Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP016106 | Clostridioides difficile strain DSM 29637 chromosome, complete genome | 20 crisprs | csa3,WYL,cas3,DEDDh,DinG,cas14j,cas14k,c2c9_V-U4,cas5,cas7,cas6,cas2,cas1,cas4,cas8b2 | 5 | 70 | 11 | 1 |
1. CP016106
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP016106_1 | 125822-125911 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP016106_1
|
1 spacers
spacers of CP016106_1
>1.1|125850|34|CP016106|CRISPRCasFinder AAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016106_1
The CRISPR arrays of CP016106_1 >merge|CP016106|1|125822-125911|CRISPRCasFinder TGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACAGAATAAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGCTGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACGGAAT >CP016106|1|1|125822-125911|CRISPRCasFinder TGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACAGAAT AAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGC TGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACGGAAT
>CP016106.1|AXU52010.1|123071_123824_+|germination-specific-N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MEYYSVFISIHIQGDVVRKYIKHIIFSFAMICLVVVSIFEIKNISEDVIKYMPVTNKTIILDAGHGGIDPGALNKDKSTSEKDINLAITLKLRELIESSGGLVILTREDDSSLYKEENNKTTRQKYNENLKNRKEIISNSNANMFVSIHLNAFEQSKYYGAQTFYPKDKQDSKELSKCIQEELKRVVDKTNNREVKPRDDIYLLKENNIPSVLIECGFLSNEKECKLLTDETYQEKIAWAIYIGIQKYLS >CP016106.1|AXU52009.1|122220_122613_+|30S-ribosomal-protein-S9 MANVQYYGTGRRKSSVARVRLVAGEGNILVNGRALENYFNYETLIRDVKQPLVLTGNENKYDVIVKVEGGGFTGQAGAIRHGISRALLKADLDLRPALKKEGFLTRDARMKERKKYGLKAARRAPQFSKR >CP016106.1|AXU52008.1|121760_122192_+|50S-ribosomal-protein-L13 MKSYIAKPADVQRKWYLVDAEGKTLGRLATEIATVLRGKHKPTFTPHVDGGDFVVVVNAEKIVLSGKKLDQKYYRYHTGYVGGLKEISYRDMMDKKPEEVISHAVSGMLPKNKLRSRMMTRLRVFAGAEHTHAAQNPEVLNFK >CP016106.1|AXU52007.1|120909_121641_+|tRNA-pseudouridine-synthase-1 MRNIKIKIQYNGKNYCGWQKQPDSLGIQGTIERAIYDITKEETSLIGSGRTDSGVHAIGQIANFKINSGISIESIPMALNAKLPKDISVIEACEVNDDFHSRYSAKGKTYKYLVYNSKFRNPILSEISYQVKYELDFDKMCSEAKSLLGTHDFKGFMSSGSSVKDTVRTIYDIDISKKDDLITFEISGNGFLYNMVRIIVGTLVDMGRGRINEPFLDIIQSKTRSRCGHTAPAQGLFLKKVHY >CP016106.1|AXU52006.1|120074_120878_+|ABC-transporter-permease MLKDITIGQYYPTSSAIHKLDPRIKLVATIVFMVSIFVVNKFWPYIVVLLCLLAMIKLANIPVKYIVKGVKPLKWIILFTFLINIFFLPGDEIWSFGFLAITKQGLRQAIFMAIRLIFLVVGTSLLTLTTSPIELTDGIERLLNPFKKIGLPVHELAMMMTIALRFIPTLLDETDKIMKAQMSRGADFESKNLINRAKNLVPLLVPLFVSAFRRADELAMAMEARCYRGGHNRTKMRESVISRRDYMACVFQVVYLGAIIATRFIAI >CP016106.1|AXU52005.1|119214_120081_+|cobalt-transporter-ATP-binding-subunit MSIIVKNLTHIYNEGMPFASKALDDVSFEIKDRDFVGLIGHTGSGKSTLIQHLNGLLKPSSGEIFINDFNITDKNLNLTEIRKRVGVVFQYPEYQLFEETIDKDIAFGPSNLGLDESEIHNRVKASMEAVGLDYEGFKDKSPFELSGGQKRRVAIAGVIAMNPEVLILDEPTAGLDPGGRDEIFNLIKDLHEKKNMTIILSSHSMDDMAKLAKTLIVMNHGSVEFMGTPREVFKSNASKLKDIGLDIPQVLELALKLREKGFDISEDILTLEEAKQEILKVVRGRGLC >CP016106.1|AXU52004.1|118393_119227_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MDNIVKVNNISFEYITDEAKLKAIDNLSLDVKKGEFVAIIGHNGSGKSTLSKNLNAILMPTEGNILIDDMDTKEEERLWDIRQTAGMVFQNPDNQIVATIVEEDVAFGPENLGIEPKEIRRIVEESLKSVGMYDLRDRQPHLLSGGQKQRVAIAGIIAMRPKCIIFDEATAMLDPSGRKEVMKTIKRLNKEENITVIHITHFMEEAVEADRVVVMEKGKKILEGTPREVFSKIKMLKEIGLDVPCMTELSSLLIEEGINISSDILTVDEMVMELCQL >CP016106.1|AXU52003.1|117932_118274_+|50S-ribosomal-protein-L17 MAKYRKLGRETAHRNLMLRNLVTCLLRSGRIETTVTRAKETRRMAEKMITLAKRGDLHARRQVLAYVMDETVVNNLFTDLAPKYAERNGGYTRIIKIGPRKGDAAEMAFIELV >CP016106.1|AXU52002.1|116964_117912_+|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-alpha MIEIEKPKVDIVELSEDYRYGKFVIEPLERGYGITIGNALRRILLSSLPGVAVNAIKIDGVLHEFSTIPGVKEDVTEIILTLKELSATIDGEGSRTLKIEAQGPCSITGADIICPPDVEILSKDLAIATLDDNAKLNMEIFVDKGRGYVSAEENKTENVPIGVLPVDSIYTPVEKVSYHVENTRVGQKTDYDKLVLEVWTNGSINPQEGISLAAKVLVEHLNLFIDLTEHVSSVEIMVEKEEDQKEKVLEMTIEELDLSVRSYNCLKRAGINTVEELANKSEDDMMKVRNLGKKSLEEVIQKLEELGLGLKPSEE >CP016106.1|AXU52001.1|116263_116887_+|30S-ribosomal-protein-S4 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MVEFVKKRDGRVIPFNEDRITRAIFLAATNVAEREGIVPDYKLSEQLTQEVIKFLNHKYSESVPSVEDIQDSVVKVLIETGHAKTSEEYIIYRTERSRIRNSKTRLMKAIEEITFEDAEDADIKRENANINGNTAMGTMLQYGSTVSKEFCKTHILKPEHSFAHDNGDIHIHDMDFLNMGTLTCCQIDVKKLFNGGFSTGHGFLREPQDIISYGALAAIAIQSNQNDQHGGQSIPFFDYGLAEGVYKTFKKFYIGNLAKALKLFKGIENNDVIKNIVYNTEKETNQKVGLKRDELYLNLEKEKLIQTFDIDDELVNKMQNFAFEESYRETDKKTYQSMEAFIHNLNTMHSRAGAQVPFSSVNFGTDTSEEGRMVTKNLLLSQERGLGNGETPIFPILIFKVKEGINLNPEDPNYDLFKLSCRVSAKRLFPNFSFLDAPFNAKYYKKGEPDTEATYMGCRTRVLSNVCGSETVSGRGNISFTTVNLPRLGIKHGIINNEKANLDGFFEELDEKINLIIEQLLERLEVQGNKKMKNFPFLMGQGVWKGSDDLGPEDTLKEVIKQGTLTIGFIGLAECLIALIGKHHGESKEAQELGLKIVSHMRHKMDEATDKYKLNFSLMGTPAEGLSGRFTKIDKKVYGEIKGITDKEYYTNSFHVPVYYNISAYDKIEIEAPYHELTNAGHITYVELDGDPSDNLEAFETVIKAMKDLGIGYGSINHPVDRDPICGFSGVITSNICPVCGRNEDESDIKFERIRRITGYLVGTVDRFNNAKKAEVRDRVKHR >CP016106.1|AXU52013.1|140222_140762_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase-activating-protein 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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP016106_2 | 132707-132791 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP016106_2
|
1 spacers
spacers of CP016106_2
>2.1|132730|39|CP016106|CRISPRCasFinder AGAATAAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016106_2
The CRISPR arrays of CP016106_2 >merge|CP016106|2|132707-132791|CRISPRCasFinder TGTGTGTTAGCACTTTAAGCAACAGAATAAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGCTGTGCGTTAGCACTTTAAGCAAC >CP016106|2|2|132707-132791|CRISPRCasFinder TGTGTGTTAGCACTTTAAGCAAC AGAATAAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGC TGTGCGTTAGCACTTTAAGCAAC
>CP016106.1|AXU52010.1|123071_123824_+|germination-specific-N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MEYYSVFISIHIQGDVVRKYIKHIIFSFAMICLVVVSIFEIKNISEDVIKYMPVTNKTIILDAGHGGIDPGALNKDKSTSEKDINLAITLKLRELIESSGGLVILTREDDSSLYKEENNKTTRQKYNENLKNRKEIISNSNANMFVSIHLNAFEQSKYYGAQTFYPKDKQDSKELSKCIQEELKRVVDKTNNREVKPRDDIYLLKENNIPSVLIECGFLSNEKECKLLTDETYQEKIAWAIYIGIQKYLS >CP016106.1|AXU52009.1|122220_122613_+|30S-ribosomal-protein-S9 MANVQYYGTGRRKSSVARVRLVAGEGNILVNGRALENYFNYETLIRDVKQPLVLTGNENKYDVIVKVEGGGFTGQAGAIRHGISRALLKADLDLRPALKKEGFLTRDARMKERKKYGLKAARRAPQFSKR >CP016106.1|AXU52008.1|121760_122192_+|50S-ribosomal-protein-L13 MKSYIAKPADVQRKWYLVDAEGKTLGRLATEIATVLRGKHKPTFTPHVDGGDFVVVVNAEKIVLSGKKLDQKYYRYHTGYVGGLKEISYRDMMDKKPEEVISHAVSGMLPKNKLRSRMMTRLRVFAGAEHTHAAQNPEVLNFK >CP016106.1|AXU52007.1|120909_121641_+|tRNA-pseudouridine-synthase-1 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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP016106_3 | 141242-141320 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP016106_3
|
1 spacers
spacers of CP016106_3
>3.1|141267|29|CP016106|CRISPRCasFinder TGTAATAAGTTAAAGCAATATGAATCAAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016106_3
The CRISPR arrays of CP016106_3 >merge|CP016106|3|141242-141320|CRISPRCasFinder TGTTTATAATGTGGATAATATTTAATGTAATAAGTTAAAGCAATATGAATCAACTGTTTATAATGTGGATAATATTATA >CP016106|3|3|141242-141320|CRISPRCasFinder TGTTTATAATGTGGATAATATTTAA TGTAATAAGTTAAAGCAATATGAATCAAC TGTTTATAATGTGGATAATATTATA
>CP016106.1|AXU52013.1|140222_140762_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase-activating-protein MKIRMSSTISYDSIVDGPGLRMVIWTQGCIHNCKECHNPQTHDLCGGFYMDTEEIINKVKSLKLQKGITLSGGEPFLQPEPLEEIAREAKINGLDVWSYTGFTFEQLLDKKNRAYFKNLNLLKQIDILVDGKFIAEKKDISLKFRGSSNQRIIDVQKSLKYKKVFLVEQYMKDDLSIAE >CP016106.1|AXU52012.1|137849_140201_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase 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>CP016106.1|AXU52015.1|154657_155839_+|membrane-associated-protein MINRLKNNTKIKIISFLSAIALWMYVMAVVDPEETKGFEDIPVSISNMSDLKDKNLVIYPDEKLTADVYIKGSLSKVQSVKKEDIHVYGTIEDPIQGQKEVYLKANIPQGVTLEFKHDVLVVNLEKNIKEKRDIKVEVSGNSKRNINKIELSKEFVDVSGPRTLVKEVKSVRANLDVGNETDDFSKKLQLIPLNSDGTKVEGVTLSSSFVTAKIELLKEKIVPIRVSLNDNKDNDVLKNYKLSKEQVTIKGKKEDIDKISYIKTKPIDLADLANGEEKEVSLEIPEGITLEDSSITIKLNDTKQLSAEFLYNAGDIELRNIPTNMDNPNVISDVDIKVVVESTEDLSKLNKKDISLYIDLSQGPEEDSKYKIKYETTYQFKKINIEPNIVEVE >CP016106.1|AXU52016.1|156142_157045_+|phosphate-butyryltransferase MRSFEEVIKFAKERGPKTISVACCQDKEVLMAVEMARKEKIANAILVGDIEKTKEIAKSIDMDIENYELIDIKDLAEASLKSVELVSQGKADMVMKGLVDTSIILKAVLNKEVGLRTGNVLSHVAVFDVEGYDRLFFVTDAAMNLAPDTNTKKQIIENACTVAHSLDISEPKVAAICAKEKVNPKMKDTVEAKELEEMYERGEIKGCMVGGPFAIDNAVSLEAAKHKGINHPVAGRADILLAPDIEGGNILYKALVFFSKSKNAGVIVGAKAPIILTSRADSEETKLNSIALGVLMAAKA >CP016106.1|AXU52017.1|157066_158146_+|butyrate-kinase 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You can click texts colored in the table to view more detailed information
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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|
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016106_4
The CRISPR arrays of CP016106_4 >merge|CP016106|4|143254-143343|CRISPRCasFinder TGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACAGAATAAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGCTGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACGGAAT >CP016106|4|4|143254-143343|CRISPRCasFinder TGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACAGAAT AAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGC TGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACGGAAT
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| CP016106_5 | 148709-148793 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP016106_5
|
1 spacers
spacers of CP016106_5
>5.1|148732|39|CP016106|CRISPRCasFinder AGAATAAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016106_5
The CRISPR arrays of CP016106_5 >merge|CP016106|5|148709-148793|CRISPRCasFinder TGTGTGTTAGCACTTTAAGCAACAGAATAAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGCTGTGCGTTAGCACTTTAAGCAAC >CP016106|5|5|148709-148793|CRISPRCasFinder TGTGTGTTAGCACTTTAAGCAAC AGAATAAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGC TGTGCGTTAGCACTTTAAGCAAC
>CP016106.1|AXU52013.1|140222_140762_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase-activating-protein MKIRMSSTISYDSIVDGPGLRMVIWTQGCIHNCKECHNPQTHDLCGGFYMDTEEIINKVKSLKLQKGITLSGGEPFLQPEPLEEIAREAKINGLDVWSYTGFTFEQLLDKKNRAYFKNLNLLKQIDILVDGKFIAEKKDISLKFRGSSNQRIIDVQKSLKYKKVFLVEQYMKDDLSIAE >CP016106.1|AXU52012.1|137849_140201_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase 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|
13 spacers
spacers of CP016106_7
>7.1|1267461|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGAAGCTTGCAAAGTATTCTCTAAAGTCCTCTGCCT >7.2|1267527|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGTACACTGTATATAACATATTATTAATACTTGT >7.3|1267591|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATATAAGTGCTTATGTTACAGCTTATGCAAGGATA >7.4|1267656|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGAGTGACTTATATTGTTTGACAGCTCTTTGTAAGT >7.5|1267722|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATGAAAATAACCCTAGAAACAACCATGATGCAGTA >7.6|1267787|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCTTTCTAGCTATTTCACAGTCTTCTTTATTATCGC >7.7|1267853|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATATAATTATAACACAGGAGTTCCTTAAATGAAAAC >7.8|1267919|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGATGTAATGAGAAGTTTATTGTATCTTGTGTAGATG >7.9|1267985|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAAATATATCAGAAGGAGAAAATAGAGATGGGAAAG >7.10|1268051|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAAAGTATTAAAAATACTAGTTTTTATAGGTAAGAG >7.11|1268117|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGAAAATTTTTATTAGCCTTACATGCACCACATGT >7.12|1268183|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGTACGGATGCGTACGACGTAATTATAATTTAATAT >7.13|1268249|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACAAAAAAGATACATCTGTAACTAATTTTTATACT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016106_7
The CRISPR arrays of CP016106_7 >merge|CP016106|7|1267432-1268313|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGATGAAGCTTGCAAAGTATTCTCTAAAGTCCTCTGCCTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTGGTACACTGTATATAACATATTATTAATACTTGTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGCATATAAGTGCTTATGTTACAGCTTATGCAAGGATAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTTGAGTGACTTATATTGTTTGACAGCTCTTTGTAAGTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTATGAAAATAACCCTAGAAACAACCATGATGCAGTAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGATCTTTCTAGCTATTTCACAGTCTTCTTTATTATCGCGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAATATAATTATAACACAGGAGTTCCTTAAATGAAAACGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAGATGTAATGAGAAGTTTATTGTATCTTGTGTAGATGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTTAAATATATCAGAAGGAGAAAATAGAGATGGGAAAGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTAAAAGTATTAAAAATACTAGTTTTTATAGGTAAGAGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAAAAAGAAAATTTTTATTAGCCTTACATGCACCACATGTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTCGTACGGATGCGTACGACGTAATTATAATTTAATATGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAACAAAAAAGATACATCTGTAACTAATTTTTATACTGTTTTATATTAATTAAGTGGTATGTAAAG >CP016106|7|1|1267432-1268313|PILER-CR GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG ATGAAGCTTGCAAAGTATTCTCTAAAGTCCTCTGCCT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TGGTACACTGTATATAACATATTATTAATACTTGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG CATATAAGTGCTTATGTTACAGCTTATGCAAGGATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TTGAGTGACTTATATTGTTTGACAGCTCTTTGTAAGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TATGAAAATAACCCTAGAAACAACCATGATGCAGTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG ATCTTTCTAGCTATTTCACAGTCTTCTTTATTATCGC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AATATAATTATAACACAGGAGTTCCTTAAATGAAAAC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AGATGTAATGAGAAGTTTATTGTATCTTGTGTAGATG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TTAAATATATCAGAAGGAGAAAATAGAGATGGGAAAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TAAAAGTATTAAAAATACTAGTTTTTATAGGTAAGAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAA AAAGAAAATTTTTATTAGCCTTACATGCACCACATGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TCGTACGGATGCGTACGACGTAATTATAATTTAATAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AACAAAAAAGATACATCTGTAACTAATTTTTATACT GTTTTATATTAATTAAGTGGTATGTAAAG >CP016106|7|7|1267432-1268313|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG ATGAAGCTTGCAAAGTATTCTCTAAAGTCCTCTGCCT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TGGTACACTGTATATAACATATTATTAATACTTGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG CATATAAGTGCTTATGTTACAGCTTATGCAAGGATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TTGAGTGACTTATATTGTTTGACAGCTCTTTGTAAGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TATGAAAATAACCCTAGAAACAACCATGATGCAGTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG ATCTTTCTAGCTATTTCACAGTCTTCTTTATTATCGC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AATATAATTATAACACAGGAGTTCCTTAAATGAAAAC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AGATGTAATGAGAAGTTTATTGTATCTTGTGTAGATG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TTAAATATATCAGAAGGAGAAAATAGAGATGGGAAAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TAAAAGTATTAAAAATACTAGTTTTTATAGGTAAGAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAA AAAGAAAATTTTTATTAGCCTTACATGCACCACATGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TCGTACGGATGCGTACGACGTAATTATAATTTAATAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AACAAAAAAGATACATCTGTAACTAATTTTTATACT GTTTTATATTAATTAAGTGGTATGTAAAG >CP016106|7|1|1267432-1268313|CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG ATGAAGCTTGCAAAGTATTCTCTAAAGTCCTCTGCCT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TGGTACACTGTATATAACATATTATTAATACTTGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG CATATAAGTGCTTATGTTACAGCTTATGCAAGGATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TTGAGTGACTTATATTGTTTGACAGCTCTTTGTAAGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TATGAAAATAACCCTAGAAACAACCATGATGCAGTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG ATCTTTCTAGCTATTTCACAGTCTTCTTTATTATCGC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AATATAATTATAACACAGGAGTTCCTTAAATGAAAAC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AGATGTAATGAGAAGTTTATTGTATCTTGTGTAGATG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TTAAATATATCAGAAGGAGAAAATAGAGATGGGAAAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TAAAAGTATTAAAAATACTAGTTTTTATAGGTAAGAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAA AAAGAAAATTTTTATTAGCCTTACATGCACCACATGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TCGTACGGATGCGTACGACGTAATTATAATTTAATAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AACAAAAAAGATACATCTGTAACTAATTTTTATACT GTTTTATATTAATTAAGTGGTATGTAAAG
>CP016106.1|AXU52967.1|1265049_1266477_+|cell-surface-protein MKIKKLLTIGLSLSIFIASCPISANALDKIESIKGADKYETAGIIADKQNYTTAILINADSTMADGLSASGLAGAINAPILLTKKNNIPNATLKRLEKAKKVYIIGGENSIDKYTETVLKGKGIEIKRLQGSDRIKTSYNVAKEINSINKVNKVILTNAFKGEPDAMSAAPVAVRDKAAIVLTDGKSVPFNTTGVESYVIGGTSSMNDKIVKDTNSTRLGGTDRYDTNKKIINKFYSGVKEFYIASGTDLVYALVGSTVAKNNAIVLVDNDSNKSVLKSTTKLTAIGNLSDSILQQCLNVTKNIGDSNTGREYTVEDAANAVKKLLGVKKFYYEPNYSEDEDLIFLLDKNFDFSGKEYYVFAYIKQGAEGDVRYCVAKNDMSKVYTYDVNGNMKVYNPDDYKNKGSITEEQAKQIALKECAKRHKVSINNLVVDMIDFRDDIYSGNVYAVKINSKNSNGTFGWFFIDIETGKVYN >CP016106.1|AXU52966.1|1264037_1264859_-|lipoprotein MIISKKITAILVSFLIMISMVGCAPKESATEVAKKYLDSIEIKDYEVAYNLLSKDSKESVSLEKFEEYQDTLFKLQTLKDYKLGEENKVEKYKYSNKEYTNLVKIKETDTIKYITENKEDTANFDRYFIIEDNEYKLLWHKDFKRALSSNYVKIARSETEKDEDKDYNKAAIDIKKAIEIDDKNPLAYYTQSYIYIELQRYDEALKSIDKYLEYLDKNNEAYKIDASDAYNLRGVIFMSKSEFNKARESYNKALELNPDNEYAKTNLNDIKGL >CP016106.1|AXU52965.1|1262395_1263913_-|site-specific-recombinase MSVAIYLRKSRADEEAEKQGEFETLSRHKSTLLKLAKEQNLDVIEIKEELVSGESIIHRPKMLELLKEVEENKYDAVLVMDLDRLGRGDMKDQGIILETFKESKTKIITPRKTYDLTDEFDEEYSEFEAFMARKELKLISRRMQRGRIKSVEEGNFIGTSAPFGYDAVTTGRKERILVPNKDADVVRTIFDLYINEDMGCSKISKYLNNLGIKTATGANWYNSAITNIIKNKVYCGYIQWQKKDYKKSKNPNKIKTVKLRPKDEWIEAKGKHEPLISEITWKKAQNILKKNGHVSYGNQIKNPLAGIVICKNCGRPLVYRPYADHDYIICYHPGCNKSSRFEFIEAAILKSLEDTVKKYQLKASDIDLDKNNKDSNIEFQKRVLKGLETELKELGKQKNKLYDLLERGIYDEDTFIERSNNISSRTEEIKDSIKTVKNRLNTVKKDNSKIIEDIKTVLSLYHDSDSLGKNKLLKSVIDKAVYYKSKEQKLDSFELMVHLKLHEDQ >CP016106.1|AXU52964.1|1262088_1262373_-|RNA-polymerase-sigma-27/28-subunit-RpsK/SigK MCNEISLLDILGTEANYVLDEVELKVQVGKLYEQLNKILTPREREIVQLRYGLTPYGYKTQREIAQKLDISRSYVSRIEKKALKKLEKELVQES >CP016106.1|AXU52963.1|1260321_1261992_+|penicillin-binding-protein MSKKKTPFLKKVGKRSWCIFTIILIIYSVLIYRLVDIQVLKGDKYKQSVESQSVEKVELNSGRGIIYDRNNKKLTDTSKSQVLIVEKEKLNNNYKILELIKKATKMTDLDIYKAVQEQLTRPIIQIQTKNIDIDKSMKKELEKNGIMVEEKTMRYAKDGLLSHTIGYIKEDDKSGQSGIEKSMDSVLRNSNEKYISAFKAGDAGNEKSLNILKGSVKTVDNKDKDRHLKTTIDYNIQKKLEQILNKEENPTAAIISEASTGEILAMCSRPNFDQNDISKSLKGKNGEFENRVIKATYPPGSVFKMVVLFSALENGVIDENYTYNCTGKTKVGNTNEILRCNKRDGHGFQNLRQAFSNSCNPAFLDIAMKLGKEKILKSAEKLHLFEKVDIGLDEEKIREAPKNISIRNLAIGQENIEFTPLQINQMTQIIANNGTFKPLYLYKSLVDNNMNTIKTYKSSKKEELISPYVCTQVKEYMKSVSRTGTAKDLKDIEGGCGVKTGTAQSSLNKKAIDHGWITGFYPEERPKYVITVLVEGTQKGNKSATPIFKEICESIK >CP016106.1|AXU52962.1|1259002_1260250_+|protease MELNKVELLAPAGDLERLKIAITYGADAVYIGGEIFGMRSAAKNFSKEDMAEGVAFAHERGKKVFVTVNIIPHNEDFLQLEDYLLELEEIGIDAVIIADPGVLSVIKKVIPNMEIHLSTQANTTNYLSANFWYEHGIKRVVVARELSFDEISEIRAKTPLDMDIEAFMHGAMCISYSGRCLISNYMTGRDANKGSCAQSCRWQYHLVEEKRPGEYFPIYEDERGTFFFNSKDLCMIEYIPELIKSGITSLKIEGRMKTAYYVATVVRAYRMAIDEFYRDPENWKFNPMWMEELKKGSHRHFTSGFYLNKPTTEDQNYQSASYVRNYDFIGIVRETEDEDGLIVVEQRNKMCVGDEIEVMGPYKETMFTKIEEMYNEEGEAIESAPHPRQIVKLKLSVKVGKDYMLRKVIEEKVEE >CP016106.1|AXU52961.1|1258341_1259016_+|O-methyltransferase MSNIVNDLVEDYIRVTLKEKEGFLKDLEIYAEENSVPIIHKEVSDLLKVLLKVQKPKRILEVGCAIGYSSIFFATIIGKDADIITVERNEKMIEKAKENIKLAGFDNNITILEGDAEEKLSQVQGEFDLIFIDAAKGQYKLFFDLVIDKLKDGGLLVSDNILYKGMVAHDDFVVRRKKTIVKRMRNYLDYICNCDYLSTSLVPIGDGVALSYKESKRGDVDGIK >CP016106.1|AXU52960.1|1257090_1258170_+|exported-aminodeoxychorismate-lyase MNFKENRLKIAVLIIVILIILAGIFVFIQIGPYDKNNKKDVIIDVPSGASVGKISDILYENKLIKNELLFKLLVKVSNKAPSIKSGTYLLNQSYSNNDIISLLVSGKIYQDGIKVTIPEGATSKEIIAMLVSKNLGDKATFENLIKKPQEFYDKFPYLKEDGITSLEGFLYPETYYFNSKKQSEEDILSEMLKVFDSKYTDKFKKKQKELNMTLQEVMEMASIIEKEAVLDKDRPIIASVFYNRLKVGMPLQSDATIQYIFEERKKIVTYDDLKIDSPYNSYKNKGLPPTPISNPGIKSIEAALYPEKTDYLYFVAKIDGGNNYSTNYQDHLKYVKEYKEARDKQSKDTKATNKENTKK >CP016106.1|AXU52959.1|1255552_1256878_+|pyrimidine-nucleoside-phosphorylase MRMYDIIKKKRDNLELSKKEINYFIENYSKGDIPDYQASALLMSIYLNKMNKQETVHLTEAMMNSGDMINLSEIDGIKVDKHSTGGVGDKTTIALIPLVASCGAPVAKMSGRGLGHTGGTIDKLESIPGFSTEMEISKFIDSVNKSKIAVCGQSAKVAIADKKIYALRDVTATVDNISLISSSVMSKKLASGADAIVLDVKTGDGAFMKTLEESFELAKSMVDIGTGMNRDTIGIVTDMDEPLGFAVGNSLEVIEAIETLKGNGPKDLVELCEVLGAYMLVLSKVAHDFEDGVEKIRESIKSGTAIQKLKEFIENQGGNKDVVDDYSLFKKSKYKYPVKSTKSGYISKIKAEDVGVSAMILGAGRETKDDILDLSAGIILEKKVGDYVNEGEVLAYMYYNDEQKLSLAKGRFIDSYSIVDSKIEKNKLIYGIVTKEEIKKF >CP016106.1|AXU52958.1|1254536_1255349_+|purine-nucleoside-phosphorylase MFEKIAQSSKFINSKSNIKPKIGLILGSGLGDLANDIEDPVTIKYSEIPNFPVSTVAGHAGQLVIGKLEGKEVIAMQGRFHYYEGYSQKEATFPVRVMKELGVEILIVTNAAGGVNKEFKAGDLMLIRDHINFSGSNPLVGKNDDRFGARFPDMSDAYSSKYVDVVKNCAKECNIDVKEGVYMFFSGPNYETPAEVRMAQILGADAVGMSTVPEVIVASHSNIGVIGISCITNMAAGILNQPLSHEEVIETTQKVKSEFMNLVKTTVKNL >CP016106.1|AXU52968.1|1268599_1268824_-|putative-transcriptional-regulator MDVNQRIKYIRENMNSSQKELLEKTNINTSVMNRIESGERPTRDDGLIIFAKIFGLYTDYILGLSDTEKLNIGN >CP016106.1|AXU52969.1|1269502_1269658_+|phage-anti-repressor MALEVKIEVKIIKDVVILNITHWKKETSLLTVKIARGQGDLSYVKYFTNES >CP016106.1|AXU52970.1|1269903_1270155_+|hypothetical-protein MSSYFITRGDVMKILQQFKPYKYDKEKNIEYDEKIIANQNTEVYIVYPRISDEENRRRWEEFNEVAKEVAINIAMKKVETVES >CP016106.1|AXU52971.1|1270475_1270589_+|hypothetical-protein MVEVNIKIKGEVSEIINSIRDIFNSFDEELILDIKSE >CP016106.1|AXU52972.1|1270796_1271006_+|hypothetical-protein MMGLKLKRRYKNVLIYINIRTIIHINCKIKFIELYLTFNELKNKLANNEKTTVINENNKAFSGLVDFSN >CP016106.1|AXU52973.1|1271374_1271758_-|hypothetical-protein MRKKFFIGILIVLIISVIAILNIKNDKNVFIGESENWKAKFVTTEGHSKLEIKYKNSKDVVEQKFNYSYQFIDGEDAVVVVKNEILEAGQEKAIKIQRPGLYSNRESSYKLIISWNGNEETINLKKK >CP016106.1|AXU52974.1|1271884_1272214_+|hypothetical-protein MNYRLKKSVTTILSLLIMTILLPTNASASKVEDSSMKVMYLEKQVTDMDKLYDMAKNGITDVKSSNEKGIIKNARTGESIYVDSISTTQLLEVKQSKNLTSKIYSKTVF >CP016106.1|AXU52975.1|1273610_1273928_-|hypothetical-protein MDFGNINLILIGIIVIIGTTIIYLIKPKTAFCSKKYFNKLESIYGNIDKKKTVKLEVLYRYVTGLEYIAIGLFTKRLDITIIAIILVATITVILYYLVRKRYITI >CP016106.1|AXU52976.1|1274219_1274789_-|hypothetical-protein MKLRNPKIKKLLSVALLAALIGIPIGQTANAMEISNNVPSYIENNPTTIEDLEINDSQLPKPGTVTYIDINKLIKNLKENGIDTTLIENELYYRKAGTNKIVWTKTGFDLYLSKGVALTLAGAGTGVAGLLAGAIPGIGQYLAAAIVGAITMHLGSNITSGKIFKFKKMRYNKGGAYVTKYYLQSVRNQ >CP016106.1|AXU52977.1|1275231_1275621_+|regulatory-protein MKINKLPHAELKLMKYIWGVDDVLASRDIIEDMKLKYDWKKSTTLTFLKNLVDKGFLTTDKVDRCTHYTIAIKEKDYLKVETKSFFSFMHNNSFKSFISALHDDEVLDSKSLNKLEEYFKNLKEEDIDD |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP016106_8 | 1474779-1475331 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP016106_8
|
8 spacers
spacers of CP016106_8
>8.1|1474808|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCACATTAAATCTCAAATTATCACCTCCTTTTTCA >8.2|1474873|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCGGATTTTTCTGCTTCTACTGGTGTTATTGAGACTT >8.3|1474939|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTAGATTCTTTCTATTCTTTTTAATAAATTATTTTT >8.4|1475004|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAGAACCATCAATATTAAGAGCTGGTAGACAAACTC >8.5|1475070|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTAATTCCTCGGCTTTCTTTTTTAGATTGCATAATT >8.6|1475135|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTATAGTCTTTTGGATAACTACCCAATTAGGATTT >8.7|1475200|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT GCATATGTATATATCATTGAAATAAGTTTTAAATGTC >8.8|1475266|37|CP016106|CRISPRCasFinder AGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016106_8
The CRISPR arrays of CP016106_8 >merge|CP016106|8|1474779-1475331|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTGCACATTAAATCTCAAATTATCACCTCCTTTTTCAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATCCGGATTTTTCTGCTTCTACTGGTGTTATTGAGACTTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATCTAGATTCTTTCTATTCTTTTTAATAAATTATTTTTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTCAGAACCATCAATATTAAGAGCTGGTAGACAAACTCGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATGTAATTCCTCGGCTTTCTTTTTTAGATTGCATAATTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATGTTATAGTCTTTTGGATAACTACCCAATTAGGATTTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATGCATATGTATATATCATTGAAATAAGTTTTAAATGTCGTTTTATATTAACCAAGTGGTATATAAATAGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAAATTTTACATTAACTAAAATGTATAGAATA >CP016106|8|2|1474779-1475199|PILER-CR GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TGCACATTAAATCTCAAATTATCACCTCCTTTTTCA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CCGGATTTTTCTGCTTCTACTGGTGTTATTGAGACTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTAGATTCTTTCTATTCTTTTTAATAAATTATTTTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TCAGAACCATCAATATTAAGAGCTGGTAGACAAACTC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GTAATTCCTCGGCTTTCTTTTTTAGATTGCATAATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GTTATAGTCTTTTGGATAACTACCCAATTAGGATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT >CP016106|8|8|1474779-1475331|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TGCACATTAAATCTCAAATTATCACCTCCTTTTTCA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CCGGATTTTTCTGCTTCTACTGGTGTTATTGAGACTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTAGATTCTTTCTATTCTTTTTAATAAATTATTTTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TCAGAACCATCAATATTAAGAGCTGGTAGACAAACTC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GTAATTCCTCGGCTTTCTTTTTTAGATTGCATAATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GTTATAGTCTTTTGGATAACTACCCAATTAGGATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GCATATGTATATATCATTGAAATAAGTTTTAAATGTC GTTTTATATTAACCAAGTGGTATATAAAT AGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAA ATTTTACATTAACTAAAATGTATAGAATA >CP016106|8|2|1474779-1475265|CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TGCACATTAAATCTCAAATTATCACCTCCTTTTTCA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CCGGATTTTTCTGCTTCTACTGGTGTTATTGAGACTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTAGATTCTTTCTATTCTTTTTAATAAATTATTTTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TCAGAACCATCAATATTAAGAGCTGGTAGACAAACTC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GTAATTCCTCGGCTTTCTTTTTTAGATTGCATAATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GTTATAGTCTTTTGGATAACTACCCAATTAGGATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GCATATGTATATATCATTGAAATAAGTTTTAAATGTC GTTTTATATTAACCAAGTGGTATATAAAT
>CP016106.1|AXU53163.1|1474346_1474499_+|hypothetical-protein MDNFLQGVLASLVASLIVYLNSKLFKKVKSHSGRSDFSFELKIKFKKNKH >CP016106.1|AXU53162.1|1471904_1473260_-|drug/sodium-antiporter MDTKISINENMSLGKRFFKYLAPSVVAMWVFSLYTMVDGIFVSKGVGELALAAVNISMPFINFIFAVSLLFSTGASTIIAIYLGKKDIKSANEVFSFNLVSIIILSIIILAITFFNLDRLALFLGATESTIGMVKDYLGIIIFFNGFFIVSYSLEVIIKTDGFPILATVGVIISALTNIILDYLFVIEFGWGVKGAGIATGLSQVFSTIFFLIHFLRKNSTLNFSKFRIDFKTLRKIVFIGFPDSTTELSCGIVVLLFNLSLTKYIGENALIYYSVINYINTLVLMTMMGITQGMQPLTSFYYGAGNIDNVKKLLKMGIKATIIASVAVFAICMAFSGPIVSLFIHPEETMLFNEGVRVFKIFSISFLLVGINVIISGFFVSVEKPSISTVISLGRGLVIVVLSLISMILIFGGQGIWMTTIVSEFICLVLSLVFLKKNFSTLDSNLNKVA >CP016106.1|AXU53161.1|1471136_1471787_+|ATP-binding-protein MADEKFVMSFSGGKDSILALNRMLKKGYKPVALLTTISEEHGKSWTHNLEYNMLKQVSSNIGLPLLVAECGVEGYEESFERALIKAKNMGATICAYGDIDIESHRKWDTDRCEAVGMKVDLPLWQESREDLVYEFIDSGFCSVVTKVNLKHLGEEFLGKKLTRELVEKIKNAGADPCGEHGEYHTFVVDGPIFKKPVEYEVKGTLIKDGYGYLEIK >CP016106.1|AXU53160.1|1470623_1471052_+|EamA-like-transporter-family-protein MTKLWAIIFALLAGGSTALEAFINGELGKSTTALVATFISLTVGAIFFLASIIVTGDLKCLVSINGFNYKLLLGGVFGGLIIYFTVKAIPNLGVSNTLILTLVSQVLVGFFIDSVILGQETMHLYKYIGVVLLILGTFFIVN >CP016106.1|AXU53159.1|1469923_1470472_-|hypothetical-protein MYTNFNIDFNNFNKKENAIKFMLMGVLLIILGLLCLTFKTLGIKLISWTFGIALLFFAYLNLKNINELKRYATKEEIKPSINIQWVLIIACILLFVFPQKIQSIFSLFLGFYLIFNQLVALVNSKNNPYSKFTTWNIVKILFGICLILSPLFLSRFIVSIMSFFIILFGLVLFFSGNTARKY >CP016106.1|AXU53158.1|1468869_1469856_-|radical-SAM-protein MFFVQAQRTILLEIGDFLDKFKYAFDNKRYHTWNYYLRNTFGEKVFKVSINAGFTCPNIDGSLGYGGCTYCSKEGSGDFAGNPKDNLISQFYNIKEMMLKKWPHAKYIGYFQAYTNTYAPLEVLKEKYETILELEDVIGLSISTRPDCLPDDVVEYLSELNKRTNLWVELGLQTIHDSTSKIINRGHDYKTFVEGVEKLKSKNIKVVVHIINGLPGEDYNMMMETAKAVGKMGVDGIKIHLLHVIKDTPMEKMLQNGMLTLMEQDEYINLVCDQLEILPETMIIHRLTGDGKRDELVGPIWSLKKWEILNQIDDTLKARNSYQGCKFV >CP016106.1|AXU53157.1|1467654_1468599_+|membrane-protein MGEKSKGYVFIAIAGLLWATLGLFGKFLMGNGLTSEQVAFTRLFFGFIVLGVYSSIRTPQILKISKKGIMYSVIIGIICQAMFNLCYFKAIDIAGVSIAAVLLYTSPLFLAIFSKVCYKENITRSKLFSLILCFIGAIMAVTGGRLDFQGLNAFGLLLGVLSAIAYALMPTISKNALKEFSSSTILVYSFLFGAIFMIPSSRPWEILNYAKDLDVLSCMLMLGIVPAALAYIFYAAGISKGVELSVAGVVASVELVGSVIIGCTILGESFSLGKLFGVMLMLISAVVALNLSYDEIRIFYKSNKLKQIEKTESI >CP016106.1|AXU53156.1|1465906_1467337_-|sigma-54-dependent-regulatory-protein MNLDLEFYQKILEASHDEICVSDDKGIIIYCNKAFEENYGLKKEDILGKNVSFLEDSGYSTKSPIPIVLKTKTKFSLEQDTQTGKKLIITATPIFDENGNLEFTVENCRDITELNNIKNKLEDTKKQVKKYKSEVETLYRTALRIEDTVIMDGIVMRPIINTVNHVSKTDVSVLLLGESGTGKSSLARYIHHNSNRSNGPFITINCATISPQLLESELFGYTSGAFTGASTKGKVGLVELANGGTLFLDEIGDIPQNLQAKFLQLIQDRTFTPVGSLKNKKVDIRIISATNVDLVSKVKEKKFREDLYYRLNVIEIKLPPLRERRDNLVEIIKYYFNRYSSDFNLNKTISKEAMDAIANYRFPGNIRELQNIIQKILLTCTDNHITIDDLPNILTKNIHITNNGNKTHISQINKVIISDSKSTNYKNKNFDTLIKEYEKNIILDAYEKFGSSYKVAKHLEISQSKANRLIRKYTNT >CP016106.1|AXU53155.1|1465122_1465707_-|hypothetical-protein MLMNTHFIMAKSILDNIDENKTFFISEKNFIYGNIKPDAFSKYKLKKHYLDESFNMIVSKINYLCSLNIDSLSKYFSVSRLSQELGVICHFLCDFFCVAHSERWEFKHSLNKHVTYERELGAFAKDVDLSKIKCGTINSSFEKFFTKLYSDYKKKTDYMNDLKFSAYTCNSVINYILDSILSNTIKSYHIANCG >CP016106.1|AXU53154.1|1464239_1465019_+|hydrolase MIKHIFCDLDGTLYENGTITKEDIVAIEEIEKKGVQFNVATGRIFKQAHNIIKDSLDMNGYYVCENGSFIYDKDYNVIFKRTIDDNLVKKVIDRFESSDAQLYFKYKGDVIVGSDTTAFRHYSSDFIVDPDFEKRSSFDNLIGNIGVCSENLEELSRIELYLKSEFSEVLEIYFSGTYTLNIVPKSVSKRGSIEHVIKTLNVSPDEVATIGDSPNDICMLEGFKYSFAMSKAREDVKQSANYVVDSVKSAIDVIMEINS >CP016106.1|AXU53164.1|1475656_1477390_-|signaling-protein MSILLKKAPKLAKHIITSFYINRDINEVLKYLCENVTWIGPGEQEFLTSFNEIKNYFYAGQDEIPSCDINNDIFETVSEDENRCMVLGRYTVRTKENAQMILEVNQRCTFEIIEDRGKLLIKHMHISNPYGEMQLDEYFPTKIGTQSYDYLQRLLKEKTEVIEMITNNINGGLKGSNDDSTYSFFYVNEGLPKILGYTYDEFMEMSGGSAVGAVYPPDLPKALEDCERCFAKGPTYSSEYRIRKKDGTLMWVLDSGMKSLNSDGIVKINSIITDITQLKNIESELKLERERYRIALQNITDIMFEYDIENDTLIKYQRVEIDKKIELENFETKNYSKLLESGKIIHLDDIGKLLEVLHGNLRETIEIRQVNSLTKNEWRWIRVQCSVIYDSDHNPIKTIGVLKDITEDKSKLESLINQAQRDPLTQLYNQRVSQNLIEEYLCSSDSKNNDALLVIDIDDFKTVNDTFGHLEGNEVLVAVSKILLHNTHDKDIVARIGGDEFTIFIKSLTKDLIIKITNDILNDASKIKVKDNHKITLSIGIAFTDDSTKLYKDLFSKADKALYLSKADGKNCYSTYE >CP016106.1|AXU53165.1|1477629_1478475_-|signaling-protein MFKEIFLRTFPGFLIIRDSNYRIIFINDNLKNLIKSYMQDNPLGMTNIEIAKKLPDNIAKFFTDSHNIQLDWEKNYPYDKISNWILEFKKDTTSYWNVLEYKVDVDEKTYIITMANDITKLYEENKRNLHYSITDPLTGAYNRKYLNDRFDIFIGDYIVLIDLDNFKMINDYEGHNVGDKILCDFVSLLNKELINSTSIIRLGGDEFIVIFSSDVDKNYVYSQLEALRENFLKVFSKYKYLSFSYGVDTVKRNLKLTIVELDKKMYKNKEKNKKKFDKNDY >CP016106.1|AXU53166.1|1478505_1480740_-|signaling-protein MQNHNYIKMLNKKVEVLSKELDSRNFKLKTLNEIDFFSKIPNREFMYQHIDDCISKNIHIGIMLLNIDNFKLFNDIYGYLVGENLLITLTQNLLHFIPESKGIVAYLKGEGFLIVLPNVSNKELNNMGATIIESARELKIKLPNEKEIYSNVTFSIGSTIWNGEPNMTTLMLFNQVYSALKKAKSEGKNRYILFDFKDNSFYNKLENDKEFLSEISHVLQTKQIEVFYQPLYNIKNNTIVGCEALARWRHPIKGLLTPDKFIPLFEQFGLITELDLHLFEENCKNIRRWIDNNDVFVPICCNFSRLHFFNPNFPSMLKGITEKYSVSTSNFSIEITENILIENTNTIIQQLAELRSYGFSVSMDDFGSGYSSFGMLQNLPFDIIKIDRIFLSHNLNDFKNTTILYSIINIARALGMLTVCEGVETEQHVEFIKSINCDIAQGYYYAKPMECKEFEKLLSKENNSEKMFIKYSDIGKSLIEKIFDGFFIMQDMKKLRANVTEDIQWFDFYNKTEITSFPKVIEHFEKHIKGKKFSILYKSITPHNTESDSLLISGEAVLSDEASEHQKYSNFYFSANCIISENKLLLAKLHLDLIKTAGYINEFESYSIPKMTNTHLDESNILSQFYSMLPVGIIRYDLFGDMIITYMNEEMFDIIGYTKEQFFGEMGGNLRAIVHPDDLDFVYKKSLDMIDTNKIEPFLYRFIKRDGQIVTVMYTQCNLSAIDGRSIAQGMYVDVNKIKNLTKI >CP016106.1|AXU53167.1|1481523_1482333_+|MerR-family-transcriptional-regulator MKDYYKIGEISKIYGIGRDSLMYYEEIGILRPVRDINGYRMYNISDIWKLNLIKEFRSLNFPMKKIKEYLDDRSIESTKNILNEELDLIDKKIAEFISHKENIIKRLSSIESVIQNTKIDEIEVVYIEKRKALELNADIKRDEDFDFLIQKLQKEYEDRFNILGNNNIGSAFSTEAINKGIFNEFKSVFCFLESNEKVYNIVFDEGYYVTLNYTGSNSNNKMYMEKVFKFIEENNYKIIADPIEIYKIDIHETGIVEEFVTEIQVPITK >CP016106.1|AXU53168.1|1482477_1482717_+|hypothetical-protein MKCSNCGSVNIEKGILTTGGIYAETIGLKYRGDGKLDKVINKTFPVQSTIYSDLCLDCGEIVRTYIKDNTDRNWCKDKK >CP016106.1|AXU53169.1|1482887_1483064_-|hypothetical-protein MFRDEMDKCTHMLTAYISSLYDYCDFIDTQLDDFILEYGENVVESCLHQVMVLVSKYN >CP016106.1|AXU53170.1|1483568_1484243_-|MgtC/SapB-transporter MNHHILIQFEYIARIITAGFCGALIGYERKNRLKEAGIRTHFIVALASALIIIVSKYGFNDIVGTPGIGLDPARVAAQVVSGIGFLGAGLIFIRNQSVSGLTTAAGIWATAGTGLAIGSGLYLVGIVSSIIIVIVQITLHRDRKWMKLPTAEQVSLKISNSTDSIEYIEGKFKKSNIEIINMNIKRLDGDWLEVVIYTKLPKGYKKTNLLKLFSDNPLIETLEI >CP016106.1|AXU53171.1|1484462_1485017_-|isochorismatase MSIALILIDIQNDYFKNGKCELFQSEETAENAKKILLFFRKNNLPVIHIQHISTDKTASFFLPNTHGSEINKIVFPLDNEEIIIKHTPDSFFETDLQSILEKKNITNLVICGMMSHMCIDTSVRTAKKLRYDITLISDACTTKNLSWNNIEINANTVHQVFMASLQNSFADVKNTDKFLSNYHK >CP016106.1|AXU53172.1|1485094_1485460_-|transcriptional-regulator MKIRAEYTCPLEIVHDIIKGKWKTILIFELRQSNKTFSELQHNIYGINQKMLIQQLKELRDFGIIDKISSAGYPLHVEYFLTNRGKKMLKAVEIMQEIGIEYMLEHGQQEILDNKGICYNK >CP016106.1|AXU53173.1|1485690_1485825_+|hypothetical-protein MNISRKAMKIIELAQKIANKRGISVEEAWSEAVTEYKNKYEHIA |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP016106_9 | 1583666-1583959 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP016106_9
|
4 spacers
spacers of CP016106_9
>9.1|1583695|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CACTCTTAAGTTGTGACCTATCTGATATATGATTAAA >9.2|1583761|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAGAATTAACTAATGTGAATTTTTTAGACATGTCAT >9.3|1583827|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTCTCATAATCTACATATTCATCATAATTCTTTTTAA >9.4|1583893|38|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT CCATCTTTTGTTGCTTTACATAAATTTATATTACTTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016106_9
The CRISPR arrays of CP016106_9 >merge|CP016106|9|1583666-1583959|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATCACTCTTAAGTTGTGACCTATCTGATATATGATTAAAGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTCAGAATTAACTAATGTGAATTTTTTAGACATGTCATGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATGTCTCATAATCTACATATTCATCATAATTCTTTTTAAGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATCCATCTTTTGTTGCTTTACATAAATTTATATTACTTATGTTTTATATTAACTATACAGAATGTAAGT >CP016106|9|3|1583666-1583892|PILER-CR GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CACTCTTAAGTTGTGACCTATCTGATATATGATTAAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TCAGAATTAACTAATGTGAATTTTTTAGACATGTCAT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT GTCTCATAATCTACATATTCATCATAATTCTTTTTAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT >CP016106|9|9|1583666-1583959|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CACTCTTAAGTTGTGACCTATCTGATATATGATTAAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TCAGAATTAACTAATGTGAATTTTTTAGACATGTCAT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT GTCTCATAATCTACATATTCATCATAATTCTTTTTAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CCATCTTTTGTTGCTTTACATAAATTTATATTACTTAT GTTTTATATTAACTATACAGAATGTAAGT >CP016106|9|3|1583666-1583959|CRT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CACTCTTAAGTTGTGACCTATCTGATATATGATTAAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TCAGAATTAACTAATGTGAATTTTTTAGACATGTCAT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT GTCTCATAATCTACATATTCATCATAATTCTTTTTAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CCATCTTTTGTTGCTTTACATAAATTTATATTACTTAT GTTTTATATTAACTATACAGAATGTAAGT
>CP016106.1|AXU53259.1|1580913_1583007_+|signaling-protein MNKHNFEVILNQLQINIYVTNIHTNEIIFMNKKMKEEYNILDPEGKVCWQVLYPEKNSTCSFCKVLELLKNDKKGVLIKWYEKCNKLNRVFENYDSLITWQDGTVVHMHQSIDIANSTSLNKPIKINEFHEISNNKEEKGVFNFSRDNFDYNSTLLYDALIRGTDEYIYICNMKTGVFRYSPSQVELFDLPGEIVENPLVYWKKIVHPEDWNRFYKSNTEIGKNQMDYHTVEFRAKNRSGEYIWLRCRGQLMRDEFGEPSIFAGIMTQLGKQNKIDSLTQLLNYHEFMSVFEDKISNPMIEKLCIVLLNIDDFKNVNEMYDRDFGDNIIKTLAQSIQSILPDNAELYKLDGDEMGILVDNVEENEILTLYNQIQNMIIHLQLWRKYGLNITISAGCVIYPKHGDTVKELYKCASYSLQYAKEHGKNRLVFFSQEILKNKMYSLEMMRDLKASINDDFRGFSLRFQPQVDTESHKIIGVEVLLRWTNDKCKAISPLEFIPILEENDMINIVGAWVLRMALRTFRKWIDYYPFFKVSVNVSAVQILEDTFIEDIVKIIDDENFPYQNLVLELTESHTVQNMSILQFKFKALQDLGIYIAMDDFGTGYSSLEVLKFSPIDIVKIDRVFVKDILKSKFDATFIHFIVAICHDVGIKVCLEGVETQEEYDLVKQIKPDYIQGYLFGKPQTATEIFDLLKLDN >CP016106.1|AXU53258.1|1579337_1580234_-|NADP-oxidoreductase,-coenzyme-F420-dependent MANYFLSKGYCVSGFYGRNQLSLLESTNLTKTKIYSNLKDIIYENDILFITTSDDSIEIIDKKLSKFNLKHKYICHTSGSLKSSILFCSKKAGALIYSIHPIFAFSNKNTNIKKMKDICFSIEGDNEQDDLVIQNFIDDLGNQFFIRDKDTSSTYHLANVLVSNLVLSLLDIGVSYFIKLGLSEEESLKAISPLVKKNIENILDNGFTKALTGPVSRGDITPIRKHLSVLDKKDEDIYKILSLNLLKIIALGNDNSLKGIKNITIENAIENLISKSEKYKEIYKLLGGKNDEKYHTDF >CP016106.1|AXU53257.1|1578535_1579363_-|3-methyl-2-oxobutanoate-hydroxymethyltransferase MKNTIQTFKNAKYEGKKLSMLTAYDYSIAKIMDECDINGILIGDSLGMVIKGEENTLSVTIDEIIYHTKAVKNGVKNALIVSDMPFLSYHVSIEDAVKNAGRLIKEGGAHAVKLEGGSNVIKQIESIVNAQIPVMGHLGLTPQSVNSFGGFKVQGNTSETARQLIEDAKLIEKAGAFSIVLEGVPTKIAEMVTNSISIPTIGIGAGINCDGQILVYQDMLGMFGDFVPKFVKQYANIGDIMKDSIKNYILEVNTGAFPQEKHSFSINESELEKLY >CP016106.1|AXU53256.1|1577668_1578517_-|pantoate--beta-alanine-ligase MLVKEIKLLRNIIKDWRKHGYSIGLVTTMGFLHEGHQSLIKKAVKENDKVVVSVFVNPTQFGPNEDFNSYPRDIDKDFKYCMDSGATVVFNPSPEEMYLKGNCTTINVSGLTDFLCGAKRPVHFGGVCLVVSKFLNIVTPDKAYFGEKDAQQLAVIKRMVKDLNIDTEIIGCPIIRENDGLAKSSRNTYLSEEERKSALILNKSLSLAKEELVKGNLNPENIKELITAKINSEHLAKIDYVEIVDSETLQPVKQIEHSILVAIAVFIGKTRLIDNFTFELNI >CP016106.1|AXU53255.1|1577075_1577258_-|hypothetical-protein MFKDKIDECVHIMTAYIASLKEYYSFIETQIGDFIKKYGEDVVELCLHRVMILLCECGLA >CP016106.1|AXU53254.1|1575329_1576244_-|hypothetical-protein MIDNQKYVILSLELHLFFSRIMKEHALFLEAGFTNKNYNLAMEADHYKKQFEDLLSYTVSASNGIIRPDILYSEELVTTLTSVAEQKTEEFTGIEINKNITTRELNLQSGVNPQVGQDLVNYVAQLNSDAIRLLDGLINFKERVLDGVLSCTIFTSNYPLLLEHIIHEANLYRSYVVDLENKIDIESKNAKEIELFWDHIMMEHALFMRGLLDPSEGELINTSNDFAIKFNELIEKTNEMTDSNIKNITEETLNETVEFKDFKEAGASGIEQCKIKSIILPLLADHVLREANHYIRILESYKNM >CP016106.1|AXU53253.1|1574292_1574940_-|lactate-utilization-protein-B/C MIRQTPLEKRYDKLGPHIVTALKKRYFDAYYCKTRNEALQQILDLIPQNHVVSWGGSETLKEMSVQTAVREKGFKVIDRDLAKTPEERTEIMRQALLCDTFLMSSNAISEDGQLFNIDGNGNRVAAMIFGPKNVIVVAGMNKIVKNIDDAIQRTRTVASPAVVQRFQDVNTPCYINGSCIDCTSPESICAYMVTTRISRPAKKIKVILVGENLGL >CP016106.1|AXU53252.1|1573556_1574126_+|lipoprotein MKKFIICIIMFAISVLVLAGCTNDNKIKNEVDSMFNSIKTQDADTVDKYFPKSGLGNLIYEDKEGFKMYSKNMTWEISDIKNNKDKVTVDLKINNTDMVSILKKNPPKLGEMMPNPTMKDIDSAKKKEFNITLELVKSGDNYVCKVNQESAMKLLNVITGGGIDYLADYNKDYYKQLDEEQKNYENKNS >CP016106.1|AXU53251.1|1572652_1573552_+|iron-sulfur-cluster-binding-protein MKLLSKVNNNIRLITQVAFTALTNGYVNGFLEGTIYGGESKKLCVPGLNCYSCPGALGACPIGSLQAVLSSREYKFSFYVVGFLMAFGAFFGRFVCGWLCPFGLIQDLLHKVPFPVKIKKVYGDKYLKYLKYIVLIMFVIILPVAIVNVAGGGNPWFCKWICPSGTLLGGIPLILGNENLRESIGFLFSWKLSILLLILLMSIITYRPFCKYICPLGAIHGFFNPISIYRFKIDKDKCTNCTACQTKCKLDIPIYKDVNSPDCIRCGECIKVCPQNAITTTFSKDKKENNICAKKYRGI >CP016106.1|AXU53250.1|1571915_1572500_+|thioredoxin MKRFFIVVLGCICVLGMISGCSKKESKPVEKNKNNSEWFSNLDTEDVDGNKVTKEIFSNKELTLINVWTTWCGPCVGEMPELEALSKEYESNNSNVAIKGLVVEVDKTDMRTGLSNEEKNLVKDIMKKSDATYQQLTVSEELKKTDFKRVMEFPTTYFVDKKGNFVGEKVVGANSKEDWKKIIDERLKMVKANE >CP016106.1|AXU53260.1|1584126_1584399_-|hypothetical-protein MKIVIGATIRYLIKHKVNYCNKKSLDKLELKYGNIDREKAVKLEIFYQYLIELEYIEMSLLIRRLDTAITSLALVSIITIASYYLIRKNM >CP016106.1|AXU53261.1|1584617_1585436_+|MerR-family-transcriptional-regulator MEKQYFTTGEFAKLCGISKQTLIFYDKIGIFSPEYKDKNNYRYYSVYQYDTLDILQSLREIGMSLEEIKEYIQNRTPQLCVKMLKEEEKKIREKIKKLRKISSKMQNRINITVEGISKMNSEEIYISKKFEEYLVLSSDLSNMSNSDFMMELIDFTNYCKSKNLYQGYELGVIVSNENIKNGDYLSISSFYLKIDKKIKDKKLYVKPEGMYACIKHIGKYEDSYKSYEKLKKYIYENKYKIIGNSYEESILDFFCESNEDNYMTEISIQVSR >CP016106.1|AXU53262.1|1585568_1587689_-|ferrous-ion-transport-protein MGLTHNSTKMSSLKDMFDIDNKEDQFVIALAGNPNTGKSTVFNHLTGLRQHTGNWPGKTVATARGNFKYKNTEYALIDLPGTYSLFALSQEEIVARDFICFGNPDAVIVVCDATCLERNLNLVFQVMELTDKVILCINLIDEARKKGITIDKKLLEDSLGIPVILTAARNGSGMDELLDTLNDVSFDKYKLNNKPVRYNENIENVVKSIQPELDNIIPGINSRWLGLRLIDGDESIFESMSNYIDKDSIDAINEVKKKIPDNINKQKIRDEFTKINYDYAKKLSDECCSNVAKKSTDREEKVDKILTSKIFGLPIMLLLLGTILWITIEGANYPSTLLSNLLLGFEPSISGILNSINCPSWLNDMLVLGLYRTLAWVISVMLPPMAIFFPLFTLLEDFGYLPRVAFNLDHLFKKACAHGKQCLTMCMGFGCNAAGVIGCRIIDSPRERLIAILTNNFVPCNGRFPTLIAISTIFFSSVITNSFVSSVATALCITLLIILGVIITLLVSYTLSKTLLKGVPSTFTLELPPYRVPQIGRTLYTSIIDRTIFVLGRAVMVAIPAGVITWIFANIYIGDLSILSHVANFLDPLAKLIGLDGFILLAFILGFPANEIVVPILLMAYLATGSMIELDSFSALGQVLREHGWTYLTALNVMLFSLLHWPCATTLLTIKKETGSLKWTALGFLMPTILAFVVCFLTTTVYNLFI >CP016106.1|AXU53263.1|1587714_1587942_-|ferrous-ion-transport-protein MKNLNDIQVKKTVKVEDILSSGNLRERMLALGLTRGAVIDVVRKGPKNNLTVYKIRGSKIALRQEESSLILVSDI >CP016106.1|AXU53264.1|1588268_1588709_-|acetyltransferase MFKIKHFNDLSLDEFYEIAKSRYEVFACEQKIFSLNDYDDIDKSSYHIFLKENGLICAYARIIPKEYSSYNDVSIGRVLVLSSHRRKGLAKQMMDCAIDFIKVNLHENNITLSAQTYIKNLYLSCGFKEISEVYDEAGIEHIKMRL >CP016106.1|AXU53265.1|1588881_1589850_+|putative-membrane-protein MNTTKKLTEAALLSSLFIVVTIIAVSTGFGYAIYLDFIVPVFFCIICLKCDLKYTILSGITSLLIISLVLGNLGTAIWASQSVLLGIMCGYLINKPTMVMDDLVYGSVFGVIVMVFIDIYASTLIGYSFMKEFQGYSKWIYFNGYTNFIYYLMIALFPFGMVFCIYLLSLILGNKLHILDSNSLKKFLIFKNFRNLNQFLCCSKKAFYICVSYLAIFEVLKLLNVKVDSVYLKTIFISITYISVYFIIRDSCMSLQNFIIAKFRKLLYARILFLIIILLLFFIFDVTVIGLIIINAFLNKKINIRLSQSNIVNKQINLLIEK >CP016106.1|AXU53266.1|1590326_1591535_+|tyrosyl-tRNA-synthetase MKSIDEQMRIIMKGVDDLIDEKELREKLIKSEKEGKPMIVKLGLDPSAPDIHLGHTVVLRKMKQLQDLGHQIVIIIGDFTGKIGDPTGKSKARKALTTEQVLANAKTYEEQIFKVLDKEKTIVRFNSEWLAKLNFEDVIKLAATITVARMLEREDFKKRYEGQMPISVHEFFYPLMQAYDSIALEADIELGGTDQRFNLLMGRSLQREFGMESQIVIMMPLIEGLDGKEKMSKSLGNYIGIDEEAGIMYQKSMEIPDELIIKYYNLVTDVHPDEVNKIESQLKEGSVNPRDIKMNLAREIVTLYHGEESAKEAEERFKSVFQKGQIPEDIQTIQVKEDGFDLIEVLVSNEIVKSKSEVRRLASQGGVKVNGEKVEDLSTIVKESELVVQIGKKKFVKIELVK >CP016106.1|AXU53267.1|1591595_1592477_-|polysaccharide-deacetylase MVKKRKKKTVTLTILVVIVIGIFSMAWADMSRKKEMKETQERLKAERLEKERIEKEKNEPIIGAKKEAVKEYGYDAKIVWDKLNKYDYSNNGEKIVFLTFDDGPSTTNTPQVLDILKRHGVRGTFFIKGDSLERKGANEILKRTFDEGNAIAHHSYTHDYKKLYPNRSLNLDTFVNELNKTDEAMKKVLGKNFSSNVVRCPGGYMSWKNMEPLGNYLKEKNMASIDWNALNADAEGKKKNAQELFEHAKKSSEGKEMVVLLMHDTYGKQETVNALDQIITYFKDNGYQFKILI >CP016106.1|AXU53268.1|1592892_1593807_+|transporter MKKYFGEIGLIFIAIIWGSGFVATQFALDGGLTPLQIITLRFFLAAIIMNLLFFKQIRANMGKKLLKAGGILGIFLFLAFTVQTIGLMYTTPSKNAFITAANVVIVPFIGFILYRRKLDKIGIISSLVALIGIGILSLEADFSINFGDFLTLICSFGFAFHIFFTSEFAKDNNPMALTAIQFTVAFLMSVVVQTFAGQLKMEAELSGYMGTMYLAVFSTTIGFLFQTICQKRVDGTRTAIILSTEAVFGTIFSIIILKELITAKLVIGSILIFVAIITAETKLSFLKSKKVKLKDSEESSLESI >CP016106.1|AXU53269.1|1594029_1594575_+|ruberythrin MKKFVCTVCGYIHEGDAAPAQCPVCKVGADKFEEMKGEMVWADEHRIGVAQGVDAEIIEGLRANFTGECTEVGMYLAMSRQADREGYPEVAEAYKRIAFEEAEHAAKFAELLGEVVVADTKENLRVRVDAEYGATDGKLKLAKRAKELGLDAIHDTVHEMCKDEARHGKAFLGLLNRHFGK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP016106_10 | 1674043-1674267 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP016106_10
|
3 spacers
spacers of CP016106_10
>10.1|1674072|37|CP016106|CRISPRCasFinder TTTTAACTCCAAGCGTTTTAGATATAAGTATAAGTGC >10.2|1674138|36|CP016106|CRISPRCasFinder ATGCCTACGTATTGTTTAAGCGAAAAAAATTATTGT >10.3|1674203|36|CP016106|CRISPRCasFinder AATTGGAAAAAGAAAAAAATAGATTTATTTGATATT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016106_10
The CRISPR arrays of CP016106_10 >merge|CP016106|10|1674043-1674267|CRISPRCasFinder GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATTTTTAACTCCAAGCGTTTTAGATATAAGTATAAGTGCGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATATGCCTACGTATTGTTTAAGCGAAAAAAATTATTGTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATATAAAAAATTGGAAAAAGAAAAAAATAGATTTATTTGATATTGTTTTATATTAACTATGTGGATTCAAAAT >CP016106|10|10|1674043-1674267|CRISPRCasFinder GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TTTTAACTCCAAGCGTTTTAGATATAAGTATAAGTGC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT ATGCCTACGTATTGTTTAAGCGAAAAAAATTATTGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATATAAAA AATTGGAAAAAGAAAAAAATAGATTTATTTGATATT GTTTTATATTAACTATGTGGATTCAAAAT
>CP016106.1|AXU53357.1|1673599_1673761_+|hypothetical-protein MDNFLIGVLASLTASLIGYIVCLCIKKVKSHSVQESDLDVELKFSFKFKKNKH >CP016106.1|AXU53356.1|1673331_1673451_+|phage-protein MGLEINERALAAASILIKIEDEEEAMKEAERERKRGRRR >CP016106.1|AXU53355.1|1672816_1673257_+|phage-protein MSNLSAFLSQNAIKVDNVKYIASDRFVDENGKPVEWELKVLSSEEDESLRRKCTKRVKVIGNNGKHTGQYTSEIDYNSYVAELCVASTVFPDLKDAELQNSYGVMGEAQLLKTMLTAGEYVNYTVKVNEVNGFDTTFEDKVEEAKN >CP016106.1|AXU53354.1|1672275_1672746_+|phage-protein MFQQIKARDTISASKAECYVTIEGKRYNFMQAINLEAKMEKNKSEVPILGSTTKGNKSTGSKYTGSATFHYNTSIFRELLYRYKETGEDIYFDIQVTNEDPTSSAGRQTIILKDCNMDSGIIVKFDADGEYLDEDMDFTCEDWELIEKFNIINGME >CP016106.1|AXU53353.1|1670947_1672258_+|phage-protein MALGGGTFVTQNKILPGSYINFISAKRATSSLSDRGIVAMPIELDWGIDEEVFQVTNDDFEKYSTKFFGYDYTHDKLKGLRDLFKNIRLGYFYKLNKGVKASCSIATAKYSGTRGNDLKVIVTTNIDDNTKFDVVTLLDNKKVDIQAAKVITDLQDNDYITWKKDATLEASAGLVFTGGTNGEAVTGAEYQAFLDKIESYSFNALGCLAITTEIKSLFVEFTKRMRDKVGAKFQTVLYKKSDADYEGVVSVENKIKDIGLVESSLIYWVTGAIAGCDINKSNTNKKYDGEFDIDVNYTQIQLEEALKSGKFIFHKVGDEVHVLEDINTFVSFTDDKNDDFSSNQSVRVLDQIANDIATLFNDKYLGKVPNDKAGRISFWNDVVKHHKELENIRAIEDFKTDDVSVELGNDKKTVIVSDAVKVINAMSKLYMTVSVS >CP016106.1|AXU53352.1|1670769_1670946_+|hypothetical-protein MSKTLSKGTDYKFTKEQIVNSKKYINRKDLLNAILKENELYSFSEVEEIINSFMKGVS >CP016106.1|AXU53351.1|1670339_1670777_+|phage-protein MLNNIIDGISIKLDKTFGESYTIYSEDVEQGINEPCFFIVPLNPSKVSYPSGRTLKKNSFDVHYFPKSNDKSFEINEVAEMLLEELEYIEIDGDLVRGTNMNFEIVDNVLHFFVDYNYFTIKNNDINKMDTVELFGGLKRGDNFE >CP016106.1|AXU53350.1|1669921_1670347_+|phage-protein MARWGSVDFREFKRACKRMEKLTKIDLDKFCKDAARELAARLLGKVIRRTPVDTGFLRQGWNGVAYARSLPVYKQGNNYIIEVVNPTTYASYVEYGHRTKDGKGWVKGQHFLTISEMELQSQVDKIIEKKLLILLKGVFDA >CP016106.1|AXU53349.1|1669559_1669922_+|phage-protein MVSKTRKAIEMLYRDKCTIVEYQPIKDPVTKRTNNKEVVVLENQPCKLSYKNITSTEQGEVAKLTQTIKLFISPNISVKVGSKLIITNQNNITREYARSGESAIYPNHQEIILELLKDKA >CP016106.1|AXU53348.1|1669164_1669566_+|hypothetical-protein MENNRIDDIERRLQGFGYVLKDGDKWLIDFVREKIENIIKLDCNIGEIPKELHNIEVDMIVGEFLFTKKNMGQLDIESLNFEAVEKSISEGDTKVDFAIGSGSQTPEQRFDSLVAYLTTYGKNKILTFRCLRW >CP016106.1|AXU53358.1|1674395_1675169_+|hypothetical-protein MGLFSGNESCCICGEKGKQKISDGVICSECLKKYKDTFSIVEPTDVIKKISSEEIKKSISLTLKNRKKFESFNASKKVGIYLLVDENKKQLIISDKISNLNKNKRVYDFREIISFELLEDDETIVKSGLGGAIGGGLLFGETGAIAGSILGKKKIKTYVNSLKIKITINNIKNSTKYIYLINSKTSTNSSLYKESYNYAQEILSTLSIITSSESIEDKKESISSSTADEILKYKNLLDMEAITQEEFDAKKKELLNL >CP016106.1|AXU53359.1|1675235_1677605_+|phage-tail-tape-measure-protein MATIQTSIRIFDGMTPAFRHMNNAMNIVLSSFEQLQRTSSNAIDANSIRTAREELARAEAGFDRLEQQIRESDNQQRRLNEDINKGASSTDRLVGSAKKLAATYLGIRTLGGLGNLSDQMTSTNARLSMINDGQLSDGGLNKMIFQSAERSRASYLDTAKIVSRIGMNAGKAFSSTKEIVGFAEQLNKKFVIAGASTEEMNSALLQLTQGLGSGVLRGEELNAVFESAPNIIQSIADYLDVDIGKIRGMASEGMLTADIVKNSLLSAAEQTNAEFEKMPYTFSQIWTSIKNNAIMIFGVIQKKIEQAMSSRGFRTFIDNFISGLYVLGNVFFNIFNGIISILGSPAFQSFSNTMIVGISLISQALGWIITQALNLANIFAQNWSIIGPIIAGVVGILGTYLIALGSIWLWETLCKVSKNALAIASAIHALAVHAELTETQMATIAQYGLNTAILACPIFWIIAGIIAFVVVVFVAVAAVNKFAGTSLTVLGAIVGAVFAAVAAIQNVMIWLLNGCIAVNEAIANGWNQCVFFMKQAIAKGVIFIIEKMASLNDSVNSAGNALGKAFIDGVNIAIRGVNKLIDLINKIPGINIGKVGEATFTPVKADNSTIKKQIADLNKWVGDAPEKIKLERMQYKDIGAAFQKGNALGEKWQKSITDKFKDTFDINKMIEDAKKKLGLDDLWDKKYGLGDGFGSAGLNSPLSDAAKGAKDTAGNTAKMAKTMDKSQEDLKYLRDIAEQETINRFTGVNIKIDMNNTNNINSEADVDGIVNVLTEKLNDAMVVSAEGIV >CP016106.1|AXU53360.1|1677620_1678316_+|phage-cell-wall-hydrolase MAYDFYLDGVQLPIAPAKLEIKITNKNKTVDLINTGEVNILKKEGLSEISFEAEFTHNKLPFCRGQFRDVQFFLSKLELLKTDCKPFQFIVSRELGNKVLFNTNMKVSLEEYNIVEDAENGSDTKVAIKLKQYRDYSTKKLVLAPPKNETGRPSVKIEPKRVDSVNATNTKTKTYTVKAGDSLWSICQKQLGNGSLYKKVYELNKSMMDKANKGKNLSKYTIYKGQVLKLG >CP016106.1|AXU53361.1|1678308_1680264_+|phage-cell-wall-hydrolase MVDELVLANDRDVRLVIAHWEDFYEPAVIDGITWEIERRGTPSKLEFTIVMDDILEFCEGNSVRLYYKGIGIFYGYIFQKKRDKENHIKIVAYDQLRYFKNKDTYVYSNKTASELVKMLAKDFNLKYNVIEDTKYKISRIEENKTLFDMILTALDDTLREKKEMYVLYDDFGRITLKNVASMKLDTVMNNDVIEDFDYNSSIDSDTYTKIKLVRDNEETGKRDVYIAQDSTHMRSWGILQMFDTVDKNMSEAEIKQKCDILLKLYNKKTKSLSLKNALGDIRVRAGCLVPVFLNLGDIKLQNYMLVEKVKHTFENNSHFMDLTLVDGDEFASYSSSSYSSGNTNNKNEKQNGPAQSTTSKEDNDMINKLNKVFKNKLSNTGNIFVKYSNAYKVNAALMAAISIHETGNGSSSLCKNKNNFFGMKGMSFSSVDEGIKKGISNLSRNYIHTGRKTLERIRDKYAPLYDSPLNKDWVPGVGKFYKQITGSTYTSNNAGTGVGSNEEAEKNLKDVTYQIQGNNQSSSTNNNSKADKLISIAKSKLGCNYVYGAEGPNNFDCSGFTQWCYKQIGIKIPRTASAQSKAGKAVDLKDRSKWKAGDLLCRIGGGSSNHVVMYIGNNQIIHSPQTGDVVKIESVNSYRKGKAYTHVRRFI >CP016106.1|AXU53362.1|1680277_1680538_+|phage-protein MSQDLLQIIKKAAMDAVETSNPMRVVFGTIESISPLRVKIEQKLSIGEIFLIQTDTFKRYTDKKIGDKLVLIRMQGGQQYLILDRM >CP016106.1|AXU53363.1|1680542_1680962_+|phage-protein MLPSDNLDYDIEDVSIINFDVRQEPSKTFKLHIEKSKIDGICDDVEALKQTIFLILNTERYQHLIYSWNYGVELNDLIGEPISFVIPELERRIKEALIQDDRVENVDNFEFENIKGKVQCRFSVHTKYGNIKAEKVVSV >CP016106.1|AXU53364.1|1680962_1682012_+|phage-protein MFELMTFENIIKRMLDSVPDTFDKREGSIIYNALAPVAIELTETYIAMDELLDQTFVDTASYYYLEKRCKERGITPLSATNTIAKGVFNIDIPLDSRFNLGEYNYIAIERISEKTYKMKCETAGPIFELGKLIPIEYIDGLETAELTEILINGEDEESEDSLRQRYYDSLNSQSFGGNIQNYKDEVNKIQDVGGVKVYPVWDGGGTVKLVIINSNFKVPSEDLVNLVQEEIDPIGHQGQGLGLAPIGHRVTVEGVTSTTINISAEITYKNGYTWENIKSIAEEAIDDYLNELNMSWEDEENLIVRISQIETRLLSIDGVLDIVNTMINEVKSNLTIDSNSTVVRGEVVG >CP016106.1|AXU53365.1|1682004_1682622_+|phage-protein MDKEINLINYLPQILQDKEEYIKVFNVENKEIKTLHDKLKDLSNDQFLEDLTISGIKRWEKIMSITPKSNESLEDRRFRIFSKYISKLPYSERFLRNWLDNVVGEGNYELTINNATYNIHLESDARNQDWFEEVHSFVSDIKPCNMTLDYTRVLVSKDNSVYFGATTITGHEITIYPWSPSDIETQGEINILSGNGFGYQEVTIY >CP016106.1|AXU53366.1|1682637_1683666_+|phage-tail-fiber-protein MATDKSYYTILTDIGKAKIANASIVGEKVDFARIQLGDGGGVEYNPTEDQTALKRVVWEGKVGNVTTDETMSNCLILESLIPANVGGFIISEIGYLDSDGNLLAISKYRAAYKPTLENDGAVIDMKVKTIFVVSNVNNIELKIDPTIIFATLKDIQDLETKIGTVNTKIDTNKTELTSNIETAKTELSAKIDTENEKQNIKIDQLVAGGVNVSHTHIIEIDDWILNNETNMYEVTINHPLLTKRILIALYDEIGETLTPNARAIDDNSILVRNEENIKMYVYLINGNAQTSLINATVDDNRVSEMTTYSSKKIHEEISKVAEQLAGINSNIISTVNNNLIPM >CP016106.1|AXU53367.1|1683679_1685158_+|hypothetical-protein MPDFIVNRNIKKRRGKYSSRNLFEARAFAYEDGTTFTGIFNVSDEKIYSVSSSTTFSLTSNVVYMPLPDEPEHQTGFSMEQKVRVEFINDPIINIDSFENLSKGCTINYSVIDQESTIKFTITEKLNNTVLTTRNNTVGGNYEIILTNEQILGLDINSQNSLIIEISTNDGGLVTSKTVTFTRTNNKPVVTINSYNSKSAKFIVSDLENNLSKIEWYLDDVLKETITTDLTAEKTINYELTDNAIHTLKIVATDAENATVEKVLSISKEIMPLQSDATLQDISTKLVEIGEGFRNGKTSIINTLALKNIEASLNNTLVELSEKIKTSFDSSDASVQDLMNQLTQANNTISQLNSKYKYASGTIDVVKNSSLMANLYGESFGRQPGTWLKIDNLGFIPNIFVAECQYVTSNNYFFKHIVIATCNINWLWEKKDFSARIVFTKEKNSNQDFSGSGIIYSNNERDVYINNKGINVPASSPNVSSYLHSWHAIKFK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP016106_11 | 1812743-1813822 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP016106_11
|
16 spacers
spacers of CP016106_11
>11.1|1812772|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATTATCTACTGTTGCAGGAAAAGCAATTTTGGTTT >11.2|1812837|38|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTAAGGGGTACTCTTACCCTGTAATTTCAATACTTT >11.3|1812904|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACTGAAACCCAGCCATATACATATTTACATACTCCA >11.4|1812970|39|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCCATTCTTGCATCACTTGCTCCAGTAGTCATAACAACA >11.5|1813038|38|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATTATTGTTGCTGAATAAATCCACTTCTCATTCTCAA >11.6|1813105|38|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCGTAAGAACCAGGAATATACGGAAGATCGTAGAAAA >11.7|1813172|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGAGTTGAGGTTGAGTTGGAGGATATTATTTAAGG >11.8|1813236|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTATTCTAAGAAACTTTTCAATTCTAGTTCTTC >11.9|1813301|32|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTCCAGACCCTAATCCTCCTGTTGACCCAGA >11.10|1813362|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAGTCAAAAGCAACATCATAATCACGTATATTATC >11.11|1813427|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAACATGTCAGTAATATTGAAACAGGAAATTCGAGT >11.12|1813492|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACACTTTAAAAACTAATGTATTCAGTATAAGAGATT >11.13|1813558|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTGTTAATGCAAATAAACAACATAGCACTATTAATA >11.14|1813624|38|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT AGGGTTTCTGATAAAATCTTCAAACATGTAAAATATGT >11.15|1813691|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT CTTATACTTAGTTAGAACTATATATCGACACAAATAT >11.16|1813757|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT TGCAATTTTTATTCGTTGTCCAATCGCTTTGAAATTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016106_11
The CRISPR arrays of CP016106_11 >merge|CP016106|11|1812743-1813822|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATGATTATCTACTGTTGCAGGAAAAGCAATTTTGGTTTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTATTAAGGGGTACTCTTACCCTGTAATTTCAATACTTTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTACTGAAACCCAGCCATATACATATTTACATACTCCAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTCCATTCTTGCATCACTTGCTCCAGTAGTCATAACAACAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATCATTATTGTTGCTGAATAAATCCACTTCTCATTCTCAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATATCGTAAGAACCAGGAATATACGGAAGATCGTAGAAAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAGAGTTGAGGTTGAGTTGGAGGATATTATTTAAGGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTTTTTATTCTAAGAAACTTTTCAATTCTAGTTCTTCGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAGTCCAGACCCTAATCCTCCTGTTGACCCAGAGTTTTATACTAACTAAGTGGTATGTAAATATAGTCAAAAGCAACATCATAATCACGTATATTATCGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATCAACATGTCAGTAATATTGAAACAGGAAATTCGAGTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAACACTTTAAAAACTAATGTATTCAGTATAAGAGATTGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATCTTGTTAATGCAAATAAACAACATAGCACTATTAATAGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAGGGTTTCTGATAAAATCTTCAAACATGTAAAATATGTGTTTTATATTAACTATGAGGTATGTAAATCTTATACTTAGTTAGAACTATATATCGACACAAATATGCTTTATATTAACTATATGGTATATAAATTGCAATTTTTATTCGTTGTCCAATCGCTTTGAAATTTGTTTTATGTTAACTATGTGGTATGTAAAT >CP016106|11|4|1812743-1813623|PILER-CR GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GATTATCTACTGTTGCAGGAAAAGCAATTTTGGTTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TATTAAGGGGTACTCTTACCCTGTAATTTCAATACTTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TACTGAAACCCAGCCATATACATATTTACATACTCCA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TCCATTCTTGCATCACTTGCTCCAGTAGTCATAACAACA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CATTATTGTTGCTGAATAAATCCACTTCTCATTCTCAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ATCGTAAGAACCAGGAATATACGGAAGATCGTAGAAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AGAGTTGAGGTTGAGTTGGAGGATATTATTTAAGG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTTTTATTCTAAGAAACTTTTCAATTCTAGTTCTTC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AGTCCAGACCCTAATCCTCCTGTTGACCCAGA GTTTTATACTAACTAAGTGGTATGTAAAT ATAGTCAAAAGCAACATCATAATCACGTATATTATC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CAACATGTCAGTAATATTGAAACAGGAAATTCGAGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AACACTTTAAAAACTAATGTATTCAGTATAAGAGATT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CTTGTTAATGCAAATAAACAACATAGCACTATTAATA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT >CP016106|11|11|1812743-1813822|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GATTATCTACTGTTGCAGGAAAAGCAATTTTGGTTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TATTAAGGGGTACTCTTACCCTGTAATTTCAATACTTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TACTGAAACCCAGCCATATACATATTTACATACTCCA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TCCATTCTTGCATCACTTGCTCCAGTAGTCATAACAACA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CATTATTGTTGCTGAATAAATCCACTTCTCATTCTCAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ATCGTAAGAACCAGGAATATACGGAAGATCGTAGAAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AGAGTTGAGGTTGAGTTGGAGGATATTATTTAAGG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTTTTATTCTAAGAAACTTTTCAATTCTAGTTCTTC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AGTCCAGACCCTAATCCTCCTGTTGACCCAGA GTTTTATACTAACTAAGTGGTATGTAAAT ATAGTCAAAAGCAACATCATAATCACGTATATTATC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CAACATGTCAGTAATATTGAAACAGGAAATTCGAGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AACACTTTAAAAACTAATGTATTCAGTATAAGAGATT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CTTGTTAATGCAAATAAACAACATAGCACTATTAATA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AGGGTTTCTGATAAAATCTTCAAACATGTAAAATATGT GTTTTATATTAACTATGAGGTATGTAAAT CTTATACTTAGTTAGAACTATATATCGACACAAATAT GCTTTATATTAACTATATGGTATATAAAT TGCAATTTTTATTCGTTGTCCAATCGCTTTGAAATTT GTTTTATGTTAACTATGTGGTATGTAAAT >CP016106|11|4|1812743-1813822|CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GATTATCTACTGTTGCAGGAAAAGCAATTTTGGTTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TATTAAGGGGTACTCTTACCCTGTAATTTCAATACTTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TACTGAAACCCAGCCATATACATATTTACATACTCCA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TCCATTCTTGCATCACTTGCTCCAGTAGTCATAACAACA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CATTATTGTTGCTGAATAAATCCACTTCTCATTCTCAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ATCGTAAGAACCAGGAATATACGGAAGATCGTAGAAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AGAGTTGAGGTTGAGTTGGAGGATATTATTTAAGG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTTTTATTCTAAGAAACTTTTCAATTCTAGTTCTTC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AGTCCAGACCCTAATCCTCCTGTTGACCCAGA GTTTTATACTAACTAAGTGGTATGTAAAT ATAGTCAAAAGCAACATCATAATCACGTATATTATC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CAACATGTCAGTAATATTGAAACAGGAAATTCGAGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AACACTTTAAAAACTAATGTATTCAGTATAAGAGATT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CTTGTTAATGCAAATAAACAACATAGCACTATTAATA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AGGGTTTCTGATAAAATCTTCAAACATGTAAAATATGT GTTTTATATTAACTATGAGGTATGTAAAT CTTATACTTAGTTAGAACTATATATCGACACAAATAT GCTTTATATTAACTATATGGTATATAAAT TGCAATTTTTATTCGTTGTCCAATCGCTTTGAAATTT GTTTTATGTTAACTATGTGGTATGTAAAT
>CP016106.1|AXU53485.1|1810824_1812096_-|guanine-deaminase MLKVLKGNIIFTKTSETFTVFENSYIILEKGKVKGIFKEIPKEYKNLKVVDYTDKLIIPGMNDLHAHASQFKNLGMAMDKELLPWLETYTFPEESNYKDIEYATKMYKKFVKELWKSGTTRIAVFATVHKEASMKLMDIFKEVGLGAYVGKVNMNMNCPDTLLENTQDSITDTEEIINKYSDTDSIVKPIITPRFIPSCTSELLKGLGDLCLKYNIPIQSHLSENYDEIEWVRSLEPESKFYGDAYNRYNLFGQTPTLMAHCVHCSQDEIDLMRENNVMAVHCPASNFNVGSGAMPIRKLIDNNIRLALGSDISGGHTLSIFKAMVSAIQLSKLYWVNSGKKYNFLSLSEAFYIATKSGGSFFGKVGSFEEGYDFDALIIDDSNLNHDNYSILERLERFIYVGDDRNIIHRYVCGKLIEEPNI >CP016106.1|AXU53484.1|1809923_1810241_-|hypothetical-protein MSEFKNVTAVKKANVYFDGKVSSRVIILPNGERKTLGLMLPGEYTFSTREEEIMEMLAGSMDVKLPGSNEFVTYKEGQKFNVPSDSSFDLKVNEVVDYCCSYIAD >CP016106.1|AXU53483.1|1807480_1809838_+|cation-transporting-ATPase MDKVNLERYSCDINVGLNKNQLQSRIDDNLINAFDNGKTKTYKQIFKDNIFTLFNLINIVLVCLLVSVGSFKNTLFIFIAVINTIIGIIQEIRAKRLLDNLSVIVSNKVSVIREKEKKEIDVQELVLDDIMILKTGNQICADSKVLNGKLEVNESLVTGESDIIIKNKGDFLYSGSFVVSGEAFVRVENIGKDNYANKIANDAKISKKHNSQLRNSLNAILKIVGIIIIPLGIILFAKQHFGNGDSIATSVVGTVAAVNGMIPEGLTLLTSIALAVGTIKLASHKTLVQELYCVETLARVDTLCLDKTGTITEGKMQVDDIVMLEEVDINEIMGNICNSLKDDNATLNAIRDKYNVLDTYKAKNLIPFSSERKYSGVTFENKGTYLLGAFEFIFKEKNKKLRIEVERYSKKGNRVIVLAHSDSYMEDDNIPEDIKPLAFILILDKIRDEAKETLEFFYNEGVDIKIISGDNPITVSEVARKAGLKTASNFIDATTLKNDSDIYKAVDKYSVFGRVSPQQKKQMILALKKQNHTVAMTGDGVNDVLALKEADCSIAMASGSDVTKNVSNLVLLDSNFASMPKVVMEGRKVINNIQRASSLFLVKTIFSFFLSLLTLFFFSRQYPFVPIQLSLIGAVTVGIPSFFLALEANKSRISGNFLLNILKNALPGALCVTVNVIIVYNIVEYLGYSSSVFSTMCAILTGVCGLLILRQQCLPFNKERLFLIVSMTIAFVIGILFLGGLFSFVALSRELILITMALAILMPIMIKVMLFVLDEILETIVPDLN >CP016106.1|AXU53482.1|1805604_1807062_+|glycine-dehydrogenase-subunit-2 MKEYNSLLIDISKKGRKAYSLPKLDIDDIKIEDMIDPDMARQSELNLPEVGELELVRHYTLLSNKNFGVDTGFYPLGSCTMKYNPKINEDMAALPNFTGMHPYQSSDTAQGSLSLMYDLSRRLAEITGMDEVTLQPSAGSHGEFTGLMIIKAYHENRGDHKRTKVIIPDSAHGTNPASAAMANFDVIQIASDKNGAVDINALKEVLNDEVAALMLTNPSTLGLFEKNIKEIATLVHEAGGLLYYDGANMNAIMGITRPGDMGFDVVHLNLHKTFSTPHGGGGPGAGPVGVKKELVPFLPIPVIERKEDKYVLNYDREKSIGKIKNFYGNFGVLVRAYTYILTMGRDGLKEASEMAVLNANYIKESIKDDYILPIDTLCKHEFVLGGLPRGEANIKTIDIAKRLLDYGYHPPTMYFPLIINEALMIEPTESESIETLDSFIEAMKSVAKEAKEEPELLKTAPHNTLVKRVDDARAVKKPILTWSQR >CP016106.1|AXU53481.1|1803130_1805605_+|bifunctional-glycine-dehydrogenase/aminomethyl-transferase-protein MNELKRVSLYNIHKELGAKLVEFAGWEMPLEYEGINKEHEKVRKSAGIFDVSHMGEVQIKGAESEKFIQNLVTNDISTLKINDIIYTPMCYENGGVVDDLLIYKFGEEDYLLVINAGNIDKDVAWIIKQSEGYNVDIKNISSEVSQLAIQGPKAEEILQKITDIDLNSIKFYKSIPSTIVCGCPCLVSRTGYTGEDGFEIYCKNKYVEIIWNEVLKVGGEDICPAGLGCRDTLRFEAALPLYGHEINEHISPIEGGLSIFVKTNKESFIGKSILSKEKESGAKRKLVGFEMQGKGMPRNGYDIRIGDKTVGFVTTGCASPTTGKILGMGIIDSEYAKVGNEIGIAIRKKVVPAVIVKKPFYKKQYKKDNIILNKENKFSYIPATSEDKSKMLKVVGLNSVDELFSDIPEEVKLKRDLNLEIGKSELEVSKIVKRLSEENLSLEDLTCFLGAGAYDHYIPSIIKHITSRSEFYTAYTPYQAEISQGTLQVVFEFQSMIAEITGMEIANASMYDGATAAIEACIMAMNQTRKSKIVVSKTIHPETLSVLRTYLQYKDCEIVEIDFCNEYGTTDIEKLKASVDKDTACVLIQTPNFFGIIEEMEEIEKITHENKAMLIMSVDPISLGVLKTPGEIGADIVVGEAQSLGNPLNFGGPYVGFLASKSKYTRKMPGRIVGQSLDVEGKIAYVLTLQTREQHVRREKATSNICSNQALNALVASIYMATMGKEGFKEVGMQSMKKAHYTYNKLVQTGKYKPIFKGKFFKEFAVQGNLNIETINDKLLEENILGGYNLEYNYPELKNSTLLCVTEKRSKEEIDKLVGIMEGL >CP016106.1|AXU53480.1|1801809_1802325_+|CF-9-family-membrane-protein MEKYIWLFPLLFIFHDMEEIIGFGIWLKKNKSMLDKKYPFISKVYENYSTEGMAFAVFEEFILCIIFCILTVITENQYVYLLWLGSFIAYTLHLVIHIGQSIIIRKYIPSLITSIICLPISIWCISKSIYIVDCEMSTTILYSIIGIIIVALNLKFAQSLIGKFTKWMSNI >CP016106.1|AXU53479.1|1799554_1801285_+|Na+/H+-antiporter MRNKKINIIFLTTIMFIMSTVMVFAEEDIDTIALANAEKFGILTLIPPLVAIILAFITKNVIISLLIGILSGSFIIKASGINVFATFIQAFLDLVDRALVSLADPWNAGIILQVLAIGGVINLVAKMGGAKAIAEALAKRAKSAKGTQLITWFLGLLVFFDDYANSLIVGPMMRPVADKMKISREKLAFIIDATAAPVAGLAIISTWIGLEVGLIHDAFESISIDVDAFGIFLNTIPFRFYNILILAFIVISALLLKEFGPMRKAEIKSRSRKISIDLDEGVEELDDLAPKNGVKLSVWNAIIPIGTLIIVALASFYYSGYTSIMGGDDKALIQLFTNSPYSFEAIKEAFSASDASRALFQSALVASLVAIIMAVVKKIFTISEAIDVWIDGMKSLVITGVILILAWSLSSVIKELGTAKFLIHLLSGSLPPFLLPSLIFGLGAIISFATGTAYGTMGILMPLAIPLAYSLNPDMSYVIVSTSAVLTGAIFGDHCSPISDTTILSSMGAGCNHIDHVNTQMPYAIFTAVITIVFGYIPAGLGLPIYIVLPVAIAAIFVGIQIIGKKVDEAEIELVE >CP016106.1|AXU53478.1|1798084_1799071_-|lipoate-protein-ligase MLLIYNEKTNPYFNLAMEEYLLKNFDEDLFILWRNEPSIIVGKNQNTLSEINLEYIKEYSIPVVRRQSGGGAVFHDLGNINFTFIACNNNNFSDFRRFTQPIIDLLKTLDVNAEFSGRNDLLIDGKKFSGNAQYNYKNKVMHHGTLLFSSEINDLSKALKVKPIKFEGKGIKSVKSRVTNISEHLHSKMDILEFKDAIMDYLSKTNTDNTNYCLSEHDIKQIEKLTKSKYETWDWNFGNSPKYTLSNELKYSGGNVEFNLNVDKGIITSIKFFGDFFGKCDVAFVENKLIGIRHEENALRNTLDSIEINDYFLGADTDILVSGILGVK >CP016106.1|AXU53477.1|1796977_1797775_-|lipoprotein MKFKKLLCLLLCLVLTLAVVGCSKAKDDKKIVVGATLVPGGELLEELKPLIKEKGYTLEVKNFDDYILPNEALNNGEIDANLFQHEPYLKEAVKAKGYKIMAGKKLYVCPAILYSYKIKSVDEFKKGDTIAISNNPSSCSKNLRYLESIGLLTLPKGDGLVSPKDIIENPKGIQFKELDIAQIPSSLPDVTAAFIDTTYAVPAGLDAKKNGIYTAPINDEYANLLAFRTEDKDSEKIKVLQDVLTSDKARSLIEEKYKGIVIPTF >CP016106.1|AXU53476.1|1796275_1796875_-|tellurium-resistance-protein MAIELKKGQKINLTKKENSDLGEILVNLNWNQKVQKKGFFGSLRSSNIDLDLGCLFEMKNGVKGAVQALGNAFGSLDNPPFAQLDGDDRTGSNTQGENLRINGNKIKDIKRILIYAFIYEGVANWSEADGIVTIKQKQDSDLVVKLDEHKNGYNMCSIALIENVNDETFSVEKVVKYFKGHREMDTEFHWGLKWVAGRK >CP016106.1|AXU53486.1|1814230_1814518_+|hypothetical-protein MKKFLYALYSFIVIIANFRLKEKNYNFILLAIFFILLLIQNGVLKTGYQNRATFYQDNYFNREDKNDKIKFMTIKIFIFLSLPLCFNILFNYLTS >CP016106.1|AXU53487.1|1814542_1814641_+|hypothetical-protein MIKVSLCVICSKYKVHIVIKQKFHINEEKNIK >CP016106.1|AXU53488.1|1815056_1815608_-|transcriptional-regulator MSINTVIAKNLNRLRNERNLSLGQLAELSGVSKVMLSQIEKGDSNPTVNTIWKIASGLNVPYTAILEQPQNETFIVSKTDIDVQVSENKDYRLYCYYPNTPTRNFELFQMELEEGHSYTSVGHSEKSQEYIMIIEGQLKLEVNDSIYQLRENDSICFSAESIHTYHNQGEKTLKAVIINYYPV >CP016106.1|AXU53489.1|1815798_1816761_+|cysteine-synthase-A MRVLNNVTEAIGNTHMLHLSKIADEFGVQGNIYAKMEYLNPGFSKKDRVALQMITEAENAGLLVPGQAVVELTSGNTGTGLAIACACKGYKFIACMSKGNSMERARMMKALGAEVVLVDQMPNSVHGQVSGEDLALVEIEAQKIAKERNAFRADQFNLEACNHAHEKYTAEEMWEQLDGNIDVFVDFLGSGSTFAGCSKTLKKHNSSIKCYVVEPETAAIYSGKEITDQGHKIQGGGYSMDLPLVDKKLIDGYIQVTDEEATDVARKLAKLEGVFAGFSSGANVCAAIKLLKSSEKGKNIVLTLNDSGLKYLSTDLYEEL >CP016106.1|AXU53490.1|1817055_1818900_+|glycerophosphoryl-diester-phosphodiesterase MQKRILRNFIFTGKNILNKLVFIIKYNFSTLILFELFHKGLALFFIWPSIRYIFDILIKSLHIVYLNMDNFIKVLTNPMSIVLIILSVIILAFYAFFEFTSVIICLNKSIKYEKIGLFELFKISFENSIKLLYPKNILLFIFVILIIPLVNTVLISGFIGKIQIPEYILDYIKSDIILNIIYMIFLLIIYISVIRWIFSIHEITLNTENFKRARKESVNLIKGKIIRTIIYSLILSLVVAIIGYAIYHSGIIFIGIWTKYCTDMEFLKNVFINRCIAFEEYFRLILSIFIFILDIGFISATYYQYKGVSISKNNIKKEKKSISKIVFNLVLILLISYIESVAFSSHINGMFNTSFSFYTTAIAHRAGAEMAPENTLAAIEEASNAKADYAEIDVQETKDGELIVLHDSNFKRTTGVDKNVWDVNYNEVKTYDAGSFYYYGKGYYDEKFVGEKIPTLKEMIKYSKGKVKLLIEIKLNGHEKGDVVKKVVQLIKENNFENQCIVASMDKTILQKVKKLDENLLTCYFMAIAYGDFSKLNYVDIYGIESTFVNKTVVEKIHKMNKKIFVWTVNSDSLIEKMLDLNVDSIITDNPYLIESAIYWKKNGFISQVSDYLF >CP016106.1|AXU53491.1|1819204_1819789_+|sugar-O-acetyltransferase MTEREKMLAGELYDCGDIELLTQWHKAKDLVRDYNQTDSSDLEKKEKILNELLGGKGKNLWITAPYYVDYGNNIYFGNNCEVNMNCTFLDDNKIIIGDNALIAPNVQIYTAFHPTNAGDRFGNAKEDGSFEFCKTQTAPVTIGDNVWIGGGAIIMPGVTIGDNVVIGAGSIVTKDIPSNMIAYGNPCRIIRENK >CP016106.1|AXU53492.1|1820891_1821068_-|hypothetical-protein MFIGEIDKCTHILTAYISSSYDYCNFLDTQLDDFISEYGETVVETCLHQVLLLVSRYN >CP016106.1|AXU53493.1|1821642_1822665_+|ABC-type-transport-system-involved-in-multi-copper-enzyme-maturation,-permease-component MVNWEIKKLAKSKSMFISLGILVLILMISIFITPVLETESYYIDKEKGRIEDTRSGIDVGNEKFQNKINVLKQFSNQTDTGEFSKKIELMSKKKLDNLSVNEYKDISFWKVFNYRVTNSLINVGMLIIISIIISNIYVDEVVTSVKDIILSSKEKKKALKSKIFVALLVPLVIYSVYLMGIFIITCMQQGVPVNGDLESFRIVDNVVALKTNLSITKYVILNIGIELLMFEGWAMIAIFGSFISKSSISSISFFIFIISITKIMSVIHILPKKLLSVVSNVNYYDLIFGFNKIIGNYLGDIMIFKVNIDIVNIAIGLLMAILIGAMSLCFLVIKSDYISR >CP016106.1|AXU53494.1|1822678_1823566_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNKLEIENLSKIYGKKVANNKITVTLENGVYGLLGPNGAGKSTLMKQITTLIKPDEGQILYNGEDIFKMDADYRNILGYLPQEFGVYKNFTAKEFLQYIGALKGLRGKYLNSKIGELLDLVGLYDVRNKSIGKFSGGMKRRVGIAQVLLNDPKIIVLDEPTAGLDPQERARFRNLIAKMSRDKIIILSTHIISDIESVAKETIMIKDGKLLMKGTHKDILSHMENKVYNVQVKNECEVDDIQSKYKVVSIQSDIDSVVLRIVSEDIPSGDNIQPVQAKFEDVYMFYFDLEDAREV >CP016106.1|AXU53495.1|1823571_1824345_+|ABC-transporter-permease MMYLVKAEMIKILKSKSVWIIWLFLIFFGFFLIRKFDVLDTYADIFYKIEGSIPLIGLIMFIITSGNYIKEYDSNMTGLINTTKKGKKSVVLSKLVANGLILSIINISFILLVGIRGFSFFDFKNLNESIHNLWYFGNSNLNLTVIQMYIIVILTTIFASFIFAQIGLTLSSIFKSAVIPFILGGLIMAIPYFSVGFIPDKAVKFMSVTPNWIMMSQQMVKYNVPSILIVFSIVISIILMIVLTKITYENFTSSKKF |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP016106_12 | 2123288-2123514 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP016106_12
|
3 spacers
spacers of CP016106_12
>12.1|2123320|33|CP016106|CRT TTTGGGCTTATTTTATTGACTTACAAGTTGAGT >12.2|2123385|34|CP016106|CRT GGGATTTAAAGATGATTAATTTAGAAACATTGTG >12.3|2123451|32|CP016106|CRT CAAGAATTGAGGACTTAAAAAATGAAGTTAGA >12.4|2123321|36|CP016106|PILER-CR TTTGGGCTTATTTTATTGACTTACAAGTTGAGTAAT >12.5|2123386|37|CP016106|PILER-CR GGGATTTAAAGATGATTAATTTAGAAACATTGTGTAA >12.6|2123452|35|CP016106|PILER-CR CAAGAATTGAGGACTTAAAAAATGAAGTTAGAAAA |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016106_12
The CRISPR arrays of CP016106_12 >merge|CP016106|12|2123288-2123514|CRT,PILER-CR AAATTTTACATACCACATAGTTGATATAAAACTTTGGGCTTATTTTATTGACTTACAAGTTGAGTAATCTTTACATACCACATAGTTGATATAAAACGGGATTTAAAGATGATTAATTTAGAAACATTGTGTAACTTTACATACCACATAGTTGATATAAAACCAAGAATTGAGGACTTAAAAAATGAAGTTAGAAAACTTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC >CP016106|12|5|2123288-2123514|CRT AAATTTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC TTTGGGCTTATTTTATTGACTTACAAGTTGAGT AATCTTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC GGGATTTAAAGATGATTAATTTAGAAACATTGTG TAACTTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC CAAGAATTGAGGACTTAAAAAATGAAGTTAGA AAACTTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC >CP016106|12|5|2123292-2123514|PILER-CR TTTACATACCACATAGTTGATATAAAACT TTGGGCTTATTTTATTGACTTACAAGTTGAGTAATC TTTACATACCACATAGTTGATATAAAACG GGATTTAAAGATGATTAATTTAGAAACATTGTGTAAC TTTACATACCACATAGTTGATATAAAACC AAGAATTGAGGACTTAAAAAATGAAGTTAGAAAAC TTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC
>CP016106.1|AXU53781.1|2122726_2122927_+|cold-shock-protein MNNGIVKWFNNEKGFGFISMEGRDDVFAHFSAIQTSGFKSLEEGQQVSFDIVKGARGPQAENITIL >CP016106.1|AXU53780.1|2122324_2122501_+|hypothetical-protein MFGNKMDKCTHVLTAYISSSYDYCNFLDTQLDDFILEYGENVVESCLHQVMVLVSKYN >CP016106.1|AXU53779.1|2121764_2121947_-|regulatory-protein MLNKKLPDTELKIMKCIWHTGYKTVISKDVADEIEKTYGWKHTTTIILLARLTKKGFLIS >CP016106.1|AXU53778.1|2120548_2121034_-|cell-wall-hydrolase MISELMLKNFRKSSINFKTKIKLNLREKPDINSLKLKSIPEGKIVKLKCVDGIWAEVESNYDKGWLLYKYLERLSNAKNNSNDTIKNRKKNYIGNIRTNGLSLELRNDRTLESKVITTIPDGFKVEVCYSVGKWARVNINKNEKRYSGYVYNQYIEEHLSL >CP016106.1|AXU53777.1|2119794_2120193_-|hypothetical-protein MNKKKKLIGIAISFLLIISIINPLQVEAEAIIESSVYISSIKENYTYDNTKFKTIKSKSRHKSRKYNKSKVKLKKRSIRTKKYGYQTINKYKRQNARRHNILTKLILFIIVIFLVIVLVVLIFIKRKKKKFY >CP016106.1|AXU53776.1|2118393_2118945_-|tryptophan-transport-protein MKTNTKKLTLNAILLAMGLLIHQITPAIGLPMKPDVPLAMLFVILVLNRDDYKTCLIAGIVTGIFTALTSSFPGGQIPNVIDKTLTANIVFLLMNISYNMPFIKKLAKKTQDTVVVAIIMPIGTLVSGTIFLLAAQAIVGLPGASFTALFLAVVLPAVLINLVAGIFLFKIVSLSIRRVSYQA >CP016106.1|AXU53775.1|2118098_2118263_+|hypothetical-protein MYSKNEKSEEINIKIYLEKSIKYILYLITTNEIHIRILYRYDNLSVKLSVIGTI >CP016106.1|AXU53774.1|2116129_2117566_-|cell-surface-protein MKFYKRILTLTLSISFVFANIQLVDAISSVEKIQGKNKYEIAGKIADKNAYKTAILINTSNSIADGLSASGLAGALNAPILLTEKNTIPTETSARLKNVSKVYIIGGTYSISTSVENSLKSKKMKVVRIKGNDRIKTSYNVAKEINSIKKVNTVMLTNAYKGEADAISIASVAARDKAPIILTNGQSIPFSTSGLKSYVIGGTASMSTTLVNNTKSTRLGGSTRFETNKAIINKFYKDAREFYIAGAYELTNALVGSFLSKHGPMVLVNDGSNKSILKNAKKITSIGYINSNIVQQCLNITNGIGDINTGVVKNVKPTTKTIKDGMYKVGKDISAGEYLITSNSGSYASYYEVTSDSTGNADSILSNDIFSGTRYITLKNGQYIKIEDSTMTLAKYAKAQKAKNGKFGSGMYKIGLEIPAGEYIIMSNSSDAYYEVRNDSLGNAEGIVTNDTFSGRRYITVEEGQYLILNDCYLIENE >CP016106.1|AXU53773.1|2114445_2115882_-|radical-SAM-protein MSKRKQVTIPIEKIQEQDKYIEQIHRQNEEYFNRTGKRKLVFTQTFGCQMNEHDSEKLCSMLEEMGYQMSMMVEESDLIIYNTCAVRENAELKVYGNLGQLKHLKGKNPDMKIAVCGCMMQQPHVVEELRKKYKHVDLIFGTHNLYKFPQLLTESINSDKMLVDVWDVDGEVIEGLRSNRKFELKAFVNIMYGCNNFCTYCIVPYTRGRERSRTPEDIINEIKELVANGTKEITLLGQNVDSYGKTLENPVSFSELLRKVNDIEGIERVRFMTSHPKDISDEVIYAIRDCDKVCEFLHLPIQCGSSSLLKKMNRHYTKEYYLEIIEKAKKEVPGIAFSTDLMIGFPGETEEDLLDTLDVVEKVRYDSAFTFIYSKRQGTPAAKMENQIPEDIKHDRFNRVLEAVNRISAEINDGYKDRIVEVLVEGRSKNNENKFAGRTRQNKLVNFEGGNDDLIGKLVMVKITEPRTFSLNGILVNN >CP016106.1|AXU53772.1|2113700_2114039_+|hypothetical-protein MFAVGFVVIIALAFFILSVLLFNGKASMLLAGYNSMSKKEKARYDKKKLCRSSSIVTFIVSIMLFIMAFLGYRIESGQMDEKKMVPFSIIFIIVILSSVFFNILYSNKKCKK >CP016106.1|AXU53782.1|2123980_2124826_+|lipoprotein MNIIKSITLLLTLLIVILMTGCSPRESASEVAKKYIDKMNSGDYETAYSLLSKDSKKKISIENLEEFQNILVSTKRIISYKIGKEKIIKKYKHDGKEYKNVVKLEETFNIKNLLYKKDDSLKVNRYFVVENNKYKLLLYESFKKEFGINSMDLAQLKLNDFGLKYFKEVDLILKKAIAINPTDSKLYYAQACNYMNFDGFPGYSDTTYNALDSINKSLKYLDKNDSDYKKNASNIYNLKGVILMFHKRFDEAQQYLNKALYFNKDNEDPKYNLNTIKKHLN >CP016106.1|AXU53783.1|2125049_2125214_-|hypothetical-protein MFGKPKESVRFLDFNDVAEKFGEKKAVAIFDAIAGKKSKEHIIKDIEKLVKNEV >CP016106.1|AXU53784.1|2125754_2126087_-|decarboxylase MNTREMKEYRGFYNKKLSETDEFFRVFGSLDDKTYSEGAISKKNKELMGLAISILSRCDECICYHIEGCINSGASKDEIIEAIKIGVIGGGSITYPNARFAIKILEEFNI >CP016106.1|AXU53785.1|2126330_2126972_-|Immunity-protein-SdpI MKKAINKQFILSTLICFIPFIVSIYFYNRLPNEVAIHFDNYGNPDNYAPKVIAAFGVPLLMLCIHLYTWFRLENEPKKANFSNVIQNLSKWGVAILSVIIQIMMVLYSTGVSLESNFYTGLILGIIVILFGNYLPKCKQNYSVGIILPWTLNDEDNWNKTHHLAGWIWLIGGILLIINAFINIPFYNIFVIFVIVILPFIYSYLMYKISGKNN >CP016106.1|AXU53786.1|2126952_2127249_-|ArsR-family-transcriptional-regulator MLGFPETFKALSDPIRREILVMLRENKMSAGEISEKFNMTNATISYHLSQLKKAGLIFETKYKNFIFYEINISVFEEVMLWFSQFMEKGEKDNEKSDK >CP016106.1|AXU53787.1|2127854_2127989_-|hypothetical-protein MNISRRAMKIIELAQKIANKRGVTVQDAWNDAMKEYKEKYEYVA >CP016106.1|AXU53788.1|2128204_2128957_-|transporter MFSVIFLCIGGFLAAFVDSIAGGGGLISMPVLMAIGVPVHLAIGTNKFAASAGCISSAYRYAKSGKINNDLLKKLVPFTIIGSVLGVRCVLSISEEILNVLVVVMILIVAIYTFISKNLGQEDNFEAVNKKNLRLGMLMALIMGFYDGFFGPGTGTFLTFGFIKIYGYDFLHASANTKILNLTSNITSLLLFMINGQVDYKIAIVFALVMIMGAYVGAKVAIKKGSKMIKPIFLVMALFMVVKLVYQTLV >CP016106.1|AXU53789.1|2129015_2130671_-|AraC-family-transcription-regulator MEYFSESNNEVQKFDWGEVMWIHEPSKTQFNRLSAGIVRFFPGNCQEKHFHLSEEQLLYVIQGEGIQIIDGKKVNIKETSIVYCPPYSEHEIINTGKIDLVILITYVPHKFSSLRQIPIVFSENNIQELVNVNIIENLANQISNILKLRISVYDLKYKEIFETKKENKFCDICKNIKQCTKKLVKSINNDNFEKVYHCEYGVSSLEIPIVLEENIVGYIECGNFIVYKSIDIDKNLSELSSSSGIDIKYINKIYNEFPLNPKSRLYVLKENLLMMSEFIQEIAKRNFFENQLSIKDEEILKSRKENIRLEEALKKANSRLLEEEYIINPIDMFNNSSKEYPFELELYIEKEIKNMNLEGVYNLIDTNKLRYNDVRDTIQEMIFVLSRTVLRDLEDLKLISYLRNKYNKKISLVNSDEDLWNVLFEFSKECIDKNRAFWRKDKGNLIENINEYIKKYYKENINLNSISDVFFISPNYLSSIFNERNKVSITEYINLLRIEESKKYLLDRSMSISDICKKVGFNNSSYFSQIFKKFNSITPNEYRKNMLDNKY >CP016106.1|AXU53790.1|2131943_2133023_-|proline-iminopeptidase MILITLCILVAVFVLAFAGLRLIAPTIIRTSHKIEAPGIDRMEMVEIGGIQQALYIRGQNADNPIILWVHGGPGNSMMPFLHLYQYEWENDFTVVNWDQRNVGKTYFANDPAAVLQTMSAERVLQDVHEVTAYLKQEFNKEKIILIGHSWGTVLGTMAVQTYPEDYSAYIGIAQTVNMVDNERVGYEKTLEMVKAAGKQKDIKVLEAIAPYPPAKYGPSYLEALMTVRTYQSKYGLSINMDLGNIISILATPYYSLRELKNTAIVNPNAIDNQGDVLRFLVEEADIRNYGVDYQVPVYYIMGENDYNSPYLPAKKFFDEIVAPDKQIFFIPDADHLPFLSKKAEFDCVLLEEIAPKLAK >CP016106.1|AXU53791.1|2133106_2133763_-|TetR-family-transcriptional-regulator MTRKNNPKQAIENIITISAKLFAEKGYDKTSMQNIVDASGMSKGGIFHHFSSKEDIFNVVMERRFEQIIETVNQWLGEMHGLTAKEKLRSLVRRHLTDEVIKESSNMITSAIESPHIILAFTQDNLKKLAPILANVLREGIEDRSIITEFPDECAEVILLLFNFWCDTDVFQGDFPTLRKRFQFLQFLMRQIGVDILEDEIIESINIFYERKPMGQVE |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP016106_13 | 2174402-2176933 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP016106_13
|
38 spacers
spacers of CP016106_13
>13.1|2174431|38|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAATGAAGTGGGTGTATGAAAGAGAAAACACAATTTTA >13.2|2174498|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGTTGGAGAAAATAATCCTCCTTATGATTTACCAAG >13.3|2174564|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATTTAGCTATACCCATTTATTTAATGTTAACGCT >13.4|2174628|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATATTTTACAGAATTTTGCTTGTCATCAAAAACGTC >13.5|2174694|38|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTTGAAAGGATACAATGTAATAGATTAATTTATGAA >13.6|2174761|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTTTTTCTATTGTAAGAGTGTTTTTGTCTATAACAG >13.7|2174827|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAATTCAGAAGGAATAAAAAATGAACAAAAAGATA >13.8|2174892|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCTGCTGAACTTTTCAATTTGATAGTTGGTTTGGC >13.9|2174957|38|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGGAAAAGATATACTACTTTTTCTAGGTGGAAAAACAG >13.10|2175024|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGTTGCTAATTTTAGTTGCTGCTCTTTATGTTAT >13.11|2175088|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGATTTGATTTTGGTTTCTGTTTATTTATTTATA >13.12|2175153|38|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCTTAAGAGGGTTTGTATGTCCTCTTTAAAAATTATAC >13.13|2175220|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAACTAAACCTAGAGCCTCTTTTTCATACTGTACA >13.14|2175286|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGCATGGCTCTTAAGTGTTCTCCTAATGAATTATT >13.15|2175352|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATATTACAAATATTATGTTTAGTAAAGGCTCTCAA >13.16|2175417|38|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGAAAATATACGTGACTATGATGTGGCTTTCAACTTT >13.17|2175484|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTTCCATAAGTGCGTCAATGTTAGTGTTTGAACTTG >13.18|2175550|38|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATTTTTTGGAACAGCAACAGTCTGAATTATATTTCC >13.19|2175617|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAAAAATCAAACATGGTGATGGAGCTATGAATTTG >13.20|2175682|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGAAAACATAGAAGAACAAGACGAGGAAACAAAACA >13.21|2175748|38|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGTATCCTCCTAAATTTAATCTATATCGTTGTAGCAA >13.22|2175815|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAGCACTACGAGACAAGGCAAATGAAATAGAAAGT >13.23|2175880|39|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATATATGTATATGCAGTTGGCTAATACCAAGTGTTTAGT >13.24|2175948|39|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGAAACTTCTCATATTCCCGATAATTGTTATTTCACGA >13.25|2176016|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATAATTTACATTTTCTCCTTGCACTTGTCTAAAATT >13.26|2176082|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGGTTATTTTATGATATATTTTTATAGTGGAACTCC >13.27|2176147|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCAGAGTAAAGAGACTGAAATAGTGACTTTTTATA >13.28|2176211|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGTTTTTGTTAAGTCTATAGATTCGAAATCTTTTT >13.29|2176276|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATATGGAGAATGCGTTAGTAACCACTTAAAGCCGA >13.30|2176341|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATATTTGAAAAAACAATTTTTGATTGAAATATCCT >13.31|2176406|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGTACGTGTAGGAGATGGTAACGCAACTGTTGAAGA >13.32|2176472|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATATTAAAATCTGCGAAAAATGCTTGGCCAACTCG >13.33|2176537|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAAAGATTTAGAAAAAGAAAAAGTTAAGATTTTAGA >13.34|2176603|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTTGATTACCTGTTCCGGCTCCTGTTTTGGGGGTAC >13.35|2176669|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCATTGTACTCGTTAAGTTTATTTGTGAAAAAATCTA >13.36|2176735|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTAGTTAAAGAAATAGCGAACGGTGTATAAAATTTTT >13.37|2176801|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGATTTATTTTTCTTTATACTTGCACTATTATGTTTG >13.38|2176867|38|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTATTAATTATATATTCATAAACCTTTTGTCTATCTGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016106_13
The CRISPR arrays of CP016106_13 >merge|CP016106|13|2174402-2176933|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTATCTTACATATAGTTAATATAAAACTAATGAAGTGGGTGTATGAAAGAGAAAACACAATTTTAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTCGTTGGAGAAAATAATCCTCCTTATGATTTACCAAGATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACGATTTAGCTATACCCATTTATTTAATGTTAACGCTATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACCATATTTTACAGAATTTTGCTTGTCATCAAAAACGTCATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACCTTTTGAAAGGATACAATGTAATAGATTAATTTATGAAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACAGTTTTTCTATTGTAAGAGTGTTTTTGTCTATAACAGATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACACAATTCAGAAGGAATAAAAAATGAACAAAAAGATAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTTCTGCTGAACTTTTCAATTTGATAGTTGGTTTGGCATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACAGGAAAAGATATACTACTTTTTCTAGGTGGAAAAACAGATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACCAGTTGCTAATTTTAGTTGCTGCTCTTTATGTTATATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACAAAGATTTGATTTTGGTTTCTGTTTATTTATTTATAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACCCTTAAGAGGGTTTGTATGTCCTCTTTAAAAATTATACATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACAAAAACTAAACCTAGAGCCTCTTTTTCATACTGTACAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTTTGCATGGCTCTTAAGTGTTCTCCTAATGAATTATTATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACAATATTACAAATATTATGTTTAGTAAAGGCTCTCAAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACAAGAAAATATACGTGACTATGATGTGGCTTTCAACTTTATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACGCTTCCATAAGTGCGTCAATGTTAGTGTTTGAACTTGATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTTATTTTTTGGAACAGCAACAGTCTGAATTATATTTCCATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACACAAAAATCAAACATGGTGATGGAGCTATGAATTTGATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTAGAAAACATAGAAGAACAAGACGAGGAAACAAAACAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACATGTATCCTCCTAAATTTAATCTATATCGTTGTAGCAAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACCAAGCACTACGAGACAAGGCAAATGAAATAGAAAGTATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACATATATGTATATGCAGTTGGCTAATACCAAGTGTTTAGTATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACCAGAAACTTCTCATATTCCCGATAATTGTTATTTCACGAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTATAATTTACATTTTCTCCTTGCACTTGTCTAAAATTATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACAGGTTATTTTATGATATATTTTTATAGTGGAACTCCATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACGCAGAGTAAAGAGACTGAAATAGTGACTTTTTATAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTAGTTTTTGTTAAGTCTATAGATTCGAAATCTTTTTATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACCATATGGAGAATGCGTTAGTAACCACTTAAAGCCGAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACGATATTTGAAAAAACAATTTTTGATTGAAATATCCTATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACCTGTACGTGTAGGAGATGGTAACGCAACTGTTGAAGAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACCATATTAAAATCTGCGAAAAATGCTTGGCCAACTCGATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACACAAAGATTTAGAAAAAGAAAAAGTTAAGATTTTAGAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACGGTTGATTACCTGTTCCGGCTCCTGTTTTGGGGGTACATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTCATTGTACTCGTTAAGTTTATTTGTGAAAAAATCTAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACGTAGTTAAAGAAATAGCGAACGGTGTATAAAATTTTTATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACAGATTTATTTTTCTTTATACTTGCACTATTATGTTTGATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACCTATTAATTATATATTCATAAACCTTTTGTCTATCTGAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC >CP016106|13|6|2174402-2176933|PILER-CR ATTTATCTTACATATAGTTAATATAAAAC TAATGAAGTGGGTGTATGAAAGAGAAAACACAATTTTA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TCGTTGGAGAAAATAATCCTCCTTATGATTTACCAAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GATTTAGCTATACCCATTTATTTAATGTTAACGCT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CATATTTTACAGAATTTTGCTTGTCATCAAAAACGTC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CTTTTGAAAGGATACAATGTAATAGATTAATTTATGAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AGTTTTTCTATTGTAAGAGTGTTTTTGTCTATAACAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC ACAATTCAGAAGGAATAAAAAATGAACAAAAAGATA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTCTGCTGAACTTTTCAATTTGATAGTTGGTTTGGC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AGGAAAAGATATACTACTTTTTCTAGGTGGAAAAACAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CAGTTGCTAATTTTAGTTGCTGCTCTTTATGTTAT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AAAGATTTGATTTTGGTTTCTGTTTATTTATTTATA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CCTTAAGAGGGTTTGTATGTCCTCTTTAAAAATTATAC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AAAAACTAAACCTAGAGCCTCTTTTTCATACTGTACA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTTGCATGGCTCTTAAGTGTTCTCCTAATGAATTATT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AATATTACAAATATTATGTTTAGTAAAGGCTCTCAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AAGAAAATATACGTGACTATGATGTGGCTTTCAACTTT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GCTTCCATAAGTGCGTCAATGTTAGTGTTTGAACTTG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTATTTTTTGGAACAGCAACAGTCTGAATTATATTTCC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC ACAAAAATCAAACATGGTGATGGAGCTATGAATTTG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TAGAAAACATAGAAGAACAAGACGAGGAAACAAAACA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC ATGTATCCTCCTAAATTTAATCTATATCGTTGTAGCAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CAAGCACTACGAGACAAGGCAAATGAAATAGAAAGT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC ATATATGTATATGCAGTTGGCTAATACCAAGTGTTTAGT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CAGAAACTTCTCATATTCCCGATAATTGTTATTTCACGA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TATAATTTACATTTTCTCCTTGCACTTGTCTAAAATT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AGGTTATTTTATGATATATTTTTATAGTGGAACTCC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GCAGAGTAAAGAGACTGAAATAGTGACTTTTTATA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TAGTTTTTGTTAAGTCTATAGATTCGAAATCTTTTT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CATATGGAGAATGCGTTAGTAACCACTTAAAGCCGA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GATATTTGAAAAAACAATTTTTGATTGAAATATCCT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CTGTACGTGTAGGAGATGGTAACGCAACTGTTGAAGA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CATATTAAAATCTGCGAAAAATGCTTGGCCAACTCG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC ACAAAGATTTAGAAAAAGAAAAAGTTAAGATTTTAGA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GGTTGATTACCTGTTCCGGCTCCTGTTTTGGGGGTAC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TCATTGTACTCGTTAAGTTTATTTGTGAAAAAATCTA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GTAGTTAAAGAAATAGCGAACGGTGTATAAAATTTTT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AGATTTATTTTTCTTTATACTTGCACTATTATGTTTG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CTATTAATTATATATTCATAAACCTTTTGTCTATCTGA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC >CP016106|13|12|2174402-2176933|CRISPRCasFinder ATTTATCTTACATATAGTTAATATAAAAC TAATGAAGTGGGTGTATGAAAGAGAAAACACAATTTTA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TCGTTGGAGAAAATAATCCTCCTTATGATTTACCAAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GATTTAGCTATACCCATTTATTTAATGTTAACGCT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CATATTTTACAGAATTTTGCTTGTCATCAAAAACGTC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CTTTTGAAAGGATACAATGTAATAGATTAATTTATGAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AGTTTTTCTATTGTAAGAGTGTTTTTGTCTATAACAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC ACAATTCAGAAGGAATAAAAAATGAACAAAAAGATA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTCTGCTGAACTTTTCAATTTGATAGTTGGTTTGGC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AGGAAAAGATATACTACTTTTTCTAGGTGGAAAAACAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CAGTTGCTAATTTTAGTTGCTGCTCTTTATGTTAT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AAAGATTTGATTTTGGTTTCTGTTTATTTATTTATA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CCTTAAGAGGGTTTGTATGTCCTCTTTAAAAATTATAC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AAAAACTAAACCTAGAGCCTCTTTTTCATACTGTACA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTTGCATGGCTCTTAAGTGTTCTCCTAATGAATTATT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AATATTACAAATATTATGTTTAGTAAAGGCTCTCAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AAGAAAATATACGTGACTATGATGTGGCTTTCAACTTT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GCTTCCATAAGTGCGTCAATGTTAGTGTTTGAACTTG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTATTTTTTGGAACAGCAACAGTCTGAATTATATTTCC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC 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ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GGTTGATTACCTGTTCCGGCTCCTGTTTTGGGGGTAC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TCATTGTACTCGTTAAGTTTATTTGTGAAAAAATCTA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GTAGTTAAAGAAATAGCGAACGGTGTATAAAATTTTT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AGATTTATTTTTCTTTATACTTGCACTATTATGTTTG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CTATTAATTATATATTCATAAACCTTTTGTCTATCTGA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC >CP016106|13|6|2174402-2176933|CRT ATTTATCTTACATATAGTTAATATAAAAC TAATGAAGTGGGTGTATGAAAGAGAAAACACAATTTTA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TCGTTGGAGAAAATAATCCTCCTTATGATTTACCAAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GATTTAGCTATACCCATTTATTTAATGTTAACGCT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CATATTTTACAGAATTTTGCTTGTCATCAAAAACGTC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CTTTTGAAAGGATACAATGTAATAGATTAATTTATGAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AGTTTTTCTATTGTAAGAGTGTTTTTGTCTATAACAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC ACAATTCAGAAGGAATAAAAAATGAACAAAAAGATA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTCTGCTGAACTTTTCAATTTGATAGTTGGTTTGGC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AGGAAAAGATATACTACTTTTTCTAGGTGGAAAAACAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CAGTTGCTAATTTTAGTTGCTGCTCTTTATGTTAT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AAAGATTTGATTTTGGTTTCTGTTTATTTATTTATA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CCTTAAGAGGGTTTGTATGTCCTCTTTAAAAATTATAC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AAAAACTAAACCTAGAGCCTCTTTTTCATACTGTACA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTTGCATGGCTCTTAAGTGTTCTCCTAATGAATTATT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AATATTACAAATATTATGTTTAGTAAAGGCTCTCAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AAGAAAATATACGTGACTATGATGTGGCTTTCAACTTT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GCTTCCATAAGTGCGTCAATGTTAGTGTTTGAACTTG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTATTTTTTGGAACAGCAACAGTCTGAATTATATTTCC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC ACAAAAATCAAACATGGTGATGGAGCTATGAATTTG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TAGAAAACATAGAAGAACAAGACGAGGAAACAAAACA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC ATGTATCCTCCTAAATTTAATCTATATCGTTGTAGCAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CAAGCACTACGAGACAAGGCAAATGAAATAGAAAGT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC ATATATGTATATGCAGTTGGCTAATACCAAGTGTTTAGT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CAGAAACTTCTCATATTCCCGATAATTGTTATTTCACGA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TATAATTTACATTTTCTCCTTGCACTTGTCTAAAATT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AGGTTATTTTATGATATATTTTTATAGTGGAACTCC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GCAGAGTAAAGAGACTGAAATAGTGACTTTTTATA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TAGTTTTTGTTAAGTCTATAGATTCGAAATCTTTTT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CATATGGAGAATGCGTTAGTAACCACTTAAAGCCGA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GATATTTGAAAAAACAATTTTTGATTGAAATATCCT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CTGTACGTGTAGGAGATGGTAACGCAACTGTTGAAGA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CATATTAAAATCTGCGAAAAATGCTTGGCCAACTCG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC ACAAAGATTTAGAAAAAGAAAAAGTTAAGATTTTAGA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GGTTGATTACCTGTTCCGGCTCCTGTTTTGGGGGTAC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TCATTGTACTCGTTAAGTTTATTTGTGAAAAAATCTA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GTAGTTAAAGAAATAGCGAACGGTGTATAAAATTTTT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AGATTTATTTTTCTTTATACTTGCACTATTATGTTTG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CTATTAATTATATATTCATAAACCTTTTGTCTATCTGA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC
>CP016106.1|AXU53830.1|2173948_2174233_-|hypothetical-protein MLVYNKSFYPNDIFPRLDFSKIKKQLKLIDNDLSDFGSICIIEKEHYTISVNSIGEINVYYDLEYENKVYRIVYEIEKLFKSQVGRFSISTYRN >CP016106.1|AXU53829.1|2172962_2173178_+|transcriptional-regulator MAIVVNLDVMMAKRKISLKDLAEKIDITNANLSILKTGKAKAIRFTTLNEICKALDCQPGDILEYVEDEND >CP016106.1|AXU53828.1|2172484_2172952_+|hypothetical-protein MITKFFSNILSVFLYFLLSLLGVAGIIFLCMIPMFLYDFSSDKVIALIARILYFSDYFIVILFLIFIINSTKYSPFVLENVKRFKVMGCCLLINTIIECINGYNLNTNNIRIFGTDSGGISPLMVISFIFALMCFVIAETFDKAIKIKEDNDLTI >CP016106.1|AXU53827.1|2170770_2171469_+|hydrolase MEKKYFEIHGVPSILLGNPSSKLYIYIHGQCGNKEEAEAFANIAVPHECQVLSVDLPEHGERKREKNSFNPWHVVPELVSIMEYAKCHWNQISLYANSIGAWFSMLSFEKENLRECIFVSPILDMQQLISNMMLWANVSEEQLKHELIIPTSFGHTLSWEYLQYVKQHPITQWNVPTKILYGKHDELTEIGVVEKFVEKFNCNLTIIENGKHWFNTPQELNSLYEWLNTLVK >CP016106.1|AXU53826.1|2169955_2170513_-|transcriptional-regulator MRVSREIVIQATSDIVNKDGLNKVSLKVIAEKLGIRTPSLYNHIESLDDLLLEVAHKGMREMNSQMIKATIGNFGDTAIKCISIAYFNFIISNPGVYETIQWATWHGNNETLEIFDEYKSLLEKLILSCNLNTKNTGEVLNLIMSVLHGYSTLQLGKSFLSKEEAIKGLVDSIDTVLLGIHKKYD >CP016106.1|AXU53825.1|2169243_2169606_+|regulatory-protein MEIDYKAIGQRIKIARIKKGITQESVANIINMTPSHMSNVETGKTKVSLPTLIAIANALSVSVDTLLCDNVLSSKVIFEKEAKDIFSDCDEYEIRSLVELLKSAKTVIRKDREIRKQFEK >CP016106.1|AXU53824.1|2168000_2168810_+|MerR-family-transcriptional-regulator MIKKLYKTSEFAELCGVKKHTLYHYDEIELLKPSITHENGYRYYTIDQFEKFNIISVLKKAGTPLEEIKQYLNDLDTNTFLNVLHRKLMDLQEEVKKIEKMCSMLRNVISTMEIHLNVNTEKIEIVNCEEEYLIATKIPEAVLTDEKTMLQGIGNHLQYCLLHDYNFHVGEIVLEKNIKQGIFRESYYYSLIKNKVDDERLFIKPKGNYAVMYHQGSYDSLYKTYQNMKNQLEEQGYHIVGNIYEEDLIDYLSEHNAENYIQKISIQVI >CP016106.1|AXU53823.1|2167285_2167909_-|cytidylate-kinase-2 MKIITISREFGSGGRELGKQLADILNFDYYDKEIITAIARKKKIDENYVSYILENHGWRNVPLTMCTSFTNILSMQSMKTDLLIEQSNVINQIASTGKDCVIVGRNADILLKKYQPFNVFVCANMNFKIQRCIEKKLNNEHISKKELERKIREIDKNRARSREFFTSSLWGNQTSYHIIVNTSEWNIKHLSYAIANFSEYWFRRYEQ >CP016106.1|AXU53822.1|2165963_2167289_-|drug/sodium-antiporter MIQLSDNFNYKRLLKFTFPTIIMLVISSIYGVVDGYFVSNFVGKTAFTAVNFIMPFLLILGCVGFLFGTGGGALIAKTMGEGKKEEANEQFSLLIVTSAGCGIILAVLGIVTMPWIASAMGADGQLLTDSILYGCVVIIAIPAYILQCEFQCLFATAEKPKLGLYVAIMAGITNIVLDALFITVFKWGLVGAALATAIGQYVGGIIPLLYFSRQNNSLLKFKKPKFDCDVLKKTVANGSSELMTNVSTSVVSMLYNAQLLKYAGEDGVASYGVLLYVALLFQAVFIGYSVGTAPIISYHYGAKNYDELKNLRKRSLIVIICFAVFMFIIGEFLSKPIAFIFVGYDNNLMEMTLRAFMIYSFSFLFSGFGVFGSSFFTALNDGLTSALIAFMRILVFQVVSVLIFPIFWGVNGIWFSIVGAEILATIMTAFFIIRKQKKYHY >CP016106.1|AXU53821.1|2165403_2165943_-|acetyltransferase MSLTIQKVTSYFKDLEKFEELNNEAFPDEERMSIQEMLNLVQSKKIEVSALYDKQQFIGFYVLMIENHIGYILFLAISPEQRSKGYGGKALSLMKKQYPNCQIVLDMETIEDSAPNLQQRILRKQFYLQNGFYETEYLMEYKGLEMEVLCNQKTFQKNEFETLLKNLKIREIPFHLWKK >CP016106.1|AXU53831.1|2177763_2178636_-|transcriptional-regulator MEETNEMKDSKHLISNIQSQYTRLSKGQKLIAQYILNNYDKVAFMTACKLGETVGVSESTVVRFANALGYSGYPKLQAALQELIKNKLTTVQRVEMAHDYSDDFAILNKVLKSDIDNIRSTLEEIDERAFKEASNKLLRARKIYILGMRSSFVVAQYLGFYLDIILDNVHIIRMDMGDAFEQIVRINEEDVIVAISFPRYSKKSYQIVNYAKEKGAHVISLTDSLFAPVASLADNTLLVKSNMASFVDSLVPALSISNALAISVGMKEKEDIKQHFDDLEQIWKRYSVYE >CP016106.1|AXU53832.1|2179029_2179608_-|rRNA-methylase MAYAKYLTKITDINKFYLENIINEGDIVIDATMGNGYDTRYLAEKVGEKGFVYAFDIQEEAIKSTRKKLEKEGYTDRVKLIFDGHEKMNQYIKEEVSCVLFNLGYLPRAKHSIITKPDTTLKAIKLSLEMLKENGVISIAIYTGHDGGQEEKDCIYNLVNNLNQDEFNVLESKFLNQVNNPPQLILIEKKKA >CP016106.1|AXU53833.1|2179665_2180382_-|23S-RNA-and-tRNA-pseudouridine-synthase MRINKYIASCGIASRRKAEEIILGGRIKVNGSVVKELSFNIDEEKDIVEFDNKKVKPSENYIYIVLNKPEGYITTVKDQFNRPSVIDILKDVRERVYPIGRLDYETSGLLILTNDGDLTYKLTHPKHEIDKTYVASVKGIISDDEIRQFETGLKIEDYTTAPAKIRVTKENKEKNYSVCEITIHEGRNRQVRKMCKAINHPVLNLRRISVGKIVLKDTKVGEYRYLTEDEIKYLKSIK >CP016106.1|AXU53834.1|2180572_2181658_+|permease MIIISKENIKYYLIVVFIGILFFKFINTPSDFISSIEGFLKFFSPFLLAILLALLLNPLVMLFEVKFKAHRLLAIFLSYIFIGFILAFAIRLLIPSIANTLNRLINEMPMYTDYIDSFIEKNMSNIDFLKTLIPHIQHSLDNLLKEASNFVGKIPKNFLIYTLSISSMLFNMTMGFILSIYIIYDKEKIALGFKRFLYSSTARNKADNIIEFFRTTHDIFYDYLLGRILDSLIIGIIAFLGFQFVIRIENALFLASIIFLGNIIPYFGPFIGAIPPIAMTILYSPQKTIWVIAFLFILQQLDGNFIEPKVMGNQVGIGAIWVISAILVGQSLFGFIGVFLSVPIAAVVKTYVDKYIDNRLQ >CP016106.1|AXU53835.1|2181812_2182472_-|lipoprotein MRGRVILLISILSIFLVGCSFNKKDEINLVEQGKTYLEKHNYKKAMESLSSALEEDSTNENARAMYMQAMRMSNMTEFEELKNYEGAIKELKLIEKIKNGSSVIKEEATKKKEELTKLEKEQNEAEEQRKKKAKDTAGEDRYRVESDARKSSYSGSSKNNKSSSKNNDKKSDSNKSDNNNSSSQNQEKPNNSNPTPAPTPQDTTGGSDSGGNSQNSNNQ >CP016106.1|AXU53836.1|2182688_2183981_-|diaminopimelate-decarboxylase MKLHGTMTVNNDELYIGGVSCLELSKKYQTPLYVFDEALVRQNCREYVEYFKAREGKNKVAYAGKAFLPLYMCNLINEEQMCLDVVSGGELYTAYKSNFPMEKVFFHGNNKTKEEINMGLDLGVGKFVVDNFYELDLLEALCEDKGKTQEIYFRITPGIEAHTHDYIKTGQIDSKFGFALVNGDLFRAIEKLSEYKNIKLVGLHAHIGSQIFDVEPYIDTVDIMMNLVKEIKEKFNIQLTEIDLGGGVGVYYSEGDKPKTIKEFCETIITKAETSCKELGIEVPTLVIEPGRSIVANAGSTLYTVGSIKDIKDVRVYVSVDGGMTDNVRPSLYQASYECSIVNKINHEAMNHVTIAGKCCESGDILIGDINIMDIKSGDILITTSTGAYGYSMSSNYNKIPRAAVVSVFDGNDKIICKRQSYEDLLALEI >CP016106.1|AXU53837.1|2183998_2185192_-|aspartokinase MSIIVQKYGGSSVADTEKIKSIAENIIERRKENPQMVIVVSAMGKSTDEYITLAKELSNEPSKRELDALMSTGEMISASLLSIALNALGCKAISYNAYQLNIKTSGLHGKSQIDDINVNRIKNSLDEGNVVIVTGFQGINEDGDVTTLGRGGSDTSAVALAVKLNGKCEIYTDVDGIYFTDPRKYSKASKLDEIEYEEMLELASLGAQVMHSRSIELAQKYGVEIYVGRTCGTEKGTYIRGGKDMKLEDKVITGLATSDDDSSITIKDFKAENISSLFEDIATIGISVDMISQTAPILDKISVSFTVPKEELGECKKIVSKYTDEEHVVIDNNITKFSLVGLGMKNTSGVAAKVFKIFNENGIMIKLITTSEIRITCAINSDDKQVAIEKIAEVFNI >CP016106.1|AXU53838.1|2185552_2186170_-|hypothetical-protein MTNMEKEILLLISRVRCVTESQFRKIYGDQKRYNKKNFKKTLRKMCSEYTLKKYPCDVDYYNYKDLSYVYYLNGSKLFKGDDLIKALVGSELVVRINTAGCDVKRFYRNVSVDDVKYDLFIEYTDQFGNIKQVLVDVDLNNEIDISKYENLSKKIDKSTIPFFKVPNVLVVTPDNLSELNDLERYDNEYSINFIDLGLNKLFNCI >CP016106.1|AXU53839.1|2186339_2188040_-|hypothetical-protein MKRYLKTYGVALIIVIIYAFIKLPVLRLDFTSLFSVGIIFFVVAGILDMMLDRNERASKMAKYNFSIAIALLVYIVVVPFITSTPVLHAKSYRELLGKVTESKFTDDISPVSVNDIRLVDEDMAMKLGDKKLGEVPAIGSVSKLGKFHIQNVDGELYWVAPLVHRDIIKWITSLSGTSGYVKVSASNPQDVQLVQEIDGKPIKIVYQPEAYLHQDLQRHLYIHGIVNVGMTDFTLEINDEGRPYWVVSLYEHKIGYGGANATGIATVDAETGKINVYDVKNTPKWVDRIQPQSFVTDQIKDWGVYVNGFLNSVISEKGVLVPTEGTSLVYGNDNRSYWYTGITSSGGDESTIGFMLVDSRTKEARLYKQPGATETAAMKSAEGNVQEKNYEATFPVMYNILGQPTYVSSLKDKAGLVKRVAFVSVEDYNVLGIGEDKNEALRNYKDALESKGNDLKLDNDLKDEVLEGTVTRISPDVRGGNTNYYVTLDSNKDIIFRATSKVSSELPLTQVGDKVKISYSKEESGVIEMSEFDNLNIANFEDKKAKEKTGTDENTDSKDSENQGNV >CP016106.1|AXU53840.1|2188436_2189000_-|hypothetical-protein MNKVYIVTTYTGTILSYLIRNISKKLYTHVSISLNENLKPMYSFGRLNPRNPFIGGFVEENINQGLYAIRKNTVCRVYSLEVDNLQYENLYKNIKLISDYREDYYYDTMALIYLLMNIQRQSEYKYVCSNFVADMLEKSEIDILNKQAFEVTPNDFYNLSGLTLEYEGLLSEYNSRQHSYVSKIANI |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP016106_14 | 2482699-2483122 | TypeV-U4 |
I-A
Consensus repeat of CP016106_14
|
6 spacers
spacers of CP016106_14
>14.1|2482728|36|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT ACAATTATTAATTGTTTTATTAGTGAAATCACAGCA >14.2|2482793|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCTATTGCTGTTGTTGCTCCAATCGCGATTTCTATCA >14.3|2482859|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGTAACACAATAGAGTTAAGGGCTGGTGGGGTTCCCT >14.4|2482925|38|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGGCTTTAGCAACTTGGAGTAATGCTGATACTAGCAAT >14.5|2482992|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTAAGATTAGATAAAAATCTGTGCGGAATTGTAAA >14.6|2483058|36|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGATAGCATAGAAGAGATGGAAAATATTGATTTAC |
c2c9_V-U4 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016106_14
The CRISPR arrays of CP016106_14 >merge|CP016106|14|2482699-2483122|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTTGAATCCAAATAGTTAATCTAAAACACAATTATTAATTGTTTTATTAGTGAAATCACAGCAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACGCTATTGCTGTTGTTGCTCCAATCGCGATTTCTATCAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACTGTAACACAATAGAGTTAAGGGCTGGTGGGGTTCCCTATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACGGGCTTTAGCAACTTGGAGTAATGCTGATACTAGCAATATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACATTTAAGATTAGATAAAAATCTGTGCGGAATTGTAAAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACTTGATAGCATAGAAGAGATGGAAAATATTGATTTACATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >CP016106|14|13|2482699-2483122|CRISPRCasFinder ATTTTGAATCCAAATAGTTAATCTAAAAC ACAATTATTAATTGTTTTATTAGTGAAATCACAGCA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GCTATTGCTGTTGTTGCTCCAATCGCGATTTCTATCA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TGTAACACAATAGAGTTAAGGGCTGGTGGGGTTCCCT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GGGCTTTAGCAACTTGGAGTAATGCTGATACTAGCAAT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ATTTAAGATTAGATAAAAATCTGTGCGGAATTGTAAA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTGATAGCATAGAAGAGATGGAAAATATTGATTTAC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >CP016106|14|7|2482699-2483122|CRT ATTTTGAATCCAAATAGTTAATCTAAAAC ACAATTATTAATTGTTTTATTAGTGAAATCACAGCA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GCTATTGCTGTTGTTGCTCCAATCGCGATTTCTATCA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TGTAACACAATAGAGTTAAGGGCTGGTGGGGTTCCCT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GGGCTTTAGCAACTTGGAGTAATGCTGATACTAGCAAT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ATTTAAGATTAGATAAAAATCTGTGCGGAATTGTAAA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTGATAGCATAGAAGAGATGGAAAATATTGATTTAC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >CP016106|14|7|2482764-2483122|PILER-CR ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GCTATTGCTGTTGTTGCTCCAATCGCGATTTCTATCA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TGTAACACAATAGAGTTAAGGGCTGGTGGGGTTCCCT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GGGCTTTAGCAACTTGGAGTAATGCTGATACTAGCAAT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ATTTAAGATTAGATAAAAATCTGTGCGGAATTGTAAA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTGATAGCATAGAAGAGATGGAAAATATTGATTTAC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC
>CP016106.1|AXU54092.1|2482355_2482508_-|hypothetical-protein MKNRRKDKRGFSVLLDKEKLDKFDEVLEEKNLTKKEWLEEKIDEELQQKE >CP016106.1|AXU54091.1|2481869_2482235_-|phage-related-regulatory-protein MKNELMMFEGKEIEVFEFEGRILFNSKDVANCLDIKNVNENIRLMNKKQVVKLRNSDISNTDIRKLNNAGENFLTESGVYKLIFKSRKEEAERFQDWISDEVLPSIRQTGAYITNNAIPKS >CP016106.1|AXU54090.1|2481421_2481817_-|prophage-antirepressor-related-protein MLKELLDDAGFDNKSKLLTAKTLYKKAGIDLPIEINEEEHYFDTKQIASKLKIYSKSNKPAQMAVCEIIKKIDLEDGEVKGVWETNGSWTGTVNKYTKSVIDKVRTWIEENNRSTKIAGEKKNYHVSYKIE >CP016106.1|AXU54089.1|2481208_2481370_-|hypothetical-protein MCENLLDNMYIEKRKEEYRIKLLKIRETDIDIYNKLESIVYKLSEKKLEKNNK >CP016106.1|AXU54088.1|2480420_2480885_+|hypothetical-protein MDFGEVKSELSDKDLKDNEEDLNKYKKYYLKVYKYYSEMDSIKSIQDIEIEQSRLKGQLQKNSNPIFALYISIMAVVFSTTINLTFDLSDITNYFIRMIMTLLFIVLLIFLVNKGILPIAIPYRNNIQFYTTALDVLEDMKNKILRERKYKKRR >CP016106.1|AXU54087.1|2478299_2479955_-|hypothetical-protein MNLDFHYYGTYLAAKIAGYNDSDAKTIAYAAQYVDESSKNMILDDVNFAFPTIQTNSEFQKYYADFNSWGYKWNLDSLNEIKKVWIPFHFLPGNLNNQVKYNGVKESKGLTTNWKFKDGDDQTFRLMCLPNSETVSAIINDLIYFHSTEEYKLQFIGMRMHVLADTWAHVYFIGKPEWYINDIKEFIAEESKYIEETKWTKAEEYRNGSWHAINFTGTPDAGGYESISYLGHGRIGHLPDYGYLNYRYVPNWSCTDDKVKIQKNNQDNFFKAFCQMVYALKCIKNGNDFSINQYDNLTAQQKTEVSKVIATRKDDQSEAWKKAIQTLGYKSLENFDKNKWKNEFIKSTNKEKTDYYYFNLVAKKHVDYVIDFLEEKRLPLEEMCSKYCEFKTFDDTQFAKNRNRVTKIILRGAYIVDAIQLVYDGKYKTPMHGETLGGSMVSLDLEADDYIVKISGSIGLYEGGEPYPNSPTRTIGKITFLTKKGKTITAGRETMFKSYGNFTLEPPTGKQIFALQGSYLIRKLRAETNKRYLDCLGIASIKDCSVVTSTK >CP016106.1|AXU54086.1|2477859_2478060_+|hypothetical-protein MYFKTYILKREVNNKQLEITRSFDLDNLICTATEILEDIEIDLIIIDEKNNVVWRNEKSTPAHENA >CP016106.1|AXU54085.1|2477427_2477841_+|hypothetical-protein MKVKSKRSFIVGIIVCMLCCASLVIYCILKDKRFLISSFLLIVIAIFNFCNAFSRKGIVEELHDSTDERDLYLTMKTSHILVKIMNYTLFTFTFLFIIAYSAWKNQSLLVIAITLCVIEIFLFVAYLLINIFLEKKE >CP016106.1|AXU54084.1|2477210_2477444_+|transcriptional-regulator MKTKVREFRTNMGLTQQQLADLVHVSNRTIISIEKEQYSPSLMLAYRMAQVFGTTIEELCCLKENKEMEDKKHESKE >CP016106.1|AXU54083.1|2476833_2476992_-|regulatory-protein MKISKLSEAELKVMRYIWEANKVLTSRELVAAMEEKYEWNESTTFTVLKRLE >CP016106.1|AXU54093.1|2483388_2484237_-|hypothetical-protein MWILVPIITIVLLIIAVSSMQYILVMIAFLLIIYSFIEKKIVMGLVSVLFFTYSIYLCATWEDKSLIADNKVETVKAQRETVEREKEMERRRIQEEVDKERYIEKHGMEISENDLKVKLEALVPQEYKGKKYELKVGKFKRYSMYFDLTVQNEKFSNSEECKKFVKEIANDLKKIKISKAYFKFHSKDDGGIYNSVYIDYFRNIQNNVDNVENLEFNEFELKTKEEEKREQEKIEQEKNSYNNYIQNRVVDPLDRIKKLKELLDSGAITQEEYNKKKKELLE >CP016106.1|AXU54094.1|2484504_2484657_-|hypothetical-protein MDNFLFNVLASVTASYIVYLISKLIKKVKSHSAAKSDLKIDINFKYHRKK >CP016106.1|AXU54095.1|2484930_2485263_-|hypothetical-protein MNDMARDVFSVKMTPLEAQKMVEKNLEADLVSVDIYNLENNKSIIVTIFEKYYARSNSDAGLVVICENTTGKTLVKITSTGSAIGLFQIDWGTGNNLIKRVKKILIDYII >CP016106.1|AXU54096.1|2485289_2485544_-|hypothetical-protein MENKDIKLTICIFAFVIGIIVLFCCIGLGQFNMACIIKQNGGSIATEQYNIYLEQSISQYRNFGSILVLLGGIGILFDKSVRKY >CP016106.1|AXU54097.1|2485692_2486124_-|transposase-like-protein-b MIRNRKLSRLISDVSWSEFIRQLEYKANWHGRKIVKVGKFFASSQICNKCGYKNEEVKDLNIREWICPSCNETHDRDINASINILKEGLRLNCIQKLKWKPSEYMNLEVNERALADDSILIKIEDEEEAMKEAEREKKRGRRR >CP016106.1|AXU54098.1|2486821_2487013_-|repressor MKISKLPEAELKVMRYIWESEKVLISREITKSMEQKYEWKDTTIFTVLKRLLKKRVFRNGENR >CP016106.1|AXU54099.1|2487117_2487492_-|regulatory-protein MKEEILIEKLLRAELIVMEYLWKKDTLMPKKEIVKEIKQIYGWHKSTIKILLKRLVAKRYLARYIINSQSHYKIIDSKEYYTFKKKVLKSSKSIKIMRSLTTTHKNVSKEKLDLLDEYYRNLKE >CP016106.1|AXU54100.1|2488295_2488784_+|pilin-protein MKNKKGFTLVELLVVIAIIGILAIVALPALFKNIEKAKIAKLEADISAIKSASLSYYADESKYTEGNIIWWTKKDGKITVNSGIGDEDPLAHKIENLGMPYNGSYTLVSSNGSEEYLELNIIIDGEISKSGLDKLEEDYGSSIKIPNDKNMIITFLSNKSDN >CP016106.1|AXU54101.1|2489819_2490008_-|hypothetical-protein MTKYDFNFKLKVAKFYLNREGRDILIVKQYGVYDHSQVERWVNILGESELKIKKFSILYGSS >CP016106.1|AXU54102.1|2490169_2490520_+|hypothetical-protein MIQKKFFMGFCGFLGFLSLRYFSSGNVADLTYIGFFAFFSNFIIAKINGDKADERYVQDEKAAMAFTGQLAIIELFILWCITIVSRNIELMCVLLSITYAITLNVYAIKLYILEEK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP016106_15 | 2644626-2644783 | Unclear |
NA
Consensus repeat of CP016106_15
|
2 spacers
spacers of CP016106_15
>15.1|2644654|38|CP016106|PILER-CR AATAATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATT >15.2|2644720|38|CP016106|PILER-CR ACAAAATCTCCAACTTATAATTATTTTCGCGATGTACC |
cas3,cas5,cas7,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016106_15
The CRISPR arrays of CP016106_15 >merge|CP016106|15|2644626-2644783|PILER-CR AAATCCGATTAGTTAATTTTAAACCTAATAATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATTTGAAATCCACTTAGTTAATCTTAAACATACAAAATCTCCAACTTATAATTATTTTCGCGATGTACCTGAAACCCACTTAGTTAATCTTAAACCT >CP016106|15|8|2644626-2644783|PILER-CR AAATCCGATTAGTTAATTTTAAACCTAA TAATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATTTG AAATCCACTTAGTTAATCTTAAACATAC AAAATCTCCAACTTATAATTATTTTCGCGATGTACCTG AAACCCACTTAGTTAATCTTAAACCT
>CP016106.1|AXU54249.1|2643536_2644484_-|50S-ribosomal-protein-L11-methyltransferase MNNWIEITIKTTTEAVEPITNILYEQGAGGAVIEDPKDFLFQKKNELDWDYVEEEVFKKNEEDDVLIKTYVSEEKNVMEFVEIIKQKVLGLKDFGIDIGEGSVSLDQVNEADWANAWKAYYKPTKVGQRVVVKPTWEDYAMQDGDLIIELDPGMAFGTGTHETTSMCIRELEKYVNKDSKVFDIGCGSGILAIAAAKLGAKEVVAVDLDEVAVKVAKENVLENKVEKSVSVMHGNLTDVIKDKADVIVANIIADIIKILAKDVQNFMKEDAIFISSGIILDKVEEVKESLIENGFEIVEVQKLGEWSAIVSKLKK >CP016106.1|AXU54248.1|2642759_2643518_-|16S-ribosomal-RNA-methyltransferase-RsmE MDRFFVEKNNINLQDKTCTIEGEDVKHISKVLRCKLGEKLEICDKNNNEYICEIMNIDKSIVNLEILEKVDINRESELKVRLYQGLPKAPKMEMILQKLTEVGVEEIILVQTKRSVVKVDDKKEDKKFERWERIIYEAAKQSKRGKIPKLRGVLSFKEALEDMKKNNVNICPYENERTVSIKHALKKCDSNIDSVGIFIGPEGGFSEEEIEQIQKNNCNVVSLGPRILRTETASVVASTIALYELSDLGGEK >CP016106.1|AXU54247.1|2641459_2642758_-|radical-SAM-superfamily-protein MKKVAFYTLGCKVNQYETEAMLELFEKDGYEQVNSEEYADVYVINTCTVTHMSDRKSRQYIRRVKKKNPDAIIAVVGCYSQVSPEEILDIEEVNLVMGTNDRRKIVEEIKNINSSKKVSTVDDIMKVKAFEEIEISQTNGKTRAFMKIQDGCDRFCTYCIIPYARGRVRSRDIDSIVDEVKKLANNGYKEVVLTGIHVASYGKDLKDRDIKLLDVIKQINQIEKIERIRLSSVEPILFTDEFVNEVLKMDKVCPHYHLSLQSGCDETLKRMNRRYTTLEYKTIVDRLRSKMPDVAITTDVIVGFPGETNEEFKKTYEFLKEIELSQMHIFKYSPRKGTPAATMENQVDPQMKHFRSEQLLNLSKVNFNKFATKFIGRELDVLFEQNIEGNKYEGLTSNYIRVVVESDKNIQGQILKVKINDVKDEYVEGILL >CP016106.1|AXU54246.1|2641066_2641417_-|histidine-triad-nucleotide-binding-protein MDCIFCKIANGEIPSTKVYEDDRVLAFNDLNPVAPYHILVVPKKHYDSLIDIPDKEMDIVSHIHVVINKIAKEKGFDQTGFRVINNCGSDGGQEVKHLHYHILAGKKLPNYEAGQN >CP016106.1|AXU54245.1|2640724_2640904_-|30S-ribosomal-protein-S21 MSEVRVRENETLDSALRRFKRQCAMSGIMSEVRKREHYDKPSVKRKKKAEAARRKNAKK >CP016106.1|AXU54244.1|2640251_2640695_-|tRNA-binding-protein MSLKQKLQEDLKSSMKNKDTVRKSVVTLIRASIKQYEVDNRVELDEDGIIDVIAKQLKQRRDALVEFEKAGREDLIKETEGEIEVLKEYLPQQLSEEELEEIVKSTISEVGATSMKDMGKIMSVIQPKVKGRADGKLINKLVKQNLQ >CP016106.1|AXU54243.1|2639643_2640141_-|sensory-protein MIISVKEIRNFLINIFIPLIIGYLSSILTMIISGTDISTYYLQLTKPSFAPPAFIFPIVWTILYILMGISSYLILRKGYNLPKVRDAIFYYGLQLVLNFIWSILFFGFGLRFTALIDIIIMILVSIIMISKFSKIDKRSGYINLIYLMWLVYAGFLNYFIWFINK >CP016106.1|AXU54242.1|2638887_2639451_-|sigma-54-modulation-protein MQIIVSGRQMKLTDGIKGYVDGKLSRLEKYLDPESEVKVTVSAKKDRQKVEVTIIPINGQIIRAEDVEDDLYAAIDIVCDKLSRQVVKYKTKVKDKVQNNKSIRFENLDFIDNSSEFDDYDYDDEEDENIVIERRKKFNVKPMSSEEAILQMELVGHNFYMFRNQDNFEINIVYKRKAGGYGLIEQD >CP016106.1|AXU54241.1|2638438_2638675_-|sporulation-protein-YqfC MLEISTDLQVNQPVITVTSNTFISIENYLSILEYEVDLIRIKTKVKTIKISGDKLSLKYITDSEIGIKGIIYNVEYVD >CP016106.1|AXU54240.1|2637082_2638426_-|stage-IV-sporulation-protein MISFIRGYYVIVVEGVGLEQFLNHLIRNGISVYNVTRIKNTKMEFHIDRQDIKEFKNVYRGSKFDIKVKQKTGVPFIIKRVYKHKGMWICALVSLFLLMSTSQFVTDVYIQSPEGIKKEALRNELYKVGVRPGVYKKSIDRKEVRDHMMSKFNDVAYLSINVKGTNIFVTVTKKAESLKSTDQSNYCNVIALKNGIIEKVIPRSGKSVIKSGDIVQKGDVLLNGANTKSIPEVWASTFYESTKKASYVDTVNKKTGEKKNIYTLSFYDKEFTMRKNIKYKDYVVENKEKKLSIGNYTFPIKIKTSTFYETKKVEVKRNKEELKKELSEKALKELEYIIPASARIIDVKHNFKVNKNMLEYLITVQTSENIAKIYPLSKSEAERFIKEESKPDEGEEEVPSNPEKRPLNDIRNEFDEDNKDNKDQNNSDENNSNQNSNNSQNNNSNNN >CP016106.1|AXU54250.1|2644924_2647333_-|ATP-dependent-helicase MKNIMQKEILAKSYNLRTNQQEQTLVEHIKDLFEVLESILELNLYSDKDVEILKICCALHDLGKINSIMQQKMEINNKISYSCSEEERKKLESDKKSLKKIARHNIFSGAFLKDILEKMNLSEEDKLYIYKSIMLHHGNYEDYMRLSTSKVQKEIYDYIEKGILEKEDFNLEDIESYINNILNVDFKFGEDVLDYDYIDKLSESMFIDSDYNKGQIDDSVLNYRKFKYILYKGMLNLIDHSASSRQKGIKFYNDFTDEEIDDMILNEIYKSQGNLDKNNIEFNTIQKRLRELSGRNVLTVAFTGSGKTAADYRKTFKRKFFLVPNKISAESFYRKNIFQNKNDLDTRSSNDYIGLLHGDINLYSENEDNGEHDFVLTLRDIDLSINFCKPCVIATVDQLLLSMFKFPGYEKIFAAVKNASITVDEVHLLEPKMFLILIYFMQFACKYLDVDFHLMTATLPKSYKEQMINKGIVFQEESNENVTDKGEIVFIESNKEEEICEGKDVKVSFIKEKEIKSIVEGALENKQKILIIKNTIDSVNRTYEFLKENLSDKYGGVDIDVLHSRFKFKDKKEKYSKILNGEGDIWISTQSVEISLDLDFNIIISDLATMDSLIQRMGRCNRNNKYEYGNFYILPSEDKIYDNKLKNTTKNILKDILKTKSIFTMGIRKTILDDYYDNSVVKKYFEENFISCDKEIKNIYGINKEIFDGLDLIFNFEPYKNIVDSKKEAAKIFRDVDVSYKIILEEDFYKEDRELQQDSIQVSGFIFNRLYYYGLISKVEGYMVLKSSSKFEYNSTVGLILK >CP016106.1|AXU54251.1|2647359_2648157_-|CRISPR-associated-protein-Cas5,-subtype-I-B/TNEAP MKVLQCKLKQPTAHYRDPKVFQNEYIGTLNLPSKTTIMGMITYLCDRRLNSDIDIGIIGTHHHRELEFSRGENIDFWNEYTNMRKGKDKEKFLLQGNYYDYYKEHKAQNSILNYEVLKEVELTIFISCKDDEELEFIRKKLESPCKYANLGRKEDFVIPSEKGCFVKEVALKEVIPMNTRDAIKENIKLKNTYVRVDLRDKENVETIINQGVLIALPHKYKDLEANRDDRVYEFCHYIYVDNDGIYPKNIKVNVCIDTKEVFTWL >CP016106.1|AXU54252.1|2648172_2649186_-|CRISPR-associated-autoregulator,-Cst2-family MNEKRVKGVTLTILTESPVPLSYDQGYGNYTPIKKEQYREKIHAKTSIATITYDLRRMLHQEYGWNLSNIVFGKKGNIYPSIKKNVGCVDENGLETDVFGYLIPLKDKGSISKASPLRIIPFRSLNPYIGSTQLITNRGFLSSEFGRKYYDEKEENEVPRDENFPTTQALAIEETLSDYYVYTITLELDRIGVVEVEDGKLLLPEERKFMSKELREKAVKDILDAITVFTRNIKHSSVLLKPLAVMGGAFDKVVPFFWDDVDYNADSGEINLEGVIETIESYSLKESNTILAINDRLKISNKKELNKFNLSKYPVKEIKNLADRLEIGEDNMWYLKE >CP016106.1|AXU54253.1|2649205_2650672_-|hypothetical-protein MREIKAKFYRSGDIVRDIGIVYFYELLMDLKNELEKNDYKLKFTCELNRNYLSLESAEYIEPKYISDYILENQLFKVFKNGKKETLEKIFSNIDNLTYVNFIEELDKSSATEKQKEGIKKDFKNRRFPYVRNSGKYGLNTSLENMETNVKRIVGTVIKSNIEIDKLDLTQYEEKDSVCNVCNINKTTKLDIDLRERKDSKYNFLFRGAEKSGFKISGQVESNICFECEFFNLMCLLYINLKRPMVFAYTNDLRELAFLNHKIMLKRKMYSDKSFYKKLLHEKISSIRLYRFDIDTNKGIILKFDSIIEYKELLKKIELIDIIDNYNFSREAANTKNLGKKMIDNGNLSNLKELLLDNISFLKQSTGTSREMDFVSSSYNIGLYIKLCWIVDGGEEYKMKNYMESNLIYSRVGKDLFNKMTDESRRKNFSMKVIQLLKSNDRAQLFQTIMHVLVSNGILIGEGFVEGIMQSSELELNTNVGIFIQEIMK >CP016106.1|AXU54254.1|2650676_2651414_-|CRISPR-associated-Cas-family-protein MSRISIFMESCNGKFPNENSMLSVSFIKNILNAENKDFAKNIFNYGEERKNNKQIKDINTAIYIPNLIRSKNELLVDGDIIFNISFYNYSMFSKLYNGILKVKELEYKGYRFKIKNIKIHKEHEIKENGVIFKTMSPIIVKNKEGKYLDVEDSNYIECLNYIANLTLESIRGSGLRKPLEFIPLNFKKRVLKEKIRGFKVREYYYINAYAGTFFLKGNMEDLNALYKMGIGYRRTENAGMVDILK >CP016106.1|AXU54255.1|2651671_2652781_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSEVILKNISKLYSNGFNAVKNINIDIKDKEFIVLVGPSGCGKSTTLRMIAGLEEISEGELYIGDKLVNDIEPKDRDIAMVFQNYALYPHLSVYENMAFALKLRKFPKDEIDKKVKEAAKILDLLPLLNKKPKTLSGGQRQRVALGRAIVRNPKVFLMDEPLSNLDAKLRTAMRTEITKLHQQLGTTFIYVTHDQVEAMTMADRIVVMKDGVVQQIATPQDVYDYPANIFVAGFIGAPQMNFIDVILIEENDEIYAQNEHIKLKLNKEKHYDLIKDNYINNEVVIGIRPEDIHVEDTFIKSNPDTCFKSRIEIKELMGAETYAHLKLGENTITIRFDSKNRINVGDDLTLSVDNSRVHIFDKETTLAIR >CP016106.1|AXU54256.1|2652810_2653578_+|sugar-diacid-utilization-regulator MEELKDFLERQLNKKINIYPYENQKLDASSHLVTFNNAIYVIDFLDKNNLDNLKGNFYLIYQSHIDFEYLKNIFYNLFEDINIIQHNGFFIVNSKYNLDINVTTQNIIETETYQSTYIFYLGELDSKADFDFRLQLCSDLLPHIIKDNAENKFLNLFDLIRYKTLDLINEDNILNKLIDFNKIKSIDEELLYTGIKFINNDLNISKTSTSMFLHRNTLVYRLEKINEILGFDLKNFENAMIFYLSVKSYFLYKKI >CP016106.1|AXU54257.1|2653765_2655139_-|transporter MGKTNARRTLFLIAIGSGTMLNPLNSSMISLALHSIQNDFHISFTTVSWIVSAFYLASAIAQPVSGKIGDLIGRKVLFLSGLMLVILSASIVPLVQSFFILIFIRVIQAIGTSTLYPSGVALIQNNIKERQSSALAVLTIFASTTAGLGPTLGGLLLDLGGWHAIFLVNIPVVLVSICLGYFLFPKEVKEKKSIKETLKNVLSRLDIIGILLFSIAMIFILLFLLSMKESFNLEQLVFGIILMCLFIWHELRTKLPFIDIKLFVSNPKLSKVYLQFIILNFFNYILFFGLPSYFQDALHYSAKSTGLFMLFMSGIGIFISPLTGKWIDKSGTRFPLVTSSIFMFISAVLLSVVFIHIPVIGKGIILSLAGISYGVGNVALQSSMFEESPRDSIGTASGLFQTSRYLGSILATVLLGMVFEVNITSEQFQILGYVMVVLGAISFLLNFILKKELRKVE >CP016106.1|AXU54258.1|2655174_2656110_-|glucokinase MYYIGVDIGGTGIQAGVVDNYGKIIFRSECKTVIEKGFEGILNDIKIMIYKLLEDNKLTMSDIKSIGFGVPGFINKEGLVTCVNLKWNKKAFNKELKRRFPDVEIHGENDATVAALGEAKFGSMKGANVGVLYTLGTGVGGGIVINQKVFSGAHGLGSEIGHQIIGENYFNCNCGNNGCVETFCSATAIIKYSQKLIEEGEKSRILDLAEGNLENVNAKMVFDAYRENDLVAIKVINRFKEYLAKTFANTINSLDPEIISIGGGISKSSDIILDGIEDLVRKFVLYKTEDIATITCATLGSDAGIIGAAFL >CP016106.1|AXU54259.1|2657075_2658230_-|chaperone-protein MSTKRDYYEVLGISKGAEAQEIKKAYRKLAMKYHPDRNPGDKEAEEKFKEINEAYEVLSDDTKRKTYDQFGHDGLNGQGGFGGQGGFGGQGFGGFEDMFGDIFGDMFGGSFGGGRARRRGPQRGADIRQSVTISFEEAAFGKKMSIKVNRSEECEECNGTGAKPGTSKKTCSTCNGTGQVRTVQRTPFGNIASSRPCSACNGTGEVIESPCSKCHGTGNTRKVKTIEVDIPAGIDDGQMIKLSGQGEVGEKGAPRGDLYIVVNVKSHPLFTRDGNDIYFEMPITFVQATLGDEIEVPTLDGKVKYSVPEGTQTGTVFRLKEKGIPRIRGNSRGDQYVKVVVEIPKKLNDKQKELLREFAKECGSNVHEKKKTFGQKIEDMFKKK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP016106_17 | 2744318-2744542 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP016106_17
|
3 spacers
spacers of CP016106_17
>17.1|2744345|40|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTAGGATAGAACAGAAAATTGGAAGAAATACAAATGAACA >17.2|2744412|39|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTACTATATTCATAGCAGTTGTCATATGCCGAAATGCC >17.3|2744478|38|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTCTTTTCTTCTACTGTAGTCGCATTAATTCCAGCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016106_17
The CRISPR arrays of CP016106_17 >merge|CP016106|17|2744318-2744542|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTACATACCACATAGTTAATATAAAACTAGGATAGAACAGAAAATTGGAAGAAATACAAATGAACATTTACATACCACATAGTTAATATAAAATGTACTATATTCATAGCAGTTGTCATATGCCGAAATGCCTTTACATACCACATAGTTAATATAAAATTTTCTTTTCTTCTACTGTAGTCGCATTAATTCCAGCCTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAT >CP016106|17|10|2744318-2744542|PILER-CR TTTACATACCACATAGTTAATATAAAA CTAGGATAGAACAGAAAATTGGAAGAAATACAAATGAACA TTTACATACCACATAGTTAATATAAAA TGTACTATATTCATAGCAGTTGTCATATGCCGAAATGCC TTTACATACCACATAGTTAATATAAAA TTTTCTTTTCTTCTACTGTAGTCGCATTAATTCCAGCC TTTACATACCACTTAGTTAATATAAAT >CP016106|17|15|2744318-2744542|CRISPRCasFinder TTTACATACCACATAGTTAATATAAAA CTAGGATAGAACAGAAAATTGGAAGAAATACAAATGAACA TTTACATACCACATAGTTAATATAAAA TGTACTATATTCATAGCAGTTGTCATATGCCGAAATGCC TTTACATACCACATAGTTAATATAAAA TTTTCTTTTCTTCTACTGTAGTCGCATTAATTCCAGCC TTTACATACCACTTAGTTAATATAAAT >CP016106|17|9|2744318-2744542|CRT TTTACATACCACATAGTTAATATAAAA CTAGGATAGAACAGAAAATTGGAAGAAATACAAATGAACA TTTACATACCACATAGTTAATATAAAA TGTACTATATTCATAGCAGTTGTCATATGCCGAAATGCC TTTACATACCACATAGTTAATATAAAA TTTTCTTTTCTTCTACTGTAGTCGCATTAATTCCAGCC TTTACATACCACTTAGTTAATATAAAT
>CP016106.1|AXU54338.1|2743255_2743816_-|phage-lipoprotein MKKKVCFLFSILIVICLAIVGCSNSESPEESSKNNEPKKEEKKDKEVVIGEKIISDKMEITINNIEFSYDVLPKVKESLYTHYPAESGKVYIDIAADIKNTQKQELNCSDLLTIEANYNDGYKYSSQTIVEDETTGFTYDNISSIDPLETKGVRFIIDCPDEVKTSDKPVILSFTFDGNKYVYKMK >CP016106.1|AXU54337.1|2742642_2743212_-|phage-protein MDDIVEYIFCSECGAKCLKGSKFCSECGTEIADIKMLNESIIKEKEYDLKGIDLQHVMQETSFIKASSVRRLKELTGIELDDCRKILEEPYQKYYNENADMLEEKRKKEDDISKIRKAKEEKKEKEKIACCPACGSTSLTTHKKGFGIGKAITGATIAGGIGLVAGNIGAKKVRVTCLNCGKQFWAGKK >CP016106.1|AXU54336.1|2742455_2742572_-|phage-tail-tape-measure-protein MAIIQTSIRIFDGMTPAFRNMTTSLTQQLIVWRDYKVD >CP016106.1|AXU54335.1|2740221_2742459_-|phage-tail-tape-measure-protein 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| CP016106_16 | 2743947-2744172 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP016106_16
|
3 spacers
spacers of CP016106_16
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016106_16
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You can click texts colored in the table to view more detailed information
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| CP016106_18 | 2746146-2746898 | Orphan |
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|
11 spacers
spacers of CP016106_18
>18.1|2746175|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT CAATTTCATGTGTGGATAGTTGCCATATCTCCCACCC >18.2|2746241|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAGCAGTTAAGATTAGAGATGAAGCTAGTTCAACACT >18.3|2746307|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATCTATAGAAGCAGCAACAAATGCCCTCTCGTAGTC >18.4|2746373|36|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATAATTGGTGATGGTACAGGATATACAAATGCAAC >18.5|2746438|38|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAAATAAAATAGACAAATACCTCGATAAAATAGATAT >18.6|2746505|35|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATAACAATAGCCCCTATTCCAACTGTTAATCCGA >18.7|2746569|38|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTGCTTGGGAAGGGCTAAAAACGATTTGCTCTAACACT >18.8|2746636|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCTTTTGTCATAGATATAAGATTATTTAATACTGCTG >18.9|2746702|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAATTAAAAGATAACAAAAAAATAATGGAAGAAGGTT >18.10|2746768|36|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAATTTATTTTTTAATTTTTAGTTATCTGCGAATA >18.11|2746833|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAAGTGGCAAATGTGGAGTTGTTATTTTTTCTAGTAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016106_18
The CRISPR arrays of CP016106_18 >merge|CP016106|18|2746146-2746898|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTTTGAATCCACATAGTTAATCTAAAACCAATTTCATGTGTGGATAGTTGCCATATCTCCCACCCATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACCAGCAGTTAAGATTAGAGATGAAGCTAGTTCAACACTATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACTATCTATAGAAGCAGCAACAAATGCCCTCTCGTAGTCATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACAATAATTGGTGATGGTACAGGATATACAAATGCAACATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACAAAAATAAAATAGACAAATACCTCGATAAAATAGATATATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACTATAACAATAGCCCCTATTCCAACTGTTAATCCGAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACCTGCTTGGGAAGGGCTAAAAACGATTTGCTCTAACACTATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACCCTTTTGTCATAGATATAAGATTATTTAATACTGCTGATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACGAATTAAAAGATAACAAAAAAATAATGGAAGAAGGTTATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACAAAATTTATTTTTTAATTTTTAGTTATCTGCGAATAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACGAAGTGGCAAATGTGGAGTTGTTATTTTTTCTAGTAGATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >CP016106|18|16|2746146-2746898|CRISPRCasFinder GTTTTGAATCCACATAGTTAATCTAAAAC CAATTTCATGTGTGGATAGTTGCCATATCTCCCACCC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CAGCAGTTAAGATTAGAGATGAAGCTAGTTCAACACT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TATCTATAGAAGCAGCAACAAATGCCCTCTCGTAGTC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AATAATTGGTGATGGTACAGGATATACAAATGCAAC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AAAAATAAAATAGACAAATACCTCGATAAAATAGATAT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TATAACAATAGCCCCTATTCCAACTGTTAATCCGA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CTGCTTGGGAAGGGCTAAAAACGATTTGCTCTAACACT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CCTTTTGTCATAGATATAAGATTATTTAATACTGCTG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GAATTAAAAGATAACAAAAAAATAATGGAAGAAGGTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AAAATTTATTTTTTAATTTTTAGTTATCTGCGAATA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GAAGTGGCAAATGTGGAGTTGTTATTTTTTCTAGTAG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >CP016106|18|10|2746146-2746898|CRT GTTTTGAATCCACATAGTTAATCTAAAAC CAATTTCATGTGTGGATAGTTGCCATATCTCCCACCC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CAGCAGTTAAGATTAGAGATGAAGCTAGTTCAACACT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TATCTATAGAAGCAGCAACAAATGCCCTCTCGTAGTC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AATAATTGGTGATGGTACAGGATATACAAATGCAAC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AAAAATAAAATAGACAAATACCTCGATAAAATAGATAT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TATAACAATAGCCCCTATTCCAACTGTTAATCCGA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CTGCTTGGGAAGGGCTAAAAACGATTTGCTCTAACACT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CCTTTTGTCATAGATATAAGATTATTTAATACTGCTG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GAATTAAAAGATAACAAAAAAATAATGGAAGAAGGTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AAAATTTATTTTTTAATTTTTAGTTATCTGCGAATA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GAAGTGGCAAATGTGGAGTTGTTATTTTTTCTAGTAG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >CP016106|18|11|2746212-2746898|PILER-CR ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CAGCAGTTAAGATTAGAGATGAAGCTAGTTCAACACT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TATCTATAGAAGCAGCAACAAATGCCCTCTCGTAGTC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AATAATTGGTGATGGTACAGGATATACAAATGCAAC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AAAAATAAAATAGACAAATACCTCGATAAAATAGATAT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TATAACAATAGCCCCTATTCCAACTGTTAATCCGA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CTGCTTGGGAAGGGCTAAAAACGATTTGCTCTAACACT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CCTTTTGTCATAGATATAAGATTATTTAATACTGCTG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GAATTAAAAGATAACAAAAAAATAATGGAAGAAGGTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AAAATTTATTTTTTAATTTTTAGTTATCTGCGAATA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GAAGTGGCAAATGTGGAGTTGTTATTTTTTCTAGTAG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC
>CP016106.1|AXU54341.1|2745799_2745982_-|hypothetical-protein MSNKLGRPPKENSKKLRFEVRLNQEQADILNECADNLKISKTDVVIRGIELVKEKLDKNK >CP016106.1|AXU54340.1|2744860_2745679_-|prophage-antirepressor-related-protein MNEIMNFEGKEIEIFEYNGQVLFNPYDCGRCLELSDSAIRNHLTKMNDTQAILLKNSNVLDKDFRKLHNTGEKFLTESGVYKLIFKSKKEEAERFQDWISDEVLPAIRQTGAYITNSANPEKLREKASEIEKLQLAYNSTSMLKELLDGAGFDNKSKLLTAKTLYKKAGIDLPIEINEEEHYFDTKQIAPKLKIYSKSNKPAQMAVCEIIKKIDLEENELKGVWETNGSWTGTVNKYTKSVIDKVRNWIEENNRPTKIAGEKKNYHVVYKIE >CP016106.1|AXU54339.1|2744621_2744798_-|hypothetical-protein MRESLLNEYNLKTDEDVEYFVKFANALYELKQNSEEKFQEYAEILRGILREQEERKNK >CP016106.1|AXU54338.1|2743255_2743816_-|phage-lipoprotein MKKKVCFLFSILIVICLAIVGCSNSESPEESSKNNEPKKEEKKDKEVVIGEKIISDKMEITINNIEFSYDVLPKVKESLYTHYPAESGKVYIDIAADIKNTQKQELNCSDLLTIEANYNDGYKYSSQTIVEDETTGFTYDNISSIDPLETKGVRFIIDCPDEVKTSDKPVILSFTFDGNKYVYKMK >CP016106.1|AXU54337.1|2742642_2743212_-|phage-protein MDDIVEYIFCSECGAKCLKGSKFCSECGTEIADIKMLNESIIKEKEYDLKGIDLQHVMQETSFIKASSVRRLKELTGIELDDCRKILEEPYQKYYNENADMLEEKRKKEDDISKIRKAKEEKKEKEKIACCPACGSTSLTTHKKGFGIGKAITGATIAGGIGLVAGNIGAKKVRVTCLNCGKQFWAGKK >CP016106.1|AXU54336.1|2742455_2742572_-|phage-tail-tape-measure-protein MAIIQTSIRIFDGMTPAFRNMTTSLTQQLIVWRDYKVD >CP016106.1|AXU54335.1|2740221_2742459_-|phage-tail-tape-measure-protein MNNPLNTGGIQTSQQSLNNIESILTRIEQSIGKADEQQRKFNDDINKGASNTDRLLGSVKKVVGTYMGLKTIGGLANLSDQMTSTNARLNMINDGQLSDGGLNKMIFQSAERSRASYLDTAQIVSRIGMNAGSAFSSTREIVSFAEQLNKKFVIAGASTQEMNSALLQLTQGLGSGVLRGEELNAVFESAPNIIRSIADYLDVDIGKIRGMASEGMLTADIVKNSLLAASAETNAQFEKMPLTIGQIFTSIKNNAVMIFGAIQKKIEDTVSSGGFRTFIVNVTDSLYVLGVVGYSVFNGFIDLLSSPTFQGFANMMIVGISLITQGFGWLLTVLGSVINFISQGWSIIQPILITSIVLWGLYKTAVIAGALVTAIQVVWIALQTFWTNLLNGSLLTNIMMNIAAKISTDALSGSMLLLITTIVMVVAAVALVIAAIFVAVAIFNHFAGTSISATGVVVGAFYFLGTCIYDVFAGAWNIVMAFAEFFVNSFNIVIYNVQLLFYKFQNFVINAMGDVGGSFDNCATALANAFVSAANIAIKGINGVIKALNLIPGVNINTLGSLDKIDSFVKQYKDYQKTLKEPVKPAEWKAPTMKLKNPVDSFKKGYEVGQNLENKIKDAFDISKIAEKAKKDLGLDDLWDDKYGLGDGFGSAGLNSPLNDAAKGAKDTAGNTAKMAKTMDKSQEDLKYLRDIAEQETINRFTGVNIKIDMNNTNNINSEADVDGIVNVLTEKLNDAMVVSAEGIV >CP016106.1|AXU54334.1|2739514_2740210_-|phage-cell-wall-hydrolase MAYDFYLDGVQLPIPPPKLEIKVTNKNKTVDLINTGEVNILKKEGLSEISFEAEFTHNKLPFYRGTFRDVQFFLSKLELLKTDCKPFQFIVSREMGGKVLFNTNIKVSLEEYAISEDADNGSDTKVAIKLKQYRDYSTKKLVLAPPKNETGRPSVKIEPKRVDSVNATNTKTKTYTVKAGDSLWSICQKQLGNGSLYKKVYELNKSMMDKANKGKNLSKYTIYKGQVLKLG >CP016106.1|AXU54333.1|2737563_2739522_-|phage-cell-wall-hydrolase MVDELVLANDRDVRLVIAHWEDFYEPTVLDGITWEIERRGTPSKLEFTIVMDDILEFCEGNSVRLYYKGVGIFYGYIFQKKRDKENHIKIVAYDQLRYFKNKDTYVYSNKTASELVKMLAKDFNLKYNVIEDTKYKISRIEENKTLFDMILTALDDTLREKKEMYVLYDDFGRLTLKNIASMKLDIVMDNDVIEDFDYNSSIDSDTYTKIKLVRDNEETSKRDVYIAQDSAHIRSWGILQLFETVDKNMSEAEIKQKCDILLKLYNRKTKTLSLKNVLGDIKVRAGCLLFITLNLGDIELQNYMLVEKVKHTFENNSHFMDLTLVDGDEFASYSSSSYSSGNTNNKDEKKNGPAQSTTSKEDTEMANKINKLLKGKLSGTGNIFVKYSNAYKVNPALMAAISMHESARGTSNIANTKNNFFGMRIDGKYLSFSSTDEGIKRGISNLSRNYIHTGRKTLESIRNKYSSSSDKEWVKCVSSFYKQITGNSYDNSSGIGVGSNEEAEKNLKNTTYQVQNNNNNANTSTNNNSKADKLINIAKSKQGCKYVWGAEGPNTFDCSGFTQWCYKQIGIKIPRTVATQSKAGKAVDLKDKSKWKAGDLLCRIGGGSSNHVVMYIGNNQIIHSPQTGDVVKIESVNSYRKGKAYTHVRRFI >CP016106.1|AXU54332.1|2737289_2737550_-|phage-protein MSQDLLQIIKKAAMDAVETSNPMRVVFGTIESISPLRVKIEQKLSIGEIFLIQTDTFKRYTDKKIGDKLVLIRMQGGQQYLILDRM >CP016106.1|AXU54342.1|2747141_2747300_-|hypothetical-protein MYENLLDSIDIEKRKEEFRIKLLKIRETDIDIYNKIESIVYKLYEKKLEKNK >CP016106.1|AXU54343.1|2747361_2748165_-|prophage-antirepressor-related-protein MNDLQIFKSEDFGEIRTVDIDNEIWFVGKDIAEALGYSNTREALKTHIDNDDIAEVVIHDGSQNRNMKITNESGLYSLIFGSKLETAKNFKNWVTKEVLPAIRQHGAYITNNADPQALRDKANEIESLDTVNKTIEILTPFLDNAGIDEKEKLLTAKTIYKKAGIELPLEIEEKEHFFDTKQIASKLKIYSKSNKPAQLAVCEIIKKIDLEENEVKGVWETNGSWTGTVNKYTESVIDKVSKWIEENNRPTKIAGEKKNYHVVYKIE >CP016106.1|AXU54344.1|2748293_2748464_-|Ribbon-helix-helix-protein,-copG-family MSPKKIGRPVVGSPKTNDIKVRVDDETNEKLDEYCKKNNLTKAEAIRQGIHLLLEK >CP016106.1|AXU54345.1|2748766_2749519_-|hypothetical-protein MGLFKKKEKEKGICMICGNEGNALKTVDNEFLCDECFEKCRGEIAVLGKGLKKLTSKEVINAVELCKDSFGNFVKNTLIQIVYLGGHPLFNREEMICLLIRSDKIVVKAFGTGPIPIVDVFEVSYSDIKSVSIEKEEEVIRRYTATRIALFGPFALAMQKAELNKKEYLIIECNDFILSFDKNDEALATVYKNLIEYRKNNGIGNVSESEVEKNKITNPLEQIKTLKELLDMDAITQEEFDVKKKELLNL >CP016106.1|AXU54346.1|2750550_2750655_-|hypothetical-protein MIGFLLSILAGVISAYIYDKIKNHPDANKGDLKK >CP016106.1|AXU54347.1|2751497_2751938_-|phage-protein MSNLSAFLSQNAIKVDNVKYVASNRFLDKEGKPVEWELKVLSSEEDEALRRKCTKRVKVIGNNGKHTGQYTSEIDYNSYVAELCVASTVFPDLKDAELQNSYGVMGEAQLLKTMLTAGEYVNYTVKVNEVNGFDTSFEDKVEEAKN >CP016106.1|AXU54348.1|2752009_2752480_-|phage-protein MAQTINAKDTVSAKKAECFITIEGKRYNFMQAIDLEAKMEKNKSEVPILGRTTKGNKTTGSTNTGSATFHYNTSIFRELLYRYKETGEDIYFDIQVTNEDPTSAVGRQTVVLKDCNMDSGIITKFDADGEYLDEDMDFTFEDWELVEKFNLLAGME >CP016106.1|AXU54349.1|2752496_2753807_-|phage-protein MALGGGTFVTQNKVLPGAYINFVSATRATSSLSDRGIVAIPLELDWGIDEDVFQVTSDDFEKYSVKYFGYDYTHEKLKGLRDLFKNIRLGYFYKLNKGVKASCTIATAKYSGIRGNDLKVTVTTNIDDNAKFDVVTLLDNKKVDTQIAKVITDLQDNDYITWKKDATLEASAGLVFTGGTNGEAVTGAEYQAFLDKIESYSFNALGCLATTTEIKSLFVEFTKRMRDKVGAKFQTVLYKKSDADYEGVVSVENKIKDIGLVESSLIYWAAGAIAGCDINKSNTNKKYDGEFDVDVNYTQIQLEEALKTGKFIFHKVGDEVHVLEDINTFVSFTDDKNDDFSSNQSVRVLDQIANDIATLFNEKYLGKVPNDKAGRISFWNDVVKHHKELENIRAIEDFKTDDVSVELGNDKKTVIVSDAVKVINAMSKLYMTVSVS >CP016106.1|AXU54350.1|2753807_2753993_-|hypothetical-protein MIILSKTLSKEDNYKFTKEQIVNSKKYVNRKDLLNAILKENDLYSFSEVEDRINKFMKGVS >CP016106.1|AXU54351.1|2753976_2754414_-|phage-protein MLNNIIDGISIKLDKTFGESYTIYSEDVEQGINEPCFFIVPLNPSKVSYPSGRTLKKNSFDVHYFPKSNDKSLEINEIAEMLLEELEYIEIDGDLVRGTNMNFEIIDNVLHFFVDYNYFTIKSNDTDKMDTVELFGGLKRGDNFE |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP016106_19 | 2749637-2750258 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP016106_19
|
9 spacers
spacers of CP016106_19
>19.1|2749666|38|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT ATGTCCATATATGGTGCTTTCCAGTCTTGTGGTTTAAT >19.2|2749733|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATTTGAAGGAGGAAGTAGTATGGCAGCAATTTATGT >19.3|2749799|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAATCTCATCCTCATAAAACTCAAGCTTTGCACAATA >19.4|2749865|36|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTAAATGATAGTAAGAGTTTGACTAAAGTTGCTAT >19.5|2749930|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATTTTCTTAATAGTCAGCTTTTCCTTAGTGGCTAGA >19.6|2749996|38|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGTAATTATGCTCAGCAGTTTCAAATGCTCCTACCAA >19.7|2750063|36|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGCACCTCTTTTAATTGCGCTTAATATTGTAGCTTG >19.8|2750128|36|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGTTAAGTGCAATCTCTGCTGTTGCTCCTATTGCTT >19.9|2750193|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTAAAAAATGTTACTTTAAAAAATAAAGTTATAGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016106_19
The CRISPR arrays of CP016106_19 >merge|CP016106|19|2749637-2750258|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGTTTTTCTCCACATAGTTAATCTAAAACATGTCCATATATGGTGCTTTCCAGTCTTGTGGTTTAATATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACAATTTGAAGGAGGAAGTAGTATGGCAGCAATTTATGTATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACCAATCTCATCCTCATAAAACTCAAGCTTTGCACAATAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACGTTAAATGATAGTAAGAGTTTGACTAAAGTTGCTATATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACTATTTTCTTAATAGTCAGCTTTTCCTTAGTGGCTAGAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACTTGTAATTATGCTCAGCAGTTTCAAATGCTCCTACCAAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACAGCACCTCTTTTAATTGCGCTTAATATTGTAGCTTGATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACCGTTAAGTGCAATCTCTGCTGTTGCTCCTATTGCTTATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACTTTTAAAAAATGTTACTTTAAAAAATAAAGTTATAGGATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >CP016106|19|17|2749637-2750258|CRISPRCasFinder AGTTTTTCTCCACATAGTTAATCTAAAAC ATGTCCATATATGGTGCTTTCCAGTCTTGTGGTTTAAT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AATTTGAAGGAGGAAGTAGTATGGCAGCAATTTATGT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CAATCTCATCCTCATAAAACTCAAGCTTTGCACAATA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GTTAAATGATAGTAAGAGTTTGACTAAAGTTGCTAT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TATTTTCTTAATAGTCAGCTTTTCCTTAGTGGCTAGA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTGTAATTATGCTCAGCAGTTTCAAATGCTCCTACCAA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AGCACCTCTTTTAATTGCGCTTAATATTGTAGCTTG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CGTTAAGTGCAATCTCTGCTGTTGCTCCTATTGCTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTTTAAAAAATGTTACTTTAAAAAATAAAGTTATAGG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >CP016106|19|11|2749637-2750258|CRT AGTTTTTCTCCACATAGTTAATCTAAAAC ATGTCCATATATGGTGCTTTCCAGTCTTGTGGTTTAAT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AATTTGAAGGAGGAAGTAGTATGGCAGCAATTTATGT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CAATCTCATCCTCATAAAACTCAAGCTTTGCACAATA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GTTAAATGATAGTAAGAGTTTGACTAAAGTTGCTAT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TATTTTCTTAATAGTCAGCTTTTCCTTAGTGGCTAGA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTGTAATTATGCTCAGCAGTTTCAAATGCTCCTACCAA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AGCACCTCTTTTAATTGCGCTTAATATTGTAGCTTG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CGTTAAGTGCAATCTCTGCTGTTGCTCCTATTGCTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTTTAAAAAATGTTACTTTAAAAAATAAAGTTATAGG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >CP016106|19|12|2749704-2750258|PILER-CR ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AATTTGAAGGAGGAAGTAGTATGGCAGCAATTTATGT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CAATCTCATCCTCATAAAACTCAAGCTTTGCACAATA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GTTAAATGATAGTAAGAGTTTGACTAAAGTTGCTAT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TATTTTCTTAATAGTCAGCTTTTCCTTAGTGGCTAGA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTGTAATTATGCTCAGCAGTTTCAAATGCTCCTACCAA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AGCACCTCTTTTAATTGCGCTTAATATTGTAGCTTG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CGTTAAGTGCAATCTCTGCTGTTGCTCCTATTGCTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTTTAAAAAATGTTACTTTAAAAAATAAAGTTATAGG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC
>CP016106.1|AXU54345.1|2748766_2749519_-|hypothetical-protein MGLFKKKEKEKGICMICGNEGNALKTVDNEFLCDECFEKCRGEIAVLGKGLKKLTSKEVINAVELCKDSFGNFVKNTLIQIVYLGGHPLFNREEMICLLIRSDKIVVKAFGTGPIPIVDVFEVSYSDIKSVSIEKEEEVIRRYTATRIALFGPFALAMQKAELNKKEYLIIECNDFILSFDKNDEALATVYKNLIEYRKNNGIGNVSESEVEKNKITNPLEQIKTLKELLDMDAITQEEFDVKKKELLNL >CP016106.1|AXU54344.1|2748293_2748464_-|Ribbon-helix-helix-protein,-copG-family MSPKKIGRPVVGSPKTNDIKVRVDDETNEKLDEYCKKNNLTKAEAIRQGIHLLLEK >CP016106.1|AXU54343.1|2747361_2748165_-|prophage-antirepressor-related-protein MNDLQIFKSEDFGEIRTVDIDNEIWFVGKDIAEALGYSNTREALKTHIDNDDIAEVVIHDGSQNRNMKITNESGLYSLIFGSKLETAKNFKNWVTKEVLPAIRQHGAYITNNADPQALRDKANEIESLDTVNKTIEILTPFLDNAGIDEKEKLLTAKTIYKKAGIELPLEIEEKEHFFDTKQIASKLKIYSKSNKPAQLAVCEIIKKIDLEENEVKGVWETNGSWTGTVNKYTESVIDKVSKWIEENNRPTKIAGEKKNYHVVYKIE >CP016106.1|AXU54342.1|2747141_2747300_-|hypothetical-protein MYENLLDSIDIEKRKEEFRIKLLKIRETDIDIYNKIESIVYKLYEKKLEKNK >CP016106.1|AXU54341.1|2745799_2745982_-|hypothetical-protein MSNKLGRPPKENSKKLRFEVRLNQEQADILNECADNLKISKTDVVIRGIELVKEKLDKNK >CP016106.1|AXU54340.1|2744860_2745679_-|prophage-antirepressor-related-protein MNEIMNFEGKEIEIFEYNGQVLFNPYDCGRCLELSDSAIRNHLTKMNDTQAILLKNSNVLDKDFRKLHNTGEKFLTESGVYKLIFKSKKEEAERFQDWISDEVLPAIRQTGAYITNSANPEKLREKASEIEKLQLAYNSTSMLKELLDGAGFDNKSKLLTAKTLYKKAGIDLPIEINEEEHYFDTKQIAPKLKIYSKSNKPAQMAVCEIIKKIDLEENELKGVWETNGSWTGTVNKYTKSVIDKVRNWIEENNRPTKIAGEKKNYHVVYKIE >CP016106.1|AXU54339.1|2744621_2744798_-|hypothetical-protein MRESLLNEYNLKTDEDVEYFVKFANALYELKQNSEEKFQEYAEILRGILREQEERKNK >CP016106.1|AXU54338.1|2743255_2743816_-|phage-lipoprotein MKKKVCFLFSILIVICLAIVGCSNSESPEESSKNNEPKKEEKKDKEVVIGEKIISDKMEITINNIEFSYDVLPKVKESLYTHYPAESGKVYIDIAADIKNTQKQELNCSDLLTIEANYNDGYKYSSQTIVEDETTGFTYDNISSIDPLETKGVRFIIDCPDEVKTSDKPVILSFTFDGNKYVYKMK >CP016106.1|AXU54337.1|2742642_2743212_-|phage-protein MDDIVEYIFCSECGAKCLKGSKFCSECGTEIADIKMLNESIIKEKEYDLKGIDLQHVMQETSFIKASSVRRLKELTGIELDDCRKILEEPYQKYYNENADMLEEKRKKEDDISKIRKAKEEKKEKEKIACCPACGSTSLTTHKKGFGIGKAITGATIAGGIGLVAGNIGAKKVRVTCLNCGKQFWAGKK >CP016106.1|AXU54336.1|2742455_2742572_-|phage-tail-tape-measure-protein MAIIQTSIRIFDGMTPAFRNMTTSLTQQLIVWRDYKVD >CP016106.1|AXU54346.1|2750550_2750655_-|hypothetical-protein MIGFLLSILAGVISAYIYDKIKNHPDANKGDLKK >CP016106.1|AXU54347.1|2751497_2751938_-|phage-protein MSNLSAFLSQNAIKVDNVKYVASNRFLDKEGKPVEWELKVLSSEEDEALRRKCTKRVKVIGNNGKHTGQYTSEIDYNSYVAELCVASTVFPDLKDAELQNSYGVMGEAQLLKTMLTAGEYVNYTVKVNEVNGFDTSFEDKVEEAKN >CP016106.1|AXU54348.1|2752009_2752480_-|phage-protein MAQTINAKDTVSAKKAECFITIEGKRYNFMQAIDLEAKMEKNKSEVPILGRTTKGNKTTGSTNTGSATFHYNTSIFRELLYRYKETGEDIYFDIQVTNEDPTSAVGRQTVVLKDCNMDSGIITKFDADGEYLDEDMDFTFEDWELVEKFNLLAGME >CP016106.1|AXU54349.1|2752496_2753807_-|phage-protein MALGGGTFVTQNKVLPGAYINFVSATRATSSLSDRGIVAIPLELDWGIDEDVFQVTSDDFEKYSVKYFGYDYTHEKLKGLRDLFKNIRLGYFYKLNKGVKASCTIATAKYSGIRGNDLKVTVTTNIDDNAKFDVVTLLDNKKVDTQIAKVITDLQDNDYITWKKDATLEASAGLVFTGGTNGEAVTGAEYQAFLDKIESYSFNALGCLATTTEIKSLFVEFTKRMRDKVGAKFQTVLYKKSDADYEGVVSVENKIKDIGLVESSLIYWAAGAIAGCDINKSNTNKKYDGEFDVDVNYTQIQLEEALKTGKFIFHKVGDEVHVLEDINTFVSFTDDKNDDFSSNQSVRVLDQIANDIATLFNEKYLGKVPNDKAGRISFWNDVVKHHKELENIRAIEDFKTDDVSVELGNDKKTVIVSDAVKVINAMSKLYMTVSVS >CP016106.1|AXU54350.1|2753807_2753993_-|hypothetical-protein MIILSKTLSKEDNYKFTKEQIVNSKKYVNRKDLLNAILKENDLYSFSEVEDRINKFMKGVS >CP016106.1|AXU54351.1|2753976_2754414_-|phage-protein MLNNIIDGISIKLDKTFGESYTIYSEDVEQGINEPCFFIVPLNPSKVSYPSGRTLKKNSFDVHYFPKSNDKSLEINEIAEMLLEELEYIEIDGDLVRGTNMNFEIIDNVLHFFVDYNYFTIKSNDTDKMDTVELFGGLKRGDNFE >CP016106.1|AXU54352.1|2754406_2754832_-|phage-protein MARWGSVDFREFKRACKRMEKLTKIDLDKFCKDAARELAARLLGKVIRRTPVDTGFLRQGWNGVAYARSLPVYKQGNNYIIEVVNPTTYASYVEYGHRTKDGKGWVKGQHFLTISEMELQSQVDKIIEKKLLILLKGVFDA >CP016106.1|AXU54353.1|2754831_2755194_-|phage-protein MVSKTRKAIEMLYRDKCTIVEYQPIKDPVTKRTNNKEVVVLENQPCKLSYKNITSTEQGEVAKLTQTIKLFISPNISVKVGSKLIITNQNNITREYARSGESAIYPNHQEIILELLKDKA >CP016106.1|AXU54354.1|2755187_2755589_-|hypothetical-protein MENNLIGEIEKRLESLGYILKDGDKWLIGFVREKIENIIKLDCNIKTMPIELKEIEVDMIVGEFLFTKKNMGQLDIESINFEAVEKSISEGDTKVDFAIGSGSQTPEQRFDSLVDYLTTYGKNKILTFRCLRW >CP016106.1|AXU54355.1|2755598_2755832_-|hypothetical-protein MAQVRKLNRILTIEECKIDDFLEMGYDLIDETGKAVKYGKSLNVKDLIAENNILRSKVESLEEENKQLKEKNKLTKK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP016106_24 | 3270646-3271067 | Unclear |
I-A
Consensus repeat of CP016106_24
|
6 spacers
spacers of CP016106_24
>24.1|3270675|35|CP016106|CRISPRCasFinder GGATGTTTTAGTATATGCTATTGTTGATTCTACAA >24.2|3270739|36|CP016106|CRISPRCasFinder AAGTTTCTAAATACTCGTTGATATTGCTAATATTCT >24.3|3270804|37|CP016106|CRISPRCasFinder CTGACACTGTATCTTGTGTGAGTCTTTTCTTTATCCT >24.4|3270870|36|CP016106|CRISPRCasFinder TCAAGTTAGAAAATATGTTAGAAATTTTGTTAGTTT >24.5|3270935|37|CP016106|CRISPRCasFinder GTTGTTCTGAATTAATAATCATATCATCCAGACCCTT >24.6|3271001|37|CP016106|CRISPRCasFinder CAATAAATTAAAAAGTTTAGAAAAGTTTATCGAGGAT >24.7|3270804|36|CP016106|CRT CTGACACTGTATCTTGTGTGAGTCTTTTCTTTATCC >24.8|3270870|35|CP016106|CRT,PILER-CR TCAAGTTAGAAAATATGTTAGAAATTTTGTTAGTT >24.9|3270935|36|CP016106|CRT,PILER-CR GTTGTTCTGAATTAATAATCATATCATCCAGACCCT >24.10|3271001|36|CP016106|CRT CAATAAATTAAAAAGTTTAGAAAAGTTTATCGAGGA |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016106_24
The CRISPR arrays of CP016106_24 >merge|CP016106|24|3270646-3271067|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTAGATATGATTTAGTTAATATAAGGTGGATGTTTTAGTATATGCTATTGTTGATTCTACAATTTTATATACTGCTTTATTAATATAAAATAAGTTTCTAAATACTCGTTGATATTGCTAATATTCTACTTATCTACCACTTAGTTGATATAAAACCTGACACTGTATCTTGTGTGAGTCTTTTCTTTATCCTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTCAAGTTAGAAAATATGTTAGAAATTTTGTTAGTTTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGTTGTTCTGAATTAATAATCATATCATCCAGACCCTTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCAATAAATTAAAAAGTTTAGAAAAGTTTATCGAGGATATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACG >CP016106|24|22|3270646-3271067|CRISPRCasFinder ATTTAGATATGATTTAGTTAATATAAGGT GGATGTTTTAGTATATGCTATTGTTGATTCTACAA TTTTATATACTGCTTTATTAATATAAAAT AAGTTTCTAAATACTCGTTGATATTGCTAATATTCT ACTTATCTACCACTTAGTTGATATAAAAC CTGACACTGTATCTTGTGTGAGTCTTTTCTTTATCCT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TCAAGTTAGAAAATATGTTAGAAATTTTGTTAGTTT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GTTGTTCTGAATTAATAATCATATCATCCAGACCCTT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CAATAAATTAAAAAGTTTAGAAAAGTTTATCGAGGAT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACG >CP016106|24|12|3270774-3271066|CRT TACTTATCTACCACTTAGTTGATATAAAAC CTGACACTGTATCTTGTGTGAGTCTTTTCTTTATCC TATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TCAAGTTAGAAAATATGTTAGAAATTTTGTTAGTT TATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GTTGTTCTGAATTAATAATCATATCATCCAGACCCT TATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CAATAAATTAAAAAGTTTAGAAAAGTTTATCGAGGA TATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC >CP016106|24|13|3270840-3271000|PILER-CR TATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TCAAGTTAGAAAATATGTTAGAAATTTTGTTAGTT TATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GTTGTTCTGAATTAATAATCATATCATCCAGACCCT TATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
>CP016106.1|AXU54791.1|3270156_3270585_-|acetyltransferase MIKKLNNKDINKIMEIWEKSTIKAHDFISKEYWQNNYNTVKNEYIPISDTFVYDDGDEIKGFISIIDKSFIGALFIKPKYQNLGIGGKLLDYATKKYKSLSLAVYKDNKKAVVFYNKKGFNIVKEQVNEDSGFKEYIMEYSK >CP016106.1|AXU54790.1|3268931_3269702_+|hypothetical-protein MKVNENNIDEELDELSRKVYLESPDFWISISDKIIDKVFDEMLLFFAVKYNYFNIVCFAIENNYLNLNMPSKNKKYTNIMEHLLDTSKQNEDKKIYNYLLSLNKGNNLDERPILDELNCNISSDTFEKKDIYLPKYLCPSCNSNIFDTGYKVSNDITYKFSSKEAEPIEMCSEVSSIRCCNCDELLEDITLDKLYNLCKIQNCNNCGSNLTKVGIIAKKKMNFDENTEKFKDVSTSYCCGNCDSEISLSQREHFKI >CP016106.1|AXU54789.1|3268062_3268608_-|biotin-synthase MKNTKVNIQDLTKMSICVALLCISSYIYIPLPFTPAGVTAQTIMINLIALILTPRQAFSTVGVYIMIGLIGIPVFGGGTSGIGKLLSPTGGFYFGFLFAALIISLLKGRNNDIKRYILITIFVGMPIIYFMGTVFMCYFNQMTVEAALFAAVVPFLIGDTIKSVIASFLGTKLNNVLRRNL >CP016106.1|AXU54788.1|3266894_3268031_-|thiolase MEEVFILGGLRSHIGLKNGIFQFVQPELLGASVLKDLIKKYEIDKIDEIICGNAVGTGGNIARLMTLTAGVSNEVPAFTVDMQCASAMMSIDIAFSKVKSGQCDLIIAGGFESSSLQPMRTYHKNDKRYNTNNPNYTVAQFSPDDNSQNSMLEGAERVAELYQIEKADLDFWVKESHKRAKEAREEKILEDIISPINNSTYDEGIRDKMSQRLLDRMPSILGKETITNAANSCLINDGASFIIICSKKYLEHVKKKPKAKIINTCTIGTDATLSPTSAIQAMDKLLEIESLNYLDVSAVEFNEAFAVIDVLFQRKYPELIDRYNIFGGALAYGHPYGASGAIIALHLLKALEKTKGRYGICSIAAAGGLGSALLLERV >CP016106.1|AXU54787.1|3265499_3266891_-|AMP-binding-protein MNYYELLRIKKERHKNKNFLIIDGEKYTYENILSYSEELGKQISLGENIPILIYSKNIMFQLISFFAINYSKNIPIICHYNLSKKVLDDILLKNNISIIISDESMDVIDLYDDNNNEVAKKVNFSIFNPKFNIYMYQYKKLINYLDKSICMGALSSGSTSVPKVLYRTYESWAGFFPIQNGIFNISGESILFVNGTLSFTGNLNSIMSVLYEGGSIVISSGLNCKSWIRTIKQYNVTNIYLIPTKLQLLVKHLKEPVLKVVSIFTGSQLLFEDTARNLKKYMPKSEIILYYGASELNYITYLCYDELIEKPLSVGRPFPGIDIYIREGKIFVNTEYAVYNATKPYSVNDIGYYDNDGYLIFEGRSDDIINIGGFKVSSTKIENEVKKIPQIEDAIVLPYSDTIRGNQIVLFVITIDKITKKDLLIKMKDNLMKNEIPKKIIFLNSFPYTSSEKIDRLALLKML >CP016106.1|AXU54786.1|3264548_3265424_-|dipicolinate-synthase-subunit-A MSNQYDITVIGGDLRQVYMVKKLINKGYSVVTYGISNEIINGIVGKSTSLAEALSKSSIILCPIPFTKNQVNIENTDDCLDATIDNLLINLSPNQILFGGNIPTKVCKFCEQHSIQIYDFMKMNDVAILNAVATAEGAIAEAIKRSIINIHQSNCLVLGYGRCAQILAKKLYALDANVCVGARNNDARSTANAFGYSSISLSQLDEKLLQFDYIFNTIPECILTKERLEKVSQEVTIIDIASSPGGVDYSVVKEAGINATLCLGLPGKYSPKTSGEILVNAIENIINERRD >CP016106.1|AXU54785.1|3263955_3264546_-|dipicolinate-synthase-subunit-B MRLEGLTIGVGFTGSFCTYDKIFIELENLVKEGANVHTIFSDVSQNIDCRFGNSEEFMKKAYELTGNKPIVTIEEAEPFGPKGIADIIIIAPCTGNTAAKLANGITDSPVLMAAKGHLRNDKPLVISISTNDALSFNFKNIGILLNSKNIYFVPFGQDNCKAKPNSMIAHTELIIPTIELALENKQLQPVIKSPHQ >CP016106.1|AXU54784.1|3263548_3263749_+|hypothetical-protein MEKLKTISVFSLIISVILTIGCIGIVTYYVDNLFIRGLSVFVLIMSSSFVSTTVRLIFEESKRYKF >CP016106.1|AXU54783.1|3260390_3263045_-|bifunctional-acetaldehyde-CoA/alcohol-dehydrogenase MAHKEQVIIENKKENEVMSVGLDTVNNVESLVKKLAKIREAQKIFATYSQEQVDKIFLAASLAANKQRVPLAIMAQKETGMGIAEDKVIKNHYASEYIYNAYKETKTCGVIEKDEAFGMTKIAEPIGVIAAVVPTTNPTSTAIFKALLALKTRNGIIFSPHPRAKNSTIEAAKVVLEAAVLAGAPEGIIGWIDEPSLELTTTVMKEVDLTLATGGPGMVKSAYSSGKPAIGVGAGNTPAIIDDSADIKTAVNSILVSKTFDNGMICASEQSVIVLENIYNEVKKEFKERGAYLLDKDETEKIRNIILVNGGLNSKIVGQTACTIAKLAGFEVPVDTKVLIGEVESVEIEEAFAHEKLSPVLAMYKASDFDDAVRKAEKLVEDGGFGHTSSLYIDDVNQREKLDKFTSAMKTCRILINTPSSQGGIGDLYNFKLAPSLTLGCGSWGGNSVSENVGVKHLLNIKTVAERRENMLWFRAPEKVYFKKGCLGVALKELKDVMNKKRAFIVTDTFLYNNGYTKAVTDLLDEMNIKHTTFFEVEPDPTLECAKIGAKAMREFNPDVIISIGGGSAMDAGKIMWTLYEHPDVDFQDLAMRFMDIRKRVYTFPKMGEKANFVAIPTSAGTGSEVTPFAVITDQDTGVKYPLADYELMPNMAIVDSDMMMNMPKSLTSASGIDALTHALEAYVSMLATDYTNGLALQAIKSIFEYLPRAYDNGAKDPEAREKMANASTMAGMAFANAFLGVCHSMAHKLGAFHHVPHGVANALLITEVMKFNSSDAPKKMGAFSQYKYPEALKRYAEIASFLGLKGNSDEEKFQSLLVAIEDLKLKVGIPKSIKEFGVEESKFMDSIDEMVIQAFDDQCTGANPRYPLMNEIKDMYLNSYYGR >CP016106.1|AXU54782.1|3257895_3260115_-|signaling-protein MTGRNKSFTLITILFLTSLFLTMGYIYIEDTKHLLMSEAKIHIKEVAVQGSQLAQRQIEKDLDVLNIFSNYYASNPDIPNEEKMKNLLDEMENQKFYTMAIVDINGNAENTKGDKFSVKDREFFKNSIKGKKYVSSPYVDEVNKSIKKIAISVPLLNNDKVVGVLYCTYNINTLMKLINISFYENNSISYVVKNDGTIILHPQGDSLSKNIYKLLEQDNDIQEVNRLKKELQENKTGATVLNMLEERRYLGYATMDNGNSENNYIKDWNLIFSIPETVVFSNSKQIINRAVYAVLSIVLIFIAIIFYIIYIKKSNEKEILSLAYEDKVTYIGNQNKFYRECSKYLLDKPSLNYIIVYFDINNFKMINDTFGYEFGDNLLITIAKALKEELTEGEVYARLSSDYFAIFCDYKNGRNKIIRKLDNIRSNIESNLSIVFEISLCVGIYFVEEGEVDIQKAVNKANMARSVAKGKNINYAIYNEDVRNKLSEESMILDDIKIALVKNQFEVYYQPKFSLVTGEMIGSEALIRWNHPEHGFISPAVFIPIAEKSKLILKIGRFVFERVCNDLSEWKKQGKKIVPVSVNLSRVELYQPDIVKFINKTIQMYNLSSDFIEIEITETVAINELNILKNVLNELRKHGFSISMDDFGTGYSSISCLRDMPIDILKLDKSFLGGIEHDERSRNIAKSIVSLAKSLDLVVIIEGVESKEQAELMKQFGCDLVQGFYFARPMPAKNFLDLL >CP016106.1|AXU54792.1|3272086_3272353_-|CRISPR-associated-Cas2-family-protein MFVIVTYDIVEARSLNRIRRILRKYLTWTQNSVFEGNITEGKLHKCISEIENIIDNSEDSIYVYEIKNPNSIKKKCYGIDKYSDEMFI >CP016106.1|AXU54793.1|3272355_3273336_-|maturase-related-protein MYKDYYIISNGDIKRKENTIYYYNLEGEKKILPVEQVDDIHIYGEVDLNTKLINYISKYGVMLHFYNYYGYYSGTYYPRKKNVSGFSLVCQSACYLDKNERLYLAKSFVESASYHILRNMRYYKVDESLIDTIKDELNDLNDVKEISELMGKEGRIRKTYYKSFNQILKDDFEFYKREKRPPKDPVNALMSFGNSIMYTNVLSEIYNTQLDPTISFLHEPSTKRFSLSLDIAEIFKPIIIDTIIFSLINNKRINKNDFEYQDKICYLSEKGKKKFLQEFENKMQTTIKHRNLNRKVSYRMFIRLECYKLIKHFINDERYKVLKVWW >CP016106.1|AXU54794.1|3273338_3273908_-|CRISPR-associated-Cas4-family-protein MIFILTMWLKFTKEGDFVPIDLEVLKVQGVKINYYYVCKRKLWLFSKGITMEQNSSRVLSGKIVHEDSYKRMKNKEILIDDILKLDIIKDEYVKEVKISSKMKEADEMQLYYYLYYLKNSMGIEKKGTINYVKEKKQEELILTEEKERIIENTLININEINTQLSPPKIEKKHYCTKCAYYEFCFVKEE >CP016106.1|AXU54795.1|3273904_3276226_-|CRISPR-associated-helicase,-Cas3-family MLYAKSNPVETLREHTDELLKQMNVLRESYGKNINSLDFLEEEIFWQLLDFVIEFHDIGKAFSPFQELIKSRMDTKINEPKIVTHLENNVGHNYLSPAFIDYSYIDRKKNKELRAVLNQVIVYHHERDIFIDKDFKNLIQKILDEDLINKVYELQHEFKVRYPIKTEKLSKVYLQSVEKRIDKNHKYYNLYIMLKGILHRLDHSASAHEIVECNSNMNIGEYTEKHLVKEFGSLREVQSFAKSNRNKNIILIASTGMGKTETALIWIDKDKAFFTLPLRVSINALFDRAKNIIGVGEANDTFLGLLHSTAIDYLEESNQENSNEIVDLAKLLSCKLTFSTIDQIFKFPFLYRGYEKVYSTLAYSKVVIDEIQAYSPEIAAVLVKGIEMIHKIGGRFMIMTATMPTIYIDELKKRGVMNSNLADLTCNTEKIRHCVSIVENSIDENLGKIIQSGMNKKVLVIVNTVKSAVEKYELIEEIVKPKGIDVNLNLLHSMYIQEDRAKLEKYIKEFADSDSNGIWITTQLVEASLDIDFDELHTENSTLDSLFQRFGRCYRSREYEENSPNIFIYTEKATGIGSIYDKDIVEKGLELLKTFINGKECVKMKEKYKVEMVKILYSKESLEGTAFEKRFTSALNILDTITPYSLGSKDAQNILRNIEGYTVIPEDIYNKIEETLIKDYEELGQELINAYSNDDRQLINKIKSKRKKARREIVKKTVNLPIYKAKQNVIDIQVKGLEDLKILLYKYDIYENKHTKQIFGKGVLISNEIDQFI >CP016106.1|AXU54796.1|3276236_3276938_-|CRISPR-associated-protein,-Cas5t-family MKVLKLDLFQETACYKKPFAMKITETYPLPPYSTINGLIHKILNATEYIPFNISVQGTYESIFNNYQTTYFYKKDSITSMPMNSHMLLNVNLIIHIGGDFDLLEEIYDSLLNYDEHLSLGRKEDLVRINDIRFVEVNKFEVDEDIQLDDYENYKLSECNIRMPIYIPKTSLQDTDIDGISYRLNNYYDNNAVEDKKRVWNKVDSYYVEDGNTISIGDILLDNEGDLLYFNNIN >CP016106.1|AXU54797.1|3276939_3277854_-|CRISPR-associated-autoregulator,-Cst2-family MKRGLTFTVIAQAQSLNYGEVIGNISELKKLSRADGNMYTFASRQCLRYDIVRLAAELFNWNLQVVDKEKGTIQFKDNISIRESEEMDLFGYMKTNKKDEKDKKGGSLTREATVRLSNAISLEPYRSDMDFLNNKGFADRIGEHPNLANIEQHLSYYTYTVTIDLSKIGKDGDIELDNKEKCRRVVEFLEIIKVLNRNIRGRQENLSPLFVVGGVYEIANPFFLGRIKLKGDKNGFKINKQAIEEVIQGTFLGKDLKEFTYVGMVDGVFINKEEFKGLFEDNFLSVDKFFGQLVKEVKEYYGVN >CP016106.1|AXU54798.1|3277855_3279706_-|CRISPR-associated-protein-Cas8a1/Cst1,-subtype-I-B/TNEAP MKLRVYRGDWFFNMGIVGFLNIIKKADKQAEIFIMEDYIEFDSLFLENFHEYYFNYFMDEYDVSKRIKKNIDYSINFIKSKPDRIKDGIKKIKDSVKQQNDKIKKFDEEKFNMIKEKLDSMSKIKSYDEFDSLESLVDETIDIFKIKSINDRLTANLYKYVVQDNYFGQVSFLNVLKAKLDLDGLKQVMFNDYLRQIIYFGELEDLLEENDYDKLKNYLNDRLNSIAKDINEKKVSKSSINTIEKIMKEINKNFIKKNKSIEDIKEYMDSLEVCEMCGLYKGILDEYSESNFAPLGVSTNNARNMFWNQEYVSSICDVCKLILFCTPAGATYTRKNYLINEENEFYLFVNMDTSINGLFERNNSLKAQKSESSDSKDENPFNQLIKSIVEENTLKSEWQLRNILFVEFKASIDSKKCKINYFNIPTYLAKFFVKENKKIQSIYDYKLKSNVLDLILKSKDLKHLINNTLRNIVKSNLESNNKSNISGLSCFNVVQLRTILNNYKRGVYKMDYKKLRKIYESGCEIHDYYIDKNAKNKIEGITYKILNLIKVGNKNDFMQTILRIFSPSEKIPPEEILQIFIEEDLDFESVGYAFVTGLISGKYEGKDKLPNEKEEK >CP016106.1|AXU54799.1|3279711_3280449_-|CRISPR-associated-Cas-family-protein MKMKIEFSTGCIPISYNSLFMSIIKEAIRKSNEDYYKNMYYYKEKNNKKTKNFTFSVYIKKYSIEGDNFIIEDKVILNISTPDLELGFHIYNGLMTSKKCLYKDYELTRIRIDLSREKKVTEERVLFNALSPICVKSKEGKFLEITDDRYIEELNYITNEVVKNYRGNGLKRKLEFENIGLKKVVVKESLREFKKITGKEYQYINGYKGKFILKGDIDDLNLIYNLGIGFRRAQGFGDVDILEWR >CP016106.1|AXU54800.1|3280526_3281414_-|putative-transcriptional-regulator MKCKELSEELEVSERQIKSYKMYLEQAGIFINSTPGIYGGYEIDKCNSISLIKLLDSEVSILDMINSQLEYNNDIYKNEFNNIVEKIKAVLNTGEKSDTYMDYFTVQAQRNCDYESEKNKCNEIIRAYTTKHKFWIEYYSLNSGNSERIVHPYGLFNYKSDTYMVAFCEKRFKFIDFKLCRIKDYKVLEEKYNVDKSFSWDEYSKNSIGIYKGEEISVVIKISHPFSTIIKEKVWVNNQQIIEYDDKSIMFKAKMRGYEEIKSWILSMGAYVEVVEPDRLRNDILSEIEKMKKIY >CP016106.1|AXU54801.1|3281722_3283639_-|ABC-transporter-permease MNIKQFAINNISRNIKAYLGYLASIVISSSLLFSFIMFTSHPDLDVSQFPDYLKEGLKMSKIIAYLFLFFFVFYSVSVFLKSRYKEFGILYITGISKRQVMKLIFIENMIINIVSSVIGIIIGLIFAKIFLVVMSTFLELSPLKFYIPFNAILSTLIYFMILAVLTSIFTSFIVKENQVLKLLKGTKTPKPEPKTSLMLAILSICLFIIAYYNAITSTDQYTTYLRLVPVTSLTIVATYLFFSQFSVFFMKKLKLNKRFYRKNTNMLWISNLIYKVKDNARIFFLITITSAVAFTAIGTVYSFWKDVERQINLIYPNTIYYSTMTLHNDTKKPDSKEKDKERMMFIENNLKKENVDYTRINGEFKTVFPKKSDFNVRIMKESKYLEITETIGIKPISFEDNECISLLSSSLPGNKNVKENIIVGNRGLKVAKQVEECVMPAYYKNMYVVKDNFYDSIESKFIVDRFTAFEVEDSSKTIEICREFENKFNNESGMQPYLFFSKELMIGTGKLMYSTFIFLAIFIGLIFFVTTSSFLYNKFYMDCQVDKKKYEQLNKLGMTYNEIKKASTIEIGIVFLFPYVVAVIHSIFALTALKNSFDIEVASSAVLVMGSLFLVQIVYFLIVRNNYLKEIRLNLVNF |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP016106_25 | 3271084-3271903 | Unclear |
I-A
Consensus repeat of CP016106_25
|
12 spacers
spacers of CP016106_25
>25.1|3271113|37|CP016106|PILER-CR,CRT TATCTGAAAAAATAAGATTTTCGCCTTTCAAAACTTT >25.2|3271179|37|CP016106|PILER-CR,CRT,CRISPRCasFinder TTGCAGAGTAAAGAGACTGAAATTGTCACATTTTACA >25.3|3271245|38|CP016106|PILER-CR,CRT,CRISPRCasFinder GAGTATTCAGAACTCGAAAAAAAAGTTGGAAATAGTAC >25.4|3271312|37|CP016106|PILER-CR,CRT,CRISPRCasFinder TTAATATCCCTAAAATAGATTCTATTGAGTTGCCATA >25.5|3271378|37|CP016106|PILER-CR,CRT,CRISPRCasFinder ATTATGTTATAATTAAAATGCAAGAGGCTACAATCTA >25.6|3271444|36|CP016106|PILER-CR,CRT,CRISPRCasFinder TTTATCAAAAAGCAAGAGAAAATACCAATTTAACAC >25.7|3271509|36|CP016106|PILER-CR,CRT,CRISPRCasFinder CCTTCCATTTCCATACACAAAAAGTCTTAAAATTAC >25.8|3271574|37|CP016106|PILER-CR,CRT,CRISPRCasFinder TATGCTTATATATTATGTTTATTCTGTTGTCTCTAGG >25.9|3271640|36|CP016106|PILER-CR,CRT,CRISPRCasFinder TAGAAAAGATTGCATCCTCTTATACTTGCTATGTCT >25.10|3271705|37|CP016106|PILER-CR,CRT,CRISPRCasFinder GACTAATATTTTGTTTAATATTACTAAATAATTTTGA >25.11|3271771|38|CP016106|PILER-CR,CRT,CRISPRCasFinder GATAAGGTTAATAGTGGTAGTTTAGATGTTTATGTTCC >25.12|3271838|37|CP016106|PILER-CR,CRT,CRISPRCasFinder TTTGTTATATGATAAGTTTAAAATATTATAAAGTTTG |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016106_25
The CRISPR arrays of CP016106_25 >merge|CP016106|25|3271084-3271903|PILER-CR,CRT,CRISPRCasFinder ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTATCTGAAAAAATAAGATTTTCGCCTTTCAAAACTTTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTGCAGAGTAAAGAGACTGAAATTGTCACATTTTACAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGAGTATTCAGAACTCGAAAAAAAAGTTGGAAATAGTACATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTAATATCCCTAAAATAGATTCTATTGAGTTGCCATAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACATTATGTTATAATTAAAATGCAAGAGGCTACAATCTAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTTATCAAAAAGCAAGAGAAAATACCAATTTAACACATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCCTTCCATTTCCATACACAAAAAGTCTTAAAATTACATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTATGCTTATATATTATGTTTATTCTGTTGTCTCTAGGATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTAGAAAAGATTGCATCCTCTTATACTTGCTATGTCTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGACTAATATTTTGTTTAATATTACTAAATAATTTTGAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGATAAGGTTAATAGTGGTAGTTTAGATGTTTATGTTCCATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTTGTTATATGATAAGTTTAAAATATTATAAAGTTTGATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC >CP016106|25|14|3271084-3271903|PILER-CR ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TATCTGAAAAAATAAGATTTTCGCCTTTCAAAACTTT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTGCAGAGTAAAGAGACTGAAATTGTCACATTTTACA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GAGTATTCAGAACTCGAAAAAAAAGTTGGAAATAGTAC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTAATATCCCTAAAATAGATTCTATTGAGTTGCCATA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ATTATGTTATAATTAAAATGCAAGAGGCTACAATCTA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTTATCAAAAAGCAAGAGAAAATACCAATTTAACAC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CCTTCCATTTCCATACACAAAAAGTCTTAAAATTAC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TATGCTTATATATTATGTTTATTCTGTTGTCTCTAGG ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TAGAAAAGATTGCATCCTCTTATACTTGCTATGTCT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GACTAATATTTTGTTTAATATTACTAAATAATTTTGA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GATAAGGTTAATAGTGGTAGTTTAGATGTTTATGTTCC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTTGTTATATGATAAGTTTAAAATATTATAAAGTTTG ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC >CP016106|25|13|3271084-3271903|CRT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TATCTGAAAAAATAAGATTTTCGCCTTTCAAAACTTT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTGCAGAGTAAAGAGACTGAAATTGTCACATTTTACA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GAGTATTCAGAACTCGAAAAAAAAGTTGGAAATAGTAC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTAATATCCCTAAAATAGATTCTATTGAGTTGCCATA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ATTATGTTATAATTAAAATGCAAGAGGCTACAATCTA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTTATCAAAAAGCAAGAGAAAATACCAATTTAACAC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CCTTCCATTTCCATACACAAAAAGTCTTAAAATTAC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TATGCTTATATATTATGTTTATTCTGTTGTCTCTAGG ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TAGAAAAGATTGCATCCTCTTATACTTGCTATGTCT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GACTAATATTTTGTTTAATATTACTAAATAATTTTGA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GATAAGGTTAATAGTGGTAGTTTAGATGTTTATGTTCC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTTGTTATATGATAAGTTTAAAATATTATAAAGTTTG ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC >CP016106|25|23|3271150-3271903|CRISPRCasFinder ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTGCAGAGTAAAGAGACTGAAATTGTCACATTTTACA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GAGTATTCAGAACTCGAAAAAAAAGTTGGAAATAGTAC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTAATATCCCTAAAATAGATTCTATTGAGTTGCCATA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ATTATGTTATAATTAAAATGCAAGAGGCTACAATCTA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTTATCAAAAAGCAAGAGAAAATACCAATTTAACAC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CCTTCCATTTCCATACACAAAAAGTCTTAAAATTAC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TATGCTTATATATTATGTTTATTCTGTTGTCTCTAGG ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TAGAAAAGATTGCATCCTCTTATACTTGCTATGTCT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GACTAATATTTTGTTTAATATTACTAAATAATTTTGA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GATAAGGTTAATAGTGGTAGTTTAGATGTTTATGTTCC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTTGTTATATGATAAGTTTAAAATATTATAAAGTTTG ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
>CP016106.1|AXU54791.1|3270156_3270585_-|acetyltransferase MIKKLNNKDINKIMEIWEKSTIKAHDFISKEYWQNNYNTVKNEYIPISDTFVYDDGDEIKGFISIIDKSFIGALFIKPKYQNLGIGGKLLDYATKKYKSLSLAVYKDNKKAVVFYNKKGFNIVKEQVNEDSGFKEYIMEYSK >CP016106.1|AXU54790.1|3268931_3269702_+|hypothetical-protein MKVNENNIDEELDELSRKVYLESPDFWISISDKIIDKVFDEMLLFFAVKYNYFNIVCFAIENNYLNLNMPSKNKKYTNIMEHLLDTSKQNEDKKIYNYLLSLNKGNNLDERPILDELNCNISSDTFEKKDIYLPKYLCPSCNSNIFDTGYKVSNDITYKFSSKEAEPIEMCSEVSSIRCCNCDELLEDITLDKLYNLCKIQNCNNCGSNLTKVGIIAKKKMNFDENTEKFKDVSTSYCCGNCDSEISLSQREHFKI >CP016106.1|AXU54789.1|3268062_3268608_-|biotin-synthase MKNTKVNIQDLTKMSICVALLCISSYIYIPLPFTPAGVTAQTIMINLIALILTPRQAFSTVGVYIMIGLIGIPVFGGGTSGIGKLLSPTGGFYFGFLFAALIISLLKGRNNDIKRYILITIFVGMPIIYFMGTVFMCYFNQMTVEAALFAAVVPFLIGDTIKSVIASFLGTKLNNVLRRNL >CP016106.1|AXU54788.1|3266894_3268031_-|thiolase MEEVFILGGLRSHIGLKNGIFQFVQPELLGASVLKDLIKKYEIDKIDEIICGNAVGTGGNIARLMTLTAGVSNEVPAFTVDMQCASAMMSIDIAFSKVKSGQCDLIIAGGFESSSLQPMRTYHKNDKRYNTNNPNYTVAQFSPDDNSQNSMLEGAERVAELYQIEKADLDFWVKESHKRAKEAREEKILEDIISPINNSTYDEGIRDKMSQRLLDRMPSILGKETITNAANSCLINDGASFIIICSKKYLEHVKKKPKAKIINTCTIGTDATLSPTSAIQAMDKLLEIESLNYLDVSAVEFNEAFAVIDVLFQRKYPELIDRYNIFGGALAYGHPYGASGAIIALHLLKALEKTKGRYGICSIAAAGGLGSALLLERV >CP016106.1|AXU54787.1|3265499_3266891_-|AMP-binding-protein MNYYELLRIKKERHKNKNFLIIDGEKYTYENILSYSEELGKQISLGENIPILIYSKNIMFQLISFFAINYSKNIPIICHYNLSKKVLDDILLKNNISIIISDESMDVIDLYDDNNNEVAKKVNFSIFNPKFNIYMYQYKKLINYLDKSICMGALSSGSTSVPKVLYRTYESWAGFFPIQNGIFNISGESILFVNGTLSFTGNLNSIMSVLYEGGSIVISSGLNCKSWIRTIKQYNVTNIYLIPTKLQLLVKHLKEPVLKVVSIFTGSQLLFEDTARNLKKYMPKSEIILYYGASELNYITYLCYDELIEKPLSVGRPFPGIDIYIREGKIFVNTEYAVYNATKPYSVNDIGYYDNDGYLIFEGRSDDIINIGGFKVSSTKIENEVKKIPQIEDAIVLPYSDTIRGNQIVLFVITIDKITKKDLLIKMKDNLMKNEIPKKIIFLNSFPYTSSEKIDRLALLKML >CP016106.1|AXU54786.1|3264548_3265424_-|dipicolinate-synthase-subunit-A MSNQYDITVIGGDLRQVYMVKKLINKGYSVVTYGISNEIINGIVGKSTSLAEALSKSSIILCPIPFTKNQVNIENTDDCLDATIDNLLINLSPNQILFGGNIPTKVCKFCEQHSIQIYDFMKMNDVAILNAVATAEGAIAEAIKRSIINIHQSNCLVLGYGRCAQILAKKLYALDANVCVGARNNDARSTANAFGYSSISLSQLDEKLLQFDYIFNTIPECILTKERLEKVSQEVTIIDIASSPGGVDYSVVKEAGINATLCLGLPGKYSPKTSGEILVNAIENIINERRD >CP016106.1|AXU54785.1|3263955_3264546_-|dipicolinate-synthase-subunit-B MRLEGLTIGVGFTGSFCTYDKIFIELENLVKEGANVHTIFSDVSQNIDCRFGNSEEFMKKAYELTGNKPIVTIEEAEPFGPKGIADIIIIAPCTGNTAAKLANGITDSPVLMAAKGHLRNDKPLVISISTNDALSFNFKNIGILLNSKNIYFVPFGQDNCKAKPNSMIAHTELIIPTIELALENKQLQPVIKSPHQ >CP016106.1|AXU54784.1|3263548_3263749_+|hypothetical-protein MEKLKTISVFSLIISVILTIGCIGIVTYYVDNLFIRGLSVFVLIMSSSFVSTTVRLIFEESKRYKF >CP016106.1|AXU54783.1|3260390_3263045_-|bifunctional-acetaldehyde-CoA/alcohol-dehydrogenase MAHKEQVIIENKKENEVMSVGLDTVNNVESLVKKLAKIREAQKIFATYSQEQVDKIFLAASLAANKQRVPLAIMAQKETGMGIAEDKVIKNHYASEYIYNAYKETKTCGVIEKDEAFGMTKIAEPIGVIAAVVPTTNPTSTAIFKALLALKTRNGIIFSPHPRAKNSTIEAAKVVLEAAVLAGAPEGIIGWIDEPSLELTTTVMKEVDLTLATGGPGMVKSAYSSGKPAIGVGAGNTPAIIDDSADIKTAVNSILVSKTFDNGMICASEQSVIVLENIYNEVKKEFKERGAYLLDKDETEKIRNIILVNGGLNSKIVGQTACTIAKLAGFEVPVDTKVLIGEVESVEIEEAFAHEKLSPVLAMYKASDFDDAVRKAEKLVEDGGFGHTSSLYIDDVNQREKLDKFTSAMKTCRILINTPSSQGGIGDLYNFKLAPSLTLGCGSWGGNSVSENVGVKHLLNIKTVAERRENMLWFRAPEKVYFKKGCLGVALKELKDVMNKKRAFIVTDTFLYNNGYTKAVTDLLDEMNIKHTTFFEVEPDPTLECAKIGAKAMREFNPDVIISIGGGSAMDAGKIMWTLYEHPDVDFQDLAMRFMDIRKRVYTFPKMGEKANFVAIPTSAGTGSEVTPFAVITDQDTGVKYPLADYELMPNMAIVDSDMMMNMPKSLTSASGIDALTHALEAYVSMLATDYTNGLALQAIKSIFEYLPRAYDNGAKDPEAREKMANASTMAGMAFANAFLGVCHSMAHKLGAFHHVPHGVANALLITEVMKFNSSDAPKKMGAFSQYKYPEALKRYAEIASFLGLKGNSDEEKFQSLLVAIEDLKLKVGIPKSIKEFGVEESKFMDSIDEMVIQAFDDQCTGANPRYPLMNEIKDMYLNSYYGR >CP016106.1|AXU54782.1|3257895_3260115_-|signaling-protein MTGRNKSFTLITILFLTSLFLTMGYIYIEDTKHLLMSEAKIHIKEVAVQGSQLAQRQIEKDLDVLNIFSNYYASNPDIPNEEKMKNLLDEMENQKFYTMAIVDINGNAENTKGDKFSVKDREFFKNSIKGKKYVSSPYVDEVNKSIKKIAISVPLLNNDKVVGVLYCTYNINTLMKLINISFYENNSISYVVKNDGTIILHPQGDSLSKNIYKLLEQDNDIQEVNRLKKELQENKTGATVLNMLEERRYLGYATMDNGNSENNYIKDWNLIFSIPETVVFSNSKQIINRAVYAVLSIVLIFIAIIFYIIYIKKSNEKEILSLAYEDKVTYIGNQNKFYRECSKYLLDKPSLNYIIVYFDINNFKMINDTFGYEFGDNLLITIAKALKEELTEGEVYARLSSDYFAIFCDYKNGRNKIIRKLDNIRSNIESNLSIVFEISLCVGIYFVEEGEVDIQKAVNKANMARSVAKGKNINYAIYNEDVRNKLSEESMILDDIKIALVKNQFEVYYQPKFSLVTGEMIGSEALIRWNHPEHGFISPAVFIPIAEKSKLILKIGRFVFERVCNDLSEWKKQGKKIVPVSVNLSRVELYQPDIVKFINKTIQMYNLSSDFIEIEITETVAINELNILKNVLNELRKHGFSISMDDFGTGYSSISCLRDMPIDILKLDKSFLGGIEHDERSRNIAKSIVSLAKSLDLVVIIEGVESKEQAELMKQFGCDLVQGFYFARPMPAKNFLDLL >CP016106.1|AXU54792.1|3272086_3272353_-|CRISPR-associated-Cas2-family-protein MFVIVTYDIVEARSLNRIRRILRKYLTWTQNSVFEGNITEGKLHKCISEIENIIDNSEDSIYVYEIKNPNSIKKKCYGIDKYSDEMFI >CP016106.1|AXU54793.1|3272355_3273336_-|maturase-related-protein MYKDYYIISNGDIKRKENTIYYYNLEGEKKILPVEQVDDIHIYGEVDLNTKLINYISKYGVMLHFYNYYGYYSGTYYPRKKNVSGFSLVCQSACYLDKNERLYLAKSFVESASYHILRNMRYYKVDESLIDTIKDELNDLNDVKEISELMGKEGRIRKTYYKSFNQILKDDFEFYKREKRPPKDPVNALMSFGNSIMYTNVLSEIYNTQLDPTISFLHEPSTKRFSLSLDIAEIFKPIIIDTIIFSLINNKRINKNDFEYQDKICYLSEKGKKKFLQEFENKMQTTIKHRNLNRKVSYRMFIRLECYKLIKHFINDERYKVLKVWW >CP016106.1|AXU54794.1|3273338_3273908_-|CRISPR-associated-Cas4-family-protein MIFILTMWLKFTKEGDFVPIDLEVLKVQGVKINYYYVCKRKLWLFSKGITMEQNSSRVLSGKIVHEDSYKRMKNKEILIDDILKLDIIKDEYVKEVKISSKMKEADEMQLYYYLYYLKNSMGIEKKGTINYVKEKKQEELILTEEKERIIENTLININEINTQLSPPKIEKKHYCTKCAYYEFCFVKEE >CP016106.1|AXU54795.1|3273904_3276226_-|CRISPR-associated-helicase,-Cas3-family MLYAKSNPVETLREHTDELLKQMNVLRESYGKNINSLDFLEEEIFWQLLDFVIEFHDIGKAFSPFQELIKSRMDTKINEPKIVTHLENNVGHNYLSPAFIDYSYIDRKKNKELRAVLNQVIVYHHERDIFIDKDFKNLIQKILDEDLINKVYELQHEFKVRYPIKTEKLSKVYLQSVEKRIDKNHKYYNLYIMLKGILHRLDHSASAHEIVECNSNMNIGEYTEKHLVKEFGSLREVQSFAKSNRNKNIILIASTGMGKTETALIWIDKDKAFFTLPLRVSINALFDRAKNIIGVGEANDTFLGLLHSTAIDYLEESNQENSNEIVDLAKLLSCKLTFSTIDQIFKFPFLYRGYEKVYSTLAYSKVVIDEIQAYSPEIAAVLVKGIEMIHKIGGRFMIMTATMPTIYIDELKKRGVMNSNLADLTCNTEKIRHCVSIVENSIDENLGKIIQSGMNKKVLVIVNTVKSAVEKYELIEEIVKPKGIDVNLNLLHSMYIQEDRAKLEKYIKEFADSDSNGIWITTQLVEASLDIDFDELHTENSTLDSLFQRFGRCYRSREYEENSPNIFIYTEKATGIGSIYDKDIVEKGLELLKTFINGKECVKMKEKYKVEMVKILYSKESLEGTAFEKRFTSALNILDTITPYSLGSKDAQNILRNIEGYTVIPEDIYNKIEETLIKDYEELGQELINAYSNDDRQLINKIKSKRKKARREIVKKTVNLPIYKAKQNVIDIQVKGLEDLKILLYKYDIYENKHTKQIFGKGVLISNEIDQFI >CP016106.1|AXU54796.1|3276236_3276938_-|CRISPR-associated-protein,-Cas5t-family MKVLKLDLFQETACYKKPFAMKITETYPLPPYSTINGLIHKILNATEYIPFNISVQGTYESIFNNYQTTYFYKKDSITSMPMNSHMLLNVNLIIHIGGDFDLLEEIYDSLLNYDEHLSLGRKEDLVRINDIRFVEVNKFEVDEDIQLDDYENYKLSECNIRMPIYIPKTSLQDTDIDGISYRLNNYYDNNAVEDKKRVWNKVDSYYVEDGNTISIGDILLDNEGDLLYFNNIN >CP016106.1|AXU54797.1|3276939_3277854_-|CRISPR-associated-autoregulator,-Cst2-family MKRGLTFTVIAQAQSLNYGEVIGNISELKKLSRADGNMYTFASRQCLRYDIVRLAAELFNWNLQVVDKEKGTIQFKDNISIRESEEMDLFGYMKTNKKDEKDKKGGSLTREATVRLSNAISLEPYRSDMDFLNNKGFADRIGEHPNLANIEQHLSYYTYTVTIDLSKIGKDGDIELDNKEKCRRVVEFLEIIKVLNRNIRGRQENLSPLFVVGGVYEIANPFFLGRIKLKGDKNGFKINKQAIEEVIQGTFLGKDLKEFTYVGMVDGVFINKEEFKGLFEDNFLSVDKFFGQLVKEVKEYYGVN >CP016106.1|AXU54798.1|3277855_3279706_-|CRISPR-associated-protein-Cas8a1/Cst1,-subtype-I-B/TNEAP MKLRVYRGDWFFNMGIVGFLNIIKKADKQAEIFIMEDYIEFDSLFLENFHEYYFNYFMDEYDVSKRIKKNIDYSINFIKSKPDRIKDGIKKIKDSVKQQNDKIKKFDEEKFNMIKEKLDSMSKIKSYDEFDSLESLVDETIDIFKIKSINDRLTANLYKYVVQDNYFGQVSFLNVLKAKLDLDGLKQVMFNDYLRQIIYFGELEDLLEENDYDKLKNYLNDRLNSIAKDINEKKVSKSSINTIEKIMKEINKNFIKKNKSIEDIKEYMDSLEVCEMCGLYKGILDEYSESNFAPLGVSTNNARNMFWNQEYVSSICDVCKLILFCTPAGATYTRKNYLINEENEFYLFVNMDTSINGLFERNNSLKAQKSESSDSKDENPFNQLIKSIVEENTLKSEWQLRNILFVEFKASIDSKKCKINYFNIPTYLAKFFVKENKKIQSIYDYKLKSNVLDLILKSKDLKHLINNTLRNIVKSNLESNNKSNISGLSCFNVVQLRTILNNYKRGVYKMDYKKLRKIYESGCEIHDYYIDKNAKNKIEGITYKILNLIKVGNKNDFMQTILRIFSPSEKIPPEEILQIFIEEDLDFESVGYAFVTGLISGKYEGKDKLPNEKEEK >CP016106.1|AXU54799.1|3279711_3280449_-|CRISPR-associated-Cas-family-protein MKMKIEFSTGCIPISYNSLFMSIIKEAIRKSNEDYYKNMYYYKEKNNKKTKNFTFSVYIKKYSIEGDNFIIEDKVILNISTPDLELGFHIYNGLMTSKKCLYKDYELTRIRIDLSREKKVTEERVLFNALSPICVKSKEGKFLEITDDRYIEELNYITNEVVKNYRGNGLKRKLEFENIGLKKVVVKESLREFKKITGKEYQYINGYKGKFILKGDIDDLNLIYNLGIGFRRAQGFGDVDILEWR >CP016106.1|AXU54800.1|3280526_3281414_-|putative-transcriptional-regulator MKCKELSEELEVSERQIKSYKMYLEQAGIFINSTPGIYGGYEIDKCNSISLIKLLDSEVSILDMINSQLEYNNDIYKNEFNNIVEKIKAVLNTGEKSDTYMDYFTVQAQRNCDYESEKNKCNEIIRAYTTKHKFWIEYYSLNSGNSERIVHPYGLFNYKSDTYMVAFCEKRFKFIDFKLCRIKDYKVLEEKYNVDKSFSWDEYSKNSIGIYKGEEISVVIKISHPFSTIIKEKVWVNNQQIIEYDDKSIMFKAKMRGYEEIKSWILSMGAYVEVVEPDRLRNDILSEIEKMKKIY >CP016106.1|AXU54801.1|3281722_3283639_-|ABC-transporter-permease MNIKQFAINNISRNIKAYLGYLASIVISSSLLFSFIMFTSHPDLDVSQFPDYLKEGLKMSKIIAYLFLFFFVFYSVSVFLKSRYKEFGILYITGISKRQVMKLIFIENMIINIVSSVIGIIIGLIFAKIFLVVMSTFLELSPLKFYIPFNAILSTLIYFMILAVLTSIFTSFIVKENQVLKLLKGTKTPKPEPKTSLMLAILSICLFIIAYYNAITSTDQYTTYLRLVPVTSLTIVATYLFFSQFSVFFMKKLKLNKRFYRKNTNMLWISNLIYKVKDNARIFFLITITSAVAFTAIGTVYSFWKDVERQINLIYPNTIYYSTMTLHNDTKKPDSKEKDKERMMFIENNLKKENVDYTRINGEFKTVFPKKSDFNVRIMKESKYLEITETIGIKPISFEDNECISLLSSSLPGNKNVKENIIVGNRGLKVAKQVEECVMPAYYKNMYVVKDNFYDSIESKFIVDRFTAFEVEDSSKTIEICREFENKFNNESGMQPYLFFSKELMIGTGKLMYSTFIFLAIFIGLIFFVTTSSFLYNKFYMDCQVDKKKYEQLNKLGMTYNEIKKASTIEIGIVFLFPYVVAVIHSIFALTALKNSFDIEVASSAVLVMGSLFLVQIVYFLIVRNNYLKEIRLNLVNF |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP016106_1 | 1.1|125850|34|CP016106|CRISPRCasFinder | 125850-125883 | 34 | CP016106.1 | 3016648-3016681 | 0 | 1.0 |
| CP016106_1 | 1.1|125850|34|CP016106|CRISPRCasFinder | 125850-125883 | 34 | CP016106.1 | 3974596-3974629 | 0 | 1.0 |
| CP016106_2 | 2.1|132730|39|CP016106|CRISPRCasFinder | 132730-132768 | 39 | CP016106.1 | 3016648-3016686 | 0 | 1.0 |
| CP016106_2 | 2.1|132730|39|CP016106|CRISPRCasFinder | 132730-132768 | 39 | CP016106.1 | 3974596-3974634 | 0 | 1.0 |
| CP016106_4 | 4.1|143282|34|CP016106|CRISPRCasFinder | 143282-143315 | 34 | CP016106.1 | 3016648-3016681 | 0 | 1.0 |
| CP016106_4 | 4.1|143282|34|CP016106|CRISPRCasFinder | 143282-143315 | 34 | CP016106.1 | 3974596-3974629 | 0 | 1.0 |
| CP016106_5 | 5.1|148732|39|CP016106|CRISPRCasFinder | 148732-148770 | 39 | CP016106.1 | 3016648-3016686 | 0 | 1.0 |
| CP016106_5 | 5.1|148732|39|CP016106|CRISPRCasFinder | 148732-148770 | 39 | CP016106.1 | 3974596-3974634 | 0 | 1.0 |
| CP016106_13 | 13.22|2175815|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2175815-2175850 | 36 | CP016106.1 | 2747785-2747820 | 0 | 1.0 |
1. spacer 1.1|125850|34|CP016106|CRISPRCasFinder matches to position: 3016648-3016681, mismatch: 0, identity: 1.0
aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer **********************************
2. spacer 1.1|125850|34|CP016106|CRISPRCasFinder matches to position: 3974596-3974629, mismatch: 0, identity: 1.0
aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer **********************************
3. spacer 2.1|132730|39|CP016106|CRISPRCasFinder matches to position: 3016648-3016686, mismatch: 0, identity: 1.0
agaataaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer agaataaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer ***************************************
4. spacer 2.1|132730|39|CP016106|CRISPRCasFinder matches to position: 3974596-3974634, mismatch: 0, identity: 1.0
agaataaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer agaataaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer ***************************************
5. spacer 4.1|143282|34|CP016106|CRISPRCasFinder matches to position: 3016648-3016681, mismatch: 0, identity: 1.0
aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer **********************************
6. spacer 4.1|143282|34|CP016106|CRISPRCasFinder matches to position: 3974596-3974629, mismatch: 0, identity: 1.0
aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer **********************************
7. spacer 5.1|148732|39|CP016106|CRISPRCasFinder matches to position: 3016648-3016686, mismatch: 0, identity: 1.0
agaataaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer agaataaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer ***************************************
8. spacer 5.1|148732|39|CP016106|CRISPRCasFinder matches to position: 3974596-3974634, mismatch: 0, identity: 1.0
agaataaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer agaataaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer ***************************************
9. spacer 13.22|2175815|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 2747785-2747820, mismatch: 0, identity: 1.0
caagcactacgagacaaggcaaatgaaatagaaagt CRISPR spacer caagcactacgagacaaggcaaatgaaatagaaagt Protospacer ************************************
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP016106_3 | 3.1|141267|29|CP016106|CRISPRCasFinder | 141267-141295 | 29 | NZ_CP033215 | Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence | 5105-5133 | 0 | 1.0 |
| CP016106_7 | 7.1|1267461|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1267461-1267497 | 37 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 15818-15854 | 0 | 1.0 |
| CP016106_7 | 7.4|1267656|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1267656-1267692 | 37 | MF547663 | Clostridioides phage LIBA2945, complete genome | 116292-116328 | 0 | 1.0 |
| CP016106_7 | 7.4|1267656|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1267656-1267692 | 37 | CP011970 | Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence | 115097-115133 | 0 | 1.0 |
| CP016106_7 | 7.4|1267656|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1267656-1267692 | 37 | LN681537 | Clostridium phage phiCD211, complete genome | 123959-123995 | 0 | 1.0 |
| CP016106_7 | 7.4|1267656|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1267656-1267692 | 37 | NZ_CP020426 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence | 6867-6903 | 0 | 1.0 |
| CP016106_7 | 7.10|1268051|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1268051-1268087 | 37 | NZ_MF547664 | Clostridioides difficile strain LIBA-6289 plasmid LIBA6289, complete sequence | 9106-9142 | 0 | 1.0 |
| CP016106_8 | 8.6|1475135|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1475135-1475170 | 36 | NZ_CP029156 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed2, complete sequence | 31024-31059 | 0 | 1.0 |
| CP016106_8 | 8.6|1475135|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1475135-1475170 | 36 | NZ_CP029153 | Clostridioides difficile strain CDT4 plasmid unnamed1, complete sequence | 25068-25103 | 0 | 1.0 |
| CP016106_10 | 10.1|1674072|37|CP016106|CRISPRCasFinder | 1674072-1674108 | 37 | AY855346 | Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome | 21014-21050 | 0 | 1.0 |
| CP016106_10 | 10.1|1674072|37|CP016106|CRISPRCasFinder | 1674072-1674108 | 37 | NC_007917 | Clostridium phage phi CD119, complete genome | 21014-21050 | 0 | 1.0 |
| CP016106_10 | 10.1|1674072|37|CP016106|CRISPRCasFinder | 1674072-1674108 | 37 | NC_028996 | Clostridium phage phiCDHM19, complete genome | 21267-21303 | 0 | 1.0 |
| CP016106_10 | 10.1|1674072|37|CP016106|CRISPRCasFinder | 1674072-1674108 | 37 | NC_028838 | Clostridium phage phiCD506, complete genome | 14598-14634 | 0 | 1.0 |
| CP016106_10 | 10.1|1674072|37|CP016106|CRISPRCasFinder | 1674072-1674108 | 37 | LN681538 | Clostridium phage phiCD481-1, complete genome | 14625-14661 | 0 | 1.0 |
| CP016106_12 | 12.3|2123451|32|CP016106|CRT | 2123451-2123482 | 32 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 37036-37067 | 0 | 1.0 |
| CP016106_12 | 12.6|2123452|35|CP016106|PILER-CR | 2123452-2123486 | 35 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 37036-37070 | 0 | 1.0 |
| CP016106_13 | 13.9|2174957|38|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2174957-2174994 | 38 | JX145341 | Clostridium phage phiMMP02, complete genome | 10429-10466 | 0 | 1.0 |
| CP016106_13 | 13.9|2174957|38|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2174957-2174994 | 38 | NC_011398 | Clostridium phage phiCD27, complete genome | 10421-10458 | 0 | 1.0 |
| CP016106_13 | 13.9|2174957|38|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2174957-2174994 | 38 | KX228400 | Clostridium phage CDKM15, complete genome | 10563-10600 | 0 | 1.0 |
| CP016106_13 | 13.13|2175220|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2175220-2175256 | 37 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 37843-37879 | 0 | 1.0 |
| CP016106_13 | 13.13|2175220|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2175220-2175256 | 37 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 37409-37445 | 0 | 1.0 |
| CP016106_13 | 13.13|2175220|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2175220-2175256 | 37 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 37341-37377 | 0 | 1.0 |
| CP016106_13 | 13.13|2175220|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2175220-2175256 | 37 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 24177-24213 | 0 | 1.0 |
| CP016106_13 | 13.17|2175484|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2175484-2175520 | 37 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 9623-9659 | 0 | 1.0 |
| CP016106_13 | 13.18|2175550|38|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2175550-2175587 | 38 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 4814-4851 | 0 | 1.0 |
| CP016106_13 | 13.38|2176867|38|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2176867-2176904 | 38 | MF547662 | Clostridioides phage LIBA6276, complete genome | 76563-76600 | 0 | 1.0 |
| CP016106_13 | 13.38|2176867|38|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2176867-2176904 | 38 | MF547663 | Clostridioides phage LIBA2945, complete genome | 75286-75323 | 0 | 1.0 |
| CP016106_14 | 14.5|2482992|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2482992-2483028 | 37 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 16208-16244 | 0 | 1.0 |
| CP016106_18 | 18.6|2746505|35|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2746505-2746539 | 35 | JX145341 | Clostridium phage phiMMP02, complete genome | 14137-14171 | 0 | 1.0 |
| CP016106_19 | 19.3|2749799|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2749799-2749835 | 37 | NZ_CP029155 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence | 127860-127896 | 0 | 1.0 |
| CP016106_19 | 19.3|2749799|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2749799-2749835 | 37 | CP011970 | Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence | 76453-76489 | 0 | 1.0 |
| CP016106_19 | 19.3|2749799|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2749799-2749835 | 37 | LN681537 | Clostridium phage phiCD211, complete genome | 85315-85351 | 0 | 1.0 |
| CP016106_19 | 19.3|2749799|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2749799-2749835 | 37 | NZ_CP020426 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence | 45511-45547 | 0 | 1.0 |
| CP016106_19 | 19.4|2749865|36|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2749865-2749900 | 36 | NZ_CP020426 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence | 14478-14513 | 0 | 1.0 |
| CP016106_19 | 19.4|2749865|36|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2749865-2749900 | 36 | MF547662 | Clostridioides phage LIBA6276, complete genome | 110839-110874 | 0 | 1.0 |
| CP016106_19 | 19.4|2749865|36|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2749865-2749900 | 36 | MF547663 | Clostridioides phage LIBA2945, complete genome | 108681-108716 | 0 | 1.0 |
| CP016106_19 | 19.4|2749865|36|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2749865-2749900 | 36 | CP011970 | Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence | 107487-107522 | 0 | 1.0 |
| CP016106_19 | 19.4|2749865|36|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2749865-2749900 | 36 | LN681537 | Clostridium phage phiCD211, complete genome | 116349-116384 | 0 | 1.0 |
| CP016106_19 | 19.6|2749996|38|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2749996-2750033 | 38 | NZ_CP020425 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence | 24814-24851 | 0 | 1.0 |
| CP016106_19 | 19.6|2749996|38|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2749996-2750033 | 38 | FN668942 | Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence | 23459-23496 | 0 | 1.0 |
| CP016106_19 | 19.6|2749996|38|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2749996-2750033 | 38 | NZ_CP011969 | Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence | 20136-20173 | 0 | 1.0 |
| CP016106_19 | 19.7|2750063|36|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2750063-2750098 | 36 | NC_028838 | Clostridium phage phiCD506, complete genome | 19883-19918 | 0 | 1.0 |
| CP016106_24 | 24.5|3270935|37|CP016106|CRISPRCasFinder | 3270935-3270971 | 37 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 39279-39315 | 0 | 1.0 |
| CP016106_24 | 24.9|3270935|36|CP016106|CRT,PILER-CR | 3270935-3270970 | 36 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 39280-39315 | 0 | 1.0 |
| CP016106_25 | 25.3|3271245|38|CP016106|PILER-CR,CRT,CRISPRCasFinder | 3271245-3271282 | 38 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 10015-10052 | 0 | 1.0 |
| CP016106_1 | 1.1|125850|34|CP016106|CRISPRCasFinder | 125850-125883 | 34 | NZ_CP033215 | Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence | 3086-3119 | 1 | 0.971 |
| CP016106_2 | 2.1|132730|39|CP016106|CRISPRCasFinder | 132730-132768 | 39 | NZ_CP033215 | Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence | 3086-3124 | 1 | 0.974 |
| CP016106_4 | 4.1|143282|34|CP016106|CRISPRCasFinder | 143282-143315 | 34 | NZ_CP033215 | Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence | 3086-3119 | 1 | 0.971 |
| CP016106_5 | 5.1|148732|39|CP016106|CRISPRCasFinder | 148732-148770 | 39 | NZ_CP033215 | Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence | 3086-3124 | 1 | 0.974 |
| CP016106_7 | 7.4|1267656|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1267656-1267692 | 37 | NZ_CP029155 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence | 37912-37948 | 1 | 0.973 |
| CP016106_7 | 7.9|1267985|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1267985-1268021 | 37 | LN681539 | Clostridium phage phiCD505, complete genome | 20743-20779 | 1 | 0.973 |
| CP016106_7 | 7.9|1267985|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1267985-1268021 | 37 | JX145341 | Clostridium phage phiMMP02, complete genome | 20649-20685 | 1 | 0.973 |
| CP016106_7 | 7.9|1267985|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1267985-1268021 | 37 | NC_048642 | Clostridium phage CDKM9, complete genome | 20681-20717 | 1 | 0.973 |
| CP016106_7 | 7.9|1267985|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1267985-1268021 | 37 | KX228400 | Clostridium phage CDKM15, complete genome | 23886-23922 | 1 | 0.973 |
| CP016106_8 | 8.6|1475135|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1475135-1475170 | 36 | NZ_CP020425 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence | 16597-16632 | 1 | 0.972 |
| CP016106_8 | 8.6|1475135|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1475135-1475170 | 36 | FN668942 | Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence | 15242-15277 | 1 | 0.972 |
| CP016106_8 | 8.6|1475135|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1475135-1475170 | 36 | NZ_CP011969 | Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence | 11919-11954 | 1 | 0.972 |
| CP016106_8 | 8.6|1475135|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1475135-1475170 | 36 | NC_048665 | Clostridium phage phiCDHM14, complete genome | 15279-15314 | 1 | 0.972 |
| CP016106_8 | 8.6|1475135|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1475135-1475170 | 36 | MK473382 | Clostridium phage JD032, complete genome | 19395-19430 | 1 | 0.972 |
| CP016106_8 | 8.6|1475135|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1475135-1475170 | 36 | HG796225 | Clostridium phage phiCDHM13 complete genome | 15247-15282 | 1 | 0.972 |
| CP016106_8 | 8.6|1475135|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1475135-1475170 | 36 | HG798901 | Clostridium phage phiCDHM11 complete genome | 15246-15281 | 1 | 0.972 |
| CP016106_13 | 13.3|2174564|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2174564-2174598 | 35 | AY855346 | Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome | 31078-31112 | 1 | 0.971 |
| CP016106_13 | 13.3|2174564|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2174564-2174598 | 35 | NC_007917 | Clostridium phage phi CD119, complete genome | 31078-31112 | 1 | 0.971 |
| CP016106_13 | 13.3|2174564|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2174564-2174598 | 35 | NC_028996 | Clostridium phage phiCDHM19, complete genome | 34763-34797 | 1 | 0.971 |
| CP016106_13 | 13.10|2175024|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2175024-2175058 | 35 | AY855346 | Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome | 24492-24526 | 1 | 0.971 |
| CP016106_13 | 13.10|2175024|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2175024-2175058 | 35 | NC_007917 | Clostridium phage phi CD119, complete genome | 24492-24526 | 1 | 0.971 |
| CP016106_13 | 13.10|2175024|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2175024-2175058 | 35 | LN681538 | Clostridium phage phiCD481-1, complete genome | 18780-18814 | 1 | 0.971 |
| CP016106_18 | 18.2|2746241|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2746241-2746277 | 37 | JX145341 | Clostridium phage phiMMP02, complete genome | 12856-12892 | 1 | 0.973 |
| CP016106_18 | 18.3|2746307|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2746307-2746343 | 37 | LN681542 | Clostridium phage phiMMP03, complete genome | 11234-11270 | 1 | 0.973 |
| CP016106_18 | 18.3|2746307|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2746307-2746343 | 37 | HG531805 | Clostridium phage CDMH1 complete genome | 11484-11520 | 1 | 0.973 |
| CP016106_18 | 18.3|2746307|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2746307-2746343 | 37 | NC_009231 | Clostridium phage phiC2, complete genome | 11265-11301 | 1 | 0.973 |
| CP016106_18 | 18.3|2746307|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2746307-2746343 | 37 | LN681541 | Clostridium phage phiMMP01, complete genome | 11234-11270 | 1 | 0.973 |
| CP016106_19 | 19.4|2749865|36|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2749865-2749900 | 36 | NZ_CP029155 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence | 34401-34436 | 1 | 0.972 |
| CP016106_19 | 19.6|2749996|38|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2749996-2750033 | 38 | NZ_CP029156 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed2, complete sequence | 21931-21968 | 1 | 0.974 |
| CP016106_19 | 19.6|2749996|38|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2749996-2750033 | 38 | NZ_CP029153 | Clostridioides difficile strain CDT4 plasmid unnamed1, complete sequence | 15975-16012 | 1 | 0.974 |
| CP016106_24 | 24.6|3271001|37|CP016106|CRISPRCasFinder | 3271001-3271037 | 37 | FN668942 | Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence | 28420-28456 | 1 | 0.973 |
| CP016106_24 | 24.10|3271001|36|CP016106|CRT | 3271001-3271036 | 36 | FN668942 | Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence | 28421-28456 | 1 | 0.972 |
| CP016106_25 | 25.4|3271312|37|CP016106|PILER-CR,CRT,CRISPRCasFinder | 3271312-3271348 | 37 | LN681538 | Clostridium phage phiCD481-1, complete genome | 18080-18116 | 1 | 0.973 |
| CP016106_7 | 7.13|1268249|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1268249-1268284 | 36 | NC_028996 | Clostridium phage phiCDHM19, complete genome | 34840-34875 | 2 | 0.944 |
| CP016106_11 | 11.5|1813038|38|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1813038-1813075 | 38 | LN681539 | Clostridium phage phiCD505, complete genome | 41344-41381 | 2 | 0.947 |
| CP016106_12 | 12.2|2123385|34|CP016106|CRT | 2123385-2123418 | 34 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 35620-35653 | 2 | 0.941 |
| CP016106_12 | 12.5|2123386|37|CP016106|PILER-CR | 2123386-2123422 | 37 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 35620-35656 | 2 | 0.946 |
| CP016106_13 | 13.10|2175024|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2175024-2175058 | 35 | NC_048665 | Clostridium phage phiCDHM14, complete genome | 18112-18146 | 2 | 0.943 |
| CP016106_13 | 13.10|2175024|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2175024-2175058 | 35 | HG796225 | Clostridium phage phiCDHM13 complete genome | 17612-17646 | 2 | 0.943 |
| CP016106_13 | 13.10|2175024|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2175024-2175058 | 35 | HG798901 | Clostridium phage phiCDHM11 complete genome | 17611-17645 | 2 | 0.943 |
| CP016106_13 | 13.10|2175024|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2175024-2175058 | 35 | NZ_CP029156 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed2, complete sequence | 27143-27177 | 2 | 0.943 |
| CP016106_13 | 13.10|2175024|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2175024-2175058 | 35 | NZ_CP029153 | Clostridioides difficile strain CDT4 plasmid unnamed1, complete sequence | 21187-21221 | 2 | 0.943 |
| CP016106_13 | 13.19|2175617|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2175617-2175652 | 36 | AY855346 | Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome | 579-614 | 2 | 0.944 |
| CP016106_13 | 13.19|2175617|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2175617-2175652 | 36 | NC_007917 | Clostridium phage phi CD119, complete genome | 579-614 | 2 | 0.944 |
| CP016106_13 | 13.19|2175617|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2175617-2175652 | 36 | NC_028996 | Clostridium phage phiCDHM19, complete genome | 824-859 | 2 | 0.944 |
| CP016106_13 | 13.33|2176537|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2176537-2176573 | 37 | NC_028838 | Clostridium phage phiCD506, complete genome | 163-199 | 2 | 0.946 |
| CP016106_13 | 13.33|2176537|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2176537-2176573 | 37 | LN681538 | Clostridium phage phiCD481-1, complete genome | 186-222 | 2 | 0.946 |
| CP016106_14 | 14.1|2482728|36|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT | 2482728-2482763 | 36 | NZ_MG973074 | Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence | 22132-22167 | 2 | 0.944 |
| CP016106_14 | 14.6|2483058|36|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2483058-2483093 | 36 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 1271-1306 | 2 | 0.944 |
| CP016106_16 | 16.4|2743975|38|CP016106|CRT | 2743975-2744012 | 38 | LN681542 | Clostridium phage phiMMP03, complete genome | 14321-14358 | 2 | 0.947 |
| CP016106_16 | 16.4|2743975|38|CP016106|CRT | 2743975-2744012 | 38 | HG531805 | Clostridium phage CDMH1 complete genome | 15461-15498 | 2 | 0.947 |
| CP016106_16 | 16.4|2743975|38|CP016106|CRT | 2743975-2744012 | 38 | NC_009231 | Clostridium phage phiC2, complete genome | 14352-14389 | 2 | 0.947 |
| CP016106_16 | 16.4|2743975|38|CP016106|CRT | 2743975-2744012 | 38 | LN681541 | Clostridium phage phiMMP01, complete genome | 14321-14358 | 2 | 0.947 |
| CP016106_16 | 16.7|2743983|38|CP016106|PILER-CR | 2743983-2744020 | 38 | LN681542 | Clostridium phage phiMMP03, complete genome | 14321-14358 | 2 | 0.947 |
| CP016106_16 | 16.7|2743983|38|CP016106|PILER-CR | 2743983-2744020 | 38 | HG531805 | Clostridium phage CDMH1 complete genome | 15461-15498 | 2 | 0.947 |
| CP016106_16 | 16.7|2743983|38|CP016106|PILER-CR | 2743983-2744020 | 38 | NC_009231 | Clostridium phage phiC2, complete genome | 14352-14389 | 2 | 0.947 |
| CP016106_16 | 16.7|2743983|38|CP016106|PILER-CR | 2743983-2744020 | 38 | LN681541 | Clostridium phage phiMMP01, complete genome | 14321-14358 | 2 | 0.947 |
| CP016106_18 | 18.5|2746438|38|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2746438-2746475 | 38 | NC_011398 | Clostridium phage phiCD27, complete genome | 20911-20948 | 2 | 0.947 |
| CP016106_18 | 18.7|2746569|38|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2746569-2746606 | 38 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 12032-12069 | 2 | 0.947 |
| CP016106_18 | 18.11|2746833|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2746833-2746869 | 37 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 17706-17742 | 2 | 0.946 |
| CP016106_19 | 19.5|2749930|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2749930-2749966 | 37 | NZ_MG266000 | Clostridioides difficile strain 7032985 plasmid pCD-ISS1, complete sequence | 295-331 | 2 | 0.946 |
| CP016106_24 | 24.6|3271001|37|CP016106|CRISPRCasFinder | 3271001-3271037 | 37 | NZ_CP029156 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed2, complete sequence | 16965-17001 | 2 | 0.946 |
| CP016106_24 | 24.6|3271001|37|CP016106|CRISPRCasFinder | 3271001-3271037 | 37 | NZ_CP029153 | Clostridioides difficile strain CDT4 plasmid unnamed1, complete sequence | 11009-11045 | 2 | 0.946 |
| CP016106_24 | 24.6|3271001|37|CP016106|CRISPRCasFinder | 3271001-3271037 | 37 | NZ_CP020425 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence | 29776-29812 | 2 | 0.946 |
| CP016106_24 | 24.6|3271001|37|CP016106|CRISPRCasFinder | 3271001-3271037 | 37 | NZ_CP011969 | Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence | 25098-25134 | 2 | 0.946 |
| CP016106_24 | 24.10|3271001|36|CP016106|CRT | 3271001-3271036 | 36 | NZ_CP020425 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence | 29777-29812 | 2 | 0.944 |
| CP016106_24 | 24.10|3271001|36|CP016106|CRT | 3271001-3271036 | 36 | NZ_CP011969 | Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence | 25099-25134 | 2 | 0.944 |
| CP016106_24 | 24.10|3271001|36|CP016106|CRT | 3271001-3271036 | 36 | NZ_CP029156 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed2, complete sequence | 16965-17000 | 2 | 0.944 |
| CP016106_24 | 24.10|3271001|36|CP016106|CRT | 3271001-3271036 | 36 | NZ_CP029153 | Clostridioides difficile strain CDT4 plasmid unnamed1, complete sequence | 11009-11044 | 2 | 0.944 |
| CP016106_7 | 7.13|1268249|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1268249-1268284 | 36 | AY855346 | Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome | 31152-31187 | 3 | 0.917 |
| CP016106_7 | 7.13|1268249|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1268249-1268284 | 36 | NC_007917 | Clostridium phage phi CD119, complete genome | 31152-31187 | 3 | 0.917 |
| CP016106_9 | 9.4|1583893|38|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT | 1583893-1583930 | 38 | NZ_MG973074 | Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence | 94861-94898 | 3 | 0.921 |
| CP016106_10 | 10.3|1674203|36|CP016106|CRISPRCasFinder | 1674203-1674238 | 36 | AY855346 | Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome | 9471-9506 | 3 | 0.917 |
| CP016106_10 | 10.3|1674203|36|CP016106|CRISPRCasFinder | 1674203-1674238 | 36 | NC_007917 | Clostridium phage phi CD119, complete genome | 9471-9506 | 3 | 0.917 |
| CP016106_10 | 10.3|1674203|36|CP016106|CRISPRCasFinder | 1674203-1674238 | 36 | NC_028996 | Clostridium phage phiCDHM19, complete genome | 9717-9752 | 3 | 0.917 |
| CP016106_13 | 13.33|2176537|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2176537-2176573 | 37 | HG796225 | Clostridium phage phiCDHM13 complete genome | 33300-33336 | 3 | 0.919 |
| CP016106_13 | 13.33|2176537|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2176537-2176573 | 37 | MK473382 | Clostridium phage JD032, complete genome | 34940-34976 | 3 | 0.919 |
| CP016106_16 | 16.1|2743974|39|CP016106|CRISPRCasFinder | 2743974-2744012 | 39 | LN681542 | Clostridium phage phiMMP03, complete genome | 14320-14358 | 3 | 0.923 |
| CP016106_16 | 16.1|2743974|39|CP016106|CRISPRCasFinder | 2743974-2744012 | 39 | HG531805 | Clostridium phage CDMH1 complete genome | 15460-15498 | 3 | 0.923 |
| CP016106_16 | 16.1|2743974|39|CP016106|CRISPRCasFinder | 2743974-2744012 | 39 | NC_009231 | Clostridium phage phiC2, complete genome | 14351-14389 | 3 | 0.923 |
| CP016106_16 | 16.1|2743974|39|CP016106|CRISPRCasFinder | 2743974-2744012 | 39 | LN681541 | Clostridium phage phiMMP01, complete genome | 14320-14358 | 3 | 0.923 |
| CP016106_16 | 16.5|2744041|38|CP016106|CRT | 2744041-2744078 | 38 | JX145341 | Clostridium phage phiMMP02, complete genome | 10860-10897 | 3 | 0.921 |
| CP016106_16 | 16.5|2744041|38|CP016106|CRT | 2744041-2744078 | 38 | NC_011398 | Clostridium phage phiCD27, complete genome | 10852-10889 | 3 | 0.921 |
| CP016106_16 | 16.8|2744049|38|CP016106|PILER-CR | 2744049-2744086 | 38 | JX145341 | Clostridium phage phiMMP02, complete genome | 10860-10897 | 3 | 0.921 |
| CP016106_16 | 16.8|2744049|38|CP016106|PILER-CR | 2744049-2744086 | 38 | NC_011398 | Clostridium phage phiCD27, complete genome | 10852-10889 | 3 | 0.921 |
| CP016106_18 | 18.4|2746373|36|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2746373-2746408 | 36 | JX145342 | Clostridium phage phiMMP04, complete genome | 12213-12248 | 3 | 0.917 |
| CP016106_19 | 19.2|2749733|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2749733-2749769 | 37 | NZ_CP029155 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence | 94710-94746 | 3 | 0.919 |
| CP016106_19 | 19.2|2749733|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2749733-2749769 | 37 | MF547662 | Clostridioides phage LIBA6276, complete genome | 48573-48609 | 3 | 0.919 |
| CP016106_19 | 19.2|2749733|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2749733-2749769 | 37 | MF547663 | Clostridioides phage LIBA2945, complete genome | 48573-48609 | 3 | 0.919 |
| CP016106_19 | 19.2|2749733|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2749733-2749769 | 37 | CP011970 | Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence | 39911-39947 | 3 | 0.919 |
| CP016106_19 | 19.2|2749733|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2749733-2749769 | 37 | LN681537 | Clostridium phage phiCD211, complete genome | 48773-48809 | 3 | 0.919 |
| CP016106_19 | 19.2|2749733|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2749733-2749769 | 37 | NZ_CP020426 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence | 82053-82089 | 3 | 0.919 |
| CP016106_12 | 12.2|2123385|34|CP016106|CRT | 2123385-2123418 | 34 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 36056-36089 | 4 | 0.882 |
| CP016106_12 | 12.2|2123385|34|CP016106|CRT | 2123385-2123418 | 34 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 25967-26000 | 4 | 0.882 |
| CP016106_12 | 12.2|2123385|34|CP016106|CRT | 2123385-2123418 | 34 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 35554-35587 | 4 | 0.882 |
| CP016106_12 | 12.2|2123385|34|CP016106|CRT | 2123385-2123418 | 34 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 35069-35102 | 4 | 0.882 |
| CP016106_12 | 12.5|2123386|37|CP016106|PILER-CR | 2123386-2123422 | 37 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 36056-36092 | 4 | 0.892 |
| CP016106_12 | 12.5|2123386|37|CP016106|PILER-CR | 2123386-2123422 | 37 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 35554-35590 | 4 | 0.892 |
| CP016106_12 | 12.5|2123386|37|CP016106|PILER-CR | 2123386-2123422 | 37 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 35069-35105 | 4 | 0.892 |
| CP016106_12 | 12.5|2123386|37|CP016106|PILER-CR | 2123386-2123422 | 37 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 25964-26000 | 4 | 0.892 |
| CP016106_16 | 16.2|2744040|39|CP016106|CRISPRCasFinder | 2744040-2744078 | 39 | JX145341 | Clostridium phage phiMMP02, complete genome | 10859-10897 | 4 | 0.897 |
| CP016106_16 | 16.2|2744040|39|CP016106|CRISPRCasFinder | 2744040-2744078 | 39 | NC_011398 | Clostridium phage phiCD27, complete genome | 10851-10889 | 4 | 0.897 |
| CP016106_17 | 17.2|2744412|39|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2744412-2744450 | 39 | LN681542 | Clostridium phage phiMMP03, complete genome | 13425-13463 | 4 | 0.897 |
| CP016106_17 | 17.2|2744412|39|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2744412-2744450 | 39 | HG531805 | Clostridium phage CDMH1 complete genome | 14565-14603 | 4 | 0.897 |
| CP016106_17 | 17.2|2744412|39|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2744412-2744450 | 39 | NC_009231 | Clostridium phage phiC2, complete genome | 13456-13494 | 4 | 0.897 |
| CP016106_17 | 17.2|2744412|39|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2744412-2744450 | 39 | LN681541 | Clostridium phage phiMMP01, complete genome | 13425-13463 | 4 | 0.897 |
| CP016106_3 | 3.1|141267|29|CP016106|CRISPRCasFinder | 141267-141295 | 29 | KY971610 | Pseudomonas phage PspYZU05, complete genome | 134239-134267 | 6 | 0.793 |
| CP016106_7 | 7.2|1267527|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1267527-1267561 | 35 | MK250021 | Prevotella phage Lak-B2, complete genome | 32964-32998 | 7 | 0.8 |
| CP016106_7 | 7.2|1267527|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1267527-1267561 | 35 | MK250024 | Prevotella phage Lak-B5, complete genome | 32047-32081 | 7 | 0.8 |
| CP016106_7 | 7.2|1267527|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1267527-1267561 | 35 | MK250028 | Prevotella phage Lak-B9, complete genome | 32975-33009 | 7 | 0.8 |
| CP016106_7 | 7.2|1267527|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1267527-1267561 | 35 | MK250023 | Prevotella phage Lak-B4, complete genome | 32996-33030 | 7 | 0.8 |
| CP016106_7 | 7.2|1267527|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1267527-1267561 | 35 | MK250025 | Prevotella phage Lak-B6, complete genome | 32031-32065 | 7 | 0.8 |
| CP016106_7 | 7.2|1267527|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1267527-1267561 | 35 | MK250022 | Prevotella phage Lak-B3, complete genome | 32046-32080 | 7 | 0.8 |
| CP016106_7 | 7.2|1267527|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1267527-1267561 | 35 | MK250027 | Prevotella phage Lak-B8, complete genome | 32996-33030 | 7 | 0.8 |
| CP016106_7 | 7.2|1267527|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1267527-1267561 | 35 | MK250026 | Prevotella phage Lak-B7, complete genome | 32996-33030 | 7 | 0.8 |
| CP016106_7 | 7.2|1267527|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1267527-1267561 | 35 | MK250020 | Prevotella phage Lak-B1, complete genome | 32955-32989 | 7 | 0.8 |
| CP016106_12 | 12.3|2123451|32|CP016106|CRT | 2123451-2123482 | 32 | AP014386 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S44-C17, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 30637-30668 | 7 | 0.781 |
| CP016106_12 | 12.3|2123451|32|CP016106|CRT | 2123451-2123482 | 32 | GU943062 | Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C93 genomic sequence | 2960-2991 | 7 | 0.781 |
| CP016106_13 | 13.11|2175088|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2175088-2175123 | 36 | MG592522 | Vibrio phage 1.154.O._10N.222.52.B12, partial genome | 35738-35773 | 7 | 0.806 |
| CP016106_13 | 13.11|2175088|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2175088-2175123 | 36 | NC_020850 | Vibrio phage VBM1 genomic sequence | 31562-31597 | 7 | 0.806 |
| CP016106_7 | 7.1|1267461|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1267461-1267497 | 37 | MN882550 | Butyrivibrio virus Arawn, complete genome | 12981-13017 | 8 | 0.784 |
| CP016106_7 | 7.1|1267461|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1267461-1267497 | 37 | MN882554 | Butyrivibrio virus Idris, complete genome | 12981-13017 | 8 | 0.784 |
| CP016106_8 | 8.3|1474939|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1474939-1474974 | 36 | NZ_CP013844 | Clostridium botulinum strain A634 plasmid pRSJ19_2, complete sequence | 24267-24302 | 8 | 0.778 |
| CP016106_12 | 12.3|2123451|32|CP016106|CRT | 2123451-2123482 | 32 | MK448892 | Streptococcus phage Javan268, complete genome | 33738-33769 | 8 | 0.75 |
| CP016106_7 | 7.2|1267527|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1267527-1267561 | 35 | MK448889 | Streptococcus phage Javan262, complete genome | 9858-9892 | 9 | 0.743 |
| CP016106_7 | 7.2|1267527|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1267527-1267561 | 35 | MN693989 | Marine virus AFVG_250M851, complete genome | 18922-18956 | 9 | 0.743 |
| CP016106_12 | 12.2|2123385|34|CP016106|CRT | 2123385-2123418 | 34 | MK250021 | Prevotella phage Lak-B2, complete genome | 408178-408211 | 9 | 0.735 |
| CP016106_12 | 12.2|2123385|34|CP016106|CRT | 2123385-2123418 | 34 | MK250024 | Prevotella phage Lak-B5, complete genome | 400502-400535 | 9 | 0.735 |
| CP016106_12 | 12.2|2123385|34|CP016106|CRT | 2123385-2123418 | 34 | MK250028 | Prevotella phage Lak-B9, complete genome | 405392-405425 | 9 | 0.735 |
| CP016106_12 | 12.2|2123385|34|CP016106|CRT | 2123385-2123418 | 34 | MK250023 | Prevotella phage Lak-B4, complete genome | 407390-407423 | 9 | 0.735 |
| CP016106_12 | 12.2|2123385|34|CP016106|CRT | 2123385-2123418 | 34 | MK250025 | Prevotella phage Lak-B6, complete genome | 404054-404087 | 9 | 0.735 |
| CP016106_12 | 12.2|2123385|34|CP016106|CRT | 2123385-2123418 | 34 | MK250022 | Prevotella phage Lak-B3, complete genome | 404145-404178 | 9 | 0.735 |
| CP016106_12 | 12.2|2123385|34|CP016106|CRT | 2123385-2123418 | 34 | MK250027 | Prevotella phage Lak-B8, complete genome | 407649-407682 | 9 | 0.735 |
| CP016106_12 | 12.2|2123385|34|CP016106|CRT | 2123385-2123418 | 34 | MK250026 | Prevotella phage Lak-B7, complete genome | 406685-406718 | 9 | 0.735 |
| CP016106_12 | 12.2|2123385|34|CP016106|CRT | 2123385-2123418 | 34 | MK250020 | Prevotella phage Lak-B1, complete genome | 405375-405408 | 9 | 0.735 |
| CP016106_12 | 12.6|2123452|35|CP016106|PILER-CR | 2123452-2123486 | 35 | AP014386 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S44-C17, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 30637-30671 | 9 | 0.743 |
| CP016106_12 | 12.6|2123452|35|CP016106|PILER-CR | 2123452-2123486 | 35 | GU943062 | Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C93 genomic sequence | 2957-2991 | 9 | 0.743 |
| CP016106_24 | 24.10|3271001|36|CP016106|CRT | 3271001-3271036 | 36 | NZ_CP024656 | Bacillus cereus strain MLY1 plasmid pMLY1.2, complete sequence | 89859-89894 | 9 | 0.75 |
| CP016106_25 | 25.1|3271113|37|CP016106|PILER-CR,CRT | 3271113-3271149 | 37 | NZ_CP020003 | Bacillus thuringiensis strain Bacillus thuringiensis L-7601 plasmid unnamed1, complete sequence | 21298-21334 | 9 | 0.757 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP026282 | Klebsiella oxytoca strain KONIH2 plasmid pKOR-e3cb, complete sequence | 3594-3628 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP026276 | Klebsiella oxytoca strain KONIH5 plasmid pKOR-ab4d, complete sequence | 236051-236085 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_LN824135 | Klebsiella pneumoniae genome assembly MS6671.v1, plasmid : _Plasmid_B_Kpneumoniae_MS6671 | 58082-58116 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP028954 | Klebsiella pneumoniae strain AR_0141 plasmid unnamed1, complete sequence | 154451-154485 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP020842 | Klebsiella pneumoniae strain KPN1482 plasmid pKPN1482-1, complete sequence | 73486-73520 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP022274 | Citrobacter freundii strain 18-1 plasmid pA18-1, complete sequence | 155431-155465 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | MN310380 | Raoultella ornithinolytica strain 170602815 plasmid p602815-NR, complete sequence | 78065-78099 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP033823 | Klebsiella sp. FDAARGOS_511 plasmid unnamed1, complete sequence | 19891-19925 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP042513 | Serratia marcescens strain E28 plasmid pE28_001, complete sequence | 63397-63431 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP026397 | Klebsiella pneumoniae strain KPNIH48 plasmid pKPN-10f7, complete sequence | 186571-186605 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP024516 | Klebsiella pneumoniae strain KSB1_10J plasmid unnamed1, complete sequence | 115925-115959 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP034132 | Klebsiella quasipneumoniae strain G4584 plasmid pG4584_81.9Kb, complete sequence | 28117-28151 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP024431 | Klebsiella pneumoniae strain DA48896 plasmid p48896_2, complete sequence | 55666-55700 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NC_021198 | Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae KPX plasmid pKPX-1 DNA, complete sequence | 30042-30076 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | CP052538 | Klebsiella pneumoniae strain B16KP0141 plasmid pB16KP0141-1, complete sequence | 67879-67913 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP045678 | Klebsiella pneumoniae strain WSD411 plasmid pWSD411_5, complete sequence | 32593-32627 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | CP052441 | Klebsiella pneumoniae strain C16KP0102 plasmid pC16KP0102-1, complete sequence | 116064-116098 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP024500 | Klebsiella pneumoniae strain KSB1_4E plasmid unnamed1, complete sequence | 115925-115959 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP029724 | Klebsiella pneumoniae strain AR_0140 plasmid unnamed2, complete sequence | 92418-92452 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP034140 | Klebsiella quasipneumoniae subsp. similipneumoniae strain G747 plasmid pG747_84.1Kb, complete sequence | 28113-28147 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP024508 | Klebsiella pneumoniae strain KSB2_1B plasmid unnamed2, complete sequence | 118208-118242 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP032189 | Klebsiella pneumoniae strain AR_0075 plasmid unnamed4, complete sequence | 16990-17024 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | CP052499 | Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid pB17KP0021-1, complete sequence | 116064-116098 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP021698 | Klebsiella pneumoniae strain AR_0158 plasmid tig00000183, complete sequence | 11366-11400 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP024483 | Klebsiella pneumoniae strain INF322 plasmid unnamed1, complete sequence | 115928-115962 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP026716 | Klebsiella oxytoca strain AR_0028 plasmid unitig_1_pilon, complete sequence | 4701-4735 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | CP052243 | Klebsiella pneumoniae strain E17KP0019 plasmid pE17KP0019-2, complete sequence | 116064-116098 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP014763 | Klebsiella pneumoniae strain KPNIH39 plasmid pKPN-332, complete sequence | 54776-54810 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP044111 | Klebsiella michiganensis strain FDAARGOS_647 plasmid unnamed2 | 134072-134106 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | CP052337 | Klebsiella pneumoniae strain D17KP0018 plasmid pD17KP0018-1, complete sequence | 118025-118059 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP016810 | Klebsiella pneumoniae strain DHQP1002001 plasmid p_IncFIB_DHQP1002001, complete sequence | 13667-13701 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_MH056209 | Enterobacter cloacae strain NRZ-10170 plasmid pNRZ-10170-LMB-1, complete sequence | 27258-27292 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP032893 | Enterobacter kobei strain WCHEK045523 plasmid p1_045523, complete sequence | 81236-81270 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_KY271406 | Klebsiella pneumoniae strain H150820806 plasmid pKPN3-307_TypeC, complete sequence | 209644-209678 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP018351 | Klebsiella pneumoniae strain CAV1417 plasmid pCAV1417-185, complete sequence | 46719-46753 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP050074 | Enterobacter kobei strain 070 plasmid p070, complete sequence | 61463-61497 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP050837 | Klebsiella pneumoniae strain Bckp021 plasmid pBckp021-3, complete sequence | 108420-108454 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_KX839208 | Klebsiella pneumoniae strain KP1814 plasmid pKP1814-2, complete sequence | 131980-132014 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP023418 | Klebsiella pneumoniae strain 1050 plasmid pKp1050-2, complete sequence | 54693-54727 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP026237 | Citrobacter freundii complex sp. CFNIH3 plasmid pCFR-9161, complete sequence | 142018-142052 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP015502 | Klebsiella pneumoniae strain SKGH01 plasmid unnamed 2, complete sequence | 118053-118087 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP025213 | Klebsiella pneumoniae strain HZW25 plasmid unnamed2, complete sequence | 29570-29604 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP012571 | Klebsiella pneumoniae strain UCLAOXA232KP plasmid pUCLAOXA232-5.X, complete sequence | 96862-96896 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP026208 | Escherichia coli strain ECONIH5 plasmid pECO-109b, complete sequence | 231648-231682 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP036193 | Klebsiella pneumoniae strain BA34918 plasmid pIncFIBpQil, complete sequence | 37703-37737 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP026179 | Klebsiella pneumoniae strain KPNIH49 plasmid pKPC-224e, complete sequence | 93084-93118 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | CP052526 | Klebsiella pneumoniae strain B16KP0177 plasmid pB16KP0177-2, complete sequence | 28750-28784 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_AP019689 | Klebsiella quasipneumoniae strain SNI47 plasmid pTMSNI47-2, complete sequence | 70631-70665 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP028551 | Klebsiella variicola strain WCHKP19 plasmid p3_020019, complete sequence | 45520-45554 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NC_022609 | Klebsiella pneumoniae strain N11-0042 plasmid pKp11-42, complete sequence | 144409-144443 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP048380 | Klebsiella variicola strain 118 plasmid p118_A, complete sequence | 27346-27380 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP012566 | Klebsiella pneumoniae strain UCLAOXA232KP plasmid pUCLAOXA232-5, complete sequence | 97689-97723 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP035907 | Klebsiella pneumoniae strain BA4656 plasmid pIncFIBpQil, complete sequence | 37709-37743 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP026212 | Citrobacter sp. CFNIH10 plasmid pCIT-a850, complete sequence | 80931-80965 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP013340 | Raoultella ornithinolytica strain Yangling I2 plasmid pKPYL2, complete sequence | 1447-1481 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP011634 | Klebsiella oxytoca strain CAV1374 plasmid pCAV1374-228, complete sequence | 197193-197227 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP024509 | Klebsiella pneumoniae strain KSB2_1B plasmid unnamed3, complete sequence | 9162-9196 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP018361 | Klebsiella oxytoca strain CAV1752 plasmid pCAV1752-278, complete sequence | 148556-148590 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP026234 | Citrobacter freundii complex sp. CFNIH4 plasmid pCFR-4109, complete sequence | 208089-208123 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_CP021758 | Klebsiella pneumoniae strain AR_0138 plasmid tig00000001, complete sequence | 41192-41226 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | MK649823 | Klebsiella pneumoniae strain BA6740 plasmid pBA6740_1, complete sequence | 122145-122179 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_KY271404 | Klebsiella pneumoniae strain Kp-48 plasmid pKPN3-307_typeA, complete sequence | 50473-50507 | 10 | 0.714 |
| CP016106_6 | 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder | 972969-973003 | 35 | NZ_MF788070 | Raoultella ornithinolytica strain 23141 plasmid p23141-2, complete sequence | 15521-15555 | 10 | 0.714 |
| CP016106_7 | 7.2|1267527|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1267527-1267561 | 35 | MT708547 | Klebsiella phage Muenster, complete genome | 243211-243245 | 10 | 0.714 |
| CP016106_7 | 7.7|1267853|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1267853-1267889 | 37 | LT599585 | Pseudomonas veronii 1YdBTEX2 genome assembly, plasmid: PVE_plasmid | 209114-209150 | 10 | 0.73 |
| CP016106_7 | 7.7|1267853|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1267853-1267889 | 37 | CP027480 | Pseudomonas koreensis strain P19E3 plasmid p3, complete sequence | 228327-228363 | 10 | 0.73 |
| CP016106_10 | 10.2|1674138|36|CP016106|CRISPRCasFinder | 1674138-1674173 | 36 | MK605244 | Nodularia phage vB_NspS-kac65v162, complete genome | 146764-146799 | 10 | 0.722 |
| CP016106_10 | 10.2|1674138|36|CP016106|CRISPRCasFinder | 1674138-1674173 | 36 | MK605242 | Nodularia phage vB_NspS-kac65v151, complete genome | 146349-146384 | 10 | 0.722 |
| CP016106_10 | 10.2|1674138|36|CP016106|CRISPRCasFinder | 1674138-1674173 | 36 | MK605243 | Nodularia phage vB_NspS-kac65v161, complete genome | 146466-146501 | 10 | 0.722 |
| CP016106_12 | 12.2|2123385|34|CP016106|CRT | 2123385-2123418 | 34 | LN866850 | Staphylococcus capitis CR01 plasmid CR01, complete sequence | 25089-25122 | 10 | 0.706 |
| CP016106_12 | 12.2|2123385|34|CP016106|CRT | 2123385-2123418 | 34 | NZ_CP030248 | Staphylococcus epidermidis strain CSF41498 plasmid pCSF41498_2, complete sequence | 10948-10981 | 10 | 0.706 |
| CP016106_12 | 12.2|2123385|34|CP016106|CRT | 2123385-2123418 | 34 | NC_005004 | Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 plasmid pSE-12228-05, complete sequence | 23573-23606 | 10 | 0.706 |
| CP016106_12 | 12.2|2123385|34|CP016106|CRT | 2123385-2123418 | 34 | NZ_CP034116 | Staphylococcus epidermidis strain CDC121 plasmid pSTA481, complete sequence | 6921-6954 | 10 | 0.706 |
| CP016106_12 | 12.2|2123385|34|CP016106|CRT | 2123385-2123418 | 34 | NZ_CP053076 | Staphylococcus aureus strain SA01 plasmid pSA01-tet, complete sequence | 69-102 | 10 | 0.706 |
| CP016106_12 | 12.2|2123385|34|CP016106|CRT | 2123385-2123418 | 34 | NZ_CP034113 | Staphylococcus epidermidis strain CDC120 plasmid pSTA492, complete sequence | 20824-20857 | 10 | 0.706 |
| CP016106_12 | 12.3|2123451|32|CP016106|CRT | 2123451-2123482 | 32 | NZ_CP012103 | Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-4, complete sequence | 44100-44131 | 10 | 0.688 |
| CP016106_12 | 12.3|2123451|32|CP016106|CRT | 2123451-2123482 | 32 | MG592614 | Vibrio phage 1.248.O._10N.261.54.F1, partial genome | 40900-40931 | 10 | 0.688 |
| CP016106_12 | 12.3|2123451|32|CP016106|CRT | 2123451-2123482 | 32 | MN856006 | Siphoviridae sp. isolate 29, complete genome | 1946-1977 | 10 | 0.688 |
| CP016106_12 | 12.3|2123451|32|CP016106|CRT | 2123451-2123482 | 32 | MG592518 | Vibrio phage 1.149.O._10N.286.55.A12, partial genome | 41046-41077 | 10 | 0.688 |
| CP016106_13 | 13.7|2174827|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2174827-2174862 | 36 | NZ_CP028104 | Fusobacterium varium ATCC 27725 plasmid pFvar_27725, complete sequence | 9941-9976 | 10 | 0.722 |
| CP016106_13 | 13.33|2176537|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2176537-2176573 | 37 | KY794641 | Staphylococcus phage vB_Sau_CG, complete genome | 17766-17802 | 10 | 0.73 |
| CP016106_13 | 13.35|2176669|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2176669-2176705 | 37 | MN855790 | Bacteriophage sp. isolate 76, complete genome | 20852-20888 | 10 | 0.73 |
| CP016106_14 | 14.1|2482728|36|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT | 2482728-2482763 | 36 | NZ_CP045274 | Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301B, complete sequence | 47033-47068 | 10 | 0.722 |
| CP016106_24 | 24.6|3271001|37|CP016106|CRISPRCasFinder | 3271001-3271037 | 37 | NZ_CP024656 | Bacillus cereus strain MLY1 plasmid pMLY1.2, complete sequence | 89858-89894 | 10 | 0.73 |
| CP016106_12 | 12.1|2123320|33|CP016106|CRT | 2123320-2123352 | 33 | CP045556 | Citrobacter sp. S39 plasmid pS39-1, complete sequence | 106036-106068 | 11 | 0.667 |
| CP016106_12 | 12.5|2123386|37|CP016106|PILER-CR | 2123386-2123422 | 37 | MK250021 | Prevotella phage Lak-B2, complete genome | 408175-408211 | 11 | 0.703 |
| CP016106_12 | 12.5|2123386|37|CP016106|PILER-CR | 2123386-2123422 | 37 | MK250024 | Prevotella phage Lak-B5, complete genome | 400499-400535 | 11 | 0.703 |
| CP016106_12 | 12.5|2123386|37|CP016106|PILER-CR | 2123386-2123422 | 37 | MK250028 | Prevotella phage Lak-B9, complete genome | 405389-405425 | 11 | 0.703 |
| CP016106_12 | 12.5|2123386|37|CP016106|PILER-CR | 2123386-2123422 | 37 | MK250023 | Prevotella phage Lak-B4, complete genome | 407387-407423 | 11 | 0.703 |
| CP016106_12 | 12.5|2123386|37|CP016106|PILER-CR | 2123386-2123422 | 37 | MK250025 | Prevotella phage Lak-B6, complete genome | 404051-404087 | 11 | 0.703 |
| CP016106_12 | 12.5|2123386|37|CP016106|PILER-CR | 2123386-2123422 | 37 | MK250022 | Prevotella phage Lak-B3, complete genome | 404142-404178 | 11 | 0.703 |
| CP016106_12 | 12.5|2123386|37|CP016106|PILER-CR | 2123386-2123422 | 37 | MK250027 | Prevotella phage Lak-B8, complete genome | 407646-407682 | 11 | 0.703 |
| CP016106_12 | 12.5|2123386|37|CP016106|PILER-CR | 2123386-2123422 | 37 | MK250026 | Prevotella phage Lak-B7, complete genome | 406682-406718 | 11 | 0.703 |
| CP016106_12 | 12.5|2123386|37|CP016106|PILER-CR | 2123386-2123422 | 37 | MK250020 | Prevotella phage Lak-B1, complete genome | 405372-405408 | 11 | 0.703 |
| CP016106_24 | 24.8|3270870|35|CP016106|CRT,PILER-CR | 3270870-3270904 | 35 | MN693428 | Marine virus AFVG_25M81, complete genome | 41973-42007 | 11 | 0.686 |
| CP016106_25 | 25.12|3271838|37|CP016106|PILER-CR,CRT,CRISPRCasFinder | 3271838-3271874 | 37 | NC_010418 | Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence | 107907-107943 | 11 | 0.703 |
| CP016106_18 | 18.9|2746702|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2746702-2746738 | 37 | NC_009466 | Clostridium kluyveri DSM 555 plasmid pCKL555A, complete sequence | 8204-8240 | 12 | 0.676 |
| CP016106_18 | 18.9|2746702|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2746702-2746738 | 37 | NC_011836 | Clostridium kluyveri NBRC 12016 plasmid pCKL1, complete sequence | 38362-38398 | 12 | 0.676 |
1. spacer 3.1|141267|29|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033215 (Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tgtaataagttaaagcaatatgaatcaac CRISPR spacer tgtaataagttaaagcaatatgaatcaac Protospacer *****************************
2. spacer 7.1|1267461|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atgaagcttgcaaagtattctctaaagtcctctgcct CRISPR spacer atgaagcttgcaaagtattctctaaagtcctctgcct Protospacer *************************************
3. spacer 7.4|1267656|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgagtgacttatattgtttgacagctctttgtaagt CRISPR spacer ttgagtgacttatattgtttgacagctctttgtaagt Protospacer *************************************
4. spacer 7.4|1267656|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP011970 (Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgagtgacttatattgtttgacagctctttgtaagt CRISPR spacer ttgagtgacttatattgtttgacagctctttgtaagt Protospacer *************************************
5. spacer 7.4|1267656|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681537 (Clostridium phage phiCD211, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgagtgacttatattgtttgacagctctttgtaagt CRISPR spacer ttgagtgacttatattgtttgacagctctttgtaagt Protospacer *************************************
6. spacer 7.4|1267656|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020426 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgagtgacttatattgtttgacagctctttgtaagt CRISPR spacer ttgagtgacttatattgtttgacagctctttgtaagt Protospacer *************************************
7. spacer 7.10|1268051|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF547664 (Clostridioides difficile strain LIBA-6289 plasmid LIBA6289, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
taaaagtattaaaaatactagtttttataggtaagag CRISPR spacer taaaagtattaaaaatactagtttttataggtaagag Protospacer *************************************
8. spacer 8.6|1475135|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029156 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gttatagtcttttggataactacccaattaggattt CRISPR spacer gttatagtcttttggataactacccaattaggattt Protospacer ************************************
9. spacer 8.6|1475135|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029153 (Clostridioides difficile strain CDT4 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gttatagtcttttggataactacccaattaggattt CRISPR spacer gttatagtcttttggataactacccaattaggattt Protospacer ************************************
10. spacer 10.1|1674072|37|CP016106|CRISPRCasFinder matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttttaactccaagcgttttagatataagtataagtgc CRISPR spacer ttttaactccaagcgttttagatataagtataagtgc Protospacer *************************************
11. spacer 10.1|1674072|37|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttttaactccaagcgttttagatataagtataagtgc CRISPR spacer ttttaactccaagcgttttagatataagtataagtgc Protospacer *************************************
12. spacer 10.1|1674072|37|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttttaactccaagcgttttagatataagtataagtgc CRISPR spacer ttttaactccaagcgttttagatataagtataagtgc Protospacer *************************************
13. spacer 10.1|1674072|37|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NC_028838 (Clostridium phage phiCD506, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttttaactccaagcgttttagatataagtataagtgc CRISPR spacer ttttaactccaagcgttttagatataagtataagtgc Protospacer *************************************
14. spacer 10.1|1674072|37|CP016106|CRISPRCasFinder matches to LN681538 (Clostridium phage phiCD481-1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttttaactccaagcgttttagatataagtataagtgc CRISPR spacer ttttaactccaagcgttttagatataagtataagtgc Protospacer *************************************
15. spacer 12.3|2123451|32|CP016106|CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caagaattgaggacttaaaaaatgaagttaga CRISPR spacer caagaattgaggacttaaaaaatgaagttaga Protospacer ********************************
16. spacer 12.6|2123452|35|CP016106|PILER-CR matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caagaattgaggacttaaaaaatgaagttagaaaa CRISPR spacer caagaattgaggacttaaaaaatgaagttagaaaa Protospacer ***********************************
17. spacer 13.9|2174957|38|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aggaaaagatatactactttttctaggtggaaaaacag CRISPR spacer aggaaaagatatactactttttctaggtggaaaaacag Protospacer **************************************
18. spacer 13.9|2174957|38|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aggaaaagatatactactttttctaggtggaaaaacag CRISPR spacer aggaaaagatatactactttttctaggtggaaaaacag Protospacer **************************************
19. spacer 13.9|2174957|38|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX228400 (Clostridium phage CDKM15, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aggaaaagatatactactttttctaggtggaaaaacag CRISPR spacer aggaaaagatatactactttttctaggtggaaaaacag Protospacer **************************************
20. spacer 13.13|2175220|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaaaactaaacctagagcctctttttcatactgtaca CRISPR spacer aaaaactaaacctagagcctctttttcatactgtaca Protospacer *************************************
21. spacer 13.13|2175220|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaaaactaaacctagagcctctttttcatactgtaca CRISPR spacer aaaaactaaacctagagcctctttttcatactgtaca Protospacer *************************************
22. spacer 13.13|2175220|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaaaactaaacctagagcctctttttcatactgtaca CRISPR spacer aaaaactaaacctagagcctctttttcatactgtaca Protospacer *************************************
23. spacer 13.13|2175220|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaaaactaaacctagagcctctttttcatactgtaca CRISPR spacer aaaaactaaacctagagcctctttttcatactgtaca Protospacer *************************************
24. spacer 13.17|2175484|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcttccataagtgcgtcaatgttagtgtttgaacttg CRISPR spacer gcttccataagtgcgtcaatgttagtgtttgaacttg Protospacer *************************************
25. spacer 13.18|2175550|38|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttattttttggaacagcaacagtctgaattatatttcc CRISPR spacer ttattttttggaacagcaacagtctgaattatatttcc Protospacer **************************************
26. spacer 13.38|2176867|38|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctattaattatatattcataaaccttttgtctatctga CRISPR spacer ctattaattatatattcataaaccttttgtctatctga Protospacer **************************************
27. spacer 13.38|2176867|38|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctattaattatatattcataaaccttttgtctatctga CRISPR spacer ctattaattatatattcataaaccttttgtctatctga Protospacer **************************************
28. spacer 14.5|2482992|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atttaagattagataaaaatctgtgcggaattgtaaa CRISPR spacer atttaagattagataaaaatctgtgcggaattgtaaa Protospacer *************************************
29. spacer 18.6|2746505|35|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tataacaatagcccctattccaactgttaatccga CRISPR spacer tataacaatagcccctattccaactgttaatccga Protospacer ***********************************
30. spacer 19.3|2749799|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP029155 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caatctcatcctcataaaactcaagctttgcacaata CRISPR spacer caatctcatcctcataaaactcaagctttgcacaata Protospacer *************************************
31. spacer 19.3|2749799|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP011970 (Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caatctcatcctcataaaactcaagctttgcacaata CRISPR spacer caatctcatcctcataaaactcaagctttgcacaata Protospacer *************************************
32. spacer 19.3|2749799|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LN681537 (Clostridium phage phiCD211, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caatctcatcctcataaaactcaagctttgcacaata CRISPR spacer caatctcatcctcataaaactcaagctttgcacaata Protospacer *************************************
33. spacer 19.3|2749799|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP020426 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caatctcatcctcataaaactcaagctttgcacaata CRISPR spacer caatctcatcctcataaaactcaagctttgcacaata Protospacer *************************************
34. spacer 19.4|2749865|36|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP020426 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gttaaatgatagtaagagtttgactaaagttgctat CRISPR spacer gttaaatgatagtaagagtttgactaaagttgctat Protospacer ************************************
35. spacer 19.4|2749865|36|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gttaaatgatagtaagagtttgactaaagttgctat CRISPR spacer gttaaatgatagtaagagtttgactaaagttgctat Protospacer ************************************
36. spacer 19.4|2749865|36|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gttaaatgatagtaagagtttgactaaagttgctat CRISPR spacer gttaaatgatagtaagagtttgactaaagttgctat Protospacer ************************************
37. spacer 19.4|2749865|36|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP011970 (Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gttaaatgatagtaagagtttgactaaagttgctat CRISPR spacer gttaaatgatagtaagagtttgactaaagttgctat Protospacer ************************************
38. spacer 19.4|2749865|36|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LN681537 (Clostridium phage phiCD211, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gttaaatgatagtaagagtttgactaaagttgctat CRISPR spacer gttaaatgatagtaagagtttgactaaagttgctat Protospacer ************************************
39. spacer 19.6|2749996|38|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP020425 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgtaattatgctcagcagtttcaaatgctcctaccaa CRISPR spacer ttgtaattatgctcagcagtttcaaatgctcctaccaa Protospacer **************************************
40. spacer 19.6|2749996|38|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to FN668942 (Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgtaattatgctcagcagtttcaaatgctcctaccaa CRISPR spacer ttgtaattatgctcagcagtttcaaatgctcctaccaa Protospacer **************************************
41. spacer 19.6|2749996|38|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP011969 (Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgtaattatgctcagcagtttcaaatgctcctaccaa CRISPR spacer ttgtaattatgctcagcagtttcaaatgctcctaccaa Protospacer **************************************
42. spacer 19.7|2750063|36|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_028838 (Clostridium phage phiCD506, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
agcacctcttttaattgcgcttaatattgtagcttg CRISPR spacer agcacctcttttaattgcgcttaatattgtagcttg Protospacer ************************************
43. spacer 24.5|3270935|37|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gttgttctgaattaataatcatatcatccagaccctt CRISPR spacer gttgttctgaattaataatcatatcatccagaccctt Protospacer *************************************
44. spacer 24.9|3270935|36|CP016106|CRT,PILER-CR matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gttgttctgaattaataatcatatcatccagaccct CRISPR spacer gttgttctgaattaataatcatatcatccagaccct Protospacer ************************************
45. spacer 25.3|3271245|38|CP016106|PILER-CR,CRT,CRISPRCasFinder matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gagtattcagaactcgaaaaaaaagttggaaatagtac CRISPR spacer gagtattcagaactcgaaaaaaaagttggaaatagtac Protospacer **************************************
46. spacer 1.1|125850|34|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033215 (Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer aaactgaacacatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer *********.************************
47. spacer 2.1|132730|39|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033215 (Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
agaataaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer agaataaactgaacacatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer **************.************************
48. spacer 4.1|143282|34|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033215 (Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer aaactgaacacatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer *********.************************
49. spacer 5.1|148732|39|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033215 (Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
agaataaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer agaataaactgaacacatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer **************.************************
50. spacer 7.4|1267656|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029155 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
ttgagtgacttatattgtttgacagctctttgtaagt CRISPR spacer ttgagtgacttatattgtttgatagctctttgtaagt Protospacer **********************.**************
51. spacer 7.9|1267985|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681539 (Clostridium phage phiCD505, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
ttaaatatatcagaaggagaaaatagagatgggaaag CRISPR spacer ttgaatatatcagaaggagaaaatagagatgggaaag Protospacer **.**********************************
52. spacer 7.9|1267985|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
ttaaatatatcagaaggagaaaatagagatgggaaag CRISPR spacer ttgaatatatcagaaggagaaaatagagatgggaaag Protospacer **.**********************************
53. spacer 7.9|1267985|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048642 (Clostridium phage CDKM9, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
ttaaatatatcagaaggagaaaatagagatgggaaag CRISPR spacer ttgaatatatcagaaggagaaaatagagatgggaaag Protospacer **.**********************************
54. spacer 7.9|1267985|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX228400 (Clostridium phage CDKM15, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
ttaaatatatcagaaggagaaaatagagatgggaaag CRISPR spacer ttgaatatatcagaaggagaaaatagagatgggaaag Protospacer **.**********************************
55. spacer 8.6|1475135|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020425 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gttatagtcttttggataactacccaattaggattt CRISPR spacer gttatagttttttggataactacccaattaggattt Protospacer ********.***************************
56. spacer 8.6|1475135|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to FN668942 (Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gttatagtcttttggataactacccaattaggattt CRISPR spacer gttatagttttttggataactacccaattaggattt Protospacer ********.***************************
57. spacer 8.6|1475135|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011969 (Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gttatagtcttttggataactacccaattaggattt CRISPR spacer gttatagttttttggataactacccaattaggattt Protospacer ********.***************************
58. spacer 8.6|1475135|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048665 (Clostridium phage phiCDHM14, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gttatagtcttttggataactacccaattaggattt CRISPR spacer gttatagttttttggataactacccaattaggattt Protospacer ********.***************************
59. spacer 8.6|1475135|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK473382 (Clostridium phage JD032, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gttatagtcttttggataactacccaattaggattt CRISPR spacer gttatagtcttttggataactacccaattaggtttt Protospacer ******************************** ***
60. spacer 8.6|1475135|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG796225 (Clostridium phage phiCDHM13 complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gttatagtcttttggataactacccaattaggattt CRISPR spacer gttatagttttttggataactacccaattaggattt Protospacer ********.***************************
61. spacer 8.6|1475135|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG798901 (Clostridium phage phiCDHM11 complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gttatagtcttttggataactacccaattaggattt CRISPR spacer gttatagttttttggataactacccaattaggattt Protospacer ********.***************************
62. spacer 13.3|2174564|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gatttagctatacccatttatttaatgttaacgct CRISPR spacer gatttagctatacctatttatttaatgttaacgct Protospacer **************.********************
63. spacer 13.3|2174564|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gatttagctatacccatttatttaatgttaacgct CRISPR spacer gatttagctatacctatttatttaatgttaacgct Protospacer **************.********************
64. spacer 13.3|2174564|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gatttagctatacccatttatttaatgttaacgct CRISPR spacer gatttagctatacctatttatttaatgttaacgct Protospacer **************.********************
65. spacer 13.10|2175024|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cagttgctaattttagttgctgctctttatgttat CRISPR spacer cagttgctaattttagtagctgctctttatgttat Protospacer ***************** *****************
66. spacer 13.10|2175024|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cagttgctaattttagttgctgctctttatgttat CRISPR spacer cagttgctaattttagtagctgctctttatgttat Protospacer ***************** *****************
67. spacer 13.10|2175024|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681538 (Clostridium phage phiCD481-1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cagttgctaattttagttgctgctctttatgttat CRISPR spacer cagttactaattttagttgctgctctttatgttat Protospacer *****.*****************************
68. spacer 18.2|2746241|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
cagcagttaagattagagatgaagctagttcaacact CRISPR spacer cagcagttaagattagagatgaagctagttcagcact Protospacer ********************************.****
69. spacer 18.3|2746307|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LN681542 (Clostridium phage phiMMP03, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
tatctatagaagcagcaacaaatgccctctcgtagtc CRISPR spacer tatctatagaagcagcaacaaatgccctctcgaagtc Protospacer ******************************** ****
70. spacer 18.3|2746307|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to HG531805 (Clostridium phage CDMH1 complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
tatctatagaagcagcaacaaatgccctctcgtagtc CRISPR spacer tatctatagaagcagcaacaaatgccctctcgaagtc Protospacer ******************************** ****
71. spacer 18.3|2746307|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_009231 (Clostridium phage phiC2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
tatctatagaagcagcaacaaatgccctctcgtagtc CRISPR spacer tatctatagaagcagcaacaaatgccctctcgaagtc Protospacer ******************************** ****
72. spacer 18.3|2746307|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LN681541 (Clostridium phage phiMMP01, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
tatctatagaagcagcaacaaatgccctctcgtagtc CRISPR spacer tatctatagaagcagcaacaaatgccctctcgaagtc Protospacer ******************************** ****
73. spacer 19.4|2749865|36|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP029155 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gttaaatgatagtaagagtttgactaaagttgctat CRISPR spacer gttaaatgatagtaagagtttgactaaagttgcaat Protospacer ********************************* **
74. spacer 19.6|2749996|38|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP029156 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
ttgtaattatgctcagcagtttcaaatgctcctaccaa CRISPR spacer ttgtaattatactcagcagtttcaaatgctcctaccaa Protospacer **********.***************************
75. spacer 19.6|2749996|38|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP029153 (Clostridioides difficile strain CDT4 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
ttgtaattatgctcagcagtttcaaatgctcctaccaa CRISPR spacer ttgtaattatactcagcagtttcaaatgctcctaccaa Protospacer **********.***************************
76. spacer 24.6|3271001|37|CP016106|CRISPRCasFinder matches to FN668942 (Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
caataaattaaaaagtttagaaaagtttatcgaggat CRISPR spacer aaataaattaaaaagtttagaaaagtttatcgaggat Protospacer ************************************
77. spacer 24.10|3271001|36|CP016106|CRT matches to FN668942 (Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
caataaattaaaaagtttagaaaagtttatcgagga CRISPR spacer aaataaattaaaaagtttagaaaagtttatcgagga Protospacer ***********************************
78. spacer 25.4|3271312|37|CP016106|PILER-CR,CRT,CRISPRCasFinder matches to LN681538 (Clostridium phage phiCD481-1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
ttaatatccctaaaatagattctattgagttgccata CRISPR spacer ttaatatccctaagatagattctattgagttgccata Protospacer *************.***********************
79. spacer 7.13|1268249|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
aacaaaaaagatacatctgtaactaatttttatact CRISPR spacer agtaaaaaagatacatctgtaactaatttttatact Protospacer *..*********************************
80. spacer 11.5|1813038|38|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681539 (Clostridium phage phiCD505, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
cattattgttgctgaataaatccacttctcattctcaa CRISPR spacer cattattgttgctgaataaatccacttttcgttctcaa Protospacer ***************************.**.*******
81. spacer 12.2|2123385|34|CP016106|CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gggattt--aaagatgattaatttagaaacattgtg CRISPR spacer --gatttaaaaagatgattaatttagaaacattgtg Protospacer ***** ***************************
82. spacer 12.5|2123386|37|CP016106|PILER-CR matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
gggattt--aaagatgattaatttagaaacattgtgtaa CRISPR spacer --gatttaaaaagatgattaatttagaaacattgtgtaa Protospacer ***** ******************************
83. spacer 13.10|2175024|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048665 (Clostridium phage phiCDHM14, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
cagttgctaattttagttgctgctctttatgttat CRISPR spacer cagttactaattttagtagctgctctttatgttat Protospacer *****.*********** *****************
84. spacer 13.10|2175024|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG796225 (Clostridium phage phiCDHM13 complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
cagttgctaattttagttgctgctctttatgttat CRISPR spacer cagttactaattttagtagctgctctttatgttat Protospacer *****.*********** *****************
85. spacer 13.10|2175024|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG798901 (Clostridium phage phiCDHM11 complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
cagttgctaattttagttgctgctctttatgttat CRISPR spacer cagttactaattttagtagctgctctttatgttat Protospacer *****.*********** *****************
86. spacer 13.10|2175024|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029156 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
cagttgctaattttagttgctgctctttatgttat CRISPR spacer cagttactaattttagtagctgctctttatgttat Protospacer *****.*********** *****************
87. spacer 13.10|2175024|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029153 (Clostridioides difficile strain CDT4 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
cagttgctaattttagttgctgctctttatgttat CRISPR spacer cagttactaattttagtagctgctctttatgttat Protospacer *****.*********** *****************
88. spacer 13.19|2175617|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
acaaaaatcaaacatggtgatggagctatgaatttg CRISPR spacer acaaaaatcaaacacggtgatggagctatgaattta Protospacer **************.********************.
89. spacer 13.19|2175617|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
acaaaaatcaaacatggtgatggagctatgaatttg CRISPR spacer acaaaaatcaaacacggtgatggagctatgaattta Protospacer **************.********************.
90. spacer 13.19|2175617|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
acaaaaatcaaacatggtgatggagctatgaatttg CRISPR spacer acaaaaatcaaacacggtgatggagctatgaattta Protospacer **************.********************.
91. spacer 13.33|2176537|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028838 (Clostridium phage phiCD506, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
acaaagatttagaaaaagaaaaagttaagattttaga CRISPR spacer ataaagatttagaaaaagaaaaagttaaaattttaga Protospacer *.**************************.********
92. spacer 13.33|2176537|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681538 (Clostridium phage phiCD481-1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
acaaagatttagaaaaagaaaaagttaagattttaga CRISPR spacer ataaagatttagaaaaagaaaaagttaaaattttaga Protospacer *.**************************.********
93. spacer 14.1|2482728|36|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG973074 (Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
acaattattaattgttttattagtgaaatcacagca CRISPR spacer acaattattaattgttttattaataaaatcacagca Protospacer **********************.*.***********
94. spacer 14.6|2483058|36|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
ttgatagcatagaagagatggaaaatattgatttac CRISPR spacer ttgatagtatagaagaaatggaaaatattgatttac Protospacer *******.********.*******************
95. spacer 16.4|2743975|38|CP016106|CRT matches to LN681542 (Clostridium phage phiMMP03, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
cctttatagataattttatagactctttgtatgtacta CRISPR spacer cctttatagataattttataaactctttgtatgtactt Protospacer ********************.****************
96. spacer 16.4|2743975|38|CP016106|CRT matches to HG531805 (Clostridium phage CDMH1 complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
cctttatagataattttatagactctttgtatgtacta CRISPR spacer cctttatagataattttataaactctttgtatgtactt Protospacer ********************.****************
97. spacer 16.4|2743975|38|CP016106|CRT matches to NC_009231 (Clostridium phage phiC2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
cctttatagataattttatagactctttgtatgtacta CRISPR spacer cctttatagataattttataaactctttgtatgtactt Protospacer ********************.****************
98. spacer 16.4|2743975|38|CP016106|CRT matches to LN681541 (Clostridium phage phiMMP01, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
cctttatagataattttatagactctttgtatgtacta CRISPR spacer cctttatagataattttataaactctttgtatgtactt Protospacer ********************.****************
99. spacer 16.7|2743983|38|CP016106|PILER-CR matches to LN681542 (Clostridium phage phiMMP03, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
cctttatagataattttatagactctttgtatgtacta CRISPR spacer cctttatagataattttataaactctttgtatgtactt Protospacer ********************.****************
100. spacer 16.7|2743983|38|CP016106|PILER-CR matches to HG531805 (Clostridium phage CDMH1 complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
cctttatagataattttatagactctttgtatgtacta CRISPR spacer cctttatagataattttataaactctttgtatgtactt Protospacer ********************.****************
101. spacer 16.7|2743983|38|CP016106|PILER-CR matches to NC_009231 (Clostridium phage phiC2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
cctttatagataattttatagactctttgtatgtacta CRISPR spacer cctttatagataattttataaactctttgtatgtactt Protospacer ********************.****************
102. spacer 16.7|2743983|38|CP016106|PILER-CR matches to LN681541 (Clostridium phage phiMMP01, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
cctttatagataattttatagactctttgtatgtacta CRISPR spacer cctttatagataattttataaactctttgtatgtactt Protospacer ********************.****************
103. spacer 18.5|2746438|38|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
aaaaataaaatagacaaatacctcgataaaatagatat CRISPR spacer aaaaataaaatagacaaatatctggataaaatagatat Protospacer ********************.** **************
104. spacer 18.7|2746569|38|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
ctgcttgggaagggctaaaaacgatttgctctaacact CRISPR spacer ctgcttgggaagggctaaaaacaatttgctctaatact Protospacer **********************.***********.***
105. spacer 18.11|2746833|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
gaagtggcaaatgtggagttgttattttttctagtag CRISPR spacer gaagtggcaaatgtggagttgttattttttctgatag Protospacer ********************************..***
106. spacer 19.5|2749930|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_MG266000 (Clostridioides difficile strain 7032985 plasmid pCD-ISS1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
tattttcttaatagtcagcttttccttagtggctaga CRISPR spacer tattttcttaatagttaacttttccttagtggctaga Protospacer ***************.*.*******************
107. spacer 24.6|3271001|37|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP029156 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
caataaattaaaaagtttagaaaagtttatcgaggat CRISPR spacer aaataaattaaaaagtttagaaaagtttattgaggat Protospacer *****************************.******
108. spacer 24.6|3271001|37|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP029153 (Clostridioides difficile strain CDT4 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
caataaattaaaaagtttagaaaagtttatcgaggat CRISPR spacer aaataaattaaaaagtttagaaaagtttattgaggat Protospacer *****************************.******
109. spacer 24.6|3271001|37|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020425 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
caataaattaaaaagtttagaaaagtttatcgaggat CRISPR spacer aaataaattaaaaagtttagaaaagtttattgaggat Protospacer *****************************.******
110. spacer 24.6|3271001|37|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011969 (Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
caataaattaaaaagtttagaaaagtttatcgaggat CRISPR spacer aaataaattaaaaagtttagaaaagtttattgaggat Protospacer *****************************.******
111. spacer 24.10|3271001|36|CP016106|CRT matches to NZ_CP020425 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
caataaattaaaaagtttagaaaagtttatcgagga CRISPR spacer aaataaattaaaaagtttagaaaagtttattgagga Protospacer *****************************.*****
112. spacer 24.10|3271001|36|CP016106|CRT matches to NZ_CP011969 (Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
caataaattaaaaagtttagaaaagtttatcgagga CRISPR spacer aaataaattaaaaagtttagaaaagtttattgagga Protospacer *****************************.*****
113. spacer 24.10|3271001|36|CP016106|CRT matches to NZ_CP029156 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
caataaattaaaaagtttagaaaagtttatcgagga CRISPR spacer aaataaattaaaaagtttagaaaagtttattgagga Protospacer *****************************.*****
114. spacer 24.10|3271001|36|CP016106|CRT matches to NZ_CP029153 (Clostridioides difficile strain CDT4 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
caataaattaaaaagtttagaaaagtttatcgagga CRISPR spacer aaataaattaaaaagtttagaaaagtttattgagga Protospacer *****************************.*****
115. spacer 7.13|1268249|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
aacaaaaaagatacatctgtaactaatttttatact CRISPR spacer agtaaaaaagatacatctgtaactattttttatact Protospacer *..********************** **********
116. spacer 7.13|1268249|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
aacaaaaaagatacatctgtaactaatttttatact CRISPR spacer agtaaaaaagatacatctgtaactattttttatact Protospacer *..********************** **********
117. spacer 9.4|1583893|38|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG973074 (Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
ccatcttttgttgctttacataaatttatattacttat CRISPR spacer ccatcttttgttgctttgcatagatttatattacttac Protospacer *****************.****.**************.
118. spacer 10.3|1674203|36|CP016106|CRISPRCasFinder matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
aattggaaaaagaaaaaaatagatttatttgatatt CRISPR spacer gactggaaaaagaaaaaaacagatttatttgatatt Protospacer .*.****************.****************
119. spacer 10.3|1674203|36|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
aattggaaaaagaaaaaaatagatttatttgatatt CRISPR spacer gactggaaaaagaaaaaaacagatttatttgatatt Protospacer .*.****************.****************
120. spacer 10.3|1674203|36|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
aattggaaaaagaaaaaaatagatttatttgatatt CRISPR spacer gactggaaaaagaaaaaaacagatttatttgatatt Protospacer .*.****************.****************
121. spacer 13.33|2176537|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG796225 (Clostridium phage phiCDHM13 complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
acaaagatttagaaaaagaaaaagttaagattttaga CRISPR spacer ataaagatttagaaaaagaaaaagttaaaattttgga Protospacer *.**************************.*****.**
122. spacer 13.33|2176537|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK473382 (Clostridium phage JD032, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
acaaagatttagaaaaagaaaaagttaagattttaga CRISPR spacer ataaagatttagaaaaagaaaaagttaaaattctaga Protospacer *.**************************.***.****
123. spacer 16.1|2743974|39|CP016106|CRISPRCasFinder matches to LN681542 (Clostridium phage phiMMP03, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
ccctttatagataattttatagactctttgtatgtacta CRISPR spacer acctttatagataattttataaactctttgtatgtactt Protospacer ********************.****************
124. spacer 16.1|2743974|39|CP016106|CRISPRCasFinder matches to HG531805 (Clostridium phage CDMH1 complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
ccctttatagataattttatagactctttgtatgtacta CRISPR spacer acctttatagataattttataaactctttgtatgtactt Protospacer ********************.****************
125. spacer 16.1|2743974|39|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NC_009231 (Clostridium phage phiC2, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
ccctttatagataattttatagactctttgtatgtacta CRISPR spacer acctttatagataattttataaactctttgtatgtactt Protospacer ********************.****************
126. spacer 16.1|2743974|39|CP016106|CRISPRCasFinder matches to LN681541 (Clostridium phage phiMMP01, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
ccctttatagataattttatagactctttgtatgtacta CRISPR spacer acctttatagataattttataaactctttgtatgtactt Protospacer ********************.****************
127. spacer 16.5|2744041|38|CP016106|CRT matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
gaaaagagtttgtagggaaaatatttaatgatgcaacc CRISPR spacer gaaaagagtttgtaggtaagatatttaatgatgcaaca Protospacer **************** **.*****************
128. spacer 16.5|2744041|38|CP016106|CRT matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
gaaaagagtttgtagggaaaatatttaatgatgcaacc CRISPR spacer gaaaagagtttgtaggtaagatatttaatgatgcaaca Protospacer **************** **.*****************
129. spacer 16.8|2744049|38|CP016106|PILER-CR matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
gaaaagagtttgtagggaaaatatttaatgatgcaacc CRISPR spacer gaaaagagtttgtaggtaagatatttaatgatgcaaca Protospacer **************** **.*****************
130. spacer 16.8|2744049|38|CP016106|PILER-CR matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
gaaaagagtttgtagggaaaatatttaatgatgcaacc CRISPR spacer gaaaagagtttgtaggtaagatatttaatgatgcaaca Protospacer **************** **.*****************
131. spacer 18.4|2746373|36|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JX145342 (Clostridium phage phiMMP04, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
aataattggtgatggtacaggatatacaaatgcaac CRISPR spacer aataattggagatggtacaggatatacaaatgcgat Protospacer ********* ***********************.*.
132. spacer 19.2|2749733|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP029155 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
aatttgaaggaggaagtagtatggcagcaatttatgt CRISPR spacer taaatgaaggaggaagtagtatggcagcaatttatgt Protospacer * *********************************
133. spacer 19.2|2749733|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
aatttgaaggaggaagtagtatggcagcaatttatgt CRISPR spacer taaatgaaggaggaagtagtatggcagcaatttatgt Protospacer * *********************************
134. spacer 19.2|2749733|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
aatttgaaggaggaagtagtatggcagcaatttatgt CRISPR spacer taaatgaaggaggaagtagtatggcagcaatttatgt Protospacer * *********************************
135. spacer 19.2|2749733|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP011970 (Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
aatttgaaggaggaagtagtatggcagcaatttatgt CRISPR spacer taaatgaaggaggaagtagtatggcagcaatttatgt Protospacer * *********************************
136. spacer 19.2|2749733|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LN681537 (Clostridium phage phiCD211, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
aatttgaaggaggaagtagtatggcagcaatttatgt CRISPR spacer taaatgaaggaggaagtagtatggcagcaatttatgt Protospacer * *********************************
137. spacer 19.2|2749733|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP020426 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
aatttgaaggaggaagtagtatggcagcaatttatgt CRISPR spacer taaatgaaggaggaagtagtatggcagcaatttatgt Protospacer * *********************************
138. spacer 12.2|2123385|34|CP016106|CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.882
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtg CRISPR spacer ggtttaaaaagatgattaatttagaaacattgtg Protospacer ** * ***************************
139. spacer 12.2|2123385|34|CP016106|CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.882
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtg CRISPR spacer ggtttaaaaagatgattaatttagaaacattgtg Protospacer ** * ***************************
140. spacer 12.2|2123385|34|CP016106|CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.882
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtg CRISPR spacer ggtttaaaaagatgattaatttagaaacattgtg Protospacer ** * ***************************
141. spacer 12.2|2123385|34|CP016106|CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.882
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtg CRISPR spacer ggtttaaaaagatgattaatttagaaacattgtg Protospacer ** * ***************************
142. spacer 12.5|2123386|37|CP016106|PILER-CR matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.892
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtgtaa CRISPR spacer ggtttaaaaagatgattaatttagaaacattgtgtaa Protospacer ** * ******************************
143. spacer 12.5|2123386|37|CP016106|PILER-CR matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.892
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtgtaa CRISPR spacer ggtttaaaaagatgattaatttagaaacattgtgtaa Protospacer ** * ******************************
144. spacer 12.5|2123386|37|CP016106|PILER-CR matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.892
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtgtaa CRISPR spacer ggtttaaaaagatgattaatttagaaacattgtgtaa Protospacer ** * ******************************
145. spacer 12.5|2123386|37|CP016106|PILER-CR matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.892
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtgtaa CRISPR spacer ggtttaaaaagatgattaatttagaaacattgtgtaa Protospacer ** * ******************************
146. spacer 16.2|2744040|39|CP016106|CRISPRCasFinder matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.897
tgaaaagagtttgtagggaaaatatttaatgatgcaacc CRISPR spacer agaaaagagtttgtaggtaagatatttaatgatgcaaca Protospacer **************** **.*****************
147. spacer 16.2|2744040|39|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.897
tgaaaagagtttgtagggaaaatatttaatgatgcaacc CRISPR spacer agaaaagagtttgtaggtaagatatttaatgatgcaaca Protospacer **************** **.*****************
148. spacer 17.2|2744412|39|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681542 (Clostridium phage phiMMP03, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.897
tgtactatattcatagcagttgtcatatgccgaaatgcc CRISPR spacer agtactatgttcatagcagttgtcatatgccgaaacgca Protospacer *******.**************************.**
149. spacer 17.2|2744412|39|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG531805 (Clostridium phage CDMH1 complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.897
tgtactatattcatagcagttgtcatatgccgaaatgcc CRISPR spacer agtactatattcatagcattagtcatatgccgaaatgca Protospacer ***************** * *****************
150. spacer 17.2|2744412|39|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009231 (Clostridium phage phiC2, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.897
tgtactatattcatagcagttgtcatatgccgaaatgcc CRISPR spacer agtactatgttcatagcagttgtcatatgccgaaacgca Protospacer *******.**************************.**
151. spacer 17.2|2744412|39|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681541 (Clostridium phage phiMMP01, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.897
tgtactatattcatagcagttgtcatatgccgaaatgcc CRISPR spacer agtactatgttcatagcagttgtcatatgccgaaacgca Protospacer *******.**************************.**
152. spacer 3.1|141267|29|CP016106|CRISPRCasFinder matches to KY971610 (Pseudomonas phage PspYZU05, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tgtaataagttaaagcaatatgaatcaac CRISPR spacer tacgataagttacagcaatacgaatcatc Protospacer *...******** *******.****** *
153. spacer 7.2|1267527|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK250021 (Prevotella phage Lak-B2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
tggtacactgtatataacatattattaatacttgt CRISPR spacer ataaactctgtatataaaatattattaatactttt Protospacer . ** ********** *************** *
154. spacer 7.2|1267527|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK250024 (Prevotella phage Lak-B5, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
tggtacactgtatataacatattattaatacttgt CRISPR spacer ataaactctgtatataaaatattattaatactttt Protospacer . ** ********** *************** *
155. spacer 7.2|1267527|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK250028 (Prevotella phage Lak-B9, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
tggtacactgtatataacatattattaatacttgt CRISPR spacer ataaactctgtatataaaatattattaatactttt Protospacer . ** ********** *************** *
156. spacer 7.2|1267527|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK250023 (Prevotella phage Lak-B4, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
tggtacactgtatataacatattattaatacttgt CRISPR spacer ataaactctgtatataaaatattattaatactttt Protospacer . ** ********** *************** *
157. spacer 7.2|1267527|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK250025 (Prevotella phage Lak-B6, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
tggtacactgtatataacatattattaatacttgt CRISPR spacer ataaactctgtatataaaatattattaatactttt Protospacer . ** ********** *************** *
158. spacer 7.2|1267527|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK250022 (Prevotella phage Lak-B3, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
tggtacactgtatataacatattattaatacttgt CRISPR spacer ataaactctgtatataaaatattattaatactttt Protospacer . ** ********** *************** *
159. spacer 7.2|1267527|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK250027 (Prevotella phage Lak-B8, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
tggtacactgtatataacatattattaatacttgt CRISPR spacer ataaactctgtatataaaatattattaatactttt Protospacer . ** ********** *************** *
160. spacer 7.2|1267527|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK250026 (Prevotella phage Lak-B7, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
tggtacactgtatataacatattattaatacttgt CRISPR spacer ataaactctgtatataaaatattattaatactttt Protospacer . ** ********** *************** *
161. spacer 7.2|1267527|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK250020 (Prevotella phage Lak-B1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
tggtacactgtatataacatattattaatacttgt CRISPR spacer ataaactctgtatataaaatattattaatactttt Protospacer . ** ********** *************** *
162. spacer 12.3|2123451|32|CP016106|CRT matches to AP014386 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S44-C17, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
caagaattgaggacttaaaaaatgaagttaga CRISPR spacer ctgaaattgatgaattaaaaaatgaagttaat Protospacer * ..****** ** ****************.
163. spacer 12.3|2123451|32|CP016106|CRT matches to GU943062 (Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C93 genomic sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
caagaattgaggacttaaaaaatgaagttaga CRISPR spacer ctgaaattgatgaattaaaaaatgaagttaat Protospacer * ..****** ** ****************.
164. spacer 13.11|2175088|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG592522 (Vibrio phage 1.154.O._10N.222.52.B12, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aaagatttgattttggtttctgtttatttatttata CRISPR spacer tcaaaattgattttggttcctgtttatttatttgga Protospacer *.* ************.**************. *
165. spacer 13.11|2175088|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_020850 (Vibrio phage VBM1 genomic sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aaagatttgattttggtttctgtttatttatttata CRISPR spacer tcaaaattgattttggttcctgtttatttatttgga Protospacer *.* ************.**************. *
166. spacer 7.1|1267461|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN882550 (Butyrivibrio virus Arawn, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
atgaagcttgcaaagtattctctaaagtcctctgcct CRISPR spacer ataaactgcgcaaagtatgccctaaagtcctctgctt Protospacer **.** . .********* *.**************.*
167. spacer 7.1|1267461|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN882554 (Butyrivibrio virus Idris, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
atgaagcttgcaaagtattctctaaagtcctctgcct CRISPR spacer ataaactgcgcaaagtatgccctaaagtcctctgctt Protospacer **.** . .********* *.**************.*
168. spacer 8.3|1474939|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013844 (Clostridium botulinum strain A634 plasmid pRSJ19_2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
ctagattctttctattctttttaataaattattttt CRISPR spacer taaaataatatctattctttttaaaaatttattttt Protospacer . *.** * ************** ** ********
169. spacer 12.3|2123451|32|CP016106|CRT matches to MK448892 (Streptococcus phage Javan268, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
caagaattgaggacttaaaaaatgaagttaga CRISPR spacer ttagaagtgaggaattaaaaaatgaaaattaa Protospacer . **** ****** ************. * .*
170. spacer 7.2|1267527|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448889 (Streptococcus phage Javan262, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tggtacactgtatataacatattattaatacttgt CRISPR spacer tgaaatcagttataaaacatattattgatacttgt Protospacer **. *. **** ***********.********
171. spacer 7.2|1267527|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693989 (Marine virus AFVG_250M851, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tggtacactg-tatataacatattattaatacttgt CRISPR spacer -gcagctttattatttaacatatcattaatacttgt Protospacer * .* .*. *** ********.************
172. spacer 12.2|2123385|34|CP016106|CRT matches to MK250021 (Prevotella phage Lak-B2, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtg CRISPR spacer tacatttatagatgattaatttagatacatatga Protospacer . ***** **************** **** .
173. spacer 12.2|2123385|34|CP016106|CRT matches to MK250024 (Prevotella phage Lak-B5, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtg CRISPR spacer tacatttatagatgattaatttagatacatatga Protospacer . ***** **************** **** .
174. spacer 12.2|2123385|34|CP016106|CRT matches to MK250028 (Prevotella phage Lak-B9, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtg CRISPR spacer tacatttatagatgattaatttagatacatatga Protospacer . ***** **************** **** .
175. spacer 12.2|2123385|34|CP016106|CRT matches to MK250023 (Prevotella phage Lak-B4, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtg CRISPR spacer tacatttatagatgattaatttagatacatatga Protospacer . ***** **************** **** .
176. spacer 12.2|2123385|34|CP016106|CRT matches to MK250025 (Prevotella phage Lak-B6, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtg CRISPR spacer tacatttatagatgattaatttagatacatatga Protospacer . ***** **************** **** .
177. spacer 12.2|2123385|34|CP016106|CRT matches to MK250022 (Prevotella phage Lak-B3, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtg CRISPR spacer tacatttatagatgattaatttagatacatatga Protospacer . ***** **************** **** .
178. spacer 12.2|2123385|34|CP016106|CRT matches to MK250027 (Prevotella phage Lak-B8, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtg CRISPR spacer tacatttatagatgattaatttagatacatatga Protospacer . ***** **************** **** .
179. spacer 12.2|2123385|34|CP016106|CRT matches to MK250026 (Prevotella phage Lak-B7, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtg CRISPR spacer tacatttatagatgattaatttagatacatatga Protospacer . ***** **************** **** .
180. spacer 12.2|2123385|34|CP016106|CRT matches to MK250020 (Prevotella phage Lak-B1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtg CRISPR spacer tacatttatagatgattaatttagatacatatga Protospacer . ***** **************** **** .
181. spacer 12.6|2123452|35|CP016106|PILER-CR matches to AP014386 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S44-C17, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
caagaattgaggacttaaaaaatgaagttagaaaa CRISPR spacer ctgaaattgatgaattaaaaaatgaagttaatatt Protospacer * ..****** ** ****************. *
182. spacer 12.6|2123452|35|CP016106|PILER-CR matches to GU943062 (Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C93 genomic sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
caagaattgaggacttaaaaaatgaagttagaaaa CRISPR spacer ctgaaattgatgaattaaaaaatgaagttaatatt Protospacer * ..****** ** ****************. *
183. spacer 24.10|3271001|36|CP016106|CRT matches to NZ_CP024656 (Bacillus cereus strain MLY1 plasmid pMLY1.2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
caataaattaaaaagtttagaaaagtttatcgagga CRISPR spacer tcctaaattaaaaagtttagaaaaatatattgctca Protospacer . *********************.* ***.* *
184. spacer 25.1|3271113|37|CP016106|PILER-CR,CRT matches to NZ_CP020003 (Bacillus thuringiensis strain Bacillus thuringiensis L-7601 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
tatctgaaaaaataagattttcgcctttcaaaacttt CRISPR spacer tatctaaagaaataagattttcgccttctctaaagct Protospacer *****.**.******************.. ** .*
185. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026282 (Klebsiella oxytoca strain KONIH2 plasmid pKOR-e3cb, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
186. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026276 (Klebsiella oxytoca strain KONIH5 plasmid pKOR-ab4d, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
187. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_LN824135 (Klebsiella pneumoniae genome assembly MS6671.v1, plasmid : _Plasmid_B_Kpneumoniae_MS6671) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
188. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028954 (Klebsiella pneumoniae strain AR_0141 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
189. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020842 (Klebsiella pneumoniae strain KPN1482 plasmid pKPN1482-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
190. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022274 (Citrobacter freundii strain 18-1 plasmid pA18-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
191. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to MN310380 (Raoultella ornithinolytica strain 170602815 plasmid p602815-NR, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
192. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033823 (Klebsiella sp. FDAARGOS_511 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
193. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP042513 (Serratia marcescens strain E28 plasmid pE28_001, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
194. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026397 (Klebsiella pneumoniae strain KPNIH48 plasmid pKPN-10f7, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
195. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024516 (Klebsiella pneumoniae strain KSB1_10J plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
196. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP034132 (Klebsiella quasipneumoniae strain G4584 plasmid pG4584_81.9Kb, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
197. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024431 (Klebsiella pneumoniae strain DA48896 plasmid p48896_2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
198. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NC_021198 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae KPX plasmid pKPX-1 DNA, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
199. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to CP052538 (Klebsiella pneumoniae strain B16KP0141 plasmid pB16KP0141-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
200. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP045678 (Klebsiella pneumoniae strain WSD411 plasmid pWSD411_5, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
201. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to CP052441 (Klebsiella pneumoniae strain C16KP0102 plasmid pC16KP0102-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
202. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024500 (Klebsiella pneumoniae strain KSB1_4E plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
203. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP029724 (Klebsiella pneumoniae strain AR_0140 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
204. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP034140 (Klebsiella quasipneumoniae subsp. similipneumoniae strain G747 plasmid pG747_84.1Kb, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
205. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024508 (Klebsiella pneumoniae strain KSB2_1B plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
206. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032189 (Klebsiella pneumoniae strain AR_0075 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
207. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to CP052499 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid pB17KP0021-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
208. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021698 (Klebsiella pneumoniae strain AR_0158 plasmid tig00000183, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
209. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024483 (Klebsiella pneumoniae strain INF322 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
210. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026716 (Klebsiella oxytoca strain AR_0028 plasmid unitig_1_pilon, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
211. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to CP052243 (Klebsiella pneumoniae strain E17KP0019 plasmid pE17KP0019-2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
212. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014763 (Klebsiella pneumoniae strain KPNIH39 plasmid pKPN-332, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
213. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044111 (Klebsiella michiganensis strain FDAARGOS_647 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
214. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to CP052337 (Klebsiella pneumoniae strain D17KP0018 plasmid pD17KP0018-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
215. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016810 (Klebsiella pneumoniae strain DHQP1002001 plasmid p_IncFIB_DHQP1002001, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
216. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_MH056209 (Enterobacter cloacae strain NRZ-10170 plasmid pNRZ-10170-LMB-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
217. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032893 (Enterobacter kobei strain WCHEK045523 plasmid p1_045523, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
218. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_KY271406 (Klebsiella pneumoniae strain H150820806 plasmid pKPN3-307_TypeC, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
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219. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018351 (Klebsiella pneumoniae strain CAV1417 plasmid pCAV1417-185, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
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220. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050074 (Enterobacter kobei strain 070 plasmid p070, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
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221. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050837 (Klebsiella pneumoniae strain Bckp021 plasmid pBckp021-3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
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222. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_KX839208 (Klebsiella pneumoniae strain KP1814 plasmid pKP1814-2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
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223. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023418 (Klebsiella pneumoniae strain 1050 plasmid pKp1050-2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
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224. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026237 (Citrobacter freundii complex sp. CFNIH3 plasmid pCFR-9161, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
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225. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP015502 (Klebsiella pneumoniae strain SKGH01 plasmid unnamed 2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
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226. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP025213 (Klebsiella pneumoniae strain HZW25 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
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227. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012571 (Klebsiella pneumoniae strain UCLAOXA232KP plasmid pUCLAOXA232-5.X, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
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228. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026208 (Escherichia coli strain ECONIH5 plasmid pECO-109b, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
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229. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP036193 (Klebsiella pneumoniae strain BA34918 plasmid pIncFIBpQil, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
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230. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026179 (Klebsiella pneumoniae strain KPNIH49 plasmid pKPC-224e, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
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231. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to CP052526 (Klebsiella pneumoniae strain B16KP0177 plasmid pB16KP0177-2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
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232. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP019689 (Klebsiella quasipneumoniae strain SNI47 plasmid pTMSNI47-2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
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233. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028551 (Klebsiella variicola strain WCHKP19 plasmid p3_020019, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
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234. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NC_022609 (Klebsiella pneumoniae strain N11-0042 plasmid pKp11-42, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
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235. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048380 (Klebsiella variicola strain 118 plasmid p118_A, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
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236. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012566 (Klebsiella pneumoniae strain UCLAOXA232KP plasmid pUCLAOXA232-5, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
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237. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035907 (Klebsiella pneumoniae strain BA4656 plasmid pIncFIBpQil, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
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238. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026212 (Citrobacter sp. CFNIH10 plasmid pCIT-a850, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
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239. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013340 (Raoultella ornithinolytica strain Yangling I2 plasmid pKPYL2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
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240. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011634 (Klebsiella oxytoca strain CAV1374 plasmid pCAV1374-228, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
241. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024509 (Klebsiella pneumoniae strain KSB2_1B plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
242. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018361 (Klebsiella oxytoca strain CAV1752 plasmid pCAV1752-278, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
243. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026234 (Citrobacter freundii complex sp. CFNIH4 plasmid pCFR-4109, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
244. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021758 (Klebsiella pneumoniae strain AR_0138 plasmid tig00000001, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
245. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to MK649823 (Klebsiella pneumoniae strain BA6740 plasmid pBA6740_1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
246. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_KY271404 (Klebsiella pneumoniae strain Kp-48 plasmid pKPN3-307_typeA, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
247. spacer 6.1|972969|35|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_MF788070 (Raoultella ornithinolytica strain 23141 plasmid p23141-2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttca CRISPR spacer atcacctccggtaataagtcagctgcaataaatca Protospacer .* ********************* ***
248. spacer 7.2|1267527|35|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT708547 (Klebsiella phage Muenster, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tggtacactgtatataacatattattaatacttgt CRISPR spacer ccaagcgttttatataaattattattaatacttgt Protospacer . . .*..* ******* ****************
249. spacer 7.7|1267853|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LT599585 (Pseudomonas veronii 1YdBTEX2 genome assembly, plasmid: PVE_plasmid) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
aatataatt----ataacacaggagttccttaaatgaaaac CRISPR spacer
----cggtttcaggtaacacaggagttacttcaatgaaaac Protospacer
...** .************* *** *********
250. spacer 7.7|1267853|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP027480 (Pseudomonas koreensis strain P19E3 plasmid p3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
aatataatt----ataacacaggagttccttaaatgaaaac CRISPR spacer
----cggtttcaggtaacaaaggagttacttaaatgaaaac Protospacer
...** .***** ******* *************
251. spacer 10.2|1674138|36|CP016106|CRISPRCasFinder matches to MK605244 (Nodularia phage vB_NspS-kac65v162, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
atgcctacgtattgtttaagcgaaaaaaattattgt CRISPR spacer atctaagtatattgtttaagcgctaaaaattattga Protospacer ** . ...************* ***********
252. spacer 10.2|1674138|36|CP016106|CRISPRCasFinder matches to MK605242 (Nodularia phage vB_NspS-kac65v151, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
atgcctacgtattgtttaagcgaaaaaaattattgt CRISPR spacer atctaagtatattgtttaagcgctaaaaattattga Protospacer ** . ...************* ***********
253. spacer 10.2|1674138|36|CP016106|CRISPRCasFinder matches to MK605243 (Nodularia phage vB_NspS-kac65v161, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
atgcctacgtattgtttaagcgaaaaaaattattgt CRISPR spacer atctaagtatattgtttaagcgctaaaaattattga Protospacer ** . ...************* ***********
254. spacer 12.2|2123385|34|CP016106|CRT matches to LN866850 (Staphylococcus capitis CR01 plasmid CR01, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtg CRISPR spacer tttatttgaagatgattattttagaaaacttagt Protospacer ****.********** ******** **.
255. spacer 12.2|2123385|34|CP016106|CRT matches to NZ_CP030248 (Staphylococcus epidermidis strain CSF41498 plasmid pCSF41498_2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtg CRISPR spacer tttatttgaagatgattattttagaaagcttagt Protospacer ****.********** ******** **.
256. spacer 12.2|2123385|34|CP016106|CRT matches to NC_005004 (Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 plasmid pSE-12228-05, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtg CRISPR spacer tttatttgaagatgattattttagaaagcttagt Protospacer ****.********** ******** **.
257. spacer 12.2|2123385|34|CP016106|CRT matches to NZ_CP034116 (Staphylococcus epidermidis strain CDC121 plasmid pSTA481, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtg CRISPR spacer tttatttgaagatgattattttagaaagcttagt Protospacer ****.********** ******** **.
258. spacer 12.2|2123385|34|CP016106|CRT matches to NZ_CP053076 (Staphylococcus aureus strain SA01 plasmid pSA01-tet, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtg CRISPR spacer tttatttgaagatgattattttagaaagcttagt Protospacer ****.********** ******** **.
259. spacer 12.2|2123385|34|CP016106|CRT matches to NZ_CP034113 (Staphylococcus epidermidis strain CDC120 plasmid pSTA492, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtg CRISPR spacer tttatttgaagatgattattttagaaagcttagt Protospacer ****.********** ******** **.
260. spacer 12.3|2123451|32|CP016106|CRT matches to NZ_CP012103 (Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-4, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
caagaattgaggacttaaaaaatgaagttaga CRISPR spacer tgccgtttgaggaatttaaaaatgaagttatt Protospacer .. . ******* ** *************
261. spacer 12.3|2123451|32|CP016106|CRT matches to MG592614 (Vibrio phage 1.248.O._10N.261.54.F1, partial genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
caagaattgaggacttaaaaaatgaagttaga CRISPR spacer tgggtattgaagagttaaaaaatgaagtagct Protospacer ...* *****.** ************** .
262. spacer 12.3|2123451|32|CP016106|CRT matches to MN856006 (Siphoviridae sp. isolate 29, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
caagaattgaggacttaaaaaatgaagttaga CRISPR spacer gccaaattgaggaattaaaaaataaaggcgca Protospacer .********* *********.*** .. *
263. spacer 12.3|2123451|32|CP016106|CRT matches to MG592518 (Vibrio phage 1.149.O._10N.286.55.A12, partial genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
caagaattgaggacttaaaaaatgaagttaga CRISPR spacer tgggtattgaagagttaaaaaatgaagtagct Protospacer ...* *****.** ************** .
264. spacer 13.7|2174827|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP028104 (Fusobacterium varium ATCC 27725 plasmid pFvar_27725, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
acaattcagaaggaataaaaaatgaacaaaaagata CRISPR spacer aatggtattgaggaatataaaattaacaaaaagata Protospacer * . * .******* ***** ************
265. spacer 13.33|2176537|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KY794641 (Staphylococcus phage vB_Sau_CG, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
acaaagatttagaaaaagaaaaagttaagattttaga CRISPR spacer acaaagattcagaaaaagataaagttagacaactgaa Protospacer *********.********* *******.. .*..*
266. spacer 13.35|2176669|37|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN855790 (Bacteriophage sp. isolate 76, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tcattgtactcgttaagtttatttgtgaaaaaatcta CRISPR spacer tcattgtacacattaagtttatttgtggtggtgttaa Protospacer ********* *.***************. .. .*. *
267. spacer 14.1|2482728|36|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045274 (Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301B, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
acaattattaattgttttattagtgaaatcacagca CRISPR spacer tgaattcttaattgttttattagagaaatacctttt Protospacer **** **************** ***** * .
268. spacer 24.6|3271001|37|CP016106|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024656 (Bacillus cereus strain MLY1 plasmid pMLY1.2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
caataaattaaaaagtttagaaaagtttatcgaggat CRISPR spacer tcctaaattaaaaagtttagaaaaatatattgctcaa Protospacer . *********************.* ***.* *
269. spacer 12.1|2123320|33|CP016106|CRT matches to CP045556 (Citrobacter sp. S39 plasmid pS39-1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.667
tttgggcttattttattgacttacaagttgagt CRISPR spacer acaaaaattattttatagacttacaagtcgata Protospacer . ... ********* ***********.**
270. spacer 12.5|2123386|37|CP016106|PILER-CR matches to MK250021 (Prevotella phage Lak-B2, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtgtaa CRISPR spacer tacatttatagatgattaatttagatacatatgattt Protospacer . ***** **************** **** .*
271. spacer 12.5|2123386|37|CP016106|PILER-CR matches to MK250024 (Prevotella phage Lak-B5, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtgtaa CRISPR spacer tacatttatagatgattaatttagatacatatgattt Protospacer . ***** **************** **** .*
272. spacer 12.5|2123386|37|CP016106|PILER-CR matches to MK250028 (Prevotella phage Lak-B9, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtgtaa CRISPR spacer tacatttatagatgattaatttagatacatatgattt Protospacer . ***** **************** **** .*
273. spacer 12.5|2123386|37|CP016106|PILER-CR matches to MK250023 (Prevotella phage Lak-B4, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtgtaa CRISPR spacer tacatttatagatgattaatttagatacatatgattt Protospacer . ***** **************** **** .*
274. spacer 12.5|2123386|37|CP016106|PILER-CR matches to MK250025 (Prevotella phage Lak-B6, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtgtaa CRISPR spacer tacatttatagatgattaatttagatacatatgattt Protospacer . ***** **************** **** .*
275. spacer 12.5|2123386|37|CP016106|PILER-CR matches to MK250022 (Prevotella phage Lak-B3, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtgtaa CRISPR spacer tacatttatagatgattaatttagatacatatgattt Protospacer . ***** **************** **** .*
276. spacer 12.5|2123386|37|CP016106|PILER-CR matches to MK250027 (Prevotella phage Lak-B8, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtgtaa CRISPR spacer tacatttatagatgattaatttagatacatatgattt Protospacer . ***** **************** **** .*
277. spacer 12.5|2123386|37|CP016106|PILER-CR matches to MK250026 (Prevotella phage Lak-B7, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtgtaa CRISPR spacer tacatttatagatgattaatttagatacatatgattt Protospacer . ***** **************** **** .*
278. spacer 12.5|2123386|37|CP016106|PILER-CR matches to MK250020 (Prevotella phage Lak-B1, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
gggatttaaagatgattaatttagaaacattgtgtaa CRISPR spacer tacatttatagatgattaatttagatacatatgattt Protospacer . ***** **************** **** .*
279. spacer 24.8|3270870|35|CP016106|CRT,PILER-CR matches to MN693428 (Marine virus AFVG_25M81, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
tcaagttagaaaatatgttagaaattttgttagtt CRISPR spacer atcaccagtaacacatgttagaaattttgttagtg Protospacer . * . . ** *.********************
280. spacer 25.12|3271838|37|CP016106|PILER-CR,CRT,CRISPRCasFinder matches to NC_010418 (Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
tttgttatatgataagtttaaaatattataaagtttg CRISPR spacer atatttatatgataagttaaaagtattatatacacaa Protospacer * ************** ***.******* * . .
281. spacer 18.9|2746702|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_009466 (Clostridium kluyveri DSM 555 plasmid pCKL555A, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.676
gaattaaaagataacaaaaaaataatggaagaaggtt CRISPR spacer tcctctggagataagaaaaagataatggaagaagtgc Protospacer *. ..****** *****.************* .
282. spacer 18.9|2746702|37|CP016106|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_011836 (Clostridium kluyveri NBRC 12016 plasmid pCKL1, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.676
gaattaaaagataacaaaaaaataatggaagaaggtt CRISPR spacer tcctctggagataagaaaaagataatggaagaagtgc Protospacer *. ..****** *****.************* .
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
206142 : 293077
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP016106|206142:293077|DBSCAN-SWA TATGAACAAATCATGGAGCAACTTGATTATTAAGAATAAAGACAAAAAAGTACGTTCAGGGTGGATTATTATAGCTGTTATGGCTACCTTTTACATATTTCAGTATTATTTAAGCATGATACTTGTGGAAATAATAAGAAAAATCCTGGTTGCTACAGGGGACATTAATTTAAAAACAAACTATTTTTCAGAATATGCTAATTGGTTAAATGATGTTGGGTTACAGATTGTATTTCAAATTCTAACAGATTCACTTATGATTATTATTCCTATAATTGTATGGAGATTTATTATGAAAAATCCTATTAGTGAAATGGGATTACATTCTTATAGAATTAAGAAAAAAGAAGGATATGTAGGAATGTTATTAGGAATATTTAATTGTACAGTAATCTTTATTATAACAATAACAATTGGTGGTGGTCATGTTACTTCATGGGTACCAAAAATTTCACCTTTAACAGTTTCTTGGATACTTGTCTTTATTTTAGTTGCTTTTGCAGAAGAAATTTTAAATCGTGGTTTTTTTATGGCAGTTTTACGAAGATGTAAAAATATTTATTTTATAATGATTGTTCCATCTGTTATTTTTGGGTTGATTCATATATGGAATCCTGATGTTACTTTTTTGTCTGTAATTAATATTATAATTATTGGGATTCTTTTTTCATATATGTTTATAAAGTCGTCGAATATATGGATGTGTATAGGTTATCATTTTACATGGAATGTATTTCAGGGGATTATATATGGTATGCCTGTAAGTGGACTTCAGGTTCCAGGGATTATAACTACACAAATCACTCATGGTAATCTATTAAATGGTGGTATGTTTGGTATTGAAGGTGGAATTTTGACTACTTTTGTTAATCTACTTAGTTTTATATTTGTATGGTATTACTATAGAGATTCTAAGTATGATTTTGTTAGTGATAAAGTAAATGTGACCAATATCAAGAATTAGTTGATTATAATAAATTTTAATAATATCTTCTAAGCTTAAAGTATTCTGTAGGATTGTTGGAAATTTACAAAAATATAAAAATAACTTGGATATTCTATTTACTCCAAGTTATTTTTATATTCTTTTGTAAATAGAAATGGAACATAAAAAATTAAAACAACCATAGATACTATTAGTATATCATGGTAAGTGATAGTTGATTCTTTAGAATTTGTGATAAGAAAAGCACTATTATTTAAAACATGAATTATAGCACAAAACCAGATATTCTTAGTTTTTATATAAAGATATCCTAAAAATATTGAAATTCCAACTATATGTATTGAACGTAATATTATTCCTAATATTGGCGCTTCAGGTGTATATAATGTAAATATTAGTGGTAAGTGCCACAAGCTCCAACACATACCTAATATTATAACTCCTAACTTTTTACCAAATTTATCAAAAAAAATATTCTGTAAAAAACCTCTCCAGGCATATTCTTCACTAAAAAAAATATAAATAGTAGTTAATGATGTTATTGGAGTAAATATAAATTTTATGATACCACTATAATTAGGTTGAGCCCCTTGTAGTATTAGTATAAATGATGTTGGAACAATTACAGAAATCATAAAGTAAATAATTAATAAAGAACCTAGTTTAATATTTTTTACAGGATATAAATTTTTTTTATTTGATGAATATATTATAATTGATAAGCTACTTATAAAAGTTAATATTAGGTTTATAATTATAAATTCATTATTATTTATTAGATTTAATAACTTAAGAACAATTAATAATGAATAAATAAGAAAAAATAATATGATTAGTGAATAAAATTCATACATATCATTATTTAATCCTTCAGTATAAAACTTTGCAATAGCAACTGAAGATAGAGGTAATATCATCATGAATGATGCAAAGTTTTCTGGATCAATAAATTTATTATAATATAACAGTAAACCTAATGAATAAGTTAAACCAAAGTTTATAAAGAAAAAGATAATAATTTGTATTTTTTTTCTTTTTATTTCATTTTTAATAAATACTGGGTTTAGAATATTTATCCATATTAATTTTAAGTTCATTAATTTAATACTCCTTTACAATATAGATTCTTAACTAAATTAAAATATTTTATTGAATATTATAAATTCATGACAGTCAATATTATTGAAAAGTAACTTATAAAATTATATATAAATAATAAAATTAATTTTACTATCTACCCATATATTTAGTTATATTGCAGGCAGAATGTGGTTTACCATAACCAAAAGGACAATAAAAAATATTTTTCTATATTTTTATTATTTTTTTGTAAAAGATTTATTATTTATTGCATTAAATTAATAGGCAGTAGAGGCATAGTTGATAAAATTAATGAAGAAATTAAACTTATGAATATAAATTTATTATTGAGTTTTAATATTACATTTATTATTCTCTTTGATTTTAATATTTTATATTTAATAATTATTACATTCGTCTGGTTAATAAATAATAATTAAATAAATCAAATGATTTTAATTTACTATATGATTATAATATAGCGTTGATTTTTTATGATTTCAATAATTTCCTATATACAAAATAATACAAAAAATTTATTAAAAAGTTAGTTTATTATTTTATTTATAAAAATTAGGATGAATTTGTAATGTTAATATCAAAAAAATAAATATAAATATCAAAAATAAATTTATTTAAAATTAAAATTTTATTTATTATTAAAGAGTAAATATAATTATTAGTAATATATATAGTATTTGTAACAAAATATCAATAATTAGAAAGATTATGAAAACTAAATTAGAAGAACTAAAAACTATATTTTTATTAATTATAATATTTGAATAATCTTTTTAATCATATAAAATGCATATACTTGTAATATTTAAAGGTGATATTAATATTATTAGTGTATATTAATATTCCCTTGAAATTAAAAAAACATAGATATTTCAGTAATCTAAAATAGTCTACAAAAATAATAGTTTTATCAAAATTAATAAGAATACATATAGATTTAAACCTAAAAGTATGAACATGTCTGTTTTTTACAAGATTAAAATTTATATTATATGATAAAATTAACTTAACTATTTCAATAAGACTTATAATTTTTTTCTTTATACTAGACCTTATTGAAACCTTTATAGTTTAATTCTAATTATATATTATAAATAAAGTATGTGTATATTAAGGAGGTAATATGAAGTTTTTAAATGTTTTAATAGTAGTTGAAGATATTGAGAAATCAAAAAAGTTTTATTATGATGTTTTGGGGTTAAAGGTAATCTGTGATTTTGGAGAAAATGTTGTATTAGAAGGTAATATATCATTACAAGAAAAAAAGCTTTGGTTAGAATTTATTAATAAGAGTGACAGTGAAGTTAAGTTCAATGGAAATGATGCTGAGTTATATTTTGAGGAAGATAATTTTGATACTTTTGTTGAAAGATTGAGTTCAATGAAAGATATAGATTATGTTCATCTAGCTATAGAGCATAGGTGGGGTCAAAGAGCAATTAGATTTTATGATTTAGATGGGCATATTATTGAGGTTGGAGAAACTATGTCATATGTGTGTAGACGTTTTTTAGATAGTGGTCTTTCAATAGATGAGGTAGCTAAAAGAATGGATGTAACTGTCGAATATATTGAATCAGTTTTAGAATAGATGGATTATATTAAAGTAAAACTATATTTTGTATAGAAGTAAGGGCTGTAAGTAAACTTGTATGGAAACAAATTTACTTACAGTTTTTGTTTTTGTAAGATACAGAATATAATATTTGTTATAATTTTATTTGGATTTTTAAAAAGTGCATGATTTTCCTTACATATTATAATAGAATTTAATATTTATTGGATGATTTAAATTTAGAAAAATATAAGTATTAGCTTATAAAAGATAATTATACTTACTATCAAGCTGTAGAATCATATATACTATTTTATGTAATTATGTTAAAATTTAATTGAACAAATTAAAAATATAGTGAAAATTGTAGTTTTAGTTTATTTATTTAATAAATATTTCAAATAAAATAATGTTTAAATAAGAAACATAAATAATAATATTATTATTGTTCTTAAAGACAAAAAATCTTAGCTTAAAAATTTGTATCATATAAAATCCCTACATATTATGGAAGTAATGATACATTATATGATATACACAATAAAGTATAAAAGTATTTACATGTTTTTTCTATATACTTTATAAGTTTTAGGTATGGAAAATTACTAAATAAAAATTAGATTAATGATTATGATAGTATAGATAAAGTTTATTCTTTTTATTAATAGAAATTGTTGTATAAAAATAATAAAAGTGAGGAGAGTGATATTTAAATAAAAAAATTTTAATAAGTATTGGTAATATAGTTTTTAGGGATGATTATTTTATGTAAAAAGTTGTTATTTGTAAAGATAAATATAGAAAATATTATAAGTATTGATTTAGTGATAATCTAAAAGGTGAGAATTGTAATAAAAAGAGAACATATCCTTCAAATGGATGTAAACTTATAAATAACATTATTACAAGAGATTTATTATACATATACTGCAACTATTAATTAGAATTTATACTGTATTTGTATTTAAATAAAAACACAAATAATATTATTGTAAAAATTTATAATTATTAAATATTTAAAGTACAAGATATAATAATTATAAGTAATTTATGTATAAATGTATAAAATATAGATATATTTAGATTAAATAATAATTATTATTATACAAAAATTTTGTATTAAAAAATATCTTTAAATTTGAAATATAATAAATGTTAGATAGAATTTTATAAAATTTAAAATAAAAAATTATATAAGGGGTGTAATATGATTAATATTATTATTTGCGAAGGTAAAAAATCAGAGAGGGTAATTCTAAATGATTATATAAATACCTTTTTTTATAATTACAATTTTGAATATAATATCAAAGAGTTTGAAAATGGAGGCGATTTATTAAAAAAGTATCCTAATAATGTTGATATCATATTTATGGATATAGACTTAAATGATGAAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP016106|206142:293077|250137_251628_+|AXU52098.1|DBSCAN-SWA MGVIGTIFLFYLIISYLAGAIISVIILLENRDPAKTMSWLLMFIIFPGVGLMIYAISGRNIRKRKLFKTQKLANNIKEKKLFDTLEKITEIVELEKESIKQNKLLRDEEDGSYRKRVINMLLKTGMFPFTKNNKVDVFVDGNEKFKRLIEDIREAKDHIHLEYFIIKDSEIGRVLKEELIKKAKEGIKIRILYDDVGCWRFWFNRKFFREMREVGIEIAAFLPTKFPIIGGKLNYRNHRKIVVIDGIIGYTGGINIGDEYLGKNDKFGYWRDTHIRIKGISVYMLQMTFLIDWYYTTKEVLVTKNYFPSVGNVGESMIQVVASGPDSDWEDIHYAYFSAICQARKNVYIETPYFIPDESLLKAIKSAALSGVDVRIIFPKIADHKIVNIASYSYFEEILRAGGKVYLYNKGFIHSKVVIIDDKIASAGTANMDLRSFMLNFEVNAFIYDEEVIRVMTDDFFEDLSHCEELNLEVFKNRNIIQKIKESVARLFSPIL >CP016106|206142:293077|232891_234118_+|AXU52083.1|DBSCAN-SWA 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>CP016106|206142:293077|246841_247732_-|AXU52095.1|DBSCAN-SWA MFEELKTFVAVVEYKNFTKAGEYLNLSQPSVSKHIKNLENYFKVVLINRSIKQKTIFITESGQILYKRAKEILNLLNITYHDVSQVSDAITGHLKIGASLTIGEYILPNFLALFSKKYPDIDVEVFIKNTSIVSSHVKDYILDIGLIEGTCSSPSFIQEYFFEDKMVLALPYKSHLLKDFSFDKLQNQKWIVREDGSGTRDYLDMFLSVKEIIPKSMMVFGSNYAVKESVRNNLGITIVSNLVTSLPVLNNELSVIELGSSYNRHFSYIFPKDITLSKAATIFIEELKIFSNLNSI >CP016106|206142:293077|234256_235444_-|AXU52084.1|DBSCAN-SWA MNITKNFLKDYLERFGETPFLVRLKDEEEFLIGEGSPQFKVIVNNDISKSELLKSTSLALGEAYINRDIEVEGDLFLTLNLLLKQIDKFNIDNSAVKHLLHSSNSMRHQKKEIHAHYDIGNDFYSLWLDKTLSYSCAYFRNDNDTLYDAQVNKVHHILTKLNLEEGMSLLDIGCGWGFLLIEAAKKYKIHGVGITLSEEQFKEFNARIKEENLQDYLEVRLMDYRELKKSDLMFDRVVSVGMLEHVGRENYELFIKNVNAVLKDGGLFLLHYISGLQESYGDPWIKKYIFPGGVIPSLREMIHICSDYKYHTIDVESLRLHYVKTLLYWQKNFSENLPKIKEMFDDKFIRMWDLYLCSCAAAFNTGIIDIHQILFTKGIKNDLPLTREYMYNCSK >CP016106|206142:293077|216568_216772_+|AXU52069.1|DBSCAN-SWA MSFGKRIEMNNIGVETRGVCTIMCPYTCKMMASSSCNCKNNDYNARGGSYNTYYNKLIHGQRTPDGM >CP016106|206142:293077|215180_216251_+|AXU52067.1|DBSCAN-SWA MEKVLIYPFNYNFFTILNHCNKISDIEINSLVSPSGWGLCNKEYNVNNIITKVTNDFQSELKKNSLVWFVDSKENLDLEKFIIPKLKVALKEGKKILYTRDDLNKISRYISHYEFKKINEWNLEKYEIRDIEGISQINTPIIFICGLYGGLDTFDVNIRIGEELRKRGFSILQFGPKKESYLFKMIPIPEFMFDDSISSKTKIINFNHFIKDKEVEAKPDLIIIEVPGELFPFSRKMVGNFGIRAFEISNAVINDCGILCIPSSIYDREYCEELKYFIKGRHGINIDYFSIEKKVIDTYETEVKQKFSYMSLDENFFVEDIEDYEKIFFIHDNKQLLELVDNIVNQLKEYAKVISI >CP016106|206142:293077|269873_270326_+|AXU52111.1|DBSCAN-SWA MNKLVNVKCSFKIHVNSKEEAIISLVDVVSKEGYLIDKNQFLKDVLKREETLSTYIGHGIGLPHSQSVGVKNSCITIGKLDTPIEWTEEGEKVDLIFLISVTKDNENNLHLKILSKLARLLMHESFRNQIRCSDEQTVYNLIKEKIEEED >CP016106|206142:293077|261609_265038_-|AXU52108.1|DBSCAN-SWA 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73 | Clostridium_phage(11.11%) | transposase,protease,coat | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
1401620 : 1425993
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP016106|1401620:1425993|DBSCAN-SWA 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29 | Clostridium_phage(54.55%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1505431 : 1515158
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP016106|1505431:1515158|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP016106|1505431:1515158|1506017_1507367_+|AXU53191.1|DBSCAN-SWA MIREINTKLNSFEIFTIFRNEHDSFILDSAMDKEKLGRYSFISSQPFKVLKYKDTDENPLEVLKEELHKYRVVNDTNLPFVGGAVGYLSYDLGNYIENLPRTAVDDIEMPDMYFGFYNHVIVIDHLVQKTYIATPNIDIELEEKIIDDIEQRILKEEKKGIDSICYEEKEVTPIRLKSNFTKEEFKNAVQSVREYIRQGDIYQANLTQRFSGETELTSFELYRDLRRFSPAPFGAFLNFEDAHILSNSPERFIRCVNKRIETRPIKGTRPRGKDKEEDLRLQQELRNSEKDRAELLMIVDLERNDIGRISKTGSVKVPELFVIEPYANVNHLVSTVVGELKDDKDATDVIKATFPGGSITGAPKIRAMEIIDELEPTQRNVYTGSIGYIGFNGDMDFNIAIRTIIKNDKKVYFQVGGGMTWDSDPDEEYQETLDKAKSIMKALRGYYEE >CP016106|1505431:1515158|1505431_1506016_+|AXU53190.1|DBSCAN-SWA MILMIDNYDSFVYNLVQYIEELGETVVVKRNNEIKISDIEELNPEVIVLSPGPCSPKEAGICIDIVEHFKGKKPILGICLGHQTIGHVFGGDIIKAQQPVHGKVYSINHTNKGVFRGLKNPLNVTRYHSLIVDSNTVPKELEITAITDKGEIMGIRHKKYLIEGVQFHPEAILSEYGHEMLKNFITEARERVHM >CP016106|1505431:1515158|1510298_1510664_+|AXU53196.1|DBSCAN-SWA MDKILLSNLGFYGYHGVLKEENFLGQKFFVDMELYIDSREAGLSDDINKSVSYAEVYNVVKDITENKQFNLLEALAENIAEEVLNKFILINGVMVRVRKPEAPVNGIYDYFGVEIRRTRDE >CP016106|1505431:1515158|1508860_1509433_+|AXU53194.1|DBSCAN-SWA MNKVDKEKIQHAVREILEAIGEDPDREGLIETPNRVARMYEEIFSGLSEEPRDHLKVLFADEKHEELVLVKDIPFYSCCEHHLVPFFGKAHIAYLPKGGRLTGLSKLARVIDTLAKRPQLQERITKNAADIIMEELQPYGVLVVVEAEHMCMTMRGVKKPGSKTVTSAVRGIFEKDIASRAEAMSLITMK >CP016106|1505431:1515158|1511143_1511929_+|AXU53198.1|DBSCAN-SWA MKENLFNNNSKIEINTNNKKITVKKDKLIIAGPCAIESYEQLLETAKFVKSQGANILRGGAYKPRTSPNSFQGLKKEGLEILKAVKDEVGMAVITELMDVRDMDELYSISDIIQIGSRNMQNFTLLSEVGKQNKPVMLKRGIASTITEWIGASEYIAIEGNSNIIMCERGIRTYNDYTRNTLDLAAVPIIQKETGLPVVVDPSHATGVRYLVKPMSLASFACGADGIMVEVHPDPENALSDGAQSLCFNEFEDLMKSINNY >CP016106|1505431:1515158|1510656_1511163_+|AXU53197.1|DBSCAN-SWA MNKAYLGIGTNMGDRFDNLSRACELLKNSDSIYKVKESSLYETKPWGYTEQADFLNMCVEIETEFEPYELLEYCQEIERELHRERIVHWGPRTIDVDVLFFNDVVSTDERLTIPHPRIQDRAFVLIPLMDLNEKLIINEKTIKEHLNLLSAEEREEVKELVGYERKPI >CP016106|1505431:1515158|1512183_1513974_+|AXU53199.1|DBSCAN-SWA MNDIKDIIEEIKARCDIASIISEYMNIKQSGANYKGLCPFHGEKTPSFYINTSKQIYKCFGCGEGGDVINFVMKMENLDFMDAVKILANKCGIEINTNMNEETRIKIEKSKKFQDIHTEAARFYLSNLLGSKNLGYEYLRIRGLDDKIIKKFGLGFSLDSWNSLMNTLISKGYKKQDLLECGLIAKNRDGTNCYDKFRNRVMFPIFDYRGNIIGFGGRVLDDSLPKYLNSPDTLIFNKKQNLYGLNFARKNLESKTIVLVEGYMDLISLYQYGIKNVVATLGTALTEQQGILIKRYADTAIISYDSDEAGIKATLRAIDILTKLGINVKVLDLKDAKDPDEFVRKYGLSDYKKAMDVSTHYIKYKIDHLKKEFNIQKDEERVKFAKEASKIIKQLTSPVEIDFYTKYLSNQIDINVESIKREVYGKNYNKPYNNKNQKKIEEKVIEKVEVRQDGKQLVEETLIKIMLEDKKIREIALLKVEESDFLLKESKEILNYMIKNQELDKITIDKLKSLNISEEYLKELNSISLNSINLENTKEIEGIITNIRKNSLEEQINSLLREQQELENNNDMKEVDGRVMEIALKIVEINKILKSL >CP016106|1505431:1515158|1513991_1515158_+|AXU53200.1|DBSCAN-SWA MENKSNKKELKKVTAKTLIEKGKKQGSLTLAEIMEAFSETELDKDQVENLYETLGNLGIEITETKNYKADIDFSVADDDLSIGHLDEDAEAISHDDSSAIEIETVDLSLPKGISIDDPVRMYLKEIGKIPLLKPHEEVEFARRMHEGDEIAKQRLVEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNLGLIKAVEKFDYTKGYKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVSRQLLQELGRDPKPEEIAKEMEMTEDKVREIMKIAQDPVSLETPIGEEEDSHLGDFIPDDDAPAPAEAAAYSLLKEQIEDVLGSLNDREQKVLKLRFGLEDGRARTLEEVGKEFDVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKKLRDYLD >CP016106|1505431:1515158|1507356_1508100_+|AXU53192.1|DBSCAN-SWA MKNNVGFDSSLSKFGIGLFETIRVKNGIAVDLDIHIERMLSSINCLDLDINYKKDFLINEIVTYIKKENVINKALRITVFDEGYNISIRDIPYNQETYEKGFKLAISPIVRGNSLIHRHKTTNYFENIYTKNIANKTGYNDGIFLNSEGVILECSMSNIFFIKGERVYTPSDRLPILNGIIKKRIIEICDELHIELIENEINISEISSFDFVFVTNSLMGAIKVTEIDKIKFNKENVVFDKIVKLLE >CP016106|1505431:1515158|1508133_1508835_+|AXU53193.1|DBSCAN-SWA MIGCIYEVYNEEMTKIIENQNTLAVYLVGSSKDVDFTLYDVVINDIDVFVFVKEGEKQERILFKKKGIEFDVNYFSKDGVKKLLSNREYFFVKEMKDAKVLFDRENISHIIKDISRDIYLEGPSKMSLEEKSFIKQDIGAKISNLKNKEKFDVFEYHFLTNLYLKDIIIGYFNINDKWVPKDKKLLKVLKKENNELFELVSKVSENYDYQRLLDVYNYIFKEIETKEVIKLIF >CP016106|1505431:1515158|1509496_1510288_+|AXU53195.1|DBSCAN-SWA MFDYGKRTYIMGILNVTPDSFSDGGDFNNLDIAIQHAKDMVDQGADIIDLGGESTRPGHSYVDSDEELRRVIPVIKKLKQELDIPISIDTYKADVAEEALKLGVTMVNDVWGLRKDKNMASVIGKYDAEVCIMHNQDGTNYDKDIMESIKDFFKVSIEMAMSCGVKKEKIVLDPGVGFGKDFEQNIEVLRRLNELKDLGYPILLGTSRKSVIGKVLPVEPKKRLEGTIATTVLGIRDGVDIVRVHDVYENLMAARMTDAIYRK |
11 | Pandoravirus(37.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1639641 : 1695728
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP016106|1639641:1695728|DBSCAN-SWA 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MKNLSKKAVILSLSLVVVSPLVHKINAQDIEKNREVRYETRKANNLENMTMEEAFPDENFRKVICDKLSILDDGNPIGISQKAIIESTKGLTLGSKSIKNLSGINYFIGLENFSCRGNNLTSLDLSSNINLKELYCNENQLTSLDLSNNRELTTLHCGENNLTDLVIENSKLDELNCRKNNLKSLDITKATNLTTLLCFENELTSLNLSKNQKLKILKCDYNNLNDLDISTNLELQDLNCSFNQLENINLDNNKELVKLICHNNKLQNLNLKNHEKLVKLYCNQEQLSTLNVENCINLEDLTCSRSNLKNLDISSNKNLKYLECVANKLTNLNIENNIELLELYCYDNEIKALDISKNIDLENLTCYKNKLDSLNTSKNKNLKYLYCSQNELTSLDVTKNTELVRLYCGENRLTSLDVSKNTKLKELDWSNQKKSTSTGGSSGSGGGSSSTNEESSEPTSTPSKEKLTGVDRNETSVKISQKGWNKADNIVLINDSSISDALSATPFAKSKDAPILLTKNNNLNKLTEKEINRLEAKNVYIVGGLKSVDEKVVSDLKKKGLNVIRISGNDRYETSIKLAKELDKNSNLSKVVVVNGEKGLADAVSMGAISAKEEMPILLTNQNDDMKDIKDLIANKNISKSYVIGGESLFNNKEVNNTLPSVTKIAGSDRTETNSKVISHFYSKDTLNDLYVAKNGMNKQDDLVDALSVGVLAGKTESPVVLVGNGLDNSQKELIKNKKFKNITQIGGNGNEKAFNEVENLVK >CP016106|1639641:1695728|1666046_1666208_+|AXU53341.1|DBSCAN-SWA MNCPVCGKDVDVFDICDNCNWQNSGPKETNYKGPNKMSLKEAKEAYEKGKKVI >CP016106|1639641:1695728|1687755_1688340_+|AXU53374.1|DBSCAN-SWA MIEKLNENASLSQLITAFENSTNEIKTTKNNLTNILGNPFSEGTRFSEFETNLQTLIATFKNNLKNKNVSISDIETLESLIDKISNINAYATARGVQIRVPTDYLPYRITTNVDFTPVVAYVYCNVPIYKAGSFRYANSLHHTPGYNENGALGNGYFFNISNLDKSGFLINVGYDKLDTRPNYNDISWVVIGYK >CP016106|1639641:1695728|1695599_1695728_-|AXU53386.1|DBSCAN-SWA MGRLERRKNKRENKFNKIKNAFSFTLVLINLVLAILRLIKEL |
76 | Clostridium_phage(82.26%) | portal,holin,capsid,terminase,head,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
2386330 : 2447258
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP016106|2386330:2447258|DBSCAN-SWA CTTATAACCGTTCCATTTCAGCTCTCGCAGAACTAAATGAACCATGTGCATAATAGCCAAGCGTCATAGTAATGTTTTTATGCCCCATAATATATTGCAATATATTAGGACTCATTCCTTTGTTAGCCATATTTGTACAGAGTGTATGCCTAAAGGTATGTGGCGTAATCTTTGGTAGCTTGTCCTCATGGGTCTTGTTATACTTCTTGACTAACGCTCTTAACATGCTTTGATAATGAGTTGCTTGTTTTGGTAATCCATCTTGTTTAAGAAATAGGAAGTTCTGGTAACCATCAACAATGATTGGTTCTGCTTTAGCGTTCTTACGCCGTTCCACGATACGTTCAAATGATTGATAAGCTCTTTCAGTCATTGGAATTTCTCGCTTACCCTGTGTGGTCTTTGGAACTTCTACATAATAGCCAATCTTAGTATCACTCAACAATTGATGGTCTACCATAATGGCTTTATTTTTCATATCCAATTCTAAAGTCAAACCGCATAATTCAGAAATGCGTAGTCCTGTTTCTAAGAAGATAACAACATCATCATAATATTTACAATAAGTCTTATCGCTCTCCATAAAGAATAATAAGCCCATTTCCTGTTCTGGTGTTAGAGCGATTTTTGGTTCTGTTGTATCTTCCAAAACATCACTTAACTGAAAATTAAATGGATTCTTTCTAATACAGTCGTCTTGAATTGCCATGAAAAACGACGCTTTCAGTGAGCGCTTATAATTGTCAATGGATTTATAAGCACACCCATCTTCACTCATTCGGATAGCCCAGCTTTTAGCGTCTGATAATTTAACCATATCAATGCTTTTTGCACCTAGTGGGTCATTGATAGTATCTATATTTTGATTTATAATTTATACATTTTTTTAAAAACAGACTTTTAACTGTAAAGAATCTATGTATAAACTTAGCTATGTTGTCCGTGTATCTACAAAGGATCTTGACGAGCTAAAAAGGCGTTGTGATGAAGTCAAAGACTTTTACGACGACTTATCAATCAAGCTCGTGCGTCCCTTTGGGGATATGTTGGGATTGCATGGCGAATTTATTCCTGTCAGCAAACGTTACATCAATGATTATATTCAATATGTCACTTCGGATTTTTTGGCTGGACTTGGTTTTGGAGCGACACAAACCCTTGGCGAACATGAGGATATCTATGTTAGCTACAATCTGGACACTGGAAAGAATGTCTATCTAAAACCTGCCCTTGCTAGTCAAGGGGTAAAGGGTTCTATTACCAATGCGTTAGCGTCTGCGTTTATCGGTTCATTGGGTGGTGGTAAATTATTCAGTAACAATATGCTTGTTTACTATGCGGTACTATTCGGCGGACAGGCGGTCATAGTTGACCCTAAAGCAGAACGCGGCAAATGGAAAGAAACGCTACCAGAAATAGCCCATGAGATAAACATTGTCAATTTAACCAGTGATGATGAAAACAAAGGATTGCTTGACCCTTACGTCATTTTGAGCCGTAAAAAGGATTCTGAAAGTTTAGCGATTGATATCCTAACATTCCTTACTGGTATCTCCAGTCGTGACAGTGATAAGTTTTTGCAGAAAAATGACAACTGGAAAATAATAATGGAATAGTTTCTATGTAAATATATTTTTACTATCTTACCTAACTAATTGAAAGATGATATAATTTAATCAAAGATTTGGTAAGGAGGGATGAATATGCATTTAATTGATTTTATGAATGAAGATATTAAAAAGAAGCTTGTTAAAAAAACGTATAAAAAGAAAGAGACTATTCTTTTTGCTGAGCAAGAAAATGAATATGTAATTCTTATGATTGACGGTATTGCAGAAGCATTCATCTTAAATGTGAAAGGAAACATCTCAACTATTCATCTTTATAGAAGTGGTAGTTTTTTTGGAGAAATGGAACAATTTAATGATGGGAAAAAACCCGTTGAAATTGTCGCTTTCACAGATTGTAATGTATATAAACTTCATAGAGATGATTTTTTAAACTGGTTAAGGGGAGATTTTGAAGCTACAAAATTTCTGATTCGAGAAATATCTAGTAAATTAGTTGTAAATGCTGAATTAATTGAAGAATTATCATCTTTAAGTGTTAAAGAACGACTTCTGAGGTGTATATCCTTACACTATTATAGAAGTGAATTAAATCTGCTTACCAAAAAACAGCTTGCTAGCGAAGTAAACGCTCCAATTAGAAGCATTAATCGTGCTATAAATGAATGTGTACAAGAACATCTAATTGCTTATGAAAACAAAAGATTCAGTGTAATTAATCAGCGAGAGGTATTAAAGAATCTTCCTACAACATAAGTATAATTTCAAAAAAGTATTGGATAATAATTATTCAATACTTTTTTATTTTGGGTCAAGTGACCTATTTTTTTTTATTTCTTCATTATATAATACTCCTATGCATAATTATGTTGGATTGATAGCTAATAAAAGAAAGTGAGAGGTGTTATACTAAAAAAGAAGCATACTTCCCAACTCCAGACTTACAGTGGATTGAAGATAGATTTTGGATTTGGGTTCATTACGCTTGCACTAAGATTGGACGTAGAGAACTATTTGAAACAATTGATTTTTTATCTTTTTTAAGACAATCAGTACTTGCCCCATTAATACAGCTTCTCTTAGGTAAATTACCTCGTGGAGTTAGAAAAATTGAATTGGACGCACCCCAATATATTGAAGCATTAGAAAAGACGGTTGCTAACCATGAATATAAAAGCTGTGTTAATGCATTGCAGGCTACTATCAACCTGTATCTTGAGTTAAGAGAGGAATTATCACAAAGTCCTATTGTCCGAAAGGTTGAAGCTGAAAGGGTTGCATTACAGTATTTTCAAGATTTAATCAAATAAACCCAAAGTAAAAAAATATTGAATAGTAAATATTCAGTGTTTTTTCATTTTTGGTCAAATGACCTAGATTAGTTGTTGTAACCATTCTATAATTATTTTGAAAGTAACAGTATGGAGGATAACTATGAGTGATATTTTAAGTAGAATTACAAATAAAATTGGGGATAAGAATATAGTTGATAAGTTATCAGCTCTATCAAAATCAGATTTGAACTCACTTCTATTAGAAGTGTTTGATAGACAAGCAAATACTTTAACTGCAACTGATATTCTAAAGTCATACCAACTAAATAGATTTACTATCCCTAGCGGTATAGATCCAGAAGAAATTCATGCTTTGGAGTCAAAATTATTGAGAAAAGCATTCAATATGGATATCAAGACGATTATGCTTTCTCCCTCTGCTCCATTAGGTAGCTGTAGCGTTTTTGGCTCCGTAGATCAATATAATGTAGTAAGTGCTCTACGAGGGACAGAAACACTTGCAGACCCCTCAAATATGTTGGCAATAATTATTGCTGATAAATTAAAAAGAAAAGAAGAAAATAATACCATACCTATCCACATGGCTACTACTGCTAGGGTAATAAGAGCACAAAATTTTGTAGGTAAAGGTTTATATTCACATTTTGGCTTATATTGTATGGTTTCATCTGGTATAGATACAGGGTCTTACACTTGTGAAAAAATGTTGTTAGAAAAGCACTTAAACTATTATAAAGATATATTAAGTGAAATAGAAAATGTTCGTTTCTCTATTATTCTACGCAAAAGAAACGGATACAAAGATAATGACGGATTTTTCGACAGAATGGTTGAAACTATCAAACTTATTTTTCCTAATATAGAGTTATCAATTCATAATGATGATGTTGACAATAATTATTATAAAGGTATCAATTTCAAATTATCGGTCAAACAAGGAAATGAAACCGTTGAAATAGTTGACGGTGGATTTGTTGACTGGACTTATCAAATGCTTGGAAATAAAAAAGAACGCTGTTTGATAAGTGGTATTGGCTTAGAAAGATTTCTTGTAGCTGTTTCATAAAAGGAGAAGAAAAATGGAACTTATAGAGTGGAATTATGCTTATATTACCGATTTAGTTGAGTTTGCGAATGATAAAGAAATTGCAAAGAATCTTCGTGACAACTTCCCCCACCCTTATAGGGAGCAAAACGCTAGAGATTTTATTAGTTTTTGTTTGGCAACTTCAGATGTTAAACAACTTAGCTATGCTATTTTTTATCAAGAGAGGGCTATTGGAAGTATCAGCCTAACATTTGAAGAAGATACCTCTATTAATAAAAATGCTGAATTAGGTTACTGGCTTACTAGGAACTATTGGGGCAAAGTGATAGCAACAAATGCAGTAAAAGAAATATGCAAAATTGTCTTTGAAAAATACAACCTTAACAAAATTCATGCTAATGTATATTCCTACAATAGAGAGTCAAGTAAAGTATTGGAAAAATGTGGCTTTAAGATTGAAGAATACTGTCACAATTCATAATAAAGAATAGAAACATGATTGATTGCCATGTATATAGTTTAATTCGACCGCAATAGCATTTATTAGAATTAACCTACTTTTTAATAACAGAATAAGTTTTTCCCCTCTATTAATTTCTTATGCATCTTTGTATTTTTATGAAAAGCTAGCCAATGCATATTTCCATACATCAATATGGTGGTGGCTTACAACCAATATAAATTAAATACGTTTTAAAGAATACACATTTTTGCCCTATAGGCAGAGTGTGTATTTTTTTCTCTTTTTTTTGAAATTTATCGAAGATTTAACGCCCTCCCACCGTGATAGGAGTAAACAAGGTTATTTAACTCCTTGCGATGGAAAGAGGGTGAAATCTTATGGTTGATGAAAAGACAATTGAACATCAATTCGACAGTTTCTGTAAAACAGTTTTGCGTAACTATGCTAGAGATATTTATAACGAAAATAAACGCAGAAATGATTATTTGGTATCTCTCGAATCTTTATCACTTGCAGAATTAAGTAAATTGAGTATTTTAGATGATTATGATTCTAACTACATCTGTATGGTTTCTTACGACTACAACATACGAATTGAAGATGTATTAATGGCGCAAGCAATCGGA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MSTEKRRDNKDRILRTGESQRKDGRYAYKYVYSFGKPQFVYSWKLVPTDKPPKGKRDDISLRDKEKQYKMTLMIALTLLVRK >CP016106|2386330:2447258|2410628_2411300_-|AXU54035.1|DBSCAN-SWA MLDKVKGRLIVSCQALEDEPLHSPFIMGRMAKAAMEGGAVGIRAQGVEDIIEIKKVTGLPVIGIIKRNYEDSDIYITPTKKEVDELLTTGCEMIALDATNRVRPNNEDLKELIKYIKENGVLVMADISNYDEAIKAQEYGVDCVSTTLSGYTPYTKTLEGPDFVLMERLVKDLEIPVIAEGKVNTPQDLKKVFELGVHSSVVGSAITRPQLITEKFVKAIEIN >CP016106|2386330:2447258|2393816_2394686_-|AXU54020.1|DBSCAN-SWA MEYDMPLYRPPSEAYSLIIQVTLGCSHNKCTFCSMYKSKKFKIKPLEVIKNEIDIFRRYYKHVERIFLADGDALIIPMEKLRDIILYIKEVFPECERITMYGSPKSIEKKSDDELKELRKLGVKMIYLGLESGSNEVLEDIKKGFSSEQLIKVGRKVKKSGIKLSATVIAGLGGTKKTHQHAVDTGKMLGAISPDYVGVLSLMVEPNTELYDLLKAGEFTILEDKAVLQEIKEMIKNIDANEKIVFRSNHASNYANLKGVLPDDKQRLIDEIDYYLSNQKLKREEYRRL >CP016106|2386330:2447258|2408142_2409645_-|AXU54033.1|DBSCAN-SWA 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MQDKKIYLNIVLTVVVSYILIKVIDNYKYFFGVISLLMSLLTPFIIAFVLAYIFNPLVKFLESKLNFKRIYSLLLTYGVLIVILISFILFTVPSIVNSLADLVAQIPTYIDKTEQFLFDLGKSLQSVDPNTLKEYGDKIMSVMPKFSNLLIGSLGGIFSTTFSVGKFIVQFLLGFIICFYILLEKEKFLLFTKKVVYISLGKKYGDFIIELCQSLNLNIGKYFTGKILDSFIVGVLSGIGLYFLKSEYALLFGTLMGVMNMVPYFGPVIGMAPVVIINLFSNPTIALTSLIYLIIIQQVEVTFIEPKIVGGQLGLSPFFTILAVTVGGGFFGIPGMILSAPVMGVIKIYFCEFVNRRHDKIQME |
52 | Streptococcus_phage(46.15%) | protease,tRNA,transposase,integrase | attL 2384650:2384667|attR 2420783:2420800 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
2481421 : 2487492
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP016106|2481421:2487492|DBSCAN-SWA TTTACTCAATTTTGTAAGATACATGATAATTCTTCTTCTCACCTGCAATCTTGGTAGATCTATTATTTTCCTCTATCCAAGTTCTCACCTTATCTATTACACTCTTTGTATATTTATTTACAGTACCAGTCCAAGAACCATTAGTTTCCCAAACACCTTTAACTTCACCATCTTCTAAATCAATCTTTTTAATAATCTCACAAACAGCCATCTGAGCTGGTTTATTACTCTTAGAATATATTTTCAGTTTAGATGCTATTTGTTTTGTATCAAAATAATGTTCTTCTTCGTTTATCTCTATTGGTAAATCAATTCCTGCTTTCTTATATAATGTTTTAGCTGTTAATAGTTTTGATTTATTGTCAAAGCCTGCATCATCTAACAATTCTTTTAACATAGATGTACTGTTATAAGCAACTGTAATTTTTCAATCTCACTTGCTTTTTCTCTCAACTTTTCGGGATTGCATTATTAGTTATGTATGCACCAGTTTGTCTTATGCTTGGTAAAACTTCATCGCTTATCCAGTCTTGGAATCTCTCAGCTTCTTCTTTTCTTGATTTAAAGATTAATTTATACACTCCACTTTCAGTAAGAAAATTTTCTCCAGCATTATTAAGTTTTCGGATGTCAGTATTACTGATATCCGAATTTCTTAACTTTACAACTTGCTTTTTATTCATAAGTCTTATATTCTCATTAACATTTTTTATGTCTAAACAGTTTGCTACATCTTTTGAGTTGAATAAAATTCTTCCTTCAAATTCAAATACTTCAATCTCTTTTCCTTCAAACATCATTAATTCATTTTTCATAATATTACACTCCTTAATAATTGATTTTTTTTAAGGAATGACATATACTATAATTGATATACGATAGTATACGTCATAGGGGTTACTCAAACTTTGGTCGGTGGGAGTGACCCTTATTTTTTATTCCTTTTGTTGCAGTTCCTCGTCGATTTTTTCTTCTAGCCATTCTTTCTTGGTTAGATTCTTTTCCTCTAACACTTCATCAAATTTATCTAACTTTTCTTTGTCTAAAAGTACACTAAAACCTCTTTTATCTTTTCGACGATTTTTCATATACTCTGCCCTACTTTTAGTTGCTATTTTATTCACCTCTTTTCTGTAACTCGTTACATTAATAACAATATTGTAACGAGTTACAGTCAATAGGTTTTTACTAATTTTTTCTAATTATTTTACCCAACCGACCAATTTTGAACAGAATAAAAGCACCTACATATTTGTAAGTGCTTTCTTTGTTTATTTAATTTTGAATCCAAATAGTTAATCTAAAACACAATTATTAATTGTTTTATTAGTGAAATCACAGCAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACGCTATTGCTGTTGTTGCTCCAATCGCGATTTCTATCAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACTGTAACACAATAGAGTTAAGGGCTGGTGGGGTTCCCTATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACGGGCTTTAGCAACTTGGAGTAATGCTGATACTAGCAATATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACATTTAAGATTAGATAAAAATCTGTGCGGAATTGTAAAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACTTGATAGCATAGAAGAGATGGAAAATATTGATTTACATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACCCCAAAATAAACTTAGCATTTCCAATACCTACATATATACAATACTCTTAAAATTGCAGTGAGCGGGCAATAGTGCAATTGATAACACTTATCACGCACCCTCAACATCTTAGATTTCAAGTATTAAGCCCTACTTTGTAACAAATATCGCACACTGCAAAACTTCTATATTTTTATTATATCATAAAATCTAAACTATAAAATTAAAATGGAATACTTTGTAAATTTAAAAGCACCTACATACTTGTAAGTGCTTACTATATTATCTATTCTAATAATTCTTTTTTCTTTTTATTATATTCTTCCTGTGTAATTGCTCCTGAATCTAGCAACTCTTTTAGTTTCTTTATTCTATCTAGTGGGTCAACCACTCTGTTTTGAATGTAGTTATTATAACTGTTTTTTTCTTGTTCTATTTTCTCTTGTTCTCGCTTCTCTTCTTCTTTAGTTTTAAGTTCAAACTCATTGAATTCTAAATTTTCAACATTATCTACATTATTTTGTATGTTTCTAAAATAATCAATATAAACAGAATTATATATACCGCCGTCATCTTTTGAATGAAACTTAAAGTACGCCTTGCTTATTTTAATTTTTTTAAGATCATTAGCAATTTCTTTTACAAATTTTTTACATTCTTCAGAATTACTAAATTTTTCATTTTGTACAGTTAAATCAAAATACATACTATATCTTTTAAATTTTCCTACTTTTAATTCATATTTCTTCCCCTTATATTCTTGAGGTACTAAAGCCTCTAGCTTAACTTTTAAATCATTTTCTGATATTTCCATTCCATGTTTTTCAATATATCTTTCTTTGTCTACTTCTTCTTGTATTCTTCTTCTTTCCATTTCTTTTTCTCTTTCTACAGTTTCTCTTTGTGCCTTAACAGTCTCAACTTTATTATCTGCTATCAAGGATTTATCTTCCCAAGTTGCACAAAGATAAATTGAATAAGTGAAAAAAAGAACTGACACAAGACCCATAACTATTTTCTTTTCTATAAAAGAATATATAATCAACAAAAAAGCTATCATAACTAAAATATATTGCATAGAAGAAACAGCTATTATAAGTAAGACTATTGTTATTATTGGTACTAATATCCACATTGTAAAATTCCCCACAAATTACTCATCTCACTCAATATTATAGCATAATTTGGCAAAACAAAAGCACCTACCATTTAAGTAAGTACTTTCTTATTTACAATTAAATTTATTCATCTAGTTAGATTCATCATCATTGTGTATAAAAAATTTCATATTTTTATTGACTATAAAAAATATTATATGCAATATTTTTTCTAATTTGTGGTATAATAAAAACAAGAAGAACTACAATCTATTTGCGGTAGAGTGAAGTTCTATAACTGAAAGTTATTTTTTACGATGATATTTAAAATTTATATCAATCTTTAAGTCACTCTTTGCGGCAGAGTGGCTTTTTACTTTTTTGATTAACTTACTAATCAAATAAACTATGTAACTAGCTGTTACACTAGCTAACACATTAAATAAAAAATTATCCATGTATATTCACCTCCCTTCTTATCGTTGGGAGGATAATTTTTTAATACATGAACTCCACTCTATAAATTGTAGATTACATCTTCTTGCTACAATTATTATAATATATAATTCTTGCATATTTTTCCTATATCTTACTTTTTATTTTATTTTCTATTTTTTCAATAAAAAGCACCTACATATTTGTAAGTGCTTTCTATGTTTATTTAGTTTTATTGATTACTTAATAGGTTAGTACAAATTCCATACCAACCTAAGAATATCTACATAAAATAATTAAATAATATAATCAATAAGTATTTTTTTCACTCTTTTAATCAAATTATTACCTGTTCCCCAATCAATCTGAAATAGTCCAATTGCACTACCAGTTGAGGTAATTTTAACAAGTGTTTTTCCTGTAGTATTTTCACAAATCACTACCAAACCTGCATCACTATTGCTTCTTGCATAATATTTTTCAAAGATTGTAACTATTATAGACTTATTATTTTCTAGGTTATAAATATCAACAGAAACTAAATCTGCTTCCAAATTTTTTTCTACCATTTTCTGTGCTTCTAGTGGTGTCATCTTTACACTAAATACATCTCTTGCCATATCATTCATCACATCCTAAATAAAAATATACTTTTTTAGTATTTTCTGACACTTTTATCAAACAGTATTCCTATTCCTCCTAGTAAAACCAGTATAGAACCAAAATTTCTATATTGTGAAATAGATTGTTCTAAATATATGTTGTATTGTTCGGTAGCTATTGACCCACCATTTTGTTTTATAATACAAGCCATATTAAATTGCCCTAGACCTATACAGCAAAATAACACTATTATTCCAATTACAAAAGCAAATATACATATTGTAAGTTTAATATCTTTATTTTCCATAAATACACCTCTCATAATTTAGATTTATTTGTTGTTTTTTACTTGGTGATATATTATCTACATTATACTATACAACATATATATCCATCTATTTCCAAAATTGTAATATTTTCATATATTAGCAATGTTACTATTTTAACTTTAAATTCTACCTTCTTCTACCTCTCTTTTTCTCTCTTTCAGCTTCTTTCATTGCTTCTTCTTCATCTTCAATTTTAATAAGTATTGAGTCGTCTGCTAATGCTCTCTCATTAACTTCTAAATTCATATATTCACTAGGTTTCCACTTTAGCTTTTGAATGCAATTTAGTCTTAATCCTTCTTTTAATATATTTATACTTGCATTTATATCTCTATCGTGAGTTTCATTGCAACTAGGACAAATCCATTCTCTTATATTTAAGTCCTTCACTTCCTCGTTTTTATACCCACATTTATTGCATATTTGTGAACTTGCAAAGAATTTACCTACCTTTACAATTTTTCTACCATGCCAATTAGCCTTGTATTCTAATTGACGAATAAATTCTGACCATGATACATCTGAAATTAAGCGAGATAGTTTACGATTTCTAATCATATTCTTTACTTGTAAATCTTCTATGCAAATAATATTGTTCTCTTTTATTAATTTAGTAGATAGTTTTTGCAGAAAATCATTTCTTTGATTAGCTATATGTTCTTAAAGTCTTGCAACTTTTAATCTTGCTTTATTTCAATTTAAACTACTGATTGTTTTTCTCGATAATTCTCTTTGTAATTTAGCAAGTTTGTTTAATGACTTCTTAAGATTTAAGATAAATTGAGGTTTATTTGAATAAATTGATTTGAATTATGTTATTTTCAGATTACTTTTATTTAAGTATTTTGATTGGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP016106|2481421:2487492|2481869_2482235_-|AXU54091.1|DBSCAN-SWA MKNELMMFEGKEIEVFEFEGRILFNSKDVANCLDIKNVNENIRLMNKKQVVKLRNSDISNTDIRKLNNAGENFLTESGVYKLIFKSRKEEAERFQDWISDEVLPSIRQTGAYITNNAIPKS >CP016106|2481421:2487492|2485692_2486124_-|AXU54097.1|transposase|DBSCAN-SWA MIRNRKLSRLISDVSWSEFIRQLEYKANWHGRKIVKVGKFFASSQICNKCGYKNEEVKDLNIREWICPSCNETHDRDINASINILKEGLRLNCIQKLKWKPSEYMNLEVNERALADDSILIKIEDEEEAMKEAEREKKRGRRR >CP016106|2481421:2487492|2486821_2487013_-|AXU54098.1|DBSCAN-SWA MKISKLPEAELKVMRYIWESEKVLISREITKSMEQKYEWKDTTIFTVLKRLLKKRVFRNGENR >CP016106|2481421:2487492|2487117_2487492_-|AXU54099.1|DBSCAN-SWA MKEEILIEKLLRAELIVMEYLWKKDTLMPKKEIVKEIKQIYGWHKSTIKILLKRLVAKRYLARYIINSQSHYKIIDSKEYYTFKKKVLKSSKSIKIMRSLTTTHKNVSKEKLDLLDEYYRNLKE >CP016106|2481421:2487492|2483388_2484237_-|AXU54093.1|DBSCAN-SWA MWILVPIITIVLLIIAVSSMQYILVMIAFLLIIYSFIEKKIVMGLVSVLFFTYSIYLCATWEDKSLIADNKVETVKAQRETVEREKEMERRRIQEEVDKERYIEKHGMEISENDLKVKLEALVPQEYKGKKYELKVGKFKRYSMYFDLTVQNEKFSNSEECKKFVKEIANDLKKIKISKAYFKFHSKDDGGIYNSVYIDYFRNIQNNVDNVENLEFNEFELKTKEEEKREQEKIEQEKNSYNNYIQNRVVDPLDRIKKLKELLDSGAITQEEYNKKKKELLE >CP016106|2481421:2487492|2484930_2485263_-|AXU54095.1|DBSCAN-SWA MNDMARDVFSVKMTPLEAQKMVEKNLEADLVSVDIYNLENNKSIIVTIFEKYYARSNSDAGLVVICENTTGKTLVKITSTGSAIGLFQIDWGTGNNLIKRVKKILIDYII >CP016106|2481421:2487492|2482355_2482508_-|AXU54092.1|DBSCAN-SWA MKNRRKDKRGFSVLLDKEKLDKFDEVLEEKNLTKKEWLEEKIDEELQQKE >CP016106|2481421:2487492|2481421_2481817_-|AXU54090.1|DBSCAN-SWA MLKELLDDAGFDNKSKLLTAKTLYKKAGIDLPIEINEEEHYFDTKQIASKLKIYSKSNKPAQMAVCEIIKKIDLEDGEVKGVWETNGSWTGTVNKYTKSVIDKVRTWIEENNRSTKIAGEKKNYHVSYKIE >CP016106|2481421:2487492|2484504_2484657_-|AXU54094.1|DBSCAN-SWA MDNFLFNVLASVTASYIVYLISKLIKKVKSHSAAKSDLKIDINFKYHRKK >CP016106|2481421:2487492|2485289_2485544_-|AXU54096.1|DBSCAN-SWA MENKDIKLTICIFAFVIGIIVLFCCIGLGQFNMACIIKQNGGSIATEQYNIYLEQSISQYRNFGSILVLLGGIGILFDKSVRKY |
10 | Clostridium_phage(71.43%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
2728950 : 2762249
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP016106|2728950:2762249|DBSCAN-SWA ACTAGTTGCTACCTTCTAATCTATCTATCAAATAAAAACTTCTAATTTGACTTTTAAACATTAATTCAATGTCTTTTACTGCATATTGAACACATTGCTTAAACTTTAAATCATAATATATATTTATCTCACCTACGCCATTTACACTTAAAGAATAGTCTTTTCTTTCTATTATACATATGCTCCCACAATCTGATAAATCATTCTTGTATATTGATTTTAACTGCCTTTTTATTTTGAGAAAATCTATCACTGGATAAATATTATTTGGATAAAAACTTTTATTGCATGTCATAATTTTGCCCATCTCTATAAAATAAAAAAGGTATAAAGATGTATAAGTATATTTTTCATATCTTATAAAGGCCTTATTTCATCAAATAAAGTTATTTGTGTTTTCTTTCTTCTTCTTTTAAGAGTACTTTAGCTCTATATTCTCCCAATCTTATTGAGGTATACACTAATTCTAAAGTTCCTTTTATACTTGATATTAAAAATCCAGTACTTAAGCCAATAATAAATAATAGTATTCTATTATATTTAATTATAAATATAATAGAAAGATATGAACTCACAATTAAAATCATATTTAATATTATTCCAATACCCCAAAACAATGCATTTAAATAAAATGGAACTACAAAATCATAGTATGCATTTGCTTTATGTATAAATTTCATGAAATTATCATTAATCATTCCTACTAATATAGACATCGCAGTAACAGTTACAGCTAACATGCCTCCTGATAAACTAACACATATAGTTGAATAACTTCTCATTAAATCTATCTTTTTATCGATTCCATCTATATTTAATTTGGGTGTTATGATTACCACTATAAATATAGCTAGAATTATTATAATTGTTTCTGTAGAAAAAAATATTTTTCTTATTCCATACTTTTTAATCATGTTAATCAAATTTTTTTTATATTTATTAATAGTAATCACCACCTTTTAATATATTTTGTACCTTATTTATTATTATCATTTCTTACATTTATAATTACTTTTTCAAATTCTTCTAAAATTTCACTTTCACTTTTATCTTTATCATCAAACTTTGATGTATATATCACATCATTAGAATCAAATTTTGTTTTTTTCTTAGTATGTTTATCTAAATATTCCATTTTTATTGTACCATATGCTTTTTTAACCATCTGTACAGATTGGAAAAATAGGCTATCTTTTTTTGTAGATAAATTCCCATTTTTATTAGATAGTTTTTGTTCATATTCATCTATTTTGTCCTCTTTTAATTTCTCATCTAGTTTAAAAAAACCATCATTTGAACTGTAGTTAGCAGGTATAATTTTAAAGTCTGCACTATAAACCTTTTCAGCATTATTTAATATATTATCTATTTCTTGTGATTTAGGATATAATTTTAATTTTAATTCTCCTAATTCATAATCTATAAGATTACATAATTTAGAAAAATATTCCATAAAATTAGTTTTTGAAATTCCTGCAACTTGTTCAAAAACAATTAGTTCATTTTCTACATCTAATAAAAAAGAGCTTACATCTGCCGAATTTTTTATAGGAACATCTTCAAATTTCCCATTTTCTTCTTTATATATATTTTCATACTTTATTGGAAGAACCTTACTAATCTTACCTGATATATATTCGTATCCATTAATATTAACTTTTTTTGTATTAGCAAATATCCAATTAAAACCTTTTTCTTTATATTCTTTTTTATTATGATTTAAAACTGCATCACCTATCAAAGGTATCATTTCCTTATACTTTGGATGAAATATATTTTCATTTATATTTATTTTAGCAATATATAAAGTCTTTACTCCCATAAAAATCCCCCTCATTAAGTTTATATAATTACATTCTACAATATAAATGATTTTTTGTTTATATATTTTCCATTTTTATCCATAATAAAATATAGAATACTTAATAATATTTCAAATCATAAAACAATCATATTAATTAATCTTATAGTACAATATAAAACATATGTTTGCAATATGAAATTAATTTATTTCTATTCTTAGTATATCATTCTTCTCATATACATTAGCTTATTTAATGTATATGAAATGTAGGTAAAATATACAAAATATTTTAAGATATTAATTTTAATTATCTATTAATAAAATCTAATACCTTGTAAAGTGTATCAAACCTATCATTACCCTTTATCATAGTGTATCTTTCTTTAGTAATAGAACTTATCTTTTCACATGCTCCACCACCAACGACATATAAATTTTCTGTCTGACCTGGTACATAATCTTTTATATCACATATTAGTATTTTCCCATCATTATAGCCCCAGCCAACTACAGTTGCAGGGATTTTGTCAACTTCTCCATCATAAACGATTGTATGTTTATACATTTTCTTATCCTCACTATTTTCTATTGTCTTATTTAAAATACCTTCTGCTATTAACTTAGCAACTATGTCTTTATGTCTAATATAATAGTCTGTATCTGCTTTGCTATCTACGAAGCACACTTCTATTAATATTGCTGGTGCTTTTGTATGACTAAGCCAGTAAAGCCCTCTCGCGTCCGATTTTGCACCTCTATTTTTAAATACAGTTGCTAATTTAGTATTTACTCTATCTGCATACACTTTGCCATTATTAGTTTTGTATATTGTCTCTGTACCCATTGCGTTTAGTGTTGTTTTATTTGCGTTGAAATGGATTTGTACAGCTAGGTCTACATCTTGTTTATTTGCTATTTGACATTGCTCTGCTAAGTAATTACTAGATTTATCTATTTTTCCAGTATATACAGTAGCTCCACCTTGTTTCAACCATTTTACTATTAAATCAGTTAGGATTCTATTTTCTTTTCCTTCATCTATATAGCGAACTGCTCCAGTTCCTTTTCCTGTTAGTGTATGCCCTGGCACTATTGCTACTTTCATTATCTATCACCTTCTTTTTTCAACATGTCTTTTATGTCTATTACATCAACTCTTATTTCTTCTACATCTGTTTTCATTGCGCCCATTTCAACAAGTATATTTTTATTTATCTCTTGTTGTTGAGTGGATAACTCTATAAAATTTTCTACCGTCTTTTTATACATGTCTCTATCCTCTTTTTTTTCTTGCATAGTGTTTTTGAATAACAAAGCACATAATATGCCTATTGCCCCTAAACTACTTAATTGCGTAACTAATTCCTCCATGTCATTTCCTCCTAATTTTATAAAATAAGGTTTAGAAATTATCTAAGCCCATAAAAAAAGAACCTATTTAATCGGTTCTACTGGTGTTTCTTCTTTATTTAATAAACCTGTTAATTCTAAATATTGTTCCTCTGTAATCCTGTTTACTGCATAAAATACATCCATCTTATGTTGCAAATCCTCTTTAGTACTATAGTTCTTTTGTTCTATCATTAATTTTAATAAGTTATACATATCATTTCCTCCTATAAATTGTTGTTTAATCTTATATTTTCTATTTCAAAAGCAGTGTTTACTATCTCACTATCTCTATTTTTATTTTCTTCTTTTAACATGCTTAATTCTTTTTCTAATACTTGTAATCTCTTTTGTTCATCAGTCAAAACAACTTCTATGTCTTTGATGATTGGTTCTTTTGTAACTGGATTTATAGACTCTATATATTGTTTACTATAGTCTATACTACCAAATTCAACATCCAAAAAGTTTAATTCAGTTATTTCTGACCACTCTTGTATATCTCCCATTGCTTCGCCAGTTTGAAGCCATATATTTCCTAATTGGTCGTAAATTATTCTATTATTTCTATTCATATTATCACCTCATTTTTATTCTATAGCTGTCCAGTTAAATGTTGTTCCAGAAATAGCACTTATTTCTGCAGTTGAACCATTCCCTGAAAGATTTTTAAGAGACAAAACAAAACTATTTCTACTAATCTCTTCAACACTCGCAAGAACAACACCACTAAAATTTTCATCATTACCTTTTAATGCAGTAGGATTTGTTTTAACAAGATTTGTAAAAAATTTTAGACTACATCTCCAAGCTGAAGCATAAGTAAAATTAAATTCAAGTCCACAAGTAACAAAAATTATTGTTGGAGTAAAAGACAAATTCATTGGAATAGTCGTACTACCATTTTTAATTTTAGTTTGGTCAAATGTTCCTTTTGCCCATCTTTTTCTTTGTCCTAATTGGGTATTCAATTGAGTTATAGTATTATTTTTTTGTGTTATTATATTTTGCAAATCCTGCAAACTTGCATCTCCACTATCAAAAGATGATTTTATCTTTTCAGCTAGCTCCACCAGTGTATTATTTAAAGATGAATCTATATTCTTTAATGCTAAAGTGTTTATAATACTTGTTTTACCACTTTTAAAACTTTCTCCAATCTCTACTAACTTAGTTGATATATCTTGTAAATTAGCATCAGCTGGCAGTGGCATTATACTTTTACTTATAGTTACAACTTGCTCATAAGTCATGTTATTAATATCTGTAACAATTATTTTAAGTGTATGAAGTGCATTATCTTCAAGTGTATAGTTAATAGTTTTTTCTAAGTATAAATCTGTAGTAAAAGTTTCTTTTAATACATCATCTATAAATACTTCTATCTTAGATAGTTTATTTTCTTCTGTATGTCCTGCTGTAAAAATAGCTTGTTGCGATGTATAAGAACTAATAACGAGAAAAGGCAAACCTTGCAATAGTGTTATTCTAGCCTTTCCGTTTTCTTCTGCAATACCTCCACCAACAGTCATAGAAGTATTTTCTAGCCAATATTCTTTGGTTGGTATATATCCAGCTGGTTTATAACTATTTTCTGTTAAAACATAGCCACTTCCACCACCTGCATTATAACCGCTCCCACCTCCATACCATCCGCCACCTCCACCGCCATAATTTTCTCCTGAACTAGCTGATACAGCACTTTCGCCTTTTCCAAAAGAGCCATCTAATCCTGCTTCGCCTTTACCACCATTAGTTTGAGTTCCTTTGCTATCTGCTTTAGAACCATCACCTCCAGCATCTCCAC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43 | Clostridium_phage(94.12%) | tail,terminase,capsid,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
2765670 : 2780174
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP016106|2765670:2780174|DBSCAN-SWA 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33 | Clostridium_phage(75.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
3083054 : 3092007
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP016106|3083054:3092007|DBSCAN-SWA TCTACTTTTCTCTAGTTGTTGCAATTTCTTTGATATTAGCATCTTCTGGTTTAATATAAGTTGGCACTAATTCCCTCATAATACCATCTATTTTTTCAACCTCTTCATTGTTAGTAATTTCTCTTAAAAGTTTTAAGTATTTTGTTATTTTTTCTCTATCAACATCTATTGGTCTACCAATAAAAATCTTTTTATGCTCTGTATCCAACAGACCTTCTTCTGACATAAGTAGTTCTTCATATAACTTTTCTCCTGGTCTAAGACCAGAAAATTCAATTTTTATATCAACATCTGGCTCAAATCCACTGAATTTAATTAAGTTTTTTGCTAAATCCAATATTCTTACAGGTTCTCCCATATCAAGTACAAATATTTCTCCACCTTTAGCCATAGCCCCAGCTTGTATGACTAAGCCTACTGCTTCTGGTATTGTCATAAAATATCTAATAATATCTGGATGAGTAACTGTCACTGGTCCGCCATCTTCAATTTGCTTCTTAAAAAGTGGAATTACACTACCATTACTACCAAGCACATTTCCAAATCTAACAGCAACAAATTCAGTCTGGCTTTCAGCATTCATAGTCTGTATAATCATTTCAGCAGCTCTTTTAGTAGCTCCCATTATGTTAGTAGGGTTTACAGCCTTATCTGTAGATATAAGGACAAATTTCTTAGCTCTATATTTTGAAGACAAGCCAGCTATGTTTAAAGTTCCAAATATATTATTCTTTATAGCTTCGCCAGGGCTCGATTCCATAAGAGGAACATGTTTATGTGCTGCTGCATGAAATACCACTTCTGGTTTATATTTATTAAATATTTCATCCATTCTTTTTTCTTCTCTTATTGATGCTATTACTGTCTTCAAATCTAATTTATTTTTATATTTTCTAAGTAATTCTTGTTGTATTGAGTAAGCATTATTTTCATAATTATCAACTATAATAAGCTCTTTAGGATTAAATCCTGCAATCTGTCTACAAAGCTCTGAACCAATTGAGCCTCCTCCTCCAGTTATTAGGATTACTTTTCCCTCAATGTAATTACTTATCTCTCTTAAATTTGTTTTTATAGGCTCTCTACCCAACAAGTCTTCTATCTCTACTTCTCTAATCTGTTTTATATCAACTTTTCCATCTATAATTTCGTAAATTCCTGGTATTGTCTTTATTTTACAGTTAGTGTTTTTACATATATCAATAATCTCTTTTTTTCTACGCTTCTCTATGTTTGCTATTGAAAAGATTATCTCATCTACATTGTACTTTTCTACCACATCTTTTATATCTGAAGTTGTTCCTACAATTTTCACATTATGGATTATTCTTCCAATTTTATTTTTATCATCATCAATTATAGCCACTGCTACTTTTTTAAGTTCTGGATTTCTTTTTAGTTCCTGTATAACCATTTCTCCTGCATCTCCTGCACCAATTATAAGGATATTTGAAACCTTTCCTCTAGAATATGTCTTGTTCATGACTATTCTTATAGCTCTATAGGCTATTCTTGCGCCACTTGTAAACATTATAATAAATATTGTATTTAATACATAAAACATTATAGGATAATCAAACCCTAATAATTTATTTATTATATAAATCGGAATTAAATAAGCTAAAGTTGCCACAAAAATAGATATAATTTCTTCTTCTCCTGCATATCTCCATAATGTGTTGTAGCACTTAAACAATCTAAATGATACTATATGAAGTACTATATATATACACGCTGAAATTATTATATCATTAGTGGTAAATGCATTTAAATTACCTGTCAAGCTTAAAGACATTCGAAACGCTACTAGTACGCTACAAATATCTAGAATTAATAGTGTTAAATGTCTAAATTTATATTTTTTAAAAAGCCTATTAAAAAAGCTTTCTTTCTCTAAATCTATACTTTCTCGCATAACTAGAAGCCCTCCTTTAAACAGCAAAAGCTACGCACCTAAGCATAGCCAACAACATCTATCTTTTGCTGTATTTTTTCATTTTATTTTTTATATTTATCAAATATAGAATCATAAATTTTTTCTATATCATTAAAGTTTAAATTAACCTCATAATTTTCTCTAACAAATTGACGCCCTTTCTTACCCATATTAAGTCTAAGTTCATCATTTTCCATTAGTTTTATTATAGCATTTTTTATTTCTTCTGGTTGTTTTGGTTCTACAATTAAGCCAGTTTCATTTTCCCATACAGATTCTGGATGTCCTCCTACATTTGTAACTATAACAGGTACTTCACATGCTTCTGATTCTATAGCTGCCACTCCAAATCCCTCTCTTAAAGAAGGAAATACAGTTACATCAAAAGAATTAAAAGTCTTGCTTACATTTCCTGGAGATATTCTTCCTAAAAACTGAACATCATTTTCTATACCCAATTCTTTAGCTAAATTTATTAGGTTGTCCATCTGACTTCCAGAGCCACCTATTTTAAGAATTATTTTCTTATCTTTATATTCATCTTTAAGCATCTTAAATGCTTGTATTAAATATTCTATTCCATATTTTTTTTCTAAACTCTTTATAATTCCTATTACAAAAGCGTCTTCTTTTTCTACTTCCATAGGCTTAAACCTATCCATATCTACTCCAAAAAAGGTTACATCTACATGTTTAGCTGTATATTTATTAGCCTCTTTAGCCATATCTCTACTATTTGAAAAGATATAGTCTGCTTTTCTAAAGTTATGCTTTATAATTTGTTTTTGTATAAAACCATTATTAGGGAAATCATAAATATCAGTACCCCAAACAGAAATAATATATGGATGATACCCAAGTAGACTTCCTATAAATCCATAACTACTTGCATACTGTGCATGCAATATATCTGGCTTTATTTCATTTACTAGCTTCTTTATCTGCTTTATTGAACCTAAGTATCCCGTTTTTTTAGAAATATTTTCATTTTTTAGTTCTTCTACATTAGAACCAAAATTATAAATTTTTATTCCTTCCATGTGACCTCCATTTAAAGAGATTACATGAATGTCATATCCTTTATTTTTAAAAAAACTACACCATTTTAAAGTATGAGGATTTGACCCATCAGCTAAATAACAAACAGTCTTCATAATATTTACCTTCCTATCGAATAATACTCAATTCCTAACTCTTCCATATCTTTAATTTTATAACAATTTCTTCCATCAAGGACTAAAGGATTTTTCATCTTTTCCTTATACTTATGTATATCATAATTTAATACATCTTTCCATTCTGTCATTATAAAACATATCTCTGCATCTTCTATCGCATCATCTACAGAATCAGCATAAAGTATAGAGTCACCAAATATTTTCTTAGTATTATTTACACCAATTGGGTCGTATACAGTAACTCTTGCCCCTCTTTCGAGCAAATATTTTATATTTGGTATAGATGGTGCTTCTCTTATATCATCAGTATCTGGTTTAAAAGTCAAACCTAAAACAGCAACCTTCATATCTTGAAAGCTCTCTACTAACTTAGATGCCTTTCTAACTAATTTAAGTTTTTGACTTTCATTAACTTCTATTGCAGCTTTTACTGTTTTTAATTCATAACCATTATGTTCAGATAACCAGTGAAGAGCTTTTGTGTCTTTTGGAAAGCAAGAACCACCATATCCTATTCCCGCCTTTAAAAACTTACTTCCTATTCTATCATCATAACTCATTCCTAAAGCTACATCTTCTATGTTAGCTCCTGCTATTTCACAAAGATTTGCAATATCATTCATAAATGATATTTTAAGAGCTAAGAAGTTATTTGATGCGTATTTTATCATCTCAGCACTATTTCTATTTGTAACTATTATAGGTTGATTAAAAGGCTTATAGATTTCCTCTAATATTTCTCTAGCCCATTCACTTTCTACACCTATAACGATTCTTGAAGCATGTAGAGTATCTTTTACTGCTGTTCCTTGTGATAAAAACTCTGGATTAGATGCAAGCTCTACTTTTACATCATTTTTTAGGTTTCTATTTATATAATCTTCTATCTCTTCATTTGTACCAATTGGAACTGTAGATTTTATTACTACTAGAGTATCTTTTGTAACAGTTTCAGCTATTTGCTTTGCAACTGCCTTTATATAATCTAGGTTGGCTGAGCCATCACTTCTCTCAGGTGTACCTACAGCTATTAATATTACATCTACATCTTCATAAGCTTTTTTATAGTCTGTAGTGTAATCTATTCTTCCTCTGTTGTAATTTTTAACCATAAGTTCTTCTAGGCCTTCTTCATATATAGGTGCTATTCCAAGTTTCATTGATTTAACTTTTTGTTCATCTACATCAACACAGACTACATTTTCATTGCCTACCTCTGCTAGACAAACACCTGTAACCAAACCTACATATCCCGTCCCAGCTATAGCTATTTTCATTTTTTTACCTCCAAGTATATAAAACTTATACTCTTTTTTTAATGGCATTAAAAACATAGAAACAAAATACATATAGACTTTTTGGTAAACTTAAATTTTCAACATTTCTATAAGTATTCCAAGTTCGTTTTAATGCTTTTATCTTGTTACTTGATATAGAATTTCCAACTAATCTGTAATTCACTAAATCTTCTTGAATCCCATATGCATATTTTTCCTTTTTAAGTAACTGTAACCAGGTTGCAGTATCTTGTCCTCTTCTTACCAAAGGCATGCTGAACTCTCCTACAATCTCCTTATCAATGACCACTGTAGAACATCCTATTATAGTATTTCTAAGTAATCCTTCATAGTCAATTTTCTTAGGAGCTCTTGCAACCTTATTCGTTTTTGACCCATCTTGTCTCATATATCTATAAGATGTAAAAGAAAAACCTACATTTTCTTTTAACATATATTCTATCTGAATCTCTAATTTTCTACTATCCCATAAATCATCACTATCTACAAATGCAATAAATCGACCTTCCGCATTCTTAATACCAACATTTCTAGATACTGCAGCTCCAGAATTTTTTTCAAGCTTTATATATTTTATTCTAGCATCTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP016106|3083054:3092007|3085051_3086143_-|AXU54647.1|DBSCAN-SWA MKTVCYLADGSNPHTLKWCSFFKNKGYDIHVISLNGGHMEGIKIYNFGSNVEELKNENISKKTGYLGSIKQIKKLVNEIKPDILHAQYASSYGFIGSLLGYHPYIISVWGTDIYDFPNNGFIQKQIIKHNFRKADYIFSNSRDMAKEANKYTAKHVDVTFFGVDMDRFKPMEVEKEDAFVIGIIKSLEKKYGIEYLIQAFKMLKDEYKDKKIILKIGGSGSQMDNLINLAKELGIENDVQFLGRISPGNVSKTFNSFDVTVFPSLREGFGVAAIESEACEVPVIVTNVGGHPESVWENETGLIVEPKQPEEIKNAIIKLMENDELRLNMGKKGRQFVRENYEVNLNFNDIEKIYDSIFDKYKK >CP016106|3083054:3092007|3089199_3089949_-|AXU54651.1|DBSCAN-SWA MKKNLVSIITPMYNSEKFIEATIKSVLNQTYQEWEMLIIDDCSTDNSPNIVKSYMQQDSRIKCIKTETNKGVSNARNLALSKATGQFIAFLDSDDQWNSSKLEKQVNFMLENDYVISFTSYELMDENDKKLNKVIKVPPNVDYRRLLKGNILGCLTVVIDKSKLDFEIRMSGVRHEDYVLWLSILKKGHIAHGINEVLALYRKSSNSLSGNKIKAAMWTWNIYRNIEKIPLYKAIYYFINYGINGIKKS >CP016106|3083054:3092007|3087469_3088222_-|AXU54649.1|DBSCAN-SWA MNEPLVSIITPVYNSEEFLSETIKSIQNQTYKNWQLLLVDDCSKDNSSEIIKSFRKEDARIKYIKLEKNSGAAVSRNVGIKNAEGRFIAFVDSDDLWDSRKLEIQIEYMLKENVGFSFTSYRYMRQDGSKTNKVARAPKKIDYEGLLRNTIIGCSTVVIDKEIVGEFSMPLVRRGQDTATWLQLLKKEKYAYGIQEDLVNYRLVGNSISSNKIKALKRTWNTYRNVENLSLPKSLYVFCFYVFNAIKKRV >CP016106|3083054:3092007|3091167_3092007_-|AXU54653.1|DBSCAN-SWA MLISLIMPTLNRYDDIYLLMDSLENQTYKNFELIVVDQNDNSKVKEIVDKYIDKLDIKYIKSSKKGLSYNRNVGIDNAVGQIIGFPDDDCVYENDTLEKVINFFNKNKDYKIYSCKTMDSNKVDAFKKMYDGTCDITSSNVLDTITSITFFIDFEGKDYTRFDEKLGVGGEFGAGEEIDYVLNLLSLGFKGKYFGNDIIYHPAKKHSKSKEKYQKDYNYGRGFGALCKKEIVYRKNYKFAKVMVSKLVRNIGGLILSSNRDYHSATIKGRINGFRQYKL >CP016106|3083054:3092007|3088269_3089178_-|AXU54650.1|DBSCAN-SWA MYKYKFTVFTPTYNRAHLLENLYNDLKAQTYDFNDFEWLIVDDGSSDSTKELVEKFISENKLNIRYIYKENGGKHTAINLGVKNADGELFFIVDSDDGLIKDSLEIANDEWDSLENKEGFSGVVGLCVYPSGDLIGTEMPEDKKICHFADLYFKYGVKGDKSIVFVTDELIKFPFPERKEVRFLPESVVWNEMSKYYKVICVNKPMIIRDYLDDGLTKNILSKNALRGRALEFLYLINQNTYPLSRYPYMWIKNYINLARYSLLSDSHYFGELRKVSDKLLYLALFPLGYYKYIGQRKLVSK >CP016106|3083054:3092007|3086148_3087444_-|AXU54648.1|DBSCAN-SWA MKIAIAGTGYVGLVTGVCLAEVGNENVVCVDVDEQKVKSMKLGIAPIYEEGLEELMVKNYNRGRIDYTTDYKKAYEDVDVILIAVGTPERSDGSANLDYIKAVAKQIAETVTKDTLVVIKSTVPIGTNEEIEDYINRNLKNDVKVELASNPEFLSQGTAVKDTLHASRIVIGVESEWAREILEEIYKPFNQPIIVTNRNSAEMIKYASNNFLALKISFMNDIANLCEIAGANIEDVALGMSYDDRIGSKFLKAGIGYGGSCFPKDTKALHWLSEHNGYELKTVKAAIEVNESQKLKLVRKASKLVESFQDMKVAVLGLTFKPDTDDIREAPSIPNIKYLLERGARVTVYDPIGVNNTKKIFGDSILYADSVDDAIEDAEICFIMTEWKDVLNYDIHKYKEKMKNPLVLDGRNCYKIKDMEELGIEYYSIGR >CP016106|3083054:3092007|3083054_3084968_-|AXU54646.1|DBSCAN-SWA MRESIDLEKESFFNRLFKKYKFRHLTLLILDICSVLVAFRMSLSLTGNLNAFTTNDIIISACIYIVLHIVSFRLFKCYNTLWRYAGEEEIISIFVATLAYLIPIYIINKLLGFDYPIMFYVLNTIFIIMFTSGARIAYRAIRIVMNKTYSRGKVSNILIIGAGDAGEMVIQELKRNPELKKVAVAIIDDDKNKIGRIIHNVKIVGTTSDIKDVVEKYNVDEIIFSIANIEKRRKKEIIDICKNTNCKIKTIPGIYEIIDGKVDIKQIREVEIEDLLGREPIKTNLREISNYIEGKVILITGGGGSIGSELCRQIAGFNPKELIIVDNYENNAYSIQQELLRKYKNKLDLKTVIASIREEKRMDEIFNKYKPEVVFHAAAHKHVPLMESSPGEAIKNNIFGTLNIAGLSSKYRAKKFVLISTDKAVNPTNIMGATKRAAEMIIQTMNAESQTEFVAVRFGNVLGSNGSVIPLFKKQIEDGGPVTVTHPDIIRYFMTIPEAVGLVIQAGAMAKGGEIFVLDMGEPVRILDLAKNLIKFSGFEPDVDIKIEFSGLRPGEKLYEELLMSEEGLLDTEHKKIFIGRPIDVDREKITKYLKLLREITNNEEVEKIDGIMRELVPTYIKPEDANIKEIATTREK >CP016106|3083054:3092007|3089977_3091153_-|AXU54652.1|DBSCAN-SWA MDKVKFLINMLLAFFIYPFNKHKFNGRDIWLIGGHSGDIYNDNSKFFYEYMLKEHNDVETYWVVNKDSKVFDKIPGKKLIRGSVENYLYYYNSKAIVFSHAPSADIAPYNFAVPVLNYFHKKTIKVFLNHGTISFKKRKPMNKKFKNIIDNLYKSYNIVTASSEFERNVMVNDWGMLDDSVYIIGNARYDNLPTNEVAQTRDILYTPTWRDWIKFSSGKFTDTDYFKNIMNFLNDDKLNKILDEKDINVKIYMHHLMHEFIDDIKENITGKRIVFLDKGVTLANEIRKSAANITDYSSVAIDFLYMNRPILFYQFDLDEYMEKVDSYIDLKSEMFGSLAYNNDEAVNKLIDIIENNFEVMDNQKNERNKFFRYNDNKNCKRIYDCVLSKIK |
8 | Catovirus(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_10 |
3693855 : 3747215
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP016106|3693855:3747215|DBSCAN-SWA 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50 | Agrobacterium_phage(22.22%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_11 |
3768825 : 3790842
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP016106|3768825:3790842|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP016106|3768825:3790842|3768825_3771591_-|AXU55203.1|DBSCAN-SWA 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MFPIKYIDNNLVWNKDNEVFAYYELIPYNYSFLSAEQKFIVHDSFRQLIAQSREGKIHALQIATESSIRSMQEQSKKLVTGKLREVAVQKIDEQTEALVSMIGDNQVDYRFFLGFKLMVTEEQLNLKNIKKSAWLTFKEFLHEVNHTLMNDFVSMPNDEINRYMKMEKLLENKISRRFKVRRLEIHDFGYLMEHLYGRDGIAYEDYEYQLPKKKLKKETLIKYYDLIRPTRCVIEESQRYLRLEHEDKESYVSYFTVNVIVGELDFPSSEIFYFQQQQFTFPVDTSMNVEIVENRKALTTVRNKKKELKDLDNHAYQAGSETSSNVVDALDSVDELETDLDQSKESMYKLSYVIRVSAPDLDELKRRCDEVKDFYDDLNVKLVRPAGDMLGLHSEFLPASKRYINDYVQYVKSDFLAGLGFGATQQLGENTGIYMGYSVDTGRNVYLQPSLASQGVKGTVTNALASAFVGSLGGGKSFCNNLLVYYAVLFGGQALLLDPKSERGNWKETLPEIAHEINIVNLTSDKDNAGLLDPFVIMKNVKDAESLAIDILTFLTGISSRDGEKFPVLRKAVRSVTQSENRGLLHVIEELRKEDTAISRNIADHIDSFTDYDFAHLLFSDGTVENAISLDNQLNIIQVADLVLPDKDTTFEEYTTIELLSVSMLIVISTFALDFIHSDRSIFKIVDLDEAWAFLNVAQGETLSNKLVRAGRAMQAGVYFVTQSAYDVSKESLKNNIGLKFAFRSTDINEIKQTLEFFGIDKDDENNQKRLRDLENGQCLLQDLYGRVGVVQIHPVFEELLHAFDTRPPVQRNEVE >CP016106|3768825:3790842|3778016_3779024_-|AXU55209.1|DBSCAN-SWA MKLKHIAIIGSLFPILFSLVLFFGVLISADSDDENSNFSSGITGMNLSAEVLKHQPMVEKYARENGISEYVNVLLAIIQVESGGTAEDVMQSSESLGLPPSSLDTESSIKQGCKYFASLLSSCKNQDIDDLNVAIQSYNYGGGYVGYVAGNGKKHTFNLAESFAREKSGGKKVTYTNPIAVAKNGGWRYGYGNMFYVELVNQYLTVPQVSGELAQKVMNEALKYQGWKYVFGGSSPTTSFDCSGLTQWCYGKAGISLPRTAQAQYDATQHLPLSQAKAGDLVFFHSTYNAGSYVTHVGIYVGNNQMYHAGDPIGYTDLSSSYWQQHLIGAGRVKQ >CP016106|3768825:3790842|3784168_3784672_-|AXU55212.1|DBSCAN-SWA MIDDMAVYIANLGRYNEGYLVGAWFTFPIDEEDVKEKIGLNEQYEEYAVHDTDNFPIDIGEYVSIEELNEMYEMIEELPDYIVECLDEFISHYGTLEEVVEHKDDIYFYPDCETMTDVAYYYIDELNALGDIPANLQNYIDYEAYGRDLDMGGRFIETSRGICEIPY >CP016106|3768825:3790842|3773129_3773633_-|AXU55206.1|DBSCAN-SWA MKKNISYIPMDSALEIWLLEKLLRDPPDSDCAKDLLSGIQEMIRGEVSSLLLGASEESDWPVGTLSDRILAGDLEIYPRGRKVLIKGSEVNLTPKEFDILYFLVQNKGEVFTKEQIYRAVWEEDYILDNSNIMAFIRKLRKKIEPAPDCPTYILTIWGIGYKFNDQI >CP016106|3768825:3790842|3772314_3772992_-|AXU55205.1|DBSCAN-SWA MFYTDFILRIALSLTLGFLIGLERQLTGHPAGIRINVLICMGTSFFTLFPMLYGSDQVFRVGSSIISGVGFLCSGVIFKDRGTVRGMNTAATLWCTAAIGILASTGMYAMAITAATILIGSNLILRPFARKFHPITSSDESEKQYRISVTCQEKAEQDIRLLLINSNSCKTLFLNNLESGDVVGDKVEIVAEYCSVGKSKNNILEGIVGQVLVIPEVISAGWEVL >CP016106|3768825:3790842|3773648_3776312_-|AXU55207.1|DBSCAN-SWA MSKATLFDSRIKKYAYCRTSEIYRDIGSSPDGLSIEQIGSMREKYGANSFNGRKNDTTMQRLRRAFINPFHVILFVLGIVSLVTDVFVASNFARNATTAIIIFSMIVISGVIRLIQELRAKSAAAQLDRLVHESVTVRRDGKLIEIPGEELVVGDIVLFSAGDRVPADIRLTKITDLFISQAAITGESAIIEKSCRKLSYGEQDTLTQLENLAFMATTVISGKGEGIVLAVGKDTLYGGFTKPDSDDKNSFKKGADSIAWVMIRFMAILVPIVFILLGITDGKWMESFAFALSVAVGLMPEMLPMVITACLAKGSLAMSKKQTIIKDINAMQSFGSMDVLCMDKTGTLTNESILLEYYMDIFGNENAEVLDLAYLNSCYHSGVCNTIDNAILACNTMPGREAHYANLLTKFQKADEIPFDYARKFVSTLVQDSNGNSQLIMKGDIEHIFSRCNHVEYRGKLLPMGQDARQSVSSVVGEMLQDGMKVIAVARKNVGAQKKITPDDEWGMTLVGYLSFFDAPKQTAKESVTALKRLKVIPKILTGDQAAIAVSVCRRVGIYTERILTGTQLDEMTDCELKKAVEHTHVFAELTPGHKVRLVSAMQDNGHSVGFLGDGVNDIPALNEANVGISVDTAVDAAKDAADVVLLQKDLNVLEQGVMEGRKTFTNMLKYIKITASSNFGNIFSIICASAFLPFLPMTSIQILLLNLLYDTLCIVLPWDNVDEEEMLSPRDWSGKTLRQFMLSFGPISSLFDIVTFLFLYYFLCPMLCGGATYLQLTDPSLQLQYVALFQTGWFLESMWTQVLILHFLRTSKIPFFQSRASAPVISITLVGIIAFTSLTFVGGASLFGLTKLPLWYFVFLLLVVSLYMLLNSVAKYFYKKKYQELI >CP016106|3768825:3790842|3786561_3786696_-|AXU55216.1|DBSCAN-SWA MWELVKDFLLVSMGMGIGVVLMCILSIGKEADYEMKQLEESEDN >CP016106|3768825:3790842|3788089_3789484_-|AXU55218.1|DBSCAN-SWA MRMILNKGHRIRASDKNLVYRFSMGTLLFVFVAVILLLNTKQLMRTDWEHFSLLDNGFTLSLYNFITILIATGVCALVAFLYYRFCYDSFKKLLHRQKLARMILENKWYEADTVQDSVFFTDLQSRSREKIVWFPKIYYQMEKGLLHIRCEITLGKYQDQLLRLEDKLESGLYCELTDKTLHDGYIEYTLLYDMIANRITIDEVRAENGCLRLMKNLVWEYDALPHALIAGGTGGGKTYFLLTLIEALLHTNAVLYILDPKNADLADLGTVMGNVYHTKEEMIDCVNAFYEGMVQRSEQMKRHPNYKTGENYAYLGLPPCFLIFDEYVAFFEMLGTKESVGLLSQLKKIVMLGRQAGYFLIVACQRPDAKYFSDGIRDNFNFRVGLGRISELGYGMLFGSDVKKQFFQKRIKGRGYCDVGTSVISEFYTPLVPKGHDFLQTIGFLAQARQDGTATCEAKGDGSD >CP016106|3768825:3790842|3786708_3787905_-|AXU55217.1|DBSCAN-SWA MVLNEEQWIKELREKRIAYGISQGRLAVASGITREYLNKIESGKMKPSKELLETLHKELARFNPEAPLTMLFDYVKIRFPTLDIQHIIKDILKLNINYMLHEDYGHYSYTEHYSLGDIFIYTSADEEKGVLLELKGRGCRQFESYLLAQQRSWYDFLMDALIDGGIMKRIDLAINDHTGILDIPELAEKCRKREYIGKSRSYKYYQSGELIKHREDDREYMGSTLYLGSLKSDVYFCIYEKDYEQYVKLGTPLEEADIINRFEIRLRNERAYYAVRDLLTYYDAEQTAFSIINQYVRFIDEEPDKRKNDWKLNDRWAWFIGDNRQSLKLTTKPEPYTLDRTLRWVQRQVAPTLKMLKKIDKGNGTDYMETIEKQAILSEKHEMIIKQQTTPAKDLVES >CP016106|3768825:3790842|3784689_3785193_-|AXU55213.1|DBSCAN-SWA MQETRVLVETGRTNGEETTSYWFDLPIDVAEFEEKLGVGAESQDYRIIEKVLPYADEVHEHTSVYQLNELDFMYRQLSADMQEEYVELLTVFENLEALYICRNVITVYHDCKSMIDVARQKLMNDPTFKHLSEDCQAYYFDFEAYASHLLENKRYLVTENSIFELPE >CP016106|3768825:3790842|3785506_3786259_-|AXU55214.1|DBSCAN-SWA MISDEMRVDILHAVFINKNFIKDEENCNYEKYLLELVNKSIYFREKSNFAEYVPPKSENHGECDCNSPNYQMDFKLLESTTRLHASKELTGQIQKFCDGVIGKCPPRRPNTQMTVTRLFASLRDYDCESLHSCLTEKYEYGTIEFDIQTYVKLLTFKKNLFFFFPYKFSFNTCYNFKYALDSIRIALEKDFRESNLFREKYYAEYDTFLAYIYEDNLIISKFEQDGKLQMIDCIYLFKSQTYSKLYEYTW >CP016106|3768825:3790842|3790116_3790500_-|AXU55219.1|DBSCAN-SWA MRLSNGFVIDKEKTFGELKFTAVRDVFLQNEDGTPSTQLKKRIYDLKCSLHGGIIPVSVPPEVPLREFPYNAVVELVNPVADTVSRKTYTGADVDWYVKAEDIVLKNKGNQNTGTSQNHTPQGQPKK >CP016106|3768825:3790842|3771756_3772068_-|AXU55204.1|DBSCAN-SWA MDFTCIFFGILFTLAGFWLAFGKGYRHLSLWKNMPQEEKDKINIVPLCRNVGEMIALNGIIFLMKGFLPGFSNHWFVFAIIAWLIVAGFDVWYIEKSVRYRNQ >CP016106|3768825:3790842|3777097_3778000_-|AXU55208.1|DBSCAN-SWA MFKKNKKQTENVKEKKVRTVKVGTHKKTVIALWVVLIASVSFGVYKNFTAIDQHTTHEKEVIELRLQDTNGIENFVKNFAKSYYTWSNSKEAIDARTQAISGYLTKELQDLNMDTIRTDIPTSSAITDVIVWSIEQSGTDTFSATYEVDQQIKEGEQTTAVKATYTVKVHVDAGGNMVIIQNPTLAPAIEKSDYEPKTPEADASVDADTINDATAFLETFFKLYPTATEKELAYYVSGNVLESIGRDYLYSELVNPIFTVDGDNVKVKVAVKFIDNQTKATQVSQFELVLHKESNWKIIG >CP016106|3768825:3790842|3786339_3786561_-|AXU55215.1|DBSCAN-SWA MNFGQNLYQWFLSNAQSLVLMAIVVIGIYLGFKREFSKLIGFLVVALIAVGLVFNAGGVKDVLLELFNKIIGA >CP016106|3768825:3790842|3790515_3790842_-|AXU55220.1|DBSCAN-SWA MEMKYVVPDMAQSFGTLEFAGESEPTFERDKNNRKVIARRSYNLYSDVQKGENVVVEIPVQAGEKHFKYEQKVKLVNPKLYGRGYAIGDVGHTDYVLVADDIVAVEEK >CP016106|3768825:3790842|3779020_3781225_-|AXU55210.1|DBSCAN-SWA MKERIQSAFTKRKILHFLKMALFVVALSLILLSLLGTVAHATGLVDDTINAENLYSKYPLSNYQLDFFVDNSWSWLPWNWLDGIGKSVQYGLYCITNFVWTISLYLSNATGYVVQEAYKLDFINDMADSIGKSIQTLAGVTENGFSSTGFYVGFLLLIILVVGMYVAYTGLIKRETSKALHAVINFVVVFVLSASFIAYAPDYIKKINEFSSDISTASLDLGTKIMLPNSDSEGKDSVDLIRDSLFSIQVQQPWLLLQFGNSNAEEIGTDRVEALVSASPEDEDGKTREEVVKTEIDDNDNNNLTIPQVVNRLGIVFFLLFFNLGITIFVFLLTGMMLFSQILFIIFAMFLPISFLLSMIPSYESMAKQAIVRVFNTIMTRAGITLIVTVAFSISSMFYNISTDYPFFMVAFLQIVCFAGIYMKLGDLMSMFSLNAGDSQSMGRRIFRRPYLFMRHRARRMEHRIARAVSAGGISGGVAGAVAGSAVAGKRAERKNTASKENRGNTTSSMGQRAGSKVGAVLDTKNKVKDKANAVKENIKDMPTQTAYAVYSAKEKAKSSVSDFKRGMVQEQQSRQTGRLEKQEQHKKSIAVKRMELQKAQEARQAQRKADGSATTGATRPHERPATASTVSKTGAEKMQELKRPATTPTTKASEPVKTSGVKERPLSSSTPDGKATQSTYRQNVEKVTVSKETRQNYTKDRRTKVQQTQTVQKNQQTTEKIRNLVTKKGQKKK |
18 | Streptococcus_phage(76.92%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Click the colored protein region to show detailed information
| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP016106.1|AXU54362.1|2761823_2762249_-|phage-like-protein |
2761823_2762249_-
Protein sequences of CP016106.1|AXU54362.1|2761823_2762249_-|phage-like-protein>CP016106.1|AXU54362.1|2761823_2762249_-|phage-like-protein MAKYEYWITEEGLIKIEGWARDGLTDEQIAFNIGINVKTLYDWKKKYSNICNALKKGKEIIDRQVENALLKRALGYEYDEITYEEGQETKRVTKHVVPDTTAQIFWLKNRKPAEWRDKRDIEHSGNLGDITIKVGDEEYGD |
141 aa aa | NA | NA | NA | 2728950-2762249 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 13.22|2175815|36|CP016106|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP016106 position: 2747820-2747785, mismatch: 0 caagcactacgagacaaggcaaatgaaatagaaagt CRISPR spacer caagcactacgagacaaggcaaatgaaatagaaagt Protospacer ************************************ |