Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP032364 | Lachnoanaerobaculum umeaense strain DSM 23576 = CCUG 58757 chromosome, complete genome | 0 crisprs | cas3HD,csx1,WYL,cas6,cas3,DEDDh,cas2,cas1,csm3gr7,csx19,cas10,csx20,csa3,csm5gr7,csm4gr5,csm2gr11,csm6 | 0 | 0 | 6 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
559398 : 567649
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP032364|559398:567649|DBSCAN-SWA TTTATAAATTTTCCAACTTTTGGGCAAGTTCTTTTTGCTTGTTTGGGTAAAGGTGTGCATAAGTGTTCAGTGTCATTTTAATGTCTGAATGGCCTAACCTGTTAGCGATTAGTAACGGGTTTTCTCCAATCTCAACCAATAAAGCAACATGTGAATGCCTAAAGTCGTGTATTCTCATGTGTGGCAAGCCTGCCAGCTTTAAATACTTATCTTTTTTATACTCTATGCTTTCCTTCCTGATGTTAAGAAGTGAGGCTGTGGCATCTGTATCAAGGCAATGTTCTTTATACTCTTTTATTTCATCTATTAGGAAGCTGGGAAGCGTTACAACTCTATTACTTGATTTTGTCTTTGGTGTTGTTGTTACATAGCTACCTGCTGCATATCCTTTTGTTTTACTAATATGCAGCAGTTTATTATCAATGTCCACATCTCCAAATGTAAGGGCCATCAGTTCGCCACGCCTCAAACCGGCAAAGAATAATAAATCAAATATAACCTTATCCCTTATGTCTGTAATGTTAGATTTAAAGGCTTTGTACTGCTCCAGTGTTAAAAATATCTTTTCTTTTTTTGTATTATCTTTTAGAGCGTCAACCAATTTACAAGGGTTTGAACCTAAGCCGTAGTATTTGCAAGCGTAAGAAAGTATAGCCGATAAATTACGCAGTATACCGTTTTTTGTTTCGGTGCTTAATGTGTCCCCTTGTTTCGGTTGTAAATTATTGAGCCATTCTCTTATCATATTGGGGGTAATATCATTTATTTGAGTTTCCCCAAAATATGGCAGTATATGGGAATGTATATTCTTTTCTTTTATATAATAGCTTGATAGCTTGTATTTAGCCTTGTAATCCTCTAGATATACATCTAATAGAGTCTTAAACAATATTGTTGGCTGGTTACTGTAATGCTCCAAGAAATCACGCTCCCAGCTTTGGGCTTCTTTTTTTGTTGTAAAGCCTCTTTTAACCTTTTGTTTCTTATGACCTAAGTAATCCTTATAGTAGCAGGACACAAACCAAGATCCCTTTTTGTTATTATCTTTATAAACAGGCATTTTCTTAATCCTCCAAAGTTTCCCGGCTATAGAGCTGTTAAGGAAATGCCGTATATAAGCGTATAAGGTCTATACACTTAATAGAACCGTTACAAAGAAAAAGAGTAACGGCACTATTAAATATATAGGCTATTTTTTATTCTATGGTGTCTATTTTGAGTTTTAACAGAACAAAGGTATAAAAATATAGGGCAGAAACCAAAAGCCGTTACAAACGAAAATAAGGGGGTTGTGCGGCGTGGTACTTTAAGCGGACACCACATAAAAGTAGAATCTGCCCTTAAAGATAGTAACCACAGGGGCAGCCTACTAACTTTGTGAGTACCCTTTTATTCTGTAACGGCAAAATAAAACCAACATTTTCCAACATTTTTGAGGGGGTCGTTTGAAAGGGCAACCACACCATGACCATACTCTAAATAACGACGTGCTTTTTAGGCACATCCTTTTATTGTTCGTCCGGATCTGTATATTTTTCTATTTCCGTGAGTTCCTCCACTCTTTCAACAGCTTTCTCACGCCCTAATTTATTAAGTTTATTGTAATGTTCAATCAATGCCCTTTTAATAATTTTATCATTCCATTTGGCCGTTTCCTCCATGGCTTTTTCCAATGCTTTCTCACTTTCTAAATCTGACTCCCCAAAAAGTAGGCCATTTAATGTGATATCTAGGGCATTGGCTATATATAGTAATGTTTCTAATTTGGGCAACTTATTAGTCCTTTCATATTGTGCAACGCTTTGCTGTGTTATCCCCAATTTTTCCGCTAGTTCTTTTTGTGTTAAACCCTTTAATTTTCTAAACTTCTTAATATTTTCGCCTACATTAAAGCCCATAATTGCCTACTTACCTTTACTTTTTATTTAATAATAACACTTTAAAATCGTAAATACAAGATAAACACAATAAAAAGCTTGTAATTACATATTGACACAGTTAAATAGTTGTAGTAATATAAAAATACAGTTATTAAGCTGTATTTTACATAGTCAAGAAAGGAGCTAATAAATGAGGGTAGACAGATACAAGCTAGGCCATATCTTAGTTGATAAGGATATGACGGCAACTCAGTTGGCAGAGCGTACCGGACTATCAAGGGCAACTATAAGCTGTATTAGGGGCGGTAAAAGTTGCCTATACGAGACAGCCGAAAAGATAGCGGAAGCGTTAGGCGTAGAAGTTAAAGACATTAGAGAAGTAAACAACCCGTAACAATCAATAAGCAAATCCCAGCTATTGAGGTGCTAAGAAGATAGTAAATAAAGAAAGGAGCAGCGAGCTAATGGAAGAAAAACACAAGCTTTGCGAAAAGGTAAGGCAGCAGGCTAATATCGAGAGCATACGAGAGCGTACGCACTTAACCGCTGAAGATATAGCGTTTTTACTAAGTCGAAGTAGTAGTGTGGCCTACAAGATATTAAATGACTTAAACGCAGATCTAAAGCGTAAGGGCTTTTATATTGTAAAGGGCAGAGTACCGAAAAAGTACTTTTGTGATAAATTTGGGATACCATACGAAAGCGTAAGTTAGAGGGTGATAATTTGCAATTAGACGAATTTTTAAGACACTTTAACGGCGTAAAACGTACTGGAGACGGTAAATATAAAGCCCTATGCCCTTGTCCTTACCATAATGACAAAAATCCAAGCTTAGGTATTACAGATAAGGGCGATAAGATACTAATAAACTGTTTCGCATATTGCAATTATTTAGATATATTGGCAGCAGTTGGATTATCTAAAGACGACCTAAAAAAGGACGGCAAGACAAAGCAAGGGGAGAGTTGGCAGGATAAATTAACTAAACTTGTAAAAATGCCAATAGAAGCAGTATATGACTATAAGGACGCTACAGGAACATACCTATATAGCAAAATCCGTTTTGTTGGTAAGCATATAAAGTATGCAGTTGTGGACTATAAGGCCGACAGCTTTAAAATGGGAAAACCTGAAGGTGTTAAATCAACTATGTATAATTTGCCTGCTGCCTTAAAAGCTATTAAAAAAGGCTTTTCGGTATATATCACAGAGGGCGAAAAAGACGTAAATACACTAAAGGAATTAAGGTATACAGCTGTAACAGCCGGAGGTGTAAACGACTGGAAGAAAGAATTTGCCCACTATTTTACAGGTGCAAGGGTTGTTATATTGCCTGATAATGATGCTCCTGGGCTTGACCTTAAGGACAAAATAATAGCAGATTTAAAGCCGTTTGCACACTCTATAAAATGGGTTGTTACATCAAAGGCAGATAAGGGAGATGTAACGGACTATTTAACCAAAGAGGGACACTCTAAAGAGGACTTGCAGAAGCTTATGGATGAAGTTAAGCCAGTTGCTGCCCCTTGGATTCAGATAACCGAAAGGAAAGACGGAAGCCAAAAACAGAGTGTTAATCCGGGATTATTAAAGGCCTGCATAAGCGAACATTTAAGTTATAAGACGGTGGACGGTAGTTATTACTGGTATGAGAACGGATATTATAAGCGAACGGACAAAAACACCGTTAAGGCTAAAATATCGGCTTATATACCGGATGGAATAGCAAACGATAATCTACTGAACAATGTTTATAATTTAATGCTTGCAGATGTTGACCACATGGCAAATGAAAAGGACTTTAATACCAACGAAAAATATATAAACTTTAAAAACGGTTTATACAATATTGATACTAAAGCCCTTGAGCCGCATAACGCCGATATTTTATATACAAGGCAAGTGAACACGGAGTATATAGAGGGTTCTACAATAACAGAATACCACATTTTTACAAAGTATGTTAGAGATTTATGTATGATGGCAGCAGGTGGCATAGATTGGCAAGCATATAAGGCATTACAAGAGATTATAGGGCTTGCAATATCTAATATATACGGCCATAAGACCAAAAAGGCGGTATTTTTGTACTCTCCTGTAGGGAACACAGGCAAAAGCCAATTTTTAGGGCTGTTAGGGCATCTGATCGGGCAGGAAAATATAACCGCTATACCGTTACAGAATATGAATGAAGACAAGGGACGTTTTGCATTTGCTAATGCCGGACTTGTCAGGCTTATTATGAACGGCGACCAAAGCAAGGCGGATATAAAAGACAGTTCAATTTTTAAGTCTGTAACAGGTGGGGACGCTATCAAGGTAGAGGCAAAGGGCAAGGATATAAAAGCCCTTGTATTCAAAGGCCTTGTACTTATTGCTTGTAACGATTTGCCATATATCGCAGATGATAAAGGCGAACACATCTATAGGCGTATGTATATAGTGCCTTGCACTCACACCATAGAGGAAAAGGAAAGAGACCCGAACATATTAGATAAAATGCTTGAAGAACTCCCGGCAATAGTAAATTGGGCGATTGAGGGACTGCATAGGCTAAAGGCTAATAATTATAACTTTACAGAGATAGCAGCAGGCAATCAATACATAGAAGACTACCGAAAGAATAGTGATACTGTTTACAGTTTCCTAATGGATGAGGGGTATACAATTACTAAGGACCCGAACGACAAAATAAGCAAAAAAAGACTTTTAGAGCAGTATAATCAATATTGCATAAGAGAAGAACGCCAGTCAGTTAGCAAGAGGCAGTTCGGCGAGAGGCTGGAAAAGATAACAGGATTTAAGACCGTGAGAACAAGAACAGCGAATATAAGAGATTATTATATTCAAGGTATTAAAGAATATAATGATGGATTTGTTCCGGTAGATAATAAGCAAATAGCTATATTCCAATAACGGAATATAGTAGCTAATGACCCAAAACAGGGCTTAAAAATGGGACTAAAAAAGGGACTAAGAGCCGTTACAAAGGAAAATATGGGGTTTAAGCTTCTTTATAATTTCTTAATAGTCCCAAAATAGGGCTTGAAAGTCCCTAAAAAGTCCCATAATAAAATATCGTTTTGGGACTCAAAAACCTAGGATTTACAAGGCTTTGGGGGTTTTAGTCCCAATAGTCCTATATATATTTATATTATAATTATAAATAATAAAATATATATATATAAATATATATATAAAAGTGAGTTGCAAAAATATAGGACTTTAGGGACTATCGCAAAAATGGGAATTACTGCCCTATAAATAGCTGTAGAATTTATAGAAGAGTAGAGCGGGCCATATTTTTCTTGGTAACGGCAGATAACAGAAAGGGTATAAAGTGGGAAGTTTTAACAGACATCAAGCATTAGGAATAATATATAGCAATATTAAAAATCTTAATGATGATTATTTGAGCCTAGTGGCTAACAAGGTCTTAGAGTTGAAGAGTGAACAAGAGTATAACCGTGCAACAAGGTATGTAATGAAGCACAGGGAAGAGTTATGGCAAAAGAGAAAAGGAGTAAAACAATGACAAGGGAACAGGCCTATGATCTGATATATGAAAGATTATATAAACTAAGTGATTACTGGCTGTATTTTATAGCAGCCTTGATATTAGATAAAGAAAAGGAGTAAAGGAATGAATAAAATAACTAATATTTTTGAGGAGTTTGAGAAAAGGAGCGGCCAAGTGGTTATAACACATGGCGAGGAGACATTAAAAATTGCTAAAAAGTTAAACGACTTAATAGCCAGATTACCGATATGCCTTGCAGATAATAATAGACTGGTGTATTTGATGAAAGACCAGTTAATGGCGGCAGAGCGTGAACAGTTCTTAGCAGGGTTTGATTTAGGATTGAAGATGGCGGATGTATTCAAAGAGGATAGGAGGAGCAAATAATAATATGAAAAGCGATATTAAAAAACTGGATAACATAAAGGAACTAATAAGTATAAACTTAGAGCCGTTACAAAATGATGATTATATTTTCTTAAAGGCTATAAATACTATGATTGTTGAGTATGTGAATGCAAAGTATGGAGAGGAGTAATAATAATGCGTTTATCAGGAAGAACAAAATACTGTATGTGTAAATATGGACACGAGGGGGAAGAGATTTATTCAGACATAGAACAGGAAGTTATTAGAGAAATTGACGGATACCTTATAAACCTTGAAGAGGCATACGGGCGTATTGATAGCCTGTACATAAACGGTTTTACAAGGGAATATTTTGATGGCCGACTGTACAAGGATTATCCAAAGCCCTATATGGAAGATGCAAGATTCCATTATGATATTTTAGGTAATGAAATAAGTATTTTAGGCAGGTTCTTAGCAGAAGCGAGGGAATATATAAAGGAGTTACAAAATGATAAAGATAAAGGCAAGTTGCAGTGATAGGCACGAAGTAAGCAAGATTATTAAGCTTTTAATGCCATACATGACAGATAAAAGGCCTAAAGTTGCCAAGTCTGAAGATGGAAAATATAAGAGGGTGTATATATGCATAGACAGCGAGAAAATCCCAAAAATCAAGCTGTAAATGCCTGTTTATACCCGGGTGGCTAACATACCATTAAAAGCTGTTAAACAACAATATATGACCTAGACCAGAATACGGGGGTATATCCATTAAGGGTATGCTCCCTATTTTGTTACCTTTTTTTCCATCGAAGCAAGGACGAAGCGAGAGAAAATCGCAAATGAACAACGGACGAACAACGAGAAAATCATTTTATAATTATACATGTCGTCCTTTTCTCCCATGCGTCACTTTTAAATTTTAACAGAGGACGAACAGAGAGAAATTGCAAAATCCCTTTGTTCTTTCCTCCAAAAGCGTTCGCTAAAATGTTTAAAAAGGTTATAAAGATTTATACATATACATCCTCTTATGTGGTATAATATAACATAGCAAACAAAATATTTGAAGTACCCCGGCAAGGCTTAATTCCTTTACCTGTTGTCGGAAGTCTGAAAAGATGTGGGAAGTATTAGGGCGAATGATTGGCGTTCGCTTTGGTGCTTCCTTTTTGTTTGCTAATTTGTAACCATTCCTTTACAACAAATTACGAAAGGAGATATAAAAATGCAGGTAAAAGATAGACTTGCAGAGTTAGGATTGACACAGGAGCAGTTGACAGCTGTAACGGCTTTATTTTCAGAGTTTGAAGCGGAACATGACAAAGCTATGGACGAATTAAAGCTTGATCACGCTATAAATACAGAGCTTGCAGCGTCTAAAGTTAAGAATGTTAACATTGTAAAAAAAGCGTTGGAGTTGGAGAATGTAAAGCTTAATGATGCGGGAGAGCTTGAGGGATTATCCGAGCAATTGAACGCACTTAAGGAAAGCGATCCATATTTATTTGGTACTGATACTAATAAGTCAGGTGTAGCCGGATATAATCCTGGTAATGGTGGAATGCCTACAGGATTTCCACAAAAAGACCCTATTTGGGGAATTGGTGGCGGAGAAAGAATATTCTAACGAAAGGAATTTTATTAAATGGCAAATACAATTAATTTGGCAACTAAATACCTGCCTTATGTTGATGAGCTTTTTACTAATGAGAGCAAAAGGGAACTTGTAACTAATAATGATTTTACTTGGGACGGTGCCCATACAGTGAAAGTTTATAAGGTTACTACAAGTCTTATGAATGATTATGACAGATCAGGCGAGAAGGTGGAAGCCGGGCAGATATGGAGCAGATACGGAGTTGTTAAGGGATTAGATGCAACAACCGAAGAAATGACACTAAAAAAGGATCGTTCCTTTACCTTTGCAATTGATAGGCTGGATATTAACGAAACAGCGGGACAACTTGCAGCACAAGCAGCACTTGCAAGGCAGATCAGGCAGGTAGTTATACCTGAAATAGATGGATATGTTTATAAAGTAATGTGTGACAATGCCGGTATTAAAGAGACCAATGTAACACTTACCAAAGAAAACATATACGATAAGATCATAGAAGCAAACTCACAACTTGACGATGTGGGAGTTCCGGAGTTTGGTAGGGTGCTTATTATGACACCGGCTACATATGTTTTACTTAAGAAGAACAAGGACGTTACAATCAATCAGGATGTAGGGCAAGAGTTGAGAGTTAAGGGCGTTGTTGGAGTTATGGACGGTTTAGGAGTGCAAAAAATTCCTGCTAATCGTTTACCGGATAAGTTCGGGTTTATGATCGCCCATAGTGTGGCGACTGTTGCACCGGTAAAATTAACTGATTACAAAATCCATGATAACCCTCCGGGAATTAGTGGCAATTTAGTAGAGGGGCGTATTGCATATGACGCCTTTGTATTAGACAACAAAGCAAAAGCAATATACTATCTGCAGAATAAATAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP032364|559398:567649|561798_561990_+|AYB00781.1|DBSCAN-SWA MRERTHLTAEDIAFLLSRSSSVAYKILNDLNADLKRKGFYIVKGRVPKKYFCDKFGIPYESVS >CP032364|559398:567649|562001_564194_+|AYA98875.1|DBSCAN-SWA MQLDEFLRHFNGVKRTGDGKYKALCPCPYHNDKNPSLGITDKGDKILINCFAYCNYLDILAAVGLSKDDLKKDGKTKQGESWQDKLTKLVKMPIEAVYDYKDATGTYLYSKIRFVGKHIKYAVVDYKADSFKMGKPEGVKSTMYNLPAALKAIKKGFSVYITEGEKDVNTLKELRYTAVTAGGVNDWKKEFAHYFTGARVVILPDNDAPGLDLKDKIIADLKPFAHSIKWVVTSKADKGDVTDYLTKEGHSKEDLQKLMDEVKPVAAPWIQITERKDGSQKQSVNPGLLKACISEHLSYKTVDGSYYWYENGYYKRTDKNTVKAKISAYIPDGIANDNLLNNVYNLMLADVDHMANEKDFNTNEKYINFKNGLYNIDTKALEPHNADILYTRQVNTEYIEGSTITEYHIFTKYVRDLCMMAAGGIDWQAYKALQEIIGLAISNIYGHKTKKAVFLYSPVGNTGKSQFLGLLGHLIGQENITAIPLQNMNEDKGRFAFANAGLVRLIMNGDQSKADIKDSSIFKSVTGGDAIKVEAKGKDIKALVFKGLVLIACNDLPYIADDKGEHIYRRMYIVPCTHTIEEKERDPNILDKMLEELPAIVNWAIEGLHRLKANNYNFTEIAAGNQYIEDYRKNSDTVYSFLMDEGYTITKDPNDKISKKRLLEQYNQYCIREERQSVSKRQFGERLEKITGFKTVRTRTANIRDYYIQGIKEYNDGFVPVDNKQIAIFQ >CP032364|559398:567649|561467_561671_+|AYA98874.1|DBSCAN-SWA MRVDRYKLGHILVDKDMTATQLAERTGLSRATISCIRGGKSCLYETAEKIAEALGVEVKDIREVNNP >CP032364|559398:567649|566377_566779_+|AYA98879.1|DBSCAN-SWA MQVKDRLAELGLTQEQLTAVTALFSEFEAEHDKAMDELKLDHAINTELAASKVKNVNIVKKALELENVKLNDAGELEGLSEQLNALKESDPYLFGTDTNKSGVAGYNPGNGGMPTGFPQKDPIWGIGGGERIF >CP032364|559398:567649|565341_565686_+|AYA98878.1|DBSCAN-SWA MRLSGRTKYCMCKYGHEGEEIYSDIEQEVIREIDGYLINLEEAYGRIDSLYINGFTREYFDGRLYKDYPKPYMEDARFHYDILGNEISILGRFLAEAREYIKELQNDKDKGKLQ >CP032364|559398:567649|559398_560457_-|AYA98872.1|integrase|DBSCAN-SWA MPVYKDNNKKGSWFVSCYYKDYLGHKKQKVKRGFTTKKEAQSWERDFLEHYSNQPTILFKTLLDVYLEDYKAKYKLSSYYIKEKNIHSHILPYFGETQINDITPNMIREWLNNLQPKQGDTLSTETKNGILRNLSAILSYACKYYGLGSNPCKLVDALKDNTKKEKIFLTLEQYKAFKSNITDIRDKVIFDLLFFAGLRRGELMALTFGDVDIDNKLLHISKTKGYAAGSYVTTTPKTKSSNRVVTLPSFLIDEIKEYKEHCLDTDATASLLNIRKESIEYKKDKYLKLAGLPHMRIHDFRHSHVALLVEIGENPLLIANRLGHSDIKMTLNTYAHLYPNKQKELAQKLENL >CP032364|559398:567649|566797_567649_+|AYA98880.1|DBSCAN-SWA MANTINLATKYLPYVDELFTNESKRELVTNNDFTWDGAHTVKVYKVTTSLMNDYDRSGEKVEAGQIWSRYGVVKGLDATTEEMTLKKDRSFTFAIDRLDINETAGQLAAQAALARQIRQVVIPEIDGYVYKVMCDNAGIKETNVTLTKENIYDKIIEANSQLDDVGVPEFGRVLIMTPATYVLLKKNKDVTINQDVGQELRVKGVVGVMDGLGVQKIPANRLPDKFGFMIAHSVATVAPVKLTDYKIHDNPPGISGNLVEGRIAYDAFVLDNKAKAIYYLQNK >CP032364|559398:567649|560905_561295_-|AYA98873.1|DBSCAN-SWA MGFNVGENIKKFRKLKGLTQKELAEKLGITQQSVAQYERTNKLPKLETLLYIANALDITLNGLLFGESDLESEKALEKAMEETAKWNDKIIKRALIEHYNKLNKLGREKAVERVEELTEIEKYTDPDEQ >CP032364|559398:567649|564618_564813_+|AYA98876.1|DBSCAN-SWA MGSFNRHQALGIIYSNIKNLNDDYLSLVANKVLELKSEQEYNRATRYVMKHREELWQKRKGVKQ >CP032364|559398:567649|564921_565185_+|AYA98877.1|DBSCAN-SWA MNKITNIFEEFEKRSGQVVITHGEETLKIAKKLNDLIARLPICLADNNRLVYLMKDQLMAAEREQFLAGFDLGLKMADVFKEDRRSK |
10 | Clostridium_phage(33.33%) | integrase | attL 559307:559325|attR 568361:568379 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
917469 : 927575
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP032364|917469:927575|DBSCAN-SWA TATGAAATTTAAGACGGAGAAATTGGGTGATTTTTTATATGTAAAAGGAAGGATAGGATGGAAAGGACTTAAAAAAGACGAATATCTAAGTGATGGGGTTTATCGTATTATTAATGGAGAAGCATTAACTAAAGATGGTATTGATTGGAGTAAAGCAGGTTTCATTTCAAAAGAACGGTATGAAGAATCTCCAGAAATAATGCTTCAGAATGATGATATTTTAATATCTAAAGATGGGACAATAGGTAAGTTAGGGTTTGTTAGAAATTTAGAAAATCCATCAACTGTTGCATCAGGAATATTTGTATTAAGAAATTTGAAGCCGGAAATGATTAATATACGATTTATATATAATTATTTGTCTTCAGTTTATTTTAGAAATTATATTATTTCAAGAACGGAAGGCAGCGTGATTCCACATTTGTATCAGAAAGATTTTGTGGATTTATATTTTCCTTTGCCTTCCCTTAAAGAACAGAATAAAATTGTAGATGTTTTAGATACAATTTCATGTAAAATTGAAATTAATAAAATGATAAACAATAATTTATTAGAGCAAGTGCTAACGTTATATCGTAATAGATTTATCGATACCATCAACAACAAGCGAAGAATTTTCCGTGCTGACAAATACTTTGATATTTCTATCGGTAAAACTCCACCTAGAAAGGAGCCACAATGGTTTAGCACTAATCCTCAAGATATTACTTGGGTATCTATTTCTGATATGGGCACTTGTGGACTTTATATTAGCAGTAGCTCCGAGCAGCTAACAAGAGAAGCTGTTGAACGACATAATGTTAAAATCGTACCTGACAATACCATTTTACTTAGCTTTAAGTTAACAGTCGGTAGAATAGCAATTACAAATGGAGAAATGACTACCAATGAAGCTATTGCACATTTCAAAACTGACAAAAAGGAAATAAATGAATATCTATATTGTTATTTGAAGTGTTTTAACTACCAAACTATGGGTAGTACATCATCAATCGCAACAGCCGTAAATTCAAAAATAATCAAAGGAATGCCTTTTGTTGTACCAACCGATGATGAACTAATAGATTTTCATAGCGTAGCTGCTCCAATATTTGCCAAGATAAAGGCTAGTCAAACCGAAAGTAAAAACTTGACAGCAGTCAGAGATATATTACTACCTAAACTTATGTCCGGCGAACTTGATGTCTCAAACATCGACATTTAAGCCGCTAATAGACTCGAAAACTGCTCCGCAGTTTCCTCGTTACCACCTCTGTCAGACACCTTGCCGTCCGTATGCAAGTATTCGTCCGTCTTCGGTGTCTGCCTACGCTGCTTCGCAGCTATCCGTGCGTTGCACGGATGAATCGGTAAATTATTGTTTGATATATAACCTATAACTCTTGTGGGTGGAAAGAGCTAATATAAGGGGACTTCCGCCCCGCAGTCGTTCTCTAAGAAAAACAAAGGAGGATAGACTGTGAAACAAGATTTAATCAAAAATGTTGTTCAAGAAATGTTGCCATATTTGAACAATGCACAAAATGAAAAGTTGAGAGAAGTTTTACAATATACCTTGGCAAACTATGATGTAATAGAAAGGCAACAAAAAGTACAAACTTCTGAAAAGAGCTTTGTAGAATTGTTTTTATCAGCAAAACGTATAGAGGGTTGCTCCGAGAAATCTCTGAAATATTACAGGGCTACTATTGAAGCTATGCTTGAAAAAGTAGAAAAAGAAGTCAAACACATAGTTACAGATGATATAAGGGAGTACTTAACTGATTATCAGAAAAATAAAAATACAAGTAAGGTTACAATAGATAATATCCGACGTATTCTTTCAAGTTTCTTTTCTTGGCTTGAAGATGAGGATTATATACTGAAGAGTCCTGTAAGACGAATACATAAAGTAAAAGCAGGGACAAATATTAAAGAGACTTATTCAGATGAATCATTGGAGCTTATGAGGGATAATTGTAAGGAAATCAGAGATTTAGCGATTATAGATATGCTTGCTTCAACAGGTATGCGTGTTGGTGAAATGGTGTTACTTAACAGGAATGATATTGATTTTAATGAGAGAGAATGTATAGTATTTGGTAAAGGTAGTAAGGAAAGAGTTGTCTATTTTGATGCTCGTACAAAGATACATTTAAAAAATTACTTGGAAAGCAGGGTAGATGATAATCCGGCACTATTTGTATCATTAAAAGCACCATACGAAAGATTGAAAATTGGTGGAGTTGAAGTGCGTCTAAGAGAATTTGGAAAACGGCTAGGAGTACAAAAGGTACATCCACACAAGTTTAGACGAACACTTGCTACTATGGCTATAGATAAAGGTATGCCAATCGAGCAGTTACAACAACTTTTGGGACATAGTAAAATAGATACAACCTTGCAATATGCAATGGTAAAGCAGAGTAATGTGAAAATTGCTCATAAGAAATATATTGGTTAGACAGGAAAATATATATGTGTAAATGGATTGAGTGTAAAATATCTGATATTGGTACAGTTGTTGGCGGTGCAACTCCGTCGACAAATATACATGAGAATTATGAGAATGGAACTATTCCTTGGATAACACCTAAAGATTTGTCTACATTCAGTGGTCGCTATATTCAGAGAGGGGAAAGAAACATTACTGAAGTTGGTTTGAAAAACTGTTCGACACAATTGCTACCAAAGAATACAGTGTTATTTTCGTCAAGAGCTCCTATAGGATATGTGGCTATTGCATCAAATGATTTATGTACAAATCAGGGATTTAAGAGTGTGATTCCGAATAAAAATATCGATCCAAATTTCTTGTATTATTTGCTTAAATATAATAAAGAGAGAATCGAAGGTATGGGAAGTGGAACAACATTTAAAGAAGTATCTGGAAATACAATGAAGAATATACCTGTTTATGTTCCAGAAGATAAGAAAGTACAAGAGAAAATTGCATCTATACTTGGTTCTATTGATGATAAAATAGAAGAAAATGAGAGAATAAACAATAATTTTGTATATTAGATGTCAAGGTTTGAGACATCAAGTTCGCCAGAAACTAGCTTTTTCAATAGCGAATCACGAATCTTTATCAAATGACAATTTTCATCGTAGTTATTTCGAATAGAAGAATCTATTGGTGAAACTATTGCTTCAAATTCATCAAGTTTTTTATTTGGTGGTATGATTATAGGCATTTCAATCAGTGATTTTTTATTAATTGAACCAAATACAGTACCTTCTCCATTAAAAACTTCCAACTGCTTTTTTAGAGAAGATATTGTATATAGTATAAATGATTGATGATTTGTTTTTGAGTGAGCTGCCGCAAGTCCACGACCGATACAACAGTCAGTATGAGCAACATTTAAGTCTCCGACAGGAGCACGAACACTTATTAAAGTGTCATTTGTGTAAGCCATTTGTTTTGGTTCGGTTGTATAAAGGCGAACAGTTGGGAATCGAAAGCTAAATTCGGCACGACCTTGAAAGAAAATTGTACCATTTTTATCTTCGTTATAGCTACTGCCACTTGGCGACTGTCCCATTGTAATATCAGCTATGTCACTCAATGTACCTTTAATACAATCTGAGCTCATATTATCAATAAACATTTGCTTATATATTGCACGTGCTTGCTGCTCTAAATTATTGTTTTACATATTATTAAGAATGTAAACCATCTTATTGACCTGCGGTCAATAAGCATCGCAAGTCTGTGACTTGCTCAATTATTGTTTTAAATATTATGAAATAAAGGAGAGTTTTATGTCTGGAGTATATACCGAAGCTGACTACGAAAACTCAATAATTGAATTATTTCAAAACACCTTGGAATATGAGTATATATATGGTCCGGATATTGAAAGAGATTTCTACAGTCCGTTATATGAGGATGTTTTGATGGATTCACTGCGCTATTTGAACAGGGATTTACCTGAAGATGCTATTTTGGAAGCAATATATAAACTAAAAAATATCGAAAACGGTGAGTTGGTTCAAAAAAATGCTACTTTTATGGACTATCTACAAAACGGTATATCTGTGAGATATTTTGCAGATGGGGAAGATCGCTCTGTAATTGTATACCTTGTTGATTATAAAAATGTAGAAAACAACTCATTTATAATCGCTAATCAGTGGACTTTTATTGAGAACAGTAACAAACGTCCGGACATTATTCTGTTTTTGAACGGTCTGCCGGTCGTATTGGTTGAGCTTAAGTCTCCGTCACGTGAAGAAACCAATGCTTCAGAAGCATATAGACAGCTACGTAACTACATGCAAGAAATTCCATCTATGTTTGTCTATAATGCCATATGTGTTATGAGTGATCAGTTGACTTCTAAAGCAGGAACTATCACCTCAGGTGAAGACCGTTTTATGGAATGGAAAACCAAAGATGGAGACTATGAAAACACACAGTATGCACAATTTGATACTTTCTTTGAGGGGATATTTCAAAAAGAAAGATTACTTGATATTATAAAGAATTTTATATGTTTTTCGAATGAGGGTATAAATAGTTTTAAAATTCTGGCAGGATACCATCAATATTTTGCTGTAAGAAAAGCTGTTGAGTCAACAAAAAAGGCTACTATAACTGACGGAAAAGGCGGTGTTTTTTGGCATACGCAAGGAAGTGGAAAATCTCTCTCAATGGTATTCTATGCTCATTTATTACAGGAAGCATTGGATAGTCCTACTATTGTTGTACTCACTGACAGAAATGACTTGGATGATCAACTCTATGGACAGTTTGCAAAGTGTAAAGACTTTTTGAGACAAGATCCTATGCAGGCAGAAAGTAGGGAAAATTTAAAAACTTTGCTTGCCGGAAGACAGGCAAATGGTATTATCTTTACTACCATGCAGAAATTTGAGGAGTCTTATGAGCCGCTTTCTGAACGTAATAATATTATAGTTATGGCAGATGAGGCACATAGGGGTCAGTATGGACTTGCAGAGAAAATTAAGATTGTAAAGAACGATGCCGGTAAGGAAGAGGCAAAGCGAGTTAT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CAGTTACCGTTCATATCAAAAATATCAGAGAAAAAATAGAACTGAATAGCTCCAAACCTCAATTTATAGAAACTATCTGGGGAGTGGGATATAGATTTAAAGGATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP032364|917469:927575|926885_927575_+|AYA99205.1|DBSCAN-SWA MGKVLIIEDEVSIAELERDYLEISGFEVDISTDGKEGLEKALSEDYELVLLDLMLPGVDGYEICKQIRAMREIPIIIVSAKKNDIDKIRGLGLGADDYMTKPFSPSELVARVKAHIGRYDRLVGVSSSDKDIIEIRDLRIDASSRRVWGYGNEKTLTAKEFDILYFLAKHPNKVYSKEDLFKEVWGLESMGDISTVTVHIKNIREKIELNSSKPQFIETIWGVGYRFKG >CP032364|917469:927575|920467_921061_-|AYA99201.1|DBSCAN-SWA MFIDNMSSDCIKGTLSDIADITMGQSPSGSSYNEDKNGTIFFQGRAEFSFRFPTVRLYTTEPKQMAYTNDTLISVRAPVGDLNVAHTDCCIGRGLAAAHSKTNHQSFILYTISSLKKQLEVFNGEGTVFGSINKKSLIEMPIIIPPNKKLDEFEAIVSPIDSSIRNNYDENCHLIKIRDSLLKKLVSGELDVSNLDI >CP032364|917469:927575|925843_926875_+|AYA99204.1|DBSCAN-SWA MKVSSGLFSVFCLIIIIPSILLIYSMNYDTTGNIGIWFTILVTVIDIVAVVMWIWIYKRILIPLDKLQIATKKIADGDLEYKLDEKDFSEIPFLYHDFERMRIKLKENEEEKRLSDDTARELVSNISHDLKTPLTAIRGYVEGILDGVASSPQKTKDYLNTIYNKTNDMTLLIDELLYYSQVAETHVSYNFAKINVKEFFQEYVKDLYLELETIKIKFVYIENIGSETYIYMNKEQIKRALNNIVSNAVKYMDKENPKIHFRVRESIDAIYIEISDNGRGIDEKDLPHIFDRFYRSDVSRNTKLGGSGIGLSIVKKVIENHDGRVVAKSKSGIGTQISIELKK >CP032364|917469:927575|919925_920471_+|AYA99200.1|DBSCAN-SWA MCKWIECKISDIGTVVGGATPSTNIHENYENGTIPWITPKDLSTFSGRYIQRGERNITEVGLKNCSTQLLPKNTVLFSSRAPIGYVAIASNDLCTNQGFKSVIPNKNIDPNFLYYLLKYNKERIEGMGSGTTFKEVSGNTMKNIPVYVPEDKKVQEKIASILGSIDDKIEENERINNNFVY >CP032364|917469:927575|918927_919911_+|AYA99199.1|integrase|DBSCAN-SWA MKQDLIKNVVQEMLPYLNNAQNEKLREVLQYTLANYDVIERQQKVQTSEKSFVELFLSAKRIEGCSEKSLKYYRATIEAMLEKVEKEVKHIVTDDIREYLTDYQKNKNTSKVTIDNIRRILSSFFSWLEDEDYILKSPVRRIHKVKAGTNIKETYSDESLELMRDNCKEIRDLAIIDMLASTGMRVGEMVLLNRNDIDFNERECIVFGKGSKERVVYFDARTKIHLKNYLESRVDDNPALFVSLKAPYERLKIGGVEVRLREFGKRLGVQKVHPHKFRRTLATMAIDKGMPIEQLQQLLGHSKIDTTLQYAMVKQSNVKIAHKKYIG >CP032364|917469:927575|917469_918672_+|AYA99198.1|DBSCAN-SWA MKFKTEKLGDFLYVKGRIGWKGLKKDEYLSDGVYRIINGEALTKDGIDWSKAGFISKERYEESPEIMLQNDDILISKDGTIGKLGFVRNLENPSTVASGIFVLRNLKPEMINIRFIYNYLSSVYFRNYIISRTEGSVIPHLYQKDFVDLYFPLPSLKEQNKIVDVLDTISCKIEINKMINNNLLEQVLTLYRNRFIDTINNKRRIFRADKYFDISIGKTPPRKEPQWFSTNPQDITWVSISDMGTCGLYISSSSEQLTREAVERHNVKIVPDNTILLSFKLTVGRIAITNGEMTTNEAIAHFKTDKKEINEYLYCYLKCFNYQTMGSTSSIATAVNSKIIKGMPFVVPTDDELIDFHSVAAPIFAKIKASQTESKNLTAVRDILLPKLMSGELDVSNIDI >CP032364|917469:927575|924659_925844_+|AYA99203.1|DBSCAN-SWA MKERRLFTSESVTEGHPDKMCDQISDAILDAYLSVDPDSRVACETATTTGMVLVMGEITSKATVDIQKIVRETVREIGYDRAKFGFDCDTCSVLVALDEQSSDIAMGVDKALEVREHIDKEDEDNGAGDQGLMFGYATDETKEFMPYPIYLAHNLAKRLTQIRKDGTLGYLRPDGKTQVTVEYDEDGKPVRIDTVVLSTQHDDDVTQEQIHKDIKKYVFDEIIPHDMVDEHTKYFINPTGRFVIGGPHGDSGLTGRKIIVDTYGGYARHGGGAFSGKDSTKVDRSAAYAARYVAKNIVAAGLAKKCEIQLSYAIGVAHPTSISVDTFGTGVISDNDIVELIRKHFDLRPTAIIKMLDLKKPIFKQTAAYGHFGRDDLDLPWERLDKVEELKKAI >CP032364|917469:927575|921215_924365_+|AYA99202.1|DBSCAN-SWA MSGVYTEADYENSIIELFQNTLEYEYIYGPDIERDFYSPLYEDVLMDSLRYLNRDLPEDAILEAIYKLKNIENGELVQKNATFMDYLQNGISVRYFADGEDRSVIVYLVDYKNVENNSFIIANQWTFIENSNKRPDIILFLNGLPVVLVELKSPSREETNASEAYRQLRNYMQEIPSMFVYNAICVMSDQLTSKAGTITSGEDRFMEWKTKDGDYENTQYAQFDTFFEGIFQKERLLDIIKNFICFSNEGINSFKILAGYHQYFAVRKAVESTKKATITDGKGGVFWHTQGSGKSLSMVFYAHLLQEALDSPTIVVLTDRNDLDDQLYGQFAKCKDFLRQDPMQAESRENLKTLLAGRQANGIIFTTMQKFEESYEPLSERNNIIVMADEAHRGQYGLAEKIKIVKNDAGKEEAKRVIGTARIIRNSLPNATYIGFTGTPISSKDRSTREVFGDYIDIYDMTQAVEDGATRPVYYESRVIKLNLDQEILDKIDAEYDLMALNADNEVIEKSKRELGQMEAVLGNDNTINSLVCDILEHYGNNRENLLTGKAMIVAYSRPIAMKIYKRILELYPDWTEKVGVVMTSGNNDPEEWRQIIGNKHHRDELAKKFKDNNSPMKIAIVVDMWLTGFDVPSLATMYVYKPMAGHNLMQAIARVNRVFRDKEGGLVVDYVGIATALKQAMNDYTSRDKKNYGDTDVAKVAYPKFMEKLAVCRDKFYGYDYSKFRNGTDLERAKAISGAVNFIIGREKVDDKDSFVKEALMLHQALSLCSSLVDEESRFEAAFFEAVRVLVIRLTVTGVGKKISLPEMNARINELLKQSIKSDGVINLFSDIKEEFSLFDPKFLQEVANMKEKNLAVELLKKLISEQVSVYRRTNVVKSEKFSDIMQRAINSYLNGMLTNEEVIEEMLKLAKQIAADQKEGNKLGLNADELAFYDALTKPQAIKDFYENEELIAITKELTETLRKNKTIDWQKRESARAKMRMLIKKLLKKHKYPPEGMEDAVQTVMTQCELWTDNNSFEDKQNIYRYNANTEEDLQMVAEEGVKYNT |
8 | Bacillus_phage(33.33%) | integrase | attL 918640:918660|attR 920480:920500 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1051927 : 1060091
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP032364|1051927:1060091|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP032364|1051927:1060091|1053432_1054026_-|AYA99315.1|DBSCAN-SWA MENITFGERLKKIRVDNNVSQNELAKYLEITPSSLSYYENGVRTPPITIINKLVNCFNVSANWLLGIENPENKKIKTYADMLAALVPILELENIWNMSINKATFKEYVDCVNDPEEREMIYTMANSAGTPYNKNDTYSIGVLKTVNSAIIGFFEDFQKVYSLYENGSMPESLYKLWIEDRILKFKDISLPGTDPDEQ >CP032364|1051927:1060091|1057363_1057627_+|AYA99318.1|DBSCAN-SWA MNKITDIFEEFEKMSGQVVITHGEETLKIAKKLSGLLARLPICLADNNRLVHLMKDQLVTAEREQFLAGFDLGLKMADVFKEDRRSK >CP032364|1051927:1060091|1058819_1059221_+|AYA99320.1|DBSCAN-SWA MQVKDRLAELGLTQEQLTAVTALFSEFEAEHDKAMDELKLDHAINTELAASKVKNVNIVKKALELENVKLNDAGELEGLSEQLNALKESDPYLFGTDTNKSGVAGYNPGNGGMPTGFPQKDPIWGIGGGERIF >CP032364|1051927:1060091|1057783_1058128_+|AYA99319.1|DBSCAN-SWA MSLSGRTKYCMGKYGHDGEEIYSDIEQEVIREIDGYLINLEEAYGRIDSLYINGFTREYFDGRLYKDYPKPYMEDARFHYDILGNEISILGRFLAEAREYIKELQNDKDKGKLQ >CP032364|1051927:1060091|1059239_1060091_+|AYA99321.1|DBSCAN-SWA MANTINLATKYLPYVDELFTNESKRELVTNNDFTWDGAHTVKVYKVTTSLMNDYDRSGEKVEAGQIWSRYGVVKGLDATTEEMTLKKDRSFTFAIDRLDINETAGQLAAQAALARQIRQVVIPEIDGYVYKVMCDNAGIKETNVTLTKENIYDKIIEANSQLDDVGVPEFGRVLIMTPATYVLLKKNKDVTINQDVGQELRVKGVVGVMDGLGVQKIPANRLPDKFGFMIAHSVATVAPVKLTDYKIHDNPPGISGNLVEGRIAYDAFVLDNKAKAIYYLQNK >CP032364|1051927:1060091|1051927_1052986_-|AYA99314.1|integrase|DBSCAN-SWA MPVYKDNNKKGSWFVSCYYKDYLGHKKQKVKRGFTTKKEAQSWERDFLEHYSNQPTILFKTLLDVYLEDYKAKYKLSSYYIKEKNIHSHILPYFGETQINDITPNMIREWLNNLQPKQGDTLSTETKNGILRNLSAILSYACKYYGLGSNPCKLVDALKDNTKKEKIFLTLEQYKAFKSNITDIRDKVIFDLLFFAGLRRGELMALTFGDVDIDNKLLHISKTKGYAAGSYVTTTPKTKSSNRVVTLPSFLIDEIKEYKEHCLDTDATASLLNIRKESIEYKKDKYLKLAGLPHMRIHDFRHSHVALLVEIGENPLLIANRLGHSDIKMTLNTYAHLYPNKQKELAQKLENL >CP032364|1051927:1060091|1054703_1056902_+|AYA99317.1|DBSCAN-SWA MQLDEFLRRFNGVKRISTGNTYKALCPCHNDRQASLGISAEGDKILINCLAGCHYKDILAEVGLTEADLFNDGKTKQEESWREKIEGCIKMPIEAVYDYKDATGKYLYSKIRFVGKHIKYAVVDRKANSFTMRKPEGIKSTMYNLPAALKAIKKGFPVYITEGEKDVDTLKKIHFTAVTAGGVSDWRSEFAHYFTGARVVILPDNDTPGLDLKDKIIADLKPFAHSIKWVVTSKAEHGDVTDYLTKEGHSKEDLKKLIEEVKPVAAPWIQITERKDGSQKQSVNPGLLKACISEHLSYKTVDGSYYWYENGYYKRTDKNTVKAKISAYIPDGIANDNLLNNVYNLMLADVDHMAREEDFNNEENYINFKNGLYNLTTRKLEPHNEHILYTRQINTDYIEGASMADITSTFTRFIGDLCKGVDGAIDWQKYKALQEIIGLAISNVHGHRTKKAAILYSPIGNTGKSQFLSLISNLVGPEHITTIPLQNMNEDKGRFAFANAGLIRLIMNGDQGKATIKDSSIFKQVTGGDYIKTEGKGKDIKALVFKGFIIIACNDLPYFADDKGDHVYRRMYIVPCTHEVPEKERDASILNKMLEELPAIVNWAIEGLHRLRENNYNFSEVAAGQEVIANYRKNSDTVYSFLMDEGYIITKNPADKVSKKELLTAYNAYCLDNGRQVVGVRQFSERLKKLTGLEITRVRVDKYRDYYAQGIKEENNEFIAATDAENEIFSNG >CP032364|1051927:1060091|1054499_1054691_+|AYB00804.1|DBSCAN-SWA MRERTHLTAEDIAFLLSRSSSVAYKILNDLNADLKCKGFYIVKGRVPKKYFCDKFGIPYESVS >CP032364|1051927:1060091|1054187_1054382_+|AYA99316.1|DBSCAN-SWA MRIDRIKFAHAMVDKDMSVSVLAELTGLSRGTISGIKCGKSCLYETAEKIAEVLGVEVKDIREK |
9 | Clostridium_phage(33.33%) | integrase | attL 1051907:1051924|attR 1060694:1060711 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1905638 : 1991064
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP032364|1905638:1991064|DBSCAN-SWA 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100 | Clostridium_phage(38.46%) | transposase,holin,portal,coat,terminase,tail,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2102239 : 2153828
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP032364|2102239:2153828|DBSCAN-SWA TATGCTCACAGTTAATTATTATAACGACTTTTTTGAAATAGGTCAACAGAAAATCAACTTTAGCTTCTATGAATTGAGTTTACCCGATGACGATCCAGTCTATACCCTAAAAAAAGTTATGGAGGATTTAGATTTTTCCGGACTATTAGCCAATTGTTCGGACAAGGGAAGAACAGGGTACAACCCGATCATGATGTATGCAGTTATTACTTATGCAAATATGCGTGGAATACGCTCTATTGATCGTATTGTGGATTTATGTGAAAGAGATATTGCTTTTATCTGGCTTACTCAAGGGAGGAAGCCTAAAAGAGATGCTTTTTATGAATTTAAAGGCAAGAAACTTACTTCAGATATCCTTGATAATCTAAACTATCAATTTATGAGAAGATTACAAAAAGAAGGATTTGTAACATTAAAAGAATTGTTTATTGATGGAACGAAAATAGAAGCTAATGCTAATCGTTATACTTTTGTATGGCGTGGAAGCATTAATTATCATCTTGCAGGTCTGCTGGATTCTATTGATAAGCTTTATTCAGACTATAACTCTTTTTTACAAGATAACGGTTTTGGGGAGAAGTACGAGCTTGGAAATGCACAGATGTTTGTGATTGACGGAATTGATAAAGTCAGAGATGTTATTGAAAAGAATAGAAAAAGAAAGATTACGAAACATAAAAAGCTATCTAATAACCGTATTATAGAGATTGATAACTGCTCGCCTATTGAAATACTTAAGCTTCAGAAAAACCTTATGACTATTGCTGACGGAGAAGGTATTGTATTTGTTAACGGAAAGGGTAAGAGAAAGCCAAAGCTTCAACAACTCTATGAAGAACTTGAGCATTGTGGACAGCGATTAATGAGCTATAAAGAATGCTTTGAAATTATGGGAAAAGATAGAAACAGCTATTCCAAAACTGATTTGGAAGCAACTTTTATGCGAATGAAGGAAGATCATATGCTGAATGGGCAGCTAAAGCCTGCATACAATGTACAGATAGCAGTAGAGAATTATTTTATTGTACATAGTTATGTAAGTAATGATCGTACAGACTATAACACACTGATTCCTGTCCTTGAAAAGCATAAGAAAGCATTTGGAGAAGTGCTTGAAGAAGTTACGGCAGATAGCGGCTATTGTAGTGAGAAAAATCTCTTATATCTAAAAGAAAATAAGATAGATAGTTATATAAAACTACAGGATCATGAAAAACGAAAAACAAGAGCATACAGTAAAGATATAGGTAAATACTACAACATGAAGACAACAGTATTTGAGGATGAGCAAGTCTATATCTGTCATGACGGCCGTGAACTGAGACATATCAACACAGAAAAGAAAGAACAGAATGGTTATACACAAACATATGAAGTATATGGATGTTCAGACTGTAGTGGATGTGAACATAAGTCTAAATGTTTATACAATTATAATCCTGATAAAGATATTGATAAGAATAAAGTAATGAAGATCAATGAAGTATGGGAAGAGCTCCGAGAGAAGTCACATGCTAACATACAGAGTGAAAAAGGTATTCTGAAACGACAGATACGCTCTATTCAAACAGAAGGTCATTTTGGAGATATTAAAGAGAATGAAGATTTCCGACGCTTTAACTATCGTACTTCAGATAAGGTTTATAAAGAATTTATGCTTTTTGCAATAGGAAGAAATATAAATAAATATCATCGTTTTCTCTATGCCAAACTAAAGAAATTTGAAGGAAAACTACAGGAGAAAACAGCATAGTAAAAAATGCAAAAGCAAAATTTCAGCCAAGGGGGTTTTATGCCCCAAAATAGCCAGTATTATAGAAAAGTAAAATATCCTGACAAAGTCGCAAAGCCAAAACGCCTTGTATTTGTCAGGATATTTCTATTTCGTTCTGTAGGGATTAAAATTCAGTATTTCCCGACAGTCCCATTTTCAAAGTTTTCTATCATAAATATATAATAGGCATCATCATCCAACACATCAACAACAGAACTTACTGTTCAATTTCATAAAAGAGTTTTATATAGTAGAAGTTTTAAGGCTTTAGAGCATCTGTTCCTTCTCTTGCAAATTGCAAGTCTATTGATGCTCCAACCTGATCTTTTAAAAATCCGTCAAATGTAATTGTATCTTCACCCAATGTTCCTACCATATTTACCTTGTCAACTTTAACTGTCACAGTAGTATTATCATTGAACCATTTACCTTCTACCCTTATATCCTCTGCTATCAATTTTGCCTGTCCGTCAGCATTTAACTCAACAGTAAATCCTTTCATCTCATCACGAGAAAGATCAAGTCCAAATGCTTTTCCTGATACAGCTATATATTTTCCTACCAATGCTTCATCTCTTTTTCTTCCATTACCTGAGCAAGCCAGGCAGATTAACAAACTAATCATTATTAATATAAAAGCTAAACTATATCTTTTCATCTTCCCTCCTTTTTGGAAATTGAACAGTTTCTGCCAGTTTATATTGGATTCAAAAACACTTGTCTAACGAATATATTCTCCATTTTTATCAACTTTGAATCCATCAGGTGTTTTTTCATTTGTATACATTGATCCAAGAGGTCTTGAATTTTCTATATTCTTAAAATACCATTCACCATTACGCAATTCCCAAGTCCAATTAGTTGTATAGTTATTAAAGAAATACCACTTTTCACCTATATTGTGCCAACCGATAAACATCACACCGTCTAAAGGATTTAAGTAATACCACTTTCCATCTTGAGGATCTAGGTGCCAACCCTTTTTCAATGTATCCCTAGTAGTTCCAGAATAGTAATACCAATTGTTATTTTCTAATATCCAACCTTGCTTAAGAGGTGAGCCGATTCCTGAACTGCCCTTACCTATAGCCTTATGACCAATTCCTCTACCACTTCCACTATTATGGCTTCTTTCGACTTTTCCTGTACCGCTACTTCCTACTGTACTTCCACTTCCTACAGTTCTGCCAGGAATTACTACTACTCCAGGTGTGGTTGTTCCGCTTTCACCGGGAGTTGTTCCGCTTCCACCGGGTGTTGTTCCGCTTCCGCCGGGTGTTGTTCCGCTTCCGCCTGGTGTTGTTCCGCTTCCACCGGGAGTTGTTCCGCTTCCACCGGGTGTTGTTCCGCTTCCACCGGGTGTTGTTCCGCTTCCACCGGGTGCTGTTCCGCTTCCACCGGGAGTTGTTCCGCTTCCACCGGGTGTTGTTCCGCTTCCGCCTGGTGTTGTTCCGCTTCCACCGGGAGTTGTTCCGCTTCCACCGGGTGTTGTTCCGCTTCCGCCGGGGATTGTTCCGCTTCCGCCGGGGGTTGTTCCGCTTCCGCCGGGTGTTGTTCCGCTTCCACCGGGTGTTGTTCCGCTTCCACCGGGAGTTGTTCCGCTTCCGCCGGGGGTTGTTCCGCTTCCACCGGGAGTTGTTCCGCTTCCACCGGGAGTTGTTCCGCTTCCGCCGGGGGTTGTTCCGCTTCCTGATGGATTCTTTCTTGTACAAACTATTGTATATAATGGATAATTTACACCTACCAGTACCTTAATATCATTTGCTGAGTTATATTGATACATATATGCACTATATACCTGAACCGGCTTTACCACATATACTACACCCGCATCATATAATGTAGCGGTAAACTCTGTATTATCCAAAGACAGCCAAGTCATGTCCGGTGCTCTACCGGTCTGATCATTAATAAGTGTATTACCTGATTCATCTTCATATTTAATTACATATGGATATCTATTATCACGACATACCAAATTATAAGTCACACCACCTGTATATGTAACCCAATTAAGCGTTACGGTAAGCAAATCATTTGACGAACTCAAAGTAACATCAGATGGTAAGTTCTGATCTACACTGCTTTTAACATAATATGTTATACCGCCTTCAGTAAATGTAGGCTGCACAGGAATTGTAAATATTTCTGTACTTAAACCGATGCCACCCAATCGACTACCGCTTTCTGATTTTATAACATTTCCTGATTCATCTACATAGTTAACAGTGTAATCAAAATATGAACCAATAGCATAAGATTCCCTTTGCATAATACACATTAACGCCAATGTCAAAAATAAAAATACTATAATTTTAACTATCTCTTTTGTAATTGCCTTTCTCTGACTCATAACACCTTCCTTTCTTATTATATTTTTATGATTTACAACAATACTAAAATTTATATATAGTTTTCCCTCCCTTCCTATAAAAATATTACTGTTTGTACTATCAATATCATATTTCACAATAAAAGTATATTACCCAAAGAATACTTTTAAGTTAGTTTTCCAAATATTATCTGATGAATACCAAATAAATGCACAAAAATACACCTAACATTTGTATAATTTATACTAATATTAGGTGTTTCTAATTTTTATTTTAATATTTCATTAATCCTTCCACAGCGTACCAATAGATCAATATATATTTGTAACTCATCTTTAGAATTGACTTCAAGCTTTGTATATATATTTCTATTATGTTTTCTTACTGTATTTAAACTTATACAAAGTAAGTCCGGTAGTTCTGCAATTTCATGTCCATTTACATAATATTCCAAAATATTTCTTTCTGATACAGTCAGGTCCTTTGAATTTTTTATAAAGCGATCAAACATCTCTTCTATTTCTGATGGAACTGCACCCATACTCTTGTATTTTTCTTCCTTGCTCTTTAGAAACTCCGCAAGAATATCTATCTCTGCAATTCCTGTACGAGAATCATTTTTATAAAAATCATCTGCTTTCAGATTCTCTATTCCCTTTTCAATCGGCTTTACAAACTGTCTGGATATTATAAATGATATTATAAACATGACAATACTAAATACCATTAGTATTGCTATCATCATTACTTTTTCATATCTTTCCTGTGCTTCAAAACTACCATAGGAAACAAGTACGGCAATCGCCCATTGCCTGCCTTGTGGGTCAAATGCACCTTCTATTGTTTGTTGTACTCCAACATATTTCCCTTGTGAATTAAAGTAAACATTA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73 | Faecalibacterium_phage(41.38%) | transposase,holin,tail,portal,head,integrase,protease,terminase,plate | attL 2109997:2110019|attR 2154329:2154351 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2508429 : 2574203
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP032364|2508429:2574203|DBSCAN-SWA AATGGATGAACAAAGAAAGTATGATGTTATCAAAGGTCTGGTGGATCACCCAGATACAGCCAATAAGGATAGAGCCGCTCTTATCCTAGGATGCACCAAAAGGCATATAAACCGTATGATACAGGGTTATATTAAATATGGTAAGGCATTCTTTATTCATGGTAACAGAGGCAAAAAGCCGGCTACCACTATCTGTCCTGATATCAGAAGTCAGGTTCTTGATCTATACAGAACTAAATACTACGAGGCTAACTTTGAACACTATACAGAGCTTCTAAAAAAGCATGAAGGCATAAGCATCTCTTCTTCCTCTGTAATGAGTATTTTGGAGTCAGAGTACATTCTATCTCCAAAGGCTACAAAAGCTAAGCGTAGACGCATTAAGCAAACTCTCAGAGCTAAGAAGGAAGCTGCAACATCAAAAAGGGAATTATCACAGATACAAGCTAACTTAGTAGCAGTTGAAGATGCTCACAGTCGTCGTCCAAGATGTGCTTATTTTGGTGAATTGCTTCAGATGGATGCTACCCCTTATGAATGGGTGCCGGGGCAGATATGGCATCTACATTTGGCTATTGATGATGCCTCAGGTGTTGTCACAGGTGCCTGGTTTGACACTCAGGAGACTCTTAATGGATACTACCATGTATTTGAGCAGATTCTTACTGATTATGGTATTCCTTATAAGTTTCTTACTGATAAACGAACTGTATTTACTTACAAGAAAAAAGGTGCCTTATCTGACGACAAAGACACCTATACACAGTTTGCATACGCCTGTAAGCAACTTGGCACACAGCTTGAATCAAGCAGCGTACCACAGGCTAAAGGACGTATAGAACGATTGAATCAGACTTTACAGTCACGCCTGCCTATTGAGTTTAGACTCGCAGGCGTAACCGATATCCATAAAGCCAATGAATTCATTTACCACTACATAAAAGAATTCAATGAGAAGTTCGCACTTCCACTTTATGGTATCAAATCTGTCTTTGAAACGCAACCATCTAAAGAAAAAATAAATCTTACTTTGGCGGTTTTAACTGAGAGAACTGTTGATGCCGGACATGCGATTCAATTCGAGAAGAAATTTTATAAGATGATAGATAATAAAGGATTGCAGACCCATTATCGAAAAGGTACCAAGGTTATGCTTATCAAGGCATTTGATAAGTCTATGTTTGCGTGCGTAAATGACAAAGATATTTATGCACTAGAAGAAATACCGGCTCATGAGCATAAATCTAAGGACTTGGACGCTGACTACAAACAGCCAAAGCCTAGAAAGCCTTATATACCTCCAATGAACCATCCTTGGAGATTGGATGCCTTTAATAAATTCGCACACTCACAGCCACACAGAATTGAAGAAGACATAAAAAGTGCATAATAAAAGCCCCTTTGTGGGGGCTTATAAATTAATTATTTTGGGACATAATCATTTATGCTTGACATAAAATCATCTATTATATATATAATTATAATTTGCATTTTGCGCCTATATTCACATATATTTATACAAAAAACTATTTAAAAAGCTATTCCATATTCCTTTAAAAGTATTTAAGAATTTTATCCACACAAACTCTGTATTATCTGTTATACTAGGTAATTGTATGGATACTCTGTTTGTCATCTACACTCCATGTTATCTATCGTAGATTCAACATCACCCAGAGCATTCAATTTATCTAAGGAAGGTAGAAATGAGAAAGAGAAGTAGAAAAAAGAAAAGAAAAATCTTCATACCGATTTTAGTATTGATTTTTTGTTGCGTTTTCACAGCAATGGTTGCTCGTGGTTGGCAAGAAAAGCAAAAAAAATCAAAGATAGCTAAAGCAAATACTGCCGATGAAACTGTAGAGATTAACCAAAGTGAAACTACTACTGAAGGACAAATCGAAGCTATCTCGGAGAATGAGACAGAAACCACAACTGCGCCTGAGACCACTCCCTCTCCAGATGAAAAGATAGTTTATCTTACATTTGATGATGGTCCATGGACAGGTACACCAAGACTTTTGGATATCCTTGATGCATACGATGTTAAGGCATGTTTTTTTGTAACAGCACAGTATATGGAGAATGATGCACTTGTTGATATGTTAAAGCAAATCAAAGATAGAGGACATAATATCGGAGTACACAGTTTAACTCATGATTATAAGAAAATATATGCCTCTGTAGACGCTTTCCTGGCAGACTATGATGCTATGGACGATATTATATTAAAAGCTACCGGAGAGCGTACAAAGCTTTTGCGTTTCCCTGGAGGAAGCAATACCGGATATAATAAGGCTATCAGAACAGAGCTTTTGCAGGCTGTAAGAGATAGAGGAATAGTATACTTTGACTGGAATTCCTTTGATGGTGATGTAGAAGGTAAGAAAGGTCAAGAACTTATTGATCAAACTATCAAACAGGTAAATGCAAATAAACACTCTATTTTGCTTATGCATGATATGCCATCCACCGCTTTTGTACATGATGCAATGCCAACCATCATTGAAAGGCTTAAATCAGATGGATACAGATTTGAATTACTTGGAATGAGCACTCCTCCAAGACAGTTTGCACAGTAGTTTTAAGGTCTTAAATCTCGTTGAGATTTGAGGCCTTTTATAAATATAAAAAAGAGAAAACCTAAATGATTTTCTCTCTAATATCCCTTTTGCAAATGTATTAATTTATTTCTCCTATTAAGAAGTTCATTAGACACATCGTCTATGTTACCTGAATGTAACTACCTCTAACTATTCCTCTATATTAACTTATTTGCTATTATCTAAATTTGTCTAATTATTGTTCTGACCAGCCTGTCTTTCAGCTCTCCTAGCTAAGATTGCATCAATCTTTTGCTGTGCTTCTTTCGCATCACCTTCTACTATATAAAGTTCCGGATATCTGATACCATGTGCACTTGTCTCAGCATCATTATGCATGTAAATATCAATAGTTCTTCCCTTGATATTTCCGCCTGTATCCTCAACTACATAGATATTATCACTGTCACCAATACGCACTCTTGTACCTGCCGGAAGTACTGACCAATCTGCTGCTATAGTTCTTCCTACAACCGGTCTATTACCGGATCTTGTCATATTTGAAGGATCACAGTCCACAGAGTAAGCATATGCTTTAAACTTACCTATAGATCTTCCTTTAGCTACTTCTCTAAGAGCAGCTATCTCTTCATCCTCCTTTGCTACAAGTTCAGCTTCCTGCTGTTGCTTATATGAGTCAAGCGTTGTCTCGTACTGATCTGCATTAAGACCGAATGCCGGACCGGTAACCGAATCTACCTCTTCCTGTGTAGCCGCATATGCACTTCCTGCCATAAGTGCAGAAAAAACAGATGCAACCATTATAACCTTTTTAAATTTGTTTTTCATTTACTTCCTTTCTTGCAAAGAACGAATCTTTTGTTCGTCGGGATGATTTAATTATATTACATAAATGTTAAATGTCAATAAGAAAATGTTGCAATCTTTTTGCAAAGGAGTAAATTCTACTTTTCACAGTATTTTTTTCATTCTATATGTATAAAAAAAACCATGTTATAATATATTTATTATATACTATAACATGACTTTGTTTTTGCTTTATATAAATTTTTGTTAAATATTTCAAGCATTTCTTTAATAAAAATATTAAGCTCTTGAGGCAAACTTGAACAATTCTACAACTTTTTCTATAGGAACAAGTAATCCACCTCCGGAGGCAGCCATCCTATCACTACATACATAAGAAGGTACAGCCTGAATTTCCAAAGTTTGCCAAACCTCAATATTGGAATCCTCAACTTTCTTTGCATTTCTGTTATCATTAAGTAAAACTATAATATCTTCTCTATTTGCTCCTGCCGCCTCTGCCAGATCTGCCAATAACTCTATATCATCTATTCTCTGTTGGATCTCAAAATGTGCTTCAAATACTAAATCATTATATTTTTTAATATCGTATCCATTCTCTGCCAGATAAAAACCAACCTGTGCAGCCAAATCTGAATGCACTCTGGCCGGCTCAGGTCTTGGATGCGCCTCACATGGTGACCACTCAATCTCCACATTCTTATAATCCGGTAAAATATCGCTAAGTTCCCTCAAACCTTTATAACAAAATGGACAGGTGTAATCATAAAATACTTTAATCTTCTTTGACATAAATTTCCTTTCTATTCACGTTATATCTGGTGATTTCATATATTGTAGTATTTATTATAACATATACCAATTATTAAGGCTACCTTTAGACTTTAAATAATACTTGCCCTTGTCTTGAGATTTTACAACAATAGCTTTAGTATGATGACTTCCTCTTCAATACCATATATCCTGCATCATCTACTGCCTTTGAAAGCTTTTCAATATCAGGCGGATTTTTTAAAAGGACTGTTGCCATATTATCTTCAAGACTCACACTTGCCCAAGTTCCGTCAAGTGAGTTCAGAGCATTCTCTACATTTCTAACACAATTACCACAGCTCATACCATCAATTGCAAGCTTTACTTCATATGGATAATGTGACTTATCCCTATCCTTTATTTTTACAGACTTGATCGCTTCCTCATGTTCCGGACAACAATCTCCACCTTTCTTCAACTTTTTTATATAACTCTTCAAACCAAAAAACACTATTGCTGCCAATATTACTATTATAATTATATTTACTTTATCCATAAAACCTCCTAGTTAGATATTACTAACTAGAAGTATATCACTTTGTTCTTAAAAAACAAGTTTCTATGTGAATTTTAATACAATATTATTCCACTATCTCTATAGGCTCACCTTGGTATACAAAAATCATTGCATCATACAGACTGCTTGGCAGCGCCTTAGGCCTGTAACTGCTCTGTACTATCCTCATCATCCATGTATATCCTTCTCCAAGAGTTCCCATTCTTAACAGGCTGTTTATCAGGTTAATGTCTTCCCGTCTCCCATACTTTTATATAAGCTCATACAATTTCTTAGACCATTCATCATCCGACTGTTTT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58 | Planktothrix_phage(23.08%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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