Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP032401 | Streptococcus iniae strain GX005 chromosome, complete genome | 0 crisprs | csa3,cas3,DEDDh,cas9,cas1,cas2,csn2,csm6 | 0 | 0 | 8 | 0 |
1. CP032401
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
7371 : 63231
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP032401|7371:63231|DBSCAN-SWA TTTGCATGAAGTTGACTTGGCAAGTGTAGATGGTGGTAAAATTAATTGGGGATCTGTTGCAGGAAATTGTGTAGGCGGAGCAATAATTACAGGAGCTTTCTCAGGCCTCTTATATATACTAGACGCAGGAATTGGATGTGTTGTTGGATCAGGACAGTCTATTATTAATGAACTATAGATTATTAATAATAGGACTAATTTTAGTTCTAGTTGCATTATTGATAGTTAGTGTTATTAAAGAGGATTTGCATTTTTTGCGAATCAAGAAGATTTTTTTTCAAGGCTACATTATCAATTAAAGAGTGGCAAAGTGTTCATCTGGCCAAATCAAGATATTTCTTACACTGTTTGATGACACTCAAACAGTTTTTTGATGCATAATTGTTGACAAAAATGACGAGAGATAATAAAATGACACTATAGAAAACAAAACGTGTTGTCACTTTTTTTAAAATAGACTTTGACTTCTATTATAAGTGTATCGGTACGATGAGTCTTCTATTTCGATAAGACACTAGGAAATGCACTGGTAAAACTAATTAGGTTTTACTAGTGTCCTATTTTCTAAAAGAGGAGAGACGTATGAAATTACATGTTAATAAAGTAGTTAAAAACAACAAAATCCCTAAAACTCAGAAAAAAGTTAGTAAAACAGACCTTGTTCAACTTGTATTATTGTTGATTCCGGCTATTAAGTTAGCGCGAAAAATACTTAATGATCGAAAAATGAGATAGGAGATTTTTATGACACCTAAAAATAAAGGACTTTTAATCGGATTAACTGTAGGAGGCTTTGCTGCAGCACTTGCTTATCTTAGTCTTTCTGAGTCTGACAAAAACCAGCTTTTAAAAGAAAGTAGTGACAAGGTTGATGATCTTAATGATAAGGTTAAAGAGTTAAGTGATCATCTGACAGACTTTCTATCTGAAAAAGCTGAGGACACTAAAGAGCTTGTTGAAGATTATTCTGATTCATTAAATTCAGGTTTTGATCACAGTTATCAAGCTGTAAAAAAAGATGTCTTATCTTACACAGGCTTAGCTGGACAAAAACTTAAAGATGTTGTGGGAAAGTTGTCTGAAAAATAATGTCATTATAAAAAAAGAGGCCTTAGCCTCTCAGATTGAAGACAAACTAGTGACATTGCTAGTTTGTTTTTTTTATTGTTTCGCCTAAATTTCACTAAAATCAGATAAATAAGGCATTTAAGCCCAAAATAAAAAGGCTTCCCAGCCATCATTTTAACCCATTTTTTGAGATTTAGGCACGCTAAAGTCAGTCCAACTTTAGCTTTCATTTTGGACTTTCCAATTTCTCTAGTATAACGAAGGTTGTGGTATTCTTTAGCCGTTCCAAAAAGCCGCTCAATACTCTGTTTGCGCTGTTTATAGAGTTCTTTCATACCACTTTGATGCCGAATATCCTCACAAATATCCAGGTAGTCTTTCCAGATATGTCGGGTCACTACCTTTTGGTGATTCTTACTGTCAGTACAAATTCCTAGAAGGGGACAAGAAACACAAATTTCGGGGGCACTTTTATATTCTCTGTAGCCAGCTCGATTTGTTGTTGTATAAGACAATACTTGGTGTTCAGGACAAAGATAACACTCATAATAGGAGTCATAAATAAAATCATTTGGTCTTAAATTGCCTTTCTTACCACGAGGCCTAGTATAGGGGAAAACAGGTCTCACTTCATTATCCAAGAGTAACTTGGCAATACTAGGAGTCTTGTAGCCAGAATCAGCGATAATAAAGTCTGGCCGGAACTCTTTTATCTTCTTCCAAAGTGCAGGAAATGCTTGACTATCATGAGTATTTCCTGCATCTACAGTATAGGCTAAGACCCAACCATTCTTATCGCATGCCACTTGACTTGTGTAAGCAAAGACATCTTTATGTTCTCCCTTATGATACCAACCACTTTCAGGATCGGTCGTAGAAACTTTCTTATTTATGGGCTCTTTTTCTTTGGCGAGCCCTAGCGACTTTTTTTCATGTTTCTCCCTGTCCCTAGCAATTTCCAGCTCCAATTGGTCACTCATAAACTTAGCTTGTCTATCAACTTTCTGATTGCTATATTTGTGACTGTTAGCAGCTGCCTTGATATGAGTGCCATCCACAAAAATTTCAGTCGGATCAATCAGCCCAGCATTAAGGCATAGCCCTAATATATGAGAAAAGATGGCTTCAATCACTTGTTTATCTTGAAAACGACGACTGTAGTTCTTGCCGTAAGTCGTAAAATGAGGGACCTTATCTTCCAATGTCAATCCAAGAAACCAGCGGTAAGCCACATTCACTTCTATCTCTTTAATGGTTTGTCTCATAGAACGAATACCAAAGAGACATTGGATAATAGGGAGTTTAACTAACATCACTGGATCTAAACTAGGACGCCCATTATCAAGACAATAACTATCTGTCACTAAGTCATAAATAAAAGAGAAATCAATAGCTTGGTCAATTTGACGAAGCAGATGATCTTCTGGAACTAACTCATCTAGGGTATAAAAACCGACTTGATTGCGATTGTAATTAGGATTTTCTTTGTGAAACATAGAGAGCACCTCACAATTATTTTTACTATTATTATACTCCCAAGAAGAGAAAATCTCTCACTTTTAATGACGATTGTGATGTTTTTCCCAGTGGCATGAGTGGCTTATTCCGAATTAGAAAAGCCACGACGGCATTTTTTAGACCAGGGCTAAAAAATGAGTAATGGAATTCTGAAGGAAGTCGCTTACGTCCGAGCCACTTTTGAAAAACATCAAAAAGAGTGAAGACAGGGACTTTGTCTTCACTCTGAGAGGCCTTAGCCTCTTTTTTTATGGGACGATGACTGTAATGGCTTCTTTTAGAACTGTTAAATCAATGGGAAGGTAGTCACTTTTATCACCGTCAATTCTAGTCCGTGCAACCGCAAAATGGTCTTTTCTAACAGGGGATAACTTTAAAGAATTGGTATGGAAATGCTTAATTTGTTTGGCATTAGAAAAATCGCCTTGACGAAATTCATTGATATGTTTTAAAAAAGGGAAAAAAGCAATTTTTTTCATGGTGTAAACCTGTAGTAAGCCATCATTAACTAAGGCATCTGGTGAAAATGAATGAAAGCCTGCTATGGTGTTACTCATTGTAATTAATAAAAATCGAGTTTTAATAATTGTGGTCTTTTGGGGAGTTTCAATCGAAAGATGGTAACTTCTATTTCGTCTTAGTATTTTAATACTATCCTTTAAGAAGGCTAATGGGCCCCATTTCCGTTTTTCTTCAGAAGTAACATTTGCAGCAATATCTGCAAGAAGTCCTAAAGTTAAACTGCTAATCATATAGTTATCATTAGCTTTACAAATGTCTACTCGTTTTTCATTGCCAGCAACAATAGTTTTGATTGCGGTCTCGACGTCTAATGGAATAGATAATGATTTTGCAAAATTATTAACAGTACCTGAAGGTATGAGACCAATTTTAGAAAAACTGCCTCCTTCATAGACACCGCCAATAATTTTATTTAAAGTGCCATCGCCTCCTAGCGGAATAACAATATCGGTTTTAGCTTGAGCGACTTTTTTGGCTTTTTCAAAGGCATCTTTGCTGTTTTCAGGACAAATTATTGTAATGTTTTCAGCTGAAAACCCATGATTGATAAGACTATTTTTAACAGTTTCTTGAAGCTGATCATCTTTTTTACCAGATTTTGGATTATAAAATATAGCAACGGTCTTCATCTAAATGTCCTCCTTATTTTTATAACTTATTATAAACCTATCAATAAACTAAATCTATTGGAGCAACTTGTCATTTTAGTTCATATGAAAAATAATGGCAAGCATTTGCAGAAATGAAGCTAATAGAATAAAAAGATGCCAAATCATATGAAAATAGGGTCTCTTCTTAGCATAAAATAGAGCACCTATAGTGTAAGATAGACCACCTAGTAACATCAATATTCCGAAAGTTATCGTCATTTTAGGAAGTATAATAGGAAAAATAAAAACAACCATCCAGCCCATAATGAGGTATAAGATAAGACTAAATTTTTCATTGATTTTTTGTGCAAATATTTTATAAAGAATTCCAAAAATAGTCACCCCCCACTGTAAAATCATGATGATATAACCAAGCCATCCACCAACTAAAGATAAGGCAATTGGTGTATATGAGCCTGCAATGGCAACATAGATCATGCTGTGGTCAATAATGCGTAAAATGTATTTTTGTGGCGAATGGTATGACATGGAGTGATAGATGCTTGATGATAGAAACATCAAAAAGAGACTAATCATAAAAATTGATGTGCCTACAGCTGTTGTAAGATTGTTGGTTTTGTAAGAAAATATAGCTACCGCAGGGATTAATAATAACATTATAAGTGCAGCAGCTCCGTGGGTGGTTGCGTTAGCGACTTCCTCACCAAAACTTAAGGGGTGGCTTTTTTTAAAGGTTTGGTTCATTGGTTTTCCTCTTTGATTTGTAATGTGTTAACAATGCTGAGTGTTTTATAATAATGCTTCACGGTTTGACAGGCTAATATGATAATCTCTGAGCAATTGTCAGTTTGTTTATGATTCCAATAATGAACAAAAGCATCGTAGAGTTGCTCAGATGAATAATGAGAAGTGAGATTTTCTAAAACCACTGCAATAGTCTGAATTGGGAAGCTATTTTTTAAGAGTGATATAGCAATCAATCTTCCTATTTGTTCTTTTTGATATTTCTTTTTAATAGGTTTTTTTAGATAGCCATGTTTGACGTAATTATTGACCATTGAGGCGGTCAATTCTTTTTGCACCAACTCAGGAGTTATTGCGGTCGTTTGATTGACATACAGTAAGACTTGGTCAAGATAGAGGTCTAAATTGGGCAATTCCTCCCAAGAGGGAAGCGTTTGATAATTCATTTTTAAAAACTCCTTAATCTAGTTATGGTAACTAGATTATATAATTATATCAAAAATAATGCAAATAAGTTCCTTATTTTTTTCAAAATCG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51 | Staphylococcus_phage(25.0%) | transposase,bacteriocin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
78942 : 200752
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP032401|78942:200752|DBSCAN-SWA 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>CP032401|78942:200752|107246_109166_-|AYB00988.1|DBSCAN-SWA MAKKDYTELARDIVAHVGGKENIIGLKHCVTRLRFHLKDEAKADDNYLKNRDGIVTVVKAGGQYQVVIGNHVPDVYESVQGVTGIAGGGLLNIDEGDAPKGSLFDRFVDLISGIFQPMLGTLAAAGIIKGLVSILSVSLGWNATNSALYVILNTAGDGFFQFLPIILAYNAARKFKMNEFTAMGIAMALVYPTLPGTLTALREAKLANVLGIPFELPAAGSYLQTVMPIILAVWVASHVEKSMKNIIPDVVKVFMVPFTTLLIVVPLTFLAVGPIANFASDLLSALFTSVMGFSPLLYGILLGALWQILVMFGLHWAIVPLAILQFSQNGWSTILLAAALPNFTQTGVLAAIMLKTKEKKVKEIAMPAFISSIFGVTEPAIYGITLPMKIPFYISCVVSGLIGAGLSFFDLKNYAMGALGIFMYPGYVSPKDGMTPMFIMMAFTLAAILVSFALQMIAPVPYLYGGQEGDDATSAIEEISDITPLKDIKQEIIASPLSGQLVPLAEVPDEVFASGAMGKGIAINPSEGIIYAPTNAEVILVFATKHAIGLKTENGADLLIHVGMDTVSLGGNGFNALVKVGEKVAAGQKLLEFDIQTIKAAGLPVITPVIVTNTEVFEDILVSQEKEIASGDYLLTTIY >CP032401|78942:200752|143974_145204_-|AYB01018.1|protease|DBSCAN-SWA 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113 | Bacillus_phage(15.15%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
408957 : 463307
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP032401|408957:463307|DBSCAN-SWA 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50 | Staphylococcus_phage(35.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
510475 : 526285
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP032401|510475:526285|DBSCAN-SWA 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20 | Streptococcus_phage(80.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1121649 : 1175247
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP032401|1121649:1175247|DBSCAN-SWA 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45 | Staphylococcus_phage(20.0%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
1222129 : 1260604
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP032401|1222129:1260604|DBSCAN-SWA 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47 | unidentified_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
1336474 : 1395795
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP032401|1336474:1395795|DBSCAN-SWA 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56 | Bacillus_phage(27.27%) | protease,transposase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
1773209 : 1841988
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP032401|1773209:1841988|DBSCAN-SWA 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56 | Staphylococcus_phage(28.57%) | transposase,bacteriocin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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