Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP032309 | Enterococcus faecium strain HY07 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP032308 | Enterococcus faecium strain HY07 chromosome, complete genome | 2 crisprs | cas9,cas1,cas2,csn2,DEDDh,cas3,csa3,DinG,cas14j | 0 | 5 | 5 | 0 |
CP032307 | Enterococcus faecium strain HY07 plasmid unnamed2, complete sequence | 0 crisprs | cas14j,csa3 | 0 | 0 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP032308_2 | 428382-428473 | TypeII |
II-A
Consensus repeat of CP032308_2
|
1 spacers
spacers of CP032308_2
>2.1|428408|40|CP032308|CRISPRCasFinder GCTTCCAAAACAAAGGAGCAATTGAAAAAGGAAACGGCGC |
csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP032308_2
The CRISPR arrays of CP032308_2 >merge|CP032308|2|428382-428473|CRISPRCasFinder GGTTTTAGAGCTATGCTGATTTGAATGCTTCCAAAACAAAGGAGCAATTGAAAAAGGAAACGGCGCGGTTTTAGAGCTATGCTGATTTGAAT >CP032308|2|1|428382-428473|CRISPRCasFinder GGTTTTAGAGCTATGCTGATTTGAAT GCTTCCAAAACAAAGGAGCAATTGAAAAAGGAAACGGCGC GGTTTTAGAGCTATGCTGATTTGAAT
>CP032308.1|AYA35484.1|427629_428292_+|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2 MNLNFPLLEQPLPLEKATFLIVEDVTVFAKVVKWFYQYSESHELKLFNDKYKELKESDLLIITDVLGFDINSASTLKLIYADLERQLNEKVEVKSMIDKLTATISELIGYELLDHELDLEGDEITVLELFKALGIKIETRSDTIFEKLLELLQVYKYLSKKKLLVLINVCSYLTEEEISEVQDYISLYHMEVLFVEPRSIKGIKQFVLDKDYFLNLENMV >CP032308.1|AYA33567.1|427310_427640_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MRMILMFDMPTETADERKAYRKFRKFLLSEGFIMHQFSVYSKLLLNPTASQAMLKRLKSNNPKKGFVTLLTVTEKQFARMVYLSGERDTSVANSDKRVIYLGEDEDAES >CP032308.1|AYA33566.1|426432_427299_+|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGWRTVVVNTHSKLAYVNNHLIFKNAEKTERLHLSEIDVLLLETTDITITTMLLKRLVDEKILVLFCDDKRLPVAKLLPFYSRHDSSLQLTRQLAWSPEKKGQVWTAIISQKIQNQSNFLQKQLFTEKAESIQELHEGLLEFDPTNREGHAARIYFQTLFGTKFTREENNEINAGLDYGYTLLLSMFAREIVKNGCMTQFGLKHANQFNDFNLASDFMEPFRPVIDEIVYRYRNCEFPVIKRRLFDLFTNKYSYGKKEMFLTNIVSDYTSNVIKVLNNETEGVPQFRI >CP032308.1|AYA33565.1|422409_426432_+|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MKKEYTIGLDIGTNSVGWSVLTDDYRLVSKKMKVAGNTEKSSTKKNFWGVRLFDEGQTAEARRSKRTARRRLARRRQRILELQKIFAPEILKIDEHFFARLNESFLVLDEKKQSRHPVFATIKQEKSYHQTYPTIYHLRQALADSSEKADIRLVYLAMAHLLKYRGHFLIEGELNTENSSVTETFRQFLSTYNQQFSEADDKQTEKLDEAVDCSFVFTEKMSKTKKAETLLKYFPHEKSNGYLSQFIKLMVGNQGNFKNVFGLEEEAKLQFSKETYEEDLEELLEKIGDDYIDLFVQAKNVYDAVLLSEILSDSTKNTRAKLSAGMIRRYDAHKEDLVLLKRFVKENLPKKYRAFFGDNSVNGYAGYIEGHATQEDFYKFVKKELTGIRGSEVFLTKIEQENFLRKQRTFDNGVIPHQIHLTELRAIIANQKKHYPFLKEEQEKLESLLTFKIPYYVGPLAKKQENSPFAWLIRKSEEKIKPWNLPEIVDMEGSAVRFIERMINTDMYMPHNKVLPKNSLLYQKFSIYNELTKVRYQDERGQMNYFSSIEKKEIFHELFEKNRKVTKKDLQEFLYLKYDIKHAELSGIEKAFNASYTTYHDFLTMSENKREMKQWLEDPELASMFEEIIKTLTVFEDREMIKTRLSHHEATLGKHIIKKLTKKHYTGWGRLSKELIQGIRDKQSNKTILDYLINDDDFPHHRNRNFMQLINDDSLSFKKEIKKAQMITDTENLEEIVKELTGSPAIKKGILQSLKIVDEIVGIMGYEPANIVVEMARENQTTGRGLKSSRPRLKALEESLKDFGSQLLKEYPTDNSFLQKDRLYLYYLQNGRDMYTGAPLDIHRLSDYDIDHIIPRSFTTDNSIDNKVLVSSKENRLKKDDVPSEKVVKKMRSFWYDLYSSKLISKRKLDNLTKIKLTEEDKAGFIKRQLVETRQITKHVAGILHHRFNKAEDTNEPIRKVRIITLKSALVSQFRNRFGIYKVREINEYHHAHDAYLNGVVALALLKKYPQLAPEFVYGEYLKFNAHKANKATVKKEFYSNIMKFFESDTPVCDENGEIFWDKSKSIAQVKKVINHHHMNIVKKTEIQKGGFSKETVEPKKDSSKLLPRKNNWDPAKYGGLGSPNVAYTVAFTYEKGKARKRTNALEGITIMEREAFEQSPVLFLKNKGYEQAEIEMKLPKYALFELENGRKRMVASNKEAQKANSFLLPEHLVTLLYHAKQYDEISHKESFDYVNEHHKEFSEVFARVLEFAGKYTLAEKNIEKLEKIYKENQTDDLAKLASSFVNLMQFNAMGAPADFKFFDVTIPRKRYTSLTEIWQSTIIHQSITGLYETRIRMGK >CP032308.1|AYA33564.1|422203_422401_+|hypothetical-protein MILKSKAQKKRREQRCFKKADDGQSLILTCYIDLNATNIFIIAKITAFTIGVFVFSIMMSCWMKG >CP032308.1|AYA33563.1|421758_421887_-|methanol-dehydrogenase MSKKLIKVGIGLGLLALGAAYLGKKTGLFEDDSHLYDEFESI >CP032308.1|AYA33562.1|420007_421702_-|oleate-hydratase MRKSKAIMIGAGIANMAAAVYLIQEGKWKGDQITFYSLDDHGSNDGAPTDTVVDEYWNKNHPLENQKGYIARGGRMLNYRTYVDLMDLLSRIPSVTEPGMTAEEDTRDFDAKHRTFDKARLMEGGKGIIDGGKLGFNNKDRILLTKLIAMPDSEEEKLDNITIEEYFKDDPHFFETNFWFMWETTFAFRTRSSAQELRRYMHQMIYEFTQIEHLVGVNRTRYNQYESIMLPLIEYLKEQGCKIILNRRVTDWEFKETPMQDEITVTGLKMTNTLTQEEEHVTVDEDTAVIFTNGSITDSATLGDYETPAVENMDYGAASSLWKKASERFYNLGNPDKFFADRDASEWVSFTLTTKNHLLLNEITRITTQEPGNALNSFISTTPITSLGQKDVNMSIVVHHQPHFTSQKPNETVIWGYFLYPRRRGEFVDKQYIKMNGKEMLEELIGQLSKVDPGPVNIREKETEIFDSVINNIPVYMPYASALFNNRAKSDRPKVIPKHSTNLAFTGEFVEQPYQMIFTEQSAVRSGEIAAFHFAGIPMSRLVKTPRYDKDIPTLARAAKKMFE >CP032308.1|AYA33561.1|419743_419935_-|hypothetical-protein MHKFGLIPRNWLLNTVYQEVVSLPFSSESQGTISKNSFLCFMNIVTCDRGVGRGTPFIHNKRL >CP032308.1|AYA33560.1|418858_419719_+|hypothetical-protein MKQIQNKWNKRIIVMISSVCLFCLTVMLCLISTLANQHFMLEQNMQSDYAKKVAAEINQEIQSYHYEIGAPAEALEKIVSEELVQKNIELFIRNRYEKEPVELIGEKEVEEKLQEIINTYKQEEAEDDPFASEENNLLIYMTSGIFRRGIQSIYLMSFIDQILTIRERMVSFLPVISSILLVLLSGVFYLYRMSWKKVLWSFAVVIGGAGFQLLSLSVSLHLYDMTSQLDIRTQALQHLLDTYILSFIQFFSVVAIIEVVIAAGLWWIGKRVNTEKMVFSKRNEYK >CP032308.1|AYA33559.1|417435_418569_-|glutathione-dependent-formaldehyde-dehydrogenase MKAVTWQGKQKMEIRNVDDPRILEPTDAIIRITATAICGSDLHLYHHGEAVLEKGYVVGHEPMGIVEEVGSQVQTLKKGQRVVIPFNISCGHCHFCLNHMESQCDESNPDQLYGGLFGFGKLNGNHWGGQAEYLRVPYADSTSFVVPDNNLPDEKVLFLSDILPTAYWSVENAGVKKGDTVVILGSGPVGLFAQKFAVMAGAERVIAVDPVQHRLDKAANYNGVETYFLEDTAQAGTELYELAKGGADVIIDCVGMDGLEPVKEKAKNLVSLQSGTISPLQMASQAVKKFGTVQVTGVYMTPASSYPLQEFFMRDIAVKHGQAPIIHLMPKIYEMIAEGLFDPTQIITHSLPLEEAAQAYEIFDKKEDKNIKVVLKP >CP032308.1|AYA33568.1|428654_429020_+|DUF1622-domain-containing-protein MFNTQLIGYLEWIIAILNICSIGILIAGIVLVLFKLFDWSHVKKNYAERNARNADTRKLLASYILLSLEVLVVADIIESVIKPTWTDILKLALIIIIRTVISYFLNQEIEDKEKQRRGEVG >CP032308.1|AYA33569.1|429016_429382_+|DUF1622-domain-containing-protein MTTELMQFLLPYFEKLVLGLDIFAICLLIWGVCLSIKDFLKYLFVHTEAKNDRVSENNAIKKMLGGYILLSLEILVSAGIIESIIKPTLQDIFQLAALVVIRTIISYFLNKEIGPVDVPNK >CP032308.1|AYA33570.1|429542_430970_-|DNA-binding-protein MIEEYIEKNILRQLFLCGQFYVNKEVNLEKLSYLLHVCKTTLLNDINNIKKEFEEQIVYTHREKDCYTLYFSEHIPRCKIMQQLTQNSLFLKTCLLYLEENEPDYLQLTECEFISVSKAYSLKKQVLAYFHDCGIEIDRYSPRFTEMERRLLLLNVAYRLGSFKSWELPESFFERADRFIESVTENSGRFYDKENKEILSIGFAISFLRQQLCTVTIDPTFIEEIKKRPIYNYVESAWETTDFQTYYKKEEFAFILTLFNLCNYGFHSYQLIAEDFQQLHQVFIDNTPEIKELVAIFETHFHQELFGNQPFERALIHLMRSAWDNYQLFMPEKFYLLNEEQTNLYKEVQTLFSSWAKRLPYDLRFNPNCMRAFVIELSGILRLTKERLTIYIVTNSDVHYLIYREALEAVTTFDFQVAPTIYASMSDIKKYAQQSSNRVLCERTLYTPEAVQYENIIPISINTIERAIVSAVQNK >CP032308.1|AYA33571.1|431675_434228_+|HAD-family-hydrolase MNWYKLTVEDTLKNHQTSTEGLSQEERQKRLTDQGYNEIEARQQTKRWKKIAKHFTDLLMIVLIIASFLKFASSEYIEGSIILFVVIVNGLVSYWQERKAEESLNGLKQLMGQEAIVLSNGMQVKIPAKELVKGDVIVLRAGYVVPADVRLIEVHDLLVEESILTGESEASEKNHSVLAAEESIGDQKNMAFSGTLVQSGSAVGVVVETGNTTEIGKINQALQSVEQQTTPLIKKINRLNKQIFQGILCLILFLVVFTTFRYGMDWHILLSAMIALVVSMVPEGLPAVLTMILSVGVHEMAKEKAIIKGLPSVETLGSMTVICSDKTGTLTKNEMTVVDVAAKEETRVLSIMKNCQELKTKEEQKIENLSGNPTELALIRHTETANLPLKKIEAKIPFSSEYKYMATMHTEEKGTVIYVKGAPEVLLAKSTLSYSEQEAWGQTATAFAKKGQRVLGFAYKKVDSKQELTHESLTQLTFAGIAGLIDPPKESAVKAVKECQQAGISVKMITGDHKDTAKAIAEQIGLKHTAKVLEGIDLDLMSEEELTRQVPKVDVFARTTPEHKLRIVKALQKNGEIVGMTGDGVNDAPALKRADIGIAMGIKGSEVSKQAADMVLGDDNFHTIAKAVKEGRRILDNLQKTINFFLPTALAQGLILIWALILNRPLPLSPVQILWVNMVTTITLSYALGFESPDPEIMKRPPRDPKQGILSGYHLFRIIYVALLIMVPAYLLAMQFEGQSLQQTILLQNIVLAQAVYMINCRELSKPSLNQGLLQNKSLFLSLGILALLQGMVIFLPIGQQLIGTVSLTMTQQLLIGANVILLFLVVEIEKGIMNKLFRKKEKTAREFSR >CP032308.1|AYA33572.1|434234_435674_-|HTH-domain-containing-protein MYSLMKKIITEKDIRRHVSLVEQLLNHTKITVNELAEIIGTTERTIFSDLQSIRSHLPEGWDIFSDQAGISLQNQQNLLTNDLWEIFFKQSVSVELLKNLLFTKKVAVPDFLADHGLSYGTLKRHVTKINQRLASYDLQIDLTKYTACILGKERAIRTFYHRLLIPFTHNNYFFEDYSIHESHYFQFLRNLSQTELAVETEEIFGTCWFFINTIRIKANCRLDSSIHINSTLSSLYDSALKKLYLKEGIYLKDTELSFASFCFLESWNYNNNYGQEIARCLHHSPFLEVLETFVEELASELSLDQLKKTSLTDNLALLVLKYHESPILIEPLERQYHRFLETYDQQYAHLYQQKENLLNDLKKEMEINEPNYFLQLLSLLIQQTIFSIKPNLFNVYFIFQGEPSWKAFLQQELKDYLGKRVCFLPIELTDLSTISFEKTDILISNFPLDSLDIPIVYISSIPTKNELNRLTELTFKTFL >CP032308.1|AYA33573.1|435817_436180_+|hypothetical-protein MLTEKELIDHIDETYNLSPEYIFKKFPDYCVFSHQKSKKWFGVLMSVPEEKIYDDASDHRIIDILDLKVDPELGGILRGKEVYFPAYHMNKEHWISVDLRKIEKLDELAGLIDESFKSTQ >CP032308.1|AYA33574.1|436366_437224_-|LysR-family-transcriptional-regulator MKLLHLQYFKKVFETKNVTQAAKELFISQPALSRAIKHLENELGVPLFYHSGRNIETTVYAEEFYPYAVKTLDTLEEGIKLLSSVNEKIVTSVILYLEVASVSIPNLVRIFMEKHPDIQLTIMQHHLPDDITDPVLYITSEMKPGMTNIPIMKEPVYVAIPKKHPLAKKEHLQLEDIQRTPILMLSKSNAFRHTLDAALEAKSIELTISSTTDDPATLRSIVKQGLAVSFFPKVSWSYDKNDPFVLREIKDLPLTRTIYLSSSFTEDHPLIKMIAKTMREFYLGK >CP032308.1|AYA33575.1|437343_438255_+|acyltransferase-domain-containing-protein MSTGFLFPGQGSQKLGMLADIPEMYMERLENVTGYRLVDKEENYQDTVFIQLALLTKAVFYLDEMEKNGIQPDIVAGHSIGAFCAAVACRSLTFENAAELVYHRAVLMKEAYPSGYAMGVVVGVTRSEAEEIVAKTFDPDHPVYLSNENCPMQHTLSGSIEGLSVTLAEAKRHQAQTAKLLKVPVPSHCLLMNDTVKKFKPYMQSVHLFDARCLYIKNTDGRATQEAEEIRKDLLENLAFPVQWNQMMDLAKELGMDLTIEFPPGNTLTKLIHTKFGVDKGIRTINLDQHGIDDATFLYQKWR >CP032308.1|AYA33576.1|438261_439908_+|malonate-decarboxylase-subunit-alpha MEKPNRNWASKREKKAQRLEKISNLLNGKYVETEKIVEVMEKLIAPGDKVVLEGDNQKQASFLSESLEKVDAEKVNDLHLIMSSISRPEHLNIFEKGIASKIDFSYAGAQSLRVAQMIEDGTMKLGDIHTYLELYGRLFIDLIPNVVLVAADKADKDGNLYTGFNTEETPTIVEAAAFKDGIVIVQVNEVVDKLPRVDIPGDWVDVVVKADQPYQLEALFTRDPQNITELQILMAMMAIKGIYAEHGVQSLNHGIGFNTAAIELLLPTYGESLGLKGKIAKNWVLNPHPTMIPAIESGWVESIHSFGGEVGMEKYIAARPDVFFVGKDGTMRSNRTLSQAAGQYAIDMFIGSTLQLDYEGNSSTVTKGRLSGFGGAPNMGHNPGGRRHSTPAWQSLRNNDDPLGKGQKLVVQMVETYGSNKKPVFVEELDALAVQKQAGLANAPVMIYSEDTTHIVTEEGIAYLYKAKTKEERQAAIAAIGGVTPLGMTSTKKSLDRLRDVGIVKLPEDLGIKRSEAKRSLLAAQTIDDLIEWSDGLYEPPMKFRTWS >CP032308.1|AYA33577.1|440009_440309_+|malonate-decarboxylase-subunit-delta MEQLAYKYPTKQPINKKIHVGVVGSGDLEILMFPTEKKESTVKICTGSDGFGEVWNNVLTRFFDRYPISADIVINDFGATPGVVYLRLTQAMEELSDEK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP032308_4 | 2293637-2293772 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP032308_4
|
1 spacers
spacers of CP032308_4
>4.1|2293689|32|CP032308|CRISPRCasFinder TACTCGCTTTGCTCGAAAGGAAACTCCTTTCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP032308_4
The CRISPR arrays of CP032308_4 >merge|CP032308|4|2293637-2293772|CRISPRCasFinder CTTTGCTCAACCAGTATTGTTCATCATCTATTCTCTTCGTTCATAGTGATTCTACTCGCTTTGCTCGAAAGGAAACTCCTTTCGCTTTGCTCAACCAGTATTGTTCATCATCTATTCTCTTCGTTCATAGTGATTC >CP032308|4|3|2293637-2293772|CRISPRCasFinder CTTTGCTCAACCAGTATTGTTCATCATCTATTCTCTTCGTTCATAGTGATTC TACTCGCTTTGCTCGAAAGGAAACTCCTTTCG CTTTGCTCAACCAGTATTGTTCATCATCTATTCTCTTCGTTCATAGTGATTC
>CP032308.1|AYA35229.1|2293060_2293564_-|50S-ribosomal-protein-L10 MSEAIIAKKAAIVDEVSEKFTAAASVVVVDYRGLTVDEVTRLRKQLRDANVEMKVIKNSILSRAAKKAGLEGMDEVFTGPTAVAFSNEDVVAPAKIMDEFAKEAKALEIKGGIIEGKVSSLEEITALAKLPNREGLLSMLLSVLQAPVRNVAYAVKAVADKEDGDAA >CP032308.1|AYA35228.1|2292639_2293008_-|50S-ribosomal-protein-L7/L12 MALNIENIVAELKEATILELNDLVKAIEEEFGVSAAAPVAVAAAGGAAAAEEQTEFTVELTAAGDQKVKVIKAVREATGLGLKEAKAVVDGAPAPVKEGVSKEEADELKAKLEEVGASVTVK >CP032308.1|AYA35227.1|2291843_2292533_-|TVP38/TMEM64-family-protein MKKKKIRLILITLGIVLILMVGYRLYLEYQTDIQLFLNPRASKEELLAHIRSHGFSASLLLIVLTAVMCAVPGIPTSVIGVIAGLSFGPFIGAGINVLGNALGNISAVFLMHRLKFLDKKTEKNHWVQSIRQMRHPKIGVMLGYMIPVIPSSMVNFAADAMKLPLQQIVMSIVIGVIPSSVLYACGGEALFHGYNKTAVTLVASVTVLVGLVVFIYKDRKKKQGKQRQK >CP032308.1|AYA35226.1|2290571_2291762_-|MFS-transporter MESKEKTPLTTSLILLLSITCGVVVANMYYIQPIGTKVAASLSVSTSAVGILTMLTQLGYALGLLFLVPLGDVVDRPKLIIRMAALSAISLLAAFFAPSFALFACASFLIGLLSIVPQIIIPYGAVLAGPKARGKVMGTLLSGLLVGILLSRTVSGIVASLFSWRMIYLFALCAVGILTLLLYWKMPRSVQQSSTSVSYLDSLKSLPHLVASQRLLREAAVSGFFMFGTFSIFWSTLIFYISSPAYNWGTFEAGILAIFGLSGAVAAPIVGRLADSYSERKIVYMGLVMQTISFIALLVGGSHLVILLLAIILLDVGNQFGQVANQTRVQGLGEAASNRNNTVFMFMYFIGGAAGSLLGTTMWQQYGWLGVTVSGLVFQGCAFFFQFVVFREKKEN >CP032308.1|AYA35225.1|2288983_2290516_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSILTLNNITQQFGDKILYEGVDLQLNAGEHLGLIGQNGAGKSTLIKIITGEILPDDGQIHWQKNIHKGYLDQYVEVDETLSIEEFLKTAYAKEYEKEEKIAFLYQTYSETFDDSLLEKAGKLQTELDQGVFYQIDTLVAEMSSGLGIDVLGLDSLLKNLSGGQRSKVILAKLLLENPDVLILDEPTNHLDDQHIQWLTQFLQDFDGAYIVISHDQEFLDQITTHIADIEFGKITKYTGHLKQALKQKEQNRESYLRQYHAQQKQIEKTEAYIRKYKAGSRSTMAKSRQKQLDKIERLTPPASASKAVFDFPFSPIVTTLAVETTDLVIGYDRPLLAPINLTIRFGENIAIRGFNGIGKSTLLKTLIGEIEKISGDFHFPDNTKINYFSQDLYWGNPLETPLQYLSSQFPKATIKELRRQLAKAGLVNQLASEPLTTLSGGEQTKVKLAQLTMNQGNLLILDEPTNHIDQETKESLQDGIRKFPGTVIIVSHEQEFYQDLVQRVIEIEPK >CP032308.1|AYA35224.1|2288048_2288750_-|glucosamine-6-phosphate-deaminase MEIIRVKNAEEGGKKAFEIIKEGMNKGAKVLGLATGSTPVTLYKEMTSSDLDFSEMTSVNLDEYVGLGGSDEQSYRHFMDVQLFDKKPFKETFVPDGKAEDLEAACKKYDQIIDAHPIDIQILGIGQNGHIGFNEPGASFDGTTSVVDLTESTINANKRFFDKAEDVPTKAVSMGIGSIMKSKEIVLMAFGESKADAIKGMIEGPVTNHLPASVLQNHDNVVVIIDEEAASKL >CP032308.1|AYA35223.1|2287076_2287790_-|MgtC/SapB-family-protein MNDMVLTIPEIILRLGIAMLFGGAIGFERQYKNRPAGMRTHILVCMGACIIALIQVEIASGALRDALAYPQLAGTIRSDEARLIAQVVSGVGFLGAGTIIVTKQSVTGLTTAASLWAIAGLGIAIGMGYYSIAIISFIGIAIALTVVKRVIHVPTTKKLEIQFIHRKETKDFLTDYFEEKNIVIEDVNFDVKFVDDYRVYKNIYTIDLPKGLTYADVIEELSVHKNITKLHLVSIAQ >CP032308.1|AYA35222.1|2285758_2286898_-|AI-2E-family-transporter MQSRFKQSKLFFWTVELVLTIVGVYFILQMPNIFSPILKMLSAIFLPLLVAGFIYYMFDPIVVFLEKHRIPRVLGFLLTFLVVIILVVLAVMNVVPQLVEQTIQLTQSLPIYADETSKWLNELAQREEFKNFNLEEQLASANLSLSNLFNIILVSLSASVTKIISFMMQFFILLFTVPFILLFMFKDGHKFIDALSHFFPKAIRKELRQTVKELNETLSAYISSTILDALIIGVMSFLAMRIFNQPYSLLLAVICGITNIIPYVGPFIGAVPAIIVGLFISPFQALYMALSILVIQQLDGNLIKPLLFGKSMNIHPLTIILVLIGAGSVAGILGMLICIPVYAVIKTIILNIRKIYLLRKMEHVSEKLDSPKLLEETSE >CP032308.1|AYA35221.1|2283641_2285378_-|DUF2264-domain-containing-protein MNQLKQNLFLTRRDFEEALEEIILPLKQELFNSEKPGVRLGSSGAVYDEKRAEMEAFIRPLWGLAPYWMNHETKDELKDVYRKKILKGMNPKDSFYWGDINDYDQYIVEMAALSLNLLLNRNYFFDELSGTSKQQLIHWLKQALDKKIPKNNWTFFKILIRIALKHCGESLDKEKMEAELRFIDTMYVGKGWYIDGKSSQKDYYVPFAFHYYGLIFAKLMKDDFPEWSEKFIYRAKEFTKDYIYYFDSDGEALPYGRSLIYRFAQGAFFSALIFAEVEAIPWGQIKTLLSNHMKQWMTHDIFTYDGRLSIGYHYENLVMAEGYNAPGSPYWALKVFLLLATKKEHPYWEAKPEPVNTKEKRLIDNGNMLLCQAKEGKHVLGYPHGLMIDGQAHAPAKYSKFVYSTKFGFSVPKAGITYEEGAFDNTLALSRDGEYFRTKKKVRSSEATETFVMYEWQPFQEVLIQTEIYPFGEWHVRFHEIYTTIPLEIREGGFSLLVKEPEITLSKDCAKIKETHVSQIIAIEGYEEAGIQVLEPNTSVFFPRTNLPYLKKKIEPGTHRFICLVGGIINGGEKNDPN >CP032308.1|AYA35220.1|2280908_2282696_+|beta-galactosidase MQTFKIKDEFLVDGIPTKIISGAIHYFRIPPSQWEHSLYNLKALGANTVETYIPWNLHEPQEGSFDFSGFKNVVRFVKIAQELDLMVILRPCAYICAEWEFGGLPAWLLKEPNIRVRSTDPRFMEKLKNYYQVLLPKLAPLQITQGGPVIMMQLENEYGSYGMEKSYLRQTKELMLAHSIDVPLFTSDGAWLEVLDAGTLIDEDIFVTGNFGSHSKENAQVLKEFMQNHQKNWPIMCMEYWDGWFNRWGEPIITRDPEELATEVKEMLEIGSLNLYMFHGGTNFGFYNGCSARGNTDLPQITSYDYDALLNEAGQPTEKYYAVQRVIKEVCPSVWQAEPRTKTLKNLGTYPVNRSVSLFHIKEQICEEIKTDYPLTMEQASNGYGYLLYSLTLKNYGHKNKLRLIETNDRAQIYIDGKYDQTQTQETLGDEMMIEGQKNQPTIALDVLVENLGRVNYGAKLNSPSQSKGIRNGVMQDIHFHLGYRHYPLTFEQAQLDKIDYSAGKDPSQPSFYQFEFDLAEEADAYIDCSLYGKGIVIVNGFNLGRYWNHGPVLSLYCPKDVLKKGRNEVVIFETEGISIDTLIFSDQPIKKDLS >CP032308.1|AYA35230.1|2293973_2294663_-|50S-ribosomal-protein-L1 MAKKSKKMQDALKKVDSSKVYPVAEAVALAKETNIAKFDATVEVAYRLNVDPKKADQQIRGAVVLPNGTGKTQTVLVFAKGDKAKEAEAAGADFVGDDDMVQKIQNGWFDFDVVVATPDMMATVGRLGRVLGPKGLMPNPKTGTVTMDVTKAVNEVKAGKVTYRVDKAGNIHVPIGKVSFDDEKLVENFATIHDVLLKAKPSAAKGQYMKNVTITTTFGPGIHVDQASF >CP032308.1|AYA35231.1|2294766_2295189_-|50S-ribosomal-protein-L11 MAKKVEKIVKLQIPAGKATPAPPVGPALGQAGINIMGFTKEFNARTADQAGLIIPVVISVYEDRSFTFVTKTPPAAVLLKKAAKIEKGSGEPNKNKVAKVSSDQVREIAELKMEDLNAANVEAAMRMVEGTARSMGITVE >CP032308.1|AYA35232.1|2295531_2296200_+|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-beta MKDLRYRSVFDIIGPVMIGPSSSHTAGAARIGKIIRSIFGEQPDSVDIYLYESFAKTYRGHGTDIALVGGLLGMEPDDERLADSLKLAYEAGMEVLFVPKSEKAEHPNSVKMLLKKGTRKLSVTGISIGGGNIQISELNGFKISLSMGTPTLIVVHQDVPGMIAKVTGILSETNTNIGTMTVTRESKGESAIMIIEVDNPQVEETVRRLKHLPNIDSVNYFD >CP032308.1|AYA35233.1|2296212_2297085_+|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-alpha MFLSIEELVDQAKAYSSVAELMIAVEMEMSGRSRSQIIAIMEKNLSVMEQSINEGKEGVTSVTGITGGDAKKLDDYLNEADFLSGETILKAVRNAVAVNEVNAKMGLICATPTAGSAGVVPGVLMAVRDRLGLSHEQQLEFLFTAGAFGLVIANNASISGAEGGCQAEVGSASAMAAAALVCAKNGTPHQAAQAVAITLKNMMGLICDPVAGLVEVPCVKRNALGSSQAFISADMALAGIESVIPPDEVVAAMYQVGRQMPSIFKETAEGGLAVTPTAKRLTEEILNKRS >CP032308.1|AYA35234.1|2297178_2298279_-|lactate-oxidase MTYHTSNEEHPIDIVNIASLEGRVKERMEAGAFGYIRGGSEDEWTMKENTTSFNAKKIMPRILRGIDSADLHTSVFGIELDTPIIQAPSAAQGLAHEKGEADTAKGVAAAGSIFSISTYANTTIKDAADAAPGAPQFFQLYMSKDDGFNEFILNKAVEAGAKAIILTADSTLGGYREEDVINQFQFPLPMPNLAAYSEQSASGNGEGKGIAEIYAAAKQGLTPDDIKTIKEITNLPVIVKGIQSPEDAVIAISAGADGIWVSNHGGRQLDGGPASFEVLPKIAEVVNKRVPVIFDSGVRRGEHVFKALASGADLVAIGRPIIYGLNLGGAEGVTSVFEHLNKELSITMQLAGTKSIDEVKNTKLMD >CP032308.1|AYA35235.1|2298370_2299252_-|alpha/beta-fold-hydrolase MTNRIKNVCKHAATAALVLISLFAISGCQTTKTTAVSDKEKTVESSKVIEKTTIPTLFFHGYSGTENSFKGMLQRLEKNQKAVKELVLIVEADGQIQAEGDLSGKADNPMVQVLFADNKNNEWNQAEWIKSCLLYLKENYSIDKVNIVGHSMGGVSALRYLGTYGQDTSLPQVQTFTAIGAPFNDFVDDSGQSLTEELAMGPAVVSSRYQDYQQIIGNMPTTTRFFLIAGQLDEADLSDGTVPLNSALAVYALLKQHGNEVEEKIVKGENAAHSMLHENQEVDQLVSRFVWNE >CP032308.1|AYA35236.1|2299328_2299874_-|transcription-termination/antitermination-protein-NusG MESFEKNWYVLHTYSGYENKVKANIESRAQSMKMADFIFRVVVPEEKETEVKNGKEKEIVHKTFPGYVLVEMIMTDASWYVVRNTPGVTGFVGSHGAGSKPAPLLPEEVNHILRSIGMSLRQNDLEVEVGEVVKIIEGAFAGLEGQVTEVDGEKEKLKVNIDMFGRETSTELDFDQVDKID >CP032308.1|AYA35237.1|2299974_2300145_-|preprotein-translocase-subunit-SecE MKFLKSVKDEIKQVTWPNRKQLRKDTLVVIETSILFGLMFYVMDTAIQSLFGWILK >CP032308.1|AYA35238.1|2300165_2300318_-|50S-ribosomal-protein-L33 MAKKKAALACSVCGSRNYTKSVSEGKSGERLEINKFCKYCNQYTLHKETK >CP032308.1|AYA35239.1|2300479_2301124_+|CBS-domain-containing-protein MLLKTLVYKKKDLTTVTETSTLEEALKILETSGYRCVPILDSSGNIFRGNIYKMHIYRHKANGGDMTLPVTHLLKNATKFIYLDTSFFKVFFTIKELPYIAVLDSENHFYGILTHSTLLNMLSQSWSVEQGSYVLTIASTGKQGDLAAIAKIISKYSSIASCITLDIEKDEYIRRTLITLPANTEPKVCETIINHIEKKNYKVVEIENLQNQEA |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP032308_1 | 1.3|322282|35|CP032308|CRT | 322282-322316 | 35 | AB711120 | Bacillus phage PM1 DNA, complete genome | 15177-15211 | 9 | 0.743 |
CP032308_1 | 1.5|322420|35|CP032308|CRT | 322420-322454 | 35 | NC_011413 | Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-2, complete sequence | 3807-3841 | 9 | 0.743 |
CP032308_1 | 1.1|322144|35|CP032308|CRT | 322144-322178 | 35 | NC_011413 | Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-2, complete sequence | 3807-3841 | 10 | 0.714 |
CP032308_1 | 1.2|322213|35|CP032308|CRT | 322213-322247 | 35 | NC_011413 | Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-2, complete sequence | 3807-3841 | 10 | 0.714 |
CP032308_1 | 1.6|322489|35|CP032308|CRT | 322489-322523 | 35 | CP031730 | Stenotrophomonas rhizophila strain GA1 plasmid unnamed1, complete sequence | 136113-136147 | 10 | 0.714 |
1. spacer 1.3|322282|35|CP032308|CRT matches to AB711120 (Bacillus phage PM1 DNA, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttctcctgtaaattcagaataattaaaagcaccat CRISPR spacer atttcctgtaaattcataataattaaaaccgttta Protospacer *.************* *********** *...
2. spacer 1.5|322420|35|CP032308|CRT matches to NC_011413 (Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
acttcctgtaaatttagaaccactgaaagcactat CRISPR spacer acttactgtaaatttagaaccattggatatatggt Protospacer **** *****************.**.* ..*. .*
3. spacer 1.1|322144|35|CP032308|CRT matches to NC_011413 (Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
acttcctgtaaatttagaaccactgaaagcactac CRISPR spacer acttactgtaaatttagaaccattggatatatggt Protospacer **** *****************.**.* ..*. ..
4. spacer 1.2|322213|35|CP032308|CRT matches to NC_011413 (Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
acttcctgtaaatttagaaccactgaaagcagaag CRISPR spacer acttactgtaaatttagaaccattggatatatggt Protospacer **** *****************.**.* ..* ..
5. spacer 1.6|322489|35|CP032308|CRT matches to CP031730 (Stenotrophomonas rhizophila strain GA1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
ttctcctgaaaaattagggtattcaaaagcatgag CRISPR spacer tgctcttgaaaaattagggttttcaaatctttcta Protospacer * ***.************** ****** . * .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
316220 : 368425
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP032308|316220:368425|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP032308|316220:368425|318051_318678_+|AYA33473.1|DBSCAN-SWA MKNEIFKQIKQLIIVIISGVCSYFIPIAHFFVNIPDTKILTGFDIAIFSFIGNSLFSAIDYFYKKNKLMIRISIEAIEQESDKLILYDKDIDKQLEIKANIKIEGKKRKCPLVSLKVPDCYLLQVQNNKSSSFVKEISTSEKYEIDINKILQKSPKEGISITREIKFILLLEEHNKGNNDYLVCEKESSWKYLGMTNIDSKRLQLLQK >CP032308|316220:368425|352521_352842_+|AYA33503.1|DBSCAN-SWA MIIPNSLEELAGYVETGKSVFFFTAGWCGDCRFIKPQMPEIENDFSDWQFIEVDRDKYIDVAAEWNIFGIPSFVVIQDGKELGRLVNKDRKTKQEIESFLESVIKG >CP032308|316220:368425|348106_349525_+|AYA33499.1|DBSCAN-SWA 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>CP032308|316220:368425|331118_332312_+|AYA33486.1|DBSCAN-SWA MANSRQKYLTKAKKSKNDEFYTQWSDIEKEINAYIEYNPNVFKGKTILLPADDPFESNFFKFFATKFNEFGIKKLISTSYAPSPIVNTQLTLLPELVPEKEIGSGRNKYFKEAYKIELTEVVDEDGMGAVNINDVITRLKKEKEKIDSGGESSILSYLEGDTNPDSIERFSAGDFRSQEVSELREEADIIITNPPFSLFREFLGWINPIEKQFLIIGNMNAITYKEVFPLIKDNKIWLGTGMGRWISGFIVPDKYELYGTEARVEKGQRIVSTNNALWMTNIDHGKRHQPLSLMTMEDNKKFSKHKSVKGKEYEVYDNFNAIEVPFTDAIPSDYDGVMGVPISFLDKYNPDQFKIIGCSYDYGRPDGWSEDIKMSVTINGKAIYKRLLIEKNKENTI >CP032308|316220:368425|339336_340763_-|AYA33492.1|transposase|DBSCAN-SWA MAKYTFELKLKIVHDYLDGKGGSDYLAKKYSVKAPSQVKRWINAYQVFGEAGLVRKRQKKKYSVQFKLDAIELYLTSELSYREVANTLNMNNPNLIASWMRQFRDGGIDGLSKTKGCPPILSKKNEPKNKKKSITKATSEERERIEELEKRVRSLQIENAFLKELRKLRKQEAQQRRMKQSHESSQASEDPFKLVELLETLKFPKATFMYWQKRLDRQNPDQEIEAEMLKIREKHKDYGCLRMTNELRNRGFSINKKKVQRLIKKLGIKVTAYTRKSRRYNSYRGQVGATAKNRIHRRFYTSICHQKITTDTTEFKYHEVDAKGIIRQKKLYLDPFMDMFNSEILSYRISEKPNALAIMEGLEEAIQITNDCPYRRTFHSDQGWAYQMNAYRNKLKEYKIFQSMSRKGNCLDNSLMENFFGLLKQEIFYGKTYNCFEELKSAIDSYIYYYNNERIKQKLNWQSPVQFRKTAVTVA >CP032308|316220:368425|318695_319616_+|AYA33474.1|DBSCAN-SWA MIYSKWIDNSNVSLDDLINNIKVNKQNHIREIDAFDNTPLNYEVDFVYEENQFTIINGKDVYYNYLQFNYEYVKNHEAVNPRREKRVSTYAMNVIIFNYEGKNHYICNKRYNNSTLKNLRKLAGYKKDLTITEQRVLGIKTDLFIWMTHYLIDNPDDFLEKDSETKLLKLTSFKGQTKDKLAEISGSGEKILNMLTTLLFLFENKEISSVKVELTRFQEYFSLTLGEKSYVDIDVNEYRGAEYFEMAETIESIVVLKCFIDVIPSLIIMFSDELDSKKWTPKKENKFFTGIGRTLSKKINESLRNK >CP032308|316220:368425|361820_362192_+|AYA33511.1|DBSCAN-SWA 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47 | Bacillus_phage(16.67%) | integrase,transposase | attL 315947:316006|attR 336919:337106 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
643394 : 703887
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP032308|643394:703887|DBSCAN-SWA 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59 | Streptococcus_phage(18.75%) | transposase,lysis,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1309926 : 1363066
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP032308|1309926:1363066|DBSCAN-SWA AATGACCTACAAACATCTTACCATAGACGAACTGACAATGATAGAATCATATTATCTTCAACATAATAAGCCGGTTGAAATCGCTAACCGAATGGGACGTGCTATACAAACTATTTATAATGTAGTCAATAAGTTCAAGCAAGGCAAGACTGTTCTTGATTATTGGCACCAGTATAAAGAAAATAAGAAAAAATGTGGTAGAAAAGTCATTCAATTACCTGCTCATGAAGTAGATTACATTAAAGAGAAAGTCACTCTTGGTTGGACGCCTGACGTCATTATCGGGCGAAAAGAAAGGCCTGTTTCATGCGGTATGAGAACACTTTATCGTTTATTTTCTAAAGGAATATTTGATATTGACACACTACCGATGAAAGGTAAAAGAAAACCCAATGGCCATCAGGAAAAACGGGGAAAACAACAGTATCAGCGCTCAATCCATGATCGACCTGATAATTATCCTGATTTCAATTCTGAGTTTGGTCACCTTGAAGGTGATACGATCGTTGGCATTCATCATAAAAGTGCCGTCATTACTTTAGTTGAAAGATTATCTAAAGTCATTATCACGATTAAACCCAACGGCCGTAAGGCATTAGATATTGAAACTGCCCTTAATCAATGGTTTTCTCGCTTCCCTAAAAACTTCTTTAAATCTATTACGTTTGACTGTGGAAAAGAATTTTCTAACTGGAAAGCCATTAGTAACCAACATGATATTGATATATATTTTGCGGACCCTGGAACACCTTCTCAACGCCCATTAAACGAAAATTCTAACGGGATTCTGCGTCGTAATGGACTGCCGAAATCAATGGATTTTAGAGAAGTGAATCAGACATTTATTTCCAGTGTCAGCAATCAACGTAATCATATTCCAAGAAAATCATTGAATTACAGAACACCAATCGAAATATTTTTGAGCTATGTACAAGAAGCATTTTATTCTAGCTTAATTTGACAAATCATATCATGTTTTTAAACAATGTAGAACAATAATTTTATATGCACAAGTAACCCAGAATAAAATTTTACTAATAAATAACAAAGTTATATCCCCTTTATTTTTTCTCTTTTGCAATATATTTATCTTATCATTATTCATTGATTATGAGAAAAAAATGAGATTGAAGGGGGGAATCGGTAATAAAAGACTTATACAAAAATGAAGGGTTGCTTAGATACGTAGATTACTACAGTATAATAAGAACGGTTTCAAGCTATATGATCATTGATACATAAGTTCAGAAAATCGACTTAAAATGTTATTGATTAATGAGAATTGGAAAAACGGCAATGAATAAATCGAGTAAACAAGAATCGAACGTACTGAAGGCAACATTTGAAAAAGAATACGGAGTTTCTACAGAAGAAGTATATAAAGTGGCAAGTCAGGGTGTTGCTATTGCAAGTGAGGTTATTCGTAAGCTTGGATTTCTATATAAAATGATGCTCGTCAATGGGAGGGAGCGGAATGAAAAAAAAGACAGATGTTACGCTAGTAGTCATGGTATAGACGGTTTAATACTAGATATGCCGATAAAGTACCCTAATTAATTCGGATTGAAAGAATGATGAAATGCGATAGACAGCAACGGTTGAAAAATAGTAAGAACAATTATGAAGAGTTGAAATTCACATCCTTGTTTCCTAGTATGTTTTTACTATTTCCGTTGCTGTCTATTAATTTATAAACATCGGAGTTACGCATATTTAAAACACATCAATTACTTATTGTCAAAGATAGATATAATACGCATCAGCTTCCGAAGTAGCAGAATTTACCTTATGGAGTCCTTCTAATTTGATGTGGAGTTCTTTGGCAATTTCTTGAATATATTTGTTAAATATACTATTTTCTAATTTTAAATAATTAGCAATCTCTATAGAAATAACTTTTTTACATTCTTTTCCTATAAACTGAATATTAAACTGTCTTATTACACTGTTTCTATCACTTTCATTAGGAAAGCTACTTATCATCGATACATATTCTTTTATAGACATAAGAGTACTTTTTATCATTTGGAATTCATCCATAATTTCACCTTCTCTAATTATTTTAATTTTAATTTAATTATACATGATACTTTTGTTTCTATCCATTTTTTTGCTGAAGAGAAAATAAGGTAAGGAAAGTTTAGCGACTATCGCTAGGTGAAAAGATAAACAGCTTCTTTTTTATTTTTTAGTTACATAGACATTCAGAAAAAAAGACAATCAACTAGTGATCGTCTTTTAGAAAGTTACCAATCAATTTTATAATATTGCTAGAAAATAAGATAAGAGCAAGACCTAAAATATTTATAAAAAATTGAAATCTAAAAAAATAGCATTAAGGATAACAAGAATCATTTCGATGTATAATAATTAATCATTCTTATAAAGATATCGCAAAACAATGATGAAAAGAATAAGTGATAAAAACAACCAACTACGTAAAAAAATAATGCTGAAAGCGATTGATAAAATGTATATTTCACTATTTTTATGATAAAAATTGCTGTAGGAAGAAAAGAAAGCATTAATATAACTGTTTTTCTAGAACGTTTAGTGAAGTAAAAAAAAGAGCTGATACCAATACAGACTGGAATCCAAAATAAAAGCATGCTAAATGTGACCACCGTATCATCTCCCATATCGTCTTATGTCAATTAGGATAATAGCACTTTATCAACTAATAACCAAATATTAAGGATAATAGTTCCGAATGGACTTCAAACACACCAGAATGGAAAAAGTCAGAAAACCGGAACTAACTGAAATAAAAGCAAAGTTTAAAAAATACGGTGTTCCTACAGAAGCAGTGGATAAAATTGCGAGCAATTGTATTGCCGGCCATCATTCAGGTTGAAAAAGTAAGTAGTTAACGAAGAACAAAAAGAAAGTAGATAGATATGAGATTTTTAATCGGAGATCATACTCGTTCATTAAACAATTGTTGTGATTTTTCTGAAATTTTACATCTTTTAAACCTTATATCGAGTGATTATCCTTGTGTTAGTATTATATCCGTGTTACAGTAAATAAGTAATCTAATTTGAAACGTAATCTGAGCGATATATTCACACTATAAAAACTCCTTTTACCAAGTAATATTAATTGCAATAAAACACGTATTATATACGTATCAGGAGGAAATATATATGAATAAAGGTACAGTAAAATGGTTTAACTCAGATAAAGGTTTTGGTTTCATCACTGGTGAAGATGGAAATGACGTATTCGCTCATTTTTCAGCAATCCAAGGAGAAGGCTTTAAGTCTTTAGATGAAGGCCAAGCAGTTACTTATGATATTGAAGAAGGTCAACGCGGTCTTCAAGCAGTAAATATCGTAAAATAATGTTGAATGTTAACCGCCTCATATGAGGTGGTTTTTTTGTTTATGTTGGTAGAAAAAATCCTTCACTGTAATATTAGGTGAGGGATTTTTTTCGTTCATTGATTAAGTTTAACACTATTGTTTGATTTAGTTTGTTTATTTTCTGTTACTCAGTTTTTACTTGCTTTGATATTTTTTTCTGAAACCGTCAAATCATAAAGAAGATACTTTTCTGAGCAAAGGAATTTACATATTTTACCAAATATGGTTTAATGGTTTAAACGTATAAACCAAAGAGGTGAGCTACAATGATTAGACATGATCGTTTAAAAACAGAACTAGAATCATTGAGTGGTTTTTTAGCAGCGTTAGGTGACACAAAAAGACAATTGATCTTGATTAGACTATTAAATGAAAAAAGCTGTCATGGTTTGCAAGTAGGAGAACTAACTGACGATACAGGTTTATCAAGACCAGCAGTATCACACCACTTGAAAATTTTAAAAGACGCCGATTTATTAGAGGTCAGAGAAGAAGGAACTAAAAATTTTTACTATCTAAAACACGAAAATAAAAATATATACAAATTAAGAGATTTTTTGAATGATGTAATAACTGAAATAGAGGAGCTAAAAGACAGTGAAGAAAATTCTGATCGTTGAAACAAACGTCAATCAATATAAAGGAACAAATAAAGCTACTGGGCTTTGGCTAGGAGAAACAGTAGAATTTTTAGCAGAAATCTATAAATATCAGTTTGAAGCTGATTTTGTTAGTCCGTTAGGTGGCTATGTGCCGATTGATCCTAGAAGTATGAAAAATCTAGATTCTGATGTTATGGACATTTATTCTAATGCAACATTTATTGAAAAAGGTTTGAGGAATACGTTGTCTCCTGCAAACGTAAAGAGTGAAGATTATATTGCTATTTACTTTACCGGAGGACATGGTGTGATGTGGGATTTTCCAGAAAATAACGCATTACAAAAAATAGCGAGTGATATTTATGAATCAAATGGCTATGTATTATCTGTGTGCCACGGTATAGCAGGTTTATTGAATATCAGACTTGCTAATAACGGAGGAACGATTAGCGATGAAAAGCAAAGTAGTTCCTTTTGATAATGAAGAGATGACTGTAAAGAGAAAAGGACATTTTATCAAGAAGCGTTTCTTTAAGAGTCATGTGGTAAAGGATGGACATCTGATTACTGGACAAAACCCGTATTCAACAAGAGAACTAGCACGAACATTCATCAAGGAGGTTATCTAAATGCAAACAGTTATTGGTAGTAATGGCCAAATTGGATACGAATTAGCAAAAGAACTCAATCAAACGTACGGGAAACAGTTGCGCTTAGTTAGTCGAAATCCGAAATCAATCAACGATACAGACGAACTAATCTCAGCGGATATTTTAGATCGTGAGGCAACTATTCGTGCTGTAGCAGGAAGTGAGATTGTTTATTTTGCTGCAGGATTACCGATGGACTCCGAACAGTGGAAAACAAAATTTGAAATCATGTTAGAAAATGTCATACAGGCTTGTAAAGAAACAAAGGCGAAATTAGTTTTTTTCGATAACACTTATATGTACGAAAAAAATGACACGGAACAATTTGAGGATAGCAAATTTATTTATGATGGTATCAAATCCACTGTTCGAGCTAAAATGGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP032308|1309926:1363066|1319992_1320208_-|AYA34353.1|DBSCAN-SWA MKTLDAIALTLLIVGGLNWLLVGLFEFDLVAMIAGGSTTIFAKIIYIIVGICAIYCLKFFPMITRKVDERY >CP032308|1309926:1363066|1328298_1329300_+|AYA34358.1|DBSCAN-SWA MKWFKRIVIAVPVIIVVILVTVFLINQITPKPISLLVRKQFDTSEKEQVYARPDDFQQKIKQIDRNKEITYPSKYKNNHMDIYTPKTEKKKLPILFWMHGGAYVGGDKNDCRDYLEYLCSDTQQIVVNIDYERSPEAKHPTPVIQLNEAIQAAKKEIKEQADWSNISIGGDSAGAQISGEYLLALQNEEIKKADQLDPTLENKQITKFVSLSGLLDFSAFTQVSDKISSFLYAKCGWAYFDSKNFERLEDVKHLALARHADRWTQKTFLTDGNTNTFTKQMEQTASAFEKVGVKVTKVDYTKKNVVLNHEYQFDFSNKQAQETYQKLVAFFKE >CP032308|1309926:1363066|1313071_1313269_+|AYA34345.1|DBSCAN-SWA MNKGTVKWFNSDKGFGFITGEDGNDVFAHFSAIQGEGFKSLDEGQAVTYDIEEGQRGLQAVNIVK >CP032308|1309926:1363066|1319369_1319855_-|AYA34352.1|DBSCAN-SWA MNKGIYVGLLGVVLLFSACGNATKNSINESSLTNSTPVVGSTKSTSTASITNTSTNNVDSQYSQSSIQSSTISSTSEMQERTEPSLPLKNSDEALLFLIAHRSELQSEDIVTSFYQKIDQDYLFTTSSKQTRAQGGSGSVGFYRVSPDGVILITDAYGTPF >CP032308|1309926:1363066|1360859_1361048_+|AYA34390.1|DBSCAN-SWA 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53 | unidentified_phage(27.27%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1636002 : 1645041
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP032308|1636002:1645041|DBSCAN-SWA GTCATTTCAGATAGCCTCCATTTTCAATAATTTCACTAATCACTTCTGGATAGATTCGATGTTCTACTCTATGGATTTTTTCTTCTAAAGAATCGAACGTGTCCTCCTGTTCGATCCTCACTTTTTCCTGTCGGATGATTGGTCCAGTATCTACACCTTGGTCGATATAATGAATTGTGACACCCGTTTCTTTTACTCCAGCTTCAAATGCATCACGAATGCCATGCAAACCAGGGAATGCAGGTAAAAGAGATGGATGGATATTGATGATTCTTTTATCATAATTTTCCAGCAATACTGGTCCAATGATTCGCATGTATCCAGCTAGTACAATCAAATCGATCTTTTTTTCTTTCAATTTATGCAAAATCGCTTCTTCATACTCTTTTTTGGATTCAAATTCTTTAGGTGAAAAACAATCTGCCGGTACATCCAATGCGACTGCACGTTTCAAAACATATGCTGCAGGCTGATCACAAAACAACCAGTCAATCGAAGCTTCCAATCCTTTTTTTGATAAATAATCGGCTAGCGCTTGAAAGTTGCTTCCGTTTCCAGAAGCAAAAACAGCGATTCTCATCGTTCTTCTCCTGTAAACACCACACGATGTTTTTCTTTGGCGATCACTTTCCCGATTTCATAAACTTTTTCGCCAGCTTGCTCAATCTCGTGTACGATTTCTTTTACTTTTGCTTCCTCGACTGCTAAGACCATCCCAATGCCCATATTGAATATTTCATACATCTCCATCATAGGAATCTCACCATATTTTTGTAAACAGCCGAAGATCGGAAGAATCGGCCATGTGCCAAGTTTGATTTCAGCAGCCATAGATTCTGGTAACATTCGCGGGATATTTTCTACAAACCCTCCACCGGTGATATGTGCAGCTCCTTTGATTTTCTTTTCTTTGATTAGGGGAAGCAAGGAAGAAACATAGATTTTCGTTGGTTCAAGTAATACTTCGCCAAGTGTTTTTTTCAATTCTGGCAGTTTTGATGATAAAGAAAACTGCTGCTGCTCAAAGAAAATTTTGCGAACAAGAGAGTACCCATTTGAATGGATTCCGCTAGATGCTATTCCAAGCAACACGTCTCCTGGGTTGATTGTTTCTCCTGTCAATAATTGAGATTTTTCAGCTATCCCTACAGCAAATCCGGCTAGATCATAATCATTTCCAGAGTACATACCGGGCATTTCAGCTGTCTCTCCGCCAATCAGTGCCATATTTCCTTGAACACACCCATCCGCTACACCTTTTACTACATTTTCTAAACGTGTCGGATCATTTTTCCCCGTTGCTAAGTAGTCTAAGAAATACAACGGCTCTGCGCCTTGTGCTAAGATATCATTGACACACATCGCTACGCAGTCAATTCCGATCGTGTCGTGTTTGTCCGCTTCGATTGCTACTGCTAATTTCGTCCCTACACCATCGGTCCCCGAAACAAGGACTGGCTCTTTTAATTGAAAGACCGATAAATCGAAACAGCCGCCGAATCCTCCTATAGCGCCCATCACACCTAATCGTTCCGTTTTTTTGACATGCTTCTTGATCCGTTCTACTACTTCATATCCAGCTTCGACATCTACGCCAGCTTTTGCGTATGCATTTGCCATTGGCTTCATATGCTCCCTTCTTGATCTGCTTTTAAAAGAACGATACTTTTTCTTTTAGTGATTCCTGATATTTTTCTTCATAGTCATATAACGGTGTCGGATAATCTCCGTTGAAATAAGCCATACACAATCCTGAATACGGGGCATCTTTTTCCAGACCGATCGATTCGATTAGACCCTCTTCACTTAAAAAACCTAAAGAATCGGCACCGATACATTCTTTGATTTCATCAATCGTATGATTGGCCGCAATGAGTTCTTTACGCGTTTGAATATCAATCCCATAAAAACATGGATATTTCAAAGGAGGAGAAGCAATCCTCACATGTACTTCTTTTGCTCCTGCTTCTTTCAAAAGATGGACGATCCGTCTGCTTGTCGTGCCCCGAACGATCGAATCATCAACCATGATCACCTTTTTCCCTTCCACTACCCCGCGTACAGCAGATAATTTCATTCGGACACCTTGCTCTCTTAGCTCTGGCGTCGGCTGGATAAATGTTCGGGCAATGTATTGATTTTTTACTAATCCAATTTCATAAGGGATACCGCTAGCTTCTGCATAACCACTTGCGGCTGACAAAGAAGAATTAGGTACACCAACGACCATGTCTGCTTTTACTGGCGATTCTTTCGCTAAATTCCGTCCCATATTTTTCCGGGCAGTATGCACATTGATCCCTGCGATATTTGAATCCGGTCTGGCAAAATAGATATATTCCATCGAACAAATAGAAAGCTGCGTGTCCTTCGTAAAGCAATCAATCTGGATTCCTTCGTCATTGATGATCACTATCTCACCAGGCTGGACATCTCTTATAAAACGTGCCCCAATAACTTCTAATGCACAAGTTTCCGAGGCAATCACGTATGCTCCGTTTTTCATTTGTCCGATTGCTAATGGACGAAAACCATTCGGGTCCAAAGCGGCAATCATTGCCGTTTCCGTCATTAATAAATAGGCAAAGCCACCTTTGACTTCATTTAAAGCACTTTTCAATTTATTTAAAAAATCTGTTTCTTCACTTCGTCGGATCAAATGCATCAATATCTCCGTATCGGAGTTGGAATGGAAGATTGCCCCATTTTCCTCTAACTCTTTTCTAAGGGAGCGAGCATTGATCAAGTTACCATTATGCGCTAAGCCGATCGACTGATCATGAAATTTGAATAGAAAAGGCTGAATATTGTCCACACTTCCATTGCCTGCTGTTGCATAACGTACATGTCCGATTGCAGCTTCTCCTGTTAACTGCTGCAATTTTCTTTGATCTTTGAATACCTCAGAAAGTAGACCCAGATCTCGATGACCCATGAGTTTCCCTCGATCATTGGACACGATACCCGCACCTTCTTGTCCTCGATGCTGAAGACTATGGAGCCCGAAGTATGCCACACTAGCGGCGTCTGGATGACCCCAAACACCGAAGATTCCGCATTCTTCATTTAAACTCTTCACTTCATAAGACATACGATTGCATCCTCCCAGCACTTTCTTGCTACTGCTGTTTCTATTTTGATTTGACCGTCAGTTGCTGATATTTCGATTATCGCTTCATCCGTCACCTTACCTGCTAAAACAGCAGCATCTCCCATCATTTCTTCGAATCGTGTCTGGTTTTCCGGTGCAACTGTCAATACAAACCTTGATTGAGTTTCTGCAAACAATTGAGCAGAGGGCAAGCCAAACTGCACAGATAAACCTAACTGATATTTGAAAGCTGATTCTGCCAGTGCAATTGCCAAACCACCTTCTGAACAGTCATGGGCACTTTCAATCAATCCATTTTGGATGGCTGTCAATACTAACTCCTGGTTTTTCTTTTCAACGGCTAGATCAAAGTTTCGAATCACCCCTTCGATTCTTCCAAGCTGCATCTTTTGTAATTCACTGCCATCAAAATCTGCAAACGTCTTGCCTAATATATAGATTAGATCCCCTGATTTTTTGAATTCTTGAGTAGTGATATGTTCATGTTCCTCGATCAATCCGACCATACCGATCATCGGTGTTGGATAGATTGCTTGACCGTCCGTTTCATTATATAAAGAGACATTTCCTGAAATAACAGGAGTTCCTAACGTTTCACACGCAGCAGCAATGCCGTCAGCTGAAGTCGATAATTCCCAAAAAACTTCTGGTTTATCAGGAGAACCATAGTTCAGGCAGTCGGTGATCGCCAAGGGTCTACCACCGCTAGCAATGATATTTCTAGCTGCTTCTGCCACTGCTATTTGTCCTCCGACTTTTGGATCCAAATAGAGATAGCGAGCGTTGCAGTCTGTGGTCATCGCTAATGCTTTATTCGTCCCTCTGACTCTCATCACAGCCGCATCGCTTCCTGGACAGACCACTGTATTGGTTTGTACTTGTGAATCATAAGTTTCGTAGATTGAACGTTTCGAAGCAATCGTCGGTTGTTGCAACAGATCAAGCAATACTTGTCCAGGTTCTTCAATAACCGGCTGATAAGGAGCCAACTGCTGAAAATCTGCGATTCGAGCTGGTTCTTTCATCTCTTTATGATAGACTGGCGCATCTTCAGCCAGCGCATCGACTGGCAGATTCGCTACTTCTTTCCCTTGATGATATAGACGATATTGCCCGTCGTCTGTTACTTTACCGATAGTGACTGCATCTAGATCATACTTCTGAAATAGTTCTTGGATTTTTTCCTCCTCTCCTGATTTGACACAAATCAACATCCGTTCTTGTGATTCGGATAGCATCATTTCATAAGGCGTCATTCCAGTTTCTCTTTGTGGGACTTCGTCTAATGTCAATATAAGTCCTGAACCAGCTTTTGAAGCCATTTCCGCACTAGATGAAACAAGTCCTGCTGCTCCCATATCCTGTATACCTACTAGAGAATCCGAATGATGCAAGATTAATTCCAAACACGCTTCAAGCAGTAGCTTTTCCATAAAAGGATCCCCTACTTGTACAGCAGAACGTTGCTGTTCTTCTTCTTGACTAAATTCTTCTGAGGCAAAAGTTGCGCCGTGGATGCCGTCGCGACCTGTTTTTGCTCCTACATACATGATCGAATTGCCGACACCAGCAGCTTGCCCTTTCTGGATATCTTTGTGTTCAATCAAACCTACACACATTGCATTGACTAATGGATTTCCTTCATAACAAGGATCAAATGCAATTTCGCCACCTACAGTCGGTATGCCGATACAATTGCCGTATCCGCCGATACCTGCAACTACTTCTTCTAGTAAATATTTTGTTCTTGGATTATCTAATTCGCCGAATCTCAATGAATCTAGCAACGCAATTGGACGAGCACCCATGCTGAAAATATCTCTGATGATTCCGCCAACTCCTGTCGCAGCTCCTTCATAAGGCTCCACGGCTGAGGGATGGTTGTGACTTTCTGCTTTGAAGACAACTGCTAGTCCATCACCGATGTCGACGATGCCTGCGCCTTCTCCAGGGCCTTGCAAGACATGAGGTCCACTAGTAGGAAATTTGCGTAGAACCGGTTTAGAATTTTTATAGGAACAATGTTCGCTCCACATAACAGAAAACAGTCCAGTTTCCGTATAATTAGGCATTCTTCCTAAGATATCTTCTTCGATCATTCGATATTCTTCATCAGTCAATCCCCATTCGGCATAGATTTTTTTTTTCTTGATCTCTTCAGCTGTCGGTTCATTCAATGTTTTCATCTATACGGTCACCTTTCCGAAGTTTTTTAAAATGGAAGCAAAGAATCGTTTCCCATCTTCTGATCCTAGCAAGTCTTCTACTGCACGTTCTGGATGAGGCATCATTCCTAACACATTCCCCGCTTTATTCGTAATCCCTGCAATGTTTTCCACGCTGCCGTTGATGTTGTCATTATAAGTAAAGACGATCTGATTATTTTCCTTTAGGTCTTCAAGTGTTTCTTCGTCACAGAAATAATTTCCTTCCCCATGAGCAACTGGAAGAGAGATTATTTCATCTGCTTCATATTCTGAAGTAAAGGCCGTCTTAGGATTGACTTTCAATGGTACAGTTTTACAAATAAAATGCAAAGACTCATTTCGTCTCAGTACACCTGGCAACAGTCCAGCTTCTGTCAATATCTGGAATCCATTACATGTACCGAATACGGGTTTCCCTTCTTCAGCAAAACGAACCACTTCTTCCATGATTGTAGAAAACCGAGCAATCGCACCACATCTCAAATAGTCACCATAGGAGAATCCTCCCGGCAGTAAAACCCCATCAAATCCTTCTAAAGAGGACTCATCATGCCGTACAAATTCGGCATCAGCGCCCATGATCTCGCGAACTGCCCATAACATATCTGCGTCACAATTTGAACCTGGAAAAACGATGACCGCAAATTTCATGTTATACTTCCTCCATTTTTTTGATTTCATATCGGTATGTTTCCATATTTACATTTGCAAGCAACTTATCACAAATCGTTTCAATCACTGTATCGATTGGTTCTTCTGTATCAGCAAGTTGTATCTCAAAGTATTTTCCGATACGGATATCTTCGATTGTTTCATATCCCATACGATGGACTGCTTTTTTTACTGCTTCTCCTTGAGGATCTAATACTGAATCTTTATAGGTTACATAAACTTTTACGAAATACATCATACTCGCTCCTTTTCTTCAGTTAGTTCCGATAGACGGTTATATACTTCTTGATAGACTGGAATCAGATTACCTAAGCCTCTGCGGTAAACGTCTTTGTCCATATGTTCATTCGTATGTTCATCCCATAATCGGCAAGTATCCGGTGTTACTTCGTCCGCAAGTAATATTTTTTCATTCGACCGACCAAACTCTAGCTTGAAATCTACTAAAACCAGACCAACCTTAGCGAATAATTCGATCAAAATTTTATTGATAGCTAATGCTTGGGTTTTCAGCTCACTGATTTCTTCCGGTTTTGCCAGTTGCAAGTAATAGATATGCTCTTCATTGACAAACGGATCATCCAACTGATCATCCTTATAGTAGAATTCAACGATTGGCTTGATTAATTTTTTGCCTTCAGGAACACCTAGACGTTTTGAGAAACTTCCTGCTGCAATATTTCGGATCACCACTTCCAGAGGGATGATTTGTACTTTTTTTACTAATTGTTCGGTTTTAGATAATTGTTCAATAAAATGATTTTTTATTCCTCGCTGGGTCAGATAGCGGAAAATCGTACTTGTGATTTTATTATTCAATTCTCCTTTCCCACTTATCTGATCTTTCCTCGCGCCATTCAACGCAGTCGCCTGATCTAAGTATTCTACCCAAATCAAGTTTTCATCAGAGGTAAGATATAATTTTTTGGCTTTCCCTTCGTACAGAAGTTCTTTTTTCTCCATGTCCGACTCTCCTTTTTATTTACATTCAAAGCAAATACAACGATTTTTGTTCGTGTTTTCACTTTGAATTTTAACAATCATCTTTTTAGAAATCAATATAAATATGTACATTAAAGGCATTAGATTCTTTTAATGTTCGTGTTTTGTTGTGAGTACAAAATCCCCCTCATCAACAAGCGTTTACATTTATATATAATGATGGTATATTAAAATTAACTAAAAATTTGGATAACTGGATCGAGGAGGCACTTGCCGATGGAAGATGCAATAAAACAAGGTCAGCTTTTTTTATCAGAGTTAACGGCTGAAGAACGTTCCTGTCTATATAATGATTTGTTGTCGATCAAAGACGTTTATTTATGCAATAAAGATACTAGTTTTTATACCTTTCGGAAAATCCGCCGAGCAGCTAAGCGTTGCGCTGAATGCCGTAAAAGGACTTTTCGTTATCGAACAGAACACAAAGGCGAACTTTTAATCAGTCAGATCCACGAGCAGAAACTTTTCAAAAATCACTATCGTATCCAGATCTTATTTAATGGACAAGAGATGGAATATACTTTTCTCGAAAATTTGCTGCAACATCTCCATAACCAGCATTTTAGTTATAATAGCCAAGCCATTTACGCTTAATTCCTCTATTTTTTGTATATAAAGAGGTAGTCGCTTTATTCCTATCATTGATAAGAAAACATAATAAACTAAAAGAAGCAGAACCGCTAACGGATCTGCTTCTTTTTTGGTTATTTTTGCTATTCTATTTTAATTAAATTTTGCAACTCACTCTTCTTTATTCCAAACCTACTCGTTTGAATATCACGTCAACGTTTTTCAAATGATGATGATAATCAAAGGCATCGTCTATTTCTTCTTTAGATAAGACCGATGTGATGGTCGGATCTTCTTCTAACAGCGGGCGGAACTGAACTTGGTTGTCCCAAGCATACGCAGTTTTTGGCTGAACAAGATCATAAGCTTCTTCTCTTGTCATTCCCTTATCGATCAATTTCAGCATAACGCGTTGGCTATAAATCAAACCAAATGTTGCAGACATATTCCGCTTCATGTTTTCAGGAAAGACCGTTAGATTTTTAACGATATTGCCAAAACGATTTAACATGTAATTCAATAAAATCGTGGTATCAGGCAAGATGATTCGCTCTGCTGAAGAATGAGAAATATCTCTTTCATGCCATAATGTGACATTTTCATAGGCAGTGACCATGTGTCCGCGCACCACTCTGGCTAGACCAGCCATATTTTCTGAACCGATTGGATTCCTTTTGTGTGGCATAGCAGAAGAACCTTTTTGACCTTTCGCAAAAAACTCTTCTACTTCACGTGTTTCAGACTTTTGCAATCCGCGTATCTCTGTTGCAAAGCGTTCAATACTTGTAGCAATAAGCGCCATCGCTGAGAAATATTCAGCATGTAGATCCCGAGGGAGAACTTGAGTAGAGATTTCTTGCGGACGGATTCCCAATTGTTTACATACATACTCTTCAATAAATGGCGGGATATTTGCGAACGTCCCCACTGCTCCTGAGATTTTTCCTGCTTCTACTCCTTTTGCCGCATGTTCGAATCGTTCGATGTTCCGTTTCATTTCTGAATACCATGTGGCAAGTTTCAATCCAAAAGTAGTTGGTTCAGCATGGACACCGTGTGTTCGACCCATCATCACTGTATATTTGTGTTCTTTTGCTTTTTCGCCAATGATTTCTGTAAAACGTTTCAGGTCTTCCCGTAATATATCATTTGCTTGCTTGATGAGATAGCCATAAGCAGTATCTACGACATCCGTACTTGTTAGACCATAATGGACCCATTTTCTTTCTTCTCCCAATGTTTCAGAAACTGCTCGTGTAAAAGCAACGACATCATGGCGTGTTGATTTTTCGATTTCCAAGATCCGATCGATATCAAATGATGCATGTTCACGGATTTTTTTCACATCTTCTTGTGGGATTTCACCAAGTTCTGCCCAAGCTTCATCTGCTAAAATCTCGACTTCGAGCCACGCACGGTATTTGTTCTCTTCCGTCCAGATATTCCCCATTTCAGGGCGTGTATAACGTTCTAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP032308|1636002:1645041|1642226_1642955_-|AYA34639.1|DBSCAN-SWA MEKKELLYEGKAKKLYLTSDENLIWVEYLDQATALNGARKDQISGKGELNNKITSTIFRYLTQRGIKNHFIEQLSKTEQLVKKVQIIPLEVVIRNIAAGSFSKRLGVPEGKKLIKPIVEFYYKDDQLDDPFVNEEHIYYLQLAKPEEISELKTQALAINKILIELFAKVGLVLVDFKLEFGRSNEKILLADEVTPDTCRLWDEHTNEHMDKDVYRRGLGNLIPVYQEVYNRLSELTEEKERV >CP032308|1636002:1645041|1643745_1645041_-|AYA34641.1|DBSCAN-SWA MLERYTRPEMGNIWTEENKYRAWLEVEILADEAWAELGEIPQEDVKKIREHASFDIDRILEIEKSTRHDVVAFTRAVSETLGEERKWVHYGLTSTDVVDTAYGYLIKQANDILREDLKRFTEIIGEKAKEHKYTVMMGRTHGVHAEPTTFGLKLATWYSEMKRNIERFEHAAKGVEAGKISGAVGTFANIPPFIEEYVCKQLGIRPQEISTQVLPRDLHAEYFSAMALIATSIERFATEIRGLQKSETREVEEFFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENMAGLARVVRGHMVTAYENVTLWHERDISHSSAERIILPDTTILLNYMLNRFGNIVKNLTVFPENMKRNMSATFGLIYSQRVMLKLIDKGMTREEAYDLVQPKTAYAWDNQVQFRPLLEEDPTITSVLSKEEIDDAFDYHHHLKNVDVIFKRVGLE >CP032308|1636002:1645041|1641972_1642227_-|AYA34638.1|DBSCAN-SWA MYFVKVYVTYKDSVLDPQGEAVKKAVHRMGYETIEDIRIGKYFEIQLADTEEPIDTVIETICDKLLANVNMETYRYEIKKMEEV >CP032308|1636002:1645041|1641299_1641971_-|AYA34637.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDADMLWAVREIMGADAEFVRHDESSLEGFDGVLLPGGFSYGDYLRCGAIARFSTIMEEVVRFAEEGKPVFGTCNGFQILTEAGLLPGVLRRNESLHFICKTVPLKVNPKTAFTSEYEADEIISLPVAHGEGNYFCDEETLEDLKENNQIVFTYNDNINGSVENIAGITNKAGNVLGMMPHPERAVEDLLGSEDGKRFFASILKNFGKVTV >CP032308|1636002:1645041|1643210_1643588_+|AYA34640.1|DBSCAN-SWA MEDAIKQGQLFLSELTAEERSCLYNDLLSIKDVYLCNKDTSFYTFRKIRRAAKRCAECRKRTFRYRTEHKGELLISQIHEQKLFKNHYRIQILFNGQEMEYTFLENLLQHLHNQHFSYNSQAIYA >CP032308|1636002:1645041|1639076_1641299_-|AYA34636.1|DBSCAN-SWA MKTLNEPTAEEIKKKKIYAEWGLTDEEYRMIEEDILGRMPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTSGPHVLQGPGEGAGIVDIGDGLAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGELDNPRTKYLLEEVVAGIGGYGNCIGIPTVGGEIAFDPCYEGNPLVNAMCVGLIEHKDIQKGQAAGVGNSIMYVGAKTGRDGIHGATFASEEFSQEEEQQRSAVQVGDPFMEKLLLEACLELILHHSDSLVGIQDMGAAGLVSSSAEMASKAGSGLILTLDEVPQRETGMTPYEMMLSESQERMLICVKSGEEEKIQELFQKYDLDAVTIGKVTDDGQYRLYHQGKEVANLPVDALAEDAPVYHKEMKEPARIADFQQLAPYQPVIEEPGQVLLDLLQQPTIASKRSIYETYDSQVQTNTVVCPGSDAAVMRVRGTNKALAMTTDCNARYLYLDPKVGGQIAVAEAARNIIASGGRPLAITDCLNYGSPDKPEVFWELSTSADGIAAACETLGTPVISGNVSLYNETDGQAIYPTPMIGMVGLIEEHEHITTQEFKKSGDLIYILGKTFADFDGSELQKMQLGRIEGVIRNFDLAVEKKNQELVLTAIQNGLIESAHDCSEGGLAIALAESAFKYQLGLSVQFGLPSAQLFAETQSRFVLTVAPENQTRFEEMMGDAAVLAGKVTDEAIIEISATDGQIKIETAVARKCWEDAIVCLMK >CP032308|1636002:1645041|1636002_1636581_-|AYA34634.1|DBSCAN-SWA MRIAVFASGNGSNFQALADYLSKKGLEASIDWLFCDQPAAYVLKRAVALDVPADCFSPKEFESKKEYEEAILHKLKEKKIDLIVLAGYMRIIGPVLLENYDKRIINIHPSLLPAFPGLHGIRDAFEAGVKETGVTIHYIDQGVDTGPIIRQEKVRIEQEDTFDSLEEKIHRVEHRIYPEVISEIIENGGYLK >CP032308|1636002:1645041|1636577_1637621_-|AYA35525.1|DBSCAN-SWA MANAYAKAGVDVEAGYEVVERIKKHVKKTERLGVMGAIGGFGGCFDLSVFQLKEPVLVSGTDGVGTKLAVAIEADKHDTIGIDCVAMCVNDILAQGAEPLYFLDYLATGKNDPTRLENVVKGVADGCVQGNMALIGGETAEMPGMYSGNDYDLAGFAVGIAEKSQLLTGETINPGDVLLGIASSGIHSNGYSLVRKIFFEQQQFSLSSKLPELKKTLGEVLLEPTKIYVSSLLPLIKEKKIKGAAHITGGGFVENIPRMLPESMAAEIKLGTWPILPIFGCLQKYGEIPMMEMYEIFNMGIGMVLAVEEAKVKEIVHEIEQAGEKVYEIGKVIAKEKHRVVFTGEER >CP032308|1636002:1645041|1637652_1639092_-|AYA34635.1|DBSCAN-SWA MSYEVKSLNEECGIFGVWGHPDAASVAYFGLHSLQHRGQEGAGIVSNDRGKLMGHRDLGLLSEVFKDQRKLQQLTGEAAIGHVRYATAGNGSVDNIQPFLFKFHDQSIGLAHNGNLINARSLRKELEENGAIFHSNSDTEILMHLIRRSEETDFLNKLKSALNEVKGGFAYLLMTETAMIAALDPNGFRPLAIGQMKNGAYVIASETCALEVIGARFIRDVQPGEIVIINDEGIQIDCFTKDTQLSICSMEYIYFARPDSNIAGINVHTARKNMGRNLAKESPVKADMVVGVPNSSLSAASGYAEASGIPYEIGLVKNQYIARTFIQPTPELREQGVRMKLSAVRGVVEGKKVIMVDDSIVRGTTSRRIVHLLKEAGAKEVHVRIASPPLKYPCFYGIDIQTRKELIAANHTIDEIKECIGADSLGFLSEEGLIESIGLEKDAPYSGLCMAYFNGDYPTPLYDYEEKYQESLKEKVSFF |
9 | Synechococcus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2015084 : 2023799
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP032308|2015084:2023799|DBSCAN-SWA AATGAAAGTAAATTATGAAGAGAAAACAGTCGTTACTCAGCAACCAGAGGCACACCAGATGAAAGTTATCAAACGAGATGGTCGCCATGTTGATTTCGATGAACAAAAGATCAACGAAGCACTAATCAAAGCTGAAAAGAAAATTCACGGCTCATTATCCCCACTTACTTACGAAAAAATCCAAATGATTGCAGACTTGGTTGTCCAAGAAATCAAAAGCCGGTTTGCTGAAAATGTCAAAATCTATGAGATTCAAAACATCGTGGAACATATCTTATTAGAAAAAAACGAATATGAATTAGCAGAAGAGTATATCAATTACCGTACAAAACGGGATTTTGCTCGTAGTAAAGCGACAGATATCAACTTTTCGATTGAAAAACTAATCAACAAAGACCAGACTGTCGTGAATGAAAATGCAAATAAAGACAGTAATGTTTTCAATACACAGCGTGATCTAACAGCCGGCATCGTCGGAAAATCAATCGGACTGAAAATGTTGCCGCCACATATAGCAAATGCGCATCAAAAAGGTGATATCCATTACCATGATTTGGATTATCATCCTTACACACCGATGACAAATTGCTGCTTGATTGATTTCAAAGGTATGCTGAACAACGGTTTCAAAATTGGAAATGCAGAAGTGGAATCACCTAAATCTATCCAGACAGCGACAGCACAAATCTCACAGATTATTGCTAATGTTGCGTCAAGTCAATATGGTGGCTGTTCTGCCGACCGAACAGATGAATTGCTGGCTCCTTTTGCAGAATTGAACTATAAAAAACATCTAAAAGACGCGGAAGAATGGATCGATTCGCCAGAACGCCAAAAAGAATATGCAAAAGCAAAAACCAAAAAAGATATCTTCGATGCTATGCAAAGTTTGGAATATGAAATCAATACCTTATTTACTTCAAATGGGCAAACCCCTTTCACTTCATTAGGGTTTGGTTTGGGGGAAAACTGGTTTGAAAGAGAAATCCAAAAAGCGATTTTACAGATCCGAATCAATGGATTAGGGAGTGAAAAGCGCACAGCTATCTTCCCTAAACTGATCTTCACTTTGAAAAAAGGTGTAAACTTAAACCCTGAAGATCCTAATTACGACATCAAACAACTAGCATTGGAATGTGCAACGAAACGAATGTATCCTGATATTCTGAATTACGACAAAATCGTCGAATTAACTGGAAGTTTCAAAGTACCTATGGGCTGTCGTTCATTCTTGCAAGGATGGAAAGACGAAAATGGTCAAGAAGTAAATGTCGGACGAATGAATTTAGGTGTGGTTACATTGAATTTACCAAGAATCGCGATCGAATCAAAAGGAGATCAGAACAAATTCTGGCAGCTATTGTCTGACCGTTTGGAAATCATGAAAGATGCGCTTCTCTATCGTGTAGAACGTTGTAAAGAAGCCATTCCAGCAAATGCACCAATCTTATATATGTATGGTGCTTTCGGAAAACGTCTTTCACGTACCGATTCTGTCAATGAATTATTCAAAAACCGTCGAGCTACTGTATCATTAGGCTACATTGGATTATATGAAGTTGCTTCAGCTTTCTTCGGTGGCGAATGGGAAACAAACCCAGAGGCAAAAGCTTTCACACTTGACATCGTCAAAGAATTAAAAGCCAATGCGGATGCATGGGGTGATGAATACGGTTATCATTTCAGCGTCTATTCAACACCAAGTGAAAGTCTGACTGATCGTTTCTGTCGTTTAGATACAGAAAAATTTGGTATCATCGAAAACATCACAGATAAAGAATATTATACAAACAGTTTCCACTATGATGTGCGTAAAAACCCAACGCCATTTGAAAAATTGGAATTTGAGAAGGATTATCCAAAATATTGTTCAGGTGGATTCATCCACTACTGTGAATACCCTATGCTCCAACAAAACCCGAAAGCCTTAGAAGCTGTATGGGATTTTGCATATGATAAAATCGGGTATCTTGGTACGAATACGCCAATTGACCATTGCTACCAATGTGGTTTTGAAGGTGATTTCAAACCAACAGAACGAGGATTCGAATGTCCAGAATGTGGAAATCATGACCCAAAAACATGTGATGTAGTCAAACGTACTTGTGGCTATTTAGGAAATCCACAAGCTCGTCCGATGGTACATGGTCGCCACAAAGAAATTTCCTCACGTGTGAAACACATGAAATGAGGTTGTGAAAAAGCTGTCCTGCATCAAGTAATAAGAACAGCTAAACAAAAATAACTCCTCATATTTTTCGTTTAGTTGGGCTTATTACCACAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAGAGGTTGTGAAAAAGCCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTGAACTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATTGAGAGGTTGTGAAAAAGCCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTGAACTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATTCAGAATAAGAGGCTGTGACAAGTCTTTTTTCACCACCCTCTTTCGATGGCTTTGTATCTTTGAACGCCCTCTATCAAAATAAGAACAAGCTTTCTTGAACAATGGATTTAGGTCAGTTTGTTCTTATTTATATGGTCGAGTGGATTTTATCTTCAATAGCTATATCTTTGAACCTTAAATGAAAGAAGTTTTTTTATGAGAAATCCAAAACCAAAAGAATGGTTAGCAAAAGACTACAGTCAAAACTATATTGCTGACTACAAACCGTTTAATTTTGTCGATGGTGAAGGTGTCCGTAACAGTCTTTACGTTAGTGGCTGCTTATTCGCCTGCGAAGGTTGCTTCAACAAAGCGGCACAAAATTTTCGATATGGCAAACCATTCACACCTGAATTAGAAGAACAAATCATCGCTGACTTGCGCAACGATTACGTACAAGGACTGACTTTATTGGGCGGCGAGCCCTTTTTGAATACAGATGTTTGCTTGCAAGTCGTACGACGTATCCGAAAAGAGTTCGGTACGACAAAAGATATCTGGTCATGGACAGGCTATACCTTCGATGAATTGCTACAAGATTCAGAAGATAAATTAGAACTCCTTTCGCAAATCGATATCCTTGTTGACGGACGCTTTGAATTGAGCAAACGTGACCTAAAACTACAATTTCGAGGAAGCAGCAACCAGCGAATCATTGATGTCCAAAAATCTTTAGAATCCAACCAAGTTATGATTTGGGAAAAATGTACGGATGCAACAGAAACCTATGAACAAATCAAAAAACAAGACTTGATATAAAAACAGCTTTGAGAGAGAAAACGGATTTCCATTTTCAACTCTCAAAGCTGTTTTTATATTTCTTGATTTCCCCATAACGGAAGAACGATATTTTCATAGGTCATCGGGTCAAGATTCGTCAAGGTGATTCCTAACAATCGGATCCCTTTTTCTACTCCCAAGATTTCCTCCCATATAAGACTTGCTTGATAAAAGAGCGCTTCTTTTTTATAGATGTATTCTGGCAATGTCACTCTTTTGGTCACAGTAGAATAATCGGTGTACCTGACCTTCAAAACCACTGTTTTCCCATGTTTTTGGACTCTTCTCAGTGCTTCTTCTACTTTTTCGGCTAGTTGGCGCAATTGGGCCAGCACGGCTTCCTCCGTTTGCAATGGCTGTCCATACGTATGCTCTTTTCCCACAGATTTTCGCTCTCTTGTAACATTTACTGGAGAATCATGGATTCCTCTCACTTTACGATAAAGAGAATAGCCCATTTTTCCAAAATTTCGAATCAACATCATTTCTGTGCATTCATATAGGTCTTTTCCTGTATAAATTCCTAACTCATGCATTCTAGGTACAGTTTTCTTCCCTACTCCATGAAATTTTTCAATTGGCAAAGCTTTTAAAAATGGCACAGCATCTTGAGGTGCAACTACTGTGATTCCTCTAGGTTTTTGATAGTCTGATGCTAATTTGGCCAAAAACTTATTGTAACTTACTCCCGCAGAACATGTTAGCTGGACTCTTTCCCAAATATCTGCCTGGATCATTCGGGCGATTTTGATGGCTGACTTGCAATTGATTTTGTTTTCGGTCACATCAAGATACGCTTCATCGATACTAACTGGTTCCACAATGTCTGTATAATGATAGAATACTTCCCGTACTTGTTTGGAAATCTCGCTGTATTTATGATGGTCGCCAGGCTTAAAGATGGCTTGCGGGCAAAGCTCATACGCTTTTTGTGCACTCATTGCTGAATGAATTCCGAATTTTCTTGCTTCATAATTTGCCGTAGTCACTACTCCACGCCCACCAGTGTCACTGGGATGTCTAGCAATTACTAATGGGTGCCCACGAAACTCAGGATGATCTCGTTCTTCAACAGAAGCGAAAAAAGCATCCATATCGATATGAATGATTTTTCTTGATGTATCATTATGTAAAGGAAATTGCAGCTCCATCATCCTCACCTCTTAGCCATTATACAGGAACGTTCGTTCGCGTTCAAGAGATTTGAGAAGTTAGTAGCTGTTTTCCACATTGTCGCTTCATTGTATACTACTTATACTATTTCAGTCTAATTCGTGATATTGACGGTAAACTTCTTGTTTTTTCAGTCCATTTTTAAGCGCTACTGCTTTGATAGCAGCATTTGGCTTTTCGCCTGATGCAATCTTTGCTTCTACCTGTTCTTTTAAGGTTCCCTGCTCTTCATCCACTTCTGTCCCTGCCGTTTCAAACAAATTTCCTTCTACAAGCAGACAACATTCTCCCCTTACTGGATGTTCTTCGATATATGCAAGTAGTTCTTCTGTACTTCCTCTAAGGTATTCTTCATGGATCTTTGTCAATTCTCGACACAAAACGACTTGGCGATTACCAAAAATGTCTAAGAAATTCGTCAACGTAGCTGTGATTCGATAAGGTGACTCATAGAAAATCAGCGTAGCTGTTTGTTCTTTTAGTTTTTCCAATGTTTCTTTCTGTTCTTTTTTCTTGCGTGGAAGGAAGCCATAAAATAAAAATGGTTGAGGCACTAACCCTGAAGCAATCAAAGCCGTCATCCCAGCTGTAGGTCCTGGGATAGAGATCACAGAAATCCCTTCTTTTATACAAGCTAAAACTAGCTCATGTCCAGGATCGCTGATGGAAGGCATTCCTGCATCACTGACTTGAGCAATCGTTTTTCCTTCTTTTAACAAAGCAATCAATTGAGGGACACGTTCTTTATAATTATGTTCATGTAAACTTTTTTGGGGTGTATGAATCTCGAAGTGATTCAATAATTTTTGTGTATTACGCGTATCTTCGCTTGCGATAAGGTCTGCTTCTTGTAGCATACGAACACTTCTGTAGCTCATATCTTCTAGATTTCCGATTGGCGTCGGTACAAGATATAAATTCCCGTATACTGGATTTCCTTTGAAACTTTTTTGATTATACATCTGTCACAATCTCCTTAATAAAAAAACTGGAGCAGTCTTTCTCCGCTCCAGTCTCCTCTTGTTATTGATCATCGACCGCTTTCGCGATAGATCACTTCTAGACAAAACGCACAAGGCTCGTCATTGTCCCGTCTTGATCCATATAAATCGTAGCAGACATGGAAGCCTTCTTCATAAATTTTTTCAAGATTCATACGAGACTTGGAAAGTTCTTGCTTCACATTTTCAGCTGGAGCTTGTGCAACTTGATTCAATTCCCGAAGATGTTCTCGCAAGCGTTGATTTTCCATCTCCAAAGTCGTATTTTTTTCTACGATCTCATGCAAAGCATGCTTCATTTCAACAAGTTCTGTTAATGTATTTCTCAACTCTGATTCTAACTGATTCAATCCGTCGTATAATGATCTCTTATCCATTTATCTCACCTACTTGGATAAATTCTTTCAATTCATCCCATTCATATTCGACAGGATTTTCCCGTCCAGTCAGCCGAATACTAACGATACGGCTAAGCAGATTCAACCCTACGACTTTCCCTTTACCATCAGGTGTAACAATTACTTTTCCAAAGTCAGGGAGTTCTTTTTTTGCTGTCTCGTATTCTTCGCTCTCATATTGTAGACAGCACATCAAGCGTCCGCATAAACCGGAAATTTTTGTTGGGTTCAAAGATAAACTTTGGTCTTTTGCCATTTTGATCGATACGGGCACGAAATCGCCTAAAAAAGAAGAACAGCATAACGGACGCCCACATGGACCAATTCCGCCTATTATCTTCGCTTCATCGCGTACACCAATTTGTCGAAGCTCAATACGAGTACGAAATACAGCGGCTAGATCCTTTACCAATTCTCTAAAGTCGATTCGCCCTTCCGCCGTAAAAGAAAAAATCAGTTTGTTTCGATCAAATGTATATTCAGCTTTGACTATTTTCATTTCCAGCTCACGCAACTGCACTTTTTCTTTTGCGATTTGCAATGCATCACACGCATCTTCTTTATTTTTTTTGTCTTTTTCTAGTTCAGCTTTTGACGCTTTATGCAAGATTGGACGAATAGCTTCAGGAAGGTCATTTGGATCAATCTCTTTTTTAGGAAGGACAACAGTAGCAATATGTAAGGATTGCTGAGATTCGACTAATACCTTGTCATTATAACTATATTCAGAGTCTCCTGGTGCAAAATAATAGATATGACCTGCATCTCTATATCGGACACCTACTACTTCTACCATTTCCATCCTCCTTGATTATCGTCCTCTGCGGCAAGCTAAAAAATCGTCTGCAAAACGAACTGTTCCGCAACAGCTTGAAAACCGACATTGCTACGTAGTTTCTGCTCTGCGATCAATATTCGTTCAATTATCTGGTTTATCTGTTTTACTTTGCCATATTCGCCTTTCGCTACTGCTTGACGTTGTGCTTCCTGATAATAAAACATCAGGACAGATAATCCTGTAAACTGCTGTGTTTTTTCTTTAAATGATTTCACTAATTTTTTTTGGACATAGATAAAGGCTTGAGTGTCTTGCTTTTGCAAGTAAACGAACCATTGATAAATCAAGTCCTTAGCATCATTAAACCATTCATCTTGAGAGATTTCAACTGCTTTTCCTAAACTGTTTGTTAAGAAAGCCAAAAGTTTTGATTTTTCTAATGGAATCTGCTCTTCTTGCAATCGATGGATCAATGCTTCTTTCGAAAGTTCTTGAAAATGCAGCACTTGACAACGGGATTGAATAGTAGGGAGAATCCTTCCTACTGCATCTGTCTCTAATACCGCTAAAAAGTCTCCCGGTGGTTCTTCCAAAAATTTCAACAGACTGTTTGCCGCACTGCTATTCATTTTTTCAGCTTCTTTAATCAAAAAAACCTTTTTTCTTGATTCATATCCGCTGCGACTGAATTCCGTCTGCAAACGTCTGATCTGATCAACTTTGATTGTTTGTCCGTCCGGTTCGATAACCAGAACATCCGGATGTTCTTTCTTTTCGATTCGCTGACAATTGTTGCATTTTCCGCAAGGCTGATTGTCTTCCATTTGGGTACAGAACAGATGCTGTGCGAGCCACACACCTACTTCATGTTTTCCTGTTCCTTTTTCTCCTTCAAAAAGATAAGCATGAGCGAGACGCCCATGCTCAAAACTCCGTTGAAGCTGCTGATACACGATCGGTTGCATTTGAGCCAAGTTTATTTCTTGATTCATAGCTCAGCTCCTCCTAAAATTGATGGAATCCTTCAACAGGTAAGACGAAGACTGTTGCGCCGCCTACTTCTACTTCTACTGGATAAGGGACGCCCCCATCCATCGAAATATCCAATGTAACAGGTGTAGATACAAATTGTTTTCTTGATTCACATGTTTTTTTGATGATTTCCAATGCTTCTTCTACTCGATCATCTTCAATACCCACGATAAACGTGCTGTTTCCAGCCTTAAGGAAGCCGCCTGTCGATGATAATTTTGTGGCACGGATATTTGCATCAATCAATTCATTTGATAAACGGTTGCTGTCTTTGTCTTGGATAATCGCTAAAATAATTTTCATAAACGTTCACCTTCCTAGTTTCCAAAAAATTGCGGATATTGTTCAATAATTGTATGATAACTTGTTTGCAGCACTTCTTCAAAGCTTTTTCTTGCATCAACTTTGTGGATTCTTTCCGGATTCTCTTCTGCCAGCTTTAAGTAAGCATGTCGTACACGCTGGTGGAATTCCAAACCTTCCGAATCTAAACGGTCGATTTGGTTTTGTCTGTTTTTCTTGATTCTTCTTAATCCGGTGTCTGAATCTACGTCAAGATAAAGGGTAAAATCTGGCGTAGTACCTTCTGTAGCAAACTCATTCAACCGAGCAATCTCGGTAACGCCGATGCGTCGGCCTGCACCTTGATAAGCAAGAGAACTGTCGACAAATCTATCGCATAAAACGATTTTCCCTTTTGCCAGAGCAGGTAAGACCTTTTCGACTAGATGCTGTCTTCTTGCCGCCGCATAAAGTAGTGCTTCCGTGCGTTCATCCATCCGATCATTTTTTGGATCCAGGATTACCGCTCGAATCTCTTCAGCAATCGGGATGCCTCCCGGTTCTCTTGTTTGAATGATTTCTGTTTTTGCTACTTCTTTCAAAAGAGGGAAAAGTTCATTCAAGATGCTGGTTTTTCCTGCACCATCAGGCCCCTCAATTGTAATAAATAGTCCGTTCAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP032308|2015084:2023799|2021858_2022797_-|AYA34986.1|DBSCAN-SWA MNQEINLAQMQPIVYQQLQRSFEHGRLAHAYLFEGEKGTGKHEVGVWLAQHLFCTQMEDNQPCGKCNNCQRIEKKEHPDVLVIEPDGQTIKVDQIRRLQTEFSRSGYESRKKVFLIKEAEKMNSSAANSLLKFLEEPPGDFLAVLETDAVGRILPTIQSRCQVLHFQELSKEALIHRLQEEQIPLEKSKLLAFLTNSLGKAVEISQDEWFNDAKDLIYQWFVYLQKQDTQAFIYVQKKLVKSFKEKTQQFTGLSVLMFYYQEAQRQAVAKGEYGKVKQINQIIERILIAEQKLRSNVGFQAVAEQFVLQTIF >CP032308|2015084:2023799|2015084_2017274_+|AYA34980.1|DBSCAN-SWA MKVNYEEKTVVTQQPEAHQMKVIKRDGRHVDFDEQKINEALIKAEKKIHGSLSPLTYEKIQMIADLVVQEIKSRFAENVKIYEIQNIVEHILLEKNEYELAEEYINYRTKRDFARSKATDINFSIEKLINKDQTVVNENANKDSNVFNTQRDLTAGIVGKSIGLKMLPPHIANAHQKGDIHYHDLDYHPYTPMTNCCLIDFKGMLNNGFKIGNAEVESPKSIQTATAQISQIIANVASSQYGGCSADRTDELLAPFAELNYKKHLKDAEEWIDSPERQKEYAKAKTKKDIFDAMQSLEYEINTLFTSNGQTPFTSLGFGLGENWFEREIQKAILQIRINGLGSEKRTAIFPKLIFTLKKGVNLNPEDPNYDIKQLALECATKRMYPDILNYDKIVELTGSFKVPMGCRSFLQGWKDENGQEVNVGRMNLGVVTLNLPRIAIESKGDQNKFWQLLSDRLEIMKDALLYRVERCKEAIPANAPILYMYGAFGKRLSRTDSVNELFKNRRATVSLGYIGLYEVASAFFGGEWETNPEAKAFTLDIVKELKANADAWGDEYGYHFSVYSTPSESLTDRFCRLDTEKFGIIENITDKEYYTNSFHYDVRKNPTPFEKLEFEKDYPKYCSGGFIHYCEYPMLQQNPKALEAVWDFAYDKIGYLGTNTPIDHCYQCGFEGDFKPTERGFECPECGNHDPKTCDVVKRTCGYLGNPQARPMVHGRHKEISSRVKHMK >CP032308|2015084:2023799|2019717_2020590_-|AYA34983.1|DBSCAN-SWA MYNQKSFKGNPVYGNLYLVPTPIGNLEDMSYRSVRMLQEADLIASEDTRNTQKLLNHFEIHTPQKSLHEHNYKERVPQLIALLKEGKTIAQVSDAGMPSISDPGHELVLACIKEGISVISIPGPTAGMTALIASGLVPQPFLFYGFLPRKKKEQKETLEKLKEQTATLIFYESPYRITATLTNFLDIFGNRQVVLCRELTKIHEEYLRGSTEELLAYIEEHPVRGECCLLVEGNLFETAGTEVDEEQGTLKEQVEAKIASGEKPNAAIKAVALKNGLKKQEVYRQYHELD >CP032308|2015084:2023799|2017477_2017657_-|AYA35534.1|DBSCAN-SWA MSQPLILNKRCSKASFSVLSSIYAKMWKAIFTKFFLILETKRLFHNLSINGVQKPVSRY >CP032308|2015084:2023799|2018487_2019609_-|AYA34982.1|DBSCAN-SWA MMELQFPLHNDTSRKIIHIDMDAFFASVEERDHPEFRGHPLVIARHPSDTGGRGVVTTANYEARKFGIHSAMSAQKAYELCPQAIFKPGDHHKYSEISKQVREVFYHYTDIVEPVSIDEAYLDVTENKINCKSAIKIARMIQADIWERVQLTCSAGVSYNKFLAKLASDYQKPRGITVVAPQDAVPFLKALPIEKFHGVGKKTVPRMHELGIYTGKDLYECTEMMLIRNFGKMGYSLYRKVRGIHDSPVNVTRERKSVGKEHTYGQPLQTEEAVLAQLRQLAEKVEEALRRVQKHGKTVVLKVRYTDYSTVTKRVTLPEYIYKKEALFYQASLIWEEILGVEKGIRLLGITLTNLDPMTYENIVLPLWGNQEI >CP032308|2015084:2023799|2017831_2018434_+|AYA34981.1|DBSCAN-SWA MRNPKPKEWLAKDYSQNYIADYKPFNFVDGEGVRNSLYVSGCLFACEGCFNKAAQNFRYGKPFTPELEEQIIADLRNDYVQGLTLLGGEPFLNTDVCLQVVRRIRKEFGTTKDIWSWTGYTFDELLQDSEDKLELLSQIDILVDGRFELSKRDLKLQFRGSSNQRIIDVQKSLESNQVMIWEKCTDATETYEQIKKQDLI >CP032308|2015084:2023799|2023154_2023799_-|AYA34988.1|DBSCAN-SWA MNGLFITIEGPDGAGKTSILNELFPLLKEVAKTEIIQTREPGGIPIAEEIRAVILDPKNDRMDERTEALLYAAARRQHLVEKVLPALAKGKIVLCDRFVDSSLAYQGAGRRIGVTEIARLNEFATEGTTPDFTLYLDVDSDTGLRRIKKNRQNQIDRLDSEGLEFHQRVRHAYLKLAEENPERIHKVDARKSFEEVLQTSYHTIIEQYPQFFGN >CP032308|2015084:2023799|2020998_2021823_-|AYA34985.1|DBSCAN-SWA MVEVVGVRYRDAGHIYYFAPGDSEYSYNDKVLVESQQSLHIATVVLPKKEIDPNDLPEAIRPILHKASKAELEKDKKNKEDACDALQIAKEKVQLRELEMKIVKAEYTFDRNKLIFSFTAEGRIDFRELVKDLAAVFRTRIELRQIGVRDEAKIIGGIGPCGRPLCCSSFLGDFVPVSIKMAKDQSLSLNPTKISGLCGRLMCCLQYESEEYETAKKELPDFGKVIVTPDGKGKVVGLNLLSRIVSIRLTGRENPVEYEWDELKEFIQVGEING >CP032308|2015084:2023799|2020658_2021006_-|AYA34984.1|DBSCAN-SWA MDKRSLYDGLNQLESELRNTLTELVEMKHALHEIVEKNTTLEMENQRLREHLRELNQVAQAPAENVKQELSKSRMNLEKIYEEGFHVCYDLYGSRRDNDEPCAFCLEVIYRESGR >CP032308|2015084:2023799|2022810_2023140_-|AYA34987.1|DBSCAN-SWA MKIILAIIQDKDSNRLSNELIDANIRATKLSSTGGFLKAGNSTFIVGIEDDRVEEALEIIKKTCESRKQFVSTPVTLDISMDGGVPYPVEVEVGGATVFVLPVEGFHQF |
10 | Streptococcus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
15753 : 58679
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP032307|15753:58679|DBSCAN-SWA 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49 | Streptococcus_phage(25.0%) | protease,holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
70273 : 128241
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP032307|70273:128241|DBSCAN-SWA 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53 | Streptococcus_phage(22.22%) | integrase,transposase | attL 75629:75651|attR 132825:132847 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
131826 : 195717
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP032307|131826:195717|DBSCAN-SWA TTTAATATCCTAAAGAATATCTCAAAGTTCCTTCAAAACGTCGTTGTGCTCGACTTAATAGAACACTGTAAGCCAGTAATATGCTTTCAAATCTACTCTCTAGCCCTTTAACAGAACGTGAGTTGAAATTTTGACAACCTAATTTTTCTAAGGAAGAAAAAACAGTCTCAACTGTTTTTCTTTGTTTTCCAAGTAAGCTGTGGTCTAGTTTTTCTGATTTATCCATGTTTTTACGTGGCGGAACGGATATAGTAATGCCCTTAAGGGCAAGCTTTTCATGGATTTCATGGCTAATATATCCTTTGTCCCCTAGGATATTGGGAAGATTCGCTTCTTCCGATAAAGTCTCTAACACTTTCACGTCATAGACACCTGGATTCGTGATTGAGTAAGTAATCGGAAAGCCAGTCTTAGTAACGATCATATGAATTTTAAGACCATAAAAATAAGATTTTTTTGTTGAGTTATAGCCAACTTTGGCTATTTGATTCAATAGTTTTGCTTGTCTATTTCTAACTGGTTTACATAATGGACTAGGAAAACTATCTATAATTCCGACTAGTTCACCTTTGGTGAGCTTCTTGATGAAAAAGTATCGAATAATCTTGATAGTGTAAGCTAAGTTTGAACTTAAGCGAGTGAATCGACTCCTACTAGGAAAGTCACCATTAGGAAATAAGACGGAACAAACCGCTCTATACGTGGCTCTTTGGCTAGTATAGCCATTAATTATGCCCCATATAACACAAGCAATAATCACTGTATCGCGTTGCTTCAGTTGATCAGTATTTCTTCGGTTTTTAATCTTATCTGGTACACAATTGTGGTATATGTTAGAAACAGTTCTCATAATTTCCTTGAATGTTATAAAAGTATCTGTATAATGTTCAGTATATTTTGATGAACGCATATGTAGTCCTCATTTCTTGGGAGTTTTGAGACTACTATATGCGTTTTTTTGTTGATTTACCAACATGTTTAGACATTTTCCTCTAGGAAAAAATTAACTAGCACCACGGGTTTATTTTAGTTTTTCTTGGAAATAAAAACAGCGAAAATCCGAACATTTTCACCTCTCTCACTTTATAACTTTTACAAAATAGTACTTCTCATAAAAAGCGCTCTAGTTAAAGAAAATAAGAGAAAAATCAAAAAAAAACAAAAGTTTCTTTTACACTTGTTTCTATATTCGTTACAATGGTTATGGGAAGTTTTTAAAAAGGTTAAGAAAAGCTTACGGGGGTTTTTGAAAGCAAAAAGTAGTAGGGGACGATAAAATGAAACATACACACAAAATCATATTGGCTGTCACTTCTGTATGCACTGTTATTATTCTAGGTGTAAGTATCTTTTTTGTTACACAAGCAGCAACAAACAATAAATTAGAAAACACTAGTCAAACAACTCAACACTCAAGCAGCAGCTCAAAACCTGTTGAAGATAAACAAACGACGAAACAGCTTGATCAAGCAAAACAGCTTGCTGCAAGTTATCATTATGATGAAGCCATCGCCTTACTTGAAAAAGACGACGCCAAAGAAGCGCAACAATTGTTAGCAACTTTGAAAAAAGAAAAAGAATCCTTGGTAAAATGGGAAGACCCGACCAAAATCTCACACGTCTTCTTTCATAGTCTGATCGTTGATCCAGCTAAGGCTTTTCATACCCAGCAAGCACAAGGGTATAAAGATTATATGGTCACTATTTCCGAATTCAATAAAACCATTGATCAGTTATATAAAAATAACTATGTTCTTGTTAATCTAAATGGATTAGTCAAAAAAGGAACAGATGGAAAACTGACCTTTACAGGTGTTTCTCTTCCAGAAGGAAAGAAACCGTTAATTCTTTCGCAAGACGATGTCAGCTATTATGAATACATGGACAATTCAGGATTTCCAAGTAAGTTGATTGTCGATAAACAGAACCAAATCAAGAATATTTATATCGACAATAAGAAGGAAACTGTTGGTGACTATGATATGGTTCCATTGATCGATTCATTCATTAAAAAACATCCCGATTTTTCTTATCAAGGCGCCAAAGGAACATTAGCTTTAACAGGCTATAATGGTGTATTAGGTTACCGTACATCAAAATCAGAATATGGTGATAACGAAAAAACACACAAAGAAATCGAAGCAGCCAAAAAAGTTGCTGATCAATTAAAGGAAGATGGTTGGAGTTTTGCTTCTCATACTTGGGGACACTTGAATATGACACAAGCTTCTTTAGCCGATATCCAACAAGATAATGAACGTTGGCAAAATGAAGTTGCACCTATTTTAGGCAAAACAAATATTTTGATCTACCCATTTGGCGCTGACATCAGCGATTGGCAACCTTATTCTGAAGCAAATCAAAAATTTGCTTACTTGAAACAACAAGGATTTGATATCTTCTGCAATGTCGATGCCTCAACTCCTGCATGGGGACAACTAGGAACTGACTACTACCGTAACGCCAGAATCAATATTGACGGTATCCGTTTCGAAGCTGACCTAAAAGGAGAAAATCCAATACTTGATCAATTTATCAACGTCAAAGAAATGTATGACCAAAAAGATCGAGGATAGAGGTTGTGAAAGAAGCGTCCAGCTCCGAGCAAATAAGAACTAGATTTCTAAAATAGTTTCTCATATTTTGGAAATCTAGCGCTTATTGCTGAGGAGTTGCTTCTTGAACACCGTGAATAGAGGTTGTAAAAAGAGCGTTTTGACTTATTGTTGAAGGTCAGCTCTTTGAACACCGCGTGTTAGGTTGTGAAAAGGCTGGTCTGCATCAAGCAATAAGAATGAACAGAGAAAAACAGCTTCTTGAATACCGCAGATAGGTTGTAAAAAAACCGTTTTGACCTGACGATAACCAGTAAAACAGAGGTGAGACCATTGCTAAAAGTAGCAGTGGTCTCATCTCTTTTTTTGCACAAGTCATATTTGATTGTTTCGTTATTTTAATCAGGATAAAGTTCTTTTTTTCATGCTAAAGAGTGATTCTTTCTTCTCGATTTTCACTTTCTTCGTTTAACTTTTGGTAAATACTTCTGTCAGAAAAAGCTCTAGGTAGACACACGAAAGCAGATAAAAAGCCTAACTTTTGCAACAGTTTATGCTGTCGTTCAAAGTTAGGCTTTTACAGTTTATAAATAGGGTTCTGTTGCAAAGTTTTCCAAAAAATCTATTTTAGTGTAAAATTGAGAAAAAAGACAGAGAGGACAGAGTAATGAATCATTTTAAAGGCAAACAATTCAAAAAAGACGTCATTATTGTCGCTGTTGGTTACTACCTGCGTTACAATCTAAGCTATCGTTAAGTTCAGGAATTGTTATATGATCGTGGAATAAATGTTTGTCATACTACGATTTATCGTTGGGTACAAGAGTACAGCAAAGTCTTCTATTATCTTTGGAAGAAGAAAAATAGACAATCCTTCTATTCATGGAAAATGGACGAAACCTATATCAAAATTAAGGGACGTTGGCATTATCTTTATCGTGCAATTGATGCGGACGGCTTAACCTTAGATATCTGGTTACGAAAGAAACGGGATACGCAAGCAGCCTATGCTTTCTTAAAACGACTCCATAAACAGTTTGGTGAGCCGAAAGCAATTGTGACCGATAAAGCACCTTCTCTTGGCTCCGCCTTTAGAAAGTTACAGAGTGTGGGTTTATATACTAAGACAGAGCACCGAACTGTGAAGTATCTTAACAATTTAATAGAACAAGACCATCGACCTATTAAACGACGAAATAAATTTTATCAAAGTCTCCGTACAGCCTCTTCCACGATTAAGGGCATGGAGACCATTCGAGGAATATATAAAAAGAACCGAAGAAATGGAACGCTCTTCGGCTTTTCGGTGTCTACTGAAATCAAGGTATTAATGGGAATAACAGCCTAAGATATTTGGAGTTCAGAGAGGGCGCGTTTGATTTTCAAACTTCGCAACAGAACCGAAAAGTTTATTCCTTATGTGCGCCTTGATTTTAGAGAAAAAAGTATGGGAAAAATAAAATATGAAGATTATGTAACATTGTTTTCTGATAGTGGTTGGAAACTAATAAAGGGAAGTCGTTCTGGTGGCGCTCAGTATTTTCAGCAAGAATATCCTGATGTAACAAGGGACATATTTTCTGACACTGATTCTCAAGAAAGTGTAAAGAAAAGATATGTAAAGTATGGTTATACTTATGGAACTCTATTTTTATTGTATTTCTTTATTTTTTTTAGTAGTAATTCTTGGAATTTGGATAAGATATTGAACTTTAAATCATGGTATTTTACCCAAGGTTTATGGGAAATGGAGGGTATGTGGTTTTGGAAAGCGTTCATTTTTGAAACTCCGTTTGTTTTACTCCGTGTATTACCGTTATTTTTCTTTCTGTTTTTGGGTATCTATTATCTTTTACGTTCACTTATAAATGATGATTCAACAGTGATAACAAAATATTTTGTGTAAATAGAAAAAAGGAAGTCCCTTGTGTAGAATAGAGTTACCACAACACATTCACAGAAAAGAGGACTTCCATATGAACGATTTTACTACAGAAATTCTAAAGACTCTAGCGAACAAAGGCGATTTGAATGAATTATTCCGTGTCCATTTGGAAAAAGCTGTCAATACGCTTCTCAAAACGGAGTTAACGGCTTTCCTCGATTACGAAAAGTACGATCGCATTGGTTTTAACACGGGTAATTCTCGTAACGGCTCCTATGACCGTACGGTCAAGACCGAGTACGGGGAACTTCATCTCCAGATTCCGCGCGACCGCAACGGCGAGTTCAAGCAACAGACTGTTCCTGCTTATAGACGGACGAATGATACCTTAGAGGAGACCGTCATTCACCTCTTCCGAAAAGGTATTACCATGTCGGAAATCGCAGACTTGATTGAGAAAATGTATGGGCATCACTACACGCCCCAAACCATGTCCAATATGACTAAATCATTTACGGAAGAAGTCACTTCATTTAAGGAACGTGAGCTTCATGACCGTT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>CP032307|131826:195717|139730_140069_+|AYA33079.1|DBSCAN-SWA MHCFWVIVAITLSAAGAFFVVPFTKNTIGGEAKTSNVVEADRLAMEKEEEVVKGAGVIGHGKVAYYEASDQGDKSVFTVWFPWSLAGILFNITMTRMTRKIEEMEQIEWDSY |
56 | Streptococcus_phage(35.71%) | bacteriocin,integrase,transposase | attL 132430:132489|attR 182465:182881 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
207696 : 217450
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP032307|207696:217450|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP032307|207696:217450|215046_216009_-|AYA33137.1|DBSCAN-SWA MVAKLTDVADLAGVSPTTVSRVINNKGYLSEKTKQKVHEAMKTLGYKPNNLARGLQGKSPQLIGLIFPNISNIFYSELIEYLEIELFKHGYKTIICNSQNDPAKEREYIEMLEANQVDGIISSSHNLGIADYERVRAPIVAFDRNLAPNVSIVSSDNFEGGKLAAKTLQKNGCQNTIMITGNDNTDSPTELRALGFSFQNPNGKIFKIPNNLSTIRREMEIKSTIINHKPDGIFVSDDLTAILTMKIAHQLKLNIPEDLKIIGYDGTSFIEKFFPQLTTIRQPIDEIASLIVDILLKKIKGEKTNKDYILPISILSGESI >CP032307|207696:217450|211038_211233_+|AYA33133.1|DBSCAN-SWA MYKLNEIVPVQLGNEKSAPEKGKPAAAKLAMRIKRENGSEVLIYNGINNYILQAILKELLSNAL >CP032307|207696:217450|207696_208989_+|AYA33132.1|transposase|DBSCAN-SWA MSYTHLIKETLDILDLSVTFNENCLTKEKYKGQICHIYRGNLIYTAQECIHCKHQIASDIVRWGTTTVRLLMNDVSEYRTYLELKKQRFKCKACQRTFVTDTSVAKKHCFISEKVRWSVVTRLKKNTSMTEIAAQKNLSVSSVYRIMKRFYRPLNPFRTPLPKVLCFDEFKSVRGVSGAMSFIMMDGQTQRLLDIVENRQLPFLKRYFSHFSREIREAVEWIVIDMYAPYVSLVKKLFPKAQLIIDRFHIVQHIGRTFHNHRIKETNQLLKSKEQKHYQLGKQLKRYWKLLQKDERKLDYTRRLWRPGFKAHLTETDIVYRLLKGSPALRVGYQLYQDFLYAVKERDYVSFEELLTNNIMLPEGYQTTLRTFQKFLPQLKNALQQSYSNGPLECLNNHIKVLKRNAYGFRSFYNFKLRIMIRHGNALIFN >CP032307|207696:217450|209177_209615_-|AYA33189.1|DBSCAN-SWA MSAESNDDDKYFANKLFQFIFPDYSSMPFFTLINFMLYVKEHLGYDDLVEMIKAYDKEPYPFKGINTGSDMAMISGETVEEILANYKEQNIKTLELIKKNIKYYDPLLANKENIDELLNAIADSDVRSPRIDELKEGILMYKELF >CP032307|207696:217450|213867_214827_+|AYA33136.1|transposase|DBSCAN-SWA MTYKHLTIDELTMIESYYLQHNKPVEIANRMGRAIQTIYNVVNKFKQGKTALDYWHQYKENKKKCGRKVIQLPAREVDYIKEKVTLGWTPDVIIGRKERPVSCGMRTLYRLFSKGIFEIDTLPMKGKRKPNGHQEKRGKQQYQRSIHDRPDNYPDFNSEFGHLEGDTIVGIHHKSAVITLVERLSKVIITIKPNGRKALDIETALNQWFSRFPKNFFKSITFDCGKEFSNWKAISNQHDIDIYFADPGTPSQRPLNENSNGILRRNGLPKSMDFREVNQTCISSVSNQRNHIPRKSLNYRTPIEIFLSYVQEAFYSSLI >CP032307|207696:217450|211677_213225_+|AYA33135.1|transposase|DBSCAN-SWA METTDTLLQLLQEAHKTNQAQQQTIQNLTTEIQLLNEKVNYLTNKLFGRSKETLFEETNGQLNLFSDEEISVSVPEAAATIIPVKGHQRVVGTKADKIKHLPITEKEHLLPLEEQFCEHCGSQMKDIGRTKVREEIRFHQAMLDCLTHYQHTYCCKSCEKEGLSSFKKAIVPKPLISNSLGSNSLVAETIRMKFGQKVPAYRQENYWKQTHGLDISRDNITNWHIKAVQNALDPLGERLRVYLNQEEILHGDETSYRVIESAKTDTYYWQFCTGKDSQHPIVYYHHDESRAGDVPKTFLKEFTGYLHCDGYSGYNAVESVRLVYCFAHVRRKFFEAIPKGKKNTDIPAAQAVKQLDKWFVLEKKWKDFSPEKRLSCRQQELRPLFIAFYEWMATIDPVAKSKLDAAVQYACKLRSGFEPIFEDGRLELTNNRAERNIKELVIGRKNWLHSTSLEGARTSGIILSVYKTAELNGLNPVKYLEFLFDKIPNLPVLSAETLDQLLPWNKDVQQHFSRN >CP032307|207696:217450|211222_211576_+|AYA33134.1|DBSCAN-SWA MLYDLLQTKHIYIVCGKTDLRKGIDGLASLIQQEYQLELYEDAVFLFCGNRQDRFKLLYWDGDGFLLCYKRIENGKLKWPRTKDEVRTLTNQQVRWLLEGLSIDQPRAILPGKKGVF >CP032307|207696:217450|209082_209181_+|AYA33188.1|DBSCAN-SWA MAISKIAKNYNITRQTIYRIKNDIEYNSNQMN >CP032307|207696:217450|216010_217450_-|AYA33138.1|DBSCAN-SWA MNLPREIRYRAYSDWTKDEMDKIKDNVKRSPWRASYHIEPKTGLLNDPNGFSFFNGKYTLFYQNWPFGAAHGLKEWVHNESDDLVHFHVTGAELLPDTKRDSHGAYSGSAYEIEGNLFLLYTGNLRNENWERDTLQIGAWMDKDYNITKGENVLIHKPADVTDHFRDPQMFNYEGQLYAIVGAQNLEKSGFIKLYKADDNNVETWEEVGNLDFGGTGSEYMIECPNLVFVDKKPVLIYCPQGLDKSELNYGNIYPNTFKICQSLDIEKVKLVGASEIQNLDYGFEAYATQGFNTPDGRALIVSWIGLPDIDYPTDKYDYQGAMSLVKELSIKDGKLYQYPVEAITSLRASSEQFTAKAETNNTYELELTFPPNQKSELLLFSDSKGNGLSLIVDTKEGKIILDRSKAGIQYATDFGTIRECSIDTKETTANIFVDNSIIEIFINKGEKVFTSRVFPENHQNGIQIKSGEPTGKYFELKY |
9 | Leptospira_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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