Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP016104 | Clostridioides difficile strain DSM 29629 chromosome, complete genome | 12 crisprs | cas14j,PD-DExK,WYL,c2c9_V-U4,cas3,DEDDh,DinG,csa3,cas14k,cas5,cas7,cas6 | 4 | 37 | 10 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP016104_1 | 634935-635059 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP016104_1
|
1 spacers
spacers of CP016104_1
>1.1|634978|39|CP016104|CRISPRCasFinder AGTTAGAGTGAAAGAGTAATCGTAAAATAAATATATGGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016104_1
The CRISPR arrays of CP016104_1 >merge|CP016104|1|634935-635059|CRISPRCasFinder TGATGGTTGATAAGAATAGTAAGAAAAAAATAGATAATTAAAGAGTTAGAGTGAAAGAGTAATCGTAAAATAAATATATGGATGATGGTTGATAAGAATAGTAAGAAAAAATAGATAATTAAAGG >CP016104|1|1|634935-635059|CRISPRCasFinder TGATGGTTGATAAGAATAGTAAGAAAAAAATAGATAATTAAAG AGTTAGAGTGAAAGAGTAATCGTAAAATAAATATATGGA TGATGGTTGATAAGAATAGTAAGAAAAAATAGATAATTAAAGG
>CP016104.1|AXU48853.1|633647_634058_+|hypothetical-protein MKIKKSLISAMMVSAMVLGGTGAVFANGNDSSNIALPKLESLIKSGITDPTELEKYGVEHYTYEEYAKHIQELKDYAKDPNAVKDVSQKDLEETIKKMEQELEKIKTEGLKIMKPITIKNEDGSQISIAYNYAAID >CP016104.1|AXU48852.1|632049_633432_+|penicillin-binding-protein MFIKLLEMSFTSGVLLLIVIFIRACLFKKLPKKVFVLLWLIVLFKLLIPVSLNSGFSIYSIIESTFDVELGNTSTENYTLKKASDSAGKNNSDEFEIMSSIENIMMLEMLGILSFIVTIMFSILLCFRYFKIINLFKTSIHIKNHEFIKKWMCKNSRFRRFIVCISEFTRTPLTSGILKPRIILPKQMNYANNQTLDFVLTHEMVHINSFDNLLKLFMLVALVVHWFNPLVWVMFFLLNKDIEFSCDEKVMSILGEEYRADYATTLISLAEENNPFSMTICSGFGKTKIEKRIVNIMKFKKSTYVTFLVSTVLVCGTGLVFATENKEINEVESFGLTKNEQSDKIGFSISSKSTDLYSPKVESDILVSKAKSDGETHFSTAKVSVIEFREHEESSTSKVTNSENSEETYVNKSSNSKDVLYTDSGEVSIERSNYNDNRFVISRKGNLLAVNKEQYRTWIE >CP016104.1|AXU48851.1|631679_632039_+|penicillin-binding-protein-repressor MEIKLFDSELKVMEVLWERGESKAGELVKILKEETGWNRNTTYTVIKKLVSKGAIERIEPNFVCKALISKEEVQKQETETLINKMFGGSSEKFLSAFINKENLSNDEITKLKQIVEKLK >CP016104.1|AXU48850.1|630695_631475_+|membrane-protein MVSRQELKRVSKAQLSGNWGICAISMAVYIALLVLISIVGLPFEPLTTIVVAVIAFCVSAGFTCMFLKITKDEKVKIGDIFVSGRIYLRSFGFYLFESIIVYIYSFIITIIGAFLSFGVLLTSGAIEYLSSDNVGIGTIISTGITLVLIILVLMLPVYILLLYVSQATFLICEDKDNMGVFKSMGASLDMMKGNVLKLFILNFSFIGWYILSIATLGIGLLWLIPYVGVTNCNFYRQLVKENPDVEDILLDKEKSYTMY >CP016104.1|AXU48849.1|629636_630248_+|lipoprotein MKMVKKLILSSIMALVLVLTIGCSNAEEKVKSNFEANLAALEMYKYDEKGISDALTEAEYKQIQTYNSKDKVSMIAQLTPLYGKENAEKIYETIVKLIQGVEKTVTVESSSKDKITLKVVSKALDTSKVMSEANTLVKSYVTDEKNYDKKEKEVQDDMTKMIIDLYNKKPTKEVTTMITYTKKDGKWQPPSNIQKLCEGIYTI >CP016104.1|AXU48848.1|628556_629546_+|ornithine-cyclodeaminase MLLLKKDDIEKVFTMRDAIEADKEAFRIYCEGKSVNPLRTNISVPSQDASMLFMPGYVEELGCGGIKIVSVFPKNAQKGKPVIPATVLLLDGETGEVSAVLDGTYVTQIRTGAASGAAIDVLAKKDSKIGALIGLGGQGEPQLEAMIEARNLDEVRVFSRNKESREKFAEEMNLKLSKYNTKIVAVESSDKAIDNADVIVLATPSKQPVFNGNLVKKGALISAVGSYMPDMQELCPNCLTRASKIFFESTDAVLSESGDILIPLKEGKISKDDFSGDLGNVINGTIPGREDDDEIIVFKTVGIGVQDVVTAKRIYDKAKENGIGMDWKW >CP016104.1|AXU48847.1|627626_628490_+|copper-amine-oxidase-domain-containing-protein MKFFKVDTKARVLRYVFVLTLTIMAVLAIKHDYKYNNLRKDASINLNSNKEAVTVMSNQSLPKGNTNSKQTLSVSTIGSKTIVKNDEYLESTINMPVITNSNKIVERSTNDKIKNDIFEFYNKSYKEAKQYLKDNPDEKNKFVANVDFELKKNTDSALSIKVRYYTYSGGAHGFYQDIAYNVDMRTGKFLELMDLFKDNTKYTEVIDEEIKRQIAELEKKDEENIGIYNFKGIKENQNFYLQDENLVVYFDLYDITPYAAGIPEFSINKALISSMLKPEYVDLFDLK >CP016104.1|AXU48846.1|626924_627521_+|chemotaxis-like-protein-glutamate-methylesterase MERFNNMVIAIGASVGGTEAILEIIKDLPKSTPGIVVVQHMPAIFTYMYAQRLDKQCIMNVREAKNNDRVEQGNVLIAPGGYQMKLCTDKQGYYVTCEKGERISGHCPSVDVLFDSVAEVAGKNSIGIILTGMGYDGANGLLKMKENGSFTIGQDENSCIVYGMPMIAFDRGSVMLQLPLGEISNCLIRHINILKQKD >CP016104.1|AXU48845.1|626081_626885_+|chemotaxis-protein-methyltransferase MIKLTDEEFIVLVNHVKKEYGIDLSKKRALIEGRLYNTMIEKKLSSFSQYMNLLFKDKTGNEAINLINRLSTNHTFFMREPQHFEFIQNSILPFWEENNKIRNINIWSAGCSSGEEAYSIAMTLDDYFGYNKELWNIKIIATDISTNSLEKAKRGIYIESNVNNVPELWKKKYFIDNKDGTFKICDKIRKSVIFKPFNLMNDFSYQHFDLIFCRNVMIYFDLKTREELINKFYNATKKDSFLFVGHAEVINRSSTKYKYVKPAIYKR >CP016104.1|AXU48844.1|625605_626046_+|chemotaxis-protein MAKDEIIKQVLTFYVNDVIYGIELENVIETIRFQSITYVPCLPTYISGVINLRGRIIPVINMHIKYNLPKADYNERTCIIITKVDEYQVGIIVDKVVDVITIENLNLLETTNSNNTNINKDIKEIAKVEDNSILILDIRKFLINSM >CP016104.1|AXU48854.1|635270_635927_+|membrane-protein MKKGDFIWSGVLICIIAVLAIPSSREVFMEATGAHPYIGGFLKFAVLATMGDLLGARILYKDWKIPVGVFYRAIVWGIIGVVTTYGMSIYSSGVGQAQVDGMLPFEGIAFANALFKSATMNILMSPTVFLFHKVMDCFIDKKYEVGKGIKVKLKDVVNIVDWNAYLGFSVLKTIPFFWIPCHTIVFLFPAEYRVIASAFASIALGLILALANKSKVAV >CP016104.1|AXU48855.1|636397_637669_-|spore-peptidoglycan-hydrolase MQDGFLTVSIIDATNNRPIQNAVVNIYSMSNGSQSSSTLYQNLRSNESGQVTGLVLPAPDVDYSLQPSDVRPYSQYIVEAIADGYETVVIEGTQLLATIEARQGVPMSPRTRSKRSFSRQSELIFDIGEHTLYGTYPPKIPESNLKPLPPPTGFVVLDNPVVPEFIVVHDGLPEDSSAPNYWIPFKEYIKNIASSEIYSTWPEQTIYANVIAIISFTLNRVFTEWYRNKGYNFTITSTTAYDHKFINNRNLFEPINVVVDAIFNTFIKRPPTSRQPLLAQYCDGQKSQCPDQMTQWGSKDLGDQGYDYESILRYFYGDEIVFERAPIVSGVPVSFPGTTLQVGSSGQYVRTIQNQLNAISNSYPAVPKVIEDGIYGTDTENAVKIFQGIFGLPQSGVVDFKTWYEISRVYVATTRIASLNPLI >CP016104.1|AXU48856.1|637913_638630_+|spore-cortex-lytic-protein MKLDLFLLAIVPILIGMFWIRSKDRYCREPLIHLIKFFLIGAFLSVIIILLENLLMKFNVFEGYSELIYVSFVVAGLVEEGVKALILIPALIKEKHFTEKLDGIIYSVFLALGFATIENMVYIFSESRNLALQVGINRAVISIPAHVMFAITMGYYISKYKFEGNKNKRREYLFMAVLIPILLHGVFDFILMIEYRWAIILLIVYVIILWKINLDKLEKYMNHSKKVFFGNLRKKKKK >CP016104.1|AXU48857.1|638708_640019_+|methylase MTELPKKFLEDIEEILKDEYDDFIKSYEESKTTGLRINTLKIDKKRLFDLELFDLNQIPWAEEGFYYDDKIDRPGRNPLHEAGAYYLQEPSAMSVIPKADIKEGEKILDMCAAPGGKSTYILSKLNDTGLLVSNEINASRIKALGENLERFGARNCIITNTDSNSLRKTFNGYFNKVIIDAPCSGQGMFRKDKVAISDWSYAKVVECQSIQKEIIRDGYKMLKKDGILIYSTCTFSREENEHVINEFISEYPHAELIEMERLWPHKIKGEGHFVAKIKKLEEEECNVKELKIKNLDKEIKDYREFEKKFLKVDFYSNKKNKFYLRGENLYLLPEIYPDTKKLKVLRYGLHLGVLKKNRFEPSHALSHYLKVEGVKNVENFSVQSESILKYLKGDVVNSNDSRGWVLVSVEGIPLGWGKESSGVIKNHYPKGLRKVF >CP016104.1|AXU48858.1|640118_640655_+|signal-peptidase-I MGEAVKKEVVEWIKVIVIALVLAFAITRFIVPTIVKGESMYPTLVERDYLIVNRIAYKVGEPKYKDIIVFKTDLTEENGKKKDLVKRVIGVPGDHVKIQDSKVYVNDKLLDETSYIHNNRTDGDIDIVVPEGKLFAMGDNREKSLDSRYDEVGLVDEHTILGKVLVRLYPFSKIGTID >CP016104.1|AXU48859.1|640820_641357_+|singal-peptidase-I MNETIKEEIVEWIKIIITALFFAFIITRFIKPTLVNGESMYPTLKSHDYLVANRMTYKLSEPKCGDIMIFKTDLLQENGRKKELVKRVIGVPGDHLKIKDSKVYINGKLLNEVSYIHDNYTEGDIDMVIPKGKVFAMGDNREVSLDSRYKEVGLVDEENIKGKVILRVFPFTDIGIFE >CP016104.1|AXU48860.1|641366_642122_+|endonuclease MAVGIASLLFNIEEALNICESIKQITHLEIGIDNISECSELCKYKERISKLGLSIGIHLPMELNTCENIEYIRNSWINFIEKIEFELKGFDIRYFNLHLGYVMTNRVIKNRDKYLGNSVDFLDKLNTNSYVCIENTYSKGGDFSNIGNISYDFEYIFKRIKNSKICFCYDTGHCLIDEDAYVKNLKDKIRLIHLSDNDGINDTHVGIGRGILSEEGIKEVLTLDAEYLVLEINYEDIEDTISKLNNIVGEG >CP016104.1|AXU48861.1|642195_643863_+|phosphoribulokinase/uridine-kinase MKKINLKIEGKDKEYSLEENSPGIRLGDIAKEFCDEHKGYITLAVVDNKLKELNCRVKKDCEINFLDTTNEDGERVYFRVMSFIFVMACREIFWDSRVTIEHSLSDGLYCEVHIDRKLKEADVENIKNKMKEIVNNDYVIEKIEVTRNEAISIFENNEMYEKAELLKYKEYDSAKVYKCRNYIDHFYGYMLPSTGYIKSFDIKLYNGGVIILGPSEEDKTLPMKFIPQPKLSSVYYEAEEWSRLMGIDKVVSLNKIIENNEYGDIIRTFEALHEKKLSQIADMIKDGNKRVILIAAPSSSGKTSFAHRLSIHLRVNNLNPISISLDDYFIDRKHTPLDEYGNYDFESIYAIDLEKFNLDLKKLLAGEEIDDIRFNFKEGKREYTGKKIKIDSNQPIILEGIHGLNPILTSSIPDEDKFKIYISALTQINLDDHNRIPTADLRMIRRIVRDYNFRGYSADNTILQWASVRRGEKKNIFPYQEEADAIFNSACVYELAVLKRFAKPLLEEIKEDNPAHIEATRLLKFLQYFVELDDTSDIPGISILREFIGGSKIVD >CP016104.1|AXU48862.1|644634_645564_+|glutaminase MNTLDETLLKEIISSNKKYTNYGQVASYIPELKNARRNDLGICIIDSENNLYSAGNCSTKFTIQSISKPIVLAMALMDNDWEDVFSNVGMEPSGDPFNSIMKLEINDTKKPCNPMINAGAIVTTSLINGSCLEEKEERMLSFFRKLAKNDNIGINYDVYKSEKMTGDRNRAMAYLLKSDGFIRGNVEDVLDLYFKQCSIEIDSVDLARIGINLANYGVDIENGEHLMSEMVSRIVKTFMMTCGMYDASGEFAIKVGIPAKSGVGGGIMASVPGRMGIGVYGPALDKKGNSVAGVKVLEELSNKLKLNIF >CP016104.1|AXU48863.1|645661_646225_+|regulatory-protein,-arsr MKEVLVLRDLECIKAIAHPRRIDILKAFDKSPLSAKQLSQLLEEPHAKINYHIKMLYKVGILELVEEKIKSGIVEKYYYPSAKNVVIGNRILNFSLDNGEEKEELYISKFENMSEVFYKAAEEDVLENENIVDYHDISLTHDELVELSDTMKSKIDEILNKRQHNVEGSKYDIAMVIVPTLEEECPS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP016104_2 | 1347267-1347822 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP016104_2
|
8 spacers
spacers of CP016104_2
>2.1|1347296|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCAAAAGGGCAGAGAGTAGTGACTCGATACTACAA >2.2|1347361|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACATATACCATATATACCCCCCTGCAACGCTTCATC >2.3|1347427|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATGTGATTAAAAAAGGACAAAAGTTGGTGATACCTA >2.4|1347493|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCGAAAAAATGCTAATAGTAAAAAACTTACAAGTAAC >2.5|1347559|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAACAGTATTAGGAATTATTACACCTATTTCAACAG >2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTATATCTTCTTTTGTAACATTTTTTATAGTTATTT >2.7|1347690|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTGTAAATTGAAATAGCTTTTCTTATATTTTTATTTA >2.8|1347757|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTTCTCACAAATAGTTTCAACTACTTTTTCATATTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016104_2
The CRISPR arrays of CP016104_2 >merge|CP016104|2|1347267-1347822|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTGCAAAAGGGCAGAGAGTAGTGACTCGATACTACAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTACATATACCATATATACCCCCCTGCAACGCTTCATCGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAATGTGATTAAAAAAGGACAAAAGTTGGTGATACCTAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGGCGAAAAAATGCTAATAGTAAAAAACTTACAAGTAACGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTAACAGTATTAGGAATTATTACACCTATTTCAACAGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTTTATATCTTCTTTTGTAACATTTTTTATAGTTATTTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGGTTGTAAATTGAAATAGCTTTTCTTATATTTTTATTTAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGGCTTCTCACAAATAGTTTCAACTACTTTTTCATATTTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG >CP016104|2|1|1347267-1347822|PILER-CR GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TGCAAAAGGGCAGAGAGTAGTGACTCGATACTACAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TACATATACCATATATACCCCCCTGCAACGCTTCATC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AATGTGATTAAAAAAGGACAAAAGTTGGTGATACCTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GCGAAAAAATGCTAATAGTAAAAAACTTACAAGTAAC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TAACAGTATTAGGAATTATTACACCTATTTCAACAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TTTATATCTTCTTTTGTAACATTTTTTATAGTTATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GTTGTAAATTGAAATAGCTTTTCTTATATTTTTATTTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GCTTCTCACAAATAGTTTCAACTACTTTTTCATATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG >CP016104|2|2|1347267-1347822|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TGCAAAAGGGCAGAGAGTAGTGACTCGATACTACAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TACATATACCATATATACCCCCCTGCAACGCTTCATC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AATGTGATTAAAAAAGGACAAAAGTTGGTGATACCTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GCGAAAAAATGCTAATAGTAAAAAACTTACAAGTAAC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TAACAGTATTAGGAATTATTACACCTATTTCAACAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TTTATATCTTCTTTTGTAACATTTTTTATAGTTATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GTTGTAAATTGAAATAGCTTTTCTTATATTTTTATTTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GCTTCTCACAAATAGTTTCAACTACTTTTTCATATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG >CP016104|2|1|1347267-1347822|CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TGCAAAAGGGCAGAGAGTAGTGACTCGATACTACAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TACATATACCATATATACCCCCCTGCAACGCTTCATC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AATGTGATTAAAAAAGGACAAAAGTTGGTGATACCTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GCGAAAAAATGCTAATAGTAAAAAACTTACAAGTAAC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TAACAGTATTAGGAATTATTACACCTATTTCAACAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TTTATATCTTCTTTTGTAACATTTTTTATAGTTATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GTTGTAAATTGAAATAGCTTTTCTTATATTTTTATTTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GCTTCTCACAAATAGTTTCAACTACTTTTTCATATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
>CP016104.1|AXU49466.1|1344868_1346296_+|cell-surface-protein MKIKKLLTIGLSLSIFIASCPISANALDKIESIKGADKYETAGIIADKQNYTTAILINADSTMSDGLSASGLAGAINAPILLTKKNNIPNATLKRLEKAKKVYIIGGENSIDKYTETVLKGKGIEIKRLQGSDRIKTSYNVAKEINSINKVNKVILTNAFKGEPDAMSAAPVAVRDKAAIVLTDGKSVPFNTTDVESYVIGGTSSMNDKIVKDTNSTRLGGTDRYDTNKKIINKFYSGVKEFYIASGTDLVYALVGSTVAKNNAIVLVDNDSNKSVLKSTTKLTAIGNLSDSILQQCLNVTKNIGDSNTGREYTVEDAANAVKKLLGVKKFYYEPNYSEDEDLIFLLDKNFDFSGKEYYVFAYIKQGAEGDVRYCVAKNDMSKVYTYDVNGNMKVCNPDDYKNKGSITEEQAKQIALKECAKRHKVSINNLVVDMIDFRDDIYSGNVYAVKINSKNSNGTFGWFFIDIETGKIYN >CP016104.1|AXU49465.1|1343856_1344678_-|lipoprotein MIISKKITAILVSFLIMISMVGCAPKESATEVAKKYLDSIEIKDYEVAYNLLSKDSKESVSLEKFEEYQDTLFKLQTLKDYKLGEENKVEKYKYSNKEYTDLVKIKETDTIKYITENKEDTANFDRYFIIEDNEYKLLWHKDFKRALSSNYVKIARSETEKDEDKDYNKAAIDIKKAIEIDDKNPLAYYTQSYIYIELQRYDEALKSIDKYLEYLDKNNEAYKIDASDAYNLRGVIFMSKSEFNKARESYNKALELNPDNEYAKTNLNDIKGL >CP016104.1|AXU49464.1|1342214_1343732_-|site-specific-recombinase MSVAIYLRKSRADEEAEKQGEFETLSRHKSTLLKLAKEQNLDVIEIKEELVSGESIIHRPKMLELLKEVEENKYDAVLVMDLDRLGRGDMKDQGIILETFKESKTKIITPRKTYDLTDEFDEEYSEFEAFMARKELKLISRRMQRGRIKSVEEGNFIGTSAPFGYDAVTTGRKERILVPNKDADVVRTIFDLYINEDMGCSKISKYLNNLGIKTATGANWYNSAITNIIKNKVYCGYIQWQKKDYKKSKNPNKIKTVKLRPKDEWIEAKGKHEPLISEITWKKAQNILKKNGHVSYGNQIKNPLAGIVICKNCGRPLVYRPYADHDYIICYHPGCNKSSRFEFIEAAILKSLEDTVKKYQLKSSDLDLDKNNKDSNIEFQKRVLKGLETELKELGKQKNKLYDLLERGIYDEDTFIERSNNISSRTEEIKDSIKTVKNRLSTVKKDNSKIIEDIKTVLSLYHDSDSLGKNKLLKSVIDKAVYYKSKEQKLDSFELMVHLKLHEEQ >CP016104.1|AXU49463.1|1341907_1342192_-|RNA-polymerase-sigma-27/28-subunit-RpsK/SigK MCNEISLLDILGTEANYVLDEVELKVQVGKLYEQLNKILTPREREIVQLRYGLTPYGYKTQREIAQKLDISRSYVSRIEKKALKKLEKELVQES >CP016104.1|AXU49462.1|1340146_1341811_+|penicillin-binding-protein MSKKKTSFLKKVGKRSWCIFTIILIIYSALIYRLVDIQVLKGDKYKQSVESQSVEKVELNSGRGIIYDRNNKKLTDTSKSQVLVVEKEKLNNSYKILELIKKATKMNDLDIYKAVQEQLTRPIIQIQTKNIDKSMKKELEKNGIMVEEKTMRYAKDGLLSHTIGYIKEDDKSGQSGIEKSMDSVLRNSNEKYISAFKAGDAGNEKSLNILKGSVKTVDNKDKDRHLKTTIDYNIQKKLEQILNKEENPTAAIISEVSTGEILAMCSRPNFDQNDISKSLKGKNGEFENRVIKATYPPGSVFKMVVLFSALENGVIDENYTYNCTGKTKVGNTNEILRCNKRDGHGFQNLRQAFSNSCNPAFLDIAMKLGKEKILKSAEKLHLFEKVDIGLDEEKIREAPKNISIRNLAIGQENIEFTPLQINQMTQIIANNGTFKPLYLYKSLVDNDMNTIKTYKSSKKEELISPYVCTQVKEYMKSVSRIGTAKDLKDIEGGCGVKTGTAQSSLNKKAIDHGWITGFYPEERPKYVITVLVEGTQKGNKSATPIFKEICESIK >CP016104.1|AXU49461.1|1338827_1340075_+|protease MELNKVELLAPAGDLERLKIAITYGADAVYIGGEIFGMRSAAKNFSKEDMAEGVAFAHERGKKVFVTVNIIPHNEDFLQLEDYLLELEDIGIDAVIIADPGVLSVIKKVIPNMEIHLSTQANTTNYLSANFWYEHGIKRVVVARELSFDEISEIRAKTPLDMDIEAFMHGAMCISYSGRCLISNYMTGRDANKGSCAQSCRWQYHLVEEKRPGEYFPIYEDERGTFFFNSKDLCMIEYIPELIKSGITSLKIEGRMKTAYYVATVVRAYRMAIDEFYRDPENWKFNPMWMEELKKGSHRHFTSGFYLNKPTTEDQNYQSASYVRNYDFIGIVRETEDEDGLIVVEQRNKMCVGDEIEVMGPYKETMFTKIEEMYNEEGEAIESAPHPRQIVKLKLSVKVGKDYMLRKVIEEKVEE >CP016104.1|AXU49460.1|1338166_1338841_+|O-methyltransferase MSNIVNDLVEDYIRVTLKEKEGFLKDLEIYAEENSVPIIHKEVSDLLKVLLKVQKPKRILEVGCAIGYSSIFFATIIGKDADIITVERNEKMIEKAKENIKLAGFDNNITILEGDAEEKLSQVQGEFDLIFIDAAKGQYKLFFDLVIDKLKDGGLLVSDNILYKGMVAHDDFVVRRKKTIVKRMRNYLDYICNCDYLSTSLVPIGDGVALSYKERKRGDVDGIK >CP016104.1|AXU49459.1|1336915_1337995_+|exported-aminodeoxychorismate-lyase MNFKENRLKIAVLIIVILIILAGIFVFIQIGPYDKNNKKDVIIDVPSGASVGKISDILYENKLIKNELLFKLLVKVSNKAPSIKSGTYLLNQSYSNNDIISLLVSGKIYQDGIKVTIPEGATSKEIIAMLVSKNLGDKATFENLIKKPQEFYDKFPYLKEDGITSLEGFLYPETYYFNSKKQSEEDILSEMLKVFDSKYTDKFKKKQKELNMTLQEVMEMASIIEKEAVLDKDRPIIASVFYNRLKVGMPLQSDATIQYIFEERKKIVTYDDLKIDSPYNSYKNKGLPPTPISNPGIESIEAALYPDKTDYLYFVAKIDGGNNYSTNYQDHLKYVKEYKEARDKQSKDTKATNKENTKR >CP016104.1|AXU49458.1|1335377_1336703_+|pyrimidine-nucleoside-phosphorylase MRMYDIIKKKRDNLELSKKEINYFIENYSKGDLPDYQASALLMSIYLNKMNKQETVYLTEAMMNSGDMINLSEIDGIKVDKHSTGGVGDKTTIALIPLVASCGAPVAKMSGRGLGHTGGTIDKLESIPGFSTEMEISKFIDSVNKSKIAVCGQSAKVAIADKKIYALRDVTATVDNISLIASSVMSKKLASGADAIVLDVKTGDGAFMKTLEESFELAKSMVDIGTGMNRDTIGIVTDMDEPLGFAVGNSLEVIEAIETLKGNGPKDLVELCEVLGAYMLVLSKVAHDFEDGVEKIRESIKSGTAIQKLKEFIENQGGNKDVVDDYSLFKKSKYKYPVKSTKSGYISKIKAEDVGVSAMILGAGRETKDDILDLSAGIILEKKVGDYVNEGEVLAYMYYNDEQKLSLAKRRFIDSYSIVDSKIEKNKLIYGIVTKEDIKKF >CP016104.1|AXU49457.1|1334361_1335174_+|purine-nucleoside-phosphorylase MFEKIAQSSEFINSKINVKPKIGLILGSGLGDLANDIEDSVTIKYSEIPNFPVSTVAGHAGQLVIGKLEGKEVIAMQGRFHYYEGYSQKEATFPVRVMKELGVEILIVTNAAGGVNKEFKAGDLMLIRDHINFSGSNPLVGKNDDRFGARFPDMSDAYSSKYVDVVKNCAKECNIDVKEGVYMFFSGPNYETPAEVRMAQILGADAVGMSTVPEVIVASHSNIGVIGISCITNMAAGILNQPLSHEEVIETTQKVKSEFMNLVKTTVKNL >CP016104.1|AXU49467.1|1348191_1348332_-|hypothetical-protein MDVNQRIKYIRENMSRSQKELFKKTNINISVMNRIESGERAIRDVC >CP016104.1|AXU49468.1|1349434_1349686_+|hypothetical-protein MSSYFITRGDVMKILQQFKPYKYDKEKNIEYDEKIIANQNTEVYIVYPRISDEENRRRWEEFNEVAKEVAINIAMKKIETVES >CP016104.1|AXU49469.1|1350002_1350116_+|hypothetical-protein MVEVNIKIKGEVSEIINSIRYIFNSFDEELILDIKSE >CP016104.1|AXU49470.1|1350339_1350720_+|hypothetical-protein MKRRYKNVLIYINIRTIIHINCKIKFIELCLTFNELKNKLANNEKTTVINEDNKAFSGLVDFSNRALILVCSISIFPNIINIINLFVIIINFCEIFLIIYRTLYIFLKVFFALIVWFPILKLINSQ >CP016104.1|AXU49471.1|1350903_1351287_-|hypothetical-protein MRKKFFIGILIVLIISVIAILNIKNDKNVFIGESENWKAKFVTTEGHSKLEIKYKNSKDVVEQKFNYSYKFIDGEDAVVVVKNEILEAGQEKAIKIQRPGLYSNRESTYKLIISWNGNEETINLKKK >CP016104.1|AXU49472.1|1353131_1353449_-|hypothetical-protein MNFRNIYLILMGLGIIILTTIISLIEIKIGFCNEKYFNKLESKYGNIDRKRTIKLEVLYRYVTGFEYIAIGLFTKRLDITIIAIILVATITVILYYLVRKRYITI >CP016104.1|AXU49473.1|1354480_1354870_+|regulatory-protein MKINKLPHAELKLMKYIWGVDDVLASRDIIEAMKLKYDWKKSTTLTFLKTLVDKGFLTTYKVDRCTHYTIAIKEKDYLKVETKSFFSFMHNNSFKSFISALHDDEVLDSKSLDKLEEYFKNLKEGDIDD >CP016104.1|AXU49474.1|1355193_1355703_+|teicoplanin-resistance-protein MKSRKHNITKGLFIVYIIILTWIILFKLQFDISSLETMNLRSINLVPFAGSLIINNRVDISEIILNVAIFVPFGIYVCMLKEEWSFIKKVIPIFITSLAFETLQYIFALGASDITDLIGNTLGGIIGIAVFMLLSKIFKNNTIKIINILALIVTIIVVLFLGLVIFANL >CP016104.1|AXU49475.1|1355804_1355999_-|phage-related-DNA-directed-RNA-polymerase-7-kDa-polypeptide MSVIVMCSRCGKEIDKYRNKYITYYEKNTNAEIKVCINCALDLLEKTRENQELNIQEFQDTIIL >CP016104.1|AXU49476.1|1356515_1356908_-|sporulation-sigma-factor-SigK MAALKSFEKPLTPEEEIEYLTKFKIENDKSAKDTLIERNMRLVAYIAKKYNNSTEDQDDLISIGTIGLIKAIETYNIDKGTRLATYASRCIENEILMNIRSNKKNKTQVSLQDPIGTDKEGNEINTTFYM |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP016104_3 | 1557411-1558098 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP016104_3
|
10 spacers
spacers of CP016104_3
>3.1|1557440|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAACTGGTTTAAGTTGGCTACTTTATAGCTTTTGCTA >3.2|1557506|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAATATTTTGGAAATTTAAATCTAAATCTATCTCATA >3.3|1557572|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATAAAATAATTGAATATGTAGCTTTCGATATGTGT >3.4|1557637|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGAGTTTTCTTAAACTAAGAATTGTTTTAGAATTTC >3.5|1557703|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAAATATTTTATTTGATGTATTATCTCCAAAAATATT >3.6|1557770|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATATCAGCACTTCCAAGATTTTTATTTTCTGAAAT >3.7|1557835|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGTATATTTAGTAAATGTTTGTTCAAAGTTGGCAAAC >3.8|1557902|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAATTTAGACGATACACAATTCCATTTCTTGTATTT >3.9|1557967|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGTTAAATTTATTACATCTAATTCTGTCTCTTCAT >3.10|1558033|37|CP016104|CRISPRCasFinder,CRT AGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016104_3
The CRISPR arrays of CP016104_3 >merge|CP016104|3|1557411-1558098|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAAACTGGTTTAAGTTGGCTACTTTATAGCTTTTGCTAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTAATATTTTGGAAATTTAAATCTAAATCTATCTCATAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATGATAAAATAATTGAATATGTAGCTTTCGATATGTGTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAAGAGTTTTCTTAAACTAAGAATTGTTTTAGAATTTCGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTTAAATATTTTATTTGATGTATTATCTCCAAAAATATTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATCATATCAGCACTTCCAAGATTTTTATTTTCTGAAATGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATCTGTATATTTAGTAAATGTTTGTTCAAAGTTGGCAAACGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTAATTTAGACGATACACAATTCCATTTCTTGTATTTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAAAGTTAAATTTATTACATCTAATTCTGTCTCTTCATGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAAGTTTTACATTAACTAAAATGTATAGAATA >CP016104|3|2|1557411-1558032|PILER-CR GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAACTGGTTTAAGTTGGCTACTTTATAGCTTTTGCTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TAATATTTTGGAAATTTAAATCTAAATCTATCTCATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GATAAAATAATTGAATATGTAGCTTTCGATATGTGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAGAGTTTTCTTAAACTAAGAATTGTTTTAGAATTTC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTAAATATTTTATTTGATGTATTATCTCCAAAAATATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CATATCAGCACTTCCAAGATTTTTATTTTCTGAAAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTGTATATTTAGTAAATGTTTGTTCAAAGTTGGCAAAC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TAATTTAGACGATACACAATTCCATTTCTTGTATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAAGTTAAATTTATTACATCTAATTCTGTCTCTTCAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT >CP016104|3|3|1557411-1558098|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAACTGGTTTAAGTTGGCTACTTTATAGCTTTTGCTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TAATATTTTGGAAATTTAAATCTAAATCTATCTCATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GATAAAATAATTGAATATGTAGCTTTCGATATGTGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAGAGTTTTCTTAAACTAAGAATTGTTTTAGAATTTC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTAAATATTTTATTTGATGTATTATCTCCAAAAATATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CATATCAGCACTTCCAAGATTTTTATTTTCTGAAAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTGTATATTTAGTAAATGTTTGTTCAAAGTTGGCAAAC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TAATTTAGACGATACACAATTCCATTTCTTGTATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAAGTTAAATTTATTACATCTAATTCTGTCTCTTCAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAA GTTTTACATTAACTAAAATGTATAGAATA >CP016104|3|2|1557411-1558098|CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAACTGGTTTAAGTTGGCTACTTTATAGCTTTTGCTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TAATATTTTGGAAATTTAAATCTAAATCTATCTCATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GATAAAATAATTGAATATGTAGCTTTCGATATGTGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAGAGTTTTCTTAAACTAAGAATTGTTTTAGAATTTC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTAAATATTTTATTTGATGTATTATCTCCAAAAATATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CATATCAGCACTTCCAAGATTTTTATTTTCTGAAAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTGTATATTTAGTAAATGTTTGTTCAAAGTTGGCAAAC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TAATTTAGACGATACACAATTCCATTTCTTGTATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAAGTTAAATTTATTACATCTAATTCTGTCTCTTCAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAA GTTTTACATTAACTAAAATGTATAGAATA
>CP016104.1|AXU49664.1|1556527_1556884_+|integrase,-catalytic-region MVFETFDKVIELYPNAKPVFHSDRGFQYTSKVFESKLLAQGMIQSMSRAGRCIDNAPTEGIWGILKVEMYYLRKFDTYEQLVKIIENYIYYYNNFRYQKRLNSMSPLEFRKYLSTEIA >CP016104.1|AXU49663.1|1555937_1556498_-|integrase MKLIDITPSILQSYINNIYNEHMLNSAKNQVGFIKSVLKESYRLKEISENICDFVTTLIKKNSSTSKFYTKQKAQLLLEKSKIIPIGIPIFLMLTLGLRFGETVSLIWSDVDLDKKIIHVNQTLVYVDNKIIFKDPKTPKSKRKLFAPDELISLLEEEKLKQNKLKLQAILKNEFDLICLNKRFNP >CP016104.1|AXU49662.1|1554079_1555435_-|drug/sodium-antiporter MDTKISINENMSLGKRFFKYLAPSVVAMWVFSLYTMVDGIFVSKGVGELALAAVNISMPFINFIFAVSLLFSTGASTIIAIYLGKKDIKSANEVFSFNLVSIIILSIIILAITFFNLDRLALFLGATESTIGMVKDYLGIIIFFNGFFIVSYSLEVIIKTDGFPILATVGVIISALTNIILDYLFVIEFGWGVKGAGIATGLSQVFSTIFFLIHFLRKNSTLNFSKFRIDFKTLRKIIFIGFPDSTTELSCGIVVLLFNLSLTKYIGENALIYYSVINYINTLVLMTMMGITQGMQPLTSFYYGAGNIDNVKKLLKMGIKATIIASIAVFAICMAFSEPIVSLFIHPEETMLFNEGVRVFKIFSISFLLVGINVIISGFFVSVEKPSISTVISLGRGLVIVVLSLISMILIFGGQGIWMTTIVSEFICLILSLVFLKKNFSTLDSNLNKVA >CP016104.1|AXU49661.1|1553311_1553962_+|ATP-binding-protein MADEKFVMSFSGGKDSILALNRMLKKGYKPVALLTTISEEHGKSWTHNLEYNMLKQVSSNIGLPLLVAECGVEGYEESFERALIKAKNMGATICAYGDIDIESHRKWDTDRCEAVGMKVDLPLWQESREDLVYEFIDSGFCSVVTKVNLKHLGEEFLGKKLTRELVEKIKNAGADPCGEHGEYHTFVVDGPIFKKPVEYEVKGTLIKDGYGYLEIK >CP016104.1|AXU49660.1|1552798_1553227_+|EamA-like-transporter-family-protein MTKLWAIIFALLAGGSTALEAFINGELGKSTTALVATFISLTVGAIFFLASIIVTGDLKCLVSINGFNYKLLLGGVFGGLIIYFTVKAIPNLGVSNTLILTLVSQVLVGFFIDSVILGQETMHLYKYIGVILLILGTFFIVN >CP016104.1|AXU49659.1|1552098_1552647_-|hypothetical-protein MYTNFNIDFNNFNKKENATKFMLMGVLLIILGLLCLTFKTLGIKLISWTFGIALLFFAYLNLKNINELKRYATKEEIKPSINIQWVLIIACILLFVFPQKIQSIFSLFLGFYLIFNQLVALVNSKNNPYSKFTTWNIVKILFGICLILSPLFLSRFIVSIMSFFIILFGLVLFFSGNTARKY >CP016104.1|AXU49658.1|1551044_1552031_-|radical-SAM-protein MFFVQAQRTILLEIGDFLDKFKYAFDNKRYHTWNYYLRNTFGEKVFKVSINAGFTCPNIDGSLGYGGCTYCSKEGSGDFAGNPKDNLISQFYNIKEMMLKKWPHAKYIGYFQAYTNTYAPLEVLKEKYETILELEDVIGLSISTRPDCLPDDVVEYLSELNKRTNLWVELGLQTIHDSTSKIINRGHDYKTFVEGVEKLKSKNIKVVVHIINGLPGEDYNMMMETAKAVGKMGVDGIKIHLLHVIKDTPMEKMLQNGMLTLMEQDEYINLVCDQLEILPETMIIHRLTGDGKRDELVGPIWSLKKWEILNQIDDTLKARNSYQGCKFV >CP016104.1|AXU49657.1|1549829_1550774_+|membrane-protein MGEKSKGYVFIAIAGLLWATLGLFGKFLMGNGLTSEQVAFTRLFFGFIVLGVYSSIRTPQILKISKKGIIYSVIIGIICQAMFNLCYFKAIDIAGVSIAAVLLYTSPLFLAIFSKVCYKENITRSKLFSLILCFIGAIMAVSGGRLDFQGLNAFGLFLGTLSAIAYALMPTISKNALKEFSSSTILVYSFLFGAIFMIPSSRPWEILNYAKDLDVLSCMLMLGIVPAALAYIFYATGISKGVELSVAGVVASVELVGSVIIGCTILGESFSLGKLFGVMLMLISAVVALNLSYDEIRIFYKSNKLKQIEKTESI >CP016104.1|AXU49656.1|1548072_1549515_-|sigma-54-dependent-regulatory-protein MNLNLELDLEFYQKILEASHDEICVSDDKGIIIYCNKAFEENYGLKKEDILGKNVSFLEDSGYSTKSPIPIVLKTKTKFSLEQDTQTGKKLIITATPIFDENGNLEFTVENCRDITELNNIKNKLEDTKKQVKKYKSEVETLYRTALRIEDTVIMDGIVMRPIINTVNHVSKTDVSVLLLGESGTGKSSLARYIHHNSNRSNGPFITINCATISPQLLESELFGYTSGAFTGASTKGKVGLVELANGGTLFLDEIGDIPQNLQAKFLQLIQDRTFTPVGSLKNKKVDIRIISATNADLVSKVKEKKFREDLYYRLNVIEIKLPPLRERRDNLVEIIKYYFNRYSSDFNLNKTISKEAMDAIANYGFPGNIRELQNIIQKILLTCTDNHITIDDLPNILTKNIHITNNGNKTHISQINKVIVSDSKSTNYKNKNFDTLIKEYEKNIILDAYEKFGSSYKVAKHLEISQSKANRLIRKYTNT >CP016104.1|AXU49655.1|1547288_1547873_-|hypothetical-protein MLMNTHFIMAKSILDNIDENKTFFISEKNFIYGNIKPDAFSKYKLKKHYLDESFNMIVSKINYLCSLNIDSLSKYFSVSRLSQELGVICHFLCDFFCVAHSERWEFKHSLNKHVTYERELGAFAKDVDLSKIKCGTINSSFEKFFTKLYSDYKKKTDYMNDLKFSAYTCNSVINYILDSILSNTIKSYHIANCG >CP016104.1|AXU49665.1|1558423_1560157_-|signaling-protein MSILLKKAPKLAKHIITSFYINRDIDEVLKYLCENVTWIGPGEQEFLTSFNEIKNYFYAGQDEIPSCDINNDIFETVSEDGNRCMVLGKYTVRTKENAQMILEVNQRCTFEIIEDRGKLLVKHMHISNPYGEMQLDEYFPTKIGTQSYDYLQRLLKEKTEVIEMITNNINGGLKGSNDDSTYSFFYVNEGLPKILGYTYDEFMEMSGGSAVGAVYPPDLPKALEDCERCFAKGPTYSSEYRIRKKDGTLMWVLDSGMKSLNSDGIVKINSIITDITQLKNIESELKLERERYRIALQNITDIMFEYDIENDTLIKYQRVEIDKKIELENFETKNYSKLLEFGKIIHLDDIGKLLEVLHGNLRETIEIRQINSLTKNEWRWIRVQCSVIYDSDHNPIKTIGVLKDITEDKSKLESLINQAQRDPLTQLYNQRVSQNLIQEYLCSSDSKNNDALLVIDIDDFKTVNDTFGHLEGNEVLVAVSKILLHNTHDKDIVARIGGDEFTIFIKSLTKDLIIKITNDILNDASKIKVKDNHKITLSIGIAFTDDSTKLYKDLFSKADKALYLSKADGKNCYSTYE >CP016104.1|AXU49666.1|1560393_1561239_-|signaling-protein MFKEIFLRTFPGFLIIRDSNYRIIFINDNLKNLIKSYMQDNPLGMTNIEIAKKLPDNIAKFFTDSHNIQLDWEKNYPYDKISNWILEFKKDTTSYWNVLEYKVDVDEKPYIITMANDITKLYEENKRNLHYSITDPLTGAYNRKYLNDRFDIFIGDYIVLIDLDNFKMINDYEGHNVGDKILCDFVSLLNKELINSTSIIRLGGDEFIVIFSSDVDKNYVYSQLETLRENFLKVFSKYKYLSFSYGVDTVKRNLKLTIVELDKKMYKNKEKNKKKFDKNDY >CP016104.1|AXU49667.1|1561269_1563504_-|signaling-protein MQNHNYIKMLNKKVEVLSKELDSRNFKLKTLNEIDFFSKIPNREFMYQYIDDCISKNIHIGIMLLNIDNFKLFNDIYGYLVGENLLITLTQNLLHFIPESKGIVAYLKGEGFLIVLPNVSNKELNNMGATIIESARELKIRLPNEKEIYSNVTFSIGSTIWNGEPNMTTLMLFNQVYSALKKAKSEGKNRYILFNFKDNSFYNKLENDKEFLSEISYVLQTKQIEVFYQPLYNIKNNTIVGCDALARWRHPIKGLLTPDKFIPLFEQFGLITELDLHLFEENCKNIRKWIDKNDVFVPICCNFSRLHFFNPNFPSMLKGITEKYNVSTSNFSIEITENILIENTNTIIQQLTELRSYGFSVSMDDFGSGYSSFGMLQNLPFDIIKIDRIFLSHNLNDFKNTTILYSIINIARALGMLTVCEGVETEQHVEFIKSINCDIAQGYYYAKPMECKEFEKLLSKENNSEKMFIKYSDIGKSLIEKIFDGFFIMQDMKKLRANVTEDIQWFDFYNKTEITSFPKVIEHFEKHIKGKKFSILYKSITPHNTESDSLLISGEAVLSDEAAKHQKYSNFYFSANCIISENKLLLAKLHLDLIKTAGYINEFESYSIPKMTNTHLDESNVLSQFYSMLPVGIIRYDLFGDMIITYMNEEMFDIIGYTKEQFFGEMGGNLRAIVHPDDLDFVYKKSLDMIDTNKIEPFLYRFIKRDGQIVTVMYTQCNLSAIDGRSIAQGMYIDINKIKNLTKI >CP016104.1|AXU49668.1|1564286_1565096_+|MerR-family-transcriptional-regulator MKDYYKIGEISKIYGIGRDSLMYYEEIGILRPVRDINGYRMYNISDIWKLNLIKEFRSLNFPMKKIKEYLDDRSIESTKNILNEELDLIDKKIAEFISHKENIIKRLSSIESVIQNTKIDEIEVVYIEKRKALELNADIKRDEDFDFLIQKLQKEYEDRFNILGNNNIGSAFSTEAINKGIFNEFKSVFCFLESNEKVYNIVFDEGYYVTLNYTGSNSNNKMYMEKVFKFIEENNYKIIADPIEIYKIDIHETGIVEEFVTEIQVPITK >CP016104.1|AXU49669.1|1565248_1565488_+|hypothetical-protein MKCSNCRSVNIEKGILTTGGIYAETIGLKYVGDGKLDKVINKTFPVQSTIYSDLCLDCGEIVRTYIKDNTDRNWCKDEK >CP016104.1|AXU49670.1|1565674_1565851_-|hypothetical-protein MFRDEMDKCTHMLTAYISSLYDYCDFIDTQLDDFILEYGENVVESCLHQVMVLVSKYN >CP016104.1|AXU49671.1|1566342_1567017_-|MgtC/SapB-transporter MNHHILIQFEYIARIITAGFCGALIGYERKNRLKEAGIRTHFIVALASALIIIVSKYGFNDIVGTPGIGLDPARVAAQVVSGIGFLGAGLIFIRNQSVSGLTTAAGIWATAGTGLAIGSGLYLVGIISSIIIVIVQITLHRDRKWMKLPTAEQVSLKISNSTDSIEYIEGKFKKSNIEIINMNIKRLDGDWLEVVIYTKLPKGYKKTNLLKLFSDNPLIETLEI >CP016104.1|AXU49672.1|1567236_1567791_-|isochorismatase MSIALILIDIQNDYFKNGKCELFQSEETAENAKKILLFFRKNNLPIIHIQHISTDKTASFFLPNTHGSEINKIVFPLDNEEIITKHTPDSFFETDLQSILEKKNITNLVICGMMSHMCIDTSVRTAKKLRYDITLISDACTTKNLSWNNIEINANTVHQVFMASLQNSFADVKNTDKFLSNYYK >CP016104.1|AXU49673.1|1567868_1568234_-|transcriptional-regulator MKIRAEYTCPLEIVHDIIKGKWKTILIFELRQSNKTFSELQHNIYGINQKMLIQQLKELRDFGIIDKISSAGYPLHVEYFLTNRGKKMLKAVEIMQEIGIEYMLEHGQQEILDNKGICYNK >CP016104.1|AXU49674.1|1568464_1568599_+|hypothetical-protein MNISRKAMKIIELAQKIANKRGISVEEAWSEAIIEYKNKYEHIA |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP016104_4 | 1667351-1667773 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP016104_4
|
6 spacers
spacers of CP016104_4
>4.1|1667380|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTCATAGTAGCGACTTATTACAAAGTATTTTTCTA >4.2|1667446|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGTTATTACATAAAAATTCTTCATCTATAACTTTAA >4.3|1667512|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAATAAGGGTTTAATTTCCCTGGTGTCGAGGAATA >4.4|1667577|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTAAATGAAACTCTTGAAATAGTTGACGTAGTAGC >4.5|1667642|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATATATTAGATGTCAATGTCAAGGATACAAAATTT >4.6|1667707|38|CP016104|CRISPRCasFinder,CRT CCATCTTTTGTTGCTTTACATAAATTTATATTACTTAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016104_4
The CRISPR arrays of CP016104_4 >merge|CP016104|4|1667351-1667773|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTTGTCATAGTAGCGACTTATTACAAAGTATTTTTCTAGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATATGTTATTACATAAAAATTCTTCATCTATAACTTTAAGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATAAAATAAGGGTTTAATTTCCCTGGTGTCGAGGAATAGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTTTAAATGAAACTCTTGAAATAGTTGACGTAGTAGCGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTATATATTAGATGTCAATGTCAAGGATACAAAATTTGTTTTATATTAACTATATGGAATTTAAATCCATCTTTTGTTGCTTTACATAAATTTATATTACTTACGTTTTATACTAACTATACAGAATATAATT >CP016104|4|3|1667351-1667706|PILER-CR GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTGTCATAGTAGCGACTTATTACAAAGTATTTTTCTA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT ATGTTATTACATAAAAATTCTTCATCTATAACTTTAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT AAAATAAGGGTTTAATTTCCCTGGTGTCGAGGAATA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTTAAATGAAACTCTTGAAATAGTTGACGTAGTAGC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TATATATTAGATGTCAATGTCAAGGATACAAAATTT GTTTTATATTAACTATATGGAATTTAAAT >CP016104|4|4|1667351-1667773|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTGTCATAGTAGCGACTTATTACAAAGTATTTTTCTA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT ATGTTATTACATAAAAATTCTTCATCTATAACTTTAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT AAAATAAGGGTTTAATTTCCCTGGTGTCGAGGAATA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTTAAATGAAACTCTTGAAATAGTTGACGTAGTAGC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TATATATTAGATGTCAATGTCAAGGATACAAAATTT GTTTTATATTAACTATATGGAATTTAAAT CCATCTTTTGTTGCTTTACATAAATTTATATTACTTAC GTTTTATACTAACTATACAGAATATAATT >CP016104|4|3|1667351-1667773|CRT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTGTCATAGTAGCGACTTATTACAAAGTATTTTTCTA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT ATGTTATTACATAAAAATTCTTCATCTATAACTTTAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT AAAATAAGGGTTTAATTTCCCTGGTGTCGAGGAATA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTTAAATGAAACTCTTGAAATAGTTGACGTAGTAGC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TATATATTAGATGTCAATGTCAAGGATACAAAATTT GTTTTATATTAACTATATGGAATTTAAAT CCATCTTTTGTTGCTTTACATAAATTTATATTACTTAC GTTTTATACTAACTATACAGAATATAATT
>CP016104.1|AXU49761.1|1664596_1666690_+|signaling-protein MNKRNFEVILNQLQINIYVTNIHTNEIIFMNKKMKEEYNILDPEGKVCWQVLYPEQNSTCSFCKVLELLKNDKKGVLIKWYEKCNKLNRAFENYDSLITWQDGTVVHMHQSIDIANSTILNKPIKINEFNEISNTKEEKGVFNFSRDNFDYNSTLLYDALIRGTDEYIYICNMKTGVFRYSPSQVELFDLPGEIVENPLIYWEKIVHPEDWNRFYKSNTEIGKNQMDYHTVEFRAKNRSGEYIWLRCRGQLMRDEFGEPSIFAGIMTQLGKQNKIDSLTQLLNYHEFMSVFEDKISNPMIEKLCIVLLNIDDFKNVNEMYDRDFGDNIIKTLAQSIQSILPDNAELYKLDGDEMGILVDNVEENEILTLYDQIQNMIIHLQLWRKYGLNITISAGCVIYPKHGDTVKELYKCASYSLQYAKEHGKNRLVFFSQEILKNKMYSLEMMRDLKASINDDFRGFSLRFQPQVDTQSHKMIGVEVLLRWTNDKYKAISPLEFIPILEENDMINIVGAWVLRMALRTFRKWIDNYPFFKVSVNVSAVQILEDTFIKDIVKIIDDENFPYQNLVLELTESHTVQNLSILQSKFKALQDLGIYIAMDDFGTGYSSLEVLKFSPIDIVKIDRVFVKDILKSKFDATFIHFIVAICHDVGIKVCLEGVETQEEYDLVKQIKPDYIQGYLFGKPQTATEIFDLLKLDN >CP016104.1|AXU49760.1|1663020_1663917_-|NADP-oxidoreductase,-coenzyme-F420-dependent MANYFLSKGYCVSGFYGRNQLSLLESTNLTKTKIYSNLKDIIYENDILFITTSDDSIEIIDKKLSKFNLKHKYICHTSGSLKSSILFCSKKAGALIYSIHPIFAFSNKNTNIKKMKDICFSIEGDNEQDDLVIQNFIDDLGNQFFIRDKDTSSTYHLANVLVSNLVLSLLDIGVSYFIKLGLSEEESLKAISPLVKKNIENILDNGFTKALTGPVSRGDITPIRKHLSVLDKKDEDIYKILSLNLLKIIALGNDNSLKGIKNITIENAIENLISKSEKYKEIYKLLGGKNDEKYHTDF >CP016104.1|AXU49759.1|1662218_1663046_-|3-methyl-2-oxobutanoate-hydroxymethyltransferase MKNTIQTFKNAKYEGKKLSMLTAYDYSIAKIMDECDINGVLIGDSLGMVIKGEENTLSVTIDEIVYHTKAVKNGVKNALIVSDMPFLSYHVSIEDAVKNAGRLIKEGGAHAVKLEGGSNVIKQIEGIVNAQIPVMGHLGLTPQSVNSFGGFKVQGNTSETARQLIEDAKLIEKAGAFSIVLEGVPTKIAEMVTNSISIPTIGIGAGINCDGQILVYQDMLGMFGDFVPKFVKQYANIGDIMKDSIKNYILEVNTGAFPQEKHSFSINESELEKLY >CP016104.1|AXU49758.1|1661351_1662200_-|pantoate--beta-alanine-ligase MLVKEIKLLRNIIKDWRKHGYSIGLVTTMGFLHEGHQSLIKKAVKENDKVVVSVFVNPTQFGPNEDFNSYPRDIDKDFKYCMDSGATVVFNPSPEEMYLKGNCTTINVSGLTDFLCGAKRPVHFGGVCLVVSKFLNIVTPDKAYFGEKDAQQLAVIKRMVKDLNIDTEIIGCPIIRENDGLAKSSRNTYLSEEERKSALILNKSLSLAKEELVKGNLNPENIKELITAKINSEHLAKIDYVEIVDSETLQPVKQIEHSILVAIAVFIGKTRLIDNFTFELNI >CP016104.1|AXU49757.1|1660701_1660884_-|hypothetical-protein MFKDKIDECVHIMTAYIASLKEYYSFIETQIGDFIKKYGEDIVELCLHRVMILLCECGLA >CP016104.1|AXU49756.1|1659221_1660136_-|hypothetical-protein MIDNQKYVILSLELHLFFSRIMKEHALFLEAGFTNKNYNLAMEADHYKKQFEDLLSYAVSASNGIIRPDILYSEELVTTLTSAAEQKTEEFTGIEINKNITTRELNLQSGVDPQVGQDLVNYVAQLNSDAIRLLDGLINFKERVLDGVLSCTIFTSNYPLLLEHIIHEANLYRSYVVDLENKIDIESKSAKEIELFWDHIMMEHALFMRGLLDPSEGELINTSNDFAIKFNELIEKTNGMTDSNIKNITEETLNETVEFKDFKEAGASGIEQCKIKSIILPLLADHVLREANHYIRILESYKNM >CP016104.1|AXU49755.1|1658183_1658831_-|lactate-utilization-protein-B/C MIRQTPLEKRYDKLGPHIVTALKKRYFDAYYCKTRNEALQQILDLIPQNHVVSWGGSETLKEIGVQTAVREKGFKVIDRDLAKTPEERTEIMRQALLCDTFLMSSNAISEDGQLFNIDGNGNRVAAMIFGPKNVIVVAGMNKIVKNIDDAIQRTRTIASPAVVQRFQDVNTPCYISGSCIDCTNPESICAYMVTTRISRPAKKIKVILVGENLGL >CP016104.1|AXU49754.1|1657447_1658017_+|lipoprotein MKKFIICIIMFAISVLVLAGCSNDNKIKNEVDSMFNAIKTQDADTVDKYFPKSGLGNLIYEDKEGFKMYSKNMTWEISDIKNNKDKVTVDLKINNTDMVSILKKNPPKLGEMMPNPTMKDIDSANKKEFNITLELVKTGDNYVCKVNQESAMKLLNVITGGGIDYLADYNKDYYKQLDEEQKNYENKNS >CP016104.1|AXU49753.1|1656543_1657443_+|iron-sulfur-cluster-binding-protein MKLLSKINNNIRLITQVAFTALTNGYVNGFLEGTIYGGESKKLCVPGLNCYSCPGALGACPIGSLQAVLSSREYKFSFYVVGFLMAFGAFFGRFVCGWLCPFGLVQDLLHKIPFPVKIKKVYGDKYLKYLKYIVLIMFVIILPVAVVNVAGGGNPWFCKWICPSGTLLGGIPLILGNENLRESIGFLFSWKLSILLLILLMSIITYRPFCKYICPLGAIYGFFNPISIYRFKIDKDKCTNCTACQTKCKLDIPIYKDVNSPDCIRCGECIKVCPQNAITTTFSKDKKENNICAKKYRGI >CP016104.1|AXU49752.1|1655806_1656391_+|thioredoxin MKKFFMVVLGCVFVLGMISGCSKKESKPVEKNKNNSEWFSNLDTEDVDGNKVTKEIFSNKELTLINVWTTWCGPCVGEMPELEALSKEYESNNSNVAIKGLVVEVDKTDMRTGLSNEEKNLVKDIMKKSDATYQQLTVSEELKKTDFKRVMEFPTTYFVDKKGNFVGEKVVGANSKEDWKKIIDERLKMVKTNE >CP016104.1|AXU49762.1|1668421_1669240_+|MerR-family-transcriptional-regulator MEKQYFTTGEFAKLCGISKQTLIFYDKIGIFSPEYKDKNNYRYYSVYQYDTLDILQSLREIGMSLEEIKEYIQNRTPQLCVKMLKEEEKKIREKIKKLRKISSKMQNRINITVEGISKMNSEEIYISKKFEEYLVLSSDLSNMSNSDFMMELIDFTNYCKSKNLYQGYELGVIVSNENIKNGDYLSISSFYLKIDKKIKDKKLYVKPEGMYACIKHIGKYEDSYKSYEKLKKYIYENEYKIIGNSYEESILDFFCESNEDNYMTEISIQVSR >CP016104.1|AXU49763.1|1669372_1671493_-|ferrous-ion-transport-protein MGLTHNSTKMSSLKDMFDIDNKEDQFIIALAGNPNTGKSTVFNHLTGLRQHTGNWPGKTVATARGNFKYKNTEYALIDLPGTYSLFALSQEEIVARDFICFGNPDAVIVVCDATCLERNLNLVFQVMELTDKVILCINLIDEARKKGITIDKKLLEDSLGIPVILTAARNGSGMDELLDTLNDVSFDKYKLNNKPVRYNENIEDVVKSIQPELDNIIPGINSRWLGLRLIDGDESIFESMSNYIDKDSIDAINEVKKKIPDNINKQKIRDEFTKINYDYAKKLSDECCSNVAKKSTDREEKVDKILTSKIFGLPIMLLLLGTILWITIEGANYPSTLLSNLLLGFEPSISGILNSINCPSWLNDMLVLGLYRTLAWVISVMLPPMAIFFPLFTLLEDFGYLPRVAFNLDHLFKKACAHGKQCLTMCMGFGCNAAGVIGCRIIDSPRERLIAILTNNFVPCNGRFPTLIAISTIFFSSVITNSFVSSVATALCITLLIILGVIITLLVSYTLSKTLLKGVPSTFTLELPPYRVPQIGRTLYTSIIDRTIFVLGRAVMVAIPAGVITWIFANIYIGDLSILSHVANFLDPLAKLIGLDGFILLAFILGFPANEIVVPILLMAYLATGSMIELDSFSALGQVLREHGWTYLTALNVMLFSLLHWPCATTLLTIKKETGSLKWTALGFLMPTILAFVVCFLTTTVYNLFI >CP016104.1|AXU49764.1|1671518_1671746_-|ferrous-ion-transport-protein MKNLNDIQVKKTVKVEDILSSGNLRERMLALGLTRGAVIDVVRKGPKNNLTVYKIRGSKIALRQEESSLILVSDI >CP016104.1|AXU49765.1|1672072_1672513_-|acetyltransferase MFKIKHFNDLSLDEFYEIAKSRYEVFACEQKIFSLNDYDDIDKSSYHIFLKENGLICAYARIIPKEYSSYNDVSIGRVLVLSSHRRKGLAKQMMDCAIDFIKVNLHENNITLSAQTYIKNLYLSCGFKEISEVYDEAGIEHIKMRL >CP016104.1|AXU49766.1|1672685_1673654_+|hypothetical-protein MNTTKKLTEAALLSSLFIVVTIIAVSTGFGYAIYLDFIVPVFFCIICLKCDLKYTILSGITSLLIISLVLGNLGTAIWASQSVLLGIMCGYLINKPTMVMDDLVYGSVFGVIVMVFIDIYASTLIGYSFMKEFQGYSKWIYFNGYTNFIYYLMIALFPFGMVFCIYLLSLILGNKLHILDSNSLKKFLIFKNFRSLNQFLCCSKKAFYICVSYLAIFEVLKLWNVKVDSVYLKTIFISITYISVYFIIRDSCMSLQNFIIAKFRKLLYARILFLIIILLLFFIFDVTVISLIIINAFLNKKIDIRLSQSNIVNKQINLLIEK >CP016104.1|AXU49767.1|1674130_1675339_+|tyrosyl-tRNA-synthetase MKSIDEQMRIIMKGVDDLIDEKELREKLIKSEKEGKPMIVKLGLDPSAPDIHLGHTVVLRKMKQLQDLGHQIVIIIGDFTGKIGDPTGKSKARKALTTEQVLANAKTYEEQIFKVLDKEKTIVRFNSEWLAKLNFEDVIKLAATITVARMLEREDFKKRYEGQMPISVHEFFYPLMQAYDSIALEADIELGGTDQRFNLLMGRSLQREFGMESQIVIMMPLIEGLDGKEKMSKSLGNYIGIDEEAGIMYQKSMEIPDELIIKYYNLVTDVHPDEVNKIESQLKEGSVNPRDIKMNLAREIVTLYHGEESAREAEERFKSVFQKGQIPEDIQTIQVEEDGFDLIEVLVANEIVKSKSEVRRLASQGGVKVNGEKVEDLSTIVKESELVVQIGKKKFVKIELVK >CP016104.1|AXU49768.1|1675420_1676302_-|polysaccharide-deacetylase MVKKRKKKTVTLTILVVIVIGIFSMAWADMSRKKEMKETQERLKAERLEKERIEKEKNEPIIGAKKEAVKEYGYDAKIVWDKLNKYDYSNNGEKIVFLTFDDGPSTTNTPQVLDILKRHGVRGTFFIKGDSLERKGANEILKRTFDEGNAIAHHSYTHDYKKLYPSRSLNLDTFVNELNKTDEAMKKALGKNFSSNVVRCPGGYMSWKNMEPLGNYLKEKNMASIDWNALNADAEGKKKNAQELFEHAKKSSEGKEMVVLLMHDTYGKQETVNALDQIITYFKDNGYQFKILI >CP016104.1|AXU49769.1|1676717_1677632_+|transporter MKKYFGEIGLIFIAIIWGSGFVATQFALDGGLTPLQIITLRFFLAAIIMNLLFFKQIRANMSKKLLKAGGILGIFLFLAFTVQTIGLMYTTPSKNAFITAANVVIVPFIGFILYRRKLDKIGIISSLVALIGIGILSLEADFSINFGDFLTLICSFGFAFHIFFTSEFAKDNNPMALTAIQFTVAFLMSVVVQTFAGQLKMEAELSGYMGTMYLAVFSTTIGFLFQTICQKRVDGTRTAIILSTEAVFGTIFSIIILKELITAKLVIGSILIFVAIITAETKLSFLKSKKVKLKDSEESSLESI >CP016104.1|AXU49770.1|1677854_1678400_+|ruberythrin MKKFVCTVCGYIHEGDAAPAQCPVCKVGADKFEEMKGEMVWADEHRIGVAQGVDAEIIEGLRANFTGECTEVGMYLAMSRQADREGYPEVAEAYKRIAFEEAEHAAKFAELLGEVVVADTKENLRVRVDAEYGATDGKLKLAKRAKELGLDAIHDTVHEMCKDEARHGKAFLGLLNRHFGK >CP016104.1|AXU49771.1|1678490_1679639_+|iron-sulfur-protein MKSVSVRSCKTYNYEEVKLSIEKNLEDIGGIDKFVKKGSKVLIKPNLLMKKKPEEATTTHPMVVKVVCEKLLELNCDITIADSPGGPYNQSSLKSIYKASGIEEVANELSIKLNYDVSDVKIHSEKAHVLKYMDIIKPIVDSDYIINLCKLKTHIMATFTGGTKNLYGCIAGLKKAEIHYRFPTEELFCENVLLDICDYIKPTLTIMDGIVGMEGDGPSAGTTREIGVLLASQNPYAIDVVACKIISLLPNRVATIRGAIKRGYIQEDFSDIEILGEDIKDLIVKNYKVPNVSKDLRLFSVKLPKFLNEPISKLITPKPVVRFQDCIKCGKCKEACPASTIEIGTKGAIIDLSKCIRCYCCHELCPKKAIDVKRNFVFKYVK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP016104_5 | 1757541-1758096 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP016104_5
|
8 spacers
spacers of CP016104_5
>5.1|1757570|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGAACATACGGAAGGTCGTAAGCAACTCCAGACAAA >5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCAAATTTATTACTTTTTTTATAAAGTTTATAAG >5.3|1757699|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTTGTTTGACTAAGTTAGTCCCCCAGCTTATGACAT >5.4|1757765|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAATTCTTAAAAGATACTGCAATTATTAAAAATACT >5.5|1757830|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTGTTCTGGTGATCAACTTCAAAGTGTTATAAAGA >5.6|1757896|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTTACTATTTTCACAGTTTAAAGAAGTATAGTAAC >5.7|1757962|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCGCCTTCCAGATTACTTTTGTATATGAGGTCAGCAA >5.8|1758029|38|CP016104|CRISPRCasFinder,CRT TCAGTTTTTCGTTTGATTGGCTCTATCTTTAAAAAAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016104_5
The CRISPR arrays of CP016104_5 >merge|CP016104|5|1757541-1758096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATGGAACATACGGAAGGTCGTAAGCAACTCCAGACAAAGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATTGCAAATTTATTACTTTTTTTATAAAGTTTATAAGGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATGCTTGTTTGACTAAGTTAGTCCCCCAGCTTATGACATGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATCAATTCTTAAAAGATACTGCAATTATTAAAAATACTGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATAATTGTTCTGGTGATCAACTTCAAAGTGTTATAAAGAGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATTATTTACTATTTTCACAGTTTAAAGAAGTATAGTAACGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATATCGCCTTCCAGATTACTTTTGTATATGAGGTCAGCAAGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATTCAGTTTTTCGTTTGATTGGCTCTATCTTTAAAAAAGAGTTTTAGATTAACTATATGGACTTAAAATT >CP016104|5|4|1757541-1758028|PILER-CR GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT GGAACATACGGAAGGTCGTAAGCAACTCCAGACAAA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TGCAAATTTATTACTTTTTTTATAAAGTTTATAAG GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT GCTTGTTTGACTAAGTTAGTCCCCCAGCTTATGACAT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT CAATTCTTAAAAGATACTGCAATTATTAAAAATACT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT AATTGTTCTGGTGATCAACTTCAAAGTGTTATAAAGA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TATTTACTATTTTCACAGTTTAAAGAAGTATAGTAAC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT ATCGCCTTCCAGATTACTTTTGTATATGAGGTCAGCAA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT >CP016104|5|5|1757541-1758096|CRISPRCasFinder GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT GGAACATACGGAAGGTCGTAAGCAACTCCAGACAAA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TGCAAATTTATTACTTTTTTTATAAAGTTTATAAG GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT GCTTGTTTGACTAAGTTAGTCCCCCAGCTTATGACAT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT CAATTCTTAAAAGATACTGCAATTATTAAAAATACT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT AATTGTTCTGGTGATCAACTTCAAAGTGTTATAAAGA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TATTTACTATTTTCACAGTTTAAAGAAGTATAGTAAC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT ATCGCCTTCCAGATTACTTTTGTATATGAGGTCAGCAA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TCAGTTTTTCGTTTGATTGGCTCTATCTTTAAAAAAGA GTTTTAGATTAACTATATGGACTTAAAATT >CP016104|5|4|1757541-1758095|CRT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT GGAACATACGGAAGGTCGTAAGCAACTCCAGACAAA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TGCAAATTTATTACTTTTTTTATAAAGTTTATAAG GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT GCTTGTTTGACTAAGTTAGTCCCCCAGCTTATGACAT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT CAATTCTTAAAAGATACTGCAATTATTAAAAATACT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT AATTGTTCTGGTGATCAACTTCAAAGTGTTATAAAGA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TATTTACTATTTTCACAGTTTAAAGAAGTATAGTAAC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT ATCGCCTTCCAGATTACTTTTGTATATGAGGTCAGCAA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TCAGTTTTTCGTTTGATTGGCTCTATCTTTAAAAAAGA GTTTTAGATTAACTATATGGACTTAAAAT
>CP016104.1|AXU49855.1|1757145_1757250_+|hypothetical-protein MIGFLLSILAGVISAYIYDKIKNHPDANKGDLKK >CP016104.1|AXU49854.1|1755862_1756303_+|phage-protein MSNLSAFLSQNAIKVDNVKYVASNRFLDKEGKPVEWELKVLSSEEDEALRRKCTKRVKVIGNNGKHTGQYTSEIDYNSYVAELCVASTVFPDLKDAELQNSYGVMGEAQLLKTMLTAGEYVNYTVKVNEVNGFDTSFEDKVEEAKN >CP016104.1|AXU49853.1|1755320_1755791_+|phage-protein MAQTINAKDTVSAKKAECFITIEGKRYNFMQAIDLEAKMEKNKSEVPILGRTTKGNKTTGSTNTGSATFHYNTSIFRELLYRYKETGEDIYFDIQVTNEDPTSAVGRQTVVLKDCNMDSGIITKFDADGEYLDEDMDFTFEDWELVEKFNLLAGME >CP016104.1|AXU49852.1|1753993_1755304_+|phage-protein MALGGGTFVTQNKVLPGAYINFISAKRATSSLSDRGIVAMPLELDWGIDEEVFQVTSDDFEKYSVKYFGYDYTHEKLKGLRDLFKNIRLGYFYKLNKGVKASCTIATAKYSGIRGNDLKVTVTTNIDDNAKFDVVTLLDNKKVDTQIAKVITDLQDNDYITWKKDATLEASAGLVFTGGTNGEAVTGAEYQAFLDKIESYSFNALGCLATTTEIKSLFVEFTKRMRDKVGAKFQTVLYKKSDADYEGVVSVENKIKDKDLVESSLIYWATGAIAGCDINKSNTNKKYDGEFDVGVNYTQIQLEEALKSGKFIFHKVGDEVHVLEDINTFVSFTDDKNDDFSSNQSVRVLDQIANDIATLFNEKYLGKVPNDKAGRISFWNDVVKHHKELENIRAIEDFKTDDVSVELGNDKKTVIVSDAVKVINAMSKLYMTVSVN >CP016104.1|AXU49851.1|1753807_1753993_+|hypothetical-protein MINLSKTLSKEENYKFTKEQIVNSKRYVNRKDLLNAILKEDELYSFSEVEEIINNFMKGVS >CP016104.1|AXU49850.1|1753386_1753824_+|phage-protein MLNNIIDGISIKLDKTFGESYTIYSEDVEQGINEPCFFIVPLNPSKVSYPSGRTLKKNSFDVHYFPKSNDKSFEINEVAEMLLEELEYIEIDGDLVRGTNMNFEIVDNVLHFFVDYNYFTIKSNNTDKMDTVELFGGLKRGDKLE >CP016104.1|AXU49849.1|1752968_1753394_+|phage-protein MARWGSVDFREFKRVCKKMEELTKIDLDKFCKDAARELAARLLGKVIRRTPVDTGFLRQGWNGVAYARSLPVYKQGNNYIIEVVNPTEYASYVEYGHRTKDGKGWVKGQHFLTISEMELQSQVDKIIEKKLLILLKGVFDA >CP016104.1|AXU49848.1|1752621_1752969_+|phage-protein MVSKTRKAIEMLYRDKCTIVEYQPIKDPVTKRTNNKEVIVLENQPCKLSYKNIVSATEGKLAKLEQTIKLFISPDIEIKAGSKLIINDKEYVRSGESAIYSNHQEIILELFKDKA >CP016104.1|AXU49847.1|1752226_1752628_+|hypothetical-protein MENNIIDEIEKRLESFGYILKDGDKWLIGFVREKIENIIKLDCNIKTMPIELKEIEVDMIVGEFLFTKKNMGQLDIESINFEAVEKSISEGDTKVDFAIGSGSQTPEQRFDSLIAYLTTYGKNNILTFRCLRW >CP016104.1|AXU49846.1|1751983_1752217_+|hypothetical-protein MAQVRKLNRILTIEECKIDDFLEMGYDLIDETGKAVKYGKSLSVKDLIAENNILRSKVESLEEENKQLKEKNKLTKK >CP016104.1|AXU49856.1|1759678_1759849_+|Ribbon-helix-helix-protein,-copG-family MSPKKIGRPVVGSPKTNDIKVRVDDETNEKLDEYCKKNNLTKAEAIRQGIHLLLEK >CP016104.1|AXU49857.1|1759976_1760819_+|prophage-antirepressor-related-protein 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP016104_6 | 1758698-1759519 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP016104_6
|
12 spacers
spacers of CP016104_6
>6.1|1758727|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATTTCCAATTACATCACCTCTATATCTATTCTAAAG >6.2|1758793|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTAACACTAACACTATTTTTATTAATATTTAACTTCAA >6.3|1758860|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATGCAGAAAAATTTGAAAGTTGGGTATTTGATGAAG >6.4|1758926|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTAACGAAATACTTATTCAATTTGCTTATTAATACT >6.5|1758992|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATCTTTAGCACTGTAATTTTTAGTGTCAGTTGTATC >6.6|1759058|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTCCAAAATTGAAGTTTATAAAATTGTAAGTATAAG >6.7|1759124|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGTTCAATTTTGCATTTGCACTTGTAGACCCTGTTG >6.8|1759190|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGGTTATAGCTCTGCTTGCATGAATTTCATTGCAAA >6.9|1759256|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTTTGTATGGGAAGTACCACGTGCAGAAGCTACAA >6.10|1759322|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTAAAGGAGTTTCTTTGTTCTTTATGCTCTACAACT >6.11|1759388|37|CP016104|CRISPRCasFinder,CRT AGATTTTATTATAGAGTAGAGGAAGGGCTTGTAAATG >6.12|1759454|37|CP016104|CRISPRCasFinder,CRT GAGATTTGTATGGAGGCTATAAAACAAAACGGATTAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016104_6
The CRISPR arrays of CP016104_6 >merge|CP016104|6|1758698-1759519|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAATCATTTCCAATTACATCACCTCTATATCTATTCTAAAGGTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAATCTAACACTAACACTATTTTTATTAATATTTAACTTCAAGTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAATAATGCAGAAAAATTTGAAAGTTGGGTATTTGATGAAGGTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAATCTTAACGAAATACTTATTCAATTTGCTTATTAATACTGTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAATTATCTTTAGCACTGTAATTTTTAGTGTCAGTTGTATCGTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAATACTCCAAAATTGAAGTTTATAAAATTGTAAGTATAAGGTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAATATGTTCAATTTTGCATTTGCACTTGTAGACCCTGTTGGTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAATTTGGTTATAGCTCTGCTTGCATGAATTTCATTGCAAAGTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAATTATTTTGTATGGGAAGTACCACGTGCAGAAGCTACAAGTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAATACTAAAGGAGTTTCTTTGTTCTTTATGCTCTACAACTGTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAATAGATTTTATTATAGAGTAGAGGAAGGGCTTGTAAATGGTTTTAGATTAACTATGTGGTATGTAAATGAGATTTGTATGGAGGCTATAAAACAAAACGGATTAGGTTTTATATTAACTATGTGGATTCAAAAC >CP016104|6|5|1758698-1759387|PILER-CR GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT CATTTCCAATTACATCACCTCTATATCTATTCTAAAG GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT CTAACACTAACACTATTTTTATTAATATTTAACTTCAA GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT AATGCAGAAAAATTTGAAAGTTGGGTATTTGATGAAG GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT CTTAACGAAATACTTATTCAATTTGCTTATTAATACT GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT TATCTTTAGCACTGTAATTTTTAGTGTCAGTTGTATC GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT ACTCCAAAATTGAAGTTTATAAAATTGTAAGTATAAG GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT ATGTTCAATTTTGCATTTGCACTTGTAGACCCTGTTG GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT TTGGTTATAGCTCTGCTTGCATGAATTTCATTGCAAA GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT TATTTTGTATGGGAAGTACCACGTGCAGAAGCTACAA GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT ACTAAAGGAGTTTCTTTGTTCTTTATGCTCTACAACT GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT >CP016104|6|6|1758698-1759519|CRISPRCasFinder GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT CATTTCCAATTACATCACCTCTATATCTATTCTAAAG GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT CTAACACTAACACTATTTTTATTAATATTTAACTTCAA GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT AATGCAGAAAAATTTGAAAGTTGGGTATTTGATGAAG GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT CTTAACGAAATACTTATTCAATTTGCTTATTAATACT GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT TATCTTTAGCACTGTAATTTTTAGTGTCAGTTGTATC GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT ACTCCAAAATTGAAGTTTATAAAATTGTAAGTATAAG GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT ATGTTCAATTTTGCATTTGCACTTGTAGACCCTGTTG GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT TTGGTTATAGCTCTGCTTGCATGAATTTCATTGCAAA GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT TATTTTGTATGGGAAGTACCACGTGCAGAAGCTACAA GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT ACTAAAGGAGTTTCTTTGTTCTTTATGCTCTACAACT GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT AGATTTTATTATAGAGTAGAGGAAGGGCTTGTAAATG GTTTTAGATTAACTATGTGGTATGTAAAT GAGATTTGTATGGAGGCTATAAAACAAAACGGATTAG GTTTTATATTAACTATGTGGATTCAAAAC >CP016104|6|5|1758698-1759519|CRT GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT CATTTCCAATTACATCACCTCTATATCTATTCTAAAG GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT CTAACACTAACACTATTTTTATTAATATTTAACTTCAA GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT AATGCAGAAAAATTTGAAAGTTGGGTATTTGATGAAG GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT CTTAACGAAATACTTATTCAATTTGCTTATTAATACT GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT TATCTTTAGCACTGTAATTTTTAGTGTCAGTTGTATC GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT ACTCCAAAATTGAAGTTTATAAAATTGTAAGTATAAG GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT ATGTTCAATTTTGCATTTGCACTTGTAGACCCTGTTG GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT TTGGTTATAGCTCTGCTTGCATGAATTTCATTGCAAA GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT TATTTTGTATGGGAAGTACCACGTGCAGAAGCTACAA GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT ACTAAAGGAGTTTCTTTGTTCTTTATGCTCTACAACT GTTTTAGATTAACTAAGTGGAATGTAAAT AGATTTTATTATAGAGTAGAGGAAGGGCTTGTAAATG GTTTTAGATTAACTATGTGGTATGTAAAT GAGATTTGTATGGAGGCTATAAAACAAAACGGATTAG GTTTTATATTAACTATGTGGATTCAAAAC
>CP016104.1|AXU49855.1|1757145_1757250_+|hypothetical-protein MIGFLLSILAGVISAYIYDKIKNHPDANKGDLKK >CP016104.1|AXU49854.1|1755862_1756303_+|phage-protein MSNLSAFLSQNAIKVDNVKYVASNRFLDKEGKPVEWELKVLSSEEDEALRRKCTKRVKVIGNNGKHTGQYTSEIDYNSYVAELCVASTVFPDLKDAELQNSYGVMGEAQLLKTMLTAGEYVNYTVKVNEVNGFDTSFEDKVEEAKN >CP016104.1|AXU49853.1|1755320_1755791_+|phage-protein MAQTINAKDTVSAKKAECFITIEGKRYNFMQAIDLEAKMEKNKSEVPILGRTTKGNKTTGSTNTGSATFHYNTSIFRELLYRYKETGEDIYFDIQVTNEDPTSAVGRQTVVLKDCNMDSGIITKFDADGEYLDEDMDFTFEDWELVEKFNLLAGME >CP016104.1|AXU49852.1|1753993_1755304_+|phage-protein MALGGGTFVTQNKVLPGAYINFISAKRATSSLSDRGIVAMPLELDWGIDEEVFQVTSDDFEKYSVKYFGYDYTHEKLKGLRDLFKNIRLGYFYKLNKGVKASCTIATAKYSGIRGNDLKVTVTTNIDDNAKFDVVTLLDNKKVDTQIAKVITDLQDNDYITWKKDATLEASAGLVFTGGTNGEAVTGAEYQAFLDKIESYSFNALGCLATTTEIKSLFVEFTKRMRDKVGAKFQTVLYKKSDADYEGVVSVENKIKDKDLVESSLIYWATGAIAGCDINKSNTNKKYDGEFDVGVNYTQIQLEEALKSGKFIFHKVGDEVHVLEDINTFVSFTDDKNDDFSSNQSVRVLDQIANDIATLFNEKYLGKVPNDKAGRISFWNDVVKHHKELENIRAIEDFKTDDVSVELGNDKKTVIVSDAVKVINAMSKLYMTVSVN >CP016104.1|AXU49851.1|1753807_1753993_+|hypothetical-protein MINLSKTLSKEENYKFTKEQIVNSKRYVNRKDLLNAILKEDELYSFSEVEEIINNFMKGVS >CP016104.1|AXU49850.1|1753386_1753824_+|phage-protein MLNNIIDGISIKLDKTFGESYTIYSEDVEQGINEPCFFIVPLNPSKVSYPSGRTLKKNSFDVHYFPKSNDKSFEINEVAEMLLEELEYIEIDGDLVRGTNMNFEIVDNVLHFFVDYNYFTIKSNNTDKMDTVELFGGLKRGDKLE >CP016104.1|AXU49849.1|1752968_1753394_+|phage-protein MARWGSVDFREFKRVCKKMEELTKIDLDKFCKDAARELAARLLGKVIRRTPVDTGFLRQGWNGVAYARSLPVYKQGNNYIIEVVNPTEYASYVEYGHRTKDGKGWVKGQHFLTISEMELQSQVDKIIEKKLLILLKGVFDA >CP016104.1|AXU49848.1|1752621_1752969_+|phage-protein MVSKTRKAIEMLYRDKCTIVEYQPIKDPVTKRTNNKEVIVLENQPCKLSYKNIVSATEGKLAKLEQTIKLFISPDIEIKAGSKLIINDKEYVRSGESAIYSNHQEIILELFKDKA >CP016104.1|AXU49847.1|1752226_1752628_+|hypothetical-protein MENNIIDEIEKRLESFGYILKDGDKWLIGFVREKIENIIKLDCNIKTMPIELKEIEVDMIVGEFLFTKKNMGQLDIESINFEAVEKSISEGDTKVDFAIGSGSQTPEQRFDSLIAYLTTYGKNNILTFRCLRW >CP016104.1|AXU49846.1|1751983_1752217_+|hypothetical-protein MAQVRKLNRILTIEECKIDDFLEMGYDLIDETGKAVKYGKSLSVKDLIAENNILRSKVESLEEENKQLKEKNKLTKK >CP016104.1|AXU49856.1|1759678_1759849_+|Ribbon-helix-helix-protein,-copG-family MSPKKIGRPVVGSPKTNDIKVRVDDETNEKLDEYCKKNNLTKAEAIRQGIHLLLEK >CP016104.1|AXU49857.1|1759976_1760819_+|prophage-antirepressor-related-protein MKTNLELIKSENFGEVECNFYENDTKDILMTREQIGMALEYTEPRIAISKIHERNKDRLDKFSTVVKLVTVEGNREVLRDTIVYNTKGVMEICRFSRQPKADTFMDWVWDVVESIFKTGAYITNNANPEKLREKASEIEKLQLAYNSTSMLKELLDGAGFDNKSKLLTAKTLYKKAGIDLPIEIEEEESFFDTKQIASKLKIYSKSNKPAQLAVCEIIKKIDLEENEVKGVWETNGSWTGTVNKYTKSVIDKIRNWIEENNRPTKIQGEKKNYHVVYKIE >CP016104.1|AXU49858.1|1760871_1761030_+|hypothetical-protein MYENLLDSIDIEKRKEEFRIKLLKIRETDIDIYNKIESIVYKLYEKKLEKNK >CP016104.1|AXU49859.1|1761587_1762370_+|hypothetical-protein MGLFGGKEPCCICGGKGKNKVLENEYLCNNCFVDFTIFSSERLKTTSAMQVLADHEGIRKFINFSKKNRELLAKFVETNRINKFISIDKDNNFIKISDIRKGGDVIESVYATDEIMQFELLEDGESIVSGGLGRAVVGGALFGATGAVVGGVTGKKTTRKIVNTFKIKITFNNINNPLEYINLINTRTKTNSSIYQNACNEAQEILSVLSIIVKNNDKANNEQYKTSSLIEQVKGLKELLDIGAITEEEFNIKKKELLNL >CP016104.1|AXU49860.1|1762433_1764785_+|phage-tail-tape-measure-protein 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>CP016104.1|AXU49863.1|1767460_1767721_+|phage-protein MSQELLQIIKKAAMDAVETSNPIQIAFGTIESVNPLVVKIEQKASFEESFLIQTDTFKKYTDKKIGDKLVLIRMQGGQQYLILDRM >CP016104.1|AXU49864.1|1767725_1768145_+|phage-protein MLPSDNLDYDIEDVSIINFDVRQEPSKTFKLNIEKNRVDGICDDVEALKQTIFLILNTERYEHLIYSRNYGVELNDLIGEPISYVIPELERRITEALIQDDRIENIDNFEFQNIKGKVQCRFSVHTKYGNIKAEKVVSV >CP016104.1|AXU49865.1|1768145_1769195_+|phage-protein MFELMTFENIIKRMLDSVPDTFDKREGSIIYNALAPVAIELTETYIAMDELLDQTFVDTASYYYLEKRCKERGITPLPATNTIAKGVFNIDIPIDSRFNLGEYNYVAIERISEKTYKMKCETTGPVFELGQLIPIEYVDKLETAELTEILINGEDEESEDSLRQRYYDSLNSQSFGGNMQNYKDEVNKIQDVGGVKVYPVWDGGGTVKLVIINSNFKVPSSDLVNLVQEEIDPLQNQGEGLGLAPIGHRVTVEGVTSTTINISAEITYKNGYTWENIKSIAEEAIDDYLNELNMSWEDEENLIVRISQIETRLLSIDGVLDIANTMINEVKSNLTINSNSIVVRGEVVG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP016104_7 | 1761107-1761463 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP016104_7
|
5 spacers
spacers of CP016104_7
>7.1|1761135|38|CP016104|CRT GTTTGTATTTGTATCTACACTACCTTGAACCTCAACTT >7.2|1761201|37|CP016104|CRT GAAAGTATCTCTAAATCCTATTGCTTTTTCGGTTAGA >7.3|1761266|37|CP016104|CRT GCAAAATGATGCTTGTTATCAAAATAGGTTGTATTAT >7.4|1761331|37|CP016104|CRT TTTCGGATACAGAATTGAAAACAAACATCTAGTAATT >7.5|1761396|39|CP016104|CRT TGTTGGTTCAATTTCCAAATGACTTAGACAGTGATTATG >7.6|1761136|40|CP016104|PILER-CR GTTTGTATTTGTATCTACACTACCTTGAACCTCAACTTGT >7.7|1761202|39|CP016104|PILER-CR GAAAGTATCTCTAAATCCTATTGCTTTTTCGGTTAGAGT >7.8|1761267|39|CP016104|PILER-CR GCAAAATGATGCTTGTTATCAAAATAGGTTGTATTATAT >7.9|1761332|39|CP016104|PILER-CR TTTCGGATACAGAATTGAAAACAAACATCTAGTAATTGT >7.10|1761136|40|CP016104|CRISPRCasFinder TTTGTATTTGTATCTACACTACCTTGAACCTCAACTTGTT >7.11|1761202|39|CP016104|CRISPRCasFinder AAAGTATCTCTAAATCCTATTGCTTTTTCGGTTAGAGTT >7.12|1761267|39|CP016104|CRISPRCasFinder CAAAATGATGCTTGTTATCAAAATAGGTTGTATTATATT >7.13|1761332|39|CP016104|CRISPRCasFinder TTCGGATACAGAATTGAAAACAAACATCTAGTAATTGTT >7.14|1761397|41|CP016104|CRISPRCasFinder GTTGGTTCAATTTCCAAATGACTTAGACAGTGATTATGGTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016104_7
The CRISPR arrays of CP016104_7 >merge|CP016104|7|1761107-1761463|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GAGTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAGTTTGTATTTGTATCTACACTACCTTGAACCTCAACTTGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAGAAAGTATCTCTAAATCCTATTGCTTTTTCGGTTAGAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGCAAAATGATGCTTGTTATCAAAATAGGTTGTATTATATTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTCGGATACAGAATTGAAAACAAACATCTAGTAATTGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATGTTGGTTCAATTTCCAAATGACTTAGACAGTGATTATGGTTTTATATTAACTATGTGGACTTAAAAT >CP016104|7|6|1761107-1761462|CRT GAGTTATATTAACTATGTGGTATGTAAA GTTTGTATTTGTATCTACACTACCTTGAACCTCAACTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAA GAAAGTATCTCTAAATCCTATTGCTTTTTCGGTTAGA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAA GCAAAATGATGCTTGTTATCAAAATAGGTTGTATTAT ATTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAA TTTCGGATACAGAATTGAAAACAAACATCTAGTAATT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAA TGTTGGTTCAATTTCCAAATGACTTAGACAGTGATTATG GTTTTATATTAACTATGTGGACTTAAAA >CP016104|7|6|1761110-1761395|PILER-CR TTATATTAACTATGTGGTATGTAAAG TTTGTATTTGTATCTACACTACCTTGAACCTCAACTTGTT TTATATTAACTATGTGGTATGTAAAG AAAGTATCTCTAAATCCTATTGCTTTTTCGGTTAGAGTT TTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG CAAAATGATGCTTGTTATCAAAATAGGTTGTATTATATT TTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTCGGATACAGAATTGAAAACAAACATCTAGTAATTGTT TTATATTAACTATGTGGTATGTAAA >CP016104|7|7|1761110-1761463|CRISPRCasFinder TTATATTAACTATGTGGTATGTAAAG TTTGTATTTGTATCTACACTACCTTGAACCTCAACTTGTT TTATATTAACTATGTGGTATGTAAAG AAAGTATCTCTAAATCCTATTGCTTTTTCGGTTAGAGTT TTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG CAAAATGATGCTTGTTATCAAAATAGGTTGTATTATATT TTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTCGGATACAGAATTGAAAACAAACATCTAGTAATTGTT TTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GTTGGTTCAATTTCCAAATGACTTAGACAGTGATTATGGTT TTATATTAACTATGTGGACTTAAAAT
>CP016104.1|AXU49858.1|1760871_1761030_+|hypothetical-protein MYENLLDSIDIEKRKEEFRIKLLKIRETDIDIYNKIESIVYKLYEKKLEKNK >CP016104.1|AXU49857.1|1759976_1760819_+|prophage-antirepressor-related-protein MKTNLELIKSENFGEVECNFYENDTKDILMTREQIGMALEYTEPRIAISKIHERNKDRLDKFSTVVKLVTVEGNREVLRDTIVYNTKGVMEICRFSRQPKADTFMDWVWDVVESIFKTGAYITNNANPEKLREKASEIEKLQLAYNSTSMLKELLDGAGFDNKSKLLTAKTLYKKAGIDLPIEIEEEESFFDTKQIASKLKIYSKSNKPAQLAVCEIIKKIDLEENEVKGVWETNGSWTGTVNKYTKSVIDKIRNWIEENNRPTKIQGEKKNYHVVYKIE >CP016104.1|AXU49856.1|1759678_1759849_+|Ribbon-helix-helix-protein,-copG-family MSPKKIGRPVVGSPKTNDIKVRVDDETNEKLDEYCKKNNLTKAEAIRQGIHLLLEK >CP016104.1|AXU49855.1|1757145_1757250_+|hypothetical-protein MIGFLLSILAGVISAYIYDKIKNHPDANKGDLKK >CP016104.1|AXU49854.1|1755862_1756303_+|phage-protein MSNLSAFLSQNAIKVDNVKYVASNRFLDKEGKPVEWELKVLSSEEDEALRRKCTKRVKVIGNNGKHTGQYTSEIDYNSYVAELCVASTVFPDLKDAELQNSYGVMGEAQLLKTMLTAGEYVNYTVKVNEVNGFDTSFEDKVEEAKN >CP016104.1|AXU49853.1|1755320_1755791_+|phage-protein MAQTINAKDTVSAKKAECFITIEGKRYNFMQAIDLEAKMEKNKSEVPILGRTTKGNKTTGSTNTGSATFHYNTSIFRELLYRYKETGEDIYFDIQVTNEDPTSAVGRQTVVLKDCNMDSGIITKFDADGEYLDEDMDFTFEDWELVEKFNLLAGME >CP016104.1|AXU49852.1|1753993_1755304_+|phage-protein MALGGGTFVTQNKVLPGAYINFISAKRATSSLSDRGIVAMPLELDWGIDEEVFQVTSDDFEKYSVKYFGYDYTHEKLKGLRDLFKNIRLGYFYKLNKGVKASCTIATAKYSGIRGNDLKVTVTTNIDDNAKFDVVTLLDNKKVDTQIAKVITDLQDNDYITWKKDATLEASAGLVFTGGTNGEAVTGAEYQAFLDKIESYSFNALGCLATTTEIKSLFVEFTKRMRDKVGAKFQTVLYKKSDADYEGVVSVENKIKDKDLVESSLIYWATGAIAGCDINKSNTNKKYDGEFDVGVNYTQIQLEEALKSGKFIFHKVGDEVHVLEDINTFVSFTDDKNDDFSSNQSVRVLDQIANDIATLFNEKYLGKVPNDKAGRISFWNDVVKHHKELENIRAIEDFKTDDVSVELGNDKKTVIVSDAVKVINAMSKLYMTVSVN >CP016104.1|AXU49851.1|1753807_1753993_+|hypothetical-protein MINLSKTLSKEENYKFTKEQIVNSKRYVNRKDLLNAILKEDELYSFSEVEEIINNFMKGVS >CP016104.1|AXU49850.1|1753386_1753824_+|phage-protein MLNNIIDGISIKLDKTFGESYTIYSEDVEQGINEPCFFIVPLNPSKVSYPSGRTLKKNSFDVHYFPKSNDKSFEINEVAEMLLEELEYIEIDGDLVRGTNMNFEIVDNVLHFFVDYNYFTIKSNNTDKMDTVELFGGLKRGDKLE >CP016104.1|AXU49849.1|1752968_1753394_+|phage-protein MARWGSVDFREFKRVCKKMEELTKIDLDKFCKDAARELAARLLGKVIRRTPVDTGFLRQGWNGVAYARSLPVYKQGNNYIIEVVNPTEYASYVEYGHRTKDGKGWVKGQHFLTISEMELQSQVDKIIEKKLLILLKGVFDA >CP016104.1|AXU49859.1|1761587_1762370_+|hypothetical-protein MGLFGGKEPCCICGGKGKNKVLENEYLCNNCFVDFTIFSSERLKTTSAMQVLADHEGIRKFINFSKKNRELLAKFVETNRINKFISIDKDNNFIKISDIRKGGDVIESVYATDEIMQFELLEDGESIVSGGLGRAVVGGALFGATGAVVGGVTGKKTTRKIVNTFKIKITFNNINNPLEYINLINTRTKTNSSIYQNACNEAQEILSVLSIIVKNNDKANNEQYKTSSLIEQVKGLKELLDIGAITEEEFNIKKKELLNL >CP016104.1|AXU49860.1|1762433_1764785_+|phage-tail-tape-measure-protein MATIQTSIRIFDGMTPAFRNMTTSINTTINSLERLQGRLNNPLNAGNIQNSQQSLNNIENILTRIEQSIGKADEQQRKFNEDIDKGVGSTDRLFGNVKRLATTYLGLKTLGGLGSLSDQMTSTNARLAMINDGQLSDSGLNKMIFQSAERSRASYLDTAQIVSRIGMNAGSAFSSTREIVSFAEQLNKKFIIAGASTQEMSSALLQLTQGLGSGVLRGEELNAVFESAPNIIRSIADYLDVDIGKIRGMASEGMLTADIVKNSLLAASAETNKQFEQMPYTLGQIFTSIKNNAVMVFGAIQKKIEDTVSSKGFRTFITDVKDSLYVLGAVGFNVFSGFINLLSSPAFQNFFNVMIVGTSLVVQGLGWIITQALNVVNVFTQNWSIISPIIWGIVGAFIAYKVIISLVLIAQAIYTAITFTQCFVTALFTGELYVATKAMLIHQLMTLGVSRANVTLCATMIMVVAAVALVIAVIFVGVAIFNHFAGTSISATGVVVGCFYFLGACIYDVFAAAWNIIMAFAEFFVNSFNIVIYNVQLLFYKFQNFVIDSMGDVGGSFDNCATALANAFVSAANIAIKGINGVIKALNLIPGVNIKTIGSLDKIDSFVKQYKDYQKTLKEPVKPAEWKAPTMKLKNPVDSFKKGYEVGQNLENKIKDAFDINKIAEKAKKDLGLDDLWDKKYGLGDGLGSAGLNSPLNDAAKGAKDTAGNTAKMAKTMDKSQEDLKYLRDIAEQETINRFTGVNIKIDMNNTNNISKDADVDGIVNVLTEKLNDAMVVSAEGIV >CP016104.1|AXU49861.1|1764800_1765490_+|phage-cell-wall-hydrolase MAYDFYLDGVQLPIPPSKLEIKVTNKNKTVDLINTGEVNILKKEGLSEISFEAEFTHNKLPFYRGTFRDVQFFLSKLELLKTDCKPFQFIVSRELGNKVLFNTNMKVSLEEYNIVEDAENASDTKVAIKLKQYRDYSTKKLVLAPPKNETGRPNVKIEPKRVDSVNATNTKTYTVKAGDSLWSICQKQLGNGSLYEKVYELNKSMMDKANKGKNLSKYTIYKGQVLKLG >CP016104.1|AXU49862.1|1765482_1767447_+|phage-cell-wall-hydrolase MVDELVLANDRDVRLVIAHWEDFYEPAVIDGITWEIERRGTPSKLEFTIVMDDILEFCEGNSVRLYYKGIGIFYGYIFQKKRDKENHIKIVAYDQLRYFKNKDTYVYSNKTASELVKMLAKDFNLKYNVIEDTKYKLSRVEENKTLFDMILTALDDTLREEKEMYTLYDDFGRITLKNVASMKLDTVMNNDVIEDFDYNSSIDSDTYTKIKLVRDNEESGKRDVYIAQDSTHMRSWGILQMFETVDKNMNEAEIKQKCDILLKLYNKKTKSLSLKNALGDIRVRAGCLVPVFLNLGDIELQNYMLVEKVKHTFENNSHFMDLTLADGDEFASYSSSSYSSGNTNNKNEKQNGPAQSTTSKEDNDMINKLNKVFKNKLSNTGNIFVKYSNAYKVNAALMAAISIHETGNGSSSLCKNKNNFFGMKGMSFSSVDEGIKKGISNLSRNYIHIGRKTLERIRDKYAPLYDSPLNKDWVPGVGKFYKQITGSTYTSNNAGTGVGSNEEAEKNLKDTTYQVQNNNSNTSTNNNSKVSKVIQEAKNQLGKPYAWGGNGPKSFDCSGLMVWAFKRGAGINLPRVSADQSKDSRGKLLCNINDVKAGDLVFFKNEQGKVHHVGLYIGNDQYIHAPQTGDVVKISSLSGRQKKKHDFARARRFF >CP016104.1|AXU49863.1|1767460_1767721_+|phage-protein MSQELLQIIKKAAMDAVETSNPIQIAFGTIESVNPLVVKIEQKASFEESFLIQTDTFKKYTDKKIGDKLVLIRMQGGQQYLILDRM >CP016104.1|AXU49864.1|1767725_1768145_+|phage-protein MLPSDNLDYDIEDVSIINFDVRQEPSKTFKLNIEKNRVDGICDDVEALKQTIFLILNTERYEHLIYSRNYGVELNDLIGEPISYVIPELERRITEALIQDDRIENIDNFEFQNIKGKVQCRFSVHTKYGNIKAEKVVSV >CP016104.1|AXU49865.1|1768145_1769195_+|phage-protein MFELMTFENIIKRMLDSVPDTFDKREGSIIYNALAPVAIELTETYIAMDELLDQTFVDTASYYYLEKRCKERGITPLPATNTIAKGVFNIDIPIDSRFNLGEYNYVAIERISEKTYKMKCETTGPVFELGQLIPIEYVDKLETAELTEILINGEDEESEDSLRQRYYDSLNSQSFGGNMQNYKDEVNKIQDVGGVKVYPVWDGGGTVKLVIINSNFKVPSSDLVNLVQEEIDPLQNQGEGLGLAPIGHRVTVEGVTSTTINISAEITYKNGYTWENIKSIAEEAIDDYLNELNMSWEDEENLIVRISQIETRLLSIDGVLDIANTMINEVKSNLTINSNSIVVRGEVVG >CP016104.1|AXU49866.1|1769187_1769805_+|phage-protein MDKEINLINYLPQILQDKEEYIKVFNVENKEIKTLHDKLKDLSNDQFLEDLTISGIKRWEKIMSITPKSNESLEDRRFRIFSKYISKLPYSERFLRNWLDNVVGEGNYELTINNATYNIHLESDARNQDWFEEVHSFVSDIKPCNMTLDYTRVLVSKDNYMNFGITTLMGQEITIYPWSPPDIETYGEIDVLTGNGVGYQEVTIF >CP016104.1|AXU49867.1|1769816_1770809_+|phage-tail-fiber-protein MAIDKSYYTIITDVGKAKIANASVTSNKVGFVKIQLGDGGGSEYTPTESQTALKNVVWEGNIGNTTTDETAPNCIILESLIPSSVGGFMIREIGYLDDENNLIAISKYKECYKPSIEQGAVVDMKVKTVLIVSNVNNIELKIDPTIIFATLKDIQDLETKIGTVNTKIDTTKTELTSNIETAKTELNTKIDQLIAGGSNVASTQTITIDDWVEDAENGFKATVTHSLLTQRIVVNIIDATTKENVVTNFKIIDDNSIEIRSEVKAELNIYIINGNAETHFINATVDDNRVSEMTTYSSKKIEDRLINIEEKVNGGLSNIATSVNELITYC >CP016104.1|AXU49868.1|1770823_1772476_+|Glycine-rich-protein MQTEWNFNYANYVQNVSLLPGRYKLECWGACGGGKGASSFNECAKGGYAKGEIVLKKRTNLIVCVGQSGYEKLPRDSNITRTGFNGGGRAGSTSIGDYIYAGYGGGATDIRLYHSSATWDSSEGLLSRILVAGGAGAIEGFSYSHPSIGHGGGEKGSDGVSANTNRFSGGGSQYQGGSNQETIEYHGSFGKGGIGYYSVGGGGGWYGGGGINVGDVAGGGSGYALTKDSYKPLGYIPTSEYWLENVVMTTGGNTTRADGYAKITLLQALPFLNISSYNSTQVTFKADHTDPTLLTKIEVFIDDTLKETITTDLTLEKTINYTLEDNALHTLKIVVTDSNNATAEKVLSISKNIMPLPENVNLQDISTKLIEVNAGFKTGKTSIINTLALKNIEASLNNTLVELSEKIKTSFDSSDASVQELQNRITELTNQLSQRKRWAKGTASLTISYVNNSVHQQIETNLSFRPSIILVKTNLFFTNSGFDSYNCNLYSANNLTETYAVNANKNTGPGRAGVYAQVVTISEESFILHFTTSLYFNVSQSSPIEWYAFE |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP016104_8 | 1893798-1894091 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP016104_8
|
4 spacers
spacers of CP016104_8
>8.1|1893827|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATTTTTTATTGATTACGCTGAAAAAAACCATGTTA >8.2|1893893|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTATTACAGAGAAGGTTATTATTGATTTAACAAAGT >8.3|1893959|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGAGTATTTTTATAGATGCATTTTTCAAAACTATCTA >8.4|1894025|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTATAACCTTTAATTACACCTCCCATATCACCACCAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016104_8
The CRISPR arrays of CP016104_8 >merge|CP016104|8|1893798-1894091|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAAATTTTTTATTGATTACGCTGAAAAAAACCATGTTAGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATATTATTACAGAGAAGGTTATTATTGATTTAACAAAGTGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTGAGTATTTTTATAGATGCATTTTTCAAAACTATCTAGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTTATAACCTTTAATTACACCTCCCATATCACCACCACGTTTTATATTAACTACGTGGTATGTAAAT >CP016104|8|7|1893798-1894091|PILER-CR GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AAATTTTTTATTGATTACGCTGAAAAAAACCATGTTA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT ATTATTACAGAGAAGGTTATTATTGATTTAACAAAGT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TGAGTATTTTTATAGATGCATTTTTCAAAACTATCTA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTATAACCTTTAATTACACCTCCCATATCACCACCAC GTTTTATATTAACTACGTGGTATGTAAAT >CP016104|8|8|1893798-1894091|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AAATTTTTTATTGATTACGCTGAAAAAAACCATGTTA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT ATTATTACAGAGAAGGTTATTATTGATTTAACAAAGT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TGAGTATTTTTATAGATGCATTTTTCAAAACTATCTA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTATAACCTTTAATTACACCTCCCATATCACCACCAC GTTTTATATTAACTACGTGGTATGTAAAT >CP016104|8|7|1893798-1894091|CRT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AAATTTTTTATTGATTACGCTGAAAAAAACCATGTTA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT ATTATTACAGAGAAGGTTATTATTGATTTAACAAAGT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TGAGTATTTTTATAGATGCATTTTTCAAAACTATCTA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTATAACCTTTAATTACACCTCCCATATCACCACCAC GTTTTATATTAACTACGTGGTATGTAAAT
>CP016104.1|AXU49976.1|1891878_1893150_-|guanine-deaminase MLKVLKGNIIFTKTSETFTVFENSYIILEKGKVKGIFKEIPKEYKNLKVVDYTDKLIIPGMNDLHAHASQFKNLGMAMDKELLPWLETYTFPEESNYKDIEYATKMYKKFVKELWKSGTTRIAVFATVHKEASMKLMDIFKEVGLGAYVGKVNMNMNCPDTLLENTQDSIADTEEIINKYSDTDSIVKPIITPRFIPSCTSELLKGLGDLCLKYNIPIQSHLSENYDEIEWVRNLEPESKFYGDAYNRYNLFGQTPTLMAHCVHCSQDEIDLMRENNVMAVHCPASNFNVGSGAMPIRKLIDNNIRLALGSDISGGHTLSIFKAMVSAIQLSKLYWVNSGKKYNFLSLSEAFYIATKSGGSFFGKVGSFEEGYDFDALIIDDSNLNHDNYSILERLERFIYVGDDRNIIHRYVCGKLIEEPNI >CP016104.1|AXU49975.1|1890482_1891238_+|hypothetical-protein MAHICFDDSCYFLLKEAMKLKLIPHNKIVLFEDDLSIGNISDVNNHELRENIFKIRNVFENNPKLLFEPDLLEDRKLSKCRNIIIWCANNPKDLCGVYYVVSKFQDKNIKIVLVDEKKTEDTLIRYSFTSEMSPEDFPFFLDKTLEIGFNEKLEFKNKWDVLVKENSIFRALVGNEIKSVEETYFDKYILRNISDKWQPLIEVVANCMFEDEMRVKDWFILWRLEKMASLKIVKIKGSKGDFYSDKEIRKI >CP016104.1|AXU49974.1|1889828_1890146_-|hypothetical-protein MNEFKNVTAVKKANVYFDGKVSSRVIILPNGERKTLGLMLPGEYTFSTREEEIMEMLAGSMDVKLPGSNEFVTYKEGQKFNVPSDSSFDLKVNEVVDYCCSYIAD >CP016104.1|AXU49973.1|1887385_1889743_+|cation-transporting-ATPase MDKVNLERYSCDINVGLNKNQLQSRIDDNLINAFENGKTKTYKQIFKDNIFTLFNLINIVLVCLLVSVGSFKNTLFIFIAVINTIIGVIQEIRAKRLLDNLSVIISNKVSVIREKEKKEIDVQELVLDDIMILKTGNQICADSKVLNGKLEVNESLVTGESDIIIKNKGDFLYSGSFVVSGEAFVRVENIGKDNYANKITNDAKISKKHNSQLRNSLNAILKIVGIIIIPLGIILFAKQHFGNGDSIATSVVGTVAAVNGMIPEGLTLLTSIALAVGTIKLASHKTLVQELYCVETLARVDTLCLDKTGTITEGKMQVDDIVMLEEVDINEIMGNICNSLKDDNATLNAIRDKYNVLDTYKAKNLIPFSSERKYSGVTFENKGTYLLGAFEFIFKEKNKKLRIEVERYSKKGNRVIVLAHSDSYMEDNNIPEDIKPLAFILILDKIRDEAKETLEFFYNEGVDIKIISGDNPITVSEVARKAGLKTASNFIDATTLKNDSDIYEAVDKYSVFGRVSPQQKKQMILALKKQNHTVAMTGDGVNDVLALKEADCSIAMASGSDVTKNVSNLVLLDSNFASMPKVVMEGRKVINNIQRASSLFLVKTIFSFFLSLLTLFFFSRQYPFVPIQLSLIGAVTVGIPSFFLALEANKSRISGNFLLNILKNALPGALCVTVNVIIVYNIVEYLGYSSSVFSTMCAILTGVCGLLILRQQCLPFNKERLFLIVSMTIAFVIGILFLGGLFSFVALSRELILITMALAILMPIMIKVMLFVLDEILETIVPDLN >CP016104.1|AXU49972.1|1885505_1886963_+|glycine-dehydrogenase-subunit-2 MKEYNSLLIDISKKGRKAYSLPKLDIDDIKIEDMIDQDMARQSELNLPEVGELELVRHYTLLSNKNFGVDTGFYPLGSCTMKYNPKINEDMAALPNFTGMHPYQSSDTAQGSLSLMYDLSRRLAEITGMDEVTLQPSAGSHGEFTGLMIIKAYHENRGDHKRTKVIIPDSAHGTNPASAAMANFDVIQIASDKNGAVDINALKEVLNDEVAALMLTNPSTLGLFEKNIKEIATLVHEAGGLLYYDGANMNAIMGITRPGDMGFDVVHLNLHKTFSTPHGGGGPGAGPVGVKKELVPFLPIPIIERKEDKYVLNYDREKSIGKIKNFYGNFGVLVRAYTYILTMGRDGLKEASEMAVLNANYIKESIKDDYILPIDTLCKHEFVLGGLPRGEANIKTIDIAKRLLDYGYHPPTMYFPLIINEALMIEPTESESIETLDSFIEAMKSVAKEAKEEPELLKTAPHNTLVKRVDDARAVKKPILTWSQR >CP016104.1|AXU49971.1|1883031_1885506_+|bifunctional-glycine-dehydrogenase/aminomethyl-transferase-protein MNELKRVPLYNIHKELGAKLVEFAGWEMPLEYKGINKEHEMVRKSAGIFDVSHMGEVQIKGVESEKFIQNLVTNDISTLNINDIIYTPMCYENGGVVDDLLIYKFGEEEYLLVINAGNIDKDVAWIIKQSEGYNVDIKNISSEVSQLAIQGPKAEEILQKITDIDLNSIKFYKSIPSTKVCGCPCLVSRTGYTGEDGFEIYCKNKYVEIIWNEVLKVGGEDICPAGLGCRDTLRFEAALPLYGHEINEHISPIEGGLSIFVKTNKESFIGKSILSKEKESGAKRKLVGFEMQGKGMPRNGYDIRIGDKTVGFVTTGCASPTTGKILGMGIIDSEYAKVGNEIGIAIRKKVVPAVIVKKPFYKKQYKKDNIILNKENKFSYIPATSEDKSKMLKVVGLNSVDELFSDIPEEVKLKRDLNLEIGKSELEVSKIVKRLSEENLSLEDLTCFLGAGAYDHYIPSIIKHITSRSEFYTAYTPYQAEISQGTLQVVFEFQSMIAEITGMEIANASMYDGATAAIEACIMAINQTRKSKIVVSKTTHPETLSVLRTYLQYKDCEIVEIDFCNEYGTTDIEKLKASVDKDTACVLIQTPNFFGIIEEMEEIEKITHENKAMLIMSVDPISLGVLKTPGEIGADIVVGEAQSLGNPLNFGGPYVGFLASKSKYTRKMPGRIVGQSLDVEGKIAYVLTLQTREQHVRREKATSNICSNQALNALVASIYMATMGKEGFKEVGMQSMKKAHYTYNKLVQTGKYKPIFKGKFFKEFAVQGNLNIETINDKLLEENILGGYNLEYNYPELKNSTLLCVTEKRSKEEIDKLVGIMEGL >CP016104.1|AXU49970.1|1881726_1882242_+|CF-9-family-membrane-protein MEKYIWLFPLLFIFHDMEEIIGFGIWLKKNKSMLDKKYPFISKIYENYSTEGMAFAVFEEFILCIIFCILIVITDNQYVYLLWLGSFIAYTLHLVIHIGQSIIIRKYIPSLITSIICLPISIWCISKSIYIVDCEMSTTILYSIIGIIIVALNLKFAQSLIGKFTKWMSNI >CP016104.1|AXU49969.1|1879471_1881202_+|Na+/H+-antiporter MRNKKINIIFLTTIMFIMSTVMVFAEEDIDTIALANAEKFGILTLIPPLVAIILAFITKNVIISLLIGILSGSFIIKASGINVFATFIQAFLDLVDRALVSLADPWNAGIILQVLAIGGVINLVAKMGGAKAIAEALAKRAKSAKGTQLITWFLGLLVFFDDYANSLIVGPMMRPVADKMKISREKLAFIIDATAAPVAGLAIISTWIGLEVGLIHDAFESISIDVDAFGIFLNTIPFRFYNILILAFIVISALLLKEFGPMRKAEIKSRSRKISIDLDEGVAELDDLAPKNGVKLSVWNAIIPIGTLIIVALASFYYSGYTSIMGGDDKALIQLFTNSPYSFEAIKEAFSASDASRALFQSALVASLVAIIMAVVKKIFTISEAIDVWIDGMKSLVITGVILILAWSLSSVIKELGTAKFLIHLLSGSLPPFLLPSLIFGLGAIISFATGTAYGTMGILMPLAIPLAYSLNPDMSYVIVSTSAVLTGAIFGDHCSPISDTTILSSMGAGCNHIDHVNTQMPYAIFTAVITIVFGYIPAGLGLPIYIVLPVAIAAIFIGIQIIGKRVDEAEIELVE >CP016104.1|AXU49968.1|1878002_1878989_-|lipoate-protein-ligase MLLIYNEKTNPYFNLAMEEYLLKNFDEDLFILWRNEPSIIVGKNQNTLSEINLEYIKEYSIPVVRRQSGGGAVFHDLGNINFTFIACNNNNFSDFRRFTQPIIDLLKTLDVNAEFSGRNDLLIDGKKFSGNAQYNYKNKVMHHGTLLFSSEINDLSKALKVKPIKFEGKGIKSVKSRVTNISEHLHSKMDILEFKDAIMDYLSKTNTDNTNYCLSEHDIKQIEKLTKSKYETWDWNFGNSPKYTLSNELKYSGGNVEFNLNVDKGIITSIKFFGDFFGKCDVAFVENKLIGIKHEENALRNTLDSIEINDYFLGADTDILVSGILGVK >CP016104.1|AXU49967.1|1876895_1877693_-|lipoprotein MKFKKLLCLLLCLVLTLAVVGCSKAKDDKKIVVGATLVPGGELLEELKPLIKEKGYTLEVKNFDDYILPNEALNNGEIDANLFQHEPYLKEAVKAKGYKIMAGKKLYVCPAILYSYKIKSVDEFKKGDTIAISNNPSSCSKNLRYLESIGLLTLPKGDGLVSPKDIIENPKGIQFKELDIAQIPSSLPDVTAAFIDTTYAVPAGLDAKKNGIYTAPINDEYANLLAFRTEDKDSEKIKVLQDVLTSDKARSLIEEKYKGIVIPTF >CP016104.1|AXU49977.1|1894497_1894785_+|hypothetical-protein MKKILYALYSFIVIIANFRLKEKNYNFILLAIFFILLLIQNGVLKTGYQNRATFYQDNYFNGEDKSDKIKFMTIKIFIFLSLPLCFNILFNYLTS >CP016104.1|AXU49978.1|1894809_1894908_+|hypothetical-protein MIKVSLCVIYIKYKVHIVIKQKFHINEEKNIK >CP016104.1|AXU49979.1|1895323_1895875_-|transcriptional-regulator MSINTIIAKNLNRLRNERNLSLGQLAELSGVSKVMLSQIEKGDSNPTVNTIWKIASGLNVPYTAILEQPQNETFIVSKTDIDVQVSENKDYRLYCYYPNTPTRNFELFQMELEEGHSYTSVGHSEKSQEYIMIIEGQLKLEVNDSIYQLRENDSICFSAESMHTYHNQGEKTLKAVIINYYPV >CP016104.1|AXU49980.1|1896065_1897028_+|cysteine-synthase-A MRVLNNVTEAIGNTHMLHLSKIADEFGVQGNIYAKMEYLNPGFSKKDRVALQMITEAENAGLLVPGQAVVELTSGNTGTGLAIACACKGYKFIACMSKGNSMERARMMKALGAEVVLVDQMPNSVHGQVSGEDLALVEIEAQKIAKERNAFRADQFNLEACNHAHEKYTAEEMWEQLDGNIDVFVDFLGSGSTFAGCSKTLKKHNSSIKCYVVEPETAAIYSGKEITDQGHKIQGGGYSMDLPLVDKKLIDGYIQVTDEEATDVARKLAKLEGVFAGFSSGANVCAAIKLLKSSEKGKNIVLTLNDSGLKYLSTDLYEEL >CP016104.1|AXU49981.1|1897319_1899164_+|glycerophosphoryl-diester-phosphodiesterase MQKRNLRNFIFTGKNILSKLVFIIKYNFSTLILFELFHKGLALFFIWPSIRYIFDILIKSLHIVYLNMDNFIKVLTNPISIVLIILSVIILAFYAFFELTSVIICFNKSIKYEKIGLFELFKISFKKSIKLLYPKNILLFIFVILIIPLVNTVLISGFIGKIQIPDYILDYIKSDIVLNIIYMIFLLIIYILVIRWIFSIHEITLNTENFKRARKESVNLIKGKIIRTIIYSLILSLVVAIIGYVIYHSGVIFIGIWTKYYTDMEFLKNIFINRCIAFEEYFRLILSIFIFILDIGFISATYYQYKGVSISKNNIKKEKKSISKIVFNLVLILLISYIESVAFSSHVNGMFNTSFSFYTTAIAHRAGAEMAPENTLAAIEEASHAKADYAEIDVQETKDGELIVLHDSNFKRTTGVDKNVWDVNYNEVKTYDAGSFYYYGKGYYDEKFVGEKIPTLKEMIKYSKGKVKLLIEIKLNGHEKGDVVKKVVQLIKENNFENQCIVASMDKTILQKVKKLDENLLTCYFMAIAYGDFSKLNYVDIYGIESTFVNKTVVEKIHKMNKKIFVWTVNSDSLIEKMLDLNVDSIITDNPYLIESAIYWKKNGFISQVSDYLF >CP016104.1|AXU49982.1|1899484_1900069_+|sugar-O-acetyltransferase MTEREKMLAGELYDCGDIELLTQWHKAKDLVRDYNQTDSSDLEKKEKILNELLGGKGKNLWITAPYYVDYGNNIYFGNNCEVNMNCTFLDDNKIIIGDNVLIAPNVQIYTAFHPTNAGDRFGNAKEDGSFEFCKTQTAPVTIGDNVWIGGGAIIMPGVTIGDNVVIGAGSIVTKDIPSNMIAYGNPCRIIRENK >CP016104.1|AXU49983.1|1901171_1901348_-|hypothetical-protein MFIGEIDKCTHILTAYISSSYDYCNFLDTQLDDFISEYGETVVETCLHQVLLLVSRYN >CP016104.1|AXU49984.1|1901916_1902939_+|ABC-type-transport-system-involved-in-multi-copper-enzyme-maturation,-permease-component MVNWEIKKLAKSKSMFISLGILVLILIISIFITPVLETESYYIDKEKGRIEDTRSGIDIGNEKFQNKINVLKQFSNQTDTGEFSKKIELMSKKKLDNLSVNEYKDISFWKVFNYRVTNSLINVGMLIIISIIISNIYVDEVVTSVKDIILSSKEKKKALKSKIFVALLVPLVIYSVYLMGIFIITCMQQGVPVNGDLESFRVVDNVVALKTNLSITKYVILNIGIELLMFEGWAMIAIFGSFISKSSISSISFFIFIISITKIMSVIHILPKKLLSVVSNVNYYDLIFGFNKIIGNYLGDIMIFKVNIDIVNIAIGLLMAILIGAISLCFLVIKSDYISR >CP016104.1|AXU49985.1|1902952_1903840_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNKLEIEKLSKIYGKKVANDKITVTLENGVYGLLGPNGAGKSTLMKQITTLIKPDEGQILYNGEDIFKMDDDYRNILGYLPQEFGVYKNFTAKEFLQYIGALKGLGGKHLNIKIGELLDLVGLYDVRNKSIGKFSGGMKRRVGIAQVLLNDPKIIVLDEPTAGLDPQERARFRNLIAKMSRDKIIILSTHIISDIESVAKETIMIKDGKLLMKGTHKDILSHMENKVYNVQVKNECEVDDIQSKYKVVSIQSDIDSIVLRIVSEDIPCGANIQPVQAKFEDVYMFYFDLEDAREV >CP016104.1|AXU49986.1|1903845_1904619_+|ABC-transporter-permease MMYLVKAEMIKILKSKSVWIIWLFLLFFGFLLIRKFDVLDTYADIFYKIEGSIPLIGLIMFIITSGNYIKEYDSNMTGLINTTKKGKKSVVLSKLLANGLTLSIINISFILLVGIRGFSFFDFKNLNEPIHNLWYFGNSNLNLTVIQMYIIVILTTIFASFIFAQIGLTLSSIFKSAVIPFILGGLIMAIPYFSVGFIPDKAIKFMSLTPNWIMMSQQIVRYNVPSILIVFSIVISIILMIVLTKITYENFTSSKRF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP016104_9 | 2690171-2690331 | Unclear |
NA
Consensus repeat of CP016104_9
|
2 spacers
spacers of CP016104_9
>9.1|2690197|40|CP016104|CRISPRCasFinder CTAATAATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATT >9.2|2690263|40|CP016104|CRISPRCasFinder ATACAAAATCTCCAACTTATAATTATTTTCGTGATGTACC >9.3|2690202|37|CP016104|PILER-CR ATAATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATT >9.4|2690268|37|CP016104|PILER-CR CAAAATCTCCAACTTATAATTATTTTCGTGATGTACC |
cas3,cas5,cas7,cas6,c2c9_V-U4 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016104_9
The CRISPR arrays of CP016104_9 >merge|CP016104|9|2690171-2690331|CRISPRCasFinder,PILER-CR AAAAATCCGATTAGTTAATTTTAAACCTAATAATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATTTGAAATCCACTTAGTTAATCTTAAACATACAAAATCTCCAACTTATAATTATTTTCGTGATGTACCTGAAACCCACTTAGTTAATCTTAAACCTC >CP016104|9|9|2690171-2690328|CRISPRCasFinder AAAAATCCGATTAGTTAATTTTAAAC CTAATAATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATT TGAAATCCACTTAGTTAATCTTAAAC ATACAAAATCTCCAACTTATAATTATTTTCGTGATGTACC TGAAACCCACTTAGTTAATCTTAAAC >CP016104|9|8|2690173-2690331|PILER-CR AAATCCGATTAGTTAATTTTAAACCTAAT AATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATTTG AAATCCACTTAGTTAATCTTAAACATACA AAATCTCCAACTTATAATTATTTTCGTGATGTACCTG AAACCCACTTAGTTAATCTTAAACCTC
>CP016104.1|AXU50707.1|2689083_2690031_-|50S-ribosomal-protein-L11-methyltransferase MNNWIEVTIKTTTEAVEPITNILYEQGAGGAVIEDPKDFLFQKKNELDWDYVEEEVFKKNEEDDVLIKTYVSEEKNVMEFVEIIKQKVLGLKDFGIDIGEGSVSLDQVNEADWANAWKAYYKPTKVGQRVVVKPTWEDYAIQEGDLIIELDPGMAFGTGTHETTSMCIRELEKYVNKDSKVFDIGCGSGILAIAAAKLGAKEVVAVDLDEVAVKVAKENVLENKVEKSVSVMHGNLTDVIKDKADVIVANIIADIIKILAKDVQNFMKEDAMFISSGIILDKVEEVKESLIENGFEIVEVQKLGEWSAIVSKLKK >CP016104.1|AXU50706.1|2688306_2689065_-|16S-ribosomal-RNA-methyltransferase-RsmE MDRFFVEKNNINLQDKTCTIEGEDVKHISKVLRCKLGEKLEICDKNNNEYICEIMNIDKSIVNLEILEKVDINRESELKVRLYQGLPKAPKMEMILQKLTEVGVEEIILVQTKRSVVKVDDKKEDKKFERWERIIYEAAKQSKRGKIPKLRGVLSFKEALEDMKKNNVNICPYENERTVSIKHALKKCDSNIDSVGIFIGPEGGFSEEEIEQIQKNNCNVVSLGPRILRTETASVVASTIALYELSDLGGEK >CP016104.1|AXU50705.1|2687006_2688305_-|radical-SAM-superfamily-protein MKKVAFYTLGCKVNQYETEAMLELFEKDGYEQVNSEEYADVYVINTCTVTHMSDRKSRQYIRRVKKKNPDAIIAVVGCYSQVSPEEILDIEEVNLVMGTNDRRKIVEEIKKINSSKKVSTVDDIMKVKAFEEIEISQTNGKTRAFMKIQDGCDRFCTYCIIPYARGRVRSRDIDSIVDEVKKLANNGYKEVVLTGIHVASYGKDLKDRDIKLLDVIKQINQIEKIERIRLSSVEPILFTDEFVNEVLKMDKVCPHYHLSLQSGCDETLKRMNRRYTTLEYKTIVDRLRSKMPDVAITTDVIVGFPGETNEEFKKTYEFLREIELSQMHIFKYSPRKGTPAATMENQVDPQMKHFRSEQLLNLSKVNFNKFATKFIGRELDVLFEQNIEGNKYEGLTSNYIRVVVESDKNIQGQILKVKINDVKDEYVEGILL >CP016104.1|AXU50704.1|2686613_2686964_-|histidine-triad-nucleotide-binding-protein MDCIFCKIANGEIPSTKVYEDDRVLAFNDLNPVAPYHILVVPKKHYDSLIDIPDKEMDIVSHIHVVINKIAKEKGFDQTGFRVINNCGSDGGQEVKHLHYHILAGKKLPNYEAGQN >CP016104.1|AXU50703.1|2686271_2686451_-|30S-ribosomal-protein-S21 MSEVRVRENETLDSALRRFKRQCAMSGIMSEVRKREHYDKPSVKRKKKAEAARRKNAKK >CP016104.1|AXU50702.1|2685798_2686242_-|tRNA-binding-protein MSLKQKLQEDLKSSMKNKDTVRKSVVTLIRASIKQYEVDNRVELDEDGIIDVIAKQLKQRRDALVEFEKAGREDLIKETEGEIEVLKEYLPQQLSEEELEEIVKSTISEVGATSMKDMGKIMSVIQPKVKGRADGKLINKLVKQNLQ >CP016104.1|AXU50701.1|2685190_2685688_-|sensory-protein MIISVKEIRNFLINIFIPLIIGYLSSILTMIISGTDISTYYLQLTKPSFAPPAFIFPIVWTILYILMGISSYLILRKGYNLPKVRDAIFYYGLQLVLNFIWSILFFGFGLRFTALIDIIIMILVSIIMISKFSKIDKRSGYINLIYLMWLVYAGFLNYFIWFINK >CP016104.1|AXU50700.1|2684434_2684998_-|sigma-54-modulation-protein MQIIVSGRQMKLTDGIKGYVDGKLSRLEKYLDPESEVKVTVSAKKDRQKVEVTIIPINGQIIRAEDVEDDLYAAIDIVCDKLSRQVVKYKTKVKDKVQNNKSIRFENLDFIDNSSEFDDYDYDDEEDENIVIERRKKFNVKPMSSEEAILQMELVGHNFYMFRNQDNFEINIVYKRKAGGYGLIEQD >CP016104.1|AXU50699.1|2683983_2684220_-|sporulation-protein-YqfC MLEISTDLQVNQPVITVTSNTFISIENYLSILEYEVDLIRIKTKVKTIKISGDKLSLKYITDSEIGIKGIIYNVEYVD >CP016104.1|AXU50698.1|2682627_2683971_-|stage-IV-sporulation-protein MISFIRGYYVIVVEGVGLEQFLNHLIRNGISVYNVTRIKNTKMEFHIDRQDIKEFKNVYRGSKFDIKVKQKTGVPFIIKRVYKHKGMWICALVSLFLLMSTSQFVTDVYIQSPEGIKKEALRNELYKVGVRPGVYKKSIDRKEVRDHMMSKFNDVAYLSINVKGTNIFVTVTKKAESLKSTDQSNYCNVIALKNGIIEKVIPRSGKSVIKSGDIVQKGDVLLNGANTKSIPEVWASTFYESTKKASYVDTVNKKTGEKKNIYTLSFYDKEFTMRKNIKYKDYVVENKEKKLSIGNYTFPIKIKTSTFYETKKVEVKKNKEELKKELSEKALKELEYIIPASARIIDVKHNFKVNKNMLEYLITVQTSENIAKIYPLSKSEAERFIKEESKPDEGEEEVPSNPEKRPLNDIRNEFDEDNKDNKDQNNSDENNSNQNSNNSQNNNSNNN >CP016104.1|AXU50708.1|2690471_2692880_-|ATP-dependent-helicase MKNIMQKEILAKSYNLRTNQQEQTLVEHIKDLFEVLESILELNLYSDKDVEILKICCVLHDLGKINSIMQQKMEINNKISYSCSEEERKKLESDKKSLKKIARHNIFSGAFLKDILEKMNLSEEDKLYIYKSIMLHHGNYEDYMRLSTSKVQEEIYEYIEKGILEKEEFNLKDIESYINDILNVDFKFDEDVLDYDYIDKLSESMFIDSDYNNGQIDDSVLNYRKFKYILYKGMLNLIDHSASSRQKGIKFYNDFTDEEIDNMILSEIYKSQGNLEKNNIKFNTIQKRLRELSGRNVLTVAFTGSGKTAADYRKTFKRKFFLVPNKISAESFYRKNIFQNKNDLDTRSSNDYIGLLHGDINLYSENEDNGEHDFVLTLRDIDLSINFCKPCVIATVDQLLLSMFKFPGYEKIFAAVKNASITVDEVHLLEPKMFLILIYFMQFACKYLDVDFHLMTATLPKSYKEQMINKGIIFQEESNENVTDKGEIVFIESNKEEEICEGKDVKVSFIKEKEIKSIVEDALENKQKILIIKNTIDSVNRTYEFLKENLSDKYGGVDIDVLHSRFKFKDKKEKYSKILNGEGDIWISTQSVEISLDLDFNIIISDLATMDSLIQRMGRCNRNNKYEYGNFYILPSEDKIYDNKLKNTTKSILNKIIKTNSIFTMGIRKIILADYYDNSVVKKYFEENFISCDKEIKNIYGINKEIFDGLDLIFNFEPYKNIVDSKKEAAKIFRDVDVSYKIILEEDFYKEDRELQQDSIQVSGFIFNRLYYYGLISKVEGYMVLKSSSKFEYNSTVGLILK >CP016104.1|AXU50709.1|2692906_2693704_-|CRISPR-associated-protein,-Cas5t-family MKVLQCKLKQPTAHYRDPKVFQNEYISTLNLPSKTTIMGMITYLCDRRLNSDIDIGIIGTHHHRELEFSRGENIDFWNEYTNMRKGKDKEKFLLKGNYYDYYKEHKAQNSILNYEVLKEVELTIFISCKDDEELEFIRKKLESPCKYANLGRKEDFVIPSEKGCFVKEVELKEVIPMNTRDAIKENIKLKNTYVRVDLRDKENVETIINQGVLIALPHKYKDLEANRDDRVYEFCHYIYVDNDGIYPKNIKVNVCIDTKEVFTWL >CP016104.1|AXU50710.1|2693719_2694733_-|CRISPR-associated-autoregulator,-Cst2-family MNEKRVKGVTLTILTESPVPLSYDQGYGNYTPIKKEQYREKIHAKTSIATITYDLRRKLHQEYGWNLSNIIFGKKGNIYPSIKKNVGCVDENGLETDVFGYLIPLKDKGSISKASPLRIIPFRSLNPYRGSTQLITNRGFLSSEFGRKYYDEKEENEVLRDENFPTTQALAIEETLSDYYVYTITLELDRIGVVEVEDGKLLLPEERKFMSKELREKAVKDILDAITVFTRNIKHSSVLLKPLAVMGGAFDKVVPFFWDDVDYNADSGEINLEGVIETIESYSLKESNTILAINDRLKISNKKELNRFNLSKYPVKEIKNLADRLEIGEDNMWYLKE >CP016104.1|AXU50711.1|2694752_2696228_-|hypothetical-protein MREIKAKFYRSGDIVRDIGIVYFYELLMDLKNELEKNGYKLKFTCELNRNYLSLESAENIDPKYISDYILENQLFKVFKNGKKEALEKIFNNIDNLTYVNFIEELDKSSATAKQKEDIKKDFKNRRFPYVRNSGKYGLNTSLENMETNVKRIVDTVIKSNIEIDEIDKLNLKQYEEKDSVCNVCNINKTTKLDIDLRERKDSKYNFLFRGAEKSGFKRSGQVESNICFECEFFNLMCLLYINLKRPMVFAYTNDLRELAFLNHKIMLKRKMYSDKSFYKKLLHEKISSIRLYRFDIDTNKGIILKFDSIIEYKELLKKIELIDIIDNYNFSREPGNTKNLGKKMIDNGNLSNLKELLLDNISFLKPSNGTSREMDFVSSSYNIGLYIKLCWIVDGGEEYKMKNYMESNLIYPRVGKDLFNKMTDESRRKNFSMKVIQLLKSNDRTQLFQTIMHVLVSNGILIGEGFVEGLMQSSELELNTNVGLFIQEIMK >CP016104.1|AXU50712.1|2696232_2696970_-|CRISPR-associated-Cas-family-protein MSRISIFMESCNGKFPNENSMLSVSFIKNILNAENKDFAKNIFNYGEERKNNKQIKDINTAIYIPNLIRSKNELLVDGDIIFNISFYNYSMFSKLYNGILKVKELEYKGYRFKIKNIKIHKEHEIKENGVIFKTMSPIIVKNKEGKYLDVEDSNYIECLNYIANLTLESIRGSGLRKPLEFIPLNFKKRVLKEKIRGFKEREFYYINAYAGTFFLKGDMEDLNALYKMGIGYRRTENAGMVDILK >CP016104.1|AXU50713.1|2697283_2697742_+|resolvase-domain-containing-protein MKNNNCKPKEFAELINISARTLQRWDIEGKLKAFRTPTNRRYYTYEQYLEYKGIHKEQVNRKNVIYTRVSISNQKDDLKNQVEFLKQYANAKGIIVDEVIEDYGSGLNYNRKKWNKLIDSCMTNEVNTIIVTHKDRFIRFGYDKYLVVAYMD >CP016104.1|AXU50714.1|2697778_2698942_+|IS605-family-transposase-OrfB MKRAYKIEINPTTEQKSKIHQTIGVSRFIYNFYIAHNKEVYDSKGEFISGMDFSKWLNNEYIPNNQDMKWIKDISSKATKQAIMNGNKAFKDFFKKTKGFPKFKKKKNQDVKAYFPKNNKTDWTIERHRVKIPTLGWVRLKEFGYIPINSIVKSGTVSQKSDRYYVSILVEEDDIQVSKCTNEGIGIDLGIKDFAICSNGSKFKNINKTSTVKKVEKKLKREQRKLSRKYESLKVRNKNIKEGVATRQNIQKQIVKVQKIHQRLANIRTDYINKTVSQVIEQKPSYITIEDLNVSGMMKNKHLSKAISSQKFFEFRTKLTAKCKQNNIELRVVDRWYPSSKTCSQCGEVNKGLKLKDRVYKCECGLSIDRDLNASINLKNAKKYKIA >CP016104.1|AXU50715.1|2699094_2700204_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSEVILKNISKLYSNGFNAVKNINIDIKDKEFIVLVGPSGCGKSTTLRMIAGLEEISEGELYIGDKLVNDIEPKDRDIAMVFQNYALYPHLSVYENMAFALKLRKLPKDEIDKKVKEAAKILDLLPLLNKKPKTLSGGQRQRVALGRAIVRNPKVFLMDEPLSNLDAKLRTAMRTEITKLHQQLGTTFIYVTHDQVEAMTMADRIVVMKDGMVQQIATPQDVYDYPANIFVAGFIGAPQMNFIDVILIEENDKIYAQNEHIKLKLNKEKHYDLIKDNYINNEVVIGIRPEDIHVEDTFIKSNPDTCFKSRIEIKELMGAETYAHLKLGENTITIRFDSKNRINVGDDLTLSVDNSRIHIFDKETTLAIR >CP016104.1|AXU50716.1|2700233_2701001_+|sugar-diacid-utilization-regulator MEELKDFLERQLNKKINIYPYENQKLDASSHLVTFNNSIYVIDFLDKNNLDNLKGNFYLIYQPHIEFEYLKNIFYNLFEDINIIQHNGFFIVNSKYNLDINVTTQNIIETETYQSTYIFYLGKLDSKADFDFRLQLCSDLLPHIIKDNAENKFLNLFDLIRYKTLDLINEDNILNKLIDFNKIKSIDEELLYTGLKFINNDLNISKTSTSMFLHRNTLVYRLEKINEILGFDLKNFENAMIFYLSVKSYFLYKKI >CP016104.1|AXU50717.1|2701188_2702562_-|transporter MGKTNARRTLFLIAIGSGTMLNPLNSSMISLALHSIQNDFHISFTTVSWIVSAFYLASAIAQPVSGKIGDLIGRKVLFLSGLMLVILSASIVPLVQSFFILIFIRVIQAIGTSTLYPSGVALIQNNIKERQSSALAVLTIFASTTAGLGPTLGGLLLDLGGWHAIFLVNIPVVLVSICLGYFLFPKEVKEKKSIKETLKNVLSRLDIIGILLFSIAMIFILLFLLSMKESFNLEQLVFGIILMCLFIWHELRTKLPFIDIKLFVSNPKLSKVYLQFIILNFFNYILFFGLPSYFQDALHYSAKSTGLFMLFMSGIGIFISPLTGRWIDKSGTRFPLVTSSIFMFISAVLLSVVFIHIPVIGKGIILSLAGISYGVGNVALQSSMFEESPRDSIGTASGLFQTSRYLGSILATVLLGMVFEVNITSEQFQILGYVMVVLGTISFLLNFILKKELRKVE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP016104_10 | 2777500-2778381 | TypeV |
I-A
Consensus repeat of CP016104_10
|
13 spacers
spacers of CP016104_10
>10.1|2777529|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAACAACTGATGCTATAAGAATTTCTATAAATTTAA >10.2|2777595|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAACCATGTAACTTTCATGTAATTTGTCCAATATCT >10.3|2777660|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTCAATAAAGTTTTCTCCTCGTCGTTTTAATGATA >10.4|2777725|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATTTTTTTATCGTTTTAAAACTTGTTTCTTCTGC >10.5|2777790|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGAACTTGAAAAGTATTCTTATGAAGTTAAATAGAA >10.6|2777856|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGACCCACTCATGGATGTTATTGTTGGAGTAGATTT >10.7|2777922|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGACTTTAGTATCTTTGTCTTAGTAAAACCTAGCCCA >10.8|2777988|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGGACTAAGACAGGCTTTGATTTATATCTTTCTAA >10.9|2778054|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGTGTATCCAAAATAATAGTATTATTGCAAATAG >10.10|2778119|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCGTTTGCTCTGAAAATAAAGTCTTTAAATCATCCCT >10.11|2778185|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTATTATGTTTATAACTCTTTTGATGATATTCTAA >10.12|2778250|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGGAAATAGCATCAAATGCTAAATCATGTCCTAACTG >10.13|2778317|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTTTTTATTGGCAAAACCATGAGATAATAATATTG |
cas14j |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016104_10
The CRISPR arrays of CP016104_10 >merge|CP016104|10|2777500-2778381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACGAAACAACTGATGCTATAAGAATTTCTATAAATTTAAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTAACCATGTAACTTTCATGTAATTTGTCCAATATCTATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACGTTCAATAAAGTTTTCTCCTCGTCGTTTTAATGATAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTTATTTTTTTATCGTTTTAAAACTTGTTTCTTCTGCATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTAGAACTTGAAAAGTATTCTTATGAAGTTAAATAGAAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTTGACCCACTCATGGATGTTATTGTTGGAGTAGATTTATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTGACTTTAGTATCTTTGTCTTAGTAAAACCTAGCCCAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTTTGGACTAAGACAGGCTTTGATTTATATCTTTCTAAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTTTGTGTATCCAAAATAATAGTATTATTGCAAATAGATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACCCGTTTGCTCTGAAAATAAAGTCTTTAAATCATCCCTATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACAGTATTATGTTTATAACTCTTTTGATGATATTCTAAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACAAGGAAATAGCATCAAATGCTAAATCATGTCCTAACTGATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACACTTTTTATTGGCAAAACCATGAGATAATAATATTGATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC >CP016104|10|9|2777500-2778381|PILER-CR ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GAAACAACTGATGCTATAAGAATTTCTATAAATTTAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TAACCATGTAACTTTCATGTAATTTGTCCAATATCT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GTTCAATAAAGTTTTCTCCTCGTCGTTTTAATGATA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTATTTTTTTATCGTTTTAAAACTTGTTTCTTCTGC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TAGAACTTGAAAAGTATTCTTATGAAGTTAAATAGAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTGACCCACTCATGGATGTTATTGTTGGAGTAGATTT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TGACTTTAGTATCTTTGTCTTAGTAAAACCTAGCCCA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTTGGACTAAGACAGGCTTTGATTTATATCTTTCTAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTTGTGTATCCAAAATAATAGTATTATTGCAAATAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CCGTTTGCTCTGAAAATAAAGTCTTTAAATCATCCCT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AGTATTATGTTTATAACTCTTTTGATGATATTCTAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AAGGAAATAGCATCAAATGCTAAATCATGTCCTAACTG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC ACTTTTTATTGGCAAAACCATGAGATAATAATATTG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC >CP016104|10|10|2777500-2778381|CRISPRCasFinder ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GAAACAACTGATGCTATAAGAATTTCTATAAATTTAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TAACCATGTAACTTTCATGTAATTTGTCCAATATCT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GTTCAATAAAGTTTTCTCCTCGTCGTTTTAATGATA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTATTTTTTTATCGTTTTAAAACTTGTTTCTTCTGC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TAGAACTTGAAAAGTATTCTTATGAAGTTAAATAGAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTGACCCACTCATGGATGTTATTGTTGGAGTAGATTT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TGACTTTAGTATCTTTGTCTTAGTAAAACCTAGCCCA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTTGGACTAAGACAGGCTTTGATTTATATCTTTCTAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTTGTGTATCCAAAATAATAGTATTATTGCAAATAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CCGTTTGCTCTGAAAATAAAGTCTTTAAATCATCCCT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AGTATTATGTTTATAACTCTTTTGATGATATTCTAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AAGGAAATAGCATCAAATGCTAAATCATGTCCTAACTG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC ACTTTTTATTGGCAAAACCATGAGATAATAATATTG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC >CP016104|10|8|2777500-2778381|CRT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GAAACAACTGATGCTATAAGAATTTCTATAAATTTAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TAACCATGTAACTTTCATGTAATTTGTCCAATATCT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GTTCAATAAAGTTTTCTCCTCGTCGTTTTAATGATA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTATTTTTTTATCGTTTTAAAACTTGTTTCTTCTGC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TAGAACTTGAAAAGTATTCTTATGAAGTTAAATAGAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTGACCCACTCATGGATGTTATTGTTGGAGTAGATTT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TGACTTTAGTATCTTTGTCTTAGTAAAACCTAGCCCA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTTGGACTAAGACAGGCTTTGATTTATATCTTTCTAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTTGTGTATCCAAAATAATAGTATTATTGCAAATAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CCGTTTGCTCTGAAAATAAAGTCTTTAAATCATCCCT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AGTATTATGTTTATAACTCTTTTGATGATATTCTAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AAGGAAATAGCATCAAATGCTAAATCATGTCCTAACTG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC ACTTTTTATTGGCAAAACCATGAGATAATAATATTG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC
>CP016104.1|AXU50778.1|2776651_2777035_-|regulatory-protein MLNKKLPDAELKIMKYIWNTGYKTVISKDVADEIEKTYGWKHTTTITLLVRLTKKDFLISQRIGKHVHYRVLIKEREYLKIEGKRIFGGLHNNPLSELILKLHNEEEITEEKIIEIGSWIKSWKDED >CP016104.1|AXU50777.1|2775471_2776467_+|L-asparaginase MSIKKKVAIVFTGGTISMTVDDKVGAAIPTLSGEQILSMVTNIDKVADVEVFNFDEIPGPHITPYRMMELKNYVNDLLARKDITGVVITHGTDSLEETAYFLDLTIDNIKPVIVTGAMRSSSELGYDGSSNLSASVCTAVSKDAMGKGVLVVLNNEVLLASEATKTNTLSLNTFKSLTSGPLGIIDCNELVLTRDIVNRTIIDTDKVESKVALFKAYVGENADFIRFAVDSGYKGIVIEAMGRGNIPPQMLSGVEYAREKGLPVVIVSRCHSGRVFDSYGYFGSGRDLKNLGCIFGGDLPGQKARIKLILALGKTDNLDEIKDFFEKGIYC >CP016104.1|AXU50776.1|2773722_2775351_+|aspartate-aminotransferase MKNHTYKEIKNIYGKISPFEFKDKLIDIAKYTAKENNRELLDAGRGNPNWTCSTAREAFFTFGHFAITETRSNWDLGHLAGMPQKKGIKERFFKFINENIDMPGAYLARDIINFGINELGFDGDEFVHELADGIIGDNYPLPDRMLPHMEKIVHDYLVQEMKYDISGKYGDVEIFAVEGATAAMCYIFDSLMANELLKKGDTIALMTPIFTPYLEIPNLPRYDFKVVNINANEVDEKGAHTWQYTKKELEKLRDKSIKALFVVNPNNPASIAMDETSCNNLIDVIENYNKDLMIISDDVYGTFVEDFSSLMSKLPYNTVGVYSYSKYFGVTGWRLGTFALHKKNVFDKKINDLTGELKKSVDKRYSDMSLNPSSLSFMERVVADSRLVALNHTAGLSTPQQVQMAFFSAFALIDKVDAYKKLNMSICHRRQKLLFEALELPINENKNNAAYYTQFDIEEWAKLNYGEDLFKFISKNASPVDVLYKLANDYSVVLLSGNGFYGPEWSIRISLANLYDEAYTKIGKAIREILNGYIVEWQKIKK >CP016104.1|AXU50775.1|2771847_2773065_-|threonine-dehydratase-catabolic MMNVTLTDVKEARETIKNIVKRTDLLESVKLSEKTGANVFYKCENLQKTGSFKLRGACNKIASLTDEEKANGVIASSAGNHAQGVALGAKMTGIKSTIVMPATAPLAKVSATKGYGAEVVLNGAVYDDAYAKAVEIQKETGATFLHPFNDKYVIAGQGTISLEIFEQLDNKVDTILCPVGGGGIISGVAVAAKALNPNVKIVGVQTANIPSMKESIKNGKVTTAFNDTTIADGIAVKTPGDLTFEIINELVDEIVVVEETEIAESILFMMESQKIVSEGAGAVCTAAILSGKYVPAKDENVVCIISGGNIDINTLYRIIGVALAKEGRRYSFSTIMEDKPGNFAELTRIISENGGNILSANQGKLSAGEALGKQSAEFILETIDYDHIARIKKAIEEKGFKIIEL >CP016104.1|AXU50774.1|2771372_2771753_-|translation-inhibitor-endoribonuclease MKHEVIHTNDAPAALGPYSQAIKAGNLLFVSGQVPLVPETMEVVEGDVQAQTAQSLKNLKAILAESGADFSNVVKTTVFIKDMNEFGAINEVYAEYFGENKPARACVEVARLPKDVKVEIEVIAVL >CP016104.1|AXU50773.1|2770606_2771089_-|PTS-system-transporter-subunit-IIA MLNFFKKNKSYKLHAVVSGNSINIEKVNDSVFSKKLMGDGVAIIPNSNVVVAPCNGKVTVLTESKHAFGMVSDEGVEILVHIGIDTVNLQGEGFKNEVSQGDTVKKGSPIISFEREKINSQGIDCTTIMVVLNHSEFSEINCMVENEVVAGKDTVIEIMK >CP016104.1|AXU50772.1|2769770_2770586_-|transcriptional-antiterminator MRVVKIFNNNALSTVTNDRKEAILLGLGIGFNKRPGDKVNEDKIEKIYYVQDHMQTKFLELLKNVSPEVMDASQQIISFIPGNEGKFNNKGILSLVEHISFAIDRMKNNVFLPNLMLLDIKMMYSKEFELGVKALEIIYRVCHIHLPEDEAGYIALHFVNLQSNDNLAYDTLKFVKGSIDLIKECYGLELDESSLSTLRFRTHLKFLAQRIFKNEICQDDKMIEMYDYLINNHPKNKEYLEKLNVYIEKEFRYKLDKPEKIYLLLHLTKIL >CP016104.1|AXU50771.1|2768167_2769718_-|PTS-system-transporter-subunit-IIBC MKEKLLGGLETFAKAMVQPLMYLSSAGILMVVGVLLTNDMLLGVLPFLKWEPIQIFGSLIYNCIMAIINNLAVIFAIGIPAALAKKEKHKAALIGFMSYIIYLTASNTMLTSLGQLAKESKMLGLIGTGQATILGIQVVDTSVFGGIILGCIAGYVFNRTSNKTFKGALQIYSGANFSFICMFFVSILIGVVSNFIWPLAQQGIASLANVIKDTGTFGLFLYGFLERILVPTGLHHLIYTPFQFSDLGGVLKVGADTVSGAYAIVMTEMNLPVEHFSDSIYYMATGFTKMFGYIGIGAAFIYTAYKQNKKKVKATVIPLIITAVLASVTEPLDFMFVFCAPLLFFVHAVIAGLFIALLKIFDVTALCGGNLLVSIIMNTTVGVEKTHWPVMMILGLAQIIVYFVVFSFLIKKFNYKTPGREDESTATGEEQSKQLNLDAGIENIIDGLGGKENINTVENCITRLRVNVKDESKINEDIINLTPNSGIVRKGKDIQIIFGLHVHEVRRAVEDFLEAY >CP016104.1|AXU50770.1|2767952_2768069_-|6-phospho-alpha-glucosidase MIITIVGGGSTFTPGIVKSIALREKELELEEIRLFDID >CP016104.1|AXU50769.1|2766096_2767206_-|transposase-like-protein-B MEKAYKFRMYPNKKQQELINKTFGCCRFVYNKYLAKRIEVYKNDKETFTYKQCSSDLTNLKKELKWLKEPDKFSLQNALKDLDNAYKKFFKEKAGFPKFKSKKINRFSYKTNFTNGNIMYFSQHIKLPKLGMVKIRDKQVPQGRILNATVSKEPSGRYYVSLCCTDVDIEVFENTNNQIGLDLGIKEFCISSCGEFIENPKYLKKSLNKLAKLQRELSRKTIGSLNRNKARLKVAGLQEHIANQRKDFLQKLSTKLIKENDIICIEDLQVKNMIRNRKLSRLISDVSWSEFIRQLEYKANWYGRQIVKVGKFFASSQICNKCGYKNEEVKNLNIREWICPSCNETHDRDINASINILKEGLRLITIQNK >CP016104.1|AXU50779.1|2778666_2778825_-|hypothetical-protein MDNFLQGILASLSASLIVYIASKLFRKRKKPLKAATKSGWEFDLKIRFHKTK >CP016104.1|AXU50780.1|2779182_2780553_-|cell-surface-protein MELKKLLSLGLAVSMFAAGPISANALDTIYTIQGKDKYETAALIADEQNYTTAILINADSTMADGLSASGLAGATNAPILLTKKNNIPNATLKRVEKAKKVYIIGGESSIDKATETLLKDKGIEAKRLQGSDRIKTSYNVAKEINSINKVNKVILTNAFKGEPDAMSAAPVAVRDKAAIVLTDGKSVPFNTTGVESYVIGGTSSMSDKLVNDTNSTRLGGVDRYDTNKKIVNKFYNGAKEFYIASGTDLVYALVGSPMAKNNPIVLVDIGSNKDILKNAAKVTGIGNLSDKIMLECENTINNISLPSSNKNIICGLKIDFDSNHIIWQDKGSYLECYDDNLEYYTEKYKDPTVPINIENTSTQNLDVTKLKVYGEANSTLYMGQYAKIKMDFNSFGVLKPGEKCTIYLDIISLDPSRSMTLTFSYVGDKENYKYEQGLASRILFYNPDGEDFFEYK >CP016104.1|AXU50781.1|2780951_2781374_+|integrase MTFVERCYKYIDMNKNNWSPYTVTNTKSWVKNYIEPFFKNLKLTEVNPSSVQAFVNYNFNNSTFTSAKVRYSFLSSVISEVYRLREIQENSCDFIKLPSKEKYSTNEIYNREEVLLLIEKLLGNNIEIPILLMLLLGLRM >CP016104.1|AXU50782.1|2782359_2783028_-|vanZF-protein METVSNNQSGVEIQLSLFEAIKDLLLINSIFLLGIILIGIFLVVIFKKNSDIPKVKTSILSLAMYYYLCLTLSHIVGIPTFSEYVRLSQLGEAFFNPNISLIPFSDGFSLSFILNILLFVPLGFLCPLISKTFERLRNTFLIGFGLSLFIETIQLFTLHRATDINDLITNVIGTIIGYFCFKLIAKLRIVKLHSDDDSMEQDYTVCIPIAIIIVALILGFFS >CP016104.1|AXU50783.1|2783909_2786330_-|leucyl-tRNA-synthetase MSVYNFKEVESKWQKIWKDNNQYKMDTAQTEKPNYYTLEMFPYPSGKIHMGHVRNYSIGDVVARFKKMEGYNVLHPMGWDSFGLPAENAAIKHGIHPHKWTMENIEEMKEQLNLLGISYDWDKEVATSTPEYYRFTQEIFLKFLEHGLAYKKKSYVNWCPSCETVLANEQVVQGACERCKATVLKKDLEQWYFKTTEFAEELLNDLDTLDGWPEKVKTMQKNWIGKSTGADLVFDIDGTDKSMTVFTTRPDTTYGVTYMVLAPEHELVKELVAGTEYEADVEAFVKKMHTMTEIERTAADVEKEGMFIGRYVINPLNGKKVPLWIANYVLVEYGTGAIMAVPAHDERDRDFAEKYNLDIIDVITEDNKMINSEEFNGLDASEGFEGIIDKLEKEGRGKRTINYRLRDWLVSRQRYWGCPIPVVYCDECGIVPVKKEDLPVLLPTDVEFTGKGESPLTTSKQFMSTTCPHCGKPARREVDTMDTFVDSSWYFLRYVDSNNENEPFSKELVNRWHPVDQYIGGVEHAIMHLLYARWFVKAFKSMGMVDFNEPFKNLLTQGMVLMDGSKMSKSKGNTVSPMDIIDEYGADTARLFVLFAAPPERDLDWSEQGVDGCFRFLNRVYRLVDELADVVKKDVEFGELNSQDKDMRYTIHSTLKKVTADLSEKFGFNTAISALMELINDMYKYKELDNINEAVIKEGVQTIVTIIAPFAPHLGEELWTMIGKEGSVFDIDWPKYDEKALVKDEIEVVVQVNGKVRGKLTVNSNISKDEMEKVALEDEKIKGLVEGKTIVKVVAVPKKLVNVVVK >CP016104.1|AXU50784.1|2786683_2787034_-|iojap-family-protein MTVEQMTKIAYDAIEDKLGQDTVIINIGKVSSLCDYFIITTASSQRQVKAIADNVEDELAKLGLEPRGKEGQGTQTWVLLDYGDIMVHVFNEENRGFYNLEKLWKDAPYIDIDTLA >CP016104.1|AXU50785.1|2787150_2787723_-|metal-dependent-phosphohydrolase MNLENINQRLNQMLPVGRLSHSKNVAKCAEKLCEIYGCDKEKAYLAGMIHDCAKYLSDKEIEDYVNKYEIYLDPIEDGNRSLSHSVIGAYICEYEFEVEDEDIINAIKYHTTGREDMSLLEKIIYIADLIEEGRKFPVVDTLRELAYGGKLDEALLTSFNNTLMFVINKKEEIHPRTVMARNYLIKEKLL >CP016104.1|AXU50786.1|2787723_2788413_-|nicotinate-nucleotide-adenylyltransferase MRSENLVKMAELKNTEKLEKFNRHKGKIKIGILGGTFDPIHYAHLATAEFIRDKYDIDKIIFIPSGNPPHKLCITTDKYDRYNMTLLATESNEDFLVSKVEIERKKRTYTIDTLKYLKKKYKNADIYFITGADAICSVEEWKDVKKNFELATFIAATRPGISLLRSQETIEKLTKKYNADIITVYVPSLDISSTYIREQLNEGKSIRYLVPENVENYLYENKLYQYGDD >CP016104.1|AXU50787.1|2788688_2789327_+|recombination-regulator-RecX MGTITKIEQQKRNDDRVNIYVDDKFFIAIFKELVYTFNLKKGNEINEEELKPILDDEMYIKAKNKALNILSHADQSEKKLKEKLSSEFDENIVERVIDFLKSYNLVNDSVLAQKIVNTNVNLNKCGKNRIKQNLYNKGINRSTIDEAVSELDKDTEFENAMYLAKKRYERVKKEDKKKIYQKISQHLSYKGFDYDIIKRVLNKLLNFDEYDI >CP016104.1|AXU50788.1|2789479_2791483_+|glycogen-branching-protein MKSQKRFKILDIDVYLQPFESDIKKRMKHYEDMKSKTLKNYKDFSSFANAHLYYGFHQTNDGWFYREWAPNADSLSLIGDFNNWNRKSHLLRKIGSGNWEIFIPGQNSLPHKSEVKVQVTANGKTFDRIPLYIKRVIQKDFGGFNGQIWQPKTPFIWTDNDFDLKNITSPLIYECHIGMSTESESIGTYNEFTEKILSKIKKAGYNTIQLMAIMEHPYYASFGYQVSNFYAISSRFGTPEDLKNLINTAHSMGIAVLLDLVHSHAVKNTLEGINEFDGSEHQFFHSGSKGNHPAWGTKLFNYGKPEVIHFLLSNIKFWLNEYHFDGFRFDGVTSMLYRNHGLGVSFDSYEKYFSMNTDIEAITYLQFANELIKEINPNSISIAEDMSGMPGMCIPIKDGGIGFDYRLAMGVPDFWIKTISNLSDEDWDLGKMWYELTTRRPGEKNIGYCESHDQALVGDKTIIFWLADKEMYWNMEINSNNHVINRAISLIKLIKLITFSLAGEGYLNFMGNEFGHPEWIDFPREGNNWSYKYARRQWSLSEDNNLKYKQLLNFDKSMLELTKYSDIFIQNSHELIHMDNDKKILVYSKGKYLFIFNFHPNLIQSVDISKFQNTNYKTILNTDMVEFGGNTKKENLRDYDVYFSSTPPSSKMPIASRTAIVLLNNGV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP016104_16 | 3642123-3642326 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP016104_16
|
1 spacers
spacers of CP016104_16
>16.1|3642172|106|CP016104|CRISPRCasFinder CATATTGTTTATTATTTCATAGTCCTTTCATCATATAAACCTATTAAATATTATCTTATTTATTGGTATATGGAATTATTTTGTTTATTATTTTATAGTCTTTTCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016104_16
The CRISPR arrays of CP016104_16 >merge|CP016104|16|3642123-3642326|CRISPRCasFinder AATATAATCATTTCTCTTAAAGATTATCTTATTTATTACTATATGGAATCATATTGTTTATTATTTCATAGTCCTTTCATCATATAAACCTATTAAATATTATCTTATTTATTGGTATATGGAATTATTTTGTTTATTATTTTATAGTCTTTTCATCATCATATAAACCTATTAAATATTATCTTATTTATTGGTATATGGAAT >CP016104|16|16|3642123-3642326|CRISPRCasFinder AATATAATCATTTCTCTTAAAGATTATCTTATTTATTACTATATGGAAT CATATTGTTTATTATTTCATAGTCCTTTCATCATATAAACCTATTAAATATTATCTTATTTATTGGTATATGGAATTATTTTGTTTATTATTTTATAGTCTTTTCA TCATCATATAAACCTATTAAATATTATCTTATTTATTGGTATATGGAAT
>CP016104.1|AXU51469.1|3641253_3642009_+|dihydrodipicolinate-reductase MLKVIISGYNGTMGRVLAECVKKDNELELVCGVARSADEKGHHSDTKLYKTMTDVTEKADVIIDFSHHETLEPILSYALKNNTPVVLATTGYDENDLHKIEEASKNIPILLSSNTSLGVNILIKLVKDASKMLEGFDIEIIEKHHNRKEDAPSGTATMIANAIKEVLPESENTHGRYGRDCKRKPNEIGIHSIRGGNIISDHDVIFAGDNEVLTLNHHSQSDEVFANGSIIAAKFLIGKQSGLYKMSDILG >CP016104.1|AXU51468.1|3639824_3640814_-|somatin-like-protein MLKEEKTYQEKEAKVFNGVAALIMIVLFLVVSIGIMVFGIVKLDSGFTGIGSLMLILGLIFIVVDFILFFGLKMINPKEAIVLVLFGNYYGTIKKEGYYWVNPFCSAINPAASRINVSKSSSDEKVDISTNSRGKKVSLKTMTLNNEKQKVNDLLGNPIIIGVVVIWKVIDATKAVFNVDNYNTFLSIQCDSTIRNVSRLYPYDVSEDGDEKSLRGSSQEIADRLKDELQSRVDIAGIEVSEVRITHLSYAPEIAAAMLQRQQAEAIIAARKKIVEGAVSMVEMALTNLSENNVVTLDEERKAAMVSNLLVVLCGNKDAQPVVNSSSIY >CP016104.1|AXU51467.1|3638645_3639362_+|2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate-N-succinyltransferase MVNLNDAYEIARYIKEVKKKTPVKVYVNTNSLHFQSTDKFKVFGSNGSYIFVGDYEDIMEVLDKHGNDITDTHVEYDRRNSAIPLKNTLSEHARIEPGAIIRDMVTIEKNAVVMMGAVINIGAVIGEGSMVDMNAVIGARGTLGKNVHLGAGAVVAGVLEPPSATPVIVEDDVLIGANAVILEGVRIGKGAVVAAGAVVTTDVEAGAVVAGSPAKVIKMKDEKTADKTKLMEDLRNLD >CP016104.1|AXU51466.1|3637677_3638427_+|dihydrodipicolinate-reductase MLKVIATGYDGKMGKILADTIREDNELELVCVAARGLDSYEGDLKIYEDMSTIVEEADVVIDFSHHSNLDNILSYVLKTKTPLVIATTGYNDDEMNKIHEAAKVIPVFQSYNMSLGVNVLVKLVKDAAKLLEGFDIEIIEKHHNRKVDAPSGTAVMIANAIKEVLPNVENNYGRYGRSAKRQPNEVGIHAIRGGNIVGEHDALFAGDNEVLTISHQAQSRGIFASGSIAAAKYLVKQKPGFYNMDSMLG >CP016104.1|AXU51465.1|3636723_3637611_+|dihydrodipicolinate-synthase MIFKGSAVALVTPFTKDNKVDFDKLGELVEYQIANGTDAIVSCGTTGEANTMTDEEQLATIKYVVEKVNKRVPVIAGSGSNDTMHSVNLSQEAEKLGVDALLIITPYYNKANKAGLKRHFETIANSVKLPIILYNVPGRTCVNISPSLIVELAKIDNIVAVKEASGDLGQVAEIASLVPDDFAIYSGNDDTILPLLSLGGQGVISVLANVCPQETHDLVAKFFEGDIEGSRKLQLGMDALIAALFIEVNPIPVKTAMNLLGFNVGDLRLPLAEMDPANLEVLKKELVNFGLKVNA >CP016104.1|AXU51464.1|3635605_3636607_+|aspartate-semialdehyde-dehydrogenase MKKVNVAIVGATGMVGRTFLKVLEERNFPIENLFLFSSSKSAGSKVMFCGKEYIVEELKETSFTDRGIQIALFSAGGSISEKYAPIAASNGILVVDNSSQWRMNPDVPLVVPEVNPEAIKNHKGIIANPNCSTIQAMVPLKALDDKYKIKRIVYSTYQAVSGSGVKGVEDLEKGMNGNPTGFYPHQISYNCLPHIDSFTENGYTKEEMKMVNETMKILDNYDLKITATTVRVPVKNGHSESINVEFNNPFELDDLVKTLEEAPGVVVVDNPAKNEYPTAVEFDDRDEVFVGRIRRDFSVDNGVNLWVVADNIRKGAATNAIQIAEMALSYDLV >CP016104.1|AXU51463.1|3634294_3635176_+|dihydrodipicolinate-synthase MLFKGSAVALVTPFTEDNNVNFEKLGELIEYHIENGTDALVVCGTTGEATTMSESEIFAVIKYTVEKVNKRIPVIAGTGSNNTMLSVHMSQEAEKLGVDGLLIITPYYNKTNEKGLKLHFETIANSVKLPIILYNVPGRTKVNIKPSVVAELAKIDNIVAVKEASGDLAQVAEIAKLVPKDFTIYSGNDDTILPLLSLGGSGVISVLANICPKETHDLVTKFFEGDIEGSKKLQLDMDALIAALFIEVNPVPVKTAMNILGFNVGDLRLPLAEMEETNLNVLKQELTNSGFKF >CP016104.1|AXU51462.1|3632778_3633972_-|L-serine-dehydratase 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>CP016104.1|AXU51470.1|3644287_3644827_-|hypoxanthine-phosphoribosyltransferase MDIETKKWEVLYSEEKIKDKLRELGAIIEKDYKDKNLMVVSLLKGSFIFCADLVRNINLPLRVNFMTTSSYGNNEESTGRVKVVSDVTTDIAGYDVLVVDDITDSALTMDFVLKHLKAKNPASLKCCVLLDKPSRRKVNLVPDYCGFEIEDKFVVGYGFDFGDYYRNVPYIFNVTDEDR >CP016104.1|AXU51471.1|3645154_3646462_-|serine-dehydratase-subunit-alpha MRDIRKELVEMLKAEVKPAVGCTEPVALALACAKAKELLGEEIVENRMLVSPSIYKNGMCVGIPGTERLGLKIAAALGIVGGHSENGLSVLETLTKEEVKIAEDYMDNTPLSITPADTREKVFIEVVLKGKNHIAKVRIRTKHDNFTFLEKDGEVLLDNEPKVSASNDVAEKAESLMDTVTIQELIKNVEEIDFKDIEFLLDGVKMNEEMAEYGLKQKTGIGVGYGIKKSIEEGLLGNDVINYAMMLTAGASDARMAGVKMPVMSSNGSGNHGLTAILPIVAYNKKFPQSDERLAKALAISHLVTGYIKNYTGRLSAVCGCGVAASTGATAGISWLMNGTENQIEGAIENMIADLSGMICDGAKAGCALKLSSAASAAIQSAIIAKQDCFVPPLNGIVGSSVEQSIQNLGRVSDKGMSITDEIILNVMNDMNKVD >CP016104.1|AXU51472.1|3646873_3648640_-|sigma-54-interacting-protein 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>CP016104.1|AXU51475.1|3649613_3650249_-|single-stranded-DNA-binding-protein MIAVKDENNVVNLRGELDNKLEFSHEIFGEKFYNMKIKINRLSDSFDILPMTVSERLLQDIDLDKQNLVNVVGQLRSYNKTLNNKNRLVLTVFVREIKSIDEENKDPNSIFLDGYVCKEPVYRKTPLGREITDLLVAINRPYNKSDYIPSIVWGRNAKFAKNLKVGDRIQLWGRVQSREYEKKIDENNVVKKMAYEVSISKIKKLDENNNE >CP016104.1|AXU51476.1|3650916_3651798_-|Sulfite-exporter-TauE/SafE MVAILKALYVVFAAIFAVVFGKDVAKANKEGKLEEQSTPKVAVTGFITDFFDTLGIGSFAPTIAMSKALKLNIPDKKMPGTLNVAHTIPVVTEAFIFTSIIPVDGVTLVSMVVAAAVGSYIGAGIIAKMDERKIQLVMGVTLALTAILMLLGHPWINVLPGGGNELGLTGAKLVIGVIGNFILGALMTAGIGLYAPGMAMVYFLGMSAKVAFPIVMGSCALLMPVASMKFIKEDAYTKKASVIIAICGLIGVFVAAYIVKTLPMDILKALVIVVIAYTSATMIMAANKNKKTA >CP016104.1|AXU51477.1|3651917_3652925_-|proline-racemase 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP016104_17 | 3642858-3644034 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP016104_17
|
20 spacers
spacers of CP016104_17
>17.1|3642883|56|CP016104|CRT ATTTGCTCCCGTTGCTCCGGTCGCCCCTGTTGCTCCGGTTGCTCCATTTGCTCCCG >17.2|3642964|29|CP016104|CRT TGCTACTCCATTTGCTCCCGTTGCTCCTA >17.3|3643018|47|CP016104|CRT ATTTGCCCCTGTTGCTCCTGTTGCTCCTGTAGCTCCTGCTACTCCAT >17.4|3643090|38|CP016104|CRT TATTGGACCTGCCGCTCCATTTGCTCCCGTTGCTCCTA >17.5|3643153|47|CP016104|CRT ATTTGCCCCTGTTGCTCCTGTCGCTCCAGTTGGACCTACTGCTCCAT >17.6|3643225|38|CP016104|CRT TACTGCTCCGGTTGGACCTATTGCCCCATCTGGACCTG >17.7|3643288|20|CP016104|CRT TACCAAACCATTTGCTCCCG >17.8|3643333|29|CP016104|CRT TACCAAACCATTTGCTCCCGTTGCTCCTG >17.9|3643387|20|CP016104|CRT TATTGCTCCATCTGGACCTG >17.10|3643432|20|CP016104|CRT TACCTCTCCATCTGCTCCGG >17.11|3643477|47|CP016104|CRT TGTAGCACCTGTTACTCCATTTGCTCCTGTTGCTCCTATACTTCCGG >17.12|3643549|29|CP016104|CRT TATTGGTCCTGTAGCACCTGTTACTCCAT >17.13|3643603|65|CP016104|CRT TGTTGGACCTGTTATTCCATTTGCTCCTGTTGCTCCAGTTGCTCCTGTTAGTCCGGTTGCCCCAG >17.14|3643693|20|CP016104|CRT TGTTGGACCTGTTATTCCAT >17.15|3643738|29|CP016104|CRT TGTTGGACCTGTAGAACCTGTTATTCCAT >17.16|3643792|20|CP016104|CRT TGTTGGACCTGTTATTCCAT >17.17|3643837|20|CP016104|CRT TGTCGGACCTGTTATTCCAT >17.18|3643882|29|CP016104|CRT TGTTGGACCTGTAGAACCTGTTGTTCCAT >17.19|3643936|20|CP016104|CRT TGTTGGACCTGTTATTCCAT >17.20|3643981|29|CP016104|CRT TGTTGGACCTGTTATTCCATTTGCTCCCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016104_17
The CRISPR arrays of CP016104_17 >merge|CP016104|17|3642858-3644034|CRT TCGCTCCGGTTGGACCTGTTGCTCCATTTGCTCCCGTTGCTCCGGTCGCCCCTGTTGCTCCGGTTGCTCCATTTGCTCCCGTTGCTCCGGTTGGGCCTATCGCTCCTGCTACTCCATTTGCTCCCGTTGCTCCTACTGCTCCGGTTGGGCCTGTTGCTCCATTTGCCCCTGTTGCTCCTGTTGCTCCTGTAGCTCCTGCTACTCCATTTGCTCCGGTTGGACCCGTTGGACCTATTGGACCTGCCGCTCCATTTGCTCCCGTTGCTCCTACCGCTCCGGTTGGGCCTGTTGCTCCATTTGCCCCTGTTGCTCCTGTCGCTCCAGTTGGACCTACTGCTCCATCTGCTCCGGTTGGGCCTGTTGCTCCTACTGCTCCGGTTGGACCTATTGCCCCATCTGGACCTGTTGCTCCAGTTGGACCTGTTGGGCCTACCAAACCATTTGCTCCCGTTGCTCCGGTTGCTCCGGTTGGGCCTACCAAACCATTTGCTCCCGTTGCTCCTGTTGCTCCTGTATTTCCGGTTGGACCTATTGCTCCATCTGGACCTGTTGCTCCTACTGCTCCGGTTGGACCTACCTCTCCATCTGCTCCGGTTGGACCTGTTGCTCCTATTGGACCTGTAGCACCTGTTACTCCATTTGCTCCTGTTGCTCCTATACTTCCGGTTGGACCTGTTGCTCCTGTATTTCCTATTGGTCCTGTAGCACCTGTTACTCCATTTGCTCCAGTCGCTCCTGTATTTCCTGTTGGACCTGTTATTCCATTTGCTCCTGTTGCTCCAGTTGCTCCTGTTAGTCCGGTTGCCCCAGTTGCTCCGGTTGCTCCTGTATTTCCTGTTGGACCTGTTATTCCATTTGCTCCAGTCGCTCCTGTATTTCCTGTTGGACCTGTAGAACCTGTTATTCCATTTGCTCCTGTTGCTCCCTTGTTTCCTGTTGGACCTGTTATTCCATTTGCTCCCGTTGCTCCGGTTGCTCCTGTCGGACCTGTTATTCCATTTGCTCCAGTCGCTCCTGTATTTCCTGTTGGACCTGTAGAACCTGTTGTTCCATTTGCTCCAGTCGCTCCCATATTTCCTGTTGGACCTGTTATTCCATTCGCTCCGGTTGCTCCCGTATTTCCTGTTGGACCTGTTATTCCATTTGCTCCCGTTGCTCCGGTTGCGCCTCTAGGTCC >CP016104|17|9|3642858-3644034|CRT TCGCTCCGGTTGGACCTGTTGCTCC ATTTGCTCCCGTTGCTCCGGTCGCCCCTGTTGCTCCGGTTGCTCCATTTGCTCCCG TTGCTCCGGTTGGGCCTATCGCTCC TGCTACTCCATTTGCTCCCGTTGCTCCTA CTGCTCCGGTTGGGCCTGTTGCTCC ATTTGCCCCTGTTGCTCCTGTTGCTCCTGTAGCTCCTGCTACTCCAT TTGCTCCGGTTGGACCCGTTGGACC TATTGGACCTGCCGCTCCATTTGCTCCCGTTGCTCCTA CCGCTCCGGTTGGGCCTGTTGCTCC ATTTGCCCCTGTTGCTCCTGTCGCTCCAGTTGGACCTACTGCTCCAT CTGCTCCGGTTGGGCCTGTTGCTCC TACTGCTCCGGTTGGACCTATTGCCCCATCTGGACCTG TTGCTCCAGTTGGACCTGTTGGGCC TACCAAACCATTTGCTCCCG TTGCTCCGGTTGCTCCGGTTGGGCC TACCAAACCATTTGCTCCCGTTGCTCCTG TTGCTCCTGTATTTCCGGTTGGACC TATTGCTCCATCTGGACCTG TTGCTCCTACTGCTCCGGTTGGACC TACCTCTCCATCTGCTCCGG TTGGACCTGTTGCTCCTATTGGACC TGTAGCACCTGTTACTCCATTTGCTCCTGTTGCTCCTATACTTCCGG TTGGACCTGTTGCTCCTGTATTTCC TATTGGTCCTGTAGCACCTGTTACTCCAT TTGCTCCAGTCGCTCCTGTATTTCC TGTTGGACCTGTTATTCCATTTGCTCCTGTTGCTCCAGTTGCTCCTGTTAGTCCGGTTGCCCCAG TTGCTCCGGTTGCTCCTGTATTTCC TGTTGGACCTGTTATTCCAT TTGCTCCAGTCGCTCCTGTATTTCC TGTTGGACCTGTAGAACCTGTTATTCCAT TTGCTCCTGTTGCTCCCTTGTTTCC TGTTGGACCTGTTATTCCAT TTGCTCCCGTTGCTCCGGTTGCTCC TGTCGGACCTGTTATTCCAT TTGCTCCAGTCGCTCCTGTATTTCC TGTTGGACCTGTAGAACCTGTTGTTCCAT TTGCTCCAGTCGCTCCCATATTTCC TGTTGGACCTGTTATTCCAT TCGCTCCGGTTGCTCCCGTATTTCC TGTTGGACCTGTTATTCCATTTGCTCCCG TTGCTCCGGTTGCGCCTCTAGGTCC
>CP016104.1|AXU51469.1|3641253_3642009_+|dihydrodipicolinate-reductase MLKVIISGYNGTMGRVLAECVKKDNELELVCGVARSADEKGHHSDTKLYKTMTDVTEKADVIIDFSHHETLEPILSYALKNNTPVVLATTGYDENDLHKIEEASKNIPILLSSNTSLGVNILIKLVKDASKMLEGFDIEIIEKHHNRKEDAPSGTATMIANAIKEVLPESENTHGRYGRDCKRKPNEIGIHSIRGGNIISDHDVIFAGDNEVLTLNHHSQSDEVFANGSIIAAKFLIGKQSGLYKMSDILG >CP016104.1|AXU51468.1|3639824_3640814_-|somatin-like-protein MLKEEKTYQEKEAKVFNGVAALIMIVLFLVVSIGIMVFGIVKLDSGFTGIGSLMLILGLIFIVVDFILFFGLKMINPKEAIVLVLFGNYYGTIKKEGYYWVNPFCSAINPAASRINVSKSSSDEKVDISTNSRGKKVSLKTMTLNNEKQKVNDLLGNPIIIGVVVIWKVIDATKAVFNVDNYNTFLSIQCDSTIRNVSRLYPYDVSEDGDEKSLRGSSQEIADRLKDELQSRVDIAGIEVSEVRITHLSYAPEIAAAMLQRQQAEAIIAARKKIVEGAVSMVEMALTNLSENNVVTLDEERKAAMVSNLLVVLCGNKDAQPVVNSSSIY >CP016104.1|AXU51467.1|3638645_3639362_+|2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate-N-succinyltransferase MVNLNDAYEIARYIKEVKKKTPVKVYVNTNSLHFQSTDKFKVFGSNGSYIFVGDYEDIMEVLDKHGNDITDTHVEYDRRNSAIPLKNTLSEHARIEPGAIIRDMVTIEKNAVVMMGAVINIGAVIGEGSMVDMNAVIGARGTLGKNVHLGAGAVVAGVLEPPSATPVIVEDDVLIGANAVILEGVRIGKGAVVAAGAVVTTDVEAGAVVAGSPAKVIKMKDEKTADKTKLMEDLRNLD >CP016104.1|AXU51466.1|3637677_3638427_+|dihydrodipicolinate-reductase MLKVIATGYDGKMGKILADTIREDNELELVCVAARGLDSYEGDLKIYEDMSTIVEEADVVIDFSHHSNLDNILSYVLKTKTPLVIATTGYNDDEMNKIHEAAKVIPVFQSYNMSLGVNVLVKLVKDAAKLLEGFDIEIIEKHHNRKVDAPSGTAVMIANAIKEVLPNVENNYGRYGRSAKRQPNEVGIHAIRGGNIVGEHDALFAGDNEVLTISHQAQSRGIFASGSIAAAKYLVKQKPGFYNMDSMLG >CP016104.1|AXU51465.1|3636723_3637611_+|dihydrodipicolinate-synthase MIFKGSAVALVTPFTKDNKVDFDKLGELVEYQIANGTDAIVSCGTTGEANTMTDEEQLATIKYVVEKVNKRVPVIAGSGSNDTMHSVNLSQEAEKLGVDALLIITPYYNKANKAGLKRHFETIANSVKLPIILYNVPGRTCVNISPSLIVELAKIDNIVAVKEASGDLGQVAEIASLVPDDFAIYSGNDDTILPLLSLGGQGVISVLANVCPQETHDLVAKFFEGDIEGSRKLQLGMDALIAALFIEVNPIPVKTAMNLLGFNVGDLRLPLAEMDPANLEVLKKELVNFGLKVNA >CP016104.1|AXU51464.1|3635605_3636607_+|aspartate-semialdehyde-dehydrogenase MKKVNVAIVGATGMVGRTFLKVLEERNFPIENLFLFSSSKSAGSKVMFCGKEYIVEELKETSFTDRGIQIALFSAGGSISEKYAPIAASNGILVVDNSSQWRMNPDVPLVVPEVNPEAIKNHKGIIANPNCSTIQAMVPLKALDDKYKIKRIVYSTYQAVSGSGVKGVEDLEKGMNGNPTGFYPHQISYNCLPHIDSFTENGYTKEEMKMVNETMKILDNYDLKITATTVRVPVKNGHSESINVEFNNPFELDDLVKTLEEAPGVVVVDNPAKNEYPTAVEFDDRDEVFVGRIRRDFSVDNGVNLWVVADNIRKGAATNAIQIAEMALSYDLV >CP016104.1|AXU51463.1|3634294_3635176_+|dihydrodipicolinate-synthase MLFKGSAVALVTPFTEDNNVNFEKLGELIEYHIENGTDALVVCGTTGEATTMSESEIFAVIKYTVEKVNKRIPVIAGTGSNNTMLSVHMSQEAEKLGVDGLLIITPYYNKTNEKGLKLHFETIANSVKLPIILYNVPGRTKVNIKPSVVAELAKIDNIVAVKEASGDLAQVAEIAKLVPKDFTIYSGNDDTILPLLSLGGSGVISVLANICPKETHDLVTKFFEGDIEGSKKLQLDMDALIAALFIEVNPVPVKTAMNILGFNVGDLRLPLAEMEETNLNVLKQELTNSGFKF >CP016104.1|AXU51462.1|3632778_3633972_-|L-serine-dehydratase MDTLKELFKIGSGPSSSHTMGPQRAAERFKNENPDAESFRAILYGSLAATGKGHLTDYIIEKTIAPKKVEIVWEEDIIKDFHPNGMKFEALDKDKNVTAEWTVYSVGGGTIAEEGQRNSKSNSIYHLDTMDEIVKWCKENNKTLVDFVLECEPKDIKDYIKTIKDAMRKSIDDGLSTDEIIPGKLLLKRRASTFYNAYKKDKSFSTLVYAYALAASEQNASGNIIVTAPTCGSAGVIPGIFFAMQDFYNYDDEKIIEALLVAGIIGNIIKTNASISGAEVGCQGEVGAACSMAAAAVAYLKGGTIDHIEYAAEIALEHHLGMTCDPVYGYVQIPCIERNAMAAQRAYDAANYALLTDGSHSVSLDQVVETMKETGIDMMDKYKETAKGGLAKHFFSC >CP016104.1|AXU51461.1|3631454_3632573_-|amidohydrolase MREASYLQEQLYKHRKSLNPIAEIGRKEYKTSKYIRDYLDKLGIEYEVYLETGIVGVIEGKRPKKDIAFRADIDGLHSEEGVKHLCGHDGHATILLGLIEYLNDNKEDLNDNIVFIFQPAEEGPGGAKALIDEGVLRKYNIDEIYGLHIYPELPEGYVGTREGYFMAQIGDIDIEIVSKSGHGAMPQNGIDGIVIASNFVSSLQTIVSRNISPIDNAVLTIGRIEGGARRNIIAENIKMEGTMRCFNPEVYEKMKLRVRELARGFGLAYNCKVNINIIDDYIAVKNDKDLYQEFVEAIGSDTVVELEPLMISEDFSYYQKEVPGLFFMLGSRNEEKGFVNGLHNINFNFDEKICVNALNVYSKLLKYKEAID >CP016104.1|AXU51460.1|3631078_3631324_-|small-acid-soluble-spore-protein MKEKIQREKKITNGKNTKILTNDDIMKYEIASELGLMDKVGERGWAGLTAKEAGRIGGMLTSRKKRLKKIVEEQNKKDESI >CP016104.1|AXU51470.1|3644287_3644827_-|hypoxanthine-phosphoribosyltransferase MDIETKKWEVLYSEEKIKDKLRELGAIIEKDYKDKNLMVVSLLKGSFIFCADLVRNINLPLRVNFMTTSSYGNNEESTGRVKVVSDVTTDIAGYDVLVVDDITDSALTMDFVLKHLKAKNPASLKCCVLLDKPSRRKVNLVPDYCGFEIEDKFVVGYGFDFGDYYRNVPYIFNVTDEDR >CP016104.1|AXU51471.1|3645154_3646462_-|serine-dehydratase-subunit-alpha MRDIRKELVEMLKAEVKPAVGCTEPVALALACAKAKELLGEEIVENRMLVSPSIYKNGMCVGIPGTERLGLKIAAALGIVGGHSENGLSVLETLTKEEVKIAEDYMDNTPLSITPADTREKVFIEVVLKGKNHIAKVRIRTKHDNFTFLEKDGEVLLDNEPKVSASNDVAEKAESLMDTVTIQELIKNVEEIDFKDIEFLLDGVKMNEEMAEYGLKQKTGIGVGYGIKKSIEEGLLGNDVINYAMMLTAGASDARMAGVKMPVMSSNGSGNHGLTAILPIVAYNKKFPQSDERLAKALAISHLVTGYIKNYTGRLSAVCGCGVAASTGATAGISWLMNGTENQIEGAIENMIADLSGMICDGAKAGCALKLSSAASAAIQSAIIAKQDCFVPPLNGIVGSSVEQSIQNLGRVSDKGMSITDEIILNVMNDMNKVD >CP016104.1|AXU51472.1|3646873_3648640_-|sigma-54-interacting-protein MIGLEYIKSDIQNIAEAIVSVLNIDVTIVNKELFRIAGTGVYIDKIGEKVDKYTAFKKSLTEQITILIDDPKSSDICRECYKSGACVEFAEVCCPIICDGDSHGVIGLIAFTKEQAQIIENNKSGLINFLGKMADLISNKLKAQIKTYELELEKKKLETLLNNMDKAVVSIDVDGKIDKYNSKFKELFNIKDSITGKNIFVELDFIKKPSINNFKKDKSCSFFYKRYGYDSKGIYNINKIVLKNELKGYVIDFIDKRDAIKNYNKMNKDYRIKLENIIGESVAIRNSKKEALIASKSTSTVLITGESGTGKELFARAIHNHSNRVDNPFIAVNCAAIPDNLLESELFGYEEGAFTGAKKGGKLGMFEVAHKGSIFLDEIGDMSLHLQSKLLRVLQEKELNKIGSKSNVSIDVRIIAATNKDLEKMVQNGTFREDLYYRLNVIPIKLPSLRERKEDIPLIIKHMVKEYSKKLDKNVIDIDSRVVDAMMEYKWPGNIRELQNIIEYSVNMSSSSIITMNVIPQKIKNTSVEELEVKSDRIIPLDELEKIEIIKALNKYKDYKKDKELTAKALGISRATLYRKIEKYNIIS >CP016104.1|AXU51473.1|3648645_3648783_-|hypothetical-protein MEINYELIIIVMLFVILMSIQFTLNKIYLILKEIRQILMLKKNKE >CP016104.1|AXU51474.1|3648860_3649430_-|Methyltransferase-domain-protein MKSILCQINKQPVKAKYTSDELECFLDTIEYNVGDKILLVGHIGNLGKRLRGLGTSVTILENSNYEDVCYSLVYNENCNVVKGKLEFLPFDDNQFNKIIIVDQFNVITDCEKASSEIQRVLKGNGEVILEDLNLKNLKVKLNYLKHKFCGSVAKIHYPHEVFNIFSRLNFDGMIKESNKLKYIYVGKRR >CP016104.1|AXU51475.1|3649613_3650249_-|single-stranded-DNA-binding-protein MIAVKDENNVVNLRGELDNKLEFSHEIFGEKFYNMKIKINRLSDSFDILPMTVSERLLQDIDLDKQNLVNVVGQLRSYNKTLNNKNRLVLTVFVREIKSIDEENKDPNSIFLDGYVCKEPVYRKTPLGREITDLLVAINRPYNKSDYIPSIVWGRNAKFAKNLKVGDRIQLWGRVQSREYEKKIDENNVVKKMAYEVSISKIKKLDENNNE >CP016104.1|AXU51476.1|3650916_3651798_-|Sulfite-exporter-TauE/SafE MVAILKALYVVFAAIFAVVFGKDVAKANKEGKLEEQSTPKVAVTGFITDFFDTLGIGSFAPTIAMSKALKLNIPDKKMPGTLNVAHTIPVVTEAFIFTSIIPVDGVTLVSMVVAAAVGSYIGAGIIAKMDERKIQLVMGVTLALTAILMLLGHPWINVLPGGGNELGLTGAKLVIGVIGNFILGALMTAGIGLYAPGMAMVYFLGMSAKVAFPIVMGSCALLMPVASMKFIKEDAYTKKASVIIAICGLIGVFVAAYIVKTLPMDILKALVIVVIAYTSATMIMAANKNKKTA >CP016104.1|AXU51477.1|3651917_3652925_-|proline-racemase MKFSRSIQAIDSHTAGEATRIVVGGIPNIKGNSMPEKKEYLEENLDYLRTAIMLEPRGHNDMFGSVMTQPCCPDADFGIIFMDGGGYLNMCGHGTIGAMTAAIETGVVPAVEPVTHVVMEAPAGIIRGDVTVVDGKAKEVSFLNVPAFLYKEGVEVDLPGVGTVKFDISFGGSFFAIIHASQLGLKIEPQNAGKLTELAMKLRDIINEKIEIQHPTLAHIKTVDLVEIYDEPTHPEATYKNVVIFGQGQVDRSPCGTGTSAKLATLHAKGELKVGEKFVYESILGTLFKGEIVEETKVADFNAVVPKITGSAYITGFNHFVIDEEDPLKHGFILK >CP016104.1|AXU51478.1|3652944_3653418_-|PrdE-protein MGISTSMKNTSLHIFRDPLLDLIDNDSDIDLLGVVVVGTSEHNEWKTFLATRLGRWIESLRPDGVIITLDMAGNQHIDFTNAIAEFVKSDIPTVGLTIMGADGLVITNPYLDKATIIDYKKTTGYIETEVVGDNHMDEVDVKKALAFLKLKMRKDAK >CP016104.1|AXU51479.1|3653444_3653912_-|PrdE-protein MGIGPSTKETSLHHFRDPLLDIVESDKDVDLLGVIVVGTPDGNENKTFVGQRTAAWLEAMRVDGAIVSSDGWGNSHVDYANTFEEIGKRDIPVVGVTFNGTQAKFVVSNQYMDTIVDMNKSKEGIETEVVGENNTNEIDAKKALAFLKLKMRKHG |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP016104_17 | 17.14|3643693|20|CP016104|CRT | 3643693-3643712 | 20 | CP016104.1 | 3757505-3757524 | 1 | 0.95 |
CP016104_17 | 17.16|3643792|20|CP016104|CRT | 3643792-3643811 | 20 | CP016104.1 | 3757505-3757524 | 1 | 0.95 |
CP016104_17 | 17.19|3643936|20|CP016104|CRT | 3643936-3643955 | 20 | CP016104.1 | 3757505-3757524 | 1 | 0.95 |
CP016104_17 | 17.14|3643693|20|CP016104|CRT | 3643693-3643712 | 20 | CP016104.1 | 3756983-3757002 | 2 | 0.9 |
CP016104_17 | 17.16|3643792|20|CP016104|CRT | 3643792-3643811 | 20 | CP016104.1 | 3756983-3757002 | 2 | 0.9 |
CP016104_17 | 17.17|3643837|20|CP016104|CRT | 3643837-3643856 | 20 | CP016104.1 | 3757505-3757524 | 2 | 0.9 |
CP016104_17 | 17.19|3643936|20|CP016104|CRT | 3643936-3643955 | 20 | CP016104.1 | 3756983-3757002 | 2 | 0.9 |
1. spacer 17.14|3643693|20|CP016104|CRT matches to position: 3757505-3757524, mismatch: 1, identity: 0.95
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3. spacer 17.19|3643936|20|CP016104|CRT matches to position: 3757505-3757524, mismatch: 1, identity: 0.95
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4. spacer 17.14|3643693|20|CP016104|CRT matches to position: 3756983-3757002, mismatch: 2, identity: 0.9
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5. spacer 17.16|3643792|20|CP016104|CRT matches to position: 3756983-3757002, mismatch: 2, identity: 0.9
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6. spacer 17.17|3643837|20|CP016104|CRT matches to position: 3757505-3757524, mismatch: 2, identity: 0.9
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7. spacer 17.19|3643936|20|CP016104|CRT matches to position: 3756983-3757002, mismatch: 2, identity: 0.9
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP016104_2 | 2.3|1347427|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1347427-1347463 | 37 | NC_011398 | Clostridium phage phiCD27, complete genome | 18184-18220 | 0 | 1.0 |
CP016104_3 | 3.4|1557637|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1557637-1557673 | 37 | NZ_CP020426 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence | 64619-64655 | 0 | 1.0 |
CP016104_3 | 3.4|1557637|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1557637-1557673 | 37 | NZ_CP029155 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence | 111177-111213 | 0 | 1.0 |
CP016104_3 | 3.4|1557637|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1557637-1557673 | 37 | MF547662 | Clostridioides phage LIBA6276, complete genome | 64522-64558 | 0 | 1.0 |
CP016104_3 | 3.4|1557637|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1557637-1557673 | 37 | CP011970 | Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence | 57345-57381 | 0 | 1.0 |
CP016104_3 | 3.4|1557637|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1557637-1557673 | 37 | LN681537 | Clostridium phage phiCD211, complete genome | 66207-66243 | 0 | 1.0 |
CP016104_3 | 3.6|1557770|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1557770-1557805 | 36 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 15116-15151 | 0 | 1.0 |
CP016104_3 | 3.9|1557967|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1557967-1558003 | 37 | NZ_MF547664 | Clostridioides difficile strain LIBA-6289 plasmid LIBA6289, complete sequence | 50447-50483 | 0 | 1.0 |
CP016104_5 | 5.3|1757699|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1757699-1757735 | 37 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 15973-16009 | 0 | 1.0 |
CP016104_5 | 5.3|1757699|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1757699-1757735 | 37 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 15469-15505 | 0 | 1.0 |
CP016104_5 | 5.3|1757699|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1757699-1757735 | 37 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 4428-4464 | 0 | 1.0 |
CP016104_5 | 5.6|1757896|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1757896-1757932 | 37 | MF547662 | Clostridioides phage LIBA6276, complete genome | 85584-85620 | 0 | 1.0 |
CP016104_5 | 5.6|1757896|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1757896-1757932 | 37 | MF547663 | Clostridioides phage LIBA2945, complete genome | 84307-84343 | 0 | 1.0 |
CP016104_6 | 6.2|1758793|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1758793-1758830 | 38 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 10566-10603 | 0 | 1.0 |
CP016104_6 | 6.2|1758793|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1758793-1758830 | 38 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 10594-10631 | 0 | 1.0 |
CP016104_6 | 6.2|1758793|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1758793-1758830 | 38 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 9834-9871 | 0 | 1.0 |
CP016104_6 | 6.3|1758860|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1758860-1758896 | 37 | NC_028996 | Clostridium phage phiCDHM19, complete genome | 38312-38348 | 0 | 1.0 |
CP016104_6 | 6.3|1758860|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1758860-1758896 | 37 | LN681541 | Clostridium phage phiMMP01, complete genome | 33821-33857 | 0 | 1.0 |
CP016104_6 | 6.7|1759124|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1759124-1759160 | 37 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 19522-19558 | 0 | 1.0 |
CP016104_6 | 6.7|1759124|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1759124-1759160 | 37 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 879-915 | 0 | 1.0 |
CP016104_6 | 6.7|1759124|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1759124-1759160 | 37 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 907-943 | 0 | 1.0 |
CP016104_10 | 10.2|2777595|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2777595-2777630 | 36 | NZ_MF547664 | Clostridioides difficile strain LIBA-6289 plasmid LIBA6289, complete sequence | 64436-64471 | 0 | 1.0 |
CP016104_10 | 10.12|2778250|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2778250-2778287 | 38 | FN668942 | Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence | 29192-29229 | 0 | 1.0 |
CP016104_2 | 2.3|1347427|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1347427-1347463 | 37 | NC_048642 | Clostridium phage CDKM9, complete genome | 18101-18137 | 1 | 0.973 |
CP016104_3 | 3.3|1557572|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1557572-1557607 | 36 | MF547663 | Clostridioides phage LIBA2945, complete genome | 64451-64486 | 1 | 0.972 |
CP016104_3 | 3.4|1557637|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1557637-1557673 | 37 | MF547663 | Clostridioides phage LIBA2945, complete genome | 62987-63023 | 1 | 0.973 |
CP016104_4 | 4.5|1667642|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1667642-1667677 | 36 | AY855346 | Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome | 20150-20185 | 1 | 0.972 |
CP016104_4 | 4.5|1667642|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1667642-1667677 | 36 | NC_007917 | Clostridium phage phi CD119, complete genome | 20150-20185 | 1 | 0.972 |
CP016104_4 | 4.5|1667642|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1667642-1667677 | 36 | NC_028996 | Clostridium phage phiCDHM19, complete genome | 20404-20439 | 1 | 0.972 |
CP016104_4 | 4.5|1667642|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1667642-1667677 | 36 | NC_028838 | Clostridium phage phiCD506, complete genome | 13735-13770 | 1 | 0.972 |
CP016104_4 | 4.5|1667642|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1667642-1667677 | 36 | LN681538 | Clostridium phage phiCD481-1, complete genome | 13762-13797 | 1 | 0.972 |
CP016104_5 | 5.6|1757896|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1757896-1757932 | 37 | NZ_CP029155 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence | 124235-124271 | 1 | 0.973 |
CP016104_6 | 6.1|1758727|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1758727-1758763 | 37 | NC_028996 | Clostridium phage phiCDHM19, complete genome | 16746-16782 | 1 | 0.973 |
CP016104_6 | 6.2|1758793|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1758793-1758830 | 38 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 10210-10247 | 1 | 0.974 |
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CP016104_6 | 6.6|1759058|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1759058-1759094 | 37 | NZ_MG019961 | Clostridioides difficile isolate ERR125910_NODE5 plasmid pCD-WTSI3, complete sequence | 387-423 | 1 | 0.973 |
CP016104_6 | 6.6|1759058|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1759058-1759094 | 37 | NZ_MG019962 | Clostridioides difficile isolate ERR125911_NODE11 plasmid pCD-WTSI4, complete sequence | 383-419 | 1 | 0.973 |
CP016104_6 | 6.6|1759058|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1759058-1759094 | 37 | NZ_MG019960 | Clostridioides difficile isolate ERR022513_NODE32 plasmid pCD-WTSI2, complete sequence | 383-419 | 1 | 0.973 |
CP016104_6 | 6.7|1759124|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1759124-1759160 | 37 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 907-943 | 1 | 0.973 |
CP016104_10 | 10.12|2778250|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2778250-2778287 | 38 | KX905163 | Clostridioides phage phiSemix9P1, complete genome | 37671-37708 | 1 | 0.974 |
CP016104_3 | 3.2|1557506|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1557506-1557542 | 37 | MK473382 | Clostridium phage JD032, complete genome | 22860-22896 | 2 | 0.946 |
CP016104_3 | 3.2|1557506|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1557506-1557542 | 37 | AY855346 | Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome | 18658-18694 | 2 | 0.946 |
CP016104_3 | 3.2|1557506|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1557506-1557542 | 37 | NC_048665 | Clostridium phage phiCDHM14, complete genome | 11816-11852 | 2 | 0.946 |
CP016104_3 | 3.2|1557506|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1557506-1557542 | 37 | NC_007917 | Clostridium phage phi CD119, complete genome | 18658-18694 | 2 | 0.946 |
CP016104_3 | 3.2|1557506|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1557506-1557542 | 37 | NC_028996 | Clostridium phage phiCDHM19, complete genome | 18911-18947 | 2 | 0.946 |
CP016104_3 | 3.2|1557506|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1557506-1557542 | 37 | JX145342 | Clostridium phage phiMMP04, complete genome | 11797-11833 | 2 | 0.946 |
CP016104_3 | 3.2|1557506|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1557506-1557542 | 37 | HG796225 | Clostridium phage phiCDHM13 complete genome | 11784-11820 | 2 | 0.946 |
CP016104_3 | 3.2|1557506|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1557506-1557542 | 37 | HG798901 | Clostridium phage phiCDHM11 complete genome | 11783-11819 | 2 | 0.946 |
CP016104_4 | 4.2|1667446|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1667446-1667482 | 37 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 27126-27162 | 2 | 0.946 |
CP016104_4 | 4.5|1667642|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1667642-1667677 | 36 | NC_048665 | Clostridium phage phiCDHM14, complete genome | 13309-13344 | 2 | 0.944 |
CP016104_4 | 4.5|1667642|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1667642-1667677 | 36 | MK473382 | Clostridium phage JD032, complete genome | 21368-21403 | 2 | 0.944 |
CP016104_4 | 4.5|1667642|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1667642-1667677 | 36 | HG796225 | Clostridium phage phiCDHM13 complete genome | 13277-13312 | 2 | 0.944 |
CP016104_4 | 4.5|1667642|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1667642-1667677 | 36 | HG798901 | Clostridium phage phiCDHM11 complete genome | 13276-13311 | 2 | 0.944 |
CP016104_4 | 4.6|1667707|38|CP016104|CRISPRCasFinder,CRT | 1667707-1667744 | 38 | NZ_MG973074 | Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence | 94861-94898 | 2 | 0.947 |
CP016104_5 | 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1757635-1757669 | 35 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 1668-1702 | 2 | 0.943 |
CP016104_5 | 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1757635-1757669 | 35 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 1668-1702 | 2 | 0.943 |
CP016104_5 | 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1757635-1757669 | 35 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 1673-1707 | 2 | 0.943 |
CP016104_5 | 5.3|1757699|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1757699-1757735 | 37 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 15478-15514 | 2 | 0.946 |
CP016104_8 | 8.4|1894025|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1894025-1894062 | 38 | NZ_MF547664 | Clostridioides difficile strain LIBA-6289 plasmid LIBA6289, complete sequence | 26432-26469 | 2 | 0.947 |
CP016104_10 | 10.1|2777529|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2777529-2777565 | 37 | NZ_CP020426 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence | 11203-11239 | 2 | 0.946 |
CP016104_10 | 10.1|2777529|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2777529-2777565 | 37 | MF547663 | Clostridioides phage LIBA2945, complete genome | 111955-111991 | 2 | 0.946 |
CP016104_10 | 10.1|2777529|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2777529-2777565 | 37 | CP011970 | Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence | 110761-110797 | 2 | 0.946 |
CP016104_10 | 10.1|2777529|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2777529-2777565 | 37 | LN681537 | Clostridium phage phiCD211, complete genome | 119623-119659 | 2 | 0.946 |
CP016104_10 | 10.6|2777856|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2777856-2777892 | 37 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 1507-1543 | 2 | 0.946 |
CP016104_10 | 10.13|2778317|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2778317-2778352 | 36 | NC_011398 | Clostridium phage phiCD27, complete genome | 47401-47436 | 2 | 0.944 |
CP016104_2 | 2.3|1347427|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1347427-1347463 | 37 | JX145341 | Clostridium phage phiMMP02, complete genome | 18069-18105 | 3 | 0.919 |
CP016104_3 | 3.3|1557572|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1557572-1557607 | 36 | NZ_CP020426 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence | 61102-61137 | 3 | 0.917 |
CP016104_3 | 3.3|1557572|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1557572-1557607 | 36 | CP011970 | Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence | 60863-60898 | 3 | 0.917 |
CP016104_3 | 3.3|1557572|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1557572-1557607 | 36 | LN681537 | Clostridium phage phiCD211, complete genome | 69725-69760 | 3 | 0.917 |
CP016104_3 | 3.5|1557703|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1557703-1557740 | 38 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 9304-9341 | 3 | 0.921 |
CP016104_5 | 5.7|1757962|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1757962-1757999 | 38 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 7234-7271 | 3 | 0.921 |
CP016104_5 | 5.7|1757962|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1757962-1757999 | 38 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 13166-13203 | 3 | 0.921 |
CP016104_5 | 5.7|1757962|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1757962-1757999 | 38 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 7263-7300 | 3 | 0.921 |
CP016104_17 | 17.20|3643981|29|CP016104|CRT | 3643981-3644009 | 29 | NZ_CP053933 | Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_794 plasmid unnamed2, complete sequence | 41416-41444 | 3 | 0.897 |
CP016104_17 | 17.20|3643981|29|CP016104|CRT | 3643981-3644009 | 29 | NZ_CP053936 | Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_794 plasmid unnamed4, complete sequence | 11736-11764 | 3 | 0.897 |
CP016104_17 | 17.20|3643981|29|CP016104|CRT | 3643981-3644009 | 29 | NZ_CP009718 | Bacillus thuringiensis strain HD682 plasmid pBGN_2, complete sequence | 15408-15436 | 3 | 0.897 |
CP016104_6 | 6.2|1758793|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1758793-1758830 | 38 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 10222-10259 | 4 | 0.895 |
CP016104_6 | 6.10|1759322|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1759322-1759358 | 37 | AY855346 | Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome | 6235-6271 | 4 | 0.892 |
CP016104_6 | 6.10|1759322|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1759322-1759358 | 37 | NC_007917 | Clostridium phage phi CD119, complete genome | 6235-6271 | 4 | 0.892 |
CP016104_6 | 6.10|1759322|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1759322-1759358 | 37 | NC_028996 | Clostridium phage phiCDHM19, complete genome | 6483-6519 | 4 | 0.892 |
CP016104_17 | 17.15|3643738|29|CP016104|CRT | 3643738-3643766 | 29 | NZ_CP011156 | Bacillus cereus strain HN001 plasmid pRML01, complete sequence | 127029-127057 | 4 | 0.862 |
CP016104_17 | 17.18|3643882|29|CP016104|CRT | 3643882-3643910 | 29 | NZ_CP012105 | Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-6, complete sequence | 995-1023 | 4 | 0.862 |
CP016104_17 | 17.18|3643882|29|CP016104|CRT | 3643882-3643910 | 29 | MK614706 | Gammaproteobacteria virus GOV_bin_2604, complete genome | 25941-25969 | 4 | 0.862 |
CP016104_17 | 17.2|3642964|29|CP016104|CRT | 3642964-3642992 | 29 | NC_007103 | Bacillus cereus E33L plasmid pE33L466, complete sequence | 141-169 | 5 | 0.828 |
CP016104_17 | 17.2|3642964|29|CP016104|CRT | 3642964-3642992 | 29 | NC_007103 | Bacillus cereus E33L plasmid pE33L466, complete sequence | 240-268 | 5 | 0.828 |
CP016104_17 | 17.2|3642964|29|CP016104|CRT | 3642964-3642992 | 29 | NZ_CP009967 | Bacillus cereus E33L plasmid pBCO_1, complete sequence | 321878-321906 | 5 | 0.828 |
CP016104_17 | 17.2|3642964|29|CP016104|CRT | 3642964-3642992 | 29 | MG209611 | Aphanizomenon phage vB_AphaS-CL131, complete genome | 32380-32408 | 5 | 0.828 |
CP016104_17 | 17.12|3643549|29|CP016104|CRT | 3643549-3643577 | 29 | MN693631 | Marine virus AFVG_250M1143, complete genome | 12342-12370 | 5 | 0.828 |
CP016104_17 | 17.15|3643738|29|CP016104|CRT | 3643738-3643766 | 29 | NZ_CP012105 | Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-6, complete sequence | 995-1023 | 5 | 0.828 |
CP016104_17 | 17.15|3643738|29|CP016104|CRT | 3643738-3643766 | 29 | MN693300 | Marine virus AFVG_25M71, complete genome | 31133-31161 | 5 | 0.828 |
CP016104_17 | 17.15|3643738|29|CP016104|CRT | 3643738-3643766 | 29 | MN693380 | Marine virus AFVG_25M72, complete genome | 31847-31875 | 5 | 0.828 |
CP016104_17 | 17.15|3643738|29|CP016104|CRT | 3643738-3643766 | 29 | MK614706 | Gammaproteobacteria virus GOV_bin_2604, complete genome | 25941-25969 | 5 | 0.828 |
CP016104_17 | 17.18|3643882|29|CP016104|CRT | 3643882-3643910 | 29 | NC_047707 | Uncultured phage_MedDCM-OCT-S38-C3 DNA, complete genome, group G9, isolate: uvMED-CGR-U-MedDCM-OCT-S38-C3 | 32618-32646 | 5 | 0.828 |
CP016104_17 | 17.2|3642964|29|CP016104|CRT | 3642964-3642992 | 29 | NC_007103 | Bacillus cereus E33L plasmid pE33L466, complete sequence | 411-439 | 6 | 0.793 |
CP016104_17 | 17.2|3642964|29|CP016104|CRT | 3642964-3642992 | 29 | NZ_CP009967 | Bacillus cereus E33L plasmid pBCO_1, complete sequence | 321734-321762 | 6 | 0.793 |
CP016104_17 | 17.12|3643549|29|CP016104|CRT | 3643549-3643577 | 29 | MN693968 | Marine virus AFVG_250M909, complete genome | 17688-17716 | 6 | 0.793 |
CP016104_17 | 17.18|3643882|29|CP016104|CRT | 3643882-3643910 | 29 | CP013001 | Bacillus thuringiensis strain XL6 plasmid, complete sequence | 355508-355536 | 6 | 0.793 |
CP016104_17 | 17.18|3643882|29|CP016104|CRT | 3643882-3643910 | 29 | CP013001 | Bacillus thuringiensis strain XL6 plasmid, complete sequence | 355517-355545 | 6 | 0.793 |
CP016104_17 | 17.18|3643882|29|CP016104|CRT | 3643882-3643910 | 29 | CP013001 | Bacillus thuringiensis strain XL6 plasmid, complete sequence | 355751-355779 | 6 | 0.793 |
CP016104_17 | 17.18|3643882|29|CP016104|CRT | 3643882-3643910 | 29 | NZ_KP791968 | Vibrio parahaemolyticus strain 2011VPH2 plasmid pVPH2, complete sequence | 120031-120059 | 6 | 0.793 |
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CP016104_2 | 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1347624-1347660 | 37 | MK373784 | Escherichia phage vB_EcoM_MM02, complete genome | 81502-81538 | 7 | 0.811 |
CP016104_2 | 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1347624-1347660 | 37 | NC_024794 | Escherichia phage vB_EcoM_PhAPEC2, complete genome | 80150-80186 | 7 | 0.811 |
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CP016104_2 | 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1347624-1347660 | 37 | MN850651 | Escherichia phage moskry, complete genome | 90240-90276 | 7 | 0.811 |
CP016104_2 | 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1347624-1347660 | 37 | KP869104 | Escherichia coli O157 typing phage 6, complete genome | 89797-89833 | 7 | 0.811 |
CP016104_2 | 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1347624-1347660 | 37 | MK962756 | Shigella phage JK42, complete genome | 81245-81281 | 7 | 0.811 |
CP016104_2 | 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1347624-1347660 | 37 | MK524178 | Escherichia phage PHB12, complete genome | 140724-140760 | 7 | 0.811 |
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CP016104_2 | 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1347624-1347660 | 37 | MT782071 | Escherichia phage JN02, complete genome | 81149-81185 | 7 | 0.811 |
CP016104_2 | 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1347624-1347660 | 37 | MK327943 | Escherichia phage vB_EcoM_G53, complete genome | 79526-79562 | 7 | 0.811 |
CP016104_2 | 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1347624-1347660 | 37 | MK373782 | Escherichia phage vB_EcoM_KAW3E185, complete genome | 79548-79584 | 7 | 0.811 |
CP016104_2 | 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1347624-1347660 | 37 | MK373774 | Escherichia phage vB_EcoM_WFL6982, complete genome | 75460-75496 | 7 | 0.811 |
CP016104_2 | 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1347624-1347660 | 37 | MK327934 | Escherichia phage vB_EcoM_G2469, complete genome | 81122-81158 | 7 | 0.811 |
CP016104_2 | 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1347624-1347660 | 37 | KM389388 | UNVERIFIED: Escherichia phage CEV1 clone contig00003 genomic sequence | 17910-17946 | 7 | 0.811 |
CP016104_2 | 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1347624-1347660 | 37 | NC_041920 | UNVERIFIED: Escherichia phage HP3, complete genome | 90159-90195 | 7 | 0.811 |
CP016104_5 | 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1757635-1757669 | 35 | NC_013164 | Anaerococcus prevotii DSM 20548 plasmid pAPRE01, complete sequence | 111432-111466 | 7 | 0.8 |
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CP016104_17 | 17.2|3642964|29|CP016104|CRT | 3642964-3642992 | 29 | NZ_CP009336 | Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence | 73554-73582 | 7 | 0.759 |
CP016104_17 | 17.12|3643549|29|CP016104|CRT | 3643549-3643577 | 29 | NC_047754 | Escherichia phage APCEc03, complete genome | 42400-42428 | 7 | 0.759 |
CP016104_17 | 17.12|3643549|29|CP016104|CRT | 3643549-3643577 | 29 | NC_048853 | Phage NBEco001, complete genome | 97810-97838 | 7 | 0.759 |
CP016104_17 | 17.12|3643549|29|CP016104|CRT | 3643549-3643577 | 29 | NC_048855 | Phage NBEco002, complete genome | 98132-98160 | 7 | 0.759 |
CP016104_17 | 17.12|3643549|29|CP016104|CRT | 3643549-3643577 | 29 | AP019559 | Escherichia phage SP15 DNA, complete genome | 99561-99589 | 7 | 0.759 |
CP016104_17 | 17.12|3643549|29|CP016104|CRT | 3643549-3643577 | 29 | MN994502 | Phage NBSal003, complete genome | 19981-20009 | 7 | 0.759 |
CP016104_17 | 17.15|3643738|29|CP016104|CRT | 3643738-3643766 | 29 | MT375529 | Pelagibacter phage Kolga EXVC01, complete genome | 13770-13798 | 7 | 0.759 |
CP016104_17 | 17.18|3643882|29|CP016104|CRT | 3643882-3643910 | 29 | NZ_KP791968 | Vibrio parahaemolyticus strain 2011VPH2 plasmid pVPH2, complete sequence | 120022-120050 | 7 | 0.759 |
CP016104_17 | 17.18|3643882|29|CP016104|CRT | 3643882-3643910 | 29 | NC_019699 | Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 plasmid pCHRO.01, complete sequence | 260685-260713 | 7 | 0.759 |
CP016104_17 | 17.18|3643882|29|CP016104|CRT | 3643882-3643910 | 29 | MG945320 | UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 1616-1801, complete genome | 2318-2346 | 7 | 0.759 |
CP016104_5 | 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1757635-1757669 | 35 | NC_010479 | Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ5, complete sequence | 20261-20295 | 8 | 0.771 |
CP016104_5 | 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1757635-1757669 | 35 | MN694190 | Marine virus AFVG_250M608, complete genome | 31721-31755 | 8 | 0.771 |
CP016104_17 | 17.8|3643333|29|CP016104|CRT | 3643333-3643361 | 29 | MN480762 | Streptococcus salivarius strain NU10 plasmid pSsal-NU10, complete sequence | 176923-176951 | 8 | 0.724 |
CP016104_15 | 15.1|3176216|31|CP016104|CRISPRCasFinder | 3176216-3176246 | 31 | LR606148 | Rhizobium sp. Q54 genome assembly, plasmid: 5 | 444883-444913 | 9 | 0.71 |
CP016104_5 | 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1757635-1757669 | 35 | NC_014633 | Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence | 54657-54691 | 10 | 0.714 |
CP016104_5 | 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1757635-1757669 | 35 | MK448791 | Streptococcus phage Javan517, complete genome | 40916-40950 | 11 | 0.686 |
CP016104_5 | 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1757635-1757669 | 35 | NC_004587 | Streptococcus prophage 315.4, complete genome | 40492-40526 | 11 | 0.686 |
CP016104_5 | 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1757635-1757669 | 35 | NC_003157 | Streptococcus pyogenes strain NIH1 putative methionine sulfoxide reductase gene, complete cds; and integrated temperate phage PhiNIH1.1, complete genome | 41762-41796 | 11 | 0.686 |
CP016104_5 | 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1757635-1757669 | 35 | MK448962 | Streptococcus phage Javan496, complete genome | 31763-31797 | 11 | 0.686 |
CP016104_5 | 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1757635-1757669 | 35 | MK448977 | Streptococcus phage Javan530, complete genome | 40397-40431 | 11 | 0.686 |
CP016104_5 | 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1757635-1757669 | 35 | MK448694 | Streptococcus phage Javan179, complete genome | 40365-40399 | 11 | 0.686 |
CP016104_5 | 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1757635-1757669 | 35 | MK448788 | Streptococcus phage Javan511, complete genome | 40397-40431 | 11 | 0.686 |
CP016104_5 | 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1757635-1757669 | 35 | MK448950 | Streptococcus phage Javan464, complete genome | 41121-41155 | 11 | 0.686 |
CP016104_9 | 9.3|2690202|37|CP016104|PILER-CR | 2690202-2690238 | 37 | NC_025449 | Escherichia phage ECML-134, complete genome | 64499-64535 | 11 | 0.703 |
CP016104_9 | 9.3|2690202|37|CP016104|PILER-CR | 2690202-2690238 | 37 | KM607002 | Enterobacteria phage RB55, complete genome | 68097-68133 | 11 | 0.703 |
CP016104_9 | 9.3|2690202|37|CP016104|PILER-CR | 2690202-2690238 | 37 | KJ477684 | Enterobacteria phage T4 strain wild, complete genome | 68134-68170 | 11 | 0.703 |
CP016104_9 | 9.3|2690202|37|CP016104|PILER-CR | 2690202-2690238 | 37 | HM137666 | Enterobacteria phage T4T, complete genome | 68133-68169 | 11 | 0.703 |
CP016104_9 | 9.3|2690202|37|CP016104|PILER-CR | 2690202-2690238 | 37 | NC_000866 | Enterobacteria phage T4, complete genome | 68154-68190 | 11 | 0.703 |
CP016104_9 | 9.3|2690202|37|CP016104|PILER-CR | 2690202-2690238 | 37 | L13089 | Bacteriophage T4 msp1-msp8 genes, complete cds's | 2697-2733 | 11 | 0.703 |
CP016104_9 | 9.3|2690202|37|CP016104|PILER-CR | 2690202-2690238 | 37 | KJ477686 | Enterobacteria phage T4 strain GT7, complete genome | 68132-68168 | 11 | 0.703 |
CP016104_9 | 9.3|2690202|37|CP016104|PILER-CR | 2690202-2690238 | 37 | X57093 | Bacteriophage T4 orfs between tRNA and e genes | 238-274 | 11 | 0.703 |
CP016104_9 | 9.3|2690202|37|CP016104|PILER-CR | 2690202-2690238 | 37 | KJ477685 | Enterobacteria phage T4 strain 147, complete genome | 66027-66063 | 11 | 0.703 |
CP016104_9 | 9.3|2690202|37|CP016104|PILER-CR | 2690202-2690238 | 37 | KM607003 | Enterobacteria phage RB59, complete genome | 68110-68146 | 11 | 0.703 |
CP016104_10 | 10.5|2777790|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2777790-2777826 | 37 | MH622943 | Myoviridae sp. isolate ctbc_4, complete genome | 249981-250017 | 11 | 0.703 |
CP016104_17 | 17.3|3643018|47|CP016104|CRT | 3643018-3643064 | 47 | NZ_CP009336 | Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence | 90206-90252 | 14 | 0.702 |
CP016104_5 | 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1757635-1757669 | 35 | NZ_CP043858 | Arcobacter cibarius strain H743 plasmid pACIB, complete sequence | 1619-1653 | 20 | 0.429 |
1. spacer 2.3|1347427|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatgtgattaaaaaaggacaaaagttggtgataccta CRISPR spacer aatgtgattaaaaaaggacaaaagttggtgataccta Protospacer *************************************
2. spacer 3.4|1557637|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020426 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagagttttcttaaactaagaattgttttagaatttc CRISPR spacer aagagttttcttaaactaagaattgttttagaatttc Protospacer *************************************
3. spacer 3.4|1557637|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029155 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagagttttcttaaactaagaattgttttagaatttc CRISPR spacer aagagttttcttaaactaagaattgttttagaatttc Protospacer *************************************
4. spacer 3.4|1557637|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagagttttcttaaactaagaattgttttagaatttc CRISPR spacer aagagttttcttaaactaagaattgttttagaatttc Protospacer *************************************
5. spacer 3.4|1557637|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP011970 (Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagagttttcttaaactaagaattgttttagaatttc CRISPR spacer aagagttttcttaaactaagaattgttttagaatttc Protospacer *************************************
6. spacer 3.4|1557637|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681537 (Clostridium phage phiCD211, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagagttttcttaaactaagaattgttttagaatttc CRISPR spacer aagagttttcttaaactaagaattgttttagaatttc Protospacer *************************************
7. spacer 3.6|1557770|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
catatcagcacttccaagatttttattttctgaaat CRISPR spacer catatcagcacttccaagatttttattttctgaaat Protospacer ************************************
8. spacer 3.9|1557967|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF547664 (Clostridioides difficile strain LIBA-6289 plasmid LIBA6289, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaagttaaatttattacatctaattctgtctcttcat CRISPR spacer aaagttaaatttattacatctaattctgtctcttcat Protospacer *************************************
9. spacer 5.3|1757699|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcttgtttgactaagttagtcccccagcttatgacat CRISPR spacer gcttgtttgactaagttagtcccccagcttatgacat Protospacer *************************************
10. spacer 5.3|1757699|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcttgtttgactaagttagtcccccagcttatgacat CRISPR spacer gcttgtttgactaagttagtcccccagcttatgacat Protospacer *************************************
11. spacer 5.3|1757699|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcttgtttgactaagttagtcccccagcttatgacat CRISPR spacer gcttgtttgactaagttagtcccccagcttatgacat Protospacer *************************************
12. spacer 5.6|1757896|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tatttactattttcacagtttaaagaagtatagtaac CRISPR spacer tatttactattttcacagtttaaagaagtatagtaac Protospacer *************************************
13. spacer 5.6|1757896|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tatttactattttcacagtttaaagaagtatagtaac CRISPR spacer tatttactattttcacagtttaaagaagtatagtaac Protospacer *************************************
14. spacer 6.2|1758793|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctaacactaacactatttttattaatatttaacttcaa CRISPR spacer ctaacactaacactatttttattaatatttaacttcaa Protospacer **************************************
15. spacer 6.2|1758793|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctaacactaacactatttttattaatatttaacttcaa CRISPR spacer ctaacactaacactatttttattaatatttaacttcaa Protospacer **************************************
16. spacer 6.2|1758793|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctaacactaacactatttttattaatatttaacttcaa CRISPR spacer ctaacactaacactatttttattaatatttaacttcaa Protospacer **************************************
17. spacer 6.3|1758860|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatgcagaaaaatttgaaagttgggtatttgatgaag CRISPR spacer aatgcagaaaaatttgaaagttgggtatttgatgaag Protospacer *************************************
18. spacer 6.3|1758860|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681541 (Clostridium phage phiMMP01, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatgcagaaaaatttgaaagttgggtatttgatgaag CRISPR spacer aatgcagaaaaatttgaaagttgggtatttgatgaag Protospacer *************************************
19. spacer 6.7|1759124|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atgttcaattttgcatttgcacttgtagaccctgttg CRISPR spacer atgttcaattttgcatttgcacttgtagaccctgttg Protospacer *************************************
20. spacer 6.7|1759124|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atgttcaattttgcatttgcacttgtagaccctgttg CRISPR spacer atgttcaattttgcatttgcacttgtagaccctgttg Protospacer *************************************
21. spacer 6.7|1759124|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atgttcaattttgcatttgcacttgtagaccctgttg CRISPR spacer atgttcaattttgcatttgcacttgtagaccctgttg Protospacer *************************************
22. spacer 10.2|2777595|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF547664 (Clostridioides difficile strain LIBA-6289 plasmid LIBA6289, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
taaccatgtaactttcatgtaatttgtccaatatct CRISPR spacer taaccatgtaactttcatgtaatttgtccaatatct Protospacer ************************************
23. spacer 10.12|2778250|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to FN668942 (Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaggaaatagcatcaaatgctaaatcatgtcctaactg CRISPR spacer aaggaaatagcatcaaatgctaaatcatgtcctaactg Protospacer **************************************
24. spacer 2.3|1347427|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048642 (Clostridium phage CDKM9, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
aatgtgattaaaaaaggacaaaagttggtgataccta CRISPR spacer aatgtgattaaaaaaggacaaaagttggtgatacctt Protospacer ************************************
25. spacer 3.3|1557572|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gataaaataattgaatatgtagctttcgatatgtgt CRISPR spacer gataaaataattgaatatgtagcttttgatatgtgt Protospacer **************************.*********
26. spacer 3.4|1557637|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
aagagttttcttaaactaagaattgttttagaatttc CRISPR spacer aagagttttcttaaactaagaattgttttagagtttc Protospacer ********************************.****
27. spacer 4.5|1667642|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tatatattagatgtcaatgtcaaggatacaaaattt CRISPR spacer tatatattagatgtcaatatcaaggatacaaaattt Protospacer ******************.*****************
28. spacer 4.5|1667642|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tatatattagatgtcaatgtcaaggatacaaaattt CRISPR spacer tatatattagatgtcaatatcaaggatacaaaattt Protospacer ******************.*****************
29. spacer 4.5|1667642|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tatatattagatgtcaatgtcaaggatacaaaattt CRISPR spacer tatatattagatgtcaatatcaaggatacaaaattt Protospacer ******************.*****************
30. spacer 4.5|1667642|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028838 (Clostridium phage phiCD506, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tatatattagatgtcaatgtcaaggatacaaaattt CRISPR spacer tatatattagatgtcaatatcaaggatacaaaattt Protospacer ******************.*****************
31. spacer 4.5|1667642|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681538 (Clostridium phage phiCD481-1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tatatattagatgtcaatgtcaaggatacaaaattt CRISPR spacer tatatattagatgtcaatatcaaggatacaaaattt Protospacer ******************.*****************
32. spacer 5.6|1757896|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029155 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
tatttactattttcacagtttaaagaagtatagtaac CRISPR spacer tattcactattttcacagtttaaagaagtatagtaac Protospacer ****.********************************
33. spacer 6.1|1758727|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
catttccaattacatcacctctatatctattctaaag CRISPR spacer catttccaactacatcacctctatatctattctaaag Protospacer *********.***************************
34. spacer 6.2|1758793|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
ctaacactaacactatttttattaatatttaacttcaa CRISPR spacer ctaacactgacactatttttattaatatttaacttcaa Protospacer ********.*****************************
35. spacer 6.6|1759058|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG019959 (Clostridioides difficile isolate ERR017368_NODE12 plasmid pCD-WTSI1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
actccaaaattgaagtttataaaattgtaagtataag CRISPR spacer actccaaaattgaagtttatataattgtaagtataag Protospacer ********************* ***************
36. spacer 6.6|1759058|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG019961 (Clostridioides difficile isolate ERR125910_NODE5 plasmid pCD-WTSI3, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
actccaaaattgaagtttataaaattgtaagtataag CRISPR spacer actccaaaattgaagtttatataattgtaagtataag Protospacer ********************* ***************
37. spacer 6.6|1759058|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG019962 (Clostridioides difficile isolate ERR125911_NODE11 plasmid pCD-WTSI4, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
actccaaaattgaagtttataaaattgtaagtataag CRISPR spacer actccaaaattgaagtttatataattgtaagtataag Protospacer ********************* ***************
38. spacer 6.6|1759058|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG019960 (Clostridioides difficile isolate ERR022513_NODE32 plasmid pCD-WTSI2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
actccaaaattgaagtttataaaattgtaagtataag CRISPR spacer actccaaaattgaagtttatataattgtaagtataag Protospacer ********************* ***************
39. spacer 6.7|1759124|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
atgttcaattttgcatttgcacttgtagaccctgttg CRISPR spacer atattcaattttgcatttgcacttgtagaccctgttg Protospacer **.**********************************
40. spacer 10.12|2778250|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX905163 (Clostridioides phage phiSemix9P1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
aaggaaatagcatcaaatgctaaatcatgtcctaactg CRISPR spacer aaggaaatagcatctaatgctaaatcatgtcctaactg Protospacer ************** ***********************
41. spacer 3.2|1557506|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK473382 (Clostridium phage JD032, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
taatattttggaaatttaaatctaaatctatctcata CRISPR spacer tgatattttgaaaatttaaatctaaatctatctcata Protospacer *.********.**************************
42. spacer 3.2|1557506|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
taatattttggaaatttaaatctaaatctatctcata CRISPR spacer tgatattttgaaaatttaaatctaaatctatctcata Protospacer *.********.**************************
43. spacer 3.2|1557506|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048665 (Clostridium phage phiCDHM14, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
taatattttggaaatttaaatctaaatctatctcata CRISPR spacer tgatattttgaaaatttaaatctaaatctatctcata Protospacer *.********.**************************
44. spacer 3.2|1557506|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
taatattttggaaatttaaatctaaatctatctcata CRISPR spacer tgatattttgaaaatttaaatctaaatctatctcata Protospacer *.********.**************************
45. spacer 3.2|1557506|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
taatattttggaaatttaaatctaaatctatctcata CRISPR spacer tgatattttgaaaatttaaatctaaatctatctcata Protospacer *.********.**************************
46. spacer 3.2|1557506|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JX145342 (Clostridium phage phiMMP04, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
taatattttggaaatttaaatctaaatctatctcata CRISPR spacer tgatattttgaaaatttaaatctaaatctatctcata Protospacer *.********.**************************
47. spacer 3.2|1557506|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG796225 (Clostridium phage phiCDHM13 complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
taatattttggaaatttaaatctaaatctatctcata CRISPR spacer tgatattttgaaaatttaaatctaaatctatctcata Protospacer *.********.**************************
48. spacer 3.2|1557506|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG798901 (Clostridium phage phiCDHM11 complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
taatattttggaaatttaaatctaaatctatctcata CRISPR spacer tgatattttgaaaatttaaatctaaatctatctcata Protospacer *.********.**************************
49. spacer 4.2|1667446|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
atgttattacataaaaattcttcatctataactttaa CRISPR spacer atattattacataaaaattcttcgtctataactttaa Protospacer **.********************.*************
50. spacer 4.5|1667642|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048665 (Clostridium phage phiCDHM14, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
tatatattagatgtcaatgtcaaggatacaaaattt CRISPR spacer tatatattagatatcaatgtcaagaatacaaaattt Protospacer ************.***********.***********
51. spacer 4.5|1667642|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK473382 (Clostridium phage JD032, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
tatatattagatgtcaatgtcaaggatacaaaattt CRISPR spacer tatatattagatatcaatgtcaagaatacaaaattt Protospacer ************.***********.***********
52. spacer 4.5|1667642|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG796225 (Clostridium phage phiCDHM13 complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
tatatattagatgtcaatgtcaaggatacaaaattt CRISPR spacer tatatattagatatcaatgtcaagaatacaaaattt Protospacer ************.***********.***********
53. spacer 4.5|1667642|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG798901 (Clostridium phage phiCDHM11 complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
tatatattagatgtcaatgtcaaggatacaaaattt CRISPR spacer tatatattagatatcaatgtcaagaatacaaaattt Protospacer ************.***********.***********
54. spacer 4.6|1667707|38|CP016104|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG973074 (Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
ccatcttttgttgctttacataaatttatattacttac CRISPR spacer ccatcttttgttgctttgcatagatttatattacttac Protospacer *****************.****.***************
55. spacer 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
tgcaaatttattactttttttataaagtttataag CRISPR spacer tgcagatttattactttttttataaaatttataag Protospacer ****.*********************.********
56. spacer 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
tgcaaatttattactttttttataaagtttataag CRISPR spacer tgcagatttattactttttttataaaatttataag Protospacer ****.*********************.********
57. spacer 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
tgcaaatttattactttttttataaagtttataag CRISPR spacer tgcatatttatcactttttttataaagtttataag Protospacer **** ******.***********************
58. spacer 5.3|1757699|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
gcttgtttgactaagttagtcccccagcttatgacat CRISPR spacer gcttgtttgactaagttagtcccccaacttataacat Protospacer **************************.*****.****
59. spacer 8.4|1894025|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF547664 (Clostridioides difficile strain LIBA-6289 plasmid LIBA6289, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
tttataacctttaattacacctcccatatcaccaccac CRISPR spacer cttgtaacctttaattacacctcccatatcaccaccac Protospacer .**.**********************************
60. spacer 10.1|2777529|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020426 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
gaaacaactgatgctataagaatttctataaatttaa CRISPR spacer gaaacaactgatactataagaatttctataaatttga Protospacer ************.**********************.*
61. spacer 10.1|2777529|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
gaaacaactgatgctataagaatttctataaatttaa CRISPR spacer gaaacaactgatactataagaatttctataaatttga Protospacer ************.**********************.*
62. spacer 10.1|2777529|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP011970 (Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
gaaacaactgatgctataagaatttctataaatttaa CRISPR spacer gaaacaactgatactataagaatttctataaatttga Protospacer ************.**********************.*
63. spacer 10.1|2777529|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681537 (Clostridium phage phiCD211, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
gaaacaactgatgctataagaatttctataaatttaa CRISPR spacer gaaacaactgatactataagaatttctataaatttga Protospacer ************.**********************.*
64. spacer 10.6|2777856|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
ttgacccactcatggatgttattgttggagtagattt CRISPR spacer ttgacccactcatggatgttattgttggggtggattt Protospacer ****************************.**.*****
65. spacer 10.13|2778317|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
actttttattggcaaaaccatgagataataatattg CRISPR spacer actttttattggtaaaaacatgagataataatattg Protospacer ************.**** ******************
66. spacer 2.3|1347427|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
aatgtgattaaaaaaggacaaaagttggtgataccta CRISPR spacer aatataattaaaaaaggacaaaagttggtgatacctt Protospacer ***.*.******************************
67. spacer 3.3|1557572|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020426 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
gataaaataattgaatatgtagctttcgatatgtgt CRISPR spacer gataaagtaattgaatatgtagcttttgatatgtgc Protospacer ******.*******************.********.
68. spacer 3.3|1557572|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP011970 (Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
gataaaataattgaatatgtagctttcgatatgtgt CRISPR spacer gataaagtaattgaatatgtagcttttgatatgtgc Protospacer ******.*******************.********.
69. spacer 3.3|1557572|36|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681537 (Clostridium phage phiCD211, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
gataaaataattgaatatgtagctttcgatatgtgt CRISPR spacer gataaagtaattgaatatgtagcttttgatatgtgc Protospacer ******.*******************.********.
70. spacer 3.5|1557703|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
ttaaatattttatttgatgtattatctccaaaaatatt CRISPR spacer gcaaatattttatttgatgtattatccccaaaaatatt Protospacer .************************.***********
71. spacer 5.7|1757962|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
atcgccttccagattacttttgtatatgaggtcagcaa CRISPR spacer gtcgccttccaggttacttttatatatgaggtcagcaa Protospacer .***********.********.****************
72. spacer 5.7|1757962|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
atcgccttccagattacttttgtatatgaggtcagcaa CRISPR spacer gtcgccttccaggttacttttatatatgaggtcagcaa Protospacer .***********.********.****************
73. spacer 5.7|1757962|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
atcgccttccagattacttttgtatatgaggtcagcaa CRISPR spacer gtcgccttccaggttacttttatatatgaggtcagcaa Protospacer .***********.********.****************
74. spacer 17.20|3643981|29|CP016104|CRT matches to NZ_CP053933 (Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_794 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.897
tgttggacctgttattccatttgctcccg CRISPR spacer agttggacctgttattcctgttgctcccg Protospacer ***************** *********
75. spacer 17.20|3643981|29|CP016104|CRT matches to NZ_CP053936 (Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_794 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.897
tgttggacctgttattccatttgctcccg CRISPR spacer agttggacctgttattcctgttgctcccg Protospacer ***************** *********
76. spacer 17.20|3643981|29|CP016104|CRT matches to NZ_CP009718 (Bacillus thuringiensis strain HD682 plasmid pBGN_2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.897
tgttggacctgttattccatttgctcccg CRISPR spacer agttggacctgttattcctgttgctcccg Protospacer ***************** *********
77. spacer 6.2|1758793|38|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.895
ctaacactaacactatttttattaatatttaacttcaa CRISPR spacer cttatgctaacactatttttattaatatttaactttaa Protospacer ** *..*****************************.**
78. spacer 6.10|1759322|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.892
actaaaggagtttctttgttctttatgctctacaact CRISPR spacer actgtgagagtttctttgttctttatgctctacaact Protospacer ***. ..******************************
79. spacer 6.10|1759322|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.892
actaaaggagtttctttgttctttatgctctacaact CRISPR spacer actgtgagagtttctttgttctttatgctctacaact Protospacer ***. ..******************************
80. spacer 6.10|1759322|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.892
actaaaggagtttctttgttctttatgctctacaact CRISPR spacer actgtgagagtttctttgttctttatgctctacaact Protospacer ***. ..******************************
81. spacer 17.15|3643738|29|CP016104|CRT matches to NZ_CP011156 (Bacillus cereus strain HN001 plasmid pRML01, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.862
tgttggacctgtagaacctgttattccat CRISPR spacer agtaggacctgtaggacctgttattccaa Protospacer ** **********.*************
82. spacer 17.18|3643882|29|CP016104|CRT matches to NZ_CP012105 (Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-6, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.862
tgttggacctgtagaacctgttgttccat CRISPR spacer tgttggacctgttgaacctgttgggccct Protospacer ************ ********** ** *
83. spacer 17.18|3643882|29|CP016104|CRT matches to MK614706 (Gammaproteobacteria virus GOV_bin_2604, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.862
tgttggacctgtagaacctgttgttccat CRISPR spacer tggagaacctgaagaacctgttgttccat Protospacer ** *.***** *****************
84. spacer 17.2|3642964|29|CP016104|CRT matches to NC_007103 (Bacillus cereus E33L plasmid pE33L466, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
tgctactccatttgctcccgttgctccta CRISPR spacer cgttactcctgttgctcccgttgctcctg Protospacer .*.****** *****************.
85. spacer 17.2|3642964|29|CP016104|CRT matches to NC_007103 (Bacillus cereus E33L plasmid pE33L466, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
tgctactccatttgctcccgttgctccta CRISPR spacer cgttactcctgttgctcccgttgctcctg Protospacer .*.****** *****************.
86. spacer 17.2|3642964|29|CP016104|CRT matches to NZ_CP009967 (Bacillus cereus E33L plasmid pBCO_1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
tgctactccatttgctcccgttgctccta CRISPR spacer cgttactcctgttgctcccgttgctcctg Protospacer .*.****** *****************.
87. spacer 17.2|3642964|29|CP016104|CRT matches to MG209611 (Aphanizomenon phage vB_AphaS-CL131, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
tgctactccatttgctcccgttgctccta CRISPR spacer cgttgctcccgttgctcccgttgctccta Protospacer .*.*.**** ******************
88. spacer 17.12|3643549|29|CP016104|CRT matches to MN693631 (Marine virus AFVG_250M1143, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
tattgg--tcctgtagcacctgttactccat CRISPR spacer --ttgatctcctgtagcaagtgttactccat Protospacer ***. ********** ***********
89. spacer 17.15|3643738|29|CP016104|CRT matches to NZ_CP012105 (Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-6, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
tgttggacctgtagaacctgttattccat CRISPR spacer tgttggacctgttgaacctgttgggccct Protospacer ************ *********. ** *
90. spacer 17.15|3643738|29|CP016104|CRT matches to MN693300 (Marine virus AFVG_25M71, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
tgttg-gacctgtagaacctgttattccat CRISPR spacer -attgtaacctgtagaacctgttatttcaa Protospacer .*** .*******************.**
91. spacer 17.15|3643738|29|CP016104|CRT matches to MN693380 (Marine virus AFVG_25M72, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
tgttg-gacctgtagaacctgttattccat CRISPR spacer -attgtaacctgtagaacctgttatttcaa Protospacer .*** .*******************.**
92. spacer 17.15|3643738|29|CP016104|CRT matches to MK614706 (Gammaproteobacteria virus GOV_bin_2604, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
tgttggacctgtagaacctgttattccat CRISPR spacer tggagaacctgaagaacctgttgttccat Protospacer ** *.***** **********.******
93. spacer 17.18|3643882|29|CP016104|CRT matches to NC_047707 (Uncultured phage_MedDCM-OCT-S38-C3 DNA, complete genome, group G9, isolate: uvMED-CGR-U-MedDCM-OCT-S38-C3) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
tgttggacctgtagaacctgttgttccat CRISPR spacer tgttggacctgaaggacctgttgttggag Protospacer *********** **.********** *
94. spacer 17.2|3642964|29|CP016104|CRT matches to NC_007103 (Bacillus cereus E33L plasmid pE33L466, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tgctactccatttgctcccgttgctccta CRISPR spacer cgtcactcctgttgctcccgttgctcctg Protospacer .*..***** *****************.
95. spacer 17.2|3642964|29|CP016104|CRT matches to NZ_CP009967 (Bacillus cereus E33L plasmid pBCO_1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tgctactccatttgctcccgttgctccta CRISPR spacer cgtcactcctgttgctcccgttgctcctg Protospacer .*..***** *****************.
96. spacer 17.12|3643549|29|CP016104|CRT matches to MN693968 (Marine virus AFVG_250M909, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tattggtcctgtagcacctgttactccat CRISPR spacer agtaggtcctgtagaacctgttgctccag Protospacer .* ********** *******.*****
97. spacer 17.18|3643882|29|CP016104|CRT matches to CP013001 (Bacillus thuringiensis strain XL6 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tgttggacctgtagaacctgttgttccat CRISPR spacer tgttggtcctgttgaacctgttgaacctg Protospacer ****** ***** ********** **
98. spacer 17.18|3643882|29|CP016104|CRT matches to CP013001 (Bacillus thuringiensis strain XL6 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tgttggacctgtagaacctgttgttccat CRISPR spacer tgttgaacctgttgaacctgttgaacctg Protospacer *****.****** ********** **
99. spacer 17.18|3643882|29|CP016104|CRT matches to CP013001 (Bacillus thuringiensis strain XL6 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tgttggacctgtagaacctgttgttccat CRISPR spacer tgttggtcctgttgaacctgttgaacctg Protospacer ****** ***** ********** **
100. spacer 17.18|3643882|29|CP016104|CRT matches to NZ_KP791968 (Vibrio parahaemolyticus strain 2011VPH2 plasmid pVPH2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tgttggacctgtagaacctgttgttccat CRISPR spacer tgttgaacctgttgaacctgttgaacctg Protospacer *****.****** ********** **
101. spacer 17.18|3643882|29|CP016104|CRT matches to NZ_KP791968 (Vibrio parahaemolyticus strain 2011VPH2 plasmid pVPH2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tgttggacctgtagaacctgttgttccat CRISPR spacer tgttgaacctgttgaacctgttgaacctg Protospacer *****.****** ********** **
102. spacer 17.18|3643882|29|CP016104|CRT matches to NZ_KP791968 (Vibrio parahaemolyticus strain 2011VPH2 plasmid pVPH2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tgttggacctgtagaacctgttgttccat CRISPR spacer tgttgaacctgttgaacctgttgaacctg Protospacer *****.****** ********** **
103. spacer 17.18|3643882|29|CP016104|CRT matches to NZ_KP791968 (Vibrio parahaemolyticus strain 2011VPH2 plasmid pVPH2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tgttggacctgtagaacctgttgttccat CRISPR spacer tgttgaacctgttgaacctgttgaacctg Protospacer *****.****** ********** **
104. spacer 17.18|3643882|29|CP016104|CRT matches to NZ_KP791968 (Vibrio parahaemolyticus strain 2011VPH2 plasmid pVPH2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tgttggacctgtagaacctgttgttccat CRISPR spacer tgttgaacctgttgaacctgttgaacctg Protospacer *****.****** ********** **
105. spacer 17.18|3643882|29|CP016104|CRT matches to NZ_KP791968 (Vibrio parahaemolyticus strain 2011VPH2 plasmid pVPH2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tgttggacctgtagaacctgttgttccat CRISPR spacer tgttgaacctgttgaacctgttgaacctg Protospacer *****.****** ********** **
106. spacer 17.18|3643882|29|CP016104|CRT matches to NZ_KP791968 (Vibrio parahaemolyticus strain 2011VPH2 plasmid pVPH2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tgttggacctgtagaacctgttgttccat CRISPR spacer tgttgaacctgttgaacctgttgaacctg Protospacer *****.****** ********** **
107. spacer 17.18|3643882|29|CP016104|CRT matches to NZ_KP791968 (Vibrio parahaemolyticus strain 2011VPH2 plasmid pVPH2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tgttggacctgtagaacctgttgttccat CRISPR spacer tgttgaacctgttgaacctgttgaacctg Protospacer *****.****** ********** **
108. spacer 17.18|3643882|29|CP016104|CRT matches to NZ_KP791968 (Vibrio parahaemolyticus strain 2011VPH2 plasmid pVPH2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
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109. spacer 17.18|3643882|29|CP016104|CRT matches to NZ_KP791968 (Vibrio parahaemolyticus strain 2011VPH2 plasmid pVPH2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tgttggacctgtagaacctgttgttccat CRISPR spacer tgttgaacctgttgaacctgttgaacctg Protospacer *****.****** ********** **
110. spacer 17.18|3643882|29|CP016104|CRT matches to NZ_KP791968 (Vibrio parahaemolyticus strain 2011VPH2 plasmid pVPH2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tgttggacctgtagaacctgttgttccat CRISPR spacer tgttgaacctgttgaacctgttgaacctg Protospacer *****.****** ********** **
111. spacer 17.18|3643882|29|CP016104|CRT matches to NZ_CP012101 (Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
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112. spacer 17.18|3643882|29|CP016104|CRT matches to CP024687 (Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-3-257K, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tgttggacctgtagaacctgttgttccat CRISPR spacer tgttggacctgttggacctgttggaccgg Protospacer ************ *.******** **.
113. spacer 17.18|3643882|29|CP016104|CRT matches to MN694558 (Marine virus AFVG_250M9, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tgttggacctgtagaacctgttgttccat CRISPR spacer tgtcggccctgtagaacctgttggccctg Protospacer ***.** **************** .**
114. spacer 17.18|3643882|29|CP016104|CRT matches to MN694640 (Marine virus AFVG_250M10, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tgttggacctgtagaacctgttgttccat CRISPR spacer tgtcggccctgtagaacctgttggccctg Protospacer ***.** **************** .**
115. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN864145 (Escherichia phage F2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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116. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN850579 (Escherichia phage mogra, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
117. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KT184309 (Enterobacteria phage ATK47, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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118. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT446423 (UNVERIFIED: Escherichia virus TH58, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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119. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LR027391 (Escherichia virus vB_Eco_mar005P1 strain vB_Eco_mar009P5 genome assembly, chromosome: 1) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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120. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK047718 (Escherichia phage p000y, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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121. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KT184310 (Enterobacteria phage ATK48, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
122. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK639187 (Shigella phage SSE1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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123. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018855 (Enterobacteria phage HX01, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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124. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_041990 (Escherichia phage ST0, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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125. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KR422352 (Escherichia phage APCEc01, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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126. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT446390 (UNVERIFIED: Escherichia virus TH12, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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127. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN850622 (Escherichia phage mobillu, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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128. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX130865 (Shigella phage SHSML-52-1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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129. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN850590 (Escherichia phage moha, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
130. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_041863 (Escherichia coli O157 typing phage 3, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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131. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_024124 (Escherichia phage vB_EcoM_JS09, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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132. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK047717 (Escherichia phage p000v, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
133. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK373778 (Escherichia phage vB_EcoM_WFbE185, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
134. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LR027383 (Escherichia virus vB_Eco_mar005P1 strain vB_Eco_mar007P3 genome assembly, chromosome: 1) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
135. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU255730 (Escherichia phage phiE142, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
136. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KM407600 (Shigella phage Shf125875, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
137. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LR027386 (Escherichia virus vB_Eco_mar005P1 strain vB_Eco_mar008P4 genome assembly, chromosome: 1) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
138. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK962754 (Shigella phage JK36, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
139. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LR027390 (Escherichia virus vB_Eco_mar005P1 genome assembly, chromosome: 1) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
140. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LR027387 (Escherichia virus vB_Eco_mar005P1 strain vB_Eco_mar006P2 genome assembly, chromosome: 1) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
141. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KP869111 (Escherichia coli O157 typing phage 13, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
142. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK373775 (Escherichia phage vB_EcoM_WFK, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
143. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK373784 (Escherichia phage vB_EcoM_MM02, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
144. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_024794 (Escherichia phage vB_EcoM_PhAPEC2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
145. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK962757 (Shigella phage JK45, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
146. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN850651 (Escherichia phage moskry, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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147. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KP869104 (Escherichia coli O157 typing phage 6, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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148. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK962756 (Shigella phage JK42, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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149. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK524178 (Escherichia phage PHB12, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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150. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG589383 (Shigella phage phi25-307, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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151. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK327933 (Escherichia phage vB_EcoM_G2285, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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152. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH243438 (Escherichia phage vB_EcoM_NBG1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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153. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT782071 (Escherichia phage JN02, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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154. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK327943 (Escherichia phage vB_EcoM_G53, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
155. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK373782 (Escherichia phage vB_EcoM_KAW3E185, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
156. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK373774 (Escherichia phage vB_EcoM_WFL6982, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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157. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK327934 (Escherichia phage vB_EcoM_G2469, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
158. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KM389388 (UNVERIFIED: Escherichia phage CEV1 clone contig00003 genomic sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
159. spacer 2.6|1347624|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_041920 (UNVERIFIED: Escherichia phage HP3, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttatatcttcttttgtaacattttttatagttattt----- CRISPR spacer tttatatcttcttttgcaacaatttttat-----tttacgaa Protospacer ****************.**** ******* ***
160. spacer 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_013164 (Anaerococcus prevotii DSM 20548 plasmid pAPRE01, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
---tgcaaatttattactttttttataaagtttataag CRISPR spacer atatacaaa---atttccttttttataaagtttataat Protospacer *.**** *** *.*******************
161. spacer 17.2|3642964|29|CP016104|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
tgctactccatttgctcccgttgctccta CRISPR spacer aattgctccgattgctcccgttgctcctg Protospacer ..*.****. *****************.
162. spacer 17.2|3642964|29|CP016104|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
tgctactccatttgctcccgttgctccta CRISPR spacer ggtcgctcccgttgctcccgttgctcctt Protospacer *...**** *****************
163. spacer 17.12|3643549|29|CP016104|CRT matches to NC_047754 (Escherichia phage APCEc03, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
tattggtcctgtagcacctgttactccat CRISPR spacer aaaacgtcctgaagcacctgttactgcac Protospacer * ****** ************* **.
164. spacer 17.12|3643549|29|CP016104|CRT matches to NC_048853 (Phage NBEco001, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
tattggtcctgtagcacctgttactccat CRISPR spacer aaaacgtcctgaagcacctgttactgcac Protospacer * ****** ************* **.
165. spacer 17.12|3643549|29|CP016104|CRT matches to NC_048855 (Phage NBEco002, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
tattggtcctgtagcacctgttactccat CRISPR spacer aaaacgtcctgaagcacctgttactgcac Protospacer * ****** ************* **.
166. spacer 17.12|3643549|29|CP016104|CRT matches to AP019559 (Escherichia phage SP15 DNA, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
tattggtcctgtagcacctgttactccat CRISPR spacer aaaacgtcctgaagcacctgttactgcac Protospacer * ****** ************* **.
167. spacer 17.12|3643549|29|CP016104|CRT matches to MN994502 (Phage NBSal003, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
tattggtcctgtagcacctgttactccat CRISPR spacer aaaacgtcctgaagcacctgttactgcac Protospacer * ****** ************* **.
168. spacer 17.15|3643738|29|CP016104|CRT matches to MT375529 (Pelagibacter phage Kolga EXVC01, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
tgttggacctgtagaacctgttattccat CRISPR spacer agttgggcctgttgaacctgttattgatg Protospacer *****.***** ************
169. spacer 17.18|3643882|29|CP016104|CRT matches to NZ_KP791968 (Vibrio parahaemolyticus strain 2011VPH2 plasmid pVPH2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
tgttggacctgtagaacctgttgttccat CRISPR spacer tgttgaacctgttgaacctgttgattatg Protospacer *****.****** ********** *.
170. spacer 17.18|3643882|29|CP016104|CRT matches to NC_019699 (Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 plasmid pCHRO.01, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
tgttggacctgtagaacctgttgttccat CRISPR spacer agttggagctgtagatcctgttgtattag Protospacer ****** ******* ******** ..*
171. spacer 17.18|3643882|29|CP016104|CRT matches to MG945320 (UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 1616-1801, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
tgttggacctgtagaacctgttgttccat CRISPR spacer tgttgaacctgtcgaacctgttgagtcta Protospacer *****.****** ********** .*
172. spacer 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010479 (Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ5, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tgcaaatttattactttttttataaagtttataag CRISPR spacer cacaagaatattattttttttataaagattataat Protospacer ..***. *****.************* ******
173. spacer 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694190 (Marine virus AFVG_250M608, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tgcaaatt--tattactttttttataaagtttataag CRISPR spacer --gaaatcaaaattactttttttataaaggttttaaa Protospacer ****. ****************** ** ***.
174. spacer 17.8|3643333|29|CP016104|CRT matches to MN480762 (Streptococcus salivarius strain NU10 plasmid pSsal-NU10, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
taccaaaccatttgctcccgttgctcctg CRISPR spacer taccaaaccagttgctcccgtaaccaaga Protospacer ********** ********** .*. .
175. spacer 15.1|3176216|31|CP016104|CRISPRCasFinder matches to LR606148 (Rhizobium sp. Q54 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
cactatctctggtattggcggatttatcata CRISPR spacer cgagcaacttggtattggcggatttatgata Protospacer *. ..****************** ***
176. spacer 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_014633 (Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tgcaaatttattactttttttataaagtttataag CRISPR spacer tttttcctctttaatttttttataaattttataag Protospacer * . .*. *** ************ ********
177. spacer 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448791 (Streptococcus phage Javan517, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
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178. spacer 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004587 (Streptococcus prophage 315.4, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
tgcaaatttattactttttttataaagtttataag CRISPR spacer atagtatttattacttttttcataaattttctcca Protospacer . ***************.***** *** * .
179. spacer 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_003157 (Streptococcus pyogenes strain NIH1 putative methionine sulfoxide reductase gene, complete cds; and integrated temperate phage PhiNIH1.1, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
tgcaaatttattactttttttataaagtttataag CRISPR spacer atagtatttattacttttttcataaattttctcca Protospacer . ***************.***** *** * .
180. spacer 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448962 (Streptococcus phage Javan496, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
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181. spacer 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448977 (Streptococcus phage Javan530, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
tgcaaatttattactttttttataaagtttataag CRISPR spacer atagtatttattacttttttcataaattttctcca Protospacer . ***************.***** *** * .
182. spacer 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448694 (Streptococcus phage Javan179, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
tgcaaatttattactttttttataaagtttataag CRISPR spacer atagtatttattacttttttcataaattttctcca Protospacer . ***************.***** *** * .
183. spacer 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448788 (Streptococcus phage Javan511, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
tgcaaatttattactttttttataaagtttataag CRISPR spacer atagtatttattacttttttcataaattttctcca Protospacer . ***************.***** *** * .
184. spacer 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448950 (Streptococcus phage Javan464, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
tgcaaatttattactttttttataaagtttataag CRISPR spacer atagtatttattacttttttcataaattttctcca Protospacer . ***************.***** *** * .
185. spacer 9.3|2690202|37|CP016104|PILER-CR matches to NC_025449 (Escherichia phage ECML-134, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
ataataaaacttctattatatctactatatcaatatt CRISPR spacer cactccaaacttctattatatctactgtaccactgat Protospacer . ********************.**.** *. *
186. spacer 9.3|2690202|37|CP016104|PILER-CR matches to KM607002 (Enterobacteria phage RB55, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
ataataaaacttctattatatctactatatcaatatt CRISPR spacer cgctccaaacttctattatatctactgtaccactgat Protospacer . ********************.**.** *. *
187. spacer 9.3|2690202|37|CP016104|PILER-CR matches to KJ477684 (Enterobacteria phage T4 strain wild, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
ataataaaacttctattatatctactatatcaatatt CRISPR spacer cgctccaaacttctattatatctactgtaccactgat Protospacer . ********************.**.** *. *
188. spacer 9.3|2690202|37|CP016104|PILER-CR matches to HM137666 (Enterobacteria phage T4T, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
ataataaaacttctattatatctactatatcaatatt CRISPR spacer cgctccaaacttctattatatctactgtaccactgat Protospacer . ********************.**.** *. *
189. spacer 9.3|2690202|37|CP016104|PILER-CR matches to NC_000866 (Enterobacteria phage T4, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
ataataaaacttctattatatctactatatcaatatt CRISPR spacer cgctccaaacttctattatatctactgtaccactgat Protospacer . ********************.**.** *. *
190. spacer 9.3|2690202|37|CP016104|PILER-CR matches to L13089 (Bacteriophage T4 msp1-msp8 genes, complete cds's) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
ataataaaacttctattatatctactatatcaatatt CRISPR spacer cgctccaaacttctattatatctactgtaccactgat Protospacer . ********************.**.** *. *
191. spacer 9.3|2690202|37|CP016104|PILER-CR matches to KJ477686 (Enterobacteria phage T4 strain GT7, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
ataataaaacttctattatatctactatatcaatatt CRISPR spacer cgctccaaacttctattatatctactgtaccactgat Protospacer . ********************.**.** *. *
192. spacer 9.3|2690202|37|CP016104|PILER-CR matches to X57093 (Bacteriophage T4 orfs between tRNA and e genes) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
ataataaaacttctattatatctactatatcaatatt CRISPR spacer cgctccaaacttctattatatctactgtaccactgat Protospacer . ********************.**.** *. *
193. spacer 9.3|2690202|37|CP016104|PILER-CR matches to KJ477685 (Enterobacteria phage T4 strain 147, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
ataataaaacttctattatatctactatatcaatatt CRISPR spacer cgctccaaacttctattatatctactgtaccactgat Protospacer . ********************.**.** *. *
194. spacer 9.3|2690202|37|CP016104|PILER-CR matches to KM607003 (Enterobacteria phage RB59, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
ataataaaacttctattatatctactatatcaatatt CRISPR spacer cgctccaaacttctattatatctactgtaccactgat Protospacer . ********************.**.** *. *
195. spacer 10.5|2777790|37|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH622943 (Myoviridae sp. isolate ctbc_4, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
tagaacttgaaaagtattcttatgaagttaaatagaa CRISPR spacer aaagtattgaaaaatattcttatgatgttaaatttgg Protospacer *.. *******.*********** ******* ..
196. spacer 17.3|3643018|47|CP016104|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 14, identity: 0.702
atttgcccctgttgctcctgttgctcctgtagctcctgctactccat--------- CRISPR spacer ---------tgttgctcctgttgctcctgttgctcctgttgctcctccagcaggtc Protospacer ********************* *******.*.**** .
197. spacer 5.2|1757635|35|CP016104|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP043858 (Arcobacter cibarius strain H743 plasmid pACIB, complete sequence) position: , mismatch: 20, identity: 0.429
tgcaaatttattactttttttataaagtttataag------------------ CRISPR spacer ------------------cttataaagtttataaaaaatgtaaaataagtata Protospacer .***************.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
277036 : 293217
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP016104|277036:293217|DBSCAN-SWA ATTATCTATTTTTATATACATTTCTATGTATTTTATTTTTATCAAATCGGTCTATAAATTCATTTTTTTCTTCACTATATCCAATAGATATAAGTGCATAAGGAACTAATTTTACTGGTAAGTCTAAAGTTTGTCTAACTTTATTTACTACTTTATTTTTAGGAAATACTCCTGCCCAACAAGCAGCTAGACCTTGATTAGTAACTTCTAATAATAAATTTTGTGTGCAAGCACCTAAATCTTGTATCCACTTACCAGGTTTTAAGAATTTATCTCTATTTCCAAGCACTACTATACATAATGGTGCAAACTCTACATGCTTTGCTCTATGCTGTGACTTTGAGAGCTCTTTCAGTAGTTCCTTATCATCTACTATAATAAATTCCCAAGGCTGAGCGTTTTTTGATGAAGGTGCTTGCATAGCTGACTTTAGTATTTCAGTTATTTTCTCTTCTTCTATATTTTTATCTTTATATGTTCTTATTGAACGTCTATTTTTTATAACTTCTAACATACAGATTCTCCTTTAAATAAAATTATTTCTATTTATATAATATCATTACTTTAAATTTTAGCTATTACTTATATAAAGAATAAACTTTGTATTGGTTTTATCTAAGTAAAGCTAACATTCAGAACTAAAAAACAAGATTATAAATCCAAGGTATTAATTAAAAAAGAAGTAATAAAAAATAATATACAAGATTTTAAAAAGGGTATTGAGCTTAAAATTTAATTAGAAAATCAATTTTGAGATAGTCTGTTTTTTATTTTAACAAAAAAACATAAATAAAGTTCGATACGTAGCGAATGAAAAAAATACAAGAAATATTTTTTTTAAAAAATTTCAAAAAAGAGTTGATAATATATGTATATTAATATAAAATTTAAGGTGTATAATTCGTATAATAATACGAATGATTTAGAGTGTAAAATAACTTATAAACGGAGAGGGGAAGTCTAATGAAAGTAGCAGTAGTTATGGGTTCAAAATCAGATTATCCAAAATTAGAAGAAGGGATAAAACTGCTTGAAAAATATGGAATAGAAGTTGTAGCAAGAGCATTATCAGCTCATAGAACACCAGAACAACTTTCAATATTCCTAAAAGAAATAGAAGATGATACTGATGTAATAATAGCAGCAGCAGGAAAAGCAGCACACTTACCAGGTGTAATAGCTTCACAAACATTAATTCCTGTAATAGGATTACCTATTAAATCATCAACTATGGATGGACTAGACTCACTTTTATCAATAGTTCAAATGCCAAAAGGAATCCCTGTTGCAACAGTTACAATAGACTTAGGTTTAAACGCAGCTTTATTGGCATTACAAATAATGACTTTAAAATACCCAAAATTAAAAGAGGATTTGAAATCATATAGAGAAGAAATGGCACAAAAGGTGTTAGAAGACGACAAGAATTTAAGGGGGTAGAAGAAATGTTATTATATGAAGGAAAAGCAAAACAAGTGTATTCTACAGATAATGAAAATGAATATGTTGTTTATTATAAAGATGATGCAACAGCATTTAATGGAGAAAAAAAAGCAGAAATATCTTCAAAAGGTATACTAAATAATAAGATATCAACAATAATCTTTGAAATGTTAAAAGAAAATAATATAAATACTCACTTTATAAAAAGTTTATCAGATAGAGAAATGTTAGTTAAAAAAGTAGAGATTTTACCATTAGAAGTAATAGTAAGAAATATTGCTGCTGGTTCTATCTGTAAAAGAGTTGGTCTTGAAGAAGGTGTAGTTTTTGATGAGCCAATTTTTGAAATAAGCTACAAAAATGATGCTTATGGTGACCCAATGCTAAATGATGATTATGCAGTGGCAATGAAGTTAGCAACTAGAGAAGAATTAAAATTCTTAAGAGAAGAAACTTTAAAAATAAACGAATTACTAAAAGCATTTTTCTTAAAATTAAACCTAAAGTTAGTTGACTTTAAAATAGAATTTGGTAAGGACTCTGAAGGAAATATAATACTGGCAGATGAAGTATCACCAGACACTTGTAGACTTTGGGATGTAAATACAAATGAAAAGTTAGATAAGGACAGATTTAGAAAAGACCTTGGAGACCTTGTAGAAGGTTATACGGAAGTACTTTCAAGAATGAATAATAAATAGGAGGCAAATGTATGTGTGGAGTTTTAGGGATTTACTCTAATAAAGATGTAACTAAAGAACTATATTATTCTTTATATTCTATGCAACACAGGGGGCAAGAAAGCTGTGGTTTAGCTCTTTTAGATGATGGAGAAATTAAGTACAAAAAAGATATGGGATTAGTTGGAGATGTTTTTAAGGAAAATGAATTATCTAAGTTAAAAGGAAATATAGGGATTGGACATGTTAGATATTCAACAGCTGGAGGAAGTCATGTTTCTAACTGTCAACCTTTAGTTGGAAGTTGTAGAAAAAGACAATTAGCCATAGCTCATAATGGAAATCTAGTTAATGCAAATTATTTAAAAGATATGCTAGAAGAAGATGGATATATGTTCCAAACTAATTCAGATACAGAAGTGATTTTATATATACTTGCGAGATATTACAAAGGGGATATAGTAGAAAGTTTAAAAGTGACAATGGATTATATAAAAGGTGCATATGCTCTTGTAATAATGAGTCAAGAAGAATTGGTTGCAGTTAGAGACCCACATGGATTCAGACCTCTTGTACTTGGTAAAAAGGGTGATGAATATATATTTGCATCAGAAAATTGTGCAATAGATATACTTGGCGGAGAAGTTATAAGAGATGTAGAGCCAGGAGAGATAATAGTAGTTAAAGATGGAGAACTAAAATCATATTTTTATTCAGAAAATTATAAACCAGTTAAGAAAAGTTGTATATTTGAACACATATACTTTGCAAGAAATGATGCAACTATAGACAATGTAAATGCATATGAATTTAGAATTAAATGTGGTGAGAGATTAGCTCAGAATGAAACTGTAAAGGCAGATATGGTAGTTCCAGTTCCAGATTCAGGTTGGCCAGGAGCTATTGGTTATGCAAATGCTAGTGGATTAAAAATAAGTGAAGGCTTAGTTAAAAATAGATATGTAGGAAGAACATTTATAAAACCTACACAAGAAGAAAGAGAAATAGCAGTAAAAATAAAATTAAATCCTCTTTCAACAATAATAAAAGGAAAGTCTATAATTTTAGTAGACGATTCAATTGTAAGAGGAACTACATCTAAACAGTTAGTAAAATCTTTAAGAGAAGCAGGAGCAAAAGAAATTCATCTTAGAATAACTTCTCCTCCAGTAGCTTACTCTTGTTACTATGGAATAGATACTCCAAATCGCTCTAAATTAATTGCATCAAGTAACAACGTAGAAGAAATGAGAGAATATATTGGATGTGATAGTTTAAAATTCCTAGATATAGAAGGAATGTTAGATGCAACAGAACATAAGTCTACTTTCTGTAAAGCTTGTTTTGATGGAGAATACCCAGTTAAGAAAATTGATAAGGAGGAACTACTTTCATGTTAACATATAAAGAATCAGGTGTAGATATAGATGAAGGAAATAGAGCAGTAGACCTTATAAAAGGTAAAATAAAAGGAACTTATGATGGAAATGTAGTTGGAGATTTAGGTAACTTCAGTGGATTATACAGTTTAAAAGATTTTGTAGGTATGAAAGAACCAGTTTTGCTTGCATCTACAGATGGTGTTGGGACTAAGTTAAAAATAGCTCAGATGATGGACAAGCATGATACTGTTGGAATAGATTTAGTTGCAATGTGTGTGAATGATTTAATTTGTCAAGGAGCAAAACCATTATTCTTCCTTGACTATATAGCTCTTGGGAAATTAGTTCCTGAGCATATCGAAAAAATAGTTGGTGGAATTGCAGATGGTTGTAAAATGTCTGGTTGTGCACTAATTGGTGGAGAAACTGCTGAAATGCCTGGAATGTACGGAGAAGATGACTATGATTTAGCAGGATTTTCTGTAGGAATAGCAGACAAAGAAAAGATTGTTTCTGGAAACAACGTTAAATCAGGAGATGTATTGGTTGGTATATCTTCAAGTGGAGTACACAGCAATGGATTTTCTTTTATAAGAAAGATATTTTTAGAAACTTACAATTATAAAATGGAACAATATGTTGAAGAACTAGGAATGACAGTTGGAGAAGCACTTTTAACACCAACTAAAATATATGTTAAATTAGCTTTAGATGTATTAGCTAAACATGACATAAAAGCTATAGCTCACATAACTGGTGGAGGGCTTATAGAAAATATAACAAGAGTTATACCTAAAGGGTTAGGACTAGATATCAATAAAAAATCTTGGGAGAAGCCTCCTATATTTAAAATGATAGAAGGTTTTAATGCTGTTGATGAGAGAGAACTTCATAAGAGTTTTAACATGGGTATTGGGCTAGTTTTAATAGTAGATAAAGAAAATGCTGATGATGTTGTAAACTTTATAAATAATAGAGAAAATGACAATGCTGCTTATGTAGATAAAAAATATAGTGAATTATTAGAAGATAAAGCGTATATAATTGGTGAAGTAGTAGATAGTCATGAAGGTGTAGAATTATGCTAAATATAGGAGTTTTAATATCTGGTGGAGGAACAAATTTACAAGCAGTTATAGATGGGACTGAGTCTGGAGAAATAAAAGGTCAGGTTAAAGTAGTTATCTCAAGTAAGCAAGGTGCTTATGGGCTAGAGAGAGCTAAAAATCATAACATAAAAGCAATTTGTGAAACTGATGAAGACAAGATAATAGAAATTCTTAAGGGAAATAAAATAGATTTAGTAGTTTTGGCTGGTTATTTAAAAATAATCAGCCCAAAGCTGGTTAATGAGTTTAGAAACAAAATGATAAACATACATCCATCATTAATTCCTTCATTTTGTGGAGCTGGATTCTATGGAGAAAAAGTTCATCAAGGTGTTATAGATTACGGAGCTAAAGTAACTGGTGCTACAGTTCATTTTGTTGATGAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP016104|277036:293217|279190_280558_+|AXU48544.1|DBSCAN-SWA MCGVLGIYSNKDVTKELYYSLYSMQHRGQESCGLALLDDGEIKYKKDMGLVGDVFKENELSKLKGNIGIGHVRYSTAGGSHVSNCQPLVGSCRKRQLAIAHNGNLVNANYLKDMLEEDGYMFQTNSDTEVILYILARYYKGDIVESLKVTMDYIKGAYALVIMSQEELVAVRDPHGFRPLVLGKKGDEYIFASENCAIDILGGEVIRDVEPGEIIVVKDGELKSYFYSENYKPVKKSCIFEHIYFARNDATIDNVNAYEFRIKCGERLAQNETVKADMVVPVPDSGWPGAIGYANASGLKISEGLVKNRYVGRTFIKPTQEEREIAVKIKLNPLSTIIKGKSIILVDDSIVRGTTSKQLVKSLREAGAKEIHLRITSPPVAYSCYYGIDTPNRSKLIASSNNVEEMREYIGCDSLKFLDIEGMLDATEHKSTFCKACFDGEYPVKKIDKEELLSC >CP016104|277036:293217|289032_289905_+|AXU48550.1|DBSCAN-SWA MKILITGCNGQLGKELVNQLKSINQSMNQPKYTILATTRDDLDISNQTNVDNFIFHNKPNVVINCAAYTKVDACEDNIEVAYKINSLGVRNLVIASEKVNAKFVHISTDYVFNGFSKYPYREDNKTEPNSVYGKSKLMGEKFVEQFSHKYFILRTAWLYGDGNNFVKTMIKLSLENKEVNVVNDQFGSPTSTVDLAKVIIRIMETENYGVYHATCEGQCSWYDFAKKIFELKKINIKVNPIKSNDFKSNVQRPQYSVLDNFMLKLIGLNSFRAWEESIEEYIKTYDIDRK >CP016104|277036:293217|290014_290884_+|AXU48551.1|DBSCAN-SWA 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14 | Synechococcus_phage(23.08%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
662412 : 706408
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP016104|662412:706408|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP016104|662412:706408|700401_700797_-|AXU48903.1|DBSCAN-SWA MNILKMKKTGIFLGGVLFGTVGVKILSSDCVKKTCTRATAGALKVKDSVLETTTKIQENVEDILAEAKEINEQEDLSTSKVNVVQDTSKYEQEVIKTETIKTAEDTNSNSIKCEEIKDNVIEEKNSTCTTE >CP016104|662412:706408|684733_686173_+|AXU48893.1|DBSCAN-SWA MKRKPQYLIIFEHIIQQIYTGKITIGDRLDSIKSMSEEYMVSKNTIKTVIKMLSEKGFIETKVGSRPVLIQSTSKQSIESDLLYEKILQISEIYKIFSLIFPSIAMYNVKRFTSKDFEELNEIIDCMEKNSSNYLIFREQRLKYINKLISKTNNFLIYHFCEIIQHDMIISQLAYSFDNLDNCCIDFFRNKYIEQIRKTYLYGLDGNLIELKKLLTYIYKACRESILKMVENRAPQSRDTSSFNSVTLEKCYLYDLIVSDVICQIFEGNIKIGDCLPSITSIINRYNVSLPTVRSAYNELNELGIAKTINGKGTYITLFSEYDDDYINTEEGAKRLRLLLDAMEFVTITLEDVVFLLGNKMDLIAVDKIETHLRYLQNNCKECKVYPDFVLLCKIVDYTQIYILQETFLHLKQYMIFGIYLERFFHEEYNEILKTRFDVCFDILRYLKKGDVESFAESFSNIFKESLQYLKKVISSLNR >CP016104|662412:706408|668835_670176_+|AXU48882.1|DBSCAN-SWA 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34 | Streptococcus_phage(22.22%) | coat,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
781268 : 852556
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP016104|781268:852556|DBSCAN-SWA 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57 | Bacillus_phage(23.53%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1482106 : 1506485
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP016104|1482106:1506485|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP016104|1482106:1506485|1485831_1486029_+|AXU49598.1|DBSCAN-SWA MFKNNLKYYRKCKGMTQIQLARKAGITNDYISQIERGIKNPGLLMAKKISSILEQNIEEVFFIQL >CP016104|1482106:1506485|1482727_1483156_+|AXU49593.1|DBSCAN-SWA MNILFFLTPKSEVAYIYEDYTIRQALEKMEYHKYSAIPIISKDGKYVGTITEGDFLWTLKNDLNLDLKGLEDVPVTDINRKMDNSPVSINADIEDLVIKSLNQNFIPVIDDQDTFIGIIKRRDVIGYCYEIIRGYKNLANDN >CP016104|1482106:1506485|1503547_1503808_+|AXU49615.1|DBSCAN-SWA MDKLITELSSLGAIGILCALLFKNTMQEKKEDRDMYKKTVENFIELSTQQQEINKNILVQMGIMKTDVEEIKEDVTDIKGMLQNGV >CP016104|1482106:1506485|1496675_1497662_+|AXU49612.1|tail|DBSCAN-SWA MEEKFYIILTKIGREKIANATALGELVGLTKFQVGDSNGEYYEPTEEQTALKNVVWEGNINSLRIDEKNPNWIVIETILPGTVGGFMIREAAVLDNENNIIAIGKYPETYKPRAEDGSIKDLVVKMILQLSNTSNVTLEVDPTLVFVTQKDIQDLDDKFDKNIKEIKVKIGDTDILTTDSKDLSGAINEVVKKIENISFDDVISGQIQTDISVLKNSYNKLSEKVLDILIYLELESEVTVDEAGYWYDTLANGNNIVAIEGLKLDLNRKCITGEIGNVIFRDVVLPFSANRVRYIHDMDNNFVETKSSNTYLKEQKDITLSKYSYEIR >CP016104|1482106:1506485|1494506_1494935_+|AXU49609.1|DBSCAN-SWA 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29 | Clostridium_phage(54.55%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1588223 : 1597952
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP016104|1588223:1597952|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP016104|1588223:1597952|1588223_1588808_+|AXU49691.1|DBSCAN-SWA MILMIDNYDSFVYNLVQYIEELGETVVVKRNNEIKISDIEELNPEVIVLSPGPCSPKEAGICIDVVEHFKGKKPILGICLGHQTIGHVFGGDIIKAQQPVHGKVYSISHTNKGVFSGLKNPLNVTRYHSLIIDSNTVPKELEITATTDKGEIMGIRHKKYLIEGVQFHPEAILSEYGHEMLKNFITEARERVHM >CP016104|1588223:1597952|1591652_1592225_+|AXU49695.1|DBSCAN-SWA MNKVDKEKIQHAVREILEAIGEDPDREGLIETPNRVARMYEEIFSGLSEEPRDHLKVLFADEKHEELVLVKDIPFYSCCEHHLVPFFGKAHIAYLPKGGRLTGLSKLARVIDTLAKRPQLQERITKNAADIIMEELQPYGVLVVVEAEHMCMTMRGVKKPGSKTVTSAVRGIFEKDIASRAEAMSLITMK >CP016104|1588223:1597952|1593937_1594723_+|AXU49699.1|DBSCAN-SWA MKENLFNNNSKIEINTNNKKITVKKDKLIIAGPCAIESYEQLLETAKFVKSQGANILRGGAYKPRTSPNSFQGLKKEGLEILKAVKDEVGMAVITELMDVRDMDELYSISDIIQIGSRNMQNFTLLSEVGKQNKPVMLKRGIASTITEWIGASEYIAIEGNSNIIMCERGIRTYNDYTRNTLDLAAVPIIQKETGLPVVVDPSHATGVRYLVKPMSLASFACGADGIMVEVHPDPENALSDGAQSLCFNEFEDLMKSINNY >CP016104|1588223:1597952|1593092_1593458_+|AXU49697.1|DBSCAN-SWA MDKILLSNLGFYGYHGVLKEENFLGQKFFVDMELYIDSREAGLSDDINKSVSYAEVYNVVKDITENKQFNLLEALAENIAEEVLNKFILINGVMVRVRKPEAPVNGIYDYFGVEIRRTRDE >CP016104|1588223:1597952|1592290_1593082_+|AXU49696.1|DBSCAN-SWA MFDYGKRTYIMGILNVTPDSFSDGGDFNNLDIAIQHAKDMVDQGADIIDLGGESTRPGHSYVDSEEELRRVIPVIKKLKQELDIPISIDTYKADVAEEALKLGVTMVNDVWGLRRDKNMASVIGKYDAEVCIMHNQDGTNYDKDIIASIKEFLKESIEMAISCGVKKEKIVLDPGIGFGKDFEQNIEVLRRLNELKDLGYPILLGTSRKSVIGKVLPVEPKKRLEGTIATTVLGIRDGVDIVRVHDVYENLMAARMTDAIYRK >CP016104|1588223:1597952|1593450_1593957_+|AXU49698.1|DBSCAN-SWA MNKVYLGIGTNMGDRFDNLSRACELLKNSDSIYKVKESSLYETKPWGYTEQADFLNMCVEIETEFEPYELLEYCQEIERELHRERIVHWGPRTIDVDILFFNDVVSTDEKLTIPHPRIQDRAFVLIPLMDLNEELIINEKTIKEHLNLLSAEEREEVKELVGYERKPI >CP016104|1588223:1597952|1594977_1596768_+|AXU49700.1|DBSCAN-SWA MNDIKDIIEEIKARCDIASIISEYMNIKQSGANYKGLCPFHGEKTPSFYINTSKQIYKCFGCGEGGDVINFVMKMENLDFMDAVKILANKCGIEINTNMNEETRIKIEKSKKFQDIHTEAARFYLSNLLGSKNLGYEYLRIRGLDDKIIKKFGLGFSLDSWNSLMNTLISKGYKKQDLLECGLIAKNRDGTNCYDKFRNRVMFPIFDYRGNIIGFGGRVLDDSLPKYLNSPDTLIFNKKQNLYGLNFARKNLESKTIVLVEGYMDLISLYQYGIKNVVATLGTALTEQQGILIKRYADTAIISYDSDEAGIKATLRAIDILTKLGINVKVLDLKDAKDPDEFVRKYGLSDYKKAMDVSTHYIKYKIDHLKKEFNIQKDEERVKFAKEASKIIKQLTSPVEIDFYTKYLSNQIDINVESIKREVYGKNYNKPYNNKNQKKIEEKVIEKVEVRQDGKQLVEETLIKIMLEDKKIREIALLKVEESDFLLKESKEILNYMIKNQELDKITIDKLKSLNISEEYLKELNSISLNSINLENTKEIEGIITNIRKNSLEEQINSLLREQQELENNNDMKEVDGRVMEIALKIVEINKILKSL >CP016104|1588223:1597952|1596785_1597952_+|AXU49701.1|DBSCAN-SWA MENKSNKKELKKVTAKTLIEKGKKQGSLTLAEIMEAFSETELDKDQVENLYETLGNLGIEITETKNYKADIDFSVADDDLSIGHLDEDAEAISHDDSSAIEIETVDLSLPKGISIDDPVRMYLKEIGKIPLLKPHEEVEFARRMHEGDEIAKQRLVEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNLGLIKAVEKFDYTKGYKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVSRQLLQELGRDPKPEEIAKEMEMTEDKVREIMKIAQDPVSLETPIGEEEDSHLGDFIPDDDAPAPAEAAAYSLLKEQIEDVLGSLNDREQKVLKLRFGLEDGRARTLEEVGKEFDVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKKLRDYLD >CP016104|1588223:1597952|1590148_1590892_+|AXU49693.1|DBSCAN-SWA MKNNVGFDSSLSKFGIGLFETIRVKNGIAIDLNIHIERMISSINCLDLDINYKKDFLINEIVTYIKKENVINKALRITVFDEGYNISIRDIPYNQETYEKGFKLAISPIVRGNSLIHRHKTTNYFENIYTKNIANKTGYNDGIFLNSEGVILECSMSNIFFIKGERVCTPSDRLPILNGIIKKRIIEICDELHIELIENEINISEISSFDFVFVTNSLMGAIKVTEIDKIKFNKENVVFDKIVKLLE >CP016104|1588223:1597952|1588809_1590159_+|AXU49692.1|DBSCAN-SWA MIREINTKLNSFEIFTIFRNEHDSFILDSAMDKEKLGRYSFISSQPFKVLKYKDTDENPLEVLKEELHKYRVANDTNLPFVGGAVGYLSYDLGNYIENLPRTAVDDIEMPDMYFGFYNHVIVIDHLVQKTYIATPNIDIELEEKIMDDIEQRILKEEKKGIDSICYEEKEVTPIRLKSNFTKEEFKNAVQSVREYIRQGDIYQANLTQRFSGETELTSFELYRDLRRFSPAPFGAFLNFEDTHILSNSPERFIKCVNKRIETRPIKGTRPRGKDKEEDLKLQQELRNSEKDRAELLMIVDLERNDIGRISKTGSVKVPELFVIEPYANVNHLVSTVVGELKDDKDATDVIKATFPGGSITGAPKIRAMEIIDELEPTQRNVYTGSIGYIGFNGDMDFNIAIRTIIKNDKKVYFQVGGGMTWDSDPDEEYQETLDKAKSIMKALRGYYEE >CP016104|1588223:1597952|1590925_1591627_+|AXU49694.1|DBSCAN-SWA MIGCIYEVYNEEMTKIIENQNTLAVYLVGSSKDVDFTLYDVEINDIDVFVFVKEGEKQERILFKKKGIEFDINYFSKDGVKKLLSNREYFFVKEMKDAKVLFDRENISHIIKDISRNIYLEGPSKISLEEKSFIKQDIGAKISNLKNKEKFDGFEYHFLTNLYLKDIIIGYFNINDKWVPKDKKLLKVLKKENNELFELVSKVSENYDYQRLLDVYNYIFKEIETKEVIKLIF |
11 | Pandoravirus(37.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1723415 : 1779990
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP016104|1723415:1779990|DBSCAN-SWA 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MVDELVLANDRDVRLVIAHWEDFYEPAVIDGITWEIERRGTPSKLEFTIVMDDILEFCEGNSVRLYYKGIGIFYGYIFQKKRDKENHIKIVAYDQLRYFKNKDTYVYSNKTASELVKMLAKDFNLKYNVIEDTKYKLSRVEENKTLFDMILTALDDTLREEKEMYTLYDDFGRITLKNVASMKLDTVMNNDVIEDFDYNSSIDSDTYTKIKLVRDNEESGKRDVYIAQDSTHMRSWGILQMFETVDKNMNEAEIKQKCDILLKLYNKKTKSLSLKNALGDIRVRAGCLVPVFLNLGDIELQNYMLVEKVKHTFENNSHFMDLTLADGDEFASYSSSSYSSGNTNNKNEKQNGPAQSTTSKEDNDMINKLNKVFKNKLSNTGNIFVKYSNAYKVNAALMAAISIHETGNGSSSLCKNKNNFFGMKGMSFSSVDEGIKKGISNLSRNYIHIGRKTLERIRDKYAPLYDSPLNKDWVPGVGKFYKQITGSTYTSNNAGTGVGSNEEAEKNLKDTTYQVQNNNSNTSTNNNSKVSKVIQEAKNQLGKPYAWGGNGPKSFDCSGLMVWAFKRGAGINLPRVSADQSKDSRGKLLCNINDVKAGDLVFFKNEQGKVHHVGLYIGNDQYIHAPQTGDVVKISSLSGRQKKKHDFARARRFF >CP016104|1723415:1779990|1773063_1773255_+|AXU49871.1|DBSCAN-SWA MTFKELVNKVRNLVLEAKNVTIEDTENNFTSDNVEGALKELSVEVNGQRAKGITIANNLIDMI >CP016104|1723415:1779990|1732743_1733181_+|AXU49825.1|DBSCAN-SWA MVEVNVNVKVKVEAPEFTNALLVVANALGGLNLGKAMQIEPINITDMKEEKKVEVKKAEKIKKVEVKEDVKEEIAEAKEEIEKNNENTTSEVKYTKEEVRTKAAQVSKAGKKDKLKELFGEFGASKLSEVKEEDYSAFMNKLESL >CP016104|1723415:1779990|1730046_1730226_+|AXU49819.1|DBSCAN-SWA MNSNKKRITVRMPEKLNEEITKKSKYLGLTKNSFILDILWKEFELLEYRSYKKEVDKHE >CP016104|1723415:1779990|1733192_1734359_+|AXU49826.1|DBSCAN-SWA MPLQHARLSASGAHRWLHCTPSIKLEENYPPSTSIYAEEGTVAHELAEVKLMLEYEKISKKAYNARIKKIQKSEYYNSEMEDYIQSYVENVVELVNDSKAICDDVIVMLEERLDFSEWVPEGFGTGDVVVISDGILQVIDLKYGKGLEVSAIENPQLRLYGLGAYNQFEMLYDIDLIKTTIIQPRLDNISSEEIEVTKLLTWADNVKKKAQMAFNGEGEFVSGSHCGFCRAKNDCRKRAEDNLKLARKYDFADTFALNKYEIADILGFAKNIQDWLKDVQSYALEQAEKHGVKYPGYKLVEGRSNRKYVDEQEVAKVLLNSDYDEEKIYKPRTLKGISDMEKAIGKKSFAKLLSDLIIKPVGKATLVVESDKRSEINSIDSAKKDFEI >CP016104|1723415:1779990|1759976_1760819_+|AXU49857.1|DBSCAN-SWA MKTNLELIKSENFGEVECNFYENDTKDILMTREQIGMALEYTEPRIAISKIHERNKDRLDKFSTVVKLVTVEGNREVLRDTIVYNTKGVMEICRFSRQPKADTFMDWVWDVVESIFKTGAYITNNANPEKLREKASEIEKLQLAYNSTSMLKELLDGAGFDNKSKLLTAKTLYKKAGIDLPIEIEEEESFFDTKQIASKLKIYSKSNKPAQLAVCEIIKKIDLEENEVKGVWETNGSWTGTVNKYTKSVIDKIRNWIEENNRPTKIQGEKKNYHVVYKIE >CP016104|1723415:1779990|1753807_1753993_+|AXU49851.1|DBSCAN-SWA 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70 | Clostridium_phage(84.75%) | head,portal,tail,capsid,terminase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2103853 : 2110045
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP016104|2103853:2110045|DBSCAN-SWA TTTATAATTTATCTATTTCTTGTAATGCTAATTTAACAGTTTCATATCTATCAGCACCATTTATTACTACATCACCTTTTACAAGTTTATTAGCTTCTCCACCTACAACATAAACCTTTTTACCTAAACCTTGCTTATAACTAGACGCCTCAATTATTAAAGAATCTTTCAATTGCCAATGTAAAATCTGAGCAGCCACTTTATCAGCATCACCTGTATAAACGATTACATTTTCATACACTTTATTTTCCCCTCCCCCTTGAGAATTTGATATAGATTTGTTTAGTATACCTTCTGCTATCAATTTAGCAACTTTATCTTTATTATTAACATAATAATCTGTATCTGCTTTACTATCTACAAAACATACTTCTATTAATATTGCTGGTGCAATAGTATGATTAAGCCAATAAAGGCCTCTAACATCAGACTTTGCACCCCTATTTTTGAATACTGTAGCTAACCTAGTATTCACTCTTTCTGCATAGGTTTTGCCATTATTAGTCTTATATATTGTTTCTGTCCCTACTGGAGTTGAAGTTGTGACATTTGAATTAAAATGAATCTGAACAGCCAAATCAGTTTCCTGTTTATTTGCTATAGCACATTGGTCTGCTAAATGATTACTTGATTCATCAACTCTTCCTGTATAAACAGTAGCTCCACCTATTTTAAGCCATTTAACAATTAAGTCATTCAGTATTCTTGTTTCTTTGCTTTCGTTTATATACCCAACAGCTCCTGTACCTTTTCCAATTAAAGTGTGCCCTGGTATTATTACTACTTTCAAACTAACATCTCCTTTACAATTAAATTTAACTTCTATTTAATATATGCATAAACTAGAATTTTGTTTCTTTTTATATCTTATACTTTTATTATAACCCATTTTGTAAAAATATAGAATATTAAGTAAATAATGTTAAAATTATAATTTTGTATATAAAACATTACTTGATTGCAATAATTTTATAGCATATTCATCTATTCTATATCCAGTTCTATAATATATATGTTTAATTCCAGCTTGAATTATAGCCTTAGTACAATTTAAGCAAGGAAAGTGAGTTACATAAATAGAGCAATCTTTAACTGAAATACCTTCTTTTGCACAATAATAAAGGGCATTTTGTTCAGCGTGAATGGTTCTAATACAATGTCCATCTCTCATTTCATGACCAACTTCACTACAATGCTTATCTCCAGAAATACTACCATTATATCCAGTAGATACTATTCTGTTTTCTGAATTGACAATTATAGCTCCTACGTAAGCTCTATCACAAGTTCCTCTTTCAGCTACTGTTTCGCACAGTCTCATAAAATATTCTTGCCATGAGCATCTATTTTCAAGTTTTTTATTCAAATCATATACCTCCAAAATTTATATCTAATATATAGGATTTATACCTTAAAAATAATATTAAAAACAAATTTATACGATAAATAAAATTTATTAATACTGTTTTTATTCTAAATTATTTTACTTTAAATTAAAGTTACAAGGAATCTAAAATTATATATATCTTTCTTTGTAATATGAATGTTATAATATAAAAAAACTGTCTCAATAAAATAGAGACAGTTTTACAGTCAAAGTTTATAATACAAGTTCATATTTTTCTTTAAATTCTTTTACAGCTTCGGGCCATGCCTTTTGTTCTGTAATACCTTTTTCTTTAGCTATTTTAATTGCAATCTCTCTTATCATTGCAGCGCCTTCTAATATTCCCATTTTTAATCTCCCTTCAAATATCTTTTTGTATAGAATATAAATAGTGCTAAGATTTATTACATGCTGCATATACAATATCTATACAACACATAACTTATAAATTCCTTTTATTTTCATACGTCTTTAACCGACATATAATTATATTCAATAAGTTTTAAAATTATGAACTCAATTATAATTATTTTTATTTTTTTAGAATCTAAACACTAAAAATTGTAGGTAAATTTGTCTTATGCCTTTATAAATATTTCTACAGTTTTAATTATTGTACATATCTATTTTTATTATAAAAAATGCTTAAAAATCGAGAACATACGCATAAACACTGTATATAAGCAAAACGGTTAAAGGAAAAAGAAGAAATTTACAGAATGGTTCGAAAAGCCCACTCCTTTAGGGGTGGGATGGATAGCATAAATAGTGTATAAAAAGTATTGATACATACACATATAATGTTAATATAAGTATATGGAGAATAAATATAGAAAAACTCAAACAAATGTCAGTTTAATTAATTATCACTTTGTATTCTGTCCCAGATATAAAAGAAAAATATTTAATATAGAAGGCTTAGAAGATAGGGTATTCAAAGAGATTGCTATTCTGCATTTTTTAATAATGAATGTTAATGATGATTTAAAGTCAATCAACAGAGAATTGTGTGTTAAAACATATGATAACTTTAAAATATTACATGATAAAGAAATAGATAGGCTAAAAGAATTAAAATTAAATGGTTATAAATTAATATCTAGTATGGGGATATAAAAACTCTATATAGATTGGGAAACGAGCCTAATATTAATGTTAATGGTGTCAACAGATACTTTGTTAATAGAAGTCTTAGGGAATATGATTAGTGATAATATATTGTAAGTTATGATTTATTATAACTGAGAGTATTGTAGAAATTCATGTAGTATATAAAAACCCTACACCTTTAAGTGTGGGAGTTTCAGTTGAATGTTAAAATGCGTTGCTTGAAGCAACGGGCAGTTTTGCCTATAATAGCGGTAACAACTGAAAGAAAGGTGGTTATCCCTAATGTTAAGCGAAAACATTAAAACAATCAGGAAGTCAAAAGGACTTTCGCAACAAGAACTTGCTATAAAATTGAATGTAGTACGACAAACAATATCTAAATGGGAGCAAGGATTGTCGGTTCCTGATTCTGATATGTTGATTTCCATATCAGAGGTACTTGAAACGCCGGTAAGCACTTTGCTTGGAGAAACTATTGTTGAGTCGGAAGTTGATAACTTAAAAGTGATTTCTGAAAAATTAGAGATTATAAACTTGCAACTTGCACAAAGAAAAAACATGAGAAGAAAAATGTTTCATTGGTTATTTATTTTATTATGTGCAGTCATAGTAATAGGTTTTTTGGTCTTAGGGGGACTAAATAGTCCTTATTTGGATTGGAATTATACTGACCCTGAAACCGCTGTTTTTGGAGTAGCTTTTCATGCGTTTGAGTGGCTATTTGTCAGATTAGCACCGATTGTCCTTATAGGGGCAATTATTGGAAGCTTTTTGACACGTAAGAAAATATGAAGACATTCTGCTTTCTATAATACAGCAAGCGTTACTTAAAAGCGTCATCCTACATGACATCGAGGACGATTATGTAAGGAAGAATCTTTTTGATTTCCAACTAAGCGAAGTCATTGAGGACGACAACAAGCCCAAAACCGTATTAAGTGAAGTACAGGAAGCAAGACTGCTAGACTTATACGCCCATGCGTCAGAGGCAAAGAAATGCTAAGTCTGATAGCATGATTTACAACGATTTGTACAACGATTGCGAGTAGAAATATATTATAAAATTAGAAAAGAAATGACTTGATAATTTATCCATGTTATAATTATTGATGTGAAATTAATAAATCGAAATTCCTTTTTTAGATTTAACAATACTGAGTAAGGAAAAAGTGAATGACTTTTGCAAGGAGGTGTTAATATTAGACAAGTAAAGTCTTTTGTTTTTCCAGTTATATCCTTAATATTCTTAGACCAAATTAGCAAAGTTCTTATAGGATTATTCTTAATAGACTTTGAAATTGATATAATTGGGAAATTTTTAAGATTCAATCCTGTTCAAAATACAAATCTCTCTTATGGGGGAAACTTTATTGGTATTCTATCTAATTTATGGGTATTGGTATTGTTTAACATTTTAGTTATCCTAGTTATTATATCTGGATATGCTTTTTACAAATCAAAAAATGAACAAACGAGCTATTCAGTAAAAGTAATTATGTCTTGTGGACTTGCTGGTACAATATGTAGCTTGATAGATAAATTATTTTGGGGAGGAAGTTTAGATTTTTTGCAGATACCAAGCTTTTTTATTTTCGACTTAAAAGATTGCTATCTTACTGTTGCAGAAATAATATTTGTTATCATAGGAATTTTACATAGTAGAGAAATATCAATGAAAGAATACATATATTTTTGCTATCGTCAGTTTAAAAGATAATTTTAGAAGATAAATTTAAGTTTCAAGGTAAACTATTTAATCACAGCAAATAGTTGGCTCACTTCAGCTTTTGGGCTAAACTGTGAGCACTCATTAGGTCTCTGCTATCTAACAAACGGAGCACAAAACGGAGTACAAAAATGAAAATTAAATATTGAATATAAAACACAGTTAATTTTGATTAAAAAGTTGGCTGTTTTTTCTTTTGTAGAAATTTAAGCATAGGTAATAAAAAAATAACTGTATTTATGTATAATTGGAGGCAATAAAAAGCCAGTAAAACCCATAAAATAGGGTCATACTGGCAACATGGTAAGTTTATAAGAAGATAATCAAAAATTTACGCTTTATTTTAATTTAAAAAAATGATTACTTTAAAGAAATCATTTTTTATTATAATCACTGAGACATCAAATACTCTAAATAAAATTTTTACTTATCTGGAATTGTATATTTTTTCTATAATATTAACTACAGCGTACATTGCCCATGCACAGATAGCCAATACAAATACTCCCATCATTACTAAATCTAATTTAAATACTTGAGAACCATATACTATCAAGTAGCCTATTCCATATCTTGAAACTAAAAATTCTCCAACTATTACACCTACCCATGCCATACCAATATTAATTTTAGTTAAATTTATTAAATTTCCTGTGTTTGCAGGTAATATGAGTTTAAATAATATTTGAGATTTACTAGCTCCAAAACTCTTTAACATCTTAATTTTTTCTTCATCTATATTCATAAAATAATTATAAGCTGAAAGTATAGTAACAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP016104|2103853:2110045|2106055_2106355_+|AXU50182.1|transposase|DBSCAN-SWA MENKYRKTQTNVSLINYHFVFCPRYKRKIFNIEGLEDRVFKEIAILHFLIMNVNDDLKSINRELCVKTYDNFKILHDKEIDRLKELKLNGYKLISSMGI >CP016104|2103853:2110045|2105452_2105587_-|AXU50181.1|DBSCAN-SWA MGILEGAAMIREIAIKIAKEKGITEQKAWPEAVKEFKEKYELVL >CP016104|2103853:2110045|2107529_2108066_+|AXU50184.1|DBSCAN-SWA MQGGVNIRQVKSFVFPVISLIFLDQISKVLIGLFLIDFEIDIIGKFLRFNPVQNTNLSYGGNFIGILSNLWVLVLFNILVILVIISGYAFYKSKNEQTSYSVKVIMSCGLAGTICSLIDKLFWGGSLDFLQIPSFFIFDLKDCYLTVAEIIFVIIGILHSREISMKEYIYFCYRQFKR >CP016104|2103853:2110045|2108502_2109303_-|AXU50185.1|DBSCAN-SWA MRLNKRSEGYINYVKGVKREKRNVLFYQLLILIGFIVIWELLADLNVINTFLFSKPSDIYNLFIQYAFSGQLFKHIGISVYETALGLVIGTVLGILVAIALWWSEKLSKILDPFLVVLNALPKTALAPIIIVWVGAGIEGIVVTAVTISVVVTILSAYNYFMNIDEEKIKMLKSFGASKSQILFKLILPANTGNLINLTKINIGMAWVGVIVGEFLVSRYGIGYLIVYGSQVFKLDLVMMGVFVLAICAWAMYAVVNIIEKIYNSR >CP016104|2103853:2110045|2103853_2104642_-|AXU50179.1|DBSCAN-SWA MKVVIIPGHTLIGKGTGAVGYINESKETRILNDLIVKWLKIGGATVYTGRVDESSNHLADQCAIANKQETDLAVQIHFNSNVTTSTPVGTETIYKTNNGKTYAERVNTRLATVFKNRGAKSDVRGLYWLNHTIAPAILIEVCFVDSKADTDYYVNNKDKVAKLIAEGILNKSISNSQGGGENKVYENVIVYTGDADKVAAQILHWQLKDSLIIEASSYKQGLGKKVYVVGGEANKLVKGDVVINGADRYETVKLALQEIDKL >CP016104|2103853:2110045|2104780_2105218_-|AXU50180.1|DBSCAN-SWA MNKKLENRCSWQEYFMRLCETVAERGTCDRAYVGAIIVNSENRIVSTGYNGSISGDKHCSEVGHEMRDGHCIRTIHAEQNALYYCAKEGISVKDCSIYVTHFPCLNCTKAIIQAGIKHIYYRTGYRIDEYAIKLLQSSNVLYTKL >CP016104|2103853:2110045|2106631_2107141_+|AXU50183.1|DBSCAN-SWA MLSENIKTIRKSKGLSQQELAIKLNVVRQTISKWEQGLSVPDSDMLISISEVLETPVSTLLGETIVESEVDNLKVISEKLEIINLQLAQRKNMRRKMFHWLFILLCAVIVIGFLVLGGLNSPYLDWNYTDPETAVFGVAFHAFEWLFVRLAPIVLIGAIIGSFLTRKKI >CP016104|2103853:2110045|2109292_2110045_-|AXU50186.1|DBSCAN-SWA MNDNIVEVKNINMNFYTKEGELEVLKDVNFNLKEGEILTLLGPSGSGKSTILNILTNLLKPTSGDIKITGNIGYMFQKDNLLEWRNIMDNITIGLEIQGKKDKKSLDRVESLLKTYGLWDFRSMYPKELSGGMRQRVALIRTLSVNPDILLLDEPFSALDYQTRLLVCDDVYSIIKNENKSTILVTHDIGEAISISDKVAILSKRPATIKNIYDIELNMDGTKTPLKTRKVPDFQKYFDILWKELDTHEA |
8 | Clostridium_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2518875 : 2530657
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP016104|2518875:2530657|DBSCAN-SWA TTTATAGTAATTTCTTATTTTTTAAGTATTCTAATACTAATTTAAAAGTTTCTTTTCTATCTGCTCCCATAAAGTTTGTGTATTTGTCGGGATACTTTTTAATTCCTTCTGTTGCTCCTCCCTCTATTACAAATACATTTCTGCACATATAACTCTTATAATCTTTTATATCTACTATAGTACTATTACTAATATAAAAAGACATAATAGTAGCTATAGCCTTATCGGTTTCCCCACTGTAGACTATAGCTGTATCAAATTTATCCATGTTATTATTTCCTCCACTTTCTGTACTGTTTGAATTAATACTCTTATTTAAAATACCTTCTGCTATTAATTTAGCAACTATATCTTTATGTCTAATATAATAATCTGTATCTGCTTTACTATCTACGAAGCACACTTCTATTAATATCGCAGGAGCTTTTGTATGACTAAGCCAAAAAAGCCCTCTTACGTCTGATTTTGCACCTCTGTTTTTAAATACTGTTGCTAATTTAGTATTTACCCTATCTGCATACACTTTGCCATTATTAGTTTTGTATATTGTCTCTGTACCCATTTTGTCCAAGGTTGTATGGTCTGCATTAAAATGTATTTGTATGGCCACATCTACATTTTGCCTATTGGCTATTTGACATTGTTCTGCTAAATAGTTATTAGACTTATCTACCTTTCCAGTATATACAGTAGCTCCACCTTGTTTCAACCATTTAACAATTAAATCAGTTAGTATTGCTATTTTCATTATTTATTTTCCTCCTTTAGTTGTTTATAAGTTTGATTTACTCCTATTGCAACTCCCCAACATAAAATACCTTGTAAAATTGATGAAGGGTTAAATCCTAGCATCCATATTGAAAATACTATTCCTAGCACAAGCAATATAATTGGAATGTATTTATTATCTAATTGTTTATATTTCTTAAATCCAAATCCTAATACATTAAGAGCAACTACTAATAAAAGCAGTTGCTCTGGTATAAAACTTATTAAATTATCCATCTCTTATCCTCCTAATTAATTAAAATATTCCTCTTTGTATTGCAAATATAAAGAACCCTACTAGTGTTGTAATCATTGTTCCAATTAGCCACTTTAACATACTTGTAAGTGAATTTAGATTCTCACACAATGCTTTTAACTCTGCTTTAGACTCTATATTTGCTACTTTTAATTCGTCTATTTCATCATTATGTTTATTTATTGTTACCTCATGTCGTTTCAAATTTTCTTTGAAAAGTTCTTCATTCATGAAAACCTCCTTATTTAATAGTAAATAGGGCTTAGAAGTTATCTAAGCCTTTGATAATTAACAACATTTAACTGCTATATAACTATACACACCATTGTTAACTGGACCTTTAGGTATCCATCCATTGTCAGTAAAAGTTATTTCATAATGATTATGATTAACATCAAGATATTTTTCTCCAGTTGTATAATTATAAAAAAGATAGAATAAAGGTGTGTATACACAATAATATTTTTCTTCTACAGCATTGATAACAGTGTATGAAATAACATCTGGCCTAAAACCTATATTTATCCCATTAGGATACGCACCAGTATAATAAGTAAAAGTTCCACTAGAATATTTATATTTAGAGTTTAATTGTGATATAGTATTATTAGCCTGTGTTAACTGGTTTATTAAATCCTGCAAACTAGCATCTGAACTATCAAAGGATTCTTTTACCTTCTCTGACAATTCTACTAAAGAATTGTTCAAACTTGATTCAATATTCTTTAATGATAATACATTTATGATAGAAGTTTTACCATTTATTAAGCCACGTTGCATTTCTTTAACTTTACTTGCTATATCTTGTAGACTGGCATCGTCACCTAATGGCATTATATTCTTGCTTATACTTACAACTTTTTCTGCTGTAGCATTGGCATTGTCTGTAACAACTATTTTAAGCGTGTGTAGTGCATTATATTCTAATATATAGTTAATTGTTTTCTCTGTTGTTAAATCTGTTATTATAGTCTCTTTTAATATATCATCTATAAATACTTCTATCTTAGTTAACAATGTAGGGTTTGTATGGTCAGCTTTAAATGTAATCTGTGTGGAATTATAAGAAGATACAGTTAAAAATGGTAAGCTTTTAAGTAATGTTATTTTAGCATAGCCATCTGATTTTGTAGTATTTCCACCTGATTCCATAACTACATTTTCTAGCCAATATTCAGAAGTTGGTATATATCCAGCAGATTTATAACTATCTTTAGTTAGTGCGTAACCACTTCCACCACCTACTCCTATTCCACCATAACCTCCTTTTCCTAACGAACCATGGTATTCTTCTGTATCGTAACTTGTTCCACCTTGGTATTGAGAACCACCACCACAAAAATCTCTGTCACGACCAACTCCATTAACACCTACATAACCACCACCATGACCAATAGAACGAGCAGAAGCAAAATTATTTTTCATACCTCCGCCACCGCCTGCAACAAGTATGCGTGAAAGCAAACTTTCAGTGTTACCCCAAGTTGCACTAGGATGATAAAGTCTTATATCAGTTGCTCCACCACCGTATTTAGAATAAGCGAATTTACCAGTAGTAACTTTGCCAGCAACGCCTCCACCATTAAAACCACTTCTAGTAAGGCTTGAACCTTCAGTAACTTTCTCATAACCAGATTGACCGACATAAATTTGTAGATTAGTTCTTTTTTTAAATACAATTTCACCTTTTGAATAACCACCTTTTGTACAATCAGTCCAATCGCTTGCATCGACAGTACCACCACAAGCACCCCAGCATTCTAATTTATATTTTCCTGGTTTTAATGTAATACTTTGTTCACTTCCTGTATAATTAAATTCATAAACTGTTGCCATTTAATCCACCTATTTCTTAATTTATGGTTTTATTGTACCTAATTTTAAAACTATAAACGTCTACAAAGTGTGGATGAAGTGTAGACAAAATGTAAATGAATTTATATATTTTAAGAAATAAAAAAGGACATTACCTATTTTGTAGGTTCTGTTCCTTCTACCACTCCACTATGCTCTATAATATAATCCTCTACTGCTTTTCTGTACTCTATGTTAGTCACGTCATCTAACTCAAAAGGTCTGTTTTTTAAAGGGTTTAATCCTCTGTTTAAAATTCTTTCTGATACTATTCTTACCACAATATTATTTATATTCATTATAATAATCCTCCTACCTTTTCATTTTCTGCAATTAGTAATTGATTTTCTAGCTCTTGTATTCTCTTTTCTTCTTCGCTTAATAGGTTGGAATATCTTTTAAAATAGGTTCTTTTGTTATTGGATTTATAGATTCTATATACTGTTTACTATAGTCTATATTTCCATATTCAACATCAATATAATGTAATTCTGTTATTGTATCATGCTCTAATATATCTCCTGTTGCTTCTCCAGTTTGTAAAAGTATTTTACCAGTTTGGTCGTGAATTATTCTATTTGCTCTATTCATTTTATCATCTCATTTATTTAAATTTTGCCGCATGCCATTTATATGCTCTAAGATTATTTAGAGTATTTAGAGCAGGTACTCGAACTCCAGTATTATCCATGGAAACATGTCTTTTGTCAAGGGTATATAAATCTCCTCGTAAACCAAAAGATTTATCACCATATTCCTTGTTAAAAGTAATATTAACTACAAACCCAGTATTATTAGAAATGGAAAAAGTATTTTTAATTGCAAAAACAAAATACTTATAAAAAGCATCTGAATTTGGTTCATATTCACATTCAGCAAAAAATATATCAGGAATAAATCCAATTCCATTTAAATCAAGCCAATAAGGACTTGTTTCTTCAACAGTGTGAGAAGTATTAGGGTCATATATACATGCAATTAAGGAAGAATTTTCTCTAGCATTAGCAGTCCCACTGGCATATTTATACTTAGAATCTAACTGTGATATAGTGTTATTAGCTTGTGTTAGCTGATTCATCAAATCCTGCACACTAGCATCTGAACTATCAAAACTTGTTTTAATTTTCTCTGATAACTCAACTAAGGTATTATTTAAACTTGCTTCTATGTTCTTTAATGCTAAAGTGTTTATAATACTTGTTTTACCATTCTTAAACCCTTCTCCAATCTCTGCTAACTTAGTTGATATATCACTTAAACTAGCATCAGATTGAAGTGGCATAATCTCTTTACTTATACTCAAAACCTTCTCAACTGTTGCATTTTCTGCATCTGTAGCAACTATTTTTAATGTGTGTACTGCATTGTCTGTAAGCTCATAGTTGATGATTTTCTCTAAATATAAATCTGTTGTTATTGTTTCTTTTAATACATCATCAATGAACCACTCTATTTTAGATAAATTATTATCTGTATCTATTGCTGTAAAGATTGTAGTAGTTGAGTTATAAGAAGTTATATTTAATTTTGGTTTAGTATTACCTTTTGTAAATATAACTGTTTTAGTTAACATATTTCTATTATTAAAATCATTAAACTCAATAACAATATGATTAGTTGAATTATGACTTAATTTAGATAAATATTCATCTGTAAGACTTATTTTATATTTTGAATCAACAGTATTAACAATTTGACCTATAATATCATTATTCAATTTATAAACTATATTATATCTTAATTCAGGAAAACCATCGCTTATAGTATACTCAATCTCACAAGCATCACTTATAATACCTAAATTATCTTTTATATTAATAGTTGGTTTTGCTACAAACATTGCAGTAACGTTTTGACGCATAACAACATCTCTAACCATAACCTCAGAACCACTAGTTGAATAATAACGCACATTAGTTGTAGTAGCAGTATAAAGTCTAGTTTCAAGTTCAAATACTTTTATTTCGTTGCCAACTTCAAAGGTACCATAATAAGTACGTCCACCAGTTTGATATGAGCAAGCACGAAGAAATATTTCTTCATCTGTATGTTCTCCTTCTCTTAATTTAACACCTCTATCAACGTCATAAGTAGCCATTTAACCTCCTCCTTTCTACATTGGTATCAGATTACTGTTTATACTTGATATAATACTACTTCTATTACCTTTTACTTCTTGCATCACTTCTTTTAATGCTCCTTCTACATTGTCACTTTCAAATAAATTATCTGTATCTTTTATACTTGTTTTATCTGCTGTTGTTTCTATACTATTTACACTAGTTTTTACCTCATTTAATGCACTAACGATATTTGTTTTATCTGTTGTAGTAAGTTGTGTTGTATCTCCTATTTTTCCAATTAACTCTGTTTTAGTAGTTTCTATGTTGCTTGTTAATTCTGTTTTAGTTGTATCAATTTTAATATTAACAGTACCTATTTTAGTTTCTAAGTCTTGCATATCTTTGAGTGTTGCAAAGTTAATACATCAATTTCTCCATAAGTTTCTATATCTGGTGGACTCCAAGGGTATATAGTTATTTCTTGACCCATTAGGGTTGTTATACCAAAATTCATATAATTGTCTTTGCTTATAAGCACTCTAGTGTAATCTAGTGTCATATTGCATGGCTTAATATTACTTACAAAAGAATGAACTTCCTCAAACCAATCTTGATTTCTAGCATCACTCTCAAGGTGTATGTTATAAGTAGCATTATTAATAGTTAATTCATAATTGCCTTCTCCAACTACATTATCTAGCCAGTTCCTTAAAAATCTCTCTGAGTAAGGTAGTTTACTTATATATTTACTAAAAATCCTAAACCTTCTATCCTCTAAAGTCTCATTTGACTTGGGATTTATAGACATTATCTTTTCCCATCTTTTTATGCCACTTGGAGTTAAATCCTCTAAAAACTGGTCACTTGATAGGTCATTTAATTTTTCATGTAGTGTTTTTATTTCTTTGTTTTCTGCATCTTCCCAACTCATATTTAACTCATTTAAATAGTCGTTTATTGCTTCTTCTGCTATAGTCTTTATATTTTCCCAAGTGTAGCCATTTTTATATGTTATCTCTGCTGATATATTTATAGTTGTACTTGTAATTCCTTCAACTGTGACTCTATGACCTATTGGTGCTAATCCAAGACCTTCTCCTTGGTTTTGTAGAGGGTCAATTTCTTCTTGAACTAAATTAACTAAATCACTAGATGGAACTTTGAAGTTAGAATTAATTATTACTAACTTAACAGTACCTCCACCGTTCCAAACTGGATATACTTTAACTCCCCCAACGTCAAGCAATTTATTAACTTCATCCTTATAGTTTTGTATATTCCCCCCAAAAGATTGAGAATTTAAACTATCATAATATCTTTGTCTTAAACTGTCCTCAGATTCTTCATCTTCTCCATTTATCAGTATGTCTGTTAACTCAGCAGTTTCAAGACCATCTATATATCCAATTGGAATCAACTGACCAAGTTCAAAAATAGTTCCAGCAGTTTCACATTTCATCTTATATATTCCTTCACTAATCCTTTCGGTTGCAATATAATTGTACTCTCCTAAGTTGAATATTGAATCAATAGGAATATCTATATTAAAAACTCCTTTTGCAATTGTATTGGTTGCAGGTAAAGGTGTAATACCTCTCTCTTTACATCTCTTCTCTAAATAATAACTGGCAGTATCTACGAATGTTTGGTCTAACAATTCATCCATTGCAATGTATGTTTCTGTGAGTTCTATGGCAACAGGAGCAAGAGCATTATATATTATAGACCCTTCTCTTTTATCAAAAGTGTCTGGTACACTATCTAACATTCTTTTAATTATATTTTCAAAAGTCATTAACTCAAACACTAAATACTTACCACCTTCTATTCTATATTATTAATCGTCTTTTTAATTATAATTTTTTGTATTTTCTTGTTTTTATAATTTTTTTTTATTATTTAATTTTAAAATATTCGTTTTGTTTTTTATACTATATAAATATAATATTTTTTTAAACTATTTAATTGCATATTTTTCCAAAACACATAGCATCTTTGTAGAAAATTTTATATACTTACATTATTACTATCATAAAGTAGAATAAAAATATGTGAGGGAGGTTTATTGAATGAAAATACTAAAAAAAATAACTAGTATAATTTTTTTAATAATAATGATAACAGTTGTTATTACAGGATGTAGCCAACAAGAACAGGGGAAAAATAATTCAGAAAAGAAATTAAATTACAATGTTTTAGGAGAAAAAACAAGACATGGTGGTACATATGGCGATTTTAAGTTTGTTGTTATAGAAATGCCTAAAGACTTTGACCCATCAAATTGCAAAAATTTGTCTAAGGATTTTTTAAACTACTATAATGAAAATGTTGATACAATAACTGTTTATGTATACGAAAAAGATTACAAATTAGAAAGCGAACAAGATATGTATAAAAATTCTTTATATGATATAACTATTGAACACAGAGATGAAAATACTTGTGTTTATTCTGTTTGGGATGTTAAATCTGAGGAGACAACAGATGAAGGTTCATTAAATTAAAACCTTTAACTTGTCTTTTTAGAAATAAAAGAGGAACTAAGTTATATTCATTTTTATAACTTAGCTCCTTATAGTAAATATTTATTTTTAACTTATTCCATCTACATCATTATCAAAAGGATTATTTTCTGATGGAACGAATATAATATTAACGTCATCAACATCTCTATTATAATGCTTATCTGCTTCTGTATTTGGGTTTACATCATGATATGATACTAATTCTTCATTTTGATTTAAACGCTGTATATCATGAACAGTCCATGTATCAGTATCTATAAAAACCCAATATGAATCTATTCCAGAACTCTCATACAATACAACTACATAAAAATCAGTACTTATATTATGTTCTTCTCTATCTAGTATCAAATCATTTTCACTAATATCATATTTACTAGAACATGCTTCAAATGCCATATCGATTGCTTTTCTCTCTTTTAAATATCCTTCCGCATCAAACCTTTTTATTGTATTATTTGAATACCATTGTAGTATATCATTCAAATTATTCATATTTACTAAAAATCTAAAATCATCATCATCTGCACCAATTGCATAATAATCTTTCCCTTGATAGGTAAAGTTTTTTATATAATACCTAAAACATTCATCCGGGTCTGTTTTTGCTTTAATAGCTGATTCATAATCTACAAATACTTTTTCATCTAAAATATAAGCTATTCTTTCAGTTGCTTCCTTTACAGTATACTTCCCTCCAGTAGTTGGACTGGCAATATTTTTTGTTATGTTTAGAGATTGTTCTATAGCATTGTTATTTAGATTTCCTATTGCTGTTATTTTAGTTGCACCTTTTAATACAGTCTTATTACTATTGTCATCAACTAACACAATTGGAGTATTTTTAGCTATTGTAGAGCCAACAAGAGCATACACTAAATCTGTTCCACTTGCTATGTAAAACTCCTTTATTCCATTATAGAGCTTATTTACTATCTTTTTATTAGTATCATATCTGTCTGCTCCGCCCAATCGAGTTGAATTAGTATCATTAACTAGTTTGTCACTCATTAATGAAGTACCACCTATTGCATAACTTTCTATTCCAGTAGTATTAAATGGTACACTTTTCCCATCAGTTAATATTATAGGTGCTTTGTCTCTAACAGCCACAGAGGCAATACTCATAGCATCTGGTTCACCTTTGAAAGCATTAGTTAATATTACCTTATTTACTTTATTAATAGAATTTATTTCTTTTGCTACATTATAACTTGTTTTAATTCTATCATTTCCTTGAAGTCTTTTAGTCTCTATTCCTTTATCTTTTAGAAAAGTTTCTGTTGCCTTATCAATAGAACTTTCTCCACCAATTATGTACACTTTGTTAGCTTTCTCTACTCTTTTAAGAGTTGCATTAGGTATATTATTTTTCTTAGTCAAAAGAATTGGTGCATTTGTAGCTCCTGCAAGCCCACTTGCACTTAACCCATCCGCCATTGTACTATCTGCATTTATAAGTATTGCAGTAGCATAACTTTGTTTGTCTGCGATAAGTCCAGCAGTTTCATATTTATCTGCTCCTTGAATCTTATCGATTTTATCAAGTGCATTTGCAGATATAGGATAACAAGCAACAAACATTGACATAGCTAACCCTAGTGATAATAATTTCTTTGATTTCACAATATCTCCCCCTTTTTCATATCACTCAATTAAATTGTATAACAAAAATATATTATATGTTGTCGAAAGTACAAACTATTTCTACTTAATTAACGACATTAAATAACATTAGAATAAATTATTTTCTTATAATCTCATTCTTTATAATATATATAATTGTTATAATATAATTAAAGCATTTTACTTTAACCACATTATTTAATTTTGAGAGGAGTTATTATTATTAAGGGTGGAGTTAGAAAAAAAGGGGAAAAGTGGTATTATTATTTTGATTTAGGAGTTATAGATAGAAAGAGAAAAAAAGTAGAAAGAGCTGGGGGAAATACTAAAAAAGATGCTGAAAAAGCACTTCGAGAAGCATTGAAAGAATATGAGAATACAGGAATAATGTTTGATGAGTGTGAAATGAACTTAGCAGAATATCTAGATTTTTGGTTTAATAAATATGTTATTTTAAACTGTAAATATAATACTCAAGAAAGTTATAGAATACACATTCAAACACATATTAAGCCAGCATTAGGACATTATAAATTAAAATCCCTAACACCAGCTACATTACAAAACTTTATTAATGCTAAGTTTAGAAGTAACTATTCTCAAAGTACACTTGAAGTTATTAGGGCTATTTTAAAAAAGCTTTAAAATCAGCTGTCTACCCATATCAGTTTTTGAAAGATAACCCAATGCAATATATCGCAATTCCTAAAAATAAGACTATAAAAAAAGAAATTAAAGTAATCACGTTAGATGAATTTAACAATATTTTAAATTTATTTAATAAAGGAACTTATCAATATATATCATTAATGGTTGCTTTTCATACTGGAATGAGAAAAGGTGAAGTTGCTGGTCTAACTTGGGAGGATATAAATCTAAAAACAAAAACTATAGATTTATATCCTCCT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP016104|2518875:2530657|2525884_2526319_+|AXU50551.1|DBSCAN-SWA MKILKKITSIIFLIIMITVVITGCSQQEQGKNNSEKKLNYNVLGEKTRHGGTYGDFKFVVIEMPKDFDPSNCKNLSKDFLNYYNENVDTITVYVYEKDYKLESEQDMYKNSLYDITIEHRDENTCVYSVWDVKSEETTDEGSLN >CP016104|2518875:2530657|2519898_2520129_-|AXU50544.1|DBSCAN-SWA MNEELFKENLKRHEVTINKHNDEIDELKVANIESKAELKALCENLNSLTSMLKWLIGTMITTLVGFFIFAIQRGIF >CP016104|2518875:2530657|2521868_2522051_-|AXU50546.1|DBSCAN-SWA MNINNIVVRIVSERILNRGLNPLKNRPFELDDVTNIEYRKAVEDYIIEHSGVVEGTEPTK >CP016104|2518875:2530657|2522130_2522343_-|AXU50547.1|DBSCAN-SWA MNRANRIIHDQTGKILLQTGEATGDILEHDTITELHYIDVEYGNIDYSKQYIESINPITKEPILKDIPTY >CP016104|2518875:2530657|2522356_2523850_-|AXU50548.1|DBSCAN-SWA MATYDVDRGVKLREGEHTDEEIFLRACSYQTGGRTYYGTFEVGNEIKVFELETRLYTATTTNVRYYSTSGSEVMVRDVVMRQNVTAMFVAKPTINIKDNLGIISDACEIEYTISDGFPELRYNIVYKLNNDIIGQIVNTVDSKYKISLTDEYLSKLSHNSTNHIVIEFNDFNNRNMLTKTVIFTKGNTKPKLNITSYNSTTTIFTAIDTDNNLSKIEWFIDDVLKETITTDLYLEKIINYELTDNAVHTLKIVATDAENATVEKVLSISKEIMPLQSDASLSDISTKLAEIGEGFKNGKTSIINTLALKNIEASLNNTLVELSEKIKTSFDSSDASVQDLMNQLTQANNTISQLDSKYKYASGTANARENSSLIACIYDPNTSHTVEETSPYWLDLNGIGFIPDIFFAECEYEPNSDAFYKYFVFAIKNTFSISNNTGFVVNITFNKEYGDKSFGLRGDLYTLDKRHVSMDNTGVRVPALNTLNNLRAYKWHAAKFK >CP016104|2518875:2530657|2520186_2521734_-|AXU50545.1|DBSCAN-SWA MATVYEFNYTGSEQSITLKPGKYKLECWGACGGTVDASDWTDCTKGGYSKGEIVFKKRTNLQIYVGQSGYEKVTEGSSLTRSGFNGGGVAGKVTTGKFAYSKYGGGATDIRLYHPSATWGNTESLLSRILVAGGGGGMKNNFASARSIGHGGGYVGVNGVGRDRDFCGGGSQYQGGTSYDTEEYHGSLGKGGYGGIGVGGGSGYALTKDSYKSAGYIPTSEYWLENVVMESGGNTTKSDGYAKITLLKSLPFLTVSSYNSTQITFKADHTNPTLLTKIEVFIDDILKETIITDLTTEKTINYILEYNALHTLKIVVTDNANATAEKVVSISKNIMPLGDDASLQDIASKVKEMQRGLINGKTSIINVLSLKNIESSLNNSLVELSEKVKESFDSSDASLQDLINQLTQANNTISQLNSKYKYSSGTFTYYTGAYPNGINIGFRPDVISYTVINAVEEKYYCVYTPLFYLFYNYTTGEKYLDVNHNHYEITFTDNGWIPKGPVNNGVYSYIAVKCC >CP016104|2518875:2530657|2523865_2524213_-|AXU50549.1|tail|DBSCAN-SWA MQDLETKIGTVNIKIDTTKTELTSNIETTKTELIGKIGDTTQLTTTDKTNIVSALNEVKTSVNSIETTADKTSIKDTDNLFESDNVEGALKEVMQEVKGNRSSIISSINSNLIPM >CP016104|2518875:2530657|2518875_2519622_-|AXU50542.1|DBSCAN-SWA MKIAILTDLIVKWLKQGGATVYTGKVDKSNNYLAEQCQIANRQNVDVAIQIHFNADHTTLDKMGTETIYKTNNGKVYADRVNTKLATVFKNRGAKSDVRGLFWLSHTKAPAILIEVCFVDSKADTDYYIRHKDIVAKLIAEGILNKSINSNSTESGGNNNMDKFDTAIVYSGETDKAIATIMSFYISNSTIVDIKDYKSYMCRNVFVIEGGATEGIKKYPDKYTNFMGADRKETFKLVLEYLKNKKLL >CP016104|2518875:2530657|2529948_2530125_-|AXU50553.1|DBSCAN-SWA MGIRQGINIKRNHQVYGTKYEWKDTTIFTVLKRLQRREFLETEKIDKRTHYNVLVKEK >CP016104|2518875:2530657|2530279_2530657_-|AXU50554.1|DBSCAN-SWA MKEEILIEKLLRAELIVMEYLWKKDTLMPKKEIVKEIKQIYGWHKSTIKILLKRLVDKRYLARYIIKFQSHYKIIIDNKEYYTFKKKVLKSSKSIKIMRSLTTTHKNVSKEKLDLLDEYYRNLKE >CP016104|2518875:2530657|2519621_2519879_-|AXU50543.1|DBSCAN-SWA MDNLISFIPEQLLLLVVALNVLGFGFKKYKQLDNKYIPIILLVLGIVFSIWMLGFNPSSILQGILCWGVAIGVNQTYKQLKEENK >CP016104|2518875:2530657|2526406_2527966_-|AXU50552.1|DBSCAN-SWA MKSKKLLSLGLAMSMFVACYPISANALDKIDKIQGADKYETAGLIADKQSYATAILINADSTMADGLSASGLAGATNAPILLTKKNNIPNATLKRVEKANKVYIIGGESSIDKATETFLKDKGIETKRLQGNDRIKTSYNVAKEINSINKVNKVILTNAFKGEPDAMSIASVAVRDKAPIILTDGKSVPFNTTGIESYAIGGTSLMSDKLVNDTNSTRLGGADRYDTNKKIVNKLYNGIKEFYIASGTDLVYALVGSTIAKNTPIVLVDDNSNKTVLKGATKITAIGNLNNNAIEQSLNITKNIASPTTGGKYTVKEATERIAYILDEKVFVDYESAIKAKTDPDECFRYYIKNFTYQGKDYYAIGADDDDFRFLVNMNNLNDILQWYSNNTIKRFDAEGYLKERKAIDMAFEACSSKYDISENDLILDREEHNISTDFYVVVLYESSGIDSYWVFIDTDTWTVHDIQRLNQNEELVSYHDVNPNTEADKHYNRDVDDVNIIFVPSENNPFDNDVDGIS >CP016104|2518875:2530657|2524200_2525622_-|AXU50550.1|DBSCAN-SWA MFELMTFENIIKRMLDSVPDTFDKREGSIIYNALAPVAIELTETYIAMDELLDQTFVDTASYYLEKRCKERGITPLPATNTIAKGVFNIDIPIDSIFNLGEYNYIATERISEGIYKMKCETAGTIFELGQLIPIGYIDGLETAELTDILINGEDEESEDSLRQRYYDSLNSQSFGGNIQNYKDEVNKLLDVGGVKVYPVWNGGGTVKLVIINSNFKVPSSDLVNLVQEEIDPLQNQGEGLGLAPIGHRVTVEGITSTTINISAEITYKNGYTWENIKTIAEEAINDYLNELNMSWEDAENKEIKTLHEKLNDLSSDQFLEDLTPSGIKRWEKIMSINPKSNETLEDRRFRIFSKYISKLPYSERFLRNWLDNVVGEGNYELTINNATYNIHLESDARNQDWFEEVHSFVSNIKPCNMTLDYTRVLISKDNYMNFGITTLMGQEITIYPWSPPDIETYGEIDVLTLQHSKICKT |
13 | Clostridium_phage(83.33%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
3090342 : 3099295
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP016104|3090342:3099295|DBSCAN-SWA 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CCTTTCGAAAACTTTTTATAATTTCACTTGAATTGTCCTTAGAACAATCATCCACTAATAAAAGCTGCCAATTTTTATAAGTTTGATTTTGGATTGACTTTATCGTCTCTGATAAAAACTCTTCTGAATTATAAACAGGAGTAATTATCGATACTAAAGGCTCATTCATATTTTTACTCTCCTTATATAGCAACTAGCAGTACTATACCAACAAGTTTACTTAGATACTAATTTTCTTTGTCCAATATATTTGTAATATCCTAATGGGAATAATGCTAAATACAACAATTTATCAGATACTTTTCTTAATTCACCAAAATAATGACTATCAGACAACAATGAGTATCTGGCTAAATTTATGTAATTTTTTATCCACATATATGGATATCTACTCAATGGATATGTATTTTGATTTATTAAATATAAAAACTCTAATGCTCTACCTCTTAATGCATTTTTACTTAATATATTCTTAGTCAAACCATCATCCAAATAATCTCTTATTATCATAGGTTTATTTACACATATAACTTTATAGTATTTAGACATTTCATTCCATACTACACTTTCTGGTAAAAATCTCACTTCTTTTCTTTCTGGAAAAGGAAATTTTATAAGCTCCTCAGTTACAAATACTATGCTTTTATCTCCCTTAACGCCATACTTAAAATATAGGTCTGCAAAGTGACATATTTTCTTATCTTCAGGCATTTCTGTCCCTATCAAATCTCCACTTGGATATACACAAAGTCCAACAACTCCACTAAATCCTTCTTTATTCTCTAAAGAATCCCACTCATCATTAGCAATTTTAAGAGAATCTTTAATTAAACCATCATCACTATCTACAATGAAAAATAGCTCTCCATCTGCATTTTTTACACCTAGATTTATTGCAGTATGTTTTCCTCCATTTTCTTTGTATATATATCTTATATTTAATTTATTTTCTGATATAAATTTTTCAACTAACTCTTTAGTACTGTCGCTACTTCCATCATCAACAATCAACCATTCAAAATCATTGAAATCATAAGTTTGAGCTTTTAAATCATTGTACAAATTTTCAAGTAAATGAGCTCTGTTATACGTCGGAGTAAATACAGTAAATTTATATTTATACATTAATTAAATCTTCCTCTCTGTCTAACTTTTTTTGATTCCGTTTATTCCATAATTAATAAAGTAGTATATAGCTTTGTATAAAGGTATTTTTTCTATATTTCTATATATATTCCAAGTCCACATAGCAGCTTTTATTTTATTACCACTTAGGGAATTGCTAGATTTTCTATATAATGCTAGAACTTCATTTATTCCATGAGCAATATGCCCTTTTTTCAATATCGATAACCATAAAACATAATCTTCATGTCTTACACCACTCATTCTTATTTCAAAATCCAATTTAGACTTATCAATCACAACAGTAAGACATCCTAAGATATTTCCTTTTAATAATCTTTTATAATCTACATTAGGTGGAACTTTTATTACTTTGTTTAATTTTTTATCATTTTCATCCATCAGTTCATATGAAGTAAATGAAATTACATAGTCATTTTCTAACATAAAATTTACTTGTTTTTCTAACTTACTACTATTCCATTGGTCATCACTATCTAAAAAAGCTATAAATTGTCCTGTTGCCTTACTTAGTGCTAAATTTCTAGCATTAGAGACACCCTTATTAGTCTCAGTCTTTATACATTTTATTCTACTATCCTGTTGCATATAAGATTTGACTATATTAGGACTATTATCTGTTGAGCAATCATCAATAATTAACATTTCCCATTCTTGATAAGTTTGGTTTAATACTGATTTTATGGTTGCTTCAATAAATTTTTCAGAATTATACATGGGAGTAATTATAGATACTAAATTCTTCTTCATATTACCTTCCTCATCATTTATAAAATATTTATTTAATTTTACTTAATACACAATCATATATCCTCTTGCAGTTCTTATTATCATTATATCTGAAAAACTTATTTCTTTCATTTTTTTGGTTATCCATAACCTCAAAATTATTTTCAATAATATCAATAAGTTTATTCACGGCTTCATCATTATTATAAGCCAAAGACCCAAACATTTCACTTTTTAAATCTATATATGAATCAACTTTTTCCATATATTCATCCAAATCGAATTGGTAAAACAAGATAGGTCTATTCATATACAAAAAGTCTATGGCTACACTTGAATAATCAGTTATATTTGCAGCTGATTTTCTAATTTCATTTGCTAGAGTTACCCCTTTATCTAAAAACACAATTCGTTTTCCTGTTATATTTTCTTTTATATCATCTATAAACTCATGCATAAGATGATGCATATAAATTTTTACATTTATATCTTTCTCATCTAATATTTTATTTAATTTATCATCATTTAAAAAATTCATTATATTTTTAAAATAATCTGTATCCGTAAATTTTCCTGAACTAAATTTTATCCAATCTCTCCATGTAGGAGTATATAATATATCTCGAGTTTGTGCAACTTCATTTGTTGGTAAATTGTCATATCTTGCATTTCCAATTATATAAACTGAGTCATCTAACATTCCCCAATCATTTACCATAACATTTCTTTCAAATTCAGAACTTGCTGTAACTATATTATAGCTTTTATATAGGTTATCTATAATGTTTTTGAACTTTTTGTTCATAGGTTTTCTCTTTTTAAAACTTATAGTCCCATGATTTAAAAACACTTTTATCGTTTTTTTATGAAAATAATTAAGAACAGGTACAGCAAAATTGTATGGTGCTATATCTGCTGATGGTGCATGTGAAAATACTATAGCTTTTGAATTGTAATAATACAGATAGTTTTCTACACTTCCTCTTATTAATTTTTTGCCTGGAATTTTATCAAATACTTTGCTGTCTTTATTTACTACCCAATAAGTTTCTACATCATTATGTTCTTTTAGCATATACTCATAAAAAAACTTTGAATTATCATTGTATATATCCCCTGAATGTCCACCTATAAGCCAGATATTTCTACCATTAAACTTATGCTTATTAAATGGATATATAAAAAAAGCCAAAAGCATATTTATTAAAAATTTAACCTTGTCCATAAACACCATCCTCATTATAACTTATACTGTCTAAATCCATTAATTCTTCCTTTTATAGTGGCACTATGATAATCTCTATTGGAACTCAATATAAGACCTCCTATATTTCTTACAAGTTTTGATACCATAACTTTTGCAAACTTATAATTTTTTCTATAGACTATTTCCTTTTTGCAAAGCGCTCCAAAGCCTCTTCCATAGTTATAATCTTTTTGATACTTTTCTTTAGATTTAGAATGTTTTTTTGCAGGATGGTAAATTATATCATTTCCAAAGTATTTTCCTTTAAAACCTAAACTCAATAAGTTTAAAACATAATCTATCTCTTCACCAGCACCAAACTCTCCACCAACACCCAATTTTTCATCAAATCTTGTATAATCCTTACCTTCAAAATCAATAAAAAAAGTTATGGATGTTATAGTATCCAAAACGTTGGAACTTGTGATATCACAAGTTCCATCATACATTTTCTTAAATGCATCAACTTTATTTGAATCCATAGTTTTGCAACTGTATATTTTATAATCTTTATTTTTATTAAAGAAATTTATAACTTTTTCTAATGTATCATTTTCGTAGACACAATCATCATCAGGGAAACCTATAATTTGCCCTACAGCATTGTCTATGCCTACATTTCGGTTATAACTCAATCCTTTTTTAGAACTTTTTATATACTTTATATCTAACTTATCAATGTATTTATCAACTATTTCTTTAACTTTGCTATTATCATTTTGGTCTACTACTATAAGTTCAAAGTTTTTGTAAGTTTGATTTTCTAAGCTGTCCATAAGTAAGTATATATCATCATATCTATTTAATGTTGGCATTATTAATGATATTAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP016104|3090342:3099295|3090342_3092256_-|AXU51036.1|DBSCAN-SWA MRESIDLEKESFFNRLFKKYKFRHLTLLILDICSVLVAFRMSLSLTGNLNAFITNDIIISACVYIVLHIVSFRLFKCYNTLWRYAGEEEIISIFMATLAYLIPIYIINKLLGFNYPIMFYVLNTIFIIMFTSGARIAYRAIRIVMNKTYSRGKVSNILIIGAGDAGEMVIQELKRNSELKKVAVAIIDDDKNKIGRIIHNVKIVGTTSDIKDVVEKYNVDEIIFSIANIEKRRKKEIIDICKNTNCKIKTIPGIYEIIDGKVDIKQIREVEIEDLLGREPIKTNLREISNYIEGKVILITGGGGSIGSELCRQIAGFNPKELIIVDNYENNAYSIQQELLRKYKNKLDLKTVIASIREEKRMDEIFNKYKPEVVFHAAAHKHVPLMESSPGEAIKNNIFGTLNIAGLSSKYRAKKFVLISTDKAVNPTNIMGATKRAAEMIIQTMNAESQTEFVAVRFGNVLGSNGSVIPLFKKQIEDGGPVTVTHPDIIRYFMTIPEAVGLVIQAGAMAKGGEIFVLDMGEPVRIFDLAKNLIKFSGFEPDVDIKIEFSGLRPGEKLYEELLMSEEGLLDTEHKKIFIGRPIDVDREKITKYLKLLREITNNEEVEKIDGIMRELVPTYIKPEDANIKEIATTREK >CP016104|3090342:3099295|3092339_3093431_-|AXU51037.1|DBSCAN-SWA MKTVCYLADGSNPHTLKWCSFFKNKGYDIHVISLNGGHMEGIKIYNFGSNVEELKNENISKKTGYLGSIKQIKKLVNEIKPDILHAQYASSYGFIGSLLGYHPYIISVWGTDIYDFPNNGFIQKQIIKHNFRKADYIFSNSRDMAKEANKYTAKHVDVTFFGVDMDRFKPMEVEKEDAFVIGIIKSLEKKYGIEYLIQAFKMLKDEYKDKKIILKIGGSGSQMDNLINLTKELGIENDVQFLGRISPENVSKTFNSFDVTVFPSLREGFGVAAIESEACEVPVIVTNVGGHPESVWQNETGLIVEPKQPEEIKNAIIKLMENDELRLSMGKKGRQFVRENYEVNLNFNDIEKIYDSIFDKYKK >CP016104|3090342:3099295|3094757_3095510_-|AXU51039.1|DBSCAN-SWA MNEPLVSIITPVYNSEEFLSETIKSIQNQTYKNWQLLLVDDCSKDNSSEIIKSFRKEDARIKYIKLEKNSGAAVSRNVGIKNAEGRFIAFVDSDDLWDSRKLEIQIEYMLKENVGFSFTSYRYMRQDGSKTNKVARAPKKIDYEGLLRNTIIGCSTVVIDKEIVGEFSMPLVRRGQDTATWLQLLKKEKYAYGIQEDLVNYRLVGNSISSNKIKALKRTWNTYRNVENLSLPKSLYVFCFYVFNAIKKRV >CP016104|3090342:3099295|3098455_3099295_-|AXU51043.1|DBSCAN-SWA MLISLIMPTLNRYDDIYLLMDSLENQTYKNFELIVVDQNDNSKVKEIVDKYIDKLDIKYIKSSKKGLSYNRNVGIDNAVGQIIGFPDDDCVYENDTLEKVINFFNKNKDYKIYSCKTMDSNKVDAFKKMYDGTCDITSSNVLDTITSITFFIDFEGKDYTRFDEKLGVGGEFGAGEEIDYVLNLLSLGFKGKYFGNDIIYHPAKKHSKSKEKYQKDYNYGRGFGALCKKEIVYRKNYKFAKVMVSKLVRNIGGLILSSNRDYHSATIKGRINGFRQYKL >CP016104|3090342:3099295|3097265_3098441_-|AXU51042.1|DBSCAN-SWA MDKVKFLINMLLAFFIYPFNKHKFNGRNIWLIGGHSGDIYNDNSKFFYEYMLKEHNDVETYWVVNKDSKVFDKIPGKKLIRGSVENYLYYYNSKAIVFSHAPSADIAPYNFAVPVLNYFHKKTIKVFLNHGTISFKKRKPMNKKFKNIIDNLYKSYNIVTASSEFERNVMVNDWGMLDDSVYIIGNARYDNLPTNEVAQTRDILYTPTWRDWIKFSSGKFTDTDYFKNIMNFLNDDKLNKILDEKDINVKIYMHHLMHEFIDDIKENITGKRIVFLDKGVTLANEIRKSAANITDYSSVAIDFLYMNRPILFYQFDLDEYMEKVDSYIDLKSEMFGSLAYNNDEAVNKLIDIIENNFEVMDNQKNERNKFFRYNDNKNCKRIYDCVLSKIK >CP016104|3090342:3099295|3095557_3096466_-|AXU51040.1|DBSCAN-SWA MYKYKFTVFTPTYNRAHLLENLYNDLKAQTYDFNDFEWLIVDDGSSDSTKELVEKFISENKLNIRYIYKENGGKHTAINLGVKNADGELFFIVDSDDGLIKDSLKIANDEWDSLENKEGFSGVVGLCVYPSGDLIGTEMPEDKKICHFADLYFKYGVKGDKSIVFVTEELIKFPFPERKEVRFLPESVVWNEMSKYYKVICVNKPMIIRDYLDDGLTKNILSKNALRGRALEFLYLINQNTYPLSRYPYMWIKNYINLARYSLLSDSHYFGELRKVSDKLLYLALFPLGYYKYIGQRKLVSK >CP016104|3090342:3099295|3096487_3097237_-|AXU51041.1|DBSCAN-SWA MKKNLVSIITPMYNSEKFIEATIKSVLNQTYQEWEMLIIDDCSTDNSPNIVKSYMQQDSRIKCIKTETNKGVSNARNLALSKATGQFIAFLDSDDQWNSSKLEKQVNFMLENDYVISFTSYELMDENDKKLNKVIKVPPNVDYKRLLKGNILGCLTVVIDKSKLDFEIRMSGVRHEDYVLWLSILKKGHIAHGINEVLALYRKSSNSLSGNKIKAAMWTWNIYRNIEKIPLYKAIYYFINYGINGIKKS >CP016104|3090342:3099295|3093436_3094732_-|AXU51038.1|DBSCAN-SWA MKIAIAGTGYVGLVTGVCLAEVGNENVVCVDVDEQKVKSMKLGIAPIYEEGLEELMVKNYNRGRIDYTTDYKKAYEDVDVILIAVGTPERSDGSANLDYIKAVAKQIAETVTKDTLVVIKSTVPIGTNEEIEDYINRNLKNDVKVELASNPEFLSQGTAVKDTLHASRIVIGVESEWAREILEEIYKPFNQPIIVTNRNSAEMIKYASNNFLALKISFMNDIANLCEIAGANIEDVALGMSYDDRIGSKFLKAGIGYGGSCFPKDTKALHWLSEHNGYELKTVKAAIEVNESQKLKLVRKASKLVESFQDMKVAVLGLTFKPDTDDIREAPSIPNIKYLLERGARVTVYDPIGVNNTKKIFGDSILYADSVDDAIEDAEICFIMTEWKDVLNYDIHKYKEKMKNPLVLDGRNCYKVKDMEELGIEYYSIGR |
8 | Catovirus(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
3711379 : 3765011
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP016104|3711379:3765011|DBSCAN-SWA 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MNFVELAKKRYSCRNYQDRKVEKEKLEKVLDVARIAPTGGNRQPQRLIVIQEKEGINKLSKAANIYDAPLAILVCGDKDKVWTRPFDGKQLTDIDTSIVTDHMMLQATELGLASVWVCYFNPDIIREEFSLPDNLEPINILLMGYESKIPESPERHEKTRVPLSEIVSYETL >CP016104|3711379:3765011|3720733_3721606_-|AXU51537.1|DBSCAN-SWA MAIIKKILNLEINDDYIRLVFLRKSHKKVFIDKSIIKEINFDIKNDSNSIEKIKYIEDVVRFVKEEIGKSKILYKNLYFNIQIQDIVIRNVEVLNTKKKRDILSMIEFEITQYIPININNYSIKYKVINSKNDKLNIQVILFPKSIIQLIKNISENLNMNPRTININFDILQKLINLNLIENFSEEGVFIECKKSQLIINITKDKKIRETYLLSKEGKSYEFIKRLLRDFKYVYYYGIENCFIEEYFKYTDKSIEVNPLRLKDKVKVENNFDTDLEDNRINYISSIGMLI >CP016104|3711379:3765011|3738767_3740792_-|AXU51553.1|DBSCAN-SWA 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MSRRKKGISLVILVAIISSILSSFLTIILVKDNLVSKSTGSSTPIVVNDDGKSQNIYQAVAEKATPSVVGITTTSVDTSNMFAIPTETQGVGTGIIVDSNGYILTNSHVISDGQATSVNVLFNDGSTTSGKVVWFDQQLDLAIVKVDKTGLTPAEFADSDKVKVGDISIAIGNPLGLDFQKTVTQGIISGLDRTIQTEKTNMTGLLQTDASINAGNSGGPLLNQKGQVIGINTAKASQAEGLGFAIPINTAKSIVEEVIKTGKYEKVTLGIKGTDVSNYEAATGTKLSTDKGVYVAEVISGSSAEKAGVKVGDIITKVGDTDITGMNDLNKKLYTFSKGASTKITVNRGGKAVTINVNF >CP016104|3711379:3765011|3725763_3726843_-|AXU51542.1|DBSCAN-SWA MEGKVKKAFPGGNTSQGSYSFFDYIIPENVKRVFYLKGGPGVGKSSLMKKIYKEFLHRGYDIDLYHCPSDPSSLDGLVIKKLGVVLMDATAPHTMDPKLPGALDEIINLGDYWNTEELEKNKQEISVYDKDISNSFKRAFKFLKSAEPIFRDIEEKYSDCMDYGKVNLVTEEFIKRLFDGVKSTGNLKREKHLFGSAITPVGCLDYTENILKDVNKVYYLAGEIGTGKTTLLNKVYKKAVEKGLNVEVYHYPLIPEKIETVLLTDLDIGITISTTFKEEDTIDLNQFLNREKLLKYEEDIKFDEKVLDDLICWAVLNLKRAKSKHDIIESYYSPNMRFDEVGKLRDKLIKRILKYEENL >CP016104|3711379:3765011|3736788_3737259_-|AXU51551.1|DBSCAN-SWA MKIGIVSDTHMMIKNMEKTIPYLKECDLIIHAGDNFTDSRYIHSMTNVGIIAVKGNCDFDAVEEEVVFEVANKTIFLCHGDKYGVKYGTHMLEKKATEIDADIVIFGHTHTPFREIKDGVLYINPGSTSLPRGVSYKSFVIMDIEEDNINIEEIRI >CP016104|3711379:3765011|3749286_3749703_-|AXU51563.1|DBSCAN-SWA MEKKILTVCPYCGAGCQLYLVVKNNKILRAEPANGRTNQESLCLKGRYGWDFLNDPKILTPRLKKPMIRKQGVLEEVEWDEAINYTASRLNEIKEKYGPDSIMGTGSARGPGNEANYIMQKFMRATIGTNNVDHCARV >CP016104|3711379:3765011|3718400_3719438_-|AXU51534.1|DBSCAN-SWA MLGRNELCPCGSGKKYKKCCLNKDIVSERACRKTELSQKQYTDLYSKLYDYSRQDKFKEECEKAKEMFYIMQNDSVNEKFERFFNTYLIQDHIMENKKVMTVGFLEENGANLSQSEVSILKSMFESYVSIYEVKEVSAGKIVLKDCLSGNELCTEDVKLLRSFKIGSCMIARIIDIEGTNILIDITISISNEVKDIILKDIMNLFNQYQDVYKDMKSFLIYHTHILYKYIQQLLDPSIAEYLKRERDKNDTKVNSENELAEEECKVLDTLKENVEKENIDACIEFWNEYKKNHENIKGAENGWAAAVEYYVKKEAGQPITQVQISKKYDISSSTLGKRYKDLKIS >CP016104|3711379:3765011|3720289_3720733_-|AXU51536.1|DBSCAN-SWA MKVDKTINFLNGFKKTKPCNKIYKIIIVLILTCILFKSFMYVKSINELEDYISQNKLVDKSKYTLPTTDKTREKFSKIKLNEIKKIYETIGINSITKISIDKNKLEMEGVCSDLDVLNNLRKIKYIKYYYIDSIVRDGEYYRFRIKS >CP016104|3711379:3765011|3753829_3754405_-|AXU51568.1|DBSCAN-SWA MQKITWEVEYISQLPVIRYCKKCGKKTEYICSGLFRINAQHKYLDIWLIYKCSNCDSTWNSTIYSRVNPKSLNPETLEQFHTNDYNLAKQYAMNMELLHRNGAEVGIPEYKIVGQEININDLTQVHIISKYPSHLKVSTLLREKLGLSRKVFDEMLDCGIIRSESGVDLKKGKLNYEIILDIGKEKQKSSN >CP016104|3711379:3765011|3745904_3746456_-|AXU51559.1|DBSCAN-SWA MKNKIGSFVIADPNKCTGCRACEVACFTMHNQHNNVGYTVGTVDIPVIPRLYLVKGDNFCMPIQCRHCEDAPCLNSCPQKAIVKENNIMSVNEEKCIGCKTCLLACPFGAIDLLPQYEDGKEVEQVILDENKKIAYKCDLCKDNEKIACISACPQEALKLVTPIDDKKAKNRQAALSLLLTNK >CP016104|3711379:3765011|3733305_3734556_-|AXU51548.1|protease|DBSCAN-SWA MSKYEEKRQLKCSFCGKNQDQVRRLIAGPNVYICDECVELCDEIIQEEIEDTIDEDTTSLPKPKEMMEILNDYVIGQEKAKKALSVAVYNHYKRIYSKKSSSKDIEIQKSNILLLGPTGSGKTLLAQTLARTLNVPFAMADATSLTEAGYVGEDVENILLKLIQAADFDIEKAERGIIYIDEIDKIARKSENPSITRDVSGEGVQQALLKILEGTVANVPPQGGRKHPHQEFLKIDTTNVLFILGGAFDGLEKIIQKRGGDKTLGFGAKIESKKELDLGKLYEKVLPEDLLKYGIIPEFIGRIPVLATLELLDEDALMQILQEPKNALVKQYKKLLELDDVELEFEEGALRAIAKKAIERNTGARGLRSIVESVMMETMFEVPSRDNIKKVIVTEKSVNEDSVNPIIVLKDQEESA >CP016104|3711379:3765011|3759792_3760377_-|AXU51573.1|protease|DBSCAN-SWA MSLVPHVIEQTGQGERSYDIYSKLLKDRIIFIGEEINDAIASLVVAQLLFLESEDPDSDIIIYINSPGGSTTAGFAIYDTMNYVRCDVSTICIGMAASMSAFLLAGGTRGKRCALPNSEIMIHQPMGGAKGQATDVKIAVDNILKIKEQLDRILSENTGKSIEDIRRDTDRDNFMTAIEAKEYGLIDYIMNRNE >CP016104|3711379:3765011|3754697_3754976_-|AXU51569.1|DBSCAN-SWA MSYKKAIHVLPEELLELIQEYVDGECIYIPRKSNNKKEWGSNTPTREELAIRNMQIYEDYQVGYDLQYLSEKYYLSLKSIQRIVLQEKRKDI >CP016104|3711379:3765011|3764098_3764422_+|AXU51578.1|DBSCAN-SWA MKKCLDSYSCPIEATLALIGGKYKTLILWHLKDTILRFNELKKLIPKATPKMLTQQLRELESDGLIIRVVYPVVPPKVEYSLSDFGKSIIPILDSMCDWGSDYLEKL >CP016104|3711379:3765011|3747558_3749238_-|AXU51562.1|DBSCAN-SWA MSNSIPEIENADVLFIFGYNGADSHPIVANRIVKAKKNGAKLIVTDPRVTESARIADIHLPIKGGTNMVLVNAFGNVLIEEGLYNKEFVQNHTQGFDEYKEIVKPYTAKYAEKITGIPEELIRKAMREYAKGKKAMILYGMGVCQFGQAVDVVKGLASIALLTGNFGRESVGIGPVRGQNNVQGACDMGALPNVYPGYQNVTDDKIREKFEKAWGVKLSPNNGYSLTQVPDLVLKEKKLKAYYIFGEDPVQSDPDASEVREALDELEFVIVQDIFMNKTALHADVILPATSWGEHEGVYTCADRGFQLMRKAIEPQGDVKPDWQIISEISTAMGYPMNYKNTKEIWDELRQLCPSFLGATYEKIETQGCVQWPCKSESMEDKGTMYLYEGQKFSTPNGKGNLFAAEWRPPMEVEDDEYPFSLCTVREVGHYSVRTMTGNCRTLSSLEDEPGRVQINSNDAEKLGIEDDELVRISSRRGSVITRATVTDRVKEGATYMTYQWWVGACNELTIANLDPISKTPEYKYCAVKLEKLEDQELAEKCVREEYQSLKDKMTATNI |
52 | Agrobacterium_phage(22.22%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP016104.1|AXU51560.1|3746492_3746708_-|hypothetical-protein |
3746492_3746708_-
Protein sequences of CP016104.1|AXU51560.1|3746492_3746708_-|hypothetical-protein>CP016104.1|AXU51560.1|3746492_3746708_-|hypothetical-protein MQIHRELSKSENEYMCTKKEEQRYSKCEICGVLIDDTDKVYNNTYNLCKKCKRNISTEKIVKYINIYDESN |
71 aa aa | NA | NA | NA | 3711379-3765011 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 17.14|3643693|20|CP016104|CRT matches to CP016104 position: 3757505-3757524, mismatch: 1 tgttggacctgttattccat CRISPR spacer tgttggacctgttactccat Protospacer **************.***** 2. spacer 17.16|3643792|20|CP016104|CRT matches to CP016104 position: 3757505-3757524, mismatch: 1 tgttggacctgttattccat CRISPR spacer tgttggacctgttactccat Protospacer **************.***** 3. spacer 17.17|3643837|20|CP016104|CRT matches to CP016104 position: 3757505-3757524, mismatch: 2 tgtcggacctgttattccat CRISPR spacer tgttggacctgttactccat Protospacer ***.**********.***** 4. spacer 17.19|3643936|20|CP016104|CRT matches to CP016104 position: 3757505-3757524, mismatch: 1 tgttggacctgttattccat CRISPR spacer tgttggacctgttactccat Protospacer **************.***** 5. spacer 17.14|3643693|20|CP016104|CRT matches to CP016104 position: 3756983-3757002, mismatch: 2 tgttggacctgttattccat CRISPR spacer tgttggacctgttgctccat Protospacer *************..***** 6. spacer 17.16|3643792|20|CP016104|CRT matches to CP016104 position: 3756983-3757002, mismatch: 2 tgttggacctgttattccat CRISPR spacer tgttggacctgttgctccat Protospacer *************..***** 7. spacer 17.19|3643936|20|CP016104|CRT matches to CP016104 position: 3756983-3757002, mismatch: 2 tgttggacctgttattccat CRISPR spacer tgttggacctgttgctccat Protospacer *************..***** |