Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012312 | Clostridioides difficile strain DSM 28670 chromosome, complete genome | 13 crisprs | cas14j,c2c9_V-U4,WYL,cas3,DEDDh,DinG,csa3,cas14k,cas5,cas7,cas6 | 12 | 43 | 11 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012312_2 | 591006-591130 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP012312_2
|
1 spacers
spacers of CP012312_2
>2.1|591049|39|CP012312|CRISPRCasFinder AGTTAGAGTGAAAGAGTAATCGTAAAATAAATATATGGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012312_2
The CRISPR arrays of CP012312_2 >merge|CP012312|2|591006-591130|CRISPRCasFinder TGATGGTTGATAAGAATAGTAAGAAAAAAATAGATAATTAAAGAGTTAGAGTGAAAGAGTAATCGTAAAATAAATATATGGATGATGGTTGATAAGAATAGTAAGAAAAAATAGATAATTAAAGG >CP012312|2|1|591006-591130|CRISPRCasFinder TGATGGTTGATAAGAATAGTAAGAAAAAAATAGATAATTAAAG AGTTAGAGTGAAAGAGTAATCGTAAAATAAATATATGGA TGATGGTTGATAAGAATAGTAAGAAAAAATAGATAATTAAAGG
>CP012312.1|AXU74237.1|589718_590129_+|hypothetical-protein MKIKKSLISAMMVSAMVLGGTGAVFANGNDSSNIALPKLESLIKSGITDPTELEKYGVEHYTYEEYAKHIQELKDYAKDPNAVKDVSQKDLEETIKKMEQELEKIKTEGLKIMKPITIKNEDGSQISIAYNYAAID >CP012312.1|AXU74236.1|588120_589503_+|penicillin-binding-protein MFIKLLEMSFTSGVLLLIVIFIRACLFKKLPKKVFVLLWLIVLFKLLIPVSLNSGFSIYSIIESTFDVELGNTSTENYTLKKASDSAGKNNSDEFEIMSSIENIMMLEMLGILSFIVTIMFSILLCFRYFKIINLFKTSIHIKNHEFIKKWMCKNSRFRRFIVCISEFTRTPLTSGILKPRIILPKQMNYANNQTLDFVLTHEMVHINSFDNLLKLFMLVALVVHWFNPLVWVMFFLLNKDIEFSCDEKVMSILGEEYRADYATTLISLAEENNPFSMTICSGFGKTKIEKRIVNIMKFKKSTYVTFLVSTVLVCGTGLVFATENKEINEVESFGLTKNEQSDKIGFSISSKSTDLYSPKVESDILVSKAKSDGETHFSTAKVSVIEFREHEESSTSKVTNSENSEETYVNKSSNSKDVLYTDSGEVSIERSNYNDNRFVISRKGNLLAVNKEQYRTWIE >CP012312.1|AXU74235.1|587750_588110_+|penicillin-binding-protein-repressor MEIKLFDSELKVMEVLWERGESKAGELVKILKEETGWNRNTTYTVIKKLVSKGAIERIEPNFVCKALISKEEVQKQETETLINKMFGGSSEKFLSAFINKENLSNDEITKLKQIVEKLK >CP012312.1|AXU74234.1|586766_587546_+|membrane-protein MVSRQELKRVSKAQLSGNWGICAISMAVYIALLVLISIVGLPFEPLTTIVVAVIAFCVSAGFTCMFLKITKDEKVKIGDIFVSGRIYLRSFGFYLFESIIVYIYSFIITIIGAFLSFGVLLTSGAIEYLSSDNVGIGTIISTGITLVLIILVLMLPVYILLLYVSQATFLICEDKDNMGVFKSMGASLDMMKGNVLKLFILNFSFIGWYILSIATLGIGLLWLIPYVGVTNCNFYRQLVKENPDVEDILLDKEKSYTMY >CP012312.1|AXU74233.1|585708_586320_+|lipoprotein MKMVKKLILSSIMALVLVLTIGCSNAEEKVKSNFEANLAALEMYKYDEKGISDALTEAEYKQIQTYNSKDKVSMIAQLTPLYGKENAEKIYETIVKLIQGVEKTVTVESSSKDKITLKVVSKALDTSKVMSEANTLVKSYVTDEKNYDKKEKEVQDDMTKMIIDLYNKKPTKEVTTMITYTKKDGKWQPPSNIQKLCEGIYTI >CP012312.1|AXU74232.1|584628_585618_+|ornithine-cyclodeaminase MLLLKKDDIEKVFTMRDAIEADKEAFRIYCEGKSVNPLRTNISVPSQDASMLFMPGYVEELGCGGIKIVSVFPKNAQKGKPVIPATVLLLDGETGEVSAVLDGTYVTQIRTGAASGAAIDVLAKKDSKIGALIGLGGQGEPQLEAMIEARNLDEVRVFSRNKESREKFAEEMNLKLSKYNTKIVAVESSDKAIDNADVIVLATPSKQPVLNGNLVKKGALISAVGSYMPDMQELCPNCLTRASKIFFESTDAVLSESGDILIPLKEGKISKDDFSGDLGNVINGTIPGREDDDEIIVFKTVGIGVQDVVTAKRIYDKAKENGIGMDWKW >CP012312.1|AXU74231.1|583698_584562_+|copper-amine-oxidase-domain-containing-protein MKFFKVDTKARVLRYVFVLTLTIMAVLAIKHDYKYNNLRKDASINLNSNKEAVTVMSNQSLPKGNTNSKQTLSVSTIGSKTIVKNDEYLESTINMPVITNSNKIVERSTNDKIKNDIFEFYNKSYKEAKQYLKDNPDEKNKFVANVDFELKKNTDSALSIKVRYYTYSGGAHGFYQDIAYNVDMRTGKFLELMDLFKDNTKYTEVIDEEIKRQIAELEKKDEENIGIYNFKGIKENQNFYLQDENLVVYFDLYDITPYAAGIPEFSINKALISSMLKPEYVDLFDLK >CP012312.1|AXU74230.1|582996_583593_+|chemotaxis-like-protein-glutamate-methylesterase MERFNNMVIAIGASVGGTEAILEIIKDLPKSTPGIVVVQHMPAIFTYMYAQRLDKQCIMNVREAKNNDRVEQGNVLIAPGGYQMKLCTDKQGYYVTCEKGERISGHCPSVDVLFDSVAEVAGKNSIGIILTGMGYDGANGLLKMKENGSFTIGQDENSCIVYGMPMIAFDRGSVMLQLPLGEISNCLIRHINILKQKD >CP012312.1|AXU74229.1|582153_582957_+|chemotaxis-protein-methyltransferase MIKLTDEEFIVLVNHVKKEYGIDLSKKRALIEGRLYNTMIEKKLSSFSQYMNLLFKDKTGNEAINLINRLSTNHTFFMREPQHFEFIQNSILPFWEENNKIRNINIWSAGCSSGEEAYSIAMTLDDYFGYNKELWNIKIIATDISTNSLEKAKRGIYIESNVNNVPELWKKKYFIDNKDGTFKICDKIRKSVIFKPFNLMNDFSYQHFDLIFCRNVMIYFDLKTREELINKFYNATKKDSFLFVGHAEVINRSSTKYKYVKPAIYKR >CP012312.1|AXU74228.1|581677_582118_+|chemotaxis-protein MAKDEIIKQVLTFYVNDVIYGIELENVIETIRFQSITYVPCLPTYISGVINLRGRIIPVINMHIKYNLPKADYNERTCIIITKVDEYQVGIIVDKVVDVITIENLNLLETTNSNNTNINKDIKEIAKVEDNSILILDIRKFLINSM >CP012312.1|AXU74238.1|591341_591998_+|membrane-protein MKKGDFIWSGVLICIIAVLAIPSSREVFMEATGAHPYIGGFLKFAVLATMGDLLGARILYKDWKIPVGVFYRAIVWGIIGVVTTYGMSIYSSGVGQAQVDGMLPFEGIAFANALFKSATMNILMSPTVFLFHKVMDCFIDKKYEVGKGIKVKLKDVVNIVDWNAYLGFSVLKTIPFFWIPCHTIVFLFPAEYRVIASAFASIALGLILALANKSKVAV >CP012312.1|AXU74239.1|592468_593740_-|spore-peptidoglycan-hydrolase MQDGFLTVSIIDATNNRPIQNAVVNIYSMSNGSQSSSTLYQNLRSNESGQVTGLVLPAPDVDYSLQPSDVRPYSQYIVEAIADGYDTVVIEGTQLLATIEARQGVPMSPRTRSKRSFSRQSELIFDIGEHTLYGTYPPKIPESNLKPLPPPTGFVVLDNPVVPEFIVVHDGLPEDSSAPNYWIPFKEYIKNIASSEIYSTWPEQTIYANVIAIISFTLNRVFTEWYRNKGYNFTITSTTAYDHKFINNRNLFEPINVVVDAIFNTFIKRPPTSRQPLLAQYCDGQKSQCPDQMTQWGSKDLGDQGYDYESILRYFYGDEIVFERAPIVSGVPVSFPGTTLQVGSSGQYVRTIQNQLNAISNSYPAVPKVIEDGIYGTDTENAVKIFQGIFGLPQSGVVDFKTWYEISRVYVATTRIASLNPLI >CP012312.1|AXU74240.1|593984_594701_+|spore-cortex-lytic-protein MKLDLFLLAIVPILIGMFWIRSKDRYCREPLIHLIKFFLIGAFLSVIIILLENLLMKFNVFEGYSELIYVSFVVAGLVEEGVKALILIPALIKEKHFTEKLDGIIYSVFLALGFATIENMVYIFSESRNLALQVGINRAVISIPAHVMFAITMGYYISKYKFEGNKNKRREYLFMAVLIPILLHGVFDFILMIEYRWAIILLIVYVIILWKINLDKLEKYMNHSKKVFFGNLRKKKKK >CP012312.1|AXU74241.1|594779_596090_+|methylase MTELPKKFLEDIEEILKDEYDDFIKSYEESKTTGLRINTLKIDKKRLFDLELFDLNQIPWAEEGFYYDDKIDRPGRNPLHEAGAYYLQEPSAMSVIPKADIKEGEKILDMCAAPGGKSTYILSKLNDTGLLVSNEINASRIKALGENLERFGARNCIITNTDSNSLRKTFNGYFNKVIIDAPCSGQGMFRKDEVAIFDWSYAKVVECQSIQKEIIRDGYKMLKKDGILIYSTCTFSREENEHVINEFISEYPHAELIEMERLWPHKIKGEGHFVAKIKKLEEEECNVKELKIKNLDKEIKDYREFEKKFLKVDFYSNKKNKFYLRGENLYLLPEIYPDTKKLKVLRYGLHLGVLKKNRFEPSHALSHYLKVEDVKNVENFSVQSESILKYLKGDVVNSNDSRGWVLVSVEGIPLGWGKESSGVIKNHYPKGLRKVF >CP012312.1|AXU74242.1|596189_596726_+|signal-peptidase-I MGEAVKKEVVEWIKVIVIALVLAFAITRFIVPTIVKGESMYPTLVERDYLIVNRIAYKVGEPKYKDIIVFKTDLTEENGKKKDLVKRVIGVPGDHVKIQDSKVYVNDKLLDETSYIHNNRTDGDIDIVVPEGKLFAMGDNREKSLDSRYDEVGLVDEHTILGKVLVRLYPFSKIGTID >CP012312.1|AXU74243.1|596891_597428_+|singal-peptidase-I MNETIKEEIVEWIKIIITALFFAFIITRFIKPTLVNGESMYPTLKSHDYLVANRMTYKLSEPKCGDIMIFKTDLLQENGRKKELVKRVIGVPGDHLKIKDSKVYINGKLLNEVSYIHDNYTEGDIDMVIPKGKVFAMGDNREVSLDSRYKEVGLVDEENIKGKVILRVFPFTDIGIFE >CP012312.1|AXU74244.1|597437_598193_+|endonuclease MAVGIASLLFNIEEALNICESIKQITHLEIGIDNISECSELCKYKERISKLGLSIGIHLPMELNTCENIEYIRNSWINFIEKIEFELKGFDIRYFNLHLGYVMTNRVIKNRDKYLGNSVDFLDKLNTNSYLCIENTYSKGGDFSNIGNISYDFEYIFKRIKNSKICFCYDTGHCLIDEDAYVKNLKDKIRLIHLSDNDGINDTHVGIGRGILSEEGIKEVLTLDAEYLVLEINYEDIEDTISKLNNIVGEG >CP012312.1|AXU74245.1|598266_599934_+|phosphoribulokinase/uridine-kinase MKKINLKIEGKDKEYSLEENSPGIRLGDIAKEFCDEHKGYITLAVVDNKLKELNCRVKKDCEINFLDTTNEDGERVYFRVMSFIFVMACREIFWDSRVTIEHSLSDGLYCEVHIDRKLKEADVENIKNKMKDIVNNDYVIEKIEVTRNEAISIFENNEMYEKAELLKYKEYDSAKVYKCRNYIDHFYGYMLPSTGYIKSFDIKLYNGGVIILGPSEEDKTLPMKFIPQPKLSSVYYEAEEWSRLMGIDKVVSLNKIIENNEYGDIIRTFEALHEKKLSQIADMIKDGNKRVILIAAPSSSGKTSFAHRLSIHLRVNNLNPISISLDDYFIDRKHTPLDEYGNYDFESIYAIDLEKFNLDLKKLLAGEEIDDIRFNFKEGKREYTGKKIKIDSNQPIILEGIHGLNPILTSSIPDEDKFKIYISALTQINLDDHNRIPTADLRMIRRIVRDYNFRGYSADNTILQWASVRRGEKKNIFPYQEEADAIFNSACVYELAVLKRFAKPLLEEIKEDNPAHIEATRLLKFLQYFVELDDTSDIPGISILREFIGGSKIVD >CP012312.1|AXU74246.1|600697_601627_+|glutaminase MNTLDETLLKEIISSNKKYTNYGQVASYIPELKNARRNDLGICIIDSENNLYSAGNCSTKFTIQSISKPIVLAMALMDNDWEDVFSNVGMEPSGDPFNSIMKLEINDTKKPCNPMINAGAIVTTSLINGSCLEEKEERMLSFFRKLAKNDNIGINYDVYKSEKMTGDRNRAMAYLLKSDGFIRGNVEDVLDLYFKQCSIEIDSVDLARIGINLANYGVDIENGEHLMSEMVSRIVKTFMMTCGMYDASGEFAIKVGIPAKSGVGGGIMASVPGRMGIGVYGPALDKKGNSVAGVKVLEELSNKLKLNIF >CP012312.1|AXU74247.1|601724_602288_+|regulatory-protein,-arsr MKEVLVLRDLECIKAIAHPRRIDILKAFDKSPLSAKQLSQLLEEPHAKINYHIKMLYKVGILELVEEKIKSGIVEKYYYPSAKNVVIGNRILNFSLDNGEEKEELYISKFENMSEVFYKAAEEDVLENENIVDYHDISLTHDELVELSDTMKSKIDEILNKRQHNVEGSKYDIAMVIVPTLEEECPS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012312_3 | 1145996-1146088 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP012312_3
|
1 spacers
spacers of CP012312_3
>3.1|1146027|31|CP012312|CRISPRCasFinder AGAATAAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012312_3
The CRISPR arrays of CP012312_3 >merge|CP012312|3|1145996-1146088|CRISPRCasFinder GTTGGCGCTGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACAGAATAAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGCTGTGCGTTAGCACTTTAAGCAAC >CP012312|3|2|1145996-1146088|CRISPRCasFinder GTTGGCGCTGTGCGTTAGCACTTTAAGCAAC AGAATAAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTT GTTGGCGCTGTGCGTTAGCACTTTAAGCAAC
>CP012312.1|AXU74750.1|1143191_1144166_+|mannosyl-glycoprotein-endo-beta-N-acetylglucosamidase MARKLIKNLGKSKSVKRVKLLFKKIFITVFIVASIVAIFNITKYFEELYKVRDLKSTKIEYYMDVADEAGDGKVQLSWKALLAIDMVIHDEDLSNIKKKDTLNIGEKFIVEDKNDKGEKVYKVKKFNKVLSELKFDSSQKSRARKYMKDLEYTYLGNKQLDSSDEKIKFIKQLEDSAIREYIDYGILPSITIGQAILESGWGNSKLTKQSNNLFGIKADKAWKGKSVEISTSEHYNEKIVASFRSYNSLQDSVKDHSLFLINNKRYRKHGLFEEKDYISQAQALENAGYSTAEDKKGNRIYAELLIDVIRSYNLQLIDNKVETK >CP012312.1|AXU74749.1|1141991_1143116_+|UDP-N-acetylglucosamine-2-epimerase MNDIKVMTVFGTRPEAIKVAPLIKELEKRENIKSIVCVTAQHREMLDQVIETFNINVDYDLDIMEKGQSLNDITCKILNKLPLILNKENPNIILVHGDTTTTLATSLTAFYNKTLVGHIEAGLRTYDKYSPFPEELNRQLTGIIADMHFAPTNLAKKNLISEGKPNNNIFVTGNTAIDALKMTIKENYNHPIIDEIGNDRMILLTSHRRENLGKPMKNIFRAIKRIVDDFEDVQIVYPIHLNPKIRTIADEIFGKFPEKIHIIEPLDVADFHNFLNKSYMIMTDSGGIQEEAPSLGKPVLVLRDKTERTEGIEAKTLKLVGTNEDRIYNSVSDLLINKDNYVQMSKASNPYGDGNASKYIVDIIIKKFNCKYLN >CP012312.1|AXU74748.1|1140864_1141938_+|TIM-barrel-fold-family-protein MNKFKLKRSILISVIILIFIFIIYFVSIELKDMSLVNNQYKGKIKSANLSVDYEINQVMKDIDKLGLNTVNVPIIINVESINSDIMSIDNNSKEKAIKLIKKLNKKGISTILEAYPWIENGKLYETDWNPINKKRFFYTWQNAILNELIIDVANPLDVNVLNIGSNFVHLEGYQQNWGEIIDFVQSKFDGLVTYRTNWWYTKKDDLSSKLFYEQKLNNNFFDKLDFISIAAYFELSNKSVNTVDELISALHSSTVNNRGQNIKQEIYNLYKAHRKPIFFGELGFSNRESASSQPWNHAPSKVVNGEEQARCFEAYKQVFENEDWINGFSVFCVGKIDDEKNFYPSKESIKVIKSWYE >CP012312.1|AXU74747.1|1138734_1140816_+|cell-wall-anchored-protein MKKFIISIISLVLFFSNISLIYKVNADETKVKNYKFERDITIDGVIGSNSTFFEVNKNWDIEEVLLHLNFSKSQILNGDVSSLTVLINNVPIKSIKLNAKTNYKNTLEVLVPKDYVIQGYNEIKIKTYKTISDKICQDDSNTGNWMVIHKESYISIRYKQKKMGNSINEYPYPYAEIENNHKLDTTIVVPDNMTRGETTAVFNLASAFGKITKNDDLKLDVKLYSEMKNWSDDNIIYIGKPENTAEEILDILSTKEQTLLSSNCIIKQVDSPYNKNKKMMVVIGSNEDDLIKASNLLIENRLSNQVLSSSVFVNKETNIKINREQKLNLGHLTLKDLGYSDFLLEGAFNQQALFDVKIPTGKVLDDGSKIILNLRYSDNLDFEKSLVTVSINDVIVGSKKLDRSHSNNDKLELKIPKDIDNKNYYQVKLTFNLSIKNSNCVTRESNNPWAYVSNNSYLALSTKENETLSFENYPYPFVRDDEFNDLTVIMPDYSGSQAMTWMFRLGVTLGANINSHNGNINVIRGKEFSDKYKDTNIVVFGVPHNNSVIKMLNNNLNIKFDKNYSDFISNDKISFIDDYGKNISTIQLIKSPYNNQKNIMVISSMNEKNLYLGMDYLLNKSKVNDLKGDTLIIDEYGEVEDLAYNLKSKKEVKDSSWNMSINKTTKVFLMISFITIIVVIILSMLYIKKYKRR >CP012312.1|AXU74746.1|1137455_1138712_+|glycosyl-transferase MRDLNVSEYLFVFSLFSIWSLLLINIILAMGGYIFYFKNFDKEIKEIDEYPMISILVPAHNEAKVIGRTVESLLLLNYPKSKMELIVINDNSSDNSKEILENIKDRYNNYNFTIINTDSLTGGKGKSNALNIGYTISKGDFIAVYDADNTPDKNALRYLVQTIVMNDELGAVIGKFRTRNKNKNLLTKFINIETLSFQWMSQAGRWQLFNLCTIPGTNFILRRSIIEEIGGWDSKAIAEDTEISFRIYKLGYKIKLVPQSITWEQEPETVKVWIKQRTRWAKGNIYVLMKYIKNIFKQGRNKIVFDIAYFFSVYFLFLTSVIISDILFALSISKLVEISIPINFFLIWILSYLLFIIEVSISLTIEKGEATIENIFIVAIMYFTYSQLWLFVAIKGMIEYLKDIIFKREVKWYKTERF >CP012312.1|AXU74745.1|1135742_1137407_+|cell-wall-anchored-protein MMFKIFNKSLLKLVVVLSIVLTISNFSLSSYASEITSSTDKVLIIYDSKKETAYNRDILNIMRTILGRFSSDIELLKLSNYDGEINKNYYSHIFILGINENSYDNDKNTKNLISSLNSYKGTICWLGYGIENLLEHKKYNLDYVGKTNNIVSVNYRGKSYNLDEHYVFNIVESKDTSNKVIGSINDTLNKYPYIINDKNLFYVSKLDLDGVLFYIFCDSLNDIFNIKTFDKGRIFVRIEDVHAFREPKNLVEIADYLSSKNIPFTIALIPAYVNPKNHKVITLSESPEIVKAIKYMQDKGGTVILHGYTHQYKKEEVSGEGYEFWDGKKDEPLKENMKIFVKDRVLNGLRVCIENGIYPLAFEAPHYAMESEGYKELKKYFSTYMGQHQNNDKKFSTNTYPYIIRDTEEFNIFIPENLGYIDPEDKFTFQNIKENLDKLSIVRGFSGGFFFHSYLNIEYLKNTIEYLEKQNIEFMNLRDFNNWVKVDEIQIKNNGDEIIVNYDKDLDEITKSDTRFKSISNISKILIFIVSISVLIFVIIFIYFKRIDKKKFLK >CP012312.1|AXU74744.1|1134904_1135753_+|signaling-protein MNRINKKIDLLILALLVFIFLIVGIVILSIRTENKLNVFIMLAIIFFIIMLTYLSNSVVGLITSSIIIFMYTSYILYNNITHNMDVEFISYMWIIAIPISSIIMGNLNKSINELQNTNKKLSEQYKELVTIDSETGLRNLKIFYNDVNMEISKSIRHNTDFSLMIVKLPYYGNLQTIFGENKTNKIVKYIGSNIIECTRNEDIIYSLQKDMIGILMPNTSLEGSKVVKDRIKKRIKELNLDLNNRGKYVNIDVKIAFLQYKSSFGDSINFKNIVEEELQYDV >CP012312.1|AXU74743.1|1133390_1134443_+|spermidine/putrescine-ABC-transporter-substrate-binding-protein MIKFKKVISLIAVGMMTVTLFTGCNKATDSTKVLNVYNVGDYIDESLIDKFEKETGIDVQYSTYDTNEMMYQKVKSGSTHYDLVFPSDYMVEKMKNEGLLEKLDFKNIPNMKYLDKSFLNPVYDKTNEYSVAYMWGTLGILYNKKEVKDPMDSWDILWNPKYKGNIMMFDSVRDTIGITLKKLGYSMNSVNPKEINEAKNLLMKQKDLVLAYVNDEGKDRLLGGEVAMGMLYSGDAVTLMEQNPDLDYAIPKEGTNKWVDAMCVPTTAQNKKEAELFINFLLDPENAKVNAEYIGYSTPNTGALKLLDPEITQNPVAYPSKEVLDKCETFEDIGENIKLYDKAWIELKSK >CP012312.1|AXU74742.1|1132662_1133391_+|spermidine/putrescine-ABC-transporter-permease MYAPIFALVLFSFNDSKSMARWNGFTWKWYGQLLQNESIMSALYYTIVIAILASVISTIVGTISAIGIHKMRGKSKKLILNVNYLPILNTEIVTAVALMSLFVFVKMEFGFTTMLLAHIMFCLPYVILSVLPKMKQLPDNIEDAAMDLGATPIYALRKVILPQIKPGIVSGFLIAFTMSIDDFIISFFNAGNGVSNLSIEIYGMARRGIKPEINALSTIMFAVVLGLLLLANKKESIVRGTK >CP012312.1|AXU74741.1|1131775_1132612_+|spermidine/putrescine-ABC-transporter-permease MKRKSFLAYPYVVWSAIFVIIPLILVVFFSFTKESGGGYAFTLENYKEVIDPIYMKVFGRSILLAGGATLICLIVGYPVAYIISKARVSRRGSLILLFILPMWMNFLLRTYAWVAILGKNGLLNTFLGWFGIQPLAILYTNFAILLGMVYNFLPFMVLPIYTALSKMDNDLINAAHDLGANNMTVFRKIIFPLSLPGVMSGITMVFMPAVTTFAISRLLGGGKIMLVGDLIEQQFTVVGDWNFGSAISIFMMIVILISMSIMSKFGDESDKEGGGLLF >CP012312.1|AXU74751.1|1149696_1151715_+|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MRRNTKLLTTGILSMAIVTPTMAFATESNAMENNADLNINLEKKSIVLGSTSKVSVKFKEKPDADSITLKYKCYDMPLDTTLNYNQSTESYEGTINYNQDPEYLNVWELQGITINSKNNPKTLNRQDLENMGLNLKDYNVTQECIIEDITSRKDVNKYLRKTSAPITELTGSDRYETAVKISKEGWKNGSDKVVIINGDVSIDGIISTPLATTYNAPILLVEKNNVPNSVKSELKRLNPKDIIIIGDENAISKTTANQIKSTVNASQTRLNGSNRYETSLLIAKEIDKNHDVEKVYITNANGGEVDALTIAAKAGQDKQPIILTDKDSITDNTYKWLKSEDLQNAYFIGGPQMISTNVINKVNDITKDSVTNNRVYGADRHETNANVIKKFYTDDELEAVLVAKSDVLVDALAAGPLAANLKSPILITPKTYVSAYHKENLEAKSANKVYKIGGGLTSKVMNSIASSLSKHNTTPTEPGNSGGKTVMIDPGHGGSDTGTTGKPLGGIKEKDYTLNTSLATTEYLRSKGFNVIMTRDTDKTLSLGNRTALSNSLRPDLFTSIHYNASDTTGNGVEVFYKLKDKDGGTTKTVATNILNRILEKFNLKNRGAKTRTLSTDPTKDYLYVLRNNDMPAVLVECAFLDNEKDMSLLNTSNKVKEMGTQIGKGIEDSLK >CP012312.1|AXU74752.1|1152219_1154232_+|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MRRNTKLLTTGILSMAIVAPTMAFATESNAMENNADLNINLEKKSIVLGSKSKVSVKFKEKPDADSITLKYKCYDMPLDTTLNYNQSTGAYEGTINYNQDPEYLNVWELQGITINSKNNPKTLNRQDLEKMGLNLKDYNVTQECIIEDITSRKDVNKYLRKTSSPITELTGSDRYETAVKISKEGWKNGSDKVVIINGDVSIDGIISTPLATTYNAPILLVEKNNVPNSVKSELKRLNPKDIIIIGDENAISKTTANQIKSTVNASQTRLNGSNRYETSLLIAKEIDKNHDVEKVYITNANGGEVDALTIAAKAGQDKQPIILTDKDSITDNTYKWLKSEDLQNAYFIGGPQMISTNVINKVNGITKDSVTNNRVYGADRHETNANVIKKFYTADELEAVLVAKSDVLVDALAAGPLAANLKSPILITPKTYVSAYHKDNLEAKSANKVYKIGGGLTSKVMSSIASSLSKHNTTPTEPGNSGGKTVMIDPGHGGSAPGNSSGGMIEKDYNLNTSLATTEYLRSKGFNVIMTRDTDKTLSLGNRTALSNSLKPDLFTSIHYNGSTNKQGHGVEVFYKLKDKNGGTTKTVATNILNRILEKFKLTNRGIKTRVLPSDSTKDYLYVLRSNDMPAVLVECAFLDNENDMSLINSSAKVKEMGTQIGKGIEDSLK >CP012312.1|AXU74753.1|1154473_1156387_+|hypothetical-protein MEYLFEKSSLKEYGNEALDKYRELLDKTGNNSRCILLLVPNNNTKIRYERALRLNYSEELKITTYISFVKKELVKYWPLIIEKCDGISTKAVSPTFISNSLSEYLIVQKVKEKRIQEGYFEDITGTNKSIANSIMTNINKSAFNLIDFDFIGEKIYSSKKNKDSIYRFSYTQMDEIISYYINSLLSNSILDNALSIYLYNQYLLNDDFYLKTLFTEVRYIIVDSLESSSNAEVDFITEALDNTLQSYIYFDYSRDYSVFNNVDIDYINEKIISKIKPKEENIKKKEIGIEDLYLLPANIELNQSSQLYNEMLDLISEKVISLIEEDVSPRDIAIISPINNSILEHQIRDSLIEKNIDVFNTKKDKKAVDYPYGNALVVATCIFYGYLDFIKDDEYLSFLETLLEINRIKAFKIFNETRHLSIDNIDEHSQYRDILQYIEEKKKSDIKIHEFLTQFYIDKMLNLKEGKKNVGLCKKIIVESESFSESLSLLGMKKEKIFIEALKSTINDYYSVVDIEELKSKDKIVITTPYSYISSDIDRSIQIWVDIGSNAWNMKIEKDISNLIVLRKSFEEKKIYTNEMEEYYKKYYLYNTVYNLLLNAKKIYAYKSEYAINGYIQESMLYSILLKISHKGDKNYD >CP012312.1|AXU74754.1|1156379_1158599_+|helicase MININYREDQIPIINYDNGTMAVPAVPGAGKTFIITNLVAKLLLEQKHKGGKILVLTYMNSAVNNFKGRIRTILEENKIDDTNSYEVMTIHSLAVKIIKEKPEVVMLSEDFNIADDLQKSIILNECISRFRFEGGERAFRWFLKEQKDERWKEITLEAWERGFFEFAGNAISELKYKGISPDKLEEILSRGHKGMLKIILPIYKLYDRKLKQNGLLDYDDILILAEKTLSLDEGLRKKFQARYKYIFEDECQDSNEIQGNIIKIISSENKNLVRVGDINQSITGTFSSSDPKFFKEFINSADFCYRMDMSNRSSKDILDLANTLVKYVTKEFRQKECRHALEDMQIKTVPNGMGYKENPNPEHYNINVKWYESWKIEIEQTARYVKGIKNKYPDKSIGILVPFNEQVTQVAKELRENNLTFEELGPNSLNKRKIINNIAYIIDFMLHCDDVEKLIVVLNKVFIDTDNEEEIKYFLEELKNYSTEEIIYNFEFSKLDNGLIEFNEESDICLGFKRGIDIIKQILEYPIIRLDLLVLFIGKKLNLEKEDKAVLDYISFYIKYLVSENINMDLEDVYNLLFDVKNKVFNHIIDVVYEINGYEPEPGSITLCNYHKSKGMEWDCVFLLGLVEYNFPDNINQKFQSDKWYLKEKYKNPMAIIKSEVEAILKGSISTDYTHKTKIDSINEKIRLLYVGITRAKEMLVLSGSAYRDESDIGNKRKEQKPCIYLNRLNQHIIEKRSN >CP012312.1|AXU74755.1|1158707_1159538_+|PD-(D/E)XK-nuclease-superfamily-protein MNDKLKYFSYSQNSINTYKSCPLKFKYKYIDRINWKNDDVGSREYYETLKTGRDFHLICERYFSNIPLGIYFNEDDKNSKKFLKWMENIKKVVPIEKGKTYLPEYEVRMTLNGDIIQAKYDLVVIGNNNIEIWDWKTESKKIDYKHVENRIQTIVYMFLAKEVIPKVLKMDINVKDINMRYYQPEFDDLPITILYDEEKHEANRNKIQNYISMIKNTNYEEHTYEDNLYNDIEKVYNKEERMCYRNKKHCKYCEFNKLCNGKEIDYSILEAEIYGT >CP012312.1|AXU74756.1|1159527_1162995_+|ATP-dependent-nuclease-subunit-B MGLRFVLGRSGSGKSTYILDEIKKEAQKNETTSIILLVPEQYTFEVENRVSKLFLGKEKDKYLRVRVLSFKTLSNIVFSQVGGLTDVNINSSGKAMMVYRAIEDVSEELNVFSKSKSQSGFVSSITDMISEMKQYNISPEMLENISGELDNETLSLKLKDISKIYNSFEGKLHENYVDAQDMLTSLASKIELSSYLDGACVYIDEFTGFTPNQYNVIKSILNKSKSVNISLTVDDINYIGYSKSDMFSRTKFTYSKLIQLCNEEGIKILPQVNLNTGVIKRFEKVKELQHLERFYNAYPYKIYSNQTENIKIKEFNNLYSEVEEIAREIVHLVRDKNVRYRDITIATRDLSRYDFLVHSIFNEYNIPNFIDKKREAKSNPIVILIISALEMKNRRYGYETMFMYLKSGLIGIDNDDINLLENYVLANGIKGKKWFDEKWDYRITQSLSGKESEFELELKEKINEIKNKVLEPIVILQEKLRGKNRVKEICRYIYEFLLDINMPETIESLIVNFKDKGELDVANQYSQVWDIVVDILDQMVELMGDEIISLEKFIKLITLGFDEYELGLVPPSIDQVLVSSVDRMKNPDTKYLYLVGTTDGVFPLITKDSGILSDNDRESLGNKGIEVDIDSKTRSFEEQFLVYKALTSTSKNLTITYPISDHEGKTLRPSIIISRLKKIFPNIENKSYLVEENKSTDEDILKKITVKSPTFNELINVIKNYDSDGYNTEEINSIWLDIYRYYLKDEIYSSITKKVIKGLSYTNQVHKIEEKKIRSLYKSNSLSISRLEKYAECPFAYFIQYGLKARKRKEYSFTPPDLGTFIHNILDRFSKELLQDNLSWRDIDEKYIELKIGIIVDEIILKIPGYILNSSERYKYLAYRLKNMLTTAITIISQQIKQGSFEPIDYEVKFGDNGKYSPIKIVLENGQEVSLIGQIDRVDEFEEGENKYIRIVDYKSGNKSISLTEIYYGLQLQLLVYLDAILESAKDEDININPAAILYCRINNPIAKFNEDKDDEEIQEAILKELRMKGLVVKDSHIVKEMDKSLIDGERKNSLVIPVGLTKDGNVGKSTSAISYEDFKLLRKYVRHAIKDLCEEMLSGEIRIAPYKHKDGTSCDFCDYSAICQFDSTIKDNKYKNLNNKSNEEIIKMMKGDVN >CP012312.1|AXU74757.1|1162994_1166822_+|ATP-dependent-nuclease-subunit-A MSSPKWTKEQLEVIESRECNLLVAAAAGSGKTAVLVERIIQMITSRENPIDIDKLLVVTFTNAAASEMRERIGDAIGKALDENPENKHLQNQLVLLNKSSITTIHSFCLDVIKSNFHRVSLDPNFRIGDQTECAILKQEAIEEVFEDLYEERDEGFLNLVESYAERGGDKEVQDIILGIYSFAMASPEPKKWLIDSAERFNIDENFDFSQSIWARAILDTVKIEINGLCLNMERALKEVESIEELEIFAEKLSVEYKKIADISQACNKSWDEAYKKMASMSFENYVKGVKRISKDAPSYIKESKEKAKTIRDKTKKSLESIVSATFNKDNDSIREEIKYLYNIVKPISNVVLRFEEEYSNKKREKGIIDFNDIEHFALNILTDVDEKGNIIPSDIAVGYRNKFYEIFIDEYQDSNLVQEVLLKAVANTETPNRFMVGDVKQSIYRFRQAKPELFLQKYNNYNDKKGSSHRKIMLYKNFRSREEVVDAVNYIFENIMNENIGEIEYTEKERLNLGANFNVDTDEKSIIGGATEIHLIQKDNKLDDDIINDKDDRINNKENEIEEEEKLDNIQLEARMVGNIIKDLMKVNEDGKIQKVYDKGIDGYRPVEFRDIVILLRATSAWAPVFADELMNMDIPTYADVGVGYFDTIEIKTILSLLQIIDNPMQDIPLISVLKSPIFGFTPEDLIDIRVQSKDKIFYEVLKSTAEYDGFTDSQNENESEFIPSEECINKSKDFLIKLKEFKEKSMYMSTDEFIWYLYTRTGYYAYVGALPGGSQRQANLKVLFERAKQFEETSLKGIFNFVNFIEKLKKSSSDMGSAKTLGENANVVRIMSIHKSKGLEFPVVICSAMGKNFNTQDFKKSILYHHNLGYGPQFVDYERRISFPSIAKEALKSKINIENLSEEMRVLYVAFTRAKEKLIITGSTRNIQDSIKRWSNGVESLDTISQYEILKGKNFLDWIMPCVLKHRDLSNLLEEVGLDAVFSVEHNSKWYGKLWNKNDILVEKKSDEEKESIEEILEKIDADSPDSNYYNEIEEKLNYIYPYEFSTRKPATISVTEIKKIQNNYEEELINTIFEQKVILKKPLFIQNEEEREKISGTERGTIVHLVMEVLDLKNVSSVNDIKSQIRGFVSKGIITEKQASIVNPYKIYKFFASNIGKRMLNAEIINREKSIYAQVNMKDIYIYEKLINNDDKKLYDNESVMLRGIVDAYFEEDNQIVLVDYKTDFVNEENINQIIEKYKKQLDLYADIIETLTGKSVKEKCIYLFGVDEAVCY >CP012312.1|AXU74758.1|1166866_1168078_+|nuclease-subunit-D MRFIHTSDWHLGKSLEGHSRIEEQAKFCEEFIKIVESNEIDMVIIAGDVYDTSNPPAQAEKLFYQTVSRLANNGQRCVLIISGNHDNPERLSAITPLAHEQGILIYGYPLSATIEAKYKGFEITYATQGCTKLNINGENIVVATLPYPSEKRLNEVFSSEDDSEKQKNYSEKVGDIFRSLEENFRSDTINIAVSHIFVIGGESTESERPIQLGGSFLVERKDLPEKAQYTALGHLHKQQKASERLNAYYSGSPLQYSKDERAYTKGAYIVDIKAGEKPIIEDVYFNNYKPIEVFKCNGVEEALDICEQNQDREIWSYFEINTDEIISQNEIKKMKELLKDIIEIKPIITSCYEQESVDIKEKSMAELFREFYSFSKGVEPKGELMDLFLDIISEEGESADETN >CP012312.1|AXU74759.1|1168064_1171592_+|exonuclease-subunit-C MRPIRLELTGLNSYIDKQVIDFEKLIERGLFGIFGTTGSGKSTILDAITIAMYGNISRNTKEYINSVCDKAIISYEFEIGSKNTRRRYIVDRTIARSKTGTKTSNARLIEVLNDNTQNVLADKVVEVNEKVAQVVGLTANDFTRSVVLPQDKFNEFLRLSRADRRDMLERIFNLEKYGRSLGEKVKKRKNLQLQNLKDLKSKLSQYDGITEEVYNNINQELIELKNLEKDKNNALDLAQKSYEESKTVYEEQLKLEKNELRKNELDLKNSEIKEKIALVENDSNAKKVDPYISSVQNLEKKIDEDSFAVSNLEKKLVILNQELEVIKNRYEKINKIKNEEVPKLSEEKIRLQQAIKLEEELVLLDRELKELKESGINLNKTKVELEKVKQVSESRKDAVTKSIKEVEGKIDKVNISAELKQKIFLAYEYEKDYNNVLEEKNQKINKLEEILKEIENINLKVRYIDKDKNDVNRNLENLSLHLDVLLKKCPGKSADLLLKSEYVTELRNKANNTKENEIKKSSIQDELKIILESKFNTEREVNLLNEKLENNRKNRDDLEKELEELKYLNLASELRRELKENMPCPVCGSKHHENHNITKYDENISFVKEKLEKLEKEKISIRNNIEELNAKVSGYLSIEKMKTKELEDVKGKLGGIPSSQLLKKLDEEQRKLVLLKSNIQEWEKEKESTENKVTLAKEEKNKIEKEELKIRESLNNYKKLTRDLNIEIEGLENKCKKLKQEYLGLKTITKVSNLLSKVKEIRENEKELELLSTGHSNLLKNRDSLDIKIRENESKLHEIEIELIKARELYVEKKLSRDNKYKEVINITKGDLAKNLLHNVEENICKILEQEESSKKKLEEQRLEYEKNIAEKHNIDGRLKTAKEQYKDQKSTLNKLLAENKFESIYAVKRALLDTDKVKKLIEEILEHEEEQKLLSFKIKSSKEKLNGRSIKKEYFEQLKDEIYNLKVEIGNISKDIGANQNQLITLKDSLDKINDFNKQLKVVEHNVDLLEELDKCVQGNKFVEYVSTNQLKYIALEASKRLDGITKGRYALEIDSTLNFVMRDNFNGGERRSIDTLSGGETFLTSLSLALALSSQIQLKGSAPLEFFFLDEGFGSLDSELLEIVIESLERLHSNNLSVGIISHVEELKNRVPVKLLVSSSEAGIGSKVKIEYS >CP012312.1|AXU74760.1|1171722_1172976_+|modulator-of-ions-transport MLESPNNLIQIIFLIVLLIGSAFFSASETALMSLSKIRIRYMQDEGVKGAKLVSSLIENPNKLLSSILVGNNVVNIAATSISTSLFIGLMGEKGVALATAVMTVLVLIFGEITPKTIAANNSEKVSLLVSKPIKAIIFILRPIVWIFNIITNIIFKLFGITNKGAKSFITEEELKTMVNVSHEEGVLEMEEREIINNVFEFGDMQAKNAMVQRIDMVAIDMEDSYDEIIQVFKTEKLSRMPVYEETIDDIVGILNIKDIIFLSDEEIESFDIKNYMREPFFTYEFKKITQLLEEMKLEKSQMAIVVDEYGGTSGLLTIEDLVEVIVGDIEDEYDEEEDEIQVIKEDEYIVDGSTKIGDVNELIGVNLESEEFDSIGGFIIGHLSRLPEENEVIEVDNIRFCIESIEKNRIKKIRIYT |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012312_4 | 1342529-1342953 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP012312_4
|
6 spacers
spacers of CP012312_4
>4.1|1342558|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACATATACCATATATACCCCCCTGCAACGCTTCATC >4.2|1342624|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATGTGATTAAAAAAGGACAAAAGTTGGTGATACCTA >4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTATATCTTCTTTTGTAACATTTTTTATAGTTATTT >4.4|1342756|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTTCTCACAAATAGTTTCAACTACTTTTTCATATTT >4.5|1342822|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGGAATATATCTCTCTTCTGCTAAAGTAACATTTA >4.6|1342888|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCAATTACAAGACATTGAGCCTTAAAAAAATTGTATT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012312_4
The CRISPR arrays of CP012312_4 >merge|CP012312|4|1342529-1342953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTACATATACCATATATACCCCCCTGCAACGCTTCATCGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAATGTGATTAAAAAAGGACAAAAGTTGGTGATACCTAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTTTATATCTTCTTTTGTAACATTTTTTATAGTTATTTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGGCTTCTCACAAATAGTTTCAACTACTTTTTCATATTTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAAAGGAATATATCTCTCTTCTGCTAAAGTAACATTTAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGGCAATTACAAGACATTGAGCCTTAAAAAAATTGTATTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG >CP012312|4|1|1342529-1342953|PILER-CR GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TACATATACCATATATACCCCCCTGCAACGCTTCATC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AATGTGATTAAAAAAGGACAAAAGTTGGTGATACCTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TTTATATCTTCTTTTGTAACATTTTTTATAGTTATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GCTTCTCACAAATAGTTTCAACTACTTTTTCATATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AAAGGAATATATCTCTCTTCTGCTAAAGTAACATTTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GCAATTACAAGACATTGAGCCTTAAAAAAATTGTATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG >CP012312|4|3|1342529-1342953|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TACATATACCATATATACCCCCCTGCAACGCTTCATC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AATGTGATTAAAAAAGGACAAAAGTTGGTGATACCTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TTTATATCTTCTTTTGTAACATTTTTTATAGTTATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GCTTCTCACAAATAGTTTCAACTACTTTTTCATATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AAAGGAATATATCTCTCTTCTGCTAAAGTAACATTTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GCAATTACAAGACATTGAGCCTTAAAAAAATTGTATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG >CP012312|4|2|1342529-1342953|CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TACATATACCATATATACCCCCCTGCAACGCTTCATC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AATGTGATTAAAAAAGGACAAAAGTTGGTGATACCTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TTTATATCTTCTTTTGTAACATTTTTTATAGTTATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GCTTCTCACAAATAGTTTCAACTACTTTTTCATATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AAAGGAATATATCTCTCTTCTGCTAAAGTAACATTTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GCAATTACAAGACATTGAGCCTTAAAAAAATTGTATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
>CP012312.1|AXU74929.1|1340130_1341558_+|cell-surface-protein MKIKKLLTIGLSLSIFIASCPISANALDKIESIKGADKYETAGIIADKQNYTTAILINADSTMADGLSASGLAGAINAPILLTKKNNIPNATLKRLEKAKKVYIIGGENSIDKYTETVLKGKGIEIKRLQGSDRIKTSYNVAKEINSINKVNKVILTNAFKGEPDAMSAAPVALRDKAAIVLTDGKSVPFNTIGVESYVIGGTSSMNDKIVKDTNSTRLGGTDRYDTNKKIINKFYSGVKEFYIASGTDLVYALVGSTVAKNNAIVLVDNDSNKSVLKSTTKLTAIGNLSDSILQQCLNVTKNIGDSNTGREYTVEDAANAVKKLLGVKKFYYESNYSEDEDLIFLLDKNFDFSGKEYYVFAYIKQGAEGDVRYCVAKNDMSKVYTYDVNGNMKVCNPDDYKNKGSITEEQAKQIALKECAKRHKVSINNLVVDMIDFRDDIYSGNVYAVKINSKNSNGTFGWFFIDIETGKIYN >CP012312.1|AXU74928.1|1339118_1339940_-|lipoprotein MIISKKITAILVSFLIMISMVGCAPKESATEVAKKYLDSIEIKDYEVAYNLLSKDSKESVSLEKFEEYQDTLFKLQTLKDYKLGEENKVEKYKYSNKEYTNLVKIKETDTIKYITENKEDTANFDRYFIIEDNEYKLLWHKDFKRALSSNYVKIARSETKKDEDKDYNKAAIDIKKAIEIDDKNPPAYYTQSYIYIELQRYDEALKSIDKSLEYLDKNNEAYKIDASDAYNLRGVIFMSKSEFNKARESYNKALELNPDNEYAKTNLNDIKGL >CP012312.1|AXU74927.1|1337476_1338994_-|site-specific-recombinase MSVAIYLRKSRADEDAEKQGEFETLSRHKSTLLKLAKEQNLDVIEIKEELVSGESIIHRPKMLELLKEVEENKYDAVLVMDLDRLGRGDMKDQGIILETFKESKTKIITPRKTYDLTDEFDEEYSEFEAFMARKELKLISRRMQRGRIKSVEEGNFIGTSAPFGYDAVTTGRKERILVPNKDADVVRTIFDLYINEDMGCSKISKYLNNLGIKTATGANWYNSAITNIIKNKVYCGYIQWQKKDYKKSKNPNKMKTVKLRPKDEWIEAKGKHEPLISEITWKKAQNILKKNGHVSYGNQIKNPLAGIVICKNCGRPLVYRPYADHDYIICYHPGCNKSSRFEFIEAAILKSLEDTVKKYQLKASDIDLDKNNKDSNIEFQKRVLKGLETELKELGKQKNKLYDLLERGIYDEDTFIERSNNISSRTEEIKDSIKTVKNRLSTVKKDNSKIIEDIKTVLSLYHDSDSLGKNKLLKSVINKAVYYKSKEQKLDSFELMVHLKLHEDQ >CP012312.1|AXU74926.1|1337169_1337454_-|RNA-polymerase-sigma-27/28-subunit-RpsK/SigK MCNEISLLDILGTEANYVLDEVELKVQVGKLYEQLNKILTPREREIVQLRYGLTPYGYKTQREIAQKLDISRSYVSRIEKKALKKLEKELVQES >CP012312.1|AXU74925.1|1335408_1337073_+|penicillin-binding-protein MSKKKTPFLKKVGKRSWCIFTIILIIYSALIYRLVDIQVLKGDKYKQSVESQSVEKVELNSGRGIIYDRNNKKLTDTSKSQVLVVEKEKLNNSYKILELIKKATKMNDLDIYKAVQEQLTRPIIQIQTKNIDKSMKKELEKNGIMVEEKTMRYAKDGLLSHTIGYIKEDDKSGQSGIEKSMDSVLRNSNEKYISAFKAGDAGNEKSLNILKGSVKTVDNKDKDRHLKTTIDYNIQKKLEQILNKEENPTAAIISEVSTGEILAMCSRPNFDQNDISKSLKGKNGEFENRVIKATYPPGSVFKMVVLFSALENGVIDENYTYNCTGKTKVGNTNEILRCNKRDGHGFQNLRQAFSNSCNPAFLDIAMKLGKEKILKSAEKLHLFEKVDIGLDEEKIREAPKNISIRNLAIGQENIEFTPLQINQMTQIIANNGTFKPLYLYKSLVDNDMNTIKTYKSSKKEDLISPYVCTQVKEYMKSVSRIGTAKDLKDIEGGCGVKTGTAQSSLNKKAIDHGWITGFYPEERPKYVITVLVEGTQKGNKSATPIFKEICESIK >CP012312.1|AXU74924.1|1334089_1335337_+|protease MELNKVELLAPAGDLERLKIAITYGADAVYIGGEIFGMRSAAKNFSKEDMAEGVAFAHERGKKVFVTVNIIPHNEDFLQLEDYLLELEDIGIDAVIIADPGVLSVIKKVIPNMEIHLSTQANTTNYLSANFWYEHGIKRVVVARELSFDEISEIRAKTPLDMDIEAFMHGAMCISYSGRCLISNYMTGRDANKGSCAQSCRWQYHLVEEKRPGEYFPIYEDERGTFFFNSKDLCMIEYIPELIKSGITSLKIEGRMKTAYYVATVVRAYRMAIDEFYRDPENWKFNPMWMEELKKGSHRHFTSGFYLNKPTTEDQNYQSASYVRNYDFIGIVRETEDEDGLIVVEQRNKMCVGDEIEVMGPYKETMFTKIEEMYNEEGEAIESAPHPRQIVKLKLSVKVGKDYMLRKVIEEKVEE >CP012312.1|AXU74923.1|1333428_1334103_+|O-methyltransferase MSNIVNDLVEDYIRVTLKEKEGFLKDLEIYAEENSVPIIHKEVSDLLKVLLKVQKPKRILEVGCAIGYSSIFFATIIGKDADIITVERNEKMIEKAKENIKLAGFDNNITILEGDAEEKLSQVQGEFDLIFIDAAKGQYKLFFDLVIDKLKDGGLLVSDNILYKGMVAHDDFVVRRKKTIVKRMRNYLDYICNCDYLSTSLVPIGDGVALSYKERKRGDVDGIK >CP012312.1|AXU74922.1|1332177_1333257_+|exported-aminodeoxychorismate-lyase MNFKENRLKIAVLIIVILIILAGIFVFIQIGPYDKNNKKDVIIDVPSGASVGKISDILYENKLIKNELLFKLLVKVSNKAPSIKSGTYLLNQSYSNNDIISLLVSGKIYQDGIKVTIPEGATSKEIIAMLVSKNLGDKATFENLIKKPQEFYDKFPYLKEDGITSLEGFLYPETYYFNSKKQSEEDILSEMLKVFDSKYTDKFKKKQKELNMTLQEVMEMASIIEKEAVLDKDRPIIASVFYNRLKVGMPLQSDATIQYIFEERKKIVTYDDLKIDSPYNSYKNKGLPPTPISNPGIESIEAALYPDKTDYLYFVAKIDGGNNYSTNYQDHLKYVKEYKEARDKQSKDTKATNKENTKR >CP012312.1|AXU74921.1|1330639_1331965_+|pyrimidine-nucleoside-phosphorylase MRMYDIIKKKRDNLELSKKEINYFIENYSKGDIPDYQASALLMSIYLNKMNKQETVYLTEAMMNSGDMINLSEIDGIKVDKHSTGGVGDKTTIALIPLVASCGAPVAKMSGRGLGHTGGTIDKLESIPGFSAEMEISKFIDSVNKSKIAVCGQSAKVAIADKKIYALRDVTATVDNISLIASSVMSKKLASGADAIVLDVKTGDGAFMKTLEESFELAKSMVDIGTGMNRDTIGIVTDMDEPLGFAVGNSLEVIEAIETLKGNGPKDLVELCEVLGAYMLVLSKVAHDFEDGVEKIRESIKSGTAIQKLKEFIENQGGNKDVVDDYSLFKKSKYKYPVKSTKSGYISKIKAEDVGVSAMILGAGRETKDDILDLSAGIILEKKVGDYVNEGEVLAYMYYNDEQKLSLAKRRFIDSYSIVDSKIEKNKLIYGIVTKEDIKKF >CP012312.1|AXU74920.1|1329623_1330436_+|purine-nucleoside-phosphorylase MFEKIAQSSEFINSKINVKPKIGLILGSGLGDLANDIEDSVTIKYSEIPNFPVSTVAGHAGQLVIGKLEGKEVIAMQGRFHYYEGYSQKEATFPVRVMKELGVEILIVTNAAGGVNKEFKAGDLMLIRDHINFSGSNPLVGKNDDRFGARFPDMSNAYSSKYVDVVKNCAKECNIDVKEGVYMFFSGPNYETPAEVRMAQILGADAVGMSTVPEVIVASHSNIGVIGISCITNMAAGILNQPLSHEEVIETTQKVKSEFMNLVKTTVKNL >CP012312.1|AXU74930.1|1343322_1343463_-|hypothetical-protein MDVNQRIKYIRENMSRSQKELFKKTNINISVMNRIESGERAIRDVC >CP012312.1|AXU74931.1|1344565_1344817_+|hypothetical-protein MSSYFITRGDVMKILQQFKPYKYDKEKNIEYDEKIIANQNTEVYIVYPRISDEENRRRWEEFNEVAKEVAINIAMKKIETVES >CP012312.1|AXU74932.1|1345133_1345247_+|hypothetical-protein MVEVNIKIKGEVSEIINSIRYIFNSFDEELILDIKSE >CP012312.1|AXU74933.1|1345470_1345665_+|hypothetical-protein MKRRYKNVLIYINIRTIIHINCKIKFIELCLTFNELKNKLANNEKTTVINEDNKAFSGLVDFSN >CP012312.1|AXU74934.1|1346033_1346417_-|hypothetical-protein MRKKFFIGILIVLIISVIAILNIKNDKNVFIGESENWKAKFVTTEGHSKLEIKYKNSKDVVEQKFNYSYQFIDGEDAVVVVKNEILEAGQEKAIKIQRPGLYSNRESSYKLIISWNGNEETINLKKK >CP012312.1|AXU74935.1|1346543_1346888_+|hypothetical-protein MNYRLKKSVTTILSLLIMTILLPTNASASKVEDSSMKVMYSEKQVTDMDKLYDMAKNGITDVKSSNEKGIIKNARTGESIYVDSISTTQLLEVKQSKNLTSKIYSKTVFLILIQ >CP012312.1|AXU74936.1|1348293_1348590_-|hypothetical-protein MDFGNINLILIGIIVIIGTTIIYLIKPKTAFCSKKYFNKLESIYGNIDKKKTVKLEILYRYVTGLEYIAIGLFTKRLDITNNINNISSYYNSNIILLS >CP012312.1|AXU74937.1|1348915_1349191_-|hypothetical-protein MTLLELYYRKAEINKIVWARIGFNLYLSKGVALTLTDAGIGISGLLAGAIPGIGQYLPLIVRVITMYLESNITSGKIFKFKKYVIIKEVLV >CP012312.1|AXU74938.1|1349626_1350016_+|regulatory-protein MKINKLPHAELKLMKYIWGVDDVLASRDIIEDMKLKYDWKKSTTLTFLKNLVDKGFLTTDKVDRCTHYTIAIKEKDYLKVETRSFFSFMHNNSFKSFISALHDDEVLDSKSLDKLEEYFKNLKEEDIDD >CP012312.1|AXU74939.1|1350339_1350849_+|teicoplanin-resistance-protein MKSRKHNITKGLFIVYIIILTWIILFKLQFDISSLETMNLRSINLVPFAGSLIINNRVDISEIILNVVIFVPFGIYVCMLKEEWSFIKKVIPIFITSLAFETLQYIFALGASDITDLIGNTLGGIIGIAVFMLLSKIFKNNTIKIINVLALIVTIIVVLFLGLVIFANL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP012312_5 | 1555280-1555637 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP012312_5
|
5 spacers
spacers of CP012312_5
>5.1|1555309|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT CTTTGAGATATATTTTATATTTTTAAAGTTTATTTTT >5.2|1555375|36|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTGCACTATTGTTGTATATTCTTATAAAGTCTGTTC >5.3|1555440|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGACAAGTATATCTTGACTTCTTAAAAGAGTTTTAA >5.4|1555506|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAAGCAGAAGAAATTGGAATAGCTACAGTTGAATTGT >5.5|1555572|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT AGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012312_5
The CRISPR arrays of CP012312_5 >merge|CP012312|5|1555280-1555637|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATCTTTGAGATATATTTTATATTTTTAAAGTTTATTTTTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATCTGCACTATTGTTGTATATTCTTATAAAGTCTGTTCGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTTGACAAGTATATCTTGACTTCTTAAAAGAGTTTTAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATCAAGCAGAAGAAATTGGAATAGCTACAGTTGAATTGTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAAGTTTTACATTAACTAAAATGTATAGAATA >CP012312|5|4|1555280-1555637|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTTTGAGATATATTTTATATTTTTAAAGTTTATTTTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTGCACTATTGTTGTATATTCTTATAAAGTCTGTTC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTGACAAGTATATCTTGACTTCTTAAAAGAGTTTTAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CAAGCAGAAGAAATTGGAATAGCTACAGTTGAATTGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAA GTTTTACATTAACTAAAATGTATAGAATA >CP012312|5|3|1555280-1555637|CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTTTGAGATATATTTTATATTTTTAAAGTTTATTTTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTGCACTATTGTTGTATATTCTTATAAAGTCTGTTC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTGACAAGTATATCTTGACTTCTTAAAAGAGTTTTAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CAAGCAGAAGAAATTGGAATAGCTACAGTTGAATTGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAA GTTTTACATTAACTAAAATGTATAGAATA >CP012312|5|2|1555346-1555571|PILER-CR GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTGCACTATTGTTGTATATTCTTATAAAGTCTGTTC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTGACAAGTATATCTTGACTTCTTAAAAGAGTTTTAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CAAGCAGAAGAAATTGGAATAGCTACAGTTGAATTGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
>CP012312.1|AXU75129.1|1554707_1555064_+|integrase,-catalytic-region MVFETFDKVIELYPNAKPVFHSDRGFQYTSKVFESKLLAQGMIQSMSRAGRCIDNAPMEGIWGILKVEMYYLRKFDTYEQLVKIIENYIYYYNNFRYQKRLNSMSPLEFRKYLSTEIA >CP012312.1|AXU75128.1|1554117_1554678_-|integrase MKLIDITPSILQSYINNIYNEHMLNSAKNQVGFIKSVLKESYRLKEISENICDFVTTPIKKNSSTSKFYTKQKAQLLLEKSKNIPIGIPIFLMLTLGLRFGEAVSLIWSDVDLDKKIIHVNQTLVYVDNKIIFKDPKTPKSKRKLFAPDELISLLEEEKLKQNKLKLQAILKNEFDLICLNKRFNP >CP012312.1|AXU75127.1|1552221_1553577_-|drug/sodium-antiporter MDTKISINENMSLGKRFFKYLAPSVVAMWVFSLYTMVDGIFVSKGVGELALAAVNISMPFINFIFAVSLLFSTGASTIIAIYLGKKDIKSANEVFSFNLVSIIILSIIILAITFFNLDRLALFLGATESTIGMVKDYLGIIIFFNGFFIVSYSLEVIIKTDGFPILATVGVIISALTNIILDYLFVIEFGWGVKGAGIATGLSQVFSTIFFLIHFLRKNSTLNFSKFRIDLKTLRKIVFIGFPDSTTELSCGIVVLLFNLSLTKYIGENALIYYSVINYINTLVLMTMMGITQGMQPLTSFYYGAGNIDNVKKLLKMGIKATIIASIAVFAICMAFSEPIVSLFIHPEETMLFNEGVRVFKIFSISFLLVGINVIISGFFVSVEKPSISTVISLGRGLVIVVLSLISMILIFGGQGIWMTTIVSEFICLILSLVFLKKNFSTLDSNLNKVA >CP012312.1|AXU75126.1|1551453_1552104_+|ATP-binding-protein MADEKFVMSFSGGKDSILALNRMLKKGYKPVALLTTISEEHGKSWTHNLEYNMLKQVSSNIGLPLLVAECGVEGYEESFERALIKAKNMGATICAYGDIDIESHRKWDTDRCEAVGMKVDLPLWQESREDLVYEFIDSGFCSVVTKVNLKHLGEEFLGKKLTRELVEKIKNVGADPCGEHGEYHTFVVDGPIFKKPVEYEVKGTLIKDGYGYLEIK >CP012312.1|AXU75125.1|1550940_1551369_+|EamA-like-transporter-family-protein MTKLWAIIFALLAGGSTALEAFINGELGKSTTALVATFISLTVGAIFFLASIIVTGDLKCLVSINGFNYKLLLGGVFGGLIIYFTVKAIPNLGVSNTLILTLVSQVLIGFFIDSVILGQETMHLYKYIGVILLILGTFFIVN >CP012312.1|AXU75124.1|1550240_1550789_-|hypothetical-protein MYTNFNIDFNNFNKKENATKFMLMGVLLIILGLLCLTFKTLGIKLISWTFGIALLFFAYLNLKNINELKRYATKEEIKPSINIQWVLIIACILLFVFPQKIQSIFSLFLGFYLIFNQLVALVNSKNNPYSKFTTWNIVKILFGICLILSPLFLSRFIVSIMSFFIILFGLVLFFSGNTARKY >CP012312.1|AXU75123.1|1549185_1550121_-|radical-SAM-protein MDKFKYAFDNKRYHTWNYYLRNTFGEKVFKVSINAGFTCPNIDGSLGYGGCTYCSKEGSGDFAGNPKDNLISQFYNIKEMMLKKWPHAKYIGYFQAYTNTYAPLEVLKEKYETILELEDVIGLSISTRPDCLPDDVVEYLSELNKRTNLWVELGLQTIHDSTSKIINRGHDYKTFVEGVEKLKSKNIKVVVHIINGLPGEDYNMMMETAKAVGKMGVDGIKIHLLHVIKDTPMEKMLQNGMLTLMEQDEYINLVCDQLEILPETMIIHRLTGDGKRDELVGPIWSLKKWEILNQIDDTLKARNSYQGCKFV >CP012312.1|AXU75122.1|1547970_1548915_+|membrane-protein MGEKSKGYVFIAIAGLLWATLGLFGKFLMGNGLTSEQVAFTRLFFGFIVLGVYSSIRTPQILKISKKGIIYSVIIGIICQAMFNLCYFKAIDIAGVSIAAVLLYTSPLFLAIFSKVCYKENITRSKLFSLILCFIGAIMAVSGGRLDFQGLNAFGLFLGTLSAIAYALMPTISKNALKEFSSSTILVYSFLFGAIFMIPSSRPWEILNYAKDLDVLSCMLMLGIVPAALAYIFYATGISKGVELSVAGVVASVELVGSVIIGCTILGESFSLGKLFGVMLMLISAVVALNLSYDEIRIFYKSNKLKQIEKTESI >CP012312.1|AXU75121.1|1546212_1547655_-|sigma-54-dependent-regulatory-protein MNLNLELDLEFYQKILEASHDEICVSDDKGIIIYCNKAFEENYGLKKEDILGKNVSFLEDSGYSTKSPIPIVLKTKTKFSLEQDTQTGKKLIITATPIFDENGNLEFTVENCRDITELNNIKNKLEDTKKQVKKYKSEVETLYRTALRIEDTVIMDGIVMRPIINTVNHVSKTDVSVLLLGESGTGKSSLARYIHHNSNRSNGPFITINCATISPQLLESELFGYTSGAFTGASTKGKVGLVELANGGTLFLDEIGDIPQNLQAKFLQLIQDRTFTPVGSLKNKKVDIRIISATNADLVSKVKEKKFREDLYYRLNVIEIKLPPLRERRDNLVEIIKYYFNRYSSDFNLNKTISKEAMDAIANYGFPGNIRELQNIIQKILLTCTDNHITIDDLPNILTKNIHITNNGNKTHISQINKVIISDSKSTNYKNKNFDTLIKEYEKNIILDAYEKFGSSYKVAKHLEISQSKANRLIRKYTNT >CP012312.1|AXU75120.1|1545428_1546013_-|hypothetical-protein MLMNTHFIMAKSILDNIDENKTFFISEKNFIYGNIKPDAFSKYKLKKHYLDESFNMIVSKINYLCSLNIDSLSKYFSVSRLSQELGVICHFLCDFFCVAHSERWEFKHSLNKHVTYERELGAFAKDVDLSKIKCGTINSSFEKFFTKLYSDYKKKTDYMNDLKFSAYTCNSVINYILDSILSNTIKSYHIANCG >CP012312.1|AXU75130.1|1555962_1557696_-|signaling-protein MSILLKKAPKLAKHIITSFYINRDIDEVLKYLCENVTWIGPGEQEFLTSFNEIKNYFYAGQDEIPSCDINNDIFETVSEDGNRCMVLGKYTVRTKENAQMILEVNQRCTFEIIEDRGKLLVKHMHISNPYGEMQLDEYFPTKIGTQSYDYLQRLLKEKTEVIEMITNNINGGLKGSNDDSTYSFFYVNEGLPKILGYTYDEFMEMSGGSAVGAVYPPDLPKALEDCERCFAKGPTYSSEYRIRKKDGTLMWVLDSGMKSLNSDGIVKINSIITDITQLKNIESELKLERERYRIALQNITDIMFEYDIENDTLIKYQRVEIDKKIELENFETKNYSKLLEFGKIIHLDDIGKLLEVLHGNLRETIEIRQINSLTKNEWRWIRVQCSVIYDSDHNPIKTIGVLKDITEDKSKLESLINQAQRDPLTQLYNQRVSQNLIQEYLCSSDSKNNDALLVIDIDDFKTVNDTFGHLEGNEVLVAVSKILLHNTHDKDIVARIGGDEFTIFIKSLTKDLIIKITNDILNDASKIKVKDNHKITLSIGIAFTDDSTKLYKDLFSKADKALYLSKADGKNCYSTYE >CP012312.1|AXU75131.1|1557932_1558778_-|signaling-protein MFKEIFLRTFPGFLIIRDSNYRIIFINDNLKNLIKSYMQDNPLGMTNIEIAKKLPDNIAKFFTDSHNIQLDWEKNYPYDKISNWILEFKKDTTSYWNVLEYKVDVDEKPYIITMANDITKLYEENKRNLHYSITDPLTGAYNRKYLNDRFDIFIGDYIVLIDLDNFKMINDYEGHNVGDKILCDFVSLLNKELINSTSIIRLGGDEFIVIFSSDVDKNYVYSQLETLREDFLKVFSKYKYLSFSYGVDTVKRNLKLTIVELDKKMYKNKEKNKKKFDKNDY >CP012312.1|AXU75132.1|1558808_1561043_-|signaling-protein MQNHNYIKMLNKKVEVLSKELDSRNFKLKTLNEIDFFSKIPNREFMYQYIDDCISKNIHIGIMLLNIDNFKLFNDIYGYLVGENLLITLTQNLLHFIPESKGIVAYLKGEGFLIVLPNVSNKELNNMGATIIESARELKIRLPNEKEIYSNVTFSIGSTIWNGEPNMTTLMLFNQVYSALKKAKSEGKNRYILFNFKDNSFYNKLENDKEFLSEISYVLQTKQIEVFYQPLYNIKNNTIVGCEALARWRHPIKGLLTPDKFIPLFEQFGLITELDLHLFEENCKNIRKWIDKNDVFVPICCNFSRLHFFNPNFPSMLKGITEKYNVSTSNFSIEITENILIENTNTIIQQLTELRSYGFSVSMDDFGSGYSSFGMLQNLPFDIIKIDRIFLSHNLNDFKNTTILYSIINIARALGMLTVCEGVETEQHVEFIKSINCDIAQGYYYAKPMECKEFEKLLSKENNSEKMFIKYSDIGKSLIEKIFDGFFIMQDMKKLRANVTEDIQWFDFYNKTEITSFPKVIEHFEKHIKGKKFSILYKSITPHNTESDSLLISGEAVLSDEAAKHQKYSNFYFSANCIISENKLLLAKLHLDLIKTAGYINEFESYSIPKMTNTHLDESNVLSQFYSMLPVGIIRYDLFGDMIITYMNEEMFDIIGYTKEQFFGEMGGNLRAIVHPDDLDFVYKKSLDMIDTNKIEPFLYRFIKRDGQIVTVMYTQCNLSAIDGRSIAQGMYIDINKIKNLTKI >CP012312.1|AXU75133.1|1561826_1562636_+|MerR-family-transcriptional-regulator MKDYYKIGEISKIYGIGRDSLMYYEEIGILRPVRDINGYRMYNISDIWKLNLIKEFRSLNFPMKKIKEYLDDRSIESTKNILNEELDLIDKKIAEFISHKENIIKRLSSIESVIQNTKIDEIEVVYIEKRKALELNADIKRDEDFDFLIQKLQKEYEDRFNILGNNNIGSAFSTEAINKGIFNEFKSVFCFLESNEKVYNIVFDEGYYVTLNYTGSNSNNKMYMEKVFKFIEENNYKIIADPIEIYKIDIHETGIVEEFVTEIQVPITK >CP012312.1|AXU75134.1|1562788_1563028_+|hypothetical-protein MKCSNCGSVNIEKGILTTGGIYAETIGLKYVGDGKLDKVINKTFPVQSTIYSDLCLDCGEIVRTYIKDNTDRNWCKDEK >CP012312.1|AXU75135.1|1563214_1563391_-|hypothetical-protein MFRDEMDKCTHMLTAYISSLYDYCDFIDTQLDDFILEYGENVVESCLHQVMVLVSKYN >CP012312.1|AXU75136.1|1563882_1564557_-|MgtC/SapB-transporter MNHHILIQFEYIARIITAGFCGALIGYERKNRLKEAGIRTHFIVALASALIIIVSKYGFNDIVGTPGIGLDPARVAAQVVSGIGFLGAGLIFIRNQSVSGLTTAAGIWATAGTGLAIGSGLYLVGIVSSIIIVIVQITLHRDRKWMKLPTAEQVSLKISNSTDSIEYIEGKFKKSNIEIINMNIKRLDGDWLEVVIYTKLPKGYKKTNLLKLFSDNPLIETLEI >CP012312.1|AXU75137.1|1565133_1565268_+|hypothetical-protein MNISRKAMKIIELAQKIANKRGISVEEAWSEAIIEYKNKYEHIA >CP012312.1|AXU75138.1|1565367_1566153_+|acetyltransferase MIVKIDNTLEKEFWQYVSHEESLNLFIIGYVENYGFSSQYQDIWFQVEDGNITSIILKNKSTLIIYSFKNNFDIGEMKNHIKDLDVESISGKKCVIDRLISKYKDFYEKLDNKFCVLKEIKEIDFSNMKEYKIENAQEKDIDEIGKLLNRSDYKVSKNYIEERKEHLKEGNVRAYFIRNDDTMISTVSTGMETSFLAMVVSVSTDKRYRGKGLASYMVYNLSKELLLEGKVPCLFYNNDIAGKIYHNIGYKEVNEWTILFK >CP012312.1|AXU75139.1|1566248_1567073_-|exported-polysaccharide-deacetylase MKKDSLKKYIMIGAFALILFGIASINFKSLDKTKTQISSPTLDTHEYDWYFNPREDGKQPSPIKEADFFKKYGAYYVGNPNEKVIYLSFDAGYESGNTPKLLDTLKKHNAKAQFFVVESYIKSNPDLIKRMEKEGHLVCNHSKSHPSMAGITDFEKFKEEITSVEKAYKDVTGKEMPKYFRPPMGKFSEQSLKYTQDLGYKSIFWSFAYVDWYEKKQPTHEFAKNKIYSRTHPGAIVLLHPNSSTNTEILDEVLTHWEKEGYKLKTLDYLNNKK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP012312_6 | 1663959-1664251 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP012312_6
|
4 spacers
spacers of CP012312_6
>6.1|1663988|36|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATATTATCTTATCATTTTTATTTATTATTAAATAT >6.2|1664053|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATACGCTTTAGTATTTACCTTATTTTTCTGTAGTGC >6.3|1664119|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCAATTCTGATATTTTTATTCTAATCATTTGAAATC >6.4|1664185|38|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT CCATCTTTTGTTGCTTTACATAAATTTATATTACTTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012312_6
The CRISPR arrays of CP012312_6 >merge|CP012312|6|1663959-1664251|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATCATATTATCTTATCATTTTTATTTATTATTAAATATGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTATACGCTTTAGTATTTACCTTATTTTTCTGTAGTGCGTTTTATATTAACTATATGGAATATAAATAGCAATTCTGATATTTTTATTCTAATCATTTGAAATCGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATCCATCTTTTGTTGCTTTACATAAATTTATATTACTTATGTTTTATATTAACTATACAGAATGTAAGT >CP012312|6|3|1663959-1664184|PILER-CR GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CATATTATCTTATCATTTTTATTTATTATTAAATAT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TATACGCTTTAGTATTTACCTTATTTTTCTGTAGTGC GTTTTATATTAACTATATGGAATATAAAT AGCAATTCTGATATTTTTATTCTAATCATTTGAAATC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT >CP012312|6|5|1663959-1664251|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CATATTATCTTATCATTTTTATTTATTATTAAATAT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TATACGCTTTAGTATTTACCTTATTTTTCTGTAGTGC GTTTTATATTAACTATATGGAATATAAAT AGCAATTCTGATATTTTTATTCTAATCATTTGAAATC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CCATCTTTTGTTGCTTTACATAAATTTATATTACTTAT GTTTTATATTAACTATACAGAATGTAAGT >CP012312|6|4|1663959-1664251|CRT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CATATTATCTTATCATTTTTATTTATTATTAAATAT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TATACGCTTTAGTATTTACCTTATTTTTCTGTAGTGC GTTTTATATTAACTATATGGAATATAAAT AGCAATTCTGATATTTTTATTCTAATCATTTGAAATC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CCATCTTTTGTTGCTTTACATAAATTTATATTACTTAT GTTTTATATTAACTATACAGAATGTAAGT
>CP012312.1|AXU75224.1|1661206_1663300_+|signaling-protein MNKRNFEVILNQLQINIYVTNIHTNEIIFMNKKMKEEYNILDPEGKVCWQVLYPEKISTCSFCKVLELLKNDKKGVLIKWYEKCNKLNRVFENYDSLITWQDGTVVHMHQSIDIANSTSLNKPIKINEFHEISNNKEEKGVFNFSRDNFDYNSTLLYDALIRGTDEYIYICNMKTGVFRYSPSQVELFDLPGEIVENPLVYWKKIVHPEDWNRFYKSNTEIGKNQMDYHTVEFRAKNRSGEYIWLRCRGQLMRDEFGEPSIFAGIMTQLGKQNKIDSLTQLLNYHEFMSVFEDKISNPMIEKLCIVLLNIDDFKNVNEMYDRDFGDNIIKTLAQSIQSILPDNAELYKLDGDEMGILVDNVEENEILTLYNQIQNMIIHLQLWRKYGLNITISAGCVIYPKHGDTVKELYKCASYSLQYAKEHGKNRLVFFSQEILKNKMYSLEMMRDLKASINDDFRGFSLRFQPQVDTESHKIIGVEVLLRWTNDKCKAISPLEFIPILEENDMINIVGAWVLRMALRTFRKWIDYYPFFKVSVNVSAVQILEDTFIEDIVKIIDDENFPYQNLVLELTESHTVQNMSILQFKFKALQDLGIYIAMDDFGTGYSSLEVLKFSPIDIVKIDRVFVKDILKSKFDATFIHFIVAICHDVGIKVCLEGVETQEEYDLVKQIKPDYIQGYLFGKPQTATEIFDLLKLDN >CP012312.1|AXU75223.1|1659630_1660527_-|NADP-oxidoreductase,-coenzyme-F420-dependent MANYFLSKGYCVSGFYGRNQLSLLESTNLTKTKIYSNLKDIIYENDILFITTSDDSIEIIDKKLSKFNLKHKYICHTSGSLKSSILFCSKKAGALIYSIHPIFAFSNKNTDIKKMKDICFSIEGDNEQDDLVVQNFIDGLGNQFFIRDKDTSSTYHLANVLVSNLVLSLLDIGVSYFIKLGLSEDESLKSISPLVKKNIENILDNGFTKALTGPVSRGDITPIKKHLSVLDKKDEEIYKILSLNLLKIIALGNDNSLKCTKNITIENAIENLISKSEKYKEIYKLLGGKNDEKYHTNF >CP012312.1|AXU75222.1|1658828_1659656_-|3-methyl-2-oxobutanoate-hydroxymethyltransferase MKNTIQTFKNAKYEGKKLSMLTAYDYSIAKIMDECDINGILIGDSLGMVIKGEENTLSVTIDEIIYHTKAVKNGVKNALIVSDMPFLSYHVSIEDAVKNAGRLIKEGGAHAVKLEGGSNVIKQIENIVNAQIPVMGHLGLTPQSVNSFGGFKVQGNTSETAKQLIEDAKLIEKAGAFSIVLEGVPAKIAEMVTNSISIPTIGIGAGINCDGQILVYQDMLGMFGDFVPKFVKQYANIGDIMKDSIKNYILEVKTGAFPQEKHSFSINESELEKLY >CP012312.1|AXU75221.1|1657961_1658810_-|pantoate--beta-alanine-ligase MLVKEIKLLRNIIKDWRKDGYSIGLVTTMGFLHEGHQSLIKKAVKENDKVVVSVFVNPTQFGPNEDFNSYPRDIDKDFKYCMDSGATVVFNPSPEEMYLKGNCTTINVSGLTDFLCGAKRPVHFGGVCLVVSKFLNIVTPDKAYFGEKDAQQLAVIKRMVKDLNIDTEIIGCPIIRENDGLAKSSRNTYLSEEERKSALILNKSLSLAKEELVKGNLNPENIKELITAKINSEHLAKIDYVEIVDSETLQPVKQIEHSILVAIAVFIGKTRLIDNFTFELNI >CP012312.1|AXU75220.1|1657368_1657551_-|hypothetical-protein MFKDKIDECVHIMTAYIASLKEYYSFIETQIGDFIKKYGEDIVELCLHRVMILLCECGLA >CP012312.1|AXU75219.1|1655888_1656803_-|hypothetical-protein MIDNQKYVILSLELHLFFSRIMKEHALFLEAGFTNKNYNLAMEADHYKKQFEDLLSYAVSASNGIIRPDILYSEELVTTLTSAAEQKTEEFTGIEINKNITTRELNLQSGVDPQVGQDLVNYVAQLNSDAIRLLDGLINFKERVLDGVLSCTIFTSNYPLLLEHIIHEANLYRSYVVDLENKIDIESKSAKEIELFWDHIMMEHALFMRGLLDPSEGELINTSNDFAIKFNELIEKTNEMTDSNIKNITEETLNETVEFKDFKEAGASGIEQCKIKSIILPLLADHVLREANHYIRILESYKNM >CP012312.1|AXU75218.1|1654851_1655499_-|lactate-utilization-protein-B/C MIRQTPLEKRYDKLGPHIVTALKKRYFDAYYCKTRNEALQQILDLIPQNHVVSWGGSETLKEIGVQTAVREKGFKVIDRDLAKTPEERTEIMRQALLCDTFLMSSNAISEDGQLFNIDGNGNRVAAMIFGPKNVIVVAGMNKIVKNIDDAIQRTRTIASPAVVQRFQDVNTPCYISGSCIDCTSPESICAYMVTTRISRPAKKIRVILVGENLGL >CP012312.1|AXU75217.1|1654115_1654685_+|lipoprotein MKKFIICIIMFAISVLVLAGCSNDNKIKNEVDSMFNAIKTQDADTVDKYFPKSGLGNLIYEDKEGFKMYSKNMTWEISDIKNNKDKVTVDLKINNTDMVSILKKNPPKLGEMMPNPTMKDIDSANKKEFNITLELVKTGDNYVCKVNQESAMKLLNVITGGGIDYLADYNKDYYKQLDEEQKNYENKNS >CP012312.1|AXU75216.1|1653211_1654111_+|iron-sulfur-cluster-binding-protein MKLLSKINNNIRLITQVAFTALTNGYVNGFLEGTIYGGESKKLCVPGLNCYSCPGALGACPIGSLQAVLSSREYKFSFYVVGFLMAFGAFFGRFVCGWLCPFGLVQDLLHKIPFPVKIKKVYGDKYLKYLKYIVLIMFVIILPVAVVNVAGGGNPWFCKWICPSGTLLGGIPLILGNENLRESIGFLFSWKLSILLLILLMSIITYRPFCKYICPLGAIYGFFNPISIYRFKIDKDKCTNCTACQTKCKLDIPIYKDVNSPDCIRCGECIKVCPQNAITTTFSKDKKENNICAKKYRGI >CP012312.1|AXU75215.1|1652474_1653059_+|thioredoxin MKKFFMVVLGCVFVLGMISGCSKKESKPVEKNKNNSEWFSNLDTEDVDGNKVTKEIFSNKELTLINVWTTWCGPCVGEMPELEALSKEYESNNSNVAIKGLVVEVDKTDMRTGLSNEEKNLVKDIMKKSDATYQQLTVSEELKKTDFKRVMEFPTTYFVDKKGNFVGEKVVGANSKEDWKKIIDERLKMVKTNE >CP012312.1|AXU75225.1|1664547_1664703_-|hypothetical-protein MLVRVKIVIGATIRYLIKHKVNYCNKKSLDKLELKYGNIDREKAVKLEIFY >CP012312.1|AXU75226.1|1664910_1665729_+|MerR-family-transcriptional-regulator MEKQYFTTGEFAKLCGISRQTLIFYDKIGIFSPEYKDKNNYRYYSVYQYDTLDILQSLREIGMSLEEIKEYIQNRTPQLCVKMLKEEEKKIREKIKKLRKISSKMQNRISITVEGISKMNSEEIYISKKFEEYLVLSSDLSNMSNSDFMMELIDFTNYCKSKNLYQGYELGVIVSNENIKNGDYLSISSFYLKIDKKIKDKKLYVKPEGMYACIKHIGKYEDSYKSYEKLKKYIYENEYKIIGNSYEESILDFFCESNEDNYMTEISIQVSR >CP012312.1|AXU75227.1|1665861_1667982_-|ferrous-ion-transport-protein MGLTHNSTKMSSLKDMFDIDNKEDQFIIALAGNPNTGKSTVFNHLTGLRQHTGNWPGKTVATARGNFKYKNTEYALIDLPGTYSLFALSQEEIVARDFICFGNPDAVIVVCDATCLERNLNLVFQVMELTDKVILCINLIDEARKKGITIDKKLLEDSLGIPVILTAARNGSGMDELLDTLNDVSFDKYKLNNKPVRYNENIEDVVKSIQPELDNIIPGINSRWLGLRLIDGDESIFESMSNYIDKDSIDAINEVKKKIPDNINKQKIRDEFTKINYDYAKKLSDECCSNVAKKSTDREEKVDKILTSKIFGLPIMLLLLGTILWITIEGANYPSTLLSNLLLGFEPSISGILNSINCPSWLNDMLVLGLYRTLAWVISVMLPPMAIFFPLFTLLEDFGYLPRVAFNLDHLFKKACAHGKQCLTMCMGFGCNAAGVIGCRIIDSPRERLIAILTNNFVPCNGRFPTLIAISTIFFSSVITNSFVSSVATALCITLLIILGVIITLLVSYTLSKTLLKGVPSTFTLELPPYRVPQIGRTLYTSIIDRTIFVLGRAVMVAIPAGVITWIFANIYIGDLSILSHVANFLDPLAKLIGLDGFILLAFILGFPANEIVVPILLMAYLATGSMIELDSFSALGQVLREHGWTYLTALNVMLFSLLHWPCATTLLTIKKETGSLKWTALGFLMPTILAFVVCFLTTTVYNLFI >CP012312.1|AXU75228.1|1668007_1668235_-|ferrous-ion-transport-protein MKNLNDIQVKKTVKVEDILSSGNLRERMLALGLTRGAVIDVVRKGPKNNLTVYKIRGSKIALRQEESSLILVSDI >CP012312.1|AXU75229.1|1668561_1669002_-|acetyltransferase MFKIKHFNDLSLDEFYEIAKSRYEVFACEQKIFSLNDYDDIDKSSYHIFLKENGLICAYARIIPKEYSSYNDVSIGRVLVLSSHRRKGLAKQMMDCAIDFIKVNLHENNITLSAQTYIKNLYLSCGFKEISEVYDEAGIEHIKMRL >CP012312.1|AXU75230.1|1669174_1670143_+|hypothetical-protein MNTTKKLTEAALLSSLFIVVTIIAVSTGFGYAIYLDFIVPVFFCIICLKCDLKYTILSGITSLLIISLVLGNLGTAIWASQSVLLGIMCGYLINKPTMVMDDLVYGSVFGVIVMVFIDIYASTLIGYSFMKEFQGYSKWIYFNGYTNFIYYLMIALFPFGMVFCIYLLSLILGNKLHILDSNSLKKFLIFKNFRSLNQFLCCSKKAFYICVSYLAIFEVLKLWNVKVDSVYLKTIFISITYISVYFIIRDSCMSLQNFIIAKFRKLLYARILFLIIILLLFFIFDVTVISLIIINAFLNKKIDIRLSQSNIVNKQINLLIEK >CP012312.1|AXU75231.1|1670619_1671828_+|tyrosyl-tRNA-synthetase MKSIDEQMRIIMKGVDDLIDEKELREKLIKSEKEGKPMIVKLGLDPSAPDIHLGHTVVLRKMKQLQDLGHQIVIIIGDFTGKIGDPTGKSKARKALTTEQVLANAKTYEEQIFKVLDKEKTIVRFNSEWLAKLNFEDVIKLAATITVARMLEREDFKKRYEGQMPISVHEFFYPLMQAYDSIALEADIELGGTDQRFNLLMGRSLQREFGMESQIVIMMPLIEGLDGKEKMSKSLGNYIGIDEEAGIMYQKSMEIPDELIIKYYNLVTDVHPDEVNKIESQLKEGSVNPRDIKMNLAREIVTLYHGEESAREAEERFKSVFQKGQIPEDIQTIQVEEDGFDLIEVLVSNEIVKSKSEVRRLASQGGVKVNGEKVEDLSTIVKESELVVQIGKKKFVKIELVK >CP012312.1|AXU75232.1|1671888_1672770_-|polysaccharide-deacetylase MVKKRKKKTVTLTILVVIVIGIFSMAWADMSRKKEMKETQERLKAERLEKERIEKEKNEPIIGAKKEAVKEYGYDAKIVWDKLNKYDYSNNGEKIVFLTFDDGPSTTNTPQVLDILKRHGVRGTFFIKGDSLERKGANEILKRTFDEGNAIAHHSYTHDYKKLYPSRSLNLDTFVNELNKTDEAMKKALGKNFSSNVVRCPGGYMSWKNMEPLGNYLKEKNMASIDWNALNADAEGKKKNAQELFEHAKKSSEGKEMVVLLMHDTYGKQETVNALDQIITYFKDNGYQFKILI >CP012312.1|AXU75233.1|1673185_1674100_+|transporter MKKYFGEIGLIFIAIIWGSGFVATQFALDGGLTPLQIITLRFFLAAIIMNLLFFKQIRANMSKKLLKAGGILGIFLFLAFTVQTIGLMYTTPSKNAFITAANVVIVPFIGFILYRRKLDKIGIISSLVALIGIGILSLEADFSINFGDFLTLICSFGFAFHIFFTSEFAKDNNPMALTAIQFTVAFLMSVVVQTFAGQLKMEAELSGYMGTMYLAVFSTTIGFLFQTICQKRVDGTRTAIILSTEAVFGTIFSIIILKELITAKLVIGSILIFVAIITAETKLSFLKSKKVKLKDSEESSLESI >CP012312.1|AXU75234.1|1674322_1674868_+|ruberythrin MKKFVCTVCGYIHEGDAAPAQCPVCKVGADKFEEMKGEMVWADEHRIGVAQGVDAEIIEGLRANFTGECTEVGMYLAMSRQADREGYPEVAEAYKRIAFEEAEHAAKFAELLGEVVVADTKENLRVRVDAEYGATDGKLKLAKRAKELGLDAIHDTVHEMCKDEARHGKAFLGLLNRHFGK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012312_7 | 1753757-1753987 | Orphan |
I-A:NA
Consensus repeat of CP012312_7
|
3 spacers
spacers of CP012312_7
>7.1|1753788|37|CP012312|PILER-CR,CRT TTCTAGGTCTTCAATTCTAAAATCAATACGACTAAAA >7.2|1753856|34|CP012312|PILER-CR,CRT ACTAGATGGATTTAAATAAGGTAATCCACCAGTA >7.3|1753786|39|CP012312|CRISPRCasFinder TTTTCTAGGTCTTCAATTCTAAAATCAATACGACTAAAA >7.4|1753854|36|CP012312|CRISPRCasFinder GTACTAGATGGATTTAAATAAGGTAATCCACCAGTA >7.5|1753919|38|CP012312|CRISPRCasFinder TTCAATTTCTTTCACTATTGTAATTTTATTTGTGACAG >7.6|1753921|36|CP012312|CRT CAATTTCTTTCACTATTGTAATTTTATTTGTGACAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012312_7
The CRISPR arrays of CP012312_7 >merge|CP012312|7|1753757-1753987|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATTTTTCTAGGTCTTCAATTCTAAAATCAATACGACTAAAAGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATGTACTAGATGGATTTAAATAAGGTAATCCACCAGTAGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATTTCAATTTCTTTCACTATTGTAATTTTATTTGTGACAGGTTTTAGATTAACTATATGGACTTAAAATTA >CP012312|7|4|1753757-1753920|PILER-CR GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATTT TTCTAGGTCTTCAATTCTAAAATCAATACGACTAAAA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATGT ACTAGATGGATTTAAATAAGGTAATCCACCAGTA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATTT >CP012312|7|6|1753757-1753986|CRISPRCasFinder GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TTTTCTAGGTCTTCAATTCTAAAATCAATACGACTAAAA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT GTACTAGATGGATTTAAATAAGGTAATCCACCAGTA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TTCAATTTCTTTCACTATTGTAATTTTATTTGTGACAG GTTTTAGATTAACTATATGGACTTAAAATT >CP012312|7|5|1753757-1753987|CRT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATTT TTCTAGGTCTTCAATTCTAAAATCAATACGACTAAAA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATGT ACTAGATGGATTTAAATAAGGTAATCCACCAGTA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATTT CAATTTCTTTCACTATTGTAATTTTATTTGTGACAG GTTTTAGATTAACTATATGGACTTAAAATTA
>CP012312.1|AXU75322.1|1753361_1753466_+|hypothetical-protein MIGFLLSILAGVISAYIYDKIKNHPDANKGDLKK >CP012312.1|AXU75321.1|1752078_1752519_+|phage-protein MSNLSAFLSQNAIKVDNVKYVASNRFLDKEGKPVEWELKVLSSEEDEALRRKCTKRVKVIGNNGKHTGQYTSEIDYNSYVAELCVASTVFPDLKDAELQNSYGVMGEAQLLKTMLTAGEYVNYTVKVNEVNGFDTSFEDKVEEAKN >CP012312.1|AXU75320.1|1751536_1752007_+|phage-protein MAQTINAKDTVSAKKAECFITIEGKRYNFMQAIDLEAKMEKNKSEVPILGRTTKGNKTTGSTNTGSATFHYNTSIFRELLYRYKETGEDIYFDIQVTNEDPTSAVGRQTVVLKDCNMDSGIITKFDADGEYLDEDMDFTFEDWELVEKFNLLAGME >CP012312.1|AXU75319.1|1750209_1751520_+|phage-protein MALGGGTFVTQNKVLPGAYINFISAKRATSSLSDRGIVAMPLELDWGIDEEVFQVTSDDFEKYSVKYFGYDYTHEKLKGLRDLFKNIRLGYFYKLNKGVKASCTIATAKYSGIRGNDLKVTVTTNIDDNAKFDVVTLLDNKKVDTQIAKVITDLQDNDYITWKKDATLEASAGLVFTGGTNGEAVTGAEYQAFLDKIESYSFNALGCLATTTEIKSLFVEFTKRMRDKVGAKFQTVLYKKSDADYEGVVSVENKIKDKDLVESSLIYWATGAIAGCDINKSNTNKKYDGEFDVGVNYTQIQLEEALKSGKFIFHKVGDEVHVLEDINTFVSFTDDKNDDFSSNQSVRVLDQIANDIATLFNEKYLGKVPNDKAGRISFWNDVVKHHKELENIRAIEDFKTDDVSVELGNDKKTVIVSDAVKVINAMSKLYMTVSVN >CP012312.1|AXU75318.1|1750023_1750209_+|hypothetical-protein MINLSKTLSKEENYKFTKEQIVNSKRYVNRKDLLNAILKEDELYSFSEVEEIINNFMKGVS >CP012312.1|AXU75317.1|1749602_1750040_+|phage-protein MLNNIIDGISIKLDKTFGESYTIYSEDVEQGINEPCFFIVPLNPSKVSYPSGRTLKKNSFDVHYFPKSNDKSFEINEVAEMLLEELEYIEIDGDLVRGTNMNFEIVDNVLHFFVDYNYFTIKSNNTDKMDTVELFGGLKRGDKLE >CP012312.1|AXU75316.1|1749184_1749610_+|phage-protein MARWGSVDFREFKRVCKKMEELTKIDLDKFCKDAARELAARLLGKVIRRTPVDTGFLRQGWNGVAYARSLPVYKQGNNYIIEVVNPTEYASYVEYGHRTKDGKGWVKGQHFLTISEMELQSQVDKIIEKKLLILLKGVFDA >CP012312.1|AXU75315.1|1748837_1749185_+|phage-protein MVSKTRKAIEMLYRDKCTIVEYQPIKDPVTKRTNNKEVIVLENQPCKLSYKNIVSATEGKLAKLEQTIKLFISPDIEIKAGSKLIINDKEYVRSGESAIYSNHQEIILELFKDKA >CP012312.1|AXU75314.1|1748442_1748844_+|hypothetical-protein MENNIIDEIEKRLESFGYILKDGDKWLIGFVREKIENIIKLDCNIKTMPIELKEIEVDMIVGEFLFTKKNMGQLDIESINFEAVEKSISEGDTKVDFAIGSGSQTPEQRFDSLIAYLTTYGKNNILTFRCLRW >CP012312.1|AXU75313.1|1748199_1748433_+|hypothetical-protein MAQVRKLNRILTIEECKIDDFLEMGYDLIDETGKAVKYGKSLSVKDLIAENNILRSKVESLEEENKQLKEKNKLTKK >CP012312.1|AXU75323.1|1755136_1756018_+|hypothetical-protein MWNKFKTLSKGKKIFFGVLAFILFPITIAAFLGEVSIKLLIGGFKNKKILKIVGGLFAIYFFMVVIIADIKIYSSLFKGELQNAEPVANENNEEHIKKAKTEKTDVIKMSKDEQKISEVINTEPEKIKNIANILKECGIEDFESIKHDDGLDNAHFNGEKGYRIEFGGSKNIILYMNKDNSVYNVRWADNDFYKNNKVVSKVSDYTLTIDEKTELQLQCQNGVSAILKSPSTAKFPNITEWVFYKDKEKIVVQSYVDSQNSLGAILRSDFQITFTSDGKNVKSFIFDGEEMIK >CP012312.1|AXU75324.1|1756088_1758377_+|phage-tail-tape-measure-protein MATIQTSIRIFDGMTPAFRHMTTAMNIVLSSFEQLQRTSSNAVDANSIIKAREELARAEAGFDRLEQQIREADGQQRRLNKDINKGASSTDKLVANAKRLVATYIGLRSVGGLINLSDQMTSTNARLNMINDGQQSDGGLNKMIFQSAERARASYLDTAKIVTRVGMNAGKAFSSTKEIVAFAEQLNKKFVIAGATTEETNSALLQLTQGLGSGVLRGEELNAVFESAPNIIQSIADYLDVDIGKIRSMASEGMLTADIVKNSLLAAAEQTNAEFEKMPYTFGQIWTSIKNNVVMIFGVIQKKIEQSMSSRGFRTFIDNFINGLYVLGNVFFNIFNGIISILSSPFFQAFVNTIIVCVSLIAQALGWVITQALNIANVFAQNWSIIAPIIYGVVAAIAIYSLALAGMWAWEKLVAASKFVVMFAQMLLNTQTLAGYKSLVLYALGQWGVNEAMLACPIFWVVAGIIALVVALFVGVAVFNHFANTSISAVGVVAGAISVAASFIGNIFVATGNMLIDIVALIWNTFATFAEFLANVFNDPLGSIIRLFSGMADTVLGILQSIASAIDTIFGSNLASAVSGWSDKLQGWTDEVAGEAKIKVERIDPSSLHYDRFNYTKAWDGGYKFGEKLENKIKDAFDISKIADKAKKDLGLDDLWDKKYGLGDGFGSGGLNSPLNDAAKGAKDTAGNTAKMAKTMDKSQEDLKYLRDIAEQETINRFTGVNIKIDMNNTNNISKDADVDGIVNVLTEKLNDAMVVSAEGIV >CP012312.1|AXU75325.1|1758392_1759085_+|phage-cell-wall-hydrolase MAYDFYLDGVQLPIPPPKLEIKITNKNKTVDLINTGEVNILKKEGLSEISFEAEFTHNKLPFYRGTFKDVQFFLSKLELLKTDCKPFQFIVSRELGNKVLFNTNMKVSLEEYNIVEDAENGSDTKVAIKLKQYRDYSTKKLVLAPPKTTETGRPSVKIEPKRVDSINAPNTKTYTVKSGDSLWSICQKQLGNGSLYKKVYELNKSMMDKANKGKNLSKYTIYKGQVLKLG >CP012312.1|AXU75326.1|1759077_1760970_+|phage-cell-wall-hydrolase MVDDLVLANDRDVRLVIAHWEDFYEPAVIDGVTWEIERQGAPSKLEFTIVMDDILQFCEGNSVRLYYKGTGVFYGYIFQKKRDKENHIKIVAYDQLRYFKNKDTYVYNNQTASELVKMLAKDFNLKYNVIEDTKYKISRVEENKTLFDMVLTALDDTLREKKEMYVLYDDFGRITLKNVASMKLDTVMNNDVIEDFDYNSSIDSDTYTKIKLVRDNEETSKRDVYIAQDSAHMRSWGILQMFDTVDKNMSEAEIKQKCDILLKLYNKKTKSLSLKNALGDIRVRAGCLVPVFLDLGDIELQNYMLVEKVKHTFENNSHFMDLTLVDGDEFASYSSSSYSSGNTNNKDEKKNGPAQSTTKKNTGKKVPAIFTAYYPGNNAMEGGKTDCNGKPLDVKSRTVAGPMNREGVKKTWYTDDFLKKHPVFEYGDKVKIILPGTAYDNKVYTVKDNGGRIYVETNGTYHIDILLANASECKKFGRKNGYIIIGGDEEQTYQVEGNNQSSTNNNSKEDKLISIAKSKLGCNYVYGAEGPNTFDCSGFTQWCYKQIGIKIPRTASAQSKAGKAVDLKDRSKWKAGDLLCRIGGGSSNHVVMYIGNNQIIHSPQTGDVVKIESVNSYRKGKAYTHVRRFI >CP012312.1|AXU75327.1|1760983_1761244_+|phage-protein MSQDLLQIIKKAAMDAVETSNPMRVVFGTIESTSPLKVKIEQKLSIGEFFLIQTDTFKRYTDKKIGDKLVLIRMQGGQQYLILDRM >CP012312.1|AXU75328.1|1761248_1761668_+|phage-protein MLPSDNLDYDIEDVSIINFDVRQEPSKTFKLNIEKSKIDGICDDVEALKQTIFLILNTERYQHLIYSWNYGVELNDLIGEPISFVIPELERRIKEALIQDDRVENVDNFEFQNVKGKVHCKFTVYSKYGNIKAEKVVSV >CP012312.1|AXU75329.1|1761668_1762718_+|phage-protein MFELMTFENIIKRMLDSVPNTLDKREGSIIYNALAPVAIELTETYIAMDELLDQTFVDTASYYYLEKRCKERGITPLPATNTIAKGVFNIDIPLDSRFNLGEYNYVAIERISEGIYKMKCETAGPIFELGQLIPIEYIDKLETAELTEILINGEDEESEDSLRQRYYDSLNSQSFGGNIQNYKDEVNKIQDVGGVKVYPTWDGGGTVKLVIINSNFKVPSTDLINLVQEEIDPIGHQGQGLGLAPIGHRVTVEGVTSTTINISAEITYKSGYTWENIKTIAEETIDDYLNELNMSWEDEENLIVRISQIETRLLSIDGVLDIANTMINSIASNLNVDKDSIVLRGEVVG >CP012312.1|AXU75330.1|1762710_1763328_+|phage-protein MDKEINLINYLPQILQDKEEYIKVFNVENKEIKTLHDKLKDLSNDQFLEDLTPSGVKRWEKIMSITPKSNESLEDRRFRIFSKYISKLPYSERFLRNWLDNIVGEGNYELTINNSTYNIHLESDARNQDWFEEVHSFVSNIKPCNMTLDYTRVLISKDNYMNFGITTLIGQEITIYPWSPPDIETYGEIDVLTGNGVGYQEVTIF >CP012312.1|AXU75331.1|1763339_1764365_+|phage-tail-fiber-protein MAIDKSYYTIITDVGKAKIANASVTGNKVGFVKIQLGDGGGSEYTPTESQTALKNVVWEGNIGNTTTDETAPNCIILESLIPSSVGGFMIREIGYLDDENNLIAISKYKECYKPSIEQGAVVDMKVKTVLIVSNVNNIELKIDPTIIFATLKDIQELETKIGTINTKIDTTKTELTSNIETAKTELNTRIDTENEKQNIKIDQLIAGGSNVAYTQRVAIDDWVEDAENGFKATVTHSLLTQRIVVNIIDATTKENVVTNFKIIDDNSIEVRSEVKVELNVYVINGNAETHFINATVDDNRVSEMTTYSSKKIEDRFVNLEEKVNGGLSNIATSVNELITYC >CP012312.1|AXU75332.1|1764381_1766070_+|Glycine-rich-protein MQTEWNFGYNGSPQSVILKPGKYKFECWGSSGGINNSSWYTDAKGGYSKGEITLKKQTTLYVYVGESGFASSSTSNNTKSGFNGGGKGYLNQQVMGTYYSMYGGGATDIRLVGGAWDNEQGLLSRIIVAGGGGGSYSPYTGGAGGGLAGGTGYSANDRHRPGGTQYQGGIGRVSTENGSFGKGCSAKDSTGEGGGGGWFGGAGMNGVGAGGGGSGYVLTKDSYKPTGYTPTSEYYFDNVVMESGGNTAGAYGYALITLLQALPFLTVSSYNSTTATFKADHTDPALLTKIEYFIDDVLKETITTDLTLEKTINYTLEDNALHTLKIVVTDSNNATAEKVLSISKNIMPLPENVNLNDISTKLTEVNAGFKTGKTSIINTLALKNIEASLNNTLVELSEKIKTSFDSSDASVQDLMNQLTQSNNTITQLNTKYQYFSGVTTLIGNSICIANFYGKASGMYPGYWIRVGGFKSVPNIFIAECEYIYDGKFYKHLIFASCGVFTKDFTIRLCFSREIDVNTFSVKGDIFNIEEQDVWYNTNLGLNLPAYNTNIPVNFNWCAIKFK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP012312_8 | 1754588-1755009 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP012312_8
|
6 spacers
spacers of CP012312_8
>8.1|1754617|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGCTACGATTTGACAGCTAAAAATGTGCTTTTCTTAG >8.2|1754683|36|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCTCGCTCTATATTGCTCATGTGCTGTGGAGTTATA >8.3|1754748|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGGTTTAAAAACCTCTGTTCTTCCACCATAATACCCA >8.4|1754814|35|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACGAAAAGGCTCGAGTCCCTTATGGCTGGTGAAAA >8.5|1754878|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCATTATTGTAATAATGAACTTTAGCGTAAGGCTGTA >8.6|1754944|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT GTGTGTATAACCATATCCACTTTTAAAACATTCTCTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012312_8
The CRISPR arrays of CP012312_8 >merge|CP012312|8|1754588-1755009|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATCGCTACGATTTGACAGCTAAAAATGTGCTTTTCTTAGGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATCCTCGCTCTATATTGCTCATGTGCTGTGGAGTTATAGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATAGGTTTAAAAACCTCTGTTCTTCCACCATAATACCCAGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATACGAAAAGGCTCGAGTCCCTTATGGCTGGTGAAAAGTTTTAGATTAACTATATAGAATGTAAATGCATTATTGTAATAATGAACTTTAGCGTAAGGCTGTAGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATGTGTGTATAACCATATCCACTTTTAAAACATTCTCTGGTTTTAGATTAACTATGTGGATTCAAAAT >CP012312|8|5|1754588-1754943|PILER-CR GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT CGCTACGATTTGACAGCTAAAAATGTGCTTTTCTTAG GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT CCTCGCTCTATATTGCTCATGTGCTGTGGAGTTATA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT AGGTTTAAAAACCTCTGTTCTTCCACCATAATACCCA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT ACGAAAAGGCTCGAGTCCCTTATGGCTGGTGAAAA GTTTTAGATTAACTATATAGAATGTAAAT GCATTATTGTAATAATGAACTTTAGCGTAAGGCTGTA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT >CP012312|8|7|1754588-1755009|CRISPRCasFinder GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT CGCTACGATTTGACAGCTAAAAATGTGCTTTTCTTAG GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT CCTCGCTCTATATTGCTCATGTGCTGTGGAGTTATA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT AGGTTTAAAAACCTCTGTTCTTCCACCATAATACCCA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT ACGAAAAGGCTCGAGTCCCTTATGGCTGGTGAAAA GTTTTAGATTAACTATATAGAATGTAAAT GCATTATTGTAATAATGAACTTTAGCGTAAGGCTGTA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT GTGTGTATAACCATATCCACTTTTAAAACATTCTCTG GTTTTAGATTAACTATGTGGATTCAAAAT >CP012312|8|6|1754588-1755009|CRT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT CGCTACGATTTGACAGCTAAAAATGTGCTTTTCTTAG GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT CCTCGCTCTATATTGCTCATGTGCTGTGGAGTTATA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT AGGTTTAAAAACCTCTGTTCTTCCACCATAATACCCA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT ACGAAAAGGCTCGAGTCCCTTATGGCTGGTGAAAA GTTTTAGATTAACTATATAGAATGTAAAT GCATTATTGTAATAATGAACTTTAGCGTAAGGCTGTA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT GTGTGTATAACCATATCCACTTTTAAAACATTCTCTG GTTTTAGATTAACTATGTGGATTCAAAAT
>CP012312.1|AXU75322.1|1753361_1753466_+|hypothetical-protein MIGFLLSILAGVISAYIYDKIKNHPDANKGDLKK >CP012312.1|AXU75321.1|1752078_1752519_+|phage-protein MSNLSAFLSQNAIKVDNVKYVASNRFLDKEGKPVEWELKVLSSEEDEALRRKCTKRVKVIGNNGKHTGQYTSEIDYNSYVAELCVASTVFPDLKDAELQNSYGVMGEAQLLKTMLTAGEYVNYTVKVNEVNGFDTSFEDKVEEAKN >CP012312.1|AXU75320.1|1751536_1752007_+|phage-protein MAQTINAKDTVSAKKAECFITIEGKRYNFMQAIDLEAKMEKNKSEVPILGRTTKGNKTTGSTNTGSATFHYNTSIFRELLYRYKETGEDIYFDIQVTNEDPTSAVGRQTVVLKDCNMDSGIITKFDADGEYLDEDMDFTFEDWELVEKFNLLAGME >CP012312.1|AXU75319.1|1750209_1751520_+|phage-protein MALGGGTFVTQNKVLPGAYINFISAKRATSSLSDRGIVAMPLELDWGIDEEVFQVTSDDFEKYSVKYFGYDYTHEKLKGLRDLFKNIRLGYFYKLNKGVKASCTIATAKYSGIRGNDLKVTVTTNIDDNAKFDVVTLLDNKKVDTQIAKVITDLQDNDYITWKKDATLEASAGLVFTGGTNGEAVTGAEYQAFLDKIESYSFNALGCLATTTEIKSLFVEFTKRMRDKVGAKFQTVLYKKSDADYEGVVSVENKIKDKDLVESSLIYWATGAIAGCDINKSNTNKKYDGEFDVGVNYTQIQLEEALKSGKFIFHKVGDEVHVLEDINTFVSFTDDKNDDFSSNQSVRVLDQIANDIATLFNEKYLGKVPNDKAGRISFWNDVVKHHKELENIRAIEDFKTDDVSVELGNDKKTVIVSDAVKVINAMSKLYMTVSVN >CP012312.1|AXU75318.1|1750023_1750209_+|hypothetical-protein MINLSKTLSKEENYKFTKEQIVNSKRYVNRKDLLNAILKEDELYSFSEVEEIINNFMKGVS >CP012312.1|AXU75317.1|1749602_1750040_+|phage-protein MLNNIIDGISIKLDKTFGESYTIYSEDVEQGINEPCFFIVPLNPSKVSYPSGRTLKKNSFDVHYFPKSNDKSFEINEVAEMLLEELEYIEIDGDLVRGTNMNFEIVDNVLHFFVDYNYFTIKSNNTDKMDTVELFGGLKRGDKLE >CP012312.1|AXU75316.1|1749184_1749610_+|phage-protein MARWGSVDFREFKRVCKKMEELTKIDLDKFCKDAARELAARLLGKVIRRTPVDTGFLRQGWNGVAYARSLPVYKQGNNYIIEVVNPTEYASYVEYGHRTKDGKGWVKGQHFLTISEMELQSQVDKIIEKKLLILLKGVFDA 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MATIQTSIRIFDGMTPAFRHMTTAMNIVLSSFEQLQRTSSNAVDANSIIKAREELARAEAGFDRLEQQIREADGQQRRLNKDINKGASSTDKLVANAKRLVATYIGLRSVGGLINLSDQMTSTNARLNMINDGQQSDGGLNKMIFQSAERARASYLDTAKIVTRVGMNAGKAFSSTKEIVAFAEQLNKKFVIAGATTEETNSALLQLTQGLGSGVLRGEELNAVFESAPNIIQSIADYLDVDIGKIRSMASEGMLTADIVKNSLLAAAEQTNAEFEKMPYTFGQIWTSIKNNVVMIFGVIQKKIEQSMSSRGFRTFIDNFINGLYVLGNVFFNIFNGIISILSSPFFQAFVNTIIVCVSLIAQALGWVITQALNIANVFAQNWSIIAPIIYGVVAAIAIYSLALAGMWAWEKLVAASKFVVMFAQMLLNTQTLAGYKSLVLYALGQWGVNEAMLACPIFWVVAGIIALVVALFVGVAVFNHFANTSISAVGVVAGAISVAASFIGNIFVATGNMLIDIVALIWNTFATFAEFLANVFNDPLGSIIRLFSGMADTVLGILQSIASAIDTIFGSNLASAVSGWSDKLQGWTDEVAGEAKIKVERIDPSSLHYDRFNYTKAWDGGYKFGEKLENKIKDAFDISKIADKAKKDLGLDDLWDKKYGLGDGFGSGGLNSPLNDAAKGAKDTAGNTAKMAKTMDKSQEDLKYLRDIAEQETINRFTGVNIKIDMNNTNNISKDADVDGIVNVLTEKLNDAMVVSAEGIV >CP012312.1|AXU75325.1|1758392_1759085_+|phage-cell-wall-hydrolase MAYDFYLDGVQLPIPPPKLEIKITNKNKTVDLINTGEVNILKKEGLSEISFEAEFTHNKLPFYRGTFKDVQFFLSKLELLKTDCKPFQFIVSRELGNKVLFNTNMKVSLEEYNIVEDAENGSDTKVAIKLKQYRDYSTKKLVLAPPKTTETGRPSVKIEPKRVDSINAPNTKTYTVKSGDSLWSICQKQLGNGSLYKKVYELNKSMMDKANKGKNLSKYTIYKGQVLKLG >CP012312.1|AXU75326.1|1759077_1760970_+|phage-cell-wall-hydrolase MVDDLVLANDRDVRLVIAHWEDFYEPAVIDGVTWEIERQGAPSKLEFTIVMDDILQFCEGNSVRLYYKGTGVFYGYIFQKKRDKENHIKIVAYDQLRYFKNKDTYVYNNQTASELVKMLAKDFNLKYNVIEDTKYKISRVEENKTLFDMVLTALDDTLREKKEMYVLYDDFGRITLKNVASMKLDTVMNNDVIEDFDYNSSIDSDTYTKIKLVRDNEETSKRDVYIAQDSAHMRSWGILQMFDTVDKNMSEAEIKQKCDILLKLYNKKTKSLSLKNALGDIRVRAGCLVPVFLDLGDIELQNYMLVEKVKHTFENNSHFMDLTLVDGDEFASYSSSSYSSGNTNNKDEKKNGPAQSTTKKNTGKKVPAIFTAYYPGNNAMEGGKTDCNGKPLDVKSRTVAGPMNREGVKKTWYTDDFLKKHPVFEYGDKVKIILPGTAYDNKVYTVKDNGGRIYVETNGTYHIDILLANASECKKFGRKNGYIIIGGDEEQTYQVEGNNQSSTNNNSKEDKLISIAKSKLGCNYVYGAEGPNTFDCSGFTQWCYKQIGIKIPRTASAQSKAGKAVDLKDRSKWKAGDLLCRIGGGSSNHVVMYIGNNQIIHSPQTGDVVKIESVNSYRKGKAYTHVRRFI >CP012312.1|AXU75327.1|1760983_1761244_+|phage-protein 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You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP012312_9 | 1887293-1887586 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP012312_9
|
4 spacers
spacers of CP012312_9
>9.1|1887325|35|CP012312|PILER-CR AAAAAATATAGTATAGCTTTTATTAGCTTATCAAA >9.2|1887392|35|CP012312|PILER-CR CAACATTGATTTGGCATCCTTATTAACTGGTGCTA >9.3|1887459|33|CP012312|PILER-CR CAACAGTGGTGGTGGTCGAGGAGTAGAAGTTCT >9.4|1887322|35|CP012312|CRISPRCasFinder AAAAAATATAGTATAGCTTTTATTAGCTTATCAAA >9.5|1887386|38|CP012312|CRISPRCasFinder TTTCAACATTGATTTGGCATCCTTATTAACTGGTGCTA >9.6|1887453|36|CP012312|CRISPRCasFinder TTTCAACAGTGGTGGTGGTCGAGGAGTAGAAGTTCT >9.7|1887518|38|CP012312|CRISPRCasFinder TTTATAACCTTTAATTACACCTCCCATATCACCACCAC >9.8|1887324|33|CP012312|CRT AAAATATAGTATAGCTTTTATTAGCTTATCAAA >9.9|1887388|36|CP012312|CRT TCAACATTGATTTGGCATCCTTATTAACTGGTGCTA >9.10|1887455|34|CP012312|CRT TCAACAGTGGTGGTGGTCGAGGAGTAGAAGTTCT >9.11|1887520|36|CP012312|CRT TATAACCTTTAATTACACCTCCCATATCACCACCAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012312_9
The CRISPR arrays of CP012312_9 >merge|CP012312|9|1887293-1887586|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAAAAAATATAGTATAGCTTTTATTAGCTTATCAAAGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTTCAACATTGATTTGGCATCCTTATTAACTGGTGCTAGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTTCAACAGTGGTGGTGGTCGAGGAGTAGAAGTTCTGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTTATAACCTTTAATTACACCTCCCATATCACCACCACGTTTTATATTAACTACATGGTATGTAAATTT >CP012312|9|6|1887293-1887520|PILER-CR GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAAA AAATATAGTATAGCTTTTATTAGCTTATCAAAGTT TTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTTCAA CATTGATTTGGCATCCTTATTAACTGGTGCTAGTT TTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTTCAA CAGTGGTGGTGGTCGAGGAGTAGAAGTTCTGTT TTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTT >CP012312|9|8|1887293-1887584|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AAAAAATATAGTATAGCTTTTATTAGCTTATCAAA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTCAACATTGATTTGGCATCCTTATTAACTGGTGCTA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTCAACAGTGGTGGTGGTCGAGGAGTAGAAGTTCT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTATAACCTTTAATTACACCTCCCATATCACCACCAC GTTTTATATTAACTACATGGTATGTAAAT >CP012312|9|7|1887293-1887586|CRT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAA AAAATATAGTATAGCTTTTATTAGCTTATCAAA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTT TCAACATTGATTTGGCATCCTTATTAACTGGTGCTA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTT TCAACAGTGGTGGTGGTCGAGGAGTAGAAGTTCT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTT TATAACCTTTAATTACACCTCCCATATCACCACCAC GTTTTATATTAACTACATGGTATGTAAATTT
>CP012312.1|AXU75442.1|1885376_1886648_-|guanine-deaminase MLKVLKGNIIFTKTSETFTVFENSYIILEKGKVKGIFKEIPKEYKNLKVVDYTDKLIIPGMNDLHAHASQFKNLGMAMDKELLPWLETYTFPEESNYKDIEYATKMYKKFVKELWKSGTTRIAVFATVHKEASMKLMDIFKEVGLGAYVGKVNMNMNCPDTLLENTQNSIADTEEIINKYSDTDSIVKPIITPRFIPSCTSELLKGLGDLCLKYNIPIQSHLSENYDEIEWVRSLEPESKFYGDAYNRYNLFGQTPTLMAHCVHCSQDEIDLMRENNVMAVHCPASNFNVGSGAMPIRKLIDNNIRLALGSDISGGHTLSIFKAMVSAIQLSKLYWVNSGKKYNFLSLSEAFYIATKSGGSFFGKVGSFEEGYDFDALIIDDSNLNHDNYSILERLERFIYVGDDRNIIHRYVSGKLIEEPNI >CP012312.1|AXU75441.1|1884169_1884487_-|hypothetical-protein MSEFKNVTAVKKANVYFDGKVSSRVIILPNGERKTLGLMLPGEYTFSTREEEIMEMLAGSMDVKLPGSNEFVTYKEGQKFNVPSDSSFDLKVNEVVDYCCSYIAD >CP012312.1|AXU75440.1|1881726_1884084_+|cation-transporting-ATPase MDKVNLERYSCDINVGLNKNQLQSRIDDNLINAFENGKTKTYKQIFKDNIFTLFNLINIVLVCLLVSVGSFKNTLFIFIAVINTIIGVIQEIRAKRLLDNLSVIVSNKVSVIREKEKKEIDVQELVLDDIMILKTGNQICADSKVLNGKLEVNESLVTGESDIIIKNKGDFLYSGSFVVSGEAFVRVENIGKDNYANKITNDAKISKKHNSQLRNSLNAILKIVGIIIIPLGIILFAKQHFGNGDSIATSVVGTVAAVNGMIPEGLTLLTSIALAVGTIKLASHKTLVQELYCVETLARVDTLCFDKTGTITEGKMQVDDIVMLEEVDINEIMGNICNSLKDDNATLNAIRDKYNVLDTYKAKNLIPFSSERKYSGVTFENKGTYLLGAFEFIFKEKNKKLRIEVERYSKKGNRVIVLAHSDSYMEDNNIPEDIKPLAFILILDKIRDEAKETLEFFYNEGVDIKIISGDNPITVSEVARKAGLKTASNFIDATTLKNDSDIYEAVDKYSVFGRVSPQQKKQMILALKKQNHTVAMTGDGVNDVLALKEADCSIAMASGSDVTKNVSNLVLLDSNFASMPKVVMEGRKVINNIQRASSLFLVKTIFSFFLSLLTLFFFSRQYPFVPIQLSLIGAVTVGIPSFFLALEANKSRISGNFLLNILKNALPGALCVTVNVIIVYNIVEYLGYSSSVFSTMCAILTGVCGLLILRQQCLPFNKERLFLIVSMTIAFVIGILFLGGLFSFVALSRELILITMALAILMPIMIKVMLFVLDEILETIVPDLN >CP012312.1|AXU75439.1|1879846_1881304_+|glycine-dehydrogenase-subunit-2 MKEYNSLLIDISKKGRKAYSLPKLDIDDIKIEDMIDQDMARQSELNLPEVGELELVRHYTLLSNKNFGVDTGFYPLGSCTMKYNPKINEDMAALPNFTRMHPYQSSDTAQGSLSLMYDLSRRLAEITGMDEVTLQPSAGSHGEFTGLMIIKAYHENRGDHKRTKVIIPDSAHGTNPASAAMANFDVIQIASDKNGAVDINALKEVLNDEVAALMLTNPSTLGLFEKNIKEIATLVHEAGGLLYYDGANMNAIMGITRPGDMGFDVVHLNLHKTFSTPHGGGGPGAGPVGVKKELVPFLPIPIIERKEDKYVLNYDREKSIGKIKNFYGNFGVLVRAYTYILTMGRDGLKEASEMAVLNANYIKESIKDDYILPIDTLCKHEFVLGGLPRGEANIKTIDIAKRLLDYGYHPPTMYFPLIINEALMIEPTESESIETLDSFIEAMKSVAKEAKEEPELLKTAPHNTLVKRVDDARAVKKPILTWSQR >CP012312.1|AXU75438.1|1877372_1879847_+|bifunctional-glycine-dehydrogenase/aminomethyl-transferase-protein MNELKRVSLYNIHKELGAKLVEFAGWEMPLEYEGINKEHEMVRKSAGIFDVSHMGEVQIKGVESEKFIQNLVTNDISTLNINDIIYTPMCYENGGVVDDLLIYKFGEEEYLLVINAGNIDKDVAWIIKQSEGYNVDIKNISSEVSQLAIQGPKAEEILQKITDIDLNSIKFYKSIPSTKVCGCPCLVSRTGYTGEDGFEIYCKNKYVEIIWNEVLKVGGEDICPAGLGCRDTLRFEAALPLYGHEINEHISPIEGGLSIFVKTNKESFIGKSILSKEKESGAKRKLVGFEMQGKGMPRNGYDIRIGDKIVGFVTTGCASPTTGKILGMGIIDSEYAKVGNEIGIAIRKKVVPAVIVKKPFYKKQYKKDNIILNKENKFSYIPATSEDKSKMLKVVGLNSVDELFSDIPEEVKLKRDLNLEIGKSELEVSKIVKRLSEENLSLEDLTCFLGAGAYDHYIPSIIKHITSRSEFYTAYTPYQAEISQGTLQVVFEFQSMIAEITGMEIANASMYDGATAAIEACIMAINQTRKSKIVVSKTTHPETLSVLRTYLQYKDCEIVEIDFCNEYGTTDIEKLKASVDKDTACVLIQTPNFFGIIEEMEEIEKITHENKAMLIMSVDPISLGVLKTPGEIGADIVVGEAQSLGNPLNFGGPYVGFLASKSKYTRKMPGRIVGQSLDVEGKIAYVLTLQTREQHVRREKATSNICSNQALNALVASIYMATMGKEGFKEVGMQSMKKAHYTYNKLVQTGKYKPIFKGKFFKEFAVQGNLNIETINDKLLEENILGGYNLEYNYPELKNSTLLCVTEKRSKEEIDKLVEIMEGL >CP012312.1|AXU75437.1|1876067_1876583_+|CF-9-family-membrane-protein MEKYIWLFPLLFIFHDMEEIIGFGIWLKKNKSMLDKKYPFISKIYENYSTEGMAFAVFEEFILCIIFCILIVITDNQYVYLLWLGSFIAYTLHLVIHIGQSIIIRKYIPSLITSIICLPISIWCISKSIYIVDCEMSTTILYSIIGIIIVALNLKFAQSLIGKFTKWMSNI >CP012312.1|AXU75436.1|1873812_1875543_+|Na+/H+-antiporter MRNKKINIIFLTTIMFIMSTVMVFAEEDIDTIALANAEKFGILTLIPPLVAIILAFITKNVIISLLIGILSGSFIIKASGINVFATFIQAFLDLVDRALVSLADPWNAGIILQVLAIGGVINLVAKMGGAKAIAEALAKRAKSAKGTQLITWFLGLLVFFDDYANSLIVGPMMRPVADKMKISREKLAFIIDATAAPVAGLAIISTWIGLEVGLIHDAFESISIDVDAFGIFLNTIPFRFYNILILAFIVISALLLKEFGPMRKAEIKSRSRKISIDLDEGVEELDDLAPKNGVKLSVWNAIIPIGTLIIVALASFYYSGYTSIMGGDDKALIQLFTNSPYSFEAIKEAFSASDASRALFQSALVASLVAIIMAVVKKIFTISEAIDVWIDGMKSLVITGVILILAWSLSSVIKELGTAKFLIHLLSGSLPPFLLPSLIFGLGAIISFATGTAYGTMGILMPLAIPLAYSLNPDMSYVIVSTSAVLTGAIFGDHCSPISDTTILSSMGAGCNHIDHVNTQMPYAIFTAVITIVFGYIPAGLGLPIYIVLPVAIAAIFMGIQIIGKRVDEAEIELVE >CP012312.1|AXU75435.1|1872343_1873330_-|lipoate-protein-ligase MLLIYNEKTNPYFNLAMEEYLLKNFDEDLFILWRNEPSIIVGKNQNTLSEINLEYIKEYSIPVVRRQSGGGAVFHDLGNINFTFIACNNNNFSDFRRFTQPIIDLLKTLDVNAEFSGRNDLLIDGKKFSGNAQYNYKNKVMHHGTLLFSSEINDLSKALKVKPIKFEGKGIKSVKSRVTNISEHLHSKMNILEFKDAIMDYLSKTNTDNTNYCLSEHDIKQIEKLTKSKYETWDWNFGNSPKYTLSNELKYSGGNVEFNLNVDKGIITSIKFFGDFFGKCDVAFVENKLIGIKHEENALRNTLDSIEINDYFLGADTDILVSGILGVK >CP012312.1|AXU75434.1|1871236_1872034_-|lipoprotein MKFKKLLCLLLCLVLTLAVVGCSKAKDDKKIVVGATLVPGGELLEELKPLIKEKGYTLEVKNFDDYILPNEALNNGEIDANLFQHEPYLKEAVKAKGYKIMAGKKLYVCPAILYSYKIKSVDEFKKGDTIAISNNPSSCSKNLRYLESIGLLTLPKGDGLVSPKDIIENPKGIQFKELDIAQIPSSLPDVTAAFIDTTYAVPAGLDAKKNGIYTAPINDEYANLLAFRTEDKDSEKIKVLQDVLTSDKARSLIEEKYKGIVIPTF >CP012312.1|AXU75433.1|1870534_1871134_-|tellurium-resistance-protein MAIELKKGQKINLTKKENSDLGEILVNLNWNQKVQKKGFFGSLRSSNIDLDLGCLFEMKNGVKGAVQALGNAFGSLDNPPFAQLDGDDRTGSNTQGENLRINGNKIKDIKRILIYAFIYEGVANWSEADGIVTIKQKQDSDLVVKLDEHKNGYNMCSIALIENVNDETFSVEKVVKYFKGHREMDTEFHWGLKWVAGRK >CP012312.1|AXU75443.1|1887990_1888278_+|hypothetical-protein MKKILYALYSFIVIIANFRLKEKNYNFILLAIFFILLLIQNGVLKTGYQNRATFYQDNYFNGEDKSDKIKFMTIKIFIFLSLPLCFNILFNYLTS >CP012312.1|AXU75444.1|1888302_1888401_+|hypothetical-protein MIKVSLCVIYIKYKVHIVIKQKFHINEEKNIK >CP012312.1|AXU75445.1|1888816_1889368_-|transcriptional-regulator MSINTIIAKNLNRLRNERNLSLGQLAELSGVSKVMLSQIEKGDSNPTVNTIWKIASGLNVPYTAILEQPQNETFIVSKTDIDVQVSENKDYRLYCYYPNTPTRNFELFQMELEEGHSYTSVGHSEKSQEYIMIIEGQLKLEVNDSIYQLRENDSICFSAESMHTYHNQGEKTLKAVIINYYPV >CP012312.1|AXU75446.1|1889558_1890521_+|cysteine-synthase-A MRVLNNVTEAIGNTHMLHLSKIADEFGVQGNIYAKMEYLNPGFSKKDRVALQMITEAENAGLLVPGQAVVELTSGNTGTGLAIACACKGYKFIACMSKGNSMERARMMKALGAEVVLVDQMPNSVHGQVSGEDLALVEIEAQKIAKERNAFRADQFNLEACNHAHEKYTAEEMWEQLDGNIDVFVDFLGSGSTFAGCSKTLKKHNSSIKCYVVEPETAAIYSGKEITDQGHKIQGGGYSMDLPLVDKKLIDGYIQVTDEEATDVARKLAKLEGVFAGFSSGANVCAAIKLLKSSEKGKNIVLTLNDSGLKYLSTDLYEEL >CP012312.1|AXU75447.1|1890813_1892658_+|glycerophosphoryl-diester-phosphodiesterase MQKRNLRNFIFTGKNILSKLVFIIKYNFSTLILFELFHKGLALFFIWPSIRYIFDILIKSLHIVYLNMDNFIKVLTNPISIVLIILSVIILAFYAFFELTSVIICFNKSIKYEKIGLFELFKISFKKSIKLLYPKNILLFIFVILIIPLVNTVLISGFIGKIQIPDYILDYIKSDIVLNIIYMIFLLIIYILVIRWIFSIHEITLNTENFKRARKESVNLIKGKIIRTIIYSLILSLVIAIIGYVIYHSGVIFIGIWTKYYTDMEFLKNIFINRCIAFEEYFRLILSIFIFILDIGFISATYYQYKGVSISKNNIKKEKKSISKIVFNLVLILLISYIESVAFSSHVNGMFNTSFSFYTTAIAHRAGAEMAPENTLAAIEEASHAKADYAEIDVQETKDGELIVLHDSNFKRTTGVDKNVWDVNYNEVKTYDAGSFYYYGKGYYDEKFVGEKIATLKEMIKYSKGKVKLLIEIKLNGHEKGDVVKKVVQLIKENNFENQCIVASMDKTILQKVKKLDENLLTCYFMAIAYGDFSKLNYVDIYGIESTFVNKTVVEKIHKMNKKIFVWTVNSDSLIEKMLDLNVDSIITDNPYLIESAIYWKKNGFISQVSDYLF >CP012312.1|AXU75448.1|1892978_1893563_+|sugar-O-acetyltransferase MTEREKMLAGELYDCGDIELLTQWHRAKDLVRDYNQTDSSDLEKKEKILNELLGGKGKNLWITAPYYVDYGNNIYFGNNCEVNMNCTFLDDNKIIIGDNVLIAPNVQIYTAFHPTNAGDRFGNAKEDGSFEFCKTQTAPVTIGDNVWIGGGAIIMPGVTIGDNVVIGAGSIVTKDIPSNMIAYGNPCRIIRENK >CP012312.1|AXU75449.1|1894664_1894841_-|hypothetical-protein MFIGEIDKCTHILTAYISSSYDYCNFLDTQLDDFISEYGETVVETCLHQVLLLVSRYN >CP012312.1|AXU75450.1|1895408_1896431_+|ABC-type-transport-system-involved-in-multi-copper-enzyme-maturation,-permease-component MVNWEIKKLAKSKSMFISLGILVLILIISIFITPVLETESYYIDKEKGRIEDTRSGIDIGNEKFQNKINVLKQFSNQTDTDKFSKKIELMSKKKLDNLSVNEYKDISFWKVFNYRVTNSLINVGMLIIISIIISNIYVDEVVTSVKDIILSSKEKKKALKSKIFVALLVPLVIYSVYLMGIFIITCMQQGVPVNGDLESFRVVDNVVALKTNLSITKYVILNIGIELLMFEGWAMIAVFGSFISKSSISSISFFIFIISITKIMSVIHILPKKLLSVISNVNYYDLIFGFNKIIGNYLGDIMIFKVNIDIVNIAIGLLMAILIGAISLCFLVIKSDYISR >CP012312.1|AXU75451.1|1896444_1897332_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNKLEIEKLSKIYGKKVANDKITVTLENGVYGLLGPNGAGKSTLMKQITTLIKPDEGQILYNGEDIFKMDDDYRNILGYLPQEFGVYKNFTAKEFLQYIGALKGLRGKHLNIKIGELLDLVGLYDVRNKSIGKFSGGMKRRVGIAQVLLNDPKIIVLDEPTAGLDPQERARFRNLIAKMSRDKIIILSTHIISDIESVAKETIMIKDGKLLMKGTHKDILSHMENKVYNVQVKNECEVDDIQSKYKVVSIQSDIDSIVLRIVSEDIPCGANIQPVQAKFEDVYMFYFDLDDAREV >CP012312.1|AXU75452.1|1897337_1898111_+|ABC-transporter-permease MMYLVKAEMIKILKSKSVWIIWLFLLFFGFLLIRKFDVLDTYADIFYKIEGSIPLIGLIMFIITSGNYIKEYDSNMTGLINTTKKGKKSVVLSKLLANGLTVSIINISFILLLGIRGFSFFDFKNLNEPIHNLWYFGNSNLNLTVIQMYIIVILTTIFASFIFAQIGLTLSSIFKSAVIPFILGGLIIAIPYFSVGFIPDKAIKFMSLTPNWIMMSQQIVRYNVPSILIVFSIVISIILMIVLTKITYENFTSSKRF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012312_10 | 2579514-2580142 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP012312_10
|
9 spacers
spacers of CP012312_10
>10.1|2579543|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT CTAATCCGTTTTGTTTTATAGCCTCCATACAAATCTC >10.2|2579609|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT CATTTACAAGCCCTTCCTCTACTCTATAATAAAATCT >10.3|2579675|38|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTGATATTCTAAAGAAGTGACAATGATGTGACACAA >10.4|2579742|39|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGGTACTACTCCAGAAGAATTTGACAGTCAATATGGTAG >10.5|2579810|38|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCATTTAGTAAATTCCAACCTTGATAGGCTCCATAGAT >10.6|2579877|38|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATTTAAGCGATAAAATTCAAGAAATAACAGAATTTTG >10.7|2579944|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAGGAATAAGATTGAGATTTAATTTTTATTATTCAAA >10.8|2580010|38|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTGAATTTAAATGGAGATACATATTTATTAAAAGAAAA >10.9|2580077|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT ACTTTGCCTTTTCATCTATTCCAGCACCATTTAGAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012312_10
The CRISPR arrays of CP012312_10 >merge|CP012312|10|2579514-2580142|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATTTTTCTCCACATAGTTAATATAAAACCTAATCCGTTTTGTTTTATAGCCTCCATACAAATCTCATTTACATACCACATAGTTAATCTAAAACCATTTACAAGCCCTTCCTCTACTCTATAATAAAATCTATTTACATTCCACTTAGTTAATCTAAAACTTTTGATATTCTAAAGAAGTGACAATGATGTGACACAAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACTGGTACTACTCCAGAAGAATTTGACAGTCAATATGGTAGATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACGCATTTAGTAAATTCCAACCTTGATAGGCTCCATAGATATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACAATTTAAGCGATAAAATTCAAGAAATAACAGAATTTTGATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACTAGGAATAAGATTGAGATTTAATTTTTATTATTCAAAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACGTGAATTTAAATGGAGATACATATTTATTAAAAGAAAAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACACTTTGCCTTTTCATCTATTCCAGCACCATTTAGAAAATTTACATACCACATAGTTAATATAACTC >CP012312|10|9|2579514-2580142|CRISPRCasFinder AATTTTTCTCCACATAGTTAATATAAAAC CTAATCCGTTTTGTTTTATAGCCTCCATACAAATCTC ATTTACATACCACATAGTTAATCTAAAAC CATTTACAAGCCCTTCCTCTACTCTATAATAAAATCT ATTTACATTCCACTTAGTTAATCTAAAAC TTTTGATATTCTAAAGAAGTGACAATGATGTGACACAA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TGGTACTACTCCAGAAGAATTTGACAGTCAATATGGTAG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GCATTTAGTAAATTCCAACCTTGATAGGCTCCATAGAT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AATTTAAGCGATAAAATTCAAGAAATAACAGAATTTTG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TAGGAATAAGATTGAGATTTAATTTTTATTATTCAAA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GTGAATTTAAATGGAGATACATATTTATTAAAAGAAAA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ACTTTGCCTTTTCATCTATTCCAGCACCATTTAGAAA ATTTACATACCACATAGTTAATATAACTC >CP012312|10|8|2579514-2580142|CRT AATTTTTCTCCACATAGTTAATATAAAAC CTAATCCGTTTTGTTTTATAGCCTCCATACAAATCTC ATTTACATACCACATAGTTAATCTAAAAC CATTTACAAGCCCTTCCTCTACTCTATAATAAAATCT ATTTACATTCCACTTAGTTAATCTAAAAC TTTTGATATTCTAAAGAAGTGACAATGATGTGACACAA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TGGTACTACTCCAGAAGAATTTGACAGTCAATATGGTAG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GCATTTAGTAAATTCCAACCTTGATAGGCTCCATAGAT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AATTTAAGCGATAAAATTCAAGAAATAACAGAATTTTG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TAGGAATAAGATTGAGATTTAATTTTTATTATTCAAA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GTGAATTTAAATGGAGATACATATTTATTAAAAGAAAA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ACTTTGCCTTTTCATCTATTCCAGCACCATTTAGAAA ATTTACATACCACATAGTTAATATAACTC >CP012312|10|7|2579646-2580076|PILER-CR ATTTACATTCCACTTAGTTAATCTAAAAC TTTTGATATTCTAAAGAAGTGACAATGATGTGACACAA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TGGTACTACTCCAGAAGAATTTGACAGTCAATATGGTAG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GCATTTAGTAAATTCCAACCTTGATAGGCTCCATAGAT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AATTTAAGCGATAAAATTCAAGAAATAACAGAATTTTG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TAGGAATAAGATTGAGATTTAATTTTTATTATTCAAA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GTGAATTTAAATGGAGATACATATTTATTAAAAGAAAA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC
>CP012312.1|AXU76080.1|2579113_2579356_-|hypothetical-protein MTVTRYNVIINVTSYRKEVNKIATKSRAEYMKNRRKDKRGFSVLLDKEKLDKFDEVLEEKNLTKKEWLEEKIDEELEQKE >CP012312.1|AXU76079.1|2578174_2578993_-|prophage-antirepressor-related-protein MKNELMMFEGKEIEVFEFEGQILFNPKHVAECLDISDVNSSIRKFNDNQVVKLTNSKMHNMQFRKLHNTGENFLTESGVYKLIFKSKKEEAERFQDWISDEVLPQIRQTGAYITNNADPDKLREKASEIESLDTVNKTIEILTPFLDNAGIDEKAKLLTAKTIYKKAGIELPLEIEEKEHFFDTVQIATKLNIYSKTNNPAFMAVCEIIKKLDIKEEEKLIVLANKKGWNGTTTKYSQSVIDKISKWIEENKRPTKIQGEKKNFYIVYKEAM >CP012312.1|AXU76078.1|2578025_2578175_-|hypothetical-protein MRDNLLNNPCSEEKEYLISCLKTLRKKDEHDFYVFKQIVDIYCKQAKYK >CP012312.1|AXU76077.1|2577125_2577896_-|hypothetical-protein MGLFGSKDNCCICGEKGKQKIADGWLCKECFKKYAVATFTPGNTLYRGLPTKLEVEKAIESKDDKEKELKNFNPTKKILKFMEFDDNNKKFIVLNGFNREKVNLSVYNYSDVIEYELLENGETVTKGGIGRALAGGALFGGVGAVVGGVTAKRTTKAFIDSLKIKITLNNLSNPNVYVNLIQLRTKSNSSIYKMAYSSAQEILSVLAIIVKDNEAVNIQNNSNDAIQQVKGLKELLDLGAITEEEFNTKKKELLNL >CP012312.1|AXU76076.1|2574717_2577069_-|phage-tail-tape-measure-protein MATIQTSIKIFDGMTPAFRNMTTSINTTINSLDRLQQRLHNPINAGSIQASQQSLNNIESILTRIEQKIKGNTNEQENFNNKIRQGSEAGSLLVSKLKSLAGIYIGIKGIESITKAADTIASTKARLNLMNDGLQTTDQLNKMIYLSAQSARASYADTAAQVAKLGILAGDAFGSSAEVVKFTELMNKAFVIGGTSASEASAAMYQLTQAMGAGKLQGDEFRSIMENAPLLAAKIADAMGKTKDQLKELSSSGAITADVIRNALFKASDEIEKKFASMPISFSQALTMMKNDAYMIFGQTLGKISGALQSVRFSEIVVSMRNVMIAISSNIYDTLNIIKNILNSDFFSDFVSNVTLGVVLIIQGLGGITNAALSVVNVFAQNWNIIEPIVYGVAAAIGIYTIAAIALAVANKVASLSAAWFNFQMTQTVIMHELATGATWMQVAAQYGLNAALYACPLTWIVLGFIAVIAVVFVAVAAVNKFAGTSLTALGVIVGAVFAAVAFIQNIMIWLFNRCVDVNEGITNGWNQCVFLMKQAIAKGVIFIIEKMASLNDSVNNAGNALGKAFVTGANIAIRGVNKLIDLLNKIPGINIGKVGEATFTPVKADNSYIKQQINSLNRWVGDAPEKIKLERMQYKDIGAEFQKGNALGTKWQNAISNKLKDTFDINKMLEDAKDKLGLKDLWDKDNPLNNLGGFGGDLGKNVKDTAGNTAKMAKTMDKSQEDLKYLRDIAEQETINRFTGVNIKIDMNNTNNISRDTDLDGIVNVLTEKLNDAMVVSAEGIV >CP012312.1|AXU76075.1|2574004_2574706_-|phage-cell-wall-hydrolase MAYDFYLDGVQLPITPGKLEIKTTNKNKTVDLINDGEVNILKTPGLSEFSFEAEFTHNKLPYYRGAFKDVQFFLSKLELLKTDCKPFQFIVSRQLGNKVLFNTNRKVSLEEYNIVEDAENGSDFKVAIKLKQYRDYSTKKLVLATPEKTNYGRTPPPVMKPKEFRPDSVNSPNAKTYTVKAGDSLWAICQKQLGNGSLYKKVYELNKTMMDKANKGKKVPKYTIYKGQVLKLG >CP012312.1|AXU76074.1|2572044_2574012_-|phage-cell-wall-hydrolase MDDELVLANDRDVRLVIAHWEDFYEPVVLDGITWEIERRGTPSKLEFTIVMDDILQFCEGNSVRLYYKGIGIFYGYIFQKKRDKENHIKIVAYDQLRYFKNKDTYVFKNYTASEIIKMLADDFKLKCKFIEDTKYKISRIEENKTLFDMILTALDDTLREKKEMYILYDDFGRLVLKNVASMKLDVVMDNDVIEDFDYNSSIDSDTYTQVKLLKEDENTGQRISTTVKDSIHIRSWGVLQLFDTVDSNMTKAEMDKKAEMLLKLYNKKTKSLSLKNVLGDIRVRAGCLVPVFLDLGDIDLQNYMLVEKVKHTFENNSHFMDLTLVDGDEFASYSSSSYSSGNTNNKDEKKNGPAQSTTSKEDNDMINKLNKVFKNKLSNTGSIFVKYSNAYKVNAALMAAISIHETGNGSSSLCKNKNNFFGMKGMSFGSVDEGIKRGISNLSRNYIHMGRKTLESIRDKYAPLYDSPLNKHWVPGVNKFYKQITGNAYSSNSAGTGVRSNEEAEKNLKDITYQVQNSNNANTSTNNNSKVNKVIQEAKNQLGKPYDWGGNGPKSFDCSGLMVWAFKRGAGINLPRVSADQSNDSRGKLLCNINDVKAGDLVFFKNEQGKVHHVGLYIGNDQYIHAPQTGDVVKISSLSGRQKKKHDFARARRFF >CP012312.1|AXU76073.1|2571770_2572031_-|phage-protein MSQELLQIIKKAAMDAVETSNPIQIAFGTIESVNPLVVKIEQKASFEESFLIQTDTFKKYTDKKIGDKLVLIRMQGGQQYLILDRM >CP012312.1|AXU76072.1|2571346_2571766_-|phage-protein MLPSDNLDYDIEDVSIINFDVRQEPSKTFKLNIEKNRVDGICDDVEALKQTIFLILNTERYEHLIYSRNYGVELNDLIGEPISYVIPELERRITEALIQDDRVENVDNFEFQNVKGKVHCKFTVYSKYGNIKAEKVVSV >CP012312.1|AXU76071.1|2570296_2571346_-|phage-protein MFELMTFENIIKRMLDSVPDTFDKREGSIIYNALAPVAVELTETYIAMDELLDQTFVDTASYYYLEKRCKERGITPLPATNTIAKGVFNIDIPIDSRFNLGEYNYVAIERISEKTYKMKCETTGPVFELGQLIPIEYVDKLETAELTEILINGEDEESEDSLRQRYYDSLNSQSFGGNMQNYKDEVNKIQDVGGVKVYPVWDGGGTVKLVIINSNFKVPSDDLVNLVQEEIDPIQNQGEGLGLAPIGHRVTVEGVTSTTINISAEITYKSGYTWENIKTIAEEAINDYLNELNMSWEDEENLIVRISQIETRLLSIDGVLDITNTMINEVKSNLTIDSNSIVVRGEVVG >CP012312.1|AXU76081.1|2580217_2580376_-|hypothetical-protein MYENLLDSIDIEKRKEEFRIKLLKIRETDIDIYNKIESIVYKLSEKKLEKNN >CP012312.1|AXU76082.1|2580408_2581188_-|prophage-antirepressor-related-protein MNNLVLINNQELQVKEFNNQRVVTFKEIDQVHERTEGTAKRNFSENRKHFIENEDFFFVKASDFEKYGNRTLEIPNRGLTLITETGYLMLVKSFTDDLAWKVQRQLVNSYFRVKEEIKTLEAVNESIKLITPIFEDLKIDKSMQFLVAKTFFKKAGVDIPLEIEEKEHFYDTKQIARKLGLYTMSNKPAFMAVKQIIRKLDIKEDEMKTVLETNGSWTGTVTKYSNKVTEKVKEWLKENNNPISIKGDKKNYYILYKNN >CP012312.1|AXU76083.1|2581431_2581635_+|DNA-binding-protein MYFNIDKLLDSRGKTRYWLAKEVGIAYPNMMKLANNETSSIKLDLFEKLCLVLECTPNELVTLSSKE >CP012312.1|AXU76084.1|2582751_2582913_-|hypothetical-protein MEILNITLSPKEIEIYLMWTKLEEIKAFDVELYNKIADTINELYEKQQGRENN >CP012312.1|AXU76085.1|2582972_2583839_-|prophage-antirepressor-related-protein MKNLIVKEFNGSQIYTFMWKEKSCWIANQIVGLFDYADVSKTIQDCIKAEDFEIEQEYDVLKGNEFNDFVTTLNVVANNIISNKARSITIFYEDGLYGFLQYTDKPIGVQFRKWLRREVLPSIRQTGAYITNNANPEKLREKASEIEKLQLAYNSTSMLKELLDGAGFDNKSKLLTAKTLYKKAGIDLPIEIDEEEHYFDTKQIASKLKIYSKSNKPAQLAVCEIIKKIDLEENEVKGVWETNGSWTGTVNKYTKSVIDKIRNWIEENNRPTKIQGEKKNFHIVYKIE >CP012312.1|AXU76086.1|2583960_2584194_-|hypothetical-protein MADINYNNKCQPIIMQEVITITKNKVGRPKTETAMNKRITVRLDSKHEEILETYTKKYGITKNEAVRKGIEKLEEKE >CP012312.1|AXU76087.1|2584597_2584756_-|hypothetical-protein MDNFLQGVLASLVASLIVYLTSKLFKKVKSHSNTTKSDFDFKLTIKFKRNKH >CP012312.1|AXU76088.1|2585078_2585519_-|phage-protein MGDLNAFLSQNAIKVENRKYVASERFVGEDGRPVEWELKAIDSDRDRQLRKDSTIRVPVLNKKGKATGQYTSETDFNTYTLKLCVETIVFPDLHDAELQNSYGVMGAEELLTTMLTPGEYTDLSSEVGEVNGFDRTFEDKVEEAKN >CP012312.1|AXU76089.1|2585523_2585781_-|hypothetical-protein MVKIKDKYEMKDSISFSYNEKIPLEERVSEVYKKAGKFLIDISDKLALDTIEGSSLAPIEIKIKLDEDNLITIEKQTKYLVMEVE >CP012312.1|AXU76090.1|2585833_2586310_-|phage-protein MSKNITMNVRDAISGSKAECFVTIKGKRYNFMQAINLEAKMEKNKSEMPILGSITKGNKSTGSKFSGSATFYYNTSIFRELLYEYKETGEDIYFDMQITNEDPTSSVGRQTIILEDCNLDSGIIAKFDADGEYLDEDVDFTFENWKIVEKFNIANGME |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012312_11 | 2581680-2582508 | Orphan |
I-A:NA
Consensus repeat of CP012312_11
|
12 spacers
spacers of CP012312_11
>11.1|2581709|37|CP012312|CRISPRCasFinder CAATTTCATGTGTGGATAGTTGCCATATCTCCCACCC >11.2|2581775|37|CP012312|CRISPRCasFinder CAGCAGTTAAGATTAGAGATGAAGCTAGTTCAACACT >11.3|2581841|36|CP012312|CRISPRCasFinder AATAATTGGTGATGGTACAGGATATACAAATGCAAC >11.4|2581906|37|CP012312|CRISPRCasFinder ATGATAAATTAGAAGGAACTTCGTATGTCTTGCCTTT >11.5|2581972|38|CP012312|CRISPRCasFinder TTAGTGTTAGAAATGCTTTGAAGAGTGCTATTAACGAT >11.6|2582039|36|CP012312|CRISPRCasFinder ACGACCGTTAAATCTGCAAATTTCTTCACCACTTGT >11.7|2582104|35|CP012312|CRISPRCasFinder TTTGATAGAGATACCCATTCTCTTAATGTTGCTGT >11.8|2582168|49|CP012312|CRISPRCasFinder CACCTCTTCTTTTATCTCTTCTTTTATCTCTTCTTTTATCTCTTCTATT >11.9|2582246|36|CP012312|CRISPRCasFinder TTTTCTAGCCTTAAAAGTATTCGCTTTATCTTTAAC >11.10|2582311|36|CP012312|CRISPRCasFinder ATAGTTTAAAAAATGTTACTTTAAAAAGTAAAGTGT >11.11|2582376|38|CP012312|CRISPRCasFinder CAAAAGAAGTCATAGAAGCTATGGAGCATGACTGTAAT >11.12|2582443|37|CP012312|CRISPRCasFinder GATATTCACACTATGCATATCTAAAATTCAAATATTT >11.13|2581709|38|CP012312|CRT CAATTTCATGTGTGGATAGTTGCCATATCTCCCACCCA >11.14|2581775|38|CP012312|CRT,PILER-CR CAGCAGTTAAGATTAGAGATGAAGCTAGTTCAACACTA >11.15|2581841|37|CP012312|CRT,PILER-CR AATAATTGGTGATGGTACAGGATATACAAATGCAACA >11.16|2581906|38|CP012312|CRT,PILER-CR ATGATAAATTAGAAGGAACTTCGTATGTCTTGCCTTTA >11.17|2581972|39|CP012312|CRT,PILER-CR TTAGTGTTAGAAATGCTTTGAAGAGTGCTATTAACGATA >11.18|2582039|37|CP012312|CRT,PILER-CR ACGACCGTTAAATCTGCAAATTTCTTCACCACTTGTC >11.19|2582104|36|CP012312|CRT,PILER-CR TTTGATAGAGATACCCATTCTCTTAATGTTGCTGTC >11.20|2582168|50|CP012312|CRT,PILER-CR CACCTCTTCTTTTATCTCTTCTTTTATCTCTTCTTTTATCTCTTCTATTC >11.21|2582246|37|CP012312|CRT,PILER-CR TTTTCTAGCCTTAAAAGTATTCGCTTTATCTTTAACC >11.22|2582311|37|CP012312|CRT,PILER-CR ATAGTTTAAAAAATGTTACTTTAAAAAGTAAAGTGTC >11.23|2582376|39|CP012312|CRT,PILER-CR CAAAAGAAGTCATAGAAGCTATGGAGCATGACTGTAATC >11.24|2582443|38|CP012312|CRT,PILER-CR GATATTCACACTATGCATATCTAAAATTCAAATATTTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012312_11
The CRISPR arrays of CP012312_11 >merge|CP012312|11|2581680-2582508|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGTTTTTCTCCACATAGTTAATCTAAAACCAATTTCATGTGTGGATAGTTGCCATATCTCCCACCCATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACCAGCAGTTAAGATTAGAGATGAAGCTAGTTCAACACTATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACAATAATTGGTGATGGTACAGGATATACAAATGCAACATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACATGATAAATTAGAAGGAACTTCGTATGTCTTGCCTTTATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACTTAGTGTTAGAAATGCTTTGAAGAGTGCTATTAACGATATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAACACGACCGTTAAATCTGCAAATTTCTTCACCACTTGTCTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACTTTGATAGAGATACCCATTCTCTTAATGTTGCTGTCTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACCACCTCTTCTTTTATCTCTTCTTTTATCTCTTCTTTTATCTCTTCTATTCTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACTTTTCTAGCCTTAAAAGTATTCGCTTTATCTTTAACCTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACATAGTTTAAAAAATGTTACTTTAAAAAGTAAAGTGTCTTTACATACCACATAGTTACTATAAAACCAAAAGAAGTCATAGAAGCTATGGAGCATGACTGTAATCTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACGATATTCACACTATGCATATCTAAAATTCAAATATTTCTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC >CP012312|11|10|2581680-2582508|CRISPRCasFinder AGTTTTTCTCCACATAGTTAATCTAAAAC CAATTTCATGTGTGGATAGTTGCCATATCTCCCACCC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CAGCAGTTAAGATTAGAGATGAAGCTAGTTCAACACT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AATAATTGGTGATGGTACAGGATATACAAATGCAAC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ATGATAAATTAGAAGGAACTTCGTATGTCTTGCCTTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTAGTGTTAGAAATGCTTTGAAGAGTGCTATTAACGAT ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC ACGACCGTTAAATCTGCAAATTTCTTCACCACTTGT CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC TTTGATAGAGATACCCATTCTCTTAATGTTGCTGT CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC CACCTCTTCTTTTATCTCTTCTTTTATCTCTTCTTTTATCTCTTCTATT CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC TTTTCTAGCCTTAAAAGTATTCGCTTTATCTTTAAC CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC ATAGTTTAAAAAATGTTACTTTAAAAAGTAAAGTGT CTTTACATACCACATAGTTACTATAAAAC CAAAAGAAGTCATAGAAGCTATGGAGCATGACTGTAAT CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC GATATTCACACTATGCATATCTAAAATTCAAATATTT CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC >CP012312|11|9|2581681-2582508|CRT GTTTTTCTCCACATAGTTAATCTAAAAC CAATTTCATGTGTGGATAGTTGCCATATCTCCCACCCA TTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CAGCAGTTAAGATTAGAGATGAAGCTAGTTCAACACTA TTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AATAATTGGTGATGGTACAGGATATACAAATGCAACA TTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ATGATAAATTAGAAGGAACTTCGTATGTCTTGCCTTTA TTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTAGTGTTAGAAATGCTTTGAAGAGTGCTATTAACGATA TTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC ACGACCGTTAAATCTGCAAATTTCTTCACCACTTGTC TTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC TTTGATAGAGATACCCATTCTCTTAATGTTGCTGTC TTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC CACCTCTTCTTTTATCTCTTCTTTTATCTCTTCTTTTATCTCTTCTATTC TTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC TTTTCTAGCCTTAAAAGTATTCGCTTTATCTTTAACC TTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC ATAGTTTAAAAAATGTTACTTTAAAAAGTAAAGTGTC TTTACATACCACATAGTTACTATAAAAC CAAAAGAAGTCATAGAAGCTATGGAGCATGACTGTAATC TTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC GATATTCACACTATGCATATCTAAAATTCAAATATTTC TTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC >CP012312|11|8|2581747-2582508|PILER-CR TTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CAGCAGTTAAGATTAGAGATGAAGCTAGTTCAACACTA TTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AATAATTGGTGATGGTACAGGATATACAAATGCAACA TTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ATGATAAATTAGAAGGAACTTCGTATGTCTTGCCTTTA TTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTAGTGTTAGAAATGCTTTGAAGAGTGCTATTAACGATA TTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC ACGACCGTTAAATCTGCAAATTTCTTCACCACTTGTC TTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC TTTGATAGAGATACCCATTCTCTTAATGTTGCTGTC TTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC CACCTCTTCTTTTATCTCTTCTTTTATCTCTTCTTTTATCTCTTCTATTC TTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC TTTTCTAGCCTTAAAAGTATTCGCTTTATCTTTAACC TTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC ATAGTTTAAAAAATGTTACTTTAAAAAGTAAAGTGTC TTTACATACCACATAGTTACTATAAAAC CAAAAGAAGTCATAGAAGCTATGGAGCATGACTGTAATC TTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC GATATTCACACTATGCATATCTAAAATTCAAATATTTC TTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
>CP012312.1|AXU76083.1|2581431_2581635_+|DNA-binding-protein MYFNIDKLLDSRGKTRYWLAKEVGIAYPNMMKLANNETSSIKLDLFEKLCLVLECTPNELVTLSSKE >CP012312.1|AXU76082.1|2580408_2581188_-|prophage-antirepressor-related-protein MNNLVLINNQELQVKEFNNQRVVTFKEIDQVHERTEGTAKRNFSENRKHFIENEDFFFVKASDFEKYGNRTLEIPNRGLTLITETGYLMLVKSFTDDLAWKVQRQLVNSYFRVKEEIKTLEAVNESIKLITPIFEDLKIDKSMQFLVAKTFFKKAGVDIPLEIEEKEHFYDTKQIARKLGLYTMSNKPAFMAVKQIIRKLDIKEDEMKTVLETNGSWTGTVTKYSNKVTEKVKEWLKENNNPISIKGDKKNYYILYKNN >CP012312.1|AXU76081.1|2580217_2580376_-|hypothetical-protein MYENLLDSIDIEKRKEEFRIKLLKIRETDIDIYNKIESIVYKLSEKKLEKNN >CP012312.1|AXU76080.1|2579113_2579356_-|hypothetical-protein MTVTRYNVIINVTSYRKEVNKIATKSRAEYMKNRRKDKRGFSVLLDKEKLDKFDEVLEEKNLTKKEWLEEKIDEELEQKE >CP012312.1|AXU76079.1|2578174_2578993_-|prophage-antirepressor-related-protein MKNELMMFEGKEIEVFEFEGQILFNPKHVAECLDISDVNSSIRKFNDNQVVKLTNSKMHNMQFRKLHNTGENFLTESGVYKLIFKSKKEEAERFQDWISDEVLPQIRQTGAYITNNADPDKLREKASEIESLDTVNKTIEILTPFLDNAGIDEKAKLLTAKTIYKKAGIELPLEIEEKEHFFDTVQIATKLNIYSKTNNPAFMAVCEIIKKLDIKEEEKLIVLANKKGWNGTTTKYSQSVIDKISKWIEENKRPTKIQGEKKNFYIVYKEAM >CP012312.1|AXU76078.1|2578025_2578175_-|hypothetical-protein MRDNLLNNPCSEEKEYLISCLKTLRKKDEHDFYVFKQIVDIYCKQAKYK >CP012312.1|AXU76077.1|2577125_2577896_-|hypothetical-protein MGLFGSKDNCCICGEKGKQKIADGWLCKECFKKYAVATFTPGNTLYRGLPTKLEVEKAIESKDDKEKELKNFNPTKKILKFMEFDDNNKKFIVLNGFNREKVNLSVYNYSDVIEYELLENGETVTKGGIGRALAGGALFGGVGAVVGGVTAKRTTKAFIDSLKIKITLNNLSNPNVYVNLIQLRTKSNSSIYKMAYSSAQEILSVLAIIVKDNEAVNIQNNSNDAIQQVKGLKELLDLGAITEEEFNTKKKELLNL >CP012312.1|AXU76076.1|2574717_2577069_-|phage-tail-tape-measure-protein MATIQTSIKIFDGMTPAFRNMTTSINTTINSLDRLQQRLHNPINAGSIQASQQSLNNIESILTRIEQKIKGNTNEQENFNNKIRQGSEAGSLLVSKLKSLAGIYIGIKGIESITKAADTIASTKARLNLMNDGLQTTDQLNKMIYLSAQSARASYADTAAQVAKLGILAGDAFGSSAEVVKFTELMNKAFVIGGTSASEASAAMYQLTQAMGAGKLQGDEFRSIMENAPLLAAKIADAMGKTKDQLKELSSSGAITADVIRNALFKASDEIEKKFASMPISFSQALTMMKNDAYMIFGQTLGKISGALQSVRFSEIVVSMRNVMIAISSNIYDTLNIIKNILNSDFFSDFVSNVTLGVVLIIQGLGGITNAALSVVNVFAQNWNIIEPIVYGVAAAIGIYTIAAIALAVANKVASLSAAWFNFQMTQTVIMHELATGATWMQVAAQYGLNAALYACPLTWIVLGFIAVIAVVFVAVAAVNKFAGTSLTALGVIVGAVFAAVAFIQNIMIWLFNRCVDVNEGITNGWNQCVFLMKQAIAKGVIFIIEKMASLNDSVNNAGNALGKAFVTGANIAIRGVNKLIDLLNKIPGINIGKVGEATFTPVKADNSYIKQQINSLNRWVGDAPEKIKLERMQYKDIGAEFQKGNALGTKWQNAISNKLKDTFDINKMLEDAKDKLGLKDLWDKDNPLNNLGGFGGDLGKNVKDTAGNTAKMAKTMDKSQEDLKYLRDIAEQETINRFTGVNIKIDMNNTNNISRDTDLDGIVNVLTEKLNDAMVVSAEGIV >CP012312.1|AXU76075.1|2574004_2574706_-|phage-cell-wall-hydrolase MAYDFYLDGVQLPITPGKLEIKTTNKNKTVDLINDGEVNILKTPGLSEFSFEAEFTHNKLPYYRGAFKDVQFFLSKLELLKTDCKPFQFIVSRQLGNKVLFNTNRKVSLEEYNIVEDAENGSDFKVAIKLKQYRDYSTKKLVLATPEKTNYGRTPPPVMKPKEFRPDSVNSPNAKTYTVKAGDSLWAICQKQLGNGSLYKKVYELNKTMMDKANKGKKVPKYTIYKGQVLKLG >CP012312.1|AXU76074.1|2572044_2574012_-|phage-cell-wall-hydrolase MDDELVLANDRDVRLVIAHWEDFYEPVVLDGITWEIERRGTPSKLEFTIVMDDILQFCEGNSVRLYYKGIGIFYGYIFQKKRDKENHIKIVAYDQLRYFKNKDTYVFKNYTASEIIKMLADDFKLKCKFIEDTKYKISRIEENKTLFDMILTALDDTLREKKEMYILYDDFGRLVLKNVASMKLDVVMDNDVIEDFDYNSSIDSDTYTQVKLLKEDENTGQRISTTVKDSIHIRSWGVLQLFDTVDSNMTKAEMDKKAEMLLKLYNKKTKSLSLKNVLGDIRVRAGCLVPVFLDLGDIDLQNYMLVEKVKHTFENNSHFMDLTLVDGDEFASYSSSSYSSGNTNNKDEKKNGPAQSTTSKEDNDMINKLNKVFKNKLSNTGSIFVKYSNAYKVNAALMAAISIHETGNGSSSLCKNKNNFFGMKGMSFGSVDEGIKRGISNLSRNYIHMGRKTLESIRDKYAPLYDSPLNKHWVPGVNKFYKQITGNAYSSNSAGTGVRSNEEAEKNLKDITYQVQNSNNANTSTNNNSKVNKVIQEAKNQLGKPYDWGGNGPKSFDCSGLMVWAFKRGAGINLPRVSADQSNDSRGKLLCNINDVKAGDLVFFKNEQGKVHHVGLYIGNDQYIHAPQTGDVVKISSLSGRQKKKHDFARARRFF >CP012312.1|AXU76084.1|2582751_2582913_-|hypothetical-protein MEILNITLSPKEIEIYLMWTKLEEIKAFDVELYNKIADTINELYEKQQGRENN >CP012312.1|AXU76085.1|2582972_2583839_-|prophage-antirepressor-related-protein MKNLIVKEFNGSQIYTFMWKEKSCWIANQIVGLFDYADVSKTIQDCIKAEDFEIEQEYDVLKGNEFNDFVTTLNVVANNIISNKARSITIFYEDGLYGFLQYTDKPIGVQFRKWLRREVLPSIRQTGAYITNNANPEKLREKASEIEKLQLAYNSTSMLKELLDGAGFDNKSKLLTAKTLYKKAGIDLPIEIDEEEHYFDTKQIASKLKIYSKSNKPAQLAVCEIIKKIDLEENEVKGVWETNGSWTGTVNKYTKSVIDKIRNWIEENNRPTKIQGEKKNFHIVYKIE >CP012312.1|AXU76086.1|2583960_2584194_-|hypothetical-protein MADINYNNKCQPIIMQEVITITKNKVGRPKTETAMNKRITVRLDSKHEEILETYTKKYGITKNEAVRKGIEKLEEKE >CP012312.1|AXU76087.1|2584597_2584756_-|hypothetical-protein MDNFLQGVLASLVASLIVYLTSKLFKKVKSHSNTTKSDFDFKLTIKFKRNKH >CP012312.1|AXU76088.1|2585078_2585519_-|phage-protein MGDLNAFLSQNAIKVENRKYVASERFVGEDGRPVEWELKAIDSDRDRQLRKDSTIRVPVLNKKGKATGQYTSETDFNTYTLKLCVETIVFPDLHDAELQNSYGVMGAEELLTTMLTPGEYTDLSSEVGEVNGFDRTFEDKVEEAKN >CP012312.1|AXU76089.1|2585523_2585781_-|hypothetical-protein MVKIKDKYEMKDSISFSYNEKIPLEERVSEVYKKAGKFLIDISDKLALDTIEGSSLAPIEIKIKLDEDNLITIEKQTKYLVMEVE >CP012312.1|AXU76090.1|2585833_2586310_-|phage-protein MSKNITMNVRDAISGSKAECFVTIKGKRYNFMQAINLEAKMEKNKSEMPILGSITKGNKSTGSKFSGSATFYYNTSIFRELLYEYKETGEDIYFDMQITNEDPTSSVGRQTIILEDCNLDSGIIAKFDADGEYLDEDVDFTFENWKIVEKFNIANGME >CP012312.1|AXU76091.1|2586329_2587640_-|phage-protein MALGGGTFVTQNKVLPGAYINFISAKRATSSLSDRGIVAIPLELDWGIDEEVFKVTSDDFEKYSVKYFGYDYTHEKLKGLRDLFKNIRLGYFYKLNKGVKASCSIATAKYSGTRGNDLKVIVTTNIDDNTKFDVVTLLDNKKVDIQAAKVITDLQDNDYITWKKDATLEASAGLVFTGGTNGEAVTGAEYQAFLDKIESYSFNALGCLATTTEIKSLFVEFTKRMRDKVGAKFQTVLYKKSDADYEGVVSVENKIKDTGLLESSLIYWATGAIAGCDINKSNTNKRYDGEFDVDVNYTQIQLEEALKTGKFIFHKVGDEVHVLEDINTFVSFTDEKNDDFSSNQSIRVLDQIANDIATLFNEKYLGEVPNDKSGRISFWNDVVKHHEQLQNMRAIEDFKADDVSVEPGSDKKTVVVSDAVKVISAMSKLYMTVSVS >CP012312.1|AXU76092.1|2587640_2587826_-|hypothetical-protein MINLSKTLSKEENYKFTKEQIVNSKRYVNRKDLLNAILKEDELYSFSEVEDMINNFMKGVS >CP012312.1|AXU76093.1|2587809_2588247_-|phage-protein MLNNIIDGISVKLDKSFGESYTIYSEDVEQGINEPCFFIVPLNPSKVSYPSGRTLKKNSFDVHYFPKSNDKSFEINEVAEMLLEELEYIEIDGDLVRGTNMNFEIVDNVLHFFVDYNYFTIKSNNTDKMDTVELFGGLKRGDKLE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012312_12 | 2779285-2779442 | Unclear |
NA
Consensus repeat of CP012312_12
|
2 spacers
spacers of CP012312_12
>12.1|2779313|38|CP012312|PILER-CR AATAATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATT >12.2|2779379|38|CP012312|PILER-CR ACAAAATCTCCAACTTATAATTATTTTCGCGATGTACC |
cas3,cas5,cas7,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012312_12
The CRISPR arrays of CP012312_12 >merge|CP012312|12|2779285-2779442|PILER-CR AAATCCGATTAGTTAATTTTAAACCTAATAATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATTTGAAATCCACTTAGTTAATCTTAAACATACAAAATCTCCAACTTATAATTATTTTCGCGATGTACCTGAAACCCACTTAGTTAATCTTAAACCT >CP012312|12|9|2779285-2779442|PILER-CR AAATCCGATTAGTTAATTTTAAACCTAA TAATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATTTG AAATCCACTTAGTTAATCTTAAACATAC AAAATCTCCAACTTATAATTATTTTCGCGATGTACCTG AAACCCACTTAGTTAATCTTAAACCT
>CP012312.1|AXU76299.1|2778195_2779143_-|50S-ribosomal-protein-L11-methyltransferase MNNWIEVTIKTTTEAVEPITNILYEQGAGGAVIEDPKDFLFQKKNELDWDYVEEEVFKKNEEDDVLIKTYVSEEKNVMEFVEIIKQKVLGLKDFGIDIGEGSVSLDQVNEADWANAWKAYYKPTKVGQRVVVKPTWEDYAIQEGDLIIELDPGMAFGTGTHETTSMCIRELEKYVNKDSKVFDIGCGSGILAIAAAKLGAKEVVAVDLDEVAVKVAKENVLENKVEKSVSVMHGNLTDVIKDKADVIVANIIADIIKILAKDVQNFMKEDAMFISSGIILDKVEEVKESLIENGFEIVEVQKLGEWSAIVSKLKK >CP012312.1|AXU76298.1|2777418_2778177_-|16S-ribosomal-RNA-methyltransferase-RsmE MDRFFVEKNNINLQDKTCTIEGEDVKHISKVLRCKLGEKLEICDKNNNEYICEIMNIDKSIVNLEILEKVDINRESELKVRLYQGLPKAPKMEMILQKLTEVGVEEIILVQTKRSVVKVDDKKEDKKFERWERIIYEAAKQSKRGKIPKLRGVLSFKEALEDMKKNNVNICPYENERTVSIKHALKKCDSNIDSVGIFIGPEGGFSEEEIEQIQKNNCNVVSLGPRILRTETASVVASTIALYELSDLGGEK >CP012312.1|AXU76297.1|2776118_2777417_-|radical-SAM-superfamily-protein MKKVAFYTLGCKVNQYETEAMLELFEKDGYEQVNSEEYADVYVINTCTVTHMSDRKSRQYIRRVKKKNPDAIIAVVGCYSQVSPEEILDIEEVNLVMGTNDRRKIVEEIKKINSSKKVSTVDDIMKVKAFEEIEISQTNGKTRAFMKIQDGCDRFCTYCIIPYARGRVRSRDIDSIVDEVKKLANNGYKEVVLTGIHVASYGKDLKDRDIKLLDVIKQINQIEKIERIRLSSVEPILFTDEFVNEVLKMDKVCPHYHLSLQSGCDETLKRMNRRYTTLEYKTIVDRLRSKMPDVAITTDVIVGFPGETNEEFKKTYEFLREIELSQMHIFKYSPRKGTPAATMENQVDPQMKHFRSEQLLNLSKVNFNKFATKFIGRELDVLFEQNIEGNKYEGLTSNYIRVVVESDKNIQGQILKVKINDVKDEYVEGILL >CP012312.1|AXU76296.1|2775725_2776076_-|histidine-triad-nucleotide-binding-protein MDCIFCKIANGEIPSTKVYEDDRVLAFNDLNPVAPYHILVVPKKHYDSLIDIPDKEMDIVSHIHVVINKIAKEKGFDQTGFRVINNCGSDGGQEVKHLHYHILAGKKLPNYEAGQN >CP012312.1|AXU76295.1|2775383_2775563_-|30S-ribosomal-protein-S21 MSEVRVRENETLDSALRRFKRQCAMSGIMSEVRKREHYDKPSVKRKKKAEAARRKNAKK >CP012312.1|AXU76294.1|2774910_2775354_-|tRNA-binding-protein MSLKQKLQEDLKSSMKNKDTVRKSVVTLIRASIKQYEVDNRVELDEDGIIDVIAKQLKQRRDALVEFEKAGREDLIKETEGEIEVLKEYLPQQLSEEELEEIVKSTISEVGATSMKDMGKIMSVIQPKVKGRADGKLINKLVKQNLQ >CP012312.1|AXU76293.1|2774302_2774800_-|sensory-protein MIISVKEIRNFLINIFIPLIIGYLSSILTMIISGTDISTYYLQLTKPSFAPPAFIFPIVWTILYILMGISSYLILRKGYNLPKVRDAIFYYGLQLVLNFIWSILFFGFGLRFTALIDIIIMILVSIIMISKFSKIDKRSGYINLIYLMWLVYAGFLNYFIWFINK >CP012312.1|AXU76292.1|2773547_2774111_-|sigma-54-modulation-protein MQIIVSGRQMKLTDGIKGYVDGKLSRLEKYLDPESEVKVTVSAKKDRQKVEVTIIPINGQIIRAEDVEDDLYAAIDIVCDKLSRQVVKYKTKVKDKVQNNKSIRFENLDFIDNSSEFDDYDYDDEEDENIVIERRKKFNVKPMSSEEAILQMELVGHNFYMFRNQDNFEINIVYKRKAGGYGLIEQD >CP012312.1|AXU76291.1|2773096_2773333_-|sporulation-protein-YqfC MLEISTDLQVNQPVITVTSNTFISIENYLSILEYEVDLIRIKTKVKTIKISGDKLSLKYITDSEIGIKGIIYNVEYVD >CP012312.1|AXU76290.1|2771740_2773084_-|stage-IV-sporulation-protein MISFIRGYYVIVVEGVGLEQFLNHLIRNGISVYNVTRIKNTKMEFHIDRQDIKEFKNVYRGSKFDIKVKQKTGVPFIIKRVYKHKGMWICALVSLFLLMSTSQFVTDVYIQSPEGIKKEALRNELYKVGVRPGVYKKSIDRKEVRDHMMSKFNDVAYLSINVKGTNIFVTVTKKAESLKSTDQSNYCNVIALKNGIIEKVIPRSGKSVIKSGDIVQKGDVLLNGANTKSIPEVWASTFYESTKKASYVDTVNKKTGEKKNIYTLSFYDKEFTMRKNIKYKDYVVENKEKKLSIGNYTFPIKIKTSTFYETKKVEVKKNKEELKKELSEKALKELEYIIPASARIIDVKHNFKVNKNMLEYLITVQTSENIAKIYPLSKSEAERFIKEESKPDEGEEEVPSNPEKRPLNDIRNEFDEDNKDNKDQNNSDENNSNQNSNNSQNNNSNNN >CP012312.1|AXU76300.1|2779583_2781992_-|ATP-dependent-helicase MENIMQKEILAKSYNLRTNQQEQTLVEHIKDLFEVLESILELNLYSDKDVEILKICCVLHDLGKINSIMQQKMEINNKISYSCSEEERKKLESDKKSLKKIARHNIFSGAFLKDILEKMNLSEEDKLYIYKSIMLHHGNYEDYMRLSTSKVQEEIYEYIEKGILEKKEFNLKDIESYINDILNVDFKFGEDVLDYDYIDKLSESIFIDSDYNNGQIDDSVLNYRKFKYILYKGMLNLIDHSASSRQKGIKFYNNFTDEEIDNMILSEIYKSQGNLEKNNIKFNTIQKRLRELSGRNVLTVAFTGSGKTAADYRKTFKRKFFLVPNKISAESFYRKNIFQNKNDLDTRNSNDYIGLLHGDINLYSENEDNGEHDFVLTLRDIDLSVNFCKPCVIATVDQLLLSMFKFPGYEKIFAAVKNASITVDEVHLLEPKMFLILIYFMQFACKYLDVDFHLMTATLPKSYKEQMINKGIIFQEESNENVTDKGEIVFIESNKEEEICEGKDVKVSFIKEKEIKSIVEDALENKQKILIIKNTIDSVNRTYEFLKENLSDKYGGVDIDVLHSRFKFKDKKEKYSKILNGEGDIWISTQSVEISLDLDFNIIISDLATMDSLIQRMGRCNRNNKYEYGNFYILPSEDKIYDNKLKSTTKNILKDILKTNSIFTMGIRKTILDDYYDNSVVKKYFEENFISCDKEIKNIYGINKEIFDGLDLIFNFEPYKNIVDSKKEAAKIFRNVDVSYKIILEEDFYKEDRELQQDSIQVSGFIFNRLYYYGLISKVEGYMVLKSSSKFEYNSTVGLILK >CP012312.1|AXU76301.1|2782018_2782816_-|CRISPR-associated-protein,-Cas5t-family MKVLQCKLKQPTAHYRDPKVFQNEYISTLNLPSKTTIMGMITYLCDRRLKSDIDIGIIGTHHHRELEFSRGENIDFWNEYIKMGKGKDKEKFLLKGNYYDYYKEHKAQNSILNYEVLKEVELTIFISCKDDEELEFIRKKLESPCKYANLGRKEDFVIPSEKGCFVKEVELKEVIPMNTRDAIKENIKLKNTYVRVDLRDKENVETIINQGVLIALPHKYKDLEANRDDRVYEFCHYIYVDNDGIYPKNIKVNVCIDTKEVFTWL >CP012312.1|AXU76302.1|2782831_2783851_-|CRISPR-associated-autoregulator,-Cst2-family MNEKRVKGVTLTILTESPVPLSYDQGYGNYTPIKKEQYREKIHAKTSIATITYDLRRMLHQEYGWNLSNIIFGKKGNIYPSIKKNVGCVDENGLETDVFGYLIPLKDKGSISKASPLRIIPFRSLNPYIGSTQLITNRGFLSSEFGRKYYDEKEENEVPRDENFPTSQALAIEETLSDYYVYTITLELDRIGVVEVEVEDGKLLLPEERKFMSKELREKAVKDILDAITVFTRNIKHSSVLLKPLAVMGGAFDKVVPFFWNDVDYNADSGEINLEGVIETIESYSLKESNTILAINDRLKISNKKELNKFNLSKYPVKEIKNLADRLEIGEDNMWYLKE >CP012312.1|AXU76303.1|2783869_2785345_-|hypothetical-protein MREIKAKFYRSGDIVRDIGIVYFYELLMDLKNELEKNGYKLKFTCELNRNYLSLESAENIDPKYISDYILENQLFKVFKNGKKEALEKIFNNIDNLTYVNFIEELDKSSATAKQKEDIKKDFKNRRFPYVRNSGKYGLNTSLENMETNVKRIVDTVIKSNIEIDEIDKLNLKQYEEKDSVCNVCNINKTTKLDIDLRERKDSKYNFLFRGAEKSGFKRSGQVESNICFECEFFNLMCLLYINLKRPMVFAYTNDLRELAFLNHKIMLKRKMYSDKSFYKKLLHEKISSIRLYRFDIDTNKGIILKFDSIIEYKELLKKIELIDIIDNYNFSREPGNTKNLGKKMIDNGNLSNLKELLLDNISFLKPSNGTSREMDFVSSSYNIGLYIKLCWIVDGGEEYKMKNYMESNLIYSRVGKDLFNKMTDESRRKNFSMKVIQLLKSNDRTQLFQTIMHVLVSNGILIGDGFVEGLMQSSELELNTNVGLFIQEIMK >CP012312.1|AXU76304.1|2785349_2786087_-|CRISPR-associated-Cas-family-protein MSRISIFMESCNGKFPNENSMLSVSFIKNILNAENKYFAKNIFNYGEERKNNKQIKDINTAIYIPNLIRSKNELLVDGDIIFNISFYNYSMFSKLYNGILKVKELEYKGYRFKIKNIKIHKEHEIKENGVIFKTMSPIIVKNKEGKYLDVEDSNYIECLNYIANLTLESIRGSGLRKPLEFIPLNFKKRVLKEKIRGFKEREFYYINAYAGTFFLKGDMEDLNALYKMGIGYRRTENAGMVDILK >CP012312.1|AXU76305.1|2786187_2786364_-|hypothetical-protein MNLNRIKEIIKKGLKKFMKVVVNLFCNKLFHRMLYVISISVVVKITMDINLYISILKY >CP012312.1|AXU76306.1|2786817_2787927_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSEVILKNISKLYSNGFNAVKNINIDIKDKEFIVLVGPSGCGKSTTLRMIAGLEEISEGELYIGDKLVNDIEPKDRDIAMVFQNYALYPHLSVYENMAFALKLRKLPKDEIDKKVKEAAKILDLLPLLNKKPKTLSGGQRQRVALGRAIVRNPKVFLMDEPLSNLDAKLRTAMRTEITKLHQQLGTTFIYVTHDQVEAMTMADRIVVMKDGVVQQIATPQDVYDYPANIFVAGFIGAPQMNFIDVILIEENDKIYAQNEHIKLKLNKEKHYDLIKDNYINNEVVIGIRPEDIHVEDTFIKSNPDTCFKSRIEIKELMGAETYAHLKLGENTITIRFDSKNRINVGDDLTLSVDNSRVHIFDKETTLAIR >CP012312.1|AXU76307.1|2787956_2788724_+|sugar-diacid-utilization-regulator MEELKDFLERQLNKKINIYPYENQKLDASSHLVTFNNSIYVIDFLDKNNLDNLKGNFYLIYQSHIEFEYLKNIFYNLFEDINIIQHNGFFIVNSKYNLDINVTTQNIIETETYQSTYIFYLGELDSKADFDFRLQLCSDLLPHIIKDNAENKFLNLFDLIRYKTLDLINEDNILNKLIDFNKIKSIDEELLYTGLKFINNDLNISKTSTSMFLHRNTLVYRLEKINEILGFDLKNFENAMIFYLSVKSYFLYKKI >CP012312.1|AXU76308.1|2788911_2790285_-|transporter MGKTNARRTLFLIAIGSGTMLNPLNSSMISLALHSIQNDFHISFTTVSWIVSAFYLASAIAQPVSGKIGDLIGRKVLFLSGLMLVILSASIVPLVQSFFILIFIRVIQAIGTSTLYPSGVALIQNNIKERQSSALAVLTIFASTTAGLGPTLGGLLLDLGGWHAIFLVNIPVVLVSICLGYFLFPKEVKEKKSIKETLKNVLSRLDIIGILLFSIAMIFILLFLLSMKESFNLEQLVFGIILMYLFIWHELRTKLPFIDIKLFVSNPKLSKVYLQFIILNFFNYILFFGLPSYFQDALHYSAKSTGLFMLFMSGIGIFISPLTGRWIDKSGTRFPLVTSSIFMFISAVLLSVVFIHIPVIGKGIILSLAGISYGVGNVALQSSMFEESPRDSIGTASGLFQTSRYLGSILATVLLGMVFEVNITSEQFQILGYVMVVLGTISFLLNFILKKELRKVE >CP012312.1|AXU76309.1|2790320_2791256_-|glucokinase MYYIGVDIGGTGIQAGVVDNYGKIIFRSECKTVIEKGFEGILNDIKIMIYKLLEDNKLTMSDIKSIGFGVPGFINKEGLVTCVNLKWNKKAFNKELKRRFPDVEIHGENDATVAALGEAKFGSMKGANVGVLYTLGTGVGGGIVINQKVFSGAHGLGSEIGHQIIGENYFNCNCGNNGCVETFCSATAIIKYSQKLIEEGEKSRILDLAEGNLENVNAKMVFDAYRENDLVAIKVINRFKEYLAKTFANTINSLDPEIISIGGGISKSSDIILDGIEDLVRKFVLYKTEDIATITCATLGSDAGIIGAAFL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012312_13 | 2867718-2868007 | Orphan |
I-A:NA
Consensus repeat of CP012312_13
|
4 spacers
spacers of CP012312_13
>13.1|2867741|45|CP012312|CRT AGCACCTACCACAAAAGTAAGTGTTTTTCAGTATTTTTAATTTTA >13.2|2867809|43|CP012312|CRT CTTAAAGCTACATAATAAAAAATTAAGAAAAAGAAAAATTTAC >13.3|2867875|43|CP012312|CRT ATTTATTGTCAGTACCTGCACTTGACGACACATAAGTATTTAC >13.4|2867941|44|CP012312|CRT GCGGAAGGAGAACTTAATTTTTATTTTGCTAAAGAAGAATTTAC >13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR CTTAAAGCTACATAATAAAAAATTAAGAAAAAG >13.6|2867878|33|CP012312|PILER-CR ATTTATTGTCAGTACCTGCACTTGACGACACAT >13.7|2867944|34|CP012312|PILER-CR GCGGAAGGAGAACTTAATTTTTATTTTGCTAAAG >13.8|2867809|37|CP012312|CRISPRCasFinder CTTAAAGCTACATAATAAAAAATTAAGAAAAAGAAAA >13.9|2867875|37|CP012312|CRISPRCasFinder ATTTATTGTCAGTACCTGCACTTGACGACACATAAGT >13.10|2867941|38|CP012312|CRISPRCasFinder GCGGAAGGAGAACTTAATTTTTATTTTGCTAAAGAAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012312_13
The CRISPR arrays of CP012312_13 >merge|CP012312|13|2867718-2868007|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GTACACAGGTTTGAATATAAAAAAGCACCTACCACAAAAGTAAGTGTTTTTCAGTATTTTTAATTTTAAGTCCATATAGTTAATATAAAACCTTAAAGCTACATAATAAAAAATTAAGAAAAAGAAAAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACATTTATTGTCAGTACCTGCACTTGACGACACATAAGTATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACGCGGAAGGAGAACTTAATTTTTATTTTGCTAAAGAAGAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC >CP012312|13|10|2867718-2868007|CRT GTACACAGGTTTGAATATAAAAA AGCACCTACCACAAAAGTAAGTGTTTTTCAGTATTTTTAATTTTA AGTCCATATAGTTAATATAAAAC CTTAAAGCTACATAATAAAAAATTAAGAAAAAGAAAAATTTAC ATTCCATATAGTTAATATAAAAC ATTTATTGTCAGTACCTGCACTTGACGACACATAAGTATTTAC ATTCCATATAGTTAATATAAAAC GCGGAAGGAGAACTTAATTTTTATTTTGCTAAAGAAGAATTTAC ATTCCATATAGTTAATATAAAAC >CP012312|13|10|2867779-2868007|PILER-CR AATTTTAAGTCCATATAGTTAATATAAAACCTT AAAGCTACATAATAAAAAATTAAGAAAAAGAAA AATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACATT TATTGTCAGTACCTGCACTTGACGACACATAAG TATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACGCG GAAGGAGAACTTAATTTTTATTTTGCTAAAGAAG AATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC >CP012312|13|11|2867780-2868007|CRISPRCasFinder ATTTTAAGTCCATATAGTTAATATAAAAC CTTAAAGCTACATAATAAAAAATTAAGAAAAAGAAAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC ATTTATTGTCAGTACCTGCACTTGACGACACATAAGT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GCGGAAGGAGAACTTAATTTTTATTTTGCTAAAGAAGA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC
>CP012312.1|AXU76374.1|2867160_2867421_-|holin MDNLISFIPEQLLLLVVALNVLGFGFKKYKQLDNKYISVILLALGIVFSIWMLGFNPSSILQGILCWGVAIGANQVYKQLKDGEKQ >CP012312.1|AXU76373.1|2866366_2867164_-|phage-related-cell-wall-hydrolase MKIAIVPGHTLSGKGTGATGYIDEGKENRILTDLIVKWLKQGGATVYTGKVDKSNNYLAEQCQIANKQNVDLAVQIHFNANKTTLNPMGTETICKTNNGKVYAERVNKKLSTIFKNRGAKSDVRGLYWLSHTKAPAILIEVCFVDSKADTDYYIRHKDIVAKLIAEGILNKKIDNDGVKLMYKHAIVYDGEVDKIPATVVGWGYNDGKILICDIKDYIPGQTENLYVVGGGACEKIGSMAKENYTLIKGNGRFDTLYKALDFIDR >CP012312.1|AXU76372.1|2866183_2866345_+|autoinducer-prepeptide MKKILYNFMKACGVLAMFVAFLSANTTSLWHVYQPKTPEKLKNSKNHQKEGNN >CP012312.1|AXU76371.1|2865584_2866166_+|accessory-gene-regulator-protein MIKSCADKIAFLFVLNQVIEKDDLEICSYGLEILLSSIINTLSSLMIGLILGRLIYSIVFLISFCIIRQFSGGYHANSNKNCILIFNSIFFISMVLGTILNNSNPIPLFLVILSSFNFLIIFIFAPVCHTNNPLNETKYKKNKLLSRTISITLFLIILLGCKYLSFYNYVVYTFLALLWINLLLIIQIIINKK >CP012312.1|AXU76370.1|2864219_2865542_+|two-component-sensor-histidine-kinase MLDMFITIVSSIIEIWACKKVFDYTSKVKTSLINLYFLISTFIIISTFYTNVGADNRILICIFVMFVFYKSNYDVNIYKCLIVLFSYWAILVCINALSMIVIVSINNLSSMNILLNDNFYRYETIVLGNVVLIVLLCIYKFISNDLQVTKKEIYMCIPIVANMISFFIFYKYILKLLDISSATRLDILIMVLLLTFSNIVLISSLVKILKSNKKYIELTKLQEKINAENKYYSNIKKYYIKTKELNHDMKNHLICIKEMNKKNIDTSNYINNIEKKLDEYSAVFDTGNITLNIILLEKKELCIEKGIDFTININFSDCNFIKEEDTCSIFANALDNAIEACEKIKDDDKKIKLQGMVLNKFFVIKITNTKSNDILLKNNAFLTTKEDKEFHGLGIKSIKNSLEKYDGAISINFSENLFCLNMMIPIRKSQEDSNIAYENS >CP012312.1|AXU76369.1|2863573_2863774_+|cold-shock-protein MNNGIVKWFNNEKGFGFISMEGRDDVFAHFSAIQTSGFKSLEEGQQVSFDIVKGARGPQAENITIL >CP012312.1|AXU76368.1|2863171_2863348_+|hypothetical-protein MFGNKMDKCTHVLTAYISSSYDYCNFLDTQLDDFILEYGENIVESCLHQVMVLISKYN >CP012312.1|AXU76367.1|2862408_2862792_-|regulatory-protein MLNKKLPDIELKIMKYIWSTGYKTVISKDVADEIEKTYGWKHTTTITLLVRLTKKDFLISQRIGKHVHYRVLIKEREYLKIEGKRIFGGLHNNPLSELILKLHNEEEITEEKIIEIGSWIKSWKDED >CP012312.1|AXU76366.1|2861229_2862225_+|L-asparaginase MSIKKKVAIVFTGGTISMTVDDKVGAAIPTLSGEQILSMVTNIDKVADVEVFNFDEIPGPHITPYRMMELKNYVNDLLARKDITGVVITHGTDSLEETAYFLDLTIDNIKPVIVTGAMRSSSELGYDGSSNLSASVCTAVSKDAMGKGVLVVLNNEVLLASEATKTNTLSLNTFKSLTSGPLGIIDCNELVLTRDIVNRTIIDTDKVESKVALFKAYVGENADFIRFAVDSGYKGIVIEAMGRGNIPPQMLSGVEYAREKGLPVVIVSRCHSGRVFDSYGYFGSGRDLKNLGCIFGGDLPGQKARIKLILALGKTDNLDEIKDFFEKGIYC >CP012312.1|AXU76365.1|2859480_2861109_+|aspartate-aminotransferase MKNHTYKEIKNIYGKISPFEFKDKLIDIAKYTAKENNRELLDAGRGNPNWTCSTAREAFFTFGHFAITETRSNWDLGHLAGMPQKKGIKERFFKFINENIDMPGAYLARDIINFGINELGFDGDEFVHELADGIIGDNYPLPDRMLPHMEKIVHDYLVQEMKYDISGKYGDVEIFAVEGATAAMCYIFDSLMANELLKKGDTIALMTPIFTPYLEIPNLPRYDFKVVNINANEVDEKGAHTWQYTKKELEKLRDKSIKALFVVNPNNPASIAMDETSCNNLIDVIENYNKDLMIISDDVYGTFVEDFSSLMSKLPYNTVGVYSYSKYFGVTGWRLGTFALHKKNVFDKKINDLTGELKKSVDKRYSDMSLNPSSLSFMERVVADSRLVALNHTAGLSTPQQVQMAFFSAFALIDKVDAYKKLNMSICHRRQKLLFEALELPINENKNNAAYYTQFDIEEWAKLNYGEDLFKFISKNASPVDVLYKLANDYSVVLLSGNGFYGPEWSIRISLANLYDEAYTKIGKAIREILNGYIVEWQKIKK >CP012312.1|AXU76375.1|2868292_2868451_-|hypothetical-protein MDNFLQGILASLSASLIVYVASKLFRKRKKPLKAATKSGWEFDLKIRFHKTK >CP012312.1|AXU76376.1|2868808_2870179_-|cell-surface-protein MKLKKVLSLGLVSMFVAGFPISANALDKIDKIQGADKYETAGIIADKQSYTTAILINADSTMADGLSASGLAGATNAPILLTKKNNIPNATLKRVEKAKKVYIIGGESSIDKATETFLKDKGIETRRLQGNDRIKTSYNVAKEINSINKVNKVILTNAFKGEPDAMSAAPVAVRDKAAIVLTDGKSVPFNTTGIESYAIGGTSSMSDSLVNDTNSTRLGGVDRYDTNKKIVNKFYNGAKEFYIASGTDLVYALVGSPMAKNNPIVLVDIGSNKDILKNAAKVTGIGNLSDKIMLECENTINNISLPSSNKNIICGLKIDFDSNHIIWQDKGSYLECYDDNLEYYTEKYKDPTVPINIENTSTQNLDVTKLKVYGEANSTLYMGQYAKIKMDFNSFGVLKPGEKCTIYLDIISLDPSRSMTLTFSYVGDKENYKYEQGLASRILFYNPDGEDFFEYK >CP012312.1|AXU76377.1|2870577_2871000_+|integrase MTFVERCYKYIDMNKNNWSPYTVTNTKSWVKNYIEPFFKNLKLTEVNPSSVQAFVNYNFNNSTFTSAKVRYSFLSSVISEVYRLREIQENSCDFIKLPSKEKYSTNEIYNREEVLLLIEKLLGNNIEIPILLMLLLGLRM >CP012312.1|AXU76378.1|2871270_2871960_-|vanZF-protein METVSNNQSGVEIQLSLFEAIKDLLLINPIFLLGIILIGISLIVIFKKDSDIPKVKTSILSLAMYYYLCLTLSHIVGIPTFSEYIRLSQLGETFFNPNISFIPFSDGFSLSFILNILLFVPLGFLCPLISKTFERLRNTFLIGFGLSLFIETIQLFTLHRATDINDLITNVIGTIIGYFCFKLIAKLRIVKLHSDDDSMEQDYTVCIPIAIIIVALILGFFCKIVKRFS >CP012312.1|AXU76379.1|2872841_2875262_-|leucyl-tRNA-synthetase MSVYNFKEVESKWQKIWKDNNQYKMDTAQTEKPNYYTLEMFPYPSGKIHMGHVRNYSIGDVVARFKKMEGYNVLHPMGWDSFGLPAENAAIKHGIHPHKWTMENIEEMKEQLNLLGISYDWDKEVATSTPEYYRFTQEIFLKFLEHGLAYKKKSYVNWCPSCETVLANEQVVQGACERCKATVLKKDLEQWYFKTTEFAEELLNDLDTLDGWPEKVKTMQKNWIGKSTGADLVFDIDGTDKSMTVFTTRPDTTYGVTYMVLAPEHELVKELVAGTEYEADVEAFVKKMHTMTEIERTAADVEKEGMFIGRYVINPLNGKKVPLWIANYVLVEYGTGAIMAVPAHDERDRDFAEKYNLDIIDVITEDNKMINSEEFNGLDASEGFEGIIDKLEKEGRGKRTINYRLRDWLVSRQRYWGCPIPVVYCDECGIVPVKKEDLPVLLPTDVEFTGKGESPLTTSKQFMSTTCPHCGKPARREVDTMDTFVDSSWYFLRYVDSNNENEPFSKELVNRWHPVDQYIGGVEHAIMHLLYARWFVKAFKSMGMVDFNEPFKNLLTQGMVLMDGSKMSKSKGNTVSPMDIIDEYGADTARLFVLFAAPPERDLDWSEQGVDGCFRFLNRVYRLVDELADVVKKDVEFGELNSQDKDMRYTIHSTLKKVTADLSEKFGFNTAISALMELINDMYKYKELDNINEAVIKEGVQTIVTIIAPFAPHLGEELWTMIGKEGSVFDIDWPKYDEKALVKDEIEVVVQVNGKVRGKLTVNSNISKDEMEKVALEDEKIKGLVEGKTIVKVVAVPKKLVNVVVK >CP012312.1|AXU76380.1|2875615_2875966_-|iojap-family-protein MTVEQMTKIAYDAIEDKLGQDTVIINIGKVSSLCDYFIITTASSQRQVKAIADNVEDELAKLGLEPRGKEGQGTQTWVLLDYGDIMVHVFNEENRGFYNLEKLWKDAPYIDIDTLA >CP012312.1|AXU76381.1|2876082_2876655_-|metal-dependent-phosphohydrolase MNLENINQRLNQMLPVGRLSHSKNVAKCAEKLCEIYGCDKEKAYLAGMIHDCAKYLSDKEIEDYVNKYEIYLDPIEDGNRSLSHSVIGAYICEYEFEVEDEDIINAIKYHTTGREDMSLLEKIIYIADLIEEGRKFPVVDTLRELAYGGKLDEALLTSFNNTLMFVINKKEEIHPRTVMARNYLIKEKLL >CP012312.1|AXU76382.1|2876655_2877345_-|nicotinate-nucleotide-adenylyltransferase MRSENLVKMAELKNTEKLEKFNRHKGKIKIGILGGTFDPIHYAHLATAEFIRDKYDIDKIIFIPSGNPPHKLCITTDKYDRYNMTLLATESNEDFLVSKVEIERKKRTYTIDTLKYLKKKYKNADIYFITGADAICSVEEWKDVKKNFELATFIAATRPGISLLRSQETIEKLTKKYNADIITVYVPSLDISSTYIREQLNEGKSIRYLVPENVENYLYENKLYQYGDD >CP012312.1|AXU76383.1|2877620_2878259_+|recombination-regulator-RecX MGIITKIEQQKRNDDRVNIYVDDKFFIAIFKELVYTFNLKKGNEINEEELKPILDDEMYIKAKNKALNILSHADQSEKKLKEKLSSEFDENIVERVIDFLKSYNLVNDSVLAQKIVNTNVNLNKCGKNRIKQNLYNKGINRSTIDEAVSELDKDTEFENAMYLAKKRYERVKKEDKKKIYQKISQHLSYKGFDYDIIKRVLNKLLNFDEYDI >CP012312.1|AXU76384.1|2878411_2880415_+|glycogen-branching-protein MKSQKRFKILDIDVYLQPFESDIKKRMKHYEDMKSKTLKNYKDFSSFANAHLYYGFHQTNDGWFYREWAPNADSLSLIGDFNNWNRKSHLLRKIGSGNWEIFIPGQNSLPHKSEVKVQVTANGKTFDRIPLYIKRVIQKDFGGFNGQIWQPKTPFIWTDNDFDLKNITSPLIYECHIGMSTESESIGTYNEFTEKILSKIKKAGYNTIQLMAIMEHPYYASFGYQVSNFYAISSRFGTPEDLKNLINTAHSMGIAVLLDLVHSHAVKNTLEGINEFDGSEHQFFHSGSKGNHPAWGTKLFNYGKPEVIHFLLSNIKFWLNEYHFDGFRFDGVTSMLYRNHGLGVSFDSYEKYFSMNTDIEAITYLQFANELIKEINPNSISIAEDMSGMPGMCIPIKDGGIGFDYRLAMGVPDFWIKTISNLSDEDWDLGKMWYELTTRRPGEKNIGYCESHDQALVGDKTIIFWLADKEMYWNMEINSNNHVINRAISLIKLIKLITFSLAGEGYLNFMGNEFGHPEWIDFPREGNNWSYKYARRQWSLSEDNNLKYKQLLNFDKSMLELTKYSDIFIQNSHELIHMDNDKKILVYSKGKYLFIFNFHPNLIQSVDISKFQNTNYKTILNTDMVEFGGNTKKENLRDYDVYFSSTPPSSKMPIASRTAIVLLNNGV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012312_19 | 3722266-3722469 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP012312_19
|
1 spacers
spacers of CP012312_19
>19.1|3722315|106|CP012312|CRISPRCasFinder CATATTGTTTATTATTTCATAGTCCTTTCATCATATAAACCTATTAAATATTATCTTATTTATTGGTATATGGAATTATTTTGTTTATTATTTTATAGTCTTTTCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012312_19
The CRISPR arrays of CP012312_19 >merge|CP012312|19|3722266-3722469|CRISPRCasFinder AATATAATCATTTCTCTTAAAGATTATCTTATTTATTACTATATGGAATCATATTGTTTATTATTTCATAGTCCTTTCATCATATAAACCTATTAAATATTATCTTATTTATTGGTATATGGAATTATTTTGTTTATTATTTTATAGTCTTTTCATCATCATATAAACCTATTAAATATTATCTTATTTATTGGTATATGGAAT >CP012312|19|17|3722266-3722469|CRISPRCasFinder AATATAATCATTTCTCTTAAAGATTATCTTATTTATTACTATATGGAAT CATATTGTTTATTATTTCATAGTCCTTTCATCATATAAACCTATTAAATATTATCTTATTTATTGGTATATGGAATTATTTTGTTTATTATTTTATAGTCTTTTCA TCATCATATAAACCTATTAAATATTATCTTATTTATTGGTATATGGAAT
>CP012312.1|AXU77062.1|3721396_3722152_+|dihydrodipicolinate-reductase MLKVIISGYNGTMGRVLAECVKKDNELELVCGVARSADEKGHHSDTKLYKTMTDVTEKADVIIDFSHHETLEPILSYALKNNTPVVLATTGYDENDLHKIEEASKNIPILLSSNTSLGVNILIKLVKDASKMLEGFDIEIIEKHHNRKEDAPSGTATMIANAIKEVLPESENTHGRYGRDCKRKPNEIGIHSIRGGNIISDHDVIFAGDNEVLTLNHHSQSDEVFANGSIIAAKFLIGKQSGLYKMSDILG >CP012312.1|AXU77061.1|3719967_3720957_-|somatin-like-protein MLKEEKTYQEKEAKVFNGVAALIMIVLFLVVSIGIMVFGIVKLDSGFTGIGSLMLILGLIFIVVDFILFFGLKMINPKEAIVLVLFGNYYGTIKKEGYYWVNPFCSAINPAASRINVSKSSSEEKVDISTNSRGKKVSLKTMTLNNEKQKVNDLLGNPIIIGVVVIWKVIDATKAVFNVDNYNTFLSIQCDSTIRNVSRLYPYDVSEDGDEKSLRGSSQEIADRLKDELQSRVDIAGIEVSEVRITHLSYAPEIAAAMLQRQQAEAIIAARKKIVEGAVSMVEMALTNLSENNVVTLDEERKAAMVSNLLVVLCGNKDAQPVVNSSSIY >CP012312.1|AXU77060.1|3718788_3719505_+|2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate-N-succinyltransferase MVNLNDAYEIARYIKEVKKKTPVKVYVNTNSLHFQSTDKFKVFGSNGSYIFVGDYEDIMEVLDKHGNDITDTHVEYDRRNSAIPLKNTLSEHARIEPGAIIRDMVTIEKNAVVMMGAVINIGAVIGEGSMVDMNAVIGARGTLGKNVHLGAGAVVAGVLEPPSATPVIVEDDVLIGANAVILEGVRIGKGAVVAAGAVVTTDVEAGAVVAGSPAKVIKMKDEKTADKTKLMEDLRNLD >CP012312.1|AXU77059.1|3717820_3718570_+|dihydrodipicolinate-reductase MLKVIATGYDGKMGKILADTIREDNELELVCVAARGLDSYEGDLKIYEDMSTIVEEADVVIDFSHHSNLDNILSYVLKTKTPLVIATTGYNDDEMNKIREAAKVIPVFQSYNMSLGVNVLVKLVKDAAKLLEGFDIEIIEKHHNRKVDAPSGTAVMIANAIKEVLPNVENNYGRYGRSAKRQPNEVGIHAIRGGNIVGEHDALFAGDNEVLTISHQAQSRGIFASGSIAAAKYLVKQKPGFYNMDSMLG >CP012312.1|AXU77058.1|3716866_3717754_+|dihydrodipicolinate-synthase MIFKGSAVALVTPFTKDNKVDFDKLGELVEYQIANGTDAIVSCGTTGEANTMTDEEQLATIKYVVEKVNKRVPVIAGSGSNDTMHSVNLSQEAEKLGVDALLIITPYYNKANKAGLKRHFETIANSVKLPIILYNVPGRTCVNISPSLIVELAKIDNIVAVKEASGDLGQVAEIASLVPDDFAIYSGNDDTILPLLSLGGQGVISVLANVCPQETHDLVAKFFEGDIEGSRKLQLGMDALIAALFIEVNPIPVKTAMNLLGFNVGDLRLPLAEMDPANLEVLKKELVNFGLKVNA >CP012312.1|AXU77057.1|3715748_3716750_+|aspartate-semialdehyde-dehydrogenase MKKVNVAIVGATGMVGRTFLKVLEERNFPIENLFLFSSSKSAGSKVMFCGKEYIVEELKETSFTDRGIQIALFSAGGSISEKYAPIAASNGILVVDNSSQWRMNPDVPLVVPEVNPEAIKNHKGIIANPNCSTIQAMVPLKALDDKYKIKRIVYSTYQAVSGSGVKGVEDLEKGMNGNPTGFYPHQISYNCLPHIDSFTENGYTKEEMKMVNETMKILDNYDLKITATTVRVPVKNGHSESINVEFNNPFELDDLVKTLEEAPGVVVVDNPAKNEYPTAVEFDDRDEVFVGRIRRDFSVDNGVNLWVVADNIRKGAATNAIQIAEMALSYDLV >CP012312.1|AXU77056.1|3714437_3715319_+|dihydrodipicolinate-synthase MLFKGSAVALVTPFTEDNNVNFEKLGELIEYHIENGTDALVVCGTTGEATTMSESEIFAVIKYTVEKVNKRIPVIAGTGSNNTMLSVHMSQEAEKLGVDGLLIITPYYNKTNEKGLKLHFETIANSVKLPIILYNVPGRTKVNIKPSVVAELAKIDNIVAVKEASGDLAQVAEIAKLVPKDFAIYSGNDDTILPLLSLGGSGVISVLANICPKETHDLVTKFFEGDIEGSKKLQLDMDALIAALFIEVNPVPVKTAMNILGFNVGDLRLPLAEMEETNLNVLKQELTNSGFKF >CP012312.1|AXU77055.1|3712921_3714115_-|L-serine-dehydratase MDTLKELFKIGSGPSSSHTMGPQRAAERFKNENPDAESFRAILYGSLAATGKGHLTDYIIEKTIAPKKVEIVWEEDIIKDFHPNGMKFEALDKDKNVTAEWTVYSVGGGTIAEEGQRNSKSNSIYHLDTMDEIVKWCKENNKTLVDFVLECEPKDIKDYIKTIKDAMRKSIDDGLSTDEIIPGKLLLKRRASTFYNAYKKDKSFSTLVYAYALAASEQNASGNIIVTAPTCGSAGVIPGIFFAMQDFYNYDDEKIIEALLVAGIIGNIIKTNASISGAEVGCQGEVGAACSMAAAAVAYLKGGTIDHIEYAAEIALEHHLGMTCDPVYGYVQIPCIERNAMAAQRAYDAANYALLTDGSHSVSLDQVVETMKETGIDMMDKYKETAKGGLAKHFFSC >CP012312.1|AXU77054.1|3711597_3712716_-|amidohydrolase MREASYLQEQLYKHRKSLNPIAEIGRKEYKTSKYIRDYLDKLGIEYEVYLETGIVGVIEGKRPKKDIAFRADIDGLHSEEGVKHLCGHDGHATILLGLIEYLNDNKEDLNDNIVFIFQPAEEGPGGAKALIDEGVLRKYNIDEIYGLHIYPELPEGYVGTREGYFMAQIGDIDIEIVSKSGHGAMPQNGIDGIVIASNFVSSLQTIVSRNISPIDNAVLTIGRIEGGARRNIIAENIKMEGTMRCFNPEVYEKMKLRVRELARGFELAYNCKVNINIIDDYIAVKNDKDLYQEFVEAIGSDTVVELEPLMISEDFSYYQKEVPGLFFMLGSRNEEKGFVNGLHNINFNFDEKICVNALNVYSKLLKYKEAID >CP012312.1|AXU77053.1|3711221_3711467_-|small-acid-soluble-spore-protein MKEKIQREKKITNGKNTKILTNDDIMKYEIASELGLMDKVGERGWAGLTAKEAGRIGGMLTSRKKRLKKIVEEQNKKDESI >CP012312.1|AXU77063.1|3722584_3724252_-|exosporium-glycoprotein MSDISGPSLYQDIGPTGPTGPTGPTGPRGATGATGANGITGPTGNTGATGANGITGPTGNMGATGANGTTGSTGPTGNTGATGANGITGPTGATGATGANGITGPTGNKGATGANGITGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGATGATGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGVTGATGPIGNTGATGSTGSIGATGANGVTGATGPIGATGPTGADGEVGPTGAVGATGPDGAIGPTGNTGATGATGANGLVGPTGATGATGANGLVGPTGPTGATGPDGAIGPTGAVGATGPTGADGAVGPTGATGATGANGATGPTGAVGATGANGAAGPIGPTGPTGANGVAGATGATGATGANGATGPTGAVGATGANGVAGAIGPTGATGANGATGATGATGATGANGATGPTGATGATGVLAANNAQFTVSSSSLGNNTLLTFNSSFINGTNITFPTSSTINLAVGGIYNVSFGIRAILSLAGFMSITTNFNGVAQNNFIAKAVNTLTSSDVSVSLSFLVDARAAAVTLSFTFGSGTTGTSPAGYVSVYRIQ >CP012312.1|AXU77064.1|3724430_3724970_-|hypoxanthine-phosphoribosyltransferase MDIETKKWEVLYSEEKIKDKLRELGAIIEKDYKDKNLMVVSLLKGSFIFCADLVRNINLPLRVNFMTTSSYGNNEESTGKVKVVSDVTTDIAGYDVLVVDDITDSALTMDFVLKHLKAKNPASLKCCVLLDKPSRRKVDLVPDYCGFEIEDKFVVGYGFDFGDYYRNVPYIFNVTDEDR >CP012312.1|AXU77065.1|3725297_3726605_-|serine-dehydratase-subunit-alpha MRDIRKELVEMLKAEVKPAVGCTEPVALALACAKAKELLGEEIVENRMLVSPSIYKNGMCVGIPGTERLGLKIAAALGIVGGHSENGLSVLETLTKEEVKIAEDYMDNTPLSITPADTREKVFIEVVLKGKNHIAKVRIRTKHDNFTFLEKDGEVLLDNEPKVSASNDVAEKAESLMDTVTIQELIKNVEEIDFKDIEFLLDGVKMNEEMAEYGLKQKTGIGVGYGIKKSIEEGLLGNDVINYAMMLTAGASDARMAGVKMPVMSSNGSGNHGLTAILPIVAYNKKFPQSDERLAKALAISHLVTGYIKNYTGRLSAVCGCGVAASTGATAGISWLMNGTENQIEGAIENMIADLSGMICDGAKAGCALKLSSAASAAIQSAIIAKQDCFVPPLNGIVGSSVEQSIQNLGRVSDKGMSITDEIILNVMNDMNKVD >CP012312.1|AXU77066.1|3727016_3728783_-|sigma-54-interacting-protein MIGLEYIKSDIQNIAEAIVSVLNIDVTIVNKELFRIAGTGVYIDKIGEKVDKYTAFKKSLTEQITILIDDPKSSDICRECYKSGACVEFAEVCCPIICDGDSHGVIGLIAFTKEQAQIIENNKSGLINFLGKMADLISNKLKAQIKTYELELEKKKLETLLNNMDKAVVSIDVDGKIDKYNSKFKELFNIKDSITGKNIFVELDFIKKPSINNFKKDKSCSFFYKRYGYDSKGIYNINKIVLKNELKGYVIDFIDKRDAIKNYNKMNKDYRIKLENIIGESVAIRNSKKEALIASKSTSTVLITGESGTGKELFARAIHNHSNRVDNPFIAVNCAAIPDNLLESELFGYEEGAFTGAKKGGKLGMFEVAHKGSIFLDEIGDMSLHLQSKLLRVLQEKELNKIGSKSNVSIDVRIIAATNKDLEKMVQNGTFREDLYYRLNVIPIKLPSLRERKEDIPLIIKHMVKEYSKKLDKNVIDIDSRVVDAMMEYKWPGNIRELQNIIEYSVNMSSSSIITMNVIPQKIKNTSVEELEVKSDRIIPLDELEKIEIIKALNKYKDYKKDKELTAKALGISRATLYRKIEKYNIIS >CP012312.1|AXU77067.1|3728788_3728926_-|hypothetical-protein MEINYELIIIVMLFVILMSIQFTLNKIYLILKEIRQILMLKKNKE >CP012312.1|AXU77068.1|3729003_3729573_-|Methyltransferase-domain-protein MKSILCQINKQPVKAKYTSDELECFLDTIEYNVGDKILLVGHIGNLGKRLRGLGTSVTILENSNYEDVCYSLVYNENCNVVKGKLEFLPFDDNQFNKIIIVDQFNVITDCEKASSEIQRVLKGNGEVILEDLNLKNLKVKLNYLKHKFCGSVAKIHYPHEVFNIFSRLNFDGMIKESNKLKYIYVGKRR >CP012312.1|AXU77069.1|3729756_3730392_-|single-stranded-DNA-binding-protein MIAVKDENNVVNLRGELDNKLEFSHEIFGEKFYNMKIKINRLSDSFDILPMTVSERLLQDIDLDKQNLVNVVGQLRSYNKTLNNKNRLVLTVFVREIKSIDEENKDPNSIFLDGYVCKEPVYRKTPLGREITDLLVAINRPYNKSDYIPSIVWGRNAKFAKNLKVGDRIQLWGRVQSREYEKKIDENNVVKKMAYEVSISKIKKLDENNNE >CP012312.1|AXU77070.1|3731059_3731941_-|Sulfite-exporter-TauE/SafE MVAILKALYVVFAAIFAVVFGKDVAKANKEGKLEEQSTPKVAVTGFITDFFDTLGIGSFAPTIAMSKALKLNIPDKKMPGTLNVAHTIPVVTEAFIFTSIIPVDGVTLVSMVVAAAVGSYIGAGIIAKMDERKIQLVMGVTLALTAILMLLGHPWINVLPGGGNELGLTGAKLVIGVIGNFILGALMTAGIGLYAPGMAMVYFLGMSAKVAFPIVMGSCALLMPVASMKFIKEDAYTKKASVIIAICGLIGVFVAAYIVKTLPMDILKALVIVVIAYTSATMIMAANKNKKTA >CP012312.1|AXU77071.1|3732060_3733068_-|proline-racemase MKFSRSIQAIDSHTAGEATRIVVGGIPNIKGNSMPEKKEYLEENLDYLRTAIMLEPRGHNDMFGSVMTQPCCPDADFGIIFMDGGGYLNMCGHGTIGAMTAAIETGVVPAVEPVTHVVMEAPAGIIRGDVTVVDGKAKEVSFLNVPAFLYKEGVEVDLPGVGTVKFDISFGGSFFAIIHASQLGLKIEPQNAGKLTELAMKLRDIINEKIEIQHPTLAHIKTVDLVEIYDEPTHPEATYKNVVIFGQGQVDRSPCGTGTSAKLATLHAKGELKVGEKFVYESILGTLFKGEIVEETKVADFNAVVPKITGSAYITGFNHFVIDEEDPLKHGFILK >CP012312.1|AXU77072.1|3733087_3733561_-|PrdE-protein MGISTSMKNTSLHIFRDPLLDLIDNDSDIDLLGVVVVGTSEHNEWKTFLATRLGRWIESLRPDGVIITLDMAGNQHIDFTNAIAEFVKSDIPTVGLTIMGVDGLVITNPYLDKATIIDYKKTTGYIETEVVGDNHMDEVDVKKALAFLKLKMRKDAK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012312_1 | 1.17|411358|19|CP012312|CRT | 411358-411376 | 19 | CP012312.1 | 410449-410467 | 0 | 1.0 |
CP012312_1 | 1.21|411556|28|CP012312|CRT | 411556-411583 | 28 | CP012312.1 | 410449-410476 | 0 | 1.0 |
CP012312_3 | 3.1|1146027|31|CP012312|CRISPRCasFinder | 1146027-1146057 | 31 | CP012312.1 | 12391-12421 | 0 | 1.0 |
CP012312_3 | 3.1|1146027|31|CP012312|CRISPRCasFinder | 1146027-1146057 | 31 | CP012312.1 | 32077-32107 | 0 | 1.0 |
CP012312_3 | 3.1|1146027|31|CP012312|CRISPRCasFinder | 1146027-1146057 | 31 | CP012312.1 | 3111546-3111576 | 0 | 1.0 |
CP012312_3 | 3.1|1146027|31|CP012312|CRISPRCasFinder | 1146027-1146057 | 31 | CP012312.1 | 3901640-3901670 | 0 | 1.0 |
CP012312_3 | 3.1|1146027|31|CP012312|CRISPRCasFinder | 1146027-1146057 | 31 | CP012312.1 | 4042202-4042232 | 0 | 1.0 |
CP012312_1 | 1.2|410593|28|CP012312|CRT | 410593-410620 | 28 | CP012312.1 | 410449-410476 | 1 | 0.964 |
CP012312_1 | 1.4|410701|19|CP012312|CRT | 410701-410719 | 19 | CP012312.1 | 410503-410521 | 1 | 0.947 |
CP012312_1 | 1.5|410746|28|CP012312|CRT | 410746-410773 | 28 | CP012312.1 | 410449-410476 | 1 | 0.964 |
CP012312_1 | 1.7|410854|19|CP012312|CRT | 410854-410872 | 19 | CP012312.1 | 410503-410521 | 1 | 0.947 |
CP012312_1 | 1.12|411106|19|CP012312|CRT | 411106-411124 | 19 | CP012312.1 | 410503-410521 | 1 | 0.947 |
CP012312_1 | 1.14|411205|19|CP012312|CRT | 411205-411223 | 19 | CP012312.1 | 410503-410521 | 1 | 0.947 |
CP012312_1 | 1.17|411358|19|CP012312|CRT | 411358-411376 | 19 | CP012312.1 | 410386-410404 | 1 | 0.947 |
CP012312_13 | 13.1|2867741|45|CP012312|CRT | 2867741-2867785 | 45 | CP012312.1 | 1753980-1754024 | 1 | 0.978 |
CP012312_1 | 1.4|410701|19|CP012312|CRT | 410701-410719 | 19 | CP012312.1 | 2298811-2298829 | 2 | 0.895 |
CP012312_1 | 1.7|410854|19|CP012312|CRT | 410854-410872 | 19 | CP012312.1 | 2298811-2298829 | 2 | 0.895 |
CP012312_1 | 1.12|411106|19|CP012312|CRT | 411106-411124 | 19 | CP012312.1 | 2298811-2298829 | 2 | 0.895 |
CP012312_1 | 1.14|411205|19|CP012312|CRT | 411205-411223 | 19 | CP012312.1 | 2298811-2298829 | 2 | 0.895 |
CP012312_1 | 1.18|411403|19|CP012312|CRT | 411403-411421 | 19 | CP012312.1 | 410503-410521 | 2 | 0.895 |
CP012312_1 | 1.22|411610|19|CP012312|CRT | 411610-411628 | 19 | CP012312.1 | 410503-410521 | 2 | 0.895 |
1. spacer 1.17|411358|19|CP012312|CRT matches to position: 410449-410467, mismatch: 0, identity: 1.0
cgacaggaagtataggacc CRISPR spacer cgacaggaagtataggacc Protospacer *******************
2. spacer 1.21|411556|28|CP012312|CRT matches to position: 410449-410476, mismatch: 0, identity: 1.0
cgacaggaagtataggaccaacgggagt CRISPR spacer cgacaggaagtataggaccaacgggagt Protospacer ****************************
3. spacer 3.1|1146027|31|CP012312|CRISPRCasFinder matches to position: 12391-12421, mismatch: 0, identity: 1.0
agaataaactgaacgcatgtgaagtttgttt CRISPR spacer agaataaactgaacgcatgtgaagtttgttt Protospacer *******************************
4. spacer 3.1|1146027|31|CP012312|CRISPRCasFinder matches to position: 32077-32107, mismatch: 0, identity: 1.0
agaataaactgaacgcatgtgaagtttgttt CRISPR spacer agaataaactgaacgcatgtgaagtttgttt Protospacer *******************************
5. spacer 3.1|1146027|31|CP012312|CRISPRCasFinder matches to position: 3111546-3111576, mismatch: 0, identity: 1.0
agaataaactgaacgcatgtgaagtttgttt CRISPR spacer agaataaactgaacgcatgtgaagtttgttt Protospacer *******************************
6. spacer 3.1|1146027|31|CP012312|CRISPRCasFinder matches to position: 3901640-3901670, mismatch: 0, identity: 1.0
agaataaactgaacgcatgtgaagtttgttt CRISPR spacer agaataaactgaacgcatgtgaagtttgttt Protospacer *******************************
7. spacer 3.1|1146027|31|CP012312|CRISPRCasFinder matches to position: 4042202-4042232, mismatch: 0, identity: 1.0
agaataaactgaacgcatgtgaagtttgttt CRISPR spacer agaataaactgaacgcatgtgaagtttgttt Protospacer *******************************
8. spacer 1.2|410593|28|CP012312|CRT matches to position: 410449-410476, mismatch: 1, identity: 0.964
cgacaggaagtatagggccaacgggagt CRISPR spacer cgacaggaagtataggaccaacgggagt Protospacer ****************.***********
9. spacer 1.4|410701|19|CP012312|CRT matches to position: 410503-410521, mismatch: 1, identity: 0.947
taacaggagaaatagggcc CRISPR spacer taacaggagaaataggccc Protospacer **************** **
10. spacer 1.5|410746|28|CP012312|CRT matches to position: 410449-410476, mismatch: 1, identity: 0.964
cgacaggaagtatagggccaacgggagt CRISPR spacer cgacaggaagtataggaccaacgggagt Protospacer ****************.***********
11. spacer 1.7|410854|19|CP012312|CRT matches to position: 410503-410521, mismatch: 1, identity: 0.947
taacaggagaaatagggcc CRISPR spacer taacaggagaaataggccc Protospacer **************** **
12. spacer 1.12|411106|19|CP012312|CRT matches to position: 410503-410521, mismatch: 1, identity: 0.947
taacaggagaaatagggcc CRISPR spacer taacaggagaaataggccc Protospacer **************** **
13. spacer 1.14|411205|19|CP012312|CRT matches to position: 410503-410521, mismatch: 1, identity: 0.947
taacaggagaaatagggcc CRISPR spacer taacaggagaaataggccc Protospacer **************** **
14. spacer 1.17|411358|19|CP012312|CRT matches to position: 410386-410404, mismatch: 1, identity: 0.947
cgacaggaagtataggacc CRISPR spacer cgacaggaagtacaggacc Protospacer ************.******
15. spacer 13.1|2867741|45|CP012312|CRT matches to position: 1753980-1754024, mismatch: 1, identity: 0.978
agcacctaccacaaaagtaagtgtttttcagtatttttaatttta CRISPR spacer agcacctaccataaaagtaagtgtttttcagtatttttaatttta Protospacer ***********.*********************************
16. spacer 1.4|410701|19|CP012312|CRT matches to position: 2298811-2298829, mismatch: 2, identity: 0.895
taacaggagaaatagggcc CRISPR spacer tatcaggagaaatagagcc Protospacer ** ************.***
17. spacer 1.7|410854|19|CP012312|CRT matches to position: 2298811-2298829, mismatch: 2, identity: 0.895
taacaggagaaatagggcc CRISPR spacer tatcaggagaaatagagcc Protospacer ** ************.***
18. spacer 1.12|411106|19|CP012312|CRT matches to position: 2298811-2298829, mismatch: 2, identity: 0.895
taacaggagaaatagggcc CRISPR spacer tatcaggagaaatagagcc Protospacer ** ************.***
19. spacer 1.14|411205|19|CP012312|CRT matches to position: 2298811-2298829, mismatch: 2, identity: 0.895
taacaggagaaatagggcc CRISPR spacer tatcaggagaaatagagcc Protospacer ** ************.***
20. spacer 1.18|411403|19|CP012312|CRT matches to position: 410503-410521, mismatch: 2, identity: 0.895
taacgggagaaatagggcc CRISPR spacer taacaggagaaataggccc Protospacer ****.*********** **
21. spacer 1.22|411610|19|CP012312|CRT matches to position: 410503-410521, mismatch: 2, identity: 0.895
taacgggagaaatagggcc CRISPR spacer taacaggagaaataggccc Protospacer ****.*********** **
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012312_4 | 4.2|1342624|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342624-1342660 | 37 | NC_011398 | Clostridium phage phiCD27, complete genome | 18184-18220 | 0 | 1.0 |
CP012312_6 | 6.2|1664053|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1664053-1664089 | 37 | JX145341 | Clostridium phage phiMMP02, complete genome | 46137-46173 | 0 | 1.0 |
CP012312_6 | 6.2|1664053|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1664053-1664089 | 37 | KX228400 | Clostridium phage CDKM15, complete genome | 48381-48417 | 0 | 1.0 |
CP012312_7 | 7.1|1753788|37|CP012312|PILER-CR,CRT | 1753788-1753824 | 37 | CP011970 | Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence | 119948-119984 | 0 | 1.0 |
CP012312_7 | 7.1|1753788|37|CP012312|PILER-CR,CRT | 1753788-1753824 | 37 | LN681537 | Clostridium phage phiCD211, complete genome | 128810-128846 | 0 | 1.0 |
CP012312_7 | 7.1|1753788|37|CP012312|PILER-CR,CRT | 1753788-1753824 | 37 | NZ_CP020426 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence | 2016-2052 | 0 | 1.0 |
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CP012312_7 | 7.3|1753786|39|CP012312|CRISPRCasFinder | 1753786-1753824 | 39 | CP011970 | Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence | 119946-119984 | 0 | 1.0 |
CP012312_7 | 7.3|1753786|39|CP012312|CRISPRCasFinder | 1753786-1753824 | 39 | LN681537 | Clostridium phage phiCD211, complete genome | 128808-128846 | 0 | 1.0 |
CP012312_8 | 8.1|1754617|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1754617-1754653 | 37 | MK473382 | Clostridium phage JD032, complete genome | 11811-11847 | 0 | 1.0 |
CP012312_8 | 8.1|1754617|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1754617-1754653 | 37 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 33006-33042 | 0 | 1.0 |
CP012312_8 | 8.1|1754617|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1754617-1754653 | 37 | NC_048665 | Clostridium phage phiCDHM14, complete genome | 22618-22654 | 0 | 1.0 |
CP012312_8 | 8.1|1754617|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1754617-1754653 | 37 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 29014-29050 | 0 | 1.0 |
CP012312_8 | 8.1|1754617|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1754617-1754653 | 37 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 28788-28824 | 0 | 1.0 |
CP012312_8 | 8.1|1754617|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1754617-1754653 | 37 | NC_028838 | Clostridium phage phiCD506, complete genome | 22439-22475 | 0 | 1.0 |
CP012312_8 | 8.1|1754617|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1754617-1754653 | 37 | HG796225 | Clostridium phage phiCDHM13 complete genome | 22118-22154 | 0 | 1.0 |
CP012312_8 | 8.1|1754617|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1754617-1754653 | 37 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 28072-28108 | 0 | 1.0 |
CP012312_8 | 8.1|1754617|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1754617-1754653 | 37 | LN681538 | Clostridium phage phiCD481-1, complete genome | 21858-21894 | 0 | 1.0 |
CP012312_8 | 8.1|1754617|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1754617-1754653 | 37 | HG798901 | Clostridium phage phiCDHM11 complete genome | 22118-22154 | 0 | 1.0 |
CP012312_9 | 9.1|1887325|35|CP012312|PILER-CR | 1887325-1887359 | 35 | AY855346 | Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome | 3699-3733 | 0 | 1.0 |
CP012312_9 | 9.1|1887325|35|CP012312|PILER-CR | 1887325-1887359 | 35 | NC_007917 | Clostridium phage phi CD119, complete genome | 3699-3733 | 0 | 1.0 |
CP012312_9 | 9.1|1887325|35|CP012312|PILER-CR | 1887325-1887359 | 35 | NC_028996 | Clostridium phage phiCDHM19, complete genome | 3946-3980 | 0 | 1.0 |
CP012312_9 | 9.4|1887322|35|CP012312|CRISPRCasFinder | 1887322-1887356 | 35 | AY855346 | Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome | 3699-3733 | 0 | 1.0 |
CP012312_9 | 9.4|1887322|35|CP012312|CRISPRCasFinder | 1887322-1887356 | 35 | NC_007917 | Clostridium phage phi CD119, complete genome | 3699-3733 | 0 | 1.0 |
CP012312_9 | 9.4|1887322|35|CP012312|CRISPRCasFinder | 1887322-1887356 | 35 | NC_028996 | Clostridium phage phiCDHM19, complete genome | 3946-3980 | 0 | 1.0 |
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CP012312_9 | 9.8|1887324|33|CP012312|CRT | 1887324-1887356 | 33 | NC_028996 | Clostridium phage phiCDHM19, complete genome | 3946-3978 | 0 | 1.0 |
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CP012312_10 | 10.7|2579944|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2579944-2579980 | 37 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 26641-26677 | 0 | 1.0 |
CP012312_10 | 10.7|2579944|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2579944-2579980 | 37 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 26363-26399 | 0 | 1.0 |
CP012312_10 | 10.7|2579944|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2579944-2579980 | 37 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 25925-25961 | 0 | 1.0 |
CP012312_10 | 10.7|2579944|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2579944-2579980 | 37 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 35153-35189 | 0 | 1.0 |
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CP012312_11 | 11.5|2581972|38|CP012312|CRISPRCasFinder | 2581972-2582009 | 38 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 1764-1801 | 0 | 1.0 |
CP012312_11 | 11.5|2581972|38|CP012312|CRISPRCasFinder | 2581972-2582009 | 38 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 1792-1829 | 0 | 1.0 |
CP012312_11 | 11.5|2581972|38|CP012312|CRISPRCasFinder | 2581972-2582009 | 38 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 1797-1834 | 0 | 1.0 |
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CP012312_11 | 11.17|2581972|39|CP012312|CRT,PILER-CR | 2581972-2582010 | 39 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 1764-1802 | 0 | 1.0 |
CP012312_11 | 11.17|2581972|39|CP012312|CRT,PILER-CR | 2581972-2582010 | 39 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 1792-1830 | 0 | 1.0 |
CP012312_11 | 11.17|2581972|39|CP012312|CRT,PILER-CR | 2581972-2582010 | 39 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 1797-1835 | 0 | 1.0 |
CP012312_3 | 3.1|1146027|31|CP012312|CRISPRCasFinder | 1146027-1146057 | 31 | NZ_CP033215 | Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence | 3094-3124 | 1 | 0.968 |
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CP012312_7 | 7.6|1753921|36|CP012312|CRT | 1753921-1753956 | 36 | NZ_CP029155 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence | 20582-20617 | 1 | 0.972 |
CP012312_9 | 9.3|1887459|33|CP012312|PILER-CR | 1887459-1887491 | 33 | NZ_CP029155 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence | 97865-97897 | 1 | 0.97 |
CP012312_9 | 9.3|1887459|33|CP012312|PILER-CR | 1887459-1887491 | 33 | MF547662 | Clostridioides phage LIBA6276, complete genome | 51718-51750 | 1 | 0.97 |
CP012312_9 | 9.3|1887459|33|CP012312|PILER-CR | 1887459-1887491 | 33 | MF547663 | Clostridioides phage LIBA2945, complete genome | 51568-51600 | 1 | 0.97 |
CP012312_9 | 9.3|1887459|33|CP012312|PILER-CR | 1887459-1887491 | 33 | CP011970 | Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence | 45658-45690 | 1 | 0.97 |
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CP012312_9 | 9.3|1887459|33|CP012312|PILER-CR | 1887459-1887491 | 33 | NZ_CP020426 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence | 76310-76342 | 1 | 0.97 |
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CP012312_9 | 9.6|1887453|36|CP012312|CRISPRCasFinder | 1887453-1887488 | 36 | NZ_CP029155 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence | 97862-97897 | 1 | 0.972 |
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CP012312_9 | 9.6|1887453|36|CP012312|CRISPRCasFinder | 1887453-1887488 | 36 | CP011970 | Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence | 45655-45690 | 1 | 0.972 |
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CP012312_9 | 9.10|1887455|34|CP012312|CRT | 1887455-1887488 | 34 | MF547662 | Clostridioides phage LIBA6276, complete genome | 51717-51750 | 1 | 0.971 |
CP012312_9 | 9.10|1887455|34|CP012312|CRT | 1887455-1887488 | 34 | MF547663 | Clostridioides phage LIBA2945, complete genome | 51567-51600 | 1 | 0.971 |
CP012312_9 | 9.10|1887455|34|CP012312|CRT | 1887455-1887488 | 34 | CP011970 | Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence | 45657-45690 | 1 | 0.971 |
CP012312_9 | 9.10|1887455|34|CP012312|CRT | 1887455-1887488 | 34 | LN681537 | Clostridium phage phiCD211, complete genome | 54519-54552 | 1 | 0.971 |
CP012312_9 | 9.11|1887520|36|CP012312|CRT | 1887520-1887555 | 36 | NZ_MF547664 | Clostridioides difficile strain LIBA-6289 plasmid LIBA6289, complete sequence | 26432-26467 | 1 | 0.972 |
CP012312_11 | 11.2|2581775|37|CP012312|CRISPRCasFinder | 2581775-2581811 | 37 | JX145341 | Clostridium phage phiMMP02, complete genome | 12856-12892 | 1 | 0.973 |
CP012312_20 | 20.7|3723431|21|CP012312|CRT | 3723431-3723451 | 21 | MN480762 | Streptococcus salivarius strain NU10 plasmid pSsal-NU10, complete sequence | 176923-176943 | 1 | 0.952 |
CP012312_20 | 20.8|3723476|21|CP012312|CRT | 3723476-3723496 | 21 | MN480762 | Streptococcus salivarius strain NU10 plasmid pSsal-NU10, complete sequence | 176923-176943 | 1 | 0.952 |
CP012312_4 | 4.5|1342822|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342822-1342858 | 37 | NZ_MG973074 | Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence | 90018-90054 | 2 | 0.946 |
CP012312_6 | 6.3|1664119|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1664119-1664155 | 37 | NZ_MG973074 | Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence | 102058-102094 | 2 | 0.946 |
CP012312_8 | 8.1|1754617|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1754617-1754653 | 37 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 28510-28546 | 2 | 0.946 |
CP012312_9 | 9.7|1887518|38|CP012312|CRISPRCasFinder | 1887518-1887555 | 38 | NZ_MF547664 | Clostridioides difficile strain LIBA-6289 plasmid LIBA6289, complete sequence | 26432-26469 | 2 | 0.947 |
CP012312_11 | 11.5|2581972|38|CP012312|CRISPRCasFinder | 2581972-2582009 | 38 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 1792-1829 | 2 | 0.947 |
CP012312_11 | 11.14|2581775|38|CP012312|CRT,PILER-CR | 2581775-2581812 | 38 | JX145341 | Clostridium phage phiMMP02, complete genome | 12856-12893 | 2 | 0.947 |
CP012312_11 | 11.17|2581972|39|CP012312|CRT,PILER-CR | 2581972-2582010 | 39 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 1792-1830 | 2 | 0.949 |
CP012312_4 | 4.2|1342624|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342624-1342660 | 37 | JX145341 | Clostridium phage phiMMP02, complete genome | 18069-18105 | 3 | 0.919 |
CP012312_6 | 6.4|1664185|38|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT | 1664185-1664222 | 38 | NZ_MG973074 | Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence | 94861-94898 | 3 | 0.921 |
CP012312_8 | 8.4|1754814|35|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1754814-1754848 | 35 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 2985-3019 | 3 | 0.914 |
CP012312_8 | 8.4|1754814|35|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1754814-1754848 | 35 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 2990-3024 | 3 | 0.914 |
CP012312_8 | 8.6|1754944|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT | 1754944-1754980 | 37 | AY855346 | Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome | 17334-17370 | 3 | 0.919 |
CP012312_8 | 8.6|1754944|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT | 1754944-1754980 | 37 | NC_007917 | Clostridium phage phi CD119, complete genome | 17334-17370 | 3 | 0.919 |
CP012312_8 | 8.6|1754944|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT | 1754944-1754980 | 37 | NC_028996 | Clostridium phage phiCDHM19, complete genome | 17588-17624 | 3 | 0.919 |
CP012312_11 | 11.3|2581841|36|CP012312|CRISPRCasFinder | 2581841-2581876 | 36 | JX145342 | Clostridium phage phiMMP04, complete genome | 12213-12248 | 3 | 0.917 |
CP012312_11 | 11.15|2581841|37|CP012312|CRT,PILER-CR | 2581841-2581877 | 37 | JX145342 | Clostridium phage phiMMP04, complete genome | 12213-12249 | 3 | 0.919 |
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CP012312_1 | 1.20|411502|28|CP012312|CRT | 411502-411529 | 28 | NZ_CP020744 | Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed1, complete sequence | 50018-50045 | 4 | 0.857 |
CP012312_1 | 1.16|411304|28|CP012312|CRT | 411304-411331 | 28 | NZ_CP020744 | Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed1, complete sequence | 49874-49901 | 5 | 0.821 |
CP012312_1 | 1.16|411304|28|CP012312|CRT | 411304-411331 | 28 | NZ_CP020744 | Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed1, complete sequence | 49982-50009 | 5 | 0.821 |
CP012312_1 | 1.20|411502|28|CP012312|CRT | 411502-411529 | 28 | NZ_CP020744 | Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed1, complete sequence | 49874-49901 | 5 | 0.821 |
CP012312_1 | 1.20|411502|28|CP012312|CRT | 411502-411529 | 28 | NZ_CP020744 | Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed1, complete sequence | 49982-50009 | 5 | 0.821 |
CP012312_1 | 1.20|411502|28|CP012312|CRT | 411502-411529 | 28 | NZ_CP009336 | Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence | 68880-68907 | 5 | 0.821 |
CP012312_1 | 1.20|411502|28|CP012312|CRT | 411502-411529 | 28 | NZ_CP009336 | Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence | 68943-68970 | 5 | 0.821 |
CP012312_1 | 1.16|411304|28|CP012312|CRT | 411304-411331 | 28 | NC_001446 | Bacillus thuringiensis sv israelensis HI4 plasmid pTX14-3, complete sequence | 3138-3165 | 6 | 0.786 |
CP012312_1 | 1.16|411304|28|CP012312|CRT | 411304-411331 | 28 | NC_018511 | Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid pBTHD789-5, complete sequence | 1470-1497 | 6 | 0.786 |
CP012312_1 | 1.16|411304|28|CP012312|CRT | 411304-411331 | 28 | NZ_CP009345 | Bacillus thuringiensis HD1002 plasmid 6, complete sequence | 2575-2602 | 6 | 0.786 |
CP012312_20 | 20.2|3723107|30|CP012312|CRT | 3723107-3723136 | 30 | NC_007103 | Bacillus cereus E33L plasmid pE33L466, complete sequence | 140-169 | 6 | 0.8 |
CP012312_20 | 20.2|3723107|30|CP012312|CRT | 3723107-3723136 | 30 | NC_007103 | Bacillus cereus E33L plasmid pE33L466, complete sequence | 239-268 | 6 | 0.8 |
CP012312_20 | 20.2|3723107|30|CP012312|CRT | 3723107-3723136 | 30 | NZ_CP009967 | Bacillus cereus E33L plasmid pBCO_1, complete sequence | 321878-321907 | 6 | 0.8 |
CP012312_20 | 20.2|3723107|30|CP012312|CRT | 3723107-3723136 | 30 | MG209611 | Aphanizomenon phage vB_AphaS-CL131, complete genome | 32379-32408 | 6 | 0.8 |
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CP012312_4 | 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342690-1342726 | 37 | MN850590 | Escherichia phage moha, complete genome | 30213-30249 | 7 | 0.811 |
CP012312_4 | 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342690-1342726 | 37 | NC_041863 | Escherichia coli O157 typing phage 3, complete genome | 70728-70764 | 7 | 0.811 |
CP012312_4 | 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342690-1342726 | 37 | NC_024124 | Escherichia phage vB_EcoM_JS09, complete genome | 90019-90055 | 7 | 0.811 |
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CP012312_4 | 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342690-1342726 | 37 | MK373778 | Escherichia phage vB_EcoM_WFbE185, complete genome | 80644-80680 | 7 | 0.811 |
CP012312_4 | 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342690-1342726 | 37 | LR027383 | Escherichia virus vB_Eco_mar005P1 strain vB_Eco_mar007P3 genome assembly, chromosome: 1 | 36559-36595 | 7 | 0.811 |
CP012312_4 | 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342690-1342726 | 37 | KU255730 | Escherichia phage phiE142, complete genome | 94292-94328 | 7 | 0.811 |
CP012312_4 | 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342690-1342726 | 37 | KM407600 | Shigella phage Shf125875, complete genome | 80619-80655 | 7 | 0.811 |
CP012312_4 | 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342690-1342726 | 37 | LR027386 | Escherichia virus vB_Eco_mar005P1 strain vB_Eco_mar008P4 genome assembly, chromosome: 1 | 19340-19376 | 7 | 0.811 |
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CP012312_4 | 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342690-1342726 | 37 | LR027390 | Escherichia virus vB_Eco_mar005P1 genome assembly, chromosome: 1 | 13673-13709 | 7 | 0.811 |
CP012312_4 | 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342690-1342726 | 37 | LR027387 | Escherichia virus vB_Eco_mar005P1 strain vB_Eco_mar006P2 genome assembly, chromosome: 1 | 114568-114604 | 7 | 0.811 |
CP012312_4 | 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342690-1342726 | 37 | KP869111 | Escherichia coli O157 typing phage 13, partial genome | 70877-70913 | 7 | 0.811 |
CP012312_4 | 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342690-1342726 | 37 | MK373775 | Escherichia phage vB_EcoM_WFK, complete genome | 75460-75496 | 7 | 0.811 |
CP012312_4 | 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342690-1342726 | 37 | MK373784 | Escherichia phage vB_EcoM_MM02, complete genome | 81502-81538 | 7 | 0.811 |
CP012312_4 | 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342690-1342726 | 37 | NC_024794 | Escherichia phage vB_EcoM_PhAPEC2, complete genome | 80150-80186 | 7 | 0.811 |
CP012312_4 | 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342690-1342726 | 37 | MK962757 | Shigella phage JK45, complete genome | 81766-81802 | 7 | 0.811 |
CP012312_4 | 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342690-1342726 | 37 | MN850651 | Escherichia phage moskry, complete genome | 90240-90276 | 7 | 0.811 |
CP012312_4 | 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342690-1342726 | 37 | KP869104 | Escherichia coli O157 typing phage 6, complete genome | 89797-89833 | 7 | 0.811 |
CP012312_4 | 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342690-1342726 | 37 | MK962756 | Shigella phage JK42, complete genome | 81245-81281 | 7 | 0.811 |
CP012312_4 | 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342690-1342726 | 37 | MK524178 | Escherichia phage PHB12, complete genome | 140724-140760 | 7 | 0.811 |
CP012312_4 | 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342690-1342726 | 37 | MG589383 | Shigella phage phi25-307, complete genome | 60430-60466 | 7 | 0.811 |
CP012312_4 | 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342690-1342726 | 37 | MK327933 | Escherichia phage vB_EcoM_G2285, complete genome | 78934-78970 | 7 | 0.811 |
CP012312_4 | 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342690-1342726 | 37 | MH243438 | Escherichia phage vB_EcoM_NBG1, complete genome | 80595-80631 | 7 | 0.811 |
CP012312_4 | 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342690-1342726 | 37 | MT782071 | Escherichia phage JN02, complete genome | 81149-81185 | 7 | 0.811 |
CP012312_4 | 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342690-1342726 | 37 | MK327943 | Escherichia phage vB_EcoM_G53, complete genome | 79526-79562 | 7 | 0.811 |
CP012312_4 | 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342690-1342726 | 37 | MK373782 | Escherichia phage vB_EcoM_KAW3E185, complete genome | 79548-79584 | 7 | 0.811 |
CP012312_4 | 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342690-1342726 | 37 | MK373774 | Escherichia phage vB_EcoM_WFL6982, complete genome | 75460-75496 | 7 | 0.811 |
CP012312_4 | 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342690-1342726 | 37 | MK327934 | Escherichia phage vB_EcoM_G2469, complete genome | 81122-81158 | 7 | 0.811 |
CP012312_4 | 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342690-1342726 | 37 | KM389388 | UNVERIFIED: Escherichia phage CEV1 clone contig00003 genomic sequence | 17910-17946 | 7 | 0.811 |
CP012312_4 | 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1342690-1342726 | 37 | NC_041920 | UNVERIFIED: Escherichia phage HP3, complete genome | 90159-90195 | 7 | 0.811 |
CP012312_13 | 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR | 2867812-2867844 | 33 | NZ_CP012644 | Rufibacter tibetensis strain 1351 plasmid 1, complete sequence | 96388-96420 | 7 | 0.788 |
CP012312_13 | 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR | 2867812-2867844 | 33 | NZ_LN865144 | Acinetobacter baumannii isolate CIP70.10 plasmid II, complete sequence | 1917-1949 | 7 | 0.788 |
CP012312_20 | 20.2|3723107|30|CP012312|CRT | 3723107-3723136 | 30 | NC_007103 | Bacillus cereus E33L plasmid pE33L466, complete sequence | 410-439 | 7 | 0.767 |
CP012312_20 | 20.2|3723107|30|CP012312|CRT | 3723107-3723136 | 30 | NZ_CP009967 | Bacillus cereus E33L plasmid pBCO_1, complete sequence | 321734-321763 | 7 | 0.767 |
CP012312_20 | 20.2|3723107|30|CP012312|CRT | 3723107-3723136 | 30 | NZ_CP009336 | Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence | 72613-72642 | 7 | 0.767 |
CP012312_5 | 5.1|1555309|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT | 1555309-1555345 | 37 | NZ_CP053952 | Bacillus cereus strain FDAARGOS_798 plasmid unnamed1, complete sequence | 222393-222429 | 8 | 0.784 |
CP012312_5 | 5.1|1555309|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT | 1555309-1555345 | 37 | NZ_CP011154 | Bacillus cereus strain CMCC P0011 plasmid pRML05, complete sequence | 263394-263430 | 8 | 0.784 |
CP012312_5 | 5.1|1555309|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT | 1555309-1555345 | 37 | NZ_CP053949 | Bacillus cereus strain FDAARGOS_799 plasmid unnamed1, complete sequence | 352543-352579 | 8 | 0.784 |
CP012312_5 | 5.1|1555309|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT | 1555309-1555345 | 37 | NZ_CP011152 | Bacillus cereus strain CMCC P0021 plasmid pRML04, complete sequence | 283485-283521 | 8 | 0.784 |
CP012312_7 | 7.5|1753919|38|CP012312|CRISPRCasFinder | 1753919-1753956 | 38 | MK301608 | Vibrio virus vB_VspP_SBP1, complete genome | 3843-3880 | 8 | 0.789 |
CP012312_13 | 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR | 2867812-2867844 | 33 | NZ_CP039703 | Clostridium butyricum strain 29-1 plasmid p-butyl_plas_29-1, complete sequence | 44029-44061 | 8 | 0.758 |
CP012312_13 | 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR | 2867812-2867844 | 33 | NZ_CP039706 | Clostridium butyricum strain 4-1 plasmid p-butyl_plas_4-1, complete sequence | 648549-648581 | 8 | 0.758 |
CP012312_13 | 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR | 2867812-2867844 | 33 | CP019152 | Acinetobacter lwoffii strain ZS207 plasmid pZS-2, complete sequence | 10016-10048 | 8 | 0.758 |
CP012312_13 | 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR | 2867812-2867844 | 33 | NZ_CP033246 | Clostridium butyricum strain CFSA3987 plasmid pCFSA3987, complete sequence | 411934-411966 | 8 | 0.758 |
CP012312_13 | 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR | 2867812-2867844 | 33 | NZ_CP033248 | Clostridium butyricum strain CFSA3989 plasmid pCFSA3989, complete sequence | 411973-412005 | 8 | 0.758 |
CP012312_13 | 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR | 2867812-2867844 | 33 | NZ_CP039148 | Acinetobacter sp. 10FS3-1 plasmid p10FS3-1-5, complete sequence | 1887-1919 | 8 | 0.758 |
CP012312_13 | 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR | 2867812-2867844 | 33 | NZ_CP039151 | Acinetobacter sp. 10FS3-1 plasmid p10FS3-1-8, complete sequence | 3186-3218 | 8 | 0.758 |
CP012312_13 | 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR | 2867812-2867844 | 33 | NZ_CP013238 | Clostridium butyricum strain CDC_51208 plasmid pNPD4_2, complete sequence | 165259-165291 | 8 | 0.758 |
CP012312_13 | 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR | 2867812-2867844 | 33 | NZ_AP019717 | Clostridium butyricum strain NBRC 13949 plasmid pCBU1, complete sequence | 686877-686909 | 8 | 0.758 |
CP012312_13 | 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR | 2867812-2867844 | 33 | MN693362 | Marine virus AFVG_25M506, complete genome | 32057-32089 | 8 | 0.758 |
CP012312_13 | 13.8|2867809|37|CP012312|CRISPRCasFinder | 2867809-2867845 | 37 | NZ_CP014325 | Borrelia anserina Es isolate UTHSCSA plasmid lpA89, complete sequence | 55630-55666 | 8 | 0.784 |
CP012312_20 | 20.2|3723107|30|CP012312|CRT | 3723107-3723136 | 30 | NZ_CP009336 | Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence | 73553-73582 | 8 | 0.733 |
CP012312_5 | 5.1|1555309|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT | 1555309-1555345 | 37 | NZ_CP033246 | Clostridium butyricum strain CFSA3987 plasmid pCFSA3987, complete sequence | 408939-408975 | 9 | 0.757 |
CP012312_5 | 5.1|1555309|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT | 1555309-1555345 | 37 | NZ_CP033248 | Clostridium butyricum strain CFSA3989 plasmid pCFSA3989, complete sequence | 408978-409014 | 9 | 0.757 |
CP012312_5 | 5.1|1555309|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT | 1555309-1555345 | 37 | NZ_AP019717 | Clostridium butyricum strain NBRC 13949 plasmid pCBU1, complete sequence | 683882-683918 | 9 | 0.757 |
CP012312_5 | 5.1|1555309|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT | 1555309-1555345 | 37 | NZ_CP039703 | Clostridium butyricum strain 29-1 plasmid p-butyl_plas_29-1, complete sequence | 47020-47056 | 9 | 0.757 |
CP012312_5 | 5.1|1555309|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT | 1555309-1555345 | 37 | NZ_CP013238 | Clostridium butyricum strain CDC_51208 plasmid pNPD4_2, complete sequence | 168249-168285 | 9 | 0.757 |
CP012312_11 | 11.7|2582104|35|CP012312|CRISPRCasFinder | 2582104-2582138 | 35 | MT135176 | Aeromonas phage vB_AsoM_yong, complete genome | 36887-36921 | 9 | 0.743 |
CP012312_13 | 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR | 2867812-2867844 | 33 | MN694223 | Marine virus AFVG_250M234, complete genome | 12542-12574 | 9 | 0.727 |
CP012312_13 | 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR | 2867812-2867844 | 33 | NZ_CP019926 | Borreliella burgdorferi strain PAbe plasmid p_lp56, complete sequence | 37031-37063 | 9 | 0.727 |
CP012312_13 | 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR | 2867812-2867844 | 33 | NC_000956 | Borreliella burgdorferi B31 plasmid lp56, complete sequence | 37031-37063 | 9 | 0.727 |
CP012312_13 | 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR | 2867812-2867844 | 33 | NZ_CP019855 | Borreliella burgdorferi plasmid lp56, complete sequence | 37031-37063 | 9 | 0.727 |
CP012312_13 | 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR | 2867812-2867844 | 33 | NZ_CP019766 | Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 plasmid p_lp56, complete sequence | 37011-37043 | 9 | 0.727 |
CP012312_13 | 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR | 2867812-2867844 | 33 | NC_020383 | Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-85, complete sequence | 42211-42243 | 9 | 0.727 |
CP012312_13 | 13.8|2867809|37|CP012312|CRISPRCasFinder | 2867809-2867845 | 37 | NZ_CP037437 | Lactobacillus plantarum strain EM plasmid pEM8, complete sequence | 21201-21237 | 9 | 0.757 |
CP012312_18 | 18.1|3259469|31|CP012312|CRISPRCasFinder | 3259469-3259499 | 31 | LR606148 | Rhizobium sp. Q54 genome assembly, plasmid: 5 | 444883-444913 | 9 | 0.71 |
CP012312_6 | 6.1|1663988|36|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1663988-1664023 | 36 | NZ_CP009620 | Vibrio coralliilyticus strain RE98 plasmid p319, complete sequence | 32919-32954 | 10 | 0.722 |
CP012312_10 | 10.9|2580077|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT | 2580077-2580113 | 37 | KU686211 | Synechococcus phage S-WAM2 isolate 0810PA29, complete genome | 86047-86083 | 11 | 0.703 |
CP012312_20 | 20.3|3723161|48|CP012312|CRT | 3723161-3723208 | 48 | NZ_CP009336 | Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence | 90205-90252 | 15 | 0.688 |
1. spacer 4.2|1342624|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatgtgattaaaaaaggacaaaagttggtgataccta CRISPR spacer aatgtgattaaaaaaggacaaaagttggtgataccta Protospacer *************************************
2. spacer 6.2|1664053|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tatacgctttagtatttaccttatttttctgtagtgc CRISPR spacer tatacgctttagtatttaccttatttttctgtagtgc Protospacer *************************************
3. spacer 6.2|1664053|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX228400 (Clostridium phage CDKM15, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tatacgctttagtatttaccttatttttctgtagtgc CRISPR spacer tatacgctttagtatttaccttatttttctgtagtgc Protospacer *************************************
4. spacer 7.1|1753788|37|CP012312|PILER-CR,CRT matches to CP011970 (Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttctaggtcttcaattctaaaatcaatacgactaaaa CRISPR spacer ttctaggtcttcaattctaaaatcaatacgactaaaa Protospacer *************************************
5. spacer 7.1|1753788|37|CP012312|PILER-CR,CRT matches to LN681537 (Clostridium phage phiCD211, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttctaggtcttcaattctaaaatcaatacgactaaaa CRISPR spacer ttctaggtcttcaattctaaaatcaatacgactaaaa Protospacer *************************************
6. spacer 7.1|1753788|37|CP012312|PILER-CR,CRT matches to NZ_CP020426 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttctaggtcttcaattctaaaatcaatacgactaaaa CRISPR spacer ttctaggtcttcaattctaaaatcaatacgactaaaa Protospacer *************************************
7. spacer 7.3|1753786|39|CP012312|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020426 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttttctaggtcttcaattctaaaatcaatacgactaaaa CRISPR spacer ttttctaggtcttcaattctaaaatcaatacgactaaaa Protospacer ***************************************
8. spacer 7.3|1753786|39|CP012312|CRISPRCasFinder matches to CP011970 (Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttttctaggtcttcaattctaaaatcaatacgactaaaa CRISPR spacer ttttctaggtcttcaattctaaaatcaatacgactaaaa Protospacer ***************************************
9. spacer 7.3|1753786|39|CP012312|CRISPRCasFinder matches to LN681537 (Clostridium phage phiCD211, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttttctaggtcttcaattctaaaatcaatacgactaaaa CRISPR spacer ttttctaggtcttcaattctaaaatcaatacgactaaaa Protospacer ***************************************
10. spacer 8.1|1754617|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK473382 (Clostridium phage JD032, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cgctacgatttgacagctaaaaatgtgcttttcttag CRISPR spacer cgctacgatttgacagctaaaaatgtgcttttcttag Protospacer *************************************
11. spacer 8.1|1754617|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cgctacgatttgacagctaaaaatgtgcttttcttag CRISPR spacer cgctacgatttgacagctaaaaatgtgcttttcttag Protospacer *************************************
12. spacer 8.1|1754617|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048665 (Clostridium phage phiCDHM14, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cgctacgatttgacagctaaaaatgtgcttttcttag CRISPR spacer cgctacgatttgacagctaaaaatgtgcttttcttag Protospacer *************************************
13. spacer 8.1|1754617|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cgctacgatttgacagctaaaaatgtgcttttcttag CRISPR spacer cgctacgatttgacagctaaaaatgtgcttttcttag Protospacer *************************************
14. spacer 8.1|1754617|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cgctacgatttgacagctaaaaatgtgcttttcttag CRISPR spacer cgctacgatttgacagctaaaaatgtgcttttcttag Protospacer *************************************
15. spacer 8.1|1754617|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028838 (Clostridium phage phiCD506, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cgctacgatttgacagctaaaaatgtgcttttcttag CRISPR spacer cgctacgatttgacagctaaaaatgtgcttttcttag Protospacer *************************************
16. spacer 8.1|1754617|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG796225 (Clostridium phage phiCDHM13 complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cgctacgatttgacagctaaaaatgtgcttttcttag CRISPR spacer cgctacgatttgacagctaaaaatgtgcttttcttag Protospacer *************************************
17. spacer 8.1|1754617|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cgctacgatttgacagctaaaaatgtgcttttcttag CRISPR spacer cgctacgatttgacagctaaaaatgtgcttttcttag Protospacer *************************************
18. spacer 8.1|1754617|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681538 (Clostridium phage phiCD481-1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cgctacgatttgacagctaaaaatgtgcttttcttag CRISPR spacer cgctacgatttgacagctaaaaatgtgcttttcttag Protospacer *************************************
19. spacer 8.1|1754617|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG798901 (Clostridium phage phiCDHM11 complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cgctacgatttgacagctaaaaatgtgcttttcttag CRISPR spacer cgctacgatttgacagctaaaaatgtgcttttcttag Protospacer *************************************
20. spacer 9.1|1887325|35|CP012312|PILER-CR matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaaaaatatagtatagcttttattagcttatcaaa CRISPR spacer aaaaaatatagtatagcttttattagcttatcaaa Protospacer ***********************************
21. spacer 9.1|1887325|35|CP012312|PILER-CR matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaaaaatatagtatagcttttattagcttatcaaa CRISPR spacer aaaaaatatagtatagcttttattagcttatcaaa Protospacer ***********************************
22. spacer 9.1|1887325|35|CP012312|PILER-CR matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaaaaatatagtatagcttttattagcttatcaaa CRISPR spacer aaaaaatatagtatagcttttattagcttatcaaa Protospacer ***********************************
23. spacer 9.4|1887322|35|CP012312|CRISPRCasFinder matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaaaaatatagtatagcttttattagcttatcaaa CRISPR spacer aaaaaatatagtatagcttttattagcttatcaaa Protospacer ***********************************
24. spacer 9.4|1887322|35|CP012312|CRISPRCasFinder matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaaaaatatagtatagcttttattagcttatcaaa CRISPR spacer aaaaaatatagtatagcttttattagcttatcaaa Protospacer ***********************************
25. spacer 9.4|1887322|35|CP012312|CRISPRCasFinder matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaaaaatatagtatagcttttattagcttatcaaa CRISPR spacer aaaaaatatagtatagcttttattagcttatcaaa Protospacer ***********************************
26. spacer 9.8|1887324|33|CP012312|CRT matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaaatatagtatagcttttattagcttatcaaa CRISPR spacer aaaatatagtatagcttttattagcttatcaaa Protospacer *********************************
27. spacer 9.8|1887324|33|CP012312|CRT matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaaatatagtatagcttttattagcttatcaaa CRISPR spacer aaaatatagtatagcttttattagcttatcaaa Protospacer *********************************
28. spacer 9.8|1887324|33|CP012312|CRT matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaaatatagtatagcttttattagcttatcaaa CRISPR spacer aaaatatagtatagcttttattagcttatcaaa Protospacer *********************************
29. spacer 10.6|2579877|38|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatttaagcgataaaattcaagaaataacagaattttg CRISPR spacer aatttaagcgataaaattcaagaaataacagaattttg Protospacer **************************************
30. spacer 10.7|2579944|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
taggaataagattgagatttaatttttattattcaaa CRISPR spacer taggaataagattgagatttaatttttattattcaaa Protospacer *************************************
31. spacer 10.7|2579944|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
taggaataagattgagatttaatttttattattcaaa CRISPR spacer taggaataagattgagatttaatttttattattcaaa Protospacer *************************************
32. spacer 10.7|2579944|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
taggaataagattgagatttaatttttattattcaaa CRISPR spacer taggaataagattgagatttaatttttattattcaaa Protospacer *************************************
33. spacer 10.7|2579944|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
taggaataagattgagatttaatttttattattcaaa CRISPR spacer taggaataagattgagatttaatttttattattcaaa Protospacer *************************************
34. spacer 10.7|2579944|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
taggaataagattgagatttaatttttattattcaaa CRISPR spacer taggaataagattgagatttaatttttattattcaaa Protospacer *************************************
35. spacer 11.5|2581972|38|CP012312|CRISPRCasFinder matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttagtgttagaaatgctttgaagagtgctattaacgat CRISPR spacer ttagtgttagaaatgctttgaagagtgctattaacgat Protospacer **************************************
36. spacer 11.5|2581972|38|CP012312|CRISPRCasFinder matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttagtgttagaaatgctttgaagagtgctattaacgat CRISPR spacer ttagtgttagaaatgctttgaagagtgctattaacgat Protospacer **************************************
37. spacer 11.5|2581972|38|CP012312|CRISPRCasFinder matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttagtgttagaaatgctttgaagagtgctattaacgat CRISPR spacer ttagtgttagaaatgctttgaagagtgctattaacgat Protospacer **************************************
38. spacer 11.5|2581972|38|CP012312|CRISPRCasFinder matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttagtgttagaaatgctttgaagagtgctattaacgat CRISPR spacer ttagtgttagaaatgctttgaagagtgctattaacgat Protospacer **************************************
39. spacer 11.17|2581972|39|CP012312|CRT,PILER-CR matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttagtgttagaaatgctttgaagagtgctattaacgata CRISPR spacer ttagtgttagaaatgctttgaagagtgctattaacgata Protospacer ***************************************
40. spacer 11.17|2581972|39|CP012312|CRT,PILER-CR matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttagtgttagaaatgctttgaagagtgctattaacgata CRISPR spacer ttagtgttagaaatgctttgaagagtgctattaacgata Protospacer ***************************************
41. spacer 11.17|2581972|39|CP012312|CRT,PILER-CR matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttagtgttagaaatgctttgaagagtgctattaacgata CRISPR spacer ttagtgttagaaatgctttgaagagtgctattaacgata Protospacer ***************************************
42. spacer 11.17|2581972|39|CP012312|CRT,PILER-CR matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttagtgttagaaatgctttgaagagtgctattaacgata CRISPR spacer ttagtgttagaaatgctttgaagagtgctattaacgata Protospacer ***************************************
43. spacer 3.1|1146027|31|CP012312|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033215 (Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.968
agaataaactgaacgcatgtgaagtttgttt CRISPR spacer agaataaactgaacacatgtgaagtttgttt Protospacer **************.****************
44. spacer 4.2|1342624|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048642 (Clostridium phage CDKM9, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
aatgtgattaaaaaaggacaaaagttggtgataccta CRISPR spacer aatgtgattaaaaaaggacaaaagttggtgatacctt Protospacer ************************************
45. spacer 7.5|1753919|38|CP012312|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP029155 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
ttcaatttctttcactattgtaattttatttgtgacag CRISPR spacer tttaatttctttcactattgtaattttatttgtgacag Protospacer **.***********************************
46. spacer 7.6|1753921|36|CP012312|CRT matches to NZ_CP029155 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
caatttctttcactattgtaattttatttgtgacag CRISPR spacer taatttctttcactattgtaattttatttgtgacag Protospacer .***********************************
47. spacer 9.3|1887459|33|CP012312|PILER-CR matches to NZ_CP029155 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
caacagtggtggtggtcgaggagtagaagttct CRISPR spacer caacagtggtggtggtcgaggagtagaagtttt Protospacer *******************************.*
48. spacer 9.3|1887459|33|CP012312|PILER-CR matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
caacagtggtggtggtcgaggagtagaagttct CRISPR spacer caacagtggtggtggtcgaggagtagaagtttt Protospacer *******************************.*
49. spacer 9.3|1887459|33|CP012312|PILER-CR matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
caacagtggtggtggtcgaggagtagaagttct CRISPR spacer caacagtggtggtggtcgaggagtagaagtttt Protospacer *******************************.*
50. spacer 9.3|1887459|33|CP012312|PILER-CR matches to CP011970 (Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
caacagtggtggtggtcgaggagtagaagttct CRISPR spacer caacagtggtggtggtcgaggagtagaagtttt Protospacer *******************************.*
51. spacer 9.3|1887459|33|CP012312|PILER-CR matches to LN681537 (Clostridium phage phiCD211, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
caacagtggtggtggtcgaggagtagaagttct CRISPR spacer caacagtggtggtggtcgaggagtagaagtttt Protospacer *******************************.*
52. spacer 9.3|1887459|33|CP012312|PILER-CR matches to NZ_CP020426 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
caacagtggtggtggtcgaggagtagaagttct CRISPR spacer caacagtggtggtggtcgaggagtagaagtttt Protospacer *******************************.*
53. spacer 9.6|1887453|36|CP012312|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020426 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tttcaacagtggtggtggtcgaggagtagaagttct CRISPR spacer tttcaacagtggtggtggtcgaggagtagaagtttt Protospacer **********************************.*
54. spacer 9.6|1887453|36|CP012312|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP029155 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tttcaacagtggtggtggtcgaggagtagaagttct CRISPR spacer tttcaacagtggtggtggtcgaggagtagaagtttt Protospacer **********************************.*
55. spacer 9.6|1887453|36|CP012312|CRISPRCasFinder matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tttcaacagtggtggtggtcgaggagtagaagttct CRISPR spacer tttcaacagtggtggtggtcgaggagtagaagtttt Protospacer **********************************.*
56. spacer 9.6|1887453|36|CP012312|CRISPRCasFinder matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tttcaacagtggtggtggtcgaggagtagaagttct CRISPR spacer tttcaacagtggtggtggtcgaggagtagaagtttt Protospacer **********************************.*
57. spacer 9.6|1887453|36|CP012312|CRISPRCasFinder matches to CP011970 (Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tttcaacagtggtggtggtcgaggagtagaagttct CRISPR spacer tttcaacagtggtggtggtcgaggagtagaagtttt Protospacer **********************************.*
58. spacer 9.6|1887453|36|CP012312|CRISPRCasFinder matches to LN681537 (Clostridium phage phiCD211, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tttcaacagtggtggtggtcgaggagtagaagttct CRISPR spacer tttcaacagtggtggtggtcgaggagtagaagtttt Protospacer **********************************.*
59. spacer 9.10|1887455|34|CP012312|CRT matches to NZ_CP020426 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
tcaacagtggtggtggtcgaggagtagaagttct CRISPR spacer tcaacagtggtggtggtcgaggagtagaagtttt Protospacer ********************************.*
60. spacer 9.10|1887455|34|CP012312|CRT matches to NZ_CP029155 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
tcaacagtggtggtggtcgaggagtagaagttct CRISPR spacer tcaacagtggtggtggtcgaggagtagaagtttt Protospacer ********************************.*
61. spacer 9.10|1887455|34|CP012312|CRT matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
tcaacagtggtggtggtcgaggagtagaagttct CRISPR spacer tcaacagtggtggtggtcgaggagtagaagtttt Protospacer ********************************.*
62. spacer 9.10|1887455|34|CP012312|CRT matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
tcaacagtggtggtggtcgaggagtagaagttct CRISPR spacer tcaacagtggtggtggtcgaggagtagaagtttt Protospacer ********************************.*
63. spacer 9.10|1887455|34|CP012312|CRT matches to CP011970 (Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
tcaacagtggtggtggtcgaggagtagaagttct CRISPR spacer tcaacagtggtggtggtcgaggagtagaagtttt Protospacer ********************************.*
64. spacer 9.10|1887455|34|CP012312|CRT matches to LN681537 (Clostridium phage phiCD211, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
tcaacagtggtggtggtcgaggagtagaagttct CRISPR spacer tcaacagtggtggtggtcgaggagtagaagtttt Protospacer ********************************.*
65. spacer 9.11|1887520|36|CP012312|CRT matches to NZ_MF547664 (Clostridioides difficile strain LIBA-6289 plasmid LIBA6289, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tataacctttaattacacctcccatatcaccaccac CRISPR spacer tgtaacctttaattacacctcccatatcaccaccac Protospacer *.**********************************
66. spacer 11.2|2581775|37|CP012312|CRISPRCasFinder matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
cagcagttaagattagagatgaagctagttcaacact CRISPR spacer cagcagttaagattagagatgaagctagttcagcact Protospacer ********************************.****
67. spacer 20.7|3723431|21|CP012312|CRT matches to MN480762 (Streptococcus salivarius strain NU10 plasmid pSsal-NU10, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.952
taccaaaccatttgctcccgt CRISPR spacer taccaaaccagttgctcccgt Protospacer ********** **********
68. spacer 20.8|3723476|21|CP012312|CRT matches to MN480762 (Streptococcus salivarius strain NU10 plasmid pSsal-NU10, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.952
taccaaaccatttgctcccgt CRISPR spacer taccaaaccagttgctcccgt Protospacer ********** **********
69. spacer 4.5|1342822|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG973074 (Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
aaaggaatatatctctcttctgctaaagtaacattta CRISPR spacer aaaggaatatatctttcttctgctaaagtaatattta Protospacer **************.****************.*****
70. spacer 6.3|1664119|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG973074 (Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
agcaattctgatatttttattctaatcatttgaaatc CRISPR spacer agcaattctgatatttttattctgatcatttaaaatc Protospacer ***********************.*******.*****
71. spacer 8.1|1754617|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
cgctacgatttgacagctaaaaatgtgcttttcttag CRISPR spacer cgctacgatttgacagctaaaaatgtacttttcttgg Protospacer **************************.********.*
72. spacer 9.7|1887518|38|CP012312|CRISPRCasFinder matches to NZ_MF547664 (Clostridioides difficile strain LIBA-6289 plasmid LIBA6289, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
tttataacctttaattacacctcccatatcaccaccac CRISPR spacer cttgtaacctttaattacacctcccatatcaccaccac Protospacer .**.**********************************
73. spacer 11.5|2581972|38|CP012312|CRISPRCasFinder matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
ttagtgttagaaatgctttgaagagtgctattaacgat CRISPR spacer ttagtgttagaaatgctttgaagaacgctattaacgat Protospacer ************************..************
74. spacer 11.14|2581775|38|CP012312|CRT,PILER-CR matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
cagcagttaagattagagatgaagctagttcaacacta CRISPR spacer cagcagttaagattagagatgaagctagttcagcactt Protospacer ********************************.****
75. spacer 11.17|2581972|39|CP012312|CRT,PILER-CR matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.949
ttagtgttagaaatgctttgaagagtgctattaacgata CRISPR spacer ttagtgttagaaatgctttgaagaacgctattaacgata Protospacer ************************..*************
76. spacer 4.2|1342624|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
aatgtgattaaaaaaggacaaaagttggtgataccta CRISPR spacer aatataattaaaaaaggacaaaagttggtgatacctt Protospacer ***.*.******************************
77. spacer 6.4|1664185|38|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG973074 (Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
ccatcttttgttgctttacataaatttatattacttat CRISPR spacer ccatcttttgttgctttgcatagatttatattacttac Protospacer *****************.****.**************.
78. spacer 8.4|1754814|35|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
acgaaaaggctcgagtcccttatggctggtgaaaa CRISPR spacer gcgaaaaggcttgaatcccttatggctggtgaaaa Protospacer .**********.**.********************
79. spacer 8.4|1754814|35|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
acgaaaaggctcgagtcccttatggctggtgaaaa CRISPR spacer gcgaaaaggctcgaatcccttatggttggtgaaaa Protospacer .*************.**********.*********
80. spacer 8.6|1754944|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
gtgtgtataaccatatccacttttaaaacattctctg CRISPR spacer gtgtgcataaccatatccacttttaaaacactctctt Protospacer *****.************************.*****
81. spacer 8.6|1754944|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
gtgtgtataaccatatccacttttaaaacattctctg CRISPR spacer gtgtgcataaccatatccacttttaaaacactctctt Protospacer *****.************************.*****
82. spacer 8.6|1754944|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
gtgtgtataaccatatccacttttaaaacattctctg CRISPR spacer gtgtgcataaccatatccacttttaaaacactctctt Protospacer *****.************************.*****
83. spacer 11.3|2581841|36|CP012312|CRISPRCasFinder matches to JX145342 (Clostridium phage phiMMP04, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
aataattggtgatggtacaggatatacaaatgcaac CRISPR spacer aataattggagatggtacaggatatacaaatgcgat Protospacer ********* ***********************.*.
84. spacer 11.15|2581841|37|CP012312|CRT,PILER-CR matches to JX145342 (Clostridium phage phiMMP04, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
aataattggtgatggtacaggatatacaaatgcaaca CRISPR spacer aataattggagatggtacaggatatacaaatgcgata Protospacer ********* ***********************.*.*
85. spacer 1.16|411304|28|CP012312|CRT matches to NZ_CP020744 (Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.857
taacaggagaaataggaccaacgggggt CRISPR spacer tgacaggagaaataggtccaacgggagc Protospacer *.************** ********.*.
86. spacer 1.20|411502|28|CP012312|CRT matches to NZ_CP020744 (Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.857
taacaggagaaatagggccaacgggggt CRISPR spacer tgacaggagaaataggtccaacgggagc Protospacer *.************** ********.*.
87. spacer 1.16|411304|28|CP012312|CRT matches to NZ_CP020744 (Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
taacaggagaaataggaccaacgggggt CRISPR spacer cgacaggagaaataggtccaacgggagc Protospacer ..************** ********.*.
88. spacer 1.16|411304|28|CP012312|CRT matches to NZ_CP020744 (Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
taacaggagaaataggaccaacgggggt CRISPR spacer cgacaggagaaataggtccaacgggagc Protospacer ..************** ********.*.
89. spacer 1.20|411502|28|CP012312|CRT matches to NZ_CP020744 (Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
taacaggagaaatagggccaacgggggt CRISPR spacer cgacaggagaaataggtccaacgggagc Protospacer ..************** ********.*.
90. spacer 1.20|411502|28|CP012312|CRT matches to NZ_CP020744 (Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
taacaggagaaatagggccaacgggggt CRISPR spacer cgacaggagaaataggtccaacgggagc Protospacer ..************** ********.*.
91. spacer 1.20|411502|28|CP012312|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
taacaggagaaatagggccaacgggggt CRISPR spacer caacaggagcaacagggccaacggggcc Protospacer .******** **.************* .
92. spacer 1.20|411502|28|CP012312|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
taacaggagaaatagggccaacgggggt CRISPR spacer caacaggagcaacagggccaacggggcc Protospacer .******** **.************* .
93. spacer 1.16|411304|28|CP012312|CRT matches to NC_001446 (Bacillus thuringiensis sv israelensis HI4 plasmid pTX14-3, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
taacaggagaaataggaccaacgggggt CRISPR spacer aaccaggagtaacaggaccaacggggcc Protospacer * ****** **.************* .
94. spacer 1.16|411304|28|CP012312|CRT matches to NC_018511 (Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid pBTHD789-5, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
taacaggagaaataggaccaacgggggt CRISPR spacer aaccaggagtaacaggaccaacggggcc Protospacer * ****** **.************* .
95. spacer 1.16|411304|28|CP012312|CRT matches to NZ_CP009345 (Bacillus thuringiensis HD1002 plasmid 6, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
taacaggagaaataggaccaacgggggt CRISPR spacer aaccaggagtaacaggaccaacggggcc Protospacer * ****** **.************* .
96. spacer 20.2|3723107|30|CP012312|CRT matches to NC_007103 (Bacillus cereus E33L plasmid pE33L466, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tgctactccatttgctcccgttgctcctac CRISPR spacer cgttactcctgttgctcccgttgctcctgt Protospacer .*.****** *****************..
97. spacer 20.2|3723107|30|CP012312|CRT matches to NC_007103 (Bacillus cereus E33L plasmid pE33L466, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tgctactccatttgctcccgttgctcctac CRISPR spacer cgttactcctgttgctcccgttgctcctgt Protospacer .*.****** *****************..
98. spacer 20.2|3723107|30|CP012312|CRT matches to NZ_CP009967 (Bacillus cereus E33L plasmid pBCO_1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tgctactccatttgctcccgttgctcctac CRISPR spacer cgttactcctgttgctcccgttgctcctgt Protospacer .*.****** *****************..
99. spacer 20.2|3723107|30|CP012312|CRT matches to MG209611 (Aphanizomenon phage vB_AphaS-CL131, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tgctactccatttgctcccgttgctcctac CRISPR spacer cgttgctcccgttgctcccgttgctcctat Protospacer .*.*.**** ******************.
100. spacer 1.16|411304|28|CP012312|CRT matches to MN693383 (Marine virus AFVG_25M295, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
taacaggagaaataggaccaacgggggt CRISPR spacer ctacaggacaaataggaccaacaggtcc Protospacer . ****** *************.** .
101. spacer 1.20|411502|28|CP012312|CRT matches to MN855771 (Siphoviridae sp. isolate 189, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
taacaggagaaatagggccaacgggggt CRISPR spacer atacaggagaagtggggccaacgggcta Protospacer *********.*.***********
102. spacer 3.1|1146027|31|CP012312|CRISPRCasFinder matches to MT533174 (Escherichia phage CJ20, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
agaataaactgaacgcatgtgaagtttgttt CRISPR spacer caattaacccgaacgcatgtgaagtttatat Protospacer .* *** *.*****************.* *
103. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN864145 (Escherichia phage F2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
104. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN850579 (Escherichia phage mogra, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
105. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KT184309 (Enterobacteria phage ATK47, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
106. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT446423 (UNVERIFIED: Escherichia virus TH58, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
107. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LR027391 (Escherichia virus vB_Eco_mar005P1 strain vB_Eco_mar009P5 genome assembly, chromosome: 1) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
108. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK047718 (Escherichia phage p000y, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
109. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KT184310 (Enterobacteria phage ATK48, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
110. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK639187 (Shigella phage SSE1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
111. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018855 (Enterobacteria phage HX01, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
112. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_041990 (Escherichia phage ST0, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
113. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KR422352 (Escherichia phage APCEc01, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
114. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT446390 (UNVERIFIED: Escherichia virus TH12, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
115. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN850622 (Escherichia phage mobillu, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
116. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX130865 (Shigella phage SHSML-52-1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
117. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN850590 (Escherichia phage moha, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
118. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_041863 (Escherichia coli O157 typing phage 3, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
119. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_024124 (Escherichia phage vB_EcoM_JS09, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
120. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK047717 (Escherichia phage p000v, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
121. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK373778 (Escherichia phage vB_EcoM_WFbE185, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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122. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LR027383 (Escherichia virus vB_Eco_mar005P1 strain vB_Eco_mar007P3 genome assembly, chromosome: 1) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
123. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU255730 (Escherichia phage phiE142, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
124. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KM407600 (Shigella phage Shf125875, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
125. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LR027386 (Escherichia virus vB_Eco_mar005P1 strain vB_Eco_mar008P4 genome assembly, chromosome: 1) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
126. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK962754 (Shigella phage JK36, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
127. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LR027390 (Escherichia virus vB_Eco_mar005P1 genome assembly, chromosome: 1) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
128. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LR027387 (Escherichia virus vB_Eco_mar005P1 strain vB_Eco_mar006P2 genome assembly, chromosome: 1) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
129. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KP869111 (Escherichia coli O157 typing phage 13, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
130. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK373775 (Escherichia phage vB_EcoM_WFK, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
131. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK373784 (Escherichia phage vB_EcoM_MM02, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
132. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_024794 (Escherichia phage vB_EcoM_PhAPEC2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
133. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK962757 (Shigella phage JK45, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
134. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN850651 (Escherichia phage moskry, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
135. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KP869104 (Escherichia coli O157 typing phage 6, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
136. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK962756 (Shigella phage JK42, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
137. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK524178 (Escherichia phage PHB12, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
138. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG589383 (Shigella phage phi25-307, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
139. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK327933 (Escherichia phage vB_EcoM_G2285, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
140. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH243438 (Escherichia phage vB_EcoM_NBG1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
141. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT782071 (Escherichia phage JN02, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
142. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK327943 (Escherichia phage vB_EcoM_G53, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
143. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK373782 (Escherichia phage vB_EcoM_KAW3E185, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
144. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK373774 (Escherichia phage vB_EcoM_WFL6982, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
145. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK327934 (Escherichia phage vB_EcoM_G2469, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
146. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KM389388 (UNVERIFIED: Escherichia phage CEV1 clone contig00003 genomic sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
147. spacer 4.3|1342690|37|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_041920 (UNVERIFIED: Escherichia phage HP3, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
148. spacer 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR matches to NZ_CP012644 (Rufibacter tibetensis strain 1351 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
cttaaagctacataataaaaaattaagaaaaag CRISPR spacer ctactaacaacataataaaaaattaagttaaag Protospacer ** *.* ****************** ****
149. spacer 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR matches to NZ_LN865144 (Acinetobacter baumannii isolate CIP70.10 plasmid II, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
cttaaagctacataataaaaaattaagaaaaag CRISPR spacer cttaaatctaaataataaaaaatttgtaaacaa Protospacer ****** *** ************* . *** *.
150. spacer 20.2|3723107|30|CP012312|CRT matches to NC_007103 (Bacillus cereus E33L plasmid pE33L466, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgctactccatttgctcccgttgctcctac CRISPR spacer cgtcactcctgttgctcccgttgctcctgt Protospacer .*..***** *****************..
151. spacer 20.2|3723107|30|CP012312|CRT matches to NZ_CP009967 (Bacillus cereus E33L plasmid pBCO_1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgctactccatttgctcccgttgctcctac CRISPR spacer cgtcactcctgttgctcccgttgctcctgt Protospacer .*..***** *****************..
152. spacer 20.2|3723107|30|CP012312|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgctactccatttgctcccgttgctcctac CRISPR spacer aattgctccgattgctcccgttgctcctgc Protospacer ..*.****. *****************.*
153. spacer 5.1|1555309|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053952 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_798 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
ctttgaga----tatattttatatttttaaagtttattttt CRISPR spacer ----gggattgttatattgtatatttttaaagtttttttat Protospacer *.** ****** **************** *** *
154. spacer 5.1|1555309|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011154 (Bacillus cereus strain CMCC P0011 plasmid pRML05, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
ctttgaga----tatattttatatttttaaagtttattttt CRISPR spacer ----gggattgttatattgtatatttttaaagtttttttat Protospacer *.** ****** **************** *** *
155. spacer 5.1|1555309|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053949 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_799 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
ctttgaga----tatattttatatttttaaagtttattttt CRISPR spacer ----gggattgttatattgtatatttttaaagtttttttat Protospacer *.** ****** **************** *** *
156. spacer 5.1|1555309|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011152 (Bacillus cereus strain CMCC P0021 plasmid pRML04, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
ctttgaga----tatattttatatttttaaagtttattttt CRISPR spacer ----gggattgttatattgtatatttttaaagtttttttat Protospacer *.** ****** **************** *** *
157. spacer 7.5|1753919|38|CP012312|CRISPRCasFinder matches to MK301608 (Vibrio virus vB_VspP_SBP1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.789
ttcaatttctttcactattgtaattttatttgtgacag CRISPR spacer ttcaatttctttcgctattggaattttgattttcaaat Protospacer *************.****** ******. ** * * *
158. spacer 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR matches to NZ_CP039703 (Clostridium butyricum strain 29-1 plasmid p-butyl_plas_29-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
----cttaaagctacataataaaaaattaagaaaaag CRISPR spacer gtgggtcaa----acataataaaagataaagaaaaag Protospacer *.** ***********.** *********
159. spacer 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR matches to NZ_CP039706 (Clostridium butyricum strain 4-1 plasmid p-butyl_plas_4-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
----cttaaagctacataataaaaaattaagaaaaag CRISPR spacer gtgggtcaa----acataataaaagataaagaaaaag Protospacer *.** ***********.** *********
160. spacer 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR matches to CP019152 (Acinetobacter lwoffii strain ZS207 plasmid pZS-2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
cttaaagctacataataaaaaattaagaaaaag CRISPR spacer cttaaatctaaataataaaaaatttgtaaatgc Protospacer ****** *** ************* . *** .
161. spacer 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR matches to NZ_CP033246 (Clostridium butyricum strain CFSA3987 plasmid pCFSA3987, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
----cttaaagctacataataaaaaattaagaaaaag CRISPR spacer gtgggtcaa----acataataaaagataaagaaaaag Protospacer *.** ***********.** *********
162. spacer 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR matches to NZ_CP033248 (Clostridium butyricum strain CFSA3989 plasmid pCFSA3989, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
----cttaaagctacataataaaaaattaagaaaaag CRISPR spacer gtgggtcaa----acataataaaagataaagaaaaag Protospacer *.** ***********.** *********
163. spacer 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR matches to NZ_CP039148 (Acinetobacter sp. 10FS3-1 plasmid p10FS3-1-5, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
cttaaagctacataataaaaaattaagaaaaag CRISPR spacer cttaaatctaaataataaaaaatttgtaaatgc Protospacer ****** *** ************* . *** .
164. spacer 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR matches to NZ_CP039151 (Acinetobacter sp. 10FS3-1 plasmid p10FS3-1-8, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
cttaaagctacataataaaaaattaagaaaaag CRISPR spacer cttaaatctaaataataaaaaatttgtaaatgc Protospacer ****** *** ************* . *** .
165. spacer 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR matches to NZ_CP013238 (Clostridium butyricum strain CDC_51208 plasmid pNPD4_2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
----cttaaagctacataataaaaaattaagaaaaag CRISPR spacer gtgggtcaa----acataataaaagataaagaaaaag Protospacer *.** ***********.** *********
166. spacer 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR matches to NZ_AP019717 (Clostridium butyricum strain NBRC 13949 plasmid pCBU1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
----cttaaagctacataataaaaaattaagaaaaag CRISPR spacer gtgggtcaa----acataataaaagataaagaaaaag Protospacer *.** ***********.** *********
167. spacer 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR matches to MN693362 (Marine virus AFVG_25M506, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
cttaaagctacataataaaaaattaagaaaaag CRISPR spacer atgtaataaacataatcaaaaattatgaaaaag Protospacer * ** ******* ******** *******
168. spacer 13.8|2867809|37|CP012312|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014325 (Borrelia anserina Es isolate UTHSCSA plasmid lpA89, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
cttaaagctac---ataataaaaaattaagaaaaagaaaa CRISPR spacer ---aaacttatgagataataaaaacttaacaaaaagaaaa Protospacer *** .**. ********** **** **********
169. spacer 20.2|3723107|30|CP012312|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgctactccatttgctcccgttgctcctac CRISPR spacer ggtcgctcccgttgctcccgttgctccttt Protospacer *...**** ***************** .
170. spacer 5.1|1555309|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP033246 (Clostridium butyricum strain CFSA3987 plasmid pCFSA3987, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
ctttgagatatattttatatttttaaagtttattttt CRISPR spacer ttttataatatactttatatttttaaattttatataa Protospacer .***. .*****.************** ***** *
171. spacer 5.1|1555309|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP033248 (Clostridium butyricum strain CFSA3989 plasmid pCFSA3989, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
ctttgagatatattttatatttttaaagtttattttt CRISPR spacer ttttataatatactttatatttttaaattttatataa Protospacer .***. .*****.************** ***** *
172. spacer 5.1|1555309|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP019717 (Clostridium butyricum strain NBRC 13949 plasmid pCBU1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
ctttgagatatattttatatttttaaagtttattttt CRISPR spacer ttttataatatactttatatttttaaattttatataa Protospacer .***. .*****.************** ***** *
173. spacer 5.1|1555309|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP039703 (Clostridium butyricum strain 29-1 plasmid p-butyl_plas_29-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
ctttgagatatattttatatttttaaagtttattttt CRISPR spacer ttttataatatactttatatttttaaattttatataa Protospacer .***. .*****.************** ***** *
174. spacer 5.1|1555309|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013238 (Clostridium butyricum strain CDC_51208 plasmid pNPD4_2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
ctttgagatatattttatatttttaaagtttattttt CRISPR spacer ttttataatatactttatatttttaaattttatataa Protospacer .***. .*****.************** ***** *
175. spacer 11.7|2582104|35|CP012312|CRISPRCasFinder matches to MT135176 (Aeromonas phage vB_AsoM_yong, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tttgatagagatacccattctcttaatgttgctgt- CRISPR spacer ttagatagagatacccattcgctt-atacctttata Protospacer ** ***************** *** **... .*.*
176. spacer 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR matches to MN694223 (Marine virus AFVG_250M234, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
cttaaagctacataataaaaaattaagaaaaag CRISPR spacer caagttcctacaaaataaaaaattaaaaaaaat Protospacer * . ***** *************.*****
177. spacer 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR matches to NZ_CP019926 (Borreliella burgdorferi strain PAbe plasmid p_lp56, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
cttaaagctacataataaaaaattaagaaaaag CRISPR spacer tgtcactgtatataataaaaaattaataaaaaa Protospacer . * * **.*************** *****.
178. spacer 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR matches to NC_000956 (Borreliella burgdorferi B31 plasmid lp56, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
cttaaagctacataataaaaaattaagaaaaag CRISPR spacer tgtcactgtatataataaaaaattaataaaaaa Protospacer . * * **.*************** *****.
179. spacer 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR matches to NZ_CP019855 (Borreliella burgdorferi plasmid lp56, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
cttaaagctacataataaaaaattaagaaaaag CRISPR spacer tgtcactgtatataataaaaaattaataaaaaa Protospacer . * * **.*************** *****.
180. spacer 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR matches to NZ_CP019766 (Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 plasmid p_lp56, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
cttaaagctacataataaaaaattaagaaaaag CRISPR spacer tgtcactgtatataataaaaaattaataaaaaa Protospacer . * * **.*************** *****.
181. spacer 13.5|2867812|33|CP012312|PILER-CR matches to NC_020383 (Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-85, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
cttaaagctacataataaaaaattaagaaaaag CRISPR spacer ttttttagtacataataaaaaaataaaaaaaac Protospacer .** . ************** ***.*****
182. spacer 13.8|2867809|37|CP012312|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP037437 (Lactobacillus plantarum strain EM plasmid pEM8, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
cttaaagct------acataataaaaaattaagaaaaagaaaa CRISPR spacer ------gcttgttagatataataaaaaatcaataaaaagaaaa Protospacer *** *.************.** **********
183. spacer 18.1|3259469|31|CP012312|CRISPRCasFinder matches to LR606148 (Rhizobium sp. Q54 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
cactatctctggtattggcggatttatcata CRISPR spacer cgagcaacttggtattggcggatttatgata Protospacer *. ..****************** ***
184. spacer 6.1|1663988|36|CP012312|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009620 (Vibrio coralliilyticus strain RE98 plasmid p319, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
catattatcttatcatttttatttattattaaatat CRISPR spacer tgtttgttcatatcatttttattcattattaaaaca Protospacer ..* * ** *************.*********
185. spacer 10.9|2580077|37|CP012312|CRISPRCasFinder,CRT matches to KU686211 (Synechococcus phage S-WAM2 isolate 0810PA29, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
actttgccttttcatctattccagcaccatttagaaa CRISPR spacer taatttccttttcatctgttccagcaccagaacggac Protospacer ** ***********.*********** *.*
186. spacer 20.3|3723161|48|CP012312|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.688
atttgcccctgttgctcctgttgctcctgtagctcctgctactccatt--------- CRISPR spacer ---------tgttgctcctgttgctcctgttgctcctgttgctcctccagcaggtcc Protospacer ********************* *******.*.**** ..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
276755 : 292936
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP012312|276755:292936|DBSCAN-SWA ATTATCTATTTTTATATACATTTCTATGTATTTTATTTTTATCAAATCGGTCTATAAATTCATTTTTTTCTTCACTATATCCAATAGATATAAGTGCATAAGGAACTAATTTTACTGGTAAGTCTAAAGTTTGTCTAACTTTATTTACTACTTTATTTTTAGGAAATACTCCTGCCCAACAAGCAGCTAGACCTTGATTAGTAACTTCTAATAATAAATTTTGTGTGCAAGCACCTAAATCTTGTATCCACTTACCAGGTTTTAAGAATTTATCTCTATTTCCAAGCACTACTATACATAATGGTGCAAACTCTACATGCTTTGCTCTATGCTGTGACTTTGAGAGCTCTTTCAGTAGTTCCTTATCATCTACTATAATAAATTCCCAAGGCTGAGCGTTTTTTGATGAAGGTGCTTGCATAGCTGACTTTAGTATTTCAGTTATTTTCTCTTCTTCTATATTTTTATCTTTATATGTTCTTATTGAACGTCTATTTTTTATAACTTCTAACATACAGATTCTCCTTTAAATAAAATTATTTCTATTTATATAATATCATTACTTTAAATTTTAGCTATTACTTATATAAAGAATAAACTTTGTATTGGTTTTATCTAAGTAAAGCTAACATTCAGAACTAAAAAACAAGATTATAAATCCAAGGTATTAATTAAAAAAGAAGTAATAAAAAATAATATACAAGATTTTAAAAAGGGTATTGAGCTTAAAATTTAATTAGAAAATCAATTTTGAGATAGCCTGTTTTTTATTTTAACAAAAAAACATAAATAAAGTTCGATACGTAGCGAATGAAAAAAATACAAGAAATATTTTTTTTAAAAAATTTCAAAAAAGAGTTGATAATATATGTATATTAATATAAAATTTAAGGTGTATAATTCGTATAATAATACGGATGATTTAGAGTGTAAAATAACTTATAAACGGAGAGGGGAAGTCTAATGAAAGTAGCAGTAGTTATGGGTTCAAAATCAGATTATCCAAAATTAGAAGAAGGGATAAAACTGCTTGAAAAATATGGAATAGAAGTTGTAGCAAGAGCATTATCAGCTCATAGAACACCAGAACAACTTTCAATATTCCTAAAAGAAATAGAAGATGATACTGATGTAATAATAGCAGCAGCAGGAAAAGCAGCACACTTACCAGGTGTAATAGCTTCACAAACATTAATTCCTGTAATAGGATTACCTATTAAATCATCAACTATGGATGGACTAGACTCACTTTTATCAATAGTTCAAATGCCAAAAGGAATCCCAGTTGCAACAGTTACAATAGACTTAGGTTTAAACGCAGCTTTATTGGCATTACAAATAATGACTTTAAAATACCCAAAATTAAAAGAGGATTTGAAATCATATAGAGAAGAGATGGCACAAAAGGTGTTAGAAGACGACAAGAATTTAAGGGGGTAGCAGAAATGTTATTATATGAAGGAAAAGCAAAACAAGTATATTCTACAGATAATGAAAATGAATATGTTGTTTATTATAAAGATGATGCAACAGCATTTAATGGAGAAAAAAAAGCAGAAATATCTTCAAAAGGTATACTAAATAATAAGATATCAACAATAATCTTTGAAATGTTAAAAGAAAATAATATAAATACTCACTTTATAAAAAGTTTATCAGATAGAGAAATGTTAGTTAAAAAAGTAGAGATTTTACCATTAGAAGTAATAGTAAGAAATATTGCTGCTGGTTCTATCTGTAAAAGAGTTGGTCTTGAAGAAGGTGTAGTTTTTGATGAGCCAATTTTTGAAATAAGCTACAAAAATGATGCTTATGGTGACCCAATGCTAAATGATGATTATGCAGTGGCAATGAAGTTAGCAACTAGAGAAGAATTAAAATTCTTAAGAGAAGAAACTTTAAAAATAAACGAATTACTAAAAGCATTTTTCTTAAAATTAAACCTAAAGTTAGTTGACTTTAAAATAGAATTTGGTAAGGATTCTGAAGGAAATATAATACTGGCAGATGAAGTATCACCAGACACTTGTAGACTTTGGGATGTAAATACAAATGAAAAGTTAGATAAGGACAGATTTAGAAAAGACCTTGGAGACCTTGTAGAAGGTTATACGGAAGTACTTTCAAGAATGAATAATAAATAGGAGGCAAATGTATGTGTGGAGTTTTAGGGATTTACTCTAATAAAGATGTAACTAAAGAACTATATTATTCTTTATATTCTATGCAACACAGGGGGCAAGAAAGCTGTGGTTTAGCTCTTTTAGATGATGGAGAAATTAAGTACAAAAAAGATATGGGATTAGTTGGAGATGTTTTTAAGGAAAATGAATTATCTAAGTTAAAAGGAAATATAGGGATTGGACATGTTAGATATTCAACAGCTGGAGGAAGTCATGTTTCTAACTGTCAACCTTTAGTTGGAAGTTGTAGAAAAAGACAATTAGCCATAGCTCATAATGGAAATCTAGTTAATGCAAATTATTTAAAAGATATGCTAGAAGAAGATGGATATATGTTCCAAACTAATTCAGATACAGAAGTGATTTTATATATACTTGCGAGATATTACAAAGGGGATATAGTAGAAAGTTTAAAAGTGACAATGGATTATATAAAAGGTGCATATGCTCTTGTAATAATGAGTCAAGAAGAATTGGTTGCAGTTAGAGACCCACATGGATTCAGACCTCTTGTACTTGGTAAAAAGGGTGATGAATATATATTTGCATCAGAAAATTGTGCAATAGATATACTTGGCGGAGAAGTTATAAGAGATGTAGAGCCAGGAGAGATAATAGTAGTTAAAGATGGAGAACTAAAATCATATTTTTATTCAGAAAATTATAAACCAGTTAAGAAAAGTTGTATATTTGAACACATATACTTTGCAAGAAATGATGCAACTATAGACAATGTAAATGCATATGAATTTAGAATTAAATGTGGTGAGAGATTAGCTCAGAATGAAACTGTAAAGGCAGATATGGTAGTTCCAGTTCCAGATTCAGGTTGGCCAGGAGCTATTGGTTATGCAAATGCTAGTGGATTAAAAATAAGTGAAGGCTTAGTTAAAAATAGATATGTAGGAAGAACATTTATAAAACCTACACAAGAAGAAAGAGAAATAGCAGTAAAAATAAAATTAAATCCTCTTTCAACAATAATAAAAGGAAAGTCTATAATTTTAGTAGACGATTCAATTGTAAGAGGAACTACATCTAAACAATTAGTAAAATCTTTAAGAGAAGCAGGAGCAAAAGAAATTCATCTTAGAATAACTTCTCCTCCAGTAGCTTACTCTTGTTACTATGGAATAGATACTCCAAATCGCTCTAAATTAATTGCATCAAGTAACAACGTAGAAGAAATGAGAGAATATATTGGATGTGATAGTTTAAAATTCCTAGATATAGAAGGAATGTTAGATGCAACAGAACATAAGTCTACTTTCTGTAAAGCTTGTTTTGATGGAGAATACCCAGTTAAGAAAATTGATAAGGAGGAACTACTTTCATGTTAACATATAAAGAATCAGGTGTAGATATAGATGAAGGAAATAGAGCAGTAGACCTTATAAAAGGTAAAATAAAAGGAACTTATGATGGAAATGTAGTTGGAGATTTAGGTAACTTCAGTGGATTATACAGTTTAAAAGATTTTGTAGGTATGAAAGAACCAGTTTTGCTTGCATCTACAGATGGTGTTGGGACTAAGTTAAAAATAGCTCAGATGATGGACAAGCATGATACTGTTGGAATAGATTTAGTTGCAATGTGTGTGAATGATTTAATTTGTCAAGGAGCAAAACCATTATTCTTCCTTGACTATATAGCTCTTGGGAAATTAGTTCCTGAGCATATCGAAAAAATAGTTGGTGGAATTGCAGATGGTTGTAAAATGTCTGGTTGTGCACTAATTGGTGGAGAAACTGCTGAAATGCCTGGAATGTACGGAGAAGATGACTATGATTTAGCAGGATTTTCTGTAGGAATAGCAGACAAAGAAAAGATTGTTTCTGGAAACAACGTTAAATCAGGAGATGTATTGGTTGGTATATCTTCAAGTGGAGTACACAGCAATGGATTTTCTTTTATAAGAAAGATATTTTTAGAAACTTACAATTATAAAATGGAACAATATGTTGAAGAACTAGGAATGACAGTTGGAGAAGCACTTTTAACACCAACTAAAATATATGTTAAATTAGCTTTAGATGTATTAGCTAAACATGACATAAAAGCTATAGCTCACATAACTGGTGGAGGGCTTATAGAAAATATAACAAGAGTTATACCTAAAGGGTTAGGACTAGATATCAATAAAAAATCTTGGGAGAAGCCTCCTATATTTAAAATGATAGAAGGTTTTAATGCTGTTGATGAGAGAGAACTTCATAAGAGTTTTAACATGGGTATTGGGCTAGTTTTAATAGTAGATAAAGAAAATGCTGATGATGTTGTAAACTTTATAAATAATAGAGAAAATGACAATGCTGCTTATGTAGATAAAAAATATAGTGAATTATTAGAAGATAAAGCGTATATAATTGGTGAAGTAGTAGATAGTCATGAAGGTGTAGAATTATGCTAAATATAGGAGTTTTAATATCTGGTGGAGGAACAAATTTACAAGCAGTTATAGATGGGACTGAGTCTGGAGAAATAAAAGGTCAGGTTAAAGTAGTTATCTCAAGTAAGCAAGGTGCTTATGGGCTAGAGAGAGCTAAAAATCATAACATAAAAGCAATTTGTGAAACTGATGAAGACAAGATAATAGAAATTCTTAAGGGAAATAAAATAGATTTAGTAGTTTTGGCTGGTTATTTAAAAATAATCAGCCCAAAGCTGGTTAATGAGTTTAGAAACAAAATGATAAACATACATCCATCATTAATTCCTTCATTTTGTGGAGCTGGATTCTATGGAGAAAAAGTTCATCAAGGTGTTATAGATTACGGAGCTAAAGTAACTGGTGCTACAGTTCATTTTGTTGATGAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP012312|276755:292936|281340_281934_+|AXU73968.1|DBSCAN-SWA MLNIGVLISGGGTNLQAVIDGTESGEIKGQVKVVISSKQGAYGLERAKNHNIKAICETDEDKIIEILKGNKIDLVVLAGYLKIISPKLVNEFRNKMINIHPSLIPSFCGAGFYGEKVHQGVIDYGAKVTGATVHFVDEGADTGPIIMQDVVKVNQDDDAKTLAKRVLEVEHRILKESISLFCENKLKLQGRRVFINE >CP012312|276755:292936|278199_278898_+|AXU73965.1|DBSCAN-SWA MLLYEGKAKQVYSTDNENEYVVYYKDDATAFNGEKKAEISSKGILNNKISTIIFEMLKENNINTHFIKSLSDREMLVKKVEILPLEVIVRNIAAGSICKRVGLEEGVVFDEPIFEISYKNDAYGDPMLNDDYAVAMKLATREELKFLREETLKINELLKAFFLKLNLKLVDFKIEFGKDSEGNIILADEVSPDTCRLWDVNTNEKLDKDRFRKDLGDLVEGYTEVLSRMNNK >CP012312|276755:292936|280270_281347_+|AXU73967.1|DBSCAN-SWA 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14 | Synechococcus_phage(23.08%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
618303 : 661836
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP012312|618303:661836|DBSCAN-SWA AATGATTAAAGTTGCTTTAAAAGATGGCTCAATAAAAGAATTTGAAAATGCTATTTCTGTTATGGATGTAGCTAAATCCATTAGTGAAGGATTAGCTAGAAATGTGGTAGCAGCGTCTGTGAACGGAGAGGTTGTAGGTCTGGACCACATTATAGATACTGACTGTGACTTGAATTTATTTAAGTTTGAAGATAAAGAAGGTAAGGAAGTTTTTAGACATACATCAGCACATATATTAGCTCAAGCTATAAAAAGACTTTACCCAGAAGCAAAACTTGCTATAGGACCAAGTATAGAAAATGGATTCTACTATGATATAGATTTAGACCATAGATTAGTTCCAGAGGACCTAGAGAAAATAGAAGCTGAAATGAAAAAAATAGCTAAAGAAGATTTAAAAATAGAAAGATTTGAACTTCCTAGAAATGAAGCTTTAGAGCTTATGAAAGAACAAGGAGAAGACTATAAGGTAGAACTTATATCTGATTTACCTGAAAGTGAAATAATATCTTTCTACAAGCAAGGTGATTTTACTGATTTATGTAGAGGACCACATTTACCATCTACTAAAAAGGTAAAAGCTGTTAAATTACAAAGTGTAGCAGGTGCATATTGGCGTGGTGACGAAAATAATAAGATGCTTCAAAGAATATATGGAACTTCTTTTGAGAAAAACAAAGACTTAGAAGAGTACTTACATTTACTAGAAGAAGCTAAAAAGAGAGACCACAGAAAATTAGGTAAAGAATTAGGATTATTTATGATACCTGAAGAAGGTCCAGGATTCCCTATGTTTTTACCAAAAGGTATGGAACTTAAAAATGAATTATTAAAATTCTGGAGAGAAATACACAGAAAAGCTGGATATATTGAGATAGAATCTCCAATCATATTAAATAGAAAATTATGGGAGACTTCAGGACACTGGTATCATTACAAAGAAAATATGTATACAGTTAAAATAGATGATGAGGATTATGCTATAAAACCTATGAACTGTCCTGGTGGATTAATTTACTATAACTCTCAACTACATTCATATAGAGATTTCCCAATGAGGGTTGCAGAGCTTGGTAGAGTTCATAGACATGAGTTATCTGGTGCATTACAAGGATTAATGAGAGTTAGAGCATTTACTCAAGACGATTCACATATATTCATGTTACCAGAGCAAATTAAGGACGAAATAAAAGGAGTAGCTAACTTAATAGATGGTATCTACAAAACTTTTGGATTTGAATATAATTTAGAATTATCTACAAGACCAGAGAACTCTATGGGAAGCGACGAAGAGTGGGAAGCAGCAGAAAATGGATTAAGAGAAGCTTTAGAAGAGTTAGGTCTACCATATACTATTAATGAGGGTGATGGAGCATTCTATGGTCCTAAGATAGACTTCCATCTAAAAGATTGTTTAGGAAGAACTTGGCAATGTGGTACTATCCAATTAGATATGCAACTTCCAAGACAATTTGATAATACTTATATTGGTCAAGATGGTGAAAAGCATAGACCAGTTATGATTCATAGAGTTGCTTTTGGTAGTATAGAAAGATTTATAGGTATATTAATAGAGCATTATGCTGGTAAATTCCCAGTTTGGTTATCTCCAACTCAAGTTAAGATACTTCCTATATCTGATAAATTTATGGATTATGCAAATGAAGTTAAGAAAGAGTTATTTGATAAGGGTATAAGAGTTGAATTAGATGATAGAGCTGAAAAAATTGGATTTAAGATAAGAGAAGCTCAGCTTGAAAAAGTGCCATACATGTTAATAGTAGGTGAAAAAGAAGTAGCTGATAATAATGTTTCTGTTAGATCAAGAGATAAAGGTGAAATAGGTAGTATTAAATTAGATGAATTTATAGCTAGTATTTCAAAAGAAATTGAATCAAGAGAAAGTATTATTCAAGACTAATATACAATATATTAGTAGCTAAGATATTGTTATATAAGATAAGTTTAATCAATATGTTGATATGTTGATGCATAGTGATTAAATTTATGAAAAGATGAGTATAATTAGAGGTACATTAATCATATTTTTATGATTAATGTACCTCTAGTTTTTTGTATGGTAGATTTATTAATAAATATATCATAGAAGTGTTTTGAACATGGAAATATTTATGTGCATTCTTTAAATAAAAGTTTATTTTTTGAGTGATAATTAAGTACTTGTTGGTAAGGCATGGCTGTAAAAATCATAACTTTATTTTCATATTTGTTCCATTTTCATAAAAATTATTATCCCTTTAAGAAAATTTCTTAATCCCCTTGAAATATTTCCTTTTTAGTCTAAAGTTAAATTTCTTTCTTCAAAATGAATATTTAAATGAACTAAAATTTAAGTACATTTTCTAATCTTAATGAGTCTATTTTTCATAGATAATTGCCCTATAATAGAAGGAGCCATGTTGGGGCTATGTGGTAACAATAACGGCATTGCCAGTGATTAATTAATGTTTTGTAAATATTAATTAATGTCTTGTGTTATTTTTGGACTTACCCCCTATACATAGATTAATTTATTTAACTTTAGATATAGAGAGAATGTCAAATACATACACAGACGTTAGAGTTTAAGAAATTGTTTATGGAGCAAGAACTTTTAAAAGAGGTAGTAACTTAGCTTAATTTCAAGAAATGATAAATACAAAAGAGTAAAAAGAGAGGTGTTGAAATGATAGAAAAAGTAGAAGAAAAATCTAAGATTATTAAAACATCAAAAGAATATAAGCGAACTATAGTTGAAGAAAAAGATAAAGAATGGACCAAAAAATTAAATGACATACTTAGTAGAAGTAGTTTTTCTAATGATGAATTAGATAAAATCAAGGAGTTAATTCCAAAAGAGATTTTGACTTGTGAAAATGTTGGAGAAGTTGTGACTGAAGATGGATATGCTAAGCCCGAGTATGATGAGGTATTTAAATCATTGTTCACTTTAAATAATGAATATGATTTACTTGTAAATTTTATAAATGATATTCTAAAAGATGCTCCATATGCTAACAGGAATATCAAACCGTTCACTCAAATAAAGAGAATAATTAGAGTTGAAACTGACCCAACAATTAATTACATTGGAGAGAAAAGACCTAGACTCGATATTTTGGCTGAAGATGAAGAAAATAATCATATAAATATTGAGATGCAAAGAGCTTTTGAGAACGATTATTTGGAAAGAGCTGAATATTATCTTAGTCGTGTACATGGTAGAAAGTTAGAAGAAGGTAAAGAGTATAAAGAAATTGGAAAAACTATTGGAATACATATACTAAATCATGTAAAATATAATCACATAGAAGATTATGTAAATTGCCTGAGATTAACAATGGACGGGCATCCAGATATTTATTCTAGTAAAACTGCATTATATTTTATAGAGCTTCCAAAAATTCATAAATCTGACTATATAGTAAATAGAATTATGCTATGGGGAAAACTTATTAGTAATCCTTCTAGCTTAGATGTAAGAGTTATAGCTAAGAATGATTCTATTATTAAAAAAGCACTTGATAGATTAAAAGAATTAGGTAGCAATGAAGAATATTTATTAAATCTGAAAAGAGGTGCTTATATCATGAATAAAAGTAGAAATTTTAAAGAAGAGATTGAAAGAGAAACGGAAACAAGAGTTGCAAGAGAGACAGCAATTAGAGTTGCAAAAGAAAAAGATTATAAAATAATTATAATGTTGAAAAAAAACGGTTTTAAATTAGATGATATATTAAATAAATTTAATGATTTTGACTTAAGTGAAGATGAGATAAAAGAAGTCTATGAAAATAATTGATGTGTAAATAAAAAGTGAACTTATATAAGTTTGCTGAATCTGAGTCTGGAAATATTTATGTGTATTTTTTAAATGAATGAAAATTTATTTTAAAGACCATAATTTAGAGGTACAGTTAATTATATTTTTATGATACTGTACTTCTAGTTTTTTCTATTATAGATTTATTATTTATTAATAAATCTACAATAGAAGTGTTTTTGTTGTAAGAATCATTTTATCTAATGATTGTTTTTTATAATAGTTAAATTTCCATTTGTAGTGCTTAAATATAAATCTGTAATACCATTTTTATAAGTGTATAAATCACTATGGCGATTCAACTCAAAGTCACTGTCCAAAACACCAGAAACTTTATCAAAATTTAAAGTGAAACCTGGATTATCAGGAATAGACAAATCGACATTGGCAGAAGTAGTTTCACAGTACAGAGAAGACAACATTTTGCTAGAAGTGATTTTTATATTACTGCTAGTTGACTCAGCTTTAATATCAGAAAAAACTCCAGATAAGTTCATTTTTCCAGAAACTGAACTACAAGTAAGATTTTTATTGTATATATCTTTTAAATTTATATTACCATTAGTTGTTTCTAAGTTTAAAACATCAATTTTCCCAGAAAGCTGTATTTCACCAGATGTTGATTTAAGAGTAGCATTTTTACTATTTAGTTTTGCTATATCAATGTGACCACTAGTTGTGTCTAAATTTATTTTATTAATATTACCAGAGAGACCTATTGCACCTGAAACTGTGTTAGCTTCAACTGTATTACTTCTTATGTAAGTGCTATATATATCTGCTGAAGTAGTATATAAGGTTATTTTATCATAAAGCTTATTGGGCAAATATAGTTCAAGTATTGTTGGTTTTGGAAGATTAATTCCAATGAAGAATTTTTTAGCTGAATTATCATATATAGAAAGAGAATCTCCATCAACCATTATTTTTGCTAGTTTTTTCTTTGAGAAATTACTAGGGATTTTTTGAATTAATTTGATTTTATTAGAATCACTTCTCTTAACTATAACTTCACCTGAAATCCAATCAACATTAATGTCATTTATTTTATCTGAAAAACTTTCATTTTTAGCCACTATATAGTTATCATAATTGTATTTAGGATTAAGAATATTAAAAGGGAAATTAAAAGAATGTGAAATTATAGTTCCTATAAGGAGTGAGACAAATACAATAG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33 | Streptococcus_phage(22.22%) | coat,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1012859 : 1072183
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP012312|1012859:1072183|DBSCAN-SWA 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|
92 | Clostridium_phage(76.32%) | holin,integrase,portal,terminase,plate,tail | attL 1017495:1017517|attR 1072369:1072391 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1480119 : 1504493
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP012312|1480119:1504493|DBSCAN-SWA 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29 | Clostridium_phage(54.55%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1584892 : 1594621
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP012312|1584892:1594621|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP012312|1584892:1594621|1593454_1594621_+|AXU75164.1|DBSCAN-SWA MENKSNKKELKKVTAKTLIEKGKKQGSLTLAEIMEAFSETELDKDQVENLYETLGNLGIEITETKNYKADIDFSVADDDLSIGHLDEDAEAISHDDSSAIEIETVDLSLPKGISIDDPVRMYLKEIGKIPLLKPHEEVEFARRMHEGDEIAKQRLVEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNLGLIKAVEKFDYTKGYKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVSRQLLQELGRDPKPEEIAKEMEMTEDKVREIMKIAQDPVSLETPIGEEEDSHLGDFIPDDDAPAPAEAAAYSLLKEQIEDVLGSLNDREQKVLKLRFGLEDGRARTLEEVGKEFDVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKKLRDYLD >CP012312|1584892:1594621|1588321_1588894_+|AXU75158.1|DBSCAN-SWA MNKVDKEKIQHAVREILEAIGEDPDREGLIETPNRVARMYEEIFSGLSEEPRDHLKVLFADEKHEELVLVKDIPFYSCCEHHLVPFFGKAHIAYLPKGGRLTGLSKLARVIDTLAKRPQLQERITKNAADIIMEELQPYGVLVVVEAEHMCMTMRGVKKPGSKTVTSAVRGIFEKDIASRAEAMSLITMK >CP012312|1584892:1594621|1590606_1591392_+|AXU75162.1|DBSCAN-SWA MKENLFNNNSKIEINTNNKKITVKKDKLIIAGPCAIESYEQLLETAKFVKSQGANILRGGAYKPRTSPNSFQGLKKEGLEILKAVKDEVGMAVITELMDVRDMDELYSISDIIQIGSRNMQNFTLLSEVGKQDKPVMLKRGIASTITEWIGASEYIAIEGNSNIIMCERGIRTYNDYTRNTLDLAAVPIIQKETGLPVVVDPSHATGVRYLVKPMSLASFACGADGIMVEVHPDPENALSDGAQSLCFNEFEDLMKSINNY >CP012312|1584892:1594621|1585478_1586828_+|AXU75155.1|DBSCAN-SWA MIREINTKLNSFEIFTIFRNEHDSFILDSAMDKEKLGRYSFISSQPFKVLKYKDTDENPLEVLKEELHKYRVANDTNLPFVGGAVGYLSYDLGNYIENLPRTAVDDIEMPDMYFGFYNHVIVIDHLVQKTYIATPNIDIELEEKIMDDIEQRILKEEKKGIDSICYEEKEVTPIRLKSNFTKEEFKNAVQSVREYIRQGDIYQANLTQRFSGETELTSFELYRDLRRFSPAPFGAFLNFEDTHILSNSPERFIKCVNKRIETRPIKGTRPRGKDKEEDLKLQQELRNSEKDRAELLMIVDLERNDIGRISKTGSVKVPELFVIEPYANVNHLVSTVVGELKDDKDATDVIKATFPGGSITGAPKIRAMEIIDELEPTQRNVYTGSIGYIGFNGDMDFNIAIRTIIKNDKKVYFQVGGGMTWDSDPDEEYQETLDKAKSIMKALRGYYEE >CP012312|1584892:1594621|1590119_1590626_+|AXU75161.1|DBSCAN-SWA MNKVYLGIGTNMGDRFDNLSRACELLKNSDSIYKVKESSLYETKPWGYTEQADFLNMCVEIETEFEPYELLEYCQGIERELHRERIVHWGPRTIDVDILFFNDVVSTDEKLTIPHPRIQDRAFVLIPLMDLNEELIINEKTIKEHLNLLSAEEREEVKELVGYERKPI >CP012312|1584892:1594621|1584892_1585477_+|AXU75154.1|DBSCAN-SWA MILMIDNYDSFVYNLVQYIEELGETVVVKRNNEIKISDIEELNPEVIVLSPGPCSPKEAGICIDVVEHFKGKKPILGICLGHQTIGHVFGGDIIKAQQPVHGKVYSISHTNKGVFSGLKNPLNVTRYHSLIIDSNTVPKELEITATTDKGEIMGIRHKKYLIEGVQFHPEAILSEYGHEMLKNFITEARERVHM >CP012312|1584892:1594621|1588959_1589751_+|AXU75159.1|DBSCAN-SWA MFDYGKRTYIMGILNVTPDSFSDGGDFNNLDIAIQHAKDMVDQGADIIDLGGESTRPGHSYVDSEEELRRVIPVIKKLKQELDIPISIDTYKADVAEEALKLGVTMVNDVWGLRRDKNMASVIGKYDAEVCIMHNQDGTNYDKDIIASIKEFLKESIEMAISCGVKKEKIVLDPGIGFGKDFEQNIEVLRRLNELKDLGYPILLGTSRKSVIGKVLPVEPKKRLEGTIATTVLGIRDGVDIVRVHDVYENLMAARMTDAIYRK >CP012312|1584892:1594621|1591646_1593437_+|AXU75163.1|DBSCAN-SWA MNDIKDIIEEIKARCDIASIISEYMNIKQSGANYKGLCPFHGEKTPSFYINTSKQIYKCFGCGEGGDVINFVMKMENLDFMDAVKILANKCGIEINTNMNEETRIKIEKSKKFQDIHTEAARFYLSNLLGSKNLGYEYLRIRGLDDKIIKKFGLGFSLDSWNSLMNTLISKGYKKQDLLECGLIAKNRDGTNCYDKFRNRVMFPIFDYRGNIIGFGGRVLDDSLPKYLNSPDTLIFNKKQNLYGLNFARKNLESKTIVLVEGYMDLISLYQYGIKNVVATLGTALTEQQGILIKRYADTAIISYDSDEAGIKATLRAIDILTKLGINVKVLDLKDAKDPDEFVRKYGLSDYKKAMDVSTHYIKYKIDHLKKEFNIQKDEERVKFAKEASKIIKQLTSPVEIDFYTKYLSNQIDINVESIKREVYGKNYNKPYNNKNQKKIEEKVIEKVEVRQDGKQLVEETLIKIMLEDKKIREIALLKVEESDFLLKESKEILNYMIKNQELDKITIDKLKSLNISEEYLKELNSISLNSINLENTKEIEGIITNIRKNSLEEQINSLLREQQELENNNDMKEVDGRVMEIALKIVEINKILKSL >CP012312|1584892:1594621|1589761_1590127_+|AXU75160.1|DBSCAN-SWA MDKILLSNLGFYGYHGVLKEENFLGQKFFVDMELYIDSREAGLSDDINKSVSYAEVYNVVKDITENKQFNLLEALAENIAEEVLNKFILINGVMVRVRKPEAPVNGIYDYFGVEIRRTRDE >CP012312|1584892:1594621|1586817_1587561_+|AXU75156.1|DBSCAN-SWA MKNNVGFDSSLSKFGIGLFETIRVKNGIAIDLNIHIERMISSINCLDLDINYKKDFLINEIVTYIKKENVINKALRITVFDEGYNISIRDIPYNQETYEKGFKLAISPIVRGNSLIHRHKTTNYFENIYTKNIANKTGYNDGIFLNSEGVILECSMSNIFFIKGERVCTPSDRLPILNGIIKKRIIEICDELHIELIENEINISEISSFDFVFVTNSLMGAIKVTEIDKIKFNKENVVFDKIVKLLE >CP012312|1584892:1594621|1587594_1588296_+|AXU75157.1|DBSCAN-SWA MIGCIYEVYNEEMTKIIENQNTLAVYLVGSSKDVDFTLYDVEINDIDVFVFVKEGEKQERILFKKKGIEFDINYFSKDGVKKLLSNREYFFVKEMKDAKVLFDRESISHIIKDISRNIYLEGPSKISLEEKSFIKQDIGAKISNLKNKEKFDGFEYHFLTNLYLKDIIIGYFNINDKWVPKDKKLLKVLKKENNELFELVSKVSENYDYQRLLDVYNYIFKEIETKEVIKLIF |
11 | Pandoravirus(37.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1719877 : 1774328
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP012312|1719877:1774328|DBSCAN-SWA 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73 | Clostridium_phage(85.94%) | capsid,portal,head,terminase,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2127443 : 2134687
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP012312|2127443:2134687|DBSCAN-SWA 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8 | Clostridium_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2557466 : 2621244
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP012312|2557466:2621244|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP012312|2557466:2621244|2590575_2591139_-|AXU76099.1|DBSCAN-SWA MDWLKELLEGIKVEDNKIDVASLQKSIEKKIKETTVTQEDYANIETQLNTANEAIKKFEGGMTKEDVENLKTTYETDKKTLEETYKKEIEEKDFNYWLNDAFKSVKCRDEIALKAHLDMEALRNSKDRQKAFEEQINPLKQDKDYLFNATLEGEEPKIDTITPGQEPKINDFGFNFTGVRPHENNNK >CP012312|2557466:2621244|2598917_2599847_-|AXU76106.1|DBSCAN-SWA MVCAYCGQEAKGTREHIISCAILDLFPECFITIDTIRDKVYLGDPVVKDVCAECNNNKISYIDSYAKDVISNYFIQKYEKDDMLDFVYNYTLVQKMLLKYAFNDLRSHKDDTSFFNSNILDFLMNKDIVEPLRNVTILAGLAINTSPIPDFIFGNNKIRWGKDPAFFSNSIIEHLDYNTGEISLRNENPHQEFKKMSFSYVFRFNSVQFLLICWDDNISDEDLEENNVILQYQYPYTILSSEGHHTLSRCTSEVTYQHEMLIDVILGQGIFDEVTFMRGTYSYKNQQYLKEIEIEWQKEEKDLARRFSR >CP012312|2557466:2621244|2566399_2566615_-|AXU76065.1|DBSCAN-SWA MTFKELVNKVRNLVLEAKNVTIEDTENNFTSDNVEDALKELAIKQNLLDTELNGQKTRGISIANTLTDMFL >CP012312|2557466:2621244|2577125_2577896_-|AXU76077.1|DBSCAN-SWA 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98 | Clostridium_phage(82.05%) | capsid,portal,terminase,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2862408 : 2875262
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP012312|2862408:2875262|DBSCAN-SWA 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ATTAAATTATCCATATCTTAATCTCTTAATTAATTAAAATATTCCTCTTTGAACTGCAAATATAAAAAAACCTATTAAAGTAGTAATCATTGGCGTTTGGGTGATTTTTTATTTTCTCGTAAATGTAAGCTGACACAATTCCAGCTACTATACTCAATAAAAAGTTAATTAACATATAAATTCACCTCCTTCCTATATTGGAATTTGGCGTTTATATGAGAAAATCACCCTCAGCTTTTCAACTTTATTTTCCTTGCTACAATTATTATATCATATAATTCTTACATATTTTAACAAATATTTCAATTAAGTACACAGGTTTGAATATAAAAAAGCACCTACCACAAAAGTAAGTGTTTTTCAGTATTTTTAATTTTAAGTCCATATAGTTAATATAAAACCTTAAAGCTACATAATAAAAAATTAAGAAAAAGAAAAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACATTTATTGTCAGTACCTGCACTTGACGACACATAAGTATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACGCGGAAGGAGAACTTAATTTTTATTTTGCTAAAGAAGAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACCCCAAAATAAATTGAGTATTTCCAATGCCTACACACATACAAATCTCTCAAATTTGCAGTGAACCATGAGTAGTGCAATTGATAACACTTATCACAAGTCCTCAATGCCTTATATTTCAACTGTTAAGCCTTAATTTCTTCAAAAAATCGAACACTGCAAAATTTCTATGACTTTATTATATCATAAAAATATTATTTTTGAATATCTGTACCAATTTGTGATATAATAAAAGCAAGAAGAACTACAATCTATTTTGCTGTAGAGTGGAGTTCATAATTTAGAAATTACTTAGTTTTATGGAATCTGATTTTTAAATCAAATTCCCAACCACTCTTAGTTGCCGCTTTGAGTGGTTTTTTACGCTTTCTAAATAGTTTGCTAGCTACATAAACTATTAAGCTAGCAGATAGACTTGCTAGTATGCCTTGTAAAAAATTATCCATGTATATTCACCTCCCTTCTTAACGTCGGGAGGATAATTTTTTGATACATGAACTCCACTCTATAAATTGTAGATTACATCTTCTTGCTAAAAATATTATAACATATAATTTTTACATATTTTACCTATTTATTACTTTTTACATTATAATAATATTCTTTTAATCAAAAAAACACCTACTATTAAAGTAAATGTTTTTAAGTATTTTTAATTTTAAATCCATATAGTTCATATGAAACTAAATATAATAACTCAACATATGAGCAATATCGAGACATTTACATACCACATAGTTAATATAAAACGAAAATAAAAAAATTAAACTTATAAAACCCTTATTAATTTACATACCCACTAGTTATTTATATTCAAAAAAATCTTCTCCATCTGGGTTATAAAATAATATTCTACTTGCCAATCCTTGTTCATATTTATAATTTTCTTTATCTCCTACATAAGAAAATGTTAATGTCATGCTTCTTGATGGATCTAATGAAATTATATCTAAATAAATAGTACATTTTTCTCCTGGTTTTAATACACCAAAACTATTAAAATCCATTTTTATTTTAGCGTATTGCCCCATATATAATGTTGAATTAGCTTCTCCATAAACTTTTAATTTTGTTACATCTAAATTTTGTGTACTTGTATTTTCTATATTTATAGGAACTGTTGGGTCTTTATATTTTTCAGTATAATATTCAAGGTTATCATCATAACATTCAAGATAACTTCCTTTATCTTGCCAAATTATGTGATTTGAATCAAAATCAATCTTTAATCCACATATTATATTTTTATTTGAAGATGGAAGACTAATATTATTGATGGTATTTTCACACTCTAGCATAATTTTATCACTTAGATTTCCTATCCCGGTTACTTTTGCAGCATTTTTAAGTATATCTTTATTACTTCCAATATCAACTAGTACAATAGGATTATTTTTAGCCATTGGTGAACCAACTAAAGCATAAACTAAATCAGTACCACTAGCTATATAAAATTCTTTTGCGCCATTATAGAACTTATTTACTATTTTTTTATTAGTATCATATCTATCTACTCCACCCAATCGAGTTGAATTAGTATCATTTACTAAACTATCACTCATTGATGAAGTGCCACCTATTGCATAACTTTCTATACCAGTTGTATTAAATGGAACACTTTTTCCATCAGTTAATACTATAGCTGCTTTATCTCTAACTGCTACAGGTGCAGCACTCATAGCATCTGGCTCACCTTTGAAAGCGTTAGTTAATATTACTTTATTTACTTTATTAATGGAATTTATTTCTTTTGCTACATTATAACTTGTCTTAATCCTATCATTACCTTGAAGCCTTCTAGTCTCTATTCCTTTATCTTTTAGAAAAGTTTCTGTTGCTTTATCAATGGAACTTTCTCCTCCTATTATGTATACCTTTTTAGCTTTTTCTACTCTTTTAAGAGTTGCATTAGGTATATTATTTTTCTTAGTTAAAAGAATTGGTGCATTTGTTGCTCCTGCAAGTCCACTCGCACTTAGCCCATCAGCCATTGTACTATCTGCATTTATAAGTATTGCAGTAGTATAACTTTGTTTGTCAGCTATGATACCAGCAGTTTCGTATTTATCTGCTCCTTGAATTTTATCAATTTTATCAAGTGCATTAGCTGATATAGGAAAACCAGCAACAAACATTGACACTAACCCTAGTGATAATACTTTCTTTAATTTCACAATATCTCCCCCTTTTATATATGAAATACTATATATCTTAATAATTCTACATTAAATTTTCTTTTCCTCCTTTAACGATATTTATCTTCCTGTTAATTTAAGTGTATACAAATACGTGTTATAATGTAACTGTAAAGAATTAAAAAGATAATGACATAATTAGAGCAGTCCAACTGTTCTTTTATAAAACTAACTTATAAAGAGAGCGTACATATATGAATATCAAATCAGCTTTTATAAGAAAAAGATGGGAAAAATTCTATGTATATGTGGAATAAGAAACTGGCAAAAAGAAACAAAAAAGTTATGGAAGCTATGAAAAGAAAAAGGATGCTGAAAAACATTTAATTGAAATAAAGTCTACTATAAATAATAATAAGTTTGTTGCTCTAAAAGGTATGACATTTGTAGAAAGATGTTATAAATATATAGACATGAATAAAAATAATTGGTCTCCATATACTGTTACAAATACAAAATCTTGGGTTAAAAATTACATAGAACCTTTTTTTAAGAATCTAAAACTCACAGAAGTAAATCCTAGTTCAGTACAAGCTTTTGTAAATTATAACTTTAATAATTCTACCTTTACTAGTGCTAAAGTAAGGTATAGCTTTCTAAGTTCTGTAATAAGTGAAGTGTATAGATTAAGAGAAATACAAGAAAATTCATGTGATTTTATAAAACTTCCTTCTAAAGAAAAATATTCTACAAATGAAATATACAATAGAGAAGAAGTATTATTGCTAATAGAAAAGTTACTTGGTAATAATATAGAAATACCTATTCTTTTAATGTTACTTCTAGGTTTAAGAATGTAAGAAGCTACTGGACTTAGGTGGTCAGATGTTGACTTAGATAACAATCTGATAAATGTTAATCAAATTCTTGTCTATTCTAATGGCAAAATATCTTTTAAAGAGCCAAAAACACCAAAATCAAAAAGAGCTTTATCAGCTCCAAAAGAATTAATTGAAAAATTGAAAATTGAAAAACTAAGACAAAGCAAATTAAAATTGCAAGGTATCCTGGAAAACAGAAATAACTTAGTTTGTCTAAACACCAATTTAAATCCGTTTCTACCTTCTTCACTAAGAAAAACGTTTCACAATTTTACAAAAAAATCCCAATATAAGGGCAACTATTATAATGGCAATTGGAATACATACTGTATAATCCTGTTCCATAGAGTCATCATCTGAATGTAGTTTTACAATTCGCAATTTAGCAATCAGTTTGAAGCAGAAATAGCCTATTATTGTTCCAATTACATTCGTAATTAAGTCGTTTATATCGGTTGCTCTGTGTAACGTAAAAAGCTGAATAGTTTCGATAAAGAGGGATAACCCAAATCCAATTAGAAATGTATTTCTCAAACGTTCAAAAGTTTTGCTTATAAGCGGACATAAAAAACCTAATGGGACAAAAAGTAAAATATTCAAAATAAAACTCAAACTAAATCCATCACTAAAAGGAATAAAACTTATGTTTGGATTAAAGAACGTTTCCCCTAACTGTGACAGTCTTATATATTCACTGAATGTAGGGATACCAACAATATGCGATAGTGTTAAACATAAGTAGTAATACATTGCCAGTGATAAAATAGATGTTTTGACCTTTGGAATATCACTATCTTTCTTGAATATTACAATTAAGGAAATACCAATCAAGATAATTCCCAACAAGAAAATAGGATTAATTAACAATAAATCTTTGATAGCTTCAAACAGACTGAGTTGAATTTCTACACCTGATTGATTATTTGATACAGTCTCCATTTGTACATACCTCCTCATAACATTTCAATTATTTCTAAAAAAGAAAATAGCAGATAAATCTTAAAATCATACTATCAAAATTCTTAAAATTGCATTTATCATTTTATACCATCAGTTAATTCCTTTCTTACTTCTGTATAGTATTTTGGGGATTCTCTCATCAAATTAGACAAAAAAATAGTCACCATATCAATAAACTGGTTACGCTCCATATCTCCCGAAGCAACTATATCCTGAGAATAAATCCGCATCAGATTTATCAGGCATTGGAAGTTTTTATGCTCCATCAGACGGTTGAGAATCTCCACATCTACTGCACCTATCACAAGTTCTTTGATAACATCCTCAGACAATACCAACTTGAATATATCGGCAACACCTATTAGAATACCGCTGCTGACCATCCTTGTTTTTCTGCTGATAATTTTAATCAACTGGGAAGTGGAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP012312|2862408:2875262|2866183_2866345_+|AXU76372.1|DBSCAN-SWA MKKILYNFMKACGVLAMFVAFLSANTTSLWHVYQPKTPEKLKNSKNHQKEGNN >CP012312|2862408:2875262|2870577_2871000_+|AXU76377.1|integrase|DBSCAN-SWA MTFVERCYKYIDMNKNNWSPYTVTNTKSWVKNYIEPFFKNLKLTEVNPSSVQAFVNYNFNNSTFTSAKVRYSFLSSVISEVYRLREIQENSCDFIKLPSKEKYSTNEIYNREEVLLLIEKLLGNNIEIPILLMLLLGLRM >CP012312|2862408:2875262|2863573_2863774_+|AXU76369.1|DBSCAN-SWA MNNGIVKWFNNEKGFGFISMEGRDDVFAHFSAIQTSGFKSLEEGQQVSFDIVKGARGPQAENITIL >CP012312|2862408:2875262|2862408_2862792_-|AXU76367.1|DBSCAN-SWA MLNKKLPDIELKIMKYIWSTGYKTVISKDVADEIEKTYGWKHTTTITLLVRLTKKDFLISQRIGKHVHYRVLIKEREYLKIEGKRIFGGLHNNPLSELILKLHNEEEITEEKIIEIGSWIKSWKDED >CP012312|2862408:2875262|2863171_2863348_+|AXU76368.1|DBSCAN-SWA MFGNKMDKCTHVLTAYISSSYDYCNFLDTQLDDFILEYGENIVESCLHQVMVLISKYN >CP012312|2862408:2875262|2872841_2875262_-|AXU76379.1|tRNA|DBSCAN-SWA MSVYNFKEVESKWQKIWKDNNQYKMDTAQTEKPNYYTLEMFPYPSGKIHMGHVRNYSIGDVVARFKKMEGYNVLHPMGWDSFGLPAENAAIKHGIHPHKWTMENIEEMKEQLNLLGISYDWDKEVATSTPEYYRFTQEIFLKFLEHGLAYKKKSYVNWCPSCETVLANEQVVQGACERCKATVLKKDLEQWYFKTTEFAEELLNDLDTLDGWPEKVKTMQKNWIGKSTGADLVFDIDGTDKSMTVFTTRPDTTYGVTYMVLAPEHELVKELVAGTEYEADVEAFVKKMHTMTEIERTAADVEKEGMFIGRYVINPLNGKKVPLWIANYVLVEYGTGAIMAVPAHDERDRDFAEKYNLDIIDVITEDNKMINSEEFNGLDASEGFEGIIDKLEKEGRGKRTINYRLRDWLVSRQRYWGCPIPVVYCDECGIVPVKKEDLPVLLPTDVEFTGKGESPLTTSKQFMSTTCPHCGKPARREVDTMDTFVDSSWYFLRYVDSNNENEPFSKELVNRWHPVDQYIGGVEHAIMHLLYARWFVKAFKSMGMVDFNEPFKNLLTQGMVLMDGSKMSKSKGNTVSPMDIIDEYGADTARLFVLFAAPPERDLDWSEQGVDGCFRFLNRVYRLVDELADVVKKDVEFGELNSQDKDMRYTIHSTLKKVTADLSEKFGFNTAISALMELINDMYKYKELDNINEAVIKEGVQTIVTIIAPFAPHLGEELWTMIGKEGSVFDIDWPKYDEKALVKDEIEVVVQVNGKVRGKLTVNSNISKDEMEKVALEDEKIKGLVEGKTIVKVVAVPKKLVNVVVK >CP012312|2862408:2875262|2871270_2871960_-|AXU76378.1|DBSCAN-SWA METVSNNQSGVEIQLSLFEAIKDLLLINPIFLLGIILIGISLIVIFKKDSDIPKVKTSILSLAMYYYLCLTLSHIVGIPTFSEYIRLSQLGETFFNPNISFIPFSDGFSLSFILNILLFVPLGFLCPLISKTFERLRNTFLIGFGLSLFIETIQLFTLHRATDINDLITNVIGTIIGYFCFKLIAKLRIVKLHSDDDSMEQDYTVCIPIAIIIVALILGFFCKIVKRFS >CP012312|2862408:2875262|2865584_2866166_+|AXU76371.1|DBSCAN-SWA MIKSCADKIAFLFVLNQVIEKDDLEICSYGLEILLSSIINTLSSLMIGLILGRLIYSIVFLISFCIIRQFSGGYHANSNKNCILIFNSIFFISMVLGTILNNSNPIPLFLVILSSFNFLIIFIFAPVCHTNNPLNETKYKKNKLLSRTISITLFLIILLGCKYLSFYNYVVYTFLALLWINLLLIIQIIINKK >CP012312|2862408:2875262|2868292_2868451_-|AXU76375.1|DBSCAN-SWA MDNFLQGILASLSASLIVYVASKLFRKRKKPLKAATKSGWEFDLKIRFHKTK >CP012312|2862408:2875262|2866366_2867164_-|AXU76373.1|DBSCAN-SWA MKIAIVPGHTLSGKGTGATGYIDEGKENRILTDLIVKWLKQGGATVYTGKVDKSNNYLAEQCQIANKQNVDLAVQIHFNANKTTLNPMGTETICKTNNGKVYAERVNKKLSTIFKNRGAKSDVRGLYWLSHTKAPAILIEVCFVDSKADTDYYIRHKDIVAKLIAEGILNKKIDNDGVKLMYKHAIVYDGEVDKIPATVVGWGYNDGKILICDIKDYIPGQTENLYVVGGGACEKIGSMAKENYTLIKGNGRFDTLYKALDFIDR >CP012312|2862408:2875262|2867160_2867421_-|AXU76374.1|holin|DBSCAN-SWA MDNLISFIPEQLLLLVVALNVLGFGFKKYKQLDNKYISVILLALGIVFSIWMLGFNPSSILQGILCWGVAIGANQVYKQLKDGEKQ >CP012312|2862408:2875262|2864219_2865542_+|AXU76370.1|DBSCAN-SWA MLDMFITIVSSIIEIWACKKVFDYTSKVKTSLINLYFLISTFIIISTFYTNVGADNRILICIFVMFVFYKSNYDVNIYKCLIVLFSYWAILVCINALSMIVIVSINNLSSMNILLNDNFYRYETIVLGNVVLIVLLCIYKFISNDLQVTKKEIYMCIPIVANMISFFIFYKYILKLLDISSATRLDILIMVLLLTFSNIVLISSLVKILKSNKKYIELTKLQEKINAENKYYSNIKKYYIKTKELNHDMKNHLICIKEMNKKNIDTSNYINNIEKKLDEYSAVFDTGNITLNIILLEKKELCIEKGIDFTININFSDCNFIKEEDTCSIFANALDNAIEACEKIKDDDKKIKLQGMVLNKFFVIKITNTKSNDILLKNNAFLTTKEDKEFHGLGIKSIKNSLEKYDGAISINFSENLFCLNMMIPIRKSQEDSNIAYENS >CP012312|2862408:2875262|2868808_2870179_-|AXU76376.1|DBSCAN-SWA MKLKKVLSLGLVSMFVAGFPISANALDKIDKIQGADKYETAGIIADKQSYTTAILINADSTMADGLSASGLAGATNAPILLTKKNNIPNATLKRVEKAKKVYIIGGESSIDKATETFLKDKGIETRRLQGNDRIKTSYNVAKEINSINKVNKVILTNAFKGEPDAMSAAPVAVRDKAAIVLTDGKSVPFNTTGIESYAIGGTSSMSDSLVNDTNSTRLGGVDRYDTNKKIVNKFYNGAKEFYIASGTDLVYALVGSPMAKNNPIVLVDIGSNKDILKNAAKVTGIGNLSDKIMLECENTINNISLPSSNKNIICGLKIDFDSNHIIWQDKGSYLECYDDNLEYYTEKYKDPTVPINIENTSTQNLDVTKLKVYGEANSTLYMGQYAKIKMDFNSFGVLKPGEKCTIYLDIISLDPSRSMTLTFSYVGDKENYKYEQGLASRILFYNPDGEDFFEYK |
13 | Clostridium_phage(60.0%) | tRNA,holin,integrase | attL 2863033:2863049|attR 2877282:2877298 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
3173594 : 3182547
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP012312|3173594:3182547|DBSCAN-SWA 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CCTTTCGAAAACTTTTTATAATTTCACTTGAATTGTCCTTAGAACAATCATCCACTAATAAAAGCTGCCAATTTTTATAAGTTTGATTTTGGATTGACTTTATCGTCTCTGATAAAAACTCTTCTGAATTATAAACAGGAGTAATTATCGATACTAAAGGCTCATTCATATTTTTACTCTCCTTATATAGCAACTAGCAGTACTATACCAACAAGTTTACTTAGATACTAATTTTCTTTGTCCAATATATTTGTAATATCCTAATGGGAATAATGCTAAATACAACAATTTATCAGATACTTTTCTTAATTCACCAAAATAATGACTATCAGACAACAATGAGTATCTGGCTAAATTTATGTAATTTTTTATCCACATATATGGATATCTACTTAATGGATATGTATTTTGATTTATTAAATATAAAAACTCTAATGCTCTACCTCTTAATGCATTTTTACTTAATATATTCTTAGTCAAACCATCATCCAAATAATCTCTTATTATCATAGGTTTATTTACACATATAACTTTATAGTATTTAGACATTTCATTCCATACTACACTTTCTGGTAAAAATCTCACTTCTTTTCTTTCTGGAAAAGGAAATTTTATAAGCTCATCAGTTACAAATACTATGCTTTTATCTCCCTTAACGCCATACTTAAAATATAGGTCTGCAAAGTGACATATTTTCTTATCTTCAGGCATTTCTGTCCCTATCAAATCTCCACTTGGATATACACAAAGTCCAACAACTCCACTAAATCCTTCTTTATTCTCTAAAGAATCCCACTCATCATTAGCAATTTTAAGAGAATCTTTAATTAAACCATCATCACTATCTACAATGAAAAATAGCTCTCCATCTGCATTTTTTACACCTAGATTTATTGCAGTATGTTTTCCTCCATTTTCTTTGTATATATATCTTATATTTAATTTATTTTCTGATATAAATTTTTCAACTAACTCTTTAGTACTGTCGCTACTTCCATCATCAACAATCAACCATTCAAAATCATTGAAATCATAAGTTTGAGCTTTTAAATCATTGTACAAATTTTCAAGTAAATGAGCTCTGTTATACGTCGGAGTAAATACAGTAAATTTATATTTATACATTAATTAAATCTTCCTCTCTGTCTAACTTTTTTTGATTCCGTTTATTCCATAATTAATAAAGTAGTATATAGCTTTGTATAAAGGTATTTTTTCTATATTTCTATATATATTCCAAGTCCACATAGCAGCTTTTATTTTATTACCACTTAGGGAATTGCTAGATTTTCTATATAATGCTAGAACTTCATTTATTCCATGAGCAATATGCCCTTTTTTCAATATCGATAACCATAAAACATAATCTTCATGTCTTACACCACTCATTCTTATTTCAAAATCCAATTTAGACTTATCAATCACAACAGTAAGACATCCTAAGATATTTCCTTTTAATAATCTTTTATAATCTACATTAGGTGGAACTTTTATTACTTTGTTTAATTTTTTATCATTTTCATCCATCAGTTCATATGAAGTAAATGAAATTACATAGTCATTTTCTAACATAAAATTTACTTGTTTTTCTAACTTACTACTATTCCATTGGTCATCACTATCTAAAAAAGCTATAAATTGTCCTGTTGCCTTACTTAGTGCTAAATTTCTAGCATTAGAGACACCCTTATTAGTCTCAGTCTTTATACATTTTATTCTACTATCCTGTTGCATATAAGATTTGACTATATTAGGACTATTATCTGTTGAGCAATCATCAATAATTAACATTTCCCATTCTTGATAAGTTTGGTTTAATACTGATTTTATGGTTGCTTCAATAAATTTTTCAGAATTATACATGGGAGTAATTATAGATACTAAATTCTTCTTCATATTACCTTCCTCATCATTTATAAAATATTTATTTAATTTTACTTAATACACAATCATATATCCTCTTGCAGTTCTTATTATCATTATATCTGAAAAACTTATTTCTTTCATTTTTTTGGTTATCCATAACCTCAAAATTATTTTCAATAATATCAATAAGTTTATTCACGGCTTCATCATTATTATAAGCCAAAGACCCAAACATTTCACTTTTTAAATCTATATATGAATCAACTTTTTCCATATATTCATCCAAATCGAATTGGTAAAACAAGATAGGTCTATTCATATACAAAAAGTCTATGGCTACACTTGAATAATCAGTTATATTTGCAGCTGATTTTCTAATTTCATTTGCTAGAGTTACCCCTTTATCTAAAAACACAATTCGTTTTCCTGTTATATTTTCTTTTATATCATCTATAAACTCATGCATAAGATGATGCATATAAATTTTTACATTTATATCTTTCTCATCTAATATTTTATTTAATTTATCATCATTTAAAAAATTCATTATATTTTTAAAATAATCTGTATCCGTAAATTTTCCTGAACTAAATTTTATCCAATCTCTCCATGTAGGAGTATATAATATATCTCGAGTTTGTGCAACTTCATTTGTTGGTAAATTGTCATATCTTGCATTTCCAATTATATAAACTGAGTCATCTAACATTCCCCAATCATTTACCATAACATTTCTTTCAAATTCAGAACTTGCTGTAACTATATTATAGCTTTTATATAGGTTATCTATAATGTTTTTGAACTTTTTGTTCATAGGTTTTCTCTTTTTAAAACTTATAGTCCCATGATTTAAAAACACTTTTATCGTTTTTTTATGAAAATAATTAAGAACAGGTACAGCAAAATTGTATGGTGCTATATCTGCTGATGGTGCATGTGAAAATACTATAGCTTTTGAATTGTAATAATACAGATAGTTTTCTACACTTCCTCTTATTAATTTTTTGCCTGGAATTTTATCAAACACTTTACTGTCTTTATTTACTACCCAATAAGTTTCTACATCATTATGTTCTTTTAGCATATACTCATAAAAAAACTTTGAATTATCATTGTATATATCCCCTGAATGTCCACCTATAAGCCAGATATTTCTACCATTAAACTTATGCTTATTAAATGGATATATAAAAAAAGCCAAAAGCATATTTATTAAAAATTTAACCTTGTCCATAAACACCATCCTCATTATAACTTATACTGTCTAAATCCATTAATTCTTCCTTTTATAGTGGCACTATGATAATCTCTATTGGAACTCAATATAAGACCTCCTATATTTCTTACAAGTTTTGATACCATAACTTTTGCAAACTTATAATTTTTTCTATAGACTATTTCCTTTTTGCAAAGCGCTCCAAAGCCTCTTCCATAGTTATAATCTTTTTGATACTTTTCTTTAGATTTAGAATGTTTTTTTGCAGGATGGTAAATTATATCATTTCCAAAGTATTTTCCTTTAAAACCTAAACTCAATAAGTTTAAAACATAATCTATCTCTTCACCAGCACCAAACTCTCCACCAACACCCAATTTTTCATCAAATCTTGTATAATCCTTACCTTCAAAATCAATAAAAAAAGTTATGGATGTTATAGTATCCAAAACGTTGGAACTTGTGATATCACAAGTTCCATCATACATTTTCTTAAATGCATCAACTTTATTTGAATCCATAGTTTTGCAACTGTATATTTTATAATCTTTATTTTTATTAAAGAAATTTATAACTTTTTCTAATGTATCATTTTCGTAGACACAATCATCATCAGGGAAACCTATAATTTGCCCTACAGCATTGTCTATGCCTACATTTCGGTTATAACTCAATCCTTTTTTAGAACTTTTTATATACTTTATATCTAACTTATCAATGTATTTATCAACTATTTCTTTAACTTTGCTATTATCATTTTGGTCTACTACTATAAGTTCAAAGTTTTTGTAAGTTTGATTTTCTAAGCTGTCCATAAGTAAGTATATATCATCATATCTATTTAATGTTGGCATTATTAATGATATTAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP012312|3173594:3182547|3173594_3175508_-|AXU76629.1|DBSCAN-SWA MRESIDLEKESFFNRLFKKYKFRHLTLLILDICSVLVAFRMSLSLTGNLNAFITNDIIISACVYIVLHIVSFRLFKCYNTLWRYAGEEEIISIFMATLAYLIPIYIINKLLGFNYPIMFYVLNTIFIIMFTSGARIAYRAIRIVMNKTYSRGKVSNILIIGAGDAGEMVIQELKRNSELKKVAVAIIDDDKNKIGRIIHNVKIVGTTSDIKDVVEKYNVDEIIFSIANIEKRRKKEIIDICKNTNCKIKTIPGIYEIIDGKVDIKQIREVEIEDLLGREPIKTNLREISNYIEGKVILITGGGGSIGSELCRQIAGFNPKELIIVDNYENNAYSIQQELLRKYKNKLDLKTVIASIREEKRMDEIFNKYKPEVVFHAAAHKHVPLMESSPGEAIKNNIFGTLNIAGLSSKYRAKKFVLISTDKAVNPTNIMGATKRAAEMIIQTMNAESQTEFVAVRFGNVLGSNGSVIPLFKKQIEDGGPVTVTHPDIIRYFMTIPEAVGLVIQAGAMAKGGEIFVLDMGEPVRILDLAKNLIKFSGFEPDVDIKIEFSGLRPGEKLYEELLMSEEGLLDTEHKKIFIGRPIDVDREKITKYLKLLREITNNEEVEKIDGIMRELVPTYIKPEDANIKEIATTREK >CP012312|3173594:3182547|3176688_3177984_-|AXU76631.1|DBSCAN-SWA MKIAIAGTGYVGLVTGVCLAEVGNENVVCVDVDEQKVKSMKLGIAPIYEEGLEELMVKNYNRGRIDYTTDYKKAYEDVDVILIAVGTPERSDGSANLDYIKAVAKQIAETVTKDTLVVIKSTVPIGTNEEIEDYINRNLKNDVKVELASNPEFLSQGTAVKDTLHASRIVIGVESEWAREILEEIYKPFNQPIIVTNRNSAEMIKYASNNFLALKISFMNDIANLCEIAGANIEDVALGMSYDDRIGSKFLKAGIGYGGSCFPKDTKALHWLSEHNGYELKTVKAAIEVNESQKLKLVRKASKLVESFQDMKVAVLGLTFKPDTDDIREAPSIPNIKYLLERGARVTVYDPIGVNNTKKIFGDSILYADSVDDAIEDAEICFIMTEWKDVLNYDIHKYKEKMKNPLVLDGRNCYKIKDMEELGIEYYSIGR >CP012312|3173594:3182547|3181707_3182547_-|AXU76636.1|DBSCAN-SWA MLISLIMPTLNRYDDIYLLMDSLENQTYKNFELIVVDQNDNSKVKEIVDKYIDKLDIKYIKSSKKGLSYNRNVGIDNAVGQIIGFPDDDCVYENDTLEKVINFFNKNKDYKIYSCKTMDSNKVDAFKKMYDGTCDITSSNVLDTITSITFFIDFEGKDYTRFDEKLGVGGEFGAGEEIDYVLNLLSLGFKGKYFGNDIIYHPAKKHSKSKEKYQKDYNYGRGFGALCKKEIVYRKNYKFAKVMVSKLVRNIGGLILSSNRDYHSATIKGRINGFRQYKL >CP012312|3173594:3182547|3179739_3180489_-|AXU76634.1|DBSCAN-SWA MKKNLVSIITPMYNSEKFIEATIKSVLNQTYQEWEMLIIDDCSTDNSPNIVKSYMQQDSRIKCIKTETNKGVSNARNLALSKATGQFIAFLDSDDQWNSSKLEKQVNFMLENDYVISFTSYELMDENDKKLNKVIKVPPNVDYKRLLKGNILGCLTVVIDKSKLDFEIRMSGVRHEDYVLWLSILKKGHIAHGINEVLALYRKSSNSLSGNKIKAAMWTWNIYRNIEKIPLYKAIYYFINYGINGIKKS >CP012312|3173594:3182547|3178809_3179718_-|AXU76633.1|DBSCAN-SWA MYKYKFTVFTPTYNRAHLLENLYNDLKAQTYDFNDFEWLIVDDGSSDSTKELVEKFISENKLNIRYIYKENGGKHTAINLGVKNADGELFFIVDSDDGLIKDSLKIANDEWDSLENKEGFSGVVGLCVYPSGDLIGTEMPEDKKICHFADLYFKYGVKGDKSIVFVTDELIKFPFPERKEVRFLPESVVWNEMSKYYKVICVNKPMIIRDYLDDGLTKNILSKNALRGRALEFLYLINQNTYPLSRYPYMWIKNYINLARYSLLSDSHYFGELRKVSDKLLYLALFPLGYYKYIGQRKLVSK >CP012312|3173594:3182547|3180517_3181693_-|AXU76635.1|DBSCAN-SWA MDKVKFLINMLLAFFIYPFNKHKFNGRNIWLIGGHSGDIYNDNSKFFYEYMLKEHNDVETYWVVNKDSKVFDKIPGKKLIRGSVENYLYYYNSKAIVFSHAPSADIAPYNFAVPVLNYFHKKTIKVFLNHGTISFKKRKPMNKKFKNIIDNLYKSYNIVTASSEFERNVMVNDWGMLDDSVYIIGNARYDNLPTNEVAQTRDILYTPTWRDWIKFSSGKFTDTDYFKNIMNFLNDDKLNKILDEKDINVKIYMHHLMHEFIDDIKENITGKRIVFLDKGVTLANEIRKSAANITDYSSVAIDFLYMNRPILFYQFDLDEYMEKVDSYIDLKSEMFGSLAYNNDEAVNKLIDIIENNFEVMDNQKNERNKFFRYNDNKNCKRIYDCVLSKIK >CP012312|3173594:3182547|3175591_3176683_-|AXU76630.1|DBSCAN-SWA MKTVCYLADGSNPHTLKWCSFFKNKGYDIHVISLNGGHMEGIKIYNFGSNVEELKNENISKKTGYLGSIKQIKKLVNEIKPDILHAQYASSYGFIGSLLGYHPYIISVWGTDIYDFPNNGFIQKQIIKHNFRKADYIFSNSRDMAKEANKYTAKHVDVTFFGVDMDRFKPMEVEKEDAFVIGIIKSLEKKYGIEYLIQAFKMLKDEYKDKKIILKIGGSGSQMDNLINLTKELGIENDVQFLGRISPENVSKTFNSFDVTVFPSLREGFGVAAIESEACEVPVIVTNVGGHPESVWENETGLIVEPKQPEEIKNAIIKLMENDELRLSMGKKGRQFVRENYEVNLNFNDIEKIYDSIFDKYKK >CP012312|3173594:3182547|3178009_3178762_-|AXU76632.1|DBSCAN-SWA MNEPLVSIITPVYNSEEFLSETIKSIQNQTYKNWQLLLVDDCSKDNSSEIIKSFRKEDARIKYIKLEKNSGAAVSRNVGIKNAEGRFIAFVDSDDLWDSRKLEIQIEYMLKENVGFSFTSYRYMRQDGSKTNKVARAPKKIDYEGLLRNTIIGCSTVVIDKEIVGEFSMPLVRRGQDTATWLQLLKKEKYAYGIQEDLVNYRLVGNSISSNKIKALKRTWNTYRNVENLSLPKSLYVFCFYVFNAIKKRV |
8 | Catovirus(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
3791459 : 3845099
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP012312|3791459:3845099|DBSCAN-SWA 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>CP012312|3791459:3845099|3803399_3804743_-|AXU77134.1|DBSCAN-SWA MLIPEKLAKKYNVFPVEFQDDNLVVEIEDEDIYALQDLRLATGKEIILKKEKKELISEKIEKYYNSFELDEDYAKKLFENLLEKAIKENASDIHIEPFKEHLIVRMRVDGELKEVSKFLVDIYPSLSTVIKLKASMDITEKRLPQDGRVDIKLGGNLIDIRVSSIPTVYGEKIVLRILNRDTFLKDKLELGFSDEAIKSINRIINKRAGILLVTGPTGSGKTTTVYSLLNDLRGINKNIMTIENPVEYKMDGISQIQVNSKVGLSFDVGLRAILRQDPDIIMVGEIRDAETAKIAVRAAITGHLVISTLHTNDAVSSIARLLEMQIPPYLLNASLIGVISQKLVRKVCNHCSHEIMIKDNFSGDVNTKVAVGCEKCNDKGYFGRTAIYEILEINDDIKTCIRNMEDSSTIKDVAQNNGMITFEDSCKRLINEKITTLEECLVVNEMI >CP012312|3791459:3845099|3834767_3835046_-|AXU77163.1|DBSCAN-SWA MSYKKAIHVLPEELLELIQEYVDGECIYIPRKSNNKKEWGSNTPTREELAIRNMQIYEDYQVGYDLQYLSEKYYLSLKSIQRIVLQEKRKDI >CP012312|3791459:3845099|3826747_3827581_-|AXU77155.1|DBSCAN-SWA 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MSVKDEINKLIETINYHNERYYNQDSPEISDYEYDKLMKELISLEEEHPELKRIDSPTNRVGGKPLDKFNQIVHKTPMLSLSNAFSEQDLRDFDKRVQEYVGENVEYVVEFKIDGLSVGLTYNNGEFEKGATRGDGIVGEDISQNLMTVKSIPLKINDKKELIVRGEVYISKDNFRKVNEQQEEQEQPLFANPRNLAAGSLRQLDPKLTAKRPLDIFVFNMENIEEYDLKSHSESLEYLEKLGFSVSQSYKVCKSIDEVIEHIEYWTDNRGNLDYEIDGMVIKVNNIKQRDEMGYTAKSPRWAIAYKFPAEKKKTKILDIIVEVGRTGTITPSAILEPVRLAGTTVSRATLHNEDYIREKDIKINDTVLVQKAGDIIPQVLEVIKEERTGDEIDFKMPEKCPVCSEPTIRLEGEAAVKCINMSCPAQIRRGIIHFVSRDAMNIDGLGESIITLLLNEKIIQDVSDLYYIKKEDVVDLERMGEKSADNLINSIEKSKENDLWRLINGLGIKFIGVKAAKILAYNFKDLDEVISATSEQLEELEEFGSIMANSVVEFFKEDKNMNVINKLKNVGVNTKSLDNTGEKVEKIFEGMKIVLTGTLPTLKRNDAKDMIEKRGGKATSSVSKSTTFVLAGEEAGSKLTKANDLGIKVIDEERFLELLKLSSKDEVKAVLES >CP012312|3791459:3845099|3842672_3843341_+|AXU77170.1|DBSCAN-SWA MLEISHKVKEIYPNIKFGVMVINITHSKPNKENFLILKDSTIKNIIEQHPEYNRKEKIKTEPASSYIKYYKKFKKTYPVLLQLESILLKSKGIPDVGVTIESMFLAELKNLLLTAGHDLDKIELPLKIELANGSEHFYGIGGKEQILTKDDLFLSDNIGILSSILNGPDNRTAITKDTKNIMYFVYGPDKISEKQIQDHLNDIKHYISSAFPDLKVNSIDIF |
52 | Agrobacterium_phage(22.22%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012312.1|AXU75285.1|1726445_1726616_+|hypothetical-protein |
1726445_1726616_+
Protein sequences of CP012312.1|AXU75285.1|1726445_1726616_+|hypothetical-protein>CP012312.1|AXU75285.1|1726445_1726616_+|hypothetical-protein MEKVRMTVRLVPKLNQDVQKIAKKCGKSKNSIIIDACWDFVEKIKKENKFNIESEE |
56 aa aa | NA | NA | NA | 1719877-1774328 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 13.1|2867741|45|CP012312|CRT matches to CP012312 position: 1754024-1753980, mismatch: 1 agcacctaccacaaaagtaagtgtttttcagtatttttaatttta CRISPR spacer agcacctaccataaaagtaagtgtttttcagtatttttaatttta Protospacer ***********.********************************* |