Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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CP027184 | Acinetobacter baumannii strain AR_0052 plasmid unnamed2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
CP027183 | Acinetobacter baumannii strain AR_0052 chromosome, complete genome | 1 crisprs | WYL,cas3,csa3,DEDDh | 0 | 0 | 16 | 0 |
CP027186 | Acinetobacter baumannii strain AR_0052 plasmid unnamed4 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP027185 | Acinetobacter baumannii strain AR_0052 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
CP027187 | Acinetobacter baumannii strain AR_0052 plasmid unnamed3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
9620 : 55527
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP027184|9620:55527|DBSCAN-SWA 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>CP027184|9620:55527|12154_12415_-|AVI39340.1|DBSCAN-SWA MMHLDPAWLKKSYEGIFNEPIELAIESTLRSDPQLSHLILSTYNILNNNESQLMKDTYLDLLLENLVNKKFYINVKSLSRHYLILH >CP027184|9620:55527|52201_52429_-|AVI39305.1|DBSCAN-SWA MTKPKYTPEIRDRAVQLLIESEKDYPSNWAAITAIAPKIGCTPETLRVWYLKHLDQQILSKYNRHQIKKNEADGT >CP027184|9620:55527|15545_15812_-|AVI39283.1|transposase|DBSCAN-SWA MIESEKDYPSNWAAITAIAPKIGCTPETLRVWYLKHLDQQNPIKVQQASDQEKMKQMEREIKELKRANEILRKAAAFFAQAELDRPHK >CP027184|9620:55527|21680_21998_-|AVI39333.1|DBSCAN-SWA MTKPKYTPEIRDRAVQLLIESEKDYPSNWAAITAIAPKIGCTPETLRVWYLKHLDQQNPIKVQQASDQEKMKQMEREIKELKRANEILRKAAAFFAQAELDRPHK >CP027184|9620:55527|49340_49652_-|AVI39295.1|transposase|DBSCAN-SWA MKTKLKQLDIHYTRIASDHWDSFITAFKNGKQSIGKFFTVGIEGNNCKIRHRIRRSFRRSCNFSKKLENHFKAFDLAFFSFTSIMASFKGSILFEAPPKFYVK >CP027184|9620:55527|45078_45981_-|AVI39269.1|DBSCAN-SWA 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MYTNTWTILWLSFLAYVIGCFNYLKIKNSYEKILYFNF >CP027184|9620:55527|47836_48541_+|AVI39284.1|transposase|DBSCAN-SWA MNPFKGRHFQRDIILWAVRWYCKYGISYRELQEMLAERGVNVDHSTIYRWVQRYAPEMEKRLRWYWRNPSDLCPWHMDETYVKVNGRWAYLYRAVDSRGRTVDFYLSSRRNSKAAYRFLGKILNNVKKWQIPRFINTDKAPAYGRALALLKREGRCPSDVEHRQIKYRNNVIECDHGKLKRIIGATLGFKSMKTAYATIKGIEVMRALRKGQASAFYYGDPLGEMRLVSRVFET >CP027184|9620:55527|34724_35222_-|AVI39292.1|DBSCAN-SWA MIYVEISEELENDAEEMGISNELNFIADQFLIYKQASRNREHPAPSRNVQERDQPASEYFGRDRFDKFSKNAQKEEIQHVHLRQEDSIWEDEEGYGYAQWHCTSDSYLVYSYFKYKNDHYYYLIEFFGESAHSLYEKKTEKFIQCAKDFRFKKLKELENNNDKLR >CP027184|9620:55527|36300_37203_+|AVI39338.1|DBSCAN-SWA MENSQPSDYAKYVYELELLNSPLFHITSKKRLAILLCSSIKELNHIVRSKNQMYQYFNENKTDDSGNIIKVRPIQNPHDRLKQIHSRIGKFLGNLKAPDYLHSKRSKSAISNAKAHVGLKGHTLNIDITDFYPSTSKAKVQSFFGYTLQYPTDIAKYISEVCTVNNCLPTGSPLSSALAFWANKSMFDEIYRMAKSRSITMTVYVDDISFTGKAVNQNFLNKIIQIIEKYQHNIKQEKIKFFPENSIKFVTGVAIVNGSLQPAHRHFRDIRQLKKIDNNIQAALRLIGKNNYIKQIINHV >CP027184|9620:55527|16397_16811_+|AVI39327.1|DBSCAN-SWA MKYSNEKIVKALLLSPLPLLFFTAVRFIVMNQEYSLYSILVVLVGHGLVYLAYCILTVPFSFIFSILLNRYNSLNLLTICIASIIIATPFFILFEWSHTGEISKEWWKMYTNTWTIFMALFPGLCYWLFLINLKDKE >CP027184|9620:55527|14644_15187_-|AVI39336.1|DBSCAN-SWA MKRNFSADHPDQLWVADFTYIQTNSGWVYTAFIIDVFSRAIVGWKVSTRMNTDMVLDALEQALHDRGMPKNVIHHSDRGVQYLSIRYTNRLEAANLRASVGTTGDSYDNALAETVNGLYKTEVIEYLKADWQGLADVQLATLNWVDWFNKERVHSALGYVSPFDFEAMYYDKINPLGQVA >CP027184|9620:55527|26190_26478_-|AVI39294.1|DBSCAN-SWA MTYKLDFLEEALAEWNKLNPSIKQPLKKKLIKVLENPHIPKNKLSGHPNRYKIKLRSVGYRLVYEVIDDEVVVIVIAVGRRENNAVYDEANSRHS >CP027184|9620:55527|52595_52838_+|AVI39306.1|transposase|DBSCAN-SWA MVRGSGIRDIAEVERISIGKVLRTLTESTYEIQPQQSHYESLEVDEFWNFVGNKRINNGLFLFKSHILPRRNRTFLLVRI |
63 | uncultured_virus(34.38%) | integrase,transposase | attL 51175:51200|attR 56297:56322 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP027183_1 | 219034-219118 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP027183_1
|
1 spacers
spacers of CP027183_1
>1.1|219058|37|CP027183|CRISPRCasFinder GCGCAAGACAAGTAGTGAAACTGCGCGTAGAGTAAAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP027183_1
The CRISPR arrays of CP027183_1 >merge|CP027183|1|219034-219118|CRISPRCasFinder AAGATTGATAATCTTTTAATTTTGGCGCAAGACAAGTAGTGAAACTGCGCGTAGAGTAAAGAAGATTGATAATATTTTAATTTTG >CP027183|1|1|219034-219118|CRISPRCasFinder AAGATTGATAATCTTTTAATTTTG GCGCAAGACAAGTAGTGAAACTGCGCGTAGAGTAAAG AAGATTGATAATATTTTAATTTTG
>CP027183.1|AVI37841.1|217659_218568_-|hypothetical-protein MNIASIKTSYFEPWLQFSHPMVRQLAFTIASPNLLSQLPCSLTIRHNFQLHTDQSWEQHFQNYLPRLKQLDAAPEPLLQFMSRLKSTRLGLRFENLLWFWLQEDQYHPYQLLGHSIQKIDGAKTLGELDFLVLNQNTQEIEHWEVALKYYLGEGQLNLEQWIGLNRQDTLSKKLYHFTDKQFQFSEALGFKVQQRFAVLKGQLYLPLNLPQEQPIPEWVNLKRRLGTWGTEIPKSDFYRLERHEWLCPHQKASSNTAYWWTDGLYCQNINETRFYMFRHPALLSLKPSLIKNNGVLQETTSL >CP027183.1|AVI37354.1|217417_217561_-|entericidin-EcnA/B-family-protein MMKKVLVASVMVAFVLTGCNTFKGFGQDVSKAGDAVTNTAQKTENKM >CP027183.1|AVI35866.1|216158_217205_-|succinyl-diaminopimelate-desuccinylase MADRLAKVGFHIEPMRFGDVDNLWARRGTQGPVFCFAGHTDVVPTGRLDAWNSDPFAPEIRDGKLYGRGSADMKTALAAMVVASERFVAKHPNHKGSIAFLITSDEEGPAVNGTVKVIETLEKRNEKITWCLVGEPSSTHKLGDIVKNGRRGSLNAVLKVQGKQGHVAYPHLARNPIHEASPALAELCQTVWDNGNEYFPATSFQISNIHAGTGATNVIPGALEVTFNFRYSTEVTAEQLKQRVHEILDKHGLQYEIVWNLSGLPFLTPVGELVNAAQTAILNVTGTETELSTSGGTSDGRFIAPTGAQVLELGVLNATIHQINEHVDVHDLDPLTDIYEQILENLLA >CP027183.1|AVI38410.1|215139_216021_+|alpha/beta-hydrolase-fold-family-protein MSIHKELHILKTDDHSEFALWEVAKSENTLIKKEAIFLSHGAFSDKTVCMGIADYLANHGYICFILEWRGHGTSPKTDIPFNFETVALYEYKTAFHYIYHHFNIASLHCVTHSGGGLCLTMFLINYPEYLKNIQSITFIACQAFGAVNNSFDFIKLFSAKLIVKGLGQIPANKFKLGRVNESYYTMRPWFNWNLKQNFISEYKNIDYKKHMSSIRVPIYSISGTGDKFIAPVKGCYKYLKAFENQDNVFREFGCSNNNLENYSHSRIVLSQNAAKEVWPTILQWIDKNSKEVL >CP027183.1|AVI37719.1|213830_215132_+|radical-SAM-superfamily-protein MWKTDLKEEENNYFLLNTDAQYKSINLYLGIPYCIPTDPPHCGFCLFPTQDYKGKREMDFYLDFLSREAHLYKEFYQGAKLESLYVGGGTPNLLQPNDYMKLTKVVSSLFPDAGISSPIEMTLEGIPQLFNEDKIRAIKDAGFNRVSMGVQQVNDELITTSSRKQTRKQVFDAIEWFHKYSLSCNVDLIYGWPNQTVEAMLRDLESIVQSGIKHITHYELNIAGRSDFATKQKQNTPSIEKKIEMYNIAKQFLISKGYKQKTVYDWEKEDNNQLISEKYLYEDNLRDCLDANGQSKMTTMSGLGYAAVNMRLQPNSSSIKSVSAMNHRNLTEYYNAISLNKLPVERMFVHDTEDVKLIWIFQALQEMKINTKKYEKIFNSDIKLDYKPIWDALAEEGWVEHNDEYIKLINEGEFYTPLIQVLLSQPRIKSLQQ >CP027183.1|AVI37611.1|213057_213486_+|hypothetical-protein MDQQELHHLITVSTGFIDAYIIECNDQVPMLLPQNIVLSAMDVKNGVKHIEWHDVKLPVYSVHNAIDQHAVALVIEGEDISQRFALICKTMPVSTRLRISEIVDEMDEHEAEQHPAVFKYVRMQDQRYYIPNLEYIEKSLGL >CP027183.1|AVI38983.1|208504_213025_+|cheW-like-domain-protein MKEILKTLTEAMTLPEDSYSEQDAEFLEIFIEEIEEIFVDLQPLINKWMQSENIAKLTEIRRHFHTLKGSGRMIGAKSSAELAWTVEDTLNRVINQSLQLTPTIQSYVQLVFKFYFLKLVDNFKQKRAHTLDFRPLILLGQQLQQQQSLEPALEELLQLSNTLTAETVTGLELDYIEQDSLAEPIIQATHTEIEINLDETLTLFMEEAEEHLATIHQFLDQELHQYDSYNALIRALHTLRGSSAMAQVETIFEASTKVEHLFKILLQEELSSHSEEILLLQEYREFVRDSLELLSRYSSSEQLEARLQQFNQSWDAYVEQHGDRTDPLMPSHGLVSQLLQLDVSELLDAELDFEKGIRNEFPDYLERLSEQADLLLQHTHSQAMLGLHEYTSQLKESYEVLLDKPALLQSDYIFEIYQKAHQQLIQLFDALAAGQRVGVVKQHQSILEELKLYTQYIPDLSNDLSQQDSTSFEPISNIEPEPEVVATVENFSDSADWAVLGQSVQQDRQYISSTQVNRNFDADLLDIFLEEAEELLEGIDTDLNIWVGEQENFAALNNLMRYLHTLKGGANMVQATYLGLIAHELESIYERLIQKQLVATSDLIDFIRLVQDDLADRLQIMREQQLDYAAPYTINALKRAGQNSNFQPVSVVEAFDAESEVFSEQEVISEIIIDEIPVELEPALAKLETHHDQVFDTAVTELATPVEVITSVTSQENEVAADEQDIDAVVEQTFLEEAIELLEMAESLLKQWFEQRTNRSILLQLQRAVHSLKGGARMVGLEAVQAIAYQLENAFEQFALHHFNSNIYDHLLESAIAWLKDAIFNHNYQHFDGLQQSLENIQFFETTIQIPTKLTRADLFSSEPVMTFIQGDGTEPPPMMGAWEQTERLDQNNEMIRVSADLIEKMIDLSGENSINRSRIEMDLSQFSHTLVEMELAIQRLADQLRRMEGELETQIIAKHGIEHSRYTDFDPLEMDQYSSLNQLSKSLAESASDLVDFKNTLSDKIRDTESLLLQQSRIQAEIQEGLMRTRLVPFSRLLPRLQRIVRQTSTALNRPAELFVNNTEGELDRNILERLVIPLEHMLRNAIDHGLEDRAQRQQANKPETGRIELNIQRQGTDVVVVFSDDGQGIDVEKVRQKALLAGLIKPEQDLEQQDILQLIFHPGLSTAEQVTQISGRGVGLDVVQSDIKSLGGHVSVESVYGQGTTFTIRVPTTVAVSDALMVKVADQQFAIPLAQIDRIIRVSPASLEQYFESPQELFEYENKRYPLRYLSEFVGNQPIPRLNGVMYSLPVLMIKANNGQTVALLVDQLIGSRAQIVVKPIGQQFSSIGAIAGATILGDGQVCLILDGQNIARQIQSTQRHKQLSEAIYRQRESDERRLIMIVDDSVTVRKVTSRLLERQGYDVVTAKDGVDAIEQLENIKPDLMLLDIEMPRMDGFEVLNLVRHHDMHQYMPIIMITSRTGEKHRERAFSLGVSQYMGKPFQEEELLENIDALLVASDSEVKS >CP027183.1|AVI38257.1|206279_208358_+|methyl-accepting-chemotaxis-(MCP)-signaling-domain-protein MGFKLKKKSGNRGATGKSSVNFIAKIQSKIEQFASLFGESEKSKPILYAALLCLVCALISLAYLFYNVPRHNQLIRSLGELRLLSQTISKQATEATESGSQEAITKLQQSKKDFDENLLEIENIHGKSTDEYQKVEKIWGEVSKNIDLISSHQRVLNQLYDTNISISETVPEIQAEYNLMVDQMARQGLPSSQVIIAKNQVFIAERILRSINSVLSGTDGNVSTSDFSVDIETFGTYLNAELNGNAELGVDRIADPALRESLESIKSEYDKVLKSAAATVLKNGSQIVNVRQASSQIFSKSDVMLESLGHLSDVARKNWLTLFLGAVLILSLGGLIFSVFKLITLRSVMDKQRVARLQEEYDRNQNAILRLLDEIADLADGDLRSYATVSEDFTGAIADSINFAIDQLRDLVSRIHETSQEVARYTQDTQSITNQLAEASEHQAQEIAGASTAMNEMAQSIDQVSANASESAEVAQRSVQIASNGAQVVNRSIEGMDTIREQIQETSKRIKRLGESSQEIGNIVSLINDIADQTNILALNAAIQASMAGEAGRGFAVVADEVQRLAERSASATKQIETLVKTIQTDTNEAVISMEQTTTEVVRGANLAKDAGIALDEIQKVSGDLAKLIASISDAAKLQSASASHIATTMTVVQEITSQTTTATFDTARSVSELANMAESLRESVTDFKLPD >CP027183.1|AVI38635.1|205696_206233_+|cheW-like-domain-protein MAANGFIELLRLSKRGNKNYASVQNEAQRWSGIAFEMRGQYFVAPLGEVSEVIYPPKYTPVPNTQSWVKGLANIRGRLLSVSDLAHFISGQRSSFSSTQKVLCISHHDQYVGLVVDQVLGIQHFNKKSFFSQSSDLEENLKEYCQGYFHQHNQHWHVFLFSRLLQNPHYMNASTKFIN >CP027183.1|AVI37800.1|205273_205636_+|response-regulator MARILIVDDSPTETFRFKEILTKHGYDVLEASNGADGVTLAKAEQPDLVLMDVVMPGVNGFQATRQITRDEDTKHIPVVIVSTKDQATDRVWGKRQGAIDYLIKPIEEKQLIDVIKQFLN >CP027183.1|AVI39072.1|219191_219695_+|L,D-transpeptidase-catalytic-domain-protein MSQFKLEDADILIDLANQTLSLPKHNKFYVVSTGKNGIGEQENTGKTPRGWHRVAKKFGMQSPKNAVFIARQPTGEVYSSELAAQFPERDWILSRILWLDGLEEGFNKGEGHDTMQRYIYIHGTPDKEPMGVPMSHGCIRMRNEEIIELFDLVSEDALVYLSEQSLT >CP027183.1|AVI35663.1|220764_221550_-|hypothetical-protein MQVSKWIRIFLAVIGSILFLDGLFLAFLNKIHVGTLVPLVLGAFFCLYALFYYHLERFFFYHYRLHTLWRFGWLCFWIWLISLGYFFNFIKENKDASQNLPAVKAIIVLGSGVENGQPSAILAKRLDTAAPVALSQPQAKVILTGGLDFSEKEPEALVMSRYLEQHFHITKDRMILEDKSTSTELNLKNSKPLLEQAHISVNQPIAIVTSDFHTPRAAAIAKKQGYTQVYMVAAETPLITRYNAWLREYFAYASGWLLNEY >CP027183.1|AVI36280.1|221676_224223_-|pepSY-associated-TM-helix-family-protein MFKKFLFQIHWFLGISAGLILSIMGVTGAIYSYDQQILKWVNTDSYVVQAQSSPKLTPAQLYQHFTTIQPEIKINSITIAKDPTASSVVNIEKEGERRGYNMMVNPYTAQVLPEVQGRKLLLLIQQIHRNLTAGEFGKQITGACALMLIYFVLSGLYLRWPKKHSARQWLAVKPKLKGRNFIWDLHAVVGTWVIVFYLLFACTGLYWSYDWWRSGMFKVLGVEQPKMQGHSGSGRNKDQLPKIQLDNAQLITALNQTWSGFNNQIGRDYSTLTVNLPKKDDGKIELSFVDAKPQHERARNQAVYNYKTANIEKMELYEDKKLNQKIMSSMLPVHRGSFFGPVYQFVAMLASLAMPLFFVTGWMLYLKRRKQKKLTQAARQSLAGHYIDQNAKPWLITYATQTGVAEQLAWSTATSLQEAHQPVQVKSVQQLTEADLQQHEQILFVISTYGTGEAPDLASNFAKKLLKTNLELQHVKYAVLALGSKEYPDTYCSFGHTVDEWLKNNGAKALFDTIEVDNANPADIQTWNQALVKATKLDLHAVNIEKVFDNWTLQQRDLLNPNSLGQPAYNIELTANHEAIWQAGDIAEIQPGNSPERINKFLQHLHILKNAVVDSLQVSIEKALWNKDLTGEIEPFANLDHLLEQLPTLPTREYSIASIPSQQVLRLVVRQQYDESGDLGLGSGWLTQHTEINQNVALRIRTNESFHLIDDNRPIICIGNGTGIAGLMSLLHTRTRHNYTENWLIFGERQRTHDFFYASTIEAWQTMGMLKRLDLAFSRDQEQRVYVQDIIRQNAAELINWIERGAVLYVCGSIDGMASGVDQALIHILGEEQVDELRQQGRYRRDVY >CP027183.1|AVI39027.1|224380_224956_-|ycxB-like-family-protein MTAKTLYAYTLQPVPYEVSEAEQRNAQLLIWRSTNKISTKIWAIMGVILALAILGLIFIKNYSTVICWVAIVCVVLYYLGRKYGLEWYVKRKMNEFPVQEIKGIRLGVQPHGIVMRQQMGLQEGVGTIGWKNIYEWYNTPDFILVNFKVKDPKGQEQQGAYILPKRMDSKNFSFNTIRKHLKESVGEPKTL >CP027183.1|AVI37231.1|225056_227231_-|integral-membrane,-YccS/YhfK-family-protein MKSWFKRLKRATYNTSFMYNVRMLIAFSGTAFVPYFLGHQLATIPLTLGVVAAGLSDIDDRFSVRIMNLIYTYIGFFITAASVQLLFPYPMLFALGLIASCIGWILLGSLGRRYATISYGCLVVSVYTMLGVHLFDQWYIQPALLVAGAAWYGLIATISFLLFPVRQLQDKLAASYASLGDFLFAKSNLFDVDMTPASYQQSMIDLSLENGKLITIFNDLKTALLTRLKGDRGQKGTRRSLHYYFVAQDIHERADSAHIDYQKLAKIFQHSDILFRFQRILAIQGKACQELNECILQRKPYIHNKRFKQSFENLRLSLVKLRDDQQYDLLWVNALFALYRNLKSIDSQLLNLETEQHIQSDKVKQAENQLKDDDLKGWNDIVVRIKQNLTPESVLFRHAIRVSIVLFIGYVFIQMTHIEYGYWIMLTALFVSQPNFNATKRRLRLRIVGTLVGIIVGLSIVFLVPSVEGQLVMLILSGVLFFELRSKQYAQATAFITILALINFNLDGSAVAAAIPRFVDTLIGCALAWFGVTFIWPDWKFRRLPRSIRRSLQAQCNYLAEVVKQYHEGHNHALNYRIVRRAAHNTDAEVASLISTLATEPDFDPTRKSDIFEFLCLNHTFLSYIAALGAHREKIQDQAVLNVLDQALDDIQGALLRDEMPDLTAQNMLQTIRQRLSQNDEDDQKSLIILQQLSLMLSVLNRFSMLKQRLSHDLDNDASELASL >CP027183.1|AVI36815.1|227403_228573_+|drug-resistance-transporter,-Bcr/CflA-subfamily-protein MLLALLTALGPLSIDMYLPALPQMAHDFGVSTQMVANTLPAYFFGLAIGQLVYGPLSDRIGRKKPLYFGLALYAVASLFCVLATNEWSLIAARILQALGGCVGVVMARAAIRDRLDVQGSAQAFSSMMIVMGLAPILAPMIGAWILIWFPWQAIFIALSIVGAICWLCVHFFFKETLAMDKRLKLSLYQVATLYGAIFKDASFRLPMFAGCLTGAALFCYISSAPAVFMDQYGLNQQEFAYVFGLNAFGIMLMSSLNKHLTTRVEITKRLKAGSMVQVTGASIVLIAGLISAAPLWLVMLGLFLAISGIGLTGPNAMALAMSKQGARAGTASAIMGSMQFACGLLGGVLLNFLIWSASLNMGVMMVLFTLSGFIVVLKAIRQAKSQSLS >CP027183.1|AVI35767.1|228600_229305_-|nitroreductase-family-protein MNLEQVRLVDEAITSRHSVRAFLSTPIEPEVIKDILRVASRAPSGTNTQPWKVYVVTGHKRDEMVERVCAAQIEVSKNPELAEQYKETFAYYPEKWVSPFIDRRRENGWGLYGLLDIKKGEKEKMAAQQLRNFKLFDAPVGIFFTVNKTMGIGSKMDIAMMIQNVMVAAKARGLDTCPQAAWNHFHPLVLDILGAADDEELVCAIALGHADPEHIVNTFITPREPVENFAVFLD >CP027183.1|AVI39133.1|229815_230019_+|hypothetical-protein MSLPLINKQFMKQGLAITIATMKMNVTHATTEPQEIQQLGTDLNALFFNEKEKGTDSRVMTMACYSL >CP027183.1|AVI36589.1|230003_230120_+|hypothetical-protein MLQSLKFKSSLDIRPKVYVNMLIGLNPVFITRLIDGNH >CP027183.1|AVI37964.1|230174_230342_+|hypothetical-protein MHSVHPNGNMFSGAMNLFYLKGAFSHVTFKGLVLGMMLLKLVTVIAIQVTLKVFP |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
400795 : 461019
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP027183|400795:461019|DBSCAN-SWA 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78 | Acinetobacter_phage(84.21%) | head,integrase,capsid,terminase,transposase | attL 430905:430921|attR 462338:462354 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
745803 : 760606
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP027183|745803:760606|DBSCAN-SWA 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10 | Acinetobacter_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
805368 : 854971
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP027183|805368:854971|DBSCAN-SWA 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71 | Acinetobacter_phage(83.33%) | head,integrase,terminase | attL 805761:805776|attR 813606:813621 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1138534 : 1181878
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP027183|1138534:1181878|DBSCAN-SWA 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41 | Enterobacteria_phage(12.5%) | transposase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1428030 : 1469818
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP027183|1428030:1469818|DBSCAN-SWA 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49 | Bacillus_virus(22.22%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1630626 : 1719727
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP027183|1630626:1719727|DBSCAN-SWA 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98 | Acinetobacter_phage(30.23%) | head,portal,capsid,integrase,protease,tRNA,terminase,transposase,holin,tail | attL 1679075:1679096|attR 1719864:1719885 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1772372 : 1852354
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP027183|1772372:1852354|DBSCAN-SWA 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>CP027183|1772372:1852354|1822887_1823100_-|AVI37039.1|DBSCAN-SWA MSFTLIFKKQSKSSKAAELLNKHVKEWAVRESRCGVLFAPDHDTTSLESCKKRFKDSPVSMKVEWSKKDE |
97 | uncultured_Caudovirales_phage(32.26%) | head,integrase,portal,capsid,protease,tRNA,terminase,transposase,holin,tail | attL 1810936:1810954|attR 1852497:1852515 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2126895 : 2195229
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP027183|2126895:2195229|DBSCAN-SWA 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61 | uncultured_Caudovirales_phage(19.05%) | transposase,integrase,tRNA | attL 2138791:2138808|attR 2201087:2201104 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2201108 : 2226924
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP027183|2201108:2226924|DBSCAN-SWA 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MDDILWLDLETYCPVPIKNGTHAYAEQVEITVFAWALNDGPVHVEDVASNPLSNELCKLLNDPNVKLIAHNSHFDRTVLRHALPKMGLDIVLPIERWEDTMVQALSHSLPGSLDSLCEIFKIDQDKAKDKAGKQLIQLFCKPRPANQKLRRATGETHPIEWARFLDYAKNDILAMRELHKKIPKWNYRGAELALWHLDQKINDRGVCIDLELVESAIGAVEKAQKGLAKRTVALTDGEVQAATQRDAMLKHILEAHGVSLPDMQKATLERRINDENLPLVVRELLAIRLQASTTSTAKYKALAKGVSSDGRLRGTLQFNGASRTGRWAGRLFQPQNLPRPTLKQDEIDEGIETLKIGCADMFYENVMELTSSAIRGCIQAPEGKKLVVADLSNIEGRALAWLAGETWKIKAFYDFDAGKGHDLYKLAYAKSFGVSPEEVDKEQRQVGKVQELALGYEGGVGAFLTFAVAYSLDLDDMAAQAFDSIDPSIMNEAIRAWEWHKKEKRTTFGLKKNTWLVCDSFKRSWRYAHPNISAWWNELRVAAINAINNPDKPFPCRKVIFIKKGSWLYIKLPSGRFLCYPGAKADDNRISYMGNNQYTRKWERLHTYGGKFAENITQAVARDVLGHNMPLIDSSGYEIDLSVHDEVITEADDVPEYNHEHLSSLLATNPEWALDLPLAAAGFESYRYKKD >CP027183|2201108:2226924|2219566_2219893_+|AVI35533.1|DBSCAN-SWA MNNLTDVPQFLGDLKGGVAEKQLGLFLSTVAGAVITHGKAGKVTLELTVNQISDSSQVEVAHKISFKAPTETGDKNENASGKTPMHVLQGGKLSLMPERVKAEDYLNG >CP027183|2201108:2226924|2203714_2204080_-|AVI38719.1|DBSCAN-SWA 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>CP027183|2201108:2226924|2216907_2217378_+|AVI37971.1|DBSCAN-SWA MTTDIHTWRSLICQDLIKAGLTNSKDIVAQASNIEVYVFGETNAADAKPESKNAEVKTSNPAKTQTVKETKAEKVEEVQETKSETAPVEEPKDEVVEETTKSEITEKEVKDTCLAVAKKDRAALLKILSDIGVTTVATIPTDKYAAVIEACEKALA >CP027183|2201108:2226924|2212190_2214800_-|AVI38417.1|DBSCAN-SWA 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>CP027183|2201108:2226924|2216096_2216762_+|AVI38860.1|DBSCAN-SWA MKAGLGNAIKQLRAAKKMSQQDLADKLGVDKGNVSRYESGKQFPDIDKLEKIASAFNVTVSALFEMAEGIEQPNVTGLRKNNKLPVLSWVQAGVWTNAEAVDLSEVTEWLPAPDDGCEDCFYLKVKGVSNEPEFLEGDYILVDPSVYYADMQSGDVIVVRKHSDATFKKLIIESDGSRYLQAINPNFVPNIIPLDEDCIFVGQVIDSVRYVYRAKRRTRFS >CP027183|2201108:2226924|2208878_2210501_-|AVI36784.1|terminase|DBSCAN-SWA MNKPNDDELLALIADMSESEIEQFINSLDEDERAVISRILANAPVWFPLEGPQMAAYTSDADIIGYGGAAGGGKTDLIAGLSLNVHKRVLIVRREKAQTDGIVQRIEEIVGHKNGYNTQKSAWRFDNGRLLEFGGLDNMGDEKRWQGRAHDLKALDEATEIRESQAMFVMGWNRTSDPTIKPKCLLTFNPPTTAEGRWVLDFFAPWIKKGYPNPAQPGELRWFARIGGKDQEVESNKPFVLIDDQIVYDFDTNDYKPELIIKPKSRTFIPARVTDNKYYMETGYMSTLQALPEPLRSQMLYGDFGAGIEDDPWQVIPTEWVEAAQARWKPLEDMRILHRGDFKMDSYGLDVARGGGDNTIGFARYAHWYDNPNVLEGKDSPDGPTSASFAVSHVRDHAPIHVDVIGVGASTYDFLKQSGIHVVPVDVRNAATAFDRSGQLSFYNLRSQLWWQFREALDPAYGSTVALPPEPKLLADLTAPRWALQGTKIKVESREEIIKRIGRSPDYGSAIINAQIDTPKRHIMQTINASAARRDYDPYA >CP027183|2201108:2226924|2224524_2225922_+|AVI35525.1|DBSCAN-SWA MTLPRKFVPHDYQHLIINHILDNERCAVFAGMGTGKTSSTLTALEILELFEPGPTLVVAPLRVAATTWPDEAKKWEHLQDYKVVAVVGSPEDRVRALKQKANAYAINYENLPWLIDFLGSKWPFTKVVADESTKLKGFRLRQGSVRARALGKVAHTRVKRFIELTGTPAPNGLKDLWGQLWFIDRGQRLGTSFSSFTDRWFQQIQVGVDRNAVNLVPFDHSQGEIHARINDVCLSIEAKDYFDIKEPIVYPIEVELTGKARKTYEEMEKEMFIELAETVEVEAFNAASKTMKCLQIASGSIYTDENGTWHPIHDLKIQALESVIEEAAGMPVLVAYHFKSDLERLLKAFPKGRHLDKDPQTIHDWNAGKIPVLFAHPASAGHGLNLQDGGNILVFFSHWWDLEQYQQIIERIGPTRQAQAGYDRPVYIYHIIAKDTMDEIVMERRESKREVQDLLMEAMKKRCEV >CP027183|2201108:2226924|2201108_2203145_-|AVI37473.1|DBSCAN-SWA MQYSFNGGVISPDMFGRIDQAKYQTGVAKCKNLYVELFGGVVYRAGFRYVHHYPKSMGKMRLIRFVFSEEQAVVLAIRAGAINFFADGGMLLNENNEPLEVAVPYAEEHLMQLRYAQSADVVTITHPNYPPRKIIRKSATEWITELVTVGYGIGTPQNVAATAHIEDKYKPGGSMHDSYIERDYSYQVTAVDEQNESAASLKVVVQNDLSLAGNYNTITWDAVTGANRYNIFKLRSGLASFIGETTETSFTDDNIETNGSITPPLIRNPFEFYPTAVAYHGQRKVYGGGYKSPQWIRMSRTATDDNFGYHIPTQDTDSIQIRFAARDGNGVKHLVTMSDLLILTSGALWKMSADGAVTAASVNMNKQYSTGANDVTPVEVDGATIFSSDQTGHVHEVSLASGYNASFYQTIDLSIMCPHLFDGHKIVDCALLRNPLNIIYFVRGDGVLLSLTYEPKQQVWAWAEHHTNGKFLSIAEIPEDDQSVLYAFIERDGFYTIERMLTRQPLDMQDKCYLDSSIQYKGGPTSTLTGLDWLEGQTVSVFADGGVKPDTKVENGTIKLPRELSNIWVGLNYEAELQTLPIFQEQKNPVKPKVVNKVHLRVRESQNILVGANQDIEDRTPIDEFKPRSNERYGSPLKLYSGLIEVPVDSTYERDIQITVKHDKPLPMKILALEVEMT >CP027183|2201108:2226924|2204862_2205885_-|AVI39070.1|DBSCAN-SWA MPTIVQTNPTLADVAHNIGTNSKVGAIIEVLNKRQDLLDDAVVLEANSGTHNKTSVRSGLPKGTWRKLNYGVQPEKTSRVQVSDSTGQLTSYSEVDKTLYDLQGENKKQWRSEEDAGFLEGMSQEVMENIIYGDVAGDVSTFNGLATRYNHLIDPETGVAPANAVNILDAGGTSTDNTSIYIVQWGREKTHLFYPQGTQAGLDIQDKGQQTVLDAQGGRYEAMRTYFQWDVGLSVRDWRSVVRIANIDVSDLSKDASTGANLIDLLDEALSLLPLAGSARTAIYMNRTVNQALKGQVNHFKNVRLTLEDFRKDGSRKIQAWDGEPIRICDVILNTEARVV >CP027183|2201108:2226924|2226279_2226576_+|AVI37676.1|DBSCAN-SWA MGKYIFVVESENPPQVYLDDVIPNIGKVIELKAEEIPNRVPASWLMERYNLSRKTIIDELRAFNLGGDGKHLYSPATVMPILDNLNKAKAQRQSRRKN >CP027183|2201108:2226924|2226600_2226924_-|AVI37066.1|DBSCAN-SWA MSVKITGNLKGLKQLTKNAEKLKAKGKASFTEIVSSEFISSHTDYSDIFDLFKQAGFEIETIEEVESIPEEDLDNFIREKTKFESFADLQKKAASEYMRKQLFNGVK |
34 | Bordetella_phage(38.1%) | head,tail,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2438833 : 2469258
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP027183|2438833:2469258|DBSCAN-SWA 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MAMTLEQTRQAIIEHMQVFTGIAQERIQYPNAPNFTVPKEGIWCRLTIAGGPSFISGIADKPCTRRTGNIMIQCFDRLHVGEKALTVLGDALLAHFEYFTIEHLECLNGQSIYAGKDADFIQYNVSIGFKVN |
38 | Acinetobacter_phage(87.5%) | head,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2473472 : 2484857
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP027183|2473472:2484857|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP027183|2473472:2484857|2480920_2481358_+|AVI38657.1|DBSCAN-SWA MNDLYLIQLIDKLTAIYLMQGVQPSELADAIFDDPYTNMSLIKNMNYIEVILSFKEQCDQTHNEHIRKVKYLYNHDRYLIQTSEAIDSKAFKISWDREKTISKIVSDIEKRLKEIGYSPKEMKKILSTLPTPPQLTNNSKLSLVS >CP027183|2473472:2484857|2482334_2483102_+|AVI35377.1|DBSCAN-SWA MTTENSKDNLHIWNAVKQTPTNFLKKIEFGYLKGKSDINPQWRLMAMTQAFGPVGHGWTYRHVRLWSETAPDGTIMAFAEVAVKTKIDGVWGEEFFGNGGSAIVEVQKGKLVAIDEGYKKAVTDALGVAFKAIGVAADVYLGNFDGSKYLYNYDYAYLEQNASTPAGQNTNPNNQTVAQGGNQKPPRTQDQLYQDALKAIKDAPDTNILNAAIKKFKGTTYEAGINRACQARADQMGWAPKNNPQQVQQQQSLHH >CP027183|2473472:2484857|2484359_2484857_+|AVI35498.1|DBSCAN-SWA MEVNFKNAKILDPCCGSRMFWFDRQNPNVVFGDIRKEEHKLCDGRTLVIEPDVLMDFRKMPFNDEQFSLVVFDPPHLLQAGKKSWLAAKYGKLSQDWREDIQKGFSECFRVLVKGGVLIFKWNETHIKVKEILALTDQRPLFGHISGKRSNTHWITFMKAESKEK >CP027183|2473472:2484857|2478326_2478995_+|AVI37517.1|DBSCAN-SWA MSLAIKHYESETGKRFKNTDLARFAGVSRANVGLWVNGPTQELEGSNLVKAAEFLGVSKDWLAGQSNKMDASKIDNNVSKKVATLAPVLSWVQAGTFTNVQSVDLSMVEEWLPLPDECTNCFYLKVQGVSNQPDFLEGDYILVDPDVYYSDMQSGDMVVVRRFEDATFKKLVIETDGSRYLQALNPKFEPNIIPLDEHCYFVGQVVDCMRYTYRAKRRSRPN >CP027183|2473472:2484857|2484114_2484360_+|AVI35602.1|DBSCAN-SWA MQLFEKFIVFNVNAGYRGKGTPHGVNLIKGNKPTLSLTDKGVMNKAAQERYKLMLLKYFKEGRSAMDELDHEVKRIYQMVA >CP027183|2473472:2484857|2473945_2474347_-|AVI37007.1|DBSCAN-SWA MSSMSLAEYRELFPIQKNKKRRSAKQGTRQPSEGETVLATHLKACKISFEQEYKFHPERKWRADFLITGTKILIEVEGGIWSGGRHTRGKGYIGDMEKYNSAAMMGFTVLRFSTEQVKAGVAIKQIEQLVGEK >CP027183|2473472:2484857|2481553_2481994_+|AVI37219.1|DBSCAN-SWA MNVKAIPHKHKVTGVTAIAVLVALGSCEYRTANSSVPSNYSYESKQVVASEYELLGIKQTGEKTGVAVIRIDGFKLNVSFDFDGVADNYGVAGSDFTAAEITNLAIESVTDLSGKPWNDFTNHDDHKNINILLAGYIDRNHWIEEA >CP027183|2473472:2484857|2473472_2473949_-|AVI38143.1|DBSCAN-SWA MSAVLKTQQMDWSKYTIDGWLEQFGAWCETVRMKGGDLPDGLHINQIYWLMREAGKEVQKSKSYIRCEISDYEADQIQALLRSLLNSDKTDFTTKFALICLIKNKVENKGLLKVAQETNQSKAQVAIMVSCARFYLLGHDKRLRQNGGSNENIHCKTI >CP027183|2473472:2484857|2481996_2482323_+|AVI36943.1|DBSCAN-SWA MQKVKHHPDGYKSYLGLDRSTSLYSVRIGWQVYASNANGSVLYKVKDGVKTPLNVSKFQTEYPKVWNELTQEIDFQRRKQLAIKLRETNIPTYDRKAYKQKRGFTGSR >CP027183|2473472:2484857|2474346_2474802_-|AVI39143.1|DBSCAN-SWA MNAVEFMKEHGIEKARFVIGSAEVGGVVTPKILDLKKLVQSLELIEQIGGVEVAKGKVFIADFNDFKMIKFLIGNKDFVVHIKRVQEAIADHEAVNGNEIDPLIKLKAGLTKLRDKFINDAHALTLLGDLDKSRVYNGIANQLDHLLKGGA >CP027183|2473472:2484857|2476487_2477411_-|AVI35919.1|DBSCAN-SWA MNELALFAGAGGGVLASYLLGWRTVCAVERDAYAAQVLAQRQNDGILEAFPIWSDITTFDGKPWQGIVDVISGGFPCQDISSAGKGAGIEGERSGLWSEMARIIGEVRPRYVFVENSPMLVSRGLTRVISDLAQMGYDAQWARFSASNFGAPHIRDRIWIVAYARCQRGEAGTSQTLRSKSEIPKWTNANNMGSNISNTKSFGWEQTRQGEQSSKERFSRRGGEFAHPDCLNEQRVFTSDADQERWQEQGKRSARSSCNEFTWWQVEPELGRVADGVAHRVDRLKAIGNGQVSIVAKCAFEYLGGAK >CP027183|2473472:2484857|2477741_2478005_-|AVI35665.1|DBSCAN-SWA MSLEKEDLRLKMLPDMMERLRLISDVRGKDYAHQAVILLEKAIMGEYHEVSLMLERAEKNRKKRERLGLLGKIGVNPESQILEIKKA >CP027183|2473472:2484857|2477407_2477698_-|AVI37252.1|DBSCAN-SWA MNTNNLSNQQQIIQSWFKPALHTLKALIKKCEENLERIKADTKNAAVKRDDFKDVLVRQHRITYNHAEEIIKSLGRAGRIRFLGSTYIQLNVQETK >CP027183|2473472:2484857|2479109_2480924_+|AVI35787.1|DBSCAN-SWA MRSPQIEAYLKIQNYFEENPNGEALVVLPTGTGKSGLISIAPYGVADGRVLIITPGLVTKNSISKTQESLQDNFWINFDVIFGLNNLPVINEYTSELTDEHLESSHIIYSNIQRIVGDSDRCLLNRVSNNFFDMIIIDESHHSAANSWEQVLSFFGSAKKLHVTGTPYRGDGQEIPGVRIHETPLSEVMRDRYVKYLKKETINAQNLFFTTPEFPNEKLTIERVLEFKDSEWLQKSVALSKECSMDVIEHSLSKLATLREISPNVPHKILAVGCSIAHAEDIQNWYTSRGVKSILIHSEMDKISQEQKFQSIENNECDVVVSVNMLMEGYDHKYLTILSIFRPYKSLNAFAQVIGRVLRAIPKEEITAFEIDNNATVIFHEEIGLNDMWSEFQKEVDRAKAERIKDYTSQELTKEYERKDQVLGSVESDMVYLSDQDSFLKGFDFNELFEIKRQEINELVKNKLQKLAELNDFDDEDLELFAKQLTEKENRKISKDYVDPVLLEKRPAQAREQLRKLIVKKVEDEISSLLVDLGYNPKGTELWQSFTRHLPYLKPNTANDGTLVNYVNLKLSNKFGRVISRDNPTLVKSLDHIPSLIEEVRKML >CP027183|2473472:2484857|2474798_2475548_-|AVI37107.1|DBSCAN-SWA MHEITLDEVRQLIASLRTVYAAQFNKQFPATGESAIPLSAVEQIALKTLVGVQQNQFNNALGRLLTAGGRFMPSFAEFRTWCIGESWMSPEEAWSRACKFTTDRTVVITQITKYALDEVMYLIEAGQMRAAQDNFFGTYNVMVAKAQLKGRQQEFYTPPLQLEHKEPKHVPVSNDEAQKHLQSLMERLKINGRKPAPVQKLQAKEKEPELAKELGPDPFDNPHEYAEMCRREGMPIPRNILQLIDGANV >CP027183|2473472:2484857|2483116_2484064_+|AVI38897.1|DBSCAN-SWA MSNLLTAAEAFAALQNGKTVLCRPAGDMLDFADLDQFPASVFGKPGFEFCIKIETIELAGITFTKPLTIDEYEDGQEVFVISTYSRTVYVLDFKTNALIDSINSGFVQRDAENAKLQLKAFSKALGIEINNDLSVIRLGEEPKKQRGKKSKAEKPSDVISAETQPTIVITEQTNVTTSEDLLVPETNEPKVDPEYLKALDALLQRVKESKTPEEVNAVYRYTRTWNDKQMEPLLLATHKRLEELEKEKAPSGEPPSLMVQIQNAPDLTTLDALEIDVAARDPQIQPRLMDFVKKRRFELENAASNEPDYLLEEPF >CP027183|2473472:2484857|2478001_2478178_-|AVI36291.1|DBSCAN-SWA MRIEMKTSDVLARFNAPKIAKILKISRQAVYQWGEFVPEAAAFKLLEQEPTLPFKRVL >CP027183|2473472:2484857|2475540_2476491_-|AVI36450.1|DBSCAN-SWA MNYYQHHIGDFNNATRHLSLIERAIYRDLLDMYYDTEKAIDASSIDRLARRLQCTTEEQKEALKYVLDEFFILEEGVYRNNRCEREIAEYHGKKKQASEAGKASAAKRAAKKKGSSNSGSSKDDQSSNENSTVVENPLNEEQTGVQPTNNHKPLTINQEPIIDSSSNTRGENSQLTPIQFAQYQIDDHKRYSMREFISEYSEFQYDFISLAQQRFVSVPEIDLRTMIQNFGDWYFANESSSLNTPSIWLVKWFSWVQNNEKQVAANRKKQEQISSKSQKTKEPGYFTNLFEEQNQSQIVDVTPSKKFLVSEEVGHA |
18 | Acinetobacter_phage(63.64%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
2594977 : 2640701
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >CP027183|2594977:2640701|DBSCAN-SWA 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38 | Vibrio_phage(50.0%) | transposase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
2646078 : 2678331
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >CP027183|2646078:2678331|DBSCAN-SWA 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32 | uncultured_virus(40.0%) | transposase,integrase | attL 2646810:2646823|attR 2684475:2684488 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
2810997 : 2851586
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >CP027183|2810997:2851586|DBSCAN-SWA 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40 | uncultured_virus(40.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
3344066 : 3395802
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >CP027183|3344066:3395802|DBSCAN-SWA TTTGGTTGGTCGGGTGAAACTATATATAAGTGCACTACAGTTAGAAAATGGAGAGCTTTTACTCGTCGTTTCTCCTCAGTTTAATGCCAATGCTATTCAGGATTATGCATTACGCTGGGAAATTGAAACCTTATTCAGTTGTCTCAAAGGACGCGGGTTTAATCTTGAAAATACGCGCTTGACAGACCCTAGACGAGTGAAAAAATTGATTGCGGTGTTAGCTATAAGCTTCTGTTGGTGTTACTTAACGGGTGAATGGCAACATGATCAAAAAAAAGCGATAAAAATAAAGAAGCATGGACGACTCTCAATGAGTTTATTTCGCTATGGTTTAGACTATGTTCAAATGGCGATTCAGCGTTTAATTGGTTTTGGGAAAAAAGAAGAGTTTAAGGAAATTTTGGCAATTTTAAGAAGGCAGAACCCTGATAGGATAAGGGTTCTGTGAAATTTGTCGTGTACAGAGGACTTCTCCAATAATAAACCTAAGAACATAAAACTTACGGACAGAATCCCCAATACGTCAGAGTACTACATTCCATTAAAAAACTATTTTCTCCCCAATAAAATTGATTATGTTCTACAAGGCTATCCATTCACTAAATACACCAATGATTCATATCGTAAAGTGAATCACTGCTTAATGCATTCCAATGATGGAACTCAAGTCATCACATCATCAATTCATATTTTGCATAGCTTATTCGTCAATCGGAAGGATATTAGGGGACTTTTATTAGGAACTTCGAGCCAATCCATCATTAATCGTTTTTTAGAATCTTATACAACAGAAATTGTGGACGATAATGTTGAATATAAAATTAAAATCAGAAAACCATATGAAGATATAGGCGAGACTGCAATTATTTTTCTTGCTAATCTTGCCTTAAACCCATATGTGCAGACGATAGTTGATAAAATTCAACGAAGTATGGAAATTACCGAGTTTAATCATCTTCAGCAGGGTGCAGGCAAAAGGTATCCCATTGTGTTTCCGCCACATCCCACAAAGCTTTTCCTTGAAGCAGAAGGAATTTGGCTAGATGACAATAAGACTCGTTTTTTTATCACTAGAGTGAAAAAATTTGATCCTATTAACGATCACATGATTGATGTCAACAAAGACCTAACCAATACTATTTCAAAGCCTGATGAGAAAAACCCTCGACCTCGTGAAAAAAGTCAAAATAAGAATGAGCACATCAATACGCAAAAACCACCATCAAGAACAAGCGGTGAATATCGTAAGCGTTCTGAGGTGGAAACTGGAAATACACAAGGTATTCTGAAGTATTCTTTTAATGAACCAATCAATGATCCAATTGAAGTCGGAGCACCTAATCAACCTTATTCAGATAAATCAGAAGAGGTTGAAACATCATCTGATGAACCTTATGGTAATCAAAATACTAAGATCAAAAAATCTGAAACGACAGATACACCACCTAGCAGAGATGAGCGCTTTGATATTCAATATATTATTCAATCTCTCCAAGAACTTGCCTCAGAAATGGACTCTCCTCTAGAACATCTGTCTGCAATTAATGAACATGGTGAAATGATAGCGAGTATTAATTTGCTTCAAATCAAAAAACTTGTGCCTGAACCCAAGCATCCCTCATGGATTGATTATGATAAAGGGCGAAAATTATTGTTCTTAAAATTAGACTTAAAAGATCAAAATAGATTTTCCTATCTCATCGATATACATAAAAATAAAAATCATGAAGCATTTTGTGCCTTTCTTATTTTTACTCAGAATAAGTTGACAAGCGAACAAATTAAAAAAATCTGTATTGAACTAGAAAATGCCAAGGGAATAAAAAAATGGGCACTCTACTGTGATAATTTCATTCATAAAATGATCGCAATAAAACATTTATACGCAACACCTGATGAATGGAAAAATCGCTTTAAAAATTTATTCATAAGCTTACAGAAGGACAAATCCTAATTAAAGAATATTTTTTATACAATCATATGTGTGTGAAATTACTTGATATTTCATGTTTTCTATAAATTTGCGAAATAGAAAAGAGTGAAATTTTAGTTCAGTTCACCTATACTAACAATTCAATTTAAATTTCTATTCGTATTCACACACTTATGCTTTTGACTCCACCCTAGTTTATTTACCCATCTTTTTGTAAATAACTCATCACTGTCTAGTGATGTGGTGTAGTCGCTTGTGTGTTGTATATATCACATCACTAGCCTTTATCTAAAACTATATAAATAGGCTATTTTTATGTTTTCCAATGTACGAGAGCAATGGTTCTCGAATATCCGTGGTGATGTACTTTCGGGTATTGTCGTTGCTTTAGCACTCATTCCAGAGGCAATTGCTTTTTCTATTATTGCAGGTGTCGATCCCAAAGTCGGGCTATATGCTTCATTCTGTATTGCAGTCGTGATCTCATTTGTGGGTGGAAGACCAGGAATGATTTCCGCAGCAACAGGTGCGATGGCTTTGCTCATGGTGACACTCGTCAAAGAGCACGGACTTGAATATTTGCTAGCAGCGACAATTCTGACTGGTGTCATTCAAATTGTCGCAGGCTTCCTAAAATTAGGCGCTTTGATGCGATTTGTGTCTAAATCTGTGGTAATTGGATTTGTGAATGCGCTTGCAATTCTCATTTTCATGGCTCAACTACCCGAATTAACCAATGTAACTTGGCATGTATATGCAATGACTGCCGTTGGTTTGGGTATCATTTATTTATTTCCATTAATACCTAAAATCGGCTCCTTAATCCCTTCACCTTTAGTGACCATCGTAGTCTTAACCATTGCAGCAATTACATTGGGATTAGACATTCGTACTGTGGGAGATATGGGGCAATTGCCAGACACACTTCCAGTGTTTTTACTACCTGATATTCCATTAAACCTTGAAACCTTAACTATTATTTTTCCATATGCAGCAGCTTTAGCGGCTGTTGGTTTACTTGAATCAATGATGACAGCAACGATTGTTGATGATTTAACTGATACATCGAGTGATAAAAATCGTGAATGTAAAGGTCAAGGGGTTGCCAATATTGCTTCAGGATTTATGGGTGGTATGGCTGGTTGCGCCATGATTGGACAATCGATTATCAATGTAAAATCTGGTGGTCGTACCCGATTATCAACTTTTTGTGCAGGAATATTCTTACTGATCATGGTGGTTTTTATCAGTGATTGGTTAAAAGTCATTCCTATGGCTGCTTTAGTTGCTGTGATGATCATGGTATCGATTGGAACATTCAACTGGGATTCACTCAGAAATATTCGTCAGTATCCCCTCTCAAGTAATATCGTGATGATTGCTACAGTAGTTGTCGTAGTTGCGACACATAACTTAGCTTACGGTGTCTTGATTGGTGTATTACTTTCAGCTCTATTTTTTGCCAACAAAATTGAACGATATATGGCAGTTCAATCTGTATTGGATGATGCTGAAAATACGAGAACTTACATTGTTAAGGGACAAGTCTTCTTCAGCTCTGCCGATAAATTTACAGCAGCTTTTGATTTTAAAGAAGCGATTTCAAAAGTCGTGATTGATGTAAGCCAAGCACATTTTTGGGATGTTTCAGCCGTAGCAGCCGTTGATAAAGTTGTCATTAAGTTTAAACGTGAAGGTACTGAAGTTGAATTAATCGGTATGAATGAAGCAAGTCAAACAATGGTTGAAAAATTTGGTATTCACGATAAACCAGATGCATTAGATCGCTTGAGTAATCACTAAAAGGAGTTAGAACAATGTCAAAAATAATTGCATGTATAGATGGCTCACTCGGTACAAATACCGTATGTGATTATGCAGCTTGGTTGAGTCAAAAACTTAACGCACCTCTTGAACTGTTACACGTAATCGATACACCCAAAGCTCAAGCACCTCAAGATTTGAGTGGCGCAATTGGCTTAGGTAGCCGTGAAACACTATTGCAAGAGTTGGTTGAGCTTGAAGAACGTAAAGGCAAGATTGAACTTGAGCATGGAAAAGTTTTGCTAAGAGAAGCAAAAAAATATGTACTCGAAAAATTCAGTCTGGATGCTCATAGTTTCCAAAGACATGGCAGTTTATTGGAAACCGTTGTTGGATTAGAAGAAGATATTCGTGTGTTGATTATGGGGAAACACGGCACTCAGACAGAATACCGTTCTGATAAAATTGGGTCGCAGATCGAAAGTATAGTACGTGCTATTCATAAACCCGTATTGATTGCATCCTTTCCATTCCAAAAGCCACTTTCATTTTTAGTGGCTTTTGATGGTAGTCCAACTGCAAGAAAATGTGTTGAACGCATTGCGTCAAGTCCATTACTTAAAGGTCTTGCAGTACATTTGGTTTATGTCGGAAATCCGAATATTGAAATGCAAAATCAGCTCTCTTGGGCAAAAGAGCAACTTGAATCACAAGGTTTTAATATCACCTCGAATACGTTGGATGGTGAAGTTGATAAGGCAATTATCAATTACGCTGAACAGCATCAAATCGATTTGATTGTGGTTGGGGCTTATGGTCATTCCAAGATACGCCAATTTTTTATTGGCAGTACCACAACAAAAGTGATCACAAGCACTAATAAACCAGTCCTGTTACTACGATAATTTTATTAGGGGGTAGATTTTGGTCTATCCCTTTATATTTATTAAGTTAGAAGTGGAAAATAGAACTACAGTCAGAAAAATGAGAAGACATCATGGATGTAATAATGCTGAGGAAAGATTTTACAAAATTTAATATATGTATTTGCATATATATGTTTATTCGTATATAAATATATTTGTGAATTTAATTGAGTTTGAGCAAATGTCTGCTAATCCAAAAGTTAAGATTTATCACAACCCTGAATGTGGTACATCACGTAATACATTGGCATTAATTCGTAATACCAATATTGAACCTGAAGTGATTGAGTACCTTGTAACACCTCCATCTAAAAATGAACTGATTCAAATGATCGCGGATGCAGGTTTAACGGTGAGAGAAGCGATTCGTAAAAATG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MQKRHSKLVILGSGPAGYSAAVYAARANLKPTLIAGLQLGGQLTTTTEVDNWPGDPEGLTGPVLMERMQAHAERFGTEIVYDHINEVDLSVRPFLLKGDMEEFTCDALIIATGATAQYLGLESEAKFMGQGVSACATCDGFFYKNQKVMVVGGGNTAVEEALYLSNIAEHVTLVHRRDSLRSEKILQDHLFAKEKEGKISILWNNQVDEVLGDNTGVTSVRLKSTSDGSTQDVEVQGLFVAIGHKPNTGMFDGQLNLRDGYIQVQSGTSGNATATSVAGVFAAGDVADSIYRQAITSAGSGCMAALDAEKYLDQLSN >CP027183|3344066:3395802|3387557_3388817_-|AVI36909.1|DBSCAN-SWA MSKKTLIALLCCASLGLTACNDDNDQDQTSPTENVTEPTLISFAKLPVETYAAGPDSGAYVKGANGIYPPFKGQPVQGFSAALKNEDGSYMAMADNGFGTQDNSSDFLLRIYKIKPDFKTKTKGTGQVNVQSFIQLRDPNKLIPFNIINGNTPERLLTGADFDPESMQRTSDGTYWIGDEFGPYLLHFSADGVLLDAPIPLPNPLNPTQELRSPQNQFNKAQINFVEPLVQQSGGFEGMAISPDGQYLYPLIEKPIKSIRETERQLLISQFDLKKKAYTGKYYWFQLDSKATNIGDFQLFNDKEGIIIERDATQNNLGGYKKLIRIKLNESGQLVSREDLVDLIKIANPNMLYGTARAGDIGTGQVFAFPFETIEDVIIENGTTLTVFNDNNFPGSTGRNAKLADDNEIIQIRLPKALF >CP027183|3344066:3395802|3393835_3394102_+|AVI38468.1|transposase|DBSCAN-SWA MAQIMKAFGSIKPHCAYLFCNKRGHRMKVLVHDGLGIWLCARRLEQGKFHWAQVHQGETVALNPEQLQALIQGLPWQRIGLQQVVNML >CP027183|3344066:3395802|3355607_3356723_-|AVI37388.1|DBSCAN-SWA MSQPEQCWYIRTPIQQGEVFSSWLIRSALDVGCSPMVLIEALWGKWRALTIDLDKGVDAERFDALLSHSMESKQNIQQSMLSSVVSEIHTNYDPKQNTPWVLSLGTRNRSNTSGRQVCVECLKSRENPPYLRLMWRMGWHCSCVEHQVSLIDHCPECGVTIQPFKADMEHGCLAICTTCGFDLRHCEENKIINLNALDFQNKAEQVLKQKFGFYNQSPVTSQVWFEIARAWLSEIRFLVNTPNKNVIQLFESFDVNLHLPNPITPLAFEYLNTQERIVLLSILDQIMDIPCDLLVQRSNEYGVSRANFWDKRKKLPVQLQQMKDLMIKPTRRYPVSRVAITVTKPKSKATVQRQWLNLLRRSNNSGARHID >CP027183|3344066:3395802|3345323_3346019_+|AVI38625.1|DBSCAN-SWA METGNTQGILKYSFNEPINDPIEVGAPNQPYSDKSEEVETSSDEPYGNQNTKIKKSETTDTPPSRDERFDIQYIIQSLQELASEMDSPLEHLSAINEHGEMIASINLLQIKKLVPEPKHPSWIDYDKGRKLLFLKLDLKDQNRFSYLIDIHKNKNHEAFCAFLIFTQNKLTSEQIKKICIELENAKGIKKWALYCDNFIHKMIAIKHLYATPDEWKNRFKNLFISLQKDKS >CP027183|3344066:3395802|3388964_3389369_-|AVI38061.1|DBSCAN-SWA MDIGEVAKKAKVTTATLRFYEEKGLIKSIGRQGLRRQYSKQVIDQLALIALGRAAGFSLNEIATMFGQDGKPDLDRQKLKDKAEQLEQMAKRLHFISQGLEHAAVCPAENHMECPTFQKFLKAAIAGEYQPTKL 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52 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
3784610 : 3797909
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >CP027183|3784610:3797909|DBSCAN-SWA TATGACTACAAATAATCAGACATCCATCGCATCTCTTGCGAAAAAACGAAGAACATACAGTGCTGAATTTAAACAGCAGATCGTTCAGGCTTGTAAAGCACCGGACGTTTCAATTGCTTCAGTCGCTTTGCAACATGGATTGAATACAAATCTTGTATCCAAATGGATTCGCTTAATTGATGCTAAGCCAGGGAGTGATCGCTCACCACTACCGAATAAACCTGCATTTATTGCCTTATCTTGCTCTGCACCATTAGATCCTACTCCTACTGACATGTTAAAAGTTCAAATTACTTTACCCCACTCAAAAGCAGAAATTGGCTTGAAATGGCAAGTATCGAAAATATCTGCTTTAGCAGAATTACTCAAGGTACTTGCAACATGATCCGCATTGATGAAATCTGGCTCTCCACCCAACCTCTGGATATGCGAGCAGGGATGGATACGGTCATGGCGCAGATTATGAAAGCCTTTGGCTCAATCAAACCGCATTGCGCCTACCTGTTCTGTAATAAACGTGGCCATCGTATGAAAGTGCTGGTACATGATGGACTGGGCATCTGGCTGTGTGCCAGGCGGCTGGAACAGGGAAAATTCCACTGGGCTCAAGTTCACCAAGGTGAAACCGTGGCCCTCAACCCGGAACAGTTACAGGCATTAATCCAAGGTTTGCCCTGGCAGAGAATTGGATTGCAGCAAGTGGTGAATATGCTCTAAACCAAGCTCGACCATTCTGCCATCCTCCAAACGTTCTATTTCATTCTCTTCATGACCTCAGGCATACTGCGGTCATGAATACGCTGCCTGACTTAAGCCAACTGACCCATGAACAACTGCTGGAATTCACCAGACAGTTGGCGATGCAGCATCAGTCTCTAGCACAATCAAACCAGCAATTAGATGCCAGAGTTCAACATCTTGAAGTCACCAATCAGCAATTAGATTCTAAAGTTCAACATCTTTCTATTCTCAATCAAAAATACGAGCATGAACTCGCACTATTTAAAAAGCACAAATTCGCCCAAAAGAATGAACACTTAACGGCAAAACAAATCCATCTGTGGGATGAAGCGGTTGAAGAAGATATTGCCGCGGTTGATCTAGAACTGGAACGGCTAAATGCAGATAAAACCAATGCAGCGACACAGAAAGCCAAAACCAATAAACCTAAACGTCGACCACTGCCAGATCATCTACACACCATCCGTATTGAGCATGAACCTGCATCAACCCAATGTGCTTGTGGCTGCCAACTCCGTCGTATCGGCGAAGATGTCAGTGAAAAACTGCATTTCAGACCGGCACAGTTCTATAAGGAACAGCATGTGCGTGGTAAATGGGTTTGTGATCAGTGTGACACTCTGACTCAGCAAGCGATGCCCGCCTATGTGATTGATAAAGGCATTGCTTCACCTGAATTGCTCAGCCATGTGCTGGTATCGAAGTATGCCGATCATTTGCCGCTGTACCGTCAACGTCTGATCTATCAGCGGGCGGGAATCGAACTTTCTAGATCAACGTTATCTGACTGGATAGGTCGCTGCGGTGTAGAACTGGAACCTCTGGCCAATGCCTTAAAAGAGGTGGTACTACAACAGCAGGTGCTGCATGCAGATGAAACACCGGTCACCATCATGCGGATGGGTGAGAATGATAAAAAACCGAAGAAAGGTTATGTCTGGGCCTATGCCACTACACAGTACAATCCAGTTCAGGCGGTGATCTATGACTTTCAGGATAGTCGTTCAGGCCAGCATGCTGCAGAGTTCTTGAAAGGCTGGCAGGGCTATCTAGTCTGTGATGATTACAGTGGTTATAAAGCACGCTTTAAATCAGGCCAGGTCATTGAGGTGGGCTGCATGGCCCATGCACGTCGTAAATTCCATGAACTGCATGTAACTGGGAAAAGTCAGGTTGCTGAACAGGCATTAGTGCTGATTCAGAAACTGTATGCGATAGAAGCAGAGCTCAGGAAAAAGACCGATGGTACAGCGGAAGACCGCCGCGAATACCGACAACAGCATAGTCAACCAGTGATGCAACAACTATATGAATGGCTCAACCAACATCATCTGACAGTGCCATCGAGTTCTCCCACCGCCAAGGCCATCAATTACACTCTGAAGCGTTGGCCAGCTTTAAGCCGCTATCTGGATGATGGCAATCTACCTATTTGCAATAATTGGGTGGAAAACCAGATGCGTCCCTGGGCGTTGGGGCGCAAGAACTGGCTGTTTGCAGGTTCGCTGCGCAGTGGTCAGCGAGCGGCAAACATCATGACGTTAATCCAGTCAGCAAAGCTGAATGGCTTGGATCCGTATGCCTATTTAAGTGATGTGCTGAAAAGGCTGCCGACACATAAAGTGACCCAGATTGAAGAGTTACTGCCACACTGCTGGAAACCTAAATCGAATTAAAAAATAGGTATGGGATTCAGCGGACGCTTACAAAGGCAGTGTATAAACACTGCCTTTTTTTATTTTTGATCAATGACTAAATATGCTAACGTATAGCGGTTTTAAAAAAGAAGTTACAAAGCATGGTGAAACAGCGTACTCTCAATCGTGTGGTAAAAGCGAGTGGAATAGGTCTTCATAGCGGTCAAAAAGTGATGATCAATTTCATTCCACATACCGTGGATGGAGGTATTGTATTTCGCCGTATCGATTTGGATCCACCTGTCGATATTCCTGCTAATGCATTGCTGATTCAAGAAGCATTTATGTGTTCAAATCTTGTTACTGGCGATATTAAAGTCGGGACAATCGAACATGTGATGAGTGCGATTGCAGGTTTAGGAATCGATAACTTAATTGTGGAAGTGTCTGCTTCTGAAGTTCCAATTATGGATGGTAGTGCTGGTCCATTTATTTATTTGCTCATGCAAGGTGGCCTGCGTGAACAAGATGCTCCTAAGAAATTTATAAAAATATTAAAGCCAGTTGAGGCTTTAATTGATGATAAAAAAGCAATATTCAGCCCGCATAATGGCTTTCAGCTTAACTTTACGATTGATTTTGATCATCCTGCATTTGCCAAAGAGTATCAGTCTGCAACCATCGATTTTTCTACTGAAACGTTTGTGTATGAGGTCAGTGAGGCACGAACTTTTGGTTTTATGAAAGACTTGGATTATCTCAAAGCAAATAATTTAGCTTTAGGAGCAAGTCTAGATAATGCAATTGGCGTAGATGATACGGGTGTGGTGAACGAAGAAGGTTTACGATTTGCCGATGAGTTTGTTCGTCACAAAATTTTAGATGCAGTTGGTGATTTGTATTTACTTGGTCATCAAATTATTGCCAAGTTTGATGGCTATAAATCAGGACATGCCTTAAATAATCAACTATTACGCAATGTTCAAAGCGATCCGAGTAATTATGAAATTGTAACATTTGATGACGAGAAAGACTGTCCAATTCCATACGTGAGTGTGACATAAGTCATTGTCTTTATTTGGCTATGTTATAATGTAACATTAGTAAGTGTGATTTTTATCACATATTAAGAACGATTCTAATTAAGAAATAGAAAGCTCATCATTTTTTATTGCTTGCCAAACGTAGTAAAGCTTGGCTAAGCTTAGGGTCGCTCACGAAGTCGGCGGCACTACGTAACATTTCTTGTGTTTCCGGGGGGATGGATTTAGAAGGCTCAGATGAGGTCGTTACAGGAATAGTTTTATTTCTTAAGCGAACTTGAATTCTTTGTAAGTCTTTTAATCCTTCAAGTTGAGATAATTTAGATACATATTGGCTCTGTAAATAGCTGAGTTGACTAATCATTGCCTGATTTTCACCAGTAATAATTAAAGAGCCATTTTGATAACACACGACTTGCCATTGTTCCGGTTGGGGCAATAAGGGTTGGATTATTTTCGTAAGTCTTTGCCATTGCGCGACTTGCGTTGTTAGAAACGTAAGGTTTCCTGTTTTTATGTGTTTTCCGGTTTGTTGAAAAACGTTATCGGGTTTAGACATTGATCATTCTCAAATGGTTTCTTGTCCTAATCTTAAGCGTTCATTTCAACCGATATCAAGGAAGAGATCATAAGGAACTTGAGTAAGAACAGTTTCAAGAGGTTTTTATGCACACGCGTCGTATTTTATTAGCGTTTTCACTTGCCGCTTCGGCAGCATCGGTTGCTTTTGCAGATTATCAAAATATTAACCAATCTACTGATTCAGATCGATTGGAACAGTTATCAAAAACACTATCTCAAGGCTCATATACTCATCCTGATGATTTAGATCTTCCGGCGAGTGCAAAAGTTTCAGTGACTTTACGTGAGAAAACAGTTGAACTCAACAATGATTCACTGGCAAAGAAATACGGCACTACGACAGCTAAAAACTCATTTAAAACCTCTTCTTCAAATCCTTATTCTTGGTTAGTTTCTCATCCTCTTCCTGATACAGTACGTGTTTCTTCTAACTTTGGTGGTCGTACCATGGGTGGTCGTGCAGAGCATCACGGTGGTTTAGATATGGCTGCACCAAGTGGTACACCAATCTATGCGACTGGCCCGGGTATTGTGACTAAATCAGGCTGGGGCACAGGTTATGGCCAATATGTTGAAATTAACCATGGTAATGGTTATTTAACACGTTACGCACATGCTTCACGCTTAATGGTTCGAGTAGGTGATCAGGTTTCTGCTGGTGACCATATTGCTAATGTTGGTTGTACAGGCCGCTGTACTGGTCCACATTTACATTATGAAGTAGTTAAAGATGGTCAACGTAAGAATCCATCAACTTACTTAGCAATGTTGCCTTAATTACATTGCCTCCAAGGTCAAGGTTATTAAATTTATGAATTTGAAATTAACTTAAACCTTTTTTAACGTAATGATTGTATAAAAAAACGCCTTTATTGGCGTTTTTTTGTTATTTTGTTTACTGCTCGGTCAATGACTATTCATTCAGAAAATAATAGGCCCCCCCCACATTCACCCGTGGCAATAACTTGAAAGGGGTAAAACGTGGTAAAAATACAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_16 >CP027183|3784610:3797909|3795942_3796209_+|AVI35637.1|transposase|DBSCAN-SWA MAQIMKAFGSIKPHCAYLFCNKRGHRMKVLVHDGLGIWLCARRLEQGKFHWAQVHQGETVALNPEQLQALIQGLPWQRIGLQQVVNML >CP027183|3784610:3797909|3785400_3787026_+|AVI38652.1|transposase|DBSCAN-SWA MNTLPDLSQLTHEQLLEFTRQLAMQHQSLAQSNQQLDARVQHLEVTNQQLDSKVQHLSILNQKYEHELALFKKHKFAQKNEHLTAKQIHLWDEAVEEDIAAVDLELERLNADKTNAATQKAKTNKPKRRPLPDHLHTIRIEHEPASTQCACGCQLRRIGEDVSEKLHFRPAQFYKEQHVRGKWVCDQCDTLTQQAMPAYVIDKGIASPELLSHVLVSKYADHLPLYRQRLIYQRAGIELSRSTLSDWIGRCGVELEPLANALKEVVLQQQVLHADETPVTIMRMGENDKKPKKGYVWAYATTQYNPVQAVIYDFQDSRSGQHAAEFLKGWQGYLVCDDYSGYKARFKSGQVIEVGCMAHARRKFHELHVTGKSQVAEQALVLIQKLYAIEAELRKKTDGTAEDRREYRQQHSQPVMQQLYEWLNQHHLTVPSSSPTAKAINYTLKRWPALSRYLDDGNLPICNNWVENQMRPWALGRKNWLFAGSLRSGQRAANIMTLIQSAKLNGLDPYAYLSDVLKRLPTHKVTQIEELLPHCWKPKSN >CP027183|3784610:3797909|3788148_3788442_-|AVI36467.1|DBSCAN-SWA MCYQNGSLIITGENQAMISQLSYLQSQYVSKLSQLEGLKDLQRIQVRLRNKTIPVTTSSEPSKSIPPETQEMLRSAADFVSDPKLSQALLRLASNKK >CP027183|3784610:3797909|3784610_3784994_+|AVI38223.1|transposase|DBSCAN-SWA MTTNNQTSIASLAKKRRTYSAEFKQQIVQACKAPDVSIASVALQHGLNTNLVSKWIRLIDAKPGSDRSPLPNKPAFIALSCSAPLDPTPTDMLKVQITLPHSKAEIGLKWQVSKISALAELLKVLAT >CP027183|3784610:3797909|3795008_3795422_+|AVI37108.1|DBSCAN-SWA MQEFLISTSIVALAEMGDKTQLLALLLSARFRKPIPILIAILLATLINHGISAVLGQWITTVLSPAILVWVLAVGFIGMAFWMLIPDELDDETASINKWQKFGVFGATFILFFLAEIGDKTQIATVALAARYDVSVR >CP027183|3784610:3797909|3788696_3789389_+|AVI35903.1|DBSCAN-SWA MHTRRILLAFSLAASAASVAFADYQNINQSTDSDRLEQLSKTLSQGSYTHPDDLDLPASAKVSVTLREKTVELNNDSLAKKYGTTTAKNSFKTSSSNPYSWLVSHPLPDTVRVSSNFGGRTMGGRAEHHGGLDMAAPSGTPIYATGPGIVTKSGWGTGYGQYVEINHGNGYLTRYAHASRLMVRVGDQVSAGDHIANVGCTGRCTGPHLHYEVVKDGQRKNPSTYLAMLP >CP027183|3784610:3797909|3795493_3795877_+|AVI37872.1|transposase|DBSCAN-SWA MTTNNQTSIASLAKKRRTYSAEFKQQIVQACKAPDVSIASVALQHGLNTNLVSKWIRLIDAKPGSDRSPLPNKPAFIALSCSAPLDPTPTDMLKVQITLPHSKAEIGLKWQVSKISALAELLKVLAT >CP027183|3784610:3797909|3787148_3788051_+|AVI37035.1|DBSCAN-SWA MVKQRTLNRVVKASGIGLHSGQKVMINFIPHTVDGGIVFRRIDLDPPVDIPANALLIQEAFMCSNLVTGDIKVGTIEHVMSAIAGLGIDNLIVEVSASEVPIMDGSAGPFIYLLMQGGLREQDAPKKFIKILKPVEALIDDKKAIFSPHNGFQLNFTIDFDHPAFAKEYQSATIDFSTETFVYEVSEARTFGFMKDLDYLKANNLALGASLDNAIGVDDTGVVNEEGLRFADEFVRHKILDAVGDLYLLGHQIIAKFDGYKSGHALNNQLLRNVQSDPSNYEIVTFDDEKDCPIPYVSVT >CP027183|3784610:3797909|3789639_3792357_+|AVI36387.1|DBSCAN-SWA MAFYGDSDAQETQEWQDAFDSVLQHMGTERAAFLLEKLYQQAIAKHVPIQRLNTPYLNTISVEEQPAMPGDQDMERRIRALIRWNALAMVLRANKTGDDLGGHLASFASSATLYDVGFNHFFRANSDNFGGDMIYYQGHCAPGIYARSFLEGRLTEEQLSNFRREVGGNGLPSYPHPYLMPDYWQFPTVSMGLGPIMSIYQAHIQKYLMNRGLIKEEDRKVWAYLGDGEMDEPESLGAISLAGREKLDNLIWVVNCNLQRLDGPVRGNGKIIQELESIFRGAGWRVIKVVWGRHWDPLLAKDTSGALKARMEEAVDGDYQRYQVKGGAYTREKFFGKYPEAAELVKDLSDEDIDNLNRGGHDPYKVFAAYAEAMKAKGQPTVILAKTIKGYGLSEEIEAVNKTHQIKKMQIDSLRYVRDRFNLPFTDEQLEELPFYRPSENSPEMKYMKARREALGGYLPARRRESESLAIPDLSVFDAVLKGSGGKEQSTTMVMVRLIAALLKEKAIKDRVVPIVPDEARTFGLEGMFRQLGIYAAHGQKYTPEDQEQLMHYREAKDGHMLQEGINEAGAMSAWAALATSYSTNNLPMIPMYMYYSMFGFQRIGDIAWAAGDAQAQGFLLGATAGRTTLNGEGLQHQDGHSHILANTIPNCVSYDPCFGYELAVIVHDGLQRMYVNQERVFYYLTVMNENYEHPAMPEGVEEGIKRGMYLFEKDEKATVQLLGSGVILREVIKAAKILRDEYQIHSNVWSVTSFNELARDGMACEEYNRLHPLAEEVKESWVSKQLRGTEGIVVSATDHMRAYSEQIRAYLPDGRPFVALGTDGYGRSDTRANLRSFFGVDAAHIVVATLKKLADEGEVDARLVKDAISNFELDTDRPVAWAPQAHPEVQPVAEYNETQTGEGN >CP027183|3784610:3797909|3785059_3785326_+|AVI37544.1|transposase|DBSCAN-SWA MAQIMKAFGSIKPHCAYLFCNKRGHRMKVLVHDGLGIWLCARRLEQGKFHWAQVHQGETVALNPEQLQALIQGLPWQRIGLQQVVNML >CP027183|3784610:3797909|3796283_3797909_+|AVI38570.1|transposase|DBSCAN-SWA MNTLPDLSQLTHEQLLEFTRQLAMQHQSLAQSNQQLDARVQHLEVTNQQLDSKVQHLSILNQKYEHELALFKKHKFAQKNEHLTAKQIHLWDEAVEEDIAAVDLELERLNADKTNAATQKAKTNKPKRRPLPDHLHTIRIEHEPASTQCACGCQLRRIGEDVSEKLHFRPAQFYKEQHVRGKWVCDQCDTLTQQAMPAYVIDKGIASPELLSHVLVSKYADHLPLYRQRLIYQRAGIELSRSTLSDWIGRCGVELEPLANALKEVVLQQQVLHADETPVTIMRMGENDKKPKKGYVWAYATTQYNPVQAVIYDFQDSRSGQHAAEFLKGWQGYLVCDDYSGYKARFKSGQVIEVGCMAHARRKFHELHVTGKSQVAEQALVLIQKLYAIEAELRKKTDGTAEDRREYRQQHSQPVMQQLYEWLNQHHLTVPSSSPTAKAINYTLKRWPALSRYLDDGNLPICNNWVENQMRPWALGRKNWLFAGSLRSGQRAANIMTLIQSAKLNGLDPYAYLSDVLKRLPTHKVTQIEELLPHCWKPKSN >CP027183|3784610:3797909|3792359_3794339_+|AVI36065.1|DBSCAN-SWA MQIKTPDIGVDKANVAEILVKVGDRVEVDDSIVVLESDKATVEVPSTSAGVVKSILINQGDDVTEGVALIEIEAEGAAQAAPEPTPAPAAEKPAAPAPAQQTQASAQPAATSSATVEVTVPDIGVEKALVGEILVKVGDQIDVEQSIVVVESDKATVEVPSSVAGTVESIQVKEGDTVKEGVVLIQVKTAAASNAQAEAPATTPAPAAVAEPVAAKQETVAAAPAQSGSVDINVPDLGVDKAVVAEILVQVGDKVDVDQSLVVVESDKATVEVPSTVAGVVKAIHLQAGQQVSQGVLLATIEAEGQAPAAAPAAKAEAAPAPQAAAPKAAAPIATQSAPAAPTSGTDKLTKEQEAENAKVYAGPAVRKLARELGVILSQVKTSGEHGRVVKEDIFAYVKSRLTAPQAAPVAQATAAPAGLPSLPDFTAFGGGEVKPMTRLQQVSVPQLSLNNYIPQVTQFDLADITELEAWRGELKDGFKKQGVSLTILAFIAKAVAHLLKEEPYFAGHLADDQKSVLLRNEIHMGIAVATPDGLTVPVLRNPDQKSIKQIAVELGDLSKKARDKKLTPKDLQGANFTITSLGSIGGTAFTPLVNWPQVAILGISPATMQPVWNGKDFDPRLMLPLSLSYDHRVINGADAARFTNKLTKLLKDIRTLLI >CP027183|3784610:3797909|3794487_3794760_+|AVI37767.1|DBSCAN-SWA MLGFLKIMLPLLLVVFLLMGIWVSILHFPWEWMTYVVMGIEVFVATLILPLEYQTGTSSSHIGFISISACLAVLLGIARLFVWTWVKFFA |
13 | uncultured_virus(66.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
194 : 65659
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP027185|194:65659|DBSCAN-SWA 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75 | Escherichia_phage(18.52%) | tail,integrase,transposase | attL 62264:62282|attR 63542:63560 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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