Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP031971 | Parvimonas micra strain KCOM 1037 chromosome, complete genome | 6 crisprs | RT,PD-DExK,DEDDh,cas3,cmr6gr7,cmr5gr11,cmr4gr7,cmr3gr5,cas10,cmr1gr7,cas6 | 1 | 8 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP031971_1 | 47696-47797 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP031971_1
|
1 spacers
spacers of CP031971_1
>1.1|47720|54|CP031971|CRISPRCasFinder GGCTCTATGCTAGTAAACAAAAGTAGGTCTGACGGAGTTATTGTATTATTTGAA |
WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP031971_1
The CRISPR arrays of CP031971_1 >merge|CP031971|1|47696-47797|CRISPRCasFinder ACAATGACTCTGGAAATCTCCTAAGGCTCTATGCTAGTAAACAAAAGTAGGTCTGACGGAGTTATTGTATTATTTGAAACAATGACTCCGGAAATCTCCTAA >CP031971|1|1|47696-47797|CRISPRCasFinder ACAATGACTCTGGAAATCTCCTAA GGCTCTATGCTAGTAAACAAAAGTAGGTCTGACGGAGTTATTGTATTATTTGAA ACAATGACTCCGGAAATCTCCTAA
>CP031971.1|AXU09797.1|46303_47179_+|radical-SAM-protein MHFVKVKGILSSKNGMNLFRGCTYGCIYCDSRSKCYQMNHSFEDIEVKENSIELLEDRLKRKRKKCMIGMGSMTDPYINEELKLNYTRKALETINKYGFGLTLITKSSNIIRDLDLLKEINSKTKCVVQMTLTTYDERLCKIIEPNVSTTKERVETLIKLREAGIPTVVWMTPILPYINDTEENIRGILNYCKEAKVKGILCFGMGLTLREGNREYFYSKLDKYFPHLKDRYIREFGNFYVVNSRNNYRLMKIFRDFCENEKIMYDYNKIFSYLNTFEEKEISKQLSIFDL >CP031971.1|AXU09796.1|45740_46280_+|ClbS/DfsB-family-four-helix-bundle-protein MARPTTKEDLLISAKENYGKLNELISKLSEKELNTPFDFSADVKKKEAHWKRDKNLRDILIHLYEWHMLILNWVNSNQNGEEKPFIPKPYNWKTYGDMNVEFWKKHQNTPLEKATEMLNKSHNDVIALAEKFSNEELFSKNIFKWVGGSTLGSYFVSSTSSHYDWAIKKLKAHQKNCKN >CP031971.1|AXU09795.1|45120_45729_+|small-molecule-binding-protein MKYEWKKNEKNLYGVKQKPQLIEIPSAYYIMIKGEGNPNESDFSNRVSALYSLAYGIKMLFKNMEKEELEYSDFTVFPLEGIWEKSDDEEFDKSKLKYTIMIKQPNFITKEIFDLAFEKVKKKKPNELYDEISFDCIENKKAIQILHIGSFDTEIESFEKLDNFASEMNLERSEKLHTEIYLNNKNRTAEDKLKTILRYTVK >CP031971.1|AXU09794.1|44166_45078_+|YafY-family-transcriptional-regulator MRDSRLFRILYYVLEKGKVTANELSEKFEVSVRTIYRDIDVISSAGIPIYATQGKGGGIEIADDFVLKKSLLSEKEQEQILVALKGLEGINKQYENELLTKLSAFFKIKNTNWIEVDFTNWQRGNEYDELFNDIKSAIINKNIIRFTYFSSNEKETSREVKPIRLLFKGWDWYVYTFCLLRNKFRYFKLSRIRDLKILDENFEDSYEDVVLIKKMEYKDTVHVKLKFDRKVAFRVYDEMGDIKEDEEGNLYAEIELPNDYNLYNYIFSFGESVEVLEPIEIRNNIRNMINKMSRIYNMTRGVR >CP031971.1|AXU09793.1|43323_44022_+|transglutaminase-domain-containing-protein MNQYLKETKMLDFSNPSIQKLIEMKCWKEKNKFDCLKAIYNFVRDEIAFGYNVDDNIPASKVLKDGYGQCNTKGTLFMALLRACKIPCRIHGFTIDKQLQKGAMSGVVYKNAPKNIFHSWVEVYFEDKWYELEAFILDKKYLYKLQKRFANCKGFFCGYGVAVKDFQHPIIDFDRNNTYIQSEGITKDFGVYDSPDELLKNHHQELSGIKTFLYRHLGRHLMNWNVKNIRNS >CP031971.1|AXU09792.1|42723_43188_+|hypothetical-protein MNKILFLGILILFGVVFLYLIFNPPRAKKYNLKRLNLNDDNNLNSEILGKELFVAKSSRKFILPTEFDLWTEIVLFEHCIVFKRNNKEKKLYFSEINEIEPMLINSFFVNGKYFGYIFKCKDNSVIVKSNNIEDLELFMEKLFELFPKEMVREI >CP031971.1|AXU09791.1|42109_42694_+|hypothetical-protein MKYYVYGMDFRDFFRKIFLPWILSFIIVFCFETLLLFRFFEYFKSKQLIIGISFWVIALLFGVFLTLEGIAILSFFQYFNRHRIKLFCLGVFEKKVVIESNGAKQVILFDDILEVKYHSGRYAEIRGLRIKANEINIGISCLGDRLNLSEKEDDVEQFDQFFNTFEEKTELFLEENGSEYGRNNECIRLKKIKK >CP031971.1|AXU09790.1|41253_42060_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MSMENLLSGVEDTLYIPLVARIYVSEKFPKFFYDEKALFLKQYIPKNLIEKNANEYFHMASVCRQDVIDKMIIKFLEENEQSNVVFLGAGLETSYNRINNKTAKFYQVDLPDVIDIRKRVLGNSENEKLIFGDMFALEWIKEIDTQLPTIIVVSGVYQYFDKDKIVDMIKKMKSIFPKGELVFDATNSKGLEVANKYVKKTGNVNAQMYFSIDNPNEFVKLTDTRLVEFQGFFERALKSCSGLKIKTKIFMYFADKLHRTFVVHLKLN >CP031971.1|AXU09789.1|37907_40997_+|Cna-B-type-domain-containing-protein MRRKIYKTLLSFLMVMVMILQVVSTAVVAEGNKKEVDATITNFRLESPKGKKATELNKHDAFYLAMDWKVDNEYEILKEGDYFDIKLPDNLSFPPAYSQGDFDLTDSNGNVIARAHLTRGADNVGGTIRVTFNNKINNKYNVRGTLYLGALFNKNIIKNNQENEFTVSVKGKTASTKVKVTKVATPPDQVLSKWGERVTEGGKPINEVIWKANINYKKANLKDAEITDSLTGDATYIQNSFKLEEVEYNDEGGVIKKIKEISLTGKLNFGADNKSFTIKLGNDGGQKQYRLTYKTTYIAGTELKNNLKLKYEGKNEEVSFTFKDQTAGGTAGGDLASKIKIIKVDAEDNNIVLADAVFEVTGPNGQKFELKTGADGTVVSGTLTQGTYKVKEKEAPKGYVLGKEEYTLNVTPAGGAIQKITNKRIKINISGKKTWDDGNNQDGKRPNKIKVSLLDDNKNVVQTKEVTPDAAGNWNYTFENVDEYNVKTKKKINYTVKEEAVEGYTTEVNGYDIKNSHTPSKTSIKVTKAWEDKNDQDGKRPTSVTIKLLADGVETGKELVLTKANNWTGSFTDLDEYKAGKKIVYTIKEETVGNGYISVVTKTGENTFTVTNTRTPEKTFVEGTKTWNDKNNQDGKRPTEITINLLKNGTKIASKKVTEADGWKWKFENLDKYENGKEINYTIAEEKVEGYTTEVKGYDVKNSYTPGKTSLQVTKAWEDKNDQDGVRPNSVTVKLLADGVETGKELVLTKANNWTGSFTDLDEYKAGKKIVYTIKEETVGNGYISVVTKTGENTFTVTNTRTPEKTFVEGTKTWNDKNNQDGKRPTEITINLLKNGTKIASKKVTEADGWKWKFENLDKYENGKEINYTITEEKVEGYTTEVKGYDVKNSYTPGKTSLQVTKAWEDKNDQDGVRPNSVTVKLLADGVETGKELVLTKANNWTGSFTDLNEYKAGKKIVYTIKEETVGNGYKSVITGNEKEGFVVTNVRTPKQRIPKTGASNNSALYTVLLGLSGTVIFSVFRRKRKENL >CP031971.1|AXU09788.1|36960_37653_+|cytochrome-c-biogenesis-protein-CcdA MLSNLESIIGEGLKSFSIFAPILALLGGILTSISPCSLASIPLIIGFMTGTKEDDTKRAFKTSVVFAIGMAITYTTLGVLAALLSKIFNQSGPFWNIFLGIVMILMALQTWEVINVVPSKILTNKSKKTGYVGALIVGIMAGLFSSPCSTPILVALLAIVASKGSLLWGVLLFLLYSIGNSILVVVAGTSAGFVGKVMSNKSYGKISDIVKIIFGIIILLIGIYFLYLGF >CP031971.1|AXU09798.1|47906_48704_+|protein-ADP-ribose-hydrolase MNKNKYQMLDFLVKAFIADSDNYKNMEIPEDETQKKVVLRSLMNIRIPRKMDDEVLKVQDEYLKLCAEEKEIVELKDIPIIKDVFSIWQGDITRLKVDTIVNAANSIMLGCWAPMHLCIDNEIHTFAGIQLRYECNEKMQELKKKYGQDFEQPTAVPMLTDAYNLPSKKVIHIVGPIVYGELTKELEKELADCYEKTLDMCLENGLKSVAFCCISTGEFRFPKERAAEIAIETTKKWALEHPFAMDRIIFNVFKDEDKKYYEKMI >CP031971.1|AXU09799.1|48740_49526_+|hypothetical-protein MSFDLFVFEKREEIKTSLDVFAYQEEFTEYKENKDYESLEGCSRVISCWAKKMFEKFPPISGKYALPDEIAYATEDSENHLTDYSLGKNGVYCAFSYNVEDEALEFVKSIADEYGVGVYNLQNNDAIFCKGIDILKCTTESTEDVVCDWENIENYIESLNDIERVKSSEGFTFITLWYETDGKQGNFIQCSPCYKNKGFFSSLFSKKISNEIDSYIFEIEKNGGVYQTFIEDKAELTKVIKAWCIDRKEPDIREYKRILDL >CP031971.1|AXU09800.1|49533_50523_+|hypothetical-protein MKEIYNKTDGYRESLEKGLRGIKSVGKNISTDSNTERDKIENLKNEIKNADAIVIGAGAGLSTSAGFVYSGERFEKYFFDFIKKFGISDMYSGGFYPFPDKKTAWAWWARNIYFNRYVEAPKPVYNDLFSIVKDKEYFVITTNVDHQFQRAGFDKKRLFYTQGDFGLFQSVNPENQNTYDNEKWVMKAIEVQGFKKNSGGIFDVPENREISMKIPTEMIPKCPADDSDVTMNLRVDSSFVEDAGWHRASKAYSDFLEKYKDKHILFLELGVGNNTPVIIKYPFWQMVIENKNSVYACINYKEAFCPTQIKDRSICIDGDIGDVLEKIME >CP031971.1|AXU09801.1|51790_52000_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MLPYPVIIVATKREPQAMNIVVQHYAGYIAHLSMRKLRDERGNTYYGIDEDIRDRLRSKLMQAVLIFKI >CP031971.1|AXU09802.1|52966_53188_-|hypothetical-protein MEKAIETAIDNGLESISSELYMFSVGIGIVLIMLAIVLFLVNRKSKGRKGITIAGLICLVIGIAAVVSGFIQM >CP031971.1|AXU09803.1|53188_53899_-|ABC-transporter-permease MKTLIRLELRRTNFRTYVISALIIAVIMLGFLYLFAYAPMLETNDADMKIFSGYENLIPLYGVLNMTVFCVLAAVIYSKIIIEEYSGKRPILLFSYPINRKKIMLSKLCIVFVFTVIAMFISNFLIFIIFGVSEKFLHLVSGDFTYSIMFQAIETTLIMSLSAASIGIIAVGIGFIKKSVPTTIVSAVLIASLMCNIVANTTSSKIAMYIFVAVMILIGIMFSAILMKKVEVMEVE >CP031971.1|AXU09804.1|53895_54627_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MNINLAVKTENITKTFLSREVLKDCNIHVEKGTIYGFLGANGAGKTTLFKIISGLLTPTMGNAQVLGMSVTSERNKILSEIGTIIETPIFYEHLSAMENLKIHLAYMGKTNSDIASVLSSVGLNNINEQPVSTFSLGMRQRLAIARAIIHKPKLLILDEPINGLDPVGIKEIRDLFIELVKNQNMTLLISSHILTEIEHIADTIGVIVNGTIVKEVSMTKIKAECPSGLEDYFIDIMNGGENK >CP031971.1|AXU09805.1|54632_55286_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MSKKYNSQSTIDDILSVSAKLFLEKGFDKTSMNDIATTAGISKGAIYHHFQSKDAIIKAVTEKKAQVIKETMNNWLSEMNSLNGKEKLQAILEKNLDSQETHYLDDVMNTRMKSAEFVLAYMQDCVCKDSHLISEIIKQGISDGSLATDYPDECAEVFLLLINVWCDPAVFSCNADKLLLRLKFLQNMMMSIGIDVLTDTIIQKSTDLLHRLYPQGE >CP031971.1|AXU09806.1|57373_58660_+|ABC-transporter-permease MVKNAIAYVLRKKNRTLIVFIILTVVLSCLYACLNILKSGTSLEKSLYKSSNSSSTIAKKDSQGYFDKNEFKGINDIKEIEEVVSQYEGLARLSNTNAVDSGQQITRDDIPSYLKNVVSIQATSNVKRNVLFNSGVFAIKEGRNIEKNDKDKILVHEEFAEKNKLKVGDKISLEFVDPNQTDKSNKKYEFEIVGIFSGKKQEKQTGLTSDLSENTMFTDYDSAQKALNVEGNKQLVNKLTFFSGTPENMDEAINKVKKLNVDWEKSYTVDKEANAFKDALESLNGVKHIIRIMTFAIMIGGSVVLSLILILWLRERIYEIGILLSIGVSKFKIVTQFIMELIFISLPAILVSLIFGNLVVNQIIGGLISSEDTTSITSNFVSNGYNMNNLITFAQSYGVLVLIIVLSVVFASGLILVKKPKEILSQIS >CP031971.1|AXU09807.1|58670_59315_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNILEIKNVTYSYANSKEKVLSLINQGFELGKFYAIIGKSGTGKSTLLSLLAGLDKPNSGEILFKDENIEKAGYSNHRKNNISLVFQNYNLIDYLSPLENIRLVNSKASEDILLELGLDKTQVRRNVMKLSGGQQQRVAIARALVSEAPVILADEPTGNLDETTAGEIIEVLKKLAKERNKCVIVVTHSKEVASAADTILELNNKRLKEVTKNK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP031971_2 | 138006-138122 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP031971_2
|
1 spacers
spacers of CP031971_2
>2.1|138035|59|CP031971|CRISPRCasFinder TACATTAATTTAATTATCAAAAAGAGATTATGATATAATAATTATAGATTTATGCCTTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP031971_2
The CRISPR arrays of CP031971_2 >merge|CP031971|2|138006-138122|CRISPRCasFinder TGATAAAGCTGTAATTATTTCATCATAATTACATTAATTTAATTATCAAAAAGAGATTATGATATAATAATTATAGATTTATGCCTTATGATAAAGCTGTAATTATTTCATCATAAT >CP031971|2|2|138006-138122|CRISPRCasFinder TGATAAAGCTGTAATTATTTCATCATAAT TACATTAATTTAATTATCAAAAAGAGATTATGATATAATAATTATAGATTTATGCCTTA TGATAAAGCTGTAATTATTTCATCATAAT
>CP031971.1|AXU09870.1|134688_137910_+|leucine-rich-repeat-domain-containing-protein MKNKNILALALLCGFSFSQVSFADSETVIYNKEGITVNLIADGEGTFKISVENKSSKDMVGVKVKTEDIKGLKIVKGKELEIGDVKVGEKKVLENEKIQFEVVEAIKDGIKKGKLSKTGIAGVYKINVTIAVAGIVGVICVLVSKKRNAKKLLSVAVGTGILMSSVLAYNSNAEGTYKNSANLSGNIEIKGKTYDYVGVLMWNGENSKVENDEQDKVVEIEDANLKKFILDKLHSYNGEDSFEAEMNEYNFKLTDKSYRKDKNSNEIYKSDLEKIEALAVRGMDAAEESLIEVNSIKGLEYCKNLKTLTISSGEIPDDNEEIRYSKGAIKDLTPLSNLKKLELLRLSHNEISDVSPLKDLTGLKYLYISHNNVSDISSLKNLANLESFDFAVNKITDMSIVENFKNLKLLDIYSNKISNINYIKELEKLTYFRADSNNIENIDALKNLKLLEDLDLGNNKLKDTSVLNRLINLKKLSLKGNNIENLNLNKLINLDDLNIENNKISDISFLKNSTKLANLNLKKNNIENIDNVSGLTKLTYLNLSDNLISNVEPIKSLTKLSSLYLSNNKISDISSLKNLNELSSVKLDGNKIKDFSSINDKKGIFEKIIHNQNVDLENVEVSEKTFEIDNVFVGLEKIAKGGNIKVSTEAEGVTVTLESGKLNFSLTDKAMENIKEGLKLTVKFKFENEMDYENNPTVLNLNVNLVKPAKKYVEIEDAKLLKVINKNLGKNRADNQKVTVEEMESLTELSIFLKEDGSADFSESAKYSILGKPTSLKGTKDFKFAVTRGMKSIKGLEYAKNLKKLKLNENEISDISPLKNLTKLEYLEIQRNRIVDVNPLKNLTNLKFLKLYNNLIEDIAPLSNLTNLTGLDLHYNVTVGGDESHKIISKGITDISALKNLKKLEFLDISANRIEDISILKNFDKIKDLDFSGNRVKNYEGLGDYIAERLGKALNEGIGSIQFSGQTIDFGSTVEVKEKEVIFTTPFKGIKELGNSLAQVFGSEDPLNAFGEIKTNVEGIDASYDLDTNKIKLTVSDGVITKYNGKELDLNLKMSLEEYTWTLKNIKLKFVSE >CP031971.1|AXU09869.1|133682_134528_+|YjjW-family-glycine-radical-enzyme-activase MSNKGIINKIIDMSVVDGPGNRTSIFLQGCNFNCFYCHNPETIRHCINCMECIPPCPTKSLKNVNGKIVWNDKTCINCDECIRVCKHLSSPKIYNWTVEETVERIKKNMPFIRGITVSGGECTLQHTFLTSLFTEVRKLGLTCFVDTNGGIPLKRLPDFVEVSDAFMLDIKAFDNEEHLFITKSKVDVVLENADYLASINKLFEIRTVTIAGMDNRTTIDNITKMLSKYIKMGHKIRYKIIKYRKYGVREEYSMFSAPTDDEMEELKQIAIRNGFEDVIIV >CP031971.1|AXU09868.1|132157_133693_+|YjjI-family-glycine-radical-enzyme MISKIKTLEEARELSMNIIKAKDLTYEQKTSQLAKLAENLNDFPVSSVNERIFEISENGGFCDLWEGHAPYAPRYICPNYQKLLDEGCKFLRLEKAETLLDAINSLLIFYHHVPSITRYPVYIGKIDKLLDPFITDREEAKKLIKWFLVSLDRTINDSFCHANIGPEKTVAGEIILELLPTLNNVTPNMTILYDEDITPDDFGEKAVYASLLTANPAFANDKYYRKDFNGNYAIASCYNGLPISGGAFTLSRLRLGSLARSSSSKQDFFDRVLPEAIDLMCNFMEGKIRFIVEETPFFEENFLVKEGFIELDRFVGLFGVVGLHECVQKLLEFESKDLVYGKDDYANNLGLEVMDFVENRVNSFESKYSTFWNHRFMLHSQVGAQDDMEDSAGVRIRIGKEIPMYNHIKHSALFHKYFPSGIGDHFPFDETAEKNPAAVLDIFKAAFRLNMRYISCYGENGDLIRVTGYLVKKSDMQKFIDGESISYDTVQYAREAFEKYHLLERKVRDVK >CP031971.1|AXU09867.1|131605_131974_+|hypothetical-protein MRLWHEKIIPLLPRNQLLGQHRECCALRGNGWGKKHKTVDYVFLYSPYYLFVYHSLVMDEMVKRGFKVSIEWKDKNYRGKKAESYNNLEEKITDTPIYKEHNNEYLIECLENLRKKGIQLEL >CP031971.1|AXU09866.1|130147_130801_+|cupin-domain-containing-protein MKEQVGKVFSIAEDNKALEGCTISKEVHGGDNYIAYFSMAEDTDISAELFPYYKLLILAEGEIEVYVFSEKTKKLKVGECIVTPIEIPVGMRTKSGAIFTEIAIKKEDFMNKLVKAGEVFKLGELLQYQEGKIVNMDVVHNDKMKFVLMAFDAGTGLSEHSAPGEAIVFALDGEGIIGYEGTDHVIKAGECFHFAKAGRHYVKAEKNFKMALLLTLE >CP031971.1|AXU09865.1|128236_129511_+|dicarboxylate/amino-acid:cation-symporter MKKKNLVLQVFIAFIAGLILGVVLWLAKVDISGYVKIVSPFGQVLVAMLKMIVIPVIFLSLIDGAASVPTKEFGKIGIKVIVWYFLTSLFAAVLGSVLAIGFNPGSGEAQQAAWKSLINTQNTSEIASKANNSLADVFISMFQNPFKALADGNFLAIIVFSIAFGLALKMISERAEYSTKVKTLLEIIDVAKEAIFKIVDWILAYSPIGVFALTSVNFASYGSSLFGPYIKLTIGVVLGIVAMVLIVYPLMMAVTLKVNPFKVLMKIKEPMLTAFVTRSSAAALPVSLRVAKEDLKISENISSFALPLGSTINMDGVCIHLPMFAILAANMFGVKVTFVSLSVLVLTTVLASVGAGGVPGGSLMLLFIILQNMKLSPDQIAIIVGLALGINPILDMFETMNNVTGDIVCTYSVAKLSGLVDEDE >CP031971.1|AXU09864.1|127222_127918_-|Crp/Fnr-family-transcriptional-regulator MESKLVTLLRKVLIDKTFDLKTDKRLYSEFTVLKVKKKTVIIKENDKLDYLYLLVRGSANVVHFTPVGELIVFNHITNTSIFGLLEFMDNKHDFYKSVAFFKDTRLIRIPIERFEKEPESLELLKVYNHFLLDFAKHSIATFDLTKNYGRKKNLIEFFLSKCVDVEFPVKITLTKKVISDYLRINERTMYRYLNELIDRNCISRKTGKIIISKENYDNLVEYSKEKGVDNE >CP031971.1|AXU09863.1|126406_127210_-|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MNESIENINLSNSDVRTSKFNKKSLILILNYFISPILILIVFFNLLKNSTIMENLMSSGFVSIFFKNNKYLLENEELFNKFFTSVLSSIATFITFIIAVLLSKKRNDSISIKKSETSLKKLLLFGIGLGIFMILWNIIISYLYPLLGLTFKSKNTGSLFESLKFNKLLILNILIAAPLGEEIAFKYGIFTFFHEIFQYKGIFLKVILPAFVSAFTFAVIHDGLYLVPLYIVPSFIGCLIYKNTSSLLPCVLGHFLNNFLALIMTLYN >CP031971.1|AXU09862.1|124410_126357_+|threonine--tRNA-ligase MEMIKVTFPDGSVHEFEKGVKILDVAISISEGFARNVIGAVVNDDIIKGLSETLKEDCTVKFVKFEDKEGKEIFWHTSSHVMALAIQRLFPDTKFGIGPAIENGFYYDLDSEHKFTPEDLEKIEAEMKKIVKEGYSVDRKEVDRDFALKYFAEKGQDYKIDLIEGFDKDAELSFYELGEFTDLCRGPHLVDVKKIKAVKLLSIAGAYWRGSEKNKMLQRIYGITFEKKKDLDEYLEFLEDAKQRDHRKIGKELGIFMISQNVGAGLPFWLPKGATIRRVVERYIVDKEIECGYEHVYTPILANVDLYKTSGHWDHYQDSMFPPMDLGNGELLVLRPMNCPHHMEIYNNDVHSYKEFPIRIAELGMMHRYEMSGTLSGLQRVREMTLNDAHIFVRPDQIKEEFTRVVNLMKSVYEDFDIKNFRFRLSYRDPENKEKYFDDDEMWNNAEAMLKSAMDDLGYEYFEAKGEAAFYGPKLDVQVKTAIGLEETLSTIQLDFLLPERFDLTYVGEDGKNTHRPVVIHRGIVSTMERFVAYLIEEYKGAFPTWLAPEQVKILPISDKFNDYAYELQKEFAKKDIRVAVDDRAEKVGLKIREAQLAKIPYSLIVGENEVNERTVSVRKRGEGDKGSMKFEAFLDKILEEVTSKVVK >CP031971.1|AXU09861.1|122915_124217_+|histidine--tRNA-ligase MGFIKPSNVVGTMELLPNEQILFDNVKNIIEDTFKKRGFLPIDTPIFEKNEILLAKGGGETTKQIFKIDSESKDISLRFDLTVPLARYVAQYFSDLNFPFRRYHIGKVYRGERNQKGRYKEFYQCDIDVIGNGKLDIKNDAELPYIIYEIFSKIINEKFAINFSNLKIINGLFENLGVDNKADMLRIIDKIEKIGFEKVVEELKNTGLDDNSLEKIIEFIKISGSNEKIIEKLNSLGISNELFEKGVEELKEVYDCMKLFGIPEDCIKINLTITRGLDYYTGTVYETFLENYRQLGSVCSGGRYDDLASNYTSQILPGVGISIGLTRLFYQLLDKNLFKEIKTNSIDALIIPMENCYDYAIKLLNKFENSGKIIQIYFEDAKMKKKISYADKLNIPYIIIVGEDEKANNTYTVKDLKTGEQSTVDFEGLIKLI >CP031971.1|AXU09871.1|138198_138651_+|tRNA-(adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase-complex-ATPase-subunit-type-1-TsaE MLEIILNSLDECDNFSKRFSKTLKNGDVISLVGDLGAGKTTFTKFLGKNLGIGEDITSPTFNLVNLYSGKFEFNHMDLYRIDSPEELYQIDYENYFYPDGITVIEWAENADYLLPKNLIELEILKISENSRKIVIKGNNKRELEIIEELQ >CP031971.1|AXU09872.1|138647_139331_+|tRNA-(adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase-complex-dimerization-subunit-type-1-TsaB MKILAIDTSTTHSSCSVMEDNNIVGDFSINQSMSHNEILLVMVDEVLKKLNIDIEDIDLFVAVTGPGSFTGIRIGVTVVKALAMALNKPIVAVNTLEALSFGIFSDKKKIPLIDARGERVYYGVYEGISNTNIVAPALLTIDELLEEFSNKGEFVFAGDCVNLYKDRILKNKNFEITPACLNSCISRNACVIGKHKFESGDISDCFNLSPEYVRLSQAQRDMENKGK >CP031971.1|AXU09873.1|139331_139766_+|ribosomal-protein-alanine-N-acetyltransferase MILYRYAENKDVFDILSLDNENFSNNFKEAFYLEYIKNQRVIVAEKEENVIGYVIFNQILDEAEIYKIVVLKEFRKKQIAFKIIEFLLNELKKNNVKKIFLEVRKNNIPAINLYKKCGFINIREIVDYYNNPKENGIMMLKEVV >CP031971.1|AXU09874.1|139765_140782_+|tRNA-(adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase-complex-transferase-subunit-TsaD MDDVKIMAIESSCDETSVAVVKNGREIISNVISSQIDMHKKFGGVVPEVASRMHLEVINNIVREALEEAKLSMDDIDAIAVTKGPGLVGALLVGISEAKALSYACKKPLVGVNHMKGHICAAFITHKELEPPFICLLVSGGHTYLVYVKDYNNMEVIGKTIDDACGEAYDKVARCLGMNYPGGPEVERLAKLGNDKSIDFPRVMLDKNSYNFSFSGLKTAVLNYLNSKKQKNEEISKEDVCASFQRAVFDVLIFKTEKLMKEKKLDTLVVSGGVSANNTLREEINKMCEKNGFKSYFPDKILCTDNAAMIASSGYYEYISGVRSDLTLNVEPNLELEN >CP031971.1|AXU09875.1|143624_143801_+|HTH-domain-containing-protein MELSEKIIELLKSSEALKGGEIAEKLGVEKSEVDKILKKLKAEEKIISPKRCYYSVEK >CP031971.1|AXU09876.1|143900_145157_-|AraC-family-transcriptional-regulator MNKQKGIEIQNKANSYINEESMYSIDREIITSPTKGLFHQSARFLLIKKGTAKMRIQNNIYEIKDKTLICILPWEYTEVIEVSKTIQYFILKYNFDSANKIIKSFYNIDAENLSLINSFYDNPVIQCTDEQFKYFSNVFDMLRDELGEDSTLYNKNESPISSAYVLNKIIDLIITYRRMQNEDTQKIKKVDEKFDKINIFRYIHAHLSEKLTISSISKLFFMSESTINRYVKETTGISFNTLINEMRVGKTMDMLLYTDLDIEEIAEITGFSDRSHLSKVFTARTGQNPNKYRQTFHKVSQICQIENIRKFYRILNYVVKNSSDDIEIESICKNFSISITELNRLFIYYVEKNFKNFLNFVRINKSTKLLLKTDMQITDIAFEVGYNTVKTFNRNFLKYQKMLPTEFRKNLKLQDREI >CP031971.1|AXU09877.1|145723_146716_+|ornithine-carbamoyltransferase MSKNLRGRNFLTLLDFTSDEIRYLLDLSKNFKDLKRSGTPHRYLEGKNIVLLFEKTSTRTRCSFEVAGMDLGMGVTYLDPGSSQMGKKESIEDTARVLGRMYDGIEYRGFSQELVETLGEYAGVPVWNGLTDKFHPTQMLADLLTIEEKFGYLKGLNFVYMGDARNNMGNSLMIACAKMGVNFTACAPKELWPEEELREKALEIAKATHCTVSFEEDVKKGTTNADVIYTDIWVSMGEPDEVWAERIKLLKPYQVNKEVMANAKETAIFMHCLPSFHDQKTVIGRQIFEKFGIPEMEVTDEVIEGPQSVVFDEAENRMHTIKAVMYSTLW >CP031971.1|AXU09878.1|146725_147661_+|carbamate-kinase MGKRIVVALGGNALGNTPLEQLEKVKIAADIISDLVKDGNDVIIGHGNGPQVGMINLAMDYSANGKEKTPLMPLVECGAMSQGYIGYHLQQALGQAFKEKGINKTAVSVVTQVEVAENDKAFEHPTKPVGMFYTKEKADELAKEKGFTFVEDSGRGYRKVVPSPKPLNIVEIDAVKKMVDAGLVVITVGGGGIPVVKKNGKLVGIDAVIDKDKSSAKLASDLNADFLLILTAVDKVCINFNKPDQKELDEINVEQANKYIAEGQFGKGSMLPKVEACLEFVNGSDNRCAIITLLEKASDAVKGLTGTKIVK >CP031971.1|AXU09879.1|147670_148606_+|DMT-family-transporter MDNISGRTSFLAKIALFIVAILWGTSLTVVKSAADVFKPNFLLGIRFTLAGIILAVVFHKKLFNAKRNELIAGAVIGVFLFVAYSSQTLGVTFTTPGRSGFLSASYCVIVPFLYWITNKVKPDKFNVSAAAFCIVGIFFIAMAGESGSIFNSSWKAIYGDALALLSGFLFASHIVMVTRLGIGKDPFVLTIMQFLVAGILSWVTTFVFENNAGMQITLRPMLEVLYLSVMCTAVALLLQNLGQKYTDPSSAAIILGCESIFGVAFPVALGIESLTVKSVIGFILIFVAIIISETKLSFIFKKKDKKIESKI >CP031971.1|AXU09880.1|148713_149913_+|DUF2974-domain-containing-protein MNIEKRTEKRGFQKAIIEKNVISIDIFLILNCIIYVHNFERDDVQEKLVGKNIFEIFDFIRNEKNSSGYYPAEINEDEFLGILNTVDHSRQVYEKIKIVDIDNSVYGNATGSDRVVNVSFLFEDCLIIVYKGTAGDYEWKDNVEGTYNITDTKQQRRALRYFDKMVKKFDNISKIYVSGHSKGGNKAQYVGVLRGDMSKLINVYSFDGQGFNINFLKKYNKEIENNKYKIFNICNEYDYVNIIMHSVSNKIFIKSVTNIGNEDNRYSKIIHRLGGVHSPYSMFKKENGILTLNDVVEQSEIMKNLEKLFEYYNANMKEEDNQFMYYRMSLLMMKSGKEVFGEECPIAPKGFSRRFIKLTRDFTKNESGLDSSEIINLFKPILSDIGSIIIKGKISENSR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP031971_4 | 181089-181193 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP031971_4
|
1 spacers
spacers of CP031971_4
>4.1|181128|27|CP031971|CRISPRCasFinder CGAAGTAACAAGGTTCTCGGGCACCCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP031971_4
The CRISPR arrays of CP031971_4 >merge|CP031971|4|181089-181193|CRISPRCasFinder CCCGATGCAAAGCATCGAGGAAGGGTGAGGTTTTTATTACGAAGTAACAAGGTTCTCGGGCACCCACCCGATGCAAAGCATCGAGGAAGGGTGAGGTTCTTATTA >CP031971|4|4|181089-181193|CRISPRCasFinder CCCGATGCAAAGCATCGAGGAAGGGTGAGGTTTTTATTA CGAAGTAACAAGGTTCTCGGGCACCCA CCCGATGCAAAGCATCGAGGAAGGGTGAGGTTCTTATTA
>CP031971.1|AXU09912.1|180818_180998_+|30S-ribosomal-protein-S21 MAEIRVGENESLDNALKRFKRQCARAGVLSEYRKREHYEKPSVKRKKKSEAARRKKKKF >CP031971.1|AXU09911.1|180331_180673_+|histidine-triad-nucleotide-binding-protein MDCIFCKIVNGEIPSNKIYEDDDIVAFNDLSPQAPIHFLVIPKRHIESCNFVDKENAEVVGKIFLKISELAKEMGFDKSGYRIVNNCNDDGGQTVKHLHFHVLAGRSLNWPPG >CP031971.1|AXU09910.1|179645_180158_+|cysteine-hydrolase MKILVVIDVQNDFVDGKLGTQEAINMIPKLKEKIKNFDGEIIYTMDTHDDNYLNTQEGRKLPIKHCIKGTDAWKIREGIYKENCKIFEKAGFGSSDLVEYLKSINEKEKIESIEFVGICTDICVIVNTLMIKGFLPEVELIVDSKCCAGVTPQSHNTALEAMKMCQVDIL >CP031971.1|AXU09909.1|178246_179578_+|multidrug-transporter-MatE MKNKRLELNKFAFPLMVNFILSYILELSDIAIVARVSTPAFNAVNLISSTLYTISGVLGVTAIIINTKLGEKLGQGDEKGLNYEFFSSLAINIFMGIIFLLLMLIGKTYFLKIFYNLSGETLEQGILFSYPMSFCVLLQLCLFTFGAYFRISNMTKWILIGSTVSSVLNLGLDYLFVLGKFGFPKFGITMVGFSTVFSMFVNLLIYIFVLKNKLNLKYELLKSYFINGINHFKLAFPIMIQEIFDGTIFVIIFNMIVIRIGNNEFAGYSIITNLIMFLFTFKHIYGSATLSLISISSGEKNFRNLIDYPKISVKITTILFIFGSALFFIFREYLPKFITDDVSVQNIATKFLIFFLVANICSSYSYIYKCALQGLNKNMFLLKTTAGVNILSLILMLILTQVFDLSLFGVAFAQFVNEFILSVIFLKYYRYIVTDEFYNLTKD >CP031971.1|AXU09908.1|176163_178257_+|type-I-DNA-topoisomerase MYKNLVIVESPTKAKTVSKMLGSNYKVVASVGHIRDLPKSKMGIDIENNFEPEYINVRGKASKIKELKELYKNSENIYLATDPDREGEAISWHIAYLLGLDINANNRIEFHEITKKSIKESIKNSRKIDMNLVNSQQARRVLDRLVGYKLSPILWKKIKSGLSAGRVQSATLKIICERQEEIDNFVPEEFWKIEGIHNVQNIEFKSLYYGEYENKKIVKKEIKNEKEALKVVEKTDKDNFIVEDVKRVKKERKPQPPFTTSTLQQEAGRKLGFSSSMTMSIAQQLYEGINVGKEGSVGLISYMRTDSTRISSEIVAEAIEYITENYGKNYASKGNEYNLKKKNSQDAHEGVRPSSIFRSPEKIKSYLTANQYKLYKLIWERTVASQMKAESYESTQIVLNSNNCIYKLNGRYTLFDGFSKIYTSSDIKDEPLPKLEVKDVINAEKIEKSQHFTKPVANFTEATLVKKLEENGIGRPSTYASIINSLTSRFYILIENKKIIPTDLGKNVNKFLVSNFETIINEKFTMEMEEKLDEIAENKKDWKKVISDFYAVFETFLKKSEGDSEDYKIKDEVLDEKCPQCGKNLVIKKTKFGRFIGCSGFPDCNYIKKEVKDTGVKCPKCGGRIIEKISKKRKVFYGCENYPECDYAIWDKPIADKKCEKCGKFLVEVKNRFKHALKCSDENCDFEIDLKKKKNEK >CP031971.1|AXU09907.1|175709_176153_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MEYRILKSEEMEKAFALREEVFVDEQKVPLEYEVDDRDSLEDTIHVGVFEGDELLATARIMNINKDIVYFGRACVKKSCRGKGVGKFLFISMEETVKKFKKENEKKTIRFSAQYHAMTFYEMLGYTKDNDDIFVEVGIEHISMSKIV >CP031971.1|AXU09906.1|175044_175581_+|flavin-reductase-family-protein MKRKINVFDYAKEIMLAVEKGVLLTTKSKEKINTMSISWGTLGIEWNRPIFTAFVRESRYTKKLLDESGEFTVNIFLNDFDKNIIGVCGTKSGRDTDKIKELPLTLVESEIVDVPAIKELPLTLECKVIYKQKQDENAIPKEIKEKNYPENVSGEFYGANRDYHTAYYGEIVSAYIIE >CP031971.1|AXU09905.1|174204_175035_+|thymidylate-synthase MSRADDIFISMCKDILENGVDTKGEKVRPVWEDGTKAYTIKKFGVVNRYNLAEEFPALTLRKTAIKLCTDEMLWIWQKKSNNIKDLKSHVWDEWADENGSIGKAYGYQLGVKHKYKEGMFDQVDRVIYDLKNNPYSRRIITNIYVHEDLSEMNLYPCAYSMTFNVTGNKLNAILNQRSQDILAANNWNVCQYAILIHMLARECNLEVGELVHVIADAHIYDRHVPIIKELITREKFPAPKVTLNPDVKNFYDFTSDDVIIENYKCGEQIKDIPIAI >CP031971.1|AXU09904.1|173747_173993_-|type-B-50S-ribosomal-protein-L31 MKKGIHPEYNKVVFMDTTSGYKFICGSTKTSNETIEMEDGNTYPLIKIEISSDSHPFYTGRQRFVEKGGRIEKFKKRYNMD >CP031971.1|AXU09903.1|173581_173782_-|hypothetical-protein MKNSKKDTIWTKNKKQSNLLFLLQKIMGFRRFLDYCLFTKNSIYERNSKIIFVCIFDTFTFAKAKV >CP031971.1|AXU09913.1|181738_182857_+|winged-helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTKREQELLDIIKENPYISQNELADLLNIKRSSVAVHISNLIKKGYLVGRAYVINSNLSKEVCVIGGCNIDFIAKSFEKINMKDSNPGTLEYSFGGVAKNIAENLLKMGIENKFISVFGDDVYSREIKDYLKKIGLDFSNSKFLTNRGMSNYISILDENNDLFTAISSMEVLDEINIEFISKLIDLIKNYKYIVMDTNLREDVLEYICKNCPNSKIIVDCVSRKKALKIKKLLKYIYLIKPNIYEAEELTDVPYKNESDLEKIVNVFLEKGVQKVFISMGEKGILYADKNENGIVKITEKPKIENTSGCGDSAMSGIIFGVVNEKDILECAKLGNIAGFITAQSMDTVSKDISEKNLLNFGGSYEIRKIFNS >CP031971.1|AXU09914.1|182828_183749_+|pseudouridine-5'-phosphate-glycosidase MKLEKYLTVSEEVKNAIKENKPVVALESTIISHGMPYPKNVETALEVEKVVRENGAIPATIAIINGEIKVGLTKEEIEVIGKAGLSVTKTSRRDLAYVVANKLNGATTVAATMICAEMAGIKVFATGGIGGVHRGAETTMDISADLEELGNTNVAVICAGCKSILDMGLTLEYLETKGVPVYGYQTNILPAFYTRESDFKVSKINSEEEIAKVLKAKWDLELNGGVVIANPIPEEYSMDRQLIDKTILDALKEADENGIKGKDTTPFLLDKVQKLTQGKSLEANIRLVFNNAKLASKIAIEYSKLA >CP031971.1|AXU09915.1|184207_184891_+|HAD-family-hydrolase MNDYQYYFFDLDDTLCNYKSAKEKANIRINRQLMNYGIDIHLFKEKYISNEVKLMNSFLEGKLNKIEYRTRRYSDILNFFGVNNVDEKAKELNLIFMEEGNIKIKIFDDVIPFMKKIKKAKKKIAIITNGPTDGQMSKLKVTGLLDYIDHIYISEEVGAAKPSKVIFNFAMHDLGALPKESVMFGDNIKEDIFGAKSVGMSAILVNRFNKNINYNNQIKNFFELDNI >CP031971.1|AXU09916.1|185767_187327_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKSKYKKNIHKIIILFISGIIVGSFSIFPMVLIQKVIDSLTTGYTVEFFKYIILYSLIYILVDLFKIILINFGSKFELNLNRDIKDEIIESILNTKIDLLEKIGGSNVFNSIIDDLKSLDDKIIPLVFGLGFSISSFIIGAIIIIKYDYIMLISMLLISCISTILIQKILNSSEIASERSQIQRLNVINKLFDIIVGARDIKLFNKEKYFSKDFTSENGKLNKLDKKIVNIKNISQTLVRLLFNLIMAILILIGGIRVSQNNLSIGALIAIILYVSMITDPIFNIIENQKEISAFKNSVKRIDNTFEMLERENIDLQKNFNVIEFKDVSLNYGDNQILSEFNFIINKNDKVKINGRTGSGKSSLAKLITNLYKPTSGHILIDGKKNKTISLSAVFQENKLFNMSIIDNITFKSNIEKEKLNQIIKICRLEEVIEKYSDNNIGFDSSTLSGGEKTRLLLSRALYKDCELYIFDEISTGLDESLFYEIFDDVMKFLQSKTIIVIDHKYIDEKYFTKSIFI >CP031971.1|AXU09917.1|187350_187671_+|competence-protein-TfoX MASSKEYLEYILEQLSELEDIKYRAMMGEYIIYYKEKVIGRIYDDRFLVKATKKAIDYVSEVQFQLPYEGAKEMLLVDDVEDKMYLKGLFETMYDELPFPKTKKKK >CP031971.1|AXU09918.1|187731_188091_+|hypothetical-protein MKLDKSKNNIIKKFLGILLIIVIYIPLYLFLFEYIDCRSLMYFYLLFISVFILKIILYIFKFKNKLIVISFAGDIMLSSKILERALTYENKCIVSFSFFGFLFCAILALYVKYVEDGKS >CP031971.1|AXU09919.1|188172_190797_-|pyruvate,-phosphate-dikinase MSKFVYNFDEGNKDMRALLGGKGANLAEMTNIGLNVPFGFTITTEACNNFYKNDEKISESLIEEIKTHIKDCESKLQKSFSSTENPLLFSVRSGAVISMPGMMDTILNLGLNDKSVIGLANSTNNERFAFDSYRRFIQMFSDVAMEIPKIYFENELDKIKEEKNVKMDTELTAEDLKILVEKFKKIFKQETGKEFPQDPIEQLIIAIKAVFKSWMNPRAIVYRKLNGIDDSLGTAVNVQAMVFGNMGNTSGTGVAFSRNPSTGENKLFGEFLMNAQGEDVVAGIRTPESIEKLKEIMPEVYDEFLRIAKVLEKHYKDMQDLEFTIEKGKLYLLQTRNGKRTTDAAINVAVDLVNEGLISKEEAILRVEPKSLDQLLHPIFNAEMMKNTPILSKGLAASPGAASGKVYFHSKDIVDAVKSGEKVILVRQETSPEDIEGMIEAEGILTARGGMTSHAAVVARGMGKCCIAGASEIKVDEIEKVIKTQNEVVKEGDIISLDGTTGIIYKGEIEKLNPQLTGNFKIFMDWVNEIKVLGVRANADNPRDAKQAVEFGAEGIGLCRTEHMFFDKDRIPVVRQMILSENTEQRVEALEKIRPMQEKDFYDIYSVLKEKSVTIRLLDPPLHEFLPYEDEDIKNLAKEMNIDESHLRDVITDLEEVNPMLGHRGCRLAVTYPEIYRMQAKAIINAAIKAQKDLNISITPEIMIPLVGELEELKYVKREIVEEIEMTLKELNENIKYKIGTMIEIPRAALLADEIATEAEFFSYGTNDLTQMTFGFSRDDAGKFLNEYENKKIFDFNPFAKLDQKGVGKLVKMSFKLGKETNPHLHVGICGEHGGDPDTIEFLNSVGIDYVSCSPFRVPIARLAAAQAKIKQNK >CP031971.1|AXU09920.1|190809_191616_-|kinase/pyrophosphorylase MLNIFLISDSTGETAEQLARAALAQFNNIEYSLERFSHIREFSDLSEILNKCKETENSILFYSLVDAPLLDYVKKFSELHSITNVDLLSASILAIQRVSNITPGNTPGALRKLNEEYFKRIDSIEFAVRYDDGKDPRGVLIADLVIIGISRTSKTPLSMYLANKNIRVANIPLVPETPVPEELFQVSPKKIIGLTNTPEKLESIRKERLKSLGLPDNSIYSNSNRILEELEYSSRIMKKIGCPVIDVSAKAIEETADIILKHLLKINK >CP031971.1|AXU09921.1|191814_193227_+|peptidoglycan-binding-protein MEVYFLIEDNKKTSRKKLIKKISIFFGALFISIYLLGVITFSFIALPNTKVNGNDVSYVMIDDVFNKDWTDVSIKLNRSDGKSDFFKPEKINYKEEYLADKKILQNQFAWPLAFFTSRDFKLEVNVSYDNDKFEEFLKNTLILKGLKHPEDAKIVYKDGKYAIQSEIMGTYTTKEKLKEAILIALSERKESIDMSKISEQPKLKKDDKSLQDALSKYEKISKLKYEINIGSNKEVLDGELLANIFTFVDGELKPDEQKARDYVRRLAIKYDTFGMDRKFKTTGKGEITVPGKDGIYGWQIDVNKTKDLLVEKLLNFKSESIEPVFIHKGLYYDKEDDIGNTYIEIDLTRQHMWLYKEGKLLLETDIVTGDVSKKVETPIGVMKVWSREKDRNLKGLSPLGYNYVAHVDYWMPINWTGVGIHDAPWRNGKFGGNIYKTSGSYGCINTPLDKVKQIYENVEINTPVIVYKSN >CP031971.1|AXU09922.1|193515_196605_+|Cna-B-type-domain-containing-protein MKSVINYKKYTFNNYYIRNCFNLLIILHKVYFLFKNYERRVIMKKKIITLLLAIFITISSIVPAVAMEQTTSDKTSNEKTSVNNVGNKENKILPNGEKGIKSKEEKDSNKLEKETKQKSNEKNSKEKEFNLLKEAKNVQMRPVKTHDDVIKKITVKSESGGPLGTVVQWQTVKVDMDFELPDHQVKEGDTTTIKLPDELVFVSTPAEFDVKDSQGNIVAKAKVDANQKTVTLTYTNYPETHSGVKGNLFFYSRIDHVKFKEKKKIDLNFKIGNKHISGGSIDWDGQGKPNGDYLQKASWKSSIGENVISYAVFINRKGQEIKNGWLEDTIDGEKVEYLKDKLKVVKGNWQWSGDKGDYELKNEIDITNSVIVNWNPNGKSFKLNFGDLSATEGITVYYKVKIGYTPVDGEVFKNKVKLTGEKIQERDAHNDYRYFTAGGKAEGYVYPIKIKKEGEKGESLAGAKFKLIRDRNNAVVGEYVTNEQGEIEIKDLLKDDYTLVETQAPKGYKLDNKEIKIKPDDFGTNKVAFKTITNKKERISIPIEKVWKGKALEKVEVTLKADGVVKEQVELSKTNNWKHTFENLDKYKDDGTLINYTIEEKAVPGYKTEIVQKDSNDITKGFVITNKETPKWTPMIPPTRNVKITKEWLGTDGSKITAPVDKIEVELYRDGKATGQKLELNKANNWTGEFKDLKAYESILNSKPYEYTIKEVGESNNSIKFDGKWFKVIYSGNMKDGIKVENKETPKWTPMIPPTRNVKITKEWLGTDGSKITAPVDKIEVELYRDGKATGQKLELNKANNWTGEFKDLKAYESILNLKPYEYTIKEVGESNNSIKFDGKWFKVIYSGNMKDGIKVENKETPKWIPMIPPTRNVKITKEWLGTDGSKITAPVDKIEVELYRDGKATGQKLELNKANNWTGEFKDLKAYESILNLKPYEYTIKEVGESNNSIKFDGKWFKVIYSGNMKDGIKVTNTLIPTTPPPMPPEKPKLPKTGIGINTLIYAGISSISGGIILLFLRKRKVKNEIDV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP031971_5 | 902609-902719 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP031971_5
|
1 spacers
spacers of CP031971_5
>5.1|902635|59|CP031971|CRISPRCasFinder TTTAAATTATATCGTAATTCCTTTTTGATTATTTTTTTGGTAATTACGATGAAATTAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP031971_5
The CRISPR arrays of CP031971_5 >merge|CP031971|5|902609-902719|CRISPRCasFinder TATAGTTTATCACAAGGCATAAAACTTTTAAATTATATCGTAATTCCTTTTTGATTATTTTTTTGGTAATTACGATGAAATTAATATAGTTTTATCACAAGGCATAAAACT >CP031971|5|5|902609-902719|CRISPRCasFinder TATAGTTTATCACAAGGCATAAAACT TTTAAATTATATCGTAATTCCTTTTTGATTATTTTTTTGGTAATTACGATGAAATTAAT ATAGTTTTATCACAAGGCATAAAACT
>CP031971.1|AXU10531.1|901055_902441_-|bifunctional-UDP-N-acetylglucosamine-diphosphorylase/glucosamine-1-phosphate-N-acetyltransferase-GlmU MNITIILAAGEGTRMKSKKSKVLHKIVNRTLIDYVYDASCDAGSDKTIIIVGKNKIEVEEKFGDKVLYKEQKIGKEYPYGTGYAVQLAVDEIRDDDSVLILSGDTPLIKGETLQKLLEEHIAMNSKATVLTAFINDTTGYGHIIKDNNGKFLKIVEDKDATIEEKRVKEINSGIYVFNGRALKNSITKIDQNNVQNELYLTDAIKVLVQDGEHVSTYKLDDIEEIYGINSKLQLFEAEKIMRYRINSEYMKNGVIMENPENTVIEKGISIGIDTFIGSGARIFGNTSIGENVYITGDSFIENSVIGNDVVIRSSYIEDSTVGDSVTMGPFAHLRPKSILKNEVHIGNFVEVKNSTVGENTKAGHLSYIGDAIVGKDVNMGCGSILVNYDGKNKHISEIGDGCFIGSNSNIVSPVKIANDTFIAAGTTVVSDIENEGSLIIGRSETFEKENWVYKKNLKIKK >CP031971.1|AXU10530.1|900076_901039_-|ribose-phosphate-pyrophosphokinase MLAYTGPMKIFSGTANRKFAEDICKCLDMPLGEITIGKFSDGEINLSVEETVRGYDVYIIQPTCNPTNDNLMEVLIMVDAFKRASAGRINVVIPYYGYARQDRKTKAREPITAKLVANLIEKSGADRVITMDLHAGQIQGYFDIPVDHLSAIKPLADFFKDELKDEDKKDMVVVSPDLGGVTRARNFSNYLDLPIAILEKRRPRPNVSEVMNVIGDIEGKTCIIVDDIIDTAGTITNAANALIAKGAKKVYITATHGVFSGKAIENIANSKVEKCVVTDTIPQEKNLGGKIEVVSVAQYFAKAIDRINNNRPVSMLFDGR >CP031971.1|AXU10529.1|899499_900087_-|aminoacyl-tRNA-hydrolase MEDNTFLIVGLGNPGKNYIGTRHNVGYGVIDILAEKYSINMKKEKFKSFYGQINMFGKKCIFLKPLTYMNLSGEAVIDAVNYFKIKPENIIVVVDDIDIPFGTVRIKKKGSAGTHNGLRSIIYHLETENFPRVKISVGKCPDYMDLKDFVLSKFLPSEEKILKKELEISADAVEEIIKNDVDKTMCKFNGMCIEE >CP031971.1|AXU10528.1|895956_899463_-|transcription-repair-coupling-factor MNFLIDFLKNNESYLDMISGLKSNNVPIYCNGLIKESLFHLIYSIFNDLPDKNLVLLVENENRANELCDELKSLVGDKVVVYPNFEIRFHNINSLETNLENIRIEIMNRLLSKEKFIIITTASALSKKISTPKFFKSHYIYIDENLEVNLKELTENLIKMHYDRVDFVEAKGQFSIRGSIFDIFPVNFKNPIRIELFGDDIDSIRIFDINSQRSVEKLNKVEIIPAKEMVLSKSDVENILNGLNKDIEKLQKLKLFGKDIEKSTEKFYQIYNDLKINYHISNMDLISPYIRKGSYSTLLDYLAQDSLICTEDILKIYDRNLEIENLFHENVVFSIENAEILDSHKDILIPFEHILRRIKDFSIINFTQLLKRTKIINPKSIINLKTIEAEIFNRKFDLLFQNLKSKLQRGYKIVIFAGSLEKANNLKEILYAENINSNIFEGLEFELKSSILGISTLNLESGFEYPIQKVLFLTHKEIYGTVRKTSKKTRKKSKENLLDYTDLNVGDFVVHENHGIGEYRGIEQIEVDGIVKDHILILYKGNDKLYIPTDQMNLIQKYIGKDGYKPKLNKLGSNDWIKTKTRAKKVLDEIAIDLVQLYAKRDKIKGFAFSEDTTWQKEFEDSFIYEETYSQLRAINEIKKDMEQFKPMDRLLCGDVGYGKTEVALRAAFKAMMDDKQVAFLVPTTILAQQHYNTAIDRVGNFPVEIEMLSRFRSPAKQKEILKNVKNGKVNLLIGTHKLLSKNLEFKDLGLLIIDEEQRFGVKHKETLKKIKENIDVLSLSATPIPRTMQMSLVGIRDMSILDDPPEERVTIATFVLEYNDSIIREAIYKEIDRGGQVYFVYNRIHDMDKMYVELSRLVPDAKIAMAHSKLSNKELENIMYDFQEGEYDILLCTTIIETGMDIKNCNTMIIYDADKMGLSQLYQLKGRIGRSTRRAYAYFTYEKDKVLTEISEKRLMAIRDFSEFGSGFKIAMRDLELRGAGNILGECQSGHIETIGYEMYVRMLEESIKTVKGENLQIKDQTTIELSVDAYIPSNYIVDNNQKIDMYRKIAAISSRDDFDEIYDELTDRFGNVPTTVLNVMNVSYLKTISTELNFIRIIDREKSVVFKFEQTNRDILQLIGRLSDVLFRKIEFNLNENAELIFNYDKDKLSESIDFVENLLFLKQKN >CP031971.1|AXU10527.1|894895_895882_-|peptidylprolyl-isomerase MKNRFIKFASAIALSAMLLTACASAPRGAMVKIGEKYITKDQVQKEYDRVIASYSDEQKAKYDESTEEGKKASLTLKQNILDMFSNIEVVKQKFAKLEKEYKDEGKSEEEIAKVSVTEQEINDNLAKVKEQLGDKFNEELEKAKLTEDELKYKIEDNLYSTKFQTWFSENYDPTDEEIMEKYKGSDFDGPQINASHILVENEEDAKKVKSRLEAGEKFEDVATEVSKDPSAKKNKGVLGTFTKGVMVKEFYDAAVKLKVGEISDPVKTKFGYHIIKLNEIVEDYDKFSDESKKRIKQNLKKSLLSEKFKTEFEKIQKEVGYLPIKNFK >CP031971.1|AXU10526.1|894498_894777_-|HU-family-DNA-binding-protein MNKSELLASMAEKGKITKVDAERALNAFIQTVEETLVKGEKVQLVGFGTFEARERKARSGRNPRNPKEVIKIPASKAPVFKAGKSLKEIVNK >CP031971.1|AXU10525.1|893536_894304_-|30S-ribosomal-protein-S2 MSQVILMKNLLEAGVHFGHQTRRWNPKMSKFIFTERNGIYIIDLQKTVKQIEQAYDFVREIVADGGRVLFVGTKKQAQEAVETEAKRSGQFYVSHRWLGGMLTNYKTIRKRIERLKKLELMEEDGTFQRLPKKEVIKLKREAEKLEKFLGGIKEMDKLPDVLFVIDPKNEKIAVNEAKILGIPVIGVVDTNCDPDEVDIAIPGNDDAIRAVKLLTGTIANAIVEAKQGEQVEAEETETVVEEVVEIEEVSEEVAE >CP031971.1|AXU10524.1|892372_893443_-|elongation-factor-Ts MEITAKLVKDLREATGAGMMECKKALQEVCGDMEKAIEFLREKGLAKAAKKANKVAAEGLITLVIDENNTKAALTEVNSQTDFVAKNENFVALTKKVTEHIFNNEIKNLEELNKSTIDGTNFEEFLKLQISSIGENIVVRRLAFAKACCENSIVCGYVHFNKKVGVILKANCDSEATKKGAKDLLQNVCMHISAMKPQYLSYKDLDVDFVEKEYLALKGSIEKENEELVRLGKQLKRIPKFASMSQITDEVLRAEEELLKEELKKQGKPEKIWDKILPGQIERFIQDNTLIDQQYALFSQQYVLDDNKTVLEAVNDKAKELGGNIEIVEYTRFEVGEGLEKKEENFAEEVAKQMGL >CP031971.1|AXU10523.1|890832_892227_+|MATE-family-efflux-transporter MKKERSEMILHGDIYKIIAIISIPIILNNFIQQLYSLADAFWLGKLGTAEFASTSFTWPVIFLFNSIGIGLSIAAISLISQLLGRKDFLHAQKYADTLINISLLFSIVFMLLGYFSADLIVKMMGATGNLAKYSVIYLKYSYLGIPFIFLYYIYSSILSAQGKNTIPTMISTICVILNMILNPIFIFDVIPFTSISGLGLGVKGAALATVLTQGIMCIVGFIHLRINKDIIKLNLHSLVYIKWEKHILKRIYRITLPSVIGQVGTAIGFMIMNSFIQSYGTETVAAYGMVNRISGLLNIPPGGIGSAITSIIGQNIGNNNIKRVKETFKKASIIIIIMSILIAFISFTFRYEILSFFINAPKESELMIQANSYMFYTLITLVMLNMFFVYQGLFQGSGNSKYSMAIDMIRLWVIRIPLILFFKYFTKQGATGIWLAMAISNILVTIIAHLIYLKGKWQQGSFCR >CP031971.1|AXU10522.1|889405_890452_-|extracellular-solute-binding-protein MKKSRILSLMLAGLMLVGCQSKKAEDKNEKKKVETTKNFEGKTLNVVATSEKYKKLFDKFSEETKAKVEFLSMSSGEVIAKLKAEGGKPSADVWFGGGIDAFMKAKSDGLLEMYKPEGFDKIKEGFKDNEGYWISKGVTVVGFLINNKILEEKGLKVPKTWAEIVDSKYKDEIIMANPAVSGTSFANVKGLIDKYGEEKAWEYFKKLNDNVKFYGKRGKDPQEKTVAGEFGIGIIPIDKSAFDVAEKNNLTAIYPEDGLCWVPEGVAIFKNSPNLEVAKAFEDFILRPENQQLIAELDGKDGVQMVIEGTKGYDLGLPKDKFIKEDIKSFGSQRDDILKKWAELTQGK >CP031971.1|AXU10532.1|902804_903380_-|hypothetical-protein MKIKDLVLVAILGALNLVVSMIVTFALFPLGPYAHCISPGIAGLFAGTVFVFMCNKVGKKGSFLLFSGVYLIAMAGAGFYLPWIISYTVSFIIGEVILSYMGYQNKIAQFIAFGLIQVGSECGQIIPVNFFLESFKKTWVGKNGVTESAINEMIKFSTGTYGLINLLIVFILGGLGVVIGNKILKKHFKKI >CP031971.1|AXU10533.1|903369_904797_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MDLLIKFENVSFTYEDSDKKALENISFEINKGELVLITGASGSGKSTIYKCINGLIPHIYDGELLGNIFIDDKNTKDCENYELCKIIGSVSQNPRGQFFTDNTTSELAFTLENLGYEVKEIVKKIENISNFFGISNILNKNVLEISGGEKQKISIACVSILDAKTLIFDEPSANLDYLGIELLKEIFLKLKKNGYTIVVVEHRIFYLKEIFDRLIHINKGKLIVNLDRKDALNYSAEDLRSLNPFDRELTMINKCSREEKILEIRNLKFKDIIKDISFDVYRGEIVGLVGKNGVGKSTISKLISGIYNKTSGKISSKSLPFVLMQDVDYQLFSESVFSEFFLSKKDLTDDEVLEILKVINLYEKRNCHPFSLSGGEKQRLLMGICAKSDSDILILDEPTSGLDFNNMTIISDIIKKLAKDKAIILISHDYELLSRVVDRVIFLENGKITEDFILKEKNQLTNIFQKIKGGKENEN >CP031971.1|AXU10534.1|904774_905467_-|cobalt-transporter MIEQRRINLFVLIFMNLIFGTLILVWNNFKLDMIYFCICSLILIYSGKTKRFIKFLIFYLFCLYIVFYIKLPDDSFFSFIGFISYSNVKMCPTYMIASFIVLDIRTSELIYVLGKLGFGKKIRFACTITLKFIPIYFAEKRIIKNALKLRGIDVSFTKPIKRFEYYIVPTLFRASNIANEMTESAYTRCAMCTDNMNSIYYKKFDIVDFILIVMLILLVASWGGGFIDKI >CP031971.1|AXU10535.1|905659_907390_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MEDVIMKMLKRMFQLTDKGTAGIVKASIASFFSYCSLMIPMILLMFFVQNVIEGKENSITFFVIGILIMLVVMYILMSIEYDCLYNETYKESANIRIEIAEILRKLPLSFFSKHDVSDLSQTIMKDVSVIEHAISHAIPKAIGLIFYLILIVIMLLIYNFKLALCILIPIILATGFILITKKIQVNGNKKYYNVMRGISEDFQESIELQQEIKSYGQVDKITKKIYDDIDYSEKIHIKAEGKMVLPLSISTNIQNLTLGATILFGTALYLKGEASILYLIGYIMCASKIIDAVNGMLSNFAELMYLDGNLQRIRELKSTKIQTGEAKELHNFDIEFKNVEFGYGENKVINDISFVAKQGEVTALVGPSGCGKTTVLRLMSRLYDYDSGKIIIDGNDIKGIETESLFENISIVFQEVTLFNTSILENIRFGNKNATDEQVKEAARLANCEEFIEKLPEKYNTLIGENGSKLSGGERQRISIARAFLKNAPIILLDEISASLDVENEMKIQESLNKLIKNKTVLVISHRMKSIENANKIIVMENGKIESQGNHNELLEKSKVYNTMVKNSSLAENYSY >CP031971.1|AXU10536.1|907377_909114_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNIYKKLFKYVPDKKHLVYIAIFMSVISSALSILPYWYLYKFLNEFLLKKDFTQAKNYAITIFVIMLLQSLIYFISVGFTHLFAFRLETNLRKAGISHLMKASFSFFDVNESGRIRKIIDDNASDTHMIVAHLIPDITVAIVTPILLFVIMFSVDVYLGIATVILTILSAIFTKLMYGDIKFMEQYNKALERVNSEAVEYVRGMQVLKIFKASIFSFKSFYDSIVDYSKTAYEYSKSCKQPYVIFQIVLLGAAAFVIPFAIMFSKGTENNVVIMIKLIFFTCFIGTLFSCLMRIMYVGMHQYMATQAVEKLENLFTEMEANDIKFGNNKEFSGYDIEFRNVSFKYDTANILENLSFRLEENKTYALVGSSGGGKSTIAKLISGFYNINEGEILIGGKNISTYSREALMNNISFVFQNSKLFKTTIFENVKIGNENASYEEVMNALKLARCGDILDKFETRENTVIGSKGVHLSGGEIQRIAIARAILKDAKIIILDEASAASDPENEHEIQLAFSNLMNNKTVIMIAHRLSSIRNVDEILVVDNGKIIERGTDKELMEIGGRYKFLQDLFSQANEWRM >CP031971.1|AXU10537.1|909361_910057_-|50S-ribosomal-protein-L1 MKKGKKYLESLKLIDKTNLYDLKEACELAVKTSTAKFDETVELHVKLGVDSRHADQQVRGTVVLPHGTGKTLRVLVLCKENKVQEAKDAGADYVGADDYIQKIQNENWFDFDVIVATPDMMGVVGRIGKILGPKGLMPNPKSGTVTFDIANAVKEIKAGKVEYRVDKANIVHCPVGKVSFGAEKIEENLRTIISAIIKAKPSAAKGKYLKSVSIATTMGPGIKLASTKLGE >CP031971.1|AXU10538.1|910103_910529_-|50S-ribosomal-protein-L11 MAKKVQALVKLQIPAGKATPAPPVGTALGPHGVNIMQFTKEFNAKTADQAGLIIPVVLTVYQDRSFTFITKTPPVPVLIKKKLGIESGSKVPNKTKVGNLTKEQVREIAEVKMPDLNAATIEAAISMVKGTARSMGITVEE >CP031971.1|AXU10539.1|910629_911169_-|transcription-termination/antitermination-factor-NusG MTTEELKDIKEKEAKWYVVHTYSGHENKVKANIEKLVVNRGNDIDIFEVVVPTVKEETETGKIKERQLFPGYVLVKMIITDISWYLVRNTRGVTGFVGSGNKPVPLSEKEVEALGVSAKPYDNVDIHEGDSITIIDGAFKDLTAKVIEVSQENGKLKAFVSLFGRDTLAELDFSDVIKN >CP031971.1|AXU10540.1|911202_911409_-|preprotein-translocase-subunit-SecE MATKTTDQKQKKTSFMRGVRHEFKKIVWPSKKSVFYYSLAVVTISIISSTMIWGLDNILKRLLGLIIH >CP031971.1|AXU10541.1|911431_911581_-|50S-ribosomal-protein-L33 MRDKVVLACTECKNRNYNTKKNKKVTTNRIELNKYCKFCKKHTLHRETK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP031971_6 | 953071-954676 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of CP031971_6
|
24 spacers
spacers of CP031971_6
>6.1|953101|38|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT TCATATCACGCAAACGGGCTAGACTATGTACCACATGA >6.2|953169|34|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGATTAGGTTCTAAATTAGCATCAACACTTGGGA >6.3|953233|34|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGATAGCACAGATTGTGTTTAGTGAAAAAACAG >6.4|953297|40|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGACTATCCAAAAACAAATAGAATTTTTAAATGCGAGAAT >6.5|953367|41|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAGCTGCAAAACCAATCGTGCTTTTTATAGCTAAACTCAT >6.6|953438|35|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTGCATTTAATACGTAATCACGCCTATAATATAA >6.7|953503|36|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTGTTCGGCTCTTTTTCTTTCTTTCTCTAGCTTC >6.8|953569|35|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CACGAAACAGAGCTTGTACTCGGAAGAACAATAAA >6.9|953634|36|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAATTCGATTCTAAAACATTTAATGCAGAAGCTTT >6.10|953700|35|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT CCTTTTTAGTAACTTTATTAAAGACAATGACCAAT >6.11|953765|36|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT TTTAAGTGAGTATGCATTTTATGTATTTAAAATAAT >6.12|953831|36|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT TCTTAAATTATTTGCTAACTGTATATATTATATCAT >6.13|953897|34|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGCGAATGGATTTATAAAGAAACAATAGCACCAG >6.14|953961|34|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAATTGAACAAATTTGTAATTCTATCAGAGAATT >6.15|954025|37|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAGCAAAGAAGATATAGAAAACAATACTTTCTTTAA >6.16|954092|34|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GATTTGATTTAAGAACTAATCTAACAAGACCTGA >6.17|954156|35|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTGTTGTATAAATTTAACATTTCTCTTGTTGTGTG >6.18|954221|37|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGATATAAATAAAATGGTGCAACACAATCATTGGAC >6.19|954288|36|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGAAAAAATTGAAGATTTATTTTTTGTAATATCGTA >6.20|954354|35|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGATGTTGATAAAATCGTGATAACAGTTACAGAGT >6.21|954419|34|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGATTAGCACAACTTTCTGCAGCAAAATTCACAG >6.22|954483|35|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAATTGAAGACGTGCTAGAAGATGCACCATTTTAG >6.23|954548|35|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAATTTATTGTAGAAAATCAGGATGAAGATAGAA >6.24|954613|34|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGAAAGAACTGTAAATGGACATGTTAATAGAATA |
cmr6gr7,cmr5gr11,cmr4gr7,cmr3gr5,cas10,cmr1gr7,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP031971_6
The CRISPR arrays of CP031971_6 >merge|CP031971|6|953071-954676|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR,PILER-CR TACGAAATTACAGTATGTTTCTATTTGAACTCATATCACGCAAACGGGCTAGACTATGTACCACATGAATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAACGGATTAGGTTCTAAATTAGCATCAACACTTGGGAATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAACAAGATAGCACAGATTGTGTTTAGTGAAAAAACAGATTCACATTACAGTATGTTTCTATTTAAACGGACTATCCAAAAACAAATAGAATTTTTAAATGCGAGAATATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAACTTAGCTGCAAAACCAATCGTGCTTTTTATAGCTAAACTCATATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAACCTTGCATTTAATACGTAATCACGCCTATAATATAAATTTACATTACAGTATATTTCTATTTAAACTTTTGTTCGGCTCTTTTTCTTTCTTTCTCTAGCTTCATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAACCACGAAACAGAGCTTGTACTCGGAAGAACAATAAAATTTACATTACAGTATGTTTATATTTAAACAAAATTCGATTCTAAAACATTTAATGCAGAAGCTTTATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAACCCTTTTTAGTAACTTTATTAAAGACAATGACCAATATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAACTTTAAGTGAGTATGCATTTTATGTATTTAAAATAATATTTCAATTCCAATAGATTTATATTTAAACTCTTAAATTATTTGCTAACTGTATATATTATATCATATTTGCATTATAGTATGTTTCTATTTAAACGGCGAATGGATTTATAAAGAAACAATAGCACCAGATTTACATTACAGTATGTTGCTATTTAAACAAATTGAACAAATTTGTAATTCTATCAGAGAATTATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAACAAAGCAAAGAAGATATAGAAAACAATACTTTCTTTAAATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAACGATTTGATTTAAGAACTAATCTAACAAGACCTGAATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAACCTGTTGTATAAATTTAACATTTCTCTTGTTGTGTGATTTACATTACAATATGTTTCTATTTAAACTTGATATAAATAAAATGGTGCAACACAATCATTGGACATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAACTGAAAAAATTGAAGATTTATTTTTTGTAATATCGTAATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAACTGATGTTGATAAAATCGTGATAACAGTTACAGAGTATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAACAGATTAGCACAACTTTCTGCAGCAAAATTCACAGATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAACCAATTGAAGACGTGCTAGAAGATGCACCATTTTAGATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAACAAAATTTATTGTAGAAAATCAGGATGAAGATAGAAATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAACGGAAAGAACTGTAAATGGACATGTTAATAGAATAATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAAT >CP031971|6|6|953071-954676|CRISPRCasFinder TACGAAATTACAGTATGTTTCTATTTGAAC TCATATCACGCAAACGGGCTAGACTATGTACCACATGA ATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAAC GGATTAGGTTCTAAATTAGCATCAACACTTGGGA ATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAAC AAGATAGCACAGATTGTGTTTAGTGAAAAAACAG ATTCACATTACAGTATGTTTCTATTTAAAC GGACTATCCAAAAACAAATAGAATTTTTAAATGCGAGAAT ATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAAC TTAGCTGCAAAACCAATCGTGCTTTTTATAGCTAAACTCAT ATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAAC CTTGCATTTAATACGTAATCACGCCTATAATATAA ATTTACATTACAGTATATTTCTATTTAAAC TTTTGTTCGGCTCTTTTTCTTTCTTTCTCTAGCTTC ATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAAC CACGAAACAGAGCTTGTACTCGGAAGAACAATAAA ATTTACATTACAGTATGTTTATATTTAAAC AAAATTCGATTCTAAAACATTTAATGCAGAAGCTTT ATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAAC CCTTTTTAGTAACTTTATTAAAGACAATGACCAAT ATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAAC TTTAAGTGAGTATGCATTTTATGTATTTAAAATAAT ATTTCAATTCCAATAGATTTATATTTAAAC TCTTAAATTATTTGCTAACTGTATATATTATATCAT ATTTGCATTATAGTATGTTTCTATTTAAAC GGCGAATGGATTTATAAAGAAACAATAGCACCAG ATTTACATTACAGTATGTTGCTATTTAAAC AAATTGAACAAATTTGTAATTCTATCAGAGAATT ATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAAC AAAGCAAAGAAGATATAGAAAACAATACTTTCTTTAA ATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAAC GATTTGATTTAAGAACTAATCTAACAAGACCTGA ATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAAC CTGTTGTATAAATTTAACATTTCTCTTGTTGTGTG ATTTACATTACAATATGTTTCTATTTAAAC TTGATATAAATAAAATGGTGCAACACAATCATTGGAC ATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAAC TGAAAAAATTGAAGATTTATTTTTTGTAATATCGTA ATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAAC TGATGTTGATAAAATCGTGATAACAGTTACAGAGT ATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAAC AGATTAGCACAACTTTCTGCAGCAAAATTCACAG ATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAAC CAATTGAAGACGTGCTAGAAGATGCACCATTTTAG ATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAAC AAAATTTATTGTAGAAAATCAGGATGAAGATAGAA ATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAAC GGAAAGAACTGTAAATGGACATGTTAATAGAATA ATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAAT >CP031971|6|1|953071-954676|CRT TACGAAATTACAGTATGTTTCTATTTGAAC TCATATCACGCAAACGGGCTAGACTATGTACCACATGA ATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAAC GGATTAGGTTCTAAATTAGCATCAACACTTGGGA ATTTACATTACAGTATGTTTCTATTTAAAC AAGATAGCACAGATTGTGTTTAGTGAAAAAACAG ATTCACATTACAGTATGTTTCTATTTAAAC 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>CP031971.1|AXU10574.1|952293_952854_-|hypothetical-protein MNEFNKYKILSAGKAFGHRAKIALLLLDSSTAYEELKEEATQTSVAGSYDCVGGFPAEILERIIMELICCNTWYLPDNVKFWDRRFGSLFETKFFCYDNDVETWSKILNKFFVKLKWMPKREDYSSTKSFNNAWGYFAELLAVVKENNHPEFNDYYEIAIKNGMNEAVFEKKLKKLSEIKQSFINV >CP031971.1|AXU10573.1|951710_952196_-|hypothetical-protein MDILFLQVVLYCLLFTLLVALSFRGNMINIIYFYPKSVIDKVVEFGYTDYKTIKRKKIIFYSLFIVLMFGSLILIVGLWNEIKDFKQAFIQLNIFLQSWNIFDGLVMDILWTSNSKKLKIKGIEDSEYIPSVLDVIKKRIIFIPALLIVALILAKIIVLIY >CP031971.1|AXU10572.1|950710_951412_-|HAD-family-hydrolase MKAILFDLDGTLLPLDEKLFVDIYFTELSKVFSEYNIESNKLVEAIWTATHEIIKNDGKRTNEEAFWEKFKSIINIDLSNVKEVLEKFYANEFFTKLKKCSTENNLAKVAVNLAKKNGRKVVLATNPVFPIDALVRLKWTGLDIDDFDYVTHYSNSSFSKPNPKYYLDLCKKLDVEPKECLMIGNDERQDIFAASSAGMNCYLVTDYLYTYPECKVNCEKGSFKDLIEKLKVL >CP031971.1|AXU10571.1|949708_950344_+|tRNA-(guanosine(46)-N7)-methyltransferase-TrmB 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MRIIKRDLSEVSFDISKIENAIYKAFISVGDEDKKLLSKRLAEEVFESILQDKAENSSISVEEVQDYVEKTLTKNNHYETLKSYILYREKRNSLRKELNSFREYIEDEILIEVLAKIQKDFSTEGYELDRLCRKFLSFVKPNSTLNEKVELLIKASSELTSKENPNWEYISARIYAYKIHKEISNYEKEWHIVDFKSKIQALTKANLYGEYILENYSSDDIDELEKYIDNSRDELFTYSSLDLVYKRYLICDSHKKVIETMQEMFMGIAMHLAIPEKNRVSFAKKVYDVLSNLKATVATPTMSNARKPFHQLSSCFIDTVPDTLKGIYRSIDNFAQVSKHGGGMGLYFGKVRASGSDIRGFKGVAGGVIRWIKLANDTAVAVDQLGVRQGSCAVYLDVWHRDIPEFLNLRTNNGDDRMKAHDVFPAICFPNLFWRLAKENINSNWYLFCPHEVKEVMGFCLEDFYGEEWEEKYRLCIKEPRLDKRILTVKDLVKLILKSQVETGTPFIFNRDNANNANPNSHKGMIYSSNLCTEIMQNMKEILDVEDKILQIDGEDHVVTDVKAGDFVVCNLASLVLGNIDLKNDEEMEFVVSTMIRALDNVIDLNYYPTPFAKITNAKYRAIGLGTSGYHHALVKNKIMWQTEEHLEFMDKVYEKINYFAIKESSKIAEEKGSYKYFEGSEWQNGKYFEKRDYNSKEWIELKEKVAKNGLRNAYLLAVAPTGSTSIIAGTTAGVDPVMMRYFLEEKKGSIIPRVAPDLTSETFWLYENAHEVDQTWSIKAGGVRQRHIDQGQSLNLYITTDYKMSQILKLLILSCEVGLKSIYYIRSKSLDIEECDSCSA >CP031971.1|AXU10570.1|945885_946935_-|ribonucleotide-diphosphate-reductase-subunit-beta MELNKKALFNENGDIELSKRKMINGNTTNLNDFNNVKYTWTTEWYRNAMNNFWIPEEINLFQDLKDYKILDEYEKTAFDKVLSFLIFLDSIQTANLPYIGEYITANEINLCLTIQAYQEAIHSQSYGYMLDSICSPEERTNILYQWRDDEHLLARNKFIGDLYNEFQENKDPYSLVKTMVANYILEGVYFYSGFMFFYNLGRNGKMPGSVQEIRYINRDENTHLWLFKKMILELQNEEPELFTEEKVAVYKDMIKTGVEQEIAWGKYVLGENIPGLTMQMVEDYIKYLGNLRSTALNFGKLYDGYDEEPESMKWVSEYSDPNAIKTDFFEAKPSAYSKASVIDDDLDDL >CP031971.1|AXU10569.1|944716_945733_-|zinc-ABC-transporter-substrate-binding-protein MNIKLKKIISIIMISCMFLVACSSNKDEKNKEQKTTEQKGNKKVIYTTFFPVTDLTKRIVGDKMEVKTIIKGSQEPHSFELKAGDMQEIAKADLVIYNGANMESFISSIEEAVKDKNKFLNLSQGLTLLESGDGLEEEAEHEDGDKHEDEHGHGHGHNHKHGHDKTNPHTWLSVKNAIIQLDTIYKKVSSIDPENEAYYKENLKKAQDEFRALDKKFETELSKVKSKQKYFVVSHAAFNYLANDYGLKQVAVTGISPEDEPSAKQLQKIADFVKKYKINTIFFEGKATPKVAETLAKNTNTKTDTLYTMENLTDEEIEMGYLKLMELNLKALLKSFNE >CP031971.1|AXU10568.1|942790_944707_-|hypothetical-protein MSRNLKKKIYKMNLILVCSAVLLASCSKKQEEKEKTSTKKFEFVEKETNYKKDETTEVLIDAEIKKGDIVRSYKHGDHWHVFTKDGKEHITYTDPSKLGDGNSLSLVSVVSRNKLRGLNVRSILKHGDHWHVYTADGREYLTYEDPSSMFPNITVGTYVGSHNSHRNRRNSNNYSHANIIEEKKDRVVKILRHGDHWHIYTASGKEYISYTDPTSKYPDAEVGEYQGNHGDSQNNTENENPSEKPNVPSASEKLYEARKNLNIVNVLGKNPVDRYDIVKILKHGDHYHIYDSKGNEGITYTDPRSLYPNAEFGEYKGNHGDENKKPFEWPKGVTKIVDHGDHWHLYIGDKEVGVVHENPRSHYPDAEYIKEGSDHSDIGVDEKELFTYESVKAEIKDKVIPYLDSNLRAMRHYGDLDTTLPVYGSNGVKKGIFYWLHGGHYHAITIKQIIQNAKAGQYGDCTAREIVAALKYIIQNPDKEIESKVTVDREEVVKYLMKVYNLKDRTDVNIIGDIAYVYINDETLTFSLADFEKVNGEIRYKKKLPEAPKKAKKDNEDYVDEEDTKDYSGYEEEKNKITKKNSEESKEKIVEEKSAEKNNSVPKAEDKKVDDKKDVEKTKINKSTKSEEKNEEKENKNN >CP031971.1|AXU10567.1|942295_942580_-|co-chaperone-GroES MKLKPIGDKLVIEMVEVEEKTSSGIVLPTSAKEAPSVAKVLAIGDEILKDEDKKDLIKVGDKIIFSKYAGTEVKLDKKEYIVVKIADVLAVVED >CP031971.1|AXU10566.1|940652_942284_-|chaperonin-GroEL MAKEIKFNEEARKGMEAGINKLSNTVKVTLGPKGRNVVLDKKFGSPLITNDGVTIAREIELEDPYENMGAQLVKEVATKTNDVAGDGTTTATLLAQAIIREGLKNVAAGANPMIIQKGIKKAVDKAVEGIKEFSKPVETKESIAQVASISAADEEVGKLISDAMEKVGKDGVITVEESRSMGTTLEVVEGMQFDRGYVSPYMVTNTEKMEAELEDPYILITDKKITNIQEVLPVLEQIVQQGKPLLIIADDVEGEAMATLVVNKLRGTFNCVAVKAPAFGDRRKDMLQDIAILTGGTVISEDLGYELKETSIEMLGKARRVTVGKELTVIVNGAGEQSAIEERVALIRNQIEISDSEYDRDKLQERLAKLAGGVAVIQVGAATETELKERKLRIEDALAATRAAVEEGIVPGGGTVLLNVIPKVKALLEETNGDERTGVNIIVKALEEPVRQIAINAGLEGSVIVENVKNAEVGIGFDALSEKYVNMLESGIVDPTKVTRSALQNASSVASMVLTTEAAVADVTKDEPMGQMPGGMNPGMGYM >CP031971.1|AXU10575.1|954914_955700_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr6 MRKKQMSDNIGYVFYNINIEDDSKNITENVKKILNYNLEKNENSFLYNTNFNKIFKDYNKNNNSKPNYEEQKLKTTYPGLLVGLGNAPMGVLIDESNEGEIKTGFSFDYVTGLPHIPGSTVKGIIRSRIKKYEKSILEWLKEEVKLENFSGNIDELINELFGSSKNTNVNKRDVFFDAVITSSGKIFEDDFITPHKNEYSGVNPIRILKIKEGVEITFRFLIRKNDILGIKDYDRKNLYVNILKELGVGAKTNTGYGFLKK >CP031971.1|AXU10576.1|955677_956136_-|hypothetical-protein MISNRNIDEFITCAIDILENEKEIVKNGKIKKGYSSQISTFGSAISTGSLLSGIAYFSKSGDSSVNRSRLMWIIYEILKNTNRLNTNLQKEIKNEVSELELYYYVKKITQDKNKKEIIKLKRTIIEIATAIKLAMNYFVIENTNLDEEKTNE >CP031971.1|AXU10577.1|956150_957005_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr4 MESKFYGLKCITNLFVGNGDNSYGIIDNQVEKDPILETPIIPSSSLKGSLRDFFENNSDNNIKITEIFGSDAKETKNTNSGSYSFFTAQLLFRPMRVSDGNFTYCLVTTVDLLEKMIQMVSDLNGDLPCDMLKAIKKVKEKMNNLKDKYGISNKDISVEGYDLEYCKEDVNKDVNKAIDLLLNIFEKFNLKNGVPIVILKPEIFKEIDLPIVARNQLEDGLSNNLWYEEIVPHESIFYFAVMYPDNNDSFKKFDEELRSNIIRFGGGASIGYGYCKIEEYTINK >CP031971.1|AXU10578.1|956980_958195_-|CRISPR-associated-protein-Cmr3 MSSIYKILFTPLEEYFFGDEGSFFSEIDEKQGYYLVSKDIPSQTTIFGIIRYLGLAHIKSDYNYTFEEYEANKTAIGCKGFNIEKAITENNSQKNFGKIKNISSIFIHEFSENLSKIFVPIPKDAKFDKSKYSSILEEYVEIEADNSKKYVPKDFDYKKGILDGYISIDYGYNTVKNELKGNTGDLEILTDLFTGIVKSRIRIYSNEEREKRKKNNEQDDEMSSLFKREYKIFNPKINKELSFGVFLETDFDDDYMEKHYNNIVGMGLGNKKFKVACEKVEAERIRLKENLTINVDKIFEKHNHKNNIIYFISPSWIEDSKIIKKSLFASINSTRNRPQINNSEIKNQIEKTKTLYRMIDSGSIIITDNKDEILKKLNNIAMKQIGYNHIYVGGEKKWKVNFMD >CP031971.1|AXU10579.1|958199_959765_-|hypothetical-protein MSNKYIGITVGPIVETLLLTTKPAGLWGASYIFSYFSKTLIENLIESKNVKKEDFIIPLWTDEISKKVKKSQVGLLHDRIIFRTNENTDLSAIEKTINRTKEDVAKIIIKAFDNCNCSKEKTDVEEYIKKYIRTHTVCIEGEIENDYNVILKIGKYLSSLELENTFIEKEEMNYILKFLENRSSMESGKSEGSNDILKNSDLTNFKDGWYFENENGIVSIDDISGINNKGDNKNNTDGYFALVQMDGDSLGKILGTLDENKLKDFSKNCFDYADKASAIINEYGGKVVYAGGDDILFLAPLISNNSNQHLFSLIEEISKIFNEIFDYSNVTLSAGIFICYYKYPLCEGLKSVFNLLNKSKEDGKCRTTIQLEQHSKSMGTLQLKTSFEDADVFKLLIKWLDDVNSKNENKVDLLRSIQRKISIYETLFLKALESEKKEEKLNILFKNLFEEVENNQKEDNYISVTNIDLKNAISFLVKSYKHKEENKIKNISKQVLDELNTLISILKFYVKEKKIKTEEGK >CP031971.1|AXU10580.1|959754_961116_-|hypothetical-protein 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MDDFYSKHIFIASFKLENNSRDIISDNVWKEDFIDDVNTVGELVDNYANYNYFNKQAQNLIFNYEKNNTDKGDSKVVNYKFSSINSSENSKYIINVNEEKTYKLNLDKIILKEYEIANKKIYLMMIYVTNNDYDSLSDIKNINQYGRRLYSPWISLDIGNGINTECPDDLKIHIGDKFIYSNDKNDGKADLNYKNEEIFKYNFDDKNKYKSYSERLNSIRQKEVNDKNDKSIIKNPHKSNLIQNILNYEKESKDEKIKIELINPDRMYVGFYLKNNSLIERIKKYSTEKQEYSTEKEEYAYLYDDSLSDQLYALAYIDGGDATCQSKVMRKKLLQETIYDRWIDWGTIHTVTHNGFGCIASDGAPYESVIMPFLTEYMEMMALVLLQRNLLLEFHLKAKELSPDFNSKKLENLQKDYVKFKTQVLLFEVTPQEQGYEIYRLMQKQLYIDEEKEKLDDIMNSLYEVANIEHSIKLNKKIRCLTIIGVIVAIISLIISFEPVKNFIICLVCNIINLK >CP031971.1|AXU10582.1|962751_963492_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MKIVLKFKTDNNFIPKDYHRFCIKFFKTAVSNYSNGEFFEKFFGDDYIKSDEKKYSWAVKFFKPKFFPNRIEVGENNFEITFKAPKTDVGTIFFNSFLEYKDKEFKISENNFIVLTDAKIVNEKKIVGNCARFKFCSPLVIREHNREDNTDRHITVEDEDFFNKFKENLKIHFPNYSNAIDDMKMDISEMKKAVVLFYGLYIDVSLGIIIINADNSLLNEMLISSVGSKNASGFGLLQLIDSWEMI >CP031971.1|AXU10583.1|963571_964258_-|hypothetical-protein 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP031971_7 | 1207897-1208031 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP031971_7
|
1 spacers
spacers of CP031971_7
>7.1|1207947|35|CP031971|CRISPRCasFinder TCGCAACTCTTTTTGATTTCTTTTATGGTTGTTGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP031971_7
The CRISPR arrays of CP031971_7 >merge|CP031971|7|1207897-1208031|CRISPRCasFinder GATGAAATTATTGTACCTTTATCACAAGGCATAAAGCTACAATAATTATATCGCAACTCTTTTTGATTTCTTTTATGGTTGTTGCGATGAAATTATTGTACCTTTATCACAAGGCATAAAGCTACAATAATTATA >CP031971|7|7|1207897-1208031|CRISPRCasFinder GATGAAATTATTGTACCTTTATCACAAGGCATAAAGCTACAATAATTATA TCGCAACTCTTTTTGATTTCTTTTATGGTTGTTGC GATGAAATTATTGTACCTTTATCACAAGGCATAAAGCTACAATAATTATA
>CP031971.1|AXU10816.1|1207242_1207743_-|dihydrofolate-reductase MILENLYLIVAITEKTNAIGKDNNLLYFLKEDMNFFKEKTCGNSIICGRKTFEGFKIKPLPKRKNIVLTKSDFSFEGVRRFKNIEDLINFVKENPKEKFFVCGGMSIYEQLIDFCSRMYITKYEEKEAVEADSHFPKIDEKVWKVVEKIDGKSENPKLTFYTYERI >CP031971.1|AXU10815.1|1206444_1207239_-|SrtB-family-sortase MKKEDIIIKKSRKKQSKVKKWFWNILFVICLGVFVYSAGNIIKDYYGSYKAGKDLSNLKESVFKSSNNANEKKTDKEKVVNLEELKKLNSDSIGWLEIPGTNIDEPLVQGKDNDYYLWRDFKKNKYPVTGTLFLDMYNKADFSDRISYIFGHNIWDKTKFYDLRKFEDKTFLENHKTFYVYTEKGKLEYEVLSVDLVDPDTPLYELSSKRNEDVDAMKKELSKHISKSEVDKIDKNTKLLMLVTCKTPDDNTARRILFAKLKEK >CP031971.1|AXU10814.1|1205352_1206330_-|glycosyltransferase-family-2-protein MDKISVIVPVYNVEKYVKKCLDSISNQTYENIEIIIVNDGATDNSENICKEFVENENRAKLYTKENGGLSSARNHGMRFVTGKYVLFIDSDDYIAEGMVEELYKNIKEEDADVSVCGVYNVYSDNQSPQCKEEIYFCCGKERFLKEYFIGEKIPGTICNKLISYEIASKISFPVSKIYEDAFYQFELVKYAKKYVVTTKPYYYYFHRENSITTKPYTVKNMNCIEIYSNFYDYINREIPSLSEYAFFRLSYAYFMVFDKMLLSEGYKNILEYREVLDFLKKNFWKIFRNKNFRKGRRIAVLMLKLNVKLYRFLLLKDLKRKGVNA >CP031971.1|AXU10813.1|1204543_1205353_-|phosphorylcholine-transferase-LicD MEIKYLSMDEIKSVELEILKYIHNFCIENDIKYFLNYGTLIGAVRHKGFIPWDDDIDICMFRKDYEKFIDLFSKDDGIYKILSLETDDKYYNNFMKVINSKTKIEDERNYKTYDLGIFVDIFPIDSFDDLKLVEKTYKLESFKLLSFSKKENIQYGDSKLKDFVRLFFWTMLKPVSPRIFARKIKEAVEKYSKENGKYFGVVGCSKLKYDDVFDYNPFDELAEFEFEGCNFFAPKKYDEILKKYYGDYMKFPPIDKQKYPHEIKAYFVD >CP031971.1|AXU10812.1|1203721_1204534_-|phosphorylcholine-transferase-LicD MKERLTVDELKNYELNILKFIDYVCKKYDIKYFVNYGTLLGSVRHKGFIPWDDDIDISMYREDYERFQKAVIEEDNERYGILSKDNSEWYFQNFFVVIDKYTLLEDNVKRNRRDSNVFVDVFPIDRFNDLNFVKKAHLMVTLRHICFIKKKFIIHKDSRIKDFCRVTFWYLLKFVNPRFFTKKIEKLVEKYSDENGIYEGAVGVDKTGMKEVFKAGTYEELIELPFEDMMVPAPKNYDKILTQFYGDYMQKPSDAEIEYKSHLLDAYRIK >CP031971.1|AXU10811.1|1202193_1203702_-|virulence-factor-MviN MAKNIKVNALASVLVRVFNILFPLITGPYLARILSKEAYGEFNVANSILNLFIPFAAFGIYSYGIRSISRVKNNIKEISKNFTVLFSINLISSLGIGILYIGYMFLNVNSNMYMLYIALSIQIFTQFVSIEWMNEAFENYGFILFKTLFVRVLMLVSIFAFVKKADDIVNYAFILSITNLVNYLISFYYIKRKVKFVKIELKDILIHIKPLIGMLLLANSYMLYTALDRAVLSLLDAKISVSYYTFALSIAQLITSVVYSIIVVSIPRLSYYHGNSDEKNYTELLNQVARTFLFLVIPMGIGLSCVSDEVMLIYAGEKYLEAGFILKLFSLRIVMWALDQLLANQVLFVRGYEKNITAFYFIGGFLNLILNIVLLKLKVVQAEYFVYTTLFSEIVVLIIQIYFITKRNIISINEILKSYVKYILCAVPFFAITYGINHTLKYSLNLNLQFFVRVLAIIVSCVLYYFIIMLITKDKILFVTLDGIKNKFRVIKYKLKSKKYKG >CP031971.1|AXU10810.1|1200298_1202077_-|winged-helix-turn-helix-transcriptional-regulator MLAIQDFDILNLFFKNRNKKYTQREISSITKISLGKVNKTLKELKNNEFIDEDLKITDKGLSALEPYKVDNAIIMAAGMSSRFAPLCYETPKGLLNVKGEKLIEREILQLKEAGIEDITLVVGYMKEKMFYLAEKFGVDIVVNEDYYRFNNTSSLILVTEKLKNTYICSSDNYFPKNPFEKYVYRAYYSAVYQDGETDEYYAEFDKKGRITGVTIGGKDDWIMLGHVFFDREFSDKFVKLLKAEYNEQIVRENLWETFYMRHIKELDNMYIRKYDLEDIKEFDSLEELRLFDEKYVTNSDSEIFQNICNILRCKEEEIKNIKPIKMGMTNTSFKFSCKEKSYVYRHPGPGTELIINRKSEFDSMKIAKELSLDDTYIYMDKDIGWKISKYIENVKILNPFDKKNVKRAISMLKKLHTSGRKTNFKFNIFDEIENFKIKIRNSHRDNFDDMSLMNDKIYKLKTFLDKDDTNECICHCDSYDLNFLLDNRDKMYLIDWEYSAMSDPAVDIGCFITSSKYSFDEAIDIIKEYFNGKPTDKQLMHYIAYIAVSSFYWFLWAINQEIQGKSIGEYLYIWYNHTKEYADYALKLYEQE >CP031971.1|AXU10809.1|1199260_1200106_-|energy-coupling-factor-transporter-ATPase MDEKIIDIKDLRYEYSGEDGKKSTALDGVSFSVNKGELISILGHNGSGKSTLAKLLNAQITPTDGEIEIFGINTKDENRIWDIRQKCAMVFQNPDNQLVATVVEEDVAFGPENLGVPSAEIRERVDEALEIVEMQEYKKHSPHMLSGGQKQRVAIAGILAMKPDVIIFDESTAMLDPIGRKDIIDTILKLNKEENKTILYITHYMEEAVLADRVIVLNEGKIEFDDSPKKVFSNVETLRELGLSVPQVTELAYLLKNDGVEIPSDILTNDEMIKFLERKLK >CP031971.1|AXU10808.1|1198406_1199261_-|energy-coupling-factor-transporter-ATPase MDINFKNVSFVYGEKTPFEKLALDNIDLTIKKGEFVGIIGHTGSGKSTLIQHFNGILKPTSGDVFIGDMNTKDKELAKSGLRYKIGLVFQYPEYQLFEETIEKDIAFGPKNMGLSEEEVTERVKEAMEIVGLDYEAKKDKSPFEISGGQKRRVAIAGILAMKPDILILDEPTAGLDPKGRDELFFQIKRLYEKNNITIVLISHSMEDVAKLVNRIIIMKNGHIHLDKSTKEAFSDVDDLKKVGLNVPQITELMDILRKKGHHFSKNILTVDEAFSEIKRELRKN >CP031971.1|AXU10807.1|1197588_1198407_-|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT MVKNISIGRFFPGDSIVHRLDPRLKLYFIFMFILSIFFIKSFLVFIPLAIFLFSIIKIAKLPILMVLKGLRGIFYIVLFTVILNLLLTPGEVLFRIWIINITKEGIKLSAFMSVRIILLVIGTSLLTLTTSPIVLTDALEYVMKPFEKIKFPAHSVAMMMTIALRFIPTILDEMDKITKAQTARGADFETGSIISRAKSLIPLLVPLFVNALKRADELAVAMEARCYRGGEGRTRMNVLKYSRTDYIVMAFITVFFGLVIASRYFLNIWIFN >CP031971.1|AXU10817.1|1208146_1208830_-|DUF1980-domain-containing-protein MNKKILSLILFCLLLCSCSKADGNSNFIKNKENKNDLKSALKNDPENAGTDKNEKKSGETDKNQNPDDYKLERHQGQNDSKDEYKQPEKKDELTKEQLNKKRDADSKDGIINISDGIFLALVNDIYVNKDEYVGKKVRISGQNVRFEDKDTGEVVYAILREGPGCCYNDSVIGFEYITDGKYPEKDKWYEMVGEVIVDKYKTGKVVKLKLIDIKEIEPKGKLIHFQN >CP031971.1|AXU10818.1|1208822_1209641_-|metal-ABC-transporter-permease MISLISEMLSYPFMVKAIFVGLLISISSALLGITLVLKRYAMIGVGLSNVSFAALSIALSFDISPIEFSMPIVIIAGIILLKYGEKYNISSDTAIALLSCVSVSIGVTFTAVTKGLNVDVCNYLFGSILIMKRSDMYISFVLGIIVLISYILLYNKIYTITVDEDFAKASGVNINLYNTLVTILISVTIVIGMKFMGSMLISCLIIFPAMTSMRIFKSYKAVVISSVIISTIALFIGITISYIYSTPTGASIVLVNLVLFVISCIVRRFISE >CP031971.1|AXU10819.1|1209633_1210305_-|metal-ABC-transporter-ATP-binding-protein MKEKILVCENLEIFYKNNKIIDNLSFSVDEGDFFLILGKNGIGKSTLLKGILGLKNISSGEIKKNFKICGYMSQEVLLKKEFPSTIWEFVLSSRAVYSKFFYGSKDIAVVKENLKKLNLWEIKDKSISSLSIGQRQRVLLCRCLCVSEKIIFLDEPTNSLDINVRKMLYDILEKLNKEGLTIVMISHDEEAFKYSNRALVLGKENRVIENVLEKYEKGEINFD >CP031971.1|AXU10820.1|1210304_1211333_-|zinc-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKNISKKIFGLILAGAVLITGCTAKTEKKDKGDNTKGKLKIVTTIFPEYDITRAIAKDKVDLELMIKPGVDVHSFTPTPQDIKTVQNSDIFVYGGTEHDKWVENLTKSIDMKNKKVVKLVDGIQQLEEESVDGMKHEHHHDDKKEDEHNHDHKHEKEDEHNHKGEEKELDPHYWTSPKNAIQMVKTITNALVEKDPDNAEFYKENAENYIKQLEGVDKELHDVVDNAKIKKVVIADRFPFRYLFKDLGLEYRALFSGCSVESTASAGQIKKMVDYVKENKIPVVYHIEMGKGELAETVAKNSGAKVKLLHSIHTVTKEDFDKGITYIDLMKQNVEALKEGLN >CP031971.1|AXU10821.1|1211594_1212374_+|hypothetical-protein MKTIFEKQHMKFTRKDGSVLTVKKDGVSYEDAKKEKKSFDISFDKISYIIALSYCNSNSNYNLLFEKKDKSAPIDFTSDTTIINDCHNILETKSILLAHAAYKLTKDFPNNLDTLDIDLARSLREKAIRISNGVISGAKHSININEIRRVQCASNGTISNLLIYKKEKKTFWNIPDMRIPCNEIALPLIEAIVTRNTGNGIDFSWGNGFDQKNSNYIIMRYMDSNFFINNDDTFDTEWQKQIYNRIRIFDHDLEYLLNK >CP031971.1|AXU10822.1|1212393_1213869_+|nicotinate-phosphoribosyltransferase MNRDFNEFNISILSDFYEYTMAQGYFNENLDNKITYFDIFYRENPDGASYAIFSGLEHLTQILNSMRFNDEDIEYFKSLNTFDDKFLNFLKNFKFECDIWSVPEGSVIFPYEPIMTVRGPAVQAQLIETIALLIINHESLIATKSNRIKRAAKGRAVMEFGARRAQGIDASVYGAKASYIAGIDGTSNVLTGKLFNIPVLGTMAHSWVQMFDTELEAFKAFAKSFPNNCVLLVDTYNTLQSGIPNAIKTFDEILKPMGIRPKGIRLDSGDLAYLSKQARKMLDNAGYEDAQIVVSNSLDEYTIRDLLHQEAKIDSFGIGERLITSKTHPVFGGVYKLVAIEENGKIIPKIKVSENVDKITTPGVKNLYRIYDRKTKKAEADLITLFDEKIDENKPISIFHPIYTWKTTTYEDYILRPMLKQIFKNGELIYKLPDIKEIREYCASEIESLWDEFKRFDNPHIYKVDLSKDLWELKNNLLKETIQISKKQKTE >CP031971.1|AXU11232.1|1213938_1214619_-|hypothetical-protein MIDIMVLIIASIAVYYGLKFKSQLVFALNVLVSSTSLGYLFVSAFGVGACLGLFCGLSSLTTSSVSREGKSFWVIATAPIGINTHIISKIFACQVLHFISAIIVVALSMVLYVFNPLVYVAVILGMALTLFTSGSLNMILGLINPYFDWKTPKEALNGGSGGINIFISILINYGLYGLIIFVTVKMIKWNYNIPYVVLADLIIILITAVISYLIDRKLFKRLLKRL >CP031971.1|AXU10823.1|1215625_1216357_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIEFKNVSKVFSKGVKAVDNISFTIEEGEIFGFLGPNGAGKSTSLKMMVGILEQTEGKITVNGVDTLENSIEVKEMISYVPDNPDIYTKMTGIKYLNFIADIYGIDEKVRKEKIEEYNQKLELGDAIYSTIDSYSHGMRQKLVLIGALITSPKVLILDEPMVGLDVKTSFNLKNILREFADAGNTVIFSTHVMEVAEKICDKLVIINKGKIAFCGKLSELKTEEHSNEDLEKIFLELTDNEKI >CP031971.1|AXU10824.1|1216502_1217231_-|hypothetical-protein MNNKIRIDKKNIRIFGIMLFLVVTLFVAFFTHRYIENRSTSNTNIVGLDINNLPEYKGKPYVVINNNEPNFEKSELVPKSFEKYSELDSLKRCGVADSIIGQDLMPTSKRENISSVKPTGWKSVKYNGIEGGSLYNRCHLIGFQLAGENANKRNLITGTRYLNTKGMLPFENMIADYVKETNNHVRYRVTPIFVGNELVARGIQIEAISIEDNGKAIKFNVYCFNIQPNIEIDYKTGNSWRK >CP031971.1|AXU10825.1|1217223_1217643_-|hypothetical-protein MKLVVCLDENNGIKFFGKRQSQDELQRKNLFELIGNLKLFLTEYSYDLYKDIEFNFEIIDENTEIIKNSVFLYEGDFLEKFLPSVDEIIVYFWNRDYPFDETFDEFLQDCWKEIEIFEFKGKSHEKITRKIFVKENKDE |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP031971_4 | 4.1|181128|27|CP031971|CRISPRCasFinder | 181128-181154 | 27 | CP031971.1 | 1288427-1288453 | 1 | 0.963 |
1. spacer 4.1|181128|27|CP031971|CRISPRCasFinder matches to position: 1288427-1288453, mismatch: 1, identity: 0.963
cgaagtaacaaggttctcgggcaccca CRISPR spacer cgaagcaacaaggttctcgggcaccca Protospacer *****.*********************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP031971_3 | 3.1|175362|30|CP031971|CRISPRCasFinder | 175362-175391 | 30 | AP014360 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S40-C32, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 4962-4991 | 7 | 0.767 |
CP031971_3 | 3.1|175362|30|CP031971|CRISPRCasFinder | 175362-175391 | 30 | MK250029 | Prevotella phage Lak-C1, complete genome | 30001-30030 | 7 | 0.767 |
CP031971_3 | 3.1|175362|30|CP031971|CRISPRCasFinder | 175362-175391 | 30 | MK250016 | Prevotella phage Lak-A1, complete genome | 54733-54762 | 7 | 0.767 |
CP031971_3 | 3.1|175362|30|CP031971|CRISPRCasFinder | 175362-175391 | 30 | MK250019 | Prevotella phage Lak-A2, complete genome | 519720-519749 | 7 | 0.767 |
CP031971_6 | 6.23|954548|35|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 954548-954582 | 35 | NZ_CP049158 | Caballeronia sp. SBC1 plasmid pSBC1_2, complete sequence | 1026918-1026952 | 7 | 0.8 |
CP031971_6 | 6.23|954548|35|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 954548-954582 | 35 | NZ_CP049318 | Caballeronia sp. SBC2 plasmid pSBC2-2, complete sequence | 1031598-1031632 | 7 | 0.8 |
CP031971_3 | 3.1|175362|30|CP031971|CRISPRCasFinder | 175362-175391 | 30 | NZ_CP033781 | Staphylococcus epidermidis strain FDAARGOS_529 plasmid unnamed1, complete sequence | 17567-17596 | 9 | 0.7 |
CP031971_6 | 6.11|953765|36|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT | 953765-953800 | 36 | NZ_CP007649 | Lactobacillus salivarius strain JCM1046 plasmid pLMP1046, complete sequence | 44508-44543 | 9 | 0.75 |
CP031971_6 | 6.15|954025|37|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 954025-954061 | 37 | MN657060 | Psychrobacter sp. strain ANT_P25 plasmid pA25P1, complete sequence | 3704-3740 | 9 | 0.757 |
CP031971_6 | 6.19|954288|36|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 954288-954323 | 36 | NZ_CP040940 | Cetia pacifica strain TB6 plasmid unnamed1, complete sequence | 22286-22321 | 9 | 0.75 |
CP031971_6 | 6.3|953233|34|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 953233-953266 | 34 | MN694000 | Marine virus AFVG_250M989, complete genome | 12802-12835 | 10 | 0.706 |
CP031971_6 | 6.24|954613|34|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 954613-954646 | 34 | MK448844 | Streptococcus phage Javan116, complete genome | 6158-6191 | 10 | 0.706 |
CP031971_7 | 7.1|1207947|35|CP031971|CRISPRCasFinder | 1207947-1207981 | 35 | NZ_CP016739 | Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM3 plasmid pJM3C, complete sequence | 24117-24151 | 10 | 0.714 |
CP031971_7 | 7.1|1207947|35|CP031971|CRISPRCasFinder | 1207947-1207981 | 35 | NZ_CP028104 | Fusobacterium varium ATCC 27725 plasmid pFvar_27725, complete sequence | 11274-11308 | 10 | 0.714 |
1. spacer 3.1|175362|30|CP031971|CRISPRCasFinder matches to AP014360 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S40-C32, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
agttgaatctgaaattgtagatgttccagc CRISPR spacer tatagtttgtgaaattgtagatgatccagc Protospacer .* * * ************** ******
2. spacer 3.1|175362|30|CP031971|CRISPRCasFinder matches to MK250029 (Prevotella phage Lak-C1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
agttgaatctgaaattgtagatgttccagc CRISPR spacer aacaaattctgaaattgaagatattccagc Protospacer *.. .* ********** ****.*******
3. spacer 3.1|175362|30|CP031971|CRISPRCasFinder matches to MK250016 (Prevotella phage Lak-A1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
agttgaatctgaaattgtagatgttccagc CRISPR spacer aacaaattctgaaattgaagatattccagc Protospacer *.. .* ********** ****.*******
4. spacer 3.1|175362|30|CP031971|CRISPRCasFinder matches to MK250019 (Prevotella phage Lak-A2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
agttgaatctgaaattgtagatgttccagc CRISPR spacer aacaaattctgaaattgaagatattccagc Protospacer *.. .* ********** ****.*******
5. spacer 6.23|954548|35|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP049158 (Caballeronia sp. SBC1 plasmid pSBC1_2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
aaaatttattgtagaaaatcaggat-gaagatagaa CRISPR spacer aaaatttattgtataaattcaggatcgtttatagg- Protospacer ************* *** ******* * ****.
6. spacer 6.23|954548|35|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP049318 (Caballeronia sp. SBC2 plasmid pSBC2-2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
aaaatttattgtagaaaatcaggat-gaagatagaa CRISPR spacer aaaatttattgtataaattcaggatcgtttatagg- Protospacer ************* *** ******* * ****.
7. spacer 3.1|175362|30|CP031971|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033781 (Staphylococcus epidermidis strain FDAARGOS_529 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
agttgaatctgaaattgtagatgttccagc CRISPR spacer tgttgaatttgaaattgtaaatgtgttgaa Protospacer *******.**********.**** ....
8. spacer 6.11|953765|36|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP007649 (Lactobacillus salivarius strain JCM1046 plasmid pLMP1046, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
-tttaagtgagtatgcattttatgtatttaaaataat CRISPR spacer acttgcat-agtaagcattttctgtatttaaaatatc Protospacer .**. .* **** ******* ************* .
9. spacer 6.15|954025|37|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN657060 (Psychrobacter sp. strain ANT_P25 plasmid pA25P1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
aaagcaaagaagatatagaaaacaatactttctttaa CRISPR spacer ctagtaaagaagatataaaaaacaatacttgcgattc Protospacer **.************.************ * *
10. spacer 6.19|954288|36|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP040940 (Cetia pacifica strain TB6 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tgaaaaaattgaagatttattttttg-------taatatcgta CRISPR spacer tgaaaaacttgaagatatattttttgatgaggttaa------- Protospacer ******* ******** ********* ***
11. spacer 6.3|953233|34|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694000 (Marine virus AFVG_250M989, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
aagatagcacagattgtgtttagtgaaaaaacag CRISPR spacer ggtcaaacgaagattgagtttagtgaaacaacag Protospacer .. *.*. ****** *********** *****
12. spacer 6.24|954613|34|CP031971|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448844 (Streptococcus phage Javan116, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ggaaagaactgtaaatggacatgttaatagaata CRISPR spacer aagtaggtatgtaaatggacacgttaattgaatt Protospacer ... **. ************.****** ****
13. spacer 7.1|1207947|35|CP031971|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016739 (Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM3 plasmid pJM3C, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tcgcaactctttttgatttcttttatggttgttgc CRISPR spacer ctccaactcttttttatttctattatggaaaattc Protospacer .. *********** ****** ****** . * *
14. spacer 7.1|1207947|35|CP031971|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028104 (Fusobacterium varium ATCC 27725 plasmid pFvar_27725, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tcgcaactctttttgatttcttttatggttgttgc CRISPR spacer cctagaaacttttttatttcttttatggtagttat Protospacer .* .* ****** ************** ***..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
247429 : 268800
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP031971|247429:268800|DBSCAN-SWA 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MIQHLKEKRLAYGLSQNRLAIATGITRQYLSDIETGKVKPSDELQQSLWETLERFNPDAPLEMLFDYVRIRFPTMDVQHVVEEILQLKLSYFLHEDYGFYSYSEHYALGDIFVLCSHEIDKGVLVELKGRGCRQFESYLLAQQRSWYEFFMDALVAGGVMKRLDLAINDKTGILNIPTLTEKCLQEECISVFRSFKSYRSGELVRKDEKECMGNTLYIGSLQSEVYFCIYEKDYEQYKKNDIPIEDAEVKNRFEIRLKNERAYYAVRDLLVYDNPEHTAFKIINRYIRFVDKDDSKARSDWKLNEEWAWFIGNNRERLKLTTKPEPYSFQRTLNWLSHQVAPTLKVAITLDEINQTQVVKDILDHAKLTDRHKQILKQQSVKEQDVITTKK >CP031971|247429:268800|263660_264878_+|AXU09981.1|integrase|DBSCAN-SWA MSEKRRDNKGRILKTGESQRKDGRYLYKYIDSFGEPQFVYSWKLVATDRVPAGKRDCISLREKIAELQKDIHDGIDVVGKKMTLCQLYAKQNAQRPKVRKNTETGRKYLMDILKKDKLGVRSIDSIKPSDAKEWAIRMSENGYAYQTINNYKRSLKASFYIAIQDDCVRKNPFDFQLKAVLDDDTVPKTVLTEEQEEKLLAFAKADKTYSKNYDEILILLKTGLRISEFGGLTLPDLDFENRLVNIDHQLLRDTEIGYYIETPKTKSGERQVPMVEEAYQAFKRVLANRKNDKRVEIDGYSDFLFLNRKNYPKVASDYNGMMKGLVKKYNKYNEDKLPHITPHSLRHTFCTNYANAGMNPKALQYIMGHANIAMTLNYYAHATFDSAMAEMKRLNKEKQQERLVA >CP031971|247429:268800|252208_254656_+|AXU09969.1|DBSCAN-SWA 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>CP031971|247429:268800|254658_256836_+|AXU09970.1|DBSCAN-SWA MKPSILNRIKSNWTLKRLGKVAMTVAFTLVIAIFLLAMMGTVVQAAGLVDDTINVANEYSRYPLENYQLDFYVDNSWGWLPWNWSDGIGKQVMYGLYAITNFIWTISLYVSNATGYLVQEAYSLDFISATADSIGKNMQTLAGVTPSGLSTEGFYVGFLLLLILVLGVYVAYTGLIKRETTKAIHAIVNFVMVFILSASFIAYAPDYIKKINDFSSDISQASLSLGTKIVMPHSDSQGKDSVDLIRDSLFSIQVQQPWLLLQYNSSDIESIGADRVESLLSTSPDSNNGEDREKIVAEEIEDRNNVNMTITKTINRLGTVFFLFVFNIGISIFVFLLTGIMIFSQVLFIIYAMFLPVSFILSMIPSFDGMSKRAITKLFNTILTRAGITLIITTAFSISTMLYTLSAGYPFFLIAFLQIVTFAGIYFKLGDLMSMFSLQSNDSQSVGSRVMRKPRMLMHAHMHRLQRKLGRSMTALGAGSAIASATGKQGQSGSSGRTQADHTRPDGQEKSTLGKRIGQTIGAVADTKDKIVDSAGNLKEQVKDIPTNARYAVYQGKSKAKENVRDLTSSISQTRADRASGRKEQQEQRRKTIAERRSEMEQVKQKKQPASSVHERPATKQEQSHDGQTAKQSSVQALRMESQQAKQERPAVKSDSSSLKAERQNRTTQERTVQKPATSTTPADRASQRPVTKERPSTVQRVQSQNLRNRPPIKSATIKKGSKKP >CP031971|247429:268800|262265_262688_+|AXU09977.1|DBSCAN-SWA MKPSSFQTTIENQFDYICKRAMEDERKNYMLYLSRIAKREVSFSDVGDYLVSQFATTDNYSTDFQIFTLNGLSVGVENDLLSEALRELPDKKREILLLFYFMDMSDSEIADLLKLNRSTVYRHRTSGLALIKKFMEEFEE >CP031971|247429:268800|265327_267073_+|AXU09982.1|DBSCAN-SWA MKQKSPATILWELAKKEHSKLKTSVFIASIGVIAGIIPYIAASRILVELLKGNEDFKIYSLWLGIGLLSYILKSFLYSMALSVSHKATFSVLKDVRLRMLEKLPKMPLGEIISVPSGNFKQIIVDQVESMEKPLAHLLPEMTSNLLGSLSIFIYLLFLDWRMALLSLVSIPVGMLFMGLVMKNYAVQYEGSVKVNREMNSAIIEYVNGIEVIKTFNQDKRSYAKYKDKVIANARYFYEWMKSCQLPVSLSKNISPTTMITVLPFGWYFYISGSLSAEVFISVIILSLGIAGPLLETINFVDGLAKIGTIANSINLILEGKEQKHSDREVTIQQYNIDLQNVKFGYEEEKEILHGISLNIKEGTTVAFVGPSGSGKSTLAKLIAGYWDITEGNINIGGYNLNEIPLKQLYSLTAFVSQDNFLFNESIRENIRMGNPSASDKEVEDIAKKSGCHDFIMKMEHGYDTVVGSSGSHVSGGERQRISIARAMLKNAPIVILDEATSYIDPENEVIIKQALSKLIKDKTVIIIAHRLSTITDAEQIFLIENGKLVSYGKHDELLKGCELYRNMWNAHIGTKDGGMKC >CP031971|247429:268800|259142_261062_+|AXU09974.1|DBSCAN-SWA 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>CP031971|247429:268800|262684_262915_+|AXU09978.1|DBSCAN-SWA MKTQYPMIPFPLIVKATDGDTEAINQILHHYRGYITKRSLRLMKDEYGNQSMVVDEVLRGRMETRLITKILSFEIK >CP031971|247429:268800|251321_251819_+|AXU09967.1|DBSCAN-SWA MDDMQVYIANLGKYNEGELVGAWFTFPIDFEEVKEKIGLNDEYEEYAIHDYELPFTVDEYTSIGELNRLWEMVSELPEELQSELSALLTHFSSIEELSEHQEDIIIHSDCDDMADVARYYIEETGVLGEVPTSLQNYIDYESYGRDLEISGTFITTNYGIFEIVY >CP031971|247429:268800|261965_262037_+|AXU11208.1|DBSCAN-SWA MKYIIYNKFPYIGFLSKKVVYLQ >CP031971|247429:268800|261162_261348_+|AXU09975.1|DBSCAN-SWA MNYKWILCPVCGNKTRLKIREDTELKKFPLYCPKCRQENLIEIKQFKVTVITEPDAKTQSR >CP031971|247429:268800|249562_249718_+|AXU09964.1|DBSCAN-SWA MLAGVAIATPAPNPPYLTGGYKSTGNSQKNSRKFFGYKEFRKFRGMSNELQ >CP031971|247429:268800|247429_247744_+|AXU09961.1|DBSCAN-SWA MELKFVIPNMEKTFGNLEFAGEDKVVQRRINGRLTVLSRSYNLYSDVQRADDIVVVLPAEAGEKHFGFEERVKLVNPRITAEGYKIGTRGFTNYLLHADDMIKE >CP031971|247429:268800|263375_263579_+|AXU09980.1|DBSCAN-SWA MKQTDIPIWERYTLTIEEASKYFRIGENKLRRLAEENKNANWLIMNGNRIQIKRKQFEKIIDTLDAI >CP031971|247429:268800|257830_258766_+|AXU09972.1|DBSCAN-SWA MRKEDLMMKFRKNQNKEKQIPKEKKPRVYYKVNPHKKVVIALWVLLGLSFSFAIFKHFTAIDTHTIHETTIIEKEYVDTHHVENFVENFAKVYYSWEQSDKSIDNRMESLKGYLTDELQALNVDTVRKDIPVSSSVRGFQIWTVEPTGDNEFNVTYSVDQLITEGENTKTVHSAYIVSVYVDGSGNMVLVKNPTITNIPKKSSYKPKAIESEGTVDSITTNEINEFLTTFFKLYPTATASELSYYVNDGILKPIGKEYIFQELVNPIHNRKDNQVTVSLTVEYIDQQTKATQVSQFDLVLEKNGSNWKIIE >CP031971|247429:268800|259040_259127_+|AXU09973.1|DBSCAN-SWA MLCIPMVMHKNPSDKSIYHWDFYALLGF >CP031971|247429:268800|256832_257834_+|AXU09971.1|DBSCAN-SWA MKLKALVIGGSGLFLMVFSLLLFVAILFSDEQDGGFSNIHYGGVNVSAEVLAHKPMVEKYAREYGIEEYVNVLLAIIQVESGGTAEDVMQSSESLGLPPNSLSTEESIKQGVKYFSELLASRDRLGVDLESVIQSYNYGGGFLGYVANRGNKYTFELAQSFSKEYSDGEKVSYPNPIAIPINGGWRYNYGNMFYVQLVTQYLVTTQFNDNTVQAIMNEALKYEGWKYVYGGASPTTSFDCSGLTQWTYGKAGIKLPRTAQQQYDVTQHIPLSEAKAGDLVFFHSTYNAGSYITHVGIYLGNNRMFHAGDPIGYADLTSPYWQQHLVGAGRIKQ >CP031971|247429:268800|261407_261761_-|AXU09976.1|DBSCAN-SWA MRKKEDKYDFRAFGLAIKEARLKRGLTREQVGALIEIDPRYLTNIENKGQHPSIQVLYDLVSLLHVSVDEFFLPANNLVKSTRRLQIEKYMDSFTDKELSLMESLASGINEARNIED |
24 | Streptococcus_phage(90.0%) | integrase | attL 242746:242762|attR 275206:275222 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
360855 : 382137
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP031971|360855:382137|DBSCAN-SWA TATGAAAATGAAAAGATACTATATGCCAACACTTAGGGAAGATCCACAAGAGGCAGAAATTATAAGTCATAAATTGCTTTTAAGAGCCGGAATGATTAGAAAGAGTGCTGCAGGAATTTACTCCTATCTTCCTCTTGGTTACAGAACAATTAGAAAAGTTGAAAATATTGTAAGGAAAGAAATGGATAGAATGGGTGGATATGAAATTTTAATGTCTGCACTTCAGCCAAAAGAAATATGGGAAGAATCAGGAAGATGGCAAACTTTTGGACCAGAAATGTTTAAAGTTAAAGATAGAAATGAAAGAGAATTCTGTCTTGGACCTACTGCTGAAGAATATTTTACAACTTTAATTAGTGGAGAAATAAAAAGCTATAAACAATTACCTTTAAATATTTATCAAATTCAAACAAAATATCGAGATGAAAAAAGACCACGTTTTGGTATAAACAGAGCCAGAGAATTTTCAATGAAAGATGCTTATACTTTTGATGTAAGCCCTGAAATGATGATGGAATCTTATAAAGAAATGTGGAAGGCATATGAAAAAGTTTTTAATAGATTAGGACTTAATTATAAAATTGTTGCCGGAGATGCCGGAGCAATGGGAGGAAACAGTTCACATGAATTTATTGCTCTTTCTGATGTTGGAGAAGGAGTTATCTGTTACTGTGACGAAAGTGGATATGCTGCTACAGATGAAAAAGCAGAAGTTATTTACAAAGTTGACGAAAGTGGAGATGAAAAGGAACTTGAATTAGTTTATACTCCAAACTGTAAAACGATAGAAGATGTCGCAAACTTTTTAAAACAAGACGCTTCAAAATGTATTAAGGCGATAGATTTGATTGTTGCAGGAGAACCAATTATAGTATTTGTTCCGGGAGATAGAGAGCTTAATATGACAAAACTTTGCGCTTATCTTGGTATTCCAGAACATGAAATTGAAATGATGGACGAAGAAACTATTATAAAAATTGGATCATCAGCTGGATACACAGGACCAGTAAACTTGAAAGTAAGAAAGATTTTAGATAAGAGAGTTACTCTTATGAAAAATACTGTAGTTGGTGGAAATAAGGAAAATCATCACTATATAAATTGTAATTTTGGAAGAGATTTTGATGGAGAAATTGCAGAAGATTTACTTATGGTTCAAGAGGGAGATGTTTGTCCTGTAAGTGGACATCCTTTGAAATTTGCAAGAGGGATAGAAGTTGGAAATATCTTTCAACTTGGAACAAAATATTCTAAGGCTTTAAACGCGACTTTCTTAGACGAAAATGGAGTTAGTCAATACTTTTGGATGGGAAGCCATGGTATTGGTATTACAAGAAGCATTACTGCAATTATTGAACAAAATAATGATGAAAAAGGAATTATTTGGCCAATCCAAGTTGCACCATATCATGCAATAGTTACAGTTGTAAATATTAATGATGAAGAACAAATGAAACTTGGTGAAAAAATCCATGATGAATTGGAAGCTCAAGGTGTTGAAGTTATGCTTGACGATAGAAAAGAAAGAATAGGCGTTAAATTTAATGATAGAGATTTAATTGGTATTCCTTTAAGAATAACTGTTGGTAAAAAAGCTAATGAAAATATAATTGAATTTTCAACAAGAAGAAAAATGGAGAATATTGAAACGACTTCTGAAGATGCAATTAATAAAGTTGTAGAAGAGGTTAGAAAGATAAAATAATATTTAAATACCACGTATTTTTATGTGGTATTTTTTCCAATTAATTATATCTTATTTTTTCTATTTAATTGGGTATCATATAAATGATTTATATTAATTTGGCGATTAGGAGTTTTTTATGGATAGTGATTTCAATACAAAAATTCAAAAACAAAAAATAAGTCGTGAAAGACGAAAAGAATTAAAAAATAGATTAAAAAAAGAGTTGGGAGATAGGATGAGATTCGTCTATATAGCTTCTTTTTTGTCTTGGATTCAGTTCTTGATGAGAATTATTTCTTTTGGCTTTATAGCAAAGGGATTTTCTAATTTATATAATAAAATAGATTTTAATCTTTTTGCTTATGTTGTAATTGCAATCGGATTAAATATTTTCGGTTTTTGGATTTCTATTTTTGCTAAGAGATACCAAGGAGTAGCTTCTCAATTTGCGAGAGATAATTTAAAAGTTAAATTTTTTGATGCCTTTTCTAAAAGTGATGAAGAAGTCTTTAAAGGCTATTCAACAGCAGATGTACTTACAGTTGCATCTCAAGGGATTGACAGTTTAGATACTTTTTACAGTAATTATTTGACAACAACTTTAAGAACATATTTTAATTGTGCAACAATTTTATTGATTGTAGCTTTTATCTATCCTTTGGGTGGTTTGGTCTTTTTAGTTAGTATTCCTTTTATTCCTGTTTCAATAGTGTTAATACAAAAGCGTTCAGCAAAGATTATGCAACATTATTGGTCAACTTATATGGATGTAAGTAATTTATTTATGGACGATTTAAAAGGATTGAATACTCTTTATTCTTATAGTGCAGATGAGATTTATGAGAAGAAATTTAATGAATCTGCTGAAAACTTTAGACTTTCCACTATGGAACTTTTAAAATTTCAACTTCAATCCGTTGGATATATGGATGGAGTTATGTATCTTGGAATTGCAATTTCAGGATTTTTAGCGGTTCTTTCAGTTTCAAAAGGCAATATGTCAATCTTTAATTTTATATTCTTTGTTTTGATTGCAACTGAATTTTTTACTCCAATTAGAGAATTGGGATATTGTATGCATTTACTTATGATGAATACTAAAATGGCAGATAGGATTTTTACTTTTTTAGATAGTGTTAAGTTAGAAAAGAAAAAAGACATCTCAAATATAGAATTGGAAAGTATAGATAATATTGAATTTAAAAATTTATCTTTTTCATATGAGAATAGAGATGTTTTAAATAATATTAATTTAAGTATAAATAAAGGTAGTTTATTCGCAATAGCAGGAGAGAGTGGACTTGGAAAGAGTACTTTTGCAAAAATTTTGTTTAAAAATCTTGAGAATTATTCCGGTGAGATTTTGATAGATGGGAAATCTTTAAGAGATTTCTTGAAGTCAGATATAAATGTATTAGGTTTTTATGTATCTCCTGATTCTTATGTCTTTAATGAAAGCATTATGGATAATTTGAAAAAAGCTACGAAAATGCCTGAACACGAAATTTTAGAATGGATTGAGGAGAAAAATATTCTAAAATTTGTAAAGACTTTGCCTGACGGTTTTAATACAATTATTGGAGAAAACGGAAGATTGATTTCTCCGGGGCAAAGGCAACAGATAATTTGTGTTAGAAGTTTACTTGCAAATAGAAAAATTTACATTTTTGATGAAATGACATCAAGTGTTGATACCGAAAATGAAATAGCAATTTTGGATTTAATCAAAATGATTTCTAAAAATTCCATAGTTATGTTTATTTCTCATAAGATGAAACAGGTTAATAAAGCTGACTTTGTTTTATTTATGGGAAAAGAAAAAAGTTGGGATTTTGGAAAACCGGAAGATTTATACAATTCAAACTTTGAATATAGATTATTATTAGATAAACAAAATGAAATGGAGGAAATTTTAAATGAAAGATAGTTTAATATTAGTAGCTAGACTTATAGATTTTATGAAAAAATTACTCCCTATAATTTTGTTAGCTGTATTTTTTGCTGTTTTCGGCTTTTTGATTACAGTATATATTCCTGCAAGAATTATTTCATTGGGATTTGATGCACTTAATGGAGAAAAAATAAAAATAATATCTTTGATAGTTTTAGTCATTTTTGCGATTTCAAGAGGACTTTTCAGATATGGAGAGCATTATTTCGGACATTTTGTTGCTTTTAATGTTTTGGCTGATTTTAGAAGAGAAATTTTTTCAAAACTTAGAAGACTTGCTCCGTCAAAACTTGACTCTCAAGACAGCGGGGCTTTACTTAAACTGATAGGAGAAGATGTTGAAGCGTTGGAAGTATTCTTTGCACATACTCTAGCTCCAATTACAACAGGGACTATTGTTTCAATAGTTTTAATTGTATATTTTTTACAATATAATTTTCATTTAAGCTTAATTGCAATAATTGTATATTTTATACTTGCAGTTATTATTCCAAATGTATTTTCAAGCAAATTAAAACCACATCTTGAAATTCAACAAAAATATAGAAAATCATATACTTCATATTTCTTGGAAAGTTTAAGAGGGATGAAAGATTTACTTCAACTTGGAGTTGAAAAGGAAAGGTTTAAGAATCTGGAAAGAGAAAGTAAAATTGTAAATAAAAAGGAAAGAAATGTTGCAAAATTAAATTTCTTACAATTTTCATTCAGTTTTTTAACAATAGGTTTTGGAGTTTTAACTTTTGCTTTTGCGGAATTTATACTCGTAAATAAAAATATAATAAGTATTAAAGATGCAGTAATTACATTGGTTGTTTTCAGTTCATCATTTGCTCCTTTTTTAGAGTTAAGCAGACTTCCTTTAGGACTTGGACGTGCATTACAAGCTGCAAAACAAACTTTTAGTTTATTAGATGAAAATGAGCCTATTGGAAATGATGGAAGTAAAGAAATTGAGAAATTAAATGAAATAAAATTTGAAAATGTTGATTTCTCTTATCCTAATAGAGATAAGAATATTTTTGAAAATTTGAATTTACATTTTGAAGATAAAAAAATTGTCGGACTTGTTGGAGAAAGTGGATCCGGAAAAAGTACATTGATGAAAATGGTAATGAAATGGTATATGGCAAAATCCGGAAAAATATTTTTAAATGATGAGGATATTTTAGATATAGACAGTAGAAAACTACAAGAAAAAATTGCTTATATTCCACAATTTCCACAAATTTTTTCTCAAACAATCAGAGAAAATTTAGTCTTAGGAAATGATAAGATTACTGATGAAGAAATTTTAGAAATTGCTGAAAAATGTAGATTAAAGGATGTAATTTTATCAACTGAAAATGGACTTGATACTAA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17 | Bacillus_phage(22.22%) | tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
660451 : 675067
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP031971|660451:675067|DBSCAN-SWA 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12 | Cyanophage(22.22%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1601393 : 1634924
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP031971|1601393:1634924|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP031971|1601393:1634924|1618079_1619471_+|AXU11163.1|terminase|DBSCAN-SWA MATKRKGNQNPTQSLILSTKRSDYKDAIEIYETSKRKAQKWQKNLIKAILSKTSKGLWKHTKFGYSLPRRNGKNEVIVIRELFALKNNEKVLHTAHRTTTSHSAWERLTSILDKSGIAYNSLRAAGREMVEVSGGGRVDFRTRSSKGGLGEGFDLLIIDEAQEYTDDQESALKYVVTDSKNPQTIFCGTPPTPVSSGTVFTNLRNKALNQETKNTGWAEWSVSEQTDPRNIESWYLTNPSLGTIFTERSVEDEIGSDEIDFNIQRLGLWIKYNQKSAISETDWGLLKVNKVPNLRGKLFAGIKYGADGTNVAMSIAVKTEDERIFVESIDCQTVRNGNLWIINFLKNADVAEVVIDGQSGQKILFDEILEYKLRKPILPTVKEVVVANSMWEQGIFQKTICHKDQPSLTKVATNCEKRFIGVSGGFGYKSQYEDNDIALMDSALLAHWICSISKPPKKQKIKY >CP031971|1601393:1634924|1631601_1631844_+|AXU11180.1|holin|DBSCAN-SWA MKNLNLKIRLKNKTFIVTMLTTIIAFVYQMLAQFEIVPKITQDQTIQVLMLIVNILAGLGILVDPTTAGVKDSERVLNKK >CP031971|1601393:1634924|1623260_1623641_+|AXU11173.1|DBSCAN-SWA MKENEDLIICDLAETYNIIDYKKLPLSTVAILVYGLRDNSRLKMKVFKAKMETKDYLLAGIYDRLTLLVYANTKDAQKGRNKPKMLLDTIEKSKDNVSSFNSGEDFEKAKANILKNIKEKECDNNE >CP031971|1601393:1634924|1625657_1626374_+|AXU11175.1|tail|DBSCAN-SWA 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55 | Streptococcus_phage(35.48%) | capsid,holin,integrase,terminase,portal,tail | attL 1581449:1581477|attR 1639624:1639652 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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