Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP031759 | Pseudoalteromonas piscicida strain DE1-A chromosome 1, complete sequence | 3 crisprs | cas3,DEDDh,WYL,DinG,csx1,RT,csa3 | 1 | 0 | 5 | 0 |
CP031760 | Pseudoalteromonas piscicida strain DE1-A chromosome 2, complete sequence | 0 crisprs | csa3,cas3,DinG,DEDDh | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP031759_1 | 230261-230360 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP031759_1
|
1 spacers
spacers of CP031759_1
>1.1|230286|50|CP031759|CRISPRCasFinder AGCAAAAAAGGTCGTTCTCTGATAAAGAGTGCGGCCTTTTTTAATGCCTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP031759_1
The CRISPR arrays of CP031759_1 >merge|CP031759|1|230261-230360|CRISPRCasFinder GTAGCAGCGATTTTATATCGCGACCAGCAAAAAAGGTCGTTCTCTGATAAAGAGTGCGGCCTTTTTTAATGCCTGGTAGCAGCGATTTTATATCGCGACC >CP031759|1|1|230261-230360|CRISPRCasFinder GTAGCAGCGATTTTATATCGCGACC AGCAAAAAAGGTCGTTCTCTGATAAAGAGTGCGGCCTTTTTTAATGCCTG GTAGCAGCGATTTTATATCGCGACC
>CP031759.1|AXQ96523.1|229070_230255_+|elongation-factor-Tu MAKEKFERVKPHVNVGTIGHVDHGKTTLTAAITNVLAKVYGGEAKDFASIDNAPEERERGITISTSHVEYDTPTRHYAHVDCPGHADYVKNMITGAAQMDGAILVVAATDGPMPQTREHILLSRQVGVPYIIVFMNKCDMVDDEELLELVEMEVRELLSEYDFPGDDLPLIQGSALKALEGEEQWEAKIVELAEALDSYIPEPERDIDKPFIMPIEDVFSIQGRGTVVTGRVEAGIINVNDEVEIVGIKETTKTTCTGVEMFRKLLDEGRAGENIGALLRGTKRDEVERGQVLCKPGSIKPHTKFTSEVYVLSKDEGGRHTPFFKGYRPQFYFRTTDVTGDIQLPDGVEMVMPGDNIKMTVELIVPIAMDEGLRFAIREGGRTVGAGVVATIEE >CP031759.1|AXQ96522.1|226711_227704_+|bifunctional-biotin--[acetyl-CoA-carboxylase]-ligase/biotin-operon-repressor-BirA MKTPDHKKQTILAALNKGEFVSGQELGAQLGISRAAIAKHIAALQEMGVDIFRVNGRGYKLNYSLPLIHQSKLNTLWQQQFQSECPIEYHAIIDSTNSELMRRLQDKQNMDSGHVLVAEMQQAGRGRRGRVWQSPFGANLYYSYYWQFDAGMQAAMGLSIAVGLAVYDALKVLYGISIELKWPNDIYLNQQKLAGILVELEGQVEGPCHLVIGIGLNICMPESASKHIDQAWTDLQTHLGQIDKNQLVVQLTHSLSERLAQYKESGLSEMVTEWNSLNVFKGDAVTLSTGQREWRGICEGIDMQGGLLLRQDGELRAFYGGEISLRKVIS >CP031759.1|AXQ96521.1|225705_226725_+|UDP-N-acetylmuramate-dehydrogenase MTSLQSYHTFSLPSGCESLIVITDPHALVELDFSRPFFLIGEGSNTIFLEDYAGTVIKLATLGIDIEQHDDDYVVTVAAGENWHQLVIKLLDKGIDGLENLALIPGTVGAAPVQNIGAYGVEVSQFITAVRGFDIAERCFITLTNAECEFGYRDSVFKHCLKDKFVITEVTLTLPKRWQPTLSYGPLQNLSNTATAQEICEAVIVTRNSKLPDPTTLANAGSFFKNPVVDRAFAAQLQSKFPEMPAFDVDNDHVKLAAGWLIDKAGLKGCHRGAIRVYEKQALVLVHSGGSTGEELKQLVSHIQQTVWQKFAVLLEHEVRLITKHGECQLQSVECHENA >CP031759.1|AXQ96520.1|223677_225525_-|M1-family-peptidase MIKLSALTLSLAMAGLVHTADVNAAVDQHTYANLNDVITTHLHLDLDVDFEDKQLEGFVEHTLDWQNRQARTLVLDTRDLEIDKVMYQGKDDKWHTAKFDLAKRDDVKGAKLTIHFKEQAKKARIYYNSLPVASGLQWLTPQQTASKSHPFMYSQSQAIHARSWIPVQDTPAMRVTYSARVHTPKDVRAVMSADNTGALIKDGDYWFDMPQAIPPYLIAIGAGNLEYKEMSHQTAIFAEPQILDASVAEFNDTQAMIDKTNAMYGEYAWGRYDLLMLPPSFPFGGMENPRLSFITPTVVAGDKSLVNLIAHELAHSWSGNLVTNATWEDLWLNEGFTSYVENRIMEEVFGRDRAVMEQALDAAGLRAQLKTIAAPDTRMNLELNGRDPDDAFSSVPYTKGQLFLIYLEEKFGRDKFDKFVKAYFKTFSFKSLTTDEFVAYLDKNLLQQYPGIVSLEKAKEWIYEPGLPSDAPNPTSDAFEKVDALTQAWLKDEKTLADLPTDSWTVHEWLHFINNLPRDLAIERMEALDKAFKLTQSTNAERAFAWYMLAVGNGYQAIYPDLEKHLVSIGRRKLIVNLYKSLIKNDKRDWAYRVYQQARPGYHPLAQGTIDALFE >CP031759.1|AXQ96519.1|222534_223599_+|uroporphyrinogen-decarboxylase MSELKNDRYLRALLKQPVDVTPVWMMRQAGRYLPEYRATRAQAGDFMSLCKNAELACEVTLQPLRRYPLDAAILFSDILTIPDAMGLGLYFETGEGPKFERPIQSLDDVKKLPKLDPTDELGYVMNAVSTIRRELKGEVPLIGFSGSPWTLATYMIEGGSSKTFGKIKKMAFAEPQTLHLLLDKVADSVIDYLNAQVKAGAQSLMIFDSWGGVLSPRDYKEFSLQYMHKIVDGLIRENDGRKVPVTLFTKNGGQWIEAIAATGCDAVGLDWTIDIADAKRRVGDKVALQGNMDPSMLHGTHERIREEVQHILAGFGEGTGHVFNLGHGITPDVDPENAGVFINAVHEFSRQYHK >CP031759.1|AXQ96518.1|221595_222066_-|sigma-D-regulator MLSQLEQAQQKWGGSHSVIDAWLAERQELLVLYYKVAGCSPTRNGKALPEQVDIQSFCQILMDYLSAGHFEIYDNIVEACQEKGPESAKLAQSLYPKITDTTDTALDFNDKYAEVNQEIQELADFDNDLSVLGETLELRFQLEDELIDNLYSNHTE >CP031759.1|AXQ96517.1|220655_221519_+|FKBP-type-peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase MWLAPFLINIKLTMAPHIKLSCASIGVLIVGTVGELRMKQTIKLSLVAASVLALVACNKKAEEQKPAEVKLDTEVQQQAYGIGASVGNFLQKDLADKKELGIELDQELLMRGFKDALAGEAKLDEAKIREVLTALDSSVREKQAAKAEADAKKNKEEGDKYLAENAKKEGVTVTDSGLQYEVLSEGDGKKPVATDMVKVHYKGTLLDGSEFDSSYARNEPASFRLNQVIAGWTEGLQLMNVGSKYKFTIPADLAYGTRDLGKIPANSTLVFEVELLDIEGEAEEATE >CP031759.1|AXQ96516.1|219484_220498_-|hypothetical-protein MVKLVNIKWTSLLFACAMFSCFTLTGCGPDTSKAVMTVEHASRGAFSAALSADGRYSLVSSIEHGAVLWDNQEQGLKFQWRHSDAPDDLIHSLALANDNSTAVTATDKTFAIWSVANGQNLGYFEIESGTIRDIAISNTGRYLLYARSDNVVVHLDLESGRRIEFLGHQENINSIAMSPNGHFALTGGNDYTAYFWNTRTGQVIHRFNHPSRVTKVALDDQGRFAFTADSMKKASIWQLTSGDLKAQLQYIARQKIFSAVRFNQDATLLATGSPNRELILWRVGDGERLQTWRVQPREGSRPKSAVVFDVAFQDQDTALLTESSSGLLEKFAQVKKP >CP031759.1|AXQ96515.1|219275_219488_-|SlyX-protein MNEIENRITELEAKLAFQEDTIETLNEELKAHQLRLAKMQRQIELLAEKMKEGRDPGLMPQHQEPPPPHY >CP031759.1|AXQ96514.1|219033_219255_+|YheV-family-putative-metal-binding-protein MFIRGVELKVKKRFIAGASCPECQKIDVMMLYKEHDVEKVECVECGHVMSQPKDAVQASTRQFEQVIGVFKPE >CP031759.1|AXQ96524.1|230595_231612_+|TAXI-family-TRAP-transporter-solute-binding-subunit MLGLSARTISAVLSITMSLCTFASFANVDKDRSYILATASSGGTFYPVGVAIATLTKLKVTPQHGMSVSAITSAGSGDNLKLMRNKEAELAILQGLYGAWATQGTGAMAPVGKQDYLRSVTMLWQNVEHFVIAKKYAKTGNVSDLKNLYSQGFGIGKRNSGTEGSGKHIMAALGVDSDKFTLVHKGYAGSSSALQNGQIAGMNIPAGVPVSAITSAYAADANGITVLDFTDEQLNKVNAEVELWSRFEIPANTYPGQTNAIKTIAQPNFLAAHKDMSEEDVYLLTKAIYENLVFLQTIHKATKAMAIKKALMGLPAKLHPGALKYYKEIGIAVPAHLQ >CP031759.1|AXQ96525.1|231648_233742_+|TRAP-transporter-fused-permease-subunit MSNSSNEQSTLAAPTAARERIAFYLAILTSLLHLYFNLVATWPDNYISAIHFMLFGSIILLTLPLRVGKLAVLSSVIDIGLFIGLIVSCGYLVLYSDALAARNYEFATADWIASSTAVLLALELVRRCMGWFIPMMILLAMSYVLFLGQYIDGVFHFAGLSAETILFRNYFDDGLFGPIAKISWTFVFLFILFGAFLVQAGTGDFIIRFANALVGRMVGGQGLVAVVSSGMMGSVSGSAIANTAATGVITIPLMKNAGFPAKFAAAVEAGASTGGQLIPPIMGAGVFVMASYTQIPYLTIIAAAFVPALLYFASIAIFVRIQAMRLNIQPALESEQLSAWQELKSGWHHLLPIVLLVALMIYGFTPTYAVSIATLSVCLFSLFSPAPMRWSKILAALATATENSAKTAILLVAIGMLVNCISISSLGVTFSLMINEWAGASLILLLVLIALASLIIGMGLPVTASYIVLATLSAPALYGLISQSALVESIVNGQLNETATMMMSMMAPALGEIYNQPNITETQVFTILASLPPEAIDIIRSSQFDTTHLAMMLLSAHMIIFWLSQDSNVTPPVCLVAFTAAGIAKTPPVATGIEAWKTAKALYIVPLLFAYTPFIGGSNFEIMQVFFTALVGMYALVAAIYGYAEAKLNKSIRMMLTFLGVALVWPHQIISVDIVAALCVVTIVIKQVIDNRTAREC >CP031759.1|AXQ96526.1|236694_237006_+|30S-ribosomal-protein-S10 MSNQRIRIRLKAFDHRLIDQSTAEIVETAKRTGAQVRGPIPLPTRKERFTVLISPHVNKDARDQYEIRTHKRLIDIVEPTDKTVDALMRLDLAAGVDVQISLG >CP031759.1|AXQ96527.1|237685_238288_+|50S-ribosomal-protein-L4 MELAIKGAGALEVSEATFGREFNEALVHQVVVAYAAGARQGTKAQLTRSEVRGGGKKPFRQKGTGRARAGTIRSPIWRSGGVSFAAKPQDHSQKVNRKMYRGAIKSILSELVRQDRLVVVENFGLEAPKTKELVAKLKELELKDVLIVTEEVDENLFLSARNLYKVDTRDVAGIDPVSLIAFDKVLITAAAVKQLEEALA >CP031759.1|AXQ96528.1|238284_238587_+|50S-ribosomal-protein-L23 MIREERLLKVILAPHISEKSTVSAEENNTIVFKVAKDATKAEVKAAVEKLFEVEVTGVRTLNVKGKTKRTGMRFGRRSDWKKAYVTLKEGSELDFVGGAE >CP031759.1|AXQ96529.1|238604_239429_+|50S-ribosomal-protein-L2 MALQKCKPTSAGRRHVVKVVNPDLHKGKPYAPLLEKNSKSGGRNNNGRITVRHIGGGHKQHYRVIDFTRTKDGIPAKVERLEYDPNRSANIALVLYADGERRYIIAPKGLKAGDAIQSGVDAPIKVGNTLPMRNIPVGSTVHNVELKPGKGAQIARSAGAYVQILAREGQYVTLRLRSGEVRKVESDCRATLGEVGNAEHMLRSLGKAGANRWRGIRPTVRGVAMNPIDHPHGGGEGRTSGGRHPVSPWGVPTKGYKTRKNKRTDKFIVRRRTK >CP031759.1|AXQ96530.1|239445_239724_+|30S-ribosomal-protein-S19 MPRSLKKGPFIDLHLLKKVEKALESGDKKPIKTWSRRSMIIPNMIGLTIAVHNGRQHVPVFITDEMIGHKLGEFAPTRTYRGHAADKKAKKR >CP031759.1|AXQ96531.1|239736_240069_+|50S-ribosomal-protein-L22 MEALAKHKFASGSAQKARLVADQIRGLPVDRALEILAYSPKKAAVLVKKVLESAIANAEHNEGADIDELKVAKVFVDEGPTMKRIMPRAKGRADRILKRTSHITVVVSDS >CP031759.1|AXQ96532.1|240081_240783_+|30S-ribosomal-protein-S3 MGQKVHPTGIRLGISKPWVSTWYANTKDFSEQLFGDHKVRTFLTKELKAASVSKIVIERPAKSIRVTIHTARPGVVIGKKGEDVEKLRQAVTKLAGVPAQINIAEVRKPELDAQLVADGISSQLERRVMFRRAMKRAVQNAMRLGAKGIKVEVSGRLGGAEIARSEWYREGRVPLHTLRADIDYATSEALTTYGIIGVKVWIFKGEVIGGLPLVQEQEKPAKRAPKKAKKSAK >CP031759.1|AXQ96533.1|240796_241210_+|50S-ribosomal-protein-L16 MLQPKRTKFRKVHKGRNRGLATSGNKVSFGSFGLKATGRGRMTARQIEAARRAMTRHVKRQGKIWIRVFPDKPITEKPLEVRMGKGKGSVEYWVAEIQPGKVLYEMEGVSEELAREAFDLAARKLPFKTTFVTRTVM |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP031759_2 | 713552-713890 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP031759_2
|
3 spacers
spacers of CP031759_2
>2.1|713593|52|CP031759|PILER-CR CTCAGGCTTAGTGCGATGCTTTGCATCGGCCACTCTATCTAAAAAAATAAAG >2.2|713686|71|CP031759|PILER-CR TAAGGGCGATGCTCTCCCAACTGAGCTAACAACCCAAATTGTGTTTCAATTTATACTCTTGAATAGAGTTA >2.3|713798|52|CP031759|PILER-CR CTCAGGCTTAGTGCGATGCTTTGCATCGGCCACTCTATCTAAAAAAATAAAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP031759_2
The CRISPR arrays of CP031759_2 >merge|CP031759|2|713552-713890|PILER-CR TGGTGGGTTGTACTGGACTTAAACCAGTGACCCTTGCCTTGCTCAGGCTTAGTGCGATGCTTTGCATCGGCCACTCTATCTAAAAAAATAAAGTGGTGGGTTGTACTGGACTTGAACCAGTGACCCTCGCCTTGTAAGGGCGATGCTCTCCCAACTGAGCTAACAACCCAAATTGTGTTTCAATTTATACTCTTGAATAGAGTTATGGTGGGTTGTACTGGACTTAAACCAGTGACCCTTGCCTTGCTCAGGCTTAGTGCGATGCTTTGCATCGGCCACTCTATCTAAAAAAATAAAGTGGTGGGTTGTACTGGACTTGAACCAGTGACCCTCGCCTTG >CP031759|2|1|713552-713890|PILER-CR TGGTGGGTTGTACTGGACTTAAACCAGTGACCCTTGCCTTG CTCAGGCTTAGTGCGATGCTTTGCATCGGCCACTCTATCTAAAAAAATAAAG TGGTGGGTTGTACTGGACTTGAACCAGTGACCCTCGCCTTG TAAGGGCGATGCTCTCCCAACTGAGCTAACAACCCAAATTGTGTTTCAATTTATACTCTTGAATAGAGTTA TGGTGGGTTGTACTGGACTTAAACCAGTGACCCTTGCCTTG CTCAGGCTTAGTGCGATGCTTTGCATCGGCCACTCTATCTAAAAAAATAAAG TGGTGGGTTGTACTGGACTTGAACCAGTGACCCTCGCCTTG
>CP031759.1|AXQ96907.1|711078_712710_-|response-regulator MSAPSIQNAKMLIVEDQPLALSYMKQSLEQLDFRNLKFAESADSAKELCTINKFDLIVCSFGLAKKQNGYQFYEELRYKQLIRSSTAFIFISSETSPELVHSVIELQPDDFLVKPFSIKELQNRIERVLKRKQALRHINLLVDDKNYSKALKALDLELDNKDHNYTSLLLKLKGELLLRLNQLEEAKSFYKSVLALQKFTWAKLGLVEALITNNEDVIAQKMLKTLIERPETRLPALDLLSKLEIKLNQYENAQQLLEQAIEMAPRNINRQQSLGRVAQINHDYEASYKAHKDIASFARYSIHDKPEVYLNAARAGIDFALSTDQSDQVTRLTRQTQQYLSDLKQQFPNAQTQAQIDVLNARVHYLKDEHKKAKQLLEQLEDEPVIRSVDSTLDKAKALHEVGLNHKAQELFSQVIAHCERHNSSADPVTMHYLYQQQQEKKEITMGPRELNNHAVTQFNKGQYETALEAFTQAFRIMPKNSGIALNLLQCMSDSCAKSGSTFNSNLAKRCTTLLNQSELDSEQQIRYGKLKAKLNEMKLDFE >CP031759.1|AXQ96906.1|710614_711055_+|peptide-methionine-(R)-S-oxide-reductase MLKWLDILNFARNGNPVAPRRVDKSDQQWQSELAPETYMITRKKGTERPFSSQSCQLFEPGKYYCVCCGELLFDAEEKFDSGSGWPSFTQPAAVEAVAYHGDKSHGMTRVEITCNVCDSHLGHVFPDGPEPSGLRYCVNALAMEKK >CP031759.1|AXQ96905.1|710100_710613_+|DUF2919-domain-containing-protein MKPVIRYGPEYWDKYGVYRTPIAFNLALVVLLRPLLIWGFSALARRPDLDLMSLFFESKFHFFVATGIACIALIPTVVFSLRRPTSSPKLAAVWRYMRLPLILTAVLDLAWLILQAGKTHYSFSPYIAVQIVLVSWVLLYLIKSRYLSCFFGDWPLPVEEQKTEVNKREN >CP031759.1|AXQ96904.1|708077_710096_+|NAD-dependent-DNA-ligase-LigA MSENIESQVAALRRQLEDYNYQYYVLDNPSVPDAEYDRVMRQLMALEQQHPELQSPDSPSQKVGGEALSKFEQVTHRVPMLSLDNAFDESEFTAFNRRLKERLLTSKDVAFCCEPKLDGLAVSILYRDGVLVQAATRGDGQVGENITENVKTIRNIPLKLRGDHIPHEVEVRGEVFMDTAGFIKLNETAQAKGDKTFANPRNAAAGSLRQLDSKITAKRPLMFYAYSMGLVEGGELANEHYAQLQQLQGWGLPMSPETKLVDNAQQALAYYQDIMTRRAELPYEIDGVVIKVNDKAQQEQLGFVARAPRWAIAFKFPAQEEITQLLDVEFQVGRTGAITPVARLEPVFVGGVTVSNATLHNGDEIARLGVKIGDTVIVRRAGDVIPQVTQVVLDRRPDDAKEIEFPDTCPVCDSHVERVEGEAVARCTGGLVCRAQRKEAIKHFASRKALDIDGLGDKIVEQLVERELIKTPADLFILRQGHFESLERMGPKSAKNLVAALEEAKQTTLAKFLYSLGIREVGEATAQNLANHFLTLEKVMAASIDTLQQVSDVGVVVAQHIHSFFAEQHNQEVVTALIEVGVTWQDVAAPSEDTQPLAGLTYVLTGTLSQLNRNDAKSRLQALGAKVAGSVSKNTDAVYAGEKAGSKLTKAQELGVEVFDEEALIALLNKYE >CP031759.1|AXQ96903.1|707286_708012_+|cell-division-protein-ZipA MATELRWALIVISALVIGGLLIHGLWSVRKKSSDKVSKKEPNELKEQTPNHDKEPDEPEIGEMTFSAVDDEPATEGIIATEAPETEVQTESSGSEEAEPEENAIEPQDFIILHVEMPEGLKMAGSRLLPTVLSLGFKYSDEGFFNRHLEPSGNGPVLFRLVNMYNPGTFDIDNMEQFSTAGISLFMTLPCEGDNLAAFNMLHSASKKLAEEFGATVLDKDREPLTVEAVRGYVEKVREFAA >CP031759.1|AXQ96902.1|703878_707268_+|chromosome-segregation-protein-SMC MRLSSIKLAGFKSFVEPTKIPFPDQMTCVVGPNGCGKSNVIDAVRWVLGESSAKNLRGDAMTDVIFNGSTKRKPISQASVELIFDNTQGRLPGTFADRNQIAIKRLVTRDGQSLYFLNGSKCRKRDITDIFLGTGLGPRSYAIIEQGMISRLIESKPQELRVFLEEAAGISKYKERRRETQTRIKSTRENMERLLDVRQELQSQLDKLALQAQQASEYKSLKSQERDLKSWIAILKWQSLEQKQAIKAKEIAKLNEKLAFFNEAHSGHDSILATLEHEIKHFNDGYEQAQHSVHRIETQLATLEQQKVNLTDKKRQLIEQSQILKSQQQEVIEAQDEQAEYVASSAEKVDEVSEQLEIALLQLEEIQLTNEQSDAEQTQLEAQFSSAQKQYQQIHAQVQQGASQLAQQQQAKLHIEKRLVELQEQAEAHHASMLENDLAEAQDAHHQLVQAMAKLQSQAGKLQSQEQANKEEILLAESHAQKALQALQEVQSEIKALSRWANEASETSATTMLSQLVVESGYEECVEAALLGLTHLVVEQSEINTLWPIELEVPCDSIATKISSGLFPSFLTKIKLCAEPTDFRSCEQFLLGVTKSGVIVGDNFKAKAKSNEESGALKRYAQLQSCHIQLSHLQKLAEEAEQVVAQKRIALEDTQACLLKTQQCVHEKAQAIASHKTKVEMLDENLSAWRELGQKIQEQLDIIAQERAEVIEQLELYTEQQLQRDELLAQAQETQQLAEAKLTEFKQHSQSRRAALQEAQQLVHTTKLTSQQAESELQLSNSKLEHLQHRHDEINQRIEQTQEDILLCEEPLAEAHEDIELLLAQHLEAKAQKQTMLDTLNQAKENLSQKQAALKDAQGEVSKLNASLQQVKLEEQSLMIKAQAALEPLQELGRTLKAELAQLPEDANLGQYQANLSRVSNDLGKLGAVNLAAIEEFEEAKARKTYLDTQLDDLTNALETLEAVIRKIDKETKTRFSATFNQVNEDLAELFPKVFGGGSAYLELTSDDLLESGVSIMARPPGKKNSTIHLLSGGEKALTALSLVFSIFRLNPAPFCMLDEVDAPLDDANVGRFCRLVEEMSQTVQFIYISHNKVAMEMAGRLTGVTMAEPGVSRMVAVDIEQAVQMAQA >CP031759.1|AXQ96901.1|703052_703814_+|RNA-methyltransferase MVNPTFEVHMISKNQQKLLRALGQKKYRKQHGLYLVQGEKNVIELVDAGLAVEQLFATSEFMTKYKSKLVNIACVEAEEEVLSKVSTLVSNNAAIAVVAMPPTEEINTAGLVLALDGVSDPGNLGTIIRLADWYGLTQLVVSENCADQFNPKVISATMGSFVRVNVVRTDLEAFLQQYQGECYGAFLGGESVHQCQFSRNAVLVMGSESHGISDSIAAHINKKVTIPAFGGAESLNVAMATGIILDNIKRCHS >CP031759.1|AXQ96900.1|702655_702952_-|hypothetical-protein MSPELTLILLNFILLFVAYVFVYPKLKEKSLASISKQDLLVTAVSLAVSGSLYYGKDIEFSLMFFESNWVVFTIVAFSVIEIPFLLWFKRRYNVKFGE >CP031759.1|AXQ96899.1|702161_702599_+|energy-transducer-TonB MKVQLLISVLVAGTCWEAEAKTLHGDVKSTQLSPSIEASIWQKKGNSIPKYPPALAKRKLAGCTVLKVMIDADGKTEDIEQIASIPSKTLAKHAKQLIKSWQWSPIDTQHLGREEKLMRIDFCLGGADLADAQMRCEAQAKLDCE >CP031759.1|AXQ96898.1|701057_702065_+|NAD(P)H-dependent-glycerol-3-phosphate-dehydrogenase MSTAKSAVTVLGAGSYGTALAICFARNGHQVTLWGRNSEHVEALAAERKNQRYLPDIQFPNTLELEADLETAVKSSECILVVVPSHAFADTLKKIKPMLLENAKVAWATKGLEPNTGRLLQEVALDVLGDDVPLAVLSGPTFAKEMAAGLPTAISVSSICAKFREELAELLHCGRSFRVYSNEDFIGIQLGGAVKNVIAIGAGMSDGFGFGANARTALITRGLAELCRLGCALGARSETFMGMAGLGDLILTCTDNQSRNRRFGLALGTGKSVDEAMSSIGQVVEGYRNTKEVYLLAKRTGIEMPITEQIYQVLYEQKDVKEAAMALLGREKRAE >CP031759.1|AXQ96908.1|716181_717771_+|PAS-domain-S-box-protein MTKGRADYTGKENDYPSSYNLLSTTNVKGQIKYANSQFCEVAGFSLSELEGKPHNIVRHPTMPKAAFKNLWDYIEAGKPWMGMVKNRCKNGDHYWVNAFVTPIKDSSGKTVEYQSVRTKPSREVVNRAEGIYADLNNGVSLSKFTRSSWSLSAQMMAIIVVFYALSMLISTLSSPWNYLAETLLTLTVLFVTYSRLAPVRSLSEKAKKVYDNPLMQKVYLNKVNDVASIELALLARESELRAVLGRVKDASATVSEYATKTVQECKTSSDILNRQQAQTGSLATAINQMTVSIGEIASNTNNAAQQSEAALESVVKGNKAVDDNMENNYALSEELSRTQKDIEDLNAQTVNIEGVVDVIRGISEQTNLLALNAAIEAARAGEQGRGFAVVADEVRALAQRTQDSTAEINGIIADLRQRAERAVTAIQSGVERSSECVLKAEGTKVSLETINTIVNEISGLNYQIATSTEEMSSVSNELNANAVTISGLADESMESARKTHETMKKTEQALDNQEVLVEQFIRKLNSTHR >CP031759.1|AXQ96909.1|717875_718796_-|GTP-cyclohydrolase-I-FolE2 MQNNMPDIAHNASALQTGTLDWVGMGNIELPLVLESKGLNQVTVTAKADAFVNLQKEDAKGIHMSRLFLALDILSCEQVLTPSTLKQLLDNFLSTHSDLSTGAKVTLRFELPIRRPSLLSKKMGWKSYPITLDATLNNGIYKLELALDVAYSSTCPCSAALSRQLIQNAFQQSFDGKQLDFHSVHDWLGSTEGIVATPHSQRSIANIKVKLIDNCNEFEILELIELVENELKTPVQAAVKREDEQEFARLNGQNLMFCEDAARKLKALLNQQTYSDFYVKINHYESLHAHDAVAYAVKGVEDGYSV >CP031759.1|AXQ96910.1|719117_721439_+|aerobic-respiration-two-component-sensor-histidine-kinase-ArcB MTENSFGSWARILSNLVEKYGNKRAFAIAYAFTLFVAVILSCMFYYVALGVVEIVDISALFFLTAVIAPALIMMSVAAMREVHSSKAYLESATQQEKMLNQTLKDNINRLNSEIDERKIALHAKHRAIDELRKEIAERKKTQQELAQQGMLLRSIVDSSPDLFYYRDENGVFAGCNKMFELVMGKSSEELIGKSVEQIYSKQYLPKVLETDSQVSETQQPLTLDVEYPVKGEPRWFEMRKLPFINDKGEYIGLLAFGRDITSRKEAEQALETAYKDKGKFIATLSHELRTPLNGIVGLTRMMLDTDLTAQQKSWCNTVFSSAETLGNIFNDIIDLDKIDREQLDIATDSINVSDFINDVVNFAGLIADQKGLEFTINRSGVLDVYALLDPTRLRQVLWNLINNAVKFTHKGNVTLECRRENRDDGPWLTISVIDTGMGISEDQLERIFEMYYKAPDASGSNAIGSGIGLAVTKALVQAMQGTIAVTSQEGKGSRFDVEIPLQLCNAPKEQSYAGRSLYILLVEDVPLNAEIATNLLEQRGHEVIWAETGEDALSFVETEDDLDLILLDMQLPDINGDVVARQIREDSHFDHLPIVALTANVRSAEQELEGINVQGALAKPINTTKLDKMLAELFGIEAQKNKQSIDIREALSQPEYSDLDIETICDFVESMGAAAFQRSCDLFTKLNPKYCQELREAVAQNDIEEYGAVAHKVKGAAGSVGLQLAQLQAKKMELESEGKEVKTLLDWVSELEAKIEEGQEALHPLIAKLAEDQ >CP031759.1|AXQ96911.1|721445_722165_-|two-component-system-response-regulator-ArcA MQTPVILIVEDEDVTRLNLVSLFEAEGYKVIEAIDGDDMHDKLTSHDDVNLVIMDINLPGKNGLILARELRQKKNIGLIFLTGRDNDVDRILGLEIGADDYITKPFNPRELTIRARNLISRTGSSAEESTIDSNGVITFNGWELDENSRCLTSPTGDSKRLPKGEYRALRLMLDSPGRIFSREQLIKHMTGRELRANDRTVDVTIRRIRKHFETDNNTPELISTIHGEGYRFIGKLDAQ >CP031759.1|AXQ96912.1|722272_722794_-|YfiR-family-protein MRLINLVILLLFVSLNTAAKSPDQVRSAFLYQMAKFVEFADENTKTSIQFCFYSLESGPASELKSATKLNVRGKPIELVEAKKTWSYSELSSACDITYIDETSENDILSAWTDTIESNMLTVGESIEFLERGGIASLVQEGSKIRLYINKQALEKQYFIVRSRLLAVSKFHPN >CP031759.1|AXQ96913.1|722790_724413_-|sensor-histidine-kinase MSKQLTKTSIRKVLISAVMLVTALCLSLSISISTYLDVKEQKQLIINKIEMIADIVAFNSQITILFDDRKTEDARLKSFQQVDIIKNIHIYAMDDVTNSPVFFTSYNASRTPPVPLKVNQIEELKTPKVSEDYIELIKPVIYEGNIEGYVYVRGGLERLSNYINKKILVDIALTLFVLLLVLLVSRGIQKRIATPIEGLSALLQDVSKNHNYSARAPGSNIAELNVLANNLNIMLARTENQLERHKADKQEIKQLNQSLEEKVNQRTIALREANQELLNALERMHQYQNQIIENEKMASLGQMVAGVAHEVNTPIGLGITGSTLLRDKLSDIREAFQTKSLTSKQLERFVNDGIENLDLIYRNLNRAAELVSSFKRLAVSQDLEVNSQIDLSNLLTEVVASMRAELSTKQPEVTIDCDTGLAIESKAGPLQQVLEQLISNSLLHGFKDQQNNSISITVKSSMGQLTIEYADNGMGVPKAIKKRIFDPFVTTRRGEGGSGLGMHLVYNLVTQALGGSITLDEEFSQGAKFIITLPLSGNLK >CP031759.1|AXQ96914.1|724577_725606_-|methyltransferase-domain-containing-protein MQFTNPSLLLLRNEEELIASNILVINHQRDGFLRELKALNPSSAIHAFSFDFADHLHADKIADVKSYVAHQLPQLQNIDLVIYYYPKSKPEAQMVFDNIRHLSTAETRLLVVGENKSGVKSAEKQLKEHAAHCYKLESAKHCILYEFDQLTANPSFDVSHYVQTFSVRIAKTEFTAASLPGVFNHGKLDAGTQLLLENVTLPYKGKVLDFGCGAGLIACYALLNSPTLKFTCLDVNALALFATQQTLALNNLSATLLLSDGLSELNGKFNLILSNPPFHTGLSTDYDIAEQFLHNIKRHMDTKSNIQLVANSFLKYPPILEAQFEQFEVVTKNTKFAIYKAQ >CP031759.1|AXQ96915.1|725691_726417_-|tRNA-(guanosine(46)-N7)-methyltransferase-TrmB MNESSKSALEQAQEEGKYIRKVRSFVKREGRLTKGQAASLEKCWPAMGLEHQQGLLDFTEVFGNSNEVVLEIGFGMGKSLVEMAKNNPQQNFIGIEVHRPGVGACLMDADEQGITNLRVFEHDAVEILADCIADGSLAKLQLFFPDPWHKKRHHKRRIVQLEFAEKIRQKLKVGGVFHMATDWENYAEHMLEVMSAAPGYQNQSQSNDYVPRPDFRPLTKFEQRGHRLGHGVWDLMFKRIS >CP031759.1|AXQ96916.1|727687_727960_+|oxidative-damage-protection-protein MARTVFCQKLQKEAPGLDFQLYPGEVGERIFNNISKEAWQQWQHKQTMLINEKHLNMMDPEHRQMLEEQMVGFLFEDKEVEIEGYRPPEK >CP031759.1|AXQ96917.1|728024_728996_-|octaprenyl-diphosphate-synthase MDIKTIQNLVEQDMLDVNQLIHQQMQSDVALVKQLGLYIVNSGGKRIRPMLALLAARALGYEGDKHITLATIVEFIHTATLLHDDVVDESLLRRGEPTANAEFGNAASVLVGDFIYTRSFQLMVGLGNMEVMQILADATNIIAEGEVLQLMNCNDPDTTEKSYMQVIYSKTAKLFEAATLLPAVVLEQSDEIKTALKLYGMHLGTAFQLVDDILDYSANAELLGKNIGDDLAEGKPTLPLIYAMQHANTQQTAQIRTAIESGNGLDHLEDILATLAETKALDFTMAKAQEEAQKAIAQLSVLPDSVHKEALVALAKLSVDREY |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP031759_3 | 2483083-2483194 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP031759_3
|
1 spacers
spacers of CP031759_3
>3.1|2483114|50|CP031759|CRISPRCasFinder CTAAAAGCCATTACCACACAACATCACCACCCGATATAACCAGCTTTGCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP031759_3
The CRISPR arrays of CP031759_3 >merge|CP031759|3|2483083-2483194|CRISPRCasFinder TCGGAGTAGGAGCTGCTTTACGCAGCGATCTCTAAAAGCCATTACCACACAACATCACCACCCGATATAACCAGCTTTGCATCGGAGTGGGAGCTGCTTTACGCAGCGATCT >CP031759|3|2|2483083-2483194|CRISPRCasFinder TCGGAGTAGGAGCTGCTTTACGCAGCGATCT CTAAAAGCCATTACCACACAACATCACCACCCGATATAACCAGCTTTGCA TCGGAGTGGGAGCTGCTTTACGCAGCGATCT
>CP031759.1|AXQ98328.1|2482132_2482564_-|hypothetical-protein MPLLSYVRHTATADDTTYQGCTITRAQLFGRIFSVLSALMMFNTALLFTGMLGDVAELEVLFADNSLPDSVLVMLGAFWAQPILSLQLLIGLYWLVFHTILPTRAGVVLRKTAFASTEAIQPQPVPSAHGCRAPPFGYRCLFA >CP031759.1|AXQ98327.1|2480910_2481819_-|ubiquinol-oxidase-subunit-II MNKRSVVNYAFASLGLMLTGCSGGILDPKGQIGMDEKSLIIIATVLMLLVVVPVIILTLYFAWKYRDGRDHEIYAPKWAHSNKIEAVVWTIPIVIIIVLGVITWRSTQSLDPYKPLEGKGEHLTVQVVSLNWKWLFIYPEQGIATVNELVFPANVPVEYKITSESTMNSFFIPQLGSQIYSMAGMETQLHLIANEPGTFKGFSANYSGAGFTGMKFDAIATKDKASFDNWVADVKANGEALTAGRYTQLAEPSEYHPVEYFGSVEQGLFHTIVMKYMQGHGEMSYYAKPEHAAHPHHGKAEE >CP031759.1|AXQ98326.1|2478925_2480908_-|cytochrome-o-ubiquinol-oxidase-subunit-I MSLFGKLSIEAIPYHEPIIMVTLAVVAIVGLIVAAMVTKHKKWGVLWHDWITSIDHKRLGVMYIILALIMLMRGFADAIMMRTQLAMATSGAAGYLPPEHYDQIFTAHGVIMIIFMAMPFMIGLMNIILPLQIGARDVAFPFLNNLSFWLTAGGAILINLSLAFGEFAKTGWVAYPPLSELSFSPGVGVDYYIWALQISGLGTLLTAVNFLVTVFKMRAPGMTLMKMPIFTWTCTWANILVAASFPILTAVLAMLTLDRYMDFHFFTNEAGGNAMMYINLFWAWGHPEVYILILPAFGIFSEIISTFTGKRLFGYKSMVYASGAISILGFIVWLHHFFTMGSSANVNAFFGVMTMVIAVPTGVKLFNWLFTMYRGRLRITVPVLWTLGFMVTFTVGGMTGVLLAIPGADYVLHNSLFLIAHFHNTIIGGAVFGYLAGFAYWFPKVMGYKLDERWGKASFWCWLVGFFVAFMPLYVLGFLGMTRRLNHTNTPEWNIWLYIACIGAFIIMFGIVFQVVQLVVSYKNREQLQDTTGDPWNGHTLEWSTDSPPQYYNFAKTPVVDDIDAWTEMKEQGQAYQKPAHYQPIHMPKNTPAGVLISASLTVFCFAMIWHIWWLAAVGFVSAIAVFIKRCYTRDVDYYVQVDEIEQIESAHLSRALQEG >CP031759.1|AXQ98325.1|2478301_2478922_-|cytochrome-o-ubiquinol-oxidase-subunit-III MSAITPATLHALEDAHEHAEHDTGSNTVFGFWLYLMTDCLLFASFFATYAVLYMNTAGGVSGKDIFELGFVAVETAALLLSSITFGFAMIAANKQKKLQTLSWLAVTFAFGAVFIGMEVYEFHHLIVHGHGPQHSAFLTSFFSLVGLHGMHVTAGLIWMTVMMIEVTRRGLKPQTVTRLSCLSLFWHFLDIVWICVFTVVYLMGAM >CP031759.1|AXQ98324.1|2477942_2478302_-|cytochrome-o-ubiquinol-oxidase-subunit-IV MSHSESQALAQMDVHEHEHDSHGSVKSYLIGFVLSVILTAIPFAAVMSGSLSSSTTFWMLVTTALVQIWVHLKYFLHLNFVTEEGKASTLSFIFSALIIVMVVGLSVWIIYESNAMMMY >CP031759.1|AXQ98323.1|2477050_2477929_-|protoheme-IX-farnesyltransferase MLRRYFQVTKPGIIMGNLISVAGGFLLASRGEVDWLLFALTLLGLSLVVASGCVVNNVIDRDIDAAMARTKTRVTVTGEISSVAALSHSLVLGLSGFGLLAYFTNWIALSFAAFGFFIYVGVYSLYMKRNSVYGTVVGSLSGAVPPVVGYCAVSGVFDSGAAILLLMFCLWQMPHSYAIAIFRFEDYRVANIPVLPVAQGVEKAKHHIVLYIAIYALVVMLLPLSGYTGIAFMAVACTTSFWWLLMALKGYQRDLDLHGWARQVFAFSIVNIIVLSIAMAIDNHSTVSAMLY >CP031759.1|AXQ98322.1|2476436_2476664_-|hypothetical-protein MDIGITEVLLLFTAIFIASFLLFKVVLWAKKMPKGAYLFLALMPLISLFPIPPPVFKNVAKAKQEQRKKAPKSEP >CP031759.1|AXQ98321.1|2476104_2476416_-|GTP-cyclohydrolase MPASIFIVNLTYITEIEQVEPLLAPHIAFLERFYANGTFIASGRKIPRTGGVILAKASSEAELLDIVRQDPFYVAEVARYDIIEFVPSKFTSCFTEVEKYINS >CP031759.1|AXQ98320.1|2475584_2476115_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MSTKRQQLIDCAMGLFYQHGIHAIGINEVLKSSGIAKKTLYNHFESKEALVLATLEQRHHLFISWLSRCLENAQTNEQLTEQLFSALDQWINNKVAVLGDFRGCYFINTAAEFGELTNPINQLCQRHKLAVKALLKQALNDADDAAVERLFLLSEGIISTAYTCHDTGVAKRALKN >CP031759.1|AXQ98319.1|2472898_2474872_-|DNA-helicase-IV MAATELLCLIYQLIALHLFSRLFYGVRGAKCTKEGLHLKSKSADSFIPFSAMTVPPAPQRGWFAQKVQIKQGHETYVLSVKNQGADELVQQLQRLWILHHGKHLQVKVRKIEQLLKHRYLSHHNQNVAGHVCSALWSSWQHLDDSVIPNSLKSQVATVREIALWSEREIAEFQSAFVDHYLAKDANYFDKIESNPLTVAQRMACVIQDDRQLLLAGAGTGKTSVIKAKVGYLLHRKLAQANELLLLAYGNDAATEMRQRCQPLCDTLNCSTFHSLGMQIIEAVTGEKPTISNLATDKKLLKQFIADTIHSLRQENHFERDFTVFLEGTGIQQASQAIDLISQVLPLMKHAQIMREVEQLLTQFSKQMSVVMPILAEYQLYLANESSIDFDDMLERAIYYVESGQFISPWKFILVDEFQDISRVRAKLIQALLDKKSGSQLFAVGDDWQAIYRFSGGDMRLTTEFSKYFGKSTTTYLDKTFRYPQTILDTASEFICRNPEQITKHITSHTAGVAGQGVVKVVVNDELSQAQQLLTLIEQRNEGKTSVALLARNHRALPDKSKIAQWRQLYPQLIISSNTFHGAKGTEADFSIVFGLQHRNFPSQVKTPAFVDALLPAQGAFPDAEERRLFYVALTRAKKQCFLLAPNDAPSYFLEEIA >CP031759.1|AXQ98329.1|2483240_2483696_-|flavodoxin-family-protein MKTVVIYSSSNPNGNTYQSAKALAEEKRAELIYLDRYKIGEYCYKHSHSDDDFVNLFRWVLGFEHIIFASPVYWYAVTPRMKAFIDRITDFMDIEALKPELRALREKQFSILSTSCQEKAPAPFTEMLVGTFEYLGMKLQEQRHVHYPYAD >CP031759.1|AXQ98330.1|2483777_2484284_+|redox-sensitive-transcriptional-activator-SoxR MKTEKLLRDEPNLSVGKVAQRADVAVSALHFYENKGLIRSWRNNGNQRRYKKDVLRRIAIIKAGQKMGITLGEIKETLDTLPDSRTPTKADWAKLSRAWQTKLDEKIAYMQRLRDYVDGCIGCGCLSMKSCPIYNPDDIVAKEANGAVWLDEPDKANKAKSCYDSENH >CP031759.1|AXQ98331.1|2484297_2486082_+|DUF885-domain-containing-protein MKKTALCMALAMSMGLTGCSLSPSSVETTPSASQQTVATNAQFADFSQQFINNLWKQYPEASLWAGFGKYDDIITVPTQATRDASVAFSRAQLAKLQQFDLANLSNSQKIDYHLIENRLKRDIWHIETFKSWQWNPSNYNVSYGFATILNSRFKTDDEKLKLVLARLQYVPAYYEAAQNNISNPTLEYTQLAIAQNQGAFSVLNDELLDKLATSLLTAEEKALFKQRFAAAKSAINGYVSYLTNLEKELSESGNARSFRIGEKLYEEKFAFDIQSGYTAKQMYEKAMADKTRVTNEMVKIVDQLWPKYFADKPRPESDIDAIATLIKHLSVKHVKRENFVSEIKAQIPELEKFVMEKDLITLDPEKPLVVRETPEYMRGFAGASISAPGPYDKKENTYYNVSPLDSMSDEQAESYLREYNHWILQILNIHEAVPGHYTQLVYSNESPSLVKSILSNGAMIEGWAVYTERMMLEEGYGNFEPEMWLMYYKWNLRVICNTILDYGIQVKGISKEEGLDLLMNGAFQERAEAEGKWRRATLSQVQLTSYYSGYREIYDFRETQKQKLGKEFDLKAFHEEFLSFGSAPVKYIRQLMAK >CP031759.1|AXQ98332.1|2486228_2488388_-|S46-family-peptidase MRIKAISAAMVLAFSQYVAADEGMWQPHQLPELESILKSKGLEIDAKSISKLTEFPMNAVISLGGCTASFVSPKGLVVTNHHCAYGSIQYNSTTDNNILENGFLAKQPSEDLPAAPGSRVYVTKEVSNVTDKVNAGTDSLTGKARFDAIDSKRKQLVAECEQDESYRCNVYTFHGGLEYYLIKSLEIKDVRLAYTPAMGVGKYGGDIDNWMWPRHTGDFAFYRAYVGKDGKPAEFSKDNVPYNPESFLSVNAKGVQEGDFVMVTGYPGRTNRYRIASEVDYVFNTVYPMVRKHNSKYVALIEENAPEGSQARIAYESTIAGYNNYIKNFGSMIESFKKGSMYSRKQQFERDLSTWINADADRKAKYGAVLNELSELVAQSQSHYERDMMVGYIHRSQMMSTARQLYRLAVEKQKPDAERESGYQERDMPKIKAGLQRMTRRYDETVDKAIMLYFMELYAALPKEARLAEVDKQLQLENGFNKAKHQALLDEMYANSKLADEKARLWMLDLELEQLNQSSDPFIQYAKAIFAVMKQIEDEEKELAGKQQSARPALMEAIIAYNKSQNKPVYADANSTLRVTYGTVGGYSPQDGLVATPFTSLEGLLAKNTDVEPFNAPKKQQQLIREKVYGQYTGGMNTVPVNFLSNVDTTGGNSGSPTLNGKAELVGLLFDGVYESIIGDWDYDKNLNRSIHVDSRYMLWVMDKVDNAQNLLDEMKIVK >CP031759.1|AXQ98333.1|2488539_2489067_-|hypothetical-protein MNNKPYTVLLAVILLCSCSSHTELEKLNIGISAYEKSDLMVKLIFDEQFSPPAGAVGGGWGNAVGSGTFWGAEIPYKVKAQWWDYKQGKHYRAALTVQRDKAYKIAGNLPSITHYTGETETDVEPYIIFGFGEKGEVKMWISNAPFDGVEGRILEEIGSAQAAWEPFELTEEMFR >CP031759.1|AXQ98334.1|2489137_2489668_-|hypothetical-protein MNNKLYTVLLAVILLCSCSSHSELEKLHIGISAYEKSDLMVKLIFDDRFSPPAGAIGCCWGNAQKKGVFWGAEIPHKVQAEWWDYKQGRHYNAEFSVQRDKAYKIAGNLPSVTYYTGKTETDVDPYIIFGFGEKGEVKMWISNSQFASGVKGRILEEIGSAQATWEPFELTDEMFN >CP031759.1|AXQ98335.1|2489664_2491731_-|DUF2235-domain-containing-protein MKIVEEKHNWLIDQQIDELEVLAPHTTTAHLPLEIRTQLKPHASDWIVLQQRHNWRHVKRDEFTRVFIKTKKGLQSVRSGSAAGSREQLIIVKRKSYFKAEIRNNAFTSSGGVDPNQPIGASQLDPLTPVEQVLASINVDKSPEVAEKRILVSLEGELAVSFVIQGANTPTLSRASEGATQTPLIFGKLSEDGRYSLKAKILGVPEQVLFNNVPYADLLDIEKVKSLKIGAEGGVQLIKHRVSGEGNIHLYFISEPPSIGIFFDGTGNNKYNDILDPFDDKEPTNIAKLHELYENEGKFTTSSYIEGVGTSAGKKDSTIDLAIAYSFDERLIEAVSDLDKFINNNGLIELCNTLLVDCFGFSRGAAAARAFVNLINEMREKQDTKLANKEVVFRFVGIFDTVASIGGDGDNDHGELYARDELDDAARLDLNQASAGAVYHLTAWDERRDKFPLSSLKNKGGSLFANHKEDYLPGVHSDIGGGYAPISIDIEYPLKRIRGIPGNPEHEAKVQQEKLAIEHKYQWPGINVDMVYRFKRLRYGASRSGRDKDFYTTYRPVWRRKIDNTLAHFGLHQMYNEAVQHGVPLRAMARLQSIYPYELSNEVATLVPKALKAGPASQAWQKLYEHYIHISSRFTGAVDKMAHGAERKAKYATENGQREMFYNNAKALPQVQIWKAYKNGNKSIWRKG >CP031759.1|AXQ98336.1|2491978_2493574_+|ABC-F-family-ATPase MLSCNNITMQFGAKPLFENISVKFGDGNRYGLIGANGCGKSTFMKILSKELEPSAGNVNYDPNERIAKLNQDQFAYEQYTVVDTVIMGHKELWEIKQERDRIYSLPEMSEEDGMRVADLETQFAEMDGYSAEAKAGELLLGVGIPTEQHYGLMSEVAPGWKLRVLLAQVLFAEPDIMLLDEPTNNLDIYTIKWLEDVLNQRDCTMIIISHDRHFLNSVCTHMADIDYGDLRIYSGNYDEYMFAATQARERLLSDNAKKKAQIAELQQFVSRFSANASKAKQATSRAKQIDKIQLEEVKASSRQNPFIRFEQEKPLFRNALELISLSQGYDDTLFSDLNGLVEVGEKVAIIGENGAGKTTLLNTLAGRKAPQAGEYKWSENANIGYYAQDHADEFEKDLDLFQWMEQWQQPGDDEQVVRGFLGRMLFSQNDIKKSVKVISGGEQGRMLFGKIMMHKPNILLMDEPTNHMDMESIESLNLALEQYEGTLFFVSHDRQFVSSLATRIWEIKDGKITDFHGTYDEYLAKKAAEAV >CP031759.1|AXQ98337.1|2493726_2493957_+|hypothetical-protein MERLQNMYSIMLLSKLKASFPESCDINHHTFSLPHVDQQLLEDVVTTHLNEGLIQADGRDQYSLTTKAIALFGEDK >CP031759.1|AXQ98338.1|2494082_2494844_-|peptidylprolyl-isomerase MFKLNSLLLASTLLGSFAANATIVEFQTSHGSFQVNLFDESTPKTVENFLKYVDNGRYSDTVIHRVIPDFVVQGGGFKYEGDVPLDAIATYDAVKNEPKWSNVKGTIAMAKVANRPDSATSQWFFNLVDNSKNLDVDNGGFTVFGQVTGDGMEILAAIAKIPRCGNVPLVNFTDEQCKDSNSEPGAANFVTINAITVLDDDPKSAQGLSPKANTLIDQVPDKPSTDSDSSGGSMFAGLMLLAGIVGFRRRFHR |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP031759_2 | 2.2|713686|71|CP031759|PILER-CR | 713686-713756 | 71 | CP031759.1 | 713145-713215 | 11 | 0.845 |
CP031759_2 | 2.2|713686|71|CP031759|PILER-CR | 713686-713756 | 71 | CP031759.1 | 713257-713327 | 11 | 0.845 |
1. spacer 2.2|713686|71|CP031759|PILER-CR matches to position: 713145-713215, mismatch: 11, identity: 0.845
taagggcgatgctctcccaactgagctaacaacccaaattgtgtttcaatttatactctt CRISPR spacer taagggcgatgctctcccaactgagctaacaacccaaattgtgtttcaatttatactctt Protospacer ************************************************************
2. spacer 2.2|713686|71|CP031759|PILER-CR matches to position: 713257-713327, mismatch: 11, identity: 0.845
taagggcgatgctctcccaactgagctaacaacccaaattgtgtttcaatttatactctt CRISPR spacer taagggcgatgctctcccaactgagctaacaacccaaattgtgtttcaatttatactctt Protospacer ************************************************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1946375 : 2014137
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP031759|1946375:2014137|DBSCAN-SWA 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>CP031759|1946375:2014137|1967182_1968334_+|AXQ97916.1|DBSCAN-SWA MFLAATKLAVHRQQLKSLWRHYQKFNARQVVETGRLHALEKQLLNHVYTLAATDDEHWINRSQLDCIAHGSIDDVFTLTQEIDSPQLLLLINHLFGTRALEDQASEIITAINSEPALAELLIHNLSAWRIDFGDALRQRILSTDENWPTSLIYLAFSTANLSRHQLMAALEHSNPEIAYTALVNMWLCNTEQLSEHLVKRFAMTDDAALKAKLLQLAGLLDEPKWDEPCLLYCQHNPSYIAEVFPYFSHTRSLQNLVKLLEVPGTARPAYEAWKQITDLDLLEEFAISDAQTGVKSQKSQKLPSFKQAEYERQALITANIQHQLAGRKVSEPAAWLQQGLAGLAIQRKLSKISSHALGAALFYMPMAYLQWQSVKQELNHASE >CP031759|1946375:2014137|1960981_1961944_+|AXQ97912.1|plate|DBSCAN-SWA MEQQNQPIWAKLPEPIAKLMATPWRFSLYKALTLIEQHWASNNELQSGHSHRVEIAPYKELGFPASDVRRCELQVRQRGKLRLETSFLGLYGVDAAMPHYLLEQAAGDEEVGARTRAFLDLFNHVLYCQLFQSWKKSQINLAGIGAQQFDQIVAAVFENNQLDKSKLNLISAKQTSAAGLEQVLKQALQDESLTLKDNIVEWEGITEAGKLGSKQSGFSLGGNGVLGKRVLVTGNRICIELGPMDEAEAQLYEPGGVKAKRLSQLLNWHTSTKMNWQLLVQINRQAREGTRLGAGKLGVSCAIGKVNARVEKKIYSQSQF >CP031759|1946375:2014137|1992948_1994280_-|AXQ97932.1|DBSCAN-SWA 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47 | Leptospira_phage(22.22%) | transposase,plate,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
2033460 : 2044314
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP031759|2033460:2044314|DBSCAN-SWA 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CTGTATTTTTGTTATTTTGATAGATAACGCGTGTTCGCCAGCCGCGCTTACCGTTATATGACCAACCATGTTTTGCAACTACCTCATCAAATCGCTTTCGAAATGACGTTAGTGTTTCACCTTGCTCAATAGAAGCTACTACTGACTTATATAGGTCATCCAACAGCTCTGTTTTTGTAGCGCCTGCAACTGTGAATGCTCGCGCATGAATATGGCCCTGTAGGTCTTTATATGACTCGGTGGGTATTTGGATTTTTTGTTTAAGGTTGGAAATGGCCTCATCGAATTTAACGAGTTGGCCATGCTGGGGAGATAAACCTGGCATATGTGCCCTACTTACTCAGCAATTTATTGGTTTTGTCCTTTGAACCAAGGCTGGAACCATAGAAAAACTGCAGGATTGCACCAAGTGTGGTGCCGAGTAAAAAGCCTAAAATGGTATCGGCATAGCGCCTTGCGGGCTCTGCGATATCAATAAAAGTAATACAGCCTATATAAATGAAGGTCGCCACCGTTAAAAACCACGCGTACTGGTAAACAAATCGCTTTGCCATTTTGTCATCTTGATCTAGCGCTTTGTTCTGCATAGTCCGAGCGCTATCCAAATTCTTGAATGCCAGCTCGGCTAGGTTCTCTTCCTTATTGAGTACCGCGAGTCTAAATTGGGTTTGTAACTCGCCACTTTTGCTTATCTTATCAAACGCCTTTGTTGCATCGCCTTCGCCCGTGAGGGTTTGCGCCATATCAACAACTTTTGTGGCTACCTCCGCGCCATTATCACCACCAATCCATTGGCCAATTTTTTTATCTAGGCCGGTTAGCTTTGCTAGGCCCAGTGCTATCGTAATTGGTTCCATATCTCACCTCACAGCTTAGCTATATCAAGTGAAACGGCGTTGTCGTTGCCGTGATCATCTTGCTTGTAAAAGCGAATAAAACGGCAGCTATCAATTGACGTTACTGACTCTGCTAGAATGTCCATAGCCTGCTGCCATTTTCCTGTGTCGTCAGCTATTTCAAGGCGGCGCAGGCTCAATATGCGCTGCGGGTTTAGCGTACCTTGCTTATCTGTTGCAAATACCTTGTTCACAATGGCGCGAATGTTCTGGTTGCCACCCTCGGTCCATTCATCTAGGCATTTATCAATGAGCTCTTTTGCTAGCTGTAGCTCTGGGCCTAATTCAATGCGCTCTTGCGCTTGTATCTTTACCGCTAACTTGTTGTCGAACGAGCGCAGCGTTACATTGCCTTTTTTACCACCCAGGTTAACGTCGTATTCTTGTGCAAGCAGCTCCATAAAATTGTCGGCTTGTTCCATCTGCAAACGCTTAAACTCGGCAAGCTCCTTTTGCTGTTTTTCAGCCAACGCTACGGCCTGTTTTACAAACTCGTCTTTAATTAGGTCGGTTTGCTTAATATTGGCGATGGCGACGAGGTTGCCCTTGCCGTCTTTCATGTAACCTTCAGGTATATTAGTCATCGTTTATCTCCGTAGAATTGGCTTCATCCATCCCTTGTAAAAACTCCAGTTCAAACGCTTTACTGGCTACGTCCGCCAGTGCGGTACCACTGAGGTTAGGGAATTCAGAAAGGATTTTGTCTTTTAGTTCGGTTAAGCTTGCTGAGTGTTTGGCAAATTCAAATATCTTGGCAATTTCCACATCAGTTGCCTGGTCAAACTCATCAAAGGAATTCACATCCATGTGGTTGCTATCCTTCGCTGCAAAGTCCTGTTTTGCAGCCGTGGCAATTCCAGCGCCATCGTCCCTTACTTCTAACACTGCCTGACCTTCCTGTGGCTTTGGTACTCCTAGTGTTTTATAGGCGTGATCTTCCGTTACTTTTATCAACTTGGCGGTTTCTCTAATGACATTAACCGCATCTAGATTGATCTCTTTTTTGTCTCGCCAAATGTATTTGGGCGGCTCGCCACCATCAAAATTCACATGGTGAATAGCCTCTAAAATTTGATTGCGATAACTCGATACACGTGCCCTATCCGCCCGTTGGTTTTCGCCTGCGCGCTTAGCGTGTGTTTCGCTCGCCGCGCGTGCGCCAGACTTTTGCTCGGTTGCTAACGTTTGTGAGGTGAGTGCTTTACTCATCTCGGCATTACACATATCTATCAGCTGTTTTTGTACGGGCTCACCGCTGAGCTTGCTTTCGATGATTTCAATAGACGAATCATCCGGTATGGTCGCGATACCATCGGTAATGAGTTTTGCTAATCCATCAATTAGCTCATTCACTTGGTCATCCGTTTTGCCGATAGGATGTTTACCCACTGGAAATGGCACGCCAAAACGCTCGCAAAGCTGTACAAAAAACTTAAAACCACCATGCTTAAACATCCACGGCCAAAAGCAGCTACTCAATAGGGCTACTCCGTACGGGTTTTTGGCGCTCGGCATGTGCCGAACACACGTCCAGCGCTGGTCTACCAACTCCTCGCCGTGCGGGTTGTCGCGGGTTTTGAGTAGAAGTTCGTGGTCGGGGGTAAACACAAACCGGCTTGCTGGCCACATCTCTATTCTGTTTGGTAGCCAAGTGTTGTCTTCCTTTTCATAAGCGCCGAGGTGAGTTACGGCAAATCCGTGCAAAATAGCGCTGTAGTTGTGCCAGTCTACGTCCATCCATTCGGTGTTTATTGCAGGCTTTCTTGCCATCAGCGTCTTTGCTAGCTCATAGCTCTTTTTACTCACTGCGTCGTCACCGCCAGGCACCAATTCAGCCGTAAACGCAAACATGCCAGAGCACAGTGTGCGCAGCTCACCAATTACATGCGCATCAGCGGCAATTTCGTCATAGATGAGGGCGCTTTTACCTGCTTTACGCAGTATTGGGTCTGGGTTAGGTAGTTCTCGCATCATGGCCCAGTGATTTGGGTCACTTTGGCTCATGTTGAACATTTTTTGCAGGGCTCTATAACCCCGATAACTTAAATGAGGTTTAGACATGATAGCCCCCTATTGATTTAGTCACTTTTCTACTGCGTACTCTGGGCATACCACCTGCCCCCGTGCTGGAAATCATCCATAAGATGGTGAGCGCACAGCTCAAGTCGTAGTGGTGTGTACTTTGTTTATCGGGCCAGTTTTCTAGCTCATCCATAACCAGCGGGCATTTTGAATTAAACGCAATTTGGGCAGGTACGTTGGTCACAAAGGGCTCCAATCCCTCTATACGTTCTTCCTGGCTTACCGTTGCGGTTACACCGCGAAGCGGCAGTGCAATACCTGCGTCCAAGCCACGCTTTATATAGTCAGTGCGCATGTATTCAAAGGCGTTGTTATTCTCAAACCCCCACACCAAACAGTTGTATTCACGCTGTAGGCGTATCAGGTCATTAAGTAGCTTGCTCGTGCCTCGCACCTTGCGGCTTTCGTATTCGATATGTAACTTGCCAAGTTCTCTGCTAAAGAGGCCAATCAATAGAGCGCTGGGATCTGCACCCGCAGATTTGCCCATACTCGGGTCACATGCGCCATAGGGGAGCCACGTGTTTAAGCGGTCTACCCAAAACTCAAACTGGTAGAAAATTTGTTCTTCATCACTTTTAGCAATACCCTGCATTTCACGGTTAAATTCGCGCTTGTTTGACGCCCACATCACCATTAAGTCATACAGGCTGCGCACGCTAGGCCAGGATGTTTTTGAGCCTTTACTCATTTGGCGTTTTTGCTTAATCCAAAACTTAAACGACGGTTTATCTTCTTTGGCTACAGCTTGGCCTTTTGCTGCCGCTTTTTTCTCGAACTCTTTGTCTCTAAAAAGCATCAAATCACGGCACTCTTCCCATAAATCCATACGCTCAGGGAATTGCTCAATGGCTTTAAAGCGATGTACCAAATGGCCAGGTGCGTTTTCAGCACGCGAGATTGGGTCGTCGCTGTTTAAAACCGTGTTTACACCAAGGAATTTTACCGTGCCGTCAGGTGGGCCAAGGTATTGCACAGCGGCTTCTAAAAATCCCCAACGTGAATCTCGCTCAGTGGCTGAGCGGGCTTCTTTATCCGTGATAATGTCATCGGCCATGAGTAATTTGGGGCGGCTAGCGCCGTGGAATGCACCACGAACAGACTGCTCAGCCCTCGGCTTTCAAAGCGTACGCCTTGGGCGGTAACAAACTCGCCTATCTTCCATGTGGGGCTGGTTTGGCACACCTCAGGAAAGTCCAAGAGCAAATTATTGTTCTGCAGTAACTCAGTTTTTACCACTTCCAGTGTTTTGGCGGGCATCTTGGCTTCAGCGCCAAACAAAATCGCGTAGTCAATAAAGAGCGAAGGCTTTGGTAAGTCCAACTCTTTGCAAACATCATCCTCTTGTAGCAGAGCCAATACCGCCACATAAACGGGTGATATTTTCACGCCCAGTGTTGATTTACCCTCACCACGAGGCGCAACAAACCAGTTTTTCCAGCCGTTGGTTAGCTTTAGGGCCTCAGGGAACCAGTTCATAAAATAACGCTGAAACTCGCTAGGCTCTTGCCCCTCGTCCAACCACATATGGTGCGGAAAATACGTATACACAAAAAACTCAAAGTCCCCGCCGAGCACGCGCTTACGTCTTTCTTTTATTGCCTCTGGCTTGGGTCTATGTCACGCTGCTTAGCCTCAATGTCTAACCTAAGGCCTGCGGTGATCTGCTCAAGCTCTGCCAGGAACTCTTTACTATTTAAGTCGCCCATCAGTCATCCATAATGTTGACAAGCTGCGGGCCAAACGCAGTTAAAATCACAACCAGTTGCGGAGAAAAGTCAGGGTGGTGCTTGCTTACAAATGCGGTCAGTTTCTTGATCACTTCTACCGCCACTGTACGGCGCTCAATGGTTTTGTTACCCCGCTTAGCTTCATAACTTTGCTATACATATCACTTAACTGAGTGAGCACTTTTACCCGCTCAGCTGGCGTCATGGCGGTTTCTGGGTCTCTGAGTAGGCTAAACGTTTCACTGGTTTGAATGGTAAATTCTTCAATAAAGTCTTGAGTAAACTCCCCTGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP031759|2033460:2044314|2043897_2044314_-|AXQ97979.1|DBSCAN-SWA MDFNLFNQLKRHEGEHLTVYNCPAGYATIGVGRNLEQRGISEAESDYLLSNDITEFTHAVRSNINTEKCNPAREAVLINMAFNLGITGLLNFKNTIAAVEDGDWELAAHEMLNSRWAVQVGNRADELAEQMASGEWYL >CP031759|2033460:2044314|2037647_2038784_-|AXQ97974.1|head|DBSCAN-SWA MPGLSPQHGQLVKFDEAISNLKQKIQIPTESYKDLQGHIHARAFTVAGATKTELLDDLYKSVVASIEQGETLTSFRKRFDEVVAKHGWSYNGKRGWRTRVIYQNNKNTARAAGRWQQQERLKHRRPYLLYLTAGDQRVRTEHKKWHYILLPLDHKFWDSHYPPNGWMCRCKVVSLSDADIKRMGLTVTPDNVVDPLLKPFKVADPQTGEELEKLTGIDLGWNYNPGKAWLGADKATGEMLGRLDNNLREVATPIFNEIINQGESHFKKQMATAAAKQVLNKVDSGTAFTLGQMQSKVFDHIIKVAPQTKSTLIVIEHSVLMTAINLLGFEKASELMRIVQTGEFISFNKSVVKLAIDGVMITVQIGSDFNRVVALNKI >CP031759|2033460:2044314|2039931_2041416_-|AXQ97977.1|DBSCAN-SWA MSKPHLSYRGYRALQKMFNMSQSDPNHWAMMRELPNPDPILRKAGKSALIYDEIAADAHVIGELRTLCSGMFAFTAELVPGGDDAVSKKSYELAKTLMARKPAINTEWMDVDWHNYSAILHGFAVTHLGAYEKEDNTWLPNRIEMWPASRFVFTPDHELLLKTRDNPHGEELVDQRWTCVRHMPSAKNPYGVALLSSCFWPWMFKHGGFKFFVQLCERFGVPFPVGKHPIGKTDDQVNELIDGLAKLITDGIATIPDDSSIEIIESKLSGEPVQKQLIDMCNAEMSKALTSQTLATEQKSGARAASETHAKRAGENQRADRARVSSYRNQILEAIHHVNFDGGEPPKYIWRDKKEINLDAVNVIRETAKLIKVTEDHAYKTLGVPKPQEGQAVLEVRDDGAGIATAAKQDFAAKDSNHMDVNSFDEFDQATDVEIAKIFEFAKHSASLTELKDKILSEFPNLSGTALADVASKAFELEFLQGMDEANSTEINDD >CP031759|2033460:2044314|2038791_2039316_-|AXQ97975.1|DBSCAN-SWA MEPITIALGLAKLTGLDKKIGQWIGGDNGAEVATKVVDMAQTLTGEGDATKAFDKISKSGELQTQFRLAVLNKEENLAELAFKNLDSARTMQNKALDQDDKMAKRFVYQYAWFLTVATFIYIGCITFIDIAEPARRYADTILGFLLGTTLGAILQFFYGSSLGSKDKTNKLLSK >CP031759|2033460:2044314|2043649_2043901_-|AXQ97978.1|DBSCAN-SWA MTPEQENQLFQSIGQIQATQTAILKEVTDIKADLTKRVDGLETRVEKVEGHVTNNRVKIAGLGGGAGLAVAIAVELLKLKTGG >CP031759|2033460:2044314|2039324_2039939_-|AXQ97976.1|DBSCAN-SWA MTNIPEGYMKDGKGNLVAIANIKQTDLIKDEFVKQAVALAEKQQKELAEFKRLQMEQADNFMELLAQEYDVNLGGKKGNVTLRSFDNKLAVKIQAQERIELGPELQLAKELIDKCLDEWTEGGNQNIRAIVNKVFATDKQGTLNPQRILSLRRLEIADDTGKWQQAMDILAESVTSIDSCRFIRFYKQDDHGNDNAVSLDIAKL >CP031759|2033460:2044314|2036356_2036572_-|AXQ97971.1|DBSCAN-SWA MKFSNTYFSAMRVAIQQCTYLHQRPTYQYTVMTLANHLWFIDELHELGMHRIAHKLDDAICNVVERNGVCR >CP031759|2033460:2044314|2036568_2036751_-|AXQ97972.1|DBSCAN-SWA MQTTLITDSNHWARQLKIVRALKSKHFPKKPRPEPLAQINEYTDLSALHSASYRSKRGEL >CP031759|2033460:2044314|2033460_2035407_-|AXQ97969.1|DBSCAN-SWA MMIHVPEHIIEDSAESALSGAFYGSPIQKATPLWWIEELDAKAREADAPKGVEKARLVRTRRSPTGLEKSKKQHVSAAQQAHTRQKAENLYTAAVNQMTPEQRLERLGLRDGERMDYATGEIVPKAVSYVDPNHFESAVFDDTPKTTTRRDGKEVTFSRDFAGYKGGKVDYNKSRVHFQTRNWDNSYRIVCTQLTQTSDAPDANTGALFTSKLTSRASGKIIDSGLYMQAVRGGFNTFATITFNATARRALNNCETTIGQQMSPFLDALGKMHKRGWVSRNGGEGFAGDKVKIGNKPVRASGEFTYLKSMGGEKVHTDVMHENERIYQFDGKPHIIKCVGASDKPIFDYVWVAEAPHEIIETRTYPWGEVSSLGHQNYHVHMLMRWNVEHHHFREWAARIESLWGKGYVKLERIKNANAAAKYLLKAVGYMTKGQAGDQGEIKGNRYNISKSARALPWENCATHEAQHMYGLIQEYMQGLEAKRQRKAKVANKLKMTIGEREKQKGLNKGNFSEKREQFIAKLTERMTALEDKVKGIGREIHGNFARGGMAQFASDSQFLEFVNWAIGVRGWRLKTAFGKCADISEIEQTRQEESTINQWLIQTQQAVNNSIDSLCNWYDRFERVQPHEALAYNELSLVTGNVYGFNE >CP031759|2033460:2044314|2036186_2036366_-|AXQ97970.1|DBSCAN-SWA MQMSNSPCEICGDEHAEYYASYTMPIELCDVAQQEYDIWLCCGCIEWCENKLESVGGDA >CP031759|2033460:2044314|2036967_2037261_+|AXQ97973.1|DBSCAN-SWA MTRKLMKITNSIELLDWFKTAIDVDSDYMAAKLLCITTQNVSSVRTGKSEFSELTCLKILLVGDHPEPLETMAIIQAHKAESRGDEEAAKIWRKSVA |
11 | Vibrio_phage(28.57%) | head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2062751 : 2121447
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP031759|2062751:2121447|DBSCAN-SWA TATGAGTAATGGCATGCCATTTACCCCAGACACCCATCAAACGGCGATTGCAATTGCGTACCATAACCGTGCGTTGATCGCTAATACGTTGATGCCATATTCGTCTGTAAATCGCCGCGAATATAAATGGGGCGAGTACGAGAAGGCCGCTAAGTTTACGCTACCAGATACTAAAATTGGCCGTAAGTCTGGCCCTAACCAAGTTGAGTTTACGTTTAATGACCAAACCGGTTCAGTGACTGACCACGGGTTAGCGGATGTTGTTCCTAACGACGATGTAGACAACGCACCAGAAGGCTATAGCCCACTAAGCGTGGCTACCGAGAATTTAACCGATTTAATCTTATTAAGCCGTGAAGTACGCGTTGCTGACAAATTTGCAGATCCAACTAACTTTGGTAAGCACCATCAACTCAGTGCCGCTGGTTTTAAACATATTGATGACCCTGATTTAGATATTTTGCCATGGTTGCTTGAACTACTAGACGAACCACTCATGCGCCCTAATGCCATGACCATGTCTTTTAAAGTGGCCACTAAGCTTAGAACCAACAAACGGATGATTAAAGCGTATAACGGTTCGTTAGGTGATGAAGGATTAGTGCCTTGGCAGTTTATTAAAGACCAATTAGAAATTGAGCATATCAATATTGGTCAAGCCCGTATTAATACCGCTAAAAAAGGTAAGTCGCCAGTATTTGAACGAGCCTGGCGTGACAACCTCGCCTTTACATATCACGACCCATTAGCTGGGTTTGATAACAAACGGATGACCTTTGCGTTGACCGCTCGATACAAAAGCCGAGTGTCGGGTAATCGTAGTGTGTCTGCTGGGTTACATGGTGGTACTGAGGTAATGGTAGGTGAGTCAGTCGAAGAGCAAATTATTGCTAAAGACTGCGGCATGTTACTAACCGATGTGCTAACACCAACATCTTAATTTCCATACTCCTTAAAGTAGAGCCAAAGGCGGGCAACCGCCTTTTATGAGGTCACTATGTTTGTATCTGCCACCCACATTATTAATCTGCTTGGTATGTCTACCCTGCTGCAGTGTGCAACAGGCCGGTTAGAACCAAACTACGATAACCCCATGACTGCTGAAGACATTAAGGCAGCATTATTAGGTGAGCCGGTTGGTGAGAACCAGATGCAAATCGCCGGATGGTTTAATGGGGCCGCCGCCAATGTAAATGCGGTGATAATGGGTTATGTAGCTAAATATGATTTGTCAGAGCGCGAAGTAGCAGATTCTTTACTTCCGGGTATTGCATCTGAGCTAATGTGGTATGAACTCAGCAATAATCCGGGAGATGTACAACTGGCCCGTAAAAAGGCTGCGCTGCAGATGCTGGATAAAATCAATGCTGGCACCATCCAAATTAAAAAACCGATACCAAAAAGCCACGGCACAATGCGCACCGCAAAGCCTACCTCTAACTTTGATTGGAGCCGGTTCTAATGGCTGGGGTGTTTGTTGAGGTCTCTGGTGATGCGCTCGACATACTCCAGTTGCTACGCCACAAGAGCTGCGACCCAACTGACATCCTAGACGACATAGGTGCATTTTTAGATCAGGACGTAACCACACGATTTTTAAACGAGCTTGCGCCAGACGGTACCAGGTGGGAGCAATCTGAAGCGGCGAGAACCGGTAAAGGCCGAACCCCAGAAAAGCCAGGGCTAACGCTTACCGATACACGAGACTTGGTGGGCTCGGTAACGCACAAGCCTAAAGGGGATGAGCTGATACATGGCTTAGGTGAAGAATACGCCGCTATACATCACTTTGGTGGTAAGGCTGGCCGTAATCATAGCGTTACCCTGCCCGCGCGCCCCATTATTGGTATAGAGCAAACACAAGCCAGCACCATTGTTGAAATGGTGACCGGGTGGCTAGTTTAAACGAGGTTTAAATGCAGTTTAATTTTGATTTAAACAAGGTGGAGCGGCTTTTAATGCAGCTTAATTTACGCGTAGGAGCTGCTGCCGATTTTAACGAGGTACGCAATAACCCAATACAAACCGCCTCTGTGTTTGTGCTACCGCTAGATGATGACTACGCGCCAGAAGACGCAGTTACAGGCCAGCAGGTTTACAACATAACAGAGCTGTTTGCTGTGATGATTGTAATACCGTGCCATGGTGGCAACCAATACGCCAATAACCAAATTGCAGAGCTGCGTAACAAAATAAAAGCTGCGCTTGCTGGCGTTAAATTCGACGACTGGCAACCCATAGCACCCCACAGAGGCCGGATTGTGGAGTTTAACAGTAAGACCAATACCCTAATTTACCAGTGCCAGTTCAAAGTAACTGGCTATGTAACCGTAAACGCGAGGCCCATGCCATGACAAAACCTAAACCAACTGAAACCAAGCCGCCAGAAACAAAGCAAAAGGTAACACGAGATGTGGCAAACCATGCGCTTGCCCTGTTGGCTGAAAAGCGCCGTACGCAGGATGTAAGCGGTGCATACAAAGTTGAGGGCAACACCCTTCTACCAGGAGGTGATGCATGAGCAGCTGGCGATTTAAAGACAAGTTACTTTTAGTTGATGCCCTTGGCACCACACTCACAGGCCAACATGCGGTGTATGCAAGCGAGGTGGAGTTTGCCATTGAGTCTGAAACAGAGGCAGACGAGCTTGAAACCGCACACAGTGGTGCAAGCCTGGATGTGATTTTTGGCAAGCACGTTACCTTAAATTTTAAAACGCCGCTCTCAATGTGTGGCACACCCGGGCAAGCCCCTGCCATCGCGCCACTATTACTGTCCTGCGGGTTTGTGCAAGTGGCGGATGCGAGCAGCGTGACGTACGCACTTGGCGATGCGAGCAAAGCCAAAGCTTTAGTGCGCTTTGGGCAAAACACCCATGAAATCAGTGAAATGCTGGGCAATGTATCGCTCAATTTAGAAAAAGGCATACCCAAGCTTAACTGGCAGTTTAAAGGCTTATTTAGCCCACCAGTGCAATCGACCGCAGCCCCAGCTGTTGACTGGAACCGCTGGCAACGGCCAGAGGTGCTAGGCGTGGAGTGCGCCTCGGCCTTCACCCTTAATGAGGTGTCGCGCGTGCTGCATAAGTTGACTGTGGATGTTGGTAATAATGTGATCTATGACCGCGCCATTAACCATGAGGCCATTATGCTCACCGGGCATGAGTCAAAAGCCCAAATGACGGTACGTGCTGATAGTTTGGGGAATTTTAACCCATTTAACGACATTGGCAAGGTGCAGCACTTTGAGTTTAGCCACGGTACCACAGCCGGTAAAAAGTTTACGCTCATTGGCCGCTACCAACTGCCCACGCCTAAATACACCAATTTAGACAGTGAGTTAACGGGCTATGAGCTCGATGGCAAACTGGTGCCAAGTGGCGCTGGTTACGATGAACTAACGTTAGTATTTGAGTGATCCAAATGAAACTAAAGAAATTAGAGCAATTGAAAAACGCAATCATCCTAGCCCCATCAACTTTGCATTTGGTGGCGTAGATTTTAAGTTTGACGCCAAAATTAGACTGGTACCAGAAGCTGAGATGACCAAATTGGTCGATGGCAGTAAAAAAGATGACGCCATTGTGCGCGAGTTACTGATTGGTTGGGACAACTTTGTGGATGACGGCCAGCAAGTCACCTTTGGGGGCGAAGTACTTGACGAGCTACTGAGTTATGGCGCTATTGCCGGGCGGCTCTCGATTGAATGCGTAAACGCACAATATCGCGTACAGGAAAAAAACTAGTCGACGTTGCTAGGTGGTATGTGGGTGACCTAGCAACCAGTAACCCAATTTTAGATGACGATGAAGCGCACTTTGGTGCGCCAAGTAAAACCAAGCCACAGACCGACTCGCTCTATGTACTCCCGGAGAACTGGACGGCGGTTACGGCGCTGAGCACTGCCGGCACACAGTGGCAGTTGTGTAAGCAAGGCATGGAGCTCGCCCTAGACTATGCCAGGGCAGAAGTCGCATGGCGCTACGCCGACATAACACTCACACCAACGGATTTTAGCAAGCTGCAACAATTAGAGCGGTTGATAGTAGGATTAATAAGGCGGCCCGATGAGAAACCAACTGAACCTGGCGTTACGTTTACGATATGATGGCCGAGCGGTTACATCAGGGACCGCCAGAAACCTACGAGATTTAAACCAATTACCCCACGCACTAAATCGGCAGGTAGCGGCTAACCAACGCTTAGGCGCAAGCCAAGGGCAGTTGATGCGCCAGCAGTCTGCCATGGGCAGTCAGTTGGGGTTGTTAAGCTCTGGCTATGACCAGTTAGCGGGCAGTATTGCCTCTATTGTGAGCCTTGGAACGGCTGCTATGTTTGTGCGAGATACTGGCAATGCACAGCTCTTAGACACGCGGTTACAAGGGCTTACTGGCTCTGCTCAAGAATACAATGCCGTTCAAAACTATTTGTTTGCGACTGCCGATAGGCTAAACACCAAGTACACCACCCTAGCCGATTCATACTCTCGTATTTTAAACCTACAAGAAGCGGGCGTTGTAACGCAAAGCCAAGGTATAAAAATACTAGAGGGCTTTGCAAATGCTGCTGCTAAAACTGGGGCGAGCAATGTACAGCTCGAACAAAGTTTATTTGGTATGACACAAGGCATGACAGCAGGTGTGCTACGTGCAGAAGAACTCAACCAGGTAACTGAGCCGCTACCTGGCTTAATGCAAAAGCTAGATAAAGCTGCGGGGCAAGCTGCAGGTGGTTTTAGGCAAATGGTGAATGACGGTAAAGTCACAAGCCAAATGTTTAAGCAGTACCTTATTAAAGCGTTTGATGAGTATGCAGGTGCAGCTGAAGCCACTGAGGGTAAAATCAATGCCTCATTTGCTGAAATGAGCAACGAGTACCAACGCCTCATACGCCACTACGAGCAACCCGTAAACTTTGCGGTAACTACAGTGGTGAGTAGCATTACCGAGGCAATGCAAGCGCTACGAGAAAACCAAGAGATTGTAGATGGGCTAACCACAT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52 | Pseudomonas_phage(28.57%) | capsid,tail,protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2131647 : 2197683
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP031759|2131647:2197683|DBSCAN-SWA 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>CP031759|2131647:2197683|2190667_2191054_-|AXQ98118.1|DBSCAN-SWA MSKYGEVAVLAMKNTDIAKDPAVAWNTSAKEAFGEKVASIKKGCPRGAFLGLAEEGFLKGVPKGNYTNSKLNKEYAVNAVNLLSKDNRFLQNKKLLWRESCNSTTKVQNGQIDVVLALWEQGYIKHAI >CP031759|2131647:2197683|2166341_2166749_-|AXQ98096.1|DBSCAN-SWA MLTGLNHITIAVSNLNTSLDFYCGFLGFELWVTWDKGAYLMLGDVWLCLSLGEISPSSDYSHIAFSVAAEDFTTFSKTILENGVGLWQQNSSEGDSLYIYDPDHHKLEIHSGSLQSRVKSLQRQPYSGLTWYKKL >CP031759|2131647:2197683|2176439_2176733_-|AXQ98106.1|DBSCAN-SWA MKKNQDCPQVLFEDMSRKEAILKEFNSLRPNNKRRFYQIIGMLTAVVFLIYRYPEIIEQPVLYIFLILMMSLSAEAYVQNKRVNKRIDLLHKLLKEE |
57 | Staphylococcus_phage(15.38%) | integrase,transposase,tRNA | attL 2154513:2154528|attR 2206082:2206097 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2845994 : 2888185
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP031759|2845994:2888185|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP031759|2845994:2888185|2884645_2885053_-|AXQ98643.1|DBSCAN-SWA MAIMSLLGSLFSAKTVAPIEAIGNILDELFTSEEEVLKQEHLKARLIAKHALVQAQINQVQAAHRSVFVAGARPFLMWVCGLGFLFSFVINPILQWLMPEHGTPELPLDVMLELTLAMLGLAGLRTVEKVKGVSK >CP031759|2845994:2888185|2870443_2872357_-|AXQ98625.1|DBSCAN-SWA MYKTPFTVLSNSEAGLGAFVACQYDGSPVSGVSSNNKCYALPIALVQRLNQGAYHPSYNPLGTAGFSRSDMPDSQGHAVTWNSPALKQKPVSTKQCFDSGIARIPAGGIDWGSISVAYSGRPDQYKYHDAIYAGQVEDLRLNAKKLHTEKVRESKLSDAIAAKFRGKERVPFTKLKSGACYDSAVTIYIYSKINSAVSSLVGRDVYYQSGAIVSKYSNLASFKADPVAIKFTDPGNTNLTTFSGGTPLNQWIIIDNFSVQWNSSFIALTNPNTGNMNWFNTGRASTIQAELLFPTDQSNAEFDILPWTDIVAKPDNFKSTFPDGVQGQWIPKLPDGTAGYPLNRKLSGDTLSATFSIDQGQTWVKNDVQFDPVKNINSASWNANTVALLQYQSDSVFTHAAANSAICGDIGRVYATQAYLNQYGNRLQSSLTGQVGKRNSSAYFQEYLNVSKHAYYSPNQTLGWTRRTGDEPIHEPLNLDVPNDNSPAVKALSTITEKNGLLYLQFHGTELKYKSIHLSYVEVIKAGVEADVVKGKIYRLQGFDNSHINRPVIALQDRLNFTFSASAFDGYRVANDGRIMTSSGADYPLLRVHNNDWGDDQTIPIIDGENTKTDLNGNTVKVFCHHTLFPIGIAHNG 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49 | Vibrio_phage(26.67%) | plate,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
560047 : 626753
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP031760|560047:626753|DBSCAN-SWA 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MQLPTVINHQESLLTLNTNDGGFVKDVLPGVHVSPLFLDPENGVWVLRVLFEPGVTLPKHFHTGVVHLYTMSGSWHYLEYPDQPQTAGSYLYEPGGSIHQFHTPKSNEGVTDTVMFIQGSNINFDGDGNFINIMDAGWIERAIIEAAKLNGEKVKYIKPSGIANYNE |
56 | Streptococcus_phage(10.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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