Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012323 | Clostridioides difficile strain DSM 28669 chromosome, complete genome | 11 crisprs | cas14j,c2c9_V-U4,WYL,cas3,DEDDh,DinG,csa3,cas14k,cas5,cas7,cas6 | 3 | 32 | 14 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012323_1 | 577919-578043 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP012323_1
|
1 spacers
spacers of CP012323_1
>1.1|577962|39|CP012323|CRISPRCasFinder AGTTAGAGTGAAAGAGTAATCGTAAAATAAATATATGGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012323_1
The CRISPR arrays of CP012323_1 >merge|CP012323|1|577919-578043|CRISPRCasFinder TGATGGTTGATAAGAATAGTAAGAAAAAAATAGATAATTAAAGAGTTAGAGTGAAAGAGTAATCGTAAAATAAATATATGGATGATGGTTGATAAGAATAGTAAGAAAAAATAGATAATTAAAGG >CP012323|1|1|577919-578043|CRISPRCasFinder TGATGGTTGATAAGAATAGTAAGAAAAAAATAGATAATTAAAG AGTTAGAGTGAAAGAGTAATCGTAAAATAAATATATGGA TGATGGTTGATAAGAATAGTAAGAAAAAATAGATAATTAAAGG
>CP012323.1|AXU63277.1|576631_577042_+|hypothetical-protein MKIKKSLISAMMVSAMVLGGTGAVFANGNDSSNIALPKLESLIKSGITDPTELEKYGVEHYTYEEYAKHIQELKDYAKDPNAVKDVSQKDLEETIKKMEQELEKIKTEGLKIMKPITIKNEDGSQISIAYNYAAID >CP012323.1|AXU63276.1|575033_576416_+|penicillin-binding-protein MFIKLLEMSFTSGVLLLIVIFIRACLFKKLPKKVFVLLWLIVLFKLLIPVSLNSGFSIYSIIESTFDVELGNTSTENYTLKKASDSAGKNNSDEFEIMSSIENIMMLEMLGILSFIVTIMFSILLCFRYFKIINLFKTSIHIKNHEFIKKWMCKNSRFRRFIVCISEFTRTPLTSGILKPRIILPKQMNYANNQTLDFVLTHEMVHINSFDNLLKLFMLVALVVHWFNPLVWVMFFLLNKDIEFSCDEKVMSILGEEYRADYATTLISLAEENNPFSMTICSGFGKTKIEKRIVNIMKFKKSTYVTFLVSTVLVCGTGLVFATENKEINEVESFGLTKNEQSDKIGFSISSKSTDLYSPKVESDILVSKAKSDGETHFSTAKVSVIEFREHEESSTSKVTNSENSEETYVNKSSNSKDVLYTDSGEVSIERSNYNDNRFVISRKGNLLAVNKEQYRTWIE >CP012323.1|AXU63275.1|574663_575023_+|penicillin-binding-protein-repressor MEIKLFDSELKVMEVLWERGESKAGELVKILKEETGWNRNTTYTVIKKLVSKGAIERIEPNFVCKALISKEEVQKQETETLINKMFGGSSEKFLSAFINKENLSNDEITKLKQIVEKLK >CP012323.1|AXU63274.1|573679_574459_+|membrane-protein MVSRQELKRVSKAQLSGNWGICAISMAVYIALLVLISIVGLPFEPLTTIVVAVIAFCVSAGFTCMFLKITKDEKVKIGDIFVSGRIYLRSFGFYLFESIIVYIYSFIITIIGAFLSFGVLLTSGAIEYLSSDNVGIGTIISTGITLVLIILVLMLPVYILLLYVSQATFLICEDKDNMGVFKSMGASLDMMKGNVLKLFILNFSFIGWYILSIATLGIGLLWLIPYVGVTNCNFYRQLVKENPDVEDILLDKEKSYTMY >CP012323.1|AXU63273.1|572620_573232_+|lipoprotein MKMVKKLILSSIMALVLVLTIGCSNAEEKVKSNFEANLAALEMYKYDEKGISDALTEAEYKQIQTYNSKDKVSMIAQLTPLYGKENAEKIYETIVKLIQGVEKTVTVESSSKDKITLKVVSKALDTSKVMSEANTLVKSYVTDEKNYDKKEKEVQDDMTKMIIDLYNKKPTKEVTTMITYTKKDGKWQPPSNIQKLCEGIYTI >CP012323.1|AXU63272.1|571540_572530_+|ornithine-cyclodeaminase MLLLKKDDIEKVFTMRDAIEADKEAFRIYCEGKSVNPLRTNISVPSQDASMLFMPGYVEELGCGGIKIVSVFPKNAQKGKPVIPATVLLLDGETGEVSAVLDGTYVTQIRTGAASGAAIDVLAKKDSKIGALIGLGGQGEPQLEAMIEARNLDEVRVFSRNKESREKFAEEMNLKLSKYNTKIVAVESSDKAIDNADVIVLATPSKQPVFNGNLVKKGALISAVGSYMPDMQELCPNCLTRASKIFFESTDAVLSESGDILIPLKEGKISKDDFSGDLGNVINGTIPGREDDDEIIVFKTVGIGVQDVVTAKRIYDKAKENGIGMDWKW >CP012323.1|AXU63271.1|570610_571474_+|copper-amine-oxidase-domain-containing-protein MKFFKVDTKARVLRYVFVLTLTIMAVLAIKHDYKYNNLRKDASINLNSNKEAVTVMSNQSLPKGNTNSKQTLSVSTIGSKTIVKNDEYLESTINMPVITNSNKIVERSTNDKIKNDIFEFYNKSYKEAKQYLKDNPDEKNKFVANVDFELKKNTDSALSIKVRYYTYSGGAHGFYQDIAYNVDMRTGKFLELMDLFKDNTKYTEVIDEEIKRQIAELEKKDEENIGIYNFKGIKENQNFYLQDENLVVYFDLYDITPYAAGIPEFSINKALISSMLKPEYVDLFDLK >CP012323.1|AXU63270.1|569909_570506_+|chemotaxis-like-protein-glutamate-methylesterase MERFNNMVIAIGASVGGTEAILEIIKDLPKSTPGIVVVQHMPAIFTYMYAQRLDKQCIMNVREAKNNDRVEQGNVLIAPGGYQMKLCTDKQGYYVTCEKGERISGHCPSVDVLFDSVAEVAGKNSIGIILTGMGYDGANGLLKMKENGSFTIGQDENSCIVYGMPMIAFDRGSVMLQLPLGEISNCLIRHINILKQKD >CP012323.1|AXU63269.1|569066_569870_+|chemotaxis-protein-methyltransferase MIKLTDEEFIVLVNHVKKEYGIDLSKKRALIEGRLYNTMIEKKLSSFSQYMNLLFKDKTGNEAINLINRLSTNHTFFMREPQHFEFIQNSILPFWEENNKIRNINIWSAGCSSGEEAYSIAMTLDDYFGYNKELWNIKIIATDISTNSLEKAKRGIYIESNVNNVPELWKKKYFIDNKDGTFKICDKIRKSVIFKPFNLMNDFSYQHFDLIFCRNVMIYFDLKTREELINKFYNATKKDSFLFVGHAEVINRSSTKYKYVKPAIYKR >CP012323.1|AXU63268.1|568590_569031_+|chemotaxis-protein MAKDEIIKQVLTFYVNDVIYGIELENVIETIRFQSITYVPCLPTYISGVINLRGRIIPVINMHIKYNLPKADYNERTCIIITKVDEYQVGIIVDKVVDVITIENLNLLETTNSNNTNINKDIKEIAKVEDNSILILDIRKFLINSM >CP012323.1|AXU63278.1|578254_578911_+|membrane-protein MKKGDFIWSGVLICIIAVLAIPSSREVFMEATGAHPYIGGFLKFAVLATMGDLLGARILYKDWKIPVGVFYRAIVWGIIGVVTTYGMSIYSSGVGQAQVDGMLPFEGIAFANALFKSATMNILMSPTVFLFHKVMDCFIDKKYEVGKGIKVKLKDVVNIVDWNAYLGFSVLKTIPFFWIPCHTIVFLFPAEYRVIASAFASIALGLILALANKSKVAV >CP012323.1|AXU63279.1|579381_580653_-|spore-peptidoglycan-hydrolase MQDGFLTVSIIDATNNRPIQNAVVNIYSMSNGSQSSSTLYQNLRSNESGQVTGLVLPAPDVDYSLQPSDVRPYSQYIVEAIADGYETVVIEGTQLLATIEARQGVPMSPRTRSKRSFSRQSELIFDIGEHTLYGTYPPKIPESNLKPLPPPTGFVVLDNPVVPEFIVVHDGLPEDSSAPNYWIPFKEYIKNIASSEIYSTWPEQTIYANVIAIISFTLNRVFTEWYRNKGYNFTITSTTAYDHKFINNRNLFEPINVVVDAIFNTFIKRPPTSRQPLLAQYCDGQKSQCPDQMTQWGSKDLGDQGYDYESILRYFYGDEIVFERAPIVSGVPVSFPGTTLQVGSSGQYVRTIQNQLNAISNSYPAVPKVIEDGIYGTDTENAVKIFQGIFGLPQSGVVDFKTWYEISRVYVATTRIASLNPLI >CP012323.1|AXU63280.1|580897_581614_+|spore-cortex-lytic-protein MKLDLFLLAIVPILIGMFWIRSKDRYCREPLIHLIKFFLIGAFLSVIIILLENLLMKFNVFEGYSELIYVSFVVAGLVEEGVKALILIPALIKEKHFTEKLDGIIYSVFLALGFATIENMVYIFSESRNLALQVGINRAVISIPAHVMFAITMGYYISKYKFEGNKNKRREYLFMAVLIPILLHGVFDFILMIEYRWAIILLIVYVIILWKINLDKLEKYMNHSKKVFFGNLRKKKKK >CP012323.1|AXU63281.1|581692_583003_+|methylase MTELPKKFLEDIEEILKDEYDDFIKSYEESKTTGLRINTLKIDKKRLFDLELFDLNQIPWAEEGFYYDDKIDRPGRNPLHEAGAYYLQEPSAMSVIPKADIKEGEKILDMCAAPGGKSTYILSKLNDTGLLVSNEINASRIKALGENLERFGARNCIITNTDSNSLRKTFNGYFNKVIIDAPCSGQGMFRKDEVAISDWSYAKVVECQSIQKEIIRDGYKMLKKDGILIYSTCTFSREENEHVINEFISEYPHAELIEMERLWPHKIKGEGHFVAKIKKLEEEECNVKELKIKNLDKEIKDYREFEKKFLKVDFYSNKKNKFYLRGENLYLLPEIYPDTKKLKVLRYGLHLGVLKKNRFEPSHALSHYLKVEDVKNVENFSVQSESILKYLKGDVVNSNDSRGWVLVSVEGIPLGWGKESSGVIKNHYPKGLRKVF >CP012323.1|AXU63282.1|583102_583639_+|signal-peptidase-I MGEAVKKEVVEWIKVIVIALVLAFAITRFIVPTIVKGESMYPTLVERDYLIVNRIAYKVGEPKYKDIIVFKTDLTEENGKKKDLVKRVIGVPGDHVKIQDSKVYVNDKLLDETSYIHNNRTDGDIDIVVPEGKLFAMGDNREKSLDSRYDEVGLVDEHTILGKVLVRLYPFSKIGTID >CP012323.1|AXU63283.1|583804_584341_+|singal-peptidase-I MNETIKEEIVEWIKIIITALFFAFIITRFIKPTLVNGESMYPTLKSHDYLVANRMTYKLSEPKCGDIMIFKTDLLQENGRKKELVKRVIGVPGDHLKIKDSKVYINGKLLNEVSYIHDNYTEGDIDMVIPKGKVFAMGDNREVSLDSRYKEVGLVDEENIKGKVILRVFPFTDIGIFE >CP012323.1|AXU63284.1|584350_585106_+|endonuclease MAVGIASLLFNIEEALNICESIKQITHLEIGIDNISECSELCKYKERISKLGLSIGIHLPMELNTCENIEYIRNSWINFIEKIEFELKGFDIRYFNLHLGYVMTNRVIKNRDKYLGNSVDFLDKLNTNSYVCIENTYSKGGDFSNIGNISYDFEYIFKRIKNSKICFCYDTGHCLIDEDAYVKNLKDKIRLIHLSDNDGINDTHVGIGRGILSEEGIKEVLTLDAEYLVLEINYEDIEDTISKLNNIVGEG >CP012323.1|AXU63285.1|585179_586847_+|phosphoribulokinase/uridine-kinase MKKINLKIEGKDKEYSLEENSPGIRLGDIAKEFCDEHKGYITLAVVDNKLKELNCRVKKDCEINFLDTTNEDGERVYFRVMSFIFVMACREIFWDSRVTIEHSLSDGLYCEVHIDRKLKEADVENIKNKMKEIVNNDYVIEKIEVTRNEAISIFENNEMYEKAELLKYKEYDSAKVYKCRNYIDHFYGYMLPSTGYIKSFDIKLYNGGVIILGPSEEDKTLPMKFVPQPKLSSVYYEAEEWSRLMGIDKVVSLNKIIENNEYGDIIRTFEALHEKKLSQIADMIKDGNKRVILIAAPSSSGKTSFAHRLSIHLRVNNLNPISISLDDYFIDRKHTPLDEYGNYDFESIYAIDLEKFNLDLKKLLAGEEIDDIRFNFKEGKREYTGKKIKIDSNQPIILEGIHGLNPILTSSIPDEDKFKIYISALTQINLDDHNRIPTADLRMIRRIVRDYNFRGYSADNTILQWASVRRGEKKNIFPYQEEADAIFNSACVYELAVLKRFAKPLLEEIKEDNPAHIEATRLLKFLQYFVELDDTSDIPGISILREFIGGSKIVD >CP012323.1|AXU63286.1|587762_588692_+|glutaminase MNTLDETLLKEIISSNKKYTNYGQVASYIPELKNARRNDLGICIIDSENNLYSAGNCSTKFTIQSISKPIVLAMALMDNDWEDVFSNVGMEPSGDPFNSIMKLEINDTKKPCNPMINAGAIVTTSLINGSCLEEKEERMLSFFRKLAKNDNIGINYDVYKSEKMTGDRNRAMAYLLKSDGFIRGNVEDVLDLYFKQCSIEIDSVDLARIGINLANYGVDIENGEHLMSEMVSRIVKTFMMTCGMYDASGEFAIKVGIPAKSGVGGGIMASVPGRMGIGVYGPALDKKGNSVAGVKVLEELSNKLKLNIF >CP012323.1|AXU63287.1|588789_589353_+|regulatory-protein,-arsr MKEVLVLRDLECIKAIAHPRRIDILKAFDKSPLSAKQLSQLLEEPHAKINYHIKMLYKVGILELVEEKIKSGIVEKYYYPSAKNVVIGNRILNFSLDNGEEKEELYISKFENMSEVFYKAAEEDVLENENIVDYHDISLTHDELVELSDTMKSKIDEILNKRQHNVEGSKYDIAMVIVPTLEEECPS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012323_2 | 1300610-1301165 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP012323_2
|
8 spacers
spacers of CP012323_2
>2.1|1300639|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGTTTCTATGGATGGTTTAGGGGATTATGATAGAT >2.2|1300705|36|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCAAAAGGGCAGAGAGTAGTGACTCGATACTACAA >2.3|1300770|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACATATACCATATATACCCCCCTGCAACGCTTCATC >2.4|1300836|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATGTGATTAAAAAAGGACAAAAGTTGGTGATACCTA >2.5|1300902|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCGAAAAAATGCTAATAGTAAAAAACTTACAAGTAAC >2.6|1300968|36|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAACAGTATTAGGAATTATTACACCTATTTCAACAG >2.7|1301033|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTGTAAATTGAAATAGCTTTTCTTATATTTTTATTTA >2.8|1301100|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTTCTCACAAATAGTTTCAACTACTTTTTCATATTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012323_2
The CRISPR arrays of CP012323_2 >merge|CP012323|2|1300610-1301165|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAAAGTTTCTATGGATGGTTTAGGGGATTATGATAGATGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTGCAAAAGGGCAGAGAGTAGTGACTCGATACTACAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTACATATACCATATATACCCCCCTGCAACGCTTCATCGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAATGTGATTAAAAAAGGACAAAAGTTGGTGATACCTAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGGCGAAAAAATGCTAATAGTAAAAAACTTACAAGTAACGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTAACAGTATTAGGAATTATTACACCTATTTCAACAGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGGTTGTAAATTGAAATAGCTTTTCTTATATTTTTATTTAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGGCTTCTCACAAATAGTTTCAACTACTTTTTCATATTTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG >CP012323|2|1|1300610-1301165|PILER-CR GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AAAGTTTCTATGGATGGTTTAGGGGATTATGATAGAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TGCAAAAGGGCAGAGAGTAGTGACTCGATACTACAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TACATATACCATATATACCCCCCTGCAACGCTTCATC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AATGTGATTAAAAAAGGACAAAAGTTGGTGATACCTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GCGAAAAAATGCTAATAGTAAAAAACTTACAAGTAAC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TAACAGTATTAGGAATTATTACACCTATTTCAACAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GTTGTAAATTGAAATAGCTTTTCTTATATTTTTATTTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GCTTCTCACAAATAGTTTCAACTACTTTTTCATATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG >CP012323|2|2|1300610-1301165|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AAAGTTTCTATGGATGGTTTAGGGGATTATGATAGAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TGCAAAAGGGCAGAGAGTAGTGACTCGATACTACAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TACATATACCATATATACCCCCCTGCAACGCTTCATC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AATGTGATTAAAAAAGGACAAAAGTTGGTGATACCTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GCGAAAAAATGCTAATAGTAAAAAACTTACAAGTAAC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TAACAGTATTAGGAATTATTACACCTATTTCAACAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GTTGTAAATTGAAATAGCTTTTCTTATATTTTTATTTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GCTTCTCACAAATAGTTTCAACTACTTTTTCATATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG >CP012323|2|1|1300610-1301165|CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AAAGTTTCTATGGATGGTTTAGGGGATTATGATAGAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TGCAAAAGGGCAGAGAGTAGTGACTCGATACTACAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TACATATACCATATATACCCCCCTGCAACGCTTCATC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AATGTGATTAAAAAAGGACAAAAGTTGGTGATACCTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GCGAAAAAATGCTAATAGTAAAAAACTTACAAGTAAC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TAACAGTATTAGGAATTATTACACCTATTTCAACAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GTTGTAAATTGAAATAGCTTTTCTTATATTTTTATTTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GCTTCTCACAAATAGTTTCAACTACTTTTTCATATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
>CP012323.1|AXU63900.1|1298211_1299639_+|cell-surface-protein MKIKKLLTIGLSLSMFIASCPISANALDKIESIKGADKYETAGIIADKQNYTTAILINADSTMADGLSASGLAGAINAPILLTKKNNIPNATLKRLEKAKKVYIIGGENSIDKYTETVLKGKGIEIKRLQGSDRIKTSYNVAKEINSINKVNKVILTNAFKGEPDAMSAAPVAVRDKAAIVLTDGKSVPFNTTDVESYVIGGTSSMNDKIVKDTNSTRLGGTDRYDTNKKIINKFYSGVKEFYIASGTDLVYALVGSTVAKNNAIVLVDNDSNKSVLKSTTKLTAIGNLSDSILQQCLNVTKNIGDSNTGREYTVEDAANAVKKLLGVKKFYYEPNYSEDEDLIFLLDKNFDFSGKEYYVFAYIKQGAEGDVRYCVAKNDMSKVYTYDVNGNMKVCNPDDYKNKGSITEEQAKQIALKECAKRHKVSINNLVVDMIDFRDDIYSGNVYAVKINSKNSNGTFGWFFIDIETGKIYN >CP012323.1|AXU63899.1|1297198_1298020_-|lipoprotein MIISKKITAILVSSLIMISMVGCAPKESATEVAKKYLDSIEIKDYEVAYNLLSKDSKESVSLEKFEEYQDTLFKLQTLKDYKLGEENKVEKYKYSNKEYTDLVKIKETDTIKYITENKEDTANFDRYFIIEDNEYKLLWHKDFKRALSSNYVKIARSETKKDEDNDYNKAAIDIKKAIEIDDKNPPAYYTQSYIYIELQRYDEALKSIDKSLEYLDKNNEAYKIDASDAYNLIGVIFMSKSEFNKARESYNKALELNPDNEYAKTNLNDIKGL >CP012323.1|AXU63898.1|1295556_1297074_-|site-specific-recombinase MSVAIYLRKSRADEEAEKQGEFETLSRHKSTLLKLAKEQNLDVIEIKEELVSGESIIHRPKMLELLKEVEENKYDAVLVMDLDRLGRGDMKDQGIILETFKESKTKIITPRKTYDLTDEFDEEYSEFEAFMARKELKLISRRMQRGRIKSVEEGNFIGTSAPFGYDAVTTGRKERILVPNKDADVVRTIFDLYINEDMGCSKISKYLNNLGIKTATGANWYNSAITNIIKNKVYCGYIQWQKKDYKKSKNPNKMKTVKLRPKDEWIEAKGKHEPLISEITWKKAQNILKKNGHISYGNQIKNPLAGIVICKNCGRPLVYRPYADHDYIICYHPGCNKSSRFEFIEAAILKSLEDTVKKYQLKSSDLDLDKNNKDSNIEFQKRVLKGLETELKELGKQKNKLYDLLERGIYDEDTFIERSNNISSRTEEIKDSIKTVKNRLSTVKKDNSKIIEDIKTVLSLYHDSDSLGKNKLLKSVIDKAVYYKSKEQKLDSFELMVHLKLHEEQ >CP012323.1|AXU63897.1|1295249_1295534_-|RNA-polymerase-sigma-27/28-subunit-RpsK/SigK MCNEISLLDILGTEANYVLDEVELKVQVGKLYEQLNKILTPREREIVQLRYGLTPYGYKTQREIAQKLDISRSYVSRIEKKALKKLEKELVQES >CP012323.1|AXU63896.1|1293488_1295153_+|penicillin-binding-protein MSKKKTPFLKKVGKRSWCIFTIILIIYSALIYRLVDIQVLKGDKYKQSVESQSVEKVELNSGRGIIYDRNNKKLTDTSKSQVLVVEKEKLNNSYKILELIKKATKMNDLDIYKAVQEQLTRPIIQIQTKNIDKSMKKELEKNGIMVEEKTMRYAKDGLLSHTIGYIKEDDKSGQSGIEKSMDSVLRNSNEKYISAFKAGDAGNEKSLNILKGSVKTVGNKDKDRHLKTTIDYNIQKKLEQILNKEENPTAAIISEVSTGEILAMCSRPNFDQNDISKSLKGKNGEFENRVIKATYPPGSVFKMVVLFSALENGVIDENYTYNCTGKTKVGNTNEILRCNKRDGHGFQNLRQAFSNSCNPAFLDIAMKLGKEKILKSAEKLHLFEKVDIGLDEEKIREAPKNISIRNLAIGQENIEFTPLQINQMTQIIANNGTFKPLYLYKSLVDNDMNTIKTYKSSKKEELISPYVCTQVKEYMKSVSRIGTAKDLKDIEGGCGVKTGTAQSSLNKKAIDHGWITGFYPEERPKYVITVLVEGTQKGNKSATPIFKEICESIK >CP012323.1|AXU63895.1|1292169_1293417_+|protease MELNKVELLAPAGDLERLKIAITYGADAVYIGGEIFGMRSAAKNFSKEDMAEGVAFAHERGKKVFVTVNIIPHNEDFLQLEDYLLELEDIGIDAVIIADPGVLSVIKKVIPNMEIHLSTQANTTNYLSANFWYEHGIKRVVVARELSFDEISEIRAKTPLDMDIEAFMHGAMCISYSGRCLISNYMTGRDANKGSCAQSCRWQYHLVEEKRPGEYFPIYEDERGTFFFNSKDLCMIEYIPELIKSGITSLKIEGRMKTAYYVATVVRAYRMAIDEFYRDPENWKFNPMWMEELKKGSHRHFTSGFYLNKPTTEDQNYQSASYVRNYDFIGIVRETEDEDGLIVVEQRNKMCVGDEIEVMGPYKETMFTKIEEMYNEEGEAIESAPHPRQIVKLKLSVKVGKDYMLRKVIEEKVEE >CP012323.1|AXU63894.1|1291508_1292183_+|O-methyltransferase MSNIVNDLVEDYIRVTLKEKEGFLKDLEIYAEENSVPIIHKEVSDLLKVLLKVQKPKRILEVGCAIGYSSIFFATIIGKDADIITVERNEKMIEKAKENIKLAGFDNNITILEGDAEEKLSQVQGEFDLIFIDAAKGQYKLFFDLVIDKLKDGGLLVSDNILYKGMVAHDDFVVRRKKTIVKRMRNYLDYICNCDYLSTSLVPIGDGVALSYKERKRGDVDGIK >CP012323.1|AXU63893.1|1290257_1291337_+|exported-aminodeoxychorismate-lyase MNFKENRLKIAVLIIVILIILAGIFVFIQIGPYDKNNKKDVIIDVPSGASVGKISDILYENKLIKNELLFKLLVKVSNKAPSIKSGTYLLNQSYSNNDIISLLVSGKIYQDGIKVTIPEGATSKEIIAMLVSKNLGDKATFENLIKKPQEFYDKFPYLKEDGITSLEGFLYPETYYFNSKKQSEEDILSEMLKVFDSKYTDKFKKKQKELNMTLQEVMEMASIIEKEAILDKDRPIIASVFYNRLKVGMPLQSDATIQYIFEERKKIVTYDDLKIDSPYNSYKNKGLPPTPISNPGIESIEAALYPDKTDYLYFVAKIDGGNNYSTNYQDHLKYVKEYKEARDKQSKDTKATNKENTKR >CP012323.1|AXU63892.1|1288719_1290045_+|pyrimidine-nucleoside-phosphorylase MRMYDIIKKKRDNLELSKKEINYFIENYSKGDIPDYQASALLMSIYLNKMNKQETVYLTEAMMNSGDMINLSEIDGIKVDKHSTGGVGDKTTIALIPLVASCGAPVAKMSGRGLGHTGGTIDKLESIPGFSAEMEISKFIDSVNKSKIAVCGQSAKVAIADKKIYALRDVTATVDNISLIASSVMSKKLASGADAIVLDVKTGDGAFMKTLEESFELAKSMVDIGTGMNRDTIGIVTDMDEPLGFAVGNSLEVIEAIETLKGNGPKDLVELCEVLGAYMLVLSKVAHDFEDGVEKIRESIKSGTAIQKLKEFIENQGGNKDVVDDYSLFKKSKYKYPVKSTKSGYISKIKAEDVGVSAMILGAGRETKDDILDLSAGIILEKKVGDYVNEGEVLAYMYYNDEQKLSLAKRRFIDSYSIVDSKIEKNKLIYGIVTKEDIKKF >CP012323.1|AXU63891.1|1287703_1288516_+|purine-nucleoside-phosphorylase MFEKIAQSSEFINSKINVKPKIGLILGSGLGDLANDIEDSVTIKYSEIPNFPVSTVAGHAGQLVIGKLEGKEVIAMQGRFHYYEGYSQKEATFPVRVMKELGVEILIVTNAAGGVNKEFKAGDLMLIRDHINFSGSNPLVGKNDDRFGARFPDMSDAYSSKYVDVVKNCAKECNIDVKEGVYMFFSGPNYETPAEVRMAQILGADAVGMSTVPEVIVASHSNIGVIGISCITNMAAGILNQPLSHEEVIETTQKVKSEFMNLVKTTVKNL >CP012323.1|AXU63901.1|1301534_1301675_-|hypothetical-protein MDVNQRIKYIRENMSRSQKELFKKTNINISVMNRIESGERAIRDVC >CP012323.1|AXU63902.1|1302777_1303029_+|hypothetical-protein MSSYFITRGDVMKILQQFKPYKYDKEKNIEYDEKIIANQNTEVYIVYPRISDEENRRRWEEFNEVAKEVAINIAMKKIETVES >CP012323.1|AXU63903.1|1303345_1303459_+|hypothetical-protein MVEVNIKIKGEVSEIINSIRYIFNSFDEELILDIKSE >CP012323.1|AXU63904.1|1303682_1304063_+|hypothetical-protein MKRRYKNVLIYINIRTIIHINCKIKFIELCLTFNELKNKLANNEKTTVINEDNKAFSGLVDFSNRALILVCSISIFPNIINIINLFVIIINFCEIFLIIYRTLYIFLKVFFALIVWFPILKLINSQ >CP012323.1|AXU63905.1|1304246_1304630_-|hypothetical-protein MRKKFFIGILIVLIISVIAILNIKNDKNVFIGESENWKAKFVTTEGHSKLEIKYKNSKDVVEQKFNYSYKFIDGEDAVVVVKNEILEAGQEKAIKIQRPGLYSNRESTYKLIISWNGNEETINLKKK >CP012323.1|AXU63906.1|1306474_1306792_-|hypothetical-protein MNFRNIYLILMGLGIIILTTIISLIEIKIGFCNEKYFNKLESKYGNIDRKRTIKLEVLYRYVTGFEYIAIGLFTKRLDITIIAIILVATITVILYYLVRKRYITI >CP012323.1|AXU63907.1|1307823_1308213_+|regulatory-protein MKINKLPHAELKLMKYIWGVDDVLASRDIIEAMKLKYDWKKSTTLTFLKTLVDKGFLTTYKVDRCTHYTIAIKEKDYLKVETKSFFSFMHNNSFKSFISALHDDEVLDSKSLDKLEEYFKNLKEGDIDD >CP012323.1|AXU63908.1|1308536_1309046_+|teicoplanin-resistance-protein MKSRKHNITKGLFIVYIIILTWIILFKLQFDISSLETMNLRSINLVPFAGSLIINNRVDISEIILNVAIFVPFGIYVCMLKEEWSFIKKVIPIFITSLAFETLQYIFALGASDITDLIGNTLGGIIGIAVFMLLSKIFKNNTIKIINILALIVTIIVVLFLGLVIFANL >CP012323.1|AXU63909.1|1309147_1309342_-|phage-related-DNA-directed-RNA-polymerase-7-kDa-polypeptide MSVIVMCSRCGKEIDKYRNKYITYYEKNTNAEIKVCINCALDLLEKTRENQELNIQEFQDTIIL >CP012323.1|AXU63910.1|1309858_1310251_-|sporulation-sigma-factor-SigK MAALKSFEKPLTPEEEIEYLTKFKIENDKSAKDTLIERNMRLVAYIAKKYNNSTEDQDDLISIGTIGLIKAIETYNIDKGTRLATYASRCIENEILMNIRSNKKNKTQVSLQDPIGTDKEGNEINTTFYM |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012323_3 | 1510889-1511378 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP012323_3
|
7 spacers
spacers of CP012323_3
>3.1|1510918|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGATTTTGTATTTTAAAAACGAAGTTTTCAAAGTTGT >3.2|1510984|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAATTAGAGCTAAGCGTAGGAATACAAGGTTATAGCTT >3.3|1511051|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCATTATACTCTATTTATTTATGTAGAATCGTTCGA >3.4|1511117|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTCCTAGGGTCGTTTTTTTTTAAAAATTCTATCATT >3.5|1511183|36|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTTTATATTTAAATAATCTAAATTCTCAGTTATA >3.6|1511248|36|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGCACTATTGTTGTATATTCTTATAAAGTCTGTTC >3.7|1511313|37|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT AGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012323_3
The CRISPR arrays of CP012323_3 >merge|CP012323|3|1510889-1511378|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTGATTTTGTATTTTAAAAACGAAGTTTTCAAAGTTGTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATCAATTAGAGCTAAGCGTAGGAATACAAGGTTATAGCTTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATATCATTATACTCTATTTATTTATGTAGAATCGTTCGAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATATTCCTAGGGTCGTTTTTTTTTAAAAATTCTATCATTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAATTTTATATTTAAATAATCTAAATTCTCAGTTATAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATCTGCACTATTGTTGTATATTCTTATAAAGTCTGTTCGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAAGTTTTACATTAACTAAAATGTATAGAATA >CP012323|3|2|1510889-1511312|PILER-CR GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TGATTTTGTATTTTAAAAACGAAGTTTTCAAAGTTGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CAATTAGAGCTAAGCGTAGGAATACAAGGTTATAGCTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ATCATTATACTCTATTTATTTATGTAGAATCGTTCGA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ATTCCTAGGGTCGTTTTTTTTTAAAAATTCTATCATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AATTTTATATTTAAATAATCTAAATTCTCAGTTATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTGCACTATTGTTGTATATTCTTATAAAGTCTGTTC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT >CP012323|3|3|1510889-1511378|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TGATTTTGTATTTTAAAAACGAAGTTTTCAAAGTTGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CAATTAGAGCTAAGCGTAGGAATACAAGGTTATAGCTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ATCATTATACTCTATTTATTTATGTAGAATCGTTCGA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ATTCCTAGGGTCGTTTTTTTTTAAAAATTCTATCATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AATTTTATATTTAAATAATCTAAATTCTCAGTTATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTGCACTATTGTTGTATATTCTTATAAAGTCTGTTC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAA GTTTTACATTAACTAAAATGTATAGAATA >CP012323|3|2|1510889-1511378|CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TGATTTTGTATTTTAAAAACGAAGTTTTCAAAGTTGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CAATTAGAGCTAAGCGTAGGAATACAAGGTTATAGCTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ATCATTATACTCTATTTATTTATGTAGAATCGTTCGA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ATTCCTAGGGTCGTTTTTTTTTAAAAATTCTATCATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AATTTTATATTTAAATAATCTAAATTCTCAGTTATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTGCACTATTGTTGTATATTCTTATAAAGTCTGTTC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAA GTTTTACATTAACTAAAATGTATAGAATA
>CP012323.1|AXU64097.1|1510073_1510283_+|integrase,-catalytic-region MLLENRIIIIWYSKLLAQGMIQSMSRVGRCIDNAPMEGFWGILKVEMYYLRKFDTYEQLVKAIDDYIYL >CP012323.1|AXU64096.1|1509527_1510073_-|integrase MKLIDITSYINNIYNEHMLNSAKNQVGFIKSVLKEPYRLKEISENICDFVTTPIKKNSSTYKFYTKQKAQLLLEKSKIIPIGIPIFLMLTLGLRFGETVSLIWSDVDLDKKIIHVNQTLVYVDNKIIFKDPKTPKSKRKLFAPDELISLLEEEKLKQNKLKLQAILKNEFDLICLNKRFNP >CP012323.1|AXU64095.1|1507631_1508987_-|drug/sodium-antiporter MDTKISINENMSLGKRFFKYLAPSVVAMWVFSLYTMVDGIFVSKGVGELALAAVNISMPFINFIFAVSLLFSTGASTIIAIYLGKKDIKSANEVFSFNLVSIIILSIIILAITFFNLDRLALFLGATESTIGMVKDYLGIIIFFNGFFIVSYSLEVIIKTDGFPILATVGVIISALTNIILDYLFVIEFGWGVKGAGIATGLSQVFSTIFFLIHFLRKNSTLNFSKFRIDFKTLRKIVFIGFPDSTTELSCGIVVLLFNLSLTKYIGENALIYYSVINYINTLVLMTMMGITQGMQPLTSFYYGAGNIDNVKKLLKMGIKATIIASIAVFAICMAFSEPIVSLFIHPEETMLFNEGVRVFKIFSISFLLVGINVIISGFFVSVEKPSISTVISLGRGLVIVVLSLISMILIFGGQGIWMTTIVSEFICLILSLVFLKKNFSTLDSNLNKVA >CP012323.1|AXU64094.1|1506863_1507514_+|ATP-binding-protein MADEKFVMSFSGGKDSILALNRMLKKGYKPVALLTTISEEHGKSWTHNLEYNMLKQVSSNIGLPLLVAECGVEGYEESFERALIKAKNMGATICAYGDIDIESHRKWDTDRCEAVGMKVDLPLWQESREDLVYEFIDSGFCSVVTKVNLKHLGEEFLGKKLTRELVEKIKNAGADPCGEHGEYHTFVVDGPIFKKPVEYEVKGTLIKDGYGYLEIK >CP012323.1|AXU64093.1|1506350_1506779_+|EamA-like-transporter-family-protein MTKLWAIIFALLAGGSTALEAFINGELGKSTTALVATFISLTVGAIFFLASIIVTGDLKCLVSINGFNYKLLLGGVFGGLIIYFTVKAIPNLGVSNTLILTLVSQVLVGFFIDSVILGQETMHLYKYIGVILLILGTFFIVN >CP012323.1|AXU64092.1|1505650_1506199_-|hypothetical-protein MYTNFNIDFNNFNKKENATKFMLMGVLLIILGLLCLTFKTLGIKLISWTFGIALLFFAYLNLKNINELKRYATKEEIKPSINIQWVLIIACILLFVFPQKIQSIFSLFLGFYLIFNQLVALVNSKNNPYSKFTTWNIVKILFGICLILSPLFLSRFIVSIMSFFIILFGLVLFFSGNTARKY >CP012323.1|AXU64091.1|1504596_1505583_-|radical-SAM-protein MFFVQAQRTILLEIGDFLDKFKYAFDNKRYHTWNYYLRNTFGEKVFKVSINAGFTCPNIDGSLGYGGCTYCSKEGSGDFAGNPKDNLISQFYNIKEMMLKKWPHAKYIGYFQAYTNTYAPLEVLKEKYETILELEDVIGLSISTRPDCLPDDVVEYLSELNKRTNLWVELGLQTIHDSTSKIINRGHDYKTFVEGVEKLKSKNIKVVVHIINGLPGEDYNMMMETAKAVGKMGVDGIKIHLLHVIKDTPMEKMLQNGMLTLMEQDEYINLVCDQLEILPETMIIHRLTGDGKRDELVGPIWSLKKWEILNQIDDTLKARNSYQGCKFV >CP012323.1|AXU64090.1|1503381_1504326_+|membrane-protein MGKKSKGYVFIAIAGLLWATLGLFGKFLMGNGLTSEQVAFTRLFFGFIVLGVYSSIRTPQILKISKKGIIYSVIIGIICQAMFNLCYFKAIDIAGVSIAAVLLYTSPLFLAIFSKVCYKENITRSKLFSLILCFIGAIMAVSGGRLDFQGLNAFGLFLGILSAIAYALMPTISKNALKEFSSSTILVYSFLFGAIFMIPSSRPWEILNYAKDLDVLSCMLMLGIVPAALAYIFYATGISKGVELSVAGVVASVELVGSVIIGCTILGESFSLGKLFGVMLMLISAVVALNLSYDEIRIFYKSNKLKQIEKTESI >CP012323.1|AXU64089.1|1501623_1503066_-|sigma-54-dependent-regulatory-protein MNLNLELDLEFYQKILEASHDEICVSDDKGIIIYCNKAFEENYGLKKEDILGKNVSFLEDSGYSTKSPIPIVLKTKTKFSLEQDTQTGKKLIITATPIFDENGNLEFTVENCRDITELNNIKNKLEDTKKQVKKYKSEVETLYRTALRIEDTVIMDGIVMRPIINTVNHVSKTDVSVLLLGESGTGKSSLARYIHHNSNRSNGPFITINCATISPQLLESELFGYTSGAFTGASTKGKVGLVELANGGTLFLDEIGDIPQNLQAKFLQLIQDRTFTPVGSLKNKKVDIRIISATNADLVSKVKEKKFREDLYYRLNVIEIKLPPLRERRDNLVEIIKYYFNRYSSDFNLNKTISKEAMDAIANYGFPGNIRELQNIIQKILLTCTDNHITIDDLPNILTKNIHITNNGNKTHISQINKVIISDSKSTNYKNKNFDTLIKEYEKNIILDAYEKFGSSYKVAKHLEISQSKANRLIRKYTNT >CP012323.1|AXU64088.1|1500839_1501424_-|hypothetical-protein MLMNTHFIMAKSILDNIDENKTFFISEKNFIYGNIKPDAFSKYKLKKHYLDESFNMIVSKINYLCSLNIDSLSKYFSVSRLSQELGVICHFLCDFFCVAHSERWEFKHSLNKHVTYERELGAFAKDVDLSKIKCGTINSSFEKFFTKLYSDYKKRTDYMNDLKFSAYTCNSVINYILDSILSNTIKSYNIANCG >CP012323.1|AXU64098.1|1511703_1513437_-|signaling-protein MSILLKKAPKLAKHIITSFYINRDIDEVLKYLCENVTWIGPGEQEFLTSFNEIKNYFYAGQDEIPSCDINNDIFETVSEDENRCMVLGKYTVRTKENAQMILEVNQRCTFEIIEDRGKLLVKHMHISNPYGEMQLDEYFPTKIGTQSYDYLQRLLKEKTEVIEMITNNINGGLKGSNDDSTYSFFYVNEGLPKILGYTYDEFMEMSGGSAVGAVYPPDLPKALEDCERCFAKGPTYSSEYRIRKKDGTLMWVLDSGMKSLNSDGIVKINSIITDITQLKNIESELKLERERYRIALQNITDIMFEYDIENDTLIKYQRVEIDKKIELENFETKNYSKLLEFGKIIHLDDIGKLLEVLHGNLRETIEIRQINSLTKNEWRWIRVQCSVIYDSDHNPIKTIGVLKDITEDKSKLESLINQAQRDPLTQLYNQRVSQNLIQEYLCSSDSKNNDALLVIDIDDFKTVNDTFGHLEGNEVLVAVSKILLHNTHDKDIVARIGGDEFTIFIKSLTKDLIIKITNDILNDASKIKVKDNHKITLSIGIAFTDDSTKLYKDLFSKADKALYLSKADGKNCYSTYE >CP012323.1|AXU64099.1|1513673_1514519_-|signaling-protein MFKEIFLRTFPGFLIIRDSNYRIIFINDNLKNLIKSYMQDNPLGMTNIEIAKKLPDNIAKFFTDSHNIQLDWEKNYPYDKISNWILEFKKDTTSYWNVLEYKVDVDEKPYIITMANDITKLYEENKRNLHYSITDPLTGAYNRKYLNDRFDIFIGDYIVLIDLDNFKMINDYEGHNVGDKILCDFVSLLNKELINSTSIIRLGGDEFIVIFSSDVDKNYVYSQLETLRENFLKVFSKYKYLSFSYGVDTVKRNLKLTIVELDKKMYKNKEKNKKKFDKNDY >CP012323.1|AXU64100.1|1514549_1516784_-|signaling-protein MQNHNYIKMLNKKVEVLSKELDSRNFKLKTLNEIDFFSKIPNREFMYQYIDDCISKNIHIGIMLLNIDNFKLFNDIYGYLVGENLLITLTQNLLHFIPESKGIVAYLKGEGFLIVLPNVSNKELNNMGATIIESARELKIRLPNEKEIYSNVTFSIGSTIWNGEPNMTTLMLFNQVYSALKKAKSEGKNRYILFNFKDNSFYNKLENDKEFLSEISYVLQTKQIEVFYQPLYNIKNNTIVGCEALARWRHPIKGLLTPDKFIPLFEQFGLITELDLHLFEENCKNIRKWIDKNDVFVPICCNFSRLHFFNPNFPSMLKGITEKYNVSTSNFSIEITENILIENTNTIIQQLTELRSYGFSVSMDDFGSGYSSFGMLQNLPFDIIKIDRIFLSHNLNDFKNTTILYSIINIARALGMLTVCEGVETEQHVEFIKSINCDIAQGYYYAKPMECKEFEKLLSKENNSEKMFIKYSDIGKSLIEKIFDGFFIMQDMKKLRANVTEDIQWFDFYNKTEITSFPKVIEHFEKHIKGKKFSILYKSITPHNTESDSLLISGEAVLSDEAAKHQKYSNFYFSANCIISENKLLLAKLHLDLIKTAGYINEFESYSIPKMTNTHLDESNVLSQFYSMLPVGIIRYDLFGDMIITYMNEEMFDIIGYTKEQFFGEMGGNLRAIVHPDDLDFVYKKSLDMIDTNKIEPFLYRFIKRDGQIVTVMYTQCNLSAIDGRSIAQGMYIDINKIKNLTKI >CP012323.1|AXU64101.1|1517566_1518376_+|MerR-family-transcriptional-regulator MKDYYKIGEISKIYGIGRDSLMYYEEIGILRPVRDINGYRMYNISDIWKLNLIKEFRSLNFPMKKIKEYLDDRSIESTKNILNEELDLIDKKIAEFISHKENIIKRLSSIESVIQNTKIDEIEVVYIEKRKALELNADIKRDEDFDFLIQKLQKEYEDRFNILGNNNIGSAFSTEAINKGIFNEFKSVFCFLESNEKVYNIVFDEGYYVTLNYTGSNSNNKMYMEKVFKFIEENNYKIIADPIEIYKIDIHETGIVEEFVTEIQVPITK >CP012323.1|AXU64102.1|1518528_1518768_+|hypothetical-protein MKCSNCGSVNIEKGILTTGGIYAETIGLKYVGDGKLDKVINKTFPVQSTIYSDLCLDCGEIVRTYIKDNTDRNWCKDEK >CP012323.1|AXU64103.1|1518954_1519131_-|hypothetical-protein MFRDEMDKCTHMLTAYISSLYDYCDFIDTQLDDFILEYGENVVESCLHQVMVLVSKYN >CP012323.1|AXU64104.1|1519622_1520297_-|MgtC/SapB-transporter MNHHILIQFEYIARIITAGFCGALIGYERKNRLKEAGIRTHFIVALASALIIIVSKYGFNDIVGTPGIGLDPARVAAQVVSGIGFLGAGLIFIRNQSVSGLTTAAGIWATAGTGLAIGSGLYLVGIVSSIIIVIVQITLHRDRKWMKLPTAEQVSLKISNSTDSIEYIEGKFKKSNIEIINMNIKRLDGDWLEVVIYTKLPKGYKKTNLLKLFSDNPLIETLEI >CP012323.1|AXU64105.1|1520516_1521053_-|isochorismatase MIDIQNDYFKNGKCELFQSEETAENAKKILLFFRKNNLPIIHIQHILTDKTASFFLPNTHGSEINKIVFPLDNEEIITKHTPDSFFETDLQSILEKKNITNLVICGMMSHMCIDTSVRTAKKLRYDITLISDACTTKNLSWNNIEINANTVHQVFMASLQNSFADVKNTDKFLSNYYK >CP012323.1|AXU64106.1|1521148_1521514_-|transcriptional-regulator MKIRAEYTCPLEIVHDIIKGKWKTILIFELRQSNKTFSELQHNIYGINQKMLIQQLKELRDFGIIDKISSAGYPLHVEYFLTNRGKKMLKAVEIMQEIGIEYMLEHGQQEILDNKGICYNK >CP012323.1|AXU64107.1|1521744_1521879_+|hypothetical-protein MNISRKAMKIIELAQKIANKRGISVEEAWSEAVTEYKNKYEHIA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP012323_4 | 1620567-1621320 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP012323_4
|
11 spacers
spacers of CP012323_4
>4.1|1620596|37|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT TCAATTGTAAAAGATCCTATAGGGTATAAACTAACTT >4.2|1620662|37|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT TTGTCATAGTAGCGACTTATTACAAAGTATTTTTCTA >4.3|1620728|38|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT CTCTTACGCTTTTCAATCACTTTTTCCTTGCTAAAATT >4.4|1620795|38|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT TTGAAATTTCAAAGATTAATCGGACGCATGCAAGGAAT >4.5|1620862|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT TTGGAAATAAGTATAAAGACAGTGATATGGAAATGG >4.6|1620927|37|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT TATCCATTTCATATTTAGATAAAATCTCTTTAAATGC >4.7|1620993|37|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT ATGTTATTACATAAAAATTCTTCATCTATAACTTTAA >4.8|1621059|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT AAAATAAGGGTTTAATTTCCCTGGTGTCGAGGAATA >4.9|1621124|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT TTTAAATGAAACTCTTGAAATAGTTGACGTAGTAGC >4.10|1621189|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT TATATATTAGATGTCAATGTCAAGGATACAAAATTT >4.11|1621254|38|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT CCATCTTTTGTTGCTTTACATAAATTTATATTACTTAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012323_4
The CRISPR arrays of CP012323_4 >merge|CP012323|4|1620567-1621320|CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTCAATTGTAAAAGATCCTATAGGGTATAAACTAACTTGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTTGTCATAGTAGCGACTTATTACAAAGTATTTTTCTAGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATCTCTTACGCTTTTCAATCACTTTTTCCTTGCTAAAATTGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTTGAAATTTCAAAGATTAATCGGACGCATGCAAGGAATGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTTGGAAATAAGTATAAAGACAGTGATATGGAAATGGGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTATCCATTTCATATTTAGATAAAATCTCTTTAAATGCGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATATGTTATTACATAAAAATTCTTCATCTATAACTTTAAGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATAAAATAAGGGTTTAATTTCCCTGGTGTCGAGGAATAGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTTTAAATGAAACTCTTGAAATAGTTGACGTAGTAGCGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTATATATTAGATGTCAATGTCAAGGATACAAAATTTGTTTTATATTAACTATATGGAATTTAAATCCATCTTTTGTTGCTTTACATAAATTTATATTACTTACGTTTTATACTAACTATACAGAATATAATT >CP012323|4|4|1620567-1621320|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TCAATTGTAAAAGATCCTATAGGGTATAAACTAACTT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTGTCATAGTAGCGACTTATTACAAAGTATTTTTCTA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CTCTTACGCTTTTCAATCACTTTTTCCTTGCTAAAATT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTGAAATTTCAAAGATTAATCGGACGCATGCAAGGAAT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTGGAAATAAGTATAAAGACAGTGATATGGAAATGG GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TATCCATTTCATATTTAGATAAAATCTCTTTAAATGC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT ATGTTATTACATAAAAATTCTTCATCTATAACTTTAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT AAAATAAGGGTTTAATTTCCCTGGTGTCGAGGAATA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTTAAATGAAACTCTTGAAATAGTTGACGTAGTAGC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TATATATTAGATGTCAATGTCAAGGATACAAAATTT GTTTTATATTAACTATATGGAATTTAAAT CCATCTTTTGTTGCTTTACATAAATTTATATTACTTAC GTTTTATACTAACTATACAGAATATAATT >CP012323|4|3|1620567-1621320|CRT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TCAATTGTAAAAGATCCTATAGGGTATAAACTAACTT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTGTCATAGTAGCGACTTATTACAAAGTATTTTTCTA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CTCTTACGCTTTTCAATCACTTTTTCCTTGCTAAAATT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTGAAATTTCAAAGATTAATCGGACGCATGCAAGGAAT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTGGAAATAAGTATAAAGACAGTGATATGGAAATGG GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TATCCATTTCATATTTAGATAAAATCTCTTTAAATGC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT ATGTTATTACATAAAAATTCTTCATCTATAACTTTAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT AAAATAAGGGTTTAATTTCCCTGGTGTCGAGGAATA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTTAAATGAAACTCTTGAAATAGTTGACGTAGTAGC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TATATATTAGATGTCAATGTCAAGGATACAAAATTT GTTTTATATTAACTATATGGAATTTAAAT CCATCTTTTGTTGCTTTACATAAATTTATATTACTTAC GTTTTATACTAACTATACAGAATATAATT
>CP012323.1|AXU64194.1|1617812_1619906_+|signaling-protein MNKRNFEVILNQLQINIYVTNIHTNEIIFMNKKMKEEYNILDPEGKVCWQVLYPEQNSTCSFCKVLELLKNDKKGVLIKWYEKCNKLNRAFENYDSLITWQDGTVVHMHQSIDIANSTILNKPIKINEFNEISNTKEEKGVFNFSRDNFDYNSTLLYDALIRGTDEYIYICNMKTGVFRYSPSQVELFDLPGEIVENQLIYWEKIVHPEDWNRFYKSNTEIGKNQMDYHTVEFRAKNRSGEYIWLRCRGQLMRDEFGEPSIFAGIMTQLGKQNKIDSLTQLLNYHEFMSVFEDKISNPMIEKLCIVLLNIDDFKNVNEMYDRDFGDNIIKTLAQSIQSILPDNAELYKLDGDEMGILVDNVEENEILTLYDQIQNMIIHLQLWRKYGLNITISAGCVIYPKHGDTVKELYKCASYSLQYAKEHGKNRLVFFSQEILKNKMYSLEMMRDLKASINDDFRGFSLRFQPQVDTQSHKMIGVEVLLRWTNDKYKAISPLEFIPILEENDMINIVGAWVLRMALRTFRKWIDNYPFFKVSVNVSAVQILEDTFIKDIVKIIDDENFPYQNLVLELTESHTVQNLSILQSKFKALQDLGIYIAMDDFGTGYSSLEVLKFSPIDIVKIDRVFVKDILKSKFDATFIHFIVAICHDVGIKVCLEGVETQEEYDLVKQIKPDYIQGYLFGKPQTATEIFDLLKLDN >CP012323.1|AXU64193.1|1616236_1617133_-|NADP-oxidoreductase,-coenzyme-F420-dependent MANYFLSKGYCVSGFYGRNQLSLLESTNLTKTKIYSNLKDIIYENDILFITTSDDSIEIIDKKLSKFNLKHKYICHTSGSLKSSILFCSKKAGALIYSIHPIFAFSNKNTDIKKMKDICFSIEGDNEQDDLVVQNFIDGLGNHFFIRDKDTSSTYHLANVLVSNLVLSLLDIGVSYFIKLGLSEDESLKAISPLVKKNIENILDNGFTKALTGPVSRGDITPIKKHLSVLDKKDEEIYKILSLNLLKIIALGNDNSLKCTKNITIENAIENLISKSEKYKEIYKLLGGKNDEKYHTNF >CP012323.1|AXU64192.1|1615434_1616262_-|3-methyl-2-oxobutanoate-hydroxymethyltransferase MKNTIQTFKNAKYEGKKLSMLTAYDYSIAKIMDECDINGILIGDSLGMVIKGEENTLSVTIDEIIYHTKAVKNGVKNALIVSDMPFLSYHVSIEDAVKNAGRLIKEGGAHAVKLEGGSNVIKQIENIVNAQIPVMGHLGLTPQSVNSFGGFKVQGNTSETAKQLIEDAKLIEKAGAFSIVLEGVPAKIAEMVTNSISIPTIGIGAGINCDGQILVYQDMLGMFGDFVPKFVKQYANIGDIMKDSIKNYILEVKTGAFPQEKHSFSINESELEKLY >CP012323.1|AXU64191.1|1614567_1615416_-|pantoate--beta-alanine-ligase MLVKEIKLLRNIIKDWRKDGYSIGLVTTMGFLHEGHQSLIKKAVKENDKVVVSVFVNPTQFGPNEDFNSYPRDIDKDFKYCMDSGATVVFNPSPEEMYLKGNCTTINVSGLTDFLCGAKRPVHFGGVCLVVSKFLNIVTPDKAYFGEKDAQQLAVIKRMVKDLNIDTEIIGCPIIRENDGLAKSSRNTYLSEEERKSALILNKSLSLAKEELVKGNLNPKNIKELIIAKINSEHLAKIDYVEIVDSETLQPVKQIEHSILVAIAVFIGKTRLIDNFTFELNI >CP012323.1|AXU64190.1|1613974_1614157_-|hypothetical-protein MFKDKIDECVHIMTAYIASLKEYYSFIETQIGDFIKKYGEDVVELCLHRVMILLCECGLA >CP012323.1|AXU64189.1|1612494_1613409_-|hypothetical-protein MIDNQKYVILSLELHLFFSRIMKEHALFLEAGFTNKNYNLAMEADHYKKQFEDLLSYAVSASNGIIRPDILYSEELVTTLTSAAEQKTEEFTGIEINKNITTRELNLQSGVDPQVGQDLVNYVAQLNSDAIRLLDGLINFKERVLDGVLSCTIFTSNYPLLLEHIIHEANLYRSYVVDLENKIDIESKSAKEIELFWDHIMMEHALFMRGLLDPSEGELINTSNDFAIKFNELIEKTNEMTYSNIKNITEETLNETVEFKDFKEAGASGIEQCKIKSIILPLLADHVLREANHYIRILESYKNM >CP012323.1|AXU64188.1|1611456_1612104_-|lactate-utilization-protein-B/C MIRQTPLEKRYDKLGPHIVTALKKRYFDAYYCKTRNEALQQILDLIPQNHVVSWGGSETLKEIGVQTAVREKGFKVIDRDLAKTPEERTEIMRQALLCDTFLMSSNAISEDGQLFNIDGNGNRVAAMIFGPKNVIVVAGMNKIVKNIDDAIQRTRTIASPAVVQRFQDVNTPCYISGSCIDCTSPESICAYMVTTRISRPAKKIKVILVGENLGL >CP012323.1|AXU64187.1|1610720_1611290_+|lipoprotein MKKFIICIIMFAISVLVLAGCSNDNKIKNEVDSMFNAIKTQDADTVDKYFPKSGLGNLIYEDKEGFKMYSKNMTWEISDIKNNKDKVTVDLKINNTDMVSILKKNPPKLGEMMPNPTMKDIDSANKKEFNITLELVKTGDNYVCKVNQESAMKLLNVITGGGIDYLADYNKDYYKQLDEEQKNYENKNS >CP012323.1|AXU64186.1|1609816_1610716_+|iron-sulfur-cluster-binding-protein MKLLSKINNNIRLITQVAFTALTNGYVNGFLEGTIYGGESKKLCVPGLNCYSCPGALGACPIGSLQAVLSSREYKFSFYVVGFLMAFGAFFGRFVCGWLCPFGLVQDLLHKIPFPVKIKKVYGDKYLKYLKYIVLIMFVIILPVAVVNVAGGGNPWFCKWICPSGTLLGGIPLILGNENLRESIGFLFSWKLSILLLILLMSIITYRPFCKYICPLGAIYGFFNPISIYRFKIDKDKCTNCTACQTKCKLDIPIYKDVNSPDCIRCGECIKVCPQNAITTTFSKDKKENNICAKKYRGI >CP012323.1|AXU64185.1|1609079_1609664_+|thioredoxin MKKFFMVVLGCVFVLGMISGCSKKESKPVEKNKNNSEWFSNLDTEDVDGNKVTKEIFSNKELTLINVWTTWCGPCVGEMPELEALSKEYESNNSNVAIKGLVVEVDKTDMRTGLSNEEKNLVKDIMKKSDATYQQLTVSEELKKTDFKRVMEFPTTYFVDKKGNFVGEKVVGANSKEDWKKIIDERLKMVKTNE >CP012323.1|AXU64195.1|1621968_1622787_+|MerR-family-transcriptional-regulator MEKQYFTTGEFAKLCGISKQTLIFYDKIGIFSPEYKDKNNYRYYSVYQYDTLDILQSLREIGMSLEEIKEYIQNRTPQLCVKMLKEEEKKIREKIKKLRKISSKMQNRINITVEGISKMNSEEIYISKKFEEYLVLSSDLSNMSNSDFMMELIDFTNYCKSKNLYQGYELGVIVSNENIKNGDYLSISSFYLKIDKKIKDKKLYVKPEGMYACIKHIGKYEDSYKSYEKLKKYIYENEYKIIGNSYEESILDFFCESNEDNYMTEISIQVSR >CP012323.1|AXU64196.1|1622919_1625040_-|ferrous-ion-transport-protein MGLTHNSTKMSSLKDMFDIDNKEDQFIIALAGNPNTGKSTVFNHLTGLRQHTGNWPGKTVATARGNFKYKNTEYALIDLPGTYSLFALSQEEIVARDFICFGNPDAVIVVCDATCLERNLNLVFQVMELTDKVILCINLIDEARKKGITIDKKLLEDSLGIPVILTAARNGSGMDELLDTLNDVSFDKYKLNNKPVRYNENIEDVVKSIQPELDNIIPGINSRWLGLRLIDGDESIFESMSNYIDKDSIDAINEVKKKIPDNINKQKIRDEFTKINYDYAKKLSDECCSNVAKKSTDREEKVDKILTSKIFGLPIMLLLLGTILWITIEGANYPSTLLSNLLLGFEPSISGILNSINCPSWLNDMLVLGLYRTLAWVISVMLPPMAIFFPLFTLLEDFGYLPRVAFNLDHLFKKACAHGKQCLTMCMGFGCNAAGVIGCRIIDSPRERLIAILTNNFVPCNGRFPTLIAISTIFFSSVITNSFVSSVATALCITLLIILGVIITLLVSYTLSKTLLKGVPSTFTLELPPYRVPQIGRTLYTSIIDRTIFVLGRAVMVAIPAGVITWIFANIYIGDLSILSHVANFLDPLAKLIGLDGFILLAFILGFPANEIVVPILLMAYLATGSMIELDSFSALGQVLREHGWTYLTALNVMLFSLLHWPCATTLLTIKKETGSLKWTALGFLMPTILAFVVCFLTTTVYNLFI >CP012323.1|AXU64197.1|1625065_1625293_-|ferrous-ion-transport-protein MKNLNDIQVKKTVKVEDILSSGNLRERMLALGLTRGAVIDVVRKGPKNNLTVYKIRGSKIALRQEESSLILVSDI >CP012323.1|AXU64198.1|1625619_1626060_-|acetyltransferase MFKIKHFNDLSLDEFYEIAKSRYEVFACEQKIFSLNDYDDIDKSSYHIFLKENGLICAYARIIPKEYSSYNDVSIGRVLVLSSHRRKGLAKQMMDCAIDFIKVNLHENNITLSAQTYIKNLYLSCGFKEISEVYDEAGIEHIKMRL >CP012323.1|AXU64199.1|1626232_1627201_+|hypothetical-protein MNTTKKLTEAALLSSLFIVVTIIAVSTGFGYAIYLDFIVPVFFCIICLKCDLKYTILSGITSLLIISLVLGNLGTAIWASQSVLLGIMCGYLINKPTMVMDDLVYGSVFGVIVMVFIDIYASTLIGYSFMKEFQGYSKWIYFNGYTNFIYYLMIALFPFGMVFCIYLLSLILGNKLHILDSNSLKKFLIFKNFRSLNQFLCCSKKAFYICVSYLAIFEVLKLWNVKVDSVYLKTIFISITYISVYFIIRDSCMSLQNFIIAKFRKLLYARILFLIIILLLFFIFDVTVISLIIINAFLNKKIDIRLSQSNIVNKQINLLIEK >CP012323.1|AXU64200.1|1627677_1628886_+|tyrosyl-tRNA-synthetase MKSIDEQMRIIMKGVDDLIDEKELREKLIKSEKEGKPMIVKLGLDPSAPDIHLGHTVVLRKMKQLQDLGHQIVIIIGDFTGKIGDPTGKSKARKALTTEQVLANAKTYEEQIFKVLDKEKTIVRFNSEWLAKLNFEDVIKLAATITVARMLEREDFKKRYEGQMPISVHEFFYPLMQAYDSIALEADIELGGTDQRFNLLMGRSLQREFGMESQIVIMMPLIEGLDGKEKMSKSLGNYIGIDEEAGIMYQKSMEIPDELIIKYYNLVTDVHPDEVNKIESQLKEGSVNPRDIKMNLAREIVTLYHGEESAREAEERFKSVFQKGQIPEDIQTIQVEEDGFDLIEVLVANEIVKSKSEVRRLASQGGVKVNGEKVEDLSTIVKESELVVQIGKKKFVKIELVK >CP012323.1|AXU64201.1|1628967_1629849_-|polysaccharide-deacetylase MVKKRKKKTVTLTILVVIVIGIFSMAWADMSRKKEMKETQERLKAERLEKERIEKEKNEPIIGAKKEAVKEYGYDAKIVWDKLNKYDYSNNGEKIVFLTFDDGPSTTNTPQVLDILKRHGVRGTFFIKGDSLERKGANEILKRTFDEGNAIAHHSYTHDYKKLYPSRSLNLDTFVNELNKTDEAMKKALGKNFSSNVVRCPGGYMSWKNMEPLGNYLKEKNMASIDWNALNADAEGKKKNAQELFEHAKKSSEGKEMVVLLMHDTYGKQETVNALDQIITYFKDNGYQFKILI >CP012323.1|AXU64202.1|1630264_1631179_+|transporter MKKYFGEIGLIFIAIIWGSGFVATQFALDGGLTPLQIITLRFFLAAIIMNLLFFKQIRANMSKKLLKAGGILGIFLFLAFTVQTIGLMYTTPSKNAFITAANVVIVPFIGFILYRRKLDKIGIISSLVALIGIGILSLEADFSINFGDFLTLICSFGFAFHIFFTSEFAKDNNPMALTAIQFTVAFLMSVVVQTFAGQLKMEAELSGYMGTMYLAVFSTTIGFLFQTICQKRVDGTRTAIILSTEAVFGTIFSIIILKELITAKLVIGSILIFVAIITAETKLSFLKSKKVKLKDSEESSLESI >CP012323.1|AXU64203.1|1631401_1631947_+|ruberythrin MKKFVCTVCGYIHEGDAAPAQCPVCKVGADKFEEMKGEMVWADEHRIGVAQGVDAEIIEGLRANFTGECTEVGMYLAMSRQADREGYPEVAEAYKRIAFEEAEHAAKFAELLGEVVVADTKENLRVRVDAEYGATDGKLKLAKRAKELGLDAIHDTVHEMCKDEARHGKAFLGLLNRHFGK >CP012323.1|AXU64204.1|1632037_1633186_+|iron-sulfur-protein MKSVSVRSCKTYNYEEVKLSIEKNLEDIGGIDKFVKKGSKVLIKPNLLMKKKPEEATTTHPMVVKVVCEKLLELNCDITIADSPGGPYNQSSLKSIYKASGIEEVANELGIKLNYDVSDVKIHSEKAHVLKYMDIIKPIVDSDYIINLCKLKTHIMATFTGGTKNLYGCIAGLKKAEIHYRFPTEELFCENVLLDICDYIKPTLTIMDGIVGMEGDGPSAGTTREIGVLLASQNPYAIDVVACKIISLLPNRVATIRGAIKRGYIQEDFSDIEILGEDIKDLIIKNYKVPNVSKDLRLFSVKLPKFLNEPISKLITPKPVVRFQDCIKCGKCKEACPASTIEIGTKGAIIDLSKCIRCYCCHELCPKKAIDVKRNFVFKYVK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012323_5 | 1710472-1710834 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP012323_5
|
5 spacers
spacers of CP012323_5
>5.1|1710501|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTACCTGCATGGTGAGTGAGGTTACCAAGCCCCACCCG >5.2|1710568|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTAGGTCTTAAACTTGCATTTACTAAAGACATATCAT >5.3|1710634|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTTACTATTTTCACAGTTTAAAGAAGTATAGTAAC >5.4|1710700|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCGCCTTCCAGATTACTTTTGTATATGAGGTCAGCAA >5.5|1710767|38|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT TCAGTTTTTCGTTTGATTGGCTCTATCTTTAAAAAAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012323_5
The CRISPR arrays of CP012323_5 >merge|CP012323|5|1710472-1710834|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATGTACCTGCATGGTGAGTGAGGTTACCAAGCCCCACCCGGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATCTAGGTCTTAAACTTGCATTTACTAAAGACATATCATGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATTATTTACTATTTTCACAGTTTAAAGAAGTATAGTAACGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATATCGCCTTCCAGATTACTTTTGTATATGAGGTCAGCAAGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATTCAGTTTTTCGTTTGATTGGCTCTATCTTTAAAAAAGAGTTTTAGATTAACTATATGGACTTAAAATT >CP012323|5|3|1710472-1710766|PILER-CR GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT GTACCTGCATGGTGAGTGAGGTTACCAAGCCCCACCCG GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT CTAGGTCTTAAACTTGCATTTACTAAAGACATATCAT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TATTTACTATTTTCACAGTTTAAAGAAGTATAGTAAC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT ATCGCCTTCCAGATTACTTTTGTATATGAGGTCAGCAA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT >CP012323|5|5|1710472-1710834|CRISPRCasFinder GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT GTACCTGCATGGTGAGTGAGGTTACCAAGCCCCACCCG GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT CTAGGTCTTAAACTTGCATTTACTAAAGACATATCAT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TATTTACTATTTTCACAGTTTAAAGAAGTATAGTAAC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT ATCGCCTTCCAGATTACTTTTGTATATGAGGTCAGCAA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TCAGTTTTTCGTTTGATTGGCTCTATCTTTAAAAAAGA GTTTTAGATTAACTATATGGACTTAAAATT >CP012323|5|4|1710472-1710833|CRT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT GTACCTGCATGGTGAGTGAGGTTACCAAGCCCCACCCG GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT CTAGGTCTTAAACTTGCATTTACTAAAGACATATCAT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TATTTACTATTTTCACAGTTTAAAGAAGTATAGTAAC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT ATCGCCTTCCAGATTACTTTTGTATATGAGGTCAGCAA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TCAGTTTTTCGTTTGATTGGCTCTATCTTTAAAAAAGA GTTTTAGATTAACTATATGGACTTAAAAT
>CP012323.1|AXU64288.1|1710076_1710181_+|hypothetical-protein MIGFLLSILAGVISAYIYDKIKNHPDANKGDLKK >CP012323.1|AXU64287.1|1708793_1709234_+|phage-protein MSNLSAFLSQNAIKVDNVKYVASNRFLDKEGKPVEWELKVLSSEEDEALRRKCTKRVKVIGNNGKHTGQYTSEIDYNSYVAELCVASTVFPDLKDAELQNSYGVMGEAQLLKTMLTAGEYVNYTVKVNEVNGFDTSFEDKVEEAKN >CP012323.1|AXU64286.1|1708251_1708722_+|phage-protein MAQTINAKDTVSAKKAECFITIEGKRYNFMQAIDLEAKMEKNKSEVPILGRTTKGNKTTGSTNTGSATFHYNTSIFRELLYRYKETGEDIYFDIQVTNEDPTSAVGRQTVVLKDCNMDSGIITKFDADGEYLDEDMDFTFEDWELVEKFNLLAGME >CP012323.1|AXU64285.1|1706924_1708235_+|phage-protein MALGGGTFVTQNKVLPGAYINFISAKRATSSLSDRGIVAMPLELDWGIDEEVFQVTSDDFEKYSTKYFGYDYTHEKLKGLRDLFKNIRLGYFYKLNKGVKASCTIATAKYSGIRGNDLKVTVTTNIDDNAKFDVVTLLDNKKVDTQIAKVITDLQDNDYITWKKDATLEASAGLVFTGGTNGEAVTGAEYQAFLDKIESYSFNALGCLATTTEIKSLFVEFTKRMRDKVGAKFQTVLYKKSDADYEGVVSVENKIKDKDLVESSLIYWATGAIAGCDINKSNTNKKYDGEFDVGVNYTQIQLEEALKSGKFIFHKVGDEVHVLEDINTFVSFTDDKNDDFSSNQSVRVLDQIANDIATLFNEKYLGKVPNDKAGRISFWNDVVKHHKELENIRAIEDFKTDDVSVELGNDKKTVIVSDAVKVINAMSKLYMTVSVN >CP012323.1|AXU64284.1|1706738_1706924_+|hypothetical-protein MINLSKTLSKEENYKFTKEQIVNSKRYVNRKDLLNAILKEDELYSFSEVEEIINNFMKGVS >CP012323.1|AXU64283.1|1706317_1706755_+|phage-protein MLNNIIDGISIKLDKTFGESYTIYSEDVEQGINEPCFFIVPLNPSKVSYPSGRTLKKNSFDVHYFPKSNDKSFEINEVAEMLLEELEYIEIDGDLVRGTNMNFEIVDNVLHFFVDYNYFTIKSNNTDKMDTVELFGGLKRGDKLE >CP012323.1|AXU64282.1|1705899_1706325_+|phage-protein MARWGSVDFREFKRVCKKMEELTKIDLDKFCKDAARELAARLLGKVIRRTPVDTGFLRQGWNGVAYARSLPVYKQGNNYIIEVVNPTEYASYVEYGHRTKDGKGWVKGQHFLTISEMELQSQVDKIIEKKLLILLKGVFDA >CP012323.1|AXU64281.1|1705552_1705900_+|phage-protein MVSKTRKAIEMLYRDKCTIVEYQPIKDPVTKRTNNKEVIVLENQPCKLSYKNIVSATEGKLAKLEQTIKLFISPDIEIKAGSKLIINDKEYVRSGESAIYSNHQEIILELFKDKA >CP012323.1|AXU64280.1|1705157_1705559_+|hypothetical-protein MENNIIDEIEKRLESFGYILKDGDKWLIGFVREKIENIIKVDCNIKTMPIELKEIEVDMIVGEFLFTKKNMGQLDIESINFEAVEKSISEGDTKVDFAIGSGSQTPEQRFDSLIAYLTTYGKNNILTFRCLRW >CP012323.1|AXU64279.1|1704914_1705148_+|hypothetical-protein MAQVRKLNRILTIEECKIDDFLEMGYDLIDETGKAVKYGKSLSVKDLIAENNILRSKVESLEEENKQLKEKNKLTKK >CP012323.1|AXU64289.1|1711662_1711752_+|hypothetical-protein MFNFAFALVDPVGFRLTKWNVNLVIALLA >CP012323.1|AXU64290.1|1711758_1712061_+|hypothetical-protein MQSFRLTKWNVNYFVWEVPRAEATSFRLTKWNVNTKGVSLFFMLYNCFRLTKWNVNRFYYRVEEGLVNGFRLTMWYVNEICMEAIKQNGLGFILTMWIQN >CP012323.1|AXU64291.1|1712217_1712388_+|Ribbon-helix-helix-protein,-copG-family MSPKKIGRPVVGSPKTNDIKVRVDDETNEKLDEYCKKNNLTKAEAIRQGIHLLLEK >CP012323.1|AXU64292.1|1712515_1713358_+|prophage-antirepressor-related-protein 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MSQDLLKIIKKAAMDAVETSNPMQIAFGTIESLNPLVVKIEQKLSIGEIFLIQTDTFKRYTDKKIGDKLVLIRMQGGQQYLILDRM |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP012323_6 | 1711436-1712058 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP012323_6
|
9 spacers
spacers of CP012323_6
>6.1|1711465|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGAGTCGGAAGCATATAATAAGTAATATCAAGAATA >6.2|1711531|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATGCAGAAAAATTTGAAAGTTGGGTATTTGATGAAG >6.3|1711597|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTCCAAAATTGAAGTTTATAAAATTGTAAGTATAAG >6.4|1711663|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGTTCAATTTTGCATTTGCACTTGTAGACCCTGTTG >6.5|1711729|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGGTTATAGCTCTGCTTGCATGAATTTCATTGCAAA >6.6|1711795|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTTTGTATGGGAAGTACCACGTGCAGAAGCTACAA >6.7|1711861|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTAAAGGAGTTTCTTTGTTCTTTATGCTCTACAACT >6.8|1711927|37|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT AGATTTTATTATAGAGTAGAGGAAGGGCTTGTAAATG >6.9|1711993|37|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT GAGATTTGTATGGAGGCTATAAAACAAAACGGATTAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012323_6
The CRISPR arrays of CP012323_6 >merge|CP012323|6|1711436-1712058|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAATCTGAGTCGGAAGCATATAATAAGTAATATCAAGAATAGTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAATAATGCAGAAAAATTTGAAAGTTGGGTATTTGATGAAGGTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAATACTCCAAAATTGAAGTTTATAAAATTGTAAGTATAAGGTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAATATGTTCAATTTTGCATTTGCACTTGTAGACCCTGTTGGTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAATTTGGTTATAGCTCTGCTTGCATGAATTTCATTGCAAAGTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAATTATTTTGTATGGGAAGTACCACGTGCAGAAGCTACAAGTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAATACTAAAGGAGTTTCTTTGTTCTTTATGCTCTACAACTGTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAATAGATTTTATTATAGAGTAGAGGAAGGGCTTGTAAATGGTTTTAGATTAACTATGTGGTATGTAAATGAGATTTGTATGGAGGCTATAAAACAAAACGGATTAGGTTTTATATTAACTATGTGGATTCAAAAC >CP012323|6|4|1711436-1711926|PILER-CR GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT CTGAGTCGGAAGCATATAATAAGTAATATCAAGAATA GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT AATGCAGAAAAATTTGAAAGTTGGGTATTTGATGAAG GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT ACTCCAAAATTGAAGTTTATAAAATTGTAAGTATAAG GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT ATGTTCAATTTTGCATTTGCACTTGTAGACCCTGTTG GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT TTGGTTATAGCTCTGCTTGCATGAATTTCATTGCAAA GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT TATTTTGTATGGGAAGTACCACGTGCAGAAGCTACAA GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT ACTAAAGGAGTTTCTTTGTTCTTTATGCTCTACAACT GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT >CP012323|6|6|1711436-1712058|CRISPRCasFinder GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT CTGAGTCGGAAGCATATAATAAGTAATATCAAGAATA GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT AATGCAGAAAAATTTGAAAGTTGGGTATTTGATGAAG GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT ACTCCAAAATTGAAGTTTATAAAATTGTAAGTATAAG GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT ATGTTCAATTTTGCATTTGCACTTGTAGACCCTGTTG GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT TTGGTTATAGCTCTGCTTGCATGAATTTCATTGCAAA GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT TATTTTGTATGGGAAGTACCACGTGCAGAAGCTACAA GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT ACTAAAGGAGTTTCTTTGTTCTTTATGCTCTACAACT GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT AGATTTTATTATAGAGTAGAGGAAGGGCTTGTAAATG GTTTTAGATTAACTATGTGGTATGTAAAT GAGATTTGTATGGAGGCTATAAAACAAAACGGATTAG GTTTTATATTAACTATGTGGATTCAAAAC >CP012323|6|5|1711436-1712058|CRT GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT CTGAGTCGGAAGCATATAATAAGTAATATCAAGAATA GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT AATGCAGAAAAATTTGAAAGTTGGGTATTTGATGAAG GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT ACTCCAAAATTGAAGTTTATAAAATTGTAAGTATAAG GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT ATGTTCAATTTTGCATTTGCACTTGTAGACCCTGTTG GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT TTGGTTATAGCTCTGCTTGCATGAATTTCATTGCAAA GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT TATTTTGTATGGGAAGTACCACGTGCAGAAGCTACAA GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT ACTAAAGGAGTTTCTTTGTTCTTTATGCTCTACAACT GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT AGATTTTATTATAGAGTAGAGGAAGGGCTTGTAAATG GTTTTAGATTAACTATGTGGTATGTAAAT GAGATTTGTATGGAGGCTATAAAACAAAACGGATTAG GTTTTATATTAACTATGTGGATTCAAAAC
>CP012323.1|AXU64288.1|1710076_1710181_+|hypothetical-protein MIGFLLSILAGVISAYIYDKIKNHPDANKGDLKK >CP012323.1|AXU64287.1|1708793_1709234_+|phage-protein MSNLSAFLSQNAIKVDNVKYVASNRFLDKEGKPVEWELKVLSSEEDEALRRKCTKRVKVIGNNGKHTGQYTSEIDYNSYVAELCVASTVFPDLKDAELQNSYGVMGEAQLLKTMLTAGEYVNYTVKVNEVNGFDTSFEDKVEEAKN >CP012323.1|AXU64286.1|1708251_1708722_+|phage-protein MAQTINAKDTVSAKKAECFITIEGKRYNFMQAIDLEAKMEKNKSEVPILGRTTKGNKTTGSTNTGSATFHYNTSIFRELLYRYKETGEDIYFDIQVTNEDPTSAVGRQTVVLKDCNMDSGIITKFDADGEYLDEDMDFTFEDWELVEKFNLLAGME >CP012323.1|AXU64285.1|1706924_1708235_+|phage-protein 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>CP012323.1|AXU64281.1|1705552_1705900_+|phage-protein MVSKTRKAIEMLYRDKCTIVEYQPIKDPVTKRTNNKEVIVLENQPCKLSYKNIVSATEGKLAKLEQTIKLFISPDIEIKAGSKLIINDKEYVRSGESAIYSNHQEIILELFKDKA >CP012323.1|AXU64280.1|1705157_1705559_+|hypothetical-protein MENNIIDEIEKRLESFGYILKDGDKWLIGFVREKIENIIKVDCNIKTMPIELKEIEVDMIVGEFLFTKKNMGQLDIESINFEAVEKSISEGDTKVDFAIGSGSQTPEQRFDSLIAYLTTYGKNNILTFRCLRW >CP012323.1|AXU64279.1|1704914_1705148_+|hypothetical-protein MAQVRKLNRILTIEECKIDDFLEMGYDLIDETGKAVKYGKSLSVKDLIAENNILRSKVESLEEENKQLKEKNKLTKK >CP012323.1|AXU64291.1|1712217_1712388_+|Ribbon-helix-helix-protein,-copG-family MSPKKIGRPVVGSPKTNDIKVRVDDETNEKLDEYCKKNNLTKAEAIRQGIHLLLEK >CP012323.1|AXU64292.1|1712515_1713358_+|prophage-antirepressor-related-protein 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP012323_7 | 1713646-1714002 | Orphan |
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|
5 spacers
spacers of CP012323_7
>7.1|1713674|38|CP012323|CRT GTTTGTATTTGTATCTACACTACCTTGAACCTCAACTT >7.2|1713740|37|CP012323|CRT GAAAGTATCTCTAAATCCTATTGCTTTTTCGGTTAGA >7.3|1713805|37|CP012323|CRT GCAAAATGATGCTTGTTATCAAAATAGGTTGTATTAT >7.4|1713870|37|CP012323|CRT TTTCGGATACAGAATTGAAAACAAACATCTAGTAATT >7.5|1713935|39|CP012323|CRT TGTTGGTTCAATTTCCAAATGACTTAGACAGTGATTATG >7.6|1713675|40|CP012323|PILER-CR GTTTGTATTTGTATCTACACTACCTTGAACCTCAACTTGT >7.7|1713741|39|CP012323|PILER-CR GAAAGTATCTCTAAATCCTATTGCTTTTTCGGTTAGAGT >7.8|1713806|39|CP012323|PILER-CR GCAAAATGATGCTTGTTATCAAAATAGGTTGTATTATAT >7.9|1713871|39|CP012323|PILER-CR TTTCGGATACAGAATTGAAAACAAACATCTAGTAATTGT >7.10|1713675|40|CP012323|CRISPRCasFinder TTTGTATTTGTATCTACACTACCTTGAACCTCAACTTGTT >7.11|1713741|39|CP012323|CRISPRCasFinder AAAGTATCTCTAAATCCTATTGCTTTTTCGGTTAGAGTT >7.12|1713806|39|CP012323|CRISPRCasFinder CAAAATGATGCTTGTTATCAAAATAGGTTGTATTATATT >7.13|1713871|39|CP012323|CRISPRCasFinder TTCGGATACAGAATTGAAAACAAACATCTAGTAATTGTT >7.14|1713936|41|CP012323|CRISPRCasFinder GTTGGTTCAATTTCCAAATGACTTAGACAGTGATTATGGTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012323_7
The CRISPR arrays of CP012323_7 >merge|CP012323|7|1713646-1714002|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GAGTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAGTTTGTATTTGTATCTACACTACCTTGAACCTCAACTTGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAGAAAGTATCTCTAAATCCTATTGCTTTTTCGGTTAGAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGCAAAATGATGCTTGTTATCAAAATAGGTTGTATTATATTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTCGGATACAGAATTGAAAACAAACATCTAGTAATTGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATGTTGGTTCAATTTCCAAATGACTTAGACAGTGATTATGGTTTTATATTAACTATGTGGACTTAAAAT >CP012323|7|6|1713646-1714001|CRT GAGTTATATTAACTATGTGGTATGTAAA GTTTGTATTTGTATCTACACTACCTTGAACCTCAACTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAA GAAAGTATCTCTAAATCCTATTGCTTTTTCGGTTAGA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAA GCAAAATGATGCTTGTTATCAAAATAGGTTGTATTAT ATTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAA TTTCGGATACAGAATTGAAAACAAACATCTAGTAATT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAA TGTTGGTTCAATTTCCAAATGACTTAGACAGTGATTATG GTTTTATATTAACTATGTGGACTTAAAA >CP012323|7|5|1713649-1713934|PILER-CR TTATATTAACTATGTGGTATGTAAAG TTTGTATTTGTATCTACACTACCTTGAACCTCAACTTGTT TTATATTAACTATGTGGTATGTAAAG AAAGTATCTCTAAATCCTATTGCTTTTTCGGTTAGAGTT TTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG CAAAATGATGCTTGTTATCAAAATAGGTTGTATTATATT TTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTCGGATACAGAATTGAAAACAAACATCTAGTAATTGTT TTATATTAACTATGTGGTATGTAAA >CP012323|7|7|1713649-1714002|CRISPRCasFinder TTATATTAACTATGTGGTATGTAAAG TTTGTATTTGTATCTACACTACCTTGAACCTCAACTTGTT TTATATTAACTATGTGGTATGTAAAG AAAGTATCTCTAAATCCTATTGCTTTTTCGGTTAGAGTT TTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG CAAAATGATGCTTGTTATCAAAATAGGTTGTATTATATT TTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTCGGATACAGAATTGAAAACAAACATCTAGTAATTGTT TTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GTTGGTTCAATTTCCAAATGACTTAGACAGTGATTATGGTT TTATATTAACTATGTGGACTTAAAAT
>CP012323.1|AXU64293.1|1713410_1713569_+|hypothetical-protein MYENLLDSIDIEKRKEEFRIKLLKIRETDIDIYNKIESIVYKLYEKKLEKNK >CP012323.1|AXU64292.1|1712515_1713358_+|prophage-antirepressor-related-protein MKTNLELIKSENFGEVECNFYENDTKDILMTREQIGMALEYTEPRIAISKIHERNKDRLDKFSTVVKLVTVEGNREVLRDTIVYNTKGVMEICRFSRQPKADTFMDWVWDVVESIFKTGAYITNNANPEKLREKASEIEKLQLAYNSTSMLKELLDGAGFDNKSKLLTAKTLYKKAGIDLPIEIEEEESFFDTKQIASKLKIYSKSNKPAQLAVCEIIKKIDLEENEVKGVWETNGSWTGTVNKYTKSVIDKIRNWIEENNRPTKIQGEKKNYHVVYKIE >CP012323.1|AXU64291.1|1712217_1712388_+|Ribbon-helix-helix-protein,-copG-family MSPKKIGRPVVGSPKTNDIKVRVDDETNEKLDEYCKKNNLTKAEAIRQGIHLLLEK >CP012323.1|AXU64290.1|1711758_1712061_+|hypothetical-protein MQSFRLTKWNVNYFVWEVPRAEATSFRLTKWNVNTKGVSLFFMLYNCFRLTKWNVNRFYYRVEEGLVNGFRLTMWYVNEICMEAIKQNGLGFILTMWIQN >CP012323.1|AXU64289.1|1711662_1711752_+|hypothetical-protein MFNFAFALVDPVGFRLTKWNVNLVIALLA >CP012323.1|AXU64288.1|1710076_1710181_+|hypothetical-protein MIGFLLSILAGVISAYIYDKIKNHPDANKGDLKK >CP012323.1|AXU64287.1|1708793_1709234_+|phage-protein MSNLSAFLSQNAIKVDNVKYVASNRFLDKEGKPVEWELKVLSSEEDEALRRKCTKRVKVIGNNGKHTGQYTSEIDYNSYVAELCVASTVFPDLKDAELQNSYGVMGEAQLLKTMLTAGEYVNYTVKVNEVNGFDTSFEDKVEEAKN >CP012323.1|AXU64286.1|1708251_1708722_+|phage-protein MAQTINAKDTVSAKKAECFITIEGKRYNFMQAIDLEAKMEKNKSEVPILGRTTKGNKTTGSTNTGSATFHYNTSIFRELLYRYKETGEDIYFDIQVTNEDPTSAVGRQTVVLKDCNMDSGIITKFDADGEYLDEDMDFTFEDWELVEKFNLLAGME >CP012323.1|AXU64285.1|1706924_1708235_+|phage-protein MALGGGTFVTQNKVLPGAYINFISAKRATSSLSDRGIVAMPLELDWGIDEEVFQVTSDDFEKYSTKYFGYDYTHEKLKGLRDLFKNIRLGYFYKLNKGVKASCTIATAKYSGIRGNDLKVTVTTNIDDNAKFDVVTLLDNKKVDTQIAKVITDLQDNDYITWKKDATLEASAGLVFTGGTNGEAVTGAEYQAFLDKIESYSFNALGCLATTTEIKSLFVEFTKRMRDKVGAKFQTVLYKKSDADYEGVVSVENKIKDKDLVESSLIYWATGAIAGCDINKSNTNKKYDGEFDVGVNYTQIQLEEALKSGKFIFHKVGDEVHVLEDINTFVSFTDDKNDDFSSNQSVRVLDQIANDIATLFNEKYLGKVPNDKAGRISFWNDVVKHHKELENIRAIEDFKTDDVSVELGNDKKTVIVSDAVKVINAMSKLYMTVSVN >CP012323.1|AXU64284.1|1706738_1706924_+|hypothetical-protein MINLSKTLSKEENYKFTKEQIVNSKRYVNRKDLLNAILKEDELYSFSEVEEIINNFMKGVS >CP012323.1|AXU64294.1|1714126_1714909_+|hypothetical-protein MGLFGGKEPCCICGGKGKNKVLENEYLCNNCFVDFTIFSSERLKTTSAMQVLADHEGIRKFINFSKKNRELLAKFVETNRINKFISIDKDNNFIKISDIRKGGDVIESVYATDEIMQFELLEDGESIVSGGLGRAVVGGALFGATGAVVGGVTGKKTTRKIVNTFKIKITFNNINNPLEYINLINTRTKTNSSIYQNACNEAQEILSVLSIIVKNNDKANNEQYKTSSLIEQVKGLKELLDIGAITEEEFNIKKKELLNL >CP012323.1|AXU64295.1|1714972_1717324_+|phage-tail-tape-measure-protein MATIQTSIRIFDGMTPAFRNMTTSINTTINSLERLQGRLNNPLNAGNIQNSQQSLNNIENILTRIEQSIGKADEQQRKFNEDIDKGVGSTDRLFGNVKRLATTYLGLKTLGGLGSLSDQMTSTNARLAMINDGQLSDSGLNKMIFQSAERSRASYLDTAQIVSRIGMNAGSAFSSTREIVSFAEQLNKKFIIAGASTQEMSSALLQLTQGLGSGVLRGEELNAVFESAPNIIRSIADYLDVDIGKIRGMASEGMLTADIVKNSLLAASAETNKQFEQMPYTLGQIFTSIKNNAVMVFGAIQKKIEDTVSSKGFRTFITDVKDSLYVLGAVGFNVFSGFINLLSSPAFQNFFNVMIVGTSLVVQGLGWIITQALNVVNVFTQNWSIISPIIWGIVGAFIAYKVIISLVLIAQAIYTAITFTQCFVTALFTGELYVATKAMLIHQLMILGVSRANVTLCATMIMVVAAVALVIAVIFVGVAIFNHFAGTSISATGVVVGCFYFLGACIYDVFAAAWNIIMAFAEFFVNSFNIVIYNVQLLFYKFQNFVIDSMGDVGGSFDNCATALANAFVSAANIAIKGINGVIKTLNLIPGVNIKTIGSLDKIDSFVKQYKDYQKTLKEPVKPAEWKAPTMKLKNPVDSFKKGYEVGQNLENKIKDAFDINKIAEKAKKDLGLDDLWDKKYGLGDGLGSAGLNSPLNDAAKGAKDTAGNTAKMAKTMDKSQEDLKYLRDIAEQETINRFTGVNIKIDMNNTNNISKDADVDGIVNVLTEKLNDAMVVSAEGIV >CP012323.1|AXU64296.1|1717339_1718035_+|phage-cell-wall-hydrolase MAYDFYLDGVQLPIPPPKLEIKVTNKNKTVDLINTGEVNILKKEGLSEISFEAEFTHNKLPFYRGTFKDVQFFLSKLELLKTDCKPFQFIVSRELGNKVLFNTNMKVSLEEYNIVEDAENASDTKVAIKLKQYRDYSTKKLVPAPPKKTNETGRPSVKIEPKRVDSVNAPNTKTYTVKSGDSLWSICQKQLGNGSLYKKVYELNKTMMDKANKGKKVPKYTIYKGQVLKLG >CP012323.1|AXU64297.1|1718027_1719920_+|phage-cell-wall-hydrolase MDDELVLANDRDVRLVIAHWEDFYEPVVLDGITWEIERRGTPSKLEFTIVMDDILQFCEGNSVRLYYKGIGIFYGYIFQKKRDKENHIKIVAYDQLRYFKNKDTYVFKNYTASEIIKMLADDFKLKCKFIEDTKYKISRIEENKTLFDMILTALDDTLREKKEMYILYDDFGRLVLKNVASMKLDVVMDNDVIEDFDYNSSIDSDTYTQVKLLKEDENTGQRISTTVKDSIHIRSWGVLQLFDTVDSNMTKAEMDKKAEMLLKLYNKKTKSLSLKNVLGDIRVRAGCLVPVFLDLGDIELRNYMLVEKVKHTFENNLHFMDLTLVDGDEFASYSSSSYSSGNSNNKDEKKNGTAQNTTKTNTGKKVPAIFTAYYPGNNAMEGGKTDCNGKPLDVKSRTVAGPMNREGVKKTWYTDDFLKKHPVFEYGDKVKIILPGTAYDNKVYTVKDNGGRIYVETNGTYHIDILLANASECKKFGRKNGYIIIGGDEEQTYQVEGNNQSSTNNNSKEDKLISIAKSKLGCNYVYGAEGPNNFDCSGFTQWCYKQIGIKIPRTASAQSKAGKAVDLKDRSKWKAGDLLCRIGGGSSNHVVMYIGNNQIIHSPQTGDVVKIESVNSYRKGKAYTHVRRFI >CP012323.1|AXU64298.1|1719933_1720194_+|phage-protein MSQDLLKIIKKAAMDAVETSNPMQIAFGTIESLNPLVVKIEQKLSIGEIFLIQTDTFKRYTDKKIGDKLVLIRMQGGQQYLILDRM >CP012323.1|AXU64299.1|1720198_1720618_+|phage-protein MIPTDAIDYDIEDVSIINFDVRQEPSKTFKLNIEKSKIDGICDDVEALKQTIFLILNTERYEHLIYSRNYGVELNDLIGEPISYVIPELERRIIEALIQDDRVENVDNFEFQNVKGKVHCKFTVYSKYGNIKAEKVVSV >CP012323.1|AXU64300.1|1720618_1721668_+|phage-protein MFELMTFENIIKRMLDSVPDTFDKREGSIIYNALAPVAIELTETYIAMDELLDQTFVDTASYYYLEKRCKERGITPLEATNTIAKGVFNIDIPLDSRFNLGEYNYTATERVSEGIYKMKCETAGPIFELGQLIPIEYIDKLETAELTEILINGEDEESEDSLRQRYYDSLNSQSFGGNIQNYKDEVNKLPDVGGVKVYPVWNGGGTVKLVIINSNFKVPSEELVNLVQEEIDPIGHQGEGLGLAPIGHRVTVEGVASTTINISAEITYKSGYTWENIKIIAEEAINDYLNELNMSWEDEENLIVRISQIETRLLSIDGVLDITNTMINDVKSNLTIDSNSIVVRGEVVG >CP012323.1|AXU64301.1|1721660_1722278_+|phage-protein MDKEINLINYLPQILQDKEEYIKVFNVENKEIKTLHDKLKELSNDQFLEDLTISGIKRWEKIMSITPKSNESLEDRRFRIFSKYISKLPYSERFLRNWLDNVVGEGNYELTINNATYNIHLESDARNQDWFEEVHSFVSNIKPCNMTLDYTRVLISKDNYMNFGITTLMGQEITIYPWSPPDIETYGEIDVLTGNGVGYQEITIF >CP012323.1|AXU64302.1|1722289_1723399_+|phage-tail-fiber-protein MAIDKSYYTIITDVGKAKIANASVTGNKVGFVKIQLGDGGGSEYTPTESQTALKNVVWEGNIGNTTTDETAPNCIILESLIPSSVGGFMIREIGYLDDENNLIAISKYKECYKPSIEQGAVVDMKVKTVLIVSNVNNIELKIDPTIIFATLKDIQDLETKIGTVNTKIDTTKTELTNNLETAKTELNTRIDTENEKQNIKIDQLIAGGSNVASTQIITIDDWVEDAENGFKATVTHSLLTQRIVVNIIDATTKENVVTNFKIIDDNSIEIRSEARSELNVYVINGNAETHFINATVDDNRVSEMTTYSSKKIEDSISSIQLIDTSISITDANDRFTSDKLDGVLEEIMVEISGQRTKGITIVNNLIDMI >CP012323.1|AXU64303.1|1723415_1724561_+|streptogramin-lyase MATKLEENAKLREMIDTLETTKDDLQTVKNNIADVLGLPFTGNDKLETTKNTLSSIRSTFVSNLSKKGVSTVSNAPFKTLAENVGKIEQGNMIVPPWYVPKNIFIKALSTAVKDKTPCVSAEKKIYFINGYTGTSGLNNLCYDTVLNTTTTKNIPSSFVESALFFYDGYIYKIGGFSGYSAPTAICQKYNILTSSWTEIANMPTARGSACCEMYSNQIHVLYGGEDSSSSQAVRVVEYYNTTLNTWSTKSTIIDSKQSHYFVCAKVSTYKIVVFGLKSSISSHYFSTINYDPVSGTYSYAGEGFDSNTFAVQLGSTLYVSDYGYKAGSGKCGVVIFSSSGIKKLTFDKGAVPDYSYFAASVDGRQIYFILNGKITCFIPEL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012323_8 | 1844119-1844677 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP012323_8
|
8 spacers
spacers of CP012323_8
>8.1|1844148|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGCTAGAAACTAATATCACGGGCATGGTTGATAACTT >8.2|1844215|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAATAAAACCGAAAAATCGTTGACAATATCCGTTT >8.3|1844281|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTATAAAGTAAAAGCATATGTAGGTGATAACAATA >8.4|1844347|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTAATGTTAAATGGTATGTTAGCAGGATTTGAACAAT >8.5|1844413|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAACTTTTCTGTTTTATCTTGCCAGTCATTTCTTCTA >8.6|1844479|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCTAATATAACTATTAAAGTAGTATTCTAGTAGTTTT >8.7|1844545|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTCTGCAAGCTTATTAGCTCCACCATTATACATTG >8.8|1844611|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTATAACCTTTAATTACACCTCCCATATCACTACCAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012323_8
The CRISPR arrays of CP012323_8 >merge|CP012323|8|1844119-1844677|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAAGCTAGAAACTAATATCACGGGCATGGTTGATAACTTGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAAAAATAAAACCGAAAAATCGTTGACAATATCCGTTTGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATCTTTATAAAGTAAAAGCATATGTAGGTGATAACAATAGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATGTAATGTTAAATGGTATGTTAGCAGGATTTGAACAATGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTAACTTTTCTGTTTTATCTTGCCAGTCATTTCTTCTAGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATCCTAATATAACTATTAAAGTAGTATTCTAGTAGTTTTGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATCTTTCTGCAAGCTTATTAGCTCCACCATTATACATTGGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTTATAACCTTTAATTACACCTCCCATATCACTACCACGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT >CP012323|8|6|1844119-1844677|PILER-CR GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AAGCTAGAAACTAATATCACGGGCATGGTTGATAACTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AAAAATAAAACCGAAAAATCGTTGACAATATCCGTTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CTTTATAAAGTAAAAGCATATGTAGGTGATAACAATA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GTAATGTTAAATGGTATGTTAGCAGGATTTGAACAAT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TAACTTTTCTGTTTTATCTTGCCAGTCATTTCTTCTA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CCTAATATAACTATTAAAGTAGTATTCTAGTAGTTTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CTTTCTGCAAGCTTATTAGCTCCACCATTATACATTG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTATAACCTTTAATTACACCTCCCATATCACTACCAC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT >CP012323|8|8|1844119-1844677|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AAGCTAGAAACTAATATCACGGGCATGGTTGATAACTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AAAAATAAAACCGAAAAATCGTTGACAATATCCGTTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CTTTATAAAGTAAAAGCATATGTAGGTGATAACAATA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GTAATGTTAAATGGTATGTTAGCAGGATTTGAACAAT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TAACTTTTCTGTTTTATCTTGCCAGTCATTTCTTCTA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CCTAATATAACTATTAAAGTAGTATTCTAGTAGTTTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CTTTCTGCAAGCTTATTAGCTCCACCATTATACATTG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTATAACCTTTAATTACACCTCCCATATCACTACCAC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT >CP012323|8|7|1844119-1844677|CRT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AAGCTAGAAACTAATATCACGGGCATGGTTGATAACTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AAAAATAAAACCGAAAAATCGTTGACAATATCCGTTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CTTTATAAAGTAAAAGCATATGTAGGTGATAACAATA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GTAATGTTAAATGGTATGTTAGCAGGATTTGAACAAT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TAACTTTTCTGTTTTATCTTGCCAGTCATTTCTTCTA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CCTAATATAACTATTAAAGTAGTATTCTAGTAGTTTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CTTTCTGCAAGCTTATTAGCTCCACCATTATACATTG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTATAACCTTTAATTACACCTCCCATATCACTACCAC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
>CP012323.1|AXU64411.1|1842202_1843474_-|guanine-deaminase MLKVLKGNIIFTKTSETFTVFENSYIILEKGKVKGIFKEIPKEYKNLKVVDYTDKLIIPGMNDLHAHASQFKNLGMAMDKELLPWLETYTFPEESNYKDIEYATKMYKKFVKELWKSGTTRIAVFATVHKEASMKLMDIFKEVGLGAYVGKVNMNMNCPDTLLENTQDSIADTEEIINKYSDTDSIVKPIITPRFIPSCTSELLKGLGDLCLKYNIPIQSHLSENYDEIEWVRNLEPESKFYGDAYNRYNLFGQTPTLMAHCIHCSQDEIDLMRENNVMAVHCPASNFNVGSGAMPIRKLIDNNIRLALGSDISGGHTLSIFKAMVSAIQLSKLYWVNSGKKYNFLSLSEAFYIATKSGGSFFGKVGSFEEGYDFDALIIDDSNLNHDNYSILERLERFIYVGDDRNIIHRYVCGKLIEEPNI >CP012323.1|AXU64410.1|1840994_1841312_-|hypothetical-protein MNEFKNVTAVKKANVYFDGKVSSRVIILPNGERKTLGLMLPGEYTFSTREEEIMEMLAGSMDVKLPGSNEFVTYKEGQKFNVPSDSSFDLKVNEVVDYCCSYIAD >CP012323.1|AXU64409.1|1838551_1840909_+|cation-transporting-ATPase MDKVNLERYSCDINVGLNKNQLQSRIDDNLINAFENGKTKTYKQIFKDNIFTLFNLINIVLVCLLVSVGSFKNTLFIFIAVINTIIGVIQEIRAKRLLDNLSVIVSNKVSVIREKEKKEIDVQELVLDDIMILKTGNQICADSKVLNGKLEVNESLVTGESDIIIKNKGDFLYSGSFVVSGEAFVRVENIGKDNYANKITNDAKISKKHNSQLRNSLNAILKIVGIIIIPLGIILFAKQHFGNGDSIATSVVGTVAAVNGMIPEGLTLLTSIALAVGTIKLASHKTLVQELYCVETLARVDTLCLDKTGTITEGKMQVDDIVMLEEVDINEIMGNICNSLKDDNATLNAIRDKYNVLDTYKAKNLIPFSSERKYSGVTFENKGTYLLGAFEFIFKEKNKKLRIEVERYSKKGNRVIVLAHSDSYMEDNNIPEDIKPLAFILILDKIRDEAKETLEFFYNEGVDIKIISGDNPITVSEVARKAGLKTASNFIDATTLKNDSDIYEAVDKYSVFGRVSPQQKKQMILALKKQNHTVAMTGDGVNDVLALKEADCSIAMASGSDVTKNVSNLVLLDSNFASMPKVVMEGRKVINNIQRASSLFLVKTIFSFFLSLLTLFFFSRQYPFVPIQLSLIGAVTVGIPSFFLALEANKSRISGNFLLNILKNALPGALCVTVNVIIVYNIVEYLGYSSSVFSTMCAILTGVCGLLILRQQCLPFNKERLFLIVSMTIAFVIGILFLGGLFSFVALSRELILITMALAILMPIMIKVMLFVLDEILETIVPDLN >CP012323.1|AXU64408.1|1836671_1838129_+|glycine-dehydrogenase-subunit-2 MKEYNSLLIDISKKGRKAYSLPKLDIDDIKIEDMIDQDMARQSELNLPEVGELELVRHYTLLSNKNFGVDTGFYPLGSCTMKYNPKINEDMAALPNFTGMHPYQSSDTAQGSLSLMYDLSRRLAEITGMDEVTLQPSAGSHGEFTGLMIIKAYHENRGDHKRTKVIIPDSAHGTNPASAAMANFDVIQIASDKNGAVDINALKEVLNDEVAALMLTNPSTLGLFEKNIKEIATLVHEAGGLLYYDGANMNAIMGITRPGDMGFDVVHLNLHKTFSTPHGGGGPGAGPVGVKKELVPFLPIPIIERKEDKYVLNYDREKSIGKIKNFYGNFGVLVRAYTYILTMGRDGLKEASEMAVLNANYIKESIKDDYILPIDTLCKHEFVLGGLPRGEANIKTIDIAKRLLDYGYHPPTMYFPLIINEALMIEPTESESIETLDSFIEAMKSVAKEAKEEPELLKTAPHNTLVKRVDDARAVKKPILTWSQR >CP012323.1|AXU64407.1|1834197_1836672_+|bifunctional-glycine-dehydrogenase/aminomethyl-transferase-protein MNELKRVSLYNIHKELGAKLVEFAGWEMPLEYKGINKEHEMVRKSAGIFDVSHMGEVQIKGVESEKFIQNLVTNDISTLNINDIIYTPMCYENGGVVDDLLIYKFGEEEYLLVINAGNIDKDVAWIIKQSEGYNVDIKNISSEVSQLAIQGPKAEEILQKITDIDLNSIKFYKSIPSTKVCGCPCLVSRTGYTGEDGFEIYCKNKYVEIIWNEVLKVGGEDICPAGLGCRDTLRFEAALPLYGHEINEHISPIEGGLSIFVKTNKESFIGKSILSKEKESGAKRKLVGFEMQGKGMPRNGYDIRIGDKTVGFVTTGCASPTTGKILGMGIIDSEYAKVGNEIGIAIRKKVVPAVIVKKPFYKKQYKKDNIILNKENKFSYIPATSEDKSKMLKVVGLNSVDELFSDIPEEVKLKRDLNLEIGKSELEVSKIVKRLSEENLSLEDLTCFLGAGAYDHYIPSIIKHITSRSEFYTAYTPYQAEISQGTLQVVFEFQSMIAEITGMEIANASMYDGATAAIEACIMAINQTRKSKIVVSKTTHPETLSVLRTYLQYKDCEIVEIDFCNEYGTTDIEKLKASVDKDTACVLIQTPNFFGIIEEMEEIEKITHENKAMLIMSVDPISLGVLKTPGEIGADIVVGEAQSLGNPLNFGGPYVGFLASKSKYTRKMPGRIVGQSLDVEGKIAYVLTLQTREQHVRREKATSNICSNQALNALVASIYMATMGKEGFKEVGMQSMKKAHYTYNKLVQTGKYKPIFKGKFFKEFAVQGNLNIETINDKLLEENILGGYNLEYNYPELKNSTLLCVTEKRSKEEIDKLVGIMEGL >CP012323.1|AXU64406.1|1832892_1833408_+|CF-9-family-membrane-protein MEKYIWLFPLLFIFHDMEEIIGFGIWLKKNKSMLDKKYPFISKIYENYSTEGMAFAVFEEFILCIIFCILIVITDNQYVYLLWLGSFIAYTLHLVIHIGQSIIIRKYIPSLITSIICLPISIWCISKSIYIVDCEMSTTILYSIIGIIIVALNLKFAQSLIGKFTKWMSNI >CP012323.1|AXU64405.1|1830637_1832368_+|Na+/H+-antiporter MRNKKINIIFLTTIMFIMSTVMVFAEEDIDTIALANAEKFGILTLIPPLVAIILAFITKNVIISLLIGILSGSFIIKASGINVFATFIQAFLDLVDRALVSLADPWNAGIILQVLAIGGVINLVAKMGGAKAIAEALAKRAKSAKGTQLITWFLGLLVFFDDYANSLIVGPMMRPVADKMKISREKLAFIIDATAAPVAGLAIISTWIGLEVGLIHDAFESISIDVDAFGIFLNTIPFRFYNILILAFIVISALLLKEFGPMRKAEIKSRSRKISIDLDEGVAELDDLAPKNGVKLSVWNAIIPIGTLIIVALASFYYSGYTSIMGGDDKALIQLFTNSPYSFEAIKEAFSASDASRALFQSALVASLVAIIMAVVKKIFTISEAIDVWIDGMKSLVITGVILILAWSLSSVIKELGTAKFLIHLLSGSLPPFLLPSLIFGLGAIISFATGTAYGTMGILMPLAIPLAYSLNPDMSYVIVSTSAVLTGAIFGDHCSPISDTTILSSMGAGCNHIDHVNTQMPYAIFTAVITIVFGYIPAGLGLPIYIVLPVAIAAIFIGIQIIGKRVDEAEIELVE >CP012323.1|AXU64404.1|1829168_1830155_-|lipoate-protein-ligase MLLIYNEKTNPYFNLAMEEYLLKNFDEDLFILWRNEPSIIVGKNQNTLSEINLEYIKEYSIPVVRRQSGGGAVFHDLGNINFTFIACNNNNFSDFRRFTQPIIDLLKTLDVNAEFSGRNDLLIDGKKFSGNAQYNYKNKVMHHGTLLFSSEINDLSKALKVKPIKFEGKGIKSVKSRVTNISEHLHSKMDILEFKDAIMDYLSKTNTDNTNYCLSEHDIKQIEKLTKSKYETWDWNFGNSPKYTLSNELKYSGGNVEFNLNVDKGIITSIKFFGDFFGKCDVAFVENKLIGIKHEENALRNTLDSIEINDYFLGADTDILVSGILGVK >CP012323.1|AXU64403.1|1828061_1828859_-|lipoprotein MKFKKLLCLLLCLVLTLAVVGCSKAKDDKKIVVGATLVPGGELLEELKPLIKEKGYTLEVKNFDDYILPNEALNNGEIDANLFQHEPYLKEAVKAKGYKIMAGKKLYVCPAILYSYKIKSVDEFKKGDTIAISNNPSSCSKNLRYLESIGLLTLPKGDGLVSPKDIIENPKGIQFKELDIAQIPSSLPDVTAAFIDTTYAVPAGLDAKKNGIYTAPINDEYANLLAFRTEDKDSEKIKVLQDVLTSDKARSLIEEKYKGIVIPTF >CP012323.1|AXU64402.1|1827359_1827959_-|tellurium-resistance-protein MAIELKKGQKINLTKKENSNLGEILVNLNWNQKVQKKGFFGSLRSSNIDLDLGCLFEMKNGVKGAVQALGNAFGSLDNPPFAQLDGDDRTGSNTQGENLRINGNKIKDIKRILIYAFIYEGVANWSEADGIVTIKQKQDSDLVVKLDEHKNGYNMCSIALIENVNDETFSVEKVVKYFKGHREMDTEFHWGLKWVAGRK >CP012323.1|AXU64412.1|1845083_1845371_+|hypothetical-protein MKKILYALYSFIVIIANFRLKEKNYNFILLAIFFILLLIQNGVLKTGYQNRATFYQDNYFNGEDKSDKIKFMTIKIFIFLSLPLCFNILFNYLTS >CP012323.1|AXU64413.1|1845395_1845494_+|hypothetical-protein MIKVSLCVIYIKYKVHIVIKQKFHINEEKNIK >CP012323.1|AXU64414.1|1845909_1846461_-|transcriptional-regulator MSINTIIAKNLNRLRNERNLSLGQLAELSGVSKVMLSQIEKGDSNPTVNTIWKIASGLNVPYTAILEQPQNETFIVSKTDIDVQVSENKDYRLYCYYPNTPTRNFELFQMELEEGHSYTSVGHSEKSQEYIMIIEGQLKLEVNDSIYQLRENDSICFSAESMHTYHNQGEKTLKAVIINYYPV >CP012323.1|AXU64415.1|1846651_1847614_+|cysteine-synthase-A MRVLNNVTEAIGNTHMLHLSKIADEFGVQGNIYAKMEYLNPGFSKKDRVALQMITEAENAGLLVPGQAVVELTSGNTGTGLAIACACKGYKFIACMSKGNSMERARMMKALGAEVVLVDQMPNSVHGQVSGEDLALVEIEAQKIAKERNAFRADQFNLEACNHAHEKYTAEEMWEQLDGNIDVFVDFLGSGSTFAGCSKTLKKHNSSIKCYVVEPETAAIYSGKEITDQGHKIQGGGYSMDLPLVDKKLIDGYIQVTDEEATDVARKLAKLEGVFAGFSSGANVCAAIKLLKSSEKGKNIVLTLNDSGLKYLSTDLYEEL >CP012323.1|AXU64416.1|1847905_1849750_+|glycerophosphoryl-diester-phosphodiesterase MQKRNLRNFIFTGKNILSKLVFIIKYNFSTLILFELFHKGLALFFIWPSIRYIFDILIKSLHIVYLNMDNFIKVLTNPISIVLIILSVIILAFYAFFELTSVIICFNKSIKYEKIGLFELFKISFKKSIKLLYPKNILLFIFVILIIPLVNTVLISGFIGKIQIPDYILDYIKSDIVLNIIYMIFLLIIYILVIRWIFSIHEITLNTENFKRARKESVNLIKGKIIRTIIYSLILSLVVAIIGYVIYHSGVIFIGIWTKYYTDMEFLKNIFINRCIAFEEYFRLILSIFIFILDIGFISATYYQYKGVSISKNNIKKEKKSISKIVFNLVLILLISYIESVAFSSHVNGMFNTSFSFYTTAIAHRAGAEMAPENTLAAIEEASHAKADYAEIDVQETKDGELIVLHDSNFKRTTGVDKNVWDVNYNEVKTYDAGSFYYYGKGYYDEKFVGEKIPTLKEMIKYSKGKVKLLIEIKLNGHEKGDVVKKVVQLIKENNFENQCIVASMDKTILQKVKKLDENLLTCYFMVIAYGDFSKLNYVDIYGIESTFVNKTVVEKIHKMNKKIFVWTVNSDSLIEKMLDLNVDSIITDNPYLIESAIYWKKNGFISQVSDYLF >CP012323.1|AXU64417.1|1850070_1850655_+|sugar-O-acetyltransferase MTEREKMLAGELYDCGDIELLTQWHKAKDLVRDYNQTDSSDLEKKEKILNELLGGKGKNLWITAPYYVDYGNNIYFGNNCEVNMNCTFLDDNKIIIGDNVLIAPNVQIYTAFHPTNAGDRFGNAKEDGSFEFCKTQTAPVTIGDNVWIGGGAIIMPGVTIGDNVVIGAGSIVTKDIPSNMIAYGNPCRIIRENK >CP012323.1|AXU64418.1|1851757_1851934_-|hypothetical-protein MFIGEIDKCTHILTAYISSSYDYCNFLDTQLDDFISEYGETVVETCLHQVLLLVSRYN >CP012323.1|AXU64419.1|1852501_1853524_+|ABC-type-transport-system-involved-in-multi-copper-enzyme-maturation,-permease-component MVNWEIKKLAKSKSMFISLGILVLILIISIFITPVLETESYYIDKEKGRIEDTRSGIDIGNEKFQNKINVLKQFSNQTDTDEFSKKIELMSKKKLDNLSVNEYKDISFWKVFNYRVTNSLINVGMLIIISIIISNIYVDEVVTSVKDIILSSKEKKKALKSKIFVALLVPLVIYSVYLMGIFIITCMQQGVPVNGDLESFRVVDNVVALKTNLSITKYVILNIGIELLMFEGWAMIAVFGSFISKSSISSISFFIFIISITKIMSVIHILPKKLLSVISNVNYYDLIFGFNKIIGNYLGDIMIFKVNIDIVNIAIGLLMAILIGAISLCFLVIKSDYISR >CP012323.1|AXU64420.1|1853537_1854425_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNKLEIEKLSKIYGKKVANDKITVTLENGVYGLLGPNGAGKSTLMKQITTLIKPDEGQILYNGEDIFKMDDDYRNILGYLPQEFGVYKNFTAKEFLQYIGALKGLRGKHLNIKIGELLDLVGLYDVRNKSIGKFSGGMKRRVGIAQVLLNEPKIIVLDEPTAGLDPQERARFRNLIAKMSRDKIIILSTHIISDIESVAKETIMIKDGKLLMKGTHKDILSHMENKVYNVQVKNECEVDDIQSKYKVVSIQSDIDSIVLRIVSEDIPCGANIQPVQAKFEDVYMFYFDLEDAREV >CP012323.1|AXU64421.1|1854430_1855204_+|ABC-transporter-permease MMYLVKAEMIKILKSKSVWIIWLFLLFFGFLLIRKFDVLDTYADIFYKIEGSIPLIGLIMFIITSGNYIKEYDSNMTGLINTTKKGKKSVVLSKLLANGLTLSIINISFILLVGIRGFSFFDFKNLNEPIHNLWYFGNSNLNLTVIQMYIIVILTTIFASFIFAQIGLTLSSIFKSAVIPFILGGLMMEIPYFSVGFIPDKAIKFMSLTPNWIMMSQQIVRYNVPSILIVFSIVISIILMIVLTKITYENFTSSKRF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012323_9 | 2674469-2674629 | Unclear |
NA
Consensus repeat of CP012323_9
|
2 spacers
spacers of CP012323_9
>9.1|2674495|40|CP012323|CRISPRCasFinder CTAATAATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATT >9.2|2674561|40|CP012323|CRISPRCasFinder ATACAAAATCTCCAACTTATAATTATTTTCGTGATGTACC >9.3|2674500|37|CP012323|PILER-CR ATAATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATT >9.4|2674566|37|CP012323|PILER-CR CAAAATCTCCAACTTATAATTATTTTCGTGATGTACC |
cas3,cas5,cas7,cas6,c2c9_V-U4 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012323_9
The CRISPR arrays of CP012323_9 >merge|CP012323|9|2674469-2674629|CRISPRCasFinder,PILER-CR AAAAATCCGATTAGTTAATTTTAAACCTAATAATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATTTGAAATCCACTTAGTTAATCTTAAACATACAAAATCTCCAACTTATAATTATTTTCGTGATGTACCTGAAACCCACTTAGTTAATCTTAAACCTC >CP012323|9|9|2674469-2674626|CRISPRCasFinder AAAAATCCGATTAGTTAATTTTAAAC CTAATAATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATT TGAAATCCACTTAGTTAATCTTAAAC ATACAAAATCTCCAACTTATAATTATTTTCGTGATGTACC TGAAACCCACTTAGTTAATCTTAAAC >CP012323|9|7|2674471-2674629|PILER-CR AAATCCGATTAGTTAATTTTAAACCTAAT AATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATTTG AAATCCACTTAGTTAATCTTAAACATACA AAATCTCCAACTTATAATTATTTTCGTGATGTACCTG AAACCCACTTAGTTAATCTTAAACCTC
>CP012323.1|AXU65178.1|2673381_2674329_-|50S-ribosomal-protein-L11-methyltransferase MNNWIEVTIKTTTEAVEPITNILYEQGAGGAVIEDPKDFLFQKKNELDWDYVEEEVFKKNEEDDVLIKTYVSEEKNVMEFVEIIKQKVLGLKDFGIDIGEGSVSLDQVNEADWANAWKAYYKPTKVGQRVVVKPTWEDYAMQDGDLIIELDPGMAFGTGTHETTSMCIRELEKYVNKDSKVFDIGCGSGILAIAAAKLGAKEVVAVDLDEVAVKVAKENVLENKVEKSVSVMHGNLTDVIKDKADVIVANIIADIIKILAKDVQNFMKEDAIFISSGIILDKVEEVKESLIENGFEIVEVQKLGEWSAIVSKLKR >CP012323.1|AXU65177.1|2672604_2673363_-|16S-ribosomal-RNA-methyltransferase-RsmE MDRFFVEKNNINLQDKTCTIEGEDVKHISKVLRCKLGEKLEICDKNNNEYICEIMNIDKSIVNLEILEKVDINRESELKVRLYQGLPKAPKMEMILQKLTEVGVEEIILVQTKRSVVKVDDKKEDKKFERWERIIYEAAKQSKRGKIPKLRGVLSFKEALEDMKKNNVNICPYENERTVSIKHALKKCDSNIDSVGIFIGPEGGFSEEEIEQIQKNNCNVVSLGPRILRTETASVVASTIALYELSDLGGEK >CP012323.1|AXU65176.1|2671304_2672603_-|radical-SAM-superfamily-protein MKKVAFYTLGCKVNQYETEAMLELFEKDGYEQVNSEEYADVYVINTCTVTHMSDRKSRQYIRRVKKKNPDAIIAVVGCYSQVSPEEILDIEEVNLVMGTNDRRKIVEEIKKINSSKKVSTVDDIMKVKAFEEIEISQTNGKTRAFMKIQDGCDRFCTYCIIPYARGRVRSRDIDSIVDEVKKLANNGYKEVVLTGIHVASYGKDLKDRDIKLLDVIKQINQIEKIERIRLSSVEPILFTDEFVNEVLKMDKVCPHYHLSLQSGCDETLKRMNRRYTTLEYKTIVDRLRSKMPDVAITTDVIVGFPGETNEEFKKTYEFLREIELSQMHIFKYSPRKGTPAATMENQVDPQMKHFRSEQLLNLSKVNFNKFATKFIGRELDVLFEQNIEGNKYEGLTSNYIRVVVESDKNIQGQILKVKINDVKDEYVEGILL >CP012323.1|AXU65175.1|2670911_2671262_-|histidine-triad-nucleotide-binding-protein MDCIFCKIANGEIPSTKVYEDDRVLAFNDLNPVAPYHILVVPKKHYDSLIDIPDKEMDIVSHIHVVINKIAKEKGFDQTGFRVINNCGSDGGQEVKHLHYHILAGKKLPNYEAGQN >CP012323.1|AXU65174.1|2670569_2670749_-|30S-ribosomal-protein-S21 MSEVRVRENETLDSALRRFKRQCAMSGIMSEVRKREHYDKPSVKRKKKAEAARRKNAKK >CP012323.1|AXU65173.1|2670096_2670540_-|tRNA-binding-protein MSLKQKLQEDLKSSMKNKDTVRKSVVTLIRASIKQYEVDNRVELDEDGIIDVIAKQLKQRRDALVEFEKAGREDLIKETEGEIEVLKEYLPQQLSEEELEEIVKSTISEVGATSMKDMGKIMSVIQPKVKGRADGKLINKLVKQNLQ >CP012323.1|AXU65172.1|2669488_2669986_-|sensory-protein MIISVKEIRNFLINIFIPLIIGYLSSILTMIISGTDISTYYLQLTKPSFAPPAFIFPIVWTILYILMGISSYLILRKGYNLPKVRDAIFYYGLQLVLNFIWSILFFGFGLRFTALIDIIIMILVSIIMISKFSKIDKRSGYINLIYLMWLVYAGFLNYFIWFINK >CP012323.1|AXU65171.1|2668732_2669296_-|sigma-54-modulation-protein MQIIVSGRQMKLTDGIKGYVDGKLSRLEKYLDPESEVKVTVSAKKDRQKVEVTIIPINGQIIRAEDVEDDLYAAIDIVCDKLSRQVVKYKTKVKDKVQNNKSIRFENLDFIDNSSEFDDYDYDDEEDENIVIERRKKFNVKPMSSEEAILQMELVGHNFYMFRNQDNFEINIVYKRKAGGYGLIEQD >CP012323.1|AXU65170.1|2668281_2668518_-|sporulation-protein-YqfC MLEISTDLQVNQPVITVTSNTFISIENYLSILEYEVDLIRIKTKVKTIKISGDKLSLKYITDSEIGIKGIIYNVEYVD >CP012323.1|AXU65169.1|2666925_2668269_-|stage-IV-sporulation-protein MISFIRGYYVIVVEGVGLEQFLNHLIRNGISVYNVTRIKNTKMEFHIDRQDIKEFKNVYRGSKFDIKVKQKTGVPFIIKRVYKHKGMWICALVSLFLLMSTSQFVTDVYIQSPEGIKKEALRNELYKVGVRPGVYKKSIDRKEVRDHMMSKFNDVAYLSINVKGTNIFVTVTKKAESLKSTDQSNYCNVIALKNGIIEKVIPRSGKSVIKSGDIVQKGDVLLNGANTKSIPEVWASTFYESTKKASYVDTVNKKTGEKKNIYTLSFYDKEFTMRKNIKYKDYVVENKEKKLSIGNYTFPIKIKTSTFYETKKVEVKKNKEELKKELSEKALKELEYIIPASARIIDVKHNFKVNKNMLEYLITVQTSENIAKIYPLSKSEAERFIKEESKPDEGEEEVPSNPEKRPLNDIRNEFDEDNKDNKDQNNSDENNSNQNTNNSQNNNSNNN >CP012323.1|AXU65179.1|2674769_2677178_-|ATP-dependent-helicase MKNIMQKEILAKSYNLRTNQQEQTLVEHIKDLFEVLESILELNLYSDKDVEILKICCVLHDLGKINSIMQQKMEINNKISYSCSEEERKKLESDKKSLKKIARHNIFSGAFLKDILEKMNLSEEDKLYIYKSIMLHHGNYEDYMRLSTSKVQEEIYEYIEKGILEKEEFNLKDIESYINDILNVDFKFDEDVLDYDYIDKLSESMFIDSDYNNGQIDDSVLNYRKFKYILYKGMLNLIDHSASSRQKGIKFYNDFTDEEIDNMILSEIYKSQGNLEKNNIKFNTIQKRLRELSGRNVLTVAFTGSGKTAADYRKTFKRKFFLVPNKISAESFYRKNIFQNKNDLDTRNSNDYIGLLHGDINLYSENEDNGEHDFVLTLRDIDLSVNFCKPCVIATVDQLLLSMFKFPGYEKIFAAVKNASITVDEVHLLEPKMFLILIYFMQFACKYLDVDFHLMTATLPKSYKEQMINKGIIFQEESNENVTDKGEIVFIESNKEEEICEGKDVKVSFIKEKEIKSIVEGALENKQKILIIKNTIDSVNRTYEFLKENLSYKYGGVDIDVLHSRFKFKDKKEKYSKILNGEGDIWISTQSVEISLDLDFNIIISDLATMDSLIQRMGRCNRNNKYEYGNFYILPSEDKIYDNKLKNTTKSILNKIIKTNSIFTMGIRKIILADYYDNSVVKKYFEENFISCDKEIKNIYGINKEIFDGLDLIFNFEPYKNIVDSKKEAAKIFRDVDVSYKIILEEDFYKEDRELQQDSIQVSGFIFNRLYYYGLISKVEGYMVLKSSSKFEYNSTVGLILK >CP012323.1|AXU65180.1|2677204_2678002_-|CRISPR-associated-protein,-Cas5t-family MKVLQCKLKQPTAHYRDPKVFQNEYISTLNLPSKTTIMGMITYLCDRRLNSDIDIGIIGTHHHRELEFSRGENIDFWNEYIKMGKGKDKEKFLLKGNYYDYYKEHKAQNSILNYEVLKEVELTIFISCKDDEELEFIRKKLESPCKYANLGRKEDFVIPSEKGCFVKEVELKEVIPMNTRDAIKENIKLKNTYVRVDLRDKENVETIINQGVLIALPHKYKDLEANRDDRVYEFCHYIYVDNDGIYPKNIKVNVCIDTKEVFTWL >CP012323.1|AXU65181.1|2678017_2679031_-|CRISPR-associated-autoregulator,-Cst2-family MNEKRVKGVTLTILTESPVPLSYDQGYGNYTPIKKEQYREKIHAKTSIATITYDLRRMLHQEYGWNLSNIIFGKKGNIYPSIKKNVGCVDENGLETDVFGYLIPLKDKGSISKASPLRIIPFRSLNPYIGSTQLITNRGFLSSEFGRKYYDEKEENEVLRDENFPTTQALAIEETLSDYYVYTITLELDRIGVVEVEDGKLLLPEERKFMSKELREKAVKDILDAITVFTRNIKHSSVLLKPLAVMGGAFDKVVPFFWDDVDYNADSGEINLEGVIETIESYSLKESNTILAINDRLKISNKKELNRFNLSKYPVKEIKNLADRLEIGEDNMWYLKE >CP012323.1|AXU65182.1|2679049_2680516_-|hypothetical-protein MREIKAKFYRSGDIVRDIGIVYFYELLMDLKNELEKNGYKLKFTCELNRNYLSLESAENIDPKYISDYILENQLFKVFKNGKKEALEKIFSNIDNLTYVNFIEELDKSSATEKQKEGIKKDFKNRRFPYVRNSGKYGLNTSLENMETNVKRIVDTVIKSNIEIDKLDLTQYEEKDSVCNVCNINKTTKLDIDLRERKDSKYNFLFRGAEKSGFKRSGQVESNICFECEFFNLMCLLYINLKRPMVFAYTNDLRELAFLNHKIMLKRKMYSDKSFYKKLLHEKISSIRLYRFDIDTNKGIILKFDSIIEYKELLKKIELIDIIDNYNFSREPGNTKNLGKKMIDNGNLSNLKELLLDNISFLKPSNGTSREMDFVSSSYNIGLYIKLCWIVDGGEEYKMKNYMESNLIYSRVGKDLFNKMTDESRRKNFSMKVIQLLKSNDRTQLFQTIMHVLVSNGILIGEGFVEGLMQSSELELNTNVGLFIQEIMK >CP012323.1|AXU65183.1|2680520_2681258_-|CRISPR-associated-Cas-family-protein MSRISIFMESCNGKFPNENSMLSVSFIKNILNAENKDFAKNIFNYGEERKNNKQIKDINTAIYIPNLIRSKNELLVDGDIIFNISFYNYSMFSKLYNGILKVKELEYKGYRFKIKNIKIHKEHEIKENGVIFKTMSPIIVKNKEGKYLDVEDSNYIECLNYIANLTLESIRGSGLRKPLEFIPLNFKKRVLKEKIRGFKVREYYYINAYAGTFFLKGDMEDLNALYKMGIGYRRTENAGMVDILK >CP012323.1|AXU65184.1|2681571_2682030_+|resolvase-domain-containing-protein MKNNNCKPKEFAELINISARTLQRWDIEGKLKAFRTPTDRRYYTYEQYLEYKGIHKEQVNRKNVIYTRVSISNQKDDLKNQVEFLKQYANAKGIIVDEVIEDYGSGLNYNRKKWNKLIDSCMTNEVNTIIVTHKDRFIRFGYDKYLVVAYMD >CP012323.1|AXU65185.1|2682066_2683230_+|IS605-family-transposase-OrfB MKRAYKIEINPTTEQKSKIHQTIGVSRFIYNFYIAHNKEVYDSKGEFISGMDFSKWLNNEYIPNNQDIKWIKDISSKATKQAIMNGDKAFKDFFKKTKGFPKFKKKKNQDVKAYFPKNNKTDWTIERHRVKIPTLGWVRLKEFGYIPINSIVKSGTVSQKSDRYYVSILVEEDDIQVSKCTNEGIGIDLGIKDFAICSNGSKFKNINKTSTVKKVEKKLKREQRKLSRKYESLKVRNKNIKEGVATRQNIQKQIVKVQKIHQRLANIRTDYINKTVSQVIEQKPSYITIEDLNVSGMMKNKHLSKAISSQKFFEFRTKLTAKCKQNNIELRVVDRWYPSSKTCSQCGEVNKGLKLKDRVYKCECGLSIDRDLNASINLKNTKKYKIA >CP012323.1|AXU65186.1|2683382_2684492_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSEVILKNISKLYSNGFNAVKNINIDIKDKEFIVLVGPSGCGKSTTLRMIAGLEEISEGELYIGDKLVNDIEPKDRDIAMVFQNYALYPHLSVYENMAFALKLRKLPKDEIDKKVKEAAKILDLLPLLNKKPKTLSGGQRQRVALGRAIVRNPKVFLMDEPLSNLDAKLRTAMRTEITKLHQQLGTTFIYVTHDQVEAMTMADRIVVMKDGVVQQIATPQDVYDYPANIFVAGFIGAPQMNFIDVTLIEENDEIYAQNEHIKLKLNKEKHYDLIKDNYINNEVVISIRPEDIHVEDTFIKSNPDTCFKSRIEIKELMGAETYAHLKLGENTITIRFDSKNRINVGDDLTLSVDNSRIHIFDKETTLAIR >CP012323.1|AXU65187.1|2684521_2685289_+|sugar-diacid-utilization-regulator MEELKDFLERQLNKKINIYPYENQKLDASSHLVTFNNSIYVIDFLDKNNLDNLKGNFYLIYQPHIEFEYLKNIFYNLFEDINIIQHNSFFIVNSKYNLDINVTTQNIIETETYQSTYIFYLGKLDSKADFDFRLQLCSDLLPHIIKDNAENKFLNLFDLIRYKTLDLINEDNILNKLIDFNKIKSIDEELLYTGLKFINNDLNISKTSTSMFLHRNTLVYRLEKINEILGFDLKNFENAMIFYLSVKSYFLYKKI >CP012323.1|AXU65188.1|2685476_2686850_-|transporter MGKTNARRTLFLIAIGSGTMLNPLNSSMISLALHSIQNDFHISFTTVSWIVSAFYLASAIAQPVSGKIGDLIGRKVLFLSGLMLVILSASIVPLVQSFFILIFIRVIQAIGTSTLYPSGVALIQNNIKERQSSALAVLTIFASTTAGLGPTLGGLLLDLGGWHAIFLVNIPVVLVSICLGYFLFPKEVKEKKSIKETLKNVLSRLDIIGILLFSIAMIFILLFLLSMKESFNLEQLVFGIILMCLFIWHELRTKLPFIDIKLFVSNPKLSKVYLQFIILNFFNYILFFGLPSYFQDALHYSAKSTGLFMLFMSGIGIFISPLTGRWIDKSGTRFPLVTSSIFMFISAVLLSVVFIHIPVIGKGIILSLAGISYGVGNVALQSSMFEESPSDSIGTASGLFQTSRYLGSILATVLLGMVFEVNITSEQFQILGYVMVVLGTISFLLNFILKKELRKVE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP012323_10 | 2764303-2764727 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP012323_10
|
6 spacers
spacers of CP012323_10
>10.1|2764332|37|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT CTTAAAGCTACATAATAAAAAATTAAGAAAAAGAAAA >10.2|2764398|37|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTTGTGTATCCAAAATAATAGTATTATTGCAAATAG >10.3|2764464|37|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CATTCATAATCAAAAATGACAATACAGTATGGTCATG >10.4|2764530|38|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGTTATAATTTATATGTAAGGAACTAAATATCTAAGAG >10.5|2764597|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TACATTATATAAGATAGCTAAAAATCTTTTAGGCAA >10.6|2764662|37|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAGCTCCTACAAAGTCAGCACCAGCTTGTTCAGCTTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012323_10
The CRISPR arrays of CP012323_10 >merge|CP012323|10|2764303-2764727|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTTAAGTCCATATAGTTAATATAAAACCTTAAAGCTACATAATAAAAAATTAAGAAAAAGAAAAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACGTTTGTGTATCCAAAATAATAGTATTATTGCAAATAGATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACCATTCATAATCAAAAATGACAATACAGTATGGTCATGATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTGTTATAATTTATATGTAAGGAACTAAATATCTAAGAGATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTACATTATATAAGATAGCTAAAAATCTTTTAGGCAAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACCAGCTCCTACAAAGTCAGCACCAGCTTGTTCAGCTTCATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC >CP012323|10|10|2764303-2764727|CRISPRCasFinder ATTTTAAGTCCATATAGTTAATATAAAAC CTTAAAGCTACATAATAAAAAATTAAGAAAAAGAAAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GTTTGTGTATCCAAAATAATAGTATTATTGCAAATAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CATTCATAATCAAAAATGACAATACAGTATGGTCATG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TGTTATAATTTATATGTAAGGAACTAAATATCTAAGAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TACATTATATAAGATAGCTAAAAATCTTTTAGGCAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CAGCTCCTACAAAGTCAGCACCAGCTTGTTCAGCTTC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC >CP012323|10|8|2764303-2764727|CRT ATTTTAAGTCCATATAGTTAATATAAAAC CTTAAAGCTACATAATAAAAAATTAAGAAAAAGAAAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GTTTGTGTATCCAAAATAATAGTATTATTGCAAATAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CATTCATAATCAAAAATGACAATACAGTATGGTCATG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TGTTATAATTTATATGTAAGGAACTAAATATCTAAGAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TACATTATATAAGATAGCTAAAAATCTTTTAGGCAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CAGCTCCTACAAAGTCAGCACCAGCTTGTTCAGCTTC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC >CP012323|10|8|2764369-2764727|PILER-CR ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GTTTGTGTATCCAAAATAATAGTATTATTGCAAATAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CATTCATAATCAAAAATGACAATACAGTATGGTCATG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TGTTATAATTTATATGTAAGGAACTAAATATCTAAGAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TACATTATATAAGATAGCTAAAAATCTTTTAGGCAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CAGCTCCTACAAAGTCAGCACCAGCTTGTTCAGCTTC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC
>CP012323.1|AXU65254.1|2763683_2763944_-|holin MDNLISFIPEQLLLLVVALNVLGFGFKKYKQLDNKYISVILLALGIVFSIWMLGFNPSSILQGILCWGVAIGANQVYKQLKDGEKQ >CP012323.1|AXU65253.1|2762889_2763687_-|phage-related-cell-wall-hydrolase MKIAIVPGHTLSGKGTGATGYIDEGKENRILTDLIVKWLKQGGATVYTGKVDKSNNYLAEQCQIANKQNVDLAVQIHFNANKTTLNPMGTETICKTNNGKVYAERVNKKLSTIFKNRGAKSDVRGLYWLSHTKAPAILIEVCFVDSKADTDYYIRHKDIVAKLIAEGILNKKIDNDGVKLMYKHAIVYDGEVDKIPATVVGWGYNDGKILICDIKDYIPGQTENLYVVGGGACEKIGSMAKENYTLIKGNGRFDTLYKALDFIDR >CP012323.1|AXU65252.1|2762706_2762868_+|autoinducer-prepeptide MKKILYNFMKACGVLAMFVAFLSANTTSLWHVYQPKTPEKLKNSKNHQKEGNN >CP012323.1|AXU65251.1|2762107_2762689_+|accessory-gene-regulator-protein MIKSCADKIAFLFVLNQVIEKDDLEICSYGLEILLSSIINTLSSLMIGLILGRLIYSIVFLISFCIIRQFSGGYHANSNKNCILIFNSIFFISMVLGTILNNSNPIPLFLVILSSFNFLIIFIFAPVCHTNNPLNETKYKKNKLLSRTISITLFLIILLGCKYLSFYNYVVYTFLALLWINLLLIIQIIINKK >CP012323.1|AXU65250.1|2760742_2762065_+|two-component-sensor-histidine-kinase MLDMFITIVSSIIEIWACKKVFDYTSKVKTSLINLYFLISTFIIISTFYTNVGADNRILICIFVMFVFYKSNYDVNIYKCLIVLFSYWAILVCINALSMIVIVSINNLSSMNILLNDNFYRYETIVLGNVVLIVLLCIYKFISNDLQVTKKEIYMCIPIVANMISFFIFYKYILKLLDISSATRLDILIMVLLLTFSNIVLISSLVKILKSNKKYIELTKLQEKINAENKYYSNIKKYYIKTKELNHDMKNHLICIKEMNKKNIDTSNYINNIEKKLDEYSAVFDTGNITLNIILLEKKELCIEKGIDFTININFSDCNFIKEEDTCSIFANALDNAIEACEKIKDDDKKIKLQGMVLNKFFVIKITNTKSNDILLKNNAFLTTKEDKEFHGLGIKSIKNSLEKYDGAISINFSENLFCLNMMIPIRKSQEDSNIAYENS >CP012323.1|AXU65249.1|2760096_2760297_+|cold-shock-protein MNNGIVKWFNNEKGFGFISMEGRDDVFAHFSAIQTSGFKSLEEGQQVSFDIVKGARGPQAENITIL >CP012323.1|AXU65248.1|2759694_2759871_+|hypothetical-protein MFGNKMDKCTHVLTAYISSSYDYCNFLDTQLDDFILEYGENIVESCLHQVMVLISKYN >CP012323.1|AXU65247.1|2758927_2759311_-|regulatory-protein MLNKKLPDIELKIMKYIWNTGYKTVISKDVADEIEKTYGWKHTTTITLLARVTKKDFLISQRIGRPVPYTVLIKEREYLKIEGKRIFGGLHNNPLSELILKLHNEEEITEEKIIEIGSWIKSWKDED >CP012323.1|AXU65246.1|2757747_2758743_+|L-asparaginase MSIKKKVAIVFTGGTISMTVDDKVGAAIPTLSGEQILSMVTNIDKVADVEVFNFDEIPGPHITPYRMMELKNYVNDLLARKDITGVVITHGTDSLEETAYFLDLTIDNIKPVIVTGAMRSSSELGYDGSSNLSASVCTAVSKDAMGKGVLVVLNNEVLLASEATKTNTLSLNTFKSLTSGPLGIIDCNELVLTRDIVNRTIIDTDKVESKVALFKAYVGENADFIRFAVDSGYKGIVIEAMGRGNIPPQMLSGVEYAREKGLPVVIVSRCHSGRVFDSYGYFGSGRDLKNLGCIFGGDLPGQKARIKLILALGKTDNLDEIKDFFEKGIYC >CP012323.1|AXU65245.1|2755998_2757627_+|aspartate-aminotransferase MKNHTYKEIKNIYGKISPFEFKDKLIDIAKYTAKENNRELLDAGRGNPNWTCSTAREAFFTFGHFAITETRSNWDLGHLAGMPQKKGIKERFFKFINENIDMPGAYLARDIINFGINELGFDGDEFVHELADGIIGDNYPLPDRMLPHMEKIVHDYLVQEMKYDISGKYGDVEIFAVEGATAAMCYIFDSLMANELLKKGDTIALMTPIFTPYLEIPNLPRYDFKVVNINANEVDEKGAHTWQYTKKELEKLRDKSIKALFVVNPNNPASIAMDETSCNNLIDVIENYNKDLMIISDDVYGTFVEDFSSLMSKLPYNTVGVYSYSKYFGVTGWRLGTFALHKKNVFDKKINDLTGELKKSVDKRYSDMSLNPSSLSFMERVVADSRLVALNHTAGLSTPQQVQMAFFSAFALIDKVDAYKKLNMSICHRRQKLLFEALELPINENKNNAAYYTQFDIEEWAKLNYGEDLFKFISKNASPVDVLYKLANDYSVVLLSGNGFYGPEWSIRISLANLYDEAYTKIGKAIREILNGYIVEWQKIKK >CP012323.1|AXU65255.1|2765012_2765171_-|hypothetical-protein MDNFLQGILASLSASLIVYVASKLFRKRKKPLKAATKSGWEFDLKIRFHKTK >CP012323.1|AXU65256.1|2765528_2766899_-|cell-surface-protein MELKKLLSLGLAVSMFAAGPISANALDTIYTIQGKDKYETAALIADEQNYTTAILINADSTMADGLSASGLAGATNAPILLTKKNNIPNATLKRVEKAKKVYIIGGESSIDKATETLLKDKGIEAKRLQGSDRIKTSYNVAKEINSINKVNKVILTNAFKGEPDAMSAASVAVRDKAAIVLTDGKSVPFNTTGVESYVIGGTSSMSDKLVNDTNSTRLGGVDRYDTNKKIVNKFYNGAKEFYIASGTDLVYALVASPMAKNNPIVLVDIGSNKDILKNAAKVTGIGNLSDKIMLECENTINNISLPSSNKNIICGLKIDFDSKHIIWQDKGSYLECYDDNLEYYTEKYKDPTVPINIENTSTQNLDVTKLKVYGEANSTLYMGQYAKIKMDFNSFGVLKPGEKCTIYLDIISLDPSRSMTLTFSYVGDKENYKYEQGLASRILFYNPDGEDFFEYK >CP012323.1|AXU65257.1|2767297_2767720_+|integrase MTFVERCYKYIDMNKNNWSPYTVTNTKSLVKNYIEPFFKNLKLTEVNPSSVQAFVNYNFNNSTFTSAKVRYSFLSSVISEVYRLREIQENSCDFIKLPSKEKYSTNEIYNREEVLLLIEKLLGNNIEIPILLMLLLGLRM >CP012323.1|AXU65258.1|2768704_2769373_-|vanZF-protein MEIVSNNQSGVEIQLSLFEAIKDLLLINPIFLLGIILIGISLIVIFKKDSDIPKVKTSILSLAMYYYLCLTLSHIVGIPTFSEYIRLSQLGETFFNPNISFIPFSDGFSLSFILNILLFVPLGFLCPLISKTFERLRNTFLIGFGLSLFIETIQLFTLHRATDINDLITNVIGTIIGYFCFKLIAKLRIVKLHSDDDSMEQDYTVCIPIAIIIVALILGFFS >CP012323.1|AXU65259.1|2770261_2772682_-|leucyl-tRNA-synthetase MSVYNFKEVESKWQKIWKDNNQYKMDTAQTEKPNYYTLEMFPYPSGKIHMGHVRNYSIGDVVARFKKMEGYNVLHPMGWDSFGLPAENAAIKHGIHPHKWTMENIEEMKEQLNLLGISYDWDKEVATSTPEYYRFTQEIFLKFLEHGLAYKKKSYVNWCPSCETVLANEQVVQGACERCKATVLKKDLEQWYFKTTEFAEELLNDLDTLDGWPEKVKTMQKNWIGKSTGADLVFDIDGTDKSMTVFTTRPDTTYGVTYMVLAPEHELVKELVAGTEYEADVEAFVKKMHTMTEIERTAADVEKEGMFIGRYVINPLNGKKVPLWIANYVLVEYGTGAIMAVPAHDERDRDFAEKYNLDIIDVITEDNKMINSEEFNGLDASEGFEGIIDKLEKEGRGKRTINYRLRDWLVSRQRYWGCPIPVVYCDECGIVPVKKEDLPVLLPTDVEFTGKGESPLTTSKQFMSTTCPHCGKPARREVDTMDTFVDSSWYFLRYVDSNNENEPFSKELVNRWHPVDQYIGGVEHAIMHLLYARWFVKAFKSMGMVDFNEPFKNLLTQGMVLMDGSKMSKSKGNTVSPMDIIDEYGADTARLFVLFAAPPERDLDWSEQGVDGCFRFLNRVYRLVDELADVVKKDVEFGELNSQDKDMRYTIHSTLKKVTADLSEKFGFNTAISALMELINDMYKYKELDNINEAVIKEGVQTIVTIIAPFAPHLGEELWTMIGKEGSVFDIDWPKYDEKALVKDEIEVVVQVNGKVRGKLTVNSNISKDEMEKVALEDEKIKGLVEGKTIVKVVAVPKKLVNVVVK >CP012323.1|AXU65260.1|2773035_2773386_-|iojap-family-protein MTVEQMTKIAYDAIEDKLGQDTVIINIGKVSSLCDYFIITTASSQRQVKAIADNVEDELAKLGLEPRGKEGQGTQTWVLLDYGDIMVHVFNEENRGFYNLEKLWKDAPYIDIDTLA >CP012323.1|AXU65261.1|2773502_2774075_-|metal-dependent-phosphohydrolase MNLENINQRLNQMLPVGRLSHSKNVAKCAEKLCEIYGCDKEKAYLAGMIHDCAKYLSDKEIEDYVNKYEIYLDPIEDGNRSLSHSVIGAYICEYEFEVEDEDIINAIKYHTTGREDMSLLEKIIYIADLIEEGRKFPVVDTLRELAYGGKLDEALLTSFNNTLMFVINKKEEIHPRTVMARNYLIKEKLL >CP012323.1|AXU65262.1|2774075_2774765_-|nicotinate-nucleotide-adenylyltransferase MRSENLVKMAELKNTEKLEKFNRHKGKIKIGILGGTFDPIHYAHLATAEFIRDKYDIDKIIFIPSGNPPHKLCITTDKYDRYNMTLLATESNEDFLVSKVEIERKKRTYTIDTLKYLKKKYKNADIYFITGADAICSVEEWKDVKKNFELATFIAATRPGISLLRSQETIEKLTKKYNADIITVYVPSLDISSTYIREQLNEGKSIRYLVPENVENYLYENKLYQYGDD >CP012323.1|AXU65263.1|2775040_2775679_+|recombination-regulator-RecX MGIITKIEQQKRNDDRVNIYVDDKFFIAIFKELVYTFNLKKGNEINEEELKPILDDEMYIKAKNKALNILSHADQSEKKLKEKLSSEFDENIVERVIDFLKSYNLVNDSVLAQKIVNTNVNLNKCGKNRIKQNLYNKGINRSTIDEAVSELDKDTEFENAMYLAKKRYERVKKEDKKKIYQKISQHLSYKGFDYDIIKRVLNKLLNFDEYDI >CP012323.1|AXU65264.1|2775831_2777835_+|glycogen-branching-protein MKSQKRFKILDIDVYLQPFESDIKKRMKHYEDMKSKTLKNYKDFSSFANAHLYYGFHQTNDGWFYREWAPNADSLSLIGDFNNWNRKSHLLRKIGSGNWEIFIPGQNSLPHKSEVKVQVTANGKTFDRIPLYIKRVIQKDFGGFNGQIWQPKTPFIWTDNDFDLKNITSPLIYECHIGMSTESESIGTYNEFTEKILSKIKKAGYNTIQLMAIMEHPYYASFGYQVSNFYAISSRFGTPEDLKNLINTAHSMGIAVLLDLVHSHAVKNTLEGINEFDGSEHQFFHSGSKGNHPAWGTKLFNYGKPEVIHFLLSNIKFWLNEYHFDGFRFDGVTSMLYRNHGLGVSFDSYEKYFSMNTDIEAITYLQFANELIKEINPNSISIAEDMSGMPGMCIPIKDGGIGFDYRLAMGVPDFWIKTISNLSDEDWDLGKMWYELTTRRPGEKNIGYCESHDQALVGDKTIIFWLADKEMYWNMEINSNNHVINRAISLIKLIKLITFSLAGEGYLNFMGNEFGHPEWIDFPREGNNWSYKYARRQWSLSEDNNLKYKQLLNFDKSMLELTKYSDIFIQNSHELIHMDNDKKILVYSKGKYLFIFNFHPNLIQSVDISKFQNTNYKTILNTDMVEFGGNTKKENLRDYDVYFSSTPPSSKMPIASRTAIVLLDNGI |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012323_17 | 3663744-3663853 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP012323_17
|
1 spacers
spacers of CP012323_17
>17.1|3663775|48|CP012323|CRISPRCasFinder TCTACTGTCGGAGTTACCGACATCTAAAATTTATTAAATTTTTGTATT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012323_17
The CRISPR arrays of CP012323_17 >merge|CP012323|17|3663744-3663853|CRISPRCasFinder AAAAAAGACCTAGAAATTAATCTGAGTCTTTTCTACTGTCGGAGTTACCGACATCTAAAATTTATTAAATTTTTGTATTAAAAAAGACCTAGAAATTAATCTAAGTCTTT >CP012323|17|16|3663744-3663853|CRISPRCasFinder AAAAAAGACCTAGAAATTAATCTGAGTCTTT TCTACTGTCGGAGTTACCGACATCTAAAATTTATTAAATTTTTGTATT AAAAAAGACCTAGAAATTAATCTAAGTCTTT
>CP012323.1|AXU66005.1|3663025_3663709_-|phage-DNA-binding-protein MQDVKEKVKQDYLKGMKQKEISAKYDISLNTLKSWIKRYKWANEKKKGAPKSKKGAPFGNKNATGPPGNKNAEKFGFFSKYLPEETRELIQEISIKDKFDILWEQITIQYAAIIRAQKIMYVKDKEEMIKELKKHESTENGEKTEYEFQFAWDRQASFLNAQSRAMSELRSLIKQYDEMIHKDWNLATEEQKTRVEKLKCEVDNLSKDDIGDDELKISVDYGDRNDS >CP012323.1|AXU66004.1|3661794_3663048_-|phage-terminase-large-subunit MVIEMIVRVNFNPDFKEANFTKKRYRAMKGSAGSGKSVNVAQDYILKLGDKKYQGANLLVVRKSEATHKYSTYAELTGAINRIYGKQADKYWKTTLNPLEIKSKVTGNSIIFRGVNDAKQREKLKSINFSKGKLTWVWCEEATELMESDIDILDDRLRGILTNPNLYYQMTFTFNPVSATHWIKRKYFDYKNDDIFTHHSTYLQNRFIDEAYYRRMQMRKEQDPEGYKVYGLGEWGETGGAILKNYVIHEFPTEFEYFDNMRLSQDFGFNHANVVLRIGFKDGELYICNEIYVHEMDTSEIIKIANNKGLEKNLFMYCDSAEPDRIKMWKSAGYKAKGVKKGPGSVKAQIDYLKQLRIHVHPSCTNTIKEIQQWKWKQDERTGLYLDEPVEFMDDAMAALRYSIDNKLKNNGISFLK >CP012323.1|AXU66003.1|3660349_3661789_-|phage-portal-protein MLNIYISETDLIKAQLKKESTFNLVKVIEHYILKHRPEKYKQGEEYYYGNTDVNNKRRYYLLDGAKVEDFTKVNNKAINNYHKLLVDQKVGYSVGNPIVFNADNNDFTKLLNDLLGEEFDDTITELYLNASNKGIEWLHPYINRKGEFKYVIIPAEEAIPIWDSKRQRELVAFIRFYYIEDIDGNKIKRVEYYTENDVTYFIERGNSFIQEFLYDEYGKMTDIQEGHFRINNKEQGWGKVPFIPFKNNEKCVSDLNFYKSLIDIYDNNISTLADNLDEIQEVIYVLKEYPGTSLQEFIDNIRYYKSIKVDGGGGVDKLEINIPVEAKKELLDRLEKNIIIFGQGVNPESQNTGDKSGVALKFLYSLLDLKCSKTEKKFKKAIRELLWFVCEYLKISGSKSYDYKSVQITFNHSMIINESEKIDMAKKSIGIISDETIVSNHPWVEDVNDELERLKKQEDTQKEYDDLIPNNQDGVIDEI >CP012323.1|AXU66002.1|3658962_3660360_-|phage-minor-head-protein MKYKDYWRKRFEQLEEAQNNKSVKYYLELEKQYKLAMNSIEKDILSWYNRFTESEGISLLEAKKLLNTRELEEFKWSVEEYIKYGKENAINQKWMKELENASARVHITRLEALKLQIQQQVEVLYGNELDGIDKLMRDIYTSGYYHTAFNVQQGVNVGWSLMSLDTNRINKIISKPWATDGLNFSERIWGKHRLALVNALHTKLTQSIIRGENPKNLVNDFSKRFNVSKSQAKNLIMTESAFFASASRKDCFSDLDVEKYEIIATLDLRTSNICRELDGKVFDRKDYQVGITAPPFHCRCRTTTAPFFSDEEGYRAARGEDGKTYYVPSSMKYNEWYEKYVKHNSILEIKNSAIIDSIKEDIKNGKYNLNIHDGKQGKHLKEHNNYIEGRSYLTITKEEAQELVNKYAGNGIIKFNRSGEWDKKELIEVDKNIGVNVNNITGEKTLTNKFKIHYSKTGTHIVPAL >CP012323.1|AXU66001.1|3658747_3658948_-|hypothetical-protein MKLWEYVGKNVQITCVDKQIIRGKCDGYTQALDNEPEIASISIARDGYGIEVYENEIESIENINKE >CP012323.1|AXU66000.1|3658118_3658682_-|phage-scaffold-protein MDWLKELLEGIKVEDNKIDVVSLQKSIEKKIKETTITQEDYTNLETQLNTANETIKKFEGGMTKEDVENLKTTYETDKKTLEETYKKEIEEKDFNYWLGDAFKSVKCRDEIALKAHLDIEALRNSKDRQKAFEEQINPLKQDKDYLFNATLEGEEPKIDTITPGQEPKINDFGFNFTGVRPHENNNK >CP012323.1|AXU65999.1|3657207_3658107_-|phage-major-capsid-protein MAALNYAKEYSNVLAQAYPYTLNFGDLYATPNNGRYRWTGSKTIEIPTISTTGRVDSNRDTIAVAQRNYDNAWEPKVLTNQRKWSTLVHPADINQTNYVASIGNITKVYNEEQKFPEMDAYCISKIYADWTALGNTADTTVLTTANVLEVFDKLMEKMTEARVPENGRILYVTPVVNTLIKNAKEIQRTVNIKDGGTSLNRQTTDIDTVKIIKVPSNLMKTAYDFTTGWKVGAGAKQIFMSLVHPSAIITPVSYQFSKLDEPTAVTEGKYFYFEESFEDVFILNKKADAIQFVVEGAGA >CP012323.1|AXU65998.1|3656974_3657208_-|hypothetical-protein MAQVRKLNRILTIEECKIDDFLEMGYDLIDETGKVVRYGKSLNVKDLIAENNILRSKVESLEEENKQLKEKNKLTKK >CP012323.1|AXU65997.1|3656563_3656965_-|hypothetical-protein MGNNIIDDIEKRLESFGYILKDGDKWLIDFVREKIENIIKLDCNIKTMPIELKEIEVDMIVGEFLFTKKNMGQLDIESINFEAVEKSISEGDTKVDFAIGSGSQTPEQRFDSLIAYLTTYGKNKILTFRCLRW >CP012323.1|AXU65996.1|3656222_3656570_-|phage-protein MVSKTRKAIEMLYRDKCTLVEYQSIKDPVTKRTNNKEVIVLENQPCKLSYKNIVSATEGKLAKLEQTIKLFISPDIEIKAGSKLIINDKEYVRSGESAIYPNHQEIILELFKDKA >CP012323.1|AXU66007.1|3664453_3664954_-|sigma-factor MSKTKKEFFNATKKFLEEYNQMDANINKLKGDICNLDKCSVGDLTKAISYDSIPTSKTYNINNKIEDKLVSIEDKKTEKEIELYTMMAIKKTLDIAINNLRYVEREIIKFRYINKFEWFQISDKLFMEERQLRRRRDIAVASISIAIFGRKALTEQEPIFNLLEIQ >CP012323.1|AXU66008.1|3665053_3665902_-|phage-protein MNENINREIIVLGTLEVEGMKFHDIEGGFGKDKKAMLVKDIAEIHNRESRQINELINKNRKRFKDGKDILDLLGVGLDDTKIKELGFTQQSINSYRGLKNKGLLSGIYILSERGYAKLLKILEDDIAWELYEKLVDGYFSMRKELNNPLLSASKELQAIFMLDKKQEVLETKIENVNEKLENFMDDAPLFNIECESIVKEVKRVATKSLGGHGSKAYKNKSLRGKVYSDIYHQIKREFGVESYKAIKRCQLDKVLEIVDNYKLPIVFEDEIRLLNSQLSIVS >CP012323.1|AXU66009.1|3666002_3666410_-|phage-protein MKVFLVIDGEPVGKERPRMNSITKRTYTPNKTRDYEELIKWLYQSKVKYRFTGYIKMTLRCYYSIAKSNSKKVKEQKRNNVLRPSKKPDIDNVVKIIADSLNEIAYKDDTQIVEVVASKYYSDKPRVEVILEDVI >CP012323.1|AXU66010.1|3666546_3666777_-|gp91 MIHELKILPQYFKEVVNGNKNFEVRKNDRGFKKGDLLVLQEFDGEKYTGLETRKEITYLLDNSNYLQDGYVVLGIK >CP012323.1|AXU66011.1|3666799_3667072_-|hypothetical-protein MVTTQMYKINNEIFLNDLCLEENKEMTIWVEKSKDTHEFIWLKIANVNGKLAIFVQDIEDAVIKEWQSQIAYKKIISQIECEQVEKGEID >CP012323.1|AXU66012.1|3667170_3667344_-|hypothetical-protein MNKCEDCKYRAYEEDGEVYFYSDGSYEGGICREEYCSRGYEKKFENNGENCKSFKKL >CP012323.1|AXU66013.1|3667441_3667624_-|hypothetical-protein MNKRIKMKKGLIHKKCDERCVNYDFVISNNLITCNVCIGCKYKENMDKVCEENYKKLRSK >CP012323.1|AXU66014.1|3667626_3667998_-|hypothetical-protein MFSIYKVKLKTKRTLEQVRNQSVDFEYSEEGLKDALRYYNLIDGLEVIVLKFADEYCLANFNEEDEKTIMEAHYLLEQDEYTGCYINEYERFKRDWENGSCDGEASMVFSDDEIEIIEKLREG >CP012323.1|AXU66015.1|3667990_3668164_-|hypothetical-protein MTNKEMCKSKNLDEREVCKSFGKEICASCINDKGDCESKDCDIAYENWLEKEIVNYV >CP012323.1|AXU66016.1|3668485_3669481_-|phage-protein MIIHKFIIHVLDKNSDTPILNDFEGRVSQDMDLFFQKKISKVSRDSDIRTAVFNDYSNNLIKKCCEQIIYDESSFLNNSKEIASYLFEIMKLNATLESCDLAICLYSQKDEKKVAILKLDYNNSYTHSIEFKDDKFNIQMSKNEINIQETKTVKIAALVGLSGMNNEYHLNVLDKDAEKEEANSKFVTEFLNATKIKDDKYKTKMFKAFVDAYIANLYSDMKQGEDVRSILLYMLREKQNLDINEFADKAIKDDLKDSFKDHAEEKGIESFNIDKKWVEKNLKNRHIKTDTGFEIKGKMDDFEDFMKYGIRHNGNGTVDIVIKNVNFYNEK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012323_10 | 10.6|2764662|37|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2764662-2764698 | 37 | CP012323.1 | 92000-92036 | 0 | 1.0 |
CP012323_16 | 16.8|3565385|18|CP012323|CRT | 3565385-3565402 | 18 | CP012323.1 | 398259-398276 | 1 | 0.944 |
CP012323_16 | 16.6|3565286|27|CP012323|CRT | 3565286-3565312 | 27 | CP012323.1 | 3750593-3750619 | 2 | 0.926 |
CP012323_16 | 16.6|3565286|27|CP012323|CRT | 3565286-3565312 | 27 | CP012323.1 | 3750665-3750691 | 2 | 0.926 |
1. spacer 10.6|2764662|37|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to position: 92000-92036, mismatch: 0, identity: 1.0
cagctcctacaaagtcagcaccagcttgttcagcttc CRISPR spacer cagctcctacaaagtcagcaccagcttgttcagcttc Protospacer *************************************
2. spacer 16.8|3565385|18|CP012323|CRT matches to position: 398259-398276, mismatch: 1, identity: 0.944
cgttgctcccgttgctcc CRISPR spacer cgttgctcccgttggtcc Protospacer ************** ***
3. spacer 16.6|3565286|27|CP012323|CRT matches to position: 3750593-3750619, mismatch: 2, identity: 0.926
agtcgctcctgtatttcctgttggacc CRISPR spacer agttcctcctgtatttcctgttggacc Protospacer ***. **********************
4. spacer 16.6|3565286|27|CP012323|CRT matches to position: 3750665-3750691, mismatch: 2, identity: 0.926
agtcgctcctgtatttcctgttggacc CRISPR spacer agttcctcctgtatttcctgttggacc Protospacer ***. **********************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012323_2 | 2.4|1300836|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1300836-1300872 | 37 | NC_011398 | Clostridium phage phiCD27, complete genome | 18184-18220 | 0 | 1.0 |
CP012323_3 | 3.4|1511117|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1511117-1511153 | 37 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 29922-29958 | 0 | 1.0 |
CP012323_4 | 4.5|1620862|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT | 1620862-1620897 | 36 | NC_011398 | Clostridium phage phiCD27, complete genome | 22207-22242 | 0 | 1.0 |
CP012323_4 | 4.6|1620927|37|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT | 1620927-1620963 | 37 | HG531805 | Clostridium phage CDMH1 complete genome | 45157-45193 | 0 | 1.0 |
CP012323_5 | 5.1|1710501|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1710501-1710538 | 38 | LN681542 | Clostridium phage phiMMP03, complete genome | 50113-50150 | 0 | 1.0 |
CP012323_5 | 5.1|1710501|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1710501-1710538 | 38 | NC_009231 | Clostridium phage phiC2, complete genome | 53651-53688 | 0 | 1.0 |
CP012323_5 | 5.1|1710501|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1710501-1710538 | 38 | LN681541 | Clostridium phage phiMMP01, complete genome | 42313-42350 | 0 | 1.0 |
CP012323_5 | 5.2|1710568|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1710568-1710604 | 37 | MF547662 | Clostridioides phage LIBA6276, complete genome | 75816-75852 | 0 | 1.0 |
CP012323_5 | 5.2|1710568|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1710568-1710604 | 37 | MF547663 | Clostridioides phage LIBA2945, complete genome | 74539-74575 | 0 | 1.0 |
CP012323_5 | 5.3|1710634|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1710634-1710670 | 37 | MF547662 | Clostridioides phage LIBA6276, complete genome | 85584-85620 | 0 | 1.0 |
CP012323_5 | 5.3|1710634|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1710634-1710670 | 37 | MF547663 | Clostridioides phage LIBA2945, complete genome | 84307-84343 | 0 | 1.0 |
CP012323_6 | 6.2|1711531|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1711531-1711567 | 37 | NC_028996 | Clostridium phage phiCDHM19, complete genome | 38312-38348 | 0 | 1.0 |
CP012323_6 | 6.2|1711531|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1711531-1711567 | 37 | LN681541 | Clostridium phage phiMMP01, complete genome | 33821-33857 | 0 | 1.0 |
CP012323_6 | 6.4|1711663|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1711663-1711699 | 37 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 19522-19558 | 0 | 1.0 |
CP012323_6 | 6.4|1711663|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1711663-1711699 | 37 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 879-915 | 0 | 1.0 |
CP012323_6 | 6.4|1711663|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1711663-1711699 | 37 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 907-943 | 0 | 1.0 |
CP012323_8 | 8.4|1844347|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1844347-1844383 | 37 | MF547662 | Clostridioides phage LIBA6276, complete genome | 119456-119492 | 0 | 1.0 |
CP012323_8 | 8.5|1844413|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1844413-1844449 | 37 | HG531805 | Clostridium phage CDMH1 complete genome | 32037-32073 | 0 | 1.0 |
CP012323_8 | 8.7|1844545|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1844545-1844581 | 37 | JX145342 | Clostridium phage phiMMP04, complete genome | 9306-9342 | 0 | 1.0 |
CP012323_10 | 10.4|2764530|38|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2764530-2764567 | 38 | LN681541 | Clostridium phage phiMMP01, complete genome | 26984-27021 | 0 | 1.0 |
CP012323_10 | 10.5|2764597|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2764597-2764632 | 36 | NC_048642 | Clostridium phage CDKM9, complete genome | 18001-18036 | 0 | 1.0 |
CP012323_2 | 2.1|1300639|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1300639-1300675 | 37 | KX905163 | Clostridioides phage phiSemix9P1, complete genome | 4597-4633 | 1 | 0.973 |
CP012323_2 | 2.4|1300836|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1300836-1300872 | 37 | NC_048642 | Clostridium phage CDKM9, complete genome | 18101-18137 | 1 | 0.973 |
CP012323_4 | 4.10|1621189|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT | 1621189-1621224 | 36 | AY855346 | Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome | 20150-20185 | 1 | 0.972 |
CP012323_4 | 4.10|1621189|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT | 1621189-1621224 | 36 | NC_007917 | Clostridium phage phi CD119, complete genome | 20150-20185 | 1 | 0.972 |
CP012323_4 | 4.10|1621189|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT | 1621189-1621224 | 36 | NC_028996 | Clostridium phage phiCDHM19, complete genome | 20404-20439 | 1 | 0.972 |
CP012323_4 | 4.10|1621189|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT | 1621189-1621224 | 36 | NC_028838 | Clostridium phage phiCD506, complete genome | 13735-13770 | 1 | 0.972 |
CP012323_4 | 4.10|1621189|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT | 1621189-1621224 | 36 | LN681538 | Clostridium phage phiCD481-1, complete genome | 13762-13797 | 1 | 0.972 |
CP012323_5 | 5.3|1710634|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1710634-1710670 | 37 | NZ_CP029155 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence | 124235-124271 | 1 | 0.973 |
CP012323_6 | 6.3|1711597|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1711597-1711633 | 37 | NZ_MG019959 | Clostridioides difficile isolate ERR017368_NODE12 plasmid pCD-WTSI1, complete sequence | 383-419 | 1 | 0.973 |
CP012323_6 | 6.3|1711597|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1711597-1711633 | 37 | NZ_MG019961 | Clostridioides difficile isolate ERR125910_NODE5 plasmid pCD-WTSI3, complete sequence | 387-423 | 1 | 0.973 |
CP012323_6 | 6.3|1711597|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1711597-1711633 | 37 | NZ_MG019962 | Clostridioides difficile isolate ERR125911_NODE11 plasmid pCD-WTSI4, complete sequence | 383-419 | 1 | 0.973 |
CP012323_6 | 6.3|1711597|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1711597-1711633 | 37 | NZ_MG019960 | Clostridioides difficile isolate ERR022513_NODE32 plasmid pCD-WTSI2, complete sequence | 383-419 | 1 | 0.973 |
CP012323_6 | 6.4|1711663|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1711663-1711699 | 37 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 907-943 | 1 | 0.973 |
CP012323_8 | 8.2|1844215|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1844215-1844251 | 37 | NZ_CP020426 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence | 2845-2881 | 1 | 0.973 |
CP012323_8 | 8.2|1844215|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1844215-1844251 | 37 | CP011970 | Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence | 119119-119155 | 1 | 0.973 |
CP012323_8 | 8.2|1844215|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1844215-1844251 | 37 | LN681537 | Clostridium phage phiCD211, complete genome | 127981-128017 | 1 | 0.973 |
CP012323_8 | 8.3|1844281|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1844281-1844317 | 37 | LN681539 | Clostridium phage phiCD505, complete genome | 44829-44865 | 1 | 0.973 |
CP012323_8 | 8.3|1844281|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1844281-1844317 | 37 | LN681542 | Clostridium phage phiMMP03, complete genome | 46622-46658 | 1 | 0.973 |
CP012323_8 | 8.3|1844281|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1844281-1844317 | 37 | NC_009231 | Clostridium phage phiC2, complete genome | 50160-50196 | 1 | 0.973 |
CP012323_8 | 8.3|1844281|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1844281-1844317 | 37 | NC_011398 | Clostridium phage phiCD27, complete genome | 44126-44162 | 1 | 0.973 |
CP012323_10 | 10.5|2764597|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2764597-2764632 | 36 | LN681539 | Clostridium phage phiCD505, complete genome | 18063-18098 | 1 | 0.972 |
CP012323_10 | 10.5|2764597|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2764597-2764632 | 36 | JX145341 | Clostridium phage phiMMP02, complete genome | 17969-18004 | 1 | 0.972 |
CP012323_4 | 4.3|1620728|38|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT | 1620728-1620765 | 38 | NC_048665 | Clostridium phage phiCDHM14, complete genome | 23559-23596 | 2 | 0.947 |
CP012323_4 | 4.3|1620728|38|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT | 1620728-1620765 | 38 | HG796225 | Clostridium phage phiCDHM13 complete genome | 23060-23097 | 2 | 0.947 |
CP012323_4 | 4.3|1620728|38|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT | 1620728-1620765 | 38 | LN681538 | Clostridium phage phiCD481-1, complete genome | 22799-22836 | 2 | 0.947 |
CP012323_4 | 4.3|1620728|38|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT | 1620728-1620765 | 38 | HG798901 | Clostridium phage phiCDHM11 complete genome | 23059-23096 | 2 | 0.947 |
CP012323_4 | 4.7|1620993|37|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT | 1620993-1621029 | 37 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 27126-27162 | 2 | 0.946 |
CP012323_4 | 4.10|1621189|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT | 1621189-1621224 | 36 | NC_048665 | Clostridium phage phiCDHM14, complete genome | 13309-13344 | 2 | 0.944 |
CP012323_4 | 4.10|1621189|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT | 1621189-1621224 | 36 | MK473382 | Clostridium phage JD032, complete genome | 21368-21403 | 2 | 0.944 |
CP012323_4 | 4.10|1621189|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT | 1621189-1621224 | 36 | HG796225 | Clostridium phage phiCDHM13 complete genome | 13277-13312 | 2 | 0.944 |
CP012323_4 | 4.10|1621189|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT | 1621189-1621224 | 36 | HG798901 | Clostridium phage phiCDHM11 complete genome | 13276-13311 | 2 | 0.944 |
CP012323_4 | 4.11|1621254|38|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT | 1621254-1621291 | 38 | NZ_MG973074 | Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence | 94861-94898 | 2 | 0.947 |
CP012323_5 | 5.1|1710501|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1710501-1710538 | 38 | AY855346 | Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome | 49569-49606 | 2 | 0.947 |
CP012323_5 | 5.1|1710501|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1710501-1710538 | 38 | NC_007917 | Clostridium phage phi CD119, complete genome | 49569-49606 | 2 | 0.947 |
CP012323_5 | 5.1|1710501|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1710501-1710538 | 38 | LN681539 | Clostridium phage phiCD505, complete genome | 48376-48413 | 2 | 0.947 |
CP012323_5 | 5.1|1710501|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1710501-1710538 | 38 | NC_028996 | Clostridium phage phiCDHM19, complete genome | 50774-50811 | 2 | 0.947 |
CP012323_5 | 5.1|1710501|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1710501-1710538 | 38 | HG531805 | Clostridium phage CDMH1 complete genome | 51098-51135 | 2 | 0.947 |
CP012323_5 | 5.1|1710501|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1710501-1710538 | 38 | JX145341 | Clostridium phage phiMMP02, complete genome | 47455-47492 | 2 | 0.947 |
CP012323_5 | 5.1|1710501|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1710501-1710538 | 38 | NC_011398 | Clostridium phage phiCD27, complete genome | 49981-50018 | 2 | 0.947 |
CP012323_5 | 5.1|1710501|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1710501-1710538 | 38 | NC_048642 | Clostridium phage CDKM9, complete genome | 48820-48857 | 2 | 0.947 |
CP012323_10 | 10.5|2764597|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2764597-2764632 | 36 | KX228400 | Clostridium phage CDKM15, complete genome | 21206-21241 | 2 | 0.944 |
CP012323_16 | 16.5|3565232|27|CP012323|CRT | 3565232-3565258 | 27 | NZ_CP014284 | Bacillus thuringiensis strain Bt185 plasmid pBT1850294, complete sequence | 179101-179127 | 2 | 0.926 |
CP012323_16 | 16.5|3565232|27|CP012323|CRT | 3565232-3565258 | 27 | NZ_CP032609 | Bacillus thuringiensis strain QZL38 plasmid p.2, complete sequence | 271002-271028 | 2 | 0.926 |
CP012323_2 | 2.4|1300836|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1300836-1300872 | 37 | JX145341 | Clostridium phage phiMMP02, complete genome | 18069-18105 | 3 | 0.919 |
CP012323_5 | 5.4|1710700|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1710700-1710737 | 38 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 7234-7271 | 3 | 0.921 |
CP012323_5 | 5.4|1710700|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1710700-1710737 | 38 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 13166-13203 | 3 | 0.921 |
CP012323_5 | 5.4|1710700|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1710700-1710737 | 38 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 7263-7300 | 3 | 0.921 |
CP012323_8 | 8.8|1844611|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1844611-1844648 | 38 | NZ_MF547664 | Clostridioides difficile strain LIBA-6289 plasmid LIBA6289, complete sequence | 26432-26469 | 3 | 0.921 |
CP012323_6 | 6.7|1711861|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1711861-1711897 | 37 | AY855346 | Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome | 6235-6271 | 4 | 0.892 |
CP012323_6 | 6.7|1711861|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1711861-1711897 | 37 | NC_007917 | Clostridium phage phi CD119, complete genome | 6235-6271 | 4 | 0.892 |
CP012323_6 | 6.7|1711861|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1711861-1711897 | 37 | NC_028996 | Clostridium phage phiCDHM19, complete genome | 6483-6519 | 4 | 0.892 |
CP012323_16 | 16.5|3565232|27|CP012323|CRT | 3565232-3565258 | 27 | CP011076 | Brevibacillus laterosporus strain B9 plasmid unnamed2, complete sequence | 251926-251952 | 5 | 0.815 |
CP012323_16 | 16.5|3565232|27|CP012323|CRT | 3565232-3565258 | 27 | CP011076 | Brevibacillus laterosporus strain B9 plasmid unnamed2, complete sequence | 251953-251979 | 5 | 0.815 |
CP012323_16 | 16.6|3565286|27|CP012323|CRT | 3565286-3565312 | 27 | MN694018 | Marine virus AFVG_250M586, complete genome | 31615-31641 | 5 | 0.815 |
CP012323_16 | 16.6|3565286|27|CP012323|CRT | 3565286-3565312 | 27 | MN694665 | Marine virus AFVG_250M495, complete genome | 19246-19272 | 5 | 0.815 |
CP012323_3 | 3.1|1510918|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1510918-1510954 | 37 | MK448896 | Streptococcus phage Javan278, complete genome | 401-437 | 6 | 0.838 |
CP012323_16 | 16.5|3565232|27|CP012323|CRT | 3565232-3565258 | 27 | MN694581 | Marine virus AFVG_250M102, complete genome | 9343-9369 | 6 | 0.778 |
CP012323_16 | 16.5|3565232|27|CP012323|CRT | 3565232-3565258 | 27 | MN694664 | Marine virus AFVG_250M101, complete genome | 9438-9464 | 7 | 0.741 |
CP012323_16 | 16.5|3565232|27|CP012323|CRT | 3565232-3565258 | 27 | MN694569 | Marine virus AFVG_250M103, complete genome | 9343-9369 | 7 | 0.741 |
CP012323_16 | 16.5|3565232|27|CP012323|CRT | 3565232-3565258 | 27 | MN693796 | Marine virus AFVG_250M93, complete genome | 33331-33357 | 7 | 0.741 |
CP012323_10 | 10.1|2764332|37|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT | 2764332-2764368 | 37 | NZ_CP014325 | Borrelia anserina Es isolate UTHSCSA plasmid lpA89, complete sequence | 55630-55666 | 8 | 0.784 |
CP012323_3 | 3.5|1511183|36|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1511183-1511218 | 36 | NZ_MG973074 | Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence | 75030-75065 | 9 | 0.75 |
CP012323_3 | 3.5|1511183|36|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1511183-1511218 | 36 | MT028491 | Ochrobactrum phage vB_OspM_OC, complete genome | 110440-110475 | 9 | 0.75 |
CP012323_10 | 10.1|2764332|37|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT | 2764332-2764368 | 37 | NZ_CP037437 | Lactobacillus plantarum strain EM plasmid pEM8, complete sequence | 21201-21237 | 9 | 0.757 |
CP012323_15 | 15.1|3161784|31|CP012323|CRISPRCasFinder | 3161784-3161814 | 31 | LR606148 | Rhizobium sp. Q54 genome assembly, plasmid: 5 | 444883-444913 | 9 | 0.71 |
CP012323_10 | 10.5|2764597|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2764597-2764632 | 36 | NZ_CP015807 | Borrelia mayonii strain MN14-1539 plasmid lp28-4 | 2136-2171 | 10 | 0.722 |
CP012323_10 | 10.5|2764597|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2764597-2764632 | 36 | NZ_CP015792 | Borrelia mayonii strain MN14-1420 plasmid lp28-4, complete sequence | 2136-2171 | 10 | 0.722 |
CP012323_9 | 9.3|2674500|37|CP012323|PILER-CR | 2674500-2674536 | 37 | NC_025449 | Escherichia phage ECML-134, complete genome | 64499-64535 | 11 | 0.703 |
CP012323_9 | 9.3|2674500|37|CP012323|PILER-CR | 2674500-2674536 | 37 | KM607002 | Enterobacteria phage RB55, complete genome | 68097-68133 | 11 | 0.703 |
CP012323_9 | 9.3|2674500|37|CP012323|PILER-CR | 2674500-2674536 | 37 | KJ477684 | Enterobacteria phage T4 strain wild, complete genome | 68134-68170 | 11 | 0.703 |
CP012323_9 | 9.3|2674500|37|CP012323|PILER-CR | 2674500-2674536 | 37 | HM137666 | Enterobacteria phage T4T, complete genome | 68133-68169 | 11 | 0.703 |
CP012323_9 | 9.3|2674500|37|CP012323|PILER-CR | 2674500-2674536 | 37 | NC_000866 | Enterobacteria phage T4, complete genome | 68154-68190 | 11 | 0.703 |
CP012323_9 | 9.3|2674500|37|CP012323|PILER-CR | 2674500-2674536 | 37 | L13089 | Bacteriophage T4 msp1-msp8 genes, complete cds's | 2697-2733 | 11 | 0.703 |
CP012323_9 | 9.3|2674500|37|CP012323|PILER-CR | 2674500-2674536 | 37 | KJ477686 | Enterobacteria phage T4 strain GT7, complete genome | 68132-68168 | 11 | 0.703 |
CP012323_9 | 9.3|2674500|37|CP012323|PILER-CR | 2674500-2674536 | 37 | X57093 | Bacteriophage T4 orfs between tRNA and e genes | 238-274 | 11 | 0.703 |
CP012323_9 | 9.3|2674500|37|CP012323|PILER-CR | 2674500-2674536 | 37 | KJ477685 | Enterobacteria phage T4 strain 147, complete genome | 66027-66063 | 11 | 0.703 |
CP012323_9 | 9.3|2674500|37|CP012323|PILER-CR | 2674500-2674536 | 37 | KM607003 | Enterobacteria phage RB59, complete genome | 68110-68146 | 11 | 0.703 |
1. spacer 2.4|1300836|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatgtgattaaaaaaggacaaaagttggtgataccta CRISPR spacer aatgtgattaaaaaaggacaaaagttggtgataccta Protospacer *************************************
2. spacer 3.4|1511117|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attcctagggtcgtttttttttaaaaattctatcatt CRISPR spacer attcctagggtcgtttttttttaaaaattctatcatt Protospacer *************************************
3. spacer 4.5|1620862|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttggaaataagtataaagacagtgatatggaaatgg CRISPR spacer ttggaaataagtataaagacagtgatatggaaatgg Protospacer ************************************
4. spacer 4.6|1620927|37|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT matches to HG531805 (Clostridium phage CDMH1 complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tatccatttcatatttagataaaatctctttaaatgc CRISPR spacer tatccatttcatatttagataaaatctctttaaatgc Protospacer *************************************
5. spacer 5.1|1710501|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681542 (Clostridium phage phiMMP03, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtacctgcatggtgagtgaggttaccaagccccacccg CRISPR spacer gtacctgcatggtgagtgaggttaccaagccccacccg Protospacer **************************************
6. spacer 5.1|1710501|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009231 (Clostridium phage phiC2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtacctgcatggtgagtgaggttaccaagccccacccg CRISPR spacer gtacctgcatggtgagtgaggttaccaagccccacccg Protospacer **************************************
7. spacer 5.1|1710501|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681541 (Clostridium phage phiMMP01, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtacctgcatggtgagtgaggttaccaagccccacccg CRISPR spacer gtacctgcatggtgagtgaggttaccaagccccacccg Protospacer **************************************
8. spacer 5.2|1710568|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctaggtcttaaacttgcatttactaaagacatatcat CRISPR spacer ctaggtcttaaacttgcatttactaaagacatatcat Protospacer *************************************
9. spacer 5.2|1710568|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctaggtcttaaacttgcatttactaaagacatatcat CRISPR spacer ctaggtcttaaacttgcatttactaaagacatatcat Protospacer *************************************
10. spacer 5.3|1710634|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tatttactattttcacagtttaaagaagtatagtaac CRISPR spacer tatttactattttcacagtttaaagaagtatagtaac Protospacer *************************************
11. spacer 5.3|1710634|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tatttactattttcacagtttaaagaagtatagtaac CRISPR spacer tatttactattttcacagtttaaagaagtatagtaac Protospacer *************************************
12. spacer 6.2|1711531|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatgcagaaaaatttgaaagttgggtatttgatgaag CRISPR spacer aatgcagaaaaatttgaaagttgggtatttgatgaag Protospacer *************************************
13. spacer 6.2|1711531|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681541 (Clostridium phage phiMMP01, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatgcagaaaaatttgaaagttgggtatttgatgaag CRISPR spacer aatgcagaaaaatttgaaagttgggtatttgatgaag Protospacer *************************************
14. spacer 6.4|1711663|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atgttcaattttgcatttgcacttgtagaccctgttg CRISPR spacer atgttcaattttgcatttgcacttgtagaccctgttg Protospacer *************************************
15. spacer 6.4|1711663|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atgttcaattttgcatttgcacttgtagaccctgttg CRISPR spacer atgttcaattttgcatttgcacttgtagaccctgttg Protospacer *************************************
16. spacer 6.4|1711663|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atgttcaattttgcatttgcacttgtagaccctgttg CRISPR spacer atgttcaattttgcatttgcacttgtagaccctgttg Protospacer *************************************
17. spacer 8.4|1844347|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtaatgttaaatggtatgttagcaggatttgaacaat CRISPR spacer gtaatgttaaatggtatgttagcaggatttgaacaat Protospacer *************************************
18. spacer 8.5|1844413|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG531805 (Clostridium phage CDMH1 complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
taacttttctgttttatcttgccagtcatttcttcta CRISPR spacer taacttttctgttttatcttgccagtcatttcttcta Protospacer *************************************
19. spacer 8.7|1844545|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JX145342 (Clostridium phage phiMMP04, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctttctgcaagcttattagctccaccattatacattg CRISPR spacer ctttctgcaagcttattagctccaccattatacattg Protospacer *************************************
20. spacer 10.4|2764530|38|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LN681541 (Clostridium phage phiMMP01, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tgttataatttatatgtaaggaactaaatatctaagag CRISPR spacer tgttataatttatatgtaaggaactaaatatctaagag Protospacer **************************************
21. spacer 10.5|2764597|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_048642 (Clostridium phage CDKM9, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tacattatataagatagctaaaaatcttttaggcaa CRISPR spacer tacattatataagatagctaaaaatcttttaggcaa Protospacer ************************************
22. spacer 2.1|1300639|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX905163 (Clostridioides phage phiSemix9P1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
aaagtttctatggatggtttaggggattatgatagat CRISPR spacer aaagtgtctatggatggtttaggggattatgatagat Protospacer ***** *******************************
23. spacer 2.4|1300836|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048642 (Clostridium phage CDKM9, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
aatgtgattaaaaaaggacaaaagttggtgataccta CRISPR spacer aatgtgattaaaaaaggacaaaagttggtgatacctt Protospacer ************************************
24. spacer 4.10|1621189|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tatatattagatgtcaatgtcaaggatacaaaattt CRISPR spacer tatatattagatgtcaatatcaaggatacaaaattt Protospacer ******************.*****************
25. spacer 4.10|1621189|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tatatattagatgtcaatgtcaaggatacaaaattt CRISPR spacer tatatattagatgtcaatatcaaggatacaaaattt Protospacer ******************.*****************
26. spacer 4.10|1621189|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tatatattagatgtcaatgtcaaggatacaaaattt CRISPR spacer tatatattagatgtcaatatcaaggatacaaaattt Protospacer ******************.*****************
27. spacer 4.10|1621189|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028838 (Clostridium phage phiCD506, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tatatattagatgtcaatgtcaaggatacaaaattt CRISPR spacer tatatattagatgtcaatatcaaggatacaaaattt Protospacer ******************.*****************
28. spacer 4.10|1621189|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681538 (Clostridium phage phiCD481-1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tatatattagatgtcaatgtcaaggatacaaaattt CRISPR spacer tatatattagatgtcaatatcaaggatacaaaattt Protospacer ******************.*****************
29. spacer 5.3|1710634|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029155 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
tatttactattttcacagtttaaagaagtatagtaac CRISPR spacer tattcactattttcacagtttaaagaagtatagtaac Protospacer ****.********************************
30. spacer 6.3|1711597|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG019959 (Clostridioides difficile isolate ERR017368_NODE12 plasmid pCD-WTSI1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
actccaaaattgaagtttataaaattgtaagtataag CRISPR spacer actccaaaattgaagtttatataattgtaagtataag Protospacer ********************* ***************
31. spacer 6.3|1711597|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG019961 (Clostridioides difficile isolate ERR125910_NODE5 plasmid pCD-WTSI3, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
actccaaaattgaagtttataaaattgtaagtataag CRISPR spacer actccaaaattgaagtttatataattgtaagtataag Protospacer ********************* ***************
32. spacer 6.3|1711597|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG019962 (Clostridioides difficile isolate ERR125911_NODE11 plasmid pCD-WTSI4, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
actccaaaattgaagtttataaaattgtaagtataag CRISPR spacer actccaaaattgaagtttatataattgtaagtataag Protospacer ********************* ***************
33. spacer 6.3|1711597|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG019960 (Clostridioides difficile isolate ERR022513_NODE32 plasmid pCD-WTSI2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
actccaaaattgaagtttataaaattgtaagtataag CRISPR spacer actccaaaattgaagtttatataattgtaagtataag Protospacer ********************* ***************
34. spacer 6.4|1711663|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
atgttcaattttgcatttgcacttgtagaccctgttg CRISPR spacer atattcaattttgcatttgcacttgtagaccctgttg Protospacer **.**********************************
35. spacer 8.2|1844215|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020426 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
aaaaataaaaccgaaaaatcgttgacaatatccgttt CRISPR spacer aataataaaaccgaaaaatcgttgacaatatccgttt Protospacer ** **********************************
36. spacer 8.2|1844215|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP011970 (Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
aaaaataaaaccgaaaaatcgttgacaatatccgttt CRISPR spacer aataataaaaccgaaaaatcgttgacaatatccgttt Protospacer ** **********************************
37. spacer 8.2|1844215|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681537 (Clostridium phage phiCD211, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
aaaaataaaaccgaaaaatcgttgacaatatccgttt CRISPR spacer aataataaaaccgaaaaatcgttgacaatatccgttt Protospacer ** **********************************
38. spacer 8.3|1844281|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681539 (Clostridium phage phiCD505, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
ctttataaagtaaaagcatatgtaggtgataacaata CRISPR spacer ctttataaagtaaaagcatatgtaggtgataacgata Protospacer *********************************.***
39. spacer 8.3|1844281|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681542 (Clostridium phage phiMMP03, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
ctttataaagtaaaagcatatgtaggtgataacaata CRISPR spacer ctttataaagtaaaagcatatgtaggtgataacgata Protospacer *********************************.***
40. spacer 8.3|1844281|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009231 (Clostridium phage phiC2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
ctttataaagtaaaagcatatgtaggtgataacaata CRISPR spacer ctttataaagtaaaagcatatgtaggtgataacgata Protospacer *********************************.***
41. spacer 8.3|1844281|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
ctttataaagtaaaagcatatgtaggtgataacaata CRISPR spacer ctttataaagtaaaagcatatgtaggtgataacgata Protospacer *********************************.***
42. spacer 10.5|2764597|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LN681539 (Clostridium phage phiCD505, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tacattatataagatagctaaaaatcttttaggcaa CRISPR spacer tacattatataagatagctaaaaatcttttaggtaa Protospacer *********************************.**
43. spacer 10.5|2764597|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tacattatataagatagctaaaaatcttttaggcaa CRISPR spacer tacattatataagatagctaaaaatcttttaggtaa Protospacer *********************************.**
44. spacer 4.3|1620728|38|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048665 (Clostridium phage phiCDHM14, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
ctcttacgcttttcaatcactttttccttgctaaaatt CRISPR spacer cccttacgcttttcaatcattttttccttgctaaaatt Protospacer *.*****************.******************
45. spacer 4.3|1620728|38|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT matches to HG796225 (Clostridium phage phiCDHM13 complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
ctcttacgcttttcaatcactttttccttgctaaaatt CRISPR spacer cccttacgcttttcaatcattttttccttgctaaaatt Protospacer *.*****************.******************
46. spacer 4.3|1620728|38|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681538 (Clostridium phage phiCD481-1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
ctcttacgcttttcaatcactttttccttgctaaaatt CRISPR spacer cccttacgcttttcaatcattttttccttgctaaaatt Protospacer *.*****************.******************
47. spacer 4.3|1620728|38|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT matches to HG798901 (Clostridium phage phiCDHM11 complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
ctcttacgcttttcaatcactttttccttgctaaaatt CRISPR spacer cccttacgcttttcaatcattttttccttgctaaaatt Protospacer *.*****************.******************
48. spacer 4.7|1620993|37|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
atgttattacataaaaattcttcatctataactttaa CRISPR spacer atattattacataaaaattcttcgtctataactttaa Protospacer **.********************.*************
49. spacer 4.10|1621189|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048665 (Clostridium phage phiCDHM14, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
tatatattagatgtcaatgtcaaggatacaaaattt CRISPR spacer tatatattagatatcaatgtcaagaatacaaaattt Protospacer ************.***********.***********
50. spacer 4.10|1621189|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK473382 (Clostridium phage JD032, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
tatatattagatgtcaatgtcaaggatacaaaattt CRISPR spacer tatatattagatatcaatgtcaagaatacaaaattt Protospacer ************.***********.***********
51. spacer 4.10|1621189|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT matches to HG796225 (Clostridium phage phiCDHM13 complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
tatatattagatgtcaatgtcaaggatacaaaattt CRISPR spacer tatatattagatatcaatgtcaagaatacaaaattt Protospacer ************.***********.***********
52. spacer 4.10|1621189|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT matches to HG798901 (Clostridium phage phiCDHM11 complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
tatatattagatgtcaatgtcaaggatacaaaattt CRISPR spacer tatatattagatatcaatgtcaagaatacaaaattt Protospacer ************.***********.***********
53. spacer 4.11|1621254|38|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG973074 (Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
ccatcttttgttgctttacataaatttatattacttac CRISPR spacer ccatcttttgttgctttgcatagatttatattacttac Protospacer *****************.****.***************
54. spacer 5.1|1710501|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
gtacctgcatggtgagtgaggttaccaagccccacccg CRISPR spacer gcacctgcatggtgagtgaggttaccaagccccactcg Protospacer *.*********************************.**
55. spacer 5.1|1710501|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
gtacctgcatggtgagtgaggttaccaagccccacccg CRISPR spacer gcacctgcatggtgagtgaggttaccaagccccactcg Protospacer *.*********************************.**
56. spacer 5.1|1710501|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681539 (Clostridium phage phiCD505, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
gtacctgcatggtgagtgaggttaccaagccccacccg CRISPR spacer gtacttgcatggtgagtgaggttaccaagccccactcg Protospacer ****.******************************.**
57. spacer 5.1|1710501|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
gtacctgcatggtgagtgaggttaccaagccccacccg CRISPR spacer gcacctgcatggtgagtgaggttaccaagccccactcg Protospacer *.*********************************.**
58. spacer 5.1|1710501|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG531805 (Clostridium phage CDMH1 complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
gtacctgcatggtgagtgaggttaccaagccccacccg CRISPR spacer gtacttgcatggtgagtgaggttaccaagccccactcg Protospacer ****.******************************.**
59. spacer 5.1|1710501|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
gtacctgcatggtgagtgaggttaccaagccccacccg CRISPR spacer gtacttgcatggtgagtgaggttaccaagccccactcg Protospacer ****.******************************.**
60. spacer 5.1|1710501|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
gtacctgcatggtgagtgaggttaccaagccccacccg CRISPR spacer gtacttgcatggtgagtgaggttaccaagccccactcg Protospacer ****.******************************.**
61. spacer 5.1|1710501|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048642 (Clostridium phage CDKM9, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
gtacctgcatggtgagtgaggttaccaagccccacccg CRISPR spacer gtacttgcatggtgagtgaggttaccaagccccactcg Protospacer ****.******************************.**
62. spacer 10.5|2764597|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KX228400 (Clostridium phage CDKM15, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
tacattatataagatagctaaaaatcttttaggcaa CRISPR spacer tacattatataagatagctaaaaatctcttaggtaa Protospacer ***************************.*****.**
63. spacer 16.5|3565232|27|CP012323|CRT matches to NZ_CP014284 (Bacillus thuringiensis strain Bt185 plasmid pBT1850294, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.926
agttgctccggttgctcctgtatttcc CRISPR spacer ggttgctccggtggctcctgtatttcc Protospacer .*********** **************
64. spacer 16.5|3565232|27|CP012323|CRT matches to NZ_CP032609 (Bacillus thuringiensis strain QZL38 plasmid p.2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.926
agttgctccggttgctcctgtatttcc CRISPR spacer ggttgctccggtggctcctgtatttcc Protospacer .*********** **************
65. spacer 2.4|1300836|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
aatgtgattaaaaaaggacaaaagttggtgataccta CRISPR spacer aatataattaaaaaaggacaaaagttggtgatacctt Protospacer ***.*.******************************
66. spacer 5.4|1710700|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
atcgccttccagattacttttgtatatgaggtcagcaa CRISPR spacer gtcgccttccaggttacttttatatatgaggtcagcaa Protospacer .***********.********.****************
67. spacer 5.4|1710700|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
atcgccttccagattacttttgtatatgaggtcagcaa CRISPR spacer gtcgccttccaggttacttttatatatgaggtcagcaa Protospacer .***********.********.****************
68. spacer 5.4|1710700|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
atcgccttccagattacttttgtatatgaggtcagcaa CRISPR spacer gtcgccttccaggttacttttatatatgaggtcagcaa Protospacer .***********.********.****************
69. spacer 8.8|1844611|38|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF547664 (Clostridioides difficile strain LIBA-6289 plasmid LIBA6289, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
tttataacctttaattacacctcccatatcactaccac CRISPR spacer cttgtaacctttaattacacctcccatatcaccaccac Protospacer .**.****************************.*****
70. spacer 6.7|1711861|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.892
actaaaggagtttctttgttctttatgctctacaact CRISPR spacer actgtgagagtttctttgttctttatgctctacaact Protospacer ***. ..******************************
71. spacer 6.7|1711861|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.892
actaaaggagtttctttgttctttatgctctacaact CRISPR spacer actgtgagagtttctttgttctttatgctctacaact Protospacer ***. ..******************************
72. spacer 6.7|1711861|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.892
actaaaggagtttctttgttctttatgctctacaact CRISPR spacer actgtgagagtttctttgttctttatgctctacaact Protospacer ***. ..******************************
73. spacer 16.5|3565232|27|CP012323|CRT matches to CP011076 (Brevibacillus laterosporus strain B9 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
agttgctccggttgctcctgtatttcc CRISPR spacer agttgctccggttgctccggttgcccc Protospacer ****************** ** ..**
74. spacer 16.5|3565232|27|CP012323|CRT matches to CP011076 (Brevibacillus laterosporus strain B9 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
agttgctccggttgctcctgtatttcc CRISPR spacer ggttgctccggttgctcctgctcctcc Protospacer .*******************. ..***
75. spacer 16.6|3565286|27|CP012323|CRT matches to MN694018 (Marine virus AFVG_250M586, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
agtcgctcctgtatttcctgttggacc CRISPR spacer gctcgctcctgtatcgcctgttggact Protospacer . ************. **********.
76. spacer 16.6|3565286|27|CP012323|CRT matches to MN694665 (Marine virus AFVG_250M495, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
agtcgctcctgtatttcctgttggacc CRISPR spacer cgatgctcctgtacttcctgttgaacc Protospacer * .*********.*********.***
77. spacer 3.1|1510918|37|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448896 (Streptococcus phage Javan278, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.838
-tgattttgtattttaaaaacgaagttttcaaagttgt CRISPR spacer atgacattg-attttaaaaaccaagttttcagagttga Protospacer ***. *** *********** *********.*****
78. spacer 16.5|3565232|27|CP012323|CRT matches to MN694581 (Marine virus AFVG_250M102, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
agttgctccggttgctcctgtatttcc CRISPR spacer ggttgctccggttgctcgtgtaactgg Protospacer .**************** **** .*
79. spacer 16.5|3565232|27|CP012323|CRT matches to MN694664 (Marine virus AFVG_250M101, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.741
agttgctccggttgctcctgtatttcc CRISPR spacer ggttgctccggttgctcgtgtaaccgg Protospacer .**************** **** ..
80. spacer 16.5|3565232|27|CP012323|CRT matches to MN694569 (Marine virus AFVG_250M103, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.741
agttgctccggttgctcctgtatttcc CRISPR spacer ggttgctccggttgctcgtgtaaccgg Protospacer .**************** **** ..
81. spacer 16.5|3565232|27|CP012323|CRT matches to MN693796 (Marine virus AFVG_250M93, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.741
agttgctccggttgctcctgtatttcc CRISPR spacer ggttgctccggttgctcgtgtaaccgg Protospacer .**************** **** ..
82. spacer 10.1|2764332|37|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014325 (Borrelia anserina Es isolate UTHSCSA plasmid lpA89, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
cttaaagctac---ataataaaaaattaagaaaaagaaaa CRISPR spacer ---aaacttatgagataataaaaacttaacaaaaagaaaa Protospacer *** .**. ********** **** **********
83. spacer 3.5|1511183|36|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG973074 (Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
aattttatatttaaataatctaaattctcagttata CRISPR spacer cattttatttttaaataatttaaattctcgatagct Protospacer ******* **********.*********..* ..
84. spacer 3.5|1511183|36|CP012323|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT028491 (Ochrobactrum phage vB_OspM_OC, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
aattttatatttaaataatctaaatt--ctcagttata CRISPR spacer aaatttatatttaaagaatctaaattaagcaagcga-- Protospacer ** ************ ********** . **. *
85. spacer 10.1|2764332|37|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP037437 (Lactobacillus plantarum strain EM plasmid pEM8, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
cttaaagct------acataataaaaaattaagaaaaagaaaa CRISPR spacer ------gcttgttagatataataaaaaatcaataaaaagaaaa Protospacer *** *.************.** **********
86. spacer 15.1|3161784|31|CP012323|CRISPRCasFinder matches to LR606148 (Rhizobium sp. Q54 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
cactatctctggtattggcggatttatcata CRISPR spacer cgagcaacttggtattggcggatttatgata Protospacer *. ..****************** ***
87. spacer 10.5|2764597|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP015807 (Borrelia mayonii strain MN14-1539 plasmid lp28-4) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
tacattatataagatagctaaaaatcttttaggcaa CRISPR spacer ataaatatataaaatagctaaaaatcatttatcaat Protospacer * *******.************* **** *
88. spacer 10.5|2764597|36|CP012323|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP015792 (Borrelia mayonii strain MN14-1420 plasmid lp28-4, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
tacattatataagatagctaaaaatcttttaggcaa CRISPR spacer ataaatatataaaatagctaaaaatcatttatcaat Protospacer * *******.************* **** *
89. spacer 9.3|2674500|37|CP012323|PILER-CR matches to NC_025449 (Escherichia phage ECML-134, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
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90. spacer 9.3|2674500|37|CP012323|PILER-CR matches to KM607002 (Enterobacteria phage RB55, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
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91. spacer 9.3|2674500|37|CP012323|PILER-CR matches to KJ477684 (Enterobacteria phage T4 strain wild, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
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92. spacer 9.3|2674500|37|CP012323|PILER-CR matches to HM137666 (Enterobacteria phage T4T, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
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93. spacer 9.3|2674500|37|CP012323|PILER-CR matches to NC_000866 (Enterobacteria phage T4, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
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94. spacer 9.3|2674500|37|CP012323|PILER-CR matches to L13089 (Bacteriophage T4 msp1-msp8 genes, complete cds's) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
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95. spacer 9.3|2674500|37|CP012323|PILER-CR matches to KJ477686 (Enterobacteria phage T4 strain GT7, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
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96. spacer 9.3|2674500|37|CP012323|PILER-CR matches to X57093 (Bacteriophage T4 orfs between tRNA and e genes) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
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97. spacer 9.3|2674500|37|CP012323|PILER-CR matches to KJ477685 (Enterobacteria phage T4 strain 147, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
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98. spacer 9.3|2674500|37|CP012323|PILER-CR matches to KM607003 (Enterobacteria phage RB59, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
276837 : 288633
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP012323|276837:288633|DBSCAN-SWA ATTATCTATTTTTATATACATTTCTATGTATTTTATTTTTATCAAATCGGTCTATAAATTCATTTTTTTCTTCACTATATCCAATAGATATAAGTGCATAAGGAACTAATTTTACTGGTAAGTCTAAAGTTTGTCTAACTTTATTTACTACTTTATTTTTAGGAAATACTCCTGCCCAACAAGCAGCTAGACCTTGATTAGTAACTTCTAATAATAAATTTTGTGTGCAAGCACCTAAATCTTGTATCCACTTACCAGGTTTTAAGAATTTATCTCTATTTCCAAGCACTACTATACATAATGGTGCAAACTCTACATGCTTTGCTCTATGCTGTGACTTTGAGAGCTCTTTCAGTAGTTCCTTATCATCTACTATAATAAATTCCCAAGGCTGAGCGTTTTTTGATGAAGGTGCTTGCATAGCTGACTTTAGTATTTCAGTTATTTTCTCTTCTTCTATATTTTTATCTTTATATGTTCTTATTGAACGTCTATTTTTTATAACTTCTAACATACAGATTCTCCTTTAAATAAAATTATTTCTATTTATATAATATCATTACTTTAAATTTTAGCTATTACTTATATAAAGAATAAACTTTGTATTGGTTTTATCTAAGTAAAGCTAACATTCAGAACTAAAAAACAAGATTATAAATCCAAGGTATTAATTAAAAAAGAAGTAATAAAAAATAATATACAAGATTTTAAAAAGGGTATTGAGCTTAAAATTTAATTAGAAAATCAATTTTGAGATAGCCTGTTTTTTATTTTAACAAAAAAACATAAATAAAGTTCGATACGTAGCGAATGAAAAAAATACAAGAAATATTTTTTTTAAAAAATTTCAAAAAAGAGTTGATAATATATGTATATTAATATAAAATTTAAGGTGTATAATTCGTATAATAATACGAATGATTTAGAGTGTAAAATAACTTATAAACGGAGAGGGGAAGTCTAATGAAAGTAGCAGTAGTTATGGGTTCAAAATCAGATTATCCAAAATTAGAAGAAGGGATAAAACTGCTTGAAAAATATGGAATAGAAGTTGTAGCAAGAGCATTATCAGCTCATAGAACACCAGAACAACTTTCAATATTCCTAAAAGAAATAGAAGATGATACTGATGTAATAATAGCAGCAGCAGGAAAAGCAGCACACTTACCAGGTGTAATAGCTTCACAAACATTAATTCCTGTAATAGGATTACCTATTAAATCATCAACTATGGATGGACTAGACTCACTTTTATCAATAGTTCAAATGCCAAAAGGAATCCCAGTTGCAACAGTTACAATAGACTTAGGTTTAAACGCAGCTTTATTGGCATTACAAATAATGACTTTAAAATACCCAAAATTAAAAGAGGATTTGAAATCATATAGAGAAGAGATGGCACAAAAGGTGTTAGAAGACGACAAGAATTTAAGGGGGTAGCAGAAATGTTATTATATGAAGGAAAAGCAAAACAAGTATATTCTACAGATAATGAAAATGAATATGTTGTTTATTATAAAGATGATGCAACAGCATTTAATGGAGAAAAAAAAGCAGAAATATCTTCAAAAGGTATACTAAATAATAAGATATCAACAATAATCTTTGAAATGTTAAAAGAAAATAATATAAATACTCACTTTATAAAAAGTTTATCAGATAGAGAAATGTTAGTTAAAAAAGTAGAGATTTTACCATTAGAAGTAATAGTAAGAAATATTGCTGCTGGTTCTATCTGTAAAAGAGTTGGTCTTGAAGAAGGTGTAGTTTTTGATGAGCCAATTTTTGAAATAAGCTACAAAAATGATGCTTATGGTGACCCAATGCTAAATGATGATTATGCAGTGGCAATGAAGTTAGCAACTAGAGAAGAATTAAAATTCTTAAGAGAAGAAACTTTAAAAATAAACGAATTACTAAAAGCATTTTTCTTAAAATTAAACCTAAAGTTAGTTGACTTTAAAATAGAATTTGGTAAGGACTCTGAAGGAAATATAATACTGGCAGATGAAGTATCACCAGACACTTGTAGACTTTGGGATGTAAATACAAATGAAAAGTTAGATAAGGACAGATTTAGAAAAGACCTTGGAGACCTTGTAGAAGGTTATACGGAAGTACTTTCAAGAATGAATAATAAATAGGAGGCAAATGTATGTGTGGAGTTTTAGGGATTTACTCTAATAAAGATGTAACTAAAGAACTATATTATTCTTTATATTCTATGCAACACAGGGGGCAAGAAAGCTGTGGTTTAGCTCTTTTAGATGATGGAGAAATTAAGTACAAAAAAGATATGGGATTAGTTGGAGATGTTTTTAAGGAAAATGAATTATCTAAGTTAAAAGGAAATATAGGGATTGGACATGTTAGATATTCAACAGCTGGAGGAAGTCATGTTTCTAACTGTCAACCTTTAGTTGGAAGTTGTAGAAAAAGACAATTAGCCATAGCTCATAATGGAAATCTAGTTAATGCAAATTATTTAAAAGATATGCTAGAAGAAGATGGATATATGTTCCAAACTAATTCAGATACAGAAGTGATTTTATATATACTTGCGAGATATTACAAAGGGGATATAGTAGAAAGTTTAAAAGTGACAATGGATTATATAAAAGGTGCATATGCTCTTGTAATAATGAGTCAAGAAGAATTGGTTGCAGTTAGAGACCCACATGGATTCAGACCTCTTGTACTTGGTAAAAAGGGTGATGAATATATATTTGCATCAGAAAATTGTGCAATAGATATACTTGGCGGAGAAGTTATAAGAGATGTAGAGCCAGGAGAGATAATAGTAGTTAAAGATGGAGAACTAAAATCATATTTTTATTCAGAAAATTATAAACCAGTTAAGAAAAGTTGTATATTTGAACACATATACTTTGCAAGAAATGATGCAACTATAGACAATGTAAATGCATATGAATTTAGAATTAAATGTGGTGAGAGATTAGCTCAGAATGAAACTGTAAAGGCAGATATGGTAGTTCCAGTTCCAGATTCAGGTTGGCCAGGAGCTATTGGTTATGCAAATGCTAGTGGATTAAAAATAAGTGAAGGCTTAGTTAAAAATAGATATGTAGGAAGAACATTTATAAAACCTACACAAGAAGAAAGAGAAATAGCAGTAAAAATAAAATTAAATCCTCTTTCAACAATAATAAAAGGAAAGTCTATAATTTTAGTAGACGATTCAATTGTAAGAGGAACTACATCTAAACAATTAGTAAAATCTTTAAGAGAAGCAGGAGCAAAAGAAATTCATCTTAGAATAACTTCTCCTCCAGTAGCTTACTCTTGTTACTATGGAATAGATACTCCAAATCGCTCTAAATTAATTGCATCAAGTAACAACGTAGAAGAAATGAGAGAATATATTGGATGTGATAGTTTAAAATTCCTAGATATAGAAGGAATGTTAGATGCAACAGAACATAAGTCTACTTTCTGTAAAGCTTGTTTTGATGGAGAATACCCAGTTAAGAAAATTGATAAGGAGGAACTACTTTCATGTTAACATATAAAGAATCAGGTGTAGATATAGATGAAGGAAATAGAGCAGTAGACCTTATAAAAGGTAAAATAAAAGGAACTTATGATGGAAATGTAGTTGGAGATTTAGGTAACTTCAGTGGATTATACAGTTTAAAAGATTTTGTAGGTATGAAAGAACCAGTTTTGCTTGCATCTACAGATGGTGTTGGGACTAAGTTAAAAATAGCTCAGATGATGGACAAGCATGATACTGTTGGAATAGATTTAGTTGCAATGTGTGTGAATGATTTAATTTGTCAAGGAGCAAAACCATTATTCTTCCTTGACTATATAGCTCTTGGGAAATTAGTTCCTGAGCATATCGAAAAAATAGTTGGTGGAATTGCAGATGGTTGTAAAATGTCTGGTTGTGCACTAATTGGTGGAGAAACTGCTGAAATGCCTGGAATGTACGGAGAAGATGACTATGATTTAGCAGGATTTTCTGTAGGAATAGCAGACAAAGAAAAGATTGTTTCTGGAAACAACGTTAAATCAGGAGATGTATTGGTTGGTATATCTTCAAGTGGAGTACACAGCAATGGATTTTCTTTTATAAGAAAGATATTTTTAGAAACTTACAATTATAAAATGGAACAATATGTTGAAGAACTAGGAATGACAGTTGGAGAAGCACTTTTAACACCAACTAAAATATATGTTAAATTAGCTTTAGATGTATTAGCTAAACATGACATAAAAGCTATAGCTCACATAACTGGTGGAGGGCTTATAGAAAATATAACAAGAGTTATACCTAAAGGGTTAGGACTAGATATCAATAAAAAATCTTGGGAGAAGCCTCCTATATTTAAAATGATAGAAGGTTTTAATGCTGTTGATGAGAGAGAACTTCATAAGAGTTTTAACATGGGTATTGGGCTAGTTTTAATAGTAGATAAAGAAAATGCTGATGATGTTGTAAACTTTATAAATAATAGAGAAAATGACAATGCTGCTTATGTAGATAAAAAATATAGTGAATTATTAGAAGATAAAGCGTATATAATTGGTGAAGTAGTAGATAGTCATGAAGGTGTAGAATTATGCTAAATATAGGAGTTTTAATATCTGGTGGAGGAACAAATTTACAAGCAGTTATAGATGGGACTGAGTCTGGAGAAATAAAAGGTCAGGTTAAAGTAGTTATCTCAAGTAAGCAAGGTGCTTATGGGCTAGAGAGAGCTAAAAATCATAACATAAAAGCAATTTGTGAAACTGATGAAGACAAGATAATAGAAATTCTTAAGGGAAATAAAATAGATTTAGTAGTTTTGGCTGGTTATTTAAAAATAATCAGCCCAAAGCTGGTTAATGAGTTTAGAAACAAAATGATAAACATACATCCATCATTAATTCCTTCATTTTGTGGAGCTGGATTCTATGGAGAAAAAGTTCATCAAGGTGTTATAGATTACGGAGCTAAAGTAACTGGTGCTACAGTTCATTTTGTTGATGAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP012323|276837:288633|280352_281429_+|AXU63011.1|DBSCAN-SWA MLTYKESGVDIDEGNRAVDLIKGKIKGTYDGNVVGDLGNFSGLYSLKDFVGMKEPVLLASTDGVGTKLKIAQMMDKHDTVGIDLVAMCVNDLICQGAKPLFFLDYIALGKLVPEHIEKIVGGIADGCKMSGCALIGGETAEMPGMYGEDDYDLAGFSVGIADKEKIVSGNNVKSGDVLVGISSSGVHSNGFSFIRKIFLETYNYKMEQYVEELGMTVGEALLTPTKIYVKLALDVLAKHDIKAIAHITGGGLIENITRVIPKGLGLDINKKSWEKPPIFKMIEGFNAVDERELHKSFNMGIGLVLIVDKENADDVVNFINNRENDNAAYVDKKYSELLEDKAYIIGEVVDSHEGVELC >CP012323|276837:288633|283551_284802_+|AXU63014.1|DBSCAN-SWA MKILVVGGGGREHAICWKLSKEKNVEKIYCAPGNAGIANVAECVNIGDTNIEELLKFAKENEIGLTIVGPEVPLVMGIVDEFEKEGLRVFGPNKKCAQLEGSKAFSKEFMIKHNIPTAKYKEYTNLEEAISEIDSFGYPVVIKADGLAAGKGVVIPENREDAIATLKEMMSDKKFGAAGDKIVIEEFLKGIETSILAFVDNDTIVPMASAKDHKKVNNYEQGPNTGGMGTFSPSEIYTEELANKVKETVLEKTLEGFKKDGLNFKGILFVGLMITEDGEKVLEYNVRFGDPETQSVLFRLETDLHEIMEAILDNKLKDIEINYSDEEAVCVMLTSGGYPDSYEKGKIITGLENLDDDIVVFHSGTKMLDGNLVTNGGRVIGITAKSVTVKDAAEKVYENIKKINFEGMHYRTDIGR >CP012323|276837:288633|277799_278276_+|AXU63008.1|DBSCAN-SWA MKVAVVMGSKSDYPKLEEGIKLLEKYGIEVVARALSAHRTPEQLSIFLKEIEDDTDVIIAAAGKAAHLPGVIASQTLIPVIGLPIKSSTMDGLDSLLSIVQMPKGIPVATVTIDLGLNAALLALQIMTLKYPKLKEDLKSYREEMAQKVLEDDKNLRG >CP012323|276837:288633|276837_277350_-|AXU63007.1|DBSCAN-SWA MLEVIKNRRSIRTYKDKNIEEEKITEILKSAMQAPSSKNAQPWEFIIVDDKELLKELSKSQHRAKHVEFAPLCIVVLGNRDKFLKPGKWIQDLGACTQNLLLEVTNQGLAACWAGVFPKNKVVNKVRQTLDLPVKLVPYALISIGYSEEKNEFIDRFDKNKIHRNVYKNR >CP012323|276837:288633|282008_283541_+|AXU63013.1|DBSCAN-SWA MSKRALISVTDKTGVVEFAKELNKLDYEIISTGNTFKTLKENGVNVMQVEDVTNFPEILDGRVKTLNPYIHGGILYKRDKESHVETVNEHKIHSIDLVAVNLYDFEGTLKAGKSHDEIIENIDIGGPSMIRSAAKNYKDVIVVVDIKDYDSIIEKLKTDTMTLEDRKKLSYKAFSTTGRYDALISSYFAGEVGDTYPDILNLTFQKEQTLRYGENPHQNGFLYSQSNAKNPILNYEQLGGKELSFNNLNDLHGCLEVMREFKDSEEVVSVAIKHANSCGVGLGKDAFEAYTKCYEADKVSIFGGIVGITSTIDKATAEKLNEIFLEIVVAYDFEPEALEILKQKKNLRILKLAKIENSLQPYEMKYLDGKLLIQDRNNILAEKSENVTKAKPTDAQLKDMEFGMRVVKNMKSNAIAIVKNGQTLALGCGQTSRIWALKNALENNKDKDFTGAVLASDAFFPFDDCVTLAHEYGISAVVQPGGSIKDKDSIEACDKYDMVMVFTGIRHFKH >CP012323|276837:288633|284826_288633_+|AXU63015.1|DBSCAN-SWA MLNTENKDSMVRRVLVEKREGFDLEAKALKKDLVESLHIDNIENLRILNRYDVEGISEEVYENAAKTIFSEPNLDVVYYEEIPELNDERVFAIEFLPGQYDQRGDWAAQCVQIVNQGIRPAINTAKVYILSGKITDEEFSKIKDYCINPVDSREASLEKPETLKMETEIPTTVEVLDGFIDLDEDGLRTFVSEKGLAMTLGDLQHVQKYFKDTEKRNPTITEIKVLDTYWSDHCRHTTFMTEIENVKIEDGKFNDIVKEAYQMYLNSRDNVYVNRHKDICLMDIATVAVKELKKNGKLNDLDESEEINACSINVDVEVDGKMEKYLVMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCLGGAIRDPLSGRSYVYQAMRVTGSADPRTTLEDTLSGKLMQRKITTEAAHGYSSYGNQIGLTTGQVAEVYDENFVAKRMEIGAVIAAAPKENVVRERPEAGDVIVLLGGKTGRDGCGGATGSSKEHSEESILTCSAEVQKGDAPNERKIQRFFRNKEVAQMIKRCNDFGAGGVCVAIGEIADSLDINLDLVPKKYDGLDGTELAISESQERMAVAIKKENKDKFIQLAVEENLEATHVATVTDTGYLRMFWNGKAIVDINREFLDTNGVKQTTDVHVTKVDEENTFFSSNEIVKDVKCASMKDKFTKVLSDLNVCSQKGLVEMFDNTIGGNTVLMPFGGKYQATPTQGMVAKIPVLGGETNTSTIMTYGYNPKVGKWSPFHGALYAVVESVCKLVAIGGNYSTTRLTFQEYFEKLGNNPEKWGKPFSALLGAFYAQSKFEIPAIGGKDSMSGTFKDIEVPPTLVSFAVDTVDAKKVVSPEFKKSDSKVVMLCVNKAENDVIDFEELKKNLDKVRELIHGNKILSTYALGFAGVGEAISKMAFGNKIGFKFSEEAEKAFIDEKLFEASYGNIVLELANDDLSILDGYNYIVLGSTAKEANIFIKGEELSLDELYKAHCSTLEPIFPTKAEEVKSKIETISYISQGEAKKSSLSIATPRVFIPAFPGTNCEYDSARAFERAGANANIRVFKNLTYKDIEDSIDTIVNEIKSSQIIMLPGGFSAGDEPDGSGKFIATVFRNPRVQEAINEFLTQKDGLMLGICNGFQVLIKLGLVPYGEIRVQSENAPTLTYNNIGRHQAKIARTRISSNKSPWLAQTNVGDIHNIAISHGEGKFVASEEVMRELIANGQVATQYVDFNNEATYDIEFNPNGSFYAVEGITSADGRVFGKMGHSERIGEEVFKNIIGEKDQKIFESGVKYFR >CP012323|276837:288633|281422_282016_+|AXU63012.1|DBSCAN-SWA MLNIGVLISGGGTNLQAVIDGTESGEIKGQVKVVISSKQGAYGLERAKNHNIKAICETDEDKIIEILKGNKIDLVVLAGYLKIISPKLVNEFRNKMINIHPSLIPSFCGAGFYGEKVHQGVIDYGAKVTGATVHFVDEGADTGPIIMQDVVKVNQDDDAKTLAKRVLEVEHRILKESISLFCENKLKLQGRRVFINE >CP012323|276837:288633|278281_278980_+|AXU63009.1|DBSCAN-SWA MLLYEGKAKQVYSTDNENEYVVYYKDDATAFNGEKKAEISSKGILNNKISTIIFEMLKENNINTHFIKSLSDREMLVKKVEILPLEVIVRNIAAGSICKRVGLEEGVVFDEPIFEISYKNDAYGDPMLNDDYAVAMKLATREELKFLREETLKINELLKAFFLKLNLKLVDFKIEFGKDSEGNIILADEVSPDTCRLWDVNTNEKLDKDRFRKDLGDLVEGYTEVLSRMNNK >CP012323|276837:288633|278991_280359_+|AXU63010.1|DBSCAN-SWA MCGVLGIYSNKDVTKELYYSLYSMQHRGQESCGLALLDDGEIKYKKDMGLVGDVFKENELSKLKGNIGIGHVRYSTAGGSHVSNCQPLVGSCRKRQLAIAHNGNLVNANYLKDMLEEDGYMFQTNSDTEVILYILARYYKGDIVESLKVTMDYIKGAYALVIMSQEELVAVRDPHGFRPLVLGKKGDEYIFASENCAIDILGGEVIRDVEPGEIIVVKDGELKSYFYSENYKPVKKSCIFEHIYFARNDATIDNVNAYEFRIKCGERLAQNETVKADMVVPVPDSGWPGAIGYANASGLKISEGLVKNRYVGRTFIKPTQEEREIAVKIKLNPLSTIIKGKSIILVDDSIVRGTTSKQLVKSLREAGAKEIHLRITSPPVAYSCYYGIDTPNRSKLIASSNNVEEMREYIGCDSLKFLDIEGMLDATEHKSTFCKACFDGEYPVKKIDKEELLSC |
9 | Synechococcus_phage(37.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
605680 : 649399
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP012323|605680:649399|DBSCAN-SWA AATGATTAAAGTTGCTTTAAAAGATGGCTCAATAAAAGAATTTGAAAATGCTATTTCTGTTATGGATGTAGCTAAATCCATTAGTGAAGGATTAGCTAGAAATGTGGTAGCAGCGTCTGTGAACGGAGAGGTTGTAGGTCTGGACCACATTATAGATACTGACTGTGACTTGAATTTATTTAAGTTTGAAGATAAAGAAGGTAAGGAAGTTTTTAGACATACATCAGCACATATATTAGCTCAAGCTATAAAAAGACTTTACCCAGAAGCAAAACTTGCTATAGGACCAAGTATAGAAAATGGATTCTACTATGATATAGATTTAGACCATAGATTAGTTCCAGAGGACCTAGAGAAAATAGAAGCTGAAATGAAAAAAATAGCTAAAGAAGATTTAAAAATAGAAAGATTTGAACTTCCTAGAAATGAAGCTTTAGAGCTTATGAAAGAACAAGGAGAAGACTATAAGGTAGAACTTATATCTGATTTACCTGAAAGTGAAATAATATCTTTCTACAAGCAAGGTGATTTTACTGATTTATGTAGAGGACCACATTTACCATCTACTAAAAAGGTAAAAGCTGTTAAATTACAAAGTGTAGCAGGTGCATATTGGCGTGGTGACGAAAATAATAAGATGCTTCAAAGAATATATGGAACTTCTTTTGAGAAAAACAAAGACTTAGAAGAGTACTTACATTTACTAGAAGAAGCTAAAAAGAGAGACCACAGAAAATTAGGTAAAGAATTAGGATTATTTATGATACCTGAAGAAGGTCCAGGATTCCCTATGTTTTTACCAAAAGGTATGGAACTTAAAAATGAATTATTAAAATTCTGGAGAGAAATACACAGAAAAGCTGGATATATTGAGATAGAATCTCCAATCATATTAAATAGAAAATTATGGGAGACTTCAGGACACTGGTATCATTACAAAGAAAATATGTATACAGTTAAAATAGATGATGAGGATTATGCTATAAAACCTATGAACTGTCCTGGTGGATTAATTTACTATAACTCTCAACTACATTCATATAGAGATTTCCCAATGAGGGTTGCAGAGCTTGGTAGAGTTCATAGACATGAGTTATCTGGTGCATTACAAGGATTAATGAGAGTTAGAGCATTTACTCAAGACGATTCACATATATTCATGTTACCAGAGCAAATTAAGGACGAAATAAAAGGAGTAGCTAACTTAATAGATGGTATCTACAAAACTTTTGGATTTGAATATAATTTAGAATTATCTACAAGACCAGAGAACTCTATGGGAAGCGACGAAGAGTGGGAAGCAGCAGAAAATGGATTAAGAGAAGCTTTAGAAGAGTTAGGTCTACCATATACTATTAATGAGGGTGATGGAGCATTCTATGGTCCTAAGATAGACTTCCATCTAAAAGATTGTTTAGGAAGAACTTGGCAATGTGGTACTATCCAATTAGATATGCAACTTCCAAGACAATTTGATAATACTTATATTGGTCAAGATGGTGAAAAGCATAGACCAGTTATGATTCATAGAGTTGCTTTTGGTAGTATAGAAAGATTTATAGGTATATTAATAGAGCATTATGCTGGTAAATTCCCAGTTTGGTTATCTCCAACTCAAGTTAAGATACTTCCTATATCTGATAAATTTATGGATTATGCAAATGAAGTTAAGAAAGAGTTATTTGATAAGGGTATAAGAGTTGAATTAGATGATAGAGCTGAAAAAATTGGATTTAAGATAAGAGAAGCTCAGCTTGAAAAAGTGCCATACATGTTAATAGTAGGTGAAAAAGAAGTAGCTGATAATAATGTTTCTGTTAGATCAAGAGATAAAGGTGAAATAGGTAGTATTAAATTAGATGAATTTATAGCTAGTATTTCAAAAGAAATTGAATCAAGAGAAAGTATTATTCAAGACTAATATACAATATATTAGTAGCTAAGATATTGTTATATAAGATAAGTTTAATCAATATGTTGATATATTGATGCATAGTGATTAAATTTATGAAAAGATGAGTATAATTAGAGGTACATTAATCATATTTTTATGATTAATGTACCTCTAGTTTTTTGTATGGTAGATTTATTAATAAATATATCATAGAAGTGTTTTGAACAAGGAAATATTTATGTGCATTCTTTAAATAAAAGTTTATTTTTTGAGTGATAATTAAGTACTTGTTGGTAAGGCTATGGCTGTAAAAATCATAACTTTATTTTCATATTTGTTCCATTTTCATAAAAATTATTATCCCTTTAAGAAAATTTCTTAATCCCCTTGAAATATTTCCTTTTTAGTCTAAAGTTAAATTTCTTTCTTCAAAATGAATATTTAAATGAACTAAAATTTAAGTACACTTTCTAATCTTATGAGTCTATTTTTCATAGATAATTGCCCTATAATAGAAGGAGCCATGTTGGGGCTATGTGGTAACAATAACAGTATTGCCAGTGATTAATTAATATTTTGTAAATATTAATTAATGTCTTATGTTATTTTTGGACTTACGCCCTATACATAGATTAATTTATTTAACTTTAGATATAGAGAGAATGTCAAATACATACACAGACGTTAGAGTTTAAGAAATTGTTTATGGAGCAAGAACTTTTAAAAGAGGTAGTAACTTAGCTTAATTTCAAGAAATGATAAATACAAAAGAGTAAAAAGAGAGGTGTTGAAATGATAGAAAAAGTAGAAGAAAAATCTAAGATTATTAAAACATCAAAAGAATATAAGCGAACTATAGTTGAAGAAAAAGATAAAGAATGGACCAAAAAATTAAATGACATACTTAGTAGAAGTAGTTTTTCTAATGATGAATTAGATAAAATCAAGGAGTTAATTCCAAAAGAGATTTTGACTTGTGAAAATGTTGGAGAAGTTGTGACTGAAGATGGATATGCTAAGCCCGAGTATGATGAGGTATTTAAATCATTGTTCACTTTAAATAATGAATATGATTTACTTGTAAATTTTATAAATGATATTCTAAAAGATGCTCCATATGCTAACAGGAATATCAAACCGTTCACTCAAATAAAGAGAATAATTAGAGTTGAAACTGACCCAACAATTAATTACATTGGAGAGAAAAGACCTAGACTCGATATTTTGGCTGAAGATGAAGAAAATAATCATATAAATATTGAGATGCAAAGAGCTTTTGAGAACGATTATTTGGAAAGAGCTGAATATTATCTTAGCCGTGTACATGGTAGAAAGTTAGAAGAAGGTAAAGAGTATAAAGAAATTGGAAAAACTATTGGAATACATATACTAAATCATGTAAAATATAATCACATAGAAGATTATGTAAATTGCCTGAGATTAACAATGGACGGGCATCCAGATATTTATTCTAGTAAAACTGCATTATATTTTATAGAGCTTCCAAAAATTCATAAATCTGACTATATAGTAAATAGAATTATGCTATGGGGAAAACTTATTAGTAATCCTTCTAGCTTAGATGTAAGAGTTATAGCTAAGAATGATTCTATTATTAAAAAAGCACTTGATAGATTAAAAGAATTAGGTAGCAATGAAGAATATTTATTAAATCTGAAAAGAGGTGCTTATATCATGAATAAAAGTAGAAATTTTAAAGAAGAGATTGAAAGAGAAACGGAAACAAGAGTTGCAAGAGAGACAGCAATTAGAGTTGCAAAAGAAAAAGATTATAAAATAATTATAATGTTGAAAAAAAACGGTTTTAAATTAGATGATATATTAAATAAATTTAATGATTTTGACTTAAGTGAAGATGAGATAAAAGAAGTCTATGAAAATAATTGATGTGTAAATAAAAAGTGAACTTATATAAGTTTGCTGAATCTGAGTCTGGAAATATTTATGTGTATTTTTTAAATGAATGAAAATTTATTTTAAAGACCATAATTTAGAGGTACAGTTAATTATATTTTTATGATACTGTACTTCTAGTTTTTTCTATTATAGATTTATTATTTATTAATAAATCTACAATAGAAGTGTTTTTGTTGTAAGAATCATTTTATCTAATGATTGTTTTTTATAATAGTTAAATTTCCATTTGTAGTGCTTAAATATAAATCTGTAATACCATTTTTATAAGTGTATAAATCACTATGGCGATTCAACTCAAAGTCACTGTCCAAAACACCAGAAACTTTATCAAAATTTAAAGTGAAACCTGGATTATCAGGAATAGACAAATCGACATTGGCAGAAGTAGTTTCACAGTACAGAGAAGACAACATTTTGCTAGAAGTGATTTTTATATTACTGCTAGTTGACTCAGCTTTAATATCAGAAAAAACTCCAGATAAGTTCATTTTTCCAGAAACTGAACTACAAGTAAGATTTTTATTGTATATATCTTTTAAATTTATATTACCATTAGTTGTTTCTAAGTTTAAAACATCAATTTTCCCAGAAAGCTGTATTTCACCAGATGTTGATTTAAGAGTAGCATTTTTACTATTTAGTTTTGCTATATCAATGTGACCACTAGTTGTGTCTAAATTTATTTTATTAATATTACCAGAGAGACCTATTGCACCTGAAACTGTGTTAGCTTCAACTGTATTACTTCTTATGTAAGTGCTATATATATCTGCTGAAGTAGTATATAAGGTTATTTTATCATAAAGCTTATTGGGCAAATATAGTTCAAGTATTGTTGGTTTTGGAAGATTAATTCCAATGAAGAATTTTTTAGCTGAATTATCATATATAGAAAGAGAATCTCCATCAACCATTATTTTTGCTAGTTTTTTCTTTGAGAAATTACTAGGGATTTTTTGAATTAATTTGATTTTATTAGAATCACTTCTCTTAATTCTAACTTCACCTGAAATCCAATCAACATTAATGTCATTTATTTTATCTGAAAAACTTTCATTTTTAGCCACTATATAGTTATCATAATTGTATTTAGGATTAAGAATATTAAAAGGGAAATTAAAAGAATGTGAAATTATAGTTCCTATAAGGAGTGAGACAAATACAATAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP012323|605680:649399|633930_639135_+|AXU63322.1|DBSCAN-SWA 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34 | Streptococcus_phage(33.33%) | transposase,tRNA,coat | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
724184 : 787060
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP012323|724184:787060|DBSCAN-SWA 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MKYLGLEFYKLKRKKIILMTFLFVAVEIMWCIVNSNRAITRNPDMLGGFEYSYMLMSFASLNGLFFPILISIITSRISDIEHKGDTWKLLKSSVTSLNSIYSSKFLCSAILVSVAVLMQVLSIVLFGHFRGVIESISVFSLLKYTLGTILVSIAIIALHLWIATVIPNQMVAITFGMIGSFIGLTSGLFYQGIRRLFIWSYYLELSPLSYAYDNVLGSSVYRIDMNFSITILVFLIGMLIYYIGRNHLLKKEV |
51 | Bacillus_phage(26.32%) | protease,transposase,integrase | attL 772221:772243|attR 782421:782443 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1435472 : 1459914
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP012323|1435472:1459914|DBSCAN-SWA AATGAAAACTGGTGTAGTTAAATGGTTTAACAACGAAAAAGGATTTGGATTCATATCTGTAGAAGGTGAAGGAGATGTTTTCGTACATTTCTCAGCTATAACTGGAGATGGATACAAAACATTAGAAGAAGGACAAAGCGTTGAGTTCGAAGTAGTAGATGGAGCTAAAGGTCCTCAAGCTGCTAACGTAGTTAGATTATAATTAAAAATTCATATATATTAGTGTTCTAGTAATATGAGAGATAAGCCGCTAATCATTTAGCGGTTTTTTCAGTTTTTGTAAATAAAATTAATATCAAAATAAATTAAAATTATTAAAATAAAATCATTAATAATGAGATAAATATGTTAAAATTAATAGTGTAGAGTAAAATTATTATGGCTAAGTTTAAGTCAATTAATTTTTAGTGAATTTTCTAAAAAGAGAATAAGTGATACTGATAGACCATATAAAAATATCAATAAAGCATAATAAGATTAAGATGAGCAAAGGAAAAACGCTTGTTACAGCGTATAGTATTAAGAATACTTAGAAAATAAGAAAGGAGAAAGTTACTGCAAAAAAGTAACATTATAAATATTGAATAATATTTATAAGTTTTCAGTAACGGTGGGTAGTGTAATGAACATATTATTCTTTCTAACACCAAAAAGTGAAGTAGCATATATATATGAAGACTACACTATAAGGCAAGCCCTAGAAAAAATGGAATATCACAAATACTCTGCAATTCCAATAATAAGTAAGGATGGTAAATATGTTGGAACTATAACAGAAGGTGATTTTTTATGGACATTAAAAAACGATTTAAATCTGGACTTAAAGGGATTGGAAGATGTTCCAGTGACAGATATAAATAGAAAAATGGATAATTCTCCTGTTTCCATCAACGCAGATATTGAAGATTTAGTTATAAAATCTTTAAATCAAAATTTCATTCCTGTTATAGATGACCAAGACACATTTATTGGGATAATAAAAAGAAGAGATGTAATAGGTTACTGCTATGAGATAATACGTGGATATAAAAATTTAGCTAATGATAATTAAAAATCTTATTTAAACTTTTAAGCTGAGTTCTTTACAATAAAAGAATGATAATATGAAACTGGATATTTAAACTTTAATATAAAAAGCTGTCTTTTCTAATAAATATTGTGAAAAGACAGCTTTTTTATATATGACCTTATGATTAATCGTTGTATTTTACAAGGTTTCCGTACTTAGCATTAAGAGCATTTATCTTATTTCCATAAACTTCATTTTGTTTTTGATATAATAAACTTTTTTCAACTTCAGCCTTAACTTCATCAAATGTAGACTCTGTACTTTCTTGAAGGTTTTCTAATTTTATTATATGGTATCCAAATTGAGTTTTAACTGGCTCACTTACTTCACCTTTAGCCATAGAGAATACAGCTTCTTCAAATTCAGGAACCATTTGTCCTCTACCGAATGTTCCTAAATCACCACCCATATCTTTAGATGGGCAAGAAGAATGTTTAAGAGCTGCGTCTTCAAAAGATATTTCTTCTGATTTTATTTGAGCAAGTATTTCTTTAGCTTTTTCATCACTATCTACTAATATATGTTTAGCAGTTGCACTTTCTGGTTTAGAGAAAGAGCTCTTATTAGCTTCAAAGAATTTTACTTTTTCATCTTCTGTTACATTAACACTAGATAAAACTTTATTTATAGCAAATTGCTTTAATACATTTTCCTCTATCTTTTTCATTTCTAATTTAAATATTTCTTCTTCATCTAATTTTTCTTCTTTAGCATCTAAGAAGAATAATTCTTGATTTACTAAATCATTTAATAAGTGTTTTTTTCCTTCTTCAGTTTTAAATTGCATAGCTTGATAAGGGTCTAATGATTTTAATGCATTTTCAATATCAATATTAGTTATCTCTTTTTCTCCAACTGTTGCTAAAACTTTTTTTTCCATAATAGTTAACTCCTTCATAGTGTATTTCATTATTAATATAAGACTACCATCTTAAATAATATCAGAAAATAATGTAGATGTCTAATATTTAAAGCCATATTAAGTCAAATAGAATTAAATTTAGTAGAACAAAGTTATTACAATTAATAAAAGTGAGCTCATAATACCCACTACACCTTCGTCATCTTTAAATTTAAGGGTTTTTACTATTGAATAATAAAGGTATATTCCAGTAAAAATAATCTTTAAATACAAGAAAAATAAACTTTTTGGGTATATTAAAAAGCTAAAAAGTGTAAATATAAAAGCAAGTAGAGTACTTATCCTGTAAAAGAAATCTATTTGTGTAATGTCTTTATATTTTATCATAAACACTGAATATAAAATGATGAAAACAATTGCGATGATTGCATATATGGTAAAGAGCATATTTTCAAGAGTACCATTTGAAATTACTATCCACTTATACCACATAATTGGCCAAAATAATAGTGCTAAGAACTTAAAATAATTATCAAACAACTTTTCTTTATACATTCATCAAACAACCTTTCTTAACAAAAGCATATATTTGTTTTTAGAATTTTAAATAATATGATATCATTATTATATATTAATATTGAATTTATAGAAACCAAAATTTGTTAAAATAAATATATAGATTTTACTGTTAAGCCAGTTAAAATTACTACTATTTTTATTATGAAATTGGATCAAATATGTAGAAATACGGCAAATTAGTTAATATTAAATATTTATTATTTCCAAGTTGTAAAGACTGTTTTTTTAATGATAAAAATTCTAATCTTTTTTGAAAGAAAGTAATATCCACATTAAGTATGTCCGCCATTTCATAAACGCAAGTGATGCCAGAATTAATTATGTTTATTATATCTTCTTCAGTAATTAAGAACTCACAAGCCCATTTTAAGGCTTTATTTTCGCATTTATCTATAATAATTTTTGTATAATAATCATTATAAGAGGATACATAGTATCCAAGGCTAGTGAAATGATGCCCAAGTTCTTCAGCTAAGATGGATGTCAATTTTTTTGAGTTTTGTTTTAAATTACTGAGTAATGATATAATTTTAATACCATGTTTGTTTATATATAGTCCTTCTAAATCACCTGCAATATAAGTGGTATAATGAATTATTATCTCTTCTTGAGAAGCTAATTCAAAAAGCTTATCCAAATTATTCATAAAAATCCCCCTAAAATAGAATGTATGTTTGCCTTTAAGTTATATTAAAAGAGCAGAAAAATAGACTGCTCATCATATGGTTTATTTTTTTTTATATTTATTTAGTAAAAATTCTATATAATCATTAAGTTGTTCTTGTGCTTCTTCAGGTAACTCTTCATGTGGATTTTTTCTATGTGCAGCTACTGTATCAATATTTTCCTTAACTAAGGTTCTTCCAAGAAGGTAATCAACTGATACATTAAATACATCAGCCAATTTATTTAAAATGTGTTCATCAGGAAATCTGTTTTCTGTTTCATAGTACCCTAAGACTCTTTGGGAAACGCCTACTTTTTCTCCAAGTTCTCTTTGAGTCAATCCAAATTCCTTTCTAAGTTCTCTTAATCTTTTGGCAAACATTATAACACCACCTTATGTATAGATTATAACAAATTGTTCTAAAAAATAAAACTAATAAAATATAAAAGAATATTTTTTTCTAAAATCTATTGATAAAGAACAAATAATTCTATATAATCTAAATATGGAAGAACAAAATATTCTTAATAGTAATGGAGGTATAAAACAATGTTTAAAAATAACTTGAAATATTATAGAAAATGCAAAGGTATGACACAAATTCAACTTGCCAGAAAGGCTGGAATTACAAATGACTATATATCTCAAATAGAAAGAGGTATAAAAAATCCTGGACTTCTTATGGCTAAGAAGATTTCTAGTATTTTAGAACAAAATATAGAAGAAGTTTTTTTTATAGAGTTATAGAACAATATGTTCTTGAAAGTTGTGAGATTAGTAAAAAATTGTGCACTAAAGAGATTATTGTAAATTTGAAGCTAATAATAATTATATAAAAAAGGAGAAGTACTATGGAAAACAAAAAAGATATATTATTTAAAGAAACAGATAAAAGATTACATAATTATAAGTATTTGGATATAAAGATAAAGAATATTAACTTGGACATAAAAAGATGTGAGAATGAATACTCTGGATGTGGAGCAATGGTATATACAGAAAAGACTACTAACACATATAACATAAGTTCTTCTGTGGAAAATGAGGTATTAAAAAGAGAGGAAAGATTAAGAAAATTAAAAATGGAAAAAGAAGATATAGAAATAGAAAAAGAGAAGATAGAAAATGCTCTAACATGTCTAAATGATATAGAAATGGAATTTTTTAATCTTTTTTATAATAGTAAGACAAAAAACAATATGACATATATTTCTATGAAACTACACTTAGATAGAACATCTTGCTACAATTTAAAGAAAAAGATGATATTTAAACTGACTGAGATATTATAAAAAATAGGACAATTTTACAACACTTTATATACACCATTGCAACAATAGGCAATAAAATATGTGAGATAATGTTATTGTGAAAGAAATCCATATTGAAGGAGGTGATAAATTGAAAAGAATAATATTACCTAGAAATATAGAAGATACTTGACAGGAATAAATGAGATGTATATTTAAAAATGGCTTATACCATTTATAGTAAGATTATCAGATTAAGCAAGAATATTTAGTGATAGTGTGGTGATTATTTGCTTAAATACAAGGAAATATTAGAAACAATTATTGAGATTCTCAAAAAAAACTTTACTGAAAGTATTTTTATTGATGATGAAAGTGTGCAAGGCTCTGAAGGGTCTTGTTTTTTTGTAAGTATACTATCAGTTATTTGTACACCTATAATGTTAAATACGAATAATAAAGATATTGTTATCTCTATAAAATACTTACCAAAACCACAGTCAAATAGTATTAGAATGTATGAAATTTCAGATGAATTAAATAAGTTATTCAACAGAAATATAAAGGTAACAG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29 | Clostridium_phage(54.55%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1541500 : 1551229
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP012323|1541500:1551229|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP012323|1541500:1551229|1545567_1546359_+|AXU64129.1|DBSCAN-SWA MFDYGKRTYIMGILNVTPDSFSDGGDFNNLDIAIQHAKDMVDQGADIIDLGGESTRPGHSYVDSEEELRRVIPVIKKLKQELDIPISIDTYKADVAEEALKLGVTMVNDVWGLRRDKNMASVIGKYDAEVCIMHNQDGTNYDKDIIASIKEFLKESIEMAISCGVKKEKIVLDPGIGFGKDFEQNIEVLRRLNELKDLGYPILLGTSRKSVIGKVLPVEPKKRLEGTIATTVLGIRDGVDIVRVHDVYENLMAARMTDAIYRK >CP012323|1541500:1551229|1550062_1551229_+|AXU64134.1|DBSCAN-SWA MENKSNKKELKKVTAKTLIEKGKKQGSLTLAEIMEAFSETELDKDQVENLYETLGNLGIEITETKNYKADIDFSVADDDLSIGHLDEDAEAISHDDSSAIEIETVDLSLPKGISIDDPVRMYLKEIGKIPLLKPHEEVEFARRMHEGDEIAKQRLVEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNLGLIKAVEKFDYTKGYKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVSRQLLQELGRDPKPEEIAKEMEMTEDKVREIMKIAQDPVSLETPIGEEEDSHLGDFIPDDDAPAPAEAAAYSLLKEQIEDVLGSLNDREQKVLKLRFGLEDGRARTLEEVGKEFDVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKKLRDYLD >CP012323|1541500:1551229|1546369_1546735_+|AXU64130.1|DBSCAN-SWA MDKILLSNLGFYGYHGVLKEENFLGQKFFVDMELYIDSREAGLSDDINKSVSYAEVYNVVKDITENKQFNLLEALAENIAEEVLNKFILINGVMVRVRKPEAPVNGIYDYFGVEIRRTRDE >CP012323|1541500:1551229|1542086_1543436_+|AXU64125.1|DBSCAN-SWA MIREINTKLNSFEIFTIFRNEHDSFILDSAMDKEKLGRYSFISSQPFKVLKYKDTDENPLEVLKEELHKYRVANDTNLPFVGGAVGYLSYDLGNYIENLPRTAVDDIEMPDMYFGFYNHVIVIDHLVQKTYIATPNIDIELEEKIMDDIEQRILKEEKKGIDSICYEEKEVTPIRLKSNFTKEEFKNAVQSVREYIRQGDIYQANLTQRFSGETELTSFELYRDLRRFSPAPFGAFLNFEDTHILSNSPERFIKCVNKRIETRPIKGTRPRGKDKEEDLKLQQELRNSEKDRAELLMIVDLERNDIGRISKTGSVKVPELFVIEPYANVNHLVSTVVGELKDDKDATDVIKATFPGGSITGAPKIRAMEIIDELEPTQRNVYTGSIGYIGFNGDMDFNIAIRTIIKNDKKVYFQVGGGMTWDSDPDEEYQETLDKAKSIMKALRGYYEE >CP012323|1541500:1551229|1544202_1544904_+|AXU64127.1|DBSCAN-SWA MIGCIYEVYNEEMTKIIENQNTLAVYLVGSSKDVDFTLYDVEINDIDVFVFVKEGEKQERILFKKKGIEFDINYFSKDGVKKLLSNREYFFVKEMKDAKVLFDRESISHIIKDISRNIYLEGPSKISLEEKSFIKQDIGAKISNLKNKEKFDGFEYHFLTNLYLKDIIIGYFNINDKWVPKDKKLLKVLKKENNELFELVSKVSENYDYQRLLDVYNYIFKEIETKEVIKLIF >CP012323|1541500:1551229|1543425_1544169_+|AXU64126.1|DBSCAN-SWA MKNNVGFDSSLSKFGIGLFETIRVKNGIAIDLNIHIERMISSINCLDLDINYKKDFLINEIVTYIKKENVINKALRITVFDEGYNISIRDIPYNQETYEKGFKLAISPIVRGNSLIHRHKTTNYFENIYTKNIANKTGYNDGIFLNSEGVILECSMSNIFFIKGERVCTPSDRLPILNGIIKKRIIEICDELHIELIENEINISEISSFDFVFVTNSLMGAIKVTEIDKIKFNKENVVFDKIVKLLE >CP012323|1541500:1551229|1546727_1547234_+|AXU64131.1|DBSCAN-SWA MNKVYLGIGTNMGDRFDNLSRACELLKNSDSIYKVKESSLYETKPWGYTEQADFLNMCVEIETEFEPYELLEYCQEIERELHRERIVHWGPRTIDVDILFFNDVVSTDEKLTIPHPRIQDRAFVLIPLMDLNEELIINEKTIKEHLNLLSAEEREEVKELVGYERKPI >CP012323|1541500:1551229|1547214_1548000_+|AXU64132.1|DBSCAN-SWA MKENLFNNNSKIEINTNNKKITVKKDKLIIAGPCAIESYEQLLETAKFVKSQGANILRGGAYKPRTSPNSFQGLKKEGLEILKAVKDEVGMAVITELMDVRDMDELYSISDIIQIGSRNMQNFTLLSEVGKQNKPVMLKRGIASTITEWIGASEYIAIEGNSNIIMCERGIRTYNDYTRNTLDLAAVPIIQKETGLPVVVDPSHATGVRYLVKPMSLASFACGADGIMVEVHPDPENALSDGAQSLCFNEFEDLMKSINNY >CP012323|1541500:1551229|1541500_1542085_+|AXU64124.1|DBSCAN-SWA MILMIDNYDSFVYNLVQYIEELGETVVVKRNNEIKISDIEELNPEVIVLSPGPCSPKEAGICIDVVEHFKGKKPILGICLGHQTIGHVFGGDIIKAQQPVHGKVYSISHTNKGVFSGLKNPLNVTRYHSLIIDSNTVPKELEITATTDKGEIMGIRHKKYLIEGVQFHPEAILSEYGHEMLKNFITEARERVHM >CP012323|1541500:1551229|1548254_1550045_+|AXU64133.1|DBSCAN-SWA MNDIKDIIEEIKARCDIASIISEYMNIKQSGANYKGLCPFHGEKTPSFYINTSKQIYKCFGCGEGGDVINFVMKMENLDFMDAVKILANKCGIEINTNMNEETRIKIEKSKKFQDIHTEAARFYLSNLLGSKNLGYEYLRIRGLDDKIIKKFGLGFSLDSWNSLMNTLISKGYKKQDLLECGLIAKNRDGTNCYDKFRNRVMFPIFDYRGNIIGFGGRVLDDSLPKYLNSPDTLIFNKKQNLYGLNFARKNLESKTIVLVEGYMDLISLYQYGIKNVVATLGTALTEQQGILIKRYADTAIISYDSDEAGIKATLRAIDILTKLGINVKVLDLKDAKDPDEFVRKYGLSDYKKAMDVSTHYIKYKIDHLKKEFNIQKDEERVKFAKEASKIIKQLTSPVEIDFYTKYLSNQIDINVESIKREVYGKNYNKPYNNKNQKKIEEKVIEKVEVRQDGKQLVEETLIKIMLEDKKIREIALLKVEESDFLLKESKEILNYMIKNQELDKITIDKLKSLNISEEYLKELNSISLNSINLENTKEIEGIITNIRKNSLEEQINSLLREQQELENNNDMKEVDGRVMEIALKIVEINKILKSL >CP012323|1541500:1551229|1544929_1545502_+|AXU64128.1|DBSCAN-SWA MNKVDKEKIQHAVREILEAIGEDPDREGLIETPNRVARMYEEIFSGLSEEPRDHLKVLFADEKHEELVLVKDIPFYSCCEHHLVPFFGKAHIAYLPKGGRLTGLSKLARVIDTLAKRPQLQERITKNAADIIMEELQPYGVLVVVEAEHMCMTMRGVKKPGSKTVTSAVRGIFEKDIASRAEAMSLITMK |
11 | Pandoravirus(37.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1676892 : 1731143
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP012323|1676892:1731143|DBSCAN-SWA 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74 | Clostridium_phage(93.55%) | portal,tail,terminase,capsid,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2063178 : 2070422
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP012323|2063178:2070422|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP012323|2063178:2070422|2065380_2065680_+|AXU64628.1|transposase|DBSCAN-SWA MENKYRKTQTNVSLINYHFVFCPRYKRKIFNIEGLEDRVFKEIAILHFLIMNVNDDLKSINRELCVKTYDNFKILHDKEIDRLKELKLNGYKLISSMGI >CP012323|2063178:2070422|2064105_2064543_-|AXU64626.1|DBSCAN-SWA MNKKLENRCSWQEYFMRLCETVAERGTCDRAYVGAIIVNSENRIVSTGYNGSISGDKHCSEVGHEMRDGHCIRTIHAEQNALYYCAKEGISVKDCSIYVTHFPCLNCTKAIIQAGIKHIYYRTGYRIDEYAIKLLQSSNVLYTKL >CP012323|2063178:2070422|2067828_2068629_-|AXU64631.1|DBSCAN-SWA MRLNKRSEGYINYVKGVKREKRNVLFYQLLILIGFIVIWELLADLNVINTFLFSKPSDIYNLFIQYAFSGQLFKHIGISVYETALGLVIGTVLGILVAIALWWSEKLSKILDPFLVVLNALPKTALAPIIIVWVGAGIEGIVVTAVTISVVVTILSAYNYFMNIDEEKIKMLKSFGASKSQILFKLILPANTGNLINLTKINIGMAWVGVIVGEFLVSRYGIGYLIVYGSQVFKLDLVMMGVFVLAICAWAMYAVVNIIEKIYNSR >CP012323|2063178:2070422|2068823_2070422_-|AXU64632.1|DBSCAN-SWA MKAAIYSRKSRFTGKGDSIENQIQLCIDYAKSIGVKDFLIYEDEGFSGSNIDRPQFKKMMQDAKDKKFSYLVCYRLDRISRNVSDFSTLIEKLNELNISFISIKEQFDTSTPMGRAMMFISSVFAQLERETIAERIKDNMYELARSGRWLGGNTPHGFNSEKITFLDENLKERSMYKLQVNNEQMEVVKLIYNKYLELRSLSKLYKYIYNNGIRGPRGGKFDPSSLSRILRNPAYVKANDEILDYLKNSGMDVVGTPDRKCGILTYAKNTANSIAAIAKHHGVIEPEIWLEVQNQLDKNRDKTPRISTGKTALLSGLIKCGKCGSNMRITYKGKKTDKDLKYYYICGTKKTLGSDSCNCKNLNGPLVESLVIDKIKNCKEESIISAFNSNNIKADNVFNAFKSETNLLKNQILDKERLIKNLVIELAKNTGSTASDYIVSQIESLNNEISILKDKINTLESSNINISSDSINIDIIVSNLKRFNDEVDNASLDDKRLLLSTIINSIVWDSSLGNLNIVYMGAEMDNSVSLSN >CP012323|2063178:2070422|2066855_2067392_+|AXU64630.1|DBSCAN-SWA MQGGVNIRQVKSFVFPVISLIFLDQISKVLIGLFLMDFEIDIIGKFLRFNPVQNTNLSYGGNFIGILSNLWVLVLFNILVILVIISGYAFYKSKNEQTSYSVKVIMSCGLAGTICSLIDKLFWGGSLDFLQIPSFFIFDLKDCYLTVAEIIFVIIGILHSREISMKEYIYFCYRQFKR >CP012323|2063178:2070422|2063178_2063967_-|AXU64625.1|DBSCAN-SWA MKVVIIPGHTLIGKGTGAVGYINESKETRILNDLIVKWLKIGGATVYTGRVDESSNHLADQCAIANKQETDLAIQIHFNSNVTTSTPVGTETIYKTNNGKTYAERVNTRLATVFKNRGAKSDVRGLYWLNHTIAPAILIEVCFVDSKADTDYYVNNKDKVAKLIAEGILNKSISNSQGGGENKVYENVIVYTGDADKVAAQILHWQLKDSLIIEASSYKQGLGKKVYVVGGEANKLVKGDVVINGADRYETVKLALQEIDKL >CP012323|2063178:2070422|2064777_2064912_-|AXU64627.1|DBSCAN-SWA MGILEGAAMIREIAIKIAKEKGITEQKAWPEAVKEFKEKYELVL >CP012323|2063178:2070422|2065956_2066466_+|AXU64629.1|DBSCAN-SWA MLSENIKTIRKSKGLSQQELAIKLNVVRQTISKWEQGLSVPDSDMLISISEVLETPVSTLLGETIVESEVDNLKVISEKLEIINLQLAQRKNMRRKMFHWLFILLCAVIVIGFLVLGGLNSPYLDWNYTDPETAVFGVAFHAFEWLFVRLAPIVLIGAIIGSFLTRKKI |
8 | Clostridium_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2435777 : 2510518
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP012323|2435777:2510518|DBSCAN-SWA 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60 | Clostridium_phage(35.29%) | protease,tail,tRNA,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2758927 : 2767720
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP012323|2758927:2767720|DBSCAN-SWA ATTAATCTTCATCTTTCCAGCTTTTTATCCAACTTCCTATTTCTATTATTTTTTCTTCAGTTATTTCTTCTTCATTATGTAATTTTAAAATTAATTCTGATAAAGGATTGTTATGTAAACCTCCAAAAATTCTTTTTCCCTCTATTTTGAGATATTCTCTCTCTTTTATTAATACTGTATAGGGTACAGGCCTCCCAATTCTCTGTGATATTAAAAAATCTTTTTTAGTTACTCTTGCTAAAAGTGTAATTGTAGTTGTATGCTTCCAACCATATGTTTTTTCTATTTCATCTGCAACATCTTTTGATATTACAGTTTTATAACCAGTATTCCATATGTATTTCATAATTTTTAATTCTATATCTGGTAATTTTTTATTTAGCATAATATATTCCTTCTTTCAATTTATGTTACTTCTTCAAATTTATCTAGCTTAAATTAATAATAGGAACTTTTTAGAACAAAAACTATAGGTGATTTTTACCAAGTATTCTATATGTTTAGTCTGTTTTTTAAGTGTAAAATTATGTTCATACCTGTAAATTTATTCAATTTTCAAACAATCTTGTTGAATAATAACTAATTCTATTGTATTGTATTGTTTAGTTATAGAATAAAACTAAATCGGCAAAACTAGAGAAATCTAGTGACGCAAAGCTATAGGGACTAAGACTTATATAAATATATTATGAGTTATGTCAGCCAGTTGCCAAAGAGATATTGTTCTTTTTGTTTTTATGAAAGTTTTTTAGGGGGATAATAATTTATATGTTTGGAAATAAAATGGATAAATGTACACATGTATTGACTGCTTATATTAGCAGTTCATATGATTATTGTAATTTTTTAGATACACAGTTAGATGATTTTATATTAGAGTATGGAGAAAATATAGTAGAGTCTTGTTTACACCAAGTAATGGTATTGATAAGTAAGTATAATTAGATAGACATTGATTTCTAGAGAACCCTTTTTAGTTTTATCTACATTTATATTAATATATAGCAATGTAAAACGCTTAAATGTATTTTTAATATTAAGAATAACTAAAATGTTAACTAAAAAATATAATTAAGTAGACATTTCTATTAATCTATGATATAATAGTATTTGTGGTAATACACAATTAAATCAAGTATATCTTGATATAGGTTAATAGGAGTATTTTTAATGAATAATGGAATAGTGAAATGGTTTAATAATGAAAAAGGATTCGGTTTTATATCAATGGAAGGTAGAGATGATGTATTTGCTCATTTCTCAGCTATACAAACTTCAGGATTTAAATCATTAGAAGAAGGTCAACAAGTAAGCTTTGATATAGTTAAAGGTGCTAGAGGTCCTCAAGCAGAAAATATAACTATATTATAATATATAGATTTTTCGGGAGAGACTCTTTTTAGGGTCTTTTTTTTATTGTTAGTATATATAAGATAATTATTGATGAAGTAAATAAGGTATATTGAGTAACGTTCTTGATAGTTTATACATTAATTAATTTCAAAAAAATAAGCACTCATATAAAAAGAGTGCTTTATAATGTATATTTATGAAATATGCAATATAATTATAACATGTCTTATGTTTTAGTATGATAGTTTTCGTTCATTGTATTATTACAATGCATATTATAGTTTTACTCATTTATATTAATAATTACATATGTAGATAAAATTATTTATATATATATATAATATTTAGCAACTTCATTCAAATATAATCTATTTTATGATATAATTATTATAAAATTTCAAATCATTTTCGTATTATTAAATGAAATTTATGCAAAATTATTTAAGCTATGGAGAGTTTTATTATGTTAGATATGTTTATAACAATCGTTTCTTCTATTATAGAGATATGGGCATGCAAGAAAGTGTTTGATTACACAAGTAAAGTAAAAACTAGTTTAATAAATTTATATTTTTTAATTTCCACTTTTATTATTATTTCTACTTTCTATACTAATGTTGGTGCTGATAATAGAATATTAATATGCATTTTTGTAATGTTTGTTTTTTATAAATCAAATTATGATGTTAATATATACAAATGTTTAATAGTTTTGTTTTCTTACTGGGCAATACTGGTGTGTATAAATGCATTAAGTATGATAGTAATAGTTTCGATAAATAATTTGAGTTCTATGAATATTTTATTAAATGATAATTTTTATAGATACGAAACTATAGTTTTAGGAAATGTAGTTCTAATTGTTTTGTTATGCATTTATAAATTCATATCTAATGATTTGCAAGTGACTAAAAAAGAAATTTATATGTGTATACCAATAGTAGCAAATATGATATCATTTTTTATATTTTATAAATATATCTTAAAACTTCTAGATATTTCTTCCGCTACCAGATTAGATATATTAATTATGGTACTATTATTAACATTTTCTAATATAGTATTGATTTCTAGCCTAGTTAAAATATTAAAAAGTAATAAAAAATATATTGAGTTAACTAAATTACAGGAAAAAATAAATGCTGAAAATAAATATTATAGTAATATAAAAAAATATTATATTAAGACAAAAGAATTAAACCATGATATGAAAAATCATCTTATTTGCATTAAGGAAATGAATAAAAAGAATATTGATACCAGTAATTACATAAATAACATAGAAAAAAAGCTTGATGAATATAGTGCTGTATTTGATACAGGAAATATTACTTTAAACATTATATTATTAGAAAAAAAAGAACTTTGTATAGAAAAAGGAATTGATTTTACAATTAATATAAACTTTAGTGATTGTAATTTTATTAAGGAAGAAGATACATGTTCTATATTTGCAAATGCATTAGATAATGCAATCGAAGCTTGTGAAAAAATCAAAGATGATGATAAAAAAATCAAATTGCAGGGAATGGTATTAAATAAATTCTTTGTAATAAAAATTACTAATACAAAATCAAATGATATTTTATTAAAAAATAATGCTTTTTTAACTACAAAAGAAGATAAAGAGTTTCATGGATTAGGAATAAAAAGTATAAAAAATTCTTTAGAAAAATATGATGGTGCAATTTCTATAAATTTCTCTGAAAATTTATTTTGTTTAAATATGATGATACCAATTAGAAAATCACAAGAAGATTCAAATATTGCATATGAGAATAGTTAATATCCATAATTTATTAATAAAATTATTTAAGGAGAAAACTAAATGATAAAATCTTGTGCTGATAAAATAGCTTTTTTGTTTGTTTTAAATCAAGTAATAGAAAAAGATGATTTAGAAATCTGTTCATATGGATTAGAAATTTTACTATCTTCCATAATAAATACTCTATCTTCATTAATGATAGGTTTAATATTAGGTAGATTGATTTATTCTATAGTATTCTTAATATCTTTTTGTATAATAAGACAATTTTCAGGTGGATATCATGCAAATAGCAATAAAAACTGTATACTAATTTTCAATAGTATTTTTTTTATCTCTATGGTTTTGGGAACGATTTTAAATAATTCTAATCCTATTCCGTTATTTTTAGTGATATTGTCTAGTTTTAACTTTCTAATCATTTTTATTTTTGCTCCAGTATGTCACACTAACAATCCACTGAATGAAACAAAATATAAAAAAAATAAGTTACTGTCAAGAACTATATCTATAACTTTATTCTTGATTATTCTTTTAGGATGCAAATACTTATCTTTTTACAATTATGTTGTATACACTTTTTTAGCTTTACTTTGGATAAATTTATTACTAATTATTCAAATCATTATAAATAAAAAATAATTTAAGGAGATACTAACATGAAAAAGATTCTATATAATTTTATGAAAGCGTGTGGTGTATTAGCTATGTTTGTAGCATTTTTATCTGCAAACACAACTTCTCTGTGGCATGTGTATCAACCAAAAACACCAGAAAAACTAAAAAATTCTAAAAACCACCAAAAAGAAGGTAACAACTAACTCTAGTTGCTACCTTCCAATCTATCTATCAATAAAATCTAATGCTTTGTAAAGTGTATCAAATCTACCATTACCTTTTATCAGGGTATAATTTTCTTTAGCCATGGAACCTATCTTCTCACATGCTCCACCACCAACAACATATAAATTTTCTGTCTGACCTGGTATATAATCTTTTATATCACATATTAATATTTTTCCATCATTATAACCCCAACCAACTACAGTTGCAGGGATTTTGTCAACTTCTCCATCATAAACGATTGCATGTTTGTACATCAGTTTAACTCCATCATTATCTATTTTTTTATTTAAAATACCTTCCGCTATTAACTTAGCAACTATGTCTTTATGTCTGATATAATAGTCTGTATCTGCTTTACTATCTACGAAACACACTTCTATTAATATTGCAGGAGCTTTTGTATGACTAAGCCAGTAAAGACCTCTTACATCCGATTTTGCACCTCTATTTTTAAATATTGTTGATAGTTTTTTGTTGACTCTTTCAGCGTATACCTTACCATTGTTAGTTTTGCATATTGTCTCTGTTCCCATAGGATTTAGAGTTGTTTTATTTGCGTTGAAATGGATTTGTACTGCTAAGTCTACATTTTGCTTATTGGCTATTTGACATTGCTCTGCTAAATAGTTATTAGATTTATCTACCTTTCCAGTATATACAGTAGCTCCACCTTGTTTCAACCATTTAACAATTAAATCAGTTAAAATTCTGTTTTCTTTTCCTTCATCTATATAGCCAGTTGCTCCTGTTCCTTTTCCACTTAAAGTGTGTCCTGGTACTATTGCTATTTTCATTGCTTTTCACCATCCTTCAACTGTTTGTAAACTTGATTTGCTCCTATTGCAACTCCCCAACATAAAATTCCTTGCAAAATTGAACTTGGATTAAACCCTAGCATCCATATTGAAAATACTATACCAAGTGCTAGCAGTATAACTGAGATATATTTATTATCTAACTGTTTGTATTTCTTAAATCCAAATCCTAATACATTAAGAGCAACTACTAATAAAAGTAGTTGCTCTGGTATAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP012323|2758927:2767720|2762107_2762689_+|AXU65251.1|DBSCAN-SWA MIKSCADKIAFLFVLNQVIEKDDLEICSYGLEILLSSIINTLSSLMIGLILGRLIYSIVFLISFCIIRQFSGGYHANSNKNCILIFNSIFFISMVLGTILNNSNPIPLFLVILSSFNFLIIFIFAPVCHTNNPLNETKYKKNKLLSRTISITLFLIILLGCKYLSFYNYVVYTFLALLWINLLLIIQIIINKK >CP012323|2758927:2767720|2762889_2763687_-|AXU65253.1|DBSCAN-SWA MKIAIVPGHTLSGKGTGATGYIDEGKENRILTDLIVKWLKQGGATVYTGKVDKSNNYLAEQCQIANKQNVDLAVQIHFNANKTTLNPMGTETICKTNNGKVYAERVNKKLSTIFKNRGAKSDVRGLYWLSHTKAPAILIEVCFVDSKADTDYYIRHKDIVAKLIAEGILNKKIDNDGVKLMYKHAIVYDGEVDKIPATVVGWGYNDGKILICDIKDYIPGQTENLYVVGGGACEKIGSMAKENYTLIKGNGRFDTLYKALDFIDR >CP012323|2758927:2767720|2762706_2762868_+|AXU65252.1|DBSCAN-SWA MKKILYNFMKACGVLAMFVAFLSANTTSLWHVYQPKTPEKLKNSKNHQKEGNN >CP012323|2758927:2767720|2765012_2765171_-|AXU65255.1|DBSCAN-SWA MDNFLQGILASLSASLIVYVASKLFRKRKKPLKAATKSGWEFDLKIRFHKTK >CP012323|2758927:2767720|2763683_2763944_-|AXU65254.1|holin|DBSCAN-SWA MDNLISFIPEQLLLLVVALNVLGFGFKKYKQLDNKYISVILLALGIVFSIWMLGFNPSSILQGILCWGVAIGANQVYKQLKDGEKQ >CP012323|2758927:2767720|2758927_2759311_-|AXU65247.1|DBSCAN-SWA MLNKKLPDIELKIMKYIWNTGYKTVISKDVADEIEKTYGWKHTTTITLLARVTKKDFLISQRIGRPVPYTVLIKEREYLKIEGKRIFGGLHNNPLSELILKLHNEEEITEEKIIEIGSWIKSWKDED >CP012323|2758927:2767720|2765528_2766899_-|AXU65256.1|DBSCAN-SWA MELKKLLSLGLAVSMFAAGPISANALDTIYTIQGKDKYETAALIADEQNYTTAILINADSTMADGLSASGLAGATNAPILLTKKNNIPNATLKRVEKAKKVYIIGGESSIDKATETLLKDKGIEAKRLQGSDRIKTSYNVAKEINSINKVNKVILTNAFKGEPDAMSAASVAVRDKAAIVLTDGKSVPFNTTGVESYVIGGTSSMSDKLVNDTNSTRLGGVDRYDTNKKIVNKFYNGAKEFYIASGTDLVYALVASPMAKNNPIVLVDIGSNKDILKNAAKVTGIGNLSDKIMLECENTINNISLPSSNKNIICGLKIDFDSKHIIWQDKGSYLECYDDNLEYYTEKYKDPTVPINIENTSTQNLDVTKLKVYGEANSTLYMGQYAKIKMDFNSFGVLKPGEKCTIYLDIISLDPSRSMTLTFSYVGDKENYKYEQGLASRILFYNPDGEDFFEYK >CP012323|2758927:2767720|2760096_2760297_+|AXU65249.1|DBSCAN-SWA MNNGIVKWFNNEKGFGFISMEGRDDVFAHFSAIQTSGFKSLEEGQQVSFDIVKGARGPQAENITIL >CP012323|2758927:2767720|2767297_2767720_+|AXU65257.1|integrase|DBSCAN-SWA MTFVERCYKYIDMNKNNWSPYTVTNTKSLVKNYIEPFFKNLKLTEVNPSSVQAFVNYNFNNSTFTSAKVRYSFLSSVISEVYRLREIQENSCDFIKLPSKEKYSTNEIYNREEVLLLIEKLLGNNIEIPILLMLLLGLRM >CP012323|2758927:2767720|2759694_2759871_+|AXU65248.1|DBSCAN-SWA MFGNKMDKCTHVLTAYISSSYDYCNFLDTQLDDFILEYGENIVESCLHQVMVLISKYN >CP012323|2758927:2767720|2760742_2762065_+|AXU65250.1|DBSCAN-SWA MLDMFITIVSSIIEIWACKKVFDYTSKVKTSLINLYFLISTFIIISTFYTNVGADNRILICIFVMFVFYKSNYDVNIYKCLIVLFSYWAILVCINALSMIVIVSINNLSSMNILLNDNFYRYETIVLGNVVLIVLLCIYKFISNDLQVTKKEIYMCIPIVANMISFFIFYKYILKLLDISSATRLDILIMVLLLTFSNIVLISSLVKILKSNKKYIELTKLQEKINAENKYYSNIKKYYIKTKELNHDMKNHLICIKEMNKKNIDTSNYINNIEKKLDEYSAVFDTGNITLNIILLEKKELCIEKGIDFTININFSDCNFIKEEDTCSIFANALDNAIEACEKIKDDDKKIKLQGMVLNKFFVIKITNTKSNDILLKNNAFLTTKEDKEFHGLGIKSIKNSLEKYDGAISINFSENLFCLNMMIPIRKSQEDSNIAYENS |
11 | Clostridium_phage(66.67%) | holin,integrase | attL 2766205:2766220|attR 2768338:2768353 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
3075971 : 3084924
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP012323|3075971:3084924|DBSCAN-SWA TCTACTTTTCTCTAGTTGTTGCAATTTCTTTGATATTAGCATCTTCTGGTTTAATATAAGTTGGCACTAATTCCCTCATAATACCATCTATTTTTTCAACCTCTTCATTGTTAGTAATTTCTCTTAAAAGTTTTAAGTATTTTGTTATTTTTTCTCTATCAACATCTATTGGTCTACCAATAAAAATCTTTTTATGCTCTGTATCCAACAGACCTTCTTCTGACATAAGTAGTTCTTCATACAACTTTTCTCCTGGTCTAAGACCAGAAAATTCAATTTTTATATCAACATCTGGCTCAAATCCACTGAATTTAATTAAATTTTTTGCTAAATCCAATATTCTTACAGGTTCTCCCATATCAAGCACAAATATTTCTCCACCTTTAGCCATAGCTCCAGCTTGTATAACTAAGCCTACTGCTTCTGGTATTGTCATAAAATATCTAATGATATCTGGATGAGTAACTGTCACTGGTCCACCATCTTCAATTTGCTTCTTAAAAAGTGGAATTACACTACCATTACTACCAAGTACATTTCCAAATCTAACAGCAACAAATTCAGTCTGGCTTTCAGCATTCATAGTCTGTATAATCATTTCAGCAGCTCTTTTAGTAGCTCCCATTATATTAGTAGGGTTTACAGCCTTGTCTGTAGATATAAGTACAAATTTCTTGGCTCTATATTTTGAAGACAAGCCAGCTATGTTTAAAGTTCCAAATATATTATTCTTTATAGCTTCGCCAGGGCTCGATTCCATAAGAGGAACATGTTTATGTGCTGCTGCATGAAATACTACTTCTGGTTTATATTTATTAAATATTTCATCCATTCTTTTTTCTTCTCTTATTGATGCTATTACTGTCTTTAAATCTAATTTATTTTTATACTTTCTAAGTAATTCTTGTTGTATTGAGTAAGCATTGTTTTCATAATTATCAACTATAATAAGCTCTTTAGGATTAAATCCTGCAATCTGTCTGCAAAGCTCTGAACCAATTGAGCCTCCTCCTCCAGTTATTAGGATTACTTTTCCCTCAATATAATTACTTATCTCTCTTAAATTTGTTTTTATAGGCTCTCTGCCCAACAAATCTTCTATCTCTACTTCTCTAATCTGTTTTATATCAACTTTTCCATCTATAATTTCGTAAATTCCTGGTATTGTCTTTATTTTACAGTTAGTGTTTTTACATATATCAATAATCTCTTTTTTTCTACGTTTCTCTATGTTTGCTATCGAAAAGATTATCTCATCTACATTGTACTTTTCTACCACATCTTTTATATCTGAAGTTGTTCCTACAATTTTCACATTATGGATTATTCTTCCAATTTTATTTTTATCATCATCAATTATAGCCACTGCTACTTTCTTAAGTTCTGAATTTCTTTTTAGTTCCTGTATAACCATTTCTCCTGCATCTCCTGCACCAATTATAAGGATATTTGAAACCTTTCCTCTAGAATATGTCTTGTTCATGACTATTCTTATAGCTCTATAGGCTATTCTTGCACCACTTGTAAACATTATAATAAATATTGTATTTAATACATAAAACATTATAGGATAATTAAACCCTAATAATTTATTTATTATATAAATTGGAATTAAATAAGCTAAAGTTGCCATAAAAATAGATATAATTTCTTCTTCTCCTGCATATCTCCATAATGTGTTGTAACACTTAAACAATCTAAATGATACTATATGAAGTACTATATATACACAAGCTGAAATTATTATATCATTAGTGATAAATGCATTTAAATTACCTGTCAAGCTTAAAGACATTCGAAACGCTACTAGTACGCTACAAATATCTAGAATTAATAGTGTTAAATGTCTAAATTTATATTTTTTAAAAAGCCTATTAAAAAAGCTTTCTTTCTCTAAATCTATACTTTCTCGCATAACTAGAAGCCCTCCTTTAAACAGCAAAAGCTACGCACCTAAGCATAGCCAACAACATCTATCTTTTGCTGTATTTTTTCATTTTATTTTTTATATTTATCAAATATAGAATCATAAATTTTTTCTATATCATTAAAGTTTAAATTAACCTCATAATTTTCTCTAACAAATTGACGCCCTTTCTTACCCATACTAAGTCTAAGTTCATCATTTTCCATTAGTTTTATTATAGCATTTTTTATTTCTTCTGGTTGTTTTGGTTCTACAATTAAGCCAGTTTCATTTTGCCATACAGATTCTGGATGTCCTCCTACATTTGTAACTATAACAGGTACTTCACATGCTTCTGATTCTATAGCTGCCACTCCAAATCCCTCTCTTAAAGAAGGAAATACAGTTACATCAAAAGAATTAAAAGTCTTACTTACATTTTCTGGAGATATTCTTCCTAAAAACTGAACATCATTTTCTATACCCAATTCTTTAGTTAAATTTATTAGGTTGTCCATCTGACTTCCAGAGCCACCTATTTTAAGAATTATTTTCTTATCTTTATATTCATCTTTAAGCATCTTAAATGCTTGTATTAAATATTCTATTCCGTATTTTTTTTCTAAACTCTTTATAATTCCTATTACAAAAGCGTCTTCTTTTTCTACTTCCATAGGCTTAAACCTATCCATATCTACTCCAAAAAAGGTTACATCTACATGTTTAGCTGTATATTTATTAGCCTCTTTAGCCATATCTCTACTATTTGAAAAGATATAGTCTGCTTTTCTAAAGTTATGTTTTATAATTTGTTTTTGTATAAAACCATTATTAGGGAAATCATAAATATCAGTACCCCAAACAGAAATAATATATGGATGATACCCAAGTAGACTTCCTATAAATCCATAACTACTTGCATACTGTGCATGCAATATATCTGGCTTTATTTCATTTACTAGCTTCTTTATCTGTTTTATCGAACCTAAGTATCCCGTTTTTTTAGAAATATTTTCATTTTTTAGCTCTTCTACATTAGAACCAAAATTATAAATTTTTATTCCTTCCATGTGACCTCCATTTAAAGAGATTACATGAATGTCATATCCTTTATTTTTAAAAAAACTACACCATTTTAAAGTATGAGGATTTGACCCATCAGCTAAATAACAAACAGTCTTCATAATATTTACCTTCCTATCGAATAATACTCAATTCCTAACTCTTCCATATCTTTAACTTTATAACAATTTCTTCCATCAAGGACTAAAGGATTTTTCATCTTTTCCTTATACTTATGTATATCATAATTTAATACATCTTTCCATTCTGTCATTATAAAACATATCTCTGCATCTTCTATCGCATCATCTACAGAATCAGCATAAAGTATAGAGTCACCAAATATTTTCTTAGTATTATTTACACCAATTGGGTCGTATACAGTAACTCTTGCCCCTCTTTCGAGCAAATATTTTATATTTGGTATAGATGGTGCTTCTCTTATATCATCAGTATCTGGTTTAAAAGTCAAACCTAAAACAGCAACCTTCATATCTTGAAAGCTCTCTACTAACTTAGATGCCTTTCTAACTAATTTAAGTTTTTGACTTTCATTAACTTCTATTGCAGCTTTTACTGTTTTTAATTCATAACCATTATGTTCAGATAACCAGTGAAGAGCTTTTGTGTCTTTTGGAAAGCAAGAACCGCCATATCCTATTCCTGCCTTTAAAAACTTACTTCCTATTCTATCATCATAACTCATTCCTAAAGCTACATCTTCTATGTTAGCCCCTGCTATTTCACAAAGATTTGCAATATCATTCATAAATGATATTTTAAGAGCTAAGAAGTTATTTGATGCGTATTTTATCATCTCAGCACTATTTCTATTTGTAACTATTATAGGTTGATTAAAAGGCTTATAGATTTCTTCTAATATTTCTCTAGCCCATTCACTTTCTACACCTATAACGATTCTTGAAGCATGTAGAGTATCTTTTACTGCTGTTCCTTGTGATAAAAACTCTGGATTAGATGCAAGTTCTACTTTTACATCATTTTTTAGGTTTCTATTTATATAATCTTCTATCTCTTCATTTGTACCAATTGGAACTGTAGATTTTATTACTACTAGAGTATCTTTTGTCACAGTTTCAGCTATTTGCTTTGCAACTGCCTTTATATAATCTAGGTTGGCTGAGCCATCACTTCTCTCAGGTGTACCTACAGCTATTAATATTACATCTACATCTTCATAAGCTTTTTTATAGTCTGTAGTGTAATCTATTCTTCCTCTGTTGTAATTTTTAACCATAAGTTCTTCTAGGCCTTCTTCATATATAGGTGCTATTCCAAGTTTCATTGATTTAACTTTTTGTTCATCTACATCAACACAGACTACATTTTCATTGCCTACCTCTGCTAGACAAACACCTGTAACCAAACCTACATATCCCGTCCCAGCTATAGCTATTTTCATTTTTTTACCTCCAAGTATATAAAACTTATACTCTTTTTTTAATGGCATTAAAAACATAGAAACAAAATACATATAGACTTTTTGGTAAACTTAAATTTTCAACATTTCTATAAGTATTCCAAGTTCGTTTTAATGCTTTTATCTTGTTACTTGATATAGAATTTCCAACTAATCTGTAATTCACTAAATCTTCTTGAATCCCATATGCATATTTTTCCTTTTTAAGTAACTGTAACCAGGTTGCAGTATCTTGTCCTCTTCTTACCAAAGGCATGCTGAACTCTCCTACAATCTCCTTATCAATGACCACTGTAGAACATCCTATTATAGTATTTCTAAGTAATCCTTCATAGTCAATTTTCTTAGGAGCTCTTGCAACCTTATTCGTTTTTGACCCATCTTGTCTCATATATCTATAAGATGTAAAAGAAAAACCTACATTTTCTTTTAACATATATTCTATCTGAATCTCTAATTTTCTACTATCCCATAAATCATCACTATCTACAAATGCAATGAATCGACCTTCCGCATTCTTAATACCAACATTTCTAGATACTGCAGCTCCAGAATTTTTTTCAAGCTTTATATATTTTATTCTAGCATCTTCCTTTCGAAAACTTTTTATAATTTCACTTGAATTGTCCTTAGAACAATCATCCACTAATAAAAGCTGCCAATTTTTATAAGTTTGATTTTGGATTGACTTTATCGTCTCTGATAAAAACTCTTCTGAATTATAAACAGGAGTAATTATCGATACTAAAGGCTCATTCATATTTTTACTCTCCTTATATAGCAACTAGCAGTACTATACCAACAAGTTTACTTAGATACTAATTTTCTTTGTCCAATATATTTGTAATATCCTAATGGGAATAATGCTAAATACAACAATTTATCAGATACTTTTCTTAATTCACCAAAATAATGACTATCAGACAACAATGAGTATCTGGCTAAATTTATGTAATTTTTTATCCACATATATGGATATCTACTCAATGGATATGTATTTTGATTTATTAAATATAAAAACTCTAATGCTCTACCTCTTAATGCATTTTTACTTAATATATTCTTAGTCAAACCATCATCCAAATAATCTCTTATTATCATAGGTTTATTTACACATATAACTTTATAGTATTTAGACATTTCATTCCATACTACACTTTCTGGTAAAAATCTCACTTCTTTTCTTTCTGGAAAAGGAAATTTTATAAGCTCATCAGTTACAAATACTATGCTTTTATCTCCCTTAACGCCATACTTAAAATATAGGTCTGCAAAGTGACATATTTTCTTATCTTCAGGCATTTCTGTCCCTATCAAATCTCCACTTGGATATACACAAAGTCCAACAACTCCACTAAATCCTTCTTTATTCTCTAAAGAATCCCACTCATCATTAGCAATTTTAAGAGAATCTTTAATTAAACCATCATCACTATCTACAATGAAAAATAGCTCTCCATCTGCATTTTTTACACCTAGATTTATTGCAGTATGTTTTCCTCCATTTTCTTTGTATATATATCTTATATTTAATTTATTTTCTGATATAAATTTTTCAACTAACTCTTTAGTACTGTCGCTACTTCCATCATCAACAATCAACCATTCAAAATCATTGAAATCATAAGTTTGAGCTTTTAAATCATTGTACAAATTTTCAAGTAAATGAGCTCTGTTATACGTCGGAGTAAATACAGTAAATTTATATTTATACATTAATTAAATCTTCCTCTCTGTCTAACTTTTTTTGATTCCGTTTATTCCATAATTAATAAAGTAGTATATAGCTTTGTATAAAGGTATTTTTTCTATATTTCTATATATATTCCAAGTCCACATAGCAGCTTTTATTTTATTACCACTTAGGGAATTGCTAGATTTTCTATATAATGCTAGAACTTCATTTATTCCATGAGCAATATGCCCTTTTTTCAATATCGATAACCATAAAACATAATCTTCATGTCTTACACCACTCATTCTTATTTCAAAATCCAATTTAGACTTATCAATCACAACAGTAAGACATCCTAAGATATTTCCTTTTAATAATCTTTTATAATCTACATTAGGTGGAACTTTTATTACTTTGTTTAATTTTTTATCATTTTCATCCATCAGTTCATATGAAGTAAATGAAATTACATAGTCATTTTCTAACATAAAATTTACTTGTTTTTCTAACTTACTACTATTCCATTGGTCATCACTATCTAAAAAAGCTATAAATTGTCCTGTTGCCTTACTTAGTGCTAAATTTCTAGCATTAGAGACACCCTTATTAGTCTCAGTCTTTATACATTTTATTCTACTATCCTGTTGCATATAAGATTTGACTATATTAGGACTATTATCTGTTGAGCAATCATCAATAATTAACATTTCCCATTCTTGATAAGTTTGGTTTAATACTGATTTTATGGTTGCTTCAATAAATTTTTCAGAATTATACATGGGAGTAATTATAGATACTAAATTCTTCTTCATATTACCTTCCTCATCATTTATAAAATATTTATTTAATTTTACTTAATACACAATCATATATCCTCTTGCAGTTCTTATTATCATTATATCTGAAAAACTTATTTCTTTCATTTTTTTGGTTATCCATAACCTCAAAATTATTTTCAATAATATCAATAAGTTTATTCACGGCTTCATCATTATTATAAGCCAAAGACCCAAACATTTCACTTTTTAAATCTATATATGAATCAACTTTTTCCATATATTCATCCAAATCGAATTGGTAAAACAAGATAGGTCTATTCATATACAAAAAGTCTATGGCTACACTTGAATAATCAGTTATATTTGCAGCTGATTTTCTAATTTCATTTGCTAGAGTTACCCCTTTATCTAAAAACACAATTCGTTTTCCTGTTATATTTTCTTTTATATCATCTATAAACTCATGCATAAGATGATGCATATAAATTTTTACATTTATATCTTTCTCATCTAATATTTTATTTAATTTATCATCATTTAAAAAATTCATTATATTTTTAAAATAATCTGTATCCGTAAATTTTCCTGAACTAAATTTTATCCAATCTCTCCATGTAGGAGTATATAATATATCTCGAGTTTGTGCAACTTCATTTGTTGGTAAATTGTCATATCTTGCATTTCCAATTATATAAACTGAGTCATCTAACATTCCCCAATCATTTACCATAACATTTCTTTCAAATTCAGAACTTGCTGTAACTATATTATAGCTTTTATATAGGTTATCTATAATGTTTTTGAACTTTTTGTTCATAGGTTTTCTCTTTTTAAAACTTATAGTCCCATGATTTAAAAACACTTTTATCGTTTTTTTATGAAAATAATTAAGAACAGGTACAGCAAAATTGTATGGTGCTATATCTGCTGATGGTGCATGTGAAAATACTATAGCTTTTGAATTGTAATAATACAGATAGTTTTCTACACTTCCTCTTATTAATTTTTTGCCTGGAATTTTATCAAATACTTTACTGTCTTTATTTACTACCCAATAAGTTTCTACATCATTATGTTCTTTTAGCATATACTCATAAAAAAACTTTGAATTATCATTGTATATATCCCCTGAATGTCCACCTATAAGCCAGATATTTCTACCATTAAACTTATGCTTATTAAATGGATATATAAAAAAAGCCAAAAGCATATTTATTAAAAATTTAACCTTGTCCATAAACACCATCCTCATTATAACTTATACTGTCTAAATCCATTAATTCTTCCTTTTATAGTGGCACTATGATAATCTCTATTGGAACTCAATATAAGACCTCCTATATTTCTTACAAGTTTTGATACCATAACTTTTGCAAACTTATAATTTTTTCTATAGACTATTTCCTTTTTGCAAAGCGCTCCAAAGCCTCTTCCATAGTTATAATCTTTTTGATACTTTTCTTTAGATTTAGAATGTTTTTTTGCAGGATGGTAAATTATATCATTTCCAAAGTATTTTCCTTTAAAACCTAAACTCAATAAGTTTAAAACATAATCTATCTCTTCACCAGCACCAAACTCTCCACCAACACCCAATTTTTCATCAAATCTTGTATAATCCTTACCTTCAAAATCAATAAAAAAAGTTATGGATGTTATAGTATCCAAAACGTTGGAACTTGTGATATCACAAGTTCCATCATACATTTTCTTAAATGCATCAACTTTATTTGAATCCATAGTTTTGCAACTGTATATTTTATAATCTTTATTTTTATTAAAGAAATTTATAACTTTTTCTAATGTATCATTTTCGTAGACACAATCATCATCAGGGAAACCTATAATTTGCCCTACAGCATTGTCTATGCCTACATTTCGGTTATAACTCAATCCTTTTTTAGAACTTTTTATATACTTTATATCTAACTTATCAATGTATTTATCAACTATTTCTTTAACTTTGCTATTATCATTTTGGTCTACTACTATAAGTTCAAAGTTTTTGTAAGTTTGATTTTCTAAGCTGTCCATAAGTAAGTATATATCATCATATCTATTTAATGTTGGCATTATTAATGATATTAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP012323|3075971:3084924|3081186_3082095_-|AXU65515.1|DBSCAN-SWA MYKYKFTVFTPTYNRAHLLENLYNDLKAQTYDFNDFEWLIVDDGSSDSTKELVEKFISENKLNIRYIYKENGGKHTAINLGVKNADGELFFIVDSDDGLIKDSLKIANDEWDSLENKEGFSGVVGLCVYPSGDLIGTEMPEDKKICHFADLYFKYGVKGDKSIVFVTDELIKFPFPERKEVRFLPESVVWNEMSKYYKVICVNKPMIIRDYLDDGLTKNILSKNALRGRALEFLYLINQNTYPLSRYPYMWIKNYINLARYSLLSDSHYFGELRKVSDKLLYLALFPLGYYKYIGQRKLVSK >CP012323|3075971:3084924|3082894_3084070_-|AXU65517.1|DBSCAN-SWA MDKVKFLINMLLAFFIYPFNKHKFNGRNIWLIGGHSGDIYNDNSKFFYEYMLKEHNDVETYWVVNKDSKVFDKIPGKKLIRGSVENYLYYYNSKAIVFSHAPSADIAPYNFAVPVLNYFHKKTIKVFLNHGTISFKKRKPMNKKFKNIIDNLYKSYNIVTASSEFERNVMVNDWGMLDDSVYIIGNARYDNLPTNEVAQTRDILYTPTWRDWIKFSSGKFTDTDYFKNIMNFLNDDKLNKILDEKDINVKIYMHHLMHEFIDDIKENITGKRIVFLDKGVTLANEIRKSAANITDYSSVAIDFLYMNRPILFYQFDLDEYMEKVDSYIDLKSEMFGSLAYNNDEAVNKLIDIIENNFEVMDNQKNERNKFFRYNDNKNCKRIYDCVLSKIK >CP012323|3075971:3084924|3079065_3080361_-|AXU65513.1|DBSCAN-SWA MKIAIAGTGYVGLVTGVCLAEVGNENVVCVDVDEQKVKSMKLGIAPIYEEGLEELMVKNYNRGRIDYTTDYKKAYEDVDVILIAVGTPERSDGSANLDYIKAVAKQIAETVTKDTLVVIKSTVPIGTNEEIEDYINRNLKNDVKVELASNPEFLSQGTAVKDTLHASRIVIGVESEWAREILEEIYKPFNQPIIVTNRNSAEMIKYASNNFLALKISFMNDIANLCEIAGANIEDVALGMSYDDRIGSKFLKAGIGYGGSCFPKDTKALHWLSEHNGYELKTVKAAIEVNESQKLKLVRKASKLVESFQDMKVAVLGLTFKPDTDDIREAPSIPNIKYLLERGARVTVYDPIGVNNTKKIFGDSILYADSVDDAIEDAEICFIMTEWKDVLNYDIHKYKEKMKNPLVLDGRNCYKVKDMEELGIEYYSIGR >CP012323|3075971:3084924|3077968_3079060_-|AXU65512.1|DBSCAN-SWA MKTVCYLADGSNPHTLKWCSFFKNKGYDIHVISLNGGHMEGIKIYNFGSNVEELKNENISKKTGYLGSIKQIKKLVNEIKPDILHAQYASSYGFIGSLLGYHPYIISVWGTDIYDFPNNGFIQKQIIKHNFRKADYIFSNSRDMAKEANKYTAKHVDVTFFGVDMDRFKPMEVEKEDAFVIGIIKSLEKKYGIEYLIQAFKMLKDEYKDKKIILKIGGSGSQMDNLINLTKELGIENDVQFLGRISPENVSKTFNSFDVTVFPSLREGFGVAAIESEACEVPVIVTNVGGHPESVWQNETGLIVEPKQPEEIKNAIIKLMENDELRLSMGKKGRQFVRENYEVNLNFNDIEKIYDSIFDKYKK >CP012323|3075971:3084924|3082116_3082866_-|AXU65516.1|DBSCAN-SWA MKKNLVSIITPMYNSEKFIEATIKSVLNQTYQEWEMLIIDDCSTDNSPNIVKSYMQQDSRIKCIKTETNKGVSNARNLALSKATGQFIAFLDSDDQWNSSKLEKQVNFMLENDYVISFTSYELMDENDKKLNKVIKVPPNVDYKRLLKGNILGCLTVVIDKSKLDFEIRMSGVRHEDYVLWLSILKKGHIAHGINEVLALYRKSSNSLSGNKIKAAMWTWNIYRNIEKIPLYKAIYYFINYGINGIKKS >CP012323|3075971:3084924|3080386_3081139_-|AXU65514.1|DBSCAN-SWA MNEPLVSIITPVYNSEEFLSETIKSIQNQTYKNWQLLLVDDCSKDNSSEIIKSFRKEDARIKYIKLEKNSGAAVSRNVGIKNAEGRFIAFVDSDDLWDSRKLEIQIEYMLKENVGFSFTSYRYMRQDGSKTNKVARAPKKIDYEGLLRNTIIGCSTVVIDKEIVGEFSMPLVRRGQDTATWLQLLKKEKYAYGIQEDLVNYRLVGNSISSNKIKALKRTWNTYRNVENLSLPKSLYVFCFYVFNAIKKRV >CP012323|3075971:3084924|3075971_3077885_-|AXU65511.1|DBSCAN-SWA MRESIDLEKESFFNRLFKKYKFRHLTLLILDICSVLVAFRMSLSLTGNLNAFITNDIIISACVYIVLHIVSFRLFKCYNTLWRYAGEEEIISIFMATLAYLIPIYIINKLLGFNYPIMFYVLNTIFIIMFTSGARIAYRAIRIVMNKTYSRGKVSNILIIGAGDAGEMVIQELKRNSELKKVAVAIIDDDKNKIGRIIHNVKIVGTTSDIKDVVEKYNVDEIIFSIANIEKRRKKEIIDICKNTNCKIKTIPGIYEIIDGKVDIKQIREVEIEDLLGREPIKTNLREISNYIEGKVILITGGGGSIGSELCRQIAGFNPKELIIVDNYENNAYSIQQELLRKYKNKLDLKTVIASIREEKRMDEIFNKYKPEVVFHAAAHKHVPLMESSPGEAIKNNIFGTLNIAGLSSKYRAKKFVLISTDKAVNPTNIMGATKRAAEMIIQTMNAESQTEFVAVRFGNVLGSNGSVIPLFKKQIEDGGPVTVTHPDIIRYFMTIPEAVGLVIQAGAMAKGGEIFVLDMGEPVRILDLAKNLIKFSGFEPDVDIKIEFSGLRPGEKLYEELLMSEEGLLDTEHKKIFIGRPIDVDREKITKYLKLLREITNNEEVEKIDGIMRELVPTYIKPEDANIKEIATTREK >CP012323|3075971:3084924|3084084_3084924_-|AXU65518.1|DBSCAN-SWA MLISLIMPTLNRYDDIYLLMDSLENQTYKNFELIVVDQNDNSKVKEIVDKYIDKLDIKYIKSSKKGLSYNRNVGIDNAVGQIIGFPDDDCVYENDTLEKVINFFNKNKDYKIYSCKTMDSNKVDAFKKMYDGTCDITSSNVLDTITSITFFIDFEGKDYTRFDEKLGVGGEFGAGEEIDYVLNLLSLGFKGKYFGNDIIYHPAKKHSKSKEKYQKDYNYGRGFGALCKKEIVYRKNYKFAKVMVSKLVRNIGGLILSSNRDYHSATIKGRINGFRQYKL |
8 | Catovirus(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
3574729 : 3596018
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP012323|3574729:3596018|DBSCAN-SWA TATGGAAATGAAATATGTCGTGCCAGATATGGCACAGTCTTTTGGAACTCTTGAATTTGCAGGCGAAAGTGAGCCAGTCTTTGAAAGAGATAAAAATAACCGCAGGGTCTTAGCCAGACGAAGCTATAACCTTTATTCTGACGTACAAAAAGGCGAAAATGTTGTGGTGGAAATTCCCGTGCAGGCTGGCGAAAAGAAGTTCAAGTATGAACAGAAAGTAAAACTTGTCAATCCGAAGTTATACGGCAGAGGTTACGCAATCGGGGATATGGGACATACCGATTATGTGTTAGTTGCTGATGATATTGTAGCAGTTGAAGAAAAGTAAAGGAGTGAAGAATTTATGAGATTATCAAACGGGTTTGTTATTGACAAAGAGAAAACATTTGGAGAATTAAAATTTACAGCGGTGCGTGATGTGTTCTTACAGAATGAGGACGGGACACCGAGTACCCAGCTTAAAAAGCGTATCTATGATTTGAAGTGCAGTCTGCATGGTGGAATTATCCCCGTGTCCGTACCGCCAGAAGTACCGTTAAGGGAATTTCCGTACAATGCAGTTGTGGAGCTTGTCAATCCCGTAGCCGATACGGTATCAAGAAAGACTTATACGGGTGCAGATGTGGACTGGTATGTAAAGGCAGAGGATATTGTATTGAAGAATAAAGGCAACCAGAACGCAGGCAGTCCACAGAACCCTACAACGCAGGGACAGCCGAAGAAATAAAAGTGATGTATTTGTCTTAATTTTGATTGACCAATTTTGATTGACACAAACAATGCGGAGTGATATATTTATCTCATAAAGATACAAAAACATCTCATTTGAAAGGAGAGATAAATATGTCAAAGAAACAAATTAAAAAAATTATTTTTATGGGGGTAGGGTGTGCTTTATTGCTTATTGTTGGTACAATCTACTCCCTATTATACAATAATGGACGCTGGGTCAAAAATATGGATATGTCGGAATATGTATTTTCTTACAAGGATATTCCTATGTTAGTAATTGGAGCTTTAATAGCACTATATGCTATCTATATAGTAATTATCTGCTTTAAAAATGTCTTTTCAAAAAACAGCAGGGAAAAACGATATTCAAGAACAATTTCTCCTTACTGGGGATTTTGTGGAATGTTTGGTTTTCTGGGGTTTGGCGGATTTTGGACATACTATAAATTTGGAGAAATATTTCCTTTTGCTTTTTTCATATTTTTTGGTTTTTTCAGTTTTTTCTTTGAAGGTAAACTTTCTCATATCTTAGAAGATGAGCTTTTTCAAGAAAATAAACGTAAGGCACAATTAGAAGCTTACAAGATAGGTTTTAAACTATTATTTGTAGTTATCTGGCTTATGGCAATAGGTATGTTTTCCCGTAATGTTGAGTGGTGTGCAATGTTTATGCTGATTTCTGTTTCACTTATCTATGCTCTTGTTCTTTTTCTTAGCAACTATTTATTATATCGTTATGAAAAAAGGGAATAAATTATGGAAGCAAAGTTTGTATGTAATTTAAAAAAATATCGTGTAGCACAAGAATTAACACAAGAACAACTCGCTGACATTGTAGGTGTTCGTCGTGAAACTATTATGAGATTAGAAAAAGCACAATATAATCCGTCACTTAAATTGGCAATAGATATTTCAAGAGCTGTAAAAGCTCCGATAGAAGATATATTTATTTTTGAATAAAGACAGTTTAAAGCAGTTAGTCTTAGGATTGACTGCTTTTTTCGTACACAGAAAGGAGAGATTGTTTTATGCGTAAGATTTGGAATAAAGGACACCGTATCAGAGCCAGCGACAAGCACCTTGTTTACCACTTTTCCATAGGAACGCTTCTGTTTGTATTCGTGGCGGTTCTCCTGCTACTGAATAGTAAACAGCTCATGCGTACCGATTGGGAGCATTTCAGCTTGTTAGAGAACGGCTTGACGCTTTGCCCTTACAACTTCATAACTATACTGATAGCGACTGGTGTTTGTGCATTGGTCGCTTTTGGGTATTACCGCTTCTGTTACGACAGTTTCAAGAAGCTCCTGCACCGTCAAAAGCTGGCAAGAATGGTACTGGAAAACAAGTGGTATGAAGCCGATACCGTACAAGACAGCGGTTTTTTTACTGACCTGCAAAGCAGATCAAGGGAAAAAATCGTCTGGTTTCCAAAGATTTATTATCAAATGGAAAAAGGCTTGCTTCATATCCGCTGTGAAATCACGCTGGGAAAATATCAAGACCAGCTTTTACGGTTAGAGGATAAGCTGGAAAGTGGCTTGTATTGCGAGCTGACTGACAAGACCCTGCATGACGGCTATATTGAATATACCCTGCTTTATGATATGATAGCGAACCGCATTACCATTGATGAAGTACGGGCAGAAAATGGCTGTCTTAGACTGATGAAAAATCTTGTCTGGGAATATGACGCACTCCCTCACGCTCTGATTGCTGGTGGGACTGGTGGCGGTAAAACCTATTTTCTGCTGACGCTCATTGAAGCCTTACTGCATACAAACGCTGTCCTTTACATTTTAGACCCAAAGAACAGCGACCTTGCGGACTTGGGAACAGTCATGCCAAACGTCTACCATACTAAAGAAGAAATGATAGATTGCGTCAATGCCTTTTATGAGGGCATGGTACGACGAAGCGAGGAAATGAAACGACACCCGAACTATAAGACGGGCGAAAACTACGCCTATCTTGGACTGCCTCCCTGCTTTCTTATCTTTGATGAATATGTGGCATTTTTTGAAATGCTGGGGACGAAAGAAAGCGTGGGCTTACTTAGCCAGTTAAAGAAAATCGTTATGTTAGGACGACAAGCAGGTTATTTCCTTATCGTTGCCTGCCAGCGTCCAGACGCAAAGTATTTCTCGGACGGTATCAGAGATAACTTCAATTTCCGTGTGGGACTTGGGCGTATCAGCGAATTAGGTTACGGTATGCTGTTCGGTTCAGATGTGAAAAAGCAATTTTTCCAGAAGCGTATCAAGGGGCGTGGCTATTGTGATGTGGGAACAAGTGTTATCAGTGAATTTTACACGCCTTTAGTCCCGAAAGGACATGATTTTTTACAGACTATCTGCTCTCTTGCACAAGCAAGGAAGGACGGGACGGCGACGTGCGAAGCGAAAGGCGACGGCACGGACTAGCCGTTGCTGGTGTGGCGTAAGCCACGCCAGCAGGTAAAACCCCTCGGTATCTAACAGAGGGGTACGTTTGCAAATAGACAATAGACGAAAAACACAGGAAACATAAGGCTTATCGCATGGTTTCCTAGCAAAAATCGGCTGTGAAGTCGCCTTAAAAAACTTCACACTTGACAGATTGGGGGTATGGTTCTGAATGAAGAACAATGGATAAAAGAATTACGGGAAAAACGGATTGCTTACGGTATCTCACAAGGCAGGCTGGCGGTGGCGTCTGGTATCACAAGAGAATATCTCAACAAGATAGAAAGCGGAAAAATGAAGCCGTCAAAGGAACTTCTGAATACTCTGCATAAAGAACTGGCAAAGTTCAATCCAGAAGCACCGCTTACCATGCTGTTTGATTATGTGAAAATTCGTTTTCCCACGCTGGATATACAGCACATCATCAAAGATATATTAAAACTGAATATCAACTATATGCTCCATGAAAATTACGGGCGTTACAGTTATACGGAGCATTACTCTTTAGGGGACATCTTTATCTATACGTCGGCTGACGAAGAAAAAGGTGTCCTTTTAGAGTTAAAGGGGCGTGGTTGCAGGCAGTTTGAAAGTTACCTGCTGGCACAGCAAAGAAGCTGGTATGACTTTCTTATGGACGCACTTATAGACGGTGGCGTGATGAAGCGTATCGACCTTGCTATCAACGACCATACGGGCATTTTGGATATTCCAGAGCTTGCGGAAAAATGCAGGAAACGGGAATATATCGGAAAGTCCAGAAGCTATAAGTTTTACCAGTCGGGCGAGCTTATCAAGCACAGAGAGGACGACAGAGAATATATGGGGCGTACCCTTTATCTTGGGTCGCTGAAATCAGATGTGTATTTCTGTATCTATGAAAAGGACTATGAGCAGTACGTCAAGTTAGGGACACCTCTGGAAGAAGCCGACATTATCAACCGTTTTGAGATACGGCTTCGCAATGAACGAGCCTATTATGCGGTACGAGATTTACTGACCTATTATGACGCAGAACAGACCGCTTTTTCTATCATCAATCAGTATGTGCGGTTTGTTGATGAAGAACCCGACAAGCGAAAAAATGACTGGAAGCTCAATGACCGCTGGGCTTGGTTTATCGGCGATAACAGACAGAGCTTGAAGCTGACGACAAAACCAGAGCCTTACACCTTAGACCGCACATTGCGGTGGGTACAACGGCAGGTAGCACCGACCTTAAAAATGCTGAAAAAGATTGATAAGGGAAACGGTACAGACTACATGGAAACAATCGAACAGCAGGCAAAGCTCACAGAAAAGCATGAAATGATAATCAAACAGCAGACGACCCCTGCAAAAGATTTAGTAGAAAGTTAGGAGTGATAAAAAATGTGGGTATTATTAAAAGACTTCCTGCTGGTATCTATGGGAATGGGTATCGGCGTAGTCTTGATGTGTATTTTGAATGTCGGCAAAGAAGCTGACTATGAAATGGAACAATTAAAAGAAAGCGAGGACAATTAAATGAATTTCGGACAAAATTTATATCAATGGTTTTTATCAAACGCACAGAGCTTAGTGCTTATGGCGATTGTGGTTATCGGTATCTACTTAGGGTTCAAGCGTGAGTTTTCAAAGCTCATTGGCTTCTTGGTAGTTGCCTTGATTGCTGTCGGCTTGGTATTCAATGCCGGCGGTGTGAAAGATGTACTGTTAGAGCTGTTCAACAAGATTATCGGTGCATAAAATTTTATTGTAGTGCTAATATGTGAGTGATATAATATGGATATGAAGAAAACGACAAATATGAATTTGAACTTAGGAGGAAAACTATTGTGTCAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP012323|3574729:3596018|3590095_3590833_-|AXU65924.1|DBSCAN-SWA MNKNIKYSQNFLTSEKVLNQIIKQLNLKETDTVYEIGTGKGHLTTKLAKISKQVTSIELDSHLFNLSSEKLKLNIRVTLIHQDILQFQFPNKQRYKIVGSIPYHLSTQIIKKVVFESHASDIYLIVEEGFYKRTLDIHRTLGLLLHTQVSIQQLLKLPAECFHPKPKVNSVLIKLTRHTTDVPDKYWKLYTYFVSKWVNREYRQLFTKNQFHQAMKHAKVNNLSTVTYEQVLSIFNSYLLFNGRK >CP012323|3574729:3596018|3578066_3579263_+|AXU65911.1|DBSCAN-SWA MVLNEEQWIKELREKRIAYGISQGRLAVASGITREYLNKIESGKMKPSKELLNTLHKELAKFNPEAPLTMLFDYVKIRFPTLDIQHIIKDILKLNINYMLHENYGRYSYTEHYSLGDIFIYTSADEEKGVLLELKGRGCRQFESYLLAQQRSWYDFLMDALIDGGVMKRIDLAINDHTGILDIPELAEKCRKREYIGKSRSYKFYQSGELIKHREDDREYMGRTLYLGSLKSDVYFCIYEKDYEQYVKLGTPLEEADIINRFEIRLRNERAYYAVRDLLTYYDAEQTAFSIINQYVRFVDEEPDKRKNDWKLNDRWAWFIGDNRQSLKLTTKPEPYTLDRTLRWVQRQVAPTLKMLKKIDKGNGTDYMETIEQQAKLTEKHEMIIKQQTTPAKDLVES >CP012323|3574729:3596018|3576216_3576420_+|AXU65909.1|DBSCAN-SWA MEAKFVCNLKKYRVAQELTQEQLADIVGVRRETIMRLEKAQYNPSLKLAIDISRAVKAPIEDIFIFE 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MIDDMAVYIANLGKYNEGYLVGAWFTFPIDEEDVKEKIGLNEQYEEYAIHDTDNFPIAIGEYVSIEELNEMYEMIEELPDYIVECLDEFISHYGTLEEVVEHKDDIYYYPDCETMTDVAYYYIDELQALGDIPPSLQNYIDYEAYGRDLDMGGCFIETSRGMCEIPY >CP012323|3574729:3596018|3576488_3577883_+|AXU65910.1|DBSCAN-SWA MRKIWNKGHRIRASDKHLVYHFSIGTLLFVFVAVLLLLNSKQLMRTDWEHFSLLENGLTLCPYNFITILIATGVCALVAFGYYRFCYDSFKKLLHRQKLARMVLENKWYEADTVQDSGFFTDLQSRSREKIVWFPKIYYQMEKGLLHIRCEITLGKYQDQLLRLEDKLESGLYCELTDKTLHDGYIEYTLLYDMIANRITIDEVRAENGCLRLMKNLVWEYDALPHALIAGGTGGGKTYFLLTLIEALLHTNAVLYILDPKNSDLADLGTVMPNVYHTKEEMIDCVNAFYEGMVRRSEEMKRHPNYKTGENYAYLGLPPCFLIFDEYVAFFEMLGTKESVGLLSQLKKIVMLGRQAGYFLIVACQRPDAKYFSDGIRDNFNFRVGLGRISELGYGMLFGSDVKKQFFQKRIKGRGYCDVGTSVISEFYTPLVPKGHDFLQTICSLAQARKDGTATCEAKGDGTD >CP012323|3574729:3596018|3591061_3591325_-|AXU65925.1|DBSCAN-SWA MGNLGAQKEKRNDTPISAKKDIMGDKTVRVRADLHHIIKIETAKNGGNVKEVMEIRLRSKLKSVLILQYLKILCIIGIEVKLDAKNL >CP012323|3574729:3596018|3575571_3576213_+|AXU65908.1|DBSCAN-SWA MSKKQIKKIIFMGVGCALLLIVGTIYSLLYNNGRWVKNMDMSEYVFSYKDIPMLVIGALIALYAIYIVIICFKNVFSKNSREKRYSRTISPYWGFCGMFGFLGFGGFWTYYKFGEIFPFAFFIFFGFFSFFFEGKLSHILEDELFQENKRKAQLEAYKIGFKLLFVVIWLMAIGMFSRNVEWCAMFMLISVSLIYALVLFLSNYLLYRYEKRE >CP012323|3574729:3596018|3595382_3596018_-|AXU65932.1|DBSCAN-SWA MIAVKDENNVVNLRGELDNKLEFSHEIFGEKFYNMKIKINRLSDSFDILPMTVSERLLQDIDLDKQNLVNVVGQLRSYNKTLNNKNRLVLTVFVREIKSIDEENKDPNSIFLDGYVCKEPVYRKTPLGREITDLLVAINRPYNKSDYIPSIVWGRNAKFAKNLKVGDRIQLWGRVQSREYEKKIDENNVVKKMAYEVSISKIKKLDENNNE >CP012323|3574729:3596018|3574729_3575056_+|AXU65906.1|DBSCAN-SWA MEMKYVVPDMAQSFGTLEFAGESEPVFERDKNNRRVLARRSYNLYSDVQKGENVVVEIPVQAGEKKFKYEQKVKLVNPKLYGRGYAIGDMGHTDYVLVADDIVAVEEK >CP012323|3574729:3596018|3588871_3589075_+|AXU65922.1|DBSCAN-SWA MKNRLEELRKQRGIKQEDLATALEVSRQTIGSLENGRYNPSIILAFKIARYFQMSIEEIFIYEEESK >CP012323|3574729:3596018|3581807_3582206_+|AXU65917.1|DBSCAN-SWA MKKIKSYTGIWNVEKVLYAINDFNLPFPVTFTQITWFVITEFLIILFGDIPPLSMIEGAFLKYFGIPVALTWFMSQKTFDGKKPYSFLKSQITYALRPKITYAGKAVKLHKQILNETITAVRSVNYVPDKIY >CP012323|3574729:3596018|3586834_3587842_+|AXU65920.1|DBSCAN-SWA MKLKHIALIGSLFPILFSIVLFFGVLISADSDDENSNFSSGITGMNLSAEVLKHQPMVEKYARENGISEYVNVLLAIIQVESGGTAEDVMQSSESLGLPPNSLDTESSIKQGCKYFASLLSSCKNQGIDDLNVAIQSYNYGGGYVGYVAGKGKKHTFNLAESFAREKSGGKKVTYTNPIAVAKNGGWRYQYGNQFYVELVNQYLTVPQVSGELAQKVMNEALKYQGWKYVYGGSNPNTSFDCSGLTQWCYGKAGISLPRTAQAQYDATQHLPLSQAKAGDLVFFHSTYNAGSYVTHVGILVSPTQMYHAGDPIGYADLSSSYWQQHLIGAGRVKQ >CP012323|3574729:3596018|3592418_3593099_+|AXU65928.1|DBSCAN-SWA MSWKVLSIILYGHTLPNSILLTTEYLTALIARTDYMFCAGFFCTRKNFFIFFQNHATNHTLLYRYGAERGINTFHVITERGCDDMKPSDFQKTIQCQFDCKLKRVVKGIVRNYRKELKRRRNKEISYCELPEIVVEKLAVWDEYESDYTAFDVCGIEVRVLDDDLAEAIKYLSEKDREILLMYFFLGMSDTEIGDRLKINRSTSFRSRKNSLEEIKKKLKENMNDE >CP012323|3574729:3596018|3591709_3592135_+|AXU65926.1|DBSCAN-SWA MKKKLSFIIEIIIGIIFICFGYFVIDTDYYATLFYAMGFGLAFASGVQLLKICYYEMPKNKEKLQNINRENHINNVDERKIFLRMKAGSLVYQLMTFVYLFVAFVLALLHIEAWIIGIIFGLFLLQTFLGIILYKHFEKHF >CP012323|3574729:3596018|3584633_3586838_+|AXU65919.1|DBSCAN-SWA MKERIKGAFTKRKILHFLKMALFVVALSLILLSLLGTVAHATGLVDDTINAENLYSKYPLSNYQLDFYVDNSWSWLPWNWLDGIGKSVQYGLYCITNFVWTISLYLSNATGYVVQEAYKLDFINDMADSIGQSIQTLAGVTENGFSSTGFYVGFLLLIILIVGLYVAYTGLIKRETSKALHAVINFVVVFVLSASFIAYAPDYIKKINEFSSDISTASLDLGTKIMLPNSDSEGKDSVDLIRDSLFSIQVEQPWLLLQFGNSNAEEIGTDRVEALVSVSPEDEDGKTREEVVKTEIEDNDNNNLTIPQVVNRLGMVFFLLFFNLGITIFVFLLTGMMLFSQILFIIFAMFLPISFLLSMIPSYESMAKQAIVRVFNTIMTRAGITLIVTVAFSISSMFYNISTDYPFFMVAFLQIVCFAGIYMKLGDLMSMFSLNAGDSQNMGRRIFRRPYLFMRHRARRMEHRIARAVSAGGISGGVAGAVAGSAVAGKRAERKNTASKENRGNTTSSMGQRAGSKVGAVLDTKNKVKDKANAVKENIKDMPTQTAYAVYSAKEKAKSSVSDFKRGMVQEQQSRQTGRLEKQEQHRQNIADKRMELQKAQEARQRKTDGSATTGATRPHERPATASTIPKPSAEKMQEVKRPATATTSKASEPVKTNVVKERPLSSGASDKKATQPAQPVHRQNVEKVVSQETRQNYKAERTTKKQTFEQSKRTTEHTEKNRNLVTKKGQKKK >CP012323|3574729:3596018|3593091_3593331_+|AXU65929.1|DBSCAN-SWA MNNTRPSFYLISSAVDGNVNAIEKILALYDPYISKCCLRPFYDKYGNVCIVVDMELKGRIREALIKMILDFDIPLETEE >CP012323|3574729:3596018|3575071_3575455_+|AXU65907.1|DBSCAN-SWA MRLSNGFVIDKEKTFGELKFTAVRDVFLQNEDGTPSTQLKKRIYDLKCSLHGGIIPVSVPPEVPLREFPYNAVVELVNPVADTVSRKTYTGADVDWYVKAEDIVLKNKGNQNAGSPQNPTTQGQPKK >CP012323|3574729:3596018|3589071_3589488_+|AXU65923.1|DBSCAN-SWA MKHKIQKVELFIGVIIFLGGLLTYGLGVHQLLPVPRPDLVVYGTTLIGIILIFMGCDIFSKPTKEMQILENDERNIAITNASLANAYKVTLTLLVLVLFALVFMGYMSKVVFFSIAGVIAIGQITWVITARYLDKNTS >CP012323|3574729:3596018|3587859_3588771_+|AXU65921.1|DBSCAN-SWA MFRKNKKQTETIKEPKEKKVRTFKVGTHKKSVIALWVVLIASVSFGAYKNFTAIDQHTTHEKEIIELRLQDTNGIENFVKNFAKPYYTWSNSKEAIEARTQAISGYLTKELQDLNVDTIRTDIPTSSTVTDVIVWSIEQSGTDTFSATYEVDQQIKEGEQTSNVKATYTVKVHVDADGDMVIVQNPTLAPAIEKSDYEPKTPEANASVDADTVNDATAFLETFFKLYPTATEKELAYYVSGNVLEPIGRDYIYAELVNPIFTKDGDNVKVKVAVKFLDNQTKATQISQYELVLHKDSNWKIVG >CP012323|3574729:3596018|3579721_3580342_+|AXU65914.1|DBSCAN-SWA MSNIKLRNTYKSYTAIFVIGILVGCICRLLDYFPADTLWSFSSPQTLFGFWIITNTIIVMLSTSNICAGISSFLYMFGMTLSFYALQAILGMFIPMFSGGFRFGLFILFTVWSIACAIAAFILYYWNREHIFSSVLYSLPVGALFAETIAVFIYFLEHQTFLFQLLMDIIGAVVFTIIFFKKVNYRKMYIVGIVLSTLVFYYIFPW >CP012323|3574729:3596018|3592166_3592391_+|AXU65927.1|DBSCAN-SWA MIGLKKRDIKKALKAGAKAGGVSLADVRADIEATIDEAMNSTDPEVQENFRKYFGNKRPTPEEYIYKITKKTKV >CP012323|3574729:3596018|3593705_3593909_+|AXU65930.1|DBSCAN-SWA MNNTDVPIWEKYTLTIEEASKYFRIGEKKLRKLAEENIDAGWVIVNGNRIQIKRKQFEKIIDTLDEI >CP012323|3574729:3596018|3580666_3581170_+|AXU65915.1|DBSCAN-SWA MQETRVLVETKGTTGEETTSYWFDLPIDVAEFEEKLGVGAESGDYRIIEKVLPFADEVHEHTSVYQLNELDFMYRQLSSDMQEEYVSLLTVYENLEALYICRNVITVYPDCKSMIDVARQKLMNDPTFKHLSEDCQEYYFDFEAYASHLQEHGKFLVTEHGIFELPE >CP012323|3574729:3596018|3593908_3595177_+|AXU65931.1|integrase|DBSCAN-SWA MSLSRRYGIINIAYHGSFHDGKELYTMSNVKRKDGKNRNLRNGESQRKDGRYVYKYTDIYGKPQFVYSWKLVPTDKTPAGKRDDISLREKEAQIKKDLNDGIDTVGGKMTVCQLYDKKNSQRKNIKRATEKGRQYLMNALKNDPLGMRAIDTVKQSDAKEWAIRMSEKGYAYKTIDNYKRSLKASFYMAIQDDCIRKNPFEFKLSDVLEDDTEQKVILTPEQEERLLAFMEKDKIYSKYYDEVVLLLETGLRISEFCGLTTHIDMQNRILNIDHQLLKDSEIGYYIETPKTKNGKRELPLTERAYQAIQRILKSRGKAQPLIVGGYSNFLFLNREGLPKVAGNYEGMVRGLIKKYNKYHTDKLPNITPHSFRHTYCTNMANRGMNPNTLQYLMGHANITMTLGYYAHGTFQSAKAELERLAC >CP012323|3574729:3596018|3579275_3579410_+|AXU65912.1|DBSCAN-SWA MWVLLKDFLLVSMGMGIGVVLMCILNVGKEADYEMEQLKESEDN >CP012323|3574729:3596018|3579410_3579632_+|AXU65913.1|DBSCAN-SWA MNFGQNLYQWFLSNAQSLVLMAIVVIGIYLGFKREFSKLIGFLVVALIAVGLVFNAGGVKDVLLELFNKIIGA |
27 | Streptococcus_phage(88.89%) | integrase | attL 3569075:3569090|attR 3595679:3595694 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
3615745 : 3727773
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >CP012323|3615745:3727773|DBSCAN-SWA TTTATAAGTTTTTGTATCTTTCCACTAATTCAGTCAGTGTATATATTGAAACTAAGTCATATTTTGAGATGTCCATATAATTAAACTTTATGTCAAATCTATGCTCTAGCTTTTTCAACAAATTAAAACAATTATCATAAACCAAGCCTATCTCCTTATTAAAAAGGCTACCCTTAAAGAGTTTTTCATTATTATCTTCAATATCTAAACAATCCCTAACAACGTCAGCAACTTTCATAAGAAGAGCATTTTCTTTATCATACAAATCCAATTTAAAGTTTACAATCCTACTACACTCATCAAAATCACAACTATTCCAATGATTTCTAGTTGCTAATGATTCAAGCTTATCATTTAAATCAGATATTGTTATGCCTGGTTTTTCTGATAATATCTTAGCTATTTTACCAGTAAGCTTTGCTGATAAATAACTATTACATTTTGGTGGTAACCTATAGGAATTATTTATGTCACAACTTATATATGAATTGCTATCCATAACACATTGAACATCATATTTTTTGTTGTACCAAAATGAATCATCTCCATCTAAAGTAAATCCCCTTACACCTATAACATTGTTAAACATAGCTGGATAACTTAAGTCAAAATCATTAGCGAGTGAACATACTATTATTTTTCCTTTTCTAAACAATTCATAGCAAACTTCAAATAAACCCTTAACACTTTCTACTCCTATGACTGATAAACTTAAATTAATTAATCTTATGTTAGTGTCTAAAAGGTATCTTAATGCTTCTTCAAGAACTTTTATATTTGTAATACCATCTTTTCTCAAAATTTTTATTACAAATAACTCTACATCTTCATACTCTTTCTTTATTATTGATGCACAAGCAGTTCCATGACCATCTTCATCATCAAATTTATCTGATATAAAGATATAATCATGCATACATTCAAAAGCAATTCCTCCAACTAAATTATCTTTTAAGTAATCATGTTCTTTGTCTATTCCTGTATCTAATACTGCAACCTTAACTTTATTATTCATATCACATATATTCTCCATTACAAAAGTTTTTAATATATCTATGTTAATAGTTCATCTTAAACTTTGATTTAAGTTGCACAATTTATCTTTTAAATGCTATATTTCTTGCTAAAAACATAAAATAAGTACACCATATATTTAATTTATATTTATTATATCAATTATTATCATTAAATGGTTAAATGTTAAGATAAAATTTTTAGATTTATATCACAATTTAGAATTATTTGTAAAAAAGGAGATTATCTTTTTTATTAGACAATCCCCTTGTATATTTTATTAATATTTATCTATGATTAAGCATCAATTTTATTTTATACTTTTTGATTTTAATACTATACATCTAAATCTTATTTAGGGGGAACAATTATTTATATGCTATAAAAATGCTAATTTGAACGAACTTGTCTTATAACCAGTTTTAGAAAATACACCATTCTACAAAGTATGAATCAAAAGGTGAAAAAATACTAAAAATAATAAATCAACATCAATTTTAATCGATATATGAAAAACTTACACCAAGTATACATAAAAACTAATATAAATATTATTTTAACAACTAATACTTACACCTTCATATATTATATCATATTTCAATAAATAAATTGCATAAAAGGAAATCTTTTCATAGAATTAAACTATTTATTAATTCATTACTATAGGTTCAATAAACTATAAGATATCGCTTTAATATTTATATTGTCCTCCATTAAATATTAATATAATTAATTAAAGTATGCATAGCTAAATGAGACATATATCTATAGAGTTTTATAAATAGTCATTATTTTAAAAAGGTAATCATATTCGAAAAATACGTATACTGCATATAAAAATCAATAATAGCATATTGATAATCAAGCTACTAATTGATAGTCAAGCTACTATAATGGAACCTCTACATATACATATTAAACAATATTAAAAGTCTATAAACTGCTATTTTGCATAATAAAACTGTCTTAATATAAATAACATTTTATATATTAAGACAGTTTTAATCAATAGCCCTGTGATGACATTAAATCTTTTTTACGATATTTTCAATTACCTTTTTAAAATTAATACATTATATCACATAACAAGCTTGTTAATGCTACTTTTAAATCTTTAAGTCTATACTTACTTATAGGTATAAATTGTTCATTAATAGTAATCATATTATCCCTAAGATCTTCTATTCTTCTTAAATTAACAATAAAACTTGTATGACATCTAAAAAAGCCATTTTCACACAGTAATTTTTCTGCTTGTTTCATACTCATATTAGCTTTATAATCTCTACCTATTGTATGTACAACTAAATCTCTCTTTACAGTTTCAACATATAAAATAGAATCTATCAGTATTCTATTAAATCCTTTTTTACTATTTAAAACTATATAACGCTCCTTCTTTCTTTGAAGGTTATCAATACAAAGATTTACACCCATTGCAAAGTTACTATACTCTATAGGCTTTACTAAGTATCTATAAGCACGAACCTCATAGCCTTGGGGGGCATACTCTGAAAAAGCTGTTGTAAATATAATTTCTACTTTTTCATCAAACTTTCTTATTTTTTTAGCCACCTCAATTCCATTGATATCTTTCATTTGGATATCTAAAAATATAATATCAATTTTTTCTGGGTATTTGGATATTAAATCTTCTCCACAGGAAAATTCCAGTATTTGATAATTTAGACATCTTTCAGACAAAAGTTTTTCTGTAAACTCTTTTAGTATGCTTCTTTGTATTTTTTCGTCATCACATATAACTACCCTGAACATAATATCACCTCCAAATCTAAAATATCATTTAGTTTACTTTATTTCAATTTCCAAACTGTACTCACTAGCTTTCAAATTTAAATTTCTTTATAAATTTAAATTGTCGATTAAACTACTTATAGAAATTCTCTTTAATATTTAAACTTAAATTACGATAAATTCCTATACTTTTCTAGATATATTATGTAAAAAAATATAGTAAAATAAATATAATATGTATTTATTACCCTATATTAAACATCATAATATATCAAATTTTTATTGCTTATAAATTTTAAGACATAAAATTCATATATTCACAACATAAAATAAAAATATAACACATCTGTAAAGAATTATAACATCATATTTGTATATATATAAAGAAAAACATACAAAAAGTATAGAATATATACTTTTTGTATGTTTTTACTCATTCTTATATTTATTTTATTTTAGATTCTAAATTTGCTAATCTTTCCTCAACAGATTTAATCATCTCTTCAAATTTTTCTTTTTTTGCTTTTTCTTCTTCAATTAAACTTTCAGGAGCTTTTGCTAAGAAACCTTGATTTGCAAGCTTTCCATTAACTCTCTTTATTTCGCCTTCTAACTTTTTCTTTTCTTTAGATAATCTCTCAATTTCTTTTTCAAAATCAACTAATTCATTAAGAGGTATAAATATTTCAACACCATCAATAACTACTCCAACTGCATCTTCTGGAACATTAGATTTATCTTTTGCTATCTCTACATTTGAAGCAGATGCTAAAGTTATAAAATAGTCTCTGCCAAGCTCAATAGCTTCTATTTTTTCTTCACTTGGGATTATTATCAATTTAGCTTTCTTAGAAGGTGGTACATTCATTTCTGCTCTCACATTTCTTATACTTCTTATACCTTCCATCAATAAGTTCATCATATCTTCTTCTTCAGCCATGTTATCTTCTTCATTATATTTTGGCCATTCAGATACTATTATACATCCTTCAACAGTAGGAAGATGAGTATATATTTCCTCTGTTATAAATGGCATGTATGGATGTAATAATTTTAATATCTTTTCAAGAACATAAGTTAATGTATATAATGCTGCAGATTTAGCATTTGCATCTTCCCCATATAATCTAGGTTTAACCATTTCAATATACCAGTCACAGTATTCTGACCAAGTAAAATCATATATCTTTTGAAGTGCTATTCCTAAATCAAACTTATCCATGTTATTAGTTGCTTCTTTTACAATATTATTTGCTCTTGATATTATCCATTTATCAGCTAGAGTTAAGTCCTCTTTAACACTTTCTCTAGTCATGTTTTTAATTATATCTTCATCAATATTCATAAATACAAATCTTGATGCATTCCACAACTTATTTGCAAAGTTTCTAGCAAATTCTACTCTTTCCATATAGAATCTCATATCATTTCCTGGGGAATTTCCAGTTGTTAATGTAAATCTTAGTGCATCAGCTCCATATTGCTCGATTATCTCCAATGGGTCGATACCATTTCCTAAAGATTTACTCATTTTTCTACCTTGAGAATCTCTTACTAATCCATGAACCAAAACATGGTCAAATGGCTTTTCATTCATACAGAACATACCTGCAAATGCCATTCTAACTACCCAGAAGAATATTATATCGTATCCTGTAACAAGTACACTTGTTGGATAATAATAATCTAAAGCTTCAGTCTTATTTGGCCATCCTAGAGTAGAGAAAGGCCATAATGCAGAACTGAACCAAGTATCTAATGCATCTTCATCTTGTTTAAAATGAGTGCTTCCACATTTAGGACACTTATCTGGCATTTTTCTAGCAACTACTATTTCTCCACACTCTTGACAATAATAAGCTGGTATTTGATGACCCCACCATAATTGTCTTGATATACACCAATCTCTTATATTTTCTAGCCATTGTAAATAAGTTTTATCAAATTTATCTGGAACAAATTCTAATTCTCCTTTTTTAAGAATATCTATAGCTGGTTTTGCAAGTTCTTCCATCTTAACAAACCATTGCTCTGATAATCTAGGCTCAACTACTGTATGGCATCTATAACAAGTTCCTACATTATGATTATGCTCTTTTATCTTAATTAGGTAACCTTGTTCTTTTAAGTCTGCTACAATGGCTTTTCTACACTCAAATCTATCCATACCTTCATATTTTCCACAAACTTCATTCATAGTTCCATCTTCATTCATAGTATTTAACTGCTCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >CP012323|3615745:3727773|3629279_3630515_-|AXU65962.1|DBSCAN-SWA MRIFYLEIKRVLHSRRTLILLLLALVLSALMAFLPITYEGINYLDDNGKVVELSGLDAIKYKKTIYANNSEISSGVVTPKKLKHALNIWKKTEEKYGKVGSEDFPLDVYSKSILPIRPLLNRLPEAFANSETGFATELSEINTNDLDSFYEQCKTHLNDIMKIERQTSSAQMKAQELYRKVDTPFEIYPGYSKDAFDYIIFYIFILLIICVAIAAPTFSGEYQTQSDSILRCTKHGHIRLAFTKILALFSIFIIMFVICISIHLAISDLAFGTECLKTSFQMLFSVISLVNINLLQAQILIAIGGLISILAMVSLTLFLSAKCKDSLTSMLIAFSICLIPMGIGVSWIGYLLPPGGIGFKISLLYQMTSFNFLHLGGISFWTPHIILFFSVIEIPIFIFLAIRTYCKHQVS >CP012323|3615745:3727773|3641473_3641767_-|AXU65978.1|DBSCAN-SWA MNRANRIIYDQTGKMLLQTGEATGDVLEYDTITELHCIDIPYGSIDYTKNRIIGINIETKEPILEEIPIFVTEEEKRIQELENQLLLNENEKVGGIL >CP012323|3615745:3727773|3692108_3693164_-|AXU66052.1|DBSCAN-SWA 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MRLSKNIFYNLEKFYLVLNRISDKEIRVICKEIGILLESGCEITKIFEIIESQSSKKVKNLLSIVSNHIQKGNSIAESFQITGTFSKFFISMIKAGETSGNLDIIMSDLSNYYDKEYKLKMKIITISIYPIILIILSILSMLFIFVFVIPNFQVVFTSNGIEPPLITRALIGISTIVTNNLAYLIFSFILFSIGSIYFFITNDNIKKLINSLKFKIPFIKRINQLVATTRFSRALSVLISSGIQIVEAIDMSASVIDNEFIYERLKISNNYIKKGNSIGKSLNLANIFPKLFISMANTGEESGKLDKSLNVINKFYENELNNKIEQIMKFIEPMLIVFMGLIIGTFILAMVVPMFDAITSF >CP012323|3615745:3727773|3678893_3679295_+|AXU66040.1|DBSCAN-SWA MKKDIYVYPAILSYDNDGISVEFPDLPGCYTCGDTTEEALKMAKEALGLHLYGMEEDDDIIPDATTIDNLNLEKNQIPTLIEIYMPIHRKAIENYSVKKTLTIPQWLNREAEKHKVNFSQILQEALKNHLNIH >CP012323|3615745:3727773|3727188_3727773_-|AXU66082.1|protease|DBSCAN-SWA MALVPVVVEQTGRGERSYDIFSRLLKDRIIFLGDQVNDATAGLIVAQLLFLEAEDPDKDIHLYINSPGGSITSGMAIYDTMQYIKPDVSTICIGMAASMGAFLLAAGAKGKRLALPNSEIMIHQPLGGAQGQATDIEIHAKRILKIKETLNEILSERTGQPLEKIKMDTERDNFMSALEAKEYGLIDEVFTKRP >CP012323|3615745:3727773|3667626_3667998_-|AXU66014.1|DBSCAN-SWA MFSIYKVKLKTKRTLEQVRNQSVDFEYSEEGLKDALRYYNLIDGLEVIVLKFADEYCLANFNEEDEKTIMEAHYLLEQDEYTGCYINEYERFKRDWENGSCDGEASMVFSDDEIEIIEKLREG >CP012323|3615745:3727773|3639743_3641093_-|AXU65976.1|DBSCAN-SWA MIEKLNANASLSDLITAFENSTNEIKTISNTLKQTLINKNIKVLDTDKLSSLVDKVDKLKAQEFGVRINKLDENPDTCVSYLGDAIGMTPASVGSYGSWDTIDFIRNIKPCGFKDGIVTKYIKKENFNMYEDGTNVEDDTDVMIEFPKFYWKIQSSDNYMDIFISKTKLDDDYECPAHLIGSTEKEFIYIGAYLASLENNNLRSKKNSSPELRERGRFYSLIYKHVPGYDSLDYQCVLMLQILFVVMFKSINFFRLGVGYSSYISGHGKPDKINTGGSNFKGMIYGEQNGDEQMKFLGIEDLWGNCLQEVGRCTCGVENACVYTRIITRDKRNIQYGVGRKVGTISDVIGGNNTGFMVKQCLPGGGNGQDSRYYRCWANLSENHIGYYTGFDYNENFRYYGLFSSYFQTEVKKASTRLIFIGEDNQNTLKTIQEDELLFVENEKVGGIL >CP012323|3615745:3727773|3646155_3646575_-|AXU65983.1|DBSCAN-SWA MIPTDAIDYDIEDVSIINFDVRQEPSKTFKLNIEKSKIDGICDDVEALKQTIFLILNTERYEHLIYSRNYGVELNDLIGEPISYVIPELERRIIEALIQDDRVENVDNFEFQNVKGKVHCKFTVYSKYGNIKAEKVVSV >CP012323|3615745:3727773|3688791_3688995_-|AXU66048.1|DBSCAN-SWA MYIKIYKFVIVVIIMANNELEALKNEIEAVREEINTYIEYPEIFQEELVESSKKIDILINKYMYLSK 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132 | Clostridium_phage(78.05%) | protease,portal,integrase,tail,terminase,tRNA,capsid,head | attL 3612458:3612479|attR 3727270:3727291 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
3778527 : 3790927
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >CP012323|3778527:3790927|DBSCAN-SWA CTTAAAGCAGTTCTCCGAAATGACGGACATAGGCTTTTTTTAAACTTGTTGCCAAAGTCATATACAGCAGAATACATGGAATCAGATAAGCAAAGTATGCTGCAGGCAATGCAACAAATCCAAGCATAGTTCCAAACACAGTAAACGGAATAATGGTCAGAACTATAATTCCAGTCATTGTTAGCAAAGTCACCGGAGCTGATGCACGACTCTGAACAAAAGGTAGCTTTGGAGTACGAATCATGTGAATGACTAATGTCTGGCTCCACATAGATTCCACGAACCACCCTGCTTGGAACATCCCGATATACTGTGCCTGAAGCATTGCCAGTTCTGCACCGCTGAAATGAGCAGGCAAATCATTAAATAATACACCATTCGATACGAACAATGGACAAAATACAAAGTACATAAAAATATAGGTTGTAAAATCAAAGATAGAACTGGTTGGTCCAATCCAGATCATAAAACTTCCAACACTGGAAGCGTCCCATTTACGAGGTTTGGTAATAAACTCCTCATCCACATTATCCCAAGGAATTGCAGTACAGGATAAATCATAAATTAAGTTTAGAAATATAAGATGAACACTCATCATTGGTAAGAAAGGTAGCAAAGCAGATGCAGCAAGCACTGAGAACATATTGCCGAAGTTGGATGAAGCAGTCATTTTAATGTACTTGATCATGTTGGCATATGTCTTTCGTCCCTCAATAATACCCTGTTCCAAAACCATCAGATCTTTTTCCAATAGAATAATGTCAGCAGATTCTTTTGCCACGTCCACGGCGGTATCCACCGAAATACCAATATCGGCGGCTTTCATAGCTGCAGCATCATTAATACCGTCACCCATGAAACCGACCGTATGACCATTTTCACGGAGAACAGAAACCACACGGGCTTTCTGATCAGGGGTTAGCTTTGCAAATACATCTGTAGACTCTGCCACTCTTGCAAGCTCTGCATCGCCCATTTGTTCCAAATCAGAACCGAGAAGCATATTGCGAACCTCTAATCCCACCTGCTTGCAAATAGTTCGAGTCACTTTGTCGTTGTCACCTGTCAAAATTTTGGTTATAACACCATGGTCTTTCAGAGCTTTAATAGCATCCGCAGTAGATTCTTTTGGAGGATCAAGGAATGCCAGATATCCAATCAGTACCATATCACACTCATCTTTAACACCAAATGCGCCGATTGGGGAAGGATTACTCTTCTGTGCAATAGCTAGTACGCGGAATCCCTTATCGTTAAGATTGTCCACTGTCTCCAGAATTCTGTAACGAACGTCATCAGTCAGAGGCTGCACTCCTCCATTACACTCTGCAAACGCACAAATAGAGAGCATTTCTTCCACAGCACCTTTTGTTACCATCTGGGTCTTACCCTTATTATCCTGTACCACTGTAGTCAGACGACGACGTGTGAAGTCAAAAGGAATCTCATCTACTTTCACATAGTTTTCAGACAGGTCAATGAGACGCGAATCTGCGGCTTCCTCTTCCTCCGTCTTATGGATAATTGCCAAATCCATCAGGTTTTTATAGCCAGTCTGGAAGTAACTATTGAGGTAAGCGTGACGCAGTACTCGCGTATCGTCCTCGCCATTTACATTCAGATGGTATTCCAGCACAACCTTATCCTGGGTCAGCGTGCCAGTCTTGTCAGTACAGAGAATATCAATAGCACCGAAGTTCTGAATGGAATTGAGGTTTTTAACGATTGTCTGCTTCTTGCTCATGGAAACAGCGCCTTTCGCAAGACAGGTTGTTACAATCATCGGCAACATTTCTGGTGTCAAACCAACAGCAATAGAAACGCCGAATAAGAAGGCCGCCAACCAATCGCCCTTGGTGATACCATTGACAAAGAACACCAGCGGAACCATAATGAGCATAAAACGAATCAATACCCAAGAAACGGCATTGACACCCTTGGTAAAGCTTGTTTCAACCGCTTCTCCAGCAACTGCGGACGCCATAGAGCCAAACAGAGTATGATCGCCAACACAAACAACAACAGCTGTTGCGCTACCAGAAATTACATTACTCCCCATAAAAGCAATGTTTGTGTAATCAGTCACGCTTTCTTTCTGAGCACTTACATTGGGTGTTTTTTCAATAGGTTCACTCTCACCAGTAAGACTTGCCTGACTGACAAACAAATCCTTCGCATCCAAAATACGAACATCCGCCGGAATCATATCTCCAGCAGAAAGATGCACAATATCTCCCACCACCAAATCATCCATAGGAAGTTCTTTTTTTTCATAGTTTCTACGAGTAACTGTACAAGTGGTCGTAATCATGGCTAACAATTTCTCTGCTGCATTTCCGCTTCTGGATTCCTGTACAAAACGAAGCGTACCGGAAATGAATACCATTGTTAAAATGATTACAACAGTCAGGGAATCAAAGTCCTCTGGCACACTGCCAAACAGAGAAAAATACGGAAAAATCATATCTGTAATTGTGGATACTAAAGCCAGACAAAATAAAATGGCGGTAAATGGATTGATAAATGCGCCAACCAGTCGTTTTGCCAGAGATTTCTTTTTTTCATGAGTGACTTTATTGGTACCATATTTAGCACGACTTACGGATACTTCATCTACTTCTAAGCCACGAAGTGTGGTATGAAGTTTTTTTAAAACTTCTTTAATAGGATTGGTTGCCGCAAATTGAATGCGGCGGTTCTGTTCGTCACGGATGACTGCTTTTTCTACAGTCTGACGAATAGCCATACGATTTTCTTTTTTGTTCATTGGTCTTACCTCCTTGAATTTTCATAGGGGCAAGGAATATTATATGAGCGACACGGAATCTCCAAATTCTCATATAATATTCTCTGCCTTCGTGGACTGACATCAGAGTCCATGTCTTTCACCTCACAATCTTAAAAAAATATCTATGTGAAACCTCAATGTGGATTATTGGTTGCGATAGCGGACACTTTTTTCGATATACCAGACATCAAAGCCGGCAACAATCAGCCATGCGATTATTGCAAATACAAACCAGTGGTTTGAAAATCCCGGCAAAAATCCTTTCATTAAGAATATAATCCCATTTAACGCAATCATTTCTCCAACATTACGACAAAGCGGGACAATATTAATTTTATCTTTCTCCTCCTGCGGCATATTTTTCCACAGGGAAAGATGACGATATCCTTTTCCAAAGGCCAACCAAAAGCCTGCAAGAGTAAATAAAATTCCAAAAAAGATACATGTAAAATCCATCGTTTGTTCCTCCTTTCAATGCTTAAACCTGTTTCTTAGTTTTGTCAGCTTCAGAAGTTTAATGAAGAGCACAATAATAGTAACAGCAAGAATAAACCAGATCACAATACTCACCTGATACCATATCTTAAAGATTACCATTCTTTGTTCAAAGAAATTCCAACCCAAATAGCTACATAAGATTGTAAATACAGGGTAGAAAGCAAAAAGAATTGCTCGTTTCAAATCTTCGATTTCTCTCCTCACTCACAACACCTCCCAACCAGCACTAATCACTTCCGGAATTACCAATACCTGCCCAACGATTCCTTCTAAAATATTGTTTTTGGATTTTCCGACAGAACAGTATTCTGCGACAATCTCAACCTTGTCACCAACCACATCACCGCTTTCCAGATTGTTCAAAAAGAGCGTCTTACAGGAATTGCTGTTAATCAGCAATAAGCGTATATCCTGCTCTGCCTTTTCCTGACATGTAACCGAAATACGATACTGCTTTTCAGATTCATCACTGGAAGTAATTGGGTGAAACTTTCTTGCAAAGGGACGTAGAATCAGGTTGGAACCAATTAAAATAGTAGCGGCGGTGATCGCCATTGCATACATTCCCGTACTTGCAAGAATTCCAATCGCTGCAGTACACCATAAGGTGGCAGCGGTATTCATTCCACGTACTGTCCCTCTGTCCTTGAAAATAACACCACTGCATAAAAAACCAACACCGGATATAATACTGCTTCCGACACGGAATACCTGATCCGAACCGTAGAGCATAGGAAACAAGGTAAAGAAACTTGTACCCATGCAGATTAACACATTGATACGAATACCTGCAGGATGACCAGTCAATTGCCGTTCTAATCCAATAAGAAATCCAAGTGTTAAGGAGAGGGCAATTCTCAAAATAAAATCTGTGTAAAACATATGAAACACCTCCCTTTAACTACTAACAGTATATAAAAAATCCAAATACAATCCTATGGCTAAAGTCTTGCGATTTTCTTGCGATTTGGTAAGAAAATAGACGGACTGAAACCGAAAATGGTCTTAGTCCGTCTTTGTCATATCTGATCATTAAATTTGTATCCAATACCCCAGATGGTCAAAATATATGTGGGACAATCCGGAGCAGGTTCAATCTTTTTTCGCAACTTCCGGATAAAAGCCATAATGTTGCTGTTATCCAGAATATAATCTTCCTCCCATACGGCACGATAAATCTGTTCCTTTGTAAAAACTTCACCTTTGTTCTGGACAAGAAAGTACAAAATATCAAATTCCTTTGGAGTCAGGTTGACTTCAGAACCTTTTATCAGTACTTTTCTGCCTCTTGGATAAATTTCCAGATCCCCTGCCAGGATTCTATCTGACAGAGTACCCACTGGCCAATCGCTTTCTTCTGATGCTCCTAACAATAACGAAGATACCTCTCCACGAATCATCTCCTGAATACCAGAAAGTAAATCCTTCGCACAATCACTGTCCGGTGGATCTCTTAGTAGTTTTTCTAATAGCCAGATTTCAAGAGCCGAATCCATCGGAATATAACTAATATTCTTTTTCATCATGAATGCCTCCTCTTAAATCAACTCTTGATATTTTTTCTTATAAAAATATTTGGCTACTGAATTCAGCAGCATATAGAGAGATACCACCAGCAGTAAAAATACGAAATACCAAAGAGGTAATTTCGTCAGTCCAAACAACGACGCACCGCCGACAAATGTAAGGGAAGTAAAAGCAATAATCCCCACTA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ATACCGTTTTCTCTGGCGTATTTTTCTACCATAGGCTGATGTTTCAAAACTTCTGCGGATAAGTTCATACCCGTAATGCCAGAAGAAAAGTTGCTGTTCTCGTCGTCGCTGTCCGCACTAATCAGCACCCCAAAGAAAAGCACCAGAGAAAAGAGAATAGGAAACAGACTTCCAATGATAGCGATATGTTTCAGTTTCATTTTTTCTTCTGTCCTTTCTTCGTTACAAGATTACGGATTTTCTCTGTGGTCTGCTGGTTCTTCTGGACAGTCTGGGTCTGCTGAACCTTTGTCCTACGGTCTTTGGTGTAATTCTGGCGTGTTTCCTTTGATACGGTAACTTTTTCTACATTCTGCCTATATGTCGATTGGGTCGCTTTCCCGTCAGGAGTACTAGAAGATAGCGGACGTTCTTTGACACCGCTTGTCTTAACTGGTTCGCTTGCTTTCGTAGTCGGAGTTGTGGCAGGGCGTTTGACTTCCTGCATTTTTTCCGCACCCGTCTTTGAAACGGTTGAAGCTGTGGCTGGTCGCTCATGGGGACGGGTAGCTCCCGTTGTCGCTGATCCGTCAGCCTTTCGCTGTGCCTGCCTTGCTTCTTGTGCCTTTTGAAGCTCCATACGCTTGACAGCGATACTTTTCTTATGCTGTTCCTGCTTTTCCAAGCGTCCCGTCTGTCTGGACTGCTGTTCCTGCACCATACCACGCTTGAAATCAGACACGCTGGACTTTGCCTTTTCCTTTGCGGAATACACCGCATAAGCGGTCTGTGTGGGCATATCCTTGATATTCTCTTTGACAGCGTTTGCCTTGTCTTTCACTTTATTTTTCGTATCTAAGACAGCACCCACCTTTGAGCCTGCACGCTGTCCCATACTGGAAGTGGTATTGCCCCGATTTTCTTTAGAAGCCGTATTTTTTCTTTCGGCTCTCTTGCCAGCAACGGCACTTCCAGCTACCGCACCAGCCACACCGCCCGAAATACCGCCAGCACTTACAGCCCTTGCAATACGGTGTTCCATACGCCTAGCCCGATGTCGCATGAACAGATACGGTCTGCGGAATATCCTGCGTCCCATGCTTTGACTGTCGCCAGCGTTGAGAGAAAACATACTCATTAAGTCGCCCAGCTTCATATAGATACCAGCGAAACATACTATCTGCAAGAACGCCACCATGAAAAACGGATAGTCCGTGGATATGTTATAAAACATACTGGAAATGCTAAATGCAACCGTTACAATGAGCGTTATTCCTGCCCGTGTCATTATGGTATTAAATACCCTCACGATTGCCTGCTTTGCCATGCTTTCATAGCTCGGTATCATGGAAAGTAGAAAGCTGATAGGTAAAAACATAGCGAAGATAATAAAAAGTATCTGGCTGAACAACATCATACCCGTAAGCAAGAATACAAATATCGTAATACCAAGATTAAAGAACAAGAGGAAGAACACCATACCTAAACGGTTTACCACCTGCGGTATCGTCAGATTGTTGTTGTCGTTGTCCTCGATTTCTGTTTTCACGACTTCTTCTCTGGTCTTTCCGTCCTCGTCCTCTGGACTTGCCGATACGAGAGCTTCGACACGGTCTGTCCCGATTTCCTCTGCGTTGCTGTTTCCAAACTGTAAGAGTAGCCACGGCTGTTGTACTTGAATAGAAAATAGGCTGTCCCGTATCAAGTCTACGCTGTCCTTGCCCTCGCTGTCAGAGTTGGGGAGCATGATTTTTGTTCCCAAATCAAGCGAAGCGGTACTGATGTCTGATGAAAATTCATTTATCTTCTTGATGTAGTCGGGAGCGTAGGCAATAAACGAAGCGGACAGCACGAACACCACCACAAAGTTGATAACAGCGTGAAGTGCCTTGCTGGTTTCCCGTTTTATCAGTCCCGTATAGGCAACATACATTCCCACCACTAAGATAATAAGAAGCAGGAAACCAACATAGAAGCCCGTAGAAGAAAAGCCGTTCTCGGTAACGCCTGCAAGGGTCTGTATGCTTTTTCCGATACTGTCTGCCATATCGTTAATAAAATCAAGTTTATAGGCTTCCTGCACCACATAGCCAGTTGCATTGCTTAAATAAAGGCTTATCGTCCAGACAAAGTTGGTAATGCAGTAAAGCCCGTACTGTACCGATTTTCCGATACCGTCCAGCCAGTTCCACGGAAGCCACGACCAGCTATTATCGACGAAAAAATCAAGCTGGTAGTTGGAAAGCGGATATTTTGAATATAGATTTTCTGCGTTTATGGTATCGTCCACAAGCCCCGTCGCATGAGCCACCGTCCCCAGAAGTGAAAGCAGGATAAGGGAAAGTGCCACCACGAACAGAGCCATTTTGAGAAAGTGAAGTATCTTCCTTTTTGTGAACGCACTCTGTATCCTTTCTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_13 >CP012323|3778527:3790927|3778527_3781293_-|AXU66131.1|DBSCAN-SWA MNKKENRMAIRQTVEKAVIRDEQNRRIQFAATNPIKEVLKKLHTTLRGLEVDEVSVSRAKYGTNKVTHEKKKSLAKRLVGAFINPFTAILFCLALVSTITDMIFPYFSLFGSVPEDFDSLTVVIILTMVFISGTLRFVQESRSGNAAEKLLAMITTTCTVTRRNYEKKELPMDDLVVGDIVHLSAGDMIPADVRILDAKDLFVSQASLTGESEPIEKTPNVSAQKESVTDYTNIAFMGSNVISGSATAVVVCVGDHTLFGSMASAVAGEAVETSFTKGVNAVSWVLIRFMLIMVPLVFFVNGITKGDWLAAFLFGVSIAVGLTPEMLPMIVTTCLAKGAVSMSKKQTIVKNLNSIQNFGAIDILCTDKTGTLTQDKVVLEYHLNVNGEDDTRVLRHAYLNSYFQTGYKNLMDLAIIHKTEEEEAADSRLIDLSENYVKVDEIPFDFTRRRLTTVVQDNKGKTQMVTKGAVEEMLSICAFAECNGGVQPLTDDVRYRILETVDNLNDKGFRVLAIAQKSNPSPIGAFGVKDECDMVLIGYLAFLDPPKESTADAIKALKDHGVITKILTGDNDKVTRTICKQVGLEVRNMLLGSDLEQMGDAELARVAESTDVFAKLTPDQKARVVSVLRENGHTVGFMGDGINDAAAMKAADIGISVDTAVDVAKESADIILLEKDLMVLEQGIIEGRKTYANMIKYIKMTASSNFGNMFSVLAASALLPFLPMMSVHLIFLNLIYDLSCTAIPWDNVDEEFITKPRKWDASSVGSFMIWIGPTSSIFDFTTYIFMYFVFCPLFVSNGVLFNDLPAHFSGAELAMLQAQYIGMFQAGWFVESMWSQTLVIHMIRTPKLPFVQSRASAPVTLLTMTGIIVLTIIPFTVFGTMLGFVALPAAYFAYLIPCILLYMTLATSLKKAYVRHFGELL >CP012323|3778527:3790927|3786799_3787702_-|AXU66136.1|DBSCAN-SWA MFKKNKKQTENVKEKKVRTVKVGTHKKTVIALWVVLIASVSFGVYKNFTAIDQHTTHEKEVIELRLQDTNGIENFVKNFAKSYYTWSNSKEAIDARTQAISGYLTKELQDLNMDTIRTDIPTSSAITDVIVWSIEQSGTDTFSATYEVDQQIKEGEQTTAVKATYTVKVHVDAGGNMVIIQNPTLAPAIEKSDYEPKTPEADASVDADTINDATAFLETFFKLYPTATEKELAYYVSGNVLESIGRDYLYSELVNPIFTVDGDNVKVKVAVKFIDNQTKATQVSQFELVLHKESNWKIIG >CP012323|3778527:3790927|3783350_3786014_-|AXU66135.1|DBSCAN-SWA MSKATLFDSRIKKYAYCRTSEIYRDIGSSPDGLSIEQIGSMREKYGANSFNGRKNDTTMQRLRRAFINPFHVILFVLGIVSLVTDVFVASNFARNATTAIIIFSMIVISGVIRLIQELRAKSAAAQLDRLVHESVTVRRDGKLIEIPGEELVVGDIVLFSAGDRVPADIRLTKITDLFISQAAITGESAIIEKSCRKLSYGEQDTLTQLENLAFMATTVISGKGEGIVLAVGKDTLYGGFTKPDSDDKNSFKKGADSIAWVMIRFMAILVPIVFILLGITDGKWMESFAFALSVAVGLMPEMLPMVITACLAKGSLAMSKKQTIIKDINAMQSFGSMDVLCMDKTGTLTNESILLEYYMDIFGNENAEVLDLAYLNSCYHSGVCNTIDNAILACNTMPGREAHYANLLTKFQKADEIPFDYARKFVSTLVQDSNGNSQLIMKGDIEHIFSRCNHVEYRGKLLPMGQDARQSVSSVVGEMLQDGMKVIAVARKNVGAQKKITPDDEWGMTLVGYLSFFDAPKQTAKESVTALKRLKVIPKILTGDQAAIAVSVCRRVGIYTERILTGTQLDEMTDCELKKAVEHTHVFAELTPGHKVRLVSAMQDNGHSVGFLGDGVNDIPALNEANVGISVDTAVDAAKDAADVVLLQKDLNVLEQGVMEGRKTFTNMLKYIKITASSNFGNIFSIICASAFLPFLPMTSIQILLLNLLYDTLCIVLPWDNVDEEEMLSPRDWSGKTLRQFMLSFGPISSLFDIVTFLFLYYFLCPMLCGGATYLQLTDPSLQLQYVALFQTGWFLESMWTQVLILHFLRTSKIPFFQSRASAPVISITLVGIIAFTSLTFVGGASLFGLTKLPLWYFVFLLLVVSLYMLLNSVAKYFYKKKYQELI >CP012323|3778527:3790927|3781458_3781770_-|AXU66132.1|DBSCAN-SWA MDFTCIFFGILFTLAGFWLAFGKGYRHLSLWKNMPQEEKDKINIVPLCRNVGEMIALNGIIFLMKGFLPGFSNHWFVFAIIAWLIVAGFDVWYIEKSVRYRNQ >CP012323|3778527:3790927|3782016_3782694_-|AXU66133.1|DBSCAN-SWA MFYTDFILRIALSLTLGFLIGLERQLTGHPAGIRINVLICMGTSFFTLFPMLYGSDQVFRVGSSIISGVGFLCSGVIFKDRGTVRGMNTAATLWCTAAIGILASTGMYAMAITAATILIGSNLILRPFARKFHPITSSDESEKQYRISVTCQEKAEQDIRLLLINSNSCKTLFLNNLESGDVVGDKVEIVAEYCSVGKSKNNILEGIVGQVLVIPEVISAGWEVL >CP012323|3778527:3790927|3787718_3788726_-|AXU66137.1|DBSCAN-SWA MKLKHIAIIGSLFPILFSLVLFFGVLISADSDDENSNFSSGITGMNLSAEVLKHQPMVEKYARENGISEYVNVLLAIIQVESGGTAEDVMQSSESLGLPPSSLDTESSIKQGCKYFASLLSSCKNQDIDDLNVAIQSYNYGGGYVGYVAGNGKKHTFNLAESFAREKSGGKKVTYTNPIAVAKNGGWRYGYGNMFYVELVNQYLTVPQVSGELAQKVMNEALKYQGWKYVFGGSSPTTSFDCSGLTQWCYGKAGISLPRTAQAQYDATQHLPLSQAKAGDLVFFHSTYNAGSYVTHVGIYVGNNQMYHAGDPIGYTDLSSSYWQQHLIGAGRVKQ >CP012323|3778527:3790927|3788722_3790927_-|AXU66138.1|DBSCAN-SWA MKERIQSAFTKRKILHFLKMALFVVALSLILLSLLGTVAHATGLVDDTINAENLYSKYPLSNYQLDFFVDNSWSWLPWNWLDGIGKSVQYGLYCITNFVWTISLYLSNATGYVVQEAYKLDFINDMADSIGKSIQTLAGVTENGFSSTGFYVGFLLLIILVVGMYVAYTGLIKRETSKALHAVINFVVVFVLSASFIAYAPDYIKKINEFSSDISTASLDLGTKIMLPNSDSEGKDSVDLIRDSLFSIQVQQPWLLLQFGNSNAEEIGTDRVEALVSASPEDEDGKTREEVVKTEIEDNDNNNLTIPQVVNRLGMVFFLLFFNLGITIFVFLLTGMMLFSQILFIIFAMFLPISFLLSMIPSYESMAKQAIVRVFNTIMTRAGITLIVTVAFSISSMFYNISTDYPFFMVAFLQIVCFAGIYMKLGDLMSMFSLNAGDSQSMGRRIFRRPYLFMRHRARRMEHRIARAVSAGGISGGVAGAVAGSAVAGKRAERKNTASKENRGNTTSSMGQRAGSKVGAVLDTKNKVKDKANAVKENIKDMPTQTAYAVYSAKEKAKSSVSDFKRGMVQEQQSRQTGRLEKQEQHKKSIAVKRMELQKAQEARQAQRKADGSATTGATRPHERPATASTVSKTGAEKMQEVKRPATTPTTKASEPVKTSGVKERPLSSSTPDGKATQSTYRQNVEKVTVSKETRQNYTKDRRTKVQQTQTVQKNQQTTEKIRNLVTKKGQKKK >CP012323|3778527:3790927|3782831_3783335_-|AXU66134.1|DBSCAN-SWA MKKNISYIPMDSALEIWLLEKLLRDPPDSDCAKDLLSGIQEMIRGEVSSLLLGASEESDWPVGTLSDRILAGDLEIYPRGRKVLIKGSEVNLTPKEFDILYFLVQNKGEVFTKEQIYRAVWEEDYILDNSNIMAFIRKLRKKIEPAPDCPTYILTIWGIGYKFNDQI |
8 | Streptococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
3793970 : 3800545
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >CP012323|3793970:3800545|DBSCAN-SWA GTTAGCTGGAATGTCCCCAAGTGCGTTCAATTCGTCTATGTAGTAGTAGGGCAACATCTGTCATGGTTTCACAATCGGGATAAAAATAAATATCGTCCTTATGTTCCACGACTTCTTCCAGCGTCCCATAGTGGCTGATAAATTCGTCCAGACACTCTACGATATAGTCGGGAAGTTCCTCTATCATTTCATACATTTCATTGAGTTCTTCAATGGAAACATATTCCCCTATGTCGATAGGAAAGTTGTCGGTATCATGGACAGCGTATTCTTCGTACTGTTCATTCAAGCCGATTTTTTCTTTTACATCTTCCTCGTCAATAGGGAAAGTGAACCACGCACCGACTAAATATCCCTCATTGTATCTGCCAAGATTAGCAATATAAACCGCCATATCATCAATCATAAGCACCACCTCATTTCCTATTCTGGCAGTTCAAAGATACTGTTTTCCGTTACAAGATAGCGTTTGTTTTCAAGTAAGTGAGAAGCGTAGGCTTCAAAATCGAAATAGTATGCTTGACAGTCCTCGGATAAATGTTTGAATGTCGGGTCGTTCATCAGCTTTTGCCTTGCAACATCTATCATGCTTTTACAGTCGTGATAAACGGTAATCACGTTCCTGCAAATATAAAGTGCTTCTAAGTTCTCAAACACGGTAAGAAGTTCTACATATTCTTCCTGCATATCGGCTGATAGCTGGCGGTACATAAAATCTAATTCGTTAAGCTGGTACACGCTGGTGTGTTCGTGGACTTCATCAGCATAAGGCAACACCTTTTCGATAATGCGGTAATCTTGACTTTCTGCACCGACACCTAACTTTTCTTCAAACTCTGCAACATCTATCGGTAAGTCAAACCAGTATGATGTTGTTTCTTCGCCATTTGTTCTTCCCGTTTCCACCAGTACCCTTGTTTCCTGCATTGTTCCTCACGTCCTTTCTGTTGTTTCATCACATCTTTTAAGGTCTGGTATGACATACCAAACACATATTTAGAAAAATCTTCCAACTGTTTTTCTTCATAGTCGGCAGGGTTCAGCCGTTTCATTTCATGCCACACCTTACGCTTGTAAGAGGGCAGGTCGGAAATGTATTCACAGCCGACTTTTGCCTGCATATCTTTAAAAATATCGTTCATTTCATCACTCCAATCTGAAATTTAGGTAAGAAAAAAGCAGTCAATCCTAAGACTAACTGCTTTGTGTGTAAGTATGAATTTGTTTAAGTGTAACTGATTTACCATGTGTACTCGTAAAGTTTACTGTATGTTTGACTTTTAAATAAATATATACAATCAATCATTTGTAACTTGCCGTCTTGTTCAAATTTACTTATTATCAGATTATCTTCATAGATATATGCTAAGAAAGTATCATACTCTGCATAGTATTTTTCTCTAAAAAGATTTGACTCTCTAAAATCTTTTTCTAAAGCAATTCTTATACTGTCTAAAGCATATTTAAAGTTATAACAAGTATTAAAACTAAACTTGTATGGAAAAAAGAAAAATAAGTTTTTCTTGAAAGTAAGCAATTTCACATAGGTTTGTATATCAAATTCAATCGTTCCATACTCATATTTCTCTGTAAGACAAGAATGTAAACTTTCACAATCATAATCCCGCAACGAAGCAAATAACCTAGTTACAGTCATTTGTGTATTTGGTCTTCTCGGTGGACACTTACCAATTACACCATCACAGAATTTCTGTATTTGACCAGTAAGTTCTTTTGAAGCATGAAGTCTTGTTGTGCTTTCAAGTAATTTAAAGTCCATTTGATAATTAGGTGAGTTACAATCACATTCTCCATGATTTTCAGATTTAGGTGGTACATATTCTGCAAAATTTGATTTTTCTCTAAAATATATTGATTTATTAACTAATTCCAACAAGTATTTTTCATAATTACAATTTTCTTCATCTTTAATAAAATTTTTGTTTATGAATACTGCATGTAAAATATCCACTCTCATTTCATCTGAAATCATAAGCACTTTTATTCCTTTCAAAAAATAATTTATCGTACCCACATTATAACATTCTCATATTACAGCAACAATAAAATTCGTTATGCTCCAATAATCTTATTGAACAGCTCTAACAGTACATCTTTCACACCGCCAGCGTTGAATACTAAGCCGACAGCAATAAGGGCAACTACCAAGAAGCCAATAAGTTTTGAAAACTCACGCTTGAACCCTAAGTAGATACCGATAACCACAATCGCCATAAGCACTAAGCTCTGTGCATTTGATAAAAACCATTGATACAAATTTTGTCCGAAATTCATTTAATTGTCCTCGCTTTCTTCTAATTGTTTCATTTCATAGTCAGCTTCTTTGCCGATACTCAAAATACACATCAAGACTACGCCGATACCCATTCCCATAGATACCAGCAGGAAGTCTTTTACTAATTCCCACATTTTTTATCACTCCTAACTTTCCACCAAATCTTTTGCAGGGGTCGTCTGCTGTTTGATTATCATTTCATGCTTTTCACTCAAGATTGCCTGCTTTTCAATCGTTTCCATGTAGTCTGTACCGTTTCCCTTATCAATCTTTTTCAGCATTTTCAAGGTCGGTGCTACCTGTCTTTGTACCCAACGCAATGTGCGGTCTAAGGTGTAAGGTTCTGGTTTTGTCGTCAGTTTCAGACTTTGCCGATTATCGCCAATAAACCAAGCCCAGCGGTCATTGAGTTTCCAGTCATTTTTCCGCTTGTCTGGTTCTTCATCAATAAACCGCACATACTGGTTGATGATAGAAAAAGCGGTCTGCTCTGCGTCATAGTAGGTCAGCAAATCTCGTACTGCATAGTAAGCACGTTCATTTCTAAGCCGTATCTCAAAACGGTTGATAATGTCGGCTTCTTCCAGAGGTGTACCTAATTTGACATACTGCTCATAGTCCTTTTCATAGATACAGAAATACACATCTGATTTCAGCGAACCAAGATAAAGGGTACTCCCCATATATTCTCTGTCGTCCTCTCTGTGCTTGATAAGCTCGCCCGACTGGTAATACTTATAGCTTCTGGACTTTCCGATATATTCCCGTTTCCTGCATTTCTCCGCAAGCTCTGGAATATCCAAAATGCCCGTATGGTCGTTGATAGCAAGGTCGATACGCTTCATAATGCCTCCGTCTATGAGTGCGTCCATAAGAAAGTCATACCAGCTTCTTTGCTGTGCCAGCAGGTAACTTTCAAACTGCCTGCAACCCCGACCCTTTAACTCTAAAAGGACACCTTTTTCTTCGTCAGCCGACGTATAGATAAAGATGTCCCCTAATGAATAATGCTCCGTATAACTGTAATGTCCGTAATCTTCATGGAGCATATAATTGATATTCAGTTTTAATATGTCTTTGATGATGTGCTGTATATCCAGCGTGGGAAAACGAATTTTCACATAATCAAACAGCATGGTAAGCGGTGCTTCTGGATTGAACCTTGCCAGTTCTTTATGCAAAGTTTCCAGAAGTTCTTTTGACGGCTTCATTTTTCCGCTTTCTATCTTGTTTAGATATTCCCTTGTGATACCAGAAGCTACCGCCAGCCTGCCTTGTGAGATACCGTAAGCAATCCGCTTCTCCCGTAATTCTTTTATCCATTGTTCTTCATTCAGAACCATACCCCCAATCTGTCAAGTGTGAAGTTTTTTAAGGCGACTTCACAGCGGATTTTTGCTAGGAAACCATGCCAGAAGCCTTATGTTTCCTATGTTTTTTTGTCTATTGTCTATTTGCAAACGTACCCCTCTGTTAGATACCGAGGGGTTTTACCTGCTGGCGTGGCTTACGCCACACCAGCAACGGCTAGTCCGAGCCGTCGCCTTTCGCTTCGCACGTCGCCGTCCCGTCCTGCCTTGCTTGTGCAAGAAAACCGATTGTCTGCAAAAAATCATGTCCTTTCGGGACTAAAGGCGTGTAAAATTCACTTATGACGCTTGTTCCCACATCACAATAGCCACGCCCTTTGATACGCTTTTGGAAAAACTGCTTTTTCACATCTGAACCAAACAGCATACCGTAACCTAACTCGCTGATACGCCCCAATCCCACACGGAAATTGAAGTTATCTCTGATACCGTCCGAGAAATATTTTGCGTCTGGACGCTGGCAGGCAACGATAAGGAAATAACCTGCTTGTCGTCCTAACATGACGATTTTCTTTAACTGGCTAAGTAAGCCCACACTTTCTTTTGTCCCCAGCATTTCAAAAAACGCCACATATTCATCAAAGATAAGAAAGCAGGGTGGCAGTCCCAGATAGGCGTAATTTTCGCCCGTCTTATAGTTCGGGTGTCGTTTCATTTGCTCGCTTCGCTGTACCATGCCCTCATAAAAAGCATTGACACAGTCTATCATTTCTTCTTTGGTGTGATACACGTTTCCCATGACTGTTCCCAAGTCTGCTAAGTCCGCATTTTTCGGGTCTAAGATGTAAAGGACAGCGTTGGTATGCAGTAGGGCTTCAATGAGCGTCAGAAGAAAATATGTTTTACCGCCACCAGTCCCACCAGCAATCAGAGCGTGAGGGAGTGCGTCATATTCCCAGACAAGATTTTTCATCAGTCTAAGACAGCCGTTCTCTGCCCGTACTTCATCAATGGTAATGCGGTTCGCTATCATATCATAAAGCAGGGTATATTCGATATAGCCGTCATGCAGGGTCTTGTCGGTCAGCTCACAATACAAGCCACTTTCCAATTTATCCTCTAACCGTAAAAGCTGGTCTTGATATTTCCCCAGCGTAATTTCACAGCGGATATGAAGCAGTCCCTTTTCCATTTGATAATAAATCTTTGGAAACCAGACGATTTTTTCCCTTGATCTGCTTTGCAGGTCAGTAAAAAAAACGCTGTCTTGTACGGTATCAGCTTCATACCACTTGTTTTCCAGTATCATTCGTGCCAGCTTTTGACGGTGCAGTAGCTTTTTGAAACTGTCGTAACAGAAGCGGTAATACAGAAAAGCGACCAATGCACAAACACCAGTCGCTATCAGTATGGTTATGAAGTTGTAAAGGGAAAGCGTAAAGCCATTGTCTAATAAGCTGAAATGTTCCCAGTCGGTACGCATGAGCTGTTTTGTATTTAATAGCAGGATAACCGCTACGAACACAAACAGGAGTGTCCCCATTGAAAAGCGATAGACAAGGTTCTTATCGCTGGCTCTGATACGGTGTCCTTTGTTTAAAATCATTCTCATAAATCAATCACTCCTTTCTGGGTATGAAAAAAGCAGTCAATCGTATAGACTAACTGCTTTGTGTGCATGGATATGAAGTTGTCAAACTGGAATTTAACGTTCACTCATATATTGTTTTATTTCATCAGAAGTCAATTTTCGTACTTCTGTATGTGGATATTCTTTATACTCTCCAACATTAAACACAGGTGTCATTTGTTTGCATTTCTTGTCTTTATTCTTTTTCAAGAATAGATGTAAATCCTCATTCCCGGCGAATATTTTATAAGATACTCTGCCTTTACTGTTCTCTATCTCATAAATACCACATGAACTTTTCGTTGTATAATCGGCTGTTCGTAAATAAAGTTTTGCAATTTCCAATGACTTAAAAGGAAAATTCCATCTTTGTAATCCTCTGTTTGGGTCATGTTCAATACAAATGCAACGTCCACAAGTTCCACAAATATATTGAGTGTGGTTTTCTAAGCAGTCCAAGGGATTTAGTAATGGTGTTATTCTATTTTCATCAGAGTAACATTCTTCACACATTTTTCTTTTCGCTCCTTATCAAATTCTAATTTGTCGCTTTCTTCATACCCATATTATAACAGTTCCGTATATCCTCTACAACGAAAATCTATTCAGCAAGTCTATTTTTTCGGTTGTCCCTGCGGTGTATGGTTCTGTGAAGTGCCTGTGTTCTGATTGCCTTTATTCTTCAGTACAATATCTTCTGCCTTTACATACCAGTCCACATCTGCACCCGTATAGGTTTTTCGTGATACCGTATCGGCTACGGGATTGACAAGCTCCACGACTGCATTGTAAGGAAATTCCCTTAACGGTACTTCTGGCGGTACGGACACGGGGATAATTCCACCATGCAGACTGCACTTCAAATCATAGATACGCTTTTTAAGCTGGGTACTCGGTGTCCCGTCCTCATTTTGCAAGAACACATCACGCACCGCTGTAAATTTTAATTCTCCAAATGTTTTCTCTTTGTCAATGACAAATCCATTTGATAATCTCATAAATTCTTCACTCCTTTACTTTTCTTCAACTGCTACAATATCATCAGCTACTAATACATAATCGGTATGTCCCACATCCCCGATTGCGTACCCTCTGCCGTATAACTTCGGATTGACAAGTTTTACTTTCTGTTCATACTTGAAATGCTTTTCGCCAGCCTGCACGGGAATTTCCACCACAACATTTTCGCCTTTCTGTACGTCAGAATAAAGGTTATAGCTTCGTCTGGCTATGACCTTGCGGTTGTTTTTATCCCTTTCAAAGATAGGCTCGCTTTCGCCTGCAAATTCAAGAGTTCCAAAAGACTGTGCCATATCTGGCACGACATATTTCATTTCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_14 >CP012323|3793970:3800545|3793970_3794375_-|AXU66140.1|DBSCAN-SWA MIDDMAVYIANLGRYNEGYLVGAWFTFPIDEEDVKEKIGLNEQYEEYAVHDTDNFPIDIGEYVSIEELNEMYEMIEELPDYIVECLDEFISHYGTLEEVVEHKDDIYFYPDCETMTDVALLLHRRIERTWGHSS >CP012323|3793970:3800545|3796264_3796399_-|AXU66145.1|DBSCAN-SWA MWELVKDFLLVSMGMGIGVVLMCILSIGKEADYEMKQLEESEDN >CP012323|3793970:3800545|3796411_3797608_-|AXU66146.1|DBSCAN-SWA MVLNEEQWIKELREKRIAYGISQGRLAVASGITREYLNKIESGKMKPSKELLETLHKELARFNPEAPLTMLFDYVKIRFPTLDIQHIIKDILKLNINYMLHEDYGHYSYTEHYSLGDIFIYTSADEEKGVLLELKGRGCRQFESYLLAQQRSWYDFLMDALIDGGIMKRIDLAINDHTGILDIPELAEKCRKREYIGKSRSYKYYQSGELIKHREDDREYMGSTLYLGSLKSDVYFCIYEKDYEQYVKLGTPLEEADIINRFEIRLRNERAYYAVRDLLTYYDAEQTAFSIINQYVRFIDEEPDKRKNDWKLNDRWAWFIGDNRQSLKLTTKPEPYTLDRTLRWVQRQVAPTLKMLKKIDKGNGTDYMETIEKQAILSEKHEMIIKQQTTPAKDLVES >CP012323|3793970:3800545|3799280_3799718_-|AXU66148.1|DBSCAN-SWA MCEECYSDENRITPLLNPLDCLENHTQYICGTCGRCICIEHDPNRGLQRWNFPFKSLEIAKLYLRTADYTTKSSCGIYEIENSKGRVSYKIFAGNEDLHLFLKKNKDKKCKQMTPVFNVGEYKEYPHTEVRKLTSDEIKQYMSER >CP012323|3793970:3800545|3797792_3799187_-|AXU66147.1|DBSCAN-SWA MRMILNKGHRIRASDKNLVYRFSMGTLLFVFVAVILLLNTKQLMRTDWEHFSLLDNGFTLSLYNFITILIATGVCALVAFLYYRFCYDSFKKLLHRQKLARMILENKWYEADTVQDSVFFTDLQSRSREKIVWFPKIYYQMEKGLLHIRCEITLGKYQDQLLRLEDKLESGLYCELTDKTLHDGYIEYTLLYDMIANRITIDEVRAENGCLRLMKNLVWEYDALPHALIAGGTGGGKTYFLLTLIEALLHTNAVLYILDPKNADLADLGTVMGNVYHTKEEMIDCVNAFYEGMVQRSEQMKRHPNYKTGENYAYLGLPPCFLIFDEYVAFFEMLGTKESVGLLSQLKKIVMLGRQAGYFLIVACQRPDAKYFSDGIRDNFNFRVGLGRISELGYGMLFGSDVKKQFFQKRIKGRGYCDVGTSVISEFYTPLVPKGHDFLQTIGFLAQARQDGTATCEAKGDGSD >CP012323|3793970:3800545|3794392_3794875_-|AXU66141.1|DBSCAN-SWA METGRTNGEETTSYWFDLPIDVAEFEEKLGVGAESQDYRIIEKVLPYADEVHEHTSVYQLNELDFMYRQLSADMQEEYVELLTVFENLEALYICRNVITVYHDCKSMIDVARQKLMNDPTFKHLSEDCQAYYFDFEAYASHLLENKRYLVTENSIFELPE >CP012323|3793970:3800545|3800218_3800545_-|AXU66150.1|DBSCAN-SWA MEMKYVVPDMAQSFGTLEFAGESEPIFERDKNNRKVIARRSYNLYSDVQKGENVVVEIPVQAGEKHFKYEQKVKLVNPKLYGRGYAIGDVGHTDYVLVADDIVAVEEK >CP012323|3793970:3800545|3795209_3795962_-|AXU66143.1|DBSCAN-SWA MISDEMRVDILHAVFINKNFIKDEENCNYEKYLLELVNKSIYFREKSNFAEYVPPKSENHGECDCNSPNYQMDFKLLESTTRLHASKELTGQIQKFCDGVIGKCPPRRPNTQMTVTRLFASLRDYDCESLHSCLTEKYEYGTIEFDIQTYVKLLTFKKNLFFFFPYKFSFNTCYNFKYALDSIRIALEKDFRESNLFREKYYAEYDTFLAYIYEDNLIISKFEQDGKLQMIDCIYLFKSQTYSKLYEYTW >CP012323|3793970:3800545|3794814_3795111_-|AXU66142.1|DBSCAN-SWA MNDIFKDMQAKVGCEYISDLPSYKRKVWHEMKRLNPADYEEKQLEDFSKYVFGMSYQTLKDVMKQQKGREEQCRKQGYWWKREEQMAKKQHHTGLTYR >CP012323|3793970:3800545|3799819_3800203_-|AXU66149.1|DBSCAN-SWA MRLSNGFVIDKEKTFGELKFTAVRDVFLQNEDGTPSTQLKKRIYDLKCSLHGGIIPVSVPPEVPLREFPYNAVVELVNPVADTVSRKTYTGADVDWYVKAEDIVLKNKGNQNTGTSQNHTPQGQPKK >CP012323|3793970:3800545|3796042_3796264_-|AXU66144.1|DBSCAN-SWA MNFGQNLYQWFLSNAQSLVLMAIVVIGIYLGFKREFSKLIGFLVVALIAVGLVFNAGGVKDVLLELFNKIIGA |
11 | Streptococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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