEHYPFHNLILFTIDYDPKVSKGKKVLICYIELFSTFEWYVILNEEYYGDSIYEFYAQQILKKDDYKVEFGRRYYKERNIWLNSLGITEEYINKKIKNQKSKMLSKLKWSQKSSIPLITQQADIFLNLMCCFGIEHEIIQEETIKQKYKFDFEGYIQNTVSGINNQVLIFKDKEKFSHINNDITKFLNNKDIVATYNNVLSSFEEHQNLRKNFFLFYSLDEEENEIFLINSFRVFYYKEGKLKNYYSELLDNFQLFQNDGSLKDYNHKKMYMLEKHIFQENIKQKIKK >CP031367|1337760:1350604|1347862_1348246_-|AXK49257.1|DBSCAN-SWA MTFEMLYSKIHRATVSDANLNYVGSITIDEELMNASNLRVGQKVDIVNINNGERFQTYVIKGEFGKRDMCLNGAAARKVAIGDKIIVIAYATYSEEELKNYKPTVVLVDDKNNIELITNELVGSDYV >CP031367|1337760:1350604|1347540_1347870_-|AXK49256.1|DBSCAN-SWA MFDGIDLKNLNLGDMINKFQDMAKEQEKNNASNLFTAKAGGGMVEISINGNSEVVDLKIDDSLLEDKDSLQILLISCMNDIIKQSEENKKRMALGMLGDMGGFGNFGQK >CP031367|1337760:1350604|1349410_1350604_-|AXK49260.1|DBSCAN-SWA MKAFSVTILNTQIKSLLETTFMQVVVSGEISNLVNHSSGHIYFSLKDENSTISCVMFKGNTKYLKFELENGQKVNITANITVFVPRGNYQLLCTKIEPDGVGSLALAFEQLKVKLEAKGYFDKSIKKPLPNFPKKIAIVTSPTGAAIEDIKKVASARWSLCELILIPTLVQGVGSVEDISRNIVFADSLNCDIIVVGRGGGSIEDLWSYNSEMVADAIFNAKTPIISSVGHEIDYLISDFVADIRAATPSNAMEIALPSREEYLLYIDSLRDSFSLNLKNIFSKKEEELRNLKLHFEQNSISSKLFFVESQIKLLKEQFFQSLNQKFQIASNILENLKSNYSLNNPATRQKDGFVELSRDKKIINLSLLKIDDIVELQSIDTIAECKIISLSKQKVK |
12 | uncultured_virus(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1458839 : 1469504
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP031367|1458839:1469504|DBSCAN-SWA ATTATTTTTTAGAAAAAGGCTCTTTTCCTAAATACTCAGCATACCCAATCTCTGCACCAATTTCAAGAAGTCTATTATATTTTGCAATTCTATCACTTCTTGCAGTACTTCCTGTTTTGATTTGTCCACAATTTAGTGCAACAGCAAAGTCAGCAATAAATGCATCTTCACTCTCTCCACTTCTGTGACTCATTACACAGTTGTAGTTGTTTCTTTGAGCAAGTCTAATTGTCTGCATAGTTTCACTTACACTTCCAATTTGATTTGGCTTAATTAAAATTGAGTTTGCAATACCTTTATTTATACCCTCAGCTAGAATTGAAGCATTTGTTACAAATAAATCATCTCCAACAAGTTGAACTTTATCTCCTAATTTTTCAGTTAATATTTTCCATCCATCCCAATCATCTTCACTTAATCCATCTTCAATTGAAACAATAGGATATTTTGAACATAGATTTTCATAGTAAGCTACAAGTTCTGCACTTGTTAATTCTCTATTTTCACTCTTTAAAACATATTTCCCAGCATCATTTATAAGCTCACTTGCAGCTACATCAAGTGCAATAGAGATTTGCTCTCCAGCTTTATATCCAGCTTTTTCAATAGCAGTCATAATAACTTGGATTGGTTCTTCATTTGATTTTAGATTTGGTGCGAAACCACCCTCATCTCCAACAGCTGTACTCTCTTTCATACCATCTATAATTTTTTTAAGATGTTGATAAATTTCAGCAACTGCTCTTAAACCTTCATTGAAGTTTTCAATTCCAGTTGGCATAATCATAAACTCTTGGAAATCAACAGAGTTATTTGCATGTTCTCCACCATTTATAATATTAAACATAGGAACAGGCATAGTCATAGCATTTGCTCCACCTAAATATCTATAAAGTGGCATATTTAGTGAAGCAGCAGCAGCTCTTGCAACGGCCATAGACACACCTAAAACTGCATTTGCACCTAAATTTGAGTAGTTATTTGTTCCATCTAACTCTTTCATAATTGCATCAACTTCTGCTTGATTAAAAGGGCTTTGTCCAATTAACTCATCTGCAATTTGTGTATTTACATTTTCAACTGCTTTTAAAACACCTTTTCCTAAGAATCTACTATCTCCATCTCTTAACTCTAAAGCTTCTCTTTTTCCAGTACTTGCACCACTTGGAACAATAGCACTAGCTTTGTTTCCATCACTTAAAACTACTGTTGCTCTTACAGTTGGATTTCCTCTACTATCCATAACTTCGTCAGCATAAACATTATCAATAAATACCACTTAGGTCTCCTAATTTTTGAATATTTTAGAAAGATTATATCTAAAAAAAATTTGGCTTTTGCTTTTATTGTGATAAAACTATTTCTAAAGTTTTTAGAAATAGTTTATATTTATTGTATTTTAACTCGAAAAATTTAAAATACCCATCCAGCTTGAAGAAGAAGTTTAGAGTTTTTATGAGATATATTACTATCACTTATCTCATCAGAATTTGCTGTCCATGCCATTTGTGCTCTAGCAAAAAAATCATTCATTCTTGCATAGTAACCAACACCTATATCTGGAATGACCCCAAGTTAGTAGACACTTTTTTAATCAGTTAACACCTTGGGTTGAGTAACACTATCATTGTATCTTTTCTCAAATTCATTTGGACTTATAAAATCTAAAAAACTATGTCGTCTTTTTGCGTTATAAAACATTTCTATATATTCAAATATTTTATCTCTAGCTTCTGCTCTTGTATGAAATATAGTTTTTCTAACTAATTCTTTTTTTAATGTCTTAAAAAAACTCTCTGCTACTGCATTATCATAACAATTACCTCTACGGCTCATACTTGGGATAATATTATGATGCTTTAAAAATGTTTGGTATTCATAAGAACTATATTGGCTACCTTGATCTGAATGAAGAATTACTTTATGATTTTTAATTCTGTGAGTTGTTTTTTTCAAAGCTTTAATAATTAAAGATGTTGATTGTCTATGTCCTGTTGCCCAACCAATTATTTTTCTTGAATAAAGATCTATAACTGTAGCTAAATATAACCATCCTTCATAAGTTCTGATATATGTGATATCACTAACCCAAGATTCATTTGGTTTATATGTTAAAAAACATTGTTTTAAATGATTTGGATGTGCTTTATGAATTGAACCAGCCTTATGCTTTGGTTTTCTTTTATAATTTCCTATTCCACAAAGTTTTGCTTCTTTCATTAATCTTGCAACTCTTTTCTTATTTACATGTATATTTGAAGCCTTTAAATCTTTATGAATATTTCTATATCCATATATCCCATTTGACTCTCTATATGCTTTTTTTATCTCTTGTAAAATTTGTTGATTTTCAATCTCTAAATTTGAAATAGGTTGTTTTAACCATTTATAATACCCACTAGGATGAACTTTCAATACAGTACACATTCTTCTGATTGTGTACTGTATTTGATACTCCTTTATAAATGCGTACTTTAATTTGGGTTGTTTGCAAAGTACGCTGCGGCCTTTTTTAAAATATCCCTCTCTTCTGTAACTCTCTTTAATTCTTTTTGCAATCTTTTTATTTCAGCTGTTGTATCTTGAGTTTTTTTTATTTCTACTTCAGCTTCTGGTGATTTGTATTTTTTTATCCAGTTTCTCAAAGAATCATAATGGACACCTAACCTCTCAGCTGTTTCAACAACCCCATATCCATTTTCTATAACTTGTTTTACAGCATCTCTTCTAAACTCTTCACTATATTCTCTTCTTGCCATTTTTAATTCCTTCAATTGTTTACAATTTTCTCTAAATTGTTATTTTAATTAACTGAATAAATTTCTGTCTACTTTTTTTGGGTCATTCCATATTGATAAATATAGATTTAATAAAATAATTGATTTGTTAGTTTATGCTCCTGAGATTTTTTTAGAAAATCTAGAAAATACTTTAAGAAATTACAAAGATCTAACTTTAAAGTTTACGAAATAACTTCATTATCTTCTATCATAGTATAATGAAGTTCTAAACCTTTTGAAGTCGCTACAAAGCCATTTATATTGATTTTTCCATCATGAACCATTTTATGGTGGAGTTTACAAAGTGGAATTAAATTATACTTATGATTTGCATTTATATGCCCTATAAATCCATCTTTATTAGCTTTTTTCTGCTCTTTGATATGATGAACCTCATCACAAGCTCTACCACAGATTATACAAGTGCTTGTATATAAATTGCTATTATATTTTGAACTATTTCTTTGTGAAATTCTCTCAATCTTTGTGTAATCATCTGCTAATCTTTTTCTTATATCATTTGCAACATTTAAGAACTCTTTATCAATATGAAGAGATTTTGCAAACTCCAAACCATATATAGATGAACCACTTCCAAAAGCCAATTTTCTATCAAAAATTAGTTTATCTTCATCACTTGAATACATAACAGACAGATGAAGGCAGATAATATTTTTTAATTTTTCAATCTCAGTAATTTGTGGTAATTGATGCAAATGTGTAGCAAAAACAAAAATGGCTTCAAGCCGTGCTAGTTTTAAAATAGCACTTGCCACAATACTAAGACCACTTAAAGTCTCCGTACTATGACTTATTTCATCTCCTAAAATAAGAGATTTTTTACTAGCTCGATTAAAAATATTTTTTAAATCCATCATCTCAACAGCAAAACTTGATAATCCTTTTGCAATATTATCAGCTCCACTAATTCTTGTAAAAATTGAGTCGAATATTGAAAATCTCATAGATTTACAAGGCACAAAAAATCCTGCTTGAGCTAAAACAACACTTATTCCAATGGCTTTCATAAGCGAAGATTTTCCAGAAGAGTTTATTCCAAAAAGTAATACTCCATGCATTTTGTTACTTTCAAGACTTATTGGATTTGAGTTTTTTACTATAATATTCTCTTCATACTCTTTACTAACTAAGTTTAGTTCTCCTAATACAATATCATTTGTAACATAAACTCCTCTATCCTCATTTGCTTCAATTATTGGATGTCGTAAATCTATAAGTTCTAAAAAATTTTCATCTTCTTTTGTTTTTACAATTTTTGGGCAACTGTAGTTATATTTTTTACTCATTTTTATATTTGAAACAGTTAAATCAACTTCAGCTATAAATAGCACTAATTCAGATAGGAGTGTTGAAAATTTATTCTCAAACTCAAGAAGCTTCTCTTTAAATACAAGCTTATTTATCTCAACTATTTTTTTAAGATTATGAACATATTTATCAGAAATATCGTCAGTTAAAGAGCAAGATATTTTTACACTATTTGTTTGAGTTTTTATAGAAAAATCTTTAAAAAGTAGTAGTTTATTATCAATTATAAGATGAGATTTTAGAAGTTCCTCTTTTATTAAGTTATATCTATTTTTTGTAATAGAGATATAAAATCCCTCTTTATCAAGCCTATTTATAGTTACAAAGCTTTTTTCATCTGATTTAAAAAAGGATAAAATATGGTTTTTTAGAATTTCCAATTTATCTAAAAGTAGTCTATTCTCTCTATTTAGTTCATCAATTTGAAGATTTACACCATTTGTTATCATATTTTCATCTACATCTTTAAGCATAAATCTTCCACTTACACTTAAATCAAAAGTAGAGTTAATAGATATTAAAAAAGAGTTTATCTCTTCACTACTACAAGGAGGAGTTATAAATTTATAACTCTCCATAAATTTCACAATCTCTTTTATACTAAGTAAAGAGTCATAGAGATAATTTAGCTCAAAAGGATGAAGTCTTGATAACTTTATTCTTCTTGTAAGCCTTTCTATATCATAAATACTTGCTAATTCATTTTCAATAGGAGAGTGAAAATCATATAACTCTTTTGAGAGATTATATCTTCGTAAAAGCTCTTTAGACTCTTTTATTGGATTTGTAATTCTCTCTTTTAAGAGTCTTTTTCCCATAGCTGTTGAAGTGTTATTTATAAGTCTAATTAGGCTTGGATTATGTGAAGTATCTATAATATTTAACTGCTCTAATGCATTATTTCCAATATATACATATCTACTAATATCTAATTTTATAGGGTGTGAAAGTTTTTGAATAATTGAACTATCATGAGCTATTACAAAATCTATTAAAATTGCTAGTGCTTCACTTGAAAGTGGGCATCTCTCCATATCTAGATGCTCTATTGGAGTTAAAAGAGACTCTATACTAAAAACATTTTTGAAAAGCTCATTTTGATATGTAATTTTTGGTCTAAAATTTCGCAAATGAAAACTTTTTAGATTTAATTCTAAATAGTCTATTATCTCTTTTTGATTAATATTTTTATCTACAAGAGTTACTATTATTTCACTTGTTTTATGCATATTCATATAGTTAAATACTTCATCAAGTGCAAAAAACTTATCCTCAGCACTTCCAAAAACTTCGTTGTAATAACACTTTGCTGTTGTTACATCTATTGCACTATAACCTATTAGATAATTCCCTCTTATTTGGTCAATTACTATTGAAGTGATAAAGTTATCATCTTGTTCTACTACAAAATCGAAATTTGTTCCAGGACTTACAACTACATCTAAATAACGACTTACCTTTGGAGGAGTTCCTTTTTGTTTTATAATTGCTATAGTATATTTTTGTTCAGCTATTATTCTTGCTAAATGTTTCTCAAATGAAATCGCTGGAACTCCTGCCATTATTGGGTTTTCTTTTGAGTTTTCAAGTATTGATTTATTTTTTCTTGTTAATTGAATATTTAGAAGTTCTGCTATTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTCTCTTTTTCATTGTTTACTTCATAAACTTCAAAAAAAGTTCCTATTTCCATAAGAACAAGTGCATTTTCTCCATATTTTTTATCAAATAACTCTTGTATCTTAAAATATGTAGTAGTTAGAAGTTCATTTCTATTTTGTAAAAGAGCAGTTACTTCTTCTCTCACTATTTTCTAACTCCCGTCCAATCTCTTATTTTTTCTCTCTCTTCTTTTGAAAGTTCTGCTTCTATATGAGCCCATGTATATGCAGGAAGAGGCATTGATGAGTGAGCTGTTCTATAAATAGCTTTTAATTTTTCATTTTTTTGTGTTTTACTATATTTCTCCCAGTTTGAAAAATTTAAAGCGTTTACACCTTCATTTGTATGATTTGTAACAACCCAAGAAAAAGGGGCAATATGTGAATACCAAGGATAGTTAATCTTATTTGAATGACAATCATAACAAGCTCTTACAAATATCTCTTTTATATCTTCAGGAACAACTATTTCGTATGTTTGGTCATCACTATATTCAACTTTATCAGGTCTTATAAACTGCATTACTACAAAAACTATCAAACAAATTATCAAAGCTCTATTCATTTTAAAATACCATCTCATATAATCTTTTTATTTCGCTATTAAAAATATCTAAACTCATATTTCTACTATATCTTTTAAACTCTTTCCCCTCAAAAAACACCAAAATAGTTGGACTTGAAAAGACATTAAAGTATGAAGCTATATCAAAATTCTGATTACTATTTATATAATATTGCTTCATCTTTGAAAAATTTTTAGAAATCTTTTTTTCTATTTTTATTTTTAAAACTTCACAAACACCACAATTTATTGCTCCAAAATAGAGCAATACACATTTTGATTTTTCTAAAATCTCTAAAATTTCTTCTTTATTATCTATTTCTATCATAAATTTAAAAAGATAGGAAAAATCCTATCTTTTTATACCTGATGACCACAATTTTTTGTAAGTCTATTTTTTTGAGATAAATATGAGTTTAAAGCACCTAAATATGCATTTGCAGTCGCTTGCATAGTATCAAGACTCAAACCATGTCCTACAAAAGATTGGCTTCCATCTTCAAAGCTAACTCTTGTTGTAACTTTTGCTAATGCATCTTTTCCTTCACTAACAGAGATAACTTTATAATCTTTTAACTCTCCAGCAAATCCAGTAATTCTATCTATCGTTTTAAAAATAGCATCCATAGTTCCATCACCTAAACCTGCATCTTTAATAATTTTATCTTCATATTTTATAGAGACTGCAGCCATTGGCATTCCACTTGAGCAATCACTTATTTGTAAACCAACTAACTCATATATTTTATCGTGATTTAAAGCTTCATCTGTTATTAACATTCTAACATCATCATCAGTTATATCTTTTTTCTTATCAGCTAAATTTTTAAATCTCTCAAATACAATATTTAACTCTTCATCACTAACTGTATCAAAACCTAATTGTATAATTTTATCTTTAAATGCTGCTCTTCCACTATGTTTTCCTAAAATCAAAGTACTATCTTTAATAACTCCAACATCTTCAGGTCTCATAATTTCATAAGTTTCTTGATGTTTTAAAACTCCATCTTGATGAATTCCACTTTCATGAGCAAAAGCATTTTTCCCAACTATTGCTTTATTTTGTTGTGGCTCAACACCAGTAATTGTAGCAACTAATCTTGAAGTTGCATAAATTTCAGGTGTATTTATAGATGTATATAAATCACCAAATACATCTTTTCTAACTTTTATAGCCATTACAGACTCTTCTAAAGCAGAGTTTCCAGCTCTTTCACCTAATCCATTTATTGTAACTTCGATTTGTCTAGCACCATTTAAAACAGCTGCTAATGTATTTGCTGTTGCAAGTCCTAAATCATTGTGATTATGAACAGATATTATTGCTCTATTGTTTGCAAATTCGCTTAACTCCTTAACCATGGCACCTAACTCATTTGGTAATCTATATCCTACAGTATCAGGTAAGTTAATAGTTGTTGCTCCAGCACTAATAACAGCATCCATAACCTCTTTCATAAAAGGGATTTCACTTCTTCCTGCATCTTCTAAAGAAAACTCTACATCATCTACAAAAGTTCTAGCATATTGCACCGCATGAATAGCTCTTTTTATAACTTCATCTGGAGTCATTTTTAATTTATACTGCATATGAATAGGACTTGTTGCTATAAATGTATGAATTCTATGCTTTGGAGCATGAGAAACTGCAAGTCCTGCTTGTTTTATATCGTTTTCAATAGCACGGCTTAATGAACAAATACTTGAGTTTTTTATAGTTTTTGCAATTTGACTAACTGCATCAAAATCTCCTGGACTTGCAGCTGCAAATCCAGCTTCGATAACATCAACTCCTAATTTTTCTAACTGTAAAGCAACTCTTAATTTCTCTTCAGTATTCATAGAACAACCTGGACTTTGTTCTCCATCTCTTAAAGTAGTATCAAATACAATAATTTTATTTTTATCCATAATATTTACCTTTTAATTTAACATTTGATTATATCTTTTTTTAAATAAAAAAAGAAAAACAGATTTTTTTGAAACTTAAACTATAATATTTATAATTTAGAGTGAGTAGTTAAGAAGGAGTAGAGAGTTTACACTTTTAATGAAATTGTTTTTAAAAATATCAAATATTTTCATATTACTCTCCTTTTTTTAATTAGGGTAGAAGTATATTTTATTTTTTTTAATTTGTCAAGGATAATTTTTATTATTTAGAATTTTTTAGGTTTATCTTATAAATTATAGTATAAGGTAAGAGATTAAAATATAAATATAATTTTGATTTTAATATTTATATAATCTCTTACTAATTTTAGTTTTCAGTATCTTTTTTTTCTTCTATTTCAGAATCTTTTACTTCTTGTGTTGAAGTTTTGTCTTCTTTTTTACCATCTTCACTGTCTTTTACCAAAGCTTCTGTATGTAAATCTTCATCTTCAAAAATAGTTCCACCATTTTCTTTGATAATCTCTCTTACTCTTTCACCTGTAATTACTTCTATTTCAAGAAGTTCAGCTGTCATTTGCTCTATTGCAACACTATTATCTCTTAAAGATTGTAAAACAACTTGGTATCTTTGATTTAGAGTATCTTTTACATGATTATCAAGCTCTTTTGCCATAGCATCTGAGAAATCTTTTTGAGTTTGACCTCCCAAAAATTGGTTTGTTCTTCGCTCTAAAACCATAAGCCCTGCGATATCACTCATCCCATAAATAGTTGCCATAGATTTTATAATATTTGTAGCTCTTTCTAAGTCATTTCCTGCACCTGTACTTATCTCACCAATAAATACCTCTTCAGCAGCACGACCTCCTAAAAGTACATCAACTTCAGCTATTAATTCATGTTTTTGCATTAAATATTTATTCTCTTCAGGTGTATTTAAAGTATATCCTAAAGCTGCAAGACCTCTTGGAACTATTGATACCTTATTTACTTTTTTTGCACCTTTTGTAATTTCAGCTATTAAAGCATGTCCACTTTCATGATAAGCTACTATTTTTCTCTCTTTTGGAGATATTCTTCTACTTTTCTTTTCAAGTCCAGCTATTTGTCTCTCAACAGCCTCTTTAAAATCACTAGCTTGTACTTCATCTTTACTTGCACGCCCAGCTAAAAGTGCAGCTTCATTTATAATATTTGCTAAATCAGCTCCTGCTAAACCAGCAGTCATCTTTGCAACCTCTTTTAAATCTACATTTTTAGCAACTTTTACATCTTTTATGTGTACATTTAAAATCTCAATTCTTCCCTCATAATCAGGTTTATCTACTAATACTTGCCTATCAAATCTACCTGGTCTAAGCAGTGCTGGATCTAAGACTTCTGGTCTATTTGTAGCAGCTAGAACTATTACAGGAGCCATTTCAGTTGAGAATCCATCCATTTCAGCTAAAAGTTGATTTAAAGTCTGTTCTCTTTCATCATTTCCACCCATAGGACCACCACTTGCCCTACTTTTACCAATTGCATCTATCTCATCTATAAAGATAATTGCAGGTGCAACTTTTTTTGCTTGTTCAAATAAATCTCTAACTCTTGAAGCTCCAACTCCAACAAACATCTCAATAAATGCAGAACCTGATACACTTAAAAATGGAACATCAGCTTCACCAGCTACTGCTTTTGCTAAAAGTGTTTTTCCTGTACCTGGAGGTCCTACAAGTAATACACCTTTTGGAATTTGAGCACCTAATCTTACATATCTATCTGGTGATTTAAGGAAATCAACAACTTCTTGAACTTCCTCTTTAGCTTCTTTATTCCCAGCCATATCAGCAAATTTTACATTTGGTTTTTCAGAATTTATCATTTTTTTAGAAGAACCAATCCCAAGGATTCCTCCACTTCCACCCATAGATTTTTGCATTCTTTTAACCAAAAACATCCAAATTGCAAAAAATAGAAAAATTGGAATTATCCAACCAAAAAGCATATCAGATAAAACATTCTCTTCACTAATTCCACCATAAGAGATACCACTTTTTTCCAATTCACTAATCAAAGTCTCATCAGGAACAACTCTTCTTGCATTATATGTAACTCTTTGCATACCATCATTTTTGCTAACAGCTCTAATTTGTGTATTCCCAATACCAACATACTCTATTTTTCCACTACTTATTAATTTCTTAAGCTCTGAATATGTAACTGTCTTATTTACACTACTTCCATAAGCTTGAATATTTGAGTTTGTAGCATTTGATTCACTATCAGGAAACATCGCTTTAAAAGCAAAAATAGTTATAAGTGAAAATGCAACAAAAATCAAAAGTGGATTATTGTTAAAGAAATTGTTATTATTATTGTTGTTGTTTTGATTATTATTGTTTGGGTTATTATTTTGTTGTTTATTTATCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP031367|1458839:1469504|1467452_1469504_-|AXK49366.1|DBSCAN-SWA MINKQQNNNPNNNNQNNNNNNNNFFNNNPLLIFVAFSLITIFAFKAMFPDSESNATNSNIQAYGSSVNKTVTYSELKKLISSGKIEYVGIGNTQIRAVSKNDGMQRVTYNARRVVPDETLISELEKSGISYGGISEENVLSDMLFGWIIPIFLFFAIWMFLVKRMQKSMGGSGGILGIGSSKKMINSEKPNVKFADMAGNKEAKEEVQEVVDFLKSPDRYVRLGAQIPKGVLLVGPPGTGKTLLAKAVAGEADVPFLSVSGSAFIEMFVGVGASRVRDLFEQAKKVAPAIIFIDEIDAIGKSRASGGPMGGNDEREQTLNQLLAEMDGFSTEMAPVIVLAATNRPEVLDPALLRPGRFDRQVLVDKPDYEGRIEILNVHIKDVKVAKNVDLKEVAKMTAGLAGADLANIINEAALLAGRASKDEVQASDFKEAVERQIAGLEKKSRRISPKERKIVAYHESGHALIAEITKGAKKVNKVSIVPRGLAALGYTLNTPEENKYLMQKHELIAEVDVLLGGRAAEEVFIGEISTGAGNDLERATNIIKSMATIYGMSDIAGLMVLERRTNQFLGGQTQKDFSDAMAKELDNHVKDTLNQRYQVVLQSLRDNSVAIEQMTAELLEIEVITGERVREIIKENGGTIFEDEDLHTEALVKDSEDGKKEDKTSTQEVKDSEIEEKKDTEN >CP031367|1458839:1469504|1461800_1464770_-|AXK49362.1|DBSCAN-SWA MREEVTALLQNRNELLTTTYFKIQELFDKKYGENALVLMEIGTFFEVYEVNNEKEKIGKAKEIAELLNIQLTRKNKSILENSKENPIMAGVPAISFEKHLARIIAEQKYTIAIIKQKGTPPKVSRYLDVVVSPGTNFDFVVEQDDNFITSIVIDQIRGNYLIGYSAIDVTTAKCYYNEVFGSAEDKFFALDEVFNYMNMHKTSEIIVTLVDKNINQKEIIDYLELNLKSFHLRNFRPKITYQNELFKNVFSIESLLTPIEHLDMERCPLSSEALAILIDFVIAHDSSIIQKLSHPIKLDISRYVYIGNNALEQLNIIDTSHNPSLIRLINNTSTAMGKRLLKERITNPIKESKELLRRYNLSKELYDFHSPIENELASIYDIERLTRRIKLSRLHPFELNYLYDSLLSIKEIVKFMESYKFITPPCSSEEINSFLISINSTFDLSVSGRFMLKDVDENMITNGVNLQIDELNRENRLLLDKLEILKNHILSFFKSDEKSFVTINRLDKEGFYISITKNRYNLIKEELLKSHLIIDNKLLLFKDFSIKTQTNSVKISCSLTDDISDKYVHNLKKIVEINKLVFKEKLLEFENKFSTLLSELVLFIAEVDLTVSNIKMSKKYNYSCPKIVKTKEDENFLELIDLRHPIIEANEDRGVYVTNDIVLGELNLVSKEYEENIIVKNSNPISLESNKMHGVLLFGINSSGKSSLMKAIGISVVLAQAGFFVPCKSMRFSIFDSIFTRISGADNIAKGLSSFAVEMMDLKNIFNRASKKSLILGDEISHSTETLSGLSIVASAILKLARLEAIFVFATHLHQLPQITEIEKLKNIICLHLSVMYSSDEDKLIFDRKLAFGSGSSIYGLEFAKSLHIDKEFLNVANDIRKRLADDYTKIERISQRNSSKYNSNLYTSTCIICGRACDEVHHIKEQKKANKDGFIGHINANHKYNLIPLCKLHHKMVHDGKININGFVATSKGLELHYTMIEDNEVIS >CP031367|1458839:1469504|1465549_1467103_-|AXK49365.1|DBSCAN-SWA MDKNKIIVFDTTLRDGEQSPGCSMNTEEKLRVALQLEKLGVDVIEAGFAAASPGDFDAVSQIAKTIKNSSICSLSRAIENDIKQAGLAVSHAPKHRIHTFIATSPIHMQYKLKMTPDEVIKRAIHAVQYARTFVDDVEFSLEDAGRSEIPFMKEVMDAVISAGATTINLPDTVGYRLPNELGAMVKELSEFANNRAIISVHNHNDLGLATANTLAAVLNGARQIEVTINGLGERAGNSALEESVMAIKVRKDVFGDLYTSINTPEIYATSRLVATITGVEPQQNKAIVGKNAFAHESGIHQDGVLKHQETYEIMRPEDVGVIKDSTLILGKHSGRAAFKDKIIQLGFDTVSDEELNIVFERFKNLADKKKDITDDDVRMLITDEALNHDKIYELVGLQISDCSSGMPMAAVSIKYEDKIIKDAGLGDGTMDAIFKTIDRITGFAGELKDYKVISVSEGKDALAKVTTRVSFEDGSQSFVGHGLSLDTMQATANAYLGALNSYLSQKNRLTKNCGHQV >CP031367|1458839:1469504|1458839_1460117_-|AXK49359.1|DBSCAN-SWA MVFIDNVYADEVMDSRGNPTVRATVVLSDGNKASAIVPSGASTGKREALELRDGDSRFLGKGVLKAVENVNTQIADELIGQSPFNQAEVDAIMKELDGTNNYSNLGANAVLGVSMAVARAAAASLNMPLYRYLGGANAMTMPVPMFNIINGGEHANNSVDFQEFMIMPTGIENFNEGLRAVAEIYQHLKKIIDGMKESTAVGDEGGFAPNLKSNEEPIQVIMTAIEKAGYKAGEQISIALDVAASELINDAGKYVLKSENRELTSAELVAYYENLCSKYPIVSIEDGLSEDDWDGWKILTEKLGDKVQLVGDDLFVTNASILAEGINKGIANSILIKPNQIGSVSETMQTIRLAQRNNYNCVMSHRSGESEDAFIADFAVALNCGQIKTGSTARSDRIAKYNRLLEIGAEIGYAEYLGKEPFSKK >CP031367|1458839:1469504|1464769_1465189_-|AXK49363.1|DBSCAN-SWA MNRALIICLIVFVVMQFIRPDKVEYSDDQTYEIVVPEDIKEIFVRACYDCHSNKINYPWYSHIAPFSWVVTNHTNEGVNALNFSNWEKYSKTQKNEKLKAIYRTAHSSMPLPAYTWAHIEAELSKEEREKIRDWTGVRK >CP031367|1458839:1469504|1465190_1465517_-|AXK49364.1|DBSCAN-SWA MIEIDNKEEILEILEKSKCVLLYFGAINCGVCEVLKIKIEKKISKNFSKMKQYYINSNQNFDIASYFNVFSSPTILVFFEGKEFKRYSRNMSLDIFNSEIKRLYEMVF >CP031367|1458839:1469504|1461312_1461597_-|AXK49361.1|transposase|DBSCAN-SWA MARREYSEEFRRDAVKQVIENGYGVVETAERLGVHYDSLRNWIKKYKSPEAEVEIKKTQDTTAEIKRLQKELKRVTEERDILKKAAAYFANNPN >CP031367|1458839:1469504|1460428_1461265_-|AXK49360.1|transposase|DBSCAN-SWA MCTVLKVHPSGYYKWLKQPISNLEIENQQILQEIKKAYRESNGIYGYRNIHKDLKASNIHVNKKRVARLMKEAKLCGIGNYKRKPKHKAGSIHKAHPNHLKQCFLTYKPNESWVSDITYIRTYEGWLYLATVIDLYSRKIIGWATGHRQSTSLIIKALKKTTHRIKNHKVILHSDQGSQYSSYEYQTFLKHHNIIPSMSRRGNCYDNAVAESFFKTLKKELVRKTIFHTRAEARDKIFEYIEMFYNAKRRHSFLDFISPNEFEKRYNDSVTQPKVLTD |
8 | Shigella_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1676105 : 1683042
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP031367|1676105:1683042|DBSCAN-SWA TATGATTAATAATTCAAATAATAAAGCAGTTGTAATTTTAAGTGGTGGTATGGACTCAACTCTTAGTTCATATATAGCAAAAAATAGTGGTTATGAGCTAATTGCGGTCCATTTTAACTATGGACAAAGAACAGAAAATAGAGAGTTAATAGCATTTAGAGATATTTGCAAAAAGCTAAATGTTTTAAATAAATATGAGATAGATATTCCATTTTTTGCTCAAATTGGTGCTAGTGCATTAACTGATAAGTCAATAGATGTACCAGTAGATGGGCTTGAAAAAGGGATTATACCAGTTACTTATGTTCCTTTTAGGAATGGAATCTTTTTAAGTATTGCTAGTGCAATAGCAGAGAAAGAAAATGCAAATGCTATCTATATCGGAGTTGTACAAGAGGATAGCTCTGGTTATCCTGATTGTACAAATAGTTTTATTAGCTCTATTCAAAATGCAATAAATGAAGGAACAAAAGATAATACAAATATTAAAATTATTACTCCATTAGTTAATCTAAGTAAAGCTCAAATTGTTCAAGAAGCAATAAAACTAAATGTACCTTTAGAACTTACTTGGTCATGTTACAAGGAAGAAGAAAGTGCTTGTGGAGTTTGTGACTCTTGCAGACTCAGATTAAATGGATTTAAAGAGGCAAATCAAAAAGATCCTATACCTTATAAGGAGAGTTAATATGTGGGAAATTTCAAAAGAGTTTGATTTTTGTTATGGACATAGAGTTTGGTCACAATCATTAAATATTGAGTTTTCTCTTGATAGCTGTCTTATGTGTAGACACCTTCACGGTCACCAAGGTAAAGTAATTGTGTATTTAAAATCAGATAGTTTACAAAGTGGAATGGTTACAGATTTTAAACATTTAAATTGGTTTAAAAAGTTTTTAGATGATATTATTGATCATAAATTTATATTAGATATAAATGATCCACTTTTTTCGACTCTTTTACCAAATATTGATAAAAAATATTTAATAAAATTTAAAGAAGGTTATAAAACTGTAAATTTAAAAGATTATAAAAATGAACTTTTAGAGTTGTATGAGAGTTACATTATTGTAGATTTTGTACCTACTAGTGAAAATATATCTGCTTGGCTTCTAAAAATTGTTCAAGAAAAGATGAGTAAATTAGATATAAAAGTATCAAAGGTTGAATTTTTAGAGACTCCAAAAAGTAAAAGTACATTTTATGCTGGAAATTAATGAGATTTTTGGACCAACAATTCAAGGAGAGGGAAAATTAGTAGGGAACCTCTCCATTTTTATTAGATTTGGTAAATGTAATTTTAAATGTGTAGGTTTTAATGTTTTTTATGAAACACCAAGCGGTAAAAAAAAATGTGCTTGTGACTCTTACTATGCAGTTGATATGGAGTTTAAGGATAGTTGGAGAAGTTACGAAAATCATCTTGAAATAATACATGAAGTTGATAAACTTCTTGAAAATTATTCTTATAAAAATAGAGTTGATATTGTAATAACAGGTGGCGAACCACTTTTATATTGGAATAATAAAGAGTTTCAGAATTTAATTAAATACTATATTGAAAAAAATCATAAACTTACAATCGAGACAAATGCTTCTTTAAATATAGATTTTAAAGAGGAGTATCAAAAAAATATTCTATTTTCAATGAGTGTAAAATTAAGTAACTCTTTAGAACCTCTAAAAAAGAGAGTTAATAAAACTACATTAACAAAAATTTTAGAAAATACAAAAGAGTCTTATCTTAAATTTGTAATTGGTGATGATTTTTTAGAAAATGCAATATCTGAAATTGAAGATATTTTAAAAGATATTCCAAAATCTGAAGTATATCTAATGCCATTAGGTGATAGTTCTAAAACTATTGATACAAACTCTGAAAAAGTTGTAAATCTAGCTATTAAACATGGATTTAAATACTCTGATAGATTACATATTAGAATTTGGAATAATAAAAGAGGAGTTTAATATAATCAAATTATTGATATAATAAACTTTATATGTAAAAAAATAAAAGGACAAAATATGAAATTTAGTGGAAAAAATGTTTTAATAACAGGTGCAAGTAAAGGGATTGGTGCAGAAATTGCAAAAAATTTAGCATCTTATGGCTTAAAAGTTTGGATAAATTATAGAAGTAAAATAGAAGAGGCTGAATATATTAAAGAGCAAATTGAAAATGCTGGAGGAGTAGCTGCAATTATAAAGGCTGATGTTTCTATTGAGGATCAATTTATTGCTGCTATTAAAACTATTATTGAAAGTGATGGAGAACTAGCATATTTAGTAAACAATGCTGGAATTACAAAAGACAAACTAGCTCTTAAAATGAGTGTTGAAGATTTTACATCTGTAATTGATGCAAACTTAACATCAGCCTTCATTGGTTGTAGAGAGTTTTTAAAACAAAGAGGAAAAAAAGGTTTTGGTTCAGTTGTAAATATCTCTTCAATTGTTGGAGAGATGGGAAATCCTGGTCAAGCAAACTATAGTGCAAGTAAAGGTGGATTAAATGCAATGACTAAATCATTTGCAAAAGAGGCTGCAAGTAGAAATCTTAGATACAATGCAATAACTCCTGGATTTATTCAAACGGATATGACAGATTTATTAAAAGATGAAGTAAAAGCACAATATGAGAAAAATATTCCACTTTCAAGATTTGGGAATCCAAGTGAAATAGCTGATGCTGTGGCATTCTTGCTAAGTGATCACTCATCATATATTACTGGTGAAATACTAAAAGTTAATGGTGGATTATATGTTTAAAGTTTATCTTTAAACTATAATTTCTACAAATTAAAAAGTTTTTAAAACTTTTTTGCTATAATTTTGTGACAATTTTATTAAAGGAATTAAAATGGCATTATTAGATGATGTAAAAGCTGTTGTAGTTGATCAATTAGATTGCGATCCAGCTGAAGTTAAAGAAGGTTCGAAATTCATCGAAGATTTAGGAGCAGATTCTCTAGATGTAGTAGAGCTTGTAATGGCTTTAGAGGAAAAGTTTGATATCGAAATCCCTGATGAAGAAGCTGAAAAAATCTTAACTGTTGGTGATGCAATAGCATACATTGAAAACAATAAATAGTTTTCTTTATATATTTAGATAAAAGAGACTCTCTTTTGTCTATTATTTTAGTTGTTGAGTTTTTAAATTTAAATAGAAAATTGAATAGTTTAAATAAAATATTGGAGCATTATTAGATGAAAAGAGTTGTTATTACAGGTTTAGGTACTATAAATTCTACTGGACATAGTGTGAACGAATCTTTTGAAGCCGTTGTAAATGGTGTTTGTGGGATTGATAAAATTACACTTTTTGATACAAGCGATTTTTCAGTGCAAATTGCAGGAGAGGTTAAAAATTTCGACCCTGAAACTGTAATGGATAAAAAAGAGGTTAAAAAAGCTGATAGATTTATTCAGTTGGGAATTAAAGCAGCATTAGAAGCGATGATTGATAGTGGATTTGTTACATCTGAAAATAAAAAAGTAGATGAGAATATAGCTCCTAGATTTGGAATTATTTCTGGGTCAGGAATTGGTGGTTTATCAACAATTCAAAAAAACTCAACTATTTGTGATACAAAAGGTTCAAGAAAAATATCTCCATTTTTTATACCATCATCTTTAGCAAATATGTTAAGTGGTTTTATCTCTATTGAACATAATTTAAAAGGTCCATCTTTAGGTCATGTAACTGCTTGTGCTGCTTCAACTCATGCTTTAAATGATGCTGTAAAAACAATTGTTTTAGGTGGTGCTGATAGAATTTTAGTTGTTGGGGCTGAAAGTGCTGTTTGTGGCGCTGGAGTTGGTGGGTTTGCTGCGATGAAAGCACTATCTACAAGAAATGACGATCCAAAAAAATCTTCAAGACCTTTTGATATAGACAGAGATGGTTTTGTAATGGGTGAAGGTGCTGGAGCTTTAGTTGTAGAAACTTTAGATAGTGCACTAGCTAGAAATGCAAAAATTTATTGTGAGATTATTGGATTTGGGGAAAGTGGTGATGCAAATCATATAACTTCACCTGTTATAGATGGTCCACTAAGAGCGATGAAAGCAGCTTTTGAGATGGCAAAAAACATAACTGGCAAATATCCAAAAATAGACTATATAAATACTCATGGAACTTCAACTCCTGTTGGAGACAAAAATGAAACAGCTGCAATAAAAGAGTTGTTTGGTGGAAAAGAGAACTGTCCTCCTGTATCATCTACAAAAGGTCAAATTGGTCACTGTTTAGGAGCAGCTGGTGCTATTGAATCTATTATGGCGATAAAAGCTCTAAATGAGGGAGTTATTCCTCCAACAATAAATGTTGAGAACCAAGACCCAGAGTGTGATTTAGATGTTGTTCCAAATATTGCTAGAAGAGTTGAACTTACAACTGTTATGAGTAATAATTTTGGTTTTGGTGGAACAAATGGTTCTGTAATTTTTAAAAAATTTACAAAATAAATTTAAACCTTAAAGGGTGATTTCACCCTTTTATTTAAGGAAAAATATTGGCTACTTACTTAGAATTTGAAGAAAAAATAAAAAAAATAGAAGATGATATAATAATCGCAAAAACAAGAGCAGATGAACCTGCTGTGGAAATATTGAATAAAAAACTAGATAAAGAAGTTGAAAAAACTTTTAAAAACCTAAATGATTATCAAAAACTTCAACTAGCACGACACCCAGACCGTCCTTATGCTCTTGATTATATTAATGCTCTTTTATCAAATGCCTATGAAATTCATGGTGATAGACATTTTGTAGATGATAGTGCCATTGTTTGTTATTTAGGTTTTATTGGAGAACAACAAACTTTAATAATTGGTGAACAAAAGGGTCGTGGAACAAAGGAAAAATTAAAAAGAAACTTTGGAATGCCTAGCCCTGAAGGTTATAGAAAAGCTTTAAGAGCAGCACAAATGGCAGAAAAATTTCAAATTCCAATTCTTATGTTAGTTGATACTCCAGGTGCATACCCAGGTCTTGGAGCT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP031367|1676105:1683042|1682049_1683042_+|AXK49568.1|tRNA|DBSCAN-SWA MELWIKKIESASTLEELESLRVDTLGKKGVLTVEFAKMKDIPAEDKKSFAENLNKQKEQVTKALDSKKIELEAIALDKKLQNEKIDVTRFNNEITSGATHPVAETMNKIITYFQNLNFAVEEGPLVEDDFHNFQALNLPEYHPARDMADTFYNKDYTLLRTHTSPVQIRTMLSQKAPIRMIAPGTVFRRDFDITHTPMFHQIEGLVVDCADKISFANLKHVMVEFLQHIFGEVEVRFRPSYFPFTEPSAEVDISCVFCKGNGCRVCSQTGWLEVLGCGVVDQNVFDAVGYKDKSGYAFGLGVERFAMLIHSIGDLRSLFESDTRLLGQFK >CP031367|1676105:1683042|1676105_1676792_+|AXK49560.1|DBSCAN-SWA MINNSNNKAVVILSGGMDSTLSSYIAKNSGYELIAVHFNYGQRTENRELIAFRDICKKLNVLNKYEIDIPFFAQIGASALTDKSIDVPVDGLEKGIIPVTYVPFRNGIFLSIASAIAEKENANAIYIGVVQEDSSGYPDCTNSFISSIQNAINEGTKDNTNIKIITPLVNLSKAQIVQEAIKLNVPLELTWSCYKEEESACGVCDSCRLRLNGFKEANQKDPIPYKES >CP031367|1676105:1683042|1678964_1679195_+|AXK49564.1|DBSCAN-SWA MALLDDVKAVVVDQLDCDPAEVKEGSKFIEDLGADSLDVVELVMALEEKFDIEIPDEEAEKILTVGDAIAYIENNK >CP031367|1676105:1683042|1681576_1681924_-|AXK49567.1|DBSCAN-SWA MCIFCKIINKEIPSNIVLEDENFLAFHDINPTRKIHVLVIPKAHYNSFEDTPSSIMNALSDFIKKVTKELKIDKSGYRMITNIGEDGGQEVAHLHFHIIGGEKVGRLVRDKNDLG >CP031367|1676105:1683042|1679311_1680571_+|AXK49565.1|DBSCAN-SWA MKRVVITGLGTINSTGHSVNESFEAVVNGVCGIDKITLFDTSDFSVQIAGEVKNFDPETVMDKKEVKKADRFIQLGIKAALEAMIDSGFVTSENKKVDENIAPRFGIISGSGIGGLSTIQKNSTICDTKGSRKISPFFIPSSLANMLSGFISIEHNLKGPSLGHVTACAASTHALNDAVKTIVLGGADRILVVGAESAVCGAGVGGFAAMKALSTRNDDPKKSSRPFDIDRDGFVMGEGAGALVVETLDSALARNAKIYCEIIGFGESGDANHITSPVIDGPLRAMKAAFEMAKNITGKYPKIDYINTHGTSTPVGDKNETAAIKELFGGKENCPPVSSTKGQIGHCLGAAGAIESIMAIKALNEGVIPPTINVENQDPECDLDVVPNIARRVELTTVMSNNFGFGGTNGSVIFKKFTK >CP031367|1676105:1683042|1680618_1681554_+|AXK49566.1|DBSCAN-SWA MATYLEFEEKIKKIEDDIIIAKTRADEPAVEILNKKLDKEVEKTFKNLNDYQKLQLARHPDRPYALDYINALLSNAYEIHGDRHFVDDSAIVCYLGFIGEQQTLIIGEQKGRGTKEKLKRNFGMPSPEGYRKALRAAQMAEKFQIPILMLVDTPGAYPGLGAEERNQSEAIAKNLYEFANLTTPTVSVVIGEGGSGGALAISIADKLAMMRYSVYAVISPEGCSAILWNDPTKVETAAQALKITAENLKHQNLIDDIVNEPLIGAHRKKDEAVMALKEYFLDSIEELKQLTPKERQEKKYQKIMNLGSFSE >CP031367|1676105:1683042|1678129_1678873_+|AXK49563.1|DBSCAN-SWA MKFSGKNVLITGASKGIGAEIAKNLASYGLKVWINYRSKIEEAEYIKEQIENAGGVAAIIKADVSIEDQFIAAIKTIIESDGELAYLVNNAGITKDKLALKMSVEDFTSVIDANLTSAFIGCREFLKQRGKKGFGSVVNISSIVGEMGNPGQANYSASKGGLNAMTKSFAKEAASRNLRYNAITPGFIQTDMTDLLKDEVKAQYEKNIPLSRFGNPSEIADAVAFLLSDHSSYITGEILKVNGGLYV >CP031367|1676105:1683042|1676793_1677321_+|AXK49561.1|DBSCAN-SWA MWEISKEFDFCYGHRVWSQSLNIEFSLDSCLMCRHLHGHQGKVIVYLKSDSLQSGMVTDFKHLNWFKKFLDDIIDHKFILDINDPLFSTLLPNIDKKYLIKFKEGYKTVNLKDYKNELLELYESYIIVDFVPTSENISAWLLKIVQEKMSKLDIKVSKVEFLETPKSKSTFYAGN >CP031367|1676105:1683042|1677307_1678072_+|AXK49562.1|DBSCAN-SWA MLEINEIFGPTIQGEGKLVGNLSIFIRFGKCNFKCVGFNVFYETPSGKKKCACDSYYAVDMEFKDSWRSYENHLEIIHEVDKLLENYSYKNRVDIVITGGEPLLYWNNKEFQNLIKYYIEKNHKLTIETNASLNIDFKEEYQKNILFSMSVKLSNSLEPLKKRVNKTTLTKILENTKESYLKFVIGDDFLENAISEIEDILKDIPKSEVYLMPLGDSSKTIDTNSEKVVNLAIKHGFKYSDRLHIRIWNNKRGV |
9 | Campylobacter_virus(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1873788 : 1880811
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP031367|1873788:1880811|DBSCAN-SWA AATGTCAAATGTAATTAAACAGTTAAATCAAATCCAAGCCGATGCTCATGCCCTTTATATAAAACTCCACAACTACCATTGGAATGTAAAAGGGATGGATTTTCATCCAGTTCATACATACACAGAAGGTGTTTACAATGAAATGGGAGTTTTATATGATGATACTGCTGAAAGAGCAATTATTTTAGGTGGAGTTGCACTTTTAACAATTGATGATTTAGTAAAAACTACAAAGATTAAAACAGAAACTGCTTCTAGCTTTAAATCAAAAGAGATAGTTGAAAAAATAACTTCTGATTTTACTTATCTTTTAGCTGAGTTTAAAAAACTAAGTAAACTTGCATCTGAATGTGATGACAGAGGAACAGAAGCTTTTGCAGATGACCATGTTGCAAAATTAGAAAAAAATCTATGGATGTTAAATAGTATGCTAAAATAAAAAAAAGAGGAAATTTCCTCTTTTTTTACTTCTATATTTTTTACTAATATTTTATCTTTCTTATATTTTTTATTTACAAAAGAGTTTTTATGCGAAAATCAATCAATCATATATATTTAATTATTCTATTATCTATTTTATCTTCAGTTGCTCCTATGGGGGTTGATACATATTTACCATCTATTCCAGAGATTGCAAAGTTTTTTAATGTAGATATTCATAAAATTGAGCTATCTTTATCTATTTTTTTAATAGGATTTGCTGTTGGACAAATATTTGGAGGTCCAATTTCTGATAGATATGGTAGAAGATTTGGCTCTATTTTAGGACTTTCTGGCTTCGCTCTTTTTAGCTTTTTAATCATTTTTAGCTCAAATATCTATGAACTTTGGTTTTATAGATTTATAGAGGCATTTTTTGGAGGAATCACTGTTGTAAATGCAACTGCTGCTGTAAGAGATAGATTTAGTGGACAAGAAGCTGCAAAAGTTTTCTCTCTTATTGGAATGGTTAGAAGTTTGGCTCCTCTTTTAGCTCCTGTATTTGGAGCGGCTATTATTCACTTTTTCCCTTGGGAAGGAGTTTTTGTATTTCTCACAATATATGCTTTAGTAGTAGCATTCTTTATACATAAAGATTTGCCAGAGAGCTTTACATATACAAAACAAAACATTATTCAATCATACAAACTTGTTTTAACTCATAAAAAAGCTATGAAAGCTATGTTGGTTCTTGCTATTAGTTTTGGAGCTTTTTTTATTATTATTGCAAAAACATCTTATATTTATATTGAATACTTTGGCATAAGAACAGACTATTTTCCACTCTTTTTTGGTATAAATTTTATTATTTTAATAGCTATGATAAAAGTAAATGTAAATCTTCTTAAAAATCACAAAGCTATTGATATTACCAAAACTGCTATTTTAGTTCAATTTTTTATTGGTTTAATATTTTTATTAATTCATAAAGATATGACTCTAATTTATACTATTATCATAATAGCTTCATATATGAGTATGATGGCATTTATTTTTGGAAATTGTATGTCTTTGGCTATTGAACACTTTTCAAAAAATGCTGGAGTTGCTAGTGGAGTTATTGGTGTTTTACAATTTGGTTTAGGAGCAATAATATCTTCTATTGCTCTAAATTTTGGTGATAATGGATTTTTTGTGATAGCTTTTAGTATAACCTTTTTATCACTTATAGGATTTTTGATTATAAGAAGTTATAAATAGTTGTTTTTCAACTATTTATTCTAAAGTTAATCCACTCTTTTTTAGAGATTTTACTAAATTCTCACTATTTTTTGTAGGAACATCTAATATTATAATATTTGATTTATGTGTAATTTTTAGTTTTGTTGCACTACTATTTTTCATCTCTTTTATTAGATTTACTAACTCTTCTTTACTTAGCTCTTTTTTTAAACTCCTTAACCCTATAAAAGAGTAACCATCATTTGTGCTTTTATTTATTCCCATTCTAGGTTTTTTAGGGCTATTTAATATTTCTAATTTCTTATTATTTTCTAGTTTTATATCTAGATTTGAACTTAAAATATCACAAAAACTCTCAAGTGTAAACTCATCTAAAAACTCTCTAAAATTACTATTTTTTTCTCTATTTCCAAAATCTCTATATACACTAGCTATTATTCTTGCTGTTTTTATTATTTGTGAACTAGTTAATTGTGCTACAACATTATCTAAAATTTTCAAATCAAAAACTATCTTTTCTCTGCTATTTTTAAAAGCATTAAAACTAATATCAGGAGTAAATCCAGCATCACAACCCTCACGGTAACCACTTATTGCAAACTGTAAAGAGTTAGGTAAATTAAAAAAGTTTTTATTCTCAACAAAACTATCATTTAATTTCTTAGCTAACTCTTCTACATCAAAAATCTGTGTAGTATCAAGCCCATTTACAGGACAAGTTAATACCTTTTTTATACTATGGCTAGACTCATAAAAGCTTTTTAAACCAACACTATTTAGGATATTGAAAACTTCTGGAATATCACTTAATTTTAAACTATCAATCTCTAATTTCTGACCATCTTTGAAAGAGAACTTTTGTAGAGAAAAGATATCTAAAATATTTAAAATAGACTCTAATTGAGCCAAATTCAACTCTCCTAAATTTAGAGGTATTTTAAGGGAAAAAAAGTTTTGCTCTTCATCTTGTGCATAAATCCCATGCCACTTAAATCTCTCCAAATCATTTTGGGATATTTTTTCTCCAAAAACTGCATAATAAAACAGTGAAGATAAAATATCTTCACTGTTTATATCTTTTTTTAGTTTCTCTATATTTATAATTGCGGACATTTAAACTCCTACTAAAAAATCTCTTTACACTCCCAATGTGGAAAATGTTTTCTAACAAGAGCATTAAACTCTATCTCAAAAGCACTATAAGAGCTATCTTTTTTGCTTTGATCACTAGATTTTGCTCTTATCATTCCAGCACCAACAGTATTATTTGTAACTCTATCTATAATAATAAAGCTTCCCATGGCCTTTATCTTATCATAAGAGTCATATGCAATTATTTGTTCTAAATCAAGTTTTGCTCTTGCTATTTCATTTAAGTTAAGCGAATTTGCAGAACTTTGAAGAAGTGTATTTACATCTGTTTTATAATATATCTGAGCAATTGTTCCAACTGTTGTACTTGTTGCCCTTTTTATAAAATATTGTTTTCCTTTAATAAGTGGATCTTCACTAAGCCAAACTAAATCAACATCAAAATTACTTGCTTCATCAGCTTGTTCGTCACTTTTAACAATTACATCTCCACGACTAATATCTATCTCATCTTCAAGTGTTAAAGTAATAGCTTGTTGTGCATAAGCATACTCTAAATTCCCATCATAAGTCACAATCTCTTTTACTTTTGAACTTTTTTTAGAAGGAAGTACAGTAATCTCATCTCCAACTTTTATTATCCCACTTGCAACTGTTCCACAAAAACCTCTAAAATCAAGATTTGGTCTATTTACATATTGTACTGGGAATCTAAAATGAGTTAAATCTCTATCGCTATCAATCTCTACATCTTCTAAATGTTCTATCAAAGTTTTACCTTTATACCAAGAAGATTTAGAACTTCTTTCAACTACATTATCACCATTTAAAGCAGATAGTGGAATAAGTGTAATATTTTGTGTAAGACCTAACTCTTTTGCAAATTTCAGATAATCCTCTTTTATCTTATTAAAAATATCTTCTCTAAAATCCATTAAGTCCATTTTATTAACTGCTACAACAATATGATTTATTCCTAAAAGTTTGTTAATAAAAGAGTGCCTTTTTGTCTGAGTTTGTACTCCATATCTTGCATCTATTAGGATAATTGCTAGGTTTGCTGTACTAGCACCAGTTGCCATATTTCTAGTATATTGTTCATGTCCAGGAGTATCAGCAATAATAAACTTTCTTTTTGGAGTTGTAAAATATCTATATGCAACATCTATTGTAATACCTTGTTCTCTCTCGCTTTGAAGACCATCAACCAATAAAGAGAGATCAAATTCACCATCTGTTGTATTGTTTTTTTTACTATCTTTTTTTATCGTTGCAAGTTGGTCTTCAAAAATCCCTTTGCTATCATGTAATAATCTTCCAATTAGAGTAGATTTTCCATCATCAACATTTCCGCAAGTGATAAATCTAAGAAGTTGTTTATCTTCATGCTCTTTTAAATAAGCTTTTATATCATCGATTTTTTCTATATTTGCCATCTTAAAAATATCCTTCAATTTTTTTCTTCTCCATAGACCCAGCACTATCACTATCTATTACTCTTCCTTGTCTCTCACTTGTTTTACTTAAAAGCATCTCTTTTATAATCTCTTCAAGTGTTGAGGCAGTTGAATTTACTGCTCCTGTTAATGGATAACATCCAAGAGTTCTAAATCTAACCATCTCTTCTTTTATTTCATCATCTTTTCCTATTGGCATTCTTTCATCATCAACCATAATTTTTACACCATCTTTTTCAACAACTGGTCTTTTTGCTGCAAAATAAAGTGGCACTATTGGAATTTGCTCAAGATAGATATATTGCCAAATATCAAGTTCTGTCCAGTTTGAAAGTGGAAAAACTCTAATACTCTCATCTTTATGAACTCTTGAGTTATAAATATTCCAAAGTTCAGGTCTTTGATTTTTTGGATCCCATCTATGGTTTTTATCTCTAAAAGAGTATATTCTCTCTTTTGCCCTACTTTTCTCTTCATCTCTTCTAGCACCACCAAAAACAGCATCAAACTTATATTTATTTAATGCTTGTTTTAAGCCTTGAGTTTTCATAATATCTGTATGTACAGCTGATCCATGAGTAAAAGGGTTAATATCCATAGCAATTCCTTCAGGATTTGTATGAACTAATAGTTCAAACCCCTCCTCTTTTGCTCTTTTATCTCTAAAAGCTATCATCTCTTTAAATTTCCATAAAGTATCCACATGTAAAAGTGGAAATGGTAATTTTGCAGGTGCAAAAGCTTTTAGAGCTAAATGCAACATAACAGCTGAATCTTTTCCAACACTAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP031367|1873788:1880811|1874315_1875467_+|AXK49747.1|DBSCAN-SWA MRKSINHIYLIILLSILSSVAPMGVDTYLPSIPEIAKFFNVDIHKIELSLSIFLIGFAVGQIFGGPISDRYGRRFGSILGLSGFALFSFLIIFSSNIYELWFYRFIEAFFGGITVVNATAAVRDRFSGQEAAKVFSLIGMVRSLAPLLAPVFGAAIIHFFPWEGVFVFLTIYALVVAFFIHKDLPESFTYTKQNIIQSYKLVLTHKKAMKAMLVLAISFGAFFIIIAKTSYIYIEYFGIRTDYFPLFFGINFIILIAMIKVNVNLLKNHKAIDITKTAILVQFFIGLIFLLIHKDMTLIYTIIIIASYMSMMAFIFGNCMSLAIEHFSKNAGVASGVIGVLQFGLGAIISSIALNFGDNGFFVIAFSITFLSLIGFLIIRSYK >CP031367|1873788:1880811|1878906_1879608_-|AXK49751.1|DBSCAN-SWA MSLEIVESIKEKISSLNTSDLIKYIINNYKNVALSSSLGAEDQVLTDMIFKVDKNSRVFTLDTGRLHSETYKVMDATNLKYDVKIEVFFPKSEDVEKLYLTQGVNGHFESIGNRKNCCNIRKIEPLKRALENVDIWITGLRASQGITRETMPLIEWDENFKVIKLNPLINWSEKEVWEYIKANSVPYNKLHDSGYPSIGCEPCTRAIKEGEDIRAGRWWWENPEHKECGLHKK >CP031367|1873788:1880811|1877978_1878890_-|AXK49750.1|DBSCAN-SWA MLDTKQLTHLKQLEAESIHIIREVVAEFDNPVMMYSVGKDSAVMLHLALKAFAPAKLPFPLLHVDTLWKFKEMIAFRDKRAKEEGFELLVHTNPEGIAMDINPFTHGSAVHTDIMKTQGLKQALNKYKFDAVFGGARRDEEKSRAKERIYSFRDKNHRWDPKNQRPELWNIYNSRVHKDESIRVFPLSNWTELDIWQYIYLEQIPIVPLYFAAKRPVVEKDGVKIMVDDERMPIGKDDEIKEEMVRFRTLGCYPLTGAVNSTASTLEEIIKEMLLSKTSERQGRVIDSDSAGSMEKKKIEGYF >CP031367|1873788:1880811|1876573_1877995_-|AXK49749.1|DBSCAN-SWA MKDIFKMANIEKIDDIKAYLKEHEDKQLLRFITCGNVDDGKSTLIGRLLHDSKGIFEDQLATIKKDSKKNNTTDGEFDLSLLVDGLQSEREQGITIDVAYRYFTTPKRKFIIADTPGHEQYTRNMATGASTANLAIILIDARYGVQTQTKRHSFINKLLGINHIVVAVNKMDLMDFREDIFNKIKEDYLKFAKELGLTQNITLIPLSALNGDNVVERSSKSSWYKGKTLIEHLEDVEIDSDRDLTHFRFPVQYVNRPNLDFRGFCGTVASGIIKVGDEITVLPSKKSSKVKEIVTYDGNLEYAYAQQAITLTLEDEIDISRGDVIVKSDEQADEASNFDVDLVWLSEDPLIKGKQYFIKRATSTTVGTIAQIYYKTDVNTLLQSSANSLNLNEIARAKLDLEQIIAYDSYDKIKAMGSFIIIDRVTNNTVGAGMIRAKSSDQSKKDSSYSAFEIEFNALVRKHFPHWECKEIF >CP031367|1873788:1880811|1873788_1874226_+|AXK49746.1|DBSCAN-SWA MSNVIKQLNQIQADAHALYIKLHNYHWNVKGMDFHPVHTYTEGVYNEMGVLYDDTAERAIILGGVALLTIDDLVKTTKIKTETASSFKSKEIVEKITSDFTYLLAEFKKLSKLASECDDRGTEAFADDHVAKLEKNLWMLNSMLK >CP031367|1873788:1880811|1879878_1880811_-|AXK49753.1|DBSCAN-SWA MKFANNITELVGNTPLVKLQDASNISGAIVLGKCEFMNPSSSVKDRIGVNMIKEALKNGEINTNSTIIEPTSGNTGIALASVSAALGLKLILVMPSSMSVERRRLLQALGAKLVLTPAEKGMKGAIEKANEIRNETPNSIILQQFQNASNPAIHRETTAQEILKDTDGKVDIFIAGVGTGGTLTGVGEILKAHNPNIKIIAVEPEASPVLSGGNPGPHKIQGIGAGFVPDVLNTKVYDEVIKIGNDDAIESSRELAKTEGLLVGVSSGSNALAAKIVASRPENKGKTIVTILCDTGERYLSSGLYDYTEE >CP031367|1873788:1880811|1875482_1876562_-|AXK49748.1|DBSCAN-SWA MSAIINIEKLKKDINSEDILSSLFYYAVFGEKISQNDLERFKWHGIYAQDEEQNFFSLKIPLNLGELNLAQLESILNILDIFSLQKFSFKDGQKLEIDSLKLSDIPEVFNILNSVGLKSFYESSHSIKKVLTCPVNGLDTTQIFDVEELAKKLNDSFVENKNFFNLPNSLQFAISGYREGCDAGFTPDISFNAFKNSREKIVFDLKILDNVVAQLTSSQIIKTARIIASVYRDFGNREKNSNFREFLDEFTLESFCDILSSNLDIKLENNKKLEILNSPKKPRMGINKSTNDGYSFIGLRSLKKELSKEELVNLIKEMKNSSATKLKITHKSNIIILDVPTKNSENLVKSLKKSGLTLE >CP031367|1873788:1880811|1879616_1879847_-|AXK49752.1|DBSCAN-SWA MHEKPYRSVAKAISWRTVGTLDTIIVSYFITGNLVMAASIGTIEVITKMVLYYFHERAWNRIKFGTVKPTENDYQI |
8 | Clostridium_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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