Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP022881 | Staphylococcus sp. M0911 chromosome, complete genome | 5 crisprs | cas1,cas2,WYL,csa3,DEDDh,cas3,DinG | 0 | 12 | 7 | 0 |
1. CP022881
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP022881_1 | 97041-97801 | TypeII |
NA
Consensus repeat of CP022881_1
|
11 spacers
spacers of CP022881_1
>1.1|97077|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACTGCACGTTGTAATACAAGCCTTCTTCT >1.2|97143|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATATTTGCTATAGATAGAAGATGCACCTTG >1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATAAAAGGTGAATTTAAAGGTGCTGAGT >1.4|97275|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GACAAGTGGACCAATCAATAACGGTACTGG >1.5|97341|29|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGTGGCGCTTGCTAGGTAACCGTATCTTA >1.6|97406|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTGGTAATCCTACCGCTACAGTGCATTTAT >1.7|97472|30|CP022881|CRISPRCasFinder,CRT TAAAGTAATGTGACTGCTCTTTTTTACTAA >1.8|97538|30|CP022881|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAGATAATTATTCTAATGCGGCTGTTATTG >1.9|97604|30|CP022881|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAACTTCTAGTATATTCAATCCAGTATCT >1.10|97670|30|CP022881|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCACTCCTTTCTGCAATAATGGGTGGGGTT >1.11|97736|30|CP022881|CRISPRCasFinder,CRT GGTGTTTTTAACAAGTCTAATCCCGTATGC |
cas9,cas1,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022881_1
The CRISPR arrays of CP022881_1 >merge|CP022881|1|97041-97801|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAACAACTGCACGTTGTAATACAAGCCTTCTTCTGTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAACATATTTGCTATAGATAGAAGATGCACCTTGGTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAACAAATAAAAGGTGAATTTAAAGGTGCTGAGTGTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAACGACAAGTGGACCAATCAATAACGGTACTGGGTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAACCGTGGCGCTTGCTAGGTAACCGTATCTTAGTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAACGTGGTAATCCTACCGCTACAGTGCATTTATGTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAACTAAAGTAATGTGACTGCTCTTTTTTACTAAGTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAACCAGATAATTATTCTAATGCGGCTGTTATTGGTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAACTTAACTTCTAGTATATTCAATCCAGTATCTGTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAACTCACTCCTTTCTGCAATAATGGGTGGGGTTGTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAACGGTGTTTTTAACAAGTCTAATCCCGTATGCGTTTTAGTACTTTGTAATTTGAATATTGAAAGTATA >CP022881|1|1|97041-97471|PILER-CR GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC AACTGCACGTTGTAATACAAGCCTTCTTCT GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC ATATTTGCTATAGATAGAAGATGCACCTTG GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC AAATAAAAGGTGAATTTAAAGGTGCTGAGT GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC GACAAGTGGACCAATCAATAACGGTACTGG GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC CGTGGCGCTTGCTAGGTAACCGTATCTTA GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC GTGGTAATCCTACCGCTACAGTGCATTTAT GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAACTAAAGTAATGTGACTGCTCTTTTTTACTAAGTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC CAGATAATTATTCTAATGCGGCTGTTATTG GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC TTAACTTCTAGTATATTCAATCCAGTATCT GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC TCACTCCTTTCTGCAATAATGGGTGGGGTT >CP022881|1|1|97041-97801|CRISPRCasFinder GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC AACTGCACGTTGTAATACAAGCCTTCTTCT GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC ATATTTGCTATAGATAGAAGATGCACCTTG GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC AAATAAAAGGTGAATTTAAAGGTGCTGAGT GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC GACAAGTGGACCAATCAATAACGGTACTGG GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC CGTGGCGCTTGCTAGGTAACCGTATCTTA GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC GTGGTAATCCTACCGCTACAGTGCATTTAT GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC TAAAGTAATGTGACTGCTCTTTTTTACTAA GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC CAGATAATTATTCTAATGCGGCTGTTATTG GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC TTAACTTCTAGTATATTCAATCCAGTATCT GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC TCACTCCTTTCTGCAATAATGGGTGGGGTT GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC GGTGTTTTTAACAAGTCTAATCCCGTATGC GTTTTAGTACTTTGTAATTTGAATATTGAAAGTATA >CP022881|1|1|97041-97801|CRT GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC AACTGCACGTTGTAATACAAGCCTTCTTCT GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC ATATTTGCTATAGATAGAAGATGCACCTTG GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC AAATAAAAGGTGAATTTAAAGGTGCTGAGT GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC GACAAGTGGACCAATCAATAACGGTACTGG GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC CGTGGCGCTTGCTAGGTAACCGTATCTTA GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC GTGGTAATCCTACCGCTACAGTGCATTTAT GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC TAAAGTAATGTGACTGCTCTTTTTTACTAA GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC CAGATAATTATTCTAATGCGGCTGTTATTG GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC TTAACTTCTAGTATATTCAATCCAGTATCT GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC TCACTCCTTTCTGCAATAATGGGTGGGGTT GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC GGTGTTTTTAACAAGTCTAATCCCGTATGC GTTTTAGTACTTTGTAATTTGAATATTGAAAGTATA >CP022881|1|2|97502-97735|PILER-CR AACTGCACGTTGTAATACAAGCCTTCTTCT GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC ATATTTGCTATAGATAGAAGATGCACCTTG GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC AAATAAAAGGTGAATTTAAAGGTGCTGAGT GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC GACAAGTGGACCAATCAATAACGGTACTGG GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC CGTGGCGCTTGCTAGGTAACCGTATCTTA GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC GTGGTAATCCTACCGCTACAGTGCATTTAT GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAACTAAAGTAATGTGACTGCTCTTTTTTACTAAGTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC CAGATAATTATTCTAATGCGGCTGTTATTG GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC TTAACTTCTAGTATATTCAATCCAGTATCT GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC TCACTCCTTTCTGCAATAATGGGTGGGGTT GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAC
>CP022881.1|AXV41196.1|95945_96884_+|Glyoxalase/bleomycin-resistance-protein/dioxygenase MTIVGHHHISMYTKDAVKNKAFYTEVLGLRLVEKTVNQDNTKMYHLFYGDNAGHPGTLLTFFEIENVGKHRPGTDSIHRLTLLVPSEAALDYFKQRLDQNNVEWTSLTYVGQSAVLLKDPDELEIILIVNDHYQTPEQWSANDETDIPKDVQILGMGPVELRSRKPEALTEFLEYILGYHQRNDIEVDDNTTIMTLDEQGLYTDFVIVNQQGHRVRPGQGYVHHVAVNLPTDTDLNDIYEKIARQPNPNSGIIDRYFFKSLYYRHNQILFEFATAEPGFTVDTPVDKLGQQLNLPDFLEDKRDEIESQLREI >CP022881.1|AXV41195.1|94127_95306_+|MFS-family-major-facilitator-transporter MKGAMAWPFLRLYILTLMFFSANAILNVFIPLRGHDLGATNTTIGIVMGAYMLTAMVFRPWAGQIIARVGPIKVLRIILLINACALILYGLTGLEGYFIARVMQGVCTAFFSMSLQLGIIDALPEEHRSEGVSLYSLFSTIPNLVGPLIAVGIWHLDRIAIFAIVMIAIALTTTFFGSRVTFASEEPDTHKKVEPLPFNAVTVFAQFFKNKELFNSGLIMIVVSIVFGAVSTFVPLYTVKLGFADAGIFLTIQAIAVVLARIYLRKYIPSDGIWHPVYMVSVLMLLVIASMLVAIGPHIHVLIFYSSGILIGATQALVYPTLTSYLSFVLPKAGRNMLLGLFIACADLGVSLGGSLMGPISDLVGFSWMYTICGMLVVVMMLMSALKSVRQK >CP022881.1|AXV41194.1|93366_94116_+|ABC-superfamily-ATP-binding-cassette-transporter,-ABC-protein MIKINHVEKHYGKRSLWGPKPKPIIKDVSLDCPVDEAIAIIGESGSGKSTLSRMILGIERPDKGTVTLNDQPMYKKKVRRHQIGAVFQDYTSSLHPFQTVRDILFEVMCQCDKQSTDEMEVAAKTLLEEVGLSEDFLDKYPNMLSGGEAQRVAIARAICINPTYILFDEAISALDMSIQTQILDLLKRLKHTHHLSYIFITHDIQAATYLCDRLVIFKDGQIEEQIATRDLHTTTNAYTQALIDKQLSF >CP022881.1|AXV41193.1|92558_93374_+|oligopeptide-ABC-superfamily-ATP-binding-cassette-transporter,-ABC-protein MTLLTVQQLTIRDEWTDTTLVDDINFHVKRGETLGIIGESGSGKSMTCKALVGLNPSRLKVTGKVHFDGHNLLALSERQLRQYRGQAIAMVMQQGARAFDPSTKVGKQMIETMQVHTSLSTPEIEQILIDYMTYMNLTDPQTILASYPYMLSGGMLQRLMIALALALKPKLIIADEPTTALDTINQFDVLEAFEDIKQHFDCAMIFISHDLTVIHKVADRVIVMKEGQLVEEGTTEAVLHHPHHRYTQYLLSTKQKVNDHFQRVMRGDSHD >CP022881.1|AXV41192.1|91692_92562_+|oligopeptide-ABC-superfamily-ATP-binding-cassette-transporter,-membrane-protein MMIVKRLLQDRGAVIALVIIATYFLLGFLAPVITFHEPNHIDTAHKFAGISATHWLGTDHLGRDVLTRLIYAIRPSLLYVSIALVISVVIGAILGFISGYFRGYIDALIMRCCDVMLAFPSYVVTLALITLFGMGVENIILAFILTRWAWFCRVIRTSVMQYTSADHVKFAKTIGMSDFTIIRKHILPLTLGDIAIISSSAMCSMILQMSGFSFLGLGVKAPTAEWGMMLNEARKVMFTHPEMMVTTGIVIVIIVMAFNFLSDALQVAMDPRISSKEKMRAVKKGVMHE >CP022881.1|AXV41191.1|90760_91696_+|oligopeptide-ABC-superfamily-ATP-binding-cassette-transporter,-membrane-protein MFKLIIKRIALMFPLLIVVSFMTFMMTYLTNEDPAVTILHAQGTPNVTPQLIAETKEKYGLDAPILVQYKDWLQQAVQFKFGTSYITGDPVSERIGPAFVNTLKLTLISSVSVMVTSICLGVVSALTRGQRTDRVIRSVAFFLTALPSYWVASMLIIYVSVKLNLLPTSGLTGPESYVLPVIVITMTYAGIYFRNVRRAMIEQLNEDYVLYLKASGVKTMTLLRHVLRNALQVAVSIFCMSIPMIMGGLVVIENVFAWPGLGQLSIKAIVEHDFPVVQTYVLIVAVLFIIFNTLADIINALLNPRLREASR >CP022881.1|AXV41190.1|89149_90748_+|oligopeptide-ABC-superfamily-ATP-binding-cassette-transporter,-binding-protein MNKLTKMSAVLLASGIILTGCGGNKGLEDKKEQKTLSYTTVKDIGDMNPHVYGGSMSAESMIYEPLVRNTKDGIKPLLAKKWDISKDGKTYTFHLRDDVKFHDGTKFNAEAVKKNIDAVQQNKKLHSWLKISTLIDDVKVKDDYTVQIHLKEAYQPALAELAMPRPYVFVSPKDFKHGTTKDGVKAFDGTGPFKMGEHKKDESATFNKNQHYWGERAKLNKVEAKVKPAGETAFLSMKKGETNFAFTDDRGTDSLDKDSLKQLKETGDYNVKRSQPMNTKMIVANAGNKGSAASDKSVRQVIGHMVDRDKIAKDILDGQEKPATQLFAKNVTDINFNMPTRQFDTKKAEKLLDQAGWKMNQDKQIRQKDGKDLAMTMYYDKGSTSQKEQAEFLEAEFKKVGIKLNINGETSDKIAERRTSGDYDLMFNQTWGLLYDPQSTIAAFKSKTGYESATSGIKDKTKLYNDIDEAFKMKDEKARSKAYQQILKQVDDEGVFIPISHGSMTVVAPKDLKNVSFTQSQYELPFNEMQYK >CP022881.1|AXV41189.1|87789_89088_+|hypothetical-protein MSNILIIGSGPVAIQLAQLCDRVSEDRIDMVGRAATSKKSLDVYQSYQQAGTFTVTTQNDTHHQFSGQFQIRHFYQDIQQIDQSYDTIILACTADAYRPMLQQLAPTILQHVKHIILVSPTFGSHMLIEQLLVDINTDVEVISFSTYLGDTRVVDTSQPHRVLTTAVKSKLFVGSNKPSSQLIPQLQTWFESLHIQLAVMDTPLQAEIHNSSLYVHPPLFMNDFALKAIFQGTEVPVYVYKLFPEGPITMTLIREMRQMWQEMMTILQKLSVPSVNLLKFMVKENYPVRSETLSESDIHQFEELPAIHQEYLLYVRYTAILIDPFSKPDKDGRYFDFSAVPFKSLYQNEQGVVHIPRMPSEDYYRTTVIQAIGKALGVSTPMIDTLLHRYVGYCERYQIEHPQQSVSSQFNLDDFEEDISLVTTYLANSSNK >CP022881.1|AXV41188.1|86981_87797_+|rRNA-methyltransferase-FmrO MHSNIKIETLLQQYLEQFEARYQHVLSDPNSIDALESLVDDYSQLILNPTYQQQYDLWHDEPRKQLITQQLQDITAQCVKQVEMIRARRLLDGKASTSGYFDNIEHCIDEEFGQCHIGKEDKLLLVGSGAYPMTLIQVAKETGASVIGIDIDPQAVDLGQRVVNVLAPNEDIQISNQTVDQLPDINEVTHIIFSSTIPVKYDILAQLFELTNDHVVVAMRYGDGMKAIFNYPSQPTASDQWQCVHQLVQPNQIFDVALYQKASSKEGITYV >CP022881.1|AXV41187.1|86142_86982_+|diaminopimelate-epimerase MNRQVIEFSKYNPSGNMTILVHSQHHPSDYAKIANQLMASTHVCCEQVGFIESNNLNHGDDCRLVMSGNEFCGNATMSYMHYLQEHQRLTAQQCHLNVSGCDDLVPCTIHGHQQYEVGMPQAQYVTTDYLHIAQHMWQAIKITYESYVHYVIPIEEITATFKQQVAQFVREQQWDEQYKTIGVMLFNVQDQYLHPLIFIPEVKSLIWENSCGSGAASIGVFNNYQSQRSCEDYIVYQPGGSISVTSAYCSEDGYRTSIKGRVSTVARGQAYIEEETMTH >CP022881.1|AXV41197.1|98052_101217_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas9 MKEKYILGLDLGITSVGYGIINFETKKIIDAGVRLFPEANIDNNEGRRSKRGSRRLKRRRIHRLDRVKSLLTEYNLINREQIPTSNNPYQIRVKGLSEILSKDELAIALLHLAKRRGIHNINVSSEDEDASNELSTKEQINRNNKLLKNKYVCEVQLQRLKEGQIRGEKNRFKTTDILKEIDQLLKVQKDYHNLDIDFINQYKEIVETRREYFEGPGQGSPFGWNGDLKKWYEMLMGYCTYFPQELRSVKYAYSADLFNALNDLNNLIIQRNDSEKLEYHEKYHIIENVFKQKKKPTLKQIAKEIGVNPEDIKGYRITKSGTPQFTEFKLYHDLKSIVFDKSILENEAILDQIVEILTIYQDEESIKEELNKLPEILNEQDKAEIAKLTGYNGTHRLSLKCIHLINEELWQTSRNQMEIFNYLNIKPNKVDLSEQNKIPKDLVDEFILSPVVKRTFIQSINVINKVIEKYGIPEDIIIELARENNSDDRKKFINNLQKKNEATRKRINEIIGQTGNQNAKRIVEKIRLHDQQEGKCLYSLESIPLMDLLNNPQNYEVDHIIPRSVAFDNSIHNKVLVKQIENSKKGNRTPYQYLNSSDAKLSYNQFKQHILNLSKSKDRISKKKKDYLLEERDINKFEVQKEFINRNLVDTRYATRELTSYLKAYFSANNMDVKVKTINGSFTNHLRKVWRFDKYRNHGYKHHAEDALIIANADFLFKENKKLQNANKILEKPTIENNTKKVTVEKEEDYNNMFETPKLVEDIKQYRDYKFSHRVDKKPNRQLINDTLYSTRMKDEHDYIVQTITDIYGKDNTNLKKQFNKNPEKFLMYQNDPKTFEKLSIIMKQYSDEKNPLAKYYEETGEYLTKYSKKNNGPIVKKIKLLGNKVGNHLDVTKKYENSTKKLVKLSIKNYRFDVYLTEKGYKFVTIAYLNVFKKDNYYYIPKDMYQELKAKKKIKDTDQFIASFYKNDLIKLNGDLYKIIGVNSDDRNIIELDYYDIKYKDYCEINNIKGEPRIKKTIGKKTESIEKLTTDVLGNLYLHSTEKAPQLIFKRGL >CP022881.1|AXV41198.1|101219_102122_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MSWRIVYVSDVNHMSLNLNSLKIMKGDLETKIPLSDIFALVIEDLTTTITARLLVELSDYNILVIFCNQKHLPECTLQPVSGHFNQYTQMKEQLKWDEARKSELWKIIIENKIQNQIECMKYLSIQSDRVDKMIELKNSVTLFDRNNIEGQAAKYYFNSFFEDFTRDNEEIIENAVLNYGYTILNSAIARTIVAKGLIPAIGIHHIGGRNHFNLASDLIEPFRPIVDLFLLKHPPQDFLTKEYRVKIINLLHARIEIDGKMQTVIRAIEIMIQSIIDYFKDGQLDRVKFPKLSKYSFYEL >CP022881.1|AXV41199.1|102126_102435_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MRVLLMFDLPTETKKHRRIYSKFRKNLIEDGFLMMQYSIYIKSVVNKDAANQTIKRVNTFLPSEGHVRALIITEKQYEHMQILLGEENQNIEILGDNRTIIF >CP022881.1|AXV41200.1|102448_103456_+|hypothetical-protein MTNLQWCIKTDSLPTITLNIGKYTAIYNEYETIEEDLLNVINQYFKKRNSNKSNVTIAEMLNQEEISPLSYESIIIDNRAIDNEFLLSSNSIINKKLQRDFYENIESNSYIESINVLFEDLLNLINKAELPLKSKTFDIKQFIKLLSFEYSLNEDYSKLIVRIEQILPLLVEELNKQYGGKLLLIYLYPEANLSPKEQIRLKELIISLGIDIIVLTGSLHFLAKDWKYNNYIRCDNQKISSELVDNLLWNAPLNFERSEIEQSLNQFILAYQDKIEIKPIISNYQIAQIMLFSSIDLYVGVSYMQHCNHEFILNIDETKLPLSMAKYLEQFVKEN >CP022881.1|AXV41201.1|103852_105586_+|hypothetical-protein MSSMRKPIIKNISYSNEELVNSLGEWQQSDDSKFLLRYPTVYIINDKNKSDHFNLYVGETTDIKNRTIQHLKNDVKLKDYWKSFYSSDTSSMYVIGHPFFNKSLTLDIENKFMQYLSSVDAVTSIFNSRTNQQNEYYTSEKLDEIFTNIWQQLHKENSKLFPIESVIKDSAIFKASPFHKLTNEQQSVKDEILNKIEHAILSESEENQLILVEGEAGSGKTVLMSTLFFELKQMMDLDEMKNLDIHLLVNHDQQLKVYKQIANKLGLEGKNQNIINKPTSFILNRDVEDKADVVIIDEAHLLLTQGKMSYRGEGHLKDIQKRAKVVVAVFDKKQILSKQQIWEFDTLDKLIQYSKDQNNHLLLKNQLRINSSIETMNWLRHLIDDHKIDPIPHDSKGYDIKIFDTPAELEKAILRKSKNIESGLSRMLATFDWEFKNGKSPNDGLFWEVKIGQWSRPWNLQLKCPRGEKNLAWPEQSQTINEIGSTFTIQGFDLNYAGVIIGPSVKFRNGKIIYDKSESKNIQVTQNRKLSDDTMKNFGEELLRNELNVLLTRGVNGLYIYAVDDELRNALKEASKG >CP022881.1|AXV41202.1|105591_105930_+|hypothetical-protein MRTENSVMEKINQFRDERNWRQFHNEKDLALSITLEASELLELFQWKSAEDVVESKRERLAEELADILIYSYMFADNLDFDINEIIEQKLVKNAEKYPVDKSKDNNSKYNEL >CP022881.1|AXV41203.1|106048_107908_+|transcription-antiterminator,-BglG-family MIERQIKLIELLRNKRSDYLKSDDIAAYLNISNRTARTDIKIINNQFMPEVIGNIKSKGYFLNTTRYSLEDIDHQLSNYLNQDGKLLIKIAYQLLMYSKSVLISELMEQFQLSKKEILDYMSRIQMWCEKYEVNIIIKRKTGITVTGNEKDINNAILHLNQLSKQHHRVEDLILNELPKAHIQMIKQIIEDNLSVHDIRTSHLQIEQLVIHLILILKRQSISEESWNINDESLVISNEIIKDINQRLGYHLNTQTVHLFSFFISYHFNKFDLGFEKVFIESYIQQLITKMEQKMHLKFGSDNVLKDNLLAHFSRTYLRIMKEVYLNNPLTGEIKILYPYVFNVLYDIIHELAKDTGINLSEDEIAFLTIHFQASIDRNEVSQVNIAICCYYGLGISQLLETKISKVNQHVKVTDILRFEDIENDAFENIDILITTHDIHMQLPQDLDVIKVSPLFSEDDQFKLNRIVKGKLNPIAKNNELNEIPVTIVNNDFIQTIPGVFETAHQILNNYKAISSGYIETALNREKASSTYIGNSMTMPHGDPTKVLSSHIIIFKSDNGFYWKEHKVKLVFFLAIAKPDIHLMKQMMQNLSLLDEEDIHQLAHLEETTFQNKILKLIKG >CP022881.1|AXV41204.1|107987_109943_+|PTS-system-mannose-specific-transporter-subunit-IIBCA MKILAITSCPNGIAHTYMAQEKLEQAAKKMGVDIKVETQGGVGAENVLTAKEIREADGIIIAADRQVDLSRFNGKRLVNENVREGIHHPENLIQRIIDQDAKIYHDKNATTQSNDSDDEEDRKSGIQMVYQHLMNGVSFMVPFIVVGGLLIAIALTLGGHPTSEGLKIPDDSFWKSIENIGKLSFGFMVPILAGYIAYSIADKPGLVPGMIGGAIAADGSLYGSEAGAGFLGGIVAGFIAGYVAKWIKNIRVPKAMAPIMPIIIIPILASLVVGLIFIFLIGAPISGIFIALTGWLKGMQGANIIILALIIGAMIAFDMGGPVNKVAFLFGSALIAEGNYAVMGMVAVAVCTPPIGLGLATFVQKHKFNHAEQEMGKASFTMGLFGITEGAIPFAAQDPLRIIPSNMIGAMVAAVIAAMGGVGDRVAHGGPIVAVLGGIDHIIWFFIAVIIGSLVTMITILILKRNTPVTDVEEDQEDAHLETSTNSSQESTDSESKVDESVEHNDNVFQKDVININTNVKTKEEAIDYMVKNLKEHRFIDNEDVVKQAILDREAESTTAIGMNVAIPHAKSDAVNQPTVAVLQNKEGVDWISLDETLPKILFMIVVPNDSNNTHLKLLQRLSRSLMDDKTREALINAPSKDDIYDILKKI >CP022881.1|AXV41205.1|109957_110893_+|mannose-6-phosphate-isomerase MALFLKPVFQEKIWGGTALESFNYHLPSNNVGECWAISAHPNGPNVIENGHYKGKTLDEVWSIDRSLFGNDQRDKFPLLTKILDANDKLSVQVHPDDDYAQKYEGEYGKTECWYILDAKEDAEIIYGINVDNKEDLVECINNREFDRLFKKVKVKPGDFYYVPAGTVHAIGSGILILETQQSSDTTYRIYDYDRKDKHGHLRDLHLEQSKAVININQENPNVVPQQSEVQGQTVTQFVSNEFFTVEKWRINGKLNYNKPHAYCLVSVIDGTGSVIIDDERYDIQKGRHFIITNEDQNILFEGKLEIIISYS >CP022881.1|AXV41206.1|111145_111982_+|OxaI/YidC-membrane-insertion-protein MKLKYVILVLLAPVFLSACNYSKPENRNGFFYNTFAKPMDLFLNWMGEHLNHNYGLAIIIIVLAIRLIMLPFMLSQTKNGQFMRKLMKIAKPELDPIQEKVRRARTQEEKMDANKEMMDVYKKYHINPMKSMLGCLPMLIQMPILFGLYASLKWPVHNHLSQYPHFLWFDLSNPDIYITLIAGILYFIQSLVSLGNMPQEQRQMGYMMMVISPIFIIYISFTSASALGLYWSINALFLIIQMYFSNQYYSKIADEYVKSFEKQNDKKSQKAKTIKKKK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP022881_2 | 103475-103839 | TypeII |
NA
Consensus repeat of CP022881_2
|
5 spacers
spacers of CP022881_2
>2.1|103511|30|CP022881|CRT CGAGATTTTAAAGTTTTATAGCCTTCGTTG >2.2|103577|30|CP022881|CRT CGTTTCACATCATCTATCCATTCCAGACAG >2.3|103643|29|CP022881|CRT CGACGTCGAATTGTTCTGTGTACGCTGCG >2.4|103708|30|CP022881|CRT CTAACATCTCATTCTGTTCCAGGTACTTAT >2.5|103774|30|CP022881|CRT ACGTTACTGAACGTGGAATCGACTTCGAGG >2.6|103513|29|CP022881|PILER-CR GAGATTTTAAAGTTTTATAGCCTTCGTTG >2.7|103579|29|CP022881|PILER-CR GTTTCACATCATCTATCCATTCCAGACAG >2.8|103645|28|CP022881|PILER-CR GACGTCGAATTGTTCTGTGTACGCTGCG >2.9|103710|29|CP022881|PILER-CR TAACATCTCATTCTGTTCCAGGTACTTAT |
cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022881_2
The CRISPR arrays of CP022881_2 >merge|CP022881|2|103475-103839|CRT,PILER-CR GGTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAACGAGATTTTAAAGTTTTATAGCCTTCGTTGAGTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAACGTTTCACATCATCTATCCATTCCAGACAGAGTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAACGACGTCGAATTGTTCTGTGTACGCTGCGAGTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAACTAACATCTCATTCTGTTCCAGGTACTTATAGTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAACGTTACTGAACGTGGAATCGACTTCGAGGAGTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAAGTAGA >CP022881|2|2|103475-103839|CRT GGTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAA CGAGATTTTAAAGTTTTATAGCCTTCGTTG AGTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAA CGTTTCACATCATCTATCCATTCCAGACAG AGTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAA CGACGTCGAATTGTTCTGTGTACGCTGCG AGTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAA CTAACATCTCATTCTGTTCCAGGTACTTAT AGTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAA ACGTTACTGAACGTGGAATCGACTTCGAGG AGTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAAGTAGA >CP022881|2|3|103476-103774|PILER-CR GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAACG AGATTTTAAAGTTTTATAGCCTTCGTTGA GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAACG TTTCACATCATCTATCCATTCCAGACAGA GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAACG ACGTCGAATTGTTCTGTGTACGCTGCGA GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAACT AACATCTCATTCTGTTCCAGGTACTTATA GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATGAGTGAAAA
>CP022881.1|AXV41200.1|102448_103456_+|hypothetical-protein MTNLQWCIKTDSLPTITLNIGKYTAIYNEYETIEEDLLNVINQYFKKRNSNKSNVTIAEMLNQEEISPLSYESIIIDNRAIDNEFLLSSNSIINKKLQRDFYENIESNSYIESINVLFEDLLNLINKAELPLKSKTFDIKQFIKLLSFEYSLNEDYSKLIVRIEQILPLLVEELNKQYGGKLLLIYLYPEANLSPKEQIRLKELIISLGIDIIVLTGSLHFLAKDWKYNNYIRCDNQKISSELVDNLLWNAPLNFERSEIEQSLNQFILAYQDKIEIKPIISNYQIAQIMLFSSIDLYVGVSYMQHCNHEFILNIDETKLPLSMAKYLEQFVKEN >CP022881.1|AXV41199.1|102126_102435_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MRVLLMFDLPTETKKHRRIYSKFRKNLIEDGFLMMQYSIYIKSVVNKDAANQTIKRVNTFLPSEGHVRALIITEKQYEHMQILLGEENQNIEILGDNRTIIF >CP022881.1|AXV41198.1|101219_102122_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MSWRIVYVSDVNHMSLNLNSLKIMKGDLETKIPLSDIFALVIEDLTTTITARLLVELSDYNILVIFCNQKHLPECTLQPVSGHFNQYTQMKEQLKWDEARKSELWKIIIENKIQNQIECMKYLSIQSDRVDKMIELKNSVTLFDRNNIEGQAAKYYFNSFFEDFTRDNEEIIENAVLNYGYTILNSAIARTIVAKGLIPAIGIHHIGGRNHFNLASDLIEPFRPIVDLFLLKHPPQDFLTKEYRVKIINLLHARIEIDGKMQTVIRAIEIMIQSIIDYFKDGQLDRVKFPKLSKYSFYEL >CP022881.1|AXV41197.1|98052_101217_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas9 MKEKYILGLDLGITSVGYGIINFETKKIIDAGVRLFPEANIDNNEGRRSKRGSRRLKRRRIHRLDRVKSLLTEYNLINREQIPTSNNPYQIRVKGLSEILSKDELAIALLHLAKRRGIHNINVSSEDEDASNELSTKEQINRNNKLLKNKYVCEVQLQRLKEGQIRGEKNRFKTTDILKEIDQLLKVQKDYHNLDIDFINQYKEIVETRREYFEGPGQGSPFGWNGDLKKWYEMLMGYCTYFPQELRSVKYAYSADLFNALNDLNNLIIQRNDSEKLEYHEKYHIIENVFKQKKKPTLKQIAKEIGVNPEDIKGYRITKSGTPQFTEFKLYHDLKSIVFDKSILENEAILDQIVEILTIYQDEESIKEELNKLPEILNEQDKAEIAKLTGYNGTHRLSLKCIHLINEELWQTSRNQMEIFNYLNIKPNKVDLSEQNKIPKDLVDEFILSPVVKRTFIQSINVINKVIEKYGIPEDIIIELARENNSDDRKKFINNLQKKNEATRKRINEIIGQTGNQNAKRIVEKIRLHDQQEGKCLYSLESIPLMDLLNNPQNYEVDHIIPRSVAFDNSIHNKVLVKQIENSKKGNRTPYQYLNSSDAKLSYNQFKQHILNLSKSKDRISKKKKDYLLEERDINKFEVQKEFINRNLVDTRYATRELTSYLKAYFSANNMDVKVKTINGSFTNHLRKVWRFDKYRNHGYKHHAEDALIIANADFLFKENKKLQNANKILEKPTIENNTKKVTVEKEEDYNNMFETPKLVEDIKQYRDYKFSHRVDKKPNRQLINDTLYSTRMKDEHDYIVQTITDIYGKDNTNLKKQFNKNPEKFLMYQNDPKTFEKLSIIMKQYSDEKNPLAKYYEETGEYLTKYSKKNNGPIVKKIKLLGNKVGNHLDVTKKYENSTKKLVKLSIKNYRFDVYLTEKGYKFVTIAYLNVFKKDNYYYIPKDMYQELKAKKKIKDTDQFIASFYKNDLIKLNGDLYKIIGVNSDDRNIIELDYYDIKYKDYCEINNIKGEPRIKKTIGKKTESIEKLTTDVLGNLYLHSTEKAPQLIFKRGL >CP022881.1|AXV41196.1|95945_96884_+|Glyoxalase/bleomycin-resistance-protein/dioxygenase MTIVGHHHISMYTKDAVKNKAFYTEVLGLRLVEKTVNQDNTKMYHLFYGDNAGHPGTLLTFFEIENVGKHRPGTDSIHRLTLLVPSEAALDYFKQRLDQNNVEWTSLTYVGQSAVLLKDPDELEIILIVNDHYQTPEQWSANDETDIPKDVQILGMGPVELRSRKPEALTEFLEYILGYHQRNDIEVDDNTTIMTLDEQGLYTDFVIVNQQGHRVRPGQGYVHHVAVNLPTDTDLNDIYEKIARQPNPNSGIIDRYFFKSLYYRHNQILFEFATAEPGFTVDTPVDKLGQQLNLPDFLEDKRDEIESQLREI >CP022881.1|AXV41195.1|94127_95306_+|MFS-family-major-facilitator-transporter MKGAMAWPFLRLYILTLMFFSANAILNVFIPLRGHDLGATNTTIGIVMGAYMLTAMVFRPWAGQIIARVGPIKVLRIILLINACALILYGLTGLEGYFIARVMQGVCTAFFSMSLQLGIIDALPEEHRSEGVSLYSLFSTIPNLVGPLIAVGIWHLDRIAIFAIVMIAIALTTTFFGSRVTFASEEPDTHKKVEPLPFNAVTVFAQFFKNKELFNSGLIMIVVSIVFGAVSTFVPLYTVKLGFADAGIFLTIQAIAVVLARIYLRKYIPSDGIWHPVYMVSVLMLLVIASMLVAIGPHIHVLIFYSSGILIGATQALVYPTLTSYLSFVLPKAGRNMLLGLFIACADLGVSLGGSLMGPISDLVGFSWMYTICGMLVVVMMLMSALKSVRQK >CP022881.1|AXV41194.1|93366_94116_+|ABC-superfamily-ATP-binding-cassette-transporter,-ABC-protein MIKINHVEKHYGKRSLWGPKPKPIIKDVSLDCPVDEAIAIIGESGSGKSTLSRMILGIERPDKGTVTLNDQPMYKKKVRRHQIGAVFQDYTSSLHPFQTVRDILFEVMCQCDKQSTDEMEVAAKTLLEEVGLSEDFLDKYPNMLSGGEAQRVAIARAICINPTYILFDEAISALDMSIQTQILDLLKRLKHTHHLSYIFITHDIQAATYLCDRLVIFKDGQIEEQIATRDLHTTTNAYTQALIDKQLSF >CP022881.1|AXV41193.1|92558_93374_+|oligopeptide-ABC-superfamily-ATP-binding-cassette-transporter,-ABC-protein MTLLTVQQLTIRDEWTDTTLVDDINFHVKRGETLGIIGESGSGKSMTCKALVGLNPSRLKVTGKVHFDGHNLLALSERQLRQYRGQAIAMVMQQGARAFDPSTKVGKQMIETMQVHTSLSTPEIEQILIDYMTYMNLTDPQTILASYPYMLSGGMLQRLMIALALALKPKLIIADEPTTALDTINQFDVLEAFEDIKQHFDCAMIFISHDLTVIHKVADRVIVMKEGQLVEEGTTEAVLHHPHHRYTQYLLSTKQKVNDHFQRVMRGDSHD >CP022881.1|AXV41192.1|91692_92562_+|oligopeptide-ABC-superfamily-ATP-binding-cassette-transporter,-membrane-protein MMIVKRLLQDRGAVIALVIIATYFLLGFLAPVITFHEPNHIDTAHKFAGISATHWLGTDHLGRDVLTRLIYAIRPSLLYVSIALVISVVIGAILGFISGYFRGYIDALIMRCCDVMLAFPSYVVTLALITLFGMGVENIILAFILTRWAWFCRVIRTSVMQYTSADHVKFAKTIGMSDFTIIRKHILPLTLGDIAIISSSAMCSMILQMSGFSFLGLGVKAPTAEWGMMLNEARKVMFTHPEMMVTTGIVIVIIVMAFNFLSDALQVAMDPRISSKEKMRAVKKGVMHE >CP022881.1|AXV41191.1|90760_91696_+|oligopeptide-ABC-superfamily-ATP-binding-cassette-transporter,-membrane-protein MFKLIIKRIALMFPLLIVVSFMTFMMTYLTNEDPAVTILHAQGTPNVTPQLIAETKEKYGLDAPILVQYKDWLQQAVQFKFGTSYITGDPVSERIGPAFVNTLKLTLISSVSVMVTSICLGVVSALTRGQRTDRVIRSVAFFLTALPSYWVASMLIIYVSVKLNLLPTSGLTGPESYVLPVIVITMTYAGIYFRNVRRAMIEQLNEDYVLYLKASGVKTMTLLRHVLRNALQVAVSIFCMSIPMIMGGLVVIENVFAWPGLGQLSIKAIVEHDFPVVQTYVLIVAVLFIIFNTLADIINALLNPRLREASR >CP022881.1|AXV41201.1|103852_105586_+|hypothetical-protein MSSMRKPIIKNISYSNEELVNSLGEWQQSDDSKFLLRYPTVYIINDKNKSDHFNLYVGETTDIKNRTIQHLKNDVKLKDYWKSFYSSDTSSMYVIGHPFFNKSLTLDIENKFMQYLSSVDAVTSIFNSRTNQQNEYYTSEKLDEIFTNIWQQLHKENSKLFPIESVIKDSAIFKASPFHKLTNEQQSVKDEILNKIEHAILSESEENQLILVEGEAGSGKTVLMSTLFFELKQMMDLDEMKNLDIHLLVNHDQQLKVYKQIANKLGLEGKNQNIINKPTSFILNRDVEDKADVVIIDEAHLLLTQGKMSYRGEGHLKDIQKRAKVVVAVFDKKQILSKQQIWEFDTLDKLIQYSKDQNNHLLLKNQLRINSSIETMNWLRHLIDDHKIDPIPHDSKGYDIKIFDTPAELEKAILRKSKNIESGLSRMLATFDWEFKNGKSPNDGLFWEVKIGQWSRPWNLQLKCPRGEKNLAWPEQSQTINEIGSTFTIQGFDLNYAGVIIGPSVKFRNGKIIYDKSESKNIQVTQNRKLSDDTMKNFGEELLRNELNVLLTRGVNGLYIYAVDDELRNALKEASKG >CP022881.1|AXV41202.1|105591_105930_+|hypothetical-protein MRTENSVMEKINQFRDERNWRQFHNEKDLALSITLEASELLELFQWKSAEDVVESKRERLAEELADILIYSYMFADNLDFDINEIIEQKLVKNAEKYPVDKSKDNNSKYNEL >CP022881.1|AXV41203.1|106048_107908_+|transcription-antiterminator,-BglG-family MIERQIKLIELLRNKRSDYLKSDDIAAYLNISNRTARTDIKIINNQFMPEVIGNIKSKGYFLNTTRYSLEDIDHQLSNYLNQDGKLLIKIAYQLLMYSKSVLISELMEQFQLSKKEILDYMSRIQMWCEKYEVNIIIKRKTGITVTGNEKDINNAILHLNQLSKQHHRVEDLILNELPKAHIQMIKQIIEDNLSVHDIRTSHLQIEQLVIHLILILKRQSISEESWNINDESLVISNEIIKDINQRLGYHLNTQTVHLFSFFISYHFNKFDLGFEKVFIESYIQQLITKMEQKMHLKFGSDNVLKDNLLAHFSRTYLRIMKEVYLNNPLTGEIKILYPYVFNVLYDIIHELAKDTGINLSEDEIAFLTIHFQASIDRNEVSQVNIAICCYYGLGISQLLETKISKVNQHVKVTDILRFEDIENDAFENIDILITTHDIHMQLPQDLDVIKVSPLFSEDDQFKLNRIVKGKLNPIAKNNELNEIPVTIVNNDFIQTIPGVFETAHQILNNYKAISSGYIETALNREKASSTYIGNSMTMPHGDPTKVLSSHIIIFKSDNGFYWKEHKVKLVFFLAIAKPDIHLMKQMMQNLSLLDEEDIHQLAHLEETTFQNKILKLIKG >CP022881.1|AXV41204.1|107987_109943_+|PTS-system-mannose-specific-transporter-subunit-IIBCA MKILAITSCPNGIAHTYMAQEKLEQAAKKMGVDIKVETQGGVGAENVLTAKEIREADGIIIAADRQVDLSRFNGKRLVNENVREGIHHPENLIQRIIDQDAKIYHDKNATTQSNDSDDEEDRKSGIQMVYQHLMNGVSFMVPFIVVGGLLIAIALTLGGHPTSEGLKIPDDSFWKSIENIGKLSFGFMVPILAGYIAYSIADKPGLVPGMIGGAIAADGSLYGSEAGAGFLGGIVAGFIAGYVAKWIKNIRVPKAMAPIMPIIIIPILASLVVGLIFIFLIGAPISGIFIALTGWLKGMQGANIIILALIIGAMIAFDMGGPVNKVAFLFGSALIAEGNYAVMGMVAVAVCTPPIGLGLATFVQKHKFNHAEQEMGKASFTMGLFGITEGAIPFAAQDPLRIIPSNMIGAMVAAVIAAMGGVGDRVAHGGPIVAVLGGIDHIIWFFIAVIIGSLVTMITILILKRNTPVTDVEEDQEDAHLETSTNSSQESTDSESKVDESVEHNDNVFQKDVININTNVKTKEEAIDYMVKNLKEHRFIDNEDVVKQAILDREAESTTAIGMNVAIPHAKSDAVNQPTVAVLQNKEGVDWISLDETLPKILFMIVVPNDSNNTHLKLLQRLSRSLMDDKTREALINAPSKDDIYDILKKI >CP022881.1|AXV41205.1|109957_110893_+|mannose-6-phosphate-isomerase MALFLKPVFQEKIWGGTALESFNYHLPSNNVGECWAISAHPNGPNVIENGHYKGKTLDEVWSIDRSLFGNDQRDKFPLLTKILDANDKLSVQVHPDDDYAQKYEGEYGKTECWYILDAKEDAEIIYGINVDNKEDLVECINNREFDRLFKKVKVKPGDFYYVPAGTVHAIGSGILILETQQSSDTTYRIYDYDRKDKHGHLRDLHLEQSKAVININQENPNVVPQQSEVQGQTVTQFVSNEFFTVEKWRINGKLNYNKPHAYCLVSVIDGTGSVIIDDERYDIQKGRHFIITNEDQNILFEGKLEIIISYS >CP022881.1|AXV41206.1|111145_111982_+|OxaI/YidC-membrane-insertion-protein MKLKYVILVLLAPVFLSACNYSKPENRNGFFYNTFAKPMDLFLNWMGEHLNHNYGLAIIIIVLAIRLIMLPFMLSQTKNGQFMRKLMKIAKPELDPIQEKVRRARTQEEKMDANKEMMDVYKKYHINPMKSMLGCLPMLIQMPILFGLYASLKWPVHNHLSQYPHFLWFDLSNPDIYITLIAGILYFIQSLVSLGNMPQEQRQMGYMMMVISPIFIIYISFTSASALGLYWSINALFLIIQMYFSNQYYSKIADEYVKSFEKQNDKKSQKAKTIKKKK >CP022881.1|AXV41207.1|112416_112644_-|hypothetical-protein MKKSWFIYVSILSILPMEYIGMIIDYQFQNILGYIPLVIVSILLVLNIKNYVLVFLFRTLGIVISLFYTHIFMNL >CP022881.1|AXV41208.1|112826_113435_+|hypothetical-protein MLNISDKQYVQRTMKWFVFSMIILIISFILSSIFSPSLDTFKSIGDQIPSSLDKATGLNKVWEFIINNGFRVPLQMLILSLIPIPFLYCVNLIFTSTITGIMFGFVINFDFHKGSIVILSSIPHIVVEIFAMCFVVSSLFKLNQAIVRKISNLFRKEKKQNVSFKQALIQLIKTYILIALPLYIIAAFLETYFTEWIYSILI >CP022881.1|AXV41209.1|113484_113817_+|hypothetical-protein MLLFPMSLFMIVVGILYSKTYPKERNRWYGFRSKKSMKNDEIWLKAQFLFIQYNKSIFKYSAIFSIVFVICDIALIILKLEDQLMGSILIQTGIIFILLGVLHWSVNRKL >CP022881.1|AXV41210.1|114151_114958_+|hypothetical-protein MKNLSIQSVDSFKSKYKSVPDNKVLRNMNSDELESYFLMLYNIRNTINQGQAQYNKLLKNNNDKKNRKIETITSEYNERQETLKYYTPETDKIDAKYKQRRDSIVKPINIICKVLSVIIAVIVFLNLFFISKILATILCFVTYKMVDLILSFVGGFIERRIYKAKYREWTVARALDQDYFNREIARCEAQFESDKQYILSEHKRFDSKIRNDYQSIYTHFENEAQKLETYLPSEFRSLDILSTLFAILNAGFGDSWKEIINVYRDQKI |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP022881_3 | 545938-546024 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022881_3
|
1 spacers
spacers of CP022881_3
>3.1|545961|41|CP022881|CRISPRCasFinder TACTTCTTACACAGTAGCGAAAGCTACTGTGATCCTTAAGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022881_3
The CRISPR arrays of CP022881_3 >merge|CP022881|3|545938-546024|CRISPRCasFinder GTACTTCCATTTTCAATGGTTAGTACTTCTTACACAGTAGCGAAAGCTACTGTGATCCTTAAGGGTACTTCCATTTTCAATGGTTAG >CP022881|3|2|545938-546024|CRISPRCasFinder GTACTTCCATTTTCAATGGTTAG TACTTCTTACACAGTAGCGAAAGCTACTGTGATCCTTAAGG GTACTTCCATTTTCAATGGTTAG
>CP022881.1|AXV41601.1|545174_545828_+|LuxR-family-two-component-transcriptional-regulator MKIVIADDHAVVRTGFSMILNYQEDMEVVATAADGVEAYQKVLEFKPDVLLMDLSMPPGESGLIATSKIHESFPETKILILTMYDDEEYLFHVLRNGAKGYILKNAPDEQLLLAIRTVYNGETYVDMKLTTSLVNEFVNSSNQEYTDTSDPFKVLSKRELEILPLIAKGYGNKEIAEKLFVSVKTVEAHKTHIMNKLELKSKPELVEYAMKKKLLEF >CP022881.1|AXV41600.1|544120_545152_+|oxygen-sensor-histidine-kinase-nreB MTVNNEQLEVLLRRYFESTNEKIVFVNNSGKIIAMNEAAKEVISEEENYSAMTNAICRRCEGYTNEYDVQSCRDCFLDVAQPHHSQFQVFMKTKNRKIAPFTASYQTIDPVKGINAFTLQDVAPQIERQEKMNQRRMMRKTISAQENERKRISRELHDSVIQEMLNIDVQLRLLKYQQDKEKILNDVKNIEGLMSQLVDDVRHLSVELRPASLDDLGLEAAFKSYFKQFEENYGMQINYVSNIVNHRFDSEVETVVYRVVQEAVYNALKYAGVSEVEVTIQQNELTLIAEIIDRGQGFDPSSKPRGSGLGLYGMKERSELVEGNLNIETHIGKGTIITLEVPL >CP022881.1|AXV41599.1|543658_544111_+|hypothetical-protein MMPDSMFESQSFQENIDRIRLEQGFDFAALAFYESASTYSPIKWQYVSGNNNDRYKLIILRKGRGLAGNVMKTGKRMIIANVDMALTPDEKVKFPILLSENLTAVIAIPLWYQQQVYGVMLFGQRNHKPLPINVYDIDIYKQLGIFNEEI >CP022881.1|AXV41598.1|542959_543637_+|respiratory-nitrate-reductase-subunit-gamma MINQFLWVIYPYLCLAIFIIGHIARYKYDQFSWTAKSSELIEKKRLKWGSLLFHLGVIPVFFGHVVGLVIPKYWMDSLGIDEHMYHFGAVYIGSIFGIMTLIGMLLLTARRITIKNVRRLSSFSDIFVNILLLIIIFMGCYSTIVTNIMHIDFNYRETISVWFRQLFMFKPHADLMANVPLQFKLHMVLGFTIFACWPFTRLVHVWSVPLSYTSRRYIIYRKNKL >CP022881.1|AXV41597.1|542391_542967_+|nitrate-reductase-molybdenum-cofactor-assembly-chaperone MINFDNLYRYQDSLGYIAMQLCFPEKKTFNENIFNEVIDPSHPGYEDLIAFREQMMQYTLSEIQQIYTDTFDFSKKAPLYMTYNQFDTQKERGKMLAKLKVLYEMFGLKMVDNELSDYLPLMLQFLQTIEWRGDERAEENIQLVIMIIEDGTFVMANELGKQNHPYGYVIQALRKTLKLCLEVPEGVAQHD >CP022881.1|AXV41596.1|540845_542399_+|nitrate-reductase-subunit-beta MKIKAQIAMVLNLDKCIGCHTCSVTCKNTWTNRPGAEYMWFNNVETKPGTGYPKRWEDQEHYKGGWVLNRKGRLQLKSGSKWSKIALGKIFYNPDMPLIQDYYEPWNYNYEHLTTAKAGQHSPVARAYSVISGEKMDIEWGPNWEDDLAGGHVTGPKDPNIQKIEEDIKFQFDETFMMYLPRLCEHCLNPSCVASCPSGAMYKRDEDGIVLVDQDACRGWRYCMTGCPYKKVYFNWKTNKAEKCTFCFPRIEAGMPTVCSETCTGRMRYLGVLLYDADRVEEMASTENEQDLYEKQLELFLDPFDEEVIAQAEKDGVNHEWIEAAQQSPIYKLAIEYKLAFPLHPEYRTMPMVWYCPPLSPIMSYFEGKNSEQDPDMIFPAIEEMRLPIEYLANMFTAGATKPVKQALQKMAMMRSYMRAQVTQKDFDVERLTQLGLTERQTKDMYRLLGLAKYEERFVIPTTHKETYLDTYHAQGSQGYGGENFGVNCEGCGVAVATDKSGQDIYNERFYGGIFRD >CP022881.1|AXV41595.1|537172_540856_+|respiratory-nitrate-reductase-subunit-alpha MGKFGLNFFKPTEKFNGNWSVLESKSREWEKMYRERWSHDKEVRTTHGVNCTGSCSWKVFVKNGVITWENQQTDYPSCGPEMPEYEPRGCPRGASFSWYEYSPLRVKYPYIRGQLLELWQEALEENHGNKIAAWASIVEDEEKAKRYKQARGMGGHVRSNWKDVTDIIAAQLLYTIKKDGPDRIAGFTPIPAMSMVSYAAGARFINLLGGEMLSFYDWYADLPPASPQIWGEQTDVPESSDWYNAAYLIMWGSNVPLTRTPDAHFMTEVRYKGTKVVSIAPDYAENVKFADNWLAPNPGTDAAVAQAMTHVILQEYYINNPNSRFINYAKQYTDMPFVLMLDQDDNGLKAGRFLRASDLGQDTTNGEWKPVLFDNLSNQLVVPNGTMGQRWEDGKQWNLKLEDEDGNVIQPSLSMDESDFELQQIQFPYFDSNGDGVFERPIPTKKIKLANGDERYITTVYDLMVSQYGIKRFNHELEATGYDDSHSKYTPAWQEDITGIKSSLVVQVAKEFAQNAIDTEGRSMIIMGAGINHWFNSDTIYRSILNLIMLCGCQGVNGGGWAHYVGQEKCRPIEGWNTIAFAKDWQGPPRLQNGTSWFYFATDQWKYEESNVDKLKSPLAKHIKHQHPADYNVTAAKLGWLPSYPQFNKNSLLFAEEAKENGDDSNEAILKRAINEVKTKQTKFAVEDPDLRKNHPKTLFVWRSNLISSSAKGQEYFMKHLLGTKSGLLASPNEDDKPDEIQWREETTGKLDLLVSLDFRMTATPLYSDIVLPAATWYEKHDLSSTDMHPYVHPFNPAIDPLWESRSDWDIYKTLAKAVSEMAKDYLPGTYKDVVTTPLGHDSKQEIATPLGIVKDWSKGEIDAIPGKTMPNFTIVERDYTLIYDKYVSVGPKLETDNVGAHGVSFSVKEQYEELKSMLGTWNDKDPNSIKNDKPRIHSARNVADAMLNISSATNGKLSQKSYQDLEKQTGMTLTDISSERASEKITFLNIGSQPREVIPTAVFPGSNKNGRRYSPFTTNIERLVPFRTLTGRQSYYIDHEVFQQFGESLPIYKPTLPPMVFGTKDKQIKGGTDTLILRYLTPHGKWNIHSMYQDNKHMLTLFRGGPTVWISDEDAKEHNIQDNDWLEVYNRNGVVTARAVISHRMPKGTMFMYHAQDKHIQTPGSEITDTRGGSHNAPTRIHLKPTQLIGGYAQISYHFNYYGPIGNQRDVYVAVRKMKEVNWLED >CP022881.1|AXV41594.1|536068_536995_+|tetrapyrrole-(corrin/porphyrin)-methylase-family-protein MSINEYGTVYLVGAGPGNPSLLTKRAQRLIENADIILYDRLVNPFILQYAKPEIEIVDVGKKPYTKHIQQESINQKTIEAASKHHHVVRLKGGDPAIFGRVQEEVEALNKLNIDFEIVPGVTSASAAAQSMNLGLTMRSIAKNVTFSTGHFKDSKDNDIDISTLLNKGTLAVYMGVKRLPRIIKQIRQYTSYDYPIAIVFRASLFDEKILTGNISNIEQKLTQYNVEGLPGICIIGDIINYSLPQNKAKHTEIIYIVKGNRNHALEKCELLYEQGYGSMIEVDETYHYSQQALYKSVLKQYAHQFIEI >CP022881.1|AXV41593.1|535763_536078_+|nitrite-reductase-small-subunit MKNMQKIKVSRIDELTPLIGKKVFVNDKEIGLFLTNEGEIFAVNNICPHKEGPLSEGTVSGSYVYCPLHDQKIDLKTGNVQEPDTGCVETYPVEIIDGDIFICL >CP022881.1|AXV41592.1|533355_535761_+|nitrite-reductase,-large-subunit MTKNKLVMIGNGMAGLRTIEEILDRDPQRFEITIIGKEDYPNYNRIMLSNILQNKMTVEETIMNSYDWYAEHDIKLINNDSVTILDRANKTVITESGQSFEYDQCIIATGSKAFVLPIPGSDLPSVIGWRTIDDTKRMMEIAQTKQKAIVIGGGLLGLECARGLLDQGMEVTVIHLAEWLMEMQLDQKAGQMLKNDLEQQGMRFELQANTQEILGDKDVEAVRLADGRVLEADLVVMAVGIRPYTEVAKAAGLEVNRGIIVNAYMQTSDPNIFAVGECAECEGKVYGLVAPLYEQGIVLADYLTQKETNGYHGSTTFTSLKVSGCDLYSAGTIEETEDIHGIEIFNSIDNHYKKVFLKDGEVVGVVLYGNTDDGSRFYNMMKKHESIEDYTLVSLLTKGGEDANVSIEDMADDETICGCNGVNKGTIVEAITKNGLTSVAEVTKMTKAGNSCGKCKGQIADILQYALGDDFVASKPTGICACTDLSRDQIVTQIRAKGLKTSKEVRHVLNFKDKNGCPKCRPAINYYLNMIYPYEHKDEKESRFANERYHANIQNDGTFSVIPQMRGGVTDADQLIRLGEVAKKYNVPLVKVTGSQRVGLYGLKKEELPSVWEDLGMRSASAYGKKTRSVKSCVGKEFCRFGTQYTTQLGIRLEKTFEYIDTPHKFKMGVSGCPRSCVESGVKDFGVISVENGFQLYIGGNGGTEVTKGQLLTTVETEDEVIRICGALMQYYRETGIYAERTAPWLERLGFENVKEVLLDPERQQALFDRVMEAKQAIQDEPWQAIVNDKASQKIFEVERV >CP022881.1|AXV41602.1|546324_547476_+|MFS-family-major-facilitator-transporter,-nitrate:nitrite-antiporter MDKTKGGFQLTLQTLSLVVGFMAWSIISPLMPFISQDIKISAGQLSIILAIPVILGSILRVPFGYLTNIIGAKWVFFCSFIVLLFPIYFLGQAQSPKMMMLSGFFLGVGGAIFSVGVTSIPKYFPKDKVGLANGIYGMGNIGTAISSFLAPPIAGIIGWQTTVRSYLIIIAIFAVLMFIFGDNREPKVKVPLISQMKILFKNYKLYYTSLWYFITFGAFVAFGLFLPNYLVQHFGIDKVDAGIRSGIFIALATFLRPVGGILGDKLNAVKVLMVDFIIMITGALILGFSNHIALFTIGCLMISVCAGIGNGLIFKLVPSYFAKEAGSANGIVSMMGGLGGFFPPLVITYITGVTGSSHLAFIFFAIFGLIALITMVHLNKKEA >CP022881.1|AXV41603.1|547529_547946_-|putative-small-heat-shock-protein MPSNDFFNNAFLKNDPTDMFRDLGKQVFNQFSSQAFPANLYNESDHYLIEAELAGVKKENISLTFDHHTLTIKANKFLEPHHGQAQLNERSNGELVRRFEFEDVDKDLIKATFEDGVLNIRLPKQQHDSEDATTISIL >CP022881.1|AXV41604.1|548184_548631_-|transcriptional-regulator MYVENSYLSKQLCFLFYVSSKEIIKKYSSYLKEYELTYTGYIVLMAIEEDEKLNIKTLGDRVFLDSGTLTPLLKKLEKKNYVVRTREEKDERNLQISLTDHGKSIKKPLSEVSLKVFGEFDIDVNEAKELINHLQMFVSKNFDKSTEK >CP022881.1|AXV41605.1|548795_549425_+|nitroreductase-family-protein MERISKFDDVLKGRKSVKVFDTEYKISHEEMDEMIQKATKAPSSVNMQPWRLMVVDSEEGKEKILPSFGMNSRQVNTSSAMIIVFGDLKNYEKAEQIYGDAVSKKHMTEEIKDKMLSWVLPHYKGLSREGMKDIVNIDSSLMAMQFMLVAKSHGYDTNPIGGFDKANIADVLGLDSDRFVPVVAIAVGKGAQEAHKSVRLPLDDVRQYL >CP022881.1|AXV41606.1|549553_549919_+|hypothetical-protein MSRKQKLIRIIIILIISLVLAFAFFFALKTYQGHKNIEMVDSYFKEHHLKDKIKKEETLYSAKKGVYYKEVIFKDEPKVTYVIQPISTNKGIFAEGFDTETKKSLKSAKHNYFNKNYKPSN >CP022881.1|AXV41607.1|550168_551446_+|DAACS-family-dicarboxylate/amino-acid:sodium-(Na+)-or-proton-(H+)-symporter MALFKRKISLPVQVLIALVLGVVVGLILYGNEEAANYIKPFGDVFLNLIKMIVIPVVFCSLALSISNVGESKTVGRYGWKTILYFEIITTIAIGLGIIFGNLFKPGSGLDPSKLPKGDISKYQSSAHAAEQSTYGNHFIDTIVNIVPTNFFEALTKGELLPIIFFAVFFGLGLAAIGEKAEPVKSFLSGTLEAVFWMINKILKLAPLGVFAFICTTIITFGASALLPLLKLVLVVVFAMVFFVVVVLGIVARMCGISIFSIMKILKSEILLAFSTSSSEAVLPVMMKKMEKFGSPKEITSFVIPIGYTFNLDGSALYQSIAALFVAQMYGMHLTLTEQIVLMLTLMLTSKGMAAVPGTSIVVLLTTLGAMGLPAQGLALIIGVDRLLDMVRTVVNVMGNALSTVVIAKWENLYDKKQGQEYLKSL >CP022881.1|AXV41608.1|551800_552145_-|hypothetical-protein MKSKKGLGFGLIAIMLIVCIVLVVAMMAGGKKETYYGVMKNDTTIDKMISEKDEKIEKNIKLPSDAKVSVKKEDFVMITKNEKTGKIAKVKKVDHDDVPHGLMTQIHDMGHMHM >CP022881.1|AXV41609.1|552521_552944_-|pyridoxamine-5'-phosphate-oxidase MDNQKATEAIEKVLDHSKVGVLSTAYNNKPNSRYMVFYNDELTLYTKTNINSIKVEEIEDNPYAYILLGYNETTNHSFVEIDATIEVVKDQKVIDWLWETQDKSFFDSNKDPELCVLKVIPKSIKLMNDKDLDTPFTIEL >CP022881.1|AXV41610.1|556008_556263_-|hypothetical-protein MKERGHIEQLWREEKYRVLLHSQKQYDAIREKLKSQVSYEEIRMMIEHAITIEPSQGSVINAYDHMWGYFKKWATDEEKQSAQN >CP022881.1|AXV41611.1|556451_557891_+|PTS-system-sucrose-specific-IIBC-component MNYKQSAEEILNAIGGEENLDSMAHCATRLRLILNDESKVDEEALSKMDVVKGTFSTGGQYQIIIGSGTVNKVFNEMEHITGKEASTTSEVKDKSTKNMNPLQRFVKMLSDIFVPIIPAIVAGGLLMGLNNLLTAKDLFYAGKSLIEVHSQFAGLADMINIFANAPFTLLPILIGFSAAKRFGGNPFLGAALGMILVHPSLMSAYDFPKAVEAGKAIPHWDVFGLHINQVGYQGQVLPMLVAAYILATIEKWLRKVVPTVLDNLLTPLLSIFITAFLTFLFVGPITRQLGYWLSDGLTWLYEFGGAIGGLIFGLLYAPIVITGMHHSFIAVETTLIADQAKTGGSFIFPIATMSNMAQGGAALASFFIIKNNKKLKGVASAAGISAVLGITEPAMFGVNLKLRYPFIGAIVGSGLGAAYISFFKVKAIALGTAGIPGFISINPNHGGWLHYLIGMVIAFVVSVIVTFVLSKRKKYKEVQ |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP022881_4 | 551641-551727 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022881_4
|
1 spacers
spacers of CP022881_4
>4.1|551664|41|CP022881|CRISPRCasFinder AGTACTTCTTACGCAGTAGCGAAAGCTACTGTGAACCTTAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022881_4
The CRISPR arrays of CP022881_4 >merge|CP022881|4|551641-551727|CRISPRCasFinder AAGTACTTCCATTTTTAATGGTTAGTACTTCTTACGCAGTAGCGAAAGCTACTGTGAACCTTAAAAGTACTTCCATTTTCAATGGTT >CP022881|4|3|551641-551727|CRISPRCasFinder AAGTACTTCCATTTTTAATGGTT AGTACTTCTTACGCAGTAGCGAAAGCTACTGTGAACCTTAA AAGTACTTCCATTTTCAATGGTT
>CP022881.1|AXV41607.1|550168_551446_+|DAACS-family-dicarboxylate/amino-acid:sodium-(Na+)-or-proton-(H+)-symporter MALFKRKISLPVQVLIALVLGVVVGLILYGNEEAANYIKPFGDVFLNLIKMIVIPVVFCSLALSISNVGESKTVGRYGWKTILYFEIITTIAIGLGIIFGNLFKPGSGLDPSKLPKGDISKYQSSAHAAEQSTYGNHFIDTIVNIVPTNFFEALTKGELLPIIFFAVFFGLGLAAIGEKAEPVKSFLSGTLEAVFWMINKILKLAPLGVFAFICTTIITFGASALLPLLKLVLVVVFAMVFFVVVVLGIVARMCGISIFSIMKILKSEILLAFSTSSSEAVLPVMMKKMEKFGSPKEITSFVIPIGYTFNLDGSALYQSIAALFVAQMYGMHLTLTEQIVLMLTLMLTSKGMAAVPGTSIVVLLTTLGAMGLPAQGLALIIGVDRLLDMVRTVVNVMGNALSTVVIAKWENLYDKKQGQEYLKSL >CP022881.1|AXV41606.1|549553_549919_+|hypothetical-protein MSRKQKLIRIIIILIISLVLAFAFFFALKTYQGHKNIEMVDSYFKEHHLKDKIKKEETLYSAKKGVYYKEVIFKDEPKVTYVIQPISTNKGIFAEGFDTETKKSLKSAKHNYFNKNYKPSN >CP022881.1|AXV41605.1|548795_549425_+|nitroreductase-family-protein MERISKFDDVLKGRKSVKVFDTEYKISHEEMDEMIQKATKAPSSVNMQPWRLMVVDSEEGKEKILPSFGMNSRQVNTSSAMIIVFGDLKNYEKAEQIYGDAVSKKHMTEEIKDKMLSWVLPHYKGLSREGMKDIVNIDSSLMAMQFMLVAKSHGYDTNPIGGFDKANIADVLGLDSDRFVPVVAIAVGKGAQEAHKSVRLPLDDVRQYL >CP022881.1|AXV41604.1|548184_548631_-|transcriptional-regulator MYVENSYLSKQLCFLFYVSSKEIIKKYSSYLKEYELTYTGYIVLMAIEEDEKLNIKTLGDRVFLDSGTLTPLLKKLEKKNYVVRTREEKDERNLQISLTDHGKSIKKPLSEVSLKVFGEFDIDVNEAKELINHLQMFVSKNFDKSTEK >CP022881.1|AXV41603.1|547529_547946_-|putative-small-heat-shock-protein MPSNDFFNNAFLKNDPTDMFRDLGKQVFNQFSSQAFPANLYNESDHYLIEAELAGVKKENISLTFDHHTLTIKANKFLEPHHGQAQLNERSNGELVRRFEFEDVDKDLIKATFEDGVLNIRLPKQQHDSEDATTISIL >CP022881.1|AXV41602.1|546324_547476_+|MFS-family-major-facilitator-transporter,-nitrate:nitrite-antiporter 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MTVNNEQLEVLLRRYFESTNEKIVFVNNSGKIIAMNEAAKEVISEEENYSAMTNAICRRCEGYTNEYDVQSCRDCFLDVAQPHHSQFQVFMKTKNRKIAPFTASYQTIDPVKGINAFTLQDVAPQIERQEKMNQRRMMRKTISAQENERKRISRELHDSVIQEMLNIDVQLRLLKYQQDKEKILNDVKNIEGLMSQLVDDVRHLSVELRPASLDDLGLEAAFKSYFKQFEENYGMQINYVSNIVNHRFDSEVETVVYRVVQEAVYNALKYAGVSEVEVTIQQNELTLIAEIIDRGQGFDPSSKPRGSGLGLYGMKERSELVEGNLNIETHIGKGTIITLEVPL >CP022881.1|AXV41599.1|543658_544111_+|hypothetical-protein MMPDSMFESQSFQENIDRIRLEQGFDFAALAFYESASTYSPIKWQYVSGNNNDRYKLIILRKGRGLAGNVMKTGKRMIIANVDMALTPDEKVKFPILLSENLTAVIAIPLWYQQQVYGVMLFGQRNHKPLPINVYDIDIYKQLGIFNEEI >CP022881.1|AXV41598.1|542959_543637_+|respiratory-nitrate-reductase-subunit-gamma MINQFLWVIYPYLCLAIFIIGHIARYKYDQFSWTAKSSELIEKKRLKWGSLLFHLGVIPVFFGHVVGLVIPKYWMDSLGIDEHMYHFGAVYIGSIFGIMTLIGMLLLTARRITIKNVRRLSSFSDIFVNILLLIIIFMGCYSTIVTNIMHIDFNYRETISVWFRQLFMFKPHADLMANVPLQFKLHMVLGFTIFACWPFTRLVHVWSVPLSYTSRRYIIYRKNKL >CP022881.1|AXV41608.1|551800_552145_-|hypothetical-protein MKSKKGLGFGLIAIMLIVCIVLVVAMMAGGKKETYYGVMKNDTTIDKMISEKDEKIEKNIKLPSDAKVSVKKEDFVMITKNEKTGKIAKVKKVDHDDVPHGLMTQIHDMGHMHM >CP022881.1|AXV41609.1|552521_552944_-|pyridoxamine-5'-phosphate-oxidase MDNQKATEAIEKVLDHSKVGVLSTAYNNKPNSRYMVFYNDELTLYTKTNINSIKVEEIEDNPYAYILLGYNETTNHSFVEIDATIEVVKDQKVIDWLWETQDKSFFDSNKDPELCVLKVIPKSIKLMNDKDLDTPFTIEL >CP022881.1|AXV41610.1|556008_556263_-|hypothetical-protein MKERGHIEQLWREEKYRVLLHSQKQYDAIREKLKSQVSYEEIRMMIEHAITIEPSQGSVINAYDHMWGYFKKWATDEEKQSAQN >CP022881.1|AXV41611.1|556451_557891_+|PTS-system-sucrose-specific-IIBC-component MNYKQSAEEILNAIGGEENLDSMAHCATRLRLILNDESKVDEEALSKMDVVKGTFSTGGQYQIIIGSGTVNKVFNEMEHITGKEASTTSEVKDKSTKNMNPLQRFVKMLSDIFVPIIPAIVAGGLLMGLNNLLTAKDLFYAGKSLIEVHSQFAGLADMINIFANAPFTLLPILIGFSAAKRFGGNPFLGAALGMILVHPSLMSAYDFPKAVEAGKAIPHWDVFGLHINQVGYQGQVLPMLVAAYILATIEKWLRKVVPTVLDNLLTPLLSIFITAFLTFLFVGPITRQLGYWLSDGLTWLYEFGGAIGGLIFGLLYAPIVITGMHHSFIAVETTLIADQAKTGGSFIFPIATMSNMAQGGAALASFFIIKNNKKLKGVASAAGISAVLGITEPAMFGVNLKLRYPFIGAIVGSGLGAAYISFFKVKAIALGTAGIPGFISINPNHGGWLHYLIGMVIAFVVSVIVTFVLSKRKKYKEVQ >CP022881.1|AXV41612.1|557959_558907_-|Mg2+-transporter-protein,-CorA-family-protein MITAYKHSNQINNEIIETPIDQQALWINVVEPDREEIEYLMDHYHLPEDFIRDPLDSEESARIEYDEDTGYSLIIIDLPLINSTNRSVLSFITIPLGIVIGNGIVMTICDAENEFLENFSRQDNINLKFHSRFALEILTTIANHYNRNLRLLNKSRIRIERELKNNITNKQLFKLMEVEKSLVYFLAALKGNDTIIKKLFRLPAIKRFEDDEELLEDLIIENNQAIETTELHQRILESITTSYASLLSNDMNTIMKTLTMFTVLLTLPTLVFSFFGMNVPLPLDDHSYISWIIVVGISLILVAIVSVYLWRKQKL >CP022881.1|AXV41613.1|558968_559577_-|TetR-family-transcriptional-regulator MKEDRRVRKTKSAIKYAFIQLLKERSLENITVQDIADKADINRGTFYLHYEDKYLLLTDMEDECIEQISKFTQFSEIQGDNVEMIATLFIDKVLRNIIQHVYDNLDFYNTILSLERKSRLEEKISDLIQYNMKHQVSVDNKIEGIPEMYFHSYVSGATISIIRYWVLDSNRISVDELVTHIFKIIYYGPLRIMAEQRYNHMN >CP022881.1|AXV41614.1|559739_561017_+|hypothetical-protein MNIFKSKLLWLTPIAIILILMIFAIAFYPAFNPKPKDMPIAIVNHDEGTSIQGKKMNIGDKLEDKLLDSDSKAIKWVKVDSEKDAKQGMEDEKYYGAAIFEKDFSKHAMSKTQKVVMDSKKAEMKEKVESGEVPAQQAQMMAKKMGNQSVDVKQAQLKTIVSQGSSLQGSQMATNVLSGMGDNINKQITKQSLQTLEKQNVKVDAKDIDSVTNPVKVDNEKINKVKDHQGGGNAPFLMFMPIWMGSIVISVLLFFAFRTSGNIKIAHRLIASVGQIIFTVIAAFLGSFAYVYFMGGALGFDFDHPNRVATFVALAIMGFVGLILGTMTWLGMKSVPIFFIAMFFSMQMVMLPKQMLPKFYQRYIVDWNPFVHYATSLKEIIYMNHHIELNSTMWMLIGFMIFGAVSSLLAAAIRKHSTKRTEVPS >CP022881.1|AXV41615.1|561135_561561_-|hypothetical-protein MSQLQEQLIGTWSLVSYQDEDENGQIFYPLGKDATGFIMYNPDGYMSAQLMQQGRPAYASGDLHTGTKDEMAKAAHGYLAYAGKYELDEENQTVYHTMNVSMNPTWLGDTQPRIFKLEGHTLSIENGNNPNQKLVWQRVNH >CP022881.1|AXV41616.1|561597_562353_-|short-chain-dehydrogenase MNRNVIVTGSGQGIGYAIAQAFDQQGDRVFIFDMSKDAAEAAAQSLEKGVAYQVDVTDETTVKNAIKDVTNQYGAIDVLVNNAGIQYISKIEDFPLDKWNQVIGVIQTGTFLMTKHVLPSMKQQQQGRIITISSAHGEMADPFKSAYVASKFAQIGFTKTIALETVDDGITANAVLPGPVRTKLIENQLAKLAEQDGTTEQEAMEKHITSKSPMNRLLEPSEIADTVVFLASDGASAITGETISVSGGSNA >CP022881.1|AXV41617.1|562652_563567_+|LysR-family-transcriptional-regulator MINTNSVQYLEAVGRFGSISRAAKHLYISQPYLSKFIKDIETELGVTLINRESNPITLTYAGERYLDYMNQINYTYKEMKQELQNISELKKGRLVIGVNPILAAHTLYDILPEFIKAYPGIELKLIEEPSHRIEQLLIDNKIDIALTILPFYQGTFKYDVLYSEAIYLALPPDYALLLSQQSEEKNTEDIHDDIRNERFILLKPNMALRHLTDQILENHDITPQIAMETMSVDNALRLVNEGLGMTYVPESVKNSMPQFKGHFIKLDASKYANHVVLAYKYDKLNHLSKGAYAFLEMAKSIYRK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP022881_6 | 1332102-1332204 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022881_6
|
1 spacers
spacers of CP022881_6
>6.1|1332135|37|CP022881|CRISPRCasFinder TCTTTGCGGTTTACAAAAGCCTTTGCTTTTTCATTAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022881_6
The CRISPR arrays of CP022881_6 >merge|CP022881|6|1332102-1332204|CRISPRCasFinder AGTACCTAACTTCTTTCTTTGTAAGAAGAAGGTTCTTTGCGGTTTACAAAAGCCTTTGCTTTTTCATTAGAGTACCTAACTTCTTTCTTTGTAAGAAGAAGGT >CP022881|6|5|1332102-1332204|CRISPRCasFinder AGTACCTAACTTCTTTCTTTGTAAGAAGAAGGT TCTTTGCGGTTTACAAAAGCCTTTGCTTTTTCATTAG AGTACCTAACTTCTTTCTTTGTAAGAAGAAGGT
>CP022881.1|AXV42357.1|1331631_1331904_+|histone-family-protein-DNA-binding-protein-HU MNKTDLINAVAEQADLTKKEAGSAVDAVFESIQNSLAKGEKVQLIGFGNFEVRERAARKGRNPQTGKEIDIPASKVPAFKAGKALKDAVK >CP022881.1|AXV42356.1|1330462_1331461_+|NAD(P)H-dependent-glycerol-3-phosphate-dehydrogenase MTKISVFGMGSFGTALANVLAQNGHDVLMWGKNSENVEELNTHHMNKNYLKEAKLEPSIKATTDLSEGVAFADIYLMALPTKAMREVATQIDDLLTSKKTFIHVAKGIENGTFKRVSEMLEDSISPEHNAGIGVLSGPSHAEEVVIKQPTTVAASSKDEKVSQLIQDLFMNDYLRVYTNNDLVGVELGGALKNIIAVASGIVAGMGFGDNAKAALMTRGLAEISRLGEKLGADPMTFLGLGGIGDLIVTCTSTHSRNFTLGYKLGQGKTTDEALEEMKMVVEGIYTTKSVYYLAQEVNVEMPITTALYKVLFEDVPVKESIKELMGRDKKSE >CP022881.1|AXV42355.1|1329130_1330441_+|GTP-binding-protein-EngA MTKPIVAIVGKPNVGKSTIFNRVVGERVSIVEDTPGVTRDRIYSSGEWLTHEFNIIDTGGIEIGDAPFQTQIRAQAEIAIEEADVIVFMVNVREGLTQSDEMVAQMLYKSKKPVVLAVNKVDNVEMRNDIYDFYSLGFGEPYPISGSHGLGLGDLLDAVVENFGEEEEDPYDDDTIRLSIIGRPNVGKSSLVNAILGEERVIVSNVAGTTRDAVDTEYSFDGQDYVLIDTAGMRKKGKVYESTEKYSVLRALKAIERSNVVLVVIDAEQGIIEQDKRVAGYAHEEGKAIVIVVNKWDTVEKDSKTMKKFTEDVRKEFQFLDYAQIAFVSAKEQLRLKTLFPYIKEASENHKKRVQSSTLNEVITDVISMNPTPTDKGRRLNVFYSTQVAIEPPTFVVFVNDVELMHFSYKRYLENQIRHAFGFEGTPVHIIPRKRN >CP022881.1|AXV42354.1|1327776_1328955_+|putative-30S-ribosomal-protein-S1 MTEEFNESMINDIKEGDKVTGEVQQVEDKQVVVHINGGKYNGIIPISQLSTHHIEKPNEVVKEGDEIEAYVTKIEFDEENDSGAYILSKRQLETEQSYDYLQEKLDNNEVIEAKVTEVVKGGLVVDVGQRGFVPASLISTDFIEDFSDFEGQTIKIKVEELDPENNRVILSRKAVEQAENEVKKASLLDSLNAGDVIEGKVARLTNFGAFVDIGGVDGLVHVSELSHQHVQSPEEVVSVGDKVKVKVKSVEKDTERISLSIKDTLPTPFAQIKGQFHENDVIEGTVVRLANFGAFVEIAPGVQGLVHISEIDHKHIGTPGEVLEPGQQVSVKILGIDEENERVSLSIKATLPNEDVVESDASTTQSYLNNDADEDNPTLGDVFGDKFKDLKF >CP022881.1|AXV42353.1|1326833_1327493_+|cytidylate-kinase MSLINIALDGPAAAGKSTIAKQVASQLSMIYVDTGAMYRAITYKYLRTNQTEDFEALIKDTTLELTYDETKGQRVILDNEDVTDYLRENDVTNNVSYVASKEPVRSFAVKKQKDLAAQKGIVMDGRDIGTVVLPNAELKVYMIASVEERAERRQKENELRGIESNLEQLKVEIEQRDQYDMNREISPLRKADDAITLDTTGKSIETVTNEILDMVNQIK >CP022881.1|AXV42352.1|1325782_1326757_-|Alpha/beta-hydrolase-fold-3-domain-containing-protein MKRLLVIHTGGTISMSQDSSNRVITNKENPISQHQDIIKQYAQVDEIHPMNVPSPHMSIQHVKGLRDIIINANLNNESVYDGFVITHGTDTLEETAYLLDLLLDIDEPVVITGAMRSSNEIGSDGLYNFISAIRVASSNNSYHMGVMVVFNDEIHTARNVTKTHTSNTNTFQSPNHGPLGVLTKDNVQYHHHPLHHTSYKMINPKLNVPLVKSYMDMQSDLLHFYAESDIDGLIIEAMGQGNLPPTCLEGLYACIDKQIPIVIVSRSFNGIVSPVYAYEGGGYQLAEKGLIFSNGLNGPKARLKLLVSLSNELNREQIKQYFEE >CP022881.1|AXV42351.1|1324738_1325725_+|FAD-dependent-pyridine-nucleotide-disulfide-oxidoreductase MQKIESIIIGGGPCGLSAAIEQKKKGIETLVIEKGNVVESIYNYPTHQTFFSSSDKLSIGDIPFIVEESKPRRNQALVYYREVVKHHQLNIHAFEEVLTVKKMNNRFTITTTKDVYECKFLTVATGYYGQHNTLEVEGAELSKVFHYFKEAHPYFDQNVVVIGGKNSAVDAALELEKAGANVTVIYRGDHYPKAIKPWILPNFESLVNHEKITMEFNANVTQITEENVTYEKDGKTITIPNDYVFAMIGYHPNYEFLESIGIEINTNEYGTAPVYNRETYETNVENCYIAGVIAAGNDANTIFIENGKYHGGLITQSILTKKQTPLES >CP022881.1|AXV42350.1|1322733_1324545_+|cell-surface-elastin-binding-protein MSNNNFKDDFKKNRQAIDPEDHNEQTSSHEEQEDNAVDSTEDKANQQFPPRNAQRRKRRRDIATNNNRQADSRTKASQDGSLDDRHDDTSLHNGDNKNYDASNHNDVNKDHKQDHRPEDHSTRESEQDFKQDEPLNRSRKSDDLQHDNRHDKKDGHGKDAALAGGAAVGGAAVGKKMTSDHKQDDNHRQENRVSDHQKDRDRHDDYTKDEHRQDSSKDRQDELKKGHHDEEHHDSGKGKKAAAAGAGVAGAAGAAGLAKHHHDKKFDHTDDNELKNDRNQNHRDDKHNDKDVKDNHQSDDEKSGKGKKAAAAGAGVAGAAGAAGLAKNHHDKKESHHNDKDIKDDHKHDDHDKHDNKDKHKSNKGKKAAAVGAGAAGVAGAAGAKHHHDKNKRQDNHDGKKKGGFMKIILPIIAAVLILGAIAIFAGMALNNHSNSGNDDNKIANEDSKDGKKNNDASKDKDSSKDKDSSKDKDKSKDSDKDKATTSDESDSSDASNSDKNSASDNTNGANSQASNSQSQNGSNSQNGQGQNSQQNGQQGSNSQNSNSNQQGKQTHTVNGKENLYRIAIQYYGSGSPANVEKIRQANGLNGNNIHNGQTLVIP >CP022881.1|AXV42349.1|1321202_1322582_+|ATP-dependent-DNA-helicase MLQQKLKDWFGFDSFKPGQEDIISSVLDQKHTLGILPTGSGKSLCYQLPTYILEKPTLVISPLISLMDDQVMQMKLNGEHAVCCIHSGMDNTEKRQNLSNIRQSKFIYLSPEFILQPQNFKLIANIDFGLIVLDEAHCLSEWGYDFRPHYALIGKITTSFKSATILALTATAPPHLESDLNEMLNVTFNTIKTSMNRINISLKHLNFGSDEEKIDWLLPQLNETGPTIIYVSSKKLCLTLAQLIYDSGFLTGIYHGDLSYQERQTVQQQFLNNDIPIIVATSAFGMGINKKDIRTVIHFHLSSSPSNYLQEIGRAGRDGEASQAISLFQPDDAYILETILFADRITSEDIHSFELGQFIPPEKESILTILYNQYTINQMQRIFDQSFRRKKLGYSRMLGYTQLDQCRRKYLLEFFNEHPKLPDVCCDNDTELPSMKVINRKKVKRKLSYSEKLQNLFEL >CP022881.1|AXV42348.1|1320253_1321222_+|hypothetical-protein MYQIINHAYQHAFNYKTNKSIYNILTGKKSHQTFFDASSQQLLSLYHSLPRLKYPSFERYLNELNDEEPKVNIKTHPRCTYDSLINTFNCIQLLIQTVSQSIHNDFRFVPITQQTYIQQRVKHIYQHIKVNDLESKFITEIEQLFEDIASKHEHVYLHYYLQGYDEAMYTRQQVSLIESKSQQELFEIEMNQLVDVMFEIEDIQKHPILNQTIIRPTLLNKTKLTLHQLEQGHSIHDISTIQNVKLNTIEDHLLELFIKGYINDYDTYLDIKSIQPFIDYYKGHIGIKLREYKQQFDTLTYFQIKLMIVGIERGDLVASTET >CP022881.1|AXV42358.1|1332271_1332844_+|heptaprenyl-diphosphate-synthase-subunit-1 METTVSKLNIDINQRLKGIVDYESIQINEKLGDLLDSYDLPEKAKLACLTIDTSMKHLDDISNSGLSKHSILVGDLLSAHFYTILAEINDPTYQLAMSKAIVEVSELKSSLHQHVLTDDEASNAIFKVETLFPYITLSHFCDEENANRIYEFLYDDVHDYYPSYLKNYNKERINQIMKDIKQTLEKRRGN >CP022881.1|AXV42359.1|1332845_1333553_+|putative-2-heptaprenyl-1,4-naphthoquinone-methyltransferase MAENNAKKEQVHTVFQNISKKYDRLNNIISFEQHKVWRKRVMKEMAVKKGSTALDVCCGTADWTIALSKAVGPQGEVTGLDFSENMLEVGKEKTAHMDNIHLVHGDAMNLPFDDASFDYVTIGFGLRNVPDYLGALKEMERVLKPGGMIVCLETSQPTLPVFKQVYRLYFKFVMPIFGKLFAKSKEEYEWLQQSTFDFPGKEKLKRLFEQAGFSNIKVRSFTGGVAAMHLGYKQK >CP022881.1|AXV42360.1|1333549_1334533_+|iron-(Fe3+)-ABC-superfamily-ATP-binding-cassette-transporter,-membrane-protein MIRPKVINVAKLNMNNEIKKVEKRLEQAIHSQDKVLEEAAFHLLSSGGKRVRPAFVILSSQFGKEEGVSEDTYKVAVALELIHMATLVHDDVIDKSDKRRGRLTISKKWDQTTAIITGNFLLALGLQHLSEIKDKRVHEILSESIVDVCRGELFQFQDQFNSQQTMTNYLRRINRKTALLIQLATEVGAITAGSDIKTIHKLKMIGHYIGMSFQIVDDILDFTSTEKKLGKPVGSDLMNGHITLPVLLEMRDNSAFRQMIEELHPNSNKEQFEACINIIRQSNNIQVSKDISEKYLEKALNLIDELEDNQARQLFKKLIKKMGSRNV >CP022881.1|AXV42361.1|1334666_1335116_+|nucleoside-diphosphate-kinase-superfamily-protein MERTFLMIKPDAVQRNLIGEIISRIENKGLKLVGGKLMQVPQELAEKHYGEHEGKPFYNNLISFITSAPVFAMVVEGEDAVAVSRHIIGSTNPSEAAPGSIRGDLGLTVGRNIIHGSDSVESAEREINLWFKEEEISSYESPRDAWLYE >CP022881.1|AXV42362.1|1335376_1336543_+|chorismate-synthase MRYLTSGESHGPQLTVIIEGVPANLEIKAEDINKEMFKRQGGYGRGRRMQIEKDAIEIVSGVRNGYTLGSPITLVVTNDDFTHWRKIMGAAPISDEERENMKRTITKPRPGHADLIGGMKYNHRDLRNVLERSSARETAARVAVGAVSKILLEQLDIHIYSRVVEIGGIKDEGLYDVETFKSNVDKNDVRVINEDIAQQMRDKIDQAKKEGDSIGGVVQVIAENMPVGIGSYVHYDRKLDGRIAQGVVSINAFKGVSFGEGFKAAEKPGSEIQDEIMYNETKGYYRASNHLGGFEGGMSNGMPIIVNGVMKPIPTLYKPLNSVDINTKEDFKATIERSDSCAVPAASVVCEHVVAFELAKALLEEFQANHIDQLKAQIAERRQLNIEF >CP022881.1|AXV42363.1|1336567_1337632_+|putative-3-dehydroquinate-synthase MKLNTTYANNNYPIIVEHGAINLLNEINQSYDQSFFIIDDTVYQLFKNKLDQLIQANHATKIIIPSGEQTKTFAHFHDIIESILSHQITRNTSIVAIGGGATGDFAGFVASSLLRGVAFIQVPTTILAHDSSIGGKVGINSQHGKNLIGAFYRPSAVLYDLDFLTTLPYSEVLSGYAEVYKHALLNGEADTRKIEQHFSNKDALASLNDMETFIYKGIETKLNIVINDEKEQGVRKFLNLGHTFGHAIEYKYKIPHGHAVMIGIVYQFIVANHLLKTNYDIDHYLNYLDALAYPIQIIKELHFDDIYQFMLLDKKNNHDGIQMVLLKSLGNAVVQHVDQSTHLAAFKELQSKIK >CP022881.1|AXV42364.1|1337643_1338942_+|3-phosphoshikimate-1-carboxyvinyltransferase MSTAETIQINGPLKGEIEVPGDKSMTHRAIMLASLATGQTQIHKPLLGEDCKRTMNIFRLLGVSITEEEDRLIVDSPGYQHFKIPHQVLYTGNSGTTTRLLAGLLSGIGIESVLSGDVSIGKRPMDRVLNPLLKMNANICGVEGNYTPLIIKPSDIKGMTYTMEVASAQVKSAILFASIFSNESSSITEIDVSRNHTETMFNHFNIPIIVNGKTIVTEPLAVKHIKPHDFYVPGDISSAAFFIVAALITPGSDVTIHNVGINPTRSGIIDIVQQMGARIELSNVTKEAEPTASIRVQYTPNLKPIQIHGELVPRAIDELPVIALLCTQASGTSVIKDAEELKVKETNRIDTTADMLNQLGFELQPTNDGLIIHPSEFKTSVTVDSQTDHRIGMMLAIASLLSSEPLTIEQFDAVNVSFPGFLPKLKLLENEG >CP022881.1|AXV42365.1|1338947_1340192_+|putative-PEP-CTERM-system-TPR-repeat-lipoprotein MEDIYKLIDDINLQKLTNLDTRVNEALSSNNDDALFILGETLYNFGLTPQGLEVFRTLYHRYPDESELLIYFIEGLMSENQTDEALEYLSQVEASTEKLMLEADLYQQINMLEVAIDKIQSAIQLEPNDPILHFALAELLYFDGQYLRATTEYETVLETGEYEVNGINLFSRQADCSLQSGNYSDAIRLYDEINETEMNSQDYFKKAIAYEKNDITQEAIKIMKSLLSKDPDFLQGYFYLQSLYENEKNYPDAIEIGKEGLRLSQFYKELMVSTGSLEIEHGDANEGVTLLKQALEVDNAYHEPLLILSDLYRSEEDYEAIIELLTYVDEEDLDPVFMWHLAYAYGQEERDKEAQHFFELAYPTLKSQSEFLSDYYFYLLEIGQKDTAKSILDQLLEMDPSNETWHDEAMRLQS >CP022881.1|AXV42366.1|1340207_1340783_+|hypothetical-protein MNNSLTKMKQSFIEYLLFHYEFKSRISVWVLNYLKASPKKLQYIHFVDEGITHHQTLQIAEVESHASAIQFNGEQLQLVNTNEIFELIANNEISFDIQLHFSNKQQRESRLDDLILAQLIHSPNYSSYVQDLYAISINERKQATLIERLQDNIDLSLQMKEQERFYQLTQILNVLKTKQMNSENGDSDDDN >CP022881.1|AXV42367.1|1340772_1341369_+|hypothetical-protein MTIKQYWEISLYNRPFLIFLLICNVLGTIYGYDWYSGQLYITPTYFLPFVPDSPTASLFLSIAIGLLLLNRSSSIIQALAFVTLVKYGVWAVIMNIIMFIIDGDITINGLMLLLSHGIMALQAFYFYPRFNITTIGFIVSFIWVLVNDYIDYVKMQFPYYKFIASHVVEIGVLSICLSMISLFLYLYLERIIKVKSFD |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP022881_2 | 2.3|103643|29|CP022881|CRT | 103643-103671 | 29 | NC_019961 | Prevotella dentalis DSM 3688 plasmid pPREDE01, complete sequence | 3595-3623 | 0 | 1.0 |
| CP022881_2 | 2.8|103645|28|CP022881|PILER-CR | 103645-103672 | 28 | NC_019961 | Prevotella dentalis DSM 3688 plasmid pPREDE01, complete sequence | 3596-3623 | 0 | 1.0 |
| CP022881_2 | 2.3|103643|29|CP022881|CRT | 103643-103671 | 29 | NZ_CP033989 | Staphylococcus aureus strain P1D14C1 plasmid unnamed2, complete sequence | 2087-2115 | 1 | 0.966 |
| CP022881_2 | 2.8|103645|28|CP022881|PILER-CR | 103645-103672 | 28 | NZ_CP033989 | Staphylococcus aureus strain P1D14C1 plasmid unnamed2, complete sequence | 2088-2115 | 1 | 0.964 |
| CP022881_1 | 1.4|97275|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 97275-97304 | 30 | KY653124 | Staphylococcus phage IME1367_01, complete genome | 40821-40850 | 2 | 0.933 |
| CP022881_1 | 1.4|97275|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 97275-97304 | 30 | MF417885 | Uncultured Caudovirales phage clone 3S_9, partial genome | 23199-23228 | 2 | 0.933 |
| CP022881_1 | 1.10|97670|30|CP022881|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 97670-97699 | 30 | MF417889 | Uncultured Caudovirales phage clone 10S_14, partial genome | 52-81 | 2 | 0.933 |
| CP022881_2 | 2.3|103643|29|CP022881|CRT | 103643-103671 | 29 | NC_013391 | Staphylococcus epidermidis plasmid SAP108C, complete sequence | 3018-3046 | 2 | 0.931 |
| CP022881_2 | 2.7|103579|29|CP022881|PILER-CR | 103579-103607 | 29 | NZ_LR735422 | Staphylococcus epidermidis strain none isolate Se_BPH0697 plasmid 2 | 2139-2167 | 2 | 0.931 |
| CP022881_2 | 2.8|103645|28|CP022881|PILER-CR | 103645-103672 | 28 | NC_013391 | Staphylococcus epidermidis plasmid SAP108C, complete sequence | 3018-3045 | 2 | 0.929 |
| CP022881_2 | 2.2|103577|30|CP022881|CRT | 103577-103606 | 30 | NZ_LR735422 | Staphylococcus epidermidis strain none isolate Se_BPH0697 plasmid 2 | 2138-2167 | 3 | 0.9 |
| CP022881_2 | 2.3|103643|29|CP022881|CRT | 103643-103671 | 29 | NC_019145 | Staphylococcus aureus plasmid pUR2355, complete sequence | 6464-6492 | 3 | 0.897 |
| CP022881_2 | 2.3|103643|29|CP022881|CRT | 103643-103671 | 29 | NZ_KX712120 | Staphylococcus haemolyticus isolate 131A plasmid p131A, complete sequence | 1478-1506 | 3 | 0.897 |
| CP022881_2 | 2.3|103643|29|CP022881|CRT | 103643-103671 | 29 | NZ_CP054009 | Staphylococcus hominis strain FDAARGOS_762 plasmid unnamed4, complete sequence | 1927-1955 | 3 | 0.897 |
| CP022881_2 | 2.8|103645|28|CP022881|PILER-CR | 103645-103672 | 28 | NC_019145 | Staphylococcus aureus plasmid pUR2355, complete sequence | 6465-6492 | 3 | 0.893 |
| CP022881_2 | 2.8|103645|28|CP022881|PILER-CR | 103645-103672 | 28 | NZ_KX712120 | Staphylococcus haemolyticus isolate 131A plasmid p131A, complete sequence | 1478-1505 | 3 | 0.893 |
| CP022881_2 | 2.8|103645|28|CP022881|PILER-CR | 103645-103672 | 28 | NZ_CP054009 | Staphylococcus hominis strain FDAARGOS_762 plasmid unnamed4, complete sequence | 1927-1954 | 3 | 0.893 |
| CP022881_1 | 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 97209-97238 | 30 | NZ_CP039285 | Leptospira interrogans strain FMAS_AW1 plasmid pLiSL2, complete sequence | 119360-119389 | 5 | 0.833 |
| CP022881_1 | 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 97209-97238 | 30 | NZ_CP043040 | Leptospira interrogans serovar Hardjo strain L53 plasmid p1 | 31923-31952 | 5 | 0.833 |
| CP022881_1 | 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 97209-97238 | 30 | NZ_CP044515 | Leptospira interrogans serovar Canicola strain 611 plasmid p1, complete sequence | 61402-61431 | 5 | 0.833 |
| CP022881_1 | 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 97209-97238 | 30 | NC_025136 | Leptospira interrogans serovar Canicola strain Gui44 plasmid pGui1, complete sequence | 60456-60485 | 5 | 0.833 |
| CP022881_1 | 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 97209-97238 | 30 | NZ_CP044511 | Leptospira interrogans serovar Canicola strain LJ178 plasmid p1, complete sequence | 61329-61358 | 5 | 0.833 |
| CP022881_1 | 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 97209-97238 | 30 | AP013425 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G16, isolate: uvMED-CGR-C55A-MedDCM-OCT-S46-C84 | 19198-19227 | 5 | 0.833 |
| CP022881_1 | 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 97209-97238 | 30 | AP013698 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C55A-MedDCM-OCT-S36-C68, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 10169-10198 | 5 | 0.833 |
| CP022881_1 | 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 97209-97238 | 30 | NC_031046 | Staphylococcus phage BP39, complete genome | 10317-10346 | 6 | 0.8 |
| CP022881_2 | 2.8|103645|28|CP022881|PILER-CR | 103645-103672 | 28 | MH622920 | Podoviridae sp. isolate ctda_1, complete genome | 1436-1463 | 6 | 0.786 |
| CP022881_1 | 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 97209-97238 | 30 | KT895374 | Bacillus phage vB_BpuM-BpSp, complete genome | 107093-107122 | 7 | 0.767 |
| CP022881_1 | 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 97209-97238 | 30 | NZ_CP038025 | Acinetobacter radioresistens strain DD78 plasmid pAR3, complete sequence | 23592-23621 | 7 | 0.767 |
| CP022881_1 | 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 97209-97238 | 30 | NZ_CP053689 | Arthrobacter citreus strain NEB 577 plasmid unnamed1, complete sequence | 11867-11896 | 7 | 0.767 |
| CP022881_1 | 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 97209-97238 | 30 | NC_013329 | Staphylococcus aureus plasmid pWBG758, complete sequence | 19550-19579 | 7 | 0.767 |
| CP022881_1 | 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 97209-97238 | 30 | NC_019401 | Cronobacter phage vB_CsaM_GAP32, complete genome | 27717-27746 | 7 | 0.767 |
| CP022881_2 | 2.3|103643|29|CP022881|CRT | 103643-103671 | 29 | MH622920 | Podoviridae sp. isolate ctda_1, complete genome | 1436-1464 | 7 | 0.759 |
| CP022881_2 | 2.5|103774|30|CP022881|CRT | 103774-103803 | 30 | NZ_CP020047 | Thiomonas intermedia strain ATCC 15466 plasmid pXI1, complete sequence | 41792-41821 | 7 | 0.767 |
| CP022881_1 | 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 97209-97238 | 30 | KF562340 | Escherichia phage vB_EcoP_PhAPEC7, complete genome | 47679-47708 | 8 | 0.733 |
| CP022881_1 | 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 97209-97238 | 30 | KF192075 | Escherichia phage vB_EcoP_PhAPEC5, complete genome | 47643-47672 | 8 | 0.733 |
| CP022881_1 | 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 97209-97238 | 30 | HQ259105 | Escherichia phage vB_EcoP_G7C, complete genome | 48154-48183 | 8 | 0.733 |
| CP022881_1 | 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 97209-97238 | 30 | NC_019423 | Enterobacter phage IME11, complete genome | 14736-14765 | 8 | 0.733 |
| CP022881_1 | 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 97209-97238 | 30 | MN855733 | Siphoviridae sp. isolate 355, complete genome | 18282-18311 | 8 | 0.733 |
| CP022881_1 | 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 97209-97238 | 30 | MH358458 | Escherichia phage phi G17, complete genome | 14226-14255 | 8 | 0.733 |
| CP022881_1 | 1.7|97472|30|CP022881|CRISPRCasFinder,CRT | 97472-97501 | 30 | NZ_CP042875 | Bacillus cereus strain 09 plasmid unnamed1, complete sequence | 350436-350465 | 8 | 0.733 |
| CP022881_2 | 2.5|103774|30|CP022881|CRT | 103774-103803 | 30 | KY417925 | Ochrobactrum phage POI1126, complete genome | 47375-47404 | 8 | 0.733 |
| CP022881_5 | 5.1|610331|30|CP022881|CRISPRCasFinder | 610331-610360 | 30 | NZ_CP017944 | Phyllobacterium zundukense strain Tri-48 plasmid unnamed4, complete sequence | 284262-284291 | 8 | 0.733 |
| CP022881_1 | 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 97209-97238 | 30 | NZ_CP018901 | Campylobacter coli strain YH502 plasmid pCOS502, complete sequence | 121438-121467 | 9 | 0.7 |
| CP022881_1 | 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 97209-97238 | 30 | NZ_CP017026 | Campylobacter coli plasmid pCC14983A-1, complete sequence | 176018-176047 | 9 | 0.7 |
| CP022881_1 | 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 97209-97238 | 30 | NZ_CP044176 | Campylobacter coli strain AR-0411 plasmid pAR-0411, complete sequence | 89159-89188 | 9 | 0.7 |
| CP022881_1 | 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 97209-97238 | 30 | NZ_CP025282 | Campylobacter coli strain YH503 plasmid pCOS503, complete sequence | 103966-103995 | 9 | 0.7 |
| CP022881_1 | 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 97209-97238 | 30 | NZ_CP048772 | Campylobacter jejuni strain ZS007 plasmid pCJ145K, complete sequence | 130523-130552 | 9 | 0.7 |
| CP022881_1 | 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 97209-97238 | 30 | NZ_CP028373 | Campylobacter jejuni subsp. jejuni strain huA17 plasmid unnamed1, complete sequence | 71550-71579 | 9 | 0.7 |
| CP022881_1 | 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 97209-97238 | 30 | NZ_CP014345 | Campylobacter jejuni strain RM3194 plasmid unnamed, complete sequence | 54612-54641 | 9 | 0.7 |
| CP022881_1 | 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 97209-97238 | 30 | NZ_CP044166 | Campylobacter coli strain AR-0416 plasmid pAR-0416 | 41377-41406 | 9 | 0.7 |
| CP022881_1 | 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 97209-97238 | 30 | MN693192 | Marine virus AFVG_25M42, complete genome | 32386-32415 | 9 | 0.7 |
| CP022881_2 | 2.6|103513|29|CP022881|PILER-CR | 103513-103541 | 29 | CP003671 | Staphylococcus warneri SG1 plasmid clone pvSw2 genomic sequence | 1067-1095 | 9 | 0.69 |
| CP022881_2 | 2.6|103513|29|CP022881|PILER-CR | 103513-103541 | 29 | CP003676 | Staphylococcus warneri SG1 plasmid clone pvSw7 genomic sequence | 42-70 | 9 | 0.69 |
| CP022881_2 | 2.1|103511|30|CP022881|CRT | 103511-103540 | 30 | CP003671 | Staphylococcus warneri SG1 plasmid clone pvSw2 genomic sequence | 1066-1095 | 10 | 0.667 |
| CP022881_2 | 2.1|103511|30|CP022881|CRT | 103511-103540 | 30 | CP003676 | Staphylococcus warneri SG1 plasmid clone pvSw7 genomic sequence | 42-71 | 10 | 0.667 |
1. spacer 2.3|103643|29|CP022881|CRT matches to NC_019961 (Prevotella dentalis DSM 3688 plasmid pPREDE01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cgacgtcgaattgttctgtgtacgctgcg CRISPR spacer cgacgtcgaattgttctgtgtacgctgcg Protospacer *****************************
2. spacer 2.8|103645|28|CP022881|PILER-CR matches to NC_019961 (Prevotella dentalis DSM 3688 plasmid pPREDE01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gacgtcgaattgttctgtgtacgctgcg CRISPR spacer gacgtcgaattgttctgtgtacgctgcg Protospacer ****************************
3. spacer 2.3|103643|29|CP022881|CRT matches to NZ_CP033989 (Staphylococcus aureus strain P1D14C1 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
cgacgtcgaattgttctgtgtacgctgcg CRISPR spacer cgacgtcgaattgttctgtgtacgctgtg Protospacer ***************************.*
4. spacer 2.8|103645|28|CP022881|PILER-CR matches to NZ_CP033989 (Staphylococcus aureus strain P1D14C1 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.964
gacgtcgaattgttctgtgtacgctgcg CRISPR spacer gacgtcgaattgttctgtgtacgctgtg Protospacer **************************.*
5. spacer 1.4|97275|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KY653124 (Staphylococcus phage IME1367_01, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
gacaagtggaccaatcaataacggtactgg CRISPR spacer gacaagtggaccaatcaataatggaactgg Protospacer *********************.** *****
6. spacer 1.4|97275|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF417885 (Uncultured Caudovirales phage clone 3S_9, partial genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
gacaagtggaccaatcaataacggtactgg CRISPR spacer gacaagtggaccaatcaataatggaactgg Protospacer *********************.** *****
7. spacer 1.10|97670|30|CP022881|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF417889 (Uncultured Caudovirales phage clone 10S_14, partial genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
tcactcctttctgcaataatgggtggggtt CRISPR spacer tcactcctttctgctttaatgggtggggtt Protospacer ************** **************
8. spacer 2.3|103643|29|CP022881|CRT matches to NC_013391 (Staphylococcus epidermidis plasmid SAP108C, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
cgacgtcgaattgttctgtgtacgctgcg CRISPR spacer caacgtcgaattgttctgtgtacgctgtg Protospacer *.*************************.*
9. spacer 2.7|103579|29|CP022881|PILER-CR matches to NZ_LR735422 (Staphylococcus epidermidis strain none isolate Se_BPH0697 plasmid 2) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
gtttcacatcatctatccattccagacag CRISPR spacer gtttctcatcatctatccattccaaacag Protospacer ***** ******************.****
10. spacer 2.8|103645|28|CP022881|PILER-CR matches to NC_013391 (Staphylococcus epidermidis plasmid SAP108C, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.929
gacgtcgaattgttctgtgtacgctgcg CRISPR spacer aacgtcgaattgttctgtgtacgctgtg Protospacer .*************************.*
11. spacer 2.2|103577|30|CP022881|CRT matches to NZ_LR735422 (Staphylococcus epidermidis strain none isolate Se_BPH0697 plasmid 2) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
cgtttcacatcatctatccattccagacag CRISPR spacer tgtttctcatcatctatccattccaaacag Protospacer .***** ******************.****
12. spacer 2.3|103643|29|CP022881|CRT matches to NC_019145 (Staphylococcus aureus plasmid pUR2355, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.897
cgacgtcgaattgttctgtgtacgctgcg CRISPR spacer caacttcgaattggtctgtgtacgctgcg Protospacer *.** ******** ***************
13. spacer 2.3|103643|29|CP022881|CRT matches to NZ_KX712120 (Staphylococcus haemolyticus isolate 131A plasmid p131A, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.897
cgacgtcgaattgttctgtgtacgctgcg CRISPR spacer caacttcgaattggtctgtgtacgctgcg Protospacer *.** ******** ***************
14. spacer 2.3|103643|29|CP022881|CRT matches to NZ_CP054009 (Staphylococcus hominis strain FDAARGOS_762 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.897
cgacgtcgaattgttctgtgtacgctgcg CRISPR spacer caacttcgaattggtctgtgtacgctgcg Protospacer *.** ******** ***************
15. spacer 2.8|103645|28|CP022881|PILER-CR matches to NC_019145 (Staphylococcus aureus plasmid pUR2355, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.893
gacgtcgaattgttctgtgtacgctgcg CRISPR spacer aacttcgaattggtctgtgtacgctgcg Protospacer .** ******** ***************
16. spacer 2.8|103645|28|CP022881|PILER-CR matches to NZ_KX712120 (Staphylococcus haemolyticus isolate 131A plasmid p131A, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.893
gacgtcgaattgttctgtgtacgctgcg CRISPR spacer aacttcgaattggtctgtgtacgctgcg Protospacer .** ******** ***************
17. spacer 2.8|103645|28|CP022881|PILER-CR matches to NZ_CP054009 (Staphylococcus hominis strain FDAARGOS_762 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.893
gacgtcgaattgttctgtgtacgctgcg CRISPR spacer aacttcgaattggtctgtgtacgctgcg Protospacer .** ******** ***************
18. spacer 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP039285 (Leptospira interrogans strain FMAS_AW1 plasmid pLiSL2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
aaataaaaggtgaatttaaaggtg--ctgagt CRISPR spacer aaataaaaggtgaaatgaaaggtgaactca-- Protospacer ************** * ******* ** *
19. spacer 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP043040 (Leptospira interrogans serovar Hardjo strain L53 plasmid p1) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
aaataaaaggtgaatttaaaggtg--ctgagt CRISPR spacer aaataaaaggtgaaatgaaaggtgaactca-- Protospacer ************** * ******* ** *
20. spacer 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP044515 (Leptospira interrogans serovar Canicola strain 611 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
aaataaaaggtgaatttaaaggtg--ctgagt CRISPR spacer aaataaaaggtgaaatgaaaggtgaactca-- Protospacer ************** * ******* ** *
21. spacer 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_025136 (Leptospira interrogans serovar Canicola strain Gui44 plasmid pGui1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
aaataaaaggtgaatttaaaggtg--ctgagt CRISPR spacer aaataaaaggtgaaatgaaaggtgaactca-- Protospacer ************** * ******* ** *
22. spacer 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP044511 (Leptospira interrogans serovar Canicola strain LJ178 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
aaataaaaggtgaatttaaaggtg--ctgagt CRISPR spacer aaataaaaggtgaaatgaaaggtgaactca-- Protospacer ************** * ******* ** *
23. spacer 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP013425 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G16, isolate: uvMED-CGR-C55A-MedDCM-OCT-S46-C84) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
aaataaaaggtgaatttaaaggtgctgagt- CRISPR spacer gaataaagggtgagtttaaaggtg-taagtg Protospacer .******.*****.********** *.***
24. spacer 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP013698 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C55A-MedDCM-OCT-S36-C68, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
aaataaaaggtgaatttaaaggtgctgagt- CRISPR spacer gaataaagggtgagtttaaaggtg-taagtg Protospacer .******.*****.********** *.***
25. spacer 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_031046 (Staphylococcus phage BP39, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
aaataaaaggtgaatttaaaggtgctgagt CRISPR spacer aattaaaaggtgtatttaaaggtattaaga Protospacer ** ********* **********..*.**
26. spacer 2.8|103645|28|CP022881|PILER-CR matches to MH622920 (Podoviridae sp. isolate ctda_1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
gacgtcgaattgttctgtgtacgctgcg CRISPR spacer gacgtcgaagtgttcggtgtacgcgaac Protospacer ********* ***** ******** .
27. spacer 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KT895374 (Bacillus phage vB_BpuM-BpSp, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aaataaaaggtgaatttaaaggtgctgagt CRISPR spacer aaataaaaggggaatttaaagatgttatta Protospacer ********** **********.**.*.
28. spacer 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP038025 (Acinetobacter radioresistens strain DD78 plasmid pAR3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aaataaaaggtgaatttaaaggtgctgagt CRISPR spacer atgtaaaaggtgcatttacaggtgctgtcc Protospacer * .********* ***** ******** .
29. spacer 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053689 (Arthrobacter citreus strain NEB 577 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aaataaaaggtgaatttaaaggtgctgagt CRISPR spacer atttaaaaggtgcatttaaaggtggttacg Protospacer * ********* *********** * *
30. spacer 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_013329 (Staphylococcus aureus plasmid pWBG758, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aaataaaaggtgaatttaaaggtgctgagt CRISPR spacer catttaaagctgtatttaaaggtgctgacc Protospacer * * **** ** *************** .
31. spacer 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019401 (Cronobacter phage vB_CsaM_GAP32, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aaataaaaggtgaatttaaaggtgctgagt CRISPR spacer aaataaaagatgaatttaaagtttgtggcg Protospacer *********.*********** * **.
32. spacer 2.3|103643|29|CP022881|CRT matches to MH622920 (Podoviridae sp. isolate ctda_1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
cgacgtcgaattgttctgtgtacgctgcg CRISPR spacer tgacgtcgaagtgttcggtgtacgcgaac Protospacer .********* ***** ******** .
33. spacer 2.5|103774|30|CP022881|CRT matches to NZ_CP020047 (Thiomonas intermedia strain ATCC 15466 plasmid pXI1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
acgttactgaacgtggaatcgacttcgagg CRISPR spacer acccgcctgaacgtgtaatcggcttcgagc Protospacer ** . ********* *****.*******
34. spacer 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KF562340 (Escherichia phage vB_EcoP_PhAPEC7, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaataaaaggtgaatttaaaggtgctgagt CRISPR spacer tgctggaaggtgattttaaaggtgctgacc Protospacer . *..******* ************** .
35. spacer 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KF192075 (Escherichia phage vB_EcoP_PhAPEC5, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaataaaaggtgaatttaaaggtgctgagt CRISPR spacer tgttggaaggtgactttaaaggtgctgacc Protospacer . *..******* ************** .
36. spacer 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HQ259105 (Escherichia phage vB_EcoP_G7C, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaataaaaggtgaatttaaaggtgctgagt CRISPR spacer tgttggaaggtgattttaaaggtgctgacc Protospacer . *..******* ************** .
37. spacer 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019423 (Enterobacter phage IME11, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaataaaaggtgaatttaaaggtgctgagt CRISPR spacer tgttggaaggtgactttaaaggtgctgacc Protospacer . *..******* ************** .
38. spacer 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN855733 (Siphoviridae sp. isolate 355, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaataaaaggtgaatttaaaggtgctgagt CRISPR spacer tgttggaaggtgattttaaaggtgctgacc Protospacer . *..******* ************** .
39. spacer 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH358458 (Escherichia phage phi G17, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaataaaaggtgaatttaaaggtgctgagt CRISPR spacer tgttggaaggtgactttaaaggtgctgacc Protospacer . *..******* ************** .
40. spacer 1.7|97472|30|CP022881|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP042875 (Bacillus cereus strain 09 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
taaagtaatgtgactgctcttttttactaa CRISPR spacer gttagtaatatggctgctcttttttagaag Protospacer ******.**.************* *.
41. spacer 2.5|103774|30|CP022881|CRT matches to KY417925 (Ochrobactrum phage POI1126, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
acgttactgaacgtggaatcgacttcgagg CRISPR spacer gggacgctgaacgtgaaatcgccttcgaga Protospacer . * ..*********.***** *******.
42. spacer 5.1|610331|30|CP022881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017944 (Phyllobacterium zundukense strain Tri-48 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaacaactcacattgaattcaccaaccgc CRISPR spacer agtacgactcacattgaattcaccgatcat Protospacer **.******************.*.*..
43. spacer 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018901 (Campylobacter coli strain YH502 plasmid pCOS502, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aaataaaaggtgaatttaaaggtgctgagt CRISPR spacer aactaaaaggtgaatttaaagagcttagag Protospacer ** ******************. .*...
44. spacer 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017026 (Campylobacter coli plasmid pCC14983A-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aaataaaaggtgaatttaaaggtgctgagt CRISPR spacer aactaaaaggtgaatttaaagagcttagag Protospacer ** ******************. .*...
45. spacer 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP044176 (Campylobacter coli strain AR-0411 plasmid pAR-0411, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aaataaaaggtgaatttaaaggtgctgagt CRISPR spacer aactaaaaggtgaatttaaagagcttagag Protospacer ** ******************. .*...
46. spacer 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP025282 (Campylobacter coli strain YH503 plasmid pCOS503, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aaataaaaggtgaatttaaaggtgctgagt CRISPR spacer aactaaaaggtgaatttaaagagcttagag Protospacer ** ******************. .*...
47. spacer 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP048772 (Campylobacter jejuni strain ZS007 plasmid pCJ145K, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aaataaaaggtgaatttaaaggtgctgagt CRISPR spacer aactaaaaggtgaatttaaagagcttagag Protospacer ** ******************. .*...
48. spacer 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP028373 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni strain huA17 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aaataaaaggtgaatttaaaggtgctgagt CRISPR spacer aactaaaaggtgaatttaaagagcttagag Protospacer ** ******************. .*...
49. spacer 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014345 (Campylobacter jejuni strain RM3194 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aaataaaaggtgaatttaaaggtgctgagt CRISPR spacer aactaaaaggtgaatttaaagagcttagag Protospacer ** ******************. .*...
50. spacer 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP044166 (Campylobacter coli strain AR-0416 plasmid pAR-0416) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aaataaaaggtgaatttaaaggtgctgagt CRISPR spacer aactaaaaggtgaatttaaagagcttagag Protospacer ** ******************. .*...
51. spacer 1.3|97209|30|CP022881|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693192 (Marine virus AFVG_25M42, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aaataaaaggtgaatttaaaggtgctgagt CRISPR spacer gtcttgaaggtgagtttaaaggtgctggtg Protospacer . * .*******.*************.
52. spacer 2.6|103513|29|CP022881|PILER-CR matches to CP003671 (Staphylococcus warneri SG1 plasmid clone pvSw2 genomic sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.69
gagattttaaagttttatagccttcgttg CRISPR spacer
cttcttctaaagttttatagccttctcca Protospacer
**.****************** ...
53. spacer 2.6|103513|29|CP022881|PILER-CR matches to CP003676 (Staphylococcus warneri SG1 plasmid clone pvSw7 genomic sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.69
gagattttaaagttttatagccttcgttg CRISPR spacer
cttcttctaaagttttatagccttctcca Protospacer
**.****************** ...
54. spacer 2.1|103511|30|CP022881|CRT matches to CP003671 (Staphylococcus warneri SG1 plasmid clone pvSw2 genomic sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.667
cgagattttaaagttttatagccttcgttg CRISPR spacer tcttcttctaaagttttatagccttctcca Protospacer . **.****************** ...
55. spacer 2.1|103511|30|CP022881|CRT matches to CP003676 (Staphylococcus warneri SG1 plasmid clone pvSw7 genomic sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.667
cgagattttaaagttttatagccttcgttg CRISPR spacer tcttcttctaaagttttatagccttctcca Protospacer . **.****************** ...
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
1017421 : 1042221
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP022881|1017421:1042221|DBSCAN-SWA CGTGGACTTTTGGTTAAAGGAACAATCTATCAAGAATAAAAACAAAATAGCTGTGACTGATGGACAACGCTCGCTTACATTCAAAGCTTTATATGATGAAGCGCATGTACTTTCACAACATTTAATACAATTAGCTCAGTCAAGAATTGGTTTACATATTAACAATCGAATTGAATCATTGATATTAATACATGCATGTTGGCTTGCTAATATTGAAATTGCGATGATTAATACTCGATTAACGACTAATGAAATGATTGCTCAAATGAATTCAATCGATGTTAATACAATTATCACAATGACATCTTTAGAATTAGAAGGTTTTAATATATACAATATTGAGGAAATTCAGCTTTTAAATCAAATAGAAGATCAAATGAATATTTTTAAATTAGAAAATATCGCATCAATCATGTTTACGTCGGGTACGACAGGTCCACAAAAGGCTGTGCCTCAAACGTTTAAGAATCATCTAGCAAGTGCAGAAGGATGTAAAAGGAGCTTAGGTTATAGTCAACAATCTAAATGGTTATCTGTACTCCCGATTTATCATATATCTGGTTTGAGTGTGATATTACGTAGTGTGATGGAAGGATTTACTGTCAGACTATTAGAGAAATATAATACAGAAGATATGCTTGATATAATTAAAAATGAAGATATTACTCATGTGTCTCTTGTACCACAAACATTAAAATGGTTAATGGATGCCGGTTTAGAAAAGCCTTATCAATTAGAAAAGATACTGTTAGGTGGCGCAAAGCTTTCTTCTAATTTAATTCAACAAGCTTTAAAGTATCGCTTGCCTATTTATAATTCGTTTGGAATGACTGAAACATGTTCACAATTTTTAACTGCGACACCAGATATGTTGGCTCAACGATATGATACAGTTGGAAAACCGAGTGATAATGTCAAAGTTAAAATTAAAGATGCTGATCAAAATGGTCACGGTGAATTACTTATAAAAGGGGAAAATGTAATGAATGGTTATTTATATCCTTCTAATTTAACAGATACCTTTGAAGATGGCTTTTTTAAAACAGGTGATATTGCTGAAATTGACGATGATGGCTTCGTTATGATTTATGATCGTCGTAAAGACTTAATCATTAGTGGTGGAGAAAATATCTATCCATATCAAATTGAATCTGTAGCTAAATATTTTCCTGAAATTGAAGACGCCGTATGTATCGGTCAAAATGACGACACATGGGGTCAAGTACCGGTACTATATTATATCGCCCAAGACTATGTTGATAAAAATGATTTACAGCAACATTTCTCCACACATTTAGCTAAATATAAAATACCTAAAGCCTTTTATGAAGTAAATGAATTACCATATACATCAACAGGTAAACTACAAAGAAATAAAGTGATGTCAAAGGAATCAAAAAATGAAGATAAATGAGTTGAAGTTTTATTTATATAGTCAGGCATTTAAATCACCTATTGTGACACCTAAAGTGTCGTTAGACAAAAGAGAATGTTTAGTTATCGAACTGATTACTGATACAGGTGATACGTATTTTGGTGAGTGCAATGCCTTTAAAACACCATGGTATGATAAGGAAACCATATCATCGGTTAAACAACAGATTGAACAGTGGTTTGTATCAATTAAAAATAAAGATGTACATTCGTTTGAAGAATGGCAGGCATTATTGAATACATTAAATCATTGTCCGGCAGCCCGCAGTACAGTTGTCATGGCGTTATATCAAATGTATTATAAACTTAAAGCATTTAAGGTTGAATATGGTGCTACCGTGAGTGGATGGAGTGATGCCCAATTTGCGACGTTAAAGCAAACACAACCTAAACGTATAAAAGTGAAATATTCAAATCAATTAATTTCTGATATTAATAAATTAAAGTCATTAGAATTTCCATTTGATATTGTCATCGATGCAAATGAGTCACTCGATATCAATCAATACCAAGAAATAAATAAAAATACTAAGCAGAACATATTATATATAGAAGAACCATTTGCTAATATTAATACCTTAAAACAGTTTGATGATGAACCTCAATTACCTATTGCTATTGATGAAAAAGCTACATCAATTGATGATATTCAGTTTATTGTTTCGCATTATCCAATTGATACGGTCGTACTCAAGCCGTTTAGATTAGGTGGCATTGACCGTGTTATCGAAACCATTGATTATCTAAAAAATAGGGGTATTAATATTGTTGTAGGTGGTATGTACGAATATGGATTGAGTCGATATTTTACTGCGATGTTATCTCAATATGGTGATTATCCTGGAGATGTGACGCCAGCAGGCTATTATTTTGAAAATGATTTTGTGGAAAATGAAGGTATTTTAAAAGAGGGAATGATTGCATTCATCCCCCCAGTAGTTGATAGAAGTAAATTAGAATGTATTAATGGTGATGTTTAGACTTATTTTTAGCAAGCGGTACTGGGTCATAGCCACCTTTATGTAGTGGATGGCATTTGAGTATGCGTCGAATGCCTAAATATAATCCTTTGAAAGCACCATGATATTGAATCGCTTCACGCGTATATTCTGAACATGTAGGATAAAAGCGACAAGTAGGTGGTGTTAATGGAGATATATAGCGTTGATAAAAATGTATCAAGGCTAGAAATATTTTTTTCATAAAAAAGCCTCCAACCAGAATTTTGAATACAGTTATTTTAACATATTATAAAGGAATGTGATGTACTTGAAGTTTTTAGATAAAGACCAAAGAGAAGTGCAGTTAACATATAAAGCGAATACAGATAATCCAACAGGTAATCACGTTCTTGCAATACCAGTATACCAAGGGAAGTTATTATTTACTCGACATAAAAATAGAGGTATTGAATTTCCTGGCGGCAAAAGAGAACATGGAGAATCAAGTATTGATGCTATCCAACGAGAATTATATGAAGAAACCGGCGCATATGTAGAAGAAATGCAGTATATTGCTCAATATACTGTGAAAACTAACGATGCCACTAGGCTCGTCAAAGATGTTTATTTTATTCAAGTTTCATCTTTAGCCAATCGAACTGACTATTTAGAAACAGATGGCCCTTGTCTTTTTACTTCTATTAAAGACATACCATATAGTGAACGTAGTTTTTTGCTACAAGATGACGCCATTTTACACTGTTTTGAAAGGGTGACTTCACTTGGACTTTATTAAAATGAAAAGAATGCCGATTGAAATAGCTACGCACCAGTTTGATGAAATCACTTATGATGTTGATCATCTAAAAGTGAAAGCACTAATGATGACACCATATAGTAAAGTTAATCGAATCGTGGTTTATTTAAGAGGCGGAAAAGGACAAGTTGGTCGGGTACGAGCAGCTCGTTTAATGCAATTTTCCAATGAGCACACACTTGTTGTAGGCCCTTATTATAGAGGTAATAATGGTAGTGAAGGTAAAGATGAGTTTTATCGAGGAGATTTAAATGATGTCACTGAACTTATACGCATATTACATTCAAAATATCCCAACGCGTTTATACATATGATTGGATTTTCTCGTGGTGGGTTGCAAGGCTTGCTAACATTTCAAGATTTACCAGTTGATAGTTATATCATTTGGGGTGGTGTTTCTGATATACATTTAATGTATGAAGAGCGTGTGGATTTAAGAGGGATGCTGAGAAGAATGGTAGGACATCCTAAAAAAGATCATGAAGCATATGAAGTTAGAGAAGCGATACAATATATTACACCGCAAAGTCCACCGATTTTAATTGTACATGGTGGTAAAGATAAACAGGTAGGTATTCATCAAGCTTATTATCTAGAACGACAATTGAAAGATATTGGTGCACCTTATGATACATGTTATCAAATGGAAGAAGGACATGTACCTCGACCATTTGCTTTGCAAGAAACTTTAACGTATATACATAAATGGATGACTCAAATAGAAACAAACAAAAAATAGCGCAGCAGATTTAAGTCTGCCGCGCTTTACTTTTATTTATTGAAAGCACCTTTGTCAGAAATATGTTCCACTTCAGGGCCGAATTTTTTGAAGTTATCTTCGAATCGTTGGATAAGATCATTTGCTTGTGCTTTATATTTTTCAGCGTCGCTCCAAGCATTAATAGGATTTAAAATAGTTTTTGGTACATCTTCGATTTCAACTGGAATATTTAAACCAAATGTTGAGTCTTTTGTAAACTCTGCATCTTTTAATTTACCTGAGATTGCTTGGTTAACCATTTGACGCGTATAGTGTAAACTAATTCTTCTACCAACACCATATTTTCCGCCAGTCCATCCAGTGTTAACTAAATACACATCAACATCATGTTTATCAATTAATTCACCTAATAGGTCTGCATAAACAGTTGGATGTAGTGGTAAGAATGGTGCGCCGAAACAAGTAGAGAATGATGGTTCTGGTTCAGTTACACCACGTTCAGTACCTGCTAATTTAGACGTGAATCCACTTAAGAAATGATACATTGCTTGATCTTTAGTTAATTTTGAAATTGGAGGAATCACACCAAATGCATCTGCAGTTAAAAAGATAATCGTATTAGGATGTGCTGCTTTTGAAGGTAATACAATATTATCAATATGATGAATAGGGTATGCCGCTCTTGTATTTTCAGTGAATTTATTATCATCGAAATCAACAGTACCATCTTCTTTAACGACTGTGTTTTCTAGGATAGTGCCGTATTCAATAGCATCATAAATTTGTGGTTCTTTTTCTTTTGAAAGATTGATCGCTTTTGCGTAGCAACCACCTTCAATGTTGAACACACCATTTTTATTCCAACCATGTTCATCGTCACCGATTAATTTTCTTTCAGGATCAGCTGATAACGTTGTTTTACCTGTACCTGATAACCCAAAGAATAATGCGACATCGCCTTTTTCTCCTACGTTAGCAGAGCAATGCATACTCATAATATCTTGCATAGGTAATAAGTAGTTCATTACTGAGAAGATACCTTTTTTCATTTCACCAGCGTATTCTGTGCCACCGATTAAAATAACCT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28 | Staphylococcus_phage(95.45%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
1177582 : 1186609
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP022881|1177582:1186609|DBSCAN-SWA TATGGATGAAAGAATGGTCGACCAAGCTGCACATAATGAAGAATCTGACTTCGAATTATCTTTACGACCAACTAAATTAAAGCAGTACATTGGTCAATCTTCCATTAAAAATAATTTAGAAGTATTCATTAAAGCAGCTAAATTGAGAGAAGAGCCTTTAGATCACGTTCTCTTATATGGTCCCCCTGGGTTAGGTAAAACAACTTTATCTAATATAATAGCCAATGAAATGGACGTTAACATTAGAACAGTATCTGGCCCTTCATTAGAGCGTCCTGGAGATTTAGCAGCAATTTTATCTGGATTACAACCAGGAGATGTGTTGTTCATTGATGAAATACATCGTTTAAGTAGTGTTGTTGAAGAAGTATTATATCCCGCGATGGAAGACTTTTTCCTAGACATCATTATAGGTAAAGGTGATGAAGCACGTAGTATTCGTATTGATTTACCACCTTTTACACTGGTTGGTGCTACAACACGTGCTGGAAGTTTAACTGGACCTTTAAGGGATCGATTTGGCGTCCACTTACGACTTGAATATTATAATGAAGCAGATTTAAAAGAAATTATAATAAGAACTGCTGAAGTACTAGGAACAGATATAGATGAAGAGAGTGCGATAGAGTTAGCAAAACGATCTAGAGGTACACCACGTGTAGCAAACCGTTTATTAAAAAGAGTGAGAGATTTTCAACAAGTAAATGAAGATGATCAAATCTATATTGAAACTACAAAGCGTGCATTAAAACTATTACAAGTTGACGATTATGGATTAGATTATATTGATCACAAAATGATGAATTGTATATTAAATCAATATAAAGGTGGACCTGTCGGACTTGATACAATTGCAGTGTCTATTGGTGAAGAACGAATAACTATCGAAGATGTTTATGAACCTTTCTTGATTCAAAAAGGTTTCTTAGAACGTACACCTCGAGGTAGAAAAGCAACACCATTGGCGCATGAACATTTTGGCAATTCTAATGAAATGAGGGAGTAAGTTGAATATTGAAGATTTTGACTACGATTTACCTGAATCTCTAATCGCACAAACGCCTTTAAAAAATAGAGACCAAAGTAGATTGTTAGTATTAAATAGAAATAATGGAAATATGGAACATCTACATTTTAAAGATGTGATTAACTATTTTAATCCTGGTGATACGCTTGTTTTAAATGATACTAGAGTTATGCCCGCAAGACTTTTTGGATTAAAAGAAGAAACGGGTGCTAAAGTTGAGATGCTTATGTTGACTCAAATTGAAGGCAATGATTGGGAGGTATTGTTAAAGCCGGCCAAACGTATTAAAGTAGGGAATCAATTGAATTTCGGAGATGGAAAAATTATCGCTGAATGTATTGAAGAGTTAGCCCAAGGTGGTAGAATTATGCGCTTGCATTATGAAGGAATATTGCAAGAACGTCTTGATGAATTAGGTGAGATGCCTTTACCACCATATATTAAAGAAAGACTAGATGATCCTGATCGTTATCAAACAGTTTATGCAAAAGAAAGTGGATCTGCTGCAGCACCTACTGCAGGGTTACATTTTACAGATGAACTTTTAGAGTCAATTAAGGCAAAAGGTGTGAATATCGCCTTTATCACATTGCATGTTGGTCTTGGTACATTTAGACCAGTAAGTGTAGATAATATTGATGATCATGAGATGCATAGTGAGTATTATCAAATGACACAAGAAACTGCAGATTTATTAAATGAAACAAGAAAAAAAGGTCATCGAATTATTTCAGTAGGTACAACATCAACTAGAACACTTGAAACAATACGTAGAGATCATTCAGAATTTGTTGAAAAAAGCGGTTGGACAGATATCTTTATCTATCCAGGTTTTGAATATAAAGCTATTGATGGTTTGATTACTAATTTCCATCTTCCTAAATCAACGCTAGTAATGTTAGTGTCAGCGTTTAGTAGTAGAGAATATATTTTAAATGCATATCAAAAAGCTGTTGAAATGGAATATAGATTCTTTAGTTTTGGAGATGCAATGTTAATTATCTAAAAGAATGTGAGGATTTTAAATATGCCTGCAGTAACATATGAACATATTAAAACTTGTAAACAATCAGGTGCACGTTTAGGAATTGTACATACACCACATGGTTCGTTTGAAACACCAATGTTTATGCCAGTAGGAACTAAAGCAACAGTTAAAACAATGAGCCCAGAAGAATTGCGTCAGATTGAGGCTAAAATTATTTTGGGAAATACATATCATTTGTGGTTACAACCTGGAAATGATATTATCAAACACGCTGGGGGACTGCATAAATTCATGAATTGGAACGGACCTATTCTTACTGATTCAGGTGGGTTCCAAGTTTTTAGTTTAAGTAATCTACGTAAAATCTCAGAAGAAGGTGTCGAATTTAGACATCATACAAATGGTTCAAAATTATTTTTAAGTCCAGAGAAATCAATGGAAATTCAAAATGATTTAGGATCTGACATTATGATGGCATTTGATGAATGTCCGCCTATGCCATCTGAGTATAAATATGTCAAAGATTCAATTGAGAGAACAACACGTTGGGCAGAAAGATGTTTAAAAGCCCATGCTCGCCCTGAAGATCAAGCGTTGTTTGGTATTATTCAAGGTGGCGAATATAAAGATTTACGTGAACAAAGTGCGAAAGAGCTTGTTGAGCTAGATTTTCCTGGCTATGCTATTGGGGGGCTTTCAGTAGGAGAGCCTAAACCTGTGATGTACGAAATGGTAGAACACACTGAACAATTTATGCCAAAAGATAAACCTAGATACTTGATGGGTGTCGGCTCTCCCGATGCATTAATCGAATGTAGCATCCGAGGTATGGATATGTTTGATTGTGTATTACCTACTCGTATAGCTAGAAATGGTACATGTATGACATCCAATGGACGTTTAGTAATCAAAAATGCAAAGTTTGCTGATGATTTAAGACCATTAGATGAAAATTGTGATTGCTATACATGTAAAAATTATTCTAGAGCATACATTAGACACTTAATCAAAGCAGAAGAAACCTTTGGTATCCGTCTTACTACTATTCATAATTTACATTTTCTGCTAAAATTAATGGAAGATATTAGACAAGCCATTCGAGAAGATAGACTTTTAGACTTTAAAGCTGAATTCTTCGAACAGTATGGATTAAATGTAGATAACCCTAAAAACTTTTAAAGAGGAGAATGTAACATGCAATTTACATCATTGATATTACCGATCTTATTGTTGGTTCTAATGTATTTCTTCTTAATTAGACCTCAACAAAAACGTGCTAAAGAGCATCGTGAAATGATAAGTCGTGTAGAAGCTGGACAAAAAATTACTACAATCGGTGGTATTAAAGGTACAGTTAAAGCGGTTGATGAAACAACAGTAGTTGTTACTGTTAATGGTCATGGCACAGAAATGACTTTTGAAAAACCAGCTATTAAACAAGTTGATCCTTCATAATAGTATGTTATTGAAGCCTGGGGCAATATTGTCTCAGGCTTCAATTATATTTACTTGGATTTTTACTTATATGTCTAAACAACTAAAAATTTAAAAATGATGTGATTTAAGCATTAAAGAATTGTTTCCAATAATTAAATGCGGCTAGAGATGAGTTAGTATCTGTATTTAGTTATTATCCATATGCATTAAATTAATTGAAAAAAGTTTTCAATAATTTCACTATAAAGTGTAGTATGTTAATATAGATAGGTCATAGGAGTTATTCTATTGACTCCGACTTGCAAATATAAGGATTAATCGAGTATTCTAGTATCATAAGTAAATAATGAGGTGTTCATGTGAAGAAAAGTAGTAGATTGATTGCATTCTTACTACTGGTGATCCTTCTGTTCGCAGGTATGGGTCTTACGTATAAGAATGTGATTAAGAATGTTAACTTAGGCCTTGATTTACAGGGTGGATTCGAAGTGCTTTATCAAGTTGACCCATTACATAAAGGTGATAAAATTGATAAAAATGCGTTGCAATCTACAGCGCAAACACTAGAAAATCGTGTTAACGTATTAGGGGTTTCTGAGCCTAAAATCCAAGTTGAAGATCCAAATAGAATTAGAGTTCAACTTGCTGGTGTAAAAGATCAGAAAGAAGCAAGAAAGATTTTATCATCACAAGCTAATTTAACGATTCGTGATGCTGACGACAAAGTTAAGTTAAGCGGTGCAGATATTAAGCAAGGATCAGCGAAGCAAGAATTTAAACAGAATACGAATGATCCTACAGTTACATTTAAAGTAAAAGATAAGAATAAATTTAAAAAAGTAACTGAAGAAATATCTAAAAAGCAAAATAACGTTATGGTTGTTTGGTTAGACTTCAAAAAAGGCGATAGCTACAAGAAAGAAGCCGATAAAAAAGATCCTAAGTTCGTATCAGCGGCAAATGTTGATCAACCAATCAATTCAGATAGTGTAGAAATTTCTGGTGGATTCCATGGTCAAGAAGGCGTTAAAAAAGCAAAACAAATTGCTGAATTATTAAATACAGGATCTTTACCGGTAGATCTTAAAGAAATTTATTCAAACTCTGTTGGTGCAGAATTTGGTCAAGATGCGTTAGATAAAACAATCTTTGCATCAGTACTTGGTGTAGCAGTCATTTATCTATTTATGTTAGGATTCTACAGATTACCAGCACTAGTAGCCATCATCGCATTAACAACATATATATATTTAACACTTGTAGCCTTTAACTTTATCTCAGGTGTACTTACATTACCTGGTTTAGCAGCCTTAGTATTAGGTGTGGGTATGGCAGTAGATGCCAATATCATTATGTATGAACGGATTAAAGACGAGTTGAGAATCGGTAGGACGCTTAAACAAGCATACTCAAAAGCCAATAAAAGTTCCTTCTTAACAATCTTTGACTCCAACTTAACAACCGTAATTGCTGCAGCAGTACTGTTCTTCTTTGGTGAAAGTTCAGTAAAAGGTTTCGCAACAATGTTGTTATTAGGTATTTTAATGATATTTGTAACTGCAGTGTTCTTATCTAGATTACTATTATCATTACTAGTTTATTCTAATCTATTTAAGAAAAAATATTGGTTATTTGGTGTTAAAAAAGCAGATAGACATGATATCAGTGAAGGTAAAGATGTCCATGACTTAAAAACATCATTTGAAAAATGGAATTTTGTTAAACTAGCTAAACCATTGATTTCATTAAGTATTTTAATTGTAGTTGTAGGATTAGTTATTCTTTATATTTTCAAATTGAATTTAGGTATAGACTTCTCTGCTGGTACGCGTGTAGACCTACAATCTAAAGAAGCACTTACTCAATCCAAAGTTGAAAAAGTAGTGAAAGATGTTGGTTTAGACCCAGATCAAATTCAAATTAATGGTTCAGGTAATAAAAACGCAACTGTCCAATTTAAACAAGATTTATCACAAGCTAAAGATAACCAATTAAGTGATAAAATGAAATCTGAATTTGGTAACGCACCGCAAATTAATACAGTTTCACCATTAATTGGACAAGAATTAGCTAAAAACGCAATGCTTGCATTAGTTTATGCAGCTGTAGGTATTATTATCTATGTATCATTACGATTCGAATGGAGAATGGGATTATCTTCTGTCTTAGCATTATTACACGACGTATTTATTATCGTCGCTGTGTTCAGTTTACTTCGATTAGAAGTTGATTTAACGTTTATCGCTGCTATCTTAACTATTGTTGGTTATTCTATTAACGATACCATCGTTACATTTGACCGTGTTCGTGAAAACCTTCATAAGATTAAAGTGATTACTTCAGCTGAACAAATTGATGACATTGTTAACAGATCAATTAGACAAACGATGACACGTTCTATTAATACAGTTTTAACAGTTGTTGTCGTAGTTGTTGCAATTCTATTATTTGGTGCACCAACAATTTTCAACTTCTCATTAGCTTTATTAATCGGTTTAATTTCAGGCGTGTTCTCTTCCATCTTCATAGCCGTCCCATTATGGGGAATTATGAAGAAACGTCAATTGAAAAAATCACCTAATCAAAAATTAGTCGTTTATAAAGAGAAAAAATCAAACGATGAAAAAATCGTAGTTTAATCAATTTAAGGTTGAGCATTGATGTTGTATAATCTTTAAAAGATTTTGCAACAAAGTGCTCAACCTTTTTATTTTATTCGATTTTCGATATAATGGCATGTGGAAATGAGGAAGGTTACTTATGATTAAATCTAAATATAATTGGAATTTAAATAACCCAACTGAATATATATCAGATAGTATAGCTAAACGTTTAAAACTATCTCCTATAATCAAGAAAATATTAGAAAGTAAACAAATTATTGAAGAAGAAGACATTCAACAAACTCTAAATGGCATTGATATCAACCATGATATTTCTTTACTTAGTGATATTGATAAAGCGATAGAACGTATCAATCAAGCTATAGATAAAAATGAGCGTATTTTAGTATATGGCGATTACGATGCTGATGGCGTAACTTCTACGACGATATTAGTACATACTTTACAAAAATTAGGAGCCCAAGTTGGATGGTATATACCGAACCGATTTACAGAAGGTTATGGTCCAAATGAAATGGCATTTCAAAATGCTTATGATGAAGGTATTTCATTAATCATCACTGTAGATAATGGTATACAAGGGCATGCTGAAATTAAAATGGCTCAAGAATTAGGTGTAGATGTCATTGTCACAGATCACCACGAAATAGGCAGAACTTTACCTGAAGCATATGCAATCGTACACCCAATGCATCCAGAATTTGATTACCCATTTAAATACTTATGTGGTGCAGGTGTAGCATATAAATTAGCTCAAGCGTTATTAGAAAATGTGCCAAATTATTTTAAAGCATACGCAGCTATAGGCACAATAGCAGATTTAGTTTCATTAACTGATGAAAATCGTTCAATTGTACAACATGGTTTGAAAGTCATGAATGACAGTTGTCCAGTAGCCGTTAAAGCTTTACTTAAACAAGCTGGTTATAACGATGACATTACTGAAGAAACAATAGGATTTATCATAGGTCCTAGATTAAATGCAGTTGGACGTTTAGAAGATGCTTCTTTAGCTGCTGAATTATTAATGTCTGATAGTGAAGATGAAGCTGAATTTTTAGCGGAACAGGTTGAGCATTTCAACCAAGAGCGTAAAGATATAGTTGCTCATATTACAGAAGAAGCATTAGCAATAGCTAAGGATTATGTCTCACAAGGACATCAATTTCTATTATTAGCCAAAGAAGATTGGCATGAAGGTGTTTTAGGTATTGTAGCATCGAAAATAGTGGAGACGTTTAGCTTACCAACATTAATTTTAAATATTGATCATGAACAAAATCATGCTAAAGGTTCAGCAAGATCGATTGAACAAGTATCCATGTTTGAAATTTTAAATGCCCATCAAGATTTAATTAGTAAATTCGGTGGACACCATATGGCAGCAGGGATGACTATGGATATTGATAATGTTGAAGCATTACGAAATGGATTAAATGAATGGATGGCAAAACTAAGTGAAACGACATCTCTTGAACCGAGTAAAAAGGTAGATATTTTACTTGATGAATCAGATATTACAATTAAAAACATTAAAGATATTCAGAAATTAAGCCCCTTTGGCACAGATTTTAATTCACCATTATTTGAAATTCAAAATATGACTATACAATCTTTAAAGGCTATTGGTAAAGAACAAAATCACTTGAAGATGACATTAGGTGATTCTAATTTACCGGCTTTATTTTGGCAAAATGGTGCATATGCTACACAATTAGAAACTGGTCAACCAGTCAACTTAATTGGTAACTTACAAATAAATGAATGGAACGGGAATCAAACACCACAGTTCATTGTTCAAGATATAGCCATGGACACAATGCAAATATTAGATTATCGAAGCAAAAGTAAAAATACTAATTTCTTAAACAATGATCAAACAACAGCGTTTGTAATTCATTCTAAAGTTCAAAAATCTAATGACAATGAGTTCTTCTATGGAGAAGTTATACCAGGGGAATATGATAAAATAGTATTTAGAGATTTACCGAATACGCTTGATGAATTAAAAAACACATTACAACAAACACAAATATCTCAAATTTATCTTGTATTTCAACATAAAACGTCTATTTATTTCGAAGGCATGCCAAGTATCAATTTATTCAAACAATGTTATAAAGCGTTAATTAATAAAAGAAAAATGAATCTAGCGACTGAAGGTATGATGTTGTGTGAATTTCTCAATATTAAAGCTAATTCATTAAAATTTATGCTAAAAGTATTTTTAGAATTAGGATTTATTAACGAAGATGATGGTATAATAACGATTGCGAGTCAACCAAATAAACAAGATATTGAATCTAGCCAATTTTATCAAGCTAGGTTATCAAGAATAGAAGTCGAAAAACTTTTATTATATGATGATTTCAAACATTTAAAACAATGGATTAAAACTCAATTGGGATATAGTAATTAGGAGGAAATAATAAGATGGATTTAAAACAATATGTTTCTGAGGTACAAGATTGGCCAAAACCAGGGGTCAGCTTTAAAGATATCACTACAATTATGGACAATGGTAAAGCATATGGATATGCTACAGACCAAATTGTTGAATATGCAAGAGAAAAAGATGTCGACGTTGTTGTTGGGCCAGAAGCACGAGGATTTATTATTGGTTGTCCAGTAGCATATTCAATGGGCATAGGGTTCGCACCTGTACGTAAAGAAGGTAAATTACCTCGTGAAGTTATTAGATACGAATATAATTTAGAATACGGCACTAATGTTTTAACAATGCATAAAGATGCTATTAAACCAGGTCAACGTGTATTAATCACAGACGATTTATTAGCAACTGGTGGGACAATCGAAGCGGCTATTAAACTTGTTGAAAAGTTAGGCGGTATCGTTGTTGGCATAGCTTTTATTATTGAATTAAAATATTTAAATGGAATTGAAAAGATAAAAGACTATGATGTTATGAGTTTAATTTCTTATGATGAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP022881|1177582:1186609|1179635_1180775_+|AXV42206.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWNGPILTDSGGFQVFSLSNLRKISEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMEIQNDLGSDIMMAFDECPPMPSEYKYVKDSIERTTRWAERCLKAHARPEDQALFGIIQGGEYKDLREQSAKELVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYEMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSNGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCKNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKAEFFEQYGLNVDNPKNF >CP022881|1177582:1186609|1186090_1186609_+|AXV42210.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGKAYGYATDQIVEYAREKDVDVVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYNLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >CP022881|1177582:1186609|1177582_1178587_+|AXV42204.1|DBSCAN-SWA MDERMVDQAAHNEESDFELSLRPTKLKQYIGQSSIKNNLEVFIKAAKLREEPLDHVLLYGPPGLGKTTLSNIIANEMDVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNEADLKEIIIRTAEVLGTDIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDDQIYIETTKRALKLLQVDDYGLDYIDHKMMNCILNQYKGGPVGLDTIAVSIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAHEHFGNSNEMRE >CP022881|1177582:1186609|1178588_1179614_+|AXV42205.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEDFDYDLPESLIAQTPLKNRDQSRLLVLNRNNGNMEHLHFKDVINYFNPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNQLNFGDGKIIAECIEELAQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLESIKAKGVNIAFITLHVGLGTFRPVSVDNIDDHEMHSEYYQMTQETADLLNETRKKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHSEFVEKSGWTDIFIYPGFEYKAIDGLITNFHLPKSTLVMLVSAFSSREYILNAYQKAVEMEYRFFSFGDAMLII >CP022881|1177582:1186609|1183793_1186076_+|AXV42209.1|DBSCAN-SWA MIKSKYNWNLNNPTEYISDSIAKRLKLSPIIKKILESKQIIEEEDIQQTLNGIDINHDISLLSDIDKAIERINQAIDKNERILVYGDYDADGVTSTTILVHTLQKLGAQVGWYIPNRFTEGYGPNEMAFQNAYDEGISLIITVDNGIQGHAEIKMAQELGVDVIVTDHHEIGRTLPEAYAIVHPMHPEFDYPFKYLCGAGVAYKLAQALLENVPNYFKAYAAIGTIADLVSLTDENRSIVQHGLKVMNDSCPVAVKALLKQAGYNDDITEETIGFIIGPRLNAVGRLEDASLAAELLMSDSEDEAEFLAEQVEHFNQERKDIVAHITEEALAIAKDYVSQGHQFLLLAKEDWHEGVLGIVASKIVETFSLPTLILNIDHEQNHAKGSARSIEQVSMFEILNAHQDLISKFGGHHMAAGMTMDIDNVEALRNGLNEWMAKLSETTSLEPSKKVDILLDESDITIKNIKDIQKLSPFGTDFNSPLFEIQNMTIQSLKAIGKEQNHLKMTLGDSNLPALFWQNGAYATQLETGQPVNLIGNLQINEWNGNQTPQFIVQDIAMDTMQILDYRSKSKNTNFLNNDQTTAFVIHSKVQKSNDNEFFYGEVIPGEYDKIVFRDLPNTLDELKNTLQQTQISQIYLVFQHKTSIYFEGMPSINLFKQCYKALINKRKMNLATEGMMLCEFLNIKANSLKFMLKVFLELGFINEDDGIITIASQPNKQDIESSQFYQARLSRIEVEKLLLYDDFKHLKQWIKTQLGYSN >CP022881|1177582:1186609|1180790_1181051_+|AXV42207.1|DBSCAN-SWA MQFTSLILPILLLVLMYFFLIRPQQKRAKEHREMISRVEAGQKITTIGGIKGTVKAVDETTVVVTVNGHGTEMTFEKPAIKQVDPS >CP022881|1177582:1186609|1181392_1183672_+|AXV42208.1|DBSCAN-SWA MKKSSRLIAFLLLVILLFAGMGLTYKNVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLHKGDKIDKNALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEDPNRIRVQLAGVKDQKEARKILSSQANLTIRDADDKVKLSGADIKQGSAKQEFKQNTNDPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKQNNVMVVWLDFKKGDSYKKEADKKDPKFVSAANVDQPINSDSVEISGGFHGQEGVKKAKQIAELLNTGSLPVDLKEIYSNSVGAEFGQDALDKTIFASVLGVAVIYLFMLGFYRLPALVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTLKQAYSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRLLLSLLVYSNLFKKKYWLFGVKKADRHDISEGKDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLISLSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSAGTRVDLQSKEALTQSKVEKVVKDVGLDPDQIQINGSGNKNATVQFKQDLSQAKDNQLSDKMKSEFGNAPQINTVSPLIGQELAKNAMLALVYAAVGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAVFSLLRLEVDLTFIAAILTIVGYSINDTIVTFDRVRENLHKIKVITSAEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVVVVVVAILLFGAPTIFNFSLALLIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPNQKLVVYKEKKSNDEKIVV |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1745233 : 1753703
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP022881|1745233:1753703|DBSCAN-SWA TCTATCGAATGATTTTCGCAATAACGCTTGGATATAATTGGTACTCTAATTGTTTGACTCTCTCTTCTAACATTTCAATAGTATCGTCCGTTTTGATATCACATTTTCTTTGTTCAATAATTTCTCCCGTATCCATACCACTATCAACATAATGTACCGTTGATCCTGTTATTGAATCCCCGCTACGAAATGCTTGTCCAATTGCGTCTATCCCCTTATATTTCGGCAATAATGATGGATGAATGTTTAATATTTTATGAGGATAAGCTGTTAAAATATCCTCCCCAATTAATCTCATATAACCGGCCAATACAATCCACTGAACCCCTTCTGCAGAAAGTAAAGATAATAAATGTTGTTCATAATGAGATTTTGAATCAAAATGTTTTGGTTCATTGATATGTACTGGTATACCAAGTTGTTCTGCTCTATTAACACAATAAGCATCATGATGATCTGTATAAAGTGCAGTAATATCAATGTCCTCTAAATGTCCTTGTTGAACATGTCGTGCGATGTTTTCAAAGTTACTTCCAGAACCTGATGCAAAGATTGCTACTTTGACCACGTTTATACCCCCTGAATACGAATCGGTTTATGGCTATCTTCTACAATTCGACCGATTTCATAGGCATTCACATTCTGTTGTTTTAATATTTCTAATGTCTGAGTTTTATCATGTTCATCGACAATAACAGTAAAACCAATGCCCATGTTAAATATGTTATACATTTCATCTGTACTAATATTACCCTGTTCCTGCAACCAATCGAATATTGCTGGTGTCGGAAACGCATTTGCATCTATGTCTGCAGATAATCCGTCTGGTAAAGAACGAGGAATATTTTCATAAAATCCACCACCAGTAATATGGTTCATAGCTTTTATTGACACATGTTTTTTTAATTCTAATATTGGTTTTACATATAATTGGGTTGGTGCTAAAAATGTCTCTAAATAAGTATGTTGCTCAAATGTATCGTTAAGGTTTATACCTGACTTTTTAATGAGTTGTCTAACTAGACTGTATCCATTGGAATGAATGCCGTTAGATGCTAAACCTATAATGATTTGACCAGGTTTCACGTCTGAACCATCAATATATTCATCTTTCTCAACAGCGCCAACTGCAAAGCCGGCCAAATCATATTCACCTTCATGATACATTTCACCCATTTCGGCAGTTTCGCCACCGATTAAAGCTGTATTAGTTTCTTCACAAGCATCACTGATACCTTTAACGATTTGTTCAATGATTTCAGGAATTACTTTATGCGTTGCAATATAATCTAAAAAGTAAAGTGGCTCTGCACCTGTAGTTAAAATATCATTCACACACATGGCCACCGCATCTATACCTATTGAATCATGCTTAGCGTGGTCAATTGCTAATTTCAATTTGGTACCTACACCATCAGTACCTGAAACTAATACTGGGGCTTTCATATTGAGTTGAGATAAATCAAATGTGGCACCAAAGCCACCTAAACCACCGATAACTTCCTTACGCATCGTACGTTTAACATGACTAGACATTCTTTCTACCGCTTCATAACCTGCATGGATATCTACACCTGATTGTTCGTATGCTTTAGACATTTATATTTCCCTCACTATCAAAATAATGTTTATTTTCATTAATATATGCTTTTTGACGATCACTTAAATGCTTTTTATAATTCTCTTCGTAATCAAACAATCCAGCTGGATAATCTCCAGTGAAGCTCTCAACACACAAACCACTATATGGTGCATCATAATCTAAACCAATCGATTCAATTAATCCATCTACGCTAAGATACGCAAGCGAATCAGCACCTATATATTCACAAATTTCTTCAGGTGATTTACTCGCTGATATTAATTCAGCAGTTGTTGATACATCAATACCATAGAAACTTGGGAACATAAATTCTGGTGATGCAATTCTAACGTGGACTTCATTGGCCCCTGAATCTTTCAACATTTTCACAATTCGTTTAGATGTTGTTCCTCTAACTATAGAATCATCGACTAGGATAATATTCTGACCTTCAACAATATCTTTGACCGCTGACAATTTAACACGTACACCCTGTTCACGAAGTTGTTGTGTCGGTTGAATAAATGTTCTCGCTACGTATTGATTTTTAACAAGACCCATTTCATAAGGTAATCCTATCTCTTCGGCATAACCGCTTGCTGCTGATAACGACGAATTAGGCACACCAATAACCATGTCAGCTTCTACTGGACTTTCTTGTGCTAAACGTTTACCAGAGGCTTTACGAACTGCATGAACATTTTTTCCGGCAATCGTAGAATCTGGTCTGGCAAAATAGATATATTCCATTGCTGAAATTGCAGTATTCGTATGTCTTGTATATGATTTAACTTGGACACCATCATCGTTAATAATGACATATTCACCAGCATGAATATCTTGTACAAACTCTGCTCCCAAAACATCAATAGCGCACGTTTCACTGGCTAGAATATAAGTGTTATCTTGCATTTTACCGACTACTAAAGGTCTAATAGCATTAGGATCAACTGCACCATATAATGCATCTTTAGTTAACACTGCGAATGTGAATCCACCTTTAATTTGACGTAAACTTTCTTTTAAAGCTTCTTCAAATGTAGGTGCTTTACTTCTACGAATTAAATGCATAATCACTTCAGTATCAGATGACGAATGGAAAATCGCACCATGTTTTTCAAGATTTTGTCTTAAAGATTGCGCATTAATCAGATTTCCATTATGGCAAATCGCAACACTCATATCATAAAAGTGATATAAGAAAGGTTGAATATTTTCTATACCTTTGTTACCAGAAGTAGCGTATCTCACATGTCCAATTGCATTATGATAATCCTTTAATCTCGATAATTGATCATCTTTAATAGCCTCAGTAAGTAAACCAAGTCCTCTTTCACCTACTAATTTTTCATGATTGGCAGCTACTATTCCTGCACCTTCTTGACCTCTATGTTGTAAACTATGCAATCCCATATACGTTAATTGAGCAGCATCTGGATGATTCCAAATGCCAAAAACACCACATTTCTCATTTAGTCCTGAGTAGTTAAACATTGGCTAATAGCTCCTTCCCAAACATCTTTGATATCTGCTACATTTTTGATAATCGTTGTTTGGTTATTTGACACTTTGAACTGACTACCACTATTAAATTGACCAATTTCAATAGCATTTTCAATGTTTAGTGATTCATTTTCTTTAACAGAAATGATATATCTACCTTGAGATTCGCTAAATAACTGAGCATTAGAAACATCTATATTAGCCTCTAATCCTAAATTATAATGAGCACTCATTTTTGCTAGTGTAATTAATAAACCACCTTTTCCGACTGTTTGAACATGTGATGCAGCACCGCTTCTAATAGCTGATTTCACCGCTTCGCCTTTTGCAACTTCATCACTTAAATCAATTGATTCAAATTCATGATTCACTGTGCCATATAATAATTTTTCTAATTGGCTACCGCCGAAGTCATCTCTTGTATCACCAACGAGATATAATGTTTCTCCAGACTGTGGTTTAAAATTAGCTAAATAATTAACATCATCAATTAACCCAACCATACCAACTACCGGCGTCGGGAAGATAGATGTACCTCTTGTTTCGTTGTATAACGATACATTACCTGATACAACAGGCGTTTTTAATACATCACAAGCTTCTGCCATTCCTTTTGTAGAATCAATTAATTGTTGGTAAATTTCTTTTTTCTCTGGAGATCCATAATTCAAACAATCTGTCATTGCTAGTGGCGTCGCACCCACAGCAATCAAATTGCGATACGCTTCTGCTACTACCATTTTTCCGCCTTCATAAGGTTGATTAAATACATATCGTGCTTCACCATCAATCGTTGAAGCAATCGCTTTATTCGTGCCTTCAACTCTTACCACTGATGCCTGTAATCCTGGTTTAATAATCGTATTTGCACCAACTTGTTGATCATATTGCTCATATAAATAATGTTTTGATGCAATCGTTGGGTGTTGTAATAACTGGTCAAATACATTCTCAGTATCTATATGACTATAGTCATTTTTAGATGTATTGTACGCTTTCTCTTCACCTTCAAGAACATATACTGGTGCTTCGTCTGATAAGGGTTGTACTGGAATATCTGCAAACACTTCATCTTCGTATGTTAATACAAAGCGATTTGTATCAGTCACTTCTCCAATGACTGCACTATCTAATTCATGTTTTTCAAATAAATCTAAAAACTTTTGTTCTGTTCCCTTTTCGACAACAAGTAACATTCTTTCTTGAGTTTCAGATAGCATCATTTCATATGGTGAGATACCTGGTTCTCTTGTTGGAACTTGGTCTAATCTTAAGTGGAGACCACTGCCACCTTTAGCCGCCATTTCTGAAGAAGAAGAAGTTAATCCTGCCGCTCCCATATCTTGAATTCCGACTAATTCATCAAATGTTATAGCTTCTAATGTTGCTTCCATTAATTTCTTACCAACAAACGGGTCACCAATTTGGACAGATGGTCGTTTGCTTTCACTTTCTTCAGTTAATTCTTCAGATGCAAACGTTGCTCCGTGAATACCATCTCTACCTGTTTTTAAACCTACATAAATAACAGAATTACCTACACCTTTAGCTGTCCCTTTTTGTACCATGTCATGATCAATAATGCCGACACACATAGCATTAACAAGAGGATTACCATCATAGCGGTCATCAAACTCGATTTCACCAGCAGTTGTTGGAATACCAATACAGTTACCATAGCCACCGATACCACTAACTACGCCTTTAAGCAGTCTCTGATTTTGCTTGTTTGATAACTCACCAAAGCGTAAGCTATTTAATAAATTAATAGGACGTGCTCCAATAGAAACAATATCCCTAATGATTCCTCCTACACCTGTAGCAGCACCTTGATAAGGTTCAATAGCTGAAGGATGGTTATGTGATTCCACTTTAAAAACGACTGCTTGGTTGTCACCAATATCTACAACACCTGCACCTTCTCCAGGTCCCATTAATACATGTTCACCAGTAGTAGGAAACTGTTTTAAAAATGGCTTTGAATGTTTGTAAGAACAGTGTTCACTCCACATTACTGAAAAGATACCTGTTTCAGTAAAATTGGGTTCTCTGCCTAAGATCTCACATACTTTAGCGTATTCTTTATCGCTCAATCCCATATCTTGATATAGTTTTTCTAACTTAATTTCTTCAACACTTGGTTCGATAAATTTAGACATTTTGTTCCCTCCAACTATTCACCATAGCCTCAAATAATTTAATACCGCTATCAGTACCTAATAATGATTCCCTTGCTCTTTCAGGATGTGGCATCATACCGCAAACATTGCCTGCTTTATTAACAATACCTGCTATATCAGCGTATGACCCATTAGGATTGTCAGTGTATTTCAAAATAATTTGATTGTTAGTAATCAAATCGTTATAAATGTCTTCATTACAGTAGTAATGTCCTTCTCCGTGTGCTACTGGATAAACAACTAATTCATTTTCTTCATATAAATTAGTGAATGGCGTTTGATTATTTACAATACGTAAAGATTCATTACGACTGACAAATAAATGTGAATCATTATGAAGTAATGCACCTGGTAGTAAACCGATTTCTGTTAAAATTTGAAATCCATTACATACACCTAGCACTGGTTTACCTTCATTCGCTAATCTTTTCACTTCATTGATAACTGGTGCGACACTTGCCATAGCACCTGATCTTAAATAATCTCCAAATGAGAACCCTCCAGGAATAAGTACACCATCAAACCCTGCTAATGTTGTCGTTCTATAATCAACATATTCTGCTTCAACACCTGATTTGATTGCTGCATTATACATATCTCTATCACAATTTGAACCAGGAAATACAAGAACAGCAAATTTCATGTTATGCATTCTCCTTTTCATCAATCACTTTATAGCTATATTCTTCAATCACTGTGTTAGCAAATAGCTTTTCACTTAATGTTGTAATAATATTATCAACCGCTTCATCCGTAGCTTCATCAACAGTCATGTATAATACCTTTCCTACACGAATATCATTAACTTGTTTATATCCTAAATCATGAACTGCACGATTTAATGCTTGACCTTGTGTATCTAATACTTGGGGTTGTAAAGTGACATGTAATTCAATTGTTTTCATTATTTTAAATCCTCCAATTTATTTAAAAATGATTGATATGTTTCAATTAATGAGCCTGTATCATTTCGATAGACATCTTTATCGAAATTCGTATCTGAGTGTTTATCCCATATTCTGCATGTATCTGGTGAAATTTCATCAGCTAATAAAATATTTCCTTCATCTGTAATACCAAATTCAATTTTAAAATCTACAAGTCTTAATTCCATTTCGTCCATAAGTTGAATAAGAACTTTGTTAATATCGAGTGCCATTGATTTTAATGTTGAAATTTGATCATCATAAGCGATGTGTAATAACTTAATATGGTCTTCTGTAATCAATGGATCGTTTAACTCATCATTTTTATAGAAAAATTCAACCAATGGCGCATCAAATTGATATCCTTTTTCAAATCCAAGTCTTTGTGTAATAGAACCTGCTGCAATATTTCTAACTACCACTTCTAATGGAATAATTTTCACTGATTCTACTAATTGTTCAGTATCCGATAATTGTTTGATAAAATGGCTTTTCAAACCATTATTTTCTAGGTATTCAAAGATAATGGAAGTAATACGATTATTTAGTTTTCCTTTGCCAGACATGGCATCCTTTTTAGCACCATTGCCAGCAGTCACTTCATCTTTGTATTCAACACGTAACTCATTGGGTTTATCCGTTGTATATATTCTTTTAGCTTTACCTTCATAAAGTAATGACATTTATTGGTCTCTCCCTTCAAAACGCTTCAACATGTCCTTTTCAGTGTCATCGATTTGGTTCGTTAATATAGTCATGTGCCCCATCTTTCTATTTGGTTTACGCTCAGATTTACCGTAAATATGGACATGCCATTCAGGATGTTCTCCAAATTCATCTTCTAATAAATCTAAATCCTTACCTAATAAATTCATCATGACAGCAGGTTTTAGTATCTCTATCTTGTCAGGCAACGTTTGACCAGTGACAGCTAAAATATGAGTATCAAATTGTGAATAATCACATGACTCAATGGAATAATGTCCAGAATTATGAGGTCGTGGTGCAATTTCATTTACATACAATTGGTCTTTATCATCTATGAAAAATTCAACTGTAAAAGTTCCTACAAAATGGACAGATTTTATAATTTTTTCAACTTCTCGTTTTGCATTCTCTGTTTGATTACATCTTGCTGGGACTACTGTTTTAAATAAAATTTGATTTCTATGTTCGTTTTCTTGTAGTGGGAAGTATGTGATTTGTTGATGATTACCAATGGTCACAGTTAGTGACACTTCTTTATTTATATTTAAAAATTGTTCTGCGACACATTCTTGATTTGATACTAGTCTAACTGCTTCTTCGATATCTTCATCAGATTGAACTAATATTTGACCTTTGCCGTCATAACCACCGAAACGTGTTTTAACAATGAATGGATAACCAAGTGTGTTAATTGCCTTTGATAAATCATCTTTTTGTTTGATTGAGGTATAAGGAACAATTTGTGTCCCTGCTTGTTCTAATGTTTGTTTTTCAGTTAAACGATCTTGAAGTAATTGTATGGCTTGATAGCCTTGAGGAATATTATATTTTTCGGTTAACACCTTAAGTTGCTCTGCTGATATATTTTCAAATTCATAAGTGATGACATCCGAACTTTCACCTAATTGTTGAAGTGCACGTTCGTCATCATAATTCGCTTCTATAAATTCATGTGCCACATATCGACATGGACAATCAGAACTTGGATCTAAAACAATCACTTTATATCCCATTTTTTGTGCTGATTGTGCCATCATCTTACCTAATTGACCACCACCAATAATTCCTATGGTTGCGCCAAATGATAGTTTATTGAAGTTCATTTTGCATTTCCTCCACTTTTTGTACCAATGTTTTTTCATAATTTTCCAAATTTTTACGAACTGATGAATGACTAATACCTAATATTCTTGCAGCTAGTATACCGGCATTTTTGGCACCTGCTTTACCAATAGCTGTCGTCGCGACTGGAATTCCGCCTGGCATCTGAACAATTGACAACAGTGAATCCATCCCTTTTAAACTTTTAGATTCAATAGGTACACCAATAACAGGTAATGTAGTCATCGATGCCACCATCCCCGGTAAATGTGCTGCACCACCGGCTCCAGCTATGATTAAATCATAACCGTTGTTACATGCATGACTCGCAAAATCTACCATTAAATGAGGCGTACGATGCGCTGAAACGACTTTCTTTTCATACGGAATTTCAAATTGTTCAAGCATTGTGCAACTTTCACTCATAATTTCCCAATCGGAAGAACTACCCATAATGACTGCTACTTTCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP022881|1745233:1753703|1751141_1751402_-|AXV42722.1|DBSCAN-SWA MKTIELHVTLQPQVLDTQGQALNRAVHDLGYKQVNDIRVGKVLYMTVDEATDEAVDNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVIDEKENA >CP022881|1745233:1753703|1748286_1750476_-|AXV42720.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKLYQDMGLSDKEYAKVCEILGREPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTTGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELSNKQNQRLLKGVVSGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDDRYDGNPLVNAMCVGIIDHDMVQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLDQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFEKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYEDEVFADIPVQPLSDEAPVYVLEGEEKAYNTSKNDYSHIDTENVFDQLLQHPTIASKHYLYEQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVFNQPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDVLKTPVVSGNVSLYNETRGTSIFPTPVVGMVGLIDDVNYLANFKPQSGETLYLVGDTRDDFGGSQLEKLLYGTVNHEFESIDLSDEVAKGEAVKSAIRSGAASHVQTVGKGGLLITLAKMSAHYNLGLEANIDVSNAQLFSESQGRYIISVKENESLNIENAIEIGQFNSGSQFKVSNNQTTIIKNVADIKDVWEGAISQCLTTQD >CP022881|1745233:1753703|1753220_1753703_-|AXV42725.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWEIMSESCTMLEQFEIPYEKKVVSAHRTPHLMVDFASHACNNGYDLIIAGAGGAAHLPGMVASMTTLPVIGVPIESKSLKGMDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGKAGAKNAGILAARILGISHSSVRKNLENYEKTLVQKVEEMQNELQ >CP022881|1745233:1753703|1752106_1753234_-|AXV42724.1|DBSCAN-SWA MNFNKLSFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVIVLDPSSDCPCRYVAHEFIEANYDDERALQQLGESSDVITYEFENISAEQLKVLTEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKQTLEQAGTQIVPYTSIKQKDDLSKAINTLGYPFIVKTRFGGYDGKGQILVQSDEDIEEAVRLVSNQECVAEQFLNINKEVSLTVTIGNHQQITYFPLQENEHRNQILFKTVVPARCNQTENAKREVEKIIKSVHFVGTFTVEFFIDDKDQLYVNEIAPRPHNSGHYSIESCDYSQFDTHILAVTGQTLPDKIEILKPAVMMNLLGKDLDLLEDEFGEHPEWHVHIYGKSERKPNRKMGHMTILTNQIDDTEKDMLKRFEGRDQ >CP022881|1745233:1753703|1745802_1746831_-|AXV42718.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVDIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMKAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDHAKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATHKVIPEIIEQIVKGISDACEETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDLAGFAVGAVEKDEYIDGSDVKPGQIIIGLASNGIHSNGYSLVRQLIKKSGINLNDTFEQHTYLETFLAPTQLYVKPILELKKHVSIKAMNHITGGGFYENIPRSLPDGLSADIDANAFPTPAIFDWLQEQGNISTDEMYNIFNMGIGFTVIVDEHDKTQTLEILKQQNVNAYEIGRIVEDSHKPIRIQGV >CP022881|1745233:1753703|1750468_1751140_-|AXV42721.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMYNAAIKSGVEAEYVDYRTTTLAGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPVINEVKRLANEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFVSRNESLRIVNNQTPFTNLYEENELVVYPVAHGEGHYYCNEDIYNDLITNNQIILKYTDNPNGSYADIAGIVNKAGNVCGMMPHPERARESLLGTDSGIKLFEAMVNSWREQNV >CP022881|1745233:1753703|1746823_1748308_-|AXV42719.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEKCGVFGIWNHPDAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVAANHEKLVGERGLGLLTEAIKDDQLSRLKDYHNAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVAICHNGNLINAQSLRQNLEKHGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRQIKGGFTFAVLTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMQDNTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVIINDDGVQVKSYTRHTNTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKRLAQESPVEADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQQLREQGVRVKLSAVKDIVEGQNIILVDDSIVRGTTSKRIVKMLKDSGANEVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEICEYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLFDYEENYKKHLSDRQKAYINENKHYFDSEGNINV >CP022881|1745233:1753703|1751401_1752106_-|AXV42723.1|DBSCAN-SWA MSLLYEGKAKRIYTTDKPNELRVEYKDEVTAGNGAKKDAMSGKGKLNNRITSIIFEYLENNGLKSHFIKQLSDTEQLVESVKIIPLEVVVRNIAAGSITQRLGFEKGYQFDAPLVEFFYKNDELNDPLITEDHIKLLHIAYDDQISTLKSMALDINKVLIQLMDEMELRLVDFKIEFGITDEGNILLADEISPDTCRIWDKHSDTNFDKDVYRNDTGSLIETYQSFLNKLEDLK >CP022881|1745233:1753703|1745233_1745800_-|AXV42717.1|DBSCAN-SWA MVKVAIFASGSGSNFENIARHVQQGHLEDIDITALYTDHHDAYCVNRAEQLGIPVHINEPKHFDSKSHYEQHLLSLLSAEGVQWIVLAGYMRLIGEDILTAYPHKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAFRSGDSITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRKCDIKTDDTIEMLEERVKQLEYQLYPSVIAKIIR |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1923926 : 1967768
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP022881|1923926:1967768|DBSCAN-SWA 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MQIKLPKPFFFEEGKRAVLLLHGFTGNSSDVRQLGRFLQKKGYTSYAPQYEGHAAPPEEILKSSPYVWFKDVLDGYQYLVDQGYDEIAVAGLSLGGVFALKLSLNRDVKGIITMCAPMDDKSSSTIYDGFLEYARNFKKYEGKDQATIDQEMEHFHPTETLEELSATMKGVKDQVDEVMDPILVVQAEQDKMIDPQSANYIYETVESDDKDIKWYANSGHVITIDKEKVQVFEDIYAFLESLDWSE >CP022881|1923926:1967768|1937566_1938673_+|AXV42919.1|integrase|DBSCAN-SWA MSYSLNLSHNIYKDAKRGTYYFRITYYDKSNTRKYITRKGFKQRKDAVKKCNEMMDELEGVGHLNRLPFDKLVEEYIDWYSARRKTSSVKALKTHTNNHLLPYFKSMDVFKMTTQDVMKFQNKKLKEGHSGDYLKKMHVYLVSLLNHAMKFHELKQNVASLVGNFEIESQKRLNYWTLEQFNQFYDALATQQQKLFFKLLFYSGARKGEIRALTWRDINFDDDFIHINKTDYHGEVTAPKTKSAIRDIYLPTHMMYDIKDYLIWYKENNIYKDDYVLFGTFYKAYSESTIDRWFTNALKVLDEQLPNGQNFPRIVIHELRHSHASMLVNLGASVMIIAQRLGHSDTTEVYNRYGHLYPSTQKEIVKYL |
50 | Staphylococcus_phage(58.33%) | coat,protease,integrase,terminase | attL 1930593:1930611|attR 1946506:1946524 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1998308 : 2011782
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP022881|1998308:2011782|DBSCAN-SWA TTTATGAAAGAATTTGTTCATCGTAATACAGACATATGCGTTGTCCATTAACCCATTCTACTTTGACATCCATTTCATATAATTCTCTTAATACCTCAGTTTGTAAAACGTCTTCATTTTTTCCAGCACGTACTAATTCACCATGTTTTAATGCAATAATATGATCTGAATAACATGACGCAAAATTAATATCATGTAATACAATAACGATTGTTTTATCTAATTGCTGTGCTAATGTACGCAATGTCTGCATAATTTGAACGGAATGTTTCATGTCTAAATTATTTAATGGCTCATCTAACAAAATGTACTCAGTATTTTGTGCAATTGTCATAGCGATATATGCTCTCTGACGCTGACCACCGGACAAAGTTTTAATATTCCTATCTTTAATGTCGTTTAACTGTAATAAATCTAAGGCATATTTAACTTGCTCTTTATCTTCTTTTTTAAGATGACTCTTACAATAAGGAAATCTGCCAAAATTCACTAATTGCTCTACAGTAATATTCATATCTGTGTGATTAGTTTGTTTTAGTATTGAAATTTTCTGAGCAAGTTCATCCGTCCTATAAAGCGACATTTCTTTATCTTCAATTTTGACTGTGCCACTATCGATACTCATTAATTTTGTAATTGCAGATAGCAAAGTACTTTTTCCTGCACCATTAGGCCCTATCAAAGAGGTAATCTTCCCCTTTTCGATATTGACATTGATATCTTTTAATATGGACTTCTTTTGAATTGATTTATTTAAATTTTGAATTTGGATCAATTTGCATTTCTCCCTTTAACTAATAAGTAAATAAAGTAACTTCCACCTATGAGGTCAATGATGATACTTACTTCTGTAGTAGCTTCGAAAAGATGTTCAACAACCCATTGAGCAATAAATAAACATATCCAACTGAAACATATTGTAGCGGGTAAAATATATTTATGTTCATAAGTTTTCATAAATTCATGAGCTAAATTGACAGTAAGTAATCCTAAAAATGTAATCGGCCCAACTAATGCCGTTGAAATAGATACTAAAATAGCGACAAGAATAAGCATTAATCTTGTTACATTTTCATAATTAACACCTAAATTGATAGCTTGTGCTTTTCCTAGTAATAACACATCTAAATAGGGTATCAGCACTATAGTTATACCTATTAAAATGATTAATAAAATAGCTGAAAATCCGACAATTTTAGAATTAGAAGCATCAAAGTTAGCAAACATGGTATTTTGAACTGCTAAAAATGACTCTGGCTCCATAATTAATTGGATAAAACCAGTAATACTTCTAAAAAATGTGCCTAATATTACACCAATCAATAAAATGAAATAGACCGAAAAATGACCTACTTTAAATAAAACTTGAAACAGAATTAAAGCAAATAACACCATTGTCACTAACGTAATTAAAAAATTGATATACACGTTATTAACGATTGTCGATTGAGTACCTAATAAAAAAACAGGTAATATTTTGACGAATAAATAGACTGAATCTAAACCAATAATAGAAGGTGGTTAGTAAGCGATTTGTTGTTATCGCTTGAAAAATGACAACTGACGTGCCAATAGCGCCACCTACTAATATAATTAAGATAAATTTTCTTAAACGACTTTGAATTTGATAATCAAATATTTCGAAATCAATACCTAAAATTAAGTATAAAGTCGCTATAATTATTGTGATTACCCCTAATAAAAAAAGCTTTTTATTAACATTAGTTAGCATAATTCTCCCTACCTTTCATCAATAAGATAAGGAATATAATCGTTCCAAAAACACCAATAGTTAGACCTATGTTAATTTCATAAGGATAAACAATTAAGCGTCCTACAATATCTGAAATAAGCACAAATATAGAACCTAACATCATCGTATGAGGTAAGGCATGTTTTAAATGGTCCCCTCGATATATTGAAATAATATTAGGAACAATGAGTCCGAGAAATGGTAATGTTCCAACAGTAACGACTACAAGTGCAGTGATTGTTGCAGTTATAAACAATGCGATATTAATGATTTTTTCATAATTCACACCTAAGTTATGGCTAAAATCTTTGCCCATACCAGCAATCGTAAAATGATTTGCAAATATATATGTAATTAATAAGAACGGTATACTTAGATATAGAACTTCATAACGACCACTTGTAATAATAGCAAAATTTCCATTTAGCCAATTTCCAATACTTTGTACTGCATTAGTTCTCAATGCGATAAATGTAGTAAAACTTGAAACAATACCTCCAAGCATAATACCTAATAACGGTATAAAGATGACTTCTTTCACTCTAATCAGTTGTACTAATTTCACGAAGAAATAAGTACCACCGACGCTACAAATAACTGCAAATATTAATTTAATAAGTATGTGACCTTTAGGGAATAAAATAAGTGATAAAAGAATACCCAACTTAGCCCACTCCATTGTGCCAGCTGTTGTTGGACTCACAAATTTATTTTGCATCATTTGTTGCATGATTAAACCTGCTATTGCCAACGTACTACCTGATATGAGAATACTAACTGTTCGAGGAATACGACTCGATAAAATGATATTTAATTGATCATCGGTAAGGTGGAAAATATCGGAGATTGATATTTGGCTAACACCGATAAATAGAGAGAGAATCGTAAGCACGACGAGAAAGATGAGTAAAACATATCCCTTTAATAAAAACTTCATAACACTTTCTCCTTGAATAGTTATCCTTGGTAACGATTGTACGATAATGATAATCGTTATCAATTAAAATGTTACAGAATTTCCTTGTCATTTTCAATAGGTTATCTATAAATATTGTTATAAATTAGATTATTTTTATGTTTTTAGTTCATTGCACATAAAAAAAGCCCTAATTTTACTTTCATTGTGCGTACACAAGTATAGTAAAATTAGAGCTAAATCTATTTTATTTTTCATCATCAAATATGAAATCTTCATCTCGTAATGCTTCAACATTTAAAGCTAGTGTATAACCATCACCTTTTACAGAGAAGAAATCATGGTTTTTAGTTGTTGTATCTAAAGCATTTTCTATAATTGGATTGAATTCACGTTCTTCAAAATATGGTTCAAATCCAAGATTTGATAATGCTTTATTACCGTTGTATTTAACGTAATTAAGCACATCTTCAGCTAAGCCAATATCATCATATAGAAGATGCGTATATGATACTTCATTATCATAAAGTTCTTTTAACAATTTGTACATTTCTTGATCTGCACGTTGCTTTTCACTTTCAGAAAGCTCATTTCTTAAACTTTGTGCATCTAGACCTGTAAACACACCATGTATCGATTCATCTAATAAGATTTTACGAATAATTTCACCAGATGTTGTCATTTTACCTTGACCAGCTAGATAAAGCGGATAATAGAATCCAGAGTAGAATAAGAATGTTTCTAAGAAAACACTTGATACTCTAGCAATATATTGGTCAAAAATTGAGGCTTCTTTCCCCCACAATTTATGGTAGTTTTCGATGATTTTGTCTGATTTGTATTTTAAATGTGGCTCTTCAATTACCCAAGTATCTAATAAATAGTTCGTTTCACTAGATGGTAATAATGTAGTGAAAATATGAGAATAACTTTTAGCATGAATTTGTTCCATCATTGCCATAAACGAATAAACGGCTTTTTTTCTTAAATCAGTTGTGTGAAGCATGATTAATGGCATTCCATCATCTGCTTGATGCGTGTCTAACCCTGTTAAACCAGCTAATGCCTTTTTAAATGTATTTTTTTCGGCTTCAGATAATGTTTTCCAACTTGCAATATCTTTTGATACTTTAAATTCTGTTTCTACCCACATTTGAGAGATATTTTGACGCCAAAACATATTTGTCATATCTTCTTGGGTATTCCAATTGACGGCCTTCATGAATAATAATCCTCCTATCCTTTAATTAAGATGATAGATAGCCATAGATAATCAATTAAACTACCAAAATCCTTATTAAGGTTATGTATTTCAAGGTTAGAACATCTACGTTGCATACTTTGAGAAATACTAAATATGCTCTTTAAAGTCAACGTGTAGTCCCAACCTTTTTAAATCTTAATATTCTATAATCCACTTCAATAATAATACTTACTATTTAATGTATCACGTTTATTTATCGTATTAAATTGCACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATAATTTATTACGTGTGTAATATAAAGATTTTAAACCTTTATGATGTGCATATACATATAATCGAGAAAGTTCACGTGTAGAAATTTCTGAATTAACATATAAAATAGTTGAAATACCTTGATCAACATGTGTTTGAATAGTTGATACTAAATCAATTAATTTCATTTGATCTGTATTAAATGCTGATTTGTAATACCACATTGTTTCAGGTGATAAGAATGGCATTGGATAAAATGTTTCAGCATTACCATAAGTACGTCGCTCGATTTGATCAACGATAGGCATTACTGAGCTTGTTGCATTTTGCACATATGAAATACTTTGTGTTGGTGCAATTGCTAAGCGATAAGCATGATATAGACCGTATTGCTCTACATCTTTTTGTAATGCTTTCCAATCTTCTGCTGTAGGAATTTCAAAACCTTTGAATAATTCGCGTACTTTTTCAAATTGTGGTTCAAATTCTTGTGAAGTATAGAACTCGAAATATTTTCCATTTGCATAATCTGATTTATCAAAATCAAGATATTTTTCTCCACGTTCTTTTGCAATTTGCATTGAACGCTCAATTGAATAATAGTTCATCATCATGAAAAAGATGTTAGCGAAATCTTTAGCTTCTTCTGACTCATAACCAATTTTATTTTTAGCTAAGTAACCATGTAAGTTCATTACACCAAGTCCTACAGAATGTAACTCACTATTAGCTTTTTTAACGCCAGGTGCGTTTTGAATATTCGCTTCATCACTAACAACTGTTAATGCGTCCATACCAGTATGAACCGAATCTCTAAATTTTTGGGATTCCATGACATTCACAATATTTAATG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP022881|1998308:2011782|2010726_2011782_-|AXV42988.1|DBSCAN-SWA MKKQLEQLSAYQPGLSPRALKEAYGIEEELYKLASNENLYGPSPKAKEAISNHLDELYYYPETGSPLLREAISQHLGVDASRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDKIVTSEATFGQYYHNAIVESAQVIQVPLKNGGFDLEGILNEVDDNTSLVWLCNPNNPTGTYFNHDDLIGFLERVPSHVPVLIDEAYFEFVTADDYPDTLKLQETFDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVATNEAIEKWNIIRPPFNVTRLSEYAAVAALEDQDYLKQITAKNAEERAKFYQIPQSKHFLPSQTNFVFVQTDKSKALYEALLKVGCITRPFPTGVRITVGFPEQNDKMIDVLQQFKF >CP022881|1998308:2011782|2010102_2010639_-|AXV42987.1|DBSCAN-SWA MSRKKIAIDMDEVLADTLGAIIDGVNERANLGITVESLNGQKLKHVIPEHDGLVTEILREPGFFRHLKVMPNAQEVVEKLNEHYDVYIATAAMDVPTSFHDKYEWLLEHFPFLDPQHFVFCGRKNIINADYLIDDNPRQLAIFEGESIMYTAVHNMNHHDYKRVNGWKDVEALFLNDK >CP022881|1998308:2011782|2005706_2006576_+|AXV42983.1|DBSCAN-SWA MNPKIKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLSGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIFKYKQPMFGKLSSQPLLISRSTLGLIGVLLNIYALDHMVLSDADTLMKLNPFWTILLCFIFLHEKVRKYQISAMIVAILGMLLIVKPEFSSSFIPALIGLLSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFSIFTFEPMSKLQLLYLFGAGLSAAVGQIGITLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAIFGFILFGETPDLLSTIGYVVIISASYYMFEKARRESNQQQQN >CP022881|1998308:2011782|1999739_2000039_-|AXV42978.1|DBSCAN-SWA MLTNVNKKLFLLGVITIIIATLYLILGIDFEIFDYQIQSRLRKFILIILVGGAIGTSVVIFQAITTNRLLTTFYYWFRFSLFIRQNITCFFIRYSIDNR >CP022881|1998308:2011782|2006599_2007100_+|AXV42984.1|DBSCAN-SWA MAQGRQNDELQDITLLGNQNNTYNFDYRPDVLETFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNIKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRMMNHDMYPENVDNR >CP022881|1998308:2011782|2007435_2008941_+|AXV42985.1|DBSCAN-SWA MKANNSHEQAVQEIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRAMLLFYMYYAIADHGLGIDKTTAMSIMSVYGALIYMSCIPGGWIADRITGTRGATLIGAVLIIIGHICLSLPFAMVGLFASMFFIIIGSGMMKPNISNIVGRLYTKDDTRMDAGFVIFYMSVNFGALISPIILQQFLNVKNFHGGFLIAAIGMALGLVWYVLFNRKNLGRVGMTPTNPLSPAEKKKYTAIVSGIVAIIIVVLIVTYLTNTLSFNLVSNTVLVLGIVLPVSYFTIMIRSKDVTDVERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLLGWKTNFGETIFQSINPLFILLFAPVVSLIWQKLGKRQPSLPIKFVIGAGLAGISYILIGLIGTIYGSAHFSVNWVILSYIICVVGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSLWLLTNASAQAFNGTLVKLIDPLGQTNYFIFLGTTVIVITLVILAFSPKIVKAMRGIR >CP022881|1998308:2011782|2002441_2004547_-|AXV42981.1|DBSCAN-SWA MKTMDEKKYNHIELNNEVTKRKDNGFFNLEKDQEALKVYLEEIHDKTIYFDSEIERLHYLVDNNFYFNVFEKYSDSDLVEITEYAKSINFQFASYMSASKFYKDYALKTNDKQQYLEDYNQHVAIVSMYLANGDKDQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPVAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKQEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKDAREMLNTIAQTQLQSGYPYLMFKDNANKVHANSDIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGTEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESQKFRDSVHTGMDALTVVSDEANIQNAPGVKKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNYYSIERSMQIAKERGEKYLDFDKSDYANGKYFEFYTSQEFEPQFEKVRELFKGFEIPTAEDWKALQKDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPETMWYYKSAFNTDQMKLIDLVSTIQTHVDQGISTILYVNSEISTRELSRLYVYAHHKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCAI >CP022881|1998308:2011782|1999078_1999702_-|AXV42977.1|DBSCAN-SWA MVLFALILFQVLFKVGHFSVYFILLIGVILGTFFRSITGFIQLIMEPESFLAVQNTMFANFDASNSKIVGFSAILLIILIGITIVLIPYLDVLLLGKAQAINLGVNYENVTRLMLILVAILVSISTALVGPITFLGLLTVNLAHEFMKTYEHKYILPATICFSWICLFIAQWVVEHLFEATTEVSIIIDLIGGSYFIYLLVKGRNAN >CP022881|1998308:2011782|2004509_2004908_-|AXV42982.1|DBSCAN-SWA MKVVYFSFSGNVRRFIKRAEIENVMEITSENCTDPINEPYILVTGTIGFGEVPQQVQSFLDVNHSYLRAVAASGNRNWGQNFAKAGRSISEDYNVPLLMKFEVQGTNKDVIEFKNKVGNFNENYGREEVQSH >CP022881|1998308:2011782|2000028_2000997_-|AXV42979.1|DBSCAN-SWA MKFLLKGYVLLIFLVVLTILSLFIGVSQISISDIFHLTDDQLNIILSSRIPRTVSILISGSTLAIAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILLSLILFPKGHILIKLIFAVICSVGGTYFFVKLVQLIRVKEVIFIPLLGIMLGGIVSSFTTFIALRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEVLYLSIPFLLITYIFANHFTIAGMGKDFSHNLGVNYEKIINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLIVPNIISIYRGDHLKHALPHTMMLGSIFVLISDIVGRLIVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRENYAN >CP022881|1998308:2011782|1998308_1999082_-|AXV42976.1|DBSCAN-SWA MIQIQNLNKSIQKKSILKDINVNIEKGKITSLIGPNGAGKSTLLSAITKLMSIDSGTVKIEDKEMSLYRTDELAQKISILKQTNHTDMNITVEQLVNFGRFPYCKSHLKKEDKEQVKYALDLLQLNDIKDRNIKTLSGGQRQRAYIAMTIAQNTEYILLDEPLNNLDMKHSVQIMQTLRTLAQQLDKTIVIVLHDINFASCYSDHIIALKHGELVRAGKNEDVLQTEVLRELYEMDVKVEWVNGQRICLYYDEQILS >CP022881|1998308:2011782|2001223_2002198_-|AXV42980.1|DBSCAN-SWA MKAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEKNTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLIMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDTWVIEEPHLKYKSDKIIENYHKLWGKEASIFDQYIARVSSVFLETFLFYSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQSLRNELSESEKQRADQEMYKLLKELYDNEVSYTHLLYDDIGLAEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYTLALNVEALRDEDFIFDDEK >CP022881|1998308:2011782|2009090_2010020_+|AXV42986.1|DBSCAN-SWA MTKKYNHGVLFYHEHSGLKDIYQGLGEVTKSLSSMCKHFSIQLSENEGDIKGYCESIKNGQYGNDIDVLFILGGDGTVNELINGVMENDLDLPIGIIPGGTFNDFTKTLNLNPNHTLASQQLLSSHIQTYDVMKINDMYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLMDPSKFDFTLTIDGEEKTGNTSMILIANGPNIGGSRIPLTDLSPQDGQLNTFIFDDQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIDHVSGKQIKLTTDPNMKIDIDGEIALETPINVEVLPDAIKLLTFPDQNNNQ |
13 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
2024543 : 2031363
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP022881|2024543:2031363|DBSCAN-SWA ATTATAATCTCTCCAGTATCCTTGTCTTATCATAAAATTCTTTGACTTCATCATCTGGATTAGAGTTAATCGTAATCCCAGCACCAACACCATAAATTGCTTGTTGATGTCGATATTCAATCGTACGTATAGGTATATTAAATATCATTTTATCGTTAGGAAGTAATAATCCAATTGTTCCACAATATATGTGTCTTGGGACTTGTTCTAAAGAATGAATTAACTTCATAGTATTTATTTTAGGTGCACCAGTAATAGAACCACACGGAAATATAGCATTTAAGATCATTTCAAGGGTCACATCTGACGATAATTTTCCTGTTACCATACTCGTCATTTGGTGTACCGTATGATACGTTTCGATAAAGAATAATTTATAAACAATAATACTCCCTGTCTTTGCTATTCTAGAAATGTCATTTCTCAATAAATCTACAATCATTACATTTTCAGCTTTATCTTTCTTAGACTGTTGTAGTTGATGGTAGTTTTGTTGATCTTCTTTATTGGTTTCACCTCTCGGCATGGTACCTTTCATAGGTTTACTAACTAACACGTTCTCTTCACCATTAAAGATTCCTTTCTGAAAAAATAATTCAGGAGAAATAGATGCAACTTTGATCTCATCTGTATCTAATAAGGCTGTGTAATTACCATTTGCCTCAGTAGTTAATTGTCGATATAACTGATGAATCGGTAAGTAGATGTCATCAGTCAAACGTGTAGTATAGTTCACTTGATAAGTATCTCCTTCGACAATTGCATGTTGAATGCTTTGTATTTTTTCTTTCATTTGTTGATTTGATTCTATAAATTTAAATTGATGTTTCGGTTGATATGATGCATTATTCAATTTCTTAGATTCATTAATATGATTGGCAACTTTAAAGCTATATGCAATTGCTAAGACACCATCTTCTTCTACATGGCACACGGTCATTTGTGGATTGAAATAACGTGCCGCTTCATATGTTATATATAATGCAACATAATGACCTTGTTGTTGTTGAAATTCTGCAAAGCGTATAACGTGCCCCACTTCTTCCACATGGTTAGCTATCTTCTTTTCAATCAATTGATCTAATTCAATATGATAGGTTTCAAATTGATTATCGTCTAAGTAATAGCGATAGTTAAATTTGATAGTCACTATTTTCACCTACAATGTCGATAAAGTTTTGAATCTGGTTTTGGCCTTGTTCGCTTAAAATAGATTCTGGGTGATACTGTAGTCCGTAAATAGGATAATTATCATGTTGTAATCCCATAATGACACCATCATCTCCTTCAGCTGTAACCTTCAATTCTTTAGGAACACAACTTTCATCTGCCTTCAAAGAATGATAGAGCATAACACTGAAGCTATCTGGTAATCCTTTGAATACACCTTCGCCGTTATGTCTTAATAATGTCGTATGACCATGTATAGGTCTATCTCTATGTATAATTGTTCCTCCAAAATATTGGTAAATCATTTGAAATCCTAAACAGACCCCCAATATAGGTATGTGCTGATAAAAGTCATCCATCACCTTAAATAAAATAGGATAATCACTAGGTCTCCCAGGACCCGGTGATATAACGATAGCTTTGGGCTTCAATTCTTTTAATTCCTCTATATTAATATCCTCTACATCAATGACGTTAACCGTCTCTTGGGTAGCCATTTTAAAATAATTAATTAAATTATAAGTAAATGAATCTTTATTATCTATCACTACTATCATGATTACGCTCCATTACATTAATATTAGTTCTTCTATACGTCTTTAACACTATTATCACAAAAATTTACTTGATTTTACATATGAATTGGTTTATTCTATGTTGCGTACAAAATATATATTTATCAGAGGTTCCTAGCCGAAACCCTCTATAAAAAACTAGACACTGAATTCAATTTCTGATTGCAAATAGACATATCATTTTAATACTTTCTTTAAAATTATATGTGTATTCACAATCTGTCGTCTATCTTTTTTATAGAGATAGGCTTTTTTTATGCCCTAATGTTCGGTTTCAGTGACTAATGATATACAGGAGGAATAATTATGGTGCAACACACTCTAGATCAAAACAAAGCCATTGTCGTCTTTAGCGGAGGTCAAGATAGTACAACATGTTTGTTTTATGCTAAAAAGCATTTTAAAGATGTTACTCTCGTTACCTTTAATTATGGACAAAGACATGATACTGAAATTGAAGTAGCAAAAAAAATTGCTCAAGAGCAAAACGTAGAACACCACATATTAGATATGTCGTTGTTATCGCAACTGACACCTAATGCATTAACACAACATGATTTAAAAATTGAAGATACTGAAGATGGCATACCAAATACATTCGTACCTGCTCGTAATTTACTCTTCTTATCATTCGCTGGTGCATTAGCTTATCAAATTAAAGCTAAACATATTATTACTGGTGTGTGCGAAACTGACTTCTCAGGTTATCCAGACTGTCGTGATAGCTTCATTAAATCCATGAACATAACATTAAACTTGTCTATGGACAGAGACTTCGTGATTCACACGCCATTAATGTGGTTAGATAAAGCACAAACATGGGAACTTGCTGACGATCTTGGGGTATTAAACTATATTCGTGAAAATACGCTAACTTGTTATAACGGTATTATTGGAGATGGGTGTGGTGAATGCCCTGCCTGCCAATTAAGATCACGTGGACTCGAAAAATATCTTGCTAAGAAAGGAGTACAATAAGATGATTCAACAAATTTATCCTAGTGTCAGTCATCCCTATCAATTCGAACTTAATAAAGACTTTAACTTTTCAGCAGCACATTACATTCCGAGTGAAGACGCTGGGAAATGTATGCGTACTCACGGGCACACATATTTCGTAAATATTACCATAGTTGGAGATGAATTAGACCATAACGGTTTTTTAGTGAATTTTAGTGATTTAAAAAAATTGATACATGACCAATTCGATCATTATTTATTAAATGATTTAGTTCAATTCAAAGGTAAAAGTCCTTCTACAGAAATTGTCGCTCAGACTATTTATCAAATGGTGCAATCATACCTTAAAGATCAAAAAAACCATCCAAAATGCGTCCAAGTTTATTTACGTGAAACACCTACTAGCTATGTCGTATATCGTCCTAAAGGTGATTTATAATGGCTAAAATACCTGTATTAGAAGTATTTGGACCAACAATTCAAGGAGAAGGACGTGTCATTGGTAGAAAAACAATGTTTGTTAGAACTGCAGGTTGTGATTATCGCTGTAGTTGGTGTGATTCTGCCTTTACATGGGATGGTAGTGCTAAAGAAGATATTCAATTAATGTCTGCAGAAGAAATCTATAACAAATTGCGTGAAATAGGTGGCAATAATTTTAATCACGTCACAATTTCTGGTGGAAATCCAGCACTTATCAAAGGTATCCAAGATTTAGTAGATTTATTTGAAGAACATCATATTCAAACTGCCCTTGAAACACAAGGTAGTAAATTCCAACCATGGATGACTCAAATCGATGACTTAACAATTAGTCCTAAACCGCCAAGCTCAAATATGAAACCTAATTTGGATATTTTAGATAGTGTTATTGAACAGTGTGTACCTGAATCACTTAATTTAAAAGTCGTCATTTTTGATGAGGATGACTTCGAATTTGCTAAAATGATACATCATCGTTATCCAACAATTCCGTTTTATTTACAAGTGGGTAATCCTTATTTAGATGAAGAGGTCGACAACCATACTGCTAAACTATTACAACGTTATGAACAATTAGTCGAACGTGTTATGACTAGTAGCGATATGAATAATGTATACGTATTGCCTCAATTACACACTTTGTTATGGAGTAATATGAAGGGCGTTTAAACTCATTTAATATAACTTTAACAATTTCGAGTGTTATATAATGATTAAGTTTATGTTAATTGATATAATAATTGAATGAAGTATTACGGATAGGAGTACACCATGATTCTATATATATTAATTAATATTGCCGTAGTATTGCTCATTGTAGGAATAGATTTATATTTGCACCAATTTAAACAACTTCGATTTAGTTCAATACTAATAGCTATTTCATTAAATGCTATTATCGATTTAATTGTAGTCGCAAAATATAATTTCATTTCAATCTATACGATGATTTTATTTATTGTATGGGCATTATTACAACTCTATTTAAATAAAAAAATTAACTCTTTCATGATAAAAGACCAAAAGTTCATTGCAGTGATATTTGTAATTGTCATCAGTTTAGCACAGTTTATAACTGATATATCCAGTGAACAATCTGTCTATATGTCGTTACCATACTTAGCTCCAGCTATTTTCATTATTGGTGCAGTATTATTATTTGTAGGTACATTTAATGTATCGGAGCTTAATCATCTACCTATTTTAAAAACAATCAAGCATCCTATGCTAATTGGTACGATATTAATTATCATCTCATTTATAGCTATGATGATACTCACACCTTTTTGGTATGTATTTACTATCATCTATGTACTATTCATATTATTTATCATATGGCAACGTATATTTAAGTAACATTTATCATATCAATAAATGTTACTTTTTTCGTTGTCGATAAATCAAATTATAAAAAGCTTACAGCTCATGGACTGATCCATAGCCTGTAAGCTTTTTGTTTAATGAACACGTTCTTTATATTCTTCACTATTTTGTGTTGCTTGATATGTTGGTTGATGTCTATGTGCATCAAATCTTCTAATTTGATGATATTGTTGAGACTGATTTTTACTAGATTGTGTCTTGTTTGAGTCATTTGACTCCTGTGATATTTCAGATGTTTGTTCAGGTTCAATATTTGTTGCCTGAACAATATATTTAGGTCGCTTTTTCACTTCATAATAGATTCGACCAATATACTCACCAATAACTCCTATGGACATTAACTGAATACCACCTAAAAGTGTAATCGCAGCTATTGTTGTGAAGTAACCAGGAATGTTTACACCTGAAATCATGATATTAATTAAAAGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP022881|2024543:2031363|2026593_2027265_+|AXV43001.1|DBSCAN-SWA MVQHTLDQNKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKDVTLVTFNYGQRHDTEIEVAKKIAQEQNVEHHILDMSLLSQLTPNALTQHDLKIEDTEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIKAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNITLNLSMDRDFVIHTPLMWLDKAQTWELADDLGVLNYIRENTLTCYNGIIGDGCGECPACQLRSRGLEKYLAKKGVQ >CP022881|2024543:2031363|2029187_2030294_-|AXV43005.1|DBSCAN-SWA MNIRVIIPCYNEGEVVLKTYEKLTEILKQDSSDKQYEYDLLFIDDGSKDSTIDHLQNLALADHHVKYISFSRNFGKEAAMVAGYQHSEHCDAVVMIDADLQHPPEFIPQMVEGYNEGYDQVIAKRDRKGENVARKSMTRAYYKLINAFVEDVQFEDGVGDFRLISKRAVQALTSMDEYNRFSKGLFEWIGYNTKVFTYENVEREAGESKWSFAKLLNYGIDGLISFNNKPLRMMIYLGMFTFSLSVLYLLYLLINIMISGVNIPGYFTTIAAITLLGGIQLMSIGVIGEYIGRIYYEVKKRPKYIVQATNIEPEQTSEISQESNDSNKTQSSKNQSQQYHQIRRFDAHRHQPTYQATQNSEEYKERVH >CP022881|2024543:2031363|2027685_2028399_+|AXV43003.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEVFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKEDIQLMSAEEIYNKLREIGGNNFNHVTISGGNPALIKGIQDLVDLFEEHHIQTALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSNMKPNLDILDSVIEQCVPESLNLKVVIFDEDDFEFAKMIHHRYPTIPFYLQVGNPYLDEEVDNHTAKLLQRYEQLVERVMTSSDMNNVYVLPQLHTLLWSNMKGV >CP022881|2024543:2031363|2027266_2027686_+|AXV43002.1|DBSCAN-SWA MIQQIYPSVSHPYQFELNKDFNFSAAHYIPSEDAGKCMRTHGHTYFVNITIVGDELDHNGFLVNFSDLKKLIHDQFDHYLLNDLVQFKGKSPSTEIVAQTIYQMVQSYLKDQKNHPKCVQVYLRETPTSYVVYRPKGDL >CP022881|2024543:2031363|2030520_2031363_-|AXV43006.1|DBSCAN-SWA MNINDTQYLNNGYPMPSIGLGVYKIADDEMNEVINTAIEAGYRAFDTAYFYGNEQSLGQALKQTNVDREDLFITSKLWNDYQGYDSTIQYFNQSLENLGLEYLDLFLIHWPCEENGLFIESYKALETLYHEGKVKAIGVCNFKQHHLEKLMQETEIVPQINQIELHPYFNQQELQDYCDHHDIKVTAWMPLMRNRGLLDDPVITDIAKRYQKTPAQIVLRWHLAHNRIIIPKSKTPSRIQENYNILDFNLELTDVAQIDSLNRNDRQGKDPDEVAIGDLK >CP022881|2024543:2031363|2025675_2026269_-|AXV43000.1|DBSCAN-SWA MIVVIDNKDSFTYNLINYFKMATQETVNVIDVEDINIEELKELKPKAIVISPGPGRPSDYPILFKVMDDFYQHIPILGVCLGFQMIYQYFGGTIIHRDRPIHGHTTLLRHNGEGVFKGLPDSFSVMLYHSLKADESCVPKELKVTAEGDDGVIMGLQHDNYPIYGLQYHPESILSEQGQNQIQNFIDIVGENSDYQI >CP022881|2024543:2031363|2028501_2029086_+|AXV43004.1|DBSCAN-SWA MILYILINIAVVLLIVGIDLYLHQFKQLRFSSILIAISLNAIIDLIVVAKYNFISIYTMILFIVWALLQLYLNKKINSFMIKDQKFIAVIFVIVISLAQFITDISSEQSVYMSLPYLAPAIFIIGAVLLFVGTFNVSELNHLPILKTIKHPMLIGTILIIISFIAMMILTPFWYVFTIIYVLFILFIIWQRIFK >CP022881|2024543:2031363|2024543_2025692_-|AXV42999.1|DBSCAN-SWA MTIKFNYRYYLDDNQFETYHIELDQLIEKKIANHVEEVGHVIRFAEFQQQQGHYVALYITYEAARYFNPQMTVCHVEEDGVLAIAYSFKVANHINESKKLNNASYQPKHQFKFIESNQQMKEKIQSIQHAIVEGDTYQVNYTTRLTDDIYLPIHQLYRQLTTEANGNYTALLDTDEIKVASISPELFFQKGIFNGEENVLVSKPMKGTMPRGETNKEDQQNYHQLQQSKKDKAENVMIVDLLRNDISRIAKTGSIIVYKLFFIETYHTVHQMTSMVTGKLSSDVTLEMILNAIFPCGSITGAPKINTMKLIHSLEQVPRHIYCGTIGLLLPNDKMIFNIPIRTIEYRHQQAIYGVGAGITINSNPDDEVKEFYDKTRILERL |
8 | Pandoravirus(14.29%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
2363840 : 2377544
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP022881|2363840:2377544|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP022881|2363840:2377544|2367346_2367865_-|AXV43300.1|DBSCAN-SWA MTTITEQGYQQFKMLSNNTMFRKHVKDSQNEIIKILMSLLMYAPTKMHKTILSRVLLLRDKYYLYISGGSLHLFTRDFKSAISFNIKQPNPKYIDYFTDYWIVEIDNLNSLKKGYGNKLMNEVLEITSVMKVDVCLWTETISNTKYFEKYGFESIGKRGRAKENLMIKRKEV >CP022881|2363840:2377544|2371908_2372181_-|AXV43307.1|DBSCAN-SWA MSRTKLQDLPTKENTITEPKQVVVKPMFAKPNTLASIFGISYSSVNRILKEWEKDSKGVDDLYYSLSSTMTVISISRFEEYMKKRHKKWM >CP022881|2363840:2377544|2375260_2375776_-|AXV43312.1|DBSCAN-SWA MLNRVVLVGRLTKDPEYRTTPSGVSVATFTLAVNRTFTNAQGEREADFINCVVFRRQAENVNNYLSKGSLAGVDGRIQSRSYENQEGRRIFVTEVVCDSVQFLEPKNSQNGGGQRSQNNEFQDYGQGFGGQQSGQNTSYNNNSSRPNSNQSDNPFANANGPIDISDDDLPF >CP022881|2363840:2377544|2376469_2377291_+|AXV43314.1|DBSCAN-SWA 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22 | Staphylococcus_phage(75.0%) | coat,integrase,terminase | attL 2361641:2361670|attR 2374961:2374990 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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