Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019858 | Clostridioides difficile strain DSM 29688 chromosome, complete genome | 13 crisprs | csa3,RT,WYL,cas3,DEDDh,DinG,cas14j,cas14k,c2c9_V-U4,cas5,cas7,cas6 | 5 | 54 | 12 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019858_1 | 17715-17804 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP019858_1
|
1 spacers
spacers of CP019858_1
>1.1|17743|34|CP019858|CRISPRCasFinder AAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019858_1
The CRISPR arrays of CP019858_1 >merge|CP019858|1|17715-17804|CRISPRCasFinder TGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACAGAATAAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGCTGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACGGAAT >CP019858|1|1|17715-17804|CRISPRCasFinder TGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACAGAAT AAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGC TGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACGGAAT
>CP019858.1|AXU77506.1|9855_10629_+|RNA-polymerase-sigma-B-factor MKNVANATHYLNMDTKELFNLYNKNKNVDIRNILIERHLYLARLLAKKYINKGVDFEDIYQVASLALIYAIDRYDVEKGFEFSSFATPTIVGEIKKYFRDKVWTLRVPRRIQELSKKISDAKIKLEQENKKHPKVKDIADYIGVSEEDVLEAMEASYGYQPMSLDSSSNDDSEDKDITLIDKIGKEEGNFGSIEYEDFINKFIETLNELEVKIFKDRFFFDKTQSSIAKELGISQMTVSRLEKKVVEKLKKEYEKNL >CP019858.1|AXU77505.1|9448_9856_+|serine-protein-kinase MACETIKMEITTNPDYVSIIRLTASGIANKMGFPIDDIEDIKVAVSEACTNAIKHSKDDVFNIVFNILDNAINIEIQDNGKGYDVSSISTPDLENPKESGLGLFIIKTLMDDVDIESEHNQGTKIKMTKYLGVDI >CP019858.1|AXU77504.1|9127_9445_+|anti-sigma-B-factor-antagonist MSMNIDSNLDSQNKFWNVCLDGELDVSTADKLKEHLHALIEKNMLDVKINLKDLDYIDSTGLGAMIGVLKKLKINEKEIYIVNPKSNVRKIFTITGLDKIFKVEG >CP019858.1|AXU77503.1|8855_9116_+|membrane-protein MNAWGWQIGAVLVGSSALIVAIYLAKTLNSINKVVEKAYKIVDYNERHIQDIVENASSISKGIDDIVYVINKILSIGNIFKIIKRK >CP019858.1|AXU77502.1|8559_8856_+|Gas-vesicle-protein MCNKRSCKKGGFLLLGAILGFIFGMFFAPKKGSELRKETKEKFNDVKENPKEVLHETFNDVKERIINLVDDDNNEEDIKISEEDIVISKSFDDEGDVN >CP019858.1|AXU77501.1|6064_8491_+|DNA-gyrase-subunit-A MEENNKILPIEIAEEMKKSYIDYSMSVIAGRALPDVRDGLKPVHRRILYSMSELNLTPDKPYRKSARIVGDVLGKYHPHGDTAVYYAMVRMAQDFSTRALLVDGHGNFGSVDGDSPAAMRYTEAKMSKLSLELLRDIEKETVDFKPNFDESLKEPSVLPARYPNLLVNGSNGIAVGMATSIPPHNLAEVIDATVYLIDNPECSVDDLIKFVQGPDFPTAAIIMGKESIAEAYRTGRGKVKVRSRAFIEELPKGKQQIIVTEIPYQVNKAKLVERIAELVKEKRIEGISDLRDESNRNGMRIVIELKRDANANIVLNNLYKHSQMEDTFSIIMLALVDGQPRVLNLKQILYHYIKHQEDVVTRRTKFELNKAEARAHILEGLKIALDNIDAVISLIRASKTGQEAKLGLIEKFKLTEIQAQAILDMRLQRLTGLERDKIEAEYEDLIKKINRLKEILADERLLLNVIKDEITIIKENYSDERRTEIRHAEGEIDMRDLISDEEIAITLTHFGYIKRLPSDTYKSQKRGGRGISALTTREEDFVRHLVTTTTHSRLLFFTNKGRVFKLNAYEIPEGKRQAKGTAIVNLLQLSADEKIATLIPIDGNDENEYLLLATKKGIVKKTKREEFKNINKSGLIAIGLRDDDELIGVELTDGKQEVLLVTKEGMSIRFDENDIRYMGRTAMGVKGITLSKEDFVVSMNLCSKGTDVLVVSKNGFGKRTNIEEYRSQIRAGKGIKTYNISEKTGTIVGADMVNEDDEIMIINSDGVLIRIRVNEISLFGRVTSGVKLMKTNDEVNVVSIAKINIEEE >CP019858.1|AXU77500.1|4143_6045_+|DNA-gyrase-subunit-B MKQEYGASQIQVLEGLEAVRKRPGMYIGSTSPRGLHHLVYEVVDNSIDEALQGYCSDIYVSINEDGSVLVKDNGRGIPVEIHPKTGKSTLETVLTNLHAGGKFGGGGYKVSGGLHGVGVSVVNALSKWMVAEVYLNGKIYKQTYEKGLPTSKLEVVGESQDKGTMIQFMPDETIFDEIEFKYETLEYRLRELSFLNKGIKIVFEDKREGQEKRKEFHYTGGLVEYIKYLNKSRTGIHDDIVYIDKKVDDCFVELAMQYTDGYTENIYSFANNINTHEGGSHLSGFKAALTKTVNDYAKRNKFLKENDVNLLGEDIREGLTAVVSVKLPEPQFEGQTKTKLGNSFMRGIVDSVTVDELGSFLEENPSTARIIVDKALRAQRAREAAKKARELTRRKSVLESTSLPGKLADCAEKDPSKSEIFLVEGDSAGGSAKQGRDRNSQAILPLRGKILNVEKSRLDRILSSDEIKNMITAYGCGIGEDFDIDKARYHKIIIMTDADVDGAHIRTLLLTFFFRYMRPLIDEGYVYAAQPPLYKVTKQKKEHYVYSDKELNILLDEIGRNGVELQRYKGLGEMNAEQLWETTMNPETRTLLQVTVEDAAIADEVFSMLMGDKVAPRKEFIEENARFVRNLDI >CP019858.1|AXU77499.1|3027_4143_+|DNA-replication-and-repair-protein MKLKSLQLVNFRNYKKLHLEFNGKVNLLVGKNGQGKTNIVESIYMLSFGKSFRTNKDKEMVRFNSENLYIGGSFSKYNKYSLIELIIGKDKKGIRINKVPLQKIQELLGNLNVVIFSPEDLRLVKEGPKERRAFIDKEISQIIPKYYKYLTNYNKTLSQRSRVLKNIHVDEALLDVYDDTLAKYGSYIYILRRDFIKKIANISENMHMNLTNGVERLSIRYKNQINITDEDTIDTVYNKFLAKLSSNRPNDIESKTTRYGIHKDDLNIFINDLDARLFGSQGQQRTASISLKLSEIELIKNEVEEYPVLILDDVFSELDEARQKLLVNNLSNVQMFITSAEVSHKKIFDEKNVTIFNIENGDVISIENGGN >CP019858.1|AXU77498.1|2804_3011_+|RNA-binding-mediating-protein MTEITIESEYIKLDQFLKLAEIASTGGHAKFLIQEGLVTVNDEIELRRGKKIKSGDIVEIEGTKIKVL >CP019858.1|AXU77497.1|1561_2668_+|DNA-polymerase-III-subunit-beta MKIICNQKILANRIGIAQKAINGKTTIELLKGILISTEEGQLKLTGYDAEIGIETYVQAEIIEKGDVVVDARLFGDIIRKLPDSFVEIETDSENNIYINCVNSRFKIKGYAAKEFPKLPELNEEDLYSIPQEILKNMIKQTVFAISQDQTKPVLMGELLEIVDRNLNLVAIDGYRLAVKSCSVDSLTENIKVIIPGKTLIDVNSLLSGEDNVKVGFNEKNAIFIINDTKIITRLLEGDFIDYKKLLPREHNSRVKLNTKELLNSIERASLLSQSEKNNLIKLSIRDKVMAITSNTEKGNVYEEVEIDLDGDYLDIAFNSRYFIEGLKNIDNEEIFIEFTTNVNPCIIKPTDDVNYIYLLLPVRISSNI >CP019858.1|AXU77507.1|21216_21726_+|small-molecule-binding-protein MNSNERRSKLIDILKESKHPVKGGTLAELLNVSRQVIVQDIALIRARGFEIIATPQGYIIYNQPYFTKQIKCKNHKDSKEIYDELKIIVDLGGIIKDVIVNHPTYGQITAELNIYSKMDIDNFMKKVETNEFKQLSVLTECSHIHTIEAIKEETIKAIVKELKDNGILS >CP019858.1|AXU77508.1|21737_22619_+|mechanosensitive-ion-channel-protein MNFLSLAKTASTNSNITKRTLENMLDNFSDNIPNIIYAIIVFVIGIYISKIVRRMVSKFLIKYGMSKGVNNFIVYGIYISMLSIISLISLGIIGIQTTSVVAVLGAAGFSIGLAFKEILSNLGSGMIILFFKPFNIGDYIQGSGVEGTVSDIQIFSTVLKTPDNKTIIIPNFQLTSNNIINYTHQNKRRIDFSYNISYDSDIDVVKSILNEIFTNEKRILNDPKPIIGLNSIGNNTMQIVARPWVKTDDYWDVYFDVMEKVKNKFDENDIKVPFVPSSLLFNNTGNLNTMDKR >CP019858.1|AXU77509.1|23077_24349_+|seryl-tRNA-synthetase MLDIKRIRENLDDIKKAMERRGEREFDLDAVVELDNKRREILQEVEVMKNELNVNSKKIPQLIKEGKDVTEEKARLKELSDKIKGIDEKVKEVEAKMEYTLMRIPNVPHPEVPQGETDEDNVQIRTWGEPTKFDFEHKAHWDIGTGLGILDFERAGKITGSRFTLYRGLGARLERSLMNFFLNTHTAKHGYTEVLPPFMANRNSFIGTGQLPKFEEDMFKIEGLEYFLIPTAEVPVTNIHANEILDVAELPIKYCAYTPCFRSEAGSAGRDTRGLVRQHQFNKVELVKFVKPEDSYNELESLTHDAETMLQMLGLPYRVVKICTGDLGFTAAFKYDLEVWMPSYNRYVEISSCSNFEDFQARRAGIRFKRDKKSKAEYVHTLNGSGLAIGRCLAAILENYQQADGSVVVPEELRPYMGVDVIK >CP019858.1|AXU77510.1|24669_25125_+|cytosine/adenosine-deaminase MESSFYMKEALKEAYKAYNKKETPIGAIIVKDNQIIARAHNLTETLKDSTAHAEILAIKQASEKLGGWRLTDCDLYVTMEPCIMCSGAIVNSRIKKLIIGTRHVKNSYIEKQHEFKLDYFNNNNVKVAFDVLQEECSIILQEFFKALRKRD >CP019858.1|AXU77511.1|25595_27233_+|DNA-polymerase-III-subunits-gamma/tau MHKALYRAYRPQKFEDVIGQDHIIKTLKNQIYSDNIGHAYLFCGTRGTGKTSTAKIFSRAVNCLNKINEEPCNECEICESVLKDNTMDVVEIDAASNNSVDDIRELRESVKYSPANAKYKVYIIDEVHMLSQGAFNALLKTLEEPPSYVIFILATTEPHKIPATILSRCQRYDFKRVTVKDMTLRMKKICEDEGIDIDDKALNLIARNSQGALRDALSILDQCMSFGESKIDYKDVVELMGSVNIEQLFELSQCIVEQDTKKSLEILNEFVLWGKDIRNLINDLIDHFRNLMVCKVSSELDEIISLPEETIEQLKIQSKNIDINDLIRILNILSITQDDIKSSSNPRVLVEITIMKIAQPMFDESKEALIKRVENLEKMIELGNFKSEKIGNNKEKEYEVDREIDVKQENVVYEDVKNEDVILIESSWKNILKQIKKDKKMPIYALLSEVKSFNVYSNMLYVIFDDKFDFAKTRLSSQDTINYLEKTIRDVLNRSFNVKIVLTSEVKDINLEVKEKKDIGEEILKNIVSEEILEIKDSIDENESK >CP019858.1|AXU77512.1|27291_27642_+|DNA-binding-protein,-YbaB/EbfC-family MAKKGFGGGMMPGGGNMNNLLKQAQKMQENMQKAQQELESKEVEASVGGGAVTVKVNGKKEVIDITIKPEVVDPDDIEMLQDLVLSAVNQALRNIDDIQASQMSKVTGGMNIPGLF >CP019858.1|AXU77513.1|27654_28254_+|recombination-protein MQVYTGPITRLIEEFSKLPGVGRKTAQRLAFHIINMNTNDVEALSKAIIDAKREIRYCSICCNITDTDPCSMCSNKSRDSSVICVVEDPRDVAAMERTREFKGQYHVLNGVISPMDGIGPDMLKIKELIQRLGNQEVKEIIMATNPTIEGEATAMYIARLVKPMGIKVTRIAHGLPVGGDLEYADEVTISKALEGRREI >CP019858.1|AXU77514.1|28394_28616_+|hypothetical-protein MKPIMNLEEHNAMKEKRVKKMKSKDKPKYDDFEDISFSNKKKTKKNVRNKNAEFRNNYKNYQYDYEEDFYEPI >CP019858.1|AXU77515.1|28686_29892_-|glycosyl-transferase MSKKVLIMSASTGGGHNRAALAIKEELTSKTLDGEPIECEIIDSLKLVNNTMDKIISRGYEKSAIYTPKAYGSVYRLSETNLLSKNEFKDNLLITFMAKKFKKLIRSEKPDLIIGTHPFPMIALSTLKKNFNLHNNESNAYTEHFYKHYTNTINVPPLISVLTDYTTHSTWIQNEIDYYIVGHEYVKELLVFDGVEPSKIRTFGIPVEKSFLSHRDKDIVLSELNLSPDKLTVLLMGGSFGAGNIKETLDELLDTDRDFQILVITGKNESLKEKIEKKLMSRYHDKNVCVLGYTDKMNDILASIDVLVSKPGGLTTTEALLKDVPMIVPYYIPGQEEENLDFLSNCGAALRTTKKYNLSILLKVLIDDPSRLEMLKRNIKSIRKSNSAQNIANLILNIISG >CP019858.1|AXU77516.1|39292_39706_+|hypothetical-protein MYIVIGNEIVDSEELKIIIDKNSEFKVEKDLSKSTKREDVIAYQLSIDLNYLDSLINEQCNLASLSDEEKFDEYMTLSDELALDLEELMPKYTIINARAYKLDEVDGIVKIILAVAYADLGHLKLSDVVKRLSRQVD |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019858_2 | 141435-141513 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP019858_2
|
1 spacers
spacers of CP019858_2
>2.1|141460|29|CP019858|CRISPRCasFinder TGTAATAAGTTAAAGCAATATGAATCAAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019858_2
The CRISPR arrays of CP019858_2 >merge|CP019858|2|141435-141513|CRISPRCasFinder TGTTTATAATGTGGATAATATTTAATGTAATAAGTTAAAGCAATATGAATCAACTGTTTATAATGTGGATAATATTATA >CP019858|2|2|141435-141513|CRISPRCasFinder TGTTTATAATGTGGATAATATTTAA TGTAATAAGTTAAAGCAATATGAATCAAC TGTTTATAATGTGGATAATATTATA
>CP019858.1|AXU77608.1|140415_140955_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase-activating-protein MKIRMSSTISYDSIVDGPGLRMVIWTQGCIHNCKECHNPQTHDLCGGFYMDTEEIINKVKSLKLQKGITLSGGEPFLQPEPLEEIAKEAKINGLDVWSYTGFTFEQLLDKKNRAYFKNLNLLKQIDILVDGKFIAEKKDISLKFRGSSNQRIIDVQKSLKYKQVFLVEQYMKDDLSIAE >CP019858.1|AXU77607.1|138042_140394_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase MVEFVKKRDGRVIPFNEDRITRAIFLAATNVAEREGIVPDYKLSEQLTQEVIKFLNHKYSESVPSVEDIQDSVVKVLIETGHAKTSEEYIIYRTERSRIRNSKTRLMKAIEEITFEDAEDADIKRENANINGNTAMGTMLQYGSTVSKEFCKTHILKPEHSFAHDNGDIHIHDMDFLNMGTLTCCQIDVKKLFNGGFSTGHGFLREPQDIISYGALAAIAIQSNQNDQHGGQSIPFFDYGLAEGVYKTFKKFYIGNLAKALKLFKGIENNDVIKNIVYNTEKETNQKVGLKRDELYLNLEKEKLIQTFDIDDELVNKMQNFAFEESYRETDKKTYQSMEAFIHNLNTMHSRAGAQVPFSSVNFGTDTSEEGRMVTKNLLLSQERGLGNGETPIFPILIFKVKEGINLNPEDPNYDLFKLSCRVSAKRLFPNFSFLDAPFNAKYYKKGEPDTEATYMGCRTRVLSNVCGSETVSGRGNISFTTVNLPRLGIKHGIINNEKANLDGFFEELDEKINLIIEQLLERLEVQGNKKMKNFPFLMGQGVWKGSDDLGPEDTLKEVIKQGTLTIGFIGLAECLIALIGKHHGESKEAQELGLKIVSHMRHKMDEATDKYKLNFSLMGTPAEGLSGRFTKIDKKVYGEIKGITDKEYYTNSFHVPVYYNISAYDKIEIEAPYHELTNAGHITYVELDGDPSDNLEAFETVIKAMKDLGIGYGSINHPVDRDPICGFSGVITSNICPVCGRNEDESDIKFERIRRITGYLVGTVDRFNNAKKAEVRDRVKHR >CP019858.1|AXU77606.1|136485_137670_-|aspartate-aminotransferase MLSKRLNFITPSYTIGISSKVKEIESNGVKVINLSIGEPDFNVPNNAKSYGIDSLNKDYTKYDLVPGLKILREEICKKLIEENNCNYSIDEIVVSSGAKNSITNTLLALTDEGDEVLLPKPYWVSYPEMIKLVNAVPVFIDTKKENGFKLTKEELEKSITDKTKILVINNPSNPTGSVYTKDELIEIVDVCIQNKIYILADEIYEKICYTGEFTSIASLSEEAKDITITINGFSKSAAMTGLRLGYTASNKTIAKAMSSIQGHLISHPSLTAQYIAYGALKDCSIDIDNMVKTYKSRRDLIKSKLDSIDNVGYVNPNGAFYIFIDLSKVSEKFEYKDSFSIEFCNQFLEEYNVAVVPGIAFGMDKYIRISYACSENTFLSGLDKLKEFVYKIMA >CP019858.1|AXU77605.1|123199_123952_+|germination-specific-N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MEYYSVFISIHIQGDVVRKYIKHIIFSFAMICLVVVSIFEIKNISEDVIKYMPVTNKTIILDAGHGGIDPGALNKDKSTSEKDINLAITLKLRELIESSGGLVILTREDDSSLYKEENNKTTRQKYNENLKNRKEIISNSNANMFVSIHLNAFEQSKYYGAQTFYPKDKQDSKELSKCIQEELKRVVDKTNNREVKPRDDIYLLKENNIPSVLIECGFLSNEKECKLLTDETYQEKIAWAIYIGIQKYLS >CP019858.1|AXU77604.1|122348_122741_+|30S-ribosomal-protein-S9 MANVQYYGTGRRKSSVARVRLVAGEGNILVNGRALENYFNYETLIRDVKQPLVLTGNENKYDVIVKVEGGGFTGQAGAIRHGISRALLKADLDLRPALKKEGFLTRDARMKERKKYGLKAARRAPQFSKR >CP019858.1|AXU77603.1|121888_122320_+|50S-ribosomal-protein-L13 MKSYIAKPADVQRKWYLVDAEGKTLGRLATEIATVLRGKHKPTFTPHVDGGDFVVVVNAEKIVLSGKKLDQKYYRYHTGYVGGLKEISYRDMMDKKPEEVISHAVSGMLPKNKLRSRMMTRLRVFAGAEHTHAAQNPEVLNFK >CP019858.1|AXU77602.1|121037_121769_+|tRNA-pseudouridine-synthase-1 MRNIKIKIQYNGKNYCGWQKQPDSLGIQGTIERAIYDITKEETSLIGSGRTDSGVHAIGQIANFKINSGISIESIPMALNAKLPKDISVIEACEVNDDFHSRYSAKGKTYKYLVYNSKFRNPILSEISYQVKYELDFDKMCSEAKSLLGTHDFKGFMSSGSSVKDTVRTIYDIDISKKDDLITFEISGNGFLYNMVRIIVGTLVDMGRGRINEPFLDIIQSKTRSRCGHTAPAQGLFLKKVHY >CP019858.1|AXU77601.1|120202_121006_+|ABC-transporter-permease MLKDITIGQYYPTSSAIHKLDPRIKLVATIVFMVSIFVVNKFWPYIVVLLCLLAMIKLANIPVKYIVKGVKPLKWIILFTFLINIFFLPGDEIWSFGFLAITKQGLRQAIFMAIRLIFLVVGTSLLTLTTSPIELTDGIERLLNPFKKIGLPVHELAMMMTIALRFIPTLLDETDKIMKAQMSRGADFESKNLINRAKNLVPLLVPLFVSAFRRADELAMAMEARCYRGGHNRTKMRESVISRRDYMACVFQVVYLGAIIATRFIAI >CP019858.1|AXU77600.1|119342_120209_+|cobalt-transporter-ATP-binding-subunit MSIIVKNLTHIYNEGMPFASKALDDVSFEIKDRDFVGLIGHTGSGKSTLIQHLNGLLKPSSGEIFINDFNITDKNLNLTEIRKRVGVVFQYPEYQLFEETIDKDIAFGPSNLGLEESEIHNRVKASMEAVGLDYEGFKDKSPFELSGGQKRRVAIAGVIAMNPEVLILDEPTAGLDPGGRDEIFNLIKDLHEKKNMTIILSSHSMDDMAKLAKTLIVMNHGSVEFMGTPREVFKSNASKLKDIGLDIPQVLELALKLREKGFDISEDILTLEEAKQEILKVVRGRGLC >CP019858.1|AXU77599.1|118521_119355_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MDNIVKVNNISFEYITDEAKLKAIDNLSLDVKKGEFVAIIGHNGSGKSTLSKNLNAILMPTEGNILIDDMDTKEEERLWDIRQTAGMVFQNPDNQIVATIVEEDVAFGPENLGIEPKEIRRIVEESLKSVGMYDLRDRQPHLLSGGQKQRVAIAGIIAMRPKCIIFDEATAMLDPSGRKEVMKTIKRLNKEENITVIHITHFMEEAVEADRVVVMEKGKKILEGTPREVFSKIKMLKEIGLDVPCMTELSSLLIEEGINISSDILTVDEMVMELCQL >CP019858.1|AXU77609.1|153979_154819_+|DNA-integrity-scanning-protein-DisA MLDINSFLNGFFNIILRMSIYDLIDISIVAYIFYKIFMFIKDTRAEQVFKGIIFLLLATQLSNTFKLHTVYWISLKALDYGVIAALIIFQPEFRAGLEHIGRAKFNLFGKNVNTSEETLNRNIEEIVEALYSLSRQKIGALIIMERETRISDIINTGTIIDAEISRQLLINIFIPNTPLHDGAVVIRDSKVKAAACFLPLTESKDLSKDLGTRHRAGIGVSEVSDCITLIVSEETGGVSIAKAGKLYRDISRERMMNILRSNLKTNTETRSFFKGGIFK >CP019858.1|AXU77610.1|154815_155997_+|membrane-associated-protein MINRLKNNTKIKIISFLSAIALWMYVMAVVDPEETKGFEDIPVSISNMSDLKDKNLVIYPDEKLTADVYIKGSLSKVQSVKKEDIHVYGTIEDPIQGQKEVYLKANIPQGVTLEFKHDVLVVNLEKNIKEKRDIKVEVSGNSKRNINKIELSKEFVDVSGPRTLVKEVKSVRANLDVGNETDDFSKKLQLIPLNSDGTKVEGVTLSSSFVTAKIELLKEKIVPIRVSLNDNKDNDVLKNYKLSKEQVTIKGKKDDIDKISYIKTKPIDLADLANGEEKEVSLEIPEGITLEDSSITIKLNDTKQLSAEFLYNAGDIELRNIPTNMDNPNVISDVDIKVVVESTEDLSKLNKKDISLYIDLSQGPEEDSKYKIKYETTYQFKKINIEPNIVEVE >CP019858.1|AXU77611.1|156300_157203_+|phosphate-butyryltransferase MRSFEEVIKFAKERGPKTISVACCQDKEVLMAVEMARKEKIANAILVGDIEKTKEIAKSIDMDIENYELIDIKDLAEASLKSVELVSQGKADMVMKGLVDTSIILKAVLNKEVGLRTGNVLSHVAVFDVEGYDRLFFVTDAAMNLAPDTNTKKQIIENACTVAHSLDISEPKVAAICAKEKVNPKMKDTVEAKELEEMYERGEIKGCMVGGPFAIDNAVSLEAAKHKGINHPVAGRADILLAPDIEGGNILYKALVFFSKSKNAGVIVGAKAPIILTSRADSEETKLNSIALGVLMAAKA >CP019858.1|AXU77612.1|157224_158304_+|butyrate-kinase MSKIFKILTINPGSTSTKIAVFDNEDLVFEKTLRHSSEEIGKYEKVSDQFEFRKQVIEEALKEGGVKTSELDAVVGRGGLLKPIKGGTYSVSAAMIEDLKVGVLGEHASNLGGIIAKQIGEEVNVPSYIVDPVVVDELEDVARISGMPEISRASVVHALNQKAIARRYAREINKKYEDINLIVAHMGGGVSVGAHKNGKIVDVANALDGEGPFSPERSGGLPVGALVKMCFSGKYTQDEIKKKIKGNGGLVAYLNTNDAREVEERIEAGDEKAKLVYEAMAYQISKEIGASAAVLKGDVKAILLTGGIAYSKMFTEMIADRVKFIADVKVYPGEDEMIALAQGGLRVLTGEEEAQVYDN >CP019858.1|AXU77613.1|158293_158971_+|ATP/GTP-binding-protein MITNDKRIRIITGHYGSGKSEFAMNYVVKLRDMVSGKVAIADLDVVNVYFRTREKKELMKSLGIQPIDSSINAPTLDLPAVSAEVMSPMVDHSYNSVIDLGGDNVGARVIGRFSHLLKEGDYDMLFVINANREKTQTSEEVIQYIKEIEKSSKLKVTGLINNTHLIRFTTIDDVLRGQKVAKEVSEKCNIPIRYVACLENLVEQLPKDLEGEIFPIKLYMREDWM >CP019858.1|AXU77614.1|159013_159229_+|ferredoxin MAKGKVSFNQERCKGCGLCVEACPVKIIQLDSNVINKKGYNPATVFEMEKCIGCASCATMCPDVVITVERD >CP019858.1|AXU77615.1|159257_160337_+|2-ketoisovalerate-ferredoxin-reductase MAKILMKGNEAFGKAAIEAGCKYFFGYPITPQSELPEYLSRELPKIGGAFVQAESEVSAINMVYGGAGAGARVMTSSSSPGVALKQEGITYAVGAEVPCVVLNVMRGGPGLGSIQPSQADYFMSTRGGGNGDYRTPVFAPATVQEAVDMIMEAFDVADYYRSPVMVVADGMIGQMMEPVEFRAPEKKRELPPKDWATVGTKGKRKPNVINSLYLEPEVLEDHCWHLQEKFDAMEKNEVQYEMYKTEDAEFVFAAYGTTSRVVKSAIDILREEGIKAGLIRPKVLWPFPFEAFNQIPNARNILTVEMSMGQMVEDVKMAVEGKLPVYFHGRPGGMTPTPAEIVEKAKKIIAGELVAGGAR >CP019858.1|AXU77616.1|160336_161089_+|subunit-of-oxidoreductase MAVVFKKTEGLQDTQTHYCPGCTHGIIHRLVGEVLEELGVLGDAVGVVPVGCSVLGYKYFNCDTQEAAHGRAPAAATGIKRVHPENTVFTYQGDGDLASIGTAEIVHAAARGEKITTIFVNNTTYGMTGGQMAPTTLVGQRATTAQSGRNAETQGYPIRVSEMLATLTGAVFVERVAVDTPAHVRQAKKAIKKAFQVQQAGLGFGIVEVLSTCPTNWGLAPNDALQWLRDNMIPYYPLGNFKNVEVEEVK >CP019858.1|AXU77617.1|161089_161647_+|subunit-of-oxidoreductase MSTARVICAGFGGQGVMSMGQLLTYAGMLEGKEVSWLPSYGPEMRGGTANCAVTVSNEPVGSPLITDDATAAILLNIPAFEKFKDDVIPGGKIIVNSSLIKEKVDRTDVDVYYIPANELAAELGNDKVANMIMLGAYLKVSDTVDIESVLEAFKKVFGPRKEKFVPLNREALQKGMDATCSKATN >CP019858.1|AXU77618.1|161816_163163_+|phosphoglucomutase/phosphomannomutase-mutase MRKYFGTDGVRGVANTELTCDLAYKLGRAGGFVLAQGDHRVKVVVGKDTRISGDMLEASLIAGLMSVGCDVITVGIIPTPAVAYLTRKYGADCGVVISASHNPVEYNGIKFFNKNGYKLDDEIELKIEEYIDDIDKIDCLPIGENVGRKLHEHCAQRDYVDYLKSIISTDFKGLKVVLDCANGASYKVAPIVFDELGASVISINSSPDGNNINYKCGSTHPEQLQRAVLEHNADLGLAYDGDADRLIAVNEKGQIVDGDHIMILSALNLKKNNKLAQDTLVVTVMSNIGLTIAAKENGINLSTTAVGDRYVLEDMVKNGYNLGGEQSGHMIFLDYNTTGDGVLSSLILANIILQEKKPLSEIASIMSQYPQVLVNATIKNENKNKYMEYPEIKTEIERIESILDGNGRVLIRPSGTEPLVRVMLEGKEEGQIKELATNLANLIQEKLS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019858_3 | 148857-148946 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP019858_3
|
1 spacers
spacers of CP019858_3
>3.1|148885|34|CP019858|CRISPRCasFinder AAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019858_3
The CRISPR arrays of CP019858_3 >merge|CP019858|3|148857-148946|CRISPRCasFinder TGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACAGAATAAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGCTGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACGGAAT >CP019858|3|3|148857-148946|CRISPRCasFinder TGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACAGAAT AAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGC TGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACGGAAT
>CP019858.1|AXU77608.1|140415_140955_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase-activating-protein MKIRMSSTISYDSIVDGPGLRMVIWTQGCIHNCKECHNPQTHDLCGGFYMDTEEIINKVKSLKLQKGITLSGGEPFLQPEPLEEIAKEAKINGLDVWSYTGFTFEQLLDKKNRAYFKNLNLLKQIDILVDGKFIAEKKDISLKFRGSSNQRIIDVQKSLKYKQVFLVEQYMKDDLSIAE >CP019858.1|AXU77607.1|138042_140394_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase MVEFVKKRDGRVIPFNEDRITRAIFLAATNVAEREGIVPDYKLSEQLTQEVIKFLNHKYSESVPSVEDIQDSVVKVLIETGHAKTSEEYIIYRTERSRIRNSKTRLMKAIEEITFEDAEDADIKRENANINGNTAMGTMLQYGSTVSKEFCKTHILKPEHSFAHDNGDIHIHDMDFLNMGTLTCCQIDVKKLFNGGFSTGHGFLREPQDIISYGALAAIAIQSNQNDQHGGQSIPFFDYGLAEGVYKTFKKFYIGNLAKALKLFKGIENNDVIKNIVYNTEKETNQKVGLKRDELYLNLEKEKLIQTFDIDDELVNKMQNFAFEESYRETDKKTYQSMEAFIHNLNTMHSRAGAQVPFSSVNFGTDTSEEGRMVTKNLLLSQERGLGNGETPIFPILIFKVKEGINLNPEDPNYDLFKLSCRVSAKRLFPNFSFLDAPFNAKYYKKGEPDTEATYMGCRTRVLSNVCGSETVSGRGNISFTTVNLPRLGIKHGIINNEKANLDGFFEELDEKINLIIEQLLERLEVQGNKKMKNFPFLMGQGVWKGSDDLGPEDTLKEVIKQGTLTIGFIGLAECLIALIGKHHGESKEAQELGLKIVSHMRHKMDEATDKYKLNFSLMGTPAEGLSGRFTKIDKKVYGEIKGITDKEYYTNSFHVPVYYNISAYDKIEIEAPYHELTNAGHITYVELDGDPSDNLEAFETVIKAMKDLGIGYGSINHPVDRDPICGFSGVITSNICPVCGRNEDESDIKFERIRRITGYLVGTVDRFNNAKKAEVRDRVKHR >CP019858.1|AXU77606.1|136485_137670_-|aspartate-aminotransferase MLSKRLNFITPSYTIGISSKVKEIESNGVKVINLSIGEPDFNVPNNAKSYGIDSLNKDYTKYDLVPGLKILREEICKKLIEENNCNYSIDEIVVSSGAKNSITNTLLALTDEGDEVLLPKPYWVSYPEMIKLVNAVPVFIDTKKENGFKLTKEELEKSITDKTKILVINNPSNPTGSVYTKDELIEIVDVCIQNKIYILADEIYEKICYTGEFTSIASLSEEAKDITITINGFSKSAAMTGLRLGYTASNKTIAKAMSSIQGHLISHPSLTAQYIAYGALKDCSIDIDNMVKTYKSRRDLIKSKLDSIDNVGYVNPNGAFYIFIDLSKVSEKFEYKDSFSIEFCNQFLEEYNVAVVPGIAFGMDKYIRISYACSENTFLSGLDKLKEFVYKIMA >CP019858.1|AXU77605.1|123199_123952_+|germination-specific-N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MEYYSVFISIHIQGDVVRKYIKHIIFSFAMICLVVVSIFEIKNISEDVIKYMPVTNKTIILDAGHGGIDPGALNKDKSTSEKDINLAITLKLRELIESSGGLVILTREDDSSLYKEENNKTTRQKYNENLKNRKEIISNSNANMFVSIHLNAFEQSKYYGAQTFYPKDKQDSKELSKCIQEELKRVVDKTNNREVKPRDDIYLLKENNIPSVLIECGFLSNEKECKLLTDETYQEKIAWAIYIGIQKYLS >CP019858.1|AXU77604.1|122348_122741_+|30S-ribosomal-protein-S9 MANVQYYGTGRRKSSVARVRLVAGEGNILVNGRALENYFNYETLIRDVKQPLVLTGNENKYDVIVKVEGGGFTGQAGAIRHGISRALLKADLDLRPALKKEGFLTRDARMKERKKYGLKAARRAPQFSKR >CP019858.1|AXU77603.1|121888_122320_+|50S-ribosomal-protein-L13 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MSIIVKNLTHIYNEGMPFASKALDDVSFEIKDRDFVGLIGHTGSGKSTLIQHLNGLLKPSSGEIFINDFNITDKNLNLTEIRKRVGVVFQYPEYQLFEETIDKDIAFGPSNLGLEESEIHNRVKASMEAVGLDYEGFKDKSPFELSGGQKRRVAIAGVIAMNPEVLILDEPTAGLDPGGRDEIFNLIKDLHEKKNMTIILSSHSMDDMAKLAKTLIVMNHGSVEFMGTPREVFKSNASKLKDIGLDIPQVLELALKLREKGFDISEDILTLEEAKQEILKVVRGRGLC >CP019858.1|AXU77599.1|118521_119355_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MDNIVKVNNISFEYITDEAKLKAIDNLSLDVKKGEFVAIIGHNGSGKSTLSKNLNAILMPTEGNILIDDMDTKEEERLWDIRQTAGMVFQNPDNQIVATIVEEDVAFGPENLGIEPKEIRRIVEESLKSVGMYDLRDRQPHLLSGGQKQRVAIAGIIAMRPKCIIFDEATAMLDPSGRKEVMKTIKRLNKEENITVIHITHFMEEAVEADRVVVMEKGKKILEGTPREVFSKIKMLKEIGLDVPCMTELSSLLIEEGINISSDILTVDEMVMELCQL >CP019858.1|AXU77609.1|153979_154819_+|DNA-integrity-scanning-protein-DisA MLDINSFLNGFFNIILRMSIYDLIDISIVAYIFYKIFMFIKDTRAEQVFKGIIFLLLATQLSNTFKLHTVYWISLKALDYGVIAALIIFQPEFRAGLEHIGRAKFNLFGKNVNTSEETLNRNIEEIVEALYSLSRQKIGALIIMERETRISDIINTGTIIDAEISRQLLINIFIPNTPLHDGAVVIRDSKVKAAACFLPLTESKDLSKDLGTRHRAGIGVSEVSDCITLIVSEETGGVSIAKAGKLYRDISRERMMNILRSNLKTNTETRSFFKGGIFK >CP019858.1|AXU77610.1|154815_155997_+|membrane-associated-protein MINRLKNNTKIKIISFLSAIALWMYVMAVVDPEETKGFEDIPVSISNMSDLKDKNLVIYPDEKLTADVYIKGSLSKVQSVKKEDIHVYGTIEDPIQGQKEVYLKANIPQGVTLEFKHDVLVVNLEKNIKEKRDIKVEVSGNSKRNINKIELSKEFVDVSGPRTLVKEVKSVRANLDVGNETDDFSKKLQLIPLNSDGTKVEGVTLSSSFVTAKIELLKEKIVPIRVSLNDNKDNDVLKNYKLSKEQVTIKGKKDDIDKISYIKTKPIDLADLANGEEKEVSLEIPEGITLEDSSITIKLNDTKQLSAEFLYNAGDIELRNIPTNMDNPNVISDVDIKVVVESTEDLSKLNKKDISLYIDLSQGPEEDSKYKIKYETTYQFKKINIEPNIVEVE >CP019858.1|AXU77611.1|156300_157203_+|phosphate-butyryltransferase MRSFEEVIKFAKERGPKTISVACCQDKEVLMAVEMARKEKIANAILVGDIEKTKEIAKSIDMDIENYELIDIKDLAEASLKSVELVSQGKADMVMKGLVDTSIILKAVLNKEVGLRTGNVLSHVAVFDVEGYDRLFFVTDAAMNLAPDTNTKKQIIENACTVAHSLDISEPKVAAICAKEKVNPKMKDTVEAKELEEMYERGEIKGCMVGGPFAIDNAVSLEAAKHKGINHPVAGRADILLAPDIEGGNILYKALVFFSKSKNAGVIVGAKAPIILTSRADSEETKLNSIALGVLMAAKA >CP019858.1|AXU77612.1|157224_158304_+|butyrate-kinase MSKIFKILTINPGSTSTKIAVFDNEDLVFEKTLRHSSEEIGKYEKVSDQFEFRKQVIEEALKEGGVKTSELDAVVGRGGLLKPIKGGTYSVSAAMIEDLKVGVLGEHASNLGGIIAKQIGEEVNVPSYIVDPVVVDELEDVARISGMPEISRASVVHALNQKAIARRYAREINKKYEDINLIVAHMGGGVSVGAHKNGKIVDVANALDGEGPFSPERSGGLPVGALVKMCFSGKYTQDEIKKKIKGNGGLVAYLNTNDAREVEERIEAGDEKAKLVYEAMAYQISKEIGASAAVLKGDVKAILLTGGIAYSKMFTEMIADRVKFIADVKVYPGEDEMIALAQGGLRVLTGEEEAQVYDN >CP019858.1|AXU77613.1|158293_158971_+|ATP/GTP-binding-protein MITNDKRIRIITGHYGSGKSEFAMNYVVKLRDMVSGKVAIADLDVVNVYFRTREKKELMKSLGIQPIDSSINAPTLDLPAVSAEVMSPMVDHSYNSVIDLGGDNVGARVIGRFSHLLKEGDYDMLFVINANREKTQTSEEVIQYIKEIEKSSKLKVTGLINNTHLIRFTTIDDVLRGQKVAKEVSEKCNIPIRYVACLENLVEQLPKDLEGEIFPIKLYMREDWM >CP019858.1|AXU77614.1|159013_159229_+|ferredoxin MAKGKVSFNQERCKGCGLCVEACPVKIIQLDSNVINKKGYNPATVFEMEKCIGCASCATMCPDVVITVERD >CP019858.1|AXU77615.1|159257_160337_+|2-ketoisovalerate-ferredoxin-reductase MAKILMKGNEAFGKAAIEAGCKYFFGYPITPQSELPEYLSRELPKIGGAFVQAESEVSAINMVYGGAGAGARVMTSSSSPGVALKQEGITYAVGAEVPCVVLNVMRGGPGLGSIQPSQADYFMSTRGGGNGDYRTPVFAPATVQEAVDMIMEAFDVADYYRSPVMVVADGMIGQMMEPVEFRAPEKKRELPPKDWATVGTKGKRKPNVINSLYLEPEVLEDHCWHLQEKFDAMEKNEVQYEMYKTEDAEFVFAAYGTTSRVVKSAIDILREEGIKAGLIRPKVLWPFPFEAFNQIPNARNILTVEMSMGQMVEDVKMAVEGKLPVYFHGRPGGMTPTPAEIVEKAKKIIAGELVAGGAR >CP019858.1|AXU77616.1|160336_161089_+|subunit-of-oxidoreductase MAVVFKKTEGLQDTQTHYCPGCTHGIIHRLVGEVLEELGVLGDAVGVVPVGCSVLGYKYFNCDTQEAAHGRAPAAATGIKRVHPENTVFTYQGDGDLASIGTAEIVHAAARGEKITTIFVNNTTYGMTGGQMAPTTLVGQRATTAQSGRNAETQGYPIRVSEMLATLTGAVFVERVAVDTPAHVRQAKKAIKKAFQVQQAGLGFGIVEVLSTCPTNWGLAPNDALQWLRDNMIPYYPLGNFKNVEVEEVK >CP019858.1|AXU77617.1|161089_161647_+|subunit-of-oxidoreductase MSTARVICAGFGGQGVMSMGQLLTYAGMLEGKEVSWLPSYGPEMRGGTANCAVTVSNEPVGSPLITDDATAAILLNIPAFEKFKDDVIPGGKIIVNSSLIKEKVDRTDVDVYYIPANELAAELGNDKVANMIMLGAYLKVSDTVDIESVLEAFKKVFGPRKEKFVPLNREALQKGMDATCSKATN >CP019858.1|AXU77618.1|161816_163163_+|phosphoglucomutase/phosphomannomutase-mutase MRKYFGTDGVRGVANTELTCDLAYKLGRAGGFVLAQGDHRVKVVVGKDTRISGDMLEASLIAGLMSVGCDVITVGIIPTPAVAYLTRKYGADCGVVISASHNPVEYNGIKFFNKNGYKLDDEIELKIEEYIDDIDKIDCLPIGENVGRKLHEHCAQRDYVDYLKSIISTDFKGLKVVLDCANGASYKVAPIVFDELGASVISINSSPDGNNINYKCGSTHPEQLQRAVLEHNADLGLAYDGDADRLIAVNEKGQIVDGDHIMILSALNLKKNNKLAQDTLVVTVMSNIGLTIAAKENGINLSTTAVGDRYVLEDMVKNGYNLGGEQSGHMIFLDYNTTGDGVLSSLILANIILQEKKPLSEIASIMSQYPQVLVNATIKNENKNKYMEYPEIKTEIERIESILDGNGRVLIRPSGTEPLVRVMLEGKEEGQIKELATNLANLIQEKLS |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP019858_4 | 1341923-1342349 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP019858_4
|
6 spacers
spacers of CP019858_4
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019858_4
The CRISPR arrays of CP019858_4 >merge|CP019858|4|1341923-1342349|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTCAATTAAATTATTATATTTTAATGCTCTTTTTAATCGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGGCAGAGTTGATAGTACTATTAAAAGAAGAAAAGTTAAGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGCTATAACTTTTATTAATTTTTGTTTCATAATCTTTCGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTTAATCTTTAAAATTAAATATAAAAATAAGCTAGACATGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTTAATAAAACTGATAGTAAAACTACTAATAATAAAGGTTTTATATTAACTAAGAGGTATGTAAAGACTTTTAAAAATTATTTAGCGTTATATTGCTGCATAAAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG >CP019858|4|1|1341923-1342349|PILER-CR GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TCAATTAAATTATTATATTTTAATGCTCTTTTTAATC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GCAGAGTTGATAGTACTATTAAAAGAAGAAAAGTTAAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG CTATAACTTTTATTAATTTTTGTTTCATAATCTTTC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TTAATCTTTAAAATTAAATATAAAAATAAGCTAGACAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TTAATAAAACTGATAGTAAAACTACTAATAATAAAG GTTTTATATTAACTAAGAGGTATGTAAAG ACTTTTAAAAATTATTTAGCGTTATATTGCTGCATAAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG >CP019858|4|4|1341923-1342349|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TCAATTAAATTATTATATTTTAATGCTCTTTTTAATC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GCAGAGTTGATAGTACTATTAAAAGAAGAAAAGTTAAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG CTATAACTTTTATTAATTTTTGTTTCATAATCTTTC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TTAATCTTTAAAATTAAATATAAAAATAAGCTAGACAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TTAATAAAACTGATAGTAAAACTACTAATAATAAAG GTTTTATATTAACTAAGAGGTATGTAAAG ACTTTTAAAAATTATTTAGCGTTATATTGCTGCATAAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG >CP019858|4|1|1341923-1342349|CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TCAATTAAATTATTATATTTTAATGCTCTTTTTAATC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GCAGAGTTGATAGTACTATTAAAAGAAGAAAAGTTAAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG CTATAACTTTTATTAATTTTTGTTTCATAATCTTTC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TTAATCTTTAAAATTAAATATAAAAATAAGCTAGACAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TTAATAAAACTGATAGTAAAACTACTAATAATAAAG GTTTTATATTAACTAAGAGGTATGTAAAG ACTTTTAAAAATTATTTAGCGTTATATTGCTGCATAAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
>CP019858.1|AXU78681.1|1339539_1340967_+|cell-surface-protein MKIKKLLTIGLSLSIFIASCPISANALDKIESIKGADKYETAGIIADKQNYTTAILINADSTMADGLSASGLAGAINAPILLTKKNNIPNATLKRLEKAKKVYIIGGENSIDKYTETVLKGKGIEIKRLQGSDRIKTSYNVAKEINSINKVNKVILTNAFKGEPDAMSVAPVAVRDKAAIVLTDGKSVPFNTTGVESYVIGGTSSMNDKIVKDTNSTRLGGTDRYDTNKKIINKFYSGVKEFYIASGTDLVYALVGSTVAKNNAIVLVDNDSNKSVLKSTIKLTAIGNLSDSILQQCLNVTKNIGDSNTGREYTVEDAANAVKKLLGVKKFYYEPNYSEDEDLIFLLDKNFDFSGKEYYVFAYIKQGAEGDLRYCVAKNDMSKVYTYDVNGNMKVCNPDDYKNKGSITEEQAKQIALKECAKRHKVSINNLVVDMIDFRDDIYSGNVYAVKINSKNSNGTFGWFFIDIETGKIYN >CP019858.1|AXU78680.1|1338527_1339349_-|lipoprotein MIISKKITAILVSFLIMISMVGCAPKESATEVAKKYLDSIEIKDYEVAYNLLSKDSKESVSLEKFEEYQDTLFKLQTLKDYKLGEENKVEKYKYSNKEYTNLVKIKETDTIKYITENKEDTANFDRYFIIEDNEYKLLWHKDFKRALSSNYVKIARSETEKDKDKDYNKAAIDIKKAIEIDDKNPLAYYTQSYIYIELQRYDEALKSIDKYLEYLDKNNEAYKIDASDAYNLRGVIFMSKSEFNKARESYNKALELNPDNEYAKTNLNDIKGL >CP019858.1|AXU78679.1|1336885_1338403_-|site-specific-recombinase MSVAIYLRKSRADEEAEKQGEFETLSRHKSTLLKLAKEQNLDVIEIKEELVSGESIIHRPKMLELLKEVEENKYDAVLVMDLDRLGRGDMKDQGIILETFKESKTKIITPRKTYDLTDEFDEEYSEFEAFMARKELKLISRRMQRGRIKSVEEGNFIGTSAPFGYDAVTTGRKERILVPNKDADVVRTIFDLYINEDMGCSKISKYLNNLGIKTATGANWYNSAITNIIKNKVYCGYIQWQKKDYKKSKNPNKIKTVKLRPKDEWIEAKGKHEPLISEITWKKAQNILKKNGHVSYGNQIKNPLAGIVICKNCGRPLVYRPYADHDYIICYHPGCNKSSRFEFIEAAILKSLEDTVKKYQLKASDIDLDKNNKDSNIEFQKRVLKGLETELKELGKQKNKLYDLLERGIYDEDTFIERSNNISSRTEEIKDSIKTVKNRLSTVKKDNSKIIEDIKTVLSLYHDSDSLGKNKLLKSVINKAVYYKSKEQKLDSFELMVHLKLHEDQ >CP019858.1|AXU78678.1|1336578_1336863_-|RNA-polymerase-sigma-27/28-subunit-RpsK/SigK MCNEISLLDILGTEANYVLDEVELKVQVGKLYEQLNKILTPREREIVQLRYGLTPYGYKTQREIAQKLDISRSYVSRIEKKALKKLEKELVQES >CP019858.1|AXU78677.1|1334817_1336482_+|penicillin-binding-protein MSKKKTPFLKKVGKRSWCIFTIILIIYSVLIYRLVDIQVLKGDKYKQSVESQSVEKVELNSGRGIIYDRNNKKLTDTSKSQVLIVEKEKLNNNYKILELIKKATKMNDLDIYKAVQEQLTRPIIQIQTKNIDKSMKKELEKNGIMVEEKTMRYAKDGLLSHTIGYIKEDDKSGQSGIEKSMDSVLRNSNEKYISAFKAGDAGNEKSLNILKGSVKTVDNKDKDRHLKTTIDYNIQKKLEQILNKEENPTAAIISEASTGEILAMCSRPNFDQNDISKSLKGKNGEFENRVIKATYPPGSVFKMVVLFSALENGVIDENYTYNCTGKTKVGNTNEILRCNKRDGHGFQNLRQAFSNSCNPAFLDIAMKLGKEKILKSAEKLHLFEKVDIGLDEEKIREAPKNISIRNLAIGQENIEFTPLQINQMTQIIANNGTFKPLYLYKSLVDNNMNTIKTYKSSKKEELISPYVCTQVKEYMKSVSRTGTAKDLKDIEGGCGVKTGTAQSSLNKKAIDHGWITGFYPEERPKYVITVLVEGTQKGNKSATPIFKEICESIK >CP019858.1|AXU78676.1|1333498_1334746_+|protease MELNKVELLAPAGDLERLKIAITYGADAVYIGGEIFGMRSAAKNFSKEDMAEGVAFAHERGKKVFVTVNIIPHNEDFLQLEDYLLELEEIGIDAVIIADPGVLSVIKKVIPNMEIHLSTQANTTNYLSANFWYEHGIKRVVVARELSFDEISEIRAKTPLDMDIEAFMHGAMCISYSGRCLISNYMTGRDANKGSCAQSCRWQYHLVEEKRPGEYFPIYEDERGTFFFNSKDLCMIEYIPELIKSGITSLKIEGRMKTAYYVATVVRAYRMAIDEFYRDPENWKFNPMWMEELKKGSHRHFTSGFYLNKPTTEDQNYQSASYVRNYDFIGIVRETEDEDGLIVVEQRNKMCVGDEIEVMGPYKETMFTKIEEMYNEEGEAIESAPHPRQIVKLKLSVKVGKDYMLRKVIEEKVEE >CP019858.1|AXU78675.1|1332837_1333512_+|O-methyltransferase MSNIVNDLVEDYIRVTLKEKEGFLKDLEIYAEENSVPIIHKEVSDLLKVLLKVQKPKRILEVGCAIGYSSIFFATIIGKDADIITVERNEKMIEKAKENIKLAGFDNNITILEGDAEEKLSQVQGEFDLIFIDAAKGQYKLFFDLVIDKLKDGGLLVSDNILYKGMVAHDDFVVRRKKTIVKRMRNYLDYICNCDYLSTSLVPIGDGVALSYKESKRGDVDGIK >CP019858.1|AXU78674.1|1331586_1332666_+|exported-aminodeoxychorismate-lyase MNFKENRLKIAVLIIVILIILAGIFVFIQIGPYDKNNKKDVIIDVPNGASVGKISDILYENKLIKNELLFKLLVKVSNKAPSIKSGTYLLNQSYSNNDIISLLVSGKIYQDGIKVTIPEGATSKEIIAMLVSKNLGDKATFENLIKKPQEFYDKFPYLKEDGITSLEGFLYPETYYFNSKKQSEEDILSEMLKVFDSKYTDKFKKKQKELNMTLQEVMEMASIIEKEAVLDKDRPIIASVFYNRLKVGMPLQSDATIQYIFEERKKIVTYDDLKIDSPYNSYKNKGLPPTPISNPGIKSIEAALYPEKTDYLYFVAKIDGGNNYSTNYQDHLKYVKEYKEARDKQSKDTKATNKENTKK >CP019858.1|AXU78673.1|1330048_1331374_+|pyrimidine-nucleoside-phosphorylase MRMYDIIKKKRDNLELSKKEINYFIENYSKGDIPDYQASALLMSIYLNKMNKQETVHLTEAMMNSGDMINLSEIDGIKVDKHSTGGVGDKTTIALIPLVASCGAPVAKMSGRGLGHTGGTIDKLESIPGFSTEMEISKFIDSVNKSKIAVCGQSAKVAIADKKIYALRDVTATVDNISLISSSVMSKKLASGADAIVLDVKTGDGAFMKTLEESFELAKSMVDIGTGMNRDTIGIVTDMDEPLGFAVGNSLEVIEAIETLKGNGPKDLVELCEVLGAYMLVLSKIAHDFEDGVEKIRESIKSGTAIQKLKEFIENQGGNKDVVDDYSLFKKSKYKYPVKSTKSGYISKIKAEDVGVSAMILGAGRETKDDILDLSAGIILEKKVGDYVNEGEVLAYMYYNDEQKLSLAKGRFIDSYSIVDSKIEKNKLIYGIVTKEEIKKF >CP019858.1|AXU78672.1|1329032_1329845_+|purine-nucleoside-phosphorylase MFEKIAQSSKFINSKSNIKPKIGLILGSGLGDLANDIEDPVTIKYSEIPNFPVSTVAGHAGQLVIGKLEGKEVIAMQGRFHYYEGYSQKEATFPVRVMKELGVEILIVTNAAGGVNKEFKAGDLMLIRDHINFSGSNPLVGKNDDRFGARFPDMSDAYSSKYVDVVKNCAKECNIDVKEGVYMFFSGPNYETPAEVRMAQILGADAVGMSTVPEVIVASHSNIGVIGISCITNMAAGILNQPLSHEEVIETTQKVKSEFMNLVKTTVKNL >CP019858.1|AXU78682.1|1342635_1342860_-|putative-transcriptional-regulator MDVNQRIKYTRENMNSSQKELLEKTNINTSVMNRIESGERPIRDDGLIIFAKIFGLYTDYILGLSDTEKLNIGN >CP019858.1|AXU78683.1|1343938_1344190_+|hypothetical-protein MSSYFITRGDVMKILQQFKPYKYDKEKNIEYDEKIIANQNTEVYIVYPRISDEENRRRWEEFNEVAKEVAINIAMKKVETVES >CP019858.1|AXU78684.1|1344498_1344612_+|hypothetical-protein MVEVNIKIKGEVSEIIDSIRGIFNSFDEELILDIKSE >CP019858.1|AXU78685.1|1344819_1345029_+|hypothetical-protein MMGLKLKRRYKNVLIYINIRTIININCKIKFIELYLTFNELKNKLANNEKTTVINENNKAFSGLVDFSN >CP019858.1|AXU78686.1|1345397_1345781_-|hypothetical-protein MRKKFFIGILIVLIISVIAILNIKNDKNVFIGESENWKAKFVTTEGHSKLEIKYKNSKDVVEQKFNYSYQFIDGEDAVVVVKNEILEAGQEKAIKIQRPGLYSNRESSYKLIISWNGNEETINLKKK >CP019858.1|AXU78687.1|1345907_1346252_+|hypothetical-protein MNYRLKKSVTTILSLLIMTILLPTNASASKVEDSSMKVMYSEKQVTDMDKLYDMAKNGITDVKSYNEKGIIKNARTGESIYVDYISTIQLLEVKQSKNLTSKTYSKTVFLILIQ >CP019858.1|AXU78688.1|1347633_1347951_-|hypothetical-protein MNFRNIYLILMGLGIIILTTIISLIEIKIGFCNEKYFNKLESKYGNIDRKRTIKLEVLYRYVTGFEYIAIGLFTKRLDITIIAIILVATITVILYYLVRKRYITI >CP019858.1|AXU78689.1|1349011_1349401_+|regulatory-protein MKINKLPHAELKLMKYIWGVDDVLASRDIIEDMKLKYDWKKSTTLTFLKNLVDKGFLTTDKVDRCTHYTIAIKEKDYLKVETKSFFSFMHNNSFKSFISALHDDEVLDSKSLDKLEEYFKNLKEGDIDD >CP019858.1|AXU78690.1|1349725_1350235_+|teicoplanin-resistance-protein MKSRKHNITKGLFIVYIIILTWIILFKLQFDISSLETMNLRSINLVPFAGSLIINNRVDISEIILNVVIFVPFGIYVCMLKEEWSFIKKVIPIFITSLAFETLQYIFALGASDITDLIGNTLGGIIGIAVFMLLSKIFKNNTIKIINVLALIVTIIVVLFLGLVIFANL >CP019858.1|AXU78691.1|1350336_1350531_-|phage-related-DNA-directed-RNA-polymerase-7-kDa-polypeptide MSVIVMCSRCGKEIDKYRNKYITYYEKNTNAEIKVCINCALDLLEKTRENQELNIQEFQDTIIL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019858_5 | 1545884-1546371 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP019858_5
|
7 spacers
spacers of CP019858_5
>5.1|1545913|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACGGAGCGACCGTGCTTAACACTGCAATAGCATCTG >5.2|1545979|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTTATGAAAAAAAGAAAAGGGGATTGGGACAGCGA >5.3|1546044|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAAATCAAACTCTTGTGTGCATCGACGAAGGTGGTA >5.4|1546110|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTATAGTCTTTTGGATAACTACCCAATTAGGATTT >5.5|1546175|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAATATTATAGATACAAAAAAAGATTCAGAAAACA >5.6|1546241|36|CP019858|CRISPRCasFinder,CRT AAGTCACACCGCCCTCCACACGACACTATAATAATA >5.7|1546306|37|CP019858|CRISPRCasFinder AGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019858_5
The CRISPR arrays of CP019858_5 >merge|CP019858|5|1545884-1546371|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTACGGAGCGACCGTGCTTAACACTGCAATAGCATCTGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATACTTATGAAAAAAAGAAAAGGGGATTGGGACAGCGAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATGAAAATCAAACTCTTGTGTGCATCGACGAAGGTGGTAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATGTTATAGTCTTTTGGATAACTACCCAATTAGGATTTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAAAAATATTATAGATACAAAAAAAGATTCAGAAAACAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAAGTCACACCGCCCTCCACACGACACTATAATAATAGTTTTATATTAACCAAGTGGTATATAAATAGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAAATTTTACATTAACTAAAATGTATAGAATA >CP019858|5|2|1545884-1546240|PILER-CR GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TACGGAGCGACCGTGCTTAACACTGCAATAGCATCTG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ACTTATGAAAAAAAGAAAAGGGGATTGGGACAGCGA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GAAAATCAAACTCTTGTGTGCATCGACGAAGGTGGTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GTTATAGTCTTTTGGATAACTACCCAATTAGGATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAAAATATTATAGATACAAAAAAAGATTCAGAAAACA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT >CP019858|5|5|1545884-1546371|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TACGGAGCGACCGTGCTTAACACTGCAATAGCATCTG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ACTTATGAAAAAAAGAAAAGGGGATTGGGACAGCGA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GAAAATCAAACTCTTGTGTGCATCGACGAAGGTGGTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GTTATAGTCTTTTGGATAACTACCCAATTAGGATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAAAATATTATAGATACAAAAAAAGATTCAGAAAACA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAGTCACACCGCCCTCCACACGACACTATAATAATA GTTTTATATTAACCAAGTGGTATATAAAT AGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAA ATTTTACATTAACTAAAATGTATAGAATA >CP019858|5|2|1545884-1546305|CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TACGGAGCGACCGTGCTTAACACTGCAATAGCATCTG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ACTTATGAAAAAAAGAAAAGGGGATTGGGACAGCGA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GAAAATCAAACTCTTGTGTGCATCGACGAAGGTGGTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GTTATAGTCTTTTGGATAACTACCCAATTAGGATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAAAATATTATAGATACAAAAAAAGATTCAGAAAACA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAGTCACACCGCCCTCCACACGACACTATAATAATA GTTTTATATTAACCAAGTGGTATATAAAT
>CP019858.1|AXU78873.1|1545451_1545604_+|hypothetical-protein MDNFLQGVLASLVASLIVYLNSKLFKKVKSHSGRSDFSFELKIKFKKNKH >CP019858.1|AXU78872.1|1543009_1544365_-|drug/sodium-antiporter MDTKISINENMSLGKRFFKYLAPSVVAMWVFSLYTMVDGIFVSKGVGELALAAVNISMPFINFIFAVSLLFSTGASTIIAIYLGKKDIKSANEVFSFNLVSIIILSIIILAITFFNLDRLALFLGATESTIGMVKDYLGIIIFFNGFFIVSYSLEVIIKTDGFPILATVGVIISALTNIILDYLFVIEFGWGVKGAGIATGLSQVFSTIFFLIHFLRKNSTLNFSKFRIDFKTLRKIVFIGFPDSTTELSCGIVVLLFNLSLTKYIGENALIYYSVINYINTLVLMTMMGITQGMQPLTSFYYGAGNIDNVKKLLKMGIKATIIASVAVFAICMAFSGPIVSLFIHPEETMLFNEGVRVFKIFSISFLLVGINVIISGFFVSVEKPSISTVISLGRGLVIVVLSLISMILIFGGQGIWMTTIVSEFICLILSLVFLKKNFSTLDSNLNKVA >CP019858.1|AXU78871.1|1542241_1542892_+|ATP-binding-protein MADEKFVMSFSGGKDSILALNRMLKKGYKPVALLTTISEEHGKSWTHNLEYNMLKQVSSNIGLPLLVAECGVEGYEESFERALIKAKNMGATICAYGDIDIESHRKWDTDRCEAVGMKVDLPLWQESREDLVYEFIDSGFCSVVTKVNLKHLGEEFLGKKLTRELVEKIKNAGADPCGEHGEYHTFVVDGPIFKKPVEYEVKGTLIKDGYGYLEIK >CP019858.1|AXU78870.1|1541728_1542157_+|EamA-like-transporter-family-protein MTKLWAIIFALLAGGSTALEAFINGELGKSTTALVATFISLTVGAIFFLASIIVTGDLKCLVSINGFNYKLLLGGVFGGLIIYFTVKAIPNLGVSNTLILTLVSQVLVGFFIDSVILGQETMHLYKYVGVILLILGTFFIVN >CP019858.1|AXU78869.1|1541028_1541577_-|hypothetical-protein MYTNFNIDFNNFNKKENAIKFMLMGVLLIILGLLCLTFKTLGIKLISWTFGIALLFFAYLNLKNINELKRYATKEEIKPSINIQWVLIIACILLFVFPQKIQSIFSLFLGFYLIFNQLVALVNSKNNPYSKFTTWNIVKILFGICLILSPLFLSRFIVSIMSFFIILFGLVLFFSGNTARKY >CP019858.1|AXU78868.1|1539974_1540961_-|radical-SAM-protein MFFVQAQRTILLEIGDFLDKFKYAFDNKRYHTWNYYLRNTFGEKVFKVSINAGFTCPNIDGSLGYGGCTYCSKEGSGDFAGNPKDNLISQFYNIKEMMLKKWPHAKYIGYFQAYTNTYAPLEVLKEKYETILELEDVIGLSISTRPDCLPDDVVEYLSELNKRTNLWVELGLQTIHDSTSKIINRGHDYKTFVEGVEKLKSKNIKVVVHIINGLPGEDYNMMMETAKAVGKMGVDGIKIHLLHVIKDTPMEKMLQNGMLTLMEQDEYINLVCDQLEILPETMIIHRLTGDGKRDELVGPIWSLKKWEILNQIDDTLKARNSYQGCKFV >CP019858.1|AXU78867.1|1538765_1539710_+|membrane-protein MGEKSKGYVFIAIAGLLWATLGLFGKFLMGNGLTSEQVAFTRLFFGFIVLGVYSSIRTPQILKISKKGIIYSVIIGIICQAMFNLCYFKAIDIAGVSIAAVLLYTSPLFLAIFSKVCYKENITRSKLFSLILCFIGAIMAVTGGRLDFQGLNAFGLLLGVLSAIAYALMPTISKNALKEFSSSTILVYSFLFGAIFMIPSSRPWEILNYAKDLDVLSCMLMLGIVPAALAYIFYAAGISKGVELSVAGVVASVELVGSVIIGCTILGESFSLGKLFGVMLMLISAVVALNLSYDEIRIFYKSNKLKQIEKTESI >CP019858.1|AXU78866.1|1537006_1538449_-|sigma-54-dependent-regulatory-protein MNLNLKLDLEFYQKILEASHDEICVSDDKGIIIYCNKAFEENYGLKKEDILGKNVSFLEDSGYSTKSPIPIVLKTKTKFSLEQDTQTGKKLIITATPIFDENGNLEFTVENCRDITELNNIKNKLEDTKKQVKKYKSEVETLYRTALRIEDTVIMDGIVMRPIINTVNHVSKTDVSVLLLGESGTGKSSLARYIHHNSNRSNGPFITINCATISPQLLESELFGYTSGAFTGASTKGKVGLVELANGGTLFLDEIGDIPQNLQAKFLQLIQDRTFTPVGSLKNKKVDIRIISATNVDLVSKVKEKKFREDLYYRLNVIEIKLPPLRERRDNLVEIIKYYFNRYSSDFNLNKTISKEAMDAIANYRFPGNIRELQNIIQKILLTCTDNHITIDDLPNILTKNIHITNNGNKTHISQINKVIISDSKSTNYKNKNFDTLIKEYEKNIILDAYEKFGSSYKVAKHLEISQSKANRLIRKYTNT >CP019858.1|AXU78865.1|1536222_1536807_-|hypothetical-protein MLMNTHFIMAKSILDNIDENKTFFISEKNFIYGNIKPDAFSKYKLKKHYLDESFNMIVSKINYLCSLNIDSLSKYFSVSRLSQELGVICHFLCDFFCVAHSERWEFKHSLNKHVTYERELGAFAKDVDLSKIKCGTINSSFEKFFTKLYSDYKKKTDYMNDLKFSAYTCNSVINYILDSILSNTIKSYHIANCG >CP019858.1|AXU78864.1|1535339_1536119_+|hydrolase MIKHIFCDLDGTLYENGTITKEDIVAIEEIEKKGVQFNVATGRIFKQAHNIIKDSLDMNGYYVCENGSFIYDKDYNVIFKRTIDDNLVKKVIDRFESSDAQLYFKYKGDVIVGSDTTAFRHYSSDFIVDPDFEKRSSFDNLIGNIGVCSENLEELSRIELYLKSEFSEVLEIYFSGTYTLNIVPKSVSKRGSIEHVIKTLNVSPDEVATIGDSPNDICMLEGFKYSFAMSKAREDVKQSANYVVDSVKSAIDVIMEINS >CP019858.1|AXU78874.1|1546696_1548430_-|signaling-protein MSILLKKAPKLAKHIITSFYINRDINEVLKYLCENVTWIGPGEQEFLTSFNEIKNYFYAGQDEIPSCDINNDIFETVSEDENRCMVLGRYTVRTKENAQMILEVNQRCTFEIIEDRGKLLIKHMHISNPYGEMQLDEYFPTKIGTQSYDYLQRLLKEKTEVIEMITNNINGGLKGSNDDSTYSFFYVNEGLPKILGYTYDEFMEMSGGSAVGAVYPPDLPKALEDCERCFAKGPTYSSEYRIRKKDGTLMWVLDSGMKSLNSDGIVKINSIITDITQLKNIESELKLERERYRIALQNITDIMFEYDIENDTLIKYQRVEIDKKIELENFETKNYSKLLESGKIIHLDDIGKLLEVLHGNLRETIEIRQVNSLTKNEWRWIRVQCSVIYDSDHNPIKTIGVLKDITEDKSKLESLINQAQRDPLTQLYNQRVSQNLIEEYLCSSDSKNNDALLVIDIDDFKTVNDTFGHLEGNEVLVAVSKILLHNTHDKDIVARIGGDEFTIFIKSLTKDLIIKITNDILNDASKIKVKDNHKITLSIGIAFTDDSTKLYKDLFSKADKALYLSKADGKNCYSTYE >CP019858.1|AXU78875.1|1548669_1549515_-|signaling-protein MFKEIFLRTFPGFLIIRDSNYRIIFINDNLKNLIKSYMQDNPLGMTNIEIAKKLPDNIAKFFTDSHNIQLDWEKNYPYDKISNWILEFKKDTTSYWNVLEYKVDVDEKTYIITMANDITKLYEENKRNLHYSITDPLTGAYNRKYLNDRFDIFIGDYIVLIDLDNFKMINDYEGHNVGDKILCDFVSLLNKELINSTSIIKLGGDEFIVIFSSDVDKNYVYSQLEALRENFLKVFSKYKYLSFSYGVDTVKRNLKLTIVELDKKMYKNKEKNKKKFDKNDY >CP019858.1|AXU78876.1|1549545_1551780_-|signaling-protein MQNHNYIKMLNKKVEVLSKELDSRNFKLKTLNEIDFFSKIPNREFMYQHIDDCISKNIHIGIMLLNIDNFKLFNDIYGYLVGENLLITLTQNLLHFIPESKGIVAYLKGEGFLIVLPNVSNKELNNMGATIIESARELKIRLPNEKEIYSNVTFSIGSTIWNGEPNMNTLMLFNQVYSALKKAKSEGKNRYILFDFKDNSFYNKLENDKEFLSEISHVLQTKQIEVFYQPLYNIKNNTIVGCEALARWRHPIKGLLTPDKFIPLFEQFGLITELDLHLFEENCKNIRRWIDNNDVFVPICCNFSRLHFFNPNFPSMLKGITEKYSVSTSNFSIEITENILIENTNTIIQQLAELRSYGFSVSMDDFGSGYSSFGMLQNLPFDIIKIDRIFLSHNLNDFKNTTILYSIINIARALGMLTVCEGVETEQHVEFIKSINCDIAQGYYYAKPMECKEFEKLLSKENNSEKMFIKYSDIGKSLIEKIFDGFFIMQDMKKLRANVTEDIQWFDFYNKTEITSFPKVIEHFEKHIKGKKFSILYKSITPHNTESDSLLISGEAVLSDEAAEHQKYSNFYFSANCIISENKLLLAKLHLDLIKTAGYINEFESYSIPKMTNTHLDESNILSQFYSMLPVGIIRYDLFGDMIITYMNEEMFDIIGYTKEQFFGEMGGNLRAIVHPDDLDFVYKKSLDMIDTNKIEPFLYRFIKRDGQIVTVMYTQCNLSAIDGRSIAQGMYVDVNKIKNLTKI >CP019858.1|AXU78877.1|1552563_1553373_+|MerR-family-transcriptional-regulator MKDYYKIGEISKIYGIGRDSLMYYEEIGILRPVRDINGYRMYNISDIWKLNLIKEFRSLNFPMKKIKEYLDDRSIESTKNILNEELDLIDKKIAEFISHKENIIKRLSSIESVIQNTKIDEIEVVYIEKRKALELNADIKRDEDFDFLIQKLQKEYEDRFNILGNNNIGSAFSTEAINKGIFNEFKSVFCFLESNEKVYNIVFDEGYYVTLNYTGSNSNNKIYMEKVFKFIEENNYKIIADPIEIYKIDIHETGIVEEFVTEIQVPITK >CP019858.1|AXU78878.1|1553517_1553757_+|hypothetical-protein MKCSNCGSVNIEKGILTTGGIYAETIGLKYRGDGKLDKVINKTFPVQSTIYSDLCLDCGEIVRTYIKDNTDRNWCKDKK >CP019858.1|AXU78879.1|1553943_1554120_-|hypothetical-protein MFRDEMDKCTHMLTAYISSLYDYCDFIDTQLDDFILEYGENVVESCLHQVMVLVSKYN >CP019858.1|AXU78880.1|1554624_1555299_-|MgtC/SapB-transporter MNHHILIQFEYIARIITAGFCGALIGYERKNRLKEAGIRTHFIVALASALIIIVSKYGFNDIVGTPGIGLDPARVAAQVVSGIGFLGAGLIFIRNQSVSGLTTAAGIWATAGTGLAIGSGLYLVGIVSSIIIVIVQITLHRDRKWMKLPTAEQVSLKISNSTDSIEYIEGKFKKSNIEIINMNIKRLDGDWLEVVIYTKLPKGYKKTNLLKLFSDNPLIETLEI >CP019858.1|AXU78881.1|1555786_1556980_-|integrase MKEKRRDSKGRILHTGESQRTDGKYLYKYVDAFGNTKYVYAWRLTPTDPTPKGKREKPSLRELEQQIRRDIEDGIDSTGKKMTLCQLYTKQNAQRANVKKSTQKQREQLMRLLKEDKLGARSIDTIKPSDAKEWALRMKDKGFSYNTINNHKRSLKASFYIAIQDDCVRKNPFDFKLSEVLENDTKEKVALTEEQEQVLLSFIKTDNVYHKHYDDVLILLKTGLRISELCGLTVADIDFKNEVVSIDHQLLKSKEQGYYIETPKTKSGTRQVPLSRETIQAFQRVMKKRPKAEPFVIDGRGNFLFVNQKGKPKVAIDYNALFVRMVKKYNKQHKDNPLPHITPHTLRHTFCTRLASKNMNPKDLQYIMGHSNISITMNWYAHASIDTAKSEVQRLIA >CP019858.1|AXU78882.1|1557058_1557262_-|excisionase MNNNDIPVWEKYTLTIEEASKYFRIGENKLRRLAEENKDAGWLIMNGNHIQIKRRQFEQVIDKLDAI >CP019858.1|AXU78883.1|1557261_1558272_-|conjugative-transposon-replication-initiation-factor MHILGLPTDIFNVYPASVKYKTYQARWQIGDIYVSGDARKTEDNPQGLGCYLVMTGRGCDDIFRILDSRNYTFGDMFRRCERRYGVDNFHFTRLDIAIDDKKEKPFFTIEQIKKKCEKEEFISNSEGYHFDESKFDDFDTAKTVYIGAGKSGLSYRFYDKDKEVCSKHNKTLDEVGSWKRTEMQLRDDKAHAFAMTFKDRPLELGELAFGLLANNLRFVVPNRNESNKSRWKTCRFWERFLGAVEVLKLQVPKQQNSLEETQQWLTEGGVISAVKSFYFLEEHDALGGLEKVGTMLDKARYSNSLSSKLTAHLQRINRTDLIPYIQYDTKHGKGGI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP019858_6 | 1662655-1663413 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP019858_6
|
11 spacers
spacers of CP019858_6
>6.1|1662684|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGACCTTGTGGTTCCATAGCAACTATATACTCGTAC >6.2|1662749|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATAAAAAGTCACTATTTCAGTCTCTTTACTCTGCAA >6.3|1662815|38|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAATCTATCGAGGGCAAAACAGGAGCAGGGTCAACAGC >6.4|1662882|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACGTACGTTGCATGTTCTTTAACAAAAGCATCTAATT >6.5|1662948|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGTATTTTTCATAATTTATTAAAGCTAATAACATGA >6.6|1663014|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTAAAAACATAAGAAATTATCCAAGCAGTAAAACCA >6.7|1663080|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTATAAAAATATATCACAGAAACTAACCTCCTAAACT >6.8|1663146|39|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGCAAACAGACGCTAGTTTAAGTGATATATCAGCTAAG >6.9|1663214|35|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTCCAGACCCGTCTCCAGACCCTAATCCTCCTGT >6.10|1663278|40|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTATATGTCATTGCGACTGCTGAAACAGATAATGTAGCTA >6.11|1663347|38|CP019858|CRISPRCasFinder,CRT CCATCTTTTGTTGCTTTACATAAATTTATATTACTTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019858_6
The CRISPR arrays of CP019858_6 >merge|CP019858|6|1662655-1663413|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATCGACCTTGTGGTTCCATAGCAACTATATACTCGTACGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTATAAAAAGTCACTATTTCAGTCTCTTTACTCTGCAAGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTAATCTATCGAGGGCAAAACAGGAGCAGGGTCAACAGCGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATACGTACGTTGCATGTTCTTTAACAAAAGCATCTAATTGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATATGTATTTTTCATAATTTATTAAAGCTAATAACATGAGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATGGTAAAAACATAAGAAATTATCCAAGCAGTAAAACCAGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATCTATAAAAATATATCACAGAAACTAACCTCCTAAACTGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTTGCAAACAGACGCTAGTTTAAGTGATATATCAGCTAAGGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATAGTCCAGACCCGTCTCCAGACCCTAATCCTCCTGTGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATGTATATGTCATTGCGACTGCTGAAACAGATAATGTAGCTAGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATCCATCTTTTGTTGCTTTACATAAATTTATATTACTTATGTTTTATATTAACTATACAGAATGTAAGT >CP019858|6|3|1662655-1663346|PILER-CR GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CGACCTTGTGGTTCCATAGCAACTATATACTCGTAC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TATAAAAAGTCACTATTTCAGTCTCTTTACTCTGCAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TAATCTATCGAGGGCAAAACAGGAGCAGGGTCAACAGC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT ACGTACGTTGCATGTTCTTTAACAAAAGCATCTAATT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT ATGTATTTTTCATAATTTATTAAAGCTAATAACATGA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT GGTAAAAACATAAGAAATTATCCAAGCAGTAAAACCA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CTATAAAAATATATCACAGAAACTAACCTCCTAAACT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTGCAAACAGACGCTAGTTTAAGTGATATATCAGCTAAG GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT AGTCCAGACCCGTCTCCAGACCCTAATCCTCCTGT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT GTATATGTCATTGCGACTGCTGAAACAGATAATGTAGCTA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT >CP019858|6|6|1662655-1663413|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CGACCTTGTGGTTCCATAGCAACTATATACTCGTAC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TATAAAAAGTCACTATTTCAGTCTCTTTACTCTGCAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TAATCTATCGAGGGCAAAACAGGAGCAGGGTCAACAGC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT ACGTACGTTGCATGTTCTTTAACAAAAGCATCTAATT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT ATGTATTTTTCATAATTTATTAAAGCTAATAACATGA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT GGTAAAAACATAAGAAATTATCCAAGCAGTAAAACCA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CTATAAAAATATATCACAGAAACTAACCTCCTAAACT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTGCAAACAGACGCTAGTTTAAGTGATATATCAGCTAAG GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT AGTCCAGACCCGTCTCCAGACCCTAATCCTCCTGT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT GTATATGTCATTGCGACTGCTGAAACAGATAATGTAGCTA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CCATCTTTTGTTGCTTTACATAAATTTATATTACTTAT GTTTTATATTAACTATACAGAATGTAAGT >CP019858|6|3|1662655-1663413|CRT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CGACCTTGTGGTTCCATAGCAACTATATACTCGTAC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TATAAAAAGTCACTATTTCAGTCTCTTTACTCTGCAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TAATCTATCGAGGGCAAAACAGGAGCAGGGTCAACAGC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT ACGTACGTTGCATGTTCTTTAACAAAAGCATCTAATT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT ATGTATTTTTCATAATTTATTAAAGCTAATAACATGA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT GGTAAAAACATAAGAAATTATCCAAGCAGTAAAACCA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CTATAAAAATATATCACAGAAACTAACCTCCTAAACT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTGCAAACAGACGCTAGTTTAAGTGATATATCAGCTAAG GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT AGTCCAGACCCGTCTCCAGACCCTAATCCTCCTGT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT GTATATGTCATTGCGACTGCTGAAACAGATAATGTAGCTA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CCATCTTTTGTTGCTTTACATAAATTTATATTACTTAT GTTTTATATTAACTATACAGAATGTAAGT
>CP019858.1|AXU78978.1|1659902_1661996_+|signaling-protein MNKHNFEVILNQLQINIYVTNIHTNEIIFMNKKMKEEYNILDPEGKVCWQVLYPEKNSTCSFCKVLELLKNDKKGVLIKWYEKCNKLNRVFENYDSLITWQDGTVVHMHQSIDIANSTSLNKPIKINEFHEISNNKEEKGVFNFSRDNFDYNSTLLYDALIRGTDEYIYICNMKTGVFRYSPSQVELFDLPGEIVENPLVYWKKIVHPEDWNRFYKSNTEIGKNQMDYHTVEFRAKNRSGEYIWLRCRGQLMRDEFGEPSIFAGIMTQLGKQNKIDSLTQLLNYHEFMSVFEDKISNPMIEKLCIVLLNIDDFKNVNEMYDRDFGDNIIKTLAQSIQSILPDNAELYKLDGDEMGILVDNVEENEILTLYNQIQNMIIHLQLWRKYGLNITISAGCVIYPKHGDTVKELYKCASYSLQYAKEHGKNRLVFFSQEILKNKMYSLEMMRDLKASINDDFRGFSLRFQPQVDTESHKIIGVEVLLRWTNDKCKAISPLEFIPILEENDMINIVGAWVLRMALRTFRKWIDYYPFFKVSVNVSAVQILEDTFIEDIVKIIDDENFPYQNLVLELTESHTVQNMSILQFKFKALQDLGIYIAMDDFGTGYSSLEVLKFSPIDIVKIDRVFVKDILKSKFDATFIHFIVAICHDVGIKVCLEGVETQEEYDLVKQIKPDYIQGYLFGKPQTATEIFDLLKLDN >CP019858.1|AXU78977.1|1658326_1659223_-|NADP-oxidoreductase,-coenzyme-F420-dependent MANYFLSKGYCVSGFYGRNQLSLLESTNLTKTKIYSNLKDIIYENDILFITTSDDSIEIIDKKLSKFNLKHKYICHTSGSLKSSILFCSKKAGALIYSIHPIFAFSNKNTNIKKMKDICFSIEGDNEQDDLVIQNFIDDLGNQFFIRDKDTSSTYHLANVLVSNLVLSLLDIGVSYFIKLGLSEEESLKAISPLVKKNIENILDNGFTKALTGPVSRGDITPIRKHLSVLDKKDEDIYKILSLNLLKIIALGNDNSLKGIKNITIENAIENLISKSEKYKEIYKLLGGKNDEKYHTDF >CP019858.1|AXU78976.1|1657524_1658352_-|3-methyl-2-oxobutanoate-hydroxymethyltransferase MKNTIQTFKNAKYEGKKLSMLTAYDYSIAKIMDECDINGILIGDSLGMVIKGEENTLSVTIDEIIYHTKAVKNGVKNALIVSDMPFLSYHVSIEDAVKNAGRLIKEGGAHAVKLEGGSNVIKQIESIVNAQIPVMGHLGLTPQSVNSFGGFKVQGNTSETARQLIEDAKLIEKAGAFSIVLEGVPTKIAEMVTNSISIPTIGIGAGINCDGQILVYQDMLGMFGDFVPKFVKQYANIGDIMKDSIKNYILEVNTGAFPQEKHSFSINESELEKLY >CP019858.1|AXU78975.1|1656657_1657506_-|pantoate--beta-alanine-ligase MLVKEIKLLRNIIKDWRKHGYSIGLVTTMGFLHEGHQSLIKKAVKENDKVVVSVFVNPTQFGPNEDFNSYPRDIDKDFKYCMDSGATVVFNPSPEEMYLKGNCTTINVSGLTDFLCGAKRPVHFGGVCLVVSKFLNIVTPDKAYFGEKDAQQLAVIKRMVKDLNIDTEIIGCPIIRENDGLAKSSRNTYLSEEERKSALILNKSLSLAKEELVKGNLNPENIKELITAKINSEHLAKIDYVEIVDSETLQPVKQIEHSILVAIAVFIGKTRLIDNFTFELNI >CP019858.1|AXU78974.1|1656064_1656247_-|hypothetical-protein MFKDKIDECVHIMTAYIASLKEYYSFIETQIGDFIKKYGEDVVELCLHRVMILLCECGLA >CP019858.1|AXU78973.1|1654318_1655233_-|hypothetical-protein MIDNQKYVILSLELHLFFSRIMKEHALFLEAGFTNKNYNLAMEADHYKKQFEDLLSYTVSASNGIIRPDILYSEELVTTLTSVAEQKTEEFTGIEINKNITTRELNLQSGVNPQVGQDLVNYVAQLNSDAIRLLDGLINFKERVLDGVLSCTIFTSNYPLLLEHIIHEANLYRSYVVDLENKIDIESKNAKEIELFWDHIMMEHALFMRGLLDPSEGELINTSNDFAIKFNELIEKTNEMTDSNIKNITEETLNETVEFKDFKEAGASGIEQCKIKSIILPLLADHVLREANHYIRILESYKNM >CP019858.1|AXU78972.1|1653281_1653929_-|lactate-utilization-protein-B/C MIRQTPLEKRYDKLGPHIVTALKKRYFDAYYCKTRNEALQQILDLIPQNHVVSWGGSETLKEMGVQTAVREKGFKVIDRDLAKTPEERTEIMRQALLCDTFLMSSNAISEDGQLFNIDGNGNRVAAMIFGPKNVIVVAGMNKIVKNIDDAIQRTRTIASPAVVQRFQDVNTPCYINGSCIDCTSPESICAYMVTTRISRPAKKIKVILVGENLGL >CP019858.1|AXU78971.1|1652545_1653115_+|lipoprotein MKKFIICIIMFAISVLVLAGCTNDNKIKNEVDSMFNSIKTQDADTVDKYFPKSGLGNLIYEDKEGFKMYSKNMTWEISDIKNNKDKVTVDLKINNTDMVSILKKNPPKLGEMMPNPTMKDIDSAKKKEFNITLELVKSGDNYVCKVNQESAMKLLNVITGGGIDYLADYNKEYYKQLDEEQKNYENKNS >CP019858.1|AXU78970.1|1651641_1652541_+|iron-sulfur-cluster-binding-protein MKLLSKVNNNIRLITQVAFTALTNGYVNGFLEGTIYGGESKKLCVPGLNCYSCPGALGACPIGSLQAVLSSREYKFSFYVVGFLMAFGAFFGRFVCGWLCPFGLVQDLLHKVPFPVKIKKVYGDKYLKYLKYIVLIMFVIILPVAIVNVAGGGNPWFCKWICPSGTLLGGIPLILGNENLRESIGFLFSWKLSILLLILLMSIITYRPFCKYICPLGAIYGFFNSISIYRFKIDKDKCTNCTACQTKCKLDIPIYKDVNSPDCIRCGECIKVCPQNAITTTFSKDKKENNICAKKYRGI >CP019858.1|AXU78969.1|1650904_1651489_+|thioredoxin MKRFFIVVLGCICVLGMISGCSKKESKPVEKNKNNSEWFSNLDTEDVDGNKVTKEIFSNKELTLINVWTTWCGPCVGEMPELEALSKEYESNNSNVAIKGLVVEVDKTDMRTGLSNEEKNLVKDIMKKSDATYQQLTVSEELKKTDFKRVMEFPTTYFVDKKGNFVGEKVVGANSKEDWKKIIDERLKMVKANE >CP019858.1|AXU78979.1|1664060_1664879_+|MerR-family-transcriptional-regulator MEKQYFTTGEFAKLCGISKQTLIFYDKIGIFSPEYKDKNNYRYYSVYQYDTLDILQSLREIGMSLEEIKEYIQNRTPQLCVKMLKEEEKKIREKIKKLRKISSKMQNRINITVEGISKMNSEEIYISKKFEEYLVLSSDLSNMSNSDFMMELIDFTNYCKSKNLYQGYELGVIVSNENIKNGDYLSISSFYLKIDKKIKDKKLYVKPEGMYACIKHIGKYEDSYKSYEKLKKYIYENEYKIIGNSYEESILDFFCESNEDNYMTEISIQVSR >CP019858.1|AXU78980.1|1665011_1667132_-|ferrous-ion-transport-protein MGLTHNSTKMSSLKDMFDIDNKEDQFVIALAGNPNTGKSTVFNHLTGLRQHTGNWPGKTVATARGNFKYKNTEYALIDLPGTYSLFALSQEEIVARDFICFGNPDAVIVVCDATCLERNLNLVFQVMELTDKVILCINLIDEARKKGITIDKKLLEDSLGIPVILTAARNGSGMDELLDTLNDVSFDKYKLNNKPVRYNENIENVVKSIQPELDNIIPSINSRWLGLRLIDGDESIFESMSNYIDKDSIDAINEVKKKIPDNINKQKIRDEFTKINYDYAKKLSDECCSNVAKKSTDREEKVDKILTSKIFGLPIMLLLLGTILWITIEGANYPSTLLSNLLLGFEPSISGILNSINCPSWLNDMLVLGLYRTLAWVISVMLPPMAIFFPLFTLLEDFGYLPRVAFNLDHLFKKACAHGKQCLTMCMGFGCNAAGVIGCRIIDSPRERLIAILTNNFVPCNGRFPTLIAISTIFFSSVITNSFVSSVATALCITLLIILGVIITLLVSYTLSKTLLKGVPSTFTLELPPYRVPQIGRTLYTSIIDRTIFVLGRAVMVAIPAGVITWIFANIYIGDLSILSHVANFLDPLAKLIGLDGFILLAFILGFPANEIVVPILLMAYLATGSMIELDSFSALGQVLREHGWTYLTALNVMLFSLLHWPCATTLLTIKKETGSLKWTALGFLMPTILAFVVCFLTTTVYNLFI >CP019858.1|AXU78981.1|1667157_1667385_-|ferrous-ion-transport-protein MKNLNDIQVKKTVKVEDILSSGNLRERMLALGLTRGAVIDVVRKGPKNNLTVYKIRGSKIALRQEESSLILVSDI >CP019858.1|AXU78982.1|1667711_1668152_-|acetyltransferase MFKIKHFNDLSLDEFYEIAKSRYEVFACEQKIFSLNDYDDIDKSSYHIFLKENGLICAYARIIPKEYSSYNDVSIGRVLVLSSHRRKGLAKQMMDCAIDFIKVNLHENNITLSAQTYIKNLYLSCGFKEISEVYDEAGIEHIKMRL >CP019858.1|AXU78983.1|1668324_1669293_+|putative-membrane-protein MNTTKKLTEAALLSSLFIVVTIIAVSTGFGYAIYLDFIVPVFFCIICLKCDLKYTILSGITSLLIISLVLGNLGTAIWASQSVLLGIMCGYLINKPTMVMDDLVYGSVFGVIVMVFIDIYASTLIGYSFMKEFQGYSKWIYFNGYINFIYYLMIALFPFGMVFCIYLLSLILGNKLHILDSNSLKKFLIFKNFRNLNQFLCCSKKAFYICVSYLAIFEVLKLLNAKVDSVYLKTIFISITYISVYFIIRDSCMSLQNFIIAKFRKLLYARILFLIIILLLFFIFDVTVIGLIIINAFLNKKINIRLSQSNIVNKQINLLIEK >CP019858.1|AXU78984.1|1669769_1670978_+|tyrosyl-tRNA-synthetase MKSIDEQMRIIMKGVDDLIDEKELREKLIKSEKEGKPMIVKLGLDPSAPDIHLGHTVVLRKMKQLQDLGHQIVIIIGDFTGKIGDPTGKSKARKALTTEQVLANAKTYEEQIFKVLDKEKTIVRFNSEWLAKLNFEDVIKLAATITVARMLEREDFKKRYEGQMPISVHEFFYPLMQAYDSIALEADIELGGTDQRFNLLMGRSLQREFGMESQIVIMMPLIEGLDGKEKMSKSLGNYIGIDEEAGIMYQKSMEIPDELIIKYYNLVTDVHPDEVNKIESQLKEGSVNPRDIKMNLAREIVTLYHGEESAKEAEERFKSVFQKGQIPEDIQTIQVKEDGFDLIEVLVSNEIVKSKSEVRRLASQGGVKVNGEKVEDLSTIVKESELVVQIGKKKFVKIELVK >CP019858.1|AXU78985.1|1671038_1671920_-|polysaccharide-deacetylase MVKKRKKKTVTLTILVVIVIGIFSMAWADMSRKKEMKETQERLKAERLEKERIEKEKNEPIIGAKKEAVKEYGYDAKIVWDKLNKYDYSNNGEKIVFLTFDDGPSTTNTPQVLDILKRHGVRGTFFIKGDSLERKGANEILKRTFDEGNAIAHHSYTHDYKKLYPNRSLNLDTFVNELNKTDEAMKKVLGKNFSSNVVRCPGGYMSWKNMEPLGNYLKEKNMASIDWNALNADAEGKKKNAQELFEHAKKSSEGKEMVVLLMHDTYGKQETVNALDQIITYFKDNGYQFKILI >CP019858.1|AXU78986.1|1672335_1673250_+|transporter MKKYFGEIGLIFIAIIWGSGFVATQFALDGGLTPLQIITLRFFLAAIIMNLLFFKQIRANMGKKLLKAGGILGIFLFLAFTVQTIGLMYTTPSKNAFITAANVVIVPFIGFILYRRKLDKIGIISSLVALIGIGILSLEADFSINFGDFLTLICSFGFAFHIFFTSEFAKDNNPMALTAIQFTVAFLMSVVVQTFAGQLKMEAELSGYMGTMYLAVFSTTIGFLFQTICQKRVDGTRTAIILSTEAVFGTIFSIIILKELITAKLVIGSILIFVAIITAETKLSFLKSKKVKLKDSEESSLESI >CP019858.1|AXU78987.1|1673472_1674018_+|ruberythrin MKKFVCTVCGYIHEGDAAPAQCPVCKVGADKFEEMKGEMVWADEHRIGVAQGVDAEIIEGLRANFTGECTEVGMYLAMSRQADREGYPEVAEAYKRIAFEEAEHAAKFAELLGEVVVADTKENLRVRVDAEYGATDGKLKLAKRAKELGLDAIHDTVHEMCKDEARHGKAFLGLLNRHFGK >CP019858.1|AXU78988.1|1674117_1675266_+|iron-sulfur-protein MKSVSVRSCKTYNYEEVKLSIEKNLEDIGGIDKFVKKGSKVLIKPNLLMKKKPEEATTTHPMVVKVVCEKLLELNCDITIADSPGGPYNQNSLKSIYKASGIEEVANELGIKLNYDVSDVKIHSEKAHVLKYMDIIKPIVDSDYIINLCKLKTHIMATFTGGTKNLYGCIAGLKKAEIHYRFPTEELFCENVLLDICDYIKPTLTIMDGIVGMEGDGPSAGTTREIGVLLASQNPYAIDVVACKIISLLPNKVATIRGAIKRGYIQEDFSDIEILGEDIKDLIIKNYKIPNVSKDLRLFSVKLPKFLNEPISKLITPKPVVRFQDCIKCGKCKEACPASTIEIGTKGAIIDLSKCIRCYCCHELCPKKAIDVKRNFVFKYVK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019858_7 | 1752938-1753493 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP019858_7
|
8 spacers
spacers of CP019858_7
>7.1|1752967|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTTTTCTTCTCTCTGTTACTTCATCTTTTGTATCTA >7.2|1753033|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACATAGTAATATATGACCAGACAGGTAGAATAATC >7.3|1753098|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAACAGCACCATACAAAAACCCATTTCTAAAAAAC >7.4|1753163|35|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTCTGTCTTTACTGCTGTAACGTATTGGTATGG >7.5|1753227|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GACTTTGAAGAAAATAATTTAGTTATATCTTGGGAAG >7.6|1753293|38|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAACCTTTTTATTGTTGTTGTTATTCTTATTGTTATTC >7.7|1753360|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTATCATTGTGTAATGCTCTTTAGTAATAGAACCTA >7.8|1753426|38|CP019858|CRISPRCasFinder,CRT TTTACTGCATTTATACCATCTACACCTTTTATTTTATT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019858_7
The CRISPR arrays of CP019858_7 >merge|CP019858|7|1752938-1753493|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATTGTTTTCTTCTCTCTGTTACTTCATCTTTTGTATCTAGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATAACATAGTAATATATGACCAGACAGGTAGAATAATCGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATACAACAGCACCATACAAAAACCCATTTCTAAAAAACGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATATTTCTGTCTTTACTGCTGTAACGTATTGGTATGGGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATGACTTTGAAGAAAATAATTTAGTTATATCTTGGGAAGGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATTAACCTTTTTATTGTTGTTGTTATTCTTATTGTTATTCGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATTTTATCATTGTGTAATGCTCTTTAGTAATAGAACCTAGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATTTTACTGCATTTATACCATCTACACCTTTTATTTTATTGTTTTAGATTAACTATATGGACTTAAAATT >CP019858|7|4|1752938-1753425|PILER-CR GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TGTTTTCTTCTCTCTGTTACTTCATCTTTTGTATCTA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT AACATAGTAATATATGACCAGACAGGTAGAATAATC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT ACAACAGCACCATACAAAAACCCATTTCTAAAAAAC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT ATTTCTGTCTTTACTGCTGTAACGTATTGGTATGG GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT GACTTTGAAGAAAATAATTTAGTTATATCTTGGGAAG GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TAACCTTTTTATTGTTGTTGTTATTCTTATTGTTATTC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TTTATCATTGTGTAATGCTCTTTAGTAATAGAACCTA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT >CP019858|7|7|1752938-1753493|CRISPRCasFinder GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TGTTTTCTTCTCTCTGTTACTTCATCTTTTGTATCTA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT AACATAGTAATATATGACCAGACAGGTAGAATAATC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT ACAACAGCACCATACAAAAACCCATTTCTAAAAAAC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT ATTTCTGTCTTTACTGCTGTAACGTATTGGTATGG GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT GACTTTGAAGAAAATAATTTAGTTATATCTTGGGAAG GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TAACCTTTTTATTGTTGTTGTTATTCTTATTGTTATTC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TTTATCATTGTGTAATGCTCTTTAGTAATAGAACCTA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TTTACTGCATTTATACCATCTACACCTTTTATTTTATT GTTTTAGATTAACTATATGGACTTAAAATT >CP019858|7|4|1752938-1753492|CRT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TGTTTTCTTCTCTCTGTTACTTCATCTTTTGTATCTA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT AACATAGTAATATATGACCAGACAGGTAGAATAATC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT ACAACAGCACCATACAAAAACCCATTTCTAAAAAAC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT ATTTCTGTCTTTACTGCTGTAACGTATTGGTATGG GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT GACTTTGAAGAAAATAATTTAGTTATATCTTGGGAAG GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TAACCTTTTTATTGTTGTTGTTATTCTTATTGTTATTC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TTTATCATTGTGTAATGCTCTTTAGTAATAGAACCTA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TTTACTGCATTTATACCATCTACACCTTTTATTTTATT GTTTTAGATTAACTATATGGACTTAAAAT
>CP019858.1|AXU79079.1|1752542_1752647_+|hypothetical-protein MIGFLLSILAGVISAYIYDKIKNHPDANKGDLKK >CP019858.1|AXU79078.1|1751259_1751700_+|phage-protein MSNLSAFLSQNAIKVDNVKYVASNRFLDKEGKPVEWELKVLSSEEDEALRRKCTKRVKVIGNNGKHTGQYTSEIDYNSYVAELCVASTVFPDLKDAELQNSYGVMGEAQLLKTMLTAGEYVNYTVKVNEVNGFDTSFEDKVEEAKN >CP019858.1|AXU79077.1|1750717_1751188_+|phage-protein MAQTINAKDTVSAKKAECFITIEGKRYNFMQAIDLEAKMEKNKSEVPILGRTTKGNKTTGSTNTGSATFHYNTSIFRELLYRYKETGEDIYFDIQVTNEDPTSAVGRQTVVLKDCNMDSGIITKFDADGEYLDEDMDFTFEDWELVEKFNLLAGME >CP019858.1|AXU79076.1|1749390_1750701_+|phage-protein MALGGGTFVTQNKVLPGAYINFVSATRATSSLSDRGIVAIPLELDWGIDEDVFQVTSDDFEKYSVKYFGYDYTHEKLKGLRDLFKNIRLGYFYKLNKGVKASCTIATAKYSGIRGNDLKVTVTTNIDDNAKFDVVTLLDNKKVDTQIAKVITDLQDNDYITWKKDATLEASAGLVFTGGTNGEAVTGAEYQAFLDKIESYSFNALGCLATTTEIKSLFVEFTKRMRDKVGAKFQTVLYKKSDADYEGVVSVENKIKDIGLVESSLIYWAAGAIAGCDINKSNTNKKYDGEFDVDVNYTQIQLEEALKTGKFIFHKVGDEVHVLEDINTFVSFTDDKNDDFSSNQSVRVLDQIANDIATLFNEKYLGKVPNDKAGRISFWNDVVKHHKELENIRAIEDFKTDDVSVKLGNDKKTVIVSDAVKVINAMSKLYMTVSVS >CP019858.1|AXU79075.1|1749204_1749390_+|hypothetical-protein MIILSKTLSKEDNYKFTKEQIVNSKKYVNRKDLLNAILKENDLYSFSEVEDRINKFMKGVS >CP019858.1|AXU79074.1|1748783_1749221_+|phage-protein MLNNIIDGISIKLDKTFGESYTIYSEDVEQGINEPCFFIVPLNPSKVSYPSGRTLKKNSFDVHYFPKSNDKSFEINEIAEMLLEELEYIEIDGDLVRGTNMNFEIIDNVLHFFVDYNYFTIKSNDTDKMDTVELFGGLKRGDNFE >CP019858.1|AXU79073.1|1748365_1748791_+|phage-protein MARWGSVDFREFKRVCKKMEELTKIDLDKFCKDAARELAARLLGKVIRRTPVDTGFLRQGWNGVAYARSLPVYKQGNNYIIEVVNPTTYASYVEYGHRTKDGKGWVKGQHFLTISEMELQSQVDKIIEKKLLILLKGVFDA >CP019858.1|AXU79072.1|1748003_1748366_+|phage-protein MVSKTRKVIEMLYRDKCTIVEYQPIKDPVTKRTNNKEVVVLENQPCKLSYKNITSTEQGEVAKLTQTIKLFISPNISVKAGSKLIITNQNNITKEYIRSGEPAIYPKHQEIILELLEDKA >CP019858.1|AXU79071.1|1747608_1748010_+|hypothetical-protein MENNLIDEIEKRLESFGYILKDGDKWLIDFIREKIENIIKLDCNIKTMPIELKEIEVDMIVGEFLFTKKNMGQLDIESINFEAVEKSISEGDTKVDFAIGSGSQTPEQRFDSLVAYLTTYGKNKILTFRCLRW >CP019858.1|AXU79070.1|1747365_1747599_+|hypothetical-protein MAQVRKLNRILTIEECKIDDFLEMGYDLIDETGKAVKYGKSLNVKDLIAENNILRSKVESLEEENKQLKEKNKLTKK >CP019858.1|AXU79080.1|1755445_1756315_+|prophage-antirepressor-related-protein MENLIVKEFNGSQIYTFMWKEKSCWIANQIVGLFDYADVSKTIQDCIKAEDFEIEQEYDVLKGNEFNDFVTTLNVVANNIISNKARSITIFYEDGLYGFLQYTDKPIGVQFRKWLRREVLPSIRQTGAYITNNANPEKLREKASEIEKLQLAYNSTSMLKELLDGAGFDNKSKLLTAKTLYKKAGIDLPIEINEEEHYFDTKQIASKLKIYSKSNKPAQMAVCEIIKKIDLEDSEVKGVWETNGSWTGTVNKYTKSVIDKVRNWIEENNRPAKIQGEKKNFHVVYKEAM >CP019858.1|AXU79081.1|1756314_1756464_+|hypothetical-protein MGDNLLNNVCNDEKEYLISYLKTLRQKDEHDFYVFKQIVDKYCKQAKYK >CP019858.1|AXU79082.1|1756593_1757370_+|hypothetical-protein MGLFRKSKEPCCICGKEKTDQKIKDGAVCIECLMDYMEYKDKQFTFKDGLPTKSEIQIVLDSKKQNDFLVEKFNVTKEINSFIKFDETNKLIYIETKRKNGKIKKNVYSFENITGFELLEDGETITKGGLGSAIAGGVLFGGTGAIVGSIVGKKKTKKIIENLQIKLTLKTISEPVAYINLINVKTKTNSIGYERAYAEAQEILSILAIILKDIEKKREEINNNNSNADEILKYKNLLDLGAITEEEFNTKKKELLNL >CP019858.1|AXU79083.1|1757432_1759784_+|phage-tail-tape-measure-protein MATIQTSIRIFDGMTPAFRHMTNAMNIVLSSFEQLQRTSSNAIDANSIRTAREELARAEAGFDRLEQQIREADGQQRRLNEDINKGASSTDRLVGSAKKLAATYLGIRTLGGLGNLSDQMTSTNARLSMINDGQQSDGGLNKMIFQSAERSRASYLDTAKIVSRVGMNAGKAFSSTKEIVGFAEQLNKKFVIAGASTEEMNSALLQLTQGLGSGVLRGEELNAVFESAPNIIQSIADYLDVDIGKIRSMASEGMLTADIVKNSLLSAAEQTNAEFEKMPYTLGQIFTSVKNNAVMIFGAIQKKIEDTVSSKGFRTFITDVKDSLYVLGAVGFNVFSGFINLLSSPAFQNFFNVMIVGSSLVVQGLGWIITQALNVANVFAQNWSIIAPVIWGIIAVIAIYKITIISLLAIQTLHTTLTLAQSFATALLNGELMAETRFLLLNKLETLGLSQANALLCVSILKVVAVMALVIAAIFVGVAIFNHFAGTSISATGVVVGAFYFLGTCIYDVFAGAWNIVMAFAEFFVNSFNIVIYNVQMLFYKFQNFVINAMGDVGGSFDNCATALANAFVSAVNIAIKGINGVIKALNLIPGINIKTIGSLDKVDSFVKQYKDYQKTLKEPVKPQDWKAPYMDIKNPFDSYKKGYEVGQNLENKLKDTFDISKIAEDAKKKLGLDDLWDKKYGLGDGLGSAGLNSPLSDAAKGAKDTAGNTAKMAKTMDKSQEDLKYLRDIAEQEVINRFTGVNIKIDMNNTNNISKDADVDGIVNVLTEKLNDAMVVSAEGIV >CP019858.1|AXU79084.1|1759800_1760493_+|phage-cell-wall-hydrolase MAYDFYLDGVQLPIPPPKLEIKVTNKNKTVDLINTGEVNILKKEGLSEISFEAEFTHNKLPFCRGQFRDVQFFLSKLELLKTDCKPFQFIVSRELGNKVLFNTNMKVSLEEYNIVEDAENGSDVKVIIKLKQYRDYSTKKLVLAPPKNETGRPNVKIEPKRVDSVNAPSGKKTYTVKAGDSLWSICQKQLGNGSLYKKVYELNKTMMDKANKGKKVPKYTIYKGQVLKLG >CP019858.1|AXU79085.1|1760485_1762378_+|phage-cell-wall-hydrolase MADELVLANDRDVRLVIAHWEDFYEPVVLDGITWEIERRGTPSKLEFTIVMDDILQFCEGNSVRLYYKGIGIFYGYIFQKKRDKENHIKIVAYDQLRYFKNKDTYVYSNKTASELVKMLAKDFNLKYNVIEDTKYKLSRVEENKTLFDMILTALDDTLREKKEMYTLYDDFGRITLKNVASMKLDTVMNNDVIEDFDYNSSIDSDTYTKIKLVRDNEESGKRDVYIAQDSTHMRSWGILQMFETVDKNMSEAEIKQKCDILLKLYNKKTKSLSLKNVLGDIRVRAGCLVPVFLDLGDIDLQNYMLVEKVKHTFENNSHFMDLTLVDGDEFASYSSSSYSSGNTNNKDEKKNGPAQSITKKNTGKKVPAIFTAYYPGNNAMEGGKTDCNGKPLDVKSRTVAGPMNREGVKKTWYTDDFLKKHPVFEYGDKVKIILPGTAYDNKVYTVKDNGGRIYVETNGTYHIDILLANASECKKFGRKNGYIIIGGDEEQTYKVEGNNQSNTNNNSKEDKLISIAKSKLGCNYVYGAEGPNTFDCSGFTQWCYKQIGIKIPRTVATQSKAGSAVDLKDRSKWKAGDLLCRVGGGSSNHVVMYIGNNQIIHSPQTGDVVKIESVNSYRKGKAYTHVRRFI >CP019858.1|AXU79086.1|1762391_1762652_+|phage-protein MSQDLLQIIKKAAMDAVETSNPMRVVFGTIESISPLRVKIEQKLSIGEIFLIQTDTFKRYTDKKIGDKLVLIRMQGGQQYLILDRM >CP019858.1|AXU79087.1|1762656_1763076_+|phage-protein MLPSDNLDYDIEDVSIINFDVRQEPSKTFKLNIEKNRVDGICDDVEALKQTIFLILNTERYQHLIYSWNYGVELNDLIGEPISYVIPELERRITEALIQDDRIENIDNFEFQNIKGKVQCRFSVHTKYGNIKAEKVVSV >CP019858.1|AXU79088.1|1763076_1764126_+|phage-protein MFELMTFENIIKRMLDSVPNTLDKREGSIIYNALAPVAVELTETYIAMDELLDQTFVDTASYYYLEKRCKERGITPLPATNTIAKGVFNIDIPIDSRFNLGEYNYVAIERISEKTYKMKCETTGPVFELGQLIPIEYVDKLETAELTEILINGEDEESEDSLRQRYYDSLNSQSFGGNIQNYKDEVNKIQDVGGVKVYPVWDGGGTVKLVIINSNFKVPSEDLVNLVQEEIDPIGHQGQGLGLAPIGHKVTVTGVVSTTINISADITYKNGYTWENIKSIAEEAVDDYLNELNMSWEDEENLIVRISQIETRLLSIDGVLDITNTMINDVKSNLTIDSNSIVVRGEVVG >CP019858.1|AXU79089.1|1764118_1764736_+|phage-protein MDKEINLINYLPQILQDKEEYIKVFNVENKEIKTLHEKLNDLSSDQFLEDLTPSGIKRWEKIMSITPKSNESLEDRRFRIFSKYISKLPYSERFLRNWLDSIVGEGNYELTINNATYNIHLESDARNQDWFEEVHSFVSSIKPCNMTLDYTRVLVSKDNYMNFGITTLIGQEITIYPWSPPDIETYGEIDVLTGNGVGYQEITIF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP019858_8 | 1754095-1754977 | Orphan |
NA:I-A
Consensus repeat of CP019858_8
|
13 spacers
spacers of CP019858_8
>8.1|1754123|38|CP019858|PILER-CR,CRT TTGTGATTCCTCAGCTCTCTCCTTTAAGCTACACAACT >8.2|1754189|37|CP019858|PILER-CR,CRT TTAATAATTATGGAGAGTTAGGATTAGGTGATACTAC >8.3|1754254|38|CP019858|PILER-CR,CRT TTTAAAAGTTACTACACCAGTTTTAGTAGTTCCAGCTA >8.4|1754320|37|CP019858|PILER-CR,CRT TAAGATACAAGAAGAATTTTCAGTAGAGGATAAATTA >8.5|1754385|37|CP019858|PILER-CR,CRT GCCAGAAGAAGCCGCATCTGCAATAAAGAAGTATGGA >8.6|1754124|37|CP019858|CRISPRCasFinder TGTGATTCCTCAGCTCTCTCCTTTAAGCTACACAACT >8.7|1754190|36|CP019858|CRISPRCasFinder TAATAATTATGGAGAGTTAGGATTAGGTGATACTAC >8.8|1754255|37|CP019858|CRISPRCasFinder TTAAAAGTTACTACACCAGTTTTAGTAGTTCCAGCTA >8.9|1754321|36|CP019858|CRISPRCasFinder AAGATACAAGAAGAATTTTCAGTAGAGGATAAATTA >8.10|1754386|36|CP019858|CRISPRCasFinder CCAGAAGAAGCCGCATCTGCAATAAAGAAGTATGGA >8.11|1754451|37|CP019858|CRISPRCasFinder ATTGAAAAAACGTCCAAATAGCAATATAATTTAATTA >8.12|1754517|38|CP019858|CRISPRCasFinder ATTTATGTCTGATTTGTGTCCAAAAATAACCGATTTGT >8.13|1754584|37|CP019858|CRISPRCasFinder ACACCTCCAAACACTGCAATTTCTCCTGTTTTCAATA >8.14|1754650|36|CP019858|CRISPRCasFinder CCTATAGGAAGCTTAACTATATGTTCATAAAAAACA >8.15|1754715|37|CP019858|CRISPRCasFinder AATATAACAAAGTGGATGTTCTCTAAAAATAAAGAGG >8.16|1754781|37|CP019858|CRISPRCasFinder ATTTTTGATGATTTAAACATTGATAAAAGTATGAAAC >8.17|1754847|37|CP019858|CRISPRCasFinder GATAACAAAGCTTGCAAAGTAGATATTTGTGTTTTTC >8.18|1754913|36|CP019858|CRISPRCasFinder TGCTGTGATTTCACTAATAAAACAATTAATAATTGT >8.19|1754450|38|CP019858|CRT GATTGAAAAAACGTCCAAATAGCAATATAATTTAATTA >8.20|1754516|39|CP019858|CRT GATTTATGTCTGATTTGTGTCCAAAAATAACCGATTTGT >8.21|1754583|38|CP019858|CRT GACACCTCCAAACACTGCAATTTCTCCTGTTTTCAATA >8.22|1754649|37|CP019858|CRT GCCTATAGGAAGCTTAACTATATGTTCATAAAAAACA >8.23|1754714|38|CP019858|CRT TAATATAACAAAGTGGATGTTCTCTAAAAATAAAGAGG >8.24|1754780|38|CP019858|CRT TATTTTTGATGATTTAAACATTGATAAAAGTATGAAAC >8.25|1754846|38|CP019858|CRT TGATAACAAAGCTTGCAAAGTAGATATTTGTGTTTTTC >8.26|1754912|37|CP019858|CRT TTGCTGTGATTTCACTAATAAAACAATTAATAATTGT >8.27|1754791|27|CP019858|PILER-CR GATTTAAACATTGATAAAAGTATGAAA >8.28|1754857|36|CP019858|PILER-CR GATAACAAAGCTTGCAAAGTAGATATTTGTGTTTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019858_8
The CRISPR arrays of CP019858_8 >merge|CP019858|8|1754095-1754977|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATTGTGATTCCTCAGCTCTCTCCTTTAAGCTACACAACTGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATTAATAATTATGGAGAGTTAGGATTAGGTGATACTACGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATTTAAAAGTTACTACACCAGTTTTAGTAGTTCCAGCTAGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATAAGATACAAGAAGAATTTTCAGTAGAGGATAAATTAGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAGCCAGAAGAAGCCGCATCTGCAATAAAGAAGTATGGAGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAGATTGAAAAAACGTCCAAATAGCAATATAATTTAATTAGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAGATTTATGTCTGATTTGTGTCCAAAAATAACCGATTTGTGTTTTAGATTAACTATGTGGTATGTAAAGACACCTCCAAACACTGCAATTTCTCCTGTTTTCAATAGTTTTAGATTAACTATGTGGTATGTAAAGCCTATAGGAAGCTTAACTATATGTTCATAAAAAACAGTTTTAGATTAACTATGTGGTATGTAAATAATATAACAAAGTGGATGTTCTCTAAAAATAAAGAGGGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATATTTTTGATGATTTAAACATTGATAAAAGTATGAAACGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATGATAACAAAGCTTGCAAAGTAGATATTTGTGTTTTTCGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATTGCTGTGATTTCACTAATAAAACAATTAATAATTGTGTTATAGATTAACTATGTGGAGAAAAACT >CP019858|8|5|1754095-1754449|PILER-CR GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA TTGTGATTCCTCAGCTCTCTCCTTTAAGCTACACAACT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA TTAATAATTATGGAGAGTTAGGATTAGGTGATACTAC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA TTTAAAAGTTACTACACCAGTTTTAGTAGTTCCAGCTA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA TAAGATACAAGAAGAATTTTCAGTAGAGGATAAATTA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA GCCAGAAGAAGCCGCATCTGCAATAAAGAAGTATGGA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAGATTGAAAAAACGTCCAAATAGCAATATAATTTAATTAGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAGATTTATGTCTGATTTGTGTCCAAAAATAACCGATTTGTGTTTTAGATTAACTATGTGGTATGTAAAGACACCTCCAAACACTGCAATTTCTCCTGTTTTCAATAGTTTTAGATTAACTATGTGGTATGTAAAGCCTATAGGAAGCTTAACTATATGTTCATAAAAAACAGTTTTAGATTAACTATGTGGTATGTAAATAATATAACAAAGTGGATGTTCTCTAAAAATAAAGAGGGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATATTTTTGATG ATTTAAACATTGATAAAAGTATGAAAC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATGATAACAAAG CTTGCAAAGTAGATATTTGTGTTTTTCGTTTTAGAT >CP019858|8|8|1754095-1754977|CRISPRCasFinder GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TGTGATTCCTCAGCTCTCTCCTTTAAGCTACACAACT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TAATAATTATGGAGAGTTAGGATTAGGTGATACTAC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TTAAAAGTTACTACACCAGTTTTAGTAGTTCCAGCTA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT AAGATACAAGAAGAATTTTCAGTAGAGGATAAATTA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAG CCAGAAGAAGCCGCATCTGCAATAAAGAAGTATGGA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAG ATTGAAAAAACGTCCAAATAGCAATATAATTTAATTA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAG ATTTATGTCTGATTTGTGTCCAAAAATAACCGATTTGT GTTTTAGATTAACTATGTGGTATGTAAAG ACACCTCCAAACACTGCAATTTCTCCTGTTTTCAATA GTTTTAGATTAACTATGTGGTATGTAAAG CCTATAGGAAGCTTAACTATATGTTCATAAAAAACA GTTTTAGATTAACTATGTGGTATGTAAAT AATATAACAAAGTGGATGTTCTCTAAAAATAAAGAGG GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT ATTTTTGATGATTTAAACATTGATAAAAGTATGAAAC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT GATAACAAAGCTTGCAAAGTAGATATTTGTGTTTTTC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TGCTGTGATTTCACTAATAAAACAATTAATAATTGT GTTATAGATTAACTATGTGGAGAAAAACT >CP019858|8|5|1754095-1754976|CRT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA TTGTGATTCCTCAGCTCTCTCCTTTAAGCTACACAACT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA TTAATAATTATGGAGAGTTAGGATTAGGTGATACTAC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA TTTAAAAGTTACTACACCAGTTTTAGTAGTTCCAGCTA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA TAAGATACAAGAAGAATTTTCAGTAGAGGATAAATTA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA GCCAGAAGAAGCCGCATCTGCAATAAAGAAGTATGGA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA GATTGAAAAAACGTCCAAATAGCAATATAATTTAATTA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA GATTTATGTCTGATTTGTGTCCAAAAATAACCGATTTGT GTTTTAGATTAACTATGTGGTATGTAAA GACACCTCCAAACACTGCAATTTCTCCTGTTTTCAATA GTTTTAGATTAACTATGTGGTATGTAAA GCCTATAGGAAGCTTAACTATATGTTCATAAAAAACA GTTTTAGATTAACTATGTGGTATGTAAA TAATATAACAAAGTGGATGTTCTCTAAAAATAAAGAGG GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA TATTTTTGATGATTTAAACATTGATAAAAGTATGAAAC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA TGATAACAAAGCTTGCAAAGTAGATATTTGTGTTTTTC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA TTGCTGTGATTTCACTAATAAAACAATTAATAATTGT GTTATAGATTAACTATGTGGAGAAAAAC >CP019858|8|6|1754752-1754921|PILER-CR TTGTGATTCCTCAGCTCTCTCCTTTAAGCTACACAACT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA TTAATAATTATGGAGAGTTAGGATTAGGTGATACTAC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA TTTAAAAGTTACTACACCAGTTTTAGTAGTTCCAGCTA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA TAAGATACAAGAAGAATTTTCAGTAGAGGATAAATTA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA GCCAGAAGAAGCCGCATCTGCAATAAAGAAGTATGGA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAGATTGAAAAAACGTCCAAATAGCAATATAATTTAATTAGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAGATTTATGTCTGATTTGTGTCCAAAAATAACCGATTTGTGTTTTAGATTAACTATGTGGTATGTAAAGACACCTCCAAACACTGCAATTTCTCCTGTTTTCAATAGTTTTAGATTAACTATGTGGTATGTAAAGCCTATAGGAAGCTTAACTATATGTTCATAAAAAACAGTTTTAGATTAACTATGTGGTATGTAAATAATATAACAAAGTGGATGTTCTCTAAAAATAAAGAGGGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATATTTTTGATG ATTTAAACATTGATAAAAGTATGAAAC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATGATAACAAAG CTTGCAAAGTAGATATTTGTGTTTTTCGTTTTAGAT TAACTATATGGAATGTAAATTGCTGTGAT
>CP019858.1|AXU79079.1|1752542_1752647_+|hypothetical-protein MIGFLLSILAGVISAYIYDKIKNHPDANKGDLKK >CP019858.1|AXU79078.1|1751259_1751700_+|phage-protein MSNLSAFLSQNAIKVDNVKYVASNRFLDKEGKPVEWELKVLSSEEDEALRRKCTKRVKVIGNNGKHTGQYTSEIDYNSYVAELCVASTVFPDLKDAELQNSYGVMGEAQLLKTMLTAGEYVNYTVKVNEVNGFDTSFEDKVEEAKN >CP019858.1|AXU79077.1|1750717_1751188_+|phage-protein MAQTINAKDTVSAKKAECFITIEGKRYNFMQAIDLEAKMEKNKSEVPILGRTTKGNKTTGSTNTGSATFHYNTSIFRELLYRYKETGEDIYFDIQVTNEDPTSAVGRQTVVLKDCNMDSGIITKFDADGEYLDEDMDFTFEDWELVEKFNLLAGME >CP019858.1|AXU79076.1|1749390_1750701_+|phage-protein MALGGGTFVTQNKVLPGAYINFVSATRATSSLSDRGIVAIPLELDWGIDEDVFQVTSDDFEKYSVKYFGYDYTHEKLKGLRDLFKNIRLGYFYKLNKGVKASCTIATAKYSGIRGNDLKVTVTTNIDDNAKFDVVTLLDNKKVDTQIAKVITDLQDNDYITWKKDATLEASAGLVFTGGTNGEAVTGAEYQAFLDKIESYSFNALGCLATTTEIKSLFVEFTKRMRDKVGAKFQTVLYKKSDADYEGVVSVENKIKDIGLVESSLIYWAAGAIAGCDINKSNTNKKYDGEFDVDVNYTQIQLEEALKTGKFIFHKVGDEVHVLEDINTFVSFTDDKNDDFSSNQSVRVLDQIANDIATLFNEKYLGKVPNDKAGRISFWNDVVKHHKELENIRAIEDFKTDDVSVKLGNDKKTVIVSDAVKVINAMSKLYMTVSVS >CP019858.1|AXU79075.1|1749204_1749390_+|hypothetical-protein MIILSKTLSKEDNYKFTKEQIVNSKKYVNRKDLLNAILKENDLYSFSEVEDRINKFMKGVS >CP019858.1|AXU79074.1|1748783_1749221_+|phage-protein MLNNIIDGISIKLDKTFGESYTIYSEDVEQGINEPCFFIVPLNPSKVSYPSGRTLKKNSFDVHYFPKSNDKSFEINEIAEMLLEELEYIEIDGDLVRGTNMNFEIIDNVLHFFVDYNYFTIKSNDTDKMDTVELFGGLKRGDNFE >CP019858.1|AXU79073.1|1748365_1748791_+|phage-protein MARWGSVDFREFKRVCKKMEELTKIDLDKFCKDAARELAARLLGKVIRRTPVDTGFLRQGWNGVAYARSLPVYKQGNNYIIEVVNPTTYASYVEYGHRTKDGKGWVKGQHFLTISEMELQSQVDKIIEKKLLILLKGVFDA >CP019858.1|AXU79072.1|1748003_1748366_+|phage-protein MVSKTRKVIEMLYRDKCTIVEYQPIKDPVTKRTNNKEVVVLENQPCKLSYKNITSTEQGEVAKLTQTIKLFISPNISVKAGSKLIITNQNNITKEYIRSGEPAIYPKHQEIILELLEDKA >CP019858.1|AXU79071.1|1747608_1748010_+|hypothetical-protein MENNLIDEIEKRLESFGYILKDGDKWLIDFIREKIENIIKLDCNIKTMPIELKEIEVDMIVGEFLFTKKNMGQLDIESINFEAVEKSISEGDTKVDFAIGSGSQTPEQRFDSLVAYLTTYGKNKILTFRCLRW >CP019858.1|AXU79070.1|1747365_1747599_+|hypothetical-protein MAQVRKLNRILTIEECKIDDFLEMGYDLIDETGKAVKYGKSLNVKDLIAENNILRSKVESLEEENKQLKEKNKLTKK >CP019858.1|AXU79080.1|1755445_1756315_+|prophage-antirepressor-related-protein MENLIVKEFNGSQIYTFMWKEKSCWIANQIVGLFDYADVSKTIQDCIKAEDFEIEQEYDVLKGNEFNDFVTTLNVVANNIISNKARSITIFYEDGLYGFLQYTDKPIGVQFRKWLRREVLPSIRQTGAYITNNANPEKLREKASEIEKLQLAYNSTSMLKELLDGAGFDNKSKLLTAKTLYKKAGIDLPIEINEEEHYFDTKQIASKLKIYSKSNKPAQMAVCEIIKKIDLEDSEVKGVWETNGSWTGTVNKYTKSVIDKVRNWIEENNRPAKIQGEKKNFHVVYKEAM >CP019858.1|AXU79081.1|1756314_1756464_+|hypothetical-protein MGDNLLNNVCNDEKEYLISYLKTLRQKDEHDFYVFKQIVDKYCKQAKYK >CP019858.1|AXU79082.1|1756593_1757370_+|hypothetical-protein MGLFRKSKEPCCICGKEKTDQKIKDGAVCIECLMDYMEYKDKQFTFKDGLPTKSEIQIVLDSKKQNDFLVEKFNVTKEINSFIKFDETNKLIYIETKRKNGKIKKNVYSFENITGFELLEDGETITKGGLGSAIAGGVLFGGTGAIVGSIVGKKKTKKIIENLQIKLTLKTISEPVAYINLINVKTKTNSIGYERAYAEAQEILSILAIILKDIEKKREEINNNNSNADEILKYKNLLDLGAITEEEFNTKKKELLNL >CP019858.1|AXU79083.1|1757432_1759784_+|phage-tail-tape-measure-protein MATIQTSIRIFDGMTPAFRHMTNAMNIVLSSFEQLQRTSSNAIDANSIRTAREELARAEAGFDRLEQQIREADGQQRRLNEDINKGASSTDRLVGSAKKLAATYLGIRTLGGLGNLSDQMTSTNARLSMINDGQQSDGGLNKMIFQSAERSRASYLDTAKIVSRVGMNAGKAFSSTKEIVGFAEQLNKKFVIAGASTEEMNSALLQLTQGLGSGVLRGEELNAVFESAPNIIQSIADYLDVDIGKIRSMASEGMLTADIVKNSLLSAAEQTNAEFEKMPYTLGQIFTSVKNNAVMIFGAIQKKIEDTVSSKGFRTFITDVKDSLYVLGAVGFNVFSGFINLLSSPAFQNFFNVMIVGSSLVVQGLGWIITQALNVANVFAQNWSIIAPVIWGIIAVIAIYKITIISLLAIQTLHTTLTLAQSFATALLNGELMAETRFLLLNKLETLGLSQANALLCVSILKVVAVMALVIAAIFVGVAIFNHFAGTSISATGVVVGAFYFLGTCIYDVFAGAWNIVMAFAEFFVNSFNIVIYNVQMLFYKFQNFVINAMGDVGGSFDNCATALANAFVSAVNIAIKGINGVIKALNLIPGINIKTIGSLDKVDSFVKQYKDYQKTLKEPVKPQDWKAPYMDIKNPFDSYKKGYEVGQNLENKLKDTFDISKIAEDAKKKLGLDDLWDKKYGLGDGLGSAGLNSPLSDAAKGAKDTAGNTAKMAKTMDKSQEDLKYLRDIAEQEVINRFTGVNIKIDMNNTNNISKDADVDGIVNVLTEKLNDAMVVSAEGIV >CP019858.1|AXU79084.1|1759800_1760493_+|phage-cell-wall-hydrolase MAYDFYLDGVQLPIPPPKLEIKVTNKNKTVDLINTGEVNILKKEGLSEISFEAEFTHNKLPFCRGQFRDVQFFLSKLELLKTDCKPFQFIVSRELGNKVLFNTNMKVSLEEYNIVEDAENGSDVKVIIKLKQYRDYSTKKLVLAPPKNETGRPNVKIEPKRVDSVNAPSGKKTYTVKAGDSLWSICQKQLGNGSLYKKVYELNKTMMDKANKGKKVPKYTIYKGQVLKLG >CP019858.1|AXU79085.1|1760485_1762378_+|phage-cell-wall-hydrolase MADELVLANDRDVRLVIAHWEDFYEPVVLDGITWEIERRGTPSKLEFTIVMDDILQFCEGNSVRLYYKGIGIFYGYIFQKKRDKENHIKIVAYDQLRYFKNKDTYVYSNKTASELVKMLAKDFNLKYNVIEDTKYKLSRVEENKTLFDMILTALDDTLREKKEMYTLYDDFGRITLKNVASMKLDTVMNNDVIEDFDYNSSIDSDTYTKIKLVRDNEESGKRDVYIAQDSTHMRSWGILQMFETVDKNMSEAEIKQKCDILLKLYNKKTKSLSLKNVLGDIRVRAGCLVPVFLDLGDIDLQNYMLVEKVKHTFENNSHFMDLTLVDGDEFASYSSSSYSSGNTNNKDEKKNGPAQSITKKNTGKKVPAIFTAYYPGNNAMEGGKTDCNGKPLDVKSRTVAGPMNREGVKKTWYTDDFLKKHPVFEYGDKVKIILPGTAYDNKVYTVKDNGGRIYVETNGTYHIDILLANASECKKFGRKNGYIIIGGDEEQTYKVEGNNQSNTNNNSKEDKLISIAKSKLGCNYVYGAEGPNTFDCSGFTQWCYKQIGIKIPRTVATQSKAGSAVDLKDRSKWKAGDLLCRVGGGSSNHVVMYIGNNQIIHSPQTGDVVKIESVNSYRKGKAYTHVRRFI >CP019858.1|AXU79086.1|1762391_1762652_+|phage-protein MSQDLLQIIKKAAMDAVETSNPMRVVFGTIESISPLRVKIEQKLSIGEIFLIQTDTFKRYTDKKIGDKLVLIRMQGGQQYLILDRM >CP019858.1|AXU79087.1|1762656_1763076_+|phage-protein MLPSDNLDYDIEDVSIINFDVRQEPSKTFKLNIEKNRVDGICDDVEALKQTIFLILNTERYQHLIYSWNYGVELNDLIGEPISYVIPELERRITEALIQDDRIENIDNFEFQNIKGKVQCRFSVHTKYGNIKAEKVVSV >CP019858.1|AXU79088.1|1763076_1764126_+|phage-protein MFELMTFENIIKRMLDSVPNTLDKREGSIIYNALAPVAVELTETYIAMDELLDQTFVDTASYYYLEKRCKERGITPLPATNTIAKGVFNIDIPIDSRFNLGEYNYVAIERISEKTYKMKCETTGPVFELGQLIPIEYVDKLETAELTEILINGEDEESEDSLRQRYYDSLNSQSFGGNIQNYKDEVNKIQDVGGVKVYPVWDGGGTVKLVIINSNFKVPSEDLVNLVQEEIDPIGHQGQGLGLAPIGHKVTVTGVVSTTINISADITYKNGYTWENIKSIAEEAVDDYLNELNMSWEDEENLIVRISQIETRLLSIDGVLDITNTMINDVKSNLTIDSNSIVVRGEVVG >CP019858.1|AXU79089.1|1764118_1764736_+|phage-protein MDKEINLINYLPQILQDKEEYIKVFNVENKEIKTLHEKLNDLSSDQFLEDLTPSGIKRWEKIMSITPKSNESLEDRRFRIFSKYISKLPYSERFLRNWLDSIVGEGNYELTINNATYNIHLESDARNQDWFEEVHSFVSSIKPCNMTLDYTRVLVSKDNYMNFGITTLIGQEITIYPWSPPDIETYGEIDVLTGNGVGYQEITIF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019858_9 | 1906075-1907814 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP019858_9
|
26 spacers
spacers of CP019858_9
>9.1|1906104|35|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTCTTGTCGCAGTTGCTCCTGAAATTATTAATGT >9.2|1906168|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAACAAAAGGAGTGGTAAAAATGGCTAAGAAAAAA >9.3|1906233|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTATGACGTAAATAGTCTATACCCTTATGTGATGAAG >9.4|1906299|38|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGTTGCGATTGGATTATTAGTAGCTGGACTTGTACAT >9.5|1906366|38|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTAAATATACCAAGATTTCCTAAAAAAGTAGAAAAA >9.6|1906433|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCAATTCTATTTTTATCAGAAAGCGTTGAACGAGGA >9.7|1906499|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGATAGATGCAGAGGCTGACAAAACTAAAGTAGTAA >9.8|1906565|38|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAGCCTGTCATACCTGCTATGAAAACATGCTCGTCTGT >9.9|1906632|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATTTCTTGCTATTTTACAGTCATTGTCATTGTCGC >9.10|1906698|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTAATTATTATGTCATCACCTAGTGTAACCTTAT >9.11|1906764|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CACATTGGCGTTGAAGCTGTTAGCAAAGCATTAAAAG >9.12|1906830|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTAGCCTATTGTTTGGCTTCCTGACATTTCGTAAGA >9.13|1906895|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTAACTATATTAAATAAGCGAATAATTAAAAGGG >9.14|1906960|35|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTAAATGGTGTGAATGGTGAAAGGCACACAACAC >9.15|1907024|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTCCTGTAGGTGCTACCATTAATACATTTTTACCCT >9.16|1907090|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGGAGATAACTTCTATTAAAGATAACTTTGATGTGG >9.17|1907155|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGTAAAGTTTAGCAAATTCAATAGTATCCATATTGT >9.18|1907221|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGACACAACAAAAATTTTTCAAACCTTTTAAAAGA >9.19|1907286|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTTCTGTGCTAAAAATTTAGTTACAGAATATAAA >9.20|1907351|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCTGTAGCACCTTTTATTATATTTTGAACGCTACCAC >9.21|1907417|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTGAATGTGACCAATTTTGTGACGAATTATCAGAG >9.22|1907482|39|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGAAAATAACGTCAGTAGTATTAGCAGGTAAATCTAAA >9.23|1907550|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTGTTAATGCAAATAAACAACATAGCACTATTAATA >9.24|1907616|38|CP019858|CRISPRCasFinder,CRT AGGGTTTCTGATAAAATCTTCAAACATGTAAAATATGT >9.25|1907683|37|CP019858|CRISPRCasFinder,CRT CTTATACTTAGTTAGAACTATATATCGACACAAATAT >9.26|1907749|37|CP019858|CRISPRCasFinder,CRT TGCAATTTTTATTCGTTGTCCAATCGCTTTGAAATTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019858_9
The CRISPR arrays of CP019858_9 >merge|CP019858|9|1906075-1907814|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATGCTCTTGTCGCAGTTGCTCCTGAAATTATTAATGTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAAAACAAAAGGAGTGGTAAAAATGGCTAAGAAAAAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATCTATGACGTAAATAGTCTATACCCTTATGTGATGAAGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTGGTTGCGATTGGATTATTAGTAGCTGGACTTGTACATGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTTTTAAATATACCAAGATTTCCTAAAAAAGTAGAAAAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATATCAATTCTATTTTTATCAGAAAGCGTTGAACGAGGAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTGGATAGATGCAGAGGCTGACAAAACTAAAGTAGTAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATGAGCCTGTCATACCTGCTATGAAAACATGCTCGTCTGTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAAATTTCTTGCTATTTTACAGTCATTGTCATTGTCGCGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTTTTTAATTATTATGTCATCACCTAGTGTAACCTTATGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATCACATTGGCGTTGAAGCTGTTAGCAAAGCATTAAAAGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATGTAGCCTATTGTTTGGCTTCCTGACATTTCGTAAGAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTTTTAACTATATTAAATAAGCGAATAATTAAAAGGGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTTTAAATGGTGTGAATGGTGAAAGGCACACAACACGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATCTTCCTGTAGGTGCTACCATTAATACATTTTTACCCTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAGGAGATAACTTCTATTAAAGATAACTTTGATGTGGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATATGTAAAGTTTAGCAAATTCAATAGTATCCATATTGTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTGGACACAACAAAAATTTTTCAAACCTTTTAAAAGAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAATTTCTGTGCTAAAAATTTAGTTACAGAATATAAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATCCTGTAGCACCTTTTATTATATTTTGAACGCTACCACGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAGTGAATGTGACCAATTTTGTGACGAATTATCAGAGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTAGAAAATAACGTCAGTAGTATTAGCAGGTAAATCTAAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATCTTGTTAATGCAAATAAACAACATAGCACTATTAATAGTTTTATATTAACTATGCGGTATGTAAATAGGGTTTCTGATAAAATCTTCAAACATGTAAAATATGTGTTTTATATTAACTATGAGGTATGTAAATCTTATACTTAGTTAGAACTATATATCGACACAAATATGCTTTATATTAACTATATGGTATATAAATTGCAATTTTTATTCGTTGTCCAATCGCTTTGAAATTTGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT >CP019858|9|7|1906075-1907615|PILER-CR GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GCTCTTGTCGCAGTTGCTCCTGAAATTATTAATGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAAACAAAAGGAGTGGTAAAAATGGCTAAGAAAAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTATGACGTAAATAGTCTATACCCTTATGTGATGAAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TGGTTGCGATTGGATTATTAGTAGCTGGACTTGTACAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTTTAAATATACCAAGATTTCCTAAAAAAGTAGAAAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ATCAATTCTATTTTTATCAGAAAGCGTTGAACGAGGA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TGGATAGATGCAGAGGCTGACAAAACTAAAGTAGTAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GAGCCTGTCATACCTGCTATGAAAACATGCTCGTCTGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAATTTCTTGCTATTTTACAGTCATTGTCATTGTCGC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTTTTAATTATTATGTCATCACCTAGTGTAACCTTAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CACATTGGCGTTGAAGCTGTTAGCAAAGCATTAAAAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GTAGCCTATTGTTTGGCTTCCTGACATTTCGTAAGA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTTTAACTATATTAAATAAGCGAATAATTAAAAGGG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTTAAATGGTGTGAATGGTGAAAGGCACACAACAC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTTCCTGTAGGTGCTACCATTAATACATTTTTACCCT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AGGAGATAACTTCTATTAAAGATAACTTTGATGTGG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ATGTAAAGTTTAGCAAATTCAATAGTATCCATATTGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TGGACACAACAAAAATTTTTCAAACCTTTTAAAAGA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AATTTCTGTGCTAAAAATTTAGTTACAGAATATAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CCTGTAGCACCTTTTATTATATTTTGAACGCTACCAC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AGTGAATGTGACCAATTTTGTGACGAATTATCAGAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TAGAAAATAACGTCAGTAGTATTAGCAGGTAAATCTAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTTGTTAATGCAAATAAACAACATAGCACTATTAATA GTTTTATATTAACTATGCGGTATGTAAAT >CP019858|9|9|1906075-1907814|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GCTCTTGTCGCAGTTGCTCCTGAAATTATTAATGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAAACAAAAGGAGTGGTAAAAATGGCTAAGAAAAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTATGACGTAAATAGTCTATACCCTTATGTGATGAAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TGGTTGCGATTGGATTATTAGTAGCTGGACTTGTACAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT 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GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TAGAAAATAACGTCAGTAGTATTAGCAGGTAAATCTAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTTGTTAATGCAAATAAACAACATAGCACTATTAATA GTTTTATATTAACTATGCGGTATGTAAAT AGGGTTTCTGATAAAATCTTCAAACATGTAAAATATGT GTTTTATATTAACTATGAGGTATGTAAAT CTTATACTTAGTTAGAACTATATATCGACACAAATAT GCTTTATATTAACTATATGGTATATAAAT TGCAATTTTTATTCGTTGTCCAATCGCTTTGAAATTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
>CP019858.1|AXU79222.1|1904156_1905428_-|guanine-deaminase MLKVLKGNIIFTKTSETFTVFENSYIILEKGKVKGIFKEIPKEYKNLKVVDYTDKLIIPGMNDLHAHASQFKNLGMAMDKELLPWLETYTFPEESNYKDIEYATKMYKKFVKELWKSGTTRIAVFATVHKESSMKLMDIFKEVGLGAYVGKVNMNMNCPDTLLENTLDSIADTEEIINKYSDTDSIVKPIITPRFIPSCTSELLKGLGDLCLKYNIPIQSHLSENYDEIEWVRSLEPESKFYGDAYNRYNLFGQTPTLMAHCVHCSQDEIDLMRENNVMAVHCPASNFNVGSGAMPIRKLIDNNIRLALGSDISGGHTLSIFKAMVSAIQLSKLYWVNSGKKYNFLSLSEAFYIATKSGGSFFGKVGSFEEDYDFDALIIDDSNLNHDNYSILERLERFIYVGDDRNIIHRYVCGKLIEEPNI >CP019858.1|AXU79221.1|1903258_1903576_-|hypothetical-protein MSEFKNVTAVKKANVYFDGKVSSRVIILPNGERKTLGLMLPGEYTFSTREEEIMEMLAGSMDVKLPGSNEFVTYKEGQKFNVPSDSSFDLKVNEVVDYCCSYIAD >CP019858.1|AXU79220.1|1900815_1903173_+|cation-transporting-ATPase MDKVNLERYSCDINVGLNKNQLQSRIDDNLINAFDNGKTKTYKQIFKDNIFTLFNLINIVLVCLLVSVGSFKNTLFIFIAVINTIIGVIQEIRAKRLLDNLSVIVSNKVSVIREKEKKEIDVQELVLDDIMILKTGNQICADSKVLNGKLEVNESLVTGESDIIIKNKGDFLYSGSFVVSGEAFVRVENIGKDNYANKIANDAKISKKHNSQLRNSLNAILKIVGIIIIPLGIILFAKQHFGNGDSIATSVVGTVAAVNGMIPEGLTLLTSIALAVGTIKLASHKTLVQELYCVETLARVDTLCLDKTGTITEGKMQVDDIVMLEEVDINEIMGNICNSLKDDNATLNAIRDKYNVLDTYKAKNLIPFSSERKYSGVTFENKGTYLLGAFEFIFKEKNKKLRIEVERYSKKGNRVIVLAHSDSYMEDNNIPEDIKPLAFILILDKIRDEAKETLEFFYNEGVDIKIISGDNPITVSEVARKAGLKTASNFIDATTLKNDSDIYKAVDKYSVFGRVSPQQKKQMILALKKQNHTVAMTGDGVNDVLALKEADCSIAMASGSDVTKNVSNLVLLDSNFASMPKVVMEGRKVINNIQRASSLFLVKTIFSFFLSLLTLFFFSRQYPFVPIQLSLIGAVTVGIPSFFLALEANKSRISGNFLLNILKNALPGALCVTVNVIIVYNIVEYLGYSSSVFSTMCAILTGVCGLLILRQQCLPFNKERLFLIVSMTIAFVIGILFLGGLFSFVALSRELILITMALAILMPIMIKVMLFVLDEILETIVPDLN >CP019858.1|AXU79219.1|1898939_1900397_+|glycine-dehydrogenase-subunit-2 MKEYNSLLIDISKKGRKAYSLPKLDIDDIKIEDMIDQDMARQSELNLPEVGELELVRHYTLLSNKNFGVDTGFYPLGSCTMKYNPKINEDMAALPNFTGMHPYQSSDTAQGSLSLMYDLSRRLAEITGMDEVTLQPSAGSHGEFTGLMIIKAYHENRGDHKRTKVIIPDSAHGTNPASAAMANFDVIQIASDKNGAVDINALKEILNDEVAALMLTNPSTLGLFEKNIKEIATLVHEAGGLLYYDGANMNAIMGVTRPGDMGFDVVHLNLHKTFSTPHGGGGPGAGPVGVKKELVPFLPIPVIERKEDKYVLNYDREKSIGKIKNFYGNFGVLVRAYTYILTMGRDGLKEASEMAVLNANYIKESIKDDYILPIDTLCKHEFVLGGLPRGEANIKTIDIAKRLLDYGYHPPTMYFPLIINEALMIEPTESESIETLDSFIEAMKSVAKEAKEEPELLKTAPHNTLVKRVDDARAVKKPILTWSQR >CP019858.1|AXU79218.1|1896465_1898940_+|bifunctional-glycine-dehydrogenase/aminomethyl-transferase-protein MNELKRVSLYNIHKELGAKLVEFAGWEMPLEYEGINKEHEKVRKSAGIFDVSHMGEVQIKGAESEKFIQNLVTNDISALKINDIIYTPMCYENGGVVDDLLIYKFGEEDYLLVINAGNIDKDVAWIIKQSEGYNVDIKNISSEVSQLAIQGPKAEEILQKITDIDLNSIKFYKSIPSTKVCGCPCLVSRTGYTGEDGFEIYCKNKYVEIIWNEVLKVGGEDICPAGLGCRDTLRFEAALPLYGHEINEHISPIEGGLSIFVKTNKESFIGKSILSKEKESGAKRKLVGFEMQGKGMPRNGYDIRIGDKTVGFVTTGCASPTTGKILGMGIIDSEYAKVGNEIGIAIRKKVVPAVIVKKPFYKKQYKKDNIILNKENKFSYIPATSEDKSKMLKVVGLNSVDELFSDIPEEVKLKRDLNLEIGKSELEVSKIVKRLSEENLSLEDLTCFLGAGAYDHYIPSIIKHITSRSEFYTAYTPYQAEISQGTLQVVFEFQSMIAEITGMEIANASMYDGATAAIEACIMAMNQTRKSKIVVSKTIHPETLSVLRTYLQYKDCEIVEIDFCNEYGTTDIEKLKASVDKDTACVLIQTPNFFGIIEEMKEIEKITHENKAMLIMSVDPISLGVLKTPGEIGADIVVGEAQSLGNPLNFGGPYVGFLASKSKYTRKMPGRIVGQSLDVEGKIAYVLTLQTREQHVRREKATSNICSNQALNALVASIYMATMGKEGFKEVGMQSMKKAHYTYNKLVQTGKYKPIFKGKFFKEFAVQGNLNIETINDKLLEENILGGYNLEYNYPELKNSTLLCVTEKRSKEEIDKLVGIMEGL >CP019858.1|AXU79217.1|1895144_1895660_+|CF-9-family-membrane-protein MEKYIWLFPLLFIFHDMEEIIGFGIWLKKNKSMLDKKYPFISKVYENYSTEGMAFAVFEEFILCIIFCILTVITENQYVYLLWLGSFIAYTLHLVIHIGQSIIIRKYIPSLITSIICLPISIWCISKSIYIVDCEMSTTILYSIIGIIIVALNLKFAQSLIGKFTKWMSNI >CP019858.1|AXU79216.1|1892889_1894620_+|Na+/H+-antiporter MRNKKINIIFLTTIMFIMSTVMVFAEEDIDTIALANAEKFGILTLIPPLVAIILAFITKNVIISLLIGILSGSFIIKASGINVFATFIQAFLDLVDRALVSLADPWNAGIILQVLAIGGVINLVAKMGGAKAIAEALAKRAKSAKGTQLITWFLGLLVFFDDYANSLIVGPMMRPVADKMKISREKLAFIIDATAAPVAGLAIISTWIGLEVGLIHDAFESISIDVDAFGIFLNTIPFRFYNILILAFIVISALLLKEFGPMRKAEIKSRSRKISIDLDEGVEELDDLAPKNGVKLSVWNAIIPIGTLIIVALASFYYSGYTSIMGGDDKALIQLFTNSPYSFEAIKEAFSASDASRALFQSALVASLVAIIMAVVKKIFTISEAIDVWIDGMKSLVITGVILILAWSLSSVIKELGTAKFLIHLLSGSLPPFLLPSLIFGLGAIISFATGTAYGTMGILMPLAIPLAYSLNPDMSYVIVSTSAVLTGAIFGDHCSPISDTTILSSMGAGCNHIDHVNTQMPYAIFTAVITIVFGYIPAGLGLPIYIVLPVAIAAIFVGIQIIGKKVDEAEIELVE >CP019858.1|AXU79215.1|1891419_1892406_-|lipoate-protein-ligase MLLIYNEKTNPYFNLAMEEYLLKNFDEDLFILWRNEPSIIVGKNQNTLSEINLEYIKEYSIPVVRRQSGGGAVFHDLGNINFTFIACNNNNFSDFRRFTQPIIDLLKTLDVNAEFSGRNDLLIDGKKFSGNAQYNYKNKVMHHGTLLFSSEINDLSKALKVKPIKFEGKGIKSVKSRVTNISEHLHSKMDILEFKDAIMDYLSKTNIDNTNYCLSEHDIKQIEKLTKSKYETWDWNFGNSPKYTLSNELKYSGGNVEFNLNVDKGIITSIKFFGDFFGKCDVAFVENKLIGIRHEENALRNILDSIEINDYFLGADTDILVSGILGVK >CP019858.1|AXU79214.1|1890312_1891110_-|lipoprotein MKFKKLLCLLLCLVLTLAVVGCSKAKDDKKIVVGATLVPGGELLEELKPLIKEKGYTLEVKNFDDYILPNEALNNGEIDANLFQHEPYLKEAVKAKGYKIMAGKKLYVCPAILYSYKIKSVDEFKKGDTIAISNNPSSCSKNLRYLESIGLLTLPKGDGLVSPKDIIENPKGIQFKELDIAQIPSSLPDVTAAFIDTTYAVPAGLDAKKNGIYTAPINDEYANLLAFRTEDKDSEKIKVLQDVLTSDKARNLIEEKYKGIVIPTF >CP019858.1|AXU79213.1|1889610_1890210_-|tellurium-resistance-protein MAIELKKGQKINLTKKENSDLGEILVNLNWNQKVQKKGFFGSLRSSNIDLDLGCLFEMKNGVKGAVQALGNAFGSLDNPPFAQLDGDDRTGSNTQGENLRINGNKIKDIKRILIYAFIYEGVANWSEADGIVTIKQKQDSDLVVKLDEHKNGYNMCSIALIENVNDETFSVEKVVKYFKGHREMDTEFHWGLKWVAGRK >CP019858.1|AXU79223.1|1908222_1908510_+|hypothetical-protein MKKFLYALYSFIVIIANFRLKEKNYNFILLAIFFILLLIQNGVLKTGYQNRATFYQDNYFNGEDKNDKIKFMTIKIFIFLSLPLCFNILFNYLTS >CP019858.1|AXU79224.1|1908534_1908633_+|hypothetical-protein MIKVSLCVICSKYKVRIVIKQKFHINEEKNIK >CP019858.1|AXU79225.1|1909048_1909600_-|transcriptional-regulator MSINTVIAKNLNRLRNERNLSLGQLAELSGVSKVMLSQIEKGDSNPTVNTIWKIASGLNVPYTAILEQPQNETFIVSKTDIDVQVSENKDYRLYCYYPNTPTRNFELFQMELEEGHSYTSVGHSEKSQEYIMIIEGQLKLEVNDSIYQLRENDSICFSAESIHTYHNQGEKTLKAVIINYYPV >CP019858.1|AXU79226.1|1909790_1910753_+|cysteine-synthase-A MRVLNNVTEAIGNTHMLHLSKIADEFGVQGNIYAKMEYLNPGFSKKDRVALQMITEAENAGLLVPGQAVVELTSGNTGTGLAIACACKGYKFIACMSKGNSMERARMMKALGAEVVLVDQMPNSVHGQVSGEDLALVEIEAQKIAKERNAFRADQFNLEACNHAHEKYTAEEMWEQLDGNIDVFVDFLGSGSTFAGCSKTLKKHNSSIKCYVVEPETAAIYSGKEITEQGHKIQGGGYSMDLPLVDKKLIDGYIQVTDEEATDVARKLAKLEGVFAGFSSGANVCAAIKLLKSSEKGKNIVLTLNDSGLKYLSTDLYEEL >CP019858.1|AXU79227.1|1911047_1912892_+|glycerophosphoryl-diester-phosphodiesterase 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>CP019858.1|AXU79230.1|1915651_1916674_+|ABC-type-transport-system-involved-in-multi-copper-enzyme-maturation,-permease-component MVNWEIKKLAKSKSMFISLGILVLILMISIFITPVLETESYYIDKEKGRIEDTRSGIDVGNEKFQNKINVLKQFSNQTDTGEFSKKIELMSKKKLDNLSVNEYKDISFWKVFNYRVTNSLINVGMLIIISIIISNIYVDEVVTSVKDIILSSKEKKKALKSKIFVALLVPLVIYSVYLMGIFIITCMQQGVPVNGDLESFRIVDNVVALKTNLSITKYVILNIGIELLMFEGWAMIAIFGSFISKSSISSISFFIFIISITKIMSVIHILPKKLLSVVSNVNYYDLIFGFNKIIGNYLGDIMIFKVNIDIVNIAIGLLMAILIGAMSLCFLVIKSDYISR >CP019858.1|AXU79231.1|1916687_1917575_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNKLEIENLSKIYGKKVANDKITVTLENGVYGLLGPNGAGKSTLMKQITTLIKPDEGQILYNGEDIFKMDADYRNILGYLPQEFGVYKNFTAKEFLQYIGALKGLRGKYLNSKIGELLDLVGLYDVRNKSIGKFSGGMKRRVGIAQVLLNDPKIIVLDEPTAGLDPQERARFRNLIAKMSRDKIIILSTHIISDIESVAKETIMIKDGKLLMKGTHKDILSHMENKVYNVQVKNECEVDDIQSKYKVVSIQSDINSIVLRIVSEDIPSEDNIQPVQAKFEDVYMFYFDLEDAREV >CP019858.1|AXU79232.1|1917580_1918354_+|ABC-transporter-permease MMYLVKAEMIKILKSKSVWIIWLFLIFFGFFLIRKFDVLDTYADIFYKIEGSIPLIGFIMFIITSGNYIKEYDSNMTGLINTTKKGKKSVVLSKLVANGLILSIINISFILLVGIRGFSFFDFKNLNESIHNLWYFGNSNLNLTVIQMYIIVILTTIFASFIFAQIGLTLSSIFKSAVIPFILGGLIMAIPYFSVGFIPDKAIKFMSVTPNWIMMSQQMVKYNVPIILIVFSIVISIILMIVLTKITYENFTSSKRF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019858_10 | 2263566-2263792 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP019858_10
|
3 spacers
spacers of CP019858_10
>10.1|2263596|36|CP019858|PILER-CR,CRT TTCCGCCAACAACACCAGCTATTGCAATTCCTATAG >10.2|2263662|35|CP019858|PILER-CR,CRT GCAGAGTAAAGAAACTGAAATAGTGACTTTTTATA >10.3|2263727|36|CP019858|PILER-CR,CRT TATATTACGAGAAAAATTTAAAAACGACTAAAATCT >10.4|2263596|37|CP019858|CRISPRCasFinder TTCCGCCAACAACACCAGCTATTGCAATTCCTATAGA >10.5|2263662|36|CP019858|CRISPRCasFinder GCAGAGTAAAGAAACTGAAATAGTGACTTTTTATAT >10.6|2263727|37|CP019858|CRISPRCasFinder TATATTACGAGAAAAATTTAAAAACGACTAAAATCTA |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019858_10
The CRISPR arrays of CP019858_10 >merge|CP019858|10|2263566-2263792|PILER-CR,CRT,CRISPRCasFinder ATTTTACATACCACATAGTTGATATAAAACTTCCGCCAACAACACCAGCTATTGCAATTCCTATAGATTTTACATACCACATAGTTGATATAAAACGCAGAGTAAAGAAACTGAAATAGTGACTTTTTATATTTTTACATACCACATAGTTGATATAAAACTATATTACGAGAAAAATTTAAAAACGACTAAAATCTATTTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC >CP019858|10|8|2263566-2263792|PILER-CR ATTTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC TTCCGCCAACAACACCAGCTATTGCAATTCCTATAG ATTTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC GCAGAGTAAAGAAACTGAAATAGTGACTTTTTATA TTTTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC TATATTACGAGAAAAATTTAAAAACGACTAAAATCT ATTTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC >CP019858|10|7|2263566-2263792|CRT ATTTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC TTCCGCCAACAACACCAGCTATTGCAATTCCTATAG ATTTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC GCAGAGTAAAGAAACTGAAATAGTGACTTTTTATA TTTTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC TATATTACGAGAAAAATTTAAAAACGACTAAAATCT ATTTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC >CP019858|10|10|2263567-2263792|CRISPRCasFinder TTTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC TTCCGCCAACAACACCAGCTATTGCAATTCCTATAGA TTTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC GCAGAGTAAAGAAACTGAAATAGTGACTTTTTATAT TTTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC TATATTACGAGAAAAATTTAAAAACGACTAAAATCTA TTTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC
>CP019858.1|AXU79575.1|2263003_2263204_+|cold-shock-protein MNNGIVKWFNNEKGFGFISMEGRDDVFAHFSAIQTSGFKSLEEGQQVSFDIVKGARGPQAENITIL >CP019858.1|AXU79574.1|2262601_2262778_+|hypothetical-protein MFGNKMDKCTHVLTAYISSSYDYCNFLDTQLDDFILEYGESVVESCLHQVMVLVSKYN >CP019858.1|AXU79573.1|2262026_2262209_-|regulatory-protein MLNKKLPDTELKIMKCIWNTGYKTVISKDVADEIEKTYGWKHTTTIILLARLTKKGFLIS >CP019858.1|AXU79572.1|2260809_2261295_-|cell-wall-hydrolase MISELMLKNFRKSSINFKTKIKLNLREKPDINSLKLKSIPEGKIVKLKCVDGIWAEVESNYDKGWLLYKYLERLSNAKNNSNDTIKNRKKNYIGNIRTNGLSLELRNDRTLESKVITTIPDGFKVEVCYSVGKWARVNINKNEKRYSGYVYNQYIEEHLSL >CP019858.1|AXU79571.1|2260055_2260454_-|hypothetical-protein MNKKKKLIGIAISFLLIISIINPLQVEAEAIIESSVYISSIKENYTYDNTKFKTIKSKSRHKSRKYNKSKVKLKKRSIRTKKYGYQTINKYKRQNARRHNILTKLILSIIVIFLVIVLVVLIFIKRKKKKFY >CP019858.1|AXU79570.1|2258654_2259206_-|tryptophan-transport-protein MKTNTKKLTLNAILLAMGLLIHQITPAIGLPMKPDVPLAMLFVILVLNRDDYKTCLIAGIVTGIFTALTSSFPGGQIPNVIDKTLTANIVFLLMNISYNMPFIKKLAKKTQDTVVVAIIMPIGTLVSGTIFLLAAQAIVGLPGASFTALFLAVVLPAVLINLVAGIFLFKIVSLSIRRVSYQA >CP019858.1|AXU79569.1|2258359_2258524_+|hypothetical-protein MYSKNEKSEEINIKIYLEKSIKYILYLITTNEIHIRILYRYDNLSVKLSVIGTI >CP019858.1|AXU79568.1|2256390_2257827_-|cell-surface-protein MKFYKRILTLTLSISFVFANIQLVDAISSVEKIQGKNKYEIAGKIADKNAYKTAILINTSNSIADGLSASGLAGALNAPILLTEKNTIPTETSARLKNVSKVYIIGGTYSISTSVENSLKSKKIKVVRIKGNDRIKTSYNVAKEINSIKKVNTVMLTNAYKGEADAISIASVAARDKAPIILTNGQSIPFSTSGLKSYVIGGTASMNTTLVNNTKSTRLGGSTRFETNKAIINKFYKDAREFYIAGAYELTNALVGSSLSKHGPMVLVNDGSNKSILKNAKKITSIGYIDSNIVQQCLNITNGIGDINTGVVKNVKPTTKTIKDGMYKVGKDISAGEYLITSNSGSYASYYEVTSDSTGNADSILSNDIFSGTRYITLKNGQYIKIEDSTMTLAKYAKAQKAKNGKFGNGMYKIGLEIPAGEYIIMSNSSDAYYEVRNDSLGNAEGIVTNDTFSGRRYITVEEGQYLILNDCYLIENE >CP019858.1|AXU79567.1|2254706_2256143_-|radical-SAM-protein MSKRKQVTIPIEKIQEQDKYIEQIHRQNEEYFNRTGKRKLVFTQTFGCQMNEHDSEKLCSMLEEMGYQMSMMVEESDLIIYNTCAVRENAELKVYGNLGQLKHLKGKNPDMKIAVCGCMMQQPHVVEELRKKYKHVDLIFGTHNLYKFPQLLTESINSDKMLVDVWDVDGEVIEGLRSNRKFELKAFVNIMYGCNNFCTYCIVPYTRGRERSRTPEDIINEIKELVANGTKEITLLGQNVDSYGKTLENPVSFSELLRKVNDIEGIERVRFMTSHPKDISDEVIYAIRDCDKVCEFLHLPIQCGSSSLLKKMNRHYTKEYYLEIIEKAKKEVPGIAFSTDLMIGFPGETEEDLLDTLDVVEKVRYDSAFTFIYSKRQGTPAAKMENQIPEDIKHDRFNRVLEAVNRISAEINDGYKDRIVEVLVEGRSKNNENKFAGRTRQNKLVNFEGGNDDLIGKLVMVKITEPRTFSLNGILVNN >CP019858.1|AXU79566.1|2253965_2254304_+|hypothetical-protein MFAVGFVVIIALAFFILSVLLFNGKASMLLAGYNSMSKKEKARYDKKKLCRSSSIVTFIVSIMLFIMAFLGYRIESGQMDEKKMVPFSIIFIIVILSSVFFNILYSNKKCKK >CP019858.1|AXU79576.1|2264271_2265117_+|lipoprotein MNIIKSITLLLTLLIVILMTGCSPRESASEVAKKYIDKMNSGDYETAYSLLSKDSKKKISIENLEEFQNILVSTKRIISYKIGKEKIIKKYKHDGKEYKNVVKLEETFNIKNLLYKKDDSLKVNRYFVVENNKYKLLLYESFKKEFGINSMDLAQLKLNDFGLKYFKEVDLILKKAIAINPTDSKLYYAQACNYMNFDGFPGYSDTTYNALDSINKSLKYLDKNDSDYKKNASNIYNLKGVILMFHKRFDEAQQYLNKALYFNKDNEDPKYNLNTIKKHLN >CP019858.1|AXU79577.1|2265339_2265504_-|hypothetical-protein MFGKPKESVRFLDFNDVAEKFGEKKAVAIFDAIAGKKSKEHIIKDIEKLVKNEV >CP019858.1|AXU79578.1|2266044_2266377_-|decarboxylase MNIREMKEYRGFYNKKLSETDEFFRVFGSLDDKTYSEGAISKKNKELMGLAISILSRCDECICYHIEGCINSGASKDEIIEAIKIGVIGGGSITYPNARFAIKILEEFNI >CP019858.1|AXU79579.1|2266620_2267262_-|Immunity-protein-SdpI MKKAINKQFILSTLICFIPFIVSIYFYNRLPNEVAIHFDNYGNPDNYAPKVIAAFGVPLLMLCIHLYTWFRLENEPKKANFSNVIQNLSKWGVAILSVIIQIMMVLYSTGVSLESNFYTGLILGIIVILFGNYLPKCKRNYSVGIILPWTLNDEDNWNKTHHLAGWIWLIGGILLIINAFINIPFYNIFVIFVIVILPFIYSYLMYKISGKNN >CP019858.1|AXU79580.1|2267242_2267539_-|ArsR-family-transcriptional-regulator MLGFPETFKALSDPIRREILVMLRENKMSAGEISEKFNMTNATISYHLSQLKKAGLIFETKYKNFIFYEINISVFEEVMLWFSQFMEKGEKDNEKSDK >CP019858.1|AXU79581.1|2268156_2268291_-|hypothetical-protein MNISRRAMKIIELAQKIANKRGVTVQDAWNDAMKEYKEKYEYVA >CP019858.1|AXU79582.1|2268501_2269254_-|transporter MFSVIFLCIGGFLAAFVDSIAGGGGLISMPVLMAIGVPVHLAIGTNKFAASAGCISSAYRYSKSGKINNDLLKKLVPFTIIGSVLGVRCVLSISEEILNVLVVVMILIVAIYTFISKNLGQEDNFEAVNKKNLRLGMLMALIMGFYDGFFGPGTGTFLTFGFIKIYGYDFLHASANTKILNLTSNITSLLLFMINGQVDYKIAIVFALVMIMGAYVGAKVAIKKGSKMIKPIFLVMALFMVVKLVYQTLV >CP019858.1|AXU79583.1|2269312_2270968_-|AraC-family-transcription-regulator MVDFIESNNEVQKFDWGEVMWIHEPSKTQFNRLSAGIVRFFPGNCQEKHFHLSEEQLLYVIQGEGIQIIDGKKVNIKETSIVYCPPYSEHEIINTGKIDLVILITYVPHKFSSLRQIPIVFSENNIQELVNVNIIENLANQISNILKLRISVYDLKYKEIFETKKENKFCDICKNIKPCTKKLVKSINNDNFEKVYHCEYGISSLEIPIVLEENIVGYIECGNFIVYKSIYIDKNLSELSSSSGIDIKYINKIYNEFPLNPKSRLYVLKENLLMMSEFIQEIAKRNFFENQLSIKDEEILKSRKENIRLEEALKKANSRLLEEEYIINPIDMFNNSSKEYPFELELYIEKEIKNMNLEGVYNLIDTNKLRYNDVRDTIQEMIFVLSRTVLRDLEDLKLISYLRNKYNKKISLVNSDEDLWNVLFEFSKECIDKNRAFWRKDKGNLIENINEYIKKYYKENINLNSISDVFFISPNYLSSIFNERNKVSITEYINLLRIEESKKYLLDRSMSISDICKKVGFNNSSYFSQIFKKFNSITPNEYRKNMLDNKY >CP019858.1|AXU79584.1|2271196_2271565_-|MerR-family-transcriptional-regulator MKYSITDVSKITKISSSAIRFYEEKGLLLPINRKPSGVRYFSEEDVERLIFIKELKNTGLSIKDIHECFHFCDMGDGTIDKRIQLFQQHKQNIKNKIHELESCMDKIDEKIYYLKEKKMCKK >CP019858.1|AXU79585.1|2271713_2272508_+|4-hydroxy-2-oxo-heptane-1,7-dioate-aldolase MEKYATMIKEKLNEGKVLCGVAVSLSDSVVSELIGISGYDFIWIEGEHGALDRKDIQQHMIAAHAGGAASLVRLVNSDPDLVKPIMDMGTDIICFPFINTVQDAQKAVAACTYPPNGIRGYNPQRASYYGNMNYFDYVKNANNETLKMMLIEQKAGYDNLEEIVKVEGIDIIALGPGDLSLDMGFSGYMNRIEIKDMISHAAEICKKYKMPFIIFPTIEKKSIEEWVNIGANMLCFAQDTTFITYVINQLLSFYNEIVPIQKQH |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019858_11 | 2605062-2605354 | TypeV-U4 |
NA:I-A
Consensus repeat of CP019858_11
|
4 spacers
spacers of CP019858_11
>11.1|2605092|35|CP019858|PILER-CR,CRT ACAATTATTAATTGTTTTATTAGTGAAATCACAGC >11.2|2605157|35|CP019858|PILER-CR,CRT ACGATAAAAGATGATTGATTACAAGCTTTGTTCAG >11.3|2605222|35|CP019858|PILER-CR,CRT ATTATTCAAAATAGGTAATTCCCATCTGGGAGCAA >11.4|2605287|38|CP019858|PILER-CR,CRT TCGCAAATCAGAAAATTCTTCAGACATTCGATAATAAA >11.5|2605092|36|CP019858|CRISPRCasFinder ACAATTATTAATTGTTTTATTAGTGAAATCACAGCA >11.6|2605157|36|CP019858|CRISPRCasFinder ACGATAAAAGATGATTGATTACAAGCTTTGTTCAGA >11.7|2605222|36|CP019858|CRISPRCasFinder ATTATTCAAAATAGGTAATTCCCATCTGGGAGCAAC >11.8|2605287|39|CP019858|CRISPRCasFinder TCGCAAATCAGAAAATTCTTCAGACATTCGATAATAAAA |
c2c9_V-U4 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019858_11
The CRISPR arrays of CP019858_11 >merge|CP019858|11|2605062-2605354|PILER-CR,CRT,CRISPRCasFinder AATTTTGAATCCACATAGTTAATCTAAAACACAATTATTAATTGTTTTATTAGTGAAATCACAGCAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACACGATAAAAGATGATTGATTACAAGCTTTGTTCAGAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACATTATTCAAAATAGGTAATTCCCATCTGGGAGCAACATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACTCGCAAATCAGAAAATTCTTCAGACATTCGATAATAAAAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >CP019858|11|9|2605062-2605354|PILER-CR AATTTTGAATCCACATAGTTAATCTAAAAC ACAATTATTAATTGTTTTATTAGTGAAATCACAGC AATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ACGATAAAAGATGATTGATTACAAGCTTTGTTCAG AATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ATTATTCAAAATAGGTAATTCCCATCTGGGAGCAA CATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TCGCAAATCAGAAAATTCTTCAGACATTCGATAATAAA AATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >CP019858|11|8|2605062-2605354|CRT AATTTTGAATCCACATAGTTAATCTAAAAC ACAATTATTAATTGTTTTATTAGTGAAATCACAGC AATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ACGATAAAAGATGATTGATTACAAGCTTTGTTCAG AATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ATTATTCAAAATAGGTAATTCCCATCTGGGAGCAA CATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TCGCAAATCAGAAAATTCTTCAGACATTCGATAATAAA AATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >CP019858|11|11|2605063-2605354|CRISPRCasFinder ATTTTGAATCCACATAGTTAATCTAAAAC ACAATTATTAATTGTTTTATTAGTGAAATCACAGCA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ACGATAAAAGATGATTGATTACAAGCTTTGTTCAGA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ATTATTCAAAATAGGTAATTCCCATCTGGGAGCAAC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TCGCAAATCAGAAAATTCTTCAGACATTCGATAATAAAA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC
>CP019858.1|AXU79875.1|2604719_2604872_-|hypothetical-protein MKNRRKDKRGFSVLLDKEKLDKFDEVLEEKNLTKKEWLEEKIDEELEQKE >CP019858.1|AXU79874.1|2604233_2604599_-|phage-related-regulatory-protein MKNELMMFEGKEIEVFEFEGRILFNSKDVANCLDIKNVNENIRLMNEKQVVKLRNSDISNTDIRKLNNAGENFLTESGVYKLIFKSRKEEAERFQGWISDEVLPSIRQTGAYINNNAIPKS >CP019858.1|AXU79873.1|2603784_2604237_-|prophage-antirepressor-related-protein MREKASEIEKLQLVYNSTSMLKELLDDAGFDNKSKLLTAKTLYKKAEIDLPIEINEEEHYFDTKQIASKLKIYSKSNKPAQMAVCEIIKKIDLEDGEVKGVWETNGSWTGTVNKYTKSVIDKVRTWIEENNRPTKIAGEKKNYHVFYKIE >CP019858.1|AXU79872.1|2603571_2603733_-|hypothetical-protein MCENLLDNMYIEKRKEEYRIKLLKIRETDIDIYNKLESIVYKLSEKKLEKNNK >CP019858.1|AXU79871.1|2602892_2603243_+|hypothetical-protein MDSIKSIQDIEIEQSRLKGQLQKNSNPIFALYISIMAVVFSTTINLTFDLSDITNYFIRMIMTLLFIVLLIFLVNKGILPIAIPYKNNIQFYTTALDVLEDMKKKILRERKYKKRR >CP019858.1|AXU79870.1|2602325_2602643_+|hypothetical-protein MDFGNINLILIGIIVIIGTTIIYLIKPKTAFCSKKYFNKLESIYGNIDKKKTVKLEVLYRYVTGLEYIAIGLFTRRLDITILAIILVAIITTALYYLIRKKYITI >CP019858.1|AXU79869.1|2601747_2601948_+|hypothetical-protein MYFKTYILKREVNNKQLEITRSFDLDNLICTATEILEDIEIDLIIIDEKNNVVWRNEKSTPAHENA >CP019858.1|AXU79868.1|2601315_2601729_+|hypothetical-protein MKVKSKRSFIVGIIVCMLCCASLVIYCILKDKRFLISSFLLIVIAIFNFCNAFSRKSIVEELHDSTDERDLYLTMKTSHILVKIMNYTLFTFTFLFIIAYSACKNQSLLVIAITLCVIEIFLFVAYLLINIFLEKKE >CP019858.1|AXU79867.1|2601098_2601332_+|transcriptional-regulator MKTKVREFRTNMGLTQQQLADLVHVSNRTIISIEKEQYSPSLMLAYRMAQVFGTTIEELCCLKENKEMEDKKHESKE >CP019858.1|AXU79866.1|2600541_2600880_-|regulatory-protein MKISKLPEVELKVMRYICEANKVLTSRELVAAMEEKYEWNESTTFTVLKRLERREFLSTEKIGKLTHYNILVKEKKYLRFETKEFLKNIHKNSISSLMSALHGKTTKWMKIN >CP019858.1|AXU79876.1|2605620_2606469_-|hypothetical-protein MWILVPIITIVLLIIAVSSMQYILVMIAFLLIIYSFIEKKIVMGLVSVLFFTYSIYLCATCEDKSLIADNKVETVKAQRETVEREKEMERRRIQEEVDKERYIEKHGMEISENDLKVKLEALVPQEYKGKKYELKVGKFKRYSMYFDLTVQNEKFSNSEECKKFVKEIANDLKKIKISKAYFKFHSKDDGGIYNSVYIDYFRNIQNNVDNVENLEFNEFELKTEEEEKREQEKIEQEKNSYNNYIQNRVVDPLDRIKKLKELLDSGAITQEEYNKKKKELLE >CP019858.1|AXU79877.1|2606736_2606889_-|hypothetical-protein MDNFLFNVLASVTASYIVYLISKLIKKVKSHSTAKSDLKIDINFKYHRKK >CP019858.1|AXU79878.1|2607162_2607495_-|hypothetical-protein MNDMARDVFSVKMTPLEAQKMVEKNLEADLISVDIYNLENNKSIIVTIFEKYYARSNSDAGLVVICENTTGKTLVKITSTGSAIGLFQIDWGTGNNLIKRVKKILIDYII >CP019858.1|AXU79879.1|2607521_2607791_-|hypothetical-protein MRGVFIENKDIKLTICIFAFVIGIIVLFCCIGLGQFNMDCIIKQNGGSIATEQYNIYLEQSISQYRNFGSILALLGGIGILFDKSVRKY >CP019858.1|AXU79880.1|2607924_2608356_-|transposase-like-protein-B MIRNRKLSRSISDVSWSEFIRQLEYKANWHGRQIVKVGKFFASSQICNKCGYKNEEVKDLNIREWIYPSCNETHDRDINASINILKEGLRLNCIQKLKWKPSEYMNLEVNERALAADSILIKIEDEEEAMKEAEREKKRGRRR >CP019858.1|AXU79881.1|2609054_2609246_-|repressor MKISKLPEAELKVMRYIWESEKVLISREITKSMEQKYEWKHTTIFTVLKRLLKKRVFRNGENR >CP019858.1|AXU79882.1|2609350_2609728_-|regulatory-protein MKEEILIEKLLRAELIVMEYLWKKDTLMPKKEIVKEIKQIYGWHKSTIKILLKRLVDKRYLDRYIINFQSYYKIIIDNKEYYTFKKKVLKSSKSIKIMHSLTTIHKNVSKEKLDLLDEYYRNLKE >CP019858.1|AXU79883.1|2610532_2611027_+|pilin-protein MKNKKGFTLVELLVVIAIIGILAIVALPALFKNIEKAKIAKLEADISAIKSASLSYYADESKYTDGGMISWVKKDGKIIINGGFKDDPLADKIENLGMPYNGSYLLMSSPGHEKYLELSILPEGEISKSGLDKLKSDYGSSIDIMNEQNKIDIVIKFLNDKSNT >CP019858.1|AXU79884.1|2612062_2612251_-|hypothetical-protein MTKYDFNFKLKIAKFYLNREGRDILIVKQYGVYNHSQVERWVNILGESELKIKNFSILYGSS >CP019858.1|AXU79885.1|2612412_2612763_+|hypothetical-protein MIQKKFFMGFCGFLGFLSLRYFSSGNVADLTYIGFFAFFSNFIIAKINGDKADERYVQDEKAAMAFTGQLAIIELFILWCITIVSRNIELMCVLLSITYAITLNVYAIKLYILEEK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019858_12 | 2770811-2770968 | Unclear |
NA
Consensus repeat of CP019858_12
|
2 spacers
spacers of CP019858_12
>12.1|2770838|39|CP019858|PILER-CR TACAAAATCTCCAACTTATAATTATTTTTGCTATGTACC >12.2|2770904|38|CP019858|PILER-CR CTCTATTTTTTCTATTATTATTTTATTTCCATCAAACC |
cas3,cas5,cas7,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019858_12
The CRISPR arrays of CP019858_12 >merge|CP019858|12|2770811-2770968|PILER-CR TGAAATCCACTTAGTTAATCTTAAACATACAAAATCTCCAACTTATAATTATTTTTGCTATGTACCTGAAACCCACTTAGTTAATCTTAAACCCTCTATTTTTTCTATTATTATTTTATTTCCATCAAACCTGAAACCCACTTAGTTAATCTTAAACC >CP019858|12|10|2770811-2770968|PILER-CR TGAAATCCACTTAGTTAATCTTAAACA TACAAAATCTCCAACTTATAATTATTTTTGCTATGTACC TGAAACCCACTTAGTTAATCTTAAACC CTCTATTTTTTCTATTATTATTTTATTTCCATCAAACC TGAAACCCACTTAGTTAATCTTAAACC
>CP019858.1|AXU80035.1|2769657_2770605_-|50S-ribosomal-protein-L11-methyltransferase MNNWIEVTIKTTTEAVEPITNILYEQGAGGAVIEDPKDFLFQKKNELDWDYVEEEVFKKNEEDDVLIKTYVSEEKNVMEFVEIIKQKVLGLKDFGIDIGEGSVSLDQVNEADWANAWKAYYKPTKVGQRVVVKPTWEDYAMQEGDLIIELDPGMAFGTGTHETTSMCIRELEKYVNKDSKVFDIGCGSGILAIAAAKLGAKEVVAVDLDEVAVKVAKENVLENKVEKSVSVMHGNLTDVIKDKADVIVANIIADIIKILAKDVQNFMKEDAIFISSGIILDKVEEVKESLIENGFEIVEVQKLGEWSAIVSKLKK >CP019858.1|AXU80034.1|2768880_2769639_-|16S-ribosomal-RNA-methyltransferase-RsmE MDRFFVEKNNINLQDKTCTIEGEDVKHISKVLRCKLGEKLEICDKNNNEYICEIMNIDKSIVNLEILEKVDINRESELKVRLYQGLPKAPKMEMILQKLTEVGVEEIILVQTKRSVVKVDDKKEDKKFERWERIIYEAAKQSKRGKIPKLRGVLSFKEALEDMKKNNVNICPYENERTVSIKHALKKCDSNIDSVGIFIGPEGGFSEEEIEQIQKNNCNVVSLGPRILRTETASVVASTIALYELSDLGGEK >CP019858.1|AXU80033.1|2767580_2768879_-|radical-SAM-superfamily-protein MKKVAFYTLGCKVNQYETEAMLELFEKDGYEQVNSEEYADVYVINTCTVTHMSDRKSRQYIRRVKKKNPDAIIAVVGCYSQVSPEEILDIEEVNLVMGTNDRRKIVEEIKNINSSKKVSTVDDIMKVKAFEEIEISQTNGKTRAFMKIQDGCDRFCTYCIIPYARGRVRSRDIDSIVDEVKKLANNGYKEVVLTGIHVASYGKDLKDRDIKLLDVIKQINQIEKIERIRLSSVEPILFTDEFVNEVLKMDKVCPHYHLSLQSGCDETLKRMNRRYTTLEYKTIVDRLRSKMPDVAITTDVIVGFPGETNEEFKKTYEFLKEIELSQMHIFKYSPRKGTPAATMENQVDPQMKHFRSEQLLNLSKVNFNKFATKFIGRELDVLFEQNIEGNKYEGLTSNYIRVVVESDKNIQGQILKVKINDVKDEYVEGILL >CP019858.1|AXU80032.1|2767187_2767538_-|histidine-triad-nucleotide-binding-protein MDCIFCKIANGEIPSTKVYEDDRVLAFNDLNPVAPYHILVVPKKHYDSLIDIPDKEMDIVSHIHVVINKIAKEKGFDQTGFRVINNCGSDGGQEVKHLHYHILAGKKLPNYEAGQN >CP019858.1|AXU80031.1|2766845_2767025_-|30S-ribosomal-protein-S21 MSEVRVRENETLDSALRRFKRQCAMSGIMSEVRKREHYDKPSVKRKKKAEAARRKNAKK >CP019858.1|AXU80030.1|2766372_2766816_-|tRNA-binding-protein MSLKQKLQEDLKSSMKNKDTVRKSVVTLIRASIKQYEVDNRVELDEDGIIDVIAKQLKQRRDALVEFEKAGREDLIKETEGEIEVLKEYLPQQLSEEELEEIVKSTISEVGATSMKDMGKIMSVIQPKVKGRADGKLINKLVKQNLQ >CP019858.1|AXU80029.1|2765764_2766262_-|sensory-protein MIISVKEIRNFLINIFIPLIIGYLSSILTMIISGTDISTYYLQLTKPSFAPPAFIFPIVWTILYILMGISSYLILRKGYNLPKVRDAIFYYGLQLVLNFIWSILFFGFGLRFTALIDIIIMILVSIIMISKFSKIDKRSGYINLIYLMWLVYAGFLNYFIWFINK >CP019858.1|AXU80028.1|2765008_2765572_-|sigma-54-modulation-protein MQIIVSGRQMKLTDGIKGYVDGKLSRLEKYLDPESEVKVTVSAKKDRQKVEVTIIPINGQIIRAEDVEDDLYAAIDIVCDKLSRQVVKYKTKVKDKVQNNKSIRFENLDFIDNSSEFDDYDYDDEEDENIVIERRKKFNVKPMSSEEAILQMELVGHNFYMFRNQDNFEINIVYKRKAGGYGLIEQD >CP019858.1|AXU80027.1|2764559_2764796_-|sporulation-protein-YqfC MLEISTDLQVNQPVITVTSNTFISIENYLSILEYEVDLIRIKTKVKTIKISGDKLSLKYITDSEIGIKGIIYNVEYVD >CP019858.1|AXU80026.1|2763203_2764547_-|stage-IV-sporulation-protein MISFIRGYYVIVVEGVGLEQFLNHLIRNGISVYNVTRIKNTKMEFHIDRQDIKEFKNVYRGSKFDIKVKQKTGVPFIIKRVYKHKGMWICALVSLFLLMSTSQFVTDVYIQSPEGIKKEALRNELYKVGVRPGVYKKSIDRKEVRDHMMSKFNDVAYLSINVKGTNIFVTVTKKAESLKSTDQSNYCNVIALKNGIIEKVIPRSGKSVIKSGDIVQKGDVLLNGANTKSIPEVWASTFYESTKKASYVDTVNKKTGEKKNIYTLSFYDKEFTMRKNIKYKDYVVENKEKKLSIGNYTFPIKIKTSTFYETKKVEVKRNKEELKKELSEKALKELEYIIPASARIIDVKHNFKVNKNMLEYLITVQTSENIAKIYPLSKSEAERFIKEESKPDEGEEEVPSNPEKRPLNDIRNEFDEDNKDNKDQNNSDENNSNQNSNNSQNNNSNNN >CP019858.1|AXU80036.1|2771110_2773519_-|ATP-dependent-helicase MKNIMQKEILAKSYNLRTNQQEQTLVEHIKDLFEVLESILELNLYSDKDVEILKICCALHDLGKINSIMQQKMEINNKISYSCSEEERKKLESDKKSLKKIARHNIFSGAFLKDILEKMNLSEEDKLYIYKSIMLHHGNYEDYMRLSISKVQEEIYEYIEKGILEKEEFNLKDIESYINSILNVDFKFGEDVLDYDYIDKLSESMFIDSDYNNGQIDDSVLNYRKFKYILYKGMLNLIDHSASSRQKGIKFYNDFTDEEIDNMILNEIYKSQGNLEKNNIEFNTIQKRLRELSGRNVLTVAFTGSGKTAADYRKTFKRKFFLVPNKISAESFYRKNIFQNKNDLDTRSSNDYIGLLHGDINLYSENEDNGEHDFVLTLRDIDLSINFCKPCVIATVDQLLLSMFKFPGYEKIFAAVKNASITVDEVHLLEPKMFLILIYFMQFACKYLDIDFHLMTATLPKSYKEQMINKGIIFQEESNENVTDKGEIVFIESNKEEEICEGKDVKVSFIKEKEIKSIVEDALENKQKILIIKNTIDSVNRTYEFLKENLSDKYGGVDIDVLHSRFKFKDKKEKYSKILNGEGDIWISTQSVEISLDLDFNIIISDLATMDSLIQRMGRCNRNNKYEYGNFYILPSEDKIYDNKLKNTTKNILKDILKTNSIFTMGIRKTILDDYYDNSVVKKYFEENFISCDKEIKNIYGVNKEIFDGLDLIFNFEPYKNIVDSKKEAAKIFRDVDVSYKIILEEDFYKEDRELQQDSIQVSGFIFNRLYYYGLISKVEGYMVLKSSSKFEYNSTVGLILK >CP019858.1|AXU80037.1|2773545_2774343_-|CRISPR-associated-protein-Cas5,-subtype-I-B/TNEAP MKVLQCKLKQPTAHYRDPKVFQNEYISTLNLPSKTTIMGMITYLCDRRLNSDIDIGIIGTHHHRELEFSRGENIDFWNEYTNMRKGKDKEKFLLQGNYYDYYKEHKAQNSILNYEVLKEVELTIFISCKDDEELEFIRKKLESPCKYANLGRKEDFAIPSEKGCFVKEVELKEVIPMNTRDAIKENIKLKNTYVRVDLRDKENVETIINQGVLIALPHKYKDLEANRDDRVYEFCHYIYVDNDGIYPKNIKVNVCIDTKEVFTWL >CP019858.1|AXU80038.1|2774358_2775372_-|CRISPR-associated-autoregulator,-Cst2-family MNEKRVKGVTLTILTESPVPLSYDQGYGNYTPIKKEQYREKIHAKTSIATITYDLRRMLHQEYGWNLSNIVFGKKGNIYPSIKKNVGCVDENGLETDVFGYLIPLKDKGSISKASPLRIIPFRSLNPYKGSTQLITNRGFLSSEFGRKYYDEKEENEVPRDENFPTSQALAIEETLSDYYVYTITLELDRIGVVEVEDGKLLLPEERKFMSKELREKAVKDILDAITVFTRNIKHSSVLLKPLAVIGGAFDKVVPFFWDDVDYNADSGEINLEGVIETIESYSLKESNTILAINDRLKISNKKELNKFNLSKYPVKEIKNLADRLEIGEDNMWYLKE >CP019858.1|AXU80039.1|2775391_2776867_-|hypothetical-protein MREIKAKFYRSGDIVRDIGIVYFYELLMDLKNELEKNDYKLKFTCELNRNYLSLESAEYIDPKYISDYILENQLFKVFKNGKKETLEKIFSNIDNLMYVNFIEELDKSSATAKQKEDIKKDFKNRRFPYVRNSGKYGLNTSLKNMETNVKRIVDTVIKSNIEIDEIDKLDLTQYEEKDSVCNVCNINKTTKLDIDLRERKDSKYNFLFRGAEKSGFKRSGQVESNICFECEFFNLMCLLYINLKRPMVFAYTNDLRELAFLNHKIMLKRKMYSDKSFYKKLLHEKISSIRLYRFDIDTNKGIILKFDSIIEYKELLKKIELIDIIDNYNFSREPGNTRNLGKRMIDNGNLSNLKELLLDNISVLKQSTGTSREMDFVSSSYNIGLYIKLCWIVDGGEEYKMKNYMESNLIYSRVGKDLFNKMTDESRRKNFSMKVIQLLKSNDRTQLFQTIMHVLVSNGILIGEGFVEGLMQSSELELNTNVGLFIQEIMK >CP019858.1|AXU80040.1|2776871_2777609_-|CRISPR-associated-Cas-family-protein MSRISIFMESCNGKFPNENSMLSVSFIKNILNAENKDFAKNIFNYGEERKNNKQIKDINTAIYIPNLIRSKNELLVDGDIIFNISFYNYSMFSKLYNGILKVKELEYKGYRFKIKNIKIHKEHEIKENGVIFKTMSPIIVKNKEGKYLDVEDSNYIECLNYIANLTLESIRGSGLRKPLEFIPINFKKRVLKEKIRGFKVREYYYINAYAGTFFLKGDMEDLNALYKMGIGYRRTENAGMVDILK >CP019858.1|AXU80041.1|2777866_2778976_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSEVILKNISKLYSNGFNAVKNINIDIKDKEFIVLVGPSGCGKSTTLRMIAGLEEISEGELYIGDKLVNNIEPKDRDIAMVFQNYALYPHLSVYENMAFALKLRKLPKDEIDKKVKEAAKILDLLPLLNKKPKTLSGGQRQRVALGRAIVRNPKVFLMDEPLSNLDAKLRTAMRTEITKLHQQLGTTFIYVTHDQVEAMTMADRIVVMKDGVVQQIATPQDVYDYPANIFVAGFIGAPQMNFIDVILIEENDEIYAQNEHIKLKLNKEKHYDLIKDNYINNEVVIGIRPEDIHVEDTFIKSNPDTCFKSRIEIKELMGAETYAHLKLGENTITIRFDSKNRINVGDDLTLSVDRSRIHIFDKETTLAIR >CP019858.1|AXU80042.1|2779005_2779773_+|sugar-diacid-utilization-regulator MEELKDFLERQLNKKINIYPYENQKLDASSHLVTFNNAIYVIDFLDKNNLDNLKGNFYLIYQSHIDFEYLKNIFYNLFEDINIIQHNGFFIVNSKYNLDINVTTQNIIETETYQSTYIFYLGELDSKADFDFRLQLCSDLLPHIIKDNAENKFLNLFDLIRYKTLDLINEDNILNKLIDFNKIKSIDEELLYTGIKFINNDLNISKTSTSMFLHRNTLVYRLEKINEILGFDLKNFENAMIFYLSVKSYFLYKKI >CP019858.1|AXU80043.1|2779960_2781334_-|transporter MGKTNARRTLFLIAIGSGTMLNPLNSSMISLALHSIQNDFHISFTTVSWIVSAFYLASAIAQPVSGKIGDLIGRKVLFLSGLMLVILSASIVPLVQSFFILIFIRVIQAIGTSTLYPSGVALIQNNIKERQSSALAVLTIFASTTAGLGPTLGGLLLDLGGWHAIFLVNIPVVLVSICLGYFLFPKEVKEKKSIKETLKNVLSRLDIIGILLFSIAMIFILLFLLSMKESFNLEQLVFGIILMCLFIWHELRTKLPFIDIKLFVSNPKLSKVYLQFIILNFFNYILFFGLPSYFQDALHYSAKSTGLFMLFMSGIGIFISPLTGKWIDKSGTRFPLVTSSIFMFISAVLLSVVFIHIPVIGKGIILSLAGISYGVGNVALQSSMFEESPRDSIGTASGLFQTSRYLGSILATVLLGMVFEVNITSEQFQILGYVMVVLGTISFLLNFILKKELRKVE >CP019858.1|AXU80044.1|2781369_2782305_-|glucokinase MYYIGVDIGGTGIQAGVVDNYGKIIFRSECKTVIEKGFEGILNDIKIMIYKLLEDNKLTMSDIKSIGFGVPGFINKEGLVTCVNLKWNKKAFNKELKRRFPDVEIHGENDATVAALGEAKFGSMKGANVGVLYTLGTGVGGGIVINQKVFSGAHGLGSEIGHQIIGENYFNCNCGNNGCVETFCSATAIIKYSQKLIEEGEKSRILDLAEGNLENVNAKMVFDAYRENDLVAIKVINRFKEYLAKTFANTINSLDPEIISIGGGISKSSDIILDGIEDLVRKFVLYKTEDIATITCATLGSDAGIIGAAFL >CP019858.1|AXU80045.1|2783270_2784425_-|chaperone-protein MSTKRDYYEVLGISKGAEAQEIKKAYRKLAMKYHPDRNPGDKEAEEKFKEINEAYEVLSDDTKRKTYDQFGHDGLNGQGGFGGQGGFGGQGFGGFEDMFGDIFGDMFGGSFGGGRARRRGPQRGADIRQSVTISFEEAAFGKKMSIKVNRSEECEECNGTGAKPGTSKKTCSTCNGTGQVRTVQRTPFGNIASSRPCSACNGTGEVIESPCSKCHGTGNTRKVKTIEVDIPAGIDDGQMIKLSGQGEVGEKGAPRGDLYIVVNVKSHPLFTRDGNDIYFEMPITFVQATLGDEIEVPTLDGKVKYSVPEGTQTGTVFRLKEKGIPRIRGNSRGDQYVKVVVEIPKKLNDKQKELLREFAKECGSNVHEKKKTFGQKIEDMFKKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP019858_13 | 2853197-2853753 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP019858_13
|
8 spacers
spacers of CP019858_13
>13.1|2853226|39|CP019858|CRISPRCasFinder TTGTGTTTATTGTGATAGTGCCGAACAGGTGTTAATACG >13.2|2853294|37|CP019858|CRISPRCasFinder ATGAACCTAAATTAAATGGTGATAGAGGGGAAATAAT >13.3|2853360|36|CP019858|CRISPRCasFinder ATCAGTTTTTTAGTCTATTATATTATAACTTTTGAA >13.4|2853425|37|CP019858|CRISPRCasFinder CAGAGATAGAAATTATTTTTATTATACGTTTTTTTAT >13.5|2853491|37|CP019858|CRISPRCasFinder AGATAACATACGTGATTATGATATTGCTTTTTCGTAT >13.6|2853557|36|CP019858|CRISPRCasFinder TATTTGAAGCTAACAGTAAGAAGTCTCAGATAATAA >13.7|2853622|38|CP019858|CRISPRCasFinder CTTATGCCCTAATGTAGTTTTATTACATTGTAAAATTT >13.8|2853689|36|CP019858|CRISPRCasFinder GTGACTATTATTATTAATATAGAATTTGAGACTAAA >13.9|2853226|40|CP019858|PILER-CR,CRT TTGTGTTTATTGTGATAGTGCCGAACAGGTGTTAATACGA >13.10|2853294|38|CP019858|PILER-CR,CRT ATGAACCTAAATTAAATGGTGATAGAGGGGAAATAATA >13.11|2853360|37|CP019858|PILER-CR,CRT ATCAGTTTTTTAGTCTATTATATTATAACTTTTGAAA >13.12|2853425|38|CP019858|PILER-CR,CRT CAGAGATAGAAATTATTTTTATTATACGTTTTTTTATG >13.13|2853491|38|CP019858|PILER-CR,CRT AGATAACATACGTGATTATGATATTGCTTTTTCGTATG >13.14|2853557|37|CP019858|PILER-CR,CRT TATTTGAAGCTAACAGTAAGAAGTCTCAGATAATAAG >13.15|2853622|39|CP019858|PILER-CR,CRT CTTATGCCCTAATGTAGTTTTATTACATTGTAAAATTTG >13.16|2853689|37|CP019858|PILER-CR,CRT GTGACTATTATTATTAATATAGAATTTGAGACTAAAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019858_13
The CRISPR arrays of CP019858_13 >merge|CP019858|13|2853197-2853753|CRISPRCasFinder,PILER-CR,CRT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTTGTGTTTATTGTGATAGTGCCGAACAGGTGTTAATACGATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACATGAACCTAAATTAAATGGTGATAGAGGGGAAATAATATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACATCAGTTTTTTAGTCTATTATATTATAACTTTTGAAATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAACCAGAGATAGAAATTATTTTTATTATACGTTTTTTTATGTTTACATTCCACATAGTTAATATAAAACAGATAACATACGTGATTATGATATTGCTTTTTCGTATGTTTACATTCCACATAGTTAATATAAAACTATTTGAAGCTAACAGTAAGAAGTCTCAGATAATAAGTTTACATTCCACATAGTTAATATAAAACCTTATGCCCTAATGTAGTTTTATTACATTGTAAAATTTGTTTACATTCCACATAGTTAATATAAAACGTGACTATTATTATTAATATAGAATTTGAGACTAAAGTTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC >CP019858|13|12|2853197-2853753|CRISPRCasFinder ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTGTGTTTATTGTGATAGTGCCGAACAGGTGTTAATACG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC ATGAACCTAAATTAAATGGTGATAGAGGGGAAATAAT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC ATCAGTTTTTTAGTCTATTATATTATAACTTTTGAA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC CAGAGATAGAAATTATTTTTATTATACGTTTTTTTAT GTTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC AGATAACATACGTGATTATGATATTGCTTTTTCGTAT GTTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC TATTTGAAGCTAACAGTAAGAAGTCTCAGATAATAA GTTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC CTTATGCCCTAATGTAGTTTTATTACATTGTAAAATTT GTTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC GTGACTATTATTATTAATATAGAATTTGAGACTAAA GTTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC >CP019858|13|11|2853198-2853753|PILER-CR TTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTGTGTTTATTGTGATAGTGCCGAACAGGTGTTAATACGA TTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC ATGAACCTAAATTAAATGGTGATAGAGGGGAAATAATA TTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC ATCAGTTTTTTAGTCTATTATATTATAACTTTTGAAA TTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC CAGAGATAGAAATTATTTTTATTATACGTTTTTTTATG TTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC AGATAACATACGTGATTATGATATTGCTTTTTCGTATG TTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC TATTTGAAGCTAACAGTAAGAAGTCTCAGATAATAAG TTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC CTTATGCCCTAATGTAGTTTTATTACATTGTAAAATTTG TTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC GTGACTATTATTATTAATATAGAATTTGAGACTAAAG TTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC >CP019858|13|9|2853198-2853753|CRT TTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTGTGTTTATTGTGATAGTGCCGAACAGGTGTTAATACGA TTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC ATGAACCTAAATTAAATGGTGATAGAGGGGAAATAATA TTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC ATCAGTTTTTTAGTCTATTATATTATAACTTTTGAAA TTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC CAGAGATAGAAATTATTTTTATTATACGTTTTTTTATG TTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC AGATAACATACGTGATTATGATATTGCTTTTTCGTATG TTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC TATTTGAAGCTAACAGTAAGAAGTCTCAGATAATAAG TTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC CTTATGCCCTAATGTAGTTTTATTACATTGTAAAATTTG TTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC GTGACTATTATTATTAATATAGAATTTGAGACTAAAG TTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC
>CP019858.1|AXU80101.1|2852347_2852731_-|regulatory-protein MLNKKLPDAELKIMKYIWNTGYKTVISKDVADEIEKTYAWKHTTIITLLARLTKKGFFISQRIGKHVHYRVLIKEKEYLKIEGKRIFGGLHNNPLSELISKLHDGEEITEEKIIEIGNWIKSWKDED >CP019858.1|AXU80100.1|2851174_2852170_+|L-asparaginase MSIKKKVAIVFTGGTISMTVDDKVGAAIPTLSGEQILSMVTNIDKVADVEVFNFDEIPGPHITPYRMMELKNYVNDLLARKDITGVVITHGTDSLEETAYFLDLTIDNIKPVIVTGAMRSSSELGYDGSSNLSASVCTAVSKDAMGKGVLVVLNNEVLLASEATKTNTLSLNTFKSLTSGPLGIIDCNELVLTRDIVNRTIIDTDKVESKVALFKAYVGENADFIRFAVDSGYKGIVIEAMGRGNIPPQMLSGVEYAREKGLPVVIVSRCHSGRVFDSYGYFGSGRDLKNLGCIFGGDLPGQKARIKLILALGKTDNLDEIKDFFEKGIYC >CP019858.1|AXU80099.1|2849425_2851054_+|aspartate-aminotransferase MKNHTYKEIKNIYGKISPFEFKDKLIDIAKYTAKENNRELLDAGRGNPNWTCSTAREAFFTFGHFAITETRSNWDLGHLAGMPQKKGIKERFFKFINENIDMPGAYLARDIINFGINELGFDGDEFVHELADGIIGDNYPLPDRMLPHMEKIVHDYLVQEMKYDISGKYGDVEIFAVEGATAAMCYIFDSLMANELLKKGDTIALMTPIFTPYLEIPNLPRYDFKVVNINANEVDEKGAHTWQYTKKELEKLRDKSIKALFVVNPNNPASIAMDETSCNNLIDVIENYNKDLMIISDDVYGTFVEDFSSLMSKLPYNTVGVYSYSKYFGVTGWRLGTFALHKKNVFDKKINDLTGELKKSVDKRYSDMSLNPSSLSFMERVVADSRLVALNHTAGLSTPQQVQMAFFSAFALIDKVDAYKKLNMSICHRRQKLLFEALELPINENKNNAAYYTQFDIEEWAKLNYGEDLFKFISKTASPVDVLYKLANDYSVVLLSGNGFYGPEWSIRISLANLYDEAYTKIGKAIREILNGYIVEWQKIKK >CP019858.1|AXU80098.1|2847549_2848767_-|threonine-dehydratase-catabolic MMNVTLTDVKEARETIKNIVKRTDLLESVKLSEKTGANVFYKCENLQKTGSFKLRGACNKIASLTDEEKANGVIASSAGNHAQGVALGAKMTGIKSTIVMPATAPLAKVSATKGYGAEVVLNGAVYDDAYAKAVEIQKETGATFLHPFNDKYVIAGQGTISLEIFEQLDNKVDTILCPVGGGGIISGVAVAAKALNPNVKIVGVQTANIPSMKESIKNGKVTTAFNDTTIADGIAVKTPGDLTFEIINELVDEIVVVEETEIAESILFMMESQKIVSEGAGAVCTAAILSGKYVPAKDENVVCIISGGNIDINTLYRIIGVALAKEGRRYSFSTIMEDKPGNFAELTRIISENGGNILSANQGKLSAGEALGKQSAEFILETIDYDHIARIKKAIEEKGFKIIEL >CP019858.1|AXU80097.1|2847074_2847455_-|translation-inhibitor-endoribonuclease MKHEVIHTNDAPAALGPYSQAIKAGNLLFVSGQVPLVPETMEVVEGDVQAQTAQSLKNLKAILAESGADFSNVVKTTVFIKDMNEFGAINEVYAEYFGENKPARACVEVARLPKDVKVEIEVIAVL >CP019858.1|AXU80096.1|2845472_2846288_-|transcriptional-antiterminator MRVVKIFNNNALSTVTNDRKEAILLGLGIGFNKRPGDKVNEDKIEKIYYVQDHMQTKFLELLKNVSPEVMDASQQIISLIPGNEGKFNNKGILSLVEHISFAIDRMKNNVFLPNLMLLDIKMMYSKEFELGVKALEIIYRVCHIHLPEDEAGYIALHFVNLQSNDNLAYDTLKFVKGSIDLIKECYGLELDESSLSTLRFRTHLKFLAQRIFKNEICQDDKMIEMYDYLINNHPKNKEYLEKLNVYIEKEFRYKLDKPEKIYLLLHLTKIL >CP019858.1|AXU80095.1|2843871_2845422_-|PTS-system-transporter-subunit-IIBC MKEKLLGGLETFAKAMVQPLMYLSSAGILMVVGVLLTNDMLLGVLPFFKWEPIQIFGSLIYNCIMAIINNLAVIFAIGIPAALAKKEKHKAALIGFMSYIIYLTASNTMLTSLGQLAKESKMLGLIGTGQATILGIQVVDTSVFGGIILGCIAGYVFNRTSNKTFKGALQIYSGANFSFICMFFVSILIGVVSNFIWPLAQQGIASLANVIKDTGTFGLFLYGFLERILVPTGLHHLIYTPFQFSDLGGVLKVGADTVSGAYAIVMTEMNLPVERFSDSIYYMATGFTKMFGYIGIGAAFIYTAYKQNKKKVKATIIPLIITAVLASVTEPLDFMFVFCAPLLFFVHAVIAGLFIALLKIFDVTALCGGNLLVSIIMNTTVGVEKTHWPVMMILGLAQIIVYFVVFSFLIKKFNYKTPGREDESTATGEEQSKQLNLDAGIENIIDGLGGKENINTVENCITRLRVNVKDESKINEDIINLTPNSGIVRKGKDIQIIFGLHVHEVRRAVEDFLEAY >CP019858.1|AXU80094.1|2842422_2843775_-|6-phospho-alpha-glucosidase MIITIVGGGSTFTPGIVKSIALREKELELEEIRLFDIDKERQDKVAVVVNWILKEDVKTDVKLTVTNCEKEAYTDATFIFAQMRVGKYEMREQDEKIPLKYGCVGQETCGCGGMAYGLRTIQPMIKVIDDVEKYAKKDYWILNYSNPAAIVSEACRKLRPNARIINICDMPIAIIDMIAGSLNINDVHNIRYDYFGLNHFGWFTSIDYKHRDLIEEIKEYIKENKILLPKSYIENLNKSRSTGNRHAVSSWIHVWESVYTMLESFPKYLPNTYLTYYLLSKETVEHSNINRTRANEVMESREKDLFEGVRHYLETGEISEKAFYAGSHGDWISDLAVSIKNDTRSRFLVITENRGAIPNMPYDAMVEIPAYIGKDGPEVIARGPIPLFQQGLMMQQLNSEKLIVEAYIENSYEKALQAFTLNKTIPSMNVAKEILDEMIEVNKEYWPELR >CP019858.1|AXU80093.1|2841533_2842247_-|AraC-family-transcription-regulator MITNNLEADTHSHCMLQLFLGIEDSIEITVNEKLVKCNCIIVDKNISHSFSARKKVYYSAIIEPTSIYAEQLTSKMNDFGYWICDNDGLEKLRQQGTFLIDNSSKEQYLRFMEMLNNYLNIPITLKHYDDRITELLNLLRTCNCDNHTISSFADKVSLSASRLSHLFKEQIGIPLKSYILFHQMECAFRELLSGKNVTEASMTAGFDTPSHFAGTVKRMMGMPVSLSLKDSEFLKVY >CP019858.1|AXU80092.1|2840767_2841487_-|transglutaminase-domain-containing-protein MNKEYLEETKMLNYNEPQLKLLVSSKNWLELDDFHKIKSIYEFVQNDILFGYNASDMLSATQVLNDGMGQCNTKATLLMALLRAVNIPCRLHAFDVTKDFQRGATSKLISLLAPKYILHTWVEVFYQDRWIALEGVITDKKYLEAIQKKFFNHGGTFKKYAIATNDLKNTSIDWDGKDTFIQKEAIVYDYGIFPSPDVFFSTHSQHMSKLKNFIYVHLIRKIMTKNVCKARNNYIDKNE >CP019858.1|AXU80102.1|2854038_2854197_-|hypothetical-protein MDNFLQGILASLSASLIVYIASKLFRKRKKPLKAATKSGWEFDLKIRFHKTK >CP019858.1|AXU80103.1|2854555_2855926_-|cell-surface-protein MKLKKLLSLGLVSMFVVGFPISANALDKIDKIQGADKYETAGIIADKQSYTTAILINADSTMADGLSASGLAGATNAPILLTKKNNIPNATLKRVEKAKKVYIIGGESSIDKATETFLKDKGIEIRRLQGNDRIKTSYNVAKEINSINKANKVILTNAFKGEPDAMSIASVAVRDKAPIILTDGKSVPFNTTGIESYAIGGTSSMSDSLVNDTNSTRLGGVDRYDTNKKIVNKFYNGAKEFYIASGTDLVYALVGSPMAKNNPIVLVDIGSNKDILKNAAKVTGIGNLSDKIMLECENTINNISLPSSNKNIICGLKIDFDSNHIIWQDKGSYLECYDDNLEYYTEKYKDPTVPINIENTSTQNLDVTKLKVYGEANSTLYMGQYAKIKMDFNSFGVLKPGEKCTIYLDIISLDPSRSMTLTFSYVGDKENYKYEQGLASRILFYNPDGEDFFEYK >CP019858.1|AXU80104.1|2856139_2857258_+|integrase MNIKSAFIRKRGEKFYVYVEYIEETTGKIKQKSYGSYEKKKDAEKHLIEIKSTINNNKFVAPKDMTFVERCYKYIDMNKNNWSPYTVTNTKSWVKNYIEPFFKNLKLTEVNPSSVQAFVNYNFNNSTFTSAKVRYSFLSSVIREAYRLREIQENSCDFIKLPSKEKYSTNEIYNREEVLLLIEKLLGNNIEIPILLMLLLGLRMGEATGLRWSDVDLDNNLINVNQILVYSNGKISFKEPKTPKSKRALSAPKELIEKLKIEKLRQSKLKLQGILENKNNLVCLNTNLNPFLPSSLRKTFHNFTKKNNLKKIRIHDLRHTSATLLLLGGTNMKVVSERLGHTDIKITMNRYSHVLKEMDKEASDNLSELLFK >CP019858.1|AXU80105.1|2857574_2858243_-|vanZF-protein MEIVTNNQSGVEIQLSLFEAIKDLLLINPIFLLGIILIGIFLVVIFKKNSDIPKVKTSILSLAMYYYLCLTLSHIVGIPTFSEYIRLSQLGETFFNPNINLIPFSDGFSLSFILNILLFVPLGFLCPLISKTFERLRNTFLIGFGLSLFIETIQLFTLHRATDIDDLLTNVIGTIIGYFCFKLIAKLRIVKLHSDDDSMEQDYTVCIPIAIIIVALILGFFS >CP019858.1|AXU80106.1|2859093_2861514_-|leucyl-tRNA-synthetase MSVYNFKEVESKWQKIWKDNNQYKMDTAQTEKPNYYTLEMFPYPSGKIHMGHVRNYSIGDVVARFKKMEGYNVLHPMGWDSFGLPAENAAIKHGIHPHKWTMENIEEMKEQLNLLGISYDWDKEVATSTPEYYRFTQEIFLKFLEHGLAYKKKSYVNWCPSCETVLANEQVVQGACERCKATVLKKDLEQWYFKTTEFAEELLNDLDTLDGWPEKVKTMQKNWIGKSTGADLVFDIDGTDKSMTVFTTRPDTTYGVTYMVLAPEHELVKELVAGTEYEADVEAFVQKMHTMTEIERTAADVEKEGMFIGRYVINPLNGKKVPLWIANYVLVEYGTGAIMAVPAHDERDRDFAEKYNLDIIDVITEDNKMINSEEFNGLDASEGFEGIIDKLEKEGRGKRTINYRLRDWLVSRQRYWGCPIPVVYCDECGIVPVKKEDLPVLLPTDVEFTGKGESPLTTSKQFMSTTCPHCGKPARREVDTMDTFVDSSWYFLRYVDSNNENEPFSKELVNRWHPVDQYIGGVEHAIMHLLYARWFVKAFKSMGMVDFNEPFKNLLTQGMVLMDGSKMSKSKGNTVSPMDIIDEYGADTARLFVLFAAPPERDLDWSEQGVDGCFRFLNRVYRLVDELADVVKKDVEFGELNSQDKDMRYTIHSTLKKVTADLSEKFGFNTAISALMELINDMYKYKELDNINEAVIKEGVQTIVTIIAPFAPHLGEELWTMIGKEGSVFDIDWPKYDEKALVKDEIEVVVQVNGKVRGKLTVNSNISKDEMEKVALEDEKIKGLVEGKTIVKVVAVPKKLVNIVVK >CP019858.1|AXU80107.1|2861867_2862218_-|iojap-family-protein MTVEQMTKIAYDAIEDKLGQDTVIINIGKVSSLCDYFIITTASSQRQVKAIADNVEDELSKLGLEPRGKEGQGTQTWVLLDYGDIMVHVFNEENRGFYNLEKLWKDAPYIDIDTLA >CP019858.1|AXU80108.1|2862334_2862907_-|metal-dependent-phosphohydrolase MNLENINQRLNQMLPVGRLSHSKNVAKCAEKLCEIYGCDKEKAYLAGMIHDCAKYLSDKEIEDYVNKYEIYLDPIEDGNRSLSHSVIGAYICEYEFEVEDEDIINAIKYHTTGREDMSLLEKIIYIADLIEEGRKFPVVDTLRELAYGGKLDEALLTSFNNTLMFVINKKEEIHPRTVMARNYLIKEKLL >CP019858.1|AXU80109.1|2862907_2863597_-|nicotinate-nucleotide-adenylyltransferase MRSENLVKMAELKNTEKLEKFNRHKGKIKIGILGGTFDPIHYAHLATAEFIRDKYDIDKIIFIPSGNPPHKLCITTDKYDRYNMTLLATESNEDFLVSKVEIERKKRTYTIDTLKYLKKKYKNADIYFITGADAICSVEEWKDVKKNFELATFIAATRPGISLLRSQETIEKLTKKYNADIITVYVPSLDISSTYIREQLNEGKSIRYLVPENVENYLYENKLYQYGDD >CP019858.1|AXU80110.1|2863872_2864511_+|recombination-regulator-RecX MGIITKIEQQKRNDDRVNIYVDDKFFIAIFKELVYTFNLKKGNEINEEELKPILDDEMYIKAKNKALNILSHADQSEKKLKEKLSSEFDENIIERVIDFLKSYNLVNDSVLAQKIVNTNVNLNKCGKNRIKQNLYNKGINRSTINEAVSELDKDTEFENAMYLAKKRYERVKKEDKKKIYQKISQHLSYKGFDYDIIKRVLNKLLNFDEYDI >CP019858.1|AXU80111.1|2864663_2866667_+|glycogen-branching-protein MKSQKRFKILDIDVYLQPFESDIKKRMKHYEDMKSKTLKNYKDFSSFANAHLYYGFHQTNDGFFYREWAPNADSLSLIGDFNNWNRKSHPLRKIGSGNWEIFIPGQNSLPHKSEVKVQVTANGKTFDRIPLYIKRVIQKDFGGFNGQIWQPKTPFIWTDNNFDLKNITSPLIYECHIGMSTESESIGTYNEFTEKILPKIKKAGYNTIQLMAIMEHPYYASFGYQVSNFYAISSRFGTPEDLKNLINTAHSMGIAVLLDLVHSHAVKNTLEGINEFDGSEHQFFHSGSKGNHPAWGTKLFNYGKPEVIHFLLSNIKFWLNEYHFDGFRFDGVTSMLYHNHGLGVSFDSYEKYFSMNTDIEAITYLQFANELIKEIKPNSISIAEDMSGMPGMCIPIKDGGIGFDYRLAMGVPDFWIKTISNLSDEDWDLGKMWYELTTRRPGEKNIGYCESHDQALVGDKTIIFWLADKEMYWNMEINSNNHVINRAMSLIKLIKLITFSLAGEGYLNFMGNEFGHPEWIDFPREGNNWSYKYARRQWSLSEDNNLKYKQLLSFDKSMLELTKYSDIFIQNSHELIHMDNDKKILVYSKGKYLFIFNFHPNLIQSVDISKFQNTNYKTILNTDMVEFGGNTKKENLRDYDVYFSSTPPSSKMPIASRTAIVLLDNGI |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019858_1 | 1.1|17743|34|CP019858|CRISPRCasFinder | 17743-17776 | 34 | CP019858.1 | 31977-32010 | 0 | 1.0 |
CP019858_1 | 1.1|17743|34|CP019858|CRISPRCasFinder | 17743-17776 | 34 | CP019858.1 | 125978-126011 | 0 | 1.0 |
CP019858_1 | 1.1|17743|34|CP019858|CRISPRCasFinder | 17743-17776 | 34 | CP019858.1 | 395387-395420 | 0 | 1.0 |
CP019858_1 | 1.1|17743|34|CP019858|CRISPRCasFinder | 17743-17776 | 34 | CP019858.1 | 1094769-1094802 | 0 | 1.0 |
CP019858_1 | 1.1|17743|34|CP019858|CRISPRCasFinder | 17743-17776 | 34 | CP019858.1 | 3097088-3097121 | 0 | 1.0 |
CP019858_3 | 3.1|148885|34|CP019858|CRISPRCasFinder | 148885-148918 | 34 | CP019858.1 | 31977-32010 | 0 | 1.0 |
CP019858_3 | 3.1|148885|34|CP019858|CRISPRCasFinder | 148885-148918 | 34 | CP019858.1 | 125978-126011 | 0 | 1.0 |
CP019858_3 | 3.1|148885|34|CP019858|CRISPRCasFinder | 148885-148918 | 34 | CP019858.1 | 395387-395420 | 0 | 1.0 |
CP019858_3 | 3.1|148885|34|CP019858|CRISPRCasFinder | 148885-148918 | 34 | CP019858.1 | 1094769-1094802 | 0 | 1.0 |
CP019858_3 | 3.1|148885|34|CP019858|CRISPRCasFinder | 148885-148918 | 34 | CP019858.1 | 3097088-3097121 | 0 | 1.0 |
CP019858_19 | 19.3|3706212|22|CP019858|CRT | 3706212-3706233 | 22 | CP019858.1 | 3706023-3706044 | 0 | 1.0 |
CP019858_1 | 1.1|17743|34|CP019858|CRISPRCasFinder | 17743-17776 | 34 | CP019858.1 | 4077635-4077668 | 1 | 0.971 |
CP019858_3 | 3.1|148885|34|CP019858|CRISPRCasFinder | 148885-148918 | 34 | CP019858.1 | 4077635-4077668 | 1 | 0.971 |
CP019858_19 | 19.3|3706212|22|CP019858|CRT | 3706212-3706233 | 22 | CP019858.1 | 3705978-3705999 | 1 | 0.955 |
CP019858_19 | 19.3|3706212|22|CP019858|CRT | 3706212-3706233 | 22 | CP019858.1 | 3705465-3705486 | 2 | 0.909 |
CP019858_20 | 20.2|3872322|25|CP019858|CRT | 3872322-3872346 | 25 | CP019858.1 | 3705627-3705651 | 2 | 0.92 |
CP019858_20 | 20.2|3872322|25|CP019858|CRT | 3872322-3872346 | 25 | CP019858.1 | 3705816-3705840 | 2 | 0.92 |
CP019858_20 | 20.6|3872511|25|CP019858|CRT | 3872511-3872535 | 25 | CP019858.1 | 3705591-3705615 | 2 | 0.92 |
1. spacer 1.1|17743|34|CP019858|CRISPRCasFinder matches to position: 31977-32010, mismatch: 0, identity: 1.0
aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer **********************************
2. spacer 1.1|17743|34|CP019858|CRISPRCasFinder matches to position: 125978-126011, mismatch: 0, identity: 1.0
aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer **********************************
3. spacer 1.1|17743|34|CP019858|CRISPRCasFinder matches to position: 395387-395420, mismatch: 0, identity: 1.0
aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer **********************************
4. spacer 1.1|17743|34|CP019858|CRISPRCasFinder matches to position: 1094769-1094802, mismatch: 0, identity: 1.0
aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer **********************************
5. spacer 1.1|17743|34|CP019858|CRISPRCasFinder matches to position: 3097088-3097121, mismatch: 0, identity: 1.0
aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer **********************************
6. spacer 3.1|148885|34|CP019858|CRISPRCasFinder matches to position: 31977-32010, mismatch: 0, identity: 1.0
aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer **********************************
7. spacer 3.1|148885|34|CP019858|CRISPRCasFinder matches to position: 125978-126011, mismatch: 0, identity: 1.0
aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer **********************************
8. spacer 3.1|148885|34|CP019858|CRISPRCasFinder matches to position: 395387-395420, mismatch: 0, identity: 1.0
aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer **********************************
9. spacer 3.1|148885|34|CP019858|CRISPRCasFinder matches to position: 1094769-1094802, mismatch: 0, identity: 1.0
aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer **********************************
10. spacer 3.1|148885|34|CP019858|CRISPRCasFinder matches to position: 3097088-3097121, mismatch: 0, identity: 1.0
aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer **********************************
11. spacer 19.3|3706212|22|CP019858|CRT matches to position: 3706023-3706044, mismatch: 0, identity: 1.0
tgttattccatttgctccggtt CRISPR spacer tgttattccatttgctccggtt Protospacer **********************
12. spacer 1.1|17743|34|CP019858|CRISPRCasFinder matches to position: 4077635-4077668, mismatch: 1, identity: 0.971
aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer aaactgaacgtatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer **********.***********************
13. spacer 3.1|148885|34|CP019858|CRISPRCasFinder matches to position: 4077635-4077668, mismatch: 1, identity: 0.971
aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer aaactgaacgtatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer **********.***********************
14. spacer 19.3|3706212|22|CP019858|CRT matches to position: 3705978-3705999, mismatch: 1, identity: 0.955
tgttattccatttgctccggtt CRISPR spacer tgttactccatttgctccggtt Protospacer *****.****************
15. spacer 19.3|3706212|22|CP019858|CRT matches to position: 3705465-3705486, mismatch: 2, identity: 0.909
tgttattccatttgctccggtt CRISPR spacer tgctactccatttgctccggtt Protospacer **.**.****************
16. spacer 20.2|3872322|25|CP019858|CRT matches to position: 3705627-3705651, mismatch: 2, identity: 0.92
tgttgctccatctgctcctgttgga CRISPR spacer tgttgctcctactgctcctgttgga Protospacer ********* **************
17. spacer 20.2|3872322|25|CP019858|CRT matches to position: 3705816-3705840, mismatch: 2, identity: 0.92
tgttgctccatctgctcctgttgga CRISPR spacer tgttgctcctactgctcctgttgga Protospacer ********* **************
18. spacer 20.6|3872511|25|CP019858|CRT matches to position: 3705591-3705615, mismatch: 2, identity: 0.92
tgttggacctgctactccatctgct CRISPR spacer tgttggacctactgctccatctgct Protospacer **********.**.***********
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019858_2 | 2.1|141460|29|CP019858|CRISPRCasFinder | 141460-141488 | 29 | NZ_CP033215 | Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence | 5105-5133 | 0 | 1.0 |
CP019858_4 | 4.4|1342150|38|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342150-1342187 | 38 | NZ_CP020426 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence | 460-497 | 0 | 1.0 |
CP019858_4 | 4.4|1342150|38|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342150-1342187 | 38 | NZ_CP029155 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence | 43697-43734 | 0 | 1.0 |
CP019858_4 | 4.4|1342150|38|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342150-1342187 | 38 | CP011970 | Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence | 121503-121540 | 0 | 1.0 |
CP019858_4 | 4.4|1342150|38|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342150-1342187 | 38 | LN681537 | Clostridium phage phiCD211, complete genome | 130365-130402 | 0 | 1.0 |
CP019858_5 | 5.4|1546110|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1546110-1546145 | 36 | NZ_CP029156 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed2, complete sequence | 31024-31059 | 0 | 1.0 |
CP019858_5 | 5.4|1546110|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1546110-1546145 | 36 | NZ_CP029153 | Clostridioides difficile strain CDT4 plasmid unnamed1, complete sequence | 25068-25103 | 0 | 1.0 |
CP019858_7 | 7.7|1753360|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1753360-1753396 | 37 | NZ_CP020425 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence | 20734-20770 | 0 | 1.0 |
CP019858_7 | 7.7|1753360|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1753360-1753396 | 37 | FN668942 | Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence | 19379-19415 | 0 | 1.0 |
CP019858_7 | 7.7|1753360|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1753360-1753396 | 37 | NZ_CP011969 | Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence | 16056-16092 | 0 | 1.0 |
CP019858_9 | 9.11|1906764|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1906764-1906800 | 37 | JX145342 | Clostridium phage phiMMP04, complete genome | 30188-30224 | 0 | 1.0 |
CP019858_9 | 9.12|1906830|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1906830-1906865 | 36 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 19460-19495 | 0 | 1.0 |
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CP019858_10 | 10.4|2263596|37|CP019858|CRISPRCasFinder | 2263596-2263632 | 37 | FN668942 | Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence | 8942-8978 | 0 | 1.0 |
CP019858_10 | 10.4|2263596|37|CP019858|CRISPRCasFinder | 2263596-2263632 | 37 | NZ_CP011969 | Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence | 5619-5655 | 0 | 1.0 |
CP019858_10 | 10.4|2263596|37|CP019858|CRISPRCasFinder | 2263596-2263632 | 37 | NZ_CP029156 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed2, complete sequence | 37326-37362 | 0 | 1.0 |
CP019858_10 | 10.4|2263596|37|CP019858|CRISPRCasFinder | 2263596-2263632 | 37 | NZ_CP029153 | Clostridioides difficile strain CDT4 plasmid unnamed1, complete sequence | 31370-31406 | 0 | 1.0 |
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CP019858_4 | 4.5|1342217|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342217-1342252 | 36 | NC_028996 | Clostridium phage phiCDHM19, complete genome | 14837-14872 | 1 | 0.972 |
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CP019858_4 | 4.6|1342282|39|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342282-1342320 | 39 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 38702-38740 | 1 | 0.974 |
CP019858_4 | 4.6|1342282|39|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342282-1342320 | 39 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 38229-38267 | 1 | 0.974 |
CP019858_4 | 4.6|1342282|39|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342282-1342320 | 39 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 38382-38420 | 1 | 0.974 |
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CP019858_5 | 5.4|1546110|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1546110-1546145 | 36 | FN668942 | Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence | 15242-15277 | 1 | 0.972 |
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CP019858_5 | 5.4|1546110|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1546110-1546145 | 36 | HG796225 | Clostridium phage phiCDHM13 complete genome | 15247-15282 | 1 | 0.972 |
CP019858_5 | 5.4|1546110|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1546110-1546145 | 36 | HG798901 | Clostridium phage phiCDHM11 complete genome | 15246-15281 | 1 | 0.972 |
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CP019858_9 | 9.14|1906960|35|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1906960-1906994 | 35 | MF547663 | Clostridioides phage LIBA2945, complete genome | 120380-120414 | 1 | 0.971 |
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CP019858_9 | 9.15|1907024|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1907024-1907060 | 37 | NZ_CP016319 | Clostridioides difficile strain 630 delta erm plasmid pCD630, complete sequence | 5455-5491 | 1 | 0.973 |
CP019858_9 | 9.15|1907024|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1907024-1907060 | 37 | NZ_MG266000 | Clostridioides difficile strain 7032985 plasmid pCD-ISS1, complete sequence | 2559-2595 | 1 | 0.973 |
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CP019858_9 | 9.18|1907221|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1907221-1907256 | 36 | NC_007917 | Clostridium phage phi CD119, complete genome | 30780-30815 | 1 | 0.972 |
CP019858_9 | 9.18|1907221|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1907221-1907256 | 36 | NC_028996 | Clostridium phage phiCDHM19, complete genome | 34456-34491 | 1 | 0.972 |
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CP019858_4 | 4.2|1342018|38|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342018-1342055 | 38 | NC_007917 | Clostridium phage phi CD119, complete genome | 30892-30929 | 2 | 0.947 |
CP019858_4 | 4.2|1342018|38|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342018-1342055 | 38 | NC_028996 | Clostridium phage phiCDHM19, complete genome | 34568-34605 | 2 | 0.947 |
CP019858_7 | 7.5|1753227|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1753227-1753263 | 37 | NZ_MG973074 | Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence | 84907-84943 | 2 | 0.946 |
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CP019858_8 | 8.3|1754254|38|CP019858|PILER-CR,CRT | 1754254-1754291 | 38 | NZ_CP029153 | Clostridioides difficile strain CDT4 plasmid unnamed1, complete sequence | 16397-16434 | 2 | 0.947 |
CP019858_8 | 8.3|1754254|38|CP019858|PILER-CR,CRT | 1754254-1754291 | 38 | NZ_CP020425 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence | 24392-24429 | 2 | 0.947 |
CP019858_8 | 8.3|1754254|38|CP019858|PILER-CR,CRT | 1754254-1754291 | 38 | FN668942 | Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence | 23037-23074 | 2 | 0.947 |
CP019858_8 | 8.3|1754254|38|CP019858|PILER-CR,CRT | 1754254-1754291 | 38 | NZ_CP011969 | Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence | 19714-19751 | 2 | 0.947 |
CP019858_8 | 8.8|1754255|37|CP019858|CRISPRCasFinder | 1754255-1754291 | 37 | NZ_CP029156 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed2, complete sequence | 22353-22389 | 2 | 0.946 |
CP019858_8 | 8.8|1754255|37|CP019858|CRISPRCasFinder | 1754255-1754291 | 37 | NZ_CP029153 | Clostridioides difficile strain CDT4 plasmid unnamed1, complete sequence | 16397-16433 | 2 | 0.946 |
CP019858_8 | 8.8|1754255|37|CP019858|CRISPRCasFinder | 1754255-1754291 | 37 | NZ_CP020425 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence | 24393-24429 | 2 | 0.946 |
CP019858_8 | 8.8|1754255|37|CP019858|CRISPRCasFinder | 1754255-1754291 | 37 | FN668942 | Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence | 23038-23074 | 2 | 0.946 |
CP019858_8 | 8.8|1754255|37|CP019858|CRISPRCasFinder | 1754255-1754291 | 37 | NZ_CP011969 | Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence | 19715-19751 | 2 | 0.946 |
CP019858_8 | 8.17|1754847|37|CP019858|CRISPRCasFinder | 1754847-1754883 | 37 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 9965-10001 | 2 | 0.946 |
CP019858_8 | 8.18|1754913|36|CP019858|CRISPRCasFinder | 1754913-1754948 | 36 | NZ_MG973074 | Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence | 22132-22167 | 2 | 0.944 |
CP019858_8 | 8.26|1754912|37|CP019858|CRT | 1754912-1754948 | 37 | NZ_MG973074 | Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence | 22132-22168 | 2 | 0.946 |
CP019858_8 | 8.28|1754857|36|CP019858|PILER-CR | 1754857-1754892 | 36 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 9966-10001 | 2 | 0.944 |
CP019858_9 | 9.11|1906764|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1906764-1906800 | 37 | NC_048665 | Clostridium phage phiCDHM14, complete genome | 31212-31248 | 2 | 0.946 |
CP019858_9 | 9.11|1906764|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1906764-1906800 | 37 | NC_028838 | Clostridium phage phiCD506, complete genome | 32299-32335 | 2 | 0.946 |
CP019858_9 | 9.11|1906764|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1906764-1906800 | 37 | HG796225 | Clostridium phage phiCDHM13 complete genome | 32162-32198 | 2 | 0.946 |
CP019858_9 | 9.11|1906764|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1906764-1906800 | 37 | LN681538 | Clostridium phage phiCD481-1, complete genome | 31893-31929 | 2 | 0.946 |
CP019858_9 | 9.11|1906764|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1906764-1906800 | 37 | MK473382 | Clostridium phage JD032, complete genome | 1046-1082 | 2 | 0.946 |
CP019858_9 | 9.16|1907090|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1907090-1907125 | 36 | MF547662 | Clostridioides phage LIBA6276, complete genome | 123179-123214 | 2 | 0.944 |
CP019858_9 | 9.16|1907090|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1907090-1907125 | 36 | MF547663 | Clostridioides phage LIBA2945, complete genome | 121442-121477 | 2 | 0.944 |
CP019858_10 | 10.1|2263596|36|CP019858|PILER-CR,CRT | 2263596-2263631 | 36 | KX905163 | Clostridioides phage phiSemix9P1, complete genome | 12040-12075 | 2 | 0.944 |
CP019858_11 | 11.1|2605092|35|CP019858|PILER-CR,CRT | 2605092-2605126 | 35 | NZ_MG973074 | Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence | 22132-22166 | 2 | 0.943 |
CP019858_11 | 11.5|2605092|36|CP019858|CRISPRCasFinder | 2605092-2605127 | 36 | NZ_MG973074 | Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence | 22132-22167 | 2 | 0.944 |
CP019858_19 | 19.1|3706113|22|CP019858|CRT | 3706113-3706134 | 22 | MG592608 | Vibrio phage 1.243.O._10N.261.54.B5, partial genome | 11275-11296 | 2 | 0.909 |
CP019858_20 | 20.3|3872367|34|CP019858|CRT | 3872367-3872400 | 34 | NZ_CP009336 | Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence | 130617-130650 | 2 | 0.941 |
CP019858_20 | 20.3|3872367|34|CP019858|CRT | 3872367-3872400 | 34 | NZ_CP009336 | Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence | 130644-130677 | 2 | 0.941 |
CP019858_20 | 20.5|3872466|25|CP019858|CRT | 3872466-3872490 | 25 | MN694345 | Marine virus AFVG_250M178, complete genome | 24243-24267 | 2 | 0.92 |
CP019858_20 | 20.5|3872466|25|CP019858|CRT | 3872466-3872490 | 25 | MN694528 | Marine virus AFVG_250M165, complete genome | 24363-24387 | 2 | 0.92 |
CP019858_20 | 20.13|3872913|22|CP019858|CRT | 3872913-3872934 | 22 | NZ_CP053689 | Arthrobacter citreus strain NEB 577 plasmid unnamed1, complete sequence | 173292-173313 | 2 | 0.909 |
CP019858_6 | 6.8|1663146|39|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1663146-1663184 | 39 | JX145342 | Clostridium phage phiMMP04, complete genome | 16665-16703 | 3 | 0.923 |
CP019858_6 | 6.11|1663347|38|CP019858|CRISPRCasFinder,CRT | 1663347-1663384 | 38 | NZ_MG973074 | Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence | 94861-94898 | 3 | 0.921 |
CP019858_8 | 8.25|1754846|38|CP019858|CRT | 1754846-1754883 | 38 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 9965-10002 | 3 | 0.921 |
CP019858_10 | 10.4|2263596|37|CP019858|CRISPRCasFinder | 2263596-2263632 | 37 | KX905163 | Clostridioides phage phiSemix9P1, complete genome | 12039-12075 | 3 | 0.919 |
CP019858_20 | 20.2|3872322|25|CP019858|CRT | 3872322-3872346 | 25 | MH319749 | Marine virus AG-345-F15 Ga0172271_11 genomic sequence | 126034-126058 | 3 | 0.88 |
CP019858_20 | 20.5|3872466|25|CP019858|CRT | 3872466-3872490 | 25 | NZ_CP019876 | Komagataeibacter nataicola strain RZS01 plasmid pKNA01, complete sequence | 77181-77205 | 3 | 0.88 |
CP019858_20 | 20.11|3872796|25|CP019858|CRT | 3872796-3872820 | 25 | MN694311 | Marine virus AFVG_250M573, complete genome | 10982-11006 | 3 | 0.88 |
CP019858_20 | 20.14|3872955|22|CP019858|CRT | 3872955-3872976 | 22 | NZ_CP012101 | Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-2, complete sequence | 132552-132573 | 3 | 0.864 |
CP019858_20 | 20.15|3872997|25|CP019858|CRT | 3872997-3873021 | 25 | NC_015057 | Granulicella tundricola MP5ACTX9 plasmid pACIX901, complete sequence | 28064-28088 | 3 | 0.88 |
CP019858_20 | 20.21|3873348|31|CP019858|CRT | 3873348-3873378 | 31 | CP024687 | Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-3-257K, complete sequence | 236394-236424 | 3 | 0.903 |
CP019858_18 | 18.3|3245528|25|CP019858|CRISPRCasFinder | 3245528-3245552 | 25 | MN694568 | Marine virus AFVG_250M879, complete genome | 12134-12158 | 4 | 0.84 |
CP019858_18 | 18.3|3245528|25|CP019858|CRISPRCasFinder | 3245528-3245552 | 25 | HQ634174 | Cyanophage MED4-213, complete genome | 98055-98079 | 4 | 0.84 |
CP019858_18 | 18.3|3245528|25|CP019858|CRISPRCasFinder | 3245528-3245552 | 25 | GU071101 | Prochlorococcus phage P-HM1, complete genome | 15695-15719 | 4 | 0.84 |
CP019858_20 | 20.2|3872322|25|CP019858|CRT | 3872322-3872346 | 25 | NZ_CP019876 | Komagataeibacter nataicola strain RZS01 plasmid pKNA01, complete sequence | 77181-77205 | 4 | 0.84 |
CP019858_20 | 20.2|3872322|25|CP019858|CRT | 3872322-3872346 | 25 | MN693962 | Marine virus AFVG_250M1136, complete genome | 32170-32194 | 4 | 0.84 |
CP019858_20 | 20.2|3872322|25|CP019858|CRT | 3872322-3872346 | 25 | MH576968 | Streptomyces phage Wofford, complete genome | 46948-46972 | 4 | 0.84 |
CP019858_20 | 20.2|3872322|25|CP019858|CRT | 3872322-3872346 | 25 | MN693918 | Marine virus AFVG_250M1135, complete genome | 32187-32211 | 4 | 0.84 |
CP019858_20 | 20.6|3872511|25|CP019858|CRT | 3872511-3872535 | 25 | NC_023007 | Bacillus phage vB_BanS-Tsamsa, complete genome | 113249-113273 | 4 | 0.84 |
CP019858_20 | 20.15|3872997|25|CP019858|CRT | 3872997-3873021 | 25 | AP013524 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G3, isolate: uvMED-CGR-C7-MedDCM-OCT-S39-C15 | 37332-37356 | 4 | 0.84 |
CP019858_20 | 20.15|3872997|25|CP019858|CRT | 3872997-3873021 | 25 | NZ_CP019365 | Borrelia turicatae 91E135 isolate Oz1 plasmid lpE43, complete sequence | 21755-21779 | 4 | 0.84 |
CP019858_20 | 20.15|3872997|25|CP019858|CRT | 3872997-3873021 | 25 | NZ_CP019368 | Borrelia turicatae 91E135 isolate Oz1 plasmid lpT39, complete sequence | 24104-24128 | 4 | 0.84 |
CP019858_20 | 20.15|3872997|25|CP019858|CRT | 3872997-3873021 | 25 | NZ_CP019369 | Borrelia turicatae 91E135 isolate Oz1 plasmid lpU43, complete sequence | 11043-11067 | 4 | 0.84 |
CP019858_20 | 20.15|3872997|25|CP019858|CRT | 3872997-3873021 | 25 | MK113950 | Phage 5P_2, complete genome | 71225-71249 | 4 | 0.84 |
CP019858_20 | 20.21|3873348|31|CP019858|CRT | 3873348-3873378 | 31 | CP024687 | Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-3-257K, complete sequence | 234929-234959 | 4 | 0.871 |
CP019858_7 | 7.6|1753293|38|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1753293-1753330 | 38 | LN681539 | Clostridium phage phiCD505, complete genome | 40165-40202 | 5 | 0.868 |
CP019858_8 | 8.27|1754791|27|CP019858|PILER-CR | 1754791-1754817 | 27 | NZ_LR135332 | Enterococcus faecium isolate E7471 plasmid 2 | 80868-80894 | 5 | 0.815 |
CP019858_8 | 8.27|1754791|27|CP019858|PILER-CR | 1754791-1754817 | 27 | NZ_LR135332 | Enterococcus faecium isolate E7471 plasmid 2 | 81655-81681 | 5 | 0.815 |
CP019858_12 | 12.2|2770904|38|CP019858|PILER-CR | 2770904-2770941 | 38 | NZ_CP020426 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence | 2361-2398 | 5 | 0.868 |
CP019858_12 | 12.2|2770904|38|CP019858|PILER-CR | 2770904-2770941 | 38 | CP011970 | Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence | 119602-119639 | 5 | 0.868 |
CP019858_12 | 12.2|2770904|38|CP019858|PILER-CR | 2770904-2770941 | 38 | LN681537 | Clostridium phage phiCD211, complete genome | 128464-128501 | 5 | 0.868 |
CP019858_20 | 20.5|3872466|25|CP019858|CRT | 3872466-3872490 | 25 | CP053324 | Salmonella enterica subsp. salamae serovar 40:c:e,n,z15 strain 2013K-0524 plasmid unnamed, complete sequence | 21648-21672 | 5 | 0.8 |
CP019858_20 | 20.15|3872997|25|CP019858|CRT | 3872997-3873021 | 25 | NC_007103 | Bacillus cereus E33L plasmid pE33L466, complete sequence | 397-421 | 5 | 0.8 |
CP019858_20 | 20.15|3872997|25|CP019858|CRT | 3872997-3873021 | 25 | NZ_CP009967 | Bacillus cereus E33L plasmid pBCO_1, complete sequence | 321752-321776 | 5 | 0.8 |
CP019858_20 | 20.22|3873399|34|CP019858|CRT | 3873399-3873432 | 34 | NZ_CP009336 | Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence | 68869-68902 | 5 | 0.853 |
CP019858_20 | 20.22|3873399|34|CP019858|CRT | 3873399-3873432 | 34 | NZ_CP009336 | Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence | 68932-68965 | 5 | 0.853 |
CP019858_20 | 20.22|3873399|34|CP019858|CRT | 3873399-3873432 | 34 | NZ_CP053689 | Arthrobacter citreus strain NEB 577 plasmid unnamed1, complete sequence | 173145-173178 | 5 | 0.853 |
CP019858_20 | 20.22|3873399|34|CP019858|CRT | 3873399-3873432 | 34 | MN694423 | Marine virus AFVG_250M1001, complete genome | 26193-26226 | 5 | 0.853 |
CP019858_2 | 2.1|141460|29|CP019858|CRISPRCasFinder | 141460-141488 | 29 | KY971610 | Pseudomonas phage PspYZU05, complete genome | 134239-134267 | 6 | 0.793 |
CP019858_4 | 4.3|1342085|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342085-1342120 | 36 | NZ_CP014152 | Clostridium botulinum strain BrDura plasmid pRSJ20_1, complete sequence | 22889-22924 | 6 | 0.833 |
CP019858_4 | 4.3|1342085|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342085-1342120 | 36 | NZ_CP013710 | Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_3, complete sequence | 11677-11712 | 6 | 0.833 |
CP019858_4 | 4.3|1342085|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342085-1342120 | 36 | NC_010379 | Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD, complete sequence | 66233-66268 | 6 | 0.833 |
CP019858_4 | 4.3|1342085|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342085-1342120 | 36 | NC_010418 | Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence | 186556-186591 | 6 | 0.833 |
CP019858_4 | 4.3|1342085|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342085-1342120 | 36 | NC_012654 | Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ, complete sequence | 143377-143412 | 6 | 0.833 |
CP019858_4 | 4.3|1342085|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342085-1342120 | 36 | NZ_CP006909 | Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence | 98239-98274 | 6 | 0.833 |
CP019858_4 | 4.3|1342085|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342085-1342120 | 36 | NC_025146 | Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111 | 220042-220077 | 6 | 0.833 |
CP019858_4 | 4.3|1342085|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342085-1342120 | 36 | NZ_CP031095 | Clostridium botulinum strain CFSAN034200 plasmid p1_CDC51232, complete sequence | 238771-238806 | 6 | 0.833 |
CP019858_8 | 8.27|1754791|27|CP019858|PILER-CR | 1754791-1754817 | 27 | NZ_CP035656 | Enterococcus faecium strain UAMSEF_09 plasmid unnamed2 | 80869-80895 | 6 | 0.778 |
CP019858_8 | 8.27|1754791|27|CP019858|PILER-CR | 1754791-1754817 | 27 | NZ_CP012462 | Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_7 plasmid ISMMS_VRE7_p2 | 76258-76284 | 6 | 0.778 |
CP019858_8 | 8.27|1754791|27|CP019858|PILER-CR | 1754791-1754817 | 27 | NZ_CP012462 | Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_7 plasmid ISMMS_VRE7_p2 | 77043-77069 | 6 | 0.778 |
CP019858_8 | 8.27|1754791|27|CP019858|PILER-CR | 1754791-1754817 | 27 | NZ_CP035662 | Enterococcus faecium strain UAMSEF_20 plasmid unnamed2 | 381-407 | 6 | 0.778 |
CP019858_19 | 19.2|3706158|31|CP019858|CRT | 3706158-3706188 | 31 | MN693124 | Marine virus AFVG_25M44, complete genome | 16498-16528 | 6 | 0.806 |
CP019858_20 | 20.15|3872997|25|CP019858|CRT | 3872997-3873021 | 25 | NZ_CP012101 | Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-2, complete sequence | 132558-132582 | 6 | 0.76 |
CP019858_18 | 18.1|3245393|31|CP019858|CRISPRCasFinder | 3245393-3245423 | 31 | MG869618 | Polaromonas sp. E5S plasmid pE5SP1, complete sequence | 53570-53600 | 7 | 0.774 |
CP019858_19 | 19.2|3706158|31|CP019858|CRT | 3706158-3706188 | 31 | NC_021536 | Synechococcus phage S-IOM18 genomic sequence | 42082-42112 | 7 | 0.774 |
CP019858_20 | 20.3|3872367|34|CP019858|CRT | 3872367-3872400 | 34 | NZ_CP047963 | Aeromonas media strain MC64 plasmid pMC64A, complete sequence | 193736-193769 | 7 | 0.794 |
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CP019858_20 | 20.22|3873399|34|CP019858|CRT | 3873399-3873432 | 34 | AP013524 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G3, isolate: uvMED-CGR-C7-MedDCM-OCT-S39-C15 | 37341-37374 | 7 | 0.794 |
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CP019858_9 | 9.18|1907221|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1907221-1907256 | 36 | NZ_CP044536 | Borrelia sp. CA690 plasmid lp54, complete sequence | 5759-5794 | 8 | 0.778 |
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CP019858_20 | 20.16|3873042|34|CP019858|CRT | 3873042-3873075 | 34 | NC_017575 | Ralstonia solanacearum Po82 megaplasmid, complete sequence | 697039-697072 | 8 | 0.765 |
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CP019858_20 | 20.16|3873042|34|CP019858|CRT | 3873042-3873075 | 34 | NZ_CP012940 | Ralstonia solanacearum strain UW163 plasmid unnamed, complete sequence | 1491249-1491282 | 8 | 0.765 |
CP019858_20 | 20.16|3873042|34|CP019858|CRT | 3873042-3873075 | 34 | NZ_CP051295 | Ralstonia solanacearum strain CIAT_078 plasmid megaplasmid, complete sequence | 1476804-1476837 | 8 | 0.765 |
CP019858_20 | 20.18|3873138|34|CP019858|CRT | 3873138-3873171 | 34 | MN693652 | Marine virus AFVG_250M189, complete genome | 20788-20821 | 8 | 0.765 |
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CP019858_20 | 20.21|3873348|31|CP019858|CRT | 3873348-3873378 | 31 | CP024687 | Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-3-257K, complete sequence | 169173-169203 | 8 | 0.742 |
CP019858_20 | 20.21|3873348|31|CP019858|CRT | 3873348-3873378 | 31 | NC_010180 | Bacillus mycoides KBAB4 plasmid pBWB401, complete sequence | 116631-116661 | 8 | 0.742 |
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CP019858_20 | 20.22|3873399|34|CP019858|CRT | 3873399-3873432 | 34 | NZ_CP009967 | Bacillus cereus E33L plasmid pBCO_1, complete sequence | 321878-321911 | 8 | 0.765 |
CP019858_20 | 20.22|3873399|34|CP019858|CRT | 3873399-3873432 | 34 | NZ_CP012105 | Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-6, complete sequence | 1017-1050 | 8 | 0.765 |
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CP019858_4 | 4.3|1342085|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342085-1342120 | 36 | NZ_CP024206 | Borrelia miyamotoi strain Izh-5 plasmid pIzh5-lp72, complete sequence | 19448-19483 | 9 | 0.75 |
CP019858_4 | 4.3|1342085|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342085-1342120 | 36 | NZ_CP024352 | Borrelia miyamotoi strain Izh-16 plasmid pIzh16-lp72, complete sequence | 19459-19494 | 9 | 0.75 |
CP019858_4 | 4.3|1342085|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342085-1342120 | 36 | NZ_CP021873 | Borrelia miyamotoi strain CA17-2241 plasmid lp72, complete sequence | 20983-21018 | 9 | 0.75 |
CP019858_4 | 4.3|1342085|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342085-1342120 | 36 | NZ_CP024372 | Borrelia miyamotoi strain Izh-14 plasmid pIzh14-lp72, complete sequence | 19437-19472 | 9 | 0.75 |
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CP019858_4 | 4.3|1342085|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342085-1342120 | 36 | NZ_CP024334 | Borrelia miyamotoi strain Yekat-1 plasmid pYkt1-lp72, complete sequence | 52931-52966 | 9 | 0.75 |
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CP019858_18 | 18.1|3245393|31|CP019858|CRISPRCasFinder | 3245393-3245423 | 31 | NZ_MK748462 | Candidatus Endohaliclona renieramycinifaciens plasmid p-ren_Ren-Bali-16-03 clone Ren-Bali-16-03, complete sequence | 24337-24367 | 9 | 0.71 |
CP019858_18 | 18.1|3245393|31|CP019858|CRISPRCasFinder | 3245393-3245423 | 31 | NZ_MK748463 | Candidatus Endohaliclona renieramycinifaciens plasmid p-ren_Ren-Pal-02 clone Ren-Pal-02, complete sequence | 24326-24356 | 9 | 0.71 |
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CP019858_20 | 20.22|3873399|34|CP019858|CRT | 3873399-3873432 | 34 | NZ_CP009967 | Bacillus cereus E33L plasmid pBCO_1, complete sequence | 321851-321884 | 9 | 0.735 |
CP019858_20 | 20.22|3873399|34|CP019858|CRT | 3873399-3873432 | 34 | LR606148 | Rhizobium sp. Q54 genome assembly, plasmid: 5 | 101528-101561 | 9 | 0.735 |
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CP019858_7 | 7.6|1753293|38|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1753293-1753330 | 38 | NZ_CP053963 | Bacillus cereus strain FDAARGOS_802 plasmid unnamed3, complete sequence | 113574-113611 | 10 | 0.737 |
CP019858_7 | 7.6|1753293|38|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1753293-1753330 | 38 | NZ_CP047143 | Lactobacillus sp. C25 plasmid unnamed, complete sequence | 158818-158855 | 10 | 0.737 |
CP019858_7 | 7.6|1753293|38|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1753293-1753330 | 38 | NZ_CP049229 | Lactobacillus iners strain C0210C1 plasmid pC0210C1, complete sequence | 9438-9475 | 10 | 0.737 |
CP019858_7 | 7.6|1753293|38|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1753293-1753330 | 38 | NZ_CP049229 | Lactobacillus iners strain C0210C1 plasmid pC0210C1, complete sequence | 18472-18509 | 10 | 0.737 |
CP019858_8 | 8.18|1754913|36|CP019858|CRISPRCasFinder | 1754913-1754948 | 36 | NZ_CP045274 | Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301B, complete sequence | 47033-47068 | 10 | 0.722 |
CP019858_9 | 9.19|1907286|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1907286-1907321 | 36 | AP013411 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G16, isolate: uvMED-CGR-C108A-MedDCM-OCT-S29-C43 | 10531-10566 | 10 | 0.722 |
CP019858_9 | 9.19|1907286|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1907286-1907321 | 36 | AP013669 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C108A-MedDCM-OCT-S25-C43, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 22943-22978 | 10 | 0.722 |
CP019858_11 | 11.1|2605092|35|CP019858|PILER-CR,CRT | 2605092-2605126 | 35 | NC_022783 | Bacillus toyonensis BCT-7112 plasmid pBCT8, complete sequence | 481-515 | 10 | 0.714 |
CP019858_11 | 11.1|2605092|35|CP019858|PILER-CR,CRT | 2605092-2605126 | 35 | NC_019526 | Enterobacteria phage vB_KleM-RaK2, complete genome | 17188-17222 | 10 | 0.714 |
CP019858_11 | 11.1|2605092|35|CP019858|PILER-CR,CRT | 2605092-2605126 | 35 | MT708547 | Klebsiella phage Muenster, complete genome | 139287-139321 | 10 | 0.714 |
CP019858_11 | 11.1|2605092|35|CP019858|PILER-CR,CRT | 2605092-2605126 | 35 | AB897757 | Klebsiella phage K64-1 DNA, complete genome | 17165-17199 | 10 | 0.714 |
CP019858_11 | 11.5|2605092|36|CP019858|CRISPRCasFinder | 2605092-2605127 | 36 | NZ_CP045274 | Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301B, complete sequence | 47033-47068 | 10 | 0.722 |
CP019858_19 | 19.7|3706401|40|CP019858|CRT | 3706401-3706440 | 40 | MH884511 | Exiguobacterium phage vB_EalM-132, complete genome | 75164-75203 | 10 | 0.75 |
CP019858_20 | 20.16|3873042|34|CP019858|CRT | 3873042-3873075 | 34 | MN176227 | Bacillus phage 049ML001, complete genome | 7476-7509 | 10 | 0.706 |
CP019858_20 | 20.16|3873042|34|CP019858|CRT | 3873042-3873075 | 34 | X89721 | Bacteriophage SPP1 head morphogenesis genes 7 to 15 | 4435-4468 | 10 | 0.706 |
CP019858_20 | 20.16|3873042|34|CP019858|CRT | 3873042-3873075 | 34 | MN176228 | Bacillus phage 049ML003, complete genome | 7404-7437 | 10 | 0.706 |
CP019858_20 | 20.16|3873042|34|CP019858|CRT | 3873042-3873075 | 34 | X97918 | Bacteriophage SPP1 complete nucleotide sequence | 7659-7692 | 10 | 0.706 |
CP019858_20 | 20.18|3873138|34|CP019858|CRT | 3873138-3873171 | 34 | NZ_CP020744 | Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed1, complete sequence | 49881-49914 | 10 | 0.706 |
CP019858_20 | 20.18|3873138|34|CP019858|CRT | 3873138-3873171 | 34 | NZ_CP020744 | Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed1, complete sequence | 49989-50022 | 10 | 0.706 |
CP019858_20 | 20.18|3873138|34|CP019858|CRT | 3873138-3873171 | 34 | NZ_CP020744 | Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed1, complete sequence | 50025-50058 | 10 | 0.706 |
CP019858_20 | 20.18|3873138|34|CP019858|CRT | 3873138-3873171 | 34 | MT219824 | Escherichia coli strain RT18-1 plasmid pRT18-1_294k_tetX, complete sequence | 246949-246982 | 10 | 0.706 |
CP019858_20 | 20.22|3873399|34|CP019858|CRT | 3873399-3873432 | 34 | NZ_CP053689 | Arthrobacter citreus strain NEB 577 plasmid unnamed1, complete sequence | 173136-173169 | 10 | 0.706 |
CP019858_20 | 20.22|3873399|34|CP019858|CRT | 3873399-3873432 | 34 | NZ_CP019365 | Borrelia turicatae 91E135 isolate Oz1 plasmid lpE43, complete sequence | 21746-21779 | 10 | 0.706 |
CP019858_20 | 20.22|3873399|34|CP019858|CRT | 3873399-3873432 | 34 | NZ_CP019368 | Borrelia turicatae 91E135 isolate Oz1 plasmid lpT39, complete sequence | 24095-24128 | 10 | 0.706 |
CP019858_7 | 7.5|1753227|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1753227-1753263 | 37 | NZ_CP047444 | Spiroplasma citri strain BLH-MB plasmid pSciBLHMB-7 | 22427-22463 | 11 | 0.703 |
CP019858_8 | 8.26|1754912|37|CP019858|CRT | 1754912-1754948 | 37 | NZ_CP045274 | Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301B, complete sequence | 47032-47068 | 11 | 0.703 |
1. spacer 2.1|141460|29|CP019858|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033215 (Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tgtaataagttaaagcaatatgaatcaac CRISPR spacer tgtaataagttaaagcaatatgaatcaac Protospacer *****************************
2. spacer 4.4|1342150|38|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020426 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttaatctttaaaattaaatataaaaataagctagacat CRISPR spacer ttaatctttaaaattaaatataaaaataagctagacat Protospacer **************************************
3. spacer 4.4|1342150|38|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029155 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttaatctttaaaattaaatataaaaataagctagacat CRISPR spacer ttaatctttaaaattaaatataaaaataagctagacat Protospacer **************************************
4. spacer 4.4|1342150|38|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP011970 (Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttaatctttaaaattaaatataaaaataagctagacat CRISPR spacer ttaatctttaaaattaaatataaaaataagctagacat Protospacer **************************************
5. spacer 4.4|1342150|38|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681537 (Clostridium phage phiCD211, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttaatctttaaaattaaatataaaaataagctagacat CRISPR spacer ttaatctttaaaattaaatataaaaataagctagacat Protospacer **************************************
6. spacer 5.4|1546110|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029156 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gttatagtcttttggataactacccaattaggattt CRISPR spacer gttatagtcttttggataactacccaattaggattt Protospacer ************************************
7. spacer 5.4|1546110|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029153 (Clostridioides difficile strain CDT4 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gttatagtcttttggataactacccaattaggattt CRISPR spacer gttatagtcttttggataactacccaattaggattt Protospacer ************************************
8. spacer 7.7|1753360|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020425 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tttatcattgtgtaatgctctttagtaatagaaccta CRISPR spacer tttatcattgtgtaatgctctttagtaatagaaccta Protospacer *************************************
9. spacer 7.7|1753360|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to FN668942 (Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tttatcattgtgtaatgctctttagtaatagaaccta CRISPR spacer tttatcattgtgtaatgctctttagtaatagaaccta Protospacer *************************************
10. spacer 7.7|1753360|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011969 (Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tttatcattgtgtaatgctctttagtaatagaaccta CRISPR spacer tttatcattgtgtaatgctctttagtaatagaaccta Protospacer *************************************
11. spacer 9.11|1906764|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JX145342 (Clostridium phage phiMMP04, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cacattggcgttgaagctgttagcaaagcattaaaag CRISPR spacer cacattggcgttgaagctgttagcaaagcattaaaag Protospacer *************************************
12. spacer 9.12|1906830|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtagcctattgtttggcttcctgacatttcgtaaga CRISPR spacer gtagcctattgtttggcttcctgacatttcgtaaga Protospacer ************************************
13. spacer 9.12|1906830|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtagcctattgtttggcttcctgacatttcgtaaga CRISPR spacer gtagcctattgtttggcttcctgacatttcgtaaga Protospacer ************************************
14. spacer 9.12|1906830|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtagcctattgtttggcttcctgacatttcgtaaga CRISPR spacer gtagcctattgtttggcttcctgacatttcgtaaga Protospacer ************************************
15. spacer 9.12|1906830|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtagcctattgtttggcttcctgacatttcgtaaga CRISPR spacer gtagcctattgtttggcttcctgacatttcgtaaga Protospacer ************************************
16. spacer 9.14|1906960|35|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020426 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tttaaatggtgtgaatggtgaaaggcacacaacac CRISPR spacer tttaaatggtgtgaatggtgaaaggcacacaacac Protospacer ***********************************
17. spacer 9.14|1906960|35|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP011970 (Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tttaaatggtgtgaatggtgaaaggcacacaacac CRISPR spacer tttaaatggtgtgaatggtgaaaggcacacaacac Protospacer ***********************************
18. spacer 9.14|1906960|35|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681537 (Clostridium phage phiCD211, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tttaaatggtgtgaatggtgaaaggcacacaacac CRISPR spacer tttaaatggtgtgaatggtgaaaggcacacaacac Protospacer ***********************************
19. spacer 9.17|1907155|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029155 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atgtaaagtttagcaaattcaatagtatccatattgt CRISPR spacer atgtaaagtttagcaaattcaatagtatccatattgt Protospacer *************************************
20. spacer 9.17|1907155|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atgtaaagtttagcaaattcaatagtatccatattgt CRISPR spacer atgtaaagtttagcaaattcaatagtatccatattgt Protospacer *************************************
21. spacer 9.17|1907155|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atgtaaagtttagcaaattcaatagtatccatattgt CRISPR spacer atgtaaagtttagcaaattcaatagtatccatattgt Protospacer *************************************
22. spacer 9.21|1907417|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
agtgaatgtgaccaattttgtgacgaattatcagag CRISPR spacer agtgaatgtgaccaattttgtgacgaattatcagag Protospacer ************************************
23. spacer 10.1|2263596|36|CP019858|PILER-CR,CRT matches to NZ_CP020425 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttccgccaacaacaccagctattgcaattcctatag CRISPR spacer ttccgccaacaacaccagctattgcaattcctatag Protospacer ************************************
24. spacer 10.1|2263596|36|CP019858|PILER-CR,CRT matches to NZ_CP029156 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttccgccaacaacaccagctattgcaattcctatag CRISPR spacer ttccgccaacaacaccagctattgcaattcctatag Protospacer ************************************
25. spacer 10.1|2263596|36|CP019858|PILER-CR,CRT matches to NZ_CP029153 (Clostridioides difficile strain CDT4 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttccgccaacaacaccagctattgcaattcctatag CRISPR spacer ttccgccaacaacaccagctattgcaattcctatag Protospacer ************************************
26. spacer 10.1|2263596|36|CP019858|PILER-CR,CRT matches to FN668942 (Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttccgccaacaacaccagctattgcaattcctatag CRISPR spacer ttccgccaacaacaccagctattgcaattcctatag Protospacer ************************************
27. spacer 10.1|2263596|36|CP019858|PILER-CR,CRT matches to NZ_CP011969 (Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttccgccaacaacaccagctattgcaattcctatag CRISPR spacer ttccgccaacaacaccagctattgcaattcctatag Protospacer ************************************
28. spacer 10.4|2263596|37|CP019858|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020425 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttccgccaacaacaccagctattgcaattcctataga CRISPR spacer ttccgccaacaacaccagctattgcaattcctataga Protospacer *************************************
29. spacer 10.4|2263596|37|CP019858|CRISPRCasFinder matches to FN668942 (Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttccgccaacaacaccagctattgcaattcctataga CRISPR spacer ttccgccaacaacaccagctattgcaattcctataga Protospacer *************************************
30. spacer 10.4|2263596|37|CP019858|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011969 (Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttccgccaacaacaccagctattgcaattcctataga CRISPR spacer ttccgccaacaacaccagctattgcaattcctataga Protospacer *************************************
31. spacer 10.4|2263596|37|CP019858|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP029156 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttccgccaacaacaccagctattgcaattcctataga CRISPR spacer ttccgccaacaacaccagctattgcaattcctataga Protospacer *************************************
32. spacer 10.4|2263596|37|CP019858|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP029153 (Clostridioides difficile strain CDT4 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttccgccaacaacaccagctattgcaattcctataga CRISPR spacer ttccgccaacaacaccagctattgcaattcctataga Protospacer *************************************
33. spacer 1.1|17743|34|CP019858|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033215 (Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer aaactgaacacatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer *********.************************
34. spacer 3.1|148885|34|CP019858|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033215 (Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer aaactgaacacatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer *********.************************
35. spacer 4.5|1342217|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ttaataaaactgatagtaaaactactaataataaag CRISPR spacer ttaataaaactgatagtaaaactacaaataataaag Protospacer ************************* **********
36. spacer 4.5|1342217|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ttaataaaactgatagtaaaactactaataataaag CRISPR spacer ttaataaaactgatagtaaaactacaaataataaag Protospacer ************************* **********
37. spacer 4.5|1342217|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ttaataaaactgatagtaaaactactaataataaag CRISPR spacer ttaataaaactgatagtaaaactacaaataataaag Protospacer ************************* **********
38. spacer 4.6|1342282|39|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
acttttaaaaattatttagcgttatattgctgcataaaa CRISPR spacer acttttaaaaattatttagcgttatattgttgcataaaa Protospacer *****************************.*********
39. spacer 4.6|1342282|39|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
acttttaaaaattatttagcgttatattgctgcataaaa CRISPR spacer acttttaaaaattatttagcgttatattgttgcataaaa Protospacer *****************************.*********
40. spacer 4.6|1342282|39|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
acttttaaaaattatttagcgttatattgctgcataaaa CRISPR spacer acttttaaaaattatttagcgttatattgttgcataaaa Protospacer *****************************.*********
41. spacer 4.6|1342282|39|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
acttttaaaaattatttagcgttatattgctgcataaaa CRISPR spacer acttttaaaaattatttagcgttatattgttgcataaaa Protospacer *****************************.*********
42. spacer 4.6|1342282|39|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
acttttaaaaattatttagcgttatattgctgcataaaa CRISPR spacer acttttaaaaattatttagcgttatattgttgcataaaa Protospacer *****************************.*********
43. spacer 5.4|1546110|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020425 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gttatagtcttttggataactacccaattaggattt CRISPR spacer gttatagttttttggataactacccaattaggattt Protospacer ********.***************************
44. spacer 5.4|1546110|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to FN668942 (Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gttatagtcttttggataactacccaattaggattt CRISPR spacer gttatagttttttggataactacccaattaggattt Protospacer ********.***************************
45. spacer 5.4|1546110|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011969 (Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gttatagtcttttggataactacccaattaggattt CRISPR spacer gttatagttttttggataactacccaattaggattt Protospacer ********.***************************
46. spacer 5.4|1546110|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048665 (Clostridium phage phiCDHM14, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gttatagtcttttggataactacccaattaggattt CRISPR spacer gttatagttttttggataactacccaattaggattt Protospacer ********.***************************
47. spacer 5.4|1546110|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK473382 (Clostridium phage JD032, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gttatagtcttttggataactacccaattaggattt CRISPR spacer gttatagtcttttggataactacccaattaggtttt Protospacer ******************************** ***
48. spacer 5.4|1546110|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG796225 (Clostridium phage phiCDHM13 complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gttatagtcttttggataactacccaattaggattt CRISPR spacer gttatagttttttggataactacccaattaggattt Protospacer ********.***************************
49. spacer 5.4|1546110|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG798901 (Clostridium phage phiCDHM11 complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gttatagtcttttggataactacccaattaggattt CRISPR spacer gttatagttttttggataactacccaattaggattt Protospacer ********.***************************
50. spacer 7.2|1753033|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
aacatagtaatatatgaccagacaggtagaataatc CRISPR spacer aacagagtaatatatgaccagacaggtagaataatc Protospacer **** *******************************
51. spacer 7.5|1753227|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF547664 (Clostridioides difficile strain LIBA-6289 plasmid LIBA6289, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gactttgaagaaaataatttagttatatcttgggaag CRISPR spacer gattttgaagaaaataatttagttatatcttgggaag Protospacer **.**********************************
52. spacer 9.12|1906830|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gtagcctattgtttggcttcctgacatttcgtaaga CRISPR spacer gtagcctattgtctggcttcctgacatttcgtaaga Protospacer ************.***********************
53. spacer 9.14|1906960|35|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
tttaaatggtgtgaatggtgaaaggcacacaacac CRISPR spacer ttttaatggtgtgaatggtgaaaggcacacaacac Protospacer *** *******************************
54. spacer 9.14|1906960|35|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
tttaaatggtgtgaatggtgaaaggcacacaacac CRISPR spacer ttttaatggtgtgaatggtgaaaggcacacaacac Protospacer *** *******************************
55. spacer 9.15|1907024|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_008226 (Clostridioides difficile 630 plasmid pCD630, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
cttcctgtaggtgctaccattaatacatttttaccct CRISPR spacer cttcctgtaggtgctaccattaatacattttcaccct Protospacer *******************************.*****
56. spacer 9.15|1907024|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016319 (Clostridioides difficile strain 630 delta erm plasmid pCD630, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
cttcctgtaggtgctaccattaatacatttttaccct CRISPR spacer cttcctgtaggtgctaccattaatacattttcaccct Protospacer *******************************.*****
57. spacer 9.15|1907024|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG266000 (Clostridioides difficile strain 7032985 plasmid pCD-ISS1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
cttcctgtaggtgctaccattaatacatttttaccct CRISPR spacer cttcctgtaggtgctaccattaatacattttcaccct Protospacer *******************************.*****
58. spacer 9.18|1907221|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tggacacaacaaaaatttttcaaaccttttaaaaga CRISPR spacer tggacacaacaaaaatttttcaaaccttttaaaaaa Protospacer **********************************.*
59. spacer 9.18|1907221|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tggacacaacaaaaatttttcaaaccttttaaaaga CRISPR spacer tggacacaacaaaaatttttcaaaccttttaaaaaa Protospacer **********************************.*
60. spacer 9.18|1907221|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tggacacaacaaaaatttttcaaaccttttaaaaga CRISPR spacer tggacacaacaaaaatttttcaaaccttttaaaaaa Protospacer **********************************.*
61. spacer 19.1|3706113|22|CP019858|CRT matches to MG592614 (Vibrio phage 1.248.O._10N.261.54.F1, partial genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
tgttattccatttgctccagtc CRISPR spacer tgatattccatttgctccagtc Protospacer ** *******************
62. spacer 4.2|1342018|38|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
gcagagttgatagtactattaaaagaagaaaagttaag CRISPR spacer acggagttgatagtactattaaaagaagaaaagttaag Protospacer .*.***********************************
63. spacer 4.2|1342018|38|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
gcagagttgatagtactattaaaagaagaaaagttaag CRISPR spacer acggagttgatagtactattaaaagaagaaaagttaag Protospacer .*.***********************************
64. spacer 4.2|1342018|38|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
gcagagttgatagtactattaaaagaagaaaagttaag CRISPR spacer acggagttgatagtactattaaaagaagaaaagttaag Protospacer .*.***********************************
65. spacer 7.5|1753227|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG973074 (Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
gactttgaagaaaataatttagttatatcttgggaag CRISPR spacer gactttgaagaaaataatttagtcatatcctgggaag Protospacer ***********************.*****.*******
66. spacer 8.3|1754254|38|CP019858|PILER-CR,CRT matches to NZ_CP029156 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
tttaaaagttactacaccagttttagtagttccagcta CRISPR spacer tttgaaacttactacaccagttttagtagttccagcta Protospacer ***.*** ******************************
67. spacer 8.3|1754254|38|CP019858|PILER-CR,CRT matches to NZ_CP029153 (Clostridioides difficile strain CDT4 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
tttaaaagttactacaccagttttagtagttccagcta CRISPR spacer tttgaaacttactacaccagttttagtagttccagcta Protospacer ***.*** ******************************
68. spacer 8.3|1754254|38|CP019858|PILER-CR,CRT matches to NZ_CP020425 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
tttaaaagttactacaccagttttagtagttccagcta CRISPR spacer tttgaaacttactacaccagttttagtagttccagcta Protospacer ***.*** ******************************
69. spacer 8.3|1754254|38|CP019858|PILER-CR,CRT matches to FN668942 (Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
tttaaaagttactacaccagttttagtagttccagcta CRISPR spacer tttgaaacttactacaccagttttagtagttccagcta Protospacer ***.*** ******************************
70. spacer 8.3|1754254|38|CP019858|PILER-CR,CRT matches to NZ_CP011969 (Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
tttaaaagttactacaccagttttagtagttccagcta CRISPR spacer tttgaaacttactacaccagttttagtagttccagcta Protospacer ***.*** ******************************
71. spacer 8.8|1754255|37|CP019858|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP029156 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
ttaaaagttactacaccagttttagtagttccagcta CRISPR spacer ttgaaacttactacaccagttttagtagttccagcta Protospacer **.*** ******************************
72. spacer 8.8|1754255|37|CP019858|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP029153 (Clostridioides difficile strain CDT4 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
ttaaaagttactacaccagttttagtagttccagcta CRISPR spacer ttgaaacttactacaccagttttagtagttccagcta Protospacer **.*** ******************************
73. spacer 8.8|1754255|37|CP019858|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020425 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
ttaaaagttactacaccagttttagtagttccagcta CRISPR spacer ttgaaacttactacaccagttttagtagttccagcta Protospacer **.*** ******************************
74. spacer 8.8|1754255|37|CP019858|CRISPRCasFinder matches to FN668942 (Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
ttaaaagttactacaccagttttagtagttccagcta CRISPR spacer ttgaaacttactacaccagttttagtagttccagcta Protospacer **.*** ******************************
75. spacer 8.8|1754255|37|CP019858|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011969 (Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
ttaaaagttactacaccagttttagtagttccagcta CRISPR spacer ttgaaacttactacaccagttttagtagttccagcta Protospacer **.*** ******************************
76. spacer 8.17|1754847|37|CP019858|CRISPRCasFinder matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
gataacaaagcttgcaaagtagatatttgtgtttttc CRISPR spacer gatagcaaggcttgcaaagtagatatttgtgtttttc Protospacer ****.***.****************************
77. spacer 8.18|1754913|36|CP019858|CRISPRCasFinder matches to NZ_MG973074 (Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
tgctgtgatttcactaataaaacaattaataattgt CRISPR spacer tgctgtgattttattaataaaacaattaataattgt Protospacer ***********.*.**********************
78. spacer 8.26|1754912|37|CP019858|CRT matches to NZ_MG973074 (Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
ttgctgtgatttcactaataaaacaattaataattgt CRISPR spacer ttgctgtgattttattaataaaacaattaataattgt Protospacer ************.*.**********************
79. spacer 8.28|1754857|36|CP019858|PILER-CR matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
gataacaaagcttgcaaagtagatatttgtgttttt CRISPR spacer gatagcaaggcttgcaaagtagatatttgtgttttt Protospacer ****.***.***************************
80. spacer 9.11|1906764|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048665 (Clostridium phage phiCDHM14, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
cacattggcgttgaagctgttagcaaagcattaaaag CRISPR spacer cacattggtgttgaagctgttagcaaagctttaaaag Protospacer ********.******************** *******
81. spacer 9.11|1906764|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028838 (Clostridium phage phiCD506, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
cacattggcgttgaagctgttagcaaagcattaaaag CRISPR spacer catattggtgttgaagctgttagcaaagcattaaaag Protospacer **.*****.****************************
82. spacer 9.11|1906764|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG796225 (Clostridium phage phiCDHM13 complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
cacattggcgttgaagctgttagcaaagcattaaaag CRISPR spacer cacattggtgttgaagctgttagcaaagctttaaaag Protospacer ********.******************** *******
83. spacer 9.11|1906764|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681538 (Clostridium phage phiCD481-1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
cacattggcgttgaagctgttagcaaagcattaaaag CRISPR spacer cacattggtgttgaagctgttagcaaagctttaaaag Protospacer ********.******************** *******
84. spacer 9.11|1906764|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK473382 (Clostridium phage JD032, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
cacattggcgttgaagctgttagcaaagcattaaaag CRISPR spacer cacattggtgttgaagctgttagcaaagcattgaaag Protospacer ********.***********************.****
85. spacer 9.16|1907090|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
aggagataacttctattaaagataactttgatgtgg CRISPR spacer aggaaatgacttctattaaagataactttgatgtgg Protospacer ****.**.****************************
86. spacer 9.16|1907090|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
aggagataacttctattaaagataactttgatgtgg CRISPR spacer aggaaatgacttctattaaagataactttgatgtgg Protospacer ****.**.****************************
87. spacer 10.1|2263596|36|CP019858|PILER-CR,CRT matches to KX905163 (Clostridioides phage phiSemix9P1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
ttccgccaacaacaccagctattgcaattcctatag CRISPR spacer ttccaccaacaacaccagctattgctattcctatag Protospacer ****.******************** **********
88. spacer 11.1|2605092|35|CP019858|PILER-CR,CRT matches to NZ_MG973074 (Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
acaattattaattgttttattagtgaaatcacagc CRISPR spacer acaattattaattgttttattaataaaatcacagc Protospacer **********************.*.**********
89. spacer 11.5|2605092|36|CP019858|CRISPRCasFinder matches to NZ_MG973074 (Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
acaattattaattgttttattagtgaaatcacagca CRISPR spacer acaattattaattgttttattaataaaatcacagca Protospacer **********************.*.***********
90. spacer 19.1|3706113|22|CP019858|CRT matches to MG592608 (Vibrio phage 1.243.O._10N.261.54.B5, partial genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
tgttattccatttgctccagtc CRISPR spacer cgatattccatttgctccagtc Protospacer .* *******************
91. spacer 20.3|3872367|34|CP019858|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
tgttgctcctgttgctcctgctaatcctgttgct CRISPR spacer tgttgctcctgttgctcctgcttctcctgttgct Protospacer ********************** **********
92. spacer 20.3|3872367|34|CP019858|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
tgttgctcctgttgctcctgctaatcctgttgct CRISPR spacer tgttgctcctgttgctcctgcttctcctgttgct Protospacer ********************** **********
93. spacer 20.5|3872466|25|CP019858|CRT matches to MN694345 (Marine virus AFVG_250M178, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
tgttgctccatctgctcctgtattt CRISPR spacer tgttgcttcatttgctcctgtattt Protospacer *******.***.*************
94. spacer 20.5|3872466|25|CP019858|CRT matches to MN694528 (Marine virus AFVG_250M165, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
tgttgctccatctgctcctgtattt CRISPR spacer tgttgcttcatttgctcctgtattt Protospacer *******.***.*************
95. spacer 20.13|3872913|22|CP019858|CRT matches to NZ_CP053689 (Arthrobacter citreus strain NEB 577 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
tattcctgttgctccggttgga CRISPR spacer tattcctgttgttccggttggc Protospacer ***********.*********
96. spacer 6.8|1663146|39|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JX145342 (Clostridium phage phiMMP04, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
ttgcaaacagacgctagtttaagtgatatatcagctaag CRISPR spacer ctgcaaacagacgctagtttaagcgatatatcaactaag Protospacer .**********************.*********.*****
97. spacer 6.11|1663347|38|CP019858|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG973074 (Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
ccatcttttgttgctttacataaatttatattacttat CRISPR spacer ccatcttttgttgctttgcatagatttatattacttac Protospacer *****************.****.**************.
98. spacer 8.25|1754846|38|CP019858|CRT matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
tgataacaaagcttgcaaagtagatatttgtgtttttc CRISPR spacer agatagcaaggcttgcaaagtagatatttgtgtttttc Protospacer ****.***.****************************
99. spacer 10.4|2263596|37|CP019858|CRISPRCasFinder matches to KX905163 (Clostridioides phage phiSemix9P1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
ttccgccaacaacaccagctattgcaattcctataga CRISPR spacer ttccaccaacaacaccagctattgctattcctatagc Protospacer ****.******************** **********
100. spacer 20.2|3872322|25|CP019858|CRT matches to MH319749 (Marine virus AG-345-F15 Ga0172271_11 genomic sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.88
tgttgctccatctgctcctgttgga CRISPR spacer cgttgctccatctgatccagttgga Protospacer .************* *** ******
101. spacer 20.5|3872466|25|CP019858|CRT matches to NZ_CP019876 (Komagataeibacter nataicola strain RZS01 plasmid pKNA01, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.88
tgttgctccatctgctcctgtattt CRISPR spacer tgttgttccatctgctcctgttctt Protospacer *****.*************** .**
102. spacer 20.11|3872796|25|CP019858|CRT matches to MN694311 (Marine virus AFVG_250M573, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.88
ggttggtcctattaatcctgctgct CRISPR spacer agttgctcctataaatcctgctgct Protospacer .**** ****** ************
103. spacer 20.14|3872955|22|CP019858|CRT matches to NZ_CP012101 (Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.864
aaatcctgttgctcctgttgcc CRISPR spacer tggtcctgttgctcctgttgcc Protospacer ..*******************
104. spacer 20.15|3872997|25|CP019858|CRT matches to NC_015057 (Granulicella tundricola MP5ACTX9 plasmid pACIX901, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.88
atctgctcctgttgcccctgttggg CRISPR spacer ggctgctcctgttgcccctgttgcg Protospacer . ********************* *
105. spacer 20.21|3873348|31|CP019858|CRT matches to CP024687 (Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-3-257K, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.903
tgttgggcctgttggacctgttactccaaac CRISPR spacer tgttgggccagttggacctgttactccaatt Protospacer ********* ******************* .
106. spacer 18.3|3245528|25|CP019858|CRISPRCasFinder matches to MN694568 (Marine virus AFVG_250M879, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
tactattggttcatctgtatttggt CRISPR spacer tcaatttggttcatctgtatttggt Protospacer * ********************
107. spacer 18.3|3245528|25|CP019858|CRISPRCasFinder matches to HQ634174 (Cyanophage MED4-213, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
tactattggttcatctgtatttggt CRISPR spacer tgctattggtgcatctgtatttgaa Protospacer *.******** ************.
108. spacer 18.3|3245528|25|CP019858|CRISPRCasFinder matches to GU071101 (Prochlorococcus phage P-HM1, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
tactattggttcatctgtatttggt CRISPR spacer tgctattggtgcatctgtatttgaa Protospacer *.******** ************.
109. spacer 20.2|3872322|25|CP019858|CRT matches to NZ_CP019876 (Komagataeibacter nataicola strain RZS01 plasmid pKNA01, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
tgttgctccatctgctcctgttgga CRISPR spacer tgttgttccatctgctcctgttctt Protospacer *****.****************
110. spacer 20.2|3872322|25|CP019858|CRT matches to MN693962 (Marine virus AFVG_250M1136, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
tgttgctccatctgctcctgttgga CRISPR spacer tgctgctccatctgctgctgttgct Protospacer **.************* ******
111. spacer 20.2|3872322|25|CP019858|CRT matches to MH576968 (Streptomyces phage Wofford, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
tgttgctccatctgctcctgttgga CRISPR spacer tgttgctccatctactcctgctgcg Protospacer *************.******.** .
112. spacer 20.2|3872322|25|CP019858|CRT matches to MN693918 (Marine virus AFVG_250M1135, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
tgttgctccatctgctcctgttgga CRISPR spacer tgctgctccatctgctgctgttgct Protospacer **.************* ******
113. spacer 20.6|3872511|25|CP019858|CRT matches to NC_023007 (Bacillus phage vB_BanS-Tsamsa, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
tgttggacctgctactccatctgct CRISPR spacer tgttggacttgctactgcatctgaa Protospacer ********.******* ******
114. spacer 20.15|3872997|25|CP019858|CRT matches to AP013524 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G3, isolate: uvMED-CGR-C7-MedDCM-OCT-S39-C15) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
atctgctcctgttgcccctgttggg CRISPR spacer tgctgctcctgttgcacctgttggc Protospacer ************* ********
115. spacer 20.15|3872997|25|CP019858|CRT matches to NZ_CP019365 (Borrelia turicatae 91E135 isolate Oz1 plasmid lpE43, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
atctgctcctgttgcccctgttggg CRISPR spacer atcttctcctgtagcccctgttgct Protospacer **** ******* **********
116. spacer 20.15|3872997|25|CP019858|CRT matches to NZ_CP019368 (Borrelia turicatae 91E135 isolate Oz1 plasmid lpT39, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
atctgctcctgttgcccctgttggg CRISPR spacer atcttctcctgtagcccctgttgct Protospacer **** ******* **********
117. spacer 20.15|3872997|25|CP019858|CRT matches to NZ_CP019369 (Borrelia turicatae 91E135 isolate Oz1 plasmid lpU43, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
atctgctcctgttgcccctgttggg CRISPR spacer atcttctcctgtagcccctgttgct Protospacer **** ******* **********
118. spacer 20.15|3872997|25|CP019858|CRT matches to MK113950 (Phage 5P_2, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
atctgctcctgttgcccctgttggg CRISPR spacer atctgctcctgttgctcctggtgac Protospacer ***************.**** **.
119. spacer 20.21|3873348|31|CP019858|CRT matches to CP024687 (Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-3-257K, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.871
tgttgggcctgttggacctgttactccaaac CRISPR spacer tattgggccagttggacctgttactccaatt Protospacer *.******* ******************* .
120. spacer 7.6|1753293|38|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681539 (Clostridium phage phiCD505, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.868
taacctttttattgttgttgttattcttattgttattc CRISPR spacer aatcatccttattgttgttgttattcttattgttattc Protospacer * * *..******************************
121. spacer 8.27|1754791|27|CP019858|PILER-CR matches to NZ_LR135332 (Enterococcus faecium isolate E7471 plasmid 2) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
gatttaaacattgataaaagtatgaaa CRISPR spacer catttaatcattcataaaagtatgcga Protospacer ****** **** *********** .*
122. spacer 8.27|1754791|27|CP019858|PILER-CR matches to NZ_LR135332 (Enterococcus faecium isolate E7471 plasmid 2) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
gatttaaacattgataaaagtatgaaa CRISPR spacer catttaatcattcataaaagtatgcga Protospacer ****** **** *********** .*
123. spacer 12.2|2770904|38|CP019858|PILER-CR matches to NZ_CP020426 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.868
ctctattttttctattattattttatttccatcaaacc CRISPR spacer atctattttttctattactattttattaccatcaaaag Protospacer ****************.********* ********
124. spacer 12.2|2770904|38|CP019858|PILER-CR matches to CP011970 (Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.868
ctctattttttctattattattttatttccatcaaacc CRISPR spacer atctattttttctattactattttattaccatcaaaag Protospacer ****************.********* ********
125. spacer 12.2|2770904|38|CP019858|PILER-CR matches to LN681537 (Clostridium phage phiCD211, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.868
ctctattttttctattattattttatttccatcaaacc CRISPR spacer atctattttttctattactattttattaccatcaaaag Protospacer ****************.********* ********
126. spacer 20.5|3872466|25|CP019858|CRT matches to CP053324 (Salmonella enterica subsp. salamae serovar 40:c:e,n,z15 strain 2013K-0524 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.8
tgttgctccatctgctcctgtattt CRISPR spacer acatgctccatctgttcctgtatta Protospacer ***********.*********
127. spacer 20.15|3872997|25|CP019858|CRT matches to NC_007103 (Bacillus cereus E33L plasmid pE33L466, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.8
atctgctcctgttgcccctgttggg CRISPR spacer cgttgctcctgttgctcctgttggc Protospacer .************.********
128. spacer 20.15|3872997|25|CP019858|CRT matches to NZ_CP009967 (Bacillus cereus E33L plasmid pBCO_1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.8
atctgctcctgttgcccctgttggg CRISPR spacer cgttgctcctgttgctcctgttggc Protospacer .************.********
129. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.853
tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer cgttggccctgttgctcctgttgctcctgttgct Protospacer .***** ********.****************
130. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.853
tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer cgttggccctgttgctcctgttgctcctgttgct Protospacer .***** ********.****************
131. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to NZ_CP053689 (Arthrobacter citreus strain NEB 577 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.853
tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer tgttgggcctgttgctcctgttgctcccgtcgat Protospacer ***************.***********.**.*.
132. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to MN694423 (Marine virus AFVG_250M1001, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.853
tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer tgttgggccagttgccccagttgctcctgtcgcc Protospacer ********* ******** ***********.*
133. spacer 2.1|141460|29|CP019858|CRISPRCasFinder matches to KY971610 (Pseudomonas phage PspYZU05, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tgtaataagttaaagcaatatgaatcaac CRISPR spacer tacgataagttacagcaatacgaatcatc Protospacer *...******** *******.****** *
134. spacer 4.3|1342085|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014152 (Clostridium botulinum strain BrDura plasmid pRSJ20_1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
-ctataacttttattaatttttgtttcataatctttc CRISPR spacer gataaagctttt-tttatttttgtttcataatcttcc Protospacer ** *.***** ** *******************.*
135. spacer 4.3|1342085|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013710 (Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_3, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
-ctataacttttattaatttttgtttcataatctttc CRISPR spacer gataaagctttt-tttatttttgtttcataatcttcc Protospacer ** *.***** ** *******************.*
136. spacer 4.3|1342085|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010379 (Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
-ctataacttttattaatttttgtttcataatctttc CRISPR spacer gataaagctttt-tttatttttgtttcataatcttcc Protospacer ** *.***** ** *******************.*
137. spacer 4.3|1342085|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010418 (Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
-ctataacttttattaatttttgtttcataatctttc CRISPR spacer gataaagctttt-tttatttttgtttcataatcttcc Protospacer ** *.***** ** *******************.*
138. spacer 4.3|1342085|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_012654 (Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
-ctataacttttattaatttttgtttcataatctttc CRISPR spacer gataaagctttt-tttatttttgtttcataatcttcc Protospacer ** *.***** ** *******************.*
139. spacer 4.3|1342085|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP006909 (Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
-ctataacttttattaatttttgtttcataatctttc CRISPR spacer gataaagctttt-tttatttttgtttcataatcttcc Protospacer ** *.***** ** *******************.*
140. spacer 4.3|1342085|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_025146 (Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
-ctataacttttattaatttttgtttcataatctttc CRISPR spacer gataaagctttt-tttatttttgtttcataatcttcc Protospacer ** *.***** ** *******************.*
141. spacer 4.3|1342085|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031095 (Clostridium botulinum strain CFSAN034200 plasmid p1_CDC51232, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
-ctataacttttattaatttttgtttcataatctttc CRISPR spacer gataaagctttt-tttatttttgtttcataatcttcc Protospacer ** *.***** ** *******************.*
142. spacer 8.27|1754791|27|CP019858|PILER-CR matches to NZ_CP035656 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_09 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
gatttaaacattgataaaagtatgaaa CRISPR spacer catttaaccattcataaaagtatgcgc Protospacer ****** **** *********** .
143. spacer 8.27|1754791|27|CP019858|PILER-CR matches to NZ_CP012462 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_7 plasmid ISMMS_VRE7_p2) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
gatttaaacattgataaaagtatgaaa CRISPR spacer catttaaccattcataaaagtatgcgc Protospacer ****** **** *********** .
144. spacer 8.27|1754791|27|CP019858|PILER-CR matches to NZ_CP012462 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_7 plasmid ISMMS_VRE7_p2) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
gatttaaacattgataaaagtatgaaa CRISPR spacer catttaaccattcataaaagtatgcgc Protospacer ****** **** *********** .
145. spacer 8.27|1754791|27|CP019858|PILER-CR matches to NZ_CP035662 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_20 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
gatttaaacattgataaaagtatgaaa CRISPR spacer catttaaccattcataaaagtatgcgc Protospacer ****** **** *********** .
146. spacer 19.2|3706158|31|CP019858|CRT matches to MN693124 (Marine virus AFVG_25M44, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
tgtagagcctgttattccatttgctccagtt CRISPR spacer tattgttcctgttattccatttactccattt Protospacer *.* * ***************.***** **
147. spacer 20.15|3872997|25|CP019858|CRT matches to NZ_CP012101 (Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.76
atctgctcctgttgcccctgttggg CRISPR spacer tgttgctcctgttgcccctgttcca Protospacer .******************* .
148. spacer 18.1|3245393|31|CP019858|CRISPRCasFinder matches to MG869618 (Polaromonas sp. E5S plasmid pE5SP1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
caatacctctggtattggcggatttattata CRISPR spacer cagcacctctggtactggctgatttatcttt Protospacer **..**********.**** *******. *
149. spacer 19.2|3706158|31|CP019858|CRT matches to NC_021536 (Synechococcus phage S-IOM18 genomic sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
tgtagagcctgtt---attccatttgctccagtt CRISPR spacer ---aaatgctgctctaattccatttgctccagtt Protospacer *.* ***.* ******************
150. spacer 20.3|3872367|34|CP019858|CRT matches to NZ_CP047963 (Aeromonas media strain MC64 plasmid pMC64A, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tgttgctcctgttgctcctgctaat--cctgttgct CRISPR spacer tgttgctcatgttgctcctgccaatggcaggctg-- Protospacer ******** ************.*** * *.**
151. spacer 20.16|3873042|34|CP019858|CRT matches to MG945433 (UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 4854-1711, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tgttgctccgtctgctcctgttgctcctgttgct CRISPR spacer ttctgctccttctgctcctgttgctccgtctact Protospacer * .****** ***************** .*.**
152. spacer 20.16|3873042|34|CP019858|CRT matches to NC_015057 (Granulicella tundricola MP5ACTX9 plasmid pACIX901, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tgttgctccgtctgctcctgttgctcctgttgct CRISPR spacer ctctcctccggctgctcctgttgcccctgttgcg Protospacer . .* ***** *************.********
153. spacer 20.16|3873042|34|CP019858|CRT matches to MG945309 (UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 786-1711, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tgttgctccgtctgctcctgttgctcctgttgct CRISPR spacer ttctgctccttctgctcctgttgctccctctact Protospacer * .****** *****************. .*.**
154. spacer 20.16|3873042|34|CP019858|CRT matches to MH412654 (Synechococcus phage S-T4, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tgttgctccgtctgctcctgttgctcctgttgct CRISPR spacer tggtggtgtctctgctactgctgctcctgttgct Protospacer ** ** * . ****** ***.*************
155. spacer 20.16|3873042|34|CP019858|CRT matches to HQ633071 (Synechococcus phage S-SKS1 genomic sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tgttgctccgtctgctcctgttgctcctgttgct CRISPR spacer tggtggtgtctctgctactgctgctcctgttgct Protospacer ** ** * . ****** ***.*************
156. spacer 20.21|3873348|31|CP019858|CRT matches to CP024687 (Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-3-257K, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
tgttgggcctgttggacctgttactccaaac CRISPR spacer ttgagggcctgttggacctgttacaccgatt Protospacer * ******************** **.* .
157. spacer 20.21|3873348|31|CP019858|CRT matches to NZ_CP012101 (Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
tgttgggcctgttggacctgttactccaaac CRISPR spacer tgttggacctgttggacctgttggacctgtc Protospacer ******.***************. ** . *
158. spacer 20.21|3873348|31|CP019858|CRT matches to CP024691 (Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-7-9K, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
tgttgggcctgttggacctgttactccaaac CRISPR spacer ttgagggcctgttggacctgttacacctatt Protospacer * ******************** ** * .
159. spacer 20.21|3873348|31|CP019858|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
tgttgggcctgttggacctgttactccaaac CRISPR spacer cgatggacctgttggtcctgttactcccgat Protospacer .* ***.******** *********** .*.
160. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer tgcttctcctgttgctcctgttgctcctgttgct Protospacer **.* ********.****************
161. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to NZ_CP012101 (Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer actaggtcctgttgctcctgttgctcctgttgct Protospacer * ** ********.****************
162. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to AP013524 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G3, isolate: uvMED-CGR-C7-MedDCM-OCT-S39-C15) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer agcagcgcctgttgcgcctgctgctcctgttgca Protospacer *. * ********* ****.*********** *
163. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to MN693798 (Marine virus AFVG_250M119, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer tgtgcctcctgttgctcctgttgctcctgttgct Protospacer *** ********.****************
164. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to KF437907 (Phormidium phage MIS-PhV1A, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer cgtagctcctgttgctcctgttgctccttttgca Protospacer .** * ********.************ *** *
165. spacer 9.18|1907221|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP044536 (Borrelia sp. CA690 plasmid lp54, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
tggacacaacaaaaatttttcaaaccttttaaaaga CRISPR spacer tttaaacttaaaaaatttttaaaaacttttaaaaga Protospacer * * ** ********** *** ***********
166. spacer 9.18|1907221|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP044536 (Borrelia sp. CA690 plasmid lp54, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
tggacacaacaaaaa-tttttcaaaccttttaaaaga CRISPR spacer -gaatctattaaaaattttttcaaacctttcaaaaga Protospacer *.*. .* .***** **************.******
167. spacer 18.1|3245393|31|CP019858|CRISPRCasFinder matches to LR606148 (Rhizobium sp. Q54 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
caatacctctggtattggcggatttattata CRISPR spacer cgagcaacttggtattggcggatttatgata Protospacer *.* ..****************** ***
168. spacer 20.16|3873042|34|CP019858|CRT matches to NZ_CP026091 (Ralstonia solanacearum strain IBSBF 2570 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tgttgctccgtctgctcctgttgctcctgttgct CRISPR spacer gcctgctcggtctgctcctgttgctgctgcaggt Protospacer .***** **************** ***. * *
169. spacer 20.16|3873042|34|CP019858|CRT matches to NZ_CP026093 (Ralstonia solanacearum strain SFC plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tgttgctccgtctgctcctgttgctcctgttgct CRISPR spacer gcctgctcggtctgctcctgttgctgctgcaggt Protospacer .***** **************** ***. * *
170. spacer 20.16|3873042|34|CP019858|CRT matches to NZ_CP012944 (Ralstonia solanacearum strain IBSBF1503 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tgttgctccgtctgctcctgttgctcctgttgct CRISPR spacer gcctgctcggtctgctcctgttgctgctgcaggt Protospacer .***** **************** ***. * *
171. spacer 20.16|3873042|34|CP019858|CRT matches to NC_017575 (Ralstonia solanacearum Po82 megaplasmid, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tgttgctccgtctgctcctgttgctcctgttgct CRISPR spacer gcctgctcggtctgctcctgttgctgctgcaggt Protospacer .***** **************** ***. * *
172. spacer 20.16|3873042|34|CP019858|CRT matches to NZ_CP026308 (Ralstonia solanacearum strain IBSBF 2571 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tgttgctccgtctgctcctgttgctcctgttgct CRISPR spacer gcctgctcggtctgctcctgttgctgctgcaggt Protospacer .***** **************** ***. * *
173. spacer 20.16|3873042|34|CP019858|CRT matches to NZ_CP012940 (Ralstonia solanacearum strain UW163 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tgttgctccgtctgctcctgttgctcctgttgct CRISPR spacer gcctgctcggtctgctcctgttgctgctgcaggt Protospacer .***** **************** ***. * *
174. spacer 20.16|3873042|34|CP019858|CRT matches to NZ_CP051295 (Ralstonia solanacearum strain CIAT_078 plasmid megaplasmid, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tgttgctccgtctgctcctgttgctcctgttgct CRISPR spacer gcctgctcggtctgctcctgttgctgctgcaggt Protospacer .***** **************** ***. * *
175. spacer 20.18|3873138|34|CP019858|CRT matches to MN693652 (Marine virus AFVG_250M189, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
aggtgttcctgtcgctcctgttggacctattaat CRISPR spacer atttgttcctgacgctcctgttgaacccgttgac Protospacer * ******** ***********.***..**.*.
176. spacer 20.21|3873348|31|CP019858|CRT matches to CP024687 (Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-3-257K, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tgttgggcctgttggacctgttactccaaac CRISPR spacer tgttggacctgttggacctgttggaccggtt Protospacer ******.***************. **.. .
177. spacer 20.21|3873348|31|CP019858|CRT matches to CP024687 (Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-3-257K, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tgttgggcctgttggacctgttactccaaac CRISPR spacer ttgaggtcctgttggacctgttacacctatt Protospacer * ** ***************** ** * .
178. spacer 20.21|3873348|31|CP019858|CRT matches to NC_010180 (Bacillus mycoides KBAB4 plasmid pBWB401, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tgttgggcctgttggacctgttactccaaac CRISPR spacer ggttgggcctgttgggcctgttatacctgtt Protospacer **************.*******. ** . .
179. spacer 20.21|3873348|31|CP019858|CRT matches to NZ_CP012105 (Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-6, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tgttgggcctgttggacctgttactccaaac CRISPR spacer tgttggtcctgttggacctgttgaacctgtt Protospacer ****** ***************. ** . .
180. spacer 20.21|3873348|31|CP019858|CRT matches to NZ_CP028885 (Borrelia turcica IST7 plasmid lp129, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tgttgggcctgttggacctgttactccaaac CRISPR spacer tgttgggcctgttgggcctgttgggcttatt Protospacer ***************.******. *. * .
181. spacer 20.21|3873348|31|CP019858|CRT matches to MT375529 (Pelagibacter phage Kolga EXVC01, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tgttgggcctgttggacctgttactccaaac CRISPR spacer agttgggcctgttgaacctgttattgatgaa Protospacer *************.********.* .*
182. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer ggatactcctgttgctcctgttgctcctgttgct Protospacer * *. ********.****************
183. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to NC_007103 (Bacillus cereus E33L plasmid pE33L466, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer cgtcactcctgttgctcctgttgctcctgttgct Protospacer .**.. ********.****************
184. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to NC_007103 (Bacillus cereus E33L plasmid pE33L466, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer cgttactcctgttgctcccgttgctcctgttgct Protospacer .***. ********.**.*************
185. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to NC_007103 (Bacillus cereus E33L plasmid pE33L466, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer cgttactcctgttgctcccgttgctcctgttgct Protospacer .***. ********.**.*************
186. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to NC_007103 (Bacillus cereus E33L plasmid pE33L466, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer cgttactcctgttactcctgttgctcctgttgct Protospacer .***. ******.*.****************
187. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to NZ_CP009967 (Bacillus cereus E33L plasmid pBCO_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer cgtcactcctgttgctcctgttgctcctgttgct Protospacer .**.. ********.****************
188. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to NZ_CP009967 (Bacillus cereus E33L plasmid pBCO_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer cgttactcctgttactcctgttgctcctgttgct Protospacer .***. ******.*.****************
189. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to NZ_CP009967 (Bacillus cereus E33L plasmid pBCO_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer cgttactcctgttgctcccgttgctcctgttgct Protospacer .***. ********.**.*************
190. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to NZ_CP012105 (Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-6, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer atctggaaatgttggccctgttggtcctgttgga Protospacer .***. ***** ******** **********
191. spacer 4.3|1342085|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024317 (Borrelia miyamotoi strain Yekat-6 plasmid pYkt6-lp72, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ctataacttttattaatttttgtttcataatctttc CRISPR spacer tcataaattttattaatttttgcttcatctttatta Protospacer ..**** ***************.***** *. **
192. spacer 4.3|1342085|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024206 (Borrelia miyamotoi strain Izh-5 plasmid pIzh5-lp72, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ctataacttttattaatttttgtttcataatctttc CRISPR spacer tcataaattttattaatttttgcttcatctttatta Protospacer ..**** ***************.***** *. **
193. spacer 4.3|1342085|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024352 (Borrelia miyamotoi strain Izh-16 plasmid pIzh16-lp72, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ctataacttttattaatttttgtttcataatctttc CRISPR spacer tcataaattttattaatttttgcttcatctttatta Protospacer ..**** ***************.***** *. **
194. spacer 4.3|1342085|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021873 (Borrelia miyamotoi strain CA17-2241 plasmid lp72, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ctataacttttattaatttttgtttcataatctttc CRISPR spacer tcataaattttattaatttttgcttcatctttatta Protospacer ..**** ***************.***** *. **
195. spacer 4.3|1342085|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024372 (Borrelia miyamotoi strain Izh-14 plasmid pIzh14-lp72, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ctataacttttattaatttttgtttcataatctttc CRISPR spacer tcataaattttattaatttttgcttcatctttatta Protospacer ..**** ***************.***** *. **
196. spacer 4.3|1342085|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024391 (Borrelia miyamotoi strain Izh-4 plasmid pIzh4-lp72, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ctataacttttattaatttttgtttcataatctttc CRISPR spacer tcataaattttattaatttttgcttcatctttatta Protospacer ..**** ***************.***** *. **
197. spacer 4.3|1342085|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024334 (Borrelia miyamotoi strain Yekat-1 plasmid pYkt1-lp72, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ctataacttttattaatttttgtttcataatctttc CRISPR spacer tcataaattttattaatttttgcttcatctttatta Protospacer ..**** ***************.***** *. **
198. spacer 11.1|2605092|35|CP019858|PILER-CR,CRT matches to NZ_CP045274 (Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301B, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
acaattattaattgttttattagtgaaatcacagc CRISPR spacer tgaattcttaattgttttattagagaaataccttt Protospacer **** **************** ***** * .
199. spacer 18.1|3245393|31|CP019858|CRISPRCasFinder matches to NZ_MK748464 (Candidatus Endohaliclona renieramycinifaciens plasmid p-ren_Ren-PNG-07060 clone Ren-PNG-07060, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
caatacctctggtattggcggatttattata CRISPR spacer tgcagcctctgatattggcgtatttattact Protospacer .. .******.******** ********.
200. spacer 18.1|3245393|31|CP019858|CRISPRCasFinder matches to NZ_MK748465 (Candidatus Endohaliclona renieramycinifaciens plasmid p-ren_Ren-PNG-07113 clone Ren-PNG-07113, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
caatacctctggtattggcggatttattata CRISPR spacer tgcagcctctgatattggcgtatttattact Protospacer .. .******.******** ********.
201. spacer 18.1|3245393|31|CP019858|CRISPRCasFinder matches to NZ_MK748462 (Candidatus Endohaliclona renieramycinifaciens plasmid p-ren_Ren-Bali-16-03 clone Ren-Bali-16-03, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
caatacctctggtattggcggatttattata CRISPR spacer tgcagcctctgatattggcgtatttattact Protospacer .. .******.******** ********.
202. spacer 18.1|3245393|31|CP019858|CRISPRCasFinder matches to NZ_MK748463 (Candidatus Endohaliclona renieramycinifaciens plasmid p-ren_Ren-Pal-02 clone Ren-Pal-02, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
caatacctctggtattggcggatttattata CRISPR spacer tgcagcctctgatattggcgtatttattact Protospacer .. .******.******** ********.
203. spacer 20.16|3873042|34|CP019858|CRT matches to NZ_CP034351 (Streptomyces sp. W1SF4 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tgttgctccg--tctgctcctgttgctcctgttgct CRISPR spacer --tcatctcggttctgctcctgctgctcctgtcgct Protospacer *.....** **********.*********.***
204. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer tccaacacccgttgcccctgttggtcctgttggt Protospacer * . . .**.************* *********
205. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer agttacccctgttgctcctgttactcctgttatt Protospacer ***. ********.******.********.
206. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to NC_007103 (Bacillus cereus E33L plasmid pE33L466, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer cgtcactcctgttgctcccgttgctcctgttgct Protospacer .**.. ********.**.*************
207. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to NC_007103 (Bacillus cereus E33L plasmid pE33L466, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer cgttactcctgttgctcctgttgctcccgttact Protospacer .***. ********.***********.***.
208. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to NC_007103 (Bacillus cereus E33L plasmid pE33L466, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer cgttactcctgttgctcctgttgctcccgttact Protospacer .***. ********.***********.***.
209. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to NC_007103 (Bacillus cereus E33L plasmid pE33L466, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer cgttactcctgttgctcctgttgctcccgttact Protospacer .***. ********.***********.***.
210. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to NC_007103 (Bacillus cereus E33L plasmid pE33L466, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer cgttactcctgttgctcctgttgctcccgttact Protospacer .***. ********.***********.***.
211. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to NZ_CP009967 (Bacillus cereus E33L plasmid pBCO_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer cgtcactcctgttgctcccgttgctcctgttgct Protospacer .**.. ********.**.*************
212. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to NZ_CP009967 (Bacillus cereus E33L plasmid pBCO_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer cgttactcctgttgctcctgttgctcccgttact Protospacer .***. ********.***********.***.
213. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to LR606148 (Rhizobium sp. Q54 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer ggtcaccactgttgcctctgatgctcctgttgaa Protospacer **.. ********.*** ***********.*
214. spacer 7.6|1753293|38|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009639 (Bacillus cereus 03BB108 plasmid pBFI_1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.737
taacctttttattgttgttgttattcttattgttattc CRISPR spacer cattattcgaattgttattgttattgttattgttattg Protospacer .* . **. ******.******** ***********
215. spacer 7.6|1753293|38|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053963 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_802 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.737
taacctttttattgttgttgttattcttattgttattc CRISPR spacer cattattcgaattgttattgttattgttattgttattg Protospacer .* . **. ******.******** ***********
216. spacer 7.6|1753293|38|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP047143 (Lactobacillus sp. C25 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.737
taacctttttattgttgttgttattcttattgttattc CRISPR spacer ttgatgagttattgttgttgttattattgttgttatta Protospacer * . . ***************** **.********
217. spacer 7.6|1753293|38|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP049229 (Lactobacillus iners strain C0210C1 plasmid pC0210C1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.737
taacctttttattgttgttgttattcttattgttattc CRISPR spacer tattagaactattgttattgttattattattgttatta Protospacer ** . .*******.******** ***********
218. spacer 7.6|1753293|38|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP049229 (Lactobacillus iners strain C0210C1 plasmid pC0210C1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.737
taacctttttattgttgttgttattcttattgttattc CRISPR spacer tattagaactattgttattgttattattattgttatta Protospacer ** . .*******.******** ***********
219. spacer 8.18|1754913|36|CP019858|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP045274 (Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301B, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
tgctgtgatttcactaataaaacaattaataattgt CRISPR spacer aaaaggtatttctctaataaaacaattaagaattca Protospacer . * ***** **************** ****
220. spacer 9.19|1907286|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP013411 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G16, isolate: uvMED-CGR-C108A-MedDCM-OCT-S29-C43) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
aatttctgtgctaaaaatttagttacagaatataaa CRISPR spacer aatttctttgctaaaaatttagctacttcattacct Protospacer ******* **************.*** **
221. spacer 9.19|1907286|36|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP013669 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C108A-MedDCM-OCT-S25-C43, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
aatttctgtgctaaaaatttagttacagaatataaa CRISPR spacer aatttctttgctaaaaatttagctacttcattacct Protospacer ******* **************.*** **
222. spacer 11.1|2605092|35|CP019858|PILER-CR,CRT matches to NC_022783 (Bacillus toyonensis BCT-7112 plasmid pBCT8, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
acaattattaattgttttattagtgaaatcacagc CRISPR spacer ggtattattacttgtttttttagtgaaaataaaat Protospacer . ******* ******* ********* .* *..
223. spacer 11.1|2605092|35|CP019858|PILER-CR,CRT matches to NC_019526 (Enterobacteria phage vB_KleM-RaK2, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
acaattattaattgttttattagtgaaatcacagc CRISPR spacer gaagtcattaattgttttattaatgatatcaagaa Protospacer . *.*.****************.*** **** ..
224. spacer 11.1|2605092|35|CP019858|PILER-CR,CRT matches to MT708547 (Klebsiella phage Muenster, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
acaattattaattgttttattagtgaaatcacagc CRISPR spacer gaagtcattaattgttttattaatgatatcaagaa Protospacer . *.*.****************.*** **** ..
225. spacer 11.1|2605092|35|CP019858|PILER-CR,CRT matches to AB897757 (Klebsiella phage K64-1 DNA, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
acaattattaattgttttattagtgaaatcacagc CRISPR spacer gaagtcattaattgttttattaatgatatcaagaa Protospacer . *.*.****************.*** **** ..
226. spacer 11.5|2605092|36|CP019858|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP045274 (Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301B, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
acaattattaattgttttattagtgaaatcacagca CRISPR spacer tgaattcttaattgttttattagagaaatacctttt Protospacer **** **************** ***** * .
227. spacer 19.7|3706401|40|CP019858|CRT matches to MH884511 (Exiguobacterium phage vB_EalM-132, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.75
tgttattccatttgctccggtcgctccagttgcacctcta CRISPR spacer tactaccgcatttgctccgttggctccagttgcaccatca Protospacer *..**.. *********** * ************** ..*
228. spacer 20.16|3873042|34|CP019858|CRT matches to MN176227 (Bacillus phage 049ML001, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
tgttgctccgtctgctcctgttgctcctgttgct CRISPR spacer tccaaatccgtctgcgccttttgctcctgtatca Protospacer * . . ********* *** ********** *
229. spacer 20.16|3873042|34|CP019858|CRT matches to X89721 (Bacteriophage SPP1 head morphogenesis genes 7 to 15) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
tgttgctccgtctgctcctgttgctcctgttgct CRISPR spacer tccaaatccgtctgcaccttttgctcctgtatca Protospacer * . . ********* *** ********** *
230. spacer 20.16|3873042|34|CP019858|CRT matches to MN176228 (Bacillus phage 049ML003, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
tgttgctccgtctgctcctgttgctcctgttgct CRISPR spacer tccaaatccgtctgcgccttttgctcctgtatca Protospacer * . . ********* *** ********** *
231. spacer 20.16|3873042|34|CP019858|CRT matches to X97918 (Bacteriophage SPP1 complete nucleotide sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
tgttgctccgtctgctcctgttgctcctgttgct CRISPR spacer tccaaatccgtctgcaccttttgctcctgtatca Protospacer * . . ********* *** ********** *
232. spacer 20.18|3873138|34|CP019858|CRT matches to NZ_CP020744 (Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
aggtgttcctgtcgctcctgttggacctattaat CRISPR spacer tgtcagacctgttgctcccgttggacctatttct Protospacer * .. *****.*****.************ *
233. spacer 20.18|3873138|34|CP019858|CRT matches to NZ_CP020744 (Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
aggtgttcctgtcgctcctgttggacctattaat CRISPR spacer tgtcagacctgttgctcccgttggacctatttct Protospacer * .. *****.*****.************ *
234. spacer 20.18|3873138|34|CP019858|CRT matches to NZ_CP020744 (Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
aggtgttcctgtcgctcctgttggacctattaat CRISPR spacer tgtcagacctgttgctcccgttggacctatttct Protospacer * .. *****.*****.************ *
235. spacer 20.18|3873138|34|CP019858|CRT matches to MT219824 (Escherichia coli strain RT18-1 plasmid pRT18-1_294k_tetX, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
aggtgttcctgtcgctcctgttggacctattaat CRISPR spacer tgtaggacctgtcgctcctgtaggacctgttgcg Protospacer * * ************** ******.**.
236. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to NZ_CP053689 (Arthrobacter citreus strain NEB 577 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
---------tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer cgttattcctgttgggcctgttgctcctgttgct--------- Protospacer ***************.*********
237. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to NZ_CP019365 (Borrelia turicatae 91E135 isolate Oz1 plasmid lpE43, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer atcttctcctgtagcccctgttgctgctgtttta Protospacer .* ***** ************ ***** *
238. spacer 20.22|3873399|34|CP019858|CRT matches to NZ_CP019368 (Borrelia turicatae 91E135 isolate Oz1 plasmid lpT39, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
tgttgggcctgttgcccctgttgctcctgttgga CRISPR spacer atcttctcctgtagcccctgttgctgctgtttta Protospacer .* ***** ************ ***** *
239. spacer 7.5|1753227|37|CP019858|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP047444 (Spiroplasma citri strain BLH-MB plasmid pSciBLHMB-7) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
gactttgaagaaaataatttagttatatcttgggaag CRISPR spacer aatgatgaaaaaaataatttaattatatcttatataa Protospacer .*. ****.***********.*********. . *.
240. spacer 8.26|1754912|37|CP019858|CRT matches to NZ_CP045274 (Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301B, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
ttgctgtgatttcactaataaaacaattaataattgt CRISPR spacer caaaaggtatttctctaataaaacaattaagaattca Protospacer . . * ***** **************** ****
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DBSCAN-SWA_1 |
206307 : 297681
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP019858|206307:297681|DBSCAN-SWA 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>CP019858|206307:297681|288218_289469_+|AXU77724.1|DBSCAN-SWA MKILVVGGGGREHAICWKLSKEKNVEKIYCAPGNAGIANVAECVNIGDTNIEELLKFAKENEIGLTIVGPEVPLVMGIVDEFEKEGLRVFGPNKKCAQLEGSKAFSKEFMIKHNIPTAKYKEYTNLEEAISEIDSFGYPVVIKADGLAAGKGVVIPENREDAIATLKEMMSDKKFGAAGDKIVIEEFLKGIETSILAFVDNDTIVPMASAKDHKKVNNYEQGPNTGGMGTFSPSEIYTEELANKVKETVLEKTLEGFKKDGLNFKGILFVGLMITEDGEKVLEYNVRFGDPETQSVLFRLETDLHEIMEAILDNKLKDIEINYSDDEAVCVMLTSGGYPDSYEKGKIITGLENLDDDIVVFHSGTKMFDGNLVTNGGRVIGITAKSTTVKDAAEKVYENIKKINFEGMHYRTDIGR |
75 | Clostridium_phage(10.34%) | protease,transposase,coat | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
452172 : 464007
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP019858|452172:464007|DBSCAN-SWA TGTGAAGAAAAAAGATGTTATAGAATTTGAAGTAGATAAAATGGAATTTGGTGGTACATCTTTAAGCCAAGTTGGAGATAGAGTTATCCATATGAAGGGTGGAATAAGTGGTCAAAAGGTGAGAGCTGGAGTTAAAAAAGTTAGAAGTAAGAAAGCTGAAGTTAAGATGATAGAATTATTAGAGAACTCACCACTTGAAACTGAAGAAACTTGCAAGCACTTTAGAGAGTGTGGAGGATGTACACTATTGTCTGTGCCATATGAAAAACAATTAGAAATAAAAGAAAAACAAGTTATGGATTTATTTTTAAAGCAAGATTTATTTGGATTTCAGTTTTTAGGGATAGAAGGAAGTCCAGAAAACAAATATTATAGAAATAAGATGGAATATACTTTTGGAGATGAAGTAAAAAATGGACCTTTGACATTAGGTCTTCATAAAAAAGGAAAGCATATAGATATACAAACTGTTGAGGAGTGTATGTTGGTTGATGAAGACTTCTCAAAGATATTAGTTTCTAGTGTAGAGTTTTTCAATGAAAAAAAGCTTCCTTATTATAGAACAATGAATCACAAAGGATATTTGAGACATCTTGTAGTTAGAAAAGGTATTCATACTAATGAGATTATGGTTAATATAGTAACTTCTTCTCAACAAGATTTTGATATGAATGAGTTTAAAGATATGCTTTTAGGGATTGATTTAAAAGCTGAGTTAGTAGGTGTACTTCATACTATTAATGATGGTTTAGCAGATGCAGTCCAATGTGATGAGTTAAGAGTATTGTATGGAAGAGATTATATACAAGAAGAAATTTTAGGTCTTAAGTTTAAGATTTCACCATTTTCGTTTTTCCAAACCAATACTAAGGGAGCTGAGGTTCTTTATAGTATTGCTAGGGATTTTATTGGAGATTACAATGATAAAGTTGTATTTGACTTGTATAGTGGTACTGGGTCTATTGGACAGGTTATGGCTGGTGCTGCTAAGAAAGTGTATGGTATTGAGATAGTTGAGGAAGCTGTTGTTACTGCTAATGAGAATGCTAAGTTGAATGGACTTACTAATTGTGAGTTTATTGCTGGGGATGTGGCTAAGGTTGTTAAGGATTTAAAGGACAAGCCTGATTTGATTATTGTTGACCCTCCTAGACCAGGCATTCATAAGGATGCTATTAGGGATATTTGTGGATTTGGTGCTAAGGAGATTGTTTATATTTCTTGTAATCCTAAGTCTTTGGTTGTTGATTTGGTTGATTTTAAGGGGTATGGTTATGAGATTAAGATGGTTAAGTGTATGGATATGTTCCCAAATACGCCACATTGTGAGACTGTAGTTAAACTTATTAGAGAATAACAGGGTTTCAGACTTTTATATTGTGTCTTAAAAGTAGATTTGCCACCTATTTGCCACCATAATTATTTTTGGGTGGCAAATTTATTCTACAATGATTTCAAAAATATTTACCGTCTGGTTTCTCATGTTATTAGTTACATGTAAATATGTATCCATAGTTGTTGAAGTTTTAGCATGTCCGAGTATATGCTGGATATCTTTTATATTAGTACCATTTTCTAATAACATAGTATCAGGGTTTTTAAAATAAAGTGTGTATTCTTCTAAAGTAGTGATAATTAAAATATCAAATATCACTATACAAAGGAAAGTGCACGCTTTTTATGTTTAAAAAAAACGAAATATTAAAAAACTTATTGAAGAATATGATGTCAAAACAACTACAGATATTCAAGATATGCTAAAAGATTTATTTACAAATACAATTCATCAAATATTTACATTGTCGAATTTTAACGGTTTAAACATAATATATTGACTGATATAATAAAATCATAGAATATTTTAGGGGGAAATAGATTATGTTTAAGAAAAAGTTAATAGCTGTTGCAATGAGTATAACTATGATTAGTGTAGGGAGCTTTTCGTATGCTCATTCAGGAAGAACTGATTCATCAGGAGGTCATCGTGATAATAAAAATAAATCTGGATTAGGAAGTTATCACTATCATTGTGGTGGTTATCCAGCTCATTTACATAATAATGGTGGTTGTCCTTATACTGGAGGAGGAAGCAGTTCTGGAACAACAACTTCGGTTAATAATGAAGAAAAGCAAAAGAGGTCTGTTGGAGAAAAAGGATATAATCAAGGGTATGAAGATGGGTATAAAGGAAATTATAGTTCATCAAATTATAGTGGAGATTATAGTGATACATATGAATCAAAGTACTCAGAAGGATATGAAAAAGGTAAGGCTAAATTAGAAGAGGAAGAAAAGGTGGCTAAAGAGACTGGATATAATTTAGGGCTTACAGGTGCTAAATCTAATAATACATATGAAAAAGAAGTTTTAAAAAATGCTTATGATACCGGATATTCAACTGGATACAATGAATATAAGACTAAAAAGATAGAAGAATATAAAGTTAAAGGGATAGAGGATAGCAATAAAGATAAAGAAAAAATGACATTTGAAGAAAACATAGATTCTGAATTTATAGATGCTTATAATAATGCTTATGACGAAATACAAGAACAATTAAAAAATGATTACACTACTCAAGGATTTGAGAGTGCTATCAAAGGAGAAAGATTTGACACATCAACTATAGGTAATGTTAAATATGCTAATTGGTTTAAAGAAGGATATGATAATGGTAAGGTTAAGTTACCTAAAGCAAAAGAAAGTGTATATAATCAAGGTTACAATGAAGAAGATTTTAGTATACCAGACGAAATGAAGTCTATTGAAACTAAGTTAAAAGGTGTATATGATGAAGGTTTAGAAAAAAGAGAAGAAGAGAAAAGTAGAAATGCTACTTATGGGGTTGGAGCTGGAACAGCAGCTGTAGTTGCTGGAGTAGTATATAAGAAGAAAAAACGTAAAAAGATATAGATGCTAGATATACCAATGATGACAAGTGTATAACAAATATAATTTTAAGTATAAATATTTAAAATATAGAAGGGAAGGTTATATCTATGGGATTTAACTTTAGGAAAAGCATAAATCTAGGAGGAGGACTCAAATTAAATTTAGGTAAGAAGAGTGTAGGTATAAGTGCTGGTGTTAAAGGTGCTAGAGTGTCAGTTAATTCAAAAGGAAGAAAATCAGTTACATTGAGTATACCTGGAACTGGAATATCATATACAAAAACTAGTACAAAGAAACGTAAACCTAAATAAATATTTGATATACTAAGAAATAGACTGTTACAAATAGTCTATTTTTTAGTATATAGATTTAAAAAGTGACAAAATTTTGAAATATAAACTAATTTCATAAAAGAAAATATTCTTTTATGTAGAATTATAATATTTAAGTAATATTATAAAATTTATAGGAGGATTTCATTATGAAATTAAGCAAAACACTATTGGCAATAGGGATGTCTGTTTCATTATTGATTGCTAGTTGTCCAACATCAAACGCTCTTAGTTCTATTAATTCAATAAAAGGTACAAATAAGTATGAAACAGCAGGTTTAATAGCAGATAAACAAAATTATGATATTGCAATACTTATTAATTCTGAAAATGGATTATCTGATGGATTGTCAGCAAGTGGATTGTCAGGAGCTAAAAATGCCCCAATATTGTTAACTAAGAAAGATACAATCCCTTCAGAAACATTAAAAAGATTAGAAAAGGTAAAAGAAGTATATCTAATTGGAGGAAAAAATTCGATAGGAGCATCAGTTCAGAAAATATTAAGTGATAAAAAAATAAGCATAAATAGAATAAGTGGAACTGATAGAATAGATACAAGTCATAAAGTTGCAAAAGAAATAGGAAGAGTAAGTACGGTTAAAAAAGTAATATTAACTAATGCTTTTAAAGGCGAACCAGATGCTATGAGTGTTGCTTCTATAGCAGTTAGAGATAAATCTCCAATAGTATTAACTGATGGAAATACTACAAGTTTTGTTACAGATGGATTAGAAACTTATGCAATTGGTGGAAAAGTCAGTATGAGTGATAAGTTAATAAATGAAACTAAAGCAACAAGAATAGGTGGAGTAGATAGATACGATACAAATAAACAAATAATAAATAAATTTTATAATGGCTCAAAAGAATTTTACATAGCAAGTGGGACTGATTTAGTTTATTCTTTAGTTGGTTCTACAATTGCACAAAAAACACCTATAGTGTTAGTTGGAAATGGAAGTAATAAGAGTATATTAAAAAATGCAAGTAAAATAACTGCTATTGGAAATATTGATGATGTTGTTATAAAACAATGTTTAAATATAACTAATAATGTTGGAGATTCAAATACAGGTATTGTAAAAGATACTAATTCAAATAATACGAACAAACCAAGTAATGAGCCTAGCTCTAATAATCCTGGATTAACTGATAAAAGTACAGTATATGTAACTCCTAATGGAAAATCATATCATCTAACAAAAAATTGTTCTACACTAAAAAGAAGTAAAACAATAAATAAAGTAACATTAAAACAGGCTAAGTCACAAGGTAAAATAGACCCTTGTAATGTTTGTGTAAAATAATGTATTAGCCAAATATATATTAAAAAAGACAATTAATTAAGATTGTCTTTTTTATTGAAGAAATATAAATTTATATTATGTATTATTAAAAAGAAAATTATTTTTCAAAAAACTTACTAAATTTCTGATTATCTTTTCATAAGTTGGTAAATGCCGATATATCCCGTATTTTAGGGCTTTATCGGTATTTTCTTTTCGGAAGATACCTTGCATAAGCTGGCATTTACCAGCATGAAAATGCAACCAAAAGTAGTAAATGAGTAGTAAATATAAGCTCCGATATTAACAAGCCAGTCTTTCCAGTTCTGCTTTTGCAGATTGAAATGTACCGTGTGCGTAATAGCCAAGTGTCATGGTTATGTTAGCGTGTCCCATGAGGTATTGCAGAGTGTTTGGGTTCATTCCTCTGTTTGCCATATTCGTACAATAAGTATGTCTGAATGAATGTGGCGTGATGTTCGGTAAC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CGTCCGCAGCGCCGATAATGGTATATCCCGCCCGCTTTGCGTAAAGCTGGAGCAAGAACCGCTGGTGTTCCAATGCAAAGGTATCGTCACGGGCCACACGGCAGTAAATGAAAACTCTCATATCCCACACCACCTTTACACCGCCGGGGCGTAGCTTAATGCTACGCCTTTTCTCGTTTCCAGCAGGATGTCCCGCTCGGGGATTTTGCGGCGATCCGGCACCTCAAAGGCCCCGATACAGTTGTAGTGGATCGTCACCCGCTGGTTGGTTACACCGTCCTCCTTGACCGCAGGATAGACCTCGATGTGGTCAATCAGCTCGGCTACCATTCGTTTGGTGATCTTGGCGGCGTTGGTGTAGTGGCGTACCGTTTCCAAGAAGTCATCTACATCCATCCGCTTTTCTTCCAGCTTTTTCACTTCCAGCCGCAGGGCCTTGATGCGTCCGGCGTTCTCGCCCTGCTCCTGCTCATAGCGCTTTGCCATTTTCGCAAACCGGGCATCGTCGATCTTGCCGGAAACATTGTCCTCATACAGCCGCTCAAAGAGTGTGTCCAACTCCCGGTCACGGGCCAGCAGCCCATCCAGCTCCCGCTTTTTGCGTACCCGCTCATTTTCGGCTACCTTTGCCGAGCGGCCCACCATCGCTTTGATAAAGTCGTTTTCGTACTCGTTGGCGAAACAGGCCAGCCGATGCACCTCGTAGAGAACGACCTGCTCCAAGAAGTCCAGCCGAATATAGTGGGTGGACGAGCATTTACGCAGCCCCGAATTATGGTTTTGGCAACTGAAAAACTTGATGTCGTGGTTGTTCTGATTAAAGTGGAAGTTCAGATTGCCGCCGCACTCGGGACACTTCATCACGCCGGAAAAGGCGCTTGGCTCTTGGGTGACGGTGGGGCGCTTGCGCCGGGTTCCGGCCTTCAGCGCCTGTACCTTTTCCCAAGTGGGCCGATCAATAATAGCCTCGTGAACATTGAGGAAGATCGCCCGGTTTTCCTCCGGGTTTTCGATCCGGCGCTTCATCTTGTAGGATTTGGAGTAGCTTTTGAAGTTGATGACATCGCCGCAATACTCCTGCGTGGTAAGGATTTTCTTGATCGTGGTATGGCCCCACTTGGTAGGCTCCAAGGTACTTTTGGAACCGCCCCGGCTTGTACCCTTGCTGCGCCAGTAGTAGGTGGGGTTGACGATACCATCAGCGCCGAGAGCGGCGGCAGTTTCGGCCAGCCCGTACCCCTCCAGCGCCATGCGGTAGATACGGCGCACCACATCGGCGGCCACGGGATCGACCACCCAAAACCGGGGATCGTCCGGGTTTTTGATATAGCCATAGGGCGGTGGGGACAGCGGAATCCCGGCGTTGCCTTTCATCTTATTGACGATCCGGCGCTTCTTGGAGATGTCCTTGGCGTAGTACTCATTCATTATGTTTTTGAACGGGGTGAAGTCATCCTCGCCCTCGTCGCTGTCCACGCCATCGGACACGGCCACCAGCCGCACATCATGAAGCGGGAAAAACTCCTCGGTGAGCTTACCCACCTCAATGTAGTTGCGGCCCAGCCGGGACAGGTCTTTGACGAACACCGCCGAGATATACCCGGCCTCGATTGCGGCGATCATTTTCTGAAAGCCGGGGCGCTTCATGGTGGTGCCGGTGATACCGTCATCCACGAAAAAGATGGTGTCCGTATAGCCCTTGTCCTTGGCGGCTTTTTGCAGTATCTTTTTCTGATTGCTGATGCTGTTGGACTCGTTGTCCATATTATCATCACGGCTCAGTCGGCAGTAAAGGGCGGCTGTGCCGAGGGCGGTTTTCTTGCTTGACTGTTTCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP019858|452172:464007|462306_464007_-|AXU77893.1|DBSCAN-SWA MKQSSKKTALGTAALYCRLSRDDNMDNESNSISNQKKILQKAAKDKGYTDTIFFVDDGITGTTMKRPGFQKMIAAIEAGYISAVFVKDLSRLGRNYIEVGKLTEEFFPLHDVRLVAVSDGVDSDEGEDDFTPFKNIMNEYYAKDISKKRRIVNKMKGNAGIPLSPPPYGYIKNPDDPRFWVVDPVAADVVRRIYRMALEGYGLAETAAALGADGIVNPTYYWRSKGTSRGGSKSTLEPTKWGHTTIKKILTTQEYCGDVINFKSYSKSYKMKRRIENPEENRAIFLNVHEAIIDRPTWEKVQALKAGTRRKRPTVTQEPSAFSGVMKCPECGGNLNFHFNQNNHDIKFFSCQNHNSGLRKCSSTHYIRLDFLEQVVLYEVHRLACFANEYENDFIKAMVGRSAKVAENERVRKKRELDGLLARDRELDTLFERLYEDNVSGKIDDARFAKMAKRYEQEQGENAGRIKALRLEVKKLEEKRMDVDDFLETVRHYTNAAKITKRMVAELIDHIEVYPAVKEDGVTNQRVTIHYNCIGAFEVPDRRKIPERDILLETRKGVALSYAPAV >CP019858|452172:464007|460127_461861_-|AXU77891.1|DBSCAN-SWA MKKLKEILFLSDKGYTDLKKAIIACTITNLAMLLPFCITVMVFSELLNPFLGQELDWQNIWLLWGAGIISAIIVFLASKNDYRKTYIASYKESNVTRLRIAEHLRKLPMSFFNTKDLSELTTNMMSDCSSMESMLSSTIPPLIANGISVTLTCVLLALFDWRLALCVFITLPIAFLVIWCSRKYQIKLFEKQVETKLNASSQVQEYLEGIKIIKSCNLSGVHFRTLNRALLEMKKIAVKVEMVVGIFMSSASMILQAGIGITIFVGTILLVNGQIELLPLLMFFLIVTKIYGPILAILSQLTTLLNLNVVTERMKTLLTTPAMSGKEETPQTYNIKLNDVSFAYNNEDVIHNVSCTIPQGSITALVGPSGSGKSTIAKLIARFWDIQSGSITIGNKNIKTINPENLMEKMSFVFQDVTLFNDTVFNNIQMGNPNATKEQVYKAAKVAYCDEFVRNLPNGYDTILGENGSTLSGGERQRISIARALLKDSPIILLDEATASLDPENEVFVQKALAHLIKGKTVIMIAHRLRTVVDADQILVMENGKIVEHGTHNELMERKGLYHKLYSIQQESLGWSV >CP019858|452172:464007|452172_453528_+|AXU77882.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKKKDVIEFEVDKMEFGGTSLSQVGDRVIHMKGGISGQKVRAGVKKVRSKKAEVKMIELLENSPLETEETCKHFRECGGCTLLSVPYEKQLEIKEKQVMDLFLKQDLFGFQFLGIEGSPENKYYRNKMEYTFGDEVKNGPLTLGLHKKGKHIDIQTVEECMLVDEDFSKILVSSVEFFNEKKLPYYRTMNHKGYLRHLVVRKGIHTNEIMVNIVTSSQQDFDMNEFKDMLLGIDLKAELVGVLHTINDGLADAVQCDELRVLYGRDYIQEEILGLKFKISPFSFFQTNTKGAEVLYSIARDFIGDYNDKVVFDLYSGTGSIGQVMAGAAKKVYGIEIVEEAVVTANENAKLNGLTNCEFIAGDVAKVVKDLKDKPDLIIVDPPRPGIHKDAIRDICGFGAKEIVYISCNPKSLVVDLVDFKGYGYEIKMVKCMDMFPNTPHCETVVKLIRE >CP019858|452172:464007|461947_462292_-|AXU77892.1|DBSCAN-SWA MRVFIYCRVARDDTFALEHQRFLLQLYAKRAGYTIIGAADEYGSGLTLDRPGMGKVTQAVLAGEVDVVLVHSLTRIGREWGMTQSYIDQLTRHKVKLLCIKERCLFSEKGVIHF >CP019858|452172:464007|454049_455084_+|AXU77883.1|DBSCAN-SWA MFKKKLIAVAMSITMISVGSFSYAHSGRTDSSGGHRDNKNKSGLGSYHYHCGGYPAHLHNNGGCPYTGGGSSSGTTTSVNNEEKQKRSVGEKGYNQGYEDGYKGNYSSSNYSGDYSDTYESKYSEGYEKGKAKLEEEEKVAKETGYNLGLTGAKSNNTYEKEVLKNAYDTGYSTGYNEYKTKKIEEYKVKGIEDSNKDKEKMTFEENIDSEFIDAYNNAYDEIQEQLKNDYTTQGFESAIKGERFDTSTIGNVKYANWFKEGYDNGKVKLPKAKESVYNQGYNEEDFSIPDEMKSIETKLKGVYDEGLEKREEEKSRNATYGVGAGTAAVVAGVVYKKKKRKKI >CP019858|452172:464007|455170_455374_+|AXU77884.1|DBSCAN-SWA MGFNFRKSINLGGGLKLNLGKKSVGISAGVKGARVSVNSKGRKSVTLSIPGTGISYTKTSTKKRKPK >CP019858|452172:464007|455544_456705_+|AXU77885.1|DBSCAN-SWA MKLSKTLLAIGMSVSLLIASCPTSNALSSINSIKGTNKYETAGLIADKQNYDIAILINSENGLSDGLSASGLSGAKNAPILLTKKDTIPSETLKRLEKVKEVYLIGGKNSIGASVQKILSDKKISINRISGTDRIDTSHKVAKEIGRVSTVKKVILTNAFKGEPDAMSVASIAVRDKSPIVLTDGNTTSFVTDGLETYAIGGKVSMSDKLINETKATRIGGVDRYDTNKQIINKFYNGSKEFYIASGTDLVYSLVGSTIAQKTPIVLVGNGSNKSILKNASKITAIGNIDDVVIKQCLNITNNVGDSNTGIVKDTNSNNTNKPSNEPSSNNPGLTDKSTVYVTPNGKSYHLTKNCSTLKRSKTINKVTLKQAKSQGKIDPCNVCVK >CP019858|452172:464007|459067_459496_-|AXU77889.1|DBSCAN-SWA MKPSNFQRTIQCQFDCKLKRVVKGIVRNYRKELKRRRNKEISYCELPEIVVEKLAVWDEYESDYTAFDVCGIEVRVLDDDLAEAIKYLSEKDREILLMYFFLGMSDTEIGDRLKINRSTSFRSRKNSLEEIKKKLKENMNDE >CP019858|452172:464007|458256_458460_-|AXU77887.1|DBSCAN-SWA MNNTDVPIWEKYTLTIEEASKYFRIGEKKLRKLAEENLDAGWVIVNGNRIQIKRKQFEKIIDTLDEI >CP019858|452172:464007|459776_460001_-|AXU77890.1|DBSCAN-SWA MIGLKKRDIKKALKAGAKAGGVSLSDVRADIEATIDEAMNSTDPEVQANFKKYFGNKRPTSEEYIYKITQKTKV >CP019858|452172:464007|456987_458178_-|AXU77886.1|integrase|DBSCAN-SWA MSNVKRKDSKNRNLRNGESQRKDGRYVYKYTDIYGKPQFIYSWKLVPTDKTPAGKRDDISLREKEAQIKKDLNDGIDTVGGKMTVCQLYDKKNSQRKNIKRATEKGRQYLMNALKNDPLGMRAIDTVKQSDAKEWAIRMSEKGYAYKTIDNYKRSLKASFYMAIQDDCIRKNPFEFKLSDVLEDDTEQKVILTPEQEERLLAFMEKDKIYSKYYDEVVLLLETGLRISEFCGLTTHIDMQNRVLNIDHQLLKDSEMGYYIETPKTKNGKRELPLTERAYQAIQRILKNRGKAQPLIVGGYSNFLFLNREGLPKVAGNYEGMVRGLIKKYNKYHTDKLPNITPHSFRHTYCTNMANRGMNPNTLQYLMGHANITMTLGYYAHGTFQSAKAELERLAC >CP019858|452172:464007|458835_459075_-|AXU77888.1|DBSCAN-SWA MNNTRPSFYLISSAVDGNVNSIEKILAFYDPYISKCCLRPFYDRYGNVCIVVDMELKGRIREALIKMMLDFDIPLETEE |
12 | Streptococcus_phage(37.5%) | tRNA,integrase | attL 441525:441538|attR 459968:459981 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
488659 : 505739
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP019858|488659:505739|DBSCAN-SWA CTTATCCTATAATCTTCCAGTTGCTATCCTTATGTAGCACAAGCTCATATTGCGATACCTGCGTTGCCTTTGTCTGATTATCAAGGAATTTCACAGCAACCTTGACTTTCACATTCTCCCCGTCCTTTGTAAAGATAGGGTTTATCAGTTCAGAATAAAGGTAATCTCTGCCGATAGGTTCAAGTACATTACCAGATACATAATAGGCAAGTTCTTTTTCTGTGGCTGTTGGGTACAGCTTAAAGAATGTTTCCAGAAATGCGGTAGCGTCGTTTACAGTATCAGCGTCTACACTTGCGTCTGCTTCTGGTGTCTTAGGCTCATAGTCTGATTTTTCGATTGCTGGTGCAAGGGTAGGGTTCTGAACGATTACCATATCCCCGTCAGCGTCTATATGGACTTTTACGGTATAGGTTGCTTTCACATTGCTTGTCTTTTCTCCCTCTTTTATCTGCTGATCTACTTCGTAGGTAGCAGAAAAAGTGTTCGTTCCCGATTGTTCGATACTCCATACAATCACATTTGTAGCTGTGGAGCTGGTCGGTATATCCGTTCTGATTGTATCAACATTCAAGTCCTGCAATTCCTTTGTCAGATAACCGCTGATTGCCTGCGTCCTTGCTTCGATAGCTTCTTTGCTGTTATTCCATGTGTAGTAGGACTTCGCAAAATTCTTCACGAAATTTTCTATCCCGTTGGTGTCCTGCAAGCAAAGTTCAATGATTTCTTTTTCATGGGTCGTGTGCTGGTCGATAGCAGTAAAATTCTTATACACTCCAAAGCTCACGCTTGCGATAAGCACCACCCACAACGCAATCACGGTTTTCTTATGTGTGCCTACCTTAACAGTACGCACCTTTTTTTCTTTTGGTTCTTTGATAGTTTCTGTCTGTTTCTTATTCTTCTTAAACATATTTTTCAAGTCCTTTCTATTGTTTTACTCGTCCTGCACCGATTAAGTGCTGTTGCCAGTAACTATTACTTAGGTCTGCATATCCTATCGGGTCGCCCGCATGGTACATCTGGTTATTTCCTACATAAATGCCGACGTGGGTTACATACGAACCAGCGTTATAGGTGGAATGGAAAAATACCAAGTCCCCAGCCTTTGCCTGCGAAAGCGGAAGATGTTGGGTAGCGTCATATTGTGCTTGTGCTGTTCTCGGTAAGGAGATACCAGCTTTTCCATAACACCATTGCATCAGTCCCGAGCAGTCAAAGGAAGTGTTGGGATTGCTACCGCCATACACATACTTCCAGCCTTGATATTTCAACGCTTCATTCATTACCTTTTGTGCCAGCTCTCCCGATACCTGCGGAACAGTTAAATACTGATTGACTAATTCCACATAGAACATATTTCCATAGCCATACCGCCAGCCCCCGTTCTTTGCAACGGCTATCGGGTTGGTGTAGGTTACTTTCTTTCCACCCGATTTCTCACGGGCGAAGCTCTCTGCAAGATTAAAGGTATATTTCTTTCCTTTTCCTGCCACATATCCCACATAACCACCGCCATAATTATAGGACTGTATCGCTACATTCAAGTCGTCGATACCTTGATTTTGGCAGGAAGAAAGCAGGGACGCAAAATATTTACACCCCTGCTTGATTGAACTTTCGGTATCTAAAGAGTTGGGTGGTAGTCCCAAACTTTCCGAACTCTGCATAACATCTTCTGCCGTACCGCCACTTTCTACTTGAATAATAGCAAGTAGCACATTGACATACTCGGAGATACCGTTTTCTCTGGCGTATTTTTCCACCATAGGCTGATGTTTCAAAACTTCTGCGGATAAATTCATAACCGTAATGCCAGAAGAAAAGTTGCTGTTTTCGTCGTCGCTGTCCGCACTAATGAGGACACCAAAGAACAGCACCAGAGAAAAGAGGATAGGAAACAGACTGCCAATAAGAGCGATATGTTTCAGTTTCATTTTTTCTTCTGTCCTTTCTTCATTACAAGGTTACGGTTCTTTTCGGTATGTTCCGTTGTACGCTTTGATTGTTCAAAGGTCTGTGCCTTTGTGGTACGCTCTGCTTTGTAATTCTGGTGTGTTTCCTGCGATACCACTTTTTCTACATTCTGCCTATGTGCTGGCTGTATAGGCTGGGACGCTTTTCTATCAGAAGCACCAGAAGATAACGGACGCTCTTTGATAACACTTGTCTTGACTGGCTCACTTATCTTTGAAGTGGTCGCTGTGGCAGGGCGTTTGACTTCCTGCATTTTTTCCACACTCGGCTTTGGAATGGTCGAAGCTGTGGCTGGTCGCTCATGGGGACGGGTAGCTCCCGTTGTCGCTGATCCGTCAGCCTTTCGCTGTGCCTGCCTTGCTTCTTGTGCTTTTTGAAGCTCCATACGCTTGTCAGCGATATTCTGCCTGCGTTGCTCCTGCTTTTCCAATCGTCCCGTCTGTCTGGACTGCTGTTCCTGCACCATGCCACGCTTGAAATCTGATACGCTGGACTTTGCCTTTTCCTTTGCGGAATATACCGCATAAGCGGTCTGTGTCGGCATATCCTTGATGTTTTCTTTGACAGCGTTTGCCTTGTCTTTCACTTTATTTTTCGTATCTAAGACAGCACCCACCTTTGAGCCTGCTCGCTGTCCCATGCTGGAAGTGGTATTGCCCCGATTTTCTTTAGAAGCTGTATTTTTTCTTTCCGCTCGTTTGCCAGCAACGGCACTTCCAGCCACCGCACCAGCCACACCACCCGAAATACCGCCAGCACTTACTGCCCTTGCAATACGGTGTTCCATACGCCTAGCTCTATGTCGCATAAACAGATACGGTCTGCGGAATATCCTGCGTCCCATATTTTGACTGTCGCCAGCGTTCAAAGAGAACATATTCATTAAGTCGCCTAACTTGATAAAGATACCTGCGAAACACACTATCTGTAAGAACGCCACCATAAAAAACGGGTAATCTTTGGAGATGTTATAAAACATACTGGAAATACTGAACGCCACCGTTACAATGAGCGTTATTCCTGCCCGTGTCATTATGGTATTAAACACCCTCACGATTGCCTGCTTTGCCAGATTTTCTTGACTAGGTATCATGGAAAGAAGAAAACTGATAGGCAAAAACATTGCAAAGATAATAAAAAGTATCTGGCTTAACATCATTATCCCCATCAGTAAGAATACAAAGATTGTGATACCTATATTAAAAATGAATAGGAAGAACACCATACCCAAGCGGTTTACCACCTGCGGTATCGTCAGATTGTTGTTGTCGTTATCCTCGATTTCTGTTTTCACGACTTCCTCTCTGGTCTTTCCGTCCTCGTCCTCTGGGCTTGCCGATACAAGAGCTTCTACACGGTCTGCCCCGATTTCTTCTGCGTTGCTGTTCCCGAATTGTAAGAGTAACCACGGCTGTTCCACTTGAATAGAAAATAGACTGTCCCGTATCAAGTCTACGCTGTCCTTGCCCTCGCTGTCAGAGTTTGGGAGCATGATTTTTGTTCCCAAGTCAAGTGAAGCGGTACTGATGTCTGATGAAAACTCATTTATCTTCTTGATGTAGTCGGGAGCATAGGCAATAAACGAAGCGGACAGCACGAACACCACCACAAAGTTGATAACGGCATGAAGTGCTTTACTGGTTTCCCGTTTGATAAGTCCCGTATATGCAACATAAAGTCCCACCACTAAGATAATGAGAAGCAGGAAACCAACATAGAAGCCAGAGCTGGAAAAACCGTTTGCCGTAACACCTGCAAGGGTCTGTATGCTTTTTCCGATACTGTCTGCCATATCGTTAATAAAATCAAGTTTGTAGGCTTCCTGCACCACATAGCCCGTAGCATTGCTTAAATATAGGCTTATCGTCCAGACAAAGTTGGTAATGCAGTAAAGCCCGTACTGCACCGATTTTCCGATACCGTCCAGCCAGTTCCACGGAAGCCACGACCAGCTATTATCCACATAAAAATCAAGCTGGTAGTTGGAAAGGGGATATTTTGAGTAAAGATTTTCTGCGTTTATGGTATCGTCCACAAGCCCCGTCGCATGAGCCACCGTCCCCAAAAGTGAAAGCAGGATAAGGGAGAGTGCCACCACGAACAGAGCCATTTTAAGAAAGTGGAAAATCTTCTTTTTTGTGAACGCACCTTTTATCCTTTCTTTCATCACTCCACCTCATTTCTCTGTACGGGCGGTCTTGTATCAAAGGCGTGTAGCAGTTCTTCAAAAACGGGGTGTATCTGCACCACACCGACACGCCCGTATAAATCCTGTAATAAACATTGTCCGTTCTCCAAATCACGCAAGCGTTTCTGGTTATTTTCGTCGTCCTTGTCAATGCCGAAAAATTCTAAGGTCTGCTTTATCTCGTTGATGTCAGTAGAACGAAAGGCAAACTTCAAGCCGATATTGTTTTTCAGACTTTCCTTTGCCACGTCCCCAGAAGATTGTGTAACGAAATAAACGCCTGCCTGCATAGCTCGTCCAGCACGAACCAGCTTGTTTGATAAGGTTTCGCCTTGTGCCACATTTAAGAACGCCCACGCTTCGTCAAGGTCTACAATCTTAAAAATACTTCTGTCAGAATGGATAAAATCAAGGGCAAAGGTACTAATCACAATCAGCATAGACACCGACAATAATTCAATGGTCGTGTATTCCTCAAAAGTTGTGTCCTTATCTGGCAACACAAGGTCAGCTACTTGAATGATATTGAGCTGATTATCCAGACTGATAGCATTTTCCACCGTACCGTCTGAAAACAGCAGGTGTGCAAAGTCGTAGTCCGTGAAGCTGTCGATATGGTCTGCGATATTTCTTGATACTGGCGTATCTTCACGGCGTAACTCGTCTATCACATGGAGCAAGCCCCGACTGTCGCTCTGGGTAACAGAACGTACCGCTTTTCGTAACACGGGAAATTTTTCGCCGTCCCTAGAGGAAATACCCGTAAGGAATGTTAAGATGTCGATTGCCAGACTTTCAGCGTCCTTAACATTCTTCATAATCACGAATGGGTCAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP019858|488659:505739|497955_499866_-|AXU77920.1|DBSCAN-SWA MPKNKNETLCVEDLRHAEYYEMQNTFDDLYAKSKNGDIFTHLMDIILSRENILLAYRNIKANAGSKTAGTDGTIIKDIGKLPAETVVKKVRYIVAGTPHGYRPKPVRRKEIPKPNGKTRPLGIPCMWDRLIQQCIKQVLEPICEAKFSENSYGFRPNRSVENAIKATYNRLQISQLHYVIEFDIKGFFDNVNHSKLIKQIWAMGIRDKHLIFILKRILKAPIKMPDGTITYPEKGTPQGGIISPLLANIVLNELDHWVESQWHENPVTKNYVVHINKSGSPCKSNAYKEMKKTKLKEMYMVRYADDFRVFCRYKESAEKTKIAITQWIEQRLKLEVSQEKTRIVNVRKRYSDFLGFKIKMIPRRKKLVVKSHISDKQFKTQKDKLVSQAKKIASPSKGKTELEEIRLYNSMVLGMQNYYQIATNVNLDCMKLNRAVMAIFTNRLGASKKGRLRKTGRQLTTKEATRYGKSKMLRYVAGEGEPIFPVGYIQHRKPMAKVYSANCYTPEGRKFIHTNLSVDKLLMYQLMKLSLENRTIEYADNRISLFSAQHGKCAITLEEFQQANEIHCHHIVPTRAGGNDDYKNLILVKEAVHRLIHAKTEETIQKYIALLKLNKVQLIRLNKYRVLAGNQELNLI >CP019858|488659:505739|500753_501950_-|AXU77922.1|DBSCAN-SWA MVLNEEQWIKELREKRIAYGISQGRLALASGITREYLNKIESGKMKPSKELLETLHKELARFNPEAPLTMLFDYVKIRFPTLDIQHIIKDILKLNINYMLHEDYGRYSYTEHYSLGDIFIYTSADEEKGVLLELKGRGCRQFESYLLAQQRSWYDFLMDALVDGGVMKRIDLAINDHTGILDIPELAEKCRKREYIGKSRSYKFYQSGELIKHREDDREYMGRTLYLGSLKSDVYFCIYEKDYEQYVKLGTPLEEADIINRFEIRLRNERAYYAVRDLLTYYDAEQTAFSIINQYVRFVDEEPDKRKNDWKLNDRWAWFIGDNRQSLKLTTKPEPYTLDRTLRWVQRQVAPTLKMLKKIDKGNGTDYMETIEQQAKLTEKHEMIIKQQTTPAKDLVES >CP019858|488659:505739|497077_497551_-|AXU77919.1|DBSCAN-SWA MDYIIREIKKEEYDLLNDFLYNAIYIPDGVEPPPKSIINCPELQEYVFEFGKRKDDRALVAEVQGNVVGAIWVRIMNDYGHIDNDTPSLAMSVFQKYRGQGIGTSLLQQLLLVEKTSGYSKLSLSVQKNNYAVKMYKKAGFLVVDENSEEYIMTVNL >CP019858|488659:505739|500607_500742_-|AXU77921.1|DBSCAN-SWA MWVLLKDFLLVSMGMGIGVVLMCILNIGKEADYEMKQLEESEDN >CP019858|488659:505739|505412_505739_-|AXU77928.1|DBSCAN-SWA MEMKYVVPDMAQSFGTLEFAGESEPIFERDKNNRRVLARRSYNLYSDVQKGENVVVEIPVQAGEKKFKYEQKVKLVNPKLYGRGYAIGDMGHTDYVLVADDIVAVEEK >CP019858|488659:505739|504097_504424_-|AXU77925.1|DBSCAN-SWA MDLNIVLAVICGAVALVGAFCVVFQIYHMTVIDATARGLKHPKFWGVFTMSGNNSSGLLMYLIGRRKYPIVNMSESNSKELEKRKKSAGVGLLFLAIGVIGIICATLI >CP019858|488659:505739|505013_505397_-|AXU77927.1|DBSCAN-SWA MRLSNGFVIDKEKTFGELKFTAVRDVFLQNEDGTPSTQLKKRIYDLKCSLHGGIIPVSVPPEVPLREFPYNAVVELVNPVADTVSRKTYTGADVDWYVKAEDIVLKNKGNQNAGSPQNHTPQGQSKK >CP019858|488659:505739|502194_502611_-|AXU77923.1|DBSCAN-SWA MEIKEINKIIQSEDKDEKSKSVKCICINYGDFLADCEGFVQKRYHDFKCNPKHQFEKKADTILENAIHEKNFMPDLFLIRLNRKQSACNSQIDFVFELLDKSFLETDPIRKSEISEETLNLCLSADVSFIMVYIGMNR >CP019858|488659:505739|492801_495252_-|AXU77915.1|DBSCAN-SWA MFPIKYIDNNLVWNKDNEVFAYYELIPYNYSFLSAEQKFIVHDSFRQLIAQSREGKIHALQIATESSIRSMQEQSKKLVTGKLKEVAYQKIDEQTEALVSMIGDNQVDYRFFLGFKLMVTEEQLNLKNIKKSAWLTFTEFLHEVNHTLMNDFVSMPNDEINRYMKMEKLLENKISRRFKVRRLETNDFGYLIEHLYGRDGVAYEDYEYQLPKKKLRRETQIKYYDLIRPTRCVIEESQRYLRLEHEDKESYVSYFTVNAIVGELDFPSSEIFYFQQQQFTFPVDTSMNVEIVENRKALTTVRNKKKELKDLDNHAYQAGSETSSNVVDALDSVDELETDLDQSKESMYKLSYVIRVSAPDLDELKRRCDEVKDFYDDLNVKLVRPAGDMLGLHSEFLPASKRYINDYVQYVKSDFLAGLGFGATQQLGETTGIYMGYSVDTGRNVYLQPSLASQGVKGTVTNALASAFVGSLGGGKSFCNNLLVYYSVLFGGQALLLDPKSERGNWKETLPEIAHEINIVNLTSDKDNAGLLDPFVIMKNVKDAESLAIDILTFLTGISSRDGEKFPVLRKAVRSVTQSDSRGLLHVIDELRREDTPVSRNIADHIDSFTDYDFAHLLFSDGTVENAISLDNQLNIIQVADLVLPDKDTTFEEYTTIELLSVSMLIVISTFALDFIHSDRSIFKIVDLDEAWAFLNVAQGETLSNKLVRAGRAMQAGVYFVTQSSGDVAKESLKNNIGLKFAFRSTDINEIKQTLEFFGIDKDDENNQKRLRDLENGQCLLQDLYGRVGVVQIHPVFEELLHAFDTRPPVQRNEVE >CP019858|488659:505739|488659_489571_-|AXU77912.1|DBSCAN-SWA MFKKNKKQTETIKEPKEKKVRTVKVGTHKKTVIALWVVLIASVSFGVYKNFTAIDQHTTHEKEIIELCLQDTNGIENFVKNFAKSYYTWNNSKEAIEARTQAISGYLTKELQDLNVDTIRTDIPTSSTATNVIVWSIEQSGTNTFSATYEVDQQIKEGEKTSNVKATYTVKVHIDADGDMVIVQNPTLAPAIEKSDYEPKTPEADASVDADTVNDATAFLETFFKLYPTATEKELAYYVSGNVLEPIGRDYLYSELINPIFTKDGENVKVKVAVKFLDNQTKATQVSQYELVLHKDSNWKIIG >CP019858|488659:505739|495229_495628_-|AXU77916.1|DBSCAN-SWA MKKIKSYTGIWNVEKVLYAINDFNLPFPVTFTQITWFVITEFIIILFGDIPPLSMIEGAFLKYFGIPVALTWFMSQKTFDGKKPYSFLKSQITYALRPKITYAGKAVKLHKQILNETITAVRSVNYVPDKIY >CP019858|488659:505739|504439_504847_-|AXU77926.1|DBSCAN-SWA MEIGKKLKNARVQSGMTQENVAEKINVSRQTISNWENEKSYPDIISVIELSNLYSISLDVLLKGDEKMIEHLEESTNVVKSNQKMIWAIIVNIIVVALLITLNMFIPDNRYFLVGIFCLMVITSSALLYQIIKKF >CP019858|488659:505739|502614_503997_-|AXU77924.1|DBSCAN-SWA MRKIWNKGHRIRASDKHLVYHFSIGTLLFVFVAVLLLLNIKQLMCTDWEHFSLLENDLTLSPYNFITILIATGACVLVAFLYYRFCYDSFKKLLHRQKLARMILENKWYEADTVQDSGFFTDLQSRSREKIVWFPKIYYQMEKGLLHIRCEITLGKYQDQLLRLEDKLESGLYCELTDKTLHDGYIEYTLLYDMIANRITIDEVRAENGSLKLMNNLVWEYDALPHALIAGGTGGGKTYFLLTLIEALLHTNAVLYILDPKNADLADLGTVMGNVYHTKEEMIDCVNAFYEGMVQRSEEMKRHPNYKTGENYAYLGLPPCFLIFDEYVAFFEMLGTKESVSLLSQLKKIVMLGRQAGYFLIVACQRPDAKYFSDGIRDNFNFRVGLGRISELGYGMLFGSDVKKQFFQKRIKGRGYCDVGTSVISEFYTPLVPKGHDFLQTIGRLAQERQVMPEQQGKEN >CP019858|488659:505739|496258_496762_-|AXU77918.1|DBSCAN-SWA MQETRVLVETRGTTGEETISYWFDLPIDVAEFEEKLGVGAESGDYRIIEKVLAFANEVHEHTSVYQLNELDFMYRQLSSDMQEEYVSLLTVFENLEALYICRNVITVYPDCKSMIDVARQKLMNDPTFKHLSEDCQEYYFDFEAYASHLQEHGKFLVTEHGIFELPE >CP019858|488659:505739|490591_492802_-|AXU77914.1|DBSCAN-SWA MKERIKGAFTKKKIFHFLKMALFVVALSLILLSLLGTVAHATGLVDDTINAENLYSKYPLSNYQLDFYVDNSWSWLPWNWLDGIGKSVQYGLYCITNFVWTISLYLSNATGYVVQEAYKLDFINDMADSIGKSIQTLAGVTANGFSSSGFYVGFLLLIILVVGLYVAYTGLIKRETSKALHAVINFVVVFVLSASFIAYAPDYIKKINEFSSDISTASLDLGTKIMLPNSDSEGKDSVDLIRDSLFSIQVEQPWLLLQFGNSNAEEIGADRVEALVSASPEDEDGKTREEVVKTEIEDNDNNNLTIPQVVNRLGMVFFLFIFNIGITIFVFLLMGIMMLSQILFIIFAMFLPISFLLSMIPSQENLAKQAIVRVFNTIMTRAGITLIVTVAFSISSMFYNISKDYPFFMVAFLQIVCFAGIFIKLGDLMNMFSLNAGDSQNMGRRIFRRPYLFMRHRARRMEHRIARAVSAGGISGGVAGAVAGSAVAGKRAERKNTASKENRGNTTSSMGQRAGSKVGAVLDTKNKVKDKANAVKENIKDMPTQTAYAVYSAKEKAKSSVSDFKRGMVQEQQSRQTGRLEKQEQRRQNIADKRMELQKAQEARQAQRKADGSATTGATRPHERPATASTIPKPSVEKMQEVKRPATATTSKISEPVKTSVIKERPLSSGASDRKASQPIQPAHRQNVEKVVSQETHQNYKAERTTKAQTFEQSKRTTEHTEKNRNLVMKKGQKKK >CP019858|488659:505739|489587_490595_-|AXU77913.1|DBSCAN-SWA MKLKHIALIGSLFPILFSLVLFFGVLISADSDDENSNFSSGITVMNLSAEVLKHQPMVEKYARENGISEYVNVLLAIIQVESGGTAEDVMQSSESLGLPPNSLDTESSIKQGCKYFASLLSSCQNQGIDDLNVAIQSYNYGGGYVGYVAGKGKKYTFNLAESFAREKSGGKKVTYTNPIAVAKNGGWRYGYGNMFYVELVNQYLTVPQVSGELAQKVMNEALKYQGWKYVYGGSNPNTSFDCSGLMQWCYGKAGISLPRTAQAQYDATQHLPLSQAKAGDLVFFHSTYNAGSYVTHVGIYVGNNQMYHAGDPIGYADLSNSYWQQHLIGAGRVKQ >CP019858|488659:505739|495737_496241_-|AXU77917.1|DBSCAN-SWA MIDDMAVYIANLGKYNEGYLVGAWFTFPIDEEDVKEKIGLNEQYEEYAIHDTDNFPIAIGEYVSIEELNSMYEMIEELPDYIVECLDEFISHYGTLEEVVEHKDDIYYYPDCETMTDVAYYYIDELQALGDIPPSLQNYIDYEAYGRDLDMGGCFIETSRGMCEIPY |
17 | Streptococcus_phage(83.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1151427 : 1204918
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP019858|1151427:1204918|DBSCAN-SWA ATTATTGTAAAATGCCCTCCAAAATATCTATTGTTTCACTTTCCATTTTACTTGTAACATGTGAATATGTGTCCATAGTGGTTGATAATTGACTATGACCTAATCTTTGTTGTATATATTTTACATTAGCTCCATTTTCTAATAATAATGTGGCATGTGTATGTCGCAAGCAATGAAAATTAAAGTTAATATTTAGTTTCTTGTTAATAGTTCTTATAGCAGCGTCAATATTGTTGTGATTTACAAATGAGCCATCTTTTTTTCTACAAACCCAATCATACTCAGTTTCTTTATACCATTTTCCAATTTTAATTTTTTGTTTTTTTTGATTCAATTTTTCCTCTTTTAATATCCTAGACAAAGTATCACCTATTTTAATATCTCTTATTGATGTTTTTGTCTTAGGTGATGCTAATTCAAATTCTGAAACTTTTCTCTTTATTAAATTTTTTCTAACTTTGATTATATTATTATCTAAATCAACATTATCCCAACAAAGACCTAATATTTCTCCTTTTCTCATGCCTGTATGAAACCCTATAAGTAGAGGAATATAGATATTTGTATTTTTAGGATATATTTCTAGTATTTTATTGAACTCATCTAGTGTTATAGTCTTGTTATCTGACTCATTTTTTACCTTTAAAACATTTTTTGGTATACTGGCATATTGAACAGGATTTTCCTTAATGAGTTTGTAAGGGTAAACAGCAGATTTTAAAGCAGCATTTAATACAACATAAATCGCTTTTAAAACTCCTTTTGTGTAGTGTTTTTCTTCTCCGTTTTGTGTGTATGTCTCTTTTGATTTATTATTTAAAAATTCTTGAATAATAGCTGGATTTATAGATTTTAGCTTACATTTACCAAGTCTAGGTTCTATATGATTTTCAATTAAATTTCTATAACTTTCCTGAGTATTGTATTTGCAATTAAGAAGTACATACTCTTTGTACCAAAAGTTAAGATAGTCTGATAAACTCATATTTGTTTCATCAAACACTATACCAGCATTTTCATATTCATTTATTGCATCACGGAGCGATTTTTCAGCTTCTTTCTTAGTGTTTCCACCAACTCTTTCTACCTTTTTTCTCTTGCCATCTACTATACCTGCATCAAAGTAGTAATACCACTTCTTTCCACGTTTTCTTACGCCGCCTTTCATAAAATCTCTCCTCTCAAAAGCTTTTTTTATGTAATTATATAATAACATATATCAATTTAAATAAAATAAATAAAAAAGACTATAAGAAACAAAGTTTTATGTTTATAATTAATAGTCTTTTTTATTTAGATACATATTTAATGTTTTTTATCACGTGATTCCAGCACTTTTTCTGCCAAATAAACAACTATTTTTTCATACTCAATATCAGTTTCTAAAGAAAAGTCAACAATAGCAGGTATCGTCATATCTCCTGCATATTTATTACCTAACCAATTTTCAATTAATTCCAATTCTTCTTTGCTTAATTCAAATTTTTTCTTTTTATTAAAACTTAAGTTCAATTTATTCACCTCAAATAATATTATATATTAAAAATAGTATTTGATAGAAACATTCGAATTATTTATGTAATTTTCTTTTTTTAATATATTCATCAGCAAAATAATTTACTAAATATTTTTCCTCCAATCCTAAAGCTATTTCTAATTCAATAAGAGCAGGGATAGTTAAATCTTTATTCTCATTATTTTCCAACCTAGAAATTTGACTTCTGTGGCAACCAACTCTTTTTGCTAACTCTATTTGTGTTAATTTCTTCTTTTTTCGTAACTCTTTTAACATATATTTAACCTACCTTTTAGATAATTTTATATATGTTAGTTTGTGTAATTTCTTGTAATAAATGTGCAATATTCGCACACTTTTTGTTGGAAATTTGTGCTAGAATGTAGTTAAGAAATAACTTTATCTAGATAAAGCAAAAATAATAGAAGCTATAAAATATAATAATATTTTACAGTTATTTTATAGTTTTAAGCTTTGAAAAAGAGGTGGTTGTAACTATTTTTAAGAACGTATGTTTCGTGGAATTAATAAATAAAATATTTTATAGGGGATGATATATTTGAATAAGACGAAATATTATGATATTTTAAAGTTAAACTTATTAATGAAAAAGTTGAAAGAATTGGATAAAAATAAAATCAATGAATATAAAATAAAAGTGAAAGAAATACATAAAATCAATAAAAAAGAGGAATGATTCCTCTTTTTTATTATATTCATTTTCAGAAATAAACTATTTTTTATTTTTTTCGTCTAGTAAAAATAATTCTGCAACTTTTAATGCTTTTTCTCTTGCGTCTGGGCTTAGCTCGCTAAATATATTAAAAACTTCTTTCATATCTTCGTCAAGATACATATTCTCAATAAGCTCCTTTTCTGTTTTAAAATTTTCAGCATCATAATCTTTTTCGTTTTTATTTATAAATAAGCTATTTCTAACATCAGTTCTTCCTAATAAATAATCTGTAGACACATCAAAATAGTTTGCATATTCTTCTATTGTACTTTTCTTAGGTTCTCTTAAACCATTTTCTATCCTTGATAGTGTAGATTTGTTTATATGTAAATCCTCGCTTAATTTGTCTAGCGAGATGCCTTTTTCTTCTCTCAATTCTTTTATCCTATTCAATTTGCACAACCCCTTTTTATATTAATTCCAAAATAGCAACTTTTATTTATATTATAGCAACAAAATTAATTATTACAATTTTTTTTGCTAAAAAAGCAACAAAAGTATTGACTATAATCACAAAACTTGATATTATATAAATATGAAGTTGCCAAAATAGCAAAAAGGAAGTGATTTAATGTACTTAAATAGATTAGAAGGATTGATGAAGGAAAATAGACACACCCAAAAAAATGTGGCAGATATATTAGGTCTTAGCTCATATGGTTTTAGATTAAAATTAAAAGGAAAAAACGAATTTAAAGCAAGTGAAATAAAAAAGATATCTAAATTATATAATGTATCTGCGGATTATTTTTTTTCAGATGAAGTTGCTAAAATAGCAATAAAAGAAGAAAGGGGCAATAAATAATGAAGAATCTAACCATAATCAAGCAAAATAATCAATTTTTAGTTGAAAGTAGAGAAGTAGCAGAATTAATAGAAAAGAAGCACGATAATTTATTAAGAGATATAAGAGGATACAAGAAGATTTTAGAGGACTCATCAAATTTGAAGAGTCAAGATTTCTTCATAGAAAGTACTTATATAAATACTCAAAATAAAATTCAACCTTGCTACTTATTAACTAAAAAAGGTTGTGACATGGTAGCTAACAAAATGACAGGAGAAAAAGGGATTATATTTACAGCGATTTATGTAACTAAGTTTGAAGAAATGGAGCGAGAGTTAAAAGAACAGCAACCTAAACTACCAACTACGTACAAAGAAGCATTGCAACAGTTATTAATAGAAGTTGAAGAAAAAGAGCAATTACAATTAGAAAATCAAGAAAAAGATAAGGTAATCCAGTTACAACAACCAAAAGTACTGTTTGCTGATTCGGTAGCATCTTCTGACAATTCAATCCTAATTGGAGAATTAGCAAAATTGCTTAGACAAAATGGAATTGATACAGGACAAAATAGATTATTTGACTGGTTAAGAAATAATGGTTACTTAATAAAACGTAAAGGTGAGGATTACAATACACCAACTCAAAAAAGTGTAGATTTAGGAGTTATAGAAACAAAAGAAGGTACAAGAGTACATCCAGATGGTCATACAAGTATTACTAAAACACCTAAGATTACTGGTAAGGGACAAATATACTTTATTAATAAGTTTAAAAAGAACAATCAAATATCAATGTTAGGTTAAAGATTAATAGCACTTTGAAAACTAAATACAGAATATTTTGAAAAGGAAGTGATTACATGAGTAATAAAAAGAAATATACTTTGAGTATTACAGAAGAATTATATAATAAATGCAAAGAAAAAGCTAATCAAAAAGGTATGTCAGTAAATGAGTACATACTATTAGTGATTAGCAAGAATTTAAAAAATATTTAATTTTTATTAACTTAAACATTAATTTTGCCATTTATTTTTTCATAACTTTCAACATGTTTTTTAATTAATTGTTCTATTTCTTTGTTGGCAGAACGACCTTCACTTTCAGCTATATACTTGATTTTTTCAAGTAGATTGTTATCTATTCTAAGTGTGTATCTCGGTAATTTTGATGGCATAAATATAGCACCCTCCTTAAGTCTAAATGATGTCACTATTATACCACGTAAATTATTTCAAAAAAAGTGTTGACGCAAAGGTGACGCAATGATAATATAATAAACAAGGAGGTGGTTCAAAAGTGACGGCAAAGAAGAGAGTAACTGTTAGAATGCCAGACGAATTAAATGAAGAGCTACATAGACAATCTCAAAGAAAAGGATTAAGTAAAAATGCTTTTATAATAAATATCTTATGGAAAGAATTTGAGGATTTACAGGACTTAAAAGATGAACAGGAGGTTGATAAGTATGAATAACTTACAAATATTTGAAAAGATGGAGTTTGGACAAATAAGAATGGCAGAGATTGATAATAAGCCTTACTTTGTAGGAAAAGATATTGCAAAGTCATTAGGTTATAAAAATACCAATGATGCAATTTTAAGACATTGCAAAGGGGTAGTGAAACACGAGGGGTTTAAAATTAATGGTATTAAGATTGCTTTGATAACTGAGGGTGATGTTTACAGATTAATAGTAGGTTCAAATCTTCCAAACGCAGAAAAGTTTGAGAGTTGGGTATTTGATGAAGTGCTTCCAACTATTCGACAAACTGGTCAATATCAAGCACAACAAAATGTAATAACAGAACTTACAGGAACTATAGGAGATTTAAAAGGAACAATAAAAGAATATAAAAAGTTGTGTAAGATAACATGCTCTAAGAAACAACAGTATTCTAAATACATAAAGAATAGACTGGATATAGACAAAGCTAATAAAGAATACAACCAAGTGAA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MNNLQIFEKMEFGQIRMAEIDNKPYFVGKDIAKSLGYKNTNDAILRHCKGVVKHEGFKINGIKIALITEGDVYRLIVGSNLPNAEKFESWVFDEVLPTIRQTGQYQAQQNVITELTGTIGDLKGTIKEYKKLCKITCSKKQQYSKYIKNRLDIDKANKEYNQVKARLFLILGVEKWEDIDFDTSNNLIQIIDDCIKVIKSERPYKQLSYFEN >CP019858|1151427:1204918|1176881_1177082_+|AXU78508.1|DBSCAN-SWA MKLWEYVGKNVQITCVDKQIIRGKCDGYTQALDNEPEIASISIARDGYGIEVYENEIESIENINKE |
85 | Clostridium_phage(92.94%) | terminase,integrase,capsid,portal,tail | attL 1159031:1159049|attR 1177709:1177727 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1472577 : 1497099
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP019858|1472577:1497099|DBSCAN-SWA 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29 | Clostridium_phage(54.55%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1584422 : 1594149
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP019858|1584422:1594149|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP019858|1584422:1594149|1589647_1590154_+|AXU78916.1|DBSCAN-SWA MNKAYLGIGTNMGDRFDNLSRACELLKNSDSIYKVKESSLYETKPWGYTEQADFLNMCVEIETEFEPYELLEYCQEIERELHRERIVHWGPRTIDVDILFFNDVVSTDERLTIPHPRIQDRAFVLIPLMDLNEELIINEKTIKEHLNLLSAEEREEVKELVGYERKPI >CP019858|1584422:1594149|1591174_1592965_+|AXU78918.1|DBSCAN-SWA MNDIKDIIEEIKARCDIASIISEYMNIKQSGANYKGLCPFHGEKTPSFYINTSKQIYKCFGCGEGGDVINFVMKMENLDFMDAVKILANKCGIEINTNMNEETRIKIEKSKKFQDIHTEAARFYLSNLLGSKNLGYEYLRIRGLDDKIIKKFGLGFSLDSWNSLMNTLISKGYKKQDLLECGLIAKNRDGTNCYDKFRNRVMFPIFDYRGNIIGFGGRVLDDSLPKYLNSPDTLIFNKKQNLYGLNFARKNLESKTIVLVEGYMDLISLYQYGIKNVVATLGTALTEQQGILIKRYADTAIISYDSDEAGIKATLRAIDILTKLGINVKVLDLKDAKDPDEFVRKYGLSDYKKAMDVSTHYIKYKIDHLKKEFNIQKDEERVKFAKEASKIIKQLTSPVEIDFYTKYLSNQIDINVESIKREVYGKNYNKPYNNKNQKKIEEKVIEKVEVRQDGKQLVEETLIKIMLEDKKIREIALLKVEESDFLLKESKEILNYMIKNQELDKITIDKLKSLNISEEYLKELNSISLNSINLENTKEIEGIITNIRKNSLEEQINSLLREQQELENNNDMKEVDGRVMEIALKIVEINKILKSL >CP019858|1584422:1594149|1586347_1587091_+|AXU78911.1|DBSCAN-SWA MKNNVGFDSSLSKFGIGLFETIRVKNGIAVDLDIHIERMLSSINCLDLDINYKKDFLINEIVTYIKKENVINKALRITVFDEGYNISIRDIPYNQETYEKGFKLAISPIVRGNSLIHRHKTTNYFENIYTKNIANKTGYNDGIFLNSEGVILECSMSNIFFIKGERVYTPSDRLPILNGIIKKRIIEICDELHIELIENEINISEISSFDFVFVTNSLMGAIKVTEIDKIKFNKENVVFDKIVKLLE >CP019858|1584422:1594149|1587124_1587826_+|AXU78912.1|DBSCAN-SWA MIGCIYEVYNEEMTKIIENQNTLAVYLVGSSKDVDFTLYDVEINDIDVFVFVKEGEKQERILFKKKGIEFDVNYFSKDGVKKLLSNREYFFVKEMKDAKVLFDRENISHIIKDISRNIYLEGPSKMSLEEKSFIKQDIGAKISNLKNKEKFDVFEYHFLTNLYLKDIIIGYFNINDKWVPKDKKLLKVLKKENNELFELVSKVSENYDYQRLLDVYNYIFKEIETKEVIKLIF >CP019858|1584422:1594149|1590134_1590920_+|AXU78917.1|DBSCAN-SWA MKENLFNNNSKIEINTNNKKITVKKDKLIIAGPCAIESYEQLLETAKFVKSQGANILRGGAYKPRTSPNSFQGLKKEGLEILKAVKDEVGMAVITELMDVRDMDELYSISDIIQIGSRNMQNFTLLSEVGKQNKPVMLKRGIASTITEWIGASEYIAIEGNSNIIMCERGIRTYNDYTRNTLDLAAVPIIQKETGLPVVVDPSHATGVRYLVKPMSLASFACGADGIMVEVHPDPENALSDGAQSLCFNEFEDLMKSINNY >CP019858|1584422:1594149|1587851_1588424_+|AXU78913.1|DBSCAN-SWA MNKVDKEKIQHAVREILEAIGEDPDREGLIETPNRVARMYEEIFSGLSEEPRDHLKVLFADEKHEELVLVKDIPFYSCCEHHLVPFFGKAHIAYLPKGGRLTGLSKLARVIDTLAKRPQLQERITKNAADIIMEELQPYGVLVVVEAEHMCMTMRGVKKPGSKTVTSAVRGIFEKDIASRAEAMSLITMK >CP019858|1584422:1594149|1584422_1585007_+|AXU78909.1|DBSCAN-SWA MILMIDNYDSFVYNLVQYIEELGETVVVKRNNEIKISDIEELNPEVIVLSPGPCSPKEAGICIDIVEHFKGKKPILGICLGHQTIGHVFGGDIIKAQQPVHGKVYSINHTNKGVFRGLKNPLNVTRYHSLIVDSNTVPKELEITAITDKGEIMGIRHKKYLIEGVQFHPEAILSEYGHEMLKNFITEARERVHM >CP019858|1584422:1594149|1592982_1594149_+|AXU78919.1|DBSCAN-SWA MENKSNKKELKKVTAKTLIEKGKKQGSLTLAEIMEAFSETELDKDQVENLYETLGNLGIEITETKNYKADIDFSVADDDLSIGHLDEDAEAISHDDSSAIEIETVDLSLPKGISIDDPVRMYLKEIGKIPLLKPHEEVEFARRMHEGDEIAKQRLVEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNLGLIKAVEKFDYTKGYKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVSRQLLQELGRDPKPEEIAKEMEMTEDKVREIMKIAQDPVSLETPIGEEEDSHLGDFIPDDDAPAPAEAAAYSLLKEQIEDVLGSLNDREQKVLKLRFGLEDGRARTLEEVGKEFDVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKKLRDYLD >CP019858|1584422:1594149|1585008_1586358_+|AXU78910.1|DBSCAN-SWA MIREINTKLNSFEIFTIFRNEHDSFILDSAMDKEKLGRYSFISSQPFKVLKYKDTDENPLEVLKEELHKYRVVNDTNLPFVGGAVGYLSYDLGNYIENLPRTAVDDIEMPDMYFGFYNHVIVIDHLVQKTYIATPNIDIELEEKIIDDIEQRILKEEKKGIDSICYEEKEVTPIRLKSNFTKEEFKNAVQSVREYIRQGDIYQANLTQRFSGETELTSFELYRDLRRFSPAPFGAFLNFEDAHILSNSPERFIRCVNKRIETRPIKGTRPRGKDKEEDLRLQQELRNSEKDRAELLMIVDLERNDIGRISKTGSVKVPELFVIEPYANVNHLVSTVVGELKDDKDATDVIKATFPGGSITGAPKIRAMEIIDELEPTQRNVYTGSIGYIGFNGDMDFNIAIRTIIKNDKKVYFQVGGGMTWDSDPDEEYQETLDKAKSIMKALRGYYEE >CP019858|1584422:1594149|1589289_1589655_+|AXU78915.1|DBSCAN-SWA MDKILLSNLGFYGYHGVLKEENFLGQKFFVDMELYIDSREAGLSDDINKSVSYAEVYNVVKDITENKQFNLLEALAENIAEEVLNKFILINGVMVRVRKPEAPVNGIYDYFGVEIRRARDE >CP019858|1584422:1594149|1588487_1589279_+|AXU78914.1|DBSCAN-SWA MFDYGKRTYIMGILNVTPDSFSDGGDFNNLDIAIQHAKDMVDQGADIIDLGGESTRPGHSYVDSDEELRRVIPVIKKLKQELDVPISVDTYKADVAEEALKLGVTMVNDVWGLRKDKNMASVIGKYDAEVCIMHNQDGTNYDKDIMESIKDFFKVSIEMAMSCGVKKEKIVLDPGVGFGKDFEQNIEVLRRLNELKDLGYPILLGTSRKSVIGKVLPVEPKKRLEGTIATTVLGIRDGVDIVRVHDVYENLMAARMTDAIYRK |
11 | Pandoravirus(37.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1719084 : 1776006
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP019858|1719084:1776006|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP019858|1719084:1776006|1741192_1742446_+|AXU79063.1|terminase|DBSCAN-SWA MVIEMIVRIDFNPDFKEANFTKKRYRAMKGSAGSGKSVNVAQDYILKLGDKKYQGANLLVVRKSEATHKYSTYAELTGAINRIYGKQADKYWKTTLNPLEIKSKVTGNSIIFRGVNDAKQREKLKSINFSKGKLTWVWCEEATELMESDIDILDDRLRGILTNPNLYYQMTFTFNPVSSTHWIKRKYFDYKNDDIFTHHSTYLQNRFIDEAYYRRMQMRKEQDPEGYKVYGLGEWGETGGAILKNYVIHEFPTEFEYFDNMRLSQDFGFNHANVVLRIGFKDGELYICNEIYVHEMDTSEIIKIANSKGLEKNLFMYCDSAEPDRIKMWKSAGYRAKSVKKGPGSVKAQIDYLKQLRIHVHPSCTNTIKEIQQWKWKQDERTGLYLDEPVEFMDDAMAALRYSIDNKLKNNGISFLK >CP019858|1719084:1776006|1775463_1775640_-|AXU79105.1|DBSCAN-SWA MEQRKLRIGFNKSGKGSFTPRLILPMSWIKEMNISPDERDVLVTFEDGKIIIEKTENE >CP019858|1719084:1776006|1752542_1752647_+|AXU79079.1|DBSCAN-SWA MIGFLLSILAGVISAYIYDKIKNHPDANKGDLKK >CP019858|1719084:1776006|1755445_1756315_+|AXU79080.1|DBSCAN-SWA 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>CP019858|1719084:1776006|1730171_1730546_-|AXU79042.1|DBSCAN-SWA MQFSNNISKELQESIRKTVSDTSNTEYFYYAEFQYKIILKSIEEFEKELDDEHEIALKLTNFGKDVLMIVEEVGYHNPCLIHYYGIVNGVYSEILQHTSQINFMITSVKKTDPSKPARRIGFIL >CP019858|1719084:1776006|1733691_1734111_+|AXU79050.1|DBSCAN-SWA MNQVVLVGRLTRDPELKYIPGTGTAVASFTIAVDRNYINKEGKRDTDFIPIEVIGKSAEYCANYITKGKLVALEGNIRVDNYKTQSGEKRTFIKVSTKSVQSLESKSKSSNSYKESVQDGTIGLDPQGFEIIDDDELAF >CP019858|1719084:1776006|1730621_1730819_+|AXU79043.1|DBSCAN-SWA MLIGDNIKQILRKRDIKPYKLAKELNIDVSGLYKLLKNKNSNPTIDTLIKLADYLDITLDELVGR >CP019858|1719084:1776006|1762391_1762652_+|AXU79086.1|DBSCAN-SWA MSQDLLQIIKKAAMDAVETSNPMRVVFGTIESISPLRVKIEQKLSIGEIFLIQTDTFKRYTDKKIGDKLVLIRMQGGQQYLILDRM >CP019858|1719084:1776006|1727310_1728102_+|AXU79038.1|DBSCAN-SWA 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MMLYEKLENISILLGNQSKAKSIIEELEKLMKSDIITPRLLARKTKVTLLEATRVLEFLVKENELEFFIVVECSNPDSIYENEIGHYKYFTSIKEFNAFSKGQECPICGCGYKYNFEDTKIGFRRLEK >CP019858|1719084:1776006|1732775_1733672_+|AXU79049.1|DBSCAN-SWA MKDRDKATIEKGNILSDGYGLSPQLVARDSWLTTGARALYFYLSSFAGASGTCYPSRDIMTHELGINKDTFSKYLNELKTSGYIKVYKNKTREGRMQNNIYEVVFDRSYIESHISIRCKKENKKKPCPKKADMEPCPNLPDMVQPDMEKSDTISNSIINNSFKSSMYIEQAVDNSLKEFKKLYEENIGVVYPVTAEWLLEVSNEVDIRVFKRAIEICAERMNMNLSYLKGILKKWKDANITTYEQLESYKLQHENKKSKKTNSVVSKNKFANFEQTFTQYSNKELDEIIKKSQKAKFK >CP019858|1719084:1776006|1749390_1750701_+|AXU79076.1|DBSCAN-SWA MALGGGTFVTQNKVLPGAYINFVSATRATSSLSDRGIVAIPLELDWGIDEDVFQVTSDDFEKYSVKYFGYDYTHEKLKGLRDLFKNIRLGYFYKLNKGVKASCTIATAKYSGIRGNDLKVTVTTNIDDNAKFDVVTLLDNKKVDTQIAKVITDLQDNDYITWKKDATLEASAGLVFTGGTNGEAVTGAEYQAFLDKIESYSFNALGCLATTTEIKSLFVEFTKRMRDKVGAKFQTVLYKKSDADYEGVVSVENKIKDIGLVESSLIYWAAGAIAGCDINKSNTNKKYDGEFDVDVNYTQIQLEEALKTGKFIFHKVGDEVHVLEDINTFVSFTDDKNDDFSSNQSVRVLDQIANDIATLFNEKYLGKVPNDKAGRISFWNDVVKHHKELENIRAIEDFKTDDVSVKLGNDKKTVIVSDAVKVINAMSKLYMTVSVS >CP019858|1719084:1776006|1769297_1769903_+|AXU79097.1|tail|DBSCAN-SWA MIEKLNENASLSDLITTFENVKDELQIGKNNIASTLGSPFVGTDKLSVTKTKIQTLKNTLAISLSMKNISAQSTETLHSLISKVVGIENIFIAQGECTQVGEKTFQLYQVDNNTPKTCSANAISFNLAFTPKFIIVYRNAYNIDLCSFVFYSSFRNIITAVPQPSNFGEMYTPNTFDCVVGHTCILPVKDYKIPHFFYAIA |
78 | Clostridium_phage(78.87%) | terminase,head,capsid,holin,portal,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1783999 : 1790513
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP019858|1783999:1790513|DBSCAN-SWA ATTAAGCCACTTTCTCTTTATTCAAAACTTGTTTTGAATAGCGATTCATTGACCGCCAATACTCATGAACGGCTTGTAATTCTTCTAAAGAATAATCAAAAAGATTTACACGTTTTGCAAGCTTTAATTGGTTTAATAAATTGACTTCCAATAATTGAGAGTCATTTTTATTTAATTCATGATTCAAAACATAGTTTAATACTCGATTATAAACGCTTGCCGATAATTCGTTAATGATCTCTATTTCAAATGTTTTTTCATAAGTAACTGCCATTTCATTTTCACTCCTTTTAAAGTTTGTCAGGTAAATATTTCCGAATATATTCTTCTAAGGCTTTATCCATAACTTCTTTTACGTTTCCGCCATTCTTTGCTGTTTCGATTTTTATAATATGGTGCAAGTCAGCACGAACACGAACCGTCTTATCCCCCATAATATCTTTTTTTGCACTGATTGGTGTATCATTTCGTTTTGCTTTTTGTGCGCCTAAATTTCCCACAACCACTCACTTCTTTCTATTTCTTCTTACTCTTATTTTATCATCAACAATCACAAATCACAAGTGATTTGTGATTAATCACTTGTGATTTGTGATTCTATTCTTTTTCGTTTTCTAATTGAATGATTCGCTCAAGCATTTCAAAAAATACGTTCTCATACATAGATAAAACTTTTTTGTCATAGCCTTTGTGTTCTGTAATGCCGTTTTTAGACCAGGTACTTACTTTATTACTTCGCTTGATAATATTTTGGAAAACCAAGTTATCTTCTTTATGTTGCTTGTACAGTTCTTCCAGGTTTGATTTTATCGTTGTGCTGTCCGTATCAACTAAATAAGGAACAAAACCGATCATATCTAGTCCAGGGTTAAACTGTTCTTGTAAATCAATCAAATAGGAAATATAGTTTTGAATGTTGTTTGTACTTTCTTCTTCTGCTTGTAAAGGGATCATGACGTAATCACTTGCCACGATTGCATTATTTGTATAAACGCTTGGCGTTGGTACAGTATCAATAATAATGAGATCATAGTCACTTTTTAAAGGTGCTAAAAGAGTAGCAAGCAATCTACTTTCATTTTCAAAAGTCCATGAGCGAGTTAATTTTGGCAGTAACATCAAATCAAACGTGCCAGGGATCAAGTCTAAATTATCAGTCAAATGAACAATAGAAGAAGCCAAGTTTCCATTTTTCAGTCCTTCATAAAAATTAACACGTGGCAATTCTACCTTAAATGTTTTTGCTAAGTCTTTTGTCAATGTTGCTTGTAAGTCCTTATCGATCATTAAAACTTTTAAATTAAATTTGTCTGTCAAGTAAGCAAACATAGTCGATAATTTTGACTTTCCAACACCACCTTTAAAATAATTGTTTAAGATAACAATCGCTTCATTTTTACTGTTTAAAATACGTCTTAATTCTTCAAGTATTTTGAGTTCTTCCTTCTCCATAACTACGCCCCATTCTTTTTTTGTATAGTAATATTGTATCATTAGGAATCACAAATCACAAGTGATTTGTGATTAATCACTTGTGATTTGTGATAAGTGATTTGTGATTAATATATAAAAGCCCTCTTTAAAGGGCTTTTATGCTTATTTTGAAAAAGAGATAAAATCAATATATCCCTTTTCTCCGATTTTTACAACGGCATTGTAGGACTTTCTATCTTTCGTTTTGATTCCTTTTACCAGGGTTTCTTTTCCCTCTAGTAATTCTTTTACATTTGTTTTGGTGAGTTTTTTCTTTCTAAAATGTTCAGCTAAAGTGAAGGTACATTCAGGATAATTTGAACAACCATAAAACGATTTTTTTAATACAATATTGTTGCCACACTTAGGACATTTTCCTACAAGGGGTCCCGAGCGCTTAGTGGGAATTTGTACCCCTTATCGATACAAATTCCCCGTAGGCGCTAGGGACCTCTTTAGCTCCTTGGAAGCTGTCAGTAGTATACCTAATAATTTATCTACATTCCCTTTAGTAACGTGTAACTTTCCAAATTTACAAAAGCGACTCATAGAATTATTTCCTCCCGTTAAATAATAGATAACTATTAAAAATAGACAATACTTGCTCATAAGTAACGGTACTTAAATTGTTTACTTTGGCGTGTTTCATTGCTTGATGAAACTGATTTTTAGTAAACAGTTGACGATATTCTCGATTGACCCATTTTGAAACAAAGTACGTATATAGCTTCCAATATTTATCTGGAACATCTGTGGTATGGCGGGTAAGTTTTATTAAGACACTGTTTACTTTTGGTTTAGGATGAAAGCATTCCGCTGGCAGCTTAAGCAATTGCTGAATCGAGACTTGAGTGTGCAAGAGCAACCCTAGTGTTCGGTGAATATCCAAGGTACGCTTGTAGAATCCTTCTTCAACAATCAGATAGATGTCAGACGCATGGCTTTCAAAAACCACTTTTTTAATAATTTGTGTGCTTAAATGGTAAGGAATACTCCCAACAATTTTATACCTCTGTTTGTTAGGGAATTGAAACTGTAGAATATCTTGGTGAATTAAAGTGACACGAGTATTCAGTTTTAATTTTTCTGACGATAAGTTGAATAGATGACTGTCTAATTCAATAGACGTTACCTGTTTACTTATTTTAGCCAGTTTCGTCGTTAAATGCCCTTTACCTGTTCCAATTTCGTAAACGGTATCGGTTTCTTTTAAATTCAATTGTTTTATTATTTGGTTGAGTACTTTTTCACTCGTTAAAAAGTTTTGAGAATATTTTATATTTTTGTTCATGTAATCACTCCTTCTTAATTACAAATTTTTAGCATCTAATTTAACTTCAATTCCTATTATACAAAATTTTAAGATACTGCACTATCAACACACTCTTAAGTTTGCTTCTAAGTCTTATTTCCATAACTTCTTTTACGTTTCCGCCATTCTTTGCTGTTTCGATTTTTATGATATGGTGCAAGTCAGCACGAACACGAACCGTCTTATCTCCCATTATATCTTTTTTTGCACTGATTGGTGTATCATTTCGTTTTTCTTTTTGTGCGCCTAAATTTCCCACAATCACTCACTTCTTTCTATTTCTTCTTATTCTTATTTTATCATCAACAATCACAAATCACTTGTGATTTGTGATAAGTGATTTGTGATTAATATATAAAAGCCCTCTTTAAAGGGCTTTTATGTTTATTTTGAGAAAGATATAAAATCAATATATCCCTTTTCTCCGATTTTTACAACGGCATTGTAGGACTTTCTATCTTTCGTTTTGATTCCTTTTACCAGGGTTTCTTTTCCCTCTAGTAATTCTTTTACATTTGTTTTGGTGAGTTTTTTCTTTCTAAAATGTTCAGCTAAAGTAAACTTACATTCAGGATAATTTGAACAACCATAAAACGATTTTTTTAATACAATATTGTTGCCACACTTAGGACATTTTCCTACAATACTTTTTTCTGCTTCTTTTTCTTTCTGTTCCTGGTAATCAGAAAAATTTAGTTTTTCTATATCGTTAGGTACAGCTTCCAGTAAATGAACAATGAATTTTTTGATATTCGTAATAAAGTTCTCTTGATTGCCTTCTCTTTTACCGATTTTTTTTAAATACGTTTCCCATTTAGCCGTCATTTCAGCACTCGTTAAAAGGTGCTGACTTTCAACTGCCTGGCACAATAATTTTCCTTTTTCAGTTACAACAAGCTTATTCTTAATCACTTGGATATATTCTTTTTGTTTCAAGGCTTCAATAATGCTTGCTCTTGTCGCTTCTGTTCCAATCCCCTCAACTTCTTGTAAAATCTTGATTGCTTCTTCATCATCAACCGTTTTATTCGCCGTTTTCATAGCAGTTAATAATGTACCCTCTGTAAAAGCTTTCGGTGGTTGTGTTTCTTTTTCGGCACTCTTAACGTCAACCTCGGCATGTTCTCCAATGATAACCAAGGGTAACGTTTGAACGTCCTCTTCTTCTTCTTTGGTTTGTTGTTTGAAAAGAATTTTCCAACCTTCTTGCTTTGGTGTCTTGCCTATTGATTGAAAAAGTAAGTCGGCTACTTTGGTTTGTATCTTAGTTTCTTCATACAAATAATCAGGTAGAAACATGGCAACGGTCGTTTTAACGACTAAAGCATATATTTTTCGTTGTAAATCGTCCATTTTCGCTAATGCAGATTCGGTAGGTACTTGTTTTGTTGGGATAATGGCGTGGTGTTCCTGTACCTTACTACCGTCCACATAACGCTTTCTAGGCTCTGTTTGAACCATTTCAAGATCAAGTCCTAAAAAACCGCTATATTTGCCAAAATTCGCTTTTAAATAAGCAAATTCGTTCTCTGTAATAAATGGTGTATCTGTTCTTGGATAACTCAATAATTTTGCTTCATACAGTCCTTGCATAGCTTTTAAAGTTTGGCTCGCTGTCGCTTTATAAAGCTGATTAACTTTTGATTGCAAACTACTTAAAGAAAACAAACTCGGACTATTCGTTTTCTTCTCTTTGGTTTGAACATCAGCAATTATCCCCTCTTGATTGCCTATTTTAGCTTGTTCAGAAGAAACAAAAGCTAAAAGCTCCTCTTGGGTTTTAAAGCGCTGTGTGGGGCTTATAACGCCCTTAAATGACCCTTGGTTTACTTTTATACTAGCTTCCACCTCGAAAAAAGGTTCTTTTCTAAAGTTTTCTATGGCTTCCTGGCGCTGAAAAATAAGATATAAGGTGGGCGTTTGAACACGTCCTAGTGAAAATGTACCTTGTACGCCCTTCTGCTGTAAATTTAACGTATACAAAGGGCTTGCATTCATGCCGATCAACCAATCGGCAATTTGGCGTGTTTGCGCTTCTTGATAAAAGGGATAGTAATTCATTCCTGGTTGCAAATTTTGAAAACCGCTACGGATCACATCTTTTTCTAAACTATTGATCCATAGTCTTTTATACGTTTTATCTTTAGAAAAGGCATTTGCTTTATGAATGATCGACCAGGCAATGTTTTCGCCTTCTCTGTCGCTATCTGTTGCGACAATGATTGTATTTGCTTGTTTTAAAAGTTCAGCAACAATTTTAAACTGCTTTTTTTTATCTGTTGCCACTTCAAAATCGTATCGATCAGGAAAAATCGGCAATGATTTATGTATGTTAGTGTATCACAAAGACACAAGCAAGTCAAGGAAAAGGGCAATGATGATAATGAGTATAAGGCAGGGTACTTTCTGTTTTTGCTTCTCTGCGGGATATGAGATTTCGTAAAATCCGATTTAGATGTTAAGGCTCATGTATAAAAGCGGATAAGGATTGCCCTGTTCGTCAAGGTCTGTCCTTTTATAAACCTGAAAGCCCATGTGTTCATAAAAGCCCTTGGCCTGTGGGTTTTGCTCATTCACAGCCACCCGCTCTACGGCATAGGTTTTAATCCCATATTGGAGCAGGCGCTTTCCGAGCCCCTTTCCTCTTTCTTCCGGGGAAATGAACAGCATTTCCAAGGTGCCGTCCTTGATCCCCATAAAAGCCCCGGGGCAGCCCCTATCATCTTCTGCGATCATCAAATGCGCAATTCCAGCGAGCGCCTGCGGTACATATTCTTTTATCTTTTTGATTTCACTGTCCGACAGAAACAGGTGTGTTGCTCTTACAGAACTTTCCCATACCGTCAGCAGCCGATTTATGAAATCCGCCGTCCTGTTTTTGGTTTCTACTTCAATGAATCTCATTTTTCCTTTTTGCATATCTAATTTCTCATTTTCTTCCCCGCTGCGGGTTTGGATTTTTCAGCAAGTCCGACTTCTGTGCAATCCTTTTCAGCCATTTCTTTTCCTCCTCCGACAGCTTCCCATAGTTCAGTTTGAGCCGCTTGCAGATAAAGGCCATCGCAGCCTGTTCCGGGTCGCTGTTTGGGCTGGCGGCTTCTTCGGCGGTCTGCAAGAAATCTTCCAGAGGATTGTCCTCCGGGACACTGAAAAAATCGTCCTTGTGGGCTTTCCGCAGGTCAAGGGCTATCTTGTTTATATCCTGCTGTATCACATGGCGGCAAAAGCTGTCATCGTCAATGTGGGCGGCGATCAGCTGCCTTAACTGCGGGTCGGTCAGACCGGGATTGTGCTGCTTCATAATAGTTGCGCTCACAGCGTCCACAATGGCGTTTGCCCCCTGTACCTGCTTTGCCGCTATGCCGTTTACATAGATTTCAAGGTCAGCCATGAGCCGGGGAAAATCCGGGTGCGTCGCCAGTTCACACAGGAGGGCATTATCCACCAGCCTGCTTTTCAAAAATTCAATCATATCATCACTCAAACGCAGGTCTGCAAGATCGGCGTTTGGGTGATTTTTTGTTTCAGAACGGCACAGCAGATAATCAACGGACACTTCGTAAAACTTTGCCAGCTGGATAAGGGCATAGTGGCTGATGTCCTTGAACTTGTCCCCCTCATAGCTGCCTAACGCAGACTTGGAGAGATGGGTTTCTTCCGCAAGCTGCTCCAGCGTCAGGCCACGCTCCACACGCAGGTCTTTCAGGCGTTCTTGTATGGATAGTTCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP019858|1783999:1790513|1784595_1785492_-|AXU79118.1|DBSCAN-SWA MIQYYYTKKEWGVVMEKEELKILEELRRILNSKNEAIVILNNYFKGGVGKSKLSTMFAYLTDKFNLKVLMIDKDLQATLTKDLAKTFKVELPRVNFYEGLKNGNLASSIVHLTDNLDLIPGTFDLMLLPKLTRSWTFENESRLLATLLAPLKSDYDLIIIDTVPTPSVYTNNAIVASDYVMIPLQAEEESTNNIQNYISYLIDLQEQFNPGLDMIGFVPYLVDTDSTTIKSNLEELYKQHKEDNLVFQNIIKRSNKVSTWSKNGITEHKGYDKKVLSMYENVFFEMLERIIQLENEKE >CP019858|1783999:1790513|1786024_1786762_-|AXU79119.1|DBSCAN-SWA MNKNIKYSQNFLTSEKVLNQIIKQLNLKETDTVYEIGTGKGHLTTKLAKISKQVTSIELDSHLFNLSSEKLKLNTRVTLIHQDILQFQFPNKQRYKIVGSIPYHLSTQIIKKVVFESHASDIYLIVEEGFYKRTLDIHRTLGLLLHTQVSIQQLLKLPAECFHPKPKVNSVLIKLTRHTTDVPDKYWKLYTYFVSKWVNREYRQLFTKNQFHQAMKHAKVNNLSTVTYEQVLSIFNSYLLFNGRK >CP019858|1783999:1790513|1783999_1784272_-|AXU79116.1|DBSCAN-SWA MAVTYEKTFEIEIINELSASVYNRVLNYVLNHELNKNDSQLLEVNLLNQLKLAKRVNLFDYSLEELQAVHEYWRSMNRYSKQVLNKEKVA >CP019858|1783999:1790513|1786808_1787042_-|AXU79120.1|DBSCAN-SWA MGNLGAQKEKRNDTPISAKKDIMGDKTVRVRADLHHIIKIETAKNGGNVKEVMEIRLRSKLKSVLIVQYLKILYNRN >CP019858|1783999:1790513|1789712_1790513_-|AXU79123.1|DBSCAN-SWA MELSIQERLKDLRVERGLTLEQLAEETHLSKSALGSYEGDKFKDISHYALIQLAKFYEVSVDYLLCRSETKNHPNADLADLRLSDDMIEFLKSRLVDNALLCELATHPDFPRLMADLEIYVNGIAAKQVQGANAIVDAVSATIMKQHNPGLTDPQLRQLIAAHIDDDSFCRHVIQQDINKIALDLRKAHKDDFFSVPEDNPLEDFLQTAEEAASPNSDPEQAAMAFICKRLKLNYGKLSEEEKKWLKRIAQKSDLLKNPNPQRGRK >CP019858|1783999:1790513|1784288_1784498_-|AXU79117.1|DBSCAN-SWA MGNLGAQKAKRNDTPISAKKDIMGDKTVRVRADLHHIIKIETAKNGGNVKEVMDKALEEYIRKYLPDKL >CP019858|1783999:1790513|1789234_1789702_-|AXU79122.1|DBSCAN-SWA MQKGKMRFIEVETKNRTADFINRLLTVWESSVRATHLFLSDSEIKKIKEYVPQALAGIAHLMIAEDDRGCPGAFMGIKDGTLEMLFISPEERGKGLGKRLLQYGIKTYAVERVAVNEQNPQAKGFYEHMGFQVYKRTDLDEQGNPYPLLYMSLNI >CP019858|1783999:1790513|1787167_1789102_-|AXU79121.1|DBSCAN-SWA MPIFPDRYDFEVATDKKKQFKIVAELLKQANTIIVATDSDREGENIAWSIIHKANAFSKDKTYKRLWINSLEKDVIRSGFQNLQPGMNYYPFYQEAQTRQIADWLIGMNASPLYTLNLQQKGVQGTFSLGRVQTPTLYLIFQRQEAIENFRKEPFFEVEASIKVNQGSFKGVISPTQRFKTQEELLAFVSSEQAKIGNQEGIIADVQTKEKKTNSPSLFSLSSLQSKVNQLYKATASQTLKAMQGLYEAKLLSYPRTDTPFITENEFAYLKANFGKYSGFLGLDLEMVQTEPRKRYVDGSKVQEHHAIIPTKQVPTESALAKMDDLQRKIYALVVKTTVAMFLPDYLYEETKIQTKVADLLFQSIGKTPKQEGWKILFKQQTKEEEEDVQTLPLVIIGEHAEVDVKSAEKETQPPKAFTEGTLLTAMKTANKTVDDEEAIKILQEVEGIGTEATRASIIEALKQKEYIQVIKNKLVVTEKGKLLCQAVESQHLLTSAEMTAKWETYLKKIGKREGNQENFITNIKKFIVHLLEAVPNDIEKLNFSDYQEQKEKEAEKSIVGKCPKCGNNIVLKKSFYGCSNYPECKFTLAEHFRKKKLTKTNVKELLEGKETLVKGIKTKDRKSYNAVVKIGEKGYIDFISFSK |
8 | Streptococcus_phage(85.71%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1930279 : 1962489
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP019858|1930279:1962489|DBSCAN-SWA AATGAATCTTAATTTTAAATCTACAAAAATACCTATATATGATATAGAAAATTCAGCAGGTATAAGTTATCCAAGAAGAACAGGAACAAGAGATAGCAACACTCATTACAAAGCTACTAAAAATAAAGTTATTTTTAGAGTAAAAAAAGAAGATATATTTATTAGGTTTTTAGAAACTGGGGAAAAAGAACTTAATGAAAAATATTATTTATATATTGAGTATTTAAAAGAGATTATTTTAAAAGAAGAAGTTGAATCTTTTAAAAAAGGATTTGAAAAAGCTGATATTTGGGCTGGTAAATACTTGAACAACTTTGAATATTTAAATAAATTAATTTGGGATATTAAAGAAAAGAGACAATTCAAAATGTTAGAAGAAGAAAAAGTTGATACACTAGAGAAAGCTAAAAATATTAAATTTCCTTGTTTTTCAAAATATTCGGGTGAGTATATATATAATGTAATGCAAACTGATTTAGAACATTGCATTGCTTATTATGTAGGAAATTTAAGCAATAGAGAATTTGATTTTTCAAATATTGGTGTTAGTCAATTAAAATACAATCAGTCACCAGAAAGAACTAGAAGTTATAACTGCATAAAATATTTACTAAATGAATTTTATCCTCATATATCACGAAATTTATTAGCTTATTTTAAATATATAAATATAGATGATGCAAAAAGAATTACTTTTAAAAACGGAAAATATAAAGATAAAACAGTATATTATGTTTTCAAAGAAAATCGAAGTTATATAGAGTGGTTTTTACAAAACACAAAGAAAACTATATATAATATTAGATTGATAACAGCTATTACATTAATTAGAGAACAAGAGTAGAAAGGAAGTTATTGCATGCTAAAAGGAATAGGAGAAGGGACTGAAAATATAAATATTGATATGTTAATTGAAAAGGTAACAAATATAGCAGCAGAGAAGGCTATATCTACATATGAAAATAGAAGAAAAGAAGAGCTTAAGTATTCGTATGATAGAAAACTTAGAAATACAAAGTTATTACTAAAACATTATAAAGATTTTAAAAGACATGTTAATAATTCTATTTTTAAAGTATCAAATGTAAGTGAAAATGCTATTGAGATATTAGAAGAATTAATAAACACTAAAATAACAGAAAACTTATTTGTAGAAAGTATAAGTAATAGTGTATCACGTACAAATATAATAATATCTCATATAAATACGATGATAAATATTTATGAAGCTTATAGTAAACAGCATGGAGAACTAGAAGAAAGAAAGTATAGAATAATATATAAAAGATTCATAGATGAAAAGCAATGGAGTATAAAAGAAATAGCTACATCTGAAAATATAGACAATAGAACTGTATATAGAGATATAAACCTAGCTTGTGGGAAAATATCTGTATTTCTATTTGGTATAGATGGAGTAAATAAATTCTAATATAATAGTTGAATGTCATGTTTTTATAGAATAATAAAATAACATGTTAATTAGTTAAATAAATGCAAGATAGTTATTTCAATGTATACAGTAATATAATTCAATCAATACAGAAAGTTATATGATAAGAATGATATGTCAATAAGTGTTCATATACAAAACAATTTCAAAATGCTAATATATAAAGTGTAAGATTAGATTTATTGTGAACCAGAAATATATACTGTAAAAAATAAAAAAGGATTATCTCTTTAAATATATTGAGATAGTCCTTTTTGTTTTTGTGATAGGAGTGATTAAATGAGTAAAGTTATATGTGATAAGTGTAATCATAGTTTTAAAGTTAATTTAAAAGATATAAAAACATACTTCATTGATGATATAGAAATAAAATACTTTAAATGCAGAAAATGTAAAGAAAGATATATTATATCTTTTGAAGATGATAAATTAAAAGAAATGAAAAAGAATTATAATGAAATGTTAAATGAGGAAAAAGAGTATAGAGCAAATGGATTAGACTATAAAGAAACACCACTATGGTTAATGATAGATAGTTTTAATAATTTAGTTGAATATCAAAATAAATTGAAAGTGAAAGTTTATGGTGAAACTATATGCCAATGAAACGAATCTGTAAATGTGGTAAAAAGATTGATTATGATAAGAAAATGTGTGAAGAATGTTATAAAAGATACAATAAGACAAATAAAAAGATATATGATTATAAAAAATATAATAAAAAATATAATTCAGAGAAAAGAAATAATCAAGAGTTTTATGGTTCTAAGAATTGGAGAATAGCAAAAGATAAAGCTAGAGTTAGAGACAAGAACTTATGTAGGTTATGTTATGATAATAAAACTATCAAGAAGGCTGATTTGGTGCATCATATTGAAGAGGTAAAGAAATGTAAAGATAAAATATATGATACTAATAATCTTATATGTTTGTGTGAAAGATGCCATAGAGAGGTGCATTTATTATATAAAAGTAAAGCAAGTATAATAAAAGAAAAATTGAAAGACTTAGTAGAAGAAGGATTTTAAGAATATAGAAAACTTATGCATAATCTTACATTAAGCAGAAAAACAAAGCCCTTTAGAATCGAAGCTAGAGGTAGTAGGGGGGCATAAAAAAGTTTTTGGAGGGGTAGACGAGCGATAGGGTGGAGTCAACTGTGCAACCAAACATAATTTTTCAAAGGGGGTGGTTTATTGGAAAATAGTAGGGGGGAGGGGGCAAGTCTAAAAACATATGAAATAATACCGAAACCACCAGCAATTTTATCTAAATTAGGAAAAGAAAAGTATACTGAAATTGCAAAAAGTTTGGTAGATGAAGAAAAATGGAAAGTCGGAGATGAAATAGCATTAACTGCATTATGTGTAAATTATCAGCGTTGGATGCAAGCCGAAAAAGCAATTAAAACTAATAAAGATTTATGTTTTGAAACAGAAACAGGATATAGGCAACAAATACCAGAGATTTCAATTGCGAATAACTGTATGAAAATGATGTTAACCTTTATAAAAGAATTTGCTTTAACTCCAAGAGAAAGAGTAAAGTTAAAAGAACTTGTTTTAAATCCTACAGAGGTAGAAAATATAGACAAAGAACTAGATGACATGATTCAGAAATAAGGTAATTATATGAATGAAAAATTAAAAGAAATAATAGATAAACAATTGACTTGGAATTTGGATGATGCCATTGGAGAACTAAAAAATAAGTGGGATAATGAAAAATATTACTATGATGTAGAAGAAGCTAAGAAATTTCTTACCTTTGCAAGCAAGTTGGAGCTTGATAAAGGCAAAAAAGGTAAAAAAATAAAGTTAATAAAATTTCAATTTGAAATATGCACCAGTATTATTTGTGTTAAAAGAAGAAGTGATAATTTAAGAAGATTTAGAGAAGCACATATAAATATACCTCGTAAAAATTCTAAGTCATTCTTGATAGCCCTTATAGCTAGTTACTTATATTTCTGTAAAAATGAGTTTGGAAGCGAAACAATAATAACTGCAAACAGTAGAGACCAAGCATCATTACTTTTTAATACAATACATCACATGGTTAAGACTAATAAAACTTTAAAAAAATATGTAAATATACTTGAAAGTAGAAAGTATATGTTTAAAAAGAATATGAACGCATATTTGAGAGTTTTATCATCAGATGCAGGAACAGCAGACAGTTATGCAGGCTATGTTTGTATAATTGATGAAATCCATGAAGCTAAAAATAGACAATTATATGATAAGTTAAAAACTGGAGCTGGAATTTGGGAAGAACCCTTAATGTTAACAATAACAACTGCAAGTTCTGGCGATAATCCAGAAAATCTAGAGTTTGAATTATATTCGTATTCAAAAGAGTTAATGAAAGGCGAATTTGAGGATGATTCTTTTTTTTATGCAATTTATGAAGCAGAGGAAAAGTGTGAATTATTGGATGAAGAACAATGGTTTAAAGCTAATCCAGCACTTGGAACATTTAGAAGTTATGAAGAACTGAAAAACCTTGCAATAAGAGCCACAAGATTAAAGACACAAGAAGCAGCATTTAGAAGGTTATATTTAAATCAACATGTTGCACTTGATGGTGAAGGTGCAATAAATATGGAATTGTGGGAAAAAGCAGAAAGAGAAATAAATTTAGAAGAATTGAGAAATATGAAAACTTGGGATGGAATGGACATGGGTTCAACACAAGACATAACAGCCTATGTGATGGTTTTTTATGATGAAGATACTAATAAGTATATAATTTACCCATTTTTATTTACCCCAAAAGATACAATTGAAGAAAGAAGTGAAAGGGATGATATTCGATATGATATTTTAGTACAAGAAAAAGAATTAATTGCATTAGAAGGTCGTTCTATTAACTATCAATATATGCATGATTATTTAGAAGAAACTAAAATAAAATATGAATTAGAAACTCAAGAAATAGGCTTCGATAGATGGGGTTCTATAGGAATAAGAAATAAGCTAGAAGAAGATTATGACGTTTTGCCATTTGGGCAAGGATATAGTTCTATGTCACCAGCAGTTCGAGATTTTGAAAATATCTTGTTAGATGAAAGAATAATAATAGCTAAAAATAGTCTTTTTAGACGAATGGCAAAGAATGTTGTTGCAGTTATGGATGATGCTGGAAATATAAAATATTCAAAGAAAAGAAGTAAATATAAAATAGATGGTATCATAGCAATGCTAATGGGAATATCAAGAGCAATTTTTAATAATGAGGGTGAACAATTTTCAACACAAAATAATGTAGATAAATTTTTAAATAAAGTAATGGGAGGTGAAGAAGATTAATGCTGTTAATAAAATAAGAAAATATATAGCTAATAAAATAGACCCTACACCCAAAAGTGTAGGTGATAGTGATATTTTAACATGGTTAGGAATTGATGAAACAAGTAAAAATATAAGAAGTGAAATAACATATTTTACATGTTTGAAGATTTTATCAGAAGGCATCGGAAAACTTTCTTTGAAAACATATAAAAGAACAGAAAAAGGAAGAGAAGCAATTGAATTATCAGATATAA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>CP019858|1930279:1962489|1936274_1936982_+|AXU79261.1|protease|DBSCAN-SWA MSKKNKDNLINILQIKNSTDKKAELYFYGDIVSSSWGAWEEEDQYPESIKNFLKGQEGKDLDIYINSGGGSVFAGMAIYNMLKRHTGFKTIKIDGIAGSIASIIALAGDKIIIPRNAFFMIHKAWGIVQGNSKKVIEYASLLEKIDKTALEIYKENLKNENDIEKIKQMIEEETWLTGEEAAKYFNFELSSEVDAVACSGDILDKYNKTPKVINNIKVNDIEERKNNLLKRIERI >CP019858|1930279:1962489|1950554_1952498_+|AXU79273.1|DBSCAN-SWA 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29 | Clostridium_phage(42.11%) | protease,terminase,head,capsid,lysis,holin,portal,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2603784 : 2609728
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP019858|2603784:2609728|DBSCAN-SWA TTTACTCAATTTTGTAAAATACATGATAATTCTTCTTCTCACCTGCAATCTTGGTAGGTCTATTATTTTCCTCTATCCAAGTTCTCACCTTATCTATTACACTCTTTGTATATTTATTTACAGTACCAGTCCAAGAACCATTAGTTTCCCAAACACCTTTAACTTCACCATCTTCTAAATCAATCTTTTTAATAATCTCACAAACAGCCATCTGAGCTGGTTTATTACTCTTAGAATATATTTTCAGTTTAGATGCTATTTGTTTTGTATCAAAATAATGTTCTTCTTCGTTTATCTCTATTGGTAAATCAATTTCTGCTTTCTTATATAATGTTTTAGCTGTTAATAGTTTTGATTTATTGTCAAAGCCTGCATCATCTAGCAATTCTTTTAACATAGATGTACTGTTATAAACTAACTGTAATTTTTCAATCTCACTTGCTTTTTCTCTCAACTTTTCGGTATTGCATTATTATTTATGTATGCACCAGTTTGTCTTATGCTTGGTAAAACTTCATCACTTATCCAGCCTTGGAATCTCTCAGCTTCTTCTTTTCTTGATTTAAAGATTAATTTATACACTCCACTTTCAGTAAGAAAATTTTCTCCAGCATTATTAAGTTTTCGGATGTCAGTATTACTGATATCCGAATTTCTTAACTTTACAACTTGCTTTTCATTCATAAGTCTTATATTCTCATTAACATTTTTTATGTCTAAACAGTTTGCTACATCTTTTGAGTTGAATAAAATTCTTCCTTCAAATTCAAATACTTCAATCTCTTTTCCTTCAAACATCATTAATTCATTTTTCATAATATTACACTCCTTAATAATTGATTTTTTTTAAGGAATGACATATATTATAATTGATATACGATAGTATACGTCATAGGGGTTACTCAAACTTTGGTCGGTGGGAGTGACCCTTATTTTTTATTCCTTTTGTTCCAGTTCCTCGTCGATTTTTTCTTCTAGCCATTCTTTCTTGGTTAGATTCTTTTCCTCTAATACTTCATCAAATTTATCTAACTTTTCTTTGTCTAAAAGTACACTAAAACCTCTTTTATCTTTTCGACGATTTTTCATATACTCTGCCCTACTTTTAGTTGCTATTTTATTCACCTCTTTTCTGTAACTCGTTACATTAATAACAATATTGTAACGAGTTACAGTCAATAGGTTTTTACTAACTTTTTCTAATTATTTTACCCAACCAACCAATTTTGAGCAGAATAAAAGCACCTACATATTTGTAAGTGCTTTCTTTGTTTATTTAATTTTGAATCCACATAGTTAATCTAAAACACAATTATTAATTGTTTTATTAGTGAAATCACAGCAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACACGATAAAAGATGATTGATTACAAGCTTTGTTCAGAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACATTATTCAAAATAGGTAATTCCCATCTGGGAGCAACATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACTCGCAAATCAGAAAATTCTTCAGACATTCGATAATAAAAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACCCCAAAATAAACTTAGCATTTCCAATACCTACATATATACAATACTCTTAAAATTGCAGTGAGCGGGCAATAGTGCAATTGATAACACTTATCACGCACCCTCAACATCTTAGATTTCAAGTATTAAGCCCTACTTTGTAACAAATATCGCACACTGCAAAACTTCTATATTTTTATTATATCATAAAATCTAAACTATAAAATTAAAATGGAATACTTTGTAAATTTAAAAGCACCTACATACTTGTAAGTGCTTACTATATTATCTATTCTAATAATTCTTTTTTCTTTTTATTATATTCTTCCTGTGTAATTGCTCCTGAATCTAGCAACTCTTTTAGTTTCTTTATTCTATCTAGTGGGTCAACCACTCTGTTTTGAATGTAGTTATTATAACTGTTTTTTTCTTGTTCTATTTTCTCTTGTTCTCGCTTCTCTTCTTCTTCGGTTTTAAGTTCAAATTCATTGAATTCTAAATTTTCAACATTATCTACATTATTTTGTATGTTTCTAAAATAATCAATATAAACAGAATTATATATACCACCGTCATCTTTTGAATGAAACTTAAAGTACGCCTTGCTTATTTTAATTTTTTTAAGATCATTAGCAATTTCTTTTACAAATTTTTTACATTCTTCAGAATTACTAAATTTTTCATTTTGTACAGTTAAATCAAAATACATACTATATCTTTTAAATTTTCCTACTTTTAATTCATATTTCTTCCCCTTATATTCTTGAGGTACTAAAGCCTCTAGCTTAACTTTTAAATCATTTTCTGATATTTCCATTCCATGTTTTTCAATATATCTTTCTTTGTCTACTTCTTCTTGTATTCTTCTTCTTTCCATTTCTTTTTCTCTTTCTACAGTTTCTCTTTGTGCCTTAACAGTCTCAACTTTATTATCTGCTATCAAGGATTTATCTTCACAAGTTGCACAAAGATAAATTGAATAAGTGAAAAAAAGAACTGACACAAGACCCATAACTATTTTCTTTTCTATAAAAGAATATATAATCAACAAAAAAGCTATCATAACTAAAATATATTGCATAGAAGAAACAGCTATTATAAGTAATACTATTGTTATTATTGGTACTAATATCCACATTGTAAAATTCCCCACAAATTACTCATCTCACTCAATATTATAGCATAATTTGGCAAAACAAAAGCACCTACCATTTAAGTAAGTACTTTCTTATTTACAATTAAATTTATTCATCTAGTTAGATTCATCATCATTGTGTATAAAAAAATTCATCTTTTTATTGACTATAAAAAATATTATATGCAATATTTTTTCTAATTTGTGGTATAATAAAAGCAAGAAGAACTACAATCTATTTGCGGTAGAGTGAAGTTCTATAACTGAAAGTTATTTTTTACGATGATATTTAAAATTTATATCAATCTTTAAGTCACTCTTTGCAGTAGAGTGGCTTTTTACTTTTTTGATTAACTTGCTAATCAAATAAACTATGTAACTAGCTGTTACACTAGCTAACACATTAAATAAAAAATTATCCATGTATATTCACCTCCCTTCTTATCGTTGGGAGAATAATTTTTTAATACATGAACTCCACTCTATAAATTGTAGATTACATCTTCTTGCTACAATTATTATAATATATAATTCTTATATATTTTTCCTATATCTTACTTTTTATTTTATTTTCTATTTTTTCAATAAAAAGCACCTACATATTTGTAAGTATTTTCTATGTTTATTTAGTTTTATTGATTACTTAATAGGTTAGTACAAATTCCATATCAACCTAAGAATATCTACATAAAATAATTAAATAATATAATCAATAAGTATTTTTTTCACTCTTTTAATCAAATTATTACCTGTTCCCCAATCAATCTGAAATAGTCCAATTGCACTACCAGTTGAGGTAATTTTAACAAGTGTTTTTCCTGTAGTATTTTCACAAATCACTACCAAACCTGCATCACTATTGCTTCTTGCATAATATTTTTCAAAGATTGTAACTATTATAGACTTATTATTTTCTAGGTTATAAATATCAACAGAAATTAAATCTGCTTCCAAATTTTTTTCTACCATTTTCTGTGCTTCTAGTGGTGTCATCTTTACACTAAATACATCTCTTGCCATATCATTCATCACATCCTAAATAAAAATATACTTTTTTAGTATTTTCTGACACTTTTATCAAACAGTATTCCTATTCCTCCTAGTAAAGCCAGTATAGAACCAAAATTTCTATATTGTGAAATAGATTGTTCTAAATATATGTTGTATTGTTCGGTAGCTATTGACCCACCATTTTGTTTTATAATACAATCCATATTAAATTGACCTAGACCTATACAGCAAAATAACACTATTATTCCAATTACAAAAGCAAATATACATATTGTAAGTTTAATATCTTTATTTTCTATAAATACACCCCTCATAATTTAGATTTATTTGTTGTTTTTTACTTGGTGATATATTATCTACATTATACTATACAACATATATATCCATCTATTTCCAAAATTGTAACATTTTCATATATTAGCAATGTGACTATTTTAACTTTAAATTCTACCTTCTTCTACCTCTCTTTTTCTCTCTTTCAGCTTCTTTCATTGCTTCTTCTTCATCTTCAATTTTAATAAGTATTGAGTCGGCTGCTAATGCTCTCTCATTAACTTCTAAATTCATATATTCACTAGGTTTCCACTTTAGCTTTTGAATGCAATTTAGTCTTAATCCTTCTTTTAATATATTTATACTTGCATTTATATCTCTATCGTGAGTTTCATTACAACTAGGATAAATCCATTCTCTTATATTTAAGTCCTTCACTTCCTCGTTTTTATACCCACATTTATTGCATATTTGTGAACTTGCAAAGAATTTACCCACCTTTACAATTTGTCTACCATGCCAATTAGCCTTGTATTCTAATTGACGAATAAACTCTGACCATGACACATCAGAAATTGAGCGAGATAGTTTACGATTCCTAATCATATTCTTTACTTGTAAATCTTCTATGCAAATAATATCGTTCTCTTTTATTAATTTAGTAGATAGTTTTTGTAGAAAATCATTTCTTTGATTAGCTATATGTTCTTGAAGTCTTGCAACTTTTAATCTCGCTTTATTTCTATTTAAACTACCGATTGTTTTTCTCGATAATTCTCTTTGTAATTTAGCAAGTTTGTTTAATGACTTCTTAAGATTTGAGATAAATTGAGGTTTATTTGAATAAATTGATTTGAATTATGTTATTTTCAGATTACTTTTATTTAAGTATTTTGATTGGATTCAGCTGAATTAATGTATATTAATTCTTATTGAACAGTTTTTATTTTTATACATACTATCTACTATATCCTATACATATTCTACTAAAATTTATATAAATATTAGACAAACCTATTTTATTTTCTTAACATGTTCAGAATAATAAACAAAATGAAGGTAGAAAAAGTTATAATTTCATACCTTCTTTTTATTTATTATGTATCAATTTGTCATTTTCTTATTTCAAATTCTTAAAATATTCTTCTAATAAATTTAAAATATCACCATCTACTTCATCATCCTTACTACATAGTGCTGACATTAAACTTAATATTGAATTTTTATGTGTATTCTTTAAAAATTCTTTTGTTTAAAATCTCTGATATTATTTTTCTTTTACTAATACATTATAGTGTGTACACTTATCTATTTTCTCCGTTTCTAAAAACTCTCTTCTTTAGTAATCTTTTTAATACTGTAAATATAGTTGTATGTTTCCATTCATATTTTTGTTCCATAGACTTGGTGATTTCTCTTGATATTAATACCTTTTCTGATTCCCAAATATATCTCATAACTTTTAATTCCGCTTCTGGTAATTTACTAATTTTCATAGTATACATCCCTTTACCAATTTATGTATATGTCAAATTCTATATCAATAAAGTTTTACAAACAAAGGAATTAAGGTAAATAATTACATTCGATTTTTACTATATCATTCTTTTAAGTTTCTATAATACTCATCTAATAGGTCTAACTTCTCTTTACTTACATTTTTATGTATAGTGGTAAGTGAATGCATTATTTTTATGCTTTTACTAGATTTTAGTACCTTTTTCTTAAAAGTATAATATTCTTTATTATCTATTATTATTTTATAATAAGATTGAAAATTTATAATATATCTATCCAAATACCTTTTATCAACTAGCCTTTTTAGTAGTATTTTTATTGTACTTTTATGCCATCCATAAATCTGTTTTATTTCTTTTACAATTTCTTTTTTAGGCATTAGAGTGTCTTTTTTCCATAAATACTCCATTACTATTAATTCTGCTCTTAATAATTTTTCTATTAATATTTCTTCTTTCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP019858|2603784:2609728|2604233_2604599_-|AXU79874.1|DBSCAN-SWA MKNELMMFEGKEIEVFEFEGRILFNSKDVANCLDIKNVNENIRLMNEKQVVKLRNSDISNTDIRKLNNAGENFLTESGVYKLIFKSRKEEAERFQGWISDEVLPSIRQTGAYINNNAIPKS >CP019858|2603784:2609728|2604719_2604872_-|AXU79875.1|DBSCAN-SWA MKNRRKDKRGFSVLLDKEKLDKFDEVLEEKNLTKKEWLEEKIDEELEQKE >CP019858|2603784:2609728|2606736_2606889_-|AXU79877.1|DBSCAN-SWA MDNFLFNVLASVTASYIVYLISKLIKKVKSHSTAKSDLKIDINFKYHRKK >CP019858|2603784:2609728|2607924_2608356_-|AXU79880.1|transposase|DBSCAN-SWA MIRNRKLSRSISDVSWSEFIRQLEYKANWHGRQIVKVGKFFASSQICNKCGYKNEEVKDLNIREWIYPSCNETHDRDINASINILKEGLRLNCIQKLKWKPSEYMNLEVNERALAADSILIKIEDEEEAMKEAEREKKRGRRR >CP019858|2603784:2609728|2607162_2607495_-|AXU79878.1|DBSCAN-SWA MNDMARDVFSVKMTPLEAQKMVEKNLEADLISVDIYNLENNKSIIVTIFEKYYARSNSDAGLVVICENTTGKTLVKITSTGSAIGLFQIDWGTGNNLIKRVKKILIDYII >CP019858|2603784:2609728|2609350_2609728_-|AXU79882.1|DBSCAN-SWA MKEEILIEKLLRAELIVMEYLWKKDTLMPKKEIVKEIKQIYGWHKSTIKILLKRLVDKRYLDRYIINFQSYYKIIIDNKEYYTFKKKVLKSSKSIKIMHSLTTIHKNVSKEKLDLLDEYYRNLKE >CP019858|2603784:2609728|2603784_2604237_-|AXU79873.1|DBSCAN-SWA MREKASEIEKLQLVYNSTSMLKELLDDAGFDNKSKLLTAKTLYKKAEIDLPIEINEEEHYFDTKQIASKLKIYSKSNKPAQMAVCEIIKKIDLEDGEVKGVWETNGSWTGTVNKYTKSVIDKVRTWIEENNRPTKIAGEKKNYHVFYKIE >CP019858|2603784:2609728|2609054_2609246_-|AXU79881.1|DBSCAN-SWA MKISKLPEAELKVMRYIWESEKVLISREITKSMEQKYEWKHTTIFTVLKRLLKKRVFRNGENR >CP019858|2603784:2609728|2607521_2607791_-|AXU79879.1|DBSCAN-SWA MRGVFIENKDIKLTICIFAFVIGIIVLFCCIGLGQFNMDCIIKQNGGSIATEQYNIYLEQSISQYRNFGSILALLGGIGILFDKSVRKY >CP019858|2603784:2609728|2605620_2606469_-|AXU79876.1|DBSCAN-SWA MWILVPIITIVLLIIAVSSMQYILVMIAFLLIIYSFIEKKIVMGLVSVLFFTYSIYLCATCEDKSLIADNKVETVKAQRETVEREKEMERRRIQEEVDKERYIEKHGMEISENDLKVKLEALVPQEYKGKKYELKVGKFKRYSMYFDLTVQNEKFSNSEECKKFVKEIANDLKKIKISKAYFKFHSKDDGGIYNSVYIDYFRNIQNNVDNVENLEFNEFELKTEEEEKREQEKIEQEKNSYNNYIQNRVVDPLDRIKKLKELLDSGAITQEEYNKKKKELLE |
10 | Clostridium_phage(71.43%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
3159140 : 3168093
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP019858|3159140:3168093|DBSCAN-SWA TCTACTTTTCTCTAGTTGTTGCAATTTCTTTGATATTAGCATCTTCTGGTTTAATATAAGTTGGCACTAATTCCCTCATAATACCATCTATTTTTTCAACCTCTTCATTGTTAGTAATTTCTCTTAAAAGTTTTAAGTATTTTGTTATTTTTTCTCTATCAACATCTATTGGTCTACCAATAAAAATCTTTTTATGCTCTGTATCCAACAGACCTTCTTCTGACATAAGTAGTTCTTCATATAACTTTTCTCCTGGTCTAAGACCAGAAAATTCAATTTTTATATCAACATCTGGCTCAAATCCACTGAATTTAATTAAGTTTTTTGCTAAATCCAATATTCTTACAGGTTCTCCCATATCAAGTACAAATATTTCTCCACCTTTAGCCATAGCCCCAGCTTGTATGACTAAGCCTACTGCTTCTGGTATTGTCATAAAATATCTAATAATATCTGGATGAGTAACTGTCACTGGTCCGCCATCTTCAATTTGCTTCTTAAAAAGTGGAATTACACTACCATTACTACCAAGCACATTTCCAAATCTAACAGCAACAAATTCAGTCTGGCTTTCAGCATTCATAGTCTGTATAATCATTTCAGCAGCTCTTTTAGTAGCTCCCATTATGTTAGTAGGGTTTACAGCCTTATCTGTAGATATAAGGACAAATTTCTTAGCTCTATATTTTGAAGACAAGCCAGCTATGTTTAAAGTTCCAAATATATTATTCTTTATAGCTTCGCCAGGGCTCGATTCCATAAGAGGAACATGTTTATGTGCTGCTGCATGAAATACCACTTCTGGTTTATATTTATTAAATATTTCATCCATTCTTTTTTCTTCTCTTATTGATGCTATTACTGTCTTTAAATCTAATTTATTTTTATATTTTCTAAGTAATTCTTGTTGTATTGAGTAAGCATTATTTTCATAATTATCAACTATAATAAGCTCTTTAGGATTAAATCCTGCAATCTGTCTACAAAGCTCTGAACCAATTGAGCCTCCTCCTCCAGTTATTAGGATTACTTTTCCCTCAATGTAATTACTTATCTCTCTTAAATTTGTTTTTATAGGCTCTCTACCCAACAAGTCTTCTATCTCTACTTCTCTAATCTGTTTTATATCAACTTTTCCATCTATAATTTCGTAAATTCCTGGTATTGTCTTTATTTTACAGTTAGTGTTTTTACATATATCAATAATCTCTTTTTTTCTACGTTTCTCTATGTTTGCTATTGAAAAGATTATCTCATCTACATTGTACTTTTCTACCACATCTTTTATATCTGAAGTTGTTCCTACAATTTTCACATTGTGGATTATTCTTCCAATTTTATTTTTATCATCATCAATTATAGCCACTGCTACTTTTTTAAGTTCTGGATTTCTTTTTAGTTCCTGTATAACCATTTCTCCTGCATCTCCTGCACCAATTATAAGGATATTTGAAACCTTTCCTCTAGAATATGTCTTATTCATGACTATTCTTATAGCTCTATAGGCTATTCTTGCGCCACTTGTAAACATTATAATAAATATTGTATTTAATACATAAAACATTATAGGATAATCAAACCCTAATAATTTATTTATTATATAAATCGGAATTAAATAAGCTAAAGTTGCCACAAAAATAGATATAATTTCTTCTTCTCCTGCATATCTCCATAATGTGTTGTAGCACTTAAACAATCTAAATGATACTATATGAAGTACTATATATGTACACGCTGAAATTATTATATCATTAGTGGTAAATGCATTTAAATTACCTGTCAAGCTTAAAGACATTCGAAACGCTACTAGTACGCTACAAATATCTAGAATTAATAGTGTTAAATGTCTAAATTTATATTTTTTAAAAAGCCTATTAAAAAAGCTTTCTTTCTCTAAATCTATACTTTCTCGCATAACTAGAAGCCCTCCTTTAAACAGCAAAAGCTACGCACCTAAGCATAGCCAACAACATCTATCTTTTGCTGTATTTTTTCATTTTATTTTTTATATTTATCAAATATAGAATCATAAATTTTTTCTATATCATTAAAGTTTAAATTAACCTCATAATTTTCTCTAACAAATTGACGCCCTTTCTTACCCATATTAAGTCTAAGTTCATCATTTTCCATTAGTTTTATTATAGCATTTTTTATTTCTTCTGGTTGTTTTGGTTCTACAATTAAGCCAGTTTCATTTTCCCATACAGATTCTGGATGTCCTCCTACATTTGTAACTATAACAGGTACTTCACATGCTTCTGATTCTATAGCTGCCACTCCAAATCCCTCTCTTAAAGAAGGAAATACAGTTACATCAAAAGAATTAAAAGTCTTGCTTACATTTTCTGGAGATATTCTTCCTAAAAACTGAACATCATTTTCTATACCCAATTCTTTAGCTAAATTTATTAGGTTGTCCATCTGACTTCCAGAGCCACCTATTTTAAGAATTATTTTCTTATCTTTATATTCATCTTTAAGCATCTTAAATGCTTGTATTAAATATTCTATTCCATATTTTTTTTCTAAACTCTTTATAATTCCTATTACAAAAGCGTCTTCTTTTTCTACTTCCATAGGCTTAAACCTATCCATATCTACTCCAAAAAAGGTTACATCTACATGTTTAGCTGTATATTTATTAGCCTCTTTAGCCATATCTCTACTATTTGAAAAGATATAGTCTGCTTTTCTAAAGTTATGCTTTATAATTTGTTTTTGTATAAAACCATTATTAGGGAAATCATAAATATCAGTACCCCAAACAGAAATAATATATGGATGATACCCAAGTAGACTTCCTATAAATCCATAACTACTTGCATACTGTGCATGCAATATATCTGGCTTTATTTCATTTACTAGCTTCTTTATCTGCTTTATTGAACCTAAGTATCCCGTTTTTTTAGAAATATTTTCATTTTTTAGTTCTTCTACATTAGAACCAAAATTATAAATTTTTATTCCTTCCATGTGACCTCCATTTAAAGAGATTACATGAATGTCATATCCTTTATTTTTAAAAAAACTACACCATTTTAAAGTATGAGGATTTGACCCATCAGCTAAATAACAAACAGTCTTCATAATATTTACCTTCCTATCGAATAATACTCAATTCCTAACTCTTCCATATCTTTAATTTTATAACAATTTCTTCCATCAAGGACTAAAGGATTTTTCATCTTTTCCTTATACTTATGTATATCATAATTTAATACATCTTTCCATTCTGTCATTATAAAACATATCTCTGCATCTTCTATCGCATCATCTACAGAATCAGCATAAAGTATAGAGTCACCAAATATTTTCTTAGTATTATTTACACCAATTGGGTCATATACAGTAACTCTTGCCCCTCTTTCGAGCAAATATTTTATATTTGGTATAGATGGTGCTTCTCTTATATCATCAGTATCTGGCTTAAAAGTCAAACCTAAAACAGCAACCTTCATATCTTGAAAGCTCTCTACTAACTTAGATGCCTTTCTAACTAATTTAAGTTTTTGACTTTCATTAACTTCTATTGCAGCTTTTACTGTTTTTAATTCATAACCATTATGTTCAGATAACCAGTGAAGAGCTTTTGTGTCTTTTGGAAAGCAAGAACCACCATATCCTATTCCCGCCTTTAAAAACTTACTTCCTATTCTATCATCATAACTCATTCCTAAAGCTACATCTTCTATGTTAGCTCCTGCTATTTCACAAAGATTTGCAATATCATTCATAAATGATATTTTAAGAGCTAAGAAGTTATTTGATGCGTATTTTATCATCTCAGCACTATTTCTATTTGTAACTATTATAGGTTGATTAAAAGGCTTATAGATTTCCTCTAATATTTCTCTAGCCCATTCACTTTCTACACCTATAACGATTCTTGAAGCATGTAGAGTATCTTTTACTGCTGTTCCTTGTGATAAAAACTCTGGATTAGATGCAAGCTCTACTTTTACATCATTTTTTAGGTTTCTATTTATATAATCTTCTATCTCTTCATTTGTACCAATTGGAACTGTAGATTTTATTACTACTAGAGTATCTTTTGTCACAGTTTCAGCTATTTGCTTTGCAACTGCCTTTATATAATCTAGGTTGGCTGAGCCATCACTTCTCTCAGGTGTACCTACAGCTATTAATATTACATCTACATCTTCATAAGCTTTTTTATAGTCTGTAGTGTAATCTATTCTTCCTCTGTTGTAATTTTTAACCATAAGTTCTTCTAGGCCTTCTTCATATATAGGTGCTATTCCAAGTTTCATTGATTTAACTTTTTGTTCATCTACATCAACACAGACTACATTTTCATTGCCTACCTCTGCTAGACAAACACCTGTAACCAAACCTACATATCCCGTCCCAGCTATAGCTATTTTCATTTTTTTACCTCCAAGTATATAAAACTTATACTCTTTTTTTAATGGCATTAAAAACATAGAAACAAAATACATATAGACTTTTTGGTAAACTTAAATTTTCAACATTTCTATAAGTATTCCAAGTTCGTTTTAATGCTTTTATCTTGTTACTTGATATAGAATTTCCAACTAATCTGTAATTCACTAAATCTTCTTGAATCCCATATGCATATTTTTCCTTTTTAAGTAACTGTAACCAGGTTGCAGTATCTTGTCCTCTTCTTACCAAAGGCATGCTGAACTCTCCTACAATCTCCTTATCAATGACCACTGTAGAACATCCTATTATAGTATTTCTAAGTAATCCTTCATAGTCAATTTTCTTAGGAGCTCTTGCAACCTTATTCGTTTTTGACCCATCTTGTCTCATATATCTATAAGATGTAAAAGAAAAACCTACATTTTCTTTTAACATATATTCTATCTGAATCTCTAATTTTCTACTATCCCATAAATCATCACTATCTACAAATGCAATAAATCGACCTTCCGCATTCTTAATACCAACATTTCTAGATACTGCAGCTCCAGAATTTTTTTCAAGCTTTATATATTTTATTCTAGCATCTTCTTTTCGAAAACTTTTTATAATTTCACTTGAATTGTCCTTAGAACAATCATCCACTAATAAAAGCTGCCAATTTTTATAAGTTTGATTTTGGATTGACTTTATCGTCTCTGATAAAAACTCTTCTGAATTATAAACAGGAGTAATTATCGATACTAAAGGCTCATTCATATTTTTACTCTCCTTATATAGCAACTAGCAGTACTATACCAACAAGTTTACTTAGATACTAATTTTCTTTGTCCAATATATTTGTAATATCCTAATGGGAATAATGCTAAATACAACAATTTATCAGATACTTTTCTTAATTCACCAAAATAATGACTATCAGACAACAATGAGTATCTGGCTAAATTTATGTAATTTTTTATCCACATATATGGATATCTACTTAATGGATATGTATTTTGATTTATTAAATATAAAAATTCTAATGCTCTACCTCTTAATGCATTTTTACTTAATATATTCTTAGTCAAACCATCATCCAAATAATCTCTTATTATCATAGGTTTATTTACACATATAACTTTATAGTATTTAGACATTTCATTCCATACTACACTTTCTGGTAAAAATCTCACTTCTTTTCTTTCTGGAAAAGGAAATTTTATAAGCTCATCAGTTACAAATACTATGCTTTTATCTCCCTTAACGCCATACTTAAAATATAGGTCTGCAAAGTGACATATTTTCTTATCTTCAGGCATTTCTGTCCCTATCAAATCTCCACTTGGATATACACAAAGTCCAACAACTCCACTAAATCCTTCTTTATTCTCTAAAGAATCCCACTCATCATTAGCAATTTCAAGAGAATCTTTAATTAAACCATCATCACTATCTACAATGAAAAATAGCTCTCCATCTGCATTTTTTACACCTAGATTTATTGCAGTATGTTTTCCTCCATTTTCTTTGTATATATATCTTATATTTAATTTATTTTCTGATATAAATTTTTCAACTAACTCTTTAGTACTGTCGCTACTTCCATCATCAACAATCAACCATTCAAAATCATTGAAATCATAAGTTTGAGCTTTTAAATCATTGTACAAATTTTCAAGTAAATGAGCTCTGTTATACGTCGGAGTAAATACAGTAAATTTATATTTATACATTAATTAAATCTTCCTCTCTGTCTAACTTTTTTTGATTCCGTTTATTCCATAATTAATAAAGTAGTATATAGCTTTGTATAAAGGTATTTTTTCTATATTTCTATATATATTCCAAGTCCACATAGCAGCTTTTATTTTATTACCACTTAGGGAATTGCTAGATTTTCTATATAATGCTAGAACTTCATTTATTCCATGAGCAATATGCCCTTTTTTCAATATCGATAACCATAAAACATAATCTTCATGTCTTACACCACTCATTCTTATTTCAAAATCCAATTTAGACTTATCAATCACAACAGTAAGACATCCTAAGATATTTCCTTTTAATAATCTTCTATAATCTACATTAGGTGGAACTTTTATTACTTTGTTTAATTTTTTATCATTTTCATCCATCAGTTCATATGAAGTAAATGAAATTACATAGTCATTTTCTAACATAAAATTTACTTGTTTTTCTAACTTACTACTATTCCATTGGTCATCACTATCTAAAAAAGCTATAAATTGTCCTGTTGCCTTACTTAGTGCTAAATTTCTAGCATTAGAGACACCCTTATTAGTCTCAGTCTTTATACATTTTATTCTACTATCCTGTTGCATATAAGATTTGACTATATTAGGACTATTATCTGTTGAGCAATCATCAATAATTAACATTTCCCATTCTTGATAAGTTTGGTTTAATACTGATTTTATGGTTGCTTCAATAAATTTTTCAGAATTATACATGGGAGTAATTATAGATACTAAATTCTTCTTCATATTACCTTCCTCATCATTTATAAAATATTTATTTAATTTTACTTAATACACAATCATATATCCTCTTGCAGTTCTTATTATCATTATATCTGAAAAACTTATTTCTTTCATTTTTTTGGTTATCCATAACCTCAAAATTATTTTCAATAATATCAATAAGTTTATTCACGGCTTCATCATTATTATAAGCCAAAGACCCAAACATTTCACTTTTTAAATCTATATATGAATCAACTTTTTCCATATATTCATCCAAATCGAATTGGTAAAACAAGATAGGTCTATTCATATACAAAAAGTCTATGGCTACACTTGAATAATCAGTTATATTTGCAGCTGATTTTCTGATTTCATTTGCTAGAGTTACCCCTTTATCTAAAAACACAATTCGTTTTCCTGTTATATTTTCTTTTATATCATCTATAAACTCATGCATAAGATGATGCATATAAATTTTTACATTTATATCTTTCTCATCTAATATTTTATTTAATTTGTCATCATTTAAAAAATTCATTATATTTTTAAAATAATCTGTATCCGTAAATTTTCCTGAACTAAATTTTATCCAATCTCTCCATGTAGGAGTATATAATATATCTCGAGTTTGTGCAACTTCATTTGTTGGTAAATTGTCATATCTTGCATTTCCAATTATATAAACTGAGTCATCTAACATTCCCCAATCATTTACCATAACATTTCTTTCAAATTCAGAACTTGCTGTAACTATATTATAGCTTTTATATAGGTTATCTATAATATTTTTGAACTTTTTGTTCATAGGTTTTCTTTTTTTAAAACTTATAGTCCCATGATTTAAAAACACTTTTATCGTTTTTTTATGAAAATAATTAAGAACAGGTACAGCAAAATTGTATGGTGCTATATCTGCTGATGGTGCATGTGAAAATACTATAGCTTTTGAATTGTAATAATACAGATAGTTTTCTACACTTCCTCTTATTAATTTTTTGCCTGGAATTTTATCAAATACTTTACTGTCTTTATTTACTACCCAATAAGTTTCTACATCATTATGTTCTTTTAGCATATACTCATAAAAAAACTTTGAATTATCATTGTATATATCCCCTGAATGTCCACCTATAAGCCAGATATCTCTACCATTAAACTTATGCTTATTAAATGGATATATAAAAAAAGCCAAAAGCATATTTATTAAAAATTTAACCTTGTCCATAAACACCATCCTCATTATAACTTGTACTGTCTAAATCCATTAATTCTTCCTTTTATAGTGGCACTATGATAATCTCTATTGGAACTCAATATAAGACCTCCTATATTTCTTACAAGTTTTGATACCATAACTTTTGCAAACTTATAATTTTTTCTATAGACTATTTCCTTTTTGCAAAGCGCTCCAAAGCCTCTTCCATAGTTATAATCTTTTTGATACTTTTCCTTAGATTTAGAATGTTTTTTTGCAGGATGGTAAATTATATCATTTCCAAAGTATTTTCCTTTAAAACCTAAACTCAATAAGTTTAAAACATAATCTATCTCTTCACCAGCACCAAACTCTCCACCAACACCCAATTTTTCATCAAATCTTGTATAATCTTTACCTTCAAAATCAATAAAAAAAGTTATGGATGTTATAGTATCCAAAACGTTGGAACTTGTGATATCACAAGTTCCATCATACATTTTCTTAAATGCATCAACTTTATTTGAATCCATAGTTTTGCAACTGTATATTTTATAATCTTTATTTTTATTAAAGAAATTTATAACTTTTTCTAATGTATCATTTTCGTAGACACAATCATCATCAGGGAAACCTATAATTTGCCCTACAGCATTGTCTATGCCTACATTTCTGTTATAACTCAATCCTTTTTTAGAGCTTTTTATATACTTTATATCTAACTTATCAATGTATTTATCAACTATTTCTTTAACTTTGCTATTATCATTTTGGTCTACTACTATAAGTTCAAAGTTTTTGTAAGTTTGATTTTCTAAGCTATCCATAAGTAAGTATATATCATCATATCTATTTAATGTTGGCATTATTAATGATATTAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP019858|3159140:3168093|3167253_3168093_-|AXU80357.1|DBSCAN-SWA MLISLIMPTLNRYDDIYLLMDSLENQTYKNFELIVVDQNDNSKVKEIVDKYIDKLDIKYIKSSKKGLSYNRNVGIDNAVGQIIGFPDDDCVYENDTLEKVINFFNKNKDYKIYSCKTMDSNKVDAFKKMYDGTCDITSSNVLDTITSITFFIDFEGKDYTRFDEKLGVGGEFGAGEEIDYVLNLLSLGFKGKYFGNDIIYHPAKKHSKSKEKYQKDYNYGRGFGALCKKEIVYRKNYKFAKVMVSKLVRNIGGLILSSNRDYHSATIKGRINGFRQYKL >CP019858|3159140:3168093|3159140_3161054_-|AXU80350.1|DBSCAN-SWA MRESIDLEKESFFNRLFKKYKFRHLTLLILDICSVLVAFRMSLSLTGNLNAFTTNDIIISACTYIVLHIVSFRLFKCYNTLWRYAGEEEIISIFVATLAYLIPIYIINKLLGFDYPIMFYVLNTIFIIMFTSGARIAYRAIRIVMNKTYSRGKVSNILIIGAGDAGEMVIQELKRNPELKKVAVAIIDDDKNKIGRIIHNVKIVGTTSDIKDVVEKYNVDEIIFSIANIEKRRKKEIIDICKNTNCKIKTIPGIYEIIDGKVDIKQIREVEIEDLLGREPIKTNLREISNYIEGKVILITGGGGSIGSELCRQIAGFNPKELIIVDNYENNAYSIQQELLRKYKNKLDLKTVIASIREEKRMDEIFNKYKPEVVFHAAAHKHVPLMESSPGEAIKNNIFGTLNIAGLSSKYRAKKFVLISTDKAVNPTNIMGATKRAAEMIIQTMNAESQTEFVAVRFGNVLGSNGSVIPLFKKQIEDGGPVTVTHPDIIRYFMTIPEAVGLVIQAGAMAKGGEIFVLDMGEPVRILDLAKNLIKFSGFEPDVDIKIEFSGLRPGEKLYEELLMSEEGLLDTEHKKIFIGRPIDVDREKITKYLKLLREITNNEEVEKIDGIMRELVPTYIKPEDANIKEIATTREK >CP019858|3159140:3168093|3164355_3165264_-|AXU80354.1|DBSCAN-SWA MYKYKFTVFTPTYNRAHLLENLYNDLKAQTYDFNDFEWLIVDDGSSDSTKELVEKFISENKLNIRYIYKENGGKHTAINLGVKNADGELFFIVDSDDGLIKDSLEIANDEWDSLENKEGFSGVVGLCVYPSGDLIGTEMPEDKKICHFADLYFKYGVKGDKSIVFVTDELIKFPFPERKEVRFLPESVVWNEMSKYYKVICVNKPMIIRDYLDDGLTKNILSKNALRGRALEFLYLINQNTYPLSRYPYMWIKNYINLARYSLLSDSHYFGELRKVSDKLLYLALFPLGYYKYIGQRKLVSK >CP019858|3159140:3168093|3163555_3164308_-|AXU80353.1|DBSCAN-SWA MNEPLVSIITPVYNSEEFLSETIKSIQNQTYKNWQLLLVDDCSKDNSSEIIKSFRKEDARIKYIKLEKNSGAAVSRNVGIKNAEGRFIAFVDSDDLWDSRKLEIQIEYMLKENVGFSFTSYRYMRQDGSKTNKVARAPKKIDYEGLLRNTIIGCSTVVIDKEIVGEFSMPLVRRGQDTATWLQLLKKEKYAYGIQEDLVNYRLVGNSISSNKIKALKRTWNTYRNVENLSLPKSLYVFCFYVFNAIKKRV >CP019858|3159140:3168093|3166063_3167239_-|AXU80356.1|DBSCAN-SWA MDKVKFLINMLLAFFIYPFNKHKFNGRDIWLIGGHSGDIYNDNSKFFYEYMLKEHNDVETYWVVNKDSKVFDKIPGKKLIRGSVENYLYYYNSKAIVFSHAPSADIAPYNFAVPVLNYFHKKTIKVFLNHGTISFKKRKPMNKKFKNIIDNLYKSYNIVTASSEFERNVMVNDWGMLDDSVYIIGNARYDNLPTNEVAQTRDILYTPTWRDWIKFSSGKFTDTDYFKNIMNFLNDDKLNKILDEKDINVKIYMHHLMHEFIDDIKENITGKRIVFLDKGVTLANEIRKSAANITDYSSVAIDFLYMNRPILFYQFDLDEYMEKVDSYIDLKSEMFGSLAYNNDEAVNKLIDIIENNFEVMDNQKNERNKFFRYNDNKNCKRIYDCVLSKIK >CP019858|3159140:3168093|3161137_3162229_-|AXU80351.1|DBSCAN-SWA MKTVCYLADGSNPHTLKWCSFFKNKGYDIHVISLNGGHMEGIKIYNFGSNVEELKNENISKKTGYLGSIKQIKKLVNEIKPDILHAQYASSYGFIGSLLGYHPYIISVWGTDIYDFPNNGFIQKQIIKHNFRKADYIFSNSRDMAKEANKYTAKHVDVTFFGVDMDRFKPMEVEKEDAFVIGIIKSLEKKYGIEYLIQAFKMLKDEYKDKKIILKIGGSGSQMDNLINLAKELGIENDVQFLGRISPENVSKTFNSFDVTVFPSLREGFGVAAIESEACEVPVIVTNVGGHPESVWENETGLIVEPKQPEEIKNAIIKLMENDELRLNMGKKGRQFVRENYEVNLNFNDIEKIYDSIFDKYKK >CP019858|3159140:3168093|3165285_3166035_-|AXU80355.1|DBSCAN-SWA MKKNLVSIITPMYNSEKFIEATIKSVLNQTYQEWEMLIIDDCSTDNSPNIVKSYMQQDSRIKCIKTETNKGVSNARNLALSKATGQFIAFLDSDDQWNSSKLEKQVNFMLENDYVISFTSYELMDENDKKLNKVIKVPPNVDYRRLLKGNILGCLTVVIDKSKLDFEIRMSGVRHEDYVLWLSILKKGHIAHGINEVLALYRKSSNSLSGNKIKAAMWTWNIYRNIEKIPLYKAIYYFINYGINGIKKS >CP019858|3159140:3168093|3162234_3163530_-|AXU80352.1|DBSCAN-SWA MKIAIAGTGYVGLVTGVCLAEVGNENVVCVDVDEQKVKSMKLGIAPIYEEGLEELMVKNYNRGRIDYTTDYKKAYEDVDVILIAVGTPERSDGSANLDYIKAVAKQIAETVTKDTLVVIKSTVPIGTNEEIEDYINRNLKNDVKVELASNPEFLSQGTAVKDTLHASRIVIGVESEWAREILEEIYKPFNQPIIVTNRNSAEMIKYASNNFLALKISFMNDIANLCEIAGANIEDVALGMSYDDRIGSKFLKAGIGYGGSCFPKDTKALHWLSEHNGYELKTVKAAIEVNESQKLKLVRKASKLVESFQDMKVAVLGLTFKPDTDDIREAPSIPNIKYLLERGARVTVYDPIGVNNTKKIFGDSILYADSVDDAIEDAEICFIMTEWKDVLNYDIHKYKEKMKNPLVLDGRNCYKIKDMEELGIEYYSIGR |
8 | Catovirus(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
3732802 : 3843835
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >CP019858|3732802:3843835|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >CP019858|3732802:3843835|3790542_3790908_+|AXU80884.1|DBSCAN-SWA MIGYRIKELRKEKDITQKELATFLGLTPKMISFYEKEERFPPHDIILKLSDFFNVSTDYLLGKVNVKNIDNLSELELIENLNFSDDIKEALKLISELSPSSQEKMFKIAKVFLEEELNEKK >CP019858|3732802:3843835|3827076_3828114_-|AXU80915.1|DBSCAN-SWA MLGRNELCPCGSGKKYKKCCLNKDIVSERACRKTELSQKQYTDLYSKLYDYSRQDKFKEECEKAKEMFYIMQNDSVNEKFERFFNTYLIQDHIMENKKVMTVGFLEENGANLSQSEVSILKSMFESYVSIYEVKEVSAGKIVLKDCLSGNELCTEDVKLLRSFKIGSCMIARIVDIEGTNILIDITISISNEVKDIILKDIMNLFNQYQDVYKDMKSFLIYHTHILYKYIQQLLDPSIAEYLKRERDKNDTKVNSENELAEEECKVLDTLKENVEKENIDACIEFWNEYKKNHENIKGAENGWAAAVEYYVKKEAGQPITQVQISKKYDISSSTLGKRYKDLKIS >CP019858|3732802:3843835|3810066_3810858_-|AXU80902.1|DBSCAN-SWA MLVQATMLAIIAGVGILDGRIFGQSMLDRPIVTGMLVGLVLGDIKSGIMIGAQLELIWMGIAGIGAATPPDVVTGGVLGTAFAILSGNGAEVALAVAVPVAVLAQSLGVLVRIINSYFSQKAVFYAKQADFKKVTIMMWLPVILFFLSTSVPTFLAIMIGADKVTALINAIPKVILDGLGVAGTLLPAVGFALLMDMLLSKKMSVFFFIGFLLASYGGLDITAIALFGVCVAFVLNFYINNKENNQNPQLAINTLTEGEIDFE 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121 | Clostridium_phage(70.0%) | protease,plate,tRNA,integrase,portal,tail | attL 3729515:3729536|attR 3843332:3843353 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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