Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP020380 | Clostridioides difficile strain DSM 102978 chromosome, complete genome | 18 crisprs | csa3,WYL,c2c9_V-U4,cas14j,cas3,DEDDh,DinG,cas14k,RT,cas5,cas7,cas6,cas2,cas1,cas4,cas8b2 | 14 | 87 | 15 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP020380_1 | 31917-32002 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP020380_1
|
1 spacers
spacers of CP020380_1
>1.1|31941|38|CP020380|CRISPRCasFinder TAGCAACAGAATAAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP020380_1
The CRISPR arrays of CP020380_1 >merge|CP020380|1|31917-32002|CRISPRCasFinder GTTGGCGCCGTGCTTTAGCACTTTTAGCAACAGAATAAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGCCGTGCTTTAGCACTTT >CP020380|1|1|31917-32002|CRISPRCasFinder GTTGGCGCCGTGCTTTAGCACTTT TAGCAACAGAATAAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTT GTTGGCGCCGTGCTTTAGCACTTT
>CP020380.1|AXU33551.1|28624_29830_-|glycosyl-transferase MSKKVLIMSASTGGGHNRAALAIKEELTSKTLDGEPIKCEIIDSLKLVNNTMDKIISRGYEKSAIYTPKAYGSVYRLSETNLLSKNEFKDNLLITFMAKKFKKLIRNEKPDLIIGTHPFPMIALSTLKKNFNLHNNESNAYTEHFYKHYTNTINVPPLISVLTDYTTHSTWIQNEIDYYIVGHEYVKELLVFDGVEPSKIRTFGIPVEKSFLSHRDKDIVLSELNLSPDKLTVLLMGGSFGAGNIKETLDELLDTDRDFQILVITGKNESLKEKIEKKLMSRYHDKNVCVLGYTDKMNDILASIDVLVSKPGGLTTTEALLKDVPMIVPYYIPGQEEENLDFLSNCGAALRTTKKYNLSILLKVLIDDPSRLEMLKRNIKSIRKSNSAQNIANLILNIISG >CP020380.1|AXU33550.1|28332_28554_+|hypothetical-protein MKPIMNLEEHNAMKEKRVKKMKSKDKPKYDDFEDISFSNKKKTKKNVRNKNAEFRNNYKNYQYDYEEDFYEPI >CP020380.1|AXU33549.1|27591_28191_+|recombination-protein MQVYTGPITRLIEEFSKLPGVGRKTAQRLAFHIINMNTNDVEALSKAIIDAKREIRYCSICCNITDTDPCSMCSNKSRDSSVICVVEDPRDVAAMERTREFKGQYHVLNGVISPMDGIGPDMLKIKELIQRLGNQEVKEIIMATNPTIEGEATAMYIARLVKPMGIKVTRIAHGLPVGGDLEYADEVTISKALEGRREI >CP020380.1|AXU33548.1|27228_27579_+|DNA-binding-protein,-YbaB/EbfC-family MAKKGFGGGMMPGGGNMNNLLKQAQKMQENMQKAQQELESKEVEASVGGGAVTVKVNGKKEVIDITIKPEVVDPDDIEMLQDLVLSAVNQALRNIDDIQASQMSKVTGGMNIPGLF >CP020380.1|AXU33547.1|25532_27170_+|DNA-polymerase-III-subunits-gamma/tau MHKALYRAYRPQKFEDVIGQDHIIKTLKNQIYSDNIGHAYLFCGTRGTGKTSTAKIFSRAVNCLNKINEEPCNECEICESVLKDNTMDVVEIDAASNNSVDDIRELRESVKYSPANAKYKVYIIDEVHMLSQGAFNALLKTLEEPPSYVIFILATTEPHKIPATILSRCQRYDFKRVTVKDMTLRMKKICEDEGIDIDDKALNLIARNSQGALRDALSILDQCMSFGESKIDYKDVVELMGSVNIEQLFELSQCIVEQDTKKSLEILNEFVLWGKDIRNLINDLIDHFRNLMVCKVSSELDEIISLPEETIEQLKIQSKNIDINDLIRILNILSITQDDIKSSSNPRVLVEITIMKIAQPMFDESKEALIKRVENLEKMIELGNFKSEKIGNNKEKEYEVDREIDVKQENVVYEDVKNEDVILIESSWKNILKQIKKDKKMPIYALLSEVKSFNVYSNMLYVIFDDKFDFAKTRLSSQDTINYLEKTIRDVLNRSFNVKIVLTSEVKDINLEVKEKKDIGEEILKNIVSEEILEIKDSIDENESK >CP020380.1|AXU33546.1|24606_25062_+|cytosine/adenosine-deaminase MESSFYMKEALKEAYKAYNKKETPIGAIIVKDNQIIARAHNLTETLKDSTAHAEILAIKQASEKLGGWRLTDCDLYVTMEPCIMCSGAIVNSRIKKLIIGTRHVKNSYIEKQHEFKLDYFNNNNVKVAFDVLQEECSIILQEFFKALRKRD >CP020380.1|AXU33545.1|23014_24286_+|seryl-tRNA-synthetase MLDIKRIRENLDDIKKAMERRGEREFDLDAVVELDNKRREILQEVEVMKNELNVNSKKIPQLIKEGKDVTEEKARLKELSDKIKGIDEKVKEVEAKMEYTLMRIPNVPHPEVPQGETDEDNVQIRTWGEPTKFDFEHKAHWDIGTGLGILDFERAGKITGSRFTLYRGLGARLERSLMNFFLNTHTAKHGYTEVLPPFMANRNSFIGTGQLPKFEEDMFKIEGLEYFLIPTAEVPVTNIHANEILDVAELPIKYCAYTPCFRSEAGSAGRDTRGLVRQHQFNKVELVKFVKPEDSYNELESLTHDAETMLQMLGLPYRVVKICTGDLGFTAAFKYDLEVWMPSYNRYVEISSCSNFEDFQARRAGIRFKRDKKSKAEYVHTLNGSGLAIGRCLAAILENYQQADGSVVVPEELRPYMGVDVIR >CP020380.1|AXU33544.1|21674_22556_+|mechanosensitive-ion-channel-protein MNFLSLAKTASTNSNITKRTLENMLDNFSDNIPNIIYAIIVFVIGIYISKIVRRMVSKFLIKYGMSKGVNNFIVYGIYISMLSIISLISLGIIGIQTTSVVAVLGAAGFSIGLAFKEILSNLGSGMIILFFKPFNIGDYIQGSGVEGTVSDIQIFSTVLKTPDNKTIIIPNFQLTSNNIINYTHQNKRRIDFSYNISYDSDIDVVKSILNEIFTNEKRILNDPKPIIGLNSIGNNTMQIVARPWVKTDDYWDVYFDVMEKVKNKFDENDIKVPFVPSSLLFNNTGNLNTMDKR >CP020380.1|AXU33543.1|21153_21663_+|small-molecule-binding-protein MNSNERRSKLIDILKESKHPVKGGILAEILNVSRQVIVQDIALIRARGFEIIATPQGYIIYNQPYFTKQIKCKNHKDSKEIYDELKIIVDLGGIIKDVIVNHPTYGQITAELNIYSKMDIDNFMKKVETNEFKQLSVLTECSHIHTIEAIKEETIEAIVKELKDNGILS >CP020380.1|AXU33542.1|9856_10630_+|RNA-polymerase-sigma-B-factor MKNVANATHYLNMDTKELFNLYNKNKNVDIRNILIERHLYLARLLAKKYINKGVDFEDIYQVASLALIYAIDRYDVEKGFEFSSFATPTIVGEIKKYFRDKVWTLRVPRRIQELSKKISDAKIKLEQENKKHPKVKDIADYIGVSEEDVLEAMEASYGYQPMSLDSSSNDDSEDKDITLIDKIGKEEGNFGSIEYEDFINKFIETLNELEVKIFKDRFFFDKTQSSIAKELGISQMTVSRLEKKVVEKLKKEYEKNL >CP020380.1|AXU33552.1|39225_39639_+|hypothetical-protein MYIVIGNEIVDSEELKIIIDKNSKFKVEKDLSKSTKREDVIAYQLSIDLNYLDSLINEQCNLASLSDEEKFDEYMTLSDELALDLEELMPKYTIINARAYKLDEVDGIVKIILAVAYADLGHLKLSDVVKRLSRQVD >CP020380.1|AXU33553.1|39648_39744_+|hypothetical-protein MNYIKKMYKILRKDENNYVNIEKNSIKSSQL >CP020380.1|AXU33554.1|39947_43379_+|pyruvate-carboxylase MLKKFNKILVANRGEIAIRIFRACSELGIKSVGIYSKEDKYGLFRTKADESYLIGEGKGPIDAYLDMDGIIDLAKRKKVDAIHPGYGFLAENAEFARKCEENGITFIGPSSKVMNMMGDKINSKKIAKEVNVQTIPGVEKAIRSTEEAKEVANKIGYPVMIKASNGGGGRGMRIVHREEDLELEYETACSESRKAFGEDIIFIEKYIADPKHIEVQILGDNYGNIVHLYERDCSVQRRHQKIIEYAPAFSLDDKVRKEICEDAVKLSKHVGYSNAGTLEFLVDANGGHYFIEMNTRVQVEHTVTEMVTGIDIVQSQILIAQGYSLDSEEINIKSQDDVEIRGYSIQCRITTEDPKNKFMPDTGKIQVYRTGSGFGIRLDGGNGFTGANISPHYDSLLVKTISWDRTFQGAINKTIRSIKELRVRGVKTNVGFLVNVLNNPIFSNGKCSTKFIDENPDLFEITESKDRGTKLLQFIGDVIVNDNACKEKPLFDALHDPRMDKDGSKSEGSKILFDKLGKSAYIEKIKNDKKLLLTDTTMRDAHQSLLATRIRTYDLLKAAKPTEKYQKDLFSLEMWGGATYDVAYRFLKESPWRRLQKLREEIPSIMFQMLLRASNGVGYKNYPDNVIEEFTKESARQGIDVFRIFDSLNWVENMKPSINTALETGKIVEATMCYTGDILDKTKTKYNLEYYIKMAQELESLGADIIAIKDMSGLLKPYSAYTLVKELKKNVKAPIHLHTHDTSGNGVATCLMASEAGVDIIDAALESMAGLTSQPSLNAIVEALKNTERDTGIDLFGYDELGKYYKDLRKVYNKFESDLTNSCAEIYNFEIPGGQYTNLKPQADSLGLVNRFDEVKEKYKEANEVVGDIIKVTPSSKVVGDLAIFMTKNKLDKDNIIEEGKNLSFPDSVVDYCKGMIGQPEGGIPKDLQEVVLKGEEAITVRPGSLLPAEDFDEIAKYLNEKYDINANIRNVISYALYPKVYEDYIKHLQHYNDISKLESDVFFYGLNKNEECEVEIEEGKVLTIRLVEIGEVKENGFRTIGFELNGMVREVEIKDKNFSGKINNVEKADMNDPLQIGASIPGKVIKIMVKEEDEVKANQPLIVIEAMKMETIIVAKTDGVIKSIKVKEDDMVEDKQLLMIMK >CP020380.1|AXU33555.1|43620_45549_+|translation-elongation-factor MKVYDSKMLRNVAVLGHSGCGKTNLIETIAYTANTNKIPKLTDKVNMTYSMGLIPIEYNDYKFNLLDTPGYFDFSGDVVSSLRASDAAIIVIDATAPIQVGTEKSLELTESIPKIMFINKIDNEKARYKDAIAMLREKYNNKIVPMISPIYKDKNFVKLHNVFENIDDLEGEFKEQAMSVKEALMELIAETDDQILDKYFNGEELTTEEIQKGIIIGIQRGDIIPVICGSTINNIGTKEILDTISSYLEPIFTEESKPFRGLVFKTMVDPFVGKMSYIKITEGVLSKDKDVFNINKNVKEKIANIYTLRNSELVEIEKAKAGDIVVITKVNSLKTGDTISADKDAEALEKIDFPKPQIYYAVTPKNKGDEEKVASVLNKLVEEDPTLHWYRNTETKQALLGGQGELHIKTIKNKMKDKFGVDVELNDLKVPYRETIKGTADVQGKHKKQSGGHGQYGDVKIRFERCESDFEFTEEIFGGSVPKQYIPAVEKGLKDSMQKGILAGYPVTNIKATLYDGSYHDVDSSEMAFKMAASAAFKKGMEEAHPILLEPIMKLKITVPEEYMGDVMGDINKRRGKIFGMEPDDKGKQIIFAEAPQAETFKYAIDLRAMTQGRGYFEMELERYGEVPSQFAEKIIGLATAK >CP020380.1|AXU33556.1|45996_46470_+|transcriptional-regulator MILMATMTDIIEKFIKDLMEEDNSIQIQRNELANLFSCAPSQINYVLTTRFTIDRGYYIESKKGGGGYVQIEKIRKSKDGHIRELLNEKIGSQISYKKAKELLEGLKESDLINERELKLILYAIDDKSLCMPIYELKEKVRSNILKNIIIGLFSIEE >CP020380.1|AXU33557.1|46476_46971_+|DNA-repair-protein MLCQKCNKNKASVYYNKIVNGEKTEMYLCSECAKENTEMNFNLDMPFSMMDIFSNLGFQPKKELEEKLVCPKCNTTYSEFKNNGRFGCSECYNAFSSQVNPMLQNIHGHIEHTGKAPKKSFYKISVENEIKELKEDLDRAIKNEEYELAAQFRDKIKYLKGSID >CP020380.1|AXU33558.1|46986_48012_+|ATP:guanido-phosphotransferase MKENIVMKSRVRLARNLNNYPFPNKLDKECAMEIIEKVKNAFINSNLEQKEEFDFYKIEDLDQSKKMLMVEEHIISPDLAENDKSAVIVKKDKTISIMINEEDHIRIQTICDDLNLEYAYSVANEIDDLLESSLEYAFNTKLGYLTSCPTNTGTGMRASVMMHLPALSQLGYMDELYKISSQIGIAIRGIYGERTEALGNIYQISNQLTLGRTESNIIENVSGLTKDAISKEIKAREILQKKLGIKLEDKIFRSIGTLENSRVMSSAEAMSHLSNIKMGIEMNYIDKLDLRAIEQLMIGIQPAHQSIMYKSDDVENRDINRATYIRETLEKLRGGMNCELQ >CP020380.1|AXU33559.1|47998_50446_+|ATP-dependent-Clp-protease MNFNRFTQRAKKAIDLAFESAKSLGHNIVGSEHILLGLLREEEGIAAKVLSKVGFTEAYLEGKIVDMEGKGEEISEDIVLSPRSKQILELSGMFANKLKTNYIGTEHILLAIIQEGEGIANKILNYAGVNDRTLAQLTIDMMGISDKNQYKAENSYTGNQNQAESKVLDKYGRNLTLYAKQNKIDPVIGREKEIQRVIQILSRRTKNNPVLIGDPGVGKTAIAEGLATNIALGNVPETLKNKTLYSLEMGSLLAGAKYRGEFEERIKEVVDEVVKNGNIILFIDEMHTIIGAGSTGEGSIDASNILKPALARGEIQVIGATTIDEYRKHVEKDSALERRFQPVMVDEPTKEDSIKILEGLRDKYEAHHKVKITDDAIKAAVELSTRYISDRYLPDKAIDLIDEAASKVRLKENTPPSEIKKLELEIENIDKEKEEAVRCQDFEKAAKIRDEQGLLKKQLEDVRERWNKSSKHSDLVDGEVIAEVVGLWTGIPVNKILEEEADRLLRLEEILHNRVIGQEQAVKSISKAIRRSRAGLKDPNRPIGSFLFLGPTGVGKTELSKALAEVQFGDENQIIRIDMSEYMEKHAVSRMIGSPPGYVGHDEGGQLTEKVRRNPYSVILFDEIEKAHPDVFNILLQILDDGRLTDSKGRTVDFKNTIVIMTSNVGASTIGRQKTLGFSIAKGDEEEKSQYEKMKENIMGELKQRFRPEFLNRIDDIIVFHSLNENHISKIVLLMAAKLQERLKEMDIKLEMSDEAVKLISKSGFDLEYGARPLKRALQKELEDELSEAILKGNVKKGSNVVAKVKDEKIVFETK >CP020380.1|AXU33560.1|50625_51999_+|DNA-repair-protein-RadA MAKIKTKYVCQSCGYETAKWLGKCPECTKWNTFVEEIDQKSTKKEVFIIDKSSSKPVSINSIESKEEERFTTDINELDRVLGGGIVKGSLVLVGGDPGIGKSTLLIQVSSNVANLGKTVLYITGEESESQIKMRAKRLGINSENLYIFAENNLSIIESYLESVNPELIILDSIQTVFSPEISSAPGTVSQIKEGTSKFMKISKKMGISTFIVGHVTKEGSLAGPKLLEHMVDTVLYFEGERYNTYRLVRAVKNRFGSTNELGVFEMRDLGLVELDNPSKILISEKPKDVAGSVIISTVEGTRPMLLELQALVSPTSFGIPKRTSTGVDYNRVGMLLAVLEKRVGLQIQNQDVYINIVGGIKINEPSIDLGIAISVASSFRNIPIDEDIAVTGEVGLTGEVRAVSFIEKRIAECKKLGFKKIVVPRSNYDVVKETKGIEIWPVDNLRQAINIVLGRNQ >CP020380.1|AXU33561.1|52001_53072_+|DNA-integrity-scanning-protein-DisA MENFLDNKNMLYALKMISPGTPLRLGLNNVLRAKTGGLIVIATNEDVMKIVDGGFAINAEYSPSYLYELAKMDGAIVLSGDVKKILFANAQLIPDYFIETSETGTRHRTAERVAKQTGAIVIGISQRRNVITVYRGNEKYVVEDISKIFTKANQAIQTLEKYKTVLDQAITNLNALEFNDLVTIYDVALVMQKMEMVMRVTSIIEKYVIELGDEGTLVSMQLEELMGTTRIDQKLIFKDYNKENTEIKELMKKVKNLNSEELIELVNMAKLLGYSGFSESMDMPIKTRGYRILSKIHRLPTAIIENLVNYFENFQQILDASIEELDEVEGIGEIRATYIKNGLIKMKQLVLLDRHI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP020380_2 | 128788-128877 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP020380_2
|
1 spacers
spacers of CP020380_2
>2.1|128816|34|CP020380|CRISPRCasFinder AAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP020380_2
The CRISPR arrays of CP020380_2 >merge|CP020380|2|128788-128877|CRISPRCasFinder TGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACAGAATAAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGCTGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACGGAAT >CP020380|2|2|128788-128877|CRISPRCasFinder TGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACAGAAT AAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGC TGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACGGAAT
>CP020380.1|AXU33643.1|126085_126790_+|germination-specific-N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MRKYIKHIIFSFAMICLVVVSIFEIKNISEDVIKYMPVTNKTIILDAGHGGIDPGALNKDKSTSEKDINLAITLKLRELIELSGGLVILTREDDSSLYKEENNKTTRQKYNENLKNRKEIISNSNANMFVSIHLNAFEQSKYYGAQTFYPKDKQDSKELSKCIQEELKRVVDKTNNREVKPRDDIYLLKENNIPSVLIECGFLSNEKECKLLTDETYQEKIAWAIYIGIQKYLS >CP020380.1|AXU33642.1|125186_125579_+|30S-ribosomal-protein-S9 MANVQYYGTGRRKSSVARVRLVAGEGNILVNGRALENYFNYETLIRDVKQPLVLTGNENKYDVIVKVEGGGFTGQAGAIRHGISRALLKADLDLRPALKKEGFLTRDARMKERKKYGLKAARRAPQFSKR >CP020380.1|AXU33641.1|124726_125158_+|50S-ribosomal-protein-L13 MKSYIAKPADVQRKWYLVDAEGKTLGRLATEIATVLRGKHKPTFTPHVDGGDFVVVVNAEKIVLSGKKLDQKYYRYHTGYVGGLKEISYRDMMDKKPEEVISHAVSGMLPKNKLRSRMMTRLRVFAGAEHTHAAQNPEVLNFK >CP020380.1|AXU33640.1|123875_124607_+|tRNA-pseudouridine-synthase-1 MRNIKITIQYNGKNYCGWQKQPDSLGIQGTIERAIYDITKEETSLIGSGRTDSGVHAIGQIANFKINSGISIESIPMALNAKLPKDISVIEACEVNDDFHSRYSAKGKTYKYLVYNSKFRNPILSEISYQVKYELDFDKMCSEAKSLLGTHDFKGFMSSGTSVKDTVRTIYDIDISKKDDLITFEISGNGFLYNMVRIIVGTLVDMGRGRINEPFLDIIQSKTRSRCGHTAPAQGLFLKKVHY >CP020380.1|AXU33639.1|123040_123844_+|ABC-transporter-permease MLKDITIGQYYPTSSAIHKLDPRIKLVATIVFMVSIFVVNKFWPYIVVLLCLLAMIKLANIPVKYIVKGVKPLKWIILFTFLINIFFLPGDEIWSFGFLAITKQGLRQAIFMAIRLIFLVVGTSLLTLTTSPIELTDGIERLLNPFKKIGLPVHELAMMMTIALRFIPTLLDETDKIMKAQMSRGADFESKNLINRAKNLVPLLVPLFVSAFRRADELAMAMEARCYRGGHNRTKMRESVISRRDYMACVFQVVYLGAIIATRFIAI >CP020380.1|AXU33638.1|122180_123047_+|cobalt-transporter-ATP-binding-subunit MSIIVKNLTHIYNEGMPFASKALDDVSFEIKDRDFVGLIGHTGSGKSTLIQHLNGLLKPSSGEIFINDFNITDKNLNLTEIRKRVGVVFQYPEYQLFEETIDKDIAFGPSNLGLEESEIHNRVKASMEAVGLDYEEFKDKSPFELSGGQKRRVAIAGVIAMNPEVLILDEPTAGLDPGGRDEIFNLIKGLHEKKNMTIILSSHSMDDMAKLAKTLIVMNHGSVEFMGTPREVFKSNASKLKDIGLDIPQVLELALKLREKGFDISEDILTLEEAKQEILKVVRGRGLC >CP020380.1|AXU33637.1|121359_122193_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MDNIVKVNNISFEYITDEAKLKAIDNLSLDVKKGEFVAIIGHNGSGKSTLSKNLNAILMPTEGNILIDGMDTKEEERLWDIRQTAGMVFQNPDNQIVATIVEEDVAFGPENLGIEPKEIRRIVEESLKSVGMYDLRDRQPHLLSGGQKQRVAIAGIIAMRPKCIIFDEATAMLDPSGRKEVMKTIKRLNKEENITVIHITHFMEEAVEADRVVVMEKGKKILEGTPREVFSKIKMLKEIGLDVPCMTELSSLLIEEGINISSDILTVDEMVMELCRL >CP020380.1|AXU33636.1|120898_121240_+|50S-ribosomal-protein-L17 MAKYRKLGRETAHRNLMLRNLVTCLLRSGRIETTVTRAKETRRMAEKMITLAKRGDLHARRQVLAYVMDETVVNNLFTDLAPKYAERNGGYTRIIKIGPRKGDAAEMAFIELV >CP020380.1|AXU33635.1|119930_120878_+|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-alpha MIEIEKPKVDIVELSEDYRYGKFVIEPLERGYGITIGNALRRILLSSLPGVAVNAIKIDGVLHEFSTIPGVKEDVTEIILTLKELSATIDGEGIRTLKIEAQGPCSITGADIICPPDVEILSKDLAIATLDDNAKLNMEIFVDKGRGYVSAEENKTENVPIGVLPVDSIYTPVEKVSYHVENTRVGQKTDYDKLVLEVWTNGSINPQEGISLAAKVLVEHLNLFIDLTEHVSSVEIMVEKEEDQKEKVLEMTIEELDLSVRSYNCLKRAGINTVEELANKSEDDMMKVRNLGKKSLEEVIQKLEELGLGLKPSEE >CP020380.1|AXU33634.1|119229_119853_+|30S-ribosomal-protein-S4 MARYTGASCRQCRREGMKLFLKGDRCYTDKCAIVKRNYAPGQHGQGRKKVSNYGLQLREKQKVKRIYGVLETQFRNLYERAENMPGKAGENLLSLLERRLDNVVYRMGLASSRKEARQLVTHGHFTLNGNKVDIPSLIVKVGDVIEVKEKSRSSAKFKNLVEVNSRIAPKWLEANVEGMTAKVVGVPTREDIDLEIAEHLIIELYSK >CP020380.1|AXU33644.1|139266_140451_-|aspartate-aminotransferase MLSKRLNFITPSYTIGISSKVKEMESNGVKVINLSIGEPDFNVPNNAKSYGIDSLNKDYTKYDLVPGLKILREEICKKLIEENNCNYSIDEIVVSSGAKNSITNTLLALTDKGDEVLLPKPYWVSYPEMIKLVNAVPVFIDTKKENGFKLTKEELEKSITDKTKILVINNPSNPTGSVYTKDELIEIVDVCIQNKIYILADEIYEKICYTGEFTSIASLSEEAKDITITINGFSKSAAMTGLRLGYTASNKTIAKAMSSIQGHLISHPSLTAQYIAYGALKDCSIDIDNMVKTYKSRRDLIKSKLDSIDNVGYVNPNGAFYIFIDLSKVSEKFEYKDSFSIEFCNQFLEEYNVAVVPGIAFGMDKYIRISYACSENTFLSGLDKLKEFVYKIMA >CP020380.1|AXU33645.1|140823_143175_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase MVEFVKKRDGRVIPFNEDRITRAIFLAATNVAEREGIVPDYKLSEQLTQEVIKFLNHKYSESVPSVEDIQDSVVKVLIETGHAKTSEEYIIYRTERSRIRNSKTRLMKAIEEITFEDAEDADIKRENANINGNTAMGTMLQYGSTVSKEFCKTHILKPEHSFAHDNGDIHIHDMDFLNMGTLTCCQIDVKKLFNGGFSTGHGFLREPQDIISYGALAAIAIQSNQNDQHGGQSIPFFDYGLAEGVYKTFKKFYIGNLAKALKLFKGIENNDVIKNIVYNTEKETNQKVGLKRDELYLNLEKEKLIQTFDIDDELVNKMQNFAFEESYRETDKKTYQSMEAFIHNLNTMHSRAGAQVPFSSVNFGTDTSEEGRMVTKNLLLSQERGLGNGETPIFPILIFKVKEGINLNPEDPNYDLFKLSCRVSAKRLFPNFSFLDAPFNAKYYKKGEPDTEATYMGCRTRVLSNVCGSETVSGRGNISFTTVNLPRLGIKHGIINNEKANLDGFFEELDEKINLIIEQLLERLEVQGNKKMKNFPFLMGQGVWKGSDDLGPEDTLKEVIKQGTLTIGFIGLAECLIALIGKHHGESKEAQELGLKIVSHMRHKMDEATDKYKLNFSLMGTPAEGLSGRFTKIDKKVYGEIKGITDKEYYTNSFHVPVYYNISAYDKIEIEAPYHELTNAGHITYVELDGDPSDNLEAFETVIKAMKDLGIGYGSINHPVDRDPICGFSGVITSNICPVCGRNEDESDIKFERIRRITGYLVGTVDRFNNAKKAEVRDRVKHR >CP020380.1|AXU33646.1|143196_143736_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase-activating-protein MKIRMSSTISYDSIVDGPGLRMVIWTQGCIHNCKECHNPQTHDLCGGFYMDTEEIINKVKSLKLQKGITLSGGEPFLQPEPLEEIAREAKINGLDVWSYTGFTFEQLLDKKNRAYFKNLNLLKQIDILVDGKFIAEKKDISLKFRGSSNQRIIDVQKSLKYKKVFLVEQYMKDDLSIAE >CP020380.1|AXU33647.1|156792_157632_+|DNA-integrity-scanning-protein-DisA MLDINSFLNGFFNIILRMSIYDLIDISIVAYIFYKIFMFIKDTRAEQVFKGIIFLLLATQLSNTFKLHTVYWISLKALDYGVIAALIIFQPEFRAGLEHIGRAKFNLFGKNVNTSEETLNRNIEEIVEALYSLSRQKIGALIIMERETRISDIINTGTIIDAEISRQLLINIFIPNTPLHDGAVVIRDSKVKAAACFLPLTESKDLSKDLGTRHRAGIGVSEVSDCITLIVSEETGGVSIAKAGKLYRDISRERMMNILRSNLKTNTETRSFFKGGIFK >CP020380.1|AXU33648.1|157628_158810_+|membrane-associated-protein MINRLKNNTKIKIISFLSAIALWMYVMAVVDPEETKGFEDIPVSISNMSDLKDKNLVIYPDEKLTADVYIKGSLSKVQSVKKEDIHVYGTIEDPIQGQKEVYLKANIPQGVTLEFKHDVLVVNLEKNIKEKRDIKVEVSGNSKRNINKIELSKEFVDVSGPRTLVKEVKSVRANLDVGNETDDFSKKLQLIPLNSDGTKVEGVTLSSSFVTAKIELLKEKIVPIRVSLNDNKDNDVLKNYKLSKEQVTIKGKKEDIDKINYIKTKPIDLADLANGEEKEVSLEIPEGITLEDSSITIKLNDTKQLSAEFLYNAGDIELRNIPTNMDNPNVISDVDIKVVVESTEDLSKLNKKDISLYIDLSQGPEEDSKYKIKYETTYQFKKINIEPNIVEVE 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CP020380_3 | 135678-135767 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP020380_3
|
1 spacers
spacers of CP020380_3
>3.1|135706|34|CP020380|CRISPRCasFinder AAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP020380_3
The CRISPR arrays of CP020380_3 >merge|CP020380|3|135678-135767|CRISPRCasFinder TGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACAGAATAAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGCTGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACGGAAT >CP020380|3|3|135678-135767|CRISPRCasFinder TGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACAGAAT AAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGC TGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACGGAAT
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP020380_5 | 151683-151772 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP020380_5
|
1 spacers
spacers of CP020380_5
>5.1|151711|34|CP020380|CRISPRCasFinder AAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP020380_5
The CRISPR arrays of CP020380_5 >merge|CP020380|5|151683-151772|CRISPRCasFinder TGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACAGAATAAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGCTGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACGGAAT >CP020380|5|5|151683-151772|CRISPRCasFinder TGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACAGAAT AAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGC TGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACGGAAT
>CP020380.1|AXU33646.1|143196_143736_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase-activating-protein MKIRMSSTISYDSIVDGPGLRMVIWTQGCIHNCKECHNPQTHDLCGGFYMDTEEIINKVKSLKLQKGITLSGGEPFLQPEPLEEIAREAKINGLDVWSYTGFTFEQLLDKKNRAYFKNLNLLKQIDILVDGKFIAEKKDISLKFRGSSNQRIIDVQKSLKYKKVFLVEQYMKDDLSIAE >CP020380.1|AXU33645.1|140823_143175_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase 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>6.1|300440|36|CP020380|CRISPRCasFinder CCTTATACACGACATTATAATATAAGTACGTTTTTA >6.2|300505|37|CP020380|CRISPRCasFinder TGTTTATCTTTTCATTGTTCATGTACATTTCATTGAA >6.3|300571|38|CP020380|CRISPRCasFinder TTTACTGCATTTATACCATCTACACCTTTTATTTTATT >6.4|300441|35|CP020380|CRT CTTATACACGACATTATAATATAAGTACGTTTTTA >6.5|300506|36|CP020380|CRT GTTTATCTTTTCATTGTTCATGTACATTTCATTGAA >6.6|300572|37|CP020380|CRT TTACTGCATTTATACCATCTACACCTTTTATTTTATT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP020380_6
The CRISPR arrays of CP020380_6 >merge|CP020380|6|300411-300638|CRISPRCasFinder,CRT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATCCTTATACACGACATTATAATATAAGTACGTTTTTAGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATTGTTTATCTTTTCATTGTTCATGTACATTTCATTGAAGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATTTTACTGCATTTATACCATCTACACCTTTTATTTTATTGTTTTAGATTAACTATATGGACTTAAAATT >CP020380|6|6|300411-300637|CRISPRCasFinder GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT CCTTATACACGACATTATAATATAAGTACGTTTTTA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TGTTTATCTTTTCATTGTTCATGTACATTTCATTGAA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TTTACTGCATTTATACCATCTACACCTTTTATTTTATT GTTTTAGATTAACTATATGGACTTAAAAT >CP020380|6|1|300411-300638|CRT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATC CTTATACACGACATTATAATATAAGTACGTTTTTA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATT GTTTATCTTTTCATTGTTCATGTACATTTCATTGAA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATT TTACTGCATTTATACCATCTACACCTTTTATTTTATT GTTTTAGATTAACTATATGGACTTAAAATT
>CP020380.1|AXU33807.1|299909_300119_-|hypothetical-protein MKEYEAELNISISIPFFTVISYLVIVSIVMLCLSALNNFANISSVPVSALGSTTGFIIFNLIISLFKNK >CP020380.1|AXU33806.1|299577_299685_+|hypothetical-protein MLINFLLSIVAGIVSAYIYEKIKNHPNANKGDLKK >CP020380.1|AXU33805.1|299042_299201_+|hypothetical-protein MGNFLQNVLERLSVSLIVFLVSNLLKKRKKPLKAGTKSGWEFDLKIRFHKFK >CP020380.1|AXU33804.1|298259_298700_+|phage-protein MSNLSAFLSQNAIKVDNVKYVASNRFLDKEGKPVEWELKVLSSEEDEALRRKCTKRVKVIGNNGKHTGQYTSEIDYNSYVAELCVASTVFPDLKDAELQNSYGVMGEAQLLKTMLTAGEYVNYTVKVNEVNGFDTSFEDKVEEAKN >CP020380.1|AXU33803.1|297717_298188_+|phage-protein MAQTINAKDTVSAKKAECFITIEGKRYNFMQAIDLEAKMEKNKSEVPILGRTTKGNKTTGSTNTGSATFHYNTSIFRELLYRYKETGEDIYFDIQVTNEDPTSVVGRQTVVLKDCNMDSGIITKFDADGEYLDEDMDFTFEDWELVEKFNLLAGME >CP020380.1|AXU33802.1|296390_297701_+|phage-protein MALGGGTFVTQNKVLPGAYINFVSATRATSSLSDRGIVAIPLELDWGIDEEVFQVTSDDFEKYSVKYFGYDYTHEKLKGLRDLFKNIRLGYFYKLNKGVKASCTIATAKYSGIRGNDLKVTVTTNIDDNAKFDVVTLLDNKKVDTQIAKVITDLQDNDYITWKKDATLEASAGLVFTGGTNGEAVTGAEYQAFLDKIESYSFNALGCLATTTEIKSLFVEFTKRMRDKVGAKFQTVLYKKSDADYEGVVSVENKIKDKDLVESSLIYWAAGAIAGCDINKSNTNKKYDGEFDVDVNYTQIQLEEALKTGKFIFHKVGDEVHVLEDINTFVSFTDDKNDDFSSNQSVRVLDQIANDIATLFNEKYLGKVPNDKAGRISFWNDVVKHHKELENIRAIEDFKTDDVSVELGNDKKTVIVSDAVKVINAMSKLYMTVSVS >CP020380.1|AXU33801.1|296204_296390_+|hypothetical-protein MINLSKTLSKEENYKFTKEQIVNSKRYVNRKDLLNAILKEDELYSFSEVEDMINNFMKGVS >CP020380.1|AXU33800.1|295783_296221_+|phage-protein MLNNIIDGISIKLDKTFGESYTIYSEDVEQGINEPCFFIVPLNPSKVSYPSGRTLKKNSFDVHYFPKSNDKSFEINEVAEMLLEELEYIEIDGDLVRGTNMNFEIVDNVLHFFVDYNYFTIKSNNTDKMDTVELFGGLKRGDKLE >CP020380.1|AXU33799.1|295365_295791_+|phage-protein MARWGSVDFREFKRVCKKVEKLTKIDLDKFCKDAARELAARLLGKVIRRTPVDTGFLREGWSGVAYARSLPVYKQGNNYIIEVVNPTEYASYVNFGHRTKDGKGWVKGQHFLTISEMELQSQVDKIIEKKLLILLKGVFDA >CP020380.1|AXU33798.1|295018_295366_+|phage-protein MVSKTRKAIEMLYRDKCTIVEYQPIKDAITKRTNNKEVIVLENQPCKLSYKNIVSATEGKVAKLEQTIKLFISPDIEIKAGSKLIINDKEYVRSGESAIYPNHQEIILELFKDKA >CP020380.1|AXU33808.1|300765_301326_+|phage-protein MFCSNCGAEITGVGKFCSSCGVAVETEIIEDNNIKSNDLIVDANGIEINMTEIYRKYRKEKVNAIKNVMEISGLNIKEAKKIVDSSFEELKINFIDDTMSNSEKEKIINTQNRKNNIEKAQQESVACCPKCGSTSLSAQKKGFGIGKAVAGATIAGGIGLVAGNLGAKKVRVTCLNCGKQFWAGKK >CP020380.1|AXU33809.1|301401_303768_+|phage-tail-tape-measure-protein MATIQTSIRIFDGMTPAFRHMTNAMNIVLSSFEQLQRTSSNAIDANSIRTAREELARAEAGFDRLEQQIREADEQQKRFNDDIRKGASSTDKLVENAKRLVATYIGLRSVGGLINLSDQMTSTNARLAMINDGQQSDGGLNKMIFQSAERARASYLDTAKIVSRVGMNAGKAFSSTKEIVAFAEQLNKKFVIAGATTEETNSALLQLTQGLGSGVLRGEELNAVFESAPNIIQSIADYLEVDIGKIRGMASEGMLTADIVKNSLLSAAEQTNAEFEKMPYTFGQIFTSIKNNAVMIFGVIQKKIEQSMSSKGFRTFIDNFIDSLYVLGAVAFSIFNGIINILGSPFFQAFVNAIIVGVSLIVQVLGWVITQALNITNVFAQNWSIIAPIVLGVAAAMLVYNNALLLSIANKVKDIALSAKTLAMNFAHIIAESYRAAALVASTIAQDGLNAAMAACPITWILYGIIAIVVAFFVAIAVINKFAGTSYSAIGIVAGALSGLTAFIINSVFFWINVFISFAEFFTNVLDHPVYSVKKLFFNLATAVLNNLISMTKGCDEFATNLANSIIDGINGALKAWNKFVDVLNKFGGLADKLGLGKADMVGHTKSITSTLQKAKGDLNKWLGAEPEGYKSFKQLEYKNVGDWAKNGYAFGQNLENKLKDAFDINKIAEKAKKDLGLDDLWDKKYGLGDGLGSAGLNSPLSDAAKGAKDTAGNTAKMAKTMDKSQEDLKYLRDIAEQEVINKYTGVNIKIDMNNTNNISKDTDLDGIVNVLTEKLNDAMVVSAEGVV >CP020380.1|AXU33810.1|303783_304479_+|phage-cell-wall-hydrolase MAYDFYLDGVQLPIPPPKLEIKVTNKNKTVDLINTGEVNILKKEGLSEISFEAEFTHNKLPFYRGAFRDVQFFLSKLELLKTDCKPFQFIVSREMGGKVLFNTNIKVSLEEYAISEDADNGSDVKVAIKLKQYRDYSTKKLVPAQPKTTNETGRPNVKIEPKRVDSVNAPNAKTYTVKAGDSLWSICQKQLGNGSLYKKVYELNKSMMDKANKGKKVPKYTIYKGQVLRLV >CP020380.1|AXU33811.1|304471_306430_+|phage-cell-wall-hydrolase MSDELVLANDRDVRLVIAHWEDFYEPVVLDGITWEIERRGAPSKLEFTIVMDDILEFCEGNSVRLYYKGIGIFYGYIFQKKRDKENHIKIVAYDQLRYFKNKDTYVYSNKTASELVKMLAKDFNLKYNVIEDTKYKISRVEENKTLFDMVLTALDDTLREKKEMYVLYDDFGRITLKNVASMKLDTVMNNDVIEDFDYNSSIDSDTYTKIKLVRDNEETGKRDVYIAQDSTHMRSWGILQMFDTVDKNMSEAEIKQKCDILLKLYNKKTKSLSLKNVLGDIRVRAGCLVPVFLDLGDIELQNYMLVEKVKHTFENNSHFMDLTLVDGDEFASYSSSSYSSGNTNNKNEKQNGPAQSTTSKEDNDMINKLNKVFKNKLSNTGNIFVKYSNAYKVNAALMAAISIHETGNGSSSLCKNKNNFFGMKGMSFGSVDEGIKRGISNLSRNYIHTGRKTLESIRDKYAPLYDSPLNKDWVPGVGKFYKQITGSTYSPNNTGTGVGSNEEAEKNLKDTTYQVQNNNNANTSTNNSSKADKLISIAKGKLGCKYARGAEGPNTFDCSGFTQWCYKQIGIKIPRTVATQSKAGKAVDLKDRSKWKAGDLLCRVGGGSSNHVMMYLGNGQMIHSPQTGDVVKIQSVDSYRKGKAYTHVRRFI >CP020380.1|AXU33812.1|306443_306707_+|phage-protein MSQELLQVIKKAAMDAVETSNPMQIAFGTIESLNPLVVKIEQKLSIGEIFLIQTDTFKRYTDKKIGDKLVLIRMQGGQQYLVLDRMW >CP020380.1|AXU33813.1|306708_307128_+|phage-protein MLPSDNLDYDIEDVSIINFDVRQEPSKTFKLNIEKNRVDGICDGVEALKQTIFLILNTERYQHLIYSWNYGVELNDLIGEPISYVIPELERRIKEALTQDDRVENVDNFEFENIKGKVHCKFTVHSKYGNIKAEKVVSV >CP020380.1|AXU33814.1|307127_308177_+|phage-protein MFELMTFENIIKRMLDSVPDTFDKREGSIIYNALAPVAIELTETYIAMDELLDQTFVDTASYYYLEKRCKERGITPLEATNTIAKGVFNIDIPIDSRFNLGEYNYIATERIGEGIYKMKCETAGPIFELGQLIPIEYVDGLETAELTEILINGEDEESEDSLRQRYYDSLNSQSFGGNIQNYKDEVNKIQDVGGVKVYPVWDGGGTVKLVIINSNFKVPSEDLVNLVQEEIDPIGHQGQGLGLAPIGHRVTVEGVTSTTINISAEITYKSGYTWENIKIISEEAIDDYLNELNMSWEDEENLIVRISQIETRLLSIDGVLDIANTMINDVKSNLTIDSNSIVLRGEVVG >CP020380.1|AXU33815.1|308169_308787_+|phage-protein MDKEINLINYLPQILQDKEEYIKVFNVENKEIKTLHDKLKDLSNDQFLEDLTISGIKRWEKIMSITPKSNESLEDRRFRIFSKYISKLPYSERFLRNWLDNVVGEGNYELTINNATYNIHLESDARNQDWFEEVHSFVSDIKPCNMTLDYTRVLVSKDNYMNFGATTITGHEVTIYPWSPSDIETQGEINILSGNGFGYQEVTIY >CP020380.1|AXU33816.1|308802_309606_+|phage-tail-fiber-protein MATDKSYYTILTDIGKAKIANASLVGEKVDFVKIQLGDGGGNEYNPTEEQTALKNIVWEGKVGNVKTDESMTNCLILESLIPASAGGFVVREIGYLDTEGNLLAISKYRSAYKPKVEDGAVIDMKVKTIFVVSNVNNIELKIDPTIIFATLKDLQDLDTKIGTVNTKIDTTKAELTSNIETAKTELNNKIGDTTQLNTTDKTNIVSALNEVKTSVDSIETTAEKTSYNNATSNLTATTVQGAIDEVVRKIENFNEVNISIQNDMLPI >CP020380.1|AXU33817.1|309622_311350_+|Glycine-rich-protein MAIVYEFNYTGAEQSVVLPPGKYKFECFGACGGNYYDFVQCAKGGYTAGSLILKENTTLHVYVGQSGYCKGVNGIETCRSGFNGAGGITTYKSTSDGYYSLAGGGATDIRLIGGNWDNLQSLLSRIIVAGGGGGGSGNSHDSIGHGGGTKGKDGISIANKYFAGGGSQFQGGLTFNSLYNGSFGVSGAGDGISGVGGGGGWYCGAGSFYAEFGGGGSGYILTKDSYKPANYSPSSKYYFSDINSVVGGNTTKQDGYAKITLLQALPFLTISSYNSTTATFKADHTDPTLLTKIEYFIDDVLKETITTDLTLEKTINYTLEDNALHTLKIVVTDSANATAEKVVSISKGIAPLPAGSTTDEVTSKWIEIKDAFKSGKTSIINTLALKNIEASLNNTLVELSEKIKTSFDSSDASVQDLMNQLTQANNTISQLNTKYKVASGRTSALTDTISTAYLYVNSQSNPNYPINPGGWINIEGLNFIPNIFFAECECTANSPTQFYKYLVFATYSIPSLSDKDFVITTALRKTNSDTKFTADSQVYINNRGNTYINNQGVYVPAYRPSVSYTLYNWYAIKFI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP020380_7 | 922846-923024 | TypeV |
NA
Consensus repeat of CP020380_7
|
2 spacers
spacers of CP020380_7
>7.1|922873|57|CP020380|CRISPRCasFinder AGATGTATATCATATAAAAAATGATTGAGTTGATTATGTATTAGATATATATTATAT >7.2|922957|41|CP020380|CRISPRCasFinder GGATATATATTAAAAATAGTCACATAATTTGAATGGAAATG |
cas14j |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP020380_7
The CRISPR arrays of CP020380_7 >merge|CP020380|7|922846-923024|CRISPRCasFinder AAAAAATAATTAAATTAATTATATATTAGATGTATATCATATAAAAAATGATTGAGTTGATTATGTATTAGATATATATTATATAAAAAATAATTAAATTAATTATGTATTGGATATATATTAAAAATAGTCACATAATTTGAATGGAAATGATATAATACTAAAATAAACAATATAAT >CP020380|7|7|922846-923024|CRISPRCasFinder AAAAAATAATTAAATTAATTATATATT AGATGTATATCATATAAAAAATGATTGAGTTGATTATGTATTAGATATATATTATAT AAAAAATAATTAAATTAATTATGTATT GGATATATATTAAAAATAGTCACATAATTTGAATGGAAATG ATATAATACTAAAATAAACAATATAAT
>CP020380.1|AXU34339.1|921970_922768_+|RNA-methylase MITNINSKDNEKLKYTRALLKSKNRNKESKFIIEGYRIVVLALECMANLDYVFINDEFENKKEHVKLLEDLDKKNTKIYKTTNKNFKELVDTENTQGIIGVVSFKKKKLSESINKKDKFVLILDRIQDPGNMGTIIRTADSAGVDAIIALKGCVDIYNPKVIRSTMGSIFDMNIIDASQDETVDMLKSLDFNIVSSYLNTENFYDKIDYGSKVALVIGNEANGINEELVSKSDILVKIPIYGKAESLNAAISSAILMYEIKKYLI >CP020380.1|AXU34338.1|921110_921782_+|cation-transport-protein MKQYIVIGCGRFGSSVASTMHLLGHQVMAIDKNEDSVQSISDKVTHSLIVDVTDEQALRSLGLGNFDVAVVAIGSDIRASIMATLIAKEMGVELIICKAKDELQAKVLYKIGADRVVFPERDMGVRVAHNLVSDNILDHIELDPEYSIVEIVTPNSWVGKTLIELELRARYEITVLAIKTGKNINVTPSPDEELTAGSILVIIGQNTSITAITSGNKGIIRRR >CP020380.1|AXU34337.1|919446_920823_+|cation-transport-protein MKTIVRRLILYADGMRPTQIMVSGFAAIIVIGALLLTLPIASQSGESIGLLNALFTATSAVCVTGLVMVDTATYWSLFGQIVIITLIQIGGLGFMTVATMFSLMARKKIQLRERLLIQESLNQADLSGLVRLTRFVLIITITIEGIGALVLSTVFIPQFGLSKGIWYSVFHAISAFCNAGFDLMGSVSGPFTSLNSYVNNFTVSMTVCALIVLGGLGFPVVLDIVRKRRFSKLNVHSKVVLFSTATLILMGALFIFLIEFNQKATMADLPLKGKVLSAIFQSVTARTAGFNTLDLATLRESSVFVMIILMFIGASPASTGGGIKTTTLAVLIITVRSFLSGKSDIEAFERRLAPSTIKKSLGIFVISISAVIFGTLIISITQPNFTLVQSAFEVTSALATVGSSLAGTPNLNALGKIIIIIFMFMGRVGSLTLFMAILSGGRRKSQPIRYAEGKIMVG >CP020380.1|AXU34336.1|917275_919018_-|exported-peptidase MVKSKKKIFVSLILIAVFIIFASYIRNYTNDTKKDSVRGTIPFEKMEYKRPNIQSICENINKCNDKLLTAKTAKEQLNLFNEVDKIYQDFYSTLTISKIRNNIDSSDEFYSKEYKYLMSKSVDVDMSYKDFQDRFVTSKFSKELEKELGKDTFNYLKNIGKLNSKEVEGLLKKEQDLVVKYEDLLAKSTVSIDGIEVDFEEALSRPNLSPEEYVKIYSDYLKKYNPIFGNIFLELIQTRTEIASKQGFKNYIDYAYMNLNKDYSQEEAKKFRQDVKDYIVPLYREISSKPSDSSIYIKVYKNRSFRKFDKVLEDISPKLKESFDYMKKYDLYDYSSRKNKSPGGYTTYINKYKAPFLFNTWDNSFLGVTSFAHEFGHFYNYYNSINLNNKMQPSIDVCEVHSTSLEILFYKYFDDFFGKQSEAIKKEHLSIVLNTIIDACLYDEFQEIIYKNPYMSLNDINKLFFDLEEEYGVPNNILKEKNAPFWILVSHNFQVPFYYLSYGLASDVSLQIWQLSQDDYRKAVDVYMDFLNQNTDAGFKDVVEKVNLQLPFQDGNLEEISSALYDYFGIDNPLELKNAS >CP020380.1|AXU34335.1|916354_916549_+|hypothetical-protein MKIITIGSSLITVLLFLSTMVCGFWIKNNKVTDASSIKFHMNSAIFTGIFLLISTILLIIYIKK >CP020380.1|AXU34334.1|915776_916358_+|TetR-family-transcriptional-regulator MKSNDKDARERIIEVTLNLLNEVDDIEEITVRKIAERANVGVGLINYHFKTKDNLLSTAIGDVMSNIIAELYDDSVYTLRPIEDLKNLLKKLCDTGLHYEKVLPFVLNQCIANGDMQAELDIVPMLRKIFGNKKDEMSLRIIALQIILPIQISALSTESFQLYSGINIKNKYERDKFIDILIENIIGEDVDVR >CP020380.1|AXU34333.1|914790_915609_-|MerR-family-transcriptional-regulator MFKIGDFSKLSKISIRMLRHYDEIGLLTPSHTNKTNGYRYYSADQLSTTNRIHALKDMGFGLYSIKEILSEYNDKESLIKYLNIHHSQVKEQLEDTQKKLLKIENTIKRIGGNDIMKNYDVTIKNFAPKYMMTLRRVIPTYQDEGMLWHQAFLETKDQNVQIEPPRHSKAVFYDTGYKEDYVDVEVQVAVSGKYKDTEHVKFKTVPSVIAATAIVNGNFNQVADACEAIGTWISDNNYDVDGPMFNIYHVSPGNDNNPDNWVTEVCFPVKKK >CP020380.1|AXU34332.1|913103_913925_-|carbon-phosphorus-lyase-complex-accessory-protein MKLKIVGSGGMSIIPSSFCKCKICEEARQKGGRYERLGPSLYIDDIKMLIDAPEDIAVACNRQKISEVKHLSISHHDPDHVKGIRIVEKIGCDFITGENNPIGFYALPEVIEDINRTNLDCLKYYGDVINCISINETSHVKINNFDIDLINNNPDRNITFYVIKENEKKVIYACCNPKPFTHSDMYFDADVLIISLVSDDGILNDGTKLKDTPFKDEIFTLDEIVEIKNYYRIKKVIVTHIDEIWGKSYGYYSELEKKLDNIYFAYDGMEIIV >CP020380.1|AXU34331.1|909871_911776_+|nucleotide-phosphodiesterase MKIKFIIVASIIFLIVLLVGCQSTKDTEINVLATSDLHSIIPDNLISYVEEERKYDENLLMVDAGDFFDMQSGEMNKWFTGQKLVRFKDGIPEYKKIAEPREGEVPLVKKMAKLKYDAVTFGNHEFVSNDKQSLDKLVSDFKNNNIPLVSANVYEQSGENYVKPYVMKNVNTDKGAVKVGILGLTIKEVGERSRFKSFEQDKKARELGEQPQYKGKLYANDLVEDANKWVKVMEKKEKPDIIVAIVHSGEEPKNPKNPGNRIKELATTVEGIDAIVAGHTHEKIEQHTYKNNSGEEVIVTQPGAHGNSISKINFKLDKKNDKWFIKDKYSELKIFGKEVNIITTSGLNPKFSDEMAVNLFNERDRDVQPIFIDTGDFLNTNTKEMIKLAKEWQYNENKGIHKKINEWPIVYLGYDAVVLGSHEFTEDKETFEEKKSTLDYIIENFEEMKIPVLSANIYDEFGENYVKPYIIHNVETREGNIKVGVLGLTTTDNDEEDLSGSSLIKDSKTLKIHGETGKLYTNSLVKDASEWVKVMQKESPDVIVAVVHSDNNSTLKNPSSEVKKLAMSVDGIDAIVVGHTKNKVEEHIYKNKSGDEVIVTQSGEDCYSKISLELRKENGKWNIINKYSKAIKMK >CP020380.1|AXU34330.1|907522_909469_+|nucleotide-phosphodiesterase MKIKLVMIISLMFLMVLLVGCQSTKDTEVRKQDMKVKAKDTEIKILGTGDLHSILTDSMVSYVNEEREKNKNLLMVDAGDFYGTQSREMWEWSSGKKLINIRRDGRAEYDDIIKSSKDEVPIVKDMAKLKYDAVVLGDNEFVSNDKQSLDKLVSDFKNNNMPLVSANIYEQSGENYVQPYVMKNIKTDDGDVKVGILGLTIKEVGETLGLEDFEKDKKARELGEQADYKGKLYANDLVEDAKKWIKVMEKESPDIIVAVVHSGEEPKTDRNPGNRIKELANTVDGIDAIIAGHTHKKIDEHKYKNKSGDEVIVTQPGSHGDRMSEINFKLNKENGKWDIKEKSSKLKIIDKEISIVATADLHSHFSDKLTVDLVNERSNPIEPVVVDAGDFLDPQTDEMTQWYKEWKNIRDNNSDKTISRCPMVKDMNQGMYDAVVLGNHEFVSEKDEFWSDERLLDAVIEDFEQVAISVLSANIYRQSGKNYVKPYIIKDVETNEGNVKVGILGLTIKEVGKGLENVNLQEQFQYKDKLYANDLVEDAKKWVKVMKKEKPDIIVAVVHSGEEPKNPKHPGNRIKELATTVDGIDAIVASHTHEKIDEHEYKNKSGEKVIVTQPGEHGKYYSKITFKVNKEKGSWIINDKFSKTIEVE >CP020380.1|AXU34340.1|923311_924331_+|phenylalanyl-tRNA-synthetase-subunit-alpha MQEKLLALREAALAEIKEAQSIESVESLRVKYLGKKGEITAILKEMGKLSAEERPVVGKVANEVRENIELSINSKKEEINAIEKERKLKEEVIDVTQPGKVLKVGKKHPITQIIDEVTDIFIGMGFSIAEGPEVETVENNFDALNAPKDHPSRDMSDTFYINDGVLLRTQTSPVQVRTMRSQELPIKVIAPGRCFRSDSPDATHSPMFHQIEGLVVGKDVTMAEFKGTMDIFVEKLFGSDIKTKFRPHNFPFTEPSAEVDVTCFKCGGKGCPMCKYEGWIEILGSGMVHPNVLRNCGIDPEVYSGFAFGVGVERLAMLKYEIDDIRLLFENDMRFLNQF >CP020380.1|AXU34341.1|924347_926741_+|phenylalanyl-tRNA-synthetase-subunit-beta MLVSLKWLRDYVDIDMDVKEFADKMTMTGTKVETIDYYGEEIENILVGKILEIKQHPNADKLVVTKVDIGDKVVQIVTGATNISEGDYIPVAINGSKLPGGVEIKQTDFRGELSDGMMCSAAELGIDEHYIEEYKRGGIYILDHEDSYELGKDIKDVLGLKDALIDFELTSNRPDCKCMMGIAREAAATIGTKVKYPEIEVKESDEEIDFKVEIDNPDLCRRYVARMVTDVKIEPSPYWMQRRLTEAGVRPISNIVDITNFVMLELGQPLHAFDINQVETGRIVVRNAKDGEKLVTLDDVERTLDKDMLVITNGEKSLGLAGVMGGANSEITSNTKTVLFESANFKPENIRMTAKKVGIRSEASSRNEKDLDPNLAEIAANRAAQLVEMLGAGKVLKGVVDVYPNKPEPKKLVVNPQRINHLLGVDVPMKQFVGILESLEFKCNLVADDKLEIDVPSFRTDMEQEADVWEEIARIYGFENIPSVQLEGNTTAGIKTSKQKFMDALKDNSTAVGLNEILTYSFVSPKGVDKIRVPEGNAKRNFVKLLNPLGEETSVMRTTLIPNMLDVLSTNVSHKIEEVSAFECGHIFIPQDSELPKEENRMCIGMYGKDVDFFALKGTIETILVNVGFKGYEIEPQDNNTTFHPGRCAKIVYNNKYVGTLGELHPDVIENYNLGQRVYVAEIDIDFVFDNSDRTKNYVPLPKYPSTSRDIALIVKDDVFVKQIEDIIKENGQGLVESYKLFDVYKGSQIEAGYKSIAYSITYRSKDKTLTDEDVAKVHDKILSELSEKLNANLRSN >CP020380.1|AXU34342.1|926765_927356_+|Z-ring-associated-protein-ZapA MNKVMVKIHGAEYPMVGDKSEKFMISIADFVDKEMDKITRQNPKLSLSVAAILTALNISDLLFECSDENEKLIKANEELSKKVGASNEELQLEIKSLKLTIAEKEAENREAETKMKELIEIIENKKQEIFELSNTTEGSRAELDAYKNKIEELSTQLEEANERATIAENLASEFQNKAYDLQLKCTGLNNDVKNVE >CP020380.1|AXU34343.1|928275_929385_+|transposase-like-protein-B MEKAYKFRMYPNKKQQELINKTFGCCRFVYNKYLTKRIDVYKNNKETFTYKQCSSDLTNLKKELKWLKEPDKFSLQNTLKDLENAYEKFFKKKAGFPKFKSKKINRFSYKTNFTNGNIMYCGQHIKLPKLGMVKIRDKQVPQGRILNATISKEPSGRYYVSLCCTDVDIEAFENTNNHIGLDLGIKEFCISSCGEFIENPKYLKKSLNKLAKLQRELSRKTIGSLNRNKARLKVARLQEHIANQRNDFLQKLSTKLIKENDIICIEDLQVKNMIRNHKLSRLISDVSWSEFIRQLKYKANWYGRKIIKVGKFFASSQICNKCGYKNEEVKNLNIREWICPSCNETHDRDINASINILKEGLRLITIQNK >CP020380.1|AXU34344.1|929537_930221_+|putative-membrane-protein MTSKSQMSESFFLCSLLAITGGFLDIYTYVVRGKVFANAQTGNIVLFGLNIAEGNVKESFYYLIPILAFMLGVFIAEKIRKYFTNNKAKIHWRQVIIIIEMITILIVSFVPRGRFNMFVNVAISFICSMQVESFRKVNGNSFATTMCTGNLRSATETLFHYIHTKNIFMIKKSLQYYAIIIFFISGAILGTFFTKIFVEKSILICFFILSVVFGIMFINKDDSFNEN >CP020380.1|AXU34345.1|930516_933099_+|protease MKKIELLAPVGSFDSLKAAVQNGANAVYLGGKDFSARASANNFDRNELIEAVKYSHIRGVQVFVTVNTLIKQYEIEDFVEYVKFLYDIDIDALIVQDIGMARLIKKLLPDFELHASTQMVAHSLEDVKYLQSVGFDRVVLARELNVDEIKWICENTTVDIEVFVHGALCVCYSGQCLMSSMIGNRSGNRGRCAQPCRQKYELIDINTGEVVKSNGDYLLSPRDLSTIEDLDKIIEAGVLSLKIEGRMKKPEYVATVVSGYREAINEFVDKKKISISEEIINNLYTIFNRKFTKGYILGEVGKDIMNSNRPNNQGLYIGKVLDYNRKNKRLRVMLENTLKKGDGINLGGGTIGRIIKDGDITTIAHKGDLIELDFVGEAKKNQLIYKTSDSELMDRVQATFQQDKEFIKTNIRAKVSIKLGKKPELFISDFCGNKSGVEGDKIVEKAIKVALSKEKIETQIQKLGNTPYKLKEIEIDLDEGVSMPISVLNQMRRDCIELLDEERIKIKDRKFKKNRLKYQPNRVNKQKKLDTVPKIRVKVKNLEQLEAVLNYNVDLIYYEDINTLSKALQMVSSISIDSSIFMDLDTSSSLGIPKELMGSNTNNIDTLSNTSKIDTLNKKHSNTAVTDKKLIYSAPRIVRNKEYKQFEILDNIKGINKVQIGNWGSMEYFKKKDLNIDCYLNAFNSESINHFKEEGASTVCLSQELNLNEIKQTLKYTDVEIEAVIYGYAPMMVTEYCPMGVVVRDCKKDKRVAKCKESSYALRDFTDASYRITQDIFCRSTIYNSKVTCMLDNLYELEEIGIDVFRIDFTVEDSEMVKKVIEAHIEVLSNNYKLGKKATDLYKKLDEIGTVTGHYYKGVE >CP020380.1|AXU34346.1|933202_933781_+|phosphohydrolase MREEALEILFKYLETDRMRKHCYAVEAVMRELAKRLEPEKEEEWAVAGLLHDLDSDIVGRKPGEICEGHATTTVELLKKENFGDEEMYRAILGHHDGMGVTRTSLMEKAIYAADPITGFITAIALVYPDKKLTSVKTKSVIKRMKETRFASNVNRNAMRSIEDIGIPFDEFAELSLNAMKNISDVLESAENN >CP020380.1|AXU34347.1|933814_934291_+|DNA-repair-protein MKLTTICYIEKDDKTLMLYRNKKKDDIHEGKYVGVGGKFEQGETPEECVIREVKEETGLTLKSLSYKGLITFPKFKDEEDWYMFLYFSDEFEGELSEKDLNDCKEGNLIWVDNDKIFDLNMWEGDRLFLNWAKTGNIFSAKIVYDNGKLKDYNVSFLD >CP020380.1|AXU34348.1|934744_935566_+|reductase MIDINLEKCVGCGMCESDCLVNAIKVKDDKAKVKNILCINCGHCMAICPTDAIEMQGFDKNEVIEYNRESFELEPEKLLNFIKFRRSIRQYKDIEVEEEKIKNIVEAGRYTPTGGNRQPIRYILVKEKLKEVKDLAIQGLYNLALDTDDNDPVRSIYKNTFKKMYKRYTENGNDSLFYDAPLLMVVVGDMSLGGSAYVDGGLAASNMELMAYSQGLGICYNGFFVMASNVEPKIKELLGMSENEAVITSFILGYPDVKYKRTVNRNTAKFEVR >CP020380.1|AXU34349.1|935803_937738_+|signaling-protein MNLKKLLLLIIVITSIFTSCIFSFDINAIGNDNRTIRVAYPIQKGLTEIDEQGNYFGYTYEYLLEIAQYTGWNYEFVQVPGEINESITKLMKMLENGEIDIMGGMLYNEPMQKIYNYAGNSYGVANTVLQALYENTDIDNIMSSQDVKKIRIAVIENSDTRLKELDEYCKMNLMSPELVYCKTNDEQLEALKSGKADVLLNVSMNPIEGVRTVAKFSSRPFYFITPKGSTNLTQKLNSAINNIEQKDPYFSTTLYEKYFTPENNQMFLSDEETNYIKDTEKLKVGVLLNKPPFQNVDKDTGELRGISIDLLNHICDKTGLEFELVPVKSQEDLENMTKDHEIDIVAGMIYDYEYSREHNVAMSRPFISTQYTMMINNKLNENSLDGKRIALTKGINYDGQFEENIVWYDNLEECIEAVNKGYADYTYGEGYSIQYYMNQPKYKNVRLVPQTYKAKSICFGIIKKDKQELLNIFNKAIISISSEKMQSIVYQNTTYRQDFSLLYIMQQNPIETIFIVASLLICIIGFMAFGLHTRTSMNEKISLELKKHTQLYEMTSEYFFEYDYKQDKLIISMPEKGIETYYGLDKNDKESENGNIENERDKIRREYNKKFFDVIKSQENGTTEMYSIMLDDTFQMNLVFISMI |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP020380_9 | 1661699-1661858 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP020380_9
|
2 spacers
spacers of CP020380_9
>9.1|1661727|38|CP020380|CRISPRCasFinder GTTTTTTGGGGTGCAGTTGCGAGTCCAACCCCCTCTTT >9.2|1661793|38|CP020380|CRISPRCasFinder TAGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP020380_9
The CRISPR arrays of CP020380_9 >merge|CP020380|9|1661699-1661858|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAGTTTTTTGGGGTGCAGTTGCGAGTCCAACCCCCTCTTTGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAAGTTTTACATTAACTAAAATGTATAGAAT >CP020380|9|9|1661699-1661858|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAA GTTTTTTGGGGTGCAGTTGCGAGTCCAACCCCCTCTTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAA TAGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAA GTTTTACATTAACTAAAATGTATAGAAT
>CP020380.1|AXU35035.1|1660815_1661172_+|integrase,-catalytic-region MVFEIFDKAIELYPNAKPVFHSDRGFQYTSKVFESKLLAQGMIQSMSRAGRCIYNAPMEGFWGILKVEMYYLRKFDTYEQLVKAIDDYIYYYNNFRYQKRLNSMSPLEFRKYLSTEIA >CP020380.1|AXU35034.1|1660240_1660786_-|integrase MKLIDITSYINNIYNEHMLNSAKNQVGFIKSVLKEPYRLKEISENICDFVTTPIKKNSSTSKFYTKQEAQLLLEKSKNIPIGIPIFLMLTLGLRFGEAVSLRWSDVDLDKKIIHVNQTLVYVDNKIIFKDPKTPRSKRKLFAPDELISLLEEEKLKQNKLKLQAILKNEFDLICLNKRFNL >CP020380.1|AXU35033.1|1658342_1659698_-|drug/sodium-antiporter MDTKISINENMSLGKRFFKYLAPSVVAMWVFSLYTMVDGIFVSKGVGELALAAVNISMPFINFIFAVSLLFSTGASTIIAIYLGKKDIKSANEVFSFNLVSIIILSIIILAITFFNLDRLALFLGATESTIGMVKDYLGIIIFFNGFFIVSYSLEVIIKTDGFPILATVGVIISALTNIILDYLFVIEFGWGVKGAGIATGLSQVFSTIFFLIHFLRKNSTLNFSKFRIDFKTLRKIVFIGFPDSTTELSCGIVVLLFNLSLTKYIGENALIYYSVINYINTLVLMTMMGITQGMQPLTSFYYGAGNIDNVKKLLKMGIKATIIASIAVFAICMAFSEPIVSLFIHPEETMLFNEGVRVFKIFSISFLLVGINVIISGFFVSVEKPSISTVISLGRGLVIVVLSLISMILIFGGQGIWMTTIVSEFICLILSLVFLKKNFSTLDSNLNKVA >CP020380.1|AXU35032.1|1657574_1658225_+|ATP-binding-protein MADEKFVMSFSGGKDSILALNRMLKKGYKPVALLTTISEEHGKSWTHNLEYNMLKQVSSNIGLPLLVAECGVEGYEESFERALIKAKNMGATICAYGDIDIESHRKWDTDRCEAVGMKVDLPLWQESREDLVYEFIDSGFCSVVTKVNLKHLGEGFLGKKLTRELVEKIKNAGADPCGEHGEYHTFVVDGPIFKKPVEYEVKGTLIKDGYGYLEIK >CP020380.1|AXU35031.1|1657061_1657490_+|EamA-like-transporter-family-protein MTKLWAIIFALLAGGSTALEAFINGELGKSTTALVATFISLTVGAIFFLASIIVTGDLKCLVSINGFNYKLLLGGVFGGLIIYFTVKAIPNLGVSNTLILTLVSQVLVGFFIDSVILGQETMHLYKYIGVILLILGTFFIVN >CP020380.1|AXU35030.1|1656361_1656910_-|hypothetical-protein MYTNFNIDFNNFNKKENATKFMLMGVLLIILGLLCLTFKTLGIKLISWTFGIALLFFAYLNLKNINELKRYATKEEIKPSINIQWVLIIACILLFVFPQKIQSIFSLFLGFYLIFNQLVALVNSKNNPYSKFTTWNIVKILFGICLILSPLFLSRFIVSIMSFFIILFGLVLFFSGNTARKY >CP020380.1|AXU35029.1|1655306_1656242_-|radical-SAM-protein MDKFKYAFDNKRYHTWNYYLRNTFGEKVFKVSINAGFTCPNIDGNLGYGGCTYCSKEGSGDFAGNPKDNLISQFYNIKEMMLKKWPHAKYIGYFQAYTNTYAPLEVLKEKYETILELEDVIGLSISTRPDCLPDDVVEYLSELNKRTNLWVELGLQTIHDSTSKIINRGHDYKTFVEGVEKLKSKNIKVVVHIINGLPGEDYNMMMETAKAVGKMGVDGIKIHLLHVIKDTPMEKMLQNGMLTLMEQDEYINLVCDQLEILPETMIIHRLTGDGKRDELVGPIWSLKKWEILNQIDDTLKARNSYQGCKFV >CP020380.1|AXU35028.1|1654091_1655036_+|membrane-protein MGEKSKGYVFIAIAGLLWVTLGLFGKFLMGNGLTSEQVAFTRLFFGFIVLGVYSSIRTPQILKISKKGIIYSVIIGIICQAMFNLCYFKAIDIAGVSIAAVLLYTSPLFLAIFSKVCYKENITRSKLFSLILCFIGAIMAVTGGRLDFQGLNAFGLLLGILSAIAYALMPTISKNALKEFSSSTILVYSFLFGAIFMIPSSRPWEILNYAKDLDVLSCMLMLGIVPAALAYIFYAAGISKGVELSVAGVVASVELVGSVIIGCTILGESFSLGKLFGVMLMLISAVVALNLSYDEIRIFYKSNKLKQIEKTESI >CP020380.1|AXU35027.1|1652332_1653775_-|sigma-54-dependent-regulatory-protein MNLNLELDLEFYQKILEASHDEICVSDDKGIIIYCNKAFEENYGLKKEDILGKNVSFLEDSGYSTKSPIPIVLKTKTKFSLEQDTQTGKKLIITATPIFDENGNLEFTVENCRDITELNNIKNKLEDTKKQVKKYKSEVETLYRTALRIEDTVIMDGIVMRPIINTVNHVSKTDVSVLLLGESGTGKSSLARYIHHNSNRSNGPFITINCATISPQLLESELFGYTSGAFTGASTKGKVGLVELANGGTLFLDEIGDIPQNLQAKFLQLIQDRTFTPVGSLKNKKVDIRIISATNVDLVSKVKEKKFREDLYYRLNVIEIKLPPLRERRDNLVEIIKYYFNRYSSDFNLNKTISKEAMDAIANYRFPGNIRELQNIIQKILLTCTDNHITIDDLPNILTKNIHITNNGNKTHISQINKVIISDSKSTNYKNKNFDTLIKEYEKNIILDAYEKFASSYKVAKHLEISQSKANRLIRKYTNT >CP020380.1|AXU35026.1|1651548_1652133_-|hypothetical-protein MLMNTHFIMAKSILDNIDENKTFFISEKNFIYGNIKPDAFSKYKLKKHYLDESFNMIVSKINYLCSLNIDSLSKYFSVSRLSQELGVICHFLCDFFCVAHSERWEFKHSLNKHVTYERELGAFAKDVDLSKIKCGTINSSFEKFFTKLYSDYKKKTDYMNDLKFSAYTCNSVINYILDSILSNTIKSYHIANCG >CP020380.1|AXU35036.1|1662184_1663918_-|signaling-protein MSILLKKAPKLAKHIITSFYINRDIDEVLKYLCENVTWIGPGEQEFLTSFNEIKNYFYAGQDEIPSCDINNDIFETVSEDENRCMVLGKYTVRTKENAQMILEVNQRCTFEIIEDRGKLLVKHMHISNPYGEMQLDEYFPTKIGTQSYDYLQRLLKEKTEVIEMITNNINGGLKGSNDDSTYSFFYVNEGLPKILGYTYDEFMEMSGGSAVGAVYPPDLPKALEDCERCFAKGPTYSSEYRIRKKDGTLMWVLDSGMKSLNSDGIVKINSIITDITQLKNIESELKLERERYRIALQNITDIMFEYDIENDTLIKYQRVKIDKKIELENFETKNYSKLLESGKIIHLDDIGKLLEVLHGNLRETIEIRQVNSLTKNEWRWIRVQCSVIYDSDHNPIKTIGVLKDITEDKSKLESLINQAQRDPLTQLYNQRVSQNLIEEYLCSSDSKNNDALLVIDIDDFKTVNDTFGHLEGNEVLVAVSKILLHNTHDKDIVARIGGDEFTIFIKSLTKDLIIKITNDILNDASKIKVKDNHKITLSIGIAFTDDSTKLYKDLFSKADKALYLSKADGKNCYSTYE >CP020380.1|AXU35037.1|1664157_1665003_-|signaling-protein MFKEIFLRTFPGFLIIRDSNYRIIFINDNLKNLIKSYMQDNPLGMTNIEIAKKLPDNIAKFFTDSHNIQLDWEKNYPYDKISNWILEFKKDTTSYWNILEYKVDVDEKTYIITMANDITKLYEENKRNLHYSITDPLTGAYNRKYLNDRFDIFIGDYIVLIDLDNFKMINDYEGHNVGDKILCDFVSLLNKELINSTSIIRLGGDEFIVIFSSDVDKNYVYSQLEALRENFLKVFSKYKYLSFSYGVDTVKRNLKLTIVELDKKMYKNKEKNKKKFDKNDY >CP020380.1|AXU35038.1|1668042_1668852_+|MerR-family-transcriptional-regulator MKDYYKIGEISKIYGIGRDSLMYYEEIGILRPVRDINGYRMYNISDIWKLNLIKEFRSLNFPMKKIKEYLDDRSIESTKNILNEELDLIDKKIAEFISHKENIIKRLSSIESVIQNTKIDEIEVVYIEKRKALELNADIKRDEDFDFLIQKLQKEYEDRFNILGNNNIGSAFSTEAINKGIFNEFKSVFCFLESNEKVYNIVFDEGYYVTLNYTGSNSNNKIYMEKVFKFIEENNYKIIADPIEIYKIDIHETGIVEEFVTEIQVPITK >CP020380.1|AXU35039.1|1668993_1669233_+|hypothetical-protein MKCSNCGSVNIEKGILTTGGIYAETIGLKYVGYGKLDKVINENFPVQSTIYSDLCLDCGEIVRTYIKDNTDRNWCKDEK >CP020380.1|AXU35040.1|1669419_1669596_-|hypothetical-protein MFRDEMDKCTHMLTAYISSSYDYCDFIDTQLDDFILEYGENVVESCLHQVMVLVSKYN >CP020380.1|AXU35041.1|1670815_1671223_-|isochorismatase MLIQQLKELHEFWIIDTSARIAKKLGYDITLISDTGTTKNLFWNNIEIYADAVHQVFMASLQNSFADIKNTAKFLSSITNKNIYYVKRASSIYLSLLFNHLKLDTFYHFYIHNILLYILYSYITIIEILNFTIFT >CP020380.1|AXU35042.1|1671277_1671373_-|transcriptional-regulator MKIRDEYTCPLEIVHDIIKGKWKTILIFELK >CP020380.1|AXU35043.1|1671603_1671738_+|hypothetical-protein MNISRKAMKIIELAQKIANKRGISVEEAWNEAVTEYKNKYEHIA >CP020380.1|AXU35044.1|1671837_1672623_+|acetyltransferase MIVKIDNTLEKEFWQYVSHEESLNLFIIGYVENYGFSSQYQDIWSQVEDGNITSIILKNKSTLIIYSFKNNFDIGEMKNHIKNLDVESISGKKCVIDRLISKYKDFYEKLDNKFCVLKEIKEIDFSNMKEYKIENAQEKDIDEIGKLLNRSDYKVSKNYIEERKEHLKEGNVRAYFIRNNDTMISTVSTGMETSFLAMVVSVSTDKRYRGKGLASYMVYNLSKELLLEGKVPCLFYNNDIAGKIYHNIGYKEVNEWTILFK >CP020380.1|AXU35045.1|1672719_1673544_-|exported-polysaccharide-deacetylase MKKDSLKKYIMIGAFALILFGIASINFKSLDKTKTQISSPTLDTHEYDWYFNPREDGKQPSPIKEADFFKKYGAYYVGNPNEKVIYLSFDAGYESGNTPKLLDTLKKHNAKAQFFVVESYIKSNPDLIKRMEKEGHLVCNHSKSHPSMAGITDFEKFKEEITSVEKAYKDVTGKEMPKYFRPPMGKFSEQSLKYTQDLGYKSIFWSFAYVDWYEKKQPTHEFAKNKIYSRTHPGAIVLLHPNSSTNTEILDEVLTHWEKEGYKLKTLDYLNNKK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP020380_10 | 1769637-1769994 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP020380_10
|
5 spacers
spacers of CP020380_10
>10.1|1769665|39|CP020380|PILER-CR,CRT TCTCTTACGCTTTTTCAATCACTTTTTTCCTTGCTAAAA >10.2|1769732|38|CP020380|PILER-CR,CRT TTGCGGTATATTGGAATTGAACAGGATGATTTAAACAA >10.3|1769798|37|CP020380|PILER-CR,CRT TGATGTAACCGCACAGATATTCTGGCTAAAGAATCGT >10.4|1769863|38|CP020380|PILER-CR,CRT TAGCAACTAGAGTTGATAAAATTAATTTAATAGGAATA >10.5|1769666|38|CP020380|CRISPRCasFinder CTCTTACGCTTTTTCAATCACTTTTTTCCTTGCTAAAA >10.6|1769733|37|CP020380|CRISPRCasFinder TGCGGTATATTGGAATTGAACAGGATGATTTAAACAA >10.7|1769799|36|CP020380|CRISPRCasFinder GATGTAACCGCACAGATATTCTGGCTAAAGAATCGT >10.8|1769864|37|CP020380|CRISPRCasFinder AGCAACTAGAGTTGATAAAATTAATTTAATAGGAATA >10.9|1769930|36|CP020380|CRISPRCasFinder AGTTTATGATTTTTCATTGCATATTCAATAAAAAAT >10.10|1769929|37|CP020380|CRT GAGTTTATGATTTTTCATTGCATATTCAATAAAAAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP020380_10
The CRISPR arrays of CP020380_10 >merge|CP020380|10|1769637-1769994|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATCTCTTACGCTTTTTCAATCACTTTTTTCCTTGCTAAAAGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTGCGGTATATTGGAATTGAACAGGATGATTTAAACAAGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATGATGTAACCGCACAGATATTCTGGCTAAAGAATCGTGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATAGCAACTAGAGTTGATAAAATTAATTTAATAGGAATAGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAGAGTTTATGATTTTTCATTGCATATTCAATAAAAAATGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAG >CP020380|10|1|1769637-1769928|PILER-CR GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAA TCTCTTACGCTTTTTCAATCACTTTTTTCCTTGCTAAAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAA TTGCGGTATATTGGAATTGAACAGGATGATTTAAACAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAA TGATGTAACCGCACAGATATTCTGGCTAAAGAATCGT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAA TAGCAACTAGAGTTGATAAAATTAATTTAATAGGAATA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAA >CP020380|10|10|1769637-1769994|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CTCTTACGCTTTTTCAATCACTTTTTTCCTTGCTAAAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TGCGGTATATTGGAATTGAACAGGATGATTTAAACAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT GATGTAACCGCACAGATATTCTGGCTAAAGAATCGT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT AGCAACTAGAGTTGATAAAATTAATTTAATAGGAATA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAG AGTTTATGATTTTTCATTGCATATTCAATAAAAAAT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAG >CP020380|10|2|1769637-1769993|CRT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAA TCTCTTACGCTTTTTCAATCACTTTTTTCCTTGCTAAAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAA TTGCGGTATATTGGAATTGAACAGGATGATTTAAACAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAA TGATGTAACCGCACAGATATTCTGGCTAAAGAATCGT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAA TAGCAACTAGAGTTGATAAAATTAATTTAATAGGAATA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAA GAGTTTATGATTTTTCATTGCATATTCAATAAAAAAT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAA
>CP020380.1|AXU35127.1|1766882_1768976_+|signaling-protein MNKHNFEVILNQLQINIYVTNIHTNEIIFMNKKMKEEYNILDPEGKVCWQVLYPEKNSTCSFCKVLELLKNDKKGVLIKWYEKCNKLNRVFENYDSLITWQDGTVVHMHQSIDIANSTSLNKPIKINEFHEISNTKEEKGVFNFSRDNFDYNSTLLYDALIRGTDEYIYICNMKTGVFRYSPSQVELFDLPGEIVENPLIYWEKIVHPEDWNRFYKSNTEIGKNQMDYHTVEFRAKNRSGEYIWLRCRGQLMRDEFGESSIFAGIMTQLGKQNKIDSLTQLLNYHEFMSVFEDKISNPMIEKLCIVLLNIDDFKNVNEMYDRDFGDNIIKTLAQSIQSILPDNAELYKLDGDEMGILVDNVEENEILTLYDQIQNMIIHLQLWRKYGLNITISAGCVIYPKHGDTVKELYKCASYSLQYAKEHGKNRLVFFSQEILKNKMYSLEMMRDLKASINDDFSGFSLRFQPQVDTQSHKIIGVEVLLRWTNDKYKAISPLEFIPILEENDMINIVGAWVLRMALRTFRKWIDYYPFFKLSVNVSAVQILEDTFIEDIVKIIDDENFPYQNLVLELTESHTVQNMSILQFKFKALQDLGIYIAMDDFGTGYSSLEVLKFSPIDIVKIDRVFVKDILKSKFDAILIHFIVAICHDVGIKVCLEGVETQEEYDLVKQIKPDYIQGYLFGKPQTATEIFDLLKLDN >CP020380.1|AXU35126.1|1765308_1766205_-|NADP-oxidoreductase,-coenzyme-F420-dependent MANYFLSKGYCVSGFYGRNQLSLLESTNLTKTKIYSNLKDIIYENDILFITTSDDSIEIIDKKLSKFNLKHKYICHTSGSLKSSILFCSKKAGALIYSIHPIFAFSNKNTDIKKMKDICFSIEGDNEQDDLVIQNFIDGLGNQFFIRDKDTSSTYHLANVLVSNLVLSLLDIGVSYFIKLGLSEEESLKAISPLVKKNIENILDNGFTKALTGPVSRGDITPIRKHLSVLDKKDEEIYKILSLNLLKIIALGNDNSLKCTKNITIENAIENLISKSEKYKEIYKLLGGKNDEKYHTDF >CP020380.1|AXU35125.1|1764506_1765334_-|3-methyl-2-oxobutanoate-hydroxymethyltransferase MKNTIQTFKNAKYEGKKLSMLTAYDYSIAKIMDECDINGILIGDSLGMVIKGEENTLSVTIDEIIYHTKAVKNGVKNALIVSDMPFLSYHVSIEDAVKNAGRLIKEGGAHAVKLEGGSNVIKQIESIVNAQIPVMGHLGLTPQSVNSFGGFKVQGNNSETARQLIEDAKLIEKAGAFSIVLEGVPTKIAEMVTNSISIPTIGIGAGINCDGQILVYQDMLGMFGDFVPKFVKQYANIGAIMKDSINNYILEVKTGAFPQEKHSFSINESELEKLY >CP020380.1|AXU35124.1|1763639_1764488_-|pantoate--beta-alanine-ligase MLVKEIKLLRNIIKDWRKDGYSIGLVTTMGFLHEGHQSLIKKAVKENDKVVVSVFVNPTQFGPNEDFNSYPRDIDKDFKYCMDSGATVVFNPSPEEMYLKGNCTTINVSGLTDFLCGAKRPVHFGGVCLVVSKFLNIVTPDKAYFGEKDAQQLAVIKRMVKDLNIDTEIIGCPIIRENDGLAKSSRNTYLSEEERKSALILNKSLSLAKEELVKGNLNPKNIKELITAKINSEHLAKIDYVEIVDSETLQPVKQIEHSILVAIAVFIGKTRLIDNFTFELNI >CP020380.1|AXU35123.1|1763046_1763229_-|hypothetical-protein MFKDKIDECVHIMTAYIASLKEYYSFIETQIGDFIKKYGEDVVELCLHRVMILLCECGLA >CP020380.1|AXU35122.1|1761299_1762214_-|hypothetical-protein MIDNQKYVILSLELHLFFSRIMKEHALFLEAGFTNKNYNLAMEADHYKKQFEDLLSYAVSASNGIIRPDILYSEELVTTLTSAAEQKTEEFTGIEINKNITTRELNLQSGVDPQVGQDLVNYVAQLNSDAIRLLDGLINFKERVLDGVLSCTIFTSNYPLLLEHIIHEANLYRSYVVDLENKIDIESKNAKEIELFWDHIMMEHALFMRGLLDPSEGELINTSNDFAIKFNELIEKANGMTDSNIKSITEETLNKTVEFKDFKEAGASGIEQCKIKSIILPLLADHVLREANHYIRILESYKNM >CP020380.1|AXU35121.1|1760261_1760909_-|lactate-utilization-protein-B/C MIRQTPLEKRYDKLGPHIVTALKKRYFDAYYCKTRNEALQQILDLIPQNHVVSWGGSETLKEMGVQTAIREKGFKVIDRDLAKTPEERTEIMRQALLCDTFLMSSNAISEDGQLFNIDGNGNRVAAMIFGPKNVIVVAGMNKIVKNIDDAIQRTRTIASPAVVQRFQDVNTPCYINGSCIDCTSPESICAYMVTTRISRPAKKIKVILVGENLGL >CP020380.1|AXU35120.1|1759543_1760095_+|lipoprotein MYYNVCNISTDVSWLTNDNKIKNEVDSMFNAIKTQDADTVDKYFPKSGLGNLIYEDKEGFKMYSKNMTWEISDIKNNKDKVTVDLKINNTDMVSILKNNPPKLGEMMPNPTMKDIDSANKKEFNITLELVKSGDNYVCKVNQESAMKLLNVITGGGIDYLTDYNKDYYKQLDEEQKNYENKNS >CP020380.1|AXU35119.1|1758622_1759522_+|iron-sulfur-cluster-binding-protein MKLLSKINNNIRLITQVAFTALTNGYVNGFLEGTIYGGESKKLCVPGLNCYSCPGALGACPIGSLQAVLSSREYKFSFYVVGFLMAFGAFFGRFVCGWLCPFGLVQDLLHKVPFPVKIKKVYGDKYLKYLKYIVLIMFVIILPVAIVNVAGGGNPWFCKWICPSGTLLGGIPLILGNENLRESIGFLFSWKLSILLLILLMSIITYRPFCKYICPLGAIYGFFNPISIYRFKIDKEKCTNCTACQTKCKLDIPIYKDVNSPDCIRCGECIKVCPQNAITTTFSKDKKENNVCAKKYRGI >CP020380.1|AXU35118.1|1757885_1758470_+|thioredoxin MKKFFMVVLGCIFVLGMISGCSKKESKPVEKNKNNSEWFSNLDTEDVDGNKVTKEIFSNKELTLINVWTTWCGPCVGEMPELEALSKEYESNNSNVAIKGLVVEVDKTDMRTGLSNEEKNLVKDIMKKSDATYQQLTVSEELKKTDFKRVMEFPTTYFVDKKGNFVGEKVVGANSKEEWKKIIDERLKMVKANE >CP020380.1|AXU35128.1|1770284_1770446_-|hypothetical-protein MLVRVEFIIGATIRYLIKHKVNYCNKKVLDKLELKYGNIDREKAVKLENFINI >CP020380.1|AXU35129.1|1770652_1771471_+|MerR-family-transcriptional-regulator MEKQYFTTGEFAKLCGISKQTLIFYDKIGIFSPEYKDKNNYRYYSVYQYDTLDILQSLREIGMSLEEIKEYIQNRTPQLCVKMLKEEEKKIREKIKKLRKISSKMQNRINITVEGISKMNSEEIYMSKKFEEYLVLSSDLSNMSNGDFMMELIDFTNYCKSKNLYQGYELGVIVSNENIKNGDYLSISSFYLKIDKKIKDKKLYVKPEGMYACIKHIGKYEDSYKSYEKLKKYIYENEYKIIGNSYEESILDFFCESNEDNYMTEISIQVSR >CP020380.1|AXU35130.1|1771603_1773724_-|ferrous-ion-transport-protein MGLTHNSTKMSSLKDMFDIDNKEDQFVIALAGNPNTGKSTVFNHLTGLRQHTGNWPGKTVATARGNFKYKNTEYALIDLPGTYSLFALSQEEIVARDFICFGNPDAVIVVCDATCLERNLNLVFQVMELTDKVILCINLVDEARKKGITIDKKLLEDSLGIPVILTAARNGSGMDELLDTLNDVSFDKYKLNNKPVRYNENIENLVKSIQPELDNIIPGINSRWLGLRLIDGDESIFESMSNYIDKDSIDAINEVKKKIPDNINKQKIRDEFTKINYDYAKKLSDECCSNVAKKSTDREEKVDKILTSKIFGLPIMLLLLGTILWITIEGANYPSTLLSNLLLGFEPSISGILNSINCPSWLNDMLVLGLYRTLAWVISVMLPPMAIFFPLFTLLEDFGYLPRVAFNLDHLFKKACAHGKQCLTMCMGFGCNAAGVIGCRIIDSPRERLIAILTNNFVPCNGRFPTLIAISTIFFSSVITNSFVSSVATALCITLLIILGVIITLLVSYTLSKTLLKGVPSTFTLELPPYRVPQIGRTLYTSIIDRTIFVLGRAVMVAIPAGVITWIFANIYIGDLSILSHVANFLDPLAKLIGLDGFILLAFILGFPANEIVVPILLMAYLATGSMIELDSFSALGQVLREHGWTYLTALNVMLFSLLHWPCATTLLTIKKETGSLKWTALGFLMPTILAFVVCFLTTTVYNLFI >CP020380.1|AXU35131.1|1773749_1773977_-|ferrous-ion-transport-protein MKNLNDIQVKKTVKVEDILSSGNLRERMLALGLTRGAVIDVVRKGPKNNLTVYKIRGSKIALRQEESSLILVSDI >CP020380.1|AXU35132.1|1774302_1774743_-|acetyltransferase MFKIKHFNDLSLDEFYEIAKSRYEVFACEQKIFSLNDYDDIDKSSYHIFLKENGLICAYARIIPKEYSSYNDVSIGRVLVLSSHRRKGLAKQMMDCAIDFIKVNLHENNITLSAQTYIKNLYLSCGFKEISEVYDEAGIEHIKMRL >CP020380.1|AXU35133.1|1774915_1775884_+|hypothetical-protein MNTTKKLTEAALLSSLFIVVTIIAVSTGFGYAIYLDFIVPVFFCIICLKCDLKYTILSGITSLLIISMVLGNLGTAIWVSQSVLLGIMCGYLINKPTMVMDDLVYGSVFGVIVMVFIDIYASTLIGYSFMKEFQGYSKWIYFNGYTNFIYYLMIALFPFGMVFCIYLLSLILGNKLHILDSNSLKKFLIFKNFRSLNQFLCCSKKAFYICVSYLAIFEVLKLWNVKVDSVYLKTIFISISYISVYFIIRDSCMSLQNFIIAKFRKLLYARILFLIIILLLFFIFDVTVISLIIINAFLNKTIDIRLSQSNIVNKQINFLIEK >CP020380.1|AXU35134.1|1776369_1777578_+|tyrosyl-tRNA-synthetase MKSIDEQMRIIMKGVDNLIDEKELREKLIKSEKEGKPMIVKLGLDPSAPDIHLGHTVVLRKMKQLQDLGHQIVIIIGDFTGKIGDPTGKSKARKALTTEQVLANAKTYEEQIFKVLDKEKTIVRFNSEWLAKLNFEDVIKLAATITVARMLEREDFKKRYEGQMPISVHEFFYPLMQAYDSIALEADIELGGTDQRFNLLMGRSLQREFGMESQIVIMMPLIEGLDGKEKMSKSLGNYIGIDEEAGIMYQKSMEIPDELIIKYYNLVTDVHPDEVNKIESQLKEGSVNPRDIKMNLAREIVTLYHGEESAREAEERFKSVFQKGQIPEDIQTIQVKEDGFDLIEVLVVNEIVKSKSEVRRLASQGGVKINGEKVEDLSTIVKESELVVQIGKKKFVKIELVK >CP020380.1|AXU35135.1|1777638_1778520_-|polysaccharide-deacetylase MVKKRKKKTVTLTILVVIVIGIFSMAWADMSRKKEMKETQERLKAERLEKERIEKEKNEPIIGAKKEAVKEYGYDAKIVWDKLNKYDYSNNGEKIVFLTFDDGPSTTNTPQVLDILKRHGVRGTFFIKGDSLERKGANEILKRTFDEGNAIAHHSYTHDYKKLYPGRSLNLDTFVNELNKTDEAMKKVLGKNFSSNVVRCPGGYMSWKNMEPLGNYLKEKNMASIDWNALNADAEGKKKNAQELFEHSKKSSEGKEMVVLLMHDTYGKQETVNALDQIITYFKDNGYQFKILI >CP020380.1|AXU35136.1|1778935_1779850_+|transporter MKKYFGEIGLIFIAIIWGSGFVATQFALDGGLTPLQIITLRFFLAAIIMNLLFFKQIRANMGKKLLKAGGILGIFLFLAFTVQTIGLMYTTPSKNAFITAANVVIVPFIGFILYRRKLDKIGIISSLVALIGIGILSLEADFSINFGDFLTLICSFGFAFHIFFTSEFAKDNNPMALTAIQFTVAFLMSVVVQTFAGQLKMEAELSGYMGTMYLAVFSTTIGFLFQTICQKRVDGTRTAIILSTEAVFGTIFSIIILKELITAKLVIGSILIFVAIITAETKLSFLKSKKVKLKDSEESSLESI >CP020380.1|AXU35137.1|1780072_1780618_+|ruberythrin MKKFVCTVCGYIHEGDAAPAQCPVCKVGADKFEEMKGEMVWADEHRIGVAQGVDAEIIEGLRANFTGECTEVGMYLAMSRQADREGYPEVAEAYKRIAFEEAEHAAKFAELLGEVVVADTKENLRVRVDAEYGATDGKLKLAKRAKELGLDAIHDTVHEMCKDEARHGKAFLGLLNRHFGK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP020380_11 | 1945616-1946827 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP020380_11
|
18 spacers
spacers of CP020380_11
>11.1|1945645|36|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTAAAACCTCATGAGAGGTAAGGGGATGATAAGTG >11.2|1945710|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAAGTGATAGAATTTCGTCTCAATTGAGCAAAGAAT >11.3|1945776|38|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAACAAAAAATCCAATTTTAAATTATTATTTTGATT >11.4|1945843|38|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAACTAAAGAATCAATATTTTTCAAATTAACTCTAAC >11.5|1945910|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTCATTTTTTCACACCTCTCTTATTTATATAATAAC >11.6|1945976|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTGTATTTATGTTGGCAAGAAGCGTTGATGAAATGA >11.7|1946042|36|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGAGTAACAAGGATTTTTATTAAAAGTATTATCAG >11.8|1946107|36|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATCTTTAGAATAACAGTATCCATCATAATTATTTG >11.9|1946172|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGGTTAAATCACGAAGTATTTCGTTTACTGATTCAG >11.10|1946238|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTCTCAACATTATATATTGAAAATAATCTTGTCACT >11.11|1946304|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCCATTTATTTACATTGTATCTAAAGAATATTTTAGT >11.12|1946370|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTGGTAAGTTTGATTTTATATCATGGTAGTAAGCAG >11.13|1946436|36|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAAATCCAAATTGTTTACCTGCAACAGAAATGTCT >11.14|1946501|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTATAAATTGAAATCAGAAGGTTTTATTATTGATTTA >11.15|1946567|35|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTATTAACTTTAGGTATTTTGTAAGATTTTTCCTC >11.16|1946631|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATGAACATTCTCTATAATATGTGTGTTCTTCAACTA >11.17|1946697|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTGTATTTATAATTTTTTATATTTGAGTAAATTAGC >11.18|1946763|36|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTATACCAACAATTTTCTTCTCCATACTTTTCCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP020380_11
The CRISPR arrays of CP020380_11 >merge|CP020380|11|1945616-1946827|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTTAAAACCTCATGAGAGGTAAGGGGATGATAAGTGGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTAAGTGATAGAATTTCGTCTCAATTGAGCAAAGAATGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAAAAACAAAAAATCCAATTTTAAATTATTATTTTGATTGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTCAACTAAAGAATCAATATTTTTCAAATTAACTCTAACGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTGTCATTTTTTCACACCTCTCTTATTTATATAATAACGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATGGTGTATTTATGTTGGCAAGAAGCGTTGATGAAATGAGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATCTGAGTAACAAGGATTTTTATTAAAAGTATTATCAGGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTATCTTTAGAATAACAGTATCCATCATAATTATTTGGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTCGGTTAAATCACGAAGTATTTCGTTTACTGATTCAGGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATCTTCTCAACATTATATATTGAAAATAATCTTGTCACTGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATCCCATTTATTTACATTGTATCTAAAGAATATTTTAGTGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATGCTGGTAAGTTTGATTTTATATCATGGTAGTAAGCAGGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTAAATCCAAATTGTTTACCTGCAACAGAAATGTCTGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATGTATAAATTGAAATCAGAAGGTTTTATTATTGATTTAGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATCTATTAACTTTAGGTATTTTGTAAGATTTTTCCTCGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATCATGAACATTCTCTATAATATGTGTGTTCTTCAACTAGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATGCTGTATTTATAATTTTTTATATTTGAGTAAATTAGCGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTTATACCAACAATTTTCTTCTCCATACTTTTCCATGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT >CP020380|11|2|1945616-1946827|PILER-CR GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTAAAACCTCATGAGAGGTAAGGGGATGATAAGTG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTAAGTGATAGAATTTCGTCTCAATTGAGCAAAGAAT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AAAAACAAAAAATCCAATTTTAAATTATTATTTTGATT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TCAACTAAAGAATCAATATTTTTCAAATTAACTCTAAC GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TGTCATTTTTTCACACCTCTCTTATTTATATAATAAC GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GGTGTATTTATGTTGGCAAGAAGCGTTGATGAAATGA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CTGAGTAACAAGGATTTTTATTAAAAGTATTATCAG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TATCTTTAGAATAACAGTATCCATCATAATTATTTG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TCGGTTAAATCACGAAGTATTTCGTTTACTGATTCAG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CTTCTCAACATTATATATTGAAAATAATCTTGTCACT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CCCATTTATTTACATTGTATCTAAAGAATATTTTAGT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GCTGGTAAGTTTGATTTTATATCATGGTAGTAAGCAG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTAAATCCAAATTGTTTACCTGCAACAGAAATGTCT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GTATAAATTGAAATCAGAAGGTTTTATTATTGATTTA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CTATTAACTTTAGGTATTTTGTAAGATTTTTCCTC GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CATGAACATTCTCTATAATATGTGTGTTCTTCAACTA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GCTGTATTTATAATTTTTTATATTTGAGTAAATTAGC GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTATACCAACAATTTTCTTCTCCATACTTTTCCAT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT >CP020380|11|11|1945616-1946827|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTAAAACCTCATGAGAGGTAAGGGGATGATAAGTG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTAAGTGATAGAATTTCGTCTCAATTGAGCAAAGAAT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AAAAACAAAAAATCCAATTTTAAATTATTATTTTGATT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TCAACTAAAGAATCAATATTTTTCAAATTAACTCTAAC GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TGTCATTTTTTCACACCTCTCTTATTTATATAATAAC GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GGTGTATTTATGTTGGCAAGAAGCGTTGATGAAATGA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CTGAGTAACAAGGATTTTTATTAAAAGTATTATCAG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TATCTTTAGAATAACAGTATCCATCATAATTATTTG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TCGGTTAAATCACGAAGTATTTCGTTTACTGATTCAG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CTTCTCAACATTATATATTGAAAATAATCTTGTCACT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CCCATTTATTTACATTGTATCTAAAGAATATTTTAGT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GCTGGTAAGTTTGATTTTATATCATGGTAGTAAGCAG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTAAATCCAAATTGTTTACCTGCAACAGAAATGTCT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GTATAAATTGAAATCAGAAGGTTTTATTATTGATTTA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CTATTAACTTTAGGTATTTTGTAAGATTTTTCCTC GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CATGAACATTCTCTATAATATGTGTGTTCTTCAACTA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GCTGTATTTATAATTTTTTATATTTGAGTAAATTAGC GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTATACCAACAATTTTCTTCTCCATACTTTTCCAT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT >CP020380|11|3|1945616-1946827|CRT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTAAAACCTCATGAGAGGTAAGGGGATGATAAGTG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTAAGTGATAGAATTTCGTCTCAATTGAGCAAAGAAT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AAAAACAAAAAATCCAATTTTAAATTATTATTTTGATT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TCAACTAAAGAATCAATATTTTTCAAATTAACTCTAAC GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TGTCATTTTTTCACACCTCTCTTATTTATATAATAAC GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GGTGTATTTATGTTGGCAAGAAGCGTTGATGAAATGA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CTGAGTAACAAGGATTTTTATTAAAAGTATTATCAG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TATCTTTAGAATAACAGTATCCATCATAATTATTTG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TCGGTTAAATCACGAAGTATTTCGTTTACTGATTCAG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CTTCTCAACATTATATATTGAAAATAATCTTGTCACT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CCCATTTATTTACATTGTATCTAAAGAATATTTTAGT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GCTGGTAAGTTTGATTTTATATCATGGTAGTAAGCAG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTAAATCCAAATTGTTTACCTGCAACAGAAATGTCT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GTATAAATTGAAATCAGAAGGTTTTATTATTGATTTA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CTATTAACTTTAGGTATTTTGTAAGATTTTTCCTC GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CATGAACATTCTCTATAATATGTGTGTTCTTCAACTA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GCTGTATTTATAATTTTTTATATTTGAGTAAATTAGC GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTATACCAACAATTTTCTTCTCCATACTTTTCCAT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
>CP020380.1|AXU35273.1|1943740_1945012_-|guanine-deaminase MLKVLKGNIIFTKTSETFTVFENSYIILEKGKVKGIFKEIPKEYKNLKVVDYTDKLIIPGMNDLHAHASQFKNLGMAMDKELLPWLEAYTFPEESNYKDIEYATKMYKKFVKELWKSGTTRIAVFATVHKEASMKLMDIFKEVGLGAYVGKVNMNMNCPDTLLENTQDSIADTEEIINKYSDTDSIVKPIITPRFIPSCTSELLKGLGDLCLKYNIPMQSHLSENYDEIEWVRSLEPESKFYGDAYNRYNLFGQTPTLMAHCVHCSQDEIDLMRENNVMAVHCPASNFNVGSGAMPIRKLIDNNIRLALGSDISGGHTLSIFKAMVSAIQLSKLYWVNSGKKYNFLSLSEAFYIATKSGGSFFGKVGSFEEDYDFDALIIDDSNLNHDNYSILERLERFIYVGDDRNIIHRYVCGKLIEEPNI >CP020380.1|AXU35272.1|1942342_1943059_+|hypothetical-protein MVHICFDDICYFLLKEAMRLKLILHNKIVLLEDDLSIGNISDANNYKLRENIFKIRSIFENNPKLLFKPDLLDDRKLSKCRNVIIWCANNPKDLCGVYYVVSKFQDKNIKVVIADEKKTEDALIKYSFTSEMSPEDFPFFLDKTLEIGFNEKLEFKNKWDVLVKENSIFRALINNEIKSVEETYFDKYILKNISDKWQPLIEVVAKCMFEDELRVKDWFIPLEIREDGKFKNSKNKRK >CP020380.1|AXU35271.1|1941695_1942013_-|hypothetical-protein MSEFKNVTAVKKANVYFDGKVSSRVIILPNGERKTLGLMLPGEYTFSTREEEIMEMLAGSMDVKLPGSNEFVTYKEGQKFNVPSDSSFDLKVNEVVDYCCSYIAD >CP020380.1|AXU35270.1|1939252_1941610_+|cation-transporting-ATPase MDKVNLERYSCDINVGLNKNQLQSRIDDNLINAFDNGKTKTYKQIFKDNIFTLFNLINIVLVCLLVSVGSFKNTLFIFIAVINTIIGVIQEIRAKRLLDNLSVIVSNKVSVIREKEKKEIDVQELVLDDIMILKTGNQICADSKVLNGKLEVNESLVTGESDIIIKNKGDFLYSGSFVVSGEAFVRVENIGKDNYANKIANDAKISKKHNSQLRNSLNAILKIVGIIIIPLGIILFAKQHFGNGDSIATSVVGTVAAVNGMIPEGLTLLTSIALAVGTIKLASHKTLVQELYCVETLARVDTLCLDKTGTITEGKMQVDDIVMLEEVDINEIMGNICNSLKDDNATLNAIRDKYNVLDTYKAKNLIPFSSERKYSGVTFENKGTYLLGAFEFIFKEKNKKLRIEVERYSKKGNRVIVLAHSDYYMEDNNIPEDIKPLAFILILDKIRDEAKETLEFFYNEGVDIKIISGDNPITVSEVARKAGLKTASNFIDATTLKNDSDIYEAVDKYSVFGRVSPQQKKQMILALKKQNHTVAMTGDGVNDVLALKEADCSIAMASGSDVTKNVSNLVLLDSNFASMPKVVMEGRKVINNIQRASSLFLVKTIFSFFLSLLTLFFFSRQYPFVPIQLSLIGAVTVGIPSFFLALEANKSRISGNFLLNILKNALPGALCVTVNVIIVYNIVEYLGYSSSVFSTMCAILTGVCGLLILRQQCLPFNKERLFLIVSMTIAFVIGILFLGGLFSFVALSRELILITMALAILMPIMIKVMLFVLDEILETIVPDLN >CP020380.1|AXU35269.1|1937372_1938830_+|glycine-dehydrogenase-subunit-2 MKEYNSLLIDISKKGRKAYSLPKLDIDDIKIEDMIDQDMARQSELNLPEVGELELVRHYTLLSNKNFGVDTGFYPLGSCTMKYNPKINEDMAALPNFTEMHPYQSSDTAQGSLSLMYDLSRRLAEITGMDEVTLQPSAGSHGEFTGLMIIKAYHENRGDHKRTKVIIPDSAHGTNPASATMANFDVIQIASDKNGAVDINALKEVLNDEVAALMLTNPSTLGLFEKNIKEIATLVHEAGGLLYYDGANMNAIMGITRPGDMGFDVVHLNLHKTFSTPHGGGGPGAGPVGVKKELVPFLPIPVIERKEDKYVLNYDREKSIGKIKNFYGNFGVLVRAYTYILTMGRDGLKEASEMAVLNANYIKESIKDDYILPIDTLCKHEFVLGGLPRGEANIKTIDIAKRLLDYGYHPPTMYFPLIINEALMIEPTESESIETLDSFIEAMKSVAKEAKEEPELLKTAPHNTLVKRVDDARAVKKPILTWSQR >CP020380.1|AXU35268.1|1934898_1937373_+|bifunctional-glycine-dehydrogenase/aminomethyl-transferase-protein MNELKRVSLYNIHKELGAKLVEFAGWEMPLEYEGINKEHEKVRKSAGIFDVSHMGEVQIKGAESEKFIQNLVTNDISTLKINDIIYTPMCYENGGVVDDLLIYKFGEEDYLLVINAGNIDKDVAWIIKQSEGYNVDIKNISSEVSQLAIQGPKAEEILQKITDIDLNSIKFYKSIPSTKVCGCPCLVSRTGYTGEDGFEIYCKNKYVEIIWNEVLKVGGEDICPAGLGCRDTLRFEAALPLYGHEINEHISPIEGSLSIFVKTNKESFIGKSILSKEKESGAKRKLVGFEMQGKGMPRNGYDIRIGDKTVGFVTTGCASPTTGKILGMGIIDSEYAKVGNEIGIAIRKKIVPAVIVKKPFYKKQYKKDNIILNKENKFSYIPATSEDKSKMLKVVGLNSVDELFSDIPEEVKLKRDLNLEIGKSELEVSKIVKRLSEENLSLEDLTCFLGAGAYDHYIPSIIKHITSRSEFYTAYTPYQAEISQGTLQVVFEFQSMIAEITGMEIANASMYDGATAAIEACIMAMNQTRKSKIVVSKTTHPETLSVLRTYLQYKDCEIVEIDFCNEYGTTDVEKLKASVDKDTACVLIQTPNFFGIIEEMEEIEKITHENKAMLIMSVDPISLGVLKTPGEIGADIVVGEAQSLGNPLNFGGPYVGFLASKSKYTRKMPGRIVGQSLDVEGKIAYVLTLQTREQHVRREKATSNICSNQALNALVASIYMATMGKEGFKEVGMQSMKKAHYTYNKLVQTGKYKPIFKGKFFKEFAVQGNLNIETINDKLLEENILGGYNLEYNYPELKNSTLLCVTEKRSKEEIDKLVGIMEGL >CP020380.1|AXU35267.1|1933594_1934110_+|CF-9-family-membrane-protein MEKYIWLFPLLFIFHDMEEIIGFGIWLKKNKSMLDKKYPFISKIYESYSTEGMAFAVFEEFILCIIFCILTVITDNQYVYLLWLGSFIAYTLHLVIHIGQSIIIRKYIPSLITSIICLPISIWCISKSIYIVDCEMSTTILYSIIGIIIVALNLKFAQSLIGKFTKWMSNI >CP020380.1|AXU35266.1|1931327_1933058_+|Na+/H+-antiporter MRNKKINIIFLTTIMFIMSTVMVFAEEDIDTIALANAEKFGILTLIPPLVAIILAFITKNVIISLLIGILSGSFIIKASGINVFATFIQAFLDLVDRALVSLADPWNAGIILQVLAIGGVINLVAKMGGAKAIAEALAKRAKSAKGTQLITWFLGLLVFFDDYANSLIVGPMMRPVADKMKISREKLAFIIDATAAPVAGLAIISTWIGLEVGLIHDAFESISIDVDAFGIFLNTIPFRFYNILILAFIVISALLLKEFGPMRKAEIKSRSRKISIDLDEGVEELDDLAPKNGVKLSVWNAIIPIGTLIIVALASFYYSGYTSIMGGDDKALIQLFTNSPYSFEAIKEAFSASDASRALFQSALVASLVAIIMAVVKKIFTISEAIDVWIDGMKSLVITGVILILAWSLSSVIKELGTAKFLIHLLSGSLPPFLLPSLIFGLGAIISFATGTAYGTMGILMPLAIPLAYSLNPDMSYVIVSTSAVLTGAIFGDHCSPISDTTILSSMGAGCNHIDHVNTQMPYAIFTAVITIVFGYIPAGLGLPIYIVLPVAITAIFVGIQIIGKKVDEAEIELVE >CP020380.1|AXU35265.1|1929857_1930844_-|lipoate-protein-ligase MLLIYNEKTNPYFNLAMEEYLLKNFDEDLFILWRNEPSIIVGKNQNTLSEINLEYIKEYSIPIIRRQSGGGAVFHDLGNINFTFIACNNNNFSDFRRFTQPIIDLLKTLDVNAEFSGRNDLLIDGKKFSGNAQYNYKNKVMHHGTLLFSSEINDLSKALKVKPIKFEGKGIKSVKSRVTNISEHLHSKMDILEFKDAIMDYLSKTNTDNTNYCLSEHDIKQIEKLTKSKYETWDWNFGNSPKYTLSNELKYSGGNVEFNLNVDKGIITSIKFFGDFFGKCDVAFVENKLIGIRHEENALRNTLDSIEINDYFLGADTDILVSGILGVK >CP020380.1|AXU35264.1|1928750_1929548_-|lipoprotein MKFKKLLCLLLCLVLTLAVVGCSKAKDDKKIVVGATLVPGGELLEELKPLIKEKGYTLEVKNFDDYILPNEALNNGEIDANLFQHEPYLKEAVKAKGYKIMAGKKLYVCPAILYSYKIKSVDEFKKGDTIAISNNPSSCSKNLRYLESIGLLTLPKGDGLVSPKDIIENPKGIQFKELDIAQIPSSLPDVTAAFIDTTYAVPAGLDAKKNGIYTAPINDEYANLLAFRTEDKDSEKIKVLQDVLTSDKARSLIEEKYKGIVIPTF >CP020380.1|AXU35274.1|1947398_1947587_+|hypothetical-protein MKKILYALYSFIVIMANFRLKEKNYNFILLAIFFILLLIQNGVLKTGYQNRATFYQDNYFNG >CP020380.1|AXU35275.1|1948223_1948775_-|transcriptional-regulator MSINTIIAKNLNRLRNERNLSLGQLAELSGVSKVMLSQIEKGDSNPTVNTIWKIASGLNVPYTAILEQPQNETFIVSKTDIDVQVSENKDYRLYCYYTNTPTRNFELFQMELEEGHSYTSVGHSEKSQEYIMIIEGQLKLEVNDSIYQLRENDSICFSAESMHTYHNQGEKTLKAVIINYYPV >CP020380.1|AXU35276.1|1950224_1952069_+|glycerophosphoryl-diester-phosphodiesterase MQKRILRNFIFTGKNILSKLVFIIKYNFSTLILFELFHKGLALFFIWPSIRYIFDILIKSLHIVYLNMDNFIKVLTNPMSIVLIILSVIILAFYAFFELTSVIICFNKSIKYEKIGLFELFKISFKNSIKLLYPKNILLFIFVLLIIPLVNTVLISGFIGKIQISEYILDYIKSDIILNIIYMIFLLIIYISVIRWIFSIHEITLNTENFKRARKESVNLIKGKIIRTIIYSLILSLVVAIIGYVTYHSGIIFIGTWSKYYTDMEFLKNIFINRCIAFEEYFRLILSIFIFILDIGFISATYYQYKGVSISKNNIKKEKKSISKIVFNLVLILLISYIESVAFSSHVNGMFNTSFSFYTTAIAHRAGAEMAPENTLAAIEEASHAKADYAEIDVQETKDGELIVLHDSNFKRTTGVDKNVWDVNYNEVKTYDAGSFYYYGKGYYDEKFVGEKIPTLKKMIKYSKGKVKLLIEIKLNGHEEGDVVKKVVQLIKENNFENQCIVASMDKTILQKVKKLDENLLTCYFMAIAYGDFSKLNYVDIYGIESSFVNKTVVEKIHKMNKKIFVWTVNSDSLIEKMLNLNVDSIITDNPYLIESAIYWKKNGFISQVSDYLF >CP020380.1|AXU35277.1|1952389_1952983_+|sugar-O-acetyltransferase MTEREKMLAGELYDCGDIELLNQWHKAKDLVRDYNQTDSSDLEKKEKILNELLGGKGKNLWITAPYYVDYGNNIYFGNNCEVNMNCTFLDDNKIIIGDNALIALNVPNVQIYTAFHPTNAGDRFGNAKEDGSFEFCKTQTAPVTIGDNVWIGGGAIIMPGVTIGDNVVIGAGSVVTKDIPSNMIAYGNPCRIIRENK >CP020380.1|AXU35278.1|1954086_1954263_-|hypothetical-protein MFIGEIDKCTHILTAYISSSYDYCNFLDTQLDDFISEYGETVVETCLHQVLLLVSRYN >CP020380.1|AXU35279.1|1954837_1955851_+|ABC-2-family-transporter-protein MVNWEIKKLAKSKSMFISLGILVLILIISIFITPVLETESYYIDKEKGRIEDTRSGIDIGNEKFQNKINVLKQFSNQTDTGEFSKKIELMSKKKLDNLSVNEYKDISFWKVFNYRVTNSLINVGMLIIISIIISNIYVDEVVTSVKDIILSSKEKKKALKSKIFVALLVPLVIYSVYLMGIFIITCMQQGVPVNGDLESFRIVDNVVALKTNLSITKYVILNIGIELLMFEGWAMIAIFGSFISKSSISFFIFIISITKIMSVIHILPKKLLSVISNVNYYDLIFGFNKIIGNYLGDIMIFKVNIDIVNIAIGLLMAILIGAMSLCFLVIKSDYISR >CP020380.1|AXU35280.1|1955864_1956752_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNKLEIENLSKIYGKKVANDKITVTLENGVYGLLGPNGAGKSTLMKQITTLIKPNEGQILYNGEDIFKMDDDYRNTLGYLPQEFGVYKNFTAKEFLQYIGALKGLRGKRLNSKIGELLDLVGLYDVRNKSIGKFSGGMKRRVGIAQVLLNDPKIIVLDEPTAGLDPQERARFRNLIAKMSRDKIIILSTHIISDIESVAKETIMIKDDKLLMKGTHKDILRHMENKVYNVQVKNECEVDDIQSKYKVVSIQSDIDLIVLRIVSEDIPSGVNIQPVQAKFEDVYMFYFDLEDAREV >CP020380.1|AXU35281.1|1956757_1957531_+|ABC-transporter-permease MMYLVKAEMIKILKSKSVWIIWLFLIFFGFLLIRKFDVLDTYADIFYKIEGSIPLIGLIMFIITSGNYIKEYDSNMTGLINTTKKGKKSVVLSKLVANGLILSIINISFILLVGIRGFSFFDFKNLNEPIHNLWYFGNSNLNLTVIQMYIIVILTTIFASFIFAQIGLTLSSIFKSAVIPFILGGLIMAIPYFSVGFIPDKAIKFMSVTPNWIMMSQQIVRYNVPSILIVFSIVISIILMIVLTKITYENFTSSKRF >CP020380.1|AXU35282.1|1957642_1958368_+|two-component-response-regulator MENRVLIIDDEVEILKLLETVLKKEGLNNIYTAKTKKEGLEVFKSINPDLIVFDIMLPDGEGYDICKEIRKTSNSPIVFLSAKTEELDKLLGLAIGGDDYVTKPFSPKEVDFRVKAHLRRLSYFSDVQNESKNLNNNEEKIISFGPYILNESRAELIKDGKSIGLSAKELKILSLFAHNQNQIISKEKLWDKVWGEDYVGFDNTIMVHIRKIREKLEDNPSKPEYILTIKGLGYKLAVKED >CP020380.1|AXU35283.1|1959224_1959845_-|NADPH-dependent-FMN-reductase MKVLLINGSPNQYGCTYTALNEITKVLSKHDIKTEILCLGKEAIPGCISCASCFETGKCIRNDKVNELIEDLDNIDGIIIGSPVYFSSATGQLTSFLDRLFFIAGSRMATKLGASVVSCRRGGASATFDQLNKYFSISNMPIVSSQYWNQVHGFTPEDVMKDEEGLQTMRTLGENMAWLLKCISAGKKAGIKEPQYEETIMTNFIK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP020380_12 | 2814277-2814434 | TypeV |
NA
Consensus repeat of CP020380_12
|
2 spacers
spacers of CP020380_12
>12.1|2814303|40|CP020380|CRISPRCasFinder CTAATAATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATT >12.2|2814369|40|CP020380|CRISPRCasFinder ATACAAAATCTCCAATTTATAATTATTTTCGTGATGTACC |
cas14j,cas3,cas5,cas7,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP020380_12
The CRISPR arrays of CP020380_12 >merge|CP020380|12|2814277-2814434|CRISPRCasFinder AAAAATCCGATTAGTTAATTTTAAACCTAATAATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATTTGAAATCCACTTAGTTAATCTTAAACATACAAAATCTCCAATTTATAATTATTTTCGTGATGTACCTGAAATCCACTTAGTTAATCTTAAAC >CP020380|12|12|2814277-2814434|CRISPRCasFinder AAAAATCCGATTAGTTAATTTTAAAC CTAATAATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATT TGAAATCCACTTAGTTAATCTTAAAC ATACAAAATCTCCAATTTATAATTATTTTCGTGATGTACC TGAAATCCACTTAGTTAATCTTAAAC
>CP020380.1|AXU36052.1|2813189_2814137_-|50S-ribosomal-protein-L11-methyltransferase MNNWIEITIKTTTEAVEPITNILYEQGAGGAVIEDPKDFLFQKKNELDWDYVEEEVFKKNEEDDVLIKTYVSEEKNVMEFVEIIKQKVLGLKDFGIDIGEGSVSLDQVNEADWANAWKAYYKPTKVGQRVVVKPTWEDYAMQDGDLIIELDPGMAFGTGTHETTSMCIRELEKYVNKDSKVFDIGCGSGILAIAAAKLGAKEVVAVDLDEVAVKVAKENVLENKVEKSVSVMHGNLTDVIKDKADVIVANIIADIIKILAKDVQNFMKEDAIFISSGIILDKVEEVKESLIENGFEIVEVQKLGEWSAIVSKLKK >CP020380.1|AXU36051.1|2812808_2813171_-|16S-ribosomal-RNA-methyltransferase-RsmE MDRFFVEKNNINLQDKTCTIEGEDVKHISKVLRCKLGEKLEICDKNNNEYICEIMNIDKSIVNLEILEKVDINRESELKVRLYQGLPKAPKMEMILQKLTEVGVEEIILVQTKRSVVKVD >CP020380.1|AXU36050.1|2811049_2812159_-|transposase-like-protein-B MEKAYKFRMYPNKKQQELINKTFGCCRFVYNKYLAKRIDVYKNDKETFTYKQCSSDLTNLKKELKWLKEPDKFSLQNALKDLENAYEKFFKEKAGFPKFKSKKINRFSYKTNFTNGNIMYCGQHIKLPKLGMVKIRDKQVPQGRILNATISKEPSGRYYVSLCCTDVDIEAFENTNNQIGLDLGIKEFCISSCGEFIENPKYLKKSLNKLAKLQRELSRKTIGSLNRNKARLKVVRLQEHIANQRNNFLQKLSTKLIKENDIICIEDLQVKNMIKNRKLSRLISDVSWSEFIRQLKYKANWYGRKIVKVGKFFASSQICNKCGYKNEEVKNLNIREWICPSCNETHDRDINASINILKEGLRLITIQNK >CP020380.1|AXU36049.1|2810534_2810807_-|16S-ribosomal-RNA-methyltransferase-RsmE MKKNNVNICPYENERTVSIKHALKKCDSNIDSIGIFIGPEGGFSEEEIEQIQKNNCNVVSLGPRILRTETASVVASTIALYELSDLGGEK >CP020380.1|AXU36048.1|2809234_2810533_-|radical-SAM-superfamily-protein MKKVAFYTLGCKVNQYETEAMLELFEKDGYEQVNSEEYADVYVINTCTVTHMSDRKSRQYIRRVKKKNPDAIIAVVGCYSQVSPEEILDIEEVNLVMGTNDRRKIVEEIKKINSSKKVSTVDDIMKVKAFEEIEISQTNGKTRAFMKIQDGCDRFCTYCIIPYARGRVRSRDIDSIVDEVKKLANNGYKEVVLTGIHVASYGKDLKDRDIKLLDVIKQINQIEKIERIRLSSVEPILFTDEFVNEVLKMDKVCPHYHLSLQSGCDETLKRMNRRYTTLEYKTIVDRLRSKMPDVAITTDVIVGFPGETNEEFKKTYEFLKEIELSQMHIFKYSPRKGTPAATMENQVDPQMKHFRSEQLLNLSKVNFNKFATKFIGCELDVLFEQNIEGNKYEGLTSNYIRVVVESDKNIQGQILKVKINDVKDEYVEGILL >CP020380.1|AXU36047.1|2808841_2809192_-|histidine-triad-nucleotide-binding-protein MDCIFCKIANGEIPSTKVYEDDRVLAFNDLNPVAPYHILVVPKKHYDSLIDIPDKEMDIVSHIHVVINKIAKEKGFDQTGFRVINNCGSDGGQEVKHLHYHILAGKKLPNYEAGQN >CP020380.1|AXU36046.1|2808499_2808679_-|30S-ribosomal-protein-S21 MSEVRVRENETLDSALRRFKRQCAMSGIMSEVRKREHYDKPSVKRKKKAEAARRKNAKK >CP020380.1|AXU36045.1|2808026_2808470_-|tRNA-binding-protein MSLKQKLQEDLKSSMKNKDTVRKSVVTLIRASIKQYEVDNRVELDEDGIIDVIAKQLKQRRDALVEFEKAGREDLIKETEGEIEVLKEYLPQQLSEEELEEIVKSTISEVGATSMKDMGKIMSVIQPKVKGRADGKLINKLVKQNLQ >CP020380.1|AXU36044.1|2807418_2807916_-|sensory-protein MIISVKEIRNFLINIFIPLIIGYLSSILTMIISGTDISTYYLQLTKPSFAPPAFIFPIVWTILYILMGISSYLILRKGYNLPKVRDAIFYYGLQLVLNFIWSILFFGFGLRFTALIDIIIMILVSIIMISKFSKIDKRSGYINLIYLMWLVYAGFLNYFIWFINK >CP020380.1|AXU36043.1|2806662_2807226_-|sigma-54-modulation-protein MQIIVSGRQMKLTDGIKGYVDGKLSRLEKYLDPESEVKVTVSAKKDRQKVEVTIIPINGQIIRAEDVEDDLYAAIDIVCDKLSRQVVKYKTKVKDKVQNNKSIRFENLDFIDNSSEFDDYDYDDEEDENIVIERRKKFNVKPMSSEEAILQMELVGHNFYMFRNQDNFEINIVYKRKAGGYGLIEQD >CP020380.1|AXU36053.1|2814577_2816986_-|ATP-dependent-helicase MENIMQKKILAKSYNLRTNQQEQTLVEHIKDLFEVLESILELNLYSDKDVEILKICCALHDLGKINSIMQQKMEINNKISSSCSEEERKKLESDKKSLKKIARHNIFSGAFLKDILEKMNLSEEDKLYIYKSIMLHHGNYEDYMRLSTSKVQEEIYDYIEKGILEKEDFNLKDIEIYIKDILDVDFKFSEDVLDYDYIDKLSESMVVDSDYNNGQIEDSVLNYRKFKYILYKGMLNLIDHSASSRQKGIKFYNDFTDEEIDNMILNEIYKSQGNLEKNNIEFNTIQKRLRELSGRNVLTVAFTGSGKTAADYRKAFKRKFFLVPNKISAESFYRKNIFQNKNDLDTRNSNDYIGLLHGDINLYSENEYNGEHDFVLTLRDIDLSINFCKPCVISTVDQLLLSMFKFPGYEKIFAAVKNASITVDEVHLLEPKMFLILIYFMQFACKYLDVDFHLMTATLPKSYKEQMINKGIIFQEESNENVTDKGEIVFIESNKEEEICEGKDVKVSFIKEKEIKSIVEGALENKQKILIIKNTIDSVNRTYEFLKENLSDKYGGVDIDVLHSRFKFKDKKEKYSKILNGEGDIWISTQSVEISLDLDFNIIISDLSTMDSLIQRMGRCNRNNKYEYGNFYILPSEDKIYDNKLKNTTKNILKDILKTNSIFTMGIRKTILDDYYDNSVVKKYFEENFISCDKEIKNIYGINKEIFDGLDLIFNFEPYKNIVDSKKEAAKIFRDVDVSYKIILEEDFYKEDRELQQDSIQVSGFIFNRLYYYGLISKVEGYMVLKSSSKFEYNSTVGLILK >CP020380.1|AXU36054.1|2817012_2817810_-|CRISPR-associated-protein,-Cas5t-family MKVLQCKLKQPTAHYRDPKVFQNEYISTLNLPSKTTIMGMITYLCDRRLNSDIDIGIIGTHHHRELEFSRGENINFWNEYTNMRKGKDKEKFLLQGNYYDYYKEHKAQNSILNYEVLKEVELTIFISCKDDEELEFIKKKLESPCKYANLGRKEDFVIPSEKGCFVKEVELKEVIPMNTRDAIKENIKLKNTYVRVDLRDKENVETIINQGVLIALPHKYKDLEANRDDRVYEFCHYIYVDNDGIYPKNIKVNVCIDTKEVFTWL >CP020380.1|AXU36055.1|2817825_2818842_-|CRISPR-associated-autoregulator,-Cst2-family MNEKRVKGVTLTILTESPVPLSYDQGYGNYTPIKKEQYRDKVHAKTSIATITYDLRRILHQEYGWNLSNIVFGKKGNIYPSIKKNVGCVDENGLETDVFGYLIPLKEKGSISKASPLRIIPFRSLNSYRGSTQLITNRGFLSSEFGRKYYDEKEENEVLRDENFPTTQALAIEETLSDYYVYTITLELDRIGVVEVEEDGKLLLPEERKFMGKELREKAVKDILDAITVFTRNIKHSSVLLKPLAVMGGAFDKVVPFFWDDVDYNADSGEINLEGVIETIESYSLKESNTILAINDRLKISNKKELNKFNLSKYPVKEIKNLADRLEIGEDNMWYLKE >CP020380.1|AXU36056.1|2818860_2820336_-|hypothetical-protein MREIKAKFYRSGDIVRDIGIVYFYELLMDLKNELEKNDYKLKFTCELNRNYLSLESAEYIDPKYISDYILENQLFKVFKNGKKETLEKIFSNIDNLTYVNFIEELDKSSATEKQKEGIKKDFKNRRFPYVRNSGKYGLNTSLENMETNVKRIVDTVIKSNIEIDEIDKLDLTQYEEKDSVCNVCNINKTTKLDIDLRERKDSKYNFLFRGAEKSGFKRSGQVESNICFECEFFNLMCLLYINLKRPMVFAYTNDLRELAFLNHKIMLKRKMYSDKSFYKKLLHEKISSIRLYRIDIDTNKGIILKFDSIIEYKELLKKIELIDIIDNYNFSREPMNTRNLGKKMIDNGNLSNLKELLLDNISVLRQLTGTSREMDFVSSSYNIGLYIKLCWIVDGGEEYKMKNYMESNLIYSRVGKDLFNKMTDESRRKNFSMKVIQLLKSNDRTQLFQTIMHVLVSNGILIGEGFVEGIMQSSELELNTNVGIFIQEIMK >CP020380.1|AXU36057.1|2820340_2821078_-|CRISPR-associated-Cas-family-protein MSRISIFMESCNGKFPNENSMLSVSFIKNILNAENKDFAKNIFNYGEERKNNKQIKDINTAIYIPNLIRSKNELLVDGDIIFNISFYNYSMFSKLYNGILKVKELEYKGYRFKIKNIKIHKEHEIKENGVIFKTMSPIIVKNKEGKYLDVEDSNYIECLNYIANLTLESIRGSGLRKPLEFIPLNFKKRVLKEKIRGFKVREYYYINAYAGTFFLKGDMEDLNALYKMGIGYRRTENAGMVDILK >CP020380.1|AXU36058.1|2821335_2822445_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSEVILKNISKLYSNGFNAVKNINIDIKDKEFIVLVGPSGCGKSTTLRMIAGLEEISEGELYIGDKLVNDIEPKDRDIAMVFQNYALYPHLSVYENMAFALKLRKLPKDEIDKKVKEAAKILDLLPLLNKKPKTLSGGQRQRVALGRAIVRNPKVFLMDEPLSNLDAKLRTAMRTEITKLHQQLGTTFIYVTHDQVEAMTMADRIVVMKDGVVQQIATPQDVYDYPANIFVAGFIGAPQMNFIDVILIEENDEIYAQNEHIKLKLNKEKHYDLIKDNYINNEVVIGIRPEDIHVEDTFIKSNPDTCFKSRIEIKELMGAETYAHLKLGENTITIRFDSKNRINVGDDLTLSVDSSRVHIFDKETTLAIR >CP020380.1|AXU36059.1|2822474_2823242_+|sugar-diacid-utilization-regulator MEELKDFLERQLNKKINIYPYENQKLDASSHLVTFNNAIYVIDFLDKNNLDNLKGNFYLIYQSHIDFEYLKNIFYNLFEDINIIQHNGFFIVNSKYNLDINVTTQNIIETETYQSTYIFYLGKLDSKADFDFRLQLCSDLLPHIIKDNAENKFLNLFDLIRYKTLDLINEDNILNKLIDFNKIKSIDEELLYTGIKFINNDLNISKTSTSMFLHRNTLVYRLEKINEILGFDLKNFENAMIFYLSVKSYFLYKKI >CP020380.1|AXU36060.1|2823429_2824803_-|transporter MGKTNARRTLFLIAIGSGTMLNPLNSSMISLALHSIQNDFHISFTTVSWIVSAFYLASAIAQPVSGKIGDLIGRKVLFLSGLMLVILSASIVPLVQSFFILIFIRVIQAIGTSTLYPSGVALIQNNIKERQSSALAVLTIFASTTAGLGPTLGGLLLDLGGWHAIFLVNIPVVLVSICLGYFLFPKEVKEKKSIKETLKNVLSRLDIIGILLFSIAMIFILLFLLSMKESFNLEQLVFGIILMCLFIWHELRTKLPFIDIKLFVSNPKLSKVYLQFIILNFFNYILFFGLPSYFQDALHYSAKSTGLFMLFMSGIGIFISPLTGKWIDKSGTRFPLVTSSIFMFISAVLLSVVFIHIPVIGKGIILSLAGISYGVGNVALQSSMFEESPRDSIGTASGLFQTSRYLGSILATVLLGMVFEVNITSEQFQILGYVMVVLGTISFLLNFILKKELRNVE >CP020380.1|AXU36061.1|2824838_2825774_-|glucokinase MYYIGVDIGGTGIQAGVVDNYGKIIFRSECKTVIEKGFEGILNDIKIMIYKLLEDNKLTMSDIKSIGFGVPGFINKEGLVTCVNLKWNKKAFNKELKRRFPDVEIHGENDATVAALGEAKFGSMKGANVGVLYTLGTGVGGGIVINQKVFSGAHGLGSEIGHQIIGENYFNCNCGNNGCVETFCSATAIIKYSQKLIEEGEKSRILDLAEGNLENVTAKMVFDAYRENDLVAIKVINRFKEYLAKTFANTINSLDPEIISIGGGISKSSDIILDGIEDLVRKFVLYKTEDIATITCATLGSDAGIIGAAFL >CP020380.1|AXU36062.1|2826736_2827891_-|chaperone-protein MSTKRDYYEVLGISKGAEAQEIKKAYRKLAMKYHPDRNPGDKEAEEKFKEINEAYEVLSDDTKRKTYDQFGHDGLNGQGDFGGQGGFGGQGFGGFEDMFGDIFGDMFGGSFGGGRARRRGPQRGADIRQSVTISFEEAAFGKKMSIKVNRSEECEECNGTGAKPGTSKKTCSTCNGTGQVRTVQRTPFGNIASSRPCSACNGTGEVIESPCSKCHGTGNTRKVKNIEVDIPAGIDDGQMIKLSGQGEVGEKGAPRGDLYIVVNVKAHPLFTRDGNDIYFEMPITFVQATLGDEIEVPTLDGKVKYSVPEGTQTGTVFRLKEKGIPRIRGNSRGDQYVKVVVEIPKKLNDKQKELLREFAKECGSNVHEKKKTFGQKIEDMFKKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP020380_13 | 2895008-2895235 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP020380_13
|
3 spacers
spacers of CP020380_13
>13.1|2895037|36|CP020380|PILER-CR,CRT CTTTGCTTATAAAGTAGTAGACGAAGCTAAAAAGCT >13.2|2895102|37|CP020380|PILER-CR,CRT AGTAACTGAAACAAATAGAGAAAAGGCAGTTTACAGA >13.3|2895168|38|CP020380|PILER-CR,CRT ATGTTATTTACCTAAAAAGATGTAAATTTGCTTAAAAA >13.4|2895038|35|CP020380|CRISPRCasFinder TTTGCTTATAAAGTAGTAGACGAAGCTAAAAAGCT >13.5|2895103|36|CP020380|CRISPRCasFinder GTAACTGAAACAAATAGAGAAAAGGCAGTTTACAGA >13.6|2895169|37|CP020380|CRISPRCasFinder TGTTATTTACCTAAAAAGATGTAAATTTGCTTAAAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP020380_13
The CRISPR arrays of CP020380_13 >merge|CP020380|13|2895008-2895235|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCTTTGCTTATAAAGTAGTAGACGAAGCTAAAAAGCTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAGTAACTGAAACAAATAGAGAAAAGGCAGTTTACAGAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACATGTTATTTACCTAAAAAGATGTAAATTTGCTTAAAAAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACC >CP020380|13|3|2895008-2895234|PILER-CR ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CTTTGCTTATAAAGTAGTAGACGAAGCTAAAAAGCT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AGTAACTGAAACAAATAGAGAAAAGGCAGTTTACAGA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ATGTTATTTACCTAAAAAGATGTAAATTTGCTTAAAAA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC >CP020380|13|13|2895008-2895235|CRISPRCasFinder ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACC TTTGCTTATAAAGTAGTAGACGAAGCTAAAAAGCT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACA GTAACTGAAACAAATAGAGAAAAGGCAGTTTACAGA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACA TGTTATTTACCTAAAAAGATGTAAATTTGCTTAAAAA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACC >CP020380|13|4|2895008-2895234|CRT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CTTTGCTTATAAAGTAGTAGACGAAGCTAAAAAGCT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AGTAACTGAAACAAATAGAGAAAAGGCAGTTTACAGA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ATGTTATTTACCTAAAAAGATGTAAATTTGCTTAAAAA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
>CP020380.1|AXU36117.1|2893654_2894650_+|L-asparaginase MSIKKKVAIVFTGGTISMTVDDKVGAAIPTLSGEQILSMVTNIDKVADVEVFNFDEIPGPHITPYRMMELKNYVNDLLERKDITGVVITHGTDSLEETAYFLDLTIDNIKPVIVTGAMRSSSELGYDGSSNLSASVCTAVSKDAMGKGVLVVLNNEVLLASEATKTNTLSLNTFKSLTSGPLGIIDCNELVLTRDIVNRTIIDTDKVESKVALFKAYVGENADFIRFAVDSGYKGIVIEAMGRGNIPPQMLSGVEYAREKGLPVVIVSRCHSGRVFDSYGYFGSGRDLKNLGCIFGGDLPGQKARIKLILALGKTDNLDEIKDFFEKGIYC >CP020380.1|AXU36116.1|2891905_2893534_+|aspartate-aminotransferase MKNHTYKEIKNIYGKISPFEFKDKLIDIAKYTAKENNRELFDAGRGNPNWTCSTAREAFFTFGHFAITETRSNWDLGHLAGMPQKKGIKERFFKFINENIDMPGAYLARDIINFGINELGFDGDEFVHELADGIIGDNYPLPDRMLPHMEKIVHDYLVQEMKYDISGKYGDVEIFAVEGATAAMCYIFDSLMANELLKKGDTIALMTPIFTPYLEIPNLPRYDFKVVNINANEVDEKGAHTWQYTKKELEKLRDKSIKALFVVNPNNPASIAMDETSCNNLIDVIENYNKDLMIISDDVYGTFVEDFSSLMSKLPYNTVGVYSYSKYFGVTGWRLGTFALHKKNVFDKKINDLTGELKKSVDKRYSDMSLNPSSLSFMERVVADSRLVALNHTAGLSTPQQVQMAFFSAFALIDKVDAYKKLNMSICHRRQKLLFEALELPINGNKNNAAYYTQFDIEEWAKLNYGEDLFKFISKNASPVDVLYKLANDYSVVLLSGNGFYGPEWSIRISLANLYDEAYTKIGKAIREILNGYIVEWKKIKK >CP020380.1|AXU36115.1|2890029_2891247_-|threonine-dehydratase-catabolic MMNVTLTDVKEARETIKNIVKRTDLLESVKLSEKTGANVFYKCENLQKTGSFKLRGACNKIASLTDEEKANGVIASSAGNHAQGVALGAKMTGIKSTIVMPATAPLAKVSATKGYGAEVVLNGAVYDDAYAKAVEIQQETGATFLHPFNDKYVIAGQGTISLEIFEQLDNKVDTILCPVGGGGIISGVAVAAKALNPNVKIVGVQTANIPSMKESMKNGKVTTAFNDTTIADGIAVKTPGDLTFEIINELVDEIVVVEETEIAESILFMMESQKIVSEGAGAVCTAAILSGKYVPAKDENVVCIISGGNIDINTLYRIIGVALAKEGRRYSFSTIMEDKPGNFAELTRIISENGGNILSANQGKLSAGEALGKQSAEFILETIDYDHIARIKKAIEEKGFKIIEL >CP020380.1|AXU36114.1|2889554_2889935_-|translation-inhibitor-endoribonuclease MKHEVIHTNDAPAALGPYSQAIKAGNLLFVSGQVPLVPETMEVVEGDVQAQTAQSLKNLKAILAESGADFSNVVKTTVFIKDMNEFGAINEVYAEYFGENKPARACVEVARLPKDVKVEIEVIAVL >CP020380.1|AXU36113.1|2888788_2889271_-|PTS-system-transporter-subunit-IIA MLNFFKKNKSYKLHAVVSGNSINIEKVNDSVFSKKLMGDGVAIIPNSNVIVAPCNGKVTVLTESKHAFGMVSDEGVEILVHIGIDTVNLQGEGFKNEVSQGDTVKKGSPIISFEREKINSQGIDCTTIMVVLNHSEFSEINCMVENEVVAGQDTVIEIMK >CP020380.1|AXU36112.1|2887952_2888768_-|transcriptional-antiterminator MRVVKIFNNNALSTVTNDRKEAILLGLGIGFNKRPGDKVNEDKIEKIYYVQDHMQTKFLELLKNVSPEVMDASQQIISLIPGNEGKFNNKGILSLVEHISFAIDRMKNNVFLPNLMLLDIKMMYSKEFELGVKALEIIYRVCHIRLPEDEAGYIALHFVNLQSNDNLAYDTLKFVKGSIDLIKECYGLELDESSLSTLRFRTHLKFLAQRIFKNEICQDDKMIEMYDYLINNHPKNKEYLEKLNVYIEKEFRYKLDKPEKIYLLLHLTKIL >CP020380.1|AXU36111.1|2886349_2887900_-|PTS-system-transporter-subunit-IIBC MKEKLLGGLETFAKAMVQPLIYLSSAGILMVVGVLLTNDMLLGVLPFFKWEPIQIFGSLIYNCIMAIINNLAVIFAIGIPAALAKKEKHKAALIGFMSYIIYLTASNTMLTSLGQLAKESKMLGLIGTGQATILGIQVVDTSVFGGIILGCIAGYVFNRTSNKTFKGALQIYSGANFSFICMFFVSILIGVVSNFIWPLAQQGIASLANVIKDTGTFGLFLYGFLERILVPTGLHHLIYTPFQFSDLGGVLKVGADTVSGAYAIVMTEMNLPVERFSDSIYYMATGFTKMFGYIGIGAAFIYTAYKQNKKKVKATVIPLIITAVLASVTEPLDFMFVFCAPLLFFVHAVIAGLFIALLKIFDVTALCGGNLLVSIIMNTTVGIEKTHWPVMMILGLAQIIVYFVVFSFLIKKFNYKTPGREDESTATGEEQSKQLNLDTGIENIIDGLGGKENINTVENCITRLRVNVKDESKINEDIINLTPNSGIVRKGKDIQIIFGLHVHEVRRAVEDFLEVY >CP020380.1|AXU36110.1|2884950_2886303_-|6-phospho-alpha-glucosidase MIITIVGGGSTFTPGIVKSIALREKELELEEIRLFDIDKERQDKVAVVVNWILKEDVKTDVKLTVTNCEKEAYTDATFIFAQMRVGKYEMREQDEKIPLKYGCVGQETCGCGGMAYGLRTIQLMIKVIDDVEKYAKKDYWILNYSNPAAIVSEACRKLRPNARIINICDMPIAIIDMIAGSLNINDVHNIRYDYFGLNHFGWFTSIDYKHRDLMEEIKEYIKENKILLPKSYIENLNKSRSTGNRHAVSSWIHVWESVYTMLESFPKYLPNTYLTYYLLSKETVEHSNINRTRANEVMESREKDLFEGVRHYLETGEISEKAFYAGSHGDWISDLAVSIKNDTRSRFLVITENRGAIPNMPYDAMVEIPAYIGKDGPEVIARGPIPLFQQGLMMQQLNSEKLIVEAYIENSYEKALQAFTLNKTIPSMNVAKEILDEMIEVNKEYWPELR >CP020380.1|AXU36109.1|2884061_2884775_-|AraC-family-transcription-regulator MITNNLEVDTHSHCMLQLFLGIEDSIEITVNEKLVKCNCIVVDKNISHSFSARKKVYYSAIIEPTSIYAEQLTSKMNDFGYWICDNDGLEKLRQQGTFLIYNSSKEQYLRFMEMLNNYLNIPITLKHYDDRITELLNLLRTCNCDNHTISSFADKVSLSASRLSHLFKEQIGIPLKSYILFHQMECAFRELLSGKNVTEASMTAGFDTPSHFAGTVKRMMGMPVSLSLKDSEFLKVY >CP020380.1|AXU36108.1|2883295_2884015_-|transglutaminase-domain-containing-protein MNKEYLEETKMLNYNEPQLKLLVSSKNWLELDDFYKIKSIYEFVQNDILFGYNASDMLSATQVLNDGMGQCNTKATLLMALLRAVNIPCRLHAFDVTKDFQRGATSKLISLLAPKYILHTWVEVFYQDRWIALEGVITDKKYLQAIQKKFFNHGGTFKKYAIATNDLKNTSIDWDGKDTFIQKEAIVYDYGIFPSPDVFFSTHSQHMSKLKDFIYVHLIRKIMTKNVCKARNNYIDKNE >CP020380.1|AXU36118.1|2895527_2895686_-|hypothetical-protein MDNFLQGILASLSASLIVYITSKLFGKRKKPLKAATKSGWEFDFKIKFRRFK >CP020380.1|AXU36119.1|2896107_2898528_-|leucyl-tRNA-synthetase MSVYNFKEVESKWQKIWKDNNQYKMDTAQTEKPNYYTLEMFPYPSGKIHMGHVRNYSIGDVVARFKKMEGYNVLHPMGWDSFGLPAENAAIKHGIHPHKWTMENIEEMKEQLNLLGLSYDWDKEVATSTPEYYRFTQEIFLKFLEHGLAYKKKSYVNWCPSCETVLANEQVVQGACERCKATVLKKDLEQWYFKTTEFAEELLNDLDTLDGWPEKVKTMQKNWIGKSTGADLVFDIDGTDKSMTVFTTRPDTTYGVTYMVLAPEHELVKELVAGTEYEADVEAFVQKMHTMTEIERTAADVEKEGMFIGRYVINPLNGKKVPLWIANYVLVEYGTGAIMAVPAHDERDRDFAEKYNLDIIDVITEDNKMINSEEFNGLDASEGFEGIIDKLEKEGRGKRTINYRLRDWLVSRQRYWGCPIPVVYCDECGIVPVKKEDLPVLLPTDVEFTGKGESPLTTSKQFMSTTCPHCGKPARREVDTMDTFVDSSWYFLRYVDSNNENEPFSKELVNRWHPVDQYIGGVEHAIMHLLYARWFVKAFKSMGMVDFNEPFKNLLTQGMVLMDGSKMSKSKGNTVSPMDIIDEYGADTARLFVLFAAPPERDLDWSEQGVDGCFRFLNRVYRLVDELADVVKKDVEFGELNSQDKDMRYTIHSTLKKVTADLSEKFGFNTAISALMELINDMYKYKELDNINEAVIKEGVQTIVTIIAPFAPHLGEELWTMIGKEGSVFDIDWPKYDEKALVKDEIEVVVQVNGKVRGKLTVNSNISKDEMEKVALEDEKIKGLVEGKTIVKVVAVPKKLVNIVVK >CP020380.1|AXU36120.1|2898881_2899232_-|iojap-family-protein MTVEQMTKIAYDAIEDKLGQDTVIINIGKVSSLCDYFIITTASSQRQVKAIADNVEDELAKLGLEPRGKEGQGTQTWVLLDYGDIMVHVFNEENRGFYNLEKLWKDAPYIDIDTLA >CP020380.1|AXU36121.1|2899348_2899921_-|metal-dependent-phosphohydrolase MNLENINQRLNQMLPVGRLSHSKNVAKCAEKLCEIYGCDKEKAYLAGMIHDCAKYLSDKEIEDYVNKYEIYLDPIEDGNRSLSHSVIGAYICEYEFEVEDEDIINAIKYHTTGREDMSLLEKIIYIADLIEEGRKFPVVDTLRELAYGGKLDEALLTSFNNTLMFVINKKEEIHPRTVMARNYLIKEKLL >CP020380.1|AXU36122.1|2899921_2900611_-|nicotinate-nucleotide-adenylyltransferase MRSENLVKMAELKNTEKLEKFNRHKGKIKIGILGGTFDPIHYAHLATAEFIRDKYDIDKIIFIPSGNPPHKLCITTDKYDRYNMTLLATESNEDFLVSKVEIERKKRTYTIDTLKYLKKKYKTADIYFITGADAICSVEEWKDVKKNFELATFIAATRPGISLLRSQETIEKLTKKYNADIITVYVPSLDISSTYIREQLNEGKSIRYLVPENVENYLYENKLYQYGDD >CP020380.1|AXU36123.1|2900886_2901525_+|recombination-regulator-RecX MGIITKIEQQKRNDDRVNIYVDDKFFIAIFKELVYTFNLKKGNEINEEELKPILDDEMYIKAKNKALNILSHADQSEKKLKEKLSSEFDENIIDRVIDFLKSYNLVNDSVLAQKIVNTNVNLNKCGKNRIKQNLYYKGINRSTIDEAVSELDKDTEFENAMYLAKKRYERVKKEDKKKIYQKISQHLSYKGFDYDIIKRVLNKLLNFDEYDI >CP020380.1|AXU36124.1|2901677_2903681_+|glycogen-branching-protein MKSQKRFKILDIDVYLQPFESDIKKRMKHYEDMKSKTLKNYKDFSSFANAHLYYGFHQTNDGCFYREWAPNADSLSLIGDFNNWNRKSHPLRKIGSGNWEIFIPGQNSLPHKSEVKVQVTANGKTFDRIPLYIKRVIQKDFGGFNGQIWQPKTPFIWTDNDFDLKNITSPLIYECHIGMSTESESIGTYNEFTEKILPKIKKAGYNTIQLMAIMEHPYYASFGYQVSNFYAISSRFGTPEDLKNLINTAHSMGIAVLLDLVHSHAVKNTLEGINEFDGSEHQFFHSGSKGNHPAWGTKLFNYGKPEVMHFLLSNIKFWLNEYHFDGFRFDGVTSMLYHNHGLGVSFDSYEKYFSMNTDIEAITYLQFANELIKEIKPNSISIAEDMSGMPGMCIPIKDGGIGFDYRLAMGVPDFWIKTISNLSDEDWDLGKMWYELTTRRPGEKNIGYCESHDQALVGDKTIIFWLADKEMYWNMEINSNNHVINRAISLIKLIKLITFSLAGEGYLNFMGNEFGHPEWIDFPREGNNWSYKYARRQWSLSEDNNLKYKQLLNFDKSMLELTKYSDIFIQNSHELIHMDNDKKILVYSKGKYLFIFNFHPNLIQSVDISKFQNTNYKTILNTDMVEFGGNTKKENLRDYDVYFSSTPPSSKIPIASRTAIVLLDNGI >CP020380.1|AXU36125.1|2903807_2904119_-|hypothetical-protein MKIITEIVEFNVEENLSKEEFIEIVNDLELKFHSIQSGFIDTELLYDEKSQKWIMIQHWESIEDLKSASSKMFKDSSTEKFRKALKNQTVKMNIIPQIKSWKL >CP020380.1|AXU36126.1|2904196_2905015_-|AraC-family-transcriptional-regulator MLSVTRYSIKNVRLKPWVKFIWYFETKSNILLNNKLLPTDSIDIILNLSDIMEYKIENQDYTASNIHFNGIRDKHGFIIQRGNIRVIGISFYPFGLYPFLKIPISEFNRQIVDLEAVSKLFAKKLEESLNPTKAIEKIVLCLEEVLLSILEEDLISNKSVKLLNSFIYVNRYSNIKAFCDDTNINIKTLERICLKYTGYTPKILKRIYRFKLASNQLIYNYKDNELFDFIYENEYYDQAHFIKEFKKFSGTSPIKFIGENKTIKENIKYSYL >CP020380.1|AXU36127.1|2905114_2905639_-|membrane-spanning-protein MEVTAKQKFTTKDMVETSLLIALVFIATKFINIRLPISINGGLVHLGTAMLFISAIVFGGKKGALSGAIGMSLFDLMSGWTLWAPFTFIVRGVMGYLLGKIAWANGNNGNNFLINVIGICVSSIWMLFGYYVTEVILYGNFIVPLTSIPGNLMQVLIGLIIALPISKVLKKCIK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP020380_14 | 3108072-3108562 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP020380_14
|
7 spacers
spacers of CP020380_14
>14.1|3108101|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT TAGTGTCTAAACTAAAAAGTATTGCTGGGATATACAT >14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT TTAAATAAAAAACTAAATCTATTGGAAAAATATGTTA >14.3|3108233|36|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTTCTTTTTATTTCCACCTAGATTAGTTGTCTCC >14.4|3108298|38|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGTAATTCCATTATTAAAAGTATTTGGGGATTTTGCAT >14.5|3108365|36|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAAAAAGTTGGAAAAAACAATGAGGCTACTTTCTAA >14.6|3108430|38|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCTCTTTTTGGAGTTGCTTATGATCTTCCTTACGTCCC >14.7|3108497|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGAGGATAAGAAAAAAGGGGAGATAAATACAAAAAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP020380_14
The CRISPR arrays of CP020380_14 >merge|CP020380|14|3108072-3108562|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTTAAGTCCACATAGTTAATATAAAACTAGTGTCTAAACTAAAAAGTATTGCTGGGATATACATATTTACATACCACATAGTTAATATAAAACTTAAATAAAAAACTAAATCTATTGGAAAAATATGTTAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACTTTTTCTTTTTATTTCCACCTAGATTAGTTGTCTCCATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACTGTAATTCCATTATTAAAAGTATTTGGGGATTTTGCATATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACTAAAAAGTTGGAAAAAACAATGAGGCTACTTTCTAAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACCCTCTTTTTGGAGTTGCTTATGATCTTCCTTACGTCCCATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACAAGAGGATAAGAAAAAAGGGGAGATAAATACAAAAACATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >CP020380|14|14|3108072-3108562|CRISPRCasFinder ATTTTAAGTCCACATAGTTAATATAAAAC TAGTGTCTAAACTAAAAAGTATTGCTGGGATATACAT ATTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC TTAAATAAAAAACTAAATCTATTGGAAAAATATGTTA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTTTTCTTTTTATTTCCACCTAGATTAGTTGTCTCC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TGTAATTCCATTATTAAAAGTATTTGGGGATTTTGCAT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TAAAAAGTTGGAAAAAACAATGAGGCTACTTTCTAA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CCTCTTTTTGGAGTTGCTTATGATCTTCCTTACGTCCC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AAGAGGATAAGAAAAAAGGGGAGATAAATACAAAAAC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >CP020380|14|5|3108072-3108562|CRT ATTTTAAGTCCACATAGTTAATATAAAAC TAGTGTCTAAACTAAAAAGTATTGCTGGGATATACAT ATTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC TTAAATAAAAAACTAAATCTATTGGAAAAATATGTTA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTTTTCTTTTTATTTCCACCTAGATTAGTTGTCTCC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TGTAATTCCATTATTAAAAGTATTTGGGGATTTTGCAT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TAAAAAGTTGGAAAAAACAATGAGGCTACTTTCTAA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CCTCTTTTTGGAGTTGCTTATGATCTTCCTTACGTCCC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AAGAGGATAAGAAAAAAGGGGAGATAAATACAAAAAC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >CP020380|14|4|3108204-3108562|PILER-CR ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTTTTCTTTTTATTTCCACCTAGATTAGTTGTCTCC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TGTAATTCCATTATTAAAAGTATTTGGGGATTTTGCAT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TAAAAAGTTGGAAAAAACAATGAGGCTACTTTCTAA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CCTCTTTTTGGAGTTGCTTATGATCTTCCTTACGTCCC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AAGAGGATAAGAAAAAAGGGGAGATAAATACAAAAAC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC
>CP020380.1|AXU36307.1|3106750_3107422_-|SH3-type-3-domain-containing-protein MVIDIYLKNEKEKIDFHFPVNPQDSLSIKKEKRFETVDIVNLGEFDIKKEGEKIREISFKTFLPNLYDASYCRYSELKNPIEVVAMIEKWVDQAEPLRLIITGFGYNGLVTISSFSNTQTAGREEDRDIEITFRTYRELKIETLKKETKSNAKTDLKDNRPSTQTTQKIYTVTSTDTLWSIAKKFLGKGSRWTEIYNIPENKKVIGKNPNIIKKGQKLVIPSK >CP020380.1|AXU36306.1|3105791_3106754_-|XkdQ-like-protein MKIILNGKYDIANFNEGITLSEAIDGVAYKMDVSLIEPKQLQDIWIKKGDKIVLIDIAYESKKEEIIFDGVIWETRRSEKSKKLTLSCRERTVYMEESEEQYSFKENTATQRIEYYCKQWNIPYYNLANTGKKLAKVIHKTNILDMIKKDLKETASKGGDLFRVRMDNKLKLFKLGTNANVYKLDSILEDANFTSSFNDAVTSVKVLGKSKDENTKAPIIGTYKKDSDKYGTLQKIKQDEKIKNAKEAKKAAEAMFNSGEETISVDCVVDINRIRAGDKVSLKGKEYYVIDVTHTLDSKPKMKLNVGTLDYIRRKFYTND >CP020380.1|AXU36305.1|3105433_3105799_-|hypothetical-protein MTDARFNGVARILKEKMNKSVNDGVFGIGCELAEITANGLKINGYKDEMQDYLVLENLTLKEDYFTFSDEVSSGEYRHKHKIETPKELKPLTIGDKVLVAVMGAEFVVIGRVVNAKPISSK >CP020380.1|AXU36304.1|3104997_3105459_-|XkdS-like-protein MPNLFPQNETFETVELKNNNENELDLKGSFLFDFEKGEFVKNADGTLKKCDKVQAYKQWCQKAILTPRYKRSAYSSVYGSEIKELIASNLSKNAKELEISRLIKETILVHPYTKEVGEFNFNWLENSRLVEYEFDVLTIDDENITIDGNIKGR >CP020380.1|AXU36303.1|3103856_3104993_-|putative-baseplate-J-like-protein MERELPIPIFLTEDEDSVHERMLSNFQDVSTLEGDFIYDATRPTAEQIAELKQLGLQNNLKIAFPQTSYGTYLEWLGECKGVFKNQPTKSVGMITFTGVQGTIIKKGTILTTVATDEKQSIEFELLETKTIGENETVDIKAECRVAGITGNVSKGSVSVLLGSINGIKSVTNKEDFKGGTDIEDEEHFRERVLVAEQEDKLSGASSDYIRWAKEVDGVGYAYVVSEWAGAGTVKVLILDKNRKAATQELIDKVQEYIYPLNIEEGQNRDGKAPIGALVTVVTPETLLINVKASFIFSNSFNEETVLNNLKTKIDKYLDKIDLGGTVSYNAIQAIVGSMMLTDEGIQDFSNLTINDVKENIKLQDQVVGVGEIVNEVVV >CP020380.1|AXU36302.1|3103089_3103860_-|XkdU-related-phage-protein MITSRKGREMLITLSPIYEQSLIMNSIYEAIGSEFDNLELLDEEIELQLFPQTATWGLEFWENRVGLSTNIDEDIEARRRKVIAKLQMKYIVNPNRLATIIKSYTGADVYIKENIAPYTFKVTANVDDVINYEDFKYITNKTKPSHLHWMPSFALKFTDIEKFEVKMINRVFIDFRGNISNFLNGLWLLNGSKNLSAYILYHEPISLNMKNKLFVKESEVFTNLKVIIKKNLYYLDGIEVLNGNKLLNAELREEVL >CP020380.1|AXU36301.1|3102708_3103089_-|hypothetical-protein MANAVTTDIARQKMCKARAGDITLPTIVSMVFGDGGVGNDGTIIAPLSSDTALKNEVFRKDIENYVYPISTTCRYSTTLLKNEAEGKNINEIGLIDSDGDLIAIKTFGNKYKDSDMEMVFQIDDEF >CP020380.1|AXU36300.1|3102079_3102697_-|phage-tail-fiber-protein MPNELNFSNEIEEYLITTPAHANEFNNRQQKLLDNDKYLNNKIDTTKTELNTRIDTENEKQNIKIDNIIAGGVNVSHTHIIEVADWTLNNETNMYEVTINHPLLTKRILIALYDEIGEALTPNARAIDDNSILVRNEENIKMYVYLINGNAETHFINATVDDNRVSEMTTYSSKKIEDRFLNLEEKVNGGISSIATSVNELITYC >CP020380.1|AXU36299.1|3100382_3102065_-|Glycine-rich-protein MQTEWNFGYNGSPQSVILKPGKYKFECWGSSGGINNSSWYTDAKGGYSKGEITLKKQTTLYVYVGESGFASSSTSNNTKSGFNGGGKGYLNQQIMGTYYSMYGGGATDIRLVGGAWDNEQGLLSRIIVAGGGGGSYYPSTGGAGGGLEGGTGYSSNDRYRPGGTQYQGGIGRVNTENGSFGKGCSVKDSTGEGGGGGWFGGAGMNGVGAGGGGSSYVLTKDSYKPTGYTPTSEYYFDNIVMTPGGNTAGAYGYAQITLLQSLPFLNISSYNSTQATFKADHTDPTLLTKIEYFIDDVLKETITTDLTEEKTINYTLEDNALHTLKIVVTDSNNATAEKAVSISKNIMPLPENVNLNDISTKLVEVNAGFKTGKTSIINTLALKNIEASLNNTLVELSEKIKTSFDSSDASVQDLMNQLTQANNTISQLNSKYKVASGNSVVNYCTNTKGFYFNSDYLFLFPGAIQINGLNFVPNIFFTTFELIDDGYFHKYFVFACRGIFTQDFVITAHYYRLTSYLQDFKVGGEVLKLNERDVYMDNRGIQLPCSRQGSSFKWQAIKFI >CP020380.1|AXU36298.1|3100072_3100366_-|hypothetical-protein MDRANRIIYDQTGKILLQTGEATGDILEHDTITELHYIDVEYGSIDYTRNRIIGINIETKEPILEEIPVFISEEEKRIQELENQILLNENKKVGGIL >CP020380.1|AXU36308.1|3108803_3108980_-|hypothetical-protein MSENLLNEYNLKTDEDVEYFVKFANALYELKQNSEEKFQEYAEILRSILREQQERENK >CP020380.1|AXU36309.1|3109039_3109906_-|prophage-antirepressor-related-protein MKNLIVKEFNGSQIYTFMWKEKSCWIANQIVGLFDYADVSKTIQDCIKAEDFEIEQEYDVLKGNEFNDFVTTLNVVANNIISNKARSITIFYEDGLYGFLQYTDKPIGVQFRKWLRREVLPSIRQTGAYITNNADPQALRDKANEIESLDTVNKTIEILTPFLDNAGIDEKAKLLTAKTIYKKAGIELPLEIEEKEHFFDTKQIATKLNMYSKTNNPAFVAVCEIIKKLDIKEEEKLIVLANKDNWNGTTTKYSQSVIDKIRNWIEENNRPTKIQGEKKNFHVVYKIE >CP020380.1|AXU36310.1|3110682_3111477_-|putative-HD-superfamily-hydrolase MWGRFKNMSIILKVLVLVCAIAIFPITLLAFSIEFVVKSFKRNERFKVVFGVFLVFITFSFVCIWYLLEDNITTSNSSNKKQEEHLKEEPDKNLATREAEEETNKKKEQEKQKNEGTEAEKKERDKTEKKEKVDKKYQEKNKEKAETKKQTLTSEELKKKVESIISSQYKGNYYTNDILDADGSCVLSLQVQNASFDNESSCKVFTKDLINKLKEFRIDSAEIYFVGSSGQTTYQINIDDFLKVQDNIDSIDNMEFFSFKDFKN >CP020380.1|AXU36311.1|3111556_3114817_-|phage-tail-tape-measure-protein,-TP901-family MFVDVMAATVTNSNTDIERMGETFKYMGSVGGALGVSMKDLSLATGLMASASVKGSMAGTALRGGLVRLIKPPAEAQKAMNKYGIEIKKTKDGNLDLASTIVGLREKLGGLEGVQKSAAISSIFGRTAMAGWAAVVNASEKDFNKLTTAIAESEGEAKRIADMKLDTLSGQFTILKSAIDDVRISVGQKLGKVTRGFVEQLTKDMPKIGDAIVSFVSNFINNFDKIKNVLQSVISVIGGVVAGFMAFKALKFISFLIPILSDIVFAIAAFAGGAATLGEALLFALGGPVSAVIAGVALLATAFTLAYQKSDAFRKIVKNVGKSIKNFLQEAIIAISPFINTLGNKLKELGRAVIPLLKAFGDFASTLMSKIGPAISLLSSNVLAGFILTFTAIVEAVKSAVVAITGVLQGLTSIIKGVFDIVGGIISGDGKQIINGLKSVFEGGIKIVSSVWKGLVDIVTSPIKAVVDILDEKFGKKVEGIKKKWNELKDFLKNPTKAVPKVQPVNLSSEKSSSELQTSSNGAKAYISSLGQKIGEGIGKIKDKFGELKISATEVFNNIVSFVGGKATELKDKLLEGIKPAIDTFKGSLSNLKEVFGDSLDSIKEAFGGLKTVFNENIKTPFENLKQKVLETKESLKTVFDNLKSSFAELIKALEPIKDFFSNLFKPIKDDGTTKATKTNMDELKQSTQSVGTSFKELGNAFNQLKEAAKPFIDYLKQIKDSLTSTLGDIGGGLLKGVATSIVLVITSVINAIASIINAVAGAIKGVIDIIKGIFEVIGGIVSGDGEKIKQGFSDIFKGIGEVVKSLWEGIKGILGAPIKAVVDFVSNGFSEKVGQVKQWWTDLKTNVGQKISGFVSFVSNGFQQKVQQVGLWWQGLKIKLSGKISGFVSLVENGFKSKVDSIKSAWDSLRKKLSQKITGFVSIVKTGISNVLDRFAEGGVASKPSICGEAGPEMVIPLSNSKRSRALSLYEQAGQILGTKASNNVIPISQKLGTSFNSTNSIQNSTSNIINNVRQFPTKQEEFNNTENRIYQEAQPQNIISSGSNAINVGGISINIQGSNNKEEMIQEILSQVEREIREALQDIG >CP020380.1|AXU36312.1|3115109_3116207_-|TP901-family-phage-tail-tape-measure-protein MREIAKKEMYHIDVVIDVTGDEQTKSKLSAMERYMKQTEKRMKALNRIKANPVIQAQDKTSSVVNRISNNLKRVGRTISTTINAKDKASSVVNRVKNKVNSLLTSRQREVLLRARDKASQVVDKVKAKVQNLTAATIISLNMKADPALRVISQTRSKLGELKNNTIINIKAKGEEALNTISRTKNKLQEFVSKRYEAAVKIRDEASPTLSGLDGKISSFISSTISKFTQLAVTATALIGGVGVGSAIKGFADFEQAMKNAQAVSSANSKEMAEMTAMAREMGRTTSFTAKDAGNAMYFMGMAGWKSKEMIAGLPGILNLAATGQTDLALTADIVTKLLVGYKETYFKKIRQNRFQQLKKFKYCGI >CP020380.1|AXU36313.1|3116387_3116861_-|Phage-XkdN-like-protein MANLDKEFLNEGIEEERELTKEEIAKQQEDNIIMKLTEDAILPEKTIFVKRLDIPLTLKALTEKEISALQKKYTKVTKVRGRRESKLMEDEFNIALIEKATIVPNFSDIRLLNAMNVSSGVEFIRRKFLAGEIALISDEVLELSGFYEELSDDDIKN >CP020380.1|AXU36314.1|3116937_3117360_-|XkdM-like-protein MGKYDENIIDAANVVDGSNARIIIDGEEEGYGTEFTAEVENDKKTFRVIGCKWELNKASTQKGTFSFTVLKTTSKWIKKGFNKFEIITEIENPGLVGYERIRYKNCMVDKIQLASIKSDENVEMQIDGTFEGYELLDEIA >CP020380.1|AXU36315.1|3117374_3118796_-|putative-tail-sheath-protein MATGTWNEKERKEIPGFYNRFKTQAEKSTNTGLKGRLAMPIKSNWGEVGKVVTIKNDLRQLKTLFGDDMSYSAYKLGKLALLGNVKELLLYRLVDGNQKKGTLTLKDTTENTAKDIIKLETKYPTSRNFNITIKSNLVDADKKDFIFFEGTKQLFSSSVKGTIDEIVLEINSNLDNEYVVATKVADSDTTLANVVNQALEGGNDGCTSITNESYLKALEEFERYSFDGFTLDGVAEEALQETTKAWVAKNKELGKDILLFLGGKTEDNIKQINDKSKGFNDENIVNVGSSAYYENVKYTPSEVAVYIGALAVSKGITGSICNAKTIFEEVEPRLSQSEVKECLKSGTLILDFDDGDVIIVDDVNTFKKYVDDKNEAMGYISNIMFINTINKDTSLKRKEFVGKIFNDSTGQTTVICALKKYFEELMSQGIISEFNVDIDTELQATAKADEFYWKWDAVKVDVMKKIYGTGYLG >CP020380.1|AXU36316.1|3118797_3119001_-|hypothetical-protein MAETNNKKTNVSKQEEKYLKEDFLKNSEALGYEKMVVAGALFNCKKEELTKSEFEKAIKEFLEREVK >CP020380.1|AXU36317.1|3119013_3119838_-|hypothetical-protein MRAGIRKALIENIPKLKDCYEPTVPNKKTIKPYAVIVQGEDADNEGDVIGFRRIINIWLYEKRTTFNKLDELTKEVIETLDFKTITDNTSNEVFTCIYEGAVGQDVIDEEWEAIIRCLRFSVIALDDKDDITSDRWVEALSKYTKDLLEIESYKDNWKKNFIAPCCLWRTTNIENKRINYHLIEITKTMKCHVVSKNKDEIIKLLEALETKLIIDKRVRLREDKNMYLTLVSVVEDRESDMFTTGQLTVIFKMIGKIKREGPIMNAIYNSGNLR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP020380_15 | 3110365-3110588 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP020380_15
|
3 spacers
spacers of CP020380_15
>15.1|3110392|38|CP020380|CRISPRCasFinder ATAAAGACTACTAAAAACTTAGATGACGCCTTTAAGGC >15.2|3110457|38|CP020380|CRISPRCasFinder ACAGAAGTGGCTGATGCGATATATTACGCAGGTATGGC >15.3|3110522|39|CP020380|CRISPRCasFinder ATTTACCATTAGTCCCGTTGCCAGAGCTACATCTTTCAT >15.4|3110393|43|CP020380|CRT TAAAGACTACTAAAAACTTAGATGACGCCTTTAAGGCCTTTAC >15.5|3110458|43|CP020380|CRT CAGAAGTGGCTGATGCGATATATTACGCAGGTATGGCTTTTAA >15.6|3110523|44|CP020380|CRT TTTACCATTAGTCCCGTTGCCAGAGCTACATCTTTCATTTTTAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP020380_15
The CRISPR arrays of CP020380_15 >merge|CP020380|15|3110365-3110588|CRISPRCasFinder,CRT AGTTTTACTCCACTTAGTTAATATAAAATAAAGACTACTAAAAACTTAGATGACGCCTTTAAGGCCTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACAGAAGTGGCTGATGCGATATATTACGCAGGTATGGCTTTTAAATACCACTTAGTTAATATAAAATTTACCATTAGTCCCGTTGCCAGAGCTACATCTTTCATTTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAG >CP020380|15|15|3110365-3110587|CRISPRCasFinder AGTTTTACTCCACTTAGTTAATATAAA ATAAAGACTACTAAAAACTTAGATGACGCCTTTAAGGC CTTTACATACCACATAGTTAATATAAA ACAGAAGTGGCTGATGCGATATATTACGCAGGTATGGC TTTTAAATACCACTTAGTTAATATAAA ATTTACCATTAGTCCCGTTGCCAGAGCTACATCTTTCAT TTTTACATACCACTTAGTTAATATAAA >CP020380|15|6|3110371-3110588|CRT ACTCCACTTAGTTAATATAAAA TAAAGACTACTAAAAACTTAGATGACGCCTTTAAGGCCTTTAC ATACCACATAGTTAATATAAAA CAGAAGTGGCTGATGCGATATATTACGCAGGTATGGCTTTTAA ATACCACTTAGTTAATATAAAA TTTACCATTAGTCCCGTTGCCAGAGCTACATCTTTCATTTTTAC ATACCACTTAGTTAATATAAAG
>CP020380.1|AXU36309.1|3109039_3109906_-|prophage-antirepressor-related-protein MKNLIVKEFNGSQIYTFMWKEKSCWIANQIVGLFDYADVSKTIQDCIKAEDFEIEQEYDVLKGNEFNDFVTTLNVVANNIISNKARSITIFYEDGLYGFLQYTDKPIGVQFRKWLRREVLPSIRQTGAYITNNADPQALRDKANEIESLDTVNKTIEILTPFLDNAGIDEKAKLLTAKTIYKKAGIELPLEIEEKEHFFDTKQIATKLNMYSKTNNPAFVAVCEIIKKLDIKEEEKLIVLANKDNWNGTTTKYSQSVIDKIRNWIEENNRPTKIQGEKKNFHVVYKIE >CP020380.1|AXU36308.1|3108803_3108980_-|hypothetical-protein MSENLLNEYNLKTDEDVEYFVKFANALYELKQNSEEKFQEYAEILRSILREQQERENK >CP020380.1|AXU36307.1|3106750_3107422_-|SH3-type-3-domain-containing-protein MVIDIYLKNEKEKIDFHFPVNPQDSLSIKKEKRFETVDIVNLGEFDIKKEGEKIREISFKTFLPNLYDASYCRYSELKNPIEVVAMIEKWVDQAEPLRLIITGFGYNGLVTISSFSNTQTAGREEDRDIEITFRTYRELKIETLKKETKSNAKTDLKDNRPSTQTTQKIYTVTSTDTLWSIAKKFLGKGSRWTEIYNIPENKKVIGKNPNIIKKGQKLVIPSK >CP020380.1|AXU36306.1|3105791_3106754_-|XkdQ-like-protein 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MFVDVMAATVTNSNTDIERMGETFKYMGSVGGALGVSMKDLSLATGLMASASVKGSMAGTALRGGLVRLIKPPAEAQKAMNKYGIEIKKTKDGNLDLASTIVGLREKLGGLEGVQKSAAISSIFGRTAMAGWAAVVNASEKDFNKLTTAIAESEGEAKRIADMKLDTLSGQFTILKSAIDDVRISVGQKLGKVTRGFVEQLTKDMPKIGDAIVSFVSNFINNFDKIKNVLQSVISVIGGVVAGFMAFKALKFISFLIPILSDIVFAIAAFAGGAATLGEALLFALGGPVSAVIAGVALLATAFTLAYQKSDAFRKIVKNVGKSIKNFLQEAIIAISPFINTLGNKLKELGRAVIPLLKAFGDFASTLMSKIGPAISLLSSNVLAGFILTFTAIVEAVKSAVVAITGVLQGLTSIIKGVFDIVGGIISGDGKQIINGLKSVFEGGIKIVSSVWKGLVDIVTSPIKAVVDILDEKFGKKVEGIKKKWNELKDFLKNPTKAVPKVQPVNLSSEKSSSELQTSSNGAKAYISSLGQKIGEGIGKIKDKFGELKISATEVFNNIVSFVGGKATELKDKLLEGIKPAIDTFKGSLSNLKEVFGDSLDSIKEAFGGLKTVFNENIKTPFENLKQKVLETKESLKTVFDNLKSSFAELIKALEPIKDFFSNLFKPIKDDGTTKATKTNMDELKQSTQSVGTSFKELGNAFNQLKEAAKPFIDYLKQIKDSLTSTLGDIGGGLLKGVATSIVLVITSVINAIASIINAVAGAIKGVIDIIKGIFEVIGGIVSGDGEKIKQGFSDIFKGIGEVVKSLWEGIKGILGAPIKAVVDFVSNGFSEKVGQVKQWWTDLKTNVGQKISGFVSFVSNGFQQKVQQVGLWWQGLKIKLSGKISGFVSLVENGFKSKVDSIKSAWDSLRKKLSQKITGFVSIVKTGISNVLDRFAEGGVASKPSICGEAGPEMVIPLSNSKRSRALSLYEQAGQILGTKASNNVIPISQKLGTSFNSTNSIQNSTSNIINNVRQFPTKQEEFNNTENRIYQEAQPQNIISSGSNAINVGGISINIQGSNNKEEMIQEILSQVEREIREALQDIG >CP020380.1|AXU36312.1|3115109_3116207_-|TP901-family-phage-tail-tape-measure-protein MREIAKKEMYHIDVVIDVTGDEQTKSKLSAMERYMKQTEKRMKALNRIKANPVIQAQDKTSSVVNRISNNLKRVGRTISTTINAKDKASSVVNRVKNKVNSLLTSRQREVLLRARDKASQVVDKVKAKVQNLTAATIISLNMKADPALRVISQTRSKLGELKNNTIINIKAKGEEALNTISRTKNKLQEFVSKRYEAAVKIRDEASPTLSGLDGKISSFISSTISKFTQLAVTATALIGGVGVGSAIKGFADFEQAMKNAQAVSSANSKEMAEMTAMAREMGRTTSFTAKDAGNAMYFMGMAGWKSKEMIAGLPGILNLAATGQTDLALTADIVTKLLVGYKETYFKKIRQNRFQQLKKFKYCGI >CP020380.1|AXU36313.1|3116387_3116861_-|Phage-XkdN-like-protein MANLDKEFLNEGIEEERELTKEEIAKQQEDNIIMKLTEDAILPEKTIFVKRLDIPLTLKALTEKEISALQKKYTKVTKVRGRRESKLMEDEFNIALIEKATIVPNFSDIRLLNAMNVSSGVEFIRRKFLAGEIALISDEVLELSGFYEELSDDDIKN >CP020380.1|AXU36314.1|3116937_3117360_-|XkdM-like-protein MGKYDENIIDAANVVDGSNARIIIDGEEEGYGTEFTAEVENDKKTFRVIGCKWELNKASTQKGTFSFTVLKTTSKWIKKGFNKFEIITEIENPGLVGYERIRYKNCMVDKIQLASIKSDENVEMQIDGTFEGYELLDEIA >CP020380.1|AXU36315.1|3117374_3118796_-|putative-tail-sheath-protein MATGTWNEKERKEIPGFYNRFKTQAEKSTNTGLKGRLAMPIKSNWGEVGKVVTIKNDLRQLKTLFGDDMSYSAYKLGKLALLGNVKELLLYRLVDGNQKKGTLTLKDTTENTAKDIIKLETKYPTSRNFNITIKSNLVDADKKDFIFFEGTKQLFSSSVKGTIDEIVLEINSNLDNEYVVATKVADSDTTLANVVNQALEGGNDGCTSITNESYLKALEEFERYSFDGFTLDGVAEEALQETTKAWVAKNKELGKDILLFLGGKTEDNIKQINDKSKGFNDENIVNVGSSAYYENVKYTPSEVAVYIGALAVSKGITGSICNAKTIFEEVEPRLSQSEVKECLKSGTLILDFDDGDVIIVDDVNTFKKYVDDKNEAMGYISNIMFINTINKDTSLKRKEFVGKIFNDSTGQTTVICALKKYFEELMSQGIISEFNVDIDTELQATAKADEFYWKWDAVKVDVMKKIYGTGYLG >CP020380.1|AXU36316.1|3118797_3119001_-|hypothetical-protein MAETNNKKTNVSKQEEKYLKEDFLKNSEALGYEKMVVAGALFNCKKEELTKSEFEKAIKEFLEREVK >CP020380.1|AXU36317.1|3119013_3119838_-|hypothetical-protein MRAGIRKALIENIPKLKDCYEPTVPNKKTIKPYAVIVQGEDADNEGDVIGFRRIINIWLYEKRTTFNKLDELTKEVIETLDFKTITDNTSNEVFTCIYEGAVGQDVIDEEWEAIIRCLRFSVIALDDKDDITSDRWVEALSKYTKDLLEIESYKDNWKKNFIAPCCLWRTTNIENKRINYHLIEITKTMKCHVVSKNKDEIIKLLEALETKLIIDKRVRLREDKNMYLTLVSVVEDRESDMFTTGQLTVIFKMIGKIKREGPIMNAIYNSGNLR >CP020380.1|AXU36318.1|3119839_3120250_-|hypothetical-protein MSVFTKAINEIDRKKSTMPLLCMNIAFMLEGEAKNSAKWTDRTGNARQGITGTSLGGGNQYIVRLGHGVDYGTVLEEGSAPHIIKPRNAKALFWNGASHPVMKVQHPGTKGTHSLESTISRNMPKIGKLIEGHWSK >CP020380.1|AXU36319.1|3120260_3120644_-|hypothetical-protein MRKLRADKIIKTINRGITLNPQTITIEQEVKNIVDGAIEVTNEVKELTVVIYPEKTNDTVINSETIGTAYKNKNFGMVTDKEADLRLNTESNITFKCIEGTMKLNYVNPVVVEGKICGYICGLEKLD |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP020380_20 | 3460709-3463696 | Unclear |
I-A
Consensus repeat of CP020380_20
|
45 spacers
spacers of CP020380_20
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cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP020380_20
The CRISPR arrays of CP020380_20 >merge|CP020380|20|3460709-3463696|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTAGATATGATTTAGTTAATATAAGGTGGCTGATTTAGTATATGCTATTGTTGATTCTACAATTTTATATACTGCTTTATTAATATAAAACAAGTTTCTAAATACTCGTTGATATTGCTAATATTCTACTTATCTACCACTTAGTTAATATAAAACTCTTAAATAATAAAACAAAAGAAACATACACTCAAAACTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTAGCAACAGCAAGAGTAGTAACAACATTAACAATTTCCTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACATTTATATAAGAAGAAAGATAAACTTGATTGCTTTCAATCTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCATGTAAAAAGAAAAGTAAAACTAAAGATGGTATATATCTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACACTGCAATGGATAATATAAACGATCTTAAAAAAGACTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTATTAAAAGATTCTCAATTTGCAAAAGAGAGCAGAGATCTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTAGTTTTATATCTTGCAAATAACTTAAAAAATTAAGCTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGCGAAAGAACTGTTATATATAAAAATAACTAAAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAAAAATGTAGAAAGTGACCTTATAGCCAATGTAAGACCATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTATCACATATTTAAACTCGCCTTTTCTATTAATATAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTACAGTTCCTAATGTTGATAATCCTGCTATTGATATATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCTCTTGCAAAATATCCTTTTTCTTTCAAACAAAAAGTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGCAGTTGCAGGTCTTGCAGCTGGAATTGTATATTTGATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTAATCATGCTGCGCCGAGTATTACGCTGCATTATATATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGGTCTTTCGTGCTTGTGAAGAAGAGAACCGATTTAGATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTTGAAAAGAATTGGAGCATGGTCGATATAGACAATAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAAGGAAAAAGAAATAATAAAAGAATTTACTCCGAAAAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAAGTTTTGCATGTACCAGCGAGCTAAAAATTTTTCTCATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCAAACACTATTTATATTCCTACGAGTTGCCATGATGAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGAAAAGGCTAAGAATGAATGACTTTTTCTATAAAAGAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAGAGTGGTTTAAGAAAATAAGTTATTTTTCAAAACATATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTAATTACATTATTTTCTAAAATCGCTCTTATAACTGCATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGTAACAAGGTTAGTTTAGATTTTAGTAATTTTAATGAAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCCTCGTTCTACTCTTTCTGATAAGAATCGTATTGATATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTCTTGATATATTAGAATTAAGTCGACCCGCTATTTAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCAGTATCATCCATAAAACCATCAAATTCAGCCAATAAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCCATTATACATTGTTTCAAGCTTCTTTTGTACTTCTTTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACATATGGCTACAAGTTTTGAAAGTAAAAATGTAATAAAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAAACGACATTAATATTTAGTTAATGAAACTTCACTCTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAAAAGAACTTGGAGTTAAAGAAAAAGTATTTGTATCAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAGACACACCTCGCACAGATGCAGAAAGTTCCAATTGATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTTAAAATATAACCTGAAAGATTATTCAAGACTTTTTGATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTAACAGCAATAAAGAACACTAACAAAAAAGCTAAAAGATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCTTATTTCAAAGAAAGATATTGTTATAAAACAAAAAAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACACTGAAATAATTAATTGTCTTTTCAAATTAATTATTGAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAACTGTAACAGTTCCAACGCTCGGTAGGTCATAAGGATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACATTTTCAACTCATCATCTCCAATATCATCTTTACTTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCATAATAATAAAGTGTTATACTTTGTATTAAAGATATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCAGAATTCATCACAAATTTATGCTAAAATTTTATTGAAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACACAGTTCCTGATGTTGAGAATCCTTCTTTGCCCGTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTTGAATTTTATTACATTTATTACATTTCGGACATTTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAGTTTTGATATTTTCTTTTAATACATTTAAAAAATAGATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTAGTTAGTAAACATTATAATGATGAGTTGCTTAGTTGATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC >CP020380|20|20|3460709-3463696|CRISPRCasFinder ATTTAGATATGATTTAGTTAATATAAGGT GGCTGATTTAGTATATGCTATTGTTGATTCTACAA TTTTATATACTGCTTTATTAATATAAAAC AAGTTTCTAAATACTCGTTGATATTGCTAATATTCT ACTTATCTACCACTTAGTTAATATAAAAC TCTTAAATAATAAAACAAAAGAAACATACACTCAAAA CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TAGCAACAGCAAGAGTAGTAACAACATTAACAATTTC CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ATTTATATAAGAAGAAAGATAAACTTGATTGCTTTCAAT CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CATGTAAAAAGAAAAGTAAAACTAAAGATGGTATATAT CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ACTGCAATGGATAATATAAACGATCTTAAAAAAGA CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TATTAAAAGATTCTCAATTTGCAAAAGAGAGCAGAGAT CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TAGTTTTATATCTTGCAAATAACTTAAAAAATTAAG CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GCGAAAGAACTGTTATATATAAAAATAACTAAA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AAAAATGTAGAAAGTGACCTTATAGCCAATGTAAGACC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTATCACATATTTAAACTCGCCTTTTCTATTAATATA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTACAGTTCCTAATGTTGATAATCCTGCTATTGATAT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CTCTTGCAAAATATCCTTTTTCTTTCAAACAAAAAGT 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>CP020380.1|AXU36601.1|3460219_3460648_-|acetyltransferase MIRKLNNQDINKIMEIWEKSTIKAHDFISKEYWQNNYNAVKNEYIPISDTFVYDGGDEIKGFISIIDKSFIGALFIKPKYQNLGIGGKLLDYATKKYKSLSLAVYKDNKKAVVFYNKKGFNIVKEQVNEDSGFKEYIMEYSK >CP020380.1|AXU36600.1|3458975_3459755_+|hypothetical-protein MKVNENNINNIDEELDELSRKVYLESPDFWISISDKIIDKVFDEMLLFFAVKYNYFNIVCFAIENNYLDLNMPSKNKKYTNIMEHLLDTSKQNEDKKIYNYLLSLNKDNNLDERPILDELNCNTSSDTFEKKDIYLPKYLCPSCNSNIFDTGYKVSNDITYKFSSKEAEPIEMSSEVSSIRCCNCDELLEDITLDKLYNLCKIQNCNNCGSNLTKVGIIAKKKMNFDENTEKFKDVSTSYCCGNCDSEINLSQREHFKI >CP020380.1|AXU36599.1|3458106_3458652_-|biotin-synthase MKNTKVNIQDLTKMSICVALLCISSYIYIPLPFTPAGVTAQTIMINLIALILTPRQAFSTVGVYIMIGLIGIPVFGGGTSGIGKLLSPTGGFYFGFLFAALIISLLKGRNNDIKRYILITIFVGMPIIYFMGTVFMCYFNQMTVEAALFAAVVPFLIGDTIKSVIASFLGTKLNNVLRRNL >CP020380.1|AXU36598.1|3456938_3458075_-|thiolase MKEVFILGGLRSHIGLKNGIFQFVQPELLGASVLKDLIKKYEIDKIDEIICGNAVGTGGNIARLMTLTAGVSNEVPAFTVDMQCASAMMSIDIAFSKVKSGQCDLIIAGGFESSSLQPMRTYHKNDKRYNTNNPNYTVAQFSPDDNSQNSMLEGAERVAELYQIEKADLDFWVKESHKRAKEAREEKILEDIISPINNSTYDEGIRDKMSQRLLDRMPSILGKETITNAANSCLINDGASFIIICSKKYLEHVKKKPKAKIINTCTIGTDATLSPTSAIQAMDKLLEIESLNYLDVSAVEFNEAFAVIDVLFQRKYPELIDRYNIFGGALAYGHPYGASGAIIALHLLKALEKTKGRYGICSIAAAGGLGSALLLERV >CP020380.1|AXU36597.1|3455543_3456935_-|AMP-binding-protein MNYYELLRIKKDRHKNKNFLIIDGEKYTYENILSYSEELGKQISLGENIPILIYSKNIMFQLISFFAINYSKNIPIICHYNLSKKVLDDILLKNNISIIISDESMDVINLYDDNNNEVVKKVNFSIFNPKFNIYMYQYKNLINYLDKSICMGALSSGSTSVPKVLYRTYESWAGFFPIQNGIFNISGESILFVNGTLSFTGNLNSIMSVLYEGGSIVISSGLNCKSWIRTIKQYNVTNIYLIPTKLQLLVKHLKEPVLKVVSIFTGSQLLFEDTARNLKKYMPKSEIILYYGASELNYITYLCYDELIEKPLSVGRPFPGIDIYIREGKIFVNTEYAVYNATKPYSVNDIGYFDNDGYLIFEGRSDDIVNIGGFKVSSTKIENEIKKIPQIEDAVVLSYSDTIRGNQIVLFVITIDKITKKDLLIKMKDNLMKNEIPKKIIFLNSFPYTSSEKIDRLALLKML >CP020380.1|AXU36596.1|3454589_3455468_-|dipicolinate-synthase-subunit-A MSNQYDITVIGGDLRQVYMVKKLINKGYSVVTYGISNEIINGIVGKSTSLAEALSKSSIILCPIPFTKNQVNIENTDDCLDATIDNLLINLSPNQILFGGNIPTKVCKFCEQHSIQIYDFMKMNDVAILNAVATAEGAIAEAIKRSIINIHQSNCLVLGYGRCAQILAKKLCALDANVCVGARNNDARSTANAFGYSSISLNQLDEKLLQFDYIFNTIPECILTKERLEKVSQEVTIIDIASSPGGVDYSVVKEEAGINANLCLGLPGKYSPKTSGEILVNAIENIINERRD >CP020380.1|AXU36595.1|3453996_3454587_-|dipicolinate-synthase-subunit-B MRLEGLTIGVGFTGSFCTYDKIFIELENLVKEGANVHTIFSDVSQNIDCRFGNSEEFMKKAYELTGNKPIVTIEEAEPFGPKGIADIIIIAPCTGNTAAKLANGITDSPVLMAAKGHLRNDKPLVISISTNDALSFNFKNIGILLNSKNIYFVPFGQDNCKAKPNSMIAHTELIIPTIELALENKQLQPVIKSPHQ >CP020380.1|AXU36594.1|3453589_3453790_+|hypothetical-protein MKKLKIISIFSLIISVILTIGGIGIVTYYVDNLFIRGLSVFVLIMSSFFVSTTVRLIFEESKRYKF >CP020380.1|AXU36593.1|3450432_3453087_-|bifunctional-acetaldehyde-CoA/alcohol-dehydrogenase MAHKEQVIIENKKENEVMSVGLDTVNNVESLVKKLAKIREAQKIFATYTQEQVDKIFLAASLAANKQRVPLAIMAQKETGMGIAEDKVIKNHYASEYIYNAYKETKTCGVIEKDEAFGMTKIAEPIGVIAAVVPTTNPTSTAIFKALLALKTRNGIIFSPHPRAKNSTIEAAKVVLEAAVLAGAPEGIIGWIDEPSLELTTTVMKEVDLTLATGGPGMVKSAYSSGKPAIGVGAGNTPAIIDESADIKTAVNSILVSKTFDNGMICASEQSVIVLENIYNEVKKEFKERGAYLLDKDETEKIRNIILVNGGLNSKIVGQTACTIAKLAGFEVPVDTKVLIGGVESVEIEEAFAHEKLSPVLAMYKASDFDDAVRKAEKLVEDGGFGHTSSLYIDDVNQREKLDKFTSAMKTCRILINTPSSQGGIGDLYNFKLAPSLTLGCGSWGGNSVSENVGVKHLLNIKTVAERRENMLWFRAPEKVYFKKGCLGVALKELKDVMNKKRAFIVTDTFLYNNGYTKAVTDLLDEMNIKHTTFFEVEPDPTLECAKIGAKAMREFNPDVIISIGGGSAMDAGKIMWTLYEHPDVDFQDLAMRFMDIRKRVYTFPKMGEKANFVAIPTSAGTGSEVTPFAVITDQDTGVKYPLADYELMPNMAIVDSDMMMNMPKSLTSASGIDALTHALEAYVSMLATDYTNGLALQAIKSIFEYLPRAYDNGAKDPEAREKMANASTMAGMAFANAFLGVCHSMAHKLGAFHHVPHGVANALLITEVMKFNSSDAPKKMGAFSQYKYPEALKRYAEIASFLGLKGNSDEEKFKSLLVAIEDLKLKVGIPKSIKEFGVEESKFMDSIDEMVIQAFDDQCTGANPRYPLMNEIKDMYLNSYYGR >CP020380.1|AXU36592.1|3447024_3447687_-|B3/4-domain-containing-protein MIDVSIDDKLKERWPNAKLGCIQAKVAVNKSSEKLINEINEFCDTINQSLKLEDITKLDKIKDARNAYKELGKNPSRYRTSSEALVRRIIQGKGLYTINNIVEINNLISIKSLYPVGTYNVSKLHSPVCFTVGDEGEQYKGIGKELINIENLPILSDSVGKFGSPTSDSERAMITEDANEILICIFSFSQESDIEEYFGYAKELLKEYADGKDIETKIIK >CP020380.1|AXU36602.1|3463879_3464146_-|CRISPR-associated-Cas2-family-protein MFVIVTYDIVEAKSLNRIRKILRKYLTWTQNSVFEGNITDGKLHKCISEIENIIDNSEDSIYVYEIKNPNSIKKKCYGIDKYSDEMFI >CP020380.1|AXU36603.1|3464148_3465129_-|maturase-related-protein MYKDYYIISNGNIKRKENTIYYYNLEGEKKILPVEQVDDIHIYGEVDLNTKLINYISKYGVMLHFYNYYGYYSGTYYPRKKNVSGFSLVCQSACYLDKNERLYLAKSFVESASYHILRNMRYYKVDESLIDTIKDELNDLNDVKEISELMGKEGRIRKTYYKSFNQILKDDFEFYKREKRPPKDPVNALMSFGNSIMYTNVLSEIYKTQLDPTISFLHEPSTKRFSLSLDIAEIFKPIIIDTIIFSLINNKRINKNDFEYQDKICYLSEKGKKKFLQEFENKMQTTIKHRNLNRKVSYRMFIRLECYKLIKHFINDERYKVLKVWW >CP020380.1|AXU36604.1|3465131_3465701_-|CRISPR-associated-Cas4-family-protein MIFILTMWLKFTKEGDFVPIDLEVLKVQGVKINYYYVCKRKLWLFSKGITMEQNSSRVLSGKIVHEDSYKRMKNKEMLIDDILKLDIIKDEYVKEVKISSKMKEADEMQLYYYLYYLKNSMGIEKKGTINYVKEKKQEELILTEEKERIIENTLININEINMQLSPPKIEKKHYCTKCAYYEFCFVKEE >CP020380.1|AXU36605.1|3465697_3468019_-|CRISPR-associated-helicase,-Cas3-family MLYAKSNPVETLREHTDELLKQMNMLRECYGTNINSLNFLEVERFWQLLDFVIEFHDIGKAFSPFQKLIRSRMDIEVNEPKIVTHLENNIGHNYLSPAFIDYRYIDRKKDRELRAVLIQVIVYHHERDVFIDKDFRNLIQKILDEDLINKGYELQHEFKVRYPIRTEELSNTYLQSVIKRIDKNHKYYNLYIMLKGILHRLDHSASAHEIVECNSNMNIGEYTEKHLVKEFGSLREVQSFAKSNRNKNIILIASTGMGKTETALIWIDKDKAFFTLPLRVSINALFDRAKNIIGVGEANDTFLGLLHSTAIDYLEESNQENSNEIVDLAKLLSCKLTFSTIDQIFKFPFLYRGYEKVYSTLAYSKVVIDEIQAYSPEIAAVLVKGIEMIHKIGGKFMIMTATMPTIYIDELKKRDVIDSNLADLTCNTEKIRHCVSIVENSIDENLDKIIQSGMNKKVLVIVNTVKSAVEKYELIEEIVKTKGVDVNLNLLHSMYIQEDRAKLEKYIKEFANSDRNGIWITTQLVEASLDIDFDELHTENSTLDSLFQRFGRCYRSREYEENSPNIFIYTEKATGIGSIYDKDIVEKGLELLKTFINGKECVKMKEKYKVEMVKILYSKESLEGTAFEKRFTSALNILDTITPYSLGSKDAQNILRNIEGYTVIPEDIYNKIEKTLLKDYEALGKELTEAYSNEDRESINEIKSKRKKARREIIKKSVNIPIYKVKQNIEDINIKGLEDLKILLYKYDIHENKHTKQIFGKGVLISNEIDQFI >CP020380.1|AXU36606.1|3468029_3468731_-|CRISPR-associated-protein,-Cas5t-family MKVLKLDLFQETACYKKPFAMKITETYPLPPYSTINGLIHKILNATEYIPFNISVQGTYESIFNNYQTTYFYKKDSITSMPMNSHMLLNVNLIIHIGGDFDLLKKLYGSLLNCNEYLSLGRKEDLVRINDIRFVEVNKFEVDEDIQLDDYENYRLSKYNIRMPIYIPKSSLQDEYIEGISYRLNNYYDNNAKEDKKRVWNKVDSYYVDDGIPISVGNILLDDEGDLLYFNNIN >CP020380.1|AXU36607.1|3468732_3469647_-|CRISPR-associated-autoregulator,-Cst2-family MKRGLTFTVIAQAQSLNYGEGIGNISELKKLSRADGNMYTFASRQCLRYDIVRLAAELFNWNLQVVDKGKGTIQFKDNISIRESEEMDLFGYMKTNKKDEKDKKGGSLTREATVRLSNAISLEPYRSDMDFLNNKGLADRIGEHPNLANIEQHLSYYTYTVTIDLSKIGKDGEIELDNKEKCRRVVEFLEIIKVLNRNIRGRQENLSPLFVVGGVYEIANPFFLGRIKLKGDKNGFKINKQAIEEVIQGTFLGKDLKEFTYVGMVDGVFINKEEFKGLFEDNFLSVDKFFGQLVKEVKEYYGVN >CP020380.1|AXU36608.1|3469648_3471499_-|CRISPR-associated-protein-Cas8a1/Cst1,-subtype-I-B/TNEAP MKLRVYRGDWFFNMGIVGFLNIIKKADKQAEIFIMEDYIEFDSLFLENFHEYYFNYFMDEYDVSKRIKKSIDYSINFIKSKPDRIKDGIKKIKDSVKPQNDKIKKFDEEKFNLIKEKLDSMSKIKSYDEFDSLEALVDETIDIFKIKSINDRLTANLYKYVVQDNYFGQVSFFNVAKAKLDLDGLKQVMFNDYLRQIIYFGELEDLLEENDYDKLKNYLNDRLNSIAKDINEKKVSKSSVNTIEKIMKEINKNFIKKNKSIEDIKEYMDSLEVCEMCGLYKGILDEYSESNFAPLGVSTNNARNMFWNQEYVSSICDVCKLILFCTPAGATYTRKNYLTNEENEFYLFVNMDTSINELFERNNSLKAQKSESSDSKDENPFNQLIKSIVEENKLKSEWQLHNILFVEFKASIDSKKCKINYFNIPTYLAKFFVKENKKIQSIYDYKLKSNVLDLILKNKDLKHLINNTLRNIVKSNLESNNKSNISGLSCFNVVQLRTILNNYKRGVYKMDYKKLRKIYESGCEIHDYYIDKNAKNKIEGITYKILSLIKVGNKNDFMQTILRIFSPSEKTPPEEILQIFVEEDLDFESVGYAFVTGLISGKYEGKDKLPNEKEEK >CP020380.1|AXU36609.1|3471504_3472242_-|CRISPR-associated-Cas-family-protein MKMKIEFSTGCIPISYNSLFMSIIKEAIRKSNEDYYKNMYYYKEKNNKKTKNFTFSVYIKKYSIEGDNFIIEDKVILNISTPDLELGFHIYNGLMTSKKCLYKDYELTRIRIDLSREKKVTEERVLFNALSPICVKSKEGKFLEITDDRYIEELNYITNEVVKNYRGNGLKRKLEFENIGLKKVVVKESLREFKKITGKEYQYINGYKGKFILKGDIDDLNLIYNLGIGFRRAQGFGDVDILEWR >CP020380.1|AXU36610.1|3472319_3473273_-|putative-transcriptional-regulator MLLISKLANTLRMMILIQSRGKMKCKELAEELEVSERQIKSYKMYLEQAGIFINSTPGIYGGYEIDKCNSISLIKLLDSEVSILDMINSQLEYNNDIYKNEFNNIVEKIKAVLNTRAKSDTYMDYFTIQPQRNCDYESEKNNCNEIIRAYTTKRKLWIEYYSLNSGNSERIVHPYGLFNYKSDTYMVAFCEKRFKFIDFKLCRIKKCEVLEEKYNVDKSFSWDEYSKNSIGIYKGEEINVVIKISHPFSTIIKEKVWVNNQQIIEYDDKSIMFKAKMRGYEEIKSWILSMGAYVEVVEPDRLRNDILSEIEKMKKIY >CP020380.1|AXU36611.1|3473515_3475432_-|ABC-transporter-permease MNIKQFAINNISRNIKAYLGYLASIIISSSLLFSFIMFIAHPDLDVSQFPDYLKEGYKMSKIIAYLFLFFFVFYSVSVFLKSRYKEFGILYITGISKRQVMKLIFIENMIINIVSSVIGIIIGLIFAKIFLVVMSTFLELSPLKFYIPFNAILSTLIYFMILAVLTSIFTSFIVKENQVLKLLKGTKTPKPEPKTSLMLAILSICLFIIAYYNAVTSTDQYTTYLRLVPVTSITIVATYLFFSQFSVFFIKKLKLNKRFYRKNTNMLWISNLIYKVKDNARIFFLITITSAVAFTAIGTVYSFWKDVKRQINLIYPNTIYYSTMTLHNDPKKPDSKEKDKERMRFIENNLKKENVDYTRINGEFKTVFPKKSDFNVRIMKESKYLEITEVIGVKPISFEDNESISLLSSSLPGNKKIKENVIVGNRSLKVAKQVEECVMPAYYKNMYVVKDNFYDSIESKFIVDRFTAFEVEDSSKTIEICREFENKFDNESGMQPYLFFSKELMIETGKLMYSTFIFLAIFIGLIFFVTTSSFLYNKFYMDCQVDKKKYGQLNKLGMTYNEIKKASTIEIGIVFLLPYVVAVIHSIFALTALKNSFDIEVASSAVLVMGSLFLVQIVYFLIVRNNYLKEIRLNLVNF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP020380_21 | 3744200-3744295 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP020380_21
|
1 spacers
spacers of CP020380_21
>21.1|3744229|38|CP020380|CRISPRCasFinder GTTTATTATACTTCTTTAGATTAATTTTCTATATTTCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP020380_21
The CRISPR arrays of CP020380_21 >merge|CP020380|21|3744200-3744295|CRISPRCasFinder TAAATTAATTTTCTATACTTCCTAAATTAGTTTATTATACTTCTTTAGATTAATTTTCTATATTTCTTAAATTAGTTTATTATACTTCCTAAATTA >CP020380|21|21|3744200-3744295|CRISPRCasFinder TAAATTAATTTTCTATACTTCCTAAATTA GTTTATTATACTTCTTTAGATTAATTTTCTATATTTCT TAAATTAGTTTATTATACTTCCTAAATTA
>CP020380.1|AXU36840.1|3743780_3744029_+|hypothetical-protein MHQIGQDSKSIILIGLNPILSIISTIDSFFVFMDSGMQIPCRTITGSISIYWYIASILSFLIYGIILDLIRIVISKIGNKTK >CP020380.1|AXU36839.1|3743069_3743663_+|nitroreductase MISDSISKRRSIRKYKNQSISHETIEKIIEAGINAPSSKNRQPWRFVVITEKEKESMLKAMSKGIQNEINDNGLLPGSRQHIAGANYTVEIMKQAPVTIFILNILGKSPLENLSPEERFYEMANMQSIGAAIQNMSLTAVELGLGSLWICDVYFAYRELCEWLNTDSQLVAAISLGYPDEEPSRRPRLQLSDVTEWR >CP020380.1|AXU36838.1|3742282_3742513_-|hypothetical-protein MRLDMDSMLYVLIYMTLLVSIIGSIFYFCKDLLNHKIKYVLIRDIFVNRTTYSEERLPKQYIVFQKYDIWRYCSLF >CP020380.1|AXU36837.1|3741575_3742226_-|60-kDa-inner-membrane-insertion-protein MDFISSILQGLLSILFNFTGDFGISIVLITLIVKLVLMPLSLKQRFSVKKQQELAEKMEHIKEKYKNDTKELEKQIQVSSVESMKSMLGCLIVLVQMPVVYALYHVCLDMTKEFTTIIIPWIANLGTFDNLFILPCIYTLIMLASNLVNYIPYLKINSQVKFNKQMAVVTTITSLILTVRTPVAIGLYFITSAIYSLIEDICFRIYFNRKNRIVTK >CP020380.1|AXU36836.1|3740713_3741385_-|two-component-response-regulator MAKILVVEDEKRMQSIIVEYMQKGGYTCITADDGVEALTILKSNNIDLMILDIMMPYLDGFSVCRVSREMTNIHIIILTAKGEEEDKLKGYEYGADDYITKPFSPKVLLAKVNALLRRYTTDIPKNSLSLGKIFIMVASRQVYVEDKLIDLTYKEFELLRLFMENPNQVFSREKLLNCIWGYDFEGNTRTVDTHIKTLRKKLGSEGHHIVTLIRSGYKFEVKE >CP020380.1|AXU36835.1|3739586_3740717_-|two-component-sensor-histidine-kinase MNSLRKIIEKLKNVDISNWTKQNFGLYSVRKKVFLLSKLSGALIILFYLVVEGFSINSKFEFWIWFIILVIFIMSIDFLLGKFISEPITSINKSAKSMSQLDFSNPCTVNTNDEFGELSRSLNTMSTNLQQALSDLESANIQLEKDVNKERMLLEQRKELVDTISHEMKTPLGIIRAYTEGLMYEVGEEKKKNYMNVIIEETDRMNNMIVSLLDLSALEAGVSKLNPERFDFIEFVETVAGRLLIDIPDANFYFTYDLPEYEVFVVVDKMRMEQVVENLIINAKKHVVYNGNLDLSITCENGLLLFEIYNDGRIIEQDEISKIWSKFYRSVQSQRTGGSGLGLAIVSQILTMQGLEYGVKNRDRGVEFYFMIPIDE >CP020380.1|AXU36834.1|3739151_3739274_-|hypothetical-protein MKWYTWLTIILIVLVSIPLKIKFIKWWDRRQKNDKGGYDR >CP020380.1|AXU36833.1|3738309_3739155_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKVEELKFSYGKDKQILHGLNFEVKEGEIFGFLGPNGSGKSTTQKILNGVLKGYNGHVSLFGKEVKAYTESLYQKIGVLFEFPYLYTNLSAIDNLEYFSSFYPKNQRRDIYELLDLLEFKKEFTNKPVSSYSKGMKQRISMARALVSNPKLLFLDEPTSGLDPSGAVLFRKIIEEERKKGTTIFLTTHNMLDADLMCNNVAFIADGKIMAIDKPKNLKMKNSNNKVEVEFVYNGNRDIEIVDIQELESGITFKYDEILSVHSKEPTLEEVFIKYTGRMLV >CP020380.1|AXU36832.1|3737281_3738310_-|ABC-transporter-permease MYSKFFTLVKKDFWMMIYGKFFVLTLGSLILYSCYINFGYVKFMDEDSYHNNVYLYNPENISMSASPLIHQVSSIDELKAKLDEDTNAVCIDMSFSKPKVILHESIKGVDNYRADYALSLLSSEKDHNSKISDNNAIIQINDKDTSEIKQRKEMTCEILFFEIVAIGFLGIASLLFKEKQMGVMRITGILPVKRSLFILSKIFAFLICDLCFTVLLVVFNVGFSEGIKILPQVLVQASILSIIMSLIGIGCSMLLRDFKQFSLMYLVVAVFITTPIFLSANTSFEIDWIKYHPFYHVYSQLKNAFFMNFSKELIYFVVCSLTIIVLFLLVKNIFNKELVREG >CP020380.1|AXU36831.1|3736265_3737279_-|ABC-transporter-permease MIGLRYQLKSIKKDKMCIISFFLPVVMVILINFMGTIDISSLGEIRFGIVKDTLPVQTEQWLKKYGMVSVYDTKMHLIREIKDIKTDTIGVVRDGKGIKTVLYGNEINAIKNVGKTLPKMFRLKGDLKDVEVTILPKDSILREFQNVFIAVILITAMFMGCTFNAMNIISEKEDGISFINEVLPQSRSQHIIQKVFLGLLCGCLSSMITVFICLDISILDMIMMLLLVVFSSFISSLIGLFIGKLSEGLMVGIVYIKIVMILFIGAPLLIYLLGVNTSGIGNLCYIMPSVATFNGIMEIINGNVIIIKDIVILAVHCVAWFMLYIILDKKRKLSFSR >CP020380.1|AXU36841.1|3744343_3745747_-|Na+-driven-multidrug-efflux-pump MEEKYKEPLEYEKVSKLLTKYAIPSIIAMLVSALYNIVDQIFIGQGVGVLGNAATNVTFPLTTICTAIALLLGIGGASKCSLELGAKNSEKATKATGNSICLMAVFGISLFIIVSIFLTPLLKFFGSTSEILPYAHTYTKITSIGLPFLIMSTGMSKLILADGRPKASMFCMLIGAVINTILNPLFIFVFNMGIAGSALATVIGQLISFGISVHYIKNFQHIKLHKKSFKLDSIIYKHIFALGSSSCFNQLAMTVTQIVMNNTLAYYGARSVYGSEIPLACVGIIIKVNMIFISIIIGISQGMQPIIGYNYGAEKYNRVKEAYKFAVGSATIISVIAFLCFQFFPRQITSIFGNGNETYFIFAEHYFRTFLFLTFINGVQIVSSTFFTSIGKSVLGLFTSLTRQILFLIPLIVILPMFMGIDGVMFAGPIADAAAAMVCIYFAVHEMKSLTIKQNNLMSNHNKIAEV >CP020380.1|AXU36842.1|3745730_3746192_-|MarR-family-transcriptional-regulator MRELLKWVSIINRYNTNYIDRKLADIGINNSQYFYVLHICNNPGITQDTIFEKILVNPSNITRALANLEKEGFITREPGVKDKRTWHLYPTEKSLECYDEILKITNGYVEELLSSFEKEEQELFMSMLKKVAFLAIDMNEEAKLEAKENGRKI >CP020380.1|AXU36843.1|3746538_3747054_+|PadR-family-transcriptional-regulator MLEYIILGFLMEKELSGYDLKQIMSESTSYFFDASFGSIYPALKRLETKGYIHYHEVIDGSKLKKLYSITNTGKEVFLEWLKKPINFSKTKQDHLVNIFFYKYLPKEIIETNLKMLITEVELLLNKLSKQKIDVEENHCVDQYTYMYATMIYGVDYYNFVINWCKDLLKNL >CP020380.1|AXU36844.1|3747102_3747606_+|multimeric-flavodoxin-WrbA MRLLIHDLTDKELEKLLPKLDDNIKILPNTKEIHKCIGCFGCWIKTPTECVVKDYYSNMGKLINESDGIIIISRCCYGGFSPFVKNVLDKSINYILPYFVIKDNMMRHKSRYDKQINLKAIFYGDCITEAEKETATKLVNGNAINFNIKEHSVCFYENIQDIRGESI >CP020380.1|AXU36845.1|3747602_3748253_+|multimeric-flavodoxin-WrbA-family-protein,-diverged-or-disrupted MNIVMINGSPKVNKNNSQYFLSELKQFIQNDNKVFTFKVDSTSKYPDTLNAILNCDRLIIAFPLYVDGIPSHLLHFLEECEKFLKTQNKKPIPVYAIVNCGFNEGEHNHLAIQMIEHWCKKINFTWVQGIGIGAGEMFGSLESVSLGKGPKKDLGVALKELSKNILSDNIHIDDSNKSTIFISPNFPRFLYKLMGNHQWNTQAKSNGLTKSDMLKK >CP020380.1|AXU36846.1|3748387_3749167_-|bifunctional-3-demethylubiquinone-9-3-methyltransferase/-2-octaprenyl-6-hydroxy-phenol-methylase MNDTVKEKLAESLTSDTTDILPYLPYLLQDFWKLGSSPEQMLQLFRKHIPFNEDTKVLDLACGKGVVSVKLAKELNIHIKGIDLIPEFIDYARRKAIEYKVDALCDFEVNDANSSVKIEHDYDCVIFGAVGDILGNYKETISKLLPTIKSKGFILIDDAYVVDKSTNEHLNFERVYPTYNEWCILFKELGLKLIECVPCLELENDVDEEMNWIITRTNELIKKYPSQKDMFEQYVISQKNEYTDLQQDLVGATWILQKE >CP020380.1|AXU36847.1|3749283_3749535_-|hypothetical-protein MNVENELLKNLDRLHTTELGVVRIKKNLSLETNDVVNWCKTKIESPNAIINRKGKNWYISVYDCIITVNAHSYTIITAHKEKK >CP020380.1|AXU36848.1|3749728_3750598_-|AraC-family-transcription-regulator MDNNLITIEKTLDYIEKHLLDEMLDLDVISKEIGYSKYHLHRMFTSVVGFSIHNYIQRRRLTEAARMLIFTEKPIIEIASISGYDTQRSFSTGFKKMFKHRPKFFRKHQDFLPLQLKFDINNRKRLHGDMVLDVKKVNCTDINIVGYSGKVKKGFHVIGKYWMGLHKNKEMIENKVDLDFLIGVNDYSDFKEIENNPTFTYIAGAQVATFGKLPNGMKKFILPKSNYIVFTFIGKNEDSMQNVVEYIYQEWFLNSSCQFNENNLYDFVKYGEKTDENGLSEIQFWVPII >CP020380.1|AXU36849.1|3750935_3751697_-|osmoprotectant-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MTPIIQFKNIKKQYNDKTIIDNLNLDIEKGEFLTVIGSSGSGKTTLLKMINGLILPDGGNILINQTDIKNEDLIKLRRRIGYCVQGSVLFPHMTVEENISYVPNLLSKKNKLEVKSAVNKWMEIVGLPNDMKVRYPSELSGGQQQRVGIARALASSPEILLMDEPFGAVDEITRKQLQKEIKEIHKKTGVTIIFITHDIYEALILGTKTLVLNYGVVQQYDTPENILNTPANQFVDQLLNIRKSIIDDENLKE >CP020380.1|AXU36850.1|3751712_3753248_-|osmoprotectant-ABC-transporter-substrate-binding/permease MINDILTLLSERSDFFIKLSIEHLMISIISIIIAIVLGGIIGVIVSEFHNSSKPILGTINFLYTIPSISMLGFLIPFSGIGNTTAVIALTIYALLPMVRNTYTGITNVDKNILEAARGMGSTDFQILYKIKLPLALPVIMSGIRNMVIMTIALAGIASFIGAGGLGVAIYRGITTNNTVMTISGSILIALLALIFDFILGLVEKFFQRKRKKKNRKKVFATLGSLILIVTIFTSYLFNPSKTQTIHIATKPMTEQYILGEMLDILIEKNTGLNVEITQGVGGGTSNIQPAMENGEFDIYPEYTGTGWNMVLKKNELYTESMFNKLQSEYKTKLKMQWAGMYGFSNSYALAVRKEVADKYNLKNISDLKDVSSKLTFGAEYDFYEREDGYTPLCNTYGLNFKDTVDLDIGLKYQAINEGKIDVMPIFTTDGRYSVSDVVVLKDDKNFYPSYQCGNVVRLEVLEENPELSKVFKMVGDILTDKEMAKMNYDVENNNLEPREVAREFLNKKGLL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP020380_22 | 3771110-3771343 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP020380_22
|
4 spacers
spacers of CP020380_22
>22.1|3771137|18|CP020380|CRT CCGGTTGCTCCTGTATTT >22.2|3771182|27|CP020380|CRT CCGGTTGCCCCAGTTGCTCCTGTATTC >22.3|3771236|18|CP020380|CRT CCAGTCGCTCCTGTATTT >22.4|3771281|36|CP020380|CRT CCAGTCGCTCCGGTTGCACCTCTAGGCCCCATCGGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP020380_22
The CRISPR arrays of CP020380_22 >merge|CP020380|22|3771110-3771343|CRT CCTGTAGCACCTGTTACTCAATTTGCTCCGGTTGCTCCTGTATTTCCTGTTGGTCCTGTTATTCCATTTGCTCCGGTTGCCCCAGTTGCTCCTGTATTCCCTGTTGGTCCTGTTATTCCATTTGCTCCAGTCGCTCCTGTATTTCCTGTTGGTCCTGTTATTCCATTTGCTCCAGTCGCTCCGGTTGCACCTCTAGGCCCCATCGGGCCTGTTGGACCAGTAGCACCTGTTGGA >CP020380|22|8|3771110-3771343|CRT CCTGTAGCACCTGTTACTCAATTTGCT CCGGTTGCTCCTGTATTT CCTGTTGGTCCTGTTATTCCATTTGCT CCGGTTGCCCCAGTTGCTCCTGTATTC CCTGTTGGTCCTGTTATTCCATTTGCT CCAGTCGCTCCTGTATTT CCTGTTGGTCCTGTTATTCCATTTGCT CCAGTCGCTCCGGTTGCACCTCTAGGCCCCATCGGG CCTGTTGGACCAGTAGCACCTGTTGGA
>CP020380.1|AXU36864.1|3769646_3770402_+|dihydrodipicolinate-reductase MLKVIISGYNGTMGRVLAECVKKDNELELVCGVARSADEKGHHSDTKLYKTMTDVTEKTDVIIDFSHHETLEPILSYALKNNTPVVLATTGYDENDLHKIEEASKNIPILLSSNTSLGVNILIKLVKDASKMLEGFDIEIIEKHHNRKEDAPSGTATMIANAIKEVLPESENTHGRYGRDCKRKPNEIGIHSIRGGNIISDHDVIFAGDNEVLTLSHHSQSDEVFANGSIVAAKFLIGKQSGLYKMSDILG >CP020380.1|AXU36863.1|3768217_3769207_-|somatin-like-protein MLKEEKTYQEKEAKVFNGVAALIMIVLFLVVSIGIMVFGIVKLDSGFTGIGSLMLILGLVFIVVDFILFFGLKMINPKEAIVLVLFGNYYGTIKKEGYYWVNPFCSAINPAVSRINVSKSSSDEKVDISTNSRGKKVSLKTMTLNNEKQKVNDLLGNPIIIGVVVIWKVIDATKAVFNVDNYNTFLSIQCDSTIRNVSRLYPYDVSEDGDEKSLRGSSQEIADRLKDELQSRVDIAGIEVCEVRITHLSYAPEIAAAMLQRQQAEAIIAARKKIVEGAVSMVEMALTNLSENNVVTLDEERKAAMVSNLLVVLCGNKDAQPVVNSSSIY >CP020380.1|AXU36862.1|3767083_3767800_+|2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate-N-succinyltransferase MVNLNDAYEIARYIKEVKKKTPVKVYVNTNSLHFQSTDKFKVFGSNGSYIFVGDYEDIMEVLDKHGNDITDTHVEYDRRNSAIPLKNTLSEHARIEPGAIIRDMVTIEKNAVVMMGAVINIGAVIGEGSMVDMNAVIGARGTLGKNVHLGAGAVVAGVLEPPSATPVIVEDDVLIGANAVILEGVRIGKGAVVAAGAVVTTDVEAGAVVAGSPAKVIKMKDEKTADKTKLMEDLRNLD >CP020380.1|AXU36861.1|3766110_3766860_+|dihydrodipicolinate-reductase MLKVIATGYDGKMGKILADTIREDNELELVCVAARGLDSYEGDLKIYEDMSTIVEEADVVIDFSHHSNLDNILSYVLKTKTPLVIATTGYNDDEMNKIREAAKVIPVFQSYNMSLGVNVLVKLVKDAAKLLEGFDIEIIEKHHNRKVDAPSGTAVMIANAIKEVLPNVENNYGRYGRSAKRQPNEVGIHAIRGGNIVGEHDALFAGDNEVLTISHQAQSRGIFASGSIAAAKYLVKQKPGFYNMDSMLG >CP020380.1|AXU36860.1|3765156_3766044_+|dihydrodipicolinate-synthase MIFKGSAVALVTPFTKDNKVDFDKLGELVEYQIANGTDAIVSCGTTGEANTMTDEEQLATIKYVVEKVNKRVPVIAGSGSNDTMHSVNLSQEAEKLGVDALLIITPYYNKANKAGLKRHFETIANSVKLPIILYNVPGRTCVNISPSLIVELAKIDNIVAVKEASGDLGQVAEIASLVPDDFAIYSGNDDTILPLLSLGGQGVISVLANVCPQETHDLVAKFFEGDIEGSRKLQLGMDALIAALFIEVNPIPVKTAMNLLGFNVGDLRLPLAEMDPANLEVLKKELVNFGLKVNA >CP020380.1|AXU36859.1|3764038_3765040_+|aspartate-semialdehyde-dehydrogenase MKKVNVAIVGATGMVGRTFLKVLEERNFPIENLFLFSSSKSAGSKVMFCGKEYIVEELKETSFTDRGIQIALFSAGGSISEKYAPIAASNGILVVDNSSQWRMNPDVPLVVPEVNPEAIKNHKGIIANPNCSTIQAMVPLKALDDKYKIKRVVYSTYQAVSGSGVKGVEDLEKGMNGNPTGFYPHQISYNCLPHIDSFTENGYTKEEMKMVNETMKILDNYDLKITATTVRVPVKNGHSESINVEFNNPFELDDLVKTLEEAPGVVVVDNPAKNEYPTAVEFDDRDEVFVGRIRRDFSVDNGVNLWVVADNIRKGAATNAIQIAEMALSYDLV >CP020380.1|AXU36858.1|3762727_3763609_+|dihydrodipicolinate-synthase MLFKGSAVALITPFTEDNNVNFEKLGELIEYHIENGTDALVVCGTTGEATTMSESEIFAVIKYTVEKVNKRIPVIAGTGSNNTMLSVHMSQEVEKLGVDGLLIITPYYNKTNEKGLKLHFETIANSVKLPIILYNVPGRTKVNIKPSVVAELAKIDNIVAVKEASGDLAQVAEIAKLVPKDFAIYSGNDDTILPLLSLGGSGVISVLANICPKETHDLVTKFFEGDIEGSKKLQLDMDALIAALFIEVNPVPVKTAMNILGFNVGNLRLPLAEMEETNLNVLKQELTNFGFKF >CP020380.1|AXU36857.1|3761211_3762405_-|L-serine-dehydratase MDTLKELFKIGSGPSSSHTMGPQRAAERFKNENPDAESFRAILYGSLAATGKGHLTDYIIEKTIAPKKVEIVWEEDIIKDFHPNGMKFEALDKDKNVTAEWTVYSVGGGTIAEEGQRNSKSNSIYHLDTMDEIVKWCKENNKTLVDFVLECEPKDIKDYIKTIKDAMRKSIDDGLSTDEIIPGKLLLKRRASTFYNAYKKDKSFSTLVYAYALAASEQNASGNIIVTAPTCGSAGVIPGIFFAMQDFYNYDDEKIIEALLVAGIIGNIIKTNASISGAEVGCQGEVGAACSMAAAAVAYLKGGTIDHIEYAAEIALEHHLGMTCDPVYGYVQIPCIERNAMAAQRAYDAANYALLTDGSHSVSLDQVVETMKETGIDMMDKYKETAKGGLAKHFFSC >CP020380.1|AXU36856.1|3759887_3761006_-|amidohydrolase MREASYLQEQLYKHRKSLNPIAEIGRKEYKTSKYIRDYLDKLGIEYEVYLETGIVGVIEGKRPKKDIAFRADIDGLHSEEGVKHLCGHDGHATILLGLIEYLNDNKEDLNDNIVFIFQPAEEGPGGAKALIDEGVLRKYNIDEIYGLHIYPELPEGYVGTREGYFMAQIGDIDIEIVSKSGHGAMPQNGIDGIVIASNFVSSLQTIVSRNISPIDNAVLTIGRIEGGARRNIIAENIKMEGTMRCFSPEVYEKMKLRVRELARGFELAYNCKVNINIIDDYIAVKNDKDLYQEFVEAIGSDTVVELEPLMISEDFSYYQKEVPGLFFMLGSRNEEKGFVNGLHNINFNFDEKICVNALNVYSKLLKYKEAID >CP020380.1|AXU36855.1|3759511_3759757_-|small-acid-soluble-spore-protein MKEKIQREKKITNGKNTKILTNDDIMKYEIASELGLMDKVGERGWAGLTAKEAGRIGGMLTSRKKRLKKIVEEQNKKDESI >CP020380.1|AXU36865.1|3771741_3772281_-|hypoxanthine-phosphoribosyltransferase MDIETKKWEVLYSEEKIKDKLRELGAIIEKDYKDKNLMVVSLLKGSFIFCADLVRNINLPLRVNFMTTSSYGNNEESTGKVKVVSDVTTDIAGYDVLVVDDITDSALTMDFVLKHLKAKNPASLKCCVLLDKPSRRKVDLVPDYCGFEIEDKFVVGYGFDFGDYYRNVPYIFNVTDEDR >CP020380.1|AXU36866.1|3772608_3773916_-|serine-dehydratase-subunit-alpha MRDIRKELVEMLKAEVKPAVGCTEPVALALACAKAKELLGEEIVENRMLVSPSIYKNGMCVGIPGTERLGLKIAAALGIVGGHSENGLSVLETLTKEEVKIAEDYMDNTPLSITPADTREKVFIEVVLKGKNHIAKVRIRTKHDNFTFLEKDGEVLLDNEPKVSASNDAAEKAESLMDTVTIQELIKNVEGIDFKDIEFLLDGVKMNEEMAEYGLKQKTGIGAGYGIKKSIEEGLLGNDVINYAMMLTAGASDARMAGVKMPVMSSNGSGNHGLTAILPIVAYNKKFPQSDERLAKALAISHLVTGYIKNYTGRLSAVCGCGVAASTGATAGISWLMNGTEKQIEGAIENMIADLSGMICDGAKAGCALKLSSAASAAIQSAIIAKQDCFVPPLNGIVGSSVEQSIQNLGRVSDKGMSITDEIILNVMNDMNKVD >CP020380.1|AXU36867.1|3774128_3774266_+|hypothetical-protein MTISQKDKKKSQNEILYHFETTQMYYFLTYKNHFLIHKKDYAKHL >CP020380.1|AXU36868.1|3774339_3776106_-|sigma-54-interacting-protein MIGLEYIKSDIQNIAEAIVSVLNIDVTIVNKELFRIAGTGVYIDKIGEKVDKYTAFKKSLTEQITILIDDPKSSDICRECYKSGACVEFAEVCCPIICDGDSHGVIGLIAFTKEQAQIIENNKSGLINFLGKMADLISNKLKAQIKTYELELEKKKLETLLNNMDKAVVSIDVDGKIDKYNSKFKELFNIKDSITGKNIFVELDFIKKPSINNFKKDKSCSFFYKRYGYDSKGIYNINKIVLKNELKGYVIDFIDKRDAIKNYNKMNKDYRIKLENIIGESVAIRNSKKEALIASKSTSTVLITGESGTGKELFARAIHNHSNRVDNPFIAVNCAAIPDNLLESELFGYEEGAFTGAKKGGKLGMFEVAHKGSIFLDEIGDMSLHLQSKLLRVLQEKELNKIGSKSNVSIDVRIIAATNKDLEKMVQNGTFREDLYYRLNVIPIKLPSLRERKEDIPLIIKHMVKEYSKKLDKNVIDIDSRVVDAMMEYKWPGNIRELQNIIEYSVNMSSSSIITMNVIPQKIKNTSVEELEVKSDRIIPLDELEKIEIIKALNKYKDYKKDKELTAKALGISRATLYRKIEKYNIIS >CP020380.1|AXU36869.1|3776326_3776896_-|Methyltransferase-domain-protein MKSILCQINKQPVKAKYTSDELECFLDTIEYNVGDKILLVGHIGNLGKRLRGLGTSVTILENSNYEDVCYSLVYNENCNVVKGKLEFLPFDDNQFNKIIIVDQFNVITDCEKASSEIQRVLKGNGEVILEDLNLKNLKVKLNYLKHKFCGSVAKIHYPHEVFNIFSRLNFDGMIKESNKLKYIYVGKRR >CP020380.1|AXU36870.1|3777079_3777715_-|single-stranded-DNA-binding-protein MIAVKDENNVVNLRGELDNKLEFSHEIFGEKFYNMKIKINRLSDSFDILPMTVSERLLQDIDLDKQNLVNVVGQLRSYNKTLNNKNRLVLTVFVREIKSIDEENKDPNSIFLDGYVCKEPVYRKTPLGREITDLLVAINRPYNKSDYIPSIVWGRNAKFAKNLKVGDRIQLWGRVQSREYEKKIDENNVVKKMAYEVSISKIKKLDENNNE >CP020380.1|AXU36871.1|3778381_3779263_-|Sulfite-exporter-TauE/SafE MVAILKALYVVFAAIFAVVFGKDVAKANKEGKLEEQSTPKVAVTGFITDFFDTLGIGSFAPTIAMSKALKLNIPDKKMPGTLNVAHTIPVVTEAFIFTSIIPVDGVTLVSMVVAAAVGSYIGAGIIAKMDERKIQLVMGVTLALTAILMLLGHPWINVLPGGGNELGLTGVKLVIGVIGNFILGALMTAGIGLYAPGMAMVYFLGMSAKVAFPIVMGSCALLMPVASMKFIKEDAYTKKASVIIAICGLIGVFVAAYIVKTLPMDILKALVIVVIAYTSATMIMAANKNKKTA >CP020380.1|AXU36872.1|3779382_3780390_-|proline-racemase MKFSRSIQAIDSHTAGEATRIVVGGIPNIKGNSMPEKKEYLEENLDYLRTAIMLEPRGHNDMFGSVMTQPCCPDADFGIIFMDGGGYLNMCGHGTIGAMTAAIETGVVPAVEPVTHVVMEAPAGIIRGDVTVVDGKAKEVSFLNVPAFLYKEGVEVDLPGVGTVKFDISFGGSFFAIIHASQLGLKIEPQNAGKLTELAMKLRDIINEKIEIQHPTLAHIKTVDLVEIYDEPTHPEATYKNVVIFGQGQVDRSPCGTGTSAKLATLHAKGELKVGEKFVYESILGTLFKGEIVEETKVADFNAVVPKITGSAYITGFNHFVIDEEDPLKHGFILK >CP020380.1|AXU36873.1|3780909_3781377_-|PrdE-protein MGIGPSTKETSLHHFRDPLLDIVESDKDVDLLGVIVVGTPDGNENKTFVGQRTAAWLEAMRVDGAIVSSDGWGNSHVDYANTFEEIGKRDIPVVGVTFNGTQAKFVVSNQYMDTIVDMNKSKEGIETEVVGENNTNEIDAKKALAFLKLKMRKHG >CP020380.1|AXU36874.1|3781391_3782150_-|PrdD-protein MEEKIMRRLVIKPFHMNEVNFGSKTSIKKDVLTIDLSSIDEIKEREELITDIKVDIIKPGDYDREINTIMDIIPISTKVLGRLGEGITHTLTGVYVMLTGADEDGNQMHEFGSSEGILKDQMVFGRYGTPSVEDYIIHVDVTLKGGLPFERTLPLAAFRACDDFIQEIRASLKMEDGRNATQVREYFDKIRPNAKKVVIVKQIAGQGAMYDNQLFSKEPSGFEGGTSIIDMGNVPMIISPNEYRDGALRAMT |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP020380_23 | 3830954-3831599 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP020380_23
|
9 spacers
spacers of CP020380_23
>23.1|3830984|35|CP020380|CRISPRCasFinder ACAATGTATGAGTGATGCTTTCAATGCTTTTAAAG >23.2|3831049|35|CP020380|CRISPRCasFinder AGTTTTTGATAACTTAAAATCTAGCTTTGCAGAGT >23.3|3831114|37|CP020380|CRISPRCasFinder CTAATGGGTGAAACATTTAAATATGTTGGTTCTATGG >23.4|3831181|37|CP020380|CRISPRCasFinder GCTACAAGTATAAGTGCTATGTTGCTACCAGTTGCTA >23.5|3831248|59|CP020380|CRISPRCasFinder ATTCCATATAGTTAATATAAAACTTGTTGAAGTGTTTTGTAACTCTCAAAAATGAAAAT >23.6|3831337|35|CP020380|CRISPRCasFinder GCAGCAGGATTATATGAAGCAGATGGTGGAGCATG >23.7|3831402|36|CP020380|CRISPRCasFinder GAGGTTTTTTAATGATATATTTTTACAGTGGAACTA >23.8|3831468|36|CP020380|CRISPRCasFinder GCTATTAAAAGAAAAAATGTGAACCGAGGTAGATAC >23.9|3831534|36|CP020380|CRISPRCasFinder ACACTTATCATCCCCTTACCTCTCATGAGGTTTTAA >23.10|3830983|38|CP020380|CRT CACAATGTATGAGTGATGCTTTCAATGCTTTTAAAGAA >23.11|3831048|38|CP020380|CRT TAGTTTTTGATAACTTAAAATCTAGCTTTGCAGAGTTC >23.12|3831113|40|CP020380|CRT TCTAATGGGTGAAACATTTAAATATGTTGGTTCTATGGGC >23.13|3831180|63|CP020380|CRT TGCTACAAGTATAAGTGCTATGTTGCTACCAGTTGCTATCTTTACATACCACATAGTTAATAA >23.14|3831270|39|CP020380|CRT CTTGTTGAAGTGTTTTGTAACTCTCAAAAATGAAAATAA >23.15|3831336|38|CP020380|CRT CGCAGCAGGATTATATGAAGCAGATGGTGGAGCATGGA >23.16|3831401|39|CP020380|CRT CGAGGTTTTTTAATGATATATTTTTACAGTGGAACTAAA >23.17|3831467|39|CP020380|CRT CGCTATTAAAAGAAAAAATGTGAACCGAGGTAGATACAA >23.18|3831533|39|CP020380|CRT CACACTTATCATCCCCTTACCTCTCATGAGGTTTTAAAA >23.19|3831049|37|CP020380|PILER-CR AGTTTTTGATAACTTAAAATCTAGCTTTGCAGAGTTC >23.20|3831114|39|CP020380|PILER-CR CTAATGGGTGAAACATTTAAATATGTTGGTTCTATGGGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP020380_23
The CRISPR arrays of CP020380_23 >merge|CP020380|23|3830954-3831599|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGTTTTGAATCCACTTAGTTAATATAAAACACAATGTATGAGTGATGCTTTCAATGCTTTTAAAGAATTTACATACCTCTTAGTTAATATAAAATAGTTTTTGATAACTTAAAATCTAGCTTTGCAGAGTTCTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAATCTAATGGGTGAAACATTTAAATATGTTGGTTCTATGGGCTTTACATACCACATAGTTAATATAAAATGCTACAAGTATAAGTGCTATGTTGCTACCAGTTGCTATCTTTACATACCACATAGTTAATAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTTGTTGAAGTGTTTTGTAACTCTCAAAAATGAAAATAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACGCAGCAGGATTATATGAAGCAGATGGTGGAGCATGGATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACGAGGTTTTTTAATGATATATTTTTACAGTGGAACTAAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACGCTATTAAAAGAAAAAATGTGAACCGAGGTAGATACAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACACACTTATCATCCCCTTACCTCTCATGAGGTTTTAAAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC >CP020380|23|22|3830954-3831599|CRISPRCasFinder AGTTTTGAATCCACTTAGTTAATATAAAAC ACAATGTATGAGTGATGCTTTCAATGCTTTTAAAG AATTTACATACCTCTTAGTTAATATAAAAT AGTTTTTGATAACTTAAAATCTAGCTTTGCAGAGT TCTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAT CTAATGGGTGAAACATTTAAATATGTTGGTTCTATGG GCTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAT GCTACAAGTATAAGTGCTATGTTGCTACCAGTTGCTA TCTTTACATACCACATAGTTAATAATTTAC ATTCCATATAGTTAATATAAAACTTGTTGAAGTGTTTTGTAACTCTCAAAAATGAAAAT AATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GCAGCAGGATTATATGAAGCAGATGGTGGAGCATG GATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GAGGTTTTTTAATGATATATTTTTACAGTGGAACTA AATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GCTATTAAAAGAAAAAATGTGAACCGAGGTAGATAC AATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC ACACTTATCATCCCCTTACCTCTCATGAGGTTTTAA AATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC >CP020380|23|9|3830956-3831598|CRT TTTTGAATCCACTTAGTTAATATAAAA CACAATGTATGAGTGATGCTTTCAATGCTTTTAAAGAA TTTACATACCTCTTAGTTAATATAAAA TAGTTTTTGATAACTTAAAATCTAGCTTTGCAGAGTTC TTTACATACCACTTAGTTAATATAAAA TCTAATGGGTGAAACATTTAAATATGTTGGTTCTATGGGC TTTACATACCACATAGTTAATATAAAA TGCTACAAGTATAAGTGCTATGTTGCTACCAGTTGCTATCTTTACATACCACATAGTTAATAA TTTACATTCCATATAGTTAATATAAAA CTTGTTGAAGTGTTTTGTAACTCTCAAAAATGAAAATAA TTTACATTCCATATAGTTAATATAAAA CGCAGCAGGATTATATGAAGCAGATGGTGGAGCATGGA TTTACATTCCATATAGTTAATATAAAA CGAGGTTTTTTAATGATATATTTTTACAGTGGAACTAAA TTTACATTCCATATAGTTAATATAAAA CGCTATTAAAAGAAAAAATGTGAACCGAGGTAGATACAA TTTACATTCCATATAGTTAATATAAAA CACACTTATCATCCCCTTACCTCTCATGAGGTTTTAAAA TTTACATTCCATATAGTTAATATAAAA >CP020380|23|6|3831021-3831180|PILER-CR TTTACATACCTCTTAGTTAATATAAAAT AGTTTTTGATAACTTAAAATCTAGCTTTGCAGAGTTC TTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAT CTAATGGGTGAAACATTTAAATATGTTGGTTCTATGGGC TTTACATACCACATAGTTAATATAAAAT
>CP020380.1|AXU36924.1|3830618_3830795_-|hypothetical-protein MPQKKMGRPTESVKDTMIRVRADKDTIDKLDECVNLLDSNRSEIIRKGIDKIYDDLKK >CP020380.1|AXU36923.1|3829674_3830493_-|prophage-antirepressor-related-protein MNELMNFEGKEIEIFEYNGQVLFNPYDCGRCLELSDSAIRNHLSKMNDTQAILLKNSAVLDKDIRKLNNAGEKFLTESGVYKLIFKSQKEEAEKFQDWISDEVLPAIRQTGAYITNNADPDKLREKASEIEKLQLAYNSTSMLKELLDDAGFDNKSKLLTAKTLYKKAGIDLPIEIDEEEHYFDTKQIASKLKIYSKSNKPAQMAVCEIIKKIKLEENEVKGVWETNGSWTGTVNKYTKSVIDKVRNWIEENNRPTKIQGEKKNFHVVYKIE >CP020380.1|AXU36922.1|3829411_3829615_-|hypothetical-protein MSENLLNEYNLKTDEDVEYFVKFANALYELKQNSGEKFQEYVKILREILREQQENENILDNILKTLT >CP020380.1|AXU36921.1|3829078_3829237_-|hypothetical-protein MDNFLQGVLASILASYIVYLISKLFRKRKKPLKAGTKSGWEFDFKIKFHKFK >CP020380.1|AXU36920.1|3828067_3828739_-|SH3-type-3-domain-containing-protein MVIDIYLKNEKEKIDFHFPVNPQDSLSIKKEKRFETVDIVNLGEFDIKKEGEKIREISFKTFLPNLYDASYCRYSELKNPIEVVAMLEKWVDQAEPLRLIVTGFSYNGLVTISSFSNTQTAGREEDRDIEITFRTYRELKIETLKKETKSSTKTDLKDNRPNNKTTTKIYTVKASDTLYKIAKNLLGKGSRWPEIYNIPENKKVIGKNPNVIKKGQKLVIPSK >CP020380.1|AXU36919.1|3827108_3828071_-|XkdQ-like-protein MKIILNGKYDIANFNEGITLSEAIDGVAYKMDVSLIEPKQLQDIGIKKGDKIVLIDIAYESKKEETIFDGVVWEARRSEKSKKLTLSCRERTVYMEESEEQYLFKENTATQRIEYYCKQWNIPYYNLANTGKKLAKVIHKTNILDMIKKDLKETASKGGDLFRVRMDNKLKLFKLGTNANVYKLDSILEDANFTSSFNDAVTSVKVLGKSKDENTKAPIIGTYKKDADKFGTLQKIKQDEKIKNAKEAKKAAEAMFNSGEETISVDCVVGINRIRAGDKVSLKGKEYYVIDVTHTLDSKPKMKLNVGTLDYIRRKFYTND >CP020380.1|AXU36918.1|3826750_3827116_-|hypothetical-protein MTDARFNGVARILKEKMNKSVNDGVFGIGCELAEITANGLKINGYKDEMQDYLVLENLTLKEDYFTFSDEVSSGEYRHKHKIETPKELKPLTIGDKVLVAVMGAEFVVIGRVVNAKPISSK >CP020380.1|AXU36917.1|3826314_3826776_-|XkdS-like-protein MPNLFPQNETFETVELKNNNENELDLKGSFLFDFEKGEFVKNADGTLKKCDKVQAYKQWCQKAILTPRYKRSAYSSVYGSEIKDLIASNLSQNAKELEITRLIKETILVHPYTKEVGEFNFNWLENSRLVEYEFDVLTIDDENITIDGNIKGR >CP020380.1|AXU36916.1|3825176_3826310_-|putative-baseplate-J-like-protein MERELPIPIFLTEDEDSVHERMLSNFQDVSTLEGDFIYDATRPTAEEITQLKQLGLQNNLKIAFPQTSYGTYLEWLGECKGVFKNQPTKSVGMITFTGVQGTIIKKGTILTTVATDEKQSIEFELLETKTIGENETVDIKAECRVAGITGNVSKGSISVLLGSINGIKSVTNKEDFKGGTDIEDEEHFRERVLVAEQEDKLSGASSDYIRWAKEVDGVGYAYVVPEWAGTGTVKGLILDKNRKAATQELINKVQEYIYPNVEDGQNRDGKAPIGAIVTIATPQTLLINVKASFVFLNGFSQETVLNILKNKIDKYLDKIDIGGTVSYNAIYSLTGSMMLADEGIQDFSSLTINDGTTNIILNDQVVGIGEIINEVIA >CP020380.1|AXU36915.1|3824409_3825180_-|XkdU-related-phage-protein MITSKKGREMLLTLSPIYEQSLVMSSIYEAIGSEFDNLELLNKEIELQLFPQSATWGLEFWENRVGLSTNIDEDIESRRRKVIAKLQMKYIVNPSRLATIIKSYTGTDVYIQEDIAAYTFKVTANVDDVVNYEDFKYITNKTKPSHLHWMPSFALKFTDIEKFEVKMINRIFIDFRGNISNFLDGMWLLNGSKNLSAYILYHEPVSLNMKNKLFVKESEVFTNLKVIIKKNLYYLDGIEVLNGNKLLNAELREEVL >CP020380.1|AXU36925.1|3831884_3832043_-|hypothetical-protein MDNFLQGILASLSASLIVYIASKLFRKRKKPLKAATKSGWEFDLKIKFHKTK >CP020380.1|AXU36926.1|3832261_3832663_+|phage-like-protein MKKDIYVYPAILSYDEDGISVEFPDLPGCYTCGDTTEEALKMAKETLGLHLYGMEEDDDIIPNATTIDNLNLEKNQIPTLIEIYMPIHRKAIENYSVKKTLTIPQWLNREAEKHKVNFSQILQEALKNHLNIH >CP020380.1|AXU36927.1|3832731_3833823_+|phage-integrase MNIKSAFIRKRGEKFHVYVEYVEEETGKKKQKSYGSYEKKKDAEKHLIEIKSTINNNKFITPNKITLVERCYKYIMANEKNWSPYTTVNRKSWVNNYIEPFFKDTKLIDINPSLLQFFINKSFNNSTSSSAKVRYNFLSSVLKEAYRLKEISENPCDFVKLPAKNVTSEIEIYNREETLLLIEKLNNSIIEMPILLMLLLGLRIGEVAGLRWSDVDLDNSVININQILIYANSKIIFKEPKTEKSKRTLSVPKELIEKLKIEKLKQNKMKLQGTLINENNLVCLNTNFNAWIPTALSKTFHNFIKRNNLRNIRVHDLRHTNASLLLLGGTNMKVVSERLGHTDIKITMNRYSHVLEEMDKEGF >CP020380.1|AXU36928.1|3834001_3834682_-|two-component-response-regulator MQTKILIIDGDKDNCQKLKGFLEEKGISIDLAYNCEEAIGKIFSNKYDLIFLEIILTDGDGWTLCKKIRNVTTCPIVYMTYINEDQSILNALNSGGDDYLIKPLNLEILYAKVKAILRRMNSYLNNNENNTKLEEYNRTSGVIKLEDKIIKLTPTENKLLNFFIENPEKTLTTKEIYEHVWMNEYLEDNYSVVVAVNGLRKKIEKDYKNPQKIITIRGAGYYFNKE >CP020380.1|AXU36929.1|3834731_3836708_-|two-component-sensor-histidine-kinase MIVSLLAITGLNLLYKYDNKYTYKSIRASNGILTIDNDTFTKGKLVFLIDDWEFYNHKIFKPNDFTKQDIKPEYVFIGQYPDFSMRKGNQSPYGNATYRMRIKNEGKDKLLSLELPEIFSASEVWINGEMVSKLGDVGTEKYRPKIKNSVVSFIAKKDTEIIINVSNFSHYYSGLYYPPALGETKDISNMMFYRLLFYSIICFTTFAIAIFSLSVWFLSNKSKLYLYFGCMCVFFAIHVSYPFVHLLGLPLVSFTYAVEDSSYFMVVLCIICINGSISKIEENKVYRFLILPLGITMSIISIVIPIILLPYDMYFVNIYGKLIDIYKYIVFIYILMSSLVSIYKKTCSEHISSYILVSVNTVFGISILFDAVTSNRFEPIFTGWQTEYCGFVIVILFSVMMINRNKIIIKENEKLTRNLEHEVEVRTNELTTLLNERKKFLADVAHDLKAPVSAIQAFIDLIKVGNIHVDEETRTYLYAINQKSNEVQNRVRSLQEFTSQDKSIGISEKICLNDFIKEIYENNLPDTQACGVNFETYVLEKKIYAKINKEMFTRAFENLIYNALTFTPFDGKIILSMDKEDGFAIIKISDNGKGIPPENIPKVFDRFFTERDNNEPKGQGLGLYIVKSIIREHGGEIFVDSELGKGTVFTIKLSLCFL >CP020380.1|AXU36930.1|3836818_3837496_-|two-component-response-regulator MYNLLVVDDDVDILNINQIYFSNIGFNVYTSETAKDAMDIVESIVLDCIILDISLPDIDGYKMCNDIKEKVNIPIIFLSNYEHEEEKVRGFLAGGDDYITKPYSLKELELRIYARMRQYKNITSVPNVLKFSALVINVNSRKVTFDGESIDLTTMEFEILLFLAENKEQVFSKIEIYNQVWKMPDIGDQHTVQVHIAQMRKKINSLSREHQYIQTVWGKGYKFVP >CP020380.1|AXU36931.1|3838390_3839233_-|phosphate-ABC-transporter-substrate-binding-protein MFKKKIGVLLASTMLVGALAVGCGSNSGGSGDSGDSSKVSVSGSTSIGPLMETIGEKFQEKNQGVSVEVQQIGSSGGIKNAIEGTSEIGMSSRDLKDEEKSAGLKETKIAIDGIALITNTANPVKNLTMDQVKGIYTGKITNWKEVGGNDAPIVIVSREEGSGTRDGFQEIVGFDSEELTKDAQISDGSGNIKTTVEGNENAIGYISFGYVDEKVNSLKINDVEATDANVIANKYPISRPFILVNKEDGLSEKGKALIDYILSDEGQALVSEKGFIKVNQ >CP020380.1|AXU36932.1|3839484_3841269_-|endopeptidase MGTDRSTIEEKYKWKIDKMYSSKEEIEKDISKVKNLIQEVKEYKGKLSESKENLYKVLNISENASRIVQNLYVYTHMKQHEDTRINDNQGRATKTEMLSTDLGVATSYIVPEILAIEENKLSEYLKDEKLSFYTKYIKDILRDKPHTLSEREEEILAATSELSTIPENVYDMLAYADMEFPEIEDEEGNKVKLSHSNYSLFIKSKNSRVRKDAFEGEFSTYEKYKNTFASTLYGGIKSEIFYAKTRKYNSAIEASLFSDDVSLDVYNNLISAIDKSIPNLNKYVELKKKFLGLSEIHMYDLYVPLTDKFDMDIPYDKAQDIILEALKPLGEKYLKVIKSAFDEGWIDVYDNEGKKGGAYSWGSYDSHPYILMSYKNDLNSLFTLIHELGHSVHSHYSRTSQPFLYSDYKIFVAEVASTLNELLLINYLLENSKSKDETIYLLNYYLEQFRTTVHRQTMFAEFEKIVHQRVESGEPLTADEFTNIYYKLNEKYYGKSAIVDKQIGIEWARIPHFYSNFYVYKYATGFSAASALSQQILSEGSTAVDRYINFLKSGGSEYPLEQLKSAGVDMTKKESIEEALNVFAELVNKLEKEL >CP020380.1|AXU36933.1|3841334_3842000_-|cation-transporter MIDIGSKEIAIRLLLALIIGGIIGLEREKIRQFAGFRTHILIAIGSCIVSITSIQLFFDYNLYTNADPARMPAQVLSGIGFLGAGAILKNKGGVKGLTTAAGMWATACIGIAVGYGYYELAILGGLFVMIALFVLRIINTFLFSQEKNVLILKLSNLDSIPFLYDKFEKNQLIVRNMEIECRNEEYWKVNFFVSYAKRIHLHDVMKEINMIEGVINVDYLD >CP020380.1|AXU36934.1|3842150_3842354_-|Spo0E-like-sporulation-regulatory-protein MYIKIYKFVIVVIIMANNELEALKNEIEAVREEINTYIEYPEIFQEELVESSKKIDILINKYMYLSK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP020380_1 | 1.1|31941|38|CP020380|CRISPRCasFinder | 31941-31978 | 38 | CP020380.1 | 4105958-4105995 | 0 | 1.0 |
CP020380_2 | 2.1|128816|34|CP020380|CRISPRCasFinder | 128816-128849 | 34 | CP020380.1 | 146256-146289 | 0 | 1.0 |
CP020380_2 | 2.1|128816|34|CP020380|CRISPRCasFinder | 128816-128849 | 34 | CP020380.1 | 1229318-1229351 | 0 | 1.0 |
CP020380_2 | 2.1|128816|34|CP020380|CRISPRCasFinder | 128816-128849 | 34 | CP020380.1 | 3970001-3970034 | 0 | 1.0 |
CP020380_2 | 2.1|128816|34|CP020380|CRISPRCasFinder | 128816-128849 | 34 | CP020380.1 | 4105950-4105983 | 0 | 1.0 |
CP020380_3 | 3.1|135706|34|CP020380|CRISPRCasFinder | 135706-135739 | 34 | CP020380.1 | 146256-146289 | 0 | 1.0 |
CP020380_3 | 3.1|135706|34|CP020380|CRISPRCasFinder | 135706-135739 | 34 | CP020380.1 | 1229318-1229351 | 0 | 1.0 |
CP020380_3 | 3.1|135706|34|CP020380|CRISPRCasFinder | 135706-135739 | 34 | CP020380.1 | 3970001-3970034 | 0 | 1.0 |
CP020380_3 | 3.1|135706|34|CP020380|CRISPRCasFinder | 135706-135739 | 34 | CP020380.1 | 4105950-4105983 | 0 | 1.0 |
CP020380_5 | 5.1|151711|34|CP020380|CRISPRCasFinder | 151711-151744 | 34 | CP020380.1 | 146256-146289 | 0 | 1.0 |
CP020380_5 | 5.1|151711|34|CP020380|CRISPRCasFinder | 151711-151744 | 34 | CP020380.1 | 1229318-1229351 | 0 | 1.0 |
CP020380_5 | 5.1|151711|34|CP020380|CRISPRCasFinder | 151711-151744 | 34 | CP020380.1 | 3970001-3970034 | 0 | 1.0 |
CP020380_5 | 5.1|151711|34|CP020380|CRISPRCasFinder | 151711-151744 | 34 | CP020380.1 | 4105950-4105983 | 0 | 1.0 |
CP020380_20 | 20.35|3462975|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3462975-3463011 | 37 | CP020380.1 | 315963-315999 | 0 | 1.0 |
CP020380_20 | 20.35|3462975|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3462975-3463011 | 37 | CP020380.1 | 1332244-1332280 | 0 | 1.0 |
CP020380_20 | 20.36|3463041|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3463041-3463077 | 37 | CP020380.1 | 272933-272969 | 0 | 1.0 |
CP020380_20 | 20.78|3463041|38|CP020380|PILER-CR | 3463041-3463078 | 38 | CP020380.1 | 272933-272970 | 0 | 1.0 |
CP020380_23 | 23.2|3831049|35|CP020380|CRISPRCasFinder | 3831049-3831083 | 35 | CP020380.1 | 3112870-3112904 | 0 | 1.0 |
CP020380_11 | 11.16|1946631|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1946631-1946667 | 37 | CP020380.1 | 277946-277982 | 1 | 0.973 |
CP020380_11 | 11.16|1946631|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1946631-1946667 | 37 | CP020380.1 | 1294692-1294728 | 1 | 0.973 |
CP020380_20 | 20.39|3463239|36|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3463239-3463274 | 36 | CP020380.1 | 287162-287197 | 1 | 0.972 |
CP020380_20 | 20.81|3463239|37|CP020380|PILER-CR | 3463239-3463275 | 37 | CP020380.1 | 287161-287197 | 1 | 0.973 |
CP020380_22 | 22.1|3771137|18|CP020380|CRT | 3771137-3771154 | 18 | CP020380.1 | 3771083-3771100 | 1 | 0.944 |
CP020380_11 | 11.6|1945976|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1945976-1946012 | 37 | CP020380.1 | 1312990-1313026 | 2 | 0.946 |
CP020380_22 | 22.2|3771182|27|CP020380|CRT | 3771182-3771208 | 27 | CP020380.1 | 3909103-3909129 | 2 | 0.926 |
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aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer **********************************
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aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer **********************************
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taacagcaataaagaacactaacaaaaaagctaaaag CRISPR spacer taacagcaataaagaacactaacaaaaaagctaaaag Protospacer *************************************
15. spacer 20.35|3462975|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 1332244-1332280, mismatch: 0, identity: 1.0
taacagcaataaagaacactaacaaaaaagctaaaag CRISPR spacer taacagcaataaagaacactaacaaaaaagctaaaag Protospacer *************************************
16. spacer 20.36|3463041|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 272933-272969, mismatch: 0, identity: 1.0
cttatttcaaagaaagatattgttataaaacaaaaaa CRISPR spacer cttatttcaaagaaagatattgttataaaacaaaaaa Protospacer *************************************
17. spacer 20.78|3463041|38|CP020380|PILER-CR matches to position: 272933-272970, mismatch: 0, identity: 1.0
cttatttcaaagaaagatattgttataaaacaaaaaaa CRISPR spacer cttatttcaaagaaagatattgttataaaacaaaaaaa Protospacer **************************************
18. spacer 23.2|3831049|35|CP020380|CRISPRCasFinder matches to position: 3112870-3112904, mismatch: 0, identity: 1.0
agtttttgataacttaaaatctagctttgcagagt CRISPR spacer agtttttgataacttaaaatctagctttgcagagt Protospacer ***********************************
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20. spacer 11.16|1946631|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 1294692-1294728, mismatch: 1, identity: 0.973
catgaacattctctataatatgtgtgttcttcaacta CRISPR spacer caagaacattctctataatatgtgtgttcttcaacta Protospacer ** **********************************
21. spacer 20.39|3463239|36|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 287162-287197, mismatch: 1, identity: 0.972
attttcaactcatcatctccaatatcatctttactt CRISPR spacer attttcaactcatcatctccaatgtcatctttactt Protospacer ***********************.************
22. spacer 20.81|3463239|37|CP020380|PILER-CR matches to position: 287161-287197, mismatch: 1, identity: 0.973
attttcaactcatcatctccaatatcatctttactta CRISPR spacer attttcaactcatcatctccaatgtcatctttactta Protospacer ***********************.*************
23. spacer 22.1|3771137|18|CP020380|CRT matches to position: 3771083-3771100, mismatch: 1, identity: 0.944
ccggttgctcctgtattt CRISPR spacer cctgttgctcctgtattt Protospacer ** ***************
24. spacer 11.6|1945976|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 1312990-1313026, mismatch: 2, identity: 0.946
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25. spacer 22.2|3771182|27|CP020380|CRT matches to position: 3909103-3909129, mismatch: 2, identity: 0.926
ccggttgccccagttgctcctgtattc CRISPR spacer ccagttgcccctgttgctcctgtattc Protospacer **.******** ***************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP020380_4 | 4.1|144242|29|CP020380|CRISPRCasFinder | 144242-144270 | 29 | NZ_CP033215 | Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence | 5105-5133 | 0 | 1.0 |
CP020380_10 | 10.5|1769666|38|CP020380|CRISPRCasFinder | 1769666-1769703 | 38 | NC_028838 | Clostridium phage phiCD506, complete genome | 24132-24169 | 0 | 1.0 |
CP020380_10 | 10.5|1769666|38|CP020380|CRISPRCasFinder | 1769666-1769703 | 38 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 29963-30000 | 0 | 1.0 |
CP020380_10 | 10.5|1769666|38|CP020380|CRISPRCasFinder | 1769666-1769703 | 38 | MK473382 | Clostridium phage JD032, complete genome | 10118-10155 | 0 | 1.0 |
CP020380_11 | 11.2|1945710|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1945710-1945746 | 37 | FN668942 | Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence | 30461-30497 | 0 | 1.0 |
CP020380_11 | 11.5|1945910|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1945910-1945946 | 37 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 25566-25602 | 0 | 1.0 |
CP020380_11 | 11.5|1945910|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1945910-1945946 | 37 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 36454-36490 | 0 | 1.0 |
CP020380_11 | 11.5|1945910|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1945910-1945946 | 37 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 25340-25376 | 0 | 1.0 |
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CP020380_20 | 20.73|3462711|38|CP020380|PILER-CR | 3462711-3462748 | 38 | HG531805 | Clostridium phage CDMH1 complete genome | 29324-29361 | 0 | 1.0 |
CP020380_20 | 20.73|3462711|38|CP020380|PILER-CR | 3462711-3462748 | 38 | NC_009231 | Clostridium phage phiC2, complete genome | 33485-33522 | 0 | 1.0 |
CP020380_20 | 20.73|3462711|38|CP020380|PILER-CR | 3462711-3462748 | 38 | JX145341 | Clostridium phage phiMMP02, complete genome | 30207-30244 | 0 | 1.0 |
CP020380_20 | 20.73|3462711|38|CP020380|PILER-CR | 3462711-3462748 | 38 | NC_011398 | Clostridium phage phiCD27, complete genome | 32744-32781 | 0 | 1.0 |
CP020380_20 | 20.73|3462711|38|CP020380|PILER-CR | 3462711-3462748 | 38 | NC_048642 | Clostridium phage CDKM9, complete genome | 31432-31469 | 0 | 1.0 |
CP020380_20 | 20.73|3462711|38|CP020380|PILER-CR | 3462711-3462748 | 38 | KX228400 | Clostridium phage CDKM15, complete genome | 32353-32390 | 0 | 1.0 |
CP020380_20 | 20.78|3463041|38|CP020380|PILER-CR | 3463041-3463078 | 38 | JX145341 | Clostridium phage phiMMP02, complete genome | 37071-37108 | 0 | 1.0 |
CP020380_20 | 20.81|3463239|37|CP020380|PILER-CR | 3463239-3463275 | 37 | LN681542 | Clostridium phage phiMMP03, complete genome | 692-728 | 0 | 1.0 |
CP020380_20 | 20.81|3463239|37|CP020380|PILER-CR | 3463239-3463275 | 37 | HG531805 | Clostridium phage CDMH1 complete genome | 605-641 | 0 | 1.0 |
CP020380_20 | 20.81|3463239|37|CP020380|PILER-CR | 3463239-3463275 | 37 | NC_009231 | Clostridium phage phiC2, complete genome | 723-759 | 0 | 1.0 |
CP020380_20 | 20.81|3463239|37|CP020380|PILER-CR | 3463239-3463275 | 37 | NC_009231 | Clostridium phage phiC2, complete genome | 56491-56527 | 0 | 1.0 |
CP020380_20 | 20.81|3463239|37|CP020380|PILER-CR | 3463239-3463275 | 37 | LN681541 | Clostridium phage phiMMP01, complete genome | 692-728 | 0 | 1.0 |
CP020380_23 | 23.6|3831337|35|CP020380|CRISPRCasFinder | 3831337-3831371 | 35 | NZ_CP020425 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence | 37117-37151 | 0 | 1.0 |
CP020380_23 | 23.6|3831337|35|CP020380|CRISPRCasFinder | 3831337-3831371 | 35 | FN668942 | Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence | 35851-35885 | 0 | 1.0 |
CP020380_23 | 23.6|3831337|35|CP020380|CRISPRCasFinder | 3831337-3831371 | 35 | NZ_CP011969 | Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence | 32439-32473 | 0 | 1.0 |
CP020380_23 | 23.6|3831337|35|CP020380|CRISPRCasFinder | 3831337-3831371 | 35 | NZ_CP029156 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed2, complete sequence | 8675-8709 | 0 | 1.0 |
CP020380_23 | 23.6|3831337|35|CP020380|CRISPRCasFinder | 3831337-3831371 | 35 | NZ_CP029153 | Clostridioides difficile strain CDT4 plasmid unnamed1, complete sequence | 2719-2753 | 0 | 1.0 |
CP020380_2 | 2.1|128816|34|CP020380|CRISPRCasFinder | 128816-128849 | 34 | NZ_CP033215 | Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence | 3086-3119 | 1 | 0.971 |
CP020380_3 | 3.1|135706|34|CP020380|CRISPRCasFinder | 135706-135739 | 34 | NZ_CP033215 | Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence | 3086-3119 | 1 | 0.971 |
CP020380_5 | 5.1|151711|34|CP020380|CRISPRCasFinder | 151711-151744 | 34 | NZ_CP033215 | Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence | 3086-3119 | 1 | 0.971 |
CP020380_9 | 9.1|1661727|38|CP020380|CRISPRCasFinder | 1661727-1661764 | 38 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 127-164 | 1 | 0.974 |
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CP020380_10 | 10.1|1769665|39|CP020380|PILER-CR,CRT | 1769665-1769703 | 39 | NC_028838 | Clostridium phage phiCD506, complete genome | 24131-24169 | 1 | 0.974 |
CP020380_10 | 10.1|1769665|39|CP020380|PILER-CR,CRT | 1769665-1769703 | 39 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 29962-30000 | 1 | 0.974 |
CP020380_10 | 10.2|1769732|38|CP020380|PILER-CR,CRT | 1769732-1769769 | 38 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 36663-36700 | 1 | 0.974 |
CP020380_10 | 10.6|1769733|37|CP020380|CRISPRCasFinder | 1769733-1769769 | 37 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 36664-36700 | 1 | 0.973 |
CP020380_11 | 11.7|1946042|36|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1946042-1946077 | 36 | MF547662 | Clostridioides phage LIBA6276, complete genome | 11889-11924 | 1 | 0.972 |
CP020380_11 | 11.7|1946042|36|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1946042-1946077 | 36 | MF547663 | Clostridioides phage LIBA2945, complete genome | 11889-11924 | 1 | 0.972 |
CP020380_11 | 11.8|1946107|36|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1946107-1946142 | 36 | MF547662 | Clostridioides phage LIBA6276, complete genome | 103999-104034 | 1 | 0.972 |
CP020380_11 | 11.8|1946107|36|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1946107-1946142 | 36 | MF547663 | Clostridioides phage LIBA2945, complete genome | 102539-102574 | 1 | 0.972 |
CP020380_11 | 11.12|1946370|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1946370-1946406 | 37 | MF547662 | Clostridioides phage LIBA6276, complete genome | 3466-3502 | 1 | 0.973 |
CP020380_11 | 11.12|1946370|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1946370-1946406 | 37 | MF547663 | Clostridioides phage LIBA2945, complete genome | 3466-3502 | 1 | 0.973 |
CP020380_13 | 13.1|2895037|36|CP020380|PILER-CR,CRT | 2895037-2895072 | 36 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 12396-12431 | 1 | 0.972 |
CP020380_13 | 13.4|2895038|35|CP020380|CRISPRCasFinder | 2895038-2895072 | 35 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 12397-12431 | 1 | 0.971 |
CP020380_14 | 14.4|3108298|38|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3108298-3108335 | 38 | LN681539 | Clostridium phage phiCD505, complete genome | 14366-14403 | 1 | 0.974 |
CP020380_14 | 14.4|3108298|38|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3108298-3108335 | 38 | NC_048642 | Clostridium phage CDKM9, complete genome | 14304-14341 | 1 | 0.974 |
CP020380_20 | 20.9|3461265|36|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3461265-3461300 | 36 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 22095-22130 | 1 | 0.972 |
CP020380_20 | 20.19|3461919|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3461919-3461955 | 37 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 19780-19816 | 1 | 0.973 |
CP020380_20 | 20.19|3461919|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3461919-3461955 | 37 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 19276-19312 | 1 | 0.973 |
CP020380_20 | 20.19|3461919|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3461919-3461955 | 37 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 19285-19321 | 1 | 0.973 |
CP020380_20 | 20.19|3461919|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3461919-3461955 | 37 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 621-657 | 1 | 0.973 |
CP020380_20 | 20.20|3461985|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3461985-3462021 | 37 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 28593-28629 | 1 | 0.973 |
CP020380_20 | 20.23|3462183|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3462183-3462219 | 37 | NC_048665 | Clostridium phage phiCDHM14, complete genome | 23380-23416 | 1 | 0.973 |
CP020380_20 | 20.23|3462183|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3462183-3462219 | 37 | MK473382 | Clostridium phage JD032, complete genome | 10298-10334 | 1 | 0.973 |
CP020380_20 | 20.23|3462183|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3462183-3462219 | 37 | NC_028838 | Clostridium phage phiCD506, complete genome | 23953-23989 | 1 | 0.973 |
CP020380_20 | 20.23|3462183|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3462183-3462219 | 37 | HG796225 | Clostridium phage phiCDHM13 complete genome | 22881-22917 | 1 | 0.973 |
CP020380_20 | 20.23|3462183|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3462183-3462219 | 37 | LN681538 | Clostridium phage phiCD481-1, complete genome | 22620-22656 | 1 | 0.973 |
CP020380_20 | 20.23|3462183|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3462183-3462219 | 37 | HG798901 | Clostridium phage phiCDHM11 complete genome | 22880-22916 | 1 | 0.973 |
CP020380_20 | 20.28|3462512|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3462512-3462548 | 37 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 4750-4786 | 1 | 0.973 |
CP020380_20 | 20.35|3462975|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3462975-3463011 | 37 | NC_048665 | Clostridium phage phiCDHM14, complete genome | 20206-20242 | 1 | 0.973 |
CP020380_20 | 20.35|3462975|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3462975-3463011 | 37 | HG796225 | Clostridium phage phiCDHM13 complete genome | 19706-19742 | 1 | 0.973 |
CP020380_20 | 20.35|3462975|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3462975-3463011 | 37 | HG798901 | Clostridium phage phiCDHM11 complete genome | 19705-19741 | 1 | 0.973 |
CP020380_20 | 20.49|3461134|36|CP020380|PILER-CR | 3461134-3461169 | 36 | FN668942 | Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence | 29555-29590 | 1 | 0.972 |
CP020380_20 | 20.56|3461591|38|CP020380|PILER-CR | 3461591-3461628 | 38 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 26722-26759 | 1 | 0.974 |
CP020380_20 | 20.61|3461919|38|CP020380|PILER-CR | 3461919-3461956 | 38 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 19748-19785 | 1 | 0.974 |
CP020380_20 | 20.62|3461985|38|CP020380|PILER-CR | 3461985-3462022 | 38 | MK473382 | Clostridium phage JD032, complete genome | 11727-11764 | 1 | 0.974 |
CP020380_20 | 20.62|3461985|38|CP020380|PILER-CR | 3461985-3462022 | 38 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 32922-32959 | 1 | 0.974 |
CP020380_20 | 20.62|3461985|38|CP020380|PILER-CR | 3461985-3462022 | 38 | NC_048665 | Clostridium phage phiCDHM14, complete genome | 22701-22738 | 1 | 0.974 |
CP020380_20 | 20.62|3461985|38|CP020380|PILER-CR | 3461985-3462022 | 38 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 29097-29134 | 1 | 0.974 |
CP020380_20 | 20.62|3461985|38|CP020380|PILER-CR | 3461985-3462022 | 38 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 28871-28908 | 1 | 0.974 |
CP020380_20 | 20.62|3461985|38|CP020380|PILER-CR | 3461985-3462022 | 38 | NC_028838 | Clostridium phage phiCD506, complete genome | 22522-22559 | 1 | 0.974 |
CP020380_20 | 20.62|3461985|38|CP020380|PILER-CR | 3461985-3462022 | 38 | HG796225 | Clostridium phage phiCDHM13 complete genome | 22201-22238 | 1 | 0.974 |
CP020380_20 | 20.62|3461985|38|CP020380|PILER-CR | 3461985-3462022 | 38 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 28155-28192 | 1 | 0.974 |
CP020380_20 | 20.62|3461985|38|CP020380|PILER-CR | 3461985-3462022 | 38 | LN681538 | Clostridium phage phiCD481-1, complete genome | 21941-21978 | 1 | 0.974 |
CP020380_20 | 20.62|3461985|38|CP020380|PILER-CR | 3461985-3462022 | 38 | HG798901 | Clostridium phage phiCDHM11 complete genome | 22201-22238 | 1 | 0.974 |
CP020380_20 | 20.65|3462183|38|CP020380|PILER-CR | 3462183-3462220 | 38 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 31489-31526 | 1 | 0.974 |
CP020380_20 | 20.65|3462183|38|CP020380|PILER-CR | 3462183-3462220 | 38 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 30530-30567 | 1 | 0.974 |
CP020380_20 | 20.65|3462183|38|CP020380|PILER-CR | 3462183-3462220 | 38 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 30022-30059 | 1 | 0.974 |
CP020380_20 | 20.65|3462183|38|CP020380|PILER-CR | 3462183-3462220 | 38 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 29783-29820 | 1 | 0.974 |
CP020380_20 | 20.70|3462512|38|CP020380|PILER-CR | 3462512-3462549 | 38 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 4749-4786 | 1 | 0.974 |
CP020380_20 | 20.71|3462578|39|CP020380|PILER-CR | 3462578-3462616 | 39 | JX145342 | Clostridium phage phiMMP04, complete genome | 9280-9318 | 1 | 0.974 |
CP020380_20 | 20.72|3462645|38|CP020380|PILER-CR | 3462645-3462682 | 38 | AY855346 | Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome | 10806-10843 | 1 | 0.974 |
CP020380_20 | 20.72|3462645|38|CP020380|PILER-CR | 3462645-3462682 | 38 | NC_007917 | Clostridium phage phi CD119, complete genome | 10806-10843 | 1 | 0.974 |
CP020380_20 | 20.72|3462645|38|CP020380|PILER-CR | 3462645-3462682 | 38 | NC_028996 | Clostridium phage phiCDHM19, complete genome | 11052-11089 | 1 | 0.974 |
CP020380_20 | 20.75|3462843|37|CP020380|PILER-CR | 3462843-3462879 | 37 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 19426-19462 | 1 | 0.973 |
CP020380_20 | 20.75|3462843|37|CP020380|PILER-CR | 3462843-3462879 | 37 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 18922-18958 | 1 | 0.973 |
CP020380_20 | 20.75|3462843|37|CP020380|PILER-CR | 3462843-3462879 | 37 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 18931-18967 | 1 | 0.973 |
CP020380_20 | 20.75|3462843|37|CP020380|PILER-CR | 3462843-3462879 | 37 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 975-1011 | 1 | 0.973 |
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CP020380_23 | 23.2|3831049|35|CP020380|CRISPRCasFinder | 3831049-3831083 | 35 | KX228400 | Clostridium phage CDKM15, complete genome | 15316-15350 | 1 | 0.971 |
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CP020380_23 | 23.15|3831336|38|CP020380|CRT | 3831336-3831373 | 38 | NZ_CP029156 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed2, complete sequence | 8673-8710 | 1 | 0.974 |
CP020380_23 | 23.15|3831336|38|CP020380|CRT | 3831336-3831373 | 38 | NZ_CP029153 | Clostridioides difficile strain CDT4 plasmid unnamed1, complete sequence | 2717-2754 | 1 | 0.974 |
CP020380_23 | 23.15|3831336|38|CP020380|CRT | 3831336-3831373 | 38 | NZ_CP020425 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence | 37116-37153 | 1 | 0.974 |
CP020380_23 | 23.15|3831336|38|CP020380|CRT | 3831336-3831373 | 38 | FN668942 | Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence | 35850-35887 | 1 | 0.974 |
CP020380_23 | 23.15|3831336|38|CP020380|CRT | 3831336-3831373 | 38 | NZ_CP011969 | Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence | 32438-32475 | 1 | 0.974 |
CP020380_1 | 1.1|31941|38|CP020380|CRISPRCasFinder | 31941-31978 | 38 | NZ_CP033215 | Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence | 3094-3131 | 2 | 0.947 |
CP020380_11 | 11.15|1946567|35|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1946567-1946601 | 35 | MK473382 | Clostridium phage JD032, complete genome | 15887-15921 | 2 | 0.943 |
CP020380_13 | 13.2|2895102|37|CP020380|PILER-CR,CRT | 2895102-2895138 | 37 | JX145342 | Clostridium phage phiMMP04, complete genome | 20116-20152 | 2 | 0.946 |
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CP020380_13 | 13.3|2895168|38|CP020380|PILER-CR,CRT | 2895168-2895205 | 38 | FN668942 | Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence | 28308-28345 | 2 | 0.947 |
CP020380_13 | 13.3|2895168|38|CP020380|PILER-CR,CRT | 2895168-2895205 | 38 | NZ_CP011969 | Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence | 24986-25023 | 2 | 0.947 |
CP020380_13 | 13.5|2895103|36|CP020380|CRISPRCasFinder | 2895103-2895138 | 36 | JX145342 | Clostridium phage phiMMP04, complete genome | 20116-20151 | 2 | 0.944 |
CP020380_13 | 13.6|2895169|37|CP020380|CRISPRCasFinder | 2895169-2895205 | 37 | NZ_CP020425 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence | 29665-29701 | 2 | 0.946 |
CP020380_13 | 13.6|2895169|37|CP020380|CRISPRCasFinder | 2895169-2895205 | 37 | FN668942 | Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence | 28309-28345 | 2 | 0.946 |
CP020380_13 | 13.6|2895169|37|CP020380|CRISPRCasFinder | 2895169-2895205 | 37 | NZ_CP011969 | Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence | 24987-25023 | 2 | 0.946 |
CP020380_20 | 20.9|3461265|36|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3461265-3461300 | 36 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 22355-22390 | 2 | 0.944 |
CP020380_20 | 20.9|3461265|36|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3461265-3461300 | 36 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 21851-21886 | 2 | 0.944 |
CP020380_20 | 20.9|3461265|36|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3461265-3461300 | 36 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 21413-21448 | 2 | 0.944 |
CP020380_20 | 20.9|3461265|36|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3461265-3461300 | 36 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 39666-39701 | 2 | 0.944 |
CP020380_20 | 20.10|3461330|33|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3461330-3461362 | 33 | MF547662 | Clostridioides phage LIBA6276, complete genome | 115468-115500 | 2 | 0.939 |
CP020380_20 | 20.10|3461330|33|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3461330-3461362 | 33 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 27134-27166 | 2 | 0.939 |
CP020380_20 | 20.10|3461330|33|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3461330-3461362 | 33 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 34890-34922 | 2 | 0.939 |
CP020380_20 | 20.10|3461330|33|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3461330-3461362 | 33 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 26908-26940 | 2 | 0.939 |
CP020380_20 | 20.10|3461330|33|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3461330-3461362 | 33 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 26630-26662 | 2 | 0.939 |
CP020380_20 | 20.10|3461330|33|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3461330-3461362 | 33 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 26192-26224 | 2 | 0.939 |
CP020380_20 | 20.11|3461392|38|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3461392-3461429 | 38 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 26968-27005 | 2 | 0.947 |
CP020380_20 | 20.11|3461392|38|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3461392-3461429 | 38 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 35051-35088 | 2 | 0.947 |
CP020380_20 | 20.11|3461392|38|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3461392-3461429 | 38 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 26742-26779 | 2 | 0.947 |
CP020380_20 | 20.11|3461392|38|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3461392-3461429 | 38 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 26464-26501 | 2 | 0.947 |
CP020380_20 | 20.11|3461392|38|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3461392-3461429 | 38 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 26026-26063 | 2 | 0.947 |
CP020380_20 | 20.12|3461459|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3461459-3461495 | 37 | LN681542 | Clostridium phage phiMMP03, complete genome | 2419-2455 | 2 | 0.946 |
CP020380_20 | 20.12|3461459|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3461459-3461495 | 37 | HG531805 | Clostridium phage CDMH1 complete genome | 2332-2368 | 2 | 0.946 |
CP020380_20 | 20.12|3461459|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3461459-3461495 | 37 | NC_009231 | Clostridium phage phiC2, complete genome | 2450-2486 | 2 | 0.946 |
CP020380_20 | 20.12|3461459|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3461459-3461495 | 37 | LN681541 | Clostridium phage phiMMP01, complete genome | 2419-2455 | 2 | 0.946 |
CP020380_20 | 20.12|3461459|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3461459-3461495 | 37 | AY522340 | Clostridium difficile phage phiC2 isolate RW11 portal protein and hypothetical protein genes, complete cds | 89-125 | 2 | 0.946 |
CP020380_20 | 20.24|3462249|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3462249-3462285 | 37 | LN681534 | Clostridium phage phiCD24-1, complete genome | 24273-24309 | 2 | 0.946 |
CP020380_20 | 20.24|3462249|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3462249-3462285 | 37 | MN718463 | Clostridium phage phiCDKH01, complete genome | 44007-44043 | 2 | 0.946 |
CP020380_20 | 20.33|3462843|36|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3462843-3462878 | 36 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 19397-19432 | 2 | 0.944 |
CP020380_20 | 20.35|3462975|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3462975-3463011 | 37 | MK473382 | Clostridium phage JD032, complete genome | 14177-14213 | 2 | 0.946 |
CP020380_20 | 20.51|3461265|37|CP020380|PILER-CR | 3461265-3461301 | 37 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 22094-22130 | 2 | 0.946 |
CP020380_20 | 20.52|3461330|34|CP020380|PILER-CR | 3461330-3461363 | 34 | MF547662 | Clostridioides phage LIBA6276, complete genome | 115467-115500 | 2 | 0.941 |
CP020380_20 | 20.52|3461330|34|CP020380|PILER-CR | 3461330-3461363 | 34 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 27134-27167 | 2 | 0.941 |
CP020380_20 | 20.52|3461330|34|CP020380|PILER-CR | 3461330-3461363 | 34 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 34889-34922 | 2 | 0.941 |
CP020380_20 | 20.52|3461330|34|CP020380|PILER-CR | 3461330-3461363 | 34 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 26908-26941 | 2 | 0.941 |
CP020380_20 | 20.52|3461330|34|CP020380|PILER-CR | 3461330-3461363 | 34 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 26630-26663 | 2 | 0.941 |
CP020380_20 | 20.52|3461330|34|CP020380|PILER-CR | 3461330-3461363 | 34 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 26192-26225 | 2 | 0.941 |
CP020380_20 | 20.61|3461919|38|CP020380|PILER-CR | 3461919-3461956 | 38 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 19780-19817 | 2 | 0.947 |
CP020380_20 | 20.61|3461919|38|CP020380|PILER-CR | 3461919-3461956 | 38 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 19276-19313 | 2 | 0.947 |
CP020380_20 | 20.61|3461919|38|CP020380|PILER-CR | 3461919-3461956 | 38 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 19285-19322 | 2 | 0.947 |
CP020380_20 | 20.61|3461919|38|CP020380|PILER-CR | 3461919-3461956 | 38 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 620-657 | 2 | 0.947 |
CP020380_20 | 20.62|3461985|38|CP020380|PILER-CR | 3461985-3462022 | 38 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 28593-28630 | 2 | 0.947 |
CP020380_20 | 20.65|3462183|38|CP020380|PILER-CR | 3462183-3462220 | 38 | MK473382 | Clostridium phage JD032, complete genome | 10298-10335 | 2 | 0.947 |
CP020380_20 | 20.65|3462183|38|CP020380|PILER-CR | 3462183-3462220 | 38 | NC_048665 | Clostridium phage phiCDHM14, complete genome | 23379-23416 | 2 | 0.947 |
CP020380_20 | 20.65|3462183|38|CP020380|PILER-CR | 3462183-3462220 | 38 | NC_028838 | Clostridium phage phiCD506, complete genome | 23952-23989 | 2 | 0.947 |
CP020380_20 | 20.65|3462183|38|CP020380|PILER-CR | 3462183-3462220 | 38 | HG796225 | Clostridium phage phiCDHM13 complete genome | 22880-22917 | 2 | 0.947 |
CP020380_20 | 20.65|3462183|38|CP020380|PILER-CR | 3462183-3462220 | 38 | LN681538 | Clostridium phage phiCD481-1, complete genome | 22619-22656 | 2 | 0.947 |
CP020380_20 | 20.65|3462183|38|CP020380|PILER-CR | 3462183-3462220 | 38 | HG798901 | Clostridium phage phiCDHM11 complete genome | 22879-22916 | 2 | 0.947 |
CP020380_20 | 20.77|3462975|38|CP020380|PILER-CR | 3462975-3463012 | 38 | NC_048665 | Clostridium phage phiCDHM14, complete genome | 20206-20243 | 2 | 0.947 |
CP020380_20 | 20.77|3462975|38|CP020380|PILER-CR | 3462975-3463012 | 38 | HG796225 | Clostridium phage phiCDHM13 complete genome | 19706-19743 | 2 | 0.947 |
CP020380_20 | 20.77|3462975|38|CP020380|PILER-CR | 3462975-3463012 | 38 | HG798901 | Clostridium phage phiCDHM11 complete genome | 19705-19742 | 2 | 0.947 |
CP020380_23 | 23.2|3831049|35|CP020380|CRISPRCasFinder | 3831049-3831083 | 35 | LN681539 | Clostridium phage phiCD505, complete genome | 15224-15258 | 2 | 0.943 |
CP020380_23 | 23.2|3831049|35|CP020380|CRISPRCasFinder | 3831049-3831083 | 35 | NC_048642 | Clostridium phage CDKM9, complete genome | 15162-15196 | 2 | 0.943 |
CP020380_23 | 23.14|3831270|39|CP020380|CRT | 3831270-3831308 | 39 | LN681539 | Clostridium phage phiCD505, complete genome | 42100-42138 | 2 | 0.949 |
CP020380_23 | 23.14|3831270|39|CP020380|CRT | 3831270-3831308 | 39 | AY855346 | Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome | 43071-43109 | 2 | 0.949 |
CP020380_23 | 23.14|3831270|39|CP020380|CRT | 3831270-3831308 | 39 | NC_007917 | Clostridium phage phi CD119, complete genome | 43071-43109 | 2 | 0.949 |
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CP020380_11 | 11.13|1946436|36|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1946436-1946471 | 36 | LN681539 | Clostridium phage phiCD505, complete genome | 42378-42413 | 3 | 0.917 |
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CP020380_13 | 13.6|2895169|37|CP020380|CRISPRCasFinder | 2895169-2895205 | 37 | NZ_CP029153 | Clostridioides difficile strain CDT4 plasmid unnamed1, complete sequence | 11120-11156 | 3 | 0.919 |
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CP020380_20 | 20.54|3461459|38|CP020380|PILER-CR | 3461459-3461496 | 38 | HG531805 | Clostridium phage CDMH1 complete genome | 2331-2368 | 3 | 0.921 |
CP020380_20 | 20.54|3461459|38|CP020380|PILER-CR | 3461459-3461496 | 38 | NC_009231 | Clostridium phage phiC2, complete genome | 2449-2486 | 3 | 0.921 |
CP020380_20 | 20.54|3461459|38|CP020380|PILER-CR | 3461459-3461496 | 38 | LN681541 | Clostridium phage phiMMP01, complete genome | 2418-2455 | 3 | 0.921 |
CP020380_20 | 20.54|3461459|38|CP020380|PILER-CR | 3461459-3461496 | 38 | AY522340 | Clostridium difficile phage phiC2 isolate RW11 portal protein and hypothetical protein genes, complete cds | 88-125 | 3 | 0.921 |
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CP020380_20 | 20.66|3462249|38|CP020380|PILER-CR | 3462249-3462286 | 38 | MN718463 | Clostridium phage phiCDKH01, complete genome | 44006-44043 | 3 | 0.921 |
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CP020380_23 | 23.19|3831049|37|CP020380|PILER-CR | 3831049-3831085 | 37 | NC_048642 | Clostridium phage CDKM9, complete genome | 15162-15198 | 3 | 0.919 |
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CP020380_22 | 22.2|3771182|27|CP020380|CRT | 3771182-3771208 | 27 | CP011076 | Brevibacillus laterosporus strain B9 plasmid unnamed2, complete sequence | 251910-251936 | 4 | 0.852 |
CP020380_22 | 22.2|3771182|27|CP020380|CRT | 3771182-3771208 | 27 | MN693514 | Marine virus AFVG_25M225, complete genome | 17808-17834 | 4 | 0.852 |
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CP020380_23 | 23.11|3831048|38|CP020380|CRT | 3831048-3831085 | 38 | NC_048642 | Clostridium phage CDKM9, complete genome | 15161-15198 | 4 | 0.895 |
CP020380_23 | 23.14|3831270|39|CP020380|CRT | 3831270-3831308 | 39 | HG531805 | Clostridium phage CDMH1 complete genome | 45252-45290 | 4 | 0.897 |
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CP020380_20 | 20.29|3462578|38|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3462578-3462615 | 38 | HG798901 | Clostridium phage phiCDHM11 complete genome | 9262-9299 | 5 | 0.868 |
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CP020380_22 | 22.2|3771182|27|CP020380|CRT | 3771182-3771208 | 27 | NZ_CP053689 | Arthrobacter citreus strain NEB 577 plasmid unnamed1, complete sequence | 173305-173331 | 5 | 0.815 |
CP020380_22 | 22.2|3771182|27|CP020380|CRT | 3771182-3771208 | 27 | CP011076 | Brevibacillus laterosporus strain B9 plasmid unnamed2, complete sequence | 251982-252008 | 5 | 0.815 |
CP020380_22 | 22.2|3771182|27|CP020380|CRT | 3771182-3771208 | 27 | CP011076 | Brevibacillus laterosporus strain B9 plasmid unnamed2, complete sequence | 252000-252026 | 5 | 0.815 |
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CP020380_23 | 23.14|3831270|39|CP020380|CRT | 3831270-3831308 | 39 | KX228400 | Clostridium phage CDKM15, complete genome | 44411-44449 | 5 | 0.872 |
CP020380_23 | 23.14|3831270|39|CP020380|CRT | 3831270-3831308 | 39 | NC_028996 | Clostridium phage phiCDHM19, complete genome | 44930-44968 | 5 | 0.872 |
CP020380_23 | 23.14|3831270|39|CP020380|CRT | 3831270-3831308 | 39 | NC_011398 | Clostridium phage phiCD27, complete genome | 42978-43016 | 5 | 0.872 |
CP020380_4 | 4.1|144242|29|CP020380|CRISPRCasFinder | 144242-144270 | 29 | KY971610 | Pseudomonas phage PspYZU05, complete genome | 134239-134267 | 6 | 0.793 |
CP020380_20 | 20.65|3462183|38|CP020380|PILER-CR | 3462183-3462220 | 38 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 30325-30362 | 6 | 0.842 |
CP020380_20 | 20.71|3462578|39|CP020380|PILER-CR | 3462578-3462616 | 39 | NC_048665 | Clostridium phage phiCDHM14, complete genome | 9294-9332 | 6 | 0.846 |
CP020380_20 | 20.71|3462578|39|CP020380|PILER-CR | 3462578-3462616 | 39 | NC_028838 | Clostridium phage phiCD506, complete genome | 9720-9758 | 6 | 0.846 |
CP020380_20 | 20.71|3462578|39|CP020380|PILER-CR | 3462578-3462616 | 39 | HG796225 | Clostridium phage phiCDHM13 complete genome | 9262-9300 | 6 | 0.846 |
CP020380_20 | 20.71|3462578|39|CP020380|PILER-CR | 3462578-3462616 | 39 | LN681538 | Clostridium phage phiCD481-1, complete genome | 9747-9785 | 6 | 0.846 |
CP020380_20 | 20.71|3462578|39|CP020380|PILER-CR | 3462578-3462616 | 39 | HG798901 | Clostridium phage phiCDHM11 complete genome | 9261-9299 | 6 | 0.846 |
CP020380_20 | 20.71|3462578|39|CP020380|PILER-CR | 3462578-3462616 | 39 | MK473382 | Clostridium phage JD032, complete genome | 25380-25418 | 6 | 0.846 |
CP020380_22 | 22.2|3771182|27|CP020380|CRT | 3771182-3771208 | 27 | NZ_CP039340 | Ralstonia solanacearum strain UW386 plasmid pUW386, complete sequence | 1500640-1500666 | 6 | 0.778 |
CP020380_22 | 22.2|3771182|27|CP020380|CRT | 3771182-3771208 | 27 | CP024687 | Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-3-257K, complete sequence | 236002-236028 | 6 | 0.778 |
CP020380_22 | 22.2|3771182|27|CP020380|CRT | 3771182-3771208 | 27 | NZ_CP009336 | Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence | 71554-71580 | 6 | 0.778 |
CP020380_23 | 23.14|3831270|39|CP020380|CRT | 3831270-3831308 | 39 | AY855346 | Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome | 41918-41956 | 7 | 0.821 |
CP020380_23 | 23.14|3831270|39|CP020380|CRT | 3831270-3831308 | 39 | NC_007917 | Clostridium phage phi CD119, complete genome | 41918-41956 | 7 | 0.821 |
CP020380_10 | 10.7|1769799|36|CP020380|CRISPRCasFinder | 1769799-1769834 | 36 | MK448930 | Streptococcus phage Javan406, complete genome | 17755-17790 | 8 | 0.778 |
CP020380_14 | 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3108167-3108203 | 37 | NZ_CP031904 | Escherichia coli O104:H4 strain FWSEC0009 plasmid unnamed19, complete sequence | 2094-2130 | 8 | 0.784 |
CP020380_14 | 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3108167-3108203 | 37 | NC_018654 | Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 plasmid pAA-09EL50, complete sequence | 35072-35108 | 8 | 0.784 |
CP020380_14 | 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3108167-3108203 | 37 | NZ_CP023530 | Escherichia coli strain FDAARGOS_401 plasmid unnamed, complete sequence | 25016-25052 | 8 | 0.784 |
CP020380_14 | 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3108167-3108203 | 37 | NZ_CP041001 | Escherichia coli strain FDAARGOS_772 plasmid unnamed1, complete sequence | 6438-6474 | 8 | 0.784 |
CP020380_14 | 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3108167-3108203 | 37 | CP025574 | Escherichia coli strain E-1246 plasmid pE1246_1, complete sequence | 63983-64019 | 8 | 0.784 |
CP020380_14 | 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3108167-3108203 | 37 | NZ_CP023533 | Escherichia coli strain FDAARGOS_403 plasmid unnamed2, complete sequence | 42889-42925 | 8 | 0.784 |
CP020380_14 | 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3108167-3108203 | 37 | CP049615 | Escherichia coli O157:H7 strain K1516 plasmid pK1516-3, complete sequence | 27821-27857 | 8 | 0.784 |
CP020380_14 | 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3108167-3108203 | 37 | NZ_CP027392 | Escherichia coli O104:H4 strain FDAARGOS_349 plasmid unnamed2, complete sequence | 23042-23078 | 8 | 0.784 |
CP020380_14 | 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3108167-3108203 | 37 | NZ_CP023062 | Escherichia coli strain FORC_069 plasmid pFORC69, complete sequence | 66286-66322 | 8 | 0.784 |
CP020380_14 | 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3108167-3108203 | 37 | NZ_CP023552 | Escherichia coli strain FORC_043 plasmid pFORC43, complete sequence | 58470-58506 | 8 | 0.784 |
CP020380_14 | 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3108167-3108203 | 37 | NZ_KY706108 | Escherichia coli strain pAA-ST131 plasmid ESBL20150001, complete sequence | 80876-80912 | 8 | 0.784 |
CP020380_14 | 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3108167-3108203 | 37 | NC_011752 | Escherichia coli 55989 plasmid 55989p, complete sequence | 38858-38894 | 8 | 0.784 |
CP020380_14 | 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3108167-3108203 | 37 | CP042952 | Escherichia coli strain D8-1 plasmid pD8-1_1, complete sequence | 56360-56396 | 8 | 0.784 |
CP020380_14 | 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3108167-3108203 | 37 | NZ_CP026724 | Escherichia coli strain 266917_2 plasmid p266917_2_01, complete sequence | 88485-88521 | 8 | 0.784 |
CP020380_14 | 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3108167-3108203 | 37 | CP051693 | Escherichia coli strain SCU-318 plasmid pSCU-318-1, complete sequence | 19506-19542 | 8 | 0.784 |
CP020380_14 | 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3108167-3108203 | 37 | NC_019000 | Escherichia coli plasmid pHUSEC41-2, complete sequence | 39942-39978 | 8 | 0.784 |
CP020380_14 | 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3108167-3108203 | 37 | NZ_CP009053 | Escherichia coli NCCP15648 plasmid p15648-3, complete sequence | 44488-44524 | 8 | 0.784 |
CP020380_14 | 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3108167-3108203 | 37 | NC_018666 | Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pAA-EA11, complete sequence | 67772-67808 | 8 | 0.784 |
CP020380_14 | 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3108167-3108203 | 37 | NC_018662 | Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 plasmid pAA-09EL71, complete sequence | 40019-40055 | 8 | 0.784 |
CP020380_14 | 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3108167-3108203 | 37 | NZ_CP013186 | Escherichia coli strain FORC_029 plasmid FORC_029p, complete sequence | 28785-28821 | 8 | 0.784 |
CP020380_14 | 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3108167-3108203 | 37 | NZ_CP022087 | Escherichia coli O104:H4 strain FDAARGOS_348 plasmid unnamed2, complete sequence | 21507-21543 | 8 | 0.784 |
CP020380_14 | 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3108167-3108203 | 37 | NC_022743 | Escherichia coli plasmid pHUSEC2011-2, complete sequence | 35437-35473 | 8 | 0.784 |
CP020380_10 | 10.3|1769798|37|CP020380|PILER-CR,CRT | 1769798-1769834 | 37 | MK448930 | Streptococcus phage Javan406, complete genome | 17754-17790 | 9 | 0.757 |
CP020380_11 | 11.17|1946697|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1946697-1946733 | 37 | NZ_CP020425 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence | 21108-21144 | 9 | 0.757 |
CP020380_11 | 11.17|1946697|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1946697-1946733 | 37 | FN668942 | Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence | 19753-19789 | 9 | 0.757 |
CP020380_11 | 11.17|1946697|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1946697-1946733 | 37 | NZ_CP011969 | Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence | 16430-16466 | 9 | 0.757 |
CP020380_11 | 11.18|1946763|36|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1946763-1946798 | 36 | NC_015390 | Carnobacterium sp. 17-4 plasmid pCAR50, complete sequence | 33747-33782 | 9 | 0.75 |
CP020380_20 | 20.4|3460933|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3460933-3460969 | 37 | JN371769 | Synechococcus phage metaG-MbCM1, complete genome | 97464-97500 | 9 | 0.757 |
CP020380_20 | 20.10|3461330|33|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3461330-3461362 | 33 | NZ_CP046302 | Staphylococcus hominis strain FDAARGOS_747 plasmid unnamed2, complete sequence | 12220-12252 | 9 | 0.727 |
CP020380_20 | 20.10|3461330|33|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3461330-3461362 | 33 | MT074146 | Bacteroides phage SJC03, complete genome | 71744-71776 | 9 | 0.727 |
CP020380_20 | 20.19|3461919|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3461919-3461955 | 37 | MN693953 | Marine virus AFVG_250M577, complete genome | 38694-38730 | 9 | 0.757 |
CP020380_20 | 20.39|3463239|36|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3463239-3463274 | 36 | NZ_CP013238 | Clostridium butyricum strain CDC_51208 plasmid pNPD4_2, complete sequence | 46390-46425 | 9 | 0.75 |
CP020380_20 | 20.52|3461330|34|CP020380|PILER-CR | 3461330-3461363 | 34 | NZ_CP020004 | Bacillus thuringiensis strain Bacillus thuringiensis L-7601 plasmid unnamed2, complete sequence | 37459-37492 | 9 | 0.735 |
CP020380_20 | 20.52|3461330|34|CP020380|PILER-CR | 3461330-3461363 | 34 | NC_048762 | Bacillus phage vB_BtS_B83, complete genome | 6545-6578 | 9 | 0.735 |
CP020380_20 | 20.52|3461330|34|CP020380|PILER-CR | 3461330-3461363 | 34 | MT074146 | Bacteroides phage SJC03, complete genome | 71744-71777 | 9 | 0.735 |
CP020380_21 | 21.1|3744229|38|CP020380|CRISPRCasFinder | 3744229-3744266 | 38 | NZ_CP013716 | Staphylococcus equorum strain C2014 plasmid pC2014-2, complete sequence | 38348-38385 | 9 | 0.763 |
CP020380_11 | 11.17|1946697|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1946697-1946733 | 37 | MT932329 | Campylobacter phage F379, complete genome | 82494-82530 | 10 | 0.73 |
CP020380_11 | 11.17|1946697|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1946697-1946733 | 37 | MT446421 | UNVERIFIED: Escherichia virus TH55, complete genome | 110583-110619 | 10 | 0.73 |
CP020380_11 | 11.17|1946697|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1946697-1946733 | 37 | MT533174 | Escherichia phage CJ20, complete genome | 146195-146231 | 10 | 0.73 |
CP020380_11 | 11.17|1946697|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1946697-1946733 | 37 | FN667788 | Campylobacter phage CP220, complete genome | 77257-77293 | 10 | 0.73 |
CP020380_20 | 20.23|3462183|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3462183-3462219 | 37 | NC_016820 | Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 plasmid pKLE02, complete sequence | 9475-9511 | 10 | 0.73 |
CP020380_20 | 20.23|3462183|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3462183-3462219 | 37 | NZ_AP017937 | Leuconostoc mesenteroides strain LK-151 plasmid pLm151-a, complete sequence | 19940-19976 | 10 | 0.73 |
CP020380_20 | 20.23|3462183|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3462183-3462219 | 37 | NZ_CP014602 | Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides strain DRC0211 plasmid pDSK2, complete sequence | 15194-15230 | 10 | 0.73 |
CP020380_20 | 20.23|3462183|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3462183-3462219 | 37 | NZ_CP014602 | Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides strain DRC0211 plasmid pDSK2, complete sequence | 50622-50658 | 10 | 0.73 |
CP020380_20 | 20.28|3462512|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3462512-3462548 | 37 | MN693392 | Marine virus AFVG_25M95, complete genome | 33202-33238 | 10 | 0.73 |
CP020380_20 | 20.42|3463435|35|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3463435-3463469 | 35 | AP014374 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S42-C54, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 20462-20496 | 10 | 0.714 |
CP020380_20 | 20.52|3461330|34|CP020380|PILER-CR | 3461330-3461363 | 34 | NZ_CP046302 | Staphylococcus hominis strain FDAARGOS_747 plasmid unnamed2, complete sequence | 12219-12252 | 10 | 0.706 |
CP020380_20 | 20.81|3463239|37|CP020380|PILER-CR | 3463239-3463275 | 37 | NZ_CP013238 | Clostridium butyricum strain CDC_51208 plasmid pNPD4_2, complete sequence | 46389-46425 | 10 | 0.73 |
CP020380_20 | 20.84|3463435|36|CP020380|PILER-CR | 3463435-3463470 | 36 | AP014374 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S42-C54, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 20462-20497 | 10 | 0.722 |
CP020380_11 | 11.17|1946697|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1946697-1946733 | 37 | CP011075 | Brevibacillus laterosporus strain B9 plasmid unnamed1, complete sequence | 698312-698348 | 11 | 0.703 |
CP020380_13 | 13.4|2895038|35|CP020380|CRISPRCasFinder | 2895038-2895072 | 35 | NZ_CP031276 | Staphylococcus xylosus strain 2 plasmid unnamed1, complete sequence | 42154-42188 | 11 | 0.686 |
CP020380_20 | 20.32|3462777|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3462777-3462813 | 37 | MN694760 | Marine virus AFVG_250M661, complete genome | 45652-45688 | 11 | 0.703 |
CP020380_20 | 20.41|3463368|38|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3463368-3463405 | 38 | NZ_MN602039 | Staphylococcus capitis strain APC2923 plasmid pJOS_01, complete sequence | 9535-9572 | 11 | 0.711 |
CP020380_20 | 20.44|3463565|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT | 3463565-3463601 | 37 | NZ_AP019826 | Leptotrichia hofstadii strain JCM16775 plasmid pJCM16775-3, complete sequence | 3014-3050 | 11 | 0.703 |
CP020380_20 | 20.65|3462183|38|CP020380|PILER-CR | 3462183-3462220 | 38 | NC_016820 | Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 plasmid pKLE02, complete sequence | 9475-9512 | 11 | 0.711 |
CP020380_20 | 20.65|3462183|38|CP020380|PILER-CR | 3462183-3462220 | 38 | NZ_AP017937 | Leuconostoc mesenteroides strain LK-151 plasmid pLm151-a, complete sequence | 19939-19976 | 11 | 0.711 |
CP020380_20 | 20.65|3462183|38|CP020380|PILER-CR | 3462183-3462220 | 38 | NZ_CP014602 | Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides strain DRC0211 plasmid pDSK2, complete sequence | 15193-15230 | 11 | 0.711 |
CP020380_20 | 20.65|3462183|38|CP020380|PILER-CR | 3462183-3462220 | 38 | NZ_CP014602 | Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides strain DRC0211 plasmid pDSK2, complete sequence | 50621-50658 | 11 | 0.711 |
1. spacer 4.1|144242|29|CP020380|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033215 (Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tgtaataagttaaagcaatatgaatcaac CRISPR spacer tgtaataagttaaagcaatatgaatcaac Protospacer *****************************
2. spacer 10.5|1769666|38|CP020380|CRISPRCasFinder matches to NC_028838 (Clostridium phage phiCD506, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctcttacgctttttcaatcacttttttccttgctaaaa CRISPR spacer ctcttacgctttttcaatcacttttttccttgctaaaa Protospacer **************************************
3. spacer 10.5|1769666|38|CP020380|CRISPRCasFinder matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctcttacgctttttcaatcacttttttccttgctaaaa CRISPR spacer ctcttacgctttttcaatcacttttttccttgctaaaa Protospacer **************************************
4. spacer 10.5|1769666|38|CP020380|CRISPRCasFinder matches to MK473382 (Clostridium phage JD032, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctcttacgctttttcaatcacttttttccttgctaaaa CRISPR spacer ctcttacgctttttcaatcacttttttccttgctaaaa Protospacer **************************************
5. spacer 11.2|1945710|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to FN668942 (Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttaagtgatagaatttcgtctcaattgagcaaagaat CRISPR spacer ttaagtgatagaatttcgtctcaattgagcaaagaat Protospacer *************************************
6. spacer 11.5|1945910|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tgtcattttttcacacctctcttatttatataataac CRISPR spacer tgtcattttttcacacctctcttatttatataataac Protospacer *************************************
7. spacer 11.5|1945910|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tgtcattttttcacacctctcttatttatataataac CRISPR spacer tgtcattttttcacacctctcttatttatataataac Protospacer *************************************
8. spacer 11.5|1945910|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tgtcattttttcacacctctcttatttatataataac CRISPR spacer tgtcattttttcacacctctcttatttatataataac Protospacer *************************************
9. spacer 11.5|1945910|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tgtcattttttcacacctctcttatttatataataac CRISPR spacer tgtcattttttcacacctctcttatttatataataac Protospacer *************************************
10. spacer 11.5|1945910|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tgtcattttttcacacctctcttatttatataataac CRISPR spacer tgtcattttttcacacctctcttatttatataataac Protospacer *************************************
11. spacer 11.6|1945976|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ggtgtatttatgttggcaagaagcgttgatgaaatga CRISPR spacer ggtgtatttatgttggcaagaagcgttgatgaaatga Protospacer *************************************
12. spacer 11.6|1945976|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ggtgtatttatgttggcaagaagcgttgatgaaatga CRISPR spacer ggtgtatttatgttggcaagaagcgttgatgaaatga Protospacer *************************************
13. spacer 11.6|1945976|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ggtgtatttatgttggcaagaagcgttgatgaaatga CRISPR spacer ggtgtatttatgttggcaagaagcgttgatgaaatga Protospacer *************************************
14. spacer 11.9|1946172|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029155 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tcggttaaatcacgaagtatttcgtttactgattcag CRISPR spacer tcggttaaatcacgaagtatttcgtttactgattcag Protospacer *************************************
15. spacer 11.9|1946172|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tcggttaaatcacgaagtatttcgtttactgattcag CRISPR spacer tcggttaaatcacgaagtatttcgtttactgattcag Protospacer *************************************
16. spacer 11.9|1946172|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tcggttaaatcacgaagtatttcgtttactgattcag CRISPR spacer tcggttaaatcacgaagtatttcgtttactgattcag Protospacer *************************************
17. spacer 11.14|1946501|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681539 (Clostridium phage phiCD505, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtataaattgaaatcagaaggttttattattgattta CRISPR spacer gtataaattgaaatcagaaggttttattattgattta Protospacer *************************************
18. spacer 11.15|1946567|35|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048642 (Clostridium phage CDKM9, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctattaactttaggtattttgtaagatttttcctc CRISPR spacer ctattaactttaggtattttgtaagatttttcctc Protospacer ***********************************
19. spacer 11.16|1946631|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
catgaacattctctataatatgtgtgttcttcaacta CRISPR spacer catgaacattctctataatatgtgtgttcttcaacta Protospacer *************************************
20. spacer 11.16|1946631|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
catgaacattctctataatatgtgtgttcttcaacta CRISPR spacer catgaacattctctataatatgtgtgttcttcaacta Protospacer *************************************
21. spacer 11.16|1946631|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG531805 (Clostridium phage CDMH1 complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
catgaacattctctataatatgtgtgttcttcaacta CRISPR spacer catgaacattctctataatatgtgtgttcttcaacta Protospacer *************************************
22. spacer 20.7|3461134|35|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to FN668942 (Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
actgcaatggataatataaacgatcttaaaaaaga CRISPR spacer actgcaatggataatataaacgatcttaaaaaaga Protospacer ***********************************
23. spacer 20.14|3461591|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctcttgcaaaatatcctttttctttcaaacaaaaagt CRISPR spacer ctcttgcaaaatatcctttttctttcaaacaaaaagt Protospacer *************************************
24. spacer 20.19|3461919|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaggaaaaagaaataataaaagaatttactccgaaaa CRISPR spacer aaggaaaaagaaataataaaagaatttactccgaaaa Protospacer *************************************
25. spacer 20.20|3461985|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048665 (Clostridium phage phiCDHM14, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctc CRISPR spacer aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctc Protospacer *************************************
26. spacer 20.20|3461985|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctc CRISPR spacer aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctc Protospacer *************************************
27. spacer 20.20|3461985|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctc CRISPR spacer aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctc Protospacer *************************************
28. spacer 20.20|3461985|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028838 (Clostridium phage phiCD506, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctc CRISPR spacer aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctc Protospacer *************************************
29. spacer 20.20|3461985|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to HG796225 (Clostridium phage phiCDHM13 complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctc CRISPR spacer aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctc Protospacer *************************************
30. spacer 20.20|3461985|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctc CRISPR spacer aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctc Protospacer *************************************
31. spacer 20.20|3461985|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681538 (Clostridium phage phiCD481-1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctc CRISPR spacer aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctc Protospacer *************************************
32. spacer 20.20|3461985|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to HG798901 (Clostridium phage phiCDHM11 complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctc CRISPR spacer aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctc Protospacer *************************************
33. spacer 20.20|3461985|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK473382 (Clostridium phage JD032, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctc CRISPR spacer aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctc Protospacer *************************************
34. spacer 20.20|3461985|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctc CRISPR spacer aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctc Protospacer *************************************
35. spacer 20.22|3462117|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaaga CRISPR spacer gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaaga Protospacer *************************************
36. spacer 20.22|3462117|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaaga CRISPR spacer gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaaga Protospacer *************************************
37. spacer 20.22|3462117|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028838 (Clostridium phage phiCD506, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaaga CRISPR spacer gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaaga Protospacer *************************************
38. spacer 20.22|3462117|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaaga CRISPR spacer gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaaga Protospacer *************************************
39. spacer 20.22|3462117|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaaga CRISPR spacer gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaaga Protospacer *************************************
40. spacer 20.22|3462117|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK473382 (Clostridium phage JD032, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaaga CRISPR spacer gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaaga Protospacer *************************************
41. spacer 20.22|3462117|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaaga CRISPR spacer gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaaga Protospacer *************************************
42. spacer 20.23|3462183|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacat CRISPR spacer agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacat Protospacer *************************************
43. spacer 20.23|3462183|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacat CRISPR spacer agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacat Protospacer *************************************
44. spacer 20.23|3462183|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacat CRISPR spacer agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacat Protospacer *************************************
45. spacer 20.23|3462183|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacat CRISPR spacer agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacat Protospacer *************************************
46. spacer 20.29|3462578|38|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to JX145342 (Clostridium phage phiMMP04, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ccattatacattgtttcaagcttcttttgtacttcttt CRISPR spacer ccattatacattgtttcaagcttcttttgtacttcttt Protospacer **************************************
47. spacer 20.30|3462645|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atatggctacaagttttgaaagtaaaaatgtaataaa CRISPR spacer atatggctacaagttttgaaagtaaaaatgtaataaa Protospacer *************************************
48. spacer 20.30|3462645|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atatggctacaagttttgaaagtaaaaatgtaataaa CRISPR spacer atatggctacaagttttgaaagtaaaaatgtaataaa Protospacer *************************************
49. spacer 20.30|3462645|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atatggctacaagttttgaaagtaaaaatgtaataaa CRISPR spacer atatggctacaagttttgaaagtaaaaatgtaataaa Protospacer *************************************
50. spacer 20.31|3462711|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactct CRISPR spacer aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactct Protospacer *************************************
51. spacer 20.31|3462711|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactct CRISPR spacer aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactct Protospacer *************************************
52. spacer 20.31|3462711|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681539 (Clostridium phage phiCD505, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactct CRISPR spacer aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactct Protospacer *************************************
53. spacer 20.31|3462711|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactct CRISPR spacer aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactct Protospacer *************************************
54. spacer 20.31|3462711|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681542 (Clostridium phage phiMMP03, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactct CRISPR spacer aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactct Protospacer *************************************
55. spacer 20.31|3462711|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to HG531805 (Clostridium phage CDMH1 complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactct CRISPR spacer aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactct Protospacer *************************************
56. spacer 20.31|3462711|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009231 (Clostridium phage phiC2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactct CRISPR spacer aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactct Protospacer *************************************
57. spacer 20.31|3462711|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactct CRISPR spacer aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactct Protospacer *************************************
58. spacer 20.31|3462711|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactct CRISPR spacer aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactct Protospacer *************************************
59. spacer 20.31|3462711|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048642 (Clostridium phage CDKM9, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactct CRISPR spacer aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactct Protospacer *************************************
60. spacer 20.31|3462711|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to KX228400 (Clostridium phage CDKM15, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactct CRISPR spacer aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactct Protospacer *************************************
61. spacer 20.33|3462843|36|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
agacacacctcgcacagatgcagaaagttccaattg CRISPR spacer agacacacctcgcacagatgcagaaagttccaattg Protospacer ************************************
62. spacer 20.33|3462843|36|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
agacacacctcgcacagatgcagaaagttccaattg CRISPR spacer agacacacctcgcacagatgcagaaagttccaattg Protospacer ************************************
63. spacer 20.33|3462843|36|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
agacacacctcgcacagatgcagaaagttccaattg CRISPR spacer agacacacctcgcacagatgcagaaagttccaattg Protospacer ************************************
64. spacer 20.33|3462843|36|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
agacacacctcgcacagatgcagaaagttccaattg CRISPR spacer agacacacctcgcacagatgcagaaagttccaattg Protospacer ************************************
65. spacer 20.36|3463041|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cttatttcaaagaaagatattgttataaaacaaaaaa CRISPR spacer cttatttcaaagaaagatattgttataaaacaaaaaa Protospacer *************************************
66. spacer 20.39|3463239|36|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681542 (Clostridium phage phiMMP03, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attttcaactcatcatctccaatatcatctttactt CRISPR spacer attttcaactcatcatctccaatatcatctttactt Protospacer ************************************
67. spacer 20.39|3463239|36|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to HG531805 (Clostridium phage CDMH1 complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attttcaactcatcatctccaatatcatctttactt CRISPR spacer attttcaactcatcatctccaatatcatctttactt Protospacer ************************************
68. spacer 20.39|3463239|36|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009231 (Clostridium phage phiC2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attttcaactcatcatctccaatatcatctttactt CRISPR spacer attttcaactcatcatctccaatatcatctttactt Protospacer ************************************
69. spacer 20.39|3463239|36|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009231 (Clostridium phage phiC2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attttcaactcatcatctccaatatcatctttactt CRISPR spacer attttcaactcatcatctccaatatcatctttactt Protospacer ************************************
70. spacer 20.39|3463239|36|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681541 (Clostridium phage phiMMP01, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attttcaactcatcatctccaatatcatctttactt CRISPR spacer attttcaactcatcatctccaatatcatctttactt Protospacer ************************************
71. spacer 20.64|3462117|38|CP020380|PILER-CR matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaagaa CRISPR spacer gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaagaa Protospacer **************************************
72. spacer 20.64|3462117|38|CP020380|PILER-CR matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaagaa CRISPR spacer gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaagaa Protospacer **************************************
73. spacer 20.64|3462117|38|CP020380|PILER-CR matches to NC_028838 (Clostridium phage phiCD506, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaagaa CRISPR spacer gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaagaa Protospacer **************************************
74. spacer 20.64|3462117|38|CP020380|PILER-CR matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaagaa CRISPR spacer gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaagaa Protospacer **************************************
75. spacer 20.64|3462117|38|CP020380|PILER-CR matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaagaa CRISPR spacer gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaagaa Protospacer **************************************
76. spacer 20.64|3462117|38|CP020380|PILER-CR matches to MK473382 (Clostridium phage JD032, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaagaa CRISPR spacer gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaagaa Protospacer **************************************
77. spacer 20.64|3462117|38|CP020380|PILER-CR matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaagaa CRISPR spacer gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaagaa Protospacer **************************************
78. spacer 20.73|3462711|38|CP020380|PILER-CR matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactcta CRISPR spacer aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactcta Protospacer **************************************
79. spacer 20.73|3462711|38|CP020380|PILER-CR matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactcta CRISPR spacer aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactcta Protospacer **************************************
80. spacer 20.73|3462711|38|CP020380|PILER-CR matches to LN681539 (Clostridium phage phiCD505, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactcta CRISPR spacer aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactcta Protospacer **************************************
81. spacer 20.73|3462711|38|CP020380|PILER-CR matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactcta CRISPR spacer aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactcta Protospacer **************************************
82. spacer 20.73|3462711|38|CP020380|PILER-CR matches to LN681542 (Clostridium phage phiMMP03, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactcta CRISPR spacer aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactcta Protospacer **************************************
83. spacer 20.73|3462711|38|CP020380|PILER-CR matches to HG531805 (Clostridium phage CDMH1 complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactcta CRISPR spacer aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactcta Protospacer **************************************
84. spacer 20.73|3462711|38|CP020380|PILER-CR matches to NC_009231 (Clostridium phage phiC2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactcta CRISPR spacer aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactcta Protospacer **************************************
85. spacer 20.73|3462711|38|CP020380|PILER-CR matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactcta CRISPR spacer aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactcta Protospacer **************************************
86. spacer 20.73|3462711|38|CP020380|PILER-CR matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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87. spacer 20.73|3462711|38|CP020380|PILER-CR matches to NC_048642 (Clostridium phage CDKM9, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactcta CRISPR spacer aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactcta Protospacer **************************************
88. spacer 20.73|3462711|38|CP020380|PILER-CR matches to KX228400 (Clostridium phage CDKM15, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactcta CRISPR spacer aaacgacattaatatttagttaatgaaacttcactcta Protospacer **************************************
89. spacer 20.78|3463041|38|CP020380|PILER-CR matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cttatttcaaagaaagatattgttataaaacaaaaaaa CRISPR spacer cttatttcaaagaaagatattgttataaaacaaaaaaa Protospacer **************************************
90. spacer 20.81|3463239|37|CP020380|PILER-CR matches to LN681542 (Clostridium phage phiMMP03, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attttcaactcatcatctccaatatcatctttactta CRISPR spacer attttcaactcatcatctccaatatcatctttactta Protospacer *************************************
91. spacer 20.81|3463239|37|CP020380|PILER-CR matches to HG531805 (Clostridium phage CDMH1 complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attttcaactcatcatctccaatatcatctttactta CRISPR spacer attttcaactcatcatctccaatatcatctttactta Protospacer *************************************
92. spacer 20.81|3463239|37|CP020380|PILER-CR matches to NC_009231 (Clostridium phage phiC2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attttcaactcatcatctccaatatcatctttactta CRISPR spacer attttcaactcatcatctccaatatcatctttactta Protospacer *************************************
93. spacer 20.81|3463239|37|CP020380|PILER-CR matches to NC_009231 (Clostridium phage phiC2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attttcaactcatcatctccaatatcatctttactta CRISPR spacer attttcaactcatcatctccaatatcatctttactta Protospacer *************************************
94. spacer 20.81|3463239|37|CP020380|PILER-CR matches to LN681541 (Clostridium phage phiMMP01, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attttcaactcatcatctccaatatcatctttactta CRISPR spacer attttcaactcatcatctccaatatcatctttactta Protospacer *************************************
95. spacer 23.6|3831337|35|CP020380|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020425 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcagcaggattatatgaagcagatggtggagcatg CRISPR spacer gcagcaggattatatgaagcagatggtggagcatg Protospacer ***********************************
96. spacer 23.6|3831337|35|CP020380|CRISPRCasFinder matches to FN668942 (Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcagcaggattatatgaagcagatggtggagcatg CRISPR spacer gcagcaggattatatgaagcagatggtggagcatg Protospacer ***********************************
97. spacer 23.6|3831337|35|CP020380|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011969 (Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcagcaggattatatgaagcagatggtggagcatg CRISPR spacer gcagcaggattatatgaagcagatggtggagcatg Protospacer ***********************************
98. spacer 23.6|3831337|35|CP020380|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP029156 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcagcaggattatatgaagcagatggtggagcatg CRISPR spacer gcagcaggattatatgaagcagatggtggagcatg Protospacer ***********************************
99. spacer 23.6|3831337|35|CP020380|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP029153 (Clostridioides difficile strain CDT4 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcagcaggattatatgaagcagatggtggagcatg CRISPR spacer gcagcaggattatatgaagcagatggtggagcatg Protospacer ***********************************
100. spacer 2.1|128816|34|CP020380|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033215 (Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer aaactgaacacatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer *********.************************
101. spacer 3.1|135706|34|CP020380|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033215 (Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer aaactgaacacatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer *********.************************
102. spacer 5.1|151711|34|CP020380|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033215 (Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer aaactgaacacatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer *********.************************
103. spacer 9.1|1661727|38|CP020380|CRISPRCasFinder matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
gttttttggggtgcagttgcgagtccaaccccctcttt CRISPR spacer cttttttggggtgcagttgcgagtccaaccccctcttt Protospacer *************************************
104. spacer 10.1|1769665|39|CP020380|PILER-CR,CRT matches to MK473382 (Clostridium phage JD032, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
tctcttacgctttttcaatcacttttttccttgctaaaa CRISPR spacer actcttacgctttttcaatcacttttttccttgctaaaa Protospacer **************************************
105. spacer 10.1|1769665|39|CP020380|PILER-CR,CRT matches to NC_028838 (Clostridium phage phiCD506, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
tctcttacgctttttcaatcacttttttccttgctaaaa CRISPR spacer actcttacgctttttcaatcacttttttccttgctaaaa Protospacer **************************************
106. spacer 10.1|1769665|39|CP020380|PILER-CR,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
tctcttacgctttttcaatcacttttttccttgctaaaa CRISPR spacer actcttacgctttttcaatcacttttttccttgctaaaa Protospacer **************************************
107. spacer 10.2|1769732|38|CP020380|PILER-CR,CRT matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
ttgcggtatattggaattgaacaggatgatttaaacaa CRISPR spacer ttgcgttatattggaattgaacaggatgatttaaacaa Protospacer ***** ********************************
108. spacer 10.6|1769733|37|CP020380|CRISPRCasFinder matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
tgcggtatattggaattgaacaggatgatttaaacaa CRISPR spacer tgcgttatattggaattgaacaggatgatttaaacaa Protospacer **** ********************************
109. spacer 11.7|1946042|36|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ctgagtaacaaggatttttattaaaagtattatcag CRISPR spacer ctgagtaacaaggatttttattaaaagtactatcag Protospacer *****************************.******
110. spacer 11.7|1946042|36|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ctgagtaacaaggatttttattaaaagtattatcag CRISPR spacer ctgagtaacaaggatttttattaaaagtactatcag Protospacer *****************************.******
111. spacer 11.8|1946107|36|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tatctttagaataacagtatccatcataattatttg CRISPR spacer tatctttagaataacagtatccattataattatttg Protospacer ************************.***********
112. spacer 11.8|1946107|36|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tatctttagaataacagtatccatcataattatttg CRISPR spacer tatctttagaataacagtatccattataattatttg Protospacer ************************.***********
113. spacer 11.12|1946370|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gctggtaagtttgattttatatcatggtagtaagcag CRISPR spacer gctggtaagtttgattttatatcatggtagtaagcac Protospacer ************************************
114. spacer 11.12|1946370|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gctggtaagtttgattttatatcatggtagtaagcag CRISPR spacer gctggtaagtttgattttatatcatggtagtaagcac Protospacer ************************************
115. spacer 13.1|2895037|36|CP020380|PILER-CR,CRT matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ctttgcttataaagtagtagacgaagctaaaaagct CRISPR spacer ctttgcttataaagtagtagacgaagctaaaaagtt Protospacer **********************************.*
116. spacer 13.4|2895038|35|CP020380|CRISPRCasFinder matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
tttgcttataaagtagtagacgaagctaaaaagct CRISPR spacer tttgcttataaagtagtagacgaagctaaaaagtt Protospacer *********************************.*
117. spacer 14.4|3108298|38|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LN681539 (Clostridium phage phiCD505, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
tgtaattccattattaaaagtatttggggattttgcat CRISPR spacer tgtaattccattgttaaaagtatttggggattttgcat Protospacer ************.*************************
118. spacer 14.4|3108298|38|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_048642 (Clostridium phage CDKM9, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
tgtaattccattattaaaagtatttggggattttgcat CRISPR spacer tgtaattccattgttaaaagtatttggggattttgcat Protospacer ************.*************************
119. spacer 20.9|3461265|36|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tagttttatatcttgcaaataacttaaaaaattaag CRISPR spacer tagttttatgtcttgcaaataacttaaaaaattaag Protospacer *********.**************************
120. spacer 20.19|3461919|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
aaggaaaaagaaataataaaagaatttactccgaaaa CRISPR spacer aaggaaaaagaaataataaaagaatttactccaaaaa Protospacer ********************************.****
121. spacer 20.19|3461919|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
aaggaaaaagaaataataaaagaatttactccgaaaa CRISPR spacer aaggaaaaagaaataataaaagaatttactccaaaaa Protospacer ********************************.****
122. spacer 20.19|3461919|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
aaggaaaaagaaataataaaagaatttactccgaaaa CRISPR spacer aaggaaaaagaaataataaaagaatttactccaaaaa Protospacer ********************************.****
123. spacer 20.19|3461919|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
aaggaaaaagaaataataaaagaatttactccgaaaa CRISPR spacer aaggaaaaagaaataataaaagaatttactccaaaaa Protospacer ********************************.****
124. spacer 20.20|3461985|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctc CRISPR spacer aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttctctc Protospacer ********************************.****
125. spacer 20.23|3462183|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048665 (Clostridium phage phiCDHM14, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacat CRISPR spacer agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaagcat Protospacer *********************************.***
126. spacer 20.23|3462183|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK473382 (Clostridium phage JD032, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacat CRISPR spacer agagtggttaaagaaaataagttatttttcaaaacat Protospacer ********* ***************************
127. spacer 20.23|3462183|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028838 (Clostridium phage phiCD506, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacat CRISPR spacer agagtggttaaagaaaataagttatttttcaaaacat Protospacer ********* ***************************
128. spacer 20.23|3462183|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to HG796225 (Clostridium phage phiCDHM13 complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacat CRISPR spacer agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaagcat Protospacer *********************************.***
129. spacer 20.23|3462183|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681538 (Clostridium phage phiCD481-1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacat CRISPR spacer agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaagcat Protospacer *********************************.***
130. spacer 20.23|3462183|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to HG798901 (Clostridium phage phiCDHM11 complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacat CRISPR spacer agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaagcat Protospacer *********************************.***
131. spacer 20.28|3462512|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
cagtatcatccataaaaccatcaaattcagccaataa CRISPR spacer cagtatcatccataaaaccatcaaatttagccaataa Protospacer ***************************.*********
132. spacer 20.35|3462975|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048665 (Clostridium phage phiCDHM14, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
taacagcaataaagaacactaacaaaaaagctaaaag CRISPR spacer taacagcaataaagaacactaataaaaaagctaaaag Protospacer **********************.**************
133. spacer 20.35|3462975|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to HG796225 (Clostridium phage phiCDHM13 complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
taacagcaataaagaacactaacaaaaaagctaaaag CRISPR spacer taacagcaataaagaacactaataaaaaagctaaaag Protospacer **********************.**************
134. spacer 20.35|3462975|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to HG798901 (Clostridium phage phiCDHM11 complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
taacagcaataaagaacactaacaaaaaagctaaaag CRISPR spacer taacagcaataaagaacactaataaaaaagctaaaag Protospacer **********************.**************
135. spacer 20.49|3461134|36|CP020380|PILER-CR matches to FN668942 (Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
actgcaatggataatataaacgatcttaaaaaagac CRISPR spacer actgcaatggataatataaacgatcttaaaaaagat Protospacer ***********************************.
136. spacer 20.56|3461591|38|CP020380|PILER-CR matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
ctcttgcaaaatatcctttttctttcaaacaaaaagta CRISPR spacer ctcttgcaaaatatcctttttctttcaaacaaaaagtt Protospacer *************************************
137. spacer 20.61|3461919|38|CP020380|PILER-CR matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
aaggaaaaagaaataataaaagaatttactccgaaaaa CRISPR spacer aaggaaaaagaaataataaaagaatttactccgaaaat Protospacer *************************************
138. spacer 20.62|3461985|38|CP020380|PILER-CR matches to MK473382 (Clostridium phage JD032, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctca CRISPR spacer aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctct Protospacer *************************************
139. spacer 20.62|3461985|38|CP020380|PILER-CR matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctca CRISPR spacer aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctct Protospacer *************************************
140. spacer 20.62|3461985|38|CP020380|PILER-CR matches to NC_048665 (Clostridium phage phiCDHM14, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctca CRISPR spacer aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctct Protospacer *************************************
141. spacer 20.62|3461985|38|CP020380|PILER-CR matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctca CRISPR spacer aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctct Protospacer *************************************
142. spacer 20.62|3461985|38|CP020380|PILER-CR matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctca CRISPR spacer aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctct Protospacer *************************************
143. spacer 20.62|3461985|38|CP020380|PILER-CR matches to NC_028838 (Clostridium phage phiCD506, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctca CRISPR spacer aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctct Protospacer *************************************
144. spacer 20.62|3461985|38|CP020380|PILER-CR matches to HG796225 (Clostridium phage phiCDHM13 complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctca CRISPR spacer aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctct Protospacer *************************************
145. spacer 20.62|3461985|38|CP020380|PILER-CR matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctca CRISPR spacer aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctct Protospacer *************************************
146. spacer 20.62|3461985|38|CP020380|PILER-CR matches to LN681538 (Clostridium phage phiCD481-1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctca CRISPR spacer aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctct Protospacer *************************************
147. spacer 20.62|3461985|38|CP020380|PILER-CR matches to HG798901 (Clostridium phage phiCDHM11 complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctca CRISPR spacer aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctct Protospacer *************************************
148. spacer 20.65|3462183|38|CP020380|PILER-CR matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacata CRISPR spacer agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacatt Protospacer *************************************
149. spacer 20.65|3462183|38|CP020380|PILER-CR matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacata CRISPR spacer agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacatt Protospacer *************************************
150. spacer 20.65|3462183|38|CP020380|PILER-CR matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacata CRISPR spacer agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacatt Protospacer *************************************
151. spacer 20.65|3462183|38|CP020380|PILER-CR matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacata CRISPR spacer agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacatt Protospacer *************************************
152. spacer 20.70|3462512|38|CP020380|PILER-CR matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
cagtatcatccataaaaccatcaaattcagccaataaa CRISPR spacer cagtatcatccataaaaccatcaaatttagccaataaa Protospacer ***************************.**********
153. spacer 20.71|3462578|39|CP020380|PILER-CR matches to JX145342 (Clostridium phage phiMMP04, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
ccattatacattgtttcaagcttcttttgtacttcttta CRISPR spacer ccattatacattgtttcaagcttcttttgtacttctttt Protospacer **************************************
154. spacer 20.72|3462645|38|CP020380|PILER-CR matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
atatggctacaagttttgaaagtaaaaatgtaataaaa CRISPR spacer atatggctacaagttttgaaagtaaaaatgtaataaat Protospacer *************************************
155. spacer 20.72|3462645|38|CP020380|PILER-CR matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
atatggctacaagttttgaaagtaaaaatgtaataaaa CRISPR spacer atatggctacaagttttgaaagtaaaaatgtaataaat Protospacer *************************************
156. spacer 20.72|3462645|38|CP020380|PILER-CR matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
atatggctacaagttttgaaagtaaaaatgtaataaaa CRISPR spacer atatggctacaagttttgaaagtaaaaatgtaataaat Protospacer *************************************
157. spacer 20.75|3462843|37|CP020380|PILER-CR matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
agacacacctcgcacagatgcagaaagttccaattga CRISPR spacer agacacacctcgcacagatgcagaaagttccaattgt Protospacer ************************************
158. spacer 20.75|3462843|37|CP020380|PILER-CR matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
agacacacctcgcacagatgcagaaagttccaattga CRISPR spacer agacacacctcgcacagatgcagaaagttccaattgt Protospacer ************************************
159. spacer 20.75|3462843|37|CP020380|PILER-CR matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
agacacacctcgcacagatgcagaaagttccaattga CRISPR spacer agacacacctcgcacagatgcagaaagttccaattgt Protospacer ************************************
160. spacer 20.75|3462843|37|CP020380|PILER-CR matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
agacacacctcgcacagatgcagaaagttccaattga CRISPR spacer agacacacctcgcacagatgcagaaagttccaattgt Protospacer ************************************
161. spacer 23.2|3831049|35|CP020380|CRISPRCasFinder matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
agtttttgataacttaaaatctagctttgcagagt CRISPR spacer agtttttgataacttaaaatctagttttgcagagt Protospacer ************************.**********
162. spacer 23.2|3831049|35|CP020380|CRISPRCasFinder matches to KX228400 (Clostridium phage CDKM15, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
agtttttgataacttaaaatctagctttgcagagt CRISPR spacer agtttttgataacttaaaatctagttttgcagagt Protospacer ************************.**********
163. spacer 23.14|3831270|39|CP020380|CRT matches to LN681539 (Clostridium phage phiCD505, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
cttgttgaagtgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa CRISPR spacer attgttgaagtgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa Protospacer **************************************
164. spacer 23.15|3831336|38|CP020380|CRT matches to NZ_CP029156 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
cgcagcaggattatatgaagcagatggtggagcatgga CRISPR spacer agcagcaggattatatgaagcagatggtggagcatgga Protospacer *************************************
165. spacer 23.15|3831336|38|CP020380|CRT matches to NZ_CP029153 (Clostridioides difficile strain CDT4 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
cgcagcaggattatatgaagcagatggtggagcatgga CRISPR spacer agcagcaggattatatgaagcagatggtggagcatgga Protospacer *************************************
166. spacer 23.15|3831336|38|CP020380|CRT matches to NZ_CP020425 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
cgcagcaggattatatgaagcagatggtggagcatgga CRISPR spacer agcagcaggattatatgaagcagatggtggagcatgga Protospacer *************************************
167. spacer 23.15|3831336|38|CP020380|CRT matches to FN668942 (Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
cgcagcaggattatatgaagcagatggtggagcatgga CRISPR spacer agcagcaggattatatgaagcagatggtggagcatgga Protospacer *************************************
168. spacer 23.15|3831336|38|CP020380|CRT matches to NZ_CP011969 (Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
cgcagcaggattatatgaagcagatggtggagcatgga CRISPR spacer agcagcaggattatatgaagcagatggtggagcatgga Protospacer *************************************
169. spacer 1.1|31941|38|CP020380|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033215 (Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
tagcaacagaataaactgaacgcatgtgaagtttgttt CRISPR spacer aagcaacagaataaactgaacacatgtgaagtttgttt Protospacer ********************.****************
170. spacer 11.15|1946567|35|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK473382 (Clostridium phage JD032, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctattaactttaggtattttgtaagatttttcctc CRISPR spacer ctattaactctaggtattttgtaagacttttcctc Protospacer *********.****************.********
171. spacer 13.2|2895102|37|CP020380|PILER-CR,CRT matches to JX145342 (Clostridium phage phiMMP04, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
agtaactgaaacaaatagagaaaaggcagtttacaga CRISPR spacer agtaactgaaacaaatagagaaaaagcagtttataga Protospacer ************************.********.***
172. spacer 13.3|2895168|38|CP020380|PILER-CR,CRT matches to NZ_CP020425 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
atgttatttacctaaaaagatgtaaatttgcttaaaaa CRISPR spacer atgttatttacctaaaaagatacaaatttgcttaaaaa Protospacer *********************..***************
173. spacer 13.3|2895168|38|CP020380|PILER-CR,CRT matches to FN668942 (Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
atgttatttacctaaaaagatgtaaatttgcttaaaaa CRISPR spacer atgttatttacctaaaaagatacaaatttgcttaaaaa Protospacer *********************..***************
174. spacer 13.3|2895168|38|CP020380|PILER-CR,CRT matches to NZ_CP011969 (Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
atgttatttacctaaaaagatgtaaatttgcttaaaaa CRISPR spacer atgttatttacctaaaaagatacaaatttgcttaaaaa Protospacer *********************..***************
175. spacer 13.5|2895103|36|CP020380|CRISPRCasFinder matches to JX145342 (Clostridium phage phiMMP04, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
gtaactgaaacaaatagagaaaaggcagtttacaga CRISPR spacer gtaactgaaacaaatagagaaaaagcagtttataga Protospacer ***********************.********.***
176. spacer 13.6|2895169|37|CP020380|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020425 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
tgttatttacctaaaaagatgtaaatttgcttaaaaa CRISPR spacer tgttatttacctaaaaagatacaaatttgcttaaaaa Protospacer ********************..***************
177. spacer 13.6|2895169|37|CP020380|CRISPRCasFinder matches to FN668942 (Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
tgttatttacctaaaaagatgtaaatttgcttaaaaa CRISPR spacer tgttatttacctaaaaagatacaaatttgcttaaaaa Protospacer ********************..***************
178. spacer 13.6|2895169|37|CP020380|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011969 (Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
tgttatttacctaaaaagatgtaaatttgcttaaaaa CRISPR spacer tgttatttacctaaaaagatacaaatttgcttaaaaa Protospacer ********************..***************
179. spacer 20.9|3461265|36|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
tagttttatatcttgcaaataacttaaaaaattaag CRISPR spacer tagttttatgtcttgcaaataacttaaaaaatttag Protospacer *********.*********************** **
180. spacer 20.9|3461265|36|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
tagttttatatcttgcaaataacttaaaaaattaag CRISPR spacer tagttttatgtcttgcaaataacttaaaaaatttag Protospacer *********.*********************** **
181. spacer 20.9|3461265|36|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
tagttttatatcttgcaaataacttaaaaaattaag CRISPR spacer tagttttatgtcttgcaaataacttaaaaaatttag Protospacer *********.*********************** **
182. spacer 20.9|3461265|36|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
tagttttatatcttgcaaataacttaaaaaattaag CRISPR spacer tagttttatgtcttgcaaataacttaaaaaatttag Protospacer *********.*********************** **
183. spacer 20.10|3461330|33|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
gcgaaagaactgttatatataaaaataactaaa CRISPR spacer gcgaaagaactgttgtatataaaaataattaaa Protospacer **************.*************.****
184. spacer 20.10|3461330|33|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
gcgaaagaactgttatatataaaaataactaaa CRISPR spacer gcgaaagaactgttatgtataaaaacaactaaa Protospacer ****************.********.*******
185. spacer 20.10|3461330|33|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
gcgaaagaactgttatatataaaaataactaaa CRISPR spacer gcgaaagaactgttatgtataaaaacaactaaa Protospacer ****************.********.*******
186. spacer 20.10|3461330|33|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
gcgaaagaactgttatatataaaaataactaaa CRISPR spacer gcgaaagaactgttatgtataaaaacaactaaa Protospacer ****************.********.*******
187. spacer 20.10|3461330|33|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
gcgaaagaactgttatatataaaaataactaaa CRISPR spacer gcgaaagaactgttatgtataaaaacaactaaa Protospacer ****************.********.*******
188. spacer 20.10|3461330|33|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
gcgaaagaactgttatatataaaaataactaaa CRISPR spacer gcgaaagaactgttatgtataaaaacaactaaa Protospacer ****************.********.*******
189. spacer 20.11|3461392|38|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
aaaaatgtagaaagtgaccttatagccaatgtaagacc CRISPR spacer aaaaatgtagaaagtgaccttatagctagtgtaagacc Protospacer **************************.*.*********
190. spacer 20.11|3461392|38|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
aaaaatgtagaaagtgaccttatagccaatgtaagacc CRISPR spacer aaaaatgtagaaagtgaccttatagctagtgtaagacc Protospacer **************************.*.*********
191. spacer 20.11|3461392|38|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
aaaaatgtagaaagtgaccttatagccaatgtaagacc CRISPR spacer aaaaatgtagaaagtgaccttatagctagtgtaagacc Protospacer **************************.*.*********
192. spacer 20.11|3461392|38|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
aaaaatgtagaaagtgaccttatagccaatgtaagacc CRISPR spacer aaaaatgtagaaagtgaccttatagctagtgtaagacc Protospacer **************************.*.*********
193. spacer 20.11|3461392|38|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
aaaaatgtagaaagtgaccttatagccaatgtaagacc CRISPR spacer aaaaatgtagaaagtgaccttatagctagtgtaagacc Protospacer **************************.*.*********
194. spacer 20.12|3461459|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681542 (Clostridium phage phiMMP03, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
ttatcacatatttaaactcgccttttctattaatata CRISPR spacer ttattacatatttaaactcaccttttctattaatata Protospacer ****.**************.*****************
195. spacer 20.12|3461459|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to HG531805 (Clostridium phage CDMH1 complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
ttatcacatatttaaactcgccttttctattaatata CRISPR spacer ttattacatatttaaactcaccttttctattaatata Protospacer ****.**************.*****************
196. spacer 20.12|3461459|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009231 (Clostridium phage phiC2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
ttatcacatatttaaactcgccttttctattaatata CRISPR spacer ttattacatatttaaactcaccttttctattaatata Protospacer ****.**************.*****************
197. spacer 20.12|3461459|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681541 (Clostridium phage phiMMP01, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
ttatcacatatttaaactcgccttttctattaatata CRISPR spacer ttattacatatttaaactcaccttttctattaatata Protospacer ****.**************.*****************
198. spacer 20.12|3461459|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to AY522340 (Clostridium difficile phage phiC2 isolate RW11 portal protein and hypothetical protein genes, complete cds) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
ttatcacatatttaaactcgccttttctattaatata CRISPR spacer ttattacatatttaaactcaccttttctattaatata Protospacer ****.**************.*****************
199. spacer 20.24|3462249|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681534 (Clostridium phage phiCD24-1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
taattacattattttctaaaatcgctcttataactgc CRISPR spacer taattacattattttctaaaatcgcttttataacagc Protospacer **************************.******* **
200. spacer 20.24|3462249|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN718463 (Clostridium phage phiCDKH01, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
taattacattattttctaaaatcgctcttataactgc CRISPR spacer taattacattattttctaaaatcgcttttataacagc Protospacer **************************.******* **
201. spacer 20.33|3462843|36|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
agacacacctcgcacagatgcagaaagttccaattg CRISPR spacer agacacacctcgcacagatgcagaaagctctaattg Protospacer ***************************.**.*****
202. spacer 20.35|3462975|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK473382 (Clostridium phage JD032, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
taacagcaataaagaacactaacaaaaaagctaaaag CRISPR spacer taacagcaataaagaacactaataaaaaaactaaaag Protospacer **********************.******.*******
203. spacer 20.51|3461265|37|CP020380|PILER-CR matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
tagttttatatcttgcaaataacttaaaaaattaagc CRISPR spacer tagttttatgtcttgcaaataacttaaaaaattaagt Protospacer *********.**************************.
204. spacer 20.52|3461330|34|CP020380|PILER-CR matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gcgaaagaactgttatatataaaaataactaaaa CRISPR spacer gcgaaagaactgttgtatataaaaataattaaaa Protospacer **************.*************.*****
205. spacer 20.52|3461330|34|CP020380|PILER-CR matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gcgaaagaactgttatatataaaaataactaaaa CRISPR spacer gcgaaagaactgttatgtataaaaacaactaaaa Protospacer ****************.********.********
206. spacer 20.52|3461330|34|CP020380|PILER-CR matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gcgaaagaactgttatatataaaaataactaaaa CRISPR spacer gcgaaagaactgttatgtataaaaacaactaaaa Protospacer ****************.********.********
207. spacer 20.52|3461330|34|CP020380|PILER-CR matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gcgaaagaactgttatatataaaaataactaaaa CRISPR spacer gcgaaagaactgttatgtataaaaacaactaaaa Protospacer ****************.********.********
208. spacer 20.52|3461330|34|CP020380|PILER-CR matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gcgaaagaactgttatatataaaaataactaaaa CRISPR spacer gcgaaagaactgttatgtataaaaacaactaaaa Protospacer ****************.********.********
209. spacer 20.52|3461330|34|CP020380|PILER-CR matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gcgaaagaactgttatatataaaaataactaaaa CRISPR spacer gcgaaagaactgttatgtataaaaacaactaaaa Protospacer ****************.********.********
210. spacer 20.61|3461919|38|CP020380|PILER-CR matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
aaggaaaaagaaataataaaagaatttactccgaaaaa CRISPR spacer aaggaaaaagaaataataaaagaatttactccaaaaat Protospacer ********************************.****
211. spacer 20.61|3461919|38|CP020380|PILER-CR matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
aaggaaaaagaaataataaaagaatttactccgaaaaa CRISPR spacer aaggaaaaagaaataataaaagaatttactccaaaaat Protospacer ********************************.****
212. spacer 20.61|3461919|38|CP020380|PILER-CR matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
aaggaaaaagaaataataaaagaatttactccgaaaaa CRISPR spacer aaggaaaaagaaataataaaagaatttactccaaaaat Protospacer ********************************.****
213. spacer 20.61|3461919|38|CP020380|PILER-CR matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
aaggaaaaagaaataataaaagaatttactccgaaaaa CRISPR spacer aaggaaaaagaaataataaaagaatttactccaaaaat Protospacer ********************************.****
214. spacer 20.62|3461985|38|CP020380|PILER-CR matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttttctca CRISPR spacer aagttttgcatgtaccagcgagctaaaaatttctctct Protospacer ********************************.****
215. spacer 20.65|3462183|38|CP020380|PILER-CR matches to MK473382 (Clostridium phage JD032, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacata CRISPR spacer agagtggttaaagaaaataagttatttttcaaaacatt Protospacer ********* ***************************
216. spacer 20.65|3462183|38|CP020380|PILER-CR matches to NC_048665 (Clostridium phage phiCDHM14, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacata CRISPR spacer agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaagcatt Protospacer *********************************.***
217. spacer 20.65|3462183|38|CP020380|PILER-CR matches to NC_028838 (Clostridium phage phiCD506, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacata CRISPR spacer agagtggttaaagaaaataagttatttttcaaaacatt Protospacer ********* ***************************
218. spacer 20.65|3462183|38|CP020380|PILER-CR matches to HG796225 (Clostridium phage phiCDHM13 complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacata CRISPR spacer agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaagcatt Protospacer *********************************.***
219. spacer 20.65|3462183|38|CP020380|PILER-CR matches to LN681538 (Clostridium phage phiCD481-1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacata CRISPR spacer agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaagcatt Protospacer *********************************.***
220. spacer 20.65|3462183|38|CP020380|PILER-CR matches to HG798901 (Clostridium phage phiCDHM11 complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacata CRISPR spacer agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaagcatt Protospacer *********************************.***
221. spacer 20.77|3462975|38|CP020380|PILER-CR matches to NC_048665 (Clostridium phage phiCDHM14, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
taacagcaataaagaacactaacaaaaaagctaaaaga CRISPR spacer taacagcaataaagaacactaataaaaaagctaaaagt Protospacer **********************.**************
222. spacer 20.77|3462975|38|CP020380|PILER-CR matches to HG796225 (Clostridium phage phiCDHM13 complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
taacagcaataaagaacactaacaaaaaagctaaaaga CRISPR spacer taacagcaataaagaacactaataaaaaagctaaaagt Protospacer **********************.**************
223. spacer 20.77|3462975|38|CP020380|PILER-CR matches to HG798901 (Clostridium phage phiCDHM11 complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
taacagcaataaagaacactaacaaaaaagctaaaaga CRISPR spacer taacagcaataaagaacactaataaaaaagctaaaagt Protospacer **********************.**************
224. spacer 23.2|3831049|35|CP020380|CRISPRCasFinder matches to LN681539 (Clostridium phage phiCD505, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
agtttttgataacttaaaatctagctttgcagagt CRISPR spacer agtttttgataacttaaaatctagctttgcagaac Protospacer *********************************..
225. spacer 23.2|3831049|35|CP020380|CRISPRCasFinder matches to NC_048642 (Clostridium phage CDKM9, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
agtttttgataacttaaaatctagctttgcagagt CRISPR spacer agtttttgataacttaaaatctagctttgcagaac Protospacer *********************************..
226. spacer 23.14|3831270|39|CP020380|CRT matches to LN681539 (Clostridium phage phiCD505, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.949
cttgttgaagtgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa CRISPR spacer attgttgaagtgttttgtgactctcaaaaatgaaaataa Protospacer *****************.********************
227. spacer 23.14|3831270|39|CP020380|CRT matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.949
cttgttgaagtgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa CRISPR spacer atttttgaagtgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa Protospacer ** ***********************************
228. spacer 23.14|3831270|39|CP020380|CRT matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.949
cttgttgaagtgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa CRISPR spacer atttttgaagtgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa Protospacer ** ***********************************
229. spacer 23.14|3831270|39|CP020380|CRT matches to LN681542 (Clostridium phage phiMMP03, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.949
cttgttgaagtgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa CRISPR spacer atttttgaagtgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa Protospacer ** ***********************************
230. spacer 23.14|3831270|39|CP020380|CRT matches to NC_009231 (Clostridium phage phiC2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.949
cttgttgaagtgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa CRISPR spacer atttttgaagtgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa Protospacer ** ***********************************
231. spacer 23.14|3831270|39|CP020380|CRT matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.949
cttgttgaagtgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa CRISPR spacer attgttgaagtgttttgtgactctcaaaaatgaaaataa Protospacer *****************.********************
232. spacer 23.14|3831270|39|CP020380|CRT matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.949
cttgttgaagtgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa CRISPR spacer atttttgaagtgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa Protospacer ** ***********************************
233. spacer 23.14|3831270|39|CP020380|CRT matches to NC_048642 (Clostridium phage CDKM9, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.949
cttgttgaagtgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa CRISPR spacer attgttgaagtgttttgtgactctcaaaaatgaaaataa Protospacer *****************.********************
234. spacer 23.14|3831270|39|CP020380|CRT matches to KX228400 (Clostridium phage CDKM15, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.949
cttgttgaagtgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa CRISPR spacer atttttgaagtgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa Protospacer ** ***********************************
235. spacer 23.19|3831049|37|CP020380|PILER-CR matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
agtttttgataacttaaaatctagctttgcagagttc CRISPR spacer agtttttgataacttaaaatctagttttgcagagtta Protospacer ************************.***********
236. spacer 23.19|3831049|37|CP020380|PILER-CR matches to KX228400 (Clostridium phage CDKM15, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
agtttttgataacttaaaatctagctttgcagagttc CRISPR spacer agtttttgataacttaaaatctagttttgcagagtta Protospacer ************************.***********
237. spacer 6.2|300505|37|CP020380|CRISPRCasFinder matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
tgtttatcttttcattgttcatgtacatttcattgaa CRISPR spacer tatttatcttttcattattcatatacatttcattgaa Protospacer *.**************.*****.**************
238. spacer 6.5|300506|36|CP020380|CRT matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
gtttatcttttcattgttcatgtacatttcattgaa CRISPR spacer atttatcttttcattattcatatacatttcattgaa Protospacer .**************.*****.**************
239. spacer 11.7|1946042|36|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029155 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
ctgagtaacaaggatttttattaaaagtattatcag CRISPR spacer cactgtaacaaggatttttattaaaagtattatcag Protospacer * ********************************
240. spacer 11.13|1946436|36|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
ttaaatccaaattgtttacctgcaacagaaatgtct CRISPR spacer ctgaatccaaattgtttccctgcaacagaaatgtct Protospacer .*.************** ******************
241. spacer 11.13|1946436|36|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
ttaaatccaaattgtttacctgcaacagaaatgtct CRISPR spacer ctgaatccaaattgtttccctgcaacagaaatgtct Protospacer .*.************** ******************
242. spacer 11.13|1946436|36|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681539 (Clostridium phage phiCD505, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
ttaaatccaaattgtttacctgcaacagaaatgtct CRISPR spacer ctgaatccaaattgtttccctgcaacagaaatgtct Protospacer .*.************** ******************
243. spacer 11.13|1946436|36|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
ttaaatccaaattgtttacctgcaacagaaatgtct CRISPR spacer ctgaatccaaattgtttccctgcaacagaaatgtct Protospacer .*.************** ******************
244. spacer 11.13|1946436|36|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681542 (Clostridium phage phiMMP03, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
ttaaatccaaattgtttacctgcaacagaaatgtct CRISPR spacer ctgaatccaaattgtttccctgcaacagaaatgtct Protospacer .*.************** ******************
245. spacer 11.13|1946436|36|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG531805 (Clostridium phage CDMH1 complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
ttaaatccaaattgtttacctgcaacagaaatgtct CRISPR spacer ctgaatccaaattgtttccctgcaacagaaatgtct Protospacer .*.************** ******************
246. spacer 11.13|1946436|36|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009231 (Clostridium phage phiC2, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
ttaaatccaaattgtttacctgcaacagaaatgtct CRISPR spacer ctgaatccaaattgtttccctgcaacagaaatgtct Protospacer .*.************** ******************
247. spacer 11.13|1946436|36|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
ttaaatccaaattgtttacctgcaacagaaatgtct CRISPR spacer ctgaatccaaattgtttccctgcaacagaaatgtct Protospacer .*.************** ******************
248. spacer 11.13|1946436|36|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
ttaaatccaaattgtttacctgcaacagaaatgtct CRISPR spacer ctgaatccaaattgtttccctgcaacagaaatgtct Protospacer .*.************** ******************
249. spacer 11.13|1946436|36|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048642 (Clostridium phage CDKM9, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
ttaaatccaaattgtttacctgcaacagaaatgtct CRISPR spacer ctgaatccaaattgtttccctgcaacagaaatgtct Protospacer .*.************** ******************
250. spacer 11.13|1946436|36|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX228400 (Clostridium phage CDKM15, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
ttaaatccaaattgtttacctgcaacagaaatgtct CRISPR spacer ctgaatccaaattgtttccctgcaacagaaatgtct Protospacer .*.************** ******************
251. spacer 13.6|2895169|37|CP020380|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP029156 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
tgttatttacctaaaaagatgtaaatttgcttaaaaa CRISPR spacer tattatttacctaaaaagatacaaatttgcttaaaaa Protospacer *.******************..***************
252. spacer 13.6|2895169|37|CP020380|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP029153 (Clostridioides difficile strain CDT4 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
tgttatttacctaaaaagatgtaaatttgcttaaaaa CRISPR spacer tattatttacctaaaaagatacaaatttgcttaaaaa Protospacer *.******************..***************
253. spacer 20.51|3461265|37|CP020380|PILER-CR matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
tagttttatatcttgcaaataacttaaaaaattaagc CRISPR spacer tagttttatgtcttgcaaataacttaaaaaatttagt Protospacer *********.*********************** **.
254. spacer 20.51|3461265|37|CP020380|PILER-CR matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
tagttttatatcttgcaaataacttaaaaaattaagc CRISPR spacer tagttttatgtcttgcaaataacttaaaaaatttagt Protospacer *********.*********************** **.
255. spacer 20.51|3461265|37|CP020380|PILER-CR matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
tagttttatatcttgcaaataacttaaaaaattaagc CRISPR spacer tagttttatgtcttgcaaataacttaaaaaatttagt Protospacer *********.*********************** **.
256. spacer 20.51|3461265|37|CP020380|PILER-CR matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
tagttttatatcttgcaaataacttaaaaaattaagc CRISPR spacer tagttttatgtcttgcaaataacttaaaaaatttagt Protospacer *********.*********************** **.
257. spacer 20.53|3461392|39|CP020380|PILER-CR matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
aaaaatgtagaaagtgaccttatagccaatgtaagacca CRISPR spacer aaaaatgtagaaagtgaccttatagctagtgtaagacct Protospacer **************************.*.*********
258. spacer 20.53|3461392|39|CP020380|PILER-CR matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
aaaaatgtagaaagtgaccttatagccaatgtaagacca CRISPR spacer aaaaatgtagaaagtgaccttatagctagtgtaagacct Protospacer **************************.*.*********
259. spacer 20.53|3461392|39|CP020380|PILER-CR matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
aaaaatgtagaaagtgaccttatagccaatgtaagacca CRISPR spacer aaaaatgtagaaagtgaccttatagctagtgtaagacct Protospacer **************************.*.*********
260. spacer 20.53|3461392|39|CP020380|PILER-CR matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
aaaaatgtagaaagtgaccttatagccaatgtaagacca CRISPR spacer aaaaatgtagaaagtgaccttatagctagtgtaagacct Protospacer **************************.*.*********
261. spacer 20.53|3461392|39|CP020380|PILER-CR matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
aaaaatgtagaaagtgaccttatagccaatgtaagacca CRISPR spacer aaaaatgtagaaagtgaccttatagctagtgtaagacct Protospacer **************************.*.*********
262. spacer 20.54|3461459|38|CP020380|PILER-CR matches to LN681542 (Clostridium phage phiMMP03, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
ttatcacatatttaaactcgccttttctattaatataa CRISPR spacer ttattacatatttaaactcaccttttctattaatatat Protospacer ****.**************.*****************
263. spacer 20.54|3461459|38|CP020380|PILER-CR matches to HG531805 (Clostridium phage CDMH1 complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
ttatcacatatttaaactcgccttttctattaatataa CRISPR spacer ttattacatatttaaactcaccttttctattaatatat Protospacer ****.**************.*****************
264. spacer 20.54|3461459|38|CP020380|PILER-CR matches to NC_009231 (Clostridium phage phiC2, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
ttatcacatatttaaactcgccttttctattaatataa CRISPR spacer ttattacatatttaaactcaccttttctattaatatat Protospacer ****.**************.*****************
265. spacer 20.54|3461459|38|CP020380|PILER-CR matches to LN681541 (Clostridium phage phiMMP01, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
ttatcacatatttaaactcgccttttctattaatataa CRISPR spacer ttattacatatttaaactcaccttttctattaatatat Protospacer ****.**************.*****************
266. spacer 20.54|3461459|38|CP020380|PILER-CR matches to AY522340 (Clostridium difficile phage phiC2 isolate RW11 portal protein and hypothetical protein genes, complete cds) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
ttatcacatatttaaactcgccttttctattaatataa CRISPR spacer ttattacatatttaaactcaccttttctattaatatat Protospacer ****.**************.*****************
267. spacer 20.66|3462249|38|CP020380|PILER-CR matches to LN681534 (Clostridium phage phiCD24-1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
taattacattattttctaaaatcgctcttataactgca CRISPR spacer taattacattattttctaaaatcgcttttataacagct Protospacer **************************.******* **
268. spacer 20.66|3462249|38|CP020380|PILER-CR matches to MN718463 (Clostridium phage phiCDKH01, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
taattacattattttctaaaatcgctcttataactgca CRISPR spacer taattacattattttctaaaatcgcttttataacagct Protospacer **************************.******* **
269. spacer 20.75|3462843|37|CP020380|PILER-CR matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
agacacacctcgcacagatgcagaaagttccaattga CRISPR spacer agacacacctcgcacagatgcagaaagctctaattgt Protospacer ***************************.**.*****
270. spacer 20.77|3462975|38|CP020380|PILER-CR matches to MK473382 (Clostridium phage JD032, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
taacagcaataaagaacactaacaaaaaagctaaaaga CRISPR spacer taacagcaataaagaacactaataaaaaaactaaaagt Protospacer **********************.******.*******
271. spacer 23.11|3831048|38|CP020380|CRT matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
tagtttttgataacttaaaatctagctttgcagagttc CRISPR spacer cagtttttgataacttaaaatctagttttgcagagtta Protospacer .************************.***********
272. spacer 23.11|3831048|38|CP020380|CRT matches to KX228400 (Clostridium phage CDKM15, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
tagtttttgataacttaaaatctagctttgcagagttc CRISPR spacer cagtttttgataacttaaaatctagttttgcagagtta Protospacer .************************.***********
273. spacer 23.14|3831270|39|CP020380|CRT matches to NC_048642 (Clostridium phage CDKM9, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
cttgttgaagtgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa CRISPR spacer attgttgaagtgttttgtaactctcaaaaactaaaataa Protospacer *****************************. *******
274. spacer 23.19|3831049|37|CP020380|PILER-CR matches to LN681539 (Clostridium phage phiCD505, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
agtttttgataacttaaaatctagctttgcagagttc CRISPR spacer agtttttgataacttaaaatctagctttgcagaacta Protospacer *********************************..*
275. spacer 23.19|3831049|37|CP020380|PILER-CR matches to NC_048642 (Clostridium phage CDKM9, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
agtttttgataacttaaaatctagctttgcagagttc CRISPR spacer agtttttgataacttaaaatctagctttgcagaacta Protospacer *********************************..*
276. spacer 22.2|3771182|27|CP020380|CRT matches to MN694423 (Marine virus AFVG_250M1001, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
ccggttgccccagttgctcctgtattc CRISPR spacer ccagttgccccagttgctcctgtcgcc Protospacer **.******************** .*
277. spacer 22.2|3771182|27|CP020380|CRT matches to CP011076 (Brevibacillus laterosporus strain B9 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
ccggttgccccagttgctcctgtattc CRISPR spacer ccggttgccccggttgctcctgttgcc Protospacer ***********.*********** .*
278. spacer 22.2|3771182|27|CP020380|CRT matches to MN693514 (Marine virus AFVG_25M225, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
ccggttgccccagttgctcctgtattc CRISPR spacer cccattgccccagttgcgcctgtatta Protospacer ** .************* ********
279. spacer 23.11|3831048|38|CP020380|CRT matches to LN681539 (Clostridium phage phiCD505, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.895
tagtttttgataacttaaaatctagctttgcagagttc CRISPR spacer cagtttttgataacttaaaatctagctttgcagaacta Protospacer .*********************************..*
280. spacer 23.11|3831048|38|CP020380|CRT matches to NC_048642 (Clostridium phage CDKM9, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.895
tagtttttgataacttaaaatctagctttgcagagttc CRISPR spacer cagtttttgataacttaaaatctagctttgcagaacta Protospacer .*********************************..*
281. spacer 23.14|3831270|39|CP020380|CRT matches to HG531805 (Clostridium phage CDMH1 complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.897
cttgttgaagtgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa CRISPR spacer attgttgaagtgttttgtgactctcaaaaatgaaataaa Protospacer *****************.**************** **
282. spacer 20.22|3462117|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.865
gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaaga----- CRISPR spacer gaaaaggctaagaatgaatgacttttt-----aaagaaggtt Protospacer *************************** *****
283. spacer 20.22|3462117|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to JX145342 (Clostridium phage phiMMP04, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.865
gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaaga----- CRISPR spacer gaaaaggctaagaatgaatgacttttt-----aaagaaggtt Protospacer *************************** *****
284. spacer 20.23|3462183|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.865
agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacat CRISPR spacer agagtggtttaagaaaataagttatttttaatctgat Protospacer ***************************** * **
285. spacer 20.29|3462578|38|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048665 (Clostridium phage phiCDHM14, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.868
ccattatacattgtttcaagcttcttttgtacttcttt CRISPR spacer cctgcatacattgtttcaagtttcttttgtacttcctt Protospacer ** .***************.**************.**
286. spacer 20.29|3462578|38|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK473382 (Clostridium phage JD032, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.868
ccattatacattgtttcaagcttcttttgtacttcttt CRISPR spacer cctgcatacattgtttcaagtttcttttgtacttcctt Protospacer ** .***************.**************.**
287. spacer 20.29|3462578|38|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028838 (Clostridium phage phiCD506, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.868
ccattatacattgtttcaagcttcttttgtacttcttt CRISPR spacer cctgcatacattgtttcaagtttcttttgtacttcctt Protospacer ** .***************.**************.**
288. spacer 20.29|3462578|38|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to HG796225 (Clostridium phage phiCDHM13 complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.868
ccattatacattgtttcaagcttcttttgtacttcttt CRISPR spacer cctgcatacattgtttcaagtttcttttgtacttcctt Protospacer ** .***************.**************.**
289. spacer 20.29|3462578|38|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681538 (Clostridium phage phiCD481-1, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.868
ccattatacattgtttcaagcttcttttgtacttcttt CRISPR spacer cctgcatacattgtttcaagtttcttttgtacttcctt Protospacer ** .***************.**************.**
290. spacer 20.29|3462578|38|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to HG798901 (Clostridium phage phiCDHM11 complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.868
ccattatacattgtttcaagcttcttttgtacttcttt CRISPR spacer cctgcatacattgtttcaagtttcttttgtacttcctt Protospacer ** .***************.**************.**
291. spacer 20.64|3462117|38|CP020380|PILER-CR matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.868
gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaagaa----- CRISPR spacer gaaaaggctaagaatgaatgacttttt-----aaagaaggttg Protospacer *************************** ******
292. spacer 20.64|3462117|38|CP020380|PILER-CR matches to JX145342 (Clostridium phage phiMMP04, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.868
gaaaaggctaagaatgaatgactttttctataaaagaa----- CRISPR spacer gaaaaggctaagaatgaatgacttttt-----aaagaaggttg Protospacer *************************** ******
293. spacer 22.2|3771182|27|CP020380|CRT matches to NZ_CP053689 (Arthrobacter citreus strain NEB 577 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
ccggttgccccagttgctcctgtattc CRISPR spacer ccggttggcccagttgctcctgtcgat Protospacer ******* *************** .
294. spacer 22.2|3771182|27|CP020380|CRT matches to NZ_CP053689 (Arthrobacter citreus strain NEB 577 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
ccggttgccccagttgctcctgtattc CRISPR spacer ccggttggcccagttgctcctgtcgat Protospacer ******* *************** .
295. spacer 22.2|3771182|27|CP020380|CRT matches to CP011076 (Brevibacillus laterosporus strain B9 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
ccggttgccccagttgctcctgtattc CRISPR spacer cctgttgccccggttgctcctgttgcc Protospacer ** ********.*********** .*
296. spacer 22.2|3771182|27|CP020380|CRT matches to CP011076 (Brevibacillus laterosporus strain B9 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
ccggttgccccagttgctcctgtattc CRISPR spacer cctgttgccccggttgctcctgttgcc Protospacer ** ********.*********** .*
297. spacer 23.14|3831270|39|CP020380|CRT matches to LN681542 (Clostridium phage phiMMP03, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.872
cttgttgaagtgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa CRISPR spacer atcattgagatgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa Protospacer *..****..*****************************
298. spacer 23.14|3831270|39|CP020380|CRT matches to NC_009231 (Clostridium phage phiC2, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.872
cttgttgaagtgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa CRISPR spacer atcattgagatgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa Protospacer *..****..*****************************
299. spacer 23.14|3831270|39|CP020380|CRT matches to KX228400 (Clostridium phage CDKM15, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.872
cttgttgaagtgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa CRISPR spacer atcattgagatgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa Protospacer *..****..*****************************
300. spacer 23.14|3831270|39|CP020380|CRT matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.872
cttgttgaagtgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa CRISPR spacer atcattgagatgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa Protospacer *..****..*****************************
301. spacer 23.14|3831270|39|CP020380|CRT matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.872
cttgttgaagtgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa CRISPR spacer atcattgagatgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa Protospacer *..****..*****************************
302. spacer 4.1|144242|29|CP020380|CRISPRCasFinder matches to KY971610 (Pseudomonas phage PspYZU05, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tgtaataagttaaagcaatatgaatcaac CRISPR spacer tacgataagttacagcaatacgaatcatc Protospacer *...******** *******.****** *
303. spacer 20.65|3462183|38|CP020380|PILER-CR matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.842
agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacata CRISPR spacer agagtggtttaagaaaataagttatttttaatctgatt Protospacer ***************************** * **
304. spacer 20.71|3462578|39|CP020380|PILER-CR matches to NC_048665 (Clostridium phage phiCDHM14, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.846
ccattatacattgtttcaagcttcttttgtacttcttta CRISPR spacer cctgcatacattgtttcaagtttcttttgtacttccttt Protospacer ** .***************.**************.**
305. spacer 20.71|3462578|39|CP020380|PILER-CR matches to NC_028838 (Clostridium phage phiCD506, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.846
ccattatacattgtttcaagcttcttttgtacttcttta CRISPR spacer cctgcatacattgtttcaagtttcttttgtacttccttt Protospacer ** .***************.**************.**
306. spacer 20.71|3462578|39|CP020380|PILER-CR matches to HG796225 (Clostridium phage phiCDHM13 complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.846
ccattatacattgtttcaagcttcttttgtacttcttta CRISPR spacer cctgcatacattgtttcaagtttcttttgtacttccttt Protospacer ** .***************.**************.**
307. spacer 20.71|3462578|39|CP020380|PILER-CR matches to LN681538 (Clostridium phage phiCD481-1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.846
ccattatacattgtttcaagcttcttttgtacttcttta CRISPR spacer cctgcatacattgtttcaagtttcttttgtacttccttt Protospacer ** .***************.**************.**
308. spacer 20.71|3462578|39|CP020380|PILER-CR matches to HG798901 (Clostridium phage phiCDHM11 complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.846
ccattatacattgtttcaagcttcttttgtacttcttta CRISPR spacer cctgcatacattgtttcaagtttcttttgtacttccttt Protospacer ** .***************.**************.**
309. spacer 20.71|3462578|39|CP020380|PILER-CR matches to MK473382 (Clostridium phage JD032, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.846
ccattatacattgtttcaagcttcttttgtacttcttta CRISPR spacer cctgcatacattgtttcaagtttcttttgtacttccttt Protospacer ** .***************.**************.**
310. spacer 22.2|3771182|27|CP020380|CRT matches to NZ_CP039340 (Ralstonia solanacearum strain UW386 plasmid pUW386, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
ccggttgccccagttgctcctgtattc CRISPR spacer gcggtagccccagttgctcctgcgtat Protospacer **** ****************..* .
311. spacer 22.2|3771182|27|CP020380|CRT matches to CP024687 (Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-3-257K, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
ccggttgccccagttgctcctgtattc CRISPR spacer ccggttgcccctgttggtcctgttggg Protospacer *********** **** ******
312. spacer 22.2|3771182|27|CP020380|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
ccggttgccccagttgctcctgtattc CRISPR spacer cctgttgctccagttgctcctgtcact Protospacer ** *****.************** ..
313. spacer 23.14|3831270|39|CP020380|CRT matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.821
cttgttgaagtgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa CRISPR spacer tatcattagatgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa Protospacer . * * *..*****************************
314. spacer 23.14|3831270|39|CP020380|CRT matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.821
cttgttgaagtgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa CRISPR spacer tatcattagatgttttgtaactctcaaaaatgaaaataa Protospacer . * * *..*****************************
315. spacer 10.7|1769799|36|CP020380|CRISPRCasFinder matches to MK448930 (Streptococcus phage Javan406, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
gatgtaaccgcacagatattctggctaaagaatcgt CRISPR spacer aacacaaccgcacagatattctggttgaagaatagg Protospacer .*...*******************.*.****** *
316. spacer 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031904 (Escherichia coli O104:H4 strain FWSEC0009 plasmid unnamed19, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
ttaaataaaaaactaaatctattggaaaaatatgtta CRISPR spacer gaaaatataaaactagatctattggaaaaagaaattc Protospacer ***** *******.************** * .**
317. spacer 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018654 (Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 plasmid pAA-09EL50, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
ttaaataaaaaactaaatctattggaaaaatatgtta CRISPR spacer gaaaatataaaactagatctattggaaaaagaaattc Protospacer ***** *******.************** * .**
318. spacer 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023530 (Escherichia coli strain FDAARGOS_401 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
ttaaataaaaaactaaatctattggaaaaatatgtta CRISPR spacer gaaaatataaaactagatctattggaaaaagaaattc Protospacer ***** *******.************** * .**
319. spacer 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP041001 (Escherichia coli strain FDAARGOS_772 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
ttaaataaaaaactaaatctattggaaaaatatgtta CRISPR spacer gaaaatataaaactagatctattggaaaaagaaattc Protospacer ***** *******.************** * .**
320. spacer 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP025574 (Escherichia coli strain E-1246 plasmid pE1246_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
ttaaataaaaaactaaatctattggaaaaatatgtta CRISPR spacer gaaaatataaaactagatctattggaaaaagaaattc Protospacer ***** *******.************** * .**
321. spacer 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023533 (Escherichia coli strain FDAARGOS_403 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
ttaaataaaaaactaaatctattggaaaaatatgtta CRISPR spacer gaaaatataaaactagatctattggaaaaagaaattc Protospacer ***** *******.************** * .**
322. spacer 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP049615 (Escherichia coli O157:H7 strain K1516 plasmid pK1516-3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
ttaaataaaaaactaaatctattggaaaaatatgtta CRISPR spacer gaaaatataaaactagatctattggaaaaagaaattc Protospacer ***** *******.************** * .**
323. spacer 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP027392 (Escherichia coli O104:H4 strain FDAARGOS_349 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
ttaaataaaaaactaaatctattggaaaaatatgtta CRISPR spacer gaaaatataaaactagatctattggaaaaagaaattc Protospacer ***** *******.************** * .**
324. spacer 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023062 (Escherichia coli strain FORC_069 plasmid pFORC69, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
ttaaataaaaaactaaatctattggaaaaatatgtta CRISPR spacer gaaaatataaaactagatctattggaaaaagaaattc Protospacer ***** *******.************** * .**
325. spacer 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023552 (Escherichia coli strain FORC_043 plasmid pFORC43, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
ttaaataaaaaactaaatctattggaaaaatatgtta CRISPR spacer gaaaatataaaactagatctattggaaaaagaaattc Protospacer ***** *******.************** * .**
326. spacer 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KY706108 (Escherichia coli strain pAA-ST131 plasmid ESBL20150001, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
ttaaataaaaaactaaatctattggaaaaatatgtta CRISPR spacer gaaaatataaaactagatctattggaaaaagaaattc Protospacer ***** *******.************** * .**
327. spacer 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011752 (Escherichia coli 55989 plasmid 55989p, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
ttaaataaaaaactaaatctattggaaaaatatgtta CRISPR spacer gaaaatataaaactagatctattggaaaaagaaattc Protospacer ***** *******.************** * .**
328. spacer 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP042952 (Escherichia coli strain D8-1 plasmid pD8-1_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
ttaaataaaaaactaaatctattggaaaaatatgtta CRISPR spacer gaaaatataaaactagatctattggaaaaagaaattc Protospacer ***** *******.************** * .**
329. spacer 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026724 (Escherichia coli strain 266917_2 plasmid p266917_2_01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
ttaaataaaaaactaaatctattggaaaaatatgtta CRISPR spacer gaaaatataaaactagatctattggaaaaagaaattc Protospacer ***** *******.************** * .**
330. spacer 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP051693 (Escherichia coli strain SCU-318 plasmid pSCU-318-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
ttaaataaaaaactaaatctattggaaaaatatgtta CRISPR spacer gaaaatataaaactagatctattggaaaaagaaattc Protospacer ***** *******.************** * .**
331. spacer 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019000 (Escherichia coli plasmid pHUSEC41-2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
ttaaataaaaaactaaatctattggaaaaatatgtta CRISPR spacer gaaaatataaaactagatctattggaaaaagaaattc Protospacer ***** *******.************** * .**
332. spacer 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009053 (Escherichia coli NCCP15648 plasmid p15648-3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
ttaaataaaaaactaaatctattggaaaaatatgtta CRISPR spacer gaaaatataaaactagatctattggaaaaagaaattc Protospacer ***** *******.************** * .**
333. spacer 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018666 (Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pAA-EA11, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
ttaaataaaaaactaaatctattggaaaaatatgtta CRISPR spacer gaaaatataaaactagatctattggaaaaagaaattc Protospacer ***** *******.************** * .**
334. spacer 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018662 (Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 plasmid pAA-09EL71, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
ttaaataaaaaactaaatctattggaaaaatatgtta CRISPR spacer gaaaatataaaactagatctattggaaaaagaaattc Protospacer ***** *******.************** * .**
335. spacer 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013186 (Escherichia coli strain FORC_029 plasmid FORC_029p, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
ttaaataaaaaactaaatctattggaaaaatatgtta CRISPR spacer gaaaatataaaactagatctattggaaaaagaaattc Protospacer ***** *******.************** * .**
336. spacer 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022087 (Escherichia coli O104:H4 strain FDAARGOS_348 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
ttaaataaaaaactaaatctattggaaaaatatgtta CRISPR spacer gaaaatataaaactagatctattggaaaaagaaattc Protospacer ***** *******.************** * .**
337. spacer 14.2|3108167|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_022743 (Escherichia coli plasmid pHUSEC2011-2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
ttaaataaaaaactaaatctattggaaaaatatgtta CRISPR spacer gaaaatataaaactagatctattggaaaaagaaattc Protospacer ***** *******.************** * .**
338. spacer 10.3|1769798|37|CP020380|PILER-CR,CRT matches to MK448930 (Streptococcus phage Javan406, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
tgatgtaaccgcacagatattctggctaaagaatcgt CRISPR spacer aaacacaaccgcacagatattctggttgaagaatagg Protospacer .*...*******************.*.****** *
339. spacer 11.17|1946697|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020425 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
gctgtatttataattttttatatttgagtaaattagc CRISPR spacer actgtatttatagtttttaatatttgaatttatcaaa Protospacer .***********.***** ********.* **.*.
340. spacer 11.17|1946697|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to FN668942 (Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
gctgtatttataattttttatatttgagtaaattagc CRISPR spacer actgtatttatagtttttaatatttgaatttatcaaa Protospacer .***********.***** ********.* **.*.
341. spacer 11.17|1946697|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011969 (Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
gctgtatttataattttttatatttgagtaaattagc CRISPR spacer actgtatttatagtttttaatatttgaatttatcaaa Protospacer .***********.***** ********.* **.*.
342. spacer 11.18|1946763|36|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_015390 (Carnobacterium sp. 17-4 plasmid pCAR50, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tttataccaacaattttcttctccatacttttccat CRISPR spacer tatataccgataattttcttctccatacataaaatt Protospacer * ******.*.***************** * *
343. spacer 20.4|3460933|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to JN371769 (Synechococcus phage metaG-MbCM1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
tagcaacagcaagagtagtaacaacattaacaatttc CRISPR spacer tagcagcagaaagagtagtaacaacagttccatctct Protospacer *****.*** **************** * ** .*..
344. spacer 20.10|3461330|33|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP046302 (Staphylococcus hominis strain FDAARGOS_747 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gcgaaagaa------ctgttatatataaaaataactaaa CRISPR spacer ------taattcctcctattatatttaaaaataactaaa Protospacer ** **.****** **************
345. spacer 20.10|3461330|33|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT074146 (Bacteroides phage SJC03, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gcgaaagaactgttatatataaaaataactaaa CRISPR spacer tccaaagagctgttatatataataatactagta Protospacer * *****.************* **** . . *
346. spacer 20.19|3461919|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693953 (Marine virus AFVG_250M577, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
aaggaaaaagaaataataaaagaatttactccgaaaa CRISPR spacer aaggaaaaagaaattataaaaaaattgttacgataaa Protospacer ************** ******.**** . * . ***
347. spacer 20.39|3463239|36|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013238 (Clostridium butyricum strain CDC_51208 plasmid pNPD4_2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
attttcaactcatcatctccaatatcatctttactt CRISPR spacer tctaagaatccatcatcttcaatatcatctttattt Protospacer .* **..********.**************.**
348. spacer 20.52|3461330|34|CP020380|PILER-CR matches to NZ_CP020004 (Bacillus thuringiensis strain Bacillus thuringiensis L-7601 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gcgaaagaactgttatatataaaaataactaaaa CRISPR spacer tgaataggtgtgttatatacaaaaataacaaaaa Protospacer .* **. *********.********* ****
349. spacer 20.52|3461330|34|CP020380|PILER-CR matches to NC_048762 (Bacillus phage vB_BtS_B83, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gcgaaagaactgttatatataaaaataactaaaa CRISPR spacer tgaataggtgtgttatatacaaaaataacaaaaa Protospacer .* **. *********.********* ****
350. spacer 20.52|3461330|34|CP020380|PILER-CR matches to MT074146 (Bacteroides phage SJC03, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gcgaaagaactgttatatataaaaataactaaaa CRISPR spacer tccaaagagctgttatatataataatactagtaa Protospacer * *****.************* **** . . **
351. spacer 21.1|3744229|38|CP020380|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013716 (Staphylococcus equorum strain C2014 plasmid pC2014-2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gtttattatacttctttagattaattttctatatttct CRISPR spacer gtaacattttgttcattagatttattttctatatttct Protospacer ** * * *** ******* ***************
352. spacer 11.17|1946697|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT932329 (Campylobacter phage F379, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
gctgtatttataattttttatatttgagtaaattagc CRISPR spacer tgtataaaaataattttttatatttaattaaattata Protospacer *.** ****************.* *******
353. spacer 11.17|1946697|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT446421 (UNVERIFIED: Escherichia virus TH55, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
gctgtatttataattttttatatttgagtaaattagc CRISPR spacer actgtatttataatcttttaaatttgaaacaatacat Protospacer .*************.***** ******. *** ..
354. spacer 11.17|1946697|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT533174 (Escherichia phage CJ20, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
gctgtatttataattttttatatttgagtaaattagc CRISPR spacer actgtatttataatcttttaaatttgaaacaatacat Protospacer .*************.***** ******. *** ..
355. spacer 11.17|1946697|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to FN667788 (Campylobacter phage CP220, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
gctgtatttataattttttatatttgagtaaattagc CRISPR spacer tgtataaaaataattttttatatttaattaaattata Protospacer *.** ****************.* *******
356. spacer 20.23|3462183|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_016820 (Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 plasmid pKLE02, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacat CRISPR spacer ttatctcctcaagaaattaagttatttttaaaaacat Protospacer * . .*.****** ************ *******
357. spacer 20.23|3462183|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP017937 (Leuconostoc mesenteroides strain LK-151 plasmid pLm151-a, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacat CRISPR spacer ttatctcctcaagaaattaagttatttttaaaaacat Protospacer * . .*.****** ************ *******
358. spacer 20.23|3462183|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014602 (Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides strain DRC0211 plasmid pDSK2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacat CRISPR spacer ttatctcctcaagaaattaagttatttttaaaaacat Protospacer * . .*.****** ************ *******
359. spacer 20.23|3462183|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014602 (Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides strain DRC0211 plasmid pDSK2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacat CRISPR spacer ttatctcctcaagaaattaagttatttttaaaaacat Protospacer * . .*.****** ************ *******
360. spacer 20.28|3462512|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693392 (Marine virus AFVG_25M95, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
cagtatcatccataaaaccatcaaattcagccaataa CRISPR spacer caagttcatcaatcaaaccatcaaattcagctacatc Protospacer **. ***** ** *****************.*
361. spacer 20.42|3463435|35|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to AP014374 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S42-C54, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
acagttcctgatgttgagaatccttctttgcccgt CRISPR spacer acagttcttcatgttgagaatccttcaactacaaa Protospacer *******.* **************** . * .
362. spacer 20.52|3461330|34|CP020380|PILER-CR matches to NZ_CP046302 (Staphylococcus hominis strain FDAARGOS_747 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gcgaaagaa------ctgttatatataaaaataactaaaa CRISPR spacer ------taattcctcctattatatttaaaaataactaaac Protospacer ** **.****** **************
363. spacer 20.81|3463239|37|CP020380|PILER-CR matches to NZ_CP013238 (Clostridium butyricum strain CDC_51208 plasmid pNPD4_2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
attttcaactcatcatctccaatatcatctttactta CRISPR spacer tctaagaatccatcatcttcaatatcatctttatttc Protospacer .* **..********.**************.**
364. spacer 20.84|3463435|36|CP020380|PILER-CR matches to AP014374 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S42-C54, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
acagttcctgatgttgagaatccttctttgcccgta CRISPR spacer acagttcttcatgttgagaatccttcaactacaaaa Protospacer *******.* **************** . * . *
365. spacer 11.17|1946697|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP011075 (Brevibacillus laterosporus strain B9 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
gctgtatttataattttttatatttgagtaaattagc-- CRISPR spacer ttcacatttataattttttgtgtttgagtaa--cagtca Protospacer ....**************.*.********* .**.
366. spacer 13.4|2895038|35|CP020380|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP031276 (Staphylococcus xylosus strain 2 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
tttgcttataaagtagtagacgaagctaaaaagct CRISPR spacer gaaaaatctaaagcagtagacaaagctaaaaagaa Protospacer . * *****.*******.***********
367. spacer 20.32|3462777|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694760 (Marine virus AFVG_250M661, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
aaaagaacttggagttaaagaaaaagtatttgtatca CRISPR spacer cgatgcgacgggagttaaagaaaaaatatctgtatct Protospacer .* * . . ***************.***.******
368. spacer 20.41|3463368|38|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MN602039 (Staphylococcus capitis strain APC2923 plasmid pJOS_01, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.711
cagaattcatcacaaatttatgctaaaattttattgaa CRISPR spacer tttttctcatcacaaattttttctaaaattttaagtaa Protospacer . .************* * *********** **
369. spacer 20.44|3463565|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP019826 (Leptotrichia hofstadii strain JCM16775 plasmid pJCM16775-3, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
agttttgatattttcttttaatacatttaaaaaatag CRISPR spacer ttgcctgttattttcttttaacacatttaaagcaaaa Protospacer ..** *************.*********. * *.
370. spacer 20.65|3462183|38|CP020380|PILER-CR matches to NC_016820 (Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 plasmid pKLE02, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.711
agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacata CRISPR spacer ttatctcctcaagaaattaagttatttttaaaaacatt Protospacer * . .*.****** ************ *******
371. spacer 20.65|3462183|38|CP020380|PILER-CR matches to NZ_AP017937 (Leuconostoc mesenteroides strain LK-151 plasmid pLm151-a, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.711
agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacata CRISPR spacer ttatctcctcaagaaattaagttatttttaaaaacatt Protospacer * . .*.****** ************ *******
372. spacer 20.65|3462183|38|CP020380|PILER-CR matches to NZ_CP014602 (Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides strain DRC0211 plasmid pDSK2, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.711
agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacata CRISPR spacer ttatctcctcaagaaattaagttatttttaaaaacatt Protospacer * . .*.****** ************ *******
373. spacer 20.65|3462183|38|CP020380|PILER-CR matches to NZ_CP014602 (Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides strain DRC0211 plasmid pDSK2, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.711
agagtggtttaagaaaataagttatttttcaaaacata CRISPR spacer ttatctcctcaagaaattaagttatttttaaaaacatt Protospacer * . .*.****** ************ *******
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
202435 : 245444
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP020380|202435:245444|DBSCAN-SWA AATGAAAATACTAGGTATGGATACGTCTTCTATGGCAGCAAGTGTAGCAGTTGTTGAAGATGATAACTTAATATGTGAGTTTACAGTAAACAACAAAAAAACTCATTCACAAAAGCTTATGCCAATGATAGAAAATATGTTGAGTATGAGTGATTTAAGTATAAAAGATATGGATTTATTAGCTGTATGTATAGGTCCAGGTTCGTTTACAGGACTTAGAATAGGTATGGCTACAGTAAAAGCTATGGCCCATGTAAATAATATACCAATAATAGCAGTAAATTCTTTGGAATCTCTAGCAAATAACATAAATTTCTGTGATAGAAAGATATGTTGTATATTAGATGCGCAGAAAAATCAAGTTTATTCAGCTAAATACAAGTTTGAAAATGGAGAGATGATAGAATTAGATGGTGTTGATGTTGTAGAGTTTGATGCTTTAGTAGATGAAATTGTATCAACTAATGAAGAATTTATAATAGTTGGAGAAGCTGTATACAAATATAAAGACAAGTTAGAGAATATAAAAAATATAAAAATACCTTCACCAGCTAATAATGTATCTAACGCAGGAAGCTTATGCTCTTTAGCATTAAATAAATATAATAAAAATATAGATGTACATACTTGTTATACGATAAATCCTATGTATATCAGAAAATCTCAAGCTGAAGTACAATATGATGAAAAAATGAAGAGGCTAAATAATGGAAGATAATACAAAACTAATAGTAGATGATATAAAAATAGAAGAAATGACTACAGAAGATATAGATGAAGTTTTTGAAGTAGAAAAAAATTGTTTTGAAGATTATTGGTCAAAAGAGTCTTTTAGAAAAGAGTTGTCTAATGAAGTAGCAAGGTATATAGTAGCTAAGTTAAATGGAAAAATTGTCGGATATGTGGGAATTTGGCTTATACTTGATGAAGGGCATATAAATAATGTGGCTGTTCATAGTGACTATAGAGGGAAAAAAATAGGGGACAAGTTGATTAAAAAATAGCTACGCACACTCGTGACTTTAGTCATGAGTTAGTAGCTAAAATAGTCAGCATATAGGGAAACCTATATGTAGAGATAGGATAGAACCTATCCAATACTACTTGAATTGCTGGAAACCCCTAAAGCTAATCAAACTAAAACATAAGGATGAAATAAACCTAAGTGTGAAAGTTACGAAAGTAGAAAAAATTGGTTAGATGGTATAAGGTTAAATCCTAAGTACTTTAAAATGGGCAATCAGCAGGTAAACTCCGAATAGGAGAAACTTCAACGACTATTCCTCTTGAGGGAAGTACACTACAAGCTATTGGTAGTGGAAGTGGGTAGACCTTAACGGATAATGCCGAAGGATAAGATATAGTCTGTGCTTACGTGAAAGTGTAAGAAGTTCATAAGAGAACTGCATAGGTAGTAGCGAACTTATGTGAACGACAACCTCAAAAATGATAAAAGTTAAGACTTACGGTTCTTAAATATGTTATTTAAAATTAAATATAAAACCTTCTAAATAATTGTTTTAAATAATTACATTTGTTAATATTATGATAGGTGATTAATAAATTGTTCACCACAGCATAATATATTAAATATGATAAAATCATTAAAAAGTGTATCAAAAAACAATTAAAGTGAGGTGATAGCAGTGGAAAAAGCTTATAAGTTTAGAATGTATCCAAATAAAAAACAACAAGAGTTAATTAACAAAACTTTTGGATGTTGTAGATTTGTATATAATAAGTATCTTGCTAAAAGAATAGATGTTTATAAAAACGATAAAGAAACTTTTACTTATAAACAGTGTAGTTCTGATTTAACCAATTTAAAAAAAGAATTAAAATGGCTTAAGGAACCTGACAAATTTTCACTACAAAACGCCTTAAAAGATTTAGAAAACGCATATGAAAAATTCTTTAAAGAAAAAGCAGGATTTCCTAAATTTAAATCAAAGAAAATTAATAGATTTTCATATAAAACTAACTTTACAAATGGAAACATTATGTATTGTGGTCAACATATAAAACTACCTAAACTTGGTATGGTTAAGATAAGGGATAAACAAGTACCTCAAGGTAGAATACTTAATGCTACTATATCTAAAGAACCAAGTGGTAGATATTATGTATCATTATGCTGTACTGATGTAGATATTGAAGCATTTGAAAATACTAATAATCAGATAGGTTTAGATTTAGGAATTAAAGAATTTTGTATCTCAAGTTGTGGAGAATTTATAGAAAATCCTAAGTATCTTAAGAAGTCATTAAACAAACTTGCTAAATTACAAAGAGAATTATCGAGAAAAACAATCGGTAGTTTAAATAGAAATAAAACAAGATTAAAAGTTGCGAGACTTCAAGAACATATAGCTAATCAAAGAAAGGATTTTCTACAAAAATTATCTACTAAATTAATAAAAGAGAATGATATTATTTGCATAGAAGATTTACAAGTAAAGAATATGATTAAAAATCATAAACTATCTCACTTAATTTCAGATGTATCATGGTCAGAATTTATTCGTCAATTAGAATACAAGGCTAATTGGTATGGTAGACAAATTGTAAAGGTAGGTAAATTCTTTGCAAGTTCACAAATATGTAATAAATGTGGGTATAAAAACGAGGAAGTTAAGGACTTAAATATAAGAGAATGGATTTGTCCTAGTTGTAATGAAACTCACGATAGAGATATAAATGCAAGTATAAATATATTAAAAGAAGGATTAAGACTAATAACAATTCAAAATAAATAACGTATGTAAGAACCGTAGGAACTACGGGGATAGCCTGTGGAGAATTAGTAAGACATATTTTAGTATGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGAAAAGGCATAGTTGATTTATGTAAAGATAATAATATTGCATCTATGACATTAGAAGTTAGAGCATCAAATAAAATAGCACAAAATTTATATAGAAAATATGGATTTAAAATGGGTGGAATAAGAAAAGAATACTACAGTGATAATAAAGAAGATGCAATTATAATGTGGAACCAATTAAAAGAGGTGTAGAGTTTATGAGTGATATAATAACATTAGCTATAGAGAGTAGTTGTGACGAAACAGCTGCATCAGTTTTAAAAAATGGTAGAGAAGTACTTTCAAACATAATCTCTACTCAAATCGAGACACATAAAAAATTTGGTGGTGTAGTTCCAGAAGTGGCCTCAAGAAAACATGTGGAAAATATTGATATAGTTGTTCAAGAAGCTTTAGACAAAGCAAATATAGGTTTTAATGATATAGACCATATCGCAGTTACATATGGACCTGGGCTAGTAGGTGCTTTATTGGTTGGTCTATCTTATGCTAAAGCACTTGCATATACTTTGAATATTCCACTTGTAGGAGTAAATCATATAGAAGGGCATCTAAGTGCAAACTATATAGAGCATAAGGATTTAAAACCTCCTTTTATAACATTAATAGTATCTGGAGGTCATACTCACTTGGTTGAAGTAAAAGATTATGGCAAGTATGAAATTTTAGGAAAAACAAGAGATGATGCATCTGGAGAAGCATTTGATAAGATTTCAAGAGCTATGAATTTAGGCTATCCAGGAGGTCCTATTATTGATAATCTGGCCAAGAATGGAAATAAACATGCTATAGAATTTCCAAGAGCCTATTTAGAAGAAGATAGCTATGATTTTAGTTTTAGTGGATTAAAATCTTCTGTATTAAATTATCTAAATGGAAAAAGGATGAAAAATGAAGAAATAGTAGTTGAAGATGTAGCAGCATCTTTCCAAGAGGCTGTAGTAGAGGTTTTATCTACTAAAGCACTAAAAGCAGTAAAAGACAAAGGATACAATATCATAACTCTTTCTGGTGGGGTTGCTTCTAATTCGGGGCTTAGAGCTAAAATAACAGAGCTTGCTAAAGACAATGGTATTACTGTTAAGTATCCTCCTCTAATTTTATGCACAGATAATGCAGCTATGATAGGGTGTGCAGGATATTATAATTTTATAAACGGGAAAACGCATGATATGAGTTTAAATGCAGTTCCAAATTTAAAGATAAATCAGTAGAGTTAGATGGATTTGTAAATATAAAAGTATTGTTTCAAAAAAGTAAGTAGAAGTGAAATTAAATATAATAAAAATAAATATAGTATATATTAAAACTTGAAGTAAAACTATTTATAATCTTTATATTCCAATGAATTGCAACAAATTTTAGGATATACAGATTGTCTTTGGCTTAGATTTGCTTCAAGTTTAATTTTTTTTATAGAAAGATTATTTTAAAAAGTGGGTAATATACCCTTTTTTTTCATTCTTAAAAAGTTTTATACTAATTATAGAAAGATTAAGGAGGGGAAGAAATGAGTCAAAGTAAAGAAGACAAAATAAGAAGTATTTTGGAAGCAAAAAATATTAAATCAAATTTTCAAAATAAAGAAAATTTAAGTGAATTTAATGAAAAAAAAGCAAGTAAAAGAGCAGAAGACTTATTAGATGTATATTATAATACATTATCTACTGCTGATATGGAATTTCCATATTGGTATAATAGAGAATATAGAAAATCAGATGGTGATATACCAGTAGTTAGAAGAGCTAAAGCTCTTAAAGCTGCTTTTTCACATATGACACCAAATATAATACCTGGTGAGAAAATAGTAATGCAAAAGACACGCCATTATAGAGGTTCTTTTCCAATGCCATGGGTAAGTGAAAGTTTCTTTGTTGCTCAAGGAGAACAAATGAGAGAAGAGGCAAAGAAATTAGCCAGTAACACAGCTGATGAACTTACAAAATTTGGGTCTGGTGGAGGAAATGTTACTGAAAGTTTTGGAAATGTCGTTTCAATAGCTGGTAAATTCGGAATGAGAAAAGAAGAAGTACCTGTACTTGTAAAAATGGCAAAGGAATGGGTTGGAAAGTCTGTTGAAGATTTAGGTTTTCACTATGAAAAAATGATGCCAGATTATGATTTAAAAG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35 | Geobacillus_virus(14.29%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
258863 : 318754
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020380|258863:318754|DBSCAN-SWA 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MGFKKLPDSELKVMKFIWGLDGNKVASGEVVEAMKQIYDWNKNTTLTILSKLAKKNYLYSQKTSKCTYYTIAVREKDYLKVETKKFFSFFHNNSLKSFFTALNDEENLSDDKLDMLEEWVKNWEEDE |
97 | Clostridium_phage(85.88%) | terminase,portal,capsid,tail,integrase,head | attL 263440:263457|attR 285258:285275 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
337382 : 353558
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP020380|337382:353558|DBSCAN-SWA 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14 | Synechococcus_phage(23.08%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
509069 : 522067
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP020380|509069:522067|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP020380|509069:522067|513547_513682_+|AXU34009.1|DBSCAN-SWA MWELLKDFLLVSVGTGIGVALMCILSVGKEADYEMKKLKESEDK >CP020380|509069:522067|513683_513905_+|AXU34010.1|DBSCAN-SWA MNFGQNLYQWFLSNAQSLVLMSIVVIGIYLGFKREFSKLIGFLVVALIAVGLVFNAGGVKDVLLELFNKIIGA >CP020380|509069:522067|509411_509795_+|AXU34005.1|DBSCAN-SWA MRLSNGFAIDKEKTFGELKFTAVRDVFLQNEDGTPSTQLKKRIYDLKCSLHGGIIPVSVPPEVPLREFPYNAVVELVNPVADTVSRKTYTGADVDWYVKAEDIVLKNKGNQNAGNPQNHAPQGQPKK >CP020380|509069:522067|512337_513534_+|AXU34008.1|DBSCAN-SWA MVLNEEQWIKELREKRIAYGISQGRLAVASGITREYLNKIESGKMKPSKELLNTLHKELERFNPEAPLTMLFDYVKIRFPTLDIQHIIKEILKLNINYMLHEDYGHYSYTEHYSLGDIFIYTSADEEKGVLLELKGRGCRQFESYLLAQQRSWYDFLMDALIDGGVMKRIDLAINDHTGILDIPELAEKCRKREYIGKSRSYKFYQSGELIKHREDDREYMGRTLYLGSLKSDVYFCIYEKDYEQYVKVGTPLEEADIINRFEIRLRNERAYYAVRDLLTYYDAEQTAFSIINQYVRFVDEEPDKRKNDWKLNERWAWFIGDNRQSLKLTTKPEPYTLDRTLRWVQRQVAPTLKMLKRIDKGNGTDYMKTIEQQAKLTEKHEMIIKQQTTPAKDLVES >CP020380|509069:522067|516402_518853_+|AXU34014.1|DBSCAN-SWA MFPIKYIDNNLVWNKDNEVFAYYELIPYNYSFLSAEQKFIVHDSFRQLIAQSREGKIHALQIATESSIRSMQEQSKKLVTGKLKEVAYQKIDEQTEALVSMIGDNQVDYRFFLGFKLMVTEEQLNLKNIKKSAWLTFKEFLHEVNHTLMNDFVSMPNDEINRYMKMEKLLENKISRRFKVRRLEIHDFGYLMEHLYGRDGVAYEDYEYQLPKKNYKKETLIKYYDLIRPTRCVIEESQRYLRLEHEDKESYVSYFTVNAIVGELDFPSSEIFYFQQQQFIFPVDTSMNVEIVENRKALTTVRNKKKELKDLDNHAYQTGNETISNVVDALDSVDELETDLDQSKESMYKLSYVIRVSAPDLDELRRRCDEVKDFYDDLNVKLVRPAGDMLGLHSEFLPASKRYINDYVQYVKSDFLAGLGFGATQQLGETTGIYMGYSVDTGRNVYLQPSLASQGVKGTVTNALASAFVGSLGGGKSFCNNLLVYYAVLFGGQALLLDPKSERGNWKETLPEIAHEINIVNLTSDKDNAGLLDPFVIMKNVKDAESLAIDILTFLTGISSRDSEKFPVLRKAVRSVTQSKNRGLLHVIEELRKEDTAISRNIADHIDSFTDYDFAHLLFSDGTVENAISLDNQLNIIQVADLVLPDKDTTFEEYTTIELLSVSMLIVISTFALDFIHSDRSIFKIVDLDEAWAFLNVAQGETLSNKLVRAGRAMQAGVYFVTQSSGDVSKESLKNNIGLKFAFRSTDINEIKQTLEFFGIDKDDENNQKRLRDLENGQCLLQDLYGRVGVVQIHPVFEELLHAFDTRPPVQRNEVE >CP020380|509069:522067|518852_521063_+|AXU34015.1|DBSCAN-SWA MKERLKGLLTKRKLFHFVKVAVLAIFISIVFLSLLGTVAHATGLVDDTVNTENLYSKYPLSNYQLDFYVDNSWGWLPWNWLDGIGKSVQYGLYCITNFVWTISLYLSNATGYVVQEAYKLDFINDMADSIGQSIQTLSGVTENGFSSTGFYIGFLLLIILVVGIYVAYTGLIKRETSKALHAVINFVVVFILSASFIAYAPDYIKKINEFSSDISTASLDLGTKIMLPNSDSEGKDSVDLIRDSLFSIQVEQPWLLLQFGNSNAEEIGTDRVEALVSASPEDEDGKTREEVVKTEIEDNDNNNLTIPQVVNRLGMVFFLLFFNLGITIFVFLLTGMMLFSQILFIIFAMFLPISFLLSMIPSYESMAKQAIVRVFNTIMTRAGITLIVTVAFSISSMFYNISTDYPFFMVAFLQIVCFAGIYMKLGDLMSMFSLNAGDSQSMGRRIFRRPYLFMRHRARRMEHRIARAVSAGGISGGVAGAVAGSAVAGKRAERKNTASKENRSNTTSSMGQRAGSKVGAVLDTKNKVKDKANAVKENIKDMPTQTAYAVYSAKEKAKSSVSDFKRGMVQEQQSRQTGRLEKQEQRKKNIADKRMELQKAQEARQAQRKADGSATTGATRPHERPATASTIPKPSAEKMQEVKRPATALTSKASEPVKTNVIKERPLSSGASDRKATQSAQPVHRQNVEKVVSQETRQNDTKDRRIKVQQTQSVQKNQQTTEKSRNLVTKKGQKKK >CP020380|509069:522067|509069_509396_+|AXU34004.1|DBSCAN-SWA MEMKYVVPDMAQSFGTLEFAGESEPVFERDKNNRRVLARRSYNLYSDIQKGENVVVEIPVQAGEKHFKYEQKVKLVNPKLYGRGYAIGDMGHTDYVLVADDIVAVEEK >CP020380|509069:522067|510759_512154_+|AXU34007.1|DBSCAN-SWA MRMIWNKGHRIRASDKHLVYHFSIGTLLFVFVAVILLLNSKQLMRTDWEHFSLLENGLTLSPYNFITILIATGICALVAFLYYRFCYDSFKKLLHRQKLARMVLENKWYEADTVQDSGFFTDLQSRSREKIVWFPKIYYQMEKGLLHIRCEITLGKYQDQLLRLEDKLESGLYCELTDKTLHDGYIEYTLLYDMIANRITIDEVRAENGCLRLMKNLVWEYDALPHALIAGGTGGGKTYFLLTLIEALLHTNAVLYILDPKNADLADLGTVMGNVYHTKEEMIDCVNSFYEGMVQRSKEMKRHPNYKTGENYAYMGLPPCFLIFDEYVAFFEMLGTKESVSLLSQLKKIVMLGRQAGYFLIVACQRPDAKYFSDGIRDNFNFRVGLGRISELGYGMLFGSDVKKQFFQKRIKGRGYCDVGTSVISEFYTPLVPKGHDFLQTIGSLAQARQDGTATCEAKGDGTD >CP020380|509069:522067|514884_515388_+|AXU34012.1|DBSCAN-SWA MQETRVLVETRGTTGKETTSYWFDLPIDVAQFEEKLGVGAESQDYRIIEKVLPYADEVHEQTSVYQLNELDFMYRQLPADMQEEYIALLTVFENLEALYICRNVITVYPDCKSMIDVAKQKLMNDPTFKHLSEDCQAYYFDFEAYASHLLENRRYLVTEHSVFELPE >CP020380|509069:522067|513978_514581_+|AXU34011.1|DBSCAN-SWA MKKAMIYVHGKGGSYLEAEQFKNICLDFDVFGVDYNDYFPWIVKNEIMEVYDKISEKYDYIYVLANSIGAYFTMHTLQNFKIEKALFISPILDMEQLIVDMMSWANVSEKELSERKEIPTDFGETLSWEYLCFVRENPINWKTPTEILYAEHDNLTSRQTVDKFIDRHCANLTVMNDGEHWFHTNEQIFFRDNWLRKVIQ >CP020380|509069:522067|509896_510661_+|AXU34006.1|DBSCAN-SWA MDSWFTVEQIDQDTFVISEYKHWEETHCYLLCGTKRAILIDTGLGVSNIREVIDGLTKLPVTVITTHVHWDHIGGHKYFRSIAVHEAEKEWLSVKFPIPLQVVKNNIMCNPCDFPSDFKVEKYQIFQGVPQMILHDEDCIDLGNRKLVVIHTPGHSPGHCCFYEAGRKYLYSGDLIYSGCLDAFYPSTNPQEFWKSVRKIQSLKISRILPGHHHLSIPVTIIDKIETAFHNLSNEGKLKQGNGIFSYEGFQIHI >CP020380|509069:522067|521059_522067_+|AXU34016.1|DBSCAN-SWA MKLKHIALIGSLFPILFSLVLFFGVLISADSDDENSNFSSSITGMNLSAEVLKHQPMVEKYARENGISEYVNVLLAIIQVESGGTAEDVMQSSESLGLPPNSLDTESSIKQGCKYFASLLSSCKNQGMDDLNVAIQSYNYGGGYVGYVAGNGKKHTYNLAESFAREKSGGKKVTYTNPIAVAKNGGWRYQYGNQFYVELVNQYLTVPQVSGELAQKVMNEALKYQGWKYVYGGSNPNTSFDCSGLTQWCYGKAGISLPRTAQAQYDATQHLPLSQAKAGDLVFFHSTYNAGTYVTHVAIYVGNNKIYHAGDPIGYADLNNSYWQQHLIGAGRVKQ >CP020380|509069:522067|515405_515909_+|AXU34013.1|DBSCAN-SWA MIDDMAVYIANLGKYNEGYLVGAWFTFPIDEEDVKEKIGLNEQYEEYAIHDTDNFPIAIGEYVSIDELNEMYEMLEELPDYIVECLDEFIGHYGTLEEVVEHKDDIYYYPDCETMTDVAYYYIDELQALGDISPSLQNYIDYEAYGRDLDMGGCFIETSRGMCEIPY |
13 | Streptococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
584788 : 602191
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP020380|584788:602191|DBSCAN-SWA 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16 | Streptococcus_phage(91.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
804452 : 863758
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP020380|804452:863758|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP020380|804452:863758|830367_830643_+|AXU34262.1|DBSCAN-SWA MLELTKIIELLEEHKIEVSIPKELHKYSLLEYLELCQQSGGTYFYIKTLEGALKEARNELIIKLFNGKNYMELARMFEMSVINVRHIVRKK >CP020380|804452:863758|805663_806077_-|AXU34240.1|DBSCAN-SWA MYEALVSVCSLWLIMIKNIVLPPIKHKNRINIHMQKILHYIEEYYCENLILEYLSSSANISKSECSRCFKLSLNITPYKYFTEFRLLKATQFLKGTNELISDIAIKVVFHQIIYFSKCFKEKTGYSPKVYRNIKKEI >CP020380|804452:863758|833894_835259_-|AXU34266.1|DBSCAN-SWA MKESNKRIKLLGSAPISKALLSMGLPTMIGMMITALYNLVDAYFVGGLGTSQMGAISVAFPLGQLVVGLGLLFGNGAASYIARLLGHGDNEKAGKVVSTSIYSSIIVGTLVIIVIMIFLNPILKLLGATKSIMPYAISYASIYVVSSIFNIFNVTMTNIVTSEGAAKTTMCAMLLGALLNMILDPIFIYTFGMGVRGASIATVISQIASTLVYIGYILSKKSIFSFRINECCFSKEIFSEILKIGIPTLIFQLLISLAITLTNMEATKYGDSVIAGMGAVTRITSLGSLIVFGFIKGFQPIAGYNFGSKNYDRLHIAIKTSILWTTIFCVVLGLILVLFPKSIISQFTSGDILLIENGSKALRANGVSFMLFGFYTVYSTLFIALGKAKEGGFLGMYRQGICFIPIILIIPVFYGLNGILYAQPIADLMAAIIAGFMSIRLHKELNLLKINCMH >CP020380|804452:863758|809449_809863_+|AXU34243.1|DBSCAN-SWA 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52 | Clostridium_phage(41.67%) | transposase,integrase,protease,coat | attL 862611:862645|attR 870343:870377 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1283266 : 1335037
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP020380|1283266:1335037|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP020380|1283266:1335037|1290393_1290903_+|AXU34650.1|DBSCAN-SWA MSTLYELTTDLLEIEEGLTETTGNEAEKLEEIKEIIKQEIQNKNTRIVSVILNIDSDINSIDSEIKRLQELKKVKKNTLDRLKSNIKDCMELLGTKKVETVLGNISIRKSAGSLVIEDEEKIPAIYKTVEQVVKVDKNTIKDFIKKGHEVEGCRIEYGTTLTIPKAKKE >CP020380|1283266:1335037|1318644_1319493_+|AXU34697.1|DBSCAN-SWA MWEKFKNLNIFLKIILILVLIPITILVLGAFVAGWPIFLVAGVALFLLITGYKKKKRIRLIIGAILACFVVYIFATADYSKENMARITNETRLKEEAKQKEKDKKELEKIKQEEKVKAEEQKKQEEAKKKIEEQKKQETDKKTKEEQQKKKDEEAKTTSEEKQNNKAEKNLSKKELKEKVESVIPNNFKDKATYYADMLTPTKGDGYIVSIQVENSKFNNESECRKFTKEFVNNVKDIKNISSVRINFVVDGALSYNVFLDDWNNIKNNLDLIDNLSFKLTE >CP020380|1283266:1335037|1296931_1297141_+|AXU34667.1|DBSCAN-SWA MYEYILRWQIGLSLENRKIHYTYGSKEALRKKAKALAKDENIVLITIDKVDEVIKNTISEKIIERFKNL >CP020380|1283266:1335037|1312668_1313079_+|AXU34690.1|DBSCAN-SWA MIEFNSLDTLIRDLEREGREMSKNLRRAKNNIGNKLLRKVKPKTPVAKVDGGTARKSWKYKEPNLFEGVVSNNVEYIYHLEYGHRTRQGTGTSENYRPKPGGISFVPGVFMLARSVDEMSSIIDDELNQIIIDFWN 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MSLIKYRGYDFENEKWIYSETIKWSDAVDCLFMLKENCEWQKVSNVGVFSKCWSGNNEEIYEGDILKEPYNTKNKYEYGIVRQENYALELYVEWHYLKQFEGKWEEITSKATIMNSKKYVVVGNECENLEEVRKEFLESKEKLENENTNAVN >CP020380|1283266:1335037|1314634_1315066_+|AXU34693.1|DBSCAN-SWA MATSYEPRNVINGTYGEVWINNEQIAECKAMKAEIKFDKAEIVRPRKIIKGQKIIGASAEGSLTLYHVDSKILDYVTQIIKEGREPKFTITSKLSDPDSFGTERIAITGVSFDGLTIIDWENGKEGEKEVSFTFEDYNPIQTI >CP020380|1283266:1335037|1332716_1333190_+|AXU34719.1|DBSCAN-SWA MNKQKIKRFLKIIDKNMNEIKEEAIKAYKESFLAKDNNIRIYINLAGKVEAVVVPSWSRYIEDTYEKEIFVCEFDKEEINLNELLGELCYLNDYEEFKKWCEIENEDLKWDSYKKFNKDNFDEFIERNIEYSLSDFLKELSESIENCKQDLKLMIEI >CP020380|1283266:1335037|1322628_1322991_+|AXU34702.1|DBSCAN-SWA MSEDICKKDGDIMANPINEFIGIIREEGKHYNEPSFFVGKIKSKLPDLKIEVKNIILEKEDILIDSWILDRQIETFNTEANQEHKHEVKNPFIDKFELDDTVIMFKISDKFAVVSKLVSL >CP020380|1283266:1335037|1299163_1299538_-|AXU34671.1|DBSCAN-SWA MTILSYLQASNTFIILSIILGILMAINDNKKQLLKFKILNYCFFICMSISYIFSFLVFFQDFNSNILEIIAHILSIILLIACNRVATKNALNTSLYTLLAFWFSPLFATILLFWIHKPHKYLNS >CP020380|1283266:1335037|1289178_1289376_+|AXU34646.1|DBSCAN-SWA MAINDNINKILKDRDLKAWKLAKEIGVDSGNLYAILRGENKNPTIDTLIKIADYLDITLDELVGR >CP020380|1283266:1335037|1322990_1323419_+|AXU34703.1|DBSCAN-SWA MSTIFPFIGVSEDYEIPKTEELELFREVAWNFEKDEPILENGDFKIVEGNEAIKVWVYKCIKTNRYEHEIYSWGYGTELSELIGQKYSKGLTESEASRYIKEALLVNPYVLDVNISNTRFIDDLLSVDIVINTIYGEVEVNV >CP020380|1283266:1335037|1310766_1311705_+|AXU34686.1|DBSCAN-SWA MANVIEYAPIIQQTLDEAAIQTLLTGWMDANAGKAIYNGGKEIKIPSLEVDGLGDYNRGSSDGYANGDIKFGYETKTMTQDRGRKFTIDPNDVDETNFALTASEIMGKFQRTKVIPEVDAYRLSKLATVAISIENDTNVEYGYTPHKDTVISKIKKGITTIREAGYTGELVIHLTYDTLTAVEEKTLEKLMAIDFSKGGITTKVPTIDFCPLIATPQNRMYSSITLYDGKSEGQKQGGYVKGSKALDCNFIIAGRDVPIAVTKQDQMRIFDPLTYQGGNSWAMDYRRYHELWVTNLNSNLVYANFKDAKPTA >CP020380|1283266:1335037|1333431_1333731_-|AXU34720.1|DBSCAN-SWA MDVEQSKKVYLQVGKELSEKMTKSELNKFSQEVTNYLQFAGFDKNMKIKLFQTIIEVVARKKVSLPNDSKFTQGILQSDEAEMTTNVGFIIEGLSYHNN >CP020380|1283266:1335037|1302758_1302890_+|AXU34675.1|DBSCAN-SWA MGILEGATKIREIAKKIAIEKGITEQEAWNDAIKEYKEKYEFN >CP020380|1283266:1335037|1284834_1285056_-|AXU34638.1|DBSCAN-SWA MLKELRKKKKLTQIELAKRVGCHRSQISRLENNEDKDLTISILIELEIALGLEEKYLVNYFADEYIKKRKLHK >CP020380|1283266:1335037|1330857_1331154_+|AXU34715.1|DBSCAN-SWA MLIQEKSFYPNNIYLKIDFLKIKRQLKSIYNNDLSDCGSICIIERKDYSLSVNSIGEVNIYYDLKFKQCVQDAIREIEGMFKSQIRSFYLIDRLEGSN >CP020380|1283266:1335037|1324461_1325070_+|AXU34705.1|DBSCAN-SWA MKLIDKLPSFYNNDITRKIQDAYDIELETLRETYDDTFDQFFVDTATWGLDYWENILSIKNRFDLSIEDRRSNIKAKMRGKGTTTIEVIKAISEAYTKTNVNVEVFSNLFSFTLSFITNNCSYNTILELDKKIEEIKPAHLEHKFERILFNKNELYTGAAISTGETVTIYPYVPRNLESFGEIAICSGNDRALEKVTLYPKK >CP020380|1283266:1335037|1315585_1315732_+|AXU34695.1|DBSCAN-SWA MYLMFRYHDMMPADFFKLKYGEKHVIRAFMYQEIDERIEEIKSFGKGL >CP020380|1283266:1335037|1295780_1296854_+|AXU34666.1|DBSCAN-SWA 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87 | Clostridium_phage(88.75%) | portal,tail,integrase,head | attL 1285555:1285571|attR 1305997:1306013 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1524113 : 1533788
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP020380|1524113:1533788|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP020380|1524113:1533788|1527334_1527775_+|AXU34912.1|DBSCAN-SWA MSDKELSILLLESMNNFHNLIKIINNERYKKDKVLTERQFFALVKIRKHDKIELKNLSRDLHVSTSSLCILLNKLVEQEYVYREEDSRDRRNTFYGITKNGEKILDNEILKFVSIISDKMDCLDIDNKDKLFTSLEESKNIIEQLF >CP020380|1524113:1533788|1527790_1529242_+|AXU34913.1|DBSCAN-SWA MNIKYSKEILKSLENAITVVALFEGEDVSTTFDKINMISRNFNSKENSIDTVTLVENDNLVNVCLVGFGKRELLNREKIRIIGGNLCKKLKNILKNEVYKSSDVNILNLNLNSDEIGSFAEGILLGNYKFDKYKTKSKDFERKEVDTITIFTEKEVECQIEKAKILASSTIIARNLVNEPSNVIYPKTLAIETVKLGAEFGFNVDVYEEEKIKALGMDAFFAVSRGSINKPRFIVMRYFGDKESTDILGLVGKGLTYDTGGYSLKSNASMLDMKTDMAGAASVIGAMCAISQSKLKKNVIAVVAACENALSGGSYKPGDIISSMAKKTIEVLNTDAEGRLTLADAIYYIINNEKVTKVVDVATLTGAALTLLGNVATPIVTNNDDFYCELEKAATLSGERVWKMPIYDEFKDMIKGEEADLKNTGGKNAGCITAGAFIGEFVGNTPWIHMDIAGTSTSSKSIGYKAKGATGEPVRTLYYLAEI >CP020380|1524113:1533788|1525374_1525914_+|AXU34909.1|DBSCAN-SWA MKREDIKYIIESVMFAYGEPISIKELNYIINKELSSKEIEIMLNLLIEEYREQNRGIQIIKLENKYQMCTNKDYAEYIKKIIEPKKKKSLSQATLETLTIIAYKQPITKVEIEDIRGVKCDKVLQTLFENELIREAGRLNKIGKPIIYKTTDEFLKLLNIESLEELPPIENYQEVVTNE >CP020380|1524113:1533788|1524113_1525223_+|AXU34908.1|transposase|DBSCAN-SWA MEKAYKFRMYPNKKQQELINKTFGCCRFVYNKYLAKRIEVYKNDKETFTYKQCSSDLTNLKKELNWLKEPDKFSLQNALKDLDNAYEKFFKKKAGFPKFKSKKINRFSYKTNFTNGNIMYCGQHIKLPKLGMVKIRDKQVPKGRILNATIPKEPSGRYYVSLCCTDVDIEVFENTNNQIGLDLGIKEFCISSCGDFIENPKYLKKSLNKLAKLQRELSRKTIGSLNRNKARLKVARLQEHIANQRNDFLQKLSTKLIKENDIICIEDLQVKNMIRNHKLSRLISDVSWSEFIRQLEYKANWYGRQIVKVGKFFASSQICNKCGYKNEEVKNLNIREWICPSCNETHDRDINASINILKEGLRLITIQNK >CP020380|1524113:1533788|1530269_1530410_+|AXU34915.1|DBSCAN-SWA MGIIESASKLAEMVHLLAVEKGITDIEAWDEAVKEYSKIYEERKNE >CP020380|1524113:1533788|1531976_1533788_+|AXU34918.1|DBSCAN-SWA MKKKAALATLAMLPLSVVNAHADGDIGIVTINYLNVRNEPTAESSIAFVAKKDDKVLIKDSSNGWYKIKAESGQEGWASSKYIAKSNSDSLRTSTNKEKQVTSNSLNMRNGAGTSYRVITVLKKGQKVEVISESNGWSKIKYDGRLGYVSSSYLGDVSNSTNKSKTKQVNTTSLNVRSGPNTSYGLLGKLSKGSKVEVISESNGWSKIKYNGKDAYVSSMYLSDVSQSNSDNSSQSNDKKNTDKVVNTASLNVRSGPGSTYSKLGKVYKGSKVTVLSESSGWAKINFNNKEAFVVGNYLSTSPDTSNNNSDNSSNSNGNNSSSSGQVNGMSGISGAKIDYKSLSYTLESHISKQVEKAASGGNVIAPSNRRSTPSPEFSTFSAQRTSSFVNASSSDIEYYLNPKNFTNTTKGMMQFLKINSYRDGISESSLNSYLNGLSSSVFKNQGAAFINAAKKYNIDVVYLVAHAMWETAYGKSTLAQGQTLTSYKGQPLKKPVKVYNFFGIGAIDKSANVSGAEAAYSNGWTSVEATIDGSAKWISQNYVNSSKYNQNTIYKMKWNYDYTWHQYATDVNWANGISGIMENLIGLYGGGSSLVFEVPQYK >CP020380|1524113:1533788|1526658_1527087_+|AXU34911.1|DBSCAN-SWA MRATGSIQSLMETTLETIKGSIDANTIIGDPIKTDTTVVVPISKVTIGFGIGGGEYSKGYDDKDREIELKNEKSDTNFAGGSAGAISVQPVAFVVVESGETRIMSLDSNINLVDNILSITPRVLEKIQNISQSNKNQDKNNM >CP020380|1524113:1533788|1529332_1530001_-|AXU34914.1|DBSCAN-SWA MFKIFLFSSEQFVSLFIFGLFLYYCPKLTKNILPYSYTVEKIICTLLVIIIALEQLLLISSGNYSTLNSLPIGINYICIYLCIAILVFKQYHLFNIFFSWSLVCSVGELIFSKNLGYEFPSLIYFIFIFSKCLIIYADIYMVDVRKFKVNRYALRDNLAICFIYFSFIFLLNTFTNSQYYYGFLSHSTTAIFTFIFVTSIMYIPALLFNRDTFILEKKKKSK >CP020380|1524113:1533788|1530584_1530905_-|AXU34916.1|DBSCAN-SWA MKLKTISLPELNNLDPTLESTFIKMGEEQGELAECIGKFRNLSGENNDLDEVDIIKKTAKELMDVAQTCVTMMFKLEEQYGINLDEIRKEHIKKLEKRGYIKNMDK >CP020380|1524113:1533788|1531024_1531762_-|AXU34917.1|DBSCAN-SWA MDANSLKDLIANHNNIVFFGGAGVSTESNIPDFRSSTGLFSQKLNKQFTAEQLVSHTFFVRYPEEFFEFYKDKLIYPNAKPNNAHIALAKLEEMGKLKTVITQNIDGLHQMAGSKNVLELHGSVHRNYCTKCGKFFDLESMLNLGGNIPYCDNCGSIVKPDVVLYEEALDSDVITKTISAISNADLLIIGGTSLAVYPAASFIDYYKGDYIALINKANTVYDKSASLVINKPIGEVLYEAVLRQI >CP020380|1524113:1533788|1526075_1526705_+|AXU34910.1|DBSCAN-SWA MELNELFNFKYLIIAVIFIISVTMLILISHINILIIADINNKDICLKLNIKYMFNLININRQFYPAENSKNNDKKEGMKNNIDSSILLADDLLSIYRLLKKIKIHELYSNINFGTGNIGLTSSVYVLINTLYGNLFNIIDAEKMYLNVNPDFTKDYVLGNIRIHIRPRIKALFNIIIMINKIMNKNKGNKEGDSNESNRFDTESYGNNS |
11 | Geobacillus_virus(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1588110 : 1612426
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP020380|1588110:1612426|DBSCAN-SWA 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29 | Clostridium_phage(54.55%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1691380 : 1701109
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP020380|1691380:1701109|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP020380|1691380:1701109|1694809_1695382_+|AXU35064.1|DBSCAN-SWA MNKVDKEKIQHAVREILEAIGEDPDREGLIETPNRVARMYEEIFSGLSEEPRDHLKVLFADEKHEELVLVKDIPFYSCCEHHLVPFFGKAHIAYLPKGGRLTGLSKLARVIDTLAKRPQLQERITKNAADIIMEELQPYGVLVVVEAEHMCMTMRGVKKPGSKTVTSAVRGIFEKDIASRAEAMSLITMK >CP020380|1691380:1701109|1699942_1701109_+|AXU35070.1|DBSCAN-SWA MENKSNKKELKKVTAKTLIEKGKKQGSLTLAEIMEAFSETELDKDQVENLYETLGNLGIEITETKNYKADIDFSVADDDLSIGHLDEDAEAISHDDSSAIEIETVDLSLPKGISIDDPVRMYLKEIGKIPLLKPHEEVEFARRMHEGDEIAKQRLVEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNLGLIKAVEKFDYTKGYKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVSRQLLQELGRDPKPEEIAKEMEMTEDKVREIMKIAQDPVSLETPIGEEEDSHLGDFIPDDDAPAPAEAAAYSLLKEQIEDVLGSLNDREQKVLKLRFGLEDGRARTLEEVGKEFDVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKKLRDYLD >CP020380|1691380:1701109|1697094_1697880_+|AXU35068.1|DBSCAN-SWA MKENLFNNNSKIEINTNNKKITVKKDKLIIAGPCAIESYEQLLETAKFVKSQGANILRGGAYKPRTSPNSFQGLKKEGLEILKAVKDEVGMAVITELMDVRDMDELYSISDIIQIGSRNMQNFTLLSEVGKQNKPVMLKRGIASTITEWIGASEYIAIEGNSNIIMCERGIRTYNDYTRNTLDLAAVPIIQKETGLPVVVDPSHATGVRYLVKPMSLASFACGADGIMVEVHPDPENALSDGAQSLCFNEFEDLMKSINNY >CP020380|1691380:1701109|1698134_1699925_+|AXU35069.1|DBSCAN-SWA MNDIKDIIEEIKARCDIASIISEYMNIKQSGANYKGLCPFHGEKTPSFYINTSKQIYKCFGCGEGGDVINFVMKMENLDFMDAVKILANKCGIEINTNMNEETRIKIEKSKKFQDIHTEAARFYLSNLLGSKNLGYEYLRIRGLDDKIIKKFGLGFSLDSWNSLMNTLISKGYKKQDLLECGLIAKNRDGTNCYDKFRNRVMFPIFDYRGNIIGFGGRVLDDSLPKYLNSPDTLIFNKKQNLYGLNFARKNLESKTIVLVEGYMDLISLYQYSIKNVVATLGTALTEQQGILIKRYADTAIISYDSDEAGIKATLRAIDILTKLGINVKVLDLKDAKDPDEFVRKYGLSDYKKAMDVSTHYIKYKIDHLKKEFNIQKDEERVKFAKEASKIIKQLTSPVEIDFYTKYLSNQIDINVESIKREVYGKNYNKPYNNKNQKKIEEKVIEKVEVRQDGKQLVEETLIKIMLEDKKIREIALLKVEESDFLLKESKEILNYMIKNQELDKITIDKLKSLNISEEYLKELNSISLNSINLENTKEIEGIITNIRKNSLEEQINSLLREQQELENNNDMKEVDGRVMEIALKIVEINKILKSL >CP020380|1691380:1701109|1696607_1697114_+|AXU35067.1|DBSCAN-SWA MNKAYLGIGTNMGDRFDNLSRACELLKNSDSIYKVKESSLYETKPWGYTEQADFLNMCVEIETEFEPYELLEYCQEIERELHRERIVHWGPRTIDVDILFFNDVVSTDERLTIPHPSIQDRAFVLIPLMDLNEELIINEKTIKEHLNLLSAEEREEVKELVGYERKPI >CP020380|1691380:1701109|1696249_1696615_+|AXU35066.1|DBSCAN-SWA MDKILLSNLGFYGYHGVLKEENFLGQKFFVDMELYIDSREAGLSDDINKSVSYAEVYNVVKDITENKQFNLLEALAENIAEEILNKFILINGVMVRVRKPEAPVNGIYDYFGVEIRRTRDE >CP020380|1691380:1701109|1694082_1694784_+|AXU35063.1|DBSCAN-SWA MIGCIYEVYNEEMTKIIENQNTLAVYLVGSSKDVDFTLYDVEINDIDVFVFVKEGEKQERILFKKKGIEFDINYFSKDGVKKLLSNREYFFVKEMKDAKVLFDRENISHIIKDISRDIYLEGPSKISLEEKSFIKQDIGAKISNLKNKEKFDGFEYHFLTNLYLKDIIIGYFNINDKWVPKDKKLLKVLKKENNELFELVSKVSENYDYQRLLDVYNYIFKEIETKEVIKLIF >CP020380|1691380:1701109|1695447_1696239_+|AXU35065.1|DBSCAN-SWA MFDYGKRTYIMGILNVTPDSFSDGGDFNNLDIAIQHAKDMVDQGADIIDLGGESTRPGHSYVDSDEELRRVIPVIKKLKQELDIPISIDTYKADVAEEALKLGVTMVNDVWGLRKDKNMASVIGKYDAEVCIMHNQDGTNYDKDIMESIKDFFKVSIEMAISCGVKKEKIVLDPGVGFGKDFEQNIEVLRRLNELKDLGYPILLGTSRKSVIGKVLPVEPKKRLEGTIATTVLGIRDGVDIVRVHDVYENLMAARMTDAIYRK >CP020380|1691380:1701109|1693305_1694049_+|AXU35062.1|DBSCAN-SWA MKNNVGFDSSLSKFGIGLFETIRVKNGIAIDLNIHIERMLSSINCLDLDINYKKDFLINEIVTYIKKENVINKALRITVFDEGYNISIRDIPYNQETYEKGFRLAISPIVRGNSLIHRHKTTNYFENIYTKNIANKTGYNDGIFLNSEGVILECSMSNIFFIKGERVYTPSDRLPILNGIIKKRIIEICDELHIELIENEINISEISSFDFVFVTNSLMGAIKVTEIDKIKFNKENVVFDKIVKLLE >CP020380|1691380:1701109|1691380_1691965_+|AXU35060.1|DBSCAN-SWA MILMIDNYDSFVYNLVQYIEELGETVVVKRNNEIKISDIEELNPEVIVLSPGPCSPKEAGICIDIVEHFKGKKPILGICLGHQTIGHVFGGDIIKAQQPVHGKVYSINHTNKGVFRGLKNPLNVTRYHSLIIDSNTVPKELEITAITDKGEIMGIRHKKYLIEGVQFHPEAILSEYGHEMLKNFITEARERVHM >CP020380|1691380:1701109|1691966_1693316_+|AXU35061.1|DBSCAN-SWA MIREINTKLNSFEIFTIFRNEHDSFILDSAMDKEKLGRYSFISSQPFKVLKYKDTDENPLEVLKEELHKYRVVNDTNLPFVGGAVGYLSYDLGNYIENLPRTAVDDIEMPDMYFGFYNHVIVIDHLVQKTYIATPNIDIKLEEKIMDDIEQRILKEEKKGIDSICYEEKEVTPIRLKSNFTKEEFKNAVQSVREYIRQGDIYQANLTQRFSGETELTSFELYRELRRFSPAPFGAFLNFEDTHILSNSPERFIRCVNKRIETRPIKGTRPRGKDKEEDLKLQQELRNSEKDRAELLMIVDLERNDIGRISKTGSVKVPELFVIEPYANVNHLVSTVVGELKDDKDATDVIKATFPGGSITGAPKIRAMEIIDELEPTQRNVYTGSIGYIGFNGDMDFNIAIRTIIKNDKKVYFQVGGGMTWDSDPDEEYQETLDKAKSIMKALRGYYEE |
11 | Pandoravirus(37.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2149158 : 2156889
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP020380|2149158:2156889|DBSCAN-SWA TTTATAATTTATCTATTTCTTGTAATGCTAATTTAACAGTTTCATATCTATCAGCACCATTTATTACTACATCACCTTTTACAAGTTTATTAGCTTCTCCGCCTACAACATAAACCTTTTTACCTAAACCTTGCTTATAACTAGATGCTTCAATTATTAAAGAATCTTTCAATTGCCAATGTAAAATCTGAGCAGCCACTTTATCAGCATCACCTGTATAAACGATTACATTTTCATACACTTTATTTTCCCCTCCCCCTTGAGAATTTGATATAGATTTGTTTAGTATACCTTCTGCTATCAATTTAGCAACTTTATCGTTATTATTAACATAATAATCTGTATCTGCTTTACTATCTACAAAACATACTTCTATTAATATTGCTGGTGCAATAGTATGATTAAGCCAATAAAGGCCTCTAACATCAGACTTTGCACCCCTATCTTTGAATACTGTAGCTAACCTAGTATTCACTCTTTCTGCATAGATTTTGCTATTATTAGTCTTATATATTGTTTCTGTCCCTACTGGAGTTGAAGTTGTGACATTTGAATTAAAATGAATCTGAACAGCCAAATCAGTTTCCTGTTTATTTGCTATAGCACATTGGTCTGCTAAATGATTACTTGATTCATCAACTCTTCCTGTATAAACAGTAGCTCCACCTATTTTAAGCCATTTAACAATTAAGTCATTCAGTATTCTTGTTTCTTTGCTTTCGTTTATATACCCAACAGCTCCTGTACCTTTTCCAATTAAAGTGTGCCCTGGTATTATTACTACTTTCAAATTAACATCTCCTTTACAATTAAATTTAACTTCTATTTAATATATGCATAACCTAGAATTTTGTTTCTTTTTATATCTTATACTTTTATTATAATCCATTTTGTAAAAATATAGAATATTAAGTAAATAATGTTAAAATTATAATTTTGTATATAAGACATTACTTGATTGCAATAATTTTATAGCATATTCATCTATTCTATATCCAGTTCTATAATATATATGTTTAATTCCAGCTTGAATTATAGCCTTAGTACAATTTAAGCAAGGAAAGTGAGTTACATAAATAGAGCAATCTTTAACTGAAATACCTTCTTTTGCACAATAATAAAGGGCATTTTGTTCAGCGTGAATGGTTCTAATACAATGTCCATCTCTCATTTCATGACCAACTTCACTACAATGCTTATCTCCAGAAATACTACCATTATATCCAGTAGACACTATTCTGTTTTCTGAATTGACAATTATAGCTCCTACATAAGCTCTATCACAAGTTCCTCTTTCAGCTACTGTTTCGCACAGTCTCATAAAATATTCTTGCCATGAGCATCTATTTTCAAGTTTTTTATTCAAATCATATACCTCCAAAATTTATATCTAATATATAAGATTTATACCTTAAAAATAATATTAAAAACAAATTTATACGATAAATAAAATTTATTAATACTGTTTTTATGCAAAATTATTTTACTTTAAATTAAAGTTACAAGGAATCTAAAATTATATATATCTTTCTTTGTAATATGAATGTTATAATATAAAAAACTGTCTCAATAAAATAGAGACAGTTTTACAGTCAAAGTTTATAATACAAGTTCATATTTTTCTTTAAATTCTTTTACAGCTTCGGGCCATGCCTTTTGTTCTGTAATACCTTTTTCTTTAGCTATTTTAATTGCAATCTCTCTTATCATTGCAGCGCCTTCTAATATTCCCATTTTTAATCTCCCTTCAAATATCTTTTTGTATAGAATATAAATAGTGCTAAGATTTATTACATGCTGCATATACAATATCTATACAACACATAACTTATAAATTCCTTTTATTTTCATACGTCTTTAACCGACATATAATTATATTCAATAAGTTTTAAAATTATGAACTCAATTATAATTATTTTTATTTTTTTAGAATCTAAACACTAAAAATTGTAGGTAAATTTGTCTTATGCCTTTATAAATATTTCTACAGTTTTAATTACTGGACATATCTATTTTTATTATAAAAAGCGCTTAAAAATCGAGAATATCCGCATAAACACTGTATATAAGCAAAACGTTTAAAGGAAAAAGAAGAAATTTACAGAATAATTCGGAAAGCCCACTCTTTTAGGTGTGGGATGGATAGCATAAATAGTGTATAAAAAGTATTGACACATACACATACAACGTTAATATAAGTATATGGAGAATAAATATAGAAAAACTCAAACAACTGTCAGTTTAATTAATTATCACTTTGTATTCTGTCCTAGATATAGAAGAAAAATATTTAATATAGAAGGCTTAGAAGATAGATTTAAAACATTGGTTAAAAATAAGTGTAAGGAAATGGATATCGAAATTATTGCAATAGAATGCGATAAAGACCATACACATATGTTTTTAAATAGCCTTCCAACTTTAAGTCCTTCTAATATAATGCAAAATATAAAAAGTTATACAAGTAAAATATTAAGAGGAGAATTTATTGAATTATCAAAAATGCCTAGTTTATGGACTAGAAGCTATTTTGTATCTACAGAAGAAAATGTATGTAGTGAAACTATTAGAAAATATGTGGAAAACCAGAAAACAAGATATTAGAAAGTGAGGTGAACACTATGTCAAATTATATATTAACATTACAATTAAAAACGGAAAAGTTTCAAGAAGATATTATATATAATGCTTTTAATAAATATAGAAAAATATATAATTCATGTTTATCAGAGCTATTTAAAAGATATAACCACATGATAGAATCTAAGGAGTATCAAACAAATTGCAAATATAAGGGTAAAGATAGAAATAGAATATTTAATGATATTAATAAGAAATATAATTTAACAGAGTATTCACTTCATAATTTTATTAAACCTATTTGCAAATATTATTAAAATATTACATGATAAAGAAATAAATAGGCTAAAAGAATTAAAATTAAATGGTTATAAATTAATATCTAGTATGGGGATATAAAAACTATATAGGTTGATAAACGAGCCTAATATTAACGTTAGTGATGTCGACAGATACTTTGTTAATAAAAGTCTTAGGGAATATGATTAGTGATAATATGTTGTAGGTTATGATTTATTATAACTGAGAGTATTGTAGAAATTCATGTAGTACCTAAAAACTCCACACCTTTAGGCGCGGGAGTTTCAGTTGAATGTTAAAATGCGTTGCTTGAAGCAACGGGCAGTTTTGCCTATAATAGCGGTAACAACTGAAAGAAAGGTGGTTAGCCCTAATGTTAAGCGAAAACATTAAAACAATCAGGAAGTCAAAAGGACTTTCGCAACAAGAACTTGCTATCAAACTGAATGTAGTGCGACAAACAATATCTAAATGGGAACAAGGATTGTCGGTTCCCGATTCTGATATGTTGATTTCCATATCAGAGGTACTTGAAACGCCCGTAAGCACTTTACTTGGAGAAACTATTGTTGAGTCGGAAGTTGATAACTTAAAAGTGATTTCTGAAAAATTAGAGATTATAAACTTGCAACTTGCACAAAGAAAAAACATGAGAAGAAAAATGTTTCATTGGTTATTTATTTTATTATGTGCAGTCATAGTAATAGTTTTTGTGGTCTTAGGTGGACTAAATAGTCCTTACTTGTATTGGAATTATACCGACCCTGAAACCGTTGTTTTTGGAGTAGCTTTTCATGCGTTTGAGTGGCTATTTGTCAGATTAGCACCGATTGTCCTTATAGGGGCAATTATTGGAAGCTTTTTGACACGTAAGAAAATATGAAGCAACTCTGCTTTTTATAATACAGCAAGCGTTCCTTAAAAGCATCATTCTACATGACAATCGAAGACGACTATGTAAGGAAGAACCTTTTTGATTTCCAACTAAGCGAAGTCATTGAGGACGACAGCAAGCCCAAAACCGCATTAAGTAAAGTACAGGAAGCAAGACTGTTGGACTTATACGCTCATGCGTCAGATGCAGGAGCAAACAAAGAAATGCGAAGTCTGATAGCATGATTTACAACGATTTGTACAACGATTGCGAGTAGAAATATATGGAAATAAGTATTATCTACGAAATCAGAAAAGAAATGACTTGATAATTTACCCATGTTATAATTATTGATGTGAAATCAATAAATCGAAATTCCTTTTTGGGGTTTAACAATACTGAGTAAGGAAAAAGTGAATGACTTTTGCAAGGAGGTGTTAATATCAGACAAGTAAAGTCTTTTGTTTTTCCAGTTATATCCTTAATATTCTTAGACCAAATTAGCAAAGTTCTTATAGGATTATTCTTAATGGACTTTGAAATTGATATAATTGGGAAATTTTTAAGATTCAATCCTGTTCAAAATACAAATCTCTCTTATGGGGGAAACTTTATTGGTATTCTATCTAATTTATGGGTATTGGTATTGTTTAACATTTTAGTTATCCTAGTTATTATATCTGGATATGCTTTTTACAAATCAAAAAATGAACAAACGAGCTATTCAGTAAAAGTAATTATGTCTTGTGGACTTGCTGGTACAATATGTAGCTTGATAGATAAATTATTTTGGGGAGGAAGTTTAGATTTTTTGCAGATACCAGGCTTTTTTATTTTCGACTTAAAAGACTGCTATCTTACTGTTGCAGAAATAATATTTGTTATCATAGGAATTTTGCATAATAGAGAAATATCAATGAAAGAATACATATATTTTTGCTATTGTCAGTTTAAAAGATAAATTTAGAAGATAAATTTAAGTTTCAAGGTAAACTATTTAATCACAGCAAATAGTTGGCTCACTTCAGCTTTTGGGCTAAACTGTGAGCACTCATTAAGTCTCTGCTATCTAACAAACGGAGCACAAAAATGAAAATTAAATATTGAATATAAAACGCAGTTAATTTTGATTAAAAAGTTGGCTGTCTTTTCTTTTGTAGAAATTTAAGCATAGGTAATAAAGAAATGACTGCATTTATGTATAATTGGAGGCAATAAAAAGCCAGTAAAACCCATAAAATAGGGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP020380|2149158:2156889|2152410_2152920_+|AXU35470.1|DBSCAN-SWA MLSENIKTIRKSKGLSQQELAIKLNVVRQTISKWEQGLSVPDSDMLISISEVLETPVSTLLGETIVESEVDNLKVISEKLEIINLQLAQRKNMRRKMFHWLFILLCAVIVIVFVVLGGLNSPYLYWNYTDPETVVFGVAFHAFEWLFVRLAPIVLIGAIIGSFLTRKKI >CP020380|2149158:2156889|2150756_2150891_-|AXU35467.1|DBSCAN-SWA MGILEGAAMIREIAIKIAKEKGITEQKAWPEAVKEFKEKYELVL >CP020380|2149158:2156889|2150085_2150523_-|AXU35466.1|DBSCAN-SWA MNKKLENRCSWQEYFMRLCETVAERGTCDRAYVGAIIVNSENRIVSTGYNGSISGDKHCSEVGHEMRDGHCIRTIHAEQNALYYCAKEGISVKDCSIYVTHFPCLNCTKAIIQAGIKHIYYRTGYRIDEYAIKLLQSSNVLYTKL >CP020380|2149158:2156889|2153335_2153872_+|AXU35471.1|DBSCAN-SWA MQGGVNIRQVKSFVFPVISLIFLDQISKVLIGLFLMDFEIDIIGKFLRFNPVQNTNLSYGGNFIGILSNLWVLVLFNILVILVIISGYAFYKSKNEQTSYSVKVIMSCGLAGTICSLIDKLFWGGSLDFLQIPGFFIFDLKDCYLTVAEIIFVIIGILHNREISMKEYIYFCYCQFKR >CP020380|2149158:2156889|2149158_2149947_-|AXU35465.1|DBSCAN-SWA MKVVIIPGHTLIGKGTGAVGYINESKETRILNDLIVKWLKIGGATVYTGRVDESSNHLADQCAIANKQETDLAVQIHFNSNVTTSTPVGTETIYKTNNSKIYAERVNTRLATVFKDRGAKSDVRGLYWLNHTIAPAILIEVCFVDSKADTDYYVNNNDKVAKLIAEGILNKSISNSQGGGENKVYENVIVYTGDADKVAAQILHWQLKDSLIIEASSYKQGLGKKVYVVGGEANKLVKGDVVINGADRYETVKLALQEIDKL >CP020380|2149158:2156889|2155290_2156889_-|AXU35473.1|DBSCAN-SWA MKAAIYSRKSRFTGKGDSIENQIQLCIDYAKSIGVKDFLIYEDEGFSGSNIDRPQFKKMMQDAKDKKFSYLVCYRLDRISRNVSDFSTLIEKLNELNISFISIKEQFDTSTPMGRAMMFISSVFAQLERETIAERIKDNMYELARSGRWLGGNTPHGFNSEKITFLDENLKERSMYKLQVNDEQMEIVKLIYNKYLELRSLSKLYKYVYNNGIRGPRGGKFDPSSLSRILRNPAYVKANDEILDYLKNSGMDVVGTPDRKCGILTYAKNTANSIAAIAKHHGVIEPEIWLEVQNQLDKNRDKTPRISTGKTALLSGLIKCGKCGSNMRITYKGKKTDKDLKYYYICGTKKTLGSDSCNCKNLNGPLVESLVIDKIKNCKEESIISAFNSNNIKADNVFNVFKSETNLLKNQILDKERLIKNLVIELAKNTGSTASDYIVSQIESLNNEISILKDKINTLESSNINISSDSINIDIIVSNLKRFNDEVDNASLDDKRFLLSTIINSIVWDSSLGNLNIVYMGAEMDNSVSLSN >CP020380|2149158:2156889|2151778_2152054_+|AXU35469.1|transposase|DBSCAN-SWA MSNYILTLQLKTEKFQEDIIYNAFNKYRKIYNSCLSELFKRYNHMIESKEYQTNCKYKGKDRNRIFNDINKKYNLTEYSLHNFIKPICKYY >CP020380|2149158:2156889|2154295_2155096_-|AXU35472.1|DBSCAN-SWA MRLNKRSEGYINYVKGVKREKRNVLFYQLLILIGFIVIWELLADLNVINTFLFSKPSDIYNLFIQYAFSGQLFKHIGISVYETVLGLVIGTVLGILVAIALWWSEKLSKILDPFLVVLNALPKTALAPIIIVWVGAGIEGIVVTAVTISVVVTILSAYNYFMNIDEEKIKMLKSFGASKSQILFKLILPANTGNLINLTKINIGMAWVGVIVGEFLVSRYGIGYLIVYGSQVFKLDLVMMGVFVLAICAWAMYAVVNIIEKIYNSR >CP020380|2149158:2156889|2151359_2151761_+|AXU35468.1|transposase|DBSCAN-SWA MENKYRKTQTTVSLINYHFVFCPRYRRKIFNIEGLEDRFKTLVKNKCKEMDIEIIAIECDKDHTHMFLNSLPTLSPSNIMQNIKSYTSKILRGEFIELSKMPSLWTRSYFVSTEENVCSETIRKYVENQKTRY |
9 | Clostridium_phage(42.86%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
2642971 : 2650617
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >CP020380|2642971:2650617|DBSCAN-SWA TATGGAACCTAATCGCATTGAATGGCAGAAACGCTGCACGTTCAACGGCTTTTGCAAAGCGGTATTGAGAAATGAAGCTATCGACGCTATCCGAGAAAGAAAGTATCGGAAAAAGCATGAAGTCACTTTTTCAGACCTGTCGCCACAGGAAGAAAATCAGCTTTACACTTGCGACCAGTATTTTGTAAATGATGAAGCTGAAAAATCTTTCTTTGTCGCCGGGAAAGAAATTACGGCGAAACAGCTTGCCGACGCGCTTCACTCTTTGCCGGAAGAAAAACGTCAAGCTGTACTGTTGTATTACTTCTTTGATATGAAGGACGCAGAAATCGCGGAACTGATGAAGATACCGCGCAGCACAGTACAATTTCGACGGACAAGCTCTTTTGAGCTGTTAAAAAGATTTTTGGAGGAAAGCCGATGAATGAACAGATTAGCAACAATCCCGACGAACGCGGTTTATTGCCTTACCCAGTTATTTTAGCCGCAACAAAGGGCGACCCCGAAGCAATGAAAATCGTTGTGCAGCACTACGCAAGCTACATAGCCTATCTGTCTACCCGTAAAGTGCGTGATGAATACGGCAATGTTTATTACGGCATAGATGAGGATATGCGCGACCGACTGCAAGCGAAACTCATGCGGGTTGTTCTGGACTATAAGATAGACTGACATAGTATGTGGACGTTCCCCTTTCCGTTCCACATATTCGGACTATCGCAGCACCTTGACAAAGAAAGCGGCGCAAGAGAACGGCGACGCAGCATAGGGCAAATCAGATACATTCGATATGTGGGGAGCCGTTGGGCTGATACGCGATGACCGAGAGGAGGGAGAAACACCGAGCGAGAACTATCAGCGTTCCATAGCAGACATTGGCACGTCTGCCGCCACAATCCGCATATCGGTACAATGATACTCCCTTATAGCCACAATCCGAGCGTTAGAAGCGTCGCAGGTAATGGGTAGGGCTGCATGAGGACCATGCAGGGGTGCAATTCCCGTGGAGCTTGCCGAAGCCGTCTGATTAAAGCCCGCTTTTTATAAATCTGACTTTTTAGCCATTTATGAAAGGGGGTATTTTCCTATGGCAAAAAAGGAAACTGCAAGCCCCGCTATCCCTGTATTCCCTATGTTAAAGACCGTTGAGCAAATGAGCAAAGTTAGCGGTATCGGGGAAAATAAATTGCGCGAGCTTATGGATAGCGGCGAGCTTGAATATATACAGAATGGAAACCGCCGATTGATAGCTGACGCTGCTATCTGGGACTGGTATCACAGAGCAAAGAAAACAGCGAAGCCCCCGGCACGACAGGGAGGTTAATCTATGGCGGTATCATCAAGACAAGTTAAGAACAAACGCGACAGTAACGGCGTACTGACCGGGCGACCGGGTACAGTTTACGACGTGAATATAAAGTACACCGCCCCGGACGGGAAAAAGAAGTCTTATGCGAAAAAGGGCTTTGCCACCAAAAAGGAAGCGACGCAGCACGAAGCGGAAATGAAAACGAAGCTCCAAAATCCGGGGCAAATCGCGTCAATCACTTCACAGCGGAAACAGACCGTCGCAAGCTACCTTAACGATTGGGTGGAAAGCTACGCAAGAGTGAACTTGCGCCCCTCTACCTATGACGGGTACAAAAAGACGATTGCAAACTATATCAATCCCTATATCGGCGGCGTTGCCCTCAATCAGCTTACCCCCGCTATGGTAGACAAGATGTTTCAGCAGATTATCGACAAAGGCTTGAAACCGTCCACCGCTGCCGGGGCAAAACGTGTTTTAAGCGTGGCGTTGAGCCATGCCCGCAAATACCGCTATATCGAAACAAACGCGGCAAAGGACACGCTTACGAAGTTTGGAAAGAGCGACAAGACCCCCGACCCATACACGCCGGAACAGGTAAAAGCCCTTATGCAGCGCGTCGAGGGTACCGTTTGGGAAATGCCCGTTATCTTAGGCGGGCTTTATGGTATGCGCCGTTCTGAAATCCTGGGCTTGCGTTGGCGTAATGTGGATTTGGAAAACAACACCTTTGACGTTTCCGAGCAGCTACCCTTTAAGGTGCCGCTGAAAACAAAAGTCATTGAGGAAATGGCACCGCCGAAATCCAACGGGCGAAAGCTGCCTATCACAGAGCTTGCCCGCCCGTTTTTTCTCAAACAGTTTGCTATGCAGGAAGCGCAGCGCGAACAGGCAGGAAAGGACGGAAAACCTTACTATGATAATGACCTTGTTGTAGCGAAGCCGGACGGTTCCCCTATCTCCGCGTCGTGGGTATCTTCCCAGTTTGGAAAGCTGCTTGAAGATTTGGATATGCCGCATATCCGCTTTCACGATTTGCGCCATACGGCGGCTACGAATATGCACCAACTGACGGGCGACTTCTACACCGTAGGCGAAGTGTTAGGACATACGCTTGCGGGTATCGGCGTATCGCTTGGACTGTCTATGAACTTTGAAGCCGTTACCGCCCGCTATGTGGACGTGCGGCTTGAACGCAAAAAGGAAGTCTTAGACGCTTATCATGGGGCGGTCAAACAGGCTGACCCGGCAAAGGCAGAGAAAGCCGAGCCGAAGAAAGCAAAGAGCGCGGCAAAGAAAAAGAGCAGCGATTTAGAGCTTTAACCGCTGTATCTCTTTACCGCTTCTTATATCGTTTTATAGCCCCGCGTGGGATTTGGGCACCATTTGGGCACCATTTACCGAAAAAGCACCACTAACACAGGCGATAAAAGAAACGCCGAGAACACGCAAAAACATAAAGTTTATGCGGGTTTCCGGCGTTTTCTAATCCCTCAACCGACCTAAAATCATCTTGCGGCAGAGAGAAAAATTCTACTATTTTTTATTATAATTGGAATGTACATTGTTACATATCTACCAAGAGTGCTTCCTATGTTAATTTTCTCAAAAAAAGAGATGCCTGATTTTTTGAAAAAAATCATGAAATTTATCCCTGTAGCAATACTTACTTCCTTAACCACTAAAGATGTATTTTTTAATGGAGATAGCCTATATTTATCTATAGCTAACCCTAAAATTATATCTTTTATGATTGTACTTCTTGTTGCATATAAGTTTAAATCTATTGGTATTTCTATTATTACAGGAGTGATATCTATATATTTATTTGGAATTATCCTGTGATATTTGGATAATGTTTTATTGTATAAGTTATTTTAAAACTATATGTACAATTTTAATTTAAGTTGTTATATTATTGATTTTAAATAAAAAACAGAGTGGCTTAAAGTTACTCTGTTTTTACTCTTCATTCTCTACTGTAAATATTCTAATATATTATAATAAAAGCTTCTGACAGTCAAAAATATATGTATACTTAAATACTATTTCATTCCATATTTGTTATTTCTTCTTCATATTTTTGAAACTCTAAATTTGCTTTAAATAAATCTCCATCTATTTCTATATAAAATTTTCCACCTTGTAAATCTACTAAATCTCTTGCAATAGCAAGTCCTAATCCACTACCTTCAGTATTCCTTGATTCATCAGCTCTTTTAAATCTTTCCATAATCTCACTTGGGTCAAAATTTAATTCATAAGAAGATATATTTTTCATAGTTACCTTTACATTTTCACCATAGTCATATACATCAATATAGACTCTAGTTTCTTCTAAGGAATATTTTGCTATATTAGATAAAAGATTTTCAAATACTCTATACATTCTTCTTCCATCTGCCCATATATACACCTTATCGTTTGGAACATTTAATTTTAAATACAAATTATTTTTAGATAATTTTTCTTCAAGTTCACCTATACTTTGTCTTAATAGTTGCACTAAATCAATCTTGCTAATTTGTAATTCTATATTGCCACTACTTACTCTACTCGCTTCAAATAAATCTTCTATCAATAATTTTAGTCTTTTTGACTTTGACTCAAGCACATTTATATAATCATTTATATACTCTGGTTGTATTGATTCTTCTTTTTTAATTAAATCTACATAATTTATTATAGAAGTAAGTGGAGTTTTCAAATCATGAGATACATTTGTTATAAGGTCAGACTTCATTCTTTCACTTTTTACTTGCTCTTCTATAGCTCTATCAAGACCTTCTCCAATATTATTTATATTTTCAGCTAAAGACGTAAAATTATCATTCCCAGTAATTTTTATCTTATAATCTAATTCTCCCTTTTTTATTCTTTCTGTACCTTCTATTACGTAACTAAGATATGAAAGTCTTTTAGTTATATATATTGTGAATCCTAAAAAAATACATATAGAAAACAGTAATCCCATACCTATACTTCGAGTGCTAATTACCATGATTAAAGCTAAAGATATTATCACTATAACAATAACTTTTCTTGCTAAAGATACTTTCTTTATAGCGTTACTGACCTCCCTTACAGTTTTTATTAACCATAAAATCACTCTTACTATAATACTTGTCTTAAATATACACATTTTATTTTCTAAATAACTCAATTGCACATTTATAAAAAATATATTATTTGATACTATCAGTAAAGATAAAGAAACTAATACAATTACATCAATATGATAAGATACAGCAAGAGCATACATAGTTAAAATTGCAATTGAAATAAATACTAGTATTACATTAAATTCCATAGGTATCTTACTGTATATTAGTAAAAATACATTATTTCTTTTTAAAACTTCACCTTTTATTCTGCTATATAAAATGATAGATAATAAACACACAATTGCTAAACTTAAACTAGCTACAAAAAATAATCTTACTTTTTCTGTAGCTTGTTTAAATATTTGAAAATTAGTGTATACTATTCCATCTTCTATAGTTGGCTCTTCTGGAAAAGATACATATGCCTCAAAGGCTTCATCTACTCCATTTAGTTCCATACTCAGATTATTCAGTTCAAATTTTTCTCCATTTATTGTTTTAATATACGAGCTCTTTCCTACATTATTTATTATCTCTATATTACAATAGCTCTTAGTTTTTTGTTTAAAATCATCTAAATTATCATATGATGTATTTGTATAAAATACTCCTGTATATGTATTAATAACATACACTTTTATATTTTTTAGATAACCTAAATATTCTTCAGAAGCTTGTTTATTACTCATGATTTTATCATACTCAGAATCATTACTACTTAAATCTATACTTTTACTTTTTGTTTGGAGTTTACTTTTTTCTTCACTAGTTAACTGACTATCCACATATATCTTAAAATTGGATAATAAGCTTGCCACTGTTCCTTCATCAAATATATTACTATCATAAAAATCATTAGATATATTAAAAATCCCACTCTTTGTAGAAGTTTTTTGTATATTGTATTTAGGCTCAGCAAGTCCTATTGTCGCCAACAATATAGTTAATGGAAATGAGATAGATATTATGATTAATGAAACTAACTTTAATGCTCTATATTTTTCCAAGTTGCCCACCTCATCTACATTGTCAGTATTTTATATAAAATAAAGTTTAAGAAAAGCATAATCCCCATAGAGTAAATTAAACTCTCAGAGAAAAAATTAAAACATATTAAAATTCCTAACATTTGTGTAAATGTAAAAATGACTAAAATCAAAATGCAATTAAATATTAAACTCTTTTCTTTTATAATTTTTCCACTAAAATTTTTCAATCTTATAACCAACTCCCCACACCACCTTTAAAAATCTTGGTTCTTTTGGATTTATTTCAATCTTTTCTCTTATTCGTCTGATATGTACTGCTACTGTATTTTCTGAATTAAAACTTTCCTCATTCCATACTTTTTCGTATATCTCATCTATTGAGAAAACTCGTCCTTTATTTTCTAAAAGAAGTTCAATTATTTTATACTCAATTGGAGTCATTTTTATGTTTTCACCATCAATTTTTACTTCTTTTGTTAGTGTATTTAATTCCAAAGCTCCACTTTTTAAAATTTCTTTACATGCATCTTCATAATTACCTAAAGTTACATATCGTCTTAAGTTTGATTTAACTCTAGCTATAAGCTCTAATAGATTAAATGGCTTTGTTATATAATCATCAGCTCCAATATTTAATCCCATTATTTTATCTGTATCTTCACTTTTTGCTGAAATTAAAATTATTGGAATGTTTCTTTCTTCTCGTATTTTTACAGTTGCTTTGATTCCATCTAATTTAGGCATCATTATATCCATTAGTATTAGATGAATGTCATTCTCTGTTATTATTTCCAAAGCTTTCATTCCATCATATGCTTTATATATTTTAAATCCTTCTGATTTAAGATATATTTCTATTGAATCAACAATTTCTTTATCATCGTCTACTACTAATATATTGTACATATTTTCACTTCCTCTATTGTATAATAATACTTATCTATATTATACAATATCTTTCACTTCCTTTCTCAACAATGACTAAATTGTTATATTACTTTGGCTTACATTTTTGTAACTTTCCCTTATAACTATATAATAAAATATAAATCTTAAGAAAATATTATCCTAATTCTTAAATATTTCTTAAGATTTAAGATAAATTGAGGTTTATTTGAATAAATTGATTTGAATTATGTTGTTTTCAGATTACTTTTATTTAAGTATTTTGATTGGATTCAGCTGAATTAATGTATATTAATTCTTATTGAACAGTTTTTATTTTTATACATCCTATCTACTATACATATTCTATTAAAATTTATATAAATATAAGACAAACCTATTTCATTTTTTTAACATGTTCAGAATAATAAACAAAATGAAGGTAGAAAAAGTTATAATTTCATACCTTCATTTTATTTATTATGTACCTAGTTGTCATTTTCTTCTTTCAAATTCTTAAAATATTCTTCTAATAAATTTAAAATATCACCATCTACTTCATCGTCTTTACTATGTAATGCTGACATTAAACTTAATATTGAATTTTTATGTGTATTCTTTAAAAATTCTTTTGTTTAAAATCTCTGATATTATTTTTCTTTTACTAATACATTATAGTGTGTACGCTTATCTATTTTCTCAGTTTCTAAAAACTCTCTTCTTTGTAATCTTTTTAATACTGTAAATGTAGTTGTATCTTTCCATTCATATTTTTGTTCCATAGCCTCGGTGATATCTCTTGATGTTAATACCTTGTCTGATTCCCAAACATATCTCATAACTTTTAATTCTGCTTCTGGTAATTTACTAATTTTCATAGTCTACATCCCTTTACCAATTTATGTATATGTTAAATTCTATATCAATAAAGTTTTACAAACAAAAGAATTAAGGTAAATAATTACATTCGATTTTTACTATATCATTCTTTTAAGTTTCTATAATACTCATCTAATGGGTCTAACTTCTCTTTACTTACATTTTTATGTGTAGTGGTAAGTGAATGCTTTATTTTTCTGCTTTTACTAGATTTTAGTACCTTTTTCTTAAAAGTATAATATTCTTCATTATCTATTATTATTTTATAATGAGATTGAAATTTTATAATATCTCTAGCTAAATAACCTTTGTCCACTAGCCTTTTTAGTAGTATATTTATTGTACTTTTATGCCATCCATAAATCTGTTTTATTTCTTTTACAATTTCTTTTTTAGGCATTAGAGAATCTTTTTTCCATAAATACTCCATTACTATTAATTCTGCTCTTAATAATTTTTCTATTAATATTTCTTCTTTCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >CP020380|2642971:2650617|2643390_2643642_+|AXU35893.1|DBSCAN-SWA MNEQISNNPDERGLLPYPVILAATKGDPEAMKIVVQHYASYIAYLSTRKVRDEYGNVYYGIDEDMRDRLQAKLMRVVLDYKID >CP020380|2642971:2650617|2642971_2643394_+|AXU35892.1|DBSCAN-SWA MEPNRIEWQKRCTFNGFCKAVLRNEAIDAIRERKYRKKHEVTFSDLSPQEENQLYTCDQYFVNDEAEKSFFVAGKEITAKQLADALHSLPEEKRQAVLLYYFFDMKDAEIAELMKIPRSTVQFRRTSSFELLKRFLEESR >CP020380|2642971:2650617|2649907_2650135_-|AXU35899.1|DBSCAN-SWA MKISKLPEAELKVMRYVWESDKVLTSRDITEAMEQKYEWKDTTTFTVLKRLQRREFLETEKIDKRTHYNVLVKEK >CP020380|2642971:2650617|2650239_2650617_-|AXU35900.1|DBSCAN-SWA MKEEILIEKLLRAELIVMEYLWKKDSLMPKKEIVKEIKQIYGWHKSTINILLKRLVDKGYLARDIIKFQSHYKIIIDNEEYYTFKKKVLKSSKSRKIKHSLTTTHKNVSKEKLDPLDEYYRNLKE >CP020380|2642971:2650617|2644297_2645602_+|AXU35895.1|integrase|DBSCAN-SWA MAVSSRQVKNKRDSNGVLTGRPGTVYDVNIKYTAPDGKKKSYAKKGFATKKEATQHEAEMKTKLQNPGQIASITSQRKQTVASYLNDWVESYARVNLRPSTYDGYKKTIANYINPYIGGVALNQLTPAMVDKMFQQIIDKGLKPSTAAGAKRVLSVALSHARKYRYIETNAAKDTLTKFGKSDKTPDPYTPEQVKALMQRVEGTVWEMPVILGGLYGMRRSEILGLRWRNVDLENNTFDVSEQLPFKVPLKTKVIEEMAPPKSNGRKLPITELARPFFLKQFAMQEAQREQAGKDGKPYYDNDLVVAKPDGSPISASWVSSQFGKLLEDLDMPHIRFHDLRHTAATNMHQLTGDFYTVGEVLGHTLAGIGVSLGLSMNFEAVTARYVDVRLERKKEVLDAYHGAVKQADPAKAEKAEPKKAKSAAKKKSSDLEL >CP020380|2642971:2650617|2644057_2644294_+|AXU35894.1|DBSCAN-SWA MAKKETASPAIPVFPMLKTVEQMSKVSGIGENKLRELMDSGELEYIQNGNRRLIADAAIWDWYHRAKKTAKPPARQGG >CP020380|2642971:2650617|2646329_2648390_-|AXU35897.1|DBSCAN-SWA MEKYRALKLVSLIIISISFPLTILLATIGLAEPKYNIQKTSTKSGIFNISNDFYDSNIFDEGTVASLLSNFKIYVDSQLTSEEKSKLQTKSKSIDLSSNDSEYDKIMSNKQASEEYLGYLKNIKVYVINTYTGVFYTNTSYDNLDDFKQKTKSYCNIEIINNVGKSSYIKTINGEKFELNNLSMELNGVDEAFEAYVSFPEEPTIEDGIVYTNFQIFKQATEKVRLFFVASLSLAIVCLLSIILYSRIKGEVLKRNNVFLLIYSKIPMEFNVILVFISIAILTMYALAVSYHIDVIVLVSLSLLIVSNNIFFINVQLSYLENKMCIFKTSIIVRVILWLIKTVREVSNAIKKVSLARKVIVIVIISLALIMVISTRSIGMGLLFSICIFLGFTIYITKRLSYLSYVIEGTERIKKGELDYKIKITGNDNFTSLAENINNIGEGLDRAIEEQVKSERMKSDLITNVSHDLKTPLTSIINYVDLIKKEESIQPEYINDYINVLESKSKRLKLLIEDLFEASRVSSGNIELQISKIDLVQLLRQSIGELEEKLSKNNLYLKLNVPNDKVYIWADGRRMYRVFENLLSNIAKYSLEETRVYIDVYDYGENVKVTMKNISSYELNFDPSEIMERFKRADESRNTEGSGLGLAIARDLVDLQGGKFYIEIDGDLFKANLEFQKYEEEITNME >CP020380|2642971:2650617|2648585_2649278_-|AXU35898.1|DBSCAN-SWA MYNILVVDDDKEIVDSIEIYLKSEGFKIYKAYDGMKALEIITENDIHLILMDIMMPKLDGIKATVKIREERNIPIILISAKSEDTDKIMGLNIGADDYITKPFNLLELIARVKSNLRRYVTLGNYEDACKEILKSGALELNTLTKEVKIDGENIKMTPIEYKIIELLLENKGRVFSIDEIYEKVWNEESFNSENTVAVHIRRIREKIEINPKEPRFLKVVWGVGYKIEKF >CP020380|2642971:2650617|2645872_2646124_+|AXU35896.1|DBSCAN-SWA MLIFSKKEMPDFLKKIMKFIPVAILTSLTTKDVFFNGDSLYLSIANPKIISFMIVLLVAYKFKSIGISIITGVISIYLFGIIL |
9 | Bacillus_phage(50.0%) | integrase | attL 2637850:2637863|attR 2653259:2653272 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
3092762 : 3147002
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >CP020380|3092762:3147002|DBSCAN-SWA ATTAATCTTCATCTTTCCAGCTTTTTATCCAATTTCCTATTTCTATTATTTTTTCTTCGGTTATTTCTTCTCCATCATGTAATTTTGAAATTAGTTCTGATAATGGATTGTTATGTAGACCTCCAAAAATTCTTTTTCCCTCTATTTTGAGATATTCTCTCTCTTTTATTAATACTGTATAGTGTACATGTTTCCCAATTCTCTGCGATATTAAAAAACCTTTTTTGGTTAATCTAGCCAAAAGTGTAATTGTAGTTGTATGCTTCCAACCATATGTTTTTTCTATTTCATCTGCAACATCTTTTGATATTACAGTTTTATAACCAGTATTCCATATGTATTTCATAATTTTTAATTCTGCATCTGGTAATTTTTTATTCAACATAATATATTCCTTCTTTCAATTTATGTCACTTCCTCAAATTTATCTAGCTTAAATTAATAATAGGAGCTTTTTATCACAAAAACTACAGTTAAATTTTACCATATATACATAACTTATATTTTTTCTTCTGTATCATTCATTATAAAATAAAAATCAAATTCACAATCAAGTATTTCTGCAAATTCTCTAATTTCTTTCTCTGAAAAATTATCTCTTGAAAATTTATTTGAAAGATTTTGTCTTGTTTGTCCTGTTTTTTCTGCTAATTCACCTATAGTCATGTTTTTTCTTTTTAATATTATTTTTATCTTTTCTCCGAATGAAATTGCCATACCAAACACCTCGCTTTTATATATATAATTATACACTATATAGTTTCTTTTATCCATGTTTAATTTGCGAATAAAACTATTTAATTTCATTTTTATATTTACAAACGACACTTTATAGTGTATAATTAACTTAATAAAATAATTATTGGAGGTATTTAAAATGATAAAATTTGAAGTAGGTAAAACTTATGCAACAAGAGGTGTATGTGACCATGACTGTATGTTCACTATAGAGGTTATTAAAAGAACTGATAAAACTATAACTTATAAAGATGATGATACTGTTAGACGTGCTAAAATTCGTTTTAATGATGATTATGAATATATAAGGGTTGGAAATTATAGCATGGCACCTAATTTCAGCGCTAAAGACTTAGTTATAGAAGATAAAGAAAATGAATCTAATACAGAAAAATATTTCGTAATAAGCAGATATTATGACAATGGTAAAACTATTGCTTTTATAGAAATGAATAGCACTAAATATAAGACTGAATATATTAGAAACTTCGACCAATATGTAGATGAATTTTCTACATTAGAAGAAGCAGAAGAATGCTTACAAGAATGTCTTAGTGCTTAAGAGGTGATATAAATGTGTTTTAAAACTTATATACTTAAAAGAGTTCTAAACAACAAAAAACTGGAGATAACTCGTAGTTTTGACTTAGACAATCTAATTTGTACTGCAACAGAGATTTTAAAAGACAATGAGATTGATTTAATAATTACTGATGAAGTAAATAATGTTGTTTGGAGAAATGAAAAAAGCACTCCCCAGCAAGAGAATGCTTAGTTATAGCTATAGAAGTGTACTACGAATACACTTCTATTTTTTTATTATATCATAAATTATTCATAGTATTAAGTAAAAATAGAGCTAATACAATCAGTTTTAAAATAGCTTGAATAGCTTTCTTGAGTTATTTACCTTTGCATAAATTATTGAATATTTGAAATAAAAAAAGATAGGTTTACCCCTCATCTTCAATCAAATTAAAGTCTATATTTATAGTATATAATTCTTTACTTCTATCCATTTCAAATATTGATATTTCCATATCATATGATTTATTATAGGATTTATCATATATATTCTTACATTTAATATTAATTGTACCCGCCTTAATATTTTTCCTAATATATATACCATCTTCATTATTTTCTCTAAAATTATCTATAAGTTTACTAGATAATTCCCTAATATACATTTCAGTATATGCGTTTAAACCTATCTCAACTTCTTGTAAAGAAGAAATATATTCTTTCTCGACTTTAATATTTTCGTTTTCATCAAATTCATCAAAGAAATTATTACATACTTCTAAATCATCATCTGTTAAATATTCAGTTTTAACTATATTCAGAGGTTTTTCCCAAAATACTTCTATTTGTATTGCTGCTTCTTTCCCTACATTCACAAGTGTTAATTCTATAATATCTGAACATCTTGGCACTTCGCTTGATGTCTTAATTTCATTAAACATACAAGGACTACCATAAGTTTTATACAAATATGCATTTTTCTTAATAGGAATAACCTTAGGCTCTCTTTCCATAGATATACTTTCTTTTAATTCTTCATTATCTTTTTTAGCCATTTCTCTAGTTATCAATATAGCACCTAATGTTGCTAACCCTCCAAATATACCACCTAAAAAACTGCCCCAAAAACTTAACCACTCACCATCTGTTGAATTATGTGTTTTTATATCCCAATATAACACCCTATTTATTAACGATGGTAAGCCAATACATATAATAAGAATTGCTATTACACTTATAAATATGGTTAGTATCTTATGCTTTTCAATCCAACTTTTATTTTTATTGTTTATATTGCTCATTACTTTCCCTCCGTTCTATAATATATATTTTACCATTTTGTACAAAATGGTAAAATATATTATGGGATAAATATTATTTGGATATAAACTTTCCTTTTGTATTAAGATATTATCAATCTCTTATTTTATCTATAATATGTTATTTTTAAGCCTAAAAAAGAGATAACTATTTTAATCCTAGTTACCTCTTTTTATGTTATTTTGGCCATATAGATATACCTATTGTAATAGCCATTGTAGCAATTCCTATTATAGTAGTTATACATAATGCAATAATCCATTTATTAGTTGAATCAATTCTATCTTCTATACCTTTTATACTATTCTTTATTTCACTTACATCCTTTTCTGTCACCTTTTTATGTTCGTTTATAGCTTCTTTTAAATCGCTTTTTAACTCAATTCTTTCTCTAGCTAAATCATTTTTTAGTTCTATTCTATCTTTGTCTAAATCATTCTTGTATTCTTTAAAAATACCCTTTATGTCATTAAATTGCTTATCTATACTTTCTTTTACTTCCTTATTATTTTGATGTACTCTTTTTTCAGTCTCTAATATTCTTTTTTCAGTTTCTAGTATTCTTTTTTCTTCTTCATTCATATTACCTACCTCCTCTGAAGTAGTAGCTAAAAACCAATTATCTCCAATACATTTATTTTTCTCCATCAAAGTACTATTTAAAGTATTATAATAGTCTGTATATTTGTTGATTTTACTTTTATCCTTGTTGGAATTAAACTTTATTACTTTTTCTTTTTCTTTATTATATTCACCCTTCATAACTATTCTTCCTCTATCATAGACTCTAAATGTTCAATTATTGATTGTATTTCTGATTTAGATAGTTCTAATTCCAAAGATTTTTTATCATTTCTAAATAGTTTCAAAATAAAATCATTTTCTCTAGCCAAAGAAGATATAGAATATAAGCCAATTGGATTGATTCTCTGAATATATGAGTTATCTAATATATCATATGTACTATTTGAAAAAGTATACAAATCATTTTTAAAGTTTTGGCTTATATTTACATTTTCACCTTCATTATAAAAGTCTTTCAGTTTAATTCCATACTCACCTATAAATTCTGGGTCTTCTCCCAAAATTTCATTTGCTTTAGCTTTAAATTCATGAATACAATGTGGCCAAGTTGGCATCTGCATATATAAATTAAGTAATAGTATTGTCTTTTCAAATATTTTGTTATCCTTTTCGTATTTTTTTATACAGTTAGGAAAATACGCTACCAAATTAGTCCCATTTTCATAAGCCATCTTAACTCCCCCTAAAATAATATTATTTAATACTATTCTACATTATAATTACTTTCATTGCACTATTATTTTTTATTCCTCCTCCTACCACTTATTGATATATACTCAACTGCTCTTCATATACCTGATTTTTTAAAGTTTGTAGATGACTTATGGTTATATTTAATATATCATTTTTTATTTTATAAATTGTTGTGATACTGTCATAAAATTGTAGTCAAAATGTAAAATATATTAACTCTATTGATTTTATTTATTTATAAACTCCAGTGCTTTATAAAGTGTATCAAATCTATCATTACCCTTTATCATAGTGTATCTTTCTTTAGTCATAGAACTTATCTTTTCACATGCTCCACCACCAACGACATATAAATTTTCTGTCTGACCTGGTACGTAATCTTTTATATCACATATCAGTATTTTTCCATCATTATAGCCCCAACCAACTACAGTTGCAGGGATTTTGTCAACTTCTCCATCATAAACGATTGTATGTTTGTACATGATTTTTCCCTCACCATTCTCTTTATTATCTATTGTCTTATTTAAAATACCTTCTGCTATTAACTTAGCAACTATGTCTTTATGTCTAATATAATAATCTGTATCTGCTTTACTATCTACGAAACATACTTCAATTAATATTGCTGGTGCTTTTGTATGACTAAGCCAATAAAGACCCCTCACATCTGATTTTGCACCCCTATTTTTAAATACAGTTGATAATTTTGAATTAACTCTCTCAGCATATATTTTACCATTATTCGTTTTATATATTGTTTCTGTACCCATTGGATTTAGGGTTGTACTGTTCGCATTAAAATGTATTTGTACAGCTACATCTACATCTTGTTTATTAGCTATTTGACATTGTTCTGCTAGATAGTTGTTAGATTTATCTACTTTCCCAGTATATACAGTAGCTCCACCTTGTTTCAACCATTTTACAATTAAATCAGTTAAAATTCTGTTTTCTTTTCCTTCATCTATATAGCCAGTTGCTCCTGTTCCTTTTCCACTTAAAGTGTGTCCTGGTACTATTGCTATTTTCATTATTTATTTTCCTCCTTTAACTGTTTGTAAGTTTGATTTATACCTATTGATATTCCCCAACAAATTATTCCCTGTAAGACTGCGTTAGGACTAAGCCCTAGCATC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MNIKSAFIRKRGEKFHVYVEYVEEETGKKKQKSYGSYEKKKDAEKHLIEIKSTINNNKFVAPNSVTLVERCYIYLEEKKDDFSPYTLRNRRSVIRNHIEPFFGDIKLIDISPNILQTYVNKIYKKYSLNSAKNSISFLTALLHEAYRLREIQEDVSSFVITPSKKDTSVTNFYTKEEAQLLLERCLDTDLAIPIYFMLGLGLRFGEAVGVRWSDVQLNEGVINVRQTMVHVDGKVTFKSPKTEKSKRRLTAPIELINLLKEEKIRQNKLKLQGILKNELDLICLNKKFQPWTQQKFFKPFKRLLESNNLRYIKLHELRHTNATLMLLSGTNIKTISERLGHTDIKITMNKYSHVLEEMDKEASENLSKILFK >CP020380|3092762:3147002|3140849_3140990_-|AXU36355.1|DBSCAN-SWA MEKSKKLLIDTGDTLNKLRENNSEKLEKYIELLKEYYKQENKKERE >CP020380|3092762:3147002|3119839_3120250_-|AXU36318.1|DBSCAN-SWA MSVFTKAINEIDRKKSTMPLLCMNIAFMLEGEAKNSAKWTDRTGNARQGITGTSLGGGNQYIVRLGHGVDYGTVLEEGSAPHIIKPRNAKALFWNGASHPVMKVQHPGTKGTHSLESTISRNMPKIGKLIEGHWSK >CP020380|3092762:3147002|3138473_3138617_-|AXU36349.1|DBSCAN-SWA MQREQTTIRLPRELKDKLLKQAKVKGYTLKDMVIFILKDYLQNISQE >CP020380|3092762:3147002|3134722_3135592_-|AXU36343.1|DBSCAN-SWA 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78 | Clostridium_phage(63.08%) | terminase,portal,tail,integrase,plate | attL 3087565:3087582|attR 3153092:3153109 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_14 |
3248634 : 3257587
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >CP020380|3248634:3257587|DBSCAN-SWA TCTACTTTTCTCTAGTTGTTGCAATTTCTTTGATATTAGCATCTTCTGGTTTAATATAAGTTGGCACTAATTCCCTCATAATACCATCTATTTTTTCAACCTCTTCATTGTTAGTAATTTCTCTTAAAAGTTTTAAGTATTTTGTTATTTTTTCTCTATCAACATCTATTGGTCTACCAATAAAAATCTTTTTATGCTCTGTATCCAACAGACCTTCTTCTGACATAAGTAGTTCTTCATACAACTTTTCTCCTGGTCTAAGACCAGAAAATTCAATTTTTATATCAACATCTGGCTCAAATCCACTGAATTTAATTAAATTTTTTGCTAAATCCAATATTCTTACAGGTTCTCCCATATCAAGCACAAATATTTCTCCACCTTTAGCCATAGCTCCAGCTTGTATAACTAACCCTACTGCTTCTGGTATTGTCATAAAATATCTAATGATATCTGGATGAGTAACTGTCACTGGTCCGCCATCTTCAATTTGCTTCTTAAAAAGTGGAATTACACTACCATTACTACCAAGTACATTTCCAAATCTAACAGCAACAAATTCAGTCTGACTTTCAGCATTCATAGTCTGTATAATCATTTCAGCAGCTCTTTTAGTAGCTCCCATTATGTTAGTAGGGTTTACAGCCTTATCTGTAGATATAAGGACAAATTTCTTAGCTCTATATTTTGAAGACAAGCCAGCTATATTTAAAGTTCCAAATATATTATTCTTTATAGCTTCGCCAGGGCTCGATTCCATAAGAGGAACATGTTTATGTGCTGCTGCATGAAATACTACTTCTGGTTTATATTTATTAAATATTTCATCCATTCTTTTTTCTTCTCTTATTGATGCTATTACTGTCTTTAAATCTAATTTATTTTTATACTTTCTAAGTAATTCTTGTTGTATTGAGTAAGCATTGTTTTCATAATTATCAACTATAATAAGCTCTTTAGGATTAAATCCTGCAATCTGTCTGCAAAGCTCTGAACCAATTGAGCCTCCTCCTCCAGTTATTAGGATTACTTTTCCCTCAATATAATTACTTATCTCTCTTAAATTTGTTTTTATAGGCTCTCTGCCCAACAAATCTTCTATCTCTACTTCTCTAATCTGTTTTATATCAACTTTTCCATCTATAATTTCGTAAATTCCTGGTATTGTCTTTATTTTACAGTTAGTGTTTTTACATATATCAATAATCTCTTTTTTTCTACGTTTCTCTATGTTTGCTATTGAAAAGATTATCTCATCTACATTGTACTTTTCTACCACATCTTTTATATCTGAAGTTGTTCCTACAATTTTCACATTATGGATTATTCTTCCAATTTTATTTTTATCATCATCAATTATAGCCACTGCTACTTTCTTAAGTTCTGAATTTCTTTTTAGTTCCTGTATAACCATTTCTCCTGCATCTCCTGCACCAATTATAAGGATATTTGAAACCTTTCCTCTAGAATATGTCTTGTTCATGACTATTCTTATAGCTCTATAGGCTATTCTTGCACCACTTGTAAACATTATAATAAATATTGTATTTAATACATAAAACATTATAGGATAATTAAACCCTAATAATTTATTTATTATATAAATTGGAATTAAATAAGCTAAAGTTGCCATAAAAATAGATATAATTTCTTCTTCTCCTGCATATCTCCATAATGTGTTGTAACACTTAAACAATCTAAATGATACTATATGAAGTACTATATATACACAAGCTGAAATTATTATATCATTAGTGATAAATGCATTTAAATTACCTGTCAAGCTTAAAGACATTCGAAACGCTACTAGTACGCTACAAATATCTAGAATTAATAGTGTTAAATGTCTAAATTTATATTTTTTAAAAAGCCTATTAAAAAAGCTTTCTTTCTCTAAATCTATACTTTCTCGCATAACTAGAAGCCCTCCTTTAAACAGCAAAAGCTACGCACCTAAGCATAGCCAACAACATCTATCTTTTGCTGTATTTTTTCATTTTATTTTTTATATTTATCAAATATAGAATCATAAATTTTTTCTATATCATTAAAGTTTAAATTAACCTCATAATTTTCTCTAACAAATTGACGCCCTTTCTTACCCATATTAAGTCTAAGTTCATCATTTTCCATTAGTTTTATTATAGCATTTTTTATTTCTTCTGGTTGTTTTGGTTCTACAATTAAGCCAGTTTCATTTTCCCATACAGATTCTGGATGTCCTCCTACATTTGTAACTATAACAGGTACTTCACATGCTTCTGATTCTATAGCTGCCACTCCAAATCCCTCTCTTAAAGAAGGAAATACAGTTACATCAAAAGAATTAAAAGTCTTGCTTACATTTTCTGGAGATATTCTTCCTAAAAACTGAACATCATTTTCTATACCCAATTCTTTAGCTAAATTTATTAGGTTGTCCATCTGACTTCCAGAGCCACCTATTTTAAGAATTATTTTCTTATCTTTATATTCATCTTTAAGCATCTTAAATGCTTGTATTAAATATTCTATTCCGTATTTTTTTTCTAAACTCTTTATAATTCCTATTACAAAAGCGTCTTCTTTTTCTACTTCCATAGGCTTAAACCTATCCATATCTACTCCAAAAAAGGTTACATCTACATGTTTATCTGTATATTTATTAGCCTCTTTAGCCATATCTCTACTATTTGAAAAGATATAGTCTGCTTTTCTAAAGTTATGTTTTATAATTTGTTTTTGTATAAAACCATTATTAGGGAAATCATAAATATCAGTACCCCAAACAGAAATAATATATGGATGATACCCAAGTAGACTTCCTATAAATCCATAACTACTTGCATACTGTGCATGCAATATATCTGGCTTTATTTCATTTACTAGCTTCTTTATCTGCTTTATTGAACCTAAGTATCCCGTTTTTTTAGAAATATTTTCATTTTTTAGCTCTTCTACATTAGAACCAAAATTATAAATTTTTATTCCTTCCATGTGACCTCCATTTAAAGAGATTACATGAATGTCATATCCTTTATTTTTAAAAAAACTACACCATTTTAAAGTATGAGGATTTGACCCATCAGCTAAATAACAAACAGTCTTCATAATATTTACCTTCCTATCGAATAATACTCAATTCCTAACTCTTCCATATCTTTAACTTTATAACAATTTCTTCCATCAAGGACTAAAGGATTTTTCATCTTTTCCTTATACTTATGTATATCATAATTTAATACATCTTTCCATTCTGTCATTATAAAACATATCTCTGCATCTTCTATCGCATCATCTACAGAATCAGCATAAAGTATAGAGTCACCAAATATTTTCTTAGTATTATTTACACCAATTGGGTCGTATACAGTAACTCTTGCCCCTCTTTCGAGCAAATATTTTATATTTGGTATAGATGGTGCTTCTCTTATATCATCAGTATCTGGTTTAAAAGTCAAACCTAAAACAGCAACCTTCATATCTTGAAAGCTCTCTACTAACTTAGATGCCTTTCTAACTAATTTAAGTTTTTGACTTTCATTAACTTCTATTGCAGCTTTTACTGTTTTTAATTCATAACCATTATGTTCAGATAACCAGTGAAGAGCTTTTGTGTCTTTTGGAAAGCAAGAACCGCCATATCCTATTCCTGCCTTTAAAAACTTACTTCCTATTCTATCATCATAACTCATTCCTAAAGCTACATCTTCTATGTTAGCCCCTGCTATTTCACAAAGATTTGCAATATCATTCATAAATGATATTTTAAGAGCTAAGAAGTTATTTGATGCGTATTTTATCATCTCAGCACTATTTCTATTTGTAACTATTATAGGTTGATTAAAAGGCTTATAGATTTCTTCTAATATTTCTCTAGCCCATTCACTTTCTACACCTATAACGATTCTTGAAGCATGTAGAGTATCTTTTACTGCTGTTCCTTGTGATAAAAACTCTGGATTAGATGCAAGTTCTACTTTTACATCATTTTTTAGGTTTCTATTTATATAATCTTCTATCTCTTCATTTGTACCAATTGGAACTGTAGATTTTATTACTACTAGAGTATCTTTTGTCACAGTTTCAGCTATTTGCTTTGCAACTGCCTTTATATAATCTAGGTTGGCTGAGCCATCACTTCTCTCAGGTGTACCTACAGCTATTAATATTACATCTACATCTTCATAAGCTTTTTTATAGTCTGTAGTGTAATCTATTCTTCCTCTGTTGTAATTTTTAACCATAAGTTCTTCTAGGCCTTCTTCATATATAGGTGCTATTCCAAGTTTCATTGATTTAACTTTTTGTTCATCTACATCAACACAGACTACATTTTCATTGCCTACCTCTGCTAGACAAACACCTGTAACCAAACCTACATATCCCGTCCCAGCTATAGCTATTTTCATTTTTTTACCTCCAAGTATATAAAACTTATACTCTTTTTTTAATGGCATTAAAAACATAGAAACAAAATACATATAGACTTTTTGGTAAACTTAAATTTTCAACATTTCTATAAGTATTCCAAGTTCGTTTTAATGCTTTTATCTTGTTACTTGATATAGAATTTCCAACTAATCTGTAATTCACTAAATCTTCTTGAATCCCATATGCATATTTTTCCTTTTTAAGTAACTGTAACCAGGTTGCAGTATCTTGTCCTCTTCTTACCAAAGGCATGCTGAACTCTCCTACAATCTCCTTATCAATGACCACTGTAGAACATCCTATTATAGTATTTCTAAGTAATCCTTCATAGTCAATTTTCTTAGGAGCTCTTGCAACCTTATTCGTTTTTGACCCATCTTGTCTCATATATCTATAAGATGTAAAAGAAAAACCTACATTTTCTTTTAACATATATTCTATCTGAATCTCTAATTTTCTACTATCCCATAAATCATCACTATCTACAAATGCAATAAATCGACCTTCCGCATTCTTAATACCAACATTTCTAGATACTGCAGCTCCAGAATTTTTTTCAAGCTTTATATATTTTATTCTAGCATCTTCCTTTCGAAAACTTTTTATAATTTCACTTGAATTGTCCTTAGAACAATCATCCACTAATAAAAGCTGCCAATTTTTATAAGTTTGATTTTGGATTGACTTTATCGTCTCTGATAAAAACTCTTCTGAATTATAAACAGGAGTAATTATCGATACTAAAGGCTCATTCATATTTTTACTCTCCTTATATAGCAACTAGCAGTACTATACCAACAAGTTTACTTAGATACTAATTTTCTTTGTCCAATATATTTGTAATATCCTAATGGGAATAATGCTAAATACAACAATTTATCAGATACTTTTCTTAATTCACCAAAATAATGACTATCAGACAACAATGAGTATCTGGCTAAATTTATGTAATTTTTTATCCACATATATGGATATCTACTTAATGGATATGTATTTTGATTTATTAAATATAAAAACTCTAATGCTCTACCTCTTAATGCATTTTTACTTAATATATTCTTAGTCAAACCATCATCCAAATAATCTCTTATTATCATAGGTTTATTTACACATATAACTTTATAGTATTTAGACATTTCATTCCATACTACACTTTCTGGTAAAAATCTCACTTCTTTTCTTTCTGGAAAAGGAAATTTTATAAGCTCATCAGTTACAAATACTATGCTTTTATCTCCCTTAACGCCATACTTAAAATATAGGTCTGCAAAGTGACATATTTTCTTATCTTCAGGCATTTCTGTCCCTATCAAATCTCCACTTGGATATACACAAAGTCCAACAACTCCACTAAATCCTTCTTTATTCTCTAAAGAATCCCACTCATCATTAGCAATTTTAAGAGAATCTTTAATTAAACCATCATCACTATCTACAATGAAAAATAGCTCTCCATCTGCATTTTTTACACCTAGATTTATTGCAGTATGTTTTCCTCCATTTTCTTTGTATATATATCTTATATTTAATTTATTTTCTGATATAAATTTTTCAACTAACTCTTTAGTACTGTCGCTACTTCCATCATCAACAATCAACCATTCAAAATCATTGAAATCATAAGTTTGAGCTTTTAAATCATTGTACAAATTTTCAAGTAAATGAGCTCTGTTATACGTCGGAGTAAATACAGTAAATTTATATTTATACATTAATTAAATCTTCCTCTCTGTCTAACTTTTTTTGATTCCGTTTATTCCATAATTAATAAAGTAGTATATAGCTTTGTATAAAGGTATTTTTTCTATATTTCTATATATATTCCAAGTCCACATAGCAGCTTTTATTTTATTACCACTTAGGGAATTGCTAGATTTTCTATATAATGCTAGAACTTCATTTATTCCATGAGCAATATGCCCTTTTTTCAATATCGATAACCATAAAACATAATCTTCATGTCTTACACCACTCATTCTTATTTCAAAATCCAATTTAGACTTATCAATCACAACAGTAAGACATCCTAAGATATTTCCTTTTAATAATCTTTTATAATCTACATTAGGTGGAACTTTTATTACTTTGTTTAATTTTTTATCATTTTCATCCATCAGTTCATATGAAGTAAATGAAATTACATAGTCATTTTCTAACATAAAATTTACTTGTTTTTCTAACTTACTACTATTCCATTGGTCATCACTATCTAAAAAAGCTATAAATTGTCCTGTTGCCTTACTTAGTGCTAAATTTCTAGCATTAGAGACACCCTTATTAGTCTCAGTCTTTATACATTTTATTCTACTATCCTGTTGCATATAAGATTTGACTATATTAGGACTATTATCTGTTGAGCAATCATCAATAATTAACATTTCCCATTCTTGATAAGTTTGGTTTAATACTGATTTTATGGTTGCTTCAATAAATTTTTCAGAATTATACATGGGAGTAATTATAGATACTAAATTCTTCTTCATATTACCTTCCTCATCATTTATAAAATATTTATTTAATTTTACTTAATACACAATCATATATCCTCTTGCAGTTCTTATTATCATTATATCTGAAAAACTTATTTCTTTCATTTTTTTGGTTATCCATAACCTCAAAATTATTTTCAATAATATCAATAAGTTTATTCACGGCTTCATCATTATTATAAGCCAAAGACCCAAACATTTCACTTTTTAAATCTATATATGAATCAACTTTTTCCATATATTCATCCAAATCGAATTGGTAAAACAAGATAGGTCTATTCATATACAAAAAGTCTATGGCTACACTTGAATAATCAGTTATATTTGCAGCTGATTTTCTAATTTCATTTGCTAGAGTTACCCCTTTATCTAAAAACACAATTCGTTTTCCTGTTATATTTTCTTTTATATCATCTATAAACTCATGCATAAGATGATGCATATAAATTTTTACATTTATATCTTTCTCATCTAATATTTTATTTAATTTATCATCATTTAAAAAATTCATTATATTTTTAAAATAATCTGTATCCGTAAATTTTCCTGAACTAAATTTTATCCAATCTCTCCATGTAGGAGTATATAATATATCTCGAGTTTGTGCAACTTCATTTGTTGGTAAATTGTCATATCTTGCATTTCCAATTATATAAACTGAGTCATCTAACATTCCCCAATCATTTACCATAACATTTCTTTCAAATTCAGAACTTGCTGTAACTATATTATAGCTTTTATATAGGTTATCTATAATGTTTTTGAACTTTTTGTTCATAGGTTTTCTCTTTTTAAAACTTATAGTCCCATGATTTAAAAACACTTTTATCGTTTTTTTATGAAAATAATTAAGAACAGGTACAGCAAAATTGTATGGTGCTATATCTGCTGATGGTGCATGTGAAAATACTATAGCTTTTGAATTGTAATAATACAGATAGTTTTCTACACTTCCTCTTATTAATTTTTTGCCTGGAATTTTATCAAATACTTTACTGTCTTTATTTACTACCCAATAAGTTTCTACATCATTATGTTCTTTTAGCATATACTCATAAAAAAACTTTGAATTATCATTGTATATATCCCCTGAATGTCCACCTATAAGCCAGATATCTCTACCATTAAACTTATGCTTATTAAATGGATATATAAAAAAAGCCAAAAGCATATTTATTAAAAATTTAACCTTGTCCATAAACACCATCCTCATTATAACTTGTACTGTCTAAATCCATTAATTCTTCCTTTTATAGTGGCACTATGATAATCTCTATTGGAACTCAATATAAGACCTCCTATATTTCTTACAAGTTTTGATACCATAACTTTTGCAAACTTATAATTTTTTCTATAGACTATTTCCTTTTTGCAAAGCGCTCCAAAGCCTCTTCCATAGTTATAATCTTTTTGATACTTTTCTTTAGATTTAGAATGTTTTTTTGCAGGATGGTAAATTATATCATTTCCAAAGTATTTTCCTTTAAAACCTAAACTCAATAAGTTTAAAACATAATCTATCTCTTCACCAGCACCAAACTCTCCACCAACACCCAATTTTTCATCAAATCTTGTATAATCTTTACCTTCAAAATCAATAAAAAAAGTTATGGATGTTATAGTATCCAAAACGTTGGAACTTGTGATATCACAAGTTCCATCATACATTTTCTTAAATGCATCAACTTTATTTGAATCCATAGTTTTGCAACTGTATATTTTATAATCTTTATTTTTATTAAAGAAATTTATAACTTTTTCTAATGTATCATTTTCGTAGACACAATCATCATCAGGGAAACCTATAATTTGCCCTACAGCATTGTCTATGCCTACATTTCTGTTATAACTCAATCCTTTTTTAGAGCTTTTTATATACTTTATATCTAACTTATCAATGTATTTATCAACTATTTCTTTAACTTTGCTATTATCATTTTGGTCTACTACTATAAGTTCAAAGTTTTTGTAAGTTTGATTTTCTAAGCTGTCCATAAGTAAGTATATATCATCATATCTATTTAATGTTGGCATTATTAATGATATTAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_14 >CP020380|3248634:3257587|3255557_3256733_-|AXU36443.1|DBSCAN-SWA MDKVKFLINMLLAFFIYPFNKHKFNGRDIWLIGGHSGDIYNDNSKFFYEYMLKEHNDVETYWVVNKDSKVFDKIPGKKLIRGSVENYLYYYNSKAIVFSHAPSADIAPYNFAVPVLNYFHKKTIKVFLNHGTISFKKRKPMNKKFKNIIDNLYKSYNIVTASSEFERNVMVNDWGMLDDSVYIIGNARYDNLPTNEVAQTRDILYTPTWRDWIKFSSGKFTDTDYFKNIMNFLNDDKLNKILDEKDINVKIYMHHLMHEFIDDIKENITGKRIVFLDKGVTLANEIRKSAANITDYSSVAIDFLYMNRPILFYQFDLDEYMEKVDSYIDLKSEMFGSLAYNNDEAVNKLIDIIENNFEVMDNQKNERNKFFRYNDNKNCKRIYDCVLSKIK >CP020380|3248634:3257587|3253849_3254758_-|AXU36441.1|DBSCAN-SWA MYKYKFTVFTPTYNRAHLLENLYNDLKAQTYDFNDFEWLIVDDGSSDSTKELVEKFISENKLNIRYIYKENGGKHTAINLGVKNADGELFFIVDSDDGLIKDSLKIANDEWDSLENKEGFSGVVGLCVYPSGDLIGTEMPEDKKICHFADLYFKYGVKGDKSIVFVTDELIKFPFPERKEVRFLPESVVWNEMSKYYKVICVNKPMIIRDYLDDGLTKNILSKNALRGRALEFLYLINQNTYPLSRYPYMWIKNYINLARYSLLSDSHYFGELRKVSDKLLYLALFPLGYYKYIGQRKLVSK >CP020380|3248634:3257587|3256747_3257587_-|AXU36444.1|DBSCAN-SWA MLISLIMPTLNRYDDIYLLMDSLENQTYKNFELIVVDQNDNSKVKEIVDKYIDKLDIKYIKSSKKGLSYNRNVGIDNAVGQIIGFPDDDCVYENDTLEKVINFFNKNKDYKIYSCKTMDSNKVDAFKKMYDGTCDITSSNVLDTITSITFFIDFEGKDYTRFDEKLGVGGEFGAGEEIDYVLNLLSLGFKGKYFGNDIIYHPAKKHSKSKEKYQKDYNYGRGFGALCKKEIVYRKNYKFAKVMVSKLVRNIGGLILSSNRDYHSATIKGRINGFRQYKL >CP020380|3248634:3257587|3254779_3255529_-|AXU36442.1|DBSCAN-SWA MKKNLVSIITPMYNSEKFIEATIKSVLNQTYQEWEMLIIDDCSTDNSPNIVKSYMQQDSRIKCIKTETNKGVSNARNLALSKATGQFIAFLDSDDQWNSSKLEKQVNFMLENDYVISFTSYELMDENDKKLNKVIKVPPNVDYKRLLKGNILGCLTVVIDKSKLDFEIRMSGVRHEDYVLWLSILKKGHIAHGINEVLALYRKSSNSLSGNKIKAAMWTWNIYRNIEKIPLYKAIYYFINYGINGIKKS >CP020380|3248634:3257587|3251728_3253024_-|AXU36439.1|DBSCAN-SWA MKIAIAGTGYVGLVTGVCLAEVGNENVVCVDVDEQKVKSMKLGIAPIYEEGLEELMVKNYNRGRIDYTTDYKKAYEDVDVILIAVGTPERSDGSANLDYIKAVAKQIAETVTKDTLVVIKSTVPIGTNEEIEDYINRNLKNDVKVELASNPEFLSQGTAVKDTLHASRIVIGVESEWAREILEEIYKPFNQPIIVTNRNSAEMIKYASNNFLALKISFMNDIANLCEIAGANIEDVALGMSYDDRIGSKFLKAGIGYGGSCFPKDTKALHWLSEHNGYELKTVKAAIEVNESQKLKLVRKASKLVESFQDMKVAVLGLTFKPDTDDIREAPSIPNIKYLLERGARVTVYDPIGVNNTKKIFGDSILYADSVDDAIEDAEICFIMTEWKDVLNYDIHKYKEKMKNPLVLDGRNCYKVKDMEELGIEYYSIGR >CP020380|3248634:3257587|3250631_3251723_-|AXU36438.1|DBSCAN-SWA MKTVCYLADGSNPHTLKWCSFFKNKGYDIHVISLNGGHMEGIKIYNFGSNVEELKNENISKKTGYLGSIKQIKKLVNEIKPDILHAQYASSYGFIGSLLGYHPYIISVWGTDIYDFPNNGFIQKQIIKHNFRKADYIFSNSRDMAKEANKYTDKHVDVTFFGVDMDRFKPMEVEKEDAFVIGIIKSLEKKYGIEYLIQAFKMLKDEYKDKKIILKIGGSGSQMDNLINLAKELGIENDVQFLGRISPENVSKTFNSFDVTVFPSLREGFGVAAIESEACEVPVIVTNVGGHPESVWENETGLIVEPKQPEEIKNAIIKLMENDELRLNMGKKGRQFVRENYEVNLNFNDIEKIYDSIFDKYKK >CP020380|3248634:3257587|3248634_3250548_-|AXU36437.1|DBSCAN-SWA MRESIDLEKESFFNRLFKKYKFRHLTLLILDICSVLVAFRMSLSLTGNLNAFITNDIIISACVYIVLHIVSFRLFKCYNTLWRYAGEEEIISIFMATLAYLIPIYIINKLLGFNYPIMFYVLNTIFIIMFTSGARIAYRAIRIVMNKTYSRGKVSNILIIGAGDAGEMVIQELKRNSELKKVAVAIIDDDKNKIGRIIHNVKIVGTTSDIKDVVEKYNVDEIIFSIANIEKRRKKEIIDICKNTNCKIKTIPGIYEIIDGKVDIKQIREVEIEDLLGREPIKTNLREISNYIEGKVILITGGGGSIGSELCRQIAGFNPKELIIVDNYENNAYSIQQELLRKYKNKLDLKTVIASIREEKRMDEIFNKYKPEVVFHAAAHKHVPLMESSPGEAIKNNIFGTLNIAGLSSKYRAKKFVLISTDKAVNPTNIMGATKRAAEMIIQTMNAESQTEFVAVRFGNVLGSNGSVIPLFKKQIEDGGPVTVTHPDIIRYFMTIPEAVGLVIQAGAMAKGGEIFVLDMGEPVRILDLAKNLIKFSGFEPDVDIKIEFSGLRPGEKLYEELLMSEEGLLDTEHKKIFIGRPIDVDREKITKYLKLLREITNNEEVEKIDGIMRELVPTYIKPEDANIKEIATTREK >CP020380|3248634:3257587|3253049_3253802_-|AXU36440.1|DBSCAN-SWA MNEPLVSIITPVYNSEEFLSETIKSIQNQTYKNWQLLLVDDCSKDNSSEIIKSFRKEDARIKYIKLEKNSGAAVSRNVGIKNAEGRFIAFVDSDDLWDSRKLEIQIEYMLKENVGFSFTSYRYMRQDGSKTNKVARAPKKIDYEGLLRNTIIGCSTVVIDKEIVGEFSMPLVRRGQDTATWLQLLKKEKYAYGIQEDLVNYRLVGNSISSNKIKALKRTWNTYRNVENLSLPKSLYVFCFYVFNAIKKRV |
8 | Catovirus(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
3815248 : 3880464
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >CP020380|3815248:3880464|DBSCAN-SWA 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>CP020380|3815248:3880464|3819778_3820078_-|AXU36908.1|DBSCAN-SWA MIYLGNLMDTEEQNIKYVGMIHYKPTLLSDEDLKQGILIESLPTQKYVENKEAKLFINIDTKEVFYRYTDIKSSLEDKVNSTEQTIADLTFQLMSNVVI >CP020380|3815248:3880464|3867572_3867923_-|AXU36957.1|DBSCAN-SWA MINKKRKGFTLVEMIVVVTILGVISSIALVKYSKVQESAKLNADYTNAANIVTAASMAINDDEKIIDSLSVETLKEKGYLNTVPVPQSTSGKFELVINDNGTDISVNINSKQFYPK >CP020380|3815248:3880464|3848162_3848585_-|AXU36941.1|DBSCAN-SWA MKKFLIATHGELSRELVDTSKLIIGSLANIEYFCMTKDKSADDAEKEIRSILSKNKDSEEFVVLTDVFGGSVANICTNLLLQGFKFELLTGVNLPMLLSILLLVEEDTKLIVKSGLEEAKNGIIYVNELLENRNKIKNVM >CP020380|3815248:3880464|3863546_3863864_-|AXU36951.1|DBSCAN-SWA MDYIGIENITPYENTYEFSVYEYDDEITLGSEKLYVCELRVILIKVNSLYVERLHKSVEAMVLVKNLKKDLDKTLVVNKIKNFVLDEIWVENLVKENIEVIFVES >CP020380|3815248:3880464|3845445_3846501_-|AXU36938.1|DBSCAN-SWA MTIQDYMLETPVRMREIISNADSLFNEVKRANLKKIIITGSGTSYHSGVQVQPYLQNLLDIDVVKMYPFMITEDTFKFDNENTLVVGVSQGGSSYSTYNAMKLAEDKGCKIASMAGCKNALIDEISDYILTVNCGEEKSGAKTKGYYCTKLNLMLLGLQIAREKGIISSEKYNEEINKILDAINRFEAVYKLSKQWIERNKEKLVNSKEIRIIGHSDIYGDTLEAALKLLETMRIPVTGYEFEEFIHGIYNAINSDSTIFILDTGKEPRVTKMIDVLSGWTENVFAIGRDVTENDKNLKIDITDNPYYQTFNFIVPIQLICGEIPTLKGVDPSIPKDTKFHMKLGSKKLNK >CP020380|3815248:3880464|3848600_3849080_-|AXU36942.1|DBSCAN-SWA MVSLMRIDDRLIHGQVAYGWATSLGINVILVANDEAKNDQMKAMSLNLARPSNVILYIRGVEESGEIVEKFASSKKSNVLVLVKNTKDALIVAKNSGGVLKEINVGGLRYEEGKKKLTDLVAVDDDDINNFKEIGDLGIDIEFRMLPRDKKKQLSDLIK >CP020380|3815248:3880464|3820077_3821304_-|AXU36909.1|DBSCAN-SWA MTFKELVNKVRNLVLEAKNVTIEDTENNFTSDNVEGALKEVFQNGVNAKSNVVTALNSKGADVTTSDTWEEIKNKIDKKEGRLDLREAILSSSSFLVTNGNIEYIEKYGGNPILEYEAPFFYVIKGTHLIKINTNDESVIFDITLSSNNFSCICITQDYLFISDNTKLYKINKSTGSEVQSIEGAYYKLCSYGDYVYGIYGDETSSTLHKIRISDMYIMLTKDMSSDRIYDFERGKFVCNNNGIYATTEHSNSSGLTECYLTKINFDFSVAKSFRIGGYLYEKNIKFLNDFVFVSDSSRSIEVESGKKSGLAKYDANLNLIIYDESNRYENFEICNGYVYTLNSLSSSPFKKINLNTLKEVNSYQTLINTNPQKGMLIINNIIFFIGGGIYRNILSKKVYSDEKGEEL >CP020380|3815248:3880464|3842389_3842899_-|AXU36935.1|DBSCAN-SWA MKTRKMTFLGLMIGYSLALYVLETYIPNPLIVIFPGAKLGLSNIITLISLMLLGVKDTVIIVTIRVILSSIFAGPLSYLLFSIGGAYLSLLFMYLASKIKDLSLIGISIIGAIGHNIGQLIVASLIIENILAIGYLPFMLMASLVTGMFVGLVSRYTIPKLKHFYSKFY >CP020380|3815248:3880464|3829078_3829237_-|AXU36921.1|DBSCAN-SWA MDNFLQGVLASILASYIVYLISKLFRKRKKPLKAGTKSGWEFDFKIKFHKFK >CP020380|3815248:3880464|3821825_3823388_-|AXU36912.1|DBSCAN-SWA MAKIYDFNYKNGEQKVILPSGKYLLECWGAAGGGGIRIDDFNLRSKGGYSKGELTLRKETTLYVYTGSKGSSYGSTFNGGGKAMMHEGISGGGTLYCNGGGATDIRLIGGSWDNEQGLLSRIIVAGGGGRNNFETKGGSAVSASSGENYGGGGGGWYGGGSGYNAGGGSGYVLTENSYKPSGYIPTKEYWLENTSMTVGGGIAEENGKAKITLLQGLAFLVISSYTSEQAVFTAGHTEENKLSKIEWFIDDVLKETFTTDLYLEKTINYTLEDNALHTLKIVVTDINNMTYEQVVTISKSIMPLPADANLQDISTKLAEIGESFKSGKTSIINTLALKNIEASLNNTLVELSEKIKTSFDSSDASVQDLINQLTQANNTISQLNTKYKVASGTTTVLTDTQGTISLYGVEGSYKYRTWNSWIKVNGLNFVPNIFVATKRFKAQSYYYVNIVISFVGVFDEDFSIDSLFGFMSGDTKYKGAGCNVVKINERDAYVNKNGVYLPDSAIGDYTHREWCAIKFK >CP020380|3815248:3880464|3870604_3871285_-|AXU36960.1|DBSCAN-SWA MKKQYVFIILASTILGILVGTIFRDYSNEETVYTSKDKSIRKEIKMTRKSIKELTKEKDKLDKEIDSMKQNQKNSEEISEIEILRDSLSYSDVKGSGIILSIDAIDEKTGNIANSIDYNKILVKVINELKVNGGKYIEINGQRINQYSEVVLAGSHININGVPVAQPYEIKCIGDKEKLSNYVDKGSKYLDSIQTNYPMKISIKTEENISMKKMNIPNKLKYIKGD >CP020380|3815248:3880464|3831884_3832043_-|AXU36925.1|DBSCAN-SWA MDNFLQGILASLSASLIVYIASKLFRKRKKPLKAATKSGWEFDLKIKFHKTK >CP020380|3815248:3880464|3823404_3824016_-|AXU36913.1|tail|DBSCAN-SWA MPNELNFSNEIEEYLITTPAHANEFNNRQQKLLDNDKYLNNKIDTTKTELNTRIDTENEKQNIKIDTIIAGGVNVSHTHIIEMADWVLNNETNMYEVTIENPLLTKRIVISTYNENGDTLVPDATVKDNNVIVRSTENNRTFVYLINGNAQTSLINATVDDNRVSEMTTYSSKKIEDRLVNIEEKVNGGLSSITTNVNNMLPI >CP020380|3815248:3880464|3857293_3858373_-|AXU36947.1|protease|DBSCAN-SWA MSRRKKGISLVILVAIISSILSSFLTIILVKDNLVSKSTGSSTPIVVNDDGKSQNIYQAVAEKATPSVVGITTTSVDTSNMFAIPTETQGVGTGIIVDSNGYILTNSHVISDGQATSVNVLFNDGSTTSGKVVWFDQQLDLAIVKVDKTGLTPAEFADSDKVKVGDISIAIGNPLGLDFQKTVTQGIISGLDRTIQTEKTNMTGLLQTDASINAGNSGGPLLNQKGQVIGINTAKASQAEGLGFAIPINTAKSIVEEVIKNGKYEKVTLGIKGTDVSNYEAATGTKLSTDKGVYVAEVISGSSAEKAGVKVGDIITKVGDTDITGMNDLNKKLYTFSKGASTKITVNRGGKAVTINVNF >CP020380|3815248:3880464|3829411_3829615_-|AXU36922.1|DBSCAN-SWA MSENLLNEYNLKTDEDVEYFVKFANALYELKQNSGEKFQEYVKILREILREQQENENILDNILKTLT >CP020380|3815248:3880464|3841334_3842000_-|AXU36933.1|DBSCAN-SWA MIDIGSKEIAIRLLLALIIGGIIGLEREKIRQFAGFRTHILIAIGSCIVSITSIQLFFDYNLYTNADPARMPAQVLSGIGFLGAGAILKNKGGVKGLTTAAGMWATACIGIAVGYGYYELAILGGLFVMIALFVLRIINTFLFSQEKNVLILKLSNLDSIPFLYDKFEKNQLIVRNMEIECRNEEYWKVNFFVSYAKRIHLHDVMKEINMIEGVINVDYLD >CP020380|3815248:3880464|3821518_3821812_-|AXU36911.1|DBSCAN-SWA MNRANRIICDQTGKILLQTGEATGDILEHDTITELHYIDVEYGSIDYTRNRIIGINIETKEPILEEIPVFISEEEKRIQELENQILLNENEKVGGIL >CP020380|3815248:3880464|3824027_3824408_-|AXU36914.1|DBSCAN-SWA MANAVTTDIARQKMCKARAGDITLPTIVSMVFGDGGVGNDGTIIAPLSSDTALKNEVFRKDIENYVYPISTTCRYSTTLLKNEAEGKNINEIGLIDSDGDLIAIKTFGNKYKDSDMEMVFQIDDEF >CP020380|3815248:3880464|3828067_3828739_-|AXU36920.1|DBSCAN-SWA MVIDIYLKNEKEKIDFHFPVNPQDSLSIKKEKRFETVDIVNLGEFDIKKEGEKIREISFKTFLPNLYDASYCRYSELKNPIEVVAMLEKWVDQAEPLRLIVTGFSYNGLVTISSFSNTQTAGREEDRDIEITFRTYRELKIETLKKETKSSTKTDLKDNRPNNKTTTKIYTVKASDTLYKIAKNLLGKGSRWPEIYNIPENKKVIGKNPNVIKKGQKLVIPSK >CP020380|3815248:3880464|3873336_3874707_+|AXU36962.1|DBSCAN-SWA MKQKWIVLIIICIGVFMSTLDGSILNIANPTIAADFKINMSQIQWVVTAYMLVVTATMLFFGKLGDKVGSNRLYTLGFFIFTIGSFLCSMSNNLSTLISSRIFQAVGASILMATGLGIVSNAFPANEKGKAIGITGAVVGIGNMSGPVIGGIILEHFGWPSIFIINIPIGIIAVFLGIKFLPKPVLDEQNKNFDIPGLLLFASCTTLILLAMNEKSNTRLYLGITALIIFLLLALREVKFEQSFIDLPLFKNRNFTVGNIIGVACYFPQMAVSFLLPFYLEQLKNLSPMMAGYVMTVHPLIMVLIAPIAGSLSDKHGAKNILTASFSFMTISLVGMALLKADSPLYLLIVCLVIFGLGLGAFSSPNNSSILADVPPQKQGYGGSFLATIRNLSFALGTAFFSSFFAQSLTYNQKFKSHTSAYVIASNQSYWIAASVCFIGLILTVFFMRKTDKSIS >CP020380|3815248:3880464|3816011_3816188_+|AXU36902.1|DBSCAN-SWA MFGNKMDKCTHVLTAYISSSYDYCNFLDTQLDDFILEYGENVVESCFHQVMVLVSKYN >CP020380|3815248:3880464|3836818_3837496_-|AXU36930.1|DBSCAN-SWA MYNLLVVDDDVDILNINQIYFSNIGFNVYTSETAKDAMDIVESIVLDCIILDISLPDIDGYKMCNDIKEKVNIPIIFLSNYEHEEEKVRGFLAGGDDYITKPYSLKELELRIYARMRQYKNITSVPNVLKFSALVINVNSRKVTFDGESIDLTTMEFEILLFLAENKEQVFSKIEIYNQVWKMPDIGDQHTVQVHIAQMRKKINSLSREHQYIQTVWGKGYKFVP >CP020380|3815248:3880464|3865604_3866189_-|AXU36954.1|DBSCAN-SWA MRLNNREKNLLKILLILVIILASDIAVSYLEENLTSLKNEKQNIINKINNQDNYQIKDNKHIDDKYIESVELNKNEELKNNFNNSFLDKKTNKDIVLLVENELRDIVNVEYINQESSLDNHNKKQVNLEIKVNGELANVLKLEGVMKKLRLNNKLEKIEINKLKVNNFDAQNIPNEYKQEKDNIVECKMTVRVI >CP020380|3815248:3880464|3838390_3839233_-|AXU36931.1|DBSCAN-SWA MFKKKIGVLLASTMLVGALAVGCGSNSGGSGDSGDSSKVSVSGSTSIGPLMETIGEKFQEKNQGVSVEVQQIGSSGGIKNAIEGTSEIGMSSRDLKDEEKSAGLKETKIAIDGIALITNTANPVKNLTMDQVKGIYTGKITNWKEVGGNDAPIVIVSREEGSGTRDGFQEIVGFDSEELTKDAQISDGSGNIKTTVEGNENAIGYISFGYVDEKVNSLKINDVEATDANVIANKYPISRPFILVNKEDGLSEKGKALIDYILSDEGQALVSEKGFIKVNQ >CP020380|3815248:3880464|3846548_3847349_-|AXU36939.1|DBSCAN-SWA MNKLTKKELRSMFWRSFALQGAFNYERMQNLGYCYSMLPAIKKLYNKKENQAKAIERHLEIFNTTTVVVPAILGITAAMEEENANNPEFDESSISAVKTALMGPLAGIGDSLFWGTFRIIAAGVGVSLAKEGNIFGPLLFLLLYNIPAFALRIFGLKYGYQVGVNSLERIQREGLMEKIMSMATTVGLFVVGGMVATMLSITTPLKFNLNGAEVILQDILDKIIPNMLPLTFTFVIYYMLKRKVSVTKLTIGTIVAGIALHAIGLL >CP020380|3815248:3880464|3816686_3817535_+|AXU36903.1|DBSCAN-SWA MDNTKNLEYYRNNLEAYSGDLMKLVIGLTQEEYVNTNARDYLTPCKIWRIIKYFLVGESYDLSDTKIKLDFQENLNFNLDNGILNELCEELEEIIDSNYVQNCKLREALKRAFKLCKCLAEAIKQINCNDKCEFLVGKLFCLLVQIILLIIAIIAKIIILLIFCSDCISCNDKKDVKSSFCDCLICDLEKELDQIEELIDELIKLAISFIKCGSKKCKYDEHHECDCKHEEHHKCGCKYHECDYCNTDCEKKHYTNNCEDSLQEYFDKYKKQDCTKKCNKNY >CP020380|3815248:3880464|3878115_3878628_+|AXU36965.1|DBSCAN-SWA MLKLFLTFLKIGAFTFGGGYAMVPLIQDELVNKQKLLEQEEFIDYLSIAQSYPGVLAVNISVLLGYKLYGIPGVLICTLGSALPSFCIVLVLSYLYFKNSSSKILDGFFKGVAPVVIALILYSFTSMFKKLPKSKTNILLLIIAVLSVGVFNISPIYLIIGGGVYSLCQK >CP020380|3815248:3880464|3863868_3864234_-|AXU36952.1|DBSCAN-SWA MSLSLGNAIAVSTNFIKSNPAVPVYNGEEIYAVIYHIEIGYNNGVSPDTKQYIIIDYKEFDLSMDKKNELINIAKEYCKSKGIVENENLEINLLDNEEAENFLEKVFNNMKVIRGLITKKG >CP020380|3815248:3880464|3832731_3833823_+|AXU36927.1|integrase|DBSCAN-SWA MNIKSAFIRKRGEKFHVYVEYVEEETGKKKQKSYGSYEKKKDAEKHLIEIKSTINNNKFITPNKITLVERCYKYIMANEKNWSPYTTVNRKSWVNNYIEPFFKDTKLIDINPSLLQFFINKSFNNSTSSSAKVRYNFLSSVLKEAYRLKEISENPCDFVKLPAKNVTSEIEIYNREETLLLIEKLNNSIIEMPILLMLLLGLRIGEVAGLRWSDVDLDNSVININQILIYANSKIIFKEPKTEKSKRTLSVPKELIEKLKIEKLKQNKMKLQGTLINENNLVCLNTNFNAWIPTALSKTFHNFIKRNNLRNIRVHDLRHTNASLLLLGGTNMKVVSERLGHTDIKITMNRYSHVLEEMDKEGF >CP020380|3815248:3880464|3871679_3872759_-|AXU36961.1|DBSCAN-SWA MEGKVKKAFPGGNTSQGSYSFFDYIIPENVKRVFCLKGGPGVGKSSLMKKIYKEFLHRGYDIDLYHCPSDPSSLDGLVIKKLGVVLMDATAPHTMDPKLPGALDEIINLGDYWNTEELEKNKQEISVYDKDISNSFKRAFKFLKSAEPIFRDIEEKYSDCMDYGKVNLVTEEFIKRLFDGVKSTGNLKREKHLFGSAITPVGCLDYTENILKDVKKVYYLAGEIGTGKTTLLNKVYKKAIEKGLNVEVYHYPLIPEKIETVLLTDLDIGITISTTFKEEDTIDLNQFLNREKLLKYEEDIKFDEKVLDDLICWAVLNLKRAKSKHDIIESYYSPNMRFDEVGKLRDKLIKRILKYEENL |
67 | Clostridium_phage(54.84%) | tail,integrase,plate,protease | attL 3829496:3829514|attR 3839054:3839072 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP020380.1|AXU34642.1|1287285_1287597_-|Ribbon-helix-helix-protein,-copG-family |
1287285_1287597_-
Protein sequences of CP020380.1|AXU34642.1|1287285_1287597_-|Ribbon-helix-helix-protein,-copG-family>CP020380.1|AXU34642.1|1287285_1287597_-|Ribbon-helix-helix-protein,-copG-family MTTITVRIYTPLNENLEKISYQTGILKSSLILYAINDIIRNSKVNELQSISYKSDDTVRSTLRIPGVLKELLEKTAKENNLSVNSLINNAVHSFCISHWLIYL |
103 aa aa | NA | NA | NA | 1283266-1335037 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 11.6|1945976|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP020380 position: 1312990-1313026, mismatch: 2 ggtgtatttatgttggcaagaagcgttgatgaaatga CRISPR spacer ggtgtatttatgctggcgagaagcgttgatgaaatga Protospacer ************.****.******************* 2. spacer 11.16|1946631|37|CP020380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP020380 position: 1294728-1294692, mismatch: 1 catgaacattctctataatatgtgtgttcttcaacta CRISPR spacer caagaacattctctataatatgtgtgttcttcaacta Protospacer ** ********************************** 3. spacer 20.35|3462975|37|CP020380|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP020380 position: 1332244-1332280, mismatch: 0 taacagcaataaagaacactaacaaaaaagctaaaag CRISPR spacer taacagcaataaagaacactaacaaaaaagctaaaag Protospacer ************************************* |