Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP031678 | Haemophilus influenzae strain P679-2791 chromosome, complete genome | 1 crisprs | DinG,DEDDh,cas3,WYL,RT | 1 | 0 | 5 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP031678_1 | 1140187-1140335 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP031678_1
|
1 spacers
spacers of CP031678_1
>1.1|1140236|51|CP031678|CRISPRCasFinder CGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCAATAATGCTTTTATAATGTGAAA |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP031678_1
The CRISPR arrays of CP031678_1 >merge|CP031678|1|1140187-1140335|CRISPRCasFinder TTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCGACCTTGGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCAATAATGCTTTTATAATGTGAAATTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGT >CP031678|1|1|1140187-1140335|CRISPRCasFinder TTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCGACCTTGGCAAGGT CGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCAATAATGCTTTTATAATGTGAAA TTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGT
>CP031678.1|AXP46070.1|1138989_1140057_+|undecaprenyl-phosphate-alpha-N-acetylglucosaminyl-1-phosphate-transferase MLSIFVTFLGAFLTLIVMRPLANWIGLVDKPNYRKRHQGTIPLIGGVSLFVGNLCYYLMEWDQLRLPYLYLFSIFVLLAIGILDDRFDISPFLRAGIQAILAILMIDLGNIYLDHLGQILGPFQLTLGSIGLIITVFATIAIINAFNMIDGIDGLLGGLSCVSFAAIGILMYRDGQMDMAHWSFALIVSILPYLMLNLGIPFGPKYKVFMGDAGSTLIGFTIIWILLLSTQGKGHPMNPVTALWIIAIPLIDMVAIIYRRVRKGKSPFRPDRLHVHHLMVRAGLTSRQAFLLITFVSAVCATIGILGEVYYVNEWAMFVGFFILFFLYVYSITHAWRITRWVRRMKRRAKRLKKA >CP031678.1|AXP46069.1|1136323_1138915_+|bifunctional-uridylyltransferase/uridylyl-removing-protein MLFSPTLSSPLTPSAVKIERENLKQFELENFSRYSIFELIENRCDFYDALLIQLWQEIELSEQLGIALIAVGGYGRREMFPLSDLDFLILVEQTPSPEIEEKITQFIQFLWDCGFEVGNSVRTLEQCESEGKQDITIATNLLEARFLAGNRPHFDALNELVKRADFWSKEDFFNAKVQEQIERYQRYHNTAYNLEPDIKYSPGGLRDLHLLYWVALRHSGALTLEAILQSGFIYPQEYQQLQESRAFLFKVRFALHLILKRYDNRLLFDRQIKVSELLGFRGEGNPAVEKMMKCFFQALHRISLISNLLIQHYRENVLPSNQDTVIDQLDDDFQLINQCLCLRNSFVFQEKPARILDLFFYLTQYEHANIHSDTLRQLQISLDQLSQKLCEIPAAREKFLRLFNQPNAIKRAFMPMHQYGVLTAYLPQWQAIEGLMQFDLFHIYTVDEHTLRVMLKLESFLSQESAQEHPIAHRIFSQLSDRTLLYIAALFHDIAKGRGGDHAELGAVDIADFAQLHGLDRREIDTLAWLVKSHLLMSITAQRRDIHDPEVVMNFAEAVQNQVRLDYLTCLTVADICATNGNLWNSWKRSLFASLYEFTGRQFSQGMKELLDYSEKSAENRKLAQQILMRDYSDITPISIEQLWARCPEDYFVRNTPKQIAWHTSLLVDFVEALLVKISNRFSLGGTEVFIYCQDQPHLFNKVVSTIGAKKFSIHDAQIITTQDGYVFDSFIITELNGELVEFDRRRELEQALTLALQSEKLPALSIVPNRQLQHFTVQTDVRFLQENKKEHTQMELVALDKAGLLAQVSQIFTELNLNLLNAKITTVGEKAEDFFILTNQFGQALDSQQREILRNVLYRNIG >CP031678.1|AXP46068.1|1135423_1136230_+|type-I-methionyl-aminopeptidase MAIPIRTEKEIVKLREACKLASDVLVMIEPYVKAGVTTGELDRICHEYMVNEQKVIPACLNYHGFPKATCISINEVVCHGIPSDDKVLKNGDIVNIDVTVIKDGYFGDNSKMYIVGGETNIRSKKLVEAAQEALYVGICTVKPDIRLNEIGKAVQKYTESQTFSVVREYCGHGVGTEFHCEPQVLHYYADDGGVILKPGMVFTIEPMINAGKKEVRVMGDGWTVKTKDRSHSAQYEHQLVVTETGCEVMTIRDEEIAEGRISRIMVNV >CP031678.1|AXP46067.1|1134943_1135288_-|iron-sulfur-cluster-insertion-protein-ErpA MIDDMAVPLTFTDAAANKVKSLISEEENTNLKLRVYITGGGCSGFQYGFTFDEKVNDGDLTIEKSGVQLVIDPMSLQYLIGGTVDYTEGLEGSRFTVNNPNATSTCGCGSSFSI >CP031678.1|AXP46066.1|1134588_1134942_-|UPF0231-family-protein MDFQFTHYQGNVSVKCSMEHIALANWFNTEVRSNSDKILTALSTAKSLIENQEKVLVGAEYTLFLNADEVMVRANNLAIESDEILEQDFHYYDEESLAFCGTQDFIHFLQSYVDFIA >CP031678.1|AXP46065.1|1132236_1134582_-|penicillin-binding-protein-1B MTSQHSAKKSSKNTPKNNRTFKGFLLKFSFTALVLTIFYGGYLDWQIRSKMDGQIWHLPAEVYSRLESVKIADNLAFDEVIQILLDNEYRQTTMVAAPGDFKLEDDSIVILRRAFPFPDKAEPQRVLRLRFSHNKLSRIEDLVTVKTVDEFRLSPKLIAMLQSDNEDRLAIPLQNYPRLLIDTLILTEDRRFYEHNGINPVGILRALIANIRAGQTVQGGSTLTQQLVKNLFLSRERTITRKANEALMSLVLDWRYDKNRILETYLNEIYLGQNGDTQIHGFELASQFYFGRSIREISLDQIALLVGMVKGPSLYNPWRNPQNALERRNIVLRLMLEHKMIGDELYQLLSQRPLGVQKKGQISRKYPAFIQTLQADLRRELGEHKISSLLGARIFSTMDLKQQAQAENAVVNTVSQLQLKMKNPHLEGAMIITDYRTGEIRAVVGGLQTQYAGFNRALMAKRQIGSLVKPSIYLTALSNPEQFRLNTPINNQPITINVKGSPPWQPRNYDKKYSDSVMLMDALARSLNIPTVNIGMKVGLSKVIDTQKAMGWDNVEIPKVPAMLLGSYSISPYDVTKLYQTLANQGGRIALTTVDSIADRQGNLIFQHDKSAKQVVPQEAAFQTLFAMQQTVERGTARSLQKDYADLHLAGKTGTTNESRDTWFVGIDGKNISTVWLGRDDNGETKLTGASGALQIYKDYLNRTNIEKLTITPPTTVKWVGINQYGDWDCESYRTIPVWLNNGQNFCGETSSPSLTPTTETETPPQESLWDVLDNPNPPAQ >CP031678.1|AXP46064.1|1131192_1132065_-|phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide-synthase MTQQLPILSLKKIYSGKVRDLYEIDDKRMLMVASDRLSAFDVILDDPIPRKGEILTQISNFWFNKLAHIMPNHFTGESVYDVLPKEEADLIRDRAVVCKRLNPIKIESIVRGYLTGSGLKDYKQTGTICGLKLPEGLVEASKLPEAIFTPSSKEEVGNHDINISYAECEKLIGADLAAQVKEKAIALYTVAAEYALTKGIIICDTKFEFGLDENGTLTLMDEVLTPDSSRFWSVDTYQAGTNPPSFDKQFVRDWLENSGWNKQAPAPKVPENIIQKTVDKYQEVLDLLTK >CP031678.1|AXP46063.1|1129702_1131037_-|argininosuccinate-synthase MSNTILQNLPKGQKVGIAFSGGLDTSAALLWMRQKGAVPYAYTANLGQPDEDDYNAIPKKAMAYGAENARLIDCRAQLAHEGIAAIQCGAFHISTGGIPYFNTTPLGRAVTGTMLVAAMKEDDVNIWGDGSTFKGNDIERFYRYGLLTNPNLKIYKPWLDVQFIEELGGRLEMSQFLIENGFDYKMSVEKAYSTDSNMLGATHEAKDLEQLSTGMKIVKPIMGVAFWDEKVEIKPETVTVTFEDGVPVALNGKHFDNAVDLILEANRIGGRHGLGMSDQIENRIIEAKSRGIYEAPGMALLHIAYERLVTGIHNEDTIEQYRINGIRLGRLLYQGRWFDPQALMLRETAQRWVAKAITGTVTLELRRGNDFTILNTESPNLTYEAERLSMEKVEDAPFDPIDRIGQLTMRNLDVSDTRGKLGIYAQTGLLSAIKDSVLPQLGKK >CP031678.1|AXP46062.1|1128438_1129632_+|divalent-metal-cation-transporter MASITHRRNAVLGAAFLMATSAIGPGFLTQTATFTNTLLASFGFVILLSILLDIGAQLNIWRIVIVSGKRAQDISNAVFPKAGYFLAALIVMGGLAFNIGNVGGAGLGLNSIFGIAPEMGAVISGIIAILIFLRKEAGLLMDRFAQLMGFIMVALTFYVMFKTEPPVAEAAYHSFIPEKIDPIAIVTLVGGTVGGYITFAGAHRLLDAGIQGEKAMAEVSRSSVSAILIASTMRVVLFLAVLGVVSKGVSLNPKNPAETPFEYVAGNFGQVLFGVVIWAASVTSVIGAAYTSVSFLTTLCPTIERNRNRWIIAFIVISTVVLVTVGKPAAVLVFVGTLNGLILPIALALILLAAYRSDIVGTYKHPVFLAFSGWFVVIIMAILSGKTIISYISSFFS >CP031678.1|AXP46061.1|1127657_1128395_+|LamB/YcsF-family-protein MKKIDLNADIAEGFPFDESLLQLLSSANIACGLHAGGAKEMQSAVKFAKENKVRIGAHPSFPDRENFGRTAMALSSQELIAHLRYQLGALKAICDGEGAVISYVKPHGALYNQAAKDEKIARVIAQTVYQFDPNLKLMGLAGSLMLRIAEEEKLQTISEVFADRHYMPDGSLVPRSQPNAMVESDKEAIQQVLQMVTKGQVNAIDGSLVPVKAESICLHGDNQHSLQFAKRIVEELEKNHIKITA >CP031678.1|AXP46071.1|1140456_1141005_-|oligoribonuclease MPFDKQNLIWIDLEMTGLDPEKERIIEIATIVTDKNLNILAEGPVLAVHQSDELLNKMNDWCQKTHSENGLIERVKASKLTERAAELQTLDFLKKWVPKGASPICGNSIAQDKRFLVKYMPDLADYFHYRHLDVSTLKELAARWKPEILEGFKKENTHLALDDIRESIKELAYYREHFMKLD >CP031678.1|AXP46072.1|1141075_1142116_+|small-ribosomal-subunit-biogenesis-GTPase-RsgA MAKRKLTQNQTRRIQSNNAKTLHRHKKKDIEWSDEMLGESQEGVVVTRYSIHADVENEQGEIYRCNLRRTLSSLVVGDKVVWRKGNEQLQGVSGVIEAIHPRENEISRPDYYDGLKPIAANIDRIIIVSAVLPTLSLNIIDRYLVVCEIAGITPLIVLNKVDLLAQEQRQEIEDQLKIYQDIGYEILMISAKSGENMEKLTALLAQGTAIFVGQSGVGKSSLINHILPSVNAQVGDVSETSGLGQHTTTSSRLYHLPQGGNLIDSPGIREFGLWHLDAEQITKGYREFQYVLGTCKFRDCKHLSDPGCALREAVEQGKISPVRYDSYHRLIESLSETKSQRHFSLV >CP031678.1|AXP46073.1|1142274_1142532_+|HPr-family-phosphocarrier-protein MYSKDVEIIAPNGLHTRPAAQFVKEAKAFSSEITVTSGGKSASAKSLFKLQTLVLTQGTILTISADGEDEQQAVEHLVALIPTLE >CP031678.1|AXP46074.1|1142611_1144339_+|phosphoenolpyruvate-protein-phosphotransferase-PtsI MISGILASPGIAFGKALVLKEEKIVLDTQKITDDQIDEEVARFYEGRAAAVEQLNSIRERALISLGEEKAAIFEGHLMILEDEELEEEILDYLRSNKVNAGVAASKILDQQVTMLSEIDDEYLKERAGDIRDIANRLVKNILGMHIVDLGDIQEESILVAYDLTPSETAQLNLEKVLGVVTDIGGRTSHTSIMARSLELPAIVGTNKVTKLVNTGDYLILDAINNQVYINPTASQIDELKALEAKISEEKAELAKLKDLPAITLDGHKVDIVANIGTIRDCDGAERNGAEGIGLYRTEFLFMDREQLPTEEEQFIAYKQVVEAMNGRLTVLRTMDIGGDKELSYLDLPKEMNPFLGWRAIRIALDRREILNAQLRAVLRASAFGKLAVMFPMIISVEEIRELKAVIETLKAELREEGRVFDNNIQVGVMVETPSAAVNAKFLAKEVDFFSIGTNDLTQYTLAVDRGNEFISHLYNPMHPSVLGLIKQVIDASHTEGKWTGMCGELAGDERATLLLLGMGLDEFSMSAISVPRIKKLIRNVNFQDAKALADAALQKPTAAEIDQLIEEFLLENSLN >CP031678.1|AXP46075.1|1144398_1144899_+|PTS-glucose-transporter-subunit-IIA MGLFDKLFGSKENKSVEVEIYAPISGEIVNIEDVPDVVFSEKIVGDGIAVRPIGNKIVAPVDGVIGKIFETNHAFSMESKEGVELFVHFGIDTVELKGEGFTRIAQEGQSIKRGDTVIEFDLPLLESKAKSVLTPIVISNMDEISCIVKKSGEVVAGESVVLALKK >CP031678.1|AXP46076.1|1146403_1146769_+|YgiW/YdeI-family-stress-tolerance-OB-fold-protein MKKFALATIFALATTSAFAGFNGNNSQGGFQQTAPAAISVKQALSAADNSMITLVGNITQQIDDDEFWFTDGTGQIKIEIKKRVWNGLNVDSKDKVKIYGKLDNEAFEKAELDVLRVEKAE >CP031678.1|AXP46077.1|1146832_1147498_+|DNA-binding-response-regulator MRILLIEDDNLIGNGLQIGLTKLGFAVDWFTDGKTGMAALTSASYDAVVLDLTLPKLDGLDVLQQWRSNHQDVPVLILTARDTLDERVKGLQSGADDYLCKPFALAEVAARLQALIRRRYGYHHSVIEQAGVKLDQNQRSVWLNNQPISLTSREYKLLELFMLNKDRVLSRSSIEEKLSSWDEEISSGALDVHIYNLRQKLGKQFIRTVHGVGYALGQVEK >CP031678.1|AXP46078.1|1147494_1148850_+|two-component-system-sensor-histidine-kinase-QseC MKNRSLTLRLISVLCLTALFVWLGSTLVAWWQVRHDVNKVFDAQQVLFAERLANSDLSTILLESSTTLNKNSQSVLKKSYDDDALAFAIFSKTGKLLFSDGRNGKDFIFNYKTGFYNANIYDDDDKWRIFWRMAANGELVIAVGQELDYREDLIEEMILGQMWIWFASLPILIIVLGWLIHKELRPIKRLSQEVQTRKSGDVSLLNTEGLPVEILPLVKNLNQFFDRTSAMLQRERRFTSDAAHELRSPLAALRIQTEVAQLAGDDVALREQALLHLTQGIDRASQLIEQLLTLSRLDNLQALETLQLLDWEAIVQSLISERYFVAEKRKITLVFEKESEPKQKQGQSILVSLMLRNLLDNAIKYCPEDTIVSVKISSSQIIIEDNGGGVEPEDLKKLGQRFYRPAGQNEKGSGLGLSIVMRIAELHGFKVRLENVVKEGRRIGLKAIISL >CP031678.1|AXP46079.1|1149126_1151154_+|BCCT-family-transporter MSLSQFMTKRTSFNPLVIGVTLFFILLLMAMIFIAPEQTQALLNQAKSGIFANFSWFYVLTFSVFLGFLLILSVSSLGNIKLGQDEEEPEFSFLSWLAMLFAAGMGVGLMFFGVAEPLTHYLSDITVGSAEHKQQEALLHTLFHWGIHAWAVYGTIALALAYFGFRYKLPLALRSCFYPLLKDRINGKIGDAIDVMALLATLFGIITTLGFGSSQLGAGLEQIGWISQNSFALQVGVIVVVMCLAVFSAISGIGKGVKILSEINLTLAFCLLLFVLISGPTLYLLSAFSDNIGNYFSNLVQLSFKTYAYEQEHTSWFSGWTVLYWAWWCSWAPFVGLFIARISKGRTIREFIFGVLVIPSLFGILWFTVFGNTAVWLNDGIAAGGLGEFISSPEILLFKFLNYLPLPTITGFVSLLVISLFFITSADSGIYVLNNIASRDKSLASPAWQAIMWGTLMSVVAIVLMQSGGLANLQTMTLIVALPFALLMLVMCFSLWKGLIADKKYFSTKVNPTSIFWSGDKWKSHLEQMMNQTQEKDILRFLKNTALPAMRELRQELTGKYNLSVEINTLFEQEEPALELVIHKESMRDFMYGIKSVGREVSEQLINDENLPHIQHSVTYEPYTYFFDGRVGYDVQYMDQDELIADMLKQYERYLSLLDDVGQELMAHEQTELAE >CP031678.1|AXP46080.1|1151189_1152665_-|cytosol-aminopeptidase MKYQAKNTALSQATDCIVLGIYENNKFSKSFNEIDQLTQGYLNDLVKSGELTGKLAQTILLRDLQGLSAKRLLIVGCGKKGELTERQYKQIIQAVLKTLKETNTREVISYLTEIELKDRDLYWNIRFAIETIEHTNYQFDHFKSQKAETSVLESFIFNTDCNQAQQAISHANAISSGIKAARDIANMPPNICNPAYLAEQAKNLAENSTALSLKVVDEEEMAKLGMNAYLAVSKGSENRAYMSVLTFNNAPDKNAKPIVLVGKGLTFDAGGISLKPAADMDEMKYDMCGAASVFGTMKAIAQLNLPLNVIGVLAGCENLPDGNAYRPGDILTTMNGLTVEVLNTDAEGRLVLCDALTYVERFEPELVIDVATLTGACVVALGQHNSGLVSTDNNLANALLQAATETTDKAWRLPLSEEYQEQLKSPFADLANIGGRWGGAITAGAFLSNFTKKYRWAHLDIAGTAWLQGANKGATGRPVSLLTQFLINQVK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP031678_2 | 2.1|1239262|49|CP031678|CRISPRCasFinder | 1239262-1239310 | 49 | CP031678.1 | 1239226-1239274 | 1 | 0.98 |
1. spacer 2.1|1239262|49|CP031678|CRISPRCasFinder matches to position: 1239226-1239274, mismatch: 1, identity: 0.98
tgtgcagtagtagcaggagctgctgcctgtggtgcttgtgcagtagtag CRISPR spacer tgtgcagtagtatcaggagctgctgcctgtggtgcttgtgcagtagtag Protospacer ************ ************************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1266113 : 1355301
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP031678|1266113:1355301|DBSCAN-SWA GATGCCATCTCGCCATCTTCAAATTTTAATCTGCAAAACCTTGCCACTTGTGCCTGATAACGTTTTGATTATCGGAGAAAGTGGCATTGCTTTTTCGAAAGCAACGAATTTGCTCGGACAAGAATTTGAACATATCTTATTTGATGGACGAAATGGCATTCATCTTGAAGCGCTGGCTATTGCAGCTGGAACACTAAAAATGGGCGGTACACTTTGTTTAGTCTTATCCAATTGGGAAAATTTATCTCAGCAGCCTGATCAAGACAGTTTACGTTGGAATGGAAATCAGTCAGCAATCGCCACGCCTAATTTTATTTATCATTTCAAACAGTGCATTAAACGCTATCATTTCCCCATTTTAAGAGAGGAAAGTGCGGTTGAATTTCCTGCGGTTTTTTATTCTAACGAGCATCACAAAAATGCCACGTTAGCTCAACAACAAATTATGGAGACTATTTTACAAACTGAGCAGGATATTTATTTTCTAACCGCCAAGCGAGGAAGAGGAAAATCCGCATTATTGGGGATGCTTGCTAACCAAATTCAAGCACCAGTTTATCTTACCGCACCGAATAAAAGTGCGGTGCATTCGGTTATTGAATTTTCAGAACGAGAGATAGAATTTATCGCGCCTGATGAACTGGCTATTCGGTTACAACATGAACCAGAATTCAGTCAATCAGCTTGGTTGCTGGTAGATGAAGCGGCGGTAATCCCATTGCCGTTATTGCAAGAATATTCTCAATATTTTCAACATATTGTCTTCAGCACAACAATTCATAGCTATGAAGGTACGGGGCGTGGTTTCGAATTAAAATTTAAACGGAAAATTCACCGCACTTTTCAGCATTTTGAGCTTAAACAGCCCCTACGTTGGCAAGAAAATGACCCGTTAGAACATTTTATTGATGATCTTTTGTTGCTAAATGCCGAAGATGATTTTCAGCACTTTGACTATAACAATATTACTTATAACATAGAGGAAAACGCTAAAAATCTTTCCTTCCCCTGCTTGCGGGGGAAGGTGCCCGAAGGGCGGAAGGGGGATTTAGATATAGCCAGCCTCCCTCAAGCTTTGGAAGCTCCCCTCACAAGTAAGGGTAGTAAAGGAAAATATAATCGTCAATTTTTATTTCGAGATTTTTATGGCTTAATGACATTGGCGCATTATCGAACATCGCCACTCGATCTTCGCCGTTTACTTGATGGAGAAAATCAACGTTTTTATTTTGCCGAATATCAACAGAATTTGCTCGGTGCAATTTGGGCATTAGAAGAAGGAAATATGGCTGATGATGAGTTGATTATTCAAATTCAACAAGGCAAACGCCGCCCGAAAGGGAATCTTGTTCCACAGGCGTTATGTTTCTATGAAAACTTGCCTCAAGCCTGTAAATTACGATCTTTACGTATTTCACGTATCGCCGTGCAACCAAATTGGCAGCAAAAGGGCATTGGGCAAAATTTGATGCAAGCCATGGAAAATGCCGATGTGGATTTTCTTTCAGTGAGTTTTGGCTACACCGACGAACTGGCAAAATTTTGGCAAAAGTGCGGTTTTGTTTTGGTGCATTTAGGCGAGCATCAAGAAGCGAGTAGTGGTTGTTATTCAGCGATTGCCCTTAAAGGTATTTCCAAAGAAGGCTTGGCTTTAGTTGATACTGCGTACAAACAATTTCAGCGTAATCTCCCTTTATATTTTCATCCGTTTGCCATAAATTTTGAGCAAAATCAGCTTGATTGGCAGCTTGATGATTTTGATTGGATGAGCTTAAAAAACTTCGCTAATTTTCACCGCACTTTATTTTCGAGCGTTCCTGCGATGAGGCGTTTATTAAAATTAGCGGGCAAAGAAAATTTCCCATTAATTTCCGCTTATTTAACAAAAAAACAACTTCCTATTAACAAGAAAAAAGGCGTAGAATGTTTGCGTTTAGAAATTAAACAATATTTAGAGCGAGGAACTTTATGACAGAACAAACCGCAAAACCAAAAGGCTGGTTTAAACGCGCACTTGAAAAATATGACAACTTCATTAAAGAATGGGGTTTAGATCAACCGAATTGTAGCTGCGTGCCTATGTCAGCAACAGAAGATGAAAATGGTAATTTGAAGACAAAAGAATCTTCTTTAAAGAAATAAATATTAACTGTTTTTTTAAACAGTGAACTTATTGAAAGATAGAGCAAATTCCAGTACACTATGCCTCAATTTTACACAAGATTGACGCATTATTTATATTTATGAAAACGGCTTTTTTCCAACCTGATATTCCAACCCAACCCAATGATCACAAAATTTTAGGCAATGTATTACCAGGCGCTGATGCATTGGCGATTAGTGAAATTGCAGAGCAAAACCAAAATTTAACCGTAGTGGTGACTCCAGATACACGAAGTGCGGTGCGTTTATCACGTGTTTTATCGGAATTAAGCAGTCAAAATGTATGCCTTTTCCCTGATTGGGAAACCTTACCTTACGATACTTTTTCTCCCCATCAAGAAATTATTTCCTCTCGTTTAAGTGCGCTTTTCCATTTACAAAATGCGAAAAAAGGCATTTTCTTATTGCCGATTTCGACATTAATGCAACGCCTTTGCCCGCCACAATATTTACAACACAATGTGCTTCTGATTAAAAAAGGCGATCGTTTGGTCATCGATAAAATGTGCTTACAATTAGAAGCAGCGGGCTATCGAGCTGTGGAGCAAGTATTAGAACACGGCGAGTACGCAGTTCGTGGTTCCTTGTTGGATCTTTTCCCAATGGGAAGTGCGGTGCCTTTTCGCCTTGATTTTTTTGATGATGAAATTGATTCTATTCGCACTTTTGATGTGGATACGCAACGCACTCTTGATGAAATTAACTCAATTAATCTTTTGCCAGCTCACGAATTTCCAACGGACGACAAAGGGATTGAATTTTTCCGTGCGCAATTTCGTGAAACTTTTGGGGAGATTCGCCGAGATCCCGAACATATTTATCAGCAAATCAGTAAAGGTACCTTGATTTCTGGCATTGAATATTGGCAGCCACTTTTCTTTGCTGAAATGGCAACTTTATTTGATTATTTGCCGGAGCAAACGCTGTTTGTAGATATGGAAAATAATCAAACGCAAGGCGAGCGTTTTTATCAAGATGCCAAACAGCGTTATGAACAACGTAAAGTGGATCCGATGCGTCCGCTTTTATCGCCTGAAAAATTATGGCTTAATGTAGATGAAGTCAATCGCCGATTGAAATCTTATCCACGTATTACATTTAAAGCGGAAAAAGTGCGGTCATCGGTACGCCAGAAAAATTTACCTGTTGCCGCTCTACCAGAAGTGACTATTCAATCCCAGCAAAAAGAACCATTGGGACAATTACGTCAATTTATTGAGCATTTTAAAGGAAATGTACTGTTTTCTGTGGAGACGGAAGGTCGCCGAGAGACTTTGCTTGATTTGCTTTCACCGTTAAAACTCAAGCCAAAACAAATTCAATCTTTAGAACAGATTGAAAATGAAAAATTTAGCTTGTTAGTCAGCTCTCTTGAACAAGGTTTTATAATTGAACAATCGCTTCCTGTTGCGATTATTGGCGAAGCTAATTTACTTGGCGAGCGCATTCAACAACGTTCTAGAGACAAACGTAAAACAATTAATCCTGATACGCTTGTACGAAATCTTGCCGAACTGAAAATAGGGCAACCAGTTGTGCATCTTGATCACGGTGTGGGACGTTATGGCGGTTTGGTCACCTTAGATACAGGCGGCATTAAAGCCGAATATTTGCTACTAAATTATGCAAATGAATCGAAACTTTATGTGCCAGTGACTTCATTACATTTGATTAGCCGTTATGTTGGTGGCTCTGATGAAAGTGCGCCATTACATAAATTAGGGAACGAGGCTTGGGCGAAATCACGCCAAAAAGCTGCGGAGAAAATTCGTGATGTGGCGGCAGAGTTATTAGATGTTTACGCACAACGTGAAGCGAAGAAAGGCTTTGCCTTTAAATATGATCGTGAAGAATTTCAACAATTTTCCGCAACCTTTCCTTTTGAAGAAACCTACGATCAGGAAATGGCAATTAATGCGGTAATTTCGGATATGTGTCAGCCTAAGGCAATGGATCGCCTTGTTTGTGGTGATGTGGGTTTTGGTAAAACTGAAGTGGCAATGCGCGCTGCCTTTTTGGCTGTGATGAATCATAAGCAAGTAGCAGTGCTAGTGCCAACCACACTGTTAGCCCAACAGCATTATGAGAATTTTAAAGATCGTTTTGCGAATTTGCCTGTGAATGTCGAAGTGTTATCGCGTTTCAAAACTGCAAAAGAACAAAAACAAATTCTGGAAAACCTTGCAGAAGGAAAAGTCGATATATTAATTGGTACCCATAAATTAATTCAATCAGATGTAAAATTTAACGATCTTGGATTGTTGATTATTGATGAAGAACATCGTTTTGGTGTAGGGCAAAAAGAGAAAATCAAACAGCTTCGTGCGAATATCGATATTCTTACGCTAACGGCAACGCCAATTCCTCGAACGCTTAATATGGCGATGAATGGCATTCGTGATCTTTCCATTATTTCCACACCTCCTGCTCGCCGATTAAGTATTAAAACCTTCGTCCGTCAGAATGACGATCTTGTTGTACGAGAAGCGATTTTGCGTGAAATTCTCCGAGGTGGGCAGGTTTATTATCTCCACAATGATGTCGCAAGCATTGAAAATACAGCAGAAAAACTGACCACGCTTGTGCCAGAGGCGCGAGTAATTGTGGGGCACGGACAAATGAGAGAACGTGAGTTAGAACGTGTGATGAGTGATTTTTATCATCAGCGTTATAACGTCTTAGTTTGTTCAACCATTATCGAAACGGGTATTGATGTACCAACGGCAAATACCATTATTATTGAACGAGCGGATCATTTTGGTTTGGCTCAGTTGCATCAATTACGTGGACGAGTCGGGCGTTCACATCATCAGGCTTATGCTTATTTGCTTACGCCC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP031678|1266113:1355301|1326083_1327130_-|AXP46220.1|DBSCAN-SWA MDRTTDYLERLFIEELNSEGEIIISGNSFFRHEILYTLDPEAYKDVFEFWKTERKQRNLNEANRILDITSDNRNRFIRLKELFKEKKIIPFIGAGMSMSTGLPSWSEFLRSVQQETRTDRFYFEDLLSQGEFEEAAQYLDDCSPSHLQEQLDNIFGRKYLFNEINGVICLLPKFFNNTPIITTNYDNILSTVYQKCDYPFSDELNGLYLEDLYNKLLDKQNFLLKIHGTFDKPQNRILTKNDYDKHYNDQTSKLKNCVESLFSSSLLFIGCSLTIDRLIKALAEIVQEKGSENLPRHYAFLFSDPKKDVNRINKKEELAKSNIFPIWYDGDHDESIEALLELLNDGEQ >CP031678|1266113:1355301|1294790_1295615_+|AXP46186.1|capsid|DBSCAN-SWA MAKTSKWFVVATEGATTDGRTINRTWIEQMAANYDPKKYGARVNLEHIKWRYMWNDDPHSKCYGDVVGLKTKENAEGKLQLLAQIDPTDDLIKLNKDRQKIYTSIECDPNFADTGEAYLVGLAVTDNPASLGTEMLVFSAGASANPLNNRKEKAENLFTAAIETELEFEEVKEKGLSVFAKIRALFADKEKTDNERFADQTQAIELLAEQTKETLEKLTALSDDLAKQKAEIEEMKASNAEIQATFAELQKPVEPENPRPLVYGEQPETDGRFF >CP031678|1266113:1355301|1315373_1315901_+|AXP46215.1|DBSCAN-SWA 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82 | Mannheimia_phage(39.39%) | lysis,terminase,plate,tail,protease,capsid,head,tRNA,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1402281 : 1414325
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP031678|1402281:1414325|DBSCAN-SWA 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GATTGAATCCAACGATCCGCTAATGAAAATTCGATCTCGCCTTCGCTTAAATCTAATTTGTCATTCGTTAATACGAAACGGCTTGCATTCCATAATTTATTACAGAAGTTGCGGTAGCCTTCTAAACGTTTCATATCCCAGTTGATATCACGACCGTTTGAAGCCAACGCAGCTAATGTGAAACGCAATGCGTCTGTACCGTGAGCAGCAATACCGTCCGTAAATTCTTTACGGGTTGCTTTAGCAATTTTCTCTGCTAATTGCGGCTGCATCATGTTGGCAGTACGTTTCTCAAGTAAATCTTCAAGGCTGATACCGTCAATCATATCGATTGGATCAAGTACGTTACCTTTCGATTTCGACATTTTTTGACCTTGCTCATCACGGATCAAGCCTGTTACGTACACCGTTTTGAATGGCACTTGTGGTTTGCCATTTTCATCTTTCACAAAATGCATCGTAAACATAATCATACGCGCAACCCAGAAGAAGATGATATCGAAGCCGGTAATCAACACATCCGTTGGGTGGAACATTTTGAGCTCTTTGGTTTGCTCTGGCCAGCCTAAGGTAGAGAACGTCCATAAGCCTGATGAGAACCATGTGTCTAACACATCTTCATCTTGCTTGAGTTCAACCGCAGAATCTAAATTGTATTTTGACCGCACTTCTTCTTCGTTACGCGCGACATAAACATTACCTTCCGCGTCATACCACGCTGGAATACGGTGTCCCCACCAAAGTTGGCGAGAGATACACCAATCTTGAATATCACGCATCCAAGAGAAGTAAAGATTTTCATATTGTTTCGGCACAAATTGGATTTCGCCATCTTCCACTGCTTTAATCGCTACATCAGCAAGCGGTTTTACGCTCACATACCATTGGTCTGTAAGCATTGGCTCGATTGGCACACCACCACGGTCGCCATAAGGCACTTTCAAATCGTGTGGTTTAATTTCATCTAAAAGCCCTAACGCTTCAAAATCTGCCACGATTTTTTTACGTGCAGCAAAACGCTCTAAGCCACGGTAATCCGCAGGAATAATCGCTTCATAGTCTGCAAGTGGTTTTCCGTCAGTACCGATAATTTCCGCTTCATCACGAATATCTGCGTTTAAGGTTAATACATTGACCATCGGCAAGCTGTGACGTTTACCCACTTCATAGTCGTTAAAGTCGTGCGCAGGCGTAATTTTCACCACACCAGTACCGAATTCACGATCCACATATTCATCCGCAATAATCGGAATTTCACGGTTTGCAAGCGGTAGAATTACCGTCTTACCTTGCAAATCTTTGTAGCGTTCATCTTCAGGATGCACAGCCACCGCCGTATCGCCCAACATAGTTTCTGGACGCGTGGTTGCCACCACTAAATAATCTTTACCATCTGCCGTTTTTGCACCGTTTGCTAACGGATAACGGAAATGCCAAAGAGAACCTTTGCTCTCTTTGTTTTCTACTTCTAAATCAGAAATCGCGGTGTGAAGTTTTGGGTCCCAGTTTACTAAGCGTTTGCCACGGTAAATCAAACCTTCTTCGTGCAAACGAACAAACACTTCTTTTACCGCATTGGATAACCCCTCGTCCATAGTAAAACGCTCACGTTCCCAGTCGATTGAGTTACCTAAACGACGCATTTGTTGGCTGATTGTGCCGCCTGAATAAGCTTTCCAGTCCCAAATTTTGTTGATGAATGCTTCACGACCATAATCGTGGCGAGTTTTGCCTTCTTCTGCAGCGATTTTACGCTCCACCACCATTTGGGTTGCAATACCCGCGTGGTCTGTCCCCGCTTGCCATAAGGTGTTATGCCCTTCCATACGGTTAAAACGGATTAAGGTATCCATTAAGGTTTGTTGGAAAGCATGCCCCATATGCAAAGAACCCGTGACGTTCGGCGGCGGAATCGCAATGCAATAGCTCGGCACATTTTCATTTTCAGACGGTTTAAAATAACCGCCCTCTTCCCAATGTTGATAAAGGGCTTGTTCTACCGCAGACGGATTAAAACGATCTGCCATTTGGAGGTTTTTTGTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP031678|1402281:1414325|1403743_1404292_+|AXP46277.1|DBSCAN-SWA MIAANYALLHFINQNGKELVMLNQIIINKLNDQINLEFYSSNVYLQMSAWCSKHGYEGAATFLLRHADEELEHMQKLFNYVSETSGMPILGKIDAPKHDYSSLREVFEITLEHEKLVTSKINELVEVTFESKDYSTFNFLQWYVAEQHEEEKLFSGIIDRFNLVGEDGKGLFFIDRELATLE >CP031678|1402281:1414325|1409586_1411020_+|AXP46283.1|DBSCAN-SWA MMITQDFTKPIDSATVLQKIVLDKAQWVKAKEKEFPLSQFKQNIQNSDRSFYDALAKGTHQKPAYILECKKASPSKGLIRAEFNLEEIANVYKHYASAISVLTDEKYFQGNFEFLPLVRNIVSQPVLCKDFMISEYQVYLARYYQADAILLMLSVVNDETYRVLADLAHSLGMGVLTETSNEEEFERALRLGAKIIGVNNRNLHDLTVDLNRVVELTEKYADRIPADVRIISESGIYNHNQIRQLQKVVHGFLIGSSLMGNQDLNNAVRSVIFGENKVCGLTRAQDVKIVYKNGALYGGLIFVEHSKRCVSLRQAQELVTAAPLRFVGVFQNQEIDFIIKIASQLQLYAVQLHGAENEAFITALRQQLPKNTQIWKAISVNIETQSAIDFTDDLNVDRYIFDSQTANQQGGTGKTFDWSLIPEHLKHKIILAGGISPNNVEQAIQQNCLGLDINSGVESSAGVKDQEKVRLVFNNIY >CP031678|1402281:1414325|1402281_1403286_-|AXP46745.1|DBSCAN-SWA MKKNLIIVLTLGTLPFAQANSITGAGASFPYPIYAKWASLYEKETGNKVNYQSIGSGGGQQQIIAKTVDFGASDDPMKSELLQQHQLVQFPAVIGGIVPVVNLPEIKPGKLKLSGKLLAEIFLGKIKKWNDPDLVALNPTLPLPNKNIIVIHRSDGSGTTFGFTNYLSKVSNDWKNQVGEGKSVKWLTGQGGKGNEGVASYVRQMKYSIGYVEYAYAKQNQLAWISLQNQAGQFVQPSNESFMAAASHAKWHEKAGMGVILTNETGEKSWPITAASFILLNKYSDNPETTKNVLAFFDWAFSRGQDAATELDYVPIPADVVSTIKSQWKTELKQ >CP031678|1402281:1414325|1411460_1414325_-|AXP46285.1|tRNA|DBSCAN-SWA MTKNLQMADRFNPSAVEQALYQHWEEGGYFKPSENENVPSYCIAIPPPNVTGSLHMGHAFQQTLMDTLIRFNRMEGHNTLWQAGTDHAGIATQMVVERKIAAEEGKTRHDYGREAFINKIWDWKAYSGGTISQQMRRLGNSIDWERERFTMDEGLSNAVKEVFVRLHEEGLIYRGKRLVNWDPKLHTAISDLEVENKESKGSLWHFRYPLANGAKTADGKDYLVVATTRPETMLGDTAVAVHPEDERYKDLQGKTVILPLANREIPIIADEYVDREFGTGVVKITPAHDFNDYEVGKRHSLPMVNVLTLNADIRDEAEIIGTDGKPLADYEAIIPADYRGLERFAARKKIVADFEALGLLDEIKPHDLKVPYGDRGGVPIEPMLTDQWYVSVKPLADVAIKAVEDGEIQFVPKQYENLYFSWMRDIQDWCISRQLWWGHRIPAWYDAEGNVYVARNEEEVRSKYNLDSAVELKQDEDVLDTWFSSGLWTFSTLGWPEQTKELKMFHPTDVLITGFDIIFFWVARMIMFTMHFVKDENGKPQVPFKTVYVTGLIRDEQGQKMSKSKGNVLDPIDMIDGISLEDLLEKRTANMMQPQLAEKIAKATRKEFTDGIAAHGTDALRFTLAALASNGRDINWDMKRLEGYRNFCNKLWNASRFVLTNDKLDLSEGEIEFSLADRWIQSEFNRTVETFRNSLSQYRFDLCANAIYEFTWNQFCDWYLELTKPVFANGNAAQIRAASQTLVHVLEKLLRLAHPLIPFITEEIWQKVKGFVGITADSIMLQPFPQVEENGFAPEAEAEIEWLKEVIVAVRNIRAESNIAPSKGLDLLFRNLSAENAKILEKQTALLKAMAKLDNVQVLAANETAPLAVAKLVGNAELLVPMAGFINKEAELARLTKEIEKYQNEVKRIENKLSNESFVAKAPEAVIAKEREKQAEYQSGLEKIQEQYKAIEGL >CP031678|1402281:1414325|1404307_1404805_+|AXP46278.1|DBSCAN-SWA MLSENVVKLLNDQMNLEFYSSNLYLQMSAWCDQQGFEGTAKFLSVHAAEEMQHMRKLFTYLNETGSLAVISAIEAPAHEYKSLKEVIEATYEHEKLITSKINELVGKTFEEKDYSAFNFLQWYVEEQHEEEKLFSSILDKLNFLGEDGKGLFLIDKDLGNLSTKA >CP031678|1402281:1414325|1408108_1408495_+|AXP46281.1|DBSCAN-SWA MITVFGLKSKLAPRREQLAEVIYNSLHLGLDIPKGKHAIRFLCLEKEDFYYPFDRSDDYTVIEINLMAGRMEGTKKRLIKMLFSELEYKLGIRAHDVEITIKEQPAHCWGFRGMTGDEARDLDYDIYV >CP031678|1402281:1414325|1407472_1408060_+|AXP46280.1|DBSCAN-SWA MANILFLDNFDSFTYNLVDQFRVLGHNVTIYRNDCDLEKLVETALNINTLDTILALSPGPGTPSEAGILLPLIERLKNQVPIIGICLGHQALIQAFGGKVVHAGEVLHGKVSRISHDNEAMFKDLANPMPAARYHSLMGQDLPKEFIVNAEYNGIIMAIRHRDLPICAFQFHPESILTVQGSQLLQQSIEWLLNR >CP031678|1402281:1414325|1405903_1407460_+|AXP46279.1|DBSCAN-SWA MNIQTQAFIAVTAQSIPYYADTTAIFNTLCQPNSNSLLLDSAEIGSKNSLQSLILVNAAVKITCLGHNVTFKALNKNGKQVLKEIHPKLTALGKISAVNFEDEFSVQFSPLDNQLDEDNKLQSATIFDGLRVVSTLYQHSQTPIFLGGLFAYDLVANFIPMDGITLKNDGINCPDYSFYLAEHLITIDHQNQQATLKSFCFAQEEQVNIAKTSLSIAQKLKNIDHVLSIKSASDEVKTNFDDPEFTGIVKALKHHINIGDVFQIVPSRRFSLACPNTLASYAQLKQNNPSPYMFYMNDEDFILFGASPESALKYAPENRQLEIYPIAGSRPRGFDAHGNIDPELDARLELELRLDHKEQAEHLMLVDLARNDIARVCQNGTRKVAELMQVDRYSHIMHLVSRVVGKLRPELDALHAYQACMNMGTLTGAPKIKAMQLIYQFEQQKRHSYGGAVGYLTSDGHFDTCIVIRSAFVQNGIAHVQAGCGEVLDSDPQMEADETRHKAAAVLKAIRQVNTQAK >CP031678|1402281:1414325|1408547_1409549_+|AXP46282.1|DBSCAN-SWA MQHNQLLEQLYSGHSLSTSESTALFNAVIQGELSNEQIAAMLIALKVREANTEEITGAVAASLQNAKVFPRPDYPFADIVGTGGDGQNTINISTASAIVAASMGAKVAKHGNRSVSSKSGASDVLTALGVNVNVTPEQARQALDEIGVCFLFAQQYHSGFRHVAPVRASLKTCTIFNILGPLINPARPTYHLLGVYVPELVKTYAETAVALGHQHSFVVHGSGLDEVALHGETQVAEIKNGKIEYFTLTPEDFGLKTQSLESLRGGEPQENTQYLTALLQGKGKAEHANAVAANTALLLKLFGYDDLKQNVQNVLAHLASGNAFKTLQKLTTY >CP031678|1402281:1414325|1411150_1411426_+|AXP46284.1|DBSCAN-SWA MCLGVPGQIVKIDENYLQLATVDVCGVQREVNISLVCTGNLADLLGKWVLVHVCFAMSVIDEDEAKKTQEALLAMSQLEHEVGDFLGLNQK >CP031678|1402281:1414325|1405037_1405802_+|AXP46746.1|DBSCAN-SWA MAIKSVQNQTYPCKHYVFVDGNIFWDKAKSILEQFPDVIPIYLPMNTGKNGILNGAINAVAAFLVEEDIICYLDDDNQLREDHVESLVNVIEQGADFAYSLRSFYDSNHQFICNDDFDSLGNWNTKSDIFVDVKIEDIQKQIHFTFNEVNGHIDTNCYAVPREIAQKTSYSWNTPLIGDRSFLSALKSLGLIGQTSGKYTVKYRADFNKLIAVRRVFPQLSLSDEDNNNISAKILEVINQQNIEYYGGRPWAKE |
11 | Acinetobacter_phage(42.86%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1423490 : 1439776
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP031678|1423490:1439776|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP031678|1423490:1439776|1429029_1429632_-|AXP46304.1|DBSCAN-SWA MTMMISEVTFNKIFPHAVKGVYQAISAQIEKAGCVNKMQQAMFLAQCGHESGGFTRFKENLNYSWLGLSKTFRKYFPDPLIAKKYERKPELIANRVYANRLGNGDEKSGDGWKYRGRGLIQITGKDNYAAFRKWLGRDIEPDDVAGNLDLSVKTAVWYWKCYELAELNSVEKVTRRINGGLNGIDERCKLYRALMVTDND >CP031678|1423490:1439776|1428713_1429037_-|AXP46303.1|DBSCAN-SWA MTKYIYMALAGVVVVLIGALRYQSSVIDELEITTKQQENTIQQQEDANKSLSLALQQERYAIIEQQERNNEIERIATENAESVKTIIKTQPCAHTRLPQSVLDRLHE >CP031678|1423490:1439776|1428240_1428519_+|AXP46301.1|DBSCAN-SWA MNHLLTFYEKIIFTNPLETGIPEAVAKLALLNDYSALRAWREHLGLTQAEVASRLGISQAAYSQHENSQTLRKSTRIKIATALGINSAQLDF >CP031678|1423490:1439776|1430293_1430962_-|AXP46306.1|DBSCAN-SWA MTTQIQFSIFNFKNSPVRTITDPNSEIWFCGTDVCDILGYVNAPDAMKKHCKEAGIAKRYISYPSGRKEAIFINEPNLYRLIIKSRKPEAEPFEAWVFEEVLPQIRKTGKYQLQPQQLALPEPEKKFSFEFTEYELQQLVWLWFAFMRGIVTFQHIEKAFRVLGSNMSSQIYGQAYEYLSVLRSTNQILNRITSDFDIDQMTNWRVLKHLRGFNPKAVKIDF >CP031678|1423490:1439776|1426353_1427628_-|AXP46747.1|terminase|DBSCAN-SWA 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MEMKKVIIEMVDRIPGGRSAVAGFLGFTESELKNRLYQTKGQRFKNEELIAIQQEYGCTQFIDELCRLAGGRFVPDVAENELDKVELANLQLHELSARGLLFAALETALEDGEITSKEEDKIRQALSKHLAATQHSIECAIVLHKK >CP031678|1423490:1439776|1436097_1436772_-|AXP46314.1|DBSCAN-SWA MNQLLTISKENTSTLTMSSREIAELINKNHSDLCRSIERLIAKEVIWGYQPMAYTHPQNGQTYYEYHLTKRDSLIVVAQNCPEFTAAIVDRWQALENQQKPTALIPQSFSEALMLAAQLQAEKERNAPKVAFVDHYVEVGTSKSFRETAKILKMPERALVNRLVEDKYLYRQSGVLLPYQSARTKDLFTVKTGTAEHGHNYTQTRVTSKGIEFIASRYASELML >CP031678|1423490:1439776|1432334_1432706_-|AXP46308.1|DBSCAN-SWA MNIDVISVEFGYWATPRYETEFPRVAAGFAEMKCDARYAEKYRMRPISDELGMEIDGYLGVIRKVTPELYDVFVLTYIKRWEKQEIWRYLHISRREYFNRLKTVKTSLLLLLSTEGKQCLFIA >CP031678|1423490:1439776|1423807_1425118_-|AXP46298.1|head|DBSCAN-SWA MLMNLPEILKSQKTRKIRKFKPVKMSKRTELWYRQQLKQFVKTMTDDVERAMQQPQGSFFMDDAKGFQAISAKVLMKVLEKYEKSDRTSQAENIANGFVGRGDAQNHAEVSTNLKNQTGIDLSAYLRNSPNIAERVNALTAGNIQLIKSIRSQYLDKVQNTVMQAMVRGSLNKDLAAQVKDLGKTTEKRAMFIARDQSSKLNAALTQARHEEVGIKKYMWSTSGDERVRESHAEKDGQIFEYANPPADTGHPGHDVNCRCVQIPVLDDVVNLKSEETELSYQAAEPNKTGKMDLDELFESSIGGGGNKSFSNFGGVNSELITLAKESIGLDITDWQHSIDESSIRHILKQHGNEKAENKRGQRAVTKKDILLLPLVVSAFDSIEYTGTSDSGNETFLIKKEIDDEIFSVQEVRKRHKKIAVKTMWIKRKKKATSSA >CP031678|1423490:1439776|1427683_1428196_-|AXP46300.1|terminase|DBSCAN-SWA MSDVKGKSTSGRGLTPKQEKFCQLYIELGNASEAYRQSYDCQDMKSESINRLAKKELDKIKIRSRVDVLQQEHRQRHNLTLDNIIADLQEYRDICMGRKPLTITTVVKNAQEGTAQSVNTECFVFEPTGANKALELLGKHLGMFTNKVDVTTDGKPLPTVINVTFSDEPA >CP031678|1423490:1439776|1434495_1434720_-|AXP46311.1|DBSCAN-SWA MTSYKCPKCGAELEDFYTPDYFISSSEWDDDRFRCNGHLIEPIPFPQVSKYSAVNRTKSCGYFGLEDLGVEYKE >CP031678|1423490:1439776|1439440_1439776_+|AXP46319.1|DBSCAN-SWA MQTIYVKDFSQYPGPRYIKDGKASGEEFRDSILIPAIKRDPDIILNLDDTEGYGSSFLEETFGGAIRKGISPEVVLNLVKNLISNDDHDIIDEIKSYVEKEIEILSLKDNK >CP031678|1423490:1439776|1423490_1423667_-|AXP46297.1|DBSCAN-SWA MKFTDKTTQAATQRTITKDGFLVVPATISKVGVFDYLATELGLKEDGIKKVARTEKSL >CP031678|1423490:1439776|1434042_1434459_-|AXP46310.1|DBSCAN-SWA MSQYKPFFLRDQRIKNNCLDLIKELPIDDKKPLVVKIQPITRSLEQNSKLHALLSDISKQCEFNGKKRDIDTWKMIMVSAHKIATGGQAEMVIGLEGEVINLRESTAQMSVKRLASLIEYITCWCVQNGVRFNDRWGL >CP031678|1423490:1439776|1437608_1438307_+|AXP46317.1|DBSCAN-SWA MTDLASRLNELMAKQGKNIVDLQKAVGVTYEMARRYTLGTATPRDNKIEAIAKYFGVTPAHLKYGTVDSLENQVTSNVKDVGSFDLWDCNTPLNSDEYAVPFYQDIRLAAGNGFADDIADYNNFKLRFSKSTLRKQGVQYENAVCVIADGNSMEPVIPDGTTVGIDLGNKTIRDGKIYAINHGGLLRIKLLYNMPNEQVKIRSYNTEEHPDEIAELQDISVLGKVFWYSVLL >CP031678|1423490:1439776|1434716_1435358_-|AXP46312.1|DBSCAN-SWA MANSITQNQINTLPPERTQRAEETINWLFQELKSIFPGWRAAFETEADYLSAKKTWLRVLVREKITRPQLENGICEAEKSLDKFLPSVGLFVYWCKAYDYHALGLPNEAELYQRYNTFLGYARFNRDEFQYRSKVEFWLLKNLYEKCKKKSEEDTLKAIPKLLTKAAEKVRSNFPFEDIPKMIPEKPSFYDKAKADKARDSLMAMMKGKGALQ >CP031678|1423490:1439776|1431319_1432285_+|AXP46307.1|DBSCAN-SWA MVSTSLTAEKRKERAEKAALARWEHKKALEELPLAIHEGVLSIGDKSLDVAVLQNDLRIISSASVFEALDRPNRGSRGGAITENEELIKLPAFMDANNLKPFINQDVIDVIKGVKYRTKDGKIKEGYDATILPVVCDIYLRAREEGALVGKQQNTAQKAEILIRSLAKVGIVALVDEVTGYQDARAKDALAKIFEAFVAKELQPWVKTFPLDYYKELCRLYGVQFPPKNNNQFPQFFGHITNNAVYARLAPELLPELKKSASKQAKKVKLHQFLTEDVGHPKLREHLSSIVTLLKLSKDKDNFYEMLDKIHPKLTLQEGQE >CP031678|1423490:1439776|1437309_1437498_-|AXP46316.1|DBSCAN-SWA MLPIEKAYEIVGGISAMARHFNLTPWAVSKWREKVPAERCAKIEELTDGKVKKSELRPDLWD >CP031678|1423490:1439776|1432736_1433402_-|AXP46309.1|DBSCAN-SWA MKCKIDGCNREAMYKADCVCQMHYFRFMRNGTYDLLPKPIRKYRRHNGKGYQLIFEPRHQLAMSDGYVYEHRFVIYSIYQNNLPNCKLCGCKLTWSSCHIDHIDNDITNNTLENLRPICRACNVMRSHTLIPKYTHKGHSKITFNGLTMTAAEWARQDGVTVAGNTILRRIRDGWSIERALFETSSTHPNAAVKHTTTKYKNRFEVKSTGISLDLRLQGDD >CP031678|1423490:1439776|1425017_1426352_-|AXP46299.1|DBSCAN-SWA MNILDGIKSLALKLGSKQDQTYYARGLSLTDDLMQIEALWRDNWIANKVCIKRSEDMVRNWRDIFSNDLKSEQLDEFTKLERRLKLRETLTKALQWSSLYGAVGLLLVTDTINITSPLQPTERLKRLIILPKWKISPTGQRDDDVFSPNFGRYSEYTIIGGTQSVLVHHSRLLIINANDAPLSDNDVWGVSDFEKIIDVLKRFDSASANVGDLIFESKIDIFKIAGLSDKISAGLENDVAHVISAVQSIKSATNSLLLDAENEYDRKELSFGGLKDLLTEFRNAVAGAADMPVTILFGQSVSGLASGDEDIQNYHESIHRLQETRLRPVLEVLDTLLCNELFGGQPDDWWFEFLPLTVVKQEQQVNMLNTFATAANTLIQNGVVNEYQVANELRESGLFANISAEDIEEMKNVNEFAGNFEEPENTEDSQVQASEDEQENGALV >CP031678|1423490:1439776|1428520_1428802_-|AXP46302.1|DBSCAN-SWA MLNQLKQSLRLNLVLTLVCLSLFLTACTNKITTKPEYIYPPQAYTAPCVKTAFTGETYGDVVIQLVKVTAERDKCASQVDHLNKWINQAKGGK >CP031678|1423490:1439776|1435342_1436101_-|AXP46313.1|DBSCAN-SWA MSMRLMVQAMNCKVGNPARKLVLLKLADNANDDGICFPSYQYIADKCEMTRRSAINHIEYLIKMGLVSKKERKNKDGSISNLYFLHLEQGSENFALGSENISLGSENFALGGSENISPRTSHSLEPVNEPKKTTQKSEAEMLLEQFGITGQLAKDFIAHRKAKKGVINQTQLNRLQKQADKAGISICEAVEICIERNWQGFNASWDWRDEKLRPNSPHLGQSHRNKPKFDDTQTGWSAGMNFIVDGTQWQIP >CP031678|1423490:1439776|1429600_1429957_-|AXP46305.1|holin|DBSCAN-SWA MPIKEPDVWALIWSWLQTNLSSSSAQSAFWALFISLLRFGFMRKKPAIRYVLIDAAMCASIAGVAVPICTHLFGHTEYSSFLGTMIGFVGTEKIREFLFKFINRRIEKDDNDDFRSDI |
24 | Haemophilus_phage(42.86%) | head,terminase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1681282 : 1689791
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP031678|1681282:1689791|DBSCAN-SWA TATGAATATTTTCAATCCAAACCACGATCGTAAAGCGATTGTCATCTTTTCAGGTGGACAAGACTCCACGACTTGTTTATTCCAAGCTATTGCTGAATACGGCAAAGAAAACATAGAAGCCATTACCTTTCAATATGGGCAGCGTCATGCTATTGAATTAGAAAAGGCGCGCGCCATTGTGCAAGATCTCGGCATTAAACAAACCTTGATTGATACATCTGTTATGAAAGCTATCACACATAATGCATTAATGGATGAACAGGCGCATATTGAGCAAAAAGAGAATGAATTGCCAAACACTTTTGTTGATGGTCGCAATGCCCTATTTTTACTTTATGCAGCGATTTATGCGAAAGGCCAAGGCATTCAAGATATTATCACTGGCGTATGTGAAACAGATTTCAGCGGTTATCCAGATTGCCGAGATGTGTTTATCAAGTCAATGAATGTCACATTAAATTTAGCTATGGATTATCAATTCAATATCAAAACACCATTAATGTATCTCACTAAAGCCCAAACTTGGCAGCTTGCTGATGAATTAGGCGTATTAGATTATGTACAAAAACATACTCACACTTGCTATGAAGGCATCGAAGGTGGATGCGGAAAATGCCCAAGCTGTATTTTACGCAATAAAGGTCTAAAGAAATATTTGACTCAAAAAGGTAGAAAAAATGTTTAAAATTTCCAAAGAATTTAGCTTTGACATGGCACATTTATTAGATGGACATGATGGGAAATGTCAAAATTTACATGGACACACATATAAATTACAAGTTGAAATTTCGGGTGACTTATATGAATCAGGTGCAAAAAAAGCAATGGTCATTGATTTTTCAGATCTAAAGTCTATTGTGAAAAAAGTTATTTTAGATCCGATGGATCACGCCTTTATTTATGATCAAACCAATGAGCGAGAAAGCCAAATTGCCACTCTATTGCAAAAGTTAAACTCAAAAACTTTTGGTGTTCCCTTTAGAACTACGGCAGAAGAAATAGCTCGTTTTATTTTTAATCGTTTAAAACATGATGAACAACTGTCCATATCATCCATTCGTTTATGGGAAACCCCAGCTTCATTTTGCGAGTATCAGGAGTAAATGTTGATGGAAAAATATCATGATTTTGAACCGAACTTTAACATAGTCGAAATTTTTGAAAGTCTGCAAGGGGAGGGCTTCAATACGGGAATGCCAAGTGTTTTTGTACGATTTGGTAAATGCAATCTAGACTGTCCTTGGTGTGATACACCTTATAATAATTTTAAACGCTGGTCTGTATCACAAATTCTAGAAAAAGTGCGGTCATTTTCGTCAAAGAATATTATCATCACAGGTGGTGAGCCAACAATTGTACCAAAAATTGAATACTTACTTGAGCAATTTAAATCAGATGGCTATTTTCTTGCAATTGAAACCAATGGTCTAAAAGCAATTCCTGCACAAATAGATTATATTGCGACGAGTCCTAAGAGCCTTTATGCTCATAAGTATGAAAAGCGTTGCATTCCATTTGCAAATGAAGTACGTATTGTAATGGACAGTAATATGCCATCATTTTGTGAATTGATCGAGCAAAAAATAAAAGCAAAGAATTACTATCTTTCACCTTGTGAAATTGATGGGAAAATGAATTTACTTGAGACTATCACTTTACTTGGTCAATTGAATCAACGTTCAAATAAACCTAAATGGCAGCTAAGTTTACAAACACATAAATTGATTGGTATTGAGTAATAGAAGGAAATATTATTTTTTGATCAGTATATAATTTAGTATATGACGTTTTCTACTTTAGAGAGTGATCATAATGAAACTTGGATAGCACACTTCTCCCATTCCTTTGTGCTAACCATTTTTTGAAATTTTGTACCATATCTCACTCTTTCTTATTTGTATTAATTATGAATAACATTGAATTTGAGTAACTTTTTAACCTAAAACTTAATTCGGACAAAATCACCGACTATGCGTAAAATGGCGTGCAAGTAGAAGGAAAAGCAAATGTTTATAAAATCATTACAGGAATCCTAGCAAATCAAGTATTGATTAAGTCATTAAACAACATTCCTATACTATTACATCATGGGTATTTTTGGAAAAATGAGAAACCTTGCATTTTAGGAATGAGAGGTAAACGAATTAAAAATTTGTTTATAGATAGTATAAAAATAGCTTTCAAAGCATATGGTTTTGATGTTGAGTTTAAGGATATAGGAGAATCCCGCTTAATATTATTCTTAAAATGTTCTACCCTACTTTTGATATACTCACAAATCTTATTGTTTCACAAGATAGATGAGACTATAATAACTGTAAATTTAAACAGATTAAAGATAGTTTATGATGGATATTTCTGAATTACTTGACGGGCTTAACGATAAACAACGCGAAGCCGTAGCTGCTCCTCTTGGTAATCACCTAGTGCTAGCTGGTGCAGGATCGGGCAAAACGCGTGTATTGACGCACCGTATTGCTTGGTTAATTGCGGTCGAAAATATTTCTGAAGGCAGCATTATGGCGGTGACCTTTACCAATAAAGCCGCAGCAGAAATGCGTCATCGTATTCAATCTACCCTTGCCAAACACGCACAACATCAATTAGTTGGTATGTGGATTGGCACCTTTCACAGCATTGCCCATCGTTTATTACGAGCTCATCATTTAGATGTGGGATTGCCACAAGATTTCCAAATTTTAGATTCAGAAGATCAACTTCGTTTAATTAAACGATTATTAAAATTACATAATTTTGATGAAAAAGCTTTTCCGCCTAAACAGGCTTGTTGGTACATCAATAATAAAAAAGATGAAGGCTTGCGACCAAATGATATTGAAGATTTTAATGATCGCCAAGAACGTGAATGGATTAAAATTTATCAGATCTATCAAGACACTTGCGATCGCGCAGGGTTGGTCGATTTTGCTGAATTATTAATTCGGGTCTATGAATTATTTGAGAAAAAACCATTAATTTTGCAACGTTATCAACAACGTTTTCAGCATATTTTGGTGGATGAATTTCAAGACACCAATAAAATCCAATATAAATGGATCAAAATTCTTTCTGGAAAAACAGGCAAAGTCATGATTGTGGGCGATGATGATCAATCTATATACGGTTGGCGTGGTGCACAAATAGAAAATATCCAAAAATTCTTGAAAGATTTCAAAGCCGAAACAATTCGCCTTGAACAAAACTATCGTTCTACCGCCAATATCCTAAACAGCGCAAATGAATTAATTGCAAACAATAGTGATCGTCTTGGTAAAAATTTATGGACAGAGGGTGAAAAAGGCGATCCTGTGGGCATCTATGCTGCCTTTAATGAATTAGACGAAGCAAAATTTGTCGCCTCACAAATTCAGGATTGGGTGGAACATGGCGGAAAACTTGATGATTGCGCTGTACTTTATCGTAGTAATAGCCAATCACGGGTTATTGAAGAAGCTTTAATTCGTTGTCAAATTCCATACCGTATTTATGGCGGTATGCGTTTCTTCGAACGTCAAGAAATTAAAGATGCGTTAGCCTATCTTCGTTTGATTAATAATCGTCAAGATGATGCGGCTTTTGAGCGTGTAATTAATACGCCAACCCGTGGCATTGGCGACCGCACTTTAGATATATTGCGTAACTTAACACGTGAACGCCAAATTACCTTATGGCAAGCAGTACAAGTCGCAACACAAGAAAATATGTTGGCAGGGCGAGCCTCAACAGCCTTATTACGTTTCCAAGAATTAATTAATTCACTACAACTTGATACCGCAGAAATGCCGCTTTTCGCACAAACTGATTTTGTGATTAAACATTCGGGCTTATATGAAATGTATCAACAAGAAAAAGGCGAAAAAGGCGAAGTGCGTATTGAAAATTTGGAAGAATTAGTTACCGCAACCCGTGAATTTATCAAACCTGATAATGCGGAAGAAATGACCGAACTCACTGCCTTTTTAACGCACGCTTCCTTAGAAGCTGGCGAAGAACAAGCCTCGCCGCATCAATCTTGTGTAGAAATGATGACGTTGCACTCTGCGAAAGGCTTAGAATTTCCTCGTGTATTTATGGTGGGCGTAGAAGAAGGATTATTCCCAAGTTTTCGTTCTTTTGAAGAACCCGGACGTTTAGAAGAAGAGCGTCGTTTAGCTTATGTCGGTATTACTCGTGCGCAGAAAAAACTGACCATCTCTTATGCGGAAAGCCGTCGATTATATGCCAAAGAAGAACGCCATTTGCCATCACGGTTTATCGCAGAATTACCGAGAGAATGTATCCAAGAAATTCGTTTACGAGGGACAGTCACGCGTGCGATGAACCTAGCAAAAGTCGGTTCATTGTCGAATACCAGTGCGGTCGAAAATGAATGGAAAATGGGTCAAAAAGTTAAACACGAAAAATTTGGTTTCGGCACAGTGATTAATGTGGAAGGATCTGAAAATAACACACGTTTACAAATAGCGTTCCAAGCTCAAGGCATTAAATGGTTGATTGCGCATTTGGCAAAATTGGAAAAAGTGCGGTAGAATTCAAGAGTATTATATTTTTTACCGATTAATTTCTTTGAAAAGTGCGGTGAATTTTTACCGCACTTTTATTATCTACGAGTGATGGAATGTTTAAATTTGTATTCAAACGAATCTTAATGGTGATCCCTACTTTTATTGCCATTACTCTTATTACCTTTGCCCTTGTGCATTTTATTCCCGGTGATCCTGTGGAAATTCTGATGGGGGAACGTGGCTTAACGGCAGAAGTACATCAACAAATGATGCACCAATTGGGTTTAGATTTACCTCTTTATCAGCAATATTTCCACTATATTGGCAATGTAATTCAAGGGGATTTCGGTGCATCGTTCCGCACTCAACAACCTGTCCTTAGTGAATTTTTTACGCTTTTTCCCGCTACCGCTGAATTAGCTTTTTTTGCGTTATTTTGGTCATTATTAGGTGGAATAATTTTAGGCACGATTGCCGCAGTAAAAAAAGACAGTTGGATTTCTCACACCGTTACAGCTGCATCGCTCACAGGTTATTCTATGCCGATTTTCTGGTGGGGATTGATTTTAATTTTATACGTTTCACCACAACTCGGTTTACCGCAAGGTGGACGTTTAGATAATGAATTTTGGATCGATACGCCGACTGGATTTATGCTTATTGATAGCTGGCTTTCAGGTGTTTCTGGTGCCTTCGAAAATGCGGTGAAATCCTTAATTCTTCCTGCCATCGTCTTAGGCACAGTTCCTCTCGCCATTATTACGCGTATGACACGATCTGCAATGCTGGAAGTATTAGGCGAAGATTACATTCGCACGGCAAAAGCAAAAGGTTTAAGCTATACTCGAATTGTTATTGTTCACGCATTGCGTAATGCGTTAATTCCTGTTGTCACTGTGGTCGGGTTAATTGTAGGTCAATTGCTTTCTGGTGCAGTTCTCACAGAAACTATTTTCTCTTGGCCGGGGATTGGAAAATGGATTATTGATGCCATTCAAGCCCGTGATTATCCGGTATTACAAGGTTCTGTACTGATTATTGCGACGATTATTATTGTGGTGAATTTAACCGTCGATTTACTTTACGGCGTGGTCAATCCGCGTATCCGTCATTAATTGTAGGAGAAATTATGTCTGACACGCCTTTAACTTTTGCGCCAAAAACACCTTTACAAGAATTTTGGTTTTACTTCAAACAAAATCGTGGTGCGCTAATTGGTTTAATTTTTATTTTGATTGTTGCCTTAATCAGCATTCTCGCACCTTATATTGCGCCTTTTGATCCAACAGAACAAAATCGTACCGCACTTTTACTTCCCCCTGCTTGGTATGAGGGCGGTAATCCTGCTTATTTACTCGGCACAGACGATATTGGGCGAGATATTCTTTCGCGTATTATTTATGGAACGCGAATTTCCGTCTTTGCGGGATTTATCATCGTATTACTATCTTGCGCCTTTGGTACCAGCCTTGGCTTGATTTCTGGCTATTATGGCGGCGTGCTAGATACAATTATCATTCGCCTAATTGATATTATGCTCGCAATTCCAAACTTACTTTTGACGATTGTAGTCGTCTCTATTTTAGAGCCATCACTCGCCAATGCCACTTTAGCGATCGCCGTGGTATCGATTCCTAGCTATGTGCGTTTAACTCGAGCAGCGATGATGAATGAAAAAAATCGTGATTATGTGACTTCATCTAAAGTGGCAGGGGCAGGTATTTTACGCCTCATGTTTATTGTGATTTTACCAAACTGTTTAGCCCCTTTAATTGTGCAAATGACTATGGGAATATCCAATGCTATCTTAGAACTCGCGACACTTGGTTTCTTAGGCATTGGTGCAAAACCACCAACACCAGAACTTGGCACAATGCTTTCCGAAGCTCGTGGTTTTATGCAAGCGGCAAACTGGTTAGTTACAATTCCTGGCTTAGTGATTTTATCTTTGGTATTAGCTTTCAACTTAATGGGCGATGGCTTGCGTGATGCCCTTGATCCAAAACTCAAACAATAGGAAAACAGAATGGCATTATTAGACGTAAAAGAACTTTCTGTTCACTTTGGCGATAAAAAAACGCCATTTAAAGCAGTGGATCGCATTAGCTATCAAGTCGCACAAGGCGAAGTGCTTGGCATTGTGGGAGAATCAGGTTCGGGTAAATCTGTGAGTTCTCTCGCAATTATGGGATTAATTGATCATCCTGGACGTGTATCTGCTGAATCCTTGCAATTTGAAAATACTGATTTACTCACTTTAGAGAGTAAAGCTAAACGCCAGCTTATTGGTGCTGATGTTGCGATGATTTTCCAAGATCCGATGACAAGTTTAAATCCTGCTTATACTGTGGGATTCCAAATTATGGAAGCGTTAAAAACTCACGAAGGCGGCACAAAAAAGGCGAGAAAAGACCGCACTTTAGAGCTTTTAAAATTGGTCGGTATTCCTGATCCTGAATCTCGGATTGATGTTTATCCCCATCAGCTGTCTGGTGGAATGAGCCAGCGCGTGATGATTGCGATGGCAATTGCTTGCAGACCTAAATTATTGATTGCTGACGAACCAACCACGGCATTGGACGTGACTATCCAAGCTCAAATTATGGAACTCTTACTTGAATTGCAAAAGAAAGAATGTATGTCCCTAATTTTGATTACTCACGATCTAGCACTTGTGGCTGAAGCGGCAGAGCGAATTATCGTGATGTATGCTGGACAAATCGTTGAAGAAGGCACCGCAAAAGATATTTTCCGCGAACCAAAACATCCTTACACACAAGCCTTGTTACGTTCATTACCTGAATTTGCAGAGGGAAAATCTCGCTTAGAATCATTACAAGGGGTCGTCCCTGGAAAATACGATCGCCCAACAGGCTGTTTATTAAATCCTCGCTGCCCTTATGCCACCGAATATTGTCGCCAAGTTGAACCTCAATTGCATCATATCGGTTCGCGTAAAGTAAAATGCCATACTCCGCTGAACGAGCAAGGCAATCCAGTTGAATATCAAGGAGCTTAATAATGACGAATGAAGTAAAAGAAAATACGCCATTATTAAATGCCATTGGCTTAAAAAAATATTACCCTGTAAAAAAAGGCTTGTTTGCAAAACCACAGCAAGTAAAAGCGTTGGATGGTGTCTCTTTTCAGCTTGAACGAGGTAAAACTTTAGCAGTCGTGGGGGAATCTGGTTGTGGAAAATCAACGCTAGGTCGTTTATTGACAATGATTGAAGAACCAACCAAAGGCGAACTTTATTACAAAGGGCATAATTTTTTAGAAAATGATTCTGAAACAAAAGCACTACGTCGTAAAAAAATTCAAATAGTTTTTCAAAATCCTTACGCATCGTTAAATCCACGCAAAAAGATTGGTTCAATTTTGGAAGAACCATTAATCATCAATACAAAACTTTCCGCCAAAGAACGGCGAGAAAAAGTTTTATCGATGATGGAAAAAGTGGGCTTGCGCGCTGAATTTTATGATCGTTATCCCCACATGTTCTCAGGCGGACAACGCCAACGTATTGCCATCGCTCGTGGTTTAATGTTAGATCCAGATGTTGTCGTTGCCGATGAGCCTGTTTCTGCATTGGATGTTTCCGTGCGTGCACAAGTACTGAATTTAATGATGGATTTACAAGATGAATTAGGCTTGTCTTACGTGTTCATTTCACACGATCTTTCTGTGGTAGAACATATCGCTGATGAAGTGATGGTAATGTATCTAGGTCGTTGTATTGAAAAAGGGACGACAGAGCAGATTTTTTCTAATCCTCAGCATCCTTATACCAAAGCGTTACTTTCAGCGACACCACGTTTGTCGCCAAACTTGCGCCGTGAACGCATAAAACTGACAGGCGAATTGCCAAGCCCGATTAATCCGCCAAAAGGCTGTGCATTTAATCCTCGTTGTTGGAAAGCGACAGAAAAATGTCGTGAAAATCAACCGCACTTGGAACAATATACTGATGGAAAATTAATCGCTTGTTTCCATATTGATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP031678|1681282:1689791|1688807_1689791_+|AXP46558.1|DBSCAN-SWA MTNEVKENTPLLNAIGLKKYYPVKKGLFAKPQQVKALDGVSFQLERGKTLAVVGESGCGKSTLGRLLTMIEEPTKGELYYKGHNFLENDSETKALRRKKIQIVFQNPYASLNPRKKIGSILEEPLIINTKLSAKERREKVLSMMEKVGLRAEFYDRYPHMFSGGQRQRIAIARGLMLDPDVVVADEPVSALDVSVRAQVLNLMMDLQDELGLSYVFISHDLSVVEHIADEVMVMYLGRCIEKGTTEQIFSNPQHPYTKALLSATPRLSPNLRRERIKLTGELPSPINPPKGCAFNPRCWKATEKCRENQPHLEQYTDGKLIACFHID >CP031678|1681282:1689791|1681282_1681966_+|AXP46551.1|DBSCAN-SWA MNIFNPNHDRKAIVIFSGGQDSTTCLFQAIAEYGKENIEAITFQYGQRHAIELEKARAIVQDLGIKQTLIDTSVMKAITHNALMDEQAHIEQKENELPNTFVDGRNALFLLYAAIYAKGQGIQDIITGVCETDFSGYPDCRDVFIKSMNVTLNLAMDYQFNIKTPLMYLTKAQTWQLADELGVLDYVQKHTHTCYEGIEGGCGKCPSCILRNKGLKKYLTQKGRKNV >CP031678|1681282:1689791|1683409_1683643_+|AXP46755.1|DBSCAN-SWA MRGKRIKNLFIDSIKIAFKAYGFDVEFKDIGESRLILFLKCSTLLLIYSQILLFHKIDETIITVNLNRLKIVYDGYF >CP031678|1681282:1689791|1687812_1688805_+|AXP46557.1|DBSCAN-SWA MALLDVKELSVHFGDKKTPFKAVDRISYQVAQGEVLGIVGESGSGKSVSSLAIMGLIDHPGRVSAESLQFENTDLLTLESKAKRQLIGADVAMIFQDPMTSLNPAYTVGFQIMEALKTHEGGTKKARKDRTLELLKLVGIPDPESRIDVYPHQLSGGMSQRVMIAMAIACRPKLLIADEPTTALDVTIQAQIMELLLELQKKECMSLILITHDLALVAEAAERIIVMYAGQIVEEGTAKDIFREPKHPYTQALLRSLPEFAEGKSRLESLQGVVPGKYDRPTGCLLNPRCPYATEYCRQVEPQLHHIGSRKVKCHTPLNEQGNPVEYQGA >CP031678|1681282:1689791|1683626_1685810_+|AXP46554.1|DBSCAN-SWA MMDISELLDGLNDKQREAVAAPLGNHLVLAGAGSGKTRVLTHRIAWLIAVENISEGSIMAVTFTNKAAAEMRHRIQSTLAKHAQHQLVGMWIGTFHSIAHRLLRAHHLDVGLPQDFQILDSEDQLRLIKRLLKLHNFDEKAFPPKQACWYINNKKDEGLRPNDIEDFNDRQEREWIKIYQIYQDTCDRAGLVDFAELLIRVYELFEKKPLILQRYQQRFQHILVDEFQDTNKIQYKWIKILSGKTGKVMIVGDDDQSIYGWRGAQIENIQKFLKDFKAETIRLEQNYRSTANILNSANELIANNSDRLGKNLWTEGEKGDPVGIYAAFNELDEAKFVASQIQDWVEHGGKLDDCAVLYRSNSQSRVIEEALIRCQIPYRIYGGMRFFERQEIKDALAYLRLINNRQDDAAFERVINTPTRGIGDRTLDILRNLTRERQITLWQAVQVATQENMLAGRASTALLRFQELINSLQLDTAEMPLFAQTDFVIKHSGLYEMYQQEKGEKGEVRIENLEELVTATREFIKPDNAEEMTELTAFLTHASLEAGEEQASPHQSCVEMMTLHSAKGLEFPRVFMVGVEEGLFPSFRSFEEPGRLEEERRLAYVGITRAQKKLTISYAESRRLYAKEERHLPSRFIAELPRECIQEIRLRGTVTRAMNLAKVGSLSNTSAVENEWKMGQKVKHEKFGFGTVINVEGSENNTRLQIAFQAQGIKWLIAHLAKLEKVR >CP031678|1681282:1689791|1681958_1682384_+|AXP46552.1|DBSCAN-SWA MFKISKEFSFDMAHLLDGHDGKCQNLHGHTYKLQVEISGDLYESGAKKAMVIDFSDLKSIVKKVILDPMDHAFIYDQTNERESQIATLLQKLNSKTFGVPFRTTAEEIARFIFNRLKHDEQLSISSIRLWETPASFCEYQE >CP031678|1681282:1689791|1686915_1687803_+|AXP46556.1|DBSCAN-SWA MSDTPLTFAPKTPLQEFWFYFKQNRGALIGLIFILIVALISILAPYIAPFDPTEQNRTALLLPPAWYEGGNPAYLLGTDDIGRDILSRIIYGTRISVFAGFIIVLLSCAFGTSLGLISGYYGGVLDTIIIRLIDIMLAIPNLLLTIVVVSILEPSLANATLAIAVVSIPSYVRLTRAAMMNEKNRDYVTSSKVAGAGILRLMFIVILPNCLAPLIVQMTMGISNAILELATLGFLGIGAKPPTPELGTMLSEARGFMQAANWLVTIPGLVILSLVLAFNLMGDGLRDALDPKLKQ >CP031678|1681282:1689791|1682384_1683020_+|AXP46553.1|DBSCAN-SWA MLMEKYHDFEPNFNIVEIFESLQGEGFNTGMPSVFVRFGKCNLDCPWCDTPYNNFKRWSVSQILEKVRSFSSKNIIITGGEPTIVPKIEYLLEQFKSDGYFLAIETNGLKAIPAQIDYIATSPKSLYAHKYEKRCIPFANEVRIVMDSNMPSFCELIEQKIKAKNYYLSPCEIDGKMNLLETITLLGQLNQRSNKPKWQLSLQTHKLIGIE >CP031678|1681282:1689791|1685929_1686901_+|AXP46555.1|DBSCAN-SWA MVIPTFIAITLITFALVHFIPGDPVEILMGERGLTAEVHQQMMHQLGLDLPLYQQYFHYIGNVIQGDFGASFRTQQPVLSEFFTLFPATAELAFFALFWSLLGGIILGTIAAVKKDSWISHTVTAASLTGYSMPIFWWGLILILYVSPQLGLPQGGRLDNEFWIDTPTGFMLIDSWLSGVSGAFENAVKSLILPAIVLGTVPLAIITRMTRSAMLEVLGEDYIRTAKAKGLSYTRIVIVHALRNALIPVVTVVGLIVGQLLSGAVLTETIFSWPGIGKWIIDAIQARDYPVLQGSVLIIATIIIVVNLTVDLLYGVVNPRIRH |
9 | uncultured_Caudovirales_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1816750 : 1829049
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP031678|1816750:1829049|DBSCAN-SWA TATGTTTAACAAAATTTTTTCGTGGTTTGAAAATCGTTTGAATCCCTATCCAGAAAGCAATCCAACAACACCTAAAAAAGGTTTGTTCCGTTTTATTTGGTCTAGTATTACAGGAATGAAAGGCTGGATTTTTTTGCTCGCAATTTTAACCGTAGGTACAGGTGTAATGGAAGCTGTATTATTCCAATTTATGGGAACGCTTGTAGATTGGTTAGGCACATTTACACCTGAAAGATTATGGCAAGAAAAAAGTCATTTATTAATTGGAATGGCTGCTCTATTACTTATTAGTATTGTGTGGGGATTTTTAGCTTCGGCCGTGCATTTACAAACCTTACAAGGCGTATTTCCAATGCGATTACGTTGGAATTTCCATCGTTTAATGCTTGGACAAAGTTTAAGTTTTTATCAAGACGAATTTGCAGGTAGAGTATCCGCAAAAGTAATGCAAACCGCCCTTGCAGTACGTGACACAGTACTTACACTTGCAGATATGTTCGTTTATGTATTGGTATATTTTATTACCTCTGGCGTAGTGCTAGTGGCATTAGATTCTTGGTTCTTATTACCATTTATTACTTGGATTATACTCTTCGGTTTGATCCTACGAACCCTAATTCCTAAACTATCAAAAACCGCACAACGACAAGCTGATGCTCGTTCTTTAATGACAGGACGCATTACAGATGCTTATTCTAATATTGCTACAGTAAAATTATTTTCTCACGGCTCACGCGAAGCTACTTATGCCAAGCGTTCTATGCAAGATTTTATGGTAACAGTACACGCCCAAATGCGCTTAGCAACATCACTAGATACACTCACTTACGCTACAAATATTCTACTTACGTTAAGTACTGCAATACTTGGTATTATTTTATGGAAAAATGGTCAAGTTGGCGTGGGTGCAATAGCAACGGCAACGGCCATGGCATTACGCGTAAATGGGCTTTCTCGCTGGATTATGTGGGAATCTGCCCGTTTGTTTGAGAATATCGGAACCGTAAACGACGGAATGAATACTTTAACTAAACCCCACACCATTGTGGACAAACCACAAGCGTCACCGTTACAAGTGAAACAAGGGGAAATTAAGTTTAACGATATTACCTTTGCTTACGATCCGACAAAACCATTACTCAATCATTTCAATCTCACTATCAAACCAGGGGAAAAGGTTGGGTTAATCGGTCGTTCTGGTGCAGGAAAATCTACGATTGTGAACTTATTACTTCGCTTTTATGAAGCACAACAAGGCGAAATTACCATTGATGGACAAAATGTACTCAATGTGCAACAAGAAAGCTTACGTCGCCAAATCGGTTTAGTCACTCAAGACACTTCGTTGCTACATCGCTCTGTACGTGACAATATTATTTATGGTCGCCCGAATGCTACTGATGAAGAAATGGTTTTAGCTGCTGAACGAGCGGAAGCCGCTGATTTCATCCCATTTCTCAGTGATTCTCAAGGTAGAAAAGGCTATGATGCCCATGTGGGAGAACGCGGGGTAAAACTTTCTGGTGGTCAGCGTCAGAGAATTGCCATTGCTCGTGTAATGTTAAAAGACGCACCAATTCTATTGTTAGATGAAGCCACAAGTGCATTGGATTCAGAAGTGGAAGTGGCAATACAAGAAAGTCTAGATAAGATGATGGAAAATAAAACTGTGATTGCCATTGCCCATCGTTTATCCACCATCGCAGCGATGGATCGCCTGATTGTGCTTGATAAAGGACAAATTGTCGAACAAGGTACGCACGCCGAATTACTAGAGCTCAATGGTCTGTACGCTAAACTTTGGAATCATCAAAGTGGCGGATTTTTAAGCGGAAGTGCTGAATAATATTGCGTTTATCATATTTAATTAATTGTACTGTAATCAAGCTAATTAAAAAATTAGTCTAATTTAATAGCTAAAGAAAAGTGCGGTGAATTTTCACCGCACTTTTTTGCTAGATATTTAGCGTTTAATTCACGACTTCAGCAGTATATTTCAGCTTGTGAATTGCATCGAATAATTGTTGGTTTGTGACTTTTGGATCTTCCACAACCGTCACTAAACCATCTTTAATAGATGCTTTTGTTGAAATAACGCCATCAATATTACGCAGTTCTTTATTGACTAAGTAAGCACAAAGCTGGCAATTCATTTCCTTTACTTTTAGCACAATTTGTTTGGTTTCATTCGCATGAGCGAAAAAAATTGCAAACAGCGAAAGCAAAAGTGCGGTACATAATTTCTTCATTTTTATTCCTAATTAGCTAATTCTAAAATCCAAGGTAAAATTGTTGGATAGGTTAAGAAAAAAATCATCACGATAAATACAATCCAATATAAAACGATAAGTTTTTTACGGGAAATATATTTGCTACAAATGATTTTTTTGGAAAACATCAACAGCCAAAATCCATAGGCAAAGGCACATAATGAAATGATAAGCATAGGAATACGCAAATAATCATATTCGCCTAAGCCAATCAACCAAGTGGACGACACACCAAATACTAAATAAATTAATGGTGCGATGCAGCACAAGGTTGATGCCACCGCAGCACTTAGTGCGGCGGCTATGGCAACCCAAAAGGATTTATTAGAGTTTTTTAGATACGTAGTCATATTTAAATTCTTTTGGGTCAAAGGAATTTAACGGATCGCCACCTACTTCTGCATATGGATAGCCGAAGTTATTGATTGGAGCCAGTTCTGGTTGTGGATATAAATCGAAGTCACGGGCATGATTAAATCCCACCCAGTTTGCTTCCCAGTTACCAAACAAATATTTTGCTACGGCTTGTGTATCTTTATCTTCAACAGATTTTTTCTCTGCTAAACGCATTTTGGCAACGTCTGCGGAATCAACTGGTACCCATCCAAATCCTGCAAGGTAGAATTCAGCGCGGCAGTGCTGACCGCCACTTACGTTTACGATGCCTTGTTCATTTGCACTACCGAAGGCACCTTTTGAATATTTGCCCATTTTCTCTGCCGTACCTAAGCGAATACCAAAAATTTCACGAGCAGGGATGCCTGCAGCACGAGCAAGTGCCACAAATACAGAGTTAATATCGGTACATTTACCTTTTAACACGCCAGTGGTAAGAATTTTTTCTACATCGCCGTCACCACAACCTAATACAGAATTATCACGTTCCATATTTTTTACGATCCAGTGGTGAATAAGTTCTGCTTTCTTCAATGGATTAGTTTCTTTACCTAGGATTTTGTCAGCAAATTCTTTCACAATGCCATCAGTTTTAATATGTGGAGTAGCTTTTAAGTATTCTTGTACATCCACGGAATACTGAATATCTTTTGGCGGAGTATAATTCTCTAAAGCACCTTTCACCATCGGTTCACGGTCTTTTGTTTCAATGACCATCGTGACTTTTAAATCACGTTTTTGTGCATCTTTATCCCAAGTGGCAAATAAGGTTTTCGCTCCGTATTTATTGTTTTCTGTTACATAGGCATTCATGTAATTACCTTCAAAGTGAATCGATTTCACTTGTTGGTATTCCCCATTAAATGGTAATGGAACCCATAAATTGGTTTGTCCTTGCGAGCCTTTTGGCACAACTAAATCATAGGTTTGCGTGAATTCGTAAAGATGGGCGTCTGTATTGTAGTTTGGAATAATGGTGTTTGCATGAGCTAACGAGCCACACGCAGAAAACACCGCAACCGCGATAAGTTTCTTCATGAAAAGATCCTCTAGTTAATAATAGTTAAACTTAACATATTAGATAAACTAATACGCCACTATGCTAACGGATTTTTAAATCTATAGTCAATTTGTTATTCCAAAATTTATAAAAACATCAACCTACTAAAATACCCTATAAATAATGTACCTATTAATAATTAGTTGATTTGGCTCAAGTAAAACTTCTATACAAAGATTATAATTAACTCGTTTTAGTTATTACTCGATCTTACTGTGGGGGACGATATTATGAGTAACTTTAATCAAATAAGTCGCCGAGATTTTGTCAAGGCGTCATCTGCGGGAGCTGCACTGGCAGTTTCAAATCTTACTTTACCTTTCAATGTAATGGCTAAAGAGACACAACACCTCAATGAAAATAGTCAGGAACGTATTGTTTGGAGTGCTTGTACAGTAAACTGTGGTAGCCGTTGTCCATTACGAATGCACGTAAAAGATAACCGAATCACTTATGTGGAAACCGATAATACGGGGACAGAAACATATAATCTTGATCATCAGGTTCGTGCTTGTCTACGTGGACGTTCTATGCGTCGTCGAGTGTATAACCCAGACCGTTTAAAATATCCAATGAAACGTATAGGTAAACGCGGAGAAGGTAAATTCAAACGAATCAGTTGGGATGAGGCTTTAACTGAAATTGCAGACGCATTGAAACGCAATATCAAAAAATATGGCAATGAATCAATTTATTTAAACTATGGTACGGGAACACTCGGTGGCACAATGGCTAAATCTTGGCCTCCTGCATCCACTATGATCGCTCGTTTTATGAATTGTATTGGTGGATATTTAAACCATTATGGTGATTACAGCACCGCACAAATTGCAGTCGGTTTAGATTATACCTATGGTGGTGGTTGGGCATTGGGAAATGGAATGGCTGACATTGAAAACACCAAATTAATAGTGTTATTCGGTAATAATCCTGCAGAAACTCGTATGAGTGGAGGTGGTTTAACTTATTGTATTGAACAAGCCAAAGCTCGTTCCAATGCCAAAATGATTATTATTGATCCTCGTTATAATGATACTGGTGCAGGGCGTGAAGATGAGTGGATCCCAATTCGTCCGGGTACTGATGCAGCCCTTGTTGCTGCCCTTGCTTATGTAATGATTAAAGAAAATCTCGTGGATCAACCTTTCTTAGATAAATATTGTGTTGGTTATGATGAAAAAACATTACCCGCTGACGCCCCTAAAAATGGTCATTATAAAGCCTATATTTTAGGTTATGGTGATGATGATGGTATCGCTAAAACCCCTGAATGG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AAACTCAACCCAAGCGGTATTTTAGGCATTTTCCCTGCAGAACGTGTGGACGATGATGTTGTGCTATTCTCTGATGAAGAACGCACGAAAACAATTGGCACCGCTTACGGCTTACGCCAACAAACGGAACGTGGTAAAAACAGCAAGAGCCCATTTAACTTCTGCTTAAGCGACTTTATCGCCGATCGCGAAAGCGGTAAAAAAGACTGGTTCGGCATGTTCGCCGTCTGTGCGGGTGTTGAAGAAATGGATTTAGTAGAAGGCTATAAAGCTGCAGGCGATGACTACAATGCTATCTTACTACAAGCTGTGGGCGACCGCTTAGCTGAAGCAATGGCGGAATACCTACACTTTGAGCTTCGCACCCGCATTTGGGGCTACACGCAAGAAGAATTTGACAACCAAGGGTTAATTAATGAAAATTATGTTGGCATCCGACCTGCACCGGGTTATCCAAGCTGCCCGGAACACACGGAAAAAGCCCTGATTTGGGATTTATTAGAAGTCGAACAATGCATCGGCATGAAACTCACCGAAAGCTACGCCATGTGGCCGGCAGCTTCCGTCTGCGGTTGGTACTTCACCCACCCGGTAAGCAATTATTTCACCTTAGGTCGCATTGATGAAGACCAAGCTCAAGGTTATGCCAAACGTAAAGGTTGGGATGAGAGAGAGATGATGAAATGGTTGGGTGTGGCGATGAAGTAAAATTTATCTAAATGGAAATAATAAAAATGGATTCATCAAGCATTTTAGAATTAGAGCATCATGATGCCAAAGCGTTTTTCTTAAAACATGAAAGTTATTGTAATATTGATTTACCTAGATATTTTTCATTTACAAACTTATTACAAAAAATCTCAGAAGAATTATCAGATAAGAGCCTATTAAACTTTGATCGTAACACGCATAACAATGCTAACCAAAGACCTGATATTGCAAATAATGAGATGGTAAATCATCTCATATATGCCAATAAAGATGGAAAACTCTCTTGGAGACCACTACAAATTATCCATCCATTAGTTTACGTAGATTTAGTTCATAAAATCACAAAAAAAGATAACTGGGAGAAGTTAAAAAAGCGCTTCAAAGAATACCAAAACAATCCCCAAATTGAATGTCTTAGTATCCCTGTGAAGTCCAATAGTCAATTAAAGGATAAAGCTAAACAAATCCTGAAATGGTGGGAGTCAGTGGAACAAGAGTCTATTTGCCTTTCACTTGAATATGAATATGTTTTTGATACTGATGTGGCTGATTGTTACAGCTCTATATATACTCATTCCATAGCATGGGCTATAGAAGGTAAAGACATAGCAAAAAAGAATCATAGATTAACGCTATTAGGAAACTCTATAGATAAAAAAATTCAGAACTGCCAATATGGGCAAACTAATGGAATCCCACAGGGCTCTATCTTGATGGATTTTATTGCTGAAATGATATTAGGCTATATCGATATACTATTAAGTGAAGAGTTAAAAAATAAAGGGATTTCAGAATATAAAATATTACGCTATAGAGATGATTATAAAATTTTTGTTAAAAATCATAGCGATGGAGAAAATATATTAAAGTATCTATCAGAAATAATGATGTCTTTTGGATTAAAATTAAACTCTAGTAAAACTAAAGGTAGTCAAGATATAGTTACTCAATCAATAAAAAAAGATAAACTAGCTTGGTTAAAAATTGCTAATAATACAAAAAACTTACAAAAGAAAAGCTTAATTATTAGACAGCATAGTATTGAATACCCTAATTCAGGAAGTCTTAATTCAGCACTAAATGAATTTGATCAAGCTATAGAAAAAGAAAATAAGCAGAAAATTTATTTAAGTTTAGAAGAACTTATTAATTCATTAAACACTTCTAATAATAGTATAGAAAAACTATCATCAAATACAAAACAAGTAATAAGTATTATTGCTGATATTGCATATTGTAATCCTAAAGTAATACCTGTTTGTTGTTCTATTATTAGTAAATTATTTACTAAGTTGGAAGACTCAGAGCCTATAAAGAGGCTCGTTTATAATAAACTAATAAGAATGCCAAATTCTGGCTTTGCCCAAATATGGATGCAAAGAATGCTAAAATCTGATCTAAATAATTTTAATTTCTCAGAAAAAATGTGTAATCTGTATAAGGGAGAAATTTCTTTATGGAATAATGATTGGATAATTTGTTCAAATATGTTAAGTATCTTAAAAGACACTCCCGTATTTCAACAGGATGAATTTTCTCAATTAAGTAATACTATGTCTAATGACGAAGTCTATATTTTTGATTATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP031678|1816750:1829049|1818719_1818998_-|AXP46678.1|DBSCAN-SWA MKKLCTALLLSLFAIFFAHANETKQIVLKVKEMNCQLCAYLVNKELRNIDGVISTKASIKDGLVTVVEDPKVTNQQLFDAIHKLKYTAEVVN >CP031678|1816750:1829049|1819343_1820453_-|AXP46679.1|DBSCAN-SWA MKKLIAVAVFSACGSLAHANTIIPNYNTDAHLYEFTQTYDLVVPKGSQGQTNLWVPLPFNGEYQQVKSIHFEGNYMNAYVTENNKYGAKTLFATWDKDAQKRDLKVTMVIETKDREPMVKGALENYTPPKDIQYSVDVQEYLKATPHIKTDGIVKEFADKILGKETNPLKKAELIHHWIVKNMERDNSVLGCGDGDVEKILTTGVLKGKCTDINSVFVALARAAGIPAREIFGIRLGTAEKMGKYSKGAFGSANEQGIVNVSGGQHCRAEFYLAGFGWVPVDSADVAKMRLAEKKSVEDKDTQAVAKYLFGNWEANWVGFNHARDFDLYPQPELAPINNFGYPYAEVGGDPLNSFDPKEFKYDYVSKKL >CP031678|1816750:1829049|1825320_1825821_+|AXP46684.1|DBSCAN-SWA MKNEAYYQAYLSHHHISRRGLLRHVFPATKSTIEKTQSRPPFSAREDLFSAVCNGCRECASACPNGLIQLKQQQATLEIDYAPCDLCGKCAEVCPTNALHPNFPADTLLRPQFSSACLIQKNQTCPDCQTACPQQAISSTLEIDNERCNGCGECKITCFVAAITLK >CP031678|1816750:1829049|1827483_1829049_+|AXP46686.1|DBSCAN-SWA MDSSSILELEHHDAKAFFLKHESYCNIDLPRYFSFTNLLQKISEELSDKSLLNFDRNTHNNANQRPDIANNEMVNHLIYANKDGKLSWRPLQIIHPLVYVDLVHKITKKDNWEKLKKRFKEYQNNPQIECLSIPVKSNSQLKDKAKQILKWWESVEQESICLSLEYEYVFDTDVADCYSSIYTHSIAWAIEGKDIAKKNHRLTLLGNSIDKKIQNCQYGQTNGIPQGSILMDFIAEMILGYIDILLSEELKNKGISEYKILRYRDDYKIFVKNHSDGENILKYLSEIMMSFGLKLNSSKTKGSQDIVTQSIKKDKLAWLKIANNTKNLQKKSLIIRQHSIEYPNSGSLNSALNEFDQAIEKENKQKIYLSLEELINSLNTSNNSIEKLSSNTKQVISIIADIAYCNPKVIPVCCSIISKLFTKLEDSEPIKRLVYNKLIRMPNSGFAQIWMQRMLKSDLNNFNFSEKMCNLYKGEISLWNNDWIICSNMLSILKDTPVFQQDEFSQLSNTMSNDEVYIFDY >CP031678|1816750:1829049|1826098_1827457_+|AXP46685.1|DBSCAN-SWA MGELLKHALVKGITTCQTLPSPLDVIEGPLMAGMDVVGDLFGDGKMFLPQVVKSARVMKQSVAYLEPFINATKQKGSSNAKVVIATVKGDVHDIGKNIVSVVMQCNNFEVIDLGVMVPADKIIQTAIDEKADIIALSGFSGEWADYVPPTPKQTGIVEFKNVPIAELRKFIDWSPFFRIWGLMGGYPDAFDYPEGGKEARKVWNDAQVVLDELEQNHKLNPSGILGIFPAERVDDDVVLFSDEERTKTIGTAYGLRQQTERGKNSKSPFNFCLSDFIADRESGKKDWFGMFAVCAGVEEMDLVEGYKAAGDDYNAILLQAVGDRLAEAMAEYLHFELRTRIWGYTQEEFDNQGLINENYVGIRPAPGYPSCPEHTEKALIWDLLEVEQCIGMKLTESYAMWPAASVCGWYFTHPVSNYFTLGRIDEDQAQGYAKRKGWDEREMMKWLGVAMK >CP031678|1816750:1829049|1823758_1824598_+|AXP46682.1|DBSCAN-SWA MNTGLYELPLVFFTVLAQSAVGAWLVFTFVLLNEKNTKSRTYIHKVMFVILALLGIGFIASIMHLGLPIRAFNSLNRVGSSMMSNEIAAGAIFFALAGFYWLIAILGKMPVSLGNVWRIVTALIGILFMYVMNQVYHITSIPTWNNALTSWSFYLTVVLGGLTLSYALLIPNKQREYQLQHLPSLFAIGVLLVAIVAIYQGFNLHNIHSAIQNAADLVPNYAIMTVTRLCLLSIVAFLLFRVKNIGLLGISVLLTLVAEGIGRVLFYGLHMTYGMAIGG >CP031678|1816750:1829049|1819006_1819324_-|AXP46758.1|DBSCAN-SWA MAAALSAAVASTLCCIAPLIYLVFGVSSTWLIGLGEYDYLRIPMLIISLCAFAYGFWLLMFSKKIICSKYISRKKLIVLYWIVFIVMIFFLTYPTILPWILELAN >CP031678|1816750:1829049|1824709_1825321_+|AXP46683.1|DBSCAN-SWA MQNTLQQISIYGRLLGAVFYYEPNDARLTDILTFFRQPNWMQEWEISFDVKTYKKITALIEKGLQQNITEQYQYLFIGPNELPTPPWGSVYLDPECVIFGNSLLALRDFLQQHQIAFQTQQDEPEDHIGLMLMLAAYLAENQPHLLIEFLREHFLTWAYHFLEQLSKIENSDFYQALALLTIKTLQQWQVDLHINVPTVRFYR >CP031678|1816750:1829049|1816750_1818595_+|AXP46677.1|DBSCAN-SWA MFNKIFSWFENRLNPYPESNPTTPKKGLFRFIWSSITGMKGWIFLLAILTVGTGVMEAVLFQFMGTLVDWLGTFTPERLWQEKSHLLIGMAALLLISIVWGFLASAVHLQTLQGVFPMRLRWNFHRLMLGQSLSFYQDEFAGRVSAKVMQTALAVRDTVLTLADMFVYVLVYFITSGVVLVALDSWFLLPFITWIILFGLILRTLIPKLSKTAQRQADARSLMTGRITDAYSNIATVKLFSHGSREATYAKRSMQDFMVTVHAQMRLATSLDTLTYATNILLTLSTAILGIILWKNGQVGVGAIATATAMALRVNGLSRWIMWESARLFENIGTVNDGMNTLTKPHTIVDKPQASPLQVKQGEIKFNDITFAYDPTKPLLNHFNLTIKPGEKVGLIGRSGAGKSTIVNLLLRFYEAQQGEITIDGQNVLNVQQESLRRQIGLVTQDTSLLHRSVRDNIIYGRPNATDEEMVLAAERAEAADFIPFLSDSQGRKGYDAHVGERGVKLSGGQRQRIAIARVMLKDAPILLLDEATSALDSEVEVAIQESLDKMMENKTVIAIAHRLSTIAAMDRLIVLDKGQIVEQGTHAELLELNGLYAKLWNHQSGGFLSGSAE >CP031678|1816750:1829049|1820705_1823129_+|AXP46680.1|DBSCAN-SWA MSNFNQISRRDFVKASSAGAALAVSNLTLPFNVMAKETQHLNENSQERIVWSACTVNCGSRCPLRMHVKDNRITYVETDNTGTETYNLDHQVRACLRGRSMRRRVYNPDRLKYPMKRIGKRGEGKFKRISWDEALTEIADALKRNIKKYGNESIYLNYGTGTLGGTMAKSWPPASTMIARFMNCIGGYLNHYGDYSTAQIAVGLDYTYGGGWALGNGMADIENTKLIVLFGNNPAETRMSGGGLTYCIEQAKARSNAKMIIIDPRYNDTGAGREDEWIPIRPGTDAALVAALAYVMIKENLVDQPFLDKYCVGYDEKTLPADAPKNGHYKAYILGYGDDDGIAKTPEWAAKITGIPAERIIKLAREIGSTKPAFISQGWGPQRRSNGELISRAIAMLPILTGNVGIHGGNTGARESAYSIPFVRMPTLKNPVKASIPMFLWTDAIIRGTEMTALTDGIRGVDKLSSPIKVIWNYASNCLINQHAQINRTHDILQDDTQCEMIITIDNHMTSTAKYSDILLPDCTTSEQMDFALDAFVSNMAYVIFADQVIKPSFECRPIYDMLSDLAEKMGVKEKFTEGRTQEEWLRHIYEQSREKLPELPTFEEFRQQGIFKKVDPNGFKVAYKDFRDNPEAHPLKTPSGKIEIYSSRLAEIAKTWKLAEDEVIHPLPIHAQSFEHYGNPLMEKYPLQLSGFHYKARTHSTYGNVDVLKAANPQEVWMNPIDAEPCNIKNGDMIRIFNDRGEVRINVKITPRIIPGVVALSEGAWYAPDKDRIDHSGCINVLTTQRPSPLAKGNPQHSNLVQVERL >CP031678|1816750:1829049|1823139_1823757_+|AXP46681.1|DBSCAN-SWA MEQYGFYFDSERCTGCKTCELACKDYKDLGTEVNFRRIYEYTGGQWNQQADGCWHQNIFAYYMSISCNHCADPACTKVCPTGAMHKNADGFVIVNEEICIGCRYCHMACPYDAPQYDAQKGHMTKCDGCYSRVKSGQKPICVDACPLRALDFAPIDELRAKYGTQASIAPLPPADITQPNLVVKPNKHARLSGDTSGFLGNPREV |
11 | Escherichia_phage(71.43%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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