Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012320 | Clostridioides difficile strain DSM 28196 chromosome, complete genome | 13 crisprs | cas14j,c2c9_V-U4,WYL,cas3,DEDDh,DinG,csa3,cas14k,cas5,cas7,cas6,cas2,cas1,cas4,cas8b2 | 0 | 50 | 13 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP012320_1 | 150452-150530 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP012320_1
|
1 spacers
spacers of CP012320_1
>1.1|150477|29|CP012320|CRISPRCasFinder TGTAATAAGTTAAAGCAATATGAATCAAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012320_1
The CRISPR arrays of CP012320_1 >merge|CP012320|1|150452-150530|CRISPRCasFinder TGTTTATAATGTGGATAATATTTAATGTAATAAGTTAAAGCAATATGAATCAACTGTTTATAATGTGGATAATATTATA >CP012320|1|1|150452-150530|CRISPRCasFinder TGTTTATAATGTGGATAATATTTAA TGTAATAAGTTAAAGCAATATGAATCAAC TGTTTATAATGTGGATAATATTATA
>CP012320.1|AXU55641.1|149431_149971_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase-activating-protein MKIRMSSTISYDSIVDGPGLRMVIWTQGCIHNCKECHNPQTHDLCGGFYMDTEEIINKVKSLKLQKGITLSGGEPFLQPEPLEEIAREAKINGLDVWSYTGFTFEQLLDKKNRAYFKNLNLLKQIDILVDGKFIAEKKDISLKFRGSSNQRIIDVQKSLKYKKVFLVEQYMKDDLSIAE >CP012320.1|AXU55640.1|147058_149410_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase MVEFVKKRDGRVIPFNEDRITRAIFLAATNVAEREGIVPDYKLSEQLTQEVIKFLNHKYSESVPSVEDIQDSVVKVLIETGHAKTSEEYIIYRTERSRIRNSKTRLMKAIEEITFEDAEDADIKRENANINGNTAMGTMLQYGSTVSKEFCKTHILKPEHSFAHDNGDIHIHDMDFLNMGTLTCCQIDVKKLFNGGFSTGHGFLREPQDIISYGALAAIAIQSNQNDQHGGQSIPFFDYGLAEGVYKTFKKFYIGNLAKALKLFKGIENNDVIKNIVYNTEKETNQKVGLKRDELYLNLEKEKLIQTFDIDDELVNKMQNFAFEESYRETDKKTYQSMEAFIHNLNTMHSRAGAQVPFSSVNFGTDTSEEGRMVTKNLLLSQERGLGNGETPIFPILIFKVKEGINLNPEDPNYDLFKLSCRVSAKRLFPNFSFLDAPFNAKYYKKGEPDTEATYMGCRTRVLSNVCGSETVSGRGNISFTTVNLPRLGIKHGIINNEKANLDGFFEELDEKINLIIEQLLERFEVQGNKKMKNFPFLMGQGVWKGSDDLVPEDTLKEVIKQGTLTIGFIGLAECLIALIGKHHGESKEAQELGLKIVSHMRHKMDEATDKYKLNFSLMGTPAEGLSGRFTKIDKKVYGEIKGITDKEYYTNSFHVPVYYNISAYDKIEIEAPYHELTNAGHITYVELDGDPSDNLEAFETVIKAMKDLGIGYGSINHPVDRDPICGFSGVITSNICPVCGRNEDESDIKFERIRRITGYLVGTVDRFNNAKKAEVRDRVKHR >CP012320.1|AXU55639.1|145501_146686_-|aspartate-aminotransferase MLSKRLNFITPSYTIGISSKVKEMESNGVKVINLSIGEPDFNVPNNAKSYGIDSLNKDYTKYDLVPGLKILREEICKKLIEENNCNYSIDEIVVSSGAKNSITNTLLALTDEGDEVLLPKPYWVSYPEMIKLVNAVPVFIDTKKENGFKLTKEELEKSITDKTKILVINNPSNPTGSVYTKDELIEIVDVCIQNKIYILADEIYEKICYTGEFTSIASLSEEAKDITITINGFSKSAAMTGLRLGYTASNKTIAKAMSSIQGHLISHPSLTAQYIAYGALKDCSIDIDNMVKTYKSRRDLIKSKLDSIDNVGYVNPNGAFYIFIDLSKVSEKFEYKDSFSIEFCNQFLEEYNVAVVPGIAFGMDKYIRISYACSENTFLSGLDKLKEFVYKIMA >CP012320.1|AXU55638.1|132380_133133_+|germination-specific-N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MEYYSVFISIHIQGDVVRKYIKHIIFSFAMICLVVVSIFEIKNISEDVIKYMPVTNKTIILDAGHGGIDPGALNKDKSTSEKDINLAITLKLRELIESSGGLVILTREDDSSLYKEENNKTTRQKYNENLKNRKEIISNSNANMFVSIHLNAFEQSKYYGAQTFYPKDKQDSKELSKCIQEELKRVVDKTNNREVKPRDDIYLLKENNIPSVLIECGFLSNEKECKLLTDETYQEKIAWAIYIGIQKYLS >CP012320.1|AXU55637.1|131529_131922_+|30S-ribosomal-protein-S9 MANVQYYGTGRRKSSVARVRLVAGEGNILVNGRALENYFNYETLIRDVKQPLVLTGNENKYDVIVKVEGGGFTGQAGAIRHGISRALLKADLDLRPALKKEGFLTRDARMKERKKYGLKAARRAPQFSKR >CP012320.1|AXU55636.1|131069_131501_+|50S-ribosomal-protein-L13 MKSYIAKPADVQRKWYLVDAEGKTLGRLATEIATVLRGKHKPTFTPHVDGGDFVVVVNAEKIVLSGKKLDQKYYRYHTGYVGGLKEISYRDMMDKKPEEVISHAVSGMLPKNKLRSRMMTRLRVFAGAEHTHAAQNPEVLNFK >CP012320.1|AXU55635.1|130218_130950_+|tRNA-pseudouridine-synthase-1 MRNIKIKIQYNGKNYCGWQKQPDSLGIQGTIERAIYDITKEETSLIGSGRTDSGVHAIGQIANFKINSGISIESIPMALNAKLPKDISVIEACEVNDDFHSRYSAKGKTYKYLVYNSKFRNPILSEISYQVKYELDFDKMCSEAKSLLGTHDFKGFMSSGSSVKDTVRTIYDIDISKKDDLITFEISGNGFLYNMVRIIVGTLVDMGRGRINEPFLDIIQSKTRSRCGHTAPAQGLFLKKVHY >CP012320.1|AXU55634.1|129383_130187_+|ABC-transporter-permease MLKDITIGQYYPTSSAIHKLDPRIKLVATIVFMVSIFVVNKFWPYIVVLLCLLAMIKLANIPVKYIVKGVKPLKWIILFTFLINIFFLPGDEIWSFGFLAITKQGLRQAIFMAIRLIFLVVGTSLLTLTTSPIELTDGIERLLNPFKKIGLPVHELAMMMTIALRFIPTLLDETDKIMKAQMSRGADFESKNLINRAKNLVPLLVPLFVSAFRRADELAMAMEARCYRGGHNRTKMRESVISRRDYMACVFQVVYLGAIIATRFIAI >CP012320.1|AXU55633.1|128523_129390_+|cobalt-transporter-ATP-binding-subunit MSIIVKNLTHIYNEGMPFASKALDDISFEIKDRDFVGLIGHTGSGKSTLIQHLNGLLKPSSGEIFINDFNITDKNLNLTEIRKRVGVVFQYPEYQLFEETIDKDIAFGPSNLGLEESEIHNRVKASMEAVGLDYEGFKDKSPFELSGGQKRRVAIAGVIAMNPEVLILDEPTAGLDPGGRDEIFNLIKDLHEKKNMTIILSSHSMDDMAKLAKTLIVMNHGSVEFMGTPREVFKSNASKLKDIGLDIPQVLELALKLREKGFDISEDILTLEEAKQEILKVVRGRGLC >CP012320.1|AXU55632.1|127702_128536_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MDNIVKVNNISFEYITDEAKLKAIDNLSLDVKKGEFVAIIGHNGSGKSTLSKNLNAILMPTEGNILIDDMDTKEEERLWDIRQTAGMVFQNPDNQIVATIVEEDVAFGPENLGIEPKEIRRIVEESLKSVGMYDLRDRQPHLLSGGQKQRVAIAGIIAMRPKCIIFDEATAMLDPSGRKEVMKTIKRLNKEENITVIHITHFMEEAVEADRVVVMEKGKKILEGTPREVFSKIKMLKEIGLDVPCMTELSSLLIEEGINISSDILTVDEMVMELCQL >CP012320.1|AXU55642.1|163052_163892_+|DNA-integrity-scanning-protein-DisA MLDINSFLNGFFNIILRMSIYDLIDISIVAYIFYKIFMFIKDTRAEQVFKGIIFLLLATQLSNTFKLHTVYWISLKALDYGVIAALIIFQPEFRAGLEHIGRAKFNLFGKNVNTSEETLNRNIEEIVEALYSLSRQKIGALIIMERETRISDIINTGTIIDAEISRQLLINIFIPNTPLHDGAVVIRDSKVKAAACFLPLTESKDLSKDLGTRHRAGIGVSEVSDCITLIVSEETGGVSIAKAGKLYRDISRERMMNILRSNLKTNTETRSFFKGGIFK >CP012320.1|AXU55643.1|163888_165070_+|membrane-associated-protein MINRLKNNTKIKIISFLSAIALWMYVMAVVDPEETKGFEDIPVSISNMSDLKDKNLVIYPDEKLTADVYIKGSLSKVQSVKKEDIHVYGTIEDPIQGQKEVYLKANIPQGVTLEFKHDVLVVNLEKNIKEKRDIKVEVSGNSKRNINKIELSKEFVDVSGPRTLVKEVKSVRANLDVGNETDDFSKKLQLIPLNSDGTKVEGVTLSSSFVTAKIELLKEKIVPIRVSLNDNKDNDVLKNYKLSKEQVTIKGKKEDIDKISYIKTKPIDLADLANGEEKEVSLEIPEGITLEDSSITIKLNDTKQLSAEFLYNAGDIELRNIPTNIDNPNVISDVDIKVVVESTEDLSKLNKKDISLYIDLSQGPEEDSKYKIKYETTYQFKKINIEPNIVEVE >CP012320.1|AXU55644.1|165373_166276_+|phosphate-butyryltransferase MRSFEEVIKFAKERGPKTISVACCQDKEVLMAVEMARKEKIANAILVGDIEKTKEIAKSIDMDIENYELIDIKDLAEASLKSVELVSQGKADMVMKGLVDTSIILKAVLNKEVGLRTGNVLSHVAVFDVEGYDRLFFVTDAAMNLAPDTNTKKQIIENACTVAHSLDISEPKVAAICAKEKVNPKMKDTVEAKELEEMYERGEIKGCMVGGPFAIDNAVSLEAAKHKGINHPVAGRADILLAPDIEGGNILYKALVFFSKSKNAGVIVGAKAPIILTSRADSEETKLNSIALGVLMAAKA >CP012320.1|AXU55645.1|166297_167377_+|butyrate-kinase MSKIFKILTINPGSTSTKIAVFDNEDLVFEKTLRHSSEEIGKYEKVSDQFEFRKQVIEEALKEGGVKTSELDAVVGRGGLLKPIKGGTYSVSAAMIEDLKVGVLGEHASNLGGIIAKQIGEEVNVPSYIVDPVVVDELEDVARISGMPEISRASVVHALNQKAIARRYAREINKKYEDINLIVAHMGGGVSVGAHKNGKIVDVANALDGEGPFSPERSGGLPVGALVKMCFSGKYTQDEIKKKIKGNGGLVAYLNTNDAREVEERIEAGDEKAKLVYEAMAYQISKEIGASAAVLKGDVKAILLTGGIAYSKMFTEMIADRVKFIADVKVYPGEDEMIALAQGGLRVLTGEEEAQVYDN >CP012320.1|AXU55646.1|167366_168044_+|ATP/GTP-binding-protein MITNDKRIRIITGHYGSGKSEFAMNYVVKLRDMVSGKVAIADLDVVNVYFRTREKKELMKSLGIQPIDSSINAPTLDLPAVSAEVMSPMVDHSYNSVIDLGGDNVGARVIGRFSHLLKEGDYDMLFVINANREKTQTSEEVIQYIKEIEKSSKLKVTGLINNTHLIRFTTIDDVLRGQKVAKEVSEKCNIPIRYVACLENLVEQLPKDLEGEIFPIKLYMREDWM >CP012320.1|AXU55647.1|168086_168302_+|ferredoxin MAKGKVSFNQERCKGCGLCVEACPVKIIQLDSNVINKKGYNPATVFEMEKCIGCASCATMCPDVVITVERD >CP012320.1|AXU55648.1|168330_169410_+|2-ketoisovalerate-ferredoxin-reductase MAKILMKGNEAFGKAAIEAGCKYFFGYPITPQSELPEYLSRELPKIGGAFVQAESEVSAINMVYGGAGAGARVMTSSSSPGVALKQEGITYAVGAEVPCVVLNVMRGGPGLGSIQPSQADYFMSTRGGGNGDYRTPVFAPATVQEAVDMIMEAFDVADYYRSPVMVVADGMIGQMMEPVEFRAPEKKRELPPKDWATVGTKGKRKPNVINSLYLEPEVLEDHCWHLQEKFDAMEKNEVQYEMYKTEDAEFVFAAYGTTSRVVKSAIDILREEGIKAGLIRPKVLWPFPFEAFNQIPNARNILTVEMSMGQMVEDVKMAVEGKLPVYFHGRPGGMTPTPAEIVEKAKKIIAGELVAGGAR >CP012320.1|AXU55649.1|169409_170162_+|subunit-of-oxidoreductase MAVVFKKTEGLQDTQTHYCPGCTHGIIHRLVGEVLEELGVLGDAVGVVPVGCSVLGYKYFNCDTQEAAHGRAPAAATGIKRVHPENTVFTYQGDGDLASIGTAEIVHAAARGEKITTIFVNNTTYGMTGGQMAPTTLVGQRATTAQSGRNAETQGYPIRVSEMLATLTGAVFVERVAVDTPAHVRQAKKAIKKAFQVQQAGLGFGIVEVLSTCPTNWGLAPNDALQWLRDNMIPYYPLGNFKNVEVEEVK >CP012320.1|AXU55650.1|170162_170720_+|subunit-of-oxidoreductase MSTARVICAGFGGQGVMSMGQLLTYAGMLEGKEVSWLPSYGPEMRGGTANCAVTVSNEPVGSPLITDDATAAILLNIPAFEKFKDDVIPGGKIIVNSSLIKEKVDRTDVDVYYIPANELAAELGNDKVANMIMLGAYLKVSDTVDIESVLEAFKKVFGPRKEKFVPLNREALQKGMDATCSKATN >CP012320.1|AXU55651.1|170889_172236_+|phosphoglucomutase/phosphomannomutase-mutase MRKYFGTDGVRGVANTELTCDLAYKLGRAGGFVLAQGDHRVKVVVGKDTRISGDMLEASLIAGLMSVGCDVITVGIIPTPAVAYLTRKYGADCGVVISASHNPVEYNGIKFFNKNGYKLDDEIELKIEEYIDDIDKIDCLPIGENVGRKLHEHCAQRDYVDYLKSIISTDFKGLKVVLDCANGASYKVAPIVFDELGASVISINSSPDGNNINYKCGSTHPEQLQRAVLEHNADLGLAYDGDADRLIAVNEKGQIVDGDHIMILSALNLKKNNKLAQDTLVVTVMSNIGLTIAAKENGINLSTTAVGDRYVLEDMVKNGYNLGGEQSGHMIFLDYNTTGDGVLSSLILANIILQEKKPLSEIASIMSQYPQVLVNATIKNENKNKYMEYPEIKTEIERIESILNGNGRVLIRPSGTEPLVRVMLEGKEEGQIKELATNLANLIQEKLS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012320_3 | 1007250-1007327 | TypeV |
NA
Consensus repeat of CP012320_3
|
1 spacers
spacers of CP012320_3
>3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder CTAAGTTTTAAAAAAATTAATATAAACAAC |
cas14j |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012320_3
The CRISPR arrays of CP012320_3 >merge|CP012320|3|1007250-1007327|CRISPRCasFinder AAAAAATAAGAAAGTTTATAAATACTAAGTTTTAAAAAAATTAATATAAACAACAAAAAAATAAAAAGTTTATAAATA >CP012320|3|3|1007250-1007327|CRISPRCasFinder AAAAAATAAGAAAGTTTATAAATA CTAAGTTTTAAAAAAATTAATATAAACAAC AAAAAAATAAAAAGTTTATAAATA
>CP012320.1|AXU56361.1|1006210_1006864_+|GntR-family-transcriptional-regulator MKVDPLTTQVYDYISKKIQNGEYEANQRITESEICKSIGVSRTPAREALTRLAGENLLEKIPNKGFVVKEFQEKEKLDTYSVIGVLDALAGSSALQNLTESDLVKMEELTEMMAVSIKYKNYNSYLKLSNEFHDIYITKSDNQVLVNLLNSLRYNFMSKSYTSDNEDELYKMLTYSNNQHIEVVKFMRENDLENVERVLREHWKTIPIAEMKKEKLL >CP012320.1|AXU56360.1|1004100_1005966_+|alpha-amylase MQSVIEYNSWDKNFKAPFGALKFDEELTICVKVNEGYNIKSISLEINREEEMRTITLNEELDNDKLGKCFCGKIEKFDGTGVYFYYFKVDVEMDGQIKTLFYGKNRDNGYSCEYNYSDINKYQITVYKDFKVPTWYKEGILYHIFVDRFNNGNRSGKVDNPKKNSFIYGNWEDIPMYIKDSQGDVIRWDFHGGNLRGIINKLGYLKKLGVSILYLSPIFEASSNHKYDTGDYKKIDPMFGDEDTFKELIDKAKEKGISIVLDGVFSHTGADSKYFNMYGNYNSLGAYQSKESPYYSWYMFEEFPQKYKSWWDVKTLPNINELEHSYMDYIIYDNDSVINKWVNMGIKGWRLDVADELPTKFIRELKKELKKADDDSILIGEVWEDASNKISYGQRRSYLLGEELDSVMGYPFRNNMFSFLKGEINSYELCNRYMQIKENYPKESFRSNLNLIGTHDVTRAKTELNDDVDLVKLAVAIQMTFEGVPYIYYGDEAGLCGGVDPDNRRTYPWKNEDEDMLNFYRDVIKIRNKNKLLSSGNTEFIYTNNDSVFSFIRVDENNDRMLILVNRSENVESISLCIESSFIEEIPIKYSLKNANSTIQIENNELKVDLDSKSFRIFRVN >CP012320.1|AXU56359.1|1001675_1004096_+|glycogen-phosphorylase MVTISKKKFKQKFEVKMYSLYAQSIKEATDEQLLNVLCSLLKDEIAKKWVATKLDKKKEVYYFSLEFLIGRQLKSNLLNLNIEEEVREGLSELGINLDDLIEAEVDPALGNGGLGRLAACFLDSMASLNISGQGYGIRYKYGLFEQKFVNGYQVEVPDNWLTEGRYAWETVRPNEATMVKFGGEVELIKEGSHLKVIHKNYLPVMAMPYDIPIIGYQNQCINTLRLFKSEIPKRDFGELTSNALNYSGSYEEALKHKYYTEEISQVLYPDDSNYAGKLLRLKQEYFFVSAGIQDIIRKYKKNKLNIDNLFDKVAIHINDTHPTLCIPELMRILLDEENLSWDEAWEITKKTVSYTNHTIMSEAMEKWPVSMMKELLPRIYMIIEEINRRYVEELNNKGYEQDRIKRMSIIDCDNINMANLCIVTSHSVNGVAKLHTHILETEVLKDFYQDEPNKFNNKTNGIAHRRWLISSNPQLSNLITDLIGDSWKKDTLQLKNIEKFKNDSSVLQRLDDIKYNNKANLAKFIKDKYDLNVDPSSIFDVQVKRLHAYKRQLLNIFNVLHMYHELLDNPNLNLDPRTFIFGAKAAPGYYLAKCIIKFINSVASTINNDVRVKDKLKVVFLENYGVSLAEIIIPAANVSEQISTTTKEASGTSNMKFMMNGAITLATLDGANVEICEQVGKENMFLFGLSAEQVLNYNKYGGYSSLDLYHSNMDIKRVVDDLINGFIPNLGEEGRSIYNSLTTYNDEYFVLRDFENYGQAQADINRLYRDKEKWNKMSLVNIANSGFFSSDRTISEYAKDIWFKRV >CP012320.1|AXU56358.1|1000219_1001662_+|glycogen-synthase MKVFYVTAECWPFAKTGGLGDVSYALPKELKKEGVDVRVIMPKYSTIPSYLKDQLKEIAVFSVRVGWRNQYCGLLEMELDGVKFYFIDNEFYFRREDERKSIYGYGDDAERYTFFTDAVLEAISRIDFYPDVIHINDWHTGMLPLILKERYATLEGYKNIKTMYTIHNLQYQGVFDKHVLYDILDLPQKYFDNRDIEYYGSINFMKAGINFADKIITVSPTYANEIQTSFYGEQLDGLLRKESGKLKGILNGIDYDLNDPAKDKDIFVHYDVDSIDKKVENKLRLQDILGLKKDSSIPLIGIVSRLVSQKGFDLIAYMMPELMREDLQIVVLGTGEHQYQSMFNYYDSNFSDKVSARITFNASLAQQIYAASDMFLMPSLFEPCGIGQMLAMRYGSLPIVRETGGLRDTVTPYNKFTGEGNGFSFKNYNAHEMFFCLKNAIKVFKDKEKWIKLVENAMKTDNSWKKSAKEYIETYRDICD >CP012320.1|AXU56357.1|999060_1000191_+|glycogen-biosynthesis-protein MRNECLGIINLNKKGDPAINKLNYGRPIASTPIAGRYRIIDFALSNMINSGITKVGIFAKEKYRSLTDHIGSGKDWDLSRKKGGLSIFSPENTKYRNTYSHREGDIYTILANLDYIEKSEEEYILIAPSYMLCNLNYSQALEYHKKSHNDITIIYKNVNNANKDFAGNLTLNLDSNNRVINVGNNLGKFPRANICMETYIMKREDFVECIYNIVNKGSYCYLEEFIIEEAENMKIGAYEYTGYLKCVNSVESYFEMSKDLLNLEVADELLYSERKIFTKEKNESPTIYTDSAKVENSFIASGCLIEGTVKDSIIFRKVNVEKGTVIENSIVMQNCVIKSNAKLYNAILDKNTSVSNGKELRGDEKYPLVVEKNTNI >CP012320.1|AXU56356.1|997898_999059_+|glucose-1-phosphate-adenylyltransferase MKKEMLAMILAGGQGSRLGVFTKRIAKPAVSFGGKYRIIDFVLSNCSNSGIDTVGVLTQYRPLILNSHIGMGSHWDLDRINGGVYVLQPFMNEKEGNWYNGTAHAIYQNMDFVDTYNPEYVLILSGDHIYKMDYSKMLKFHKEKRSKATIAVIEVPWDEASRFGIMNTNEDSSIYEFEEKPSEPKSNLASMGVYIFDWKMLRNYFKEAEKNPEINYDDFGKNLIPKMLEDNVGMYAYPFKGYWRDVGTIQSLWDANMDIIKSPETLDLADPKWKIYTNTMAMPPQYIGKNANVHRSMIADGCRILGEVGNSVLSHGVVVGKGSKVIDSVIMPNVVIGENVTIEKAMIGECATINDNVQIKNVNNEINVVSEYENIEPRCVLIEGGL >CP012320.1|AXU56355.1|996084_997128_+|SPFH-domain/Band-7-family-protein MGTKIVLSIVLIVVVVAISLTCIRVIKQSKVGIIMRLGKFQKVAETGVHFLIPFLDKMAYVIDLREIVIDFPPQPVITKDNVTMQIDTVVYYKVTDPVRYVFEIANPIAAIENLTATTLRNIIGELDLDETLTSRDIINVKMRTILDEATDKWGIKVNRVELKNIMPPQDIQVAMEKQMRAERERREAILQAEGNKSAAILQAEGEKQSAILTAEAKKEAMVRVAEGEKESAILVAEGEAEAIRQTAIAKAQGEAEMIKRTQMATAEGLKLVFSAMKEADIDNNILALKSMEALEKMAEGKSTKLVLPSEAVNFLGTFKGIKEVMSDDNKEVLDIKEVLNDNESLKK >CP012320.1|AXU56354.1|995617_996064_+|membrane-protease-activity-regulatory-membrane-protein MKLIWLIVAVLFGIAEMLTPSLTLIWFSVGAVILIFLSSFIESIFLQILIFAVISIAMLVVATKKIVKKDKGYKSNTNLQAMMSKKGIVTEEISPNNTGLVVVEHETWTAISIDGEKIEKGSTVEVLKIEGVKLVVKKVDATVNVTNQ >CP012320.1|AXU56353.1|994224_995334_+|transposase-like-protein-B MEKAYKFRMYPNKKQQELINKTFGCCRFVYNKYLAKRIEVYKNDKETFTYKQCSSDLTNLKKELKWLKEPDKFSLQNALKDLDNAYKKFFKEKAGFPKFKSKKINRFSYKTNFTNGNIMYCGQHIKLPKLGMVKVRDKQIPQGRILNATISKEPSGRYYVSLCCTDVDIEVFENTNNQIGLDLGIKEFCISSCGEFIENPKYLKKSLNKLAKLQRELSRKTIGSLNRNKARLKVARLQEHIANQRNDFLQKLSTKLIKENDIICIEDLQVKNMIRNRKLSRLISDVSWSEFVRQLEYKANWHGRQIVKVGKFFASSQICNKCGYKNEEVKDLNIREWICPSCNEIHDRDINASINILKEGLRLITIQNK >CP012320.1|AXU56352.1|991889_993470_+|carbohydrate-kinase MLIGTSKLSRNVDTACVEEVGIPMIVLMENAVISAMKNMDIDMYNSYTVVCGVGNNGGDGLGIARHLNTYGKEVNVFLVGNLEKLSECSKINYNVLLNMGINIININKNDLSEKNYGDENEVDKIIKVEKQNIIKNKNLTIFKDRVSKSDVVVDAIFGTGLKRDITGIFKEVIDIVNDNSKNTYSIDIPSGIDSDNGNVLGTCIRANKTISFEFYKRGFLNYDTSTLIGDVVVEKIGVPDFITRKYHDEEFITDKTFVKNNIRRRDKHGFKSDFGKVSIVAGSKGFYGASFIATESAVKSGSGLVTLISSEDVQEKVSIRLTEAMTLNFEEERLNKLLNSSDAIGFGPGMGDNSQTFDKLLKIVENSNCPIVLDADGLNVMKDRCYKFLEWKNRFVITPHLGEMARLTGDSIGYIREHRVDVAKEFAQKYNLVVLLKGYQTVITDGKKTYINPTGNSCMATGGMGDCLLGMITSFIGQGMDILEATVSGAYIHGYIGDKLSKAMYTVNATDLISNISLTMKELLDI >CP012320.1|AXU56362.1|1007501_1008977_+|arginine-decarboxylase MDSEFANAVELSYECAPLLESLKEYSEKDIACFDVPGHVKNRGVAILNKYLGESLMKMDINSSPTMDNVSAPNGIIKNAQDLLAQAYMADEAFFITNGTTQAIHAMILSVIKPGEKVLLPRNIHKSVINALILCGGIPIFIQPEFDEKLGISLNITLEKVRTEIEKDCNIKALFFLNPTYYGVCADLESIIELCHKNNVLVLVDEAHGAHFPFHLDLPPSAISLGADMVAVSIHKTGGALTQSSALLLNRDNVSFEKVLQSINMLQSTSASYLLMASIDGARVNLVENGEKQLSKALNLSRYAKSKLNKIDGIKVLSTEILKQKGVKFIDETKLCINVKELNLTGFEVYDLLYKNFSIQVELGDSYNILALVSIGTNKSDIDRLVKALSIIAKIYRKESTLNEFNMVQINPIIKLNPREAFYAPKESVEINSCIDRICGESIMAYPPGIPIIAPGELITEEIMEYIIFLKNSNAYLTDVQDKNLDRILVIK >CP012320.1|AXU56363.1|1009063_1009477_+|S-adenosylmethionine-decarboxylase-proenzyme MKFETLGRHILVEYYNCDENVLKDPRLIENFMNDSALNAKATIVDSVFHHFNPWGVSGAVIIAESHLTIHTWPEYGYAAADFFTCGDIDPWKSFELLEQLLKSERSESTEIPRGLTTKIKKYSKKDLGKITHKPEAV >CP012320.1|AXU56364.1|1009506_1010358_+|spermidine-synthase MELWYTEEWTENVRFSIKVNKHLFEGKSQFQRIDVFDSDEFGKFLTIDGLMMVTYKDEFIYHEMITHVPMATNLNIKKVLVIGGGDGGTVRELSRYPQIEKIDMVEIDKMVVDVSKEYMDICSCKLDDKRVSLYFEDGVNFVKCAHDKSYDLIIVDSTDPIGPGEGLFSTDFYKDCYRILTDDGILVNQSESPYFDFNAKEMKRANKKLKQIFPISEVYQAHIPTYPSGHWLFGFASKKLNPVKNQDRNGWEKLSLKTKYYNSDIHLGSFMLPQYVKEMLDEE >CP012320.1|AXU56365.1|1010347_1011226_+|agmatinase MKNNFYHMNTFMSMDKNYEESNLIVFGVGFDGTTSNRPGARFASSSMRKEFYGLETYSPFLDLDLEDYNICDYGDLEISVGSTEQVLKEIYQETYKIVRDSKVPFMIGGEHLVTLPAFKAVHEKYNDIYVIHFDAHTDLREEYNNSKNSHATVIKRIWDIVGDNKIFQFGIRSGTKEEFKFATEEKHTYMEIGGIDTFENIVNMLNGKNIYLTIDLDVLDASVFPGTGTPEPGGVNYREFQEIFKIIKNSNINIVGCDIVELSPDYDTTGVSTVIACKILRELCLIISDKIK >CP012320.1|AXU56366.1|1011405_1011606_-|cold-shock-protein MKNGIVKWFNNEKGFGFISVEGEDDVFVHFSAIQNDGYKTLEEGEKVSFDITQGNRGPQAENVNRI >CP012320.1|AXU56367.1|1012072_1013563_+|iron-dependent-hydrogenase MFQFETQIHKLRHDVLTAIARLGKEDNLTREAMDNIQYEIIKGEKPTYRCCVYKERAIISERVNVSMGLQPGQDKIDLDTMDIEEDEQIIYILEAACDSCPINEFTVTDICRGCLAHRCKEACKFGAITHVGGMAYINHELCKACGMCKKACQYDAISEVVRPCKSVCPTNALGFDRENMKAMIHEDKCLNCGACMSACPFGAISDKSLIAPVARKLVQKEKMYAVVAPAITGQVEANVTYGQIKNAIKSLGFVDVLEAACGADAVTVHESLEFAERMEKGEAFMTNSCCPGFVGYIEKTYPNHVGKISSTVSPMIASGRFIKSHEPDAKVVFIGPCTAKKSEAAKKELKGAVDYVLTFEEIMALFEAFDIDLAKCSNEDIDDASIFGRGFGAAGGLTKAIENYLAEKGIGVNFEPVKISGSREIKKTMTMANLGKLEGNFIEGMMCEGGCINGSGKFLSGAKVKATFDRKNSQSTKKSVLANTKIKDFSNINLEK >CP012320.1|AXU56368.1|1013820_1015317_+|iron-dependent-hydrogenase MFEFETQLKRLKHEVLTAVARLSIEENLTKENIEKIPYEIIKGEKARYRCCVYKEREVVLERAQLALSLTPNSKYGDINPDSVSLDTDEQIIYIVEAACDRCPINEFTVTELCRGCLAHRCKEACKFGAISYINGRAYINHDLCKACGMCKSSCQYDAISEVVRPCKSVCPTGALDFNRNTMKAMIHEDNCINCGACISACPFGAISDKSLIAPVAKKLAKKENMYAIVAPAITGQIDSNITYGQLKNAIKSLGFVDMIEASCGADAVTVHESNELIERIKSGDNYMTNSCCPGFFKYIEKMFPDEKDRISSTVSPMVATGRLVKKIDSDAKVVFIGPCTAKKSEATEKSLKDSVDYVLTFEELMALFEAFNIDLSKCSNEDINDGSIFGRGFGASGGLAKSVQNYIAEKGLSFEFEPIKVSGPRQIKKTMTMAKLGRLEGNFIEGMMCEEGCINGAGKFLSGVKAKNTFDRKNGQSTKKSVLSNDKIKEFEDVNLER >CP012320.1|AXU56369.1|1015450_1015801_+|metallo-beta-lactamase MKKIVLKDILFLVTTLSIIVILLFVTNITTNSKIKSTSESYLKSDKNSVRQNGIQRSTKNTAFKTTILSTGKSDCILIEIGDKFIMIDTGEDKNGEQIVDKLKEKEINALDYLIKK >CP012320.1|AXU56370.1|1016448_1017558_+|transposase-like-protein-B MEKAYKFRIYPNKKQQELINKTFGCCRFVYNKYLAKRIDVYKSDKETFTYKQCSSDLTNLKKELKWLKEPDKFSLQNALKDLDNAYKKFFKEKAGFPKFKSKKINRFSYKTNFTNGNIMYCGQHIKLPKLGMVKVRDKQIPQGRILNATISKEPSGRYYVSLCCTDVDIEVFENTNNQIGLDLGIKEFCISSCGEFIENPKYLKRSLNKLAKLQRELSRKTIGSLNRNKARLKVAGLQEHIANQRNDFLQKLSTKLIKENDIICIEDLQVKNMIKNRKLSRLISDVSWSEFVRQLEYKANWHGRQIVKVGKFFASSQICNKCGYKNEEVKNLNIREWICPSCNETHDRDINASINILKEGLRLITIQNK >CP012320.1|AXU56371.1|1017718_1018249_+|metallo-beta-lactamase MLSSVKVKNIIQANYKKDSKQYDEYIDSLKKADIEPVLLKDNMNIVINSAEINIHPASKSKYESSNDYSIITNISYGAHKFLFAGDAEEERLSEFINGNTLKYDFVKMPHHGRYDKLTETFLESTSPQYAVITCSEKKEPEEGVLKILERLNIKTFLTSSGEVVINSDGKTLSVNQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP012320_4 | 1302442-1303395 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP012320_4
|
14 spacers
spacers of CP012320_4
>4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTCCATCTCCAATTAACATAAATAATTCATCCGCTG >4.2|1302537|38|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCGCTTGGCAAATCATAAGAAGGATTATTTTCTCCAAC >4.3|1302604|35|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAATAAAAGAGTTTGAATTACCCATTTTTTCATG >4.4|1302668|39|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACGACATTGAATAAAATGGGTACAGAGACAATTTATAA >4.5|1302736|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTATAAATCTTTTAATGACTGTCTCTGATGGTACAG >4.6|1302802|39|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGGAATAGATGATATGATTGCTAATGCTGAACAACAA >4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGGTCTGACTTTAATATATATATATATATAAATT >4.8|1302933|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATAAACTCCCACGACAAAATTAACTATAACCTCGT >4.9|1302999|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTTTTAAAGAGGGCAGACCTAAAAAATATACTAAAA >4.10|1303065|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCAGAAGATTTAGCGACTGTTGTTGCTGAATGGGATG >4.11|1303131|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTAAATTGCTCAGTCTAGTACTTAAAGAATTATAAG >4.12|1303197|38|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGCTATGATTTAATTATACGACGTTTTGTCTTTAAAG >4.13|1303264|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCTGTGCCACAATTTGATGCTTCTATAGCTAAATTC >4.14|1303330|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTTAAGTGCATCAAAGGAGTTACAAGCTATATTTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012320_4
The CRISPR arrays of CP012320_4 >merge|CP012320|4|1302442-1303395|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTCTCCATCTCCAATTAACATAAATAATTCATCCGCTGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGCCGCTTGGCAAATCATAAGAAGGATTATTTTCTCCAACGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAAAATAAAAGAGTTTGAATTACCCATTTTTTCATGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTACGACATTGAATAAAATGGGTACAGAGACAATTTATAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTTTATAAATCTTTTAATGACTGTCTCTGATGGTACAGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAAAGGAATAGATGATATGATTGCTAATGCTGAACAACAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGGGGTCTGACTTTAATATATATATATATATAAATTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTTATAAACTCCCACGACAAAATTAACTATAACCTCGTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAGTTTTAAAGAGGGCAGACCTAAAAAATATACTAAAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGGCAGAAGATTTAGCGACTGTTGTTGCTGAATGGGATGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGATTAAATTGCTCAGTCTAGTACTTAAAGAATTATAAGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTTGCTATGATTTAATTATACGACGTTTTGTCTTTAAAGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTGCTGTGCCACAATTTGATGCTTCTATAGCTAAATTCGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGCTTTTAAGTGCATCAAAGGAGTTACAAGCTATATTTAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG >CP012320|4|1|1302442-1303395|PILER-CR GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TCTCCATCTCCAATTAACATAAATAATTCATCCGCTG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG CCGCTTGGCAAATCATAAGAAGGATTATTTTCTCCAAC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AAAATAAAAGAGTTTGAATTACCCATTTTTTCATG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TACGACATTGAATAAAATGGGTACAGAGACAATTTATAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TTTATAAATCTTTTAATGACTGTCTCTGATGGTACAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AAAGGAATAGATGATATGATTGCTAATGCTGAACAACAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GGGTCTGACTTTAATATATATATATATATAAATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TTATAAACTCCCACGACAAAATTAACTATAACCTCGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AGTTTTAAAGAGGGCAGACCTAAAAAATATACTAAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GCAGAAGATTTAGCGACTGTTGTTGCTGAATGGGATG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG ATTAAATTGCTCAGTCTAGTACTTAAAGAATTATAAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TTGCTATGATTTAATTATACGACGTTTTGTCTTTAAAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TGCTGTGCCACAATTTGATGCTTCTATAGCTAAATTC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG CTTTTAAGTGCATCAAAGGAGTTACAAGCTATATTTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG >CP012320|4|4|1302442-1303395|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TCTCCATCTCCAATTAACATAAATAATTCATCCGCTG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG CCGCTTGGCAAATCATAAGAAGGATTATTTTCTCCAAC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AAAATAAAAGAGTTTGAATTACCCATTTTTTCATG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TACGACATTGAATAAAATGGGTACAGAGACAATTTATAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TTTATAAATCTTTTAATGACTGTCTCTGATGGTACAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AAAGGAATAGATGATATGATTGCTAATGCTGAACAACAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GGGTCTGACTTTAATATATATATATATATAAATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TTATAAACTCCCACGACAAAATTAACTATAACCTCGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AGTTTTAAAGAGGGCAGACCTAAAAAATATACTAAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GCAGAAGATTTAGCGACTGTTGTTGCTGAATGGGATG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG ATTAAATTGCTCAGTCTAGTACTTAAAGAATTATAAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TTGCTATGATTTAATTATACGACGTTTTGTCTTTAAAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TGCTGTGCCACAATTTGATGCTTCTATAGCTAAATTC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG CTTTTAAGTGCATCAAAGGAGTTACAAGCTATATTTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG >CP012320|4|1|1302442-1303395|CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TCTCCATCTCCAATTAACATAAATAATTCATCCGCTG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG CCGCTTGGCAAATCATAAGAAGGATTATTTTCTCCAAC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AAAATAAAAGAGTTTGAATTACCCATTTTTTCATG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TACGACATTGAATAAAATGGGTACAGAGACAATTTATAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TTTATAAATCTTTTAATGACTGTCTCTGATGGTACAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AAAGGAATAGATGATATGATTGCTAATGCTGAACAACAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GGGTCTGACTTTAATATATATATATATATAAATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TTATAAACTCCCACGACAAAATTAACTATAACCTCGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AGTTTTAAAGAGGGCAGACCTAAAAAATATACTAAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GCAGAAGATTTAGCGACTGTTGTTGCTGAATGGGATG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG ATTAAATTGCTCAGTCTAGTACTTAAAGAATTATAAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TTGCTATGATTTAATTATACGACGTTTTGTCTTTAAAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TGCTGTGCCACAATTTGATGCTTCTATAGCTAAATTC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG CTTTTAAGTGCATCAAAGGAGTTACAAGCTATATTTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
>CP012320.1|AXU56620.1|1300634_1301534_+|integrase,-catalytic-region MVITLSKNEDKYKAIQSLFNEKKASLIQLCEIAKVNRSGYYKWLNRDKSNLELENIKLATLITKIYEEKKGVFGSLRMTLQLNREYKLNVNHKRVYRLMRAVGLRSICRKKKFSYVKCTPEVIAENVLNRKFSADKTSQKWLTDVTEFKLTNGTKAYLSAILDLGDRSIVSYVIGKSNNNNLVFETFNKAIEVYPNAKPIFHSDRGYQYTSRVFKSKLLTQGMIQSMSRVGHCIDNAPMEGFWGILKVEMYYLRKFDTYEQLVKAIDDYIYYYNNFRYQKRLNSMSPLEFRKYLSTEIA >CP012320.1|AXU56619.1|1299969_1300641_+|transposase MSKTKVSSEQKIEAIESYLKGENSVIKIMEELNIGKRTFREWMRNYETFGNDGLIKQSHKSCYSKEFKLNAIESYLNGEGSYDTISKKYKMRSVHPLKAWVKEYNLHKVIKETPKGGLFMETRKTTLDERAEIVKDCIEHDLNYNLIAKKYFVSYSQVRRWTLKYKENGIDALEDRRGKAKKEDELTQLDEIKLELKIVKAEKHKLQLENEFLKKLKIIERGW >CP012320.1|AXU56618.1|1298232_1299660_+|cell-surface-protein MKIKKLLTIGLSLSIFIASCPISANALDKIESIKGADKYETAGIIADKQNYTTAILINADSTMADGLSASGLAGAINAPILLTKKNNIPNATLKRLEKAKKVYIIGGENSINKYTETVLKGKGIEIKRLQGSDRIKTSYNVAKEINSINKVNKVILTNAFKGEPDAMSAAPVAVRDKAAIVLTDGKSVPFNTTGVESYVIGGTSSMNDKLVKDTNSTRLGGTDRYDTNKKIINKFYSGVKEFYIASGTDLVYALVGSTIAKNNAIVLVGNDSNKSVLKSTIKLTAIGNLSDSILQQCLNVTKNIGDSNTGREYTVEDAANAVKKLLGVKKFYYEPNYSEDEDLIFLLDKNFDFSGKEYYVFAYIKQGAEGDVRYCVAKNDMSKVYTYDVNGNMKVCNPDDYKNKGSITEEQAKQIALKECAKRHKVSINNLVVDMIDFRDDIYSGNVYAVKINSKNSNGTFGWFFIDIETGKIYN >CP012320.1|AXU56617.1|1297220_1298042_-|lipoprotein MIISKKITAILVSFLIMISMVGCAPKESATEVAKKYLDSIEIKDYEVAYNLLSKDSKESVSLEKFEEYQDTLFKLQTLKDYKLGEENKVEKYKYSNKEYTNLVKIKETDTIKYITENKEDTANFDRYFIIEDNEYKLLWHKDFKRALSSNYVKIARSETKKDEDKDYNKAAIDIKKAIEIDDKNPLAYYTQSYIYIELQRYDEALKSIDKSLEYLDKNNEAYKIDASDAYNLRGVIFMSKSEFNKARESYNKALELNPDNEYAKTNLNDIKGL >CP012320.1|AXU56616.1|1295578_1297096_-|site-specific-recombinase MSVAIYLRKSRADEEAEKQGEFETLSRHKSTLLKLAKEQNLDVIEIKEELVSGESIIHRPKMLELLKEVEENKYDAVLVMDLDRLGRGDMKDQGIILETFKESKTKIITPRKTYDLTDEFDEEYSEFEAFMARKELKLISRRMQRGRIKSVEEGNFIGTSAPFGYDAVTTGRKERILVPNKDADVVRTIFDLYINEDMGCSKISKYLNNLGIKTATGANWYNSAITNIIKNKVYCGYIQWQKKDYKKSKNPNKIKTVKLRPKDEWIEAKGKHEPLISEITWKKAQNILKKNGHVSYGNQIKNPLAGIVICKNCGRPLVYRPYADHDYIICYHPGCNKSSRFEFIEAAILKSLEDTVKKYQLKACDLDLDKNNKDSNIEFQKRVLKGLETELKELGKQKNKLYDLLERGIYDEDTFIERSNNISSRTEEIKDSIKTVKNRLSTVKKDNSKIIEDIKTVLSLYHDSDSLGKNKLLKSVIDKAIYYKSKEQKLDSFELMVHLKLHEDQ >CP012320.1|AXU56615.1|1295271_1295556_-|RNA-polymerase-sigma-27/28-subunit-RpsK/SigK MCNEISLLDILGTEANYVLDEVELKVQVGKLYEQLNKILTPREREIVQLRYGLTPYGYKTQREIAQKLDISRSYVSRIEKKALKKLEKELVQES >CP012320.1|AXU56614.1|1293510_1295175_+|penicillin-binding-protein MSKKKTPFLKKVGKRSWCIFTIILIIYSVLIYRLVDIQVLKGDKYKQSVESQSVEKVELNSGRGIIYDRNNKKLTDTSKSQVLIVEKEKLNNNYKILELIKKATKMNDLDIYKAVQEQLTRPIIQIQTKNIDKSMKKELEKNGIMVEEKTMRYAKDGLLSHTIGYIKEDDKSGQSGIEKSMDSVLRNSNEKYISAFKAGDAGNEKSLNILKGSVKTVDNKDKDRHLKTTIDYNIQKKLEQILNKEENPTAAIISEASTGEILAMCSRPNFDQNDISKSLKGKNGEFENRVIKATYPPGSVFKMVVLFSALENGVIDENYTYNCTGKTKVGNTNEILRCNKRDGHGFQNLRQAFSNSCNPAFLDIAMKLGKEKILKSAEKLHLFEKVDIGLDEEKIREAPKNISIRNLAIGQENIEFTPLQINQMTQIIANNGTFKPLYLYKSLVDNNMNTIKTYKSSKKEELISPYVCTQVKEYMKSVSRIGTAKDLKDIEGGCGVKTGTAQSSLNKKAIDHGWITGFYPEERPKYVITVLVEGTQKGNKSATPIFKEICESIK >CP012320.1|AXU56613.1|1292191_1293439_+|protease MELNKVELLAPAGDLERLKIAITYGADAVYIGGEIFGMRSAAKNFSKEDMAEGVAFAHERGKKVFVTVNIIPHNEDFLQLEDYLLELEEIGIDAVIIADPGVLSVIKKVIPNMEIHLSTQANTTNYLSANFWYEHGIKRVVVARELSFDEISEIRAKTPLDMDIEAFMHGAMCISYSGRCLISNYMTGRDANKGSCAQSCRWQYHLVEEKRPGEYFPIYEDERGTFFFNSKDLCMIEYIPELIKSGITSLKIEGRMKTAYYVATVVRAYRMAIDEFYRAPENWKFNPMWMEELKKGSHRHFTSGFYLNKPTTEDQNYQSASYVRNYDFIGIVRETEDEDGLIVVEQRNKMCVGDEIEVMGPYKETMFTKIEEMYNEEGEAIESAPHPRQIVKLKLSVKVGKDYMLRKVIEEKVEE >CP012320.1|AXU56612.1|1291530_1292205_+|O-methyltransferase MSNIVNDLVEDYIRVTLKEKEGFLKDLEIYAEENSVPIIHKEVSDLLKVLLKVQKPKRILEVGCAIGYSSIFFASIIGKDADIITVERNEKMIEKAKENIKLAGFDNNITILEGDAEEKLSQVQGEFDLIFIDAAKGQYKLFFDLVIDKLKDGGLLVSDNILYKGMVAHDDFVVRRKKTIVKRMRNYLDYICNCDYLSTSLVPIGDGVALSYKESKRGDVDGIK >CP012320.1|AXU56611.1|1290279_1291359_+|exported-aminodeoxychorismate-lyase MNFKENRLKIAVLIIVILIILAGIFVFIQIGPYDKNNKKDVIIDVPSGASVGKISDILYENKLIKNELLFKLLVKVSNKAPSIKSGTYLLNQSYSNNDIISLLVSGKIYQDGIKVTIPEGATSKEIIAMLVSKNLGDKATFENLIKKPQEFYDKFPYLKEDGITSLEGFLYPETYYFNSKKQSEEDILSEMLKVFDSKYTDKFKKKQKELNMTLQEVMEMASIIEKEAVLDKDRPIIASVFYNRLKVGMPLQSDATIQYIFEERKKIVTYDDLKIDSPYNSYKNKGLPPTPISNPGIKSIEAALYPEKTDYLYFVAKIDGGNNYSTNYQDHLKYVKEYKEARDKQSKDTKATNKENTKK >CP012320.1|AXU56621.1|1304611_1304767_+|phage-anti-repressor MALDVKIEVKIIKDVVILNIIHWKKETSLLTVKIARGQGDLSYVKYFTNES >CP012320.1|AXU56622.1|1305012_1305264_+|hypothetical-protein MSSYFITRGDVMKILQQFKPYKYDKEKNIEYDEKIIANQNTEVYIVYPRISDEENRRRWEEFNEVAKEVAINIAMKKVETVES >CP012320.1|AXU56623.1|1305573_1305687_+|hypothetical-protein MVEVNIKIKGEVSEIIDSIRGIFNSFDEELILDIKSE >CP012320.1|AXU56624.1|1305894_1306104_+|hypothetical-protein MMGLKLKRRYKNVLIYINIRTIIHINCKIKFIELYLTFNELKNKLANNEKTTVINENNKAFSGLVDFSN >CP012320.1|AXU56625.1|1306472_1306856_-|hypothetical-protein MRKKFFIGILIVLIISVIAILNIKNDKNVFIGESENWKAKFVTTEGHSKLEIKYKNSKDVVEQKFNYSYQFIDGEDAVVVVKNEILEAGQEKAIKIQRPGLYSNRESSYKLIISWNGNEETINLKKK >CP012320.1|AXU56626.1|1306982_1307327_+|hypothetical-protein MNYRLKKSVTTILSLLIMTILLPTNASASKVEDSSMKVMYSEKQVTDMDKLYDMAKNGITDVKSSNEKGIIKNARTGESIYVDSISTTQLLEVKQSKNLTSKIYSKTVFLILIQ >CP012320.1|AXU56627.1|1308710_1309028_-|hypothetical-protein MDFGNINLILIGIIVIIGTTIIYLIKPKTAFCSKKYFNKLESIYGNIDKKKTVKLEVLYRYVTGLEYISIGLFTRRLDITIIAIILVATITVILYYLVRKRYITI >CP012320.1|AXU56628.1|1309319_1309889_-|hypothetical-protein MKLRNPKIKKLLSVALLAALIGIPIGQTANAMEISNNVPSYIENNPTTIEDLEINDSQLPKPGTVTYIDINKLIKNLKENGIDTTLIENELYYRKAGTNKIVWTKTGFDLYLSKGVALTLAGAGTGVAGLLAGAIPGIGQYLAAAIVGAITMHLGSNITSGKIFKFKKMRYNKGGAYVTKYYLQSVRNQ >CP012320.1|AXU56629.1|1310332_1310515_+|regulatory-protein MKINKLPHAELKLMKYIWGADDVLASRDIIEAMKLKYDWKKSTTLTFLKTLVDKGFLTTY >CP012320.1|AXU56630.1|1311042_1311552_+|teicoplanin-resistance-protein MKSRKHNITKGLFIVYIIILTWIILFKLQFDISSLETMNLRSINLVPFAGSLIINNRVDISEIILNVAIFVPFGIYVCMLKEEWSFIKKVIPIFITSLAFETLQYIFALGASDITDLIGNTLGGIIGIAVFMLLSKIFKNNTIKIINVLALIVTIIVVLFLGLVIFANL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP012320_5 | 1513685-1514437 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP012320_5
|
11 spacers
spacers of CP012320_5
>5.1|1513714|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGGTTTTTCAGAAGTATATGTACGTCTATATTGTAAA >5.2|1513780|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGGAAGGTGGAAGTCAATATGCATGGGTCAAATGG >5.3|1513845|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACGAAATTAGAGTTTGAAATATATGACTACATAATA >5.4|1513910|38|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTGTCACATCATTGTCACTTCTTTAGAATATCAAAA >5.5|1513977|38|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTAAGCAGGTGATTAAATGATTAAAAAAGTAGAAAA >5.6|1514044|38|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATAACTTGTCAATGTAGTTATATGCAACAACTTCTAT >5.7|1514111|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAATTATATATTATGAAAAAATATGGAGTCACAGAGG >5.8|1514177|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGCAGGTTTTCCTTATAGTTTGCCATATGTTCCTG >5.9|1514242|35|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACTTTAGCACTAGTAAAGGTAGAATTATTAAAGT >5.10|1514306|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGAATGTGAATGGCACTTCTATTTCTCCAACTTTTG >5.11|1514372|37|CP012320|CRISPRCasFinder AGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012320_5
The CRISPR arrays of CP012320_5 >merge|CP012320|5|1513685-1514437|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGGAAAGAGGTTTTTCAGAAGTATATGTACGTCTATATTGTAAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAAGGAAGGTGGAAGTCAATATGCATGGGTCAAATGGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATACGAAATTAGAGTTTGAAATATATGACTACATAATAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTTGTGTCACATCATTGTCACTTCTTTAGAATATCAAAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTTTTAAGCAGGTGATTAAATGATTAAAAAAGTAGAAAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAATAACTTGTCAATGTAGTTATATGCAACAACTTCTATGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATGAATTATATATTATGAAAAAATATGGAGTCACAGAGGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTTGCAGGTTTTCCTTATAGTTTGCCATATGTTCCTGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTACTTTAGCACTAGTAAAGGTAGAATTATTAAAGTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTCGAATGTGAATGGCACTTCTATTTCTCCAACTTTTGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAAATTTTACATTAACTAAAATGTATAGAATA >CP012320|5|2|1513685-1514371|PILER-CR GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGGAAAG AGGTTTTTCAGAAGTATATGTACGTCTATATTGTAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAGGAAGGTGGAAGTCAATATGCATGGGTCAAATGG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ACGAAATTAGAGTTTGAAATATATGACTACATAATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTGTGTCACATCATTGTCACTTCTTTAGAATATCAAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTTTAAGCAGGTGATTAAATGATTAAAAAAGTAGAAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AATAACTTGTCAATGTAGTTATATGCAACAACTTCTAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GAATTATATATTATGAAAAAATATGGAGTCACAGAGG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTGCAGGTTTTCCTTATAGTTTGCCATATGTTCCTG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TACTTTAGCACTAGTAAAGGTAGAATTATTAAAGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TCGAATGTGAATGGCACTTCTATTTCTCCAACTTTTG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT >CP012320|5|5|1513685-1514437|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGGAAAG AGGTTTTTCAGAAGTATATGTACGTCTATATTGTAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAGGAAGGTGGAAGTCAATATGCATGGGTCAAATGG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ACGAAATTAGAGTTTGAAATATATGACTACATAATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTGTGTCACATCATTGTCACTTCTTTAGAATATCAAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTTTAAGCAGGTGATTAAATGATTAAAAAAGTAGAAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AATAACTTGTCAATGTAGTTATATGCAACAACTTCTAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GAATTATATATTATGAAAAAATATGGAGTCACAGAGG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTGCAGGTTTTCCTTATAGTTTGCCATATGTTCCTG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TACTTTAGCACTAGTAAAGGTAGAATTATTAAAGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TCGAATGTGAATGGCACTTCTATTTCTCCAACTTTTG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAA ATTTTACATTAACTAAAATGTATAGAATA >CP012320|5|2|1513685-1514371|CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGGAAAG AGGTTTTTCAGAAGTATATGTACGTCTATATTGTAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAGGAAGGTGGAAGTCAATATGCATGGGTCAAATGG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ACGAAATTAGAGTTTGAAATATATGACTACATAATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTGTGTCACATCATTGTCACTTCTTTAGAATATCAAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTTTAAGCAGGTGATTAAATGATTAAAAAAGTAGAAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AATAACTTGTCAATGTAGTTATATGCAACAACTTCTAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GAATTATATATTATGAAAAAATATGGAGTCACAGAGG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTGCAGGTTTTCCTTATAGTTTGCCATATGTTCCTG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TACTTTAGCACTAGTAAAGGTAGAATTATTAAAGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TCGAATGTGAATGGCACTTCTATTTCTCCAACTTTTG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
>CP012320.1|AXU56819.1|1512797_1513154_+|integrase,-catalytic-region MVFETFDKVIKLHPNAKPVFHSDRGFQYTSKVFESKLLAQGMIQSMSRAGRCIDNAPMEGIWGILKVEMYYLRKFDTYEQLVKIIETYIYYYNNFRYQKRLNSMSPLEFRKYLSTEIA >CP012320.1|AXU56818.1|1512408_1512768_-|integrase MKLIDITPSILQSYINNIYNEHMLNSIKNQVDFIKSVLKESYRLKEISENICDFVTTPIKKNSSTSKFYTKQETQLLLEKSKNIPIGIPIFLILTLGLRFGEAVSLIWSDVDLDKKSHM >CP012320.1|AXU56817.1|1510311_1511667_-|drug/sodium-antiporter MDTKISINENMSLGKRFFKYLAPSVVAMWVFSLYTMVDGIFVSKGVGELALAAVNISMPFINFIFAVSLLFSTGASTIIAIYLGKKDIKSANEVFSFNLVSIIILSIIILAITFFNLDRLALFLGATESTIGMVKDYLGIIIFFNGFFIVSYSLEVIIKTDGFPILATVGVIISALTNIILDYLFVIEFGWGVKGAGIATVLSQVFSTIFFLIHFLRKNSTLNFSKFRIDFKTLRKIVFIGFPDSTTELSCGIVVLLFNLSLTKYIGENALIYYSVINYINTLVLMTMMGITQGMQPLTSFYYGAGNIDNVKKLLKMGIKATIIASVAVFAICMAFSGPIVSLFIHPEETMLFNEGVRVFKIFSISFLLVGINVIISGFFVSVEKPSISTVISLGRGLVIVVLSLISMILIFGGQGIWMTTIVSEFICLILSLVFLKKNFSTLDSNLNKVA >CP012320.1|AXU56816.1|1509543_1510194_+|ATP-binding-protein MADEKFVMSFSGGKDSILALNRMLKKGYKPVALLTTISEEHGKSWTHNLEYNMLKQVSSNIGLPLLVAECGVEGYEESFERALIKAKNMGATICAYGDIDIESHRKWDTDRCEAVGMKVDLPLWQESREDLVYEFIDSGFCSVVTKVNLKHLGEEFLGKKLTRELVEKIKNAGADPCGEHGEYHTFVVDGPIFKKPVEYEVKGTLIKDGYGYLEIK >CP012320.1|AXU56815.1|1509030_1509459_+|EamA-like-transporter-family-protein MTKLWAIIFALLAGGSTALEAFINGELGKSTTALVATFISLTVGAIFFLASIIVTGDLKCLVSINGFNYKLLLGGVFGGLIIYFTVKAIPNLGVSNTLILTLVSQVLVGFFIDSVILGQETMHLYKYIGVILLILGTFFIVN >CP012320.1|AXU56814.1|1508330_1508879_-|hypothetical-protein MYTNFNIDFNNFNKKENATKFMLMGVLLIILGLLCLTFKTLGIKLISWTFGIALLFFAYLNLKNINELKRYATKEEIKPSINIQWVLIIACILLFVFPQKIQSIFSLFLGFYLIFNQLVALVNSKNNPYSKFTTWNIVKILFGICLILSPLFLSRFIVSIMSFFIILFGLVLFFSGNTARKY >CP012320.1|AXU56813.1|1507275_1508211_-|radical-SAM-protein MDKFKYAFDDKRYHTWNYYLRNTFGEKVFKVSINAGFTCPNIDGSLGYGGCTYCSKEGSGDFAGNPKDNLISQFYNIKEMMLKKWPHAKYIGYFQAYTNTYAPLEVLKEKYETILELEDVIGLSISTRPDCLPDDVVEYLSELNKRTNLWVELGLQTIHDSTSKIINRGHDYKTFVEGVEKLKSKNIKVVVHIINGLPGEDYNMMMETAKAVGKMGVDGIKIHLLHVIKDTPMEKMLQNGMLTLMEQDEYINLVCDQLEILPETMIIHRLTGDGKRDELVGPIWSLKKWEILNQIDDTLKARNSYQGCKFV >CP012320.1|AXU56812.1|1506060_1507005_+|membrane-protein MGEKSKGYVFIAIAGLLWATLGLFGKFLMGNGLTSEQVAFTRLFFGFIVLGVYSSIRTPQILKISKKGIIYSVIIGIICQAMFNLCYFKAIDIAGVSIAAVLLYTSPLFLAIFSKVCYKENITRSKLFSLILCFIGAIMAVTGGRLDFQGLNAFGLLLGVLSAIAYALMPTISKNALKEFSSSTILVYSFLFGAIFMIPSSRPWEILNYAKDLDVLSCMLMLGIVPAALAYIFYAAGISKGVELSVAGVVASVELVGSVIIGCTILGESFSLGKLFGVMLMLISAVVALNLSYDEIRIFYKSNKLKQIEKTESI >CP012320.1|AXU56811.1|1504314_1505745_-|sigma-54-dependent-regulatory-protein MNLDLEFYQKILEASHDEICVSDDKGIIIYCNKAFEENYGLKKEDILGKNVSFLEDSGYSTKSPIPIVLKTKTKFSLEQDTQTGKKLIITATPIFDENGNLEFTVENCRDITELNNIKNKLEDTKKQVKKYKSEVETLYRTALRIEDTVIMDGIVMRPIINTVNHVSKTDVSVLLLGESGTGKSSLARYIHHNSNRSNGPFITINCATISPQLLESELFGYTSGAFTGASTKGKVGLVELANGGTLFLDEIGDIPQNLQAKFLQLIQDRTFTPVGSLKNKKVDIRIISATNADLVSKVKEKKFREDLYYRLNVIEIKLPPLRERRDNLVEIIKYYFNRYSSDFNLNKTISKEAMDAIANYRFPGNIRELQNIIQKILLTCTDNHITIDDLPNILTKNIHITNNGNKTHISQINKVIISDSKSTNYKNKNFDTLIKEYEKNIILDAYEKFGSSYKVAKHLEISQSKANRLIRKYTNT >CP012320.1|AXU56810.1|1503530_1504115_-|hypothetical-protein MLMNTHFIMAKSILDNIDENKTFFISEKNFIYGNIKPDAFSKYKLKKHYLDESFNMIVSKINYLCSLNIDSLSKYFSVSRLSQELGVICHFLCDFFCVAHSERWEFKHSLNKHVTYERELGAFAKDVDLSKIKCGTINSSFEKFFTKLYSDYKKKTDYMNDLKFSAYTCNSVINYILDSILSNTIKSYHIANCG >CP012320.1|AXU56821.1|1514762_1516496_-|signaling-protein MSILLKKAPKLAKHIITSFYINRDINEVLKYLCENVTWIGPGEQEFLTSFNEIKNYFYAGQDEIPSCDINNDVFETVSEDENRCMVLGRYTVRTKENAQMILEVNQRCTFEIIEDRGKLLVKHMHISNPYGEMQLDEYFPTKIGTQSYDYLQRLLKEKTEVIEMITNNINGGLKGSNDDSTYSFFYVNEGLPKILGYTYDEFMEMSGGSAVGAVYPPDLPKALEDCERCFAKGPTYSSEYRIRKKDGTLMWVLDSGMKSLNSDGIVKINSIITDITQLKNIESELKLERERYRIALQNITDIMFEYDIENDTLIKYQRVEIDKKIELENFETKNYSKLLESGKIIHLDDIGKLLEVLHGNLRETIEIRQVNSLTKNEWRWIRVQCSVIYDSDHNPIKTIGVLKDITEDKSKLESLINQAQRDPLTQLYNQRVSQNLIEEYLCSSDSKNNDALLVIDIDDFKTVNDTFGHLEGNEVLVAVSKILLHNTHDKDIVARIGGDEFTIFIKSLTKDLIIKITNDILNDASKIKVKDNHKITLSIGIAFTDDSTKLYKDLFSKADKALYLSKADGKNCYSTYE >CP012320.1|AXU56822.1|1516735_1517581_-|signaling-protein MFKEIFLRTFPGFLIIRDSNYRIIFINDNLKNLIKSYMQDNPLGMTNIEIAKKLPDNIAKFFTDSHNIQLDWEKNYPYDKISNWILEFKKDTTSYWNVLEYKVDVDEKTYIITMANDITKLYEENKRNLHYSITDPLTGAYNRKYLNDRFDIFIGDYIVLIDLDNFKMINDYEGHNVGDKILCDFVSLLNKELINSTSIIRLGGDEFIVIFSSDVDKNYVYSQLEALRENFLKVFSKYKYLSFSYGVDTVKRNLKLTIVELDKKMYKNKEKNKKKFDKNDY >CP012320.1|AXU56823.1|1517611_1519846_-|signaling-protein MQNHNYIKMLNKKVEVLSKELDSRNFKLKTLNEIDFFSKIPNREFMYQYIDDCISKNIHIGIMLLNIDNFKLFNDIYGYLVGENLLITLTQNLLHFIPESKGIVAYLKGEGFLIVLPNVSNKELNNMGATIIESSRELKIRLPNEKEIYSNVTFSIGSTIWNGEPNMTTLILFNQVYSALKKAKSEGKNRYILFDFKDNSFYNKLENDKEFLSEISHVLQTKQIEVFYQPLYNIKNNTIVGCEALARWRHPIKGLLTPDKFIPLFEQFGLITELDLHLFEENCKNIRRWIDNNDVFVPICCNFSRLHFFNPNFPSMLKGITEKYSVSTSNFSIEITENILIENTNTIIQQLAELRSYGFSVSMDDFGSGYSSFGMLQNLPFDIIKIDRIFLSHNLNDFKNTTILYSIINIARALGMLTVCEGVETEQHVEFIKSINCDIAQGYYYAKPMECKEFEKLLSKENNSEKMFIKYSDIGKSLIEKIFDGFFIMQDMKKLRANVTEDIQWFDFYNKTEITSFPKVIEHFEKHIKGKKFSILYKSITPHNTESDSLLISGEAVLSDEASEHQKYSNFYFSANCIISENKLLLAKLHLDLIKTAGYINEFESYSIPKMTNTHLDESNILSQFYSMLPVGIIRYDLFGDMIITYMNEEMFDIIGYTKEQFFGEMGGNLRAIVHPDDLDFVYKKSLDMIDTNKIEPFLYRFIKRDGQIVTVMYTQCNLSAIDGRSIAQGMYVDVNKIKNLTKI >CP012320.1|AXU56824.1|1520615_1521425_+|MerR-family-transcriptional-regulator MKDYYKIGEISKIYGIGRDSLMYYEEIGILRPVRDINGYRMYNISDIWKLNLIKEFRSLNFPMKKIKEYLDDRSIESTKNILNEELDLIDKKIAEFISHKENIIKRLSSIESVIQNTKIDEIEVVYIEKRKALELNADIKRDEDFDFLIQKLQKEYEDRFNILGNNNIGSAFSTEAINKGIFNEFKSVFCFLESNEKVYNIVFDEGYYVTLNYTGSNSNNKMYMEKVFKFIEENNYKIIADPIEIYKIDIHETGIVEEFVTEIQVPITK >CP012320.1|AXU56825.1|1521569_1521809_+|hypothetical-protein MKCSNCGSVNIEKGILTTGGIYAETIGLKYRGDGKLDKVINKTFPVQSTIYSDLCLDCGEIVRTYIKDNTDRNWCKDKK >CP012320.1|AXU56826.1|1521996_1522173_-|hypothetical-protein MFRDEMDKCTHMLTAYISSLYDYCDFIDTQLDDFILEYGENVVESCLHQVMVLVSKYN >CP012320.1|AXU56827.1|1522677_1523352_-|MgtC/SapB-transporter MNHHILIQFEYIARIITAGFCGALIGYERKNRLKEAGIRTHFIVALASALIIIVSKYGFNDIVGTPGIGLDPARVAAQVVSGIGFLGAGLIFIRNQSVSGLTTAAGIWATAGTGLAIGSGLYLVGIVSSIIIVIVQITLHRDRKWMKLPTAEQVSLKISNSTDSIEYIEGKFKKSNIEIINMNIKRLDGDWLEVVIYTKLPKGYKKTNLLKLFSDNPLIETLEI >CP012320.1|AXU56828.1|1523571_1524126_-|isochorismatase MSIALILIDIQNDYFKNGKCELFQSEETAENAKKILLFFRKNNLPVIHIQHISTDKTASFFLPNTHGSEINKIVFPLDNEEIIIKHTPDSFFETDLQSILEKKNITNLVICGMMSHMCIDTSVRTAKKLRYDITLISDACTTKNLSWNNIEINANTVHQVFMASLQNSFADVKNTDKFLSNYHK >CP012320.1|AXU56829.1|1524203_1524569_-|transcriptional-regulator MKIRAEYTCPLEIVHDIIKGKWKTILIFELRQSNKTFSELQHNIYGINQKMLIQQLKELRDFGIIDKISSAGYPLHVEYFLTNRGKKMLKAVEIMQEIGIEYMLEHGQQEILDNKGICYNK >CP012320.1|AXU56830.1|1524799_1524934_+|hypothetical-protein MNISRKAMKIIELAQKIANKRGISVEEAWSEAVTEYKNKYEHIA |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP012320_6 | 1625057-1625350 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP012320_6
|
4 spacers
spacers of CP012320_6
>6.1|1625086|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCGGAGAATTTCCTAATGTGGATTTAATAGGAAGT >6.2|1625151|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTAGCAAATTTTTCGTAAAAGTCACTATTTTCAATG >6.3|1625217|38|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACATATAAAACTTTCATCTTCTGTTAATTCATTAAAAC >6.4|1625284|38|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT CCATCTTTTGTTGTTTTACATAAATTTATATTACTTAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012320_6
The CRISPR arrays of CP012320_6 >merge|CP012320|6|1625057-1625350|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATCTCGGAGAATTTCCTAATGTGGATTTAATAGGAAGTGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTTTAGCAAATTTTTCGTAAAAGTCACTATTTTCAATGGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATACATATAAAACTTTCATCTTCTGTTAATTCATTAAAACGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATCCATCTTTTGTTGTTTTACATAAATTTATATTACTTACGTTTTATACTAACTATACGGAATATAAAT >CP012320|6|3|1625057-1625283|PILER-CR GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CTCGGAGAATTTCCTAATGTGGATTTAATAGGAAGT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTTAGCAAATTTTTCGTAAAAGTCACTATTTTCAATG GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT ACATATAAAACTTTCATCTTCTGTTAATTCATTAAAAC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT >CP012320|6|6|1625057-1625350|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CTCGGAGAATTTCCTAATGTGGATTTAATAGGAAGT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTTAGCAAATTTTTCGTAAAAGTCACTATTTTCAATG GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT ACATATAAAACTTTCATCTTCTGTTAATTCATTAAAAC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CCATCTTTTGTTGTTTTACATAAATTTATATTACTTAC GTTTTATACTAACTATACGGAATATAAAT >CP012320|6|3|1625057-1625350|CRT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CTCGGAGAATTTCCTAATGTGGATTTAATAGGAAGT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTTAGCAAATTTTTCGTAAAAGTCACTATTTTCAATG GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT ACATATAAAACTTTCATCTTCTGTTAATTCATTAAAAC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CCATCTTTTGTTGTTTTACATAAATTTATATTACTTAC GTTTTATACTAACTATACGGAATATAAAT
>CP012320.1|AXU56919.1|1622302_1624396_+|signaling-protein MNKRNFEVILNQLQINIYVTNIHTNEIIFMNKKMKEEYNILDPEGKVCWQVLYPEQNSTCSFCKVLELLKNDKKGVLIKWYEKCNKLNRVFENYDSLITWQDGTVVHMHQSIDIANSTILNKPIKINEFNEISNTKEGKGVFNFSRDNFDYNSTLLYDALIRGTDEYIYICNMKTGVFRYSPSQVELFDLPGEIVENPLIYWKKIVHPEDWNRFYKSNTEIGKNQMDYHTVEFRAKNRSGEYIWLRCRGQLMRDEFGEPSIFAGIMTQLGKQNKIDSLTQLLNYHEFMSVFEDKISNPMIEKLCIVLLNIDDFKNVNEMYDRDFGDNIIKTLAQSIQSILPDNAELYKLDGDEMGILVDNVEENEILTLYNQIQNMIIHLQLWRKYGLNITISAGCVIYPKHGDTVKELYKCASYSLQYAKEHGKNRLVFFSQEILKNKMYSLEMMRDLKASINDDFRGFSLRFQPQVDTQSHKIIGVEVLLRWTNDKCKAISPLEFIPILEENDMINIVGAWVLRMALRTFRKWIDYYPFFKVSVNVSAVQILEDTFIEDIVKIIDDENFPYQNLVLELTESHTVQNMSILQFKFKALQDLGIYIAMDDFGTGYSSLEVLKFSPIDIVKIDRVFVKDILKSKFDATFIHFIVAICHDVGIKVCLEGVETQEEYDLVKQIKPDYIQGYLFGKPQTATEIFDLLKLDN >CP012320.1|AXU56918.1|1620726_1621623_-|NADP-oxidoreductase,-coenzyme-F420-dependent MANYFLSKGYCVSGFYGRNQLSLLESINLTKTKIYSNLRDIIYENDILFITTSDDSIEIIDKKLSKFNLKHKYICHTSGSLKSSILFCSKKAGALIYSIHPIFAFSNKNTNIKKMKDICFSIEGDNEQDDLVIQNFIDGLGNQFFIRDKDTSSTYHLANVLVSNLVLSLLDIGVSYFIKLGLSEEESLKAISPLVKKNIENILDNGFTKALTGPVSRGDITPIRKHLSVLNKKDEDIYKILSLNLLKIIALGNDNSLKGTKNITIENAIENLISKSEKYKEIYKLLGGKNDEKYHTDF >CP012320.1|AXU56917.1|1619924_1620752_-|3-methyl-2-oxobutanoate-hydroxymethyltransferase MKNTIQTFKNAKYEGKKLSMLTAYDYSIAKIMDECDINGILIGDSLGMVIKGEENTLSVTIDEIIYHTKAVKNGAKNALIVSDMPFLSYHVSIEDAVKNAGRLIKEGGAHAVKLEGGSNVIKQIESIVNAQIPVMGHLGLTPQSVNSFGGFKVQGNTSETARQLIEDAKLIEKAGAFSIVLEGVPTKIADMVTNSISIPTIGIGAGINCDGQILVYQDMLGVFGDFVPKFVKQYANIGDIMKDSIKNYILEVNTGAFPQEKHSFSINESELEKLY >CP012320.1|AXU56916.1|1619057_1619906_-|pantoate--beta-alanine-ligase MLVKEIKLLRNIIKDWRKHGYSIGLVTTMGFLHEGHQSLIKKAVKENDKVVVSVFVNPTQFGPNEDFNSYPRDIDKDFKYCMDSGATVVFNPSPEEMYLKGNCTTINVSGLTDFLCGAKRPVHFGGVCLVVSKFLNIVTPDKAYFGEKDAQQLAVIKRMVKDLNINTEIIGCPIIRENDGLAKSSRNTYLSEEERKSALILNKSLSLAKEELVKGNLNPKNIKELITAKINSEHLAKIDYVEIVDSETLQPVKQIEHSILVAIAVFIGKTRLIDNFTFELNI >CP012320.1|AXU56915.1|1618464_1618647_-|hypothetical-protein MFKDKIDECVHIMTAYIASLKEYYSFIETQIGDFIKKYGEDVVELCLHRVMILLCECGLA >CP012320.1|AXU56914.1|1616718_1617633_-|hypothetical-protein MIDNQKYVILSLELHLFFSRIMKEHALFLEAGFTNKNYNLAMEADHYKKQFEDLLSYTVSASNGIIRPDILYSEELVTTLTSVAEQKTEEFTGIEINKDITTRELNLQSGVNPQVGQDLVNYVAQLNSDAIRLLDGLINFKERVLDGVLSCTIFTSNYPLLLEHIIHEANLYRSYVVDLENKIDIESKNAKEIELFWDHIMMEHALFMRGLLDPSEGELINTSNDFAIKFNELIEKTNEMTDSNIKNITEETLNETVEFKDFKEAGASGIEQCKIKSIILPLLADHVLREANHYIRILESYKNM >CP012320.1|AXU56913.1|1615681_1616329_-|lactate-utilization-protein-B/C MIRQTPLEKRYDKLGPHIVTAFKKRYFDAYYCKTRNEALQQILDLIPQNHVVSWGGSETLKEMGVQTAVREKGFKVIDRDLAKTPEERTEIMRQALLCDTFLMSSNAISEDGQLFNIDGNGNRVAAMIFGPKNVIVVAGMNKIVKNIDDAIQRTRTIASPAVVQRFQDVNTPCYINGSCIDCTSPESICAYMVTTRISRPAKKIKVILVGENLGL >CP012320.1|AXU56912.1|1614945_1615515_+|lipoprotein MKKFILCIIMFAISVLVLAGCTNDNKIKNEVDSMFNSIKTQDADTVDKYFPKSGLGNLIYEDKEGFKMYSKNMTWEISDIKNNKDKVTVDLKINNTDMVSILKKNPPKLGEMMPNPTMKDIDSAKKKEFNITLELVKSGDNYVCKVNQESAMKLLNVITGGGIDYLADYNKDYYKQLDEEQKNYENKNS >CP012320.1|AXU56911.1|1614041_1614941_+|iron-sulfur-cluster-binding-protein MKLLSKVNNNIRLIIQVAFTALTNGYVNGFLEGTIYGGESKKLCVPGLNCYSCPGALGACPIGSLQAVLSSREYKFSFYVVGFLMAFGAFFGRFVCGWLCPFGLVQDLLHKVPFPVKIKKVYGDKYLKYLKYIVLIMFVIILPVAIVNVAGGGNPWFCKWICPSGTLLGGIPLILGNENLRESIGFLFSWKLSILLLILLMSIITYRPFCKYICPLGAIYGFFNPISIYRFKIDKDKCTNCTACQTKCKLDIPIYKDVNSPDCIRCGECIKVCPQNAITTTFSKDKKENNICAKKYRGI >CP012320.1|AXU56910.1|1613304_1613889_+|thioredoxin MKKFFMVVLGCIFVLGVISGCSKKESKPVEKNKSNSEWFSNLDTEDVDGNKVTKEIFSNKELTLINVWTTWCGPCVGEMPELEALSKEYESNNSNVAIKGLVVEVDKTDMRTGLSNEEKNLVKNIMKKSDATYQQLTVSEELKKTDFKRVMEFPTTYFVDKKGNFVGEKVVGANSKEEWKKIIDERLKMVKANE >CP012320.1|AXU56920.1|1625517_1625802_-|hypothetical-protein MLVRVKIVIGATIRYLIKHKVNYCNKKSLDKLELKYGNIDREKAVKLEIFYQYLIELEYIEMSLLIRRLDTAITSLALVSIITIASYYLIRKNV >CP012320.1|AXU56921.1|1626008_1626827_+|MerR-family-transcriptional-regulator MEKQYFTTGEFAKLCGISKQTLIFYDKIGIFSPEYKDKNNYRYYSVYQYDTLDILQSLREIGMSLEEIKEYIQNRTPQLCVKMLKEEEKKIREKIKKLRKISSKMQNRINITVEGISKMNSEEIYISKKFEEYLVLSSDLSNMSNSDFMMELIDFTNYCKSKNLYQGYELGVIVSNENIKNGDYLSISSFYLKIDKKIKDKKLYVKPEGMYACIKHIGKYEDSYKSYEKLKKYIYENEYKIIGNSYEESILDFFCESNEDNYMTEISIQVSR >CP012320.1|AXU56922.1|1626959_1629080_-|ferrous-ion-transport-protein MGLTHNSTKMSSLKDMFDIDNKEDQFVIALAGNPNTGKSTVFNHLTGLRQHTGNWPGKTVATARGNFKYKNTEYALIDLPGTYSLFALSQEEIVARDFICFGNPDAVIVVCDATCLERNLNLVFQVMELTDKVILCINLIDEARKKGITIDKKLLEDSLGIPVILTAARNGSGMDELLDTLNDVSFDKYKLNNKPVRYNENIENVVKSIQPELDNIIPGINSRWLGLRLIDGDESIFESMSNYIDKDSIDAINEVKKKIPDNINKQKIRDEFTKINYDYAKKLSDECCSNVAKKSTDREEKVDKILTSKIFGLPIMLLLLGTILWITIEGANYPSTLLSNLLLGFEPSISGILNSINCPSWLNDMLVLGLYRTLAWVISVMLPPMAIFFPLFTLLEDFGYLPRVAFNLDHLFKKACAHGKQCLTMCMGFGCNAAGVIGCRIIDSPRERLIAILTNNFVPCNGRFPTLIAISTIFFSSVITNSFVSSVATALCITLLIILGVIITLLVSYTLSKTLLKGVPSTFTLELPPYRVPQIGRTLYTSIIDRTIFVLGRAVMVAIPAGVITWIFANIYIGDLSILSHVANFLDPLAKLIGLDGFILLAFILGFPANEIVVPILLMAYLATGSMIELDSFSALGQVLREHGWTYLTALNVMLFSLLHWPCATTLLTIKKETGSLKWTALGFLMPTILAFVVCFLTTTVYNLFI >CP012320.1|AXU56923.1|1629105_1629333_-|ferrous-ion-transport-protein MKNLNDIQVKKTVKVEDILSSGNLRERMLALGLTRGAVIDVVRKGPKNNLTVYKIRGSKIALRQEESSLILVSDI >CP012320.1|AXU56924.1|1629659_1630100_-|acetyltransferase MFKIKHFNDLSLDEFYEIAKSRYEVFACEQKIFSLNDYDDIDKSSYHIFLKENGLICAYARIIPKEYSSYNDVSIGRVLVLSSHRRKGLAKQMMDCAIDFIKINLHENNITLSAQTYIKNLYLSCGFKEISEVYDEAGIEHIKMRL >CP012320.1|AXU56925.1|1630272_1631241_+|hypothetical-protein MNTTKKLTEAALLSSLFIVVTIIAVSTGFGYAIYLDFIVPVFFCIICLKCDLKYTILSGITSLLIISLVLGNLGTAIWASQSVLLGIMCGYLINKPTMVMDDLVYGSVFGVIVMVFIDIYASTLIGYSFMKEFQGYSKWIYFNGYTNFIYYLMIALFPFGMVFCIYLLSLILGNKLHILDSNSLKKFLIFKNFRSLNQFLCCSKKAFYICVSYLAIFEVLKLLNVKVDSVYLKTIFISITYISVYFIIRDSCMSLQNFIIAKFRKLLYARILFLIIILLLFFIFDVTVISLIIINAFLNKKINIRLSQSNIVNKQINLLIEK >CP012320.1|AXU56926.1|1631716_1632925_+|tyrosyl-tRNA-synthetase MKSIDEQMRIIMKGVDDLIDEKELREKLIKSEKEGKPMIVKLGLDPSAPDIHLGHTVVLRKMKQLQDLGHQIVIIIGDFTGKIGDPTGKSKARKALTTEQVLANAKTYEEQIFKVLDKEKTIVRFNSEWLAKLNFEDVIKLAATITVARMLEREDFKKRYEGQMPISVHEFFYPLMQAYDSIALEADIELGGTDQRFNLLMGRSLQREFGMESQIVIMMPLIEGLDGKEKMSKSLGNYIGIDEEAGIMYQKSMEIPDELIIKYYNLVTDVHPDEVNKIESQLKEGSVNPRDIKMNLAREIVTLYHGEESAKEAEERFKSVFQKGQIPEDIQTIQVKEDGFDLIEVLVSNEIVKSKSEVRRLASQGGVKVNGEKVEDLSTIVKESELVVQIGKKKFVKIELVK >CP012320.1|AXU56927.1|1632985_1633867_-|polysaccharide-deacetylase MVKKRKKKTVTLTILVVIVIGIFSMAWADMSRKKEMKETQERLKAERLEKERIEKEKNEPIIGAKKEAVKEYGYDAKIVWDKLNKYDYSNNGEKIVFLTFDDGPSTTNTPQVLDILKRHGVRGTFFIKGDSLERKGANEILKRTFDEGNAIAHHSYTHDYKKLYPGRSLNLDTFVNELNKTDEAMKKVLGKNFSSNVVRCPGGYMSWKNMEPLGNYLKEKNMASIDWNALNADAEGKKKNAQELFEHAKKSSEGKEMVVLLMHDTYGKQETVNALDQIITYFKDNGYQFKILI >CP012320.1|AXU56928.1|1634282_1635197_+|transporter MKKYFGEIGLIFIAIIWGSGFVATQFALDGGLTPLQIITLRFFLAAIIMNLLFFKQIRANMGKKLLKAGGILGIFLFLAFTVQTIGLMYTTPSKNAFITAANVVIVPFIGFILYRRKLDKIGIISSLVALIGIGILSLEADFSINFGDFLTLICSFGFAFHIFFTSEFAKDNNPMALTAIQFTVAFLMSVVVQTFAGQLKMEAELSGYMGTMYLAVFSTTIGFLFQTICQKRVDGTRTAIILSTEAVFGTIFSIIILKELITAKLIIGSILIFVAIITAETKLSFLKSKKVKLKDSEESSLESI >CP012320.1|AXU56929.1|1635419_1635965_+|ruberythrin MKKFVCTVCGYIHEGDAAPAQCPVCKVGADKFEEMKGEMVWADEHRIGVAQGVDAEIIEGLRANFTGECTEVGMYLAMSRQADREGYPEVAEAYKRIAFEEAEHAAKFAELLGEVVVADTKENLRVRVDAEYGATDGKLKLAKRAKELGLDAIHDTVHEMCKDEARHGKAFLGLLNRHFGK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP012320_7 | 1717734-1718090 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP012320_7
|
5 spacers
spacers of CP012320_7
>7.1|1717763|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTGTAAGAAGTATCATTCTATTTTTTAATCTTTCT >7.2|1717828|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCAGTGAGAATAAGCTTTATTGTCGATGTAACACTC >7.3|1717894|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTACATATAATGAGTCTTTAACATCAGTTATGAAAG >7.4|1717960|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATTGTACTTTAGCGTCTGCACTAGCTTTGTCTATC >7.5|1718025|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT TATTTTACAGATGAACAATTACAGTTACTTCTTGAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012320_7
The CRISPR arrays of CP012320_7 >merge|CP012320|7|1717734-1718090|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATGTTGTAAGAAGTATCATTCTATTTTTTAATCTTTCTGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATTTCAGTGAGAATAAGCTTTATTGTCGATGTAACACTCGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATAGTACATATAATGAGTCTTTAACATCAGTTATGAAAGGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATGATTGTACTTTAGCGTCTGCACTAGCTTTGTCTATCGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATTATTTTACAGATGAACAATTACAGTTACTTCTTGAATGTTTTATATTAACTATGTGGATTCAAAAT >CP012320|7|4|1717734-1718024|PILER-CR GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT GTTGTAAGAAGTATCATTCTATTTTTTAATCTTTCT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TTCAGTGAGAATAAGCTTTATTGTCGATGTAACACTC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT AGTACATATAATGAGTCTTTAACATCAGTTATGAAAG GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT GATTGTACTTTAGCGTCTGCACTAGCTTTGTCTATC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT >CP012320|7|7|1717734-1718090|CRISPRCasFinder GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT GTTGTAAGAAGTATCATTCTATTTTTTAATCTTTCT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TTCAGTGAGAATAAGCTTTATTGTCGATGTAACACTC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT AGTACATATAATGAGTCTTTAACATCAGTTATGAAAG GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT GATTGTACTTTAGCGTCTGCACTAGCTTTGTCTATC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TATTTTACAGATGAACAATTACAGTTACTTCTTGAAT GTTTTATATTAACTATGTGGATTCAAAAT >CP012320|7|4|1717734-1718090|CRT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT GTTGTAAGAAGTATCATTCTATTTTTTAATCTTTCT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TTCAGTGAGAATAAGCTTTATTGTCGATGTAACACTC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT AGTACATATAATGAGTCTTTAACATCAGTTATGAAAG GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT GATTGTACTTTAGCGTCTGCACTAGCTTTGTCTATC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TATTTTACAGATGAACAATTACAGTTACTTCTTGAAT GTTTTATATTAACTATGTGGATTCAAAAT
>CP012320.1|AXU57017.1|1717338_1717443_+|hypothetical-protein MIGFLLSILAGVISAYIYDKIKNHPDANKGDLKK >CP012320.1|AXU57016.1|1716049_1716490_+|phage-protein MSNLSAFLSQNAIKVDNVKYVASNRFLDKEGKPVEWELKVLSSEEDEALRRKCTKRVKVIGNNGKHTGQYTSEIDYNSYVAELCVASTVFPDLKDAELQNSYGVMGEAQLLKTMLTAGEYVNYTVKVNEVNGFDTSFEDKVEEAKN >CP012320.1|AXU57015.1|1715150_1715978_+|hypothetical-protein MEFESGIKLGKLTLIKYLGRNKHSKKVWLCQCECGNKVERVENNLKQSIKNEKPPHCGCSPNWKGQNKRFKDITGKTFGKLTVLKMSGKDKYSHNLWLCQCECGNRTITSTSALEQGKAQSCGCIRKEILLERSTTHNKSNDSLYRVYHRMIKRCTNKSNKDYNYYGGRGIEVCNEWLEDFINFYNWSIENGYRKGLTIDRINVNGNYEPSNCRWVTWEVQRNNKRNSIRVNYKGEMITLKQCAENLNVKYLFLYNQLVTKKIPLEEVIKNIGME >CP012320.1|AXU57014.1|1714621_1715092_+|phage-protein MAQTINAKDTVSAKKAECFITIEGKRYNFMQAIDLEAKMEKNKSEVPILGRTTKGNKTTGSTNTGSATFHYNTSIFRELLYRYKETGEDIYFDIQVTNEDPTSAVGRQTVVLKDCNMDSGIITKFDADGEYLDEDMDFTFEDWELVESFALLNGML >CP012320.1|AXU57013.1|1713294_1714605_+|phage-protein MALGGGTFVTQNKILPGAYINFISAKRATSSLSDRGIVAMPLELDWGIDEEAFQVTSDDFEKYSVKYFGYDYTHEKLKGLRDLFKNIRLGYFYKLNKGVKASCTIATAKYSGIRGNDLKVTVTTNIDDNAKFDVVILLDNKKVDTQIAKVITDLQDNDYITWKKDATLEASAGLVFTGGTNGEAVTGAEYQAFLDKIESYSFNALGCLATTTEIKSLFVEFTKRMRDKVGAKFQTVLYKKSDADYEGVVSIENKIKDKDLVESSLIYWATGAIAGCDINKSNTNKKYDGEFDVDVNYTQIQLEEALKTGKFIFHKVGDEVHVLEDINTFVSFTDDKNDDFSSNQSVRVLDQIANDIATLFNEKYLGKVPNDKAGRISFWNDVVKHHKELENIRAIEDFKTDDVSVELGNDKKTVIVSDAIKVINAMSKLYMTVSVN >CP012320.1|AXU57012.1|1713108_1713294_+|hypothetical-protein MIILSKALSKEDNYKFTKEQIVNSKKYVNRKDLLNAILKENELYSFSEVEDRINKFMKGVS >CP012320.1|AXU57011.1|1712687_1713125_+|phage-protein MLNNIIDGISVKLDKSFGEKYTIYSEDVEQGINEPCFFIVPLNPSKTPYPSGRELKKNSFDVHYFPRSEDKNFEINEIAEMLLEELEYIEIDGDLVRGTNMNFEIIDNVLHFFVDYNYFTIKNNDTNKMDTVELFGGLKRGDNFE >CP012320.1|AXU57010.1|1711532_1712339_+|hypothetical-protein MAKFLDITGKKFGRLRVIKFSKEIKSGKRNRKYWLCKCDCGNFKEIRTDSLTSGLVQSCGCLKKEQDKLNLTDKYQFKKKYKVQNKRLYSIWKGIISRCTDKNNKRYNRYGERNIIVCDEWFCYDNFANWALSNGYSEKLTIDRINNEGNYESSNCRWVDIKTQCRNRSTNILVKHEEKEITLIELSEKTGISYSCLRSRYSKGLVGNKLIEKVKIIEESRAKLSIEDVKEIRKKYSDGYTIKQLSEIYPVTYSSISNIVHRRTWKNI >CP012320.1|AXU57009.1|1711132_1711423_+|phage-protein MARWGSVDFREFKRVCKKMEKFTKIDLDKFCKDAARELAARLLGKVIRRTPVDTGFLREGWSGVAYARSLPVYKQGNNYIIEVVNPTEYALTQWGI >CP012320.1|AXU57008.1|1710785_1711133_+|phage-protein MVSKTRKAIEMLYRDKCTIVEYQPIKDPVTKRTNNKEVIVLENQPCKLSYKNIVSATEGKLAKLEQTIKLFISPDIEIKAGSKLIINDKEYVRSGESAIYPNHQEIILELFKDKA >CP012320.1|AXU57018.1|1718635_1719502_+|prophage-antirepressor-related-protein MKNLIVKEFNGSQIYTFMWKEKSCWIANQIVGLFDYADVSKTIQDCIKAEDFEIEQEYDVLKGNEFNDFVTTLNVVANNIISNKARSITIFYEDGLYGFLQYTDKPIGVQFRKWLRREVLPSIRQTGAYITNNANPEKLREKASEIEKLQLAYNSTSMLKELLDGAGFDNKSKLLTAKTLYKKAGIDLPIEINEEEHYFDTKQIASKLKIYSKSNKPAQLAVCEIIKKIDLEENEVKGVWETNGSWTGTVNKYTKSVIDKVRNWIEENNRPTKIAGEKKNYHVVYKIE >CP012320.1|AXU57019.1|1719554_1719689_+|hypothetical-protein MHENLLDSIDIEKRKEEFRIKLLKIRETDIDIYNKIESIVYKLS >CP012320.1|AXU57020.1|1720366_1720894_+|Telomeric-repeat-binding-factor-2 MREGKRRRGCLFWFILIILFSGVVGAIAGNSTNNESTEKQKEDLTKYIGEEGSIGDLKLTVNSISKASEISVASGYLAYTPDSGKYGIINLTIKNQTKESQSFMLNSFTLIGPDDSKYVPSLLIDVGNKYITMDTVNPNLDVTGNIAFEIPKDLLVSDCKLKYSGSEQEFILKEK >CP012320.1|AXU57021.1|1721031_1721799_+|hypothetical-protein MGLFGKKKADICCICNTEIGVLNIEDGWICNSCFKEYCDALSMTKAPKILRKLDIEKTISSTKKNNELQKIFNTTNNIENYIEFDEDNKKWLVSKKSINDKKTPIIHSYEDIVKFELLENGETVTKGGIGRALAGGILFGEAGAIVGGITGKKTTRKVVDTFKIKITINNIDNPIEYIELINKKTKTNSSAYEKAYKDAHKILSTLSAITQSIKETDNINTKSVADEILKYKNLLDMEAITQDEFNTKKKELLNL >CP012320.1|AXU57022.1|1721864_1724237_+|phage-tail-tape-measure-protein MATIQTSIKIFDGMTPAFRNMTTSINTTINSLERLQQRLHNPLNTGGIQASQQSLNNIENILTRIEQKIGRNTNEQENFNNKIKQGSEAGSLLVSKLKSLAGIYIGIRGIESITKAADTIASTKARLNLMNDGLQTTEQLNKMIYLSAQSARASYADTAAQVAKLGILAGDAFGSSAEVIKFTELMNKAFVIGGTSANEASAAMYQLTQAMGAGKLQGDEFRSIMENAPLLATKIADAMGKTKDQLKELSSSGAITADVIRNALFKASDEIEKKFASMPVTFSQALTMMKNDAYMIFGQTLGKISGALQSVRFSEIVVSIRNVMIAISSNIYDTLNIIKNILNSEFFSNLVQGFTFCAVVITKSLGSIVNTALNIVNIFAQNWSIIKPIVFGVASVFILFRGVLLATKIATIGNVIANVAHAASSSLSALMTNIQAAALMRSNGATLSATIATWGLNAALLACPITWVVLGILAFVVVVFVAVAAVNKFAGTSLTALGVIVGAVFAAVAAIQNVMIWLLNGCIAVNEGITNGWNQCVYLMKQAIAKGVIFIIEKMASLNNSVNNAGNALGKAFIDGANIAIRGVNKLIDLINKIPGINIGKVGEATFTPVKADNSYIKQQIDSLNRWVGDAPEKVKLERMGYKDIGAAFQKGNALGTKWQNAITDKFKDTFDINKMLEDAKKKLGLDDLWNKQNPLNNLGGFGGDLGKNVKDTAGNTAKMAKTMDKSQEDLKYLRDIAEQETINRFTGVNIKIDMNNTNNISKDTDVDGIVNVLTEKLNDAMVVSAEGIV >CP012320.1|AXU57023.1|1724253_1724943_+|phage-cell-wall-hydrolase MAYDFYLDGVQLPIAPPKLEVKVTNKNKTVDLINTGEVNILKKEGLSEISFEAEFTHNKLPFCRGQFRDVQFFLSKLELLKTDCKPFQFIVSRELGNKVLFNTNIKVSLEEYAISEDADNGSDTKVAIKLKQYRDYSTKKLVLAPPKNETGRPNVKIEPKRVDSVNATNTKTYTVKAGDSLWSICQKQLGNGSLYKKVYELNKSMMDKANKGKNLSKYTIYKGQVLKLG >CP012320.1|AXU57024.1|1724935_1726828_+|phage-cell-wall-hydrolase MVDELVLANDRDVRLVIAHWEDFYEPAVIDGITWEIERRGTPSKLEFTIVMDDILEFCEGNSVRLYYKGIGIFYGYIFQKKRDKENHIKIVAYDQLRYFKNKDTYVYSNKTASELVKILAKDFNLKYNVIEDTKYKISRVEENKTLFDMILTALDDTLREKKEMYTLYDDFGRITLKNVASMKLDTVMNNDVIEDFDYNSSIDSDTYTKIKLVRDNEESGKRDVYIAQDSAHMRSWGILQMFDTVDKNMSEAEIKQKCDILLKLYNKKTKSLSLKNALGDIRVRAGCLVPVFLNLGDIELQNYMLVEKVKHTFENNSHFMDLTLVDGDEFASYSSSSYSSGNTNNKDEKKNGPAQSIMKKNTGKKVPAIFTAYYPGNNAMEGGKTDCNGKPLDVKSRTVAGPMNREGVKKTWYTDDFLNKHPVFEYGDKVKIILPGTAYDNKVYTVKDNGGRIYVETNGTYHIDILLANASECKKFGRKNGYIIIGGDEEQTYQVEGNNQSNTNNNSKEDKLISIAKSKLGCNYVYGAEGPNNFDCSGFTQWCYKQIGIKIPRTASAQSKAGKAVDLKDRSKWKAGDLLCRIGGGSSNHVVMYIGNNQIIHSPQTGDVVKIESVNSYRKGKAYTHVRRFI >CP012320.1|AXU57025.1|1726841_1727102_+|phage-protein MSQDLLQIIKKAAMDAVETSNPMRVVFGTIESISPLRVKIEQKLSIGEIFLIQTDTFKRYTDKKMGDKLVLIRMQGGQQYLILDRM >CP012320.1|AXU57026.1|1727106_1727526_+|phage-protein MLPSDNLDYDIEDVSIINFDVRQEPSKTFKLHIEKSKIDGICDDVEALKQTIFLILNTERYEHLIYSRNYGVELNDLIGEPISYVIPELERRITEALIQDDRIENIDNFEFQNIKGKVQCRFSVHTKYGNIKAEKVVSV >CP012320.1|AXU57027.1|1727526_1728576_+|phage-protein MFELMTFENIIKRMLDSVPDTFDKREGSIIYNALAPVAIELTETYIAMDELLDQTFVDTASYYYLEKRCKERGITPLEATHTIAKGVFNIDIPLDSRFNLGEYNYVAIERISEKTYKMKCETTGPVFELGKLIPIEYIDGLETAELTEILINGEDEESEDSLRQRYYDSLNSQSFGGNIQNYRDEVNKIQDVGGVKVYPTWDGGGTVKLVIINSNFKVPSEELVNLVQEEIDPIGHQGEGLGLAPIGHRVTVEGVTSTTINISAEITYKNGYTWENIKSIAEEAIDDYLNELNMSWEDEENLIVRISQIETRLLSIDGVLDIANTMINDVKSNLTIDSNSIVVRGEVVG |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP012320_8 | 1719955-1720245 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP012320_8
|
4 spacers
spacers of CP012320_8
>8.1|1719985|36|CP012320|CRISPRCasFinder TTTGTAATGGTAGTGTATTTAAGATTGAAACATCAA >8.2|1720051|35|CP012320|CRISPRCasFinder AACATTAGTAGTTGTCTTTATACACATAGCATCAC >8.3|1720116|37|CP012320|CRISPRCasFinder CAGCTCCCAAGACATACAACGAATCTGTAACATCAGT >8.4|1720183|33|CP012320|CRISPRCasFinder ACTTATTTACAGCTTTATTTGCTAAATCAGAAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012320_8
The CRISPR arrays of CP012320_8 >merge|CP012320|8|1719955-1720245|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATCTTTGTAATGGTAGTGTATTTAAGATTGAAACATCAAGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATCAACATTAGTAGTTGTCTTTATACACATAGCATCACGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATACAGCTCCCAAGACATACAACGAATCTGTAACATCAGTGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAAGACTTATTTACAGCTTTATTTGCTAAATCAGAAGGTTTTATATTAACTATGTGGACTTAAAATT >CP012320|8|8|1719955-1720245|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATC TTTGTAATGGTAGTGTATTTAAGATTGAAACATCAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATC AACATTAGTAGTTGTCTTTATACACATAGCATCAC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATA CAGCTCCCAAGACATACAACGAATCTGTAACATCAGT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAAG ACTTATTTACAGCTTTATTTGCTAAATCAGAAG GTTTTATATTAACTATGTGGACTTAAAATT
>CP012320.1|AXU57019.1|1719554_1719689_+|hypothetical-protein MHENLLDSIDIEKRKEEFRIKLLKIRETDIDIYNKIESIVYKLS >CP012320.1|AXU57018.1|1718635_1719502_+|prophage-antirepressor-related-protein MKNLIVKEFNGSQIYTFMWKEKSCWIANQIVGLFDYADVSKTIQDCIKAEDFEIEQEYDVLKGNEFNDFVTTLNVVANNIISNKARSITIFYEDGLYGFLQYTDKPIGVQFRKWLRREVLPSIRQTGAYITNNANPEKLREKASEIEKLQLAYNSTSMLKELLDGAGFDNKSKLLTAKTLYKKAGIDLPIEINEEEHYFDTKQIASKLKIYSKSNKPAQLAVCEIIKKIDLEENEVKGVWETNGSWTGTVNKYTKSVIDKVRNWIEENNRPTKIAGEKKNYHVVYKIE >CP012320.1|AXU57017.1|1717338_1717443_+|hypothetical-protein MIGFLLSILAGVISAYIYDKIKNHPDANKGDLKK >CP012320.1|AXU57016.1|1716049_1716490_+|phage-protein MSNLSAFLSQNAIKVDNVKYVASNRFLDKEGKPVEWELKVLSSEEDEALRRKCTKRVKVIGNNGKHTGQYTSEIDYNSYVAELCVASTVFPDLKDAELQNSYGVMGEAQLLKTMLTAGEYVNYTVKVNEVNGFDTSFEDKVEEAKN >CP012320.1|AXU57015.1|1715150_1715978_+|hypothetical-protein MEFESGIKLGKLTLIKYLGRNKHSKKVWLCQCECGNKVERVENNLKQSIKNEKPPHCGCSPNWKGQNKRFKDITGKTFGKLTVLKMSGKDKYSHNLWLCQCECGNRTITSTSALEQGKAQSCGCIRKEILLERSTTHNKSNDSLYRVYHRMIKRCTNKSNKDYNYYGGRGIEVCNEWLEDFINFYNWSIENGYRKGLTIDRINVNGNYEPSNCRWVTWEVQRNNKRNSIRVNYKGEMITLKQCAENLNVKYLFLYNQLVTKKIPLEEVIKNIGME >CP012320.1|AXU57014.1|1714621_1715092_+|phage-protein MAQTINAKDTVSAKKAECFITIEGKRYNFMQAIDLEAKMEKNKSEVPILGRTTKGNKTTGSTNTGSATFHYNTSIFRELLYRYKETGEDIYFDIQVTNEDPTSAVGRQTVVLKDCNMDSGIITKFDADGEYLDEDMDFTFEDWELVESFALLNGML >CP012320.1|AXU57013.1|1713294_1714605_+|phage-protein MALGGGTFVTQNKILPGAYINFISAKRATSSLSDRGIVAMPLELDWGIDEEAFQVTSDDFEKYSVKYFGYDYTHEKLKGLRDLFKNIRLGYFYKLNKGVKASCTIATAKYSGIRGNDLKVTVTTNIDDNAKFDVVILLDNKKVDTQIAKVITDLQDNDYITWKKDATLEASAGLVFTGGTNGEAVTGAEYQAFLDKIESYSFNALGCLATTTEIKSLFVEFTKRMRDKVGAKFQTVLYKKSDADYEGVVSIENKIKDKDLVESSLIYWATGAIAGCDINKSNTNKKYDGEFDVDVNYTQIQLEEALKTGKFIFHKVGDEVHVLEDINTFVSFTDDKNDDFSSNQSVRVLDQIANDIATLFNEKYLGKVPNDKAGRISFWNDVVKHHKELENIRAIEDFKTDDVSVELGNDKKTVIVSDAIKVINAMSKLYMTVSVN >CP012320.1|AXU57012.1|1713108_1713294_+|hypothetical-protein MIILSKALSKEDNYKFTKEQIVNSKKYVNRKDLLNAILKENELYSFSEVEDRINKFMKGVS >CP012320.1|AXU57011.1|1712687_1713125_+|phage-protein MLNNIIDGISVKLDKSFGEKYTIYSEDVEQGINEPCFFIVPLNPSKTPYPSGRELKKNSFDVHYFPRSEDKNFEINEIAEMLLEELEYIEIDGDLVRGTNMNFEIIDNVLHFFVDYNYFTIKNNDTNKMDTVELFGGLKRGDNFE >CP012320.1|AXU57010.1|1711532_1712339_+|hypothetical-protein MAKFLDITGKKFGRLRVIKFSKEIKSGKRNRKYWLCKCDCGNFKEIRTDSLTSGLVQSCGCLKKEQDKLNLTDKYQFKKKYKVQNKRLYSIWKGIISRCTDKNNKRYNRYGERNIIVCDEWFCYDNFANWALSNGYSEKLTIDRINNEGNYESSNCRWVDIKTQCRNRSTNILVKHEEKEITLIELSEKTGISYSCLRSRYSKGLVGNKLIEKVKIIEESRAKLSIEDVKEIRKKYSDGYTIKQLSEIYPVTYSSISNIVHRRTWKNI >CP012320.1|AXU57020.1|1720366_1720894_+|Telomeric-repeat-binding-factor-2 MREGKRRRGCLFWFILIILFSGVVGAIAGNSTNNESTEKQKEDLTKYIGEEGSIGDLKLTVNSISKASEISVASGYLAYTPDSGKYGIINLTIKNQTKESQSFMLNSFTLIGPDDSKYVPSLLIDVGNKYITMDTVNPNLDVTGNIAFEIPKDLLVSDCKLKYSGSEQEFILKEK >CP012320.1|AXU57021.1|1721031_1721799_+|hypothetical-protein MGLFGKKKADICCICNTEIGVLNIEDGWICNSCFKEYCDALSMTKAPKILRKLDIEKTISSTKKNNELQKIFNTTNNIENYIEFDEDNKKWLVSKKSINDKKTPIIHSYEDIVKFELLENGETVTKGGIGRALAGGILFGEAGAIVGGITGKKTTRKVVDTFKIKITINNIDNPIEYIELINKKTKTNSSAYEKAYKDAHKILSTLSAITQSIKETDNINTKSVADEILKYKNLLDMEAITQDEFNTKKKELLNL >CP012320.1|AXU57022.1|1721864_1724237_+|phage-tail-tape-measure-protein MATIQTSIKIFDGMTPAFRNMTTSINTTINSLERLQQRLHNPLNTGGIQASQQSLNNIENILTRIEQKIGRNTNEQENFNNKIKQGSEAGSLLVSKLKSLAGIYIGIRGIESITKAADTIASTKARLNLMNDGLQTTEQLNKMIYLSAQSARASYADTAAQVAKLGILAGDAFGSSAEVIKFTELMNKAFVIGGTSANEASAAMYQLTQAMGAGKLQGDEFRSIMENAPLLATKIADAMGKTKDQLKELSSSGAITADVIRNALFKASDEIEKKFASMPVTFSQALTMMKNDAYMIFGQTLGKISGALQSVRFSEIVVSIRNVMIAISSNIYDTLNIIKNILNSEFFSNLVQGFTFCAVVITKSLGSIVNTALNIVNIFAQNWSIIKPIVFGVASVFILFRGVLLATKIATIGNVIANVAHAASSSLSALMTNIQAAALMRSNGATLSATIATWGLNAALLACPITWVVLGILAFVVVVFVAVAAVNKFAGTSLTALGVIVGAVFAAVAAIQNVMIWLLNGCIAVNEGITNGWNQCVYLMKQAIAKGVIFIIEKMASLNNSVNNAGNALGKAFIDGANIAIRGVNKLIDLINKIPGINIGKVGEATFTPVKADNSYIKQQIDSLNRWVGDAPEKVKLERMGYKDIGAAFQKGNALGTKWQNAITDKFKDTFDINKMLEDAKKKLGLDDLWNKQNPLNNLGGFGGDLGKNVKDTAGNTAKMAKTMDKSQEDLKYLRDIAEQETINRFTGVNIKIDMNNTNNISKDTDVDGIVNVLTEKLNDAMVVSAEGIV >CP012320.1|AXU57023.1|1724253_1724943_+|phage-cell-wall-hydrolase MAYDFYLDGVQLPIAPPKLEVKVTNKNKTVDLINTGEVNILKKEGLSEISFEAEFTHNKLPFCRGQFRDVQFFLSKLELLKTDCKPFQFIVSRELGNKVLFNTNIKVSLEEYAISEDADNGSDTKVAIKLKQYRDYSTKKLVLAPPKNETGRPNVKIEPKRVDSVNATNTKTYTVKAGDSLWSICQKQLGNGSLYKKVYELNKSMMDKANKGKNLSKYTIYKGQVLKLG >CP012320.1|AXU57024.1|1724935_1726828_+|phage-cell-wall-hydrolase MVDELVLANDRDVRLVIAHWEDFYEPAVIDGITWEIERRGTPSKLEFTIVMDDILEFCEGNSVRLYYKGIGIFYGYIFQKKRDKENHIKIVAYDQLRYFKNKDTYVYSNKTASELVKILAKDFNLKYNVIEDTKYKISRVEENKTLFDMILTALDDTLREKKEMYTLYDDFGRITLKNVASMKLDTVMNNDVIEDFDYNSSIDSDTYTKIKLVRDNEESGKRDVYIAQDSAHMRSWGILQMFDTVDKNMSEAEIKQKCDILLKLYNKKTKSLSLKNALGDIRVRAGCLVPVFLNLGDIELQNYMLVEKVKHTFENNSHFMDLTLVDGDEFASYSSSSYSSGNTNNKDEKKNGPAQSIMKKNTGKKVPAIFTAYYPGNNAMEGGKTDCNGKPLDVKSRTVAGPMNREGVKKTWYTDDFLNKHPVFEYGDKVKIILPGTAYDNKVYTVKDNGGRIYVETNGTYHIDILLANASECKKFGRKNGYIIIGGDEEQTYQVEGNNQSNTNNNSKEDKLISIAKSKLGCNYVYGAEGPNNFDCSGFTQWCYKQIGIKIPRTASAQSKAGKAVDLKDRSKWKAGDLLCRIGGGSSNHVVMYIGNNQIIHSPQTGDVVKIESVNSYRKGKAYTHVRRFI >CP012320.1|AXU57025.1|1726841_1727102_+|phage-protein MSQDLLQIIKKAAMDAVETSNPMRVVFGTIESISPLRVKIEQKLSIGEIFLIQTDTFKRYTDKKMGDKLVLIRMQGGQQYLILDRM >CP012320.1|AXU57026.1|1727106_1727526_+|phage-protein MLPSDNLDYDIEDVSIINFDVRQEPSKTFKLHIEKSKIDGICDDVEALKQTIFLILNTERYEHLIYSRNYGVELNDLIGEPISYVIPELERRITEALIQDDRIENIDNFEFQNIKGKVQCRFSVHTKYGNIKAEKVVSV >CP012320.1|AXU57027.1|1727526_1728576_+|phage-protein MFELMTFENIIKRMLDSVPDTFDKREGSIIYNALAPVAIELTETYIAMDELLDQTFVDTASYYYLEKRCKERGITPLEATHTIAKGVFNIDIPLDSRFNLGEYNYVAIERISEKTYKMKCETTGPVFELGKLIPIEYIDGLETAELTEILINGEDEESEDSLRQRYYDSLNSQSFGGNIQNYRDEVNKIQDVGGVKVYPTWDGGGTVKLVIINSNFKVPSEELVNLVQEEIDPIGHQGEGLGLAPIGHRVTVEGVTSTTINISAEITYKNGYTWENIKSIAEEAIDDYLNELNMSWEDEENLIVRISQIETRLLSIDGVLDIANTMINDVKSNLTIDSNSIVVRGEVVG >CP012320.1|AXU57028.1|1728568_1729186_+|phage-protein MDKEINLINYLPQILQDKEEYIKVFNVENKEIKTLHDKLKDLSNDQFLEDLTISGIKRWEKIMSITPKSNESLEDRRFRIFSKYISKLPYSERFLRNWLDNVVGEGNYELTINNATYNIHLESDARNQDWFEEVHSFVSNIKPCNMTLDYTRVLISKDNYMNFGITTLMGQEITIYPWSPPDIETYGEIDVLTGNGVGYQEITIF >CP012320.1|AXU57029.1|1729197_1730223_+|phage-tail-fiber-protein MAIDKSYYTIITDVGKAKIANASVTGNKVGFVKIQLGDGGGSEYTPTESQTELKNVVWEGNIGNTTTDETAPNCIILESLIPSSVGGFMIREIGYLDDENNLIAISKYKECYKPSIEQGAVVDMKVKTVLIVSNINNIELKIDPTIIFATLKDIQDLDAKISNVNTKIDTTKTELTSNIETAKTELNTRIDTENEKQNIKIDQLIAGGSNVASTQTITIDDWIDNQEGGFKATVTHGLLTQRITVSIIDATTKDNVVPDFTIIDDNSIEVRSGVKVELNVYVINGNAETHFINATVDDNRVSEMTTYSSKKIHEEIGKVAEQLTGINSNIISTVNNDILPI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012320_9 | 1857522-1858737 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP012320_9
|
18 spacers
spacers of CP012320_9
>9.1|1857551|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAATTTATCTATAATTTAAAACGGTGAATTACATAT >9.2|1857617|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAAGAGGGGTACTTCGTACTTTTACCACTCAAACTA >9.3|1857683|38|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGGTCAAGCATAGATTTTGCAACTGGAAGATAAGAAGA >9.4|1857750|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTAGAACAGAAAAAATTGTATAAATTGTGGAATG >9.5|1857816|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTAAAATGTAAATAGCATATTAATTTTTCTTTCAC >9.6|1857882|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGAGCATTATGTTTTTAGGTTACGGAGCAACATTTA >9.7|1857948|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTGATAGTGGAAGTTTTACTTATACTTGGCGTGCTG >9.8|1858014|38|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCAGAATACTTAGCTCCTGCGCCTATATCGTCTGAAT >9.9|1858081|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGTTTTGCGCATTGTATGTGTGCCTAGATTATCT >9.10|1858146|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGTCCCCACATCAATTTTCCTCCGCATGAAAAAATC >9.11|1858212|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTAGAAACAACAGAATAAACATAATATATAAGCATA >9.12|1858278|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTATATCGCATATTCTTTTATCTAGGTCTTCTTTTC >9.13|1858343|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAATCTTGTTATAGACTTTACTATTGTTGTAATAGA >9.14|1858409|35|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTACCAGACCCTGCAACACTAAATGACTTACATA >9.15|1858473|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCATCAGTATTTGTAAAATGCTTTAACTTATCATAAT >9.16|1858539|39|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTACTTTTCCTTTCTATGTGTCCAATTCGGACACATT >9.17|1858607|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT CTTATACTTAGTTAGAACTATATATCGACACAAATAT >9.18|1858673|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT TGCAATTTTTATTCGTTGTCCAATCGCTTGAAATTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012320_9
The CRISPR arrays of CP012320_9 >merge|CP012320|9|1857522-1858737|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTAATTTATCTATAATTTAAAACGGTGAATTACATATGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTAAAGAGGGGTACTTCGTACTTTTACCACTCAAACTAGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAGGTCAAGCATAGATTTTGCAACTGGAAGATAAGAAGAGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATGTTTTAGAACAGAAAAAATTGTATAAATTGTGGAATGGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTGTAAAATGTAAATAGCATATTAATTTTTCTTTCACGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTGGAGCATTATGTTTTTAGGTTACGGAGCAACATTTAGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATGGTGATAGTGGAAGTTTTACTTATACTTGGCGTGCTGGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTCAGAATACTTAGCTCCTGCGCCTATATCGTCTGAATGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAAAGTTTTGCGCATTGTATGTGTGCCTAGATTATCTGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATATGTCCCCACATCAATTTTCCTCCGCATGAAAAAATCGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTTAGAAACAACAGAATAAACATAATATATAAGCATAGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATCTATATCGCATATTCTTTTATCTAGGTCTTCTTTTCGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATATAATCTTGTTATAGACTTTACTATTGTTGTAATAGAGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATCTTACCAGACCCTGCAACACTAAATGACTTACATAGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTCATCAGTATTTGTAAAATGCTTTAACTTATCATAATGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTTTACTTTTCCTTTCTATGTGTCCAATTCGGACACATTGTTTTATATTAACTATGAGGTATGTAAATCTTATACTTAGTTAGAACTATATATCGACACAAATATGCTTTATATTAACTACATGATATATAAATTGCAATTTTTATTCGTTGTCCAATCGCTTGAAATTTGTTTTATATTAACTACGTGGTATGTAAAT >CP012320|9|5|1857522-1858606|PILER-CR GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTAATTTATCTATAATTTAAAACGGTGAATTACATAT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TAAAGAGGGGTACTTCGTACTTTTACCACTCAAACTA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AGGTCAAGCATAGATTTTGCAACTGGAAGATAAGAAGA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GTTTTAGAACAGAAAAAATTGTATAAATTGTGGAATG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTGTAAAATGTAAATAGCATATTAATTTTTCTTTCAC GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TGGAGCATTATGTTTTTAGGTTACGGAGCAACATTTA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GGTGATAGTGGAAGTTTTACTTATACTTGGCGTGCTG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTCAGAATACTTAGCTCCTGCGCCTATATCGTCTGAAT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AAAGTTTTGCGCATTGTATGTGTGCCTAGATTATCT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT ATGTCCCCACATCAATTTTCCTCCGCATGAAAAAATC GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTAGAAACAACAGAATAAACATAATATATAAGCATA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CTATATCGCATATTCTTTTATCTAGGTCTTCTTTTC GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT ATAATCTTGTTATAGACTTTACTATTGTTGTAATAGA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CTTACCAGACCCTGCAACACTAAATGACTTACATA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TCATCAGTATTTGTAAAATGCTTTAACTTATCATAAT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTTACTTTTCCTTTCTATGTGTCCAATTCGGACACATT GTTTTATATTAACTATGAGGTATGTAAAT >CP012320|9|9|1857522-1858737|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTAATTTATCTATAATTTAAAACGGTGAATTACATAT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TAAAGAGGGGTACTTCGTACTTTTACCACTCAAACTA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AGGTCAAGCATAGATTTTGCAACTGGAAGATAAGAAGA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GTTTTAGAACAGAAAAAATTGTATAAATTGTGGAATG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTGTAAAATGTAAATAGCATATTAATTTTTCTTTCAC GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TGGAGCATTATGTTTTTAGGTTACGGAGCAACATTTA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GGTGATAGTGGAAGTTTTACTTATACTTGGCGTGCTG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTCAGAATACTTAGCTCCTGCGCCTATATCGTCTGAAT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AAAGTTTTGCGCATTGTATGTGTGCCTAGATTATCT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT ATGTCCCCACATCAATTTTCCTCCGCATGAAAAAATC GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTAGAAACAACAGAATAAACATAATATATAAGCATA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CTATATCGCATATTCTTTTATCTAGGTCTTCTTTTC GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT ATAATCTTGTTATAGACTTTACTATTGTTGTAATAGA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CTTACCAGACCCTGCAACACTAAATGACTTACATA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TCATCAGTATTTGTAAAATGCTTTAACTTATCATAAT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTTACTTTTCCTTTCTATGTGTCCAATTCGGACACATT GTTTTATATTAACTATGAGGTATGTAAAT CTTATACTTAGTTAGAACTATATATCGACACAAATAT GCTTTATATTAACTACATGATATATAAAT TGCAATTTTTATTCGTTGTCCAATCGCTTGAAATTT GTTTTATATTAACTACGTGGTATGTAAAT >CP012320|9|5|1857522-1858737|CRT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTAATTTATCTATAATTTAAAACGGTGAATTACATAT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TAAAGAGGGGTACTTCGTACTTTTACCACTCAAACTA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AGGTCAAGCATAGATTTTGCAACTGGAAGATAAGAAGA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GTTTTAGAACAGAAAAAATTGTATAAATTGTGGAATG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTGTAAAATGTAAATAGCATATTAATTTTTCTTTCAC GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TGGAGCATTATGTTTTTAGGTTACGGAGCAACATTTA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GGTGATAGTGGAAGTTTTACTTATACTTGGCGTGCTG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTCAGAATACTTAGCTCCTGCGCCTATATCGTCTGAAT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AAAGTTTTGCGCATTGTATGTGTGCCTAGATTATCT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT ATGTCCCCACATCAATTTTCCTCCGCATGAAAAAATC GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTAGAAACAACAGAATAAACATAATATATAAGCATA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CTATATCGCATATTCTTTTATCTAGGTCTTCTTTTC GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT ATAATCTTGTTATAGACTTTACTATTGTTGTAATAGA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CTTACCAGACCCTGCAACACTAAATGACTTACATA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TCATCAGTATTTGTAAAATGCTTTAACTTATCATAAT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTTACTTTTCCTTTCTATGTGTCCAATTCGGACACATT GTTTTATATTAACTATGAGGTATGTAAAT CTTATACTTAGTTAGAACTATATATCGACACAAATAT GCTTTATATTAACTACATGATATATAAAT TGCAATTTTTATTCGTTGTCCAATCGCTTGAAATTT GTTTTATATTAACTACGTGGTATGTAAAT
>CP012320.1|AXU57140.1|1855603_1856875_-|guanine-deaminase MLKVLKGNIIFTKTSETFTVFENSYIILEKGKVKGIFKEIPKEYKNLKVVDYTDKLIIPGMNDLHAHASQFKNLGMAMDKELLPWLETYTFPEESNYKDIEYATKMYKKFVKELWKSGTTRIAVFATVHKEASMKLMDIFKEVGLGAYVGKVNMNMNCPDTLLENTQDSIADTEEIINKYSDTDSIVKPIITPRFIPSCTSELLKGLGDLCLKYNIPMQSHLSENYDEIEWVRSLEPESKFYGDAYNRYNLFGQTPTLMAHCVHCSQDEIDLMRENNVMAVHCPASNFNVGSGAMPIRKLIDNNIRLALGSDISGGHTLSIFKAMVSAIQLSKLYWVNSGKKYNFLSLSEAFYIATKSGGSFFGKVGSFEEGYDFDALIIDDSNLNHDNYSILERLERFIYVGDDRNIIHRYVCGKLIEEPNI >CP012320.1|AXU57139.1|1854209_1854965_+|hypothetical-protein MAHICFEDICYLLLKEAMKLKLIPHNKIVLFEDDLSIGNIFDVNNYELRENIFKIRNVFENNPKLLFKPDLLEDRKLSKCRNIIIWCANNPKDLCGVYYVVSKFQDKNIKIALVDEKKTEDALIRYSFTSEMSPEDFPFFLDKTLEIGFNEKLEFKNKWDVLVKENSIFRALVGNEIKSVEETYFDKYILRNISDKWQPLIEVVANCMFEDEMRVKDWFILWRLEKMASLKIVKIKGSKGDFYSDKEIRKV >CP012320.1|AXU57138.1|1853554_1853872_-|hypothetical-protein MSEFKNVTAVKKANVYFDGKVSSRVIILPNGERKTLGLMLPGEYTFSTREEEIMEMLAGSMDVKLPGSNEFVTYKEGQKFNVPSDSSFDLKVNEVVDYCCSYIAD >CP012320.1|AXU57137.1|1851111_1853469_+|cation-transporting-ATPase MDKVNLERYSCDINVGLNKNQLQSRIDDNLINAFDNGKTKTYKQIFKDNIFTLFNLINIVLVCLLVSVGSFKNTLFIFIAVINTIIGVIQEIRAKRLLDNLSVIVSNKVSVIREKEKKEIDVQELVLDDIMILKTGNQICADSKVLNGKLEVNESLVTGESDIIIKNKDDFLYSGSFVVSGEAFVRVENIGKDNYANKIVNDAKISKKHNSQLRNSLNSILKIVGIIIIPLGIILFAKQHFGNGDSIATSVVGTVAAVNGMIPEGLTLLTSIALAVGTIKLASHKTLVQELYCVETLARVDTLCLDKTGTITEGKMQVDDIVMLEEVDINEIMGNICNSLKDDNATLNAIRDKYNVLDTYKAKNLIPFSSERKYSGVTFENKGTYLLGAFEFIFKEKNKKIRIEVEKYSKKGNRVIVLAHSDSYMEDNNIPEDIKPLAFILILDKIRDEAKETLEFFYNEGVDIKIISGDNPITVSEVARKAGLKTASNFIDATTLKNDNDIYEAVDKYSVFGRVSPQQKKQMILALKKQNHTVAMTGDGVNDVLALKEADCSIAMASGSDVTKNVSNLVLLDSNFASMPKVVMEGRKVINNIQRASSLFLVKTIFSFFLSLLTLFFFSRQYPFVPIQLSLIGAVTVGIPSFFLALEANKSRISGNFLLNILKNALPGALCVTVNVIIVYNIVEYLGYSSSVFSTMCAILTGVCGLLILRQQCLPFNKERLFLIVSMTIAFVIGILFLGGLFSFVALSRELILITMALAILMPIMIKVMLFVLDEILETIVPDLN >CP012320.1|AXU57136.1|1849231_1850689_+|glycine-dehydrogenase-subunit-2 MKEYNSLLIDISKKGRKAYSLPKLDIDDIKIEDMIDQDMARQSELNLPEVGELELVRHYTLLSNKNFGVDTGFYPLGSCTMKYNPKINEDMAALPNFTGMHPYQSSDTAQGSLSLMYDLSRRLAEITGMDEVTLQPSAGSHGEFTGLMIIKAYHENRGDHKRTKVIIPDSAHGTNPASAAMANFDVIQIASDKNGAVDINALKEVLNDEVAALMLTNPSTLGLFEKNIKEIATLVHEAGGLLYYDGANMNAIMGITRPGDMGFDVVHLNLHKTFSTPHGGGGPGAGPVGVKKELVPFLPIPLIERKEDKYVLNYDREKSIGKIKNFYGNFGVLVRAYTYILTMGRDGLKEASEMAVLNANYIKESIKDDYILPIDTLCKHEFVLGGLPRGEANIKTIDIAKRLLDYGYHPPTMYFPLIINEALMIEPTESESIETLDSFIEAMKSVAKEAKEEPELLKTAPHNTLVKRVDDARAVKKPILTWSQR >CP012320.1|AXU57135.1|1846757_1849232_+|bifunctional-glycine-dehydrogenase/aminomethyl-transferase-protein MNELKRVSLYNIHKELGAKLVEFAGWEMPLEYEGINKEHEKVRKSAGIFDVSHMGEVQIKGAESEKFIQNLVTNDISTLKINDIIYTPMCYENGGVVDDLLIYKFGEEDYLLVINAGNIDKDVAWIIKQSEGYNVDIKNISSEVSQLAIQGPKAEEILQKITDIDLNSIKFYKSIPSTKVCGCPCLVSRTGYTGEDGFEIYCKNKYVEIIWNEVLKVGGEDICPAGLGCRDTLRFEAALPLYGHEINEHISPIEGGLSIFVKTNKESFIGKSILSKEKESGAKRKLVGFEMQGKGMPRNGYDIRIGDKTVGFVTTGCASPTTGKILGMGIIDSEYAKVGNEIGIAIRKKVVPAVIVKKPFYKKQYKKDNIILNKENKFSYIPATSEDKSKMLKVVGLNSVDELFSDIPEEVKLKRDLNLEIGKSELEVSKIVKRLSEENLSLEDLTCFLGAGAYDHYIPSIIKHITSRSEFYTAYTPYQAEISQGTLQVVFEFQSMIAEITGMEIANASMYDGATAAIEACIMAMNQTRKSKIVVSKTIHHETLSVLRTYLQYKDCEIVEIDFCNEYGTTDIEKLKASVDKDTACVLIQTPNFFGIIEEMEEIEKITHENKAMLIMSVDPISLGVLKTPGEIGADIVVGEAQSLGNPLNFGGPYVGFLASKSKYTRKMPGRIVGQSLDVEGKIAYVLTLQTREQHVRREKATSNICSNQALNALVASIYMATMGKEGFKEVGMQSMKKAHYTYNKLVQTGKYKPIFKGKFFKEFAVQGNLNIETINDKLLEENILGGYNLEYNYPELKNSTLLCVTEKRSKEEIDKLVGIMEGL >CP012320.1|AXU57134.1|1843626_1845357_+|Na+/H+-antiporter MRNKKINIIFLTTIMFIMSTVMVFAEEDIDTIALANAEKFGILTLIPPLVAIILAFITKNVIISLLIGILSGSFIIKASGINVFATFIQAFLDLVDRALVSLADPWNAGIILQVLAIGGVINLVAKMGGAKAIAEALAKRAKSAKGTQLITWFLGLLVFFDDYANSLIVGPMMRPVADKMKISREKLAFIIDATAAPVAGLAIISTWIGLEVGLIHDAFESISIDVDAFGIFLNTIPFRFYNILILAFIVISALLLKEFGPMRKAEIKSRSRKISIDLDEGVEELDDLAPKNGVKLSVWNAIIPIGTLIIVALASFYYSGYTSIMGGDDKALIQLFTNSPYSFEAIKEAFSASDASRALFQSALVASLVAIIMAVVKKIFTISEAIDVWIDGMKSLVITGVILILAWSLSSVIKELGTAKFLIHLLSGSLPPFLLPSLIFGLGAIISFATGTAYGTMGILMPLAIPLAYSLNPDMSYVIVSTSAVLTGAIFGDHCSPISDTTILSSMGAGCNHIDHVNTQMPYAIFTAVITIVFGYIPAGLGLPIYIVLPVAIAAIFVGIQIIGKKVDEAEIELVE >CP012320.1|AXU57133.1|1842156_1843143_-|lipoate-protein-ligase MLLIYNEKTNPYFNLAMEEYLLKNFDEDLFILWRNEPSIIVGKNQNTLSEINLEYIKEYSIPVVRRQSGGGAVFHDLGNINFTFIACNNNNFSDFRRFTQPIIDLLKTLDVNAEFSGRNDLLIDGKKFSGNAQYNYKNKVMHHGTLLFSSEINDLSKALKVKPIKFEGKGIKSVKSRVTNISEHLHSKMDILEFKDAIMDYLSKTNTDNTNYCLNEHDIKQIEKLTKSKYETWDWNFGNSPKYTLSNELKYSGGNVEFNLNVDKGIITSIKFFGDFFGKCDVAFVENKLIGIRHEENALRNTLDSIEINDYFLGADTDILVSGILGVK >CP012320.1|AXU57132.1|1841049_1841847_-|lipoprotein MKFKKLLCLLLCLVLTLAVVGCSKAKDDKKIVVGATLVPGGELLEELKPLIKEKGYTLEVKNFDDYILPNEALNNGEIDANLFQHEPYLKEAVKAKGYKIMAGKKLYVCPAILYSYKIKSVDEFKKGDTIAISNNPSSCSKNLRYLESIGLLTLPKGDGLVSPKDIIENPKGIQFKELDIAQIPSSLPDVTAAFIDTTYAVPAGLDAKKNGIYTAPINDEYANLLAFRTEDKDSEKIKVLQDVLTSDKARSLIEEKYKGIVIPTF >CP012320.1|AXU57131.1|1840347_1840947_-|tellurium-resistance-protein MAIELKKGQKINLTKKENSDLGEILVNLNWNQKVQKKGFFGSLRSSNIDLDLGCLFEMKNGVKGAVQALGNAFGSLDNPPFAQLDGDDRTGSNTQGENLRINGNKIKDIKRILIYAFIYEGVANWSEADGIVTIKQKQDSDLVVKLDEHKNGYNMCSIALIENVNDETFSVEKVVKYFKGHREMDTEFHWGLKWVAGRK >CP012320.1|AXU57141.1|1859145_1859433_+|hypothetical-protein MKKILYALYSFIVIIANFRLKEKNYNFILLAIFFILLLIQNGVLKTGYQNRATFYQDNYFNGEDKNDKIKFITIKIFIFLSLPLCFNILFNYLTS >CP012320.1|AXU57142.1|1859457_1859550_+|hypothetical-protein MIKVRLCVVYIKYKVHIVIKQKFHINEEKI >CP012320.1|AXU57143.1|1859970_1860522_-|transcriptional-regulator MSINTVIAKNLNRLRNERNLSLGQLAELSGVSKVMLSQIEKGDSNPTVNTIWKIASGLNVPYTAILEQPQNETFIVSKTDIDVQVSENKDYRLYCYYPNTPTRNFELFQMELEEGHSYTSVGHSEKSQEYIMIIEGQLKLEVNDSIYQLRENDSICFSAESIHTYHNQGEKTLKAVIINYYPV >CP012320.1|AXU57144.1|1860712_1861675_+|cysteine-synthase-A MRVLNNVTEAIGNTHMLHLSKIADEFGVQGNIYAKMEYLNPGFSKKDRVALQMITEAENAGLLVPGQAVVELTSGNTGTGLAIACACKGYKFIACMSKGNSMERARMMKALGAEVVLVDQMPNSVHGQVSGEDLALVEIEAQKIAKERNAFRADQFNLEACNHAHEKYTAEEMWEQLDGNIDVFVDFLGSGSTFAGCSKTLKKHNSSIKCYVVEPETAAIYSGKEITDQGHKIQGGGYSMDLPLVDKKLIDGYIQVTDEEATDVARKLAKLEGVFAGFSSGANVCAAIKLLKSSEKGKNIVLTLNDSGLKYLSTDLYEEL >CP012320.1|AXU57145.1|1861969_1863814_+|glycerophosphoryl-diester-phosphodiesterase MQKRILRNFIFTGKNILSKLVFIIKYNFSTLILFELFHKGLALFFIWPSIRYIFDILIKSLHIVYLNMDNFIKVLTNPMSIVLIILSVIILAFYAFFEFTSVIICFNKSIKYEKIGLFELFKISFKNSIKLLYPKNILLFIFVILIIPLVNTVLISGFIGKIQIPEYILDYIKSDIILNIIYMIFLLIIYISVIRWIFSIHEITLNTENFKRARKESVNLIKRKIIRTIIYSLILSLVVAIIGYAIYHSGIIFIGIWTKYCTDMEFLKNVFINRCIAFEEYFRLILSIFIFILDIGFISATYYQYKGVNISKNNIKKEKKSISKIVFNLVLILLISYIESVAFSSHINGMFNTSFSFYTTAIAHRAGAEMAPENTLAAIEEASNAKADYAEIDVQETKDGELIVLHDSNFKRTTGVDKNVWDVNYNEVKTYDAGSFYYYGKGYYDEKFVGEKIPTLKEMIKYSKGKVKLLIEIKLNGHEKGDIVKKVVQLIKENNFENQCIVASMDKTILQKVKKLDENLLTCYFMAIAYGDFSKLNYVDIYGIESTFVNKTVVEKIHKMNKKIFVWTVNSDSLIEKMLDLNVDSIITDNPYLIESAIYWKKNGFISQVSDYLF >CP012320.1|AXU57146.1|1864135_1864720_+|sugar-O-acetyltransferase MTEREKMLAGELYDCGDIELLTQWHKAKDLVRDYNQTDSSDLEKKEKILNELLGGKDKNLWITAPYYVDYGNNIYFGNNCEVNMNCTFLDDNKIIIGDNALIAPNVQIYTAFHPTNAGDRFGNVKEDGSFEFCKTQTAPVTIGDNVWIGGGAIIMPGVTIGDNVVIGAGSIVTKDIPSNMIAYGNPCRIIRENK >CP012320.1|AXU57147.1|1865820_1865997_-|hypothetical-protein MFIGEIDKCTHILTAYISSSYDYCNFLDTQLDDFISEYGETVVETCLHQVLLLVSRYN >CP012320.1|AXU57148.1|1866571_1867594_+|ABC-type-transport-system-involved-in-multi-copper-enzyme-maturation,-permease-component MVNWEIKKLAKSKSMFISLGILVLILMISIFITPVLETERYYIDKEKGCIEDTRSGIDIGNEKFQNKINVLKQFSNQTDTGEFSKKIELMSKKKLDNLSVNEYKDISFWKVFNYRVTNSLINVGMLIIISIIISNIYVDEVVTSVKDIILSSKEKKKALKSKIFVALLVPLVIYSVYLMGIFIITCMQQGVPVNGDLESFRIVDNVVALKTNLSITKYVILNIGIELLMFEGWAMIAIFGSFISKSSISSISFFIFIISITKIMSVIHILPKKLLSVVSNVNYYDLIFGFNKIIGNYLGDIMIFKVNIDIVNIAIGLLMAILIGAMSLCFLVIKSDYISR >CP012320.1|AXU57149.1|1867607_1868495_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNKLEIENLSKIYGKKVANDKITVTLENGVYGLLGPNGAGKSTLMKQITTLIKPDEGQILYNGEDIFKMDANYRNILGYLPQEFGVYKNFTAKEFLQYIGALKGLRGKYLNSKIGELLDLVGLYDVRNKSIGKFSGGMKRRVGIAQVLLNDPKIIVFDEPTAGIDPQERARFRNLIAKMSRDKIIILSTHIISDIESVAKETIMIKDGKLLMKGTHKDILSHMENKVYNVQVKNECEVDDIQSKYKVVSIQSDIDSVVLRIVSEDIPSGDNIQPVQAKFEDVYMFYFDLEDAREV >CP012320.1|AXU57150.1|1868500_1869274_+|ABC-transporter-permease MMYLVKAEMIKILKSKSVWIIWLFLIFLGFLLIRKFDVLDTYADIFYKIEGSIPLIGLIMFIITSGNYIKEYDSNMTGLINTTKKGKKSVVLSKLVANGLILSIINISFILLVGIRGFSFFDFKNLNEPIHNLWYFGNSNLNLTVIQMYIIVILTTIFASFIFAQIGLTLSSIFKSAVIPFILGGLIMAIPYFSVGFIPDKAIKFMSVTPNWIMMSQQMVRYNVPSILIVFSIVISIILMIVLTKITYENFTSSKRF |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012320_10 | 2208041-2208724 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP012320_10
|
10 spacers
spacers of CP012320_10
>10.1|2208069|31|CP012320|CRT TGACTCAATCTTTATTTAATAAGAAAAAACA >10.2|2208128|39|CP012320|CRT TAATGAAGTGGGTGTATGAAAGAGAAAACACAATTTTAA >10.3|2208195|37|CP012320|CRT AGTTGTTTTTATTTTTTCTAAAGAGAAAAAACTAGAC >10.4|2208260|38|CP012320|CRT TTTCTGTATATTTTAGTTGTGTTTTAATATTATAACAC >10.5|2208326|39|CP012320|CRT ATGGCAGTAACTAAGAAGAAAACTATACCTTTTTTATTC >10.6|2208393|38|CP012320|CRT GAGGAAATTTTATACTAATGACTGATGCTAGATTTAAC >10.7|2208459|39|CP012320|CRT TATTATAAGGAGCATTATACGACCAAAAGCCAAAGCAGC >10.8|2208526|38|CP012320|CRT AAGCAACAGCAAGAGTCGCGACAACATTAAAAACTTCC >10.9|2208592|40|CP012320|CRT CTTTATTTTTTTCTCTATATCGAGTTCGCCAAATTCACTC >10.10|2208660|37|CP012320|CRT AGTCCAGCGTTGTGTGGTCGTAACACACCAATCCTAC >10.11|2208128|38|CP012320|CRISPRCasFinder TAATGAAGTGGGTGTATGAAAGAGAAAACACAATTTTA >10.12|2208195|36|CP012320|CRISPRCasFinder AGTTGTTTTTATTTTTTCTAAAGAGAAAAAACTAGA >10.13|2208260|37|CP012320|CRISPRCasFinder TTTCTGTATATTTTAGTTGTGTTTTAATATTATAACA >10.14|2208326|38|CP012320|CRISPRCasFinder ATGGCAGTAACTAAGAAGAAAACTATACCTTTTTTATT >10.15|2208393|37|CP012320|CRISPRCasFinder GAGGAAATTTTATACTAATGACTGATGCTAGATTTAA >10.16|2208459|38|CP012320|CRISPRCasFinder TATTATAAGGAGCATTATACGACCAAAAGCCAAAGCAG >10.17|2208526|37|CP012320|CRISPRCasFinder AAGCAACAGCAAGAGTCGCGACAACATTAAAAACTTC >10.18|2208592|39|CP012320|CRISPRCasFinder CTTTATTTTTTTCTCTATATCGAGTTCGCCAAATTCACT >10.19|2208660|36|CP012320|CRISPRCasFinder AGTCCAGCGTTGTGTGGTCGTAACACACCAATCCTA >10.20|2208196|36|CP012320|PILER-CR AGTTGTTTTTATTTTTTCTAAAGAGAAAAAACTAGA >10.21|2208261|37|CP012320|PILER-CR TTTCTGTATATTTTAGTTGTGTTTTAATATTATAACA >10.22|2208327|38|CP012320|PILER-CR ATGGCAGTAACTAAGAAGAAAACTATACCTTTTTTATT >10.23|2208394|37|CP012320|PILER-CR GAGGAAATTTTATACTAATGACTGATGCTAGATTTAA >10.24|2208460|38|CP012320|PILER-CR TATTATAAGGAGCATTATACGACCAAAAGCCAAAGCAG >10.25|2208527|37|CP012320|PILER-CR AAGCAACAGCAAGAGTCGCGACAACATTAAAAACTTC >10.26|2208593|39|CP012320|PILER-CR CTTTATTTTTTTCTCTATATCGAGTTCGCCAAATTCACT >10.27|2208661|36|CP012320|PILER-CR AGTCCAGCGTTGTGTGGTCGTAACACACCAATCCTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012320_10
The CRISPR arrays of CP012320_10 >merge|CP012320|10|2208041-2208724|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR TTTAGAATATGTATTATTAAATATAAAGTGACTCAATCTTTATTTAATAAGAAAAAACATTTATATTACATATAATTAATATAAAACTAATGAAGTGGGTGTATGAAAGAGAAAACACAATTTTAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACAGTTGTTTTTATTTTTTCTAAAGAGAAAAAACTAGACTTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTTTCTGTATATTTTAGTTGTGTTTTAATATTATAACACTTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACATGGCAGTAACTAAGAAGAAAACTATACCTTTTTTATTCTTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACGAGGAAATTTTATACTAATGACTGATGCTAGATTTAACTTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTATTATAAGGAGCATTATACGACCAAAAGCCAAAGCAGCTTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACAAGCAACAGCAAGAGTCGCGACAACATTAAAAACTTCCTTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACCTTTATTTTTTTCTCTATATCGAGTTCGCCAAATTCACTCTTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACAGTCCAGCGTTGTGTGGTCGTAACACACCAATCCTACTTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC >CP012320|10|6|2208041-2208724|CRT TTTAGAATATGTATTATTAAATATAAAG TGACTCAATCTTTATTTAATAAGAAAAAACA TTTATATTACATATAATTAATATAAAAC TAATGAAGTGGGTGTATGAAAGAGAAAACACAATTTTAA TTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AGTTGTTTTTATTTTTTCTAAAGAGAAAAAACTAGAC TTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTTCTGTATATTTTAGTTGTGTTTTAATATTATAACAC TTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC ATGGCAGTAACTAAGAAGAAAACTATACCTTTTTTATTC TTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GAGGAAATTTTATACTAATGACTGATGCTAGATTTAAC TTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TATTATAAGGAGCATTATACGACCAAAAGCCAAAGCAGC TTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AAGCAACAGCAAGAGTCGCGACAACATTAAAAACTTCC TTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CTTTATTTTTTTCTCTATATCGAGTTCGCCAAATTCACTC TTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AGTCCAGCGTTGTGTGGTCGTAACACACCAATCCTAC TTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC >CP012320|10|10|2208099-2208724|CRISPRCasFinder ATTTATATTACATATAATTAATATAAAAC TAATGAAGTGGGTGTATGAAAGAGAAAACACAATTTTA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AGTTGTTTTTATTTTTTCTAAAGAGAAAAAACTAGA CTTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTTCTGTATATTTTAGTTGTGTTTTAATATTATAACA CTTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC ATGGCAGTAACTAAGAAGAAAACTATACCTTTTTTATT CTTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GAGGAAATTTTATACTAATGACTGATGCTAGATTTAA CTTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TATTATAAGGAGCATTATACGACCAAAAGCCAAAGCAG CTTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AAGCAACAGCAAGAGTCGCGACAACATTAAAAACTTC CTTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CTTTATTTTTTTCTCTATATCGAGTTCGCCAAATTCACT CTTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AGTCCAGCGTTGTGTGGTCGTAACACACCAATCCTA CTTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC >CP012320|10|6|2208167-2208724|PILER-CR TTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACA GTTGTTTTTATTTTTTCTAAAGAGAAAAAACTAGAC TTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACT TTCTGTATATTTTAGTTGTGTTTTAATATTATAACAC TTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACA TGGCAGTAACTAAGAAGAAAACTATACCTTTTTTATTC TTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACG AGGAAATTTTATACTAATGACTGATGCTAGATTTAAC TTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACT ATTATAAGGAGCATTATACGACCAAAAGCCAAAGCAGC TTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACA AGCAACAGCAAGAGTCGCGACAACATTAAAAACTTCC TTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACC TTTATTTTTTTCTCTATATCGAGTTCGCCAAATTCACTC TTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACA GTCCAGCGTTGTGTGGTCGTAACACACCAATCCTAC TTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC
>CP012320.1|AXU57476.1|2207645_2207930_-|hypothetical-protein MLVYNKSFYPNDIFPRLDFSKIKKQLKLIDNDLSDFGRICIIEKEHYTISVNSIGEINVYYDLEYENKVYRIVYEIEKLFKSQVGRFSISTYRN >CP012320.1|AXU57475.1|2206660_2206876_+|transcriptional-regulator MAIVVNLDVMMAKRKISLKDLAEKIDITNANLSILKTGKAKAIRFTTLNEICKALDCQPGDILEYVEDEND >CP012320.1|AXU57474.1|2206182_2206650_+|hypothetical-protein MITKFFSNILSVFLYFLLSLLGVAGIIFLCMIPMFLYDFSSDKVIALIARILYFSDYFIVILFLIFIINSTKYSPFILENVKRFKVMGCCLLINTIIECVIGYNSNTSLIMIFGDNSGGISPLMVISFIFALMCFVIAETFDKAIKIKEDNDLTI >CP012320.1|AXU57473.1|2204462_2205161_+|hydrolase MEKKYFEIHGVPSILWGNPSSKLYIYIHGQCGNKEEAEAFANIAVPHEYQVLSVDLPEHGERKREKNSFNPWHVVPELVSIMEYAKCHWNQISLYANSIGAWFSMLSFEKENLRECIFVSPILDMQQLISNMMLWANVSEEQLKHELIIPTSFGHTLSWEYLQYVKQHPITQWNVPTKILYGKHDELTEIGVVEKFVEKFNCNLTILENGKHWFNTPQELNSLYEWLNTLVK >CP012320.1|AXU57472.1|2203647_2204205_-|transcriptional-regulator MRVSREIVIQATSDIVNKDGLNKVSLKVIAEKLGIRTPSLYNHIESLDDLLLEVAHKGMREMNSQMIKATIGNFGDTAIKCISIAYFNFIISNPGVYETIQWATWHGNNETLEIFDEYKSLLEKLILSCNLNTKNTGEVLNLIMSVLHGYSTLQLGKSLLSKEEAIKGLADSIDTVLLGIHKKYD >CP012320.1|AXU57471.1|2202805_2203279_+|N-acetyltransferase-GCN5 MFKEYLIRELKEDDIKNALDLIWNVFEEFESPDYCDEGITTFHQFIEYNSIIEKIKEKTLFFWGCFDSKKLIGVLAIRNLNHICMLFVDKNYHKHGVAKKLMTTGIQYCICNKFNLTEITVNSSPYAVEVYHKLGFEDIAVEQIVDGIRFTPMKLLI >CP012320.1|AXU57470.1|2201738_2202503_-|GCN5-related-N-acetyltransferase MQIIDININNIDSRHICCSISEKKGENCVFSKKAWMKNNFDKGLAFKRFDVRGKAFIEYIPAENAWCPITADNYIFINCFWISGKFKGQGYSNLLLQECVDDAKSKGKYGLVVLSSSKKMPFLSDAKYLKYKGFCLADTSEPNYELLYFPFTDNAPIPCFKNCVKKRKLNENGIVLYYSNQCPHTEKYAPILKKIANSRGIDVNLIKFETAKEAQNAPAPFTTYSLFFNGEFVTNEILSEKKIEKFLDTNIKKI >CP012320.1|AXU57469.1|2200014_2201049_-|N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate-reductase MNKIKVGIIGATGYVGAELIRLLMNHDKVEVTAIGSNSYVGKNIVDIYPSIGYKNNMICIENEKVIDMCDVVFTALPHGVSEKFVIKAIKSKKKVIDLGADFRIKDEEVYSKWYGVSFIDKILHKKAVYGLSEIYKEDIKDADIIANPGCYPTSISLPLMPLLSSKLIKNNNIIIDSKSGLTGAGRELSISSHFTEVNENITAYKIGKHRHTPEIEQNLSESCKEKVSVVFTPNLIPVNRGILSTIYCTKEDNISINDIHRKLTDYYEFKEFIEVLPLDKVASLKNVRFSNKCVISLHENGDTLIICSAIDNMIKGAAGQAIQNMNIIFGIEENTGLKNIAPSF >CP012320.1|AXU57468.1|2198755_2199973_-|arginine-biosynthesis-bifunctional-protein-ArgJ MEIIKGGVTVSEGFFASGIHCGLRKNKEKRDLALVYSDVLCDAAAVVTQNKVKGNPVYVTQEHIKNGKAQAIIVNSANANTFNGKEGLINAYKMAKFTSDKLNIKENDVLVASTGVIGKPLNINLIEENMDELVNNLSKQGHIGAREAIMTTDIIKKEIAVAIMYGDKKITIGGMAKGSGMIHPNMATTLGFITTDANIDGVLLKEALKIAVDKSFNRVSVDGDTSTNDMVMILANGKAKNDRINKKDEHYQVFLSALTYVCIELAKLVAKDGEGCTKLIECYINGALSEEHAVKLAKTVISSSLVKTAVFGADANWGRILCALGYAGEEIDMEKVDIIFESMKGYIEVCKNGNGLDFNEEKAKKILEDDEISILVDLNMGNARGNAWGCDLSYDYVRINGSYRN >CP012320.1|AXU57467.1|2197880_2198741_-|acetylglutamate-kinase MINIEKANTLIEALPYIEKHQGKTIVVKYGGSAMKKDGLKESVMEDLVLMSYVGINIVLVHGGGAEINKMLAKVDIESKFVNGLRYTDEETMEIVKMVLAGKVNKDLVNKIHTKGGKAVGLCGMDNNMILCDPYKNYELGFVGEIKKVNVELIESCLKSGYISVIATIGVGDDGETYNINGDTAASAIAKELNADKLILLTDVPGLLREPDEEKSLITEVILEDVDKLFEEGIITGGMIPKIEGCVDALNNGVNRVHILDGRVPHSIITELFTDSGIGTLIRKENE >CP012320.1|AXU57477.1|2209554_2210427_-|transcriptional-regulator MEETNEMKDSKHLISNIQSQYTRLSKGQKLIAQYILNNYDKVAFMTACKLGETVGVSESTVVRFANALGYSGYPKLQAALQELIKNKLTTVQRVEMAHDYSDDFAILNKVLKSDIDNIRSTLEEIDERAFKEASNKLLRARKIYILGMRSSFVVAQYLGFYLDIILDNVHIIRMDMGDAFEQIVRINEEDVIVAISFPRYSKKSYQIVNYAKEKGAHVISLTDSLFAPVASLADNTLLVKSNMASFVDSLVPALSISNALAISVGMKEKEDIKQHFDDLEQIWKRYSVYE >CP012320.1|AXU57478.1|2210820_2211399_-|rRNA-methylase MAYAKYLTKITDINKFYLENIINEGDIVIDATMGNGYDTRYLAEKVGEKGFVYAFDIQEEAIKSTRKKLEKEGYTDRVKLIFDGHEKMNQYIKEEVSCVLFNLGYLPRAKHSIITKPDTTLKAIKLSLEMLKENGVISIAIYTGHDGGQEEKDCIYNLVNNLNQDEFNVLESKFLNQVNNPPQLILIEKKKA >CP012320.1|AXU57479.1|2211456_2212173_-|23S-RNA-and-tRNA-pseudouridine-synthase MRINKYIASCGIASRRKSEEIILGGRIKVNGSVVKELSFNIDEEKDIVEFDNKKVKPSENYIYIVLNKPEGYITTVKDQFNRPSVIDILKDVRERVYPIGRLDYETSGLLILTNDGDLTYKLTHPKHEIDKTYVASVKGIISDDEIRQFETGLKIEDYTTAPAKIRVTKENKEKNYSVCEITIHEGRNRQVRKMCKAINHPVLNLRRISVGKIVLKDTKVGEYRYLTEDEIKYLKSIK >CP012320.1|AXU57480.1|2212363_2213449_+|permease MIIILKENIKYYLIVVFIGILFFKFINTPSNFISSIEGFLKFFSPFLLAILLALLLNPLVMLFEVKFKAHRLLAIFLSYIFIGFILAFAIRLLIPSIANTLNRLINEMPMYTDYIDSFIEKNMSNIDFLKTLIPHIQHSLDNLLKEASNFVGKIPKNFLIYTLSISSMLFNMTMGFILSIYIIYDKEKIALGFKRFLYSSTARNKADNIIEFFRTTHDIFYDYLLGRILDSLIIGIIAFLGFQFVIRIENALFLASIIFLGNIIPYFGPFIGAIPPIAMTILYSPQKTIWVIAFLFILQQLDGNFIEPKVMGNQVGIGAIWVISAILVGQSLFGFIGVFLSVPIAAVVKTYVDKYIDNRLQ >CP012320.1|AXU57481.1|2213603_2214263_-|lipoprotein MRGRVILLISILSIFLVGCSFNKKDEINLVEQGKTYLEKHNYKKAMESLSSALEEDSTNENARAMYMQAMRMSNMTEFEELKNYEGAIKELKLIEKIKNGSSVIKEEATKKKEELTKLEKEQNEAEEQRKKKAKDTAGEDRYRVESDARKSSYSGSSKNNKYSSKNNDKKSDSNKSDNNNSSSQNQEKPNNSNPTPAPTPQDTTGGSDSGGNSQNSNNQ >CP012320.1|AXU57482.1|2214479_2215772_-|diaminopimelate-decarboxylase MKLHGTMTVNNDELYIGGVSCLELSKKYQTPLYVFDEALVRQNCREYIEYFKAREGKNKVAYAGKAFLPLYMCNLINEEQMCLDVVSGGELYTAYKSNFPMEKVFFHGNNKTKEEINMGLDLGVGKFVVDNFYELDLLEALCEDKGKTQEIYFRITPGIEAHTHDYIKTGQIDSKFGFALVNGDLFRAIEKLSEYKNIKLVGLHAHIGSQIFDVEPYIDTVDIMMNLVKEIKEKFNIQLTEIDLGGGVGVYYSEGDKPKTIKEFCETIITKAETSCKELGIEVPTLVIEPGRSIVANAGSTLYTVGSIKDIKDVRVYVSVDGGMTDNVRPSLYQASYECSIVNKINHEAMNHVTIAGKCCESGDILIGDINIMDIKSGDILITTSTGAYGYSMSSNYNKIPRAAVVSVFDGNDKIICKRQSYEDLLALEI >CP012320.1|AXU57483.1|2215789_2216983_-|aspartokinase MSIIVQKYGGSSVADTEKIKSIAENIIERRKENPQMVIVVSAMGKSTDEYITLAKELSNEPSKRELDALMSTGEMISASLLSIALNALGCKAISYNAYQLNIKTSGLHGKSQIDDINVNRIKNSLDEGNVVIVTGFQGINEDGDVTTLGRGGSDTSAVALAVKLNGKCEIYTDVDGIYFTDPRKYSKASKLDEIEYEEMLELASLGAQVMHSRSIELAQKYGVEIYVGRTCGTEKGTYIRGGKDMKLEDKVITGLATSDDDSSITIKDFKAENISSLFEDIATIGISVDMISQTAPILDKISVSFTVPKEELGECKKIVSKYTDEEHVVIDNNITKFSLVGLGMKNTSGVAAKVFKIFNENGIMIKLITTSEIRITCAINSDDKQVAIEKIAEVFNI >CP012320.1|AXU57484.1|2217343_2217961_-|hypothetical-protein MTNMEKEILLLISRVRCVTESQFRKIYGDQKRYNKKNFKKTLRKMCSEYTLKKYPCDVDYYNYKDLSYVYYLNGSKLFKGDDLIKALVGSELVVRINTAGCDVKRFYRNVSVDDVKYDLFIEYTDQFGNIKQVLVDVDLNNEIDISKYENLSKKIDKSTIPFFKVPNVLVVTPDNLSELNDLERYDNEYSINFIDLGLNKLFNCI >CP012320.1|AXU57485.1|2218130_2219831_-|hypothetical-protein MKRYLKTYGVALIIVIIYAFIKLPVLRLDFTSLFSVGIIFFVVAGILDMMLDRNERASKMAKYNFSIAIALLVYIVVVPFITSTPVLHAKSYRELLGKVTESKFTDDISPVSVNDIRLVDEDMAMKLGDKKLGEVPAIGSVSKLGKFHIQNVDGELYWVAPLVHRDIIKWITSLSGTSGYVKVSASNPQDVQLVQEIDGKPIKIVYQPEAYLHQDLQRHLYIHGIVNVGMTDFTLEINDEGRPYWVVSLYEHKIGYGGANATGIATVDAETGKINVYDVKNTPKWVDRIQPQSFVTDQIKDWGVYVNGFLNSVISEKGVLVPTEGTSLVYGNDNRSYWYTGITSSGGDESTIGFMLVDSRTKEARLYKQPGATETAAMKSAEGNVQEKNYEATFPVMYNILGQPTYVSSLKDKAGLVKRVAFVSVEDYNVLGIGEDKNEALRNYKDALESKGNDLKLDNDLKDEVLEGTVTRISPDVRGGNTNYYVTLDSNKDIIFRATSKVSSELPLTQVGDKVKISYSKEESGVIEMSEFDNLNIANFEDKKAKEKTGTDENTDSKDSENQGNV >CP012320.1|AXU57486.1|2220227_2220791_-|hypothetical-protein MNKVYIVTTYTGTILSYLIRNISKKLYTHVSISLNENLKPMYSFGRLNPRNPFIGGFVEENINQGLYAIRKNTVCRVYSLEVDNLQYENLYKNIKLISDYREDYYYDTMALIYLLMNIQRQSEYKYVCSNFVADMLEKSEIDILNKQAFEVTPNDFYNLSGLTLEYEGLLSEYNSRQHSYVSKIANI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012320_11 | 2508440-2509391 | TypeV-U4 |
I-A
Consensus repeat of CP012320_11
|
14 spacers
spacers of CP012320_11
>11.1|2508469|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT ACAATTATTAATTGTTTTATTAGTGAAATCACAGCA >11.2|2508534|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATATAAAATGGGATTAGTAAAAAACACAACAGGAAC >11.3|2508599|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTCTTCGTCTTTAGATGATTGTTTTATTGTTCATC >11.4|2508664|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTTTATCACCTGAGATAGTAATAGTCGCTTTGTC >11.5|2508729|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATAATGTATTGAAAAATCAAATAGGCGTGCAACTTTT >11.6|2508795|38|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTATGCTTGTTTATTATATTTATTCAATAGTCATGAGA >11.7|2508862|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCACGCATTTTAGTTCAAATTCGAAGTTTTTGGCTG >11.8|2508927|38|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTATCCTTTCATTCATTTAAAATTTATTCCTTTCAAAT >11.9|2508994|38|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACGACGTTGAGATTGCGGAGCTTCTCAACCTTGTACGC >11.10|2509061|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTCATCAGATGGATATGCAAATGGAGATATAAAGTT >11.11|2509127|38|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTATATCAGTCTTTTTAGTCGCTGTCTGAATCTCCTC >11.12|2509194|38|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACTATCTAAAAGATGATAATAGCTACATTTTGTACGTT >11.13|2509261|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGTAGATTTTGTAAGTAATGGTTTTTCGGAAAAAG >11.14|2509326|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAATAAGCTATGAAGCTAAAGGAGAAATGAAAGGAG |
c2c9_V-U4 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012320_11
The CRISPR arrays of CP012320_11 >merge|CP012320|11|2508440-2509391|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTTGAATCCACATAGTTAATCTAAAACACAATTATTAATTGTTTTATTAGTGAAATCACAGCAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACATATAAAATGGGATTAGTAAAAAACACAACAGGAACATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACTTTCTTCGTCTTTAGATGATTGTTTTATTGTTCATCATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACATTTTTATCACCTGAGATAGTAATAGTCGCTTTGTCATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACATAATGTATTGAAAAATCAAATAGGCGTGCAACTTTTATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACGTATGCTTGTTTATTATATTTATTCAATAGTCATGAGAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACCCACGCATTTTAGTTCAAATTCGAAGTTTTTGGCTGATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACCTATCCTTTCATTCATTTAAAATTTATTCCTTTCAAATATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACACGACGTTGAGATTGCGGAGCTTCTCAACCTTGTACGCATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACGTTCATCAGATGGATATGCAAATGGAGATATAAAGTTATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACTTTATATCAGTCTTTTTAGTCGCTGTCTGAATCTCCTCATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACACTATCTAAAAGATGATAATAGCTACATTTTGTACGTTATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACTTGTAGATTTTGTAAGTAATGGTTTTTCGGAAAAAGATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACAAAATAAGCTATGAAGCTAAAGGAGAAATGAAAGGAGATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >CP012320|11|11|2508440-2509391|CRISPRCasFinder ATTTTGAATCCACATAGTTAATCTAAAAC ACAATTATTAATTGTTTTATTAGTGAAATCACAGCA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ATATAAAATGGGATTAGTAAAAAACACAACAGGAAC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTTCTTCGTCTTTAGATGATTGTTTTATTGTTCATC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ATTTTTATCACCTGAGATAGTAATAGTCGCTTTGTC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ATAATGTATTGAAAAATCAAATAGGCGTGCAACTTTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GTATGCTTGTTTATTATATTTATTCAATAGTCATGAGA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CCACGCATTTTAGTTCAAATTCGAAGTTTTTGGCTG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CTATCCTTTCATTCATTTAAAATTTATTCCTTTCAAAT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ACGACGTTGAGATTGCGGAGCTTCTCAACCTTGTACGC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GTTCATCAGATGGATATGCAAATGGAGATATAAAGTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTTATATCAGTCTTTTTAGTCGCTGTCTGAATCTCCTC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ACTATCTAAAAGATGATAATAGCTACATTTTGTACGTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTGTAGATTTTGTAAGTAATGGTTTTTCGGAAAAAG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AAAATAAGCTATGAAGCTAAAGGAGAAATGAAAGGAG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >CP012320|11|7|2508440-2509391|CRT ATTTTGAATCCACATAGTTAATCTAAAAC ACAATTATTAATTGTTTTATTAGTGAAATCACAGCA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ATATAAAATGGGATTAGTAAAAAACACAACAGGAAC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTTCTTCGTCTTTAGATGATTGTTTTATTGTTCATC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ATTTTTATCACCTGAGATAGTAATAGTCGCTTTGTC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ATAATGTATTGAAAAATCAAATAGGCGTGCAACTTTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GTATGCTTGTTTATTATATTTATTCAATAGTCATGAGA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CCACGCATTTTAGTTCAAATTCGAAGTTTTTGGCTG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CTATCCTTTCATTCATTTAAAATTTATTCCTTTCAAAT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ACGACGTTGAGATTGCGGAGCTTCTCAACCTTGTACGC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GTTCATCAGATGGATATGCAAATGGAGATATAAAGTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTTATATCAGTCTTTTTAGTCGCTGTCTGAATCTCCTC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ACTATCTAAAAGATGATAATAGCTACATTTTGTACGTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTGTAGATTTTGTAAGTAATGGTTTTTCGGAAAAAG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AAAATAAGCTATGAAGCTAAAGGAGAAATGAAAGGAG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >CP012320|11|7|2508505-2509391|PILER-CR ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ATATAAAATGGGATTAGTAAAAAACACAACAGGAAC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTTCTTCGTCTTTAGATGATTGTTTTATTGTTCATC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ATTTTTATCACCTGAGATAGTAATAGTCGCTTTGTC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ATAATGTATTGAAAAATCAAATAGGCGTGCAACTTTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GTATGCTTGTTTATTATATTTATTCAATAGTCATGAGA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CCACGCATTTTAGTTCAAATTCGAAGTTTTTGGCTG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CTATCCTTTCATTCATTTAAAATTTATTCCTTTCAAAT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ACGACGTTGAGATTGCGGAGCTTCTCAACCTTGTACGC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GTTCATCAGATGGATATGCAAATGGAGATATAAAGTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTTATATCAGTCTTTTTAGTCGCTGTCTGAATCTCCTC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ACTATCTAAAAGATGATAATAGCTACATTTTGTACGTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTGTAGATTTTGTAAGTAATGGTTTTTCGGAAAAAG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AAAATAAGCTATGAAGCTAAAGGAGAAATGAAAGGAG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC
>CP012320.1|AXU57730.1|2508096_2508249_-|hypothetical-protein MKNCRKDKRGFSVLLDKEKLDKFDEVLEEKNLTKKEWLEEKIDEELEQKE >CP012320.1|AXU57729.1|2507611_2507977_-|phage-related-regulatory-protein MKNELMMFEGKEIEVFEFEGRILFNSKDVANCLDIKNVNENIILMNEKQVVKLRNSDISNTDIRKLNNAGENFLTESGVYKLIFKSRKEEAERFQDWISDEVLPSIRQTGAYITNNVIPKS >CP012320.1|AXU57728.1|2507163_2507559_-|prophage-antirepressor-related-protein MLKELLDDAGFDNKSKLLTAKTLYKKAEIDLPIEINEEEHYFDTKQIASKLKIYSKSNKPAQMAVCEIIKKIDLEDGEVKGVWEINGSWTGTVNKYTKSVIDKVRTWIEENNRPTKIAGEKKNYYVFYKIE >CP012320.1|AXU57727.1|2506950_2507112_-|hypothetical-protein MCENLLDNMYIEKRKEEYRIKLLKIRETDIDIYNKLESIVYKLSEKKLEKNNK >CP012320.1|AXU57726.1|2506158_2506623_+|hypothetical-protein MDFGEVKSELSDKDLKDNEEALNKYKKYYLKVYKYYSEMDSIKSIQDIEIEQSRLKGQLQKNSNPIFALYISIMAVVFSTTINLTFDLSDITNYFIRMIMTLLFIVLLIFLVNKGILPIAIPYRNNIQFYTTALDVLEDMKNKILRERKYKKRR >CP012320.1|AXU57725.1|2505705_2506023_+|hypothetical-protein MDFGNINLILIGIIVIIGTTIIYLIKPKTAFCSKKYFNKLESIYGNIDKKKTVKLEVLYRYVTGLEYIAIGLFTRRLDITIIAIILVAIITTALYYLIRKKYITI >CP012320.1|AXU57724.1|2505126_2505423_+|hypothetical-protein MYFKTYILKREVNNKQLEITRSFDLDNLICTATEILKDNEIDLIITDEVNNVVWRNEKSTPPARECLVIAIEVYWWYTSIFLLYHINYVIKKNYLNRF >CP012320.1|AXU57723.1|2504694_2505108_+|hypothetical-protein MKVKSKRSFIVGIIVCVLCCASLVIYCILKDKRFLISSFLLIVIAIFNFCNAFSRKGIVEELHDSTDERDLYLTMKTSHILVKIMNYTLFTFTFLFIIAYSAWKNQSLLVIAITLCVIEIFLFVAYLLINIFLEKKE >CP012320.1|AXU57722.1|2504477_2504711_+|transcriptional-regulator MKTKVREFRTNMGLTQQQLADLVHVSNRTIISIEKEQYSPSLMLAYRMAQVFGTTIEELCCLKENKEMEDKKHESKE >CP012320.1|AXU57721.1|2503884_2504259_-|regulatory-protein MKISKLPEAELKVMRYICEANKVLTSRELVAAMEEKYEWNESTTFTVLKRLERREFLSTEKIGKLTHYNILVKEKKYLRFETKEFLKNIHKNSISSLMSALHGEDDEVDEDKLSELEECFKNLK >CP012320.1|AXU57731.1|2509657_2510581_-|hypothetical-protein MVGAFVLPNYAITLSEMSNLWGNFTMWILVPIITIVLLIIAVSSMQYILVMIAFLLIIYSFIEKKIVMALVSVLFFTYSIYLCATWKDKSLIADNKVETVKAQRETVEREKEMERRRIQEEVDKERYIEKHGMEISENDLKVKLEALVPQEYKGKKYELKVEKFKRYSMYFDLTVQNEKFSNSEECKKFVKEIANDLKKIKISKAYFKFHSKDDGGIYNSVYIDYFRNIQNNVDNVENLEFNEFELKTEEEEKREQEKIEQEKNSYNNYIQNRVVDPLDRIKKLKELLDSGAITQEEYNKKKKELLE >CP012320.1|AXU57732.1|2510774_2510927_-|hypothetical-protein MDNFLFNVLASVTASYIVYLISKLIKKVKSHSTAKSDLKIDINFKYHRKK >CP012320.1|AXU57733.1|2511200_2511533_-|hypothetical-protein MNDMARDVFSVKMTPLEAQKMVEKNLEADLVSVDIYNLENNKSIIVTIFEKYYARSNSDAGLVVICENTTGKTLVKITSTGSAIGLFQIDWGTGNNLIKRVKKILIDYII >CP012320.1|AXU57734.1|2511559_2511814_-|hypothetical-protein MENKDIKLTICIFAFVIGIIVLFCCIGLGQFNMDCIIKQNGGSIATEQYNIYLEQSISQYRNFGSILVLLGGIGILFDKSVRKY >CP012320.1|AXU57735.1|2512249_2512543_-|transposase-like-protein-B MIRNRKLSRSISDVSWSEFIRQLEYKANWHGRQIVKVGKFFASSQICNKCGYKNEEVKDLNIREWIYPSCNETHDRDINASINILKEGLRLITIQNK >CP012320.1|AXU57736.1|2513241_2513433_-|repressor MKISKLPEAELKVMRYIWESEKVLISREITKSMEQKYEWKDTTIFTVLKRLLKKRVFRNGENR >CP012320.1|AXU57737.1|2513537_2513915_-|regulatory-protein MKEEILIEKLLRVELIVMEYLWKKDTLMPKKEIVKEIKQIYGWHKSTIKILLKRLVDKRYLARYIINFQSYYKIIIDNKEYYTFKKKVLKSSKSIKIMHSLTTIHKNVSKEKLDLLDEYYRNLKE >CP012320.1|AXU57738.1|2514718_2515213_+|pilin-protein MKNKKGFTLVELLVVIAIIGILAIVALPALFKNIEKAKIAKLEADISAIKSASLSYYADESKYTDGGMISWVKKDGKIIINGGFKDDPLADKIENLGMPYNGSYLLMSSPGHEKYLELSILPEGEISKSGLDKLKSDYGSSIDIKNDQNKIDIVIKLLNDKSNT >CP012320.1|AXU57739.1|2516204_2516438_-|transposase-IS3/IS911-family-protein MTKYDFNFKLKVAKFYLNREGRDILIVKQYGVYNHSQVERWVNILGECALKIKKIFYTIWFKLDVINYMMITKYSVQ >CP012320.1|AXU57740.1|2516599_2516950_+|hypothetical-protein MIQKKFFMGFCGFLGFLSLRYFSSGNVADLTYIGFFAFFSNFIIAKINGDKADERYVQDEKAAMAFTGQLAIIELFILWCITIVSRNVELMCVLLSITYAITLNVYAIKLYILEEK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012320_12 | 2676019-2676176 | Unclear |
NA
Consensus repeat of CP012320_12
|
2 spacers
spacers of CP012320_12
>12.1|2676047|38|CP012320|PILER-CR AATAATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATT >12.2|2676113|38|CP012320|PILER-CR ACAAAATCTCCAACTTATAATTATTTTCGCGATGTACC |
cas3,cas5,cas7,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012320_12
The CRISPR arrays of CP012320_12 >merge|CP012320|12|2676019-2676176|PILER-CR AAATCCGATTAGTTAATTTTAAACCTAATAATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATTTGAAATCCACTTAGTTAATCTTAAACATACAAAATCTCCAACTTATAATTATTTTCGCGATGTACCTGAAACCCACTTAGTTAATCTTAAACCT >CP012320|12|8|2676019-2676176|PILER-CR AAATCCGATTAGTTAATTTTAAACCTAA TAATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATTTG AAATCCACTTAGTTAATCTTAAACATAC AAAATCTCCAACTTATAATTATTTTCGCGATGTACCTG AAACCCACTTAGTTAATCTTAAACCT
>CP012320.1|AXU57892.1|2674929_2675877_-|50S-ribosomal-protein-L11-methyltransferase MNNWIEVTIKTTTEAVEPITNILYEQGAGGAVIEDPKDFLFQKKNELDWDYVEEEVFKKNEEDDVLIKTYVSEEKNVMEFVEIIKQKVLGLKDFGIDIGEGSVSLDQVNEADWANAWKAYYKPTKVGQRVVVKPTWEDYAMQDGDLIIELDPGMAFGTGTHETTSMCIRELEKYVNKDSKVFDIGCGSGILAIAAAKLGAKEVVAVDLDEVAVKVAKENVLENKVEKSVSVMHGNLTDVIKDKADVIVANIIADIIKILAKDVQNFMKEDAIFISSGIILDKVEEVKESLIENGFEIVEVQKLGEWSAIVSKLKK >CP012320.1|AXU57891.1|2674152_2674911_-|16S-ribosomal-RNA-methyltransferase-RsmE MDRFFVEKNNINLQDKTCTIEGEDVKHISKVLRCKLGEKLEICDKNNNEYICEIMNIDKSIVNLEILEKVDINRESELKVRLYQGLPKAPKMEMILQKLTEVGVEEIILVQTKRSVVKVDDKKEDKKFERWERIIYEAAKQSKRGKIPKLRGVLSFKEALEDMKKNNVNICPYENERTVSIKHALKKCDSNIDSVGIFIGPEGGFSEEEIEQIQKNNCNVVSLGPRILRTETASVVASTIALYELSDLGGEK >CP012320.1|AXU57890.1|2672852_2674151_-|radical-SAM-superfamily-protein MKKVAFYTLGCKVNQYETEAMLELFEKDGYEQVNSEEYADVYVINTCTVTHMSDRKSRQYIRRVKKKNPDAIIAVVGCYSQVSPEEILDIEEVNLVMGTNDRRKIVEEIKKINSSKKVSTVDDIMKVKAFEEIEISQTNGKTRAFMKIQDGCDRFCTYCIIPYARGRVRSRDIDSIVDEVKKLANNGYKEVVLTGIHVASYGKDLKDRDIKLLDVIKQINQIEKIERIRLSSVEPILFTDEFVNEVLKMDKVCPHYHLSLQSGCDETLKRMNRRYTTLEYKTIVDRLRSKMPDVAITTDVIVGFPGETNEEFKKTYEFLKEIELSQMHIFKYSPRKGTPAATMENQVDPQMKHFRSEQLLNLSKVNFNKFATKFIGRELDVLFEQNIEGNKYEGLTSNYIRVVVESDKNIQGQILKVKINDVKDEYVEGILL >CP012320.1|AXU57889.1|2672459_2672810_-|histidine-triad-nucleotide-binding-protein MDCIFCKIANGEIPSTKVYEDDRVLAFNDLNPVAPYHILVVPKKHYDSLIDIPDKEMDIVSHIHVVINKIAKEKGFDQTGFRVINNCGSDGGQEVKHLHYHILAGKKLPNYEAGQN >CP012320.1|AXU57888.1|2672117_2672297_-|30S-ribosomal-protein-S21 MSEVRVRENETLDSALRRFKRQCAMSGIMSEVRKREHYDKPSVKRKKKAEAARRKNAKK >CP012320.1|AXU57887.1|2671644_2672088_-|tRNA-binding-protein MSLKQKLQEDLKSSMKNKDTVRKSVVTLIRASIKQYEVDNRVELDEDGIIDVIAKQLKQRRDALVEFEKAGREDLIKETEGEIEVLKEYLPQQLSEEELEEIVKSTISEVGATSMKDMGKIMSVIQPKVKGRADGKLINKLVKQNLQ >CP012320.1|AXU57886.1|2671036_2671534_-|sensory-protein MIISVKEIRNFLINIFIPLIIGYLSSILTMIISGTDISTYYLQLTKPSFAPPAFIFPIVWTILYILMGISSYLILRKGYNLPKVRDAIFYYGLQLVLNFIWSILFFGFGLRFTALIDIIIMILVSIIMISKFSKIDKRSGYINLIYLMWLVYAGFLNYFIWFINK >CP012320.1|AXU57885.1|2670280_2670844_-|sigma-54-modulation-protein MQIIVSGRQMKLTDGIKGYVDGKLSRLEKYLDPESEVKVTVSAKKDRQKVEVTIIPINGQIIRAEDVEDDLYAAIDIVCDKLSRQVVKYKTKVKDKVQNNKSIRFENLDFIDNSSEFDDYDYDDEEDENIVIERRKKFNVKPMSSEEAILQMELVGHNFYMFRNQDNFEINIVYKRKAGGYGLIEQD >CP012320.1|AXU57884.1|2669831_2670068_-|sporulation-protein-YqfC MLEISTDLQVNQPVITVTSNTFISIENYLSILEYEVDLIRIKTKVKTIKISGDKLSLKYITDSEIGIKGIIYNVEYVD >CP012320.1|AXU57883.1|2668475_2669819_-|stage-IV-sporulation-protein MISFIRGYYVIVVEGVGLEQFLNHLIRNGISVYNVTRIKNTKMEFHIDRQDIKEFKNVYRGSKFDIKVKQKTGVPFIIKRVYKHKGMWICALVSLFLLMSTSQFVTDVYIQSPEGIKKEALRNELYKVGVRPGVYKKSIDRKEVRDHMMSKFNDVAYLSINVKGTNIFVTVTKKAESLKSTDQSNYCNVIALKNGIIEKVIPRSGKSVIKSGDIVQKGDVLLNGANTKSIPEVWASTFYESTKKASYVDTVNKKTGEKKNIYTLSFYDKEFTMRKNIKYKDYVVENKEKKLSIGNYTFPIKIKTSTFYETKKVEVKRNKEELKKELSEKALKELEYIIPASARIIDVKHNFKVNKNMLEYLITVQTSENIAKIYPLSKSEAERFIKEESKPDEGEEEVPSNPEKRPLNDIRNEFDEDNKDNKDQNNSDENNSNQNSNNSQNNNSNNN >CP012320.1|AXU57893.1|2676317_2678726_-|ATP-dependent-helicase MKNIMQKEILAKSYNLRTNQQEQTLVEHIKDLFEVLESILELNLYSDKDVEILKICCALHDLGKINSIMQQKMEINNKISYSCSEEERKKLESDKKSLKKIARHNIFSGAFLKDILEKMNLLEEDKLYIYKSIMLHHGNYEDYMRLSTSKVQEEIYDYIEKGILEKEEFNLKDIESYINDILNVDFKFGEDVLDYDYIDKLSESMFIDSDYNNGQIDDSVLNYRKFKYILYKGMLNLIDHSASSRQKGIKFYNDFTDEEIDDMILNEIYKSQGNLEKNNIEFNTIQKRLRELSGRNVLTVAFTGSGKTAADYRKTFKRKFFLVPNKISAESFYRKNIFQNKNDLDTRSSNDYIGLLHGDINLYSENEDNGEHDFVLTLRDIDLSINFCKPCVIATVDQLLLSMFKFPGYEKIFAAVKNASITVDEVHLLEPKMFLILIYFMQFACKYLDVDFHLMTATLPKSYKEQMINKGIIFQEESNENVTDKGEIVFIESNKEEEICEGKDVKVSFIKEKEIKSIVEGALENKQKILIIKNTIDSVNRTYEFLKENLSDKYGGVDIDVLHSRFKFKDKKEKYSKILNGEGDIWISTQSVEISLDLDFNIIISDLATMDSLIQRMGRCNRNNKYEYGNFYILPSEDKIYDNKLKNTTKNILKDILKTNSIFTMGIRKTILDDYYDNSVVKNYFEENFISCDKEIKNIYGINKEIFDGLDLIFNFEPYKNIVDSKKEAAKIFRDVDVSYKIILEEDFYKEDRELQQDSIQVSGFIFNRLYYYGLISKVEGYMVLKSSSKFEYNSTVGLILK >CP012320.1|AXU57894.1|2678752_2679559_-|CRISPR-associated-protein,-Cas5t-family MKVLQCKLKQPTAHYRDPKVFQNEYISTLNLPSKTTIMGMITYLCDRRLNSDIDIGIIGTHHHRELEFSRGENIDFWNEYTNMRKGKDKEKFLLQGNYYDYYKEHKAQNSILNYEVLKEVELTIFISCKDDEELEFIKKKLESPCKYANLGRKEDFVIPSEKGCFVKEVELKEVMPMNTRDAIKENIKLKNTYVRVDLRDKENVETIINQGVLIALPYKYKDLEANRDDRVYEFCHYIYVDNDGIYPKNIKVNVCNVCIDTKEVFTWL >CP012320.1|AXU57895.1|2679574_2680588_-|CRISPR-associated-autoregulator,-Cst2-family MNEKRVKGVTLTILTESPVPLSYDQGYGNYTPIKKEQYREKIHAKTSIATITYDLRRMLHQEYGWNLSNIIFGKKGNIYPSIKQNVGCVDENGLETDVFGYLIPLKDKGSISKASPLRIIPFRSLNSYRGSTQLITNRGFLSSEFGRKYYDEKEENEVLRDENFPTSQALAIEETLSDYYVYTITLELDRIGVVEVEDGKLLLPEERKFMSKELREKAVKDILDAITVFTRNIKHSSVLLKPLAVMGGAFDKVVPFFWDDVDYNADSGEINLEGVIETIESYSLKESNTILAINDKLKISNKKELNKFNLSKYPVKEIKNLADRLEIGEDNMWYLKE >CP012320.1|AXU57896.1|2680607_2682083_-|hypothetical-protein MREIKAKFYRSGDIVRDIGIVYFYELLMDLKNELEKNDYKLKFTCELNRNYLSLESAEYIDPKYISDYILENQLFKVFKNGKKETLEKIFSNIDNLTYVNFIEELDKSSATEKQKEGIKKDFKNRRFPYVRNSGKYGLNTSLENMETNVKRIVDTVIKSNIEIDEIDKLDLTQYEEKDSVCNVCNINKTTKLDIDLRERKDSKYNFLFRGAEKSGFKRSGQVESNICFECEFFNLMCLLYINLKRPMVFAYTNDLRELAFLNHKIMLKRKMYSDKSFYKKLLHEKISSIRLYRFDIDTNKGIILKFDSIIEYKELLKKIELIDIIDNYNFSREPGNTRNLGKKMIDNGNLSNLKELLLDNISVLRQLTGTSREMDFVSSSYNIGLYIKLCWIVDGGEEYKMKNYMESNLIYSRVGKDLFNKMTDESRRKNFSMKVIQLLKSNDRTQLFQTIMHVLVSNGILIGEGFVEGLMQSSELELNTNVGLFIQEIMK >CP012320.1|AXU57897.1|2682087_2682825_-|CRISPR-associated-Cas-family-protein MSRISIFMESCNGKFPNENSMLSVSFIKNILNAENKDFAKNIFNYGEERKNNKQIKDINTAIYIPNLIRSKNELLVDGDIIFNISFYNYSMFSKLYNGILKVKELEYKGYRFKIKNIKIHKEHEIKENGVIFKTMSPIIVKNKEGKYLDVEDSNYIECLNYIANLTLESIRGSGLRKPLEFIPLNFKKRVLKEKIRGFKVREYYYINAYAGTFFLKGNMEDLNALYKMGIGYRRTENAGMVDILK >CP012320.1|AXU57898.1|2683083_2684193_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSEVILKNISKLYSNGFNAVKNINIDIKDKEFIVLVGPSGCGKSTTLRMIAGLEEISEGELYIGDKLVNDIEPKDRDIAMVFQNYALYPHLSVYENMAFALKLRKLPKDEIDKKVKEAAKILDLLPLLNKKPKTLSGGQRQRVALGRAIVRNPKVFLMDEPLSNLDAKLRTAMRTEITKLHQQLGTTFIYVTHDQVEAMTMADRIVVMKDGVVQQIATPQDVYDYPANIFVAGFIGAPQMNFIDVILIEENDKIYAQNEHIKLKLNKEKHYDLIKDNYINNEVVIGIRPEDIHVEDTFIKSNPDTCFKSRIEIKELMGAETYAHLKLGENTITIRFDSKNRINVGDDLTLSVDNSRVHIFDKETTLAIR >CP012320.1|AXU57899.1|2684222_2684990_+|sugar-diacid-utilization-regulator MEELKDFLERQLNKKINIYPYENQKLDASSHLVTFNNAIYVIDFLDKNNLDNLKGNFYLIYQSHIDFEYLKNIFYNLFEDINIIQHNGFFIVNSKYNLDINVTTQNIIETETYQSTYIFYLGELDSKADFYFRLQLCSDLLPHIIKDNAENKFLNLFDLIRYKTLDLINEDNILNKLIDFNKIKSIDEELLYTGIKFINNDLNISKTSTSMFLHRNTLVYRLEKINEILGFDLKNFENAMIFYLSVKSYFLYKKI >CP012320.1|AXU57900.1|2685177_2686551_-|transporter MGKTNARRTLFLIAIGSGTMLNPLNSSMISLALHSIQNDFHISFTTVSWIVSAFYLASAIAQPVSGKIGDLIGRKVLFLSGLMLVILSASIVPLVQSFFILIFIRVIQAIGTSTLYPSGVALIQNNIKERQSSALAVLTIFASTTAGLGPTLGGLLLDLGGWHAIFLVNIPVVLVSICLGYFLFPKEVKEKKSIKETLKNVLSRLDIIGILLFSIAMIFILLFLLSMKESFNLEQLVFGIILMCLFIWHELRTKLPFIDIKLFVSNPKLSKVYLQFIILNFFNYILFFGLPSYFQDALHYSAKSTGLFMLFMSGIGIFISPLTGKWIDKSGTRFPLVTSSIFMFISAVLLSVVFIHIPVIGKGIILSLAGISYGVGNVALQSSMFEESPRDSIGTASGLFQTSRYLGSILATVLLGMVFEGNITSEQFQILGYVMVVLGTISFLLNFILKKELRKVE >CP012320.1|AXU57901.1|2686586_2687522_-|glucokinase MYYIGVDIGGTGIQAGVVDNYGKIIFRSECKTVIEKGFEGILNDIKIMIYKLLEDNKLTMSDIKSIGFGVPGFINKEGLVTCVNLKWNKKAFNKELKRRFPDAEIHGENDATVAALGEAKFGSMKGANVGVLYTLGTGVGGGIVINQKVFSGAHGLGSEIGHQIIGENYFNCNCGNNGCVETFCSATAIIKYSQKLIEEGEKSRILDLAEGNLENVNAKMVFDAYRENDLVAIKVINRFKDYLAKTFANTINSLDPEIISIGGGISKSSDIILDGIEDLVRKFVLYKTEDIATITCATLGSDAGIIGAAFL >CP012320.1|AXU57902.1|2688487_2689642_-|chaperone-protein MSTKRDYYEVLGISKDAEAQEIKKAYRKLAMKYHPDRNPGDKEAEEKFKEINEAYEVLSDDTKRKTYDQFGHDGLNGQGGFGGQGGFGGQGFGGFEDMFGDIFGDMFGGSFGGGRARRRGPQRGADIRQSVTISFEEAAFGKKMSIKVNRSEECEECNGTGAKPGTSKKTCSTCNGTGQVRTVQRTPFGNIASSRPCSACNGTGEVIESPCSKCHGTGNTRKVKTIEVDIPAGIDDGQMIKLSGQGEVGEKGAPRGDLYIVVNVKSHPLFTRDGNDIYFEMPITFVQATLGDEIEVPTLDGKVKYSVPEGTQTGTVFRLKEKGIPRIRGNSRGDQYVKVVVEIPKKLNDKQKELLREFAKECGSNVHEKKKTFGQKIEDMFKKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012320_15 | 3287581-3289194 | Unclear |
I-A
Consensus repeat of CP012320_15
|
24 spacers
spacers of CP012320_15
>15.1|3287610|35|CP012320|CRISPRCasFinder GGATGTTTTAGTATATGCTATTGTTTATTCTACAA >15.2|3287674|36|CP012320|CRISPRCasFinder AAGTTTCTAAATACTCGTTGATATTGCTAATATTCT >15.3|3287739|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT CTGACACTGTGTCTTGTGTGAGTCTTTTCTTTATCCT >15.4|3287805|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GATTAAGCCCAGTAAAAAGACTCGAATCTCTTATCGC >15.5|3287871|38|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCAAAAAATGTTGATATTCCCAAAATTAATATTGATGA >15.6|3287938|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTATAGAAGTACATATATTGCTGAAAAACCTCTTGT >15.7|3288004|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGTTAGTGATATCAATATGCTAAGCAATATTTTTACA >15.8|3288070|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTATATTTCGTCGCACGGATTCGTGCGAAGGGTTGG >15.9|3288136|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATTTAGTTATATCCATTTGTTTAACCCAATTAGT >15.10|3288201|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTTCATTTTGCACTATATCAAGCTTAGTATACAATG >15.11|3288267|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTATATTTAATTTTAAAGATTAAAGGTATAAACAA >15.12|3288333|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TACTAGAATTATTAAATGAAATGAACAATAATATTGT >15.13|3288399|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GATTTAAATGCAACACAAATTATAACATCTAAGAAT >15.14|3288464|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGATTGAAATTTCAACACTTTCACCTTGTATATCT >15.15|3288529|38|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGGTTAAAAAGCAATATAAAAGATTGCATGGAATTACT >15.16|3288596|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGTCTCAATAACAACAGTCGAAGCAGAAAAATCCGG >15.17|3288662|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTAAAATGAGAAATAAAAGTAAACAAAAAGGTTTAGT >15.18|3288728|41|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTGAAACCCTCGGATTTAGTAACCGATTCTATGTCGAGTCT >15.19|3288798|38|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATCTAAAATATGTTCGTTAAAAGGGAGTGTGTAATTA >15.20|3288865|38|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTTCTTATACAACTCTTAACTCCAAGCCCATTTTGGA >15.21|3288932|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTATAAAAAAAGAGTTAGAAGCATTAGACAAATGGA >15.22|3288997|38|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATAATTGGGATGGTCAGGTTTCTGATAAGGTTAATAA >15.23|3289064|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGTTTTTTAGTTTTCGTGATTCAAATGGTTCTTTGTT >15.24|3289130|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AACTCATGTAACAAGTATTAAGACTTGCACCTTTAA |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012320_15
The CRISPR arrays of CP012320_15 >merge|CP012320|15|3287581-3289194|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTAGATATGATTTAGTTAATATAAGGTGGATGTTTTAGTATATGCTATTGTTTATTCTACAATTTTATATACTGCTTTATTAATATAAAATAAGTTTCTAAATACTCGTTGATATTGCTAATATTCTACTTATCTACCACTTAGTTGATATAAAACCTGACACTGTGTCTTGTGTGAGTCTTTTCTTTATCCTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGATTAAGCCCAGTAAAAAGACTCGAATCTCTTATCGCATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGCAAAAAATGTTGATATTCCCAAAATTAATATTGATGAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACATTATAGAAGTACATATATTGCTGAAAAACCTCTTGTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAGTTAGTGATATCAATATGCTAAGCAATATTTTTACAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTTATATTTCGTCGCACGGATTCGTGCGAAGGGTTGGATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTAATTTAGTTATATCCATTTGTTTAACCCAATTAGTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGTTTCATTTTGCACTATATCAAGCTTAGTATACAATGATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTTTATATTTAATTTTAAAGATTAAAGGTATAAACAAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTACTAGAATTATTAAATGAAATGAACAATAATATTGTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGATTTAAATGCAACACAAATTATAACATCTAAGAATATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAAGATTGAAATTTCAACACTTTCACCTTGTATATCTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAGGTTAAAAAGCAATATAAAAGATTGCATGGAATTACTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAAGTCTCAATAACAACAGTCGAAGCAGAAAAATCCGGATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGTAAAATGAGAAATAAAAGTAAACAAAAAGGTTTAGTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCTGAAACCCTCGGATTTAGTAACCGATTCTATGTCGAGTCTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAATCTAAAATATGTTCGTTAAAAGGGAGTGTGTAATTAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGTTTCTTATACAACTCTTAACTCCAAGCCCATTTTGGAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGTATAAAAAAAGAGTTAGAAGCATTAGACAAATGGAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTATAATTGGGATGGTCAGGTTTCTGATAAGGTTAATAAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTGTTTTTTAGTTTTCGTGATTCAAATGGTTCTTTGTTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAACTCATGTAACAAGTATTAAGACTTGCACCTTTAAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC >CP012320|15|14|3287581-3289194|CRISPRCasFinder ATTTAGATATGATTTAGTTAATATAAGGT GGATGTTTTAGTATATGCTATTGTTTATTCTACAA TTTTATATACTGCTTTATTAATATAAAAT AAGTTTCTAAATACTCGTTGATATTGCTAATATTCT ACTTATCTACCACTTAGTTGATATAAAAC CTGACACTGTGTCTTGTGTGAGTCTTTTCTTTATCCT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GATTAAGCCCAGTAAAAAGACTCGAATCTCTTATCGC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GCAAAAAATGTTGATATTCCCAAAATTAATATTGATGA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ATTATAGAAGTACATATATTGCTGAAAAACCTCTTGT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AGTTAGTGATATCAATATGCTAAGCAATATTTTTACA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTTATATTTCGTCGCACGGATTCGTGCGAAGGGTTGG ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TAATTTAGTTATATCCATTTGTTTAACCCAATTAGT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GTTTCATTTTGCACTATATCAAGCTTAGTATACAATG ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTTTATATTTAATTTTAAAGATTAAAGGTATAAACAA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TACTAGAATTATTAAATGAAATGAACAATAATATTGT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GATTTAAATGCAACACAAATTATAACATCTAAGAAT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AAGATTGAAATTTCAACACTTTCACCTTGTATATCT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AGGTTAAAAAGCAATATAAAAGATTGCATGGAATTACT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AAGTCTCAATAACAACAGTCGAAGCAGAAAAATCCGG ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GTAAAATGAGAAATAAAAGTAAACAAAAAGGTTTAGT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CTGAAACCCTCGGATTTAGTAACCGATTCTATGTCGAGTCT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AATCTAAAATATGTTCGTTAAAAGGGAGTGTGTAATTA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GTTTCTTATACAACTCTTAACTCCAAGCCCATTTTGGA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GTATAAAAAAAGAGTTAGAAGCATTAGACAAATGGA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TATAATTGGGATGGTCAGGTTTCTGATAAGGTTAATAA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TGTTTTTTAGTTTTCGTGATTCAAATGGTTCTTTGTT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AACTCATGTAACAAGTATTAAGACTTGCACCTTTAA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC >CP012320|15|8|3287710-3289194|CRT ACTTATCTACCACTTAGTTGATATAAAAC CTGACACTGTGTCTTGTGTGAGTCTTTTCTTTATCCT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GATTAAGCCCAGTAAAAAGACTCGAATCTCTTATCGC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GCAAAAAATGTTGATATTCCCAAAATTAATATTGATGA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ATTATAGAAGTACATATATTGCTGAAAAACCTCTTGT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AGTTAGTGATATCAATATGCTAAGCAATATTTTTACA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTTATATTTCGTCGCACGGATTCGTGCGAAGGGTTGG ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TAATTTAGTTATATCCATTTGTTTAACCCAATTAGT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GTTTCATTTTGCACTATATCAAGCTTAGTATACAATG ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTTTATATTTAATTTTAAAGATTAAAGGTATAAACAA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TACTAGAATTATTAAATGAAATGAACAATAATATTGT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GATTTAAATGCAACACAAATTATAACATCTAAGAAT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AAGATTGAAATTTCAACACTTTCACCTTGTATATCT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AGGTTAAAAAGCAATATAAAAGATTGCATGGAATTACT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AAGTCTCAATAACAACAGTCGAAGCAGAAAAATCCGG ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GTAAAATGAGAAATAAAAGTAAACAAAAAGGTTTAGT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CTGAAACCCTCGGATTTAGTAACCGATTCTATGTCGAGTCT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AATCTAAAATATGTTCGTTAAAAGGGAGTGTGTAATTA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GTTTCTTATACAACTCTTAACTCCAAGCCCATTTTGGA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GTATAAAAAAAGAGTTAGAAGCATTAGACAAATGGA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TATAATTGGGATGGTCAGGTTTCTGATAAGGTTAATAA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TGTTTTTTAGTTTTCGTGATTCAAATGGTTCTTTGTT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AACTCATGTAACAAGTATTAAGACTTGCACCTTTAA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC >CP012320|15|9|3287776-3289194|PILER-CR ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GATTAAGCCCAGTAAAAAGACTCGAATCTCTTATCGC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GCAAAAAATGTTGATATTCCCAAAATTAATATTGATGA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ATTATAGAAGTACATATATTGCTGAAAAACCTCTTGT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AGTTAGTGATATCAATATGCTAAGCAATATTTTTACA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTTATATTTCGTCGCACGGATTCGTGCGAAGGGTTGG ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TAATTTAGTTATATCCATTTGTTTAACCCAATTAGT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GTTTCATTTTGCACTATATCAAGCTTAGTATACAATG ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTTTATATTTAATTTTAAAGATTAAAGGTATAAACAA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TACTAGAATTATTAAATGAAATGAACAATAATATTGT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GATTTAAATGCAACACAAATTATAACATCTAAGAAT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AAGATTGAAATTTCAACACTTTCACCTTGTATATCT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AGGTTAAAAAGCAATATAAAAGATTGCATGGAATTACT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AAGTCTCAATAACAACAGTCGAAGCAGAAAAATCCGG ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GTAAAATGAGAAATAAAAGTAAACAAAAAGGTTTAGT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CTGAAACCCTCGGATTTAGTAACCGATTCTATGTCGAGTCT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AATCTAAAATATGTTCGTTAAAAGGGAGTGTGTAATTA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GTTTCTTATACAACTCTTAACTCCAAGCCCATTTTGGA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GTATAAAAAAAGAGTTAGAAGCATTAGACAAATGGA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TATAATTGGGATGGTCAGGTTTCTGATAAGGTTAATAA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TGTTTTTTAGTTTTCGTGATTCAAATGGTTCTTTGTT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AACTCATGTAACAAGTATTAAGACTTGCACCTTTAA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
>CP012320.1|AXU58397.1|3287091_3287520_-|acetyltransferase MIKKLNNKDINKIMEIWEKSTIKAHDFISKEYWQNNYNTVKNEYIPISDTFVYDDGDEIKGFISIIDKSFIGALFIEPKYQNLGIGGKLLDYATKKYKSLSLAVYKDNKKAVVFYNKKGFNIVKEQVNEDSGFKEYIMEYSK >CP012320.1|AXU58396.1|3285856_3286636_+|hypothetical-protein MKVNENNINNIDEELDELSRKVYLESPDFWISISDKIIDKVFDEMLLFFAVKYNYFNIVCFAIENNYLDLNMPSKNKKYTNIMEHLLDTSKQNEDKKIYNYLLSLNKGNNLDERPILDELNCNISSDTFEKKDIYLPKYLCPSCNSNIFDTGYKVSNDITYKFSSKEAEPIEMSSEVSSIRCCNCDELLEDITLNKLYNLCKIQNCNNCGSNLTKVGIIAKKKMNFDENTEKFKDVSTSYCCGNCDSEINLSQREHFKI >CP012320.1|AXU58395.1|3284987_3285533_-|biotin-synthase MKNTKVNIQDLTKMSICVALLCISSYIYIPLPFTPAGVTAQTIMINLIALILTPRQAFSTVGVYIMIGLIGIPVFGGGTSGIGKLLSPTGGFYFGFLFAALIISLLKGRNNDIKRYILITIFVGMPIIYFMGTVFMCYFNQMTVEAALFAAVVPFLIGDTIKSVIASFLGTKLNNVLRRNL >CP012320.1|AXU58394.1|3283819_3284956_-|thiolase MKEVFILGGLRSHIGLKNGIFQFVQPELLGASVLKDLIKKYEIDKIDEIICGNAVGTGGNIARLMTLTAGVSNEVPAFTVDMQCASAMMSIDIAFSKVKSGQCNLIIAGGFESSSLQPMRTYHKNDKRYNTNNPNYTVAQFSPDDNSQNSMLEGAERVAELYQIERADLDFWVKESHKRAKEAREEKILEDIISPINNSTYDEGIRDKMSQRLLDRMPPILGKETITNAANSCLINDGASFIIICSKKYLEHVKKKPKTKIINTCTIGTDATLSPTSAIQAMDKLLEIESLNYLDVSAVEFNEAFAVIDVLFQRKYPELIERYNIFGGALAYGHPYGASGAIITLHLLKALEKTKGRYGICSIAAAGGLGSALLLERV >CP012320.1|AXU58393.1|3282424_3283816_-|AMP-binding-protein MNYYELLRIKKERHKNKNFLIIDGEKYTYENILSYSEQLGKQISLGENISILIYSKNIMFQLISFFAINYSKNIPIICHYNLSKKVLDDILLKNNISIIISDESMDVIDLYDDNNNEVAKKVNFSIFNPKFNLYMYQYKNLINYLDKSICMGALSSGSTSVPKVLYRTYESWAGFFPIQNGIFNISGESILFVNGTLSFTGNLNSIMSVLYEGGSIVISSGLNCKSWIRTIKQYNVTNIYLIPTKLQLLVKHLKEPVLKVVSIFTGSQLLFEYTARNLKKYMPKSEIILYYGASELNYITYLCYDELIEKPLSVGRPFPGIDIYIRGGKIFVNTEYAVYNATKPYSVNDIGYYDNDGYLIFEGRSDDIVNIGGFKVSSAKIENEVKKIPQIEDAIVLPYSDTIRGNQIVLFVITIDKITKKDLLIKMKDNLMKNEIPKKIIFLNSFPYTSSEKIDRLALLKML >CP012320.1|AXU58392.1|3281473_3282349_-|dipicolinate-synthase-subunit-A MSNQYDITVIGGDLRQVYMVKKLINKGYSVVTYGISNEIINGIVGKSTSLAEALSKSSIILCPIPFTKNQVNIENTDDCLDATIDNLLINLSPNQILFGGNIPTKVCKFCEQHSIQIYDFMKMNDVAILNAVATAEGAIAEAIKRSIINIHQSNCLVLGYGRCAQILAKKLYALDANVCVGARNNDARSTANAFGYSSISLSQLDEKLLQFDYIFNTIPECILTKERLEKVSQEVTIIDIASSPGGVDYSVVKEVGINATLCLGLPGKYSPKTSGEILVNAIENIINERRD >CP012320.1|AXU58391.1|3280880_3281471_-|dipicolinate-synthase-subunit-B MRLEGLTIGVGFTGSFCTYDKIFIELENLVKEGANVHTIFSDVSQNIDCRFGNSEEFMKKAYELTGNKPIVTIEEAEPFGPKGIADIIIIAPCTGNTAAKLANGITDSPVLMAAKGHLRNDKPLVISISTNDALSFNFKNIGILLNSKNIYFVPFGQDNCKAKPNSMIAHTELIIPTIELALENKQLQPVIKSPHQ >CP012320.1|AXU58390.1|3280472_3280673_+|hypothetical-protein MKKLKTISIFSLIISVILTIGGIGIVTYYVDNLFIRGLSVFVLIMSSSFVSTTVRLIFEESKRYKF >CP012320.1|AXU58389.1|3277314_3279969_-|bifunctional-acetaldehyde-CoA/alcohol-dehydrogenase MAHKEQVIIENKKENEVMSVGLDTVNNVESLVKKLAKIREAQKIFATYTQEQVDKIFLAASLAANKQRVPLAIMAQKETGMGIAEDKVIKNHYASEYIYNAYKETKTCGVIEKDEAFGMTKIAEPIGVIAAVVPTTNPTSTAIFKALLALKTRNGIIFSPHPRAKNSTIEAAKVVLEAAVLAGAPEGIIGWIDEPSLELTTTVMKEVDLTLATGGPGMVKSAYSSGKPAIGVGAGNTPAIIDESADIKTAVNSILVSKTFDNGMICASEQSVIVLENIYNEVKKEFKERGAYLLDKDETEKIRNIILVNGGLNSKIVGQTACTIAKLAGFEVPVDTKVLIGEVESVEIEEAFAHEKLSPVLAMYKASDFDNAVRKAEKLVEDGGFGHTSSLYIDDVNQREKLDKFTSAMKTCRILINTPSSQGGIGDLYNFKLAPSLTLGCGSWGGNSVSENVGVKHLLNIKTVAERRENMLWFRSPGKVYFKKGCLGVALKELKDVMNKKRAFIVTDTFLYNNGYTKAVTDLLDEMNIKHTTFFEVEPDPTLECAKIGAKAMREFNPDVIISIGGGSAMDAGKIMWTLYEHPDVDFQDLAMRFMDIRKRVYTFPKMGEKANFVAIPTSAGTGSEVTPFAVITDQDTGVKYPLADYELMPNMAIVDSDMMMNMPKSLTSASGIDALTHALEAYVSMLATDYTNGLALQAIKSIFEYLPRAYDNGAKDPEAREKMANASTMAGMAFANAFLGVCHSMAHKLGAFHHVPHGVANALLITEVMKFNSSDAPKKMGAFSQYKYPEALKRYAEIASFLGLKGNSDEEKFQSLLVAIEDLKLKVGIPKSIKEFGVEEPKFMDSIDEMVIQAFDDQCTGANPRYPLMNEIKDMYLNSYYGR >CP012320.1|AXU58388.1|3274819_3277039_-|signaling-protein MTGRNKSFTLITILFLTSLFLTMGYIYIEDTKHLLMSEAKIHIKEVAVQGSQLAQRQIEKDLDVLNIFSNYYALNQDIPNEEKMKNLLDEMENQKFYTMAIVDINGNAENTKGDKFSVKDREFFKNSIKGKKYVSSPYVDEVNKSIKKITISVPLLNNDKVVGVLYCTYNINTLMKLINVSFYENNSISYVVRNDGTIILHPQEDSLSKNIYKLLKQDNDIREINRLKKELQENKTGATVLNMLEERRYLGYATMDNGNSENNYIKDWNLIFSIPETVVFSNSEQIINRAIYAVLFIILIFIAIIFYIIYIKKSNEKEILSLAYEDKVTHIGNQNKFYRECSKYLLDKPSLNYIIVYFDINNFKMINDTFGYEFGDNLLITIAKALKEELTEGEVYARLSSDYFAIFCDYKNGKNKRIRKIDSIRNNIESNLSIVFEISLCVGIYFVEEGEVDIQKAVNKANMARSVAKGKNINYAIYNEDVRNKLSEESMILDDIKIALVKNQFEVYYQPKFSLVTGEMIGSEALIRWNHPEHGFISPAVFIPIAEKSKLILKIGRFVFERVCNDLSEWKKQGKKIVPVSINLSRVELYQPDIVKFINKTIQMYNLSSDLIEIEITETVAINELNILKNVLNELRKYGFSISMDDFGTGYSSISCLRDMPIDILKLDKSFLNGIEHDERSRNIAKSIVSLAKSLDLVVIIEGVESKEQAELMKQFGCDLVQGFYFARPMPAKNFLDLL >CP012320.1|AXU58398.1|3289377_3289644_-|CRISPR-associated-Cas2-family-protein MFVIVTYDIVEARSLNRIRRILRKYLTWTQNSVFEGNITDGKLHKCISEIENIIDNSEDSIYVYEIKNPNSIKKKCYGIDKYSDEMFI >CP012320.1|AXU58399.1|3289646_3290627_-|maturase-related-protein MYKDYYIISNGNIKRKENTIYYYNLEGEKKILPVEQVDDIHIYGEVDLNTKLINYISKYGVMLHFYNYYGYYSGTYYPRKKNVSGFSLVCQSACYLDKNERLYLAKSFVESASYHILRNMRYYKVDESLIDTIKDELNDLNDVKEISELMGKEGRIRKTYYKSFNQILKDDFEFYKREKRPPKDPVNTLMSFGNSIMYTNVLSEIYKTQLDPTISFLHEPSTKRFSLSLDIAEIFKPIIVDTIIFSLINNKRINKNDFEYQDKICYLSEKGKKKFLQEFENKMQTTIKHRNLNRKVSYRMFIRLECYKLIKHFINDERYKVLKVWW >CP012320.1|AXU58400.1|3290629_3291199_-|CRISPR-associated-Cas4-family-protein MIFILTMWLKFTKEGDFVPIDLEVLKVQGVKINYYYVCKRKLWLFSKGITMEQNSSRVLSGKIVHEDSYKRMKNKEMLIDDILKLDIIKDEYVKEVKISSKMKEADEMQLYYYLYYLKNSMGIEKKGTINYVKEKKQEELILTEEKEKIIENTLININEINMQLSPPKIEKKHYCTKCAYYEFCFVKEE >CP012320.1|AXU58401.1|3291195_3293517_-|CRISPR-associated-helicase,-Cas3-family MLYAKSNPVETLREHTDELLKQMNVLRESYGKNINSLDFLEEEIFWQLLDFVIEFHDIGKAFSPFQELIKSRMDTKINEPKIVTHLENNVGHNYLSPAFIDYSYIDRKKNKELRAVLNQVIVYHHERDIFIDKDFKNLIQKILDEDLINKVYELQREFKVRYPIKTEKLSKVYLQSVEKRIDKNHKYYNLYIMLKGILHRLDHSASAHEVVECNNVINIGEQTENYLMKEFGSLREAQSFAKSNRNKNIILIASTGMGKTETALIWIDKDKAFFTLPLRVSINALFDRAKNIIGVGEANDTFLGLLHSTAIDYLEESNQENSSEIVDLAKLLSCKLTFSTIDQIFKFPFLYRGYEKVYSTLAYSKVVIDEIQAYSPEIAAVLVKGIEMIHKIGGRFMIMTATMPTIYIDELKKRGVMNSNLADLTCNTEKIRHCVSIVENSIDENLGKIIQSGMNKKVLVIVNTVKSAVEKYELIEEIVKPKGIDVNLNLLHSMYIQEDRAKLEKYIKEFADSDSNGIWITTQLVEASLDIDFDELHTENSTLDSLFQRFGRCYRSREYEENSPNIFIYTEKATGIGSIYDKDIVEKGLELLKTFINGKECVKMKEKYKVEMVKILYSKESLEGTAFEKRFTSALNILDTITPYSLGSKDAQNILRNIEGYTVIPEDIYNKIEETLIKDYEELGQELINAYSNDDRQLINKIKSKRKKARREIIKKTVNLPIYKAKQNVIDIQVKGLEDLKILLYKYDIHENKHTKQIFGKGVLISNEIDQFI >CP012320.1|AXU58402.1|3293527_3294229_-|CRISPR-associated-protein,-Cas5t-family MKVLKLDLFQETACYKKPFAMKITETYPLPPYSTINGLIHKILNATEYIPFNISVQGTYESIFNNYQTTYFYKKDSITSMPMNSHMLLNVNLIIHIGGDFDLLEEIYDSLLNYDEHLSLGRKEDLVRINDIRFVEVNKFEVDEDIQLDDYENYKLSECNIRMPIYIPKTSLQDTDIDGISYRLNNYYDNNAVEDKKRVWNKVDSYYVEDGNTISIGDILLDNEGDLLYFNNIN >CP012320.1|AXU58403.1|3294230_3295145_-|CRISPR-associated-autoregulator,-Cst2-family MKRGLTFTVIAQAQSLNYGEGIGNISELKKLSRDDGNIYTFASRQCLRYDIVRLAAELFNWNLQVVDKEKGTIQFKDNISIRESEEMDLFGYMKTNKKDEKDKKGGSLTREATVRLSNAISLEPYRSDMDFLNNKGLADRIGEHPNLANIEQHLSYYTYTVTIDLSKIGKDGDIELDNKEKCRRVVEFLEIIKVLNRNIRGRQENLSPLFVVGGVYEIANPFFLGRIKLKGDKNGFKINKQAIEEVIQGTFLGKDLKEFTYVGMVDGVFINKEEFKGLFEDNFLSVDKFFGQLVKEVKEYYGVN >CP012320.1|AXU58404.1|3295146_3297024_-|CRISPR-associated-protein-Cas8a1/Cst1,-subtype-I-B/TNEAP MKLRVYRGDWFFNMGIVGFLNIIKKADKQAEIFIMEDYIEFDSLFLENFHEYYFNYFMDEYDVSKRIKKNIDYSINFIKSKPDRIKDGIKKIKDSVKQQNDKIKKFDEEKFNLIKEKLDSMSKIKSYDEFDSLEALVDETIDIFKIKSINDRLTANLYKYVVQDNYFGQVSFFNVAKAKLDLDGLKQIMFNDYLRQIIYFGELADLLEENDYDKLKNYLNDRLNSIAKDINEKKVSKSSINTIEKIMKEINKNFIKKNKSIEDIKEYMDSLEVCEMCGLYKGILDEYSESNFAPLGVSTNNARNMFWNQAYVPSICDICKLILFCTPAGATYTRKNYLINEENEFYLFVNMDTSINELFERNNSLKAQKSEYSDSKDENPFNQLIKSIVEENTLKSEWQLRNILFVEFKASIDSKKCKINYFNIPTYLAKFFTDKYANKKIQSIYDYKLKSNVLDLLLKNRDLKHLTNNILRNKVKNDMESNNKSNISGIDCFRVVQLRALINSYKKGVYKMDSKNLEKNDEKLRIIYYLGCDIHDYFVNKNSKNKIDGVSYKLLNSVKVGNKSDFMDTIIRVFMSAEKQIPAFILDIEIEKDLDFESIGHAFISGLISGKYEGKDKLPNEKEEK >CP012320.1|AXU58405.1|3297029_3297767_-|CRISPR-associated-Cas-family-protein MKMKIEFSTGCIPISYNSLFMSIIKEAIRKSNEDYYKNMYYYKEKNNKKTKNFTFSVYIKKYSIEGDNFIIEDKVILNISTPDLELGFHIYNGLMTSKKCLYKAYELTRIRIDLSREKKVTEERVLFNALSPICVKSKEGKFLEITDDRYIEELNYITNEVVKNYRGNGLKRKLEFENIGLKKIVVKESLREFKKITGKEYQYINGYKGKFILKGDIDDLNLIYNLGIGFRRAQGFGDVDILEWR >CP012320.1|AXU58406.1|3297844_3298732_-|putative-transcriptional-regulator MKCKELSEELEVSERQIKSYKMYLEQAGIFINSTPGIYGGYEIDKCNSISLIKLLDSEVSILDMINSQLEYNNDIYKNEFNNIVEKIKAVLNTGEKSDTYMDYFTVQAQRNCDYKSEKNKCNEIIRAYTTKHKFWIEYYSLNSGNSERIVHPYGLFNYKSDTYMVAFCEKRFKFIDFKLCRIKDYKVLEEKYNVDKSFSWDEYSKNSIGIYKGEEINVVIKISHPFSIIIKEKVWVNNQQIIEYDDKSIMFKAKMRGYEEIKSWILSMGAYVEVVEPDRLRNDILSEIEKMKKIY >CP012320.1|AXU58407.1|3299040_3300957_-|ABC-transporter-permease MNIKQFAINNISRNIKAYLGYLASIVISSSLLFSFIMFTSHPDLDVSQFPDYLKEGLKMSKIIAYLFLFFFVFYSVSVFLKSRYKEFGILYITGISKRQVMKLIFIENMIINIVSSVIGIIIGLIFAKIFLVVMSTFLELSPLKFYIPFNAILSTLIYFMILAVLTSIFTYFIVKENQVLKLLKGTKTPKPEPKTSLMLAILSICLFIIAYYNAITSTDQYTTYLRLVPVTSLTIVATYLFFSQFSVFFMKKLKLNKRFYRKNTNMLWISNLIYKVKDNARIFFLITITSAVAFTAIGTVYSFWKDVERQINLIYPNTIYYSTMTLHNDPKKPDSKEKDKERMMFIENNLKKENVDYTRTNGEFKTVFPKKSDFNVRIMKESKYLEITETIGVKPISFEDNECISLLSSSLPGNNNVKENIIVGNRGLKVAKQVEECVMPAYYKNMYVVKDNFYDSIESKFIVDRFTAFEVEDSSKTIEICREFENKFNNESGMQPYLFFSKELMIGTGKLIYSTFIFLAIFIGLIFFVTTSSFLYNKFYMDCQVDKKKYEQLNKLGMTYNEIKKASTIEIGIVFLFPYVVAVIHSIFALTALKNSFDIEVASSAVLVMGSLFLVQIVYFLIVRNNYLKEIRLNLVNF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012320_16 | 3544034-3544656 | Unclear |
NA
Consensus repeat of CP012320_16
|
9 spacers
spacers of CP012320_16
>16.1|3544063|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT TTGTAGTGCCTAGTCACAACTCTCACCCCTTCAATA >16.2|3544128|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTCTCTACTAAAATTACTTCCACATATAGCTACAGA >16.3|3544193|39|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGTACCTGGGTCTTTTATCTTACTTGTAAGTGTACTTCT >16.4|3544261|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTGCAGATAGGTCTGTGCCATCATTCGTGCTGTTAC >16.5|3544327|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGGGATGGATTTTGAAGCTTCTATGTCAAATGTACA >16.6|3544392|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAAACCTCTCTTTAAAATTATTCATAGAATTTATAAA >16.7|3544458|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTGTTGCTAGAAAACATTAAAATACATTACACATA >16.8|3544523|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGCTGGACTTGTAATAGTTGTAACTAAAATTAGTGAA >16.9|3544589|39|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGGTAGAATGAATCAAATAGCAAAAGTACTTTCCGGAAT |
cas3,cas7,cas6,cas5 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012320_16
The CRISPR arrays of CP012320_16 >merge|CP012320|16|3544034-3544656|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTACAACTAATTTAGTGTAATCTAAACTTGTAGTGCCTAGTCACAACTCTCACCCCTTCAATAATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAACCTCTCTACTAAAATTACTTCCACATATAGCTACAGAATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAACTGTACCTGGGTCTTTTATCTTACTTGTAAGTGTACTTCTATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAACATTGCAGATAGGTCTGTGCCATCATTCGTGCTGTTACATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAACTGGGATGGATTTTGAAGCTTCTATGTCAAATGTACAATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAACGAAACCTCTCTTTAAAATTATTCATAGAATTTATAAAATTTATAACTAATTTAGTGTAATTTAAACATTGTTGCTAGAAAACATTAAAATACATTACACATAATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAACGGCTGGACTTGTAATAGTTGTAACTAAAATTAGTGAAATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAACGGGTAGAATGAATCAAATAGCAAAAGTACTTTCCGGAATATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC >CP012320|16|15|3544034-3544656|CRISPRCasFinder ATTTACAACTAATTTAGTGTAATCTAAAC TTGTAGTGCCTAGTCACAACTCTCACCCCTTCAATA ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC CTCTCTACTAAAATTACTTCCACATATAGCTACAGA ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC TGTACCTGGGTCTTTTATCTTACTTGTAAGTGTACTTCT ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC ATTGCAGATAGGTCTGTGCCATCATTCGTGCTGTTAC ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC TGGGATGGATTTTGAAGCTTCTATGTCAAATGTACA ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC GAAACCTCTCTTTAAAATTATTCATAGAATTTATAAA ATTTATAACTAATTTAGTGTAATTTAAAC ATTGTTGCTAGAAAACATTAAAATACATTACACATA ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC GGCTGGACTTGTAATAGTTGTAACTAAAATTAGTGAA ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC GGGTAGAATGAATCAAATAGCAAAAGTACTTTCCGGAAT ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC >CP012320|16|9|3544034-3544656|CRT ATTTACAACTAATTTAGTGTAATCTAAAC TTGTAGTGCCTAGTCACAACTCTCACCCCTTCAATA ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC CTCTCTACTAAAATTACTTCCACATATAGCTACAGA ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC TGTACCTGGGTCTTTTATCTTACTTGTAAGTGTACTTCT ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC ATTGCAGATAGGTCTGTGCCATCATTCGTGCTGTTAC ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC TGGGATGGATTTTGAAGCTTCTATGTCAAATGTACA ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC GAAACCTCTCTTTAAAATTATTCATAGAATTTATAAA ATTTATAACTAATTTAGTGTAATTTAAAC ATTGTTGCTAGAAAACATTAAAATACATTACACATA ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC GGCTGGACTTGTAATAGTTGTAACTAAAATTAGTGAA ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC GGGTAGAATGAATCAAATAGCAAAAGTACTTTCCGGAAT ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC >CP012320|16|10|3544099-3544656|PILER-CR ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC CTCTCTACTAAAATTACTTCCACATATAGCTACAGA ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC TGTACCTGGGTCTTTTATCTTACTTGTAAGTGTACTTCT ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC ATTGCAGATAGGTCTGTGCCATCATTCGTGCTGTTAC ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC TGGGATGGATTTTGAAGCTTCTATGTCAAATGTACA ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC GAAACCTCTCTTTAAAATTATTCATAGAATTTATAAA ATTTATAACTAATTTAGTGTAATTTAAAC ATTGTTGCTAGAAAACATTAAAATACATTACACATA ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC GGCTGGACTTGTAATAGTTGTAACTAAAATTAGTGAA ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC GGGTAGAATGAATCAAATAGCAAAAGTACTTTCCGGAAT ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC
>CP012320.1|AXU58600.1|3542767_3543214_-|transposase MIAQFTNFLGDNNEISKDTIFIDGTKIESSANRYTFVWKKAVNKNMAKMVNNISDFILKCEIDVGIKIVYEDKIKIYHLKKLKKISKEANVAFIHGKGNRKSTKNLHIMGERNSCSKTDNDETFMRMKEDHMKNGQLKPAYNIQFGVD >CP012320.1|AXU58599.1|3542185_3542521_-|transposase,-is4 MDYEEENNYYICTNEKKLFANKIINRKSKTGYKSEITCYICEECSNCQYKSNCIKRSNSKVPLKNRTKNLQVSKSFHEKRKENLKRIMSLEGDELRVNRSIQAEGAFAQVK >CP012320.1|AXU58598.1|3541792_3542122_-|hypothetical-protein MAIAYNVSRLHNKIVKNKRGIYLYHLKKYSKIIIYNQILSEKMVFLYLYLSCIILLRTETLYKTIENIPIKIIRKELSQNKFNLLMQQPHIDIHLGCIIIHFNITCSLG >CP012320.1|AXU58597.1|3539640_3540843_-|frg-domain-containing-protein MQSVICKIFDNKLLISNDLSEQDDVLYEVMDKFIDDIEYISKLGDEQIKSMLMEVNKFEEDSTEFELYMKNLCYLKQSYFIDTNDKSEINSIDIDILKNVKIEDLVDITNIKLERNLNINIEHISKAVNKIYEENEKWKEYNIQNTMSKYIGIPESEVIFISNLSQYVSFLSELDNAGDYVSRGQKDCMYELLPSLHRKYKKDYGIHSDEYEEAFKQKIIYYDKEIKNRSSEELRAEGQHFGLPTEYLDFTEAHLISLLFAIEDYKYTKQHSIVYFIDSISYNTDTIKRSEKLVNYSDTSAIDNCSKFSSRSFFIKVGNSNERIHFQKGCFLKVSSEDKGEFKEKLKKYCKVVVINKDAKKEILKELFNLGITFENIYPDKDNVVKSIKFYYDEIVGGNL >CP012320.1|AXU58596.1|3538348_3539641_-|hypothetical-protein MREQFKNSIKNIKSNRPLVSVQDIVNFIDKGEKYLKLSIDEIDEMEILQGIVMSPDYQRTYKSSNKEESSIIESLLIGIPIPEIFLVKIGVNDMQIRHVMDGQHRLNAIYRYVKNKYPLKNLDILGNDPLYDNKRFSELEKKDKIKILGSHLSILEFDGFDNPEIEIELFKRYNRNTKPLEMQEIEMATYFSETSKYISKFINTLIKDKYKDEIDKSEYKYANYKSDLLRIYNITKSRNDKQKNHQEICIIFSILENGLQENIRDGVTASKKFLEYKSIQYKNNESEKLELLKDKFDEFNRMILKISEKIEYPFSTSLISDDKQRQSKYLIGVSIVLASICYYYDIDLENNYLIQDIKKIISCSPIADIEYKASSTNMKNMILYLFIKNKIQDNKFESLNLKRDKIKEINTLVMNNDGYLNEQTRLLEIY >CP012320.1|AXU58595.1|3537517_3537907_+|integrase,-catalytic-region MRAVGLSSVCRKKKFSYVKCTPEVIAENVLSRKFSADKTSQKWLTGVTEFKLTNGMKAYLSAILDLDDRSIVSYVIGKSNNNNLVLETFDKAIELYPNAKPIFHNDKSFQYTSKVFKSKLLTQGMIQSM >CP012320.1|AXU58594.1|3537215_3537416_+|transposase MRNYEAFGNDGLIKQSCKLCYCEEFKLNAIKSYLNGEGSYDTISKKYKMRSVYSLKAWGKEYNPHK >CP012320.1|AXU58593.1|3535606_3536617_-|hypothetical-protein MITKIKKTYIYLKEIQKIYKINEHKELVHIIKKLINDNKIKPIKTSDLTPQHEQLYTKYRIIKQETEEDKKILEEINYKICDKLSIDYYRKNLVHYKNNRVAIMDLNSYLIKKSDNLSKKISINERSYEIFKDEKFISSKVGKEVLKNLKIDLIKDLNVYKTPEPFIYLSINRISPQKILIIENKDTYITITKMLLEGKEILKNKIDTVIYGEGKKIINSIKGLKEDITIEYLTNKENEFLYWGDIDKTGLSIYTSLKDTNEINNIRLFEVAYEHMIDKTKENTLRNIPKNQKDNFECGLENINNLNLKESIKNILVQGKYIPQEALNRFDLEEYN >CP012320.1|AXU58592.1|3533987_3535607_-|hypothetical-protein MEMINILEGYNKRVNCIGSYYLIATLANNRNKFKEFDNIQFYNLLIQVLCYIFDRSLRRKNCLRDDIKDFIEEINRMDYKIMLSEDDLKDLANYIINGLTNSGKVYLFTYYSLEQEKHIDESIKIIEDKNVKINNQERLSYSLTTEGYRLLLSTKEYDELFQIQISQMIAKLRIEKGDYQGAKEDIYDIINTLEIHQQKIDNYIKIIKVNILYIKEEKYSTVIDTTVETLLEEMDKYEELKKEVKLLIKDKEDYLEKDEDIDKEKIKNIRTQLLQMKELIDGIVLAKSTATNLLSRVQDFREEFKEILKKLLTTPVIKRFNFKEEILDRLEKDSDFLLIIRELYISLFKVELPNRFNIGVAYQEQKLLNTREIENEIVNKDELEIIENKEKEERINYCENYYFDFFKYLIKYGLEKGQFTLEEFLKNYLKYDKVIYLEITKDSKLMRDIIIYFANQRESINIKKIIRMLENSAFSPNTDFQIERLIERLLVEDFELLNSVSHIKSNKIFEDEMKINTEINLETMTAVKLEIANIKFEII >CP012320.1|AXU58591.1|3533241_3533970_-|hypothetical-protein MNISLNDYKIANEIFYRLLKKSELKEKEAKELFLAYINNSNVRYALEAICEVSKIKIILISDTLYLIPNNDNDIFGFDYRRESLLGKDLKDSYLGYLIMTIIFSEFTNGVAPASYIQVLNLLDLVQESLERSIARDNLEEIEKSCEFNITILKNYWESKRKWDESSKKGIETTSADFQIGFIRKIINFLKNEGLIVHIEDEDKIKPTRRFLDLMNNYFLDEERKVLIEKLVLRKGESINASN >CP012320.1|AXU58601.1|3544908_3546894_-|CRISPR-associated-helicase-cas3 MNNLYEYKAKSDGTSIDKHNEDMNYIMNQLVSIYNISNDMKNDLYEAIVCHDVGKVVKSFQDNIESSTRRVRHELLSASIKYLNRGQKLAILTHHKDIKFLEGQITNSIYEIELKELKELLDIEVEDIRPFIKEISRARNDDTRKLENILLKGYLQYCDHIASAGIKSIDKGFNSIKDFSIPKGVSYNSIQEKVLNMDKNEDIMIMAMTGLGKTATSLYWSNLVQNEYKSKRVYYILPYTASINSLYENLYNRNISVSMLHSKAPYFLNKISDEEDIKQLYQIYKKSVKQINVCTIFQLVKSVFSCKRFEMLLSQLKDSIFIVDEIHCFDTRVLCYTLEFLKYLKENLNVKICIMSASIPTCLKKLIQERLQISTIIEPDSKDLIFRHRLNRLSEGILDSIHKIENDLMQGKRVLICVNSVDLSQELYGRLQKYNPKLIHGRFNTRDREQAEKGIEESFLLIGTQSIEVSLDISYDVLYTELAPLDSLLQRFGRVNRRGDNAELSNIYIYDYDRKLNIYDEDIINRTDIVISDIIHNDNSIVDESKVPSYLDNVYLDIDMDKYNKHKVALEIIMKNMRLGVWNKSANNDMLNNDTISVVPECLLEEYKLYIDKKMYLEASSLFVNVSVKRYNYNKKMFYECGDIVVTSYSYNDKLGLIFDC >CP012320.1|AXU58602.1|3546904_3547975_-|CRISPR-associated-autoregulator MENKNSNRMLNIGYAIEVLCGRLNGSSSEVEKKNNSYKNSTYTKKIGSRSRISSQCQKYNQKLFMEQVCGYEQNVKTKDGKQVKLVPNPFKYATDDIFGFMMAEKLSIEEDVYKELSDEEKEIYKKNKKKYEVNITKKRKSRWQMNSLINVSNRKVEWEWNVCGTTGDSMPYQVEVYSGVHTNIANLNIGKIGEYDISDIASEHRDYTTLEAKSIGVEKLDKEEKFKRIEALLKSLEYLSVEGNKTNHLTDTKPKFVILGEYSWGNNVFQGIIKENGLDVEMLKESIEQNEEFRKSDIWIGINKFYDDTFNEIEVNNEKEQIKKYLEEEFEEYDFMKISNVHQAFESYLKYLKETL >CP012320.1|AXU58603.1|3547995_3549162_-|hypothetical-protein MDRSYNVFVDNGLYVLAYYLNKDINDITYQDIENSIDLMSDKIEEFVSCEKYSNLKSMCFSNSTLTQPKGKVTLNEKLKGFVKNQGDEYCSLCGQYKAKVKIEDKEYNIGRSYMPNLVANTFYNFSNNLQGLNVCPYCLVLTMYSILNCRVSRYAFLYNSTSSEFMEDYTFHIQKENLTDVELGAKKEKEKYSIVKLLESLVCKYNLFNGDIEQYMFNNSGQSQDIQVNRIKNKYVNLLIKLQEKALLSNFEKLHLDRYILNGTLESNYLREVYRVKKEEKMDEKEQKNFDELVIFLNREVNVLKKVKIDIIKKLTDKLKTSDLDIDKIYKELKMLGKFYAYEDWLVNLNEMYYEKTGEKLFEAEDYIELDDIRSFRQIKNLILVSLI >CP012320.1|AXU58604.1|3549163_3549928_-|CRISPR-associated-protein-cas6 MHLVRRHLILTVDNEVVLDYNYQYELMKRIYEAIEINDKRKALSLHNEGYKVDKKVFKLFNYTIMFENAKYLKEGIHLNPQTKIKLILSGYDDILNNIIKGFIKCKVFKLNNIEFKVSDIEEDSKKNFNNITLYKVRSPIVASLYDLKSRKQVYLNPMQEEFYKALHDNLGNKYKLIHNKEYTGELYFDIEDVLAVKKKYITNIKGKGFIIGYTDFEIFVQANKDMQEVIYYCGLGEKNSIGMGLLTYITSRRA >CP012320.1|AXU58605.1|3549918_3550566_-|CRISPR-associated-protein-cas5-family-protein MILNKIEIIGDMAHFKIPMHSKIQRTYEIPPISTVVGILKNIYGEEIDDFILGYVIYHDGTFKDLQTIYKEINPNVKTLTDSDRFQTDVCPIEYLINPKLIIYTNIDKNIEFNEPLCLGKTNCLAKVLSLSEIEVNLIDKKAIGYNQYTDINIGDGMIKRINTLTEYNEKKGYYDIYSSMVRENDEFEYGKYYDEDEQQNIFLWKWKKGGVIKCI >CP012320.1|AXU58606.1|3551045_3552173_-|HNH-endonuclease MIIPKLEPNDRKREFNKYSSEQINKVVYNYLFKNNMSNRKIDDEILDLSSKQSKGYQSMGIVHHLGINKNHKGIFTGYTIDKAIEVLKEDEIHFKQIINILLEIRNINEYPIIVDSWELLDEKIALKTIDKSTLKHNGTGVPIEIRYFFEINNLGKNEKKNVNFKYNDNYYSAVIEMDKLENPRSRIIWKSKFRDLLRSIFSEYYEKFLENKIEGKTNLPKIRFIKLDSNNFNIEFIFTAEIEDDVLEEISQDNPLNINTINIELETEIRKEGKVKYVYGKQYERNPRNRIEAIKYHGTKCIVCGFDFEKTYGDRGKGYIEIHHIKPLSSVGEESNINPKTDLVPICSNCHRMIHRKKDNVLSIDDLKQIIKDSK >CP012320.1|AXU58607.1|3552445_3552718_-|hypothetical-protein MYDEIIEIYFDYWINEHMYRSILEKDEYYIECWKEVKKINELLEINLEDDKKYLLVELNDLFNSLIEFERELSYKLGFKTGAKFIIELLK >CP012320.1|AXU58608.1|3552967_3554203_-|phage-related-replicative-helicase MLNEDMFYHEEHKYIFNAIKEINKRNEVIDIITLTEELKRKGHLNNIGGISYITSLSTIVPTVSNFTSYVSIVIEKYKNRNIIDKFNKFNLGEIDDNTLIYQLENDINKANQKLIKKDSSITAISERAFEYINDEMNEGIKTGIKFLDDTIGGLYGGELTTIAAKSGRGKTALALQILRNVIFQGKKVLFISGEMSDIQILFRNIASLTGISVVKMKNRNLNDDEIVKYIQALSIINQENNLYINDSVNTVSGIKREIKSTKPSLVIIDYLQILDYEGKEVGEAKFADLSRQIKKITLDFNIPVIQLAQLNDELKDERPKGDRVMRSSKQIYMDSNSVIYIHRPTEKEALNYCKTMGIEDIRELRRREKGFGANLSEIIVAKNRDGESGFRPYWYIGNLFSFEECKKIQEI >CP012320.1|AXU58609.1|3554314_3555058_-|replication-initiator-A-domain-containing-protein MSNKGWIKLYRELLDKSIWKDIKPERKVILITLLLMASHKENHVFIDNKRIKIKSGQFISSYSKIAERCGKGVSYQMVRSCLLVFKNAGFLTYETTNKYIVITIENWELYQENIENQQPNQQTINNQSTTIKNIKNENNIIYSEIISKFNSTCIELSKVKKLTDTRKRRINSIIREYDKEAVLEVINIVSKTSFLNGNNNTGWKANFDWIMNSSNFTKILEGNYHSKEIVINKETGIYNPDDSQLKW >CP012320.1|AXU58610.1|3555079_3555394_-|hypothetical-protein MKENNNLEVLKTLQATLNIIVKNEEEAQEKKQGYKIIENAKRNKAELITCKEASKLYPIGESKFRQLCHSKNKGFPCIWINNRVYIIKNKLDDWFIENANGIKL |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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CP012320_2 | 2.1|727817|37|CP012320|CRISPRCasFinder | 727817-727853 | 37 | NZ_MG973074 | Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence | 49102-49138 | 0 | 1.0 |
CP012320_4 | 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302471-1302507 | 37 | MK473382 | Clostridium phage JD032, complete genome | 34305-34341 | 0 | 1.0 |
CP012320_4 | 4.8|1302933|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302933-1302969 | 37 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 22302-22338 | 0 | 1.0 |
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CP012320_4 | 4.14|1303330|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1303330-1303366 | 37 | NC_011398 | Clostridium phage phiCD27, complete genome | 46321-46357 | 0 | 1.0 |
CP012320_4 | 4.14|1303330|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1303330-1303366 | 37 | NC_048642 | Clostridium phage CDKM9, complete genome | 47466-47502 | 0 | 1.0 |
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CP012320_9 | 9.3|1857683|38|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1857683-1857720 | 38 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 4418-4455 | 0 | 1.0 |
CP012320_9 | 9.10|1858146|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1858146-1858182 | 37 | NC_048665 | Clostridium phage phiCDHM14, complete genome | 32222-32258 | 0 | 1.0 |
CP012320_9 | 9.10|1858146|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1858146-1858182 | 37 | JX145342 | Clostridium phage phiMMP04, complete genome | 31272-31308 | 0 | 1.0 |
CP012320_9 | 9.10|1858146|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1858146-1858182 | 37 | NC_028838 | Clostridium phage phiCD506, complete genome | 35-71 | 0 | 1.0 |
CP012320_9 | 9.10|1858146|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1858146-1858182 | 37 | HG796225 | Clostridium phage phiCDHM13 complete genome | 33172-33208 | 0 | 1.0 |
CP012320_9 | 9.10|1858146|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1858146-1858182 | 37 | LN681538 | Clostridium phage phiCD481-1, complete genome | 58-94 | 0 | 1.0 |
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CP012320_10 | 10.22|2208327|38|CP012320|PILER-CR | 2208327-2208364 | 38 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 723-760 | 0 | 1.0 |
CP012320_11 | 11.13|2509261|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2509261-2509296 | 36 | NC_011398 | Clostridium phage phiCD27, complete genome | 15745-15780 | 0 | 1.0 |
CP012320_11 | 11.13|2509261|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2509261-2509296 | 36 | KX228400 | Clostridium phage CDKM15, complete genome | 15888-15923 | 0 | 1.0 |
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CP012320_11 | 11.14|2509326|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2509326-2509362 | 37 | JX145341 | Clostridium phage phiMMP02, complete genome | 5458-5494 | 0 | 1.0 |
CP012320_11 | 11.14|2509326|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2509326-2509362 | 37 | NC_011398 | Clostridium phage phiCD27, complete genome | 5450-5486 | 0 | 1.0 |
CP012320_11 | 11.14|2509326|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2509326-2509362 | 37 | NC_048642 | Clostridium phage CDKM9, complete genome | 5397-5433 | 0 | 1.0 |
CP012320_11 | 11.14|2509326|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2509326-2509362 | 37 | KX228400 | Clostridium phage CDKM15, complete genome | 5397-5433 | 0 | 1.0 |
CP012320_15 | 15.9|3288136|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3288136-3288171 | 36 | MF547662 | Clostridioides phage LIBA6276, complete genome | 121180-121215 | 0 | 1.0 |
CP012320_15 | 15.9|3288136|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3288136-3288171 | 36 | MF547663 | Clostridioides phage LIBA2945, complete genome | 119443-119478 | 0 | 1.0 |
CP012320_15 | 15.10|3288201|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3288201-3288237 | 37 | NZ_CP020426 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence | 2066-2102 | 0 | 1.0 |
CP012320_15 | 15.10|3288201|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3288201-3288237 | 37 | CP011970 | Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence | 119898-119934 | 0 | 1.0 |
CP012320_15 | 15.10|3288201|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3288201-3288237 | 37 | LN681537 | Clostridium phage phiCD211, complete genome | 128760-128796 | 0 | 1.0 |
CP012320_15 | 15.17|3288662|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3288662-3288698 | 37 | JX145341 | Clostridium phage phiMMP02, complete genome | 41433-41469 | 0 | 1.0 |
CP012320_2 | 2.2|727877|37|CP012320|CRISPRCasFinder | 727877-727913 | 37 | NZ_MG973074 | Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence | 49042-49078 | 1 | 0.973 |
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CP012320_4 | 4.14|1303330|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1303330-1303366 | 37 | NC_009231 | Clostridium phage phiC2, complete genome | 52360-52396 | 1 | 0.973 |
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CP012320_5 | 5.5|1513977|38|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1513977-1514014 | 38 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 38145-38182 | 1 | 0.974 |
CP012320_5 | 5.5|1513977|38|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1513977-1514014 | 38 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 23372-23409 | 1 | 0.974 |
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CP012320_5 | 5.7|1514111|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1514111-1514147 | 37 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 3320-3356 | 1 | 0.973 |
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CP012320_5 | 5.7|1514111|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1514111-1514147 | 37 | LN680009 | Clostridium phage phiCDHS1 gp03 gene for putative portal capsid protein | 1303-1339 | 1 | 0.973 |
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CP012320_10 | 10.15|2208393|37|CP012320|CRISPRCasFinder | 2208393-2208429 | 37 | NC_048642 | Clostridium phage CDKM9, complete genome | 19080-19116 | 1 | 0.973 |
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CP012320_10 | 10.23|2208394|37|CP012320|PILER-CR | 2208394-2208430 | 37 | JX145341 | Clostridium phage phiMMP02, complete genome | 19048-19084 | 1 | 0.973 |
CP012320_10 | 10.23|2208394|37|CP012320|PILER-CR | 2208394-2208430 | 37 | NC_048642 | Clostridium phage CDKM9, complete genome | 19080-19116 | 1 | 0.973 |
CP012320_10 | 10.23|2208394|37|CP012320|PILER-CR | 2208394-2208430 | 37 | KX228400 | Clostridium phage CDKM15, complete genome | 22285-22321 | 1 | 0.973 |
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CP012320_15 | 15.11|3288267|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3288267-3288303 | 37 | CP011970 | Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence | 121516-121552 | 1 | 0.973 |
CP012320_15 | 15.11|3288267|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3288267-3288303 | 37 | LN681537 | Clostridium phage phiCD211, complete genome | 130378-130414 | 1 | 0.973 |
CP012320_16 | 16.2|3544128|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3544128-3544163 | 36 | NZ_CP020426 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence | 56560-56595 | 1 | 0.972 |
CP012320_16 | 16.2|3544128|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3544128-3544163 | 36 | NZ_CP029155 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence | 118780-118815 | 1 | 0.972 |
CP012320_16 | 16.2|3544128|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3544128-3544163 | 36 | CP011970 | Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence | 65405-65440 | 1 | 0.972 |
CP012320_16 | 16.2|3544128|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3544128-3544163 | 36 | LN681537 | Clostridium phage phiCD211, complete genome | 74267-74302 | 1 | 0.972 |
CP012320_4 | 4.3|1302604|35|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302604-1302638 | 35 | NC_011398 | Clostridium phage phiCD27, complete genome | 47316-47350 | 2 | 0.943 |
CP012320_4 | 4.5|1302736|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302736-1302772 | 37 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 7995-8031 | 2 | 0.946 |
CP012320_5 | 5.3|1513845|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1513845-1513880 | 36 | NC_028838 | Clostridium phage phiCD506, complete genome | 25906-25941 | 2 | 0.944 |
CP012320_9 | 9.10|1858146|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1858146-1858182 | 37 | NC_008226 | Clostridioides difficile 630 plasmid pCD630, complete sequence | 5142-5178 | 2 | 0.946 |
CP012320_9 | 9.10|1858146|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1858146-1858182 | 37 | NZ_CP016319 | Clostridioides difficile strain 630 delta erm plasmid pCD630, complete sequence | 163-199 | 2 | 0.946 |
CP012320_10 | 10.6|2208393|38|CP012320|CRT | 2208393-2208430 | 38 | LN681539 | Clostridium phage phiCD505, complete genome | 19142-19179 | 2 | 0.947 |
CP012320_10 | 10.6|2208393|38|CP012320|CRT | 2208393-2208430 | 38 | JX145341 | Clostridium phage phiMMP02, complete genome | 19048-19085 | 2 | 0.947 |
CP012320_10 | 10.6|2208393|38|CP012320|CRT | 2208393-2208430 | 38 | NC_048642 | Clostridium phage CDKM9, complete genome | 19080-19117 | 2 | 0.947 |
CP012320_10 | 10.6|2208393|38|CP012320|CRT | 2208393-2208430 | 38 | KX228400 | Clostridium phage CDKM15, complete genome | 22285-22322 | 2 | 0.947 |
CP012320_10 | 10.14|2208326|38|CP012320|CRISPRCasFinder | 2208326-2208363 | 38 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 19705-19742 | 2 | 0.947 |
CP012320_10 | 10.14|2208326|38|CP012320|CRISPRCasFinder | 2208326-2208363 | 38 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 695-732 | 2 | 0.947 |
CP012320_10 | 10.14|2208326|38|CP012320|CRISPRCasFinder | 2208326-2208363 | 38 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 723-760 | 2 | 0.947 |
CP012320_10 | 10.14|2208326|38|CP012320|CRISPRCasFinder | 2208326-2208363 | 38 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 728-765 | 2 | 0.947 |
CP012320_10 | 10.15|2208393|37|CP012320|CRISPRCasFinder | 2208393-2208429 | 37 | NC_011398 | Clostridium phage phiCD27, complete genome | 19163-19199 | 2 | 0.946 |
CP012320_10 | 10.22|2208327|38|CP012320|PILER-CR | 2208327-2208364 | 38 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 19705-19742 | 2 | 0.947 |
CP012320_10 | 10.22|2208327|38|CP012320|PILER-CR | 2208327-2208364 | 38 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 695-732 | 2 | 0.947 |
CP012320_10 | 10.22|2208327|38|CP012320|PILER-CR | 2208327-2208364 | 38 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 723-760 | 2 | 0.947 |
CP012320_10 | 10.22|2208327|38|CP012320|PILER-CR | 2208327-2208364 | 38 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 728-765 | 2 | 0.947 |
CP012320_10 | 10.23|2208394|37|CP012320|PILER-CR | 2208394-2208430 | 37 | NC_011398 | Clostridium phage phiCD27, complete genome | 19163-19199 | 2 | 0.946 |
CP012320_11 | 11.1|2508469|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT | 2508469-2508504 | 36 | NZ_MG973074 | Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence | 22132-22167 | 2 | 0.944 |
CP012320_15 | 15.7|3288004|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3288004-3288040 | 37 | MF547662 | Clostridioides phage LIBA6276, complete genome | 123631-123667 | 2 | 0.946 |
CP012320_15 | 15.7|3288004|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3288004-3288040 | 37 | MF547663 | Clostridioides phage LIBA2945, complete genome | 121894-121930 | 2 | 0.946 |
CP012320_15 | 15.11|3288267|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3288267-3288303 | 37 | NZ_CP029155 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence | 43710-43746 | 2 | 0.946 |
CP012320_15 | 15.21|3288932|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3288932-3288967 | 36 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 12962-12997 | 2 | 0.944 |
CP012320_16 | 16.5|3544327|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3544327-3544362 | 36 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 9291-9326 | 2 | 0.944 |
CP012320_4 | 4.10|1303065|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1303065-1303101 | 37 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 1435-1471 | 3 | 0.919 |
CP012320_5 | 5.10|1514306|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1514306-1514342 | 37 | NZ_CP020425 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence | 6906-6942 | 3 | 0.919 |
CP012320_5 | 5.10|1514306|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1514306-1514342 | 37 | NZ_CP011969 | Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence | 2228-2264 | 3 | 0.919 |
CP012320_5 | 5.10|1514306|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1514306-1514342 | 37 | NZ_CP029156 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed2, complete sequence | 40717-40753 | 3 | 0.919 |
CP012320_5 | 5.10|1514306|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1514306-1514342 | 37 | NZ_CP029153 | Clostridioides difficile strain CDT4 plasmid unnamed1, complete sequence | 34761-34797 | 3 | 0.919 |
CP012320_7 | 7.1|1717763|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1717763-1717798 | 36 | NZ_CP029155 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence | 17906-17941 | 3 | 0.917 |
CP012320_9 | 9.10|1858146|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1858146-1858182 | 37 | NZ_MG266000 | Clostridioides difficile strain 7032985 plasmid pCD-ISS1, complete sequence | 5148-5184 | 3 | 0.919 |
CP012320_10 | 10.5|2208326|39|CP012320|CRT | 2208326-2208364 | 39 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 695-733 | 3 | 0.923 |
CP012320_10 | 10.5|2208326|39|CP012320|CRT | 2208326-2208364 | 39 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 723-761 | 3 | 0.923 |
CP012320_10 | 10.5|2208326|39|CP012320|CRT | 2208326-2208364 | 39 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 728-766 | 3 | 0.923 |
CP012320_10 | 10.5|2208326|39|CP012320|CRT | 2208326-2208364 | 39 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 19704-19742 | 3 | 0.923 |
CP012320_10 | 10.6|2208393|38|CP012320|CRT | 2208393-2208430 | 38 | NC_011398 | Clostridium phage phiCD27, complete genome | 19163-19200 | 3 | 0.921 |
CP012320_16 | 16.3|3544193|39|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3544193-3544231 | 39 | JX145342 | Clostridium phage phiMMP04, complete genome | 7668-7706 | 3 | 0.923 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | KC821618 | Cellulophaga phage phi10:1, complete genome | 1207-1236 | 4 | 0.867 |
CP012320_5 | 5.3|1513845|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1513845-1513880 | 36 | JX145342 | Clostridium phage phiMMP04, complete genome | 23777-23812 | 4 | 0.889 |
CP012320_9 | 9.10|1858146|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1858146-1858182 | 37 | MK473382 | Clostridium phage JD032, complete genome | 35069-35105 | 4 | 0.892 |
CP012320_10 | 10.1|2208069|31|CP012320|CRT | 2208069-2208099 | 31 | NZ_CP014419 | Staphylococcus aureus strain USA300-SUR15 plasmid pUSA08-1-SUR15, complete sequence | 14287-14317 | 4 | 0.871 |
CP012320_14 | 14.3|3152296|25|CP012320|CRISPRCasFinder | 3152296-3152320 | 25 | HQ634174 | Cyanophage MED4-213, complete genome | 98055-98079 | 4 | 0.84 |
CP012320_14 | 14.3|3152296|25|CP012320|CRISPRCasFinder | 3152296-3152320 | 25 | GU071101 | Prochlorococcus phage P-HM1, complete genome | 15695-15719 | 4 | 0.84 |
CP012320_15 | 15.15|3288529|38|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3288529-3288566 | 38 | JX145341 | Clostridium phage phiMMP02, complete genome | 38170-38207 | 4 | 0.895 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP045692 | Klebsiella pneumoniae strain TK421 plasmid pTK421_2, complete sequence | 78485-78514 | 5 | 0.833 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP042421 | Leuconostoc lactis strain CBA3622 plasmid unnamed1, complete sequence | 41155-41184 | 5 | 0.833 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NC_010418 | Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence | 30253-30282 | 5 | 0.833 |
CP012320_14 | 14.3|3152296|25|CP012320|CRISPRCasFinder | 3152296-3152320 | 25 | MN694568 | Marine virus AFVG_250M879, complete genome | 12134-12158 | 5 | 0.8 |
CP012320_1 | 1.1|150477|29|CP012320|CRISPRCasFinder | 150477-150505 | 29 | KY971610 | Pseudomonas phage PspYZU05, complete genome | 134239-134267 | 6 | 0.793 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP009068 | Borreliella afzelii K78 plasmid cp32-9, complete sequence | 17310-17339 | 6 | 0.8 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP009069 | Borreliella afzelii K78 plasmid cp32-4, complete sequence | 17206-17235 | 6 | 0.8 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NC_015917 | Borreliella bissettii DN127 plasmid lp28-4, complete sequence | 20571-20600 | 6 | 0.8 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP015882 | Ensifer adhaerens strain Casida A plasmid pCasidaAB, complete sequence | 1306356-1306385 | 6 | 0.8 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP028837 | Enterococcus faecalis strain FC plasmid unnamed2, complete sequence | 72809-72838 | 6 | 0.8 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP030264 | Ensifer adhaerens strain Corn53 plasmid AB, complete sequence | 1114535-1114564 | 6 | 0.8 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP042215 | Enterococcus faecalis strain L15 plasmid pL15-A, complete sequence | 17519-17548 | 6 | 0.8 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | CP040041 | Acinetobacter baumannii strain VB958 plasmid unnamed1, complete sequence | 30325-30354 | 6 | 0.8 |
CP012320_4 | 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302471-1302507 | 37 | NC_048665 | Clostridium phage phiCDHM14, complete genome | 338-374 | 6 | 0.838 |
CP012320_4 | 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302471-1302507 | 37 | NC_028838 | Clostridium phage phiCD506, complete genome | 798-834 | 6 | 0.838 |
CP012320_4 | 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302471-1302507 | 37 | HG796225 | Clostridium phage phiCDHM13 complete genome | 338-374 | 6 | 0.838 |
CP012320_4 | 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302471-1302507 | 37 | LN681538 | Clostridium phage phiCD481-1, complete genome | 821-857 | 6 | 0.838 |
CP012320_4 | 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302471-1302507 | 37 | HG798901 | Clostridium phage phiCDHM11 complete genome | 338-374 | 6 | 0.838 |
CP012320_11 | 11.11|2509127|38|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2509127-2509164 | 38 | AY855346 | Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome | 9402-9439 | 6 | 0.842 |
CP012320_11 | 11.11|2509127|38|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2509127-2509164 | 38 | NC_007917 | Clostridium phage phi CD119, complete genome | 9402-9439 | 6 | 0.842 |
CP012320_11 | 11.11|2509127|38|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2509127-2509164 | 38 | NC_028996 | Clostridium phage phiCDHM19, complete genome | 9648-9685 | 6 | 0.842 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | CP016195 | Bacillus thuringiensis serovar coreanensis strain ST7 plasmid pST7-1, complete sequence | 182637-182666 | 7 | 0.767 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | MN693725 | Marine virus AFVG_250M494, complete genome | 7495-7524 | 7 | 0.767 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP017230 | Campylobacter jejuni strain FORC_046 isolate Not reported plasmid pFORC46.1, complete sequence | 20957-20986 | 7 | 0.767 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NC_017577 | Shewanella baltica OS117 plasmid pSBAL11701, complete sequence | 108731-108760 | 7 | 0.767 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_LR214986 | Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13 | 357630-357659 | 7 | 0.767 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP014203 | Clostridium baratii strain CDC51267 plasmid pNPD11_1, complete sequence | 111331-111360 | 7 | 0.767 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | NC_013357 | Zymomonas mobilis subsp. mobilis NCIMB 11163 plasmid pZA1002, complete sequence | 39380-39413 | 7 | 0.794 |
CP012320_6 | 6.2|1625151|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1625151-1625187 | 37 | MF417840 | Uncultured Caudovirales phage clone 2AX_3, partial genome | 5012-5048 | 7 | 0.811 |
CP012320_10 | 10.1|2208069|31|CP012320|CRT | 2208069-2208099 | 31 | NZ_CP007752 | Campylobacter jejuni subsp. jejuni D42a plasmid pTet-D42a, complete sequence | 38371-38401 | 7 | 0.774 |
CP012320_10 | 10.1|2208069|31|CP012320|CRT | 2208069-2208099 | 31 | NZ_CP017026 | Campylobacter coli plasmid pCC14983A-1, complete sequence | 111425-111455 | 7 | 0.774 |
CP012320_10 | 10.1|2208069|31|CP012320|CRT | 2208069-2208099 | 31 | NZ_CP007182 | Campylobacter coli RM4661 plasmid pRM4661_48kbp, complete sequence | 32132-32162 | 7 | 0.774 |
CP012320_14 | 14.1|3152161|31|CP012320|CRISPRCasFinder | 3152161-3152191 | 31 | NC_019765 | Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.01, complete sequence | 168164-168194 | 7 | 0.774 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP006906 | Clostridium baratii str. Sullivan plasmid pCBJ, complete sequence | 75812-75841 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | MN693547 | Marine virus AFVG_25M424, complete genome | 13091-13120 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | MN693297 | Marine virus AFVG_25M423, complete genome | 9184-9213 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP006570 | Sodalis praecaptivus strain HS1 plasmid pHS1, complete sequence | 274006-274035 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | AP014396 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S46-C203, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 2835-2864 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | MN693353 | Marine virus AFVG_25M425, complete genome | 17638-17667 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP028373 | Campylobacter jejuni subsp. jejuni strain huA17 plasmid unnamed1, complete sequence | 71028-71057 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP028373 | Campylobacter jejuni subsp. jejuni strain huA17 plasmid unnamed1, complete sequence | 72280-72309 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | AP022644 | Bacillus wiedmannii PL1 plasmid pBwiPL1-1 DNA, complete sequence | 88412-88441 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_LR214999 | Mycoplasma conjunctivae strain NCTC10147 plasmid 3 | 47192-47221 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | LR214965 | Mycoplasma fermentans strain NCTC10117 genome assembly, plasmid: 11 | 36784-36813 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP014745 | Campylobacter jejuni strain OD267 plasmid pCJDM67 L, complete sequence | 113566-113595 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | CP024686 | Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-2-313K, complete sequence | 34948-34977 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP014345 | Campylobacter jejuni strain RM3194 plasmid unnamed, complete sequence | 54090-54119 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP014345 | Campylobacter jejuni strain RM3194 plasmid unnamed, complete sequence | 55342-55371 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP014743 | Campylobacter jejuni strain WP2202 plasmid pCJDM202, complete sequence | 116226-116255 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP017417 | Campylobacter jejuni strain MTVDSCj13 plasmid pMTVDSCj13-2, complete sequence | 28139-28168 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_LR134420 | Legionella adelaidensis strain NCTC12735 genome assembly, plasmid: 11 | 60920-60949 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP044174 | Campylobacter jejuni strain AR-0412 plasmid pAR-0412, complete sequence | 10352-10381 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | MK448965 | Streptococcus phage Javan506, complete genome | 13313-13342 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NC_007581 | Clostridium phage c-st, complete genome | 13365-13394 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | MK448959 | Streptococcus phage Javan488, complete genome | 13313-13342 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | MK448686 | Streptococcus phage Javan157, complete genome | 12914-12943 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | MK448949 | Streptococcus phage Javan460, complete genome | 13313-13342 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | MK448951 | Streptococcus phage Javan470, complete genome | 12914-12943 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | MK448676 | Streptococcus phage Javan131, complete genome | 14779-14808 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | AP008983 | Clostridium phage c-st genomic DNA, complete genome | 13365-13394 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP043762 | Paenibacillus sp. 37 plasmid pART37, complete sequence | 6554-6583 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP019232 | Bacillus thuringiensis strain YGd22-03 plasmid pYGD36, complete sequence | 3173-3202 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP010112 | Bacillus thuringiensis serovar indiana strain HD521 plasmid pBTHD521-6, complete sequence | 199881-199910 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP015730 | Bacillus cereus strain A1 plasmid pBCA1, complete sequence | 134417-134446 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | CP012553 | Campylobacter sp. RM16192 plasmid p16192, complete sequence | 15672-15701 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | KY554775 | Lactococcus phage AM11, complete genome | 20566-20595 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | KY554773 | Lactococcus phage AM8, complete genome | 20565-20594 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | KY554768 | Lactococcus phage AM1, complete genome | 20565-20594 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | KY554769 | Lactococcus phage AM2, complete genome | 20565-20594 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | KY554770 | Lactococcus phage AM3, complete genome | 20567-20596 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | MN694408 | Marine virus AFVG_250M293, complete genome | 5785-5814 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | KY554776 | Lactococcus phage AM12, complete genome | 20547-20576 | 8 | 0.733 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | KY554774 | Lactococcus phage AM9, complete genome | 20565-20594 | 8 | 0.733 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | NZ_CP014853 | Bacillus thuringiensis strain HD12 plasmid pHD120345, complete sequence | 184073-184106 | 8 | 0.765 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | NZ_CP053953 | Bacillus cereus strain FDAARGOS_798 plasmid unnamed2, complete sequence | 159293-159326 | 8 | 0.765 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | NZ_CP053950 | Bacillus cereus strain FDAARGOS_799 plasmid unnamed2, complete sequence | 53540-53573 | 8 | 0.765 |
CP012320_4 | 4.9|1302999|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302999-1303035 | 37 | MN856006 | Siphoviridae sp. isolate 29, complete genome | 2302-2338 | 8 | 0.784 |
CP012320_4 | 4.9|1302999|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302999-1303035 | 37 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 41439-41475 | 8 | 0.784 |
CP012320_4 | 4.9|1302999|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302999-1303035 | 37 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 20581-20617 | 8 | 0.784 |
CP012320_4 | 4.9|1302999|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302999-1303035 | 37 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 41408-41444 | 8 | 0.784 |
CP012320_4 | 4.9|1302999|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302999-1303035 | 37 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 40938-40974 | 8 | 0.784 |
CP012320_5 | 5.3|1513845|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1513845-1513880 | 36 | MK373783 | Escherichia phage vB_EcoM_KWBSE43-6, complete genome | 127068-127103 | 8 | 0.778 |
CP012320_9 | 9.9|1858081|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1858081-1858116 | 36 | NZ_AP017932 | Lactobacillus sakei strain LK-145 plasmid pLs145-a, complete sequence | 32832-32867 | 8 | 0.778 |
CP012320_10 | 10.1|2208069|31|CP012320|CRT | 2208069-2208099 | 31 | NZ_CP053971 | Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_796 plasmid unnamed3, complete sequence | 12400-12430 | 8 | 0.742 |
CP012320_10 | 10.1|2208069|31|CP012320|CRT | 2208069-2208099 | 31 | NZ_CP039724 | Bacillus thuringiensis strain BT-59 plasmid p3, complete sequence | 70259-70289 | 8 | 0.742 |
CP012320_10 | 10.1|2208069|31|CP012320|CRT | 2208069-2208099 | 31 | NZ_CP013278 | Bacillus thuringiensis serovar israelensis strain AM65-52 plasmid pAM65-52-3-235K, complete sequence | 63045-63075 | 8 | 0.742 |
CP012320_10 | 10.1|2208069|31|CP012320|CRT | 2208069-2208099 | 31 | NC_018509 | Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid pBTHD789-2, complete sequence | 56929-56959 | 8 | 0.742 |
CP012320_10 | 10.1|2208069|31|CP012320|CRT | 2208069-2208099 | 31 | NZ_CP051859 | Bacillus thuringiensis serovar israelensis strain BGSC 4Q7rifR plasmid pBtic235, complete sequence | 169573-169603 | 8 | 0.742 |
CP012320_10 | 10.1|2208069|31|CP012320|CRT | 2208069-2208099 | 31 | NZ_CP009347 | Bacillus thuringiensis HD1002 plasmid 3, complete sequence | 208329-208359 | 8 | 0.742 |
CP012320_10 | 10.1|2208069|31|CP012320|CRT | 2208069-2208099 | 31 | NZ_CP045025 | Bacillus thuringiensis strain JW-1 plasmid p3, complete sequence | 63045-63075 | 8 | 0.742 |
CP012320_10 | 10.1|2208069|31|CP012320|CRT | 2208069-2208099 | 31 | NC_014633 | Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence | 857477-857507 | 8 | 0.742 |
CP012320_10 | 10.13|2208260|37|CP012320|CRISPRCasFinder | 2208260-2208296 | 37 | NZ_CP034684 | Bacillus sp. BD59S plasmid pBTBD59S1, complete sequence | 35137-35173 | 8 | 0.784 |
CP012320_10 | 10.21|2208261|37|CP012320|PILER-CR | 2208261-2208297 | 37 | NZ_CP034684 | Bacillus sp. BD59S plasmid pBTBD59S1, complete sequence | 35137-35173 | 8 | 0.784 |
CP012320_2 | 2.2|727877|37|CP012320|CRISPRCasFinder | 727877-727913 | 37 | NC_022879 | Enterococcus mundtii QU 25 plasmid pQY182, complete sequence | 9006-9042 | 9 | 0.757 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP004877 | Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD-1 plasmid pBMB431, complete sequence | 64826-64855 | 9 | 0.7 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP004860 | Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. YBT-1520 plasmid pBMB422, complete sequence | 85077-85106 | 9 | 0.7 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP011156 | Bacillus cereus strain HN001 plasmid pRML01, complete sequence | 234555-234584 | 9 | 0.7 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP010090 | Bacillus thuringiensis serovar galleriae strain 4G5 plasmid pBMB426, complete sequence | 68597-68626 | 9 | 0.7 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | AP013426 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G16, isolate: uvMED-CGR-C57-MedDCM-OCT-S27-C24 | 23413-23442 | 9 | 0.7 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | KJ535721 | Listeria phage List-36, complete genome | 131839-131868 | 9 | 0.7 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP014283 | Bacillus thuringiensis strain Bt185 plasmid pBT1850636, complete sequence | 430237-430266 | 9 | 0.7 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP033461 | Brevibacillus laterosporus strain 1821L plasmid p1821L01, complete sequence | 7252-7281 | 9 | 0.7 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP011350 | Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC1, complete sequence | 190785-190814 | 9 | 0.7 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP032614 | Bacillus thuringiensis strain QZL38 plasmid p.1, complete sequence | 119421-119450 | 9 | 0.7 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP007616 | Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. YBT-1520 plasmid pBMB400, complete sequence | 293348-293377 | 9 | 0.7 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NC_002253 | Buchnera aphidicola str. APS (Acyrthosiphon pisum) plasmid pLeu, complete sequence | 2039-2068 | 9 | 0.7 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP023246 | Bacillus cereus strain HBL-AI plasmid unnamed1, complete sequence | 252793-252822 | 9 | 0.7 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP048772 | Campylobacter jejuni strain ZS007 plasmid pCJ145K, complete sequence | 129793-129822 | 9 | 0.7 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP048772 | Campylobacter jejuni strain ZS007 plasmid pCJ145K, complete sequence | 131046-131075 | 9 | 0.7 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | MN172529 | Listeria phage LP-039, complete genome | 130877-130906 | 9 | 0.7 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | DQ003638 | Listeria phage A511, complete genome | 132156-132185 | 9 | 0.7 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | KJ591604 | Listeria phage LMTA-148, complete genome | 7271-7300 | 9 | 0.7 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | KJ094033 | Listeria phage LP-048, complete genome | 305-334 | 9 | 0.7 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | JQ797329 | Listeria phage vB_LmoM_AG20, complete genome | 130913-130942 | 9 | 0.7 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | NZ_CP038617 | Arsenophonus nasoniae strain FIN plasmid pArsFIN5, complete sequence | 74655-74688 | 9 | 0.735 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | NC_012577 | Bacillus anthracis str. CDC 684 plasmid pX02, complete sequence | 73434-73467 | 9 | 0.735 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | NZ_AP018445 | Bacillus anthracis strain CZC5 plasmid pXO2, complete sequence | 74990-75023 | 9 | 0.735 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | NZ_CP006744 | Bacillus anthracis str. SVA11 plasmid pXO2, complete sequence | 74950-74983 | 9 | 0.735 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | NC_017727 | Bacillus anthracis str. H9401 plasmid BAP2, complete sequence | 75004-75037 | 9 | 0.735 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | NZ_CP009462 | Bacillus anthracis strain SK-102 plasmid pXO2, complete sequence | 7723-7756 | 9 | 0.735 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | NZ_CP009326 | Bacillus anthracis strain Vollum 1B plasmid 2, complete sequence | 54288-54321 | 9 | 0.735 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | MH542234 | Staphylococcus phage Terranova, complete genome | 32909-32942 | 9 | 0.735 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | MH321491 | Staphylococcus phage Twillingate, complete genome | 33428-33461 | 9 | 0.735 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | NZ_CP014283 | Bacillus thuringiensis strain Bt185 plasmid pBT1850636, complete sequence | 556003-556036 | 9 | 0.735 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | NZ_CP032614 | Bacillus thuringiensis strain QZL38 plasmid p.1, complete sequence | 245187-245220 | 9 | 0.735 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | MN871490 | UNVERIFIED: Salmonella phage SEzh_1, complete genome | 44341-44374 | 9 | 0.735 |
CP012320_8 | 8.4|1720183|33|CP012320|CRISPRCasFinder | 1720183-1720215 | 33 | NZ_CP053838 | Aliiarcobacter faecis strain CCUG 66484 plasmid pAFAEC, complete sequence | 73614-73646 | 9 | 0.727 |
CP012320_8 | 8.4|1720183|33|CP012320|CRISPRCasFinder | 1720183-1720215 | 33 | NZ_CP032824 | Arcobacter cryaerophilus ATCC 43158 plasmid pACRY43158, complete sequence | 2020-2052 | 9 | 0.727 |
CP012320_8 | 8.4|1720183|33|CP012320|CRISPRCasFinder | 1720183-1720215 | 33 | NZ_MK715471 | Arcobacter cryaerophilus strain M830MA plasmid pM830MA, complete sequence | 60841-60873 | 9 | 0.727 |
CP012320_9 | 9.9|1858081|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1858081-1858116 | 36 | NZ_LN890332 | Leuconostoc gelidum subsp. gasicomitatum KG16-1 isolate LEKG1 plasmid II, complete sequence | 19456-19491 | 9 | 0.75 |
CP012320_9 | 9.9|1858081|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1858081-1858116 | 36 | NZ_CP032750 | Lactobacillus paraplantarum strain DSM 10667 plasmid unnamed6, complete sequence | 11726-11761 | 9 | 0.75 |
CP012320_9 | 9.9|1858081|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1858081-1858116 | 36 | NZ_CP042398 | Leuconostoc citreum strain CBA3623 plasmid unnamed5, complete sequence | 10132-10167 | 9 | 0.75 |
CP012320_9 | 9.9|1858081|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1858081-1858116 | 36 | NZ_CP042376 | Leuconostoc carnosum strain CBA3620 plasmid unnamed2, complete sequence | 27080-27115 | 9 | 0.75 |
CP012320_9 | 9.9|1858081|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1858081-1858116 | 36 | NZ_CP042400 | Weissella hellenica strain CBA3632 plasmid unnamed1, complete sequence | 36943-36978 | 9 | 0.75 |
CP012320_9 | 9.9|1858081|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1858081-1858116 | 36 | NZ_CP014612 | Leuconostoc mesenteroides subsp. jonggajibkimchii strain DRC1506 plasmid pDRC1, complete sequence | 7827-7862 | 9 | 0.75 |
CP012320_9 | 9.9|1858081|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1858081-1858116 | 36 | NZ_CP017200 | Leuconostoc gelidum subsp. gasicomitatum strain TMW 2.1619 plasmid pL21619-3, complete genome | 7159-7194 | 9 | 0.75 |
CP012320_9 | 9.9|1858081|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1858081-1858116 | 36 | NZ_CP042384 | Leuconostoc pseudomesenteroides strain CBA3630 plasmid unnamed1, complete sequence | 11740-11775 | 9 | 0.75 |
CP012320_9 | 9.9|1858081|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1858081-1858116 | 36 | NZ_CP012874 | Weissella cibaria strain CH2 plasmid pMKC01, complete sequence | 15401-15436 | 9 | 0.75 |
CP012320_9 | 9.9|1858081|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1858081-1858116 | 36 | NZ_CP012876 | Weissella cibaria strain CH2 plasmid pMKC03, complete sequence | 6103-6138 | 9 | 0.75 |
CP012320_9 | 9.9|1858081|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1858081-1858116 | 36 | NZ_CP012876 | Weissella cibaria strain CH2 plasmid pMKC03, complete sequence | 13134-13169 | 9 | 0.75 |
CP012320_9 | 9.9|1858081|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1858081-1858116 | 36 | NZ_CP012876 | Weissella cibaria strain CH2 plasmid pMKC03, complete sequence | 20165-20200 | 9 | 0.75 |
CP012320_10 | 10.1|2208069|31|CP012320|CRT | 2208069-2208099 | 31 | NC_011246 | Borrelia recurrentis A1 plasmid pl124, complete sequence | 62584-62614 | 9 | 0.71 |
CP012320_10 | 10.1|2208069|31|CP012320|CRT | 2208069-2208099 | 31 | NC_011247 | Borrelia duttonii Ly plasmid pl165, complete sequence | 100908-100938 | 9 | 0.71 |
CP012320_10 | 10.1|2208069|31|CP012320|CRT | 2208069-2208099 | 31 | NZ_CP028890 | Borrelia turcica IST7 plasmid lp34, complete sequence | 2064-2094 | 9 | 0.71 |
CP012320_10 | 10.1|2208069|31|CP012320|CRT | 2208069-2208099 | 31 | NZ_CP017832 | Butyrivibrio hungatei strain MB2003 plasmid pNP144, complete sequence | 52592-52622 | 9 | 0.71 |
CP012320_10 | 10.4|2208260|38|CP012320|CRT | 2208260-2208297 | 38 | NZ_CP034684 | Bacillus sp. BD59S plasmid pBTBD59S1, complete sequence | 35136-35173 | 9 | 0.763 |
CP012320_10 | 10.13|2208260|37|CP012320|CRISPRCasFinder | 2208260-2208296 | 37 | NZ_CP009691 | Bacillus mycoides strain ATCC 6462 plasmid pBMX_1, complete sequence | 294136-294172 | 9 | 0.757 |
CP012320_10 | 10.21|2208261|37|CP012320|PILER-CR | 2208261-2208297 | 37 | NZ_CP009691 | Bacillus mycoides strain ATCC 6462 plasmid pBMX_1, complete sequence | 294136-294172 | 9 | 0.757 |
CP012320_15 | 15.11|3288267|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3288267-3288303 | 37 | NZ_CP033246 | Clostridium butyricum strain CFSA3987 plasmid pCFSA3987, complete sequence | 212802-212838 | 9 | 0.757 |
CP012320_15 | 15.11|3288267|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3288267-3288303 | 37 | NZ_CP033248 | Clostridium butyricum strain CFSA3989 plasmid pCFSA3989, complete sequence | 212842-212878 | 9 | 0.757 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | KJ018210 | Flavobacterium sp. phage 1/32, complete genome | 7455-7484 | 10 | 0.667 |
CP012320_4 | 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302471-1302507 | 37 | MF288922 | Bacillus phage Janet, complete genome | 40501-40537 | 10 | 0.73 |
CP012320_4 | 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302471-1302507 | 37 | MH538296 | Bacillus phage Maceta, complete genome | 36442-36478 | 10 | 0.73 |
CP012320_4 | 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302471-1302507 | 37 | NC_024216 | Bacillus phage CAM003, complete genome | 40425-40461 | 10 | 0.73 |
CP012320_4 | 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302471-1302507 | 37 | KJ489400 | Bacillus phage Hoody T, complete genome | 40245-40281 | 10 | 0.73 |
CP012320_4 | 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302471-1302507 | 37 | MF288921 | Bacillus phage OTooleKemple52, complete genome | 39856-39892 | 10 | 0.73 |
CP012320_4 | 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302471-1302507 | 37 | MH638310 | Bacillus phage Kamfam, complete genome | 39856-39892 | 10 | 0.73 |
CP012320_4 | 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302471-1302507 | 37 | MK215646 | Bacillus phage vB_BthM-Goe5, complete genome | 38291-38327 | 10 | 0.73 |
CP012320_4 | 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302471-1302507 | 37 | KU737346 | Bacillus phage Vinny, complete genome | 40763-40799 | 10 | 0.73 |
CP012320_4 | 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302471-1302507 | 37 | NC_024207 | Bacillus phage Evoli, complete genome | 40158-40194 | 10 | 0.73 |
CP012320_4 | 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302471-1302507 | 37 | MF498901 | Bacillus phage Anthony, complete genome | 40764-40800 | 10 | 0.73 |
CP012320_4 | 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302471-1302507 | 37 | NC_018856 | Bacillus phage Bastille, complete genome | 14410-14446 | 10 | 0.73 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | NC_011655 | Bacillus cereus AH187 plasmid pAH187_270, complete sequence | 211572-211605 | 10 | 0.706 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | NZ_LR215033 | Mycoplasma gallopavonis strain NCTC10186 plasmid 3 | 18706-18739 | 10 | 0.706 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | NZ_CP015507 | Bacillus oceanisediminis 2691 plasmid pBO1, complete sequence | 324084-324117 | 10 | 0.706 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | NC_010924 | Bacillus cereus strain AH187 plasmid pCER270, complete sequence | 267981-268014 | 10 | 0.706 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | MN693105 | Marine virus AFVG_25M79, complete genome | 33974-34007 | 10 | 0.706 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | KY554775 | Lactococcus phage AM11, complete genome | 45977-46010 | 10 | 0.706 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | KY554773 | Lactococcus phage AM8, complete genome | 45976-46009 | 10 | 0.706 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | KY554768 | Lactococcus phage AM1, complete genome | 46208-46241 | 10 | 0.706 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | KY554769 | Lactococcus phage AM2, complete genome | 46201-46234 | 10 | 0.706 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 34307-34340 | 10 | 0.706 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | KY554770 | Lactococcus phage AM3, complete genome | 46578-46611 | 10 | 0.706 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 27716-27749 | 10 | 0.706 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | KY554776 | Lactococcus phage AM12, complete genome | 45958-45991 | 10 | 0.706 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | KY554774 | Lactococcus phage AM9, complete genome | 45975-46008 | 10 | 0.706 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | NZ_CP004866 | Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. YBT-1520 plasmid pBMB7921, complete sequence | 5227-5260 | 10 | 0.706 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | NZ_CP009542 | Bacillus anthracis strain BA1015 plasmid pXO2, complete sequence | 54338-54371 | 10 | 0.706 |
CP012320_8 | 8.4|1720183|33|CP012320|CRISPRCasFinder | 1720183-1720215 | 33 | AP019525 | Tenacibaculum phage PTm5 DNA, complete genome | 76997-77029 | 10 | 0.697 |
CP012320_8 | 8.4|1720183|33|CP012320|CRISPRCasFinder | 1720183-1720215 | 33 | AP019524 | Tenacibaculum phage PTm1 DNA, complete genome | 77006-77038 | 10 | 0.697 |
CP012320_9 | 9.9|1858081|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1858081-1858116 | 36 | NZ_CP033609 | Weissella hellenica strain 0916-4-2 plasmid pWHSP041, complete sequence | 30210-30245 | 10 | 0.722 |
CP012320_9 | 9.10|1858146|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1858146-1858182 | 37 | HG798901 | Clostridium phage phiCDHM11 complete genome | 31575-31611 | 10 | 0.73 |
CP012320_10 | 10.4|2208260|38|CP012320|CRT | 2208260-2208297 | 38 | NZ_CP009691 | Bacillus mycoides strain ATCC 6462 plasmid pBMX_1, complete sequence | 294136-294173 | 10 | 0.737 |
CP012320_11 | 11.1|2508469|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT | 2508469-2508504 | 36 | NZ_CP045274 | Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301B, complete sequence | 47033-47068 | 10 | 0.722 |
CP012320_11 | 11.13|2509261|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2509261-2509296 | 36 | AP014113 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C35-MedDCM-OCT-S46-C200, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 269-304 | 10 | 0.722 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | NZ_CP053290 | Bacillus cereus strain WPySW2 plasmid unnamed, complete sequence | 40718-40751 | 11 | 0.676 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | NZ_CP029455 | Bacillus cereus strain FORC087 plasmid pFORC087.1, complete sequence | 161754-161787 | 11 | 0.676 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | NC_005707 | Bacillus cereus ATCC 10987 plasmid pBc10987, complete sequence | 124705-124738 | 11 | 0.676 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | CP045776 | Bacillus paranthracis strain CFSAN068816 plasmid p1CFSAN068816, complete sequence | 260406-260439 | 11 | 0.676 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | NC_016792 | Bacillus cereus NC7401 plasmid pNCcld, complete sequence | 266850-266883 | 11 | 0.676 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | AP013659 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C24-MedDCM-OCT-S34-C213, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 1354-1387 | 11 | 0.676 |
CP012320_11 | 11.10|2509061|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2509061-2509097 | 37 | NC_018878 | Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_502p, complete sequence | 269698-269734 | 11 | 0.703 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | MN694638 | Marine virus AFVG_250M1093, complete genome | 452-485 | 12 | 0.647 |
CP012320_4 | 4.13|1303264|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1303264-1303300 | 37 | NZ_CP024773 | Bacillus thuringiensis LM1212 plasmid pLM2, complete sequence | 122227-122263 | 12 | 0.676 |
CP012320_4 | 4.13|1303264|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1303264-1303300 | 37 | NZ_CP041075 | Bacillus tropicus strain LM1212-W3 plasmid p2, complete sequence | 49110-49146 | 12 | 0.676 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | MT774377 | CrAssphage cr107_1, complete genome | 300-333 | 13 | 0.618 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | LR794151 | Bacteriophage APSE-7 strain HaDrplatanoidis-3702 genome assembly, chromosome: 1 | 17413-17446 | 13 | 0.618 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | MK504442 | Lactobacillus phage 3-SAC12, complete genome | 37723-37756 | 13 | 0.618 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | NZ_CP020746 | Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed3, complete sequence | 72615-72648 | 14 | 0.588 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | NZ_CP050055 | Pseudomonas aeruginosa strain LIUYANG-A plasmid unnamed2, complete sequence | 4713-4746 | 14 | 0.588 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | MN694330 | Marine virus AFVG_250M1134, complete genome | 561-594 | 14 | 0.588 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | MH892354 | Streptococcus phage SW3, complete genome | 24328-24361 | 14 | 0.588 |
CP012320_4 | 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1302870-1302903 | 34 | NZ_CP009698 | Bacillus anthracis strain BA1035 plasmid pXO2, complete sequence | 72203-72236 | 15 | 0.559 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP011156 | Bacillus cereus strain HN001 plasmid pRML01, complete sequence | 429045-429074 | 16 | 0.467 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP040783 | Bacillus thuringiensis strain HM-311 plasmid p1, complete sequence | 410674-410703 | 16 | 0.467 |
CP012320_3 | 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder | 1007274-1007303 | 30 | NZ_CP014283 | Bacillus thuringiensis strain Bt185 plasmid pBT1850636, complete sequence | 141205-141234 | 16 | 0.467 |
1. spacer 1.1|150477|29|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033215 (Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tgtaataagttaaagcaatatgaatcaac CRISPR spacer tgtaataagttaaagcaatatgaatcaac Protospacer *****************************
2. spacer 2.1|727817|37|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_MG973074 (Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aacaggtcttataacatttgaagataatcattactat CRISPR spacer aacaggtcttataacatttgaagataatcattactat Protospacer *************************************
3. spacer 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK473382 (Clostridium phage JD032, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tctccatctccaattaacataaataattcatccgctg CRISPR spacer tctccatctccaattaacataaataattcatccgctg Protospacer *************************************
4. spacer 4.8|1302933|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttataaactcccacgacaaaattaactataacctcgt CRISPR spacer ttataaactcccacgacaaaattaactataacctcgt Protospacer *************************************
5. spacer 4.14|1303330|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681539 (Clostridium phage phiCD505, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cttttaagtgcatcaaaggagttacaagctatattta CRISPR spacer cttttaagtgcatcaaaggagttacaagctatattta Protospacer *************************************
6. spacer 4.14|1303330|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cttttaagtgcatcaaaggagttacaagctatattta CRISPR spacer cttttaagtgcatcaaaggagttacaagctatattta Protospacer *************************************
7. spacer 4.14|1303330|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048642 (Clostridium phage CDKM9, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cttttaagtgcatcaaaggagttacaagctatattta CRISPR spacer cttttaagtgcatcaaaggagttacaagctatattta Protospacer *************************************
8. spacer 5.7|1514111|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gaattatatattatgaaaaaatatggagtcacagagg CRISPR spacer gaattatatattatgaaaaaatatggagtcacagagg Protospacer *************************************
9. spacer 9.3|1857683|38|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aggtcaagcatagattttgcaactggaagataagaaga CRISPR spacer aggtcaagcatagattttgcaactggaagataagaaga Protospacer **************************************
10. spacer 9.10|1858146|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048665 (Clostridium phage phiCDHM14, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atgtccccacatcaattttcctccgcatgaaaaaatc CRISPR spacer atgtccccacatcaattttcctccgcatgaaaaaatc Protospacer *************************************
11. spacer 9.10|1858146|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JX145342 (Clostridium phage phiMMP04, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atgtccccacatcaattttcctccgcatgaaaaaatc CRISPR spacer atgtccccacatcaattttcctccgcatgaaaaaatc Protospacer *************************************
12. spacer 9.10|1858146|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028838 (Clostridium phage phiCD506, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atgtccccacatcaattttcctccgcatgaaaaaatc CRISPR spacer atgtccccacatcaattttcctccgcatgaaaaaatc Protospacer *************************************
13. spacer 9.10|1858146|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG796225 (Clostridium phage phiCDHM13 complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atgtccccacatcaattttcctccgcatgaaaaaatc CRISPR spacer atgtccccacatcaattttcctccgcatgaaaaaatc Protospacer *************************************
14. spacer 9.10|1858146|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681538 (Clostridium phage phiCD481-1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atgtccccacatcaattttcctccgcatgaaaaaatc CRISPR spacer atgtccccacatcaattttcctccgcatgaaaaaatc Protospacer *************************************
15. spacer 10.14|2208326|38|CP012320|CRISPRCasFinder matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atggcagtaactaagaagaaaactataccttttttatt CRISPR spacer atggcagtaactaagaagaaaactataccttttttatt Protospacer **************************************
16. spacer 10.22|2208327|38|CP012320|PILER-CR matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atggcagtaactaagaagaaaactataccttttttatt CRISPR spacer atggcagtaactaagaagaaaactataccttttttatt Protospacer **************************************
17. spacer 11.13|2509261|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgtagattttgtaagtaatggtttttcggaaaaag CRISPR spacer ttgtagattttgtaagtaatggtttttcggaaaaag Protospacer ************************************
18. spacer 11.13|2509261|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KX228400 (Clostridium phage CDKM15, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgtagattttgtaagtaatggtttttcggaaaaag CRISPR spacer ttgtagattttgtaagtaatggtttttcggaaaaag Protospacer ************************************
19. spacer 11.14|2509326|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LN681539 (Clostridium phage phiCD505, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaaataagctatgaagctaaaggagaaatgaaaggag CRISPR spacer aaaataagctatgaagctaaaggagaaatgaaaggag Protospacer *************************************
20. spacer 11.14|2509326|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaaataagctatgaagctaaaggagaaatgaaaggag CRISPR spacer aaaataagctatgaagctaaaggagaaatgaaaggag Protospacer *************************************
21. spacer 11.14|2509326|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaaataagctatgaagctaaaggagaaatgaaaggag CRISPR spacer aaaataagctatgaagctaaaggagaaatgaaaggag Protospacer *************************************
22. spacer 11.14|2509326|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_048642 (Clostridium phage CDKM9, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaaataagctatgaagctaaaggagaaatgaaaggag CRISPR spacer aaaataagctatgaagctaaaggagaaatgaaaggag Protospacer *************************************
23. spacer 11.14|2509326|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KX228400 (Clostridium phage CDKM15, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaaataagctatgaagctaaaggagaaatgaaaggag CRISPR spacer aaaataagctatgaagctaaaggagaaatgaaaggag Protospacer *************************************
24. spacer 15.9|3288136|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
taatttagttatatccatttgtttaacccaattagt CRISPR spacer taatttagttatatccatttgtttaacccaattagt Protospacer ************************************
25. spacer 15.9|3288136|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
taatttagttatatccatttgtttaacccaattagt CRISPR spacer taatttagttatatccatttgtttaacccaattagt Protospacer ************************************
26. spacer 15.10|3288201|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP020426 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtttcattttgcactatatcaagcttagtatacaatg CRISPR spacer gtttcattttgcactatatcaagcttagtatacaatg Protospacer *************************************
27. spacer 15.10|3288201|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP011970 (Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtttcattttgcactatatcaagcttagtatacaatg CRISPR spacer gtttcattttgcactatatcaagcttagtatacaatg Protospacer *************************************
28. spacer 15.10|3288201|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LN681537 (Clostridium phage phiCD211, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtttcattttgcactatatcaagcttagtatacaatg CRISPR spacer gtttcattttgcactatatcaagcttagtatacaatg Protospacer *************************************
29. spacer 15.17|3288662|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtaaaatgagaaataaaagtaaacaaaaaggtttagt CRISPR spacer gtaaaatgagaaataaaagtaaacaaaaaggtttagt Protospacer *************************************
30. spacer 2.2|727877|37|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_MG973074 (Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
atatggttatctaaatatagaagataagacgttctac CRISPR spacer atatggttatctaaatatagaagataagatgttctac Protospacer *****************************.*******
31. spacer 4.5|1302736|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
tttataaatcttttaatgactgtctctgatggtacag CRISPR spacer tttataaatcttttaatgactgtctctgatggaacag Protospacer ******************************** ****
32. spacer 4.14|1303330|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681542 (Clostridium phage phiMMP03, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
cttttaagtgcatcaaaggagttacaagctatattta CRISPR spacer cttttaagtgcatcaaaggagttacaggctatattta Protospacer **************************.**********
33. spacer 4.14|1303330|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009231 (Clostridium phage phiC2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
cttttaagtgcatcaaaggagttacaagctatattta CRISPR spacer cttttaagtgcatcaaaggagttacaggctatattta Protospacer **************************.**********
34. spacer 5.5|1513977|38|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
ttttaagcaggtgattaaatgattaaaaaagtagaaaa CRISPR spacer ttttaagtaggtgattaaatgattaaaaaagtagaaaa Protospacer *******.******************************
35. spacer 5.5|1513977|38|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
ttttaagcaggtgattaaatgattaaaaaagtagaaaa CRISPR spacer ttttaagtaggtgattaaatgattaaaaaagtagaaaa Protospacer *******.******************************
36. spacer 5.5|1513977|38|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
ttttaagcaggtgattaaatgattaaaaaagtagaaaa CRISPR spacer ttttaagtaggtgattaaatgattaaaaaagtagaaaa Protospacer *******.******************************
37. spacer 5.7|1514111|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gaattatatattatgaaaaaatatggagtcacagagg CRISPR spacer gaattgtatattatgaaaaaatatggagtcacagagg Protospacer *****.*******************************
38. spacer 5.7|1514111|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gaattatatattatgaaaaaatatggagtcacagagg CRISPR spacer gaattgtatattatgaaaaaatatggagtcacagagg Protospacer *****.*******************************
39. spacer 5.7|1514111|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gaattatatattatgaaaaaatatggagtcacagagg CRISPR spacer gaattgtatattatgaaaaaatatggagtcacagagg Protospacer *****.*******************************
40. spacer 5.7|1514111|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN680009 (Clostridium phage phiCDHS1 gp03 gene for putative portal capsid protein) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gaattatatattatgaaaaaatatggagtcacagagg CRISPR spacer gaattgtatattatgaaaaaatatggagtcacagagg Protospacer *****.*******************************
41. spacer 9.9|1858081|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
aaagttttgcgcattgtatgtgtgcctagattatct CRISPR spacer aaagttttacgcattgtatgtgtgcctagattatct Protospacer ********.***************************
42. spacer 10.5|2208326|39|CP012320|CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
atggcagtaactaagaagaaaactataccttttttattc CRISPR spacer atggcagtaactaagaagaaaactataccttttttattt Protospacer **************************************.
43. spacer 10.15|2208393|37|CP012320|CRISPRCasFinder matches to LN681539 (Clostridium phage phiCD505, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gaggaaattttatactaatgactgatgctagatttaa CRISPR spacer gaggaaattttataataatgactgatgctagatttaa Protospacer ************** **********************
44. spacer 10.15|2208393|37|CP012320|CRISPRCasFinder matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gaggaaattttatactaatgactgatgctagatttaa CRISPR spacer gaggaaattttataataatgactgatgctagatttaa Protospacer ************** **********************
45. spacer 10.15|2208393|37|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NC_048642 (Clostridium phage CDKM9, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gaggaaattttatactaatgactgatgctagatttaa CRISPR spacer gaggaaattttataataatgactgatgctagatttaa Protospacer ************** **********************
46. spacer 10.15|2208393|37|CP012320|CRISPRCasFinder matches to KX228400 (Clostridium phage CDKM15, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gaggaaattttatactaatgactgatgctagatttaa CRISPR spacer gaggaaattttataataatgactgatgctagatttaa Protospacer ************** **********************
47. spacer 10.23|2208394|37|CP012320|PILER-CR matches to LN681539 (Clostridium phage phiCD505, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gaggaaattttatactaatgactgatgctagatttaa CRISPR spacer gaggaaattttataataatgactgatgctagatttaa Protospacer ************** **********************
48. spacer 10.23|2208394|37|CP012320|PILER-CR matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gaggaaattttatactaatgactgatgctagatttaa CRISPR spacer gaggaaattttataataatgactgatgctagatttaa Protospacer ************** **********************
49. spacer 10.23|2208394|37|CP012320|PILER-CR matches to NC_048642 (Clostridium phage CDKM9, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gaggaaattttatactaatgactgatgctagatttaa CRISPR spacer gaggaaattttataataatgactgatgctagatttaa Protospacer ************** **********************
50. spacer 10.23|2208394|37|CP012320|PILER-CR matches to KX228400 (Clostridium phage CDKM15, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gaggaaattttatactaatgactgatgctagatttaa CRISPR spacer gaggaaattttataataatgactgatgctagatttaa Protospacer ************** **********************
51. spacer 15.11|3288267|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP020426 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
ttttatatttaattttaaagattaaaggtataaacaa CRISPR spacer ttttatatttaattttaaagattaaaggtataaacat Protospacer ************************************
52. spacer 15.11|3288267|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP011970 (Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
ttttatatttaattttaaagattaaaggtataaacaa CRISPR spacer ttttatatttaattttaaagattaaaggtataaacat Protospacer ************************************
53. spacer 15.11|3288267|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LN681537 (Clostridium phage phiCD211, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
ttttatatttaattttaaagattaaaggtataaacaa CRISPR spacer ttttatatttaattttaaagattaaaggtataaacat Protospacer ************************************
54. spacer 16.2|3544128|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP020426 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ctctctactaaaattacttccacatatagctacaga CRISPR spacer ctctctactaaaattactcccacatatagctacaga Protospacer ******************.*****************
55. spacer 16.2|3544128|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP029155 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ctctctactaaaattacttccacatatagctacaga CRISPR spacer ctctctactaaaattactcccacatatagctacaga Protospacer ******************.*****************
56. spacer 16.2|3544128|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP011970 (Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ctctctactaaaattacttccacatatagctacaga CRISPR spacer ctctctactaaaattactcccacatatagctacaga Protospacer ******************.*****************
57. spacer 16.2|3544128|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LN681537 (Clostridium phage phiCD211, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ctctctactaaaattacttccacatatagctacaga CRISPR spacer ctctctactaaaattactcccacatatagctacaga Protospacer ******************.*****************
58. spacer 4.3|1302604|35|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
aaaataaaagagtttgaattacccattttttcatg CRISPR spacer aagataaaggagtttgaattacccattttttcatg Protospacer **.*****.**************************
59. spacer 4.5|1302736|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
tttataaatcttttaatgactgtctctgatggtacag CRISPR spacer tttataaatcttttaatgactgtttctgatggaacag Protospacer ***********************.******** ****
60. spacer 5.3|1513845|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028838 (Clostridium phage phiCD506, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
acgaaattagagtttgaaatatatgactacataata CRISPR spacer acgaaactagaatttgaaatatatgactacataata Protospacer ******.****.************************
61. spacer 9.10|1858146|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_008226 (Clostridioides difficile 630 plasmid pCD630, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
atgtccccacatcaattttcctccgcatgaaaaaatc CRISPR spacer atgtccccacatcaattttcctccgaatgaaaaaatg Protospacer ************************* **********
62. spacer 9.10|1858146|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016319 (Clostridioides difficile strain 630 delta erm plasmid pCD630, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
atgtccccacatcaattttcctccgcatgaaaaaatc CRISPR spacer atgtccccacatcaattttcctccgaatgaaaaaatg Protospacer ************************* **********
63. spacer 10.6|2208393|38|CP012320|CRT matches to LN681539 (Clostridium phage phiCD505, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
gaggaaattttatactaatgactgatgctagatttaac CRISPR spacer gaggaaattttataataatgactgatgctagatttaat Protospacer ************** **********************.
64. spacer 10.6|2208393|38|CP012320|CRT matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
gaggaaattttatactaatgactgatgctagatttaac CRISPR spacer gaggaaattttataataatgactgatgctagatttaat Protospacer ************** **********************.
65. spacer 10.6|2208393|38|CP012320|CRT matches to NC_048642 (Clostridium phage CDKM9, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
gaggaaattttatactaatgactgatgctagatttaac CRISPR spacer gaggaaattttataataatgactgatgctagatttaat Protospacer ************** **********************.
66. spacer 10.6|2208393|38|CP012320|CRT matches to KX228400 (Clostridium phage CDKM15, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
gaggaaattttatactaatgactgatgctagatttaac CRISPR spacer gaggaaattttataataatgactgatgctagatttaat Protospacer ************** **********************.
67. spacer 10.14|2208326|38|CP012320|CRISPRCasFinder matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
atggcagtaactaagaagaaaactataccttttttatt CRISPR spacer atggcagtaactaagaagaaaactataccttttcgatt Protospacer *********************************. ***
68. spacer 10.14|2208326|38|CP012320|CRISPRCasFinder matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
atggcagtaactaagaagaaaactataccttttttatt CRISPR spacer atggcagtaactaagaagaaaactataccttttcgatt Protospacer *********************************. ***
69. spacer 10.14|2208326|38|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
atggcagtaactaagaagaaaactataccttttttatt CRISPR spacer atggcagtaactaagaagaaaactataccttttcaatt Protospacer *********************************. ***
70. spacer 10.14|2208326|38|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
atggcagtaactaagaagaaaactataccttttttatt CRISPR spacer atggcagtaactaagaagaaaactataccttttaaatt Protospacer ********************************* ***
71. spacer 10.15|2208393|37|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
gaggaaattttatactaatgactgatgctagatttaa CRISPR spacer gaggaagttttatacaaatgactgatgctagatttaa Protospacer ******.******** *********************
72. spacer 10.22|2208327|38|CP012320|PILER-CR matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
atggcagtaactaagaagaaaactataccttttttatt CRISPR spacer atggcagtaactaagaagaaaactataccttttcgatt Protospacer *********************************. ***
73. spacer 10.22|2208327|38|CP012320|PILER-CR matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
atggcagtaactaagaagaaaactataccttttttatt CRISPR spacer atggcagtaactaagaagaaaactataccttttcgatt Protospacer *********************************. ***
74. spacer 10.22|2208327|38|CP012320|PILER-CR matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
atggcagtaactaagaagaaaactataccttttttatt CRISPR spacer atggcagtaactaagaagaaaactataccttttcaatt Protospacer *********************************. ***
75. spacer 10.22|2208327|38|CP012320|PILER-CR matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
atggcagtaactaagaagaaaactataccttttttatt CRISPR spacer atggcagtaactaagaagaaaactataccttttaaatt Protospacer ********************************* ***
76. spacer 10.23|2208394|37|CP012320|PILER-CR matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
gaggaaattttatactaatgactgatgctagatttaa CRISPR spacer gaggaagttttatacaaatgactgatgctagatttaa Protospacer ******.******** *********************
77. spacer 11.1|2508469|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG973074 (Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
acaattattaattgttttattagtgaaatcacagca CRISPR spacer acaattattaattgttttattaataaaatcacagca Protospacer **********************.*.***********
78. spacer 15.7|3288004|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
agttagtgatatcaatatgctaagcaatatttttaca CRISPR spacer agctagtgatatcaatatgataagcaatatttttaca Protospacer **.**************** *****************
79. spacer 15.7|3288004|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
agttagtgatatcaatatgctaagcaatatttttaca CRISPR spacer agctagtgatatcaatatgataagcaatatttttaca Protospacer **.**************** *****************
80. spacer 15.11|3288267|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP029155 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
ttttatatttaattttaaagattaaaggtataaacaa CRISPR spacer ttttatatttaattttaaagattaaaggtataaatat Protospacer **********************************.*
81. spacer 15.21|3288932|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
gtataaaaaaagagttagaagcattagacaaatgga CRISPR spacer gtataaaaaaagagttagaagcattagatagatgga Protospacer ****************************.*.*****
82. spacer 16.5|3544327|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
tgggatggattttgaagcttctatgtcaaatgtaca CRISPR spacer tggaatggattttgaagcatctatgtcaaatgtaca Protospacer ***.************** *****************
83. spacer 4.10|1303065|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
gcagaagatttagcgactgttgttgctgaatgggatg CRISPR spacer gcgcaaaatttagcgactgttgttgctgaatgggatg Protospacer **. **.******************************
84. spacer 5.10|1514306|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020425 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
tcgaatgtgaatggcacttctatttctccaacttttg CRISPR spacer tcaaatgtgaatggtacttctatttctccaactttcg Protospacer **.***********.********************.*
85. spacer 5.10|1514306|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011969 (Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
tcgaatgtgaatggcacttctatttctccaacttttg CRISPR spacer tcaaatgtgaatggtacttctatttctccaactttcg Protospacer **.***********.********************.*
86. spacer 5.10|1514306|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029156 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
tcgaatgtgaatggcacttctatttctccaacttttg CRISPR spacer tcaaatgtgaatggtacttctatttctccaactttcg Protospacer **.***********.********************.*
87. spacer 5.10|1514306|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029153 (Clostridioides difficile strain CDT4 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
tcgaatgtgaatggcacttctatttctccaacttttg CRISPR spacer tcaaatgtgaatggtacttctatttctccaactttcg Protospacer **.***********.********************.*
88. spacer 7.1|1717763|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029155 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
gttgtaagaagtatcattctattttttaatctttct CRISPR spacer attggaggaagtatcattctattttttaatctttct Protospacer .*** *.*****************************
89. spacer 9.10|1858146|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG266000 (Clostridioides difficile strain 7032985 plasmid pCD-ISS1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
atgtccccacatcaattttcctccgcatgaaaaaatc CRISPR spacer atgcccccacatcaattttcctccgaatgaaaaaatg Protospacer ***.********************* **********
90. spacer 10.5|2208326|39|CP012320|CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
atggcagtaactaagaagaaaactataccttttttattc CRISPR spacer atggcagtaactaagaagaaaactataccttttcgattt Protospacer *********************************. ***.
91. spacer 10.5|2208326|39|CP012320|CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
atggcagtaactaagaagaaaactataccttttttattc CRISPR spacer atggcagtaactaagaagaaaactataccttttcaattt Protospacer *********************************. ***.
92. spacer 10.5|2208326|39|CP012320|CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
atggcagtaactaagaagaaaactataccttttttattc CRISPR spacer atggcagtaactaagaagaaaactataccttttaaattt Protospacer ********************************* ***.
93. spacer 10.5|2208326|39|CP012320|CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
atggcagtaactaagaagaaaactataccttttttattc CRISPR spacer atggcagtaactaagaagaaaactataccttttcgattt Protospacer *********************************. ***.
94. spacer 10.6|2208393|38|CP012320|CRT matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
gaggaaattttatactaatgactgatgctagatttaac CRISPR spacer gaggaagttttatacaaatgactgatgctagatttaat Protospacer ******.******** *********************.
95. spacer 16.3|3544193|39|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JX145342 (Clostridium phage phiMMP04, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
tgtacctgggtcttttatcttacttgtaagtgtacttct CRISPR spacer tgtaccagggtcttttatcttacttgtaagtgtgcttcg Protospacer ****** **************************.****
96. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to KC821618 (Cellulophaga phage phi10:1, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
ctaagtt-ttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer -taatttatttaaaaaactaatataaacaac Protospacer *** ** ** ******.*************
97. spacer 5.3|1513845|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JX145342 (Clostridium phage phiMMP04, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
acgaaattagagtttgaaatatatgactacataata CRISPR spacer agtaaattagaatttgaaatctatgactacataata Protospacer * ********.******** ***************
98. spacer 9.10|1858146|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK473382 (Clostridium phage JD032, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.892
atgtccccacatcaattttcctccgcatgaaaaaatc CRISPR spacer atgtccccacctcaattttcctccgcacgaaaaaaat Protospacer ********** ****************.******* .
99. spacer 10.1|2208069|31|CP012320|CRT matches to NZ_CP014419 (Staphylococcus aureus strain USA300-SUR15 plasmid pUSA08-1-SUR15, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.871
tgactcaatctttatttaataagaaaaaaca CRISPR spacer taaatcaatctttatttaataacaaaaaact Protospacer *.* ****************** *******
100. spacer 14.3|3152296|25|CP012320|CRISPRCasFinder matches to HQ634174 (Cyanophage MED4-213, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
tactattggttcatctgtatttggc CRISPR spacer tgctattggtgcatctgtatttgaa Protospacer *.******** ************.
101. spacer 14.3|3152296|25|CP012320|CRISPRCasFinder matches to GU071101 (Prochlorococcus phage P-HM1, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
tactattggttcatctgtatttggc CRISPR spacer tgctattggtgcatctgtatttgaa Protospacer *.******** ************.
102. spacer 15.15|3288529|38|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.895
aggttaaaaagcaatataaaagattgcatggaattact CRISPR spacer aaattaaaaagcaatataaaagactgtatggaattact Protospacer *..********************.**.***********
103. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP045692 (Klebsiella pneumoniae strain TK421 plasmid pTK421_2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer tttagttttaaaaaaagtaataaaaacaaa Protospacer .* ************* ***** ******
104. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP042421 (Leuconostoc lactis strain CBA3622 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
ctaagt--tttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer --aactcgtttaaaaaaattaatataaataaa Protospacer ** * ********************.**
105. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NC_010418 (Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
ctaagttttaaaaaaattaa-tataaacaac CRISPR spacer ctaagttctaaaaaaattaattatgatcga- Protospacer *******.************ ***.* *.*
106. spacer 14.3|3152296|25|CP012320|CRISPRCasFinder matches to MN694568 (Marine virus AFVG_250M879, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.8
tactattggttcatctgtatttggc CRISPR spacer tcaatttggttcatctgtatttggt Protospacer * *******************.
107. spacer 1.1|150477|29|CP012320|CRISPRCasFinder matches to KY971610 (Pseudomonas phage PspYZU05, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tgtaataagttaaagcaatatgaatcaac CRISPR spacer tacgataagttacagcaatacgaatcatc Protospacer *...******** *******.****** *
108. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009068 (Borreliella afzelii K78 plasmid cp32-9, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer gacacttttaagaaaaataatataaacaac Protospacer * ******.**** *************
109. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009069 (Borreliella afzelii K78 plasmid cp32-4, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer gacacttttaagaaaaataatataaacaac Protospacer * ******.**** *************
110. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NC_015917 (Borreliella bissettii DN127 plasmid lp28-4, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer taatgatttaaaaaatttaatagaaacaac Protospacer . * * ********* ****** *******
111. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP015882 (Ensifer adhaerens strain Casida A plasmid pCasidaAB, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer gtgcgctttaaaagaattaatgtaaacaac Protospacer *. *.*******.*******.********
112. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028837 (Enterococcus faecalis strain FC plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer caaacttttaaaaaaattaatttaaaaatt Protospacer * ** **************** **** * .
113. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP030264 (Ensifer adhaerens strain Corn53 plasmid AB, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer gtgcgctttaaaagaattaatgtaaacaac Protospacer *. *.*******.*******.********
114. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP042215 (Enterococcus faecalis strain L15 plasmid pL15-A, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer caaacttttaaaaaaattaatttaaaaatt Protospacer * ** **************** **** * .
115. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to CP040041 (Acinetobacter baumannii strain VB958 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
---ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer accgtaa---ttaaaaaaattaataggaacaac Protospacer *** *************** .******
116. spacer 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048665 (Clostridium phage phiCDHM14, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.838
tctccatctccaattaacataaataattcatccgctg CRISPR spacer tcattgtctgcaattaacataaataattcatctgctg Protospacer ** ...*** **********************.****
117. spacer 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028838 (Clostridium phage phiCD506, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.838
tctccatctccaattaacataaataattcatccgctg CRISPR spacer tcattgtctgcaattaacataaataattcatctgctg Protospacer ** ...*** **********************.****
118. spacer 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG796225 (Clostridium phage phiCDHM13 complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.838
tctccatctccaattaacataaataattcatccgctg CRISPR spacer tcattgtctgcaattaacataaataattcatctgctg Protospacer ** ...*** **********************.****
119. spacer 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681538 (Clostridium phage phiCD481-1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.838
tctccatctccaattaacataaataattcatccgctg CRISPR spacer tcattgtctgcaattaacataaataattcatctgctg Protospacer ** ...*** **********************.****
120. spacer 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG798901 (Clostridium phage phiCDHM11 complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.838
tctccatctccaattaacataaataattcatccgctg CRISPR spacer tcattgtctgcaattaacataaataattcatctgctg Protospacer ** ...*** **********************.****
121. spacer 11.11|2509127|38|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.842
tttatatcagtctttttagtcgctgtctgaatctcctc CRISPR spacer tttatgtcagtctttttagtcgctgtctgtgccacttc Protospacer *****.*********************** ..* *.**
122. spacer 11.11|2509127|38|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.842
tttatatcagtctttttagtcgctgtctgaatctcctc CRISPR spacer tttatgtcagtctttttagtcgctgtctgtgccacttc Protospacer *****.*********************** ..* *.**
123. spacer 11.11|2509127|38|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.842
tttatatcagtctttttagtcgctgtctgaatctcctc CRISPR spacer tttatgtcagtctttttagtcgctgtctgtgccacttc Protospacer *****.*********************** ..* *.**
124. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to CP016195 (Bacillus thuringiensis serovar coreanensis strain ST7 plasmid pST7-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer taaaattttaaaaaaattaatataataata Protospacer . **.******************** *
125. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to MN693725 (Marine virus AFVG_250M494, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer tttttttttaaaaaaattaaaacaaacaaa Protospacer .* *************** *.******
126. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017230 (Campylobacter jejuni strain FORC_046 isolate Not reported plasmid pFORC46.1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer ttagattttaaaaaaattaatatgaaaatt Protospacer .**..******************.** * .
127. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NC_017577 (Shewanella baltica OS117 plasmid pSBAL11701, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer gaaaagtttaaaaaaataaataaaaacaaa Protospacer **. *********** **** ******
128. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR214986 (Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer aaaagtttttaaaaaattcatataataaat Protospacer ******* ******** ****** **.
129. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014203 (Clostridium baratii strain CDC51267 plasmid pNPD11_1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer ctttaattttaaataattaatataaacaaa Protospacer ** . *** *** ***************
130. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_013357 (Zymomonas mobilis subsp. mobilis NCIMB 11163 plasmid pZA1002, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
-gggtctgactttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer agcatctaa-tttaataaatatatatatttaaatg Protospacer * .***.* ******* ********** *****
131. spacer 6.2|1625151|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF417840 (Uncultured Caudovirales phage clone 2AX_3, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttagcaaatttttcgtaaaagtcactattttcaatg CRISPR spacer ttgaaaaaattttacgtaaaagtaactattttcaact Protospacer ** *. ******* ********* ***********.
132. spacer 10.1|2208069|31|CP012320|CRT matches to NZ_CP007752 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni D42a plasmid pTet-D42a, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
tgactcaatctttatttaataagaaaaaaca CRISPR spacer ttatttttactttatttaaaaagaaaaaaca Protospacer * *.*. ********** ***********
133. spacer 10.1|2208069|31|CP012320|CRT matches to NZ_CP017026 (Campylobacter coli plasmid pCC14983A-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
tgactcaatctttatttaataagaaaaaaca CRISPR spacer ttatttttactttatttaaaaagaaaaaaca Protospacer * *.*. ********** ***********
134. spacer 10.1|2208069|31|CP012320|CRT matches to NZ_CP007182 (Campylobacter coli RM4661 plasmid pRM4661_48kbp, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
tgactcaatctttatttaataagaaaaaaca CRISPR spacer ttatttttactttatttaaaaagaaaaaaca Protospacer * *.*. ********** ***********
135. spacer 14.1|3152161|31|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NC_019765 (Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.01, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
caatatctctggtattggaggatttattata CRISPR spacer ctatgcctctggtattaaaggatttattact Protospacer * **..**********..***********.
136. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP006906 (Clostridium baratii str. Sullivan plasmid pCBJ, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer tactattttaaccaaattaatataaacaat Protospacer . .****** ****************.
137. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to MN693547 (Marine virus AFVG_25M424, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer aaaagtttaaaaaaaaataatataaatttt Protospacer ****** ******* *********. .
138. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to MN693297 (Marine virus AFVG_25M423, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer aaaagtttaaaaaaaaataatataaatttt Protospacer ****** ******* *********. .
139. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP006570 (Sodalis praecaptivus strain HS1 plasmid pHS1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer gattgttttaaaaaaaataatataaaatat Protospacer ************ ********* *.
140. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to AP014396 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S46-C203, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer aaaagtttaaaaaaaaataatataaattta Protospacer ****** ******* *********.
141. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to MN693353 (Marine virus AFVG_25M425, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer aaaagtttaaaaaaaaataatataaatttt Protospacer ****** ******* *********. .
142. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028373 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni strain huA17 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer cggttttttaaaaaaactaatataaatata Protospacer * . ***********.*********.*
143. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028373 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni strain huA17 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer cggttttttaaaaaaactaatataaatata Protospacer * . ***********.*********.*
144. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to AP022644 (Bacillus wiedmannii PL1 plasmid pBwiPL1-1 DNA, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer tcacattttaaaaaaattaataaaaaaaca Protospacer ..* .***************** *** *
145. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR214999 (Mycoplasma conjunctivae strain NCTC10147 plasmid 3) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer atttattttaaaaaaattaatacaaaaatt Protospacer * .*****************.*** * .
146. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to LR214965 (Mycoplasma fermentans strain NCTC10117 genome assembly, plasmid: 11) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer atttattttaaaaaaattaatacaaaaatt Protospacer * .*****************.*** * .
147. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014745 (Campylobacter jejuni strain OD267 plasmid pCJDM67 L, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer cggttttttaaaaaaactaatataaatata Protospacer * . ***********.*********.*
148. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to CP024686 (Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-2-313K, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer tcacattttaaaaaaattaataaaaaaaca Protospacer ..* .***************** *** *
149. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014345 (Campylobacter jejuni strain RM3194 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer cggttttttaaaaaaactaatataaatata Protospacer * . ***********.*********.*
150. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014345 (Campylobacter jejuni strain RM3194 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer cggttttttaaaaaaactaatataaatata Protospacer * . ***********.*********.*
151. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014743 (Campylobacter jejuni strain WP2202 plasmid pCJDM202, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer cggttttttaaaaaaactaatataaatata Protospacer * . ***********.*********.*
152. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017417 (Campylobacter jejuni strain MTVDSCj13 plasmid pMTVDSCj13-2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer cggttttttaaaaaaactaatataaatata Protospacer * . ***********.*********.*
153. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR134420 (Legionella adelaidensis strain NCTC12735 genome assembly, plasmid: 11) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer ctaacttttaaaaaaattagtatcgccgcg Protospacer **** **************.*** . *.
154. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044174 (Campylobacter jejuni strain AR-0412 plasmid pAR-0412, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer cggttttttaaaaaaactaatataaaatat Protospacer * . ***********.********* *.
155. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to MK448965 (Streptococcus phage Javan506, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer cacttgttcaaaaaaattaatataatcaat Protospacer * **.**************** ***.
156. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NC_007581 (Clostridium phage c-st, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer aagaataagaaaaaaattaatataaccaac Protospacer .*.* **************** ****
157. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to MK448959 (Streptococcus phage Javan488, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer cacttgttcaaaaaaattaatataatcaat Protospacer * **.**************** ***.
158. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to MK448686 (Streptococcus phage Javan157, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer cactcgttcaaaaaaattaatataatcaat Protospacer * **.**************** ***.
159. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to MK448949 (Streptococcus phage Javan460, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer cacttgttcaaaaaaattaatataatcaat Protospacer * **.**************** ***.
160. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to MK448951 (Streptococcus phage Javan470, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer cactcgttcaaaaaaattaatataatcaat Protospacer * **.**************** ***.
161. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to MK448676 (Streptococcus phage Javan131, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer cactcgttcaaaaaaattaatataatcaat Protospacer * **.**************** ***.
162. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to AP008983 (Clostridium phage c-st genomic DNA, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer aagaataagaaaaaaattaatataaccaac Protospacer .*.* **************** ****
163. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP043762 (Paenibacillus sp. 37 plasmid pART37, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer tcgggattcaaaaaaattaatataaccaag Protospacer ....* **.**************** ***
164. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP019232 (Bacillus thuringiensis strain YGd22-03 plasmid pYGD36, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer gaaagttttaaaaaaatcattataataata Protospacer ***************.* ***** *
165. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP010112 (Bacillus thuringiensis serovar indiana strain HD521 plasmid pBTHD521-6, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer tcacattttaaaaaaattaataaaaaaaca Protospacer ..* .***************** *** *
166. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP015730 (Bacillus cereus strain A1 plasmid pBCA1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer tcacattttaaaaaaattaataaaaaaaca Protospacer ..* .***************** *** *
167. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to CP012553 (Campylobacter sp. RM16192 plasmid p16192, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer tttgattttaaaaaaattaatgtaaaaatt Protospacer .* ..****************.**** * .
168. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to KY554775 (Lactococcus phage AM11, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer aggaaatttaaaaacattaatataaataaa Protospacer .*. ******** ***********.**
169. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to KY554773 (Lactococcus phage AM8, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer aggaaatttaaaaacattaatataaataaa Protospacer .*. ******** ***********.**
170. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to KY554768 (Lactococcus phage AM1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer aggaaatttaaaaacattaatataaataaa Protospacer .*. ******** ***********.**
171. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to KY554769 (Lactococcus phage AM2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer aggaaatttaaaaacattaatataaataaa Protospacer .*. ******** ***********.**
172. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to KY554770 (Lactococcus phage AM3, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer aggaaatttaaaaacattaatataaataaa Protospacer .*. ******** ***********.**
173. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to MN694408 (Marine virus AFVG_250M293, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer aatagtttaaaaaaaattaatagaaaatgc Protospacer ***** ************* *** .*
174. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to KY554776 (Lactococcus phage AM12, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer aggaaatttaaaaacattaatataaataaa Protospacer .*. ******** ***********.**
175. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to KY554774 (Lactococcus phage AM9, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer aggaaatttaaaaacattaatataaataaa Protospacer .*. ******** ***********.**
176. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014853 (Bacillus thuringiensis strain HD12 plasmid pHD120345, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
gggtctgact-------ttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer -------actatataaattaatatatatatatatatatatt Protospacer *** ******************** ***
177. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053953 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_798 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer cactctttatttaatataaatatatatatagatt Protospacer . *** ********* ***********.***
178. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053950 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_799 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer cactctttatttaatataaatatatatatagatt Protospacer . *** ********* ***********.***
179. spacer 4.9|1302999|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN856006 (Siphoviridae sp. isolate 29, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
agttttaaagagggcagacctaaaaaatatactaaaa CRISPR spacer aactttaaagaaggcagacctaaaaaatataccgtct Protospacer *..********.********************..
180. spacer 4.9|1302999|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
agttttaaagagggcagacctaaaaaatatactaaaa CRISPR spacer aatttccgggaaggtagacctaaaaaatatactaaga Protospacer *.***. ..**.**.********************.*
181. spacer 4.9|1302999|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
agttttaaagagggcagacctaaaaaatatactaaaa CRISPR spacer aatttccgggaaggtagacctaaaaaatatactaaga Protospacer *.***. ..**.**.********************.*
182. spacer 4.9|1302999|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
agttttaaagagggcagacctaaaaaatatactaaaa CRISPR spacer aatttccgggaaggtagacctaaaaaatatactaaga Protospacer *.***. ..**.**.********************.*
183. spacer 4.9|1302999|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
agttttaaagagggcagacctaaaaaatatactaaaa CRISPR spacer aatttccgggaaggtagacctaaaaaatatactaaga Protospacer *.***. ..**.**.********************.*
184. spacer 5.3|1513845|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK373783 (Escherichia phage vB_EcoM_KWBSE43-6, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
acgaaattagagtttgaaatatatgactacataata CRISPR spacer agggcttcagagtttgaaatatttgagtacataaaa Protospacer * *. *.************** *** ******* *
185. spacer 9.9|1858081|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP017932 (Lactobacillus sakei strain LK-145 plasmid pLs145-a, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
aaagttttgcgcattgtatgtgtgcctagattatct CRISPR spacer ccggttttacgcatggtatgtgtgcctagatagttt Protospacer .*****.***** **************** .*.*
186. spacer 10.1|2208069|31|CP012320|CRT matches to NZ_CP053971 (Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_796 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tgactcaatctttatttaataagaaaaaaca CRISPR spacer tccatcaatctttattaagtaagaaaaagat Protospacer * ************ *.*********.
187. spacer 10.1|2208069|31|CP012320|CRT matches to NZ_CP039724 (Bacillus thuringiensis strain BT-59 plasmid p3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tgactcaatctttatttaataagaaaaaaca CRISPR spacer tccatcaatctttattaagtaagaaaaagat Protospacer * ************ *.*********.
188. spacer 10.1|2208069|31|CP012320|CRT matches to NZ_CP013278 (Bacillus thuringiensis serovar israelensis strain AM65-52 plasmid pAM65-52-3-235K, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tgactcaatctttatttaataagaaaaaaca CRISPR spacer tccatcaatctttattaagtaagaaaaagat Protospacer * ************ *.*********.
189. spacer 10.1|2208069|31|CP012320|CRT matches to NC_018509 (Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid pBTHD789-2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tgactcaatctttatttaataagaaaaaaca CRISPR spacer tccatcaatctttattaagtaagaaaaagat Protospacer * ************ *.*********.
190. spacer 10.1|2208069|31|CP012320|CRT matches to NZ_CP051859 (Bacillus thuringiensis serovar israelensis strain BGSC 4Q7rifR plasmid pBtic235, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tgactcaatctttatttaataagaaaaaaca CRISPR spacer tccatcaatctttattaagtaagaaaaagat Protospacer * ************ *.*********.
191. spacer 10.1|2208069|31|CP012320|CRT matches to NZ_CP009347 (Bacillus thuringiensis HD1002 plasmid 3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tgactcaatctttatttaataagaaaaaaca CRISPR spacer tccatcaatctttattaagtaagaaaaagat Protospacer * ************ *.*********.
192. spacer 10.1|2208069|31|CP012320|CRT matches to NZ_CP045025 (Bacillus thuringiensis strain JW-1 plasmid p3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tgactcaatctttatttaataagaaaaaaca CRISPR spacer tccatcaatctttattaagtaagaaaaagat Protospacer * ************ *.*********.
193. spacer 10.1|2208069|31|CP012320|CRT matches to NC_014633 (Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tgactcaatctttatttaataagaaaaaaca CRISPR spacer taagataatctttattaaatcagaaaaaaat Protospacer *.* .********** *** ********
194. spacer 10.13|2208260|37|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP034684 (Bacillus sp. BD59S plasmid pBTBD59S1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
tttctgtatattttagttgtgttttaatattataaca CRISPR spacer attctgaatattttggttgtgttttaatatatagtca Protospacer ***** *******.*************** . **
195. spacer 10.21|2208261|37|CP012320|PILER-CR matches to NZ_CP034684 (Bacillus sp. BD59S plasmid pBTBD59S1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
tttctgtatattttagttgtgttttaatattataaca CRISPR spacer attctgaatattttggttgtgttttaatatatagtca Protospacer ***** *******.*************** . **
196. spacer 2.2|727877|37|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NC_022879 (Enterococcus mundtii QU 25 plasmid pQY182, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
atatggttatctaaatatagaagataagacgttctac CRISPR spacer aagtggttatctagatatagaaggtaagacgtcaagt Protospacer * .**********.*********.********. ..
197. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP004877 (Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD-1 plasmid pBMB431, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer taatattttaaaaaaattcatataaaattt Protospacer . * .************* ******* .
198. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP004860 (Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. YBT-1520 plasmid pBMB422, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer taatattttaaaaaaattcatataaaattt Protospacer . * .************* ******* .
199. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011156 (Bacillus cereus strain HN001 plasmid pRML01, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer atttattttaaaaatattaatataaatgga Protospacer * .********* ***********...
200. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP010090 (Bacillus thuringiensis serovar galleriae strain 4G5 plasmid pBMB426, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer taatattttaaaaaaattcatataaaattt Protospacer . * .************* ******* .
201. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to AP013426 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G16, isolate: uvMED-CGR-C57-MedDCM-OCT-S27-C24) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer tcttttgttaaaaaaattaatatgaacaga Protospacer .. * ****************.****.
202. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to KJ535721 (Listeria phage List-36, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer gatagtaataaaaaaattaatataaagtgt Protospacer *** ****************** ..
203. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014283 (Bacillus thuringiensis strain Bt185 plasmid pBT1850636, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer atttattttaaaaatattaatataaatgga Protospacer * .********* ***********...
204. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033461 (Brevibacillus laterosporus strain 1821L plasmid p1821L01, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer taaagttttaaaaacattaatagaaggtct Protospacer . ************ ******* **. .
205. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011350 (Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer taatattttaaaaaaattcatataaaattt Protospacer . * .************* ******* .
206. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032614 (Bacillus thuringiensis strain QZL38 plasmid p.1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer atttattttaaaaatattaatataaatgga Protospacer * .********* ***********...
207. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP007616 (Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. YBT-1520 plasmid pBMB400, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer taatattttaaaaaaattcatataaaattt Protospacer . * .************* ******* .
208. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NC_002253 (Buchnera aphidicola str. APS (Acyrthosiphon pisum) plasmid pLeu, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer tttttttttaaaaaaactaatataaaagta Protospacer .* ***********.********* .
209. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023246 (Bacillus cereus strain HBL-AI plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer taatattttaaaaaaattcatataaaattt Protospacer . * .************* ******* .
210. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048772 (Campylobacter jejuni strain ZS007 plasmid pCJ145K, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer ggtttttttaaaaaaactaatataaatata Protospacer ***********.*********.*
211. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048772 (Campylobacter jejuni strain ZS007 plasmid pCJ145K, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer ggtttttttaaaaaaactaatataaatata Protospacer ***********.*********.*
212. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to MN172529 (Listeria phage LP-039, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer gatagtaataaaaaaattaatataaagtgt Protospacer *** ****************** ..
213. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to DQ003638 (Listeria phage A511, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer gatagtaataaaaaaattaatataaagtgt Protospacer *** ****************** ..
214. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to KJ591604 (Listeria phage LMTA-148, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer gatagtaataaaaaaattaatataaagtgt Protospacer *** ****************** ..
215. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to KJ094033 (Listeria phage LP-048, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer gatagtaataaaaaaattaatataaagtgt Protospacer *** ****************** ..
216. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to JQ797329 (Listeria phage vB_LmoM_AG20, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer gatagtaataaaaaaattaatataaagtgt Protospacer *** ****************** ..
217. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP038617 (Arsenophonus nasoniae strain FIN plasmid pArsFIN5, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gggtctgac----tttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer ----ataatattatttaatatatatatatatatatata Protospacer *.*. ********************* **
218. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_012577 (Bacillus anthracis str. CDC 684 plasmid pX02, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer cttttttcttttgatatatatatatatataattt Protospacer *.* .***.****************** **
219. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP018445 (Bacillus anthracis strain CZC5 plasmid pXO2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer cttttttcttttgatatatatatatatataattt Protospacer *.* .***.****************** **
220. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP006744 (Bacillus anthracis str. SVA11 plasmid pXO2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer cttttttcttttgatatatatatatatataattt Protospacer *.* .***.****************** **
221. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_017727 (Bacillus anthracis str. H9401 plasmid BAP2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer cttttttcttttgatatatatatatatataattt Protospacer *.* .***.****************** **
222. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009462 (Bacillus anthracis strain SK-102 plasmid pXO2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer cttttttcttttgatatatatatatatataattt Protospacer *.* .***.****************** **
223. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009326 (Bacillus anthracis strain Vollum 1B plasmid 2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer cttttttcttttgatatatatatatatataattt Protospacer *.* .***.****************** **
224. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH542234 (Staphylococcus phage Terranova, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gggtctgact-----ttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer -----ttattaataattaatatatataaatatatatatt Protospacer * *.* ************ ******* ***
225. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH321491 (Staphylococcus phage Twillingate, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gggtctgact-----ttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer -----ttattaataattaatatatataaatatatatatt Protospacer * *.* ************ ******* ***
226. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014283 (Bacillus thuringiensis strain Bt185 plasmid pBT1850636, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer agcttaaaatttaatataaatatatatatatata Protospacer .* *. .* ********* *********** **
227. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032614 (Bacillus thuringiensis strain QZL38 plasmid p.1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer agcttaaaatttaatataaatatatatatatata Protospacer .* *. .* ********* *********** **
228. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN871490 (UNVERIFIED: Salmonella phage SEzh_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer cggataaatattaatatatatatatataataatt Protospacer ** . .*. ****************** ****
229. spacer 8.4|1720183|33|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053838 (Aliiarcobacter faecis strain CCUG 66484 plasmid pAFAEC, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
acttatttacagctttatttgctaaatcagaag CRISPR spacer gaacatttaaagctttatttgctaaatctaatt Protospacer . .***** ****************** .*
230. spacer 8.4|1720183|33|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032824 (Arcobacter cryaerophilus ATCC 43158 plasmid pACRY43158, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
acttatttacagctttatttgctaaatcagaag CRISPR spacer gaacatttaaagctttatttgctaaatctaatc Protospacer . .***** ****************** .*
231. spacer 8.4|1720183|33|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_MK715471 (Arcobacter cryaerophilus strain M830MA plasmid pM830MA, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
acttatttacagctttatttgctaaatcagaag CRISPR spacer gaacatttaaagctttatttgctaaatccaatc Protospacer . .***** ****************** .*
232. spacer 9.9|1858081|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LN890332 (Leuconostoc gelidum subsp. gasicomitatum KG16-1 isolate LEKG1 plasmid II, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
aaagttttgcgcattgtatgtgtgcctagattatct CRISPR spacer cctgttttacgcatggtatgtgtgcctagatagttg Protospacer *****.***** **************** .*.
233. spacer 9.9|1858081|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032750 (Lactobacillus paraplantarum strain DSM 10667 plasmid unnamed6, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
aaagttttgcgcattgtatgtgtgcctagattatct CRISPR spacer cctgttttacgcatcgtatgtgtgcctagatagttg Protospacer *****.*****.**************** .*.
234. spacer 9.9|1858081|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP042398 (Leuconostoc citreum strain CBA3623 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
aaagttttgcgcattgtatgtgtgcctagattatct CRISPR spacer cctgttttacgcatggtatgtgtgcctagatagttg Protospacer *****.***** **************** .*.
235. spacer 9.9|1858081|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP042376 (Leuconostoc carnosum strain CBA3620 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
aaagttttgcgcattgtatgtgtgcctagattatct CRISPR spacer cctgttttacgcatggtatgtgtgcctagatagttg Protospacer *****.***** **************** .*.
236. spacer 9.9|1858081|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP042400 (Weissella hellenica strain CBA3632 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
aaagttttgcgcattgtatgtgtgcctagattatct CRISPR spacer cctgttttacgcatggtatgtgtgcctagatagggt Protospacer *****.***** **************** . *
237. spacer 9.9|1858081|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014612 (Leuconostoc mesenteroides subsp. jonggajibkimchii strain DRC1506 plasmid pDRC1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
aaagttttgcgcattgtatgtgtgcctagattatct CRISPR spacer cctgttttacgcatggtatgtgtgcctagatagttg Protospacer *****.***** **************** .*.
238. spacer 9.9|1858081|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017200 (Leuconostoc gelidum subsp. gasicomitatum strain TMW 2.1619 plasmid pL21619-3, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
aaagttttgcgcattgtatgtgtgcctagattatct CRISPR spacer cctgttttacgcatcgtatgtgtgcctagatagttg Protospacer *****.*****.**************** .*.
239. spacer 9.9|1858081|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP042384 (Leuconostoc pseudomesenteroides strain CBA3630 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
aaagttttgcgcattgtatgtgtgcctagattatct CRISPR spacer cctgttttgcgcatggtatgggtgcctagatagtta Protospacer *********** ***** ********** .*.
240. spacer 9.9|1858081|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP012874 (Weissella cibaria strain CH2 plasmid pMKC01, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
aaagttttgcgcattgtatgtgtgcctagattatct CRISPR spacer cctgttttacgcatcgtatgtgtgcctagatagttg Protospacer *****.*****.**************** .*.
241. spacer 9.9|1858081|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP012876 (Weissella cibaria strain CH2 plasmid pMKC03, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
aaagttttgcgcattgtatgtgtgcctagattatct CRISPR spacer cctgttttacgcatggtatgtgtgcctagatagtta Protospacer *****.***** **************** .*.
242. spacer 9.9|1858081|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP012876 (Weissella cibaria strain CH2 plasmid pMKC03, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
aaagttttgcgcattgtatgtgtgcctagattatct CRISPR spacer cctgttttacgcatggtatgtgtgcctagatagtta Protospacer *****.***** **************** .*.
243. spacer 9.9|1858081|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP012876 (Weissella cibaria strain CH2 plasmid pMKC03, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
aaagttttgcgcattgtatgtgtgcctagattatct CRISPR spacer cctgttttacgcatggtatgtgtgcctagatagtta Protospacer *****.***** **************** .*.
244. spacer 10.1|2208069|31|CP012320|CRT matches to NC_011246 (Borrelia recurrentis A1 plasmid pl124, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
tgactcaatctttatttaataagaaaaaaca CRISPR spacer cttatcaatcttaatttcataagaaaaattg Protospacer . ******** **** ********** ..
245. spacer 10.1|2208069|31|CP012320|CRT matches to NC_011247 (Borrelia duttonii Ly plasmid pl165, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
tgactcaatctttatttaataagaaaaaaca CRISPR spacer cttatcaatcttaatttcataagaaaaattg Protospacer . ******** **** ********** ..
246. spacer 10.1|2208069|31|CP012320|CRT matches to NZ_CP028890 (Borrelia turcica IST7 plasmid lp34, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
tgactcaatctttatttaataagaaaaaaca CRISPR spacer aggtcttatctttatttaaaaagaaaaaaag Protospacer *.... ************ ********* .
247. spacer 10.1|2208069|31|CP012320|CRT matches to NZ_CP017832 (Butyrivibrio hungatei strain MB2003 plasmid pNP144, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
tgactcaatctttatttaataagaaaaaaca CRISPR spacer aaaagaaatctatatttaataagaagaaagt Protospacer .* ***** *************.***
248. spacer 10.4|2208260|38|CP012320|CRT matches to NZ_CP034684 (Bacillus sp. BD59S plasmid pBTBD59S1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
tttctgtatattttagttgtgttttaatattataacac CRISPR spacer attctgaatattttggttgtgttttaatatatagtcat Protospacer ***** *******.*************** . **.
249. spacer 10.13|2208260|37|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009691 (Bacillus mycoides strain ATCC 6462 plasmid pBMX_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
tttctgtatattttagttgtgttttaatattataaca CRISPR spacer ctatcgtatattttacttgtgtattaatattattgct Protospacer .* ..********** ****** ********** .*
250. spacer 10.21|2208261|37|CP012320|PILER-CR matches to NZ_CP009691 (Bacillus mycoides strain ATCC 6462 plasmid pBMX_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
tttctgtatattttagttgtgttttaatattataaca CRISPR spacer ctatcgtatattttacttgtgtattaatattattgct Protospacer .* ..********** ****** ********** .*
251. spacer 15.11|3288267|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP033246 (Clostridium butyricum strain CFSA3987 plasmid pCFSA3987, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
ttttatatttaattttaaagattaaaggtataaacaa CRISPR spacer tttacaatttaatattaaagaataaaggtataactct Protospacer *** ******* ******* *********** .
252. spacer 15.11|3288267|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP033248 (Clostridium butyricum strain CFSA3989 plasmid pCFSA3989, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
ttttatatttaattttaaagattaaaggtataaacaa CRISPR spacer tttacaatttaatattaaagaataaaggtataactct Protospacer *** ******* ******* *********** .
253. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to KJ018210 (Flavobacterium sp. phage 1/32, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.667
ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer tagtaaattacaaaaattaatataaacatt Protospacer . . . *** ***************** .
254. spacer 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF288922 (Bacillus phage Janet, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tctccatctccaattaacataaataattcatccgctg CRISPR spacer acgcgttctccaattaacataaataaatcctccttaa Protospacer * * ******************** ** *** . .
255. spacer 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH538296 (Bacillus phage Maceta, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tctccatctccaattaacataaataattcatccgctg CRISPR spacer acgcgttctccaattaacataaataaatcctccttaa Protospacer * * ******************** ** *** . .
256. spacer 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_024216 (Bacillus phage CAM003, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tctccatctccaattaacataaataattcatccgctg CRISPR spacer acgcgttctccaattaacataaataaatcctccttaa Protospacer * * ******************** ** *** . .
257. spacer 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ489400 (Bacillus phage Hoody T, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tctccatctccaattaacataaataattcatccgctg CRISPR spacer acgcgttctccaattaacataaataaatcctccttaa Protospacer * * ******************** ** *** . .
258. spacer 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF288921 (Bacillus phage OTooleKemple52, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tctccatctccaattaacataaataattcatccgctg CRISPR spacer acgcgttctccaattaacataaataaatcctccttaa Protospacer * * ******************** ** *** . .
259. spacer 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH638310 (Bacillus phage Kamfam, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tctccatctccaattaacataaataattcatccgctg CRISPR spacer acgcgttctccaattaacataaataaatcctccttaa Protospacer * * ******************** ** *** . .
260. spacer 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK215646 (Bacillus phage vB_BthM-Goe5, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tctccatctccaattaacataaataattcatccgctg CRISPR spacer acgcgttctccaattaacataaataaatcctccttaa Protospacer * * ******************** ** *** . .
261. spacer 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU737346 (Bacillus phage Vinny, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tctccatctccaattaacataaataattcatccgctg CRISPR spacer acgcgttctccaattaacataaataaatcctccttaa Protospacer * * ******************** ** *** . .
262. spacer 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_024207 (Bacillus phage Evoli, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tctccatctccaattaacataaataattcatccgctg CRISPR spacer acgcgttctccaattaacataaataaatcctccttaa Protospacer * * ******************** ** *** . .
263. spacer 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF498901 (Bacillus phage Anthony, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tctccatctccaattaacataaataattcatccgctg CRISPR spacer acgcgttctccaattaacataaataaatcctccttaa Protospacer * * ******************** ** *** . .
264. spacer 4.1|1302471|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018856 (Bacillus phage Bastille, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tctccatctccaattaacataaataattcatccgctg CRISPR spacer acgcgttctccaattaacataaataaatcctccttaa Protospacer * * ******************** ** *** . .
265. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011655 (Bacillus cereus AH187 plasmid pAH187_270, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer ttaatttcttttattatatatatatatataaata Protospacer . .* .**** *******************
266. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR215033 (Mycoplasma gallopavonis strain NCTC10186 plasmid 3) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer ttagtacattttaatatatatatatatatatata Protospacer . . *.********************* **
267. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015507 (Bacillus oceanisediminis 2691 plasmid pBO1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer taaaaagactttaatatatatatttatatagaaa Protospacer .. ***************** ******.*
268. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010924 (Bacillus cereus strain AH187 plasmid pCER270, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer ttaatttcttttattatatatatatatataaata Protospacer . .* .**** *******************
269. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693105 (Marine virus AFVG_25M79, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer ataaatatatttaatatatatatatatatatata Protospacer . . *. ********************* **
270. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KY554775 (Lactococcus phage AM11, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer ataaaataatttaatatatatatatatatatata Protospacer . . * ********************* **
271. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KY554773 (Lactococcus phage AM8, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer ataaaataatttaatatatatatatatatatata Protospacer . . * ********************* **
272. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KY554768 (Lactococcus phage AM1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer ataaaataatttaatatatatatatatatatata Protospacer . . * ********************* **
273. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KY554769 (Lactococcus phage AM2, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer ataaaataatttaatatatatatatatatatata Protospacer . . * ********************* **
274. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer caagtaggatttaatatatatatatatatatata Protospacer .. . *. ********************* **
275. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KY554770 (Lactococcus phage AM3, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer ataaaataatttaatatatatatatatatatata Protospacer . . * ********************* **
276. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer caagtaggatttaatatatatatatatatatata Protospacer .. . *. ********************* **
277. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KY554776 (Lactococcus phage AM12, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer ataaaataatttaatatatatatatatatatata Protospacer . . * ********************* **
278. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KY554774 (Lactococcus phage AM9, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer ataaaataatttaatatatatatatatatatata Protospacer . . * ********************* **
279. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP004866 (Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. YBT-1520 plasmid pBMB7921, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer aaatacaattttaatatatatatctaaataaata Protospacer ...* ..*.************** ** ******
280. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009542 (Bacillus anthracis strain BA1015 plasmid pXO2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer cttttttcttttgatatatatatatatatatata Protospacer *.* .***.***************** **
281. spacer 8.4|1720183|33|CP012320|CRISPRCasFinder matches to AP019525 (Tenacibaculum phage PTm5 DNA, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
acttatttacagctttatttgctaaatcagaag CRISPR spacer taccatttacagctttttttggtaaatctttaa Protospacer ..************ **** ****** *.
282. spacer 8.4|1720183|33|CP012320|CRISPRCasFinder matches to AP019524 (Tenacibaculum phage PTm1 DNA, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
acttatttacagctttatttgctaaatcagaag CRISPR spacer taccatttacagctttttttggtaaatctttaa Protospacer ..************ **** ****** *.
283. spacer 9.9|1858081|36|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP033609 (Weissella hellenica strain 0916-4-2 plasmid pWHSP041, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
aaagttttgcgcattgtatgtgtgcctagattatct CRISPR spacer cctgttttacgcatggtatgtgtgcctagataggtc Protospacer *****.***** **************** . ..
284. spacer 9.10|1858146|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG798901 (Clostridium phage phiCDHM11 complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
atgtccccacatcaattttcctccgcatgaaaaaatc CRISPR spacer nnnnnnnnnnatcaattttcctccgcatgaaaaaatc Protospacer ***************************
285. spacer 10.4|2208260|38|CP012320|CRT matches to NZ_CP009691 (Bacillus mycoides strain ATCC 6462 plasmid pBMX_1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.737
tttctgtatattttagttgtgttttaatattataacac CRISPR spacer ctatcgtatattttacttgtgtattaatattattgcta Protospacer .* ..********** ****** ********** .*
286. spacer 11.1|2508469|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045274 (Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301B, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
acaattattaattgttttattagtgaaatcacagca CRISPR spacer tgaattcttaattgttttattagagaaatacctttt Protospacer **** **************** ***** * .
287. spacer 11.13|2509261|36|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AP014113 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C35-MedDCM-OCT-S46-C200, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
ttgtagattttgtaagtaatggtttttcggaaaaag CRISPR spacer ttgtagattttttaagtaatggttttaaaattagga Protospacer *********** ************** .. *...
288. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053290 (Bacillus cereus strain WPySW2 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
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289. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029455 (Bacillus cereus strain FORC087 plasmid pFORC087.1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
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290. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_005707 (Bacillus cereus ATCC 10987 plasmid pBc10987, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
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291. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP045776 (Bacillus paranthracis strain CFSAN068816 plasmid p1CFSAN068816, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
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292. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_016792 (Bacillus cereus NC7401 plasmid pNCcld, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer ttaatttcttttattttatatatatatataaata Protospacer . .* .**** * *****************
293. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP013659 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C24-MedDCM-OCT-S34-C213, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt CRISPR spacer tctattgactttaataaataaatatatattttgt Protospacer .*********** *** ******** *
294. spacer 11.10|2509061|37|CP012320|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_018878 (Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_502p, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
gttcatcagatggatatgcaaatggagatataaagtt CRISPR spacer caatagaagatggttatgcaaatggagatatgaaaaa Protospacer .* ****** *****************.**.
295. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694638 (Marine virus AFVG_250M1093, complete genome) position: , mismatch: 12, identity: 0.647
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt-------- CRISPR spacer --------tattaatatatatatatatataaaagagtaaaga Protospacer . **********************
296. spacer 4.13|1303264|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024773 (Bacillus thuringiensis LM1212 plasmid pLM2, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.676
tgctgtgccacaatttgatgcttctatagctaaattc CRISPR spacer caatgtggcacaatttgttgcttctataggcggaaag Protospacer .. **** ********* *********** ...*
297. spacer 4.13|1303264|37|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP041075 (Bacillus tropicus strain LM1212-W3 plasmid p2, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.676
tgctgtgccacaatttgatgcttctatagctaaattc CRISPR spacer caatgtggcacaatttgttgcttctataggcggaaag Protospacer .. **** ********* *********** ...*
298. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT774377 (CrAssphage cr107_1, complete genome) position: , mismatch: 13, identity: 0.618
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299. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LR794151 (Bacteriophage APSE-7 strain HaDrplatanoidis-3702 genome assembly, chromosome: 1) position: , mismatch: 13, identity: 0.618
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300. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK504442 (Lactobacillus phage 3-SAC12, complete genome) position: , mismatch: 13, identity: 0.618
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301. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020746 (Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 14, identity: 0.588
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302. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP050055 (Pseudomonas aeruginosa strain LIUYANG-A plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 14, identity: 0.588
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt-------- CRISPR spacer --------aatctatatatatatatatataaacaatacacac Protospacer *. *******************.
303. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694330 (Marine virus AFVG_250M1134, complete genome) position: , mismatch: 14, identity: 0.588
gggtctgactttaatatatatatatatataaatt-------- CRISPR spacer --------catatatatatatatatatatgaaacatgggggg Protospacer * * ****************.** .
304. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH892354 (Streptococcus phage SW3, complete genome) position: , mismatch: 14, identity: 0.588
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305. spacer 4.7|1302870|34|CP012320|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009698 (Bacillus anthracis strain BA1035 plasmid pXO2, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.559
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306. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011156 (Bacillus cereus strain HN001 plasmid pRML01, complete sequence) position: , mismatch: 16, identity: 0.467
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307. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040783 (Bacillus thuringiensis strain HM-311 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 16, identity: 0.467
----------ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer aatatatatataaatttttttaaaaattat---------- Protospacer . ** **** ********
308. spacer 3.1|1007274|30|CP012320|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014283 (Bacillus thuringiensis strain Bt185 plasmid pBT1850636, complete sequence) position: , mismatch: 16, identity: 0.467
----------ctaagttttaaaaaaattaatataaacaac CRISPR spacer aatatatatataaatttttttaaaaattat---------- Protospacer . ** **** ********
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
285761 : 301947
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP012320|285761:301947|DBSCAN-SWA 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14 | Synechococcus_phage(23.08%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
441081 : 503248
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP012320|441081:503248|DBSCAN-SWA 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MAKILLLEDDDTITFGIKTSLEKKNHTVCCYNTIAEAKKNFDKTIDLILLDLNLPDGIGYEFCQYVKSIEDTPVIFLTVRDDEKDIIRGLDMGADDYVVKPFLLSVLQSRINAVLRRTHSNTNNTITCGNISLNKVEVKAYLDNVEVLLTAGEYKLLLSLMENKNRAMTRTKLLEMLWDVDGNFVNDNTLTVTIKRLREKLKNPPCIKTLRGIGYRMEDS >CP012320|441081:503248|449614_450211_-|AXU55902.1|DBSCAN-SWA MNILYTVENSIYVNITNTCPCSCVFCIRNEKDEVANSGSLWLEHEPSVDEVKEAFNKYNLDDYDEIVFCGYGEPLMRINELIDVAKFIKEKSSIKIRINTNGLSDLIHNKKTAILLKDVIDAVSISLNAPNKEAYNRVTQPKFGEKSFDYMLDFAKDCKKYIKEVAFSVVDEISPEEIEESKQLAKKLDIPLRVRHKN >CP012320|441081:503248|501959_502166_-|AXU55945.1|transposase|DBSCAN-SWA MVDKLYKVGKFFASSQICNKCGYKNEEVKNLNIREWICPSCNETHDRDINASINILKEGLRLITIQNK >CP012320|441081:503248|474464_475838_+|AXU55924.1|DBSCAN-SWA 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>CP012320|441081:503248|476093_477161_+|AXU55925.1|DBSCAN-SWA MRKVRVGIWGFGAMGIGMANMILKKEGIEIVSVCSRSTSGKSMYDVLGIERGERPEVIINKNYEEVFREKSVDVVLLATDSFTKKAFDKIIFLLNRKINVISTAEQMAYPQADDADLAKKMDEVAKENGVSILGTGINPGFVLDLLVLALSGTCEEVTSIKAKRVNDLSPFGKSVMEEQGVGVTREEFIKGVEDKTIAGHVGFVESINMIADGLGWKLDKIEQTKEPIMTTVDRKSKYGEALAGNVAGCRQCGYGYVNGDVLIEMEHPQQIIPEVEGIKTGDYVSIKGIPNIDLQINPEIPGGVGTYAMIVNSIPLIINARPGLKTMLDIPVPRAIMGDIRNQIEVELEEESKAN >CP012320|441081:503248|469734_469938_+|AXU55920.1|DBSCAN-SWA MGFNFRKSINLGGGLKLNLGKKSVGISAGVKGARVSVNSKGRKSATLSIPGTGISYTKTSTKKRKPK >CP012320|441081:503248|486738_487101_+|AXU55934.1|DBSCAN-SWA MKIYDILTRFYIQDIEKAIPFYENLLKEKCSLRFSYKEVGLELAQIGNVLLLSGSDDALKPFIETKSTFMVDSVDEWRSYLLDNGAVVVRDKKKVPTGYNMTLRHPDGTIIEYVQHTKQD >CP012320|441081:503248|485976_486441_+|AXU55933.1|DBSCAN-SWA MTRISNITIAEQSEYCFLAIRKTIDFMVEFSEFSKQSFEKISKYLEERGILSSGAPIVCFHNMDLAKLDVEVGFPVATYIDGKNEILQRIVPAQKIITAIDLGPYELQDPTLEDLFSWANSNGYKLHGDIYYQYLNDINRPASEYLTKMMLPII 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MILSYFALLIRVVLLAFERVVVRLLGDEEGDIYKNIASSFLFFFIGGVCLLPFSIMDRVSDWSFLIPCYISSLVYSIGSVAYVTSLATGEVSLVTPINSLNSLFLLLLSVIFLGEGLSLAKVAGIIIMIGGVFILKKVSSFLKNVSVIFNNLPCRLMFLYIFLQSVGRVLDKAFFVQVSPILYSTILYFFVGLNLFIFLAFKKKQKIICEIFSNKKGLSILSGAINGYSYLALLIALNNLELSIAEPFSQVSMIITLILAHFIFKENIKEKIPGSILILIGGWLLLL |
53 | Geobacillus_virus(15.38%) | transposase,integrase,tRNA | attL 434124:434140|attR 485686:485702 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
613505 : 652404
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP012320|613505:652404|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP012320|613505:652404|626084_626663_-|AXU56052.1|DBSCAN-SWA MAKSFTEIEKDNIRKRLISECEINWSKYGYKKTNIDELCSKSGIAKGSFYTFFDSKEKLFFEVLNGIQNRLISSVDEILSNMPPKEGFAKSLKMLYRLYDKNPFLYSPNNPDFISLINKLPQDMFLQLESNNIQSFYDLIKRHNLKLKIEKEKAFGVCNSLLSSLLVKENIEYNYIEVFDFMVDNLVEHILE >CP012320|613505:652404|616192_616624_+|AXU56043.1|DBSCAN-SWA MIEKVEEKSKIIKTSKEYKRTIIEEKDKEWTKKLNDILSRSSFCNDELDKIKALIPKEILTNENVGEVVTEDGYAKPEYDEVFKSLFTLNNEYDLLVNFINDILKDAPYANRNIKPFTQIKRIIRVETDPTINYIGEKRPRLD >CP012320|613505:652404|651506_651770_+|AXU56071.1|coat|DBSCAN-SWA MSLNRRELLERISEYQFACIELNLYLDNNPRDKKALDLYNRYCDKFTQAVCDYESKYGALTNFGYESSEYPWSWISEPWPWDKSFYK >CP012320|613505:652404|620415_621102_-|AXU56047.1|DBSCAN-SWA MLDKIRTYIDSSFTGVNETKKVKELKDELFENLKEKYNDQIQDGKTEQEAYNSVISGIGDLSELIESVKEPYSLPSELIEEKKKRALRASIAVALFIISPFLFVVSVVSFGIEPTIAILLMLILIALGVGLLVYNQMTRTNYALYNDNLSNKFKEFEDFEENYNHINPVYKSFMNAYWIIVVSIYLITSILFNIWSFSWILFIIGAAGVNIVKGIIQLKGYKEEDKYE 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31 | Streptococcus_phage(37.5%) | coat,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1439998 : 1464389
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP012320|1439998:1464389|DBSCAN-SWA 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29 | Clostridium_phage(54.55%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1547081 : 1555626
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP012320|1547081:1555626|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP012320|1547081:1555626|1551148_1551940_+|AXU56854.1|DBSCAN-SWA MFDYGKRTYIMGILNVTPDSFSDGGDFNNLDIAIQHAKDMVDQGADIIDLGGESTRPGHSYVDSDEELRRVIPVIKKLKQELEIPISIDTYKADVAEEALKLGVTMVNDVWGLRKDKNMASVIGKYDAEVCIMHNQDGTNYDKDIMESIKDFFKVSIEMAMSCGVKKEKIVLDPGVGFGKDFEQNIEVLRRLNELKDLGYPILLGTSRKSVIGKVLPVEPKKRLEGTIATTVLGIRDGVDIVRVHDVYENLMAARMTDAIYRK >CP012320|1547081:1555626|1551950_1552316_+|AXU56855.1|DBSCAN-SWA MDKILLSNLGFYGYHGVLKEENFLGQKFFVDMELYIDSREAGLSDDINKSVSYAEVYNVVKDITENKQFNLLEALAENIAEEVLNKFILINGVMVRVRKPEAPVNGIYDYFGVEIRRTRDE >CP012320|1547081:1555626|1547081_1547666_+|AXU56849.1|DBSCAN-SWA MILMIDNYDSFVYNLVQYIEELGEAVVVKRNNEIKISDIEELNPEVIVLSPGPCSPKEAGICIDIVEHFKGKKPILGICLGHQTIGYVFGGDIIKAQQPVHGKVYSINHTNKGVFRGLKNPLNVTRYHSLIIDSNTVPKELEITAITDKGEIMGIRHKKYLIEGVQFHPEAILSEYGHEMLENFITEARERVHM >CP012320|1547081:1555626|1547667_1549017_+|AXU56850.1|DBSCAN-SWA MIREINTKLNSFEIFTIFRNEHDSFILDSAMDKEKLGRYSFISSQPFKVLKYKDTDENPLEVLKEELHKYRVVNDTNLPFVGGAVGYLSYDLGNYIENLPRTAVDDIEMPDMYFGFYNHVIVIDHLVQKTYIATPNIDIELEEKIIDDIEQRILKEEKKGIDSICYEEKEVTPIRLKSNFTKEEFKNAVQSVREYIRQGDIYQANLTQRFSGETELTSFELYRDLRRFSPAPFGAFLNFEDTHILSNSPERFIRCVNKRIETRPIKGTRPRGKDKEEDLRLQQELRNSEKDRAELLMIVDLERNDIGRISKTGSVKVPELFVIEPYANVNHLVSTVVGELKDDKDATDVIKATFPGGSITGAPKIRAMEIIDELEPTQRNVYTGSIGYIGFNGDMDFNIAIRTIIKNDKKVYFQVGGGMTWDSDPDEEYQETLDKAKSIMKALRGYYEE >CP012320|1547081:1555626|1549006_1549750_+|AXU56851.1|DBSCAN-SWA MKNNVGFDSSLSKFGIGLFETIRVKNGIAVDLDIHIERMLSSINCLDLDINYKKDFLINEIVTYIKKENVINKALRITVFDEGYNISIRDIPYNQETYEKGFKLAISPIVRGNSLIHRHKTTNYFENIYTKNIANKTGYNDGIFLNSEGVILECSMSNIFFIKGERVYTPSDRLPILNGIIKKRIIEICDELHIELIENEINISEISSFDFVFVTNSLMGAIKVTEIDKIKFNKENVVFDKIVKLLE >CP012320|1547081:1555626|1552795_1553581_+|AXU56857.1|DBSCAN-SWA MKENLFNNNSKIEINTNNKKITVKKDKLIIAGPCAIESYEQLLETAKFVKSQGANILRGGAYKPRTSPNSFQGLKKEGLKILKAVKDEVGMAVITELMDVRDIDELYSISDIIQIGSRNMQNFTLLSEVGKQNKPVMLKRGIASTITEWIGASEYIAIEGNSNIIMCERGIRTYNDYTRNTLDLAAVPIIQKETGLPVVVDPSHATGVRYLVKPMSLASFACGADGIMVEVHPDPENALSDGAQSLCFNEFEDLMKSINNY >CP012320|1547081:1555626|1553835_1555626_+|AXU56858.1|DBSCAN-SWA MNDIKDIIEEIKARCDIASIISEYMNIKQSGANYKGLCPFHGEKTPSFYINTSKQIYKCFGCGEGGDVINFVMKMENLDFMDAVKILANKCGIEINTNMNEETRIKIEKSKKFQDIHTEAARFYLSNLLGSKNLGYEYLRIRGLDDKIIKKFGLGFSLDSWNSLMNTLISKGYKKQDLLDCGLIAKNRDGTNCYDKFRNRVMFPIFDYRGNIIGFGGRVLDDSLPKYLNSPDTLIFNKKQNLYGLNFARKNLESKTIVLVEGYMDLISLYQYGIKNVVATLGTALTEQQGILIKRYADTAIISYDSDEAGIKATLRAIDILTKLGINVKVLDLKDAKDPDEFVRKYGLSDYKKAMDVSTHYIKYKIDHLKKEFNIQKDEERVKFAKEASKIIKQLTSPVEIDFYTKYLSNQIDINVESIKREVYGKNYNKPYNNKNQKKIEEKVIEKVEVRQDGKQLVEETLIKIMLEDKKIREIALLKVEESDFLLKESKEILNYMIKNQELDKITIDKLKSLNISEEYLKELNSISLNSINLENTKEIEGIITNIRKNSLEEQINSLLREQQELENNNDMKEVDGRVMEIALKIVEINKILKSL >CP012320|1547081:1555626|1550510_1551083_+|AXU56853.1|DBSCAN-SWA MNKVDKEKIQHAVREILEAIGEDPDREGLIETPNRVARMYEEIFSGLSEEPRDHLKVLFADEKHEELVLVKDIPFYSCCEHHLVPFFGKAHIAYLPKGGRLTGLSKLARVIDTLAKRPQLQERITKNAADIIMEELQPYGVLVVVEAEHMCMTMRGVKKPGSKTVTSAVRGIFEKDIASRAEAMSLITMK >CP012320|1547081:1555626|1549783_1550485_+|AXU56852.1|DBSCAN-SWA MIGCIYEVYNEEMTKIIENQNTLAVYLVGSSKDVDFTLYDVEINDIDVFVFVKEGEKQERILFKKKGIEFDVNYFSKDGVKKLLSNREYFFVKEMKDAKVLFDRENISNIIKDISRDIYLEGPSKMSLEEKSFIKQDIGAKISNLKNKEKFDVFEYHFLTNLYLKDIIIGYFNINDKWVPKDKKLLKVLKKENNELFELASKVSENYDYQRLLDVYNYIFKEIETKEVIKLIF >CP012320|1547081:1555626|1552308_1552815_+|AXU56856.1|DBSCAN-SWA MNKAYLGIGTNMGDRFDNLSRACELLKNSDSIYKVKESSLYETKPWGYTEQADFLNMCVEIETEFEPYELLEYCQEIERELHRERIVHWGPRTIDVDILFFNDVASTDERLTIPHPRIQDRAFVLIPLMDLNEELIINEKTVKEHLNLLSAEEREEVKELVGYERKPI |
10 | Pandoravirus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1683041 : 1738529
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP012320|1683041:1738529|DBSCAN-SWA TCTAATTTGTAATTTTTTCAAATATATCTACAGTTTCATTTTTCATTTTATCAGTTACATGTGAATAGGTATCCATTGTAGTTGATAATTGGCTATGACCCAAACGGTTTTGTATGTCTTTAATGTTAGCACCATTTTCTAATAATAGAGTAGCATGTGCATGTCTTAAAGAATGAAAATGGAAGTCATTGTTTAAAGCTACTCGAATTTGTCTTACTATAGTGTCTAAAGTGTGAGTATTCACTTGTTGACCATTTTCTTTGGTACATACCCAATCACTATCAAAGTAAAATTCTCCGTATTTTAATTTCATTTTCTTTTGATATAATTTATGTTCTTTTAATGCCTTTATTAAAGTGTCACCTGTAAATATAGTTCTGCAAGAGCTTTCTGTTTTTGGTTGCCCTAATTCAAACATTCCATTTGGTTTTTTAATCAAAGTATGCTTTACTGTGATAGTTTTATTATCAAGGTCTATATTATCCCATTTTAGTGCAATAATTTCACCTCTTCGCATACCAGTATGAAATCCAATTAGTAAAACTATACGTTGAAATGAATCTTGAGGAAATATATTTAGTATTTGATTAAATTCTTCTAATGTAATAGTTTTAACTTTATTAGTTTCTGTTTTAGATTTAGTTTTTGGTATGCTTACATATTGCATAGGGTTTTCTCGTATGTGTTTGTAAGGATGGACTGCTGATTTTAATGACCTATGTAATATGGCTTTTAATACTTGTAATGTATTTTGAGAATAATCCTCTTTGTACTTTTTATTTATGAAGTTTTGTAGTATTGCAGGAGTTAAAGCTTTTACTTTGTAAGCTCCTAGTTTTGGCTTTATATGTTTTTCTATGTTTATTCGGTAGCTTTCTTGAGTGTTGTATTTACAGTTGAGTAAAACATATTCTTTGTACCAAAAGTCTAGGTAGTCTGATAAGCTGATGTTACTTTCTTCAAAGACTATGCCAGAGTTTTCATATTCATTTAGTGCTTCTCTTAGTGCTTTTTCTGCTTCTTTTTTTGTATTGCCACCAACTCTTTCTACTTTTTTTCTTTTTCCTTCTACTATGCCTAGGTCAAAGTAGTAATACCATTTGTTGCTTCTTTTTCTTACTCCACCTTTCATAATAGTATCCCTCCCTTTTAGAATGTATGTTTGTTTGGTGTTTATATAAAAAATGTCTCCTATATTTACAAGAAGACATTAATTATATTCGTCAAATAATATTTCTAATTTAACTTTTATACATTCATCACAATTATTTTCTTTGTTAACAAATTTAATAATGCAATTATACTTTAATCCTCTATTTATTATACTTGTTAATTCTCCACTATAATATCTAGGAATGTAACCTATATGATTCTCTTTTTTATCAAATACCTTGATTGCATGAGGATCAAATTTATTTTCTGGTTCTAACTCTAGAACTAGAGCTTCATTTGATTCTAATTCTATTGAATTATCACATTCATGTCCTTCACACCCAGCATAATGTCTTACTCCTGCAATATAAAAATATCTAATTATATTTTTATCAATGTCCAAAGGAATTGGATCTACAAATTCTAGTGTATCTATAGGTAATCTTGCACCACTTCTTTTTAAAAGTTCATATGTATCATACTCAGACATATCATACTTATCCAAAATTTTATTGATGTCCTTTCTTTTTTTATCAGGTAATCTACTTGCAAATGGGCTAAATAAATCTTCACTATAATATGTTTTACTAATATCATCAAATGATATTAAAGCATTAAAACCTGCTTTAATAGCTTCATCAATTTCATATTCATAAGAAAATTCATACAATCCATTTTTAGCTAACTTTCCAATTATAAATTGTCTTCTACTTTTTGGATCTTTCCAAATAACATATAAAAAATCTTTTCCATTTTTAATTGACATTTTATCCCTCTTTCACAAATTATATATATTTTTTATTCTTAACACTTTTTCTTTTAGATATATTTTTAGCAATTTTTTTAACTTTGGGCTTATAATATTTTCTGAATAGTTATCTATTAATGTATTTATGTTTACTTCATTCATAAGATTTATTATCTTTTCTACAAAATCTATAGTTTGTTCATAATAATTTGAATTTAAATATTTTAGCACTTCTAAGTGTGTTGGTTCTTTTTTATTTTTTCCATCTATCCTTATTCTTGATCTTGAACGTGTATTTATAAGAGCTTCAAATCTTTGATGATCAGTGAAGAAAGAATCTATGTTCTCAATATTAACATAACAACATAATGATGATCCGTTATCATATAGAGGACTAAGAGTAATTTTATTTTGACTTTCTAGTAGAGCCCAATTATTTTGATGCCTATCTCTATTTCCAATCAAGTAATCAAAAATTAACATTTTTAGAAAATCATTTTTTATGTTATATTCTTCTATAGATTTAAAAATCATTTTCAATGAATAGTATTCATTATTTTTATAATCATATAACTTATCTGTATTATAACAAGGATAATATTTGTTTATTAACCACACGCCTTCAATCAATTTCTCATCATTTTTATTGATTAAATAACTCATTGAACCAATTCTTTTATTATATGTACCTATCTCAACATTAGCACAAGGAATCTTTAACAAACTAGCTATTTCACAGGCTAATTTTTCTGCCCAATATTCTCCAGTTTCTTTTGTTTTAGGGAATTTAAACAAGCCTATATCTTTAGTTTTTTCATTAATTAGCCAGATTTTCTCGCTTCTTCCACTACCATAAGAAAAACCATCATACTCTTTCCATTCATCAAAATTTTTAATCACGAAAATAATCCTCTCAAACAAGTATTTTATATTCTTATTGTATCATTTGATTCTAAATTTGCAAGAATTTTATTATCCATAATAAGCTTAACTTAAAATAAAAATTTTTTCTAGATTTTATTTATTCCACTTTTAACTTCAAGCTTTATTACATATGGAATATGTGTTTACTCATCAAAATTACTACTGTGTATAATGGTTTTACTTTATAAATACTTAATTTTAGTTTTCTATATTTATTTGGTAATTTTTTTGAGTGTTGTTAAGTAAGAAATATTTTTTGTACCAAAAGGTAAGCTGATATTGCTTTATTCAGATACTATGCCTAGGTCAAAGTAGTAATACCATTTGTTGCTTCTTTTTCTTACTCCACCTTTCATAATAGTATCTCTCCCTTTTAGAATGTATGTATGTTTGGTGTTTATATAAAAGAGCAGATTAACTGCTCTTTATATACTTTTGTTATGTACAATATTATCTTAATTTTGTTTATCTGGTTTTTACTTAATTATTTTCTTAATATTCTTACAATTTTTTAGCTTTTATGTGTAGTTTATTATAATAATATTGAAATATATATTTATTAAGTAAAAAATCTATAAAAGTAGAATAAATGAGTTTAAAAAATATCCTCATATATGTAGAAATTTGGCAAATTAGTTAATACTAAAAATCTATTATTTCCTAAGTCCAACATGCTTTTCTTTTTTGATAGAAATTCTAATCTTTTTAGTAAGAAGTTGATGCTAACTTGTAATTCTTCAGCTATTTCGTATACACTTGTAGCGTGTGAATTAATAACATGTATTATTTCTTCTTCTGTTATAAGAAATTCACATGCCCATTTTAGTGCTTTGTTTTCAGTTTTGTCTATCAAGATTTTATTTTTGTAACTGTTTTTTGAAGATACATAGTTTCCAACACTGGTAAAATGATGTCCTAATTCTTCTGCTAAGATTTCTATTAGTTTAGCATTGTTTTGTTTTAATGAATTAAGTAATGATATAATTTTTAGTCCTTGTCTGTTTATATACAATCCTTTTATGTCATCTGCTATTTTGTCAGTGTAGTAAATTTCTATCTCTTCATTATTTGCTAAGTCTAAAAGTGCGTCTAGTTTGTTCATTGAAATCCCCCTATAAAAAGAATGTATGTGTTACTTTTTTATATATAAAGAGCAGGAGTGAACTGCTCTAAATATTCATTTTTTATATCTATCAACTAAAAACTCTATGTAGCTATTAATATGTTCTTGCGCTTCTTTAGGTAAACTTTCATAAGATTTAATTATTTTGGATATTTCATCAGTAGTTATGTAATTTTCAATTGAGGTTTTACCAAGTAGATAATCAACTGACACATTAAAAAATTCTGAAATTCTTAACAAGTCTTCTTTAACAGGTTCTCTTTTGCTAGTTTCTAACATAGCAATTTTGCTTAGTGAACAATTAAGTAATTTTGATAATTCTGCTTGAGTTAATTCTTTTTTCTTTCTTAATTCTTTTAACCTTATTGGAAAAGTTGAATTTAAGCATTTTGTTAATTTATTTGAATCATCTATGTTAATTTTTCCAATTAAGTAATCTGTAGATACTCCAAAATAGTCTGAGCAATCTTTAATAAATGATTCTTTTGGTTCTCTTAACCCATTTTCAATTCTGGATAAAGTGGATTTATTTATATTTAAGTCTGTGCTTAATTTATCTAAAGAAATTCCTTTTTCAGTTCTCAATTTTTTTAATATTAACATAGATTCAATCCTTATTTTTTATATTTATTCATTAAAAATTCAATATAATCGTTGAGTTGTTCTTGAGCTTCCTCTGGTAAATCTTTGTGAGGATTAACTCTGTGTGCGGCTACAGTATCGATGTGATTTCTAACAAGAGTTCTACCCAAAAGATAATCAATTGATACATCAAAAAAATCTGCCCAATTTTCTAGAATATTTATTTCTGGTTTTCTTTTATTATTTTCATATTGCGATATTGTTGATTTATTAAAACTTGTAAAGTAAACTTTATTGAATTTTGAAACTAGTTCATCTTGAGTAAGTTTTTTCTCTTCTCGTAATTGTTTGAAACGTTCTCCAAAAGTTGCCACAAACAACACCTCCCAATAATTAAATGATACTATAAGTTTACAGAAACGTAAACTTATGTTTAGAAAAAAATAAAAAAGTTAACAAAAAAATAAACTT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69 | Clostridium_phage(78.95%) | terminase,capsid,tail,portal,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2507611 : 2513915
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP012320|2507611:2513915|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP012320|2507611:2513915|2510774_2510927_-|AXU57732.1|DBSCAN-SWA MDNFLFNVLASVTASYIVYLISKLIKKVKSHSTAKSDLKIDINFKYHRKK >CP012320|2507611:2513915|2512249_2512543_-|AXU57735.1|transposase|DBSCAN-SWA MIRNRKLSRSISDVSWSEFIRQLEYKANWHGRQIVKVGKFFASSQICNKCGYKNEEVKDLNIREWIYPSCNETHDRDINASINILKEGLRLITIQNK >CP012320|2507611:2513915|2509657_2510581_-|AXU57731.1|DBSCAN-SWA MVGAFVLPNYAITLSEMSNLWGNFTMWILVPIITIVLLIIAVSSMQYILVMIAFLLIIYSFIEKKIVMALVSVLFFTYSIYLCATWKDKSLIADNKVETVKAQRETVEREKEMERRRIQEEVDKERYIEKHGMEISENDLKVKLEALVPQEYKGKKYELKVEKFKRYSMYFDLTVQNEKFSNSEECKKFVKEIANDLKKIKISKAYFKFHSKDDGGIYNSVYIDYFRNIQNNVDNVENLEFNEFELKTEEEEKREQEKIEQEKNSYNNYIQNRVVDPLDRIKKLKELLDSGAITQEEYNKKKKELLE >CP012320|2507611:2513915|2511200_2511533_-|AXU57733.1|DBSCAN-SWA MNDMARDVFSVKMTPLEAQKMVEKNLEADLVSVDIYNLENNKSIIVTIFEKYYARSNSDAGLVVICENTTGKTLVKITSTGSAIGLFQIDWGTGNNLIKRVKKILIDYII >CP012320|2507611:2513915|2507611_2507977_-|AXU57729.1|DBSCAN-SWA MKNELMMFEGKEIEVFEFEGRILFNSKDVANCLDIKNVNENIILMNEKQVVKLRNSDISNTDIRKLNNAGENFLTESGVYKLIFKSRKEEAERFQDWISDEVLPSIRQTGAYITNNVIPKS >CP012320|2507611:2513915|2508096_2508249_-|AXU57730.1|DBSCAN-SWA MKNCRKDKRGFSVLLDKEKLDKFDEVLEEKNLTKKEWLEEKIDEELEQKE >CP012320|2507611:2513915|2513537_2513915_-|AXU57737.1|DBSCAN-SWA MKEEILIEKLLRVELIVMEYLWKKDTLMPKKEIVKEIKQIYGWHKSTIKILLKRLVDKRYLARYIINFQSYYKIIIDNKEYYTFKKKVLKSSKSIKIMHSLTTIHKNVSKEKLDLLDEYYRNLKE >CP012320|2507611:2513915|2511559_2511814_-|AXU57734.1|DBSCAN-SWA MENKDIKLTICIFAFVIGIIVLFCCIGLGQFNMDCIIKQNGGSIATEQYNIYLEQSISQYRNFGSILVLLGGIGILFDKSVRKY >CP012320|2507611:2513915|2513241_2513433_-|AXU57736.1|DBSCAN-SWA MKISKLPEAELKVMRYIWESEKVLISREITKSMEQKYEWKDTTIFTVLKRLLKKRVFRNGENR |
9 | Clostridium_phage(66.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2617749 : 2667365
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP012320|2617749:2667365|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP012320|2617749:2667365|2661751_2662354_-|AXU57874.1|DBSCAN-SWA MMSSNITIEMVDSVFERVPGATYAEAKEALVMCNGDVIEAVIYLENKKNTCNCKAKSAKETMEEVFGKDGENIKFQLKELLRKSSVVRIIVEKDGKTMMNIPLTVGVVGLAFVPLATLVGLSAAVISKYRIKVQNEEDGEIVDLGELNEEKLHVLKNMITNAAKDVKDVVVDKKEDDKDVTADLMKEESEKNKEDEDENK >CP012320|2617749:2667365|2636485_2637778_-|AXU57852.1|DBSCAN-SWA MLDLNRKLAKLEEEGKKIKVALIGAGHMGNGMVSQMANMKGIEASIVVDINLELAHKAFTDAGIDEEIIDNVTNEKDAEIKLQEGKVLTCNDFLVACKTKSIDVVIDATGGIAIGAEIALNSILNKKHIVMLNAETDCVVGPILKKLADDAGVIFTGSAGDEPGAVMELFDFADAMGFEVRVIGKGKNNKLDLDCNPDTVREEAERKGASPHMIASFKEGTKTMVEMALMCNATGFVPDVRGGHGIEATVNEVPKKYALKSEGGVLDNYGVVDFVNGIAPGVFVVVAHKLKAVNDELKYLSMGDGPNYILYRPYHLCSLETPLSAAMAVLDHKATIVPKAGLVAEVMTIAKKDLKKGEFMDGYGAYTCYGTIEKYDVAKAMNAVPIGLISKKTKVVKDIKKGEVITYDMVEIEKDTTLYHLRQLQEKIFG >CP012320|2617749:2667365|2619059_2620250_-|AXU57839.1|DBSCAN-SWA 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46 | Clostridium_phage(16.67%) | coat,protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
3062978 : 3071931
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP012320|3062978:3071931|DBSCAN-SWA TCTACTTTTCTCTAGTTGTTGCAATTTCTTTGATATTAGCATCTTCTGGTTTAATATAAGTTGGCACTAATTCCCTCATAATACCATCTATTTTTTCAACCTCTTCATTGTTAGTAATTTCTCTTAAAAGTTTTAAGTATTTTGTTATTTTTTCTCTATCAACATCTATTGGTCTGCCAATAAAAATCTTTTTATGCTCTGTATCCAACAGACCTTCTTCTGACATAAGTAGTTCTTCATACAACTTTTCTCCTGGTCTAAGACCAGAAAATTCAATTTTTATATCAACATCTGGCTCAAATCCACTGAATTTAATTAAGTTTTTTGCTAAATCCAATATTCTTACAGGTTCTCCCATATCAAGCACAAATATTTCTCCACCTTTAGCCATAGCCCCAGCTTGTATAACTAAGCCTACTGCTTCTGGTATTGTCATAAAATATCTAATGATATCTGGATGAGTAACTGTCACTGGTCCGCCATCTTCAATTTGCTTCTTAAAAAGTGGAATTACACTACCATTACTACCAAGCACATTTCCAAATCTAACAGCAACAAATTCAGTCTGGCTTTCAGCATTCATAGTCTGTATAATCATTTCAGCAGCTCTTTTAGTAGCTCCCATTATGTTAGTAGGGTTTACAGCCTTATCTGTAGATATAAGGACAAATTTCTTAGCTCTATATTTTGAAGACAAGCCAGCTATGTTTAAAGTTCCAAATATATTATTCTTTATAGCTTCGCCAGGGCTCGATTCCATAAGAGGAACATGTTTATGTGCTGCTGCATGAAATACCACTTCTGGTTTATATTTATTAAATATTTCATCCATTCTTTTTTCTTCTCTTATTGATGCTATTACTGTCTTTAAATCTAATTTATTTTTATATTTTCTAAGTAATTCTTGTTGTATTGAGTAAGCATTATTTTCATAATTATCAACTATAATAAGCTCTTTAGGATTAAATCCTGCAATCTGTCTGCAAAGCTCTGAACCAATTGAGCCTCCTCCTCCAGTTATTAGGATTACTTTTCCCTCAATGTAATTACTTATCTCTCTTAAATTTGTTTTTATAGGCTCTCTACCCAACAAGTCTTCTATCTCTACTTCTCTAATCTGTTTTATATCAACTTTTCCATCTATAATTTCGTAAATTCCTGGTATTGTCTTTATTTTACAGTTAGTGTTTTTACATATATCAATAATCTCTTTTTTTCTACGTTTCTCTATGTTTGCTATTGAAAAGATTATCTCATCTACATTGTACTTTTCTACCACAGCTTTTATATCCGAAGTTGTTCCTACAATTTTCACATTATGGATTATTCTTCCAATTTTATCTTTATCATCATCAATTATAGCCACTGCTACTTTTTTAAGTTCTGAATTTCTTTTTAGTTCCTGTATAACCATTTCTCCTGCATCTCCTGCACCAATTATAAGGATATTTGAAACCTTTCCTCTAGAATATGTCTTGTTCATGACTATTCTTATAGCTCTATAAGCTATTCTTGCGCCACTTGTAAACATTATAATAAATATTGTATTTAATACATAAAACATTATAGGATAATCAAACCCTAATAATTTATTTATTATATAAATCGGAATTAAATAAGCTAAAGTTGCCACAAAAATAGATATAATTTCTTCTTCTCCTGCATATCTCCATAATGTGTTGTAGCACTTAAACAATCTAAATGATACTATATGAAGTACTATATATATACACACTGAAATTATTATATCATTAGTGGTAAATGCATTTAAATTACCTGTCAAGCTTAAAGACATTCGAAACGCTACTAGTACGCTACAAATATCTAGAATTAATAGTGTTAAATGTCTAAATTTATATTTTTTAAAAAGCCTATTAAAAAAGCTTTCTTTCTCTAAATCTATACTTTCTCGCATAACTAGAAGCCCTCCTTTAAACAGCAAAAGCTACGCACCTAAGCATAGCCAACAACATCTATCTTTTGCTGTATTTTTTCATTTTATTTTTTATATTTATCAAATATAGAATCATAAATTTTTTCTATATCATTAAAGTTTAAATTAACCTCATAATTTTCTCTAACAAATTGACGCCCTTTCTTACCCATATTAAGTCTAAGTTCATCATTTTCCATTAGTTTTATTATAGCATTTTTTATTTCTTCTGGTTGTTTTGGTTCTACAATTAAGCCAGTTTCATTTTCCCATACAGATTCTGGATGTCCTCCTACATTTGTAACTATAACAGGTACTTCACATGCTTCTGATTCTATAGCTGCCACTCCAAATCCCTCTCTTAAAGAAGGAAATACAGTTACATCAAAAGAATTAAAAGTCTTGCTTACATTTTCTGGAGATATTCTTCCTAAAAACTGAACATCATTTTCTATACCCAATTCTTTAGCTAAATTTATTAGGTTGTCCATCTGACTTCCAGAGCCACCTATTTTAAGAATTATTTTCTTATCTTTATATTCATCTTTAAGCATCTTAAATGCTTGTATTAAATATTCTATTCCATATTTTTTTTCTAAACTCTTTATAATTCCTATTACAAAAGCGTCTTCTTTTTCTACTTCCATAGGCTTAAACCTATCCATATCTACTCCAAAAAAGGTTACATCTACATGTTTAGCTGTATATTTATTAGCCTCTTTAGCCATATCTCTACTATTTGAAAAGATATAGTCTGCTTTTCTAAAGTTATGTTTTATAATTTGTTTTTGTATAAAACCATTATTAGGGAAATCATAAATATCAGTACCCCAAACAGAAATAATATATGGATGATACCCAAGTAGACTTCCTATAAATCCATAACTACTTGCATACTGTGCATGCAATATATCTGGCTTTATTTCATTTACTAGCTTCTTTATCTGCTTTATTGAACCTAAGTATCCCGTTTTTTTAGAAATATTTTCATTTTTTAATTCTTCTACATTAGAACCAAAATTATAAATTTTTATTCCTTCCATGTGACCTCCATTTAAAGAGATTACATGAATGTCATATCCTTTATTTTTAAAAAAACTACACCATTTTAAAGTATGAGGATTTGACCCATCAGCTAAATAACAAACAGTCTTCATAATATTTACCTTCCTATCGAATAATACTCAATTCCTAACTCTTCCATATCTTTAATTTTATAACAATTTCTTCCATCAAGGACTAAAGGATTTTTCATCTTTTCCTTATACTTATGTATATCATAATTTAATACATCTTTCCATTCTGTCATTATAAAACATATCTCTGCATCTTCTATCGCATCATCTACAGAATCAGCATAAAGTATAGAGTCACCAAATATTTTCTTAGTATTATTTACACCAATTGGGTCGTATACAGTAACTCTTGCCCCTCTTTCAAGCAAATATTTTATATTTGGTATAGATGGTGCTTCTCTTATATCATCAGTGTCTGGTTTAAAAGTCAAACCTAAAACAGCAACTTTCATATCTTGAAAGCTCTCTACTAACTTAGATGCCTTTCTAACTAATTTAAGTTTTTGACTTTCATTAACTTCTATTGCAGCTTTTACTGTTTTTAATTCATAACCATTATGTTCAGATAACCAGTGAAGAGCTTTTGTGTCTTTTGGAAAGCAAGAACCGCCATACCCTATTCCCGCCTTTAAAAACTTACTTCCTATTCTATCATCATAACTCATTCCTAAAGCTACATCTTCTATGTTAGCTCCTGCTATTTCACAAAGATTTGCAATATCATTCATAAATGATATTTTAAGAGCTAAGAAGTTATTTGATGCGTATTTTATCATCTCAGCACTATTTCTATTTGTAACTATTATAGGTTGATTAAAAGGCTTATAGATTTCTTCTAATATTTCTCTAGCCCATTCACTTTCTACACCTATAACGATTCTTGAAGCATATAGAGTATCTTTTACTGCTGTTCCTTGTGATAAAAACTCTGGATTAGATGCAAGCTCTACTTTTACATTATTTTTTAGGTTTCTATTTATATAATCTTCTATCTCTTCATTTGTACCAATTGGAACTGTAGATTTTATTACTACTAGAGTATCTTTTGTCACAGTTTCAGCTATTTGCTTTGCAACTGCCTTTATATAATCTAGGTTGGCTGAGCCATCACTTCTCTCAGGTGTACCTACAGCTATTAATATTACATCTACATCTTCATAAGCTTTTTTATAGTCTGTAGTGTAATCTATTCTTCCTCTGTTGTAATTTTTAACCATAAGTTCTTCTAGGCCTTCTTCATATATAGGTGCTATTCCAAGTTTCATTGATTTAACTTTTTGTTCATCTACATCAACACAGACTACATTTTCATTGCCTACCTCTGCTAGACAAACACCTGTAACCAAACCTACATATCCCGTCCCAGCTATAGCTATTTTCATTTTTTTACCTCCAAGTATATAAAACTTATACTCTTTTTTTAATGGCATTAAAAACATAGAAACAAAATACATATAGACTTTTTGGTAAACTTAAATTTTCAACATTTCTATAAGTATTCCAAGTTCGTTTTAATGCTTTTATCTTGTTACTTGATATAGAATTTCCAACTAATCTGTAATTCACTAAATCCTCCTGAATCCCATATGCATATTTTTCCTTTTTAAGTAACTGTAACCAGGTCGCAGTATCTTGTCCTCTTCTTACCAAAGGCATGCTGAACTCTCCTACAATCTCCTTATCAATGACCACTGTAGAACATCCTATTATAGTATTTCTAAGTAATCCTTCATAGTCAATTTTCTTAGGAGCTCTTGCAACCTTATTCGTTTTTGACCCATCTTGTCTCATATATCTATAAGATGTAAAAGAAAAACCTACATTTTCTTTTAACATATATTCTATCTGAATCTCTAATTTTCTACTATCCCATAAATCATCACTATCTACAAATGCAATAAATCGACCTTCCGCATTCTTAATACCAACATTTCTAGATACTGCAGCTCCAGAATTTTTTTCAAGCTTTATATATTTTATTCTAGCATCTTCTTTTCGAAAACTTTTTATAATTTCACTTGAATTGTCCTTAGAACAATCATCCACTAATAAAAGCTGCCAATTTTTATAAGTTTGATTTTGGATTGACTTTATCGTCTCTGATAAAAACTCTTCTGAATTATAAACAGGAGTAATTATCGATACTAAAGGCTCATTCATATTTTTACTCTCCTTATATAGCAACTAGCAGTACTATACCAACAAGTTTACTTAGATACTAATTTTCTTTGTCCAATATATTTGTAATATCCTAATGGGAATAATGCTAAATACAACAATTTATCAGATACTTTTCTTAATTCACCAAAATAATGACTATCAGACAACAATGAGTATCTGGCTAAATTTATGTAATTTTTTATCCACATATATGGATATCTACTTAATGGATATGTATTTTGATTTATTAAATATAAAAACTCTAATGCTCTACCTCTTAATGCATTTTTACTTAATATATTCTTAGTCAAACCATCATCCAAATAATCTCTTATTATCATAGGTTTATTTACACATATAACTTTATAGTATTTAGACATTTCATTCCATACTACACTTTCTGGTAAAAATCTCACTTCTTTTCTTTCTGGAAAAGGAAATTTTATAAGCTCATCAGTTACAAATACTATGCTTTTATCTCCCTTAACGCCATACTTAAAATATAGGTCTGCAAAGTGACATATTTTCTTATCTTCAGGCATTTCTGTCCCTATCAAATCTCCACTTGGATATACACAAAGTCCAACAACTCCACTAAATCCTTCTTTATTCTCTAAAGAATCCCACTCATCATTAGCAATTTCAAGAGAATCTTTAATTAAACCATCATCACTATCTACAATGAAAAATAGCTCTCCATCTGCATTTTTTACACCTAGATTTATTGCAGTATGTTTTCCTCCATTTTCTTTGTATATATATCTTATATTTAATTTATTTTCTGATATAAATTTTTCAACTAACTCTTTAGTACTGTCGCTACTTCCATCATCAACAATCAACCATTCAAAATCATTGAAATCATAAGTTTGAGCTTTTAAATCATTGTACAAATTTTCAAGTAAATGAGCTCTGTTATACGTCGGAGTAAATACAGTAAATTTATATTTATACATTAATTAAATCTTCCTCTCTGTCTAACTTTTTTTGATTCCGTTTATTCCATAATTAATAAAGTAGTATATAGCTTTGTATAAAGGTATTTTTTCTATATTTCTATATATATTCCAAGTCCACATAGCAGCTTTTATTTTATTACCACTTAGGGAATTGCTAGATTTTCTATATAATGCTAGAACTTCATTTATTCCATGAGCAATATGCCCTTTTTTCAATATCGATAACCATAAAACATAGTCTTCATGTCTTACACCACTCATTCTTATTTCAAAATCCAATTTAGACTTATCAATCACAACAGTAAGACATCCTAAGATATTTCCTTTTAATAATCTTTTATAATCTACATTAGGTGGAACTTTTATTACTTTGTTTAATTTTTTATCATTTTCATCCATCAGTTCATATGAAGTAAATGAAATTACATAGTCATTTTCTAACATAAAATTTACTTGTTTTTCTAACTTACTGCTATTCCATTGGTCATCACTATCTAAAAAAGCTATAAATTGTCCTGTTGCCTTACTTAGTGCTAAATTTCTAGCATTAGAGACACCCTTATTAGTCTCAGTCTTTATACATTTTATTCTACTATCCTGTTGCATATAAGATTTGACTATATTAGGACTATTATCTGTTGAGCAATCATCAATAATTAACATTTCCCATTCTTGATAAGTTTGGTTTAATACTGATTTTATGGTTGCTTCAATAAATTTTTCAGAATTATACATGGGAGTAATTATAGATACTAAATTCTTCTTCATATTACCTTCCTCATCATTTATAAAATATTTATTTAATTTTACTTAATACACAATCATATATCCTCTTGCAGTTCTTATTATCATTATATCTGAAAAACTTATTTCTTTCATTTTTTTGGTTATCCATAACCTCAAAATTATTTTCAATAATATCAATAAGTTTATTCACGGCTTCATCATTATTATAAGCCAAAGACCCAAACATTTCACTTTTTAAATCTATATATGAATCAACTTTTTCCATATATTCATCCAAATCGAATTGGTAAAACAAGATAGGTCTATTCATATACAAAAAGTCTATGGCTACACTTGAATAATCAGTTATATTTGCAGCTGATTTTCTGATTTCATTTGCTAGAGTTACCCCTTTATCTAAAAACACAATTCGTTTTCCTGTTATATTTTCTTTTATATCATCTATAAACTCATGCATAAGATGATGCATATAAATTTTTACATTTATATCTTTCTCATCTAATATTTTATTTAATTTGTCATCATTTAAAAAATTCATTATATTTTTAAAATAATCTGTATCCGTAAATTTTCCTGAACTAAATTTTATCCAATCTCTCCATGTAGGAGTATATAATATATCTCGAGTTTGTGCAACTTCATTTGTTGGTAAATTGTCATATCTTGCATTCCCAATTATATAAACTGAGTCATCTAACATTCCCCAATCATTTACCATAACATTTCTTTCAAATTCAGAACTTGCTGTAACTATATTATAGCTTTTATATAGGTTATCTATAATATTTTTGAACTTTTTGTTCATAGGTTTTCTTTTTTTAAAGCTTATAGTCCCATGATTTAAAAACACTTTTATCGTTTTTTTATGAAAATAATTAAGAACAGGTACAGCAAAATTGTATGGTGCTATATCTGCTGATGGTGCATGTGAAAATACTATAGCTTTTGAATTGTAATAATACAGATAGTTTTCTACACTTCCTCTTATTAATTTTTTGCCTGGAATTTTATCAAATACTTTACTGTCTTTATTTACTACCCAATAAGTTTCTACATCATTATGTTCTTTTAGCATATACTCATAAAAAAACTTTGAATTATCATTGTATATATCCCCTGAATGTCCACCTATAAGCCAGATATCTCTACCATTAAACTTATGCTTATTAAATGGATATATAAAAAAAGCCAAAAGCATATTTATTAAAAATTTAACCTTGTCCATAAACACCATCCTCATTATAACTTGTACTGTCTAAATCCATTAATTCTTCCTTTTATAGTGGCACTATGATAATCTCTATTGGAACTCAATATAAGACCCCCTATATTTCTTACAAGTTTTGATACCATAACTTTTGCAAACGTATAATTTTTTCTATAGACTATTTCCTTTTTGCAAAGCGCTCCAAAGCCTCTTCCATAATTATAATCTTTTTGATACTTTTCTTTAGATTTAGAATGTTTTTTTGCAGGATGGTAAATTATATCATTTCCAAAGTATTTTCCTTTAAAACCTAAACTCAATAAGTTTAAAACATAATCTATCTCTTCACCAGCACCAAACTCTCCACCAACACCCAATTTTTCATCAAATCTTGTATAATCTTTACCTTCAAAATCAATAAAAAAAGTTATGGATGTTATAGTATCCAAAACGTTGGAACTTGTGATATCACAAGTTCCATCATACATTTTCTTAAATGCATCAACTTTATTTGAATCCATAGTTTTGCAACTGTATATTTTATAATCTTCATTTTTATTAAAGAAATTTATAACTTTTTCTAATGTATCATTTTCGTAGACACAATCATCATCAGGGAAACCTATAATTTGCCCTACAGCATTATCTATGCCTACATTTCTGTTATAACTCAATCCTTTTTTAGAGCTTTTTATATACTTTATATCTAACTTATCAATGTATTTATCAACTATTTCTTTAACTTTGCTATTATCATTTTGGTCTACTACTATAAGTTCAAAGTTTTTGTAAGTTTGATTTTCTAAGCTATCCATAAGTAAGTATATATCATCATATCTATTTAATGTTGGCATTATTAATGATATTAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP012320|3062978:3071931|3064975_3066067_-|AXU58208.1|DBSCAN-SWA MKTVCYLADGSNPHTLKWCSFFKNKGYDIHVISLNGGHMEGIKIYNFGSNVEELKNENISKKTGYLGSIKQIKKLVNEIKPDILHAQYASSYGFIGSLLGYHPYIISVWGTDIYDFPNNGFIQKQIIKHNFRKADYIFSNSRDMAKEANKYTAKHVDVTFFGVDMDRFKPMEVEKEDAFVIGIIKSLEKKYGIEYLIQAFKMLKDEYKDKKIILKIGGSGSQMDNLINLAKELGIENDVQFLGRISPENVSKTFNSFDVTVFPSLREGFGVAAIESEACEVPVIVTNVGGHPESVWENETGLIVEPKQPEEIKNAIIKLMENDELRLNMGKKGRQFVRENYEVNLNFNDIEKIYDSIFDKYKK >CP012320|3062978:3071931|3068193_3069102_-|AXU58211.1|DBSCAN-SWA MYKYKFTVFTPTYNRAHLLENLYNDLKAQTYDFNDFEWLIVDDGSSDSTKELVEKFISENKLNIRYIYKENGGKHTAINLGVKNADGELFFIVDSDDGLIKDSLEIANDEWDSLENKEGFSGVVGLCVYPSGDLIGTEMPEDKKICHFADLYFKYGVKGDKSIVFVTDELIKFPFPERKEVRFLPESVVWNEMSKYYKVICVNKPMIIRDYLDDGLTKNILSKNALRGRALEFLYLINQNTYPLSRYPYMWIKNYINLARYSLLSDSHYFGELRKVSDKLLYLALFPLGYYKYIGQRKLVSK >CP012320|3062978:3071931|3062978_3064892_-|AXU58207.1|DBSCAN-SWA MRESIDLEKESFFNRLFKKYKFRHLTLLILDICSVLVAFRMSLSLTGNLNAFTTNDIIISVCIYIVLHIVSFRLFKCYNTLWRYAGEEEIISIFVATLAYLIPIYIINKLLGFDYPIMFYVLNTIFIIMFTSGARIAYRAIRIVMNKTYSRGKVSNILIIGAGDAGEMVIQELKRNSELKKVAVAIIDDDKDKIGRIIHNVKIVGTTSDIKAVVEKYNVDEIIFSIANIEKRRKKEIIDICKNTNCKIKTIPGIYEIIDGKVDIKQIREVEIEDLLGREPIKTNLREISNYIEGKVILITGGGGSIGSELCRQIAGFNPKELIIVDNYENNAYSIQQELLRKYKNKLDLKTVIASIREEKRMDEIFNKYKPEVVFHAAAHKHVPLMESSPGEAIKNNIFGTLNIAGLSSKYRAKKFVLISTDKAVNPTNIMGATKRAAEMIIQTMNAESQTEFVAVRFGNVLGSNGSVIPLFKKQIEDGGPVTVTHPDIIRYFMTIPEAVGLVIQAGAMAKGGEIFVLDMGEPVRILDLAKNLIKFSGFEPDVDIKIEFSGLRPGEKLYEELLMSEEGLLDTEHKKIFIGRPIDVDREKITKYLKLLREITNNEEVEKIDGIMRELVPTYIKPEDANIKEIATTREK >CP012320|3062978:3071931|3071091_3071931_-|AXU58214.1|DBSCAN-SWA MLISLIMPTLNRYDDIYLLMDSLENQTYKNFELIVVDQNDNSKVKEIVDKYIDKLDIKYIKSSKKGLSYNRNVGIDNAVGQIIGFPDDDCVYENDTLEKVINFFNKNEDYKIYSCKTMDSNKVDAFKKMYDGTCDITSSNVLDTITSITFFIDFEGKDYTRFDEKLGVGGEFGAGEEIDYVLNLLSLGFKGKYFGNDIIYHPAKKHSKSKEKYQKDYNYGRGFGALCKKEIVYRKNYTFAKVMVSKLVRNIGGLILSSNRDYHSATIKGRINGFRQYKL >CP012320|3062978:3071931|3067393_3068146_-|AXU58210.1|DBSCAN-SWA MNEPLVSIITPVYNSEEFLSETIKSIQNQTYKNWQLLLVDDCSKDNSSEIIKSFRKEDARIKYIKLEKNSGAAVSRNVGIKNAEGRFIAFVDSDDLWDSRKLEIQIEYMLKENVGFSFTSYRYMRQDGSKTNKVARAPKKIDYEGLLRNTIIGCSTVVIDKEIVGEFSMPLVRRGQDTATWLQLLKKEKYAYGIQEDLVNYRLVGNSISSNKIKALKRTWNTYRNVENLSLPKSLYVFCFYVFNAIKKRV >CP012320|3062978:3071931|3066072_3067368_-|AXU58209.1|DBSCAN-SWA MKIAIAGTGYVGLVTGVCLAEVGNENVVCVDVDEQKVKSMKLGIAPIYEEGLEELMVKNYNRGRIDYTTDYKKAYEDVDVILIAVGTPERSDGSANLDYIKAVAKQIAETVTKDTLVVIKSTVPIGTNEEIEDYINRNLKNNVKVELASNPEFLSQGTAVKDTLYASRIVIGVESEWAREILEEIYKPFNQPIIVTNRNSAEMIKYASNNFLALKISFMNDIANLCEIAGANIEDVALGMSYDDRIGSKFLKAGIGYGGSCFPKDTKALHWLSEHNGYELKTVKAAIEVNESQKLKLVRKASKLVESFQDMKVAVLGLTFKPDTDDIREAPSIPNIKYLLERGARVTVYDPIGVNNTKKIFGDSILYADSVDDAIEDAEICFIMTEWKDVLNYDIHKYKEKMKNPLVLDGRNCYKIKDMEELGIEYYSIGR >CP012320|3062978:3071931|3069123_3069873_-|AXU58212.1|DBSCAN-SWA MKKNLVSIITPMYNSEKFIEATIKSVLNQTYQEWEMLIIDDCSTDNSPNIVKSYMQQDSRIKCIKTETNKGVSNARNLALSKATGQFIAFLDSDDQWNSSKLEKQVNFMLENDYVISFTSYELMDENDKKLNKVIKVPPNVDYKRLLKGNILGCLTVVIDKSKLDFEIRMSGVRHEDYVLWLSILKKGHIAHGINEVLALYRKSSNSLSGNKIKAAMWTWNIYRNIEKIPLYKAIYYFINYGINGIKKS >CP012320|3062978:3071931|3069901_3071077_-|AXU58213.1|DBSCAN-SWA MDKVKFLINMLLAFFIYPFNKHKFNGRDIWLIGGHSGDIYNDNSKFFYEYMLKEHNDVETYWVVNKDSKVFDKIPGKKLIRGSVENYLYYYNSKAIVFSHAPSADIAPYNFAVPVLNYFHKKTIKVFLNHGTISFKKRKPMNKKFKNIIDNLYKSYNIVTASSEFERNVMVNDWGMLDDSVYIIGNARYDNLPTNEVAQTRDILYTPTWRDWIKFSSGKFTDTDYFKNIMNFLNDDKLNKILDEKDINVKIYMHHLMHEFIDDIKENITGKRIVFLDKGVTLANEIRKSAANITDYSSVAIDFLYMNRPILFYQFDLDEYMEKVDSYIDLKSEMFGSLAYNNDEAVNKLIDIIENNFEVMDNQKNERNKFFRYNDNKNCKRIYDCVLSKIK |
8 | Catovirus(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
3155120 : 3179200
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP012320|3155120:3179200|DBSCAN-SWA 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32 | Streptococcus_phage(86.36%) | integrase | attL 3152848:3152862|attR 3160481:3160495 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
3727620 : 3787968
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP012320|3727620:3787968|DBSCAN-SWA 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57 | Agrobacterium_phage(15.38%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
3932897 : 3944662
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >CP012320|3932897:3944662|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >CP012320|3932897:3944662|3932897_3933086_+|AXU58934.1|DBSCAN-SWA MNNKKKSFLISGTINVILLIIVFALFSYNIIENSTRNMIITVILIFIFEIIKIKILEKYYNL >CP012320|3932897:3944662|3938831_3939149_-|AXU58941.1|DBSCAN-SWA MKSDLYLCKSNKLYRDNEVLEKFMEDLSFLIDDYKFSLETISILCKINIEKLTNFYAGKGYILYEEMSLIESVLAPFLSAIDIAKHNYDVVIKSRESDKPLIFEN >CP012320|3932897:3944662|3937705_3938149_-|AXU58939.1|DBSCAN-SWA MNLRKTVISGMCALVCSSAVAIPAFADEYQDKNIEQYSAVNYIDDTMVKMSYIKSGTCNLSISGSTAKVTCFVRGASNVTSTSIIARLQKSNDNGKTWSTIQTWNASGNISCSLSKSKTIGKGYYRVHSTIKANSESKNIISSTKKY >CP012320|3932897:3944662|3941024_3941636_-|AXU58945.1|DBSCAN-SWA MNIKRINLLLSTVMAAVIISLPLAVTANAMEKTESDNNVKIELSDKEVEELHNYWPEDKIFSDEKIDEILIKTGQFTQKELDKINQEVDDSAKKVNQNSRVKYINGYNKYRTFTKNGKNYLYIYVSGKTLKKIKAGTDLASTFGGFLPKIWVELDVVAIGKIITINMDGINTNYGIVLSYIEDKWNFQGATYTYRYDHWFYQT >CP012320|3932897:3944662|3940032_3940575_-|AXU58943.1|DBSCAN-SWA MLIYLAILELEEDKIKFEKVYEKYRQIMFYVANKILKDDHLSEDAVHNAFLRIIKNIDKIDEVDSPRTKAFIVIIVERIAIDFYRKRKREKVSDIEEEYKNREINFSIEDKVCESNLAIALAKLNESYFQVLSLKFQYGFSNKEIANALNLGEENVYKRIQRARKKLKEILEEMEVGNIE >CP012320|3932897:3944662|3937392_3937575_+|AXU58938.1|DBSCAN-SWA MYKHTIIYDGEADMIPATVIGWGYNDGKILICDIKDYIPGQTENLYINYVSFSIITYFIK >CP012320|3932897:3944662|3939338_3940040_-|AXU58942.1|DBSCAN-SWA MSNKKDDFDITDDMLRESIPIATKIIIDDLLSDDELNHVFSKGFERKMKKLIKQQKRSSLTNKIIFYSKQTAIVFLIVLASLLTITMSSEALRSRFFRLVIRVYEDLTSFVFSTNGEDNLSLKNKEPEYIPKGFKEVDRVDDFVITYRNDENIEIQYVTDKISSNSIILDTENAKVKDIFVNGHKAKYIVKGTFLQLFWNDNNFIYLLNVDYQNSGESEFYEDILIKIAKSIK >CP012320|3932897:3944662|3933280_3933838_+|AXU58935.1|DBSCAN-SWA MVVGYMRVSTAEQNEDRQLVTMKKHNVEKMYQEKISAKDTKRSKLNAMLDFVREGDTIIVHDFSRLARSTKDLLEIVELLEKKHVKLISDKENLDTSTPTGKLMLTMLGAIYEFERTNMLERQREGISIAKEQGKYKGRKEVKIDNFGSYYDRYKTRELNKTQLAKELGVSRPTLDRLIKSHESN >CP012320|3932897:3944662|3942112_3943327_-|AXU58946.1|transposase|DBSCAN-SWA MFNKNEILKKLIEEYDVKTTTDIQDMLKDLFASTIHQMLEAELDDHLGYDRYDNKNKNTKNSRNRYRNKNVKSDFGEITLNIPRDRNGDFEPKVIRNYENDISGIENQVIGMYSKGMSTRDISSHLKSIYGIDISHSLIAKITDRVLPLAHEWQSRALDMVYPIVFMGAIHYKVRSEGRIINKAAYIAIGVNLEGITEVLGIWIGENESSKYWLKVLTDVKNRGVKDILITSVDGLVGFSDAIKAVFPDTEIQRCVVHQIRNTLNYVSYKNRKEFAKDLKKVYAAITEEVALSELSLLEEKWGNQYAIALRSWRSNWNELATYFKYPQEIRTLIYTTNSMESYNRLLRKVTKSKSIFPSDDSLHKSLYLATMDISERWTQKIRNWTQILAHLSIYFEERILTLN >CP012320|3932897:3944662|3940814_3940997_-|AXU58944.1|DBSCAN-SWA MKKRLYKVFLKTIPNLIIVILSLALSFYTNTFDIDLKILLLIPLAYVLLFIYYYIKTKKD >CP012320|3932897:3944662|3943513_3944662_-|AXU58947.1|protease|DBSCAN-SWA MISKKKAIFLGVILVIITAMVTSAFQLTLGNKVVISKELYEDYKKYDKLLGLESIIKQDFYKKVSDTDLVNGAAKGLFLGTNDKYSGYYTKDEMENLINDSEGSYVGVGMYIGASKDGGLVVVPMKDSPAEKAGVKSGDKLVKVNGKSVSYKNSDEAVRMMKGKKGKTVELTILREDKQLNFKVKTDQIIEKSIESKVIDNDLGYIEITQFISSTYTDFDKALKELKAKNIKGLVIDLRNNPGGMLDICKEVADELIGEGTIVYTKDNKGNTEYLKSDKEKLGLPIVVLTNGESASAAEILTAAIVDNKEGISVGTTTFGKGLVQSVVRLKDGTGYKLTTAQYFTPNGDYINEKGIKPTIEEKDENKQLDVATKWLREQIDK >CP012320|3932897:3944662|3938366_3938810_-|AXU58940.1|DBSCAN-SWA MKRLFALLLTLSLVILPSTLVFANEKAENDSIYAEAPLVFQSNEKAYTHGSGGTAYIGYMSSKHLNWRITSSKGIVILFSGTVEIRNSKNMLVASYPISGGGSSTISGQIDVKYLKKGDYKAILKGTSTTGGGVLVVKSGLVQMFTI >CP012320|3932897:3944662|3937154_3937322_+|AXU58937.1|DBSCAN-SWA MNQKIITKLTEDIYKSAENRGAKSDVRELYWLSHTKAPAILIEVCFVDSKADTDY >CP012320|3932897:3944662|3935971_3937177_+|AXU58936.1|portal|DBSCAN-SWA MYKYYKGETDAISNYKMVTKRSNNKINTNFLKKFINEEVAYSLANKITYTSRLGDEKIINDLEYYTCHWSKKHDSDLLRYTLLFGFCYELYYVKNNEMKVRIIKPTDGCHYENEDGETIYFFREFKKDFKDDIYIDVYDKEYIYHFDSNFKEIEKPTVNNIFNGNVPISICKRSEELGKNTIFNDIKGLQDAYETNLSDISNEISDFRNAYLTFSECNIKEDDLPRMKELGILQVNGDGKIEWLIKDMNDTFVQNTLSSIKENIYKITSHINHNEKMQSNTSSLAVVARLISTEWICSQNNDSIADTLFNRYKLLCIWLNKKYGFDYDYKDIKAKFTPKIPHNDLVVANILSQLGDKLSTETGLSQPSFIDNPHAEMEKAKKEQEIVSEGEILLDESKDYN |
14 | Clostridioides_phage(60.0%) | protease,portal,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
4116396 : 4131819
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >CP012320|4116396:4131819|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_13 >CP012320|4116396:4131819|4117733_4118192_+|AXU59116.1|DBSCAN-SWA MKLKNPMLVVTDIDKSVEFYKKVFGLYVIMDFGANKTLTGGLALQTSETYKEFIGTSDISFGGNNFEVYFEEEDFDKFADRLKEYDIEYVHPIIEHSWGQRVVRFYDPDKHIIEVGENMKIVCKRFLNSGMTPEQVAERMDVPMKFINACMR >CP012320|4116396:4131819|4122233_4122368_+|AXU59121.1|DBSCAN-SWA MWELIKDLLLVSLGMGIGVVLMCIMSVGKEADRHMIELKESEEK >CP012320|4116396:4131819|4116734_4117118_+|AXU59114.1|DBSCAN-SWA MRLTNGIVLDNEKTFGVLKFSALRHEVRVENEDGTTSDEIKRRTYDLKCSVQERMIQVSIPADVPVKDFPYNAEVELINPVADTVANANFRGTTVDWYIKADDIVLKNKGGQAGNPQNNAPQGQQKK >CP012320|4116396:4131819|4118216_4118759_+|AXU59117.1|DBSCAN-SWA MKGFERKNQLFSLCGLNCGLCPMLLGNYCGGCGNGNQSCRIAKCSLEHGQIEYCYECKQYPCEKYQHIDDYDSFITHKRRKADLERAKNIGIEQYNLEQQEKTQILSYLLSNYNDGRRKTFFCVAVNLLELSELQEAMKQIQSNDELTLLPFKAQCLYVVEVFQKIAERRNIKLKLFKKK >CP012320|4116396:4131819|4119431_4120826_+|AXU59119.1|DBSCAN-SWA 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18 | Streptococcus_phage(92.31%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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