Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012309 | Clostridioides difficile strain DSM 28668 chromosome, complete genome | 17 crisprs | csa3,WYL,cas3,DEDDh,cas14j,DinG,cas14k,c2c9_V-U4,cas5,cas7,cas6,cas2,cas1,cas4,cas8b2 | 4 | 50 | 9 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP012309_1 | 17863-17952 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP012309_1
|
1 spacers
spacers of CP012309_1
>1.1|17891|34|CP012309|CRISPRCasFinder AAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012309_1
The CRISPR arrays of CP012309_1 >merge|CP012309|1|17863-17952|CRISPRCasFinder TGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACAGAATAAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGCTGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACGGAAT >CP012309|1|1|17863-17952|CRISPRCasFinder TGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACAGAAT AAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGC TGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACGGAAT
>CP012309.1|AXU70087.1|9856_10630_+|RNA-polymerase-sigma-B-factor MKNVANATHYLNMDTKELFNLYNKNKNVDIRNILIERHLYLARLLAKKYINKGVDFEDIYQVASLALIYAIDRYDVEKGFEFSSFATPTIVGEIKKYFRDKVWTLRVPRRIQELSKKISDAKIKLEQENKKHPKVKDIADYIGVSEEDVLEAMEASYGYQPMSLDSSSNDDSEDKDITLIDKIGKEEGNFGSIEYEDFINKFIETLNELEVKIFKDRFFFDKTQSSIAKELGISQMTVSRLEKKVVEKLKKEYEKNL >CP012309.1|AXU70086.1|9449_9857_+|serine-protein-kinase MACETIKMEITTNPDYVSIIRLTASGIANKMGFPIDDIEDIKVAVSEACTNAIKHSKDDVFNIVFNILDNAINIEIQDNGKGYDVSSISTPDLENPKESGLGLFIIKTLMDDVDIESEHNQGTKIKMTKYLGVDI >CP012309.1|AXU70085.1|9128_9446_+|anti-sigma-B-factor-antagonist MSMNIDSNLDSQNKFWNVCLDGELDVSTADKLKEHLHALIEKNMLDVKINLKDLDYIDSTGLGAMIGVLKKLKINEKEIYIVNPKSNVRKIFTITGLDKIFKVEG >CP012309.1|AXU70084.1|8856_9117_+|membrane-protein MNAWGWQIGAVLVGSSALIVAIYLAKTLNSINKVVEKAYKIVDYNERHIQDIVENASSISKGIDDIVYVINKILSIGNIFKIIKRK >CP012309.1|AXU70083.1|8560_8857_+|Gas-vesicle-protein MCNKRSCKKGGFLLLGAILGFIFGMFFAPKKGSELRKETKEKFNDVKENPKEVLHETFNDVKERIINLVDDDNNEEDIKISEEDIVISKSFDDEGDVN >CP012309.1|AXU70082.1|6065_8492_+|DNA-gyrase-subunit-A MEENNKILPIEIAEEMKKSYIDYSMSVIAGRALPDVRDGLKPVHRRILYSMSELNLTPDKPYRKSARIVGDVLGKYHPHGDTAVYYAMVRMAQDFSTRALLVDGHGNFGSVDGDSPAAMRYTEAKMSKLSLELLRDIEKETVDFKPNFDESLKEPSVLPARYPNLLVNGSNGIAVGMATSIPPHNLAEVIDATVYLIDNPECSVDDLIKFVQGPDFPTAAIIMGKESIAEAYRTGRGKVKVRSRAFIEELPKGKQQIIVTEIPYQVNKAKLVERIAELVKEKRIEGISDLRDESNRNGMRIVIELKRDANANIVLNNLYKHSQMEDTFSIIMLALVDGQPRVLNLKQILYHYIKHQEDVVTRRTKFELNKAEARAHILEGLKIALDNIDAVISLIRASKTGQEAKLGLIEKFKLTEIQAQAILDMRLQRLTGLERDKIEAEYEDLIKKINRLKEILADERLLLNVIKDEITIIKENYSDERRTEIRHAEGEIDMRDLISDEEIAITLTHFGYIKRLPSDTYKSQKRGGRGISALTTREEDFVRHLVTTTTHSRLLFFTNKGRVFKLNAYEIPEGKRQAKGTAIVNLLQLSADEKIATLIPIDGNDENEYLLLATKKGIVKKTKREEFKNINKSGLIAIGLRDDDELIGVELTDGKQEVLLVTKEGMSIRFDENDIRYMGRTAMGVKGITLSKEDFVVSMNLCSKGTDVLVVSKNGFGKRTNIEEYRSQIRAGKGIKTYNISEKTGTIVGADMVNEDDEIMIINSDGVLIRIRVNEISLFGRVTSGVKLMKTNDEVNVVSIAKINIEEE >CP012309.1|AXU70081.1|4144_6046_+|DNA-gyrase-subunit-B MKQEYGASQIQVLEGLEAVRKRPGMYIGSTSPRGLHHLVYEVVDNSIDEALQGYCSDIYVSINEDGSVLVKDNGRGIPVEIHPKTGKSTLETVLTNLHAGGKFGGGGYKVSGGLHGVGVSVVNALSKWMVAEVYLNGKIYKQTYEKGLPTSKLEVVGESQDKGTMIQFMPDETIFDEIEFKYETLEYRLRELSFLNKGIKIVFEDKREGQEKRKEFHYTGGLVEYIKYLNKSRTGIHDDIVYIDKKVDDCFVELAMQYTDGYTENIYSFANNINTHEGGSHLSGFKAALTKTVNDYAKRNKFLKENDVNLLGEDIREGLTAVVSVKLPEPQFEGQTKTKLGNSFMRGIVDSVTVDELGSFLEENPSTARIIVDKALRAQRAREAAKKARELTRRKSVLESTSLPGKLADCAEKDPSKSEIFLVEGDSAGGSAKQGRDRNSQAILPLRGKILNVEKSRLDRILSSDEIKNMITAYGCGIGEDFDIDKARYHKIIIMTDADVDGAHIRTLLLTFFFRYMRPLIDEGYVYAAQPPLYKVTKQKKEHYVYSDKELNILLDEIGRNGVELQRYKGLGEMNAEQLWETTMNPETRTLLQVTVEDAAIADEVFSMLMGDKVAPRKEFIEENARFVRNLDI >CP012309.1|AXU70080.1|3028_4144_+|DNA-replication-and-repair-protein MKLKSLQLVNFRNYKKLHLEFNEKVNLLVGKNGQGKTNIVESIYMLSFGKSFRTNKDKEMVRFNSENLYIGGSFSKYNKYSLIELIIGKDKKGIRINKVPLQKIQELLGNLNVVIFSPEDLRLVKEGPKERRAFIDKEISQIIPKYYKYLTNYNKTLSQRSRVLKNIHVDEALLDVYDDTLAKYGSYIYILRRDFIKKIANISENMHMNLTNGVERLSIRYKNQINITDEDTIDTVYNKFLAKLSSNRPNDIESKTTRYGIHKDDLNIFINDLDARLFGSQGQQRTASISLKLSEIELIKNEVEEYPVLILDDVFSELDEARQKLLVNNLSNVQMFITSAEVSHKKIFDEKNVTIFNIENGDVISIENGGN >CP012309.1|AXU70079.1|2804_3011_+|RNA-binding-mediating-protein MTEITIESEYIKLDQFLKLAEIASTGGHAKFLIQEGLVTVNDEIELRRGKKIKSGDIVEIEGTKIKVL >CP012309.1|AXU70078.1|1561_2668_+|DNA-polymerase-III-subunit-beta MKIICNQKILANRIGIAQKAINGKTTIELLKGILISTEEGQLKLTGYDAEIGIETYVQAEIIEKGDVVVDARLFGDIIRKLPDSFVEIETDSENNIYINCVNSRFKIKGYAAKEFPKLPELNEEDLYSIPQEILKNMIKQTVFAISQDQTKPVLMGELLEIVDRNLNLVAIDGYRLAVKSCSVDSLTENIKVIIPGKTLIDVNSLLSGEDNVKVGFNEKNAIFIINDTKIITRLLEGDFIDYKKLLPREHNSRVKLNTKELLNSIERASLLSQSEKNNLIKLSIRDKVMAITSNTEKGNVYEEVEIDLDGDYLDIAFNSRYFIEGLKNIDNEEIFIEFTTNVNPCIIKPTDDVNYIYLLLPVRISSNI >CP012309.1|AXU70088.1|21364_21874_+|small-molecule-binding-protein MNSNERRSKLIDILKESKHPVKGGTLAELLNVSRQVIVQDIALIRARGFEIIATPQGYIIYNQPYFTKQIKCKNHKDSKEIYDELKIIVDLGGIIKDVIVNHPTYGQITAELNIYSKMDIDNFMKKVETNEFKQLSVLTECSHIHTIEAIKEETIEAIVKELKDNGILS >CP012309.1|AXU70089.1|21885_22767_+|mechanosensitive-ion-channel-protein MNFLSLAKTASTNSNITKRTLENMLDNFSDNIPNIIYAIIVFVIGIYISKIVRRMVSKFLIKYGMSKGVNNFIVYGIYISMLSIISLISLGIIGIQTTSVVAVLGAAGFSIGLAFKEILSNLGSGMIILFFKPFNIGDYIQGSGVEGTVSDIQIFSTVLKTPDNKTIIIPNFQLTSNNIINYTHQNKRRIDFSYNISYDSDIDVVKSILNEIFTNEKRILNDPKPIIGLNSIGNNTMQIVARPWVKTDDYWDVYFDVMEKVKNKFDENDIKVPFVPSSLLFNNTGNLNTMDKR >CP012309.1|AXU70090.1|23225_24497_+|seryl-tRNA-synthetase MLDIKRIRENLDDIKKAMERRGEREFDLDAVVELDNKRREILQEVEVMKNELNVNSKKIPQLIKEGKDVTEEKARLKELSDKIKGIDEKVKEVEAKMEYTLMRIPNVPHPEVPQGETDEDNVQIRTWGEPTKFDFEHKAHWDIGTGLGILDFERAGKITGSRFTLYRGLGARLERSLMNFFLNTHTAKHGYTEVLPPFMANRNSFIGTGQLPKFEEDMFKIEGLEYFLIPTAEVPVTNIHANEILDVAELPIKYCAYTPCFRSEAGSAGRDTRGLVRQHQFNKVELVKFVKPEDSYNELESLTHDAETMLQMLGLPYRVVKICTGDLGFTAAFKYDLEVWMPSYNRYVEISSCSNFEDFQARRAGIRFKRDKKSKAEYVHTLNGSGLAIGRCLAAILENYQQADGSVVVPEELRPYMGVDVIK >CP012309.1|AXU70091.1|24817_25273_+|cytosine/adenosine-deaminase MESSFYMKEALKEAYKAYNKKETPIGAIIVKDNQIIARAHNLTETLKDSTAHAEILAIKQASEKLGGWRLTDCDLYVTMEPCIMCSGAIVNSRIKKLIIGTRHVKNSYIEKQHEFKLDYFNNNNVKVAFDVLQEECSIILQEFFKALRKRD >CP012309.1|AXU70092.1|25743_27381_+|DNA-polymerase-III-subunits-gamma/tau MHKALYRAYRPQKFEDVIGQDHIIKTLKNQIYSDNIGHAYLFCGTRGTGKTSTAKIFSRAVNCLNKINEEPCNECEICESVLKDNTMDVVEIDAASNNSVDDIRELRESVKYSPANAKYKVYIIDEVHMLSQGAFNALLKTLEEPPSYVIFILATTEPHKIPATILSRCQRYDFKRVTVKDMTLRMKKICEDEGIDIDDKALNLIARNSQGALRDALSILDQCMSFGESKIDYKDVVELMGSVNIEQLFELSQCIVEQDTKKSLEILNEFVLWGKDIRNLINDLIDHFRNLMVCKVSSELDEIISLPEETIEQLKIQSKNIDINDLIRILNILSTTQDDIKSSSNPRVLVEITIMKIAQPMFDESKEALIKRVENLEKMIELGNFKSEKIGNNKEKEYEVDREIDVKQENVVYEDVKNEDVILIESSWKNILKQIKKDKKMPIYALLSEVKSFNVYSNMLYVIFDDKFDFAKTRLSSQDTINYLEKTIRDVLNRSFNVKIVLTSEVKDINLEVKEKKDIGEEILKNIVSEEILEIKDSIDENESK >CP012309.1|AXU70093.1|27439_27790_+|DNA-binding-protein,-YbaB/EbfC-family MAKKGFGGGMMPGGGNMNNLLKQAQKMQENMQKAQQELESKEVEASVGGGAVTVKVNGKKEVIDITIKPEVVDPDDIEMLQDLVLSAVNQALRNIDDIQASQMSKVTGGMNIPGLF >CP012309.1|AXU70094.1|27802_28402_+|recombination-protein MQVYTGPITRLIEEFSKLPGVGRKTAQRLAFHIINMNTNDVEALSKAIIDAKREIRYCSICCNITDTDPCSMCSNKSRDSSVICVVEDPRDVAAMERTREFKGQYHVLNGVISPMDGIGPDMLKIKELIQRLGNQEVKEIIMATNPTIEGEATAMYIARLVKPMGIKVTRIAHGLPVGGDLEYADEVTISKALEGRREI >CP012309.1|AXU70095.1|28542_28764_+|hypothetical-protein MKPIMNLEEHNAMKEKRVKKMKSKDKPKYDDFEDISFSNKKKTKKNVRNKNAEFRNNYKNYQYDYEEDFYEPI >CP012309.1|AXU70096.1|28834_30040_-|glycosyl-transferase MSKKVLIMSASTGGGHNRAALAIKEELTSKTLDGEPIECEIIDSLKLVNNTMDKIISRGYEKSAIYTPKAYGSVYRLSETNLLSKNEFKDNLLITFMAKKFKKLIRSEKPDLIIGTHPFPMIALSTLKKNFNLHNNESNAYTEHFYKHYTNTINVPPLISVLTDYTTHSTWIQNEIDYYIVGHEYVKELLVFDGVEPSKIRTFGIPVEKSFLSHRDKDIVLSELNLSPDKLTVLLMGGSFGAGNIKETLDELLDTDRDFQILVITGKNESLKEKIEKKLMSRYHDKNVCVLGYTDKMNDILASIDVLVSKPGGLTTTEALLKDVPMIVPYYIPGQEEENLDFLSNCGAALRTTKKYNLSILLKVLIDDPSRLEMLKRNIKSIRKSNSAQNIANLILNIISG >CP012309.1|AXU70097.1|39397_39811_+|hypothetical-protein MYIVIGNEIVDSEELKIIIDKNSEFKVEKDLSKSTKREDVIAYQLSIDLNYLDSLINEQCNLASLSDEEKFDEYMTLSDELALDLEELMPKYTIINARAYKLDEVDGIVKIILAVAYADLGHLKLSDVVKRLSRQVD |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP012309_2 | 138113-138199 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP012309_2
|
1 spacers
spacers of CP012309_2
>2.1|138138|37|CP012309|CRISPRCasFinder ACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGCTGTGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012309_2
The CRISPR arrays of CP012309_2 >merge|CP012309|2|138113-138199|CRISPRCasFinder GTTAGCACTTTAAGCAACAGAATAAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGCTGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACGGAATAA >CP012309|2|2|138113-138199|CRISPRCasFinder GTTAGCACTTTAAGCAACAGAATAA ACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGCTGTGC GTTAGCACTTTAAGCAACGGAATAA
>CP012309.1|AXU70190.1|128411_129164_+|germination-specific-N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MEYYSVFISIHIQGDVVRKYIKHIIFSFAMICLVVVSIFEIKNISEDVIKYMPVTNKTIILDAGHGGIDPGALNKDKSTSEKDINLAITLKLRELIESSGGLVILTREDDSSLYKEENNKTTRQKYNENLKNRKEIISNSNANMFVSIHLNAFEQSKYYGAQTFYPKDKQDSKELSKCIQEELKRVVDKTNNREVKPRDDIYLLKENNIPSVLIECGFLSNEKECKLLTDETYQEKIAWAIYIGIQKYLS >CP012309.1|AXU70189.1|127560_127953_+|30S-ribosomal-protein-S9 MANVQYYGTGRRKSSVARVRLVAGEGNILVNGRALENYFNYETLIRDVKQPLVLTGNENKYDVIVKVEGGGFTGQAGAIRHGISRALLKADLDLRPALKKEGFLTRDARMKERKKYGLKAARRAPQFSKR >CP012309.1|AXU70188.1|127100_127532_+|50S-ribosomal-protein-L13 MKSYIAKPADVQRKWYLVDAEGKTLGRLATEIATVLRGKHKPTFTPHVDGGDFVVVVNAEKIVLSGKKLDQKYYRYHTGYVGGLKEISYRDMMDKKPEEVISHAVSGMLPKNKLRSRMMTRLRVFAGAEHTHAAQNPEVLNFK >CP012309.1|AXU70187.1|126249_126981_+|tRNA-pseudouridine-synthase-1 MRNIKIKIQYNGKNYCGWQKQPDSLGIQGTIERAIYDITKEETSLIGSGRTDSGVHAIGQIANFKINSGISIESIPMALNAKLPKDISVIEACEVNDDFHSRYSAKGKTYKYLVYNSKFRNPILSEISYQVKYELDFDKMCSEAKSLLGTHDFKGFMSSGSSVKDTVRTIYDIDISKKDDLITFEISGNGFLYNMVRIIVGTLVDMGRGRINEPFLDIIQSKTRSRCGHTAPAQGLFLKKVHY >CP012309.1|AXU70186.1|125414_126218_+|ABC-transporter-permease MLKDITIGQYYPTSSAIHKLDPRIKLVATIVFMVSIFVVNKFWPYIVVLLCLLAMIKLANIPVKYIVKGVKPLKWIILFTFLINIFFLPGDEIWSFGFLAITKQGLRQAIFMAIRLIFLVVGTSLLTLTTSPIELTDGIERLLNPFKKIGLPVHELAMMMTIALRFIPTLLDETDKIMKAQMSRGADFESKNLINRAKNLVPLLVPLFVSAFRRADELAMAMEARCYRGGHNRTKMRESVISRRDYMACVFQVVYLGAIIATRFIAI >CP012309.1|AXU70185.1|124554_125421_+|cobalt-transporter-ATP-binding-subunit MSIIVKNLTHIYNEGMPFASKALDDVSFEIKDRDFVGLIGHTGSGKSTLIQHLNGLLKPSSGEIFINDFNITDKNLNLTEIRKRVGVVFQYPEYQLFEETIDKDIAFGPSNLGLEESEIHNRVKASMEAVGLDYEGFKDKSPFELSGGQKRRVAIAGVIAMNPEVLILDEPTAGLDPGGRDEIFNLIKDLHEKKNMTIILSSHSMDDMAKLAKTLIVMNHGSVEFMGTPREVFKSNASKLKDIGLDIPQVLELALKLREKGFDISEDILTLEEAKQEILKVVRGRGLC >CP012309.1|AXU70184.1|123733_124567_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MDNIVKVNNISFEYITDEAKLKAIDNLSLDVKKGEFVAIIGHNGSGKSTLSKNLNAILMPTEGNILIDDMDTKEEERLWDIRQTAGMVFQNPDNQIVATIVEEDVAFGPENLGIEPKEIRRIVEESLKSVGMYDLRDRQPHLLSGGQKQRVAIAGIIAMRPKCIIFDEATAMLDPSGRKEVMKTIKRLNKEENITVIHITHFMEEAVEADRVVVMEKGKKILEGTPREVFSKIKMLKEIGLDVPCMTELSSLLIEEGINISSDILTVDEMVMELCQL >CP012309.1|AXU70183.1|123272_123614_+|50S-ribosomal-protein-L17 MAKYRKLGRETAHRNLMLRNLVTCLLRSGRIETTVTRAKETRRMAEKMITLAKRGDLHARRQVLAYVMDETVVNNLFTDLAPKYAERNGGYTRIIKIGPRKGDAAEMAFIELV >CP012309.1|AXU70182.1|122304_123252_+|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-alpha MIEIEKPKVDIVELSEDYRYGKFVIEPLERGYGITIGNALRRILLSSLPGVAVNAIKIDGVLHEFSTIPGVKEDVTEIILTLKELSATIDGEGSRTLKIEAQGPCSITGADIICPPDVEILSKDLAIATLDDNAKLNMEIFVDKGRGYVSAEENKTENVPIGVLPVDSIYTPVEKVSYHVENTRVGQKTDYDKLVLEVWTNGSINPQEGISLAAKVLVEHLNLFIDLTEHVSSVEIMVEKEEDQKEKVLEMTIEELDLSVRSYNCLKRAGINTVEELANKSEDDMMKVRNLGKKSLEEVIQKLEELGLGLKPSEE >CP012309.1|AXU70181.1|121603_122227_+|30S-ribosomal-protein-S4 MARYTGASCRQCRREGMKLFLKGDRCYTDKCAIVKRNYAPGQHGQGRKKVSNYGLQLREKQKVKRIYGVLETQFRNLYERAENMPGKAGENLLSLLERRLDNVVYRMGLASSRKEARQLVTHGHFTLNGNKVDIPSLIVKVGDVIEVKEKSRSSAKFKNLVEVNSRIAPKWLEANVEGMTAKVVGVPTREDIDLEIAEHLIIELYSK >CP012309.1|AXU70191.1|141759_142944_-|aspartate-aminotransferase MLSKRLNFITPSYTIGISSKVKEMESNGVKVINLSIGEPDFNVPNNAKSYGIDSLNKDYTKYDLVPGLKILREEICKKLIEENNCNYSIDEIVVSSGAKNSITNTLLALTDEGDEVLLPKPYWVSYPEMIKLVNAVPVFIDTKKENGFKLTKEELEKSITDKTKILVINNPSNPTGSVYTKDELIEIVDICIQNKIYILADEIYEKICYTGEFTSIASLSEEAKDITITINGFSKSAAMTGLRLGYTASNKTIAKAMSSIQGHLISHPSLTAQYIAYGALKDCSIDIDNMVKTYKSRRDLIKSKLDSIDNVGYVNPNGAFYIFIDLSKVSEKFEYKDSFSIEFCNQFLEEYNVAVVPGIAFGMDKYIRISYACSENTFLSGLDKLKEFVYKIMA >CP012309.1|AXU70192.1|143316_145668_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase MVEFVKKRDGRVIPFNEDRITRAIFLAATNVAEREGIVPDYKLSEQLTQEVIKFLNHKYSESVPSVEDIQDSVVKVLIETGHAKTSEEYIIYRTERSRIRNSKTRLMKAIEEITFEDAEDADIKRENANINGNTAMGTMLQYGSTVSKEFCKTHILKPEHSFAHDNGDIHIHDMDFLNMGTLTCCQIDVKKLFNGGFSTGHGFLREPQDIISYGALAAIAIQSNQNDQHGGQSIPFFDYGLAEGVYKTFKKFYIGNLAKALKLFKGIENNDVIKNIVYNTEKETNQKVGLKRDELYLNLEKEKLIQTFDIDDELVNKMQNFAFEESYRETDKKTYQSMEAFIHNLNTMHSRAGAQVPFSSVNFGTDTSEEGRMVTKNLLLSQERGLGNGETPIFPILIFKVKEGINLNPKDPNYDLFKLSCRVSAKRLFPNFSFLDAPFNAKYYKKGEPDTEATYMGCRTRVLSNVCGSETVSGRGNISFTTVNLPRLGIKHGIINNEKANLDGFFEELDEKINLIIEQLLERLEVQGNKKMKNFPFLMGQGVWKGSDDLGPEDTLKEVIKQGTLTIGFIGLAECLIALIGKHHGESKEAQELGLKIVSHMRHKMDEATDKYKLNFSLMGTPAEGLSGRFTKIDKKVYGEIKGITDKEYYTNSFHVPVYYNISAYDKIEIEAPYHELTNAGHITYVELDGDPSDNLEAFETVIKAMKDLGIGYGSINHPVDRDPICGFSGVITSNICPVCGRNEDESDIKFERIRRITGYLVGTVDRFNNAKKAEVRDRVKHR >CP012309.1|AXU70193.1|145689_146229_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase-activating-protein MKIRMSSTISYDSIVDGPGLRMVIWTQGCIHNCKECHNPQTHDLCGGFYMDTEEIINKVKSLKLQKGITLSGGEPFLQPEPLEEIAREAKINGLDVWSYTGFTFEQLLDKKNRAYFKNLNLLKQIDILVDGKFIAEKKDISLKFRGSSNQRIIDVQKSLKYKKVFLVEQYMKDDLSIAE >CP012309.1|AXU70194.1|159360_160200_+|DNA-integrity-scanning-protein-DisA MLDINSFLNGFFNIILRMSIYDLIDISIVAYIFYKIFMFIKDTRAEQVFKGIIFLLLATQLSNTFKLHTVYWISLKALDYGVIAALIIFQPEFRAGLEHIGRAKFNLFGKNVNTSEETLNRNIEEIVEALYSLSRQKIGALIIMERETRISDIINTGTIIDAEISRQLLINIFIPNTPLHDGAVVIRDSKVKAAACFLPLTESKDLSKDLGTRHRAGIGVSEVSDCITLIVSEETGGVSIAKAGKLYRDISRERMMNILRSNLKTNTETRSFFKGGIFK >CP012309.1|AXU70195.1|160196_161378_+|membrane-associated-protein MINRLKNNTKIKIISFLSAIALWMYVMAVVDPEETKGFEDIPVSISNMSDLKDKNLVIYPDEKLTADVYIKGSLSKVQSVKKEDIHVYGTIEDPIQGQKEVYLKANIPQGVTLEFKHDVLVVNLEKNIKEKRDIKVEVSGNSKRNINKIELSKEFVDVSGPRTLVKEVKSVRANLDVGNETDDFSKKLQLIPLNSDGTKVEGVTLSSSFVTAKIELLKEKIVPIRVSLNDNKDNDVLKNYKLSKEQVTIKGKKEDIDKISYIKTKPIDLADLANGEEKEVSLEIPEGITLEDSSITIKLNDTKQLSAEFLYNAGDIELRNIPTNMDNPNVISDVDIKVVVESTEDLSKLNKKDISLYIDLSQGPEEDSKYKIKYETTYQFKKINIEPNIVEVE >CP012309.1|AXU70196.1|161681_162584_+|phosphate-butyryltransferase MRSFEEVIKFAKERGPKTISVACCQDKEVLMAVEMARKEKIANAILVGDIEKTKEIAKSIDMDIENYELIDIKDLAEASLKSVELVSQGKADMVMKGLVDTSIILKAVLNKEVGLRTGNVLSHVAVFDVEGYDRLFFVTDAAMNLAPDTNTKKQIIENACTVAHSLDISEPKVAAICAKEKVNPKMKDTVEAKELEEMYERGEIKGCMVGGPFAIDNAVSLEAAKHKGINHPVAGRADILLAPDIEGGNILYKALVFFSKSKNAGVIVGAKAPIILTSRADSEETKLNSIALGVLMAAKA >CP012309.1|AXU70197.1|162605_163685_+|butyrate-kinase MSKIFKILTINPGSTSTKIAVFDNEDLVFEKTLRHSSEEIGKYEKVSDQFEFRKQVIEEALKEGGVKTSELDAVVGRGGLLKPIKGGTYSVSAAMIEDLKVGVLGEHASNLGGIIAKQIGEEVNVPSYIVDPVVVDELEDVARISGMPEISRASVVHALNQKAIARRYAREINKKYEDINLIVAHMGGGVSVGAHKNGKIVDVANALDGEGPFSPERSGGLPVGALVKMCFSGKYTQDEIKKKIKGNGGLVAYLNTNDAREVEERIEAGDEKAKLVYEAMAYQISKEIGASAAVLKGDVKAILLTGGIAYSKMFTEMIADRVKFIADVKVYPGEDEMIALAQGGLRVLTGEEEAQVYDN >CP012309.1|AXU70198.1|163674_164352_+|ATP/GTP-binding-protein 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CP012309_3 | 146710-146788 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP012309_3
|
1 spacers
spacers of CP012309_3
>3.1|146735|29|CP012309|CRISPRCasFinder TGTAATAAGTTAAAGCAATATGAATCAAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012309_3
The CRISPR arrays of CP012309_3 >merge|CP012309|3|146710-146788|CRISPRCasFinder TGTTTATAATGTGGATAATATTTAATGTAATAAGTTAAAGCAATATGAATCAACTGTTTATAATGTGGATAATATTATA >CP012309|3|3|146710-146788|CRISPRCasFinder TGTTTATAATGTGGATAATATTTAA TGTAATAAGTTAAAGCAATATGAATCAAC TGTTTATAATGTGGATAATATTATA
>CP012309.1|AXU70193.1|145689_146229_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase-activating-protein MKIRMSSTISYDSIVDGPGLRMVIWTQGCIHNCKECHNPQTHDLCGGFYMDTEEIINKVKSLKLQKGITLSGGEPFLQPEPLEEIAREAKINGLDVWSYTGFTFEQLLDKKNRAYFKNLNLLKQIDILVDGKFIAEKKDISLKFRGSSNQRIIDVQKSLKYKKVFLVEQYMKDDLSIAE >CP012309.1|AXU70192.1|143316_145668_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase 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You can click texts colored in the table to view more detailed information
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CP012309_4 | 154239-154323 | Orphan |
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|
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spacers of CP012309_4
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012309_4
The CRISPR arrays of CP012309_4 >merge|CP012309|4|154239-154323|CRISPRCasFinder TGTGTGTTAGCACTTTAAGCAACAGAATAAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGCTGTGCGTTAGCACTTTAAGCAAC >CP012309|4|4|154239-154323|CRISPRCasFinder TGTGTGTTAGCACTTTAAGCAAC AGAATAAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGC TGTGCGTTAGCACTTTAAGCAAC
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MLSKRLNFITPSYTIGISSKVKEMESNGVKVINLSIGEPDFNVPNNAKSYGIDSLNKDYTKYDLVPGLKILREEICKKLIEENNCNYSIDEIVVSSGAKNSITNTLLALTDEGDEVLLPKPYWVSYPEMIKLVNAVPVFIDTKKENGFKLTKEELEKSITDKTKILVINNPSNPTGSVYTKDELIEIVDICIQNKIYILADEIYEKICYTGEFTSIASLSEEAKDITITINGFSKSAAMTGLRLGYTASNKTIAKAMSSIQGHLISHPSLTAQYIAYGALKDCSIDIDNMVKTYKSRRDLIKSKLDSIDNVGYVNPNGAFYIFIDLSKVSEKFEYKDSFSIEFCNQFLEEYNVAVVPGIAFGMDKYIRISYACSENTFLSGLDKLKEFVYKIMA >CP012309.1|AXU70190.1|128411_129164_+|germination-specific-N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MEYYSVFISIHIQGDVVRKYIKHIIFSFAMICLVVVSIFEIKNISEDVIKYMPVTNKTIILDAGHGGIDPGALNKDKSTSEKDINLAITLKLRELIESSGGLVILTREDDSSLYKEENNKTTRQKYNENLKNRKEIISNSNANMFVSIHLNAFEQSKYYGAQTFYPKDKQDSKELSKCIQEELKRVVDKTNNREVKPRDDIYLLKENNIPSVLIECGFLSNEKECKLLTDETYQEKIAWAIYIGIQKYLS >CP012309.1|AXU70189.1|127560_127953_+|30S-ribosomal-protein-S9 MANVQYYGTGRRKSSVARVRLVAGEGNILVNGRALENYFNYETLIRDVKQPLVLTGNENKYDVIVKVEGGGFTGQAGAIRHGISRALLKADLDLRPALKKEGFLTRDARMKERKKYGLKAARRAPQFSKR >CP012309.1|AXU70188.1|127100_127532_+|50S-ribosomal-protein-L13 MKSYIAKPADVQRKWYLVDAEGKTLGRLATEIATVLRGKHKPTFTPHVDGGDFVVVVNAEKIVLSGKKLDQKYYRYHTGYVGGLKEISYRDMMDKKPEEVISHAVSGMLPKNKLRSRMMTRLRVFAGAEHTHAAQNPEVLNFK >CP012309.1|AXU70187.1|126249_126981_+|tRNA-pseudouridine-synthase-1 MRNIKIKIQYNGKNYCGWQKQPDSLGIQGTIERAIYDITKEETSLIGSGRTDSGVHAIGQIANFKINSGISIESIPMALNAKLPKDISVIEACEVNDDFHSRYSAKGKTYKYLVYNSKFRNPILSEISYQVKYELDFDKMCSEAKSLLGTHDFKGFMSSGSSVKDTVRTIYDIDISKKDDLITFEISGNGFLYNMVRIIVGTLVDMGRGRINEPFLDIIQSKTRSRCGHTAPAQGLFLKKVHY >CP012309.1|AXU70186.1|125414_126218_+|ABC-transporter-permease MLKDITIGQYYPTSSAIHKLDPRIKLVATIVFMVSIFVVNKFWPYIVVLLCLLAMIKLANIPVKYIVKGVKPLKWIILFTFLINIFFLPGDEIWSFGFLAITKQGLRQAIFMAIRLIFLVVGTSLLTLTTSPIELTDGIERLLNPFKKIGLPVHELAMMMTIALRFIPTLLDETDKIMKAQMSRGADFESKNLINRAKNLVPLLVPLFVSAFRRADELAMAMEARCYRGGHNRTKMRESVISRRDYMACVFQVVYLGAIIATRFIAI >CP012309.1|AXU70185.1|124554_125421_+|cobalt-transporter-ATP-binding-subunit MSIIVKNLTHIYNEGMPFASKALDDVSFEIKDRDFVGLIGHTGSGKSTLIQHLNGLLKPSSGEIFINDFNITDKNLNLTEIRKRVGVVFQYPEYQLFEETIDKDIAFGPSNLGLEESEIHNRVKASMEAVGLDYEGFKDKSPFELSGGQKRRVAIAGVIAMNPEVLILDEPTAGLDPGGRDEIFNLIKDLHEKKNMTIILSSHSMDDMAKLAKTLIVMNHGSVEFMGTPREVFKSNASKLKDIGLDIPQVLELALKLREKGFDISEDILTLEEAKQEILKVVRGRGLC >CP012309.1|AXU70184.1|123733_124567_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MDNIVKVNNISFEYITDEAKLKAIDNLSLDVKKGEFVAIIGHNGSGKSTLSKNLNAILMPTEGNILIDDMDTKEEERLWDIRQTAGMVFQNPDNQIVATIVEEDVAFGPENLGIEPKEIRRIVEESLKSVGMYDLRDRQPHLLSGGQKQRVAIAGIIAMRPKCIIFDEATAMLDPSGRKEVMKTIKRLNKEENITVIHITHFMEEAVEADRVVVMEKGKKILEGTPREVFSKIKMLKEIGLDVPCMTELSSLLIEEGINISSDILTVDEMVMELCQL >CP012309.1|AXU70194.1|159360_160200_+|DNA-integrity-scanning-protein-DisA MLDINSFLNGFFNIILRMSIYDLIDISIVAYIFYKIFMFIKDTRAEQVFKGIIFLLLATQLSNTFKLHTVYWISLKALDYGVIAALIIFQPEFRAGLEHIGRAKFNLFGKNVNTSEETLNRNIEEIVEALYSLSRQKIGALIIMERETRISDIINTGTIIDAEISRQLLINIFIPNTPLHDGAVVIRDSKVKAAACFLPLTESKDLSKDLGTRHRAGIGVSEVSDCITLIVSEETGGVSIAKAGKLYRDISRERMMNILRSNLKTNTETRSFFKGGIFK >CP012309.1|AXU70195.1|160196_161378_+|membrane-associated-protein MINRLKNNTKIKIISFLSAIALWMYVMAVVDPEETKGFEDIPVSISNMSDLKDKNLVIYPDEKLTADVYIKGSLSKVQSVKKEDIHVYGTIEDPIQGQKEVYLKANIPQGVTLEFKHDVLVVNLEKNIKEKRDIKVEVSGNSKRNINKIELSKEFVDVSGPRTLVKEVKSVRANLDVGNETDDFSKKLQLIPLNSDGTKVEGVTLSSSFVTAKIELLKEKIVPIRVSLNDNKDNDVLKNYKLSKEQVTIKGKKEDIDKISYIKTKPIDLADLANGEEKEVSLEIPEGITLEDSSITIKLNDTKQLSAEFLYNAGDIELRNIPTNMDNPNVISDVDIKVVVESTEDLSKLNKKDISLYIDLSQGPEEDSKYKIKYETTYQFKKINIEPNIVEVE >CP012309.1|AXU70196.1|161681_162584_+|phosphate-butyryltransferase MRSFEEVIKFAKERGPKTISVACCQDKEVLMAVEMARKEKIANAILVGDIEKTKEIAKSIDMDIENYELIDIKDLAEASLKSVELVSQGKADMVMKGLVDTSIILKAVLNKEVGLRTGNVLSHVAVFDVEGYDRLFFVTDAAMNLAPDTNTKKQIIENACTVAHSLDISEPKVAAICAKEKVNPKMKDTVEAKELEEMYERGEIKGCMVGGPFAIDNAVSLEAAKHKGINHPVAGRADILLAPDIEGGNILYKALVFFSKSKNAGVIVGAKAPIILTSRADSEETKLNSIALGVLMAAKA >CP012309.1|AXU70197.1|162605_163685_+|butyrate-kinase MSKIFKILTINPGSTSTKIAVFDNEDLVFEKTLRHSSEEIGKYEKVSDQFEFRKQVIEEALKEGGVKTSELDAVVGRGGLLKPIKGGTYSVSAAMIEDLKVGVLGEHASNLGGIIAKQIGEEVNVPSYIVDPVVVDELEDVARISGMPEISRASVVHALNQKAIARRYAREINKKYEDINLIVAHMGGGVSVGAHKNGKIVDVANALDGEGPFSPERSGGLPVGALVKMCFSGKYTQDEIKKKIKGNGGLVAYLNTNDAREVEERIEAGDEKAKLVYEAMAYQISKEIGASAAVLKGDVKAILLTGGIAYSKMFTEMIADRVKFIADVKVYPGEDEMIALAQGGLRVLTGEEEAQVYDN >CP012309.1|AXU70198.1|163674_164352_+|ATP/GTP-binding-protein MITNDKRIRIITGHYGSGKSEFAMNYVVKLRDMVSGKVAIADLDVVNVYFRTREKKELMKSLGIQPIDSSINAPTLDLPAVSAEVMSPMVDHSYNSVIDLGGDNVGARVIGRFSHLLKEGDYDMLFVINANREKTQTSEEVIQYIKEIEKSSKLKVTGLINNTHLIRFTTIDDVLRGQKVAKEVSEKCNIPIRYVACLENLVEQLPKDLEGEIFPIKLYMREDWM >CP012309.1|AXU70199.1|164394_164610_+|ferredoxin MAKGKVSFNQERCKGCGLCVEACPVKIIQLDSNVINKKGYNPATVFEMEKCIGCASCATMCPDVVITVERD >CP012309.1|AXU70200.1|164638_165718_+|2-ketoisovalerate-ferredoxin-reductase MAKILMKGNEAFGKAAIEAGCKYFFGYPITPQSELPEYLSRELPKIGGAFVQAESEVSAINMVYGGAGAGARVMTSSSSPGVALKQEGITYAVGAEVPCVVLNVMRGGPGLGSIQPSQADYFMSTRGGGNGDYRTPVFAPATVQEAVDMIMEAFDVADYYRSPVMVVADGMIGQMMEPVEFRAPEKKRELPPKDWATVGTKGKRKPNVINSLYLEPEVLEDHCWHLQEKFDAMEKNEVQYEMYKTEDAEFVFAAYGTTSRVVKSAIDILREEGIKAGLIRPKVLWPFPFEAFNQIPNARNILTVEMSMGQMVEDVKMAVEGKLPVYFHGRPGGMTPTPAEIVEKAKKIIAGELVAGGAR >CP012309.1|AXU70201.1|165717_166470_+|subunit-of-oxidoreductase MAVVFKKTEGLQDTQTHYCPGCTHGIIHRLVGEVLEELGVLGDAVGVVPVGCSVLGYKYFNCDTQEAAHGRAPAAATGIKRVHPENTVFTYQGDGDLASIGTAEIVHAAARGEKITTIFVNNTTYGMTGGQMAPTTLVGQRATTAQSGRNAETQGYPIRVSEMLATLTGAVFVERVAVDTPAHVRQAKKAIKKAFQVQQAGLGFGIVEVLSTCPTNWGLAPNDALQWLRDNMIPYYPLGNFKNVEVEEVK >CP012309.1|AXU70202.1|166470_167028_+|subunit-of-oxidoreductase MSTARVICAGFGGQGVMSMGQLLTYAGMLEGKEVSWLPSYGPEMRGGTANCAVTVSNEPVGSPLITDDATAAILLNIPAFEKFKDDVIPGGKIIVNSSLIKEKVDRTDVDVYYIPANELAAELGNDKVANMIMLGAYLKVSDTVDIESVLEAFKKVFGPRKEKFVPLNREALQKGMDATCSKATN >CP012309.1|AXU70203.1|167197_168544_+|phosphoglucomutase/phosphomannomutase-mutase MRKYFGTDGVRGVANTELTCDLAYKLGRAGGFVLAQGDHRVKVVVGKDTRISGDMLEASLIAGLMSVGCDVITVGIIPTPAVAYLTRKYGADCGVVISASHNPVEYNGIKFFNKNGYKLDDEIELKIEEYIDDIDKIDCLPIGENVGRKLHEHCAQRDYVDYLKSIISTDFKGLKVVLDCANGASYKVAPIVFDELGASVISINSSPDGNNINYKCGSTHPEQLQRAVLEHNADLGLAYDGDADRLIAVNEKGQIVDGDHIMILSALNLKKNNKLAQDTLVVTVMSNIGLTIAAKENGINLSTTAVGDRYVLEDMVKNGYNLGGEQSGHMIFLDYNTTGDGVLSSLILANIILQEKKPLSEIASIMSQYPQVLVNATIKNENKNKYMEYPEIKTEIERIESILDGNGRVLIRPSGTEPLVRVMLEGKEEGQIKELATNLANLIQEKLS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012309_5 | 572206-572530 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP012309_5
|
6 spacers
spacers of CP012309_5
>5.1|572228|37|CP012309|CRT AAATAAGTAAATTAAGTAAGATGATAACAAATGAGAT >5.2|572287|22|CP012309|CRT CAATAAGTAAATTGAGTAAGAC >5.3|572331|34|CP012309|CRT AAATAAGTAAGTTAAGTAAGATGATAACAAATGA >5.4|572387|22|CP012309|CRT CAATAAGTAAGTTAAATAAGAT >5.5|572431|38|CP012309|CRT GCAATAAGTAAATTAAGTAAGACGATAACAAATGAGAT >5.6|572491|18|CP012309|CRT TAATAAATAAATTAAGAT |
WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012309_5
The CRISPR arrays of CP012309_5 >merge|CP012309|5|572206-572530|CRT GATAATAAGTGAATTGATATAGAAATAAGTAAATTAAGTAAGATGATAACAAATGAGATGATAATAAGTGAATTGACATAGCAATAAGTAAATTGAGTAAGACGATAATAAGTGAATTGATATAGAAATAAGTAAGTTAAGTAAGATGATAACAAATGAGATAATAAGTGAATTGATATAGCAATAAGTAAGTTAAATAAGATGATAATAAGTGGAATTGATATAGCAATAAGTAAATTAAGTAAGACGATAACAAATGAGATGATAATAAGTAAATTGATATAGTAATAAATAAATTAAGATGATAATATCCAAAGTGAGAAAG >CP012309|5|1|572206-572530|CRT GATAATAAGTGAATTGATATAG AAATAAGTAAATTAAGTAAGATGATAACAAATGAGAT GATAATAAGTGAATTGACATAG CAATAAGTAAATTGAGTAAGAC GATAATAAGTGAATTGATATAG AAATAAGTAAGTTAAGTAAGATGATAACAAATGA GATAATAAGTGAATTGATATAG CAATAAGTAAGTTAAATAAGAT GATAATAAGTGGAATTGATATA GCAATAAGTAAATTAAGTAAGACGATAACAAATGAGAT GATAATAAGTAAATTGATATAG TAATAAATAAATTAAGAT GATAATATCCAAAGTGAGAAAG
>CP012309.1|AXU70548.1|570853_571705_-|hypothetical-protein MEINKKHFIQVFLTCLILVVICEFIGQRTIAIGKASIVLFPMLYAVIIGLIITPDLLGKKIKALKKVVGEKEINIAGEVVGIALVMLGIKYGTTVGPNIDKIIQAGPAFIAQEFGHILAPIVALPLALMFGMKREAVGATASISREPSLGVISEKYGINSPEGSGVLGTYLMGTVLGTIYFSVLGSISIYSGLHPYALGMACGVGSGSMMTAAAGSLSTMVPPEMADTILAYAATSNMMSSITGIIFLVFVSLPFTNFMYKILEPKFSRNKKTKEIKSTEGEC >CP012309.1|AXU70547.1|570379_570850_-|hypothetical-protein MFANLNLKKSSYQLLVMSVIGVIILIGQRISVGTSIVTALPGMVMLILAAMAAMIIKDLFPKSIFPAFGFATIIGLLLSMPYSPTSEVFLTNTNNINFMAITTPLLAFAGISVGNKIEALKEMSWKIVIISLIVFTTIFFACASIAHIVLSIQGKI >CP012309.1|AXU70546.1|569056_570367_-|amidohydrolase MNKEQLKSLVIKTIDENREKILKIGQGIYKNPEYGYKEFKTTEAVSNFFEQELNLSVEKNIAVTGCKADANSSKKGPHISILGELDGISCKEHKDANEIGASHTCGHNIQIAGMLGAAVGLVKSGVLEHLDGKVSFMATPAEEFIELEYREQLKKEGKITYFGGKQELIKRGYFDDIDISMMFHASDLGEDKALVGPESNGFVGKKVKFIGKESHAGSAPHDGINALNAAMLAINNVNALRETFKESERVRFHPIITKGGDIVNVVPADVHMESYVRARTINGMIDANERINKALMAGGMAVGADVEITEIPGYLPILRYKSLDNLFKNNLEDLGLKGKVIDGGDFTGSFDFGDVSHIMPTLHPMIGGVKGALHTRDFEIVDEDLAYIIPAKAMALTVVDLLFDNAKDAKDILDTFTPVMTKEEYLTFLEKHDKTL >CP012309.1|AXU70545.1|568098_568845_-|metallo-beta-lactamase-superfamily-hydrolase MFNAGNRIINTWLYPIQDGFVLIDTGYENGFKHFKKRISKFNIKIKDIRYIFLTHAHDDHVGFLNQILDESPNTKIVMHDKALEILYKGQNSFIGGCTSRTAFLFCQIMKLFGKGEHSFSPLKQEFEKRCILVSDKNRKEIEKELNGKIIDTPGHTADSISLLIYDGVLFCGDSAMNGFPSTHKITIFAESKLEFIQSWKTIINTKPKMIYPGHGKPFEYSKLEQNLIYVNKINLYPLHNSKDIHRFL >CP012309.1|AXU70544.1|566195_567737_-|aminobenzoyl-glutamate-transport-protein MNDNVVKKKNFFDRTLNRIETVGNKLPDPVTIFLGLCVLLLILSSLVGSMGISVVHPGTGETITAVNLLTVEQLQILLGNIVSNFQGFAPLGLVLVTMIGAGVCDKTGLMTATIKASVSKIPETRVTLVVMTIGMLANIASDAGTILFPPLAALVYLGVGRHPLIGLFSGYAAVCLGFAANIMISVNDILAASFTVPAAQMIDSGFQANATMNLFFMIASTFVLILLATWVTEKIVAPRFGKYEGNAELDVDGSLSDVEKKGLKKAGISILIYVAIIVALSVIGKKPFLADPETGDLLSNNAPLMKGMVPIIALAFFIPGVVYGKTIGKIKKDKDVVSIMASAMSDMGGYIILAFAASQFLQLFTNSNLGLILAVKGGEFLKSAGINGPLLLIGFIILSCFINLFIGSASAKWAILAPIFVPMFMMVGYNPALTQMAYRIGDCITNPLSPLFPYFPIILAFTRKYDKDAGMGTVIANMIPYSISFLIVWTILLILFMVFNIPLGPGILPSYSM >CP012309.1|AXU70543.1|565054_566161_-|peptidase MLDKNRLINNFMDMVRIDSPSNQELEMSKWLVNYLKERNIDAIIDDAGEKYGGNTGNVIAYIKGEEGSRPLCLCAHMDQVQPCLGVKPILDGNVVRSDGTTTLGADDKAGIAAILEALEHVITEKIPHRDIYLCFTICEEAGMHGVKNFNPDNLPCKDMVILDSGGAIGSIAYKAPAQQSIKISFHGKKAHAGIEPEKGLNAILVASHAISNMHIGRIDSLTTSNIGKIEGGGATNIVTDKVTLTAEIRSHIPETLEYELNHMEKCCKDAASKFNTTYTFEHNMSYPSFELSRDSHVFKLSEEAIRQVGIVPNPMVIGGGSDANILANLGYNCAILSLGMYDVHTVNEYVNIDELYDTAKIVYHMIKL >CP012309.1|AXU70542.1|563557_564844_+|transcriptional-regulator MIVGIIGPSDSGFKIKDDLKQIDSDLKTKIYVREKVVDTIEVISKCEDECDAIIFTGCAVYEFIKSKYEISKPHSFVPRSGTSIMKAFWAIKSANIKLDKFSIDVVDRYVVEDALKEFDIKATSVFCNPFSLEVGESELVEWHIKLFEENKTDIMLTGFGAVYNELKERGYPVFRLQATIQLIKESYDKVKSEYALSKARFSQIAVEILSLIDYKEKIDNYYSDMIKKSDMDKLVVNYVRSIQGSLFLLGRNDYVVFVHKGVADNEYNYDKLFNLKREIKDMGFSLSIGIGTGVTAYQAENNAHKALRHSIDSKEIGIYLVDEDENIRGPLASENELNYSLMLSDEKVIEISKKTGMSCESVAKIIAINENRKSKIYDSKELAEYLNVSERSARRILNKIVNAGLGRICAKETSIGGGRPKNITEILF >CP012309.1|AXU70541.1|560336_563435_+|signaling-protein MDVINLIDELDEIVYVSSLDTYELLYINEIGKKAMGLNDISHLKCYKALQGKDSPCEFCTNSILKEDEYYIWENTNTRTNRHFILKDKLIKWEGKHARLEIALDITEKEDISKSIAEKLEIKELLVGCIKHLITESNFSDAVNLVLTNIGKFHKADRAYVFEVSEDRTKVTNTYEWCNEGVDEQKQALTNLDINELKNWFLLFEQKGFVIIDDIENIKEEQPIEYEILKPQKIESLMTSSLKQDDKVVGFIGVDNPHKAVGDTSLLTSLSYFLLTEMKKRKVENKLNYMSYYDFLTGAYNRNKYIKYIDNFQKGKVKSIGVVFVDINGLKDINDNFGHANGDSAIVSACVIIKKYFHSYNVYRIGGDEFVVLCEDISKQLFEELVSWLSEEFKDEMIYSVAVGSIWSDDNIDIHKLIKVADERMYQDKKRYYNKNKLRNNEMKVISDLADSTNNILFKHKELVDKVYFDDLMIKGYSKAYEKLAYNTYDIILSICIDTNLITPIYQSESNIFSFPIKENLEKTFSYIKKHLIHPDDIILFNDNHLLKSLDSLNNSKQDDLELNFEYRRLGIDKKYYWALIYMLKISSKNKLGEKQTHILVAIKNIDYLMQLHKNQKDTLTGLYNYESFCEQISLMLKRYPDKRYAIIMMDIDKFKVINDIYGVRGGDKALIYVAELIQKNIGSNGICCRMYADVFCIFYESYSDRDIHKVIYKIKNSLNRKKFEYMLVPCFGVYRILDNHIPITNACEMAGYAHKKVKKQSINNYIFYDDTIRNDALEEKQMEREMEYALENGQFHVYLQPKYNLNANKIVGAEALVRWVHPEKGIIPPIKFISLFEKNGFIIRLDMYVWEQVCSLIRKWIDLGEEPVPISVNVSRLHLHNPHFKEIVLSLINKYSIPKSFLELELTESLFIKNIKLFTKIIADLRMDGIVLNMDDFGSAYSSLNMLKNINIDTLKIDCGFFNEEGITDREKIVLKHTIAMAKDLDMDVVAEGVETKEQAEFLVSLDCVVIQGYYYCKPIPSADFEKLLYQK >CP012309.1|AXU70540.1|559453_559612_-|hypothetical-protein MKIFSFLLFVIGICLCIAGFIGHYPVFVGTTLSFLAIAMIAVRQVKTKKKMK >CP012309.1|AXU70539.1|558462_559167_+|two-component-response-regulator MEIKPLVLIVEDDKPICKFIKVSLETQNYRCVETDNGGTAISLIHSLDPDLIILDLGLPDIDGIEVIGRVRACAKTNKIIVVSAREHERDKVEALDGGADDYLTKPFSVTELLARVRVALRNKAQQDNINNDAPKSFEVKNLKIDYENHIVSINGEEIHLTPIEYKIIELMSKYSGRVLTHKFIIDKVWGNYYESENQSLRVFMASIRRKIEKNPAQPEYILTEVGVGYRMADE >CP012309.1|AXU70549.1|572655_573567_+|DeoR-family-transcriptional-regulator MKINRLTEIIVILLNKKLVTAKELADRFEVSTRTIYRDIETLSMSGVPVYMTKGKGGGISLIEEYSIDKAILSKKDKESLIVALKTLQATKYPEINSVVNKIGSIFGEQNFSNWIEIDFTEWGSNFNEDDKFTKIKEAILRRNTINFNYVNSLSSQTNRTVEPLKLMYKSKTWYLYGFCKLKDDFRIFRISRIRNLSIKDEVFSRKIIEEVCLNDSKVIKENTITLKLRFKEKMLFRVFDDFNKDLITKNEDDTYDVITEFPIGEWIYGYILSFGDNVEVLEPKDVRDNVITRLRELSKIYSL >CP012309.1|AXU70550.1|573741_574239_+|AraC-family-transcriptional-regulator MNYEIVEINEKIVIGISKETTNKDGQAVNDIGELWKKFMGKGIYNAIKGKKNDKTIGLYTDYQGDFTSPYSFVACCEVNSNSDKEKNLEELNTNNTVGESIISKVIPAGKYAKFVIVGGQKEVGDFWFEFWQMDFDRTYISDFEEYQCNTFDTKKQEVHIYIGIK >CP012309.1|AXU70551.1|574981_575344_+|chemotaxis-protein MENKILIVDDAIFMRMIIKEALSKSGYNNLIEANDGEEACNIFKYEKPDLMLLDITMPKKDGLEVLREIKKLDSSAKVVMCSAIGQENMIVEAIKLGALDFIVKPFKTETLVKVVNNVLK >CP012309.1|AXU70552.1|575504_576026_+|chemotaxis-protein-CheC MINSNVEVLIPMVKILEYNEATNLLGGPENKVVCILLDMKGDINGMFMFLLDESITQLMLSSLFNKEEAFLDEIEAIEISAIKEIGNIMASSYVNAIASMLNMTISVSIPDICIDMVGAVLNVPMIRFSDVGDKVLFIENKFKMSDNYFTSHILMIPEMSSLREILVRLGLEV >CP012309.1|AXU70553.1|576022_576508_+|chemotaxis-protein MNREIVVNIADMKIAYRPNVLVTYALGSCVGVCLIDKVAGIGGMLHVMLPYSKDAINIENKCKFADTGINELIKSMENIGANRIYIKAKIAGGAQMFLGSSNSVIASIGHRNVEAVKKTLLGLNIPILAEDTGMNYGRTIRFYTETGELLVDSINKGKKKL >CP012309.1|AXU70554.1|576550_577069_+|chemotaxis-protein MRFPDDPYLDYGLIDEGIKYLKFKVDEQDFGVELEKVIEITGNQEIIFIPELPTYSKGIINLRGKIIPIIDMRLRLKKDELMTTNCMYIVVTEIKDLVVGFVVDRVDDIVSLEKSKISPPPRVTIEYSDYFVSGVGELEGKIITLLDLEKLLTDKDEVLIDELINGFDCTIM >CP012309.1|AXU70555.1|577204_578164_+|chemosensory-protein MKNKQQGTILVVDDSVLMCDLIDKTLTKDNFKVKKAFNAIEAKEFIEEFIPDIILLDIILPDNSGFEFCKEVKSNARTADIPIIFITSKNTDTDIVKGFGVGAIDYMVKPFSMTELKARVIAHLEVKKSQDKLKKINNELESSLEKLNRLVVRDYLTGLYNRRHIINQLMEQRRINKYSETSISLILGDIDDFKVINDTYGHEAGDFVLTVISSIIKKNCRQIDTVSRWGGEEFLIMLTNTPIEGAKILSERIRKEIKEFDFNYKEHKIKCTITLGVVEVNSNISLEENISLADKAMYEGKNLGKDCSVVSTMKGLKKI >CP012309.1|AXU70556.1|578189_579893_+|methyl-accpeting-chemotaxis-protein MKREVKLSKLAIVLLIIIVLAVLAGIFSSISSYKAFEKVEKSINDMNNLRTQSQYIKDTTREISDVLRRYVFTGEKKNKDIYEKELYGKTRESALNKLEKIGLTKSESNKILEAKEISDSLVPTEQSAIKAVESNDKSKAQSIIFGSDYINSQEKMDSLINEFQEDIVTRSNSKIVEVKKELQSLILRTIFILSLLIILTIIEYTVIKLKIVIPINKVEKHFSRIASGDLRTSIDVEESKSEIGLLVSSVKKMQSMLLNYIDLIDSTLTSIAKGDLRVEIDQEFIGDFKSIKISLESIINSFNGDFSEINLSAEQVASASEQVAAGAQALSQGATEQASSVEELASTINEISDGIKKCADSASLACEVSDQSASQVGFGSRCMDDMMTSMGEISEKSSEISKIIKTIDEIAFQTNILALNAAVEAARAGQYGRGFAVVADEVRSLAGKSAKAAQNTAILIEEAIKTVENGVRIAKETANALDLVVNGVEKTTNYINGISSAVHSQEVAITQILSGIEQISIVVQMNSATAEESAAASEEMSAQAQILKELVEKFHLKESEVRESSWV >CP012309.1|AXU70557.1|580123_582256_+|chemotaxis-protein MINVNYIEPSMRQMLDMFIFETSLLLEQLDEIMIQIEKEKVFTHNNINETFRIMHTIKGSASMMGLDNISALAHSVEDLFYAIREGKIEVLDNDLLFDLVFQSLDFIRRDIDELQSRGCISSDYSNFIEGIEEYVSTLELSSSMKSKDNANLESKDEKEVIDSNFEYKEDSDVVKIIFEQGCMMENVRAFMLVFELRDYCEFIDFYPKDVETNAESTEYIKSYGFYIQFVAKEDKAIVYKTIEDNLYVKEYINISKKEIEMKNTSNNDAVENKLKDNNKVSKSYQNNYTEDEIQEDVLNEKTDMEKDSLSEENEHLPISKQSIMSVNLEKLDLLQNIVGEIVIMESMVVNSVNSTGVDIDNFNKATRQLHKLTDELQDIVMSMRMIQIAGVFQKMHRIVRDMNKKLDKNVELITIGAETEVDKSVIDNLAEPFMHLIRNAMDHAIEPIEERIAKGKEEVGKIVLSAENLGGEAVISISDDGRGIMRDKILAKAKEQGLLKHQSNEYTDDEVNSLIMTPGFSTKESITEFSGRGVGMDIVRKSIEKVGGSIEVKSKQDEGTTFTIKIPLTLSIVEGMKFKVGDSLFTLPISSIRRTFKLTDLNQIITEGNKTELITIYGACIPIIRLHKIYNIQTKVTNLMNGNMIIIENEHKAVCIFVDEIIGNQQVVVKPFPVYFNRFNIKNKGLSGCTILGDGSISLIIDADSIIEIY >CP012309.1|AXU70558.1|582268_582709_+|chemotaxis-protein MAKDEIIKQVLTFYVNDVIYGIELENVIETIRFQSITYVPCLPTYISGVINLRGRIIPVINMHIKYNLPKADYNERTCIIITKVDEYQVGIIVDKVVDVIHIENLNLLETTNSNNTNINKDIKEIAKVEDNSILILDIRKFLINSI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP012309_6 | 1112547-1112635 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP012309_6
|
1 spacers
spacers of CP012309_6
>6.1|1112574|35|CP012309|CRISPRCasFinder AATCTGAGTGAATACGAAGGTTGTTCGTTGACGTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012309_6
The CRISPR arrays of CP012309_6 >merge|CP012309|6|1112547-1112635|CRISPRCasFinder GTGCGTTAGCACTTTAAGTAACGGAATAATCTGAGTGAATACGAAGGTTGTTCGTTGACGTGGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACGGAAT >CP012309|6|5|1112547-1112635|CRISPRCasFinder GTGCGTTAGCACTTTAAGTAACGGAAT AATCTGAGTGAATACGAAGGTTGTTCGTTGACGTG GTGCGTTAGCACTTTAAGCAACGGAAT
>CP012309.1|AXU70996.1|1109671_1110646_+|mannosyl-glycoprotein-endo-beta-N-acetylglucosamidase MARKLIKNLGKSKSVKRVKLLFKKIFITVFIVASIVAIFNITKYFEELYKVRDLKSTKIEYYMDVADEAGDGKVQLSWKALLAIDMVIHDEDLSNIKKKDTLDIGEKFIVEDKNDKGEKVYKVKKFNKVLSELKFDSSQKSRARKYMKDLEYTYLGNKQLDSSDEKIKFIKKLEDSAIREYIDYGILPSITIGQAILESGWGNSKLTKQSNNLFGIKADKAWKGKSVEISTSEHYNEKIVASFRSYNSLQDSVKDHSLFLINNKRYRKHGLFEAKDYISQAQSLENAGYSTAEDKKGNRIYAELLIDVIRSYNLQLIDNKVETK >CP012309.1|AXU70995.1|1108469_1109594_+|UDP-N-acetylglucosamine-2-epimerase MNDIKVMTVFGTRPEAIKVAPLIKELEKRENINSIVCVTAQHREMLDQVIETFNINVDYDLDIMEKGQSLNDITCKILNKLPLILNKENPNIILVHGDTTTTLATSLTAFYNKTLVGHIEAGLRTYDKYSPFPEELNRQLTGIIADMHFAPTNLARKNLISEGKPNNNIFVTGNTAIDALKMTIKENYNHPIIDEIGNDRMILLTSHRRENLGKPMKNIFRAIKRIVDDFEDVQIVYPIHLNPKIRTIADEIFGKFPEKIHIIEPLDVADFHNFLNKSYMIMTDSGGIQEEAPSLGKPVLVLRDKTERTEGIEAKTLKLVGTNEDRIYNSVSDLLINKDNYVQMSKASNPYGDGNASKYIVDIIIKKFNCKYLN >CP012309.1|AXU70994.1|1107342_1108416_+|TIM-barrel-fold-family-protein MNEFKLKRSILISLIILIFIFIVYFVSIELKDRSLVNNQYKGKIKSANLSVDYEINQVMKDIDKLGLNTVNVPIIINVESINSDIMSIDNNSKEKAIKLIKKLNKKGISTILEAYPWIENGKLYETDWNPINKKRFFYTWQNAILNELIIDVANPLDVNVLNIGSNFVHLEEYQQNWGEIIDFVQSKFDGLVTYRTNWWYTKKDDLSSKLFYEQKLNNNFFDKLDFISIAAYFELSNKPVNTVDELISALHSSTVNNRGQNIKQEIYNLYKAHRKPIFFGELGFSNRESASSQPWNHTPSKAVNGEEQARCFEAYKKVFENEDWINGFSVFCVGKIDDEKNFYPSKESIKVIKSWYE >CP012309.1|AXU70993.1|1105212_1107294_+|cell-wall-anchored-protein MKKFIISIISLVLFFSNISLIYKVNADETKVKNYKFERDITIDGVIGSNSTFFEVNKNWDIEEVLLHLNFSKSQILNGDVSSLTVLINNVPIKSIKLNAKTNYKNTLEVLVPKDYIIQGYNEIKIKTYKTISDKICQDDSNTGNWMVIHKESYISIRYKQKKVENSINEYPYPYAEIENNHKLDTTIVVPDNMTRGETTAVFNLASAFGKITKNDDLKLDVKLYSEMKNWSDDNIIYIGKPENTAEEILDILSIKEQTLLSSNCIIKQVDSPYNKNKKMMVVIGSNEDDLIKASNLLIENRLSNQVLSSSVLVNKETNIKINREQKLNLGHLTLKDLGYSDFLLEGAFNQQALFDVKIPTGKVLDDGSKIILNLRYSDNLDFEKSLVTVSINDVIVGSKKLDRSHSNNDKLELKIPKDIDNKNYYQVKLTFNLSIKNSNCVTRESNNPWAYVSNNSYLALSTKENETLSFENYPYPFVRDDEFNDLTVIMPDYSGSQAMTWMFRLGVTLGANINSHNGNINVIRGKEFSDKYKDTNIVVFGVPHNNSVIKMLNNNLNIKFDKNYSNFISNDKISFIDDYGKNISTIQLIKSPYNNQKNIMVISSMNEKNLYLGMDYLLNKSKVNDLKGDTLIIDEYGEVEDLAYNLKSKKEVKDSSWNMSINKTTKVFLMISFITIIVVMILSMLYIKKYKRR >CP012309.1|AXU70992.1|1103933_1105190_+|glycosyl-transferase MRDLNVSEYLFVFSLFSIWSLLLINIILAMGGYIFYFKNFDKEIKEIDEYPMISILVPAHNEAKVIGRTVESLLLLNYPKSKMELIVINDNSSDNSKEILENIKDRYNNYNFTIINTDSLTGGKGKSNALNIGYTISKGDFIAVYDADNTPDKNALRYLVQTIVMNDELGAVIGKFRTRNKNKNLLTKFINIETLSFQWMSQAGRWQLFNLCTIPGTNFILRRSIIEEIGGWDSKAIAEDTEISFRIYKLGYKIKLVPQSITWEQEPETVKVWIKQRTRWAKGNIYVLMKYIKNIFKQGRNKIVFDIAYFFSVYFLFLTSVIISDILFVLSISKLVEISIPINFFLIWILSYLLFIIEVSISLTIEKGEATIENIFIVAIMYFTYSQLWLFVAIKGMIEYLKDIIFKREVKWYKTERF >CP012309.1|AXU70991.1|1102220_1103885_+|cell-wall-anchored-protein MMFKIFNKSLLKLVVVLSIVLTISNFSLSSYASEITSSTDKVLIIYDSKKETAYNRDILNIMRTLLGRFSSDIELLKLSNYDGEINKNYYSHIFILGINENSYNNDKNTKNLISSLNSYKGTICWLGYGIENLLEHKKYNLDYVGKTNNIVSVNYRGKSYNLDEHYVFNIVESKDTSNKVIGSINDTLNKYPYIINDKNLFYVSKLDLDGVLFYIFCDSLNDIFNIKTFDKGRIFVRIEDVHAFREPKNLVEIADYLSSKNIPFTIALIPAYVNPKNHKVITLSESPEIVKAIKYMQDKGGTVILHGYTHQYKKEEVSGEGYEFWDGKKDEPLKENMKIFVKDRVLNGLRVCIENGIYPLAFEAPHYAMESEGYKELKKYFSTYMGQHQNNDKKFSTNTYPYIIRDTEEFNIFIPENLGYIDPEDKFTFQNIKENLNKLSIVRGFSGGFFFHSYLNIEYLKNTIEYLEKQNIEFMNLRDFNNWVKVDEIQIRNNGDEIIVNYDKDLDELTKSDTRFKSISNISKILIFIVSTSVLIFVIIFIYFKRIDKKKFLK >CP012309.1|AXU70990.1|1101382_1102231_+|signaling-protein MNRINKKIDLLILALLVFIFLIVGIVILSIRTENKLNVFIMLAIIFFIIMLTYLSNSVVGLITSSIIIFMYTSYILYNNITHNMDVEFISYMWIIATPVSSIIMGNLNKSINELQNTNKKLSEQYKELVTIDSETGLRNLKIFYNDVNMEISKSIRHNTDFSLMIVKLPYYGNLQTIFGENKTNKIVKYIGSNIIECTRNEDIIYSLQKDMIGILMPNTSLEGSKVVKDRIKKRIKELNLDLNNRGKYVNIDVKIAFLQYKSSFGDSINFKNIVEEELQYDV >CP012309.1|AXU70989.1|1100100_1101153_+|spermidine/putrescine-ABC-transporter-substrate-binding-protein MIKFKKAISLIAVGMMTVTLFTGCNKATDSTKVLNVYNVGDYIDESLIDKFEKETGIDVQYSTYDTNEMMYQKVKSGSTHYDLVFPSDYMVEKMKNEGLLEKLDFKNIPNMKYLDKSFLNPVYDKTNEYSVAYMWGTLGILYNKKEVKDPMDSWNILWNPKYKGNIMMFDSVRDTIGITLKKLGYSMNSVNPKEINEAKNLLMKQKDLVLAYVNDEGKDRLLGGEVAMGMLYSGDAVTLMEQNPDLDYAIPKEGTNKWVDAMCVPTTAQNKKEAELFINFLLDPENAKVNAEYIGYSTPNTGALKLLDPEITQNPVAYPSKEVLDKCETFEDIGENIKLYDKAWIELKSK >CP012309.1|AXU70988.1|1099372_1100101_+|spermidine/putrescine-ABC-transporter-permease MYAPIFALVLFSFNDSKSMARWNGFTWKWYGQLLQNESIMSALYYTIVIAILASVISTIVGTISAIGIHKMRGKSKKLILNVNYLPILNTEIVTAVALMSLFVFVKMEFGFTTMLLAHIMFCLPYVILSVLPKMKQLPDNIEDAAMDLGATPIYALRKVILPQIKPGIVSGFLIAFTMSIDDFIISFFNAGNGVSNLSIEIYGMARRGIKPEINALSTIMFAVVLGLLLLANKKESIVRGIK >CP012309.1|AXU70987.1|1098485_1099322_+|spermidine/putrescine-ABC-transporter-permease MKRKSFLAYPYVVWSAIFVIIPLILVVFFSFTKESGGGYAFTLENYKEVIDPIYMKVFGRSILLAGGATLICLIVGYPVAYIISKARVSRRGSLILLFILPMWMNFLLRTYAWVAILGKNGLLNTFLGWFGIQPLAILYTNFAILLGMVYNFLPFMVLPIYTALSKMDNDLINAAHDLGANNMTVFRKIIFPLSLPGVMSGITMVFMPAVTTFAISRLLGGGKIMLVGDLIEQQFTVVGDWNFGSAISIFMMIVILISMSIMSKFGDESDKEGGGLLF >CP012309.1|AXU70997.1|1116241_1118260_+|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MRRNTKLLTTGILSMAIVTPTMAFATESNAMENNADLNINLEKKSIVLGSTSKVSVKFKEKPDADSITLKYKCYDMPLDTTLNYNQSTESYEGTINYNKDPEYLNVWELQGITINSKNNPKTLNKQELEKMGLNLKDYNVTQECIIEDITSRKDVNKYLRKTSAPITELTGSDRYETAVKISKEGWKNGSDKVVIINGDVSIDGIISTPLATTYNAPILLVEKNNVPNSVKSELKRLNPRDVIIIGDENAISKTTANQIKSTVNASQTRLKGSNRYETSLLIAKEIDKNHDVEKVYITNANGGEVDALTIAAKAGQDKQPIILTDKNSITDNTYKWLKSEDLQNAYFIGGPQMISTNVINKVNDITKDNVTNNRVYGADRHETNANVIKKFYTDDELEAVLVAKSDVLVDALAAGPLAANLKSPILITPKTYVSAYHKENLEAKSANKVYKIGGGLTSKVMNSIASSLSKHNTTPTEPGNSGGKTVMIDPGHGGSDTGTTGKPLGGIKEKDYTLNTSLATTEYLRSKGFNVIMTRDTDKTLSLGNRTALSNSLRPDLFTSIHYNASDTTGNGVEVFYKLKDKDGGTTKTVATNILNRILEKFNLKNRGAKTRTLSTDPTKDYLYVLRNNDMPAVLVECAFLDNEKDMSLLNTSNKVKEMGTQIGKGIEDSLK >CP012309.1|AXU70998.1|1118764_1120777_+|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MRRNTKLLTTGILSMAIVAPTMAFATESNAMENNADLNINLEKKSIVLGSKSKVSVKFKEKPDADSITLKYKCYDMPLDTTLNYNQSTGAYEGTINYNQDPEYLNVWELQGITINSKNNPKTLNRQDLEKLGLNLKDYNVTQECIIEDITSRKDVNKYLRKTSSPITELTGSDRYETAVKISKEGWKNGSDKVVIINGDVSIDGIISTPLATTYNAPILLVEKNNVPNSVKSELKRLNPKDIIIIGDENAISKTTANQIKSTVNASQTRLNGSNRYETSLLIAKEIDKNHDVEKVYITNANGGEVDALTIAAKAGQDKQPIILTDKDSITDNTYKWLKSEDLQNAYFIGGPQMISTNVINKVNGITKDSVTNNRVYGADRHETNANVIKKFYTDDELEAVLVAKSDVLVDALAAGPLAANLKSPILITPKTYVSAYHKDNLEAKSANKVYKIGGGLTSKVMSSIASSLSKHNTTPTEPGNSGGKTVMIDPGHGGSAPGNSSGGMIEKDYNLNTSLATTEYLRSKGFNVIMTRDTDKTLSLGNRTALSNSLKPDLFTSIHYNGSTNKQGHGVEVFYKLKDKNGGTTKTVATNILNRILEKFKLTNRGIKTRVLPSDSTKDYLYVLRSNDMPAVLVECAFLDNENDMSLINSSAKVKEMGTQIGKGIEDSLK >CP012309.1|AXU70999.1|1121018_1122932_+|hypothetical-protein MEYLFEKSSLKEYGNEALDKYRELLDKTGNNSRCILLLVPNNNTKIRYERALRLNYSEELKITTYISFVKKELVKYWPLIIEKCDGISTKAVSPTFISNSLSEYLIVQKVKEKRIQEGYFEDITGTNKSIANSIMTNINKSAFNLIDFDFIGEKIYSSKKNKDSIYRFSYTQMDEIISYYINSLLSNSILDNALSIYLYNQYLLNDDFYLKNLFTEVRYIIVDSLESSSNAEVDFITEALDNTLQSYIYFDYSRDYSVFNNVDIDYINEKIISKIKPKEENIKKKEIRIEDLYLLPANIELNQSSQLYNEMLDLISEKVISLIEEDVSPRDIAIISPINNSILEHQIRDSLIEKNIDVFSTKKDKKAVDYPYGNALVVATCIFYGYLDFIKDDEYLSFLETLLEINRIKAFKIFNETRHLSIDNIDEHSQYRDILQYIEEKKKSDIKIHEFLTQFYIDKMLNLKEGKKNVGLCKKIIAESESFSESLSLLGMKKEKIFVEALKSTINDYYSVVDIEELKSKDKIVITTPYSYISSNIDRSIQIWVDIGSNAWNMKIEKDISNLIVLRKSFKEKKIYTNEMEEYYKKYYLYNTVYNLLLNAKKIYAFKSEYAINGYIQESILYSILLKISHKGDKNYD >CP012309.1|AXU71000.1|1122924_1125144_+|helicase MININYREDQIPIINYDNGTMAVPAVPGAGKTFIITNLVAKLLLEQKHKGGKILILTYMNSAVNNFKGRIRKILEENKIDDTNSYEVMTIHSLAVKIIKEKPEVVMLSEDFNIADDLQKSIILNECISRFRFEGGERAFRWFLKEQKDERWKEITLEAWERGFFEFAGNAISELKYKGISPDKLEEILSRGHKGMLKIILPIYKLYDRKLKQNGLLDYDDILILAEKTLSLDEGLRKKFQTRYKYIFEDECQDSNEIQGNIIKIISSENKNLVRVGDINQSITGTFSSSDPKFFKEFINSADFCYRMDMSNRSSKDILDLANTLVKYVTKEFRQKECRHALEDMQIKTVPNGMGYKENPNPEHYNINVKWYESWKIEIEQTARYVKGIKNKYPDKSIGILVPFNEQVTQVAKELRENNLTFEELGPNSLNKRKVINNIAYIIDFMLHCDDVEKLIVVLNKVFIDTDNEEEIKYFLEELKNYSTEEIIYNFEFSKLDNDLIEFKEESDIYLSFKRGIDIIKQILEYPIIRLDLLVLFIGKKLNLEKEDKAVLDYISFYIKYLVSENINMDLEDVYNLLFDVKNRVFNHIIDVVYEINGYEPEPGSITLCNYHKSKGMEWDCVFLLGLVEYNFPDNINQKFQSDKWYLKEKYKNPMAIIKSEVEAILKGSISTDYAHKTKIDSINEKIRLLYVGITRAKEMLVLSGSAYRDESDIGNKRKEQKPCIYLSRLNQHIIEKRSN >CP012309.1|AXU71001.1|1125252_1126083_+|Inactivated-superfamily-I-helicase MNDKLKYFSYSQNSINTYKSCPLKFKYKYIDRINWKNDDVGSREYYETLKTGRDFHLICERYFSNIPLGIYFNEDDKNSKKFLKWMENIKKVVPIEKGKTYLPEYEVRMTLNGDIIQAKYDLVVIGNNNIEIWDWKTESKKIDYKHVENRIQTIVYMFLAKEVIPKVLKMDINVKDINMRYYQPEFDDLPITISYDEEKHEANRNKIQNYISMIKNTNYEEHTYEDNLYNDIEKVYNKEERMCYRNKKHCKYCEFNKLCNGKEIDYSILEAEIYGT >CP012309.1|AXU71002.1|1126072_1129540_+|ATP-dependent-nuclease-subunit-B MGLRFVLGRSGSGKSTYILDEIKKEAQKNETTSIILLVPEQYTFEAENRVSKLFLGKEKDKYLRVRVLSFKTLSNIVFSQVGGLTDVNINSSGKAMMVYRAIEDVSEELNVFSKSKSQSGFVSSITDMISEMKQYNISPEMLENISGELDNETLSLKLKDISKIYNSFEGKLHENYVDAQDMLTSLASKIELSSYLDGACVYIDEFTGFTPNQYNVIKSILNKSKSVNISLTVDDINYIGYSKSDMFSRTKFTYSKLTQLCNEEGIKILPQVNLNTGVIKRFEKVKELQHLERFYNAYPYKIYSNQTENIKIKEFNNLYSEVEEIAREIVHLVRDKNVRYRDITIATRDLNRYDFLVHSIFNEYNIPNFIDKKREAKSNPIVILIISALEMKNRRYGYETMFRYLKSGLIGIDNDDINLLENYVLANGIKGKKWFDEKWDYRITQSLSGQESEFELELKEKINEIKNRVLEPIVILQEKLRGKNRVKEICRYIYEFLLDINMPETIESLIVNFKDKGELDVANQYSQVWDIVVDILDQMVELMGDEIISLEKFIKLITLGFDEYELGLVPPSIDQVLVSSVDRMKNPDTKYLYLVGTTDGVFPLITKDSGILSDNDRESLGNKGIEVDIDSKTRSFEEQFLVYKALTSTSKNLTITYPISDHEGKTLRPSIIISRLKKIFPNIENKSYLVEENKSTDKDILKKITVKSPTFNELINVIKNYDSDGYNTEEINSIWLDIYRYYLKDEIYSSITKKVIKGLSYTNQVHKIEEKKIRSLYKSNSLSISRLEKYAECPFAYFIQYGLKAKKRKEYSFTPPDLGTFIHNILDRFSKELLQDNLTWRDIDEKYIELKIGIIVDEIILKIPGYILNSSERYKYLAYRLKNMLTTAITIISQQIKQGSFEPIDYEVKFGDNGKYPPIKMVLENGQEVSLIGQIDRVDEFEEGENKYIRIIDYKSGNKSISLTEIYYGLQLQLLVYLDAILESAKDEDININPAAILYCRINNPIAKFNEDKDDEEIQEAILKELRMKGLVVKDSHIVKEMDKSLIDGERKNSLVIPVGLTKDGNVGKSTSAISYEDFKLLRKYVRHAIKDLCEEMLSGEIRIAPYKHKDGTSCDFCDYSAICQFDSTIKDNKYKNLNNKSNEEIIKMMKGDVN >CP012309.1|AXU71003.1|1129539_1133367_+|ATP-dependent-nuclease-subunit-A MSSPKWTKEQLEVIESRECNLLVAAAAGSGKTAVLVERIIQMITSRENPIDIDKLLVVTFTNAAASEMRERIGDAIGKALDENPENKHLQNQLVLLNKSSITTIHSFCLDVIKSNFHRINLDPNFRIGDQTECAILKQEAIEEVFEDLYEERDEGFLNLVESYAERGGDKEVQDIILGIYSFAMASPEPKKWLIDSAERFNIDENFDFSQSIWARAILDTVKIEINGLCLNMERALKEVESIEELETFAEKLSVEYKKIADISQACNKSWDEAYKKMASMSFENYVKGVKRISKDAPSYIKESKEKAKTIRDKTKKSLESIVSATFNKDNDSIREEIKYLYNIVKPISSVVLRFEEEYSNKKREKGIIDFNDIEHFALNILTDVDEKGNIVPSDIAVGYRNKFYEIFIDEYQDSNLVQEVLLKAVANTETPNRFMVGDVKQSIYRFRQAKPELFLQKYNNYNDKKGSSHRKIMLYKNFRSREEVVGAVNYIFENIMNENIGEIEYTEKERLNLGANFNVDTDEKSIIGGATEIHLIQKDNKLDDDIINDKDDRINNKEDEIEEEEKLDNIQLEARMVGKIIKDLMKVNEDGKIQKVYDKGIDGYRPVEFRDIVILLRATSAWAPVFADELMNMDIPTYADVGVGYFDTIEIKTILSLLQIIDNPMQDIPLISVLKSPIFGFTPEDLIDIRVQSKDKIFYEVLKSTAEYDGFTDSQNENESEFIPSEECINKSKDFLIKLKEFKEKSMYMSTDEFIWYLYTRTGYYAYVGALPGGSQRQANLKVLFERAKQFEETSLKGIFNFVNFIEKLKKSSSDMGSAKTLGENANVVRIMSIHKSKGLEFPVVICSAMGKNFNTQDFKKSILYHHNLGYGPQFVDYERRISFPSIAKEALKSKINIENLSEEMRVLYVAFTRAKEKLIITGSTRNIQDSIKRWSNGIESLDTISQYEILKGKNFLDWIMPCVLRHRDLSNLLEEVGLDAVFNVEHNSKWYGKLWNKNDILVEKKSDEEKESIEEILEKIDVDNPDSDYYSEIEEKLNYIYPYEFSTRKPATISVTEIKKIQNNYEEELINTIFEQKVILKKPIFIQNEEEREKISGTERGTIVHLVMEVLDLKNVSSVNDIKSQIRGFVSKGIITEKQASIVNPYKIYKFFASNIGKRMLNAEIINREKSIYAQVNMKDIYIYEKLINNDDKKLYDNESVMLRGIVDAYFEEDNQIVLVDYKTDFVNEENINQIIEKYKKQLDLYADIIETLTGKSVKEKCIYLFGVDEAVCY >CP012309.1|AXU71004.1|1133412_1134624_+|nuclease-subunit-D MRFIHTSDWHLGKSLEGHSRIEEQAKFCEEFIKIVESNEIDMVIIAGDVYDTSNPPAQAEKLFYQTVSRLANNGQRCVLIISGNHDNPERLSAITPLAHEQGILIYGYPLSATIKAKYKGFEITYATQGCTKLNINGENIVVATLPYPSEKRLNEVFSSEDEFEKQKNYSEKVGDIFRSLEENFRSDTINIAVSHIFVIGGESTESERPIQLGGSFLVERKDLPEKAQYTALGHLHKQQKASERLNAYYSGSPLQYSKDERAYTKGAYIVDIKAGEKPIIEDVYFNNYKPIEVFKCNGIEEALDICEQNQDREIWSYFEINTDEIISQNEIKKMKELLKDIIEIKPIITSCYEQESVDIKEKSMAELFREFYSFSKGVEPKGELMDLFLDIISEEGESADETN >CP012309.1|AXU71005.1|1134610_1138138_+|exonuclease-subunit-C MRPIRLELTGLNSYIDKQVIDFEKLIERGLFGIFGTTGSGKSTILDAITIAMYGNISRNTKEYINSVCDKAIISYEFEIGSKNTRRRYIVDRTIARSKTGTKTSNARLIEVLNDNTQNVLADKVVEVNEKVAQVVGLTANDFTRSVVLPQDKFNEFLRLSRADRRDMLERIFNLEKYGRSLGEKVKKRKNIQLQNLKDLKSKLSQYDGITEEVYNNINQELIELKNLEKDKNNALDLAQKSYEESKTVYEEQLKLEKNELRKNELDLKNSEIKEKIALVENDSNAKKVDPYISSVQNLEKKIDEDSFAVSNLEKKLAILNQELEVTKNRYEKINKIKNEEVPKLSEEKIRLQQAIKLEEELVLLDRELKELKESGINLNKTKVELEKVKQVSESRKDAVTKSIKEVEGKIDKVNISAELKQKIFLAYEYEKDYNNVLEEKNQKLNKLEEILKETENINLKVRYIDKDKNDVNRNLENLSLHLDVLLKKCPGKSADLLLKSEYVTELRNKANNTKENEIKKSSIQDELKIILESKFNTEREVNLLNEKLENNRKNRDDLEKELEELKYLNLASELRRELKENMPCPVCGSKHHENNDITKYDENISFVKEKLEKLEKEKISIRNNIEELNAKVSGYLSIEKMKTKELEDVKGKLGGIPSSQLLKKLDEEQRKLALLKSNIQEWEKEKESTENKVTLAKEEKNKIEKEELKIRESLNNYKKLTRDLNIEIEGLENKCKKIKQEYLGLKTITKVSNLLSKVKEIRENEKELELLSTGHSNLLKNRDSLDIKIRENESKLHEIEIELIKARELYVEKKLSRDNKYKEVISITKGDLAKNLLHNVEENICKILEQEESSKKKLEEQRLEYEKNIAEKHNIDGRLKTAKEQYKDQKSTLNKLLAENKFESIYAVKRALLDTDAVKKLIEEILEHEEEQKLLSFKIKSSKEKLNGRSIKKEYFEQLKDEIYNLKVEIGNISKDIGANQNQLITLKDSLDKINDFNKQLKVVEHNVDLLEELDKCVQGNKFVEYVSTNQLKYIALEASKRLDGITKGRYALEIDSTLNFVMRDNFNGGERRSIDTLSGGETFLTSLSLALALSSQIQLKGSAPLEFFFLDEGFGSLDSELLEIVIESLERLHSNNLSVGIISHVEELKNRVPVKLLVSSSEAGIGSKVKIEYS >CP012309.1|AXU71006.1|1138268_1139522_+|modulator-of-ions-transport MLESPNNLIQIIFLIVLLIGSAFFSASETALMSLSKIRIRYMQDEGVKGAKLVSSLIENPNKLLSSILVGNNVVNIAATSISTSLFIGLMGEKGVALATAVMTVLVLIFGEITPKTIAANNSEKVSLLVSKPIKAIIFILRPIVWIFNIITNIIFKLFGITNKGAKSFITEEELKTMVNVSHEEGVLEMEEREIINNVFEFGDMQAKNAMVQRIDMVAIDMEDSYDEIIQVFKTEKLSRMPVYEETIDDIVGILNIKDIIFLSDEEIESFDIKNYMREPFFTYEFKKITQLLEEMKLEKSQMAIVVDEYGGTSGLLTIEDLVEVIVGDIEDEYDEEEDEIQVIKEDEYIVDGSTKIGDVNELIGVNLESEEFDSIGGFIIGHLSRLPEENEVIEVDNIRFCIESIEKNRIKKIRIYT |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP012309_7 | 1311260-1312010 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP012309_7
|
11 spacers
spacers of CP012309_7
>7.1|1311289|36|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCAAGTATTACCAAATTATAACATAGAAATCATAGA >7.2|1311354|36|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCTGAAAAGGTCGCAAACATAGCAGAAAGAGGAAA >7.3|1311419|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGTTTATGATTTTTAATTGCATATTCAATAAAAAATT >7.4|1311485|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATACTGTTGTCAATAATCCTATTACTGTTAATGTTA >7.5|1311551|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGGAACTTTACCGCTTATCACTTCTTTTTTCTGTA >7.6|1311617|36|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGGCATCAGGAGAGATGAATTGAATCAAGGAGAA >7.7|1311682|36|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTATTTTTCATAGTGGCAGCAACTTCAATTAATG >7.8|1311747|36|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGCACGAATCCGTGCGACGTAATTAAAATTATATA >7.9|1311812|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCATCAACCTTATCAGAAACTTGACCATCCCAATCATA >7.10|1311879|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACATTTGCAATTTAATGTTAACTATCAATACCCCCAAT >7.11|1311946|36|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACAAAAAAGATACATCTGTAACTAATTTTTATACT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012309_7
The CRISPR arrays of CP012309_7 >merge|CP012309|7|1311260-1312010|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGCCAAGTATTACCAAATTATAACATAGAAATCATAGAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAGCTGAAAAGGTCGCAAACATAGCAGAAAGAGGAAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGCGTTTATGATTTTTAATTGCATATTCAATAAAAAATTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAATACTGTTGTCAATAATCCTATTACTGTTAATGTTAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAAAGGAACTTTACCGCTTATCACTTCTTTTTTCTGTAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAAAGGCATCAGGAGAGATGAATTGAATCAAGGAGAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAATTATTTTTCATAGTGGCAGCAACTTCAATTAATGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTCGCACGAATCCGTGCGACGTAATTAAAATTATATAGTTTTATATTAACTAAGTGATATGTAAAGCCATCAACCTTATCAGAAACTTGACCATCCCAATCATAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGACATTTGCAATTTAATGTTAACTATCAATACCCCCAATGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAACAAAAAAGATACATCTGTAACTAATTTTTATACTGTTTTATATTAATTAAGTGGTATGTAAAG >CP012309|7|1|1311260-1312010|PILER-CR GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG CCAAGTATTACCAAATTATAACATAGAAATCATAGA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AGCTGAAAAGGTCGCAAACATAGCAGAAAGAGGAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG CGTTTATGATTTTTAATTGCATATTCAATAAAAAATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AATACTGTTGTCAATAATCCTATTACTGTTAATGTTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AAAGGAACTTTACCGCTTATCACTTCTTTTTTCTGTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AAAGGCATCAGGAGAGATGAATTGAATCAAGGAGAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AATTATTTTTCATAGTGGCAGCAACTTCAATTAATG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TCGCACGAATCCGTGCGACGTAATTAAAATTATATA GTTTTATATTAACTAAGTGATATGTAAAG CCATCAACCTTATCAGAAACTTGACCATCCCAATCATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG ACATTTGCAATTTAATGTTAACTATCAATACCCCCAAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AACAAAAAAGATACATCTGTAACTAATTTTTATACT GTTTTATATTAATTAAGTGGTATGTAAAG >CP012309|7|6|1311260-1312010|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG CCAAGTATTACCAAATTATAACATAGAAATCATAGA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AGCTGAAAAGGTCGCAAACATAGCAGAAAGAGGAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG CGTTTATGATTTTTAATTGCATATTCAATAAAAAATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AATACTGTTGTCAATAATCCTATTACTGTTAATGTTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AAAGGAACTTTACCGCTTATCACTTCTTTTTTCTGTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AAAGGCATCAGGAGAGATGAATTGAATCAAGGAGAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AATTATTTTTCATAGTGGCAGCAACTTCAATTAATG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TCGCACGAATCCGTGCGACGTAATTAAAATTATATA GTTTTATATTAACTAAGTGATATGTAAAG CCATCAACCTTATCAGAAACTTGACCATCCCAATCATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG ACATTTGCAATTTAATGTTAACTATCAATACCCCCAAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AACAAAAAAGATACATCTGTAACTAATTTTTATACT GTTTTATATTAATTAAGTGGTATGTAAAG >CP012309|7|2|1311260-1312010|CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG CCAAGTATTACCAAATTATAACATAGAAATCATAGA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AGCTGAAAAGGTCGCAAACATAGCAGAAAGAGGAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG CGTTTATGATTTTTAATTGCATATTCAATAAAAAATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AATACTGTTGTCAATAATCCTATTACTGTTAATGTTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AAAGGAACTTTACCGCTTATCACTTCTTTTTTCTGTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AAAGGCATCAGGAGAGATGAATTGAATCAAGGAGAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AATTATTTTTCATAGTGGCAGCAACTTCAATTAATG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TCGCACGAATCCGTGCGACGTAATTAAAATTATATA GTTTTATATTAACTAAGTGATATGTAAAG CCATCAACCTTATCAGAAACTTGACCATCCCAATCATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG ACATTTGCAATTTAATGTTAACTATCAATACCCCCAAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AACAAAAAAGATACATCTGTAACTAATTTTTATACT GTTTTATATTAATTAAGTGGTATGTAAAG
>CP012309.1|AXU71177.1|1308876_1310304_+|cell-surface-protein MKIKKLLTIGLSLSIFIASCPISVNALDKIESIKGADKYETAGIIADKQNYTTAILINADSTMADGLSASGLAGAINAPILLTKKNNIPNATLKRLEKAKKVYIIGGENSIDKYTETVLKGKGIEIKRLQGSDRIKTSYNVAKEINSINKVNKVILTNAFKGEPDAMSAAPVAVRDKAAIVLTDGKSVPFNTTGVESYVIGGTSSMNDKIVKDTNSTRLGGTDRYDTNKKIINKFYSGVKEFYIASGTDLVYALVGSTVAKNTAIVLVDNDSNKSVLKSTIKLTAIGNLSDSILQQCLNVTKNIGDSNTGREYTVEDAANAVKKLLGVKKFYYEPNYSEDEDLIFLLDKNFDFSGKEYYVFAYIKQGAEGDVRYCVAKNDMSKVYTYDVNGNMKVCNPDDYKNKGSITEEQAKQIALKECAKRHKVSINNLVVDMIDFRDDIYSGNVYAVKINSKNSNGTFGWFFIDIETGKVYN >CP012309.1|AXU71176.1|1307864_1308686_-|lipoprotein MIISKKITAILVSFLIMISMVGCAPKESATEVAKKYLDSIEIKDYEVAYNLLSKDSKESVSLEKFEEYQDTLFKLQTLKDYKLGEENKVEKYKYSNKEYTNLVKIKETDTIKYITENKEDTANFDRYFIIEDNEYKLLWHKDFKRALSSNYVKIARSETEKDEDKDYNKAAIDIKKAIEIDDKNPLAYYTQSYIYIELQRYDEALKSIDKYLEYLDKNNEAYKIDASDAYNLRGVIFMSKSEFNKARESYNKALELNPDNEYAKTNLNDIKGL >CP012309.1|AXU71175.1|1306222_1307740_-|site-specific-recombinase MSVAIYLRKSRADEEAEKQGEFETLSRHKSTLLKLAKEQNLDVIEIKEELVSGESIIHRPKMLELLKEVEENKYDAVLVMDLDRLGRGDMKDQGIILETFKESKTKIITPRKTYDLTDEFDEEYSEFEAFMARKELKLISRRMQRGRIKSVEEGNFIGTSAPFGYDAVTTGRKERILVPNKDADVVRTIFDLYINEDMGCSKISKYLNNLGIKTATGANWYNSAITNIIKNKVYCGYIQWQKKDYKKSKNPNKIKTVKLRPKDEWIEAKGKHEPLISEITWKKAQNILKKNGHVSYGNQIKNPLAGIVICKNCGRPLVYRPYADHDYIICYHPGCNKSSRFEFIEAAILKSLEDTVKKYQLKASDIDLDKNNKDSNIEFQKRVLKGLETELKELGKQKNKLYDLLERGIYDEDTFIERSNNISSRTEEIKDSIKTVKNRLNTVKKDNSKIIEDIKTVLSLYHDSDSLGKNKLLKSVIDKAVYYKSKEQKLDSFELMVHLKLHEDQ >CP012309.1|AXU71174.1|1305915_1306200_-|RNA-polymerase-sigma-27/28-subunit-RpsK/SigK MCNEISLLDILGTEANYVLDEVELKVQVGKLYEQLNKILTPREREIVQLRYGLTPYGYKTQREIAQKLDISRSYVSRIEKKALKKLEKELVQES >CP012309.1|AXU71173.1|1304154_1305819_+|penicillin-binding-protein MSKKKTPFLKKVGKRSWCIFTIILIIYSVLIYRLVDIQVLKGDKYKQSVESQSVEKVELNSGRGIIYDRNNKKLTDTSKSQVLIVEKEKLNNNYKILELIKKATKMNDLDIYKAVQEQLTRPIIQIQTKNIDKSMKKELEKNGIMVEEKTMRYAKDGLLSHTIGYIKEDDKSGQSGIEKSMDSVLRNSNEKYISAFKAGDAGNEKSLNILKGSVKTVDNKDKDRHLKTTIDYNIQKKLEQILNKEENPTAAIISEASTGEILAMCSRPNFDQNDISKSLKGKNGEFENRVIKATYPPGSVFKMVVLFSALENGVIDENYTYNCTGKTKVGNTNEILRCNKRDGHGFQNLRQAFSNSCNPAFLDIAMKLGKEKILKSAEKLHLFEKVDIGLDEEKIREAPKNISIRNLAIGQENIEFTPLQINQMTQIIANNGTFKPLYLYKSLVDNNMNTIKTYKSSKKEELISPYVCTQVKEYMKSVSRTGTAKDLKDIEGGCGVKTGTAQSSLNKKAIDHGWITGFYPEERPKYVITVLVEGTQKGNKSATPIFKEICESIK >CP012309.1|AXU71172.1|1302835_1304083_+|protease MELNKVELLAPAGDLERLKIAITYGADAVYIGGEIFGMRSAAKNFSKEDMAEGVAFAHERGKKVFVTVNIIPHNEDFLQLEDYLLELEEIGIDAVIIADPGVLSVIKKVIPNMEIHLSTQANTTNYLSANFWYEHGIKRVVVARELSFDEISEIRAKTPLDMDIEAFMHGAMCISYSGRCLISNYMTGRDANKGSCAQSCRWQYHLVEEKRPGEYFPIYEDERGTFFFNSKDLCMIEYIPELIKSGITSLKIEGRMKTAYYVATVVRAYRMAIDEFYRDPENWKFNPMWMEELKKGSHRHFTSGFYLNKPTTEDQNYQSASYVRNYDFIGIVRETEDEDGLIVVEQRNKMCVGDEIEVMGPYKETMFTKIEEMYNEEGEAIESAPHPRQIVKLKLSVKVGKDYMLRKVIEEKVEE >CP012309.1|AXU71171.1|1302174_1302849_+|O-methyltransferase MSNIVNDLVEDYIRVTLKEKEGFLKDLEIYAEENSVPIIHKEVSDLLKVLLKVQKPKRILEVGCAIGYSSIFFATIIGKDADIITVERNEKMIEKAKENIKLAGFDNNITILEGDAEEKLSQVQGEFDLIFIDAAKGQYKLFFDLVIDKLKDGGLLVSDNILYKGMVAHDDFVVRRKKTIVKRMRNYLDYICNCDYLSTSLVPIGDGVALSYKESKRGDVDGIK >CP012309.1|AXU71170.1|1300923_1302003_+|exported-aminodeoxychorismate-lyase MNFKENRLKIAVLIIVILIILAGIFVFIQIGPYDKNNKKDVIIDVPNGASVGKISDILYENKLIKNELLFKLLVKVSNKAPSIKSGTYLLNQSYSNNDIISLLVSGKIYQDGIKVTIPEGATSKEIIAMLVSKNLGDKATFENLIKKPQEFYDKFSYLKEDGITSLEGFLYPETYYFNSKKQSEEDILSEMLKVFDSKYTDKFKKKQKELNMTLQEVMEMASIIEKEAVLDKDRPIIASVFYNRLKVGMPLQSDATIQYIFEERKKIVTYDDLKIDSPYNSYKNKGLPPTPISNPGIKSIEAALYPEKTDYLYFVAKIDGGNNYSTNYQDHLKYVKEYKEARDKQSKDTKATNKENTKK >CP012309.1|AXU71169.1|1299385_1300711_+|pyrimidine-nucleoside-phosphorylase MRMYDIIKKKRDNLELSKKEINYFIENYSKGDIPDYQASALLMSIYLNKMNKQETVHLTEAMMNSGDMINLSEIDGIKVDKHSTGGVGDKTTIALIPLVASCGAPVAKMSGRGLGHTGGTIDKLESIPGFSTEMEISKFIDSVNKSKIAVCGQSAKVAIADKKIYALRDVTATVDNISLISSSVMSKKLASGADAIVLDVKTGDGAFMKTLEESFELAKSMVDIGTGMNRDTIGIVTDMDEPLGFAVGNSLEVIEAIETLKGNGPKDLVELCEVLGAYMLVLSKVAHDFEDGVEKIRESIKSGTAIQKLKEFIENQGGNKDVVDDYSLFKKSKYKYPVKSTKSGYISKIKAEDVGVSAMILGAGRETKDDILDLSAGIILEKKVGDYVNEGEVLAYMYYNDEQKLSLAKGRFIDSYSIVDSKIEKNKLIYGIVTKEEIKKF >CP012309.1|AXU71168.1|1298369_1299182_+|purine-nucleoside-phosphorylase MFEKIAQSSKFINSKSNIKPKIGLILGSGLGDLANDIEDPVTIKYSEIPNFPVSTVAGHAGQLVIGKLEGKEVIAMQGRFHYYEGYSQKEATFPVRVMKELGVEILIVTNAAGGVNKEFKAGDLMLIRDHINFSGSNPLVGKNDDRFGARFPDMSDAYSSKYVDVVKNCAKECNIDVKEGVYMFFSGPNYETPAEVRMAQILGADAVGMSTVPEVIVASHSNIGVIGISCITNMAAGILNQPLSHEEVIETTQKVKSEFMNLVKTTVKNL >CP012309.1|AXU71178.1|1312296_1312521_-|putative-transcriptional-regulator MDVNQRIKYIRENMNSSQKELLEKTNINTSVMNRIESGERPTRDDGLIIFAKIFGLYTDYILGLSDTEKLNIGN >CP012309.1|AXU71179.1|1313199_1313355_+|phage-anti-repressor MALEVKIEVKIIKDVVILNITHWKKETSLLTVKIARGQGDLSYVKYFTNES >CP012309.1|AXU71180.1|1313600_1313852_+|hypothetical-protein MSSYFITRGDVMKILQQFKPYKYDKEKNIEYDEKIIANQNTEVYIVYPRISDEENRRRWEEFNEVAKEVAINIAMKKVETVES >CP012309.1|AXU71181.1|1314172_1314286_+|hypothetical-protein MVEVNIKIKGEVSEIIDSIRGIFNSFDEELILDIKSE >CP012309.1|AXU71182.1|1315071_1315455_-|hypothetical-protein MRKKFFIGILIVLIISVIAILNIKNDKNVFIGESENWKAKFVTTEGHSKLEIKYKNSKDVVEQKFNYSYQFIDGEDAVVVVKNEILEAGQEKAIKIQRPGLYSNRESSYKLIISWNGNEETIKLKKK >CP012309.1|AXU71183.1|1315581_1315926_+|hypothetical-protein MNYRLKKSVTTILSLLIMTILLPTNASASKVEDSSMKVMYSEKQVTDMDKLYDMAKNGITDVKSSNEKGIIKNARTGESIYVDSISTTQLLEVKQSKNLTSKIYSKTVFLILIQ >CP012309.1|AXU71184.1|1317309_1317627_-|hypothetical-protein MNFRNIYLILMGLGIIILTTIISLIEIKIGFCNEKYFNKLESKYGNIDRKRTIKLEVLYRYVTGFEYIAIGLFTKRLDITIIAIILVATITVILYYLVRKRYITI >CP012309.1|AXU71185.1|1317940_1318510_-|hypothetical-protein MKLRNPKIKKLLSVALLAALIGIPIGQTANAMEISNNVPSYIENNPTTIEDLEINDSQLPKPGTVTYIDINKLIKNLKENGIDTTLIENELYYRKAGTNKIVWTKTGFDLYLSKGVALTLAGAGTGVAGLLAGAIPGIGQYLAAAIVGAITMHLGSNITSGKIFKFKKMRYNKGGAYVTKYYLQSVRNQ >CP012309.1|AXU71186.1|1318952_1319096_+|regulatory-protein MKINKLPHAELKLMKYIWGVDDVLASRDIIEDMKLKYDWKKSTTLTF >CP012309.1|AXU71187.1|1319661_1320171_+|teicoplanin-resistance-protein MKSRKHNITKGLFIVYIIILTWIILFKLQFDISSLETMNLRSINLVPFAGSLIINNRVDISEIILNVAIFVPFGIYVCMLKEEWSFIKKVIPIFITSLAFETLQYIFALGASDITDLIGNTLGGIIGIAVFMLLSKIFKNNTIKIINVLALIVTIIVVLFLGLVIFANL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012309_8 | 1523898-1526179 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP012309_8
|
34 spacers
spacers of CP012309_8
>8.1|1523927|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAACCAAAAACTTCGAATTTGAACTAAAATGCGTGGG >8.2|1523993|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGCACTTATTGGGATTAAATTCAACAACAATATCAA >8.3|1524059|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTGGATTGATGCAAAAGTTTCTTATACAGCTCTTAA >8.4|1524125|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAATTGGAAAATCAAAAGAAGGACAAACTGGTTCAAC >8.5|1524192|36|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAATCAAAGGCAACATCATAGTCACGTATATTATC >8.6|1524257|36|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAAACAAGAAACTAAGGAATCAATAGCAGAGAAA >8.7|1524322|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAAATTCAGAAGAACAGGAGGTATTTAATAGTATTA >8.8|1524388|36|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAGTTGTTTTTACTCCTGTTATATCTGTTTCTATA >8.9|1524453|39|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGATTGGGTTTATAAACAAATACCAAGATGGTTTAACTA >8.10|1524521|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTCCTGCTCCTGTTCCTGTACCGGGTTGATTACCTG >8.11|1524587|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTTTCCATAAACATTTCTAATTGACTTTTATTATTT >8.12|1524654|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGGAAACTTTTTTATGAATGTTGAACCGGACGACGA >8.13|1524720|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGTCAAATATTAAGTTTTGAGAGGGAAATCTTTATTT >8.14|1524787|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATTATATATCTGTTTTGACTTAGCACTATTCTTATA >8.15|1524854|36|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAAAGAATTATTATTATTGAAAGAAATAGTGTTTT >8.16|1524919|40|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGACTAAAATCATAGAAAAAGCACTAGAACCAGCTAAGG >8.17|1524988|36|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAATAATAAGCTTTCCTATTCTTTTTTCTTCACAA >8.18|1525053|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAACCAAAAACTTCGAATTTGAACTAAAATGCGTGGG >8.19|1525119|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGCACTTATTGGGATTAAATTCAACAACAATATCAA >8.20|1525185|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTGGATTGATGCAAAAGTTTCTTATACAGCTCTTAA >8.21|1525251|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAATTGGAAAATCAAAAGAAGGACAAACTGGTTCAAC >8.22|1525318|36|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAATCAAAGGCAACATCATAGTCACGTATATTATC >8.23|1525383|36|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAAACAAGAAACTAAGGAATCAATAGCAGAGAAA >8.24|1525448|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAAATTCAGAAGAACAGGAGGTATTTAATAGTATTA >8.25|1525514|36|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAGTTGTTTTTACTCCTGTTATATCTGTTTCTATA >8.26|1525579|39|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGATTGGGTTTATAAACAAATACCAAGATGGTTTAACTA >8.27|1525647|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTCCTGCTCCTGTTCCTGTACCGGGTTGATTACCTG >8.28|1525713|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTTTCCATAAACATTTCTAATTGACTTTTATTATTT >8.29|1525780|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGGAAACTTTTTTATGAATGTTGAACCGGACGACGA >8.30|1525846|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGTCAAATATTAAGTTTTGAGAGGGAAATCTTTATTT >8.31|1525913|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATTATATATCTGTTTTGACTTAGCACTATTCTTATA >8.32|1525980|36|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAAAGAATTATTATTATTGAAAGAAATAGTGTTTT >8.33|1526045|40|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGACTAAAATCATAGAAAAAGCACTAGAACCAGCTAAGG >8.34|1526114|37|CP012309|CRISPRCasFinder AGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012309_8
The CRISPR arrays of CP012309_8 >merge|CP012309|8|1523898-1526179|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATCAACCAAAAACTTCGAATTTGAACTAAAATGCGTGGGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTCGCACTTATTGGGATTAAATTCAACAACAATATCAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATGTTGGATTGATGCAAAAGTTTCTTATACAGCTCTTAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAAAATTGGAAAATCAAAAGAAGGACAAACTGGTTCAACGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAAAATCAAAGGCAACATCATAGTCACGTATATTATCGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAAAAAACAAGAAACTAAGGAATCAATAGCAGAGAAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTTAAATTCAGAAGAACAGGAGGTATTTAATAGTATTAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATATAGTTGTTTTTACTCCTGTTATATCTGTTTCTATAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTGATTGGGTTTATAAACAAATACCAAGATGGTTTAACTAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATGTTCCTGCTCCTGTTCCTGTACCGGGTTGATTACCTGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTATTTTCCATAAACATTTCTAATTGACTTTTATTATTTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAAGGAAACTTTTTTATGAATGTTGAACCGGACGACGAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTAGTCAAATATTAAGTTTTGAGAGGGAAATCTTTATTTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTTATTATATATCTGTTTTGACTTAGCACTATTCTTATAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATCAAAAGAATTATTATTATTGAAAGAAATAGTGTTTTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATATGACTAAAATCATAGAAAAAGCACTAGAACCAGCTAAGGGGTTTATATTAACTAAGTGGTATATAAATTCAATAATAAGCTTTCCTATTCTTTTTTCTTCACAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATCAACCAAAAACTTCGAATTTGAACTAAAATGCGTGGGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTCGCACTTATTGGGATTAAATTCAACAACAATATCAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATGTTGGATTGATGCAAAAGTTTCTTATACAGCTCTTAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAAAATTGGAAAATCAAAAGAAGGACAAACTGGTTCAACGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAAAATCAAAGGCAACATCATAGTCACGTATATTATCGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAAAAAACAAGAAACTAAGGAATCAATAGCAGAGAAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTTAAATTCAGAAGAACAGGAGGTATTTAATAGTATTAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATATAGTTGTTTTTACTCCTGTTATATCTGTTTCTATAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTGATTGGGTTTATAAACAAATACCAAGATGGTTTAACTAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATGTTCCTGCTCCTGTTCCTGTACCGGGTTGATTACCTGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTATTTTCCATAAACATTTCTAATTGACTTTTATTATTTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAAGGAAACTTTTTTATGAATGTTGAACCGGACGACGAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTAGTCAAATATTAAGTTTTGAGAGGGAAATCTTTATTTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTTATTATATATCTGTTTTGACTTAGCACTATTCTTATAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATCAAAAGAATTATTATTATTGAAAGAAATAGTGTTTTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATATGACTAAAATCATAGAAAAAGCACTAGAACCAGCTAAGGGGTTTATATTAACTAAGTGGTATATAAATAGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAAATTTTACATTAACTAAAATGTATAGAATA >CP012309|8|2|1523898-1526113|PILER-CR GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CAACCAAAAACTTCGAATTTGAACTAAAATGCGTGGG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TCGCACTTATTGGGATTAAATTCAACAACAATATCAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GTTGGATTGATGCAAAAGTTTCTTATACAGCTCTTAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAAATTGGAAAATCAAAAGAAGGACAAACTGGTTCAAC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAAATCAAAGGCAACATCATAGTCACGTATATTATC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAAAAACAAGAAACTAAGGAATCAATAGCAGAGAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTAAATTCAGAAGAACAGGAGGTATTTAATAGTATTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ATAGTTGTTTTTACTCCTGTTATATCTGTTTCTATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TGATTGGGTTTATAAACAAATACCAAGATGGTTTAACTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GTTCCTGCTCCTGTTCCTGTACCGGGTTGATTACCTG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TATTTTCCATAAACATTTCTAATTGACTTTTATTATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAGGAAACTTTTTTATGAATGTTGAACCGGACGACGA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TAGTCAAATATTAAGTTTTGAGAGGGAAATCTTTATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTATTATATATCTGTTTTGACTTAGCACTATTCTTATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CAAAAGAATTATTATTATTGAAAGAAATAGTGTTTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ATGACTAAAATCATAGAAAAAGCACTAGAACCAGCTAAGG GGTTTATATTAACTAAGTGGTATATAAAT TCAATAATAAGCTTTCCTATTCTTTTTTCTTCACAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CAACCAAAAACTTCGAATTTGAACTAAAATGCGTGGG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TCGCACTTATTGGGATTAAATTCAACAACAATATCAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GTTGGATTGATGCAAAAGTTTCTTATACAGCTCTTAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAAATTGGAAAATCAAAAGAAGGACAAACTGGTTCAAC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAAATCAAAGGCAACATCATAGTCACGTATATTATC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAAAAACAAGAAACTAAGGAATCAATAGCAGAGAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTAAATTCAGAAGAACAGGAGGTATTTAATAGTATTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ATAGTTGTTTTTACTCCTGTTATATCTGTTTCTATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TGATTGGGTTTATAAACAAATACCAAGATGGTTTAACTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GTTCCTGCTCCTGTTCCTGTACCGGGTTGATTACCTG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TATTTTCCATAAACATTTCTAATTGACTTTTATTATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT 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GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CAACCAAAAACTTCGAATTTGAACTAAAATGCGTGGG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TCGCACTTATTGGGATTAAATTCAACAACAATATCAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GTTGGATTGATGCAAAAGTTTCTTATACAGCTCTTAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAAATTGGAAAATCAAAAGAAGGACAAACTGGTTCAAC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAAATCAAAGGCAACATCATAGTCACGTATATTATC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAAAAACAAGAAACTAAGGAATCAATAGCAGAGAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTAAATTCAGAAGAACAGGAGGTATTTAATAGTATTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ATAGTTGTTTTTACTCCTGTTATATCTGTTTCTATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TGATTGGGTTTATAAACAAATACCAAGATGGTTTAACTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GTTCCTGCTCCTGTTCCTGTACCGGGTTGATTACCTG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TATTTTCCATAAACATTTCTAATTGACTTTTATTATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAGGAAACTTTTTTATGAATGTTGAACCGGACGACGA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TAGTCAAATATTAAGTTTTGAGAGGGAAATCTTTATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTATTATATATCTGTTTTGACTTAGCACTATTCTTATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CAAAAGAATTATTATTATTGAAAGAAATAGTGTTTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ATGACTAAAATCATAGAAAAAGCACTAGAACCAGCTAAGG GGTTTATATTAACTAAGTGGTATATAAAT
>CP012309.1|AXU71376.1|1522393_1522639_-|hypothetical-protein MNQKKIKISIKMVIIGIFAVIIAFVLSRLFVEYIDELLRSNWQYQLFESESSYIVFANCIMFSNILLEIFLIYICRKFRKI >CP012309.1|AXU71375.1|1520949_1521345_-|phage-integrase MIKNQIEVFFKDMKLIDITPSILQSYINNIYNEHMLNSTKNQVDFIKSVLKESYRLKEISENICDFVTTPIKKNSSTSKLYTKQKAQLLLEKSKNIPIGIPIFLMLTLGLRFGEAVSLIWSDVDLDKKSHM >CP012309.1|AXU71374.1|1518891_1520247_-|drug/sodium-antiporter MDTKISINENMSLGKRFFKYLAPSVVAMWVFSLYTMVDGIFVSKGVGELALAAVNISMPFINFIFAVSLLFSTGASTIIAIYLGKKDIKSANEVFSFNLVSIIILSIIILAITFFNLDRLALFLGATESTIGMVKDYLGIIIFFNGFFIVSYSLEVIIKTDGFPILATVGVIISALTNIILDYLFVIEFGWGVKGAGIATGLSQVFSTIFFLIHFLRKNSTLNFSKFRIDFKTLRKIVFIGFPDSTTELSCGIVVLLFNLSLTKYIGENALIYYSVINYINTLVLMTMMGITQGMQPLTSFYYGAGNIDNVKKLLKMGIKATIIASVAVFAICMAFSGPIVSLFIHPEETMLFNEGVRVFKIFSISFLLVGINVIISGFFVSVEKPSISTVISLGRGLVIVVLSLISMILIFGGQGIWMTTIVSEFICLILSLVFLKKNFSTLDSNLNKVA >CP012309.1|AXU71373.1|1518123_1518774_+|ATP-binding-protein MADEKFVMSFSGGKDSILALNRMLKKGYKPVALLTTISEEHGKSWTHNLEYNMLKQVSSNIGLPLLVAECGVEGYEESFERALIKAKNMGATICAYGDIDIESHRKWDTDRCEAVGMKVDLPLWQESREDLVYEFIDSGFCSVVTKVNLKHLGEEFLGKKLTRELVEKIKNAGADPCGEHGEYHTFVVDGPIFKKPVEYEVKGTLIKDGYGYLEIK >CP012309.1|AXU71372.1|1517610_1518039_+|EamA-like-transporter-family-protein MTKLWAIIFALLAGGSTALEAFINGELGKSTTALVATFISLTVGAIFFLASIIVTGDLKCLVSINGFNYKLLLGGVFGGLIIYFTVKAIPNLGVSNTLILTLVSQVLVGFFIDSVILGQETMHLYKYIGVILLILGTFFIVN >CP012309.1|AXU71371.1|1516910_1517459_-|hypothetical-protein MYTNFNIDFNNFNKKENAIKFMLMGVLLIILGLLCLTFKTLGIKLISWTFGIALLFFAYLNLKNINELKRYATKEEIKPSINIQWVLIIACILLFVFPQKIQSIFSLFLGFYLIFNQLVALVNSKNNPYSKFTTWNIVKILFGICLILSPLFLSRFIVSIMSFFIILFGLVLFFSGNTARKY >CP012309.1|AXU71370.1|1515855_1516791_-|radical-SAM-protein MDKFKYAFDNKRYHTWNYYLRNTFGEKVFKVSINAGFTCPNIDGSLGYGGCTYCSKEGSGDFAGNPKDNLISQFYNIKEMMLKKWPHAKYIGYFQAYTNTYAPLEVLKEKYETILELEDVIGLSISTRPDCLPDDVVEYLSELNKRTNLWVELGLQTIHDSTSKIINRGHDYKTFVEGVEKLKSKNIKVVVHIINGLPGEDYNMMMETAKAVGKMGVDGIKIHLLHVIKDTPMEKMLQNGMLTLMEQDEYINLVCDQLEILPETMIIHRLTGDGKRDELVGPIWSLKKWEILNQIDDTLKARNSYQGCKFV >CP012309.1|AXU71369.1|1514646_1515591_+|membrane-protein MGEKSKGYVFIAIAGLLWATLGLFGKFLMGNGLTSEQVAFTRLFFGFIVLGVYSSIRTPQILKISKKGIMYSVIIGIICQAMFNLCYFKAIDIAGVSIAAVLLYTSPLFLAIFSKICYKENITRSKLFSLILCFIGAIMAVTGGRLDFQGLNAFGLLLGVLSAIAYALMPTISKNALKEFSSSTILVYSFLFGAIFMIPSSRPWEILNYAKDLDVLSCMLMLGIVPAALAYIFYAAGISKGVELSVAGVVASVELVGSVIIGCTILGESFSLGKLFGVMLMLISAVVALNLSYDEIRIFYKSNKLKQIEKTESI >CP012309.1|AXU71368.1|1512898_1514329_-|sigma-54-dependent-regulatory-protein MNLDLEFYQKILEASHDEICVSDDKGIIIYCNKAFEENYGLKKEDILGKNVSFLEDSGYSTKSPIPIVLKTKTKFSLEQDTQTGKKLIITATPIFDENGHLEFTVENCRDITELNNIKNKLEDTKKQVKKYKSEVETLYRTALRIEDTVIMDGIVMRPIINTVNHVSKTDVSVLLLGESGTGKSSLARYIHHNSNRSNGPFITINCATISPQLLESELFGYTSGAFTGASTKGKVGLVELANGGTLFLDEIGDIPQNLQAKFLQLIQDRTFTPVGSLKNKKVDIRIISATNVDLVSKVKEKKFREDLYYRLNVIEIKLPPLRERRDNLVEIIKYYFNRYSSDFNLNKTISKEAMDAIANYRFPGNIRELQNIIQKILLTCTDNHITIDDLPNILTKNIHITNNGNKTHISQINKVIISDSKSTNYKNKNFDTLIKEYEKNIILDAYEKFGSSYKVAKHLEISQSKANRLIRKYTNT >CP012309.1|AXU71367.1|1512114_1512699_-|hypothetical-protein MLMNTHFIMAKSILDNIDENKTFFISEKNFIYGNIKPDAFSKYKLKKHYLDESFNMIVSKINYLCSLNIDSLSKYFSVSRLSQELGVICHFLCDFFCVAHSERWEFKHSLNKHVTYERELGAFAKDVDLSKIKCGTINSSFEKFFTKLYSDYKKKTDYMNDLKFSAYTCNSVINYILDSILSNTIKSYHIANCG >CP012309.1|AXU71377.1|1526504_1528238_-|signaling-protein MSILLKKAPKLAKHIITSFYINRDINEVLKYLCENVTWIGPGEQEFLTSFNEIKNYFYAGQDEIPSCDINNDIFETVSEDENRCMVLGRYTVRTKENAQMILEVNQRCTFEIIEDRGKLLIKHMHISNPYGEMQLDEYFPTKIGTQSYDYLQRLLKEKTEVIEMITNNINGGLKGSNDDSTYSFFYVNEGLPKILGYTYNEFMEMSGGSAVGAVYPPDLPKALEDCERCFAKGPTYSSEYRIRKKDGTLMWVLDSGMKSLNSDGIVKINSIITDITQLKNIESELKLERERYRIALQNITDIMFEYDIENDTLIKYQRVEIDKKIELENFETKNYSKLLESGKIIHLDDIGKLLEVLHGNLRETIEIRQVNSLTKNEWRWIRVQCSVIYDSDHNPIKTIGVLKDITEDKSKLESLINQAQRDPLTQLYNQRVSQNLIEEYLCSSDSKNNDALLVIDIDDFKTVNDTFGHLEGNEVLVAVSKILLHNTHDKDIVARIGGDEFTIFIKSLTKDLIIKITNDILNDASKIKVKDNHKITLSIGIAFTDDSTKLYKDLFSKADKALYLSKADGKNCYSTYE >CP012309.1|AXU71378.1|1528477_1529323_-|signaling-protein MFKEIFLRTFPGFLIIRDSNYRIIFINDNLKNLIKSYMQDNPLGMTNIEIAKKLPDNIAKFFTDSHNIQLDWEKNYPYDKISNWILEFKKDTTSYWNVLEYKVDVDEKTYIITMANDITKLYEENKRNLHYSITDPLTGAYNRKYLNDRFDIFIGDYIVLIDLDNFKMINDYEGHNVGDKILCDFVSLLNKELINSTSIIRLGGDEFIVIFSSDVDKNYVYSQLEALRENFLKVFSKYKYLSFSYGVDTVKRNLKLTIVELDKKMYKNKEKNKKKFDKNDY >CP012309.1|AXU71379.1|1529353_1531588_-|signaling-protein MQNHNYIKMLNKKVEVLSKELDSRNFKLKTLNEIDFFSKIPNREFMYQHIDDCISKNIHIGIMLLNIDNFKLFNDIYGYLVGENLLITLTQNLLHFIPESKGIVAYLKGEGFLIVLPNVSNKELNNMGATIIESARELKIRLPNEKEIYSNVTFSIGSTIWNGEPNMTTLMLFNQVYSALKKAKSEGKNRYILFDFKDNSFYNKLENDKEFLSEISHVLQTKQIEVFYQPLYNIKNNTIVGCEALARWRHPIKGLLTPDKFIPLFEQFGLITELDLHLFEENCKNIRRWIDNNDVFVPICCNFSRLHFFNPNFPSMLKGITEKYSVSTSNFSIEITENILIENTNTIIQQLAELRSYGFSVSMDDFGSGYSSFGMLQNLPFDIIKIDRIFLSHNLNDFKNTTILYSIINIARALGMLTVCEGVETEQHVEFIKSINCDIAQGYYYAKPMECKEFEKLLSKENNSEKMFIKYSDIGKSLIEKIFDGFFIMQDMKKLRANVTEDIQWFDFYNKTEITSFPKVIDHFEKHIKGKKFSILYKSITPHNTESDSLLISGEAVLSDEASEHQKYSNFYFSANCIISENKLLLAKLHLDLIKTAGYINEFESYSIPKMTNTHLDESNILSQFYSMLPVGIIRYDLFGDMIITYMNEEMFDIIGYTKEQFFGEMGGNLRAIVHPDDLDFVYKKSLDMIDTNKIEPFLYRFIKRDGQIVTVMYTQCNLSAIDGRSIAQGMYVDVNKIKNLTKI >CP012309.1|AXU71380.1|1532371_1533181_+|MerR-family-transcriptional-regulator MKDYYKIGEISKIYGIGRDSLMYYEEIGILRPVRDINGYRMYNISDIWKLNLIKEFRSLNFPMKKIKEYLDDRSIESTKNILNEELDLIDKKIAEFISHKENIIKRLSSIESVIQNTKIDEIEVVYIEKRKALELNADIKRDEDFDFLIQKLQKEYEDRFNILGNNNIGSAFSTEAINKGIFNEFKSVFCFLESNEKVYNIVFDEGYYVTLNYTGSNSNNKIYMEKVFKFIEENNYKIIADPIEIYKIDIHETGIVEEFVTEIQVPITK >CP012309.1|AXU71381.1|1533325_1533565_+|hypothetical-protein MKCSNCGSVNIEKGILTTGGIYAETIGLKYRGDGKLDKVINKTFPVQSTIYSDLCLDCGEIVRTYIKDNTDRNWCKDKK >CP012309.1|AXU71382.1|1533735_1533912_-|hypothetical-protein MFRDEMDKCTHMLTAYISSLYDYCDFIDTQLDDFILEYGENVVESCLHQVMVLVSKYN >CP012309.1|AXU71383.1|1534416_1535091_-|MgtC/SapB-transporter MNHHILIQFEYIARIITAGFCGALIGYERKNRLKEAGIRTHFIVALASALIIIVSKYGFNDIVGTPGIGLDPARVAAQVVSGIGFLGAGLIFIRNQSVSGLTTAAGIWATAGTGLAIGSGLYLVGIVSSIIIVIVQITLHRDRKWMKLPTAEQVSLKISNSPDSIEYIEGKFKKSNIEIINMNIKRLDGDWLEVVIYTKLPKGYKKTNLLKLFSDNPLIETLEI >CP012309.1|AXU71384.1|1535310_1535865_-|isochorismatase MSIALILIDIQNDYFKNGKCELFQSEETAKNAKKILLFFRKNNLPVIHIQHISTDKTASFFLPNTHGSEINKIVFPLDNEEIIIKHTPDSFFETDLQSILEKKNITNLVICGMMSHMCIDTSVRTAKKLRYDITLISDACTTKNLSWNNIEINANTVHQVFMASLQNSFADVKNTDKFLSNYYK >CP012309.1|AXU71385.1|1535942_1536308_-|transcriptional-regulator MKIRAEYTCPLEIVHDIIKGKWKTILIFELRQSNKTFSELQHNIYGINQKMLIQQLKELRDFGIIDKISSTGYPLHVEYFLTNRGKKMLKAVEIMQEIGIEYMLEHGQQEILDNKGICYNK >CP012309.1|AXU71386.1|1536538_1536673_+|hypothetical-protein MNISRKAMKIIELAQKIANKRGISVEEAWSEAVTEYKNKYEHIA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP012309_9 | 1637482-1638629 | TypeV |
I-A
Consensus repeat of CP012309_9
|
17 spacers
spacers of CP012309_9
>9.1|1637511|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT CAAATTGCTGACAACACTGAAAGCATTATGAACGCTA >9.2|1637577|38|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT ATTGCTCTAGCGATTATGGGTGTTTTTCTTGTTTGGAA >9.3|1637644|35|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT TCAGAATATAATGAACTTGAAGTAAATAAGTTCAT >9.4|1637708|36|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT AATAAAAGATGGCTGGGTTTTAATAATTCCTTAAGC >9.5|1637773|38|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT TTGACCTACTTCATCCACTGCACCAGATTCTAATTCTA >9.6|1637840|35|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT ATACTTGGTCAATACATTTCAAAAGTTGCAACAGA >9.7|1637904|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT GGTGTTAGCCCTAAACCATTTCTAGCACCCGCATACG >9.8|1637970|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT TTTAAAAGGTCAACTTAAAGGTAGTAATTTTTTAATA >9.9|1638036|38|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT ATATTATCATCATTTAGCAAAGAATTTGCGTATTTTTC >9.10|1638103|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT TTTAAAATAAAATATATTTGCCTACCATCAACTGAAG >9.11|1638169|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT GGTGGTAGTGGAGAAGCTTCATCAGAAATTACAGCAG >9.12|1638235|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT TCAAATATCATTTTTTCAATAATTATTTTCATGTATT >9.13|1638301|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT CTTGTCAAGTATCGCCCTGTCAGCTGATTCCATATTA >9.14|1638367|36|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT GTACCAGTTCCACCAACACCGGAGCAGGAACAACCA >9.15|1638432|36|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT TGGTTTGCAAGGTAGCTCTAAAGACACTTGTTTAAG >9.16|1638497|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT AGCAATTCTGATATTTTTATTCTAATCATTTGAAATC >9.17|1638563|38|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT CCATCTTTTGTTGCTTTACATAAATTTATATTACTTAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012309_9
The CRISPR arrays of CP012309_9 >merge|CP012309|9|1637482-1638629|CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATCAAATTGCTGACAACACTGAAAGCATTATGAACGCTAGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATATTGCTCTAGCGATTATGGGTGTTTTTCTTGTTTGGAAGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTCAGAATATAATGAACTTGAAGTAAATAAGTTCATGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATAATAAAAGATGGCTGGGTTTTAATAATTCCTTAAGCGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTTGACCTACTTCATCCACTGCACCAGATTCTAATTCTAGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATATACTTGGTCAATACATTTCAAAAGTTGCAACAGAGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATGGTGTTAGCCCTAAACCATTTCTAGCACCCGCATACGGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTTTAAAAGGTCAACTTAAAGGTAGTAATTTTTTAATAGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATATATTATCATCATTTAGCAAAGAATTTGCGTATTTTTCGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTTTAAAATAAAATATATTTGCCTACCATCAACTGAAGGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATGGTGGTAGTGGAGAAGCTTCATCAGAAATTACAGCAGGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTCAAATATCATTTTTTCAATAATTATTTTCATGTATTGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATCTTGTCAAGTATCGCCCTGTCAGCTGATTCCATATTAGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATGTACCAGTTCCACCAACACCGGAGCAGGAACAACCAGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTGGTTTGCAAGGTAGCTCTAAAGACACTTGTTTAAGGTTTTATATTAACTATATGGAATATAAATAGCAATTCTGATATTTTTATTCTAATCATTTGAAATCGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATCCATCTTTTGTTGCTTTACATAAATTTATATTACTTACGTTTTATACTAACTATACAGAATATAATT >CP012309|9|8|1637482-1638629|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CAAATTGCTGACAACACTGAAAGCATTATGAACGCTA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT ATTGCTCTAGCGATTATGGGTGTTTTTCTTGTTTGGAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TCAGAATATAATGAACTTGAAGTAAATAAGTTCAT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT AATAAAAGATGGCTGGGTTTTAATAATTCCTTAAGC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTGACCTACTTCATCCACTGCACCAGATTCTAATTCTA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT ATACTTGGTCAATACATTTCAAAAGTTGCAACAGA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT GGTGTTAGCCCTAAACCATTTCTAGCACCCGCATACG GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTTAAAAGGTCAACTTAAAGGTAGTAATTTTTTAATA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT ATATTATCATCATTTAGCAAAGAATTTGCGTATTTTTC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTTAAAATAAAATATATTTGCCTACCATCAACTGAAG GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT GGTGGTAGTGGAGAAGCTTCATCAGAAATTACAGCAG GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TCAAATATCATTTTTTCAATAATTATTTTCATGTATT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CTTGTCAAGTATCGCCCTGTCAGCTGATTCCATATTA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT GTACCAGTTCCACCAACACCGGAGCAGGAACAACCA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TGGTTTGCAAGGTAGCTCTAAAGACACTTGTTTAAG GTTTTATATTAACTATATGGAATATAAAT AGCAATTCTGATATTTTTATTCTAATCATTTGAAATC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CCATCTTTTGTTGCTTTACATAAATTTATATTACTTAC GTTTTATACTAACTATACAGAATATAATT >CP012309|9|4|1637482-1638629|CRT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CAAATTGCTGACAACACTGAAAGCATTATGAACGCTA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT ATTGCTCTAGCGATTATGGGTGTTTTTCTTGTTTGGAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TCAGAATATAATGAACTTGAAGTAAATAAGTTCAT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT AATAAAAGATGGCTGGGTTTTAATAATTCCTTAAGC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTGACCTACTTCATCCACTGCACCAGATTCTAATTCTA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT ATACTTGGTCAATACATTTCAAAAGTTGCAACAGA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT GGTGTTAGCCCTAAACCATTTCTAGCACCCGCATACG GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTTAAAAGGTCAACTTAAAGGTAGTAATTTTTTAATA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT ATATTATCATCATTTAGCAAAGAATTTGCGTATTTTTC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTTAAAATAAAATATATTTGCCTACCATCAACTGAAG GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT GGTGGTAGTGGAGAAGCTTCATCAGAAATTACAGCAG GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TCAAATATCATTTTTTCAATAATTATTTTCATGTATT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CTTGTCAAGTATCGCCCTGTCAGCTGATTCCATATTA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT GTACCAGTTCCACCAACACCGGAGCAGGAACAACCA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TGGTTTGCAAGGTAGCTCTAAAGACACTTGTTTAAG GTTTTATATTAACTATATGGAATATAAAT AGCAATTCTGATATTTTTATTCTAATCATTTGAAATC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CCATCTTTTGTTGCTTTACATAAATTTATATTACTTAC GTTTTATACTAACTATACAGAATATAATT
>CP012309.1|AXU71475.1|1634729_1636823_+|signaling-protein MNKHNFEVILNQLQINIYVTNIHTNEIIFMNKKMKEEYNILDPEGKVCWQVLYPEKNSTCSFCKVLELLKNDKKGVLIKWYEKCNKLNRVFENYDSLITWQDGTVVHMHQSIDIANSTSLNKPIKINEFHEISNNKEEKGVFNFSRDNFDYNSTLLYDALIRGTDEYIYICNMKTGVFRYSPSQVELFDLPGEIVENPLVYWKKIVHPEDWNRFYKSNTEIGKNQMDYHTVEFRAKNRSGEYIWLRCRGQLMRDEFGEPSIFAGIMTQLGKQNKIDSLTQLLNYHEFMSVFEDKISNPMIEKLCIVLLNIDDFKNVNEMYDRDFGDNIIKTLAQSIQSILPDNAELYKLDGDEMGILVDNVEENEILTLYNQIQNMIIHLQLWRKYGLNITISAGCVIYPKHGDTVKELYKCASYSLQYAKEHGKNKLVFFSQEILKNKMYSLEMMRDLKASINDDFRGFSLRFQPQVDTESHKIIGVEVLLRWTNDKCKAISPLEFIPILEENDMINIVGAWVLRMALRTFRKWIDYYPFFKVSVNVSAVQILEDTFIEDIVKIIDDENFPYQNLVLELTESHTVQNMSILQFKFKALQDLGIYIAMDDFGTGYSSLEVLKFSPIDIVKIDRVFVKDILKSKFDATFIHFIVAICHDVGIKVCLEGVETQEEYDLVKQIKPDYIQGYLFGKPQTATEIFDLLKLDN >CP012309.1|AXU71474.1|1633153_1634050_-|NADP-oxidoreductase,-coenzyme-F420-dependent MANYFLSKGYCVSGFYGRNQLSLLESTNLTKTKIYSNLKDIIYENDILFITTSDDSIEIIDKKLSKFNLKHKYICHTSGSLKSSILFCSKKAGALIYSIHPIFAFSNKNTNIKKMKDICFSIEGDNEQDDLVIQNFIDDLGNQFFIRDKDTSSTYHLANVLVSNLVLSLLDIGVSYFIKLGLSEEESLKAISPLVKKNIENILDNGFTKALTGPVSRGDITPIRKHLSVLDKKDEDIYKILSLNLLKIIALGNDNSLKGIKNITIENAIENLISKSEKYKEIYKLLGGKNDEKYHTDF >CP012309.1|AXU71473.1|1632351_1633179_-|3-methyl-2-oxobutanoate-hydroxymethyltransferase MKNTIQTFKNAKYEGKKLSMLTAYDYSIAKIMDECDINGILIGDSLGMVIKGEENTLSVTIDEIIYHTKAVKNGVKNALIVSDMPFLSYHVSIEDAVKNAGRLIKEGGAHAVKLEGGSNVIKQIESIVNAQIPVMGHLGLTPQSVNSFGGFKVQGNTSETARQLIEDAKLIEKAGAFSIVLEGVPTKIAEMVTNSISIPTIGIGAGINCDGQILVYQDMLGMFGDFVPKFVKQYANIGDIMKDSIKNYILEVNTGAFPQEKHSFSINKSELEKLY >CP012309.1|AXU71472.1|1631484_1632333_-|pantoate--beta-alanine-ligase MLVKEIKLLRNIIKDWRKHGYSIGLVTTMGFLHEGHQSLIKKAVKENDKVVVSVFVNPTQFGPNEDFNSYPRDIDKDFKYCMDSGATVVFNPSPEEMYLKGNCTTINVSGLTDFLCGAKRPVHFGGVCLVVSKFLNIVTPDKAYFGEKDAQQLAVIKRMVKDLNIDTEIIGCPIIRENDGLAKSSRNTYLSEEERKSALILNKSLSLAKEKLVKGNLNPENIKELITAKINSEHLAKIDYVEIVDSETLQPVKQIEHSILVAIAVFIGKTRLIDNFTFKLNI >CP012309.1|AXU71471.1|1630891_1631074_-|hypothetical-protein MFKDKIDECVHIMTAYIASLKEYYSFIETQIGDFIKKYGEDVVELCLHRVMILLCECGLA >CP012309.1|AXU71470.1|1629145_1630060_-|hypothetical-protein MIDNQKYVILSLELHLFFSRIMKEHALFLEAGFTNKNYNLAMEADHYKKQFEDLLSYTVSASNGIIRPDILYSEELVTTLTSVAEQKTEEFTGIEINKNITTRELNLQSGVNPQVGQDLVNYVAQLNSDAIRLLDGLINFKERVLDGVLSCTIFTSNYPLLLEHIIHEANLYRSYVVDLENKIDIESKNAKEIELFWDHIMMEHALFMRGLLDPSEDELINTSNDFAIKFNELIEKTNEMTDSNIKNITEETLNETVEFKDFKEAGASGIEQCKIKSIILPLLADHVLREANHYIRILESYKNM >CP012309.1|AXU71469.1|1628108_1628756_-|lactate-utilization-protein-B/C MIRQTPLEKRYDKLGPHIVTALKKRYFDAYYCKTRNEALQQILDLIPQNHVVSWGGSETLKEMGVQTAVREKGFKVIDRDLAKTPEERTEIMRQALLCDTFLMSSNAISEDGQLFNIDGNGNRVAAMIFGPKNVIVVAGMNKIVKNIDDAIQRTRTIASPAVVQRFQDVNTPCYINGSCIDCTSPESICAYMVTTRISRPAKKIKVILVGENLGL >CP012309.1|AXU71468.1|1627372_1627942_+|lipoprotein MKKFIICIIIFAISVLVLAGCTNDNKIKNEVDSMFNSIKTQDADTVDKYFPKSGLGNLIYEDKEGFKMYSKNMTWEISDIKNNKDKVTVDLKINNTDMVSILKKNPPKLGEMMPNPTMKDIDSAKKKEFNITLELVKSGDNYVCKVNQESAMKLLNVITGGGIDYLADYNKDYYKQLDEEQKNYENKNS >CP012309.1|AXU71467.1|1626468_1627368_+|iron-sulfur-cluster-binding-protein MKLLSKVNNNIRLITQVAFTALTNGYVNGFLEGTIYGGESKKLCVPGLNCYSCPGALGACPIGSLQAVLSSREYKFSFYVVGFLMAFGAFFGRFVCGWLCPFGLVQDLLHKVPFPVKIKKVYGDKYLKYLKYIVLIMFVIILPVAIVNVAGGGNPWFCKWICPSGTLLGGIPLILGNENLRESIGFLFSWKLSILLLILLMSIITYRPFCKYICPLGAIYGFFNPISIYRFKIDKDKCTNCTACQTKCKLDIPIYKDVNSPDCIRCGECIKVCPQNAITTTFSKDKKENNICAKKYRGI >CP012309.1|AXU71466.1|1625731_1626316_+|thioredoxin MKKFFMVVLGCIFVLGVISGCSKKESKPVEKNKNNSEWFSNLDTEDVDGNKVTKEIFSNKELTLINVWTTWCGPCVGEMPELEALSKEYESNNSNVAIKGLVVEVDKTDMRTGLSNEEKNLVKDIMKKSDATYQQLTVSEELKKTDFKRVMEFPTTYFVDKKGNFVGEKVVGANSKEDWKKIIDERLKMVKANE >CP012309.1|AXU71477.1|1638786_1639185_-|hypothetical-protein MVLILKLKCQLDVSYKYFIHSHHKKRYTLLTFGWNIIFILVRVKIVIGATIRYLIKHKVNYCNKKSLDKLELKYGNIDREKAVKLEIFYQYLIELEYIEMSLLIRRLDTAITSLALVSIITIASYYLIRKNV >CP012309.1|AXU71478.1|1639278_1640097_+|MerR-family-transcriptional-regulator MEKQYFTTGEFAKLCGISKQTLIFYDKIGIFSPEYKDKNNYRYYSVYQYDTLDILQSLREIGMSLEEIKEYIQNRTPQLCVKMLKEEEKKIREKIKKLRKISSKMQNRINITVEGISKMNSEEIYISKKFEEYLVLSSDLSNMSNSDFMMELIDFTNYCKSKNLYQGYELGVIVSNESIKNGDYLSISSFYLKIDKKIKDKKLYVKPEGMYACIKHIGKYEDSYKSYEKLKKYIYENEYKIIGNSYEESILDFFCESNEDNYMTEISIQVSR >CP012309.1|AXU71479.1|1640229_1642350_-|ferrous-ion-transport-protein MGLTHNSTKMSSLKDMFDIDNKEDQFVIALAGNPNTGKSTVFNHLTGLRQHTGNWPGKTVATARGNFKYKNTEYALIDLPGTYSLFALSQEEIVARDFICFGNPDAVIVVCDATCLERNLNLVFQVMELTDKVILCINLIDEARKKGITIDKKLLEDSLGIPVILTAARNGSGMDELLDTLNDVSFDKYKLNNKPVRYNENIENVVKSIQPELDNIIPGINSRWLGLRLIDGDESIFESMSNYIDKDSIDAINEVKKKIPDNINKQKIRDEFTKINYDYAKKLSDECCSNVAKKSTDREEKVDKILTSKIFGLPIMLLLLGTILWITIEGANYPSTLLSNLLLGFEPSISGILNSINCPSWLNDMLVLGLYRTLAWVISVMLPPMAIFFPLFTLLEDFGYLPRVAFNLDHLFKKACAHGKQCLTMCMGFGCNAAGVIGCRIIDSPRERLIAILTNNFVPCNGRFPTLIAISTIFFSSVITNSFVSSVVTALCITLLIILGVIITLLVSYTLSKTLLKGVPSTFTLELPPYRVPQIGRTLYTSIIDRTIFVLGRAVMVAIPAGVITWIFANIYIGDLSILSHVANFLDPLAKLIGLDGFILLAFILGFPANEIVVPILLMAYLATGSMIELDSFSALGQVLREHGWTYLTALNVMLFSLLHWPCATTLLTIKKETGSLKWTALGFLMPTILAFVVCFLTTTVYNLFI >CP012309.1|AXU71480.1|1642375_1642603_-|ferrous-ion-transport-protein MKNLNDIQVKKTVKVEDILSSGNLRERMLALGLTRGAVIDVVRKGPKNNLTVYKIRGSKIALRQEESSLILVSDI >CP012309.1|AXU71481.1|1642929_1643370_-|acetyltransferase MFKIKHFNDLSLDEFYEIAKSRYEVFACEQKIFSLNDYDDIDKSSYHIFLKENGLICAYARIIPKEYSSYNDVSIGRVLVLSSHRRKGLAKQMMDCAIDFIKVNLHENNITLSAQTYIKNLYLSCGFKEISEVYDEAGIEHIKMRL >CP012309.1|AXU71482.1|1643542_1644511_+|putative-membrane-protein MNTTKKLTEAALLSSLFIVVTIIAVSTGFGYAIYLDFIVPVFFCIICLKCDLKYTILSGITSLLIISLVLGNLGTAIWASQSVLLGIMCGYLINKPTMVMDDLVYGSVFGVIVMVFIDIYASTLIGYSFMKEFQGYSKWIYFNGYTNFIYYLMIALFPFGMVFCIYLLSLILGNKLHILDSNSLKKFLIFKNFRNLNQFLCCSKKAFYICVSYLAIFEVLKLLNVKVDSVYLKTIFISITYISVYFIIRDSCMSLQNFIIAKFRKLLYARILFLIIILLLFFIFDVTVISLIIINAFLNKKINIRLSQSNIVNKQINLLIEK >CP012309.1|AXU71483.1|1644987_1646196_+|tyrosyl-tRNA-synthetase MKSIDEQMRIIMKGVDDLIDEKELREKLIKSEKEGKPMIVKLGLDPSAPDIHLGHTVVLRKMKQLQDLGHQIVIIIGDFTGKIGDPTGKSKARKALTTEQVLANAKTYEEQIFKVLDKEKTIVRFNSEWLAKLNFEDVIKLAATITVARMLEREDFKKRYEGQMPISVHEFFYPLMQAYDSIALEADIELGGTDQRFNLLMGRSLQREFGMESQIVIMMPLIEGLDGKEKMSKSLGNYIGIDEEAGIMYQKSMEIPDELIIKYYNLVTDVHPDEVNKIESQLKEGSVNPRDIKMNLAREIVTLYHGEESAKEAEERFKSVFQKGQIPEDIQTIQVKEDGFDLIEVLVSNEIVKSKSEVRRLASQGGVKVNGEKVEDLSTIVKESELVVQIGKKKFVKIELVK >CP012309.1|AXU71484.1|1646256_1647138_-|polysaccharide-deacetylase MVKKRKKKTVTLTILVVIVIGIFSMAWADMSRKKEMKETQERLKAERLEKERIEKEKNEPIIGAKKEAVKEYGYDAKIVWDKLNKYDYSNNGEKIVFLTFDDGPSTTNTPQVLDILKRHGVRGTFFIKGDSLERKGANEILKRTFDEGNAIAHHSYTHDYKKLYPNRSLNLDTFVNELNKTDEAMKKVLGKNFSSNVVRCPGGYMSWKNMEPLGNYLKEKNMASIDWNALNADAEGKKKNAQELFEHAKKSSEGKEMVVLLMHDTYGKQETVNALDQIITYFKDNGYQFKILI >CP012309.1|AXU71485.1|1647553_1648468_+|transporter MKKYFGEIGLIFIAIIWGSGFVATQFALDGGLTPLQIITLRFFLAAIIMNLLFFKQIRANMGKKLLKAGGILGIFLFLAFTVQTIGLMYTTPSKNAFITAANVVIVPFIGFILYRRKLDKIGIISSLVALIGIGILSLEADFSINFGDFLTLICSFGFAFHIFFTSEFAKDNNPMALTAIQFTVAFLMSVVVQTFAGQLKMEAELSGYMGTMYLAVFSTTIGFLFQTICQKRVDGTRTAIILSTEAVFGTIFSIIILKELITAKLVIGSILIFVAIITAETKLSFLKSKKMKLKDSEESSLESI >CP012309.1|AXU71486.1|1648690_1649236_+|ruberythrin MKKFVCTVCGYIHEGDAAPAQCPVCKVGADKFEEMKGEMVWADEHRIGVAQGVDAEIIEGLRANFTGECTEVGMYLAMSRQADREGYPEVAEAYKRIAFEEAEHAAKFAELLGEVVVADTKENLRVRVDAEYGATDGKLKLAKRAKELGLDAIHDTVHEMCKDEARHGKAFLGLLNRHFGK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012309_10 | 1726531-1726691 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP012309_10
|
2 spacers
spacers of CP012309_10
>10.1|1726560|37|CP012309|CRISPRCasFinder CCACCTTATAGAACTTCAATGTTTTTATTAGTTCCAT >10.2|1726626|37|CP012309|CRISPRCasFinder ATAACTAATACATGGGAATATACAAATGAAATAACTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012309_10
The CRISPR arrays of CP012309_10 >merge|CP012309|10|1726531-1726691|CRISPRCasFinder GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATCCACCTTATAGAACTTCAATGTTTTTATTAGTTCCATGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATATAACTAATACATGGGAATATACAAATGAAATAACTAGTTTTAGATTAACTATGTGGACTTAAAAT >CP012309|10|9|1726531-1726691|CRISPRCasFinder GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT CCACCTTATAGAACTTCAATGTTTTTATTAGTTCCAT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT ATAACTAATACATGGGAATATACAAATGAAATAACTA GTTTTAGATTAACTATGTGGACTTAAAAT
>CP012309.1|AXU71567.1|1726133_1726238_+|hypothetical-protein MIGFLLSILAGVISAYIYDKIKNHPDANKGDLKK >CP012309.1|AXU71566.1|1724850_1725291_+|phage-protein MSNLSAFLSQNAIKVDNVKYVASNRFLDKEGKPVEWELKVLSSEEDEALRRKCTKRVKVIGNNGKHTGQYTSEIDYNSYVAELCVASTVFPDLKDAELQNSYGVMGEAQLLKTMLTAGEYVNYTVKVNEVNGFDTSFEDKVEEAKN >CP012309.1|AXU71565.1|1724308_1724779_+|phage-protein MAQTINAKDTVSAKKAECFITIEGKRYNFMQAIDLEAKMEKNKSEVPILGRTTKGNKTTGSTNTGSATFHYNTSIFRELLYRYKETGEDIYFDIQVTNEDPTSAVGRQTVVLKDCNMDSGIITKFDADGEYLDEDMDFTFEDWELVEKFNLLAGME >CP012309.1|AXU71564.1|1722981_1724292_+|phage-protein MALGGGTFVTQNKILPGSYINFISAKRATSSLSDRGIVAIPLELDWGIDEDVFQVTNDDFEKYSTKFFGYDYTHEKLKGLRDLFKNIRLGYFYKLNKGVKASCTIATAKYSGIRGNDLKVTVTTNIDDNAKFDVVTLLDNKKVDTQIAKVITDLQDNDYITWKKDATLEASAGLVFTGGTNGEAVTGAEYQAFLDKIESYSFNALGCLATTTEIKSLFVEFTKRMRDKVGAKFQTVLYKKSDADYEGVVSVENKIKDIGLVESSLIYWAAGAIAGCDINKSNTNKKYDGEFDVDVNYTQIQLEEALKTGKFIFHKVGDEVHVLEDINTFVSFTDDKNDDFSSNQSVRVLDQIANDIATLFNEKYLGKVPNDKAGRISFWNDVVKHHKELENVRAIEDFKTDDVSVELGNDKKTVIVSDAVKVINAMSKLYMTVSVS >CP012309.1|AXU71563.1|1722794_1722980_+|hypothetical-protein MIILSKTLSKGTDYKFTKEQIVNSKKYINRKDLLNAILKENELYSFSEVEEIINSFMKGVS >CP012309.1|AXU71562.1|1722373_1722811_+|phage-protein MLNNIIDGISIKLDKTFGESYTIYSEDVEQGINEPCFFIVPLNPSKVSYPSGRTLKKNSFDVHYFPRSKDKSFEINEIAEMLLEELEYIEIDGDLVRGTNMNFEIIDNVLHFFVDYNYFTIKNNDINKMDTVELFGGLKRGDNFE >CP012309.1|AXU71561.1|1721955_1722381_+|phage-protein MARWGSVDFREFKRVCKKMEKLTKIDLDKFCKDAARELAARLLGKVIRRTPVDTGFLRQGWSGVAYARSLPVYKQGNNYIIEVVNPTEYASYVEYGHRTKGGKGWVKGQHFLTISEMELQSQVDKIIEKKLLILLKGVFDA >CP012309.1|AXU71560.1|1721608_1721956_+|phage-protein MVSKTRKAIEMLYRDKCTIVEYQPIKDPVTKRTNNKEVIVLENQPCKLSYKNIVSATEGKVAKLEQTIKLFISPDIEIKAGSKLIINDKEYVRSGESAIYPNHQEIILELFKDKA >CP012309.1|AXU71559.1|1721213_1721615_+|hypothetical-protein MENNIIDEIEKRLESFGYILKDGDKWLIGFVREKIENIIKLDCNIKTMPIELKEIEVDMIVGEFLFTKKNMGQLDIESINFEAVEKSISEGDTKVDFAIGSGSQTPEQRFDSLIAYLTTYGKNKILTFRCLRW >CP012309.1|AXU71558.1|1720970_1721204_+|hypothetical-protein MAQVRKLNRILTIEECKIDDFLEMGYDLIDETGKAVKYGKSLNVKDLIAENNILRSKVESLEEENKQLKEKNKLTKK >CP012309.1|AXU71568.1|1726817_1727699_+|hypothetical-protein MWNKFKSLNTLNKIFFGIIAFVIFPITITAFLGELSIKLLSNGFKNKKKLKIISGFIAAYFFIACATSTFLIYKDSFKNSSETAKMSTGESEVQADKNIDSKDKKDVKLSEDEQKISKVTNLAPEQVQNTAKILKECGIEEFESIKHDEGLDNAHFDGEKGYRIEFGGSKNIILYMNKDNSVYNVRWADNDFYKDGKVVSKVSDYTLTMDEKTALQLQCQNGVSAVLKSPSTAKFPNITKWMFSKNKEEIVVQSYVDSQNSFGATMRSEFQIIFTSDGKDVKSFIFDGKEMIK >CP012309.1|AXU71569.1|1727722_1730113_+|phage-tail-tape-measure-protein MVTLFLYLGLRKESEEMATIQTSIRIFDGMTPAFRSMTASINTTINSLERLQGRLNNPLNTGGIQTSQQSLNNIESVLTRIEQKIGSADNEQRKFNEDISKGASNTDRLLGSVKKVVGTYMDLKTIGGLANLSDQMTSTNARLNMINDGQLSDGGLNKMIFQSAERSRASYLDTAQIVSRIGMNAGSAFSSTREIVSFAEQLNKKFIIAGASTQEMSSALLQLTQGLGSGVLRGEELNAVFESAPNIIKSIADYLDVDIGKIRGMASEGMLTADIVKNSLLSAAEQTNAEFEKMPYTLGQIFTSVKNNAVMIFGAIQKKIEDTVSSGGFRTFIANVTDAIYVLGSVGYSVFNGFIDLLSSPVFQNFFNVMIVGSSLVVQGLGWIITQVLNVANVFAQNWSIISPIIYGVVAATIIYSLALVGVWVWEKLVAASKFAVMFAQMLLNTQTLAGYRYLILYATGQWIANEAMLACPIFWVIAGIIALTVALFIAVAVYNHFAGTSISAISLVVGAWYWLCAVVYNIISGIVNAINICVVGIANAFRTGLYAVQCFFIDMANAGLRSAENLAKGFDKFATNLANGIIKGVNIAVKALNWLVEQINKIPGIELPQMQEFQKINTVIGTNTKFKQIQKPPEPKAWKPELVELKNLKSEFIKGYDVGHQLQNKLKDTFDISKIAEDAKKKLGLDDLWDKKYGLGDGIGSAGLNSPLGDAAKGAKDTAGNTAKMAKTMDKSQEDLKYLRDIAEQETINRFTGVNIKIDMNNTNNINSEADVDGIVNVLTEKLNDAMVVSAEGIV >CP012309.1|AXU71570.1|1730124_1730814_+|phage-cell-wall-hydrolase MAYDFYLDGVQLPIPPPKLEIKVTNKNKTVDLINTGEVNILKKEGLSEISFEAEFTHNKLPFYRGTFRDVQFFLSKLELLKTDCKPFQFIVSRELGNKVLFNTNIKVSLEEYAISEDAENGSDTKVAIKLKQYRDYSTKKLVLAPPKNETGRPNVKIEPKQVDSVNATNTKTYTVKAGDSLWSICQKQLGNGSLYKKVYELNKSMMDKANKGKNLSKYTIYKGQVLKLG >CP012309.1|AXU71571.1|1730806_1732771_+|phage-cell-wall-hydrolase MVDELVLANDRDVRLVIAHWEDFYEPAVIDGITWEIERRGTPSKLEFTIVMDDILEFCEGNSVRLYYKGIGIFYGYIFQKKRDKENHIKIVAYDQLRYFKNKDTYVYSNKTASELVKMLAKDFNLKYNVIEDTKYKISRIEENKTLFDMILTALDDTLREKKEMYVLYDDFGRITLKNVASMKLDTVMNNDVIEDFDYNSSIDSDTYTKIKLVRDNEESGKRDVYIAQDSAHMRSWGILQMFDTVDKNMSEAEIKQKCDILLKLYNKKTKSLSLKNALGDIRVRAGCLVPIFLNLGDIELQNYMLVEKVKHTFENNSHFMDLTLVDGDEFASYSSSSYSSGNTNNKNEKQNGPAQSTTSKEDNDMINKLNKIFKNKLSNTGNIFVKYSNAYKVNAALMAAISIHETGNGSSSLCKNKNNFFGMKGMSFSSVDEGIKKGISNLSRNYIHTGRKTLERIRDKYAPLYDSPLNKDWVPGVGKFYKQITGSTYTSNNAGTGVGSNEEAEKNLKDTTYQVQNNNSNTSTNNNSKVSKVIQEAKNQLGKPYAWGGNGPKSFDCSGLMVWAFKRGAGINLPRVSADQSKDSRGKLLCNINDVKAGDLVFFKNEQGKVHHVGLYIGNDQYIHAPQTGDVVKISSLSGRQKKKHDFARARRFF >CP012309.1|AXU71572.1|1732784_1733045_+|phage-protein MSQELLQIIKKAAMDAVETSNPIQIAFGTIESISPLRVKIEQKLSIGEIFLIQTETFKRYTDKKIGDKLVLIRMQGGQQYLILDRM >CP012309.1|AXU71573.1|1733049_1733469_+|phage-protein MLPSDNLDYDIEDVSIVNFDVRQEPSKTFKLNIEKSKIDGICDDVEALKQTIFLILNTERYQHLIYSWNYGVELNYLIGEPISFVIPELERRIKEALIQDDRVENVDNFEFQNVKGKVHCKFTVYSKYGNIKAEKVVSV >CP012309.1|AXU71574.1|1733469_1734519_+|phage-protein MFELMTFENIIKRMLDSVPDTFDKREGSIIYNALAPVAIELTETYIAMDELLDQTFVDTASYYYLEKRCKERGITPLEATNTIAKGVFNIDIPLDSRFNLGEYNYIATERISEGIYKMKCETAGPIFELGQLIPIEYIDGLETAELTEILINGEDEESEDSLRQRYYDSLNSQSFGGNIQNYKDEVNKLPDVGGVKVYPVWDGGGTVKLVIINSNFKVPSSDLVNLVQEEIDPLQKQGEGLGLAPIGHRVTVEGVTSTTINISAEITYKNGYTWENIKSIAEEAIDDYLNELNMSWEDEENLIVRISQIETRLLSIDGVLDIANTMINEVKSNLTINSNSIVVRGEVVG >CP012309.1|AXU71575.1|1734511_1735129_+|phage-protein MDKEINLINYLPQILQDKEEYIKVFNVENKEIKTLYDKLKDLSNDQFLEDLTISGIKRWEKIMSITPKSNESLEDRRFRIFSKYISKLPYSERFLRNWLDNVVGEGNYELTINNATYNIHLESDARNQDWFEEVHSFVSNIKPCNMTLDYTRVLISKDNYMNFGITTLMGQEITIYPWSPPDIETYGEIDVLTGNGVGYQEITIF >CP012309.1|AXU71576.1|1735140_1736166_+|phage-tail-fiber-protein MAIDKSYYTIITDVGKAKIANASVTGNKVGFVKIQLGDGGGSEYTPTESQTALKNVVWEGNIGNTTTDETAPNCIILESLIPSSVGGFMIREIGYLDDENNLIAISKYKECYKPSIEQGAVVDMKVKTVLIVSNVNNIELKIDPTIIFATLKDIQDLETKIGTVNTKIDTTKTELTSNIETAKTELNTRIDTENEKQNIKIDQLIAGGSNVASTQTITIDDWVEDVENGFKTTVTHSLLTQRIVVNIIDATTKENVVTNFKIIDDNSIEIRSEVKVELNVYVINGNAETRFINATVDDNRVSEMTTYSSKKIEDRFLNLEEKVNGNLSNISTSVNELITYC >CP012309.1|AXU71577.1|1736180_1737764_+|Glycine-rich-protein MQTEWIFGYTGAEQSIILPNGRYRLECWGAGANSLTNSAESYSCFGGYSKGELTLKKETTLHIFVGQYTGNFNGGGKGMTGTGGGATDIRLIGGSWDNEQGLLSRIIVAGGAGAGSGYGYTGSHGGGIVGNNGEGSENRWTAGATQTEGGRGQVGGLGGSFGKGNRSSGDMTNAPKFGGGGGWFGGAGSGSNFASGGGGSGYVLTKDSYKPVGYTPTNEYWLENTSMTVGGNNINASHGKVKITLLQALPFLNISSYNSTTATFKADHTDPTLLTKIEYFIDDVLKETITTDLTTEKTINYTLEDNALHTLKIVVTDSNNATAEKVLSISKNIMPLPENVNLNDISTKLVEVNAGFKVGKTSIINTLALKNIEASLNNTLVELSEKIKTSFNSSDASVQDLMNQLTQANNTISQLNSKYKFAYSLDLTVNWFIDCGFKPDFVIYECINNHGKFLVFLTPFNYFVFDIGNSGWTITAREDISEKDSFSTNDINKFWGTKIRDTGFNNADMPKDSLNDRYVFWIAIKCL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP012309_11 | 1875709-1876591 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP012309_11
|
13 spacers
spacers of CP012309_11
>11.1|1875738|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTATAAAAGGTCTAGCAAATAATTGTTAGACTTTT >11.2|1875804|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTATAACATTACTAGCAAAATCAAGGACTTGGTCTT >11.3|1875870|36|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGAACTTGAAAGCGAAGTAGTCGGGAATGACTTTTT >11.4|1875935|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATACAAAGAGAAACGAATTGATAAAATCGGGTGTAT >11.5|1876001|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAATTTTTACTATTTCGGTATCCTCTTTCAAAGACTT >11.6|1876067|35|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAATCAATGTTATAACCTTCCTAGTTCAACATGG >11.7|1876131|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAAATCAGTTTTTCGGGATTTTAGCTTCTGAGGATT >11.8|1876197|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGGCAACAGAAACATTACCAAAAATAATAAATAGCAT >11.9|1876263|36|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATCTATTTCACTTATATTGTCGACATCCCACTCA >11.10|1876328|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATGGTAAAGTAGGTTCTGGAGCAGTAGGAAATATAA >11.11|1876394|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCGTTTTTTGGGGCTATGTTGTTGGGATTTTCTTTTT >11.12|1876460|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTCAGTTGCGATGGATCTGGGACAGAAACACATA >11.13|1876526|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATGTTAAGTACTTCTTGTGGGGTCATAAAAAAACGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012309_11
The CRISPR arrays of CP012309_11 >merge|CP012309|11|1875709-1876591|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTTTATAAAAGGTCTAGCAAATAATTGTTAGACTTTTGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTCTATAACATTACTAGCAAAATCAAGGACTTGGTCTTGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTGAACTTGAAAGCGAAGTAGTCGGGAATGACTTTTTGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAATACAAAGAGAAACGAATTGATAAAATCGGGTGTATGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTAATTTTTACTATTTCGGTATCCTCTTTCAAAGACTTGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTAATCAATGTTATAACCTTCCTAGTTCAACATGGGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATGAAAATCAGTTTTTCGGGATTTTAGCTTCTGAGGATTGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATGGGCAACAGAAACATTACCAAAAATAATAAATAGCATGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTATCTATTTCACTTATATTGTCGACATCCCACTCAGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATGATGGTAAAGTAGGTTCTGGAGCAGTAGGAAATATAAGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATGCGTTTTTTGGGGCTATGTTGTTGGGATTTTCTTTTTGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTTTTCAGTTGCGATGGATCTGGGACAGAAACACATAGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTATGTTAAGTACTTCTTGTGGGGTCATAAAAAAACGAGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT >CP012309|11|3|1875709-1876591|PILER-CR GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTTATAAAAGGTCTAGCAAATAATTGTTAGACTTTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TCTATAACATTACTAGCAAAATCAAGGACTTGGTCTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TGAACTTGAAAGCGAAGTAGTCGGGAATGACTTTTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AATACAAAGAGAAACGAATTGATAAAATCGGGTGTAT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TAATTTTTACTATTTCGGTATCCTCTTTCAAAGACTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTAATCAATGTTATAACCTTCCTAGTTCAACATGG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GAAAATCAGTTTTTCGGGATTTTAGCTTCTGAGGATT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GGGCAACAGAAACATTACCAAAAATAATAAATAGCAT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTATCTATTTCACTTATATTGTCGACATCCCACTCA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GATGGTAAAGTAGGTTCTGGAGCAGTAGGAAATATAA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GCGTTTTTTGGGGCTATGTTGTTGGGATTTTCTTTTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTTTCAGTTGCGATGGATCTGGGACAGAAACACATA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TATGTTAAGTACTTCTTGTGGGGTCATAAAAAAACGA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT >CP012309|11|10|1875709-1876591|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTTATAAAAGGTCTAGCAAATAATTGTTAGACTTTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TCTATAACATTACTAGCAAAATCAAGGACTTGGTCTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TGAACTTGAAAGCGAAGTAGTCGGGAATGACTTTTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AATACAAAGAGAAACGAATTGATAAAATCGGGTGTAT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TAATTTTTACTATTTCGGTATCCTCTTTCAAAGACTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTAATCAATGTTATAACCTTCCTAGTTCAACATGG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GAAAATCAGTTTTTCGGGATTTTAGCTTCTGAGGATT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GGGCAACAGAAACATTACCAAAAATAATAAATAGCAT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTATCTATTTCACTTATATTGTCGACATCCCACTCA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GATGGTAAAGTAGGTTCTGGAGCAGTAGGAAATATAA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GCGTTTTTTGGGGCTATGTTGTTGGGATTTTCTTTTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTTTCAGTTGCGATGGATCTGGGACAGAAACACATA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TATGTTAAGTACTTCTTGTGGGGTCATAAAAAAACGA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT >CP012309|11|5|1875709-1876591|CRT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTTATAAAAGGTCTAGCAAATAATTGTTAGACTTTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TCTATAACATTACTAGCAAAATCAAGGACTTGGTCTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TGAACTTGAAAGCGAAGTAGTCGGGAATGACTTTTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AATACAAAGAGAAACGAATTGATAAAATCGGGTGTAT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TAATTTTTACTATTTCGGTATCCTCTTTCAAAGACTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTAATCAATGTTATAACCTTCCTAGTTCAACATGG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GAAAATCAGTTTTTCGGGATTTTAGCTTCTGAGGATT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GGGCAACAGAAACATTACCAAAAATAATAAATAGCAT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTATCTATTTCACTTATATTGTCGACATCCCACTCA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GATGGTAAAGTAGGTTCTGGAGCAGTAGGAAATATAA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT GCGTTTTTTGGGGCTATGTTGTTGGGATTTTCTTTTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTTTCAGTTGCGATGGATCTGGGACAGAAACACATA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TATGTTAAGTACTTCTTGTGGGGTCATAAAAAAACGA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
>CP012309.1|AXU71696.1|1873781_1875053_-|guanine-deaminase MLKVLKGNIIFTKTSETFTVFENSYIILEKGKVKGIFKEIPKEYKNLEVVDYTDKLIIPGMNDLHAHASQFKNLGIAMDKELLPWLETYVFPEESNYKDIEYATKMYKKFVKEVWKSGTTRTAVFATVHKEASMKLMDIFKEVGLGAYIGKVNMNMNCPDTLLENTHDSIADTEEFINKYSDTDSIVKPIVTPRFIPSCTSELLKALGDLCLKYNIPMQSHLSENYDEIEWVKNLEPESKFYGDAYNRYNLFGQTPTLMAHCVHCSQDEIDLMRENNVMAVHCPASNFNVGSGAMPIRKLIDNNIRLALGSDISGGHTLSIFKAMVSAIQLSKLYWVNSGKKYNFLSLSEAFYIATKSGGSFFGKVGSFEEGYDFDALIIDDSNLNHDNYSILERLERFIYVGDDRNIIHRYVCGKLIEEPNI >CP012309.1|AXU71695.1|1872880_1873198_-|hypothetical-protein MSEFKNVTAVKKANVYFDGKVSSRVIILPNGERKTLGLMLPGEYTFSTREEEIMEMLAGSMDVKLPGSNEFVTYKEGQKFNVPSDSSFDLKVNEVVDYCCSYIAD >CP012309.1|AXU71694.1|1870437_1872795_+|cation-transporting-ATPase MDKVNLERYSCDINVGLNKNQLQSRIDDNLINAFDNGKTKTYKQIFKDNIFTLFNLINIVLVCLLVSVGSFKNTLFIFIAVINTIIGVIQEIRAKRLLDNLSVIVSNKVSVIREKEKKEIDVQELVLDDIMILKTGNQICADSKVLNGKLEVNESLVTGESDIIIKNKGDFLYSGSFVVSGEAFVRVENIGKDNYANKIANDAKISKKHNSQLRNSLNAILKIVGIIIIPLGIILFAKQHFGNGDSIATSVVGTVAAVNGMIPEGLTLLTSIALAVGTIKLASHKTLVQELYCVETLARVDTLCLDKTGTITEGKMQVDDIVMLEEVDINEIMGNICNSLKDDNATLNAIRDKYNVLDTYKAKNLIPFSSERKYSGVTFENKGTYLLGAFEFIFKEKNKKLRIEVERYSKKGNRVIVLAHSDSYMEDNNIPEDIKPLAFILILDKIRDEAKETLEFFYNEGVDIKIISGDNPITVSEVARKAGLKTASNFIDATTLKNDSDIYKAVDKYSVFGRVSPQQKKQMILALKKQNHTVAMTGDGVNDVLALKEADCSISMASGSDVTKNVSNLVLLDSNFASMPKVVMEGRKVINNIQRASSLFLVKTIFSFFLSLLTLFFFSRQYPFVPIQLSLIGAVTVGIPSFFLALEANKSRISGNFLLNILKNALPGALCVTVNVIIVYNIVEYLGYSSSVFSTMCAILTGVCGLLILRQQCLPFNKERLFLIVSMTIAFVIGILFLGGLFSFVALSRELILITMTLAILMPIMIKVMLFVLDEILETIVPDLN >CP012309.1|AXU71693.1|1868557_1870015_+|glycine-dehydrogenase-subunit-2 MKEYNSLLIDISKKGRKAYSLPKLDIDDIKIEDMIDQDMARQSELNLPEVGELELVRHYTLLSNKNFGVDTGFYPLGSCTMKYNPKINEDMAALPNFTGIHPYQSSDTAQGSLSLMYDLSRRLAEITGMDEVTLQPSAGSHGEFTGLMIIKAYHENRDDHKRTKVIIPDSAHGTNPASAAMANFDVIQIASDKNGAVDINALKEVLNDEVAALMLTNPSTLGLFEKNIKEIATLVHEAGGLLYYDGANMNAIMGITRPGDMGFDVVHLNLHKTFSTPHGGGGPGAGPVGVKKELVPFLPIPVIERKEDKYVLNYDREKSIGKIKNFYGNFGVLVRAYTYILTMGRDGLKEASEMAVLNANYIKESIKDDYILPIDTLCKHEFVLGGLPRGEANIKTIDIAKRLLDYGYHPPTMYFPLIINEALMIEPTESESIETLDSFIEAMKSVAKEAKEEPELLKTAPHNTLVKRVDDARAVKKPILTWSQR >CP012309.1|AXU71692.1|1866083_1868558_+|bifunctional-glycine-dehydrogenase/aminomethyl-transferase-protein MNELKRVSLYNIHKELGAKLVEFAGWEMPLEYEGINKEHEKVRKSAGIFDVSHMGEVQIKGAESEKFIQNLVTNDISALKINDIIYTPMCYENGGVVDDLLIYKFGEEDYLLVINAGNIDKDVAWIIKQSEGYNVDIKNISSEVSQLAIQGPKAEEILQKITDIDLNSIKFYKSIPSTIVCGCPCLVSRTGYTGEDGFEIYCKNKYVEIIWNEVLKVGGEDICPAGLGCRDTLRFEAALPLYGHEINEHISPIEGGLSIFVKTNKESFIGKSILSKEKESGAKRKLVGFEMQGKGMPRNGYDIRIGDKTVGFVTTGCASPTTGKILGMGIIDSEYAKVGNEIGIAIRKKVVPAVIVKKPFYKKQYKKDNIILNKENKFSYIPATSEDKSKMLKVVGLNSVDELFSDIPEEVKLKRDLNLEIGKSELEVSKIVKRLSEENLSLEDLTCFLGAGAYDHYIPSIIKHITSRSEFYTAYTPYQAEISQGTLQVVFEFQSMIAEITGMEIANASMYDGATAAIEACIMAMNQTRKSKIVVSKTIHPETLSVLRTYLQYKDCEIVEIDFCNEYGTTDIEKLKASVDKDTACVLIQTPNFFGIIEEMEEIEKITHENKAMLIMSVDPISLGVLKTPGEIGADIVVGEAQSLGNPLNFGGPYVGFLASKSKYTRKMPGRIVGQSLDVEGKIAYVLTLQTREQHVRREKATSNICSNQALNALVASIYMATMGKEGFKEVGMQSMKKAHYTYNKLVQTGKYKPIFKGKFFKEFAVQGNLNIETINDKLLEENILGGYNLEYNYPELKNSTLLCVTEKRSKEEIDKLVGIMEGL >CP012309.1|AXU71691.1|1864762_1865278_+|CF-9-family-membrane-protein MEKYIWLFPLLFIFHDMEEIIGFGIWLKKNKSMLDKKYPFISKVYENYSTEGMAFAVFEEFILCIIFCILTVITENQYVYLLWLGSFIAYTLHLVIHIGQSIIIRKYIPSLITSIICLPISIWCISKSIYIVDCEMSTTILYSIIGIIIVALNLKFAQSLIGKFTKWMSNI >CP012309.1|AXU71690.1|1862507_1864238_+|Na+/H+-antiporter MRNKKINIIFLTTIMFIMSTVMVFAEEDIDTIALANAEKFGILTLIPPLVAIILAFITKNVIISLLIGILSGSFIIKASGINVFATFIQAFLDLVDRALVSLADPWNAGIILQVLAIGGVINLVAKMGGAKAIAEALAKRAKSAKGTQLITWFLGLLVFFDDYANSLIVGPMMRPVADKMKISREKLAFIIDATAAPVAGLAIISTWIGLEVGLIHDAFESISIDVDAFGIFLNTIPFRFYNILILAFIVISALLLKEFGPMRKAEIKSRSRKISIDLDEGVEELDDLAPKNGVKLSVWNAIIPIGTLIIVALASFYYSGYTSIMGGDDKALIQLFTNSPYSFEAIKEAFSASDASRALFQSALVASLVAIIMAVVKKIFTISEAIDVWIDGMKSLVITGVILILAWSLSSVIKELGTAKFLIHLLSGSLPPFLLPSLIFGLGAIISFATGTAYGTMGILMPLAIPLAYSLNPDMSYVIVSTSAVLTGAIFGDHCSPISDTTILSSMGAGCNHIDHVNTQMPYAIFTAVITIVFGYIPAGLGLPIYIVLPVAIAAIFVGIQIIGKKVDEAEIELVE >CP012309.1|AXU71689.1|1861037_1862024_-|lipoate-protein-ligase MLLIYNEKTNPYFNLAMEEYLLKNFDEDLFILWRNEPSIIVGKNQNTLSEINLEYIKEYSIPVVRRQSGGGAVFHDLGNINFTFIACNNNNFSDFRRFTQPIIDLLKTLDVNAEFSGRNDLLIDGKKFSGNAQYNYKNKVMHHGTLLFSSEINDLSKALKVKPIKFEGKGIKSVKSRVTNISEHLHSKMDILEFKDAIMDYLSKTNTDNTNYCLSEHDIKQIEKLTKSKYETWDWNFGNSPKYTLSNELKYSGGNVEFNLNVDKGIITSIKFFGDFFGKCDVAFVENKLIGIRHEENALRNTLDSIEINDYFLGADTDILVSGILGVK >CP012309.1|AXU71688.1|1859930_1860728_-|lipoprotein MKFKKLLCLLLCLVLTLAVVGCSKAKDDKKIVVGATLVPGGELLEELKPLIKEKGYTLEVKNFDDYILPNEALNNGEIDANLFQHEPYLKEAVKAKGYKIMAGKKLYVCPAILYSYKIKSVDEFKKGDTIAISNNPSSCSKNLRYLESIGLLTLPKGDGLVSPKDIIENPKGIQFKELDIAQIPSSLPDVTAAFIDTTYAVPAGLDAKKNGIYTAPINDEYANLLAFRTEDKDSEKIKVLQDVLTSDKARSLIEEKYKGIVIPTF >CP012309.1|AXU71687.1|1859228_1859828_-|tellurium-resistance-protein MAIELKKGQKINLTKKENSDLGEILVNLNWNQKVQKKGFFGSLRSSNIDLDLGCLFEMKNGVKGAVQALGNAFGSLDNPPFAQLDGDDRTGSNTQGENLRINGNKIKDIKRILIYAFIYEGVANWSEADGIVTIKQKQDSDLVVKLDEHKNGYNMCSIALIENVNDETFSVEKVVKYFKGHREMDTEFHWGLKWVAGRK >CP012309.1|AXU71697.1|1876999_1877287_+|hypothetical-protein MKKFLYALYSFIVIIANFRLKEKNYNFILLAIFFILLLIQNGVLKTGYQNRATFYQDNYFNGEDKNDKIKFMTIKIFIFLSLPLCFNILFNYLTS >CP012309.1|AXU71698.1|1877311_1877410_+|hypothetical-protein MIKVSLCVICSKYKVHIVIKQKFHINEEKNIK >CP012309.1|AXU71699.1|1877825_1878377_-|transcriptional-regulator MSINTVIAKNLNRLRNERNLSLGQLAELSGVSKVMLSQIEKGDSNPTVNTIWKIASGLNVPYTAILEQPQNETFIVSKTDIDVQVSENKDYRLYCYYPNTPTRNFELFQMELEEGHSYTSVGHSEKSQEYIMIIEGQLKLEVNDSIYQLRENDSICFSAESIHTYHNQGEKTLKAVIINYYPV >CP012309.1|AXU71700.1|1878567_1879530_+|cysteine-synthase-A MRVLNNVTEAIGNTHMLHLSKIADEFGVQGNIYAKMEYLNPGFSKKDRVALQMITEAENAGLLVPGQAVVELTSGNTGTGLAIACACKGYKFIACMSKGNSMERARMMKALGAEVVLVDQMPNSVHGQVSGEDLALVEIEAQKIAKERNAFRADQFNLEACNHAHEKYTAEEMWEQLDGNIDVFVDFLGSGSTFAGCSKTLKKHNSSIKCYVVEPETAAIYSGKEITDQGHKIQGGGYSMDLPLVDKKLIDGYIQVTDEEATDVARKLAKLEGVFAGFSSGANVCAAIKLLKSSEKGKNIVLTLNDSGLKYLSTDLYEEL >CP012309.1|AXU71701.1|1879824_1881669_+|glycerophosphoryl-diester-phosphodiesterase MQKRILRNFIFTGKNILSKLVFIIKYNFSTLILFELFHKGLALFFIWPSIRYIFDILIKSLHIVYLNMDNFIKVLTNPMSIVLIILSVIILAFYAFFEFTSVIICFNKSIKYEKIGLFELFKISFKNSIKLLYPKNILLFIFVILIIPLVNTVLISGFIGKIQIPEYILDYIKSDIILNIIYMIFLLIIYISVIRWIFSIHEITLNTENFKRARKESVNLIKGKIIRTIIYSLILSLVVAIIGYAIYHSGIIFIGIWTKYCTDMEFLKNVFINRCIAFEEYFRLILSIFIFILDIGFISATYYQYKGVSISKNNIKKEKKSISKIVFNLVLILLISYIESVAFSSHINGMFNTSFSFYTTAIAHRAGAEMAPENTLAAIEEASHAKADYAEIDVQETKDGELIVLHDSNFKRTTGVDKNVWDVNYNEVKTYDAGSFYYYGKGYYDEKFVGEKIPTLKEMIKYSKGKVKLLIEIKLNGHEKGDVVKKVVQLIKENNFENQCIVASMDKTILQKVKKLDENLLTCYFMAIAYGDFSKLNYVDIYGIESTFVNKTVVEKIHKMNKKIFVWTVNSDSLIEKMLDLNVDSIITDNPYLIESAIYWKKNGFISQVSDYLF >CP012309.1|AXU71702.1|1881990_1882575_+|sugar-O-acetyltransferase MTEREKMLAGELYDCGDIELLTQWHKAKDLVRDYNQTDSSDLEKKEKILNELLGGKGKNLWITAPYYVDYGNNIYFGNNCEVNMNCTFLDDNKIIIGDNALIAPNVQIYTAFHPTNAGDRFGNAKEDGSFEFCKTQTAPVTIGDNVWIGGGAIIMPGVTIGDNVVIGAGSIVTKDIPSNMIAYGNPCRIIRENK >CP012309.1|AXU71703.1|1883677_1883854_-|hypothetical-protein MFIGEIDKCTHILTAYISSSYDYCNFLDTQLDDFISEYGETVVETCLHQVLLLVSRYN >CP012309.1|AXU71704.1|1884428_1885451_+|ABC-type-transport-system-involved-in-multi-copper-enzyme-maturation,-permease-component MVNWEIKKLAKSKSMFISLGILVLILMISIFIAPVLETESYYIDKEKGRIEDTRSGIDIGNEKFQNKINVLKQFSNQTDTGEFSKKIELMSKKKLDNLSVNEYKDISFWKVFNYRVTNSLINVGMLIIISIIISNIYVDEVVTSVKDIILSSKEKKKALKSKIFVALLVPLVIYSVYLMGIFIITCMQQGVPVNGDLESFRIVDNVVALKTNLSITKYVILNIGIELLMFEGWAMIAIFGSFISKSSISSISFFIFIISITKIMSVIHILPKKLLSVVSNVNYYDLMFGFNKIIGNYLGDIMIFKVNIDIVNIAIGFLMAILIGAMSLCFLVIKSDYISR >CP012309.1|AXU71705.1|1885464_1886352_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNKLEIENLSKIYGKKVANDKITVTLENGVYGLLGPNGAGKSTLMKQITTLIKPDEGQILYNGEDIFKMDADYRNILGYLPQEFGVYKNFTAKEFLQYIGALKGLRGKYLNSKIGELLDLVGLYDVRNKSIGKFSGGMKRRVGIAQVLLNDPKIIVLDEPTAGLDPQERARFRNLIAKMSRDKIIILSTHIISDIESVAKETIMIKDGKLLMKGTHKDILSHMENKVYNVQVKNECEVDDIQSKYKVVSIQSDIDSVVLRIVSEDIPSGDNIQPVQAKFEDVYMFYFDLEDAREV >CP012309.1|AXU71706.1|1886357_1887131_+|ABC-transporter-permease MMYLVKAEMIKILKSKSVWIIWLFLIFFGFFLIRKFDVLDTYADIFYKIEGSIPLIGLIMFIITSGNYIKEYDSNMTGLINTTKKGKKSVVLSKLVANGLILSIINISFILLVGIRGFSFFDFKNLNEPIHNLWYFGNSNLNLTVIQMYIIVILTTIFASFIFAQIGLTLSSIFKSAVIPFILGGLIMAIPYFSVGFIPDKAIKFMSVTPNWIMMSQQMVKYNVPSILIVFSIVISIILMIVLTKITYENFTSSKRF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP012309_12 | 2189084-2189375 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP012309_12
|
4 spacers
spacers of CP012309_12
>12.1|2189113|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT TTAAGACTAGCAGACTCATAAGCAATTAGTTGCCTCT >12.2|2189179|36|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT TTTAATAATAAGGAGAGAAAAAATGAATATTTATGA >12.3|2189244|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT TAATTGGAGTCCAATCTAATTTAATAGAAGGAATACT >12.4|2189310|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT GTTTTGGGGGTACTGGTACTTTTACCTCCTGCACTTC >12.5|2189114|37|CP012309|PILER-CR TTAAGACTAGCAGACTCATAAGCAATTAGTTGCCTCT >12.6|2189180|36|CP012309|PILER-CR TTTAATAATAAGGAGAGAAAAAATGAATATTTATGA >12.7|2189245|37|CP012309|PILER-CR TAATTGGAGTCCAATCTAATTTAATAGAAGGAATACT >12.8|2189311|37|CP012309|PILER-CR GTTTTGGGGGTACTGGTACTTTTACCTCCTGCACTTC |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012309_12
The CRISPR arrays of CP012309_12 >merge|CP012309|12|2189084-2189375|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTACATACCACATAGTTGATATAAAACTTAAGACTAGCAGACTCATAAGCAATTAGTTGCCTCTCTTTACATACCACATAGTTGATATAAAACTTTAATAATAAGGAGAGAAAAAATGAATATTTATGACTTTACATACCACATAGTTGATATAAAACTAATTGGAGTCCAATCTAATTTAATAGAAGGAATACTCTTTACATACCACATAGTTGATATAAAACGTTTTGGGGGTACTGGTACTTTTACCTCCTGCACTTCCTTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC >CP012309|12|11|2189084-2189375|CRISPRCasFinder TTTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC TTAAGACTAGCAGACTCATAAGCAATTAGTTGCCTCT CTTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC TTTAATAATAAGGAGAGAAAAAATGAATATTTATGA CTTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC TAATTGGAGTCCAATCTAATTTAATAGAAGGAATACT CTTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC GTTTTGGGGGTACTGGTACTTTTACCTCCTGCACTTC CTTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC >CP012309|12|6|2189084-2189375|CRT TTTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC TTAAGACTAGCAGACTCATAAGCAATTAGTTGCCTCT CTTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC TTTAATAATAAGGAGAGAAAAAATGAATATTTATGA CTTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC TAATTGGAGTCCAATCTAATTTAATAGAAGGAATACT CTTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC GTTTTGGGGGTACTGGTACTTTTACCTCCTGCACTTC CTTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC >CP012309|12|4|2189085-2189375|PILER-CR TTTACATACCACATAGTTGATATAAAACT TAAGACTAGCAGACTCATAAGCAATTAGTTGCCTCTC TTTACATACCACATAGTTGATATAAAACT TTAATAATAAGGAGAGAAAAAATGAATATTTATGAC TTTACATACCACATAGTTGATATAAAACT AATTGGAGTCCAATCTAATTTAATAGAAGGAATACTC TTTACATACCACATAGTTGATATAAAACG TTTTGGGGGTACTGGTACTTTTACCTCCTGCACTTCC TTTACATACCACATAGTTGATATAAAAC
>CP012309.1|AXU72000.1|2188519_2188720_+|cold-shock-protein MNNGIVKWFNNEKGFGFISMEGRDDVFAHFSAIQTSGFKSLEEGQQVSFDIVKGARGPQAENITIL >CP012309.1|AXU71999.1|2188117_2188294_+|hypothetical-protein MFGNKMDKCTHVLTAYISSSYDYCNFLDTQLDDFILEYGENVVESCLHQVMVLVSKYN >CP012309.1|AXU71998.1|2187557_2187740_-|regulatory-protein MLNKKLPDTELKIMKCIWHTGYKTVISKDVADEIEKTYGWKHTTTIILLARLTKKGFLIS >CP012309.1|AXU71997.1|2186341_2186827_-|cell-wall-hydrolase MISELMLKNFRKSSINFKTKIKLNLREKPDINSLKLKSIPEGKIVKLKCVDGIWAEVESNYDKGWLLYKYLERLSNAKNNSNDTIKNRKKNYIGNIRTNGLSLELRNDRTLESKVITTIPDGFKVEVCYSVGKWARVNINKNEKRYSGYVYNQYIEEHLSL >CP012309.1|AXU71996.1|2185587_2185986_-|hypothetical-protein MNKKKKLIGIAISFLLIISIINPLQVEAEAIIESSVYISSIKENYTYDNTKFKTIKSKSRHKSRKYNKSKVKLKKRSIRTKKYGYQTINKYKRQNARRHNILTKLILSIIVIFLVIVLVVLIFIKRKKKKFY >CP012309.1|AXU71995.1|2184186_2184738_-|tryptophan-transport-protein MKTNTKKLTLNAILLAMGLLIHQITPAIGLPMKPDVPLAMLFVILVLNRDDYKTCLIAGIVTGIFTALTSSFPGGQIPNVIDKTLTANIVFLLMNISYNMPFIKKLAKKTQDTVVVAIIMPIGTLVSGTIFLLAAQAIVGLPGASFTALFLAVVLPAVLINLVAGIFLFKIVSLSIRRVSYQA >CP012309.1|AXU71994.1|2183891_2184056_+|hypothetical-protein MYSKNEKSEEINIKIYLEKSIKYILYLITTNEIHIRILYRYDNLSVKLSVIGTI >CP012309.1|AXU71993.1|2181922_2183359_-|cell-surface-protein MKFYKRILTLTLSISFVFANIQLVDAISSVEKIQGKNKYEIAGKIADKNAYKTAILINTSNSIADGLSASGLAGALNAPILLTEKNTIPTETSARLKNVSKVYIIGGTYSISTSVENSLKSKKMKVVRIKGNDRIKTSYNVAKEINSIKKVNTVMLTNAYKGEADAISIASVAARDKAPIILTNGQSIPFSTSGLKSYVIGGTASMSTTLVNNTKSTRLGGSTRFETNKAIINKFYKDAREFYIAGAYELTNALVGSSLSKHGPMVLVNDGSNKSILKNAKKITSIGYIDSNIVQQCLNITNGIGDINTGVVKNVKPTTKTIKDGMYKVGKDISAGEYLITSNSGSYASYYEVTSDSTGNADSILSNDIFSGTRYITLKNGQYIKIEDSTMTLAKYAKAQKAKNGKFGNGMYKIGLEIPAGEYIIMSNSSDAYYEVRNDSLGNAEGIVTNDTFSGRRYITVEEGQYLILNDCYLIENE >CP012309.1|AXU71992.1|2180238_2181675_-|radical-SAM-protein MSKRKQVTIPIEKIQEQDKYIEQIHRQNEEYFNRTGKRKLVFTQTFGCQMNEHDSEKLCSMLEEMGYQMSMMVEESDLIIYNTCAVRENAELKVYGNLGQLKHLKGKNPDMKIAVCGCMMQQPHVVEELRKKYKHVDLIFGTHNLYKFPQLLTESINSDKMLVDVWDVDGEVIEGLRSNRKFELKAFVNIMYGCNNFCTYCIVPYTRGRERSRTPEDIINEIKELVANGTKEITLLGQNVDSYGKTLENPVSFSELLRKVNDIEGIERVRFMTSHPKDISDEVIYAIRDCDKVCEFLHLPIQCGSSSLLKKMNRHYTKEYYLEIIEKAKKEVPGIAFSTDLMIGFPGETEEDLLDTLDVVEKVRYDSAFTFIYSKRQGTPAAKMENQIPEDIKHDRFNRVLEAVNRISAEINDGYKDRIVEVLVEGRSKNNENKFAGRTRQNKLVNFEGGNDDLIGKLVMVKITEPRTFSLNGILVNN >CP012309.1|AXU71991.1|2179493_2179832_+|hypothetical-protein MFAVGFVVIIALAFFILSVLLFNGKASMLLAGYNSMSKKEKARYDKKKLCRSSSIVTFIVSIMLFIMAFLGYRIESGQMDEKKMVPFSIIFIIVILSSVFFNILYSNKKCKK >CP012309.1|AXU72002.1|2189854_2190700_+|lipoprotein MNIIKSITLLLTLLIVILMTGCSPRESASEVAKKYIDKMNSGDYETAYSLLSKDSKKKISIENLEEFQNILVSTKRIISYKIGKEKIIKKYKHDGKEYKNVVKLEETFNIKNLLYKKDDSLKVNRYFVVENNKYKLLLYESFKKEFGINSMDLAQLKLNDFGLKYFKEVDLILKKAIAINPTDSKLYYAQACNYMNFDGFPGYSDTTYNALDSINKSLKYLDKNDSDYKKNASNIYNLKGVILMFHKRFDEAQQYLNKALYFNKDNEDPKYNLNTIKKHLN >CP012309.1|AXU72003.1|2190923_2191088_-|hypothetical-protein MFGKPKESVRFLDFNDVAEKFGEKKAVAIFDAIAGKKSKEHIIKDIEKLVKNEV >CP012309.1|AXU72004.1|2191628_2191961_-|decarboxylase MNTREMKEYRVFYNKKLSETDEFFRVFGSLDDKTYSEGAISKKNKELMGLAISILSRCDECICYHIEGCINSGASKDEIIEAIKIGVIGGGSITYPNARFAIKILEEFNI >CP012309.1|AXU72005.1|2192204_2192846_-|Immunity-protein-SdpI MKKAINKQFILSTLICFIPFIVSIYFYNRLPNEVAIHFDNYGNPDNYAPKVIAAFGVPLLMLCIHLYTWFRLENEPKKANFSNVIQNLSKWGVAILSVIIQIMMVLYSTGVSLESNFYTGLILGIIVILFGNYLPKCKRNYSVGIILPWTLNDEDNWNKTHHLAGWIWLIGGILLIINAFINIPFYNIFVIFVIVILPFIYSYLMYKISGKNN >CP012309.1|AXU72006.1|2192826_2193123_-|ArsR-family-transcriptional-regulator MLGFPETFKALSDPIRREILVMLRENKMSAGEISEKFNMTNATISYHLSQLKKAGLIFETKYKNFIFYEINISVFEEVMLWFSQFMEKGEKDNEKSDK >CP012309.1|AXU72007.1|2193742_2193877_-|hypothetical-protein MNISRRAMKIIELAQKIANKRGVTVQDAWNDAMKEYKEKYEYVA >CP012309.1|AXU72008.1|2194087_2194840_-|transporter MFSVIFLCIGGFLAAFVDSIAGGGGLISMPVLMAIGVPVHLAIGTNKFAASAGCISSAYRYAKSGKINNNLLKKLVPFTIIGSVLGVRCVLSISEEILNVLVVVMILIVAIYTFISKNLGQEDNFEAVNKKNLRLGMLMALIMGFYDGFFGPGTGTFLTFGFIKIYGYDFLHASANTKILNLTSNITSLLLFMINGQVDYKIAIVFALVMIMGAYVGAKVAIKKGSKMIKPIFLVMALFMVVKLVYQTLV >CP012309.1|AXU72009.1|2194898_2196554_-|AraC-family-transcription-regulator MEYFSESNNEVQKFDWGEVMWIHEPSKTQFNRLSAGIVRFFPGNYQEKHFHLSEEQLLYVIQGEGIQIIDGKKVNIKEISIVYCPPYSEHEIINTGKIDLVILITYVPHKFSSLRQIPIVFSENNIQELVNVNIIENLANQISNILKLRISVYDLKYKEIFETKKENKFCDICKNIKQCTKKLVKSINNDNFEKVYHCEYGVSSLEIPIVLEENIVGYIECGNFIVYKSIDIDKNLSELSSSSGIDIKYINKIYNEFPLNPKSRLYVLKENLLMMSEFIQEIAKRNFFENQLSIKDEEILKSRKENIRLEEALKKANSRLLEEEYIINPIDMFNNSSKEYPFELELYIEKEIKNMNLEGVYNLIDTNKLRYNDVRDTIQEMIFVLSRTVLRDLEDLKLISYLRNKYNKKISLVNSDEDLWNVLFEFSKECIDKNRAFWRKDKGNLIENINEYIKKYYKENINLNSISDVFFISPNYLSSIFNERNKVSITEYINLLRIEESKKYLLDRSMSISDICKKVGFNNSSYFSQIFKKFNSITPNEYRKNMLDNKY >CP012309.1|AXU72010.1|2197826_2198906_-|proline-iminopeptidase MILITLCILVAVFVLAFAGLRLIAPTIIRTSHKIESPGIDRMEMVEIGGIQQALYIRGQNADNPIILWVHGGPGNSMMPFLHLYQYEWENDFTVVNWDQRNVGKTYFANDPAAVLQTMSAERVLQDVHEVTAYLKQQFNKEKIILIGHSWGTVLGTMAVQTYPEDYSAYIGIAQTVNMVDNERVGYEKTLEMVKAAGKQKDIKALEAVAPYPPAKYGPSYLAALMTVRTYQSKYGLSINMDLGNIISILATPYYSLSELKNTTIVNPNAIDNQGDVLRFLVEEADIRNYGVDYQVPVYYIMGENDYNSPYLPAKKFFDEIVAPDKQIFFIPDADHLPFLSKKAEFDCILLEEIAPKLAK >CP012309.1|AXU72011.1|2198989_2199646_-|TetR-family-transcriptional-regulator MTRKNNPKQAIENIITISAKLFAEKGYDKTSMQNIVDASGMSKGGIFHHFSSKEDIFNVVMERRFEQIIETVNQWLGEMHGLTAKEKLRSLVRRHLTDEVIKESSNMITSAIESPHIILAFTQDNLKKLAPILANVLREGIEDRSIITEFPDECAEVILLLFNFWCDTDVFQGDFPTLRKRFQFLQFLMRQIGVDILEDEIIESINIFYERKPMGQVE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP012309_13 | 2240400-2242001 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP012309_13
|
24 spacers
spacers of CP012309_13
>13.1|2240429|30|CP012309|CRT TGACTCAATCTTTATTTAATAAGAAAAAAC >13.2|2240488|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAGCTAAAATAAAAGGATAAGGTGGAACTGTTAATAT >13.3|2240554|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CATCCTGTTCAATTCCAATATAATGCAGCGTAATACT >13.4|2240620|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTTACTGTCTGTCATAAGCATCAAACACATGAAAAT >13.5|2240686|38|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCTATTAGGCGATTTGTAATGTTTTTATCTTCTTGTGA >13.6|2240753|38|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTCATGCAATAATAAACATTTGAATCAATTCTAATTGG >13.7|2240820|38|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTACACTCTTTAATATTCCAATAAATCCATAGTACTCA >13.8|2240887|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCGAGGAACTAGAATTAAAAAGTTTCTTAGAATAAA >13.9|2240952|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGAAATATGTGTTAGCAGGTAGTTTATTAGGTGAGAG >13.10|2241018|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAATTTATTTTTTGTTTTTGAATTGAGCCTCACCCT >13.11|2241083|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GAAATATTAAATTGTGTGTCATCACACACCAGACCT >13.12|2241148|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GATGTATGGGATTTAAATATGCAGTTGTGTATGGTAA >13.13|2241214|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCCATTACATTGTAACCTTTCCAAAAATAGAATATAA >13.14|2241280|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AACATTAGCAAGTAAAAAAGAGCAAAAATTCACTCAA >13.15|2241346|38|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTAAAGCATTTCCAAAGAGGACATGCCTTAACTTCAGA >13.16|2241413|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TATGTTGTAAAATCAAAGAAGCTGATTGTACAAGGT >13.17|2241478|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GATGATGTATATAGTCATAGAGAAGAAATAAGAGAAA >13.18|2241544|35|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTAGCAAGAGAAAGCAATCTGTGTTCAAAAAAGAG >13.19|2241608|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCCAGGATGTAGTAACTATGATATACCCTTATGCCC >13.20|2241673|38|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGATGAAGTATGGATAATTTTTTACTTAATGTATTATC >13.21|2241740|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GCAAAAGGCGTAGTTATTGATACTCGATATGATAAAG >13.22|2241806|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CATTTATGGAATATGTTAAAACAGGAAAATGGCATA >13.23|2241871|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GGATGTCAGAGGTATACAACTTCCTTGTTCCAAAAA >13.24|2241936|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTTGTCTAATATTTATAATAAAAAAGTTGTTTTTTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012309_13
The CRISPR arrays of CP012309_13 >merge|CP012309|13|2240400-2242001|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTTAGAATATGTATTATTAAATATAAAGTGACTCAATCTTTATTTAATAAGAAAAAACATTTATATTATATATAGTTAATATAAAACAAGCTAAAATAAAAGGATAAGGTGGAACTGTTAATATATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACCATCCTGTTCAATTCCAATATAATGCAGCGTAATACTATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTTTTACTGTCTGTCATAAGCATCAAACACATGAAAATATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTCTATTAGGCGATTTGTAATGTTTTTATCTTCTTGTGAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTTCATGCAATAATAAACATTTGAATCAATTCTAATTGGATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACCTACACTCTTTAATATTCCAATAAATCCATAGTACTCAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTCGAGGAACTAGAATTAAAAAGTTTCTTAGAATAAAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACAGAAATATGTGTTAGCAGGTAGTTTATTAGGTGAGAGATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACAAATTTATTTTTTGTTTTTGAATTGAGCCTCACCCTATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACGAAATATTAAATTGTGTGTCATCACACACCAGACCTATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACGATGTATGGGATTTAAATATGCAGTTGTGTATGGTAAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTCCATTACATTGTAACCTTTCCAAAAATAGAATATAAATTTACATTCCATATAGTTAATACAAAACAACATTAGCAAGTAAAAAAGAGCAAAAATTCACTCAAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACCTAAAGCATTTCCAAAGAGGACATGCCTTAACTTCAGAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTATGTTGTAAAATCAAAGAAGCTGATTGTACAAGGTATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACGATGATGTATATAGTCATAGAGAAGAAATAAGAGAAAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTTAGCAAGAGAAAGCAATCTGTGTTCAAAAAAGAGATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTCCAGGATGTAGTAACTATGATATACCCTTATGCCCATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTGATGAAGTATGGATAATTTTTTACTTAATGTATTATCATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACGCAAAAGGCGTAGTTATTGATACTCGATATGATAAAGATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACCATTTATGGAATATGTTAAAACAGGAAAATGGCATAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACGGATGTCAGAGGTATACAACTTCCTTGTTCCAAAAAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACATTTGTCTAATATTTATAATAAAAAAGTTGTTTTTTCATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC >CP012309|13|7|2240400-2242001|CRT ATTTAGAATATGTATTATTAAATATAAAG TGACTCAATCTTTATTTAATAAGAAAAAAC ATTTATATTATATATAGTTAATATAAAAC AAGCTAAAATAAAAGGATAAGGTGGAACTGTTAATAT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CATCCTGTTCAATTCCAATATAATGCAGCGTAATACT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTTTACTGTCTGTCATAAGCATCAAACACATGAAAAT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TCTATTAGGCGATTTGTAATGTTTTTATCTTCTTGTGA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTCATGCAATAATAAACATTTGAATCAATTCTAATTGG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CTACACTCTTTAATATTCCAATAAATCCATAGTACTCA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TCGAGGAACTAGAATTAAAAAGTTTCTTAGAATAAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AGAAATATGTGTTAGCAGGTAGTTTATTAGGTGAGAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AAATTTATTTTTTGTTTTTGAATTGAGCCTCACCCT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GAAATATTAAATTGTGTGTCATCACACACCAGACCT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GATGTATGGGATTTAAATATGCAGTTGTGTATGGTAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TCCATTACATTGTAACCTTTCCAAAAATAGAATATAA ATTTACATTCCATATAGTTAATACAAAAC AACATTAGCAAGTAAAAAAGAGCAAAAATTCACTCAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CTAAAGCATTTCCAAAGAGGACATGCCTTAACTTCAGA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TATGTTGTAAAATCAAAGAAGCTGATTGTACAAGGT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GATGATGTATATAGTCATAGAGAAGAAATAAGAGAAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTAGCAAGAGAAAGCAATCTGTGTTCAAAAAAGAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TCCAGGATGTAGTAACTATGATATACCCTTATGCCC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TGATGAAGTATGGATAATTTTTTACTTAATGTATTATC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GCAAAAGGCGTAGTTATTGATACTCGATATGATAAAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CATTTATGGAATATGTTAAAACAGGAAAATGGCATA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GGATGTCAGAGGTATACAACTTCCTTGTTCCAAAAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC ATTTGTCTAATATTTATAATAAAAAAGTTGTTTTTTC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC >CP012309|13|5|2240459-2242001|PILER-CR ATTTATATTATATATAGTTAATATAAAAC AAGCTAAAATAAAAGGATAAGGTGGAACTGTTAATAT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CATCCTGTTCAATTCCAATATAATGCAGCGTAATACT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTTTACTGTCTGTCATAAGCATCAAACACATGAAAAT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TCTATTAGGCGATTTGTAATGTTTTTATCTTCTTGTGA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTCATGCAATAATAAACATTTGAATCAATTCTAATTGG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CTACACTCTTTAATATTCCAATAAATCCATAGTACTCA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TCGAGGAACTAGAATTAAAAAGTTTCTTAGAATAAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AGAAATATGTGTTAGCAGGTAGTTTATTAGGTGAGAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AAATTTATTTTTTGTTTTTGAATTGAGCCTCACCCT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GAAATATTAAATTGTGTGTCATCACACACCAGACCT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GATGTATGGGATTTAAATATGCAGTTGTGTATGGTAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TCCATTACATTGTAACCTTTCCAAAAATAGAATATAA ATTTACATTCCATATAGTTAATACAAAAC AACATTAGCAAGTAAAAAAGAGCAAAAATTCACTCAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CTAAAGCATTTCCAAAGAGGACATGCCTTAACTTCAGA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TATGTTGTAAAATCAAAGAAGCTGATTGTACAAGGT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GATGATGTATATAGTCATAGAGAAGAAATAAGAGAAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTAGCAAGAGAAAGCAATCTGTGTTCAAAAAAGAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TCCAGGATGTAGTAACTATGATATACCCTTATGCCC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TGATGAAGTATGGATAATTTTTTACTTAATGTATTATC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GCAAAAGGCGTAGTTATTGATACTCGATATGATAAAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CATTTATGGAATATGTTAAAACAGGAAAATGGCATA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GGATGTCAGAGGTATACAACTTCCTTGTTCCAAAAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC ATTTGTCTAATATTTATAATAAAAAAGTTGTTTTTTC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC >CP012309|13|12|2240459-2242001|CRISPRCasFinder ATTTATATTATATATAGTTAATATAAAAC AAGCTAAAATAAAAGGATAAGGTGGAACTGTTAATAT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CATCCTGTTCAATTCCAATATAATGCAGCGTAATACT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTTTACTGTCTGTCATAAGCATCAAACACATGAAAAT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TCTATTAGGCGATTTGTAATGTTTTTATCTTCTTGTGA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTCATGCAATAATAAACATTTGAATCAATTCTAATTGG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CTACACTCTTTAATATTCCAATAAATCCATAGTACTCA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TCGAGGAACTAGAATTAAAAAGTTTCTTAGAATAAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AGAAATATGTGTTAGCAGGTAGTTTATTAGGTGAGAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AAATTTATTTTTTGTTTTTGAATTGAGCCTCACCCT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GAAATATTAAATTGTGTGTCATCACACACCAGACCT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GATGTATGGGATTTAAATATGCAGTTGTGTATGGTAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TCCATTACATTGTAACCTTTCCAAAAATAGAATATAA ATTTACATTCCATATAGTTAATACAAAAC AACATTAGCAAGTAAAAAAGAGCAAAAATTCACTCAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CTAAAGCATTTCCAAAGAGGACATGCCTTAACTTCAGA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TATGTTGTAAAATCAAAGAAGCTGATTGTACAAGGT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GATGATGTATATAGTCATAGAGAAGAAATAAGAGAAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTAGCAAGAGAAAGCAATCTGTGTTCAAAAAAGAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TCCAGGATGTAGTAACTATGATATACCCTTATGCCC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TGATGAAGTATGGATAATTTTTTACTTAATGTATTATC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GCAAAAGGCGTAGTTATTGATACTCGATATGATAAAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CATTTATGGAATATGTTAAAACAGGAAAATGGCATA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GGATGTCAGAGGTATACAACTTCCTTGTTCCAAAAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC ATTTGTCTAATATTTATAATAAAAAAGTTGTTTTTTC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC
>CP012309.1|AXU72050.1|2240005_2240290_-|hypothetical-protein MLVYNKSFYPNDIFPRLDFSKIKKQLKLIDNDLSDFGSICIIEKEHYTISVNSIGEINVYYDLEYENKVYRIVYEIEKLFKSQVGRFSISTYRN >CP012309.1|AXU72049.1|2239019_2239235_+|transcriptional-regulator MAIVVNLDVMMAKRKISLKELAEKIDITNANLSILKTGKAKAIRFTTLNEICKALDCQPGDILEYVEDEND >CP012309.1|AXU72048.1|2238541_2239009_+|hypothetical-protein MITKFFSNILSVFLYFLLSLLGVAGIIFLCMIPMFLYDFSSDKVIALIARILYFSDYFIVILFLIFIINSTKYSPFVLENVKRFKVMGFCLLINTIIECINGYNSNTSLIMIFGDNSGGISPLMVISFIFALMCFVIAETFDKAIKIKEDNDLTI >CP012309.1|AXU72047.1|2236820_2237519_+|hydrolase MEKKYFEIHGVPSILWGNPSSKLYIYIHGQCGNKEEAEAFANIAVPHECQVLSVDLPEHGERKIEKNSFNPWHVVPELVSIMEYAKCHWNQISLYANSIGAWFSMLSFEKENLRECIFVSPILDMQQLISNMMLWANVSEEQLKHELIIPTSFGHTLSWEYLQYVKQHPITQWNVPTKILYGKHDELTEIGVVEKFVEKFNCNLTIVENGKHWFNTPQELNSLYEWLNTLVK >CP012309.1|AXU72046.1|2236005_2236563_-|transcriptional-regulator MRVSREIVIQATSDIVNKDGLNKVSLKVIAEKLGIRTPSLYNHIESLDDLLLEVAHKGMREMNSQMIKATIGNFGDTAIKCISIAYFNFIISNPGVYETIQWATWHGNNETLEIFDEYKSLLEKLILSCNLNTKNTGEVLNLIMSVLHGYSTLQLGKSLLSKEEAIKGLADSIDTVLLGIHKKYD >CP012309.1|AXU72045.1|2235163_2235637_+|N-acetyltransferase-GCN5 MFKEYLIRELKEDDIKNALDLIWNVFEEFESPDYCDEGITTFHQFIEYNSIIEKIKEKTLFFWGCFDSKKLIGVLAIRNLNHICMLFVDKNYHKHGVAKKLMTTGIQYCICNKFNLTEITVNSSPYAVEVYHKLGFKDTAVEQIVDGIRFTPMKLLI >CP012309.1|AXU72044.1|2234096_2234864_-|GCN5-related-N-acetyltransferase MQIIDININNIDNEHICCSISEKKGENCVFSKKAWMKNNFDKGLVFKRFDVRGKAFIEYIPAENAWCPITADNYIFINCFWISGKFKGQGYSNLLLQECVDDAKSKGKYGLVVLSYSKKMPFLSDAKYLKYKGFCLADTSEPNYELLYFPFTDNAPIPYFKNCVKKRKLNENGIVLYYSNQCPHTEKYAPILKKIANSRGIDVNLIKFETAKEAQNAPAPFTTYSLFFNGEFVTNEILSEKKIEKFLDTNIKKFN >CP012309.1|AXU72043.1|2232377_2233412_-|N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate-reductase MNKIKVGIIGATGYVGAELIRLLMNHDKVEVTAIGSNSYVGKDIVDIYPSIGYKNNMICIENEKVIDMCDVVFTALPHGVSEKFVIKAIKSKKKVIDLGADFRIKDEEVYSKWYGVSFIDKILHKKAVYGLSEIYKEDIKDADIIANPGCYPTSISLPLMPLLSSKLIKNNNIIIDSKSGLTGAGRELSISSHFTEVNENITAYKIGKHRHTPEIEQNLSESCKEKVSVVFTPNLIPVNRGILSTIYCTKEDNISINDIHRKLTDYYEFKEFIEILPLDKIASLKNVRFSNKCVISLHENGDTLIICSAIDNMIKGAAGQAIQNMNIIFGIEENTGLKNIAPSF >CP012309.1|AXU72042.1|2231119_2232337_-|arginine-biosynthesis-bifunctional-protein-ArgJ MEIIKGGVTVSEGFFASGIHCGLRKNKEKRDLALVYSDVLCDAAAVVTQNKVKGNPVYVTQEHIKNGKAQAIIVNSANANTFNGKEGLINAYKMAKFTSDKLNIKESDVLVASTGVIGKPLNIDLIEENMDELVNNLSKQGHIGAREAIMTTDIIKKEIAVAIMYGDKKITIGGMAKGSGMIHPNMATTLGFITTDANIDGVLLKEALKIAVDKSFNRVSVDGDTSTNDMVMILANGKAKNDRINKKDEHYQVFLSALTYVCIELAKLVAKDGEGCTKLIECYINGALSEEHAVKLAKTVISSSLVKTAVFGADANWGRILCALGYAGEEIDMEKVDIIFESMKGYIEVCKNGNGLDFNEEKAKKILEDDEISILVDLNMGNARGNAWGCDLSYDYVRINGSYRN >CP012309.1|AXU72041.1|2230244_2231105_-|acetylglutamate-kinase MINIEKANTLIEALPYIEKHQGKTIVVKYGGSAMKKDGLKESVMEDLVLMSYVGINIVLVHGGGAEINKMLAKVDIESKFVNGLRYTDEETMEIVKMVLAGKVNKDLVNKIHTKGGKAVGLCGIDNNMILCDPYKNYELGFVGEIKKVNVELIESCLKSGYISVIATIGVGDDGETYNINGDTAASAIAKELNADKLILLTDVPGLLREPDEEKSLITEVILEDVDKLFEEGIITGGMIPKIEGCVDALNNGVNRVHILDGRVPHSIITELFTDSGIGTLIRKENE >CP012309.1|AXU72051.1|2242831_2243704_-|transcriptional-regulator MEETNEMKDSKHLISNIQSQYTRLSKGQKLIAQYILNNYDKVAFMTACKLGETVGVSESTVVRFANALGYSGYPKLQAALQELIKNKLTTVQRVEMAHDYSDDFAILNKVLKSDIDNIRSTLEEIDERAFKEASNKLLRARKIYILGMRSSFVVAQYLGFYLDIILDNVHIIRMDMGDAFEQIVRINEEDVIVAISFPRYSKKSYQIVNYAKEKGAHVISLTDSLFAPVASLADNTLLVKSNMASFVDSLVPALSISNALAISVGMKEKEDIKQHFDDLEQIWKRYSVYE >CP012309.1|AXU72052.1|2244097_2244676_-|rRNA-methylase MAYAKYLTKITDINKFYLENIINEGDIVIDATMGNGYDTRYLAEKVGEKGFVYAFDIQEEAIKSTRKKLEKEGYTDRVKLIFDGHEKMNQYIKEEVSCVLFNLGYLPRAKHSIITKPDTTLKAIKLSLEMLKENGVISIAIYTGHDGGQEEKDCIYNLVNNLNQDEFNVLESKFLNQVNNPPQLILIEKKKA >CP012309.1|AXU72053.1|2244733_2245450_-|23S-RNA-and-tRNA-pseudouridine-synthase MRINKYIASCGIASRRKAEEIILGGRIKVNGSVVKELSFNIDEEKDIVEFDNKKVKPSENYIYIVLNKPEGYITTVKDQFNRPSVIDILKDVRERVYPIGRLDYETSGLLILTNDGDLTYKLTHPKHEIDKTYVASVKGIISDDEIRQFETGLKIEDYTTAPAKIRVTKENKEKNYSVCEITIHEGRNRQVRKMCKAINHPVLNLRRISVGKIVLKDTKVGEYRYLTEDEIKYLKSIK >CP012309.1|AXU72054.1|2245640_2246726_+|permease MIIISKENIKYYLIVVFIGILFFKFINTPSDFISSIEGFLKFFSPFLLAILLALLLNPLVMLFEVKFKAHRLLAIFLSYIFIGFILAFAIRLLIPSIANTLNRLINEMPMYTDYIDSFIEKNMSNIDFLKTLIPHIQHSLDNLLKEASNFVGKIPKNFLIYTLSISSMLFNMTMGFILSIYIIYDKEKIALGFKRFLYSSTARNKADNIIEFFRTTHDIFYDYLLGRILDSLIIGIIAFLGFQFVIRIENALFLASIIFLGNIIPYFGPFIGAIPPIAMTILYSPQKTIWVIAFLFILQQLDGNFIEPKVMGNQVGIGAIWVISAILVGQSLFGFIGVFLSVPIAAVVKTYVDKYIDNRLQ >CP012309.1|AXU72055.1|2246880_2247540_-|lipoprotein MRGRVILLISILSIFLVGCSFNKKDEINLVEQGKTYLEKHNYKKAMESLSSALEEDSTNENARAMYMQAMRMSNMTEFEELKNYEGAIKELKLIEKIKNGSSVIKEEATKKKEELTKLEKEQNEAEEQRKKKAKDTAGEDRYRVESDARKSSYSGSSKNNKSSSKNNDKKSDSNKSDNNNSSSQNQEKPNNSNPTPAPTPQDTTGGSDSGGNSQNSNNQ >CP012309.1|AXU72056.1|2247756_2249049_-|diaminopimelate-decarboxylase MKLHGTMTVNNDELYIGGVSCLELSKKYQTPLYVFDEALVRQNCREYIEYFKAREGKNKVAYAGKAFLPLYMCNLINEEQMCLDVVSGGELYTAYKSNFPMEKVFFHGNNKTKEEINMGLDLGVGKFVVDNFYELDLLEALCEDKGKTQEIYFRITPGIEAHTHDYIKTGQIDSKFGFALVNGDLFRAIEKLSEYKNIKLVGLHAHIGSQIFDVEPYIDTVDIMMNLVKEIKEKFNIQLTEIDLGGGVGVYYSEGDKPKTIKEFCETIITKAETSCKELGIEVPTLVIEPGRSIVANAGSTLYTVGSIKDIKDVRVYVSVDGGMTDNVRPSLYQASYECSIVNKINHEAMNHVTIAGKCCESGDILIGDINIMDIKSGDILITTSTGAYGYSMSSNYNKIPRAAVVSVFDGNDKIICKRQSYEDLLALEI >CP012309.1|AXU72057.1|2249066_2250260_-|aspartokinase MSIIVQKYGGSSVADTEKIKSIAENIIERRKENPQMVIVVSAMGKSTDEYITLAKELSNEPSKRELDALMSTGEMISASLLSIALNALGCKAISYNAYQLNIKTSGLHGKSQIDDINVNRIKNSLDEGNVVIVTGFQGINEDGDVTTLGRGGSDTSAVALAVKLNGKCEIYTDVDGIYFTDPRKYSKASKLDEIEYEEMLELASLGAQVMHSRSIELAQKYGVEIYVGRTCGTEKGTYIRGGKDMKLEDKVITGLATSDDDSSITIKDFKAENISSLFEDIATIGISVDMISQTAPILDKISVSFTVPKEELGECKKIVSKYTDEEHVVIDNNITKFSLVGLGMKNTSGVAAKVFKIFNENGIMIKLITTSEIRITCAINSDDKQVAIEKIAEVFNI >CP012309.1|AXU72058.1|2250620_2251238_-|hypothetical-protein MTNMEKEILLLISRVRCVTESQFRKIYGDQKRYNKKNFKKTLRKMCSEYTLKKYPCDVDYYNYKDLSYVYYLNGSKLFKGDDLIKALVGSELVVRINTAGCDVKRFYRNVSVDDVKYDLFIEYTDQFGNIKQVLVDVDLNNEIDISKYENLSKKIDKSTIPFFKVPNVLVVTPDNLSELNDLERYDNEYSINFIDLGLNKLFNCI >CP012309.1|AXU72059.1|2251407_2253108_-|hypothetical-protein MKRYLKTYGVALIIVIIYAFIKLPVLRLDFTSLFSVGIIFFVVAGILDMMLDRNERASKMAKYNFSIAIALLVYIVVVPFITSTPVLHAKSYRELLGKVTESKFTDDISPVSVNDIRLVDEDMAMKLGDKKLGEVPAIGSVSKLGKFHIQNVDGELYWVAPLVHRDIIKWITSLSGTSGYVKVSASNPQDVQLVQEIDGKPIKIVYQPEAYLHQDLQRHLYIHGIVNVGMTDFTLEINDEGRPYWVVSLYEHKIGYGGANATGIATVDAETGKINVYDVKNTPKWVDRIQPQSFVTDQIKDWGVYVNGFLNSVISEKGVLVPTEGTSLVYGNDNRSYWYTGITSSGGDESTIGFMLVDSRTKEARLYKQPGATETAAMKSAEGNVQEKNYEATFPVMYNILGQPTYVSSLKDKAGLVKRVAFVSVEDYNVLGIGEDKNEALRNYKDALESKGNDLKLDNDLKDEVLEGTVTRISPDVRGGNTNYYVTLDSNKDIIFRATSKVSSELPLTQVGDKVKISYSKEESGVIEMSEFDNLNIANFEDKKAKEKTGTDENTDSKDSENQGNV >CP012309.1|AXU72060.1|2253504_2254068_-|hypothetical-protein MNKVYIVTTYTGTILSYLIRNISKKLYTHVSISLNENLKPMYSFGRLNPRNPFIGGFVEENINQGLYAIRKNTVCRVYSLEVDNLQYENLYKNIKLISDYREDYYYDTMALIYLLMNIQRQSEYKYVCSNFVADMLEKSEIDILNKQAFEVTPNDFYNLSGLTLEYEGLLSEYNSRQHSYVSKIANI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP012309_14 | 2600653-2601339 | TypeV-U4 |
I-A
Consensus repeat of CP012309_14
|
10 spacers
spacers of CP012309_14
>14.1|2600682|36|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT ACAATTATTAATTGTTTTATTAGTGAAATCACAGCA >14.2|2600747|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGTCAATTTCTCTAGTAGATAAATAGTCATACCCTGA >14.3|2600813|36|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CATTCATGGAGATTGCTCAAAATACAGATGCTATAA >14.4|2600878|36|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAGAATGAGAAGTGGATTTATTCTGAAACAATAAAG >14.5|2600943|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAGATTTTCAACCTCCTTTTGATGTTCCAAGTAGTAG >14.6|2601009|38|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAGAACTGGAGAAATATATAATTGCATAAAATCAGAGA >14.7|2601076|35|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTGTTTCTTCTGTTAATTTTATTATACCTTGTTT >14.8|2601140|40|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTTAATTTTTATACACCATTAGCAATATCTTTAGCTAA >14.9|2601209|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGTGCTATTGTAAGAATGTTAACAACCGAGTATGGTA >14.10|2601275|36|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACCAGCAACTATTCCACCATTCGCAGAACTAGCAAT |
c2c9_V-U4 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012309_14
The CRISPR arrays of CP012309_14 >merge|CP012309|14|2600653-2601339|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTTAAATCCACATAGTTAATCTAAAACACAATTATTAATTGTTTTATTAGTGAAATCACAGCAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACTGTCAATTTCTCTAGTAGATAAATAGTCATACCCTGAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACCATTCATGGAGATTGCTCAAAATACAGATGCTATAAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACCAGAATGAGAAGTGGATTTATTCTGAAACAATAAAGATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACCAGATTTTCAACCTCCTTTTGATGTTCCAAGTAGTAGATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACGAGAACTGGAGAAATATATAATTGCATAAAATCAGAGAATTTGCATTCCATATAGTTAATCTAAAACCTTGTTTCTTCTGTTAATTTTATTATACCTTGTTTATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACATTTTAATTTTTATACACCATTAGCAATATCTTTAGCTAAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACGGTGCTATTGTAAGAATGTTAACAACCGAGTATGGTAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACACCAGCAACTATTCCACCATTCGCAGAACTAGCAATATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >CP012309|14|13|2600653-2601339|CRISPRCasFinder ATTTTAAATCCACATAGTTAATCTAAAAC ACAATTATTAATTGTTTTATTAGTGAAATCACAGCA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TGTCAATTTCTCTAGTAGATAAATAGTCATACCCTGA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CATTCATGGAGATTGCTCAAAATACAGATGCTATAA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CAGAATGAGAAGTGGATTTATTCTGAAACAATAAAG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CAGATTTTCAACCTCCTTTTGATGTTCCAAGTAGTAG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GAGAACTGGAGAAATATATAATTGCATAAAATCAGAGA ATTTGCATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CTTGTTTCTTCTGTTAATTTTATTATACCTTGTTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ATTTTAATTTTTATACACCATTAGCAATATCTTTAGCTAA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GGTGCTATTGTAAGAATGTTAACAACCGAGTATGGTA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ACCAGCAACTATTCCACCATTCGCAGAACTAGCAAT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >CP012309|14|8|2600653-2601339|CRT ATTTTAAATCCACATAGTTAATCTAAAAC ACAATTATTAATTGTTTTATTAGTGAAATCACAGCA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TGTCAATTTCTCTAGTAGATAAATAGTCATACCCTGA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CATTCATGGAGATTGCTCAAAATACAGATGCTATAA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CAGAATGAGAAGTGGATTTATTCTGAAACAATAAAG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CAGATTTTCAACCTCCTTTTGATGTTCCAAGTAGTAG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GAGAACTGGAGAAATATATAATTGCATAAAATCAGAGA ATTTGCATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CTTGTTTCTTCTGTTAATTTTATTATACCTTGTTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ATTTTAATTTTTATACACCATTAGCAATATCTTTAGCTAA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GGTGCTATTGTAAGAATGTTAACAACCGAGTATGGTA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ACCAGCAACTATTCCACCATTCGCAGAACTAGCAAT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >CP012309|14|6|2600718-2601339|PILER-CR ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TGTCAATTTCTCTAGTAGATAAATAGTCATACCCTGA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CATTCATGGAGATTGCTCAAAATACAGATGCTATAA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CAGAATGAGAAGTGGATTTATTCTGAAACAATAAAG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CAGATTTTCAACCTCCTTTTGATGTTCCAAGTAGTAG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GAGAACTGGAGAAATATATAATTGCATAAAATCAGAGA ATTTGCATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CTTGTTTCTTCTGTTAATTTTATTATACCTTGTTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ATTTTAATTTTTATACACCATTAGCAATATCTTTAGCTAA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GGTGCTATTGTAAGAATGTTAACAACCGAGTATGGTA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ACCAGCAACTATTCCACCATTCGCAGAACTAGCAAT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC
>CP012309.1|AXU72358.1|2600309_2600462_-|hypothetical-protein MKNRRKDKRGFSVLLDKEKLDKFDEVLEEKNLTKKEWLEEKIDEELEQKE >CP012309.1|AXU72357.1|2599823_2600189_-|phage-related-regulatory-protein MKNELMMFEGKEIEVFEFEGRILFNSKDVANCLDIKNVNENIRLMNKKQVVKLRNSDISNTDIRKLNNAGENFLTESGVYKLIFKSRKEEAERFQDWISDEVLPSIRQTGAYITNNAIPKS >CP012309.1|AXU72356.1|2599374_2599827_-|prophage-antirepressor-related-protein MREKASEIEKLQLAYNSTSMLKELLDDAGFDNKSKLLTAKTLYKKAGIDLPIEINEEEHYFDTKQIASKLKIYSKSNKPAQMAVCEIIKKIDLEDGEVKGVWETNGSWTGTVNKYTKSVIDKVRTWIEENNRPTKIAGEKKNYHVFYKIE >CP012309.1|AXU72355.1|2599161_2599323_-|hypothetical-protein MCENLLDNMYIEKRKEEYRIKLLKIRETDIDIYNKLESIVYKLSEKKLEKNNK >CP012309.1|AXU72354.1|2598368_2598833_+|hypothetical-protein MDFGEVKSELSDKDLKDNEEDLNKYKKYYLKVYKYYSEMDSIKSIQDIEIEQSRLKGQLQKNSNPIFALYISIMAVVFSTTINLTFDLSDITNYFIRMIMTLLFIVLLIFLVNKGILPIAIPYKNNIQFYTTALDVLEDMKKKILRERKYKKRR >CP012309.1|AXU72353.1|2596247_2597903_-|hypothetical-protein MNLDFHYYGTYLAAKIAGYNDSDAKTIAYAAQYVDESSKNMILDDVNFAFPTIQTNSEFQKYYADFNSWGYKWNLDSLNEIKKVWIPFHFLPGNLNNQVKYNGVKESKGLTTNWKFKDGDDQTFRLMCLPNSETVSAIINDLIYFHSTEEYKLQFIGMRMHVLADTWAHVYFIGKPEWYINDIKEFIAEESKYIEETKWTKAEEYRNGSWHAINFTGTPDAGGYESISYLGHGRIGHLPDYGYLNYRYVPNWSCTDDKVKIQKNNQDNFFKAFCQMVYALKCIKNGNDFSINQYDNLTAQQKTEVSKVIATRKDDQSEAWKKAIQTLGYKSLENFDKNKWKNEFIKSTNKEKTDYYYFNLVAKKHVDYVIDFLEEKRLPLEEMCSKYCEFKTFDDTQFAKNRNRVTKIILRGAYIVDAIQLVYDGKYKTPMHGETLGGSMVSLDLEADDYIVKISGSIGLYEGGEPYPNSPTRTIGKITFLTKKGKTITAGRETMFKSYGNFTLEPPTGKQIFALQGSYLIRKLRAETNKRYLDCLGIASIKDCSVVTSTK >CP012309.1|AXU72352.1|2595797_2595998_+|hypothetical-protein MYFKTYILKREVNNKQLEITRSFDLDNLICTATEILEDIEIDLIIIDEKNNVVWRNEKSTPAHENA >CP012309.1|AXU72351.1|2595365_2595779_+|hypothetical-protein MKVKSKRSFIVGIIVCMLCCASLVIYCILKDKRFLISSFLLIVIAIFNFCNAFSRKGIVEELHDSTDERDLYLTMKTSHILVKIMNYTLFTFTFLFIIAYSAWKNQSLLVIAITLCVIEIFLFVAYLLINIFLEKKE >CP012309.1|AXU72350.1|2595148_2595382_+|transcriptional-regulator MKTKVREFRTNMGLTQQQLADLVHVSNRTIISIEKEQYSPSLMLAYRMAQVFGTTIEELCCLKENKEMEDKKHESKE >CP012309.1|AXU72349.1|2594771_2594930_-|regulatory-protein MKISKLSEAELKVMRYIWEANKVLTSRELVAAMEEKYEWNESTTFTVLKRLE >CP012309.1|AXU72360.1|2601605_2602520_-|hypothetical-protein MVGAFVLPNYAITLSEMSNLWGNFTMWILVPIVLLIIAVSSMQYILVMIAFLLIIYSFIEKKIVMALVSVLFFTYSIYICATWEDKSLIADNKVETVKAQRETVEREKEMERRRIQEEVDKERYIEKHGMEISENDLKVKLEALVPQEYKGKKYELKVEKFKRYSMYFDLTVQNEKFSNSEECKKFVKEIANDFKKIKISKAYFKFHSKDDGGIYNSVYIDYFRNIQNNVDNVENLGFNEFKLKTEEEEKREQEKIEQEKNSYNNYIQNRVVDPLDRIKKLKELLDSGAITQEEYNKKKKELLE >CP012309.1|AXU72361.1|2602713_2602866_-|hypothetical-protein MDNFLFNVLASVTASYIVYLISKLIKKVKSHSTAKSDLKIDINFKYHRKK >CP012309.1|AXU72362.1|2603139_2603472_-|hypothetical-protein MNDMARDVFSVKMTPLEAQKMVEKNLEADLVSVDIYNLENNKSIIVTIFEKYYARSNSDAGLVVICENTTGKTLVKITSTGSAIGLFQIDWGTGNNLIKRVKKILIDYII >CP012309.1|AXU72363.1|2603498_2603768_-|hypothetical-protein MRGVFIENKDIKLTICIFAFVIGIIVLFCCIGLGQFNMDCIIKQNGGSIATEQYNIYLEQSISQYRNFGSILVLLGGIGILFDKSVRKY >CP012309.1|AXU72364.1|2603901_2604333_-|transposase-like-protein-B MIRNRKLSRSISDVSWSEFIRQLEYKANWHGRQIVKVGKFFASSQICNKCGYKNEEVKDLNIREWIYPSCNETHDRDINASINILKEGLRLNCIQKLKWKPSEYMNLEVNERALAADSILIKIEDEEEAMKEAEREKKRGRRR >CP012309.1|AXU72365.1|2605031_2605223_-|repressor MKISKLPEAELKVMRYIWESEKVLISREITKSMEQKYEWKDTTIFTVLKRLLKKRVFRNGENR >CP012309.1|AXU72366.1|2605327_2605705_-|regulatory-protein MKEEILIEKLLRVELIVMEYLWKKDTLMPKKEIVKEIKQIYGWHKSTIKILLKRLVNKRYLARYIINFQSYYKIIIDSKEYYTFKKKVLKSSKSIKIMHSLTTIHKNVSKEKLDLLDEYYRNLKE >CP012309.1|AXU72367.1|2606509_2607004_+|pilin-protein MKNKKGFTLVELLVVIAIIGILAIVALPALFKNIEKAKIAKLEADISAIKSASLSYYADESKYTDGGMISWVKKDGKIIINGGFKDDPLADKIENLGMPYNGSYLLMSSPGHEKYLELSILPEGEISKSGLDKLKSDYGSSIDIMNEQNKIDIVIKLLNDKSNT >CP012309.1|AXU72368.1|2607995_2608229_-|transposase-IS3/IS911-family-protein MTKYDFNFKLKVAKFYLNREGRDILIVKQYGVYDHSQVERWVNILGESALKIKKIFYTIWFKLDVINYMMITKYSVQ >CP012309.1|AXU72369.1|2608390_2608741_+|hypothetical-protein MIQKKFFMGFCGFLGFLSLRYFSSGNVADLTYIGFFAFFSNFIIAKINGDKADERYVQDEKAAMAFTGQLAIIELFILWCITIVSRNVELMCVLLSITYAITLNVYAIKLYILEEK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012309_15 | 2765900-2766057 | Unclear |
NA
Consensus repeat of CP012309_15
|
2 spacers
spacers of CP012309_15
>15.1|2765928|38|CP012309|PILER-CR AATAATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATT >15.2|2765994|38|CP012309|PILER-CR ACAAAATCTCCAACTTATAATTATTTTCGCGATGTACC |
cas3,cas5,cas7,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012309_15
The CRISPR arrays of CP012309_15 >merge|CP012309|15|2765900-2766057|PILER-CR AAATCCGATTAGTTAATTTTAAACCTAATAATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATTTGAAATCCACTTAGTTAATCTTAAACATACAAAATCTCCAACTTATAATTATTTTCGCGATGTACCTGAAACCCACTTAGTTAATCTTAAACCT >CP012309|15|7|2765900-2766057|PILER-CR AAATCCGATTAGTTAATTTTAAACCTAA TAATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATTTG AAATCCACTTAGTTAATCTTAAACATAC AAAATCTCCAACTTATAATTATTTTCGCGATGTACCTG AAACCCACTTAGTTAATCTTAAACCT
>CP012309.1|AXU72519.1|2764810_2765758_-|50S-ribosomal-protein-L11-methyltransferase MNNWIEVTIKTTTEAVEPITNILYEQGAGGAVIEDPKDFLFQKKNELDWDYVEEEVFKKNEEDDVLIKTYVSEEKNVMEFVEIIKQKVLGLKDFGIDIGEGSVSLDQVNEADWANAWKAYYKPTKVGQRVVVKPTWEDYAMQEGDLIIELDPGMAFGTGTHETTSMCIRELEKYVNKDSKVFDIGCGSGILAIAAAKLGAKEVVAVDLDEVAVKVAKENVLENKVEKSVSVMHGNLTDVIKDKADVIVANIIADIIKILAKDVQNFMKEDAIFISSGIILDKVEEVKESLIENGFEIVEVQKLGEWSAIVSKLKK >CP012309.1|AXU72518.1|2764033_2764792_-|16S-ribosomal-RNA-methyltransferase-RsmE MDRFFVEKNNINLQDKTCTIEGEDVKHISKVLRCKLGEKLEICDKNNNEYICEIMNIDKSIVNLEILEKVDINRESELKVRLYQGLPKAPKMEMILQKLTEVGVEEIILVQTKRSVVKVDDKKEDKKFERWERIIYEAAKQSKRGKIPKLRGVLSFKEALEDMKKNNVNICPYENERTVSIKHALKKCDSNIDSVGIFIGPEGGFSEEEIEQIQKNNCNVVSLGPRILRTETASVVASTIALYELSDLGGEK >CP012309.1|AXU72517.1|2762733_2764032_-|radical-SAM-superfamily-protein MKKVAFYTLGCKVNQYETEAMLELFEKDGYEQVNSEEYADVYVINTCTVTHMSDRKSRQYIRRVKKKNPDAIIAVVGCYSQVSPEEILDIEEVNLVMGTNDRRKIVEEIKKINSSKKVSTVDDIMKVKAFEEIEISQTNGKTRAFMKIQDGCDRFCTYCIIPYARGRVRSRDIDSIVDEVKKLANNGYKEVVLTGIHVASYGKDLKDRDIKLLDVIKQINQIEKIERIRLSSVEPILFTDEFVNEVLKMDKVCPHYHLSLQSGCDETLKRMNRRYTTLEYKTIVDRLRSKMPDVAITTDVIVGFPGETNEEFKKTYEFLKEIELSQMHIFKYSPRKGTPAATMENQVDPQMKHFRSEQLLNLSKVNFNKFATKFIGRELDVLFEQNIEGNKYEGLTSNYIRVVVESDKNIQGQILKVKINDVKDEYVEGILL >CP012309.1|AXU72516.1|2762340_2762691_-|histidine-triad-nucleotide-binding-protein MDCIFCKIANGEIPSTKVYEDDRVLAFNDLNPVAPYHILVVPKKHYDSLIDIPDKEMDIVSHIHVVINKIAKEKGFDQTGFRVINNCGSDGGQEVKHLHYHILAGKKLPNYEAGQN >CP012309.1|AXU72515.1|2761998_2762178_-|30S-ribosomal-protein-S21 MSEVRVRENETLDSALRRFKRQCAMSGIMSEVRKREHYDKPSVKRKKKAEAARRKNAKK >CP012309.1|AXU72514.1|2761525_2761969_-|tRNA-binding-protein MSLKQKLQEDLKSSMKNKDTVRKSVVTLIRASIKQYEVDNRVELDEDGIIDVIAKQLKQRRDALVEFEKAGREDLIKETEGEIEVLKEYLPQQLSEEELEEIVKSTISEVGATSMKDMGKIMSVIQPKVKGRADGKLINKLVKQNLQ >CP012309.1|AXU72513.1|2760917_2761415_-|sensory-protein MIISVKEIRNFLINIFIPLIIGYLSSILTMIISGTDISTYYLQLTKPSFAPPAFIFPIVWTILYILMGISSYLILRKGYNLPKVRDAIFYYGLQLVLNFIWSILFFGFGLRFTALIDIIIMILVSIIMISKFSKIDKRSGYINLIYLMWLVYAGFLNYFIWFINK >CP012309.1|AXU72512.1|2760161_2760725_-|sigma-54-modulation-protein MQIIVSGRQMKLTDGIKGYVDGKLSRLEKYLDPESEVKVTVSAKKDRQKVEVTIIPINGQIIRAEDVEDDLYAAIDIVCDKLSRQVVKYKTKVKDKVQNNKSIRFENLDFIDNSSEFDDYDYDDEEDENIVIERRKKFNVKPMSSEEAILQMELVGHNFYMFRNQDNFEINIVYKRKAGGYGLIEQD >CP012309.1|AXU72511.1|2759712_2759949_-|sporulation-protein-YqfC MLEISTDLQVNQPVITVTSNTFISIENYLSILEYEVDLIRIKTKVKTIKISGDKLSLKYITDSEIGIKGIIYNVEYVD >CP012309.1|AXU72510.1|2758356_2759700_-|stage-IV-sporulation-protein MISFIRGYYVIVVEGVGLEQFLNHLIRNGISVYNVTRIKNTKMEFHIDRQDIKEFKNVYRGSKFDIKVKQKTGIPFIIKRVYKHKGMWICALVSLFLLMSTSQFVTDVYIQSPEGIKKEALRNELYKVGVRPGVYKKSIDRKEVRDHMMSKFNDVAYLSINVKGTNIFVTVTKKAESLKSTDQSNYCNVIALKNGIIEKVIPRSGKSVIKSGDIVQKGDVLLNGANTKSIPEVWASTFYESTKKASYVDTVNKKTGEKKNIYTLSFYDKEFTMRKNIKYKDYVVENKEKKLSIGNYTFPIKIKTSTFYETKKVEVKRNKEELKKELSEKALKELEYIIPASARIIDVKHNFKVNKNMLEYLITVQTSENIAKIYPLSKSEAERFIKEESKPDEGEEEVPSNPEKRPLNDIRNEFDEDNKDNKDQNNSDENNSNQNSNNSQNNNSNNN >CP012309.1|AXU72520.1|2766198_2768607_-|ATP-dependent-helicase MKNIMQKEILAKSYNLRTNQQEQTLVEHIKDLFEVLESILELNLYSDKDVEILKICCALHDLGKINSIMQQKIEINNKIAYSCSEEERKKLESDKKSLKKIARHNIFSGAFLKDILEKMNLSEEDKLYIYKSIMLHHGNYEDYMRLSTSKVQKEIYDYIEKGILEKEDFNLEDIEDYIKEILYVDFKFNEDVLDYDYIDKLSESMVIDSDYNNGQIEDSVLNYRKFKYILYKGMLNLIDHSASSRQKGIKFYNDFTDEEIDNMILSEIYKSQGNLEKNNIKFNTIQKRLRELSGRNVLTVAFTGSGKTAADYRKTFKRKFFLVPNKISAESFYRKNIFQNKNDLDTRSSNDYIGLLHGDINLYSENEDNGEHDFVLTLRDIDLSINFCKPCVIATVDQLLLSMFKFPGYEKIFAAVKNASITVDEVHLLEPKMFLILIYFMQFACKYLDVDFHLMTATLPKSYKEQMINKGIIFQEESNENVTDKGEIVFIESNKEEEICEGKDVKVSFIKEKEIKSIVEDALENKQKILIIKNTIDSVNRTYEFLKENLSDKYGGVDIDVLHSRFKFKDKKEKYSKILNGEGDIWISTQSVEISLDLDFNIIISDLATMDSLIQRMGRCNRNNKYEYGNFYILPSEDKIYDNKLKSTTKNILKDILKTNSIFTMGIRKTILDDYYDNSVVKKYFEENFISCDKEIKNIYGVNKEIFDGLDLIFNFEPYKNIVDSKKEAAKIFRDVDVSYKIILEEDFYKEDRELQQDSIQVSGFIFNRLYYYGLISKVEGYMVLKSSSKFEYNSTVGLILK >CP012309.1|AXU72521.1|2768633_2769431_-|CRISPR-associated-protein-Cas5,-subtype-I-B/TNEAP MKVLQCKLKQPTAHYRDPKVFQNEYISTLNLPSKTTIMGMITYLCDRRLNSDIDIGIIGTHHHRELEFSRGENIDFWNEYTNMRKGKDKEKFLLKGNYYDYYKEHKAQNSILNYEVLKEVELTIFISCKDDEELEFIRKKLESPCKYANLGRKEDFAIPSEKGCFVKEVELKEVIPMNTRDAIKENIKLKNTYVRVDLRDKENVETIINQGVLIALPHKYKDLEANRDDRVYEFCHYIYVDNDGIYPKNIKVNVCIDTKEVFTWL >CP012309.1|AXU72522.1|2769446_2770460_-|CRISPR-associated-autoregulator,-Cst2-family MNEKRVKGVTLTILTESPVPLSYDQGYGNYTPIKKEQYREKIHAKTSIATITYDLRRMLHQEYGWNLSNIVFGKKGNIYPSIKKNVGCVDENGLETDVFGYLIPLKDKGSISKASPLRIIPFRSLNPYKGSTQLITNRGFLSSEFGRKYYDEKEENEVPRDENFPTSQALAIEETLSDYYVYTITLELDRIGVVEVEDGKLLLPEERKFMSKELREKAVKDILDAITVFTRNIKHSSVLLKPLAVIGGAFDKVVPFFWDDVDYNADSGEINLEGVIETIESYSLKESNTILAINDRLKISNKKELNKFNLSKYPVKEIKNLADRLEIGEDNMWYLKE >CP012309.1|AXU72523.1|2770479_2771955_-|hypothetical-protein MREIKAKFYRSGDIVRDIGIVYFYELLMDLKNELEKNDYKLKFTCELNRNYLSLESAEYIEPKYISDYILENQLFKVFKNGKKETLEKIFSNIDNLTYVNFIEELDKSSATAKQKEDIKKDFKNRRFPYVRNSGKYGLNTSLKNMETNVKRIVDTVIKSNIEIDEIDKLDLTQYEEKDSVCNVCNINKTTKLDIDLRERKDSKYNFLFRGAEKSGFKRSGQVESNICFECEFFNLMCLLYINLKRPMVFAYTNDLRELAFLNHKIMLKRKMYSDKSFYKKLLHEKISSIRLYRFDIDTNKGIILKFDSIIEYKELLKKIELIDIIDNYNFSREPGNTRNLGKRMIDNGNLSNLKELLLDNISVLKQSTGTSREMDFVSSSYNIGLYIKLCWIVDGGEEYKMKNYMESNLIYSRVGKDLFNKMTDESRRKNFSMKVIQLLKSNDRTQLFQTIMHVLVSNGILIGEGFVEGLMQSSELELNTNVGLFIQEIMK >CP012309.1|AXU72524.1|2771959_2772697_-|CRISPR-associated-Cas-family-protein MSRISIFMESCNGKFPNENSMLSVSFIKNILNAENKDFAKNIFNYGEERKNNKQIKDINTAIYIPNLIRSKNELLVDGDIIFNISFYNYSMFSKLYNGILKVKELEYKGYRFKIKNIKIHKEHEIKENGVIFKTMSPIIVKNKEGKYLDVEDSNYIECLNYIANLTLESIRGSGLRKPLEFIPLNFKKRVLKEKIRGFKVREYYYINAYAGTFFLKGNMEDLNALYKMGIGYRRTENAGMVDILK >CP012309.1|AXU72525.1|2772954_2774064_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSEVILKNISKLYSNGFNAVKNINIDIKDKEFIVLVGPSGCGKSTTLRMIAGLEEISEGELYIGDKLVNDIEPKDRDIAMVFQNYALYPHLSVYENMAFALKLRKLPKDEIDKKVKEAAKILDLLPLLNKKPKTLSGGQRQRVALGRAIVRNPKVFLMDEPLSNLDAKLRTAMRTEITKLHQQLGTTFIYVTHDQVEAMTMADRIVVMKDGVVQQIATPQDVYDYPANIFVAGFIGAPQMNFIDVILIEENDEIYAQNEHIKLKLNKEKHYDLIKDNYINNEVVIGIRPEDIHVEDTFIKSNPDTCFKSRIEIKELMGAETYAHLKLGENTITIRFDSKNRINVGDDLTLSVDNSRVHIFDKETTLAIR >CP012309.1|AXU72526.1|2774093_2774861_+|sugar-diacid-utilization-regulator MEELKDFLERQLNKKINIYPYENQKLDASSHLVTFNNAIYVIDFLDKNNLDNLKGNFYLIYQSHIDFEYLKNIFYNLFEDINIIQHNGFFIVNSKYNLDINVTTQNIIETETYQSTYIFYLGKLDSKADFDFRLQLCSDLLPHIIKDNAENKFLNLFDLIRYKTLDLINEDNILNKLIDFNKIKSIDEELLYTGIKFINNDLNISKTSTSMFLHRNTLVYRLEKINEILGFDLKNFENAMIFYLSVKSYFLYKKI >CP012309.1|AXU72527.1|2775048_2776422_-|transporter MGKTNARRTLFLIAIGSGTMLNPLNSSMISLALHSIQNDFHISFTTVSWIVSAFYLASAIAQPVSGKIGDLIGRKVLFLSGLMLVILSASIVPLVQSFFILIFIRVIQAIGTSTLYPSGVALIQNNIKERQSSALAVLTIFASTTAGLGPTLGGLLLDLGGWHAIFLVNIPVVLVSICLGYFLFPKEVKEKKSIKETLKNVLSRLDIIGILLFSIAMIFILLFLLSMKESFNLEQLVFGIILMCLFIWHELRTKLPFIDIKLFVSNPKLSKVYLQFIILNFFNYILFFGLPSYFQDALHYSAKSTGLFMLFMSGIGIFISPLTGKWIDKSGTRFPLVTSSIFMFISAVLLSVVFIHIPVIGKGIILSLAGISYGVGNVALQSSMFEESPRDSIGTASGLFQTSRYLGSILATVLLGMVFEVNITSEQFQILGYVMVVLGTISFLLNFILKKELRKVE >CP012309.1|AXU72528.1|2776457_2777393_-|glucokinase MYYIGVDIGGTGIQAGVVDNYGKIIFRSECKTVIEKGFEGILNDIKIMIYKLLEDNKLTMSDIKSIGFGVPGFINKEGLVTCVNLKWNKKAFNKELKRRFPDVEIHGENDATVAALGEAKFGSMKGANVGVLYTLGTGVGGGIVINQKVFSGAHGLGSEIGHQIIGENYFNCNCGNNGCVETFCSATAIIKYSQKLIEEGEKSRILDLAEGNLENVNAKMVFDAYRENDLVAIKVINRFKEYLAKTFANTINSLDPEIISIGGGISKSSDIILDGIEDLVRKFVLYKTEDIATITCATLGSDAGIIGAAFL >CP012309.1|AXU72529.1|2778358_2779513_-|chaperone-protein MSTKRDYYEVLGISKGAEAQEIKKAYRKLAMKYHPDRNPGDKEAEEKFKEINEAYEVLSDDTKRKTYDQFGHDGLNGQGGFGGQGGFGGQGFGGFEDMFGDIFGDMFGGSFGGGRARRRGPQRGADIRQSVTISFEEAAFGKKMSIKVNRSEECEECNGTGAKPGTSKKTCSTCNGTGQVRTVQRTPFGNIASSRPCSACNGTGEVIESPCSKCHGTGNTRKVKTIEVDIPAGIDDGQMIKLSGQGEVGEKGAPRGDLYIVVNVKSHPLFTRDGNDIYFEMPITFVQATLGDEIEVPTLDGKVKYSVPEGTQTGTVFRLKEKGIPRIRGNSRGDQYVKVVVEIPKKLNDKQKELLREFAKECGSNVHEKKKTFGQKIEDMFKKK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012309_16 | 2847332-2847503 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP012309_16
|
2 spacers
spacers of CP012309_16
>16.1|2847374|36|CP012309|PILER-CR TCAATTAAATTATGACCTTGGTTTAGATAGTTCATT >16.2|2847452|23|CP012309|PILER-CR AGTAGATTTATCAAGATAAGAAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012309_16
The CRISPR arrays of CP012309_16 >merge|CP012309|16|2847332-2847503|PILER-CR TTTTTTGGATACAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTCAATTAAATTATGACCTTGGTTTAGATAGTTCATTATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACAGTAGATTTATCAAGATAAGAAGTTATTCAGATAGAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC >CP012309|16|8|2847332-2847503|PILER-CR TTTTTTGGATACAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TCAATTAAATTATGACCTTGGTTTAGATAGTTCATT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACAGTAGATTTATCA AGATAAGAAGTTATTCAGATAGA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC
>CP012309.1|AXU72585.1|2846781_2846880_-|regulatory-protein MLNKKLPDAELKIMKYIWNTGYKTVISKDVAD >CP012309.1|AXU72584.1|2845312_2846308_+|L-asparaginase MSIKKKVAIVFTGGTISMTVDDKVGAAIPTLSGEQILSMVTNIDKVADVEVFNFDEIPGPHITPYRMMELKNYVNDLLARKDITGVVITHGTDSLEETAYFLDLTIDNIKPVIVTGAMRSSSELGYDGSSNLSASVCTAVSKDAMGKGVLVVLNNEVLLASEATKTNTLSLNTFKSLTSGPLGIIDCNELVLTRDIVNRTIIDTDKVESKVALFKAYVGENADFIRFAVDSGYKGIVIEAMGRGNIPPQMLSGVEYAREKGLPVVIVSRCHSGRVFDSYGYFGSGRDLKNLGCIFGGDLPGQKARIKLILALGKTDNLDEIKDFFEKGIYC >CP012309.1|AXU72583.1|2843563_2845192_+|aspartate-aminotransferase MKNHTYKEIKNIYGKISPFEFKDKLIDIAKYTAKENNRELLDAGRGNPNWTCSTAREAFFTFGHFAITETRSNWDLGHLAGMPQKKGIKERFFKFINENIDMPGAYLARDIINFGINELGFDGDEFVHELADGIIGDNYPLPDRMLPHMEKIVHDYLVQEMKYDISGKYGDVEIFAVEGATAAMCYIFDSLMANELLKKGDTIALMTPIFTPYLEIPNLPRYDFKVVNINANEVDEKGAHTWQYTKKELEKLRDKSIKALFVVNPNNPASIAMDETSCNNLIDVIENYNKDLMIISDDVYGTFVEDFSSLMSKLPYNTVGVYSYSKYFGVTGWRLGTFALHKKNVFDKKINDLTGELKKSVDKRYSDMSLNPSSLSFMERVVADSRLVALNHTAGLSTPQQVQMAFFSAFALIDKVDAYKKLNMSICHRRQKLLFEALELPINENKNNAAYYTQFDIEEWAKLNYGEDLFKFISKTASPVDVLYKLANDYSVVLLSGNGFYGPEWSIRISLANLYDEAYTKIGKAIREILNGYIVEWQKIKK >CP012309.1|AXU72582.1|2841687_2842905_-|threonine-dehydratase-catabolic MMNVTLTDVKEARETIKNIVKRTDLLESVKLSEKTGANVFYKCENLQKTGSFKLRGACNKIASLTDEEKANGVIASSAGNHAQGVALGAKMTGIKSTIVMPATAPLAKVSATKGYGAEVVLNGAVYDDAYAKAVEIQKETGATFLHPFNDKYVIAGQGTISLEIFEQLDNKVDTILCPVGGGGIISGVAVAAKALNPNVKIVGVQTANIPSMKESIKNGKVTTAFNDTTIADGIAVKTPGDLTFEIINELVDEIVVVEETEIAESILFMMESQKIVSEGAGAVCTAAILSGKYVPAKDENVVCIISGGNIDINTLYRIIGVALAKEGRRYSFSTIMEDKPGNFAELTRVISENGGNILSANQGKLSAGEALGKQSAEFILETIDYDHIARIKKAIEEKGFKIIEL >CP012309.1|AXU72581.1|2841212_2841593_-|translation-inhibitor-endoribonuclease MKHEVIHTNDAPAALGPYSQAIKAGNLLFVSGQVPLVPETMEVVEGDVQAQTAQSLKNLKAILAESGADFSNVVKTTVFIKDMNEFGAINEVYAEYFGENKPARACVEVARLPKDVKVEIEVIAVL >CP012309.1|AXU72580.1|2840446_2840929_-|PTS-system-transporter-subunit-IIA MLNFFKKNKSYKLHAVVSGNSINIEKVNDSVFSKKLMGDGVAIIPNSNVVVAPCNGKVTVLTESKHAFGMVSDEGVEILVHIGIDTVSLQGEGFKNEVSQGDTVKKGSPIISFEREKINSQGIDCTTIIIVLNHSEFSEINCMVENEVVAGQDTVIEIMK >CP012309.1|AXU72579.1|2839610_2840426_-|transcriptional-antiterminator MRVVKIFNNNALSTVTNDRKEAILLGLGIGFNKRPGDKVNEDKIEKIYYVQDHMQTKFLELLKNVSPEVMDASQQIISLIPGNEGKFNNKGILSLVEHISFAIDRIKNNVFLPNLMLLDIKMMYSKEFELGVKALEIIYKVCHIHLPEDEAGYIALHFVNLQSNDNLAYDTLKFVKGSIDLIKECYGLELDESSLSTLRFRTHLKFLAQRIFKNEICQDDKMIEMYDYLINNHPKNKEYLEKLNVYIEKEFRYKLDKPEKIYLLLHLTKIL >CP012309.1|AXU72578.1|2838009_2839560_-|PTS-system-transporter-subunit-IIBC MKEKLLGGLETFAKAMVQPLMYLSSAGILMVVGVLLTNDMLLGVLPFFKWEPIQIFGSLIYNCIMAIINNLAVIFAIGIPAALAKKEKHKAALIGFMSYIIYLTASNTMLTSLGQLAKESKMLGLIGTGQATILGIQVVDTSVFGGIILGCIAGYVFNRTSNKTFKGALQIYSGANFSFICMFFVSILIGVVSNFIWPLAQQGIASLANVIKDTGTFGLFLYGFLERILVPTGLHHLIYTPFQFSDLGGVLKVGADTVSGAYAIVMTEMNLPVERFSDSIYYMATGFTKMFGYIGIGAAFIYTAYKQNKKKVKATIIPLIITAVLASVTEPLDFMFVFCAPLLFFVHAVIAGLFIALLKIFDVTALCGGNLLVSIIMNTTVGVEKTHWPVMMILGLAQIIVYFVVFSFLIKKFNYKTPGREDESTATGEEQSKQLNLDAGIENIIDGLGGKENINTVENCITRLRVNVKDESKINEDIINLTPNSGIVRKGKDIQIIFGLHVHEVRRAVEDFLEAY >CP012309.1|AXU72577.1|2836560_2837913_-|6-phospho-alpha-glucosidase MIITIVGGGSTFTPGIVKSIALREKELELEEIRLFDIDKERQDKVAVVVNWILKEDVKTDVKLTVTNCEKEAYTDATFIFAQMRVGKYEMREQDEKIPLKYGCVGQETCGCGGMAYGLRTIQPMIKVIDDVEKYAKKDYWILNYSNPAAIVSEACRKLRPNARIINICDMPIAIIDMIAGSLNINDVHNIRYDYFGLNHFGWFTSIDYKHRDLMEEIKEYIKENKILLPKSYIENLNKSRSTGNRHAVSSWIHVWESVYTMLESFPKYLPNTYLTYYLLSKETVEHSNINRTRANEVMESREKDLFEGVRHYLETGEISEKAFYAGSHGDWISDLAVSIKNDTRSRFLVITENRGAIPNMPYDAMVEIPAYIGKDGPEVIARGPIPLFQQGLMMQQLNSEKLIVEAYIENSYEKALQAFTLNKTIPSMNVAKEILDEMIEVNKEYWPELR >CP012309.1|AXU72576.1|2835671_2836451_-|AraC-family-transcription-regulator MEEWGDAMNIINKIFWEEDRIGMITNNLEADTHSHCMLQLFLGIEDSIEITVNEKLVKCNCIIVDKNISHSFSARKKVYYSAIIEPTSIYAEQLTSKMNDFGYWICDNDGLEKLRQQGTFLIDNSSKEQYLRFMEMLNNYLNIPITLKHYDDRITELLNLLRTCNCDNHTISSFADKVSLSASRLSHLFKEQIGIPLKSYILFHQMECAFRELLSGKNVTEASMTAGFDTPSHFAGTVKRMMGMPVSLSLKDSEFLKVY >CP012309.1|AXU72586.1|2847788_2847947_-|hypothetical-protein MDNFLQGILVSLSASLIVYIASKLFRKRKKPLKAATKSGWEFDLKIRFHKTK >CP012309.1|AXU72587.1|2848305_2849676_-|cell-surface-protein MKLKKLLSLGLVSMFVAGFPISANALDKIDKIQGADKYETAGIIADKQSYTTAILINADSTMADGLSASGLAGATNAPILLTKKNNIPNATLKRVEKAKKVYIIGGESSIDKATETFLKDKGIETRRLQGNDRIKTSYNVAKEINSINKVNKVILTNAFKGEPDAMSIASVAVRDKAPIILTDGKSVPFNTTGIESYAIGGTSSMSDSLVNDTNSTRLGGVDRYDTNKKIVNKFYNGAKEFYIASGTDLVYALVASPMAKNNPIVLVDIGSNKDILKNAAKVTGIGNLSDKIMLECENTINNISLPSSNKNIICGLKIDFDSNHIIWQDKGSYLECYDDNLEYYTEKYKDPTVPINIENTSTQNLDVTKLKVYGEANSTLYMGQYAKIKMDFNSFGVLKPGEKCTIYLDIISLDPSRSMTLTFSYVGDKENYKYEQGLASRILFYNPDGEDFFEYK >CP012309.1|AXU72588.1|2851223_2851892_-|vanZF-protein MEIVTNNQSGVEIQLNLFEAIKDLLLINPIFLLGIILIGIFLVVIFKKNSDIPKVKTSILSLAMYYYLCLTLSHIVGIPTFSEYIRLSQLGETFFNPNINLIPFSDGFSLSFILNILLFVPLGFLCPLISKTFERLRNTFLIGFGLSLFIETIQLFTLHRATDIDDLLTNVIGTIIGYFCFKLIAKLRIVKLHSDDDSMEQDYTVCIPIAIIIVALILGFFS >CP012309.1|AXU72589.1|2852743_2855164_-|leucyl-tRNA-synthetase MSVYNFKEVESKWQKIWKDNNQYKMDTAQTEKPNYYTLEMFPYPSGKIHMGHVRNYSIGDVVARFKKMEGYNVLHPMGWDSFGLPAENAAIKHGIHPHKWTMENIEEMKEQLNLLGISYDWDKEVATSTPEYYRFTQEIFLKFLEHGLAYKKKSYVNWCPSCETVLANEQVVQGACERCKATVLKKDLEQWYFKTTEFAEELLNDLDTLDGWPEKVKTMQKNWIGKSTGADLVFDIDGTDKSMTVFTTRPDTTYGVTYMVLAPEHELVKELVAGTEYEADVEAFVQKMHTMTEIERTAADVEKEGMFIGRYVINPLNGKKVPLWIANYVLVEYGTGAIMAVPAHDERDRDFAEKYNLDIIDVITEDNKMINSEEFNGLDASEGFEGIIDKLEKEGRGKRTINYRLRDWLVSRQRYWGCPIPVVYCDECGIVPVKKEDLPVLLPTDVEFTGKGESPLTTSKQFMSTTCPHCGKPARREVDTMDTFVDSSWYFLRYVDSNNENEPFSKELVNRWHPVDQYIGGVEHAIMHLLYARWFVKAFKSMGMVDFNEPFKNLLTQGMVLMDGSKMSKSKGNTVSPMDIIDEYGADTARLFVLFAAPPERDLDWSEQGVDGCFRFLNRVYRLVDELADVVKKDVEFGELNSQDKDMRYTIHSTLKKVTADLSEKFGFNTAISALMELINDMYKYKELDNINEAVIKEGVQTIVTIIAPFAPHLGEELWTMIGKEGSVFDIDWPKYDEKALVKDEIEVVVQVNGKVRGKLTVNSNISKDEMEKVALEDEKIKGLVEGKTIVKVVAVPKKLVNIVVK >CP012309.1|AXU72590.1|2855517_2855868_-|iojap-family-protein MTVEQMTKIAYDAIEDKLGQDTVIINIGKVSSLCDYFIITTASSQRQVKAIADNVEDELAKLGLEPRGKEGQGTQTWVLLDYGDIMVHVFNEENRGFYNLEKLWKDAPYIDIDTLA >CP012309.1|AXU72591.1|2855984_2856557_-|metal-dependent-phosphohydrolase MNLENINQRLNQMLPVGRLSHSKNVAKCAEKLCEIYGCDKEKAYLAGMIHDCAKYLSDKEIEDYVNKYEIYLDPIEDGNRSLSHSVIGAYICEYEFEVEDEDIINAIKYHTTGREDMSLLEKIIYIADLIEEGRKFPVVDTLRELAYGGKLDEALLTSFNNTLMFVINKKEEIHPRTVMARNYLIKEKLL >CP012309.1|AXU72592.1|2856557_2857247_-|nicotinate-nucleotide-adenylyltransferase MRSENLVKMAELKNTEKLEKFNRHKGKIKIGILGGTFDPIHYAHLATAEFIRDKYDIDKIIFIPSGNPPHKLCITTDKYDRYNMTLLATESNEDFLVSKVEIERKKRTYTIDTLKYLKKKYKNADIYFITGADAICSVEEWKDVKKNFELATFIAATRPGISLLRSQETIEKLTKKYNADIITVYVPSLDISSTYIREQLNEGKSIRYLVPENVENYLYENKLYQYGDD >CP012309.1|AXU72593.1|2857522_2858161_+|recombination-regulator-RecX MGIITKIEQQKRNDDRVNIYVDDKFFIAIFKELVYTFNLKKGNEINEEELKPILDDEMYIKAKNKALNILSHADQSEKKLKEKLSSEFDENIIERVIDFLKSYNLVNDSVLAQKIVNTNVNLNKCGKNRIKQNLYNKGINRSTINEAVSELDKDTEFENAMYLAKKRYERVKKEDKKKIYQKISQHLSYKGFDYDIIKRVLNKLLNFDEYDI >CP012309.1|AXU72594.1|2858313_2860317_+|glycogen-branching-protein MKSQKRFKILDIDVYLQPFESDIKKRMKHYEDMKSKTLKNYKDFSSFANAHLYYGFHQTNDGFFYREWAPNADSLSLIGDFNNWNRKSHPLRKIGSGNWEIFIPGQNSLPHKSEVKVQVTANGKTFDRIPLYIKRVIQKDFGGFNGQIWQPKTPFIWTDNDFDLKNITSPLIYECHIGMSTESESIGTYNEFTEKILPKIKKAGYNTIQLMAIMEHPYYASFGYQVSNFYAISSRFGTPEDLKNLINTAHSMGIAVLLDLVHSHAVKNTLEGINEFDGSEHQFFHSGSKGNHPAWGTKLFNYGKPEVIHFLLSNIKFWLNEYHFDGFRFDGVTSMLYHNHGLGVSFDSYEKYFSMNTDIEAITYLQFANELIKEIKPNSISIAEDMSGMPGMCIPIKDGGIGFDYRLAMGVPDFWIKTISNLSDEDWDLGKMWYELTTRRPGEKNIGYCESHDQALVGDKTIIFWLADKEMYWNMEINSNNHVINRAISLIKLIKLITFSLAGEGYLNFMGNEFGHPEWIDFPREGNNWSYKYARRQWSLSEDNNLKYKQLLNFDKSMLELTKYSDIFIQNSHELIHMDNDKKILVYSKGKYLFIFNFHPNLIQSVDISKFQNTNYKTILNTDMVEFGGNTKKENLRDYDVYFNSTPPSSKMPIASRTAIVLLDNGI >CP012309.1|AXU72595.1|2860490_2861132_+|TetR-family-transcriptional-regulator MGRKKEPDNTIQKILDISHKLFLEKGYEQTTIQDIVDNLDGLSRGAIYHHFKSKDEIIKAITSRLYNDGFYGYEVKNDEGKTALEKLQYRLLHAYEQHNKQDIFLMSSSLLRNPKYLATQFDEIINDIVPWIKALIEEGNQDNSMQVKNPEIAAQMFGFLLNTWCIPTVYPGNPQQMIERFTLFGEQAAFMGISFMNDKIMCEYQKFVNKFSK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012309_21 | 3362887-3365008 | Unclear |
I-A
Consensus repeat of CP012309_21
|
32 spacers
spacers of CP012309_21
>21.1|3362916|35|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT GGATGTTTTAGTATATGCTATTGTTGATTCTACAA >21.2|3362980|35|CP012309|CRT AAGTTTCTAAATACTCGTTGATATTGCTAATATTC >21.3|3363044|37|CP012309|CRT CTGACACTGTGCCTTGTGTGAGTCTTTTCTTTATCCT >21.4|3363110|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ACTTCGAAATTGCAGTTTTCAGCATGTTATTGCGCA >21.5|3363175|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CAGGATTAGCAGCAGCGCTCGGACCCGTTTTACTTAT >21.6|3363241|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATAATTCTGAACAGGTTACAATATGTGTGAATACTCT >21.7|3363307|35|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GTTTAATATGTTAACAGATTTATTTAACAGGGTAA >21.8|3363371|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGATAACTTATTTAAAAATAAATCTAATGTTGCAATT >21.9|3363437|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CAGCATTCTCAACAATCTTATCTATTCTGTCTTTTCT >21.10|3363503|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AATGTTATCATAAATTAGAATAAATAGAACGAAGTTC >21.11|3363569|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAAGAGTTTGATTTAACATACGAGTATATAGTTGCTA >21.12|3363635|35|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GTGAGTGGTTTGATTTATTTTTATTCTGGTACTCC >21.13|3363699|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCAAGTTAGAAAATATGTTCGAAATTTTGTTAATTT >21.14|3363764|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AATCTATTTTTTGAACAGATAAATACAACAATTTAT >21.15|3363829|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAGTGACTCGATACTACAAAAATAAAAAAGCGAGGGG >21.16|3363895|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATACCCGTTCAAACCAGTTTGCAAATTCATTGCTCCG >21.17|3363961|35|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ACTATCGGAATCAGTGATTTTAAGAGTTTTTTCGA >21.18|3364025|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTTTACATATCGTACATAAATCATCCTCAGAATTTTC >21.19|3364091|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAAGATTAGTTAATCTTAAAATTTCTTCTATTTCTAA >21.20|3364157|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTGCTATTTTACAAAAGGTACGGTCGTGATTTATCA >21.21|3364222|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CGTTAATGGGATAGATTTTTCTCCTGTTCTAAATCT >21.22|3364287|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAAAGACAACTACTAACGTTGTAGAAAAAATAGTTAC >21.23|3364353|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ACTTTAATAATTAAAATGATATTTTTAAACTAACTT >21.24|3364418|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAGAGAACCAAGCGCAGAAATAGAAGTAGCAGACTT >21.25|3364483|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGAGTATGAGTATAAGCATAGAAAAGTCAATAATTT >21.26|3364548|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGTAATAAGTCAGATAAGCCCCAACGTTATCAACTT >21.27|3364613|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TATATTTTATATAATATTTGTTTAATTAAAATTGTAA >21.28|3364679|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAGACGTTATTGCAAATTTTCCAATGAATTTTGACTT >21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGTATTCACACAGATAAGAAAATTAATCTAATAATAG >21.30|3364811|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATATGGAGTTGCCCTAATAATTGTAGAGGTTCAGAAA >21.31|3364877|38|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GTTAGGAGATGAATCTGCTATCCTCAATGGTATTCTCA >21.32|3364944|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAACTTCTATAATATTACCCATCTCTTTTAATCTAA |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP012309_21
The CRISPR arrays of CP012309_21 >merge|CP012309|21|3362887-3365008|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTTAGATATGATTTAGTTAATATAAGGTGGATGTTTTAGTATATGCTATTGTTGATTCTACAATTTTATATACTGCTTTATTAATATAAAATAAGTTTCTAAATACTCGTTGATATTGCTAATATTCTACTTATCTACCCTTAGTTGATATAAAACCTGACACTGTGCCTTGTGTGAGTCTTTTCTTTATCCTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACACTTCGAAATTGCAGTTTTCAGCATGTTATTGCGCAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCAGGATTAGCAGCAGCGCTCGGACCCGTTTTACTTATATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACATAATTCTGAACAGGTTACAATATGTGTGAATACTCTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGTTTAATATGTTAACAGATTTATTTAACAGGGTAAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTGATAACTTATTTAAAAATAAATCTAATGTTGCAATTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCAGCATTCTCAACAATCTTATCTATTCTGTCTTTTCTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAATGTTATCATAAATTAGAATAAATAGAACGAAGTTCATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAAAGAGTTTGATTTAACATACGAGTATATAGTTGCTAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGTGAGTGGTTTGATTTATTTTTATTCTGGTACTCCATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTCAAGTTAGAAAATATGTTCGAAATTTTGTTAATTTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAATCTATTTTTTGAACAGATAAATACAACAATTTATATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTAGTGACTCGATACTACAAAAATAAAAAAGCGAGGGGATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACATACCCGTTCAAACCAGTTTGCAAATTCATTGCTCCGATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACACTATCGGAATCAGTGATTTTAAGAGTTTTTTCGAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCTTTACATATCGTACATAAATCATCCTCAGAATTTTCATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAAAGATTAGTTAATCTTAAAATTTCTTCTATTTCTAAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTGCTATTTTACAAAAGGTACGGTCGTGATTTATCAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCGTTAATGGGATAGATTTTTCTCCTGTTCTAAATCTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTAAAGACAACTACTAACGTTGTAGAAAAAATAGTTACATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACACTTTAATAATTAAAATGATATTTTTAAACTAACTTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAAGAGAACCAAGCGCAGAAATAGAAGTAGCAGACTTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTGAGTATGAGTATAAGCATAGAAAAGTCAATAATTTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTGTAATAAGTCAGATAAGCCCCAACGTTATCAACTTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTATATTTTATATAATATTTGTTTAATTAAAATTGTAAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAAGACGTTATTGCAAATTTTCCAATGAATTTTGACTTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAGTATTCACACAGATAAGAAAATTAATCTAATAATAGATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACATATGGAGTTGCCCTAATAATTGTAGAGGTTCAGAAAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGTTAGGAGATGAATCTGCTATCCTCAATGGTATTCTCAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTAACTTCTATAATATTACCCATCTCTTTTAATCTAAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC >CP012309|21|18|3362887-3362980|CRISPRCasFinder ATTTAGATATGATTTAGTTAATATAAGGT GGATGTTTTAGTATATGCTATTGTTGATTCTACAA TTTTATATACTGCTTTATTAATATAAAATAAGTTTCTAAATACTCGTTGATATTGCTAATATTCTACTTATCTACCCTTAGTTGATATAAAACCTGACACTGTGCCTTGTGTGAGTCTTTTCTTTATCCTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ACTTCGAAATTGCAGTTTTCAGCATGTTATTGCGCA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CAGGATTAGCAGCAGCGCTCGGACCCGTTTTACTTAT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ATAATTCTGAACAGGTTACAATATGTGTGAATACTCT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GTTTAATATGTTAACAGATTTATTTAACAGGGTAA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TGATAACTTATTTAAAAATAAATCTAATGTTGCAATT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CAGCATTCTCAACAATCTTATCTATTCTGTCTTTTCT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AATGTTATCATAAATTAGAATAAATAGAACGAAGTTC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AAAGAGTTTGATTTAACATACGAGTATATAGTTGCTA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GTGAGTGGTTTGATTTATTTTTATTCTGGTACTCC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TCAAGTTAGAAAATATGTTCGAAATTTTGTTAATTT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AATCTATTTTTTGAACAGATAAATACAACAATTTAT 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>CP012309.1|AXU72993.1|3362397_3362826_-|acetyltransferase MIKKLNNKDINKIMEIWEKSTIKAHDFISKEYWQNNYNTVKNEYIPISDTFVYDDGDEIKGFISIIDKSFIGALFIKPKYQNLGIGGKLLDYATKKYKSLSLAVYKDNKKAVVFYNKKGFNIVKEQVNEDSGFKEYIMEYSK >CP012309.1|AXU72992.1|3361163_3361943_+|hypothetical-protein MKVNENNINNIDEELDELSRKVYLESPDFWISISDKIIDKVFDEMLLFFAVKYNYFNIVCFAIENNYLDLNMPSKNKKYTNIMEHLLDTSKQNEDKKIYNYLLSLNKGNNLDERPILDELNCNISSDTFEKKDIYLPKYLCPSCNSNIFDTGYKVSNDITYKFSSKEAEPIEMCSEVSSIRCCNCDELLEDITLDKLYNLCKIQNCNNCGSNLTKVGIIAKKKMNFDENTEKFKDVSTSYCCGNCDSEISLSQREHFKI >CP012309.1|AXU72991.1|3360294_3360840_-|biotin-synthase MKNTKVNIQDLTKMSICVALLCISSYIYIPLPFTPAGVTAQTIMINLIALILTPRQAFSTVGVYIMIGLIGIPVFGGGTSGIGKLLSPTGGFYFGFLFAALIISLLKGRNNDIKRYILITIFVGMPIIYFMGTVFMCYFNQMTVEAALFAAVVPFLIGDTIKSVIASFLGTKLNNVLRRNL >CP012309.1|AXU72990.1|3359126_3360263_-|thiolase MKEVFILGGLRSHIGLKNGIFQFVQPELLGASVLKDLIKKYEIDKIDEIICGNAVGTGGNIARLMTLTAGVSNEVPAFTVDMQCASAMMSIDIAFSKVKSGQCDLIIAGGFESSSLQPMRTYHKNDKRYNTNNPNYTVAQFSPDDNSQNSMLEGAERVAELYQIEKADLDFWVKESHKRAKEAREEKILEDIISPINNSTYDEGIRDKMSQRLLDRMPSILGKETITNAANSCLINDGASFIIICSKKYLEHVKKKPKAKIINTCTIGTDATLSPTSAIQAMDKLLEIESLNYLDVSAVEFNEAFAVIDVLFQRKYPELIDRYNIFGGALAYGHPYGASGAIIALHLLKALEKTKGRYGICSIAAAGGLGSALLLERV >CP012309.1|AXU72989.1|3357731_3359123_-|AMP-binding-protein MNYYELLRIKKERHKNKNFLIIDGEKYTYENILSYSEELGKQISLGENIPILIYSKNIMFQLISFFAINYSKNIPIICHYNLSKKVLDDILLKNNISIIISDESMDVIDLYDDNNNEVAKKVNFSIFNPKFNIYMYQYKKLINYLDKSICMGALSSGSTSVPKVLYRTYESWAGFFPIQNGIFNISGESILFVNGTLSFTGNLNSIMSVLYEGGSIVISSGLNCKSWIRKIKQYNVTNIYLIPTKLQLLVKHLKEPVLKVVSIFTGSQLLFEDTARNLKKYMPKSEIILYYGASELNYITYLCYDELIEKPLSVGRPFPGIDIYIREGKIFVNTEYAVYNATKPYSVNDIGYYDNDGYLIFEGRSDDIINIGGFKVSSTKIENEVKKIPQIEDAIVLPYSDTIRGNKIVLFVITIDKITKKDLLIKMKDNLMKNEIPKKIIFLNSFPYTSSEKIDRLALLKML >CP012309.1|AXU72988.1|3356780_3357656_-|dipicolinate-synthase-subunit-A MSNQYDITVIGGDLRQVYMVKKLINKGYSVVTYGISNEIINGIVGKSTSLAEALSKSSIILCPIPFTKNQVNIENTDDCLDATIDNLLINLSPNQILFGGNIPTKVCKFCEQHSIQIYDFMKMNDVAILNAVATAEGAIAEAIKRSIINIHQSNCLVLGYGRCAQILAKKLYALDANVCVGARNNDARSTANAFGYSSISLSQLDEKLLQFDYIFNTIPECILTKERLEKVSQEVTIIDIASSPGGVDYSVVKEAGINATLCLGLPGKYSPKTSGEILVNAIENIINERRD >CP012309.1|AXU72987.1|3356187_3356778_-|dipicolinate-synthase-subunit-B MRLEGLTIGVGFTGSFCTYDKIFIELENLVKEGANVHTIFSDVSQNIDCRFGNSEEFMKKAYELTGNKPIVTIEEAEPFGPKGIADIIIIAPCTGNTAAKLANGITDSPVLMAAKGHLRNDKPLVISISTNDALSFNFKNIGILLNSKNIYFVPFGQDNCKAKPNSMIAHTELIIPTIELALENKQLQPVIKSPHQ >CP012309.1|AXU72986.1|3355780_3355981_+|hypothetical-protein MKKLKTISIFSLIISVILTIGGIGIVTYYVDNLFIRGLSVFVLIMSSSFVSTTVRLIFEESKRYKF >CP012309.1|AXU72985.1|3352622_3355277_-|bifunctional-acetaldehyde-CoA/alcohol-dehydrogenase MAHKEQVIIENKKENEVMSVGLDTVNNVESLVKKLAKIREAQKIFATYSQEQVDKIFLAASLAANKQRVPLAIMAQKETGMGIAEDKVIKNHYASEYIYNAYKETKTCGVIEKDEAFGMTKIAEPIGVIAAVVPTTNPTSTAIFKALLALKTRNGIIFSPHPRAKNSTIEAAKVVLEAAVLAGAPEGIIGWIDEPSLELTTTVMKEVDLTLATGGPGMVKSAYSSGKPAIGVGAGNTPAIIDDSADIKTAVNSILVSKTFDNGMICASEQSVIVLESIYNEVKKEFKERGAYLLDKDKTEKIRNIILVNGGLNSKIVGQTACTIAKLAGFEVPVDTKVLIGEVESVEIEEAFAHEKLSPVLAMYKASDFDDAVRKAEKLVEDGGFGHTSSLYIDDVNQREKLDKFTSAMKTCRILINTPSSQGGIGDLYNFKLAPSLTLGCGSWGGNSVSENVGVKHLLNIKTVAERRENMLWFRAPEKVYFKKGCLGVALKELKDVMNKKRAFIVTDTFLYNNGYTKAVTDLLDEMNIKHTTFFEVEPDPTLECAKIGAKAMREFNPDVIISIGGGSAMDAGKIMWTLYEHPDVDFQDLAMRFMDIRKRVYTFPKMGEKANFVAIPTSAGTGSEVTPFAVITDQDTGVKYPLADYELMPDMAIVDSDMMMNMPKSLTSASGIDALTHALEAYVSMLATDYTNGLALQAIKSIFEYLPRAYDNGAKDPEAREKMANASTMAGMAFANAFLGVCHSMAHKLGAFHHVPHGVANALLITEVMKFNSSDAPKKMGAFSQYKYPEALKRYAEIASFLGLKGNSDEEKFQSLLVAIEDLKLKVGIPKSIKEFGVEESKFMDSIDEMVIQAFDDQCTGANPRYPLMNEIKDMYLNSYYGR >CP012309.1|AXU72984.1|3350127_3352347_-|signaling-protein MTGRNKSFTLITILFLTSLFLTMGYIYIEDTKHLLMSEAKIHIKEVAVQGSQLAQRQIEKDLDVLNIFSNYYASNPDIPNEEKMKNLLDEMENQKFYTMAIVDINGNAENTKGDKFSVKDREFFKNSIKGKKYVSSPYVDEVNKSIKKIAISVPLLNNDKVVGVLYCTYNINTLMKLINISFYENNSISYVVKNDGTIILHPQGDSLSKNIYKLLEQDNDIQEVNRLKKELQENKTGATVLNMLEERRYLGYATMDNGNSENNYIKDWNLIFSIPETVVFSNSKQIINRAVYAVLSIVLIFIAIIFYIIYIKKSNEKEILSLAYEDKVTYIGNQNKFYRECSKYLLDKPSLNYIIVYFDINNFKMINDTFGYEFGDNLLITIAKALKEELTEGEVYARLSSDYFAIFCDYKNGRNKIIRKLDNIRSNIESNLSIVFEISLCVGIYFVEEGEVDIQKAVNKANMARSVAKGKNINYAIYNEDVRNKLSEESMILDDIKIALVKNQFEVYYQPKFSLVTGEMIGSEALIRWNHPEHGFISPAVFIPIAEKSKLILKIGRFVFERVCNDLSEWKKQGKKIVPVSVNLSRVELYQPDIVKFINKTIQMYNLSSDFIEIEITETVAINELNILKNVLNELRKHGFSISMDDFGTGYSSISCLRDMPIDILKLDKSFLGGIEHDERSRNIAKSIVSLAKSLDLVVIIEGVESKEQAELMKQFGCDLVQGFYFARPMPAKNFLDLL >CP012309.1|AXU72994.1|3365191_3365458_-|CRISPR-associated-Cas2-family-protein MFVIVTYDIVEARSLNRIRRILRKYLTWTQNSVFEGNITEGKLHKCISEIENIIDNSEDSIYVYEIKNPNSIKKKCYGIDKYSDEMFI >CP012309.1|AXU72995.1|3365460_3366441_-|maturase-related-protein MYKDYYIISNGDIKRKENTIYYYNLEGEKKILPVEQVDDIHIYGEVDLNTKLINYISKYGVMLHFYNYYGYYSGTYYPRKKNVSGFSLVCQSACYLDKNERLYLAKSFVESASYHILRNMRYYKVDESLIDTIKDELNDLNDVKEISELMGKEGRIRKTYYKSFNQILKDDFEFYKREKRPPKDPVNALMSFGNSIMYTNVLSEIYKTQLDPTISFLHEPSTKRFSLSLDIAEIFKPIIVDTIIFSLINNKRINKNDFEYQDKICYLSEKGKKKFLQEFENKMQTTIKHRNLNRKVSYRMFIRLECYKLIKHFINDERYKVLKVWW >CP012309.1|AXU72996.1|3366443_3367013_-|CRISPR-associated-Cas4-family-protein MIFILTMWLKFTKEGDFVPIDLEVLKVQGVKINYYYVCKRKLWLFSKGITMEQNSSRVLSGKIVHEDSYKRMKNKEILIDDILKLDIIKDEYVKEVKISSKMKEADEMQLYYYLYYLKNSMGIEKKGTINYVKEKKQEELILTEEKERIIENTLININEINMQLSPSKIEKKHYCTKCAYYEFCFVKEE >CP012309.1|AXU72997.1|3367009_3369331_-|CRISPR-associated-helicase,-Cas3-family MLYAKSNPVETLREHTDELLKQMNVLRESYGKNINSLDFLEEEIFWQLLDFVIEFHDIGKAFSPFQELIKSRMDTKINEPKIVTHLENNVGHNYLSPAFIDYSYIDRKKNKELRAVLNQVIVYHHERDIFIDKDFKNLIQKILDEDLINKVYELQHEFKVRYPIKTERLSKVYLQSVEKRIDKNHKYYNLYIMLKGILHRLDHSASAHEVVECNNVINIGEQTENYLMKEFGSLREAQSFAKSNRNKNIILIASTGMGKTETALIWIDKDKAFFTLPLRVSINALFDRAKNIVGVGESNDTFLGLLHSTAIDYLEESNQENSSEIVDLAKLLSCKLTFSTIDQIFKFPFLYRGYEKVYSTLAYSKVVIDEIQAYSPEIAAVLVKGIEMIHKIGGRFMIMTATMPTIYIDELKKRGVMNSNLAELTCNTEKIRHCVSIVENSIDENLGKIIQSGMNKKVLVIVNTVKSAVEKYELIEEIVKPKGIDVNLNLLHSMYIQEDRAKLEKYIKEFADSDRNGIWITTQLVEASLDIDFDELHTENSTLDSLFQRFGRCYRSREYEENSPNIFIYTEKATGIGSIYDKDIVEKGLELLKTFINGKECVKMKEKYKVEMVKILYSKESLEGTAFEKRFTSALNILDTITPYSLGSKDAQNILRNIEGYTVIPEDIYNKIEETLIKDYEELGQELINAYSNDDRQLINKIKSKRKKARREIIKKTVNLPIYKAKQNVIDIQVKGLEDLKILLYKYDIYENKHTKQIFGKGVLISNEIDQFI >CP012309.1|AXU72998.1|3369341_3370043_-|CRISPR-associated-protein,-Cas5t-family MKVLKLDLFQETACYKKPFAMKITETYPLPPYSTINGLIHKILNATEYIPFNISVQGTYESIFNNYQTTYFYKKDSITSMPMNSHMLLNVNLIIHIGGDFDLLEEIYDSLLNYDEHLSLGRKEDLVRINDIRFVEVNKFEVDEDIQLDDYENYKLSECNIRMPIYIPKTSLQDTDIDGISYRLNNYYDNNAVEDKKRVWNKVDSYYVEDGNTISIGDILLDNEGDLLYFNNIN >CP012309.1|AXU72999.1|3370044_3370959_-|CRISPR-associated-autoregulator,-Cst2-family MKRGLTFTVIAQAQSLNYGEGIGNISELKKLSRDDGNIYTFASRQCLRYDIVRLAAELFNWNLQVVDKEKGTIQFKDNISIRESEEMDLFGYMKTNKKDEKDKKGGSLTREATVRLSNAISLEPYRSDMDFLNNKGFADRIGEHPNLANIEQHLSYYTYTVTIDLSKIGKDGEIELDNKEKCRRVVEFLEIIKVLNRNIRGRQENLSPLFVVGGVYEIANPFFLGRIKLKGDKNGFKINKQAIEEVIQGTFLGKDLKEFTYVGMVDGVFINKEEFKGLFEDNFFSVDKFFGQLVKEVKEYYGVN >CP012309.1|AXU73000.1|3370960_3372838_-|CRISPR-associated-protein-Cas8a1/Cst1,-subtype-I-B/TNEAP MKLRVYRGDWFFNMGIVGFLNIIKKADKQAEIFIMEDYIEFDSLFLENFHEYYFNYFMDEYDVSKRIKKNIDYSINFIKSKPDRIKDGIKKIKDSVKQQNDKIKKFDEEKFNLIKEKLDSMSKIKSYDEFDSLEALVDETIDIFKIKSINDRLTANLYKYVVQDNYFGQVSFFNVAKAKLDLDGLKQVMFNDYLRQIIYFGELEDLLEENDYDKLKNYLNDRLNSIAKDINEKKVSKSSINTIEKIMKEINKNFIKKNKSIEDIKKYMDSLEVCEMCGLYKGILDEYSESNFAPLGVSTNNARNMFWNQAYVPSICDICKLILFCTPAGATYTRKNYLINEENEFYLFVNMDTCINELFERNNSLKAQKSEYSDSKDENPFNQLIKSIVEENTLKSEWQLRNILFVEFKASIDSKKCKINYFNIPTYLAKFFTDKYANKKIQSIYDYKLKSNVLDLLLKNRDLKHLINNILRNKVKNDMESNNKSNISGIDCFRVVQLRALINSYKKGVYKMDSKNLEKNDEKLRIIYYLGCDIHDYFVNKNSKNKIDGVSYKLLNSVKVGNKSDFMDTIIRVFMSAEKQIPAFILDIEIEKDLDFESIGHAFISGLISGKYEGKDKLPNEKEEK >CP012309.1|AXU73001.1|3372843_3373581_-|CRISPR-associated-Cas-family-protein MKMKIEFSTGCIPISYNSLFMSIIKEAIRKSNEDYYKSMYYYKEKNNKKTKNFTFSVYIKKYSIEGDNFIIEDKVILNISTPDLELGFHIYNGLMTSKKCLYKDYELTRIRIDLSREKKVTEERVLFNALSPICVKSKEGKFLEITDDRYIEELNYITNEVVKNYRGNGLKRKLEFENIGLKKVVVKESLREFKKITGKEYQYINGYKGKFILKGDIDDLNLIYNLGIGFRRAQGFGDVDILEWR >CP012309.1|AXU73002.1|3373658_3374546_-|putative-transcriptional-regulator MKCKELSEELEVSERQIKSYKMYLEQAGIFINSTPGIYGGYEIDKCNSISLIKLLDSEVSILDMINSQLEYNNDIYKNEFNNIVEKIKAVLNTGEKSDTYMDYFTVQAQRNCDYESEKNKCNEIIRAYTTKHKFWIEYYSLNSGNSERIVHPYGLFNYKSDTYMVAFCEKRFKFIDFKLCRIKDYKVLEEKYNVDKSFSWDEYSKNSIGIYKGEEINVVIKISHPFSTIIKEKVWVNNQQIIEYDDKSIMFKAKMRGYEEIKSWILSMGAYVEVVEPDRLRNDILSEIEKMKKIY >CP012309.1|AXU73003.1|3374854_3376771_-|ABC-transporter-permease MNIKQFAINNISRNIKAYLGYLASIVISSSLLFSFIMFTSHPDLDVSQFPDYLKEGLKMSKIIAYLFLFFFVFYSVSVFLKSRYKEFGILYITGISKRQVMKLIFIENMIINIVSSVIGIIIGLIFAKIFLVVMSTFLELSPLKFYIPFNAILSTLIYFMILAVLTSIFTSFIVKENQVLKLLKGTKTPKSEPKTSLMLAILSICLFIIAYYNAITSTDQYTTYLRLVPVTSLTIVATYLFFSQFSVFFMKKLKLNKRFYRKNTNMLWISNLIYKVKDNARIFFLITITSAVAFTAIGTVYSFWKDVERQINLIYPNTIYYSTMTLHNDPKKPDSKEKDKERMMFIENNLKKENVDYTRTNGEFKTVFPKKSDFNVRIMKESKYLEITETIGVKPISFEDNECISLLSSSLPGNKNVKENIIVGNRGLKVAKQVEECVMPAYYKNMYVVKDNFYDSIESKFIVDRFTAFEVEDSSKTIEICREFENKFNNESGMQPYLFFSKELMIGTGKLMYSTFIFLAIFIGLIFFVTTSSFLYNKFYMDCQVDKKKYEQLNKLGMTYNEIKKASTIEIGIVFLFPYVVAVIHSIFALTALKNSFDIEVASSAVLVMGSLFLVQIVYFLIVRNNYLKEIRLNLVNF |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
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CP012309_1 | 1.1|17891|34|CP012309|CRISPRCasFinder | 17891-17924 | 34 | CP012309.1 | 32125-32158 | 0 | 1.0 |
CP012309_1 | 1.1|17891|34|CP012309|CRISPRCasFinder | 17891-17924 | 34 | CP012309.1 | 131190-131223 | 0 | 1.0 |
CP012309_1 | 1.1|17891|34|CP012309|CRISPRCasFinder | 17891-17924 | 34 | CP012309.1 | 148750-148783 | 0 | 1.0 |
CP012309_1 | 1.1|17891|34|CP012309|CRISPRCasFinder | 17891-17924 | 34 | CP012309.1 | 1112512-1112545 | 0 | 1.0 |
CP012309_1 | 1.1|17891|34|CP012309|CRISPRCasFinder | 17891-17924 | 34 | CP012309.1 | 3934454-3934487 | 0 | 1.0 |
CP012309_1 | 1.1|17891|34|CP012309|CRISPRCasFinder | 17891-17924 | 34 | CP012309.1 | 4074816-4074849 | 0 | 1.0 |
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CP012309_2 | 2.1|138138|37|CP012309|CRISPRCasFinder | 138138-138174 | 37 | CP012309.1 | 32127-32163 | 0 | 1.0 |
CP012309_2 | 2.1|138138|37|CP012309|CRISPRCasFinder | 138138-138174 | 37 | CP012309.1 | 131192-131228 | 0 | 1.0 |
CP012309_2 | 2.1|138138|37|CP012309|CRISPRCasFinder | 138138-138174 | 37 | CP012309.1 | 148752-148788 | 0 | 1.0 |
CP012309_2 | 2.1|138138|37|CP012309|CRISPRCasFinder | 138138-138174 | 37 | CP012309.1 | 1112514-1112550 | 0 | 1.0 |
CP012309_2 | 2.1|138138|37|CP012309|CRISPRCasFinder | 138138-138174 | 37 | CP012309.1 | 3934449-3934485 | 0 | 1.0 |
CP012309_2 | 2.1|138138|37|CP012309|CRISPRCasFinder | 138138-138174 | 37 | CP012309.1 | 4074811-4074847 | 0 | 1.0 |
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CP012309_4 | 4.1|154262|39|CP012309|CRISPRCasFinder | 154262-154300 | 39 | CP012309.1 | 131185-131223 | 0 | 1.0 |
CP012309_4 | 4.1|154262|39|CP012309|CRISPRCasFinder | 154262-154300 | 39 | CP012309.1 | 148745-148783 | 0 | 1.0 |
CP012309_4 | 4.1|154262|39|CP012309|CRISPRCasFinder | 154262-154300 | 39 | CP012309.1 | 3934454-3934492 | 0 | 1.0 |
CP012309_4 | 4.1|154262|39|CP012309|CRISPRCasFinder | 154262-154300 | 39 | CP012309.1 | 4074816-4074854 | 0 | 1.0 |
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CP012309_6 | 6.1|1112574|35|CP012309|CRISPRCasFinder | 1112574-1112608 | 35 | CP012309.1 | 138198-138232 | 1 | 0.971 |
CP012309_6 | 6.1|1112574|35|CP012309|CRISPRCasFinder | 1112574-1112608 | 35 | CP012309.1 | 148812-148846 | 1 | 0.971 |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP012309_3 | 3.1|146735|29|CP012309|CRISPRCasFinder | 146735-146763 | 29 | NZ_CP033215 | Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence | 5105-5133 | 0 | 1.0 |
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CP012309_8 | 8.13|1524720|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1524720-1524757 | 38 | LN681542 | Clostridium phage phiMMP03, complete genome | 49909-49946 | 0 | 1.0 |
CP012309_8 | 8.13|1524720|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1524720-1524757 | 38 | NC_009231 | Clostridium phage phiC2, complete genome | 53447-53484 | 0 | 1.0 |
CP012309_8 | 8.13|1524720|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1524720-1524757 | 38 | JX145341 | Clostridium phage phiMMP02, complete genome | 47251-47288 | 0 | 1.0 |
CP012309_8 | 8.13|1524720|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1524720-1524757 | 38 | NC_048642 | Clostridium phage CDKM9, complete genome | 48593-48630 | 0 | 1.0 |
CP012309_8 | 8.13|1524720|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1524720-1524757 | 38 | KX228400 | Clostridium phage CDKM15, complete genome | 49495-49532 | 0 | 1.0 |
CP012309_8 | 8.30|1525846|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1525846-1525883 | 38 | LN681539 | Clostridium phage phiCD505, complete genome | 48149-48186 | 0 | 1.0 |
CP012309_8 | 8.30|1525846|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1525846-1525883 | 38 | LN681542 | Clostridium phage phiMMP03, complete genome | 49909-49946 | 0 | 1.0 |
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CP012309_8 | 8.24|1525448|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1525448-1525484 | 37 | HG798901 | Clostridium phage phiCDHM11 complete genome | 3892-3928 | 1 | 0.973 |
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CP012309_11 | 11.7|1876131|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1876131-1876167 | 37 | JX145341 | Clostridium phage phiMMP02, complete genome | 39376-39412 | 1 | 0.973 |
CP012309_11 | 11.7|1876131|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1876131-1876167 | 37 | LN681541 | Clostridium phage phiMMP01, complete genome | 37493-37529 | 1 | 0.973 |
CP012309_11 | 11.7|1876131|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1876131-1876167 | 37 | KX228400 | Clostridium phage CDKM15, complete genome | 41716-41752 | 1 | 0.973 |
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CP012309_11 | 11.8|1876197|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1876197-1876233 | 37 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 14842-14878 | 1 | 0.973 |
CP012309_11 | 11.8|1876197|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1876197-1876233 | 37 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 5055-5091 | 1 | 0.973 |
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CP012309_13 | 13.7|2240820|38|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2240820-2240857 | 38 | CP011970 | Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence | 17046-17083 | 1 | 0.974 |
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CP012309_13 | 13.20|2241673|38|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2241673-2241710 | 38 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 31148-31185 | 1 | 0.974 |
CP012309_13 | 13.20|2241673|38|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2241673-2241710 | 38 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 30363-30400 | 1 | 0.974 |
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CP012309_9 | 9.16|1638497|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT | 1638497-1638533 | 37 | NZ_MG973074 | Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence | 102058-102094 | 2 | 0.946 |
CP012309_9 | 9.17|1638563|38|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT | 1638563-1638600 | 38 | NZ_MG973074 | Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence | 94861-94898 | 2 | 0.947 |
CP012309_11 | 11.2|1875804|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1875804-1875840 | 37 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 15649-15685 | 2 | 0.946 |
CP012309_11 | 11.3|1875870|36|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1875870-1875905 | 36 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 2281-2316 | 2 | 0.944 |
CP012309_11 | 11.8|1876197|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1876197-1876233 | 37 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 14851-14887 | 2 | 0.946 |
CP012309_12 | 12.1|2189113|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT | 2189113-2189149 | 37 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 4452-4488 | 2 | 0.946 |
CP012309_12 | 12.1|2189113|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT | 2189113-2189149 | 37 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 4485-4521 | 2 | 0.946 |
CP012309_12 | 12.1|2189113|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT | 2189113-2189149 | 37 | LN680008 | Clostridium phage phiCDHS1 gp04 gene for putative capsid protein | 1022-1058 | 2 | 0.946 |
CP012309_12 | 12.1|2189113|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT | 2189113-2189149 | 37 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 15949-15985 | 2 | 0.946 |
CP012309_12 | 12.5|2189114|37|CP012309|PILER-CR | 2189114-2189150 | 37 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 4452-4488 | 2 | 0.946 |
CP012309_12 | 12.5|2189114|37|CP012309|PILER-CR | 2189114-2189150 | 37 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 4485-4521 | 2 | 0.946 |
CP012309_12 | 12.5|2189114|37|CP012309|PILER-CR | 2189114-2189150 | 37 | LN680008 | Clostridium phage phiCDHS1 gp04 gene for putative capsid protein | 1022-1058 | 2 | 0.946 |
CP012309_12 | 12.5|2189114|37|CP012309|PILER-CR | 2189114-2189150 | 37 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 15949-15985 | 2 | 0.946 |
CP012309_13 | 13.7|2240820|38|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2240820-2240857 | 38 | MF547662 | Clostridioides phage LIBA6276, complete genome | 24386-24423 | 2 | 0.947 |
CP012309_13 | 13.7|2240820|38|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2240820-2240857 | 38 | MF547663 | Clostridioides phage LIBA2945, complete genome | 24386-24423 | 2 | 0.947 |
CP012309_14 | 14.1|2600682|36|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT | 2600682-2600717 | 36 | NZ_MG973074 | Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence | 22132-22167 | 2 | 0.944 |
CP012309_7 | 7.11|1311946|36|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1311946-1311981 | 36 | AY855346 | Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome | 31152-31187 | 3 | 0.917 |
CP012309_7 | 7.11|1311946|36|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1311946-1311981 | 36 | NC_007917 | Clostridium phage phi CD119, complete genome | 31152-31187 | 3 | 0.917 |
CP012309_11 | 11.1|1875738|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1875738-1875774 | 37 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 39661-39697 | 3 | 0.919 |
CP012309_13 | 13.1|2240429|30|CP012309|CRT | 2240429-2240458 | 30 | NZ_CP014419 | Staphylococcus aureus strain USA300-SUR15 plasmid pUSA08-1-SUR15, complete sequence | 14287-14316 | 3 | 0.9 |
CP012309_13 | 13.20|2241673|38|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2241673-2241710 | 38 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 26150-26187 | 3 | 0.921 |
CP012309_13 | 13.20|2241673|38|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2241673-2241710 | 38 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 30665-30702 | 3 | 0.921 |
CP012309_16 | 16.2|2847452|23|CP012309|PILER-CR | 2847452-2847474 | 23 | KJ489400 | Bacillus phage Hoody T, complete genome | 75255-75277 | 3 | 0.87 |
CP012309_16 | 16.2|2847452|23|CP012309|PILER-CR | 2847452-2847474 | 23 | MK215646 | Bacillus phage vB_BthM-Goe5, complete genome | 74409-74431 | 3 | 0.87 |
CP012309_16 | 16.2|2847452|23|CP012309|PILER-CR | 2847452-2847474 | 23 | KU737346 | Bacillus phage Vinny, complete genome | 75774-75796 | 3 | 0.87 |
CP012309_16 | 16.2|2847452|23|CP012309|PILER-CR | 2847452-2847474 | 23 | NC_024207 | Bacillus phage Evoli, complete genome | 75169-75191 | 3 | 0.87 |
CP012309_16 | 16.2|2847452|23|CP012309|PILER-CR | 2847452-2847474 | 23 | MF498901 | Bacillus phage Anthony, complete genome | 76003-76025 | 3 | 0.87 |
CP012309_21 | 21.5|3363175|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3363175-3363211 | 37 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 10259-10295 | 5 | 0.865 |
CP012309_3 | 3.1|146735|29|CP012309|CRISPRCasFinder | 146735-146763 | 29 | KY971610 | Pseudomonas phage PspYZU05, complete genome | 134239-134267 | 6 | 0.793 |
CP012309_8 | 8.13|1524720|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1524720-1524757 | 38 | AY855346 | Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome | 49365-49402 | 6 | 0.842 |
CP012309_8 | 8.13|1524720|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1524720-1524757 | 38 | NC_007917 | Clostridium phage phi CD119, complete genome | 49365-49402 | 6 | 0.842 |
CP012309_8 | 8.13|1524720|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1524720-1524757 | 38 | NC_028996 | Clostridium phage phiCDHM19, complete genome | 50570-50607 | 6 | 0.842 |
CP012309_8 | 8.30|1525846|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1525846-1525883 | 38 | AY855346 | Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome | 49365-49402 | 6 | 0.842 |
CP012309_8 | 8.30|1525846|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1525846-1525883 | 38 | NC_007917 | Clostridium phage phi CD119, complete genome | 49365-49402 | 6 | 0.842 |
CP012309_8 | 8.30|1525846|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1525846-1525883 | 38 | NC_028996 | Clostridium phage phiCDHM19, complete genome | 50570-50607 | 6 | 0.842 |
CP012309_9 | 9.9|1638036|38|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT | 1638036-1638073 | 38 | NC_008226 | Clostridioides difficile 630 plasmid pCD630, complete sequence | 425-462 | 7 | 0.816 |
CP012309_9 | 9.9|1638036|38|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT | 1638036-1638073 | 38 | NZ_CP016319 | Clostridioides difficile strain 630 delta erm plasmid pCD630, complete sequence | 3327-3364 | 7 | 0.816 |
CP012309_9 | 9.9|1638036|38|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT | 1638036-1638073 | 38 | NZ_MG266000 | Clostridioides difficile strain 7032985 plasmid pCD-ISS1, complete sequence | 431-468 | 7 | 0.816 |
CP012309_13 | 13.1|2240429|30|CP012309|CRT | 2240429-2240458 | 30 | NZ_CP053971 | Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_796 plasmid unnamed3, complete sequence | 12400-12429 | 7 | 0.767 |
CP012309_13 | 13.1|2240429|30|CP012309|CRT | 2240429-2240458 | 30 | NZ_CP013278 | Bacillus thuringiensis serovar israelensis strain AM65-52 plasmid pAM65-52-3-235K, complete sequence | 63046-63075 | 7 | 0.767 |
CP012309_13 | 13.1|2240429|30|CP012309|CRT | 2240429-2240458 | 30 | NC_018509 | Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid pBTHD789-2, complete sequence | 56930-56959 | 7 | 0.767 |
CP012309_13 | 13.1|2240429|30|CP012309|CRT | 2240429-2240458 | 30 | NZ_CP039724 | Bacillus thuringiensis strain BT-59 plasmid p3, complete sequence | 70259-70288 | 7 | 0.767 |
CP012309_13 | 13.1|2240429|30|CP012309|CRT | 2240429-2240458 | 30 | NZ_CP051859 | Bacillus thuringiensis serovar israelensis strain BGSC 4Q7rifR plasmid pBtic235, complete sequence | 169574-169603 | 7 | 0.767 |
CP012309_13 | 13.1|2240429|30|CP012309|CRT | 2240429-2240458 | 30 | NZ_CP009347 | Bacillus thuringiensis HD1002 plasmid 3, complete sequence | 208330-208359 | 7 | 0.767 |
CP012309_13 | 13.1|2240429|30|CP012309|CRT | 2240429-2240458 | 30 | NZ_CP045025 | Bacillus thuringiensis strain JW-1 plasmid p3, complete sequence | 63046-63075 | 7 | 0.767 |
CP012309_13 | 13.1|2240429|30|CP012309|CRT | 2240429-2240458 | 30 | NZ_CP007182 | Campylobacter coli RM4661 plasmid pRM4661_48kbp, complete sequence | 32133-32162 | 7 | 0.767 |
CP012309_13 | 13.1|2240429|30|CP012309|CRT | 2240429-2240458 | 30 | NC_014633 | Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence | 857478-857507 | 7 | 0.767 |
CP012309_13 | 13.1|2240429|30|CP012309|CRT | 2240429-2240458 | 30 | NZ_CP007752 | Campylobacter jejuni subsp. jejuni D42a plasmid pTet-D42a, complete sequence | 38371-38400 | 7 | 0.767 |
CP012309_13 | 13.1|2240429|30|CP012309|CRT | 2240429-2240458 | 30 | NZ_CP017026 | Campylobacter coli plasmid pCC14983A-1, complete sequence | 111425-111454 | 7 | 0.767 |
CP012309_13 | 13.1|2240429|30|CP012309|CRT | 2240429-2240458 | 30 | MN895437 | Escherichia phage teqskov, complete genome | 133992-134021 | 7 | 0.767 |
CP012309_13 | 13.1|2240429|30|CP012309|CRT | 2240429-2240458 | 30 | MN994497 | Phage NBEco003, complete genome | 117255-117284 | 7 | 0.767 |
CP012309_13 | 13.1|2240429|30|CP012309|CRT | 2240429-2240458 | 30 | KT184312 | Enterobacteria phage Kha5h, complete genome | 74684-74713 | 7 | 0.767 |
CP012309_21 | 21.23|3364353|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3364353-3364388 | 36 | NZ_CP018094 | Francisella hispaniensis FSC454 strain CCUG 58020 plasmid pFSC454, complete sequence | 5635-5670 | 7 | 0.806 |
CP012309_21 | 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3364745-3364781 | 37 | NZ_CP021787 | Acinetobacter baumannii strain A85 plasmid pA85-3, complete sequence | 52403-52439 | 7 | 0.811 |
CP012309_21 | 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3364745-3364781 | 37 | NZ_MF078634 | Acinetobacter pittii strain HGSA488 plasmid pLS488, complete sequence | 20453-20489 | 7 | 0.811 |
CP012309_21 | 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3364745-3364781 | 37 | NZ_CP039519 | Acinetobacter baumannii strain TG22653 plasmid pTG22653, complete sequence | 124139-124175 | 7 | 0.811 |
CP012309_21 | 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3364745-3364781 | 37 | NZ_CP018144 | Acinetobacter baumannii strain HRAB-85 plasmid unnamed, complete sequence | 56581-56617 | 7 | 0.811 |
CP012309_21 | 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3364745-3364781 | 37 | NZ_CP033130 | Acinetobacter wuhouensis strain WCHAW010062 plasmid pOXA23_010062, complete sequence | 105569-105605 | 7 | 0.811 |
CP012309_21 | 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3364745-3364781 | 37 | NC_025109 | Acinetobacter baumannii strain A85 plasmid pA85-3 clone GC1 AbaR4 resistance island, complete sequence | 52404-52440 | 7 | 0.811 |
CP012309_21 | 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3364745-3364781 | 37 | NZ_CP050404 | Acinetobacter baumannii strain VB2486 plasmid pVB2486_1, complete sequence | 69318-69354 | 7 | 0.811 |
CP012309_21 | 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3364745-3364781 | 37 | NZ_LT984690 | Acinetobacter baumannii isolate K50 plasmid I, complete sequence | 37976-38012 | 7 | 0.811 |
CP012309_21 | 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3364745-3364781 | 37 | NZ_CP050386 | Acinetobacter baumannii strain VB82 plasmid pVB82_1, complete sequence | 122785-122821 | 7 | 0.811 |
CP012309_21 | 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3364745-3364781 | 37 | NZ_CP008851 | Acinetobacter baumannii strain AC29 plasmid pAC29b, complete sequence | 62806-62842 | 7 | 0.811 |
CP012309_21 | 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3364745-3364781 | 37 | NZ_CP051872 | Acinetobacter baumannii strain Ab-D10a-a plasmid pAb-D10a-a_3, complete sequence | 7015-7051 | 7 | 0.811 |
CP012309_21 | 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3364745-3364781 | 37 | NZ_CP027121 | Acinetobacter baumannii strain AR_0056 plasmid unnamed2, complete sequence | 13417-13453 | 7 | 0.811 |
CP012309_21 | 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3364745-3364781 | 37 | NZ_KX118105 | Acinetobacter baumannii strain IHIT7853 plasmid IHIT7853-OXA-23, complete sequence | 20566-20602 | 7 | 0.811 |
CP012309_21 | 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3364745-3364781 | 37 | NZ_CP020594 | Acinetobacter baumannii strain USA15 plasmid pUSA15_1, complete sequence | 96829-96865 | 7 | 0.811 |
CP012309_21 | 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3364745-3364781 | 37 | NZ_CP026712 | Acinetobacter baumannii strain AR_0063 plasmid unitig_2_pilon, complete sequence | 22073-22109 | 7 | 0.811 |
CP012309_21 | 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3364745-3364781 | 37 | NZ_KM977710 | Acinetobacter baumannii strain D46 plasmid pD46-3, complete sequence | 32240-32276 | 7 | 0.811 |
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CP012309_21 | 21.32|3364944|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3364944-3364979 | 36 | NZ_CP017861 | Campylobacter jejuni strain TS1218 plasmid pCJDM218, complete sequence | 16284-16319 | 8 | 0.778 |
CP012309_21 | 21.32|3364944|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3364944-3364979 | 36 | NZ_CP048762 | Campylobacter jejuni strain ZS004 plasmid pCJFEX, complete sequence | 22918-22953 | 8 | 0.778 |
CP012309_21 | 21.32|3364944|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3364944-3364979 | 36 | NC_022354 | Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 plasmid unnamed, complete sequence | 40061-40096 | 8 | 0.778 |
CP012309_8 | 8.10|1524521|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1524521-1524557 | 37 | MH733496 | Escherichia phage PGN829.1, complete genome | 51565-51601 | 9 | 0.757 |
CP012309_8 | 8.27|1525647|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1525647-1525683 | 37 | MH733496 | Escherichia phage PGN829.1, complete genome | 51565-51601 | 9 | 0.757 |
CP012309_21 | 21.7|3363307|35|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3363307-3363341 | 35 | MK295204 | Shigella phage vB_SdyM_006, complete genome | 8425-8459 | 9 | 0.743 |
CP012309_21 | 21.23|3364353|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3364353-3364388 | 36 | NZ_CP047434 | Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-6 | 83069-83104 | 9 | 0.75 |
CP012309_21 | 21.23|3364353|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3364353-3364388 | 36 | NZ_CP047434 | Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-6 | 92393-92428 | 9 | 0.75 |
CP012309_21 | 21.23|3364353|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3364353-3364388 | 36 | X51344 | Spiroplasma phage 1-R8A2B complete genome | 5794-5829 | 9 | 0.75 |
CP012309_9 | 9.6|1637840|35|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT | 1637840-1637874 | 35 | NZ_CP033935 | Chryseobacterium balustinum strain KC_1863 plasmid unnamed, complete sequence | 25554-25588 | 10 | 0.714 |
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CP012309_14 | 14.1|2600682|36|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT | 2600682-2600717 | 36 | NZ_CP045274 | Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301B, complete sequence | 47033-47068 | 10 | 0.722 |
CP012309_14 | 14.7|2601076|35|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2601076-2601110 | 35 | NZ_CP021678 | Bacillus licheniformis strain SRCM100027 plasmid pBL027-1 sequence | 75875-75909 | 10 | 0.714 |
CP012309_21 | 21.8|3363371|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3363371-3363407 | 37 | NZ_CP009635 | Bacillus cereus 03BB108 plasmid pBFI_6, complete sequence | 7115-7151 | 11 | 0.703 |
CP012309_21 | 21.8|3363371|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3363371-3363407 | 37 | NZ_CP053967 | Bacillus cereus strain FDAARGOS_802 plasmid unnamed6, complete sequence | 1566-1602 | 11 | 0.703 |
CP012309_13 | 13.24|2241936|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2241936-2241972 | 37 | MH319723 | Marine virus AG-345-D19 Ga0172267_104 genomic sequence | 13530-13566 | 12 | 0.676 |
CP012309_21 | 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3364745-3364781 | 37 | CP035932 | Acinetobacter baumannii strain VB31459 plasmid unnamed2, complete sequence | 38934-38962 | 12 | 0.676 |
1. spacer 3.1|146735|29|CP012309|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033215 (Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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3. spacer 8.13|1524720|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681542 (Clostridium phage phiMMP03, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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4. spacer 8.13|1524720|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009231 (Clostridium phage phiC2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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5. spacer 8.13|1524720|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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6. spacer 8.13|1524720|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048642 (Clostridium phage CDKM9, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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7. spacer 8.13|1524720|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX228400 (Clostridium phage CDKM15, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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8. spacer 8.30|1525846|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681539 (Clostridium phage phiCD505, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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9. spacer 8.30|1525846|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681542 (Clostridium phage phiMMP03, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tagtcaaatattaagttttgagagggaaatctttattt CRISPR spacer tagtcaaatattaagttttgagagggaaatctttattt Protospacer **************************************
10. spacer 8.30|1525846|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009231 (Clostridium phage phiC2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tagtcaaatattaagttttgagagggaaatctttattt CRISPR spacer tagtcaaatattaagttttgagagggaaatctttattt Protospacer **************************************
11. spacer 8.30|1525846|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tagtcaaatattaagttttgagagggaaatctttattt CRISPR spacer tagtcaaatattaagttttgagagggaaatctttattt Protospacer **************************************
12. spacer 8.30|1525846|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048642 (Clostridium phage CDKM9, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tagtcaaatattaagttttgagagggaaatctttattt CRISPR spacer tagtcaaatattaagttttgagagggaaatctttattt Protospacer **************************************
13. spacer 8.30|1525846|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX228400 (Clostridium phage CDKM15, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tagtcaaatattaagttttgagagggaaatctttattt CRISPR spacer tagtcaaatattaagttttgagagggaaatctttattt Protospacer **************************************
14. spacer 9.8|1637970|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020426 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tttaaaaggtcaacttaaaggtagtaattttttaata CRISPR spacer tttaaaaggtcaacttaaaggtagtaattttttaata Protospacer *************************************
15. spacer 9.8|1637970|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP011970 (Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tttaaaaggtcaacttaaaggtagtaattttttaata CRISPR spacer tttaaaaggtcaacttaaaggtagtaattttttaata Protospacer *************************************
16. spacer 9.8|1637970|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681537 (Clostridium phage phiCD211, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tttaaaaggtcaacttaaaggtagtaattttttaata CRISPR spacer tttaaaaggtcaacttaaaggtagtaattttttaata Protospacer *************************************
17. spacer 11.2|1875804|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tctataacattactagcaaaatcaaggacttggtctt CRISPR spacer tctataacattactagcaaaatcaaggacttggtctt Protospacer *************************************
18. spacer 11.2|1875804|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tctataacattactagcaaaatcaaggacttggtctt CRISPR spacer tctataacattactagcaaaatcaaggacttggtctt Protospacer *************************************
19. spacer 11.2|1875804|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tctataacattactagcaaaatcaaggacttggtctt CRISPR spacer tctataacattactagcaaaatcaaggacttggtctt Protospacer *************************************
20. spacer 11.3|1875870|36|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tgaacttgaaagcgaagtagtcgggaatgacttttt CRISPR spacer tgaacttgaaagcgaagtagtcgggaatgacttttt Protospacer ************************************
21. spacer 11.9|1876263|36|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029155 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttatctatttcacttatattgtcgacatcccactca CRISPR spacer ttatctatttcacttatattgtcgacatcccactca Protospacer ************************************
22. spacer 11.9|1876263|36|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttatctatttcacttatattgtcgacatcccactca CRISPR spacer ttatctatttcacttatattgtcgacatcccactca Protospacer ************************************
23. spacer 11.9|1876263|36|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttatctatttcacttatattgtcgacatcccactca CRISPR spacer ttatctatttcacttatattgtcgacatcccactca Protospacer ************************************
24. spacer 11.10|1876328|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029155 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gatggtaaagtaggttctggagcagtaggaaatataa CRISPR spacer gatggtaaagtaggttctggagcagtaggaaatataa Protospacer *************************************
25. spacer 11.10|1876328|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gatggtaaagtaggttctggagcagtaggaaatataa CRISPR spacer gatggtaaagtaggttctggagcagtaggaaatataa Protospacer *************************************
26. spacer 11.10|1876328|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gatggtaaagtaggttctggagcagtaggaaatataa CRISPR spacer gatggtaaagtaggttctggagcagtaggaaatataa Protospacer *************************************
27. spacer 13.5|2240686|38|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_MF547664 (Clostridioides difficile strain LIBA-6289 plasmid LIBA6289, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tctattaggcgatttgtaatgtttttatcttcttgtga CRISPR spacer tctattaggcgatttgtaatgtttttatcttcttgtga Protospacer **************************************
28. spacer 14.6|2601009|38|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gagaactggagaaatatataattgcataaaatcagaga CRISPR spacer gagaactggagaaatatataattgcataaaatcagaga Protospacer **************************************
29. spacer 14.6|2601009|38|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gagaactggagaaatatataattgcataaaatcagaga CRISPR spacer gagaactggagaaatatataattgcataaaatcagaga Protospacer **************************************
30. spacer 14.6|2601009|38|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gagaactggagaaatatataattgcataaaatcagaga CRISPR spacer gagaactggagaaatatataattgcataaaatcagaga Protospacer **************************************
31. spacer 14.6|2601009|38|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gagaactggagaaatatataattgcataaaatcagaga CRISPR spacer gagaactggagaaatatataattgcataaaatcagaga Protospacer **************************************
32. spacer 21.7|3363307|35|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtttaatatgttaacagatttatttaacagggtaa CRISPR spacer gtttaatatgttaacagatttatttaacagggtaa Protospacer ***********************************
33. spacer 21.7|3363307|35|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtttaatatgttaacagatttatttaacagggtaa CRISPR spacer gtttaatatgttaacagatttatttaacagggtaa Protospacer ***********************************
34. spacer 21.7|3363307|35|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtttaatatgttaacagatttatttaacagggtaa CRISPR spacer gtttaatatgttaacagatttatttaacagggtaa Protospacer ***********************************
35. spacer 21.7|3363307|35|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtttaatatgttaacagatttatttaacagggtaa CRISPR spacer gtttaatatgttaacagatttatttaacagggtaa Protospacer ***********************************
36. spacer 21.14|3363764|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_MG019959 (Clostridioides difficile isolate ERR017368_NODE12 plasmid pCD-WTSI1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatctattttttgaacagataaatacaacaatttat CRISPR spacer aatctattttttgaacagataaatacaacaatttat Protospacer ************************************
37. spacer 21.14|3363764|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_MG019961 (Clostridioides difficile isolate ERR125910_NODE5 plasmid pCD-WTSI3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatctattttttgaacagataaatacaacaatttat CRISPR spacer aatctattttttgaacagataaatacaacaatttat Protospacer ************************************
38. spacer 21.14|3363764|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_MG019962 (Clostridioides difficile isolate ERR125911_NODE11 plasmid pCD-WTSI4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatctattttttgaacagataaatacaacaatttat CRISPR spacer aatctattttttgaacagataaatacaacaatttat Protospacer ************************************
39. spacer 21.14|3363764|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_MG019960 (Clostridioides difficile isolate ERR022513_NODE32 plasmid pCD-WTSI2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatctattttttgaacagataaatacaacaatttat CRISPR spacer aatctattttttgaacagataaatacaacaatttat Protospacer ************************************
40. spacer 1.1|17891|34|CP012309|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033215 (Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer aaactgaacacatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer *********.************************
41. spacer 2.1|138138|37|CP012309|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033215 (Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
actgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgctgtgc CRISPR spacer actgaacacatgtgaagtttgtttgttggcgctgtgc Protospacer *******.*****************************
42. spacer 4.1|154262|39|CP012309|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033215 (Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
agaataaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer agaataaactgaacacatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer **************.************************
43. spacer 8.3|1524059|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gttggattgatgcaaaagtttcttatacagctcttaa CRISPR spacer gttggattaatgcaaaagtttcttatacagctcttaa Protospacer ********.****************************
44. spacer 8.7|1524322|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048665 (Clostridium phage phiCDHM14, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
ttaaattcagaagaacaggaggtatttaatagtatta CRISPR spacer ttaaattcagaagaacaggagatatttaatagtatta Protospacer *********************.***************
45. spacer 8.7|1524322|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG796225 (Clostridium phage phiCDHM13 complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
ttaaattcagaagaacaggaggtatttaatagtatta CRISPR spacer ttaaattcagaagaacaggagatatttaatagtatta Protospacer *********************.***************
46. spacer 8.7|1524322|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG798901 (Clostridium phage phiCDHM11 complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
ttaaattcagaagaacaggaggtatttaatagtatta CRISPR spacer ttaaattcagaagaacaggagatatttaatagtatta Protospacer *********************.***************
47. spacer 8.20|1525185|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gttggattgatgcaaaagtttcttatacagctcttaa CRISPR spacer gttggattaatgcaaaagtttcttatacagctcttaa Protospacer ********.****************************
48. spacer 8.24|1525448|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048665 (Clostridium phage phiCDHM14, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
ttaaattcagaagaacaggaggtatttaatagtatta CRISPR spacer ttaaattcagaagaacaggagatatttaatagtatta Protospacer *********************.***************
49. spacer 8.24|1525448|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG796225 (Clostridium phage phiCDHM13 complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
ttaaattcagaagaacaggaggtatttaatagtatta CRISPR spacer ttaaattcagaagaacaggagatatttaatagtatta Protospacer *********************.***************
50. spacer 8.24|1525448|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG798901 (Clostridium phage phiCDHM11 complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
ttaaattcagaagaacaggaggtatttaatagtatta CRISPR spacer ttaaattcagaagaacaggagatatttaatagtatta Protospacer *********************.***************
51. spacer 9.8|1637970|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
tttaaaaggtcaacttaaaggtagtaattttttaata CRISPR spacer attaaaaggtcaacttaaaggtagtaattttttaata Protospacer ************************************
52. spacer 9.8|1637970|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
tttaaaaggtcaacttaaaggtagtaattttttaata CRISPR spacer attaaaaggtcaacttaaaggtagtaattttttaata Protospacer ************************************
53. spacer 9.9|1638036|38|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG019959 (Clostridioides difficile isolate ERR017368_NODE12 plasmid pCD-WTSI1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
atattatcatcatttagcaaagaatttgcgtatttttc CRISPR spacer atattatcatcatttagcaaagaatttgcgtatttttt Protospacer *************************************.
54. spacer 9.9|1638036|38|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG019961 (Clostridioides difficile isolate ERR125910_NODE5 plasmid pCD-WTSI3, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
atattatcatcatttagcaaagaatttgcgtatttttc CRISPR spacer atattatcatcatttagcaaagaatttgcgtatttttt Protospacer *************************************.
55. spacer 9.9|1638036|38|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG019962 (Clostridioides difficile isolate ERR125911_NODE11 plasmid pCD-WTSI4, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
atattatcatcatttagcaaagaatttgcgtatttttc CRISPR spacer atattatcatcatttagcaaagaatttgcgtatttttt Protospacer *************************************.
56. spacer 9.9|1638036|38|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG019960 (Clostridioides difficile isolate ERR022513_NODE32 plasmid pCD-WTSI2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
atattatcatcatttagcaaagaatttgcgtatttttc CRISPR spacer atattatcatcatttagcaaagaatttgcgtatttttt Protospacer *************************************.
57. spacer 9.13|1638301|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
cttgtcaagtatcgccctgtcagctgattccatatta CRISPR spacer cttgtcaagtatcgccctgtcagctgattctatatta Protospacer ******************************.******
58. spacer 11.7|1876131|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gaaaatcagtttttcgggattttagcttctgaggatt CRISPR spacer ggaaatcagtttttcgggattttagcttctgaggatt Protospacer *.***********************************
59. spacer 11.7|1876131|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gaaaatcagtttttcgggattttagcttctgaggatt CRISPR spacer ggaaatcagtttttcgggattttagcttctgaggatt Protospacer *.***********************************
60. spacer 11.7|1876131|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681542 (Clostridium phage phiMMP03, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gaaaatcagtttttcgggattttagcttctgaggatt CRISPR spacer ggaaatcagtttttcgggattttagcttctgaggatt Protospacer *.***********************************
61. spacer 11.7|1876131|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009231 (Clostridium phage phiC2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gaaaatcagtttttcgggattttagcttctgaggatt CRISPR spacer ggaaatcagtttttcgggattttagcttctgaggatt Protospacer *.***********************************
62. spacer 11.7|1876131|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gaaaatcagtttttcgggattttagcttctgaggatt CRISPR spacer ggaaatcagtttttcgggattttagcttctgaggatt Protospacer *.***********************************
63. spacer 11.7|1876131|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681541 (Clostridium phage phiMMP01, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gaaaatcagtttttcgggattttagcttctgaggatt CRISPR spacer ggaaatcagtttttcgggattttagcttctgaggatt Protospacer *.***********************************
64. spacer 11.7|1876131|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX228400 (Clostridium phage CDKM15, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gaaaatcagtttttcgggattttagcttctgaggatt CRISPR spacer ggaaatcagtttttcgggattttagcttctgaggatt Protospacer *.***********************************
65. spacer 11.8|1876197|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gggcaacagaaacattaccaaaaataataaatagcat CRISPR spacer gggcaacagaaacattaccagaaataataaatagcat Protospacer ********************.****************
66. spacer 11.8|1876197|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gggcaacagaaacattaccaaaaataataaatagcat CRISPR spacer gggcaacagaaacattaccagaaataataaatagcat Protospacer ********************.****************
67. spacer 11.8|1876197|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gggcaacagaaacattaccaaaaataataaatagcat CRISPR spacer gggcaacagaaacattaccagaaataataaatagcat Protospacer ********************.****************
68. spacer 13.7|2240820|38|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020426 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
ctacactctttaatattccaataaatccatagtactca CRISPR spacer ttacactctttaatattccaataaatccatagtactca Protospacer .*************************************
69. spacer 13.7|2240820|38|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to CP011970 (Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
ctacactctttaatattccaataaatccatagtactca CRISPR spacer ttacactctttaatattccaataaatccatagtactca Protospacer .*************************************
70. spacer 13.7|2240820|38|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to LN681537 (Clostridium phage phiCD211, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
ctacactctttaatattccaataaatccatagtactca CRISPR spacer ttacactctttaatattccaataaatccatagtactca Protospacer .*************************************
71. spacer 13.18|2241544|35|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ttagcaagag-aaagcaatctgtgttcaaaaaagag CRISPR spacer -tagcaagagaaaagcaatctgtgttcaaaaaagag Protospacer ********* *************************
72. spacer 13.20|2241673|38|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
tgatgaagtatggataattttttacttaatgtattatc CRISPR spacer tgatgaagtatggataattttttacttaatgtattagc Protospacer ************************************ *
73. spacer 13.20|2241673|38|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
tgatgaagtatggataattttttacttaatgtattatc CRISPR spacer tgatgaagtatggataattttttacttaatgtattagc Protospacer ************************************ *
74. spacer 13.20|2241673|38|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
tgatgaagtatggataattttttacttaatgtattatc CRISPR spacer tgatgaagtatggataattttttacttaatgtattagc Protospacer ************************************ *
75. spacer 14.6|2601009|38|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
gagaactggagaaatatataattgcataaaatcagaga CRISPR spacer gagaactggagaaatatataattgcataaaatcagagg Protospacer *************************************.
76. spacer 21.7|3363307|35|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gtttaatatgttaacagatttatttaacagggtaa CRISPR spacer gtttaatatgttaacagatttatttaacagagtaa Protospacer ******************************.****
77. spacer 7.11|1311946|36|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
aacaaaaaagatacatctgtaactaatttttatact CRISPR spacer agtaaaaaagatacatctgtaactaatttttatact Protospacer *..*********************************
78. spacer 9.10|1638103|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
tttaaaataaaatatatttgcctaccatcaactgaag CRISPR spacer tttaaaataaaatatatttgtctaccatcaaccgaag Protospacer ********************.***********.****
79. spacer 9.16|1638497|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG973074 (Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
agcaattctgatatttttattctaatcatttgaaatc CRISPR spacer agcaattctgatatttttattctgatcatttaaaatc Protospacer ***********************.*******.*****
80. spacer 9.17|1638563|38|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG973074 (Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
ccatcttttgttgctttacataaatttatattacttac CRISPR spacer ccatcttttgttgctttgcatagatttatattacttac Protospacer *****************.****.***************
81. spacer 11.2|1875804|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
tctataacattactagcaaaatcaaggacttggtctt CRISPR spacer tctataacgttaccagcaaaatcaaggacttggtctt Protospacer ********.****.***********************
82. spacer 11.3|1875870|36|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
tgaacttgaaagcgaagtagtcgggaatgacttttt CRISPR spacer tgaacttgaaagtgaagtggtcgggaatgacttttt Protospacer ************.*****.*****************
83. spacer 11.8|1876197|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
gggcaacagaaacattaccaaaaataataaatagcat CRISPR spacer gggcaacagagacattaccagaaataataaatagcat Protospacer **********.*********.****************
84. spacer 12.1|2189113|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
ttaagactagcagactcataagcaattagttgcctct CRISPR spacer ttaagaccagcagactcataagcaattagttgtctct Protospacer *******.************************.****
85. spacer 12.1|2189113|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
ttaagactagcagactcataagcaattagttgcctct CRISPR spacer ttaagaccagcagactcataagcaattagttgtctct Protospacer *******.************************.****
86. spacer 12.1|2189113|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT matches to LN680008 (Clostridium phage phiCDHS1 gp04 gene for putative capsid protein) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
ttaagactagcagactcataagcaattagttgcctct CRISPR spacer ttaagaccagcagactcataagcaattagttgtctct Protospacer *******.************************.****
87. spacer 12.1|2189113|37|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
ttaagactagcagactcataagcaattagttgcctct CRISPR spacer ttaagaccagcagactcataagcaattagttgtctct Protospacer *******.************************.****
88. spacer 12.5|2189114|37|CP012309|PILER-CR matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
ttaagactagcagactcataagcaattagttgcctct CRISPR spacer ttaagaccagcagactcataagcaattagttgtctct Protospacer *******.************************.****
89. spacer 12.5|2189114|37|CP012309|PILER-CR matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
ttaagactagcagactcataagcaattagttgcctct CRISPR spacer ttaagaccagcagactcataagcaattagttgtctct Protospacer *******.************************.****
90. spacer 12.5|2189114|37|CP012309|PILER-CR matches to LN680008 (Clostridium phage phiCDHS1 gp04 gene for putative capsid protein) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
ttaagactagcagactcataagcaattagttgcctct CRISPR spacer ttaagaccagcagactcataagcaattagttgtctct Protospacer *******.************************.****
91. spacer 12.5|2189114|37|CP012309|PILER-CR matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
ttaagactagcagactcataagcaattagttgcctct CRISPR spacer ttaagaccagcagactcataagcaattagttgtctct Protospacer *******.************************.****
92. spacer 13.7|2240820|38|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
ctacactctttaatattccaataaatccatagtactca CRISPR spacer ttacactctttaatataccaataaatccatagtactca Protospacer .*************** *********************
93. spacer 13.7|2240820|38|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
ctacactctttaatattccaataaatccatagtactca CRISPR spacer ttacactctttaatataccaataaatccatagtactca Protospacer .*************** *********************
94. spacer 14.1|2600682|36|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG973074 (Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
acaattattaattgttttattagtgaaatcacagca CRISPR spacer acaattattaattgttttattaataaaatcacagca Protospacer **********************.*.***********
95. spacer 7.11|1311946|36|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
aacaaaaaagatacatctgtaactaatttttatact CRISPR spacer agtaaaaaagatacatctgtaactattttttatact Protospacer *..********************** **********
96. spacer 7.11|1311946|36|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
aacaaaaaagatacatctgtaactaatttttatact CRISPR spacer agtaaaaaagatacatctgtaactattttttatact Protospacer *..********************** **********
97. spacer 11.1|1875738|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
ttttataaaaggtctagcaaataattgttagactttt CRISPR spacer ccttataaaaggtctagcaaataattgttagaccttt Protospacer ..*******************************.***
98. spacer 13.1|2240429|30|CP012309|CRT matches to NZ_CP014419 (Staphylococcus aureus strain USA300-SUR15 plasmid pUSA08-1-SUR15, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
tgactcaatctttatttaataagaaaaaac CRISPR spacer taaatcaatctttatttaataacaaaaaac Protospacer *.* ****************** *******
99. spacer 13.20|2241673|38|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
tgatgaagtatggataattttttacttaatgtattatc CRISPR spacer tgatgaagtatggataattttttacttaatatactagc Protospacer ******************************.**.** *
100. spacer 13.20|2241673|38|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
tgatgaagtatggataattttttacttaatgtattatc CRISPR spacer tgatgaagtatggataattttttacttaacatattagc Protospacer *****************************..***** *
101. spacer 16.2|2847452|23|CP012309|PILER-CR matches to KJ489400 (Bacillus phage Hoody T, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
agtagatttatcaagataagaag CRISPR spacer tttagatttatcaaaataagaag Protospacer ************.********
102. spacer 16.2|2847452|23|CP012309|PILER-CR matches to MK215646 (Bacillus phage vB_BthM-Goe5, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
agtagatttatcaagataagaag CRISPR spacer tttagatttatcaaaataagaag Protospacer ************.********
103. spacer 16.2|2847452|23|CP012309|PILER-CR matches to KU737346 (Bacillus phage Vinny, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
agtagatttatcaagataagaag CRISPR spacer tttagatttatcaaaataagaag Protospacer ************.********
104. spacer 16.2|2847452|23|CP012309|PILER-CR matches to NC_024207 (Bacillus phage Evoli, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
agtagatttatcaagataagaag CRISPR spacer tttagatttatcaaaataagaag Protospacer ************.********
105. spacer 16.2|2847452|23|CP012309|PILER-CR matches to MF498901 (Bacillus phage Anthony, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
agtagatttatcaagataagaag CRISPR spacer tttagatttatcaaaataagaag Protospacer ************.********
106. spacer 21.5|3363175|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.865
caggattagcagcagcgctcggacccgttttacttat CRISPR spacer caggattagcagcagcgctcggacctgttcttttaat Protospacer *************************.***.* .* **
107. spacer 3.1|146735|29|CP012309|CRISPRCasFinder matches to KY971610 (Pseudomonas phage PspYZU05, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tgtaataagttaaagcaatatgaatcaac CRISPR spacer tacgataagttacagcaatacgaatcatc Protospacer *...******** *******.****** *
108. spacer 8.13|1524720|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.842
tagtcaaatattaagttttgagagggaaatctttattt CRISPR spacer ctagcaattatttagttttgagagggaaatctttattt Protospacer . . *** **** *************************
109. spacer 8.13|1524720|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.842
tagtcaaatattaagttttgagagggaaatctttattt CRISPR spacer ctagcaattatttagttttgagagggaaatctttattt Protospacer . . *** **** *************************
110. spacer 8.13|1524720|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.842
tagtcaaatattaagttttgagagggaaatctttattt CRISPR spacer ctagcaattatttagttttgagagggaaatctttattt Protospacer . . *** **** *************************
111. spacer 8.30|1525846|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.842
tagtcaaatattaagttttgagagggaaatctttattt CRISPR spacer ctagcaattatttagttttgagagggaaatctttattt Protospacer . . *** **** *************************
112. spacer 8.30|1525846|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.842
tagtcaaatattaagttttgagagggaaatctttattt CRISPR spacer ctagcaattatttagttttgagagggaaatctttattt Protospacer . . *** **** *************************
113. spacer 8.30|1525846|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.842
tagtcaaatattaagttttgagagggaaatctttattt CRISPR spacer ctagcaattatttagttttgagagggaaatctttattt Protospacer . . *** **** *************************
114. spacer 9.9|1638036|38|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_008226 (Clostridioides difficile 630 plasmid pCD630, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.816
atattatcatcatttagcaaagaatttgcgtatttttc CRISPR spacer atattatcatcatttagcaaagaatttaacaaaatatc Protospacer ***************************. * * **
115. spacer 9.9|1638036|38|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016319 (Clostridioides difficile strain 630 delta erm plasmid pCD630, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.816
atattatcatcatttagcaaagaatttgcgtatttttc CRISPR spacer atattatcatcatttagcaaagaatttaacaaaatatc Protospacer ***************************. * * **
116. spacer 9.9|1638036|38|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG266000 (Clostridioides difficile strain 7032985 plasmid pCD-ISS1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.816
atattatcatcatttagcaaagaatttgcgtatttttc CRISPR spacer atattatcatcatttagcaaagaatttaacaaaatatc Protospacer ***************************. * * **
117. spacer 13.1|2240429|30|CP012309|CRT matches to NZ_CP053971 (Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_796 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgactcaatctttatttaataagaaaaaac CRISPR spacer tccatcaatctttattaagtaagaaaaaga Protospacer * ************ *.*********.
118. spacer 13.1|2240429|30|CP012309|CRT matches to NZ_CP013278 (Bacillus thuringiensis serovar israelensis strain AM65-52 plasmid pAM65-52-3-235K, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgactcaatctttatttaataagaaaaaac CRISPR spacer tccatcaatctttattaagtaagaaaaaga Protospacer * ************ *.*********.
119. spacer 13.1|2240429|30|CP012309|CRT matches to NC_018509 (Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid pBTHD789-2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgactcaatctttatttaataagaaaaaac CRISPR spacer tccatcaatctttattaagtaagaaaaaga Protospacer * ************ *.*********.
120. spacer 13.1|2240429|30|CP012309|CRT matches to NZ_CP039724 (Bacillus thuringiensis strain BT-59 plasmid p3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgactcaatctttatttaataagaaaaaac CRISPR spacer tccatcaatctttattaagtaagaaaaaga Protospacer * ************ *.*********.
121. spacer 13.1|2240429|30|CP012309|CRT matches to NZ_CP051859 (Bacillus thuringiensis serovar israelensis strain BGSC 4Q7rifR plasmid pBtic235, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgactcaatctttatttaataagaaaaaac CRISPR spacer tccatcaatctttattaagtaagaaaaaga Protospacer * ************ *.*********.
122. spacer 13.1|2240429|30|CP012309|CRT matches to NZ_CP009347 (Bacillus thuringiensis HD1002 plasmid 3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgactcaatctttatttaataagaaaaaac CRISPR spacer tccatcaatctttattaagtaagaaaaaga Protospacer * ************ *.*********.
123. spacer 13.1|2240429|30|CP012309|CRT matches to NZ_CP045025 (Bacillus thuringiensis strain JW-1 plasmid p3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgactcaatctttatttaataagaaaaaac CRISPR spacer tccatcaatctttattaagtaagaaaaaga Protospacer * ************ *.*********.
124. spacer 13.1|2240429|30|CP012309|CRT matches to NZ_CP007182 (Campylobacter coli RM4661 plasmid pRM4661_48kbp, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgactcaatctttatttaataagaaaaaac CRISPR spacer ttatttttactttatttaaaaagaaaaaac Protospacer * *.*. ********** **********
125. spacer 13.1|2240429|30|CP012309|CRT matches to NC_014633 (Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgactcaatctttatttaataagaaaaaac CRISPR spacer taagataatctttattaaatcagaaaaaaa Protospacer *.* .********** *** ********
126. spacer 13.1|2240429|30|CP012309|CRT matches to NZ_CP007752 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni D42a plasmid pTet-D42a, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgactcaatctttatttaataagaaaaaac CRISPR spacer ttatttttactttatttaaaaagaaaaaac Protospacer * *.*. ********** **********
127. spacer 13.1|2240429|30|CP012309|CRT matches to NZ_CP017026 (Campylobacter coli plasmid pCC14983A-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgactcaatctttatttaataagaaaaaac CRISPR spacer ttatttttactttatttaaaaagaaaaaac Protospacer * *.*. ********** **********
128. spacer 13.1|2240429|30|CP012309|CRT matches to MN895437 (Escherichia phage teqskov, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgactcaatctttatttaataagaaaaaac CRISPR spacer taattaaatctttagttaataagaaaatga Protospacer *.*.* ******** ************ .
129. spacer 13.1|2240429|30|CP012309|CRT matches to MN994497 (Phage NBEco003, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgactcaatctttatttaataagaaaaaac CRISPR spacer taattaaatctttagttaataagaaaatga Protospacer *.*.* ******** ************ .
130. spacer 13.1|2240429|30|CP012309|CRT matches to KT184312 (Enterobacteria phage Kha5h, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgactcaatctttatttaataagaaaaaac CRISPR spacer taattaaatctttagttaataagaaaatga Protospacer *.*.* ******** ************ .
131. spacer 21.23|3364353|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018094 (Francisella hispaniensis FSC454 strain CCUG 58020 plasmid pFSC454, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
actttaataattaaaatgatatttttaaactaactt CRISPR spacer cctttaataattaaattaatatttttaaatttaaat Protospacer ************** *.***********.* * *
132. spacer 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021787 (Acinetobacter baumannii strain A85 plasmid pA85-3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
agtattcacacagataagaaaattaatcta-ataatag CRISPR spacer gttattcaaacagataaaaaaattaatctatatggta- Protospacer . ****** ********.************ **..**
133. spacer 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_MF078634 (Acinetobacter pittii strain HGSA488 plasmid pLS488, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
agtattcacacagataagaaaattaatcta-ataatag CRISPR spacer gttattcaaacagataaaaaaattaatctatatggta- Protospacer . ****** ********.************ **..**
134. spacer 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039519 (Acinetobacter baumannii strain TG22653 plasmid pTG22653, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
agtattcacacagataagaaaattaatcta-ataatag CRISPR spacer gttattcaaacagataaaaaaattaatctatatggta- Protospacer . ****** ********.************ **..**
135. spacer 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018144 (Acinetobacter baumannii strain HRAB-85 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
agtattcacacagataagaaaattaatcta-ataatag CRISPR spacer gttattcaaacagataaaaaaattaatctatatggta- Protospacer . ****** ********.************ **..**
136. spacer 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033130 (Acinetobacter wuhouensis strain WCHAW010062 plasmid pOXA23_010062, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
agtattcacacagataagaaaattaatcta-ataatag CRISPR spacer gttattcaaacagataaaaaaattaatctatatggta- Protospacer . ****** ********.************ **..**
137. spacer 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_025109 (Acinetobacter baumannii strain A85 plasmid pA85-3 clone GC1 AbaR4 resistance island, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
agtattcacacagataagaaaattaatcta-ataatag CRISPR spacer gttattcaaacagataaaaaaattaatctatatggta- Protospacer . ****** ********.************ **..**
138. spacer 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050404 (Acinetobacter baumannii strain VB2486 plasmid pVB2486_1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
agtattcacacagataagaaaattaatcta-ataatag CRISPR spacer gttattcaaacagataaaaaaattaatctatatggta- Protospacer . ****** ********.************ **..**
139. spacer 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_LT984690 (Acinetobacter baumannii isolate K50 plasmid I, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
agtattcacacagataagaaaattaatcta-ataatag CRISPR spacer gttattcaaacagataaaaaaattaatctatatggta- Protospacer . ****** ********.************ **..**
140. spacer 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050386 (Acinetobacter baumannii strain VB82 plasmid pVB82_1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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141. spacer 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP008851 (Acinetobacter baumannii strain AC29 plasmid pAC29b, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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142. spacer 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP051872 (Acinetobacter baumannii strain Ab-D10a-a plasmid pAb-D10a-a_3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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143. spacer 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP027121 (Acinetobacter baumannii strain AR_0056 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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144. spacer 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_KX118105 (Acinetobacter baumannii strain IHIT7853 plasmid IHIT7853-OXA-23, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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145. spacer 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020594 (Acinetobacter baumannii strain USA15 plasmid pUSA15_1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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146. spacer 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026712 (Acinetobacter baumannii strain AR_0063 plasmid unitig_2_pilon, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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147. spacer 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_KM977710 (Acinetobacter baumannii strain D46 plasmid pD46-3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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148. spacer 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026706 (Acinetobacter baumannii strain AR_0056 plasmid tig00000059_pilon, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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149. spacer 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP037425 (Acinetobacter johnsonii strain M19 plasmid pFM-M19, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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150. spacer 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_MG954378 (Acinetobacter baumannii strain SGH0905 plasmid pS32-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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151. spacer 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_MG954377 (Acinetobacter baumannii strain SGH9601 plasmid pS21-2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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152. spacer 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035052 (Acinetobacter baumannii strain ABUH763 plasmid p74.1Kbp, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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153. spacer 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012008 (Acinetobacter baumannii strain Ab04-mff plasmid pAB04-2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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154. spacer 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016302 (Acinetobacter baumannii strain CMC-CR-MDR-Ab66 plasmid pCMCVTAb2-Ab66, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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155. spacer 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016297 (Acinetobacter baumannii strain CMC-CR-MDR-Ab4 plasmid pCMCVTAb2-Ab4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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156. spacer 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_017848 (Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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157. spacer 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_KM922672 (Acinetobacter baumannii strain A221 plasmid pAZJ221, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
agtattcacacagataagaaaattaatcta-ataatag CRISPR spacer gttattcaaacagataaaaaaattaatctatatggta- Protospacer . ****** ********.************ **..**
158. spacer 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_MK941846 (Proteus mirabilis strain PM1157 plasmid pOXA-23, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
agtattcacacagataagaaaattaatcta-ataatag CRISPR spacer gttattcaaacagataaaaaaattaatctatatggta- Protospacer . ****** ********.************ **..**
159. spacer 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024578 (Acinetobacter baumannii strain AbPK1 plasmid pAbPK1b, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
agtattcacacagataagaaaattaatcta-ataatag CRISPR spacer gttattcaaacagataaaaaaattaatctatatggta- Protospacer . ****** ********.************ **..**
160. spacer 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035047 (Acinetobacter baumannii strain ABUH793 plasmid p74.1Kbp, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
agtattcacacagataagaaaattaatcta-ataatag CRISPR spacer gttattcaaacagataaaaaaattaatctatatggta- Protospacer . ****** ********.************ **..**
161. spacer 8.13|1524720|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG531805 (Clostridium phage CDMH1 complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.789
tagtcaaatattaagttttgagagggaaatctttattt CRISPR spacer ctaatatatatttaattttgagagggaaatctttattt Protospacer . . .* ***** *.***********************
162. spacer 8.30|1525846|38|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG531805 (Clostridium phage CDMH1 complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.789
tagtcaaatattaagttttgagagggaaatctttattt CRISPR spacer ctaatatatatttaattttgagagggaaatctttattt Protospacer . . .* ***** *.***********************
163. spacer 9.3|1637644|35|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693101 (Marine virus AFVG_25M559, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tcagaatataatgaacttgaagtaaataagttcat----- CRISPR spacer ccagaaaataatgaaattgaagtaaa-----tcatggaaa Protospacer .***** ******** ********** ****
164. spacer 13.1|2240429|30|CP012309|CRT matches to NC_011246 (Borrelia recurrentis A1 plasmid pl124, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgactcaatctttatttaataagaaaaaac CRISPR spacer cttatcaatcttaatttcataagaaaaatt Protospacer . ******** **** ********** .
165. spacer 13.1|2240429|30|CP012309|CRT matches to NC_011247 (Borrelia duttonii Ly plasmid pl165, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgactcaatctttatttaataagaaaaaac CRISPR spacer cttatcaatcttaatttcataagaaaaatt Protospacer . ******** **** ********** .
166. spacer 13.1|2240429|30|CP012309|CRT matches to NZ_CP028890 (Borrelia turcica IST7 plasmid lp34, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgactcaatctttatttaataagaaaaaac CRISPR spacer aggtcttatctttatttaaaaagaaaaaaa Protospacer *.... ************ *********
167. spacer 13.1|2240429|30|CP012309|CRT matches to NZ_CP017832 (Butyrivibrio hungatei strain MB2003 plasmid pNP144, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgactcaatctttatttaataagaaaaaac CRISPR spacer aaaagaaatctatatttaataagaagaaag Protospacer .* ***** *************.***
168. spacer 13.16|2241413|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MN693089 (Marine virus AFVG_25M562, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
tatgttgtaaaatcaaagaagctgattgtacaaggt CRISPR spacer tgtctggtaaaatgaaagaagctgatggtacagtgg Protospacer *.* * ******* ************ *****. *
169. spacer 21.23|3364353|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP047434 (Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-6) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
acttta---ataattaaaatgatatttttaaactaactt CRISPR spacer ---ttaaatataattaaattgatatttttacactatatc Protospacer *** ********* *********** **** *.
170. spacer 21.32|3364944|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_006134 (Campylobacter coli plasmid pCC31, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
taacttctataatattacccatctcttttaatctaa CRISPR spacer actcctatataattttatccatctcttttaatctca Protospacer *.* ****** ***.**************** *
171. spacer 21.32|3364944|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017869 (Campylobacter coli strain MG1116 plasmid pCCDM116L, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
taacttctataatattacccatctcttttaatctaa CRISPR spacer actcctatataattttatccatctcttttaatctca Protospacer *.* ****** ***.**************** *
172. spacer 21.32|3364944|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044166 (Campylobacter coli strain AR-0416 plasmid pAR-0416) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
taacttctataatattacccatctcttttaatctaa CRISPR spacer actcctatataattttatccatctcttttaatctca Protospacer *.* ****** ***.**************** *
173. spacer 21.32|3364944|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023544 (Campylobacter jejuni strain CFSAN032806 plasmid pCFSAN032806, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
taacttctataatattacccatctcttttaatctaa CRISPR spacer actcctatataattttatccatctcttttaatctca Protospacer *.* ****** ***.**************** *
174. spacer 21.32|3364944|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028186 (Campylobacter jejuni strain CFSAN054107 plasmid pGMI16-002, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
taacttctataatattacccatctcttttaatctaa CRISPR spacer actcctatataattttatccatctcttttaatctca Protospacer *.* ****** ***.**************** *
175. spacer 21.32|3364944|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017416 (Campylobacter jejuni strain MTVDSCj07 plasmid pMTVDSCj07-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
taacttctataatattacccatctcttttaatctaa CRISPR spacer actcctatataattttatccatctcttttaatctca Protospacer *.* ****** ***.**************** *
176. spacer 21.32|3364944|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017872 (Campylobacter coli strain BP3183 plasmid pCCDM183, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
taacttctataatattacccatctcttttaatctaa CRISPR spacer actcctatataattttatccatctcttttaatctca Protospacer *.* ****** ***.**************** *
177. spacer 21.32|3364944|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020775 (Campylobacter jejuni strain YH002 plasmid pCJP002, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
taacttctataatattacccatctcttttaatctaa CRISPR spacer actcctatataattttatccatctcttttaatctca Protospacer *.* ****** ***.**************** *
178. spacer 21.32|3364944|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_022355 (Campylobacter coli CVM N29710 plasmid pN29710-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
taacttctataatattacccatctcttttaatctaa CRISPR spacer actcctatataattttatccatctcttttaatctca Protospacer *.* ****** ***.**************** *
179. spacer 21.32|3364944|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP045793 (Campylobacter coli strain CFSAN032805 plasmid p1CFSAN032805, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
taacttctataatattacccatctcttttaatctaa CRISPR spacer actcctatataattttatccatctcttttaatctca Protospacer *.* ****** ***.**************** *
180. spacer 21.32|3364944|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_017282 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni S3 plasmid pTet, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
taacttctataatattacccatctcttttaatctaa CRISPR spacer actcctatataattttatccatctcttttaatctca Protospacer *.* ****** ***.**************** *
181. spacer 21.32|3364944|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023546 (Campylobacter coli strain CFSAN032805 plasmid pCFSAN032805_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
taacttctataatattacccatctcttttaatctaa CRISPR spacer actcctatataattttatccatctcttttaatctca Protospacer *.* ****** ***.**************** *
182. spacer 21.32|3364944|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011017 (Campylobacter coli strain FB1 plasmid pFB1TET, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
taacttctataatattacccatctcttttaatctaa CRISPR spacer actcctatataattttatccatctcttttaatctca Protospacer *.* ****** ***.**************** *
183. spacer 21.32|3364944|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017030 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni strain 14980A plasmid pCJ14980A, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
taacttctataatattacccatctcttttaatctaa CRISPR spacer actcctatataattttatccatctcttttaatctca Protospacer *.* ****** ***.**************** *
184. spacer 21.32|3364944|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044168 (Campylobacter jejuni strain AR-0415 plasmid pAR-0415, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
taacttctataatattacccatctcttttaatctaa CRISPR spacer actcctatataattttatccatctcttttaatctca Protospacer *.* ****** ***.**************** *
185. spacer 21.32|3364944|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017861 (Campylobacter jejuni strain TS1218 plasmid pCJDM218, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
taacttctataatattacccatctcttttaatctaa CRISPR spacer actcctatataattttatccatctcttttaatctca Protospacer *.* ****** ***.**************** *
186. spacer 21.32|3364944|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048762 (Campylobacter jejuni strain ZS004 plasmid pCJFEX, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
taacttctataatattacccatctcttttaatctaa CRISPR spacer actcctatataattttatccatctcttttaatctca Protospacer *.* ****** ***.**************** *
187. spacer 21.32|3364944|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_022354 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
taacttctataatattacccatctcttttaatctaa CRISPR spacer actcctatataattttatccatctcttttaatctca Protospacer *.* ****** ***.**************** *
188. spacer 8.10|1524521|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH733496 (Escherichia phage PGN829.1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
gttcctgctcctgttcctgtaccgggttgattacctg CRISPR spacer gaccattctcctgttcctgtaactggttgattacacc Protospacer * .* * ************** * ********** .
189. spacer 8.27|1525647|37|CP012309|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH733496 (Escherichia phage PGN829.1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
gttcctgctcctgttcctgtaccgggttgattacctg CRISPR spacer gaccattctcctgttcctgtaactggttgattacacc Protospacer * .* * ************** * ********** .
190. spacer 21.7|3363307|35|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MK295204 (Shigella phage vB_SdyM_006, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
gtttaatatgttaacagatttatttaacagggtaa CRISPR spacer gtttaatttgtcaacagatttatttgtgtatgcaa Protospacer ******* ***.*************. . *.**
191. spacer 21.23|3364353|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP047434 (Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-6) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
acttta---ataattaaaatgatatttttaaactaactt CRISPR spacer ---ttaaatataattaaattgatatttttacactataca Protospacer *** ********* *********** **** .
192. spacer 21.23|3364353|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP047434 (Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-6) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
acttta---ataattaaaatgatatttttaaactaactt CRISPR spacer ---ttaaatataattaaattgatatttttacactataca Protospacer *** ********* *********** **** .
193. spacer 21.23|3364353|36|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to X51344 (Spiroplasma phage 1-R8A2B complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
acttta---ataattaaaatgatatttttaaactaactt CRISPR spacer ---ttaaatataattaaattgatatttttacactataca Protospacer *** ********* *********** **** .
194. spacer 9.6|1637840|35|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP033935 (Chryseobacterium balustinum strain KC_1863 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
atacttggtcaatacatttcaaaagttgcaacaga CRISPR spacer caaacggaaaaataaatttgaaaagttgcaacaga Protospacer * . *. **** **** ***************
195. spacer 12.2|2189179|36|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT matches to MG945528 (UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 2156-1801, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
tttaataataaggagagaaaaaatgaatatttatga CRISPR spacer cttcggcctaaggagtgaaaaaatgaaaatttattc Protospacer .** . ******* *********** ******
196. spacer 12.6|2189180|36|CP012309|PILER-CR matches to MG945528 (UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 2156-1801, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
tttaataataaggagagaaaaaatgaatatttatga CRISPR spacer cttcggcctaaggagtgaaaaaatgaaaatttattc Protospacer .** . ******* *********** ******
197. spacer 14.1|2600682|36|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045274 (Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301B, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
acaattattaattgttttattagtgaaatcacagca CRISPR spacer tgaattcttaattgttttattagagaaatacctttt Protospacer **** **************** ***** * .
198. spacer 14.7|2601076|35|CP012309|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP021678 (Bacillus licheniformis strain SRCM100027 plasmid pBL027-1 sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
cttgtttcttctgttaattttattataccttgttt CRISPR spacer tcggttcctgctgttaattttattatactcatttg Protospacer .. ***.** ******************.. **
199. spacer 21.8|3363371|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009635 (Bacillus cereus 03BB108 plasmid pBFI_6, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
tgataacttatttaaaaataaatctaatgttgcaatt CRISPR spacer tatcaacttatttaaaagttaatctaatgtaatacca Protospacer *. .*************.* ********** ..* .
200. spacer 21.8|3363371|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053967 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_802 plasmid unnamed6, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
tgataacttatttaaaaataaatctaatgttgcaatt CRISPR spacer tatcaacttatttaaaagttaatctaatgtaatacca Protospacer *. .*************.* ********** ..* .
201. spacer 13.24|2241936|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MH319723 (Marine virus AG-345-D19 Ga0172267_104 genomic sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.676
atttgtctaatatttataataaaaaagttgttttttc CRISPR spacer tattgtcaaatatctataataaaaaagtaccaaatat Protospacer ***** *****.************** . * .
202. spacer 21.29|3364745|37|CP012309|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to CP035932 (Acinetobacter baumannii strain VB31459 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.676
agtattcacacagataagaaaattaatctaataatag CRISPR spacer gttattcaaacagataaaaaaattaatct-------- Protospacer . ****** ********.***********
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
211665 : 301741
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP012309|211665:301741|DBSCAN-SWA TATGAACAAATCATGGAGCAACTTGATTATTAAGAATAAAGACAGAAAAGTACGTTCAGGGTGGATTATTATAGCTGTTATGGCTACCTTTTACATACTTCAGTATTATTTAAGCATGACACTTGTGGAAATAATAAGAAAAATTCTGATTGCGACAGGTGATATTAATTTAAAAACAAACTATTTTTCAGAATATGCTAATTGGGTAAGTGATGTTGGGTTACAGGTTGTATTTCAAATTCTAACAGAGTCACTTACGATTATTATTCCTATAATTGTATGGAGATTTATTATGAAAAATCCTATTCGTGAAATGGGATTACATTCTTATAGAATTAAGAAAAAAGAAAGATATGTAGGAATGTTATTAGGAATATTTAATTGTACAGTAATCTTTATTATAACAATAACAATTGGTGGTGGTCATGTTACTTCATGGGTACCAAAAATTTCACCTTTAACAGTTTATTGGATACTTTTCTTTGCTTTAGTTGCTTTTGCAGAAGAAATTTTAAATCGTGGTTTTTTTATGGCAGTTTTACGAAGATGTAAAAATATTTATTTTATAATGATTGTTCCATCTGTTATTTTTGGGTTGGTTCATATATGGAATCCTGATGTTACTCTTTTATCTGTAATTAATATTATAACTATTGGGATTCTTTTTTCATATATGTTTATAAAATCGTCGAATATATGGATGTGTATAGGTTATCATTTTACATGGAATGTATTTCAGGGGATTATATATGGGATGCCTATAAGTGGACTTCAAGTTCCAAGGATTATAACTACACAAATCACTCATGGTAATCTATTAAATGGAGGGATGTTTGGTATTGAAGGTGGAATTTTGACTACTTTTGTTAATCTACTTAGCTTTATATTTGTATGGTATTACTATAGAGATTCTAAGTATGATTTTGTTAGTGATAAAGTAAATGTGACCAATATCAAGAATTAGTTGATTATAATAAATTTTAATAATATCTTCTAAGCTTAAAGTATTCTGTAGGATTGTTGGAAATTTACAAAAATATAAAAATAACTTGGATATTCTATTTACTCCAAGTTATTTTTATATTCTTTTGTAAATAGAAATGGAACATAAAAAATTAAAACAACCATAGATACTATTAGTATATCATGGTAAGTGATAGTTGATTCTTTAGAATTTGTGATAAGAAAAGCACTATTATTTAAAACATGAATTATAGCACAAAACCAGATATTCTTAGTTTTTATATAAAGATATCCTAAAAATATTGAAATTCCAACTATATGTATTGAACGTAATATTATTCCTAATATTGGCGCTTCAGGTGTATATAATGTAAATATTAGTGGTAAGTGCCACAAGCTCCAACACATACCTAATATTATAACTCCTAATTTTTTACCAAATTTATCAAAAAAAATATTCTGTAAAAAACCTCTCCAGGCATATTCTTCACTAAAAAAAATATAAATAGTAGTTAATGATGTTATTGGAGTAAATATAAATTTTATGAGACCACTATAATTAGGTTGAGCCCCTTGTAGTATTAGTATAAATGATGTTGGAACAATTACAGAAATCATAAAGTAAATAATTAATAAAGAACCTAGTTTAATATTTTTTACAGGATATAAATTTTTTTTATTTGATGAATATATTATAATTGATAAGCTACTTATAAAAGTTAATATTAGGTTTATAATTATAAATTCATTATTATTTATTAGATTTAATAACTTAAGAACAATTAATAATGAATAAATAAGAAAAAATAATATGATTAGTGAATAAAATTCATACATATCATTATTTAATCCTTCAGTATAAAACTTTGCAATAGCAACTGAAGATAGAGGTAATATCATCATGAATGATGCAAAGTTTTCTGGATCAATAAATTTATTATAATATAACAGTAAACCTAATGAATAAGTTAAACCAAAGTTTATAAAGAAAAAGATAATAATTTGTATTTTTTTTCTTTTTATTTCATTTTTAATAAATACTGGGTTTAGAATATTTATCCATATTAATTTTAAGTTCATTAATTTAATACTCCTTTACAATATAGATTCTTAACTAAATTAAAATATTTTATTGAATATTATAAATTCATGACAGTCAATATTATTGAAAAGTAACTTATAAAATTATATATAAATAATAAAATTAATTTTACTATCTACCCATATATTTAGTTATATTGCAGGCAGAATGTGGTTTAACATAACCAAAAGGACAATAAAAAATATTTTTCTATATTTTTATTATCTTTTTGTAAAAGATTTATTATTTATTGCATTAAATTAATAGGCAGTAGAGGCATAGTTGATAAAATTAATGAAGAAATTAAACTTATGAATATAAATTTATTATTGAGTTTTAATATTACATTTATTATTCTCTTTGATTTTAATATTTTATATTTAATAATTATTACATTCATCTGGTTAATAAATAATAATTAAATAAATCAAATGATTTTAATTTACTATATGATTATAATATAGCGTTGATTTTTTATGATTTCAATAATTTCCTATATACAAAATAATACAAAAAATTTATTAGAAAGTTAATTTATTATTTTATTTATAAAAATTAGGATGAATTTGTAATGTTAATATCAAAAAAATAAATATAAATATAAAAAATAAATTTATTTAAAATTAAAATTTTATTTATTATTAAAGAGTAAATATAATTATTAGTAATATATATAGTATTTGTAACAAAATATCAATAATTAGAAAGAATATGAAAACTAAATTAGAAGAACTAAAAACTATATTTTTATTAATTATAATATTTGAATAATCTTTTTAATCATATAAAATGCATATACTTGTAATATTTAAAGGTGATATTAATATTATTAGTGTATATTAATATTCCCTTGAAATTAAAAAAACATAGATATTTCAGTAATCTAAAATAGTCTACAAAAATAACAGTTTTAGCAAAATTAATAAGAATACATATAGATTTAAACCTAAAAGTATGAACATGTCTGTTTTTTACAAGATTAAAATTTATATTATATGATAAAATTAACTTAACTATTTCAATAAGACTTATAATTTTTTTCTTTATACTAGACCTTATTGAAACCTTTATAGTTTAATTCTAATTATATATTATAAATAAAGTATGTGTATATTAAGGAGGTAATATGAAGTTTTTAAATGTTTTAGTAGTAGTTGAAGATATTGAGAAATCAAAAAAGTTTTATTATGATGTTTTGGGGTTAAAGGTAATCTGTGATTTTGGAGAAAATGTTGTATTAGAAGGTAATATATCATTACAAGAAAAAAAGCTTTGGTTAGAATTTATTAATAAGAGTGACAGTGAAGTTAAGTTCAATGGAAATGATGCTGAGTTATATTTTGAGGAAGATAATTTTGATACTTTTGTTGAAAGATTGAGTACAATGAAAGATATAGATTATGTTCATCTAGCTATAGAGCATAGGTGGGGTCAAAGAGCAATTAGATTTTATGATTTAGATGGGCATATTATTGAGGTTGGAGAAACTATGTCATCTGTGTGTAGACGTTTTTTAGATAGTGGTCTTTCAATAGATGAGGTAGCTAAAAGAATGGATGTAACTGTCGAATATATTGAATCAGTTTTAGAATAGATGGATTATATTAAAGTAAAATTGAGGTGAAGGCTGTAAGTAAACTTGTGTGAAAACAAATTTGCTTACAGTTTTTATTTTTCTAAAATAAAGAATATAATACTTGTTTAGCTTTATTTGAGTTTTTAAAAATATTATGATATTTCTTATATATTTATACTAAAGTTTAAATTTAGAAAAAATATATAAAAGATAGTTATATATACTATTTTATATAACTATGCTAAAATTTAATTGAATAAATTAAAAATATAATGAAAGTTTAGTTTTAATTCATTTATTTAATAAACATTTCAAGTAAAATAATGTTTAAATCAGAAATATAAATAAATATTATTATAATCGTTATTAAAGACCAAAAATCCCATCTTAGAAGTTTGTATCATATGAAACCTTTATAGATTATGAAAGCAATAATATAGTGTATGATATATAAAATAAGTTATAAAAGTATTTTTTTAGATATTCAAAAAGACATTGTAAGTTATATTAATAATATGGGTATCAACGAATTTTGGATATAATGAGTTTTTCAACTTAAAGTTATGTAATAATGAATGTAAAGAATATTTAATGAAATCATTTTGTTGGTTATGTCTAGCTGAATACAATAATCTTTTAGATAAAGATTTTATATTTGAAGATAGGGGTGAAAAAATTAAGAAGATATTAACATCAGCAGTTTAGAGGCAAAGCATGTAAAGTAAAGTCTGGGTAACTAAAAGTAGTAATTTAGATTGTAACTATTGTTATAAATATGAAAATGAGGAAACAGGAAATATAAGTTAGGATGTAGAAAATAGGTTACTAAATAAAAAGCTTAATTATATAATCAAAGAAATAGGTATATACTGTACAATTTCATGGTGAAGAACTTTTCCTAAATAAAAAGGTTGGTAAAAGAGATATAAGAAATAAAATTCAATTATAAGATATGGTATGATAACTAAAGGCACTATATGGAGTGAATAGGCGGAAGAATTTTTTGAAAATTATAAAAATAGTTTCTGTTGCTACATATCAATAAGTATAGATAGAGATTGCAAAATCCATAGCAAAAATCGAATTTATAAGTGTAAATAACATGTAAGACAAGGAGTAAATTATGAGTATTTTAGAGATAAAAAACCTAAATAAAATATATGGTAAATCGGAAACAGAGGTGAAAGCGTTAAGTCAAATAAATCTAAAAATAAATAGTGGAGAATTTGTTGTGATAGTAGGTAAAAGTGGAAGTGGGAAAAGTACTTTACTACACATAATGGCAGGACTTGAAACTCCAACAAATGGTGATGTGATTATTGATAATATAAATATATCATCTCTTGATGAAAAGAAAAGATCTGCATTACGTAAAGAAAA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73 | Clostridium_phage(10.34%) | protease,coat,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1448561 : 1473001
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP012309|1448561:1473001|DBSCAN-SWA 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29 | Clostridium_phage(54.55%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1556279 : 1566006
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP012309|1556279:1566006|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP012309|1556279:1566006|1556865_1558215_+|AXU71404.1|DBSCAN-SWA MIREINTKLNSFEIFTIFRNEHDSFILDSAMDKEKLGRYSFISSQPFKVLKYKDTDENPLEVLKEELHKYRVVNDTNLPFVGGAVGYLSYDLGNYIENLPRTAVDDIEMPDMYFGFYNHVIVIDHLVQKTYIATPNIDIELEEKIIDDIEQRILKEEKKGIDSICYEEKEVTPIRLKSNFTKEEFKNAVQSVREYIRQGDIYQANLTQRFSGETELTSFELYRDLRRFSPAPFGAFLNFEDAHILSNSPERFIRCVNKRIETRPIKGTRPRGKDKEEDLRLQQELRNSEKDRAELLMIVDLERNDIGRISKTGSVKVPELFVIEPYANVNHLVSTVVGELKDDKDATDVIKATFPGGSITGAPKIRAMEIIDELEPTQRNVYTGSIGYIGFNGDMDFNIAIRTIIKNDKKVYFQVGGGMTWDSDPDEEYQETLDKAKSIMKALRGYYEE >CP012309|1556279:1566006|1561991_1562777_+|AXU71411.1|DBSCAN-SWA MKENLFNNNSKIEINTNNKKITVKKDKLIIAGPCAIESYEQLLETAKFVKSQGANILRGGAYKPRTSPNSFQGLKKEGLEILKAVKDEVGMAVITELMDVRDMDELYSISDIIQIGSRNMQNFTLLSEVGKQNKPVMLKRGIASTITEWIGASEYIAIEGNSNIIMCERGIRTYNDYTRNTLDLAAVPIIQKETGLPVVVDPSHATGVRYLVKPMSLASFACGADGIMVEVHPDPENALSDGAQSLCFNEFEDLMKSINNY >CP012309|1556279:1566006|1559708_1560281_+|AXU71407.1|DBSCAN-SWA MNKVDKEKIQHAVREILEAIGEDPDREGLIETPNRVARMYEEIFSGLSEEPRDHLKVLFADEKHEELVLVKDIPFYSCCEHHLVPFFGKAHIAYLPKGGRLTGLSKLARVIDTLAKRPQLQERITKNAADIIMEELQPYGVLVVVEAEHMCMTMRGVKKPGSKTVTSAVRGIFEKDIASRAEAMSLITMK >CP012309|1556279:1566006|1563031_1564822_+|AXU71412.1|DBSCAN-SWA MNDIKDIIEEIKARCDIASIISEYMNIKQSGANYKGLCPFHGEKTPSFYINTSKQIYKCFGCGEGGDVINFVMKMENLDFMDAVKILANKCGIEINTNMNEETRIKIEKSKKFQDIHTEAARFYLSNLLGSKNLGYEYLRIRGLDDKIIKKFGLGFSLDSWNSLMNTLISKGYKKQDLLECGLIAKNRDGTNCYDKFRNRVMFPIFDYRGNIIGFGGRVLDDSLPKYLNSPDTLIFNKKQNLYGLNFARKNLESKTIVLVEGYMDLISLYQYGIKNVVATLGTALTEQQGILIKRYADTAIISYDSDEAGIKATLRAIDILTKLGINVKVLDLKDAKDPDEFVRKYGLSDYKKAMDVSTHYIKYKIDHLKKEFNIQKDEERVKFAKEASKIIKQLTSPVEIDFYTKYLSNQIDINVESIKREVYGKNYNKPYNNKNQKKIEEKVIEKVEVRQDGKQLVEETLIKIMLEDKKIREIALLKVEESDFLLKESKEILNYMIKNQELDKITIDKLKSLNISEEYLKELNSISLNSINLENTKEIEGIITNIRKNSLEEQINSLLREQQELENNNDMKEVDGRVMEIALKIVEINKILKSL >CP012309|1556279:1566006|1558204_1558948_+|AXU71405.1|DBSCAN-SWA MKNNVGFDSSLSKFGIGLFETIRVKNGIAVDLDIHIERMLSSINCLDLDINYKKDFLINEIVTYIKKENVINKALRITVFDEGYNISIRDIPYNQETYEKGFKLAISPIVRGNSLIHRHKTTNYFENIYTKNIANKTGYNDGIFLNSEGVILECSMSNIFFIKGERVYTPSDRLPILNGIIKKRIIEICDELHIELIENEINISEISSFDFVFVTNSLMGAIKVTEIDKIKFNKENVVFDKIVKLLE >CP012309|1556279:1566006|1556279_1556864_+|AXU71403.1|DBSCAN-SWA MILMIDNYDSFVYNLVQYIEELGETVVVKRNNEIKISDIEELNPEVIVLSPGPCSPKEAGICIDIVEHFKGKKPILGICLGHQTIGHVFGGDIIKAQQPVHGKVYSINHTNKGVFRGLKNPLNVTRYHSLIVDSNTVPKELEITAITDKGEIMGIRHKKYLIEGVQFHPEAILSEYGHEMLKNFITEARERVHM >CP012309|1556279:1566006|1564839_1566006_+|AXU71413.1|DBSCAN-SWA MENKSNKKELKKVTAKTLIEKGKKQGSLTLAEIMEAFSETELDKDQVENLYETLGNLGIEITETKNYKADIDFSVADDDLSIGHLDEDAEAISHDDSSAIEIETVDLSLPKGISIDDPVRMYLKEIGKIPLLKPHEEVEFARRMHEGDEIAKQRLVEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNLGLIKAVEKFDYTKGYKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVSRQLLQELGRDPKPEEIAKEMEMTEDKVREIMKIAQDPVSLETPIGEEEDSHLGDFIPDDDAPAPAEAAAYSLLKEQIEDVLGSLNDREQKVLKLRFGLEDGRARTLEEVGKEFDVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKKLRDYLD >CP012309|1556279:1566006|1561146_1561512_+|AXU71409.1|DBSCAN-SWA MDKILLSNLGFYGYHGVLKEENFLGQKFFVDMELYIDSREAGLSDDINKSVSYAEVYNVVKDITENKQFNLLEALAENIAEEVLNKFILINGVMVRVRKPEAPVNGIYDYFGVEIRRARDE >CP012309|1556279:1566006|1558981_1559683_+|AXU71406.1|DBSCAN-SWA MIGCIYEVYNEEMTKIIENQNTLAVYLVGSSKDVDFTLYDVVINDIDVFVFVKEGEKQERILFKKKGIEFDVNYFSKDGVKKLLSNREYFFVKEMKDAKVLFDRENISHIIKDISRDIYLEGPSKMSLEEKSFIKQDIGAKISNLKNKEKFDVFEYHFLTNLYLKDIIIGYFNINDKWVPKDKKLLKVLKKENNELFELVSKVSENYDYQRLLDVYNYIFKEIETKEIIKLIF >CP012309|1556279:1566006|1561504_1562011_+|AXU71410.1|DBSCAN-SWA MNKAYLGIGTNMGDRFDNLSRACELLKNSDSIYKVKESSLYETKPWGYTEQADFLNMCVEIETEFEPYELLEYCQEIERELHRERIVHWGPRTIDVDVLFFNDVVSTDERLTIPHPRIQDRAFVLIPLMDLNEKLIINEKTIKEHLNLLSAEEREEVKELVGYERKPI >CP012309|1556279:1566006|1560344_1561136_+|AXU71408.1|DBSCAN-SWA MFDYGKRTYIMGILNVTPDSFSDGGDFNNLDIAIQHAKDMVDQGADIIDLGGESTRPGHSYVDSDEELRRVIPVIKKLKQELDIPISIDTYKADVAEEALKLGVTMVNDVWGLRKDKNMASVIGKYDAEVCIMHNQDGTNYDKDIMESIKDFFKVSIEMAMSCGVKKEKIVLDPGVGFGKDFEQNIEVLRRLNELKDLGYPILLGTSRKSVIGKVLPVEPKKRLEGTIATTVLGIRDGVDIVRVHDVYENLMAARMTDAIYRK |
11 | Pandoravirus(37.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1694266 : 1748519
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP012309|1694266:1748519|DBSCAN-SWA 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67 | Clostridium_phage(78.95%) | head,terminase,tail,portal,capsid,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1832196 : 1842433
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP012309|1832196:1842433|DBSCAN-SWA TATGGACGGCAATATTTCAATTTATTATAAAGGTGATATATCTAAAAAAGAAGATATTAAATTTAAAATAAAAGAATCTGTAAATAATACAAGACTTTCTAGTAGAATAGAGTATAAGGATGAGGAAAAAACTTTTGATTTTGAAAGATTTAATGTAATTGATGCTATTTATGGAAATAAACCATTTGAAAAAGATGGAAAAGTTATTGTTTTTAATGGAAATATATATAACTATCATGAAATAAAAGAAGAATTAATTAAAAAAGGACACAATTTTACTACAAATGATGATATTGAAGTCTTATTGGCATCTTATATAGAATTTGGTAAGAATTGTGTACATAAGATTAAAGGAATGTTCAACTTTATAATCTATGATAGAGAAAATGAAAGTATATTTGGAGCAAGAGATTTATTTGGGATAAAACCACTTTATTATATAAATAAGGAAAATGCAATAATTTTTTCCTCAGAGTATAAGTTTTTACTTGAATATATGAAAAATTTAAATATAAATGAAAGAAGCTTACAAAGTTATTTTTCATTTCAATATGTACTTCCTGAAGATACTATGATACAAGGAATAAGGCTGATACCAGCAGGTCACTATTTTAGGGTAGAAAATGGTATACTATCTTTAAAGAGATATAATAAACTTGAGTTTAGAAGTAGTACAAAATTTTTTTATACTAAAAATCACTTAGGCAATAGAGATGTGAACGAGGATGATATAAGAAATATAGTAGTAGATTCAATAGTAACTCATATGGAAGAGGAGAAAGAAATTGGAACATTTTTGTCTGGTGGAATAGATTCATCTATTATAACTACTGTGGCTTCACAAATTAATCCAAATATAAAATCTTTTTCTGCAGGCTTTAGTGTCAAAGGATATAGTGAATTAGAAGTAGCAAAGAAAACAGCTGATAAGTTAGGTATAGAAAATATCCAGATTAATATAACACAAGATGAATATATAAAATCATTACCGAATGTAATTTATTCTTTGGATGACCCTATAGCAGACCCTTCAGAAGTAGGTCTTTATTTCTTAATTAAAGAGGCAGGTAAACATGTTAAAGTAGCATTGTCTGGAGAAGGAGCAGATGAATTATTTGGAGGATATAATATATATAAAGAGTATAGTACTATGAAATCAGTTGTCAATTCACCTACTTATATTAAAAGTATATTAGGAAGAGTTTCAGAACTTATGCCAAACATAAAAGGAAGAAATTATCTTTATAGAGCTACAACACCATTAGAAAAAAGATATATAGGAAATGCAAAAGTTTTTGAAAACAGCGAAGTAAAAAGATTCTTTTTTAAGTATAAGGAAAAGAATATATATGAATACCTGTTGTCTAATTTGTATAGAGATGCACAAAAAAATAATTACGATTATATAAGTAAAATGCAACATATAGATGTGAATACATGGCTTCAAGGCGATATACTTCAAAAAATTAGCAAACTTTCTACAGCTGAGCAGGTTGAACTTAGAGTACCATTTTTATATAAAGATGTATTTGATGTAGCAAAAAATTTAAGAATGGAGCAAAAAATAAATAAGAATAATACAAAAGTTTTACTTAGAGAGGCGTTTAGAGAAATAATCCCAGAACATGTTGTTCAAAGGAAAAAATTAGGATTTCCAACTCCAATAAGAGTTTGGTTAAAAGATTCTCTAGGGGATATTGTAAAGGAAACTATTTATAATTCAAATGTAGATGAATTTATAGATAAAAAATATGCAATAAAACTTTTAGATACGCATCTTAAAGGTCATAGAGATAATTCGAGAAAAATATGGACTATATTTACATTTTGTCTATGGCATCAATTATTTATTGAGCATAAAAATGTCGAGTATTAATACTTTTTTCAATATTAATCAGAGGGCAAAAGCATGCAATGTTTTCACCCTCCTGATTATTATGGAATAGGATAAGTAGAATTTTGATTGATTAGTTTACTATCTCAATAAAATTATTGGCAAATATTTTGACAAGATTACTTTCAACAGCTAAATTTAAGTTTTGTCCATCATCATATCCAGCGGAAATCAATCCTAGTAAGTTTCCAAACATATCTAAAAGAGCTCCTCCTGAACTACCACTAGAGATTGGAGCTGTAAATTGTATCATTTGAACCGTTTCAAAATCACGAAAAGCTGAAATAATTCCATCTGAAACTGTATTAAAAAGACCTAAAGGGCTTCCAATTGCAACTATTTTTTGACCTCTCACAGGTTTTTTACTGACTTTAACAGGTATTGGCTTGCATTTTCTATCAACCTTTATCACAGCTAAATCATAATCTGAATGGTATTTTATAATTTGGTAAGATGTATAAACTTTATCATCATTTTCAAATCTAACTAAAAATGAATACCCATCATTGACTACGTGAAGATTCGTAAGTATATAACCTTCATTATTTATTACTACTCCAGAACCGCTCTTAAACGGTTTATTTTCGTTATTGCACACAACAATCATAACAACAGAAGCTGATAACTTTGCAAGGTCTTCATAAGAAAGTTCTACTTCCTCATCTTGTACAATTTTTTTAGATGTTAGATTTGTGTTATTAAGTGTATTTTTAGAGTTAGGTTTATTCGTAGTATGAGAAGTCTTATTGGTATTTTCACTGTAATTTATATTTGTAATATGCCTTTCAAAAGGTATTTCTAATATATTTGGAGTCTTCCTAGAAAGTTCAAATAGAGTAGAAAATTTTGAACATTCAGGATATAAATCAAGAATATCTTTATTTGGATTTATATATAAAATATCACACCCAAGTTGTGATAAAAAATATAAGAAAAAAAGTTCTTGCCTTTTAATATTTCCAAAGTATACTATCTTTGGTGAAATAGTAGTCTTCACCTTGTTATAAAATAATTTAGGTAGAAAATAGTCTATCCAACACAAAAGTTTAACTGCAAAGTTTTTGATGATAGAGGATGTACAATTTGGCATACTTGTGGAAAATAAATCTAAAGTATTTTTAAATGCAATCTTTTTAGTCCAATTTAAGGTGTCATTTTCTATTTTACATGGAAAGTCGATATTATATAAATCCCAACTGTTAAACTTAGAACTATTATAAATATTAAAAATTTTAAGCATCTTATCTGTTTGTTCTTTGTCAAAATTTATTTTTAGATTGTTTAATCTAATATAGGGAATTGTAGGATTATTAAAAAAATAAGTATCTATATTTTTAATTTTTTCTATGTATTTATCAATTGAATCATCAACACCTATATATCTTGTAAAGTAGACTTCTTTAATATATGAAGAACTCTTATTTTTATAGGTAGTATCAGATATAAATTCAATTAGAGGTTCAGTAGACTTTTTTATTGAAATCTTTAATGGTTTAATAGTACAAATCATATTTTTTCTCCTATAAATAAGATGATATAATCTATTATAAAACAACTTAAAACAATATAGTACAATAATTTTGTAGTTTCAAAATAAAATATGTACTTGTTTATATAAATGATATATAATTACAATAAAATTGCCGAAAAGCCCTCTCCTTTAGGTGTAGGGATGAAAGGTAAGGTCTTAATATAAAAAAAGTTAGAATAATGCTTGTAATCTAATACCGCTACTGATACCCTATATTTAGGAGGTGTTAGTTTTTATGTATAAATCTAACAAAAATATAGTTTATGATTGCAAATATCATATTGTATTTTGCCCTAAGTATCGTAAACCTGTTTTAGTTGGCGAAGTTGAAAAGATGTTAAAAGAAATACTACCATATAAAGCAGATGAACTTGGAGCAGAAATAATAGAAATGGAAACTGATAAAGAACATGTGCACTTATTAATATCTTGTGACCCTCAATATGGAATTCATAAAGTAGTAAAAGGTTTAAAAGGCTTTAGTTCGAGAGTATTAAGAGAGAACTTTCCACATTTAAAGTCTAGTATGCCTAGCATGTGGACTAATAGCTATTTTGTAGGTACTGTTGGTTCTGTGAGTTTAGAAGTAGTTAAACAATATATAGAAAATCAACAAGTTAGGACAAAGAAATGATAAAAACTCATAGAGTGAAATTAAACCTAACTAGAACACAATTTGAATTAGTAAGGGAAAAGCAAATGGAAAGTGCTAACTGTTGGAACTACATAGTTAACTTATCTAAAGAATACTATTTTGAACATAAACAATGGATTAAAAAGAATGATATACAAAAGTTAATCAAAGGTAAGTACAATCTTCATAGTCAAACTATTCAAGCTATATCAGATAAATTTGATGCAAATAGAAAGACTATATCAGAATTAAGAAAAAAAGGTAATACTAAAGCAAAATATCCATACAAGACTAAGAAATTTTATATAATACCTTTTAAAGCTAGTGCTATTAATAGAAATGCTAAAGGCAACTTAAAATTATCAATGTCAAAAGGCAGGTATTTAGAATTAGATTTTAATGTTGAGAATATAAAAACTGCTGAAATAGTATGGCGAAATGGATATTATTTATACTACACTTTTGACAATGAATTAAATGGAGTTGTAGCCAAAGGCACTAATACCGTAGGTGTAGACTTAGGGGAAATACATTCGATAGCTAGTGTAACAAATAAAGGTGTAGGGCTTATTCTATCTAATAGAGAAGGCAGAAGTATTAAACAATTTAGAAATAAGATGTATGCTTATATATCTAAAAGATTAAGTAAATGTAAAAAAGGTAGTAGACAATCAAAGAAGTTATGGAGATTAAAAAATAAGATAAGAAGTAAAACAGATAATCAGTTAATGAATTTATATCATCAAACAACTAGAAAGTTTATAGACTTTTGTGTAGAGCAGAAGGTATGTGAAATAGTTCTTGGGGATATAAAAGGGGTTGAAAAAGATACTAAGAAAAAGAAAAGATTAAACAGAGTTAATAGACAGAAAATATCTCAAATGGAGTATGGTCGAATAAAGGACTATATAAAATATAAAGCAAAAGAGCAAGGTATTGAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP012309|1832196:1842433|1836250_1837414_+|AXU71668.1|transposase|DBSCAN-SWA MIKTHRVKLNLTRTQFELVREKQMESANCWNYIVNLSKEYYFEHKQWIKKNDIQKLIKGKYNLHSQTIQAISDKFDANRKTISELRKKGNTKAKYPYKTKKFYIIPFKASAINRNAKGNLKLSMSKGRYLELDFNVENIKTAEIVWRNGYYLYYTFDNELNGVVAKGTNTVGVDLGEIHSIASVTNKGVGLILSNREGRSIKQFRNKMYAYISKRLSKCKKGSRQSKKLWRLKNKIRSKTDNQLMNLYHQTTRKFIDFCVEQKVCEIVLGDIKGVEKDTKKKKRLNRVNRQKISQMEYGRIKDYIKYKAKEQGIEVKLVKENYTSQTCPKCSKKHKPTGRTYSCTCGYETHRDIVGAWNILNKKHKYGLVDFRINHKQPINLKVSTV >CP012309|1832196:1842433|1837773_1838352_+|AXU71669.1|DBSCAN-SWA MGITLSKGQKVDLTKGNPGLKNILVGLGWDTNKYDGGFDFDLDTAAFLTGASGSVTNDGDFVFYNNLKHTSGAVEHLGDNRTGEGDGDDEQIVVDLSKIPGEISKISFTVTIHDATERRQNFGQVSNSYIRIVDKDTNEELIKYELGEDFSIETAIVVAEIYKHNGEWKFNALGSGFEGGLAALCGNFGINL >CP012309|1832196:1842433|1838390_1838969_+|AXU71670.1|DBSCAN-SWA MAIVLKKGQKIDLTKGNPGLKNIKLGLGWDTNSFDSGYDYDLDVSVFMVGESQRVEKDEDFIFYNNLKHPSGAVEHLGDNRTGEGDGDDEEILVNLETMPKHIQKIAVTVTIYEAAERRQNFGQVSNSYIRVLNSENDEEILRYDLGEEFSIETAITVCEIYKYNGEWKFSAVGAGFEGGLEALCRNYGLNV >CP012309|1832196:1842433|1839054_1839684_+|AXU71671.1|DBSCAN-SWA MSINLSKGDKIDLKKSNPGLSNILVGLGWDPVQQSGGGFFKSLFGGGQADIDCDASVFMLNQEGKLSGIKDLIYFGNLKSACKSVLHTGDNLTGEGTGDDEQILVNLDKVPSNIHKLLFVVNIYNCVDRKQHFGMIENAYIRVEDQGNKKEIAKYNLSDNYSEKTTLIVGAIYRKDGSWQFKAIGEGTKDAGLKEVMQNLDRIECAYGI >CP012309|1832196:1842433|1835855_1836254_+|AXU71667.1|transposase|DBSCAN-SWA MYKSNKNIVYDCKYHIVFCPKYRKPVLVGEVEKMLKEILPYKADELGAEIIEMETDKEHVHLLISCDPQYGIHKVVKGLKGFSSRVLRENFPHLKSSMPSMWTNSYFVGTVGSVSLEVVKQYIENQQVRTKK >CP012309|1832196:1842433|1832196_1834071_+|AXU71665.1|DBSCAN-SWA MDGNISIYYKGDISKKEDIKFKIKESVNNTRLSSRIEYKDEEKTFDFERFNVIDAIYGNKPFEKDGKVIVFNGNIYNYHEIKEELIKKGHNFTTNDDIEVLLASYIEFGKNCVHKIKGMFNFIIYDRENESIFGARDLFGIKPLYYINKENAIIFSSEYKFLLEYMKNLNINERSLQSYFSFQYVLPEDTMIQGIRLIPAGHYFRVENGILSLKRYNKLEFRSSTKFFYTKNHLGNRDVNEDDIRNIVVDSIVTHMEEEKEIGTFLSGGIDSSIITTVASQINPNIKSFSAGFSVKGYSELEVAKKTADKLGIENIQINITQDEYIKSLPNVIYSLDDPIADPSEVGLYFLIKEAGKHVKVALSGEGADELFGGYNIYKEYSTMKSVVNSPTYIKSILGRVSELMPNIKGRNYLYRATTPLEKRYIGNAKVFENSEVKRFFFKYKEKNIYEYLLSNLYRDAQKNNYDYISKMQHIDVNTWLQGDILQKISKLSTAEQVELRVPFLYKDVFDVAKNLRMEQKINKNNTKVLLREAFREIIPEHVVQRKKLGFPTPIRVWLKDSLGDIVKETIYNSNVDEFIDKKYAIKLLDTHLKGHRDNSRKIWTIFTFCLWHQLFIEHKNVEY >CP012309|1832196:1842433|1834162_1835599_-|AXU71666.1|protease|DBSCAN-SWA MICTIKPLKISIKKSTEPLIEFISDTTYKNKSSSYIKEVYFTRYIGVDDSIDKYIEKIKNIDTYFFNNPTIPYIRLNNLKINFDKEQTDKMLKIFNIYNSSKFNSWDLYNIDFPCKIENDTLNWTKKIAFKNTLDLFSTSMPNCTSSIIKNFAVKLLCWIDYFLPKLFYNKVKTTISPKIVYFGNIKRQELFFLYFLSQLGCDILYINPNKDILDLYPECSKFSTLFELSRKTPNILEIPFERHITNINYSENTNKTSHTTNKPNSKNTLNNTNLTSKKIVQDEEVELSYEDLAKLSASVVMIVVCNNENKPFKSGSGVVINNEGYILTNLHVVNDGYSFLVRFENDDKVYTSYQIIKYHSDYDLAVIKVDRKCKPIPVKVSKKPVRGQKIVAIGSPLGLFNTVSDGIISAFRDFETVQMIQFTAPISSGSSGGALLDMFGNLLGLISAGYDDGQNLNLAVESNLVKIFANNFIEIVN >CP012309|1832196:1842433|1839673_1842433_+|AXU71672.1|DBSCAN-SWA MEFNNDIKYYNVDKEEVTKDLSVNPEKGLSESEVKTRREKYGLNEFTPKEEGSFWDDLKESLSEPMIVILIIAAVVSAVIGETHDAIGIVGAIAIGIAIGMITEGRSKKAAEALSKLTENIEVKVLRDGEVHQISKSELVPGDIVYIETGDMVPADGRLIESINLKIREDMLTGESDDVSKKCDVVVSMEEIESKGAVVVQEPIPAKQINMVFGGTLVAYGRGALVVTSIGDNSEMGKIAQNLSETDEQTPLQIKLGNLGGLIAKVSSAVAGLLFIFMVFQMISKNVLNVDMSGILPFLESIDPVKTAFTVCVALIVAAVPEGLPTMINMTLAITMQKMAKINALVTKKEACETIGSVSVICSDKTGTLTENRMTVEVAYVDGRYIESSEEEINSYFEENCMINSTADVEHNDGDIKYLGSATECALLLYYKNVDYRQVRKNSNIVAQNPFTSDSKRMTSVIGRDNHHVLLSKGAPEVLLELCSHIQRGKDIVPLTENIKHEILEEIKKLQIKSMRTLGFAYKEISQAEEEAAVTAESDAMNVSAMENNLVFSGFVGIRDPLRKDVIESVNTANKAGVSVKMLTGDNINTARAIGEELGLLKNNMRVVEASYIDTLDDEELKQEIQSISIVARSKPDSKMRIVSALQKSGDVVAVTGDGINDAPALSKADVGIAMGISGTEVSKNAADIILTDDSFSTIVKGIKWGRGIYDNFQRFVQFQLTVNVIAFLVAIISQVMGQEMPFTTIQLLWVNIIMDGPPALALGLEPVRDHVLNRKPVDRKANIISKSMVYTIVLNAFYITAILMLQSTFNFLGVDEAHKGTVMFALFAFSALFNAFNCREFNADSIFPNFTHNKLALQIIVLTGIAQVIFTQLFQDFFNSVAMDFMTWVKVLCVAASVIVVNEVVKCIIRLVKPKKTA |
8 | Clostridium_phage(33.33%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2599374 : 2605705
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP012309|2599374:2605705|DBSCAN-SWA TTTACTCAATTTTGTAAAATACATGATAATTCTTCTTCTCACCTGCAATCTTGGTAGGTCTATTATTTTCCTCTATCCAAGTTCTCACCTTATCTATTACACTCTTTGTATATTTATTTACAGTACCAGTCCAAGAACCATTAGTTTCCCAAACACCTTTAACTTCACCATCTTCTAAATCAATCTTTTTAATAATCTCACAAACAGCCATCTGAGCTGGTTTATTACTCTTAGAATATATTTTCAGTTTAGATGCTATTTGTTTTGTATCAAAATAATGTTCTTCTTCGTTTATCTCTATTGGTAAATCAATTCCTGCTTTCTTATATAATGTTTTAGCTGTTAATAGTTTTGATTTATTGTCAAAGCCTGCATCATCTAGCAATTCTTTTAACATAGATGTACTGTTATAAGCCAACTGTAATTTTTCAATCTCACTTGCTTTTTCTCTCAACTTTTCGGTATTGCATTATTAGTTATGTATGCACCAGTTTGTCTTATGCTTGGTAAAACTTCATCACTTATCCAGTCTTGGAATCTCTCAGCTTCTTCTTTTCTTGATTTAAAGATTAATTTATACACTCCACTTTCAGTAAGAAAATTTTCTCCAGCATTATTAAGTTTTCGGATGTCAGTATTACTGATATCCGAATTTCTTAACTTTACAACTTGCTTTTTATTCATAAGTCTTATATTCTCATTAACATTTTTTATGTCTAAACAGTTTGCTACATCTTTTGAGTTGAATAAAATTCTTCCTTCAAATTCAAATACTTCAATCTCTTTTCCTTCAAACATCATTAATTCATTTTTCATAATATTACACTCCTTAATAATTGATTTTTTTTAAGGAATGACATATACTATAATTGATATACGATAGTATACGTCATAGGGGTTACTCAAACTTTGGTCGGTGGGAGTGACCCTTATTTTTTATTCCTTTTGTTCCAGTTCCTCGTCGATTTTTTCTTCTAGCCATTCTTTCTTGGTTAGATTCTTTTCCTCTAATACTTCATCAAATTTATCTAACTTTTCTTTGTCTAAAAGTACACTAAAACCTCTTTTATCTTTTCGACGATTTTTCATATACTCTGCCCTACTTTTAGTTGCTATTTTATTCACCTCTTTTCTGTAACTTGTTACATTAATAATAATATTGTAACGAGTTACAGTCAATAGGTTTTTACTAATTTTTTCTAATTATTTTACCCAACCGACCAATTTTGAGCAGAATAAAAGCACCCACATATTTGTAAGTGCTTTCTTTGTTTATTTAATTTTAAATCCACATAGTTAATCTAAAACACAATTATTAATTGTTTTATTAGTGAAATCACAGCAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACTGTCAATTTCTCTAGTAGATAAATAGTCATACCCTGAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACCATTCATGGAGATTGCTCAAAATACAGATGCTATAAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACCAGAATGAGAAGTGGATTTATTCTGAAACAATAAAGATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACCAGATTTTCAACCTCCTTTTGATGTTCCAAGTAGTAGATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACGAGAACTGGAGAAATATATAATTGCATAAAATCAGAGAATTTGCATTCCATATAGTTAATCTAAAACCTTGTTTCTTCTGTTAATTTTATTATACCTTGTTTATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACATTTTAATTTTTATACACCATTAGCAATATCTTTAGCTAAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACGGTGCTATTGTAAGAATGTTAACAACCGAGTATGGTAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACACCAGCAACTATTCCACCATTCGCAGAACTAGCAATATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACCCCAAAATAAACTTAGCATTTCCAATACCTACATATATACAATACTCTTAAAATTGCAGTGAGCGGGCAATAGTGCAATTGATAACACTTATCACGCACCCTCAACATCTTAGATTTCAAGTATTAAGCCCTACTTTGTAACAAATATCGCACACTGCAAAACTTCTATATTTTTATTATATCATAAAATTTAAACTATAAAATTAAAATGGAATACTTTGTAAATTTAAAAGCACCTACATACTTGTAAGTGCTTACTATATTATCTATTCTAATAATTCTTTTTTCTTTTTATTATATTCTTCCTGTGTAATTGCTCCTGAATCTAGCAACTCTTTTAGTTTCTTTATTCTATCTAGTGGGTCAACCACTCTGTTTTGAATGTAGTTATTATAACTGTTTTTTTCTTGTTCTATTTTCTCTTGTTCTCGCTTCTCTTCTTCTTCGGTTTTAAGTTTAAACTCATTGAATCCTAAATTTTCAACATTATCTACATTATTTTGTATGTTTCTAAAATAATCAATATAAACAGAATTATATATACCTCCGTCATCTTTTGAATGAAACTTAAAGTACGCCTTGCTTATTTTAATTTTTTTAAAATCATTAGCAATTTCTTTTACAAATTTTTTACATTCTTCAGAATTACTAAATTTTTCATTTTGTACAGTTAAATCAAAATACATACTATATCTTTTAAATTTTTCTACTTTTAATTCATATTTCTTCCCCTTATATTCTTGAGGTACTAAAGCCTCTAGCTTAACTTTTAAATCATTTTCTGATATTTCCATTCCATGTTTTTCAATATATCTTTCTTTGTCTACTTCTTCTTGTATTCTTCTTCTTTCCATTTCTTTTTCTCTTTCTACAGTTTCTCTTTGTGCCTTAACAGTCTCAACTTTATTATCTGCTATCAAGGATTTATCTTCCCAAGTTGCACAAATATAAATTGAATAAGTGAAAAAAAGAACTGACACAAGAGCCATAACTATTTTCTTTTCTATAAAAGAATATATAATCAACAAAAAAGCTATCATAACTAAAATATATTGCATAGAAGAAACAGCTATTATAAGTAATACTATTGGTACTAATATCCACATTGTAAAATTCCCCCACAAATTACTCATCTCACTCAATGTTATAGCATAATTTGGCAAAACAAAAGCACCTACCATTTAAGTAAGTACTTTCTTATTTACAATTAAATTTATTCATCTAGTTAGATTCATCATCATTGTGTATAAAAAATTTCATATTTTTATTGACTATAAAAAATATTATATGCAATATTTTTTCTAATTTATGGTATAATAAAAGCAAGAAGAACTACAATCTATTTGCGGTAGAGTGAAGTTCTATAACTGAAAGTTATTTTTTACGATGATATTTAAAATTTATATCAATCTTTAAGTCACTCTTTGCGGTAGAGTGGCTTTTTACTTTTTTGATTAACTTGCTAATCAAATAAACTATGTAACTAGCTGTTACACTAGCTAACACATTAAATAAAAAATTATCCATGTATATTCACCTCCCTTCTTATCGTTGGGAAGATAATTTTTTAATACATGAACTCCACTCTATAAATTGTAGATTACATCTTCTTGCTACAATTATTATAATATATAATTCTTACATATTTTTCCTATATCTTACTTTTTATTTTATTTTCTATTTTTTCAATAAAAAGCACCTACATATTTGTAAGTACTTTCTATGTTTATTTAGTTTTATTGATTACTTAATAGGTTAGTACAAATTCCATACCAACCTAAGAATATCTACATAAAATAATTAAATAATATAATCAATAAGTATTTTTTTCACTCTTTTAATCAAATTATTACCTGTTCCCCAATCAATCTGAAATAGTCCAATTGCACTACCAGTTGAGGTAATTTTAACAAGTGTTTTTCCTGTAGTATTTTCACAAATCACTACCAAACCTGCATCACTATTGCTTCTTGCATAATATTTTTCAAAGATTGTAACTATTATAGACTTATTATTTTCTAGGTTATAAATATCAACAGAAACTAAATCTGCTTCCAAATTTTTTTCTACCATTTTCTGTGCTTCTAGTGGTGTCATCTTTACACTAAATACATCTCTTGCCATATCATTCATCACATCCTAAATAAAAATATACTTTTTTAGTATTTTCTGACACTTTTATCAAACAGTATTCCTATTCCTCCTAGTAAAACCAGTATAGAACCAAAATTTCTATATTGTGAAATAGATTGTTCTAAATATATGTTGTATTGTTCGGTAGCTATTGACCCACCATTTTGTTTTATAATACAATCCATATTAAATTGACCTAGACCTATACAGCAAAATAACACTATTATTCCAATTACAAAAGCAAATATACATATTGTAAGTTTAATATCTTTATTTTCTATAAATACACCCCTCATAATTTAGATTTATTTGTTGTTTTTTACTTGGTGATATATTATCTACATTATACTATACAACATATATATCCATCTATTTCCAAAATTGTAACATTTTCATATATTAGCAATGTGACTATTTTAACTTTAAATTCTACCTTCTTCTACCTCTCTTTTTCTCTCTTTCAGCTTCTTTCATTGCTTCTTCTTCATCTTCAATTTTAATAAGTATTGAGTCGGCTGCTAATGCTCTCTCATTAACTTCTAAATTCATATATTCACTAGGTTTCCACTTTAGCTTTTGAATGCAATTTAGTCTTAATCCTTCTTTTAATATATTTATACTTGCATTTATATCTCTATCGTGAGTTTCATTACAACTAGGATAAATCCATTCTCTTATATTTAAGTCCTTCACTTCCTCGTTTTTATACCCACATTTATTGCATATTTGTGAACTTGCAAAGAATTTACCCACCTTTACAATTTGTCTACCATGCCAATTAGCCTTGTATTCTAATTGACGAATAAACTCTGACCATGACACATCAGAAATTGAGCGAGATAGTTTACGATTCCTAATCATATTCTTTACTTGTAAATCTTCTATGCAAATAATATCGTTCTCTTTTATTAATTTAGTAGATAGTTTTTGTAGAAAATCATTTCTTTGATTAGCTATATGTTCTTGAAGTCTTGCAACTTTTAATCTTGCTTTATTTCTATTTAAACTACCGATTGTTTTTCTCGATAATTCTCTTTGTAATTTAGCAAGTTTGTTTAATGACTTCTTAAGATTTGAGATAAATTGAGGTTTATTTGAATAAATTGATTTGAATTATGTTATTTTCAGATTACTTTTATTTAAGTATTTTGATTGGATTCAGCTGAATTAATGTATATTAATTCTTATTGAACAGTTTTTATTTTTATACATACTATCTACTATATACTATACATATTCTACTAAAATTTATATAAATATTAGACAAACCTATTTCATTTTCTTAACATGTTCAGAATAATAAACAAAATGAAGGTAGAAAAAGTTATAATTTCATACCTTCATTTTATTTATTATGTATCAATTTGTCATTTTCTTATTTCAAATTCTTAAAATATTCTTCTAATAAATTTAAAATATCACCATCTACTTCATCATCCTTACTACATAGTGCTGACATTAAACTTAATATTGAATTTTTATGTGTATTCTTTAAAAATTCTTTTGTTTAAAATCTCTGATATTATTTTTCTTTTACTAATACATTATAGTGTGTACACTTATCTATTTTCTCCGTTTCTAAAAACTCTCTTCTTTAGTAATCTTTTTAATACTGTAAATATAGTTGTATCTTTCCATTCATATTTTTGTTCCATAGACTTGGTGATTTCTCTTGATATTAATACCTTTTCTGATTCCCAAATATATCTCATAACTTTTAATTCCGCTTCTGGTAATTTACTAATTTTCATAGTATACATCCCTTTACCAATTTATGTATATGTCAAATTCTATATCAATAAAGTTTTACAAACAAAGGAATTAAGGTAAATAATTACATTCGATTTTTACTATATCATTCTTTTAAGTTTCTATAATACTCATCTAATAGGTCTAACTTCTCTTTACTTACATTTTTATGTATAGTGGTAAGTGAATGCATTATTTTTATGCTTTTACTAGATTTTAGTACCTTTTTCTTAAAAGTATAATATTCTTTACTATCTATTATTATTTTATAATAAGATTGAAAATTTATAATATATCTAGCCAAATACCTTTTATTAACTAGCCTTTTTAGTAGTATTTTTATTGTACTTTTATGCCATCCATAAATCTGTTTTATTTCTTTTACAATTTCTTTTTTAGGCATTAGAGTGTCTTTTTTCCATAAATACTCCATTACTATTAATTCTACTCTTAATAATTTTTCTATTAATATTTCTTCTTTCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP012309|2599374:2605705|2599823_2600189_-|AXU72357.1|DBSCAN-SWA MKNELMMFEGKEIEVFEFEGRILFNSKDVANCLDIKNVNENIRLMNKKQVVKLRNSDISNTDIRKLNNAGENFLTESGVYKLIFKSRKEEAERFQDWISDEVLPSIRQTGAYITNNAIPKS >CP012309|2599374:2605705|2602713_2602866_-|AXU72361.1|DBSCAN-SWA MDNFLFNVLASVTASYIVYLISKLIKKVKSHSTAKSDLKIDINFKYHRKK >CP012309|2599374:2605705|2603139_2603472_-|AXU72362.1|DBSCAN-SWA MNDMARDVFSVKMTPLEAQKMVEKNLEADLVSVDIYNLENNKSIIVTIFEKYYARSNSDAGLVVICENTTGKTLVKITSTGSAIGLFQIDWGTGNNLIKRVKKILIDYII >CP012309|2599374:2605705|2603498_2603768_-|AXU72363.1|DBSCAN-SWA MRGVFIENKDIKLTICIFAFVIGIIVLFCCIGLGQFNMDCIIKQNGGSIATEQYNIYLEQSISQYRNFGSILVLLGGIGILFDKSVRKY >CP012309|2599374:2605705|2599374_2599827_-|AXU72356.1|DBSCAN-SWA MREKASEIEKLQLAYNSTSMLKELLDDAGFDNKSKLLTAKTLYKKAGIDLPIEINEEEHYFDTKQIASKLKIYSKSNKPAQMAVCEIIKKIDLEDGEVKGVWETNGSWTGTVNKYTKSVIDKVRTWIEENNRPTKIAGEKKNYHVFYKIE >CP012309|2599374:2605705|2601605_2602520_-|AXU72360.1|DBSCAN-SWA MVGAFVLPNYAITLSEMSNLWGNFTMWILVPIVLLIIAVSSMQYILVMIAFLLIIYSFIEKKIVMALVSVLFFTYSIYICATWEDKSLIADNKVETVKAQRETVEREKEMERRRIQEEVDKERYIEKHGMEISENDLKVKLEALVPQEYKGKKYELKVEKFKRYSMYFDLTVQNEKFSNSEECKKFVKEIANDFKKIKISKAYFKFHSKDDGGIYNSVYIDYFRNIQNNVDNVENLGFNEFKLKTEEEEKREQEKIEQEKNSYNNYIQNRVVDPLDRIKKLKELLDSGAITQEEYNKKKKELLE >CP012309|2599374:2605705|2600309_2600462_-|AXU72358.1|DBSCAN-SWA MKNRRKDKRGFSVLLDKEKLDKFDEVLEEKNLTKKEWLEEKIDEELEQKE >CP012309|2599374:2605705|2605327_2605705_-|AXU72366.1|DBSCAN-SWA MKEEILIEKLLRVELIVMEYLWKKDTLMPKKEIVKEIKQIYGWHKSTIKILLKRLVNKRYLARYIINFQSYYKIIIDSKEYYTFKKKVLKSSKSIKIMHSLTTIHKNVSKEKLDLLDEYYRNLKE >CP012309|2599374:2605705|2605031_2605223_-|AXU72365.1|DBSCAN-SWA MKISKLPEAELKVMRYIWESEKVLISREITKSMEQKYEWKDTTIFTVLKRLLKKRVFRNGENR >CP012309|2599374:2605705|2600669_2600819_-|AXU72359.1|DBSCAN-SWA MNGFRLTIWNVNSGYDYLSTREIDSFRLTIWNVNCCDFTNKTINNCVLD >CP012309|2599374:2605705|2603901_2604333_-|AXU72364.1|transposase|DBSCAN-SWA MIRNRKLSRSISDVSWSEFIRQLEYKANWHGRQIVKVGKFFASSQICNKCGYKNEEVKDLNIREWIYPSCNETHDRDINASINILKEGLRLNCIQKLKWKPSEYMNLEVNERALAADSILIKIEDEEEAMKEAEREKKRGRRR |
11 | Clostridium_phage(71.43%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
3158236 : 3167189
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP012309|3158236:3167189|DBSCAN-SWA TCTACTTTTCTCTAGTTGTTGCAATTTCTTTGATATTAGCATCTTCTGGTTTAATATAAGTTGGCACTAATTCCCTCATAATACCATCTATTTTTTCAACCTCTTCATTGTTAGTAATTTCTCTTAAAAGTTTTAAGTATTTTGTTATTTTTTCTCTATCAACATCTATTGGTCTACCAATAAAAATCTTTTTATGCTCTGTATCCAACAGACCTTCTTCTGACATAAGTAGTTCTTCATATAACTTTTCTCCTGGTCTAAGACCAGAAAATTCAATTTTTATATCAACATCTGGCTCAAATCCACTGAATTTAATTAAGTTTTTTGCTAAATCCAATATTCTTACAGGTTCTCCCATATCAAGTACAAATATTTCTCCACCTTTAGCCATAGCCCCAGCTTGTATGACTAAGCCTACTGCTTCTGGTATTGTCATAAAATATCTAATAATATCTGGATGAGTAACTGTCACTGGTCCGCCATCTTCAATTTGCTTCTTAAAAAGTGGAATTACACTACCATTACTACCAAGCACATTTCCAAATCTAACAGCAACAAATTCAGTCTGGCTTTCAGCATTCATAGTCTGTATAATCATTTCAGCAGCTCTTTTAGTAGCTCCCATTATGTTAGTAGGGTTTACAGCCTTATCTGTAGATATAAGGACAAATTTCTTAGCTCTATATTTTGAAGACAAGCCAGCTATGTTTAAAGTTCCAAATATATTATTCTTTATAGCTTCGCCAGGGCTCGATTCCATAAGAGGAACATGTTTATGTGCTGCTGCATGAAATACCACTTCTGGTTTATATTTATTAAATATTTCATCCATTCTTTTTTCTTCTCTTATTGATGCTATTACTGTTTTTAAATCTAATTTATTTTTATATTTTCTAAGTAATTCTTGTTGTATTGAGTAAGCATTATTTTCATAATTATCAACTATAATAAGCTCTTTAGGATTAAATCCTGCAATCTGTCTGCAAAGCTCTGAACCAATTGAGCCTCCTCCTCCAGTTATTAGGATTACTTTTCCCTCAATGTAATTACTTATCTCTCTTAAATTTGTTTTTATAGGCTCTCTACCCAACAAGTCTTCTATCTCTACTTCTCTAATCTGCTTTATATCAACTTTTCCATCTATAATTTCGTAAATTCCTGGTATTGTCTTTATTTTACAGTTAGTGTTTTTACATACATCAATAATCTCTTTTTTTCTACGTTTCTCTATGTTTGCTATTGAAAAGATTATCTCATCTACATTGTACTTTTCTACCACATCTTTTATATCTGAAGTTGTTCCTACAATTTTCACATTATGGATTATTCTTCCAATTTTATTTTTATCATCATCAATTATAGCCACTGCTACTTTCTTAAGTTCTGGATTTCTTTTTAGTTCCTGTATAACCATTTCTCCTGCATCTCCTGCACCAATTATAAGGATATTTGAAACCTTTCCTCTAGAATATGTCTTGTTCATGACTATTCTTATAGCTCTATAGGCTATTCTTGCGCCACTTGTAAACATTATAATAAATATTGTATTTAATACATAAAACATTATAGGATAATCAAACCCTAATAATTTATTTATTATATAAATCGGAATTAAATAAGCTAAAGTTGCCACAAAAATAGATATAATTTCTTCTTCTCCTGCATATCTCCATAATGTGTTGTAGCACTTAAACAATCTAAATGATACTATATGAAGTACTATATATATACACACTGAAATTATTATATCATTAGTGGTAAATGCATTTAAATTACCTGTCAAGCTTAAAGACATTCGAAACGCTACTAGTACGCTACAAATATCTAGAATTAATAGTGTTAAATGTCTAAATTTATATTTTTTAAAAAGCCTATTAAAAAAGCTTTCTTTCTCTAAATCTATACTTTCTCGCATAACTAGAAGCCCTCCTTTAAACAGCAAAAGCTACGCACCTAAGCATAGCCAACAACATCTATCTTTTGCTGTATTTTTTCATTTTATTTTTTATATTTATCAAATATAGAATCATAAATTTTTTCTATATCATTAAAGTTTAAATTAACCTCATAATTTTCTCTAACAAATTGACGCCCTTTCTTACCCATATTAAGTCTAAGTTCATCATTTTCCATTAGTTTTATTATAGCATTTTTTATTTCTTCTGGTTGTTTTGGTTCTACAATTAAGCCAGTTTCATTTTCCCATACAGATTCTGGATGTCCTCCTACATTTGTAACTATAACAGGTACTTCACATGCTTCTGATTCTATAGCTGCCACTCCAAATCCCTCTCTTAAAGAAGGAAATACAGTTACATCAAAAGAATTAAAAGTCTTGCTTACATTTTCTGGAGATATTCTTCCTAAAAACTGAACATCATTTTCTATACCCAATTCTTTAGCTAAATTTATTAGGTTGTCCATCTGACTTCCAGAGCCACCTATTTTAAGAATTATTTTCTTATCTTTATATTCATCTTTAAGCATCTTAAATGCTTGTATTAAATATTCTATTCCATATTTTTTTTCTAAACTCTTTATAATTCCTATTACAAAAGCGTCTTCTTTTTCTACTTCCATAGGCTTAAACCTATCCATATCTACTCCAAAAAAGGTTACATCTACATGTTTATCTGTATATTTATTAGCCTCTTTAGCCATATCTCTACTATTTGAAAAGATATAGTCTGCTTTTCTAAAGTTATGCTTTATAATTTGTTTTTGTATAAAACCATTATTAGGGAAATCATAAATATCAGTACCCCAAACAGAAATAATATATGGATGATACCCAAGTAGACTTCCTATAAATCCATAACTACTTGCATACTGTGCATGCAATATATCTGGCTTTATTTCATTTACTAGCTTCTTTATCTGCTTTATTGAACCTAAGTATCCCGTTTTTTTAGAAATATTTTCATTTTTTAGTTCTTTTACATTAGAACCAAAATTATAAATTTTTATTCCTTCCATGTGACCTCCATTTAAAGAAATTACATGAATGTCATATCCTTTATTTTTAAAAAAACTACACCATTTTAAAGTATGAGGATTTGACCCATCAGCTAAATAACAAACAGTCTTCATAATATTTACCTTCCTATCGAATAATACTCAATTCCTAACTCTTCCATATCTTTAATTTTATAACAATTTCTTCCATCAAGGACTAAAGGATTTTTCATCTTTTCCTTATACTTATGTATATCATAATTTAATACATCTTTCCATTCTGTCATTATAAAACATATCTCTGCATCTTCTATCGCATCATCTACAGAATCAGCATAAAGTATAGAGTCACCAAATATTTTCTTAGTATTATTTACACCAATTGGGTCGTATACAGTAACTCTTGCCCCTCTTTCGAGCAAATATTTTATATTTGGTATAGATGGTGCTTCTCTTATATCATCAGTATCTGGTTTAAAAGTCAAACCTAAAACAGCAACCTTCATATCTTGAAAGCTCTCTACTAACTTAGATGCCTTTCTAACTAATTTAAGTTTTTGACTTTCATTAACTTCTATTGCAGCTTTTACTGTTTTTAATTCATAACCATTATGTTCAGATAACCAGTGAAGAGCTTTTGTGTCTTTTGGAAAGCAAGAACCACCATATCCTATTCCCGCCTTTAAAAACTTACTTCCTATTCTATCATCATAACTCATTCCTAAAGCTACATCTTCTATGTTAGCTCCTGCTATTTCACAAAGATTTGCAATATCATTCATAAATGATATTTTAAGAGCTAAGAAGTTATTTGATGCGTATTTTATCATCTCAGCACTATTTCTATTTGTAACTATTATAGGTTGATTAAAAGGCTTATAGATTTCCTCTAATATTTCTCTAGCCCATTCACTTTCTACACCTATAACGATTCTTGAAGCATGTAGAGTATCTTTTACTGCTGTTCCTTGTGATAAAAACTCTGGATTAGATGCAAGCTCTACTTTTACATCATTTTTTAGGTTTCTATTTATATAATCTTCTATCTCTTCATTTGTACCAATTGGAACTGTAGATTTTATTACTACTAGAGTATCTTTTGTCACAGTTTCAGCTATTTGCTTTGCAACTGCCTTTATATAATCTAGGTTGGCTGAGCCATCACTTCTCTCAGGTGTACCTACAGCTATTAATATTACATCTACATCTTCATAAGCTTTTTTATAGTCTGTAGTGTAATCTATTCTTCCTCTGTTGTAATTTTTAACCATAAGTTCTTCTAGGCCTTCTTCATATATAGGTGCTATTCCAAGTTTCATTGATTTAACTTTTTGTTCATCTACATCAACACAGACTACATTTTCATTGCCTACCTCTGCTAGACAAACACCTGTAACCAAACCTACATATCCCGTCCCAGCTATAGCTATTTTCATTTTTTTACCTCCAAGTATATAAAACTTATACTCTTTTTTTAATGGCATTAAAAACATAGAAACAAAATACATATAGACTTTTTGGTAAACTTAAATTTTCAACATTTCTATAAGTATTCCAAGTTCGTTTTAATGCTTTTATCTTGTTACTTGATATAGAATTTCCAACTAATCTGTAATTCACTAAATCTTCTTGAATCCCATATGCATATTTTTCCTTTTTAAGTAACTGTAACCAGGTTGCAGTATCTTGTCCTCTTCTTACCAAAGGCATGCTGAACTCTCCTACAATCTCCTTATCAATGACCACTGTAGAACATCCTATTATAGTATTTCTAAGTAATCCTTCATAGTCAATTTTCTTAGGAGCTCTTGCAACCTTATTCGTTTTTGACCCATCTTGTCTCATATATCTATAAGATGTAAAAGAAAAACCTACATTTTCTTTTAACATATATTCTATCTGAATCTCTAATTTTCTACTATCCCATAAATCATCACTATCTACAAATGCAATAAATCGACCTTCCGCATTCTTAATACCAACATTTCTAGATACTGCAGCTCCAGAATTTTTTTCAAGCTTTATATATTTTATTCTAGCATCTTCTTTTCGAAAACTTTTTATAATTTCACTTGAATTGTCCTTAGAACAATCATCCACTAATAAAAGCTGCCAATTTTTATAAGTTTGATTTTGGATTGACTTTATCGTCTCTGATAAAAACTCTTCTGAATTATAAACAGGAGTAATTATCGATACTAAAGGCTCATTCATATTTTTACTCTCCTTATATAGCAACTAGCAGTACTATACCAACAAGTTTACTTAGATACTAATTTTCTTTGTCCAATATATTTGTAATATCCTAATGGGAATAATGCTAAATACAACAATTTATCAGATACTTTTCTTAATTCACCAAAATAATGACTATCAGACAACAATGAGTATCTGGCTAAATTTATGTAATTTTTTATCCACATATATGGATATCTACTTAATGGATATGTATTTTGATTTATTAAATATAAAAACTCTAATGCTCTACCTCTTAATGCATTTTTACTTAATATATTCTTAGTCAAACCATCATCCAAATAATCTCTTATTATCATAGGTTTATTTACACATATAACTTTATAGTATTTAGACATTTCATTCCATACTACACTTTCTGGTAAAAATCTCACTTCTTTTCTTTCTGGAAAAGGAAATTTTATAAGCTCATCAGTTACAAATACTATGCTTTTATCTCCCTTAACGCCATACTTAAAATATAGGTCTGCAAAGTGACATATTTTCTTATCTTCAGGCATTTCTGTCCCTATCAAATCTCCACTTGGATATACACAAAGTCCAACAACTCCACTAAATCCTTCTTTATTCTCTAAAGAATCCCACTCATCATTAGCAATTTCAAGAGAATCTTTAATTAAACCATCATCACTATCTACAATGAAAAATAGCTCTCCATCTGCATTTTTTACACCTAGATTTATTGCAGTATGTTTTCCTCCATTTTCTTTGTATATATATCTTATATTTAATTTATTTTCTGATATAAATTTTTCAACTAACTCTTTAGTACTGTCGCTACTTCCATCATCAACAATCAACCATTCAAAATCATTGAAATCATAAGTTTGAGCTTTTAAATCATTGTACAAATTTTCAAGTAAATGAGCTCTGTTATACGTCGGAGTAAATACAGTAAATTTATATTTATACATTAATTAAATCTTCCTCTCTGTCTAACTTTTTTTGATTCCGTTTATTCCATAATTAATAAAGTAGTATATAGCTTTGTATAAAGGTATTTTTTCTATATTTCTATATATATTCCAAGTCCACATAGCAGCTTTTATTTTATTACCACTTAGGGAATTGCTAGATTTTCTATATAATGCTAGAACTTCATTTATTCCATGAGCAATATGCCCTTTTTTCAATATCGATAACCATAAAACATAATCTTCATGTCTTACACCACTCATTCTTATTTCAAAATCCAATTTAGACTTATCAATCACAACAGTAAGACATCCTAAGATATTTCCTTTTAATAATCTTCTATAATCTACATTAGGTGGAACTTTTATTACTTTGTTTAATTTTTTATCATTTTCATCCATCAGTTCATATGAAGTAAATGAAATTACATAGTCATTTTCTAACATAAAATTTACTTGTTTTTCTAACTTACTACTATTCCATTGGTCATCACTATCTAAAAAAGCTATAAATTGTCCTGTTGCCTTACTTAGTGCTAAATTTCTAGCATTAGAGACACCCTTATTAGTCTCAGTCTTTATACATTTTATTCTACTATCCTGTTGCATATAAGATTTGACTATATTAGGACTATTATCTGTTGAGCAATCATCAATAATTAACATTTCCCATTCTTGATAAGTTTGGTTTAATACTGATTTTATGGTTGCTTCAATAAATTTTTCAGAATTATACATGGGAGTAATTATAGATACTAAATTCTTCTTCATATTACCTTCCTCATCATTTATAAAATATTTATTTAATTTTACTTAATACACAATCATATATCCTCTTGCAGTTCTTATTATCATTATATCTGAAAAACTTATTTCTTTCATTTTTTTGGTTATCCATAACCTCAAAATTATTTTCAATAATATCAATAAGTTTATTCACGGCTTCATCATTATTATAAGCCAAAGACCCAAACATTTCACTTTTTAAATCTATATATGAATCAACTTTTTCCATATATTCATCCAAATCGAATTGGTAAAACAAGATAGGTCTATTCATATACAAAAAGTCTATGGCTACACTTGAATAATCAGTTATATTTGCAGCTGATTTTCTGATTTCATTTGCTAGAGTTACCCCTTTATCTAAAAACACAATTCGTTTTCCTGTTATATTTTCTTTTATATCATCTATAAACTCATGCATAAGATGATGCATATAAATTTTTACATTTATATCTTTCTCATCTAATATTTTATTTAATTTGTCATCATTTAAAAAATTCATTATATTTTTAAAATAATCTGTATCCGTAAATTTTCCTGAACTAAATTTTATCCAATCTCTCCATGTAGGAGTATATAATATATCTCGAGTTTGTGCAACTTCATTTGTTGGTAAATTGTCATATCTTGCATTTCCAATTATATAAACTGAGTCATCTAACATTCCCCAATCATTTACCATGACATTTCTTTCAAATTCAGAACTTGCTGTAACTATATTATAGCTTTTATATAGGTTATCTATAATATTTTTGAACTTTTTGTTCATAGGTTTTCTTTTTTTAAAACTTATAGTCCCATGATTTAAAAACACTTTTATCGTTTTTTTATGAAAATAATTAAGAACAGGTACAGCAAAATTGTATGGTGCTATATCTGCTGATGGTGCATGTGAAAATACTATAGCTTTTGAATTGTAATAATACAGATAGTTTTCTACACTTCCTCTTATTAATTTTTTGCCTGGAATTTTATCAAATACTTTACTGTCTTTATTTACTACCCAATAAGTTTCTACATCATTATGTTCTTTTAGCATATACTCATAAAAAAACTTTGAATTATCATTGTATATATCCCCTGAATGTCCACCTATAAGCCAGATATCTCTACCATTAAACTTATGCTTATTAAATGGATATATAAAAAAAGCCAAAAGCATATTTATTAAAAATTTAACCTTGTCCATAAACACCATCCTCATTATAACTTGTACTGTCTAAATCCATTAATTCTTCCTTTTATAGTGGCACTATGATAATCTCTATTGGAACTCAATATAAGACCTCCTATATTTCTTACAAGTTTTGATACCATAACTTTTGCAAACTTATAATTTTTTCTATAGACTATTTCCTTTTTGCAAAGCGCTCCAAAGCCTCTTCCATAGTTATAATCTTTTTGATACTTTTCTTTAGATTTAGAATGTTTTTTTGCAGGATGGTAAATTATATCATTTCCAAAGTATTTTCCTTTAAAACCTAAACTCAATAAGTTTAAAACATAATCTATCTCTTCACCAGCACCAAACTCTCCACCAACACCCAATTTCTCATCAAATCTTGTATAGTCTTTACCTTCAAAATCAATAAAAAAAGTTATGGATGTTATAGTATCCAAAACGTTGGAACTTGTGATATCACAAGTTCCATCATACATTTTCTTAAATGCATCAACTTTATTTGAATCCATAGTTTTGCAACTGTATATTTTATAATCTTTATTTTTATTAAAGAAATTTATAACTTTTTCTAATGTATCATTTTCGTAGACACAATCATCATCAGGGAAACCTATAATTTGCCCTACAGCATTGTCTATGCCTACATTTCTGTTATAACTCAATCCTTTTTTAGAGCTTTTTATATACTTTATATCTAACTTATCAATGTATTTATCAACTATTTCTTTAACTTTGCTATTATCATTTTGGTCTACTACTATAAGTTCAAAGTTTTTGTAAGTTTGATTTTCTAAGCTGTCCATAAGTAAGTATATATCATCATATCTATTTAATGTTGGCATTATTAATGATATTAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP012309|3158236:3167189|3166349_3167189_-|AXU72843.1|DBSCAN-SWA MLISLIMPTLNRYDDIYLLMDSLENQTYKNFELIVVDQNDNSKVKEIVDKYIDKLDIKYIKSSKKGLSYNRNVGIDNAVGQIIGFPDDDCVYENDTLEKVINFFNKNKDYKIYSCKTMDSNKVDAFKKMYDGTCDITSSNVLDTITSITFFIDFEGKDYTRFDEKLGVGGEFGAGEEIDYVLNLLSLGFKGKYFGNDIIYHPAKKHSKSKEKYQKDYNYGRGFGALCKKEIVYRKNYKFAKVMVSKLVRNIGGLILSSNRDYHSATIKGRINGFRQYKL >CP012309|3158236:3167189|3160233_3161325_-|AXU72837.1|DBSCAN-SWA MKTVCYLADGSNPHTLKWCSFFKNKGYDIHVISLNGGHMEGIKIYNFGSNVKELKNENISKKTGYLGSIKQIKKLVNEIKPDILHAQYASSYGFIGSLLGYHPYIISVWGTDIYDFPNNGFIQKQIIKHNFRKADYIFSNSRDMAKEANKYTDKHVDVTFFGVDMDRFKPMEVEKEDAFVIGIIKSLEKKYGIEYLIQAFKMLKDEYKDKKIILKIGGSGSQMDNLINLAKELGIENDVQFLGRISPENVSKTFNSFDVTVFPSLREGFGVAAIESEACEVPVIVTNVGGHPESVWENETGLIVEPKQPEEIKNAIIKLMENDELRLNMGKKGRQFVRENYEVNLNFNDIEKIYDSIFDKYKK >CP012309|3158236:3167189|3161330_3162626_-|AXU72838.1|DBSCAN-SWA MKIAIAGTGYVGLVTGVCLAEVGNENVVCVDVDEQKVKSMKLGIAPIYEEGLEELMVKNYNRGRIDYTTDYKKAYEDVDVILIAVGTPERSDGSANLDYIKAVAKQIAETVTKDTLVVIKSTVPIGTNEEIEDYINRNLKNDVKVELASNPEFLSQGTAVKDTLHASRIVIGVESEWAREILEEIYKPFNQPIIVTNRNSAEMIKYASNNFLALKISFMNDIANLCEIAGANIEDVALGMSYDDRIGSKFLKAGIGYGGSCFPKDTKALHWLSEHNGYELKTVKAAIEVNESQKLKLVRKASKLVESFQDMKVAVLGLTFKPDTDDIREAPSIPNIKYLLERGARVTVYDPIGVNNTKKIFGDSILYADSVDDAIEDAEICFIMTEWKDVLNYDIHKYKEKMKNPLVLDGRNCYKIKDMEELGIEYYSIGR >CP012309|3158236:3167189|3165159_3166335_-|AXU72842.1|DBSCAN-SWA MDKVKFLINMLLAFFIYPFNKHKFNGRDIWLIGGHSGDIYNDNSKFFYEYMLKEHNDVETYWVVNKDSKVFDKIPGKKLIRGSVENYLYYYNSKAIVFSHAPSADIAPYNFAVPVLNYFHKKTIKVFLNHGTISFKKRKPMNKKFKNIIDNLYKSYNIVTASSEFERNVMVNDWGMLDDSVYIIGNARYDNLPTNEVAQTRDILYTPTWRDWIKFSSGKFTDTDYFKNIMNFLNDDKLNKILDEKDINVKIYMHHLMHEFIDDIKENITGKRIVFLDKGVTLANEIRKSAANITDYSSVAIDFLYMNRPILFYQFDLDEYMEKVDSYIDLKSEMFGSLAYNNDEAVNKLIDIIENNFEVMDNQKNERNKFFRYNDNKNCKRIYDCVLSKIK >CP012309|3158236:3167189|3163451_3164360_-|AXU72840.1|DBSCAN-SWA MYKYKFTVFTPTYNRAHLLENLYNDLKAQTYDFNDFEWLIVDDGSSDSTKELVEKFISENKLNIRYIYKENGGKHTAINLGVKNADGELFFIVDSDDGLIKDSLEIANDEWDSLENKEGFSGVVGLCVYPSGDLIGTEMPEDKKICHFADLYFKYGVKGDKSIVFVTDELIKFPFPERKEVRFLPESVVWNEMSKYYKVICVNKPMIIRDYLDDGLTKNILSKNALRGRALEFLYLINQNTYPLSRYPYMWIKNYINLARYSLLSDSHYFGELRKVSDKLLYLALFPLGYYKYIGQRKLVSK >CP012309|3158236:3167189|3158236_3160150_-|AXU72836.1|DBSCAN-SWA MRESIDLEKESFFNRLFKKYKFRHLTLLILDICSVLVAFRMSLSLTGNLNAFTTNDIIISVCIYIVLHIVSFRLFKCYNTLWRYAGEEEIISIFVATLAYLIPIYIINKLLGFDYPIMFYVLNTIFIIMFTSGARIAYRAIRIVMNKTYSRGKVSNILIIGAGDAGEMVIQELKRNPELKKVAVAIIDDDKNKIGRIIHNVKIVGTTSDIKDVVEKYNVDEIIFSIANIEKRRKKEIIDVCKNTNCKIKTIPGIYEIIDGKVDIKQIREVEIEDLLGREPIKTNLREISNYIEGKVILITGGGGSIGSELCRQIAGFNPKELIIVDNYENNAYSIQQELLRKYKNKLDLKTVIASIREEKRMDEIFNKYKPEVVFHAAAHKHVPLMESSPGEAIKNNIFGTLNIAGLSSKYRAKKFVLISTDKAVNPTNIMGATKRAAEMIIQTMNAESQTEFVAVRFGNVLGSNGSVIPLFKKQIEDGGPVTVTHPDIIRYFMTIPEAVGLVIQAGAMAKGGEIFVLDMGEPVRILDLAKNLIKFSGFEPDVDIKIEFSGLRPGEKLYEELLMSEEGLLDTEHKKIFIGRPIDVDREKITKYLKLLREITNNEEVEKIDGIMRELVPTYIKPEDANIKEIATTREK >CP012309|3158236:3167189|3164381_3165131_-|AXU72841.1|DBSCAN-SWA MKKNLVSIITPMYNSEKFIEATIKSVLNQTYQEWEMLIIDDCSTDNSPNIVKSYMQQDSRIKCIKTETNKGVSNARNLALSKATGQFIAFLDSDDQWNSSKLEKQVNFMLENDYVISFTSYELMDENDKKLNKVIKVPPNVDYRRLLKGNILGCLTVVIDKSKLDFEIRMSGVRHEDYVLWLSILKKGHIAHGINEVLALYRKSSNSLSGNKIKAAMWTWNIYRNIEKIPLYKAIYYFINYGINGIKKS >CP012309|3158236:3167189|3162651_3163404_-|AXU72839.1|DBSCAN-SWA MNEPLVSIITPVYNSEEFLSETIKSIQNQTYKNWQLLLVDDCSKDNSSEIIKSFRKEDARIKYIKLEKNSGAAVSRNVGIKNAEGRFIAFVDSDDLWDSRKLEIQIEYMLKENVGFSFTSYRYMRQDGSKTNKVARAPKKIDYEGLLRNTIIGCSTVVIDKEIVGEFSMPLVRRGQDTATWLQLLKKEKYAYGIQEDLVNYRLVGNSISSNKIKALKRTWNTYRNVENLSLPKSLYVFCFYVFNAIKKRV |
8 | Catovirus(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
3646830 : 3655173
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP012309|3646830:3655173|DBSCAN-SWA ATTACCCTAGCACCTTCCTTATCTCCAGTGCTATCTCACTTTCTAAACTTTCAACTTCCTTCATAATATCATCAAAGCTTTTTAACTTTTCATACTTATAAAAATATCTAGTAAAAGGTATCTCATATCCTATATTATCTATACTACTTTCATCTATATAAGCATCTTCAACATGAGGTTTTACCTCTTTTTCAAAATACTCATACACATCTTCTTTAAGTGCTATACTTTCAGTATCTTTTAAACTACTATCACTCTCTATATTCCCTTTAGCATCTTTGCAAACTACTGCGTCTTCATTTCTTACTCCTATAGCATTAACTATAGCTTTAATTAGTCCTGCTGATAAAGCTACATCATATAACTTAGACTTAGATTTTAAATCTTTAATAAACTTATCCCTCTTCATATACTCAAATTCACTATCAAAACTTTCTAAAAGTTTTAATAACTTATCTTGTTTTACTCTTCCTTCTGCTTCTTCCTTAACTTTAACTTCTTCATCTTTTTTCTTAGAAACTGAAAGATTTATAAATTGAGTAGTATTTTTAACATTTTCTATAGCTTCTTCATTTACTCTAAAGCTCAGTTTTAAAGGTCTTTCTATTGTTACTTTTCTATATCCAAAGCCTTCATTGTCAAATATTTTACTATTTTCACTTTCTTCAAATCTTTCATATATTTCTTTTATTTCTTCTATTTGTTCAAGACTTATTTCTTTTCTTTTATTTCCTAAACTTTTTCTCATTAATTGATAATATTCACTAGCATTTACAAGTTGTATCTTACCTTTTCTTTTATCCTCTTTTTTATTAGTAAGTACCCATATATATGTAGCTATTCCTGTGTTATAGAACATATCAGTAGGTAGTGCTATTATACCCTCTAGTAAATCCTTTTCTATTATCCATTTTCTAATGTTAGATTCACCACTTCCTGCATCTCCTGTAAATAATGGTGATCCATTGAATATTATAGCTATTCTACTACCTTCTTCATCATCATACATTTTGCTTATCATATTTTGTAAGAATAGTAACGACCCATCACTTACTCTTGGTGTTCCTGCCCCAAATCTTCCATCAAATCCTAAGTCAGCTTCTTCTTTTACTTTCTTCTCTTCATCTTTCCATGTGACACCAAATGGTGGATTTGATATTAAAAATCTTATCTTTTCTCCACTAAATCTATCTTGCGTAAGAGTATTTCCTAGTCTTATATTATCTGGATTTTGTCCTTTCATTATCATATCTGCCTGACATATTGCAAATGATTCATCTAGTAATTCTTGTCCATATACATTTACTATGGCACTTGGATTTACTTTTTCCACATAGTCTTCAGCTATTGAAAGCATCCCACCAGTACCACAGCAAAAATCTGCTATAGATATTACTTTTCCTTCTTCTGTAAGGAAGTTTTCTTTGCCCATAAATAACATTTCCATACAAAGTCTTATAACTTCTCTTGGAGTATATTGTTCTCCTGCTGCTGAGTTTTCTGTAAATCTTCTTAGCATTTCTTCGTATATGTATCCCATTTCGTTGTTTGATACAGAGTTTATATGTAGGTCTACTTCATACATTTTGCTAAGGACTGCATATAGCTTGTCTTTTTTATCTAATTGAGCTATTTCATCTTTGAATTTAAATTTCCCTATTATTTCTTTTACACTGTTTGAGAATCCATTTAGGTATTCTTCAAAGTTCGATTTTATATTTTCACTATCATCTAACAGTTTTTTCCATGTAAAATCACTCACATTGTAGAACTGTAAGTCTATATTATGGTTTTCTTTTAGATCCACTATTACAAGTTCGTCTTTTTCTTCTTCTGGTAAGAAATCATATTCTTTGTATACTGATTTCACTATTTCTCTATCATAATCATCTAATAGACAATCAAATCTTCTTATTACTATTAGTGGTAACATTACTTTTCTGTAGTCTTCTTCTTTGTATGTACCCCTTAAACTTTCTGCTATATTCCATAAAAAAGCAATATGATTAAAATTATTATCTATACTCACTTATACTATCTCCTTTTAATTAAATTTTAAATTAGTTTATATTATAATTATATCATTTCATGGCACAAAAAAAACATATTGACAAAACTATCAATATGTTTTTCGTGGATTTCAATGGTGGAGACGAGGGGATGCTACATTCTTATTTCTGCATCTTCATGTCTTGTCACTTTTTATGTTATATCAACACTTGTAATTTTTATATTTCATGTATATTATTATAAATTCATATACATTATTAAATTAGTTGTGTGCTAAATGTGTGTTAAATTCATATATTTTTTACATATATAAATTATTCTATTGAGTCCCTTTTTTTATAAATTTCTAATTCTTTTTGCTCTGCTAAATGTATTTTATTAGTTTCTTTTTCTAAATCCTCATCTGATATATTATGTTCAGCAAGAAATACTTCTTTCATTAAATTCCAATATTTTGCCTTAATATTCCTTATCTCAACATTTTCAATCCTGCTTATTTCTTCTTGATTTAGATTTTTTTTGAATTGGTCTTCATAACTCAAATAATTTTTTTTGCTCAACACTACGCCTCTCTTTCTATATCAGATATTATTTAATAATTACATAACTACTATTAATAAATTTCTCTTCTAATTTATTTCAAATTTTATTATCTCTTTTAATTCCTTCAAATCCGCATCTTTCAATTTATCTATTAAACAAAATTTTTTACCTATTCCATTTAAAGATGTCCCAACAACAATTCCTTTATTATCTGTTAGCCAGAATCTATCATGAAAATTTTTTGAAATCTTAATTTCAATGTCTATATCTAAAATTTCTTTTACGAAACTATACAATTCTTCATTATAATCACTTGTTATTATAGTTATTTTTTTACATCCATTTAAAATTTTCAAGAGCATTGTTTTATAATGTTCATCATATCTGTTTGGTAAAATATAATTATCTACTATTATTAAATCTTTCTCATACCCATCTATTTTTTCAATATAATCTCTCATTTTTACCACTTTTTCATCTCGACTCATGTCTATACGTAACAAGTCATAATCTTCTGTATCATTAATATCACTTTCTTCTTTAAAACCTAAATCATAAGCTACTACATCATCAGTAAACGAAGGATAAAAGCGTAACTCCCATCCATGTTCTTTTACAAAATCAGAAATTAAAAACACAAGTTCAGTCAATTTGGTGCCTCTATCGTCTATTTTAGTAACATTAAAATAAAATAACATATAAATACTCCTTTTTAATTTATTGTATATTAGAATAAAAGATAAATAAAGATGCTGTTATATTATTTATTCACAAAATCCAATACCTTGTAAAAAATGAATCTATCATTATGCTTTATTTTTGCTAGAATCATTCGACAAATTGCTGATATAAGTTCTTAAATATGCTATAAATTAAAGTATATTATTTACAAAATATAGATGATAAGAAAGGATTTTTAATATGCCTAAAACTAATGATGAGAGATATAATATTGATGAATTTAAAAAAATTCATAAAGAGGAAATAATTGATATAGAAAAATATAGAGAATATTATGATTATAATTTTATATTTTATAATAATATGAAAGAAATGAACTCTATTGAAAATATAAGAAAAGAAAGGGCTAGAATTAAGTCAGCATTGGAATCTAAAAATAACCCTGTAACCCCATTTTATATTACTTTGTATGCGGCATTTTTAACAACCTTCTTTGGAATTATAATTAGTGAATTAAAAATATACTTTATTATCATTGAAAGTTTTATCTTAATTTTCTTCATTATTATTCTAGGCAAAGCAGATAAAAAATCAATAGAGTCTAAAGAATACCAAATATTTTGCATGACTTCATTACAGGTGTTGGATGATATAGAAAGGAAAAAGCTTAGAGAAAGAAAGTATAAAAAAAGAAAGTAGCAACTAACTAGTTGCTACCTTCTAATCTATCTATTAATAAAATCTAATGCCTTATAAAGTGTATCAAATCTATCATTGCCTTTTATTGCAGTATACTTCTCTTTGGTAATGGAACCTATCTTATTACATGCCTCTCCCCCTATGACATAAAGATTTTGCGTATGACCAGGTACATAATCTTTTATATCGCATACTCTACATTCATTTTTCTTATAGTTCCAACTAATTATTTGCGCTAGAACTTTGTCAACTTCTCCTTCATAGACTATTGTGTATTTTGTCATCTTATTCGCTCCCTCACCATGTTTTACTTTATCTTTAAAATCTACCCATAACTTTGGATTATCAAGCATTTTACGAGGACAATATTTTTTCTTAGCATCATAGTGTCTAATTACTTTGTCAGCACTAATATTTAAATCTTTCATTAGTTTTCTAGTTAAGTCTATTGCATTTTCTCTTGCTTTTGTATAGTTACCATCTTTATTTACACATATTTCTATATTAATACTATTATAGTTTGTAACTCCTGCAACTAATGCAGTTCCATAACTTTTGCCAACTGCCCAAGCTCCGTCTTTATAGTCTAATGTTTGATATATTACTTTATCATCTACATAGTAATGTACACTTGCTTCTAAATTACCATTGTTAAGTGCTTGTGCATGTCTTTTGGCATCTGCTCCCTTGTCCTCGTTATCAGTTTCATGAATCACTATGAACTTTGCATTATTCTTGTTTGGATAACACTTTTTCTTTGTTAACATTTTTATTATATCTACCATTATTTGCTCTCCTCTCTAAGTTGTTGAAGTGCCTTTTTTATTTGTTGTGGAACTGGTAATCCTATTACACTACAATTTTCTAGTATACTTAGTGCTTCATTCGCTATATAGAAATAACATACTAGACTTCTAAATACCTATGTTCCATTACTCAAAAGTCTGTCTAATACAACAGCAACAATTAAAACTATTAGAATTCCACTTTTCTTAGCTAAACCCTTAAATCCTTTTGTACTAGATAATTCTTTTAATGTATAACCTTTAATAATACCTAGTAAATAATCTGCAACCATTAAAGTTATTAAACCTATCAACTCCAAATAACCATGTTGATATTGTTCCTATTACTGCTATGATTGAACTTAATTTTCCATCATATATATTCATACATCCTCCTAATTTTGTATTAAAAAAAGAACTTAGATTTAACTAAGCCCTTTTTAGTGCAATTTATTATTTTACCTTTAAATTATTAATAAAATCTGCAGCTATAATAAAATATGCTGCATCGCATTTCGCTTTTCCAATAATACCCGGATTAGAAATGTAACAACTTGTTGGGTTTTGTTCTATCCCCTCTAGCTTTATATTTTCTACCATTATAAATATCTCCCCCATAGTAGGTATAATTAACATTAGAACTAGAATGCAAATTACAATTATTTTCTTCATTTTTTAATCTCCTTTTAATAGAATTTTTTTATTATAGATAAAAATAAAAAATATATAACTAAAAAAGGAAATTATTTTTAATTTATATAAAAAAAGAACCTACTTTGTTGGTTCTGCTCCTTCTACTACTCCACTTTCTCTAATTATATAATCCTCTACTGCTTTTCTGTGCTCTGTGTTAGTTACGTCATCCAGTTCAAATTCTCGATTTTTTAGAGGGTTTAAACCTCCACTTAAAATCCTCTCTGCTAATATTCTTACTACAATATTATTTATGTTCATTATAAAATTCCTCCTACTTTTTCGTTTTCTGCAATTAATAATTGATTTTCTAATTCTTGTATTCTTTTTTCTTCTTCATTTACATATACTGGCATTTCTTCTGAAATTGGTTCTTTTGTTTCTATATTTATACCTATTATTCTATATTTTTCATAGTCTATACTTCCATATGGAACATCAATACAATGCAACTGTGTTATTATATCATGCTCCAATATATCCCCTGTTGCTTCTCCTGTTTGCAAGAGTATTTTACCTGTTTGGTCACATATAATTCTATTTGCTCTGTTCACTTTATCACCTCATTTATTAAATAAATTTTATAGCTTGCCACTTAAAAGAAGAACCTTGTCTTTGGCAAGGAAGTTGTATGCCTCTATTATCCATATAAACATCACGTTCATTTAATTTAAGAACTTCGCCTTCAACTTTAAAATCTTTTAAATATGTTTCTAAGCGGTGATAATGTGCAGTAATTACAAAATCCTGAGTGAAAATACCACGACAAGCAAAAACAAAAAATTTACGAAAATAACCGCTATCAATTAATTCAAAAGTAGTAAAAAATATATTAGGAACAAAATTAAGTCCGTTAATTTGAATGGCTCCAGGAAATAGGAATAGATAATCGCTTCCATGATAAAACCCATATTTATTAACACAACTATTAACAACACTATTACCACTAGCAACTTTATATTTAGAATTTAACTGACTTATAGTATTATTAGCCTGTGTTAATTTGTTTGTTAAATCCTCGATACTAGCATCTCCACTATCAAAACTTGCTTTAATTTTTTCTGATAATTCCACTAATGTATTATTTAAACTTGCTTCTATATTCTTTAATGCTAAAGTATTTATAATACTTGTTTTCCCATTTTTAAACCCTTCTCCAATCTCTATCAACTTAGTTGATATATCGCTTAAACTAGCGTCTGTTTGCAGTGGCATTATTTCTTTACTTATGCTCAAAATTTTCTCAACTGTTGCATTTTCTGCATCTGTAGCAACTATTTTTAATGTGTGTATTGCATTGTCTGTAAGTTCATAGTTAATAGTTTTCTCTAAATATAAATCTGTTGTTATAGTTTCTTTTAATACATCATCAATAAACCACTCTATTTTAGATAAATTATTATCCGTGTCTATTGCTGTAAATGTTGCAAAAGTGGAGTTATAAGAGGATATATCCAACTTTGGTTTAGTGTTTCCTTTTGTAAATGTAACTGTTTTTTCTAAGAACTTACCTCCTTGATAAGTACTAAGTTCTATAGTTATATTATTTGTAGAGTTAAAACTTAAAGTTGACAAATGTTCGTCTGTAATATTTAAAGTATAGTTACCATCAACAGCATAGTTTTTTTTAGATATTACAACACCATTTAATTTTTCAGTTACATCAAATTTTACGCTTGCATTGCTGTCTGGAATTCTATAATTTATACTACAAGAATCACTAATAACACCTAAATCATCATTTATAATAATATTAGGGTCGGGTATAAGTTCAAGAGTAATAGCTTGTTTCATGCCATTACTACTAGTTATCATACTTCCACCAGATATAAAATAAACACGAGTTGCAGTTTTTTCATATTTAGTGCTTGTAGGAACTGTTATATATTTAGAATTACTTAAATCAAACACACCATAGTAAGTTGACTCATACATACCACCTTCCCCATAAACATAAGGACAAGGCGAAAGAAAAACATCTTGCTCTGAATAATAACCTCTTCTTTTTTTAACAGTTCTATTACAAATAAACGTTGATGCTGGAGGCATTTAATCACATCCTTTCTACATTGGTATTAAATTATTATTTATACTAGATATAATACTGCTTCTATTACCTCTTACCTCTGCCACTATTTCATCAATCGCCCCTTGCACATTCGTAGCAGTAAGATTACTTGTTGTATTATTATAACTTGTTTTCTCTGCTGTTGTTTCTATGCTATCTACGCTAGTTTTTACCTCATTGATTGCATTAACAAGACTAGTTTTATCTGTTGTTTCAAGTTGTGTTGTATCCCCTATTTTGTTGTTTAACTCTGTTTTAGCAGTTTCTAAGTTACTTGTTAATTCTGTCTTATTTGTATCTATTTTAGTGTCTAAATCTTGTATATCTTTTAAAGTTGCTAAAATAACAGATTAGTATACTTTGATTCAGATGCTATGTTAAAAACTACATCTACATCAAAAGTTGTTTTTGCAAATTTCTTTAAGTGAGATATTTTATTTTCATCTATATCTAATAAATTTATAGTCATAAATGGTTTTTCATCCATTTTGTTTTTTTCTTCTAAATCTGTAAAAAACTTATAAATTATTCCATTTGTAAGTATTGCGAACCTTGCCTCTGTAGCTGTAAAATATCTAAATAATTGTGCATCATGCTTTGTAAGCTTATCTTTTATATTTTTGGCTTCTATTAAAATAATTGGCTTACCATCTTCTAGTATTGCATAATCGACTTTTTCCCCTCTTTTAACTCCAACATCTGCTGTATATTCTGGCATAAATTCTAATGGATTGAAAACATCATATTCTAAGATTTGAAAGAATGGCATTATTAATGCTGTTTTTGTTGCTTCTTCTGTAGTTAAATTTCCTTTTATCACCTCTATTCTTTTACTAAATTGTTTTATTTTATCTGAAAAATCCAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP012309|3646830:3655173|3652000_3652219_-|AXU73236.1|DBSCAN-SWA MKKIIVICILVLMLIIPTMGEIFIMVENIKLEGIEQNPTSCYISNPGIIGKAKCDAAYFIIAADFINNLKVK >CP012309|3646830:3655173|3651808_3651934_-|AXU73235.1|DBSCAN-SWA MNIYDGKLSSIIAVIGTISTWLFGVDRFNNFNGCRLFTRYY >CP012309|3646830:3655173|3650788_3651547_-|AXU73233.1|DBSCAN-SWA MVDIIKMLTKKKCYPNKNNAKFIVIHETDNEDKGADAKRHAQALNNGNLEASVHYYVDDKVIYQTLDYKDGAWAVGKSYGTALVAGVTNYNSINIEICVNKDGNYTKARENAIDLTRKLMKDLNISADKVIRHYDAKKKYCPRKMLDNPKLWVDFKDKVKHGEGANKMTKYTIVYEGEVDKVLAQIISWNYKKNECRVCDIKDYVPGHTQNLYVIGGEACNKIGSITKEKYTAIKGNDRFDTLYKALDFINR >CP012309|3646830:3655173|3654645_3655173_-|AXU73240.1|DBSCAN-SWA MDFSDKIKQFSKRIEVIKGNLTTEEATKTALIMPFFQILEYDVFNPLEFMPEYTADVGVKRGEKVDYAILEDGKPIILIEAKNIKDKLTKHDAQLFRYFTATEARFAILTNGIIYKFFTDLEEKNKMDEKPFMTINLLDIDENKISHLKKFAKTTFDVDVVFNIASESKYTNLLF >CP012309|3646830:3655173|3652810_3654289_-|AXU73239.1|DBSCAN-SWA MPPASTFICNRTVKKRRGYYSEQDVFLSPCPYVYGEGGMYESTYYGVFDLSNSKYITVPTSTKYEKTATRVYFISGGSMITSSNGMKQAITLELIPDPNIIINDDLGVISDSCSINYRIPDSNASVKFDVTEKLNGVVISKKNYAVDGNYTLNITDEHLSTLSFNSTNNITIELSTYQGGKFLEKTVTFTKGNTKPKLDISSYNSTFATFTAIDTDNNLSKIEWFIDDVLKETITTDLYLEKTINYELTDNAIHTLKIVATDAENATVEKILSISKEIMPLQTDASLSDISTKLIEIGEGFKNGKTSIINTLALKNIEASLNNTLVELSEKIKASFDSGDASIEDLTNKLTQANNTISQLNSKYKVASGNSVVNSCVNKYGFYHGSDYLFLFPGAIQINGLNFVPNIFFTTFELIDSGYFRKFFVFACRGIFTQDFVITAHYHRLETYLKDFKVEGEVLKLNERDVYMDNRGIQLPCQRQGSSFKWQAIKFI >CP012309|3646830:3655173|3649468_3650080_-|AXU73231.1|DBSCAN-SWA MLFYFNVTKIDDRGTKLTELVFLISDFVKEHGWELRFYPSFTDDVVAYDLGFKEESDINDTEDYDLLRIDMSRDEKVVKMRDYIEKIDGYEKDLIIVDNYILPNRYDEHYKTMLLKILNGCKKITIITSDYNEELYSFVKEILDIDIEIKISKNFHDRFWLTDNKGIVVGTSLNGIGKKFCLIDKLKDADLKELKEIIKFEIN >CP012309|3646830:3655173|3650303_3650762_+|AXU73232.1|DBSCAN-SWA MPKTNDERYNIDEFKKIHKEEIIDIEKYREYYDYNFIFYNNMKEMNSIENIRKERARIKSALESKNNPVTPFYITLYAAFLTTFFGIIISELKIYFIIIESFILIFFIIILGKADKKSIESKEYQIFCMTSLQVLDDIERKKLRERKYKKRK >CP012309|3646830:3655173|3646830_3648858_-|AXU73229.1|DBSCAN-SWA MSIDNNFNHIAFLWNIAESLRGTYKEEDYRKVMLPLIVIRRFDCLLDDYDREIVKSVYKEYDFLPEEEKDELVIVDLKENHNIDLQFYNVSDFTWKKLLDDSENIKSNFEEYLNGFSNSVKEIIGKFKFKDEIAQLDKKDKLYAVLSKMYEVDLHINSVSNNEMGYIYEEMLRRFTENSAAGEQYTPREVIRLCMEMLFMGKENFLTEEGKVISIADFCCGTGGMLSIAEDYVEKVNPSAIVNVYGQELLDESFAICQADMIMKGQNPDNIRLGNTLTQDRFSGEKIRFLISNPPFGVTWKDEEKKVKEEADLGFDGRFGAGTPRVSDGSLLFLQNMISKMYDDEEGSRIAIIFNGSPLFTGDAGSGESNIRKWIIEKDLLEGIIALPTDMFYNTGIATYIWVLTNKKEDKRKGKIQLVNASEYYQLMRKSLGNKRKEISLEQIEEIKEIYERFEESENSKIFDNEGFGYRKVTIERPLKLSFRVNEEAIENVKNTTQFINLSVSKKKDEEVKVKEEAEGRVKQDKLLKLLESFDSEFEYMKRDKFIKDLKSKSKLYDVALSAGLIKAIVNAIGVRNEDAVVCKDAKGNIESDSSLKDTESIALKEDVYEYFEKEVKPHVEDAYIDESSIDNIGYEIPFTRYFYKYEKLKSFDDIMKEVESLESEIALEIRKVLG >CP012309|3646830:3655173|3652318_3652501_-|AXU73237.1|DBSCAN-SWA MNINNIVVRILAERILSGGLNPLKNREFELDDVTNTEHRKAVEDYIIRESGVVEGAEPTK >CP012309|3646830:3655173|3649153_3649399_-|AXU73230.1|DBSCAN-SWA MSKKNYLSYEDQFKKNLNQEEISRIENVEIRNIKAKYWNLMKEVFLAEHNISDEDLEKETNKIHLAEQKELEIYKKRDSIE >CP012309|3646830:3655173|3651684_3651840_-|AXU73234.1|holin,lysis|DBSCAN-SWA MVADYLLGIIKGYTLKELSSTKGFKGLAKKSGILIVLIVAVVLDRLLSNGT >CP012309|3646830:3655173|3652500_3652794_-|AXU73238.1|DBSCAN-SWA MNRANRIICDQTGKILLQTGEATGDILEHDIITQLHCIDVPYGSIDYEKYRIIGINIETKEPISEEMPVYVNEEEKRIQELENQLLIAENEKVGGIL |
12 | Clostridium_phage(57.14%) | lysis,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
3817385 : 3877222
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP012309|3817385:3877222|DBSCAN-SWA TTTAGAAATTCACATTTATTGTTACTGCTTTTCCACCTCTATTTACTGTTATTTTTGTACTAGCACCTTTTGAGAAAGTATACAACTTTTTATTTAAATCATTCATACCTGTTATATCTGTATCTCCTACTTTAGTTATAATATCCCCTACCTTTACTCCAGCTTTTTCTGCTGATGAACCAGATATTACTTCTGCAACATAAACACCTTTATCAGTACTTAATTTTGTACCTGTTGCTGCTTCATAATTTGATACATCTGTACCTTTTATGCCTAAAGTTACTTTTTCATATTTTCCATTTTTGATTACTTCTTCAACTATACTCTTAGCTGTATTGATTGGTATTGCAAATCCTAATCCTTCTGCTTGAGAAGCTTTTGCTGTGTTTATACCAATTACTTGACCTTTTTGATTTAACAATGGTCCTCCACTATTTCCTGCATTTATACTTGCATCAGTTTGTAATAAACCAGTCATATTAGTTTTTTCTGTTTGTATAGTTCTATCTAATCCACTTATTATCCCTTGAGTAACTGTTTTTTGAAAATCTAATCCAAGAGGATTACCTATTGCTATTGATATATCTCCAACTTTTACTTTGTCACTATCAGCAAATTCTGCTGGTGTTAGTCCAGTTTTATCAACCTTAACTATAGCTAAATCAAGTTGTTGGTCAAACCATACTACTTTACCTGAAGTTGTTGAACCATCATTGAATAATACATTTACACTTGTAGCTTGACCATCTGATATAACATGAGAATTAGTAAGTATATATCCATTTGAATCAACTATGATTCCAGTTCCTACACCTTGTGTTTCAGTTGGTATTGCAAACATATTACTAGTATCAACACTAGTTGTTGTAATACCTACAACAGATGGCGTAGCTTTTTCTGCAACTGCTTGATAAATATTTTGACTCTTACCATCATCATTTACAACTATCGGCGTAGAACTTCCTGTAGATTTACTTACTAAATTGTCCTTAACTAAAATTATTGTTAGAAAACTACTAAGTATTGAACTTATTATAGCAACTAATATTACTAAACTTATCCCTTTCTTTCTTCTTGACATCTCATACCACTCCCTATCTTAATATAATATAAATTATCAAAATATATTTTTCCCAATTTTTCATAAAAAAAATGAAATCATCTATTTTGAGTAAACTCCTTTTTGATGATTTCATTATATTATTTTAATCTTAATTAAACCTTAACTATTTAAAATTATTTAAGTCTTTTTTCTAGCTCTTCCTTTTCTTTTTCATAACCTGGTTTGCCTAGTAAAGCAAACATATTTTTCTTGTAAGCTTCTACTCCTGGTTGGTCAAATGGATTAACTCCCAATAAATATCCACTTATTCCACAAGCCTTCTCAAAGAAATAAACTAAATATCCAAAATTATACTCATCTAGTTGAGGTATATTTATTACTAAATTAGGTACTTTTCCATCTGTATGAGCCAATAGAGTTCCTTCAAAAGCTTTATGATTTACAAAATCTACAGTCTTACCTGCTAAATAGTTTAAACCATCTAAGTCTACTTCCTCTGAACTTATAGTTATATTTCTCTTACAGTTTTCAACATTAAGTACTGTCTCAAATAAAAGCCTTTTTCCATCTTGTATGTATTGACCCATAGAATGTAAATCTGTTGAGAAATCTACAGAAGCAGGGAATAAACCTTTATTTTCTTTTCCTTCACTTTCTCCATAAAGCTGTTTCCACCACTCACTTACATAATGTAGTTGAGGTTCATAGTTCACTAATAACTCTACATCTTTTCCTTTTCTATGTAAAATTGTTCTAGCAACAGCATATCTATAACTATCATTACTTTTTAAGTCAGGATTTTGAAATGCTTCTCTAGCATCATTTGCGCCTTTCATCATAGCATCAATATCAAGTCCAGCAGCAGCAATAGGAAGTAACCCAACTGCTGTCAATACAGAAAAACGACCACCTACATCATCTGGTATTACAAAAGTCTCATATCCTTCTTCTGTAGCTAACTGTCTAAGTGCACCTTTACTTGCATCTGTTGTTGCATAAATTCTCTTTCTTGCTTCTTCCTTACCATACTTTTTCTCTAAGTAATCTTTAAATATTCTAAAAGCCAGAGCTGGTTCTGTAGTAGTTCCTGATTTAGATATTACATTTACAGAAATATCCTTTCCTTCAATTATATCTAATAAATCCATAATATATGTTGAGCTTATATTATGCCCTACAAAATATACTTCTGGAGCCTTTCTTTGCTCTTTTTTAAGTCCATTCCTAAAAGAATGACTTACCATATCTATAGCAGCTCTCGAACCTAAATAAGAGCCTCCTATACCTATTACCAAAAGAACATCTGAGTCTGATTTTATCTTCTCAGCAGATTTTTTTATTCTGTCAAACTCTTCTTTATCATAATTTTTAGGAAGGTCTATCCATCCTAAAAAAGTATTTCCTAAACCAGTTTTATTATGTAACATGTCGTGCGCAACATCTACATATGGTTGCATGACATCTATTTCGTTTTGACAAAAAAACTCTGTAGCTTTACTATAATCAAAATTTATTTTTCCCATTTAAATCCCTCTTTTCAGCATATTCGTTTTAAAGAGATTATAACACAAAATATAGGTGTTTTTTTTAAAAGTTTGCCACAAAATCATACATATCTCATCATTTATTATCAGGAAATCGATTCTTCTAAATGCTATAACTATGTATAAATTTAAAAATTTTAGTCAAATAAATTTACAAAAAAAGAAACTCTAAACGTATCATTTAAAGTTTCTCTTTTATTTATCCTCTATTTTAAATTTTATATTATTTTAAATTAATTATTTTTAATCATTTCCTAATCTCTTTGCTATAACTTGTTGTGCTATATTGACAGCATGGTCAGATATTCTCTCTAAATTACTTATTACGTCTAAATAAATAACTCCATTTTCTATACTACATAGATTATTGTTCAATCTATACATGTGATTAGCTCTACAAGATTTCTCCATTATATCAACTTGTTCTTCAATTTTTATAACCTTACAAGCTAAATCAACATTATCAGTTCTCATTGATTCTAATGCATAAGTATATGCTGAAACAACTCTATTATACATAACATCAAGTTCAGATTGTCCTTCTTCTGAGAAAGAAATATTTGAATCTATTGCAACTTGCGATAATTCAGCTATATTTTTAGCGTGGTCACCAATTCTTTCTATATCATTGACTGTATTAAACAAAGTATCCACAACTTCTCTTGAATCATCATCTAAAGGTGCTTTTGAAAGTTTAAGTAAATAATTTAAAATAGCTTTCTGTAAATCATTGATTAATCTCTCTCGCCTATATGTCTTATCTATTTTTTCAGTTGAATGTTCTACTAAAGCTTCCATAGATGCATTTAGGCTTTCCTTCGCCTTCTCACCCATACGAAGTGCTTCTTTTATCGTATTTGCAAGAGCTATAGAAGGAGTTTCTATCATTCTATCATCTATATATTTAATAGTTTTAGTTTCATCTTCATCTATATCACCTGCTCTATCAGGAACAAGTTTTATAGCTAGTTTTATAATAAGATTTGTAAATGGTAAAAGTATCAATACAGATATTATATTAAACAATGTATGTGTATTGGCTATTTGTCTTGCAACATTGCTTGGGTCCCAACTTGTAACCATGCTTACTACTGGTTTATTCAAGAATATTAAGAATATCACTGTTCCTAAAACATTGAAGATTAGATGCATCATAGCTGCTCTTCGTGCATTTTTGTTAGCACCAATACTTGATAACAGTGAAGTTACACATGTACCAATATTTTGGCCATAAAGAATTGGCAGTGCTGCTGATAATGGCACTAGACCTTCTGCTGCCAGTGCAACCAACATACCCATAGATGCACTTGAACTTTGTATTATTGCTGTAATCCCAAATCCCAATAATAATCCAAGTAGTGGATATCTACCAAATGTAACAAGTAAGTCAGTAAATCCTTGATAGTCTCTTAGTGGCTCCACTGCCATCTTCATAAAATCCATACCTGTAAATAATATACCAAAACCTATAAGTATTTCGGCTATATTTTTTATTCTAGGCTTATTTCCAAATAAATAAAGTATAATACCTACACCTAATGCTACTGGGGCCATACCAGTTAAGTCGAAAGATACCAATTGGGCTGTAACAGTAGTCCCTATATTAGCACCCATTATAACTCCTATTGCCTGTTTTAAAGTCATTATTCCTGCATTTACGAAACCAACAACCATTACAGTAGTAGCACTTGAACTTTGTATTACTGCTGTAACTCCTGTACCTACCAAAACTCCCATAAATAGGTTACTAGTAAGTAGTTTTATTATCTTTTTTAGCTTTGTCCCAGCAGATTTTTGAAGACCTTCTCCCATAAGGTTCATACCATATAAGAACAGACCTAATCCACCCATTAGACTTATTATAATGTTCAAATTATTTCCTCCTTGTAAAGAGATTACTGTATCTAAAAATTTTATAACCTATTGTATTTTATCAAATTATAGGAGTGATAATGTTAAATTCATGTTAAATATTAAAAAATCATTAAGTTTATGTTAAATTTTTGTATTATTTTTTCTGCACATTTTATACCATCAACTGCTGCTGTAACTATACCACCTGCATATCCAGCACCTTCACCACATGGATATAGATTCTTAATACTCACTGATTCTAAAGTATTTTCATCTCTTACTATTCTTATTGGTGATGATGACCTAGTTTCTACTCCCGTCAAAACAGCATCATACATTGCAAACCCATTCAATTTTTTATCAAGAGATATAAACGCTTCTCTCATAGTCTCTGTTACGAAGCTAGGCAAACATTCACTTAAATTTGTAAGTGTATATCCTGGTCTATATGATGGCTCAACACTTCCTAAATTCAAAGAAGTCTTATTGTTTATAAAATCTCCAACAAGCTGAACTGGTGCATTATAATTTTTTCCACC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57 | Agrobacterium_phage(15.38%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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