Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP032098 | Arcobacter molluscorum LMG 25693 strain CECT 7696 chromosome, complete genome | 2 crisprs | cas4,PrimPol,DEDDh,cas6,csm2gr11,csm3gr7,csm4gr5,csm5gr7,csa3,cas2,cas1,cas3,cas5,cas7,cas8b1 | 2 | 15 | 5 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP032098_2 | 691083-691906 | TypeIII-A |
NA
Consensus repeat of CP032098_2
|
12 spacers
spacers of CP032098_2
>2.1|691113|36|CP032098|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTTAGTGACAATATATGTTGAACCATGCGGAATT >2.2|691179|38|CP032098|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTGGTTTTGAGATAGGCAAAATATTATATTGCTTGCA >2.3|691247|35|CP032098|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAGTATATTCTATCTCTTTTGTAACCTTGATATTA >2.4|691312|36|CP032098|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAAAGATGTTAGTTCTTCTGTATTTAGAAGATATT >2.5|691378|34|CP032098|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCAGGATTACTTTTAGGTTTATTCTCATATCCA >2.6|691442|38|CP032098|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGCAAATACTAAAAGCAACAAAGATTTACTTACAAAG >2.7|691510|36|CP032098|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAAAACAGAAGAACATAAAACAACAACTTCACAC >2.8|691576|39|CP032098|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAATCTAACATTCTCTTTTGAAATTGTTAAAATATTAT >2.9|691645|37|CP032098|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAACAAACAACAGTACCAAAACTTTATACAGAGCAAG >2.10|691712|34|CP032098|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAAGGTATCTTTTAACTTTAAAAGGTGAAGAAG >2.11|691776|34|CP032098|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTCACTTTGAATAATGCTACTAATAATTTTCG >2.12|691840|37|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT AGTAGAGCTGTAATATTGTTTGCAGTTGCAATAACAA |
csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,csm2gr11,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP032098_2
The CRISPR arrays of CP032098_2 >merge|CP032098|2|691083-691906|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAACTATTTAGTGACAATATATGTTGAACCATGCGGAATTGTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAACTCTGGTTTTGAGATAGGCAAAATATTATATTGCTTGCAGTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAACGAGTATATTCTATCTCTTTTGTAACCTTGATATTAGTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAACCAAAAGATGTTAGTTCTTCTGTATTTAGAAGATATTGTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAACTGCAGGATTACTTTTAGGTTTATTCTCATATCCAGTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAACAAGCAAATACTAAAAGCAACAAAGATTTACTTACAAAGGTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAACAAAAAAACAGAAGAACATAAAACAACAACTTCACACGTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAACATAATCTAACATTCTCTTTTGAAATTGTTAAAATATTATGTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAACAAACAAACAACAGTACCAAAACTTTATACAGAGCAAGGTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAACCAAAGGTATCTTTTAACTTTAAAAGGTGAAGAAGGTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAACTTTTCACTTTGAATAATGCTACTAATAATTTTCGGTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAACAGTAGAGCTGTAATATTGTTTGCAGTTGCAATAACAAGTAGAACTCCAACATATAAGAGATTTAATT >CP032098|2|1|691083-691839|PILER-CR GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC TATTTAGTGACAATATATGTTGAACCATGCGGAATT GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC TCTGGTTTTGAGATAGGCAAAATATTATATTGCTTGCA GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC GAGTATATTCTATCTCTTTTGTAACCTTGATATTA GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC CAAAAGATGTTAGTTCTTCTGTATTTAGAAGATATT GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC TGCAGGATTACTTTTAGGTTTATTCTCATATCCA GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC AAGCAAATACTAAAAGCAACAAAGATTTACTTACAAAG GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC AAAAAAACAGAAGAACATAAAACAACAACTTCACAC GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC ATAATCTAACATTCTCTTTTGAAATTGTTAAAATATTAT GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC AAACAAACAACAGTACCAAAACTTTATACAGAGCAAG GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC CAAAGGTATCTTTTAACTTTAAAAGGTGAAGAAG GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC TTTTCACTTTGAATAATGCTACTAATAATTTTCG GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC >CP032098|2|2|691083-691906|CRISPRCasFinder GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC TATTTAGTGACAATATATGTTGAACCATGCGGAATT GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC TCTGGTTTTGAGATAGGCAAAATATTATATTGCTTGCA GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC GAGTATATTCTATCTCTTTTGTAACCTTGATATTA GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC CAAAAGATGTTAGTTCTTCTGTATTTAGAAGATATT GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC TGCAGGATTACTTTTAGGTTTATTCTCATATCCA GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC AAGCAAATACTAAAAGCAACAAAGATTTACTTACAAAG GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC AAAAAAACAGAAGAACATAAAACAACAACTTCACAC GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC ATAATCTAACATTCTCTTTTGAAATTGTTAAAATATTAT GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC AAACAAACAACAGTACCAAAACTTTATACAGAGCAAG GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC CAAAGGTATCTTTTAACTTTAAAAGGTGAAGAAG GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC TTTTCACTTTGAATAATGCTACTAATAATTTTCG GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC AGTAGAGCTGTAATATTGTTTGCAGTTGCAATAACAA GTAGAACTCCAACATATAAGAGATTTAATT >CP032098|2|1|691083-691906|CRT GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC TATTTAGTGACAATATATGTTGAACCATGCGGAATT GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC TCTGGTTTTGAGATAGGCAAAATATTATATTGCTTGCA GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC GAGTATATTCTATCTCTTTTGTAACCTTGATATTA GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC CAAAAGATGTTAGTTCTTCTGTATTTAGAAGATATT GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC TGCAGGATTACTTTTAGGTTTATTCTCATATCCA GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC AAGCAAATACTAAAAGCAACAAAGATTTACTTACAAAG GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC AAAAAAACAGAAGAACATAAAACAACAACTTCACAC GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC ATAATCTAACATTCTCTTTTGAAATTGTTAAAATATTAT GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC AAACAAACAACAGTACCAAAACTTTATACAGAGCAAG GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC CAAAGGTATCTTTTAACTTTAAAAGGTGAAGAAG GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC TTTTCACTTTGAATAATGCTACTAATAATTTTCG GTAGAACTCCAACATATAGGAGATTGAAAC AGTAGAGCTGTAATATTGTTTGCAGTTGCAATAACAA GTAGAACTCCAACATATAAGAGATTTAATT
>CP032098.1|AXX91685.1|690319_690919_+|hypothetical-protein MNLYDLLNKIFDMYPMGFPIVFTIICFLVIAGIVGILYFFNGLIAEKVINRYLKKYFENKKKEYGEIVMNFEREKEFKQKEVLVLNDEKSIISKTLHTLDYKYTTNEENWKGKMVILYLLDVEANDKNQEKRHEVFKEKLKILKTLDKNEHILLIYATQPNFEIGKYKDNLPKKYTFVNSQFTLIERLYSAYIISNIKE >CP032098.1|AXX91684.1|689292_690318_+|CRISPR/Cas-system-associated-RAMP-protein-Csm5,-type-III-A MAKYKITVLTPLHIGTGNSYSQNFNMLCKGGFVYFYDEFKLVDFLLSKDEYIPEDFNKLKEKIKNYKDEIIKSNLHLRKIKNDFSSLENKDVLENVSSSNKPIVAGSSIKGAIRTAVLNSLQLKDERNEDLYNSLKNKNIYKNRFSKGRKTEDTFDEDFKSLFTYLKISDSIESNLNTQIFKSINIKKNKKHQSSREKRVINIQNNVECISAKQMFYIDIKDESIKKYGKNIFSNLGKICNKFYLNAFNKEKELYFNLFSLGKDFEINEESNDVFLLNIGRFSGAEMKSLDNFRYIKNSKSKDKKESSTRTFALKDDVEDNVYFEKELLPFGWVLCELVKD >CP032098.1|AXX91683.1|688408_689311_+|CRISPR/Cas-system-associated-RAMP-protein-Csm4,-type-III-A MKLLSFEITPLSDFGSFPKGDMLFSQMLAQSFWQRENTFANYLEEEPKLIVSDMMPLGYFYKPTLPFSYFDKLSKKERKKSLDRKDFKKKAFIKCDYLESGELYKCEEINFYRKITQGKNSINRLTFTTSEGDFAPYKEEQISFSSKLWIFLLVDESIESKAIELLKSVGKFGFGKNSSTGKGQFEIKQINNPFNLKSSDYFMSISPMILNQDENIKSCFYEPFTKFGKFHMANESKNTFKKPLLLAKSSAVLEQVKKVDTFYYGSSIDNSSVQDKKSFVQGFSVKIPINIKEKQWLNTK >CP032098.1|AXX91682.1|687452_688406_+|CRISPR/Cas-system-associated-RAMP-protein-Csm3,-type-III-A MKYNLKVLTGLHIGTSDDTMNIGGIDSAVIKREIYADKTTGKICFDSYEKENIKKLSEPYIPGSSLKGKIRSLLEWKFGFYDLLYKDYKEKRKILEEFLKSKNWQYKIEDLEKTFKNDEDKKLQKEIKESNEYKSYDEINTLKDKPISSDTIKYLDNFKAFETKLAKLIIKLFGESAGTNSNEEIKITRAVFRDCYITNRTRKLFLEDKIKLKEEKAENSINRVDIGANPRFIERVPSGVEFDFEVIIRNFANDNNELLKNTIKLGLLLLQNDALGGGGSRGNGRIEFNGLKEEDIEKTFKSIKEKLGIEKEGKEGK >CP032098.1|AXX91681.1|686999_687431_+|CRISPR/Cas-system-associated-protein-Csm2,-type-III-A MSQNENKNKDEEKDSNLSVHNLDYEKETQLFGDIAQEWADKISKERGRSSQKNKISQLRAFYDKVYDLNEKAEGLNDEKYKKSIYPFVVMLNSKVKYAKTRNLVTDSFVKMINECVKSCENSSDKLNNFKLFFEAVIGFYPKK >CP032098.1|AXX91680.1|684605_685325_+|CRISPR/Cas-system-associated-RAMP-protein-Cas6,-type-III MKYSKILFKLNSENKPAYFMGSEIRGTFGYGLKRVVCVNPSFECSDCFSKEQCIFYDFFEKKNVYHKYRFDIELNSDSYEFSIVLFSKACENIPYIISAFYETFTKIGFGKDRLKYEDFEIYLNSKKIYKDKKLKLPKKLTKKIKKTDDYHKSVVINIKTPLRIKKDSTYVYDERLDLHDILLSIYKRSISLKDKKFKRIELQDDYKIIDKTLCKRYIKRYSGIQKKSMNFNYSSNKLK >CP032098.1|AXX91679.1|683337_684495_+|diheme-cytochrome-c-peroxidase MNNYLKILGFLFVGLFIVGCNSSSLSKEQLAKIQLEKEKLGQVLFFDKNLSKNRTQSCSTCHNPQTGFTDNRDNGVEKMASLGDDGKSIGDREAPSAAYAKFSPKFHYDAKKKEYIGGQFWDGREATLAGQAGGPPLNPAEMGMPSKKAVVNRLKENEFYVKQFKKIYGEDIFKSDEKAYTAMTKVIEAFEMTKEFAPFDSKYDRYLKGEYDLTPLEDLGKSIFFSNNNNSCANCHVLRGEDKEYETFSNYEYHNIGTPINHKLRAKNGVKAIDNGLLNNPAVTDEKQKGKYKVPTLRNVAVTAPYMHNGVFKDLRTVIEFYDKYNNQDRKINPETNKPWEDPEVKENIALEKLKANKLSDRKVDALIAFLKLLTDKRYEHLLEK >CP032098.1|AXX91678.1|682438_683341_+|fatty-acid-hydroxylase-superfamily-protein MDFVLEYLTNPNKRVFWGFLLSSFIIALICVYVKKDRSKRILFSSKLWWHPSARVDYVYFLFSYFIKVFMIYPVVVSAKTIALGVNSFMIQEFGFYRITSLSYGSIMILYTLCLFVVSDFTRYWTHRFLHTIPFLWHFHKVHHSAKVLNPLTFYRVHPVENILFGFRYSLSIGVVTGVFIYYFGAMLSLFDIFGVNIFIFVFSLIGTNLRHSHVKFTYFSFLEKWLISPYMHQIHHSTKHFDRNYGGYLAIWDRLFNTLTLSKDVKSMKFGLRKEQMKDYDNIFKLFFTPFFSLLKRKQR >CP032098.1|AXX91677.1|681488_682436_+|peptidase,-M75-family MKKIVILFMFLVSFGFSNTFTQVIKNVSLPNANQAVKDLKNLQKSYSKDDFKKFAYSWKKVQALYLAGTIDSDYIDNPRYIDIFHQGHEDIVTQLNRAIKSTDDAKITLFKNSTKSINAVEYILFKDDKKLTKREKDLLDVMFSAILSHLKEVQEVYADYAKNNKETIDEETGNAAIINTLIDSTYKLKEWRVGEPAGLTMKYKGKPDNKRAEYYLSQQSFAAIRAILETHDDVIGDKKYKNFATMAVYSGAKPQVIEVRKALEKVKEELAKLKTDDFSNAQDLYKAMVTFHNSYYLSLIEQLSVTAKILEADGD >CP032098.1|AXX91676.1|680091_681489_+|diheme-oxidoreductase,-putative-peroxidase MLQILKKQNFNFSIKKLILLKSLVAIFATGLFAVNNSSDVFTEKLSKKSIFQPIKGLNNKEYDKYILGKSFFRIPWVESPSATTARDGLGPLYNANTCISCHPANGRGNLYTKNNTISRALVVRLSIKNDNSKEHKQIFEKVGFIPEPVYGAQLSINAVHGVKFEGKPNIKYEKKEVVFPDKEVATLLKPIYILEDLNYGKLHKDTVISYRLAPTLMGMGLIELISNEQILKNEDIDDKNGDGISGKANWVYSSLTNKLELGRYTWKASVATVLEQIANAMHNDMGLTTFLHKTQNCTKYQKECNEAPKDLKYEFDVPKHRLDSVEYYLANSKVYKPKEDKEFKKGLELFKQVGCASCHITSFDTKIGKIRPYSDFLLHDMGEELADNRVEFEASGSEFRTAPLWGLALHEKINKKKPRLLHDGRARNFQEAILWHGGEGLTAKKNYMNLSKSKREELIKFLGKL >CP032098.1|AXX91686.1|691986_692694_+|short-chain-dehydrogenase/reductase MSKKRVLITGGNKGIGLAVSRAMLELGHEIIIVAREFETCPLIGVKDVTAIECDLSKLDTLPALAKEVGDIDILINNAGYMQPKYTYDNYPVERRDNIMNVDLYAPVELMNIFSEHMKKQKYGRIVNTASIAGQIGHPDVWYGIAKAGLINATKIYGKLLGSHGITVNCVAPSPVETDMQKDNSEERKKEFKKTVATGRFAEPEEIAKAIVWLATDCPEYINGICIDINNCSYPR >CP032098.1|AXX91687.1|692803_694135_+|hypothetical-protein MVYKVIFFLLFCISNIFAQENRQIIDLKQLYKNSLKDNHKINISNNNLIIDDKLSFKIDENKSKCLIGFYCQGNYNSFIILEQFAKKNYDEKKTKKNKILLDELEKQKKHKLNDAMLFQLSLLYFEVLKLKKDEALLKNRISLVKESLELFDKRKKIGLKEEDDLKSWKTELENTKNDLKRVTNLKKKIKEQLSYIAKINLEDKILQDYHMQSKEFTILNETVAFYLNNSQKITSMTSKISDYIIDNNIDIKTLNYLINSKKSTLEQTKKYKKELEKSSEDNIKQGKNLSNEHKPWDSKKFDKVIEEKLPLYINAKITQKEVQDKALLQNLTYTLSNKKIKIKKNVNDVLKKIVSSYKTINNTSISSNTTRKNFVFIKKLYDKANIDMKTLLDSQNSMIISKKNENNSQYDYLENIIMLFYNTNKIRAVFNNSEKKQLETQIF >CP032098.1|AXX91688.1|694131_695028_-|EamA/RhaT-family-transporter MTQTNKNIFYILMVLAMAGWGASWVNAKVLSSYINEYEMIVFRNFFTIITLAPVLIYSRNYFYINKRSFLLCIVASVLMIAYMKCYFLGTKYGTASLGGALVTTLIPINTFILMAIFYKKKIQRKDIFALILGGFGVLTILHVWTFNIEQIFSIDNLYFLCGSVLWALVTIVSAKSTKTSPMVFSFYMYVIMTIITSIFFVDFSNINYSSFDSIFWINLFIVSVISTTFATTIYFIGIEKLGANEVSTFIFLVPFFAISLSALFLKENVSLSIIIGTVMTLFAVKILNNIKIIKKRRV >CP032098.1|AXX91689.1|695093_695462_-|transcriptional-regulator,-Fur-family MNVEKLIDNKNFKLTTARKVILEILIDSEKPLCYDDIKSSLSMDKATFYRNITKFEDENIINSFESNDKKRYYEIQNKPHAHFICCKCSNIECIPENIDFNLPKHKIDNIIIKGICPNCLKK >CP032098.1|AXX91690.1|695579_696479_+|metal-ion-ABC-transporter,-periplasmic-metal-binding-protein MKKLLMLFLAFSIVALAKEVTVSIVPQKYFVEKIAKNKISVNVMVRPGFEPATYEPKASQMRKLVSSSVYFSIGVPFEKVWLEKFKNANKNLLIVDTSKSIDKLPMAAHHHHDEHQHHEDEEHESHEHHEHESHEHGSLDPHIWLDPLLVKIQAKSIYETLVKIDSQNKEFYKTNYEEFIKEIDSLYMQIKNILKPVKGKTFMVFHPAWGYFAKRFDLKQMPIEIEGKEPKPSQLANLIEEAKEHNIKVVFVAPEFSQKSAKVIAKSIDGVAVAMSPLKANWSQNLIETAKQIVSSYNK >CP032098.1|AXX91691.1|696475_697924_+|metal-ion-ABC-transporter,-permease-protein MIKRILIFLFIAKSIAFGCALCAIYSPETKVAIDVRSTDTKITSIDIKWVITKQFTDQLKQVYDTNLDNKIDDNELKFVEKALVDYTKYKNYMTHISYGEVINKEKSDKFEVTKHKVKIINGILHFFYTIKVDYDIKNDYSLYIHLNDDENYFVLLLEKNFLNFRNRAKVSKVTDNQSVIFLIQNAHIPKQQIQKDEQPKELEKKEEITTTLKTTKEQKEPTLLTKFVNKVKKYLLEVQKGNNFALLTLLFVSFIYGVIHALGPGHGKTLAFSYFTTNKSSYKKAFIISISSAFVHIIGALILVCISVFILETVLNNFVKDSVKILTQISAVMIMLLAFYILLQKLNNKGCGCSSCSSKKDSISWSNTKNKNLKPNSNINFNKLKKKRSDLYFVLTAGLIPCPGTVILFIYAFILKTYFAVLLASIAISLGMGIVIFASSFLGVSLHKISSKSHKFTYILELISPVIMFILGLLLLFSSNNL >CP032098.1|AXX91692.1|698022_698898_+|EamA/RhaT-family-transporter MFKNLPSIAFWLIGIIWGSNFIYMKWASEYLSASQVVFIRVLFGFIPVLCYALYLKVIKLEHFKYAIHFFIMSLLGTTVYYYFFVKAAALLLSGVNGALSGSIPLFTFILSIIFINEERATFRRFLGIIVGLLGVVLIAKPFDANLLQTNINGVIYIVTGSLVLGMSFVYAKKFLTRLKIHFAALTTYQLGFALLVLVIFTDFTNITNILNNTHVFLGASIGLGLLGTGLAFILYYYLVEKLGAVNASTATYIPPVVALIIGYFFIGENITLVDILATMLIFSGVFLINKK >CP032098.1|AXX91693.1|698913_700251_+|MATE-family-efflux-protein MLTSKPLNVFFKYAIPAVFGLVAISSASIIDGYFVGNYVGPVALASLNMSYPIVTIIIGFAFMFAAGSSVICAKLIGEKNVKEANNIFTKAIIFIVLSSILIVSILLVNLDNIFTLFHAENKLKELTIEYLSILLYFLPIVMTAIVLDYFVRVDERPNLAFFALFFSSVLNIILDYYLIAIKGYGISAAAYATGISQCFIFIILIIYFLLGKSNFSFIAPYGGINTIMKAIKNGSSEFVNEASSGITIIIFNYVMLKNFGTYGVTAFTVIGYFIMASLVVNFAVADSMQPVISKNYGALNFKRIKKILKIAVTFLIFYGIILAFIILSYPNILIELFLEGENKKVIETLTLRFVFYIWPAFLFSGICILITSYFTALHRPMDSIIIAISRSLILPISLIMILPKLLGDIGIFITIPLSEFITFLIASFLFIRLKSDKSFVKLTHN >CP032098.1|AXX91694.1|700296_700959_+|signal-transduction-response-regulator MNAIKILVLESVDSNISQIIKILKDNNFQIKICNDNNEFFECIYNNLYDLYIININQMSLSRFHLIKLLNDFHDMTMKMVITSASNIIVPSFIYGCDECIIKNIDKKEILLRIKALIRRQFHIHTDRILLKKNISYDIFSKKVLKNDEELFLGEKAQLILDYLLKYRGNFVSSSDLESAVYPVSNNCKNGSIRFHIHKIRQLIGNDVIISNRTNGYKIDE >CP032098.1|AXX91695.1|700985_702179_-|putative-membrane-protein MNADILNLLRDPAGLPFYPVVFQGLYILTWALHALFVFLSLGALGLSLYGTLRQKTDKNWSILTPHLIQVGKISVSLLIVLGVAPLLFTQVIYDPNWYTINTLSGLWVVIFIYCLLVGYSMYYWYYYANKANKSSSKLIGAVSFLLLIFAGLLMHSFAVQSIQPEKWMQWYAPNGVVDTSGLNFHVNTIRFLFLISLSITAIGLFLQNYSDFIKSNKAFLESYDNYIKNLGSKITTFAIIINFVLFIAWSFQLGKITDIFSIVICIYLLIFLLLTKNIKNSYISSALFIILLLIISGFREYIKFNIMNNIGYNIYDYPLNIEWTSISMFILTFVSLGGIGVTFICTMAWKVGKNNGYFDATKDKTVTLLANSVLWILSIWCIVYFAWGFFILFKNSL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP032098_4 | 2145884-2150559 | TypeI-B |
III-B:NA
Consensus repeat of CP032098_4
|
71 spacers
spacers of CP032098_4
>4.1|2145941|11|CP032098|PILER-CR TCTTTTTGTAA >4.2|2146009|27|CP032098|PILER-CR GTAAGTTTGCAAGAACTGGAACACAAG >4.3|2145921|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT TAATTTTGTGGTAATAATATTCTTTTTGTAAATC >4.4|2145985|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT GTAAGTTTGCAAGAACTGGAACACAAGAAAGATT >4.5|2146049|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT TAATTTTGTGGTAATAATATTCTTTTTGTAAATC >4.6|2146113|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT GTAAGTTTGCAAGAACTGGAACACAAGAAAGATT >4.7|2146177|36|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCAAGAGCATTAATCCAATCTTCAGTAGCTTTAGGG >4.8|2146243|37|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAAATTCTATCATACATTAACGGAACTCCAAAAAGAT >4.9|2146310|36|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGATTATTATGCAAGTAAAGGCCTTTATCTTATCAA >4.10|2146376|36|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAATAACATATTAGATTCTGCTAAATGCTTATATA >4.11|2146442|35|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAAAGAGTTTGAATCTATGAGCCATGAAATAACT >4.12|2146507|35|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GATGTTGAATCTGTTCCTTTAAAAGTTTTTATAGG >4.13|2146572|36|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTAATTCCTAGTTTAGATAACGCTTTAAGCTCTTCC >4.14|2146638|35|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CATTATTTATCCTTTTCTTTTAATTTGTCTATATT >4.15|2146703|35|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTACAATGAAAAAGAAGAGCAGAAACTTAAAAGCA >4.16|2146768|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTATTGATAGTCAAACTATTCAAGATATCAAAGA >4.17|2146832|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GACAATTTTGAATACTTAAAATACAAATACGAAG >4.18|2146896|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGTAATATCTAGTAAGTTCTAATTCCTTATATTT >4.19|2146960|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGTTAAAGAATTTCACTTGTATCTCTCCGTCTTT >4.20|2147024|36|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGCATTAATTGAAGCACCTTCAATTGTTAGAGGATA >4.21|2147090|36|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCCTTTATAATAAGGCATAACATCTATTGCCAAGCT >4.22|2147156|39|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTAATTTAAACTCTTCTACATACTTATCTAAAGTAAGT >4.23|2147225|36|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR 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cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP032098_4
The CRISPR arrays of CP032098_4 >merge|CP032098|4|2145884-2150559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR 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MSIIKNDYEKMTITKIKKAKNNKKLTMITAYDALFSNLFKDIADFILVGDSLNMSFAGKQDTLSATLEQMIYHTDAVCNGAPDAFVITDMPFGTYNNEKEALENAVKIYQKTNAAAVKIEGGENRAHIVKHLTSNSIAVVGHIGLMPQYVRSEGGYKVRGKTKEDEEQLLKDAIAIEKAGAFCIVVEGVLSNVAKKITELVSVPVIGIGAGNVTDGQVLVWSDMLGFFDAFKPKFVRKYLDGANLVKQAVNQYRNDVQDASFPNNDEEY >CP032098.1|AXX93096.1|2140424_2141165_-|tryptophan-synthase,-alpha-subunit MKKLVGYITASYPENSFTVDLALNMKEAGVDTLELGIPFSDPVADGPVIEKANLLALENNFSLEDLFEVSSKIAPQMDTLWMGYLNPFYHYGMEEFFKKAKDFNIQGEIIPDLPYEEAIAYKELAKKYEQSIISFVAPTHTEERIAKVVKDAQKFIYMVAYAGITGSGKSEDLTQIIKTVKKYSNTPLYIGFGVDEKTCKEKAIGVDGVIVGSAFVKHIVDDSLSYDEKISKITNIAKEIKEKINE >CP032098.1|AXX93095.1|2139684_2140422_-|arginyltransferase MHILNEDLEFVEENRECSYFDNEISDMRYRYINHCTVEDYQNMLEHGWRRFGKMHFVPECKGCTKCISMRIDVKNYKFSKSEKRVISKNNDTKLYIQTPTITKEHLDLYDKYHRFMNEKKQWPYQPITPDDYVRSYVQGKDKFTKEFLYFKDEKLVAVALVDILPKSISAIYCFYDHDYADLSLGKFSILAQIKIAKELDIPYIYLGYWIKNHYSMGYKELYKPFEILKNRASLEEETIWEKYEL >CP032098.1|AXX93094.1|2139482_2139695_-|putative-membrane-protein MSYNIVSIISIVITALLALLFSHYLSLVFFEDANNFRKIVQLIIAIVVMTTFYASIKYILLKYMGINEKE >CP032098.1|AXX93093.1|2139150_2139480_-|hypothetical-protein MKKFVFLIFLLFTSIFAQDKIEDKVDCVILEDENSIICKYNQDRVDFEKKVIFEWIDPDKEISRSREMIIPAQHGSIYDFRYIDGRKKGTWLFRVKDGKKVYETKFEIK >CP032098.1|AXX93092.1|2138733_2139150_+|hypothetical-protein MLNISFALAGQIARNALVGAIATKVVDTFITNKVNNKNDQKKWLRTTKLEAFSKLSQEILSIDLNELKPESIRSIKEYSAKAILLLDDRRLMNQIEDYLTSLINLDKSSEDRSKDLKKILDKKGIDLVMNLNKNLKKL >CP032098.1|AXX93102.1|2150723_2151038_-|CRISPR/Cas-system-associated-endoribonuclease-Cas2,-type-I-B MAKKQTFNYNYIFLFYDIADEFSDIGKYRVAKVFKICKQYLKHHQKSIFRGNITPSDQIMLETKLKKVIDKDLDFISIIKVQNSGSFAEVVIGNDKKESESIFI >CP032098.1|AXX93103.1|2151039_2152044_-|CRISPR/Cas-system-associated-endonuclease-Cas1,-type-I-B MAKNHTRYIFSMGELKRKDNSIAFRNEKGNFYIPIQDTRELYCMNEVSFNTKFLDFISRAGITLHLFNYHGNYSGSFYPKEQLVSGDLTIKQSMCFIEQRLVIAKAIVEAIAANIYETLYHYFRHGKKELKQTLDWLKNDVKKFLCKDLTIEQILFIEGQIWSRFYDSFKYFLPKDFVMNKRVKRPPDNPINALVSFGNTLLYTKTISSIYETHLNQTISFLHSPREGRFSLSLDISEAFKPIVVFKTIFDLVGKKRLQVTKHFDKSLNYALLNEEGKKIFIDAFETRINETFMHKKLKRKTSFKNCIKLDGYKLIKYIVEGKDFKPFLLKEKV >CP032098.1|AXX93104.1|2152052_2152547_-|CRISPR/Cas-system-associated-RecB-like-nuclease-Cas4,-type-I-B MKINGTLISYFFICKTKLWLHANRINLEDNSEDVRIGKILHEINEEKSKKSEISIDNIKIDKLTRDYLVEIKKSDSDPEAVKWQVLLYLYKLKQKGVERKGKIEFIEKNRQDKKVHYIELDEVNEKELLDILKRIETIINQDTPPQAKFENKCKKCAYYEYCFI >CP032098.1|AXX93105.1|2152543_2153356_-|BRO-domain-containing-protein MDKIQLFKSKQIRSHWDENSELWYFSIVDVIEVLVKTDRPRKYWSDIKSKLKKEGSELSEEIGHLKMKASDGKMRLTDVATTEQLLRLIQSIPSPQVEPFKMWLAKVGYERIESIQDPEKSIDAALRDYIKLGYSEKWINQRLKSIEVRKELTDEWKQRGVEEGKEFALLTDIISKAWSGNTTKEYKKLKNLKKENLRDNMTNLELVLNMLAEATTTEISKEKKPEGLDESKKIAKEGGTIAGDTRKAIEEKTGKKVVTNQNAKDLLENK >CP032098.1|AXX93106.1|2153367_2155569_-|CRISPR/Cas-system-associated-endonuclease/helicase-Cas3,-type-I-B MEILAKKIIEDEQIKTQTLQEHTSWVTEEALKLIDDKSLSKISMISGWEEEKILDLIFFSCYFHDIGKATIEFQNTINNGTNSYHSLYSVSVLNQINEFNISGEEDSTINLLLTLCLTHHTLLPYNSNNAYFTFLDSVERVFFNYKDSYKNYLNKECIYDFDFEIEEDIEDILFDIEDDLKYIKENHKLRTLYTYCSGILNFADWLASARFNKSLPKTYFEKLPTKENFKGKLPFDTLRDFQKDLSILSKSVLVEIPTGEGKTEGSLLWAIKNLYDKNSKIIYTLPTQVTSNKLYERVTSLFDKNECGLIHSSSKLYLEKDYEKEHGLVDDFFKSEITFNKNFSKPVTVSTVDSLLKFFINIGRFNIATKNYLNSVVIIDEVHCYDFKLMGFLKRFLELCNEFDVKVCLMSASIPKKIKELLGIENYPIITEKKLFKKKANEIIKMDEELDENFDLIIKKFKENKNILIIRNSVKSATDTYKKLRDDYDIDEDDLILYHSTFKKRDKNQKEKDIFDKLDTKKPFILIATQIVEISLNIDFDVMFTDNAPIDSLIQRFGRVNRKKDETKKGEIYIFKYEKEFPYKSKYLLSTTFDTIKNGYFELGEYVKWLNTVYDKVFENDIKINNEVDSLFKQGYKKYDDVLKELDGIKKSKDNYDLRHIEQSKVDYLLIDDFLDDKIDSKKFHEYTISLPNYYEKKYSYSLQKESFYKVLDLKYNYREGLLIDDNKSCEFM >CP032098.1|AXX93107.1|2155568_2156288_-|CRISPR/Cas-system-associated-RAMP-protein-Cas5,-type-I-B MKVIRFEIQGLINSYRIPFFRTYHKSFLAPPKTTIIGMLCNISLKSQKEFFEILDKEVFEVSVVINEIKGRAKDLWSYKTLEKKNMGKSVVRRDKLFSPKYTIYLKIKDEKLYNEILENLKLPKNTPSLGMDDELIEIKNIKTLEMEEHDTNKINSIFLDKNISYKAYVKDLSKSIELPTINLAPTKFIAFDKKNRRIPKESNKDFEFSQVEYLNCEIEFSQDIENFVDDELNNKVMFY >CP032098.1|AXX93108.1|2156287_2157211_-|CRISPR/Cas-system-associated-RAMP-protein-Cas7,-type-I-B MFLNIAYITKVNLASLNGSEGTGGNITEMKKIASSNGEEYAYVSGQALRRYFKETLLQLGQRITEVSENGNPTFRDENGKYIDLDKNLKDVKELAYKKFIDLDLFGYMFPNGGRRWSPVKVTPLISIHPYKGEYDYLTRKQKPKKENEKSGNIVQIEIDTLNFMRGNIMVNTSHIGNEIDEYTYDVNEILDNEEKNTRLNIFLDAIKNFNGGAKQSRNLEDISPKFIVIATQKTGNPFLLNSLDVDIEGNINIENIKEAIEDNDVQSLTIGISKGIFKNEEEIKNSFENVVSVAKAIEEYKDILKSK >CP032098.1|AXX93109.1|2157220_2158906_-|hypothetical-protein MIRKFTVKDVFFNNGLINLYQFLQEYAFDIDIKLEKSFLELKYKDEKIFFEILNKFLEEKEIVTFNKKNTRIFFDTNTNEFTQSAKVNIKNGGSNDSKNALIRVHIDNLSISKEELLKKEEKYIQENENYTKDEYKIEKCYYDKSKQEIYVLSSLQEHIEKFSSYLVKDDFLALNSSIHNFEDGQKSFHDMIKISKNYNIDKWEALIYWFGTKIQHYFNFAFFIYPNSSNLEALNIFKRDLKIRDEKNSFRDEDDNLITTNTNVNFYDQLRKDKIFGKKFKNFYISKSDVEFELKFFMYLFSKISHIESSYEKALDKDKMTKRKEKIFNALQEITFVVYVEDGTFKKSLSEYTKTYQFIQFLEELKKTKINIQKEQESNLFVYLADMIVTFGLSQSSKEININFQKWCKAFLEFKSLRKYYYVTSFNILKNESKSFGKDLYEFEKNYLKNIMKGKNMSTHEKSKILGESIGYFCAELGDKDLLFKLRNVKNYKQLLSYFKDLKFVSLKYEHKARFSKEFNESLEEVINILETDWEIIRDYIAIYAIDKFKATNYAKSQQNK >CP032098.1|AXX93110.1|2159188_2159923_-|CRISPR/Cas-system-associated-RAMP-protein-Cas6,-type-I-B MKYFELKCTSYIKKNIELNNSFDILSSYINFSFTKDENLKKLHEKNDFKNYCFGNFYPIEKDKIYKSGNTYEFIIRSLDEESIYTLQRILRENINNSYLQVLQATKKEVKQFFISELYTITPTITTVKDENNKSIFWTVPKDGDILKLQEQLQNNLLKKYENFYNEKLEPTQNFIQLLEIKNQKPQSIFFTKKSDEKQIKVRLFGNKFKIVPNEDEVSQKLAFVALGCGLGEKQSYGGGFCLWK >CP032098.1|AXX93111.1|2160007_2160676_-|leucyl,-phenylalanyl-tRNA-protein-transferase MQIPPLTDDVYTFPNPRLACNEGILAYGGDLTPARLISAYANGIFPWYNEDEPILWWSPNPRLVMELDEFKLSKSLAKTIKKNKFEIKFDTNFTQVMIECKNMFRPDQDGTWLQDELIEAYTNLHNLGYAHSFESYYDGQLVGGGYGLVIGDMFCGESMFAKKSDASKVALYYLVQRLKKNGFSLLDCQTPTNHLQSLGAKCISRDEFLNRLSIAIENFPKF |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP032098_4 | 4.3|2145921|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT | 2145921-2145954 | 34 | CP032098.1 | 1225053-1225086 | 1 | 0.971 |
CP032098_4 | 4.5|2146049|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT | 2146049-2146082 | 34 | CP032098.1 | 1225053-1225086 | 1 | 0.971 |
1. spacer 4.3|2145921|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 1225053-1225086, mismatch: 1, identity: 0.971
taattttgtggtaataatattctttttgtaaatc CRISPR spacer taattttgtggtaataatattctttttgtaagtc Protospacer *******************************.**
2. spacer 4.5|2146049|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 1225053-1225086, mismatch: 1, identity: 0.971
taattttgtggtaataatattctttttgtaaatc CRISPR spacer taattttgtggtaataatattctttttgtaagtc Protospacer *******************************.**
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP032098_4 | 4.14|2146638|35|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2146638-2146672 | 35 | MH356730 | Staphylococcus phage VB-SauS-SA2, complete genome | 89005-89039 | 4 | 0.886 |
CP032098_4 | 4.14|2146638|35|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2146638-2146672 | 35 | JX194239 | Staphylococcus phage SA11, complete genome | 125051-125085 | 5 | 0.857 |
CP032098_4 | 4.14|2146638|35|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2146638-2146672 | 35 | MT080584 | UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW15, complete genome | 34770-34804 | 5 | 0.857 |
CP032098_4 | 4.14|2146638|35|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2146638-2146672 | 35 | MT080590 | UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW27, complete genome | 101097-101131 | 5 | 0.857 |
CP032098_4 | 4.14|2146638|35|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2146638-2146672 | 35 | KX532239 | Staphylococcus phage StAP1, complete genome | 9927-9961 | 5 | 0.857 |
CP032098_4 | 4.14|2146638|35|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2146638-2146672 | 35 | LC492751 | Staphylococcus phage KSAP7 genomic DNA, compelete genome | 134299-134333 | 5 | 0.857 |
CP032098_4 | 4.14|2146638|35|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2146638-2146672 | 35 | LC492752 | Staphylococcus phage KSAP11 genomic DNA, compelete genome | 134656-134690 | 5 | 0.857 |
CP032098_4 | 4.14|2146638|35|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2146638-2146672 | 35 | MT080587 | UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW20, complete genome | 29059-29093 | 5 | 0.857 |
CP032098_4 | 4.14|2146638|35|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2146638-2146672 | 35 | NC_022090 | Staphylococcus phage vB_SauM_Remus, complete genome | 130993-131027 | 5 | 0.857 |
CP032098_4 | 4.14|2146638|35|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2146638-2146672 | 35 | MT080588 | UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW22, complete genome | 5246-5280 | 5 | 0.857 |
CP032098_4 | 4.14|2146638|35|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2146638-2146672 | 35 | NC_020877 | Staphylococcus phage vB_SauM_Romulus, complete genome | 127682-127716 | 5 | 0.857 |
CP032098_4 | 4.14|2146638|35|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2146638-2146672 | 35 | MN692974 | Marine virus AFVG_117M89, complete genome | 37804-37838 | 5 | 0.857 |
CP032098_4 | 4.3|2145921|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT | 2145921-2145954 | 34 | NC_009930 | Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB5, complete sequence | 17638-17671 | 7 | 0.794 |
CP032098_4 | 4.5|2146049|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT | 2146049-2146082 | 34 | NC_009930 | Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB5, complete sequence | 17638-17671 | 7 | 0.794 |
CP032098_4 | 4.16|2146768|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2146768-2146801 | 34 | MF547663 | Clostridioides phage LIBA2945, complete genome | 110011-110044 | 7 | 0.794 |
CP032098_4 | 4.16|2146768|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2146768-2146801 | 34 | CP011970 | Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence | 108817-108850 | 7 | 0.794 |
CP032098_4 | 4.16|2146768|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2146768-2146801 | 34 | LN681537 | Clostridium phage phiCD211, complete genome | 117679-117712 | 7 | 0.794 |
CP032098_4 | 4.16|2146768|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2146768-2146801 | 34 | NZ_CP020426 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence | 13150-13183 | 7 | 0.794 |
CP032098_4 | 4.50|2148993|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2148993-2149026 | 34 | NZ_LR217736 | Candidatus Erwinia haradaeae strain ErCisplendens isolate 3004 plasmid pBioThi | 4238-4271 | 7 | 0.794 |
CP032098_4 | 4.50|2148993|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2148993-2149026 | 34 | NC_022778 | Clostridium tetani 12124569 plasmid p12124569, complete sequence | 16895-16928 | 7 | 0.794 |
CP032098_4 | 4.54|2149255|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2149255-2149288 | 34 | NZ_LR217736 | Candidatus Erwinia haradaeae strain ErCisplendens isolate 3004 plasmid pBioThi | 4238-4271 | 7 | 0.794 |
CP032098_4 | 4.54|2149255|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2149255-2149288 | 34 | NC_022778 | Clostridium tetani 12124569 plasmid p12124569, complete sequence | 16895-16928 | 7 | 0.794 |
CP032098_4 | 4.72|2150431|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2150431-2150464 | 34 | NZ_CP026270 | Klebsiella oxytoca strain KONIH4 plasmid unnamed, complete sequence | 3756-3789 | 7 | 0.794 |
CP032098_2 | 2.10|691712|34|CP032098|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 691712-691745 | 34 | NZ_CP022605 | Ochrobactrum quorumnocens strain A44 plasmid unnamed1, complete sequence | 472233-472266 | 8 | 0.765 |
CP032098_4 | 4.26|2147420|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2147420-2147453 | 34 | MN694619 | Marine virus AFVG_250M660, complete genome | 54154-54187 | 8 | 0.765 |
CP032098_4 | 4.26|2147420|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2147420-2147453 | 34 | MN693646 | Marine virus AFVG_250M659, complete genome | 54141-54174 | 8 | 0.765 |
CP032098_4 | 4.26|2147420|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2147420-2147453 | 34 | MN694157 | Marine virus AFVG_250M658, complete genome | 54140-54173 | 8 | 0.765 |
CP032098_4 | 4.27|2147484|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2147484-2147517 | 34 | MN694619 | Marine virus AFVG_250M660, complete genome | 54154-54187 | 8 | 0.765 |
CP032098_4 | 4.27|2147484|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2147484-2147517 | 34 | MN693646 | Marine virus AFVG_250M659, complete genome | 54141-54174 | 8 | 0.765 |
CP032098_4 | 4.27|2147484|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2147484-2147517 | 34 | MN694157 | Marine virus AFVG_250M658, complete genome | 54140-54173 | 8 | 0.765 |
CP032098_4 | 4.50|2148993|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2148993-2149026 | 34 | CP037991 | Bacillus mycoides strain TH26 plasmid unnamed1, complete sequence | 363007-363040 | 8 | 0.765 |
CP032098_4 | 4.50|2148993|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2148993-2149026 | 34 | NC_009795 | Campylobacter concisus 13826 plasmid pCCON31, complete sequence | 26679-26712 | 8 | 0.765 |
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CP032098_4 | 4.54|2149255|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2149255-2149288 | 34 | NZ_CP040341 | Bacillus cereus strain DLOU-Tangshan plasmid unnamed1, complete sequence | 158372-158405 | 9 | 0.735 |
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CP032098_2 | 2.10|691712|34|CP032098|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 691712-691745 | 34 | NZ_CP053950 | Bacillus cereus strain FDAARGOS_799 plasmid unnamed2, complete sequence | 156205-156238 | 10 | 0.706 |
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CP032098_4 | 4.19|2146960|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2146960-2146993 | 34 | MF775691 | Lactococcus phage LP0109, complete genome | 19793-19826 | 10 | 0.706 |
CP032098_4 | 4.19|2146960|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2146960-2146993 | 34 | MF775689 | Lactococcus phage LP0004c, complete genome | 20230-20263 | 10 | 0.706 |
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CP032098_4 | 4.50|2148993|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2148993-2149026 | 34 | MN694077 | Marine virus AFVG_250M852, complete genome | 31981-32014 | 10 | 0.706 |
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CP032098_4 | 4.54|2149255|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2149255-2149288 | 34 | MN694758 | Marine virus AFVG_250M853, complete genome | 31976-32009 | 10 | 0.706 |
CP032098_4 | 4.54|2149255|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2149255-2149288 | 34 | MN694077 | Marine virus AFVG_250M852, complete genome | 31981-32014 | 10 | 0.706 |
CP032098_4 | 4.12|2146507|35|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2146507-2146541 | 35 | MF351863 | Synechococcus phage Bellamy, complete genome | 79043-79077 | 11 | 0.686 |
CP032098_4 | 4.30|2147678|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2147678-2147711 | 34 | NC_022879 | Enterococcus mundtii QU 25 plasmid pQY182, complete sequence | 92609-92642 | 12 | 0.647 |
CP032098_4 | 4.30|2147678|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2147678-2147711 | 34 | NC_022879 | Enterococcus mundtii QU 25 plasmid pQY182, complete sequence | 178302-178335 | 12 | 0.647 |
CP032098_4 | 4.50|2148993|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2148993-2149026 | 34 | NZ_LR214986 | Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13 | 3305-3338 | 12 | 0.647 |
CP032098_4 | 4.54|2149255|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2149255-2149288 | 34 | NZ_LR214986 | Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13 | 3305-3338 | 12 | 0.647 |
1. spacer 4.14|2146638|35|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH356730 (Staphylococcus phage VB-SauS-SA2, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.886
cattatttatccttttcttttaatttgtctatatt CRISPR spacer tcctatttatccttttcttttaatctgtctatatt Protospacer . .*********************.**********
2. spacer 4.14|2146638|35|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JX194239 (Staphylococcus phage SA11, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.857
cattatttatccttttcttttaatttg-tctatatt CRISPR spacer gattatcaatccttttcttttaatttgttttatat- Protospacer *****. ******************* *.*****
3. spacer 4.14|2146638|35|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT080584 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW15, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.857
cattatttatccttttcttttaatttg-tctatatt CRISPR spacer gattatcaatccttttcttttaatttgttttatat- Protospacer *****. ******************* *.*****
4. spacer 4.14|2146638|35|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT080590 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW27, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.857
cattatttatccttttcttttaatttg-tctatatt CRISPR spacer gattatcaatccttttcttttaatttgttttatat- Protospacer *****. ******************* *.*****
5. spacer 4.14|2146638|35|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KX532239 (Staphylococcus phage StAP1, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.857
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6. spacer 4.14|2146638|35|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LC492751 (Staphylococcus phage KSAP7 genomic DNA, compelete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.857
cattatttatccttttcttttaatttg-tctatatt CRISPR spacer gattatcaatccttttcttttaatttgttttatat- Protospacer *****. ******************* *.*****
7. spacer 4.14|2146638|35|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LC492752 (Staphylococcus phage KSAP11 genomic DNA, compelete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.857
cattatttatccttttcttttaatttg-tctatatt CRISPR spacer gattatcaatccttttcttttaatttgttttatat- Protospacer *****. ******************* *.*****
8. spacer 4.14|2146638|35|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT080587 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW20, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.857
cattatttatccttttcttttaatttg-tctatatt CRISPR spacer gattatcaatccttttcttttaatttgttttatat- Protospacer *****. ******************* *.*****
9. spacer 4.14|2146638|35|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_022090 (Staphylococcus phage vB_SauM_Remus, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.857
cattatttatccttttcttttaatttg-tctatatt CRISPR spacer gattatcaatccttttcttttaatttgttttatat- Protospacer *****. ******************* *.*****
10. spacer 4.14|2146638|35|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT080588 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW22, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.857
cattatttatccttttcttttaatttg-tctatatt CRISPR spacer gattatcaatccttttcttttaatttgttttatat- Protospacer *****. ******************* *.*****
11. spacer 4.14|2146638|35|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_020877 (Staphylococcus phage vB_SauM_Romulus, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.857
cattatttatccttttcttttaatttg-tctatatt CRISPR spacer gattatcaatccttttcttttaatttgttttatat- Protospacer *****. ******************* *.*****
12. spacer 4.14|2146638|35|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN692974 (Marine virus AFVG_117M89, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.857
cattatttatccttttcttttaatt--tgtctatatt CRISPR spacer cattatttattcctttcttttaattcctgtctaaa-- Protospacer **********.*.************ ****** *
13. spacer 4.3|2145921|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009930 (Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB5, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
taatt--ttgtggtaataatattctttttgtaaatc CRISPR spacer --attgatggtggtaataatattattattgtaaacg Protospacer *** * ************** ** *******.
14. spacer 4.5|2146049|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009930 (Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB5, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
taatt--ttgtggtaataatattctttttgtaaatc CRISPR spacer --attgatggtggtaataatattattattgtaaacg Protospacer *** * ************** ** *******.
15. spacer 4.16|2146768|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
ttattgatagtcaaactattcaagatatcaaaga CRISPR spacer atcttcatagtcaaactattcaagctatatcaga Protospacer * ** ****************** *** ***
16. spacer 4.16|2146768|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP011970 (Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
ttattgatagtcaaactattcaagatatcaaaga CRISPR spacer atcttcatagtcaaactattcaagctatatcaga Protospacer * ** ****************** *** ***
17. spacer 4.16|2146768|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LN681537 (Clostridium phage phiCD211, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
ttattgatagtcaaactattcaagatatcaaaga CRISPR spacer atcttcatagtcaaactattcaagctatatcaga Protospacer * ** ****************** *** ***
18. spacer 4.16|2146768|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP020426 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
ttattgatagtcaaactattcaagatatcaaaga CRISPR spacer atcttcatagtcaaactattcaagctatatcaga Protospacer * ** ****************** *** ***
19. spacer 4.50|2148993|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_LR217736 (Candidatus Erwinia haradaeae strain ErCisplendens isolate 3004 plasmid pBioThi) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tttttttattttcaaatatttaaag-atgatgttc CRISPR spacer tttttttattttaaaataattaaagtataacgac- Protospacer ************ ***** ****** **.*.* .
20. spacer 4.50|2148993|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_022778 (Clostridium tetani 12124569 plasmid p12124569, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer tttttttattttcaaacattttaactttataatc Protospacer ****************.**** ** * **. **
21. spacer 4.54|2149255|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_LR217736 (Candidatus Erwinia haradaeae strain ErCisplendens isolate 3004 plasmid pBioThi) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tttttttattttcaaatatttaaag-atgatgttc CRISPR spacer tttttttattttaaaataattaaagtataacgac- Protospacer ************ ***** ****** **.*.* .
22. spacer 4.54|2149255|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_022778 (Clostridium tetani 12124569 plasmid p12124569, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer tttttttattttcaaacattttaactttataatc Protospacer ****************.**** ** * **. **
23. spacer 4.72|2150431|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP026270 (Klebsiella oxytoca strain KONIH4 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
-gttacttgtttagcatagtttctaaataattcat CRISPR spacer agata-ttgtttagcttagtttctaaatcatctac Protospacer * ** ********* ************ **..*.
24. spacer 2.10|691712|34|CP032098|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022605 (Ochrobactrum quorumnocens strain A44 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
caaaggtatcttttaactttaaaaggtgaagaag CRISPR spacer cagtgctattttttaaatttaaaaggtgaattat Protospacer **. * ***.****** ************* *
25. spacer 4.26|2147420|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694619 (Marine virus AFVG_250M660, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tgatactattaattataaagaagatgactataat- CRISPR spacer tgatactattaattataataaaga-aaggaaagta Protospacer ****************** .**** .* * *.*
26. spacer 4.26|2147420|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693646 (Marine virus AFVG_250M659, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tgatactattaattataaagaagatgactataat- CRISPR spacer tgatactattaattataataaaga-aaggaaagta Protospacer ****************** .**** .* * *.*
27. spacer 4.26|2147420|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694157 (Marine virus AFVG_250M658, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tgatactattaattataaagaagatgactataat- CRISPR spacer tgatactattaattataataaaga-aaggaaagta Protospacer ****************** .**** .* * *.*
28. spacer 4.27|2147484|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694619 (Marine virus AFVG_250M660, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tgatactattaattataaagaagatgactataat- CRISPR spacer tgatactattaattataataaaga-aaggaaagta Protospacer ****************** .**** .* * *.*
29. spacer 4.27|2147484|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693646 (Marine virus AFVG_250M659, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tgatactattaattataaagaagatgactataat- CRISPR spacer tgatactattaattataataaaga-aaggaaagta Protospacer ****************** .**** .* * *.*
30. spacer 4.27|2147484|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694157 (Marine virus AFVG_250M658, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tgatactattaattataaagaagatgactataat- CRISPR spacer tgatactattaattataataaaga-aaggaaagta Protospacer ****************** .**** .* * *.*
31. spacer 4.50|2148993|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP037991 (Bacillus mycoides strain TH26 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer tttttttattttcatatatctaaagataaaaaga Protospacer ************** ****.*******.* .
32. spacer 4.50|2148993|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_009795 (Campylobacter concisus 13826 plasmid pCCON31, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc-- CRISPR spacer tttttttattttctaatattcaa--ataattgtaaa Protospacer ************* ******.** **.** *
33. spacer 4.54|2149255|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP037991 (Bacillus mycoides strain TH26 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer tttttttattttcatatatctaaagataaaaaga Protospacer ************** ****.*******.* .
34. spacer 4.54|2149255|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_009795 (Campylobacter concisus 13826 plasmid pCCON31, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc-- CRISPR spacer tttttttattttctaatattcaa--ataattgtaaa Protospacer ************* ******.** **.** *
35. spacer 4.16|2146768|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693329 (Marine virus AFVG_25M470, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ttattgatagtcaaactattcaagatatcaaaga CRISPR spacer tctttgatcgtcaaacaattcaagatatcgtttg Protospacer *. ***** ******* ************. .
36. spacer 4.16|2146768|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693598 (Marine virus AFVG_25M403, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ttattgatagtcaaactattcaagatatcaaaga CRISPR spacer atttttcaagtcaaactgttcaagacatcaaatg Protospacer * ** *********.*******.****** .
37. spacer 4.17|2146832|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP002962 (Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL01, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gacaattttgaatacttaaaatacaaatacgaag CRISPR spacer gattcttttgaatacttataataaaaatattgat Protospacer **. ************* **** *****. .*
38. spacer 4.30|2147678|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP011146 (Bacillus cereus strain FORC_013 plasmid pFORC13, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
taagttcaactgaaacaataacattagatggctt CRISPR spacer gtaaaagaacagaaacaatcacattagatggcat Protospacer *. *** ******** ************ *
39. spacer 4.30|2147678|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH616728 (Myoviridae sp. isolate ctge_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
taagttcaactgaaacaataacattagatggctt CRISPR spacer actgttcatctaaaacaataacattagaatcttt Protospacer ***** **.**************** .**
40. spacer 4.50|2148993|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP011152 (Bacillus cereus strain CMCC P0021 plasmid pRML04, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer aatttttattttcaaatatctaatgatgaaaaga Protospacer *****************.*** ***** .
41. spacer 4.50|2148993|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP011154 (Bacillus cereus strain CMCC P0011 plasmid pRML05, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer aatttttattttcaaatatctaatgatgaaaaga Protospacer *****************.*** ***** .
42. spacer 4.50|2148993|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693129 (Marine virus AFVG_25M62, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer agctcagattttcaaatatttcaagttgatgttg Protospacer .*. ************** *** *******
43. spacer 4.50|2148993|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH937494 (Streptococcus phage CHPC1042, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer attttttaatttcaaatatttaatgagacttatg Protospacer ******* ************** ** . * *
44. spacer 4.50|2148993|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KJ776585 (Clostridium botulinum strain DB2 plasmid pDB2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer tttttttatttttaaatttttaaataaacatttt Protospacer ************.**** ****** * . **.
45. spacer 4.50|2148993|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KJ776583 (Clostridium botulinum strain KapchunkaB3 plasmid pKAPB3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer tttttttatttttaaatttttaaataaacatttt Protospacer ************.**** ****** * . **.
46. spacer 4.50|2148993|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KJ776576 (Clostridium botulinum strain Eklund2B plasmid pEklund2B, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer tttttttatttttaaatttttaaataaacatttt Protospacer ************.**** ****** * . **.
47. spacer 4.50|2148993|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KJ776579 (Clostridium botulinum strain KapchunkaB2 plasmid pKAPB2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer tttttttatttttaaatttttaaataaacatttt Protospacer ************.**** ****** * . **.
48. spacer 4.50|2148993|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_018653 (Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid p17BNRP, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer tttttttatttttaaatttttaaataaacatttt Protospacer ************.**** ****** * . **.
49. spacer 4.50|2148993|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_010680 (Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid pCLL, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer tttttttatttttaaatttttaaataaacatttt Protospacer ************.**** ****** * . **.
50. spacer 4.50|2148993|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP042928 (Bacillus cereus strain G1-1 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer ttttagtattttcaaatatttaaattatatatat Protospacer **** ****************** **.* .
51. spacer 4.50|2148993|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP040343 (Bacillus cereus strain DLOU-Weihai plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer ttttagtattttcaaatatttaaattatatataa Protospacer **** ****************** **.*
52. spacer 4.50|2148993|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP040341 (Bacillus cereus strain DLOU-Tangshan plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer ttttagtattttcaaatatttaaattatatatat Protospacer **** ****************** **.* .
53. spacer 4.54|2149255|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP011152 (Bacillus cereus strain CMCC P0021 plasmid pRML04, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer aatttttattttcaaatatctaatgatgaaaaga Protospacer *****************.*** ***** .
54. spacer 4.54|2149255|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP011154 (Bacillus cereus strain CMCC P0011 plasmid pRML05, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer aatttttattttcaaatatctaatgatgaaaaga Protospacer *****************.*** ***** .
55. spacer 4.54|2149255|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693129 (Marine virus AFVG_25M62, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer agctcagattttcaaatatttcaagttgatgttg Protospacer .*. ************** *** *******
56. spacer 4.54|2149255|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH937494 (Streptococcus phage CHPC1042, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer attttttaatttcaaatatttaatgagacttatg Protospacer ******* ************** ** . * *
57. spacer 4.54|2149255|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KJ776585 (Clostridium botulinum strain DB2 plasmid pDB2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer tttttttatttttaaatttttaaataaacatttt Protospacer ************.**** ****** * . **.
58. spacer 4.54|2149255|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KJ776583 (Clostridium botulinum strain KapchunkaB3 plasmid pKAPB3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer tttttttatttttaaatttttaaataaacatttt Protospacer ************.**** ****** * . **.
59. spacer 4.54|2149255|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KJ776576 (Clostridium botulinum strain Eklund2B plasmid pEklund2B, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer tttttttatttttaaatttttaaataaacatttt Protospacer ************.**** ****** * . **.
60. spacer 4.54|2149255|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KJ776579 (Clostridium botulinum strain KapchunkaB2 plasmid pKAPB2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer tttttttatttttaaatttttaaataaacatttt Protospacer ************.**** ****** * . **.
61. spacer 4.54|2149255|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_018653 (Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid p17BNRP, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer tttttttatttttaaatttttaaataaacatttt Protospacer ************.**** ****** * . **.
62. spacer 4.54|2149255|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_010680 (Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid pCLL, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer tttttttatttttaaatttttaaataaacatttt Protospacer ************.**** ****** * . **.
63. spacer 4.54|2149255|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP042928 (Bacillus cereus strain G1-1 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer ttttagtattttcaaatatttaaattatatatat Protospacer **** ****************** **.* .
64. spacer 4.54|2149255|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP040343 (Bacillus cereus strain DLOU-Weihai plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer ttttagtattttcaaatatttaaattatatataa Protospacer **** ****************** **.*
65. spacer 4.54|2149255|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP040341 (Bacillus cereus strain DLOU-Tangshan plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer ttttagtattttcaaatatttaaattatatatat Protospacer **** ****************** **.* .
66. spacer 2.10|691712|34|CP032098|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053953 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_798 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
--------caaaggtatcttttaactttaaaaggtgaagaag CRISPR spacer gactctgcca--------ttttaaatttaaaaggtggagaag Protospacer ** ****** ***********.*****
67. spacer 2.10|691712|34|CP032098|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053950 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_799 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
--------caaaggtatcttttaactttaaaaggtgaagaag CRISPR spacer gactctgcca--------ttttaaatttaaaaggtggagaag Protospacer ** ****** ***********.*****
68. spacer 2.11|691776|34|CP032098|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MW084976 (Bacillus phage Kirov, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttttcactttgaataatgctactaataattttcg CRISPR spacer atccttctttgaataatgctacagataattcttt Protospacer *... **************** .******.*.
69. spacer 4.19|2146960|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF775688 (Lactococcus phage LP0004b, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
cgttaaagaatttcacttgtatctctccgtcttt CRISPR spacer tgttaaataatttcatttgtatctccttaatttc Protospacer .****** *******.*********.... .**.
70. spacer 4.19|2146960|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF775691 (Lactococcus phage LP0109, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
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71. spacer 4.19|2146960|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF775689 (Lactococcus phage LP0004c, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
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72. spacer 4.30|2147678|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP044979 (Bacillus thuringiensis strain BT62 plasmid pBT62A, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
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73. spacer 4.30|2147678|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_AP014865 (Bacillus thuringiensis serovar tolworthi strain Pasteur Institute Standard strain plasmid pKK1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
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74. spacer 4.30|2147678|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP042875 (Bacillus cereus strain 09 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
taagttcaactgaaacaataacattagatggctt CRISPR spacer gtaaaagaacagaaacaatcacattagatggaat Protospacer *. *** ******** *********** *
75. spacer 4.30|2147678|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP011154 (Bacillus cereus strain CMCC P0011 plasmid pRML05, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
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76. spacer 4.30|2147678|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP011152 (Bacillus cereus strain CMCC P0021 plasmid pRML04, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
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77. spacer 4.30|2147678|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK721200 (Enterococcus phage vB_EfaS_Ef5.3, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
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78. spacer 4.30|2147678|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KX284704 (Enterococcus phage SANTOR1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
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79. spacer 4.50|2148993|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693487 (Marine virus AFVG_25M100, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
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80. spacer 4.50|2148993|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694758 (Marine virus AFVG_250M853, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
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81. spacer 4.50|2148993|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694077 (Marine virus AFVG_250M852, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
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82. spacer 4.54|2149255|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693487 (Marine virus AFVG_25M100, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
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83. spacer 4.54|2149255|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694758 (Marine virus AFVG_250M853, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
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84. spacer 4.54|2149255|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694077 (Marine virus AFVG_250M852, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
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85. spacer 4.12|2146507|35|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF351863 (Synechococcus phage Bellamy, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
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86. spacer 4.30|2147678|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_022879 (Enterococcus mundtii QU 25 plasmid pQY182, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.647
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87. spacer 4.30|2147678|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_022879 (Enterococcus mundtii QU 25 plasmid pQY182, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.647
taagttcaactgaaacaataacattagatggctt CRISPR spacer aggaaggaactgaaacaatcacattatatggtgg Protospacer ... ************ ****** ****.
88. spacer 4.50|2148993|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_LR214986 (Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13) position: , mismatch: 12, identity: 0.647
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89. spacer 4.54|2149255|34|CP032098|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_LR214986 (Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13) position: , mismatch: 12, identity: 0.647
tttttttattttcaaatatttaaagatgatgttc CRISPR spacer ccaaattattttcaaccatttaaagatgaaagca Protospacer .. ********** .************ . .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
28726 : 37991
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP032098|28726:37991|DBSCAN-SWA AATGAAAAAAATATTTTTAGTAGTTTTTATTTTCATCTCTCTTTTATTTTTATTGATTTTTACTACAAATCAATCAAATAGAAAAATAGATAATTTTTTTAAAATACAAAAAAATATATCTCATCTTATCTATACAAATAAGAATTTCGATATTTTTATGTCAAGTAGTATTTCCTATAATAATTTTGATGTTATTCAAAAAGATATTTTTAAAATAAAAGATATTTTAAGACAGATGAGTAATAATGATTTTTTTAATACACAATTAAGCATATTAAGAAAAGATTTTGATGAAATAAGGAATCTTTTCAATCAAAAAATGCAAAATATTGAAAGATTAAAATCTACAAGTGCAGTTTTAAATAACTCATATAGATATATTCAAACTATTTATGAAAAAGTATCAAATAAAAAGTTCAATAGTATATATGCAAGGCTAATAGGCTTAGAATACAATAGTGAATTAAGTATTAAGAAATTAGAAAATGATATAAACATTTTAAAAACAAATACAAATCAAGAGAAGATATTTATTAAGCATGCAAAAAATATACTGCATTATTATAAAAGATTTGATGAATTAAAAAATAGAATTAACTCATTAAATATAGATATAAAATTAGAAAGTTTTGAACAAAAATATAATAACTCATCAGATATTTTTATAAGAGATATTAAATTTGTATTATGGAATGTTATTATTTTATTAAGTATTAGTTTATTGGTTTTTTTATATTACTATTCAAGAATTGCTTATCAAAAAATACAATTAAATAGATTTAAATTAGCAGTTGAGAATAGTGATAATATCATTATGACAACAGATTATAATAAAAAAATTAAATATGTAAATGATAACTTTATTAAACATAGTGGATATACATATAAAGAACTTATTGGACAAAAAGCGTCAATTTTAAAATCAGGACTTAATAGTAAAAATTTTTATAAAGAGTTAAACGATACTATTTATAGTGGAAATAGATGGTTTGGTGAGTTTATAAATAAAAGAAAAGATGGACAATTAAGTTATGAAAAAGCATCAATCTCTCCTATTTTTGATGAAAATGGTAAGATTATTGAATTTTTGGCAATTAAACTTGATATTACAAAAGAAAGAACAATAGAAAAGGATTTGAAAAATAAAGAGCATATTTTGATGCAACAAGCAAAAATGGTAGCTTTGCATGAAATGCTTGATAGTATATCTCATCAATGGAGACAACCTTTATCTTCTATTTCAACTGCGGCTAGTGGTATGAAATTAAATAAAGAGTTTAATTCATTGGATGATGAAACGTTTAATAAGCTAATAGATTCAATTGTAGAAAATTCATTGTATTTATCAAAAACTATTGATAATTTTAAAAGCTTTTTTAAAACAAACAGTGAAAATGTATTGTTTAATATAAAAAATACAGTAAATAAAGTTTTTAATCTTATGAGTTATAAGTTCAATGAAAATAAAATAGAGTGCATAATAAATGTAATTGATAAAAATATTGAAGGTTTAGAGCATGAACTTATTCAATCTTTAGTAAATTTACTAAATAATGCACAAGATGTAATAGTTAAAAAATTAATAAATGAAGAAAAAAGATTAATATTTTTAGATGCGTATAGTGATGAAAAAAATAATTTGATTATCAAAGTAAGAGACAATGCAAATGGTATTGATGAAAAGATTATAGACAAAATTTTTGAACCTTATTTTACTACAAAACATCAAAGTCAAGGTACAGGAGTTGGACTTTATATGACTTATGAAATTATTTCAAAACATTTTAATGGAATAATTTATGTAAAAAATGTATCATATACATATGAAAATAAAGAGTATAAAGGTGCAGAATTTATAATAAAAATACCTATAAAAATTAAATATTAGGCAGTTATATTGAAGATACTTTATGTTGAAGATGATGAGATTGCAAGAGTAAATGCAGTTGAATTTTTAGAAGATTATTTTGAAAGTATTTATAGTGCTAAAGATGGACTTGAGGCTTTAAGTCTTTATGAAAAATTTCATCCAGATATTATAATCACAGATATTCAAATGCCAAAAATAAATGGTTTAGAGTTTATAAAAAAAGTAAGAAAAAATGATTTAAATACTCAAATCATAATAATAAGTGCATATAGCACTAAAGATTACTTACTTCAAGCTGTTGAGTTAAGACTTATAAAATATCTTATCAAACCAATAAAATTTGATGAATTGTTAAAAGTAATAGAAGAATCAAAAGAGTTTTTACAAAATAATAGTTCAAATATTATCAACTTTTGTGATAATTTAACTTTTGATATGTTTAACAAAGTTGTAAAAAGAGACAACACTCTTATAAAAATAACTATGAAAGAGTTACTTCTTTTAGAACTATTACTTAAAAATAAAAACCGTTATGTTACTTATCAAGAGATAGAAAATTATGTTTGGGCAGATGATATGATGAGCAAAGATGCTTTAAAATCACTAATCAAAAGATTGAAAAATACTCTTGAGTGTGAGTGTATAAATAATCTTTCTGGATATGGCTATAAAATAGATGTATGATATAAATATAGTATTGGCATATGGTGTAACCTTTGGAATACTTATTATGAGTATTTTATATACTTTAGTTAGATATATTTATCTAAAAGAGTTTTTTTATTTAGCTTACTGTTTTATGCAGATATTCTCTTTAGGTTTTATTATAATTTATAGTCAATTATTTGGTATTACAGATTTTTATAAAGATATTTGCATTGTATTTGCATCTTTTTTTGCAGTAGCTTTTGCATTTGGATTTTTCAAAGGTCAGATTTTGCCCTCTATTGATAGTAAAAAAGAGTTATTTTTAATAAGTTCTTTGACTATTTTTGCGATTGTTATTGTATTTTATCACTATATGCTTTTTTCATATCTTCCTTATACAATTATTTATTTATTACTTCTATTGTCTGTTATTTTTAATATAAAAGAGGGAATAAAATCTACACTTTTACATATTCTTGCATGGTCTTTAGTGTGTTTATTTTTGTTTATTTTACAAATAAAAAGTATTTATATTAAAAGTGGTTATGTAGATTTGATTCTTATTGCTTTTATGCTTGAAGCTGTTTTATTTACTATAAATCTTGCAAATAAATATAAAGAATTAAAAATGGCAAATGAAGATTATGAAAATATGTTACTACAGCAAACAAAACTTGCAAAAACTGGTTCAATGATAGGAAATATTGCCCATCAGTATAGACAACCACTAAATAATATTTCATATATTTTAATAAATTTAAGAAATAAATATGAAAAAGATAAATTAACAAAAGAGTTCTTTTATACAAAATATAATCAAATAGAAGAACAATTACACTTTATGTCCAAAACAATTGATGATTTTAAAGAGTTTTACTCTCCAAATAAAGAAAAAGAGAACTTTTTACTAATAGATTCAATTAATCGTGCAGTAAATATACTCCAATCACTTATCAAGCAATATAATGTAGAGCTAAATATAAATTTTAATACAAGCGAAGGTACAAAAGTATATGGAGTTGCAAATGAGTTCTCACAAGTTATTCTTGTTTTGCTAAAAAATGCAATAGAAGCTTCAAAAGATGAAATAAAACCTACTATTAATATAAATATTTCTTCTAAAAATGGGTTAATAGAAATTGAAATTATTGATAATGGAAAAGGTATTTCAAAAACAACTTTTTCAAAACTTTTTAAACCATATTTTTCTACAAAAAAAGAAGGCTTTGGAATAGGTCTTTATATGGTAAAACTCATAATAGAAAAAAGTTTCAATGCAGAAATAAAAGCTTACTCTTTAGAAAAGGGAATGAAATTTACCATTTTTCTAGAGAAAAGCTTTTGATTAGAGTGTTATAAGATAAGACTACACTTCCTTTTTAGTGTTATTTTTAATAGCTTCGTATGCAACTAAAACTTTTTTTCGCTCTATTCCCCATCTATATCCTGTCATAGCTCCTGATTTACCTAAAACTCTATGACAAGGAATTAGATACCCAATAGGATTAGAGCCTATTGCATTTGCTACGGCTCTTACTGCTTTTGGATTGTCTAAGTATTTTGCAACATCTTGATAAGTAGTAATAGATCCATCTGGAATATTTATAAGCGCTTTCCATACATTTATTTGAAAGTTTGTTCCTTTTACATAAAGATTAAATTTTTTATCTTTTTTTATGAAAATACTATCTAACATTGAACTAGCTCTTTCATTATCTTTTATAAGTTTTGCATTTGCCCAAATTTGTTTAAATCTATCATAAACACTATCTTTTTCTTTGTCATAAAAACCAAGAAAACATATACCTCTTTTTGTTGTTGCAATTAGTGCATTTCCAAATGGTGTATATCCATAACCATATGTTATTTCAACATTTTGTCCTAAATCTTTATACTCTTTTGGTGTTACTCCAATAATATTTACAAATAAGTCATGTAATCTACTAGGACTTGATAATCCTAAGTCAAGTGAACTTTCAAGTAGAGAGCTTGATTCTTTTAAATGTTCTTTTGCATAGTTTAATGTAACAGATTGTAAAAATTGAATAGGAGTAACTCCAACATACTCTTTAAATACTCTAATAAAGTGGTATTTACTCATACCTATATGTTGCGCAATAATATCAATAGAAGGCTGTTCTTTAAAATTTTCATCTATATATTTTATAGCTTTGACAATTTTATTGTAGTTTTCATTTTGTAAATATAGTTTATTTTTACTCATCTTATATCTTATATAAAAAGGTTTAAGTTAGTAAAGTATACCACTTAAACCTTAAATATATTCATATAAATTAGTAAGTAGATTGAGAGTAAATAACAAAGTTAGAAGCTAAAGCTTCAAGTTCTTTGTTAACATTAGCTTGAAGTTCACTGTTTTCAATGTCATCTAAAATATCACAAATTTTATTTGCAATAAATTCAAACTCATTTTCTTTCATACCTCTTGCAGTTAAAGCAGGACTTCCTATTCTAATACCAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP032098|28726:37991|34891_36238_-|AXX91077.1|DBSCAN-SWA MSYAKKRYINFFAITIFTFCLPFITINGNQILLLSFDKMQFHFLGLAFEMQELYIMPFLLIILFIGIFAMTSIAGRVWCGWACPQTIFRVIYRDLIESKIFNLRKISNKQKDINYSTLENKIKKILSIGLFSILSLIIASNFMWYFIPPKDFFTYLQNPNDHVFMYMFIITVALFLVYDIIFTKEHFCTYVCPYSRIQSSLYDDNTIQAIYNTNRGGEIYKDSKKVIFKAKDLNKDNECTTCEACVTVCPTHIDIRKGLQVECINCLECVDACTNVMGKLSKKTLVDWGSTNSVLKNRKSKHFTFKNIMYYLSIVICIILLVISTSKKEHFLLNVNKTTNLYEIKDNKFVTNNYILTIQNRTKNDYTFALKIEDNKTFEIKRFKSFNLKPNQRVKKVLILKTKKRLFLSDLKTTPIKVKIIMYAKEDPKEIYKEKYLSFIYPRNDAFK >CP032098|28726:37991|30622_31279_+|AXX91073.1|DBSCAN-SWA MKILYVEDDEIARVNAVEFLEDYFESIYSAKDGLEALSLYEKFHPDIIITDIQMPKINGLEFIKKVRKNDLNTQIIIISAYSTKDYLLQAVELRLIKYLIKPIKFDELLKVIEESKEFLQNNSSNIINFCDNLTFDMFNKVVKRDNTLIKITMKELLLLELLLKNKNRYVTYQEIENYVWADDMMSKDALKSLIKRLKNTLECECINNLSGYGYKIDV >CP032098|28726:37991|31271_32588_+|AXX91074.1|DBSCAN-SWA MYDINIVLAYGVTFGILIMSILYTLVRYIYLKEFFYLAYCFMQIFSLGFIIIYSQLFGITDFYKDICIVFASFFAVAFAFGFFKGQILPSIDSKKELFLISSLTIFAIVIVFYHYMLFSYLPYTIIYLLLLLSVIFNIKEGIKSTLLHILAWSLVCLFLFILQIKSIYIKSGYVDLILIAFMLEAVLFTINLANKYKELKMANEDYENMLLQQTKLAKTGSMIGNIAHQYRQPLNNISYILINLRNKYEKDKLTKEFFYTKYNQIEEQLHFMSKTIDDFKEFYSPNKEKENFLLIDSINRAVNILQSLIKQYNVELNINFNTSEGTKVYGVANEFSQVILVLLKNAIEASKDEIKPTININISSKNGLIEIEIIDNGKGISKTTFSKLFKPYFSTKKEGFGIGLYMVKLIIEKSFNAEIKAYSLEKGMKFTIFLEKSF >CP032098|28726:37991|33537_34800_-|AXX91076.1|DBSCAN-SWA MNYITNARLKEADKEVFSIIENELERQTNHLEMIASENFTSPAVMEAMGSVFTNKYAEGYPNKRYYGGCEFADQVEQLAIDRACKIFNCKYANVQPHSGSQANGAVYAALLKAGDKILGMDLSHGGHLTHGSKPSFSGKNYSAFYYGVELDGRINYDKVLEIAKIVQPKIIVCGASAYAREIDFKRFREIADEVGAYLFADIAHIAGLVAAGEHQSPFPHAHIVTTTTHKTLRGPRGGMIMTNDEELAKKINSAIFPGLQGGPLVHVIAAKAVAFGEILKPEWIDYAKQVKANAKILGEVLVKRGYDIVSGGTDNHLVLVSFLNKDFSGKDADAALGNAGITVNKNTVPGETRSPFVTSGIRIGSPALTARGMKENEFEFIANKICDILDDIENSELQANVNKELEALASNFVIYSQSTY >CP032098|28726:37991|36331_37564_-|AXX91078.1|DBSCAN-SWA MQQFLKECKKVSREIATLKTDVKNKILNQMADALIEHCDFIVHNNSKDMQEAEKNNLSHDLKDRLFLDGTRVEAMAAAIRQIAAQKEPVGRTLEGWVTESGLNIQKVSIPIGVIGIIYESRPNVTSDTAALCFKSGNVCVLKGGKEAQHSNKAIADILRNVLAINKLPEQAISLLPDSSREGVANLIKQDKYVDLIVPRGGESLIRFISQNSSVPVIKHDKGICHTYIDKFADGKKALEICINAKCSRPGVCNSMETLLVHQEVANYVLPPLQEAFVYEQTELRGCKETQKYIDVNPASDEDFDTEYLANILSIKVVEDIHQAIDHINLHGSGHSECIISENYSNITRFLDEVDAACVYANASTRFTDGGAFGLGAEVGISTNKLHSRGPMGINDLTTFKYKILGNGQIR >CP032098|28726:37991|28726_30613_+|AXX91072.1|DBSCAN-SWA MKKIFLVVFIFISLLFLLIFTTNQSNRKIDNFFKIQKNISHLIYTNKNFDIFMSSSISYNNFDVIQKDIFKIKDILRQMSNNDFFNTQLSILRKDFDEIRNLFNQKMQNIERLKSTSAVLNNSYRYIQTIYEKVSNKKFNSIYARLIGLEYNSELSIKKLENDINILKTNTNQEKIFIKHAKNILHYYKRFDELKNRINSLNIDIKLESFEQKYNNSSDIFIRDIKFVLWNVIILLSISLLVFLYYYSRIAYQKIQLNRFKLAVENSDNIIMTTDYNKKIKYVNDNFIKHSGYTYKELIGQKASILKSGLNSKNFYKELNDTIYSGNRWFGEFINKRKDGQLSYEKASISPIFDENGKIIEFLAIKLDITKERTIEKDLKNKEHILMQQAKMVALHEMLDSISHQWRQPLSSISTAASGMKLNKEFNSLDDETFNKLIDSIVENSLYLSKTIDNFKSFFKTNSENVLFNIKNTVNKVFNLMSYKFNENKIECIINVIDKNIEGLEHELIQSLVNLLNNAQDVIVKKLINEEKRLIFLDAYSDEKNNLIIKVRDNANGIDEKIIDKIFEPYFTTKHQSQGTGVGLYMTYEIISKHFNGIIYVKNVSYTYENKEYKGAEFIIKIPIKIKY >CP032098|28726:37991|37673_37991_-|AXX91079.1|DBSCAN-SWA MGKYIELTQENFDNTVSNGISLVDFWAPWCGPCRMLAPVIEELAEEFEGKANICKVNTDEQQDLAVKYGIRSIPTIIFMKDGEILDQVVGASSKQALVEKLNSLS >CP032098|28726:37991|32609_33467_-|AXX91075.1|DBSCAN-SWA MSKNKLYLQNENYNKIVKAIKYIDENFKEQPSIDIIAQHIGMSKYHFIRVFKEYVGVTPIQFLQSVTLNYAKEHLKESSSLLESSLDLGLSSPSRLHDLFVNIIGVTPKEYKDLGQNVEITYGYGYTPFGNALIATTKRGICFLGFYDKEKDSVYDRFKQIWANAKLIKDNERASSMLDSIFIKKDKKFNLYVKGTNFQINVWKALINIPDGSITTYQDVAKYLDNPKAVRAVANAIGSNPIGYLIPCHRVLGKSGAMTGYRWGIERKKVLVAYEAIKNNTKKEV |
8 | Salmonella_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
322458 : 329391
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP032098|322458:329391|DBSCAN-SWA ATCATTTAAACTGTCCTAATAATTTTAAATCACTCTCAAATAAAGATCTTAAATCACCTATGTTATGAATTAACATAGCAACTCTTTCTACTCCTAAACCAAAAGCATATCCTGAAACATTTTCATATCCAACAGATTTAAATACGTTTGGATCCACAACACCACATCCAAGTATTTCTATCCAACCTGTATGTGAACATACTCTACAACCTTCACCTTTACAGAATACGCATGAAATATCAACTTCTGCACTTGGTTCAGTAAAAGGGAAAAAAGAGGGTCTAAATCTAACTTCAACATCTCCAAACATATGTTGTAAAAATTCAGTTAATACATGTTTTAAATTTGCAAAAGATACTTTATCTTCACTATCTACAACTAGACCTTCAACTTGATGAAACATTGGTGTATGCGTTAAATCAAAATCTCTTCTAAATACTGTACCTGGTGCTATCATTCTAATTGGAGGCTTTTGTTTTAACATTGATCTAATTTGCACAGGAGAAGTATGAGTTCTTAATACAGTAAAATCTTTATTATAAAATGTATCTTGCATATCTCTTGCAGGATGATATTTTGGCAAATTTAAAGCTTCAAAATTATGAAAGTCATCTTCTACAAGTGGACCTTCTTCAACTGCAAAGTTTAAGTTTTGAAAATATGTTATAATTTTATTCATAGTCTCTATTACTGGATGTACTGCAGCTGAAGAAACTTCATTGTTAAATCTTGTTACATCAATTTTTTCATCTTCTAATTTTTTATTTAATGCTTCTTCTTCAAGTACAACTTTTTTATTATCAATAGCTTCAGTTATTGAAATTTTTTGTTCATTTAAATTTTGAGCAAAGGCTTTCTTTTCTTCATTTGGGATTGTTTTTAGTTTTGCAAATTCTACTGTTAAAACACCCTTTTTCCCAAGCGTTTCAACTCTTAAAGATTCTAATTCTTCAAGTGAATTGGCATTAGTAATTTTTTCTATCCATTCTTTCACTTAATATTCTCCTGTAGTATATTCATCTTCTAATTTTTAGGGATTATACATAATAATTTATTAGAGTTTGGTTATAATAAAATCATAAAAAATAAAGGAATAGATATGTGTATATTTTGTAAAATTGTAGATGGTGAAATACCAAATCAAACTGTTCTTGAAAATGAAGACTTTTTATGCTTTCATGATATTAATCCTGTAGCAAAAATTCATGTTCTAATAATTCCTAAAAAACATTATGACTCATTTGATGTTATTGAACCTGAATTAATGGTAAAAATGACAAATTTTATTCATGAAGTTGCACAAAAATTAAATGTAAGAGAAAAGGGATATAGAATTATTACAAATATTAAAGAACATGGTGGGCAAGAAGTTCCACATTTACATTTTCATCTTTTAGCTGGAGAATATGTTGGAAGGTTAGTAGGAAATAAAAAGTAGTTTTTGCTACTTTTTATCACTTTCAAATTTACCTAATTTCATTAGTTTTTCATATCTATTATTTAATCTTTCTTCAACACTTTGTTCTTTTAATTGTGCTAAAGAATTTAAAAAATAATCACCTAATGCTTGAATTGCTTCTTCTTTTCTTTTATGAGCACCAATTAGTGGCTCTTCAATTACATCATCAATAAGTTCTAAACTTTTTAGTGCTTCTGCTGTTATTTTTAAAGAATTTGCTGCTGTTTCTGCATGTGCAGGATCATTCCATAAAATTGCTGCACATCCTTCAGGTGATATTACTGCATAAACTGAGTATCTCATCATTGCAAGTTTATCTGCCACTGAAATTGCAAGTGCACCACCTGAACCACCTTCTCCAATAACTACAGAAACTGTAGGTGTTTTTAAATTAGAAAATTCATATAAGTTTTTTGCAATTGCTTCACTTTGATTTCTTTCTTCTGCTCCAATTCCTGGATATGCACCTGGAGTGTCAACTAGCATTAAAATTGGAATACCAAATTTTTCTGCCATTTTAGCACATCGTAGAGCTTTTCTATATCCTTCAGGACTTGGCATTCCAAAGTTTCTTTTTAATTTATTTTTTGTACCTCTACCTTTTTGTTCACCAATAACCATTACTTTTTGTTGCCCAATATATCCTAGAAAACAAACTATTGCATTATCATCAACATAATGTCTATCACCATGTATTTCATATGCATCTGTTAATAGACCTCTAATATAATCTAAAGCATATGGTCTGTCTGGATGACGTGCAAGTTGTAGTTTTTGATAATCATTTAAGTTTTTAAAAGTTTTTTGTACTTCTTTTTCAAGTTTTTTTTCTAGTATATTTACAGCAGGTTCATCTGAACGGCTTTTTGCAACTAAGATGTCTTCTTCAATTTGTTTTATTTTGTCTTCAAAATCTAAATAAGTTGCCAAAATTTTCCTTTTTTCAAAGAGGAATAAATCCTCTTTTTAAGATTGTAAGTTAGTATTAAATCTTTTTGAATATAACAGAACCGTTTGTTCCACCAAATCCAAAGTTGTTACTCATAACAGTAGTTAAATTTGCTTTTCTCCCTTTTAAAGGAACAAAGTCTAAATCGCAGTTTTCATCTGGATTTTCAAGATTTATAGTTGGAGGGATAATTCCTTCATTTAATGCTTTTATTGTAAAAATTGCTTCAATTGCTCCAGCTGCACCTAAACAATGTCCAACTTGACCTTTTGTTGAAGATACAATAGGGCAATCATTATTAAATAACTCTTTAATAGCTTTTACTTCATTACCATCACCAACAGGAGTTGAAGTTCCATGAGCATTAATATAATCGATTTTTAAATCTTCTCCCACATTAGCTTTTGCCATAGAAAGCGCTGCTTTCATAGCTCTTAATGGACCATCAACTACTGGTGCAGTGATATGATTTGCATCTGCACTTTCACCAAATCCAATAACTTCAGCATAAATTTTTGCACCTCTTTCTTGTGCTGACTCTAGTGTTTCAAGAACTAATGCTCCAGCTCCTTCACCCATAACAAAGCCATCTCTATCTTTATCAAATGGTCTTGATGCTTTTTTAGGATCATCATTTCTAGTTGATAATGCTTTCATTGATGCAAAACCACCAACACCAGCGCCACAAATAGCACTTTCAGCACCAACAACTAAAATTCTATCTGCACCACCTGTTACAATTGTTTTAACACCATCAGCTAGTGCGTGAGTAGAAGCAGCACAAGCAGTAACATGAGATAAACTTGGACCTCTTAATCCATGTTCAATTGAAATAAATCCACCTAACATATTAACTAATGAAGAAGGAATAAAGAAAGGAGAGATTTTTCTTGGACCTCTATTTTGACAAACAACTGAGTTTTTTTCAATAGTTCCTAATCCACCAATACCTGATGCAGATATAATTCCAAATCTTTCTGATATAGAGTCATCAACTTTTTTATTTTCATCATCTATGAATTTTGCATCTTTCATAGCTTCATTAGCTGCTTTTATACCTAATTGGATAAATCTGTCAGCTTTTTTTACATCTTTTTTGTCCATAACTTCTGTAGGGTCAAAGTTTTTTACTTCCCCTGCAATTTGTACAGGATATTCTGAAGCATCAAATAGACTGATAGTATCAATACCACATACTCCATCTACTACAGCTTTAAATGAATCCTCTACATTATTTCCTACAGAATTAATAGTACCTAAACCAGTTACAACAACTCTTCTCATTAATTATGCTCCGTTTCTTGTATTAAAATCAATTTATTTAAAATATTCAATTTTTTTAAATAAAAAACTTAATATTTTAAATAAAAAGCTAGCATACTAGCTTTTTATTCTAAAAGTTAAAATTATGCGTGCTCTTCGATGTATTTGATAGCATCAGCAACTGTTTGGATACCTTCAGCATCTTCATCAGGGATTTCGATATCAAATTTTTCTTCTAAAGCCATAACTAATTCAACTACGTCTAAAGAGTCTGCACCTAAATCCTCAATAAATTTAGAATCTTCTTTAATTTCTGCAATATCACAATCTAGTTGCTCTACTACTACTTCTTTTACATCATCTAATAATGCCATATTTTTTCCTTTTATAAAATTATCATCGTATTATAGCCAAAAAGATTTTAAAAATTCTTTTAAACTATTTTTTTAAAAAATATTAAACGTATAATCCACCGTTAACTTTTAATATTTCACCAGTAATATAAGAAGAGTAATCACTAAGTAAAAATGCTACTGCATCTGCAATTTCGCTTGGTTGTCCAAATCTACTTAATGGAATATTCTTTTCATATTCAGCTTTAATTTCATCTTTTAATTCATCTGTCATATCAGTTTGAATAAATCCAGGTGTTACTGCATTATATCTTATACCTCTAGCAGCTGCTTCTTTTGCAAAAGATTTAGTCATTGCATTTAGACCACCTTTTGAAGCAGAATAATTAGTTTGACCTGGATTACCCATTTCTCCAACAATAGAAGAGATGTTAACAACTGCTCCAAATCTTTTTTTTCCCATAACTTTTAATGCATTCTTACATCCAATAAAAGCTGAAGTTAAATTTGCATTAATAACATCTGTAAAATCATCAACTGACATTCTTAATGCTAATTTATCTTTTGTAATACCAGCGTTGTTTACTAAGTATGAAAGTTCTCCATCTGCATCAACTACAGTTTTTATTGCAGCTGTAAACTCTTCTTCAGAAGTTACATCAGCTTTAATTACAGCAGCGCATCCTCCAGCAGCTTCAATCTCTTCTTTAATTTTGATTGCTGCATCTGCACCACTTCTATAATTTATCCATACTTTTAAACCATGTGTTGCTAATGTTTTAGCTATTTGTGCTCCAATACCTCTGCTAGCACCTGTAACTAATACATTTTTACCACTAAATTTCATTTAAATCCTTTGTTTATAAGTTTTTGTTGATGTAGATGATAATCTAAATCTTTTACATGTAGGTGGAATTATATCACCATTTTTATAAAGAAAAAAATATTGATGAAATAATTTACTTAGACACCCCTTTTATTATCCCATACTCTTATATGCAATCTATCACAATATTTAAATCCAGTCTCTAATGCTAAATTAATTACTGATTCACTATTTTCTTGCATTGATATAGCATTATCGCCCATTGGCATTAAATATACTTCAACTTCTGGAATTTGTTTTAAAATATCAAAAATCTCTTTTTTTGCATCATTTAAAAAATCTTTATTTATTACAAATTTTAAATATTTATCATCGCTTTTTGTAATAATATTTGTTAATGTTTTTATATTTACTCTTTTTCTTAATGGTTCCAAAGAGTTACTTAATTTTACACTCATTGAAAAAAGAATCTTTTTTTGATAATTTTGTGTAATATCAATATTTAAAGATGCATTTGTTTCTATAGTTACTTTATATTCATTTTCAACATAATATTTTAATAGTCTTTGAAACTCTTTATTTTTCCAATATAGTAGAGGTTCTCCTCCTGTAATTACAATATCACATTTATAAGATGGAAGATATTTTTCAACTTCTTTTATTAAATCATTTGATGAAGAAAATGTAAGCCATTGATCTTTAAATGCTGGATCAACAGCATAATATGAATCACATGCACACTTTTTTACTCCGCTTGGAGTTTCATACTCAATTGCAAAACCTTCACATCTAAAGTTACATTTTCCAAATCTAATAAATACAGAAGAAGTTCCTACCCTTTTACCTTCTCCTTGTATTGTAGGTCCAAATATTTCATTTACTTCAAGCATAAAAAGTGCTCTTACTTTTAGGTGTTTCTAAAAATTCTATATGAGATACTTTTATATTTAATTTATTCATTTTATTTTGAACTATTTTTAAAAACCAAGCTGATAAGTTTTCACTTGTTGGAACAAAGTCTACAATTACATAACCTTCATATAATTCAATTATATGAGGTTGGTTATTCTCCAATTTAGTTAAATCAACTAAATAATATCCTTGTTCATATTTTACTAAAGATTCTTTTTTTATATTTGGTAGAAGAGTTTGGAATAATGGATCATTAATATCAATTATAAATTTATGATCAAGAATATCATCAATAAACTTTTTGAACCAATTTAAATGTTTAAAGTCTGTAACCATTCCATTATCTAATTCATTTGCTTCTAAATATACTATTATTTTCCCTTGATGTCCATGTAAATGCCTACATTTTAGACATCCATCAAGAGAAAATTCTGTATTTAAACTTTGAGACCAAACTCTATGTCCATAACAAAAATCAAACTCTTTTGAAATTTTCCAATGCATTATTTTACCTTATATGGTATTTTATCTTTACTATTTGCTTTTTCAAAACCATTTAATCTTAATCTACAACTATCACATACTCCACATGCTTCTTCTTCCTCTTTATAACATGACCAAGTTAATTCTAAAGGAACATTTAATTGCATTGCTTTTAAAACTATTTCGCTCTTAAGTAAATGAACAAGTGGTGTTTTTATCTCAATATTTGTTGTATTTTTTGTTCCTGTATTTATAGTATAATTTATAGATTTTATAAATTCATCTGTGCAATCAGGATATCCTGAACTATCCTCTTCAACAACTCCTATATATAATGCATTCGCATTCTCTTTTTCTGCAATGGCTGTTGCAATAGATAAAAAAATTCCATTTCTAAAAGGTACATAAGTAATAGGAACTCCTGTTTCGATTCCATCAACTGGTACATCAATATTTTTATCTGTTAAAGCACTTGCTCCTATTTGTACAAAAAATGGAATATCTATTTCATATTTTTCTTTTATGTTTAAATCTTTACAAATATCTCTAAATGCTTTTAATTCTCTTTTTTCTGTTCTTTGTCCATAATTAAAATGAACAGCAATAATTTCATAACCCTCATTTTTGGCTATATATGATGCTAGTGTAGAGTCCATTCCTCCACTTAAAATACAAACTGCTTTTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP032098|322458:329391|327444_328197_-|AXX91351.1|DBSCAN-SWA MLEVNEIFGPTIQGEGKRVGTSSVFIRFGKCNFRCEGFAIEYETPSGVKKCACDSYYAVDPAFKDQWLTFSSSNDLIKEVEKYLPSYKCDIVITGGEPLLYWKNKEFQRLLKYYVENEYKVTIETNASLNIDITQNYQKKILFSMSVKLSNSLEPLRKRVNIKTLTNIITKSDDKYLKFVINKDFLNDAKKEIFDILKQIPEVEVYLMPMGDNAISMQENSESVINLALETGFKYCDRLHIRVWDNKRGV >CP032098|322458:329391|322458_323451_-|AXX91345.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKEWIEKITNANSLEELESLRVETLGKKGVLTVEFAKLKTIPNEEKKAFAQNLNEQKISITEAIDNKKVVLEEEALNKKLEDEKIDVTRFNNEVSSAAVHPVIETMNKIITYFQNLNFAVEEGPLVEDDFHNFEALNLPKYHPARDMQDTFYNKDFTVLRTHTSPVQIRSMLKQKPPIRMIAPGTVFRRDFDLTHTPMFHQVEGLVVDSEDKVSFANLKHVLTEFLQHMFGDVEVRFRPSFFPFTEPSAEVDISCVFCKGEGCRVCSHTGWIEILGCGVVDPNVFKSVGYENVSGYAFGLGVERVAMLIHNIGDLRSLFESDLKLLGQFK >CP032098|322458:329391|323556_323895_+|AXX91346.1|DBSCAN-SWA MCIFCKIVDGEIPNQTVLENEDFLCFHDINPVAKIHVLIIPKKHYDSFDVIEPELMVKMTNFIHEVAQKLNVREKGYRIITNIKEHGGQEVPHLHFHLLAGEYVGRLVGNKK >CP032098|322458:329391|326584_327328_-|AXX91350.1|DBSCAN-SWA MKFSGKNVLVTGASRGIGAQIAKTLATHGLKVWINYRSGADAAIKIKEEIEAAGGCAAVIKADVTSEEEFTAAIKTVVDADGELSYLVNNAGITKDKLALRMSVDDFTDVINANLTSAFIGCKNALKVMGKKRFGAVVNISSIVGEMGNPGQTNYSASKGGLNAMTKSFAKEAAARGIRYNAVTPGFIQTDMTDELKDEIKAEYEKNIPLSRFGQPSEIADAVAFLLSDYSSYITGEILKVNGGLYV >CP032098|322458:329391|328189_328723_-|AXX91352.1|DBSCAN-SWA MHWKISKEFDFCYGHRVWSQSLNTEFSLDGCLKCRHLHGHQGKIIVYLEANELDNGMVTDFKHLNWFKKFIDDILDHKFIIDINDPLFQTLLPNIKKESLVKYEQGYYLVDLTKLENNQPHIIELYEGYVIVDFVPTSENLSAWFLKIVQNKMNKLNIKVSHIEFLETPKSKSTFYA >CP032098|322458:329391|323901_324846_-|AXX91347.1|DBSCAN-SWA MATYLDFEDKIKQIEEDILVAKSRSDEPAVNILEKKLEKEVQKTFKNLNDYQKLQLARHPDRPYALDYIRGLLTDAYEIHGDRHYVDDNAIVCFLGYIGQQKVMVIGEQKGRGTKNKLKRNFGMPSPEGYRKALRCAKMAEKFGIPILMLVDTPGAYPGIGAEERNQSEAIAKNLYEFSNLKTPTVSVVIGEGGSGGALAISVADKLAMMRYSVYAVISPEGCAAILWNDPAHAETAANSLKITAEALKSLELIDDVIEEPLIGAHKRKEEAIQALGDYFLNSLAQLKEQSVEERLNNRYEKLMKLGKFESDKK >CP032098|322458:329391|324901_326149_-|AXX91348.1|DBSCAN-SWA MRRVVVTGLGTINSVGNNVEDSFKAVVDGVCGIDTISLFDASEYPVQIAGEVKNFDPTEVMDKKDVKKADRFIQLGIKAANEAMKDAKFIDDENKKVDDSISERFGIISASGIGGLGTIEKNSVVCQNRGPRKISPFFIPSSLVNMLGGFISIEHGLRGPSLSHVTACAASTHALADGVKTIVTGGADRILVVGAESAICGAGVGGFASMKALSTRNDDPKKASRPFDKDRDGFVMGEGAGALVLETLESAQERGAKIYAEVIGFGESADANHITAPVVDGPLRAMKAALSMAKANVGEDLKIDYINAHGTSTPVGDGNEVKAIKELFNNDCPIVSSTKGQVGHCLGAAGAIEAIFTIKALNEGIIPPTINLENPDENCDLDFVPLKGRKANLTTVMSNNFGFGGTNGSVIFKKI >CP032098|322458:329391|326271_326502_-|AXX91349.1|DBSCAN-SWA MALLDDVKEVVVEQLDCDIAEIKEDSKFIEDLGADSLDVVELVMALEEKFDIEIPDEDAEGIQTVADAIKYIEEHA >CP032098|322458:329391|328722_329391_-|AXX91353.1|DBSCAN-SWA MKKAVCILSGGMDSTLASYIAKNEGYEIIAVHFNYGQRTEKRELKAFRDICKDLNIKEKYEIDIPFFVQIGASALTDKNIDVPVDGIETGVPITYVPFRNGIFLSIATAIAEKENANALYIGVVEEDSSGYPDCTDEFIKSINYTINTGTKNTTNIEIKTPLVHLLKSEIVLKAMQLNVPLELTWSCYKEEEEACGVCDSCRLRLNGFEKANSKDKIPYKVK |
9 | Campylobacter_virus(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
474992 : 483313
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP032098|474992:483313|DBSCAN-SWA TATGAACGCACCAATTACAGTTACTTCTCTTAGTACACAAATAAAATCTTTATTAGAAACTACATTTATGGATGTTTATGTTGAAGGTGAAATCTCAAACTTAACATATCATAGTTCAGGACATATTTATTTCTCTATAAAAGATGATAAATCTACAATGTCTTGTGTGATGTTTAGAGGAAATACAAAATATTTAAAATTTAAATTAGAAGTTGGATTAAAAATAAATATTAGAGGTAGTTTAACTGTATATACTCCAAGAGGTAGTTATCAATTAATTTGTAATAGAATCGAGCCTTCAGGTCAAGGTGCATTGGCTTTAGCATATGAGCAGTTAAAAGAGAAATTAAAACAAAAAGGTTATTTTGACCCTTCAATTAAAAAAAATTTGCCAAAATATCCTAAAAAAATTGCATTAGTAACATCGCCTACTGGTGCAGCTATTCAAGACATGTTAAAAGTAGCAAATCATAGATGGAATTTAGTTGAGTTTATTTTAGTTCCAACTTTAGTTCAAGGCGAAACAGCAAAAGATGATATAGCAAAATCGATAAAATATGCAGATACTCTTAATTGTGATATTATTATTGTTGGAAGAGGTGGTGGAAGTATTGAGGATTTATGGGCTTTTAATGAAGAAATAGTTGCAAATGCAATATATGAAGCACAAACTGTAATAATTTCAGCAGTTGGACATGAAGTTGATTTTTTGATTTCTGATTTTGTTGCAGATGTTAGAGCTGCAACTCCTTCTAATGCAATAGAAATAGCACTTCCCGATACTAATGAACATAGAATATATATAGATACTTTAACACAAGATTTTGAAAATAGATTAAAAAATATATTATATTCAAAAGAGCAAAATATAATTCATTTAAAAAGAATGTATGAACAAAACTCTATTGAAACAAAATTTAATTTAATATCTTCAGAAATTAAAATGTTAAAATTAAGTTTTGATAATAGATTTTCTAATATTTTAAATAGTTGTCAAAATAGTATAAGTTTATTAAAAAATTCTTTTGAACATAATAGCCCAGAAAAAAAACATAAAAAAGGTTTTGTTCAAATAAGTAAAGACAATAAAATAATTGAATTAGAAAATATAAATATTGGTGACAATATATCTTTACAAACCCCTACACATATAGCAAACGCAAAAATTGAAAATATAAAAAAACAATAAAATATTAAGTTTATTATAGATAAAATATAAAAAACTTCTAAAAAGGTGCTTTATGTTTTGTTTTATGATAAAAAAAGACTCTGTTTTTATCTACAATATAAAGCCAACAATTCTCAATTTAAAAATCAGTTTTAAAGATAAATTTTGTAAAATAAATTAAGTGTAAAGAAAAGGAGAACCACCTTATGGAAAAAAATTTAAATAATGATGAGCAAGATGTAATTGATTACGCAAATAGTAGTGAGTATATGACATTTGAACTTGGGGCAATGAAGTATGCAATTGAATTACCAAAAATTAGGGAAATTTTAACTTATCCCGATATTATTACTCATTTACCAAACACAGAAGATTGGGTAAAAGGGCTTATTAATTTAAGAGGTGAAGTTGTTCCTATTTTAGATATTAGAATTAAATTTAATACAGGTGAACCAATTTATGATTCAAATACTGCTGTAATTGCAGTTATTACTGAAGATAAAAGAATGATTGGTATTATTGTAGATAAAGTTGATGATGTTCAAAGATTAGATACTTCTGCTTTGGCACCAGTTTCTGATATGGGTTCTGCAATTCCATCTAAATATTTAAAAGGTTTTGTAAGATTAGAAAATAATCAGATGCTTGTAATTATGGATATTGAATCAGTTGTACATAAAGATGAATTAAAAGATACATAATGCAAAAAAAAATAGAGAAACTTAGAAAGTTGAAGCTTCTTTTTGTTGAAGATGAAAAAGATTTAATTGAAATTATATCTGATACGTTAAGAAAATTAGAAGCTAACTTTTTAACTGCTCATAATGGTAAAGAAGCACTTGATTTAGTAGAACAAAATGATGATATAGATGCAATAATTACTGATATTAATATGCCAATATTAAATGGAATAGAGATGATAAAAATTCTAAAAGATAAAAAACCATATCTTCCAGTGATTATTATGTCTGCTCATACAGAGAATGAATATAGACAAAAAGCTAATGAATATGGTGTTAAAGACTATTTATTAAAACCTTTTGATTTTATTAAATTTATTGATCTAATAACTTCAATGAAATTAGGTAAAAATGGCAATAAATAAAGAAGTATTGAAAAGACTTAAAGCTTTATATATTGAAGATGATGATACCATAAGAAAAGAATTATCTGCACTATTATCTAACTTTTTTGGCAAAATATATATTGCCAAAGATGGAAAAGATGGATTAGAACAATATTTAAAAAATAGTGATGATATTGATGTAATTATATCTGATATTAATATGCCATATTTAACTGGTATAGAAATGGTAAAAAAAATAAGAGAAATAAATAAAAAAGTACCTGTAATTTTTACTACTGCATATTCAGATAATCAATTTTTAGCTGATGCAATAAAATTAAAAGTTTATGAATATATTATAAAACCAATAGATATTAGAAATTTATTAGTTGTGTTAAATGAACTTGCAACTATTTTATATCAAGAAGAATTGATAAATAAACAAACATTAGAATTAGAAAAATTTAAAGATGTAATTGATACTAATAATATTGTAATTAAAACTGATGAAAATATGAATATAGTTTATGTAAATGAACTTTTTTGTAAAACTACAGAATTTTTAAAAGAAGAATTAATAGGGAAAGAACTATCTTTTTTAAGGCATAATGATACAGATATAAAAATATATAAAGATATTTATGAAAGTGTAGAAGTTAATAAACAGTGGAAAGGTAGAATAAAAAATATTACAAAAGAGGGTGGATATTATGTAAGTGATACTTATATAATTACTACAACAAATGATAATAATCAAGTTACAGGTTCAATTTGTGTTCAAAATGATATAACAGATGAATTGAATAAAAAAAGAGAAATACAAAAAGCACTGATTAAAGATAAAGGTGATATTTTTATTAAAAGTAAAGCAGGTAGTGCTGAACAAACTGTAACTATTAATAATTTGAGATATGACATAGAAGAATTAAAAACTACAGTAAAAAAATTAAAAGCAGAAAGAGATAAATCTTTATATAAAATAGATAATCTAAACAAAGAGAATAAAAAATTAAGAAGTGAATTAGGTTATCAAAAAAGTATAGAACAAAAAAATAAATTAGATAATGCATTTACTTTAAAAGCTAGTAAAGAAAATGTTGATCTCAAAATTCAAGTAAAAAAACTTAATGCAAAGATAGAAGATACGGTTGAGTTTTATGAAAAAAAATGTAAACAGCTTGAAGTAAATGCACAAATGGAAATAGAAGATTTAGAACAAGAATTACATGATATAAAAACAAAACTTGGAAAAATTGATAATGCTGAGATGATGACTCAAAAAATTGAGTATTGGAAAGAAAAAGCAAAAAGTGAATCAAAAAGAGCTGAAAAAATGGAAAAAGAGATTATGAAAAGTTCTGACAAGAGTCTAATGGATAAAATATTTTCTCTTACTAAATAAATAGAGTAAAACTCTATTTATTTAATTGTGATACTTATTATTTTTTGTTCAATTAAAGGTTTATTGCCTTGATATTTCCCTGATGTTGGTACATTTTCAATTTTTCTAACTACATCCATTCCTTTTTTTACATATCCAAAAATAGTGTGTTTCCCATTTAGCCAATATGTTGGTGCTGTTGTTATAAAAAATTGACTTCCATTTGTATTTGGTCCTTTATTTGCCATTGCTAAAATTCCTGCTTTATCAAATACAGCATTTGATGCGAATTCATCTTTAAATGGTTTTTTCCAAATAGATTCACCACCTGCACCTGTTCCAGTTGGATCACCACCTTGAATCATAAAATTTTTTATAACTCTATGAAAAATAGTATTATTATAATAACCATTCTTAGCATGTGTAATAAAATTTTCAACGGCTTTAGGAGCTAAATCTTTTCTTAGCTCAACATCAATTTCTCCTTTTGATGTTTTAAGAACTGCAATAGGATTTGCAGCTTGTAACATAATTACTATAGAAGAAATAAGAATAAAAATCCTAAACATAAAATTCCTTTTAATTTATTTTCAAAAATAGTATAATATTTATGATTTTAATTTATTATTAAAAATAAACATTTATAAGAATTTAATAAATGTTTGTTAAAATTCAAATTATAAAGTTATAAGGATTTTTATGGAAACTGCCACTATACCACAGCCTACATTTTATCTATTTAAATGTGAACAAAGTGCACCTTCTGGAATGTCTAAACCTGCATGTGTAAATGAACAAACACAAGATTTGTATAATTATTTAACACAAGGTTTGATGCAAAAAGGTATAATGGGTCCAGTTCAAGCAATAAGAACTGCTTGTTTAGGAAGATGCCAGTTTGGACCAGTTATGTTGGTAGAACCAGGTCATTATATGTATTGCCATTTATCTAAGGAAAAAATAGATAAAATAATTGATAATCATATATTAAATAAAGAGCCTGTAATTGAGTATTTAATACCAGAACAATTTTGGGCAGAACCAATAAGTTTGGGAAAATAAAGGGTTGAAAAAATGACATTTGATATGTTGTATAGTAAAATTCATAGAGCTACTGTTACTGATGCTAATTTGAACTATGTTGGTTCAATTACAATAGATGAAGAACTTATGGATGCAGCTAAGATTAGAGTTGGACAAAAAGTTGATATTGTAAATATTAATAATGGTGAAAGATTTGCTACTTATGTTATAAAAGGTAAAGCAGGTAGTAAAGATATGTGTCTAAATGGTGCGGCAGCTAGAAAAGTTGAAATTGGGGATAAAATTATTGTTATTTCATATGCTTCTTACAGTGAAGAAGAATTAAAAAACTATAAACCAACTGTTGTTCTTGTTGATGATAAGAATAATGTAGAAACAATTACTAATGAACTTGTAGGAAGTGATTATGTTTGATGGAATTGATTTAAGTAAATTAAATTTAAATGAAATGATGAGCCAAGTACAAGAGATGGCTGAAAAAGCAAAAGAGGAAAACTCATCTAAAATCTTCACTGCAAAAGCAGGTGGAGGTATGGTTGAAATCTCTATAAATGGAAATAGTGAAGTTGTTGATTTACAAATAGATGATTCTTTAATGGATGATAAAGATTCATTACAAATTCTTCTAATCTCTTGCATGAATGATGTAATAAAACAATCTGATGAAAATAAAAAAATGATGGCCATGAATATGATGGGTGGTATGGGCTCTTTTGGGCAAAAATCATAATGACAAATTTATTAATAGATTTTGAAGATTATTTATTTAATAATCTTCCCTCTTCAAAAACTTTTCACCCATATTTTGAATCTGCATTAAAAGATATGTTAAAAGCTGGAGGAAAAAGATTTAGACCAATGCTTTTATTATCTGTAGTAAAATCAAAAAATAGACTTTTACTTCAAAACTCAATGCAAGTGGCATTAGGAATTGAATATTTGCATACATATTCGTTAATTCATGATGATTTACCTGCAATGGATAATGCTAATTTAAGAAGAGGTTTTCAAACACTGCATAAAAAGTATGATGAAGTAACTGCAATTTTAGTTGGAGATGCTTTAAATACTCATAGTTTTAATTTAATTGCTAATTCATCTTTAAGTAGTGATATTAAAGTACAATTAATTAAAACATTGTCAAATGATGGTGGGATAGATGGAATGATTATTGGTCAAGCAATTGATTGTTATTTTGAAAATCAATTATTAAAATTAGATCAATTAGAATTTTTGCATATTCATAAAACTGCAAAATTAATTGCTGCATCTTTAAAAATGGGAGCAATTATAGCTCAATATGATATTGAACTTCAAGATAAATTATATAATTTTGGAATTGATATTGGTTTATTATTTCAAATCCAAGATGATATTATTGATGAGACTCAAAGTGAAGAAGAAGCAGGAAAAACTACTCATAATGATGAGACTAAAAACTCATTTGTAAACTTACTTGGATTACAAGGTGCTATTGATTCAGCTGATAAATTGGCAAAGAAATGCGAAGAAGAATTGAACATATTTAATAATTCTTTAAAACAATCATTAGAAGAATTACTTTTAAAATATTTACACAGACATAAAAAATAATAAAACTTTTAGTCAAATTAACTCAAAGTACTTGACAAAAAATAAAAAATTTTATAAAATTTAGCACTCAAAAAATTAGAGTGCTAATTTAATTTTTAAACTTGATAGGAGATACTATAATGAATTTTAAACCACTAGGAGAAAGAGTTCTAGTAAAAAGAACTGAAGTTGAAAATAAAACTGCAAGTGGAATTTATATTCCTGACAATGCAAAAGAGAAACCACACACTGCAATAGTTAAAGCAGTAGGTTCAAAAGTTGAAGAGATAAAAGTGGGTGATACTGTAGTATTCGAACAATTCAGAGGAACAGAATTTAATTTAGAAGGTGAAGAATACTTAGTTTTAAATGTTGAAAATATTATTGGAGTTATGTAATATTGGTTAATTCAATATTATTAACACTTTTTAAATAAAAAATAAAAAAGGAAAATAGATGGCAAAAGAAGTAAGATTTAGTGATAATGCAAGAAATAAATTATTTGCTGGTGTAGAAAAATTAGCAGATGCTGTTAAAGTTACAATGGGACCTAGAGGAAGAAATGTTTTATTACAAAAATCTTTTGGTGCACCAAATATTACTAAAGATGGTGTATCTGTTGCAAGAGAAATTGAATTAGAAGATACTTTAGAAAATATGGGAGCACAACTTGTTAAAGAAGTTGCTTCAAAAACAGCTGATGAAGCTGGTGATGGTACGACTACAGCAACAGTTTTAGCTTATTCAATTTTTAAAGAAGGTTTAAGAAATGTAACTGCTGGAGCAAATCCAATCACTTTAAAAAGAGGTATGGATAAAGCATCTGAAGCTGTATTAAACGAATTAAAAAAATTATCAAAAGAAGTTGCAAATAAAACTGAAATTGAACAAGTAGCAACAATTTCTGCTAACTCAGATAATGCTATTGGTGCTATGATTGCTGAAGCTATGGATAAAGTAGGAAAAGATGGTGTTATTACTGTTGAAGAGGCAAAAGGTATTTCTGATGAGTTAGATGTTGTAGAAGGTATGCAATTTGATAGAGGTTATTTATCTCCATATTTTGTAACAAACTCTGAAAAAATGTTAGCAGAATTAGAAAATCCATATATTTTACTTTATGATAAAAAAATCTCTAATTTAAAAGAAATGTTACCTATTTTAGAAGCTGTTAATCAATCAGGAAGACCTTTATTAATAGTTGCTGAAGATGTAGATGGTGAAGCATTAGCTACTTTAGTTGTAAATAGATTAAGAGGTTCTTTAAATATTGCTGCGGTTAAAGCTCCAGGTTTTGGTGATAGAAGAAAAGCTATGCTTGAAGATATTGCTGTATTAACTGGAGGTACAGTTATTTCAGAAGAGATGGGAATGACTTTAGATGGTGCAACAATTGATACTTTAGGTACAGCTTCTAGAGTTGTTATTGATAAAGATAATACAACTATTGTAAATGGTTCAGGTACTGCTGAAGCTGTTGAAGCAAGAGTTGGACAAATTAGAAATGAAATTGCAAATACTACAAGTGATTATGATAGAGAAAAATTACAAGAAAGACTTGCAAAACTTTCTGGTGGAGTTGCAGTAATTAAAGTTGGTGCTGCTACAGAAACTGAAATGAAAGAGAAAAAAGATAGAGTTGATGATGCATTAAGTGCAACAAGAGCTGCTGTTGAAGAAGGAATTGTAATTGGTGGAGGTGCAGCATTAATTAAAGCTGCTGCTAAAGTAAATTTAGAACTTGATGGTGATGAACAAATTGGTGCAGATATTGTATTAAGAGCAATTTCAGCTCCTTTAAAACAAATTTCTACAAATGCAGGATTTGATGCTGGTGTTGTAGAAAATGAAGTTAAAAAAGCTGATAGTGATACTTATGGATTTGATGCAGCTAGTGGAAAATATGTTGATATGTTTGAAGCTGGTATTGTTGATCCTGCAAAAGTTGAAAGAGTTGCTATGCAAAATGCAGTATCAGTGGCATCACTTCTTTTAACAACTGAAGCAACTGTTACAGATATAAAAGAAGATAAACAAACTCCTGCAATGCCTGATATGGGTGGAATGGGTGGAATGCCTGGTATGATGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP032098|474992:483313|480056_480380_+|AXX91499.1|DBSCAN-SWA MFDGIDLSKLNLNEMMSQVQEMAEKAKEENSSKIFTAKAGGGMVEISINGNSEVVDLQIDDSLMDDKDSLQILLISCMNDVIKQSDENKKMMAMNMMGGMGSFGQKS >CP032098|474992:483313|481362_481620_+|AXX91501.1|DBSCAN-SWA MNFKPLGERVLVKRTEVENKTASGIYIPDNAKEKPHTAIVKAVGSKVEEIKVGDTVVFEQFRGTEFNLEGEEYLVLNVENIIGVM >CP032098|474992:483313|476365_476860_+|AXX91493.1|DBSCAN-SWA MEKNLNNDEQDVIDYANSSEYMTFELGAMKYAIELPKIREILTYPDIITHLPNTEDWVKGLINLRGEVVPILDIRIKFNTGEPIYDSNTAVIAVITEDKRMIGIIVDKVDDVQRLDTSALAPVSDMGSAIPSKYLKGFVRLENNQMLVIMDIESVVHKDELKDT >CP032098|474992:483313|479305_479668_+|AXX91497.1|DBSCAN-SWA METATIPQPTFYLFKCEQSAPSGMSKPACVNEQTQDLYNYLTQGLMQKGIMGPVQAIRTACLGRCQFGPVMLVEPGHYMYCHLSKEKIDKIIDNHILNKEPVIEYLIPEQFWAEPISLGK >CP032098|474992:483313|477250_478627_+|AXX91495.1|DBSCAN-SWA MAINKEVLKRLKALYIEDDDTIRKELSALLSNFFGKIYIAKDGKDGLEQYLKNSDDIDVIISDINMPYLTGIEMVKKIREINKKVPVIFTTAYSDNQFLADAIKLKVYEYIIKPIDIRNLLVVLNELATILYQEELINKQTLELEKFKDVIDTNNIVIKTDENMNIVYVNELFCKTTEFLKEELIGKELSFLRHNDTDIKIYKDIYESVEVNKQWKGRIKNITKEGGYYVSDTYIITTTNDNNQVTGSICVQNDITDELNKKREIQKALIKDKGDIFIKSKAGSAEQTVTINNLRYDIEELKTTVKKLKAERDKSLYKIDNLNKENKKLRSELGYQKSIEQKNKLDNAFTLKASKENVDLKIQVKKLNAKIEDTVEFYEKKCKQLEVNAQMEIEDLEQELHDIKTKLGKIDNAEMMTQKIEYWKEKAKSESKRAEKMEKEIMKSSDKSLMDKIFSLTK >CP032098|474992:483313|474992_476180_+|AXX91492.1|DBSCAN-SWA MNAPITVTSLSTQIKSLLETTFMDVYVEGEISNLTYHSSGHIYFSIKDDKSTMSCVMFRGNTKYLKFKLEVGLKINIRGSLTVYTPRGSYQLICNRIEPSGQGALALAYEQLKEKLKQKGYFDPSIKKNLPKYPKKIALVTSPTGAAIQDMLKVANHRWNLVEFILVPTLVQGETAKDDIAKSIKYADTLNCDIIIVGRGGGSIEDLWAFNEEIVANAIYEAQTVIISAVGHEVDFLISDFVADVRAATPSNAIEIALPDTNEHRIYIDTLTQDFENRLKNILYSKEQNIIHLKRMYEQNSIETKFNLISSEIKMLKLSFDNRFSNILNSCQNSISLLKNSFEHNSPEKKHKKGFVQISKDNKIIELENINIGDNISLQTPTHIANAKIENIKKQ >CP032098|474992:483313|480379_481243_+|AXX91500.1|DBSCAN-SWA MTNLLIDFEDYLFNNLPSSKTFHPYFESALKDMLKAGGKRFRPMLLLSVVKSKNRLLLQNSMQVALGIEYLHTYSLIHDDLPAMDNANLRRGFQTLHKKYDEVTAILVGDALNTHSFNLIANSSLSSDIKVQLIKTLSNDGGIDGMIIGQAIDCYFENQLLKLDQLEFLHIHKTAKLIAASLKMGAIIAQYDIELQDKLYNFGIDIGLLFQIQDDIIDETQSEEEAGKTTHNDETKNSFVNLLGLQGAIDSADKLAKKCEEELNIFNNSLKQSLEELLLKYLHRHKK >CP032098|474992:483313|479680_480064_+|AXX91498.1|DBSCAN-SWA MTFDMLYSKIHRATVTDANLNYVGSITIDEELMDAAKIRVGQKVDIVNINNGERFATYVIKGKAGSKDMCLNGAAARKVEIGDKIIVISYASYSEEELKNYKPTVVLVDDKNNVETITNELVGSDYV >CP032098|474992:483313|476859_477264_+|AXX91494.1|DBSCAN-SWA MQKKIEKLRKLKLLFVEDEKDLIEIISDTLRKLEANFLTAHNGKEALDLVEQNDDIDAIITDINMPILNGIEMIKILKDKKPYLPVIIMSAHTENEYRQKANEYGVKDYLLKPFDFIKFIDLITSMKLGKNGNK >CP032098|474992:483313|481678_483313_+|AXX91502.1|DBSCAN-SWA MAKEVRFSDNARNKLFAGVEKLADAVKVTMGPRGRNVLLQKSFGAPNITKDGVSVAREIELEDTLENMGAQLVKEVASKTADEAGDGTTTATVLAYSIFKEGLRNVTAGANPITLKRGMDKASEAVLNELKKLSKEVANKTEIEQVATISANSDNAIGAMIAEAMDKVGKDGVITVEEAKGISDELDVVEGMQFDRGYLSPYFVTNSEKMLAELENPYILLYDKKISNLKEMLPILEAVNQSGRPLLIVAEDVDGEALATLVVNRLRGSLNIAAVKAPGFGDRRKAMLEDIAVLTGGTVISEEMGMTLDGATIDTLGTASRVVIDKDNTTIVNGSGTAEAVEARVGQIRNEIANTTSDYDREKLQERLAKLSGGVAVIKVGAATETEMKEKKDRVDDALSATRAAVEEGIVIGGGAALIKAAAKVNLELDGDEQIGADIVLRAISAPLKQISTNAGFDAGVVENEVKKADSDTYGFDAASGKYVDMFEAGIVDPAKVERVAMQNAVSVASLLLTTEATVTDIKEDKQTPAMPDMGGMGGMPGMM >CP032098|474992:483313|478644_479175_-|AXX91496.1|DBSCAN-SWA MFRIFILISSIVIMLQAANPIAVLKTSKGEIDVELRKDLAPKAVENFITHAKNGYYNNTIFHRVIKNFMIQGGDPTGTGAGGESIWKKPFKDEFASNAVFDKAGILAMANKGPNTNGSQFFITTAPTYWLNGKHTIFGYVKKGMDVVRKIENVPTSGKYQGNKPLIEQKIISITIK |
11 | Indivirus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
784414 : 794639
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP032098|784414:794639|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP032098|784414:794639|785930_787115_+|AXX91773.1|DBSCAN-SWA MNNNKYKIAIAGTGYVGLSNGILLSQHNEVIALDIIEKKVELLNKKISPIEDKEIQEYLSSKELNFKATLDKNEAYKNADFIIIATPTDYDTQTNYFNTKSVEAVISDVLSINPNATMVIKSTVPVGYTKSIKEKFNTENIIFSPEFLREGKALYDNLYPSRIIVGEQSQRAKTFASLLAQGAIKEDISTLFIDNTEAEAVKLFSNTYLAMRVAYFNELDSYAQSNNLNTRQIIEGVGLDPRIGSHYNNPSFGYGGYCLPKDTKQLRANYKEVPNNLISAIVDANSTRKDFIADSIIAKAPKTVGIYRLVMKSGSDNFRASAIQGIMKRIKAKGIEVVVYEPALEEDEFFHSKVIKDLNEFKKISDVIVANRISQDIKDVEEKIYTRDIFNSDS >CP032098|784414:794639|788342_789587_+|AXX91775.1|DBSCAN-SWA MDKICIIGLGYVGLPLAHAFSVKYEVVGLDIYQTRIDELNNAHDRTLELSREQLKEAIDNGIKFTCNIEDIKDCNIFIVTVPTPIDKNKQPDLTPLLKASETVGKVLKKDDIVIYESTVYPGATEEVCVPILEKFSNLEFNKDFYCGYSPERINPGDKKHTVTKILKVTSGSTPKIGQKVDELYSSIITAGTHLAPTIKVAEAAKVIENSQRDINIAFVNELSIIFNKLDIDTNAVLEAAGTKWNFLPFRPGLVGGHCIGVDPYYLTHKAQSIGYNPEIILAGRRLNDNMGIYVANQVIKLMIKKGQKIEGSNVLVLGITFKENCPDIRNSRVIDVIEELQEFGCNIAVSDYWADKDEVKHEYNIDLKDEVNFEDYEAIVLAVAHDNYKVLNLKNDDNVVFDIKSILEKSDGKL >CP032098|784414:794639|784414_785818_+|AXX91772.1|DBSCAN-SWA MKINLVEKTKKLKSSIEIIILSDIEESKDKKVLKTLNFEPKDETSVFLVESNKIYVGCENQDYDSVAIAIATAIKKFISTTTKSAKIVLSDTTLLNAIVEGALLGSYSFTTYKSDKQKCKKQELNIVVEKVTNELEKVVENSIIISDNVNKVRDMVNTTPADFYPEVMAKKAEEIAVENELECKILGEKYLEKHSMNAMLSVGRASVHESKLIHLSYKPKDAKKKVVLVGKGLTYDSGGLSLKPADYMTTMKSDKSGGCAVLGIINAVSILKLPIEIHAIVGAVENMIGGDAYKPDDVLTARNGKTIEVKNTDAEGRLVLADCLCYAQDEIENIDYIFDYATLTGACVVGVGEYTTGIMGNCEKLKRKAVSNALISGEYATSLDFNRFLRKTLKSEVADINNISSTRYGGAITAGIFLDNFINKENKDKWLHFDIAGPAYVEKAWGYNPFGASGAGVRMTLELLKNL >CP032098|784414:794639|790989_792030_+|AXX91777.1|DBSCAN-SWA MNRMKKAFITGITGQDGSYLAEFLLEKGYEVHAIQRRSSVFTTQRIEHILDHPNLKTYHGDLTDSSNLHTLLAKIQPDEVYNLGAQSHVAVSFEVPEYTAEVDAIGTVRLLNAIKDLNLKPKFYQASTSELFGGLPETAPQSEKTPFYPKSPYGAAKLYAYWVTVNYRESYDLFACNGILFNHESPRRGETFVTKKITKAVANIYKGKQENLQLGNLDAKRDWGYARDYVECMWLMLQQNEPQDYVIATGKTYTIREFVELAFKEVGIEIEWSGKGVNEKGIDKVTRKELVVVNPKYFRPAEVEFLWGDPSKAMNELNWEPKTSLEKLVKIMVKYDLEYDNFGGKE >CP032098|784414:794639|792579_792984_+|AXX91779.1|DBSCAN-SWA MAVKEVIKDGIVLARHIPSEDWKEGLSFYSEDNEFIQVGAWGYDTGKELLAHIHNEVERQVYWTQEVLYIKKGSIKAKVYDTDENFVEEIIAKEGDTMILLRGGHGYTILEDGTQVLEVKNGPYVGADKDRRRI >CP032098|784414:794639|789590_790970_+|AXX91776.1|DBSCAN-SWA MTNIILCGGSGTRLWPISRTLMPKQFVKFFDDKSLFQLTVRRNSKICDNQFIVSNAEQYFLALDQLEELNKNNNRYLLEPIGRNTAPAIALACFSLDAEEIVLVTPSDHLIKDEKEYSKVLKKAQNLANENNLVTFGIKPTFAETGFGYIETISLEKEDVKAFHEKPDFDTATKYLKSGNYYWNSGMFMFKAGVFLEELKKYSPKIYESSKKSIENISNSELIRIKYEDMINIPEDSIDYAVMEKSDKVKVVSSDISWSDVGSFDSLYEELPKDEKNNTINENLINIDSSNNLIYTQDRKVAIIDIEDLIIIDTEDALLISKKGSSQKVKKVVKRLNEESSELINIHKTGYRPWGSYTVLQESNGYKIKKIEVKPGKRLSLQKHFHRNEHWIVVSGCATVTVEDEKFILNPNESTYIKAGQLHRLENEGKLPLIIIEAQVGEYTGEDDIIRIEDDFERN >CP032098|784414:794639|793544_794639_+|AXX91781.1|DBSCAN-SWA MEFIMQMQPWFAEEEKKAICEYMDEGGFLTEFKRTEKFEQMIAEYTGAKHSIVVNNGTISLTLAAMAVGIEAGDEVIVPNYTMIATPNSVKMFDAVPVFVDVEPETLCLDIEKVKNAITAKTKAIMLVSANGRYPKSGIKAFEDLCKEKNIILIEDSAQSLGSFYPDGRHIGTAGLVGSFSFSAPKIISTGQGGALITNDDEVANKIRRLKDFGRSGGGNDIHDSIGFNFKFTELQACIGIEQMKKLQQRVVRKKEIFELYTKLLKDVKEVKFFEQDLSCTTPWFYDTTVENREELQKFLKENNIGTRVMYGPINKQVAYNVEGEHEVSNMIGQKGLWLPSTTQLTDDEIKYICSKIIEFYKGL >CP032098|784414:794639|787261_788350_+|AXX91774.1|DBSCAN-SWA MKILVTGTAGFIGSHLAIKLLERGDEVVGLDNINDYYDQNVKYGRLQRGGIIDSLELGEDIPYGKLLTSKKNNNYKFIKLNLEDKEKVTKLFEDEKFDAVCNLAAQAGVRYSLTNPDSYIQSNIVGFLNLLEASRHNNVKNFSYASSSSVYGLNEELPFSTNHNVDHPISLYAASKKSNELMAHTYSHLYGISTTGLRFFTVYGPWGRPDMALFLFTKAALENRKIDVFNNGEMLRDFTYIDDIVEGVIRVIDNPAKSNETWDKKEASISSAPYKVYNIGNNNPVKLMDFIEAIENKLGKTIEKNMMPIQAGDVPATFADVNDLVQDLGYKPATPIQEGIDNFVDWYLEFFGYDKKGNKING >CP032098|784414:794639|792026_792578_+|AXX91778.1|DBSCAN-SWA MSFDFEITESKKLKGVMIIKPSISQDRRGTIWTSFLKEQIDKLLPDGLYFKHDKFSESRGNVLRGIHGDNKSWKLVTSVYGEIHQVVVDCRKDSPTYLQWEEFIINKDNQQLILIPPMMGNSYYISSENAVYHYKLAYDGDYIDADGQFTFAWNDPNIAIKWPTKTPILSDRDMEAHLKQEGK >CP032098|784414:794639|792984_793545_+|AXX91780.1|DBSCAN-SWA MNNDNIFFDISKLKSCGKNVIIGKTVRIRYPELVEIGDNVIIDDFTYISTQLKLSSNIHISSGCKIIGGRESYVEFGEFSTLAPNVTLSAGSDDYIGGIATPIVPLELKGDVELGEIIFGKHCIVGANSVVLPNVTFHDGSSLGALSLAKKDLEEWSLYAGIPAKKIKNRNKEQILDYEKKFMEKL |
10 | Tupanvirus(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1425090 : 1491572
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP032098|1425090:1491572|DBSCAN-SWA 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57 | Staphylococcus_phage(16.67%) | plate,integrase,tRNA | attL 1478187:1478204|attR 1494168:1494185 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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