Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP031673 | Staphylococcus aureus strain MOZ66 chromosome, complete genome | 10 crisprs | csa3,DEDDh,cas3,DinG | 10 | 3 | 10 | 4 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP031673_1 | 578170-578250 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP031673_1
|
1 spacers
spacers of CP031673_1
>1.1|578195|31|CP031673|CRISPRCasFinder AGCTGACAGAAAGTCAGCTTACAATAATGTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP031673_1
The CRISPR arrays of CP031673_1 >merge|CP031673|1|578170-578250|CRISPRCasFinder CAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGACAGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGA >CP031673|1|1|578170-578250|CRISPRCasFinder CAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGA AGCTGACAGAAAGTCAGCTTACAATAATGTG CAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGA
>CP031673.1|AXP51295.1|577003_578026_+|cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase MVEQIKDKLGRPIRDLRLSVTDRCNFRCDYCMPKEVFGDDFVFLPKNELLTFDEMARIAKVYAELGVKKIRITGGEPLMRRDLDVLIAKLNQIDGIEDIGLTTNGLLLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDDTLFQSINNRNIKATTILEQIDYATSIGLNVKVNVVIQKGINDDQIIPMLEYFKDKHIEIRFIEFMDVGNDNGWDFSKVVTKDEMLTMIEQHFEIDPVEPKYFGEVAKYYRHKDNGVQFGLITSVSQSFCSTCTRARLSSDGKFYGCLFATVDGFNVKAFIRSGVTDEELKEQFKALWQIRDDRYSDERTAQTVANRQRKKINMNYIGG >CP031673.1|AXP51294.1|576384_576984_+|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase MKAIILAGGHSVRFGKPKAFAEVNGETFYSRVIKTLESTNMFNEIIISTNAQLATQFKYPNVVIDDENHNDKGPLAGIYTIMKQHPEEELFFVVSVDTPMITGKAVSTLYQFLVSHLIENHLDVAAFKEDGRFIPTIAFYSPNALGAITKALHSDNYSFKNVYHELSTDYLDVRDVDAPSYWYKNINYQHDLDALIQKL >CP031673.1|AXP51293.1|576144_576378_+|molybdopterin-synthase-sulfur-carrier-subunit MKVLYFAEIKDILQKAQEDIVLEQALTVQQFEDLLFERYPQINNKKFQVAVNEEFVQKSDFIQPNDTVALIPPVSGG >CP031673.1|AXP51292.1|575692_576139_+|molybdopterin-synthase-catalytic-subunit MKQFEIVTEPIQTEQYREFTINEYQGAVVVFTGHVREWTKGVKTEYLEYEAYIPMAEKKLAQIGDEINEKWPGTITSIVHRIGPLQISDIAVLIAVSSPHRKDAYRANEYAIERIKEIVPIWKKEIWEDGSKWQGHQKGNYEEAKREE >CP031673.1|AXP51291.1|575193_575679_+|molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-protein-B MILQIVGYKKSGKTTLMRHIVSFLKSHGYTVATIKHHGHGKEDIQLQDSDVDHMKHFEAGADQSIVQGFQYQQTVTRVDNQNLTQIIEKSVTIDTNIVLVEGFKNADFEKVVVYRNEEELQVLQQLSNVCYSINVREHEDFTAFEQWLLNKIKNDCDTQLT >CP031673.1|AXP51290.1|573937_575197_+|molybdopterin-molybdenumtransferase-MoeA MVVEKRNPIPVKEAIQRIVNQQSSMPAITVALEKSLNHILAEDIVATYDIPRFDKSPYDGFAIRSVDSQGASGQNRIEFKVIDHIGAGSVSDKLVGDHEAVRIMTGAQIPNGADAVVMFEQTIELEDTFTIRKPFSKNENISLKGEETKTGDVVLKKGQVINPGAIAVLATYGYAEVKVIKQPSVAVIATGSELLDVNDVLEDGKIRNSNGPMIRALAEKLGLEVGIYKTQKDDLDSGIQVVKEAMEKHDIVITTGGVSVGDFDYLPEIYKAVKAEVLFNKVAMRPGSVTTVAFVDGKYLFGLSGNPSACFTGFELFVKPAVKHMCGALEVFPQIIKATLMEDFTKANPFTRFIRAKATLTSAGATVVPSGFNKSGAVVAIAHANCMVMLPGGSRGFKAGHTVDIILTESDAAEEELLL >CP031673.1|AXP51289.1|573380_573875_-|cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase-MoaC MTEFTHINQQGHAKMVDVSDKQITKRTAVAHSSITVNETIFKQISNNTNTKGNVLNTAQIAGIMAAKNTSTLIPMCHPLPLTGIDVHFSWDETNAPLYTLNIQTTVSTTGKTGVEMEALTAASATALTIYDMTKAVDKGMIIGETYLESKSGGKSGDFQRQSNQ >CP031673.1|AXP51288.1|572872_573379_+|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein MGEHQNVKLNRTVKAAVLTVSDTRDFDTDKGGQCVRQLLQADDVEVSDAHYTIVKDEKVAITTQVKKWLEEDIDVIITTGGTGIAQRDVTIEAVKPLLTKEIEGFGELFRYLSYVEDVGTRALLSRAVAGTVNNKLIFSIPGSTGAVKLALEKLIKPELNHLIHELTK >CP031673.1|AXP51287.1|571837_572842_+|molybdopterin-biosynthesis-protein-MoeB MSQERYSRQILFKQIGEIGQSKINQKCALIIGMGALGTHVAEGLVRAGIAKLIIVDRDYIEFSNLQRQTLFTEEDALKMMPKVVAAKKHLLALRSDVDIDDYIAHVDYYFLETHGQDVDVIIDATDNFETRQLINDFAYKYRIPWIYGGVVQSTYTEAAFIPGKTPCFNCLVPQLPALNLTCDTVGVIQPAVTMATSLQLRDAMKVLTEQPIDTKITYGDIWEGSHYSFGFSKMQRSDCTTCGDVPSYPYLNKNEQRYATLCGRDTVQYENASITHDILVQFLKQHQLNYRSNSYMVMFEFKGHRIVAFKGGRFLIHGMTRTSDATHLMNLLFG >CP031673.1|AXP51286.1|571062_571668_+|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MLKINVKYQLKNTLIRINIDDTEPKIYAVRGPSGIGKTTVLNMIAGLRKADEAIIEVNGQLLTDTAKNVNVKIQQRRIGYLFQDYQLFPNMTVYKNITFMAEPSEHIDQLIQTLNIDHLMKQYPMTLSGGEAQRVALARALSTKPDLILLDEPFSSLDDTTKDESITLVKRIFNEWQIPIIFVTHSNYEAEQMAHEIITIG >CP031673.1|AXP51296.1|578305_578476_-|hypothetical-protein MFRFISFGQLVVYSTTFIPKKDILQLNGMECDINVKEPLKIYYVVILKSGIEMIFS >CP031673.1|AXP51297.1|578601_578952_+|HTH-type-transcriptional-regulator-SarV MSNKVQRFIEAERELSQLKHWLKTTHKISIEEFVVLFKVYEAEKISGKELRDTLHFEMLWDTSKIDVIIRKIYKKELISKLRSETDERQVFYFYSTSQKKLLDKITKEIEVLSVTN >CP031673.1|AXP51298.1|579055_580267_-|MFS-transporter MTNQGSLNKSPIFTKSFTINFLVNFIVYLCMYLLLVVIAGYSKQAFDASDSLAGLVVGLFIVGSLIGRFATGKFVNQIGPKRLLFIGLIALIITQLLYFIDGSLAFLIFVRLINGIATAVVTTATGTIAAYVTPVNRKSEGISLFSLSLVLGTAIGPFLGMLLITKYAIDLLFIICVILGILGLIISLFIKVDFEVTNNKTETNVIDKPRFSIHQFIAKEAIPVAVIMLLIGVTYASILTYLQAFALERHLVTAASYFFICYAIASLITRPIAGRLMDDKNENIIVYPAFIMLFLSFVCLISSYQSWLILLAGACLGLGYGNLSSAMQSIAIKVSPPIKYGIATSTFYVGLDAGVGFGPSFLGLFTHMFSYSEIFGFMAALAIITMLVYFLIHGRHVTRNAMN >CP031673.1|AXP51299.1|580259_580700_-|MarR-family-transcriptional-regulator MLSQEFFNSFITIYRPYLKLAEPILEKHNIYYGQWLILRDIAKHQPTTLIEISHRRAIEKPTARKTLKALIENDLITVENSLEDKRQKFLTLTPKGHELYEIVCLDVQKLQQAVVAKTNISQDQMQETINVMNQIHEILLKEAHND >CP031673.1|AXP51300.1|580861_581626_+|VOC-family-protein MILKFDHIIHYIDQLDRFSFPGDVIKLHSGGYHHKYGTFNKLGYINENYIELLDVENNEKLKKMAKTIEGGVAFATQIVQEKYEQGFKNICLRTNDIEAVKNKLQSEQVEVVGPIQMERDTHKDGKVKWQLLYIMNQDDDEIKPPFFIQWEESDSMRTKKLQKYFQKQFSIETVIVKSKNRSQTVSNWLKWFDMDIVEENDHYTDLILKNDDIYFRIEDGKVSKYHSVIIKDAQATSPYSIFIRGAIYRFEPLV >CP031673.1|AXP51301.1|581617_581869_-|hypothetical-protein MRTIILSLFIIMNIVAIIMTLSQPLTVNYFSLRVILIFFTFILSIFFILIKSSRLNNILTILSIVLVIIHMGILAHSTYVYLY >CP031673.1|AXP51302.1|582257_583523_+|lipid-II:glycine-glycyltransferase-FemX MEKMHITNQEHDAFVKSHPNGDLLQLTKWAETKKLTGWYARRIAVGRDGEVQGVAQLLFKKVPKLPYTLCYISRGFVVDYSNKEALNALLDSAKEIAKAEKAYAIKIDPDVEVDKGTDALQNLKALGFKHKGFKEGLSKDYIQPRMTMITPIDKNDDELLNSFERRNRSKVRLALKRGTTVERSDREGLKTFAELMKITGERDGFLTRDISYFENIYDALHEDGDAELFLVKLDPKENIAKVNQELNELHAEIAKWQQKMKTSEKQAKKAQNMINDAQNKIAKNEDLKRDLEALEKEHPEGIYLSGALLMFAGSKSYYLYGASSNEFRDFLPNHHMQYTMMKYAREHGATTYDFGGTDNDPDKDSEHYGLWAFKKVWGTYLSEKIGEFDYVLNQPLYQLIEQVKPRLTKAKIKISRKLKRK >CP031673.1|AXP51303.1|583639_586807_+|AcrB/AcrD/AcrF-family-protein MIKKLLQFSLGNKFAIFLMVVLVVLGGVYASAKLKLELLPNVQNPVISVTTTMPGATPQSTQDEISSKIDNQVRSLAYVKNVKTQSIQNASIVTVEYENNTDMDKAEEQLKKEIDKIKFKDEVGQPELRRNSMDAFPVLAYSFSNKENDLKKVTKVLNEQLIPKLQTVDGVQNAQLNGQTNREITLKFKQNELEKYGLTADDVENYLKTATRTTPLGLFQFGDKDKSIVVDGQYQSVDAFKNINIPLTLAGGQGQSQSQSDNKQNSAMSDVNQASPQQNSKASAPNNISGMPTAKLGDLADITVGDVRTSISKTNGKDAVNLQITKAQDANTVQVAKDVQRKIDTFVDENKDFNVTKTMDTAKPVEKSLYTMVEKASLGTIVAIIVILLFLRNIRTTAISIISIPLSLLMALIALKLSDVSLNILTLGALTVAIGRVIDDSIVVVENIYRRLTDSEEQLKGENLIISATTEVFKPIMSSTLVTIIVFLPLVFVSGSVGEMFRPFALAIAFSLLASLLVSITLVPALAATLFKKGVKRRNKQHQEGLGVVSTTYKKVLHWSLNHKWIVIILSTLILVATIVFGGPRLGTSFISAGDDKFLAITYTPKPGETEQAVLNHAKDVEKYLKQKKHVKTIQYSVGGSSPVDPTGSTNSMAIMVEYDNDTPNFDVEADKVIKHADGFKHPGEWKNQDLGTGAGNKSVEVTVKGPSMDAIKSTVKDIEQKMKQVKGLANVKSDLSQTYDQYEIKVDQNKAAENGISASQLAMHLNENLPEKTVTTVKENGKTVDVKVKQNKQTDWSEDKLNNITLKKPTGGTIKLGDIATLVKTTTPSKLTQEQGDYATTVSAKVTNKDVGGTTRQVMSKINNLDKPNNVKVNIGGASDDINNAMTQLAFAMLAAIIIVYLILVITFKGGLAPFTILFSLPFTVIGVIIALLITGETISVPSLIGMLMLIGIVVTNAIVLIDRVINNEQQGMEMKEALIEAGGTRIRPILMTAIATIGALVPLLFGQDSSILISKGLAATVIGGLISSTLLTLVVVPVIYEILFTLKKRFTKR >CP031673.1|AXP51304.1|586993_587311_-|hypothetical-protein MQFYLILLAILYLIVSFISIFKMEVVFTRILRIIMGVLLLFVLALTTMSFPKENWWVFIVLLLLVGNVEVTGFKMLKKDLKGVNILNLMSLFIFVIYFILTIVLF >CP031673.1|AXP51305.1|587555_587720_-|hypothetical-protein MSLENQLAELKYDYVRLQGDIEKRESLNLDTSALVRQLKDIENEIRNVRAQMQD |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP031673_2 | 702275-702365 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP031673_2
|
1 spacers
spacers of CP031673_2
>2.1|702300|41|CP031673|CRISPRCasFinder ATAGAGGAACACAGTTGGATGCTACGCATCAACTGCATAAG |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP031673_2
The CRISPR arrays of CP031673_2 >merge|CP031673|2|702275-702365|CRISPRCasFinder AGCCCCTAACAACTAAAGTTGAAAAATAGAGGAACACAGTTGGATGCTACGCATCAACTGCATAAGAGCCCCTAACAACTAAAGTTTAAAA >CP031673|2|2|702275-702365|CRISPRCasFinder AGCCCCTAACAACTAAAGTTGAAAA ATAGAGGAACACAGTTGGATGCTACGCATCAACTGCATAAG AGCCCCTAACAACTAAAGTTTAAAA
>CP031673.1|AXP51418.1|701830_701935_+|hypothetical-protein MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISTQDHKK >CP031673.1|AXP51417.1|701202_701406_+|resolvase MIVYQRKINIDTLKEFGCGCVYSERISGVKRTELVKCLDYLRESDTLVVYQLDRLGRTTKLLIELSQ >CP031673.1|AXP51416.1|700007_701144_+|DNA-binding-protein MSVNARDLLVLHTNVNRLVGEEIFANKCLANNDVQIMNSIKKLIEAELLTTTNDFEVSIYKKTRPELQSILKSFGIKTTGNKPDLIKRIDDNFHIINNLDLPYVYIPIKKGEEILKKTEYLTSFIQSYGEISLERAYYLVENYIDENCDDKVAEIYKFEFQRKYENGEFDFNHGYNFELNMLIDHYKRDVKDYDNARKYSNIYLYFGLRDFLKKLMSNYSYYDSKGNIDLNEIQNDLNRFINSSASGMYERLIYNENLSNNIMFELFKKDTQDYSDLEEQLIEKFINYVVSNVKKESRSNTLIELSKILENGYTIDKEEFKKEDDYLSKYIFTDIDYLKKLESKINVAIDIRSGEIHLVLDDDSLDILIQNQKYGNEF >CP031673.1|AXP51415.1|699626_699719_-|hypothetical-protein MFIFKTTSKSHFHNNVKSLECIKIPINKNR >CP031673.1|AXP51414.1|698064_698922_+|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINQLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQITNLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAEHFLAE >CP031673.1|AXP51413.1|697214_697997_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLIQLDQIGRMKQGKTILKKISWQIAKGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATSGTVNLFGKMPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEIRNEAHQLLKLVGMSAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLSILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITANFSKILLLKDGQSIQQGAVEDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFPMAMLE >CP031673.1|AXP51412.1|695177_696983_+|glutamine--fructose-6-phosphate-aminotransferase MCGIVGYIGYDNAKELLLKGLEKLEYRGYDSAGIAVVNDDNTTVFKEKGRIAELRKVADSSDFDGPVGIGHTRWATHGVPNHENSHPHQSSNGRFTLVHNGVIENYEELKGEYLQGVSFISETDTEVIVQLVEYFSNQGLSTEEAFTKVVSLLHGSYALGLLDAEDKDTIYVAKNKSPLLLGVGEGFNVIASDALAMLQVTSEYKEIHDHEIVIVKKDEVIIKDADGNVVERDSYIAEIDASDAEKGVYAHYMLKEIHEQPAVMRRIIQEYQDAEGNLKIDQDIINDVKEADRIYVIAAGTSYHAGLVGKEFLEKWAGVPTEVHVASEFVYNMPLLSEKPLFVYISQSGETADSRAVLVETNKLGHKSLTITNVAGSTLSREADHTLLLHAGPEIAVASTKAYTAQIAVLSILSQIVAKEHGREADIDLLRELAKVTTAIEAIVDDAPIMEQIATDFLETTRNAFFIGRTIDYNVSLEGALKLKEISYIQAEGFAGGELKHGTIALIEEGTPVVGLATQEKVNLSIRGNVKEVVARGAHPCIISMEGLEKEGDTYVIPHVHELLTPLVSVVALQLISYYAALHRDLDVDKPRNLAKSVTVE >CP031673.1|AXP51411.1|692958_694497_-|PTS-mannitol-transporter-subunit-IICB MSQTEEKKGIGRRVQAFGSFLSSMIMPNIGAFIAWGFIAAIFIDNGWLPNKDLATLAGPMITYLIPLLIAFSGGRLIYDLRGGIIAATATMGVIVALPDTPMLLGAMIMGPLVGWLMKKTDQLIQPRTPQGFEMLFNNFSAGILGFIMTIAGFKILAPLMKFIMHILSVAVEALVHAHLLPLVSILVEPAKIVFLNNAINHGVFTPLGADQAAKAGQSILYTIESNPGPGLGILLAYMIFGKGTAKATSYGAGIIHFLGGIHEIYFPYVLMRPLLFIAVILGGMTGVATYQATGFGFKSPASPGSFIVYCLNAPRGEFLHMLLGVFLAALVSFVVAALIMKFTREPKQDLEAATAQMENTKGKKSSVASKLVSSDKNVNTEENASGNVSETSSSDDDPEALLDNYNTEDVDAHNYNNINHVIFACDAGMGSSAMGASMLRNKFKKAGINDITVTNTAINQLPKDAQLVITQKKLTDRAIKQTPNAIHISVDNFLNSPRYEELLNNLKKDDQA >CP031673.1|AXP51410.1|690791_692924_-|PRD-domain-containing-protein MLLSTREKEMIALLIKYHGQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVEAYLTSFSLTLERANKKGLRIAGTDSDLNDLKQSIAQHQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELDLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLGQIYDVTFNQAEIAFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVNKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFIVLHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLEQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIDSPYLTVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFQETHDKSSNMIDKDDVHVETKDVDGNTSFENEQTSYLTSVFEKHLSDEKSEQLLHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDVINDPTSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMILITVLEEPLTLPSIQNDNQTIKYMISMFISDNDFMASLVSDLSEFLSLKLESIDTFMENPQELETLLRNKFLERIKKQFI >CP031673.1|AXP51409.1|690345_690780_-|mannitol-specific-phosphotransferase-enzyme-IIA-component MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA >CP031673.1|AXP51419.1|702418_704065_-|IS1182-family-transposase MYKNYNMTQLTLPIETSVRIPQNDISRYVNEIVETIPDSEFDEFRHHRGATSYHPKMMLKIILYAYTQSVFSGRRIEKLLHDSIRMMWLAQNQTPSYKTINRFRVNPNTDALIESLFIQFHSQCLKQNLIDDNSIFIDGTKVEANANRYTFVWKKSIQNHESKLNENSKALYRDLVEEKIIPEIKEDGDSDLTIEEIDLIGSHLDKEIEDLNHSIQNEDCTQIRKQTRKKRTEIKKFKKKFDDYSERKSKYEEQKSILKDRNSFSKTDHDATFMRMKEDHMKNGQLKPGYNLQIATNSQFVLSYDLFQNPTDTRTLIPFLTMIQNTFGYLPEYIVADAGYGSEQNYMAIIDDFNKTPLITYGMFIKDKTRKFKSDIFNTQNWKYDELNDEFICPNNKRIGFKRYANRNDRYGFKRDFKLYECDDCSACSLRQQCMKPNSKSNKKIMKNYNWEYFKAQINQKLSEPETKKIYSQRKIDVESVFGFMKAILGFTRMSVRGINKVKRELGFVLMALNIRKIAAQRAVHYKINIKKADFHQIINRNQLFYIA >CP031673.1|AXP51420.1|704410_705502_-|transcriptional-regulator MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYAQTIAIYSQFGQKPPVDAYLKVIAVLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKNKKVVTEPKNTKVENDKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >CP031673.1|AXP51421.1|705767_706748_-|cation-transporter MSHSHHHHDHMHSHVTTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALVAFIYAEKNATTTKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH >CP031673.1|AXP51422.1|706749_707070_-|ArsR-family-transcriptional-regulator MSEQYSEINTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL >CP031673.1|AXP51423.1|707221_707887_+|SDR-family-oxidoreductase MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFDGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNHQEFQIISGDQDIKDALTQFENETD >CP031673.1|AXP51424.1|708321_709260_+|class-I-mannose-6-phosphate-isomerase MPLFLQPILKTKLWGGQRLSEFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGTSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIVIGTLAESREEVANHVQHGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDITYRLYDFNRQDNQYNDRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYV >CP031673.1|AXP51425.1|709290_709521_+|hypothetical-protein MKQFLYIALVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQISASLKFSALLINVLPLCGTFVASN >CP031673.1|AXP51426.1|710192_711566_+|EVE-domain-containing-protein MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRISNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVQKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD >CP031673.1|AXP51427.1|712023_712437_+|thiol-disulfide-oxidoreductase-DCC-family-protein MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYQFATLKGEVGQQFFKQHPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIKLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD >CP031673.1|AXP51428.1|712636_713080_+|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLENAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP031673_3 | 831323-831412 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP031673_3
|
1 spacers
spacers of CP031673_3
>3.1|831347|42|CP031673|CRISPRCasFinder TATTGCAAAAGAAAAACGATTATGTATAATAAAGTTATAAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP031673_3
The CRISPR arrays of CP031673_3 >merge|CP031673|3|831323-831412|CRISPRCasFinder TGATTGAGAAGTCAGTCGAAAAACTATTGCAAAAGAAAAACGATTATGTATAATAAAGTTATAAATTGATTGAGAAGTCAGTCAAAAACG >CP031673|3|3|831323-831412|CRISPRCasFinder TGATTGAGAAGTCAGTCGAAAAAC TATTGCAAAAGAAAAACGATTATGTATAATAAAGTTATAAAT TGATTGAGAAGTCAGTCAAAAACG
>CP031673.1|AXP51545.1|830581_831256_-|XRE-family-transcriptional-regulator MIRNRLSELLSERGLKISRVAKDVKIARSSLTSMAQNDSEMIRYDAIDKLCSYLHISPSEFFEHNPINFDFTFDEEPNYKINDVFEGFEVTANITHAFSIENFDFEILVDVELDNRQKLNFDLDVSYKETEKITNSQHRFIFTIKNEDENIGLKKYVDSLSAGLKNLLFKKINQKLSGYVSEIIVKNIDDIEELFPNKGEKSTTLHKEILQTDSRLSSDIFKEY >CP031673.1|AXP51544.1|829395_830568_-|site-specific-integrase MASYEKRGNTWRYRISLGKDAETGKYKYISNSGFKRKSDAKHHAEMVERQLRNGDYIAPSTSTFKQVADDWISQYANEVKVSSVRAREKAINHAIERFNNKPIQTINKHEYQRFVNDISAQYSKNYVDSIIASTNMIFKYAYDMKLIRIMPSEGIKRPKKKISVEELEDTEIHKKFLEKDELFQFLEVAKNHHSPQNSFEVFCTLAYTGMRAGELLALKWSDIDFENNTINITKTYYNPNNNKKQFQILTPKTESSIGKISVDPHVIKLLKNYKTDVQDTCKNELYVDNNFVFTDVNGYPLVIKKLQLWIKAILKKTDITNKQISTHSFRHTHCALLIEAGVHIKEIQERLRHKDINTTMNIYAKITNSYKKDASQKFSKLMENVSKDLF >CP031673.1|AXP51543.1|827710_829327_+|molecular-chaperone-GroEL MVKQLKFSEDARQAMLRGVDQLANAVKVTIGPKGRNVVLDKEFTAPLITNDGVTIAKEIELEDPYENMGAKLVQEVANKTNEIAGDGTTTATVLAQAMIQEGLKNVTSGANPVGLRQGIDKAVKVAVEALHENSQKVENKNEIAQVGAISAADEEIGRYISEAMEKVGNDGVITIEESNGLNTELEVVEGMQFDRGYQSPYMVTDSDKMVAELERPYILVTDKKISSFQDILPLLEQVVQSNRPILIVADEVEGDALTNIVLNRMRGTFTAVAVKAPGFGDRRKAMLEDLAILTGAQVITDDLGLDLKDASIDMLGTASKVEVTKDNTTVVDGDGDENSIDARVSQLKSQIEETESDFDREKLQERLAKLAGGVAVIKVGAASETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTALVNVYQKVSEIEAEGDIETGVNIVLKALTAPVRQIAENAGLEGSVIVERLKNAEPGVGFNAATNEWVNMLEEGIVDPTKVTRSALQHAASVAAMFLTTEAVVASIPEKNNDQPNMGGMPGMM >CP031673.1|AXP51542.1|827350_827635_+|co-chaperone-GroES MLKPIGNRVIIEKKEQEQTTKSGIVLTDSAKEKSNEGVIVAVGTGRLLNDGTRVTPEVKEGDRVVFQQYAGTEVKRDNETYLVLNEEDILAVIE >CP031673.1|AXP51541.1|826432_827176_-|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MTRLWASLLTVIIYILSQFLPLLIVKKLPFVQYSGIELTKAVIYIQLVLFLIAATTIILINLKIKNPTKLELEVKEPKKYIIPWALLGFALVMIYQMVVSIVLTQIYGGQQVSPNTEKLIIIARKIPIFIFFVSIIGPLLEEYVFRKVIFGELFNAIKGNRIVAFIIATTVSSLIFALAHNDFKFIPVYFGMGVIFSLAYVWTKRLAVPIIIHMLQNGFVVIFQLLNPEALKKATEQANFIYHIFIP >CP031673.1|AXP51540.1|825148_826408_+|hypothetical-protein MSYHWFKKMLLSTSILILSSSSLGLATHTVEAKDNLNGEKPTTNLNHNITSPSVNSEMNNNETGTPHESNQTGNEGTGSNSRDANPDSNNVKPDSNNQNPSTDSKPDPNNQNSSPNPKPDPDNPKPKPDPKPDPDKPKPNPDPKPDPDNPKPNPDPKPDPDKPKPNPDPKPDPDKPKPNPNPKPDPNKPNPNPSPDPDQPGDSNHSGGSKNGGTWNPNASDGSNQGQWQPNGNQGNSQNPTGNDFVSQRFLALANGAYKYNPYILNQINKLGKDYGEVTDEDIYNIIRKQNFSGNAYLNGLQQQSNYFRFQYFNPLKSERYYRNLDEQVLALITGEIGSMPDLKKPEDKPDSKQRSFEPHEKDDFTVVKKQEDNKKSASTAYSKSWLAIVCSMMVVFSIMLFLFVKRNKKKNKNESQRR >CP031673.1|AXP51539.1|824325_824952_-|nitroreductase-family-protein MGLFKKDKKAMTFDNAMEERRSIYNLKDSISISDDELESMIAHAVKHVPSSFNSQSTRIVLLLNDNNNKFWDNTKAILKEVMGENRDFEPTEQKIDNFKHSYGTILFYEDQDVVSGLQEQMPNYYDNFAIWSTQTNAMHQFAIWTALATKGIGASLQHYNPLVDEMTSNEFNIPKSWKLIAQMPFGDIREAAGEKTFNPVEDRFVIKK >CP031673.1|AXP51538.1|823179_823965_-|carbon-nitrogen-family-hydrolase MKVQIYQLPIVFGDSSKNETQITQWFEKNMNAEVDVVVLPEMWNNGYDLEHLNEKADNNLGQSFSFIKHLAEKYKVDIVAESVSNIRNNQIFNTAFSVNKSGQLINEYDKVHLVPMLREHEFLTAGEYVAEPFQLSDGTYVTQLICYDLRFPELLRYPARSGAKIAFYVAQWPMSRLQHWHSLLKARAIENNMFVIGTNSTGFDGNTEYAGHSIVINPNGDLVGELNESADILTVDLNLNEVEQQRENIPVFKSIKLDLYK >CP031673.1|AXP51537.1|822448_822583_+|delta-lysin-family-phenol-soluble-modulin MSCLILRIFILIKEGVISMAQDIISTIGDLVKWIIDTVNKFTKK >CP031673.1|AXP51536.1|821643_822213_-|accessory-gene-regulator-AgrB MNYFDNKIDQFATYLQKRNNLDHIQFLQVRLGMQVLAKNIGKLIVMYTIAYILNIFLFTLITNLTFYLIRRHAHGAHAPSSFWCYVESIILFILLPLVIVNFHINFLIMIILTVISLGVISVYAPAATKKKPIPVRLIKRKKYYAIIVSLTLFIITLIIKEPFAQFIQLGIIIEAITLLPIFFIKEDLK >CP031673.1|AXP51546.1|831428_831647_+|XRE-family-transcriptional-regulator MTILANTRKFKEAMFLKGFNLSDLSRETGVGISYLSQIINGKKIPSPKLAKKMAEVLQVEVNELFEFEVKEA >CP031673.1|AXP51547.1|831651_831969_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MFNINIDEDEARELLEQAINARVDELAKEKYFMTYKELSNYLNLSKPTIEELLINNGMKYYMVGSTYRFKKSDVDEFMEQLTAHMNIQNNDFKQVNIKKLLEARQ >CP031673.1|AXP51548.1|831965_832121_+|pathogenicity-island-protein MKIYLTYICLVSLLTILLLAISNMYVAFSVYAWLITLGCNLTGEITTCENK >CP031673.1|AXP51549.1|832105_832309_+|pathogenicity-island-protein MRKQVIITKTVVGWYNIKDTQHNLMLNIPPKVFEQYFPDVSKDVQVVCLEMDLSKITEIKNKKKVGS >CP031673.1|AXP51550.1|832310_832694_+|pathogenicity-island-protein MEIKQKYQLSKVVKILEVVLYEEDKFQSDKDYHYQDKALYEYALKLVHNGLFNILAELDFEDEAFLILDEVTMTLSDVMKETQHVYRYSVIDEKGEHKHTTDRKGHVIGMLEWALDYIAGNIEVEEL >CP031673.1|AXP51551.1|832694_833012_+|DUF1474-family-protein MNWEIKDLMCDIEVVKEKINDVAIKHAWFVEDRFVKNELETKREHINFSASYLEHRIQNEHTVELLHVYLKEFGELIQKFHEIEKASSENFGEVSDDAQKLKITE >CP031673.1|AXP51552.1|833075_833945_+|mobile-element-associated-protein MNEIKLEYDTHVSVVHYESLDSRSFNSFSKINWSKLVNKLSVPIEANYKYARGVAVYGDIKNGANDQGEIIKKHRNDKNVIYRDVIVLDYDEINDLKQLHEAISSALSNVAWFWHTSYSHRTEQARIRLYIPLNERISADDYRKYTKVLANKIGHKVDEGSYQPSRCFALPVIQKGHIFIKRVNDCPIMNVDMLEQWSKEFEQSNASPNVIGYTRRDSEYWRELCFGTTEGNRNNALASLIGHLLRCHVNDYIVYSFALLWGQFACKPPMKEQEINATFQSILNKHYNN >CP031673.1|AXP51553.1|833958_835668_+|DUF927-domain-containing-protein METGKSDVLDKIEKINKKDSALQEIIPKGYEIEHHQCGIALNQLIPSKKEGEPDKKVFITSTIPQITERFEDIESNEVSFNMLFYDNKTPVNIAVSAEEISDSRQLLKLVNKKLDVTSSTSTKLVDYINASKRYNPPLNVKVATRLGHVKGYFIYPYQEVMKDSNIKLFSNDKGFQKLIDSFQSKGTLEGYSKKVFGQIKDLPMVMVMLYASLGSVLLREFGLQPFIVEISGSTSTGKTFTLNLVSSVWGTSDLITTWSSTQNSIESMASFLNSFPMFKDDTRNTHPKFVTSATYNFSSGESKSRSNINLTLNAKKEWRNILISTGESSIANMADEKAGVSARVVTLQDPPYPDNFDFTTLDKSFRENYGTLGLAFIKQYESKKDVYKNAFESYQRYFNQKGSNEIMQRLGRAFALLQVTGEVLNDIDGFEHDHFKIIEQAYDSMVKNNKTIDKPKQLLEELLQYLDANRNNIAGDGYSSVKNGDIKAIYKRDYLCILGQTVHDKLGHEMQTITGQWGKKGYLIKGEKDRLQKKVSHKNIKYRGFAINKEMLEELGFDFSNSHNPYSDY >CP031673.1|AXP51554.1|835979_836360_+|hypothetical-protein MDKEQLKKYIYDYVKEYKEIPIYQLEDLFKEMNHDYIGRTSVTHDKDENIVFWSGWNKITMFALIELVKSEQLDLVYRGSFVMRYLLDGRVPNLPLAICYPEDGQQTDVPSWVPMVLRINKEEKIK >CP031673.1|AXP51555.1|836356_836998_+|pathogenicity-island-protein MNIETIVNQFETRAGTLLRYYTGLLEHSKVQPCCFKLYNDPFDMAYVMMNGKLFGHVYIKDCKVRQSFELASPKHTEGLIRSIEGHYVGYELHDGKQLSISDMMASQLFEDEYFMYGLQTYAESNNSDVFEYLENGFDTDTLEGIQSSNTDVIANIEMLYQLATGINEPAPELVEGLRLVTEFVQDENATQEDYKALEHKLTELKSSYYSLNK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP031673_4 | 959210-959288 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP031673_4
|
1 spacers
spacers of CP031673_4
>4.1|959233|33|CP031673|CRISPRCasFinder CAGAAGCTGACGAAAAGTCAGCTTACGATAATG |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP031673_4
The CRISPR arrays of CP031673_4 >merge|CP031673|4|959210-959288|CRISPRCasFinder TGCAGGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGACGAAAAGTCAGCTTACGATAATGTGCAGGTTGGCGGGGCCCCAACA >CP031673|4|4|959210-959288|CRISPRCasFinder TGCAGGTTGGCGGGGCCCCAACA CAGAAGCTGACGAAAAGTCAGCTTACGATAATG TGCAGGTTGGCGGGGCCCCAACA
>CP031673.1|AXP51700.1|957956_958943_-|aromatic-acid-exporter-family-protein MNDQWYKHLIGARTIKTGIAIFLTAVFCMALDLTPIYAILTAVVTIEPTAKASLIKGYRRLPATVIGAGFAVLFTYLFGDQSPFTYALSATFTILFCTKLKLQVGTNVAVLTSLAMIPGIHDAYIFNFLSRTLTAIIGLVTSGLINFMVFPPKYYGQVEEKLSKTDALMYKLFYNRCQELILSRLQSDKSEKAYKNIFNLNNQVETLISYQRDELSYHKKKECDWKLLNQLTKRAYTNRLFITHLSNIIYLPKNTRVNFSGDEKMALLKISSSIKDIFYDGSFKREDDSVETLRSTIKALEISGENQIKSHILYEVLMIYRLLDSRYA >CP031673.1|AXP53531.1|957112_957526_+|hypothetical-protein MKPTKVILKDASYLHSKTSITFILKDVVIEEDNKIYYFDTSATFEDQEVKFEFALFDSDMDNLKHMDCDNPVTEIYFIEPDLHFTIIDFNQELLCIYIDFDSGLRHSNMATESGISLRINVAKSDFTKFINELASLH >CP031673.1|AXP51699.1|956973_957084_+|hypothetical-protein MDGNNQIDVCFFVLVNNYYTMSIYPRIINSNGDYAT >CP031673.1|AXP51698.1|956156_956888_+|glutamine-amidotransferase MHELTIYHFMSDKLNLYSDIGNIIALRQRAKKRNIKVNVVEINETEGITFDECDIFFIGGGSDREQALATKELSKIKTPLKEAIEDGMPGLTICGGYQFLGKKYITPDGTELEGLGILDFYTESKTNRLTGDIVIESDTFGTIVGFENHGGRTYHDFGTLGHVTFGYGNNDEDKKEGIHYKNLLGTYLHGPILPKNYEITDYLLEKACERKGIPFEPKEIDNEAEIQAKQVLIDRANRQKKSR >CP031673.1|AXP51697.1|954841_956155_+|Mur-ligase-family-protein MRQWTAIHLAKLARKASRAVGKRGTDLPGQIARKVDTDILRKLAEQVDDIVFISGTNGKTTTSNLIGHTLKANNIQIIHNNEGANMAAGITSAFIMQSTPKTKIAVIEIDEGSIPRVLKEVTPSMMVFTNFFRDQMDRFGEIDIMVNNIAETISNKGIKLLLNADDPFVSRLKIASDTIVYYGMKAHAHEFEQSTMNESRYCPNCGRLLQYDYIHYNQIGHYHCQCGFKREQAKYEISSFDVAPFLYLNINDEKYDMKIAGDFNAYNALAAYTVLRELGLNEQTIKNGFETYTSDNGRMQYFKKERKEAMINLAKNPAGMNASLSVGEQLEGEKVYVISLNDNAADGRDTSWIYDADFEKLSKQQIEAIIVTGTRAEELQLRLKLAEVEVPIIVERDIYKATAKTMDYKGFTVAIPNYTSLAPMLEQLNRSFEGGQS >CP031673.1|AXP51696.1|954049_954550_-|non-heme-ferritin MLSKNLLEALNDQMNHEYFAAHAYMAMAAYCDKESYEGFANFFIQQAKEERFHGQKIYNYINDRGAHAEFRAVSAPKIDFSSILETFKDSLSQEQEVTRRFYNLSEIARQDKDYATISFLNWFLDEQVEEESMFETHINYLTRIGDDSNALYLYEKELGARTFDEE >CP031673.1|AXP51695.1|953875_953968_+|hypothetical-protein MTKNTIISLENEKTQINDSENESSDLRKAK >CP031673.1|AXP51694.1|953106_953661_-|DNA-polymerase-III-subunit-epsilon MIQDAFVALDFETANGKRTSICSVGMVKVIDSQITETFHTLVNPQDYFSQQNIKIHGIQPEDVENAPTFDYVFPYMMQFIADLPVVAHNAAFDMNVLHQSIQNIGLPTPNLTYFCSYQLAKRTVDSYRYGLKHMMEFYQLDFHGHHDALNDAKACAMITFRLLKNYENLTYVTNIYGKNLKDKG >CP031673.1|AXP51693.1|951968_953039_+|DNA-polymerase-IV MTERRIIHIDMDYFFAQVEMRDNPKLKGKPVIVGGKASSRGVVSTASYEARKYGVHSAMPMSQAHKLCPNGYFVTSNFGAYRETSAQIMSIFRSYTDKVEPMSLDEAYLDITELVRPDLPASKIAQYIRKDILEQTHLTASAGVSYNKFLAKLASGMNKPDGMTVIDYQNVHDILMTLDIGDFPGVGKASKKVMHDNGIFNGRDLYEKTEFELIRLFGKRGRGLYNKARGIDHSEVKSSRVRKSVGTERTFATDVNDDEEILRKVWELSGKTAERLNKLQKSAKTVTVKIKTYQFETLSKQMSLRDSVSSEEDIYNIAYLLYNDLKDPDVPIRLIGVTVGNLEQSTYKNMTIYDFI >CP031673.1|AXP51692.1|951191_951722_+|DUF3267-domain-containing-protein MHKIDLTTNNFQMRRFIILQLVIALFVILFTYKWALGVTAVVDQNIIINLVYGFAGFIILLILHELIHRALFLLFKKDSKPMFNIKKDRILFQTADACFNKWQFSIIMLSPLILLSTGLLILIKVFGYSSLIFMFSMHTAYCFIDILLVALTISSSFKYVQQDEDSIYLYHQKPTQ >CP031673.1|AXP51701.1|959470_960229_+|methionine-aminopeptidase MIVKTEEELQALKEIGYICAKVRNTMQAATKPGITTKELDNIAKELFEEYGAISAPIHDENFPGQTCISVNEEVAHGIPSKRVIREGDLVNIDVSALKNGYYADTGISFVVGESDDPMKQKVCDVATMAFENAIAKVKPGTKLSNIGKAVHNTARQNDLKVIKNLTGHGVGLSLHEAPAHVLNYFDPKDKTLLTEGMVLAIEPFISSNASFVTEGKNEWAFETSDKSFVAQIEHTVIVTKDGPILTTKIEEE >CP031673.1|AXP51702.1|960445_960832_+|hypothetical-protein MNYVERYIEQFLRATVRNNIKHYLLMLDEKMKNLDDYMRYLITKKEQLSKLIDSLMLTLENKYIDIAEAFQIQCAREINNQEIENIKSELNKVEAYYAQIETQIQQTSTEKIATEKTSYLINYMNAVA >CP031673.1|AXP51703.1|960846_961548_+|transporter MTHKYISTQMLIIFTALMIIANFYYIFFEKIGFLLVLLLGCVLVYVGYLYFHKIRGLLAFWIGALLIAFTLLSNKYTIIILFVFLLLLIVRYLIHKFKPKKVVATDEVMTSPSFIKQKWFGEQRTPVYVYKWEDVQIQHGIGDLHIDLTKAANIKENNTIVVRHILGKVQVILPVNYNINLHVAAFYGSTYVNEKSYKVENNNIHIEEMMKPDNYTVNIYVSTFIGDVEVIYR >CP031673.1|AXP51704.1|961544_962588_+|two-component-sensor-histidine-kinase MNHYIRTIGSMLILVYSMLAAFLFIDKVFVNIIYFQGMFYTQIFGIPVFLFLNLIIILLCIIVGSVLAYKINQQNDWIKTQIERSMEGETVGINDQNIEIYSETLDLYHTLVPLNQELHKLRLKTQNLTNENYNINDVKVKKIIEDERQRLARELHDSVSQQLFAASMMLSAIKETKLEPPLDQQIPILEKMVQDSQLEMRALLLHLRPLGLKDKSLGEGIKDLVIDLQKKVPMKVVHEIQDFKVPKGIEDHLFRITQEAISNTLRHSNGTKVTVELFNKDDYLLLRIQDNGKGFNVDEKLEQSYGLKNMRERALEIGATFHIVSLPDSGTRIEVKAPLNKEDSYDD >CP031673.1|AXP51705.1|962577_963207_+|DNA-binding-response-regulator MTIKVLFVDDHEMVRIGISSYLSTQSDIEVVGEGASGKEAIAKAHELKPDLILMDLLMDDMDGVEATTQIKKDLPQIKVLMLTSFIEDKEVYRALDAGVDSYILKTTSAKDIADAVRKTSRGESVFEPEVLVKMRNRMKKRAELYEMLTEREMEILLLIAKGYSNQEIASASHITIKTVKTHVSNILSKLEVQDRTQAVIYAFQHNLIQ >CP031673.1|AXP51706.1|963322_964540_-|YihY/virulence-factor-BrkB-family-protein MSKKDHSSSKYLNSVKEAQEESKKKNKSNPKIDVDRTYIEPQQFQSKKPKKDDQVFFLSRLNKPAKYKKDSNFLSYLIYRIGKDDASGLAAQMTYHFVLAMFPMLLFLLTLLPFFNIKQSQITNMLSNAPAETSTLIKSVIGDITQNSSGGLLSIGLILAIWSASNGMTAIMNSFNVAYDVEDSRNGIVLKLLSVVFTVVMGVVFVVALALPTLGSVISHFLFGPLGFDEQVKWIFNLIRIVLPIIIIFIIFIVLYSVAPNVKTKLKSVLPGAVFTSIIWLAGSFGFGWYISNFGNYSKTYGSIAGIIILLLWLYITSFIIIVGAEINAIIHQRSVIKGKTPEEAALEHDDNNKNHYNENTRYEYDEDSNATHQRTYHVDEHPSDTYPEDDKNIKDKIVDKLKKD >CP031673.1|AXP51707.1|964817_965093_-|YtxH-domain-containing-protein MENKFVPGILIGAVIGGAISLADKSTRQALVQSVKDAKNGNRTRKPSKVSKIKDEVLYWKDVVEEIRRNNPELERSLKDAKETFVNRKNQR >CP031673.1|AXP51708.1|965099_965564_-|protein-tyrosine-phosphatase MVDVAFVCLGNICRSPMAEAIMRQRLKDRNIHDIKVHSRGTGSWNLGEPPHEGTQKILNKHNIPFDGMISELFEATDDFDYIVAMDQSNVDNIKSINPNLKGQLFKLLEFSNMEESDVPDPYYTNNFEGVYDMVLSSCDNLIDYIVKDANLKEG >CP031673.1|AXP53532.1|965710_965911_+|DUF1128-family-protein MTNEEKVLAIREKLNIVNQGLLDPEKYKNANEEELTDIYDFVQSRERLSPSEVTAIADALGQLRHE >CP031673.1|AXP51709.1|965913_967170_+|aminopeptidase MGILTNYKEKLQQYAELLVKVGMNVQPKQPVFIRSSVETLELTHLIVEEAYHCGASDVRVVYSDPTLKRLKFENESVEHFANHEIKSYDVEARMDYVKRGAANLALISEDPDLMDGIDSQKLQAFQQQNARAFKGYMESVQKNQFPWVVAAFPSKAWAKRVYPELSVEEAYIKFIDEVFDIVRIDGNDPVENWRQHIANLSVYAQKLQQKNYHALHYVSEGTDLTVGLAKNHIWEDATSYVNGKEQAFIANIPTEEVFTAPDRNRVDGYVTNKLPLSYNGTIIDQFKLMFKDGEIIDFSAGKGEAVLKDLINTDEGSRRLGEVALVPDDSPISNRNTIFYNTLFDENAACHLAIGSAYAFNIQGGTEMTVEEKIASGLNDSNVHVDFMIGSSDLTIYGIFEDGSKELVFENGNWASTF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP031673_5 | 1810827-1811013 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP031673_5
|
3 spacers
spacers of CP031673_5
>5.1|1810846|37|CP031673|CRT AACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGGGAATCCAATTTC >5.2|1810902|37|CP031673|CRT AACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTTCGTCAGCT >5.3|1810958|37|CP031673|CRT CAACTTGCATTGTCTGTAGAATTTCTTTTTGAAATTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP031673_5
The CRISPR arrays of CP031673_5 >merge|CP031673|5|1810827-1811013|CRT TCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGGGAATCCAATTTCACTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTTCGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAATTTCTTTTTGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCCGCC >CP031673|5|1|1810827-1811013|CRT TCTATGTTGGGGCCCCGCC AACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGGGAATCCAATTTC ACTATGTTGGGGCCCCGCC AACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTTCGTCAGCT TCTGTGTTGGGGCCCACCC CAACTTGCATTGTCTGTAGAATTTCTTTTTGAAATTC TCTATGTTGGGGCCCCGCC
>CP031673.1|AXP52503.1|1809895_1810612_+|superantigen-like-protein-SSL12 MSKNITKNIILTTTLLLLGTVLPQNQKPVFSFYSEAKAYSIGQDETNINELIKYYTQPHFSFSNKWLYQYDNGNIYVELKRYSWSAHISLWGAESWGNINQLKDRYVDVFGLKDKDTDQLWWSYRETFTGGVTPAAKPSDKTYNLFVQYKDKLQTIIGAHKIYQGNKPVLTLKEIDFRAREALIKNKILYNENRNKGKLKITGGGNNYTIDLSKRLHSDLANVYVKNPNKITVDVLFD >CP031673.1|AXP52502.1|1809062_1809788_+|superantigen-like-protein-SSL13 MNNNITKKIILSTTLLLLGTASTQFPNTPINSSSEAKAYYINQNETNVNELTKYYSQKYLTFSNSTLWQKDNGTIHATLLQFSWYSHIQVYGPESWGNINQLRNKSVDIFGIKDQETIDSFALSQETFTGGVTPAATSNDKHYKLNVTYKDKAETFTGGFPVYEGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKSKKLYNNSYNKGQIKITGADNNYTIDLSKRLPSTDANRYVKKPQNAKIEVILEKSN >CP031673.1|AXP52501.1|1808242_1808968_+|superantigen-like-protein-SSL14 MKKNIMNKLVLSTALLLLETTSTQLPKTPISFSSEAKAYNISENETNINELIKYYTQPHFSLSGKWLWQKPNGSIHATLQTWVWYSHIQVFGSESWGNINQLRNKYVDIFGTKDEDTVEGYWTYDETFTGGVTPAATSSDKPYRLFLKYSDKQQTIIGGHEFYKGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKNKKLYNGEFNKGQIKITADGNNYTIDLSKKLKLTDTNRYVKNPRNAEIEVILEKSN >CP031673.1|AXP52500.1|1806803_1807805_-|ornithine-carbamoyltransferase MKNLRNRSFLTLLDFSRQEVEFLLTLSEDLKRAKYIGTEKPMLKNKNIALLFEKDSTRTRCAFEVAAHDQGANVTYLGPTGSQMGKKETTKDTARVLGGMYDGIEYRGFSQRTVETLAEYSGVPVWNGLTDEDHPTQVLADFLTAKEVLKKDYADINFTYVGDGRNNVANALMQGAAIMGMNFHLVCPKELNPTDELLNRCKNIAAENGGNILITDDIDQGVKGSDVIYTDVWVSMGEPDEVWKERLELLKPYQVNKEIMDKTGNPNVIFEHCLPSFHNADTKIGQQIFEKYGIREMEVTDEVFESKASVVFQEAENRMHTIKAVMVATLGEF >CP031673.1|AXP52499.1|1805848_1806781_-|carbamate-kinase-1 MAKIVVALGGNALGKSPQEQLELVKNTAKSLVGLITKGHEIVISHGNGPQVGSINLGLNYAAEHNQGPAFPFAECGAMSQAYIGYQLQESLQNELHSIGMDKQVVTLVTQVEVDENDPAFNNPSKPIGLFYNKEEAEQIQKEKGFIFVEDAGRGYRRVVPSPQPISIIELESIKTLIKNDTLVIAAGGGGIPVIREQHDGFKGIDAVIDKDKTSALLGANIQCDQLIILTAIDYVYINFNTENQQPLKTTNVDELKRYIDENQFAKGSMLPKIEAAISFIENNPKGSVLITSLNELDAALEGKVGTVIKK >CP031673.1|AXP53559.1|1804120_1805626_-|YfcC-family-protein MPGAFMILFILTVVAVIATWVIPAGAYSKLSYEPSSQELKIVNPHNQVKKVPGTQQELDKMGVKIKIEQFKSGAINKPVSIPNTYERLKQHPAGPEQITSSMVEGTIEAVDIMVFILVLGGLIGVVQASGSFESGLLALTKKTKGHEFMLIVFVSILMIIGGTLCGIEEEAVAFYPILVPIFIALGYDSIVSVGAIFLASSVGSTFSTINPFSVVIASNAAGTTFTDGLYWRIGACIVGAIFVISYLYWYCKKIKNDPKASYSYEDKDAFEQQWSVLKDDDSAHFTLRKKIILTLFVLPFPIMVWGVMTQGWWFPVMASAFLIFTIIIMFIAGTGKSGLGEKGTVDAFVNGASSLVGVSLIIGLARGINLVLNEGMISDTILHFSSSLVQHMSGPLFIIVLLFIFFCLGFIVPSSSGLAVLSMPIFAPLADTVGIPRFVIVTTYQFGQYAMLFLAPTGLVMATLQMLNMRYSHWFRFVWPVVAFVLIFGGGVLITQVLIYS >CP031673.1|AXP52498.1|1803585_1803813_-|hypothetical-protein MTHLTKVLDTLTGICVVLLFSKYFVAYANMVFDWNLRWYLLENIPHLPIILFILMFIFGVPSEMIKDRQRKNNGV >CP031673.1|AXP52497.1|1802333_1803281_+|permease MRLQKAPLVTSGLVLGLLGLGNLLKDLSLTLNAVCGIFAFLIWIHLLCTMIKYFNNVKEQLNSPLVSSVFTTFFMSGFLGTTYLNTFFSNITFINSLITPIWILCLVGIMTHMIIFSIKYLKDFSLENVYPSWTVLFIGIAIAGLTAPVSGYFFIGQLTVIYGFVATCIVLPIVFKRLKAFPLQTSIKPNTSTICAPFSLVAAAYVIAFPKANAFIVIIFLLLAQIFYFYIIIQLPKLLKEPFSPVFSAFTFPLVISATALKNSLPVLMFPDIWKGLLFIEVLLATVIVLRVFIGYLHFFLKKEKQDKFLRNASQ >CP031673.1|AXP52496.1|1801896_1802085_-|DNA-binding-protein MRNQIQKLLDSDLSSLHISKQTGVPQSTIHRMRKNERSLDNMSLKNAELLYKFANSIFSNEN >CP031673.1|AXP52495.1|1800850_1800985_-|beta-class-phenol-soluble-modulin MEGLFNAIKDTVTAAINNDGAKLGTSIVSIVENGVGLLGKLFGF >CP031673.1|AXP52504.1|1811168_1811393_-|hypothetical-protein MLIQERGLKMTELNNIINSLQSLFESESGYKISKNSGVPYQTVQDLRNGKTKLEDARFRTIIKLYSYYVSLKEH >CP031673.1|AXP52505.1|1811349_1811496_-|hypothetical-protein MKLFYIVFLIIIWLNIFLGNEIIHTLTVLITTLYIVNSRKGIKNDRVE >CP031673.1|AXP52506.1|1812168_1813128_+|alpha-hemolysin MKTRIVSSVTTTLLLGSILMNPVANAADSDINIKTGTTDIGSNTTVKTGDLVTYDKENGMHKKVFYSFIDDKNHNKKLLVIRTKGTIAGQYRVYSEEGANKSGLAWPSAFKVQLQLPDNEVAQISDYYPRNSIDTKEYMSTLTYGFNGNVTGDDTGKIGGLIGANVSIGHTLKYVQPDFKTILESPTDKKVGWKVIFNNMVNQNWGPYDRDSWNPVYGNQLFMKTRNGSMKAADNFLDPNKASSLLSSGFSPDFATVITMDRKASKQQTNIDVIYERVRDDYQLHWTSTNWKGTNTKDKWIDRSSERYKIDWEKEEMTN >CP031673.1|AXP52507.1|1813604_1813838_+|hypothetical-protein MVFNDWEINVVYSGEHEVVTNEKSLFVIDEFYDVAIAIYYLDGKLKVAHVNYGSDFTIDVANKVFELNIQNPNVDEH >CP031673.1|AXP53560.1|1814031_1814250_+|hypothetical-protein MINFGLIIVPLLTTNDADFVWTSSSLIYMILLTSIILIVYIKTKDSLQLTIFILNIALIILYCAPLLFIYVF >CP031673.1|AXP52508.1|1814459_1814645_+|hypothetical-protein MNKHINKKAAKLLEDYKKVQQRKSKETDRGCLKSVIMLIVLFFLIIFGIVACSTNVNFFFQ >CP031673.1|AXP52509.1|1814956_1815124_-|nitrogen-fixation-protein-NifR MTNSNRQCKLAGPQHREIGSPISTDNASWGGAQHRSWRKVSIQKCASWRGHNREK >CP031673.1|AXP52510.1|1815466_1815817_-|fibrinogen-binding-protein MKFKKYILTGTLALLLSSTGIATIEGNKADASSLDKYLTESQFHDKRIAEELRTLLNKSNVYALAAGSLNPYYKRTIMMNEYRAKAALKKNDFVSMADAKVALEKIYKEIDEIINR >CP031673.1|AXP52511.1|1815970_1816468_-|fibrinogen-binding-protein MKNKLIAKSLLTLAAIGITTTTIASTADASEGYGPREKKPVSINHNIVEYNDGTFKYQSRPKFNSTPKYIKFKHDYNILEFNDGTFEYGARPQFNKPAAKTDATIKKEQKLIQAQNLVREFEKTHTVSAHRKAQKAVNLVSFEYKVKKMVLQERIDNVLKQGLVK >CP031673.1|AXP52512.1|1816726_1817233_-|hypothetical-protein MIIKILTILLLLCILSYLVTNRKKPFLFLKTLFMGVVFIFIGYISLAISAVIIYGIIQFITIDFGSFFLMGIILILISSIFQLFIVRLLFRKKNVDLTEVVVLEHLIQWFLVYFAIYQAVNEKMDINDINIDNFQSVFFDVSNLNLVILPTLIISWVTIFNYRMRSYK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP031673_6 | 1814851-1815107 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP031673_6
|
4 spacers
spacers of CP031673_6
>6.1|1814878|29|CP031673|CRISPRCasFinder CATTTTTGTAAGCTGACTTTTCGCCAGCT >6.2|1814934|30|CP031673|CRISPRCasFinder ATTGTTTGTTGGAATTGGTGATCCTATTTC >6.3|1814882|38|CP031673|CRT TTTGTAAGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTATGTTGGGGC >6.4|1814939|37|CP031673|CRT TTGTTGGAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTGTTGTGG >6.5|1814995|38|CP031673|CRT TTTGTATGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTGTGTTGGGCC >6.6|1815052|37|CP031673|CRT CTGTTGAAATTGGTGATCCAATTTCTCTATGTTGGGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP031673_6
The CRISPR arrays of CP031673_6 >merge|CP031673|6|1814851-1815107|CRISPRCasFinder,CRT TCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTTTTGTAAGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCCGCCAACTTGCATTGTTTGTTGGAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTGTTGTGGCCCCGCCAACTTGCACATTTTTGTATGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTGTGTTGGGCCCCACCCCAACTTGCATTGTCTGTTGAAATTGGTGATCCAATTTCTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGT >CP031673|6|5|1814851-1814990|CRISPRCasFinder TCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCA CATTTTTGTAAGCTGACTTTTCGCCAGCT TCTATGTTGGGGCCCCCGCCAACTTGC ATTGTTTGTTGGAATTGGTGATCCTATTTC TCTCTGTTGTGGCCCCGCCAACTTGCA >CP031673|6|2|1814863-1815107|CRT CCCCGCCAACTTGCACATT TTTGTAAGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTATGTTGGGGC CCCCGCCAACTTGCATTGT TTGTTGGAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTGTTGTGG CCCCGCCAACTTGCACATT TTTGTATGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTGTGTTGGGCC CCACCCCAACTTGCATTGT CTGTTGAAATTGGTGATCCAATTTCTCTATGTTGGGG CCCCGCCAACTTGCATTGT
>CP031673.1|AXP52508.1|1814459_1814645_+|hypothetical-protein MNKHINKKAAKLLEDYKKVQQRKSKETDRGCLKSVIMLIVLFFLIIFGIVACSTNVNFFFQ >CP031673.1|AXP53560.1|1814031_1814250_+|hypothetical-protein MINFGLIIVPLLTTNDADFVWTSSSLIYMILLTSIILIVYIKTKDSLQLTIFILNIALIILYCAPLLFIYVF >CP031673.1|AXP52507.1|1813604_1813838_+|hypothetical-protein MVFNDWEINVVYSGEHEVVTNEKSLFVIDEFYDVAIAIYYLDGKLKVAHVNYGSDFTIDVANKVFELNIQNPNVDEH >CP031673.1|AXP52506.1|1812168_1813128_+|alpha-hemolysin MKTRIVSSVTTTLLLGSILMNPVANAADSDINIKTGTTDIGSNTTVKTGDLVTYDKENGMHKKVFYSFIDDKNHNKKLLVIRTKGTIAGQYRVYSEEGANKSGLAWPSAFKVQLQLPDNEVAQISDYYPRNSIDTKEYMSTLTYGFNGNVTGDDTGKIGGLIGANVSIGHTLKYVQPDFKTILESPTDKKVGWKVIFNNMVNQNWGPYDRDSWNPVYGNQLFMKTRNGSMKAADNFLDPNKASSLLSSGFSPDFATVITMDRKASKQQTNIDVIYERVRDDYQLHWTSTNWKGTNTKDKWIDRSSERYKIDWEKEEMTN >CP031673.1|AXP52505.1|1811349_1811496_-|hypothetical-protein MKLFYIVFLIIIWLNIFLGNEIIHTLTVLITTLYIVNSRKGIKNDRVE >CP031673.1|AXP52504.1|1811168_1811393_-|hypothetical-protein MLIQERGLKMTELNNIINSLQSLFESESGYKISKNSGVPYQTVQDLRNGKTKLEDARFRTIIKLYSYYVSLKEH >CP031673.1|AXP52503.1|1809895_1810612_+|superantigen-like-protein-SSL12 MSKNITKNIILTTTLLLLGTVLPQNQKPVFSFYSEAKAYSIGQDETNINELIKYYTQPHFSFSNKWLYQYDNGNIYVELKRYSWSAHISLWGAESWGNINQLKDRYVDVFGLKDKDTDQLWWSYRETFTGGVTPAAKPSDKTYNLFVQYKDKLQTIIGAHKIYQGNKPVLTLKEIDFRAREALIKNKILYNENRNKGKLKITGGGNNYTIDLSKRLHSDLANVYVKNPNKITVDVLFD >CP031673.1|AXP52502.1|1809062_1809788_+|superantigen-like-protein-SSL13 MNNNITKKIILSTTLLLLGTASTQFPNTPINSSSEAKAYYINQNETNVNELTKYYSQKYLTFSNSTLWQKDNGTIHATLLQFSWYSHIQVYGPESWGNINQLRNKSVDIFGIKDQETIDSFALSQETFTGGVTPAATSNDKHYKLNVTYKDKAETFTGGFPVYEGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKSKKLYNNSYNKGQIKITGADNNYTIDLSKRLPSTDANRYVKKPQNAKIEVILEKSN >CP031673.1|AXP52501.1|1808242_1808968_+|superantigen-like-protein-SSL14 MKKNIMNKLVLSTALLLLETTSTQLPKTPISFSSEAKAYNISENETNINELIKYYTQPHFSLSGKWLWQKPNGSIHATLQTWVWYSHIQVFGSESWGNINQLRNKYVDIFGTKDEDTVEGYWTYDETFTGGVTPAATSSDKPYRLFLKYSDKQQTIIGGHEFYKGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKNKKLYNGEFNKGQIKITADGNNYTIDLSKKLKLTDTNRYVKNPRNAEIEVILEKSN >CP031673.1|AXP52500.1|1806803_1807805_-|ornithine-carbamoyltransferase MKNLRNRSFLTLLDFSRQEVEFLLTLSEDLKRAKYIGTEKPMLKNKNIALLFEKDSTRTRCAFEVAAHDQGANVTYLGPTGSQMGKKETTKDTARVLGGMYDGIEYRGFSQRTVETLAEYSGVPVWNGLTDEDHPTQVLADFLTAKEVLKKDYADINFTYVGDGRNNVANALMQGAAIMGMNFHLVCPKELNPTDELLNRCKNIAAENGGNILITDDIDQGVKGSDVIYTDVWVSMGEPDEVWKERLELLKPYQVNKEIMDKTGNPNVIFEHCLPSFHNADTKIGQQIFEKYGIREMEVTDEVFESKASVVFQEAENRMHTIKAVMVATLGEF >CP031673.1|AXP52510.1|1815466_1815817_-|fibrinogen-binding-protein MKFKKYILTGTLALLLSSTGIATIEGNKADASSLDKYLTESQFHDKRIAEELRTLLNKSNVYALAAGSLNPYYKRTIMMNEYRAKAALKKNDFVSMADAKVALEKIYKEIDEIINR >CP031673.1|AXP52511.1|1815970_1816468_-|fibrinogen-binding-protein MKNKLIAKSLLTLAAIGITTTTIASTADASEGYGPREKKPVSINHNIVEYNDGTFKYQSRPKFNSTPKYIKFKHDYNILEFNDGTFEYGARPQFNKPAAKTDATIKKEQKLIQAQNLVREFEKTHTVSAHRKAQKAVNLVSFEYKVKKMVLQERIDNVLKQGLVK >CP031673.1|AXP52512.1|1816726_1817233_-|hypothetical-protein MIIKILTILLLLCILSYLVTNRKKPFLFLKTLFMGVVFIFIGYISLAISAVIIYGIIQFITIDFGSFFLMGIILILISSIFQLFIVRLLFRKKNVDLTEVVVLEHLIQWFLVYFAIYQAVNEKMDINDINIDNFQSVFFDVSNLNLVILPTLIISWVTIFNYRMRSYK >CP031673.1|AXP52513.1|1817904_1818306_+|FPRL1-inhibitory-protein MKKNITKTIIASTVIAAGLLTQTNDAKAFFSYEWKGLEIAKNLADQAKKDDERIDKLMKESDKNLTPYKAETVNDLYLIVKKLSQGDVKKAVVRIKDGGPRDYYTFDLTRPLEENRKNIKVVKNGEIDSITWY >CP031673.1|AXP52514.1|1818265_1818358_+|hypothetical-protein MLKTVKSTRLLGIKKHTELNSCTPNVRKQC >CP031673.1|AXP52515.1|1818674_1819004_-|fibrinogen-binding-protein MKKNFIGKSILSIAAISLTVSTFAGESHAQTKNVEAAKKYDQYQTNFKKQVNKKVVDAQKAVNFFKRTRTVATHRKAQRAVNLIHFQHSYEKKKLQRQIDLVLKYNTLK >CP031673.1|AXP52516.1|1819197_1819365_-|hypothetical-protein MKRIVILENVIVDNPIWLNHVDYLVKSVLLKSIKLRFQEVRKFEILVKIMNRIHI >CP031673.1|AXP52517.1|1819492_1819996_-|metallophosphoesterase MSKWIIVSDNHTESGVLYQIYEMHPDADVYLHLGDSEFAYDDTELSLFNRVKGNCDFYPEFENEAVAKYNDVKAFYTHGHLYQVNRTRDLLAEKGLELGCLFAFYGHTHVAKYEYINGVHVINPGSISQSRSSMEETYAEVIIDDQTLHGTINFKNRHHETISHTTF >CP031673.1|AXP52518.1|1819988_1820576_-|non-canonical-purine-NTP-pyrophosphatase MKEIVIASNNQGKINDFKVIFPDYHVIGISELIPDFDVEETGSTFEENAILKSEAAAKALNKTVIADDSGLEVFALNGEPGIYSARYAGENKSDEANIEKLLNKLGNTTDRRAQFVCVISMSGPDMETKVFKGTVSGEIADGKYGENGFGYDPIFYVPKLDKTMAQLSKEQKGQISHRRNAINLLQAFLEGDKNV >CP031673.1|AXP52519.1|1820587_1821388_-|glutamate-racemase MNKPIGVIDSGVGGLTVAKEIMRQLPNETIYYLGDIGRCPYGPRPGEQVKQYTVEIARKLMEFDIKMLVIACNTATAVALEYLQKTLSIPVIGVIEPGARTAIMTTRNQNVLVLGTEGTIKSEAYRTHIKRINPHVEVHGVACPGFVPLVEQMRYSDPTITSIVIHQTLKRWRNSESDTVILGCTHYPLLYKPIYDYFGGKKTVISSGLETAREVSALLTFSNEHASYTEHPDHRFFATGDPTHITNIIKEWLNLSVNVERISVND |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP031673_7 | 2077910-2077991 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP031673_7
|
1 spacers
spacers of CP031673_7
>7.1|2077934|34|CP031673|CRISPRCasFinder ATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP031673_7
The CRISPR arrays of CP031673_7 >merge|CP031673|7|2077910-2077991|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGGG >CP031673|7|6|2077910-2077991|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGG ATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT TTCTACAGACAATGCAAGTTGGGG
>CP031673.1|AXP52770.1|2077562_2077676_-|hypothetical-protein MLGPRQLAHYCKLTYHQLLCWGPAIIEKFVIGVFSFG >CP031673.1|AXP52769.1|2076966_2077353_-|topiosmerase MAIVNKVIIVEGKSDKKRVQQVIAEPVNIICTHGTMSIDKLDDMIESLYDKQVFVLADSDDEGDRIRNWFKRYLSESEHIFIDKTYCQVANCPKQYLAHVLSKHGFTCKKETPLLPNINNERLVLVNE >CP031673.1|AXP52768.1|2076677_2076974_-|thioredoxin MNNSLDIKDVTTFYEEDKHLIFGYTPTCGTCKVSERMLDIANEILQLPLLKIDLNFYPQFCKDMQIMSTPILLLMNKDKEVKRIYAFKSVTDLLENLK >CP031673.1|AXP52767.1|2075402_2076428_-|methionine-import-ATP-binding-protein-MetN-2 MIELKEVVKEYRTKNKEVLAVDHVNLSIRAGSIYGVIGFSGAGKSTLIRMFNHLEAPTSGEVIIDGDHIGQLSKNGLRAKRQKVSMIFQHFNLLWSRTVLKNIMFPLEIAGVPRRRAKQKALELVELVGLKGREKAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPTVLLCDEATSALDPQTTDEILDLLLKIREQQNLTIVLITHEMHVIRRICDEVAVMESGKVIEQGPVTQVFENPQHTVTKRFVKDDLNDDFETSLTELEPLEKDAYIVRLVFAGSTTTEPIVSSLSTAYDIKINILEANIKNTKNGTVGFLVLHIPYISSVDFGKFEKELIERQVKMEVLRHG >CP031673.1|AXP52766.1|2074714_2075410_-|ABC-transporter-permease MGKSFSEIINEMITMPNIQWPEVWTAIVETLYMTVVSTIFAFILGLILGVLLFLSAKGKSIGARLFYSIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSLILGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTWTVIRKVLLPEAMPALVSGITVTAIALVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWLTNKLDKR >CP031673.1|AXP52765.1|2073875_2074697_-|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGNKSGSDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYELDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGDVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFLPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK >CP031673.1|AXP52764.1|2073327_2073522_-|CsbD-family-protein MADESKFEQAKGNVKETVGNVTDNKNLENEGKEDKASGKAKEFVENAKEKATDFIDKVKGNKGE >CP031673.1|AXP52763.1|2072243_2073095_+|DUF368-domain-containing-protein MQQFKWINILKGFAMGTSDLVPGVSGGTIALLLGIYNQFIASISGIFSRRFWPSFTFLIPIIIGMLLAMGSLSNLFNYLLSQHHIPTMFFFGGLIIGIVPYLLKISNYKTSFTTKHYMMVIAGIAILIVITLMNNGDKHAGETLTLSTSLIIKYFIAGMCASSAMLLPGISGSFMLLVFGVYGTVMLAISEVVKLNFAGLPILLAVGFGVLAGFIISSKIIQYFLTHHKLMTFALIIGFVVGSLFAVFPGLPTNIVMWFVSLVVFIIGFIVSLTLGRITAENE >CP031673.1|AXP52762.1|2071154_2071916_-|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC MASTLEIKDLHVSIEDKEILKGVNLTINTDEIHAIMGPNGTGKSTLSSAIMGHPSYEVTKGEVLLDGVNILELEVDERAKAGLFLAMQYPSEITGVTNADFMRSAINAKREEGQEINLMQFIKKLDKNMDFLDIDKDMAQRYLNEGFSGGEKKRNEILQLMMLEPKFAILDEIDSGLDIDALKVVSKGINQMRGENFGALMITHYQRLLNYITPDKVHVMYAGKVVKSGGPELAKRLEEEGYEWVKEEFGSAE >CP031673.1|AXP52761.1|2069749_2071057_-|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MTTDILNISEEQLVDYSKAHNEPSWMTELRKKALKLTETLEMPKPDKTKLRKWDFDSFKQHDVKGDVYQSLSQLPESVREIIDVDHSKNLVIQHNNTIAYTQVDDNASKDGVIVEGLADALMNHSDLVQKYFMKDAVTVDEHRITALHTALVNGGVFVYVPKNVVVEHPVQYVVLHDDENASFYNHVIIVTEESAEVTYVENYLSNASGEGNQLNIISEVIAGANSNITYGSVDYMDKGFTGHIIRRGITEADASINWALGLMNEGSQIIDNTTNLFGDRSTSSLKSVVVGTGEQKINLTSKIVQYGKETDGYILKHGVMKEHASSVFNGIGYIKHGGTKSIANQESRVLMLSEHARGDANPILLIDEDDVQAGHAASVGRVDPDQLYYLMSRGISQREAERLVIHGFLDPVVRELPIEDVKRQLREVIERKVSK >CP031673.1|AXP52771.1|2078094_2078973_-|DUF1963-domain-containing-protein MLNIQDVSHLSKKEQKAYNRFVESVENGNLPVLPCIEMDLKEMQEETLNQSKIGGMPFLKSFKDIPLDENNVPMVLLAQINLDDLPEQQELFPVKEGILQFWISSEDQMYGMSENLKGNNINSRLVYIKEPITDLSLENIQAHLKSLDADNEDIPFSGAFSIEFRLSKQTITCTDYKYDEDVLALWNKVNPSFALKSMFGGYDELMEPVCNTFTAKEPFNQLGGYPYFDQIDPRTNDQELKMYDRVLLQIDSTRDGNSSIIWGDLGIANILVKSTDLEAMKFDDYMYSWDCS >CP031673.1|AXP52772.1|2078974_2079088_-|hypothetical-protein MKEKLLGTIIWSIATFYYSRMMEIMNLAILKIKIGGS >CP031673.1|AXP52773.1|2079151_2079532_-|glycine-cleavage-system-protein-H MAVPNELKYSKEHEWVKVEGNVAIIGITEYAQSELGDIVFVELPETDDEINEGDTFGSVESVKTVSELYAPISGKVVEVNEELEDSPEFVNESPYEKAWMVKVEISDESQIEALLTAEKYSEMIGE >CP031673.1|AXP52774.1|2079689_2080046_-|arsenate-reductase-family-protein MIKFYQYKNCTTCKKAAKFLDEYGVSYEPIDIVQHTPTINEFKTIIANTGVEINKLFNTHGAKYRELDLKNKLQTLSDDEKLELLSSDGMLVKRPLAVMGDKITLGFKEDQYKETWLA >CP031673.1|AXP52775.1|2080189_2080510_+|thioredoxin MQSIKSNESFKSVINSDTPVIVKFEAGWCPDCRAMDLWIDPIVEQYNDYQWYTVNRDELEDVVVENEVMGIPSLLVFKNGDKIAHLHSANAKSPEQVESFLAETFK >CP031673.1|AXP52776.1|2080659_2081199_-|nitroreductase MELQQAIANRRSVKKFKRDMHIDDALLYQAIEKAADAPNHGMREPWRVVHVPKDRLGDMSKDISKFAFPNELDKQQCHYDAVTKLGGMLLLILKTDPRQRQNDENYFAFGAYAQNLMLLLYEAGIGTCWKSPLYIYDPKVRKTLGIKKDEVLAGFLYLTDLEEDMPKAPRKNRNLITLY >CP031673.1|AXP52777.1|2081281_2081998_-|3-dehydroquinase MTHVEVVATIAPQLSIEETLIQKINHRIDAIDVLELRIDQIENVTVDQVAEMITKLKVMQDSFKLLVTYRTKLQGGYGQFTNDSYLNLISDLANINGIDMIDIEWQADIDIEKHQRIITHLQQYNKEVVISHHNFESTPPLDELQFIFFKMQKFNPEYVKLAVMPHNKNDVLNLLQAMSTFSDTMDCKVVGISMSKLGLISRTAQGVFGGALTYGCIGVPQAPGQIDVTDLKAQVTLY >CP031673.1|AXP52778.1|2082145_2082568_+|organic-hydroperoxide-reductase-OsmC/OhrA MAIHYETKATNVGGRKGHVYTDDRALDIDIVPPAQADGKATNPEQLFAAGYASCFNGAFDLILKQNKVRDAHPEVTLTVRLEDDSDSESPKLSVSIDATIKNVISQEEAEKYLQMAHEFCPYSKATQGNINVDLNVNVVD >CP031673.1|AXP52779.1|2082966_2083461_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MIEIKTLTNNDFNEYKRLVSTVNEEFTQDSHYSQTMTDTLIHDILNQGSPKCIVFGCYENETLIATAALEQIRYVGKEHKSLIKYNFVTNNDKSINSELINFIINYARQNNYESLLTSIVSNNIGAKVFYSALGFDILGFEKNAIKIGNTYFDEHWLFYDLINK >CP031673.1|AXP52780.1|2083615_2084233_+|amino-acid-transporter MVTAIIHGFILAIGLILPLGAQNVFIFNQGANQPKYRYVLPAIITAGLSDSLLIIIAVVGVSIIIMSLPVLQAIIYIVGLIFLMYMAWTIWHDKPSTDGETQIMSPMKQVSFALSVSLLNPHAILDTIGVIGSSAALYSGSNKIAFTIACISVSWLWFFLLAILGKMVGSIDKTGKLLTIINKISSIIIIIVALMILQKLIQLLF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP031673_8 | 2126405-2126485 | Unclear |
NA
Consensus repeat of CP031673_8
|
1 spacers
spacers of CP031673_8
>8.1|2126431|29|CP031673|CRISPRCasFinder TTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP031673_8
The CRISPR arrays of CP031673_8 >merge|CP031673|8|2126405-2126485|CRISPRCasFinder AGTTGGCGGGGCCCCAACATAAAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAAAGAA >CP031673|8|7|2126405-2126485|CRISPRCasFinder AGTTGGCGGGGCCCCAACATAAAGAA TTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCA AGTTGGCGGGGCCCCAACATAAAGAA
>CP031673.1|AXP52821.1|2125235_2126168_-|HPr-kinase/phosphorylase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >CP031673.1|AXP52820.1|2124390_2125230_-|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPSEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGSVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >CP031673.1|AXP52819.1|2123897_2124383_-|acetyltransferase MRKFLSKTHHHTNPLWRVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >CP031673.1|AXP52818.1|2122450_2123890_-|tetratricopeptide-repeat-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYHNELFVSENDVMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >CP031673.1|AXP52817.1|2121448_2122384_-|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >CP031673.1|AXP52816.1|2120968_2121103_+|nitrogen-fixation-protein-NifR MGCGPQHREIGFPISTDNASWRGPNTEAGGKSAYNNVQVGVGQR >CP031673.1|AXP52815.1|2119771_2120683_-|RNase-adaptor-protein-RapZ MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >CP031673.1|AXP52814.1|2118779_2119775_-|YvcK-family-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >CP031673.1|AXP52813.1|2117725_2118670_-|DNA-binding-protein-WhiA MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >CP031673.1|AXP52812.1|2116565_2117153_-|ATP-dependent-Clp-protease-proteolytic-subunit MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >CP031673.1|AXP52822.1|2126774_2129621_-|excinuclease-ABC-subunit-A MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNIDLSEQDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIEVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGVDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDK >CP031673.1|AXP52823.1|2129628_2131614_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrB MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVEGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >CP031673.1|AXP52824.1|2131882_2132119_-|DUF2198-family-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >CP031673.1|AXP52825.1|2132115_2132766_-|HD-domain-containing-protein MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENE >CP031673.1|AXP52826.1|2132939_2133779_-|CHAP-domain-containing-protein MKKSLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQHGTQVKTPVQHNYVSNVQAQTQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKAVKSPVRKASQAKKVVKQPVQQASKKVVVKQAPKQAVTKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTPEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH >CP031673.1|AXP52827.1|2133926_2134034_-|hypothetical-protein MCLLKQHMQCAFSNITYGDFQGIELIIENVLNYMV >CP031673.1|AXP52828.1|2134187_2135298_-|peptide-chain-release-factor-2 MELSEIKRNIDKYNQDLTQIRGSLDLENKETNIQEYEEMMAEPNFWDNQTKAQDIIDKNNALKAIVNGYKTLQAEVDDMDATWDLLQEEFDEEMKEDLEQEVINFKAKVDEYELQLLLDGPHDANNAILELHPGAGGTESQDWANMLFRMYQRYCEKKGFKVETVDYLPGDEAGIKSVTLLIKGHNAYGYLKAEKGVHRLVRISPFDSSGRRHTSFASCDVIPDFNNDEIEIEINPDDITVDTFRASGAGGQHINKTESAIRITHHPSGIVVNNQNERSQIKNREAAMKMLKSKLYQLKLEEQAREMAEIRGEQKEIGWGSQIRSYVFHPYSMVKDHRTNEETGKVDAVMDGDIGPFIESYLRQTMSHD >CP031673.1|AXP52829.1|2135466_2135571_-|hypothetical-protein MLWEESFYFTSVKYFKKCEEVVKRCYVLSFKKSV >CP031673.1|AXP52830.1|2135612_2138144_-|preprotein-translocase-subunit-SecA MGFLSKILDGNNKEIKQLGKLADKVIALEEKTAILTDEEIRNKTKQFQTELADIDNVKKQNDYLDKILPEAYALVREGSKRVFNMTPYKVQIMGGIAIHKGDIAEMRTGEGKTLTATMPTYLNALAGRGVHVITVNEYLSSVQSEEMAELYNFLGLTVGLNLNSKTTEEKREAYAQDITYSTNNELGFDYLRDNMVNYSEDRVMRPLHFAIIDEVDSILIDEARTPLIISGEAEKSTSLYTQANVFAKMLKQDEDYKYDEKTKAVHLTEQGADKAERMFKVENLYDVQNVDVISHINTALRAHVTLQRDVDYMVVDGEVLIVDQFTGRTMPGRRFSEGLHQAIEAKEGVQIQNESKTMASITFQNYFRMYNKLAGMTGTAKTEEEEFRNIYNMTVTQIPTNKPVQRNDKSDLIYISQKGKFDAVVEDVVEKHKAGQPVLLGTVAVETSEYISNLLKKRGIRHDVLNAKNHEREAEIVAGAGQKGAVTIATNMAGRGTDIKLGEGVEELGGLAVIGTERHESRRIDDQLRGRSGRQGDKGDSRFYLSLQDELMIRFGSERLQKMMSRLGLDDSTPIESKMVSRAVESAQKRVEGNNFDARKRILEYDEVLRKQREIIYNERNSIIDEEDSSQVVDAMLRSTLQRSINYYINTADDEPEYQPFIDYINDIFLQEGDITEDDIKGKDAEDIFEVVWAKIEAAYQSQKDILEEQMNEFERMILLRSIDSHWTDHIDTMDQLRQGIHLRSYAQQNPLRDYQNEGHELFDIMMQNIEEDTCKFILKSVVQVEDNIEREKTTEFGEAKHVSAEDGKEKVKPKPIVKGDQVGRNDDCPCGSGKKFKNCHGK >CP031673.1|AXP52831.1|2138557_2139130_-|ribosomal-subunit-interface-protein MIRFEIHGDNLTITDAIRNYIEEKIGKLERYFNDVPNAVAHVKVKTYSNSATKIEVTIPLKNVTLRAEERNDDLYAGIDLINNKLERQVRKYKTRINRKSRDRGDQEVFVAELQEMQETQVDNDAYDDNEIEIIRSKEFSLKPMDSEEAVLQMNLLGHDFFVFTDRETDGTSIVYRRKDGKYGLIQTSEQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP031673_9 | 2283453-2283545 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP031673_9
|
1 spacers
spacers of CP031673_9
>9.1|2283485|29|CP031673|CRISPRCasFinder CGATTAGAGGCTTTTATGCAGTTGTGCCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP031673_9
The CRISPR arrays of CP031673_9 >merge|CP031673|9|2283453-2283545|CRISPRCasFinder TAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCATCTTTAGCGATTAGAGGCTTTTATGCAGTTGTGCCTTAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCACCTTTAG >CP031673|9|8|2283453-2283545|CRISPRCasFinder TAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCATCTTTAG CGATTAGAGGCTTTTATGCAGTTGTGCCT TAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCACCTTTAG
>CP031673.1|AXP53570.1|2282496_2283324_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKDNDKQGSNDNGSSKSPYHRIVSLMPSNTEILYELGLGKYIVGVSTVDDYPKDVKKGKKQFDALNLNKEELLKAKPDLILAHESQKATANKVLSSLEKQGIKVVYVKDAQSIDETYNTFKQIGKLTHHDKQAEQLVEETKDNIDKVIDSIPAHHKKSKVFIEVSSKPEIYTAGKHTFFNDMLEKLEAQNVYSDINGWNPVTKESIIKKNPDILISTEAKTRSDYMDIIKKRGGFNKINAVKNTRIEVVNGDEVSRPGPRIDEGLKELRDAIYRK >CP031673.1|AXP53569.1|2281398_2282349_-|iron-ABC-transporter-permease MTFNKVLLSWIVILIITTSIYLFWQLGDINDVFNQSILINVRLPRLLEALLTGMILTVAGLIFQTVLNNALADSFTLGLASGATFGSGLALFLGLTTLWIPVFSITFSLITLITVLVITSVLSQGYPVRILILSGLMIGALFNSLLYFLILLKPRKLNTIANYLFGGFGDAEYSNVSIIAITFIIALFGIFIILNQLKLLQLGELKSQSLGLNVQLITYIALCIASMITAINVAYVGIIGFIGMVIPQLIRKWQWKQSLGRQLALNIVTGGQIMVMADFIGSHILSPVQIPASIIIALIGIPVLFYMLISQSKRLH >CP031673.1|AXP52976.1|2280624_2281344_-|HAD-family-hydrolase MDLNQIKAVVFDLEGTLLDRVKSREKFIEEQYERFHDYLIHVQLADFKKAFIELDDDEDNDKPDLYKEIIKRFHVDRLTWKDLFNDFEMHFYRYVFPYYDTLYTLEKLSQKGFQIGVIANGKSKIKQFRLHSLGLMHVINYLSTSETVGFRKPHPKIFEDMIDQLGVLPEQIMYVGDDALNDVAPARAMGMVSVWYKQEDAEIEPLEEEVDFTITTVEELLTILPIKNDNKGENYGSIY >CP031673.1|AXP52975.1|2279840_2280641_-|alpha/beta-hydrolase MDLFTRKDGTSIHYSTLGEGYPIVLIHTVLDNYSVFNKLAAELAKSFQVVLIDLRGHGYSDKPRHIEIKDFSDDIVELLKYLYIEEVAFVCHEMGGIIGADISVRYPEFTSSLTLVNPTSIEGELPEERLFRKYAHIIRNWDPEKQDKFLNKRKYYRPRKMNRFLKHVVDTNEISTKEEIQAVKEVFKNADISQTYRNVVVPTKIIAGEFGERTTRLEAKEVADLIQNADFEVYQESSAFPFVEEQERFVEDTAAFINKHHDEKHV >CP031673.1|AXP52974.1|2279198_2279705_-|hypothetical-protein MKKLLTASIIACSVVMGVGLVNTSAEAASGNSIDTVKQLIKGDQSLENVKIGESIKDVLTKYKNPMYSYNEDGTEHYYEFHTKKGMLLVTTDGKKNNGKVTHISMMYNDANGPTYQAVKNYVGKAVTHTEYSKVAGNFGYIEKGKTTYQFASAPKDKNIKLYRIDLEK >CP031673.1|AXP52973.1|2278320_2279037_-|hypothetical-protein MRINDKILLENIEDYFNHKGLSPHLIDDIKEKVITDIKNSEKKDQDYIEYKRKSPAQIILMIQRNLFALQMNPVIFFIINFILISYLYDKQYVQFQAITGMSLFYCLVIFPMTIVVYLRVSQKNYLRSNKIEMIMGTIIAIISLLLIILQAFNITWGVIPITNFGHQFFFFIGIILVIAGIFYKRLEFSGIGLLFCQKTVDAMIHNPQSAQIFSLIIWILLVVLVIYFTIRLSSRTRL >CP031673.1|AXP52972.1|2277364_2278153_-|alpha/beta-hydrolase MNKVTINPQIQLTYQIEGKGDPIILLHGLDGNLAGFEDLQHQLASSYKVLTYDLRGHGKSSKSESYDLNDHVEDLKILMEKLNIHEAHILGHDLGGVVAKLFTDKYAYRVKSLTTIASKKDDLIHSFTQLLIQYQDDIAGFNKSEAYILLFSKLFRNQEKTMKWYQKQRIYSIKSEDDSAVAIRSLILHKDEPMYLKKRTCVPTLLINGEHDPLIKDKNHFKLEAHFLNVTKKIFEHSGHAPHIEEPEAFMNYYLKFLKSVS >CP031673.1|AXP52971.1|2276739_2277114_+|transcriptional-regulator MAITKINDCFELLSMVTYADKLKSLIKKEFSISFEEFAVLTYISENKEKEYYLKDIINHLNYKQPQVVKAVKILSQEDYFDKKRNEHDERTVLILVNAQQRKKIESLLSRVNKRITEANNEIEL >CP031673.1|AXP52970.1|2274862_2275792_+|DMT-family-transporter MLLFYIIGVLVGMLIPIQTSVNSRLSLYTKSPFYTSFISFSVGTICLIILNIIINPEVFTIHFYNNQSFNYTWVVGGLLGVSFLTGNLLLLPKLGATLTVIATVAGQIIMGVIIDTFGLFGATIHDFNLIKAIGVLLLIVGIVIMNQFNKNNLLLTDQKYLLFWLLLGFIFGFFPPIQTTINSALASHTHSPAFASLVSFTIGSIALLILTAIFNRSLKLKTSHLKFGKLKPIYFTGGILGMAFVTANIILMPHMGAALTTLIGMFGQILMGILIDHFGLFGSPKIAMTSRKTIGLLCILTGIILLRLF >CP031673.1|AXP52969.1|2274443_2274668_+|DUF2922-domain-containing-protein MTKTLELSFKSSLDKPVKLQLPQLNNVVTEQVARDSMNALVDLNIIKSNSGTITKVHSAQIIDKTTTVLFEDKK >CP031673.1|AXP52977.1|2283762_2284398_-|endonuclease-III-domain-containing-protein MLGTDELYKVLYEHLGPQFWWPADNDIEMMLGAILVQNTRWRNAEIALNQIKEHTHFNPNHILELPIETLQSLIHSSGFYKSKSLTIKTLLTWLARHHFNYQEINERYKGGLRKELLSLKGIGSETADVLLVYIFGRIEFIPDSYTRKIYDKLGYENTKNYDQLKKVVTLPNHFTNQDANEFHALLDVFGKHYFRDKDIKNYDFLEPYFKK >CP031673.1|AXP52978.1|2284533_2284842_+|hypothetical-protein MTRIEKSLLQANFRSVNYCHYNFVEHRTLIYVSGSLMQLCRASNCVPLNLIHILSIPQYVTYLKKTLQHKVSFEKLYVGVYINVLTLIQVRLHRPLPMHFSM >CP031673.1|AXP52979.1|2284786_2286448_-|arginine--tRNA-ligase MNIIDQVKQTLVEEIAASINKAGLADEIPDIKIEVPKDTKNGDYATNIAMVLTKIAKRNPREIAQAIVDNLDTEKAHVKQIDIAGPGFINFYLDNQYLTAIIPEAIEKGDQFGHVNESKGQNVLLEYVSANPTGDLHIGHARNAAVGDALANILTAAGYNVTREYYINDAGNQITNLARSIETRFFEALGDNSYSMPEDGYNGKDIIEIGKDLAEKHPEIKDYSEEARLKEFRKLGVEYEMAKLKNDLAEFNTHFDNWFSETSLYEKGEILEVLAKMKELGYTYEADGATWLRTTDFKDDKDRVLIKNDGTYTYFLPDIAYHFDKVKRGNDILIDLFGADHHGYINRLKASLETFGVDSNRLEIQIMQMVRLMENGKEVKMSKRTGNAITLREIMDEVGVDAARYFLTMRSPDSHFDFDMELAKEQSQDNPVYYAQYAHARICSILKQAKEQGIEVTAANDFTTIANEKAIELLKKVADFEPTIESAAEHRSAHRITNYIQDLASHFHKFYNAEKVLTDDIEKTKAHVAMIEAVRITLKNALAMVGVSAPESM >CP031673.1|AXP53571.1|2286444_2286828_-|DUF1934-family-protein MLKQHNEKEKFEFTTEGTWQQRQSNFIRYVEQIEDATVNVTIKVDDDSVKLIRKGDINMNLHFVEGQTTTTFYDISAGRIPLEVKTLRILHFVSGDGGKLKIHYELYQDNEKMGSYQYEINYKEIGE >CP031673.1|AXP52980.1|2286953_2287061_-|hypothetical-protein MKDSENLVFFGFEVLFVFYKMAYIYEALIKYGIVN >CP031673.1|AXP52981.1|2287135_2288146_-|zinc-dependent-alcohol-dehydrogenase MRAAVVTKDHKVSIEDKKLRALKPGEALVQTEYCGVCHTDLHVKNADFGDVTGVTLGHEGIGKVIEVAEDVESLKIGDRVSIAWMFESCGRCEYCTTGRETLCRSVKNAGYTVDGAMAEQVIVTADYAVKVPEKLDPAAASSITCAGVTTYKAVKVSNVKPGQWLGVFGIGGLGNLALQYAKNVMGAKIVAFDINDDKLAFAKELGADAIINSKDVDPVAEVMKLTDNKGLDATVVTSVAKTPFNQAVDVVKAGARVVAVGLPVDKMNLDIPRLVLDGIEVVGSLVGTRQDLREAFEFAAENKVTPKVQLRKLEEINDIFEEMENGTITGRMVIKF >CP031673.1|AXP53572.1|2288644_2289166_-|hypothetical-protein MEVISLSEKKGFNFNIIKNDPLDGHKGTNIGSISLDNIAPVFIDVANKEAFIDIGGMHARAKVEKGVKWITDKAAVEGDEAKEYWLCWVTTERNEQGPYYAGLTACYLLVNKAIRRGYKSMPEHVNMMDKSMKHHIIIDQIGDENKAILKDFLMNHDEGMWKHSSDALHQAFN >CP031673.1|AXP52982.1|2289193_2290489_-|HD-domain-containing-protein MTNAYVDLKLVEEKVFKDPIHRYIHVEDQLIWDLIKTKEFQRLRRIRQLGTLYLSFHTAEHSRFGHSLGVYEIVRRLIDESFIGHDAWDNKDRPLALCAALLHDLGHGPFSHSFEKIFNTDHEAYTQAIITGDTEVNAVLRKVAPEFPREVAEVINKTHHNKLVISMISSQIDADRMDYLQRDAYFTGVSYGAFDMERILRLMRPSKDEVLIKESGMHAVENFIMSRYQMYWQIYFHPVSRGGEVLLNNCLKRAKQLYNEGYEFKLHPHDFIPFFEETVTIEQYVELDEAVVTYYLEKWTKEDDAILSDLASRFINRDLFKYIPFDGSIITISELQELFEAGGINPDYYFVSEAFSDLPYDYDRPGSNRKPIHLLRQDGTIREISNQSLVIHSITGINRQDYKLYYPREMVAKIKDKTIREAIENLINELN >CP031673.1|AXP52983.1|2290528_2291005_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MFKVRQATEKDVVQIRDVATKAWFNTYLNIYAATTVNHLLEASYNEHHLKKRLQEQLFLVVEEGNDIVGFANFIYGEELYLSAHYVKPESQHTGYGTALLNEGLSRFEDKFEGVYLEVDNKNEEAVAYYKEQGFTILRSYEPEMYGEKLDLALMYKAF >CP031673.1|AXP52984.1|2291173_2291710_-|flavodoxin-family-protein MITVLFGGSRPNGNTAQLTKFALQDLEYQWIDVTQHQFKPIRDVRHTAETITSYDDDYLPILDKILASDTIIFASPVYWYSISAPLKAFIEHWSETLQDKRYPNFKAQMAEKDFRVILVGGDCPKIKAKPAITQMKYSLDFLGATLNGYIIGTAEKPGDIMKDNYALARATEWNSILQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP031673_10 | 2526961-2527062 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP031673_10
|
1 spacers
spacers of CP031673_10
>10.1|2526985|54|CP031673|CRISPRCasFinder TAGCTTTGATTTAAAAACTGGTTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP031673_10
The CRISPR arrays of CP031673_10 >merge|CP031673|10|2526961-2527062|CRISPRCasFinder CAAATTTAATACTCAATTCATATATAGCTTTGATTTAAAAACTGGTTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTTCAAATTTAATACTCAATTCATAAA >CP031673|10|9|2526961-2527062|CRISPRCasFinder CAAATTTAATACTCAATTCATATA TAGCTTTGATTTAAAAACTGGTTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTT CAAATTTAATACTCAATTCATAAA
>CP031673.1|AXP53190.1|2525987_2526944_+|hypothetical-protein MLTKEFAQRVELSEKQVRKIVQHLEERGYQLSKTEYRGREATDFKEEDIELFKDIADKVKQTNSYDLAFDELEKEKDFLQVIVKNDDKNLPTNQNVAQLVEDLRLEIQKMREERHLLGQMMNQVHQQQQELKELQNQLTSKIDSNSESLKAIQTSQEAIQEAQASQAKALAESTNKVEKNAVTEDKADSKDSKVAGVNTSTDAKTDTKAENAGDGTATKVDKEDQISATEAIEKASVEQSKNDNAAETSNKEATVDAEAQHDAEQQVAEAHAEASKQATSNDSLEAKAENDSTASQSEMSEPKPQEEKKGFFARLFNL >CP031673.1|AXP53189.1|2525207_2525870_+|hypothetical-protein MEFKTIQSVKDPHYNEALKLYDTKLNLSLTEDKRIIKRSLENNKTENDYVFIVGLENDVVVSLATAHYEATTNSAFLIYLFAKDLPNHDELMTQTLHQIEHELNLLSNLVHSRSINFLMMEVPKEPADLTQDNGLIIEHRRQFLYEHQFERQTEIDYIHPTNDGHTKKVDLFLKKNIKLTKDIYGTSVKSNYILKYVFANGIAREIIYALLEEMDLRKPF >CP031673.1|AXP53188.1|2524657_2525065_+|hypothetical-protein MADITVVNDTGELYNVINQKKSEGYLESELTIISKSKLHLNDLHDSEISLISTSGTFSDRMTKLLTGEDGEHAVLSRYNLAPDELEKYKQLILDDKMLVVAVRDKSSHQEVHENNSAYEEIDITHFAEASKGPKA >CP031673.1|AXP53187.1|2523566_2524145_-|xanthine-phosphoribosyltransferase MELLGQKVKEDGVVIDEKILKVDGFLNHQIDAKLMNEVGRTFYEQFKDKGITKILTIEASGIAPAIMAALHFDVPCLFAKKAKPSTLTDGYYETSIHSFTKNKTSTVIVSKEFLSEEDTVLIIDDFLANGDASLGLYDIAQQANAKTAGIGIVVEKSFQNGHQRLEEAGLTVSSLCKVASLEGNKVTLVGEE >CP031673.1|AXP53186.1|2522298_2523567_-|purine-permease MKNLILSVQHLLAMYAGAILVPIIVGTSLKFTPEQIAYLVTVDIFMCGVATFLQANKVTGTGLPIVLGCTFTAVAPMILIGQTKGIDVLYGSLFLSGILVIIIAPFFSHLVKFFPPVVTGSVVTIIGINLMPVAMNYLAGGQGAKDYGDVKNILLGLMTLIIILLLQRFTTGFIKSIAILIGLVLGTIGAGLLGMVDINQVNHAGWLGIPVPFRFSGFSFDVTSTLVFFIVAIVSLIESTGVYHALSEITGKKLERKDFRKGYTAEGLAIVLGSIFNSFPYTAYSQNVGLVSLSGAKKNNVIYGMVVLLLICGCIPKLGALANIIPLPVLGGAMIAMFGMVMAYGVSILGHIDFKNQNNLLIIAVSVGLGTGISAVPQAFKGLGEQFAWLTQNGIVLGAISAIILNFFFNGIKYKQTEENVK >CP031673.1|AXP53185.1|2520794_2522261_-|IMP-dehydrogenase MWESKFAKESLTFDDVLLIPAQSDILPKDVDLSVQLSDKVKLNIPVISAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVIHKNMGVEEQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEESVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKIVDVMTQENLITAPVNTTLEEAEKILQKHKIEKLPLVKDGRLEGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEHGRLLVAAAIGISKDTDIRAQKLVEAGVDVLVIDTAHGHSKGVIDQVKHIKKTYPEITLVAGNVATAEATKDLFEAGADIVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATEARKHGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEIFQGRQYKVYRGMGSLGAMEKGSNDRYFQEDKAPKKFVPEGIEGRTAYKGALQDTIYQLMGGVRAGMGYTGSHDLRELREEAQFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSF >CP031673.1|AXP53184.1|2519228_2520770_-|GMP-synthase-(glutamine-hydrolyzing) MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISIEEIKKMNPKGIILSGGPNSVYEEGSFTIDPEIYNLGIPVLGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIINAKSDELFAGLPAEQTVWMSHSDKVIEIPEGFEVIADSPSTDYAAIEDKKRRIYGVQFHPEVRHTEYGNDLLNNFVRRVCDCRGQWTMENFIEIEIEKIRQRVGDRRVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVNAKDRFMNKLKGVSDPEQKRKIIGNEFVYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMEFELIEPINTLFKDEVRKLGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLEIVRESDAILRQVIREEGLEREIWQYFTVLPNIQSVGVMGDYRTYDHTVGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPSTIEWE >CP031673.1|AXP53183.1|2518579_2519116_+|hypothetical-protein MHNNNEFNKKLKDFIGSDKRMALVKGYVNEYKLTTVLRALNNSDYTKGTIHTRSIGNLKQIVDNRIIPKNITQNTIFKLSNLTLEVNLYERNTIYHGDFAIYYPVESALIIETDTPRLINHINNNPVQKIFIITTNDWSFNTLELEKIVDETIIYDLKQEDPKQYEILYKNKHGKLPY >CP031673.1|AXP53182.1|2517482_2518187_+|type-II-toxin-antitoxin-system-PemK/MazF-family-toxin MSKNINQANSKLNTSNKKLKQAYSKSDSKNMKVIYMPHWLEFYSIAIHSDVTSNKKRYYKSYSRGTVVYVKLGSNIGSEFSGNHFCVILDNKDNKGKETVTIVPLSSKGNKNYLKLNESVLNLTATDLKKQIIDISSKVQALAQKYREIDIKLSTEDKKLLSNLNQKANELYRVIGVYSKHKGKDTYVNISAITTISKRRISKINDSDPTGTIIISEDDMNEIEKQLKIKFFSN >CP031673.1|AXP53181.1|2516811_2517084_+|transposase MTKERRTFSSEFKLQMVRLYKNGKLKNEIIRKYDLKPSIISNSIKQHQNTGPFNHQDNLKSDEKELIKLRKEVQHLKMEHDVLKQILKLI >CP031673.1|AXP53191.1|2527269_2527527_+|hypothetical-protein MLVTDESHKCTLIFTFTTNAFLLKQKYLFTVAFELPPAHTNTQKMLILIRQNFLQRVCSKRLFNVDHLLSFHSINMRLAIFIKPP >CP031673.1|AXP53192.1|2527734_2527836_-|hypothetical-protein MQLNVNMMKFDRWHKGICKQIVLNSVVIGGKGK >CP031673.1|AXP53193.1|2527920_2529309_+|L-cystine-transporter MNAFLTLINIIVLVIFIVILHMMARKHISFAKRVFTALGIGIVFGVLLHLIYGTHSNVITSTSDWFNIVGQGYVALLQMIVMPLIFISIVAAFTKIQIGEKFAKIGSLIFIFLIGTVTIAAIVGVVYALVFGLDASTINLGNAEQARGSEIAKQAKDLTAHTLPQQILELLPKNPFLDFTGQRATSTIAVVIFASFIGFAYLRVARKQPDHGELLKRAIDAIYSLVMAIVTFVLRLTPYGVLAIMANTLSTSDFGAIWTLGKFLIASYAALITMYIIHLIILSLLGISPIRYVKKTLEVLIFAFTSRSSAGALPLNVQTQTRRLGVPEGIANFAATFGLSIGQNGCAGIYPAMLAIMVAPVANVEIDLQFIVTLIAVVIISSFGVAGVGGGATFASILVLSTLNLPVALAGVLISVEPLIDMGRTALNVNDSMLAGTGTAKLTKHWDKDTFDSNDNAALTSH >CP031673.1|AXP53194.1|2529389_2530145_-|NADPH-dependent-oxidoreductase MSEHVYNLVKKHHSVRKFKNKPLSEDVVKKLVEAGQSASTSSFLQAYSIIGIDDEKIKENLREVSGQPYVVENGYLFVFVIDYYRHHLVDQHAETDMENAYGSTEGLLVGAIDAALVAENIAVTAEDMGYGIVFLGSLRNDVERVREILDLPDYVFPVFGMAVGEPADDENGAAKPRLPFDHVFHHNKYHADKETQYAQMADYDQTISEYYDQRTNGNRKETWSQQIEMFLGNKARLDMLEQLQKSGLIQR >CP031673.1|AXP53195.1|2530636_2531206_+|peroxiredoxin MSLINKEILPFTAQAFDPKKDQFKEVTQEDLKGSWSVVCFYPADFSFVCPTELEDLQNQYEELQKLGVNVFSVSTDTHFVHKAWHDHSDAISKITYTMIGDPSQTITRNFDVLDEATGLAQRGTFIIDPDGVVQASEINADGIGRDASTLAHKIKAAQYVRKNPGEVCPAKWEEGAKTLQPGLDLVGKI >CP031673.1|AXP53196.1|2531221_2532745_+|alkyl-hydroperoxide-reductase-subunit-F MLNADLKQQLKQLLELMEGNVEFVASLGSDDKSKELKDLLTEITDMSPRLSLSEKSLKRTPSFSVNRPGEETGVTFAGIPLGHEFNSLVLAILQVSGRAPKEKQSIIDQIKKLEGSFHFETFISLTCQKCPDVVQALNLMSVINPNITHSMIDGAVFREESENIMAVPAVFLNGEEFGNGRMTIQDILSKLGSTADASEFENKEPYDVLIVGGGPASGSAAIYTARKGLRTGIVADRIGGQVNDTAGIENFITVKETTGSEFSSNLAAHIDQYDIDAMTGIRATDIEKTDEAIKVTLENGAVLESKTVIIATGAGWRKLNIPGEEQLINKGVAFCPHCDGPLFENKDVAVIGGGNSGVEAAIDLAGIVNHVTLFEFASELKADNVLQDRLRSLSNVDIKTNAKTTEVVGEDHVTGIRYEDMNTGEEHLLNLDGIFVQIGLLPNTSWLNDAVELNERGEIVIDRNNNTNVPGIFAAGDVTDQKNKQIIISMGAGANAALNAFDYIIRN >CP031673.1|AXP53197.1|2532823_2533117_+|hypothetical-protein MINLIYTTRCAIMLKVCTSRKQINMKNDIEKEKYVNEIIMLLRTIPTSKLVQPIMQLFIDKAILNNVQNDALLIEKATHARNHLRLWSLQGHRDIPN >CP031673.1|AXP53198.1|2533189_2533816_+|NDxxF-motif-lipoprotein MKKRLLLSTFLASTLILTGCASDQSDNEDHHTSTGIHAPKSAKKLETKDIFNSDKKNSDISDAEMKQAIEKYLSVNSDILDNKYIMQHKLDKQIDSQTKVTEKQAETLSHLSNLAVKNDLHFKKFVTENNIPKEYKKPVELMMNYFKALNSTIANVDEDIEKLSYQPQNKINVVDVPTKYAGDVNKKQQDKIKDFLKSKGIKSDVIDK >CP031673.1|AXP53199.1|2534070_2534454_+|hypothetical-protein MKVRITFIILAILSTIVCLFLAAMHPTGPNTVTFEQPYLFTLNIIIMVLVALPSLVLAIYDYMSFRISSAILQFLGAISWFFLSLILSLTQFTPFTLASFITSIILFTSTIITLAIGGKSVEKNDSP >CP031673.1|AXP53200.1|2534519_2535101_-|histidine-phosphatase-family-protein MTIYLVRHGESKSNYDNKHFRSYFCGQLDVPLTDTGTKSADDLCDYFKEKQIKHVYVSDLLRTQQTFEHIFPYDIASTTTPLLRERSLGVFEGEYKDEISANPKYEKYFNDPNFKDFRHSFSQKAPEGESYEDVYQRVEHFMNHVVNEDTQKDDIVIVAHQVVIRCLMVYFNKVSRAEAVDLKVENCKPYIIE |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP031673_5 | 5.1|1810846|37|CP031673|CRT | 1810846-1810882 | 37 | CP031673.1 | 116830-116866 | 0 | 1.0 |
CP031673_5 | 5.1|1810846|37|CP031673|CRT | 1810846-1810882 | 37 | CP031673.1 | 957780-957816 | 0 | 1.0 |
CP031673_5 | 5.1|1810846|37|CP031673|CRT | 1810846-1810882 | 37 | CP031673.1 | 1514375-1514411 | 0 | 1.0 |
CP031673_5 | 5.1|1810846|37|CP031673|CRT | 1810846-1810882 | 37 | CP031673.1 | 1602632-1602668 | 0 | 1.0 |
CP031673_5 | 5.1|1810846|37|CP031673|CRT | 1810846-1810882 | 37 | CP031673.1 | 2120993-2121029 | 0 | 1.0 |
CP031673_5 | 5.1|1810846|37|CP031673|CRT | 1810846-1810882 | 37 | CP031673.1 | 2167513-2167549 | 0 | 1.0 |
CP031673_5 | 5.1|1810846|37|CP031673|CRT | 1810846-1810882 | 37 | CP031673.1 | 2168483-2168519 | 0 | 1.0 |
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agctgacagaaagtcagcttacaataatgtg CRISPR spacer agctggcggaaagtcagcttacaataatgtg Protospacer *****.*.***********************
34. spacer 4.1|959233|33|CP031673|CRISPRCasFinder matches to position: 1514313-1514345, mismatch: 2, identity: 0.939
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35. spacer 5.1|1810846|37|CP031673|CRT matches to position: 1814814-1814850, mismatch: 2, identity: 0.946
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37. spacer 5.2|1810902|37|CP031673|CRT matches to position: 2121049-2121085, mismatch: 2, identity: 0.946
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38. spacer 5.2|1810902|37|CP031673|CRT matches to position: 2803533-2803569, mismatch: 2, identity: 0.946
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40. spacer 5.3|1810958|37|CP031673|CRT matches to position: 948490-948526, mismatch: 2, identity: 0.946
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43. spacer 5.3|1810958|37|CP031673|CRT matches to position: 2803588-2803624, mismatch: 2, identity: 0.946
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50. spacer 6.1|1814878|29|CP031673|CRISPRCasFinder matches to position: 2803541-2803569, mismatch: 2, identity: 0.931
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51. spacer 6.6|1815052|37|CP031673|CRT matches to position: 824094-824130, mismatch: 2, identity: 0.946
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52. spacer 8.1|2126431|29|CP031673|CRISPRCasFinder matches to position: 386487-386515, mismatch: 2, identity: 0.931
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53. spacer 8.1|2126431|29|CP031673|CRISPRCasFinder matches to position: 948493-948521, mismatch: 2, identity: 0.931
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54. spacer 8.1|2126431|29|CP031673|CRISPRCasFinder matches to position: 1335928-1335956, mismatch: 2, identity: 0.931
tttcgaaaagaaattctacaaacaatgca CRISPR spacer tttcgaaaagaaattctacaggcaatgca Protospacer ********************..*******
55. spacer 8.1|2126431|29|CP031673|CRISPRCasFinder matches to position: 2009553-2009581, mismatch: 2, identity: 0.931
tttcgaaaagaaattctacaaacaatgca CRISPR spacer tttcgaaaagaaattctacaggcaatgca Protospacer ********************..*******
56. spacer 8.1|2126431|29|CP031673|CRISPRCasFinder matches to position: 2077897-2077925, mismatch: 2, identity: 0.931
tttcgaaaagaaattctacaaacaatgca CRISPR spacer tttcgaaaagaaattctacaggcaatgca Protospacer ********************..*******
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP031673_6 | 6.2|1814934|30|CP031673|CRISPRCasFinder | 1814934-1814963 | 30 | NZ_LR215032 | Mycoplasma gallopavonis strain NCTC10186 plasmid 2 | 268766-268795 | 6 | 0.8 |
CP031673_6 | 6.2|1814934|30|CP031673|CRISPRCasFinder | 1814934-1814963 | 30 | MN856116 | Myoviridae sp. isolate 525, complete genome | 4992-5021 | 7 | 0.767 |
CP031673_8 | 8.1|2126431|29|CP031673|CRISPRCasFinder | 2126431-2126459 | 29 | MN693281 | Marine virus AFVG_25M371, complete genome | 6448-6476 | 7 | 0.759 |
CP031673_4 | 4.1|959233|33|CP031673|CRISPRCasFinder | 959233-959265 | 33 | NC_021536 | Synechococcus phage S-IOM18 genomic sequence | 159745-159777 | 10 | 0.697 |
1. spacer 6.2|1814934|30|CP031673|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR215032 (Mycoplasma gallopavonis strain NCTC10186 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
-attgtttgttggaattggtgatcctatttc CRISPR spacer tactg-ttgttggaattggtggtccaattaa Protospacer *.** ***************.*** ***
2. spacer 6.2|1814934|30|CP031673|CRISPRCasFinder matches to MN856116 (Myoviridae sp. isolate 525, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
attgt-ttgttggaattggtgatcctatttc CRISPR spacer -tggcattgttggaattggttttcctattgt Protospacer * *. ************** ******* .
3. spacer 8.1|2126431|29|CP031673|CRISPRCasFinder matches to MN693281 (Marine virus AFVG_25M371, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
tttcgaaaagaaattctacaaacaatgca CRISPR spacer cacttagaagaaatcctacaaacaatgca Protospacer . .. *.*******.**************
4. spacer 4.1|959233|33|CP031673|CRISPRCasFinder matches to NC_021536 (Synechococcus phage S-IOM18 genomic sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
cagaagctgacgaaaagtcagcttacgataatg CRISPR spacer aggtgcttgacgaaaactcaccttacgataaaa Protospacer .* . .********* *** ********** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
827350 : 913095
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP031673|827350:913095|DBSCAN-SWA CATGCTAAAACCAATTGGAAATCGTGTGATTATTGAGAAAAAAGAACAAGAACAAACAACTAAAAGTGGTATTGTTTTAACTGATAGTGCTAAAGAAAAATCAAACGAAGGCGTTATCGTTGCAGTAGGAACTGGACGCCTATTAAATGATGGTACAAGAGTGACTCCTGAAGTGAAAGAAGGGGACCGTGTCGTGTTCCAACAATATGCTGGTACAGAAGTTAAACGAGATAATGAAACATATCTGGTATTAAATGAAGAAGATATTTTAGCAGTTATTGAATAATACAGAACTTAATTCATAAATAAATTAAATAGAACGAAAATGAAACACAACTAAACAAATGGAGGTTTATCATTTATGGTTAAACAATTGAAATTCTCTGAAGATGCACGTCAAGCAATGTTACGTGGTGTTGACCAACTTGCAAATGCAGTTAAAGTAACGATTGGTCCTAAAGGACGTAATGTTGTATTAGATAAAGAGTTTACAGCACCTTTAATTACGAATGATGGTGTGACGATTGCTAAAGAAATCGAATTAGAAGATCCATATGAAAATATGGGGGCTAAACTAGTTCAAGAAGTCGCAAATAAGACAAATGAAATTGCTGGTGACGGTACGACAACTGCAACAGTATTAGCTCAAGCAATGATTCAAGAAGGCTTGAAAAATGTTACAAGTGGTGCGAACCCAGTTGGTTTACGACAAGGTATCGACAAAGCAGTTAAAGTTGCTGTTGAAGCGTTACATGAAAATTCTCAAAAAGTTGAAAATAAAAATGAAATTGCGCAAGTAGGTGCGATTTCAGCAGCAGATGAAGAAATTGGACGTTATATTTCTGAAGCTATGGAAAAAGTAGGTAACGATGGTGTCATTACAATTGAAGAATCAAATGGACTAAACACTGAACTAGAAGTGGTTGAAGGTATGCAATTTGATCGTGGTTATCAATCACCGTATATGGTTACTGATTCAGATAAAATGGTTGCTGAATTAGAACGCCCATACATTTTAGTAACAGATAAGAAAATCTCGTCTTTCCAAGATATCTTACCTTTATTAGAACAAGTGGTTCAATCTAATCGTCCAATCTTAATTGTAGCTGATGAAGTTGAAGGCGATGCATTAACAAATATCGTGCTAAACCGTATGCGTGGCACATTTACAGCTGTTGCAGTAAAAGCACCTGGTTTTGGTGATCGTAGAAAAGCGATGCTTGAAGATTTAGCTATTTTAACTGGTGCGCAAGTGATTACTGATGATTTAGGCTTAGATTTAAAAGATGCATCAATTGATATGTTAGGTACTGCAAGTAAAGTAGAAGTAACTAAAGATAATACCACTGTTGTTGATGGTGACGGTGACGAAAACAGCATTGATGCACGTGTTAGCCAATTGAAATCTCAAATTGAAGAAACTGAATCTGACTTTGATCGTGAAAAATTACAAGAGCGCTTAGCTAAATTAGCAGGTGGTGTTGCAGTTATCAAAGTAGGTGCAGCAAGTGAAACAGAGCTTAAAGAACGTAAATTACGTATTGAAGATGCATTAAATTCTACACGTGCAGCAGTTGAAGAAGGTATTGTTGCAGGTGGTGGTACTGCATTAGTAAATGTTTACCAAAAAGTAAGTGAAATTGAAGCTGAAGGTGACATTGAAACAGGTGTAAATATTGTACTTAAAGCATTAACTGCACCAGTTCGTCAAATTGCTGAAAATGCAGGATTAGAAGGTTCTGTTATTGTAGAACGTTTGAAAAACGCAGAGCCGGGTGTTGGTTTTAACGCTGCTACAAACGAGTGGGTTAATATGTTAGAAGAAGGTATCGTTGATCCAACTAAAGTAACACGCTCAGCATTACAACATGCTGCAAGTGTTGCAGCAATGTTCTTAACGACTGAAGCGGTTGTAGCATCAATTCCAGAAAAAAATAATGACCAACCTAACATGGGTGGCATGCCAGGAATGATGTAAAATGACTGTTAAACGCCGATTTTATAGCGTTTGTAATATTGGGTGGTCATAATTTGGTCATAGAAATTTTAAAATAAATCTTTTGAGACGTTTTCCATGAGTTTACTAAACTTTTGAGAAGCGTCTTTTTTGTATGAGTTCGTAATCTTAGCGTAGATGTTCATAGTGGTATTTATATCTTTATGGCGCAAGCGTTCTTGTATTTCCTTAATATGCACACCAGCCTCTATAAGTAACGCACAATGAGTATGACGAAATGAATGAGTGCTTATTTGTTTATTAGTTATGTCAGTCTTTTTAAGTATAGCTTTTATCCATAATTGTAGTTTTTTAATTACAAGAGGGTAGCCGTTAACATCAGTAAAAACGAAATTATTATCTACATACAATTCGTTTTTACATGTGTCCTGCACGTCGGTTTTATAATTTTTAAGTAATTTAATCACATGAGGATCCACTGAAATTTTTCCGATTGAGCTTTCAGTTTTTGGTGTAAGTATTTGAAATTGCTTTTTATTGTTATTCGGATTGTAATAAGTCTTTGTAATATTGATTGTGTTATTCTCAAAGTCTATATCAGACCATTTCAATGCCAATAATTCACCTGCACGCATGCCTGTATATGCTAATGTACAAAACACCTCAAAGCTGTTTTGGGGTGAATGGTGATTTTTAGCAACCTCCAGGAATTGAAATAATTCATCTTTTTCAAGAAACTTTTTATGTATCTCAGTATCTTCTAATTCTTCCACACTAATTTTCTTTTTAGGTCGTTTAATACCCTCGCTAGGCATTATTCTTATTAATTTCATATCGTATGCGTACTTAAATATCATATTTGTAGAGGCTATAATGCTATCAACATAATTCTTGCTATACTGTGCGCTTATATCGTTTACAAAACGTTGATATTCATGTTTATTGATAGTTTGTATTGGTTTATTGTTAAAGCGTTCTATGGCGTGGTTTATGGCTTTCTCGCGTGCTCTGACACTACTTACTTTTACTTCGTTAGCATATTGTGATATCCAATCGTCAGCAACCTGTTTAAATGTAGATGTGGACGGTGCGATATAATCGCCATTTCTTAACTGACGCTCAACCATTTCAGCGTGATGTTTAGCGTCTGATTTGCGTTTAAAACCTGAGTTTGAAATATATTTATATTTGCCCGTTTCTGCGTCTTTTCCTAGTGATATACGATAGCGCCATGTATTTCCGCGTTTTTCATAACTTGCCATTTGATCACCTCGATTAATATTCTTTAAAAATATCACTAGATAAACGGCTATCAGTTTGTAAAATTTCTTTATGTAGAGTCGTACTTTTTTCGCCTTTATTTGGAAAAAGCTCTTCAATATCGTCTATATTTTTTACTATTATTTCAGAAACATACCCACTTAACTTTTGGTTAATTTTTTTAAATAACAAGTTTTTAAGGCCTGCAGATAAACTATCAACGTATTTTTTTAATCCGATATTTTCATCTTCATTTTTAATCGTGAAAATAAATCTATGTTGTGAATTAGTTATCTTTTCAGTTTCTTTATATGAGACGTCTAAGTCAAAATTTAATTTTTGCCTATTATCTAATTCGACGTCTACTAAAATTTCAAAGTCAAAATTTTCAATCGAAAAAGCGTGAGTAATGTTTGCAGTTACTTCAAATCCCTCGAAAACATCATTAATTTTATAATTCGGTTCTTCATCAAAAGTAAAGTCAAAATTGATCGGATTATGTTCAAAAAATTCTGAAGGAGATATGTGCAGATAACTACATAATTTATCTATAGCATCATATCTTATCATTTCAGAATCATTTTGTGCCATTGAAGTAAGTGAACTTCTTGCTATTTTTACATCTTTTGCAACACGAGATATTTTTAGTCCTCTTTCTGACAGTAGTTCAGACAATCTATTTCTAATCATTACAAACCTCCTAATTATGTTAATAATAGCATTTTTTTGGACGTTTATGTACAAAAAAATAAAAAATGATTGAGAAGTCAGTCGAAAAACTATTGCAAAAGAAAAACGATTATGTATAATAAAGTTATAAATTGATTGAGAAGTCAGTCAAAAACGAAGGAGGATTTTAATTATGACTATTTTAGCGAATACTAGAAAGTTTAAAGAAGCCATGTTCTTAAAAGGCTTTAATTTATCTGATTTATCACGTGAAACAGGTGTTGGAATTTCTTATTTAAGCCAAATTATTAATGGTAAAAAGATTCCAAGCCCTAAATTAGCTAAGAAAATGGCAGAAGTTTTACAAGTTGAGGTAAATGAATTATTTGAATTTGAAGTAAAGGAGGCATAAACCAATGTTCAACATTAATATTGATGAAGATGAAGCACGTGAGTTACTTGAGCAGGCTATCAATGCACGTGTGGACGAATTAGCGAAAGAGAAATATTTTATGACTTACAAAGAGTTGTCTAACTATCTGAATTTAAGTAAGCCTACTATTGAAGAATTACTTATTAATAATGGCATGAAATATTATATGGTCGGATCTACGTACAGATTCAAAAAGTCTGATGTAGATGAATTCATGGAACAGCTTACTGCTCATATGAATATCCAGAATAACGACTTTAAACAAGTCAATATCAAAAAGTTATTGGAGGCAAGGCAATGAAAATCTACTTAACTTATATCTGCTTAGTTTCATTGTTAACAATATTATTACTAGCAATATCTAACATGTATGTTGCTTTTAGCGTTTATGCTTGGCTAATAACTTTAGGATGTAATTTAACAGGAGAGATTACAACGTGCGAAAACAAGTGATTATTACAAAAACAGTAGTTGGCTGGTACAACATTAAAGATACTCAACATAATTTAATGTTAAATATACCGCCAAAAGTATTTGAACAGTACTTTCCTGATGTTAGTAAAGATGTTCAAGTTGTGTGTTTAGAAATGGATTTATCAAAAATTACAGAAATTAAAAATAAGAAAAAAGTAGGTAGTTAAGATGGAAATCAAACAAAAATATCAATTATCAAAAGTGGTT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MPNPIGNMVIKVDLDGSGFNRGVTGLNRQMKMVSRELSANLSQFSRYDNSLEKSKIKVEGLSKKQKVQAQITKELKDSYDKLSKETGENSAKTQAAAAKYNEAYAKLNQYERELNQATQELKDMQREQKALNTAMGKLGTNFNNFGPKLQEIGNSMKNVGRNMTMYVTAPVVAGFAVAAKKGIEFDDSMRKVKATSGATGEEFEALKKKAREMGATTKFSASDSAEALNYMALAGWDSKQMMEGLSGVMDLAAASGEELGAVSDIVTDGLTAFGLKAKDSGHFADVLAQTSSKANTDVRGLGEAFKYVAPVAGALGYTIEDTSIAIGLMSNAGIKGEKAGTALRTMFTNLSSPTRAMGNEMERLGISITDSNGKMIPMRKLLDQLREKFKHLSKDQQASSAATIFGKEAMSGALAIINASDEDYQKLTKSIDSSTGASKRMADTMESGLGGKLRTLRSQLEELALTIYDRIEPALKIIVSAFSKVVTWVTKLPTSIQLAVVGFGLFVAVLGPLVFMFGLFISVMGNAMTVLGPLLINVNKASGLFAFLRTKIASLVKLFPILGVSISSLTLPITLIVGALVGIGIAFYQAYKRSETFRNIVNQAISGVANAFKAAKLALQGFFDLFKGDSKGAVTLEKIFPPETVAGIQNVVNTIRTTFFKVVDAIVGFAKEIGAQLASFWKENGSEITQALQNIAGFIKATFEFIFNFIIKPIMFAIWQVMQFIWPAVKALIVSTWENIKGVIQGAINIILGIIKVFSSLFTGNWRGVWDGIVMILKGTVQLIWNLIQLWFIGKILGVVRYFGGLLKGLITIIWVAIIGVFKKSLSAIWNATKSIFGFLFNSVKSIFTNMKNWLSSTWNNIKSNTVGKAHSLFTGVRSKFTSLWNATKDIFTKLRNWMSNIWNSIKDNTVGIAGRLWDRVRNIFGSMRDGLKSIIGKIKDHIGGMVDAVKRGLNKLIEGLNWVGGKLGMDKIPKLHTGTEHTHTTTRLVKNGKIARDTFATVGDKGRGNGPNGFRNEMIEFPNGKRVLTPNTDTTAYLPKGSKVYNGAQTYSMLNGTLPRFSIGTMWKDIKSGASSAFNWTKDQIGKGTKWLGDKVGDVMDFIDNPGKLLNYVLQAFGVDFSSLTKGMGIAGDITKAAWSKIKKSAIKWLEDAFAESGDGGVLDMNKLRYLYGHTAAYTRETGRPFHEGLDFDYIYEPVPSTINGRAQVMPFHNGGYGKWVKIVKGALEVIYAHLSKYKVKTGQQVRVGQTVGISGNTGFSTGPHLHYEMRWNGRHRDPLLWLRKNNGGGKSTPGGNGAANARRAIKAAQNILGGRYKASWITNEMMRVASRESNYTANAVNNWDSNARAGIPSRGMFQMIDPSFRAYAKSGYNNPLNPTHQAISAMRYIVGKWVPRTGSWRAAFKRAGDYAYATGGKVYNGLYHLGEEGYPEWIIPTDPSRANEAHKLLALAANDIDNRSKNKRPNNLPNPSISNSDTNYIHTLENKLDAVINCLVSLVESNQVIADKDYEPVINKYVFEDEVNNSIDKRERHESTRVRFRRGGTII >CP031673|827350:913095|831965_832121_+|AXP51548.1|DBSCAN-SWA MKIYLTYICLVSLLTILLLAISNMYVAFSVYAWLITLGCNLTGEITTCENK >CP031673|827350:913095|853425_854451_-|AXP51571.1|integrase|DBSCAN-SWA MKTRCYDGKKWQYEFKHEGKRYRKKGFRTKREANSAGLDKLNELRSGFNIDNYITLAEYFENWIKTYKQPVVKENTYRHYRNALQHIQKHKIGKMELSKINRQVYQKFINDYSKEHAKETIRKTNGAIRSALDDALYDGLIFKNPAYKVNYKAGKPTKSEQEKFISVTEYEILKDHVRKKRTRSSLALFIMICTGCRVSGARNIKIEHINQVKNTIFIDERKTDTSPRYISIAKSDMKHIMDVISTFAISYDGYIFKEAGSIINLQAINNALKSACRVNNIPIITSHALRHTHCSYLLAKGVSIHYISKRLGHKNIAITTSVYSHLLEEKFNEEDKKQLKF >CP031673|827350:913095|876682_877060_+|AXP51617.1|DBSCAN-SWA MGARIESNNIEQGLKNAVLKMNLNSNVIVKAGAMSLVPLLKSNTPFANTKKHARDHIAVSNVKTDRHTSEKIVTIGYAKGVSHRIHATEFGTMYQKPQLFITKTEKQGKNKVLKTMLDTAKRLQK >CP031673|827350:913095|894118_894379_-|AXP51636.1|DBSCAN-SWA MCIVIYLIYSLIVYFICIINFFIMAAPFLMTNADYVWTPMTTVTLFILSLIIFLIFIKTKDVVHLTIFILNLLFSILYCLPILFYL |
120 | Staphylococcus_phage(90.43%) | holin,portal,coat,tail,capsid,terminase,head,protease,integrase,transposase | attL 842294:842323|attR 892393:892422 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
969239 : 1042186
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP031673|969239:1042186|DBSCAN-SWA TTTAATCAAATATGTTCATAGCTTGATGTTTTTTATCAGTATATAAATGAGAGTACGTTTGAATTGTTTCTGTAATGTTAGAGTGCCTCATTAATTCCATTAATAAATACATATCTACACCATTATTAATTAAATAGCTTGCGTACGAGTGTCTTAAATGGTGTATTTTTAGATTCGGGAATACAGATTTAAAATGATACGAATAGGTAACGTATCTAATAGGTTCTAACCCCCCGAATATAAAATAGTTTTCGTCAAAATATTTATATCTTTTAGAAGATTCATTATACATGTTTTTAAGCATCTCTCTAATTAATTTTGGTACAGGTATTATCCCTTTAGAACTTTCTTTTTTTAGATTATATTCAATTTCTCTATTACTTAAATTGATTTTCTTATTTACGTCAATTTCGCCTTTTATTTTATCGTAATCTTTCCACTGCAAAGCTAAAGCTTCGCCTATTCTAAGACCAGAATAAAATAACAGTTTAGTTAGCTGACGAGAAGTATCGTTTGTGATTTGTTCTACTTTTTCATCAAATTCTTCACGAGTGATAAATTTAGCTTGTGGTTTTGTTCTGGGAATAGGAGTTACCGATAATGTGGGGTCGTATAAGAGCTTGTAATGCTTTTTGGCGTAATTGATAACTGCTTTAAAACCTGCCCACACAGATCGTGCATAGCCAACAGAAAGACCTGCATCGTTTAACAAATAATTCCTGAAAGCAGTACATTGCGTAGTAGTGATTTTGCCAATAGGGATATTTCCGAACCTTTCTTTTATGTGAGTATTATATTCTGTAGTTCGCTTTTCTATTGAGCGTGCAGAAAGATTTTCATTTTTTAAACGATTAAAAAATATATATTCAAAGGGTTGATTGTCCGAGTATCCATATTTAACATTTTGTATAAATTCGCTTTCAGCTAGTTTGGCATCTTTCTTACGTTCAAACCCACGCTTCATTTTTCGTTTGTTATTACCGTATACATCTTTATATCTAATGGAAAAATACCATTTACCTGTATTATCATCCTTATATACTGGCATTTTGCTTTTCCCTCCTCAAAATTGGCAAAAAATAATAAGGGTAGGCGGGCTACCCGTGAAAATTGTATAAAAAAAGAGAGAGCGCAGATGCACCCTCTCATGTCGCAAATATTTCAGCGACTTGTCTAATTTGAAGCTTGCCGCAAATATTTCAGCGGCTTGTTTTGTATATATGTAATATACCATCAAAGAGAGTGTAGTTCAAGCGATTTAACTAAGAAATCTAATTTTTATACTATTTTCAATTTTATCTACTGTTTCTTTTGAATATGATATTTCTCCGGCAGGGTCATACCTATTAATTTTCGATATTCTATCCTTGCTGATTGTAGTGATATTTAAAACGTTAGCATAGGTCTTTTTATACTTGAATCGCTCATATCTTTTGCGAACCTTCGAATATTTTTTGAAGTCGTCATTCAGCGATTTGTTTTCATCAAGTAATTTTTGATCGTATGGGTTTTCTGCTTTTGACACCTTTTCAAGATTGTTCATGATTTTTTTAGCTAAATCCTTACCCGTTACGTCCATTTTTTCCAATACTAAAGGTAACAAATCTTCTTCGATATGCACATTGAATTTACTTCTGGAAGATGTAAGTGGAACTACCGTTAATATTGGATTTTTATTTGAATCGTGATTATTAAGTACCATACAAAAATGGTTTCCAGAAAACTCTCTGCCAACATTAACACCTAACTTTACATAAATTATAGTGCCTTTTTTATATCTGGTGTAACTTTTGTTTTCTTTTAACAATCTAACTTCATCCAATAAAAACTCTGAATATTCAAGACACCATGAATTCATATATTTAAATTTGTAAATCTCGCTATTTTGAATCTTTTTAAAATTATTAACTGCTGTTTCTAAAGGTGCGTTCTCTTCCATCCCTCATCCTCCTCACGCCATATAGGCGTTATTAATCAATGTGATGCAATTTAAAAACTCTCAACGGCTCAAATGTGATCGAATACTCGCCATAGTGAGTTCCAATACCATATATCTTTTTATATTGTTCTATTGCTTCTAATATGTATTCTTCGCTTAATTGTAGATACTCAGACAATTCATACAAGTTACGTACGCCATAATTATAAGCTTCTACAATTTCGCGTAATGGAACAGCTGAGATAAAGCCGTGTCGTCTTGCGTAATTTTCGAACTTGCGATTGTTGAATTTCGAGTAATCGGCTATATCACCGTATGTAAGTTTATTATGTGCTAATTCTTCAAAGAGAATCCCTGCCTTTTCTCTATCTGATAAACCACGCTTTATCAAAATTAAATCTCCTAACCATACCCCGTCTAAATTATCTGGAAGCACATCAGCCTCTCTTATTTCAATATAATCATGTTGTATTAAAGTTTCTTCATATAATCCCATCTGATACATCCTTTACTTACGTTTGCTTCTTATATAATCTGCATAATCTAAAACTCTTTGCCATTCGTCATCTGTCAATTCTCCTTCAAGATGAGCTGCACGATGTTGTACTTCATCATCGTTTTCTTCAACCCACCCCATTAAATACGCAGGATTAACATTTAATGCAGTAGCTATACTTTCTATAGTATCGTTTTTTAGATTTTTGATATTTCCGCTTTCATAACGTTGTACAGTAGCTTCAGTTTTACCAATTTTTCTTCCTAGTTCGGCCAAAGTCATACCTTGTTTTTCTCTTGATTGTTTCATTCTTTTTGAAAAGCACATCGTAATACAGCTCCTTTTACTTGATAGTTCTATTATAAGGAAAACTTTCGGCATTTGCAATATTTTTCTAAAAAAACTTTCGTAAAATGCTTGACCTCTTTTGTAACATCATGATAAGATTACTTACGTAATGCGAAAGGTGGTGAAAAGAAATGCCTATAGATACTAAACTTTTGAAATCTAAAATGGCTTTGAAAGAACATAACATCAAAACCCTTTCTGAAGAAATTGGTGTCAATAGAGATACTTTATCTAACATGATACACGGGAGAACAAAACCATCCTACCCGGTAATAAATGGTATTTATTTTGCGTTAGAATTGACACCTCAAGAAGGAAGAGATATTTTTTTTAACGAAGACTTACGCAAAAAGAAAGTTTTAACTTAAGGAGGAACAACAAATGGAACAAACAATCAAACAATTTTTAGAATTTAGAAAGCAATTCACACCCGCACAGTGGCACGAAATCAACAGAATTATTGACGGACAATTTAGTAAAAAAGCCGCCGAGCTACAACTCGACGACCAAGATGTTGAGGTTATTAAAAATATTATTACTCAACAAAAGATTATGAAGTAACAATTTGAATAAAAGTTATTCAAAAATCACGAAAGGAAGATACAAAATGATGCTGACCAACACACTACTAGCAATTCACTTTTTCATGAATTTAGCGATATTAATTATGCTCGTAAGAATCGGTAGAGATTAACTTATACTTTTTAAGTTTGTTTATTCGTTGATTAGAAACAATCTTTATAAACGCAGGTTCTAATTCGAATTTATATAAAAACTCTGATGACGAATTAGCTATCATAACTTCTGGTTTATCTAATTGTTTATCGATTGGAGCATGCAAATAACTTGGATTATATATACCGAGAGATGAATATTCATCAGATTCCAATACTACGTTAATAGGTGTTAAAACATTTTTGTTTTTATCTAAAAATATTAATTCTTCTAAAGTATGAGTTCTAGACGAGTCATTAGCGACGACAAAATTTAATTCTACAAAATTATTTTCATAGTAGAAATTAAGATCGCTAATAACAAAACTGAACTTATTTTGAGAACGAGTATAAAAAATTGAGTATGCAGATAGACCTAAAGCTAGAAAAGCTACAACGTTTGAAAACAAAGTAGATTGTATGAATTCCATAAGAATAACCACCTTAAATATTTGATAACAACATTATACATGAAAGGAGCATAAATATTATGCAAGCATTACAAACAAAATCGAACATCGGAGAAATGTTCAATATTCAAGAAAAAGAAAATGGAGAAATCGCAATCAGCGGTCGAGAACTTCATCAAGCATTAGAAGTTAAGACAGCATATAAAGATTGGTTTCCAAGAATGCTTAAATACGGATTTGAAGAAAATACAGATTACACAGCTATCGCTCAAAAAAGAGCAACAGCTCAAGGCAATATGACTCACTATATTGACCACGCACTCACACTAGACACTGCAAAAGAAATCGCAATGATTCAACGTAGTGAACCTGGCAAACGTGCAAGACAATACTTCATCCAAGTTGAAAAAGCATGGAATAGCCCAGAAATGATTATGCAACGTGCTTTAAAAATTGCTAACAACACAATCAATCAACTAGAAACAAAGATTGAACGTGATAAACCAAAAATTGTATTTGCAGATGCAGTAGCTACTACTAAGACATCAATTTTAGTTGGAGAGTTAGCAAAGATCATTAAACAAAACGGTATAAACATCGGGCAACGCAGATTGTTTGAGTGGTTACGTCAAAACGGATTCCTTATTAAACGCAAGGGTGTGGATTATAACATGCCTACACAGTATTCAATGGAACGTGAGTTATTCGAAATTAAAGAAACATCAATCACACATTCGGACGGTCACACATCAATTAGTAAGACGCCAAAAGTAACAGGCAAAGGACAACAATACTTTGTTAATAAGTTTTTAGGAGAAAAATAAAAATCTTAATAGGAGGAATTATCAATGAACACACTATACAAAACAACCCTCCTCATCACAATGGCAGTTGTGACGTGGAAGGTTGTAAAGATTGAGAAAAACACAAGATTTAAACTTAGAAATTTTGATTATCCAAAAATTAATAATGCTCAGAGCAAATCATTGTTGGATATTGCTAGTCACGATCTAAAAGATATTTAACTGTATTCAAAATTTTCATATCTTGTTGAGCTTTTAAGCTTTCGTATAAAGCTATTGAATAAATAATTT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87 | Staphylococcus_phage(79.69%) | holin,portal,tail,capsid,terminase,tRNA,head,integrase,transposase | attL 965759:965776|attR 998731:998748 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1070708 : 1136292
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP031673|1070708:1136292|DBSCAN-SWA 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>CP031673|1070708:1136292|1088029_1088749_+|AXP51842.1|protease|DBSCAN-SWA MNKNIVIKSMAALAILTSVTGINAAVVEETQQIANAEKNVTQVKDTNIFPYNGVVSFKDATGFVIGKNTIITNKHVSKDYKVGDRITAHPNGDKGNGGIYKIKSISDYPGDEDISVMNIEEQAVERGPKGFNFNENVQAFNFAKDAKVDDKIKVIGYPLPAQNSFKQFESTGTIKRIKDNILNFDAYIEPGNSGSPVLNSNNEVIGVVYGGIGKIGSEYNGAVYFTPQIKDFIQKHIEQ >CP031673|1070708:1136292|1093244_1094444_+|AXP51849.1|DBSCAN-SWA MSNTQTKNVPELRFPGFEGEWEEKKLGNLTTKIGSGKTPKGGSENYTNKGIPFLRSQNIRNGKLNLNDLVYISKDIDDEMKNSRTYYGDVLLNITGASIGRTAINSIVETHANLNQHVCIIRLKKEYYYNFFGQYLLSRKGKRKIFLAQSGGSREGLNFKEIANLKIFTPTIFEEQQKIGKFFSKLDRQIELEEQKLELLQQQKKGYMQKIFTQELRFKDENGEEYPEWENKFIKDIFIFENNRRKPITSSLREKGLYPYYGATGIIDYVKDYLFNNEERLLIGEDGAKWGQFETSSFIANGQYWVNNHAHVVKSNDHNLFFMNYYLNFKELRAFVTGNAPAKLTHANLCNINLKIPCLTEQDKVSALLKSIDNKMNNQMNRIELLKERKKGLLQKMFI >CP031673|1070708:1136292|1123057_1123693_-|AXP51877.1|protease|DBSCAN-SWA 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71 | Staphylococcus_phage(92.86%) | bacteriocin,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1139452 : 1152181
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP031673|1139452:1152181|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP031673|1139452:1152181|1145620_1152181_+|AXP51900.1|DBSCAN-SWA MNLLKKNKYSIRKYKVGIFSTLIGTVLLLSNPNGAQALTTDNNVQSDTNQATPVNSQDKDVANNRGLANSAQNTPNQSATTNQATNQALVNHNNGSIVNQATPTSVQSSTPSAQNNNHTDGNTTATETVSNANNNDVVSNNTALNVPTKTNENGSGGHLTLKEIQEDVRHSSNKPELVAIAEPASNRPKKRSRRAAPADPNATPADPAAAAVGNGGAPVAITAPYTPTTDPNANNAGQNAPNEVLSFDDNGIRPSTNRSVPTVNVVNNLPGFTLINGGKVGVFSHAMVRTSMFDSGDNKNYQAQGNVIALGRIHGTDTNDHGDFNGIEKALTVNPNSELIFEFNTMTTKNGQGATNVIIKNADTNDTIAEKTVEGGPTLRLFKVPDNVRNLKIQFVPKNDAITDARGIYQLKDGYKYYSFVDSIGLHSGSHVFVERRTMDPTATNNKEFTVTTSLKNNGNSGASLDTNDFVYQVQLPEGVEYVNNSLTKDFPSNNSGVDVNDMNVTYDAANRVITIKSTGGGTANSPARLMPDKILDLRYKLRVNNVPTPRTVTFNETLTYKTYTQDFINSAAESHTVSTNPYTIDIIMNKDALQAEVDRRIQQADYTFASLDIFNGLKRRAQTILDENRNNVPLNKRVSQAYIDSLTNQMQHTLIRSVDAENAVNKKVDQMEDLVNQNDELTDEEKQAAIQVIEEHKNEIIGNIGDQTTDDGVTRIKDQGIQTLSGDTATPVVKPNAKKAIRDKATKQREIINATPDATEDEIQDALNQLATDETDAIDNVTNATTNADVETAKNNGINTIGAVVPQVTHKKAARDAINQATATKRQQINSNREATQEEKNAALNELTQATNHALEQINQATTNANVDNAKGDGLNAINPIAPVTVVKQAARDAVSHDAQQHIAEINANPDATQEERQAAIDKVNAAVTAANTNILNANTNADVEQVKTNAIQGIQAITPATKVKTDAKNAIDKSAETQHNTIFNNNDATLEEQQAAQQLLDQAVATAKQNINAADTNQEVAQAKDQGTQNIVVIQPATQVKTDTRNVVNDKAREAITNINATTGATREEKQEAINRVNTLKNRALTDIGVTSTTAMVNSIRDDAVNQIGAVQPHVTKKQTATGVLNDLATAKKQEINQNTNATTEEKQVALNQVDQELATAINNINQADTNAEVDQAQQLGTKAINAIQPNIVKKPAALAQINQHYNAKLAEINATPDATNDEKNAAINTLNQDRQQAIESIKQANTNAEVDQAATVAENNIDAVQVDVVKKQAARDKITAEVAKRIEAVKQTPNATDEEKQAAVNQINQLKDQAINQINQNQTNDQVDTTTNQAVNAIDNVEAEVVIKPKAIADIEKAVKEKQQQIDNSLDSTDNEKEVASQALAKEKEKALAAIDQAQTNSQVNQAATNGVSAIKIIQPETKVKPAAREKINQKANELRAKINQDKEATAEERQVALDKINEFVNQAMTDITNNRTNQQVDDTTSQALDSIALVMPDHIVRAAARDAVKQQYEAKKREIEQAEHATDEEKQVALNQLANNEKRALQNIDQAIANNDVKRVETNGIATLKGVQPHIVIKPEAQQAIKASAENQVESIKDTPHATVDELDEANQLISDTLKQAQQEIENTNQDAAVTDVRNQTIKAIEQIKPKVRRKRAALDSIEENNKNQLDAIRNTLDTTQDERDVAIDTLNKIVNTIKNDIAQNKTNAEVDRTETDGNDNIKVILPKVQVKPAARQSVGVKAEAQNALIDQSDLSTEEERLAAKHLVEQALNQAIDQINHADKTAQVNQDSINAQNIISKIKPATTVKATALQQIQNIATNKINLIKANNEATDEEQNIAIAQVEKELIKAKQQIASAVTNADVAYLLHDEKNEIREIEPVINRKASAREQLTTLFNDKKQAIEANIQATVEERNSILAQLQNIYDTAIGQIDQDRSNAQVDKTASLNLQTIHDLDVHPIKKPDAEKTINDDLARVTALVQNYRKVSNRNKADALKAITALKLQMDEELKTARTNADVDAVLKRFNVALSDIEAVITEKENSLLRIDNIAQQTYAKFKAIATPEQLAKVKVLIDQYVADGNRMIDEDATLNDIKQHTQFIVDEILAIKLPAEATKVSPKEIQPAPKVCTPIKKEETHESRKVEKELPNTGSEGMDLPLKEFALITGAALLARRRTKNEKES >CP031673|1139452:1152181|1142544_1144962_+|AXP51898.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLNYNHNQIEKKWQDYWDENKTFKTNDNLGQKKFYALDMFPYPSGAGLHVGHPEGYTATDIISRYKRMQGYNVLHPMGWDAFGLPAEQYALDTGNDPREFTKKNIQTFKRQIKELGFSYDWDREVNTTDPEYYKWTQWIFIQLYNKGLAYVDEVAVNWCPALGTVLSNEEVIDGVSERGGHPVYRKPMKQWVLKITEYADQLLADLDDLDWPESLKDMQRNWIGRSEGAKVSFDVDNTEGKVEVFTTRPDTIYGASFLVLSPEHALVNSITTDEYKEKVKAYQTEASKKSDLERTDLAKDKSGVFTGAYATNPLSGEKVQIWIADYVLSTYGTGAIMAVPAHDDRDYEFAKKFDLPIIEVIEGGNVEEAAYTGEGKHINSGELDGLENEAAITKAIQLLEQKGAGEKKVNYKLRDWLFSRQRYWGEPIPVIHWEDGTMTTVPEEELPLLLPETDEIKPSGTGESPLANIDSFVNVVDEKTGMKGRRETNTMPQWAGSCWYYLRYIDPKNENMLADPEKLKHWLPVDLYIGGVEHAVLHLLYARFWHKVLYDLAIVPTKEPFQKLFNQGMILGEGNEKMSKSKGNVINPDDIVQSHGADTLRLYEMFMGPLDAAIAWSEKGLDGSRRFLDRVWRLMVNEDGTLSSKIVTTNNKSLDKVYNQTVKKVTEDFETLRFNTAISQLMVFINECYKVDEVYKPYIEGFVKMLAPIAPHIGEELWSKLGHEESITYQPWPTYDEALLVDDEVEIVVQVNGKLRAKIKIAKDTSKEEMQEIALSNDNVKASIEGKDIMKVIAVPQKLVNIVAK >CP031673|1139452:1152181|1140012_1140966_-|AXP51896.1|DBSCAN-SWA MGNHFQYAFENKRYHTWNYHLKNKFGQKIFKVALDGGFDCPNRDGTVAHGGCTFCSAAGSGDFAGNRADSIAVQFKEIKEKMHEKWHEGKYIAYFQAFTNTHAPVEVLKEKFEPVLKEPGVVGLSIGTRPDCLPDDVVEYLADLNQRTYLWVELGLQTIHQSTSDLINRAHDMKTYYDGVAKLRKHNINVCTHIINGLPGEDYDMMMATAKEVAQMDVQGIKIHLLHLLKGTPMVKQYDKGLLTFMTQEEYTNLVVDQLEVIPPEMIVHRITGDGPIDIMVGPMWSVNKWEVLNGIDAELARRNSYQGLRYKSKVKQ >CP031673|1139452:1152181|1141075_1142257_+|AXP51897.1|DBSCAN-SWA MNIPKSVWWLVIGMALNITGSSFLWPLNTIYMKQELGKSLTVAGLVLMINSFGMVIGNLLGGSLFDKLGGYKTILIGTFTCLCSTTLLNFFHGWPWYAVWLVMLGFGGGMIIPAIYAMAGAVWPNGGRQTFNAIYLAQNIGVAVGAAMGGFVAEFSFNYIFLANLIMYVVFALVAVTQFNIEINAKVKYPTHLDITGKKNKARFISLVLICAMFAICWVAYIQWESTIASFTQSINISMAQYSVLWTINGIMILVAQPLIKPILYLLKGNLKKQMFVGIIIFMLSFFVTSFAENFTIFVVGMIILTFGEMFVWPAVPTIANQLAPDGKQGQYQGFVNSAATVGKAFGPFLGGVLVDAFNMRMMFIGMMLLLVFALILLMVFKENNTQPKKIDA >CP031673|1139452:1152181|1139452_1140016_-|AXP51895.1|DBSCAN-SWA MKLERILPFSKTLIKQHITPESIVVDATCGNGNDTLFLAEQVPEGHVYGFDIQDLALENTRDKVKDFNHVSLIKDGHENIEHHINDAHKGHIDAAIFNLGYLPKGDKSIVTKPDTTIQAINSLLSLMSIEGIIVLVIYHGHSEGQIEKHALLDYLSTLDQKHAQVLQYQFLNQRNHAPFICAIEKIS >CP031673|1139452:1152181|1144983_1145295_+|AXP51899.1|DBSCAN-SWA MKSITTDELKNKLLESKPVQIVDVRTDEETAMGYIPNAKLIPMDTIPDNLNSFNKNEIYYIVCAGGVRSAKVVEYLEANGIDAVNVEGGMHAWGDEGLEIKSI |
6 | Staphylococcus_phage(100.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1277840 : 1286883
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP031673|1277840:1286883|DBSCAN-SWA CATGAATGAGCGTATGGTTGATCAATCAATGCATAGTGAAGAAACTGATTTCGAATTGTCGCTTAGACCTACGAGATTACGACAATATATTGGTCAAAATTCAATAAAAAGTAATTTAGAAGTATTTATTAAAGCGGCTAAACTTCGTCATGAACCATTAGATCATGTATTGCTTTTTGGCCCCCCTGGATTAGGTAAGACAACATTATCTAATATCATTGCCAATGAAATGGAAGTTAATATACGTACAGTATCAGGGCCTTCATTAGAAAGACCTGGTGATTTGGCTGCAATTTTATCAGGACTTCAACCTGGAGATGTTTTGTTTATTGATGAAATACACAGACTGAGTAGTGTTGTTGAAGAAGTGTTATACCCTGCAATGGAAGATTTCTTTTTAGATATTATCATTGGTAAAGGCGATGAGGCTAGAAGTATCCGTATCGACTTACCTCCATTCACTTTGGTAGGTGCAACAACGCGAGCTGGCAGCTTAACAGGTCCACTAAGGGATCGATTTGGTGTGCACTTAAGATTAGAATATTATAACGAATCAGATTTAAAAGAAATCATTATTAGAACAGCTGAGGTTTTAGGCACAGGTATTGATGAAGAAAGTGCCATTGAACTTGCTAAACGTTCTAGAGGGACTCCAAGAGTAGCAAATCGACTATTGAAGCGGGTAAGAGACTTCCAGCAAGTGAATGAAGATGAACAAATATACATTGAAACAACGAAGCACGCATTAGGTTTACTTCAAGTTGATCAACACGGACTAGATTACATTGATCATAAAATGATGAACTGTATTATTAAGCAGTATAATGGCGGACCTGTTGGTTTAGATACGATTGCCGTAACAATTGGTGAAGAACGTATTACAATCGAGGACGTTTATGAGCCATTTCTTATTCAGAAAGGCTTTTTAGAACGTACGCCACGTGGCAGAAAAGCAACACCATTAGCTTATGAACATTTTGCAAAGTCGAATGAGGAGAGAGAATAACGTGAATATTGAAGAATTTGACTATGACTTACCAGAATCATTAATTGCTCAAACGCCTTTAAAAGATCGTGATCATAGTCGTTTATTAGTCATGGATAGAGAAACTGGTGAAATGAAACATTTACATTTCAAAGATATCATTGAGTATTTTAGACCTGGTGATACATTAGTGCTTAACGATACGCGAGTAATGCCAGCTAGACTTTTTGGTTTAAAAGAAGAAACTGGTGCAAAAGTTGAAATGTTAATGTTAACTCAAATTGAAGGTAATGATTGGGAAGTCTTACTGAAACCAGCTAAGCGTATTAAAGTTGGTAATAAATTGAATTTTGGTAATGGCAAAATTATAGCTGAATGCATAAAAGAAATGGATCAAGGTGGACGCATCATGCGTTTACATTATGAAGGTATTTTACAAGAAAGATTAGATGAATTAGGGGAAATGCCACTGCCACCATACATCAAAGAACGTTTAGATGATCCAGATCGTTATCAAACAGTTTACGCTAAAGAAAGTGGTTCAGCGGCAGCACCAACAGCAGGATTACATTTTACTGATGAGTTATTAATTGAAATTAAAAATAAAGGTGTTAATATCGCATTTGTTACATTACATGTTGGGTTAGGTACGTTTAGACCGGTGAGCGTAGACGATGTGAATGACCACGAAATGCATAGTGAATATTATCAAATGACACAAGAAACAGCTGATTTATTAAATGATACTAAGTCCAAAGGACATCGCATTATATCAGTTGGTACAACTTCAACACGTACACTTGAAACAATTCGACGCGATCATGATAAATTTGTTGAAACGAGTGGCTGGACTAATATATTTATTTATCCAGGATTTGATTTTAAAGCAATTGATGGCCAGATTACTAATTTTCATTTACCAAAATCAACATTAGTTATGCTAGTATCAGCGTTTAGTAGTCGTGAAAATGTTCTGAATGCTTATAAAACGGCAGTAAATTTAGAATATAGATTCTTTAGTTTTGGCGATGCAATGTTAATTATATAAAAAGAATGTGAGGATTTTGAATATGCCTGCAGTAACATACGAACACATTAAAACTTGTAAACAATCAGGTGCGCGTTTAGGTATCGTGCACACACCACACGGTTCATTTGAAACACCTATGTTTATGCCAGTTGGTACTAAAGCAACCGTTAAAACAATGAGTCCAGAAGAGTTAAGACAAATTGAAGCAAAAATCATTTTGGGCAACACATATCATTTGTGGTTACAACCCGGAAATGATATTATCAAACACGCTGGGGGATTACATAAATTCATGAATTGGGATGGTCCGATTCTTACAGATTCAGGCGGTTTCCAAGTGTTTAGTTTAAGTAATTTACGTAAAATTACAGAAGAAGGCGTGGAATTTAGACATCATACTAATGGGTCTAAATTATTTTTGAGTCCTGAGAAATCAATGCAAATTCAAAATGATTTAGGATCTGATATTATGATGGCATTTGATGAATGTCCACCGATGCCTGCTGAATATGATTATGTAAAAAAATCTATTGAACGTACAACACGTTGGGCGAAAAGATGTCTAGATGCACACCAAAGACCTGAAGATCAAGCATTGTTCGGCATTATACAAGGTGGCGAATATGAAGATTTAAGAGAACAAAGTGCAAAGGATTTAGTAGAATTAGATTTTCCTGGTTATGCAATCGGCGGTTTGTCAGTTGGTGAACTTAAACCGGTTATGTATAAAATGGTTGAACATACAGAGCAGTTTATGCCTAAAGATAAACCAAGATATTTAATGGGTGTAGGATCTCCAGATGCGTTAATCGAATGTAGTATTCGCGGCATGGATATGTTTGATTGTGTCTTACCGACACGTATTGCCAGAAATGGTACTTGTATGACATCGCAAGGTCGTTTAGTTATTAAAAATGCAAAATTTGCAGATGATTTAAGACCGTTAGATGAGAATTGTGACTGTTATACATGTCAAAACTATTCAAGAGCGTATATACGTCATTTAATCAAGGCAGAGGAAACTTTTGGTATTCGTCTTACTACTATTCATAATTTACATTTTCTGCTAAAATTAATGGAAGATATAAGACAAGCCATTCGAGAAGATCGTCTTTTAGATTTCAAAGAAGAATTCTTCGAGCAATATGGATTAAATGTTGAGAACCCAAAAAACTTTTAAGCAAGAGGAGCGTATAAAATGCAATTTTCATTACTAATATATATAGTCGTAATTTTTGCGGTTATGTATTTCTTGATGATCAGACCACAACAAAAACGTGCGAAACAGCATCGTGAGTTGATTAATAACATTCAATCTGGTCAAAGAATTACAACTATTGGTGGTATTAAAGGTACTGTTAAAGCAGTAGATGAAACAACTGTTGTTATTACAGTTAATGGTCATGGTACTGAATTAACTTTCGAAAAACCTGCTATTAAACAAGTTGACCCTTCATAATGAGAAGTGGTATTAAAAAGGATGAAACGAATAGCGTTTCATCCTTTTTAAGTTATAAGTAGTATGTAGAATAGCTTATTTTTATTCCAAAAAAAGAAATTGTGATACATAATAATTGTTAAATTTAAATTAAATATATCTATGACTATTTTTACTCCCTGCTCTAGTATGTTAATATGTATAAGGCTAATAAATTTTGTAAGAAAGATTTAACTTGCGTTATAAAATAGTATTCAAGTATTCTAAATACATACGTAAATAATGAGGTGTTCATGTGAAGAAAAGTAGTAGAATAATTGCGTTCTTGCTTTTAGTCGTATTGTTGTTTGCCGGAATGGCTGCAACTTATAAAAGTGTTATAAAGAATGTCAATTTAGGACTTGATTTGCAAGGTGGATTTGAGGTGCTTTATCAAGTCGATCCTTTAAATAAAGGCGACAAAATAGATAAAAAAGCTTTACAATCAACAGCGCAAACATTAGAAAATCGTGTTAACGTTTTAGGTGTTTCGGAACCTAAAATTCAAGTTGAAGAACCTAATAGAATTAGAGTACAACTTGCTGGTGTAACAGACCAGAATGAAGCACGTAAAATTTTATCTTCTCAAGCTAATTTAACAATTCGCGATGCAGAAGATAAAGTAAAATTAAGCGGTTCTGATATTAAACAGGGATCTGCCAAACAAGAATTTAAACAGGAAACAAACCAGCCTACAGTTACTTTTAAAGTAAAAGACAAAAACAAATTTAAAAAAGTAACGGAAGAAATCTCTAAGAAACGTGATAATGTCATGGTTGTTTGGTTAGATTTCAAAAAAGGTGACAGCTATAAAAAAGAAGCACAAAAGAAAAACCCTAAATTTATTTCTGCAGCAAGTGTTGATCAACCAATCAATTCTGATAGCGTAGAAATCTCGGGTGGATTTAAAGGACAAGAAGGCGTTAAAAAAGCAAAACAAATCGCCGAATTGTTAAATGCAGGTTCTTTACCAGTTGACTTGAAAGAAATTTATTCAAACTCAGTAGGTGCCCAATTTGGTCAAGATGCATTAGATAAAACTGTGTTTGCATCGTTTATTGGTGTAGCATTAATTTATTTATTCATGCTTGGATTCTACCGATTACCTGGTTTAGTAGCGATTATTGCATTGACAACTTATATCTATCTAACGTTAGTAGCATTTAATTTCATTTCCGGGGTTCTAACTTTACCAGGATTAGCGGCGTTGGTATTAGGTGTAGGTATGGCTGTAGATGCCAATATTATCATGTATGAGCGTATTAAGGATGAACTTCGAATAGGTAGAACGATAAAGCAAGCCTTTTCTAAAGCAAACAAAAGTTCATTCCTAACAATTTTTGATTCTAACTTAACAACAGTTATCGCCGCAGCAGTATTATTCTTCTTCGGTGAAAGTTCAGTTAAAGGTTTCGCGACAATGTTATTATTAGGTATTCTAATGATCTTTGTTACAGCCGTGTTCTTATCAAGATTCTTATTATCATTACTTGTTTCATCAAATATAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP031673|1277840:1286883|1281052_1281313_+|AXP52017.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >CP031673|1277840:1286883|1281587_1283867_+|AXP52018.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >CP031673|1277840:1286883|1279894_1281034_+|AXP52016.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGELKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >CP031673|1277840:1286883|1286364_1286883_+|AXP52020.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >CP031673|1277840:1286883|1284069_1286343_+|AXP52019.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDALQLSDMTKTIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTATTILVITLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDVEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKKGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKQVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQIIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >CP031673|1277840:1286883|1278846_1279872_+|AXP52015.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLIEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSSRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >CP031673|1277840:1286883|1277840_1278845_+|AXP52014.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1356020 : 1364332
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP031673|1356020:1364332|DBSCAN-SWA TTTGCGAATAGATCAATCGATCATTAATGAAATAAAAGATAAAACCGACATTTTAGACTTGGTAAGTGAATATGTAAAATTAGAAAAGAGAGGACGCAATTATATAGGTTTGTGTCCTTTTCATGATGAAAAGACACCTTCATTTACAGTTTCTGAAGATAAACAAATTTGTCATTGTTTTGGTTGTAAAAAAGGTGGCAATGTTTTTCAATTTACTCAAGAAATTAAAGACATATCATTTGTTGAAGCGGTTAAAGAATTAGGTGATAGAGTTAATGTTGCTGTAGATATTGAGGCAACACAATCTAACTCAAATGTTCAAATTGCTTCTGATGATTTACAAATGATTGAAATGCATGAGTTAATACAAGAATTTTATTATTACGCTTTAACAAAGACAGTCGAAGGCGAACAAGCATTAACGTACTTACAAGAACGTGGTTTTACAGATGCGCTTATTAAAGAGCGAGGCATTGGCTTTGCACCCGATAGCTCACATTTTTGTCATGATTTTCTTCAAAAAAAGGGTTACGATATTGAATTAGCATATGAAGCCGGATTATTATCACGTAACGAAGAAAATTTCAGTTATTACGATAGATTTCGAAATCGTATTATGTTTCCTTTGAAAAATGCGCAAGGAAGAATTGTTGGATATTCAGGTCGAACATATACCGGTCAAGAACCAAAATACTTAAATAGTCCTGAAACACCTATCTTTCAAAAAAGAAAGTTGTTATACAACTTAGATAAAGCGCGTAAATCAATTAGAAAATTAGATGAAATCGTATTACTAGAAGGTTTTATGGATGTTATAAAATCTGATACTGCTGGCTTGAAAAACGTTGTTGCAACAATGGGTACACAGTTGTCAGATGAACATATTACTTTTATACGAAAGTTAACATCAAATATAACATTAATGTTTGATGGGGATTTTGCGGGTAGTGAAGCAACACTTAAAACAGGTCAAAATTTGTTACAGCAAGGGCTAAATGTATTTGTTATACAATTGCCATCAGGCATGGATCCGGATGAATACATTGGTAAGTATGGCAACGATGCATTTACTGCTTTTGTAAAAAATGACAAAAAGTCATTTGCACATTATAAAGTGAGTATATTAAAAGATGAAATTGCACATAATGACCTTTCATATGAACGTTATTTGAAAGAACTAAGTCATGATATTTCGCTTATGAAATCATCGATTTTGCAACAAAAGGCTTTAAATGATGTTGCACCATTTTTCAATGTTAGTCCTGAGCAATTAGCTAACGAAATACAATTCAATCAAGCACCAGCCAATTATTATCCAGAAGATGAGTATGGCGGTTACATTGAACCTGAGCCAATTGGTATGGCACAATTTGACAATTTGAGCCGTCAAGAAAAAGCGGAGCGAGCATTTTTAAAACATTTAATGAGAGATAAAGATACATTTTTAAATTATTATGAAAGTGTTGATAAGGATAACTTCACAAATCAGCATTTTAAATATGTATTCGAAGTCTTACATGATTTTTATGCGGAAAATGATCAATATAATATCAGTGATGCTGTGCAGTATGTTAATTCAAATGAGTTGAGAGAAACACTAATTAGCTTAGAACAATATAATTTGAATGACGAACCATATGAAAATGAAATTGATGATTATGTCAATGTTATTAATGAAAAAGGACAAGAAACAATTGAGTCATTGAATCATAAATTAAGGGAAGCTACAAGGATTGGCGATGTAGAATTACAAAAATACTATTTACAGCAAATTGTTGCTAAGAATAAAGAACGCATGTAGCATGTGATTTTAAAGAATAATACGAATAATGATTATGTCAAAATGTATAAGGGTAAATGATAGTTACCGCATTTAAACAACACTATTGAAAAATAAATATTGGGATTAGTTCCAATTTGTAAAATAAAATTAAAAATATGGATGAATTAATTAAGAATTTAGTTTAAAATAGCAATATTGAATAAATTTCGAATGTTCATATTTAAAATCGGGAGGCCGTTTCATGTCTGATAACACAGTTAAAATTAAAAAACAAACAATTGATCCGACATTAACATTAGAAGATGTTAAGAAGCAATTAATTGAAAAAGGTAAAAAAGAGGGTCATTTAAGTCATGAAGAAATTGCTGAAAAACTTCAGAATTTTGATATCGACTCTGATCAAATGGATGATTTCTTTGATCAATTAAATGATAATGATATTTCACTAGTTAATGAAAAAGATAGTTCAGATACTGACGAGAAACTGAATCCAAGTGATCTTAGTGCCCCTCCAGGTGTTAAAATAAATGACCCAGTTCGTATGTACCTTAAAGAAATTGGGCGTGTTAACTTATTAAGTGCACAAGAAGAAATCGAATTAGCCAAACGTATTGAACAAGGTGATGAAGTAGCAAAATCAAGACTTGCAGAAGCGAACTTACGTTTAGTTGTAAGTATTGCTAAAAGATACGTAGGTCGTGGTATGTTATTCCTTGATTTAATCCAAGAAGGTAATATGGGTCTTATTAAAGCTGTTGAAAAATTTGACTTTAGCAAAGGATTTAAGTTTTCAACATATGCAACATGGTGGATTAGACAAGCAATCACTCGTGCAATTGCTGACCAAGCACGTACGATTCGTATCCCTGTGCATATGGTAGAAACAATTAATAAATTAATTCGTGTTCAACGTCAATTATTACAGGACTTAGGTCGAGATCCAGCACCAGAAGAAATTGGTGAAGAAATGGATTTACCAGCAGAAAAAGTTCGTGAAATTTTAAAAATTGCGCAAGAACCTGTTTCATTAGAAACACCAATTGGTGAAGAAGATGATAGTCATTTAGGAGACTTTATTGAGGATCAGGAAGCACAAAGTCCTTCAGATCATGCTGCTTATGAATTATTAAAAGAGCAATTAGAAGATGTGCTTGATACATTAACTGATAGAGAAGAAAATGTATTACGATTAAGATTTGGTCTTGATGACGGCAGAACAAGAACACTTGAAGAAGTTGGTAAAGTTTTCGGTGTTACACGTGAACGTATTCGACAAATTGAAGCAAAAGCACTTAGAAAATTAAGACATCCAAGTCGTAGTAAACGTTTGAAAGACTTTATGGATTAATTTATATCAATTTTAATGATTGATACCAAGACATGAATAAGCGCTTATTTATTTTTAGATTAAGATTTAACTTGAGTGAGGTTGGTACATTGAATAATGTTCAACCTCTTTTTTCATAAAGGAGAATAAAATGATTTCGTTAAATAACCGATTAACGACGGTAAGTCGATTTTTAAAACAAGGTACAATCGCGGATATTGGCTCAGATCATGCTTATTTGCCAATCTATGCAATTCAAAACCATTTATGCGAATGCGGTATTGCTGGAGAAGTTATTCAAGGCCCTTTTCAAGCTGCTGTGAAAAATGTAGCTGCAAACCAATTAGTAGATAGAATTGATGTACGTTTAGGGGATGGCTTAAGTGTTATTCAACCTGAGGACGTAATCGATAATATCACAATTTGTGGTATGGGCGGACCACTTATTGCTAAAATTTTAAAAGATGGGCAAGATAAGTTAAGTCAACATCCAAGGTTGATTTTACAAAGTAATATCCAAACTGAAAATTTAAGACAAACATTACAACAATTGAATTATGAAATAATTGATGAAATAATAATGGAAGAAAAAGGCCATATTTATGAAATTGTTGTAGCAGAATATTCTACAGAATTAATAGAGCTATCATCTGATGAATTGAAATTCGGACCAAAATTGCTGAACAACAAAAATGAATATTTTATAAAAAAATGGCAAAGAGAGTTAGAAGCACTTTATCATATTAAATCGAAACTCAATACTGAACAACATCATCAACGTTTAGCTCAAATTAATGACGAAATTGCTGTAATTGAAAGGGTGTTATAGTAATGAAAATAGCTGATTTAATGACATTGTTAGATCATCATGTGCCATTTAGTACTGCTGAATCTTGGGATAATGTAGGATTGTTAATAGGTGATGAAGATGTTGAAGTTACTGGTGTTTTAACAGCATTAGACTGTACGTTGGAAGTAGTAAATGAAGCAATCGAAAAAGGTTATAATACTATTATTAGTCATCATCCTCTAATCTTTAAAGGCGTAACATCATTAAAAGCTAATGGTTATGGTTTGATCATTAGAAAACTAATTCAACATGACATTAATTTAATAGCGATGCATACAAATTTAGATGTAAATCCGTATGGTGTCAATATGATGTTGGCGAAGACGATGGGTTTGAAGAACATTTCAATAATAAATAATCAACAAGATGTATACTATAAAGTTCAAACATATATACCTAAGGATAATGTTGGACCATTTAAAGATAAGCTTAGTGAAAATGGATTAGCGCAAGAAGGTAATTATGAATATTGTTTCTTTGAAAGTGAAGGAAGAGGGCAATTCAAACCAGTTGGTGAAGCTAATCCAACAATAGGACAAATTGATAAAATTGAATATGTAGATGAAGTTAAAATTGAATTTATGATAGATGCATATCAAAAGTCAAGGGCTGAGCAATTAATTAAACAATACCATCCATATGAAACACCGGTATTTGATTTTATTGAGATAAAACAAACATCCCTTTATGGACTTGGCGTTATGGCAGAAGTGGATAATCAAATGACATTGGAAGATTTCGCAGCTGATATTAAATCTAAATTAAATATCCCAAGTGTCCGTTTTGTTGGTGAGTCTAATCAGAAAATTAAACGTATTGCAATTATTGGTGGTTCAGGTATTGGATATGAATATCAAGCTGTCCAACAAGGCGCAGATGTCTTTGTTACAGGTGATATTAAACATCATGATGCCTTAGATGCTAAAATTCATGGTGTGAATTTAATTGATATTAATCATTACAGCGAATATGTGATGAAAGAAGGTTTAAAAGCGTTACTAATGAATTGGTTCAATACAGAAAAAATAAATTTAGATGTTGAAGCATCTACAATTAATACAGATCCATTTCAATATATTTAAACTAAAATCTCGGGATTTCTAAATTTTGAAATTTCGAGGTTTTAATATTTTTATTTAAAATAGCACATTTATACTTTATAATAGTAAAGATGAACATATAAGGAGGCCAAATCATGGCAAAACATCCATTCGAACAATTTAATCTAGAATCTAGTTTAATTGACGCTGTGAAAGACCTTAATTTTGAAAAACCAACTGAAATTCAGAATCGAATTATTCCAAGAATACTAAAGAGAACAAATTTAATTGGTCAATCTCAAACGGGTACAGGGAAATCTCATGCATTTTTATTACCATTAATGCAGTTAATTGATAGTGAAATAAAAGAACCACAAGCAATCGTAGTTGCACCAACAAGAGAACTTGCACAACAACTATACGATGCAGCGAACCATTTAAGCCAATTTAAAGCTGGTGTTTCAGTTAAAGTTTTTATTGGTGGTACAGATATAGAGAAAGATAGACAACGTTGTAATGCACAACCACAATTGATTATAGGCACCCCTACTAGAATTAATGACTTAGCTAAAACGGGACATTTACATGTGCACTTAGCATCATATTTAGTTATTGATGAAGCGGATCTTATGATTGACTTAGGATTAATTGAAGATGTAGATTACATTGCTGCAAGATTGGAAGATAATGCAAATATTGCGGTGTTTAGTGCTACAATCCCACAACAGTTACAACCATTTTTAAATAAATATTTAAGTCATCCAGAATATGTAGCTGTCGACAGTAAAAAACAAAATAAAAAGAACATCGAATTCTATTTAATACCTACTAAAGGTGCAGCTAAAGTTGAAAAGACTTTAAATTTAATTGATATACTAAATCCATACTTATGTATTATTTTCTGTAATAGTAGAGATAATGCAAATGATTTAGCACGTTCACTAAATGAAGCTGGTATTAAAGTTGGTATGATTCATGGTGGCTTAACGCCACGTGAACGTAAACAACAAATGAAACGTATACGTAATTTAGAATTCCAATACGTTATTGCCAGCGATTTAGCATCTCGTGGTATTGATATTGAAGGTGTTAGTCATGTCATCAATTTTGATGTGCCAAATGATATTGACTTCTTTACGCATAGAGTCGGACGAACTGGTCGTGGGAATTATAAAGGTGTAGCAATTACGCTTTATAGTCCTGATGAAGAACACAATATTTCATTAATAGAAGATCGCGGTTTTGTATTCAATACTGTTGATATTAAAGATGGTGAGTTAAAAGAAGTTAAAGCGCACAATCAGCGTCAAGCAAGAATGCGCAAAGATGACCATTTAACTAATCAAGTGAAGAACAAAGTTCGAAGTAAAATTAAAAACAAAGTTAAACCAGGTTATAAGAAGAAATTTAAACAAGAAGTTGAAAAAATGAAACGTCAAGAGCGTAAGCAATTTAGTAAGCAGCAAAATAGACAAAAACGTAAGCAAAACAAAAAAGGTTAGGTGTGTTTTATGTTATTAGGATCACATGTTTCAATGAGTGGTAAAAAGATGTTAGAAGGTTCTGCTATAGAAGCGCATGAATATGGTGAAACAACATTTATGATTTATACTGGTGCACCTCAAAACACGCGCCGTAAAAGTATTGAAGATTTAAATATAACTAAAGGTCATGAAGTGATGGAAAAATATGGTTTATCTAATATTGTTGTTCATGCACCATACATCATTAATATTGCAAATACAACCAAACCAGAAACGTTTAATCTTGGTGTAGATTTCTTGCAACAAGAAATTGAAAGAACGCAAGCTATAGGGGCTAAAGATATTGTATTACATCCAGGTGCGCATGTTGGAGCTGGTGTTGATGCCGGAATTAATAAGATTATTGAAGGATTAAATGAAGTTTTAACGAATGACAATAATGTACGTATTGCGCTTGAAACGATGGCAGGTAAAGGTACAGAGATTGGTCGCTCATTTGAAGAGTTAGCACGTATTATTGATGGAGTTCATAATAACGAACGTTTATCAGTATGTTTTGATACATGTCATACGCATGATGCTGGATATAATGTTAAAGAGGACTTTGATGGCGTATTAAATGAATTTGATAAAATCATTGGAGTCGACAGAATCAAAGTTGTTCATGTCAATGATTCTAAAAATGACCGTGGCGCTCAAAAAGACCGACATGAAAATATTGGCTTCGGTTACATTGGTTTTGATGCATTAAATTACATTGTGCATCATGATAGTTTTAAAGATATTCCGAAAATCTTAGAAACACCTTATGTTGGTGAAGATAAGAAAAATAAAAAACCGCCATATAAACTTGAAATTGAAATGTTAAAACAACAGCAATTTGACCCAGAATTAAAAAATAAGGTTATGCAACAATAAAATGATAATGCTCTCTTCAAGAAATGCGATAAATAAAACTTGAAGGGGGCATATCTCTTTATTTTGTCTAATTTTGAGTCGTAAACATTACTGTTTACATATGTTACTAGGAGTTGTATAGTTGAATGCGAGGTGAGAATACGATGACACCAGTCTTTGAATTGAAAAATGTCAATTACTACTATGATCATAAAAAAGTGTTAGAAAATATAAACATTAAAATAAATAAAGGTGAATTTTTAGCAATTGTTGGACCAAATGGTGCTGGTAAATCAACATTATTGAAGTTGATTCTAGGGTTATTACCTTTACAAAGTGGTGAGATTTTTGTTGAAGGTATTGATTTTAAAAATAAGAAAACATCAATTAAATTAAGCTATGTATCACAAAAAGCAAATGCCTTTAATTCAGGTTTCCCAGCAAGTGTTAAAGAAGTTGTTTTAAGCGGATTAACAAAGACAAAACGTCTTTTCCAAACATTTAATAGCAAAGATAATGAAAAAGTGATTAAAGTACTAGAAAGACTGAATATAAGTGATTTAATTCATAAAAATATAGCAGAATTATCAGGTGGTCAACAACAACGTGTAATGATTGCTCGAGCATTGATTTCAGAACCTGCAGTATTAGTACTTGATGAACCAACGAATGGTATTGATGCAAAACATGTAAGTGAATTTTATAATACTTTAGATCAATTAAAACAAGAAGGTATCACCATTATCTTAGTTACTCATGATATCGGTGTTGTAGCAGATACTGCTACTGAAGTAGCATGTTTAAATAAGCATTTGCATTTCCATGGTACAACTGATGAGTTTAAATCACTTGATGAAGTTGAAATTTCAAAAATTTATGGACATCCTGTACGTTTTGTCGATCATCAGCATAATCGAGAATGTTGTAATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP031673|1356020:1364332|1359280_1359958_+|AXP52090.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCECGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIQPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTELIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL >CP031673|1356020:1364332|1358043_1359150_+|AXP52089.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFSKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD >CP031673|1356020:1364332|1361174_1362521_+|AXP52092.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFYLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >CP031673|1356020:1364332|1363546_1364332_+|AXP52094.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >CP031673|1356020:1364332|1356020_1357820_+|AXP52088.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQNLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKALNDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYNLNDEPYENEIDDYVNVINEKGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >CP031673|1356020:1364332|1362530_1363421_+|AXP52093.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >CP031673|1356020:1364332|1359960_1361061_+|AXP52091.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFSTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPYGVNMMLAKTMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDAYQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKALLMNWFNTEKINLDVEASTINTDPFQYI |
7 | Caulobacter_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1901869 : 1910342
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP031673|1901869:1910342|DBSCAN-SWA CTTATTTTACAATTTTAGCAATAACACTTGGATATAACTCATATTCCAATTTTTTTACTTTCTCTTCTAATTGTTCTTTTGAATCGTCCGGTCTAATATCACATTTTCTCTGTTCAATAATTTCTCCCGTATCCATACCACTATCAACATAATGTACTGTCGAACCAGTAATAGTATCGCCACTATGATATGCTTGGCCTATTGCGTCAATCCCCTTATATTTCGGCAATAGAGATGGATGTATATTCAATATTTTACCTTCAAATGAAGCTAATAAGTCTGGACCAATTAGACGCATGTAGCCAGCTAGAATAATCCACTCTACCTTATCTTCATTTAATAATGTTACTAAATGTTGTTCATACGCTGCTTTTGAATCAAATTGTTTTGGTTCATTAATATAAACAGGAATATCGTGCTTTTTTGCTCTATCTATACAAAACGCATTTTGATGATCCGTATATAGCGCCGTAACTTCAATATTTTCAAGTTTTCCTGATTCAACATGCTCAACTATATTTTCAAAGTTACTTCCTGAACCTGATGCAAAAATCGCAATTTTAACCATTGTTATACCCCCAACAATTCAATTGCAGTTGACTCATTTTTCACAATATGACCAATTTGATAGGCTTCCACATTTTGTTCTGCTAAAATCTTCAAAGCGCGTGATACATCTTTTTCATCAACGATAACCGTATAGCCAATACCCATATTAAAAATGTTATACATTTCATTTGTGTCTATATTGCCTTGTTGTTGTAACCAATCAAATATTTTTGGTGTTGGAAATGATGTAGTATCAATTCTAGCAGCATATCCGGCTGGCAATGCACGTGGAATATTTTCATAAAAACCTCCACCAGTAATATGATTCATTGCCTTAATAGAAACTTCTTTTTTCAAAGCAAGTACAGGTTTGACATATAATTTAGTTGGTTCTAAAAAGACATCGATAAATGGACGATTATCGAAGTTTGATGCCAAATCAATGCCTGATTCATTAATTAATTTGCGCACTAAACTGTATCCATTTGAATGAATGCCACTTGACGCAAGCCCTATAACAACTTGTCCCTCTTTCACTTCTGAACCATCTACATAGTCATCCTTTTCAACTGCTCCAACAGCAAATCCAGCTACATCATATTCGCCTTCGTGATACATTTCACCCATTTCAGCAGTCTCTCCACCGATAAGTGCAGTATTCGTTTCAACACATGCATCACTAATACCTTTAACAATTTGTTCAATAACTTCAGGAACAACTTTGTTTGTAGCAATGTAATCTAAAAAATATAATGGTTCTGCACCTGTCGTTAAAATATCATTAACACACATTGCGACTGCATCGATACCTATCGAATCATGTTTACCATAGTCGATAGCTAGTTTTAATTTCGTACCTACTCCGTCTGTTCCAGAAACTAAAACTGGCGCTGTCATATTTAATTGTGATAAATCAAATGTAGCACCGAATCCACCTAAACCACCGATAACTTCTTTACGCATCGTACGTTTAACATGACTAGACATTCTTTCTACAGCTTCATAACCAGCATGAATATTTACACCAGATTGTTCATATGCTTTAGACATTTAAATTTCCCTCGCTATCAAAAAAGTGTTTGTTTTTAGAAATATATTGCTTTTGTCGATGACTTAAATGCGCTTTATAATTTGCTTCATAATCATATAACCCTGCAGGATAATCTCCAGTGAAACTTTCTACACATAAGCCACTATATGGCGCGTCATAATCTAAACCAATTGATTCAATTAACCCATCTACAGATAGATATGCTAATGAATCAGCGCCAATATAATCTTTAATTTCTTCAGGTGATTTGCTTGCAGAAATTAATTCTGCCGTAGTTGAAACATCGATTCCGTAAAAACTTGGAAACATAAATTCCGGTGATGCTATACGCACATGCACTTTATTTGCACCAGAATCTTTTAACATTTTCACAATGCGTCGAATTGTCGTACCGCGAACAATGGAATCATCAACAAGAATGATATTTTTCCCATCTACTATATCTTTTACCGCAGATAACTTCACTCTCACACCTTGCTCACGTAATTCTTGAGTTGGTTGAATAAATGTTCTTGCAACATATTGATTTTTAACTAGTCCCATTTCATATGGCAAACCTATTTCTTCAGCATAACCACTCGCAGCTGATAGCGATGAATTGGGTACACCGATGACCATATCAGCATTTACAGGGCTTTCTTGGGCTAATTTTTTACCAGAAGCTTTACGTACTGCATGGACATTTTTACCAGCTATTGTTGAGTCTGGTCTAGCAAAATAAATATATTCCATCGCAGAAATTGCAGTTGTCGTATGATGTGTATAAGATTTAACTGTAATACCTTTATCGTTAATCACGACATATTCACCTGCATGAATATCTTGAACAAATTCTGCACCTAACACATCTATTGCACATGTTTCACTTGCAAGGATGTATGTCCCATCTTTCATTTTACCTACAACAAGTGGTCTGATAGCATTTGGATCTACTGCGCCATATAACGCATCTTTAGTTAAAATCGCAAATGTAAAACCGCCTTTAACTTTTCGCAAACTTTCTTTCAACGCTTCCTCAAAAGTAGGAGCTTTACTTCGACGTATCAAATGCATAATGACTTCAGTATCAGAAGACGAATGGAAGATAGCACCTTGTTTTTCTAAATTCTGACGCAATGATTTAGCATTAATGAGGTTACCATTATGACAAATACCTACACTCATATCATAAAAGTGATACAGAAACGGTTGAATATTTTCAATACCTTTATTACCTGAAGTAGCATAACGGACGTGACCAATTGCATGTTGATATCCTTTTAATCGTTCCATTTGATCATCTTTAATCGCTTCAGTTAGTAAGCCTAATCCTCGCTCGCCTTTTAATTCATTTTGATCAGAAACAACTATACCTGCACCTTCTTGACCACGATGTTGCAAACTATGAAGTCCCATATATGTTAGTTGCGCTGCTTCAGGATGATTCCAAATACCAAACACGCCACATTCTTCGTTTAATCCTGAGTAGTTAAACATTGAGCAATTGCCCCTTCCCATATTTGTTTAATATCTGAAACATTTTCACTAATCTCTGTATATGGTGTTGTTACCTTGAAATTATCACTATCTGTTAAAAGTCCAATTTCTATTGCATTATCAATATTTAAAGTTTTACCTGATTTAACAGAAACAACATATCGGCCTTGCGTCTCACTAAACAATTGTGCATTTGTTATATCTATTGAAGATTTTAATCCTAAACCGTAATGCGCACTTAGTTTAGCTAAGGTAATCAGTAAGCCACCTTTACCAACTGTTTGAACATGTGATAATAGTCCTTCACGAATAGCGGTCTTGATTGATTCACCTTTTTCAACTTCTGAACTCAAATCTAATGACTCAAATTCATGATTAACTTTGCCATAAATTAACTTTTCAAGTTGACTACCACCAAAGTCGTCCTTAGTATCACCGATTAAATATAATTTATCTCCAACTTGAGGTTCAAAATCATTTAAATAATTTACATTTTCAATCAAACCTACCATTCCAACAACTGGTGTTGGGAAAATAGAAGTACCTTTCGTTTCGTTATATAAAGATACATTACCAGAAACTACTGGTGTCTTAAGAATGTCGCATGCTTCTGCCATACCTTTCGTTGAATCTATCAACTGTTGATAGATTTCTTTCTTTTCAGGAGAACCATAATTTAAACAATCTGTCATTGCTAATGGTGTTGCACCCACGGCAATTAAATTTCGATAAGCTTCAGCTACTACCATCTTTCCACCTTCATATGGATTGTTATATACATAACGCGCTTCACCATCAATTGTTGAAGCAATTGCCTTATTTGTGCCTTCCACACGTACTACCGATGCTTGAAGTCCTGGCTTAATTATCGTATTGGCACCAACTTGTTGGTCGTATTGATCATATAAATAGTGTTTAGATGCTATAGTCGGATGCTTAAGTAATTTAAAGAAAGTATCTTTAACATCGATGTGTGTATAATCATTTTTAGAAGTATTATAATCTTTTTCTTCTCCTTCTAAAATATATACAGGTGCTTCATCAGCTAGTGGTTCAACTGGAATGTCAGCATAAACTTCGTCATCATATGTTAAAACAAAACGATTTGTATCTGTAACTTCACCTATAACAGCACTATCCAATTCGTGCTTATCAAATAAATCTAAGAATTTTTGTTCAGTACCTTTTTCAACAACTAGTAACATACGTTCTTGAGTTTCTGAAAGCATCATTTCATAAGGAGAAATACCTGGCTCACGTGTTGGCACTTGTTCTAATCTCAAATGTAACCCACTACCACCTTTTGCCGCCATTTCAGACGATGAAGATGTTAAACCAGCAGCACCCATATCTTGAATACCAACTAATTCATCAAATGTAATTGCTTCAAGTGTTGCTTCCATTAATTTTTTACCTACAAATGGATCACCGATTTGTACAGAAGGTCGTTTACTTTCGCTTTCTTCCGTCAATTCTTCAGATGCAAAAGTAGCACCATGAATACCATCTCGACCAGTTTTCAAACCAACATAAATGACCGAATTACCTACACCTTTTGCTGTGCCTTTTTGAATCATGTCGTGATTGATAACACCAACACACATTGCATTAACAAGTGGATTGCCATCATAACGTTCATCAAATTCGATTTCACCAGCAGTTGTTGGAATACCAATGCAGTTACCATAACCTCCGATACCCTTTACAACACCTTTAAGTAATCTTTGGTTTTGTTTATTATCTAATTCTCCAAATCTAAGACTGTTTAACAAATTAATAGGTCTAGCCCCAATAGAGACAATGTCACGAATGATTCCACCAACGCCTGTAGCAGCCCCTTGATATGGTTCAATTGCTGATGGATGATTGTGAGACTCTACTTTAAATACTACGGCTTGATTATCACCTATATCGACTACCCCTGCACCTTCACCAGGCCCCATAAGCACATGGTCACCTGACGTAGGAAATTGCTTTAAAAACGGTTTAGAATGTTTATAAGAGCAATGTTCACTCCACATAACAGAAAAGATACCTGTTTCTGTAAAGTTAGGTTGTCTGCCTAAAATATCGCAAACTTTTTCATATTCTTGATCACTTAATCCCATATCTTGATATACTTTTTCAAGTTTAATTTCTTCAACGCTTGGTTCGATAAATTTAGACATGTTGTTCCCTCCAACTTTTTACCATCGCTTCAAATAATTTCACACCACTATCAGTACCTAACAACGTTTCTAAAGCTCTTTCAGGATGTGGCATCATGCCACATACATTGCCTTTTTCGTTAACAATTCCTGCAATATCATCATATGAACCGTTCGGATTATTCACATATTTCAGAATAATTTGATTGTTAGCTTTTAATTGTTGATATATTTCATCAGTACAATAATAATGACCTTCACCGTGAGCTACAGGATATATAACTTTTTCACCTTGTTCATAAAGATTTGTAAATGCCGTTTGATTATTCACTATTTCTAACTCTTCATTTCTACTAATAAATAAATGTGAATCGTTATGCAATAATGCACCAGGTAATAAGCCTATTTCAGTTAAAATTTGAAACCCATTACAAACACCTAATACTGGCTTACCTTCAGCTGCAAGACGTTTAACTTCCGAAATAATCGGCGCTACACTAGCCATTGCCCCAGATCTTAAGTAATCCCCGAATGAAAATCCACCAGGAATAAGTACGCCATCAAATCCACTTAGTGATGTTTCTCTATAATCTACATATTCCGCTTCAACACCACTTTTAATAGCAGCATTAAACATGTCTCTATCACAATTCGAACCTGGAAAAACAAGAACCGCAAATTTCATTTTATGCATTCTCCTTTTCATCATCTAACACTTTATAGCTATATTCTTCAATCACTGTATTTGCAAACAATTTTTCACTTAGAGTTGTAATAATGTTGTGTACCTTTTCATCACTAACCTCATCCACTGTCATATATAATACTTTTCCTACACGAATATCATTCACTTGTGCATAACCTAAGTCATGTACAGCTCGAGTAAGCGTTTGTCCTTGCGTATCTAATACTTGTGGTTGTAATGTGATATGTAGTTCAATTGTTTTCATTATTTTAAATCCTCCAATTTGTTTAAAAATATTTGATATGTTTCAATCAGTGATCCAGTGTTATTTCTATATACATCTTTATCAAAGTTTGCATTGGTAGCTTTATCCCAAATTCGACATGTATCTGGAGATATTTCATCCGCTAACAAAATTTGACCAGTCTCAGTCTTTCCAAATTCGATTTTAAAATCTACTAATTTTAAATTCATAGCATCCATTAATTGTTTCAACACATTATTAATCTTTAATGCTTTGGATTTTAGTATTTCAATATCTTCATCTGATGCTATATTGAGCAATTTAACATGGTCATCCGTTATCAACGGATCATTTAACGCATCATTTTTATAGAAAAATTCTACAAGTGGTTCTCTAAAAACTTCACCATTTTCAAAACCTAAACGCTTTGTAATAGATCCACTAGCAATATTACGAACAACTACTTCTAATGGAATTATTTTCACAGGCTTAACTAATTGTTCTGTTTCAGATAATTGTTTAATAAAGTGACTTTCTATTCCATTTTCTTGTAAATATTTAAATATAATAGAAGTAATTTGATTATTTAATCGCCCCTTACCTGCCATTGTGTCTTTCTTAGCCCCGTTTCCAGCAGTAACTTCATCTTTATATTCAACTCTTAATTCATTTTCTTGATTTGTTGAGAAAATGCGCTTCGCTTTTCCTTCATATAATAATGTCATGCTTTAATTACTCCCCTCAAATTTAGCGTACATATCTTGTTCAGTTTGGTTTACATCATTCGTTAGTACAGTCATATGCCCCATTTTTCTGCTATCTTTACGCTCAGACTTACCATAAATATGTAAGTGCCACTCTGGATGTTCATTAAATTCATTTTCCAATAAATCTAAATCTTTACCTAGTAAGTTCATCATGACTGCTGGCTTTAATAATTCAATTGAATTTGGTAATGATTGTCCGGTAACTGCTAAAATATGAGTATCAAATTGTGAATAATCACATGCTTCAATTGAATAATGTCCGGAATTGTGAGGCCTTGGTGCTATCTCGTTCACATACAATTGGTTGTTACTATCTATAAAAAATTCAACTGTAAATGTTCCAATGAAATGAATCGATTGGATAATTTTATTAACTTGCTCTTTCGCCTCAGCTGTTTTATCTATTCTCGCTGGAACAATTGTTTTGAAAAGTATTTGATTTCTATGCTCATTTTCTTGTAATGGGAAAAAAGTGATTTGATTGTTGTTTCCTCTTGTAACAGTAAGAGATACTTCTTTCTTGATATTCAAATATTTTTCAGCTACGCATTCACTAGTTTCAATTAATTTAAAACCTTCTTGTAAGTCTTTTTCGTTGTTAATTAAAACTTGACCTTTGCCATCGTAGCCACCAAATCTAGTTTTTACAATAAAAGGATATCCTAATGTTTCAATTGCTTTGTCAATATCTGTAGATTCTTTTACTGAAATGAACGGGACAACTTTGGTACCAGCACTTTTTAATGTTTCTTTTTCAGTTAAGCGATCTTGTAATAACTGTATAGCTTGGTAACCTTGCGGAATATTGTACTTTTCACATAATAGTTTTAATTGTTGGGCTGAAATGTTTTCAAATTCATAAGTAATCACATCACATTTTTGTCCTAATTGATTGAGTGCCTTTTCATCGTCATACTTGGCTTGTATAAATTCGTGTGCAACGTATCTACATGGACAATCTTCAGAAGGATCCAATACAACCACTTTATAACCCATTTTTTGAGCTGATTGTGCCATCATCTTTCCAAGCTGACCACCACCAATAATGCCAATAGTCGCACCAAACTTTAATTTATTGAAGTTCATTTTGCATGTCCTCCACTTTTTGAATTAACGAAGATTCATACTGATTTAGTTTTTCAACTAAAGAAGGATTTTGAATACTTAACATTCTTGCTGCAAGTATACCTGCGTTTTTAGCACCTGCTGCACCAATTGCAGTCGTTGCAACCGGAATACCTCCTGGCATTTGAACAATTGATAATAAAGAATCTATACCCTTTAAACTTTTTGTTTCAATCGGCACTCCAATAACTGGTAGCGTCGTTAATGATGCAACCATACCTGGTAAATGTGCCGCACCGCCAGCGCCTGCAATGATAATGTTTATACCTCTTTCTCTCGCTTCAGAAGCAAATTGAACCATCATTTTTGGCGTACGATGTGCGGATACTACTTGTTTTTCGTACGGAATTTCAAAATAATCCAACATGTTACAACTCTCTTGCATAATTTTCCAATCGGAAGAACTGCCCATAATGACTGCTACTTTCAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP031673|1901869:1910342|1907777_1908041_-|AXP52606.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >CP031673|1901869:1910342|1903459_1904944_-|AXP52603.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >CP031673|1901869:1910342|1909859_1910342_-|AXP52609.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGINIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >CP031673|1901869:1910342|1908040_1908745_-|AXP52607.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIASDEDIEILKSKALKINNVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >CP031673|1901869:1910342|1901869_1902436_-|AXP52601.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRKCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >CP031673|1901869:1910342|1904922_1907112_-|AXP52604.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGDHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >CP031673|1901869:1910342|1907104_1907776_-|AXP52605.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >CP031673|1901869:1910342|1902438_1903467_-|AXP52602.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDVSRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >CP031673|1901869:1910342|1908748_1909873_-|AXP52608.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVVVLDPSEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITFFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2154850 : 2169637
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP031673|2154850:2169637|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP031673|2154850:2169637|2161935_2162202_-|AXP52855.1|DBSCAN-SWA MCLMYNETHNIVLVKRKRHNILCFVCKCFIYEEITFKSNLTQKFNSYYQLIVIFLENVLSKWKISNDVNTTYSDFYTFNPYKLLFSQI >CP031673|2154850:2169637|2155608_2156565_-|AXP52849.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVESVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >CP031673|2154850:2169637|2157993_2158098_-|AXP52851.1|DBSCAN-SWA MYNAIYIGSSWRGPNTEAGGKSANNIVQVGGAPT >CP031673|2154850:2169637|2162586_2163453_+|AXP52856.1|DBSCAN-SWA 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18 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2181609 : 2189429
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP031673|2181609:2189429|DBSCAN-SWA ATTATAACATCTCCAAAATCTTGGTTTTTGCGTAAAATTCATTCACTTCATCTTTTGGCTTAGAATCAATTGTAATACCTGCTCCGACTCCATAAATCGCTTGTCCATATTTATACTCAATAGTGCGAATCGGAATATTAAAAATCATTTTATCATCTTCAGTTGGAAGTAATAGTCCAATTGCTCCGCAGTATATACCACGAGGTGAACTTTCTAATTGTTTAATATATTTCATTGTATTCAGTTTCGGTGCACCTGTAATCGAACCACAAGGAAATAACGATGTTAAAATTTGAGTTAAGTCTGTATTATTTTTTAAAGTTCCACTTACCATCGAAGTCATTTGAAATACAGTTTTATATGCCTCAATAAAAAATAGTTTATACACCTTAATTGAGCCACTCTGTGATATTCTCCCTATATCGTTTCTTAGTAAATCAACAATCATGACATTTTCTGCACGATCTTTCGAAGAAGTTTGCAATGTTTTATAATACTGTTGATCTTCAGCTTCCGTTTTACCTCTAGGCATTGTCCCTTTCATCGGTTTGCTTATGATAACGTTATCGACATTGTTAAATTGTCCTTTTTGAAAAAATAATTCTGGTGAGATAGACGCTACTTGGATTTCATCAGTTTGTAATAACGCAGTATAATTACCATTACTAAATTGAGTTAATCGTTCATATAAAGTACTAATAGGATAATAAATGTTATCCGTTAAGCGCGCCGTATAGTTCACTTGATACGTTTCGCCTTCAACAATTGCTTGTTGGACACGTTTAATATTAGTCATCATAACCTCAGAAGATTCAACAAATGAAAAATGATACTTTGATACATAAGAAGTTTGATGTTCATATGTTGAATTTATGCTTTCCGCTTTTTCAAAACTATAAGCTGCTGCATAAATATCATCTTTAGCTAATGAATGTGTACACATAGCATGATTAAAATACTTTGCCGCTTCGTAACTTAAATATAACGAGACATATCTACCTTGTCGTTGCTGCGCTTGTGCAAAGTGTATCACTTCTCCCACATCAGCCAACTTAGTAGCAACATACTTCTTTATAAATCCCTTTAATTGAATATGGTATTGCTTATATTCATTTTCAGTTAAATAGTAGCGATAATTATATTCTATTCTCACAGTAATCACCTACCTTCGATAAAAATAATTCAACTTGTCGATAACCGTATTCACTCAAAATAGATTCAGGATGATATTGCACACCAAAAACCGGAAATCTAATATGCTCAAATGCCATAATAATCGCTTCATCGTTTTTTGCTGTAATCTTTAAGCAATTTGGAAAAGTCGCTCCGTCAGCAATTAATGAATGATAACGCATTACATTGAAATTTTGAGGCAGTCCTTGAAAAATACCTTCATTGGTATGGCGTAACTGTGTAGTATGTCCGTGTACAGGATGATAGCCGTGAATGATATTTCCACCAAAATAAGACACGATACATTGAAATCCTAAACATACACCTAGTATAGGTACACGCTGATAAAATTGTTCTAACACTTCATTCAAGATAGGATAATCATCCGGATTACCCGGCCCAGGCGAAATAACAATTGCTTTTGGCTTCATATTAATGACGTCTTCTATCAGCAGATTATCAATACCAACAACTTGAACTGTTAGTTTCGTTTGAGTCTTAATATAGTCTATTAAATTATATGTAAATGAATCATTATTATCTATGACTAGAATCATTGTATACTCCGTTCTAAATGTGTTTTATTTTTATAATATGTATTGGATGTAGCTAAAACTTTAAAAGCATTGTCATTATCCTGACCTTGATTTTAACTAATATATGGTATATTCTATTCATCGTACATAAATGAATATCAGAGGTTCCTAGCTGAAACCCTCTATAAAAAACTAGACATTGAAATTTCAAACATTCGTTGGTAAACCTTTAATATATATTATAGGAGCAACCCATTTCTTTCGTCTATCTTTTATGGAGATAGGCTTTTTTTATTTTATAAATTAAAAACGGGCTTATCAATGCCATTAACCTCTTTATTAATATTATTAATGATAGGAGCAATTACAAAATGGAAAGTGTATTAAATAATGAAAAAGCCATCGTTGTCTTTAGTGGTGGTCAAGACAGTACAACATGTCTCTTTTATGCAAAAAAACATTTCAAAGAAGTTGAACTCGTAACGTTTAATTATGGCCAAAGACATGATACTGAAATTGAAGTCGCAAAACAAATTGCACAAGATCAAGGAATGAAACATCACGTTTTAGATATGTCATTATTATCACAACTTACTCCAAACGCATTAACACAACATGATATGGAAATTACTAATAATGAAGATGGTATACCTAATACATTTGTTCCAGCTAGAAATTTACTTTTCTTGTCGTTTGCAGGCGCTCTAGCTTATCAAATTGGGGCTAAGCATATTATTACAGGCGTATGTGAAACAGACTTTTCAGGCTACCCAGACTGTCGCGATAGTTTTATAAAATCAATGAACGTAACATTAAGCCTAGCTATGGACAAAGATTTTGTCATTCATACTCCTTTAATGTGGTTAAACAAAGCAGAAACGTGGAAATTAAGTGATGAACTCGAAGTTTTAGATTATATTCGTACAAAAACATTAACATGCTATAACGGTATCATTGGGGATGGCTGTGGTGAATGTCCAGCTTGTCATTTACGTCAACGTGGACTAAATCAATATCTTGAAAGTAAAGGAGCGCTTTAAAATGTTACAACAAATCTATCCTAGTACAACGCATCCATATCAATTCGAATTAAATAAAGATTTTAATTTTTCGGCTGCACATCACATTCCATGTGAAGAAGCAGGTATTTGTCAAAATGTCCATGGTCATACTTACTTTGTTAATTTAACAATTGTCGGTGATAAACTAGATGACACTGGCTTCTTAGTGAACTTTAGCCATTTGAAAAAGATGATACACGGTAAATTTGACCATCAACTGTTAAATAACTTACCTGCTTTTAAAAACAAAATCCCTTCAACTGAAATCGTAGCGGAAACAATTTATCAAATTGTTAAAGAAAATTTGGCATCGCTCGAACACCAACCAAAATGTATTCAAGTATTTGTAAGAGAAACACCAACAAGTTATGTCGTATTTAGACCAAAGGAACAGGTGTAACTAATGGCTAAAATTCCTGTACTCGAAATATTCGGTCCAACCATTCAGGGTGAAGGTCGAGTAATCGGTAGAAAAACGATGTTTGTGAGAACAGCTGGATGTGATTATCGCTGTAGCTGGTGTGATTCTGCATTTACTTGGGATGGTAGTGCTAAAGGCGATATAAAACTCATGACCGCTGAAGAAATTTATGATGAATTAAAACGAATTGGTGGCGATTTATTTAACCACGTTACAATTTCTGGTGGTAACCCAGCATTAATTAAAGGTATCCAAGAGTTAGTTGACTTATTTCAAGATAAAGGTATTTTCAGCGCACTGGAGACACAAGGCAGTAAATTCCAACCTTGGATGACACAAATTGATGATTTAACGATTAGTCCAAAACCACCAAGTTCAACTATGACACCTGATTTAAAAAAGTTAGATGAAGTGATTACACAATGCGTACCTTCATCATTAAACTTAAAAGTAGTTGTATTCGACGATAAAGATTATGATTTTGCCAAAATGATACACCACCGTTATCCAGATATTCCCTTCTATTTACAAGTTGGTAACCCATATTTATCAGACAGCGTAGATAATCATACCGAAAAGTTGTTAGAACGCTACGAGCAGTTGGTGGATTTAGTTATGCAAAGTAATGATATGAATCACGTTTATGTGTTACCACAACTTCATACATTACTTTGGAGCAATAAAAAAGGTGTATAAAGGATAACTTATTTTACTTTTTGCAAGTCATATCTAATGAATAACAATATATTAATTGATATAATAGTTGATTGAAGTATAACGAACAGGAGTCCATCATGATTGTATATATATTAATTAATATTGCTATCGTCGTACTTATAACTGGATTCAATTTATATAGGCATCAAATGCAACATTTATCATTAAGTGCAATGTTGTTATCTATTACGATAAACGCCTTTATAAATACATTCATAATTGATAAATATAACTTTATTACTCTGTGTACTATAACGATGTTTATCATTTGGACGATACTACAGTTTTACATTGATAAAAAATTAAAACCTGTATACATTACAGACCAAAAATTTATTGCTATCATATTAACGATTGTTGTCAGTTTAACGCAACGTGTTACCGACTTTTCAAGTACACAATCAATATATATGTCTATTCCATTTTTAGCCCCTGCCATTTTCATCATTGGTGGTATTATGTTGTTTATTTCAACATTTAATAGCTTAGATGAAACTGCTGAAAATAATAACAAAATAAAGAAACTAATGATTAAAGGACTTATCATTATTAACATTTCATTTATCGTTATGATGGTTTTAACACCATATTGGTACTTGTATTTAATCGTCTATCTTATTTTCTTGTTGTTTTTATTGTGGCAAAAGGTTTATAAATTTTAATACCAAAACTATAAAACACTTCTGATATTCTTAGTTCAAAATATCAGAAGTGTTTTATAGTGTTATCTAGTTCAGATAAATATTTCCTTACTTAAAAAAACGCCCTCCTCTTATTTTGACCCCTATTTATTTAAATCAGACAATTATTTTCATTTTCAAATTATTCTTTCTTCAATATTAGTTAAGCGATATTTAAACGAAGTTAAGAATTAGTTAATGGCATATTATTTGCCTTCATTTTAAACTTAACTTATCAAATTGAAGAAATGAGGAGTTAGCATGAATACAAAATATTTTTTAGCAGCTGGTGCTGTTATCACAACATTAGCTTTAGGTGCTTGTGGTAATTCTAATTCACAAGATCAAGGTAACAAAACTGAACAAAAAACAAAGTCAGAAGATAGCAATGTTAAAACTGATAAAACAAAAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP031673|2181609:2189429|2183688_2184357_+|AXP52876.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >CP031673|2181609:2189429|2184358_2184778_+|AXP52877.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >CP031673|2181609:2189429|2181609_2182761_-|AXP52874.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHAMCTHSLAKDDIYAAAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKYHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKNNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >CP031673|2181609:2189429|2184781_2185495_+|AXP52878.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >CP031673|2181609:2189429|2185593_2186178_+|AXP52879.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >CP031673|2181609:2189429|2187239_2187713_+|AXP52881.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >CP031673|2181609:2189429|2182744_2183338_-|AXP52875.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHIRFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >CP031673|2181609:2189429|2188373_2189429_+|AXP52883.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCNEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENEDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >CP031673|2181609:2189429|2187687_2188374_+|AXP52882.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >CP031673|2181609:2189429|2186457_2186898_+|AXP52880.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAAGAVITTLALGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK |
10 | Pandoravirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2538939 : 2591596
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP031673|2538939:2591596|DBSCAN-SWA 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MTLSKETEVIFDWRRGVEYHSANPPLYDSSTFHQTSLGGDVKYDYARSGNPNRELLEEKLARLEQGKFAFAFASGIAAISAVLLTFKSGDHVILPDDVYGGTFRLTEQILNRFNIEFTTVDTTKLEQIEGAIQSNTKLIYIETPSNPCFKITDIKAVSKIAEKHELLVAVDNTFMTPLGQSPLLLGADIVIHSATKFLSGHSDLIAGAVITNNEAISDALYLIQNGTGNMLSAQDSWTLAKHLKTFPIRFKQSVENAQKIVSFLIKQDEISEVYYPGLTTAHLEQAKNGGAVIGFRLADESKAQQFVDALTLPLVSVSLGGVETILSHPATMSHAALPEEVRQERGITFGLFRLSVGLEDPDELIADIKYALKEAFNESIPHTIER >CP031673|2538939:2591596|2543706_2544588_-|AXP53216.1|DBSCAN-SWA MNQVMNIISSLFEPLTKIETYENIATKIAMIVIYIIVALIVIKILNKMIEQGFKIQNKSKKSNKKRSKTLISLVQNVVKYIVWFIVITTILSKFGISVEGVIASAGVVGLAVGFGAQTIVKDVITGFFIIFESQFDVGDYVKINNGGTTVAEGTVKSIGLRSTRINTISGELTILPNSSMGEITNYSITNGTAIVKIPVSVEENIDNVDKKLNKLFTSLRSKYYLFVSDPVVIGIDAIEDTRVILRISAETIPGEGFAGARIIRKEVQKMFLQEGIKTPQPIMTAYNHSENGV >CP031673|2538939:2591596|2580004_2581939_-|AXP53254.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MKKFKLFLDFSTLLLISGLLFLFFFKENEEIIPESSNILTISNWDKSNSKSKVLDVIESGAKNQNIQIIKSVKDFDNKKEFFVFNSKRNNSDFIRNKTSLLTPSDLLNREIKGKYYIIGEHFNVEELTSELKKAGLTSEVEYINRNILFFELVIDNDLLVPFIFLGVLYLLYFLYDRGYNLKFYAIQKLHGFSTTRIIFHNIHIKIIYWLVLTTIFFIANILIIHIANLELDFLMFIRRFIVLLFVFACITTLLWLISYSLLLKLSIPLTLKGKKGYKFSIFMGTFTKCIMVLILSFLLAQNLNAYTKLKNIYDSEKIWQKLDNYYTLEISPNIRNSEEKQILETNIYNLIKKSEQLGGLLLKNNNIANPDKNNYIPENGNVFFINNNFLNFYKNINHDFKMIVNHSDKINVFIPPRLQYQKSEIQKNHQGWIDFQKQQNKKVDVQVLSKNVSVFSFDRTTNLKFGYLDSPIVMLLTPDDLTGDFYLAAVSQGGYLFKDLDTLKQLLKDNHLEEEISGITNYKDSVLNELNETKTKMIITIVTIIINVFILLIATVFETIQYFSWNKKQLLLRKIHGYSLFSSNVRYLTISILLSIMLAYTTHILFGSKILLFIIMSIAIIQHLLQIAYIKYLEKYFKDLMREI >CP031673|2538939:2591596|2569769_2571128_+|AXP53241.1|DBSCAN-SWA MNFLKPAKHIKPLPENQIDDTYKRLRLQVFLGIFIGYAGYYLLRKNFSLAMPALQEQGFTKAELGFALSAVSIAYGFSKFFMGTVSDRSNARIFLVLGLALTAIVNLLMGFVPFFTSGIGIMFVLLFLNGWFQGMGWPPSGRVLVHWFSVSERGSKTALWNVAHNVGGGIMAPIAAWGITTTAFINFGYLKGFEGVFIYPALLALIIAAISYVLIRDTPQSQGLPPIEIYKNDFATSDKKTLETELTTKEILFKYVLNNKWVWAIAFANIFVYFVRYGVLDWAPVYLSEEKHFDLKASGWAYFLYEWAGIPGTLLCGYISDKLFKGRRGPAGFFFMLGVTVFVLIYWLNPPDNAWLDNVSLIAIGFLIYGPVMLIGLQALDYVPKKAAGTAAGLTGLFGYLFGAVMANIVLGAVVDKFGWDVGFILLTAISVFAMLSFILTWNKVGQETVHH >CP031673|2538939:2591596|2573290_2573965_-|AXP53243.1|transposase|DBSCAN-SWA MNYFRYKQFDKDVITVAVGYYLRYALSYRDISEILRERGIYVHHSTIYRWVQEYAPILYQIWKKKNKQAYYKWHIDETYIKIKGQWNYLYRAIDADGHTLDISLRKKRDNHSAYTFIKRLIKQFGKPQMIITDQAPSTKVAMSKVIKDFKLTPNCHCTSKYLNNLIEQDHRHIKVRKISYQSINTAKNTIKGIECIYGLYKKNRRSLQIYGFSPCRVISIMLAS >CP031673|2538939:2591596|2571210_2571651_-|AXP53242.1|DBSCAN-SWA MCKSKILLKNIFSEESEVKDLTEEKYNQDYEALTFSFKEETYQSRLAKKTPTKSGYFVTCWTKDEDNYNRPYKIEEFADYLIVAVIDDELNGYFLFPRELLVEKGILASSKYQGKMAFRVYPKWCNQLNKTAGQTQKWQCKYFFEY >CP031673|2538939:2591596|2550320_2552549_+|AXP53222.1|DBSCAN-SWA MTTIKTSNLGFPRLGRKREWKKAIESYWAKKISKEELDQTLTDLHKENLLLQKYYHLDSIPVGDFSLYDHILDTSLLFNIIPERFQGRTIDDDLLFDIARGNKDHVASALIKWFNTNYHYIVPEWDNVEPKVSRNVLLDRFKYAQSLNVNAHPVIVGPITFVKLSKGGHQTFEEKVKTLLPLYKEVFESLIDAGAEYIQVDEPILVTDDSESYENITREAYDYFEKAGVAKKLVIQTYFERAHLKFLSSLPVGGIGLDFVHDNGYNLKQIEAGDFDKSKTLYAGIIDGRNVWASDIEAKKVLIDKLLAHTNELVIQPSSSLLHVPVSLDDETLDTSVGEGLSFATEKLDELDALRRLFNQNDSVKYDKLKARYERFQNQSFKNLDYDFESVRTSRQSPFAQRIEQQQKRLNLPDLPTTTIGSFPQSREVRKYRADWKNKRITDEAYETFLKNEIARWIKIQEDIGLDVLVHGEFERNDMVEFFGEKLQGFLVTKFGWVQSYGSRAVKPPIIYGDVKWTAPLTVDETVYAQSLTDKPVKGMLTGPVTILNWSFERVDLPRKVVQDQIALAINEEVLALEAAGIKVIQVDEPALREGLPLRSEYHEQYLKDAVLSFKLATSSVRDETQIHTHMCYSQFGQIIHAIHDLDADVISIETSRSHGDLIKDFEDINYDLGIGLGVYDIHSPRIPTKEEITTAINRSLQQIDRSLFWVNPDCGLKTRKEEEVKDALTVLVNAVKAKRQE >CP031673|2538939:2591596|2579689_2580001_-|AXP53253.1|DBSCAN-SWA MKRTLIIVTIVLLIIILSLLLVRNEHLDRFNPLLKEKVSYAKVPKDTQDYRNITVYSKNGEKKSYKLDFLGYDPTKEYVKVNHKGKYVRSIEYITKDIPSFLK >CP031673|2538939:2591596|2567460_2568522_-|AXP53239.1|DBSCAN-SWA MAKLEMNKNTPLEFGLYSLGDHLLNPLKGEKVSYEQRINEIIEASKLADEAGIDVFAVGESHQEHFTTQAHTVVLGAIAQATKHIKVSSSSTIISATDPVRVFEDFATLDLISHGRAEIVAGRASRTGIFDLFGYDLKDYDELFEEKLGLLLELNKTERITWSGKYRPELRNMKIFPRPIDNILPIWRAVGGPPASAIKAGKQGVPMMITTLGGPAMNFKGSIDAYRQAATEAGFDASPKSLPVSTASLFYTAETTQDAMREFYPHLNTGMSFIRGVGYPKQQFANSSDYREALMVGSPQQIIEKILYQHELYGHQRFMAQLDFGGVPFENVMKNIELIGNDIIPAIKKHLSK >CP031673|2538939:2591596|2577603_2578104_-|AXP53249.1|DBSCAN-SWA MYEIKTKNVGGWFHKEKQETGNIVITKTYFEKYTKQIKAAQMILDDYEWIKSGKSLKKSEKQNESLVNELTSVHMENEKLVEEFNDLAQRYNYLLSENEKKDKELNYTLKLFNQVFKIIKSMMKEERYHTLINHIDNHLDNSKIREVMTIDNNDEQFFKKKYQAQE >CP031673|2538939:2591596|2539525_2540464_+|AXP53583.1|DBSCAN-SWA MLNFDEQIAKLKQMNIFFNIIDTEKANEILRKNNYFFKLAYFRKNFEKKNGGYFIEFAYLSDLATIDMKLRYTMLHLTLDIEHSLKYLVLKLITENNQEDGYKIIDEFLCIDKSYSNSNFDTNSRTPEEVMETKIKNKNEIFKHMNKRGQLPEKLNKYYQNPPAWVCIEFMQLGQFVSFLNFYYKKYNDEELRVANILMPLVKNIRNKSAHNQPIIANLNYDSRLPQYLFEKGNNIGISRNMFGIKNFIDTFATLELHNQVCSNAIIQARYHDLDQLQKRYKRNESYYNNALAIKRFFIALDKIIDFNRPKV >CP031673|2538939:2591596|2560026_2560728_+|AXP53232.1|DBSCAN-SWA MVHFSELRHRLVKILLSFVITVIVVYVSSFWWMTPFITYITRAHVSLHAFSFTEMIQIYVMIIFFIAFCFISPVMFYQLWAFIAPGLHNNERQFIYKYSFFSVLLFCAGVAFAFYVGFPMIIQFALKLSLTLNISPVIGFKAYLIELIRWLFTFGLLFQLPILFMGLAKFGLIDTTSLKHYRKYIYFACFVLASIIAPPDLTLNILLTLPLILLFEFSMFIVKFTCRGKPPTH >CP031673|2538939:2591596|2574347_2575091_+|AXP53244.1|DBSCAN-SWA MKSVKKLSEELGVSKQTIFNNIKRLNIETIKQENTSFIKEDTDIEKIIQRVNENKKKYGFESTTEDKQKKGSDNINFESKSDAQIVEILKNQIDTLNNQIEKQESRHETTIEFYRKELQERSKLLENQQVLALESNKKIQKLENQLEKEKHLNYPFDTSTNTRQNVDAQEKTYTTNPVNINRDQEETKETEIQYKDISGSQSDESTQGEEAKREDVPANLNDNDSDIEEKSEETEPKKGFWSRLFGS >CP031673|2538939:2591596|2559296_2559686_+|AXP53230.1|DBSCAN-SWA MAFTLSAIQQAHQQFTGVDFPKLFKAFKDMGMTYNIVNIQDGTATYVHQSEDDIVTSSVKSNHPVAQKSNKTIVQDVLTRHQQGQTDFETFCDEMAEAGIYKWHIDIQAGTCTYIDLQDQAVISELIPQ >CP031673|2538939:2591596|2545707_2546046_-|AXP53218.1|DBSCAN-SWA MCYPILINKKSCVKNPVRHLTSMLILYRYNGRTRRHLILASTLQGHFQTRFQNLLSATKDSLYKQGVFYFPLYCVYVSLNCYKILISLQSKKRFVNNYSENFDLKVNLFVKL >CP031673|2538939:2591596|2538939_2539098_+|AXP53207.1|integrase|DBSCAN-SWA MVKAMVQFQIANDMRIGELLAIKRVNINYEDKTLDIDGKVNWITEKRREHSE >CP031673|2538939:2591596|2541547_2541844_-|AXP53211.1|DBSCAN-SWA MRTYEVMYIVRPNIEEDAKKALVERFNGILATEGAEVLEAKDWGKRRLAYEINDFKDGFYNIVRVKSDNNKATDEFQRLAKISDDIIRYMVIREDEDK >CP031673|2538939:2591596|2578436_2578814_-|AXP53251.1|DBSCAN-SWA MSYSIIRVVKVKSKTNTRGIQRENKNYENIDIDLSKSYLNYDLVNDTKFDFNKKIDEKIEKNYKGKRKIRTDAIKHIDGLITSDNVFLINYLKKRQNSFLSMLKRSWKKNTVKKIFYMRQYIWMR >CP031673|2538939:2591596|2566880_2567447_-|AXP53238.1|DBSCAN-SWA MNIVLLSGSTVGSKTRIAMDDLKNELEVINEGHQIELMDLRELELEFSVGKNYLDTTGDVYKLTTSLMQADVIFIGFPIFQASIPGALKNVFDLLPVNAFRDKVIGLVATAGSSKHYLIPEMHLKPILSYMKAHTMQTYVFIEEKDFSNQQIVNDDVVFRLKALAQSTMRTAKVQQQVFEEENNQYDF >CP031673|2538939:2591596|2546253_2547357_+|AXP53219.1|DBSCAN-SWA MKDTQLAQITLTDDSTGAIANPIHLSTAYKHPKLGQSTGFDYTRTKNPTRSTFETCFAKLEHGIASFATSSGMSAIQLICNLFKPHDEILVSFDLYGGTFRLFEFYEQQYDIKFKYVDFTDYEQVEKEITDKTVALFIEPISNPQMIAIDVKPYYQLCKAKGLLSIIDNTFLTPYLSTPLAEGADIVLHSATKYIGGHNDVLAGVVTVKDESLAQQLFDFHNMTGATLSPIDSYLLLRGLKTLHLRIERAQSNARKLAKKCQSLQAIDEVLYSGQTGMLSLRLNKAYSVAKLLENLDICIFAESLGGTETLVTFPYTQTHVDMPDAEKDKRGIDEYLIRLSLGVENYEDIERDIIQALDKAQIGEIV >CP031673|2538939:2591596|2539175_2539487_+|AXP53208.1|integrase|DBSCAN-SWA MLGMISLLIESTYSQIRLVALSTRTKLATLLKGGADISSIKKPITTHTLHHSHISTLAQLGINLKAMQEHVGHSDYKKNLEIYTHVTNQMAKDMMNKFERLGS |
60 | Staphylococcus_phage(56.25%) | transposase,bacteriocin,integrase | attL 2535850:2535867|attR 2581916:2581933 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP031673.1|AXP53248.1|2577280_2577490_+|hypothetical-protein |
2577280_2577490_+
Protein sequences of CP031673.1|AXP53248.1|2577280_2577490_+|hypothetical-protein>CP031673.1|AXP53248.1|2577280_2577490_+|hypothetical-protein MNIHSHLKTFIHNKLLYYQCQTIKGVQLFKTLLLCGKNTPLGIEIPCCSRSEQAPKKVFKKIYKNILKS |
69 aa aa | NA | NA | NA | 2538939-2591596 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|578195|31|CP031673|CRISPRCasFinder matches to CP031673 position: 2565657-2565627, mismatch: 2 agctgacagaaagtcagcttacaataatgtg CRISPR spacer agctgacgaaaagtcagcttacaataatgtg Protospacer *******..********************** 2. spacer 5.2|1810902|37|CP031673|CRT matches to CP031673 position: 2565621-2565657, mismatch: 0 aacttgcacattattgtaagctgacttttcgtcagct CRISPR spacer aacttgcacattattgtaagctgacttttcgtcagct Protospacer ************************************* 3. spacer 6.1|1814878|29|CP031673|CRISPRCasFinder matches to CP031673 position: 2565629-2565657, mismatch: 2 catttttgtaagctgacttttcgccagct CRISPR spacer cattattgtaagctgacttttcgtcagct Protospacer **** ******************.***** 4. spacer 8.1|2126431|29|CP031673|CRISPRCasFinder matches to CP031673 position: 2565540-2565512, mismatch: 1 tttcgaaaagaaattctacaaacaatgca CRISPR spacer tttcgaaaagaaattctacaagcaatgca Protospacer *********************.******* |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
CP031673.1|AXP53249.1|2577603_2578104_-|recombinase |
2577603_2578104_-
Protein sequences of CP031673.1|AXP53249.1|2577603_2578104_-|recombinase>CP031673.1|AXP53249.1|2577603_2578104_-|recombinase MYEIKTKNVGGWFHKEKQETGNIVITKTYFEKYTKQIKAAQMILDDYEWIKSGKSLKKSEKQNESLVNELTSVHMENEKLVEEFNDLAQRYNYLLSENEKKDKELNYTLKLFNQVFKIIKSMMKEERYHTLINHIDNHLDNSKIREVMTIDNNDEQFFKKKYQAQE |
166 aa aa | NA | NA | NA | 2538939-2591596 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|578195|31|CP031673|CRISPRCasFinder matches to CP031673 position: 2565657-2565627, mismatch: 2 agctgacagaaagtcagcttacaataatgtg CRISPR spacer agctgacgaaaagtcagcttacaataatgtg Protospacer *******..********************** 2. spacer 5.2|1810902|37|CP031673|CRT matches to CP031673 position: 2565621-2565657, mismatch: 0 aacttgcacattattgtaagctgacttttcgtcagct CRISPR spacer aacttgcacattattgtaagctgacttttcgtcagct Protospacer ************************************* 3. spacer 6.1|1814878|29|CP031673|CRISPRCasFinder matches to CP031673 position: 2565629-2565657, mismatch: 2 catttttgtaagctgacttttcgccagct CRISPR spacer cattattgtaagctgacttttcgtcagct Protospacer **** ******************.***** 4. spacer 8.1|2126431|29|CP031673|CRISPRCasFinder matches to CP031673 position: 2565540-2565512, mismatch: 1 tttcgaaaagaaattctacaaacaatgca CRISPR spacer tttcgaaaagaaattctacaagcaatgca Protospacer *********************.******* |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
CP031673.1|AXP53259.1|2585417_2585630_+|hypothetical-protein |
2585417_2585630_+
Protein sequences of CP031673.1|AXP53259.1|2585417_2585630_+|hypothetical-protein>CP031673.1|AXP53259.1|2585417_2585630_+|hypothetical-protein MNKKNELDIAFIMSTVLNVLFLVGLTFLVQLENLYILIPYTILGFINAVYLTVRAINITKNRRFCCKVKK |
70 aa aa | NA | NA | NA | 2538939-2591596 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|578195|31|CP031673|CRISPRCasFinder matches to CP031673 position: 2565657-2565627, mismatch: 2 agctgacagaaagtcagcttacaataatgtg CRISPR spacer agctgacgaaaagtcagcttacaataatgtg Protospacer *******..********************** 2. spacer 5.2|1810902|37|CP031673|CRT matches to CP031673 position: 2565621-2565657, mismatch: 0 aacttgcacattattgtaagctgacttttcgtcagct CRISPR spacer aacttgcacattattgtaagctgacttttcgtcagct Protospacer ************************************* 3. spacer 6.1|1814878|29|CP031673|CRISPRCasFinder matches to CP031673 position: 2565629-2565657, mismatch: 2 catttttgtaagctgacttttcgccagct CRISPR spacer cattattgtaagctgacttttcgtcagct Protospacer **** ******************.***** 4. spacer 8.1|2126431|29|CP031673|CRISPRCasFinder matches to CP031673 position: 2565540-2565512, mismatch: 1 tttcgaaaagaaattctacaaacaatgca CRISPR spacer tttcgaaaagaaattctacaagcaatgca Protospacer *********************.******* |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
CP031673.1|AXP53261.1|2586433_2586811_+|transposase |
2586433_2586811_+
Protein sequences of CP031673.1|AXP53261.1|2586433_2586811_+|transposase>CP031673.1|AXP53261.1|2586433_2586811_+|transposase MDKQVRNTTEIVRLAKQKSQKTREKVDKAISKFSIEGKAINFNSIAKEANVSKSRLYKEHDIRQRIESLRERQITSNVVSKPKKSSRSEEILIKTLKRRVMELKKENKKLQNQIQKLYGDLYNKE |
125 aa aa | NA | NA | NA | 2538939-2591596 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|578195|31|CP031673|CRISPRCasFinder matches to CP031673 position: 2565657-2565627, mismatch: 2 agctgacagaaagtcagcttacaataatgtg CRISPR spacer agctgacgaaaagtcagcttacaataatgtg Protospacer *******..********************** 2. spacer 5.2|1810902|37|CP031673|CRT matches to CP031673 position: 2565621-2565657, mismatch: 0 aacttgcacattattgtaagctgacttttcgtcagct CRISPR spacer aacttgcacattattgtaagctgacttttcgtcagct Protospacer ************************************* 3. spacer 6.1|1814878|29|CP031673|CRISPRCasFinder matches to CP031673 position: 2565629-2565657, mismatch: 2 catttttgtaagctgacttttcgccagct CRISPR spacer cattattgtaagctgacttttcgtcagct Protospacer **** ******************.***** 4. spacer 8.1|2126431|29|CP031673|CRISPRCasFinder matches to CP031673 position: 2565540-2565512, mismatch: 1 tttcgaaaagaaattctacaaacaatgca CRISPR spacer tttcgaaaagaaattctacaagcaatgca Protospacer *********************.******* |