Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP033524 | Acinetobacter pittii strain 2012N08-034 plasmid p2012N08-034-4, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP033523 | Acinetobacter pittii strain 2012N08-034 plasmid p2012N08-034-3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP033521 | Acinetobacter pittii strain 2012N08-034 plasmid p2012N08-034-1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP033520 | Acinetobacter pittii strain 2012N08-034 chromosome, complete genome | 2 crisprs | WYL,csa3,DEDDh | 1 | 0 | 1 | 0 |
CP033522 | Acinetobacter pittii strain 2012N08-034 plasmid p2012N08-034-2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP033520_1 | 435558-435782 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP033520_1
|
3 spacers
spacers of CP033520_1
>1.1|435582|60|CP033520|CRISPRCasFinder GGCGGTTTTGGCGGTGGTCGTCGTTTTGAAGGCGAAAGCAACTTCAAACGCCGTGAAGGT >1.2|435666|36|CP033520|CRISPRCasFinder AGCTTTGATGACAAACCACGTGGTGAACGTCCATTC >1.3|435726|33|CP033520|CRISPRCasFinder GAGTTCAATTCAGATCGCCCACGTCGTGAAGGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP033520_1
The CRISPR arrays of CP033520_1 >merge|CP033520|1|435558-435782|CRISPRCasFinder GGTGGTCGTGATGGTCGTCGTGGTGGCGGTTTTGGCGGTGGTCGTCGTTTTGAAGGCGAAAGCAACTTCAAACGCCGTGAAGGTGGTCGTGATGACCGTCCACGTCGTAGCTTTGATGACAAACCACGTGGTGAACGTCCATTCGGTGGTGAAGATCGTCCACGTCGCGAGTTCAATTCAGATCGCCCACGTCGTGAAGGTGGTTTTGAAGATCGTCCACGTCGT >CP033520|1|1|435558-435782|CRISPRCasFinder GGTGGTCGTGATGGTCGTCGTGGT GGCGGTTTTGGCGGTGGTCGTCGTTTTGAAGGCGAAAGCAACTTCAAACGCCGTGAAGGT GGTCGTGATGACCGTCCACGTCGT AGCTTTGATGACAAACCACGTGGTGAACGTCCATTC GGTGGTGAAGATCGTCCACGTCGC GAGTTCAATTCAGATCGCCCACGTCGTGAAGGT GGTTTTGAAGATCGTCCACGTCGT
>CP033520.1|AZB90010.1|428119_428908_-|shikimate-dehydrogenase MTKQFAVIGNPIEQSRSPELHLAFAQKTGVDLDYQKRLAPLDGFEPSMRSFFENGGSGMNVTVPFKEQAFALCDVLTERAQIAKAVNTLWMENGKLHGDNTDGQGLVAAIQALEWKLENTTILILGAGGATRGVIYPLVQAGAKKIVIANRTLARAEQLVDDLKAAVPQAQLQAVSLNELEGKFDIVINATSASLSGDALQLPENLEFKYAYEMAYGKPSSFLDQAKQRNVPYAEGFGMLVGQAIEAFYIWNGVKPELKDFL >CP033520.1|AZB90009.1|422933_423581_+|hypothetical-protein MSLKWFRFLVKHVVVVAALCMTLSACDINHTNSKDHSTTSSSSNHEENLIKSSTSIKTLDYVAGRTFLPEDTSDQTQKLNAVSLQYVGRYHTRISCEDAFADCESGEAEYILNLLPNGSAYWNVVHFGRVGSKDGAKSAAVNQLCPTLNWKVDEKERELIIQCPLSKVNFYFNIDSNKRLVTNLEKLLYSDYGKNREFLEQNYFVPNQAYVLTKE >CP033520.1|AZB90008.1|421264_422365_+|HPP-family-protein MSVIQREWLQILKPNFKVLPLKERLLCGIGALCGLAISSLISWYVLGGINAWYIAPMGASSVLLFAVPTSPLAQPWNVIVGNTLAGIIGVACAQWIPDLTTAFSVAVGFAIFLMMTTDSLHPPSGAVAITAVLGGAAIHKLGFYFIFYPVLLNSLLLLGFAVFFNRLIGRHYPVTAHLNERSKDPTPTQKVSIQPKDIEYALGHHTELLDISQYDLEKIILEAQEHANERMVNQYICQDIMSRDVIKLHEDDDIHQALDKFKQVNLMSLPVVNAENHLVGTLALYEVVEWFKGAADPRNSWQHYVKQIMSRRVVTVLPTQPIQDLVPYFVEKSFNYIPVVEDRKLIGMISRADMIAALQQQLNRKL >CP033520.1|AZB90007.1|420334_421132_+|DNA-metabolism-protein MFNDEVAYYFDGSMVGLLSCVFRAFQFKELQVRLCLNDTAQHGLFADKIEVSNNEQHAERVWSALQKKLSSSSLKQFYFAYLSESLDAYQHLFNYCIYVFTSHVSVEKDYSNLSVLAIAQWTKKVGREKHRMEAFIRFKKTKDELFLSLVRPDFNVLPLIQPHFKRRYQDQRWLIYDEKRKFGLYYDLQEIHEVSLEAPEVDRNLKNGMSQSFQLELDEQEVLYDQLWKDYFNSVNITERQNIKLHVQYLPKRYWRYLNEKLMEY >CP033520.1|AZB90006.1|418089_418515_-|hypothetical-protein MLQYSKKMIIRALALAPIPLLSISALGIIIFNAEFSLYSVAVIFLAHFLFYLLFYGLLVIPFAYITSYFLARKNRLNLMSIFICATVIWILISPITRLIFVGSFPSPWWHIYKIYSFYLMILFTSFCYWLGLKWLSQKQIG >CP033520.1|AZB90005.1|416410_417388_-|glycine--tRNA-ligase-subunit-alpha MSRAISHIDTFQGLILALQNYWAEQGCVVLQPYDMEMGAGTFHTATFLRALGPETWNAAYVQPSRRPKDGRYGENPNRLQHYYQFQVVLKPNPDNIQQLYLDSLKAIGIDTLTHDIRFVEDNWESPTLGAWGLGWEVWLNGMEVTQFTYFQQVGGVECYPVTGEITYGLERLAMYLQGVDSVYDLVWTKGQFGTVTYGDVFHQNEVEQSTYNFEYAPVEKLFELFDFYESEANRLIEAKLSLPAYEQVVKASHTFNLLDARGAISVTERQRYILRVRTLARAIAQSYVQARAELGFPMAEPHLRDEVLAQLKAQAESEAAKAEKN >CP033520.1|AZB90004.1|413781_414255_-|hypothetical-protein MNTSPIKNFYRIDAYLVLCHTLLLVIGYGLWKVYPHIKTKPDMSGLFFMIISILGGFAGLIMLAITLPRLDRSVRNLSMNKFILALLYWVSSTIIFVLFGISKFFFNNPLVLLVFVLVFFSSIYLSVIRLADMRKKDWLILSGIFGAIVLFFFLPKL >CP033520.1|AZB90003.1|411332_412199_-|LysR-family-transcriptional-regulator MDIAQLKMFQTVVECGTMAKASMQLHCVPSNITTRIKQLEEELGAPLFYREGKSLKLTPSGEIFLDYCHKILALCDEAKRSIHPDAPPSGPLKIGAIESSATTRLPNLLAKYHQRFPEVSIQIITGTWKQLLVDISQHKLDGAIVAGNIDFPMLNKLGIYQEDMVLIASHSLGEIHCQEDLIGKEIFMWTEGCPYRAALEEWLKLKNISLPITSITSYATIIGCVSAGSGVSLVPKSLFEQYKNLTNIRGYKFEHLAFMQNQFFWHKNVSNHKARDMFIELIKSEFIV >CP033520.1|AZB90002.1|410386_411097_-|aspartate/glutamate-racemase-family-protein MNKAIGILGGMGPQATIDAMNKIIKNTPAHCDQEHIPVVTVSIPDIPDRTQSIINHDDKPLEKMAEYLKILEAAQVGCIIIPCNTAHFWFNQLQKRTQTKMISIIESAVHFIQDSQIDEVCILATSATINTELYQSQFIENSIGFSTPSAEMQNKVMQSIYQYKAGNIQQAREMLNEVINFYTNKRNIKFLLACTEIPLILEESIEAYPQLFIDTTDILIKNAIAWYQNSPIAKVA >CP033520.1|AZB90001.1|408858_409278_-|hypothetical-protein MKTLQVLCVASSILASSTLFAETTQPQQVVETTPKTQPYGDNPSLGRVLLYKTGKGIQNLGNSIQGASEKTSNKISEKWQNTKEFTTEKAEVVQQKADTAKVFTEQKIEQAKQNITSSRNGENIPIEQGELSKSSTTAN >CP033520.1|AZB90011.1|436308_436518_+|hypothetical-protein MSKSKRKETIMAQLKNLLVQHGLPYLFIALVLCNGVYFAYAFITGSSIEQFQISELTSFYEHTSSISTN >CP033520.1|AZB90012.1|436608_437427_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNNKTPLSTQPLIEVKNLSFNRGERVIYDNISLNIRRGQITAIMGPSGTGKTTLLRLIGGQLVPDQGEVLLDGKDIAKMSRQELFSARARMGMLFQSGALFTDMSVYENVAFPIRAHTKLPENLIAELVALKLESVGLRGSEQLMPTELSGGMNRRVALARAIALDPDLIMYDEPFAGQDPIVKGVLTRLIRSLREALDLTTIIVSHDVPETLSIADYIYVVAEGKIQGEGTPEELQAYASPFVRQFLTGSAEGPVEYQFSHQAYLDNEVRP >CP033520.1|AZB90013.1|437423_438200_+|lipid-asymmetry-maintenance-ABC-transporter-permease-subunit-MlaE MNTIAWLGRLVIERIRGIGVAALMLLQIVFSFPSSGGFGRFIYQMHRVGVMSLLIITVSGLFIGLVLGLQGYSILVNVGSESMLGTMVSLTLLRELAPVVAALLFAGRAGSALTAEIGSMKQSEQLASMEMIGVDPLKQIVSPRLWAGVVSLPMLTVIFAAIGIVGGKMVGVDFLGVDEGSFWSGMQNNVQFGHDVVNGIIKSIVFALLCTWIAVYQGYACDPTPEGIATAMTRTVVYSSLCVLGFDFVLTAVMFGGI >CP033520.1|AZB91547.1|438954_439557_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MIAGTAFAAPSEAPPDFIKRVADGLIARLKADHAKLQNNPALVKSIVRQNLDPYVDSQAFTRIVMGTYATNQYSTAAQRAQFETNFRNTLIENYGSAFAKYTNQSYTMRPYKATAGKNPVVTLDFNHNGEKIPVSFQLADKGTQWKIRNINVSGIDLGLQFRNQFAATVKRNGGDLNKAIATFQPDADAAVNQNKKEISR >CP033520.1|AZB90014.1|439560_439848_+|anti-sigma-factor-antagonist MVQYLNQQLVVSGKIDFENAEQQYQAGLAIIKKQQSFPLVVDLTELEHGSTLALAVLVQWLRETPKNTGLHFKNVPEKMLKIIQACHLQDDLQMI >CP033520.1|AZB91548.1|445680_446664_+|RND-transporter MKKICLALILSITAVASWAEDQVWCAYDPIGSQGDITRRLNDIRLYAQQYQVKFKVVTYQKEQQAIQAFDDGKCSGLAASNFNTYRYNQFMGSTAGIGLIPNNRTTKSFLQLLNHPTIEKRLISKNYEAIGMIPIGTAYMVLKNKNLSRVAQLRNQRIGVLPNNPPQQALVRSVGAQPVYVDLSNAIAQFKQNKIDIIAAPVYGLLPYNLQKEFGPDTQVINFPLAYFGVNLIIKPQAYPANFGRKIRGWFVQNSQLLTNRATQWENHLPAYYWVDVSFYEKQSYDVMVAKIRNQYVLSGYYDAYFVQLMKRLRCMDDPRYFECPIH >CP033520.1|AZB90015.1|446616_449283_-|glycerol-3-phosphate-1-O-acyltransferase-PlsB MSKSGFGQMYRRLSSKLLDLVVTPHVLGEVPTEPVSETTETEAKTDRQKVVCYVLQNHSRSNALVVDGETRRLNLKPALDPLIVATHQEKASVLFLQHNDENNLLNPPPHAFPPRLIKLIEVLQENPELDIELVPVTVLWGRSPDKEDSWFKLLFSDTWATPSTVKQLVNIGLHGRQSYLEFHEPQSLRELVDYAQQHYPNLSPATYIVSTLNDYLDRQREVVLGPDLSDRRNVMQSVVKSRDVQEAIRRESIRGKVSMLEAERRAIGYVNEIVSDYSHSAVRFADLALTRLWTQLYDGVEVHNFSTVRELAKDYEVVYTPCHRSHIDYLLLSYVIYKRGLMVPYIAAGDNLNLPFVGQLLRGGGAFFIRRSFRGNGLYTTVFKEYLYSILSRNTPLEYFIEGGRSRTGRLLPPKTGMLAMTVHSHLRGRAKPIVFLPTYIGYERLMEGSTYVGEMQGKPKEAESIFGIVKTLRKIERIFGKVHVNFGEPVFLDDLLKQHNAENVYIEKNDDPIPQAVSDAVNSSAHAILENINRAVVINPVSLLSIILLATPKHTLDEEICIKQLEAYRNLASNFPYDQRMEVTPLSGKEIIAYGLKLKLIKRVQHALGDIIAIEDNQAVLLTYFRNNILHAFVLPSLVASLVEHNGKISRSDLTNVIYTLYPFLKAELFLKWKSSELKAQVEQYADALVQSNLIQQDDEGNLISSAPNTEEHNQLVVLATPVKQSLERYYMTLALITQRGSGNISAKQVEELSHLLGQRLSVLYEFNSPEFFDKALFQSFLKVLTQQNYIRTNDQGQIEFDDNFRQMAAGAQLVLDEVTLQMLQHITTFTDEELKDALEAMASQQAKRRLKRKKLKVFSQNKRQLRLPFILLVNWTFKITWIVHTT >CP033520.1|AZB90016.1|451853_452804_-|metal-dependent-hydrolase MMKLLSFLKNKALGSSIDYKILPRKVKFDWKDTPVDWIPNQPFASYFINEINNILPAGEFWFCRLYNKVLPQIKDEKLKQDVQAFIRQEAMHANAHTSANKEYLSARNIDIQRNLDIMNYLFTTALADKPFDKEVPQFLQGQWDLFRLGVIATVEHMTCVLGKYALYNKRWEELGADPEMVDLVKWHGSEEIEHRTVAFDLYRHLGGGYIPRYYLSLAVIVLVLGLWVDGAAHIMKQDPRFADAAKSRFFPVWVAVEWYKISRKDNQVLPNPIWLIAQQIDYLMPWYDPVKEGSTEDAVSYLSQSPAAKRAELQAA >CP033520.1|AZB90017.1|453806_454244_-|Rrf2-family-transcriptional-regulator MQLNKFTDYALRLLMYVARPSDAPYTIAEIAKDLHVSQNHLVKVVHFMGKQEWIITIRGKGGGIRLNPDALNSNLGSIVRILQGDNQIVECNTPPCVLRSHCGLKGILDQALESFYQSLDQYTLGEVLQQSKSAPANSPIAFLQI >CP033520.1|AZB90018.1|454331_455096_-|flavohemoprotein MTPQQIELVKSTVPVLREHGVTLTTYFYKRMLNNNPELKNVFNLDDQTSLRQPRALAAAVLAYAENIENPTVLAKAVERITTKHVSLDIQPDQYAIVGDNLLHSISEVLNVPFESELIEAWKQAYLQLADILIGVEKQKYEQLESLKGGWAGWRSFEITQIDPLESGKRFTLKATDHEDVLTSPANAFISVKVQVPEQQLEQPKAFKFTEAQEDNSYHFEVQPEENHTEFSVANILLEHYRVGDQVQVSAPLTL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP033520_2 | 1897491-1897591 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP033520_2
|
1 spacers
spacers of CP033520_2
>2.1|1897514|55|CP033520|CRISPRCasFinder TTCCACTCGAACATAGTTCTCGTCTTCTTGCGAAGCTTTAACCGCATCTCAGGGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP033520_2
The CRISPR arrays of CP033520_2 >merge|CP033520|2|1897491-1897591|CRISPRCasFinder AAAGCGTTGCTTTACTTATCCTCTTCCACTCGAACATAGTTCTCGTCTTCTTGCGAAGCTTTAACCGCATCTCAGGGTAAAGCGTTGCTTTACTTATCCTC >CP033520|2|2|1897491-1897591|CRISPRCasFinder AAAGCGTTGCTTTACTTATCCTC TTCCACTCGAACATAGTTCTCGTCTTCTTGCGAAGCTTTAACCGCATCTCAGGGT AAAGCGTTGCTTTACTTATCCTC
>CP033520.1|AZB90632.1|1896598_1897390_-|sulfite-exporter-TauE/SafE-family-protein MLLLVVEGIVIGFLLGLTGAGGGILAVPALMTSQGWSVAQAAPIGLLAVALSTLIGTIEGLFKKIVRYRAAIWIALIGAPMAHIGILIANTISPIWLMLMFSLVMFTVGYRLISNRVSDFHNPPCQVNPSTGRFIWNFKTGGVLAGIGIIAGLLTGMLGVGGGFVIVPALRKVTNLDMHSIVATSLMIIFLISGMSIVMHIAEGFHYPAGITSAFALACAVGMLLGRRAIRFIPSAIVQKVFALMVFAVAIYMVIKIVNLTNI >CP033520.1|AZB90631.1|1894535_1895471_+|DMT-family-transporter MNILLYVAVVLIWGTTWIGIAVQSHYATPVVAILWRFAISALLLWVVLLFSGKLQRIALKDHLFCMLQGLCVFGLNFICFYTAVKYVNSGLESVIFSMAVFFNAINALIFFKQKPSPNFAPAAILGLIGIVLLFWHDLINSQFNTQLLMGIGLCAIGTYGFSLGNMISVRHQKRGLNIFSTNCYAMTYGALVMLSLALFTGQDLMPPMNFPFLSSVLYLAVFGTVIGFSAYFSLVGRIGAAKAAYSTLLFPLVALTVSTFFEGYIWTLNAVFGILLILLGNYLMFSKLEIGKKLFNSQKVVRSRHKSLLFL >CP033520.1|AZB90630.1|1892148_1893495_+|chromate-efflux-transporter MENEKSPLPESIIQVTFWQAFLFWLKLGFISFGGPAGQIAVMHQELVEQKRWISEKRFLHALNYCMLLPGPEAQQLATYIGWLMHRTAGGLVAGILFVLPSLFILIGLSWVYIKFGDVPVIAGIFYGIKPAVTAIVFHATYRIGSRSLKNKFLWIVAIAAFFAIFVLKLPFPLIVLSAGIAGYLASKKYPELFSSAAGHKASQKDYGPAFIDDETPTPEHAKFHWLRLAKLIFVAIALWLLPILALGAYFGWHHSYTQMAWFFTKAALLTFGGAYAVLPYVYQGAVNHFGWLSPTQMIDGLALGETTPGPLIMVVAFVGFLGGVNHSLLGSEHLFFAGALGAVIVTWFTFLFSFVFIFAGAPIIESTHNEIKFTAPLTAITAAVVGVILNLALFFSYHVLWPQGFSGHFDVIAALITVAAFIALFRFNVNVLYVIFASALVGLGVYLL >CP033520.1|AZB90629.1|1887953_1890161_-|TonB-dependent-siderophore-receptor MHGMAGSYSMERRSLNLHFMTCSKTALASSIVLITSVVYANEAEVSQLPTITVNATQNHDALYTSKKVNLSGFQTGDVKKVPASITTITSERIADQHAKTLTDVIKNDSSLGDGYAAIGYYPNFVARGFALDLGSSYLINGHNIRGEQNVALENKEQVEILKGISAIQSGMSTPGGVVNYVTKRPADVKNITVDANSEGGYTLATDVGGFVNDSFGYRINLAHESIHPNVDHANGKREFGSVALDWKINDRSKLLFDIEAQHQSQRSVPGYQLLDGQEVPTNVDQDRLLGYQSWSKPVVNNSVNASLKYQYAFNDQWNASLSASQSRVVIDDYSAFPWACYSDGVCQNNTFDKDGNYGIYDFRSPDDTRITNQFSAGLNGQFSTGIIQHQIAFEIQHTYKTLKRYNSNSMELDPIGLGNIYEETKDYEPAQIDLRNYYKALESDQTAFTISDRVQFNDQWSTLLGGKLIHLDEQAYNSDGQQSRDTDLNKFLPQLALMYSPTATTNLYASYAKGLSDGGEAPWYAEANAYQVLSPRNSEQYELGVKKQIRNFLLTAAIFDLKQDNQYTTTNSEGKLEFVEQGEQHNQGIELGLTGALTDTVDVSSGITYTKSRLVDIESDSYKGHQTQNVPKVRATAQLSYKVPSVEGLRLLSGMQYSSSKYANKEGTAKVGGYSVFNIGAAYKTSFAGHDTTFRFNIDNLFNKKYWRDVGAFMGDDYLFLGNPRTAQFSTTFSF >CP033520.1|AZB90628.1|1886476_1887895_+|aspartate-ammonia-lyase MMNAEITTRIEKDLIGYREINNNDYYGVQTLRALENFNLTQSKVGNFPHLIKALAMVKLACAEANYNLKSLDQTKFEAIEYSCNQLIRGNFHDQFPIDMMQGGAGTSTNMNANEVLANVALEYMGHAKGQYQYLHPNNDINMSQSTNDVYPTAIRLGLLLSLDELNLPFNNLILSFRNKSQEFAHILKMGRTQLQDAVPMTLGQEFGAFAVTLQKDLEQINTLIPNVLAYMNLGGTAIGTGITTEYSYRELAIQALAKISGKKIKSAPDLIEATSDMGDFVLLSGLLKRTATKLSKIANDLRLLSSGPRTGINEINLEARQPGSSIMPGKVNPVIPEAMNLACFQIIANDLAVTLAAEAGQLQLNAMEPLIAFKLFESMDLLGKAMAMFQIKCIDTITANPEHCKALVENSIGIVTALNPYLGYETTTRIAKTANETGQSVLALVQNEGLLSAQVLDDILSINNMVKPKMSA >CP033520.1|AZB90627.1|1885891_1886074_-|hypothetical-protein MLKVTAALIILGSFTYYVLFHGEEKSESKTSRLLKEAEQSIASAETSVNKANSIVPISYK >CP033520.1|AZB91612.1|1885559_1885781_-|hypothetical-protein MKFIAYDPNSGEKLSLKEHIHHMDKYTTYIFFSDENDNMVFNPQKKQVFEITQYTSNMMVEISRKLYYLIGEY >CP033520.1|AZB90626.1|1882988_1883816_-|LysR-family-transcriptional-regulator MAADAIGLTQPSVSNGLNKIRQHFNDPLFIRVGNEMIPTELAKEIFPLISEVIDKVESINNFSVNFDPLTSDQLFTIAMTDVSHLVLLPQLTNYLKEKAPLIRLNIRPITPETSYQMANGEIDLAIGFLPQLEEGFYQQKFFKQHYVVISSKSHPRLDPNNFTLDDYMREYHIDIDAGIGHYHIKNELQNKGLDRNILIRLPSYLGVGLVVQETDAIATVPYYLSQVLLVRENLQILPAPLDFPTYDVKQHWHMSCHHKSSHKWFRQTCYELFKV >CP033520.1|AZB90625.1|1881769_1882942_+|thiolase-family-protein MSSIVIVSGSRTAMGGFQGSLSALTAPELGAAVIRESIQRAGIAPEQVDEVIFGCVLSAGIGQGPARQAMRKAGVPDHVGAVTINKLCGSAMKAVLMASDTLKAGSANIIVAGGMESMTNAPYILPKARGGYRMGHGEIKDHMFLDGLEDAETGRLMGSFAQDMANTKGFTREQMDNFAISSLKKAQTAITEGYFKEEIVPVEVKTRKGVEIIDQDEQPLKANLEKIPTLRPAFSKDGTITAANSSSISDGAAALVLTTEEYAQSHGLNTLAKIIATSTHSQHPSEFTIAPISAIQKVLERAGWCVDEVDAWEINEAFAMVAMAPIHELGIDEAKVNIHGGACALGHPIGATGSRIILSLIYALKRLGKKKGVAALCIGGGEATAVAIEI >CP033520.1|AZB90624.1|1879535_1880177_+|CoA-transferase-subunit-B MAWSRNEMAQRAAKELEDGFYVNLGIGLPTLVANYIPENINVWLQSENGLLGIGEFPTEETVDADLINAGKQTVTARPGAAFFSSSESFAMIRGGHVNIAILGAMEVSENGDLANWMIPGKKVKGMGGAMDLVVGVQKVVVLMEHCAKDGTPKIVKNCSLPLTGKGVVHRVITDLGVMDITPQGVELIELAKDVTLEQIQAATGVEFYKTLVA >CP033520.1|AZB90634.1|1899248_1899896_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MFGCEETREAVLIDPVASDIEIYTKELEQHQFTLIYTLDTHVHADHITAANLLRELLDCKSVLHRNSDVSCGDILITDGCMLKVGNLSIEARYTPGHTNACTSYLVENMVFTGDALLIDGCGRTDFQQGSAGTLYDSIHKQLFSLPDDTIVYPGHDYKGRFSSTIGYERLNNSRLGQNRSREDFIELMNNLNLPYPKQIDKALPANQACGSISQL >CP033520.1|AZB90635.1|1902437_1903496_-|2,3-butanediol-dehydrogenase MKAARFYDRGDIRIEDIPEPEVTPGTVGIKVAWCGICGTDLHEFMEGPIFIPPCGHPHPISGESAPITMGHEFSGVVYAVGEGVDDIEIGQHVVVEPYIVADDVPTGPGDNYHLSKNMNFIGLGGRGGGLSEKIAVKRRWVHPISNKIPLDQAALIEPLSVGHHAFVRSGAKAGDIALVGGAGPIGLLLSAILKAKGLKVIITELSAKRKEKAKESGVADYILDPSEVDVVSEVMKITNGDGIDVAFECSSVNKVLDTLVAAVKPTGVIVIVSIWSHPASINVHSVVMKELDVRGTIAYVNDHQETIKLVEEGKINLEPFITQRIQLDDLISQGFETLIHNNESAVKIIVHP >CP033520.1|AZB90636.1|1903525_1904311_-|acetoin-reductase MVKGLKNKVVLVTGAAQGIGRGIALRLAQEGAHIALVDMKQDRLNDVQQEIQALGVNASTFIADVSDREQVYSAINHAEQTFGGFDVMINNAGIAQVQAIADITPDEFQKIVDINIGGVLWGIQAAAAKFKQRQHKGKIINACSIAGHDGFALLGIYSATKFAVRALTQAAAKEYASHGITVNGYCPGIVGTDMWVEIDKRFAEITGAAIGETYKKYVEGIALGRAQTPDDVAALVAFLASEDSDYITGQSILTDGGIVYR >CP033520.1|AZB90637.1|1904337_1905741_-|dihydrolipoyl-dehydrogenase MSEAQFDLIVIGAGPGGYVAAIRAAQLGLKTAIVEEQHLGGICLNWGCIPTKALLAGAELATQFKHAGQFGFQVSQLDFDIQKLVQHSRQVSAQLVQGIDYLLKKNQVTVFNGRAQLTAKEKIAVTDAQGNSQDLSAPHIILATGAKARHVSQLPVDGTYVWSYKEALVPEQLPKSLLVVGSGAIGSEFASLYQDLGCQVTLIDLAKQILPTEDAEVAQFVRKQFEQKGMKVLTDAVVQSIQIENEQVHCVVETASDVQTLVFDRVLSAIGVQPNTTGLGLERLGVELNPQGFVAIDDYCKTNVAGLYAIGDVAGAPCLAHKASHEAMICVEKIAGVANVHSLDRSQIPGCIFTHPQVASIGLTENAAKAKNLPIRIGKFSLTANGKALAIGDASGFVKTVIHAETGELLGAHMVGHEVTEHIQGFAIAKYLEATDESLAQVIFPHPTLSEAMHESILASMQRAIHM >CP033520.1|AZB90638.1|1905751_1907290_-|diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine-deaminase 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP033520_1 | 1.3|435726|33|CP033520|CRISPRCasFinder | 435726-435758 | 33 | CP033520.1 | 435783-435815 | 2 | 0.939 |
1. spacer 1.3|435726|33|CP033520|CRISPRCasFinder matches to position: 435783-435815, mismatch: 2, identity: 0.939
gagttcaattcagatcgcccacgtcgtgaaggt CRISPR spacer gagttcaattcagatcgtccgcgtcgtgaaggt Protospacer *****************.**.************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
2560382 : 2597851
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP033520|2560382:2597851|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP033520|2560382:2597851|2590521_2590731_+|AZB90983.1|DBSCAN-SWA MSITLSGHQLKSLLEFVNPDGEKDLDQLDTELTIKFFEDGHSGKGYYFWMTEYPEEGAMKLDIESGAEG >CP033520|2560382:2597851|2583937_2584294_-|AZB90975.1|DBSCAN-SWA MSKLSVDISASARNGVSRILHGLDISNQKEIAEQLKVDPSTITRLKTDKKNNGLNEIEMFCELLSLLGLKVVPKDYQSIDKERVAALLVMSKSWMNRIETVDDLFHDEISGQKEKLGY >CP033520|2560382:2597851|2561910_2562240_-|AZB91635.1|DBSCAN-SWA MELYKYQKTYASKTPHEIEQIKFLGGRIPDPPEYSYAAESILSAFSTICRSRRYEQSIPLSLDQQAINVYAEHNDLPVAAHIFNDCIFALDNLFLDEAHKKINSKSSKK >CP033520|2560382:2597851|2589868_2590126_+|AZB90982.1|DBSCAN-SWA MKDQYKKVSQKHMLGFMYYLQLLGYVIVRQGMDQAMFLTKHYAVPVAWRRITIDYHNRLNKPAQQLYKEFVEWTKERIFEGLGND >CP033520|2560382:2597851|2567597_2567966_-|AZB90956.1|DBSCAN-SWA MGLRDEIQADIAEAFNDDLADAVHTFTCERISKTNWDPKTETYVEVKENYSGRGVLFGSYSQYEIQTLGVLATDKKATVLQNEVTMTPKIDDEWLTALGSFRVIHIQQDPASTIWKCQLRKV >CP033520|2560382:2597851|2561659_2561842_-|AZB90950.1|DBSCAN-SWA MKSLDLIKMIEADGWYEVRVSGSHHHFKHPTKKELVTIPHPKKDLPNGTVKSILKQAGLN 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44 | Acinetobacter_phage(75.68%) | terminase,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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