Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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CP031701 | Lactobacillus johnsonii strain IDCC9203 chromosome, complete genome | 0 crisprs | cas1,cas2,csn2,DinG,DEDDh,cas3,cas14j,csa3 | 0 | 0 | 2 | 0 |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
164500 : 233728
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP031701|164500:233728|DBSCAN-SWA AATGCTTTATAAACAAATTGAACAGAATAAACGAAATACTTGGATTATTTTAGGTCTATACACCTTGTTGATACTAATAATAAGTATTTTTCTTGGGATGCTTTTTACAGTTTATATTGGAGGGTTGTTCTTTGTTATAGGTTTGATTTACATTGCACACGTATACTTTGATGCAACTCGCCATCTTATGAAAGTAACAAATGCTGTTGAAATTACTAAAGAAACCGAGCCCCAAATTTATGAATTAGTTGAAGAACTCTGTTTAGCCGGTGGGTTGCCAGTTCCAAAATTATATATTACTCCTGATCAGGCGCCGAATGCTTTTGCTACCGGACGTGATCCACAACATGCAAGTTTAGCTTTAACGCAGGGACTATTGAATATGATGAATAAAAAAGAAGTTCAAGGTGTCATTGGCCATGAACTTTCTCATATTCGAAACTATGATACTCGTATTACAGTTTTGGCTAGTGCGCTAACTAGTTTAATTACAATAACTGGTGTAGGAATCGTTGTATTTGGATGGGGTGTATTAACTAGTGAGAATAAAGGCTTGTTAGGTCTTCTCATCAAATTTTTTGCCTTATTTTTGATTATTGTAGGTGGAATTATTTCTATTATTGGAATTCCTATAGCAAAGTTGCTATTTTTACTAGTATCACGTCAGAGAGAATATTTAGCGGATATTGGTTCAGTTGATTTGACACGTGAACCAAGTGGCTTAATTTCTGCATTATCTAAACTTGAAAAGCTAGAAGAAGGAGAGAGTACTCCACAAATTGTCTCGCAAGATTTAGCCCTACAACATTTGTATTTTAATTTTCCGAGTGCTCATGATTGGATTAGCCGCCTTTTCTCCGATCATCCACCTTTGGATAAAAGAATTGAGCGTTTAGAAAATAGTAATCAGATAAAATAAGATAAGCACGACCAAATATCATGAGATGGTATTTGGTCTTTTTGTTGGGTTAAGCTGTAGGTTAAGCACTCTATTTTTTGTTGATAGAAACTAATGGAAAATGATATTATTTGAATTAGGGAATGGCATTATATCAGGGATCTTTTAGTGTATTCTCCACGTAAGTGGAGGTGATCCTGAAATTTCCTTGGGATTTCCATCTTTGTCTAAGTGTTCTCCACATATGTGGAGGTAATCTACAGACCCATCGAATTCTATAGAAACTAATACAATGAATTAAATATCTCATAGTAAGAAGAACAATGGCACTATGCTAAAAAAGCGACTCGCGAGTCTACTATGAAAGTAGGAGATAGTTAGGTGGACGCGCATAAATGTCAGATAGGTGCGGGTGCAAATCTCGCCTCGCTTGTCTTAAAGAAAACGATACTCAACGAGTGTCGTTTTTATTTTTGGTTTTTTTCTCAAGGATAGGACTTAAATATTTAATAAAGATAATTCAAATCATCATCCCTAAATGCATTAACTCTACTTGTTATGAAATAAAGCATTGATAAGGTATTTCTATTTGTTATACAGCTGTAAAATCATCACGTAAAGCAGGTTTCAAGCCTGCTCTCATAACAGGCTAATCCGTAATTTGAAAATAGTAGCAGTAAACAAATACTAGTAAGTCAAAGAAGTCTGTCGAAAAGACAGATGAAAGCAGTAGTTAGAGTACAAAACGCTCTAAAAAAGATTTAAGTACAGCGGCTGACAATCAAGCTAATAATAGTAACAGTAACGAAGGTAAAGCTTATGGCGGAAATTTCCAAGATAGTAAGGGATATATCGCTATCAATAATGTAACCAACGTCACTGTTAAGAGTTCTAATGACGATGGCTACTATGCTCTAGTGCAAGGAACTTTCACTAATAATGCTAAAGAAAGCGTTGATCCAACATCTTTCTTTAGTAACCACTTAAAAGTAATAGAGAAAGTTGGCAAAGCTACTCATGACCTTGTTTTGGTCACCACAGACATTGAAAATGAATTAACACCTTGGGAAAACCAGATTAAGGAAGGGCGTAAGAAGGTTGAGCCTAATATGACCGATAATTTTGTTATAGTATATAAATTAGATCCTGCAAATGGAACTAAAACTAATGCAACCCATTATGTATTCGATCCTTACGATTCTAAATTTGGTAAATCATTAACTGTAAAAGTTTATGAGTCTAAGACCATTAAGAAATCTAGCGATAGTGCAAATAGCAATTCACATTCTGACGAAAGTACAGACATAAATTCAAGTGCCGATACAAGCAGTGATGCTGATACAGATGACTAATTAAATATTAAAAAACTTAGAACTATGAGGGTATTCATAATTCTAAGTTTTTTATTAGGTGGTATTATTGTCCAATTAGTTGCTGGAAATCGCTAACTAGTTTTTGAAAAGTTGCATTTAAATTCTGCATAAATTCGTTTTGATTATTTTTCATTTGATCTAATAATGAATCGGCCTGATTTGGATTTTGTTTGATTTGGTCGATAGTAGAGCCTAGTTGATCAATTTGATTTTGTAAGGCTTGATTATTAGCAGCATTATTTTTCAATTGTTCATTTTCAGTTTTGATTTGGTTTAATTGGTTTTGTAATTCTTCTTTATTTTGATCCTGCTTATAGGTATTGATAGCACTTTGCAACTCTTTATTTTGTTGCATTAATTGCTTGTTTTGTTCAGACAGATTATCTAATTTACTGTTAGTATTATTGAGGGCATTACTTTGAGCTTGCTCATTTTGAACCGTATCATTATGAGCCTGACAAGCTGAAATACCAAAGATGATGGCAATTAATAAAACAAGCACTCCAAGAACAATATATACTATCTTTTTCTTGCCTTTCTTTTTAGGACTAGCAGCTTTATTAGGAGAAGAAGTATATTGTGCTGTTTTTACTGGAGCTGGTTGAGGAGTAGGGGAAGAATCAACCATATTATTTTTATCTGTTACCCAGGCTTGAATTTTCTTGGTCGCATATTCATTATTAGTGCCAATCGCTGTGATAATTACAGGATATACTCCTGCTTCAGACCGGTTAACGGCCTTTTTATTTATACTAAGATTATCATTTGAAATAAGATGGCCATTTTCTGTAACTGTAAGTTCCAATTGAGAGATTATTTCTTGATTGGTCAAATTCTGATTAAGAGGCCAGGTAATTGAGTCTACTCTGGTATTGATTTGTAATGTCATATCTAAATTCCTTTGAAAAACTTTAGTCTATTTAATTCAATTATACTAATAAAATTTACTTAGAGAAATTAATTAACAGCAGTAAAATAAAACTTAAACAATTATAAACTATATAAATAATATAATTAAAATTATGTAAAATGGAGAAGAAATGAAAAGATCAGAAAATGTGACTTTAACTAATATGTGTATGATAAAAGATAAAGATAAAATTTTAGTTCTAAATAGAACTGATCCAGTTTGGCCTGGTTTAACTTTTCCAGGCGGCCACGTCGAATCTCATGAAGCTTTTCATGATTCAGTGGTTAGAGAAATAAAAGAGGAGACGGGATTAGAAATTAAGGATCCGCGTTTAGTTGGAGTAAAGCAATTTTTTGACCATAATGATGAACGCTATCTTGTCTTTTTCTATATGGCTACTAAGTTTACTGGTATGTTAAAAGCTTCTTATGAAGGAGATTTAACTTGGATGACAAGGGAAGAAATAGAAAAATCAAAATTAGCATATAACTTTGATCATGATTTACCAATCTTTTTCGATGAAAAGTTAAGTGAACATATCTTAGATGGAGATAGAGATCAAACTTATTAAAAAAAGACATTCGATTGAATGTCTTTTTTATTAGTCTTGAGTATTTTCAGTTGAACTAGTTGATTCAGATTCATTATTTTGACTAGCTGGCGTTTCTGTTTCCTTACTTGAACTTGAAGAAGACTCAGATGAAGCAGTAGAAGATGATGAAGTGTTTGAATTCTCAGAGTTTGAACTACGTGTAGCAGAAGTTTGAGTAGTTGCATTTGCATTACTGTTAGTAGTCCAGCTGTTATCAAAGTAATAGTTAGGTTGAGGATTATAATAACTATAATTGCGACGTGGAACAGTATAGAAAGAGGTACCAAAGTTAGATTTTGGTAGGGTACTGCTTGCTTTATGTTCATTACGTTGAATAGGTGTAGAAATACTTGATGAACTAGAACTTTGGCTTTCAGAACTAGATTGCTTTTCTTTATTTTGGAGACTATCTAGTTGATCATCCATCTTAATGTCTTCATCTTTTTTCTGCTCAGTCTTGTCTGATTTTTCTTTTTTATCGTCTTTATTTTTAGGTTTCTCTTTTTCAACTTTTTTATGAGATTGCCTATGAGAAGACTGAATAATGGCATAGTCTGCTGCAGAAGATTTATGTTTTGGCTCAACCAAGTTGTTACGACAACCTGTAAGTAATAAGAGACTACAACTTAAAGCACCAACGATTAACTTTTTCAAATTAATTTTCTCCATTTAAAACTTCTTTTTATTATAACCAAAATTATTAATATAAAACAGTAAAATTAAGTATTGATAAGAAGGGATTTGAAAATTAATATATTATTTTTCAAGTTTGGGAGTTTAAAGAACATATTTTTTCTAGAAAAGATATAATAGATATGTAGTGAATTAATTTGTTAAATTTATTTTTAGATAAAGATGTTAGGGGTCAGTTTCTATGGATGATCTTGAAGACGTTTTAATGAAATCTTTTAGAGAAGATAATGGCATTAGTTCGGCATTTTCAATTGAACCGGTTGATGATAATGAATATCGTGTTTCAACTAATGTGGTTGATGGCTTGAACGATACTATTCACTTTTATTTAGTTGTTTATCCTAACGGAACCTATGCCTTGAATGATCGCGTATTTACGGCACAAATGATTGATGATAATATCGGGGGTTTCGCAAGTATTGCCAGTGATGTGGCACGTTTAGCTAGTGAATTTGGTGTATTATTAGATGACCGCGGAGAACTAACACGTGACTATATTAAAGCTAGCGATCTTAGAAATGAAGTAAACAACTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP031701|164500:233728|220220_221417_+|AXQ19083.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKINNLPEVFTAALPVLKEINEAGYEAYFVGGSVRDLLLNRHIHDVDIATSAYPMEIKQIFKKTIDTGIKHGTVTVLYEGESYEITTFRTESGYQDFRRPDHVTFVQNLSEDLKRRDFTINALAMDVDGNIIDHFDGLGDLEKHLIRAVGKAENRFHEDALRMMRAVRFMSQLQFTLEPETEQAISDNHELLSKISVERIRDEFVKMGIAPGSQKAFQIFLDTGLSEEVPGFKGKKENLALYPQLNFSPTNEANLWALMIILLKLPNDKIPHFMRMWKNSNAMERQVADIVAFFDLISSHAPNNYDLYKAGLETIVSTIDLAHILGQPVNGSALVDSYEALPIKNNRDLVVDGHFLLKNGIPAGPRVGLLLEEIKKAVLEGVISNNKAAITEFISLNH >CP031701|164500:233728|227372_229454_+|AXQ19091.1|DBSCAN-SWA 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58 | Bacillus_phage(10.53%) | tRNA,protease,transposase,integrase | attL 160493:160508|attR 216282:216297 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
419816 : 537219
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP031701|419816:537219|DBSCAN-SWA 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149 | Lactobacillus_phage(42.59%) | tRNA,capsid,portal,protease,tail,integrase,holin,terminase,plate | attL 440110:440128|attR 526959:526977 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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