CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
CP017982	Lactobacillus helveticus strain LH99 chromosome, complete genome	3 crisprs	cas14j,Cas14u_CAS-V,cas3,csa3,cas2,cas14k,cas6,cas8b2,cas7,cas5,cas4,cas1,DEDDh,DinG,RT,c2c9_V-U4	0	13	27	0

1. CP017982

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: CP017982_1

• CRISPR_ID: CP017982_1
• CRISPR_location: 562582-563863
• CRISPR_type: Unclear
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 19 spacers
• Cas_protein_info: cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6

Consensus repeat of CP017982_1

Consensus_repeat	Method
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	PILER-CR
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	CRISPRCasFinder
NGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	CRT

spacers of CP017982_1

>1.1|562612|35|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
AATGCAATTAATGGAGCTATCGAAAAATACGTTAA
>1.2|562677|36|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
CGATACTTGTTAAGCCAGCTATTAAGTGGCTAGACG
>1.3|562743|36|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
TGTTGGTAAAAAGTTTAAGAATGTTGCGTCCTTTGA
>1.4|562809|35|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
AAAGCTAATAAGGGCTATAGAAGCGTCTTTACTAA
>1.5|562874|36|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
TACTAAATTAAATATTTAATAGGCAAAAGCTGATTG
>1.6|562940|36|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
TGATTCAAGGGCCAACTACTAAATGGCTGATAGACC
>1.7|563006|35|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
TGTTAGTCCTATGACTATTCAGCATATTAGAACTG
>1.8|563071|37|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
GTCATAAAAAATCGACAGTAAGATGCACTGAGGCTGA
>1.9|563138|36|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
ACCCAAGTAAAAATGGAGCTAGTACACTAAGTATGT
>1.10|563204|38|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
CTTAAACAGCAGGCAGCATGATGATTTCATTGCAAGTG
>1.11|563272|36|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
TACTTTGGCGAGATGGGACTAACTAACATTTTAACC
>1.12|563338|36|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
ATGGAGCGTATATGGGGCTTCAGATGACGGCTTTTT
>1.13|563404|36|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
AGTAAATCAACACGTGCTTGGGAATTGATTGGAAAA
>1.14|563470|35|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
GTTTTCCATAGTCTGTTCTTTCATACTTACTAATC
>1.15|563535|35|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
GAACAACCAGTAGAGTCAACTCAACCAGAACAGCT
>1.16|563600|36|CP017982|CRISPRCasFinder,CRT
AAACTTGAATGATCTATAGTACCTCTTTTTGAGTGA
>1.17|563666|38|CP017982|CRISPRCasFinder,CRT
TTTTGAAAGTTTAATCTAAAAGTTTTAGTAGTTGGTAG
>1.18|563734|36|CP017982|CRISPRCasFinder,CRT
AAAGCCGAATTTTACACCAACTTTACTAAATATGCT
>1.19|563800|34|CP017982|CRT
GTGTGATTAAAGTCAATTAAATATAAAACATAAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP017982_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of CP017982_1

>merge|CP017982|1|562582-563863|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGAATGCAATTAATGGAGCTATCGAAAAATACGTTAAGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGCGATACTTGTTAAGCCAGCTATTAAGTGGCTAGACGGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGTGTTGGTAAAAAGTTTAAGAATGTTGCGTCCTTTGAGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGAAAGCTAATAAGGGCTATAGAAGCGTCTTTACTAAGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGTACTAAATTAAATATTTAATAGGCAAAAGCTGATTGGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGTGATTCAAGGGCCAACTACTAAATGGCTGATAGACCGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGTGTTAGTCCTATGACTATTCAGCATATTAGAACTGGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGGTCATAAAAAATCGACAGTAAGATGCACTGAGGCTGAGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGACCCAAGTAAAAATGGAGCTAGTACACTAAGTATGTGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGCTTAAACAGCAGGCAGCATGATGATTTCATTGCAAGTGGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGTACTTTGGCGAGATGGGACTAACTAACATTTTAACCGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGATGGAGCGTATATGGGGCTTCAGATGACGGCTTTTTGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGAGTAAATCAACACGTGCTTGGGAATTGATTGGAAAAGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGGTTTTCCATAGTCTGTTCTTTCATACTTACTAATCGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGGAACAACCAGTAGAGTCAACTCAACCAGAACAGCTGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGAAACTTGAATGATCTATAGTACCTCTTTTTGAGTGAGTTTTTATTTAATTTAAGAGAAATGTGAATTTTTGAAAGTTTAATCTAAAAGTTTTAGTAGTTGGTAGGTCTTTATTTAATCTAAGGGAAATGTAAATAAAGCCGAATTTTACACCAACTTTACTAAATATGCTGATTTTATCTAACTTAAGAGGAAAATAATTGTGTGATTAAAGTCAATTAAATATAAAACATAAAGATTTATATTTAATTTACGGGAAGGAAACT

>CP017982|1|1|562582-563599|PILER-CR
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	AATGCAATTAATGGAGCTATCGAAAAATACGTTAA
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	CGATACTTGTTAAGCCAGCTATTAAGTGGCTAGACG
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	TGTTGGTAAAAAGTTTAAGAATGTTGCGTCCTTTGA
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	AAAGCTAATAAGGGCTATAGAAGCGTCTTTACTAA
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	TACTAAATTAAATATTTAATAGGCAAAAGCTGATTG
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	TGATTCAAGGGCCAACTACTAAATGGCTGATAGACC
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	TGTTAGTCCTATGACTATTCAGCATATTAGAACTG
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	GTCATAAAAAATCGACAGTAAGATGCACTGAGGCTGA
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	ACCCAAGTAAAAATGGAGCTAGTACACTAAGTATGT
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	CTTAAACAGCAGGCAGCATGATGATTTCATTGCAAGTG
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	TACTTTGGCGAGATGGGACTAACTAACATTTTAACC
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	ATGGAGCGTATATGGGGCTTCAGATGACGGCTTTTT
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	AGTAAATCAACACGTGCTTGGGAATTGATTGGAAAA
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	GTTTTCCATAGTCTGTTCTTTCATACTTACTAATC
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	GAACAACCAGTAGAGTCAACTCAACCAGAACAGCT
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG

>CP017982|1|1|562582-563799|CRISPRCasFinder
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	AATGCAATTAATGGAGCTATCGAAAAATACGTTAA
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	CGATACTTGTTAAGCCAGCTATTAAGTGGCTAGACG
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	TGTTGGTAAAAAGTTTAAGAATGTTGCGTCCTTTGA
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	AAAGCTAATAAGGGCTATAGAAGCGTCTTTACTAA
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	TACTAAATTAAATATTTAATAGGCAAAAGCTGATTG
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	TGATTCAAGGGCCAACTACTAAATGGCTGATAGACC
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	TGTTAGTCCTATGACTATTCAGCATATTAGAACTG
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	GTCATAAAAAATCGACAGTAAGATGCACTGAGGCTGA
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	ACCCAAGTAAAAATGGAGCTAGTACACTAAGTATGT
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	CTTAAACAGCAGGCAGCATGATGATTTCATTGCAAGTG
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	TACTTTGGCGAGATGGGACTAACTAACATTTTAACC
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	ATGGAGCGTATATGGGGCTTCAGATGACGGCTTTTT
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	AGTAAATCAACACGTGCTTGGGAATTGATTGGAAAA
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	GTTTTCCATAGTCTGTTCTTTCATACTTACTAATC
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	GAACAACCAGTAGAGTCAACTCAACCAGAACAGCT
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	AAACTTGAATGATCTATAGTACCTCTTTTTGAGTGA
GTTTTTATTTAATTTAAGAGAAATGTGAAT	TTTTGAAAGTTTAATCTAAAAGTTTTAGTAGTTGGTAG
GTCTTTATTTAATCTAAGGGAAATGTAAAT	AAAGCCGAATTTTACACCAACTTTACTAAATATGCT
GATTTTATCTAACTTAAGAGGAAAATAATT

>CP017982|1|1|562582-563863|CRT
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	AATGCAATTAATGGAGCTATCGAAAAATACGTTAA
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	CGATACTTGTTAAGCCAGCTATTAAGTGGCTAGACG
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	TGTTGGTAAAAAGTTTAAGAATGTTGCGTCCTTTGA
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	AAAGCTAATAAGGGCTATAGAAGCGTCTTTACTAA
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	TACTAAATTAAATATTTAATAGGCAAAAGCTGATTG
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	TGATTCAAGGGCCAACTACTAAATGGCTGATAGACC
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	TGTTAGTCCTATGACTATTCAGCATATTAGAACTG
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	GTCATAAAAAATCGACAGTAAGATGCACTGAGGCTGA
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	ACCCAAGTAAAAATGGAGCTAGTACACTAAGTATGT
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	CTTAAACAGCAGGCAGCATGATGATTTCATTGCAAGTG
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	TACTTTGGCGAGATGGGACTAACTAACATTTTAACC
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	ATGGAGCGTATATGGGGCTTCAGATGACGGCTTTTT
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	AGTAAATCAACACGTGCTTGGGAATTGATTGGAAAA
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	GTTTTCCATAGTCTGTTCTTTCATACTTACTAATC
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	GAACAACCAGTAGAGTCAACTCAACCAGAACAGCT
GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAG	AAACTTGAATGATCTATAGTACCTCTTTTTGAGTGA
GTTTTTATTTAATTTAAGAGAAATGTGAAT	TTTTGAAAGTTTAATCTAAAAGTTTTAGTAGTTGGTAG
GTCTTTATTTAATCTAAGGGAAATGTAAAT	AAAGCCGAATTTTACACCAACTTTACTAAATATGCT
GATTTTATCTAACTTAAGAGGAAAATAATT	GTGTGATTAAAGTCAATTAAATATAAAACATAAA
GATTTATATTTAATTTACGGGAAGGAAACT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
CP017982.1|AYE61124.1|563953_566617_+|DNA-polymerase-I	unknown	unknown	gnl|CDD|235591
CP017982.1|AYE61133.1|574898_575255_+|translational-initiation-factor-IF3	unknown	unknown	gnl|CDD|234582
CP017982.1|AYE61119.1|558175_560605_+|CRISPR-associated-helicase-cas3-domain-protein	cas3	COG1203_cas3_CAS-I	gnl|CDD|273707
CP017982.1|AYE61115.1|553881_554637_+|hypothetical-protein	cas6	COG1583_cas6_CAS-I:CAS-III:CAS-IV	gnl|CDD|273848
CP017982.1|AYE61129.1|569872_570799_+|primosomal-protein-DnaI	unknown	unknown	gnl|CDD|236353
CP017982.1|AYE61123.1|562115_562397_+|CRISPR-associated-protein-Cas2	cas2	cd09725_cas2_CAS-I:CAS-II:CAS-III:CAS-V	gnl|CDD|187856
CP017982.1|AYE61125.1|566625_567456_+|formamidopyrimidine-DNA-glycosylase	unknown	unknown	gnl|CDD|234899
CP017982.1|AYE61117.1|556430_557333_+|CRISPR-associated-protein	cas7	cd09687_cas7_CAS-I-B	gnl|CDD|274215
CP017982.1|AYE61127.1|568057_568525_+|transcriptional-regulator-NrdR	unknown	unknown	gnl|CDD|234774
CP017982.1|AYE61114.1|552830_553571_+|phosphoribosylamine--glycine-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|234856
CP017982.1|AYE61126.1|567452_568055_+|dephospho-CoA-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|234620
CP017982.1|AYE61120.1|560620_560938_+|CRISPR-associated-protein-Cas4	cas4	pfam01930_cas4_CAS-I	gnl|CDD|366863
CP017982.1|AYE61128.1|568527_569859_+|Replicative-DNA-helicase-loader-DnaB	unknown	unknown	gnl|CDD|226138
CP017982.1|AYE61122.1|561120_561996_+|CRISPR-associated-protein-Cas1	cas1	cd09722_cas1_CAS-I-B	gnl|CDD|187853
CP017982.1|AYE61121.1|560997_561111_+|CRISPR-associated-protein-cas4	unknown	unknown	gnl|CDD|366863
CP017982.1|AYE61116.1|554654_556412_+|hypothetical-protein	cas8b2	cd09754_cas8b2_CAS-I-B	gnl|CDD|187884
CP017982.1|AYE61118.1|557319_558033_+|CRISPR-associated-protein-Cas5	cas5	cd09658_cas5_CAS-I-B	gnl|CDD|273860
CP017982.1|AYE61132.1|574155_574278_-|transposase	unknown	unknown	unknown
CP017982.1|AYE61130.1|571089_573024_+|theronyl-tRNA-synthetase	unknown	unknown	gnl|CDD|234752
CP017982.1|AYE61131.1|573291_574116_-|transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225995

HMMScan for Signature genes

Protein	Cas_name	Cas_description	E-value	Identity	Coverage
CP017982.1|AYE61120.1|560620_560938_+|CRISPR-associated-protein-Cas4	cas4	pfam01930_cas4_CAS-I	8.5e-29	95.5	0.3
CP017982.1|AYE61122.1|561120_561996_+|CRISPR-associated-protein-Cas1	cas1	cd09722_cas1_CAS-I-B	1.7e-112	370.5	5.2
CP017982.1|AYE61116.1|554654_556412_+|hypothetical-protein	cas8b2	cd09754_cas8b2_CAS-I-B	1.2e-21	71.6	0.3
CP017982.1|AYE61119.1|558175_560605_+|CRISPR-associated-helicase-cas3-domain-protein	cas3	COG1203_cas3_CAS-I	2.6e-74	245.5	1.0
CP017982.1|AYE61115.1|553881_554637_+|hypothetical-protein	cas6	COG1583_cas6_CAS-I:CAS-III:CAS-IV	1.1e-24	82.3	3.4
CP017982.1|AYE61118.1|557319_558033_+|CRISPR-associated-protein-Cas5	cas5	cd09658_cas5_CAS-I-B	3e-32	106.9	0.4
CP017982.1|AYE61117.1|556430_557333_+|CRISPR-associated-protein	cas7	cd09687_cas7_CAS-I-B	2.1e-63	209.0	4.9
CP017982.1|AYE61123.1|562115_562397_+|CRISPR-associated-protein-Cas2	cas2	cd09725_cas2_CAS-I:CAS-II:CAS-III:CAS-V	1.4e-26	87.2	0.9

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
CP017982.1|AYE61124.1|563953_566617_+|DNA-polymerase-I	gnl|CDD|235591	PRK05755, PRK05755, DNA polymerase I; Provisional.	0
CP017982.1|AYE61133.1|574898_575255_+|translational-initiation-factor-IF3	gnl|CDD|234582	PRK00028, infC, translation initiation factor IF-3; Reviewed.	1.40753e-51
CP017982.1|AYE61119.1|558175_560605_+|CRISPR-associated-helicase-cas3-domain-protein	gnl|CDD|273707	TIGR01587, CRISPR-associated_endonuclease/helicase_Cas3, CRISPR-associated helicase Cas3. This model represents the highly conserved core region of an alignment of Cas3, a protein found in association with CRISPR repeat elements in a broad range of bacteria and archaea. Cas3 appears to be a helicase, with regions found by pfam00270 (DEAD/DEAH box helicase) and pfam00271 (Helicase conserved C-terminal domain). Some but not all members have an N-terminal HD domain region (pfam01966) that is not included within this model.	3.15966e-58
CP017982.1|AYE61115.1|553881_554637_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|273848	TIGR01877, CRISPR-associated_endoribonuclease_Cas6_1, CRISPR-associated endoribonuclease Cas6. CRISPR is a term for Clustered, Regularly Interspaced Short Palidromic Repeats. A number of protein families appear only in association with these repeats and are designated Cas (CRISPR-Associated) proteins. This broadly distributed, highly divergent Cas family is now characterized as an endoribonuclease that generates guide RNAs for host defense against phage and other invaders. The family contains a C-terminal motif GXGXXXXXGXG, where the each X between two Gly is hydrophobic and the spacer XXXXX contains (usually) one Arg or Lys. The seed alignment for the current version of this model has gappy columns removed. Members of this protein family are found associated with several different CRISPR/cas system subtypes, and consequently we designate this family Cas6.	1.48576e-17
CP017982.1|AYE61129.1|569872_570799_+|primosomal-protein-DnaI	gnl|CDD|236353	PRK08939, PRK08939, primosomal protein DnaI; Reviewed.	3.21012e-152
CP017982.1|AYE61123.1|562115_562397_+|CRISPR-associated-protein-Cas2	gnl|CDD|187856	cd09725, Cas2_I_II_III, CRISPR/Cas system-associated protein Cas2. CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) and associated Cas proteins comprise a system for heritable host defense by prokaryotic cells against phage and other foreign DNA; Cas2 is present in majority of CRISPR/Cas systems along with Cas1; RNAse specific to U-rich regions; Possesses an RRM/ferredoxin fold.	2.736e-27
CP017982.1|AYE61125.1|566625_567456_+|formamidopyrimidine-DNA-glycosylase	gnl|CDD|234899	PRK01103, PRK01103, bifunctional DNA-formamidopyrimidine glycosylase/DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase.	3.12672e-154
CP017982.1|AYE61117.1|556430_557333_+|CRISPR-associated-protein	gnl|CDD|274215	TIGR02585, conserved_protein, CRISPR-associated protein Cas7/Cst2/DevR, subtype I-B/TNEAP. CRISPR is a term for Clustered Regularly Interspaced Short Palidromic Repeats. A number of protein families appear only in association with these repeats and are designated Cas (CRISPR associated) proteins. This clade is a member of the DevR family (TIGR01875) and includes the DevR protein of Myxococcus xanthus, a protein whose expression appears to be regulated through a number of means, including both location and autorepression; DevR mutants are incapable of fruiting body development.	3.86559e-58
CP017982.1|AYE61127.1|568057_568525_+|transcriptional-regulator-NrdR	gnl|CDD|234774	PRK00464, nrdR, transcriptional repressor NrdR.	6.49925e-87
CP017982.1|AYE61114.1|552830_553571_+|phosphoribosylamine--glycine-ligase	gnl|CDD|234856	PRK00885, PRK00885, phosphoribosylamine--glycine ligase; Provisional.	6.15348e-102
CP017982.1|AYE61126.1|567452_568055_+|dephospho-CoA-kinase	gnl|CDD|234620	PRK00081, coaE, dephospho-CoA kinase; Reviewed.	7.35362e-84
CP017982.1|AYE61120.1|560620_560938_+|CRISPR-associated-protein-Cas4	gnl|CDD|366863	pfam01930, Cas_Cas4, Domain of unknown function DUF83. This domain has no known function. The domain contains three conserved cysteines at its C-terminus.	2.8642e-34
CP017982.1|AYE61128.1|568527_569859_+|Replicative-DNA-helicase-loader-DnaB	gnl|CDD|226138	COG3611, DnaB, Replication initiation/membrane attachment protein [DNA replication, recombination, and repair].	6.34537e-34
CP017982.1|AYE61122.1|561120_561996_+|CRISPR-associated-protein-Cas1	gnl|CDD|187853	cd09722, Cas1_I-B, CRISPR/Cas system-associated protein Cas1. CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) and associated Cas proteins comprise a system for heritable host defense by prokaryotic cells against phage and other foreign DNA; Cas1 is the most universal CRISPR system protein thought to be involved in spacer integration; Cas1 is metal-dependent deoxyribonuclease, also binds RNA; Shown to possess a unique fold consisting of a N-terminal beta-strand domain and a C-terminal alpha-helical domain.	5.36958e-133
CP017982.1|AYE61121.1|560997_561111_+|CRISPR-associated-protein-cas4	gnl|CDD|366863	pfam01930, Cas_Cas4, Domain of unknown function DUF83. This domain has no known function. The domain contains three conserved cysteines at its C-terminus.	3.98255e-10
CP017982.1|AYE61116.1|554654_556412_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|187884	cd09754, Cas8a1_I-A, CRISPR/Cas system-associated protein Cas8a1. CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) and associated Cas proteins comprise a system for heritable host defense by prokaryotic cells against phage and other foreign DNA; Large proteins, some contain Zn-finger domain; signature gene for I-A subtype; also known as CXXC_CXXC family.	1.2194e-18
CP017982.1|AYE61118.1|557319_558033_+|CRISPR-associated-protein-Cas5	gnl|CDD|273860	TIGR01895, conserved_hypothetical_protein, CRISPR-associated protein Cas5, subtype I-B/TNEAP. CRISPR is a term for Clustered Regularly Interspaced Short Palidromic Repeats. A number of protein families appear only in association with these repeats and are designated Cas (CRISPR associated) proteins. This family is represented by TM1800 from Thermotoga maritima. It is related to TIGR01868 (CRISPR-associated protein, CT1976 family).	1.28135e-27
CP017982.1|AYE61130.1|571089_573024_+|theronyl-tRNA-synthetase	gnl|CDD|234752	PRK00413, thrS, threonyl-tRNA synthetase; Reviewed.	0
CP017982.1|AYE61131.1|573291_574116_-|transposase	gnl|CDD|225995	COG3464, COG3464, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	9.34127e-25

Protein sequences

>CP017982.1|AYE61123.1|562115_562397_+|CRISPR-associated-protein-Cas2
MYVILVYDIVMDKQGAKVSRHVFKICKKYLTHVQNSVFEGELTKSQLESLKNELDRWIRQNVDSVIIFKNRNKDWLDKEFMGQDLTDLTSDIF
>CP017982.1|AYE61122.1|561120_561996_+|CRISPR-associated-protein-Cas1
MEDYYLFSSGELERKDNTVRLTRSDGKYKDLKIEVTRDIYLFGEVSTNTKCLNYLAQMKIPVHFFNYYGFYTGSFYPKEQNVSGTLLIQQVQAYTDPKRRLYYAKKFVLGAAKNLLRNLKYYQRRGRNLDDSIKEITSLIRQIDQVHDVEELMGVEGTIHRRYYASWQSVFIPDVDFSKRVRRPPDNMVNTLISFLNGLMYTTCLSEIYVTQLNPTISYLHSPMDRRFSLCLDISEIFKPMIVDRLIFSLINKNMISEEDFNKESNYCYLSEKSKRIIVSEYDKYMKQKVR
>CP017982.1|AYE61121.1|560997_561111_+|CRISPR-associated-protein-cas4
MEKYISEIEQICEQVTPPKPQFKPICKSCAFYEYCFS
>CP017982.1|AYE61120.1|560620_560938_+|CRISPR-associated-protein-Cas4
MRVTGNMVNYFFVCKRKLWLFQHQIGFEQTSERVQLGSLLDRTSYQGHGTHHVMIDNLTNIDMVENWQLIHEVKRSDAIEPAAIWQLKYYIYYLRKKGVNISKDY
>CP017982.1|AYE61119.1|558175_560605_+|CRISPR-associated-helicase-cas3-domain-protein
MNEYLAKSLDQSEGNHCETIVEHTNNLLKQYSLLKQAYPDIFQNFWLSQDRFNDMTKQVDIRSKDDWRLLEIACSYHDLGKMNLRFQKKVKAGQSFCKGEIPHALLSITMLPIDELQKHYTKDRIIALIFAIKWHHERNFSEVDEKHYEDEIEALKKEFASFDYSKSSFPIPPQEPAKVDSKYLTGNLSHRLSPNYEPKIYDEFVILKGLLNRIDYAASGHYEIESKSRVCLSQNILQEWHKKNPVADWNELQKWTYDHRNESIVVVGQTGLGKTESALRWLDNSKSFFVLPLKSAINSIYDRISRIGFQNKSHENLALLHSDMMAKALSEKFDDEDNFEEFVNEERSWSKQLSVATLDQIFNFVYHYKNYEPKLATLAYAKVVIDEIQMYSPDLLGYLIYGLGEIQKFGGKFEIMTATLPPFLIDLLESNGLEFKQAPHPFLDPKVNHRHKVKVLHKQINSDDIINLDRHQKTLVVCNTVKSATELYSELKQKGVLDVHLIHSRFIRKDRNEREKEILEFGQKENHSSGIWIGTQVVEASLDIDFDMLITELSELCGLFQRMGRCYRKRNYEGKEPNVYVFDGGDKLTSGIHESKQEYDDKRYHSVVDYHLFEISKRALAQVDGYLTESDKLKLIDENYTTDKLLDENCQLIDKVNDCIDYLNDLTFLDNPKTKEEVVNTFRNINTIDIIPEQVFLENKDKLEAAAKALNNYIRREDFLDQTEYKKQHQILVKEKIKAREVINNYLVGIPLYIINKVSKQDRWIKDKALNEVGYNILPADFNYDSMTGLSYNDNKNKNAEIDDDDNIF
>CP017982.1|AYE61118.1|557319_558033_+|CRISPR-associated-protein-Cas5
MKVIRVKLHQETANYRVPASHGFRESYPLPPISTVIGMVHYLCDFHEYHPMKVSVQGSYVSTTSDFFTRYEFKNGLKFDPGRHQLNAEGYGISRGIGHVQLLYDVNLILHIKPDDENELEDIYNALKYPREFPNLGRREDLVNFEEVKIVDVEKKDEDLTVNHGAYIPVEMSENIGLENEGIGYKGTHYYLNKDYKLVTIKKGQTQRRWNKVEVIYASGFTVYKSYVDEDNNVVFLV
>CP017982.1|AYE61117.1|556430_557333_+|CRISPR-associated-protein
MTQDKMGLTATIVFQASSANYGESLGNVASLKKLTRGDGQQYSYISRQAIRYDIVQQLGEKETNLEAEGSGDKKVIQFAKDASIKDFPEIDFFGYMKTEKGNNSSIRSAKVRLSNAISQEPYEGDTDFLTNMSLAQRIRKATGDNKIRNSIAQSEIQQSYYVYTLAVDLDQIGVDDNDDTNLNANEKNRRVAKLLDTIQYLYRDIRGRREDLKPLFAIGGVYDIKNPIFENAVKVRNSNIDIESIQSILDDPRVKENTSVGFVDGAFNNSQEIKDKLDAVTVAKFMTDLKKKVADYYEGN
>CP017982.1|AYE61116.1|554654_556412_+|hypothetical-protein
MGETSTVTIDFRINSWLENAGIVGLTRILKANPRYRGSYKEKENTLEVDPKVFDNFSDLYFNFFIKNYGQATRYWRIVSEENFLKSLKENGFKDFDNKKLNELTDWFDNVLKYSVNSASYKKVIKFINSDYDIKAEVKDCNKKIRTLNKNNFLTKSPEEAKEILQELINQLLKAIEYFSTDQARKYFPAKTLSYTVINKAWNGVSFLNPQAKNLDFYDDYQNYFVAPVQKYLQEDHSKDKYICSTCGRPIKRLEYSYGFLNDMGYDLNRKTSNAWNFKNDLYICPVCQFLYSLVPAGFTYNMASQGIFINENSSIRNLQGKNDATFNSMMRDIRSNTQTSPYRAFSAAFKDAEASGQNAALANIQLITYNNDHYNFQIIPIVASKVLIKAVEKKYTVKQTGEVKSYLANLYNAGISNFRGAGYYSILDNVLNCLFNNTNLFSIIQELELLKVGNTAGCYYNTFQIMTVIRMNGWFLNELHKYRRSENPMKVEEDKLTKARGCGMHVRMGYDNENKAKTLAYKMLEAIRANSTDRFMELLLNAYLYLDKTVPKIFIETQSNTEVFKEYAFAFIAGLIGSSNAEQDK
>CP017982.1|AYE61115.1|553881_554637_+|hypothetical-protein
MRFGIPIHLLPKNSEEKEIKINIDYDAYILSLIKTGLSTENPALFKELFGKPTQKNYSTSVFFPNATFTKDNIVLDKNGEMKLYFSTANTNLAINFYNSFVYLDHLDAEKLPFGHSYLADVKKLYTIELPKITKDRVIFKTMSTIVIRNDEGRFISCPNDSTEEGLAEFNDALRRNTFNKLRDNESLASTVKGLKFKPIKMRKTVRKSFGLNIECTKGIFELEGNPTLLNFIQESGLGEKTGTFSGMISLA
>CP017982.1|AYE61114.1|552830_553571_+|phosphoribosylamine--glycine-ligase
MFAGGQTAVVLEECLVGPEYSMFVVVSEDQFTILPMAQDHKRVGDGDKGPNTGGMGSYSPLPQLKKEDRQRMIDEIVKPTMNGLVQGDYHYCGVLYIGLMMTEDGPKVIEYNVRLGDPETQIVLPRVKNDFAELIDAAVNHEKLPEIEENDQSVLGVVVCSKGYPTHPAPNVKIGKLPHGTNTYIDYANVKGNLDNLIGDGGRLFMVISEADNLVQAQDNVYSYLSKLDLPDCFYRHDIGNRALRY
>CP017982.1|AYE61124.1|563953_566617_+|DNA-polymerase-I
MADEKLLLIDGNSVAFRAFYALYRQLESFKSPDGLHTNAIYAFKNMLDVLLKDVDPTHVLVAFDAGKVTFRTKMYGEYKGGRAKTPEELLEQMPYIQEMLHDLGIKTYELKNYEADDIIGTFAAKGEKAGFTTTIVTGDRDLTQLASDKTTVEVTKSGVSQLEAYTPEHMKEVNGVTPSEFIDMKALMGDNSDNYPGVEGIGPKTASNLIQEYGSVENLYDHIDEMKKSKRKERLIRDKDKAFLAKKLATIDRDSPVTIDIDDVKREPVDYEKLRQFYEKMNFRKFLAELNASGAGQDGAEVEKVEYTVLNDDNVKDVKATEKDTVEFYLEMLGANYHLADFVGFSLKINDKIYVSRDVDLFEEDNIKHILEDEKIKKNVFDLKRSMVGAHRLGIHTHGLDYDMLLASYLVNNENNSNDLGEIAHLYGDYSVKTDLEVYGKGKSEHIPDDDDELFNHLASKVNAIESLKKTLLEKLKDHEQDALFDTIEIPTARVLARMEMNGMKVEASTLIQLQNEFAVKLKKLEDKIYGQAGEKFNLNSPKQLGHILFEKLGLSVIKKTKTGYSTSVEVLDQLKTQSPIVSKILDYRQIAKIQSTYVKGLLDVIQPDGRVHTRYLQTLTATGRLSSVDPNLQNIPTRTEEGKQIRKAFVPSEPDGYIFSCDYSQVELRVLAHVSGDQNMQEAFKTGYDIHSHTAMKIFHLESPDEVTPLMRRHAKAVNFGIVYGISDYGLSKNLGISRKRAQEFIDNYFEQYPQIEDYMDKAVQEAREKGYAETIMHRRRYLPDIHAKKYTVRAFAERTAINSPIQGSAADIIKIAMINMQKKLDELHLKTKMVVQVHDELIFDVPKDELETIKKIVPEVMQSAVKLDVPLIADSGWGHNWYDAK
>CP017982.1|AYE61125.1|566625_567456_+|formamidopyrimidine-DNA-glycosylase
MPEMPEVETVRRTLIPLIKGKTIEKVILWYPKIVATDHEKFLSELPGKKIIDIDRYAKYLLIRLSDNLTIVSHLRMEGKYHLTTSDAHKDKHDHVEFIFTDGTALRYNDVRKFGRMQLILTGTERQTTGIGKLGYEPNSSEFTSEYLVNGLKRKKKNIKNTLLDQSVVAGLGNIYVDEVLWRTKIHPLSQANKIPAEKVMELHDQINQIITEAIKLQGTTVHSFLNANGQVGGFQSKLQVYGHVGEPCPVCGTKFEKIKVNGRGTTFCPHCQVIYK
>CP017982.1|AYE61126.1|567452_568055_+|dephospho-CoA-kinase
MSYVLALTGGIATGKSTADDFFRKKNIPIIDCDQIARELMEPGNASWQAIKDHFGMEYLNSDQTINRKKLGQLVFSNKQALSELNQVTHPLIFDKTVAKIKEYRDFALVILDAPVYFEAGLDKKHVANGVLVITLPEQLQIERLKKRNNLTDQEAINRINSQMPLVEKEKMADFVVANTGTIKELENKLKQILIKIREEE
>CP017982.1|AYE61127.1|568057_568525_+|transcriptional-regulator-NrdR
MECPNCHQNASRVIDSRPSDENRAIRRRRECENCGFRFTTFERIETAPLLVIKNDGTREPFNRKKILHGVMAAGQKRPISSDQFEQLVDHVENKVRKQGISEISSKKIGQYVMDELADLDDVAYIRFASIYREFKDMSSFMKTMEDMMAKKGKGN
>CP017982.1|AYE61128.1|568527_569859_+|Replicative-DNA-helicase-loader-DnaB
MFETADPKHLYYVANRVRLFPEDEKVLIKLYQPLVGAVAVALYQTLIQNYDPYGIISDSKGIYSLQEQLDCSLKQLFNSLHKLEAVGLVQTFLSDNVFNNVLVFKLLQVPAADKFFATPLLASLLKEKVGVPTFHDLSHAFAQEAKLKEKPIKNAKDVSANFFDVFRLPGDEAITPSSDVVQAAQENKVHEVETAKVNDHDSIDWDFIKQEYSRYQIPASEIDLNKEQIRGLIQTYGLSEKEFVDESLPCLHGSYSLNMRDISNTLAENYRRTNTRENVQAQLNEGRKKALATIKDMDDNDKKLLKAANESSPAEFLYKLKTQKGGITSANEKQIINNLHTQYGLPEDLINILTYTCLTYDTVVSSNLAYKIANDWLQHGVATAVQALQYVKKRRNSFGKKRPVRTYQKRVEKGTDWSKKKADRDAGISTEQLKNLFKDLNNK
>CP017982.1|AYE61129.1|569872_570799_+|primosomal-protein-DnaI
MEVGEKMEPIDKVIKKIVKERNLGDEQSLISQALHDPDVQAFLTANANKIDQKMVQNSMSNLYEYYSQKHTANKVMAGYAPQLFLNGKVIDIRYVPTKAKLAQDRKQAAERRLQLIDVPTRLHDVSLSEIDVNDDRKQVLTLIYDFLRKYKQDPHVQGLYLSGDYGVGKTYILAGLANYVVTNMNKNVVFLHVPTFIAGLASHFDDNSLQSEIRRLSECDLLILDDIGAESLSQWSRDDVLGVILQARMDNVLPTFFSSNLDMEALESHFEETRNATDPVKARRLMQRVRFLAKEVVVSGPDRRNSLH
>CP017982.1|AYE61130.1|571089_573024_+|theronyl-tRNA-synthetase
MSFSITLPDGSKKDFEESLTIADLAQNIATSLGKAAVAGKVNGELKPLDYKLDSDSEVAIITNKDEEGLDVLRATAAFVFEAVAKCEYPELRLGEHVADEGGFYVDTDKDDQIKVGELPKLEKAMQKVIKNGEKIEHVQIAKSELEELYKNDKFKSELLAKVEGDTVDAYKLGDFVDFGFDALLPNTGKIKQFKLLSVAGAYWLGKSSNPMLQRIFGTAFFKEADLKADLKRRQEIKERDHRTIGRDLDLFFVDPKVGAGLPYWMPKGATIRRAVERYIIDREVADGYQHVYTPVLMNLDAYKTSGHWAHYRDDMFPPMDMGDGEMLELRPMNCPSHIQIFKHHIRSYRDLPLRVAELGMMHRYEKSGALSGLQRVREMTLNDGHTFVALDQVQTEFAKILKLIMEVYKDFDITDYYFRLSYRDPKNTDKYFANDEMWEKSQKMLKGAMDDLGLDYVEAEGEAAFYGPKLDIQTKTALGNDETMSTIQLDFMLPDRFGLTYVGKDGEEHRPVMIHRGIVGTMERFIAYLTEIYKGAFPTWLAPVQAEIIPVNNEAHGEYAEKVRAELAKRGFRVEVDDRNEKMGYKIRESQTQKVPYTLVLGDEEMKSGKVNLRRYGTDEEISKSLDDFINEIDADVKSYSREN
>CP017982.1|AYE61131.1|573291_574116_-|transposase
MHNGHLITNIRYLTANASHPVTIRLAKQRVRCRDCSRWSMAQSELASKYCSISNASKLKILSASTEDRSMTSIASENNVSVNTVQRVLCSCSHRFLDSYEYLPAHLAFDEFKGVDRQLHFICLNGDNHQVVQILRTRYKKTLLKYFGRFSPQARANVRTVTMDLNFYYQDIVRACFPNAQIVIDRFHMIHMLTRSFNSLRVRTMKTFDKKSREYQLLKSPWKLYLKKYDELEKIHPRYNWHYKDCLTQVQVVMEGIGANTTLENSYNLMQSFNA
>CP017982.1|AYE61132.1|574155_574278_-|transposase
MSSLNNCIKFALDIKDKNIVFKSFFYKMVQMKKHKIYEAE
>CP017982.1|AYE61133.1|574898_575255_+|translational-initiation-factor-IF3
MDYGKYRFEQQKKLKESRKKSNTVSVKEIRLSPTIEGNDFETKLKHVRKFISKEGAKVRVSIRFRGRAITHKELGQQVLEKMAEATSDIANVISKPKMEGRSMFLMLAPKSDKDKKKK

Crispr_ID: CP017982_2

• CRISPR_ID: CP017982_2
• CRISPR_location: 679887-681012
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: I-B,III-A,III-B
• Spacer_info: 18 spacers

Consensus repeat of CP017982_2

Consensus_repeat	Method
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	PILER-CR
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CRISPRCasFinder
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CRT

spacers of CP017982_2

>2.1|679915|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
TCCAACTAAGTTCTTACAAGAAAGCTTTGCTAC
>2.2|679976|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
TAAAAATGGAGAACGAGAAGCAGATTTCATCAG
>2.3|680037|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
CGGCAAAAATAAAGAAATGGCTGCATTAAAGGA
>2.4|680098|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
CACGTGCCCTATTTCATGAGCAAATAGGAAAGG
>2.5|680159|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
CAGCAGGCTAAGTTAAAAGAGCAAGCGTCTAGA
>2.6|680220|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
CATTTTTTTAATTACTGATTTAACCATTTTTTA
>2.7|680281|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
TAAAACAATATGAATCCGATCAATTTGGAGAGG
>2.8|680342|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
CCACACTCAAGCATTTTTCAAAAAGCACAATGC
>2.9|680403|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
CAAAAATGTTAGAACAAGAATATTTTACCAAAG
>2.10|680464|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
TCCGTGTTAATGTTTACATATGAAAGCAAAAAA
>2.11|680525|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
TTCTTGAGCTACGATTTTGCTAAAACTGATTGA
>2.12|680586|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
CAAACATTTCCGCATTTTTTGGCAACATCTTAA
>2.13|680647|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
TTCTTGAGCTACGATTTTGCTAAAACTGATTGA
>2.14|680708|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
CCAATACACGCAATCTTTTATGGAACTCCAGGC
>2.15|680769|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
TTGGAGAAACCATTCAACAAATAAGACAGTTAG
>2.16|680830|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
TAATTCACAAGTACGGCTGAAAGTTGGCATGAC
>2.17|680891|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
CAACAAAGCTGTTATGGCGATTATGGACATGGA
>2.18|680952|33|CP017982|CRISPRCasFinder,CRT
CGTTAAGAATGGCAATATTCAAAAAATGTCATT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP017982_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of CP017982_2

>merge|CP017982|2|679887-681012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCTCCAACTAAGTTCTTACAAGAAAGCTTTGCTACGTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCTAAAAATGGAGAACGAGAAGCAGATTTCATCAGGTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCCGGCAAAAATAAAGAAATGGCTGCATTAAAGGAGTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCCACGTGCCCTATTTCATGAGCAAATAGGAAAGGGTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCCAGCAGGCTAAGTTAAAAGAGCAAGCGTCTAGAGTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCCATTTTTTTAATTACTGATTTAACCATTTTTTAGTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCTAAAACAATATGAATCCGATCAATTTGGAGAGGGTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCCCACACTCAAGCATTTTTCAAAAAGCACAATGCGTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCCAAAAATGTTAGAACAAGAATATTTTACCAAAGGTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCTCCGTGTTAATGTTTACATATGAAAGCAAAAAAGTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCTTCTTGAGCTACGATTTTGCTAAAACTGATTGAGTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCCAAACATTTCCGCATTTTTTGGCAACATCTTAAGTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCTTCTTGAGCTACGATTTTGCTAAAACTGATTGAGTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCCCAATACACGCAATCTTTTATGGAACTCCAGGCGTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCTTGGAGAAACCATTCAACAAATAAGACAGTTAGGTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCTAATTCACAAGTACGGCTGAAAGTTGGCATGACGTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCCAACAAAGCTGTTATGGCGATTATGGACATGGAGTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCCGTTAAGAATGGCAATATTCAAAAAATGTCATTGTATTCTCCACGTATGTGGAGCAACCAA

>CP017982|2|2|679887-680951|PILER-CR
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	TCCAACTAAGTTCTTACAAGAAAGCTTTGCTAC
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	TAAAAATGGAGAACGAGAAGCAGATTTCATCAG
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CGGCAAAAATAAAGAAATGGCTGCATTAAAGGA
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CACGTGCCCTATTTCATGAGCAAATAGGAAAGG
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CAGCAGGCTAAGTTAAAAGAGCAAGCGTCTAGA
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CATTTTTTTAATTACTGATTTAACCATTTTTTA
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	TAAAACAATATGAATCCGATCAATTTGGAGAGG
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CCACACTCAAGCATTTTTCAAAAAGCACAATGC
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CAAAAATGTTAGAACAAGAATATTTTACCAAAG
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	TCCGTGTTAATGTTTACATATGAAAGCAAAAAA
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	TTCTTGAGCTACGATTTTGCTAAAACTGATTGA
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CAAACATTTCCGCATTTTTTGGCAACATCTTAA
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	TTCTTGAGCTACGATTTTGCTAAAACTGATTGA
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CCAATACACGCAATCTTTTATGGAACTCCAGGC
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	TTGGAGAAACCATTCAACAAATAAGACAGTTAG
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	TAATTCACAAGTACGGCTGAAAGTTGGCATGAC
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CAACAAAGCTGTTATGGCGATTATGGACATGGA
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC

>CP017982|2|2|679887-681012|CRISPRCasFinder
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	TCCAACTAAGTTCTTACAAGAAAGCTTTGCTAC
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	TAAAAATGGAGAACGAGAAGCAGATTTCATCAG
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CGGCAAAAATAAAGAAATGGCTGCATTAAAGGA
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CACGTGCCCTATTTCATGAGCAAATAGGAAAGG
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CAGCAGGCTAAGTTAAAAGAGCAAGCGTCTAGA
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CATTTTTTTAATTACTGATTTAACCATTTTTTA
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	TAAAACAATATGAATCCGATCAATTTGGAGAGG
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CCACACTCAAGCATTTTTCAAAAAGCACAATGC
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CAAAAATGTTAGAACAAGAATATTTTACCAAAG
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	TCCGTGTTAATGTTTACATATGAAAGCAAAAAA
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	TTCTTGAGCTACGATTTTGCTAAAACTGATTGA
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CAAACATTTCCGCATTTTTTGGCAACATCTTAA
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	TTCTTGAGCTACGATTTTGCTAAAACTGATTGA
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CCAATACACGCAATCTTTTATGGAACTCCAGGC
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	TTGGAGAAACCATTCAACAAATAAGACAGTTAG
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	TAATTCACAAGTACGGCTGAAAGTTGGCATGAC
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CAACAAAGCTGTTATGGCGATTATGGACATGGA
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CGTTAAGAATGGCAATATTCAAAAAATGTCATT
GTATTCTCCACGTATGTGGAGCAACCAA

>CP017982|2|2|679887-681012|CRT
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	TCCAACTAAGTTCTTACAAGAAAGCTTTGCTAC
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	TAAAAATGGAGAACGAGAAGCAGATTTCATCAG
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CGGCAAAAATAAAGAAATGGCTGCATTAAAGGA
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CACGTGCCCTATTTCATGAGCAAATAGGAAAGG
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CAGCAGGCTAAGTTAAAAGAGCAAGCGTCTAGA
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CATTTTTTTAATTACTGATTTAACCATTTTTTA
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	TAAAACAATATGAATCCGATCAATTTGGAGAGG
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CCACACTCAAGCATTTTTCAAAAAGCACAATGC
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CAAAAATGTTAGAACAAGAATATTTTACCAAAG
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	TCCGTGTTAATGTTTACATATGAAAGCAAAAAA
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	TTCTTGAGCTACGATTTTGCTAAAACTGATTGA
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CAAACATTTCCGCATTTTTTGGCAACATCTTAA
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	TTCTTGAGCTACGATTTTGCTAAAACTGATTGA
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CCAATACACGCAATCTTTTATGGAACTCCAGGC
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	TTGGAGAAACCATTCAACAAATAAGACAGTTAG
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	TAATTCACAAGTACGGCTGAAAGTTGGCATGAC
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CAACAAAGCTGTTATGGCGATTATGGACATGGA
GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCC	CGTTAAGAATGGCAATATTCAAAAAATGTCATT
GTATTCTCCACGTATGTGGAGCAACCAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
CP017982.1|AYE61231.1|670124_671297_+|putative-transporter-membrane-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|341042
CP017982.1|AYE61250.1|687161_688328_+|phosphoglycerate-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|240651
CP017982.1|AYE61247.1|684225_684930_-|transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
CP017982.1|AYE61242.1|681365_682124_-|L-serine-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|129801
CP017982.1|AYE61234.1|672510_673296_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP017982.1|AYE61249.1|686073_687174_+|MFS-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|235428
CP017982.1|AYE61243.1|682261_682924_-|L-serine-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|129802
CP017982.1|AYE61237.1|675189_676641_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379084
CP017982.1|AYE61244.1|683025_683331_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP017982.1|AYE61240.1|678553_679180_-|peptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|223862
CP017982.1|AYE61245.1|683444_683741_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP017982.1|AYE61246.1|683882_684242_-|transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
CP017982.1|AYE61233.1|671742_672447_+|oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|381297
CP017982.1|AYE61238.1|676773_677214_+|type-I-restriction-endonuclease-EcoKI-subunit-R	unknown	unknown	gnl|CDD|236912
CP017982.1|AYE61241.1|681034_681361_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225062
CP017982.1|AYE61236.1|674501_675008_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP017982.1|AYE61232.1|671315_671723_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|376823
CP017982.1|AYE61239.1|677621_678545_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|227323
CP017982.1|AYE61235.1|673412_674399_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|372610
CP017982.1|AYE61248.1|685042_685672_-|phosphoglycerate-mutase	unknown	unknown	gnl|CDD|366010

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
CP017982.1|AYE61231.1|670124_671297_+|putative-transporter-membrane-protein	gnl|CDD|341042	cd17489, MFS_YfcJ_like, Escherichia coli YfcJ, YhhS, and similar transporters of the Major Facilitator Superfamily. This subfamily is composed of Escherichia coli membrane proteins, YfcJ and YhhS, Bacillus subtilis uncharacterized MFS-type transporter YwoG, and similar proteins. YfcJ and YhhS are putative arabinose efflux transporters. YhhS has been implicated glyphosate resistance. YfcJ-like arabinose efflux transporters belong to the bacterial MdtG-like and eukaryotic solute carrier 18 (SLC18) family of the Major Facilitator Superfamily (MFS) of transporters. MFS proteins are thought to function through a single substrate binding site, alternating-access mechanism involving a rocker-switch type of movement.	7.4339e-62
CP017982.1|AYE61250.1|687161_688328_+|phosphoglycerate-dehydrogenase	gnl|CDD|240651	cd12174, PGDH_like_3, Putative D-3-Phosphoglycerate Dehydrogenases, NAD-binding and catalytic domains. Phosphoglycerate dehydrogenases (PGDHs) catalyze the initial step in the biosynthesis of L-serine from D-3-phosphoglycerate. PGDHs come in 3 distinct structural forms, with this first group being related to 2-hydroxy acid dehydrogenases, sharing structural similarity to formate and glycerate dehydrogenases of the D-specific 2-hydroxyacid dehydrogenase superfamily, which also include groups such as L-alanine dehydrogenase and S-adenosylhomocysteine hydrolase. Despite often low sequence identity, these proteins typically have a characteristic arrangement of 2 similar subdomains of the alpha/beta Rossmann fold NAD+ binding form. The NAD+ binding domain is inserted within the linear sequence of the mostly N-terminal catalytic domain, which has a similar domain structure to the internal NAD binding domain. Structurally, these domains are connected by extended alpha helices and create a cleft in which NAD is bound, primarily to the C-terminal portion of the 2nd (internal) domain. Some related proteins have similar structural subdomain but with a tandem arrangement of the catalytic and NAD-binding subdomains in the linear sequence. Many, not all, members of this family are dimeric.	2.5658e-149
CP017982.1|AYE61247.1|684225_684930_-|transposase	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	4.27745e-37
CP017982.1|AYE61242.1|681365_682124_-|L-serine-dehydratase	gnl|CDD|129801	TIGR00718, Probable_L-serine_dehydratase_alpha_chain, L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit. This enzyme is also called serine deaminase. L-serine dehydratase converts serine into pyruvate in the gluconeogenesis pathway from serine. This model describes the alpha chain of an iron-sulfur-dependent L-serine dehydratase, found in Bacillus subtilis. A fairly deep split in a UPGMA tree separates members of this family of alpha chains from the homologous region of single chain forms such as found in Escherichia coli. This family of enzymes is not homologous to the pyridoxal phosphate-dependent threonine deaminases and eukaryotic serine deaminases. [Energy metabolism, Amino acids and amines, Energy metabolism, Glycolysis/gluconeogenesis].	1.80181e-92
CP017982.1|AYE61243.1|682261_682924_-|L-serine-dehydratase	gnl|CDD|129802	TIGR00719, Probable_L-serine_dehydratase_beta_chain, L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit. This enzyme is also called serine deaminase. This model describes the beta chain of an iron-sulfur-dependent L-serine dehydratase, as in Bacillus subtilis. A fairly deep split in a UPGMA tree separates members of this family of beta chains from the homologous region of single chain forms such as found in E. coli. This family of enzymes is not homologous to the pyridoxal phosphate-dependent threonine deaminases and eukaryotic serine deaminases. [Energy metabolism, Amino acids and amines, Energy metabolism, Glycolysis/gluconeogenesis].	3.23799e-43
CP017982.1|AYE61237.1|675189_676641_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|379084	pfam13240, zinc_ribbon_2, zinc-ribbon domain. This family consists of a single zinc ribbon domain, ie half of a pair as in family DZR. pfam12773.	9.81377e-06
CP017982.1|AYE61249.1|686073_687174_+|MFS-transporter	gnl|CDD|235428	PRK05355, PRK05355, 3-phosphoserine/phosphohydroxythreonine transaminase.	0
CP017982.1|AYE61240.1|678553_679180_-|peptidase	gnl|CDD|223862	COG0791, Spr, Cell wall-associated hydrolases (invasion-associated proteins) [Cell envelope biogenesis, outer membrane].	1.13548e-11
CP017982.1|AYE61246.1|683882_684242_-|transposase	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	8.60507e-31
CP017982.1|AYE61233.1|671742_672447_+|oxidoreductase	gnl|CDD|381297	cd19071, AKR_AKR1-5-like, AKR1/2/3/4/5 family of aldo-keto reductase (AKR) and similar proteins. Aldo-keto reductases (AKRs) are a superfamily of soluble NAD(P)(H) oxidoreductases whose chief purpose is to reduce aldehydes and ketones to primary and secondary alcohols. The family includes AKR1A/B/C/D/E/G/I, AKR2A/B/C/D/E, AKR3A/B/C/D/E/G, AKR4A/B/C, AKR5A/B/C/D/E/F/G/H, and similar proteins.	7.79004e-15
CP017982.1|AYE61238.1|676773_677214_+|type-I-restriction-endonuclease-EcoKI-subunit-R	gnl|CDD|236912	PRK11448, hsdR, type I restriction enzyme EcoKI subunit R; Provisional.	7.41755e-38
CP017982.1|AYE61241.1|681034_681361_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|225062	COG2151, PaaD, Predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme [General function prediction only].	8.6481e-36
CP017982.1|AYE61232.1|671315_671723_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|376823	pfam02566, OsmC, OsmC-like protein. Osmotically inducible protein C (OsmC) is a stress -induced protein found in E. Coli. This family also contains a organic hydroperoxide detoxification protein that has a novel pattern of oxidative stress regulation.	8.47142e-18
CP017982.1|AYE61239.1|677621_678545_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|227323	COG4990, COG4990, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	3.41311e-29
CP017982.1|AYE61235.1|673412_674399_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|372610	pfam13457, SH3_8, SH3-like domain.	0.000352101
CP017982.1|AYE61248.1|685042_685672_-|phosphoglycerate-mutase	gnl|CDD|366010	pfam00300, His_Phos_1, Histidine phosphatase superfamily (branch 1). The histidine phosphatase superfamily is so named because catalysis centers on a conserved His residue that is transiently phosphorylated during the catalytic cycle. Other conserved residues contribute to a 'phosphate pocket' and interact with the phospho group of substrate before, during and after its transfer to the His residue. Structure and sequence analyses show that different families contribute different additional residues to the 'phosphate pocket' and, more surprisingly, differ in the position, in sequence and in three dimensions, of a catalytically essential acidic residue. The superfamily may be divided into two main branches. The larger branch 1 contains a wide variety of catalytic functions, the best known being fructose 2,6-bisphosphatase (found in a bifunctional protein with 2-phosphofructokinase) and cofactor-dependent phosphoglycerate mutase. The latter is an unusual example of a mutase activity in the superfamily: the vast majority of members appear to be phosphatases. The bacterial regulatory protein phosphatase SixA is also in branch 1 and has a minimal, and possible ancestral-like structure, lacking the large domain insertions that contribute to binding of small molecules in branch 1 members.	8.19144e-50

Protein sequences

>CP017982.1|AYE61240.1|678553_679180_-|peptidase
MHRMGTWYGKNYYNQATYNAVKNFQSRHGLKATGNVNLKTWQKMGFSKKSWYGIDSYVAPLKAKAWQGRKAHVEAMINQAYKYMGKPWLAGCSSSPAYGVDCSGLVMQGLYAGGISPVPTSSIGHAHPGNEWNSRNLGADKHLKRVAYSQRRRGDLVFYYQPGTHTIWHVAIYLGNNRVIESWPPCVMVAPISNNQRNVIAGIKRPFI
>CP017982.1|AYE61239.1|677621_678545_-|hypothetical-protein
MKGKILFISIISCFLLTGFSTTVKADETDQSQTSQINKSDSTQDSGNKQNQTNQNSNNTPVKNNNGWKTVNGNTYYLKNGSATKGLKKINGYWYLFNKNDIMLKDVRKIPHTKHYSYFDQLGRRRMKNTSTKKAYYWINKKGQITGIKNNAKVICQRPQMPTGCEITAVTMMLNFAGKKVSKYQAAKVMPRSSNPNKGFVGSPYKKFPLGFWVAPGGVKPVVQHYLGKSKIMTNCSINAIKQKLLRSHLVVVWVGMFDGISNHAITLTGYHGNTLYYNDPWTGTKRKISVTKFKIHWALDGHRAISY
>CP017982.1|AYE61238.1|676773_677214_+|type-I-restriction-endonuclease-EcoKI-subunit-R
MSNFNTSDKNYHEYAKLASSAESLIFSDPRSSLTVFGTFGEQLTREIMHLDGLGDWELNQKARIDKMRYSGNGYPDAVLLALDEIRRKRNGATHDNQFIATKGEALKIDQKAYLVWKWFLEIFSLNDVPEYVTPVDQRNILKSRFM
>CP017982.1|AYE61237.1|675189_676641_+|hypothetical-protein
MKKICPNCGKEVDPEEKYCPFCHFNLVNNDETMVTVNIGLLGLKNNESTKKDEEKIQSEKKESDAKPEKKKQPKKAVSKSNEDKKQKIEKNEIIPSPLPPKKKPTPLPKSKKKKFHFKWSILIEIVVAVIAILVMVGMNYYSCKAQIGRIETGLKNGEVNNVVTNGKVPLTAKNLTPLKEYYKNNPAAYKKLKKSLMGKNNLPIKLIKQGHYFLFFPRYVVQLPTYELNVVNDYHHSTVTVNGMKFVKKQKVFPGAYNIEAKSSYLGQTAKFKKTVNVWKDQTAEVNLNAKTIKVQGMPNGKLYLNNHNIGKLDKKGNLVLEDVPLTKPFSMYVAKKQKGKLVKTKQVRDVPAVIKGSKNVAVLKLDWQQSKNVGKLLEDNFNYPNSKDFIGGSKNKSYVELRTLVSNWRNSPNITKYHANITVNNKSLNDIRYSVEFNFAFNKNGKRYKRVQVMKFRSASARSTSKGLKIKTIGGGRIVSSK
>CP017982.1|AYE61236.1|674501_675008_-|hypothetical-protein
MKNYTIDHDIYLMNHKNGDVLKVTVNKEDSVKILQLYRQDGLGNYYIDKNSLLKKQDNLTTKEDIVKASKKIGGHNTHHIDKWHHQVVPIYNAQHQITGFKPKLVLEHRTRIQNAKRYLRHLDHHHAIYLSTTSRNTLLKPINHLKDAIYADRNKEMVLAHKIHKLSR
>CP017982.1|AYE61235.1|673412_674399_+|hypothetical-protein
MKKLKIFIIISLMMLFWVWPKSVSAKSFSSFQTKMINGNSNYRIYQGMTHRGPVGSVGLARTFKYGNFQASAVKKVGKSKYYFVWIDGHKAGWLNQRVFLRNKISVVKKISLVNNPYYSFPTKDAINLATDSTGTVVNPNKVKASQDEVLSNSASEHKITFTYGKAHAHTVVEVKGDAQEGVGVADKPEQTGKSASSWFKHYRTSGNWGKGASYAPETKPHVLKSGSFKLKTYFYQPATLSQGRSQTGMVGPVPEGMTISNGSMYATMYKSSHNTRAHIVAYKLKNVPNRYIMQKLPWLPWGQFTRLASKLKISPYIKLGHGQAFSAS
>CP017982.1|AYE61234.1|672510_673296_+|hypothetical-protein
MKTKKLFTSIAAAIMLSTSLAGSGAVLSQTAHAANTTQTTTKNSNDKKGTVSVKRRSVTVTINSDKPTLLAVGEDGKSVKPVASTYTKGQTIQVYYSVAFTATAQGSEGQQLPAYYVENKAIDGKESMIFIPAGVVTAATAVPSQADWVKQAESDAKAIQEAYQNRDLKYIVVTPKSKKGAKIYYAYKKTRKSKKVYFKATKKKIKKGKKYKSSMIVKHGKTRYVYIGKKRYVKLSALKMVSAKYAPVKLSDDLKSLIIEN
>CP017982.1|AYE61233.1|671742_672447_+|oxidoreductase
MALLDEAVVLNDGSLMPKTGIIVKNDDDVTKATKLGYRLLDCAVDDNLKIKDVNPQLYVEVRISKLARGKELHNNLKSIRANLIADQADLCLLNLSDDNECNNLIWQKLEQLKITGWVKTLGIETDKADALEALLKNIKFKPNVLRLKCEDTDLLTIAKNNKLQVEIPVKGDIAALAEIADKYHTSPMELVLCYFNQKGIIPLVEASEMIENPQVNFNIKSADMATISQLFVKD
>CP017982.1|AYE61232.1|671315_671723_+|hypothetical-protein
MGDYLVKTKLENTEWQIANQARDHVFICDADKRSKEDAGPNPVEYLCGSINSCITMSAGMITKVHRLDVKNFHVENYAKTENLGHGKSVVTGMKIKVSFDSSMNREEKEKFIAHALHVSTVYQTLKEAIKIYVEF
>CP017982.1|AYE61231.1|670124_671297_+|putative-transporter-membrane-protein
MTEKESIYTKDVILVMAASFFFMFSTMFVNPLINGYAKNLGASRVFAGIIVGIMSIAAMFLRSVAGNLTDKFSKYRLSFIGGILILIGVVGYVLTPSSGWLLLFRLINGTGYVLCTVCMTTWLAFLVPREHVGEAMGFYGLMNALAMALAPALSINIYQKIGYRESLIAAAIAALLMVISIQFVGNHAEPIVKKNQPEKHFKIIQMNVLPVAILTTLFAIPYFITQADIVTYVEQKHLSVAVGSYFLIYAVVLLIIRIGLKRYFDTVRFGVWFWISLISTAAYICLLAIMQNNGEMALAAAGMAMGYGIIYSVLQSTALLLAPVEEQGLASSTFYLGLDIAMSFGPMISGVIDSILPVKWFYVVDLVLLPVMLLVYFVWRKRLNGAIDHH
>CP017982.1|AYE61241.1|681034_681361_-|hypothetical-protein
MRDGETIKNDIINQLATVIDPELNFDVVNLGLIYEIDLDKDGICLINMTLTTPTCPLTGYLIDSITQAVKKVPEVKNVDVEFVWYPVWTPDRMSDAAKKYFNIDEKQD
>CP017982.1|AYE61242.1|681365_682124_-|L-serine-dehydratase
MKHNLATMRAAVERGKSGAGIFSKTGLTGSEAVKIKKYRQTHHTLSGDTIMAAVQNAVATNEVNASMDVICATPTAGSSGTLPGVLFLLEKRMDLSEEQMIRSLFTAGGFGLVIANNAEIAGATGGCQAEVGSASAMGAAAAVEAAGGSAEQSAQAMSIAMSNLLGLVCDPIAGWVEVPCVKRNAIGAGNALISADIALAGCTSVIPADECIDAMKKVGHQMPASLRETGIGGLAGTPTGQAIKAKIFGKDA
>CP017982.1|AYE61243.1|682261_682924_-|L-serine-dehydratase
MTNRYKSVFDIIGPVMVGPSSSHTAGAVAIGRAGNKLFGGVPRKVTVHYYGSFAQTHRGHGTDYAIAAGILGFDTDDLRVPNAPEIAKKRGIDIRFVEEDGPSPIDHPNTAILDMSSGTKKAQISGCSIGGGSIEIRHLVIHDTEITPTGSLPIIIWLDYEKEILNEQNLTSLLQEKAPFSKKRIFHTKDCNIYEYDAENYLKPALVKELKEKFENIICL
>CP017982.1|AYE61244.1|683025_683331_+|hypothetical-protein
MNKEKDELKRNLEKVAEEQGGQQAVSYQDLFNPRFMQKNTHFTTIDVFVRELGAKSFPDIEQLGQKVVDNFVKKETNFNSWEEMQQRAVSEYISEYMSSLF
>CP017982.1|AYE61245.1|683444_683741_+|hypothetical-protein
MTDKEILQKIEQKVKDSENWSVYHHLTDNLGSPAIMLREANTNADRLGVNLDVFKGYAYLFLDNGTPAEPGKPFSVQTLSSLNALTELLDIVKPYIKK
>CP017982.1|AYE61246.1|683882_684242_-|transposase
MSQAFKELQRQYSEHWNDIFKTITTDNGSEFADLSNLEKASNTLVYYAHPYTSCDKGTVERHNGLIRRFIPKGEAIANYSLQDIINIETWCNSLPRKILAYHTPDEIFERELDQIYQAA
>CP017982.1|AYE61247.1|684225_684930_-|transposase
MDSLHSTMNQHIKGKHLSFEERVIIQLSLKDGYSLRAIARELNCSPSTISYEVKRGTVDLYHGKVKRYKATQGHDAYQAHRKNCGRKSDFLRKTQFMRYVHKHFFKDGWSLDVCSNRATAVGAFSSRDVVCTKTLYNYVDQGLLDIHNYDLPEKLKRNTKLHRIRKNKKKLGRSIEERPKEINKRNEFGHWECDLVLGHKSKDDEVLLALSERMSREFLILRIPDKTSVSVAGL
>CP017982.1|AYE61248.1|685042_685672_-|phosphoglycerate-mutase
MTDFYFVRHGQTTANVAGLKQGTINTKITFLTETGKKQAQTVRKHFDISFADRIVASPLQRTKDTADILNQSAHLPITYDKLLLEISYGNWDGSKNADLEAKYPQVFDHVLNDVLPSYAPLAHGETFTHVIDRADHFMSVTAQRYPDEKIIVVTHGFTIKAAVLAALGRPDNPMVVEEPDNLSITRITRKASSDNYYLRYYNRVVDSKF
>CP017982.1|AYE61249.1|686073_687174_+|MFS-transporter
MTVYNFAAGPATLPDPVIKQIQEELPSLQGSGMSILEISHRSQMFDKIIDTAKQDIKDLMHVPDNYHILFFQGGGTGQFAAVPMNLATKHKRIALLDSGHWATRAGDEAANLGVTVDVLDSTKDKHYQELPHMPHAISASDYDYLHITTNNTIEGTAYHTLPEHGDVTLVGDLSSNFMAEEYQVSDFGLIFGGVQKNLGPAGVTVVIVRDDLVNHVDHIPSILNYELFVKKNSMFNTPPVFAIYATGLVLKWLKQQGGIAGIEALNKKKSALLYDFLDQSTLFHNDIKKTDRSLTNIPFKTNDPVLDKQVIAEADQAGLKNLKGHRSVGGLRASLYNAMPLAGVQALVDFLYNFEKQHYGEKICIK
>CP017982.1|AYE61250.1|687161_688328_+|phosphoglycerate-dehydrogenase
MYQVKTYNAIDQAGLDQFTDNYQINQTDNADAYLIRSVDLHDETFPESLKIIVRAGAGFNNIPLDRATQNGIAVFNTPGSNANAVKELIISLLVASSRNLFDAADYSAHNSGADISLRTEHDKTKFKGTELTGKTLAVIGVGHVGSLVANAASALGMNVIGYAPYLSSDAAWHISTSITRARTLDEALKCADYVTVHVPKNEETTGLIGKEQLAVMKDGVHLFNYSRGGIVDNQAAVEALDAHHLQTYMTDFGEDILLNRDDVVVTPHIGGSTDEAEVNGATQGAHTIMTYLETGNIQNSVNLPNLQVPFQAPYRITLIHKNIPNMVGQIATALANAGINIKSMSNAARKDIAYTMIDLDNLKNEEDNKLIEKLGKIDAVFRVRVLKH

Crispr_ID: CP017982_3

• CRISPR_ID: CP017982_3
• CRISPR_location: 1626547-1626737
• CRISPR_type: TypeV
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 2 spacers
• Cas_protein_info: cas14j,cas14k

Consensus repeat of CP017982_3

Consensus_repeat	Method
ATGTGGGATTTGAACCCACGCACGCCAGAACC	PILER-CR

spacers of CP017982_3

>3.1|1626579|47|CP017982|PILER-CR
ACAAACCAGTGTGTTAACCCCTTCACCAATTCCGCCATAAACGGTCC
>3.2|1626658|60|CP017982|PILER-CR
ATCTCCTCCGTGACAGGGAGGCGAGATAAACCACTGCTCCAATGGACCAATCAGAGGAGG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP017982_3

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of CP017982_3

>merge|CP017982|3|1626547-1626737|PILER-CR
ATGTGGGATTCGAACCCACGCATGCTGGATCCACAAACCAGTGTGTTAACCCCTTCACCAATTCCGCCATAAACGGTCCATGTGGGATTTGAACCCACGATCTCCTCCGTGACAGGGAGGCGAGATAAACCACTGCTCCAATGGACCAATCAGAGGAGGATGTGGGATTTGAACTCACGCGCGGCAGAACC

>CP017982|3|3|1626547-1626737|PILER-CR
ATGTGGGATTCGAACCCACGCATGCTGGATCC	ACAAACCAGTGTGTTAACCCCTTCACCAATTCCGCCATAAACGGTCC
ATGTGGGATTTGAACCCACGATCTCCTCCGTG	ACAGGGAGGCGAGATAAACCACTGCTCCAATGGACCAATCAGAGGAGGATGTGGGATTTG
AACTCACGCGCGGCAGAACC

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
CP017982.1|AYE62182.1|1621149_1621650_+|putative-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|273772
CP017982.1|AYE62188.1|1627126_1628452_-|transposase	cas14k	-	gnl|CDD|223747
CP017982.1|AYE62181.1|1619679_1621062_-|DNA-integrase	unknown	unknown	gnl|CDD|222853
CP017982.1|AYE62197.1|1637864_1638206_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP017982.1|AYE62193.1|1633344_1633494_-|transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
CP017982.1|AYE62192.1|1631917_1633249_-|IS204/IS1001/IS1096/IS1165-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|376574
CP017982.1|AYE62179.1|1617740_1618271_+|bifunctional-pyrimidine-regulatory-protein-PyrR-uracil-phosphoribosyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|235365
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CP017982.1|AYE62189.1|1628481_1629090_-|transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|239738
CP017982.1|AYE62194.1|1633603_1634257_-|transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
CP017982.1|AYE62196.1|1636451_1637828_+|Na+-H+-exchanging-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|188097
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CP017982.1|AYE62183.1|1621714_1622185_-|acetyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|366181
CP017982.1|AYE62186.1|1624252_1625482_-|transposase	cas14j	-	gnl|CDD|223747
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HMMScan for Signature genes

Protein	Cas_name	Cas_description	E-value	Identity	Coverage
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CP017982.1|AYE62186.1|1624252_1625482_-|transposase	cas14j	-	4e-79	261.5	14.1

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
CP017982.1|AYE62182.1|1621149_1621650_+|putative-transcriptional-regulator	gnl|CDD|273772	TIGR01716, HTH-type_transcriptional_regulator_rgg, transcriptional activator, Rgg/GadR/MutR family, C-terminal domain. This model describes the whole, except for a 60 residue N-terminal helix-turn-helix DNA-binding domain (pfam01381) of the family of proteins related to the transcriptional regulator Rgg, also called RopB. Rgg is required for secretion of several proteins, including a cysteine proteinase associated with virulence. GadR is a positive regulator of a glutamate-dependent acid resistance mechanism. MutR is a transcriptional activator for mutacin biosynthesis genes in Streptococcus mutans. This family appears restricted to the low-GC Gram-positive bacteria, including at least eight members in Lactococcus lactis. [Regulatory functions, DNA interactions].	0.000111773
CP017982.1|AYE62188.1|1627126_1628452_-|transposase	gnl|CDD|223747	COG0675, COG0675, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.58315e-19
CP017982.1|AYE62181.1|1619679_1621062_-|DNA-integrase	gnl|CDD|222853	PHA02517, PHA02517, putative transposase OrfB; Reviewed.	7.28829e-50
CP017982.1|AYE62193.1|1633344_1633494_-|transposase	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	1.09632e-05
CP017982.1|AYE62192.1|1631917_1633249_-|IS204/IS1001/IS1096/IS1165-family-transposase	gnl|CDD|376574	pfam01610, DDE_Tnp_ISL3, Transposase. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. Contains transposases for IS204, IS1001, IS1096 and IS1165.	8.00182e-52
CP017982.1|AYE62179.1|1617740_1618271_+|bifunctional-pyrimidine-regulatory-protein-PyrR-uracil-phosphoribosyltransferase	gnl|CDD|235365	PRK05205, PRK05205, bifunctional pyr operon transcriptional regulator/uracil phosphoribosyltransferase PyrR.	5.76938e-99
CP017982.1|AYE62178.1|1615980_1617450_-|multidrug-ABC-transporter	gnl|CDD|341045	cd17502, MFS_Azr1_MDR_like, Saccharomyces cerevisiae Azole resistance protein 1 (Azr1p), and similar multidrug resistance (MDR) transporters of the Major Facilitator Superfamily. This subfamily is composed of multidrug resistance (MDR) transporters including various Saccharomyces cerevisiae proteins such as azole resistance protein 1 (Azr1p), vacuolar basic amino acid transporter 1 (Vba1p), vacuolar basic amino acid transporter 5 (Vba5p), and Sge1p (also known as Nor1p, 10-N-nonyl acridine orange resistance protein, and crystal violet resistance protein). MDR transporters are drug/H+ antiporters (DHA) that mediate the efflux of a variety of drugs and toxic compounds, and confer resistance to these compounds. This subfamily belongs to the Methylenomycin A resistance protein (also called MMR peptide) and similar multidrug resistance (MDR) transporters (MMR-like MDR transporter) family of the Major Facilitator Superfamily (MFS) of transporters. MFS proteins are thought to function through a single substrate binding site, alternating-access mechanism involving a rocker-switch type of movement.	4.51531e-46
CP017982.1|AYE62189.1|1628481_1629090_-|transposase	gnl|CDD|239738	cd03769, SR_IS607_transposase_like, Serine Recombinase (SR) family, IS607-like transposase subfamily, catalytic domain; members contain a DNA binding domain with homology to MerR/SoxR located N-terminal to the catalytic domain. Serine recombinases catalyze site-specific recombination of DNA molecules by a concerted, four-strand cleavage and rejoining mechanism which involves a transient phosphoserine linkage between DNA and the enzyme. They are functionally versatile and include resolvases, invertases, integrases, and transposases. This subfamily is composed of proteins that catalyze the transposition of insertion sequence (IS) elements such as IS607 from Helicobacter and IS1535 from Mycobacterium, and similar proteins from other bacteria and several archaeal species. IS elements are DNA segments that move to new sites in prokaryotic and eukaryotic genomes causing insertion mutations and gene rearrangements.	5.08784e-48
CP017982.1|AYE62194.1|1633603_1634257_-|transposase	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	1.2643e-40
CP017982.1|AYE62196.1|1636451_1637828_+|Na+-H+-exchanging-protein	gnl|CDD|188097	TIGR00931, Uncharacterized_Na+/H+_antiporter_HI_1107, Na+/H+ antiporter NhaC. A single member of the NhaC family, a protein from Bacillus firmus, has been functionally characterized.It is involved in pH homeostasis and sodium extrusion. Members of the NhaC family are found in both Gram-negative bacteria and Gram-positive bacteria. Intriguingly, archaeal homolog ArcD (just outside boundaries of family) has been identified as an arginine/ornithine antiporter. [Transport and binding proteins, Cations and iron carrying compounds].	1.89592e-108
CP017982.1|AYE62185.1|1622813_1624151_-|myosin-cross-reactive-antigen	gnl|CDD|237575	PRK13977, PRK13977, myosin-cross-reactive antigen; Provisional.	0
CP017982.1|AYE62180.1|1618283_1619612_+|Uracil-permease	gnl|CDD|236744	PRK10720, PRK10720, uracil transporter; Provisional.	3.57768e-143
CP017982.1|AYE62187.1|1625570_1625993_-|permease-of-the-major-facilitator-superfamily-protein	gnl|CDD|129794	TIGR00711, Uncharacterized_MFS-type_transporter_YhcA, drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily. This subfamily of drug efflux proteins, a part of the major faciliator family, is predicted to have 14 potential membrane-spanning regions. Members with known activities include EmrB (multiple drug resistance efflux pump) in E. coli, FarB (antibacterial fatty acid resistance) in Neisseria gonorrhoeae, TcmA (tetracenomycin C resistance) in Streptomyces glaucescens, etc. In most cases, the efflux pump is described as having a second component encoded in the same operon, such as EmrA of E. coli. [Cellular processes, Toxin production and resistance, Transport and binding proteins, Other].	8.81723e-21
CP017982.1|AYE62195.1|1634734_1636087_-|RNA-methyltransferase	gnl|CDD|225174	COG2265, TrmA, SAM-dependent methyltransferases related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase [Translation, ribosomal structure and biogenesis].	7.93893e-157
CP017982.1|AYE62190.1|1629192_1629693_-|acetyltransferase	gnl|CDD|366181	pfam00583, Acetyltransf_1, Acetyltransferase (GNAT) family. This family contains proteins with N-acetyltransferase functions such as Elp3-related proteins.	4.86332e-13
CP017982.1|AYE62183.1|1621714_1622185_-|acetyltransferase	gnl|CDD|366181	pfam00583, Acetyltransf_1, Acetyltransferase (GNAT) family. This family contains proteins with N-acetyltransferase functions such as Elp3-related proteins.	1.66722e-07
CP017982.1|AYE62186.1|1624252_1625482_-|transposase	gnl|CDD|223747	COG0675, COG0675, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	3.34043e-45
CP017982.1|AYE62191.1|1631622_1631823_+|cold-shock-protein	gnl|CDD|224197	COG1278, CspC, Cold shock proteins [Transcription].	1.28077e-33

Protein sequences

>CP017982.1|AYE62187.1|1625570_1625993_-|permease-of-the-major-facilitator-superfamily-protein
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>CP017982.1|AYE62186.1|1624252_1625482_-|transposase
MFDIILKRKEGTNVLKGIKLRLYPNRTQQNQLEQMFGNDRFVWNQMLAMMNERYQNNKALPFLGKFKLNYLLKPLKKEYPFLKNSDSSSLQVVNEFLTQSWKNFFQDKTGQIGKPRFHSRKYLKKSYTGKSIIKTAGKRYLKIPKLGYVKTSKTGVLQNTKIKRYTVLLEPTGKYYLSLQVEISEPEKYSLTGKRVGIDVGVADLAILSNGLKYPSFDSSYFEKKAKVWQRKYARRRHLAKLLVLQDRNKRVLCPRSLESFTNWQKAQKSKAKCQAKAANQRRDYLHKLTTHLVKQYDVIAIEDLKTKNLQKNHHLAKSIANASWRMFRQMLEYKCEWYGKKLIAVDPKNTSRICSKCGYNSGAKPLEIREWICSKCQTKHDQDINAAVNILHKGSTKLNGQGLAMVTS
>CP017982.1|AYE62185.1|1622813_1624151_-|myosin-cross-reactive-antigen
MFRSIPSTEHEGESILDEFYRLNRKDPSYAKTRVIINCGEALPTDGQLLLTPKAVKEIVDLCLTPEKDLQNKKINEVFTKEFFQSNFWLYWSIMFACEPWASAMEMRRYLMRFVQHVATLKNLSSLRFTKYNQYESLILPMVKYLKSHGVQFHYDTVVDNIFVNRSNGEKGAKQIILTEKGERKTIDLTENDLVLVTNGSITESTTYGDNFHPAPEEHELGASWQLWKNLAAQDSDFGHPDVFCKDIPKANWRMSATITFKNDDIVPFIEAVNKKNPHSGSIVTSGPTTIKDSNWLLGYSISRQPHFKAQKPNELIVWLYDLFSDTKGNYVEKTMPDCNGIELCEEWLYHMGVPEERIPEMAAAATTIPAHMPYITSYFMPRALGDRPKVVPDHSKNLAFIGNFAETPRDTVFTTEYSVRTAMEAVYTLLDIDRGVPEVFASAFA
>CP017982.1|AYE62184.1|1622416_1622641_+|hypothetical-protein
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>CP017982.1|AYE62183.1|1621714_1622185_-|acetyltransferase
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>CP017982.1|AYE62182.1|1621149_1621650_+|putative-transcriptional-regulator
MFYQDLSSDNIFTKYDKIRLTNILTNISEWNYKNIFYFGNTLGLLDPENINRLCSSLITYSINEKLYHQRWYDEVLAAILNSISILVRRNYLLAEKLLDRFDQMKVSDGYACEKMHAQLYRAFITYIKTKDNRRIYEIINACKALNLKELEDGFITGFKQIKQIYG
>CP017982.1|AYE62181.1|1619679_1621062_-|DNA-integrase
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>CP017982.1|AYE62180.1|1618283_1619612_+|Uracil-permease
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>CP017982.1|AYE62179.1|1617740_1618271_+|bifunctional-pyrimidine-regulatory-protein-PyrR-uracil-phosphoribosyltransferase
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MGE targeting detection<

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CP017982_2	2.9|680403|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	680403-680435	33	MN241318	Enterococcus phage PEf771, complete genome	119469-119501	5	0.848
CP017982_2	2.2|679976|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	679976-680008	33	MH341451	Listeria phage PSU-VKH-LP019, complete genome	35928-35960	6	0.818
CP017982_2	2.2|679976|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	679976-680008	33	MF417900	Uncultured Caudovirales phage clone 8AX_1, partial genome	10348-10380	7	0.788
CP017982_2	2.2|679976|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	679976-680008	33	CP016969	Staphylococcus epidermidis strain DAR1907 plasmid unnamed1, complete sequence	15654-15686	7	0.788
CP017982_2	2.2|679976|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	679976-680008	33	MF417899	Uncultured Caudovirales phage clone 7S_8, partial genome	31593-31625	7	0.788
CP017982_2	2.2|679976|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	679976-680008	33	NZ_CP015608	Bacillus safensis strain U14-5 plasmid unnamed1, complete sequence	10440-10472	7	0.788
CP017982_2	2.7|680281|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	680281-680313	33	MT774408	CrAssphage cr130_1, complete genome	53257-53289	7	0.788
CP017982_2	2.9|680403|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	680403-680435	33	MT856905	Enterococcus phage vB_EfaM_A2, complete genome	3262-3294	7	0.788
CP017982_2	2.9|680403|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	680403-680435	33	MH880817	Enterococcus phage EfV12-phi1, complete genome	3481-3513	7	0.788
CP017982_1	1.13|563404|36|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	563404-563439	36	NZ_AP018204	Leptolyngbya boryana NIES-2135 plasmid plasmid1 DNA, complete genome	153827-153862	8	0.778
CP017982_1	1.14|563470|35|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	563470-563504	35	MK448847	Streptococcus phage Javan124, complete genome	17911-17945	8	0.771
CP017982_1	1.14|563470|35|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	563470-563504	35	MK448846	Streptococcus phage Javan122, complete genome	18680-18714	8	0.771
CP017982_1	1.19|563800|34|CP017982|CRT	563800-563833	34	NZ_LR214986	Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13	554970-555003	8	0.765
CP017982_2	2.15|680769|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	680769-680801	33	NZ_CP013139	Pseudoalteromonas sp. Bsw20308 plasmid pPBSW1, complete sequence	517505-517537	8	0.758
CP017982_2	2.18|680952|33|CP017982|CRISPRCasFinder,CRT	680952-680984	33	MN694808	Marine virus AFVG_250M14, complete genome	37083-37115	8	0.758
CP017982_1	1.5|562874|36|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	562874-562909	36	CP011076	Brevibacillus laterosporus strain B9 plasmid unnamed2, complete sequence	301173-301208	9	0.75
CP017982_1	1.19|563800|34|CP017982|CRT	563800-563833	34	NZ_CP054613	Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence	481577-481610	9	0.735
CP017982_2	2.3|680037|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	680037-680069	33	CP041517	Bacillus aryabhattai strain KNU10 plasmid unnamed1, complete sequence	70310-70342	9	0.727
CP017982_2	2.5|680159|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	680159-680191	33	MN693542	Marine virus AFVG_25M165, complete genome	31681-31713	9	0.727
CP017982_2	2.9|680403|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	680403-680435	33	MH791397	UNVERIFIED: Enterococcus phage EfsSzw-1, complete genome	2945-2977	9	0.727
CP017982_2	2.10|680464|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	680464-680496	33	KJ019071	Synechococcus phage ACG-2014g isolate Syn7803US105, complete genome	21236-21268	9	0.727
CP017982_2	2.12|680586|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	680586-680618	33	MH107028	Campylobacter phage CP39, partial genome	129419-129451	9	0.727
CP017982_2	2.5|680159|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	680159-680191	33	MH616660	Microviridae sp. isolate ctbb538, complete genome	2614-2646	10	0.697

1. spacer 2.2|679976|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_003216 (Listeria phage A118, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.879

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* ****.***********************.*.

2. spacer 2.2|679976|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AJ242593 (Bacteriophage A118 complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.879

taaaaatggagaacgagaagcagatttcatcag	CRISPR spacer
tcaaaacggagaacgagaagcagatttcattaa	Protospacer
* ****.***********************.*.

3. spacer 2.2|679976|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019782 (Lactobacillus phage AQ113, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.879

taaaaatggagaacgagaagcagatttcatcag	CRISPR spacer
taaaagcggagaacgagaagcagatttcattaa	Protospacer
*****..***********************.*.

4. spacer 2.2|679976|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to DQ003642 (Listeria phage A006, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.879

taaaaatggagaacgagaagcagatttcatcag	CRISPR spacer
tcaaaacggagaacgagaagcagatttcattaa	Protospacer
* ****.***********************.*.

5. spacer 2.9|680403|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN241318 (Enterococcus phage PEf771, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.848

caaaaatgttagaacaagaatattt-taccaaag	CRISPR spacer
caaaaatgttagataaagaatatttacaccaac-	Protospacer
*************  ********** .*****  

6. spacer 2.2|679976|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH341451 (Listeria phage PSU-VKH-LP019, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.818

taaaaatggagaacgagaagcagatttcatcag	CRISPR spacer
ccaacagggagaacgagaagcagatttcattaa	Protospacer
. ** * ***********************.*.

7. spacer 2.2|679976|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF417900 (Uncultured Caudovirales phage clone 8AX_1, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788

taaaaatggagaacgagaagcagatttcatcag	CRISPR spacer
cgcacaaggtgaacgagaagcagatttcatcaa	Protospacer
.. * * ** **********************.

8. spacer 2.2|679976|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP016969 (Staphylococcus epidermidis strain DAR1907 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788

taaaaatggagaacgagaagcagatttcatcag	CRISPR spacer
cgcacaaggtgaacgagaagcagatttcatcaa	Protospacer
.. * * ** **********************.

9. spacer 2.2|679976|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF417899 (Uncultured Caudovirales phage clone 7S_8, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788

taaaaatggagaacgagaagcagatttcatcag	CRISPR spacer
cgcacaaggtgaacgagaagcagatttcatcaa	Protospacer
.. * * ** **********************.

10. spacer 2.2|679976|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015608 (Bacillus safensis strain U14-5 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788

taaaaatggagaacgagaagcagatttcatcag	CRISPR spacer
tcaatctggtgaacgtgaagcagatttcattaa	Protospacer
* **  *** ***** **************.*.

11. spacer 2.7|680281|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT774408 (CrAssphage cr130_1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788

taaaacaatatgaatccgatcaa---tttggagagg	CRISPR spacer
taaagcaatttgaatccgatcaatagttcgtag---	Protospacer
****.**** *************   **.* **   

12. spacer 2.9|680403|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT856905 (Enterococcus phage vB_EfaM_A2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788

caaaaatgttagaacaagaatattt-taccaaag	CRISPR spacer
caaaaatgttagataaagaatatttacatcagc-	Protospacer
*************  ********** .*.**.  

13. spacer 2.9|680403|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH880817 (Enterococcus phage EfV12-phi1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788

caaaaatgttagaacaagaatattt-taccaaag	CRISPR spacer
caaaaatgttagataaagaatatttacatcagc-	Protospacer
*************  ********** .*.**.  

14. spacer 1.13|563404|36|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP018204 (Leptolyngbya boryana NIES-2135 plasmid plasmid1 DNA, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778

agtaaatcaacacgtgcttgggaattgattggaaaa	CRISPR spacer
gctgatttcacacttgcatgggaattgattggaaaa	Protospacer
. *.* *. **** *** ******************

15. spacer 1.14|563470|35|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448847 (Streptococcus phage Javan124, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771

gttttccatagtctgttctttcatacttactaatc	CRISPR spacer
cttttcctttgtctgttctttcatacacatgaatt	Protospacer
 ****** * **************** .*. ***.

16. spacer 1.14|563470|35|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448846 (Streptococcus phage Javan122, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771

gttttccatagtctgttctttcatacttactaatc	CRISPR spacer
cttttcctttgtctgttctttcatacacatgaatt	Protospacer
 ****** * **************** .*. ***.

17. spacer 1.19|563800|34|CP017982|CRT matches to NZ_LR214986 (Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

gtgtgattaaagtcaattaaatataaaacataaa	CRISPR spacer
gcttcaagatagttaattaaataaaaaacataaa	Protospacer
*. * *  * ***.********* **********

18. spacer 2.15|680769|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013139 (Pseudoalteromonas sp. Bsw20308 plasmid pPBSW1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758

ttggagaaaccattcaacaaataagacagttag	CRISPR spacer
gcagagaaaccaatcaacaaattagacagcaaa	Protospacer
 ..********* ********* ******. *.

19. spacer 2.18|680952|33|CP017982|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694808 (Marine virus AFVG_250M14, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758

cgttaagaatggcaatattcaaaaaatgtcatt	CRISPR spacer
ggcgaagattggcaatattcaaaagatgaccct	Protospacer
 *. **** ***************.*** * .*

20. spacer 1.5|562874|36|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP011076 (Brevibacillus laterosporus strain B9 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75

tactaaattaaatatttaataggcaaaagctgattg--	CRISPR spacer
tactaaattaaacgtttaataggc--aagccgtacaat	Protospacer
************..**********  ****.*  ..  

21. spacer 1.19|563800|34|CP017982|CRT matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

gtgtgattaaagtcaattaaatataaaacataaa	CRISPR spacer
tacttactttagtcaagtaaatataaaatataaa	Protospacer
   * *.*  ****** ***********.*****

22. spacer 2.3|680037|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP041517 (Bacillus aryabhattai strain KNU10 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727

cggcaaaaataaagaaatggctgcattaaagga	CRISPR spacer
agataaatataaagaaatggcttcattaagctt	Protospacer
 *..*** ************** ******.   

23. spacer 2.5|680159|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693542 (Marine virus AFVG_25M165, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727

cagcaggctaagttaaaagagcaagcgtctaga	CRISPR spacer
gacagagctaatttaagagagcaagcgtctgta	Protospacer
 *  ..***** ****.*************. *

24. spacer 2.9|680403|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH791397 (UNVERIFIED: Enterococcus phage EfsSzw-1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727

caaaaatgttagaacaagaatattttaccaaag	CRISPR spacer
aaaaaatgttagataaagaatatttgcatacac	Protospacer
 ************  **********   .* * 

25. spacer 2.10|680464|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ019071 (Synechococcus phage ACG-2014g isolate Syn7803US105, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727

tccgtgttaatgtttacatatgaaa-----gcaaaaaa	CRISPR spacer
tcagtgttaatgattacatatgaagtgtctgcc-----	Protospacer
** ********* ***********.     **      

26. spacer 2.12|680586|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH107028 (Campylobacter phage CP39, partial genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727

caaacatttccgcattttttggcaacatcttaa	CRISPR spacer
caaacatttctgcattttctggcaatgcaaata	Protospacer
**********.*******.******...    *

27. spacer 2.5|680159|33|CP017982|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH616660 (Microviridae sp. isolate ctbb538, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.697

cagcaggctaagttaaaagagcaagcgtctaga	CRISPR spacer
cagcaggctaaattaaatgagcaacaattcgcc	Protospacer
***********.***** ******  .*...  

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	10532 : 54257	47	Streptococcus_phage(25.0%)	integrase,transposase	attL 24950:24966|attR 38260:38276
DBSCAN-SWA_2	61202 : 108716	44	Bacillus_virus(14.29%)	integrase,transposase,protease	attL 57678:57698|attR 114910:114930
DBSCAN-SWA_3	199912 : 264479	60	Lactobacillus_virus(21.05%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_4	293982 : 360516	79	Streptococcus_phage(29.17%)	integrase,tRNA,transposase,protease	attL 300968:301009|attR 309417:309458
DBSCAN-SWA_5	365546 : 424612	53	Streptococcus_phage(16.67%)	integrase,tRNA,transposase	attL 382146:382161|attR 416365:416380
DBSCAN-SWA_6	447651 : 500083	53	Bacillus_phage(17.65%)	integrase,tRNA,transposase	attL 469854:469869|attR 495347:495362
DBSCAN-SWA_7	507173 : 552700	43	Staphylococcus_virus(20.0%)	integrase,tRNA,transposase,protease	attL 514154:514171|attR 555732:555749
DBSCAN-SWA_8	571089 : 619933	52	Tupanvirus(27.27%)	integrase,tRNA,transposase	attL 618522:618549|attR 625363:625390
DBSCAN-SWA_9	625391 : 668101	40	Synechococcus_phage(18.18%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_10	683882 : 718335	32	unidentified_phage(20.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_11	779752 : 824817	43	Streptococcus_phage(14.29%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_12	832007 : 879154	58	Lactobacillus_phage(42.86%)	tail,integrase,terminase,head,transposase	attL 830002:830017|attR 864312:864327
DBSCAN-SWA_13	895573 : 930784	38	Streptococcus_phage(20.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_14	945400 : 1000733	52	uncultured_virus(11.76%)	integrase,tRNA,transposase	attL 945467:945482|attR 1006788:1006803
DBSCAN-SWA_15	1005088 : 1120915	116	Bacillus_phage(17.86%)	integrase,bacteriocin,transposase	attL 1069782:1069841|attR 1094050:1095600
DBSCAN-SWA_16	1128617 : 1168293	40	Bacillus_phage(17.65%)	integrase,tRNA,transposase,protease	attL 1143429:1143444|attR 1177985:1178000
DBSCAN-SWA_17	1189502 : 1310116	113	Bacillus_virus(15.38%)	integrase,tRNA,transposase,protease	attL 1190269:1190294|attR 1247671:1247696
DBSCAN-SWA_18	1334046 : 1429170	99	Lactobacillus_virus(25.0%)	integrase,tRNA,transposase	attL 1410072:1410089|attR 1431153:1431170
DBSCAN-SWA_19	1440570 : 1484582	47	Streptococcus_phage(30.77%)	integrase,transposase,protease	attL 1445182:1445241|attR 1495528:1495987
DBSCAN-SWA_20	1495625 : 1541365	44	Lactobacillus_virus(25.0%)	transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_21	1555832 : 1600030	47	Lactobacillus_virus(23.08%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_22	1613542 : 1667471	46	Bacillus_virus(17.65%)	integrase,tRNA,transposase,protease	attL 1614081:1614097|attR 1623909:1623925
DBSCAN-SWA_23	1685185 : 1740629	48	Bacillus_virus(18.18%)	integrase,tRNA,transposase	attL 1678633:1678647|attR 1739095:1739109
DBSCAN-SWA_24	1753889 : 1861674	112	Bacillus_phage(21.21%)	integrase,transposase	attL 1827316:1827375|attR 1838425:1838493
DBSCAN-SWA_25	1865639 : 1908263	41	Lactobacillus_virus(20.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_26	1922770 : 1977815	49	Streptococcus_phage(23.08%)	integrase,tRNA,transposase	attL 1916422:1916439|attR 1943504:1943521
DBSCAN-SWA_27	1992483 : 2033915	45	Staphylococcus_phage(22.22%)	transposase,protease	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>CP017982|10532:54257|DBSCAN-SWA
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>CP017982|10532:54257|52022_52730_+|AYE60620.1|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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AYE60578.1|12334_13927_-	ABC transporter ATPase and permease	W8CYL7	Bacillus_phage	1.0e-12	25.9
AYE60579.1|13904_15233_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60580.1|15261_15672_-|transposase	transposase	H7BWC8	unidentified_phage	3.1e-22	39.2
AYE60581.1|15827_16154_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60582.1|16332_18354_+	DHH domain-containing phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
AYE60583.1|18365_18821_+	ribosomal protein L9	NA	NA	NA	NA
AYE60584.1|18851_20246_+	replicative DNA helicase DnaB1	A0A1P8VVQ6	Streptococcus_phage	3.7e-120	50.6
AYE60585.1|20507_21845_-|transposase	transposase	A0A218MNE7	uncultured_virus	1.3e-37	26.7
AYE60586.1|21819_22035_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE60587.1|22089_22437_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE60588.1|22750_23680_+	putative alkylphosphonate ABC transporter	NA	NA	NA	NA
AYE60589.1|24002_24929_-|transposase	transposase	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	2.9e-28	30.2
24950:24966	attL	NA	NA	NA	NA
AYE60590.1|25202_26132_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60591.1|26567_27131_+	fructokinase	NA	NA	NA	NA
AYE60592.1|27207_28590_-|integrase	DNA integrase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	6.9e-58	46.7
AYE60593.1|28653_29883_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60594.1|29966_30671_-	hypothetical protein	G3MA03	Bacillus_virus	2.1e-18	43.6
AYE60595.1|31039_31276_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60596.1|31343_31514_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60597.1|31864_32065_-	transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AYE60598.1|32233_32872_+	ABC transporter ATP-binding protein	G3M9Y6	Bacillus_virus	2.7e-17	29.8
AYE60599.1|32868_33627_+	ABC transporter permease protein	NA	NA	NA	NA
AYE60600.1|33775_34645_+	SIR2 family protein	NA	NA	NA	NA
AYE60601.1|34654_34879_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60602.1|34888_35476_+	transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AYE60603.1|35579_36881_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60604.1|36960_37200_+	cytosol non-specific dipeptidase	NA	NA	NA	NA
AYE60605.1|37362_37899_+	dipeptidase	NA	NA	NA	NA
AYE60606.1|39072_39810_+|transposase	transposase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	2.5e-51	45.9
38260:38276	attR	NA	NA	NA	NA
AYE60607.1|40027_41407_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60608.1|41503_42277_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60609.1|42315_42876_-	putative cobalamin adenosyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE60610.1|42876_43401_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60611.1|43412_43811_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60612.1|43831_46066_-	adenosylcobalamin-dependent ribonucleoside-triphosphate reductase RtpR	A0A220NRW8	Mycobacterium_phage	7.9e-88	32.3
AYE60613.1|46403_47351_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60614.1|47347_47920_+	putative esterase	NA	NA	NA	NA
AYE60615.1|47948_48131_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60616.1|48308_48656_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60617.1|49029_49791_-	ABC transporter ATP binding protein	W6JKT0	Anomala_cuprea_entomopoxvirus	1.4e-07	28.6
AYE60618.1|49787_50684_-	ABC transporter membrane spanning permease	NA	NA	NA	NA
AYE60619.1|50680_51673_-	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
AYE60620.1|52022_52730_+	putative HAD-like hydrolase	NA	NA	NA	NA
AYE60621.1|52800_52926_-	Mg+2 and co2 transporter	NA	NA	NA	NA
AYE60622.1|53430_53958_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60623.1|53999_54257_+|transposase	putative transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>CP017982|61202:108716|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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AYE60631.1|62566_63175_-|transposase	transposase	A0A1V0SJI5	Klosneuvirus	4.0e-34	43.2
AYE60632.1|63606_64434_+	Exodeoxyribonuclease A	M1PSC0	Streptococcus_phage	3.4e-97	63.5
AYE60633.1|64843_65182_+	APC family amino acid-polyamine-organocation transporter	NA	NA	NA	NA
AYE60634.1|65450_68282_+	DNA/RNA helicase	U3PFS7	Lactobacillus_phage	2.0e-27	28.6
AYE60635.1|68321_69308_-	penicillin-binding protein	NA	NA	NA	NA
AYE60636.1|69621_69864_+	Polypeptide deformylase	NA	NA	NA	NA
AYE60637.1|75607_75766_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60638.1|76069_76528_-	transcriptional regulator	A0A2P0ZL89	Lactobacillus_phage	1.1e-17	32.9
AYE60639.1|76845_77475_-	transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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AYE60641.1|78799_79747_-	Lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE60642.1|79758_80715_-	putative glucosyl transferase	NA	NA	NA	NA
AYE60643.1|80733_81570_-	putative glycosyl transferase	NA	NA	NA	NA
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AYE60661.1|98724_100074_-	cobalt transport protein ATPase component	G3M9Y6	Bacillus_virus	3.3e-12	28.1
AYE60662.1|100231_101173_+	regulatory protein	NA	NA	NA	NA
AYE60663.1|101254_101668_-|integrase	integrase	A0A0C5AEA5	Paenibacillus_phage	4.3e-16	49.4
AYE60664.1|102435_102750_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE60665.1|102841_103738_-|protease	protease htpX-like protein	NA	NA	NA	NA
AYE60666.1|103752_104313_-	Membrane protein LemA-like protein	A0A0C5K8T5	Enterococcus_phage	6.7e-12	28.1
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Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

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MAAITINLTSKITQDDETETFTKVAPGQLEENNGVIRVSYKEDDTIPVKMLLKEDELIIRRGVDSSNYSLMKFVPGEKANCRYVVEGRQMDMTSVTNLLEYEEQASSHQLRLEYDLFNGLYLIGNYAVTLIFT
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MKDLPFKAVAIDVDGTFVNDEKKYDHEMFGEILYRLHKHGAHFIIASGRPAGRLEADFGDFIDSVDFVADNGAVLVRDGKIIRITTFSKKCILNLVDYLQLRYPGAVQSTLISGVKHSYFLKSTPAQFKRSHHYFYPNSIEVDNFDQIPEDDQYTKVTVDYPSKVRRELEYGFNSRSVEKIHVTTSGWNYMDIIPQNVNKANGLKEFLAYLDVPRTQLIAFGDGENDIEMLKLAGLSYAMENGQDSVKKIAKFIAPSNNDNGVFKVLNKYLNETRK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AYE60763.1|199912_200935_+|tRNA	tryptophanyl-tRNA synthetase	NA	NA	NA	NA
AYE60764.1|200959_201439_+	dCMP deaminase	A7KUY9	Bacillus_phage	5.2e-37	59.0
AYE60765.1|201428_202037_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60766.1|202335_204999_+	magnesium-transporting ATPase	M1HK51	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	7.6e-37	23.0
AYE60767.1|205091_207068_+|tRNA	methionyl-tRNA synthetase	A0A1V0SHR2	Klosneuvirus	1.0e-99	39.2
AYE60768.1|207067_207835_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60769.1|207821_208388_+	ribonuclease M5	NA	NA	NA	NA
AYE60770.1|208377_209262_+	dimethyladenosine transferase	NA	NA	NA	NA
AYE60771.1|209356_209581_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60772.1|209699_210530_+	purine operon repressor	NA	NA	NA	NA
AYE60773.1|210576_211962_+	UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase	A0A1V0SFS6	Hokovirus	3.9e-29	35.0
AYE60774.1|212198_212513_+	S-layer protein	NA	NA	NA	NA
AYE60775.1|212669_212951_+|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	4.8e-19	54.4
AYE60776.1|212934_213570_+|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	4.7e-62	58.3
AYE60777.1|213941_214964_+	Cell separation protein	NA	NA	NA	NA
AYE60778.1|215099_216494_+	putative bacterial surface layer protein	NA	NA	NA	NA
AYE60779.1|216734_217709_+	ribose-phosphate pyrophosphokinase	A0A2K9L2G2	Tupanvirus	6.6e-47	36.8
AYE60780.1|217774_218188_+	ROK family protein	NA	NA	NA	NA
AYE60781.1|218737_219013_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60782.1|219040_220405_-	HD family phosphohydrolase	E3T4P8	Cafeteria_roenbergensis_virus	9.6e-28	30.1
AYE60783.1|220518_220920_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60784.1|220966_221524_+	DNA-directed RNA polymerase delta subunit	NA	NA	NA	NA
AYE60785.1|221641_223261_+	CTP synthetase	A0A1J0FA14	Only_Syngen_Nebraska_virus	5.6e-136	47.2
AYE60786.1|223390_224686_+	UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE60787.1|224775_225033_+	CbbY	NA	NA	NA	NA
AYE60788.1|225066_225429_+	haloacid dehalogenase	NA	NA	NA	NA
AYE60789.1|225484_226909_-	peptidase U34	NA	NA	NA	NA
AYE60790.1|226989_227814_-	raffinose operon transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AYE60791.1|227913_229188_-	xanthine permease	NA	NA	NA	NA
AYE60792.1|229191_229770_-	xanthine phosphoribosyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE60793.1|230043_230649_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60794.1|230957_232187_+|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	4.2e-123	57.7
AYE60795.1|232725_232998_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60796.1|233040_233193_-	HTH XRE family transcription regulator	NA	NA	NA	NA
AYE60797.1|233416_234967_+	GMP synthase	A0A1V0SH76	Hokovirus	6.2e-23	34.1
AYE60798.1|235353_236481_-|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	1.8e-117	58.5
AYE60799.1|236687_236960_+	zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
AYE60800.1|237356_238592_+	serine hydroxymethyltransferase	A0A240F3L3	Aeromonas_phage	5.3e-102	53.4
AYE60801.1|238720_240001_-|transposase	transposase	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	3.5e-48	32.1
AYE60802.1|240145_240976_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60803.1|241160_241406_+	50S ribosomal protein L31	NA	NA	NA	NA
AYE60804.1|241531_242899_+	UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate-D-alanyl-D-alanine ligase	NA	NA	NA	NA
AYE60805.1|242911_244423_+	putative ATP-dependent RNA helicase	A0A0N9Q9J4	Chrysochromulina_ericina_virus	2.9e-65	38.1
AYE60806.1|244505_244862_+	4'-phosphopantetheinyl transferase	NA	NA	NA	NA
AYE60807.1|244864_245995_+	alanine racemase	NA	NA	NA	NA
AYE60808.1|246311_246728_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60809.1|246779_247487_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60810.1|247674_248646_-	L-lactate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
AYE60811.1|248780_249338_+|tRNA	peptidyl-tRNA hydrolase	NA	NA	NA	NA
AYE60812.1|249339_252837_+	transcription-repair coupling factor	NA	NA	NA	NA
AYE60813.1|252848_253091_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60814.1|253156_253534_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60815.1|253533_253896_+	putative ribosomal protein	NA	NA	NA	NA
AYE60816.1|253936_255193_+|tRNA	tRNA(Ile)-lysidine synthetase	A0A0N7G7K4	Chrysochromulina_ericina_virus	2.7e-16	25.6
AYE60817.1|255347_257453_+	cell division protein FtsH	E5EQU5	Bathycoccus_sp._RCC1105_virus	1.7e-108	47.8
AYE60818.1|257505_258396_+	Hsp33-like chaperonin	NA	NA	NA	NA
AYE60819.1|258473_259499_+|tRNA	tRNA dihydrouridine synthase B	NA	NA	NA	NA
AYE60820.1|259514_261065_+|tRNA	lysyl-tRNA synthetase	A0A2K9L3L6	Tupanvirus	1.2e-82	35.8
AYE60821.1|261438_261894_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60822.1|261998_264479_+|protease	ATP-dependent protease ATP-binding subunit ClpC	A0A223W0B1	Agrobacterium_phage	2.8e-118	33.4

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>CP017982|293982:360516|DBSCAN-SWA
TATGACAACTAGATATAAGATGACAATGGCATACGATGGTCATTTATTCCATGGCTTTCAGTTGCAACCGGATCAACGTACAGTTCAAGGGACCGTTGAAGATGCATTAAAGAAAATGACTAAGGGAAAGCGAATTATCGTTCAAGGCTCGGGTAGAACAGATGCTGGTGTTCACGCCATTGGACAAGTAATCCATTTTGATTATCCTGGTAAAACTATTCCGGCTAATCGGATGATTTTAGCATTAAATTCAATGATGCCGACTGATATTATTTTTAATAATTGTGAAATAGTTAATGAGAATTTCCATGCTAGATATTCTATCAAAGGTAAATGGTATCGCTACAGAGTAAGTTTGGATCATTTTGTTAATCCTTTTAAGCGATTCTACACAGGACATTTTTCTTATGCATTGGATGTAGGGAAAATGCAAGAAGCCGCTAAAGACTTGCTAGGCAAGCATGATTTTACTAGCTTTGCAGCAAGCGGTGGACAGATAGAGGATAAGGTCAGAACTATTTATTATGTGAACATTGCTAAAGATGAAAAAGAAAATGAAATAGTATTTGATTTTATTGGTTCTGGTTTTTTATACAATATGGTTCGAATTATGGTTGCTGCATTGCTTGAAATTGGCAATGGAAGGCGCCCGGTTCATGATTTGAAGCGTGTAATTGCCGCTAAAGATAGACAAGAAGTACGACAAACTGCTCAAGCAAGTGGTCTTTATCTATATCACGTTTTTTATGATGAATACCACAAAAATATCGACGGGACCGGCATTTATAATTGACTTTTTAGCAAAAAGGACGTACTCTAGTAAAGTATGTTTGTCCACGATAGGCCCCGGAAACTTATTGTTTTCAAACTGCAAATAAACGGAGGAATTTAAATTGCGTACTACACCATTAGCAAAATCTAGTGAAATCGAACGTAAGTGGTACATTATTGATGCAACTGACGTATCTTTAGGTCGTCTTTCTGCAGCTGTAGCCACTATTTTGAGAGGTAAGAACAAGCCTCAATACACACCTAATGTTGATACCGGTGATAACGTTATTGTTATCAACGCTTCAAAGATTAAGTTGACTGGTAAAAAGGCTTCAGACAAGTTCTACTACCACCACTCAGAATGGCGTGGTGGCTTGAAGGCTGTTTCATACGGCGAATTGCTTGCCAATAACCCAGTTAAGATGGTTGAAATCTCAGTTAAGGGTATGCTTCCAAAGAACACTCTTGGTCATCATGAATTCATGAAGATGCATGTTTATGCTGGCGAAGACCACAAGCACGAAGCACAAAAGCCTGAAAAGTTAGATATCAACAAGTTAATTTAATTAGGAGGTTAAATAATGGCACAACAAGCTGCATACACAGGTACTGGTCGCCGCAAGGATTCAGTTGCGCGTGTTCGTTTAGTACCAGGTAACGGTAAGATCACTGTTAACGGTAAAGATGTTGATCAATACATTCCATACCCTAACTTGGTTAAAGATTTGAAACAACCGTTAACATTAACTGAAACTGAAGGTCAATACGACGTTCACGTTAATGTTAACGGTGGTGGTTTCTCTGGCCAAGCCGGAGCTATCCGTCACGGTATCGCACGTGCTCTTCTTGAAGTTGACCCAGATTTTCGTGGTCTACTTAAGAAGGCAGGTTTCTTAACTCGTGACCCAAGAATGAAGGAAAGAAAGAAGCCAGGTTTGAAGAAAGCCCGTAAAGCTTCACAATTCTCAAAGCGTTAATCTTCAGATTTACGTTTATACAAAAAGCATCCCAATTAGGGATGCTTTTTTGATGCCAATTTTTATTTAGTAAATAAGTAATTGCCCCATCTAAACAGTAGGCAAAATCATAAAGTAAATGATAAAAATCCAGCCAAATGGTACTAAATATAGTAAAATCCACCAGCCTTCATGGTTAGTATCATGTAATCGTCTGACTGCAGTACCTAATAGTCCTAGTTTTAACCAAATCAATAGAATAGCTACAATCACATTGATAATAATAAACGTGATTGTGATAGATGATACAGGTTCAGTCCAACCAGTATCGTTGGTATCAACTGTGGTATAAGGTAAAAGTGCAAGCAATTCGATGGTACCAATAATAATACTTATAACGAGTTGAATAGCATAACTGACCCAAAATTCTTTTCTTGTGCTTCGAGCATTCCACTTAAAAGGTGCAAAAAAGAAATCTTTCATAATTTCTGAAAAGCTTGGATTAGGAACCTGGCTTTCCGGTTAATGATAGGGTTGTTTATAATATTCTTTTTCCATAATGAAATCACAAATTATAAACTATCTTTAATGTTATCAGCTAAGTAGTCGTAAAGCATACCATGCTTCAATTGCTTAGTATCAACGTCAAGTGCTTCTGCGATAGCGTAGGCAAATGCCCAAGCAGTAGCTGGACCACGGCTGGTCAAAACTTTGTGTTCCTTGTCAGTGACAGTAATTCTTTCGCTAAAGTGAGCACTTGGATCATACTTTTCACATTCTTCTTCGATACCTGGGTAGCAAGTGAATTCAGCATCCTTTAATACGCCATAGCGAGCCAATGCACGAGGAGCAGCACACATTGCAGCCTCCCACTTACCAGCTTCATGGCGCTTAACCATTAAATCGCGTAATTTTTCATCGTCACGCAAGTTAGCTGAACCAGTCATTCCACCTGGGAATGCTACCAAATCGTAATCAAGCAAGCTGTCGTCCACAACTTTATCACAAGTTAATTTAATATGGTGATCACCATCAACGTCTTTACTGTGTAAACCGACCATATCGCATTCAACGTTTAAACGACGCAATACATCAACAACACTTAAACCTTCAACTTCTTCGCAACCGTCTGCAAAGATAACAGCAACTTTTGTCATAGAATCATCCTTTCTAAGTTACATATATCTATTATAACTGTTAGTTGAGATCTAGATAAAAAATCAAGGTCTGCTAATTTGCTTAAATGCAAAGTAGGGCAAGGTGAGATAGGAATCTTGTCCTTTTTTGGTGCGAGCCATAATGACTTTAGATTTGCATTCTCTGCGCCCTGAATTTCTTCATCTAGATTTGTACCAATCACAAGAGTATTGTCAGGATCAATCTCAGGATGATCTTTCAATATCTTGAAGAAGATATTTTTACTAGGTAATTTGACTTTGAAGTCATCTGCGAAATAGGCAAAATCGAAAGAGCTGAGTAATTCTGTTGGTGCTAGGCGCGGTTCAATCTGAGTTCTAGTTTCTTTAGCAAGCAAGATCATACGCAGAGAACCACTGACCTCATCTAAAAAATCGGTAGCACCTTTAACCAAGCGAGTTTGTTCTTGCATTTTTTGTGCAAAAATAGTTCGTGTTGTAGCTAAATTTTCTTTTAAATATGTAGATAAAGCTAAATCGATTTGTTCATCTGTGGATAAAAGCTTGAATTGTTTCTGCAGGCTAGTATATTTAATCCGTTCTGCAGGTCCCCCAATCTACGCCATAATGTTTTAAGGTTTGGCGAAGAGCATTTCTTTCAGCTAGTTTTTCATTTAAAAGACTGCCCTCGGGAATAAAAATTAAAGTATTGAATGTAGACATGTAATGACTTCCTTTGTGTTAGTAACTACTAGAATTATAATGAAGAAGATAGTTTAAGGAAAGGGATTAGAAAATGACGATTTGGACGACAATTTTCTTGTTGCTAGGTGGAGTAGCTGGTGGGTTGCTTTCCTCTATTGCATCGATGGCATCCCTTGCCTCATATCCGGTGCTGTTAGCTGTAGGTATTCCGCCTGTTTTTGCCAATGTGACCAATGACGCTGCATTAATTTGGACTAGTATAGGTTCAACCGTTTCTTCTACGAAAGAGTTAAAAGGGCACTGGAAGCAGGTCTGGTTTTACACGATTTTTACTGTAGTTGGTTCAATTATTGGCTGCATGCTTTTGCTTTCGTTTCCATCCAGCGTTTTTGAAAAAGCAGTACCGTTTTTCATAGCATTTTCTGGAATTATGATCATTGTTTCGGGAAAACATCACAGTTTAAATACCAAAAAGCAGCCGACATGGTTAAAGATAATCTATTTCATTGCACTTTTAATAATGGGCGCCTACACCGGTTATTTTGGCGCTGCTGGTGGTGTAATAGTACTCGTGCTTTTGACTTATATAACTAATGAAAGATTCATTGTAATTAATGCAATCAAAAATGTAATTTGTGGTTTTGCTAATCTAGTGGCTCTCATCATTTTTATTTTTACTTCGCACATCTATTGGCTGCAGGCGATACCATTATCTATCGGGATGTTTATTGGTGGTTATATTGGACCAGCAATTTTAAGACGAGTACCAGAAAAACCGATCCGAATTTTTATTGCCACATTGGCGTTTGTTCAAGCCGGATATTTCTTTTATAAAGCTTATTTACATTAAGTTTGATACAATATTTAGTAATGTAAAGGGAGATTAATATGTCAACAGAAGTTTATTTAGTTCGCCATGGTGAAACCATGTTTAACCAATTGAATAAGGTTCAAGGCTGGTGTGATTCACCGCTGACTGTTAAGGGAATTAACGATTTAAAAGTGACCGCTAATGCTTTGAGCCAGGTTCACTTTGATAATATGTATTCATCTGATTTAAAAAGAGCAATTGACACTGTTCACTTAATGAAAGATGCTAACTTGGTCTCAGATATTGGTAAAATTAAAAAGTTACCTGAATTTCGTGAAGTATTCTTCGGAACTTTTGAAGGTGACGATATTAACCAAACCTGGGATCAGGTAGCAATGGCAGCAGGCATAGGGCATGAAGATAATGTTGCCAAGATTATCAATCAAGTAGGTTTGCGAGAATTTCGTGAAGCTACTAAGAGAGCAGATCCAAGACATTTGGCTGAAGATAAAGATGAGCTAGATGAACGCATGGTTCGCGCAATTGATGTCTTAAGAGATGTAACCAAAAATGAACAAAGAGTGTTATTAGTAACTCATGGTGATTTTATTAAGACCTTAT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MSKFNKEQKIEIYHKWKDENISISQLSKAYKMNLANLDYMLRLIDMHGTNILNTRKRVYSKKFKEQTIEQAIFGTKSDVQLSLELGFKSIGMLNNWLREYKENGYNFIIKQKGRPARGQRESKIAQGTGERDPKAERRKLAIAYCERIRKKTEGLGSGKRSEEIAKAITDLRHEFKVSLDYVLEAIAEHPELPIIARSSYYKIIKRKPKKPKRPKLIAKIKEIFNHHQGRYGYRRVALQLIKEGWNITEKTVRYWMHKLGLKGIRRNKRKYSSYKGTIGKIAPNLIHRDFFAPMPNMKWYTDITEFHLNGEKLYLSPILDGCGGDIVSYSISRHPDMDLVMTMLDKAFVKETALNNCTFHTDQGCQYQSPQYQRALKLQGITQSMSRKGNSMDDGLMENFFGLLKTEMFYDQEYKYHSLQELTQAIKEYIEYYNEERIKSRLKGLTPKEYRNQASINPVF
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MLSGKNTGQIQQEETADSAGQRAESAVSSIRIKVEHVFGKVKAYKIFSTTYRNHRRSFNLRMNLICGIINQELAI

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AYE60860.1|293982_294774_+|tRNA	tRNA pseudouridine synthase A	NA	NA	NA	NA
AYE60861.1|294874_295318_+	50S ribosomal protein L13	NA	NA	NA	NA
AYE60862.1|295333_295729_+	30S ribosomal protein S9	NA	NA	NA	NA
AYE60863.1|295819_296077_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60864.1|296280_296865_-	4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme, amidase family protein	NA	NA	NA	NA
AYE60865.1|296861_297317_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60866.1|297640_298399_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
AYE60867.1|298437_299118_+	phosphoglycerate mutase	NA	NA	NA	NA
AYE60868.1|299180_300080_+	cation efflux protein	NA	NA	NA	NA
AYE60869.1|300088_300271_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60870.1|300284_300965_+	phosphoglycerate mutase	NA	NA	NA	NA
300968:301009	attL	NA	NA	NA	NA
AYE60871.1|301009_302392_+|integrase	DNA integrase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	4.0e-58	46.7
AYE60872.1|302523_303459_+	2',3'-cyclic nucleotide 3'-phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
AYE60873.1|303603_304086_+|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	1.0e-37	56.9
AYE60874.1|304063_304834_+|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	3.3e-78	60.1
AYE60875.1|305302_307981_+	magnesium-translocating P-type ATPase	M1HJQ2	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	1.1e-43	24.4
AYE60876.1|308033_309416_-|integrase	DNA integrase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	4.0e-58	46.7
AYE60877.1|309650_309839_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
309417:309458	attR	NA	NA	NA	NA
AYE60878.1|310278_311559_+|transposase	transposase	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	3.9e-47	31.8
AYE60879.1|311579_312395_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60880.1|312538_313888_-	oligoendopeptidase E2 PepE2	R4TV59	Phaeocystis_globosa_virus	3.9e-74	36.1
AYE60881.1|314198_314510_-|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	8.5e-33	71.1
AYE60882.1|314618_315320_-|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	6.6e-57	51.1
AYE60883.1|315597_315900_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60884.1|316034_316586_+	dUTP diphosphatase	A0A249XZY3	Enterococcus_phage	4.6e-29	55.2
AYE60885.1|316585_317962_+	DNA repair protein RadA	NA	NA	NA	NA
AYE60886.1|318037_319537_+|tRNA	glutamyl-tRNA synthetase	NA	NA	NA	NA
AYE60887.1|319629_321060_+|tRNA	cysteinyl-tRNA synthetase	M1PG92	Moumouvirus	9.6e-47	29.4
AYE60888.1|321052_321496_+	Ribonuclease III	NA	NA	NA	NA
AYE60889.1|321482_322235_+	TrmH family RNA methyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE60890.1|322377_322923_+	Putative DNA-directed RNA polymerase sigma factor, sigma H	NA	NA	NA	NA
AYE60891.1|322998_323217_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60892.1|323328_324825_+	gluconate kinase	NA	NA	NA	NA
AYE60893.1|325351_326173_-	1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase	NA	NA	NA	NA
AYE60894.1|326908_327076_+	preprotein translocase subunit SecE	NA	NA	NA	NA
AYE60895.1|327183_327741_+	transcription antiterminator	NA	NA	NA	NA
AYE60896.1|327868_328294_+	50S ribosomal protein L11	NA	NA	NA	NA
AYE60897.1|328376_329069_+	50S ribosomal protein L1	NA	NA	NA	NA
AYE60898.1|329427_330657_-|transposase	transposase	A0A1X9I619	Streptococcus_phage	1.8e-65	38.4
AYE60899.1|330894_332049_-|transposase	transposase	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	2.9e-41	30.7
AYE60900.1|332286_332514_-	mobile genetic element	NA	NA	NA	NA
AYE60901.1|332671_333091_-	DDE endonuclease	NA	NA	NA	NA
AYE60902.1|333215_334088_+	ABC transporter	NA	NA	NA	NA
AYE60903.1|334091_335087_+	phosphate ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
AYE60904.1|335088_335976_+	phosphate ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
AYE60905.1|335983_336781_+	phosphate ABC transporter ATP-binding protein	W8CYL7	Bacillus_phage	8.1e-11	29.2
AYE60906.1|336782_337538_+	phosphate ABC transporter ATPase	G9BWD6	Planktothrix_phage	4.6e-16	30.1
AYE60907.1|337554_338232_+	phosphate uptake regulator	NA	NA	NA	NA
AYE60908.1|338390_338603_+	auxin efflux transporter type protein	NA	NA	NA	NA
AYE60909.1|338627_339566_+	Receptor	NA	NA	NA	NA
AYE60910.1|339826_340339_+	50S ribosomal protein L10	NA	NA	NA	NA
AYE60911.1|340389_340752_+	50S ribosomal protein L7/L12	NA	NA	NA	NA
AYE60912.1|341157_341652_+	potassium transporter	A0A1B0Y2S3	Lactobacillus_phage	1.7e-11	34.7
AYE60913.1|341653_342283_+	SAM-dependent methyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE60914.1|342272_342779_+	cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region	NA	NA	NA	NA
AYE60915.1|342973_344761_+	DNA polymerase III subunit gamma/tau	A0A1U9WR94	Streptococcus_virus	2.0e-49	39.7
AYE60916.1|344792_345128_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60917.1|345128_345728_+	recombination protein RecR	NA	NA	NA	NA
AYE60918.1|345727_345973_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60919.1|346076_346715_+	thymidylate kinase	M1PSC7	Streptococcus_phage	8.9e-53	50.5
AYE60920.1|346726_347047_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60921.1|347047_347905_+	DNA polymerase III, delta subunit	M1NSC1	Streptococcus_phage	3.9e-19	29.2
AYE60922.1|347915_348266_+	DNA replication initiation control protein YabA	NA	NA	NA	NA
AYE60923.1|348267_349122_+	putative methyltransferase	M1PLC5	Streptococcus_phage	2.3e-64	47.7
AYE60924.1|349124_349859_+	acyl-ACP thioesterase	NA	NA	NA	NA
AYE60925.1|349900_350419_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60926.1|350443_351178_+	ROK family protein	NA	NA	NA	NA
AYE60927.1|351212_351734_+	putative N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE60928.1|351730_352834_+|protease	protease	A0A0R6PI74	Moraxella_phage	4.7e-49	35.3
AYE60929.1|353312_353450_+	Deoxyribose-phosphate aldolase (Phosphodeoxyriboaldolase) (Deoxyriboaldolase) (DERA)	NA	NA	NA	NA
AYE60930.1|353538_354768_+|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	2.2e-124	58.2
AYE60931.1|354905_355094_+	deoxyribose-phosphate aldolase	NA	NA	NA	NA
AYE60932.1|355103_356075_+	Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
AYE60933.1|356067_356778_+	transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AYE60934.1|357218_357566_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE60935.1|357620_357836_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE60936.1|357810_359148_+|transposase	transposase	A0A218MNE7	uncultured_virus	1.3e-37	26.7
AYE60937.1|359236_359476_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE60938.1|359454_360516_+|transposase	transposase	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	1.7e-40	31.6

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>CP017982|365546:424612|DBSCAN-SWA
ACTAAAGTCTTTGGTTATGTGTGGCTACGTTGTAATCGTATAATTGATCATGTTTGATAAGAGCAAACATTGTACGTATCAGTTTATGAACTGATGCAATGGCGATTTTCTTATAGCCCCGGCTATTTGAAGATCGTTTTTTCTTATCATAATAATCAGTGATATGACAAGGCTGAGTAGCTTTGACAGTTTCCATTTGAGTAATTGTTCGATAAAGAATCTTTCTAGCTAAGTGATTGCCATGTTTGGTTATTCCTAAATGACTGTCCTTTTCACCTGATTGATAGCGGCCTGGATCAATGCCAACAAAGGCATCAATTTGGGCTGAAGTATCAAACCGTCTTAAATCACCTAATTCGGCTACCAACCTAACAGCAGTAGTTTTGGCAATGCCAGGAATACTCTCATAGATATTCAAAGACCGTGCATTTGCTTGCATAGCAAGCTTTTCCATATAATTGATCACATTATCTCTTTCGGCACTTAGAGAAAGCAAATTGGCAATATTACGCTGAATTGCTCGAATAGTAATACTGCTTTCATTGTCATATGGATAAGCTTGTCTGGCTAAGGCATAGAGCCTAGTTGTTAAATAATGAGCTCTTTGTCTGCCAATTCCTGAAATGGCCAACAAACTTTGAAAGACCTGGTTTTCATTGTGATTTAAAACATATTGGGCATGCGGGAATAAGCTGACAATCGTCCAATAAACTCTGCCAGATGAAGTTGAAAGGATATTCTCTATCTGAGGAAAAGTAGACTGCAAATTACGATGGAGCTGATTTTTATTGATTATCAGGGCTTGAGTAAGCTCTTCGTAATAACGACTCGCATTTTGCAGTTCATGATATTCCTTAGGTTGAGGAGCACGCAATTTTTGTGGCGCATTGAATTGAATTAAAGCTAACCGATAAGCATCAACTTTATCGGTTTTATTATGCCTTAGATTATTGTCCATCAGCTTCTTAGCCTTTAAGGGATTAAGCTTTAAATACTTGATATGATAATCTTCTAAAAAAGCCTGTAAACTCAATGAATAAACTCCCGTAGCTTCAAAAACTACTAAAGGCGTGATCAAGTATTGATTTAAACGATCCAATAGATCTTGATAGCCAAAGGAATCATTAGTAATCTTAAAGGTTTCACCTTGCTTAATTCGATCAATTACTACACAAACTGTAGACGATTTACTGCTAACATCAATGCCAAAGATAATATTTTGTTTCATCATTCTAACCTCCAAGTGAAGACAAACAGTTTTATCAACCTATTAATTCTCATTTTCTGAACTCGGCATCAAGTGCCCACAGACTTCGAAGAGACTTATAAATAGGCGGTAAAGCAGTCCGTTTTCTTTGCGACGTTACACGTCCAAAAGAACCAAGACTTTATTTGCTTTATCTTCACTTTCTATTTTAGACAAAATAAAAAGTGCCAGATCATGAATCCGTCGATTCATAATCCAACACTAGGTTAGTATGTTTTCTTTATTTCTTTGAGCGTTGCAAAGGATTACCTTATATCCCTTTTCGAATAAAATGCTTTCGATATCTTGAATTAGCTCCGCAAAAAAAGATTGGTTATTTCTGGGAAAATCAATCCAATTAATTTCATTTTTTTGCCTTGAAGTGATCGAGCTAGGGAATTAGGTTGATAATTTAATTCTTTCATGGCTGCAAAAACTTTATGTTTAGTTTTGTCGCTCAGATAGCCATGATTGTTAATTACTCGAGAGACAGTTGTTACTGAAACACCAGCTTTTTGTTCAACATCTGTTAATTTTACTGCCATAATATCACCTTATTAAAGAATCGGTTCCATATTGTAGAAAGTTCCTTGATAATTTGTATCTTGACCAAATTCAATTCGTTGGTTAGCTGGATCAGTAAAGAATCTGCCAGTTAAAACATGTTCACCATCATTGACGAAAATTTCTGCTAATGAGTGGTCGACAAAAATATCAAGTTTTAAGTCTTCATGTGGAGTAAAACTTGTAGATCTAGTAGTTCCATAGTCAACTGCTACTTGTTTACCAGCCTTGGAGCGATCTAAAGTTAATTTTCCGGTTTTAGTATCAAATTTGATTTGCAGGCTTTACACATGTTACTGCTGCTGCACTTGGTTCAGCTGGTTTCCTTGGATTCCTTTCAATTTATCCAAAGACCATTCCAATGTGGATCGTTTCTGTGTTAATCAGTTTCGCAGTTGCCTTCATCTTAACTTACGTTTACGGTAAGGGGCACTTGAAGGAAGAAGTTGCTGAACAAGACGTTCCAGTAAACGATGCTGATGATTACGCTGAAGAAAACCAAAAGGCAGAAAAGCTTGGTAAAGAAGAATTATCATTAAAGGATGAAATTATTGTTTCACCAGTTAATGGTACTCCTGAGAGTTTAACTAAGGTTAATGACCAAGTATTCTCAGCTAAGTTAATGGGTGACGGTGCCGCTGTTATCCCTAGTGATGGCACAATTTACTCACTAGTTACTGGTACTGTAACTATTGCTTATGAAAGTAAGCACGCATATGGTATTAAGTCAGATAACGGTGCAGAAGTCTTGATTCACATCGGTCTTGATACTGTAAACCTTAAGGGTGAACACTTTGAAAGCTTTGTAAAACAAGGTCAAAGAGTTGAAAAAGGCGATAAGCTTGGCAGTGTTGACCTTGATGCTGTAAAGAAGGCAGGCTACGACACTACTGTTATGGTAGTCATTACTAACACTGCTAACTACGCAAACGTTCAACGCATTACTGACGCTGGCGACAAGCATGGTGATAAGTTGATCGCTGTTACAGCTCATAATTAATCATTAATTTACATAACTTACTCTTCTCTAGAAAACAAAAAAGTTAAAACGATAGATAAAATAAAGAAGACACTAAGAAAGATTATTTCTTGGTGTCTTTTTGAGTAGTTAATAATTATAGGTAAAATGAAAGGAGAAATTACTTACAGGAAAAGATGAGAAGATGCTATATCCATACATTGAATTGCCTGATGAAACAATAATTACTCATTTGAAAATTAAACCATATAATACTGTTTTAATTAATTTCGAACAACCGGTAGAAAATGGCTTTAGGGAGGCTAAAATTAAACTTCCTAGTTATAAGTGGCTTTATAATGAGGAGTTTAGCAATGAGCAAATTGCTTCTTTTGAAGATTTTGCACATAAAAATTCTGCGGTCATATATAAATATGCTAGATTAGGTGGAATTGATAATAATAACTAGTAAAATATGCTATAATTAAGTAAAGAAAAAGGAGACCCGAAGGTCCCCCGTGCAGCCCGCTTTAAGAGTGGTGGCTAAGATTATTTTTTGCGATGAACGCTACTCAATAACTCTTCCAAAGTTATCAAATTGAGCGGCGTTTTTATTTTTTGTCGTGATGATCGATGTAAGTCAGCAAAGCCAACACAAACATCCCAAACAAAGTATCAAAGAAATGCAATCGTAAACCGACATGGTTGAACCCTTTCTCTAGTATATTGACCATAGGCCCCACCTCCGGGAGGTAAAACAACCACCGCTCATAAAACTTTCTGCGGAATAATTATATCTAATAAGTCTTCTCAAGGAAGACGAACAAGATAAAAAAGAATCCAATTAACTTCAATCTCTTGCTAATTTAACCAAAAGATTCCAACTAATTGGATTTTTACACTGAAATAGAGTAAAGCTGTGAGTTAATTCAATTTTGATTATCGGTGCTAGTTTTTCACCTTAACAGCGTGCTATAATTTTGACTAACTAAAGGGGATGATAAGAATGAAAAAGAAGAAAAATGAAACATTAAAAATTACTTGGATCATGACCGCTGTCTATTGGGTAGTCGGTTTATTGTGCATGTTTTGGGGCAAATTAGACCATGTATTTTCTGGTCAATTAAAAGATATTAACAATGTGTATGCACTGACTTTATTAATCGTTCTGATTTTGCCGCTGCTTTTTTCAATCTTATTATCCATGAAAGTAAAGCCGCCACGTCTAATTTGCAATCCACTAGTTACCGTAATCTATCTGTTAGTCGTAATTGCAGCAGGGATGGCATATTATTTTCAAAATATCATTGGTTACTTCTTCCCGATTATTCTCTTTGTTTTGATGGCATTTTTGGCAATCTTTTATGCCTTGTTTAAAACTTTCAGAAATAAGAAAAAGGGTAAATATTATTTCATTGATGGTAAAGATAGAGAAGAATGCCGCAATTTTTGGGATGCATACAAGCAATATTATGCAATGGGATTAACCTCTGGCATTATTGAAGGGCTGTTGTCGGCAGTTTTTAAATAATTAGTGTACCTTATAGGTAGAAAAACTCCGTTTACAATCATAATCGATAAAATTAGCACTATTTGTAAAAAAGTGAGTTTGCTATTTTAGGATAAATTCAATTAATAAGAATCTTGATATAATAGGCTTTGTGCTTATTGTGATGTTTTAAATTTAACTAGAATTATTGTTTTTAGGAGCAATATTAGGAGCAATATTTTTTAGTTGGAGCAAGCGAGTTAATCAAAGGTTTTTAATTATTAATCACGTGATATAATTAACGCTGTATTCTATATCATTATTCATTATCGAACGGGCTATCTTACGGGATAGCTCATTTTTTATGTTAAAATAAGCACGGGCTAGAGGTGTGAGCGTCATCGACAACAGATAGACACTCAATAAATAAAACGGCATCCCTTTTAGGGATGCTTTTTGTTTATTCTTGAAATTTGCCGTCTATTCTTTGCTATGCTGAATTTAAATCTTAAACACGTGTAATCATACTAAGAAATAATAAAAACTCTTATATCGCCTTAAAATGATAATCAGAGCAAGGGTAAAAGAACTGTGGATTTTTGGATATAGGGTTACTTACTAGCATGTTTACACTTTGAGGTGAAAACGTATAAATACATTTTGTGTCTATAGGTCAAACGGCAGCGTCATTGATCTCCTTTTTTAGGGGTCGGCATTTCTTAGTCGTATTGCATACCTACCAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5

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>CP017982|365546:424612|382199_384110_+|AYE60959.1|DBSCAN-SWA
MAKIHELSENLTNQIAAGEVIERPASVVKELVENSLDAGATRIRVDFIDAGLKQIVVQDNGTGIARDQVDLAFTRHATSKISNEYDLFKVSTLGFRGEALASISAVSHVEIVTATENAIGIKADFSGGSKKGQEDAASQKGTKITVRDLFFNTPARLKYLRSPRTEIMKIVDIINRLSLGYPHVSFTLSNTGKVLFRTTGNGNLKQTVANVYGRHIAEKMESFEAKDSDFKITGLMSKPELTRSTRNFISILLNGRYIKNFQLNNAIMDGYGSKLAARHYPIVVIAIHVDPMLVDVNVHPTKQEVRLSKEKELSRLITGAISDALLDKTEQSSGFANLENKRETLVDQLEFNLNQDVVNTTRKTPEVHEEAEKPEFLVKQEAKNSEELKNETEHNYVDINIPREDDQYIITKTWDKNVALQQKLMPFSNKKVDQEVISTGDETLANNLPRLAYVGKIDTYLLAENDGDLYLIDQVAARRRLQFEQIYQTITSKKIVQQGLLTPIVLEFGNLDFLQIKDKIYQIKQLGIYLDEFGQNSFIVRSYPTWIHDHVEESIREILDNYLNLDKGKTQNLFKRVAALEAKRSVKGKINLSAAEGTQIITDLRKTSDPYHDADGRLILVRISQNELRKMFKKGE
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MKKLTSSEFRQMFLDFFKDHGHMIMPSASLIPQDDPTLLWINSGVATMKKYFDGSVVPKNHRITSSQKSIRTNDIENVGKTARHQTFFEMLGNFSVGDYFRDEAIPWAWEFLTSPKWLGLPKEKLYCTVYPKDVDSQRVWEKAGMPADHIVKLEDNFWDIGEGPCGPDTEIFYDRGQENNDVAEDDPENFPGGENARYLEIWNIVFSQYNHLPNGKYVDQPHKNIDTGMGLERVLSILQDAPTNFETDLFLPIIHATEEMTDGKKYGENKEDTTAFKIIADHVRAVSFAIADGALPSNSGRGYVLRRLIRRADLHGQRLGIKGAFLYKLVPVVGKIMQSHYPEVMDQRGFIEKVIQNEEERFQAALDTGLTLLDDLIDKAKKSDDKTISGKDAFKMFDTYGFPYELTFESAQDAGLKVDKKGFDAEMQAQKERARKARGDLQSMGRQDVTLMNIKDKSVFERDTYEEPHAKLLDIVVDDKLVDKADGEHATLVFDKTPFYAERGGQVADHGNIYDQDGELVAKVTDVQHAPNNQNLHFVDLILPMEKGKEYVLKIDKERREGLRHSHSATHLLHAALRQVLGEHTHQAGSLVDSDYLRFDFTAMEPMTPREIKSVEELVNQKIWEAIDVKTTITTPEEGEKMGALALFDGKYGDKVRVVQMGDFSSEFCGGTHCSNTNQIGIFKIISESAVGAGMRRIEAVTSKKAYEYLANRSSLLDDIQADVKATKPDNIIDKIDSLESELHDSQKQVEALTKQINQAKAGQIFDDVKQAGDLTVIATVADVNGMNDLRELADNWKSGNKSDVLVLAAENDGKANMIISLGQKALDKGLKAGDLIKKAAPIFGGGGGGRPNMAQAGGKRPEGLNDAIKAVIEEISKN
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MNKHELAKNINRFLEYDLDNYIYSTGMQREWILTLKEDSLASYLNKGSISSDTRNMIRIVYSVAKAFQGLSDTKKHPFKKILALKYFDGFLPSQQIADKVGYCLHTYYLKKNDALLEFYKSFLPAQSYYGVFPVIYLDNGVVDAESTKKALDTPKMDNLASFLSSLTYWQTINLYITLLQARSNISFNDAKKQAIVNYSNASNLKKMLNESLNSPSPKE
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MLYPFKKISDIPAYNSINGTALIQNLKSSLPKETEIITNHKVNDIKKNADGFVLDNVVLAKSIIIATGAGAFKPKELPLKMSDEIQKRVHYFIKDPKDFANQKIGVFGGGNSALDLAIELADYANVKIIHRRNEFRGLELNVKKLRSLTNVKILTPYLPKDIQLINNQLDITLKGMGDVQSRHEQFDQIVVAYGFKANNRFIKNWGIELNGTNIAVDPTMKTNIDGIYAAGDVVSYPGRVPLIALGFGEAQIAITSIMRDLFPEKTLTIHSTSI
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MAAQVNGDDKDRQITLIDDQGNEELYEVLFTFHSDDYDKSYVLLYPAAVGDDEDIEVQAFSYDTDDAGDVTSSDLHEIESDDEWDMVQGVLNTFLDDDRLSGK
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MIIDSFPAPVCQPIRNYRAKIFRGYANIGYKATKKIYFYGFKVHAIVSDDGYILDYVVTKASVHDARETVELMENTHPSNYYLLGDKGYLGKELHQQLKQMGYELWTPYRKNMTGAKKHNDHQLMAIRRTIESDFSLLTYYNAENNRARSLIGFQSRLEIAILAYNLAYCLERFN
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MAKDIKFSENARRSLLKGVDKLADTVKTTIGPKGRNVVLEQSYGNPDITNDGVTIAKSIELKDRYENMGAKLVAEAAQKTNDIAGDGTTTATVLTQAIVREGMKNVTAGANPVGIRRGIEKATKAAVDELHKISHKVESKDQIANVAAVSSASKEIGALIADAMEKVGHDGVITIEDSRGINTELSVVEGMQFDRGYLSQYMVTDNDKMEADLDNPYILITDKKISNIQDILPLLQEIVQQGKSLLIVADDITGEALPTLVLNKIRGTFNVVAVKAPGFGDRRKAQLQDIAALTGGTVITEDLGLELKDTKIDQLGQARRITVTKDSTTIVGGAGSKEAIDERVDTIRKQIEDSTSDFDKKKLQERLAKLTGGVAVIHVGAATETELKERRYRIEDALNSTRAAVDEGYVAGGGTALVNVEKAVREVKGETTDEQTGINIVLRALSAPVRQIAENAGKDGSVILDKLEHQENEIGYNAATDKWENMVDAGIIDPTKVTRTALQNAASIAALLLTTEAVVAEIPEPKQAAPQGGAGAPMGM
>CP017982|365546:424612|401972_402593_+|AYE60980.1|DBSCAN-SWA
MTKEILFATGNQGKAKELKEAFKRAGVGVEIKTNADLDNPPHPIESGRTFEANAKIKAHELADFSGLPTIADDSGLMVDALNGEPGVRSARYAGEAHNDAKNNAKLLANLGGVPDEKRTAKFWTTIVVSMPGEFDKDLVVSGTCSGRILAAPRGEDGFGYDPLFFIPEKGKTFAQMTTDEKNEISHRGNAVRKLLQELPDWLKQFN
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MLRRSASFSKINGSVIKKNLINGTLKPNGLHLTNSKQIFNRKAKSKMTKHLINNDDVIRIGQKLYQLSSNSPETDFLKCKDASKDYEERLIENDINAEIFHDGNDQNTTALMQGDLVQSKQESDLKFILISTRLMPLQEAKYALDAYSKNQRPNVVKIPNPKPTLKASKQYDKRDHRMTKDIDTLKALVDNAENQGWETIDGVNYGASHTWREVAQLALDLADQQEWFDRYDNKYFN
>CP017982|365546:424612|395608_396037_+|AYE60971.1|DBSCAN-SWA
MRLLGLDIGSKTVGVAVSDELGITAQKLETIKIDETKYNFGMRPLKKLVRQYEVDGFVLGLPKNMDGTSGASVARSKAYGKRLEEKFGLPVHYSDERLTTIESRRVLVEDAGIHDRKKRKQVIDQMAAVLILQNYLDLHRKD

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AYE60944.1|365546_366776_-|transposase	transposase	A0A1X9I619	Streptococcus_phage	6.1e-66	38.6
AYE60945.1|367102_367336_-	LacI family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AYE60946.1|367731_368355_+	PTS transport system subunit IIABC	NA	NA	NA	NA
AYE60947.1|368518_368782_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60948.1|369319_369844_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60949.1|370700_371360_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60950.1|371412_372879_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60951.1|372996_373317_-	prophage DNA packaging protein NU1	NA	NA	NA	NA
AYE60952.1|373332_374046_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60953.1|374659_374839_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60954.1|374972_375704_+	transcriptional regulator, Cro/CI family	Q9AZN3	Lactococcus_phage	7.7e-08	49.2
AYE60955.1|376095_377247_+|integrase	integrase	A0A1S5S7K9	Streptococcus_phage	7.0e-56	36.8
AYE60956.1|377483_377768_+	co-chaperonin GroES	A0A221S3C8	uncultured_virus	4.3e-15	42.4
AYE60957.1|377821_379444_+	heat shock protein 60 family chaperone GroEL	A0A240F766	uncultured_virus	5.8e-157	54.2
AYE60958.1|379602_382200_+	DNA mismatch repair protein MutS	A0A1V0SJ67	Klosneuvirus	1.0e-38	25.3
382146:382161	attL	NA	NA	NA	NA
AYE60959.1|382199_384110_+	DNA mismatch repair protein MutL	A0A1B2LRQ5	Wolbachia_phage	2.6e-55	29.8
AYE60960.1|384110_384701_+	Holliday junction DNA helicase RuvA	NA	NA	NA	NA
AYE60961.1|384749_385766_+	Holliday junction DNA helicase RuvB	A0A127AWE7	Bacillus_phage	5.5e-12	31.6
AYE60962.1|385824_386250_+	preprotein translocase subunit YajC	NA	NA	NA	NA
AYE60963.1|386383_387835_+	glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase	M4SIY3	Cyanophage	1.5e-63	32.6
AYE60964.1|387827_388949_+	DNA-damage-inducible protein	NA	NA	NA	NA
AYE60965.1|389008_389965_+	oligoribonuclease	NA	NA	NA	NA
AYE60966.1|389957_391319_+	putative RNA helicase	Q5GF26	Diachasmimorpha_longicaudata_entomopoxvirus	4.4e-49	32.2
AYE60967.1|391589_391844_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60968.1|391934_392192_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60969.1|392651_395291_+|tRNA	alanyl-tRNA synthase	A0A1V0SK38	Klosneuvirus	1.0e-62	33.0
AYE60970.1|395351_395609_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60971.1|395608_396037_+	Putative Holliday junction resolvase	NA	NA	NA	NA
AYE60972.1|396038_396350_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60973.1|396412_398770_+	DNA mismatch repair protein MutS	Q94M10	Lactobacillus_phage	9.7e-20	48.7
AYE60974.1|398890_399202_+	thioredoxin	A0A1X9I9P5	Staphylococcus_phage	9.1e-19	37.8
AYE60975.1|399246_399618_-	large-conductance mechanosensitive channel	NA	NA	NA	NA
AYE60976.1|399688_400216_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE60977.1|400212_400545_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE60978.1|400679_401081_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60979.1|401169_401973_+	glutamate racemase	NA	NA	NA	NA
AYE60980.1|401972_402593_+	putative nucleoside triphosphatase	A0A0P0A2M4	Ugandan_cassava_brown_streak_virus	1.4e-10	30.5
AYE60981.1|402948_404151_-|transposase	transposase	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	6.0e-42	30.1
AYE60982.1|404407_405226_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60983.1|405391_405817_+	Methyl-accepting chemotaxis-like protein	NA	NA	NA	NA
AYE60984.1|405834_406206_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60985.1|406271_407378_-	Xaa-Pro aminopeptidase Q PepQ	NA	NA	NA	NA
AYE60986.1|407524_408526_+	catabolite control protein A	NA	NA	NA	NA
AYE60987.1|408606_409977_-	putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase	A0A173GBD0	Staphylococcus_phage	9.6e-12	26.5
AYE60988.1|410070_410391_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60989.1|410405_411797_+	Ser/Thr phosphatase family protein	NA	NA	NA	NA
AYE60990.1|411780_412404_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE60991.1|412403_413183_+	putative sugar phosphatase	NA	NA	NA	NA
AYE60992.1|413320_413788_+	Membrane protein	NA	NA	NA	NA
AYE60993.1|413854_415237_+|integrase	DNA integrase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	4.0e-58	46.7
AYE60994.1|415256_415907_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
AYE60995.1|415915_416740_-	ferredoxin-NADP reductase	A0A249XZT7	Enterococcus_phage	1.1e-07	29.6
416365:416380	attR	NA	NA	NA	NA
AYE60996.1|424147_424612_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>CP017982|447651:500083|DBSCAN-SWA
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>CP017982|447651:500083|465255_466551_+|AYE61028.1|DBSCAN-SWA
MFFSKKIKRAVISLVALISLVSCGATFSAPAKADVANYQTDQVKLNVKSAIAIDSNSGQVLYAKNADKTLPIASMTKLMTVYLTLNAIKNQKLAWDQKVKPTASIVKVANNAEYSNVPLKMGHSYTIKQLYQATLIESANGAAMLLGQTIAGSQKAFIDQMRSQVKKWGIKDAKIYTACGLPNGNVGKDAYPGVNKNAENSMSAKDMAIVGQNLIQDFPEVLDTTKLAHLDFKDQGHTTKMANFNWMLKGLSQYDQAYPVDGLKTGTTDAAGACFIGTVNHAGARLITVVMGARHKDGTDPARFMQTKKLMNYVFTKYRPVTFNAGSQMAGVKNIKVTDGDNATTNLGLKEKTTIWDPADGKTLVAKLNKQTIEAPITKGQVVGNYQFKSGNEKIVSLSNPNGMNVKAKALAANGKVNFFVRIWRMLFGGR
>CP017982|447651:500083|468301_468766_-|AYE61031.1|DBSCAN-SWA
MPKKRILPYIIMGILKQNPNSTGKELTNQFNEEIGEFWKASHSQIYPELKKMLADDWITETQRENNEKEINYSLTKKGALQLENWIKQPITELAVSHDLFSLKLFFINDQNDPRIAELINEEKALIKTQLQHLYARKKLLFDDQKDIEKTMVIT
>CP017982|447651:500083|462155_463079_+|AYE61023.1|DBSCAN-SWA
MKEYDLVVIGAGPGGMTAAMYGARANLKVAMIDRGVYGGQMNNTAEVENYPGFPSIMGPDLGEKMYKSATKQGVEFVYGDVQKIELDGQKRIVKMDPEDITAKAVIIATGSTNRKLGIPGEEEYSGRGVSYCAVCDGAFFKDENVAVVGGGDSAISEGLYLANLAKDVDVIHRRDQLRAERVLQTRAFKNPKMEFTWDSVPVEIVGDENKVTGVKVHNKKTDEDKVIDASGVFIYIGNVPNSEPFKELKITDDQGWIITNDQMETTVPGIYAVGDVRQKKLRQIVTAVGDGGIAGQNAFEYISELTD

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AYE61010.1|447651_449034_-|integrase	DNA integrase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	4.0e-58	46.7
AYE61011.1|449094_449757_-	PAP2 family protein	NA	NA	NA	NA
AYE61012.1|450045_452460_+|tRNA	leucyl-tRNA synthetase	A0A2H4PQS0	Staphylococcus_phage	0.0e+00	65.8
AYE61013.1|452553_454200_+	transporter	NA	NA	NA	NA
AYE61014.1|454379_455084_+|transposase	transposase	Q9MBM9	Staphylococcus_prophage	1.6e-23	31.3
AYE61015.1|455067_455427_+|transposase	transposase	H7BWC8	unidentified_phage	9.5e-20	41.1
AYE61016.1|455880_456633_+	PrtP precursor	NA	NA	NA	NA
AYE61017.1|456651_457107_+	Thermostable pullulanase	NA	NA	NA	NA
AYE61018.1|457915_459223_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61019.1|460025_460409_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61020.1|460491_460779_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61021.1|461036_461402_+	thioredoxin	NA	NA	NA	NA
AYE61022.1|461391_462042_+	putative transcription regulator	NA	NA	NA	NA
AYE61023.1|462155_463079_+	thioredoxin reductase	G3MA85	Bacillus_virus	9.5e-80	49.7
AYE61024.1|463386_463740_+	dithiol-disulfide isomerase	NA	NA	NA	NA
AYE61025.1|463800_464100_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61026.1|464386_464587_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61027.1|464647_464956_-	PspC family transcription regulator	NA	NA	NA	NA
AYE61028.1|465255_466551_+	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase	NA	NA	NA	NA
AYE61029.1|466552_467401_+	ribokinase-like protein	NA	NA	NA	NA
AYE61030.1|467528_468203_+	putative cell surface protein	NA	NA	NA	NA
AYE61031.1|468301_468766_-	PadR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AYE61032.1|468820_469348_-	Phenolic acid decarboxylase padC	NA	NA	NA	NA
AYE61033.1|469529_470054_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
469854:469869	attL	NA	NA	NA	NA
AYE61034.1|470066_470378_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61035.1|470586_472272_+|tRNA	arginyl-tRNA synthetase	A0A2I2L3K1	Orpheovirus	6.0e-72	31.4
AYE61036.1|472382_473294_+	fructose-bisphosphate aldolase	NA	NA	NA	NA
AYE61037.1|473366_473885_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61038.1|473887_474157_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61039.1|474304_474589_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61040.1|475189_476173_+	ATP-binding protein	W5SAS9	Pithovirus	1.8e-12	27.8
AYE61041.1|476551_477730_+|transposase	transposase IS1201	A0A220NQR7	Corynebacterium_phage	5.2e-38	28.8
AYE61042.1|478206_479067_+	phage protein	A0A1B0Y4T1	Lactobacillus_phage	1.9e-37	36.8
AYE61043.1|479744_480551_+	DNA primase	A0A060ADU2	Enterococcus_phage	2.4e-10	26.9
AYE61044.1|482469_483453_+|integrase	putative integrase	NA	NA	NA	NA
AYE61045.1|483472_484255_+	ATPase, para family protein	Q8JL10	Natrialba_phage	1.5e-17	38.0
AYE61046.1|485394_485625_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61047.1|485843_486056_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61048.1|487302_488481_+|transposase	transposase IS1201	A0A220NQR7	Corynebacterium_phage	8.8e-38	29.5
AYE61049.1|488753_490349_+	lactococcin A	W8CYL7	Bacillus_phage	3.1e-09	20.8
AYE61050.1|490345_491929_+	ABC transport protein ATPase and permease	A0A076FI99	Aureococcus_anophage	3.3e-16	24.6
AYE61051.1|492345_492597_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61052.1|492693_492867_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61053.1|493237_493585_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE61054.1|493639_493855_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE61055.1|493829_495167_+|transposase	transposase	A0A218MNE7	uncultured_virus	1.3e-37	26.7
AYE61056.1|495624_495921_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
495347:495362	attR	NA	NA	NA	NA
AYE61057.1|496081_496345_+	toxin-antitoxin system	NA	NA	NA	NA
AYE61058.1|496409_496724_+	PemK family protein	NA	NA	NA	NA
AYE61059.1|496773_497631_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE61060.1|497702_499097_-|transposase	transposase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	2.8e-51	42.6
AYE61061.1|499276_499594_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE61062.1|499750_500083_+|transposase	transposase	G3MB42	Bacillus_virus	5.0e-07	35.2

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>CP017982|507173:552700|DBSCAN-SWA
AATGTATCAAAATTATACCACAGGCCAAACTGCTTTAACACTTAATCTGGACTTTACTATCCCTAACAATCATTTAGCCAACACAATCAGCTGCTTCGTTGATTCTATTCCGGAAGATGTTTTGCTGGGTGATACCGCTAAAACTGGACGGCCTGCTTATCATCCGGCTATGATGCTTAAGATTTTGCTTTTTGCATATTCCAGAAGAGTATTTTCAGGCAGAAAGATTGAATTAATGCTGGAAGAAAACCTGCCTATGATGGTGTTGGCAGAGCACCAAAAGATTTCATATCATACCATCAATAACTTTAGGTCTAGTGATCACGCCAATGAACTGGTTAAGAAAAGCTTCCTCTACTTTACCAATTTGTTAGAAGCAGAAGGTCTAATCAATGAGGGCGCCATCTTTATTGATGGTACCAAGATTGAAGCTGACGCTAATCGCTATACTTTTGTTTGGCGCAAGGCAGCTGAAAAGTTCCATGAAAAGCTCAAAGGCCAAGCAGTTGAACTTTATGATGAACTGATTGCCAAAGAAGTAGTCAAAGCAATGGCTCAAGAAAAGGTACAAACCAGTCAAGGCTTAGAAGAACTAGCGCAAGAAACAGAAGATGAGATTGAAAAGCTGACTAAAGAAATTGAGCAAGAACCTAAGGCAATTCCTGGCGGCTCGCTTAGAAAAGCAAGAAGACGTGGTCTTAAAAAGCTGCTTCATAGGCTAAAAAAAGACTATGTTCCTCGCATGAAGAAATATGAAGAAGCAGAAGAAATCTTTGCTGGACGCAACAGCTATTCCAAGACTGATCATGATGCGACTTTTATGCATATGAAGGAAGACCATATGAAGAATGGTCAGCTGAAGCCAGGCTACAATATTCAAGCCGCTACAACGGATCAATATGTAGTCGGCTTTGCCTTGTACCCTAACCCAACTGACTTTAAGACATTAGAACCATTTTTAAAGCAGATGCCAATATTAGATAAGTTCGATAAGATTGTCGCCGATGCTGGTTATGGCAGCGAGTACAACTATTCTATGCTAGAGAAAGAATATCCAGACAAGAAGTACTATATTCCCTACACTATGTATGAAAAGGAAAAGACCAGAAAATATCGCAACGATCCGACTAAGCTGGCTAACTGGTTCTATGATGAAAAAGATGATTACTATCTTGATCAAAATGGCGTCAGGTTCAACTTTAAGTATTATAGTCAGCGTAAAGACCGCTCGACTGGTCAGGTTCGTGATTTTAAGGTCTATGAAGCAGATGAATTCCAACTAACGCCAGAATTAGAACGCCTAGCCAAAACCAAAAGTGGTCGTCAACGCCAAGTACGCTATAATCCTAACTGGCAGTATTTAAAGGAAAAAGCCAAAGAAGTTCTTCAGAGTCCTGAAGGCAGGCACATCTACAGCATGAGAAAGTATGATGTGGAGCCAATTTTTGGACATTTGAAGAACGTTTTTGGCATGCGTCGAACTCATTTAAGAGGCAAAAAGAAGGTTGAAACTGATGTTGGCATAGCCTTCATGATGATGAATTTAAGCAAATATTGGAACAGAAGATGGTCAAAAGACCAATTTTCTTTGTTCAAAAATAAAAATAGAGAGAAAAAACGACCAATCAAACTCAAATTAAGAGTTGAATTGATCGTTTTTCAGTATCTAAGGGTTGGTTATTTCCCAGACACTTTTGTTTATAATTTAATTTCTTCTTCTGGTAATTTAACTGTTAATTTTTCAAAAGAAAAAGGTTTAATCAATGAAATCTCATAAGCGTCGAGTGCCAAGTCTTCTCCACCAAAGTTGGGATTATACAACGGATCGCCAATAATTGGTGTACCAAGGGATGCGAGGTGCACACGAATTTGGTGAGTACGACCAGTTTCCAAAGTTAGTTTAACTACCGCTGTATTATTATCATTTCTTTTTAACACTTGATAATGTGTTACGGCATGAAGTCCAGCAGGTGAGATCATTCTTTTTCGTTGATCTTCAGGATCATGATCAATTGGCTGATTAATTGTTCCTTGATCGCTTAATTTATCTGCATGGTCAACTTTAGCCAAATAATCGCGATGGAAGGTTTTACTGGTGAGTTCACGATTTAAAATCGGCACTACTGCAGGATTTTTTGCGACAAGCAGTAAGCCACCGGTAAGCATGTCCAATCGATGAACAATGTAAGGACTTTGTCCTAAATAGGTGGCGCAATCATTTAAGGTGGTATTGGTTTCATTTAAGTTGGGGTGAGTTTTTTGCCCCTTCTTTTTGTTAATGATTAAAAGATTATCGTCTTCATAAATGATATCAGGCAATTTTCCACTAGCTGGATATTTTTGTTGAGCAGAGTCAACCTGATCTAATATAATGTCAATTTTATCGCCTGGCAAAACATTTTGATTAAAATAGCGATATGTGCCGTTAATTGTAATATTTTGTTCAATTCTTAAGTAATGACGCCATTTTCTCGGAATAAGCAATTTGCGTAATACGTCATTTACAGGTAAGGGCTCGAGATTTTTAGGATAAAAAAGTGTAAAATGATAAACCATAAATATTTCCTAAGACTATTTCATTTCTAAACAAGTGTACTAGCAATGTGATACAATTTTCTTGTTTCTAAAAAGGAGCATTGTATTAATGAATAATGACCAACCAAAGAGAAGTGGCTTTAAAGATGTTTGGCATCGAATTGATCGCCGCTTCTTTATCGGACGCTGGATTATTTTAATCCTGCTCACTCTTATATTGATAACTTGTACATATTATACAATTAAAGTTAAAACTTCGAATATTTCAAATTTGAAGGCATCACTTTCAACGACTACAACTATTTATGACTATAAAGGCAAAAAAGCTGGTTCTTTATATTCACAAAAAGGAACGTTTGTTGAATATGATAAAATTTCTCCTAATATTCAAAATGCTGTGATTTCTACAGAAGACCGTACTTTCTGGAAGAATCCTGGCCTTAGTATTAAGGGAATGGCCCGTGCTGCGATAAGTTTGATTATTCACCACGGACAAGTAACCGGTGGTGGTTCAACTTTAACGCAGCAATTAGCCAAAAATTTGCTTTTAACTCAGCAGCAAACTTTTTCACGTAAATTAGAAGAACTATTCTTTGCGATTGAAATTAACCATGTTTATTCCAAAAAAGATATTCTGACGATGTATTTGAATAATGCTTATTTTGGTAATGGAGTCTGGGGCGTTCAAGATGCAAGTCGCAGGTACTTTGGTAAAAATGCTAGCGATGTCACAGTAGGTGAAGCTGCAACATTAGCAGGAATTTTGCGTAATCCAAGTTTTTACAATCCTGTTGATCATATGGCTAATGCTTTATCACGGCGCAATTTGATTTTAGGATTAATGGCTGACAACGGTAAGTTAACTGCCACTCAAGCTAAAGCTTATTCTAAACAAGGATTAACTCTGAGAAATACGTTTAGAAATAAATATGGCTATCGCTATCCATATTTCTTTGATGCTGTAGTAGATGAAGCTATTAGCAAATATGGCTTAACTGAAGAGCAGGTAATGAATAAAGGACTTAAGATTTACACTACTCTTAATCAAAATTACCAAGGAAGATTGCAAGATACCTTTAATGAAAGCTGGCTTTTCCCACAAAATGGTGCTGATGGCACAAAGTGTCAAGGTGCGAGTGTGGCAATGGATCCAGAAACAGGTGCTGTAAGAGCGGTAATCGGTGGTCGCGGCAAGCATGTCTTCCGCGGTTATAATCGTGCAATTCAAATGAAGCGTCAGCCTGGTTCATCAATTAAGCCAATTGCTGTTTATGCACCAGCTCTTCAAAATGGCTATCATTATGATTCTGAACTTTCCAATAAGTTGCAGAAGTTTGGTAAAAATGGTTATGAGCCTCACAACGTGGATAATGGCTATTCTGATAAAATTCCAATGTATGAGGCTTTGGCTCAAAGTAAAAACGTTCCTGCAGTATGGTTACTCGATAAAATCGGTGTAAACAAGGGCGTCCAATCTGTTCAGAATTTTGGTATAAAGGTGCCTAAGTCAGATCGTAACTTAGCTTTGGCTTTAGGCGGATTTTCTACAGGGGTTTCACCTTTACAGATGGCTCGTGCATATTCTGCCTTTGCCAATAAGGGTAATTTGCCTAATAATTCCTACTTTATTACTCAAATTACCGATGCCAGTGGCAATGTTTTGGTTGAAAATAATAATCCAGGTAATCATAGAATTATTTCTGAAAATACTGCCAAAGAAATGACAACAATGATGCTTGGCGTTTTCACTAATGGTACTGCGCAAACTGCTCAACCTAATGGCTTCCGGGTTGCTGGTAAAACTGGTTCAACTGAAGTTCCTAATTCATATGGTTTTGGAACAAGGGACCAATGGATTGTCGGTTATACTCCTGATATTGTGTTAGCTACTTGGGTTGGTTTTGACCAAACAAGCAAGCAGCGTTATATGCAAGGAGTATCAGAAACAGGGATCACTAGATTGTATAAGGCAGAAATGGAAGGGATTTTACCGTATACTGCTCAAACGCAATTTACCGAAAAATCGCCTGGTCAACTTGTTAAAAACAATGGATCTAATTTTGATTGGACCAATGGCTTAGGACAAAAAATTCAAGCTGGCATTGGATCAGCAGGACAGAAAATTAATGAATGGTATAATGATGTCAAAGGTTTATTTGGCCAATAAAATTTAGGAGGACCAATTTAATGATTAATATTTATGATTCAGCTAATCAATTAGCACAAGATTTAACAAAGACTGACCAATACAAGGCTGTTGGTGACGCTGTTAAGGCTGTTCAAGCAGACGACGAAAGTGCAGCTTTATTTAAGAAGATGGATGAGGTTCAAGCTAAGATTATGCAAGCTCAACAAACTGGCAAGCCATTATCTGATGAAGATCAAAAGGCTTACCAAGAATTAAACGCTCAAGTACAAAAGAACGACAAGATTGTTGCTCTTCTTAAGAGTGAACAAGGCTTGTA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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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AYE61072.1|509816_511874_+	penicillin-binding protein	NA	NA	NA	NA
AYE61073.1|511894_512245_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61074.1|512253_513474_+	phosphoesterase	NA	NA	NA	NA
AYE61075.1|513454_515956_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
514154:514171	attL	NA	NA	NA	NA
AYE61076.1|515948_516926_+	CMP-binding factor	NA	NA	NA	NA
AYE61077.1|517073_518831_+|transposase	transposase	A0ZS58	Staphylococcus_virus	4.8e-88	36.9
AYE61078.1|519337_520240_-	peptidylprolyl isomerase	NA	NA	NA	NA
AYE61079.1|520356_520692_-	putative tropomyosin	NA	NA	NA	NA
AYE61080.1|520701_521139_-	histidine triad (HIT) family protein	D7NW73	Streptomyces_phage	5.4e-09	34.9
AYE61081.1|521350_521605_+	RelE family toxin-antitoxin system	NA	NA	NA	NA
AYE61082.1|521634_521970_+	XRE family transcription regulator	NA	NA	NA	NA
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AYE61092.1|528882_529491_+|transposase	transposase	A0A1V0SJI5	Klosneuvirus	3.0e-34	43.2
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AYE61097.1|538907_539117_-|transposase	transposase	A0A2I6AZV9	Macacine_betaherpesvirus	6.8e-10	53.2
AYE61098.1|539537_540260_-|integrase	DNA integrase	NA	NA	NA	NA
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AYE61102.1|542200_542779_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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AYE61113.1|552538_552700_-|transposase	transposase IS1201	NA	NA	NA	NA
555732:555749	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>CP017982|571089:619933|DBSCAN-SWA
TATGAGTTTTTCAATCACTTTGCCTGATGGCTCAAAGAAAGATTTTGAAGAAAGTTTAACTATTGCTGACTTAGCTCAAAACATTGCAACTTCACTTGGTAAGGCTGCTGTTGCTGGTAAGGTTAACGGTGAACTTAAGCCCCTTGATTACAAGCTTGATAGTGACAGCGAAGTTGCTATTATCACTAATAAAGACGAAGAAGGCTTAGATGTTTTACGTGCTACTGCTGCTTTTGTATTTGAAGCTGTAGCTAAGTGTGAATATCCTGAACTTCGTTTAGGTGAACATGTAGCTGACGAAGGCGGCTTCTATGTTGATACTGATAAGGATGACCAAATTAAAGTTGGTGAATTACCAAAGCTTGAAAAAGCTATGCAAAAGGTAATTAAGAACGGTGAAAAGATTGAACACGTTCAAATTGCTAAGTCAGAACTTGAAGAGCTTTACAAGAATGATAAGTTCAAGAGCGAACTTCTTGCTAAAGTTGAAGGCGATACTGTTGATGCCTACAAGCTTGGTGATTTTGTTGACTTTGGCTTCGATGCTTTGCTTCCAAACACTGGTAAGATTAAGCAATTTAAGTTATTGTCAGTAGCTGGTGCTTACTGGTTAGGTAAGTCATCAAACCCAATGCTTCAAAGAATCTTTGGTACTGCATTCTTTAAGGAAGCTGATTTAAAGGCTGACCTTAAGCGTCGTCAAGAAATTAAGGAACGTGACCACAGAACTATTGGTCGTGACCTTGACCTCTTCTTCGTAGATCCTAAGGTTGGTGCAGGTCTTCCATACTGGATGCCAAAGGGTGCTACTATTCGTCGTGCTGTTGAACGCTACATCATTGACCGTGAAGTAGCAGACGGTTACCAACACGTTTACACTCCAGTACTTATGAACCTTGATGCTTACAAGACTTCAGGCCACTGGGCACACTACCGTGATGACATGTTCCCACCAATGGACATGGGTGATGGTGAAATGCTTGAACTTCGTCCAATGAACTGTCCTTCACACATTCAAATCTTTAAGCACCACATCCGTTCATACCGTGATCTTCCACTTCGTGTTGCTGAACTTGGTATGATGCACAGATATGAAAAATCAGGTGCTTTGTCAGGTCTTCAACGTGTACGTGAAATGACTTTGAACGATGGTCACACATTCGTAGCTCTTGATCAAGTTCAAACTGAATTTGCTAAGATCTTGAAGTTGATCATGGAGGTATACAAGGACTTCGATATTACTGATTACTACTTCAGACTTTCATACCGTGATCCAAAGAACACTGATAAGTACTTTGCAAATGACGAAATGTGGGAAAAGTCACAAAAGATGCTTAAGGGTGCTATGGATGATCTTGGCCTTGACTACGTTGAGGCTGAAGGTGAAGCTGCATTCTACGGTCCAAAGCTTGATATTCAAACTAAGACTGCTTTGGGTAACGATGAAACTATGTCAACTATTCAACTTGACTTCATGCTTCCAGATCGTTTCGGTTTAACTTATGTAGGTAAAGATGGTGAAGAACACCGTCCAGTTATGATTCACCGTGGTATTGTTGGTACTATGGAAAGATTTATTGCTTACTTAACTGAAATTTACAAGGGTGCATTCCCAACTTGGCTTGCTCCAGTTCAAGCTGAAATTATTCCAGTTAACAACGAAGCTCACGGCGAATACGCTGAAAAGGTTCGTGCAGAACTTGCTAAGCGCGGCTTCAGAGTAGAAGTTGATGACAGAAACGAAAAGATGGGTTACAAGATTCGTGAATCACAAACTCAAAAGGTACCTTACACTTTGGTATTAGGTGACGAAGAAATGAAGTCAGGCAAGGTTAACCTACGTCGTTACGGTACTGATGAAGAAATTTCTAAGAGTCTTGATGACTTCATTAACGAAATTGACGCTGACGTTAAGTCATACTCACGTGAAAACTAATTAAAGAGGCTCTTTGTCAAATCCTGTTGATAGAGAGTAAATGAATAGAATCAAGCGGCCATTAAAAGGCTGTTTGGTTCTTTTTCTTTAAACAAGTTTTCCTCTAAACGAATTCTGGTTAAAAGATTGATAAAGTTAGAATAGCCGAAGGCTGTTCGCTCAATTTGTTTGATTTTGCGATTGAAGCCTTCAAGGCAGCCATTGGAGTAAGTCAAAGCTGCTCCGTTGAGTACCGCTTTTAGATTATGTTTGAAGGTTAGCAGCGTTTTATGCATTAAAGCTCTGCATCAGATTATATGAGTTTTCTAATGTAGTGTTGGCACCGATACCCTCCATCACTACTTGCACTTGAGTTAGGCAATCTTTATAATGCCAATTATAGCGAGGATGAATCTTTTCGAGTTCATCATACTTTTTTAAATATAGTTTCCAGGGAGATTTGAGCAGCTGATACTCTCTGGATTTCTTGTCAAAGGTCTTCATGGTTCGAACTCTTAATGAATTGAATGATCGAGTGAGCATATGAATCATGTGGAAGCGATCAATGACAATCTGTGCATTAGGGAAACAGGCTCTGACAATGTCCTGATAGTAAAAGTTGAGATCCATCGTAACGGTTCTAACGTTGGCTCTGGCTTGAGGCGAAAAACGTCCAAAATACTTAAGCAGGGTCTTCTTATAGCGTGTTCTAAGAATCTGAACGACTTGATGATTGTCACCATTTAAACAGATAAAGTGCAGCTGACGATCAACGCCCTTGAACTCATCAAAAGCTAAATGAGCTGGCAAGTATTCATAGCTGTCAAGGAAACGGTGAGAGCAGCTGCATAAAACTCTTTGAACAGTGTTGACAGAAACATTGTTTTCGCTGGCAATGCTGGTCATAGATCGGTCTTCAGTTGACGCAGACAAAATTTTTAGCTTAGAGGCATTAGAAATAGAACAGTACTTGCTTGCCAATTCTGATTGGGCCATTGACCAGCGACTGCAATCACGGCATCTAACTCGCTGTTTAGCTAGTCTAATAGTTACTGGATGGCTGGCATTAGCTGTTAAATAGCGAATGTTGGTAATCAGATGTCCATTATGCAAAAGATCTAAAGAGCCACAGCAAGGGCAAGCGGGTTGAATTCATTCGGCTTCATAGATTTTATGCTTCTTCATTTGAACCATCTTGTAGAAAAAGCTCTTAAAAACAATATTTTTATCTTTAATATCAAGCGCAAATTTAATACAATTATTTAAAGAGGACATAGTACACACCTTTACTTATAAAATGTTTAGTGGAATAGATTTTTTATTGCAATAAAAAAACTGTTAACAGCTTATCATATTGATAAGCAATCAACAGGAAAAATTATAGAGTAACATAATTGAAGTTGATGCACATGGAAATCAAGTATTCAATTTGACAATTACTAATAGTGCTAAGGACATGACTTATGTATATCGGGCATATAGAATGCAATTCTATCCTGATAACTATGTTTTTGATGTAACTAAATAATTGCATATCATGTATTGACGCGAGTAGTTTAAACGCGTATAATACAGCTAGTTGAGAACAAGAAGAAGCTCCCGCTTCTCGCCTAAGTTAAGTAAACCTCTGGGCTGATCGATAATTTCTGTTGATTAGAGGCAGGTGATACTTATCCCGCCTTTTTCTTGTCCTCAAATTAACACGGAGGTGAATAATCATACCAAGAAGTTTAATCTTAAACGAAAGAATTCGTGCACGCGAAGTTCGTTTAATTGATGAAGATGGTCAGCAAGTTGGTGTTGTATCTAAGAACGAAGCTTTACATAAAGCAAGTGATGCTGGTTTAGATTTAGTTCTTATTTCACCTAATGCTAAACCACCTGTAGCACGTATCATGGACTACGGTAAATATCGTTTCGAACAACAGAAGAAACTTAAAGAATCCCGTAAAAAGTCCAATACAGTTAGTGTCAAAGAAATTCGTTTGAGTCCAACTATTGAAGGCAACGACTTTGAAACTAAATTGAAGCATGTTCGTAAGTTCATTTCTAAAGAAGGAGCTAAGGTCCGTGTATCAATTCGTTTTAGAGGTCGTGCCATCACTCACAAGGAATTAGGTCAACAAGTTCTTGAAAAGATGGCTGAAGCAACTTCAGATATTGCTAATGTTATCAGTAAGCCTAAGATGGAAGGCCGTTCAATGTTCTTGATGTTAGCACCTAAGAGTGATAAAGACAAAAAGAAAAAGTAGTTAATTGGAGGAAATAGGAATATGCCAAAAATGAAAACACACCGCGCTTCTGCTAAGCGTTTTAAGAGAACTGCAAATGGTGGTTTAAAGCGTCACCACGCATTTACTGGTCACCGTTTCCATGGTAAGACTAAGAAGCAACGTCGTCACTTGAGAAAGGCTGCTATGGTTTCACGTAGCGACATAAAGCGTATCAAGCAAATGCTTGCTCAAATGCACTAATTATTAGTTCTTGATAGACTGACTATAGTAGGAGGAATTTTAAATGCCAAGAGTTAAAGGTGGAATTGTAACACGTAAACGTCGTAAGAAGGTCATGAAGCTTGCCAAGGGTTACCGCGGCGCAAAGCACATGCAATTTAAGGCTGCAAGCACTCAATTATTCGTTTCATACAAGTACGCATTCCGCGACCGTAGAAGACGTAAGAGCGAATTCAGAAAGTTATGGATTGCTCGTATTAACGCAGCTGCAAGACAAAATGATATTTCATATTCTAAGTTAATGCACGGCTTAAAGTTAGCTGGTGTTGACATGAACCGTAAGATGTTAGCTGATATTGCTTACAACGATTCAAAGACTTTTGCACAATTAGCAGAAACTGCTAAGAAGGCATTGAACTAATTATCATTAGAAATAGAGATTAGGAGATAGTCCTGATCTCTATTTTTTTCGCTAAAATATTATTTTTCGATATTAATGAAACAAAAATTTCTAATGCAACTCCATTTTTGATATTATAGAGAATGAGAGAAAATGGAGAATTTTTATGTTATTTAGACCAAAATATACAATAAATACAATTTATAATTTGGACCCCGTCAAATTGAATGAA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MALTYQIGVDAGGTHSTAIAYDENGKELGRAEGGPGQINADYEGGIKNISDTINELLNKIDGDCMRVLVGIAGLSVVGNAPEVAATISSRINNLPTRAITDSLLALYAGLEGDDGALVIAGTGSVYNGLQNGHLIAVGGYGNILGDEGSGYAIARSAMQSALLSWDKREDNALIPMFTKLFGVEHMDECTAKFYRMSNPEVAGMAVHVAKLADEGSDDAIKVIQQQAHLLARDIIIGLDRYEDPKPMKIALTGSVLANNEMMRGIIEDEVKDKYPDAIFSISNGENARAVLFDKSKDYRYFTNHEDR
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MKQKINLSQSFVTLGILIGLLIVFLIEVFLGGSENINVLMKMGAMNNYAVVAGHQWWRLFAAQFLHIGVMHLVSNAIIIYYMGQYMEPIMGHVRFLVTYLLAGIGGNLFSLAFSSDRGLSAGASTALFGLFGTMVAIGLRNLHNPMISFLGRQALVLALINLALDIFVPGIDIWGHIGGLITGFLLAIILGDRVMRTYNPKWRVLAGAVLIVYIVWTVRTGMVISF
>CP017982|571089:619933|590406_590883_+|AYE61152.1|DBSCAN-SWA
MPEKSYPMTAEGKEKLQAELKNLKLVKRPEVIERIKVARSFGDLSENSEYDAAKDEQSHVEDRIAQVEEMLKYAQVVDADSVDPNEVSVGKTVTYTEVGTDDAETYTIVGSDESDPLNGKISNDSPIAQALLGKKKGETVSITTPGSQFDVVINNVEA

Homologous phage analysis in the prophage region

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AYE61131.1|573291_574116_-|transposase	transposase	A0A2D1GQC1	Lysinibacillus_phage	1.9e-07	23.4
AYE61132.1|574155_574278_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE61133.1|574898_575255_+	translational initiation factor IF3	NA	NA	NA	NA
AYE61134.1|575276_575477_+	50S ribosomal protein L35	NA	NA	NA	NA
AYE61135.1|575520_575877_+	50S ribosomal protein L20	NA	NA	NA	NA
AYE61136.1|576022_576547_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61137.1|576539_577649_+	GTP-binding protein YqeH	NA	NA	NA	NA
AYE61138.1|577659_578316_+	Nicotinate-nucleotide adenylyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE61139.1|578296_578890_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61140.1|578911_579259_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61141.1|579264_580416_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61142.1|580417_580972_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61143.1|581134_581851_+	two-component system regulator	W8CYM9	Bacillus_phage	1.8e-25	30.1
AYE61144.1|581837_583397_+	two-component sensor	Q8QNA2	Ectocarpus_siliculosus_virus	3.2e-11	32.2
AYE61145.1|583433_583922_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61146.1|583969_584932_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61147.1|584978_585251_-	acylphosphate phosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
AYE61148.1|585348_586116_+	rRNA methylase	NA	NA	NA	NA
AYE61149.1|586227_586578_+	putative transcription regulator	NA	NA	NA	NA
AYE61150.1|586862_587912_+|tRNA	phenylalanyl-tRNA synthetase alpha chain	A0A2K9L3A8	Tupanvirus	5.3e-34	37.3
AYE61151.1|587915_590330_+|tRNA	phenylalanyl-tRNA synthetase beta chain	NA	NA	NA	NA
AYE61152.1|590406_590883_+	transcription elongation	NA	NA	NA	NA
AYE61153.1|590945_591860_+	L-2-hydroxyisocaproate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
AYE61154.1|592380_592653_+	putative transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AYE61155.1|592708_594103_-|transposase	transposase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	7.0e-50	41.9
AYE61156.1|594186_595110_-	BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein	NA	NA	NA	NA
AYE61157.1|595216_597808_-	putative ABC transporter	NA	NA	NA	NA
AYE61158.1|597898_600007_+	penicillin-binding protein	NA	NA	NA	NA
AYE61159.1|600083_600233_+	50S ribosomal protein l33	NA	NA	NA	NA
AYE61160.1|600295_600856_+	5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase	NA	NA	NA	NA
AYE61161.1|600876_601557_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61162.1|601557_601785_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61163.1|601843_602245_+	putative rhodanese-related sulfurtransferase	NA	NA	NA	NA
AYE61164.1|602323_603244_+|tRNA	tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase	NA	NA	NA	NA
AYE61165.1|603308_603728_+	DDE endonuclease	NA	NA	NA	NA
AYE61166.1|604446_604875_+	aluminum resistance protein	NA	NA	NA	NA
AYE61167.1|605003_606341_+	glutamine synthetase	NA	NA	NA	NA
AYE61168.1|606680_607028_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE61169.1|607082_607298_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE61170.1|607272_608610_+|transposase	transposase	A0A218MNE7	uncultured_virus	1.3e-37	26.7
AYE61171.1|608715_609585_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61172.1|609722_610628_+	putative ABC transporter	NA	NA	NA	NA
AYE61173.1|610725_611736_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61174.1|611802_612288_-|transposase	transposase	A0A2I6AZV9	Macacine_betaherpesvirus	1.2e-33	46.5
AYE61175.1|612364_612748_-	Transposase domain protein	NA	NA	NA	NA
AYE61176.1|612856_613201_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE61177.1|613311_614304_-	UDP-galactose 4-epimerase	A0A2K9L1R4	Tupanvirus	1.1e-52	39.9
AYE61178.1|614408_615365_-	beta-galactosidase small subunit	NA	NA	NA	NA
AYE61179.1|615348_617235_-	LacL	L0N6M2	Herpes_simplex_virus	1.8e-93	33.5
AYE61180.1|617461_618469_+	LacI family transcription regulator	NA	NA	NA	NA
618522:618549	attL	NA	NA	NA	NA
AYE61181.1|618550_619933_-|integrase	DNA integrase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	4.0e-58	46.7
AYE61181.1|618550_619933_-|integrase	DNA integrase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	4.0e-58	46.7
625363:625390	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>CP017982|625391:668101|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AYE61188.1|625391_626024_-|transposase	transposase	A0A2I6AZV9	Macacine_betaherpesvirus	7.0e-50	51.5
AYE61189.1|626564_626690_-	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AYE61190.1|626908_627862_+	shikimate 5-dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
AYE61191.1|627998_629144_+	permease	NA	NA	NA	NA
AYE61192.1|629159_629534_+	3-dehydroquinate dehydratase	NA	NA	NA	NA
AYE61193.1|629565_629904_+	3-dehydroquinate dehydratase	W6LP76	Streptococcus_phage	1.3e-10	35.1
AYE61194.1|630294_631956_+	formate-tetrahydrofolate ligase	NA	NA	NA	NA
AYE61195.1|631966_632455_+	hypothetical protein	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	4.8e-22	45.1
AYE61196.1|632438_633584_+	phosphoribosylaminoimidazole carboxylase	NA	NA	NA	NA
AYE61197.1|633779_634496_+	phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase	G8EYA2	Synechococcus_phage	2.8e-39	37.4
AYE61198.1|634495_634747_+	putative phosphoribosylformylglycinamidine	NA	NA	NA	NA
AYE61199.1|634746_635418_+	phosphoribosylformylglycinamidine synthase I	NA	NA	NA	NA
AYE61200.1|635414_637646_+	phosphoribosylformylglycinamidine synthase II	A6N228	Microbacterium_phage	7.8e-144	38.9
AYE61201.1|637621_639055_+	amidophosphoribosyltransferase	A0A0M3SGR2	Mollivirus	3.1e-61	35.3
AYE61202.1|639080_640130_+	phosphoribosylaminoimidazole synthetase	A0A0E3F0L1	Synechococcus_phage	9.2e-63	43.9
AYE61203.1|640126_642262_+	phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase	Q58MG4	Prochlorococcus_phage	9.6e-75	46.3
AYE61204.1|642274_643531_+	phosphoribosylamine-glycine ligase	NA	NA	NA	NA
AYE61205.1|644100_644580_+	RpiR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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AYE61207.1|645572_646721_-	branched-chain amino acid ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
AYE61208.1|646701_648246_-	ABC transporter	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	2.0e-18	30.4
AYE61209.1|648314_649400_-	putative lipoprotein A-antigen precursor	A0A0A7DN02	Lactobacillus_phage	3.0e-77	47.5
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AYE61212.1|651035_652265_+	permease	NA	NA	NA	NA
AYE61213.1|652380_653718_-|transposase	transposase	A0A218MNE7	uncultured_virus	1.3e-37	26.7
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AYE61215.1|653962_654310_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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AYE61217.1|656996_657803_+	oligopeptide ABC transporter binding protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10

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MRRPFTTNITARLIRAIAVGLVTGLIVSIFRWIIDQTMQLLYHLYPQMAAHQVLILSYILLMIFITFILGKITAPYLDQVIGSGVPQIEAIFLNENQMPWWSIIWRKFIGGLLAIYPGLMLGREGPCIEMEAMIGQGLAEKTFKTDAEGLKEMQECGVAAGLAAAFSAPIAGALFLVEEISFSFKPRKVISILAATFSADFVTILFFVNKPCLYLPVNGYLPVKIYWSLPLIGIALGLLAYLYQYVLLSLKPWFSKIKKLPATYHSIIPFVLIIPVGLWNARLLGGSHVLIDDLFNNNLGLHQISSWSFITIPILLFMIHFIFSMLSYGSSVPGGIFMLILVLGALLGIICANLLIKVQIIAPMYYPHILVISMAAYFGAIEKAPFTAIMLLTEMVGTIQQVLPMIITVFFAYYVLDLLGGKPIYEALRLQMNYHKLN
>CP017982|683882:718335|688894_689437_+|AYE61252.1|DBSCAN-SWA
MFRTWHQPGKIINRKSVYTGRVFSVDQLHIETPDGLRVERDLIKTAPTITILAITANEEVVMTSEYRAGVNSDSVSLPAGIVNPGTSEQAAKRELQEEAGYIADTVTKMTRITSSEGFMDQFADLMLIKFDPQKRVQPHFDKDEFVNSQLVPLQQVLKWIKSGAVNTAQAVSAISYYMLF

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AYE61246.1|683882_684242_-|transposase	transposase	H7BWC8	unidentified_phage	9.5e-20	41.1
AYE61247.1|684225_684930_-|transposase	transposase	Q9MBM9	Staphylococcus_prophage	9.6e-24	31.3
AYE61248.1|685042_685672_-	phosphoglycerate mutase	NA	NA	NA	NA
AYE61249.1|686073_687174_+	MFS transporter	M1Q1P2	Streptococcus_phage	3.4e-92	46.8
AYE61250.1|687161_688328_+	phosphoglycerate dehydrogenase	M1NSB9	Streptococcus_phage	1.7e-97	46.7
AYE61251.1|688495_688810_+	chaperone transmembrane protein	NA	NA	NA	NA
AYE61252.1|688894_689437_+	NUDIX hydrolase	NA	NA	NA	NA
AYE61253.1|689565_690348_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE61254.1|691053_692097_-|transposase	transposase	H7BUM7	unidentified_phage	2.2e-40	31.9
AYE61255.1|692301_693471_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
AYE61256.1|693722_693989_+|transposase	transposase, ISSmi4	NA	NA	NA	NA
AYE61257.1|694394_694928_+	surface layer protein	NA	NA	NA	NA
AYE61258.1|695251_696997_+	peptide ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
AYE61259.1|697095_697263_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61260.1|697253_697385_+	Xre family toxin-antitoxin system	NA	NA	NA	NA
AYE61261.1|697409_698570_-|transposase	transposase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	2.7e-55	47.3
AYE61262.1|698840_700013_+	Permease of the major facilitator superfamily	NA	NA	NA	NA
AYE61263.1|700430_700709_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61264.1|700746_700989_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61265.1|701464_702781_-	chloride channel protein	NA	NA	NA	NA
AYE61266.1|702903_705528_-	Cation-transporting ATPase PacL	M1IAU8	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	4.0e-83	29.6
AYE61267.1|706110_706698_-	sugar ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
AYE61268.1|706694_707267_-	sugar ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
AYE61269.1|707964_708588_-	orotate phosphoribosyltransferase	S4VS55	Pandoravirus	9.1e-26	30.3
AYE61270.1|708589_709294_-	orotidine 5'-phosphate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
AYE61271.1|709549_710473_+	dihydroorotate dehydrogenase 1B	NA	NA	NA	NA
AYE61272.1|710639_711182_+	uracil phosphoribosyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE61273.1|711326_712283_+	aspartate carbamoyltransferase	A0A1J0F9B8	Only_Syngen_Nebraska_virus	8.2e-26	34.8
AYE61274.1|712282_713560_+	dihydroorotase	NA	NA	NA	NA
AYE61275.1|713559_714645_+	Carbamoyl-phosphate synthase, small subunit	R4TGJ8	Halovirus	6.6e-56	35.5
AYE61276.1|714637_717826_+	carbamoyl phosphate synthase large subunit	NA	NA	NA	NA
AYE61277.1|718038_718335_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>CP017982|779752:824817|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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AYE61338.1|780580_780922_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61339.1|780926_782357_+	Signal recognition protein Ffh	D6PHS7	uncultured_phage	1.4e-05	27.0
AYE61340.1|782446_782719_+	30S ribosomal protein S16	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12

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Homologous phage analysis in the prophage region

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830002:830017	attL	NA	NA	NA	NA
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AYE61387.1|833464_834259_-	homoserine o-succinyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE61388.1|835420_835873_-	cardiolipin synthase	NA	NA	NA	NA
AYE61389.1|836015_836513_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61390.1|836580_838854_-	cation transport ATPase	M1I547	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	5.5e-44	24.4
AYE61391.1|838982_839837_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AYE61392.1|840721_841150_+	arginine deiminase	NA	NA	NA	NA
AYE61393.1|841397_842006_+	ornithine carbamoyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE61394.1|842200_842623_+	carbamate kinase	NA	NA	NA	NA
AYE61395.1|843149_843686_+	apo-citrate lyase	NA	NA	NA	NA
AYE61396.1|843806_844973_+	putative acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
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AYE61398.1|845152_845758_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61399.1|845980_846952_+|transposase	transposase	H7BUM7	unidentified_phage	1.8e-44	32.9
AYE61400.1|846962_847352_-	putative temperature-sensitive replication protein	NA	NA	NA	NA
AYE61401.1|847663_848878_-|integrase	integrase	F8J1D8	Lactobacillus_phage	1.5e-45	32.7
AYE61402.1|849229_849898_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61403.1|850054_850342_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61404.1|850835_851483_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61405.1|851535_851814_-	repressor	E9LUL3	Lactobacillus_phage	6.7e-05	36.9
AYE61406.1|851980_852364_-	transcriptional regulator	J7KJ52	Streptococcus_phage	4.7e-17	56.9
AYE61407.1|852532_852706_+	Cro-like protein phage associated	L0P7D3	Lactobacillus_phage	5.1e-19	80.7
AYE61408.1|853039_853885_+	prophage antirepressor	Q38330	Lactococcus_phage	4.1e-61	46.6
AYE61409.1|853897_854140_+	hypothetical protein	Q9T1I6	Lactobacillus_phage	1.3e-07	37.1
AYE61410.1|854152_854323_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61411.1|854553_854733_+	hypothetical protein	L0P6F4	Lactobacillus_phage	1.4e-08	47.5
AYE61412.1|854747_854909_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61413.1|854963_855527_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61414.1|855539_855911_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61415.1|855931_856813_+	prophage replication protein	A0A1S5SE30	Streptococcus_phage	6.6e-06	25.5
AYE61416.1|856815_857613_+	prophage replication protein	Q6SE93	Lactobacillus_prophage	1.5e-57	46.7
AYE61417.1|857638_858385_+	hypothetical protein	Q9AZA0	Lactobacillus_prophage	2.2e-63	71.1
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AYE61424.1|859743_859992_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61425.1|860039_860543_+	ArpU family transcriptional regulator	B8R690	Lactobacillus_phage	2.3e-11	38.2
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AYE61427.1|861897_862410_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61428.1|862402_863860_+|terminase	terminase	A5GYP8	Lactococcus_phage	5.1e-120	47.6
AYE61429.1|863872_865357_+	hypothetical protein	A8ATG1	Listeria_phage	1.3e-46	31.6
864312:864327	attR	NA	NA	NA	NA
AYE61430.1|865334_866111_+|head	SPP1 gp7 family phage head morphogenesis protein	A9DEG6	Yersinia_phage	1.5e-17	27.8
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AYE61433.1|867663_868212_+	hypothetical protein	D6PSX6	Lactobacillus_phage	7.0e-14	33.8
AYE61434.1|868214_869192_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61435.1|869191_869587_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61436.1|869583_870120_+	hypothetical protein	A0A1L2JY56	Aeribacillus_phage	1.4e-19	32.3
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AYE61438.1|870511_871075_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61439.1|871074_872337_+	hypothetical protein	A8ATH2	Listeria_phage	2.4e-49	36.2
AYE61440.1|872351_872777_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61441.1|872825_873305_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61442.1|873339_873495_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61443.1|873574_879154_+|tail	phage tail tape measure protein	A0A0A7DMV4	Lactobacillus_phage	8.5e-107	30.7

Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>CP017982|895573:930784|DBSCAN-SWA
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MTRAETKDEIIKGLMTTINNLNEEISFLREQVAYLTQKRYGKSSEQTPLSGQTSLFDEENFAGDEDEDLPC
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MNKKVGFSWSWPDVMGIIEMLLYLIGLVLIIFCFVSFADLLTRTITDQLPGKNSTVIKIFVMAILVIIGVTIAFKINDQLTAAYIRHLMKNSNGYSVDTLPMAIIEFFAGSIILGAINSFLIEKFD
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MKTRIFPVETEEIAYRRRRRKAKRANVLKAFASEEIHHQLTGKDLLCPDCQQKMKEIGSCPVRQELLFIPAQIKRLDHIQHAYKCQCCSLKNTSDKIVKAPVPKAPLAHSYGSASVIAHTIYQKYELKVPAYRQKNDWQKMGLPITRRDIINWQIKSTEYYFKPLYQLLKKKLLEQKFLHADETTYRVLESKTQKTFYWTFLSDKQAEKPITLYHHNPHRSGQVAIQFLGNYAGYLHCDMWQAYGQLAQATLVGCWAHVRRKFFEAVPPKASDKSISKQGVRYCNRMFALEKDWGNLSNEERLRLRRKKLAPLMKEFFNWCRKQKTRTLPNSKLGKAIAYSLNHEETFKHVLLDGRLVLSNNLAERAIKSLVIGRKNWLFSQSFNGAQSSAIILSLIETAKRNGLDPEKYLVYLLSNLPNESTLTDKEALSAYLPWEKAAQANCR
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MAEKETTQKLSLDKMVKKVVKDVKKDKPITEKDFTARLIKPYNLQGKAVDQLVQEFEDNGISIVDENGNPSKLALKKQKDVEKAELKDMSAPSGVRMNDPVRMYLKEIGRVPLITADQEIALAKRIEEGDEEAKQELAEANLRLVVSIAKRYVGRGMSFLDLIQEGNMGLMKAVDKFDYCLGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRIQRQLLQDLGREPTPEEIGAEMNMPTNKVRDILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDKDATSPEQHASYEMLKEQLEQVLETLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSNQLRDFMD

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AYE61465.1|895573_896017_+|tRNA	Glutaminyl-tRNA synthase b subunit	A0A0K2FLI9	Brevibacillus_phage	2.2e-10	35.2
AYE61466.1|896042_897002_+	phosphate starvation-inducible protein PhoH	W8D063	Erwinia_phage	1.7e-47	46.1
AYE61467.1|897004_897529_+	rRNA maturation factor	NA	NA	NA	NA
AYE61468.1|897528_898434_+	GTP-binding protein Era	NA	NA	NA	NA
AYE61469.1|898434_899187_+	DNA recombination and repair protein RecO	NA	NA	NA	NA
AYE61470.1|899440_900358_+|tRNA	glycyl-tRNA synthetase subunit alpha	NA	NA	NA	NA
AYE61471.1|900350_902414_+|tRNA	glycyl-tRNA synthetase subunit beta	NA	NA	NA	NA
AYE61472.1|902439_904275_+	DNA primase	A0A1S5RH70	Helicobacter_phage	7.3e-39	28.2
AYE61473.1|904291_905404_+	RNA polymerase sigma factor RpoD	A0A2I7SAT0	Vibrio_phage	2.4e-37	37.6
AYE61474.1|905522_906803_-|transposase	transposase	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	3.9e-47	31.8
AYE61475.1|907027_908365_-|transposase	transposase	A0A218MNE7	uncultured_virus	1.3e-37	26.7
AYE61476.1|908339_908555_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE61477.1|908609_908957_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE61478.1|909208_909853_-	Enterolysin A	NA	NA	NA	NA
AYE61479.1|909989_910214_-	MutT/NUDIX family protein	NA	NA	NA	NA
AYE61480.1|910352_911039_+	SAM-dependent methyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE61481.1|911031_911829_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61482.1|911848_913090_+	tripeptidase T PepT	NA	NA	NA	NA
AYE61483.1|913363_913711_+	GntR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AYE61484.1|913729_914437_+	ABC transporter ATP binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	2.8e-15	26.9
AYE61485.1|914436_915282_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61486.1|915726_916107_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
AYE61487.1|916129_916567_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61488.1|916714_917956_+|transposase	transposase	A0A0P0IJS6	Lactobacillus_phage	2.8e-119	57.2
AYE61489.1|918960_919617_+	replication-associated recombination protein A	G3MBE0	Bacillus_virus	1.3e-30	35.3
AYE61490.1|919613_919805_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61491.1|919949_920807_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE61492.1|920803_920974_-	Malonyl-CoA-(acyl-carrier-protein)transacylase	NA	NA	NA	NA
AYE61493.1|921574_921934_-	toxin MazF	NA	NA	NA	NA
AYE61494.1|921937_922207_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61495.1|922345_923758_+	DNA topoisomerase	A0A1X9I6W8	Streptococcus_phage	1.8e-05	26.2
AYE61496.1|923980_924325_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE61497.1|924545_925403_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE61498.1|925581_926973_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE61499.1|927046_927616_-	signal peptidase I	NA	NA	NA	NA
AYE61500.1|927701_928454_+	SAM-dependent methyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE61501.1|928443_929427_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61502.1|929401_930784_+|tRNA	tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

>CP017982|945400:1000733|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AYE61511.1|945400_946699_+|tRNA	asparaginyl-tRNA synthetase-like protein	A0A2P1EMB4	Moumouvirus	1.0e-47	27.3
945467:945482	attL	NA	NA	NA	NA
AYE61512.1|946784_947429_+	chromosome replication initiation protein dnaD	A0A0N7AE27	Bacillus_phage	4.2e-10	36.0
AYE61513.1|947430_948051_+	endonuclease III	NA	NA	NA	NA
AYE61514.1|948263_950561_-	penicillin-binding protein 1A	NA	NA	NA	NA
AYE61515.1|950557_951190_-	recombinase RecU	A0A2H4J3A4	uncultured_Caudovirales_phage	1.5e-20	37.1
AYE61516.1|951253_951823_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61517.1|951913_952330_+	Cell division initiation protein	NA	NA	NA	NA
AYE61518.1|952791_953916_+	putative DNA methylase	NA	NA	NA	NA
AYE61519.1|953992_954574_+	3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
AYE61520.1|955498_957175_+	formate-tetrahydrofolate ligase	NA	NA	NA	NA
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AYE61522.1|957638_958550_+	Pseudouridine synthase	NA	NA	NA	NA
AYE61523.1|958552_959608_+	carbamoyl phosphate synthase small subunit	NA	NA	NA	NA
AYE61524.1|959611_962803_+	Carbamoyl-phosphate synthase large chain	NA	NA	NA	NA
AYE61525.1|962870_964565_-	fibronectin-binding protein	Q84500	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	3.2e-09	40.0
AYE61526.1|964713_965130_+	L-fucose operon regulator	NA	NA	NA	NA
AYE61527.1|965204_965618_+	DegV family protein	A0A0N9SI50	Staphylococcus_phage	1.0e-09	35.9
AYE61528.1|966256_967339_-|integrase	Phage integrase family site-specific recombinase	NA	NA	NA	NA
AYE61529.1|967853_968309_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61530.1|968876_969485_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61531.1|969691_970048_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61532.1|970669_970972_-	gametolysin	Q6SEB5	Lactobacillus_prophage	1.6e-23	56.6
AYE61533.1|971879_972089_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61534.1|972717_973017_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE61535.1|973139_973355_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE61536.1|973329_974667_+|transposase	transposase	A0A218MNE7	uncultured_virus	1.0e-37	26.7
AYE61537.1|975681_976032_-	ABC superfamily ATP binding cassette transporter, ABC protein	NA	NA	NA	NA
AYE61538.1|976712_977066_+	XRE family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AYE61539.1|977094_977679_-	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase	A0A1V0S9I2	Catovirus	6.3e-29	44.6
AYE61540.1|977763_978699_-	Inorganic diphosphatase PpaC	NA	NA	NA	NA
AYE61541.1|978731_979694_-	Putative transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AYE61542.1|979844_982301_-	DNA topoisomerase IV subunit A	G3M9Z5	Bacillus_virus	3.0e-96	31.3
AYE61543.1|982317_984279_-	DNA topoisomerase IV subunit B	G3M9Z3	Bacillus_virus	2.7e-116	41.0
AYE61544.1|984360_984987_+	Glycerol-3-phosphate acyltransferase 2	NA	NA	NA	NA
AYE61545.1|985292_987041_-	Snf2 family protein	A0A0P0YMN2	Yellowstone_lake_phycodnavirus	4.7e-27	25.8
AYE61546.1|987284_987743_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61547.1|987976_988444_-	stress induced DNA-binding protein	A0A291I9P0	Lactobacillus_phage	1.3e-13	30.1
AYE61548.1|988532_989051_-	acetyltransferase	M1PSC3	Streptococcus_phage	5.1e-22	38.4
AYE61549.1|989265_990126_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61550.1|990118_990808_+	Sir2 silent information regulator family NAD-dependent deacetylase	NA	NA	NA	NA
AYE61551.1|990862_991465_+	Sir2 silent information regulator family NAD-dependent deacetylase	NA	NA	NA	NA
AYE61552.1|991687_991954_+	transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AYE61553.1|992178_992448_-	Transposase, IS4 family	NA	NA	NA	NA
AYE61554.1|993391_994570_-|transposase	transposase IS1201	A0A220NQR7	Corynebacterium_phage	8.8e-38	29.5
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AYE61556.1|995285_995924_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61557.1|996235_996796_-	DNA methyltransferase	A0A1S5PRR3	Streptococcus_phage	2.2e-39	44.9
AYE61558.1|996860_997892_-|transposase	transposase	A0A0C5AC89	Paenibacillus_phage	1.8e-34	39.2
AYE61559.1|998129_998495_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE61560.1|998803_999151_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE61561.1|999205_999421_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE61562.1|999395_1000733_+|transposase	transposase	A0A218MNE7	uncultured_virus	1.3e-37	26.7
1006788:1006803	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

>CP017982|1005088:1120915|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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AYE61569.1|1006134_1006302_-	N-formylglutamate amidohydrolase	NA	NA	NA	NA
AYE61570.1|1006335_1006872_-	NUDIX family hydrolase	NA	NA	NA	NA
AYE61571.1|1006883_1007975_-	dihydropteroate synthase	NA	NA	NA	NA
AYE61572.1|1007964_1009302_-	folylpolyglutamate synthase	NA	NA	NA	NA
AYE61573.1|1009285_1010359_-	GTP cyclohydrolase	A0A2I7S8W4	Vibrio_phage	5.4e-34	40.7
AYE61574.1|1010355_1010706_-	dihydroneopterin aldolase	NA	NA	NA	NA
AYE61575.1|1011145_1011799_+	deoxyribonuclease	NA	NA	NA	NA
AYE61576.1|1012054_1013437_-|integrase	DNA integrase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	2.4e-58	46.7
AYE61577.1|1013772_1014210_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61578.1|1014211_1014625_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61579.1|1014660_1015158_-	acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE61580.1|1015287_1016466_-|transposase	transposase IS1201	A0A220NQR7	Corynebacterium_phage	8.8e-38	29.5
AYE61581.1|1016695_1017460_-	putative ATPase	NA	NA	NA	NA
AYE61582.1|1017635_1017959_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61583.1|1018060_1018234_+	transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AYE61584.1|1018269_1021008_-	phosphoenolpyruvate carboxykinase	NA	NA	NA	NA
AYE61585.1|1021621_1022260_-	penicillin-binding protein	NA	NA	NA	NA
AYE61586.1|1022343_1023747_+	dipeptidase V PepV	NA	NA	NA	NA
AYE61587.1|1023800_1025036_-|transposase	transposase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	7.0e-54	46.5
AYE61588.1|1025084_1026464_-	branched-chain amino acid transporter II carrier protein	NA	NA	NA	NA
AYE61589.1|1026846_1027182_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61590.1|1027199_1027700_+	PLP-dependent protein	NA	NA	NA	NA
AYE61591.1|1027769_1028147_+	PLP-dependent aminotransferase	NA	NA	NA	NA
AYE61592.1|1028211_1028451_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61593.1|1028562_1029114_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
AYE61594.1|1029248_1029479_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61595.1|1029635_1030169_-	hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase	A0A218MMB5	uncultured_virus	6.0e-10	23.9
AYE61596.1|1030654_1030972_-|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	4.4e-37	70.7
AYE61597.1|1031016_1031739_-|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	1.6e-37	41.8
AYE61598.1|1031794_1031992_-	pyridine mercuric reductase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	3.2e-17	76.4
AYE61599.1|1032058_1033306_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61600.1|1033658_1034387_-	Amino acid transport protein	NA	NA	NA	NA
AYE61601.1|1034754_1035609_-	homocysteine methyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE61602.1|1036019_1037402_+|integrase	DNA integrase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	6.9e-58	46.7
AYE61603.1|1037448_1038636_-	amidohydrolase	NA	NA	NA	NA
AYE61604.1|1038667_1039999_-	serine/threonine exchanger SteT	NA	NA	NA	NA
AYE61605.1|1040294_1040660_-	pyridoxine 5'-phosphate oxidase V related favin-nucleotide-binding protein	NA	NA	NA	NA
AYE61606.1|1040856_1042803_+	endopeptidase O2	E3T4I7	Cafeteria_roenbergensis_virus	8.8e-59	29.3
AYE61607.1|1043028_1045509_+	5-nucleotidase/2,3-cyclic phosphodiesterase related esterase	NA	NA	NA	NA
AYE61608.1|1045739_1046825_-	putative type IV restriction endonuclease	NA	NA	NA	NA
AYE61609.1|1047226_1048186_-	ATPase	NA	NA	NA	NA
AYE61610.1|1049386_1049716_-|transposase	transposase	A0A286QMQ9	Streptococcus_phage	1.3e-18	46.1
AYE61611.1|1049740_1050109_-|transposase	transposase	A0A7E5	Microcystis_virus	1.8e-05	47.6
AYE61612.1|1050149_1050626_-|transposase	transposase	Q332I1	Clostridium_botulinum_C_phage	2.7e-06	30.9
AYE61613.1|1051124_1051616_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61614.1|1051608_1052427_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61615.1|1052429_1053695_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61616.1|1054133_1054289_+	putative DDE endonuclease	NA	NA	NA	NA
AYE61617.1|1054251_1054554_+	DDE endonuclease	NA	NA	NA	NA
AYE61618.1|1054982_1058006_-	Type I restriction-modification system, restriction subunit	NA	NA	NA	NA
AYE61619.1|1058135_1059230_+	type IC specificity subunit	NA	NA	NA	NA
AYE61620.1|1059260_1060190_-|integrase	Phage integrase	A8ATM2	Listeria_phage	1.4e-86	51.0
AYE61621.1|1060255_1061476_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61622.1|1061468_1063124_-	Type I restriction-modification system modification subunit	A0A2H4PQP4	Staphylococcus_phage	6.9e-113	46.2
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AYE61624.1|1064129_1064672_-|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	1.0e-41	57.6
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AYE61626.1|1065505_1066414_-	restriction endonuclease	NA	NA	NA	NA
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AYE61628.1|1066837_1067407_-	Peptide methionine sulfoxide reductase msrA	NA	NA	NA	NA
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1069782:1069841	attL	NA	NA	NA	NA
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AYE61633.1|1071624_1073139_-	ABC transport protein ATP-binding component	A0A2I4R674	Erysipelothrix_phage	6.7e-22	24.5
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AYE61636.1|1074481_1075864_-|integrase	DNA integrase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	6.9e-58	46.7
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AYE61640.1|1078089_1080594_-	excinuclease ABC subunit A-like protein	A0A1B1IVR3	uncultured_Mediterranean_phage	7.9e-137	32.0
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AYE61643.1|1082797_1083415_-|integrase	DNA integrase	A0A2I6AZV9	Macacine_betaherpesvirus	4.4e-49	51.5
AYE61644.1|1083540_1085730_-|transposase	transposase	A0ZS58	Staphylococcus_virus	5.9e-88	36.9
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AYE61646.1|1086943_1087303_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61647.1|1087693_1088317_-	MutT/NUDIX family protein	NA	NA	NA	NA
AYE61648.1|1088319_1089081_-	uridine phosphorylase	F5CA76	Streptococcus_phi-m46.1-like_phage	1.1e-36	45.3
AYE61649.1|1089096_1089516_-	cytidine deaminase	NA	NA	NA	NA
AYE61650.1|1089780_1090242_-	GNAT family acetyltraansferase	NA	NA	NA	NA
AYE61651.1|1090429_1090747_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61652.1|1090807_1091518_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61653.1|1091607_1091931_+	putative permease	NA	NA	NA	NA
AYE61654.1|1092698_1093175_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61655.1|1093227_1093656_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE61656.1|1094139_1094721_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61657.1|1094850_1095168_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61658.1|1095684_1096131_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
1094050:1095600	attR	NA	NA	NA	NA
AYE61659.1|1096142_1096694_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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AYE61661.1|1097448_1097946_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61662.1|1097952_1099536_-	ABC transporter permease	W8CYL7	Bacillus_phage	1.4e-14	22.9
AYE61663.1|1100182_1100944_-|bacteriocin	bacteriocin ABC transporter	NA	NA	NA	NA
AYE61664.1|1101301_1101652_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61665.1|1101876_1102428_-	cell division protein	NA	NA	NA	NA
AYE61666.1|1102490_1102652_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61667.1|1102645_1103932_-	Peptidase T	NA	NA	NA	NA
AYE61668.1|1104090_1105425_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61669.1|1105473_1106493_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61670.1|1106756_1107314_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61671.1|1107320_1108202_-	pyridoxal kinase	NA	NA	NA	NA
AYE61672.1|1108208_1109306_-	penicillin-binding protein	NA	NA	NA	NA
AYE61673.1|1109430_1110045_-	transferase	NA	NA	NA	NA
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AYE61676.1|1111565_1113365_-	ATP-dependent DNA helicase RecQ	A0A1V0SBK0	Catovirus	1.7e-77	38.3
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AYE61678.1|1114543_1114894_+	NAD+ binding protein for K+transport	NA	NA	NA	NA
AYE61679.1|1114959_1116219_-	aluminum resistance protein	NA	NA	NA	NA
AYE61680.1|1116235_1118332_-	ornithine decarboxylase	NA	NA	NA	NA
AYE61681.1|1118534_1119392_-|transposase	transposase, IS4 family protein	NA	NA	NA	NA
AYE61682.1|1119494_1119941_-	putative resolvase	A0A1V0E035	Clostridioides_phage	1.3e-10	33.3
AYE61683.1|1120207_1120915_-|transposase	transposase	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	1.1e-22	30.8

Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

>CP017982|1128617:1168293|DBSCAN-SWA
TTTAAAATACAGGATTAATAGAGGCTTGATTCCGATATTCTTTCGGAGTTAAGCCTTTTAATCTGCTCTTTATCCTTTCTTCGTTATAGTATTCAATATATTCTTTAATAGCTTGAGTTAATTCTTGAAGGCTATGGTATTTGTACTCTTGATCGTAAAACATCTCTGTTTTAAGCAGACCAAAGAAGTTCTCCATTAAACCATCATCCATGGAATTGCCTTTTCTAGACATGCTTTGAGTAATGCCCTGAAGTTTTAAGGCACGTTGGTATTGGGGACTCTGATATTGACAGCCTTGGTCAGTATGAAAAGTGCAGTTATTAAGAGCTGTTTCTTTAGTGAAAGCTTTATCAAGCATTGTCATTACTAAATCCATATCTGGATGTTTTGAAATAGAATAAGAAACTATATCGCCTCCACAACCATCCAAAATAGGCGATAAATATAGCTTTTCACCATTAAGGTGAAATTCAGTGATGTCAGTATACCATTTCATATTAGGCATTGGCGCAAAGAAATCACGATGAATCAAATTAGGTGCTATTTTGCCAATAGTACCTTTATAGCTCGAGTATTTGCGCTTATTGCGTCTAATGCCCTTAAGGCCTAGTTTATGCATCCAGTAGCGAACTGTTTTTTCAGTAATGTTCCAGCCTTCTTTAATTAGCTGCAGCGCTACTCGGCGATAGCCATAACGGCCTTGATGATAATTAAAGATTTCTTTGATCTTGGCAATAAGCTTAGGGCGCTTAGGCTTTTTAGGTTTTCTTTTAATGATCTTATAGTAAGAGCTTCTGGCAATTATGGGCAGTTCTGGATGCTCAGCGATTGCTTCTAGCACATAGTCCAAGCTGACCTTAAATTCATGCCTTAGATCAGTAATTGCCTTAGCTATCTCTTCTGATCTTTTTCCTGATCCAAGGCCTTCAGTTTTTTTACGTATTCGTTCACAATACGCAATCGCAAGTTTTCTTCTTTCAGCTTTTGGATCTCTTTCTCCAGTTCCTTGCGCGATTTTTGACTCTCTTTGACCACGGGCAGGACGTCCTTTCTGTTTGATAATGAAATTATACCCGTTTTCTTTGTATTCTCTAAGCCAATTGTTAAGCATGCCAATGCTTTTGAAACCTAATTCTAGAGATAATTGAACATCTGACTTAGTACCAAAGATAGCTTGTTCAATTGTTTGTTCTTTAAACTTCTTAGAATAAACCCGCTTTCTAGTATTCAAAATATTTGTTCCATGCATATCAATCAATCTAAGCATGTAATCCAGATTAGCTAAGTTCATTTTATATGCTTTAGACAATTGACTTATTGAAATATTCTCATCTTTCCATTTATGATAAATTTCTATTTTTTGTTCTTTATTAAATTTAGACATAGTAAAAGACCTAAAAGTGTCTCACTTTTAGGTCTCACTTCATTTTTAAAGACTCCTGATAATTTATTTTTATCACTTCTCCATTTACATAATTCCTAATTATTAACTTGTCTCCTTCTAAAGATTCGAACAATGCTATACCATCTTGTAATGTAATCATATTTTCTCCTTAAAAAAACTAACAAAAAAAGACTGATATTCATTGTACATCCATAAATCATTTTTTAAGATTTAAAAATATATACTAAATATAAATACCAGTCTTATAGTTTTTAACGCAACCTTAATTTACTAATTCCAGGTTTGCCAACTGTTTCCCTTCATTGGTCTATCATTTAAAATAACCAATGATGACAAATCAATTTCTTCTTGTTTAATATTTTCTTTTTGCATAATAGTCCTCCATAACACTTGTTATATTTAATTTTACATTTAATATTACTTAAGACATATGTACTTTGTCAATAGTTTTGAAACTGTCAAATCTTTTGTGTAAATAGATCTTTCTCATAGCTTGATTTTTTATTCTTTATTTAATCAAAGTAAGATTCTAAGGTGTCCTGAACCTGACCAAAGCCTTTGTGAATTCGGTTGAAGTAGCGATCATTGTAACTCATTGCTTGGATGCCAATAAAAGTATCAAGCGACTGTTCAGTCGGAAACTCTGCTTTAGGCTTAGCCTTGCGCTTAATGACGTTGTTAAAAGATTCAATCATGTTGGTAGAGTAAATTGAAGCTCTGATCTGCTTAGGATAATTATAGAAGACCAGCAGGTCCGGCTCGATGTCTTTCAGGTTTCTTATGACATGATTATAACTCTTGTCCCATTTGGCATAGAAGGCATGCAATACATCAACAGCAGCTGCTTTATTGGCTTGCTGGTGAATCTGCTTGAATTCGTTCATAATTGCCTCGCGATCCTCCACGCGTACTTTAGCGCAGATATTACGCATGACATGAACCAAGCAACGCTGGAAATGAGCTTGAGGATAGGTCTTTGCCAGTGCTGTCTTCATGCCCACAACGCCATCTGAAAGAAAAAGCTCTACTTGCTCTAAGCCGCGAGACTTCATGCTTTGGAGCAGCTCCGTCCAGACTTCAATGTTTTCATTGGGCGCAATGCAGTAGTCGATAACTTCCTTGTGGCCATTAGGTTTGATGCCAATGGCAATATAGACAGCTTCACGTTCAAAAGTTTCTCGGCGCAGAGGAACGTAGGTAGCGTCTAGATAAACGCAGAAGAACTTATCGCTAAGCTTACGCTTGTGATAGGCCTCTACCTTGGGGATCATCTGCTTAGAAATATTGGATACTTGAGCGGGGTTGTAATGGCTGCCATACATTTTTTCAATCAAATCAGCTATCTCTCTGGTAGTTACGCCTTTAGAGTAAAGCTTGATGATCATGTTTTCCAACACATCTGCATGCTGCTTGTAGTCAGGCAGCGTGTGCTGATGAAACAGGCCGTTGCGGTCTCGTGGCACCTGGATTTCAATTTTGCCAAACTGCGTATCCACCTTGCGAAAGTAGGTACCGTTCCTAGAATTGCCGGTATTCCAGCCGTCTCTTGCATAAGGATTATAACCTAAAAAGGCGGTTAATTCAGCTTCTAACAAGTCATTAACTGCTTGTTGTAATTCTTTACGCAATAAATCATTAATTTTGTCTTGATTGAATAGAGCTTGAGCAATATTTTTGGTAAAATCATTCATGAAGGAGTTCTTCTTTCTGTATGTTTTTTTTGTTCAAACCAATCATACGAGAAAGGAACTCCTTTTTCTAATATTTTAAGAAATTAAATTAAGGAATAATTCATCCTTACACAAACTATTTTACAGTCTCATAGTTTTTTAATAATTAATTGAATCGAGTATCAAGTGTATACTACTCAGTAGTATTATGAATACAAATATGTCATCATACGCGTGGTGCTAGTTAAATCGTTCTAGACAATATGCCATATTGTAAGCTAAAACTGCAGCTTCAAGCCGTTCCTGAAAACCTGTTAGGCTCCGGGCACGATTGTTTTCAGCGTTGTAATAGCTAAGCAAGGAAAAGTCGCTTTCGATTGTTCTTCTGATAGCCATTAGCTGATGATCATTATGCTCTTTAGCACCTGCCATGTTTTTGCGGTATGGCGTCCAAAGTTTATAGCCCATTTGTTTTAACTTGAAGGCCAAATCTTTACCGAGGTAACCTTCATCACCTAAAAGATAATGGTTGTCAGGATGGGCATTGGCCATCAGCTCTGTGGTTTCTTTAGCATCATGTACTGATGCTTTAGTGACCGCGTAATCAAGCAAGTAGCCATCATCACTTACAATGGCATGAACTTTGAAACCATAATAGTAGACTTTTTCCGTTGCTTTGTATCCAATATCAGCCATATCGTGAAAGATTTTAACGCGATAATTGCGAACAGGCTGACAGACCGGAACAGGAAAACTATCAATAATCAATATTTTGCCTGACAGATCTACTTCTTGGTTCAGAACATGACGAATCAAGTAAATCAGTGGTAAAAGCTGACGAGATCTGCGATTAAATCTTGAATGGGATAATCCTACAAAGAATTTACAGAATCTTCTTTGAGATTCGATTTCTAATTCTGCTTGCCAGATAAGCATAGCCAGTATAGAACTATCAGATATCTTGGTCTGATCAGTATTTCTGCGATGCTTCAAAGAATCCGGTGCATACAGCTTGTACCAGGAACGACAAATCATATTCAAACGACTAAAACTAACTTGTAAATGGTGAGAAAAACGCTTAAGCTTGAGGTAGTTCAATCGAGTCAGACTCTTTTCTATTATTACTATTTACAAGTCGAGTCTAACAAGATTGGACTTTTTATTTAACTAAAACGATTTAACTAGCACCACGCGTATTTAAATGTAATTGAATAATACTCGGAGGAAAATATTTTTATGTCAGAGGAAATAGAAACCATTAATTTTGAGCCCGGCAAAAAACATTATATGAGCTGGCCGGTCATTGCATTAATTGACTTTGTTACCATCATCAGTTTTGAAAACATCTTTTATCCATTTCAAAACCAAGGATTATCTGTAGTTGTATCTTGGATTTTCCTTTTATTTGCTTATGTTATCCCTTATGCATTAATGTCTACTCAAATGGGATTAACTTTCAATGACCAAACCGGTGGTCTGGCATCTTGGGTACGTTATTCATCCAATGACACTCTAGGCTATTGGACCTCTTGGATGTACTGGGTGCAAACCGTTCCATACTTAGTTGACGTTTCTAACTCAGTCATCGTGTCCTTTTCCTGGATTATCCTAGGAAATAATACTTTAGACAAGCATATGTCCACCTTCTGGTTCGGAATTCTTACCTTTGTAATCATCTTGGCTTTCATTTTAATTGAAAATGCCATTAAGAATTCACTTGAATTGCTTTCACTAATCGGTGGTGGCGCAATGTTCATCATGTCCATGCTCTTTGTTTTACTTGCAGTTTGGGCAGTAATGCATGGCCATCATATTGCTACTAAGCCATTTAATTGGGGTGCTTTTAAGCCATCATTCAGTTTGCGTTACTTCTCTACTACTGGATTGTTAATTTTTGCTATGTCTGGTGCCGAACTTGCTGCACC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MKRHNHVSITALRGRETLTSVGFTLQGYVDEISLSYLNEIFEIKPEMHHIYANKTEDFDTLRAFALTPVIGSVYDLHDENVFQKQFDFINQNKEEMA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AYE61691.1|1128617_1130000_-|integrase	DNA integrase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	6.9e-58	46.7
AYE61692.1|1130533_1131712_-|transposase	transposase IS1201	A0A220NQR7	Corynebacterium_phage	1.5e-37	29.2
AYE61693.1|1131931_1132789_-|transposase	putative transposase	NA	NA	NA	NA
AYE61694.1|1132927_1133818_+	amino acid transporter	NA	NA	NA	NA
AYE61695.1|1134417_1134711_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61696.1|1135026_1135404_-	Membrane protein	A0A2H4PQR0	Staphylococcus_phage	3.6e-09	32.8
AYE61697.1|1135405_1135789_-	hypothetical protein	A0A2H4PQR0	Staphylococcus_phage	8.9e-08	35.7
AYE61698.1|1135999_1137301_-	Transposase ISLhe15	NA	NA	NA	NA
AYE61699.1|1137474_1138290_+|integrase	putative integrase-recombinase	NA	NA	NA	NA
AYE61700.1|1138270_1138438_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61701.1|1138494_1139265_+|transposase	transposase	H7BWC8	unidentified_phage	4.3e-17	37.5
AYE61702.1|1139355_1140255_-	Aldose epimerase	NA	NA	NA	NA
AYE61703.1|1140407_1141811_-|protease	ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU	A0A1B2IB03	Erwinia_phage	5.8e-28	24.9
AYE61704.1|1141821_1142346_-|protease	ATP-dependent protease peptidase subunit	NA	NA	NA	NA
AYE61705.1|1142354_1143263_-|integrase	integrase/recombinase	A0A1B1IQT7	uncultured_Mediterranean_phage	3.4e-21	36.1
AYE61706.1|1143262_1144579_-|tRNA	tRNA (uracil-5-)-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
1143429:1143444	attL	NA	NA	NA	NA
AYE61707.1|1144600_1146715_-	DNA topoisomerase I	E3T4K4	Cafeteria_roenbergensis_virus	6.7e-97	37.2
AYE61708.1|1146786_1147635_-	DNA processing protein chain A	NA	NA	NA	NA
AYE61709.1|1147695_1148448_-	ribonuclease HII	G4YAY0	Emiliania_huxleyi_virus	1.7e-26	38.1
AYE61710.1|1148437_1149289_-	GTP binding protein	NA	NA	NA	NA
AYE61711.1|1149312_1150905_-	Na+/H+ antiporter	NA	NA	NA	NA
AYE61712.1|1150952_1151183_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61713.1|1151185_1152028_-	hypothetical protein	A0A0N9SI50	Staphylococcus_phage	1.8e-21	46.3
AYE61714.1|1152141_1152825_+	hemolysin III	NA	NA	NA	NA
AYE61715.1|1152862_1154062_-|tRNA	tRNA CCA-pyrophosphorylase	G3MAR3	Bacillus_virus	2.9e-36	44.8
AYE61716.1|1154146_1155034_+	hypothetical protein	M1Q1P6	Streptococcus_phage	5.8e-50	37.2
AYE61717.1|1155019_1156729_-|transposase	transposase	A0ZS58	Staphylococcus_virus	2.1e-88	36.9
AYE61718.1|1156848_1158231_-|integrase	DNA integrase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	4.0e-58	46.7
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AYE61727.1|1165704_1166298_-	hypothetical protein	A0A1B1IVT7	uncultured_Mediterranean_phage	7.8e-19	31.7
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1177985:1178000	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_17

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17

>CP017982|1189502:1310116|DBSCAN-SWA
ATTAGTTGATGATTGTTATTTTTTTAGCACCTTGCATATTTTTACGATACGGTGTCCAAAGCACATAGCCCATGTGTTTTAGTTTAGCGGCTAAATCCTTACCTAAATAACCTTCATCGCCTAAAAGATAATGATTAGTAGGATGGGCATTATTCATCAATTCTACTGTTTCTTTAGCATCATGCACCGATGCTTTAGTGACTGCGTAATCAAGCAGATAGCCATCATCGCTCACTATTGCGTGAACCTTGAACCCATAATAGTAGACTTTTTTAGTCGCCTTATAACCAATATCGGCAATATCATGAAAGATTTTGACGCGATAATTACGAACAGGTTGGCAGACCGGAACTGGGAAACTATCAATAATCAGAATTTTACCTGAAAGATCCACTTCTTGGTTCAAAGTATGACGAATCAGATAGATTAAAGGCAAAAGTTGACGAGCTCGGCGATTAAATCGGGAATGGGATAATCCTACAAAGAACCTGCAAAATCTTCTTTGTGATTCAATCCCTAATTCCGCTTGCCAGATAAGCATAGCTAAGATGGAACTATCAGATAGCTTGATCTGATCTGTATTTCTGCGATGCTTAAGGGAGTTCGGAGCATACAGCTTATACCAAGAACGACAAATCATATTAAACTAACTTGTATAATGATGAGAAAAACTCTTAAGCTTAAGATAGTTCAATCTAGTCAGACTCTTTTCTATTATTACTATTTACAAGTCGAGTCTAACAAGATTGGACTTTTTATTTAACTAAAACGATTTAACTAGCACCACGCGTATTTAAATTAAAATTTGCTAAATTGAGTTTACATTGATATAGAAACATAGAGGATACATGATGACTAATTTTGTTTTTGACTTAATTAACCAATTTAGCTACATGGCCATCAGTTTTTTAATTGCCATCGAAAATGTCTTTCCACCTATCCCTTCAGAAGTCATTTTATCTTTTGCAGGGTTTGCCACACACCACTCCCAAATGACGGTTGTAGGAACGGTTATTGCTTCTACTTATTGGGGCGCTTTAATTTTATACGGTATCGGCTGGTTCTTAAATGAAGAACGCTTAGAACGCATCTTAGATCATAAAGCTTTTAAAATGCTTGGCTTTAAAAGAGGCGATGTACAAAAGGCAATCAATTGGTTTGATAAGTACGGCACAGGCGCTATTTTCTATGGGCGCTGCATTCCTGTCGTACGAAGCTTAATTTCAATTCCTGCTGGAACTGCAAAAGTAAAAATGTCTAAGTTCTTAATTTACACTACTTTAGGGAGCTTAGTTTGGAACACAATTCTAGTAGCGTTGGGTTCTTACATGAGAGAAAAATGGCATGTAATAGTTACTATTTTTGAAGAATACTCTTTGATTATTGCTGGCCTAATTCTAATTGCAATGATCTTCTTCTCCTTCAGATGGTACAAACAAAAAAATTAAAAACTAACATAAAAAGTCCTATTTCACATGAATAGGGCTTTTTCTTCTTCAAAAAATTAAAAAGATAATGTAAAATTAATCTAACTCTATTTTAAGGGATGATGTAATGGGATTTAACATTTTTAGGAAACAAAGCATTCAAAATTATCTTGGCAAAGATATCAAATTTGCTAAGACAATTAATGCGGTAGATTTAATATCCCTCGGTGTTGGTGCTGTAATTGGTACTGGGATCTTCATTTTACCAGGGACAGTAGCTGCTACTCTTGCAGGACCCGGGGTAAGTCTATCATTTGTAGTAGCCGCCATAGTTTGTGCGCTGGCTGGAATGTGCTATGCCGAATTTGCTTCAGCTATTCCAGTAGCCGGGAGTGCTTATTCATACGGTAATATTGTGTACGGCGAATTCACTGGCTGGATTATCGGCTGGGCCTTAATTCTAGAATACATGCTTTCGGTAGCAACGGTAGCTGCTGGCTGGTCCTCTTATTTCAGCTCCTTCATAAGTCCATTCGGGTTGAAAATTCCACATGCTGTTTCTGGGCCAATGAATCTTTCTCATGGGGTTTACTTTGACTTAGTTTCAGTCTTAATAATTTTACTAATTAGCATCCTGCTTTCTCGCGGGATGAAAAATTCTATCAAAATCAACATCGTAGCCGTTTTTATTAAAATAGCTATCATTTTAATTTTCATCTTTGCCGGTTTACACTTCATTAAACCAGCCAATTATCATCCATTTTTACCATATCATTTCTCAGGCGTAATCAAAGGTGCTACTACAGTCTTCTTTGCTTTCCTTGGATTCGATGTAGTTTCATCTTCTGCTGCCGAAGTTAAAAATCCTAAGAAAAATATGCCATTAGGAATTATCGGTACTTTAGCAATTGCAGCTCTGCTTTACTTTGGTGTTTCAATAGTTTTAACAGGGATGGTCAACTATACCAAGCTTAATGTATCTAATCCAGTTGCATTCGCCTTGCAATACGTTCACCAAAATTGGGTAGCAGAACTACTCTCATTTGGGGCAATGCTAGGAATGGCTACAATGATGCTGACGATGATTTATTCAAGTTCTCGTTTAATTTATGCCATGGCAAGAGACGGCTTGCTTCCTACAGCTTTTAGTAAGTTAGATAAAAAGCATAATTCTCCTCAAAATGCCTTAATAGTTGTAACCATTATTATTGCTTCAGGAGCCGCATTTTTTTCAGTTGATCAATTAGCCAACTTAGTAAATTTCGGCACACTTTTTGCCTTTACCTTAGTATCATTTGGTATTTTAAAACTAAGAAAAAGAACAGACATTACCAACGATGGCTTTAAGGTTCCAGGGTATCCATATTTGCCAATTATTTCTGGTTTAATCTGTATCTTTATGATTTGTCACCTAAGTTCCGAAGTTTATCTAATGGCAATCATTTGGCTCGTAATCGGTAGTGTGATTTACTTCGTTTATGGCTACCATCACAGTCAGCTTGACCATGACTAACATACCAAAAATTATGTAAAATAAAAAAAGCAATTGCAAAATTGCTTTTTTATTTTTACCTCTAATTAATTTGATTAATAGCCTTACCATCCTTGAAGAAGGACAAAACATTGTTAGCTGCTTCTTTAGATAAATTATATCTAGCAACATGTGTAGCTGAGCCTACATGTGGAGTCATAATCACATTATCCATCTCCACTAATTCTTGTCTAGGATGAGGTTCATTTTCAAACACGTCTAACGCTGCACCAGCAATCTCATCATTCTTTAAAGCTGAAATCAATGCATTGCTATCAACTAAAGAACCACGAGCTACATTAATTAAAAATGCAGTATCCTTCATTTGTTTAAACGCATCAGCATTAATAATGTGGTAAGTTTCAATCGGTTAAAGGAGCACAGCAAACTTAAGAAATCTGCATTCTTGATCAAATCAGCAAAATCAACATACTTAGCATCAAGTTCTGCTTCAAGTTTTTCATCAAGTTGATGGCGATTATGATAGATAATCTTCATTCCTAAAGCTTTAGCAAAACGTGCAACTTGTTGACCAATTCTGCCCATGCCTAAAATACCTAAAGTTTTGCCTTCAATTGCATATCCTTGATTATCATATTCATCAGCATTCAAAAATACGCCTTCACGCAAAGTATGGTCATAATAACGAAGACGACGTGCCGAAGCTAAGATCATTGTTAAAGCCAATTCGGCTGTTGGACGCAAAACGCTTTCAGGACAATTTAAAACTACAATTCCCTTTTCCTTAGCATATTCTGTATCAACATGATCAAAGCCAACACCATAAGTAGAAATAATTTTCAAATTCTTGGCAGCATCAATCATTTGCTTATCAAAGATCATCTTAGCCACAATTACGCCATCATATGCAGCAATATGATCTAAACCCATTGACGATCATCATCTGGGCGATGTCCAACAGGTCCAACAGTTATATCACATACTTCTTTTAATTCTGTTAAGGCGTCGTCTCTCAAACCGCCTAAAACTAAAACTTTTGCTTTACTCATCTTTATTAACCTCTATTTAATATTTCTTAAGTCAAGATACCACTAATTGCTTTAAATTAACATCTATTTTGCAAATTTATTAATAGCTACAGCGACGCCATCATGATCACAATCTGCTGTTACTGCATCGGCATGCTTCTTAGTGTAATCTACAGCATTCCCCATTGCCACACCTATTCCAGCATATTCCAGCATCGGTGCATCATTTGCTTGATCACCTAAAGCCATAACATTTTCTGGAGCGATTTTCAAATAATTGCACAGTCTTTCTAATCCAGTTCCTTTATCAACTCCAGCTGCAGTAGCTTCATAATAAAAAAGTTCAGTTTTAGAAAAAACTACTCTGTCTTTCATCTGTTAAAATAACGGACTAGTAATTTTGCTATCTAAATAATCTGGATCATCAATATACATACACTTAATAATCGAAATATGTCGCATCTCTTCTTGAGTTCGATAAGAGACTTCTAATTTTACTACCCGTGAATTATAGATCGTATAGTGTCCTAGATCGCGATTAGCTGTATAAATTCGATCTAGACTCACGCTATGAAAATGCAAATTCAATTTGCGAGCGATCGCTTCAAGATCAATATAGTCTTCATATTTCAAACCTTGCTTGAAAATAACTTGACCATTTGTCGATTCAACTACCGCTCCATTGAAGCTTACTACGTACTCATTATCCTGACAATTTAAACCTAACTCATCAAGATAACACTGCACACCAGATAGAGGACGACCTGTACAAATAACTATCTGTATTACGCGCTCTCTTGCAGCAAAAACTGCCTCTTTTACTGCTGGTGTTATTTCTTTTTTAGAATTTACTAAGGTGCCATCAATATCAATTGCTATTAATTTTATTTTGCTCATTTTTCTTTCTCAAAAATAAATAAGTATTGCTTAAACGCGATACTTATTAAACAGCTACATTTTGATCACGCTCTTTAAGCTTGATCAACTTCTCCATATCTTCATCATTGATTCTAAAATCAATGTGTAAATTTTCTTTCATTTCCGCAATATTAT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Homologous phage analysis in the prophage region

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1190269:1190294	attL	NA	NA	NA	NA
AYE61753.1|1190349_1190949_+	alkaline phosphatase	NA	NA	NA	NA
AYE61754.1|1191055_1192441_+	amino acid transporter	NA	NA	NA	NA
AYE61755.1|1192780_1193350_-	glyoxylate reductase	M1HKI4	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	4.0e-12	30.8
AYE61756.1|1193826_1194345_-	haloacid dehalogenase	NA	NA	NA	NA
AYE61757.1|1194391_1195228_-	aldo/keto reductase family oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
AYE61758.1|1195399_1196593_-	DNA/pantothenate metabolism flavoprotein	Q9HH70	Methanothermobacter_phage	1.1e-40	32.2
AYE61759.1|1197025_1198210_+	amino acid aminotransferase	NA	NA	NA	NA
AYE61760.1|1198299_1200153_-|tRNA	aspartyl-tRNA synthase	A0A1V0SFI4	Hokovirus	3.1e-05	34.5
AYE61761.1|1200158_1201445_-|tRNA	histidyl-tRNA synthetase	A0A1V0SLE3	Klosneuvirus	1.4e-28	26.6
AYE61762.1|1201735_1202173_-|tRNA	D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase	NA	NA	NA	NA
AYE61763.1|1202172_1204413_-	ppGpp synthetase	A0A2I2L310	Orpheovirus	1.3e-10	38.0
AYE61764.1|1204844_1205792_-	ribosomal protein L11 methyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE61765.1|1205852_1206362_+	transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AYE61766.1|1206625_1207783_-	hypothetical protein	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	1.6e-44	31.3
AYE61767.1|1208054_1208561_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61768.1|1208663_1210010_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
AYE61769.1|1210179_1211133_+	putative transcription regulator	NA	NA	NA	NA
AYE61770.1|1211134_1211467_+	putative transporter protein	A0A0P0I7G8	Lactobacillus_phage	3.4e-19	44.4
AYE61771.1|1211722_1212103_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61772.1|1212234_1212792_+	ABC-type cobalt transport protein substrate-binding component	NA	NA	NA	NA
AYE61773.1|1212804_1214514_+	ABC transporter ATP binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	2.6e-14	25.0
AYE61774.1|1214506_1215340_+	ABC-type cobalt transport protein permease component	NA	NA	NA	NA
AYE61775.1|1215391_1216774_-|integrase	DNA integrase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	5.8e-57	46.3
AYE61776.1|1216816_1216975_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61777.1|1217005_1217461_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
AYE61778.1|1217719_1218898_+|transposase	transposase IS1201	A0A220NQR7	Corynebacterium_phage	1.8e-35	27.7
AYE61779.1|1218919_1219552_-	putative surface protein	NA	NA	NA	NA
AYE61780.1|1220142_1221684_-	citrate lyase alpha chain	NA	NA	NA	NA
AYE61781.1|1221673_1222588_-	Citrate lyase beta chain	NA	NA	NA	NA
AYE61782.1|1222588_1222882_-	Citrate lyase acyl carrier protein	NA	NA	NA	NA
AYE61783.1|1222871_1223924_-	Citrate lyase ligase	NA	NA	NA	NA
AYE61784.1|1224014_1224806_-	Alpha/beta superfamily hydrolase	NA	NA	NA	NA
AYE61785.1|1224884_1226351_-	cation transport protein	NA	NA	NA	NA
AYE61786.1|1226669_1227983_-	peptidase CE PepCE	NA	NA	NA	NA
AYE61787.1|1228080_1228560_-	Putative surface protein	NA	NA	NA	NA
AYE61788.1|1228582_1229110_-	putative surface protein	NA	NA	NA	NA
AYE61789.1|1229490_1231248_-	Surface protein	NA	NA	NA	NA
AYE61790.1|1232248_1232692_+|transposase	transposase	H7BVY4	unidentified_phage	2.5e-22	38.2
AYE61791.1|1232888_1233815_-	L-lactate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
AYE61792.1|1234432_1234834_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61793.1|1234955_1235153_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61794.1|1235294_1236833_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61795.1|1236801_1236954_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61796.1|1236981_1237557_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61797.1|1237593_1237788_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61798.1|1237842_1238862_-|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	3.1e-92	48.4
AYE61799.1|1238934_1239279_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61800.1|1239285_1239786_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61801.1|1239855_1241373_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61802.1|1241912_1242599_-	mucus-binding protein	NA	NA	NA	NA
AYE61803.1|1243211_1244588_-	fumarate reductase	A0A2P0ZL82	Lactobacillus_phage	5.8e-57	32.3
AYE61804.1|1244599_1246003_-	fumarate hydratase	NA	NA	NA	NA
AYE61805.1|1246189_1246414_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61806.1|1246520_1247606_-	AAA ATPase	NA	NA	NA	NA
AYE61807.1|1247682_1248540_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
1247671:1247696	attR	NA	NA	NA	NA
AYE61808.1|1248694_1249600_-	peptidyl-prolyl isomerase	NA	NA	NA	NA
AYE61809.1|1249860_1250832_-|transposase	transposase	H7BUM7	unidentified_phage	3.0e-44	32.9
AYE61810.1|1251154_1256674_+	lactocepin H proteinase PrtH	NA	NA	NA	NA
AYE61811.1|1256862_1257819_-	thermostable pullulanase	NA	NA	NA	NA
AYE61812.1|1257858_1258170_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE61813.1|1258382_1258715_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61814.1|1258781_1258898_-	AAA ATPase	NA	NA	NA	NA
AYE61815.1|1259038_1259740_-	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
AYE61816.1|1259732_1260794_-	methionine ABC transport protein ATP-binding component	G9BWD6	Planktothrix_phage	3.6e-30	35.6
AYE61817.1|1260806_1261667_-	Outer membrane lipoprotein precursor	NA	NA	NA	NA
AYE61818.1|1262017_1264435_-	cation transporting ATPase	A0A1J0FA34	Only_Syngen_Nebraska_virus	1.1e-37	25.0
AYE61819.1|1264750_1265653_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE61820.1|1265642_1265945_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61821.1|1266307_1266511_-	xre family toxin-antitoxin system	Q9AZG0	Lactococcus_phage	2.5e-09	50.0
AYE61822.1|1266630_1267149_-	dihydrofolate reductase	G3MBI7	Bacillus_virus	7.6e-26	40.1
AYE61823.1|1267163_1268120_-	thymidylate synthase	A0A0N9SH48	Staphylococcus_phage	3.6e-114	60.5
AYE61824.1|1269074_1269788_+	choloylglycine hydrolase	M1HS66	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	5.7e-16	30.7
AYE61825.1|1269775_1269973_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61826.1|1270068_1270644_+	membrane-associated phospholipid phosphatase	NA	NA	NA	NA
AYE61827.1|1270851_1271172_-	DegV family protein	NA	NA	NA	NA
AYE61828.1|1271660_1272947_+	phosphopyruvate hydratase	A0A1X9I5Z8	Streptococcus_phage	2.3e-108	51.7
AYE61829.1|1273022_1273538_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61830.1|1273689_1274178_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61831.1|1274309_1274540_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61832.1|1274533_1275442_-|transposase	transposase ISLhe15	NA	NA	NA	NA
AYE61833.1|1276279_1276771_+	ROK family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AYE61834.1|1277154_1278330_+	Beta-glucosidase	NA	NA	NA	NA
AYE61835.1|1278329_1279268_+	PTS beta-glucoside transporter subunit IIC	NA	NA	NA	NA
AYE61836.1|1279427_1280669_-	Transposase IS607 family	A0A0P0IJS6	Lactobacillus_phage	1.7e-119	56.8
AYE61837.1|1280846_1281275_+	PTS N-acetylgalactosamine transporter subunit IID	NA	NA	NA	NA
AYE61838.1|1281424_1282147_+	transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AYE61839.1|1282156_1282876_+	family 1 glycosyl hydrolase	NA	NA	NA	NA
AYE61840.1|1282845_1283313_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE61841.1|1284217_1285645_+	nicotinate phosphoribosyltransferase	G3MA18	Bacillus_virus	6.1e-94	41.2
AYE61842.1|1285653_1286208_+	pyrazinamidase/nicotinamidase	G3MA16	Bacillus_virus	1.6e-34	42.4
AYE61843.1|1286279_1286690_-	glycolate oxidase	NA	NA	NA	NA
AYE61844.1|1286746_1287679_-	glycolate oxidase	NA	NA	NA	NA
AYE61845.1|1287761_1287935_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE61846.1|1288116_1289037_-	oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
AYE61847.1|1289175_1290105_+	inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase	NA	NA	NA	NA
AYE61848.1|1290167_1290686_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61849.1|1290805_1290928_-	polyferredoxin	NA	NA	NA	NA
AYE61850.1|1291294_1292905_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61851.1|1293210_1293519_-	nudix family hydrolase	NA	NA	NA	NA
AYE61852.1|1293590_1294712_-	penicillin-binding protein	NA	NA	NA	NA
AYE61853.1|1294761_1295820_-	aspartate-semialdehyde dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
AYE61854.1|1295831_1296998_-	aspartate aminotransferase	NA	NA	NA	NA
AYE61855.1|1297018_1297798_-	dihydrodipicolinate reductase DapB	NA	NA	NA	NA
AYE61856.1|1297790_1298726_-	dihydrodipicolinate synthase DapA	NA	NA	NA	NA
AYE61857.1|1298727_1299882_-	amino acid amidohydrolase	NA	NA	NA	NA
AYE61858.1|1299884_1300595_-	tetrahydrodipicolinate succinylase	NA	NA	NA	NA
AYE61859.1|1300614_1301931_-	diaminopimelate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
AYE61860.1|1303049_1303781_+	aspartate kinase	NA	NA	NA	NA
AYE61861.1|1303773_1304778_+	diaminopimelate epimerase	NA	NA	NA	NA
AYE61862.1|1304818_1305862_-	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
AYE61863.1|1306561_1308349_+|transposase	transposase	A0ZS58	Staphylococcus_virus	2.2e-88	36.9
AYE61864.1|1308841_1310116_-|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpX	G3M9Z9	Bacillus_virus	2.3e-132	55.6

Sequences of DBSCAN-SWA_18

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18

>CP017982|1334046:1429170|DBSCAN-SWA
TTTAAACTAATTGTAATTGCTTATCTTCTTGGTAAGCAGCATCAATATTTCCGCCACCAAGACATTCTTCACCTTGGTATAAAACAAGAGCTTGACCAGGGGTAACTGCACGTGCTGGCTCATCGAAGTAAACATCAGCAGTGTTATCATCTGCATGATACTTAACAGTTACACCAACATCACATTGACGATAGCGGAACTTGGCACTGCAATGAAATTCTACATCATGATCTGGCTTGCCAGTAAAGAATGACATGTCACTAGCCTTTAAGCGACTTGCATAAAGAAGCTTGCTGTCGTAGCCTTGTTCAACGATCAATTCATTCTTCTTCAAGTCCTTACCAACAACAAACCATGGATCTGTTGATTCCTTGGTTGAACCTAAACCCAAACCTTGTCTTTGACCAATGGTGTAGTACATTAATCCTGCATGTTCACCAACCACCTTGCCATCTGGAGTAACCATTTTACCTGACTTAGCTGGCAAAAATTCACTTAAGAACTTTCTGAAGTTCCTTTCACCAATAAAGCAAATACCAGTAGAATCCTTCTTCTTGGCAGTAGCTAAACCATTAGCTAAGGCAATTTCACGCACTTGAGGCTTAGTTAAATCAGCAAGTGGGAAAATGACCTTCTTAATTTGGTCTTGATTTAATTGACTCAAGAAATAAGTTTGATCCTTATTTCCATCCTTAGGACGCATCATATGAGTAAGACCATCAGCATCCTTAACAGTTTTAGCATAATGTCCCATTGCAATATAATCAGCATCAAGATCCATCGCAAAATCTAGGAATGACTTGAATTTAATTTGACTATTGCACATTACGTCAGGGTTAGGTGTTCTTCCCTTTTTATATTCATTCAAGAAATATTCAAAAACTCGATGCCAGTATTCTTTTTCAAAATTAATTGAATAATATGGAATACCGATTTTATCAGCAACCTTTTTCACATCTTCGTAATCTTCAGTAGCGGTACAAACACCAGAATCATCAGTATCGTCCCAATTTTTCATGAAAACACCGACAACATCATAGCCTTGTTGTTTGAGCAGCAATGCTGATACTGATGAATCTACACCACCACTCATACCTACAACTACTCTAGTCTTGCTATTGTCAAACATTATTCAATCAATCCTTTACCTCAAGCAATATTTTGCGCTCTTCGAGATCTTTTAAAATATAATTCAAAAGTTCAACAGTAGCTGCTAATTGCTTGTTTTTAAAAATATTAACCTTTTGCAAACCATTGCGATCAGTAACAACCATTGTTAAATGAGATAAGTCCTTGTTAATTGTCATCTTTAACTTAGTTGGTGCATTGTAAGGTGAATCATTATATAAAGGATGTTCATAATTGAAATTACCTTTAGTAGTCTTCACAAAACCTGCATCAATTAAAGCATAGAGTTTCAAATCTGGACTTACAGTAAACTTACGTTTATCACCATTAATCACAACTATATTTGCCATATTTTCCTCACTTATTTATAATAAGTTACCTTCTTTTTAAAAGCAACTATTTTCTTTTAGATTGAATTCTTTGAACGATTTTTACCAAGTTTTTAGCAAAAGATGCTACTTCTTCATCTGTATTATAGCGTCCAAATGAAATACGAATAGATTCATTAATCCGAGGAGAATCTGCACCAAAGCATGCAATCAATACATGTGAAGGTTCAAGTGAACCAGCAGTACATGCAGAGCCACCTGATACAGCATAACCATTTAAATCTAAATTAGTTTGCAATGAAATGGTAGAAGCTCCCTTAAACCATAGATTCAAAACATGGTGAGAATATCCAGAACCATGACCACCATTAATTTTATAATCTATCTTATTTTGATCAAGTTCATTCAAAATTAGATCTTGAAAATGAGCATATTTTGCTTGAAGATCATCATGACCAATATTGGTCAATTCTTTAACTGCTTCGCCAAAACCGGCAATACCTGGTACATTTTCAGTTCCAGCGCGACGTTTAGTTTCTTGTTCGCCACCTAAAACTAAATTTGGCAAATCAATGTCAGAATTTTCATACAAAAATCCTAAAAACTTTGGTCCATTAATTTTATGTGCAGACACTGACAAAAGATCAATATTCATAGCTTTGACATCAATGTCAACGGTTCCCATGCCTTGAACATTGTCAACATGGAAATATGCATTGCTGTCTTTGACCATTTCACCAATTTCTTTAAGTGGCATAATAGAGCCTACTTCGTTATTAACAGCCATAATAGATACTAAAATCGTATCTGGCGTTAATTCTTTTTTCAATTCATCTAAAGAAATATGCCCAGTCTCGTCAACATTTAAATAGACAACGTTGTAGCCTTCAGCTTCTAATCGCTTCATAGGATTTAAGACTGAAGGGTGTTCAATTTGCGTAGTAATAATTTTTTTACCAATATTTTTTCGACTGTATGCTGTTCCAAAAATAGCAGTATTATTGCTCTCTGAACCGCCAGAAGTAAAAATAATTTCATTGTCTTTGGCATTAATACTTGCCGCAATTTGATGACGGGCTCGATCAATTACATTTCTTGCTCGACGTCCCAACTCATAAGTACTTGATGCATTACCAAAATCATTTTTCATTTCATCAGTAATTACATCAATTACTTTAGGTGACATTGGTGTAGTCGCAGCGTTATCCAAATAAATTTCACGCACTTTAATTCATCTTTTCTACGTAATCACTAATTAATTTAGCAGCCTTAGCGCCAACCTTCTTGACAAAAACGTCAAAATCTTCATTTGCACTGCCATCGCCATTATCGGAGATTGCTCTCATTGCAACTAATGGCTTATTAAAGGCATGAGCAACTTGAGCAAAGGCAGCACCTTCCATTTCACAAGCTAATGCGTCAGGGAAGTTTTCTTTTATTTCGTCCTTTTGTTTAGTTGAAGCTACAAATGAATCTCCAGTAACTACTAAACCTTCGCTAAAGGCAACATTTTGCTTTTTAAGATATTCCGCAAATGCAGCTCTTTCTGGTGAATCAAGGACAAATTGAGCCGGTTGTTGTGGAATTTGACCTTCAACATAATCACCTGCAGCAGTATTATGAGCATCATAATACATGAATGCATTAGGTAAAACTAAATCTTCTTGATGAATATCCTTAGCTAAAGCACCAGCAGACCCAGTCATAAAGATCACATCAATATCAACGTTACTTAATAAACTAGCTAGGTTCATAGCAGCTTGAACTTTGCCGATACCACTTAAACCTAAATATACATCATTTCCATTAACAGAAAAATGTTCGAATTCAGTTGATCCGAACATTTCTTTCTTTTCTGCTTGGAAATGATTACGATAAAATTCAGCTTCTTCAGCCATTGGAACAATAATCGCAATCTTCATAAATTTCCTCGCTTAAATTATAAATGAAACAGTGCTAAAAGCACTAATATAATTAGAACAAACACTATCAGAATAGCACTATTCAATCTTTTTTTCAGTTTTAAAGACTTCTGCTCTTTTAACTGTTCTTTATCGATTGACTGCTGTGCCTGATAAAACTCCTGACCATCACCTTCTAAAGGACGTCTTCTTTCAGAAGCATCCCTTTGAAAGTCAGGATTAACATTAACTTCTTCTGTTGCATTATTATCATTAAAAGCAGATTTGACTTTATTCAATAAACTCTTTTTCTGTCTTTTACGATAATCAGAACGTTTTGCTGTCATGATTATTTATTACTTTCAGCTTGGGCATTACGCAATAACATATTTTCCCAAACAGAAATTGCATAAACTGTCTTTGCATCAACAATTTTGCCTTCAGCTAATAAATTCTTCAACTTATCCAAACTATACCAATCAGAAGTCAAAAATTCATCTGCATCTAAAGAACGCTTATCAGTCAATTTAATTAACGTATCACAGTAGAACAGATGCATCTTTTCGTCACAAAAGCCTGGTGTAGAATAAAATTCGCTAACTTTTTCCCAATATTCTGCTCTATAGCCGCCCTCTTCATTCAATTCACGCTTCATTGCGTCAAGTGGGCTGGCATCAGTTGGATCGACAATTCCAGCAGGAATTTCTAAGGTTACCTGTTTAATTGCTTCACGCCATTGTTTTACCAAAAGCATTTCTTGTTGATCGTTAATTGCAATTACACAAGATGCTGGACGGTGCTTAACTATTTCTCTAGTTGCAGTTTCGCCGTTGGGTAATTTGATTGTTCGAACAGATAAATCTAAGATTCGACCTTGAAAAATCTGTTGCGATGAGATTTCTGTTTCTTTTAAATCCACTAAGTCTCATCCTCCTTTTTTAGGCTAAATATACATTAACACATTGTAGGCCGTTTTTCCCTTGAGCCAATTGATATTGTACTCGGTCGCCTACTCGTAATGATTTATAGCCCTCTTCTTTAATAGCTTTATAGAAAACAAAGTATGATTTATGATTTCGATCATCTTCGATAAAACCATAGCTGCTTCCTTCATCAAATTGTTTAACAGTACCTAAACGCATTATTTTTCTAATCCTTCTTGTACTACTTCAGGATAGTTTGCTTCAACAATTTCTGCACAACGACCACAAAGCATTGGCAACTTAGGATCTGCACCAATATCAGTTCTGATCATTCTACAACGTGGACAAACTTCGCCTTCAGCATGCTTAACTACAACAGCAGCATTAGCAAGTTGTTCAGCATCTACTGGAGCTTCATCATCTGAAATAGTTAACTTAGAAACAATTAAAATTTCTCTGAAGTCAGCATCTAATTCATCAAGCATTGCCTTGGTTTCTTTATCTGGGTAGATTGTGACAGCTGCTTCAAATGACTTACCGATTAACTTCTTGTTTCTTGCATCTTCAAGTGCCTTCAAAACATCATCACGCAACTTCATGAATTTAGCCCAGTTTTCAAGCAATTCATCATGGTTAGCATAATTTTCTACTTCTGGCATATTTGCAAGTTGAACGTAATCTTCGTCTTCTTTCAAGAAGCCCCAGATTTCTTCCATAGT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MTIQTLFAASHHIYLGNALWYLICFAILLLLIKHFAWGPVSDMMEKRRQKVINDLDSAASDRKKAETLANEREAALKNSRQEATQILSDAKANAQKTGKEIVASANEYAAAIRKKANEEAAKAKSDALDSARDQVADISLAIAEKVIAKNLSAEDQKNLVDQFIKGLDD
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MTAKRSDYRKRQKKSLLNKVKSAFNDNNATEEVNVNPDFQRDASERRRPLEGDGQEFYQAQQSIDKEQLKEQKSLKLKKRLNSAILIVFVLIILVLLALFHL
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MAKVENKTSLIDRLAWNIIIPVALLALISLYCIYIAALGDPSHIGSPVKAVVMQALWYLISIVIVVIVMQFDADQLFKVAPIFFGIGIFLLIAVLFFYNRSVAADTGAKSWFKLGPVTFQPSEIMKPAFILMLARVVKDHNDKYGHTIKSDWLLLGKIVAWLAPVAILLKLQNDFGTMLVFIAIVGGVVLVSGISWKIIIPLYGIVIVGAIAVILMVVTPGGQAFLSHFFQAYQFERIKSWLNPSGDTSSGAYQLWQSMKAIGSGQLFGNGFGKASVYVPVRGSDMVFSVIGENFGFVGCVALILIYLYLIIQMVKISFNTRNAFYSYISTGVIMMSLFHVFENIGMNIDLLPLTGIPLPFVSQGGSALVGNMIGIGLILSMKFHNRDYMFSTAGDF
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MNNDIKEYTTPSGEKRYKFLIYVGKDETTGNTIQIKKQGFRTQEQALESYLNYKLKVVRGEYVPVTKRKLRLNDLYKMWVKLYKRTVQESTFVSTEKIFKNHILKQLGNIYLNKLTVSQCQNAVNMWADVAPKTFKRFVFYASKLINYGITMELMKKNPMKKVILPKIERDNKKFDNFYSKDELNTFLNDAKQYNFRYFMFFRLLAYSGMRKGECLALKWSDIDFKNNTIDINKSLASGENNRLYLSPCKTSNSVRTLDMDTETMHYLKEWRTKQQKEMLKLGLNFLSNDNLVFANSEGNYTVLSKPQRWDNAICKKFGLRHIKVHGFRHTHASLLFDAGVSMKDVKERLGHSDITTTMNIYTHVTENKAKETANSFAKFMQS

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AYE61887.1|1334046_1335174_-|tRNA	tRNA methyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE61888.1|1335181_1335523_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61889.1|1335569_1336727_-	cysteine desulfurase	NA	NA	NA	NA
AYE61890.1|1336728_1337424_-	Nucleosidase phosphorylase	NA	NA	NA	NA
AYE61891.1|1337441_1337750_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61892.1|1337752_1338322_-	ADP-ribose pyrophosphatase	NA	NA	NA	NA
AYE61893.1|1338341_1338545_-	cold shock protein	NA	NA	NA	NA
AYE61894.1|1338544_1341328_-|tRNA	isoleucyl-tRNA synthetase	A0A2K9L260	Tupanvirus	3.4e-88	27.9
AYE61895.1|1341549_1342317_-	cell division initiation protein DivIVA	NA	NA	NA	NA
AYE61896.1|1342322_1343123_-	RNA-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AYE61897.1|1343122_1343326_-	cell division membrane protein	NA	NA	NA	NA
AYE61898.1|1343424_1343862_-	FtsZ-interacting cell division protein	NA	NA	NA	NA
AYE61899.1|1343879_1345199_-	cell division protein FtsZ	NA	NA	NA	NA
AYE61900.1|1345213_1346551_-	cell division protein	NA	NA	NA	NA
AYE61901.1|1346634_1347492_-	cell division protein FtsQ	NA	NA	NA	NA
AYE61902.1|1347508_1348615_-	UDP-diphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE61903.1|1348616_1349996_-	UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase	NA	NA	NA	NA
AYE61904.1|1350005_1350974_-	phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase	NA	NA	NA	NA
AYE61905.1|1351311_1353045_-	penicillin-binding protein 2B	NA	NA	NA	NA
AYE61906.1|1353128_1353491_-	cell division protein	NA	NA	NA	NA
AYE61907.1|1353504_1354467_-	Ribosomal RNA small subunit methyltransferase H	NA	NA	NA	NA
AYE61908.1|1354456_1354888_-	cell division protein MraZ	NA	NA	NA	NA
AYE61909.1|1355081_1355414_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
AYE61910.1|1355682_1356222_-	MreD-like cell shape-determining protein	NA	NA	NA	NA
AYE61911.1|1356221_1357073_-	rod shape-determining protein MreC	NA	NA	NA	NA
AYE61912.1|1357118_1358123_-	rod shape-determining protein MreB	NA	NA	NA	NA
AYE61913.1|1358218_1358842_-	DNA repair protein RadC	NA	NA	NA	NA
AYE61914.1|1358880_1359558_-	HAD superfamily hydrolase	NA	NA	NA	NA
AYE61915.1|1359547_1360822_-	folylpolyglutamate synthase	NA	NA	NA	NA
AYE61916.1|1360822_1363462_-|tRNA	valyl-tRNA synthase	A0A1V0S951	Catovirus	3.1e-160	43.1
AYE61917.1|1364182_1365412_-|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	1.4e-123	57.4
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AYE61919.1|1365885_1367202_-|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	1.1e-65	39.1
AYE61920.1|1367472_1368399_-	glycosyltransferase	V5USA4	Oenococcus_phage	4.9e-76	49.0
AYE61921.1|1368395_1368812_-	dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE61922.1|1368955_1369696_-	glycerophosphodiester phosphodiesterase family protein	NA	NA	NA	NA
AYE61923.1|1370140_1370311_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61924.1|1370495_1370678_-	Transposase, Mutator family	NA	NA	NA	NA
AYE61925.1|1370832_1371318_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE61926.1|1371338_1371677_-|transposase	transposase	A0A220NQR7	Corynebacterium_phage	2.1e-05	34.1
AYE61927.1|1371957_1372680_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61928.1|1372672_1374277_-	ABC transport protein ATP-binding permease component	W8CYL7	Bacillus_phage	7.3e-11	23.2
AYE61929.1|1374251_1374539_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61930.1|1375590_1375962_-	Transposase IS1201	NA	NA	NA	NA
AYE61931.1|1375958_1376522_-|transposase	mutator family transposase	NA	NA	NA	NA
AYE61932.1|1376995_1377331_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61933.1|1377810_1378521_-	pseudouridine synthase	NA	NA	NA	NA
AYE61934.1|1378698_1379013_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE61935.1|1379704_1379959_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE61936.1|1380146_1380947_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61937.1|1381186_1382050_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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AYE61943.1|1386177_1386351_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61944.1|1386485_1387703_-|tRNA	tRNA sulfurtransferase	NA	NA	NA	NA
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AYE61948.1|1391725_1393453_+|transposase	transposase	A0ZS58	Staphylococcus_virus	2.7e-88	36.9
AYE61949.1|1393457_1393925_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61950.1|1393924_1395238_+	putative recombination factor ATPase	A0A127AWE7	Bacillus_phage	4.8e-101	49.3
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AYE61952.1|1395886_1396351_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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AYE61955.1|1398192_1399164_-	MreB-like cell shape-determining protein	NA	NA	NA	NA
AYE61956.1|1399247_1399478_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61957.1|1399541_1399982_-	F0F1 ATP synthase subunit epsilon	NA	NA	NA	NA
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AYE61963.1|1405063_1405297_-	F0F1 ATP synthase subunit C	NA	NA	NA	NA
AYE61964.1|1405316_1406030_-	ATP synthase A chain	NA	NA	NA	NA
AYE61965.1|1406154_1406784_-	Uracil phosphoribosyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE61966.1|1406867_1407869_-	Sua5 family protein	S4VW33	Pandoravirus	1.2e-48	38.1
AYE61967.1|1407874_1408717_-	methylase of polypeptide chain release factor	NA	NA	NA	NA
AYE61968.1|1408709_1409798_-	peptide chain release factor 1	W8EDB3	Pseudomonas_phage	1.4e-05	44.6
AYE61969.1|1409814_1410414_-	thymidine kinase	C1KFH3	Lactobacillus_virus	2.4e-47	50.8
1410072:1410089	attL	NA	NA	NA	NA
AYE61970.1|1410563_1411916_+	UDP-N-acetylmuramyl peptide synthase	NA	NA	NA	NA
AYE61971.1|1412233_1413247_+	penicillin binding protein	NA	NA	NA	NA
AYE61972.1|1413300_1414299_-|transposase	transposase	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	1.7e-34	30.9
AYE61973.1|1415184_1416153_-	multi-drug-type permease	NA	NA	NA	NA
AYE61974.1|1416298_1417639_-	glucose-6-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
AYE61975.1|1417714_1418329_-	Glycopeptide antibiotics resistance protein	NA	NA	NA	NA
AYE61976.1|1418471_1420625_+	alkaline phosphatase	W6LM83	Streptococcus_phage	4.1e-150	43.5
AYE61977.1|1420804_1421086_+|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	2.9e-16	54.9
AYE61978.1|1421048_1422029_+|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	1.3e-95	56.9
AYE61979.1|1422121_1423579_-	sensor histidine kinase	A0A1X9VNV7	Mimivirus	3.8e-06	25.9
AYE61980.1|1423578_1424283_-	response regulator	W8CYM9	Bacillus_phage	2.2e-36	36.5
AYE61981.1|1424303_1424666_-	Integral membrane protein	NA	NA	NA	NA
AYE61982.1|1424727_1425693_-	mannose-6-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
AYE61983.1|1425785_1426943_-	plastocyanin	NA	NA	NA	NA
AYE61984.1|1427326_1427683_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE61985.1|1428018_1429170_-|integrase	integrase	Q6SEA7	Lactobacillus_prophage	2.7e-55	35.3
1431153:1431170	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_19

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19

>CP017982|1440570:1484582|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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AYE62001.1|1442055_1443285_+|transposase	transposase	A0A1X9I619	Streptococcus_phage	1.8e-65	38.4
AYE62002.1|1443566_1444295_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62003.1|1444385_1444856_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62004.1|1444995_1445181_-	30S ribosomal protein S14A	NA	NA	NA	NA
1445182:1445241	attL	NA	NA	NA	NA
AYE62005.1|1445279_1445597_-|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	3.4e-37	71.7
AYE62006.1|1445641_1446376_-|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	3.1e-49	48.0
AYE62007.1|1446376_1446511_-|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	4.5e-07	74.2
AYE62008.1|1447079_1448057_+	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
AYE62009.1|1448269_1449652_+|integrase	DNA integrase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	4.0e-58	46.7
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AYE62011.1|1450837_1451470_-	6-phospho-beta-glucosidase	NA	NA	NA	NA
AYE62012.1|1452358_1454380_-	PTS system enzyme IIABC	NA	NA	NA	NA
AYE62013.1|1454509_1454782_-	transcription antiterminator	NA	NA	NA	NA
AYE62014.1|1455559_1456714_+	glycerate kinase	W6LM47	Streptococcus_phage	3.4e-42	38.4
AYE62015.1|1456718_1457186_-	protein-tyrosine phosphatase	NA	NA	NA	NA
AYE62016.1|1457203_1457788_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62017.1|1457918_1458734_-	HAD family hydrolase	NA	NA	NA	NA
AYE62018.1|1458743_1459571_-	HAD family hydrolase	NA	NA	NA	NA
AYE62019.1|1459665_1461018_-	phosphoglucosamine mutase	NA	NA	NA	NA
AYE62020.1|1461048_1462008_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62021.1|1462004_1462847_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62022.1|1462904_1463978_-	spermidine putrescine ABC transport substrate-binding protein PotD	NA	NA	NA	NA
AYE62023.1|1463974_1464682_-	spermidine/putrescine ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
AYE62024.1|1464786_1465599_-	spermidine putrescine ABC transport permease PotB	Q6GZ02	Mycoplasma_phage	6.7e-13	30.5
AYE62025.1|1465588_1466692_-	spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA	Q6GZ03	Mycoplasma_phage	5.5e-34	41.1
AYE62026.1|1466751_1467648_-	UDP-N-acetylenolpyruvoylglucosamine reductase	NA	NA	NA	NA
AYE62027.1|1467745_1468279_+	DNA polymerase III alpha chain	M1PFD8	Streptococcus_phage	6.8e-22	36.6
AYE62028.1|1468285_1468786_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62029.1|1468785_1469775_-	Phosphate acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE62030.1|1469786_1470485_-	uracil-DNA glycosylase	A0A0Y0A6W9	Macropodid_alphaherpesvirus	4.0e-38	40.1
AYE62031.1|1470553_1471132_+	HAD family hydrolase	NA	NA	NA	NA
AYE62032.1|1471442_1471964_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62033.1|1472300_1473059_-	triosephosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
AYE62034.1|1473084_1474296_-	phosphoglycerate kinase	NA	NA	NA	NA
AYE62035.1|1474408_1475425_-	glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
AYE62036.1|1475480_1476395_-	putative transcription regulator	NA	NA	NA	NA
AYE62037.1|1476838_1477366_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE62038.1|1477740_1478061_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE62039.1|1478456_1478690_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE62040.1|1478850_1479411_+|transposase	transposase	A0A146ICT8	Staphylococcus_phage	4.8e-18	51.0
AYE62041.1|1479567_1479717_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE62042.1|1479855_1479996_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE62043.1|1479985_1481230_+	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
AYE62044.1|1481555_1482131_+	HAD family hydrolase	NA	NA	NA	NA
AYE62045.1|1482185_1483811_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62046.1|1483997_1484582_+|protease	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP	A0A223W000	Agrobacterium_phage	6.3e-53	54.4
1495528:1495987	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_20

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20

>CP017982|1495625:1541365|DBSCAN-SWA
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MKRKTIRIILFILGGILGLLLLYKLYLSYLPELKLLVHFDHHNEELLIKMVRSHGIEDLAFLFILNAICVAIPDLSNGIFCVLNGILYGPAFGFIVNWISDILGQIILMQLLHKLYNIKHMSNSKIYKLLTTQKYSMVALTIGYLIPFIPSATVSYVNILINKNDFKKQLTPIVIGVSPFAYLYAYGGDSILHLNTSRIIKAAVMIVAVALIAAAILFILKSVKKHTKKA
>CP017982|1495625:1541365|1537030_1539220_+|AYE62096.1|protease|DBSCAN-SWA
MLCQNCHKRPASIHLFTKVNGQSHEIDLCQQCYQDLKNQQGNLENMNNNNEFFGDFDDLFNALNGNNNNVANNNMNENNPRMQMGGGNGNGNHGGKSLLDQYGTDLTALAKKGKIDPVIGRDKEIARVIEILNRRTKNNPVLIGEAGVGKTAVVEGLAQEIVDGSVPAKLQNKRIISLNVVSLVQGTGIRGQFEQRMEQLIKELQQNDDIILFIDEIHEIVGAGNAEGGMDAGNIIKPALARGELQLVGATTIKEYRDIEKDSALARRFQPVEVKEPTIDETIRILKGIQQRYEDYHHVHYTDDAIEAAAKLSARYIQDRFLPDKAIDLLDEAGSRMNLTIPYIDKDKMQERINAAEQLKKEALKNEDYEKAAYYRDQIEKYEKVKDQKVDPDKSPVITNKIMNKIVEEKTGIPVGDIQKQEENQLRNLANDLKAHVIGQDKAVEKVARAIRRNRIGFNKSGRPIGSFLFVGPTGVGKTELAKQLAKQMFGSENAMIRFDMSEYMEQYSVSKLIGSAPGYVGYEEAGQLTEQVRHNPYSLILLDEIEKAHPDVLNLFLQILDDGRLTDSQGRTVSFKDTIIIMTSNAGQGIKNASVGFTAENETKSKESARNNMSQFFKPEFLNRLDDVIEFNELTKPDLLKIVDLMLKNTNDMVKDQGLHIDVIQAAKDKLVEKGFNPALGARPLRRTIQEEIEDNVADFKLDHTDSKNLKADVVDDKIVISDENAAE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AYE62055.1|1495625_1495943_-|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	3.4e-37	71.7
AYE62056.1|1495987_1496722_-|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	3.1e-49	48.0
AYE62057.1|1496722_1496857_-|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	4.5e-07	74.2
AYE62058.1|1497143_1498163_-	NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
AYE62059.1|1498204_1499044_-	prolipoprotein diacylglyceryl transferase	NA	NA	NA	NA
AYE62060.1|1499036_1500005_-	HPr kinase/phosphorylase	NA	NA	NA	NA
AYE62061.1|1500021_1500213_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62062.1|1500307_1501306_-	peptide chain release factor 2	NA	NA	NA	NA
AYE62063.1|1501491_1503891_-	helicase	NA	NA	NA	NA
AYE62064.1|1504030_1504576_-	sigma-54 modulation protein	NA	NA	NA	NA
AYE62065.1|1504652_1505348_-	competence protein	NA	NA	NA	NA
AYE62066.1|1505344_1506631_-	superfamily II DNA/RNA helicase protein ComFA	A0A1X9I5S6	Streptococcus_phage	2.0e-83	44.0
AYE62067.1|1506675_1507338_+	hypothetical protein	A0A1X9I5T8	Streptococcus_phage	5.8e-39	43.8
AYE62068.1|1507365_1508523_-	Glycosyl transferase, group 4 family protein	NA	NA	NA	NA
AYE62069.1|1508629_1510261_-	HAD family hydrolase	NA	NA	NA	NA
AYE62070.1|1510380_1511478_-	recombinase A RecA	A0A0S2MVG1	Bacillus_phage	3.2e-119	62.1
AYE62071.1|1511661_1512222_-	CDP-diacylglycerol- phosphatephosphatidyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE62072.1|1512244_1513369_-	transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AYE62073.1|1513436_1514165_-	3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase	NA	NA	NA	NA
AYE62074.1|1514165_1515422_-|protease	protease	L7RBE7	Acanthamoeba_polyphaga_moumouvirus	1.5e-14	29.1
AYE62075.1|1515418_1516633_-|protease	putative protease	NA	NA	NA	NA
AYE62076.1|1516619_1519037_-	DNA translocase ftsK	Q853W3	Mycobacterium_phage	2.2e-83	47.8
AYE62077.1|1519057_1519447_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62078.1|1519446_1520007_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62079.1|1520057_1521257_-	permease	NA	NA	NA	NA
AYE62080.1|1521462_1521654_-	Glucitol/sorbitol-specific PTS system, IIA component	NA	NA	NA	NA
AYE62081.1|1521724_1524481_-	haloacid dehalogenase	A0A1J0FA34	Only_Syngen_Nebraska_virus	7.2e-75	29.3
AYE62082.1|1524634_1525663_+	6-phosphogluconolactonase	NA	NA	NA	NA
AYE62083.1|1525769_1526462_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62084.1|1526496_1527996_-	oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
AYE62085.1|1528391_1529288_-	ribosomal large subunit pseudouridine synthase	A0A2H4UV25	Bodo_saltans_virus	2.3e-06	30.1
AYE62086.1|1529271_1530084_-	NAD kinase	NA	NA	NA	NA
AYE62087.1|1530080_1530713_-	GTP pyrophosphokinase	NA	NA	NA	NA
AYE62088.1|1530836_1531451_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62089.1|1531529_1532147_+	dihydroorotate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
AYE62090.1|1532155_1533004_-	competence protein	NA	NA	NA	NA
AYE62091.1|1533081_1533822_-	putative competence regulatory protein	NA	NA	NA	NA
AYE62092.1|1533913_1534312_-	arsenate reductase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AYE62093.1|1534543_1536277_-	PTS system phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase	NA	NA	NA	NA
AYE62094.1|1536276_1536543_-	PTS system phosphocarrier protein	NA	NA	NA	NA
AYE62095.1|1536657_1536840_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62096.1|1537030_1539220_+|protease	ATP-dependent Clp protease ClpE	A0A1C3S747	Escherichia_phage	2.3e-124	40.6
AYE62097.1|1539371_1539653_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62098.1|1540165_1541365_-|transposase	transposase	A0ZS58	Staphylococcus_virus	6.2e-63	36.5

Sequences of DBSCAN-SWA_21

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21

>CP017982|1555832:1600030|DBSCAN-SWA
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MIPAQIATNLVATLLIFVVAAFFVAAEFALVQTRPSQLEDMLAKGQGNKKKLQHALHMTHNLNEYLSTTQVGTTLVGVVLGWFSADTFDVILADAFHLTPMSESLIKSVSAILGVILLTYLEVVLTEVVPKNIAIDKPVRMMMAIVTPLHIFHTIVYPFVWLLNTSSNGILKLMGFAPADEENEVYSQSEIIKLSRNAVHGGSLDKEDLTYMERAFELNDKVAKDIMTDRTRLSVLDSTDIIEYALKKYLEEGYSRFPVVRDKDKDDVVGYVYAYDIVQQSQVDSSVPVTRIIRTIITVPESMPIQDILHLMISKHTPIVLVVDEYGGTSGIVTDKDIYEELFGSVKDEIDDVSDDYIIKDKDGNVHVSGKTTLYDFERFFHTDLKAFQDSDIITIGGYMMEHYPNLKKGETIELEDYKFTLDSIEQGFMRWFIVAPINVKKKTKEKEKSSQK
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MLLAINRGLGIMPAHSMVSYPDLVRKYAKIPEDEAVGMATAVGYIDKNAEINDPKFIPARVPFEKIYKLTK
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MPAHLAFDEFKGVDRQLHFICLDGDSHQVVQILRTRYKKTLLKYFGRFSPQARANVRTVTMDLNFYYQDIVRACFPNAQIVIDCFHMIQMLTRSFNSLRVKVFDKRSRQYQLLKSPWKLYLKKFDELEKVHPRYNWHYKGCLTQAQVVTEGINTSTTLENSYNLMQSFIQAFETGNTHELKSLINCQDQIGTLMHKTLLTFKHNLTAVLNGAALPYSNGCLEGFNRKIKQIERTAFGYSNFTNLLTRIRLEEDLYKEKEPNSLLMTA
>CP017982|1555832:1600030|1597033_1597201_+|AYE62157.1|transposase|DBSCAN-SWA
MKKHKIYEAELIQPARPYCGSLALLHNGHLITNIRYLTANASHPATIRLAKQRVR
>CP017982|1555832:1600030|1581505_1582300_-|AYE62141.1|DBSCAN-SWA
MSVLEIKDLHVEVKDDEKKKMKEILKGVNLTLKTGEIHAIMGPNGTGKSTLSETIMGNPHYHVTQGDILLNGESILSMPVDERARKGLFLAMQYPAEVPGVTNAEFLRTTINVRRPKNDPMPITEFLKELDKNLDLLDMNEAMTERYLNEGFSGGEKKRNEILQLLMIKPQFAIMDEIDSGLDIDALKVVARGVNAMRGDNFGSLIITHYQRLLNYIVPDVVHVMMGGRVVKDGGPELAKRLENEGYAGLRDELGLHIKLVDED
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MTKVEDIVKDEDYQYGFHDNVKPKFSTGRGLNEKVVRKISAEKHEPQWMLDYRLKSFKIYQKMAMPNFGPDLSGLDLKDMLYYQKMTDKKYRDWKDVPEDIKETFERLGVPQAERKYLAGSAAQYESEMVYHNMKKQFDKLGIVFMDTDSALQQYPELFKKYFGKLVKPTSNKFAALNGAVWSGGTFIYVPKGVKVPTPVQAYFRLNAENSGQFERTLIIVDKGAHLDYVEGCTAPQYSSGSLHAAVVEVNVLSDAYCRYTTIQNWSDNVYSLETKRAVAGAHATMEWVDGNLGAKVTMKYPSVYLNGEGARGTMLSIAVAHHGIHQDSGAGMFHNAPNTSSSIVSKSIAKGGGSTDYRGSVKFAKNSDGSKAHVECDTIIMDDQSSSDTIPTNEINNAHVAMEHEATVSKVSDEELYYLESRGIPERKATEMIIMGFVEPFTKQLSMEYAVELNRLISFQMEGAIG
>CP017982|1555832:1600030|1562340_1562529_+|AYE62122.1|DBSCAN-SWA
MNSSLIFLSTTALFIIIGSFCLVFGLDKAKPAKLRRRLLYSALICVFVVWGLITYIMLNPLG

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AYE62115.1|1555832_1557170_-|transposase	transposase, IS605 OrfB family protein	A0A286QMQ9	Streptococcus_phage	7.9e-59	41.3
AYE62116.1|1557225_1558125_-	UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase	A0A127AW70	Bacillus_phage	6.4e-73	48.1
AYE62117.1|1558186_1559110_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62118.1|1559118_1559946_-	methionine aminopeptidase	NA	NA	NA	NA
AYE62119.1|1560088_1560535_+	flavodoxin	NA	NA	NA	NA
AYE62120.1|1560527_1561067_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62121.1|1561090_1562233_-	UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase	A0A0N9R0B2	Chrysochromulina_ericina_virus	5.5e-29	30.3
AYE62122.1|1562340_1562529_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62123.1|1562697_1564026_-	PTS system cellobiose-specific IIC component	NA	NA	NA	NA
AYE62124.1|1564022_1565255_-	ATP-dependent RNA helicase	A0A1B1IS59	uncultured_Mediterranean_phage	1.2e-34	28.5
AYE62125.1|1565254_1565959_-	lysozyme	NA	NA	NA	NA
AYE62126.1|1566331_1567372_+	APC family amino acid-polyamine-organocation transporter	NA	NA	NA	NA
AYE62127.1|1567389_1567959_-	Hypoxanthine phosphoribosyltransferase	A0A218MMB5	uncultured_virus	1.3e-07	27.1
AYE62128.1|1568067_1569429_-	CBS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AYE62129.1|1569521_1569737_-	nitroreductase	NA	NA	NA	NA
AYE62130.1|1570837_1571128_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE62131.1|1571149_1571953_+	hypothetical protein	A0A2D1GQC1	Lysinibacillus_phage	1.1e-07	22.2
AYE62132.1|1572002_1572851_-	patatin family phospholipase	NA	NA	NA	NA
AYE62133.1|1572919_1575319_-	putative phosphoketolase	NA	NA	NA	NA
AYE62134.1|1575615_1576380_+	transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AYE62135.1|1576385_1576751_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62136.1|1576836_1577160_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62137.1|1577159_1578563_-	Iron-sulfur cluster assembly protein SufB	NA	NA	NA	NA
AYE62138.1|1578555_1579017_-	Iron-sulfur cluster assembly scaffold protein IscU	NA	NA	NA	NA
AYE62139.1|1579003_1580242_-	cysteine desulfurase	Q2XUY6	environmental_halophage	1.0e-97	41.8
AYE62140.1|1580216_1581494_-	iron-sulfur cluster assembly protein SufD	NA	NA	NA	NA
AYE62141.1|1581505_1582300_-	ABC transporter ATPase component	A0A1M7XV31	Cedratvirus	1.2e-11	27.2
AYE62142.1|1582386_1583088_-	Transposase, IS4 family	NA	NA	NA	NA
AYE62143.1|1583423_1584242_+	HAD family hydrolase	NA	NA	NA	NA
AYE62144.1|1584306_1584630_-	aminoglycoside N3-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE62145.1|1584869_1585370_-|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	1.0e-48	56.6
AYE62146.1|1585762_1586002_-	GntR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AYE62147.1|1586253_1587180_-	nucleoside hydrolase	NA	NA	NA	NA
AYE62148.1|1587297_1589313_-	potassium transporter Kup	M1IAJ4	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	5.0e-65	36.0
AYE62149.1|1589373_1590066_-	ribose 5-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
AYE62150.1|1590065_1590992_-	ribokinase	NA	NA	NA	NA
AYE62151.1|1591075_1591879_-	putative galactose-1-phosphate uridylyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE62152.1|1592099_1592402_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE62153.1|1592391_1593513_+	Transposase ISLhe15	NA	NA	NA	NA
AYE62154.1|1593667_1593937_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62155.1|1593949_1595293_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62156.1|1595442_1596744_+	glycerol-3-phosphate ABC transporter	NA	NA	NA	NA
AYE62157.1|1597033_1597201_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE62158.1|1597197_1598106_+|transposase	transposase	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	8.0e-31	30.2
AYE62159.1|1598159_1598450_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62160.1|1598800_1599895_-|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	1.2e-108	56.4
AYE62161.1|1599895_1600030_-|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	4.5e-07	74.2

Sequences of DBSCAN-SWA_22

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22

>CP017982|1613542:1667471|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_22

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MDKVNILGVNFDNKTFNQFQNEFISRLNDHLSTFVVTANPEIVMAANENPEFMKILKNDTDYITADGIGIVKAAKMLKQPLPERVTGYDLFTWLMSVANDRGSRVYLIGAKPAVIHAVQAKVAKEYPNINLVGAEDGYFKGDLDLVARRIQKTHPDMVFAALGFPKQEKLLAILRRNETPALMMGVGGSFDVFSGMVKRAPEGFQKTHLEWFYRLITNPSRFKRMMVLPKFVVRVKQSKRGK
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MQTGTVKWFNADKGFGFITGSDNKDVFVHFSAIKTDGFKSLEEGQKVSYDVEQGGRGPQATNVVPQ
>CP017982|1613542:1667471|1655221_1656382_-|AYE62212.1|DBSCAN-SWA
MADRINMAYSSTNVTYGRGEGIVVGTGMNTEVGKIATMLNNADETDTPLKENLNHLGKILTIMILAICVIVFVVGMFTKQGTEPMNALLIDMFLVAVSLAVAAIPKGLPAIVTIILALGTQTMAKHKAIVRKLPAVETLGATDIICSDKTGTLTQNRRTVEKIFYRGSLHDDNDEIEENNPALLSMVLANDTKIENGRDLLGDPTETALIQYAFDQNINVHDLLEEHKRVQEVPFDSERKLMSTVNKYGDKFFVAVKGAPDELLKRVTSVKINDEITPITAQQRQDILQTNQDMAKKALRVLGLAYKVIDKTYDDPSTDNVEQDLIFAGLAGMIDPERPEAKAAVAEAHSAGIRTVMITGDHQVTAQAIAERLGILDPGHDDWCTA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AYE62176.1|1613542_1614625_-|protease	Aminopeptidase I zinc metalloprotease	NA	NA	NA	NA
1614081:1614097	attL	NA	NA	NA	NA
AYE62177.1|1614751_1615957_+	MFS transporter permease	NA	NA	NA	NA
AYE62178.1|1615980_1617450_-	multidrug ABC transporter	NA	NA	NA	NA
AYE62179.1|1617740_1618271_+	bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE62180.1|1618283_1619612_+	Uracil permease	Q9KX94	Enterobacteria_phage	1.3e-61	35.6
AYE62181.1|1619679_1621062_-|integrase	DNA integrase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	4.0e-58	46.7
AYE62182.1|1621149_1621650_+	putative transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AYE62183.1|1621714_1622185_-	acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE62184.1|1622416_1622641_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62185.1|1622813_1624151_-	myosin-cross-reactive antigen	NA	NA	NA	NA
1623909:1623925	attR	NA	NA	NA	NA
AYE62186.1|1624252_1625482_-|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	8.4e-124	57.9
AYE62187.1|1625570_1625993_-	permease of the major facilitator superfamily protein	NA	NA	NA	NA
AYE62188.1|1627126_1628452_-|transposase	transposase	G3MB42	Bacillus_virus	1.2e-56	36.3
AYE62189.1|1628481_1629090_-|transposase	transposase	A0A1V0SJI5	Klosneuvirus	1.2e-33	43.2
AYE62190.1|1629192_1629693_-	acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE62191.1|1631622_1631823_+	cold-shock protein	Q9AZD3	Lactococcus_phage	2.4e-20	71.4
AYE62192.1|1631917_1633249_-|transposase	IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family transposase	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	2.1e-51	31.4
AYE62193.1|1633344_1633494_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE62194.1|1633603_1634257_-|transposase	transposase	H7BVY4	unidentified_phage	7.6e-15	29.1
AYE62195.1|1634734_1636087_-	RNA methyltransferase	F5CA72	Streptococcus_phi-m46.1-like_phage	7.1e-116	48.0
AYE62196.1|1636451_1637828_+	Na+-H+-exchanging protein	NA	NA	NA	NA
AYE62197.1|1637864_1638206_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62198.1|1638387_1639092_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62199.1|1639135_1639828_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62200.1|1639894_1640815_-	putative transcription regulator	A0A1V0SBJ0	Catovirus	2.7e-18	25.8
AYE62201.1|1640839_1642270_-|tRNA	aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B	NA	NA	NA	NA
AYE62202.1|1642274_1643714_-|tRNA	aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A	NA	NA	NA	NA
AYE62203.1|1643713_1644022_-|tRNA	aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit C	NA	NA	NA	NA
AYE62204.1|1644035_1645184_-	Lipoprotein	NA	NA	NA	NA
AYE62205.1|1645196_1647203_-	DNA ligase LigA	A0A0K2QQN8	Ralstonia_phage	4.1e-104	36.4
AYE62206.1|1647243_1649490_-	ATP-dependent helicase	A7KV33	Bacillus_phage	5.3e-132	41.4
AYE62207.1|1649575_1650214_-	N-acetylmuramidase	S5M633	Brevibacillus_phage	1.2e-28	48.3
AYE62208.1|1650451_1650922_-	putative SprT family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
AYE62209.1|1650909_1651608_-	putative mannosyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE62210.1|1651610_1653041_-	putative membrane protein	NA	NA	NA	NA
AYE62211.1|1653045_1654137_-	CDP-glycerol:glycerophosphate glycerophosphotransferase	NA	NA	NA	NA
AYE62212.1|1655221_1656382_-	cation-transporting P-type ATPase	NA	NA	NA	NA
AYE62213.1|1657195_1658437_-	Transposase IS607 family	A0A0P0IJS6	Lactobacillus_phage	6.9e-118	57.4
AYE62214.1|1658876_1660064_-	Transposase ISLhe15	NA	NA	NA	NA
AYE62215.1|1660201_1661032_-	NH(3)-dependent NAD(+) synthetase	G3MA24	Bacillus_virus	5.7e-68	51.4
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AYE62217.1|1662592_1663696_-	poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE62218.1|1663700_1664429_-	UDP-N-acetyl-D-mannosamine transferase	NA	NA	NA	NA
AYE62219.1|1664617_1665493_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE62220.1|1665523_1666000_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62221.1|1666241_1667471_+|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	4.2e-123	57.4

Sequences of DBSCAN-SWA_23

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23

>CP017982|1685185:1740629|DBSCAN-SWA
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>CP017982|1685185:1740629|1711920_1712475_-|AYE62268.1|DBSCAN-SWA
MGSETHFLNKISSMQLDFVDQEFEIITLPGAHMNERQLSRSKIDQGIHTYASNRGTSSPQMNPFIALVNHDTNEFNGKAYGFAFVYSGNHKFEVEKDQIEQLRLNVGINNYGFAWKLNKGAEFQTSEVVLTYSDRGLNQMSQTFHHFIKEHIIRSRYKDMERPISWLIIGRQHISTLLKKNCCH

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
1678633:1678647	attL	NA	NA	NA	NA
AYE62240.1|1685185_1686511_-|transposase	transposase	G3MB42	Bacillus_virus	1.2e-56	36.3
AYE62241.1|1686540_1687149_-|transposase	transposase	A0A1V0SJI5	Klosneuvirus	1.5e-33	43.2
AYE62242.1|1688173_1688722_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62243.1|1688920_1689670_+	hypothetical protein	G3MBH6	Bacillus_virus	5.6e-14	32.1
AYE62244.1|1689687_1690059_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62245.1|1690051_1690273_-	ATP-dependent helicase	NA	NA	NA	NA
AYE62246.1|1690327_1690639_-|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	8.5e-33	71.1
AYE62247.1|1690747_1691449_-|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	6.6e-57	51.1
AYE62248.1|1692007_1692799_+	phosphoenolpyruvate carboxykinase	NA	NA	NA	NA
AYE62249.1|1693428_1693842_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62250.1|1693966_1694194_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62251.1|1694280_1694580_-	Carboxymuconolactone decarboxylase	NA	NA	NA	NA
AYE62252.1|1695104_1696289_-	acetate kinase	NA	NA	NA	NA
AYE62253.1|1696620_1697754_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62254.1|1697707_1698130_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62255.1|1698159_1698759_+	amino acid permease-associated region	NA	NA	NA	NA
AYE62256.1|1699269_1699563_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62257.1|1699636_1701448_-	Glutamine-fructose-6-phosphate transaminase	M1I1B8	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	3.3e-84	34.5
AYE62258.1|1701643_1704268_-	acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
AYE62259.1|1704581_1705955_+	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
AYE62260.1|1705992_1706160_-	Maltose o-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE62261.1|1706171_1706507_-	maltose o-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE62262.1|1706667_1707498_+	LysR family transcription regulator	NA	NA	NA	NA
AYE62263.1|1707542_1707911_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62264.1|1707914_1708835_-	PTS system mannose-specific IID component ManN	NA	NA	NA	NA
AYE62265.1|1708863_1709676_-	PTS system mannose-specific IIC component ManM	NA	NA	NA	NA
AYE62266.1|1709712_1710723_-	Phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA	NA	NA	NA	NA
AYE62267.1|1711312_1711891_-	alpha-galactosidase	NA	NA	NA	NA
AYE62268.1|1711920_1712475_-	alpha-galactosidase	NA	NA	NA	NA
AYE62269.1|1712996_1713503_-	PTS system sucrose-specific IIABC component	NA	NA	NA	NA
AYE62270.1|1713592_1714033_-	putative PTS system sucrose-specific IIABC component	NA	NA	NA	NA
AYE62271.1|1714209_1714854_-	PTS system sucrose-specific IIABC component	NA	NA	NA	NA
AYE62272.1|1714936_1715743_-	Sucrase	NA	NA	NA	NA
AYE62273.1|1716306_1717158_+	msm operon regulatory protein	NA	NA	NA	NA
AYE62274.1|1717208_1718354_-|transposase	transposase	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	4.8e-41	31.8
AYE62275.1|1724212_1725520_-|tRNA	seryl-tRNA synthetase	A0A1B1IVT2	uncultured_Mediterranean_phage	1.1e-92	44.1
AYE62276.1|1725743_1726295_-	N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE62277.1|1726294_1726903_-	hypothetical protein	M1Q152	Streptococcus_phage	4.7e-35	38.5
AYE62278.1|1727032_1727830_+	putative esterase	NA	NA	NA	NA
AYE62279.1|1727985_1728687_+	putative Cro/CI-like transcription regulator	NA	NA	NA	NA
AYE62280.1|1728770_1730153_+	NAD-dependent aldehyde	NA	NA	NA	NA
AYE62281.1|1730198_1731275_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62282.1|1731431_1734800_-	RND superfamily resistance-nodulation-cell division:proton (H+) antiporter	NA	NA	NA	NA
AYE62283.1|1734804_1735377_-	putative transcription regulator	NA	NA	NA	NA
AYE62284.1|1735522_1736905_-|integrase	DNA integrase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	4.0e-58	46.7
AYE62285.1|1736967_1737918_-	penicillin-binding protein	NA	NA	NA	NA
AYE62286.1|1737930_1738764_-	putative cation transporter	NA	NA	NA	NA
AYE62287.1|1738931_1740629_-|transposase	transposase	A0ZS58	Staphylococcus_virus	2.3e-87	36.7
1739095:1739109	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_24

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24

>CP017982|1753889:1861674|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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AYE62302.1|1754680_1756315_-	ABC transporter ATP-binding protein/permease	A0A285PWH2	Cedratvirus	1.2e-05	24.9
AYE62303.1|1756406_1757321_+	Proline iminopeptidase	NA	NA	NA	NA
AYE62304.1|1757410_1758412_+	adenosine deaminase	NA	NA	NA	NA
AYE62305.1|1758459_1758963_+	Nucleoside deoxyribosyltransferase	K4I206	Lactobacillus_phage	3.8e-14	29.9
AYE62306.1|1759113_1759290_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62307.1|1759422_1759791_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62308.1|1759961_1761263_+	glycerol-3-phosphate ABC transporter	NA	NA	NA	NA
AYE62309.1|1761315_1761888_-	elongation factor P	NA	NA	NA	NA
AYE62310.1|1761922_1762849_-	pantothenate kinase	NA	NA	NA	NA
AYE62311.1|1762915_1764094_-|transposase	transposase IS1201	A0A220NQR7	Corynebacterium_phage	8.8e-38	29.5
AYE62312.1|1764273_1764834_+	arylesterase	NA	NA	NA	NA
AYE62313.1|1764830_1764956_-	acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE62314.1|1765140_1765359_-|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	2.6e-12	60.4
AYE62315.1|1765499_1767806_-	putative ATP-dependent helicase	NA	NA	NA	NA
AYE62316.1|1768242_1768641_+	Peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin	NA	NA	NA	NA
AYE62317.1|1768701_1769352_+	phosphoglycerate mutase	A0A1X9IGJ2	Lactococcus_phage	1.4e-08	31.3
AYE62318.1|1769567_1771367_-	ABC transporter	NA	NA	NA	NA
AYE62319.1|1771379_1772129_-	ABC transporter	G9BWD6	Planktothrix_phage	3.7e-34	39.5
AYE62320.1|1772275_1773547_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62321.1|1773635_1774307_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62322.1|1774723_1775308_-|transposase	transposase	A0A146ICT8	Staphylococcus_phage	1.1e-33	39.0
AYE62323.1|1775683_1776688_-	L-asparaginase	NA	NA	NA	NA
AYE62324.1|1777025_1777394_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62325.1|1778172_1778307_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE62326.1|1778306_1778945_-|transposase	putative transposase	NA	NA	NA	NA
AYE62327.1|1779167_1779674_+	transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AYE62328.1|1779654_1779816_-	penicillin-binding protein	NA	NA	NA	NA
AYE62329.1|1779897_1780779_-	UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase	A0A127AW70	Bacillus_phage	2.0e-74	49.8
AYE62330.1|1780951_1783057_-	arginine/lysine/ornithine decarboxylase	NA	NA	NA	NA
AYE62331.1|1783282_1784734_+	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
AYE62332.1|1784989_1785955_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62333.1|1786059_1786191_-|transposase	transposase, Mutator family	NA	NA	NA	NA
AYE62334.1|1786540_1787770_+|transposase	transposase	A0A1X9I619	Streptococcus_phage	4.4e-64	37.9
AYE62335.1|1788062_1788221_-	transferase hexapeptide domain protein	A0A191KBJ5	Streptococcus_virus	3.5e-11	63.3
AYE62336.1|1788503_1789955_-	EpsN protein	NA	NA	NA	NA
AYE62337.1|1789951_1791082_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62338.1|1791099_1791651_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62339.1|1791806_1792535_-	glycosyltransferase in exopolysaccharide biosynthesis	A0A2K9L639	Tupanvirus	4.5e-08	28.7
AYE62340.1|1792535_1793561_-	family 2 glycosyl transferase	A0A1V0SAH6	Catovirus	2.7e-11	36.8
AYE62341.1|1793547_1794612_-	glycosyl transferase family 1	A0A1V0SL50	Klosneuvirus	6.3e-11	30.1
AYE62342.1|1794656_1796621_-	Glycosyl transferase	NA	NA	NA	NA
AYE62343.1|1796629_1797130_-	glycosyl transferase family protein	NA	NA	NA	NA
AYE62344.1|1797129_1797579_-	UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase	NA	NA	NA	NA
AYE62345.1|1797593_1798247_-	Phospho-glucosyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE62346.1|1798363_1799134_-	exopolysaccharide biosynthesis protein	NA	NA	NA	NA
AYE62347.1|1799133_1799928_-	putative exopolysaccharide biosynthesis protein	NA	NA	NA	NA
AYE62348.1|1799938_1800826_-	exopolysaccharide biosynthesis protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_25

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25

>CP017982|1865639:1908263|DBSCAN-SWA
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MKTKNLQKNHHLAKSMANASWRMFRQMLEYKCEWYGKKLIAVDPKNTSRICSKCGYNSGAKPLEIREWTCSKCQTKHDRDINAAVNILHKGSTKLNGQGLAMVTS

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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AYE62419.1|1867043_1867604_-|transposase	transposase	A0A1V0SJI5	Klosneuvirus	7.6e-32	41.8
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AYE62422.1|1869583_1870258_-	peptide ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	1.7e-33	39.4
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AYE62428.1|1874274_1874919_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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AYE62430.1|1875473_1875707_+|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	2.4e-16	64.5
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AYE62435.1|1881007_1882255_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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AYE62437.1|1882812_1883616_-|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	1.0e-66	52.4
AYE62438.1|1883747_1884110_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62439.1|1884264_1885968_+|transposase	transposase	A0ZS58	Staphylococcus_virus	2.1e-88	36.9
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AYE62449.1|1895370_1896222_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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AYE62453.1|1900751_1903037_+	5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine S-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
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AYE62455.1|1904347_1904941_-|transposase	putative transposase	NA	NA	NA	NA
AYE62456.1|1905156_1906233_+	Integral membrane protein	NA	NA	NA	NA
AYE62457.1|1906235_1906793_+	adenine phosphoribosyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE62458.1|1906985_1908263_+|transposase	transposase	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	5.2e-44	31.1

Sequences of DBSCAN-SWA_26

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26

>CP017982|1922770:1977815|DBSCAN-SWA
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MNKYIKSVLTSATLVIAALTLSTTTNAASIRKASTSTIHSRIARTYSYAKKMIKENKTGLSGQSSSIFSKKLNPDTGAAAGYSDFLLGLKGNGYKFNTKEKTLLRKNLVIKKTTPAATMANAVMAVQAMGLNARDYKPYGHKKGINLVTKLYRTSVSKQTTSAQAQVLIAISMSSKFKRPKGAKFSKASLSARLVKAQLNNHGWTYNNQQGVRDADTTSMVLTALALGKVNTTNVKDSLLKGQKFLTGIVQPSGAFGYTFNGKTTPNANSTAEAIIALSNDFGMKKYVNNTTMKTSQTRTPLYAMLTYVNKSGSIKNAATQLYGVGQVNLAVAAYKAALKNRSVYTIN

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
1916422:1916439	attL	NA	NA	NA	NA
AYE62476.1|1922770_1924153_+|integrase	DNA integrase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	5.8e-57	46.3
AYE62477.1|1924182_1924764_+	serine recombinase family protein	A0A0A8WIK3	Clostridium_phage	3.9e-23	42.3
AYE62478.1|1924983_1925796_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE62479.1|1925792_1926176_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE62480.1|1926408_1927296_+	putative glucose uptake protein	NA	NA	NA	NA
AYE62481.1|1927348_1928161_-	hypothetical protein	A0A2D1GQC1	Lysinibacillus_phage	2.1e-06	20.7
AYE62482.1|1928715_1929996_-|transposase	transposase	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	6.0e-48	32.1
AYE62483.1|1930592_1931006_+	Multidrug efflux pump protein	NA	NA	NA	NA
AYE62484.1|1931080_1933327_-	ATPase	E4ZFI9	Streptococcus_phage	2.4e-60	30.1
AYE62485.1|1933812_1934331_-	N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
AYE62486.1|1934674_1935913_-|transposase	transposase	A0A0A8WEF4	Clostridium_phage	3.4e-08	24.6
AYE62487.1|1936549_1937299_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62488.1|1937727_1938774_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62489.1|1938861_1941300_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62490.1|1941768_1943178_-	Transposase ISLhe15	NA	NA	NA	NA
AYE62491.1|1943996_1944893_+	ABC transporter	NA	NA	NA	NA
1943504:1943521	attR	NA	NA	NA	NA
AYE62492.1|1944880_1946545_+	ABC transporter ATPase	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	9.0e-20	30.5
AYE62493.1|1946552_1947263_+	putative metal ion ABC transporter	NA	NA	NA	NA
AYE62494.1|1947443_1948331_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62495.1|1948368_1948704_+	ethanolamine utilization protein	NA	NA	NA	NA
AYE62496.1|1949286_1950432_+|transposase	transposase	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	1.6e-39	31.0
AYE62497.1|1950573_1951923_-	oxidoreductase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	1.4e-124	50.3
AYE62498.1|1952575_1952989_-	LtrC	NA	NA	NA	NA
AYE62499.1|1953536_1953689_-	LtrC-like protein	NA	NA	NA	NA
AYE62500.1|1954029_1954224_-	DNA topoisomerase	NA	NA	NA	NA
AYE62501.1|1954343_1954901_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE62502.1|1955113_1955449_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62503.1|1955631_1956522_-	sugar kinase	NA	NA	NA	NA
AYE62504.1|1956522_1957881_-	purine-cytosine permease	NA	NA	NA	NA
AYE62505.1|1957886_1958897_-	ADP-ribosylglycohydrolase	A0A172WZB4	Catopsilia_pomona_nucleopolyhedrovirus	9.0e-07	23.0
AYE62506.1|1959066_1959243_+	HsdS specificity protein of type I restriction-modification system	NA	NA	NA	NA
AYE62507.1|1959431_1959674_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE62508.1|1959953_1961195_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62509.1|1962212_1962338_-	acetate kinase	NA	NA	NA	NA
AYE62510.1|1962635_1963325_-	putative transcription regulator	NA	NA	NA	NA
AYE62511.1|1963532_1964471_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE62512.1|1964467_1964797_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE62513.1|1965035_1965908_+|transposase	transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.4e-37	33.2
AYE62514.1|1966435_1966555_+	carbamoyl-phosphate synthase large subunit	NA	NA	NA	NA
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AYE62516.1|1967897_1968695_-	putative restriction endonuclease	NA	NA	NA	NA
AYE62517.1|1968938_1970297_-|tRNA	tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme	F5CA72	Streptococcus_phi-m46.1-like_phage	4.6e-107	46.8
AYE62518.1|1970299_1971037_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62519.1|1971306_1972698_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AYE62520.1|1972782_1973556_-	Phosphatase	NA	NA	NA	NA
AYE62521.1|1973611_1974544_-	glycerol kinase	NA	NA	NA	NA
AYE62522.1|1975236_1976049_+	phosphomethylpyrimidine kinase ThiD	NA	NA	NA	NA
AYE62523.1|1976330_1977017_+	cobyric acid	NA	NA	NA	NA
AYE62524.1|1977077_1977815_-|transposase	transposase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	2.5e-51	45.9

Sequences of DBSCAN-SWA_27

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27

>CP017982|1992483:2033915|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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AYE62543.1|1996808_1997573_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AYE62544.1|1997666_1998308_-	Signal peptidase	NA	NA	NA	NA
AYE62545.1|1998414_2000538_-|protease	ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit	A0A223W0B1	Agrobacterium_phage	7.7e-117	40.7
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