Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP023491 | Lactobacillus plantarum strain NCIMB 700965 plasmid unamed1, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 1 | 0 |
CP023493 | Lactobacillus plantarum strain NCIMB 700965 plasmid unamed3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP023492 | Lactobacillus plantarum strain NCIMB 700965 plasmid unamed2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP023495 | Lactobacillus plantarum strain NCIMB 700965 plasmid unamed5, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP023494 | Lactobacillus plantarum strain NCIMB 700965 plasmid unamed4, complete sequence | 1 crisprs | NA | 0 | 1 | 0 | 0 |
CP023490 | Lactobacillus plantarum strain NCIMB 700965 chromosome, complete genome | 0 crisprs | DEDDh,cas3,csa3,WYL,DinG | 0 | 0 | 14 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
19546 : 54955
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP023491|19546:54955|DBSCAN-SWA 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>CP023491|19546:54955|23989_24292_+|AYE60396.1|DBSCAN-SWA MTAEEYEKNILSSKKTTVLQVMPGWYLTNQGIDWPGWSFFADDFTKDEVSITTNLAKAMHFDFETRTDPAYRFAKQVARNFSESQFIKVSIKLVSYEENN >CP023491|19546:54955|26186_26792_+|AYE60400.1|DBSCAN-SWA MSITTIKLTGITWGAGQDLCLNGQLIPLETPVELIFKKPVDQALVDQVLQALQEKQVLTLTGEAREKIPAGTNELVNNQPKMAPDQRTEPATSTDQIDKDKPGEHLQSVDETQDFDPEKVGTAVADHLASATKVDQATPKLNVPSALPSHGHPEPFTATDFEQQPTNQQTVNQPTIFGADGDKLTREEVDDTPESDSLPGL >CP023491|19546:54955|25989_26184_+|AYE60399.1|DBSCAN-SWA MSSRRSRIVDIKAEQARLLKAQAAFRAQEDALQKETGRLVIEAKGFTSTKQVEQWLSQLKERGL >CP023491|19546:54955|39034_39763_+|AYE60410.1|DBSCAN-SWA MFKRKEQNITTTAPINLTTINEPMSVITEQIKTIRTNINFAATDHKLRTLMVTSAMLGEGKSTVSGNLAVEYAKEGMQVLLVDADLRRPTIHKTFGLKNHKGLSSWLANQMDDVNDAIHPVIGNLFVMTSGPKPPNPAELLGSNKMTEFLTSATRKLDLVIVDAPPILPVTDSQLLANKVDGTVLVVRQGVAQKAAVRDAVNSLKKSQANILGTVLNDVRDGSHHGYYGYNSGYGYYSDEDK >CP023491|19546:54955|29055_31170_+|AYE60403.1|DBSCAN-SWA MALFKKRAKLQEPFVLEFSKGDSQKLRHDAVVTELIEELGQQERVARSGIIQQLPLMTLNVACQLFQRLREHVIDQGDPMNFEAITVLQRQAAGRGFKYEPYVRVGQFTLDRDYRDFTGAVVNSIFNAPEFADIDYDDKRTWASDFMAAYQAANPDQQVVALVPSEAQAEADDFHVRYAGLDEVVQPATRPASEAPAASSATEKVPASQTGATTKNQATKVAASGGATTSQPTSSGDRTGERKAGSNESTSQAEGSSTAKPEKMPVIPKPSRIGQIKVPQFKVQNLTAVPEADQQYVAYQVEQKKRHSNTYLRTLEQRLNADATQDLVSYSEQQRQAVAKQLRDYQAQHDPQADLRETIQAQVAQSKAQTEAKVLADLKSKCDVDVQQIQADAERAVTKRQAEYDQQVQATKQDLDTKAVQDANERYTSELKARQTALKQQLASLKHELDQQTRAEYNRRVGQLVANNQNIAGTVYQNLAKKLDEYALEVTKVHLNAVELQASADRAKRNLVDVQQLEHKLDRTIAEKQTVTREKEELQKLLQTQTTELTQLKQQSGQVQPPAASSQLEQLLAAQLATKQQPTPAKSVEREPQPKTLQKVGLGLGTAVGLAVLGGGGLWAYHDHQQVAQALTTNQQQLRQAQSNTASLNRQYYQLSQHNTTLKGQVSAAQQDKKTAQAEASQTKAQLTKAQATAKSAAKKTSEK >CP023491|19546:54955|52552_53352_-|AYE60421.1|transposase|DBSCAN-SWA MKSFAHHYSSDISREQFELIRTDLEGIRKRTKPRKVDLYDIFCALLYTLKNGCVWRDLPSDFPKWETVYYYWLLWTKTPSPAGITPLDKVFKKIVSQHRLAQKRSVYTSFIILDAQSVKNTDPAESSGYDGGKKVSGIKRHLAVDINGLPMAVHVTTANVSERDGANALLALNKSQFDLVQRVMADGGYTGNNFAQSVQAMINAEVIIAKQSDLRHGQVTPQRWVIERSFSWLGKYRRLWRNCERKLNTSKMMISLAFLRILLKRF >CP023491|19546:54955|19546_20182_+|AYE60393.1|protease|DBSCAN-SWA MQLVVKVGGWLGLILIEQWATGVCLTGLQARSGGATIFLLGSGTLVLMVLALGLGYGSRQAWWRPIDHWRPVLINGGWALVSLLGLSLIMMTSMHRGGQDTTANQQVLTDWLISLRGWRQVWLIGQLVIIAPLMEELLFRGLFCRWFLGNHQSWQAIVSAGAFASVHEMRLSLSWLLYFGAGLILACLYQRQHDLRLNLVVHSLYNGLSLI >CP023491|19546:54955|54703_54955_-|AYE60423.1|transposase|DBSCAN-SWA MPTRYDKEFKQNIINLYKQGESAAQLAREYGIGYSTVHKWIQGQAKTQSGKSPDEIKAMEKRLASLSEENEILKKALGFLAQK >CP023491|19546:54955|39749_40523_+|AYE60411.1|DBSCAN-SWA MKINNLVDLHCHILPAIDDGSPSLEASLELARQAVADGIRYILATPHHMDRHYLNHAGDVATAVKAFQEELDANDIPLTIFPGQEVHLNGQLMENIDDLLGIDTSRHYLLLELPHEMVPSYLDEMIFQLSCEGITPVIAHPERNAQIIAEPQRLYKLAEDGVLAQVTATSLVGTFGDQVQRTAKEFVKCGLVQVVASDAHTLKNRGFAMTKAYQVLNEMDSQYPERFATNARNLLNGEQIAIGRVVVPEKQKRFWLL >CP023491|19546:54955|38243_39023_+|AYE60409.1|DBSCAN-SWA MESEQNISMMQIVGILRKHIKAIFGTTIVVTLAAIFVTFFVMTPKYSATTQILVNRKLSEGMQSAQFQQVQADVQMISTYKDIITSPTVLKDVNKKVSSYPGYPGSMGALKESLSISNSQNSQVFSVTAKSTDAGTAAAIANMTAKVFKKKVVKIMSVNNVSIVSEAETNTKPVSPRKTLNVLVGIVLGLILGVALAFVREITDRTVTTQNFLTDELGLTSLGLVNHQHHLSMKKQALNLNGGYHTHNDRTSSQAMKRV >CP023491|19546:54955|49914_51222_-|AYE60419.1|DBSCAN-SWA MNNVSVSDKKSPVRNAILGFQHLLAMYSGDILVPLLIGAALKFNAVQMTYLVSMDIFMCGVATLLQIRRTPITGIGLPVVLGCAVEYVAPLQSVGKNFGLGYMYGGIIVAGLFIILVAKPFAHLRKYFPLVVTGSLITLIGFTLMPVAFQNIGGGDTAAKAFGNPTHLFLGFFTALVIIVLNIWAKGFLKQISILIGILVGTITAIAMGTIDFAAVGQAHWAQLPQFFYFSAPKFEWSSIATLILAALTCMIESTGVYFALSDITGRKLEDRDLEHGYRSEGIAAILGGVFNTFPYSTFSQNVGIVQLSGIKTLTPIYYSAFMLMILGLIPKFGAIATLIPSSVLGGAMLVMFGMVGAQGIKMLSKVELNNKNLLIIAISVGLGIGVTTQPSLFQYLPASVQVIMSNGMVVGSFTAVILNILLNHTGLRERVEEE >CP023491|19546:54955|48085_48454_-|AYE60417.1|DBSCAN-SWA MSNKDTCEIYCYDEKKVNRIREELQKEDISSVSQLFKALADENRAKITYALCQDGELCVCDVANIIGSTVATASHHLRTLHKQGIVKYRKEGKLAFYSLDNEHIKQLILIALAHKNEVKANV >CP023491|19546:54955|40765_41335_+|AYE60412.1|DBSCAN-SWA MKYGYARVSTIDQKLANQIELLKLAGAEKIFQEKFTGTTTERPEFQKLLRVLKTGDTLIVTKLDRFARNTREALAIIQKLFKENVKVNILNMGLIDNTPTGQLVFTIFSAFAQFERDMIVTRTQEGKLYAKQHDPSFREGRPKTYSDEQIRFAYELRKQGMTYKMIERKTGISKRTQQRRFKLIEKDSF >CP023491|19546:54955|43969_44623_+|AYE60415.1|DBSCAN-SWA MKSRTSNYLKTIYETSYTQRWTCNKQLATMLGVLPGSVTEAVNRLISQKLVVKNKGQINLTKRGYQLVADLMYRYRLCEIWLADNIQLSLPEVPRQAWLMSAIDSSVVMAKLNQQMAYPKTSPFGGALKLESFSKYQYPTLLSLLSIPVGKEVKIISFLETPATIHYFQHSGLHLGQVLTINSKNTVLPNISITDVKDNEYLIDNSMAVYIYCELLS >CP023491|19546:54955|21007_21145_+|AYE60395.1|holin|DBSCAN-SWA MSVSDALQLMLAFGTFIVALIALIVELIKSQQKNSRLSSGKLAAI >CP023491|19546:54955|31179_31968_+|AYE60404.1|DBSCAN-SWA MQWIKQHQLWSALIGIVSLIVLIGGGIWGWAQYQAYEMTTEYVQTQKRLGRKSNRQLQGQLKQTVSGVSGQTGRVAKASQSQTLSQRYTENNNAGVTNQDYQQLLKTQRKAQQAGLANREIAYVKVPSIGLALPIYQGTNQYTLSLGATTYFAHQQMGQGNYVLAGHNMTMPGVLFSNVPQIEIGATVNLISATKVYHYRVNRLLTGKKAVTPNQTYINGSPVSTSVLYQQPKQAMVTLFTCNAAGSMREVVQGNLTSTSAE >CP023491|19546:54955|42253_43846_-|AYE60414.1|DBSCAN-SWA MSKEEKGSVKKHKLIEYANGPSLEEINSTIEVPKNMSFWKTLFAYSGPGALVAVGYMDPGNWSTSITGGQNFQYLLMSVILMSSLIAMLLQYMAAKLGIVSQMDLAQAIRARTSKSLGVVLWILTELAIMATDIAEVIGAAIALYLLFNIPLVIAVFITVLDVLVLLLLTKIGFRKIEAIVVCLIIVILAVFVYQVALSNPDWGGIIKGLVPTADTFSGSKSVAGMTPLSGALGIIGATVMPHNLYLHSAVSQTRKVDHDDDEDIARTVKFSAWDSNIQLSFAFVVNSLLLIMGVAVFKTGAVKDPSFFGLYQALSNTSMLSNGVLIAVAKSGVLSVLFAVALLASGQNSTITGTLTGQVIMEGFVHLRMPLWLRRLVTRLISVIPVLICVVLTSGKSAIAEHTALNNLMNNSQVFLAFALPFSMLPLLMMTNSEVEMGQRFKNSLWVKVLGWFSVIALTFLNLKGLPDSILGFFGDNPSTAEQTLSSIIANILIVGILALLAWTIYDLYRGNKRYAAKLAAHQTESEDK >CP023491|19546:54955|45963_48093_-|AYE60416.1|DBSCAN-SWA MSDQQAKLSEEEMKTYRVQGFTCTNCAGIFENNVKQLPGVKDAKVNFGASKVYVQGNTTIEELEKAGAFENLKVRDEKEQKVEREPFWKQKENIKVYISALLLVISWFLGEQLGEEHLLPMIGYAASILIGGYTLFIKGLKNLSRLKFDMNTLMTIAIIGAAIIGEWGEGATVVILFAISEALERYSMDKARQSIGSLMDIAPKEALIRRGNEEMMIHVEDIQVGDIMIVKPGQKLAMDGLVIKGTSTLNQAAITGESVPVTKTIDDEVFAGTLNEEGLLEVKVTKRVEDTTISKIIHLVEEAQAERAPSQAFVDKFAKYYTPAIVLLALLIAVVPPLFGGDWSQWIYQGLAVLVVGCPCALVVSTPVAVVTAIGNAAKNGVLIKGGIHLEEAGHLKAIAFDKTGTLTKGIPAITDIVTYGGNENELLTVTAAIEKGSQHPLASAIVRKAEENGLNLNGVSVEEFQSITGKGVKAKVNNEMYYVGSPNLFEELHQTIESTIKERITRMQTEGKTVMVLGTEKEILSLIAVADEMRETSKEVISKLNHIGIETVMLTGDNQRTAEAIGKQVGVSDIKADLLPEDKLNFIKELRRKHQSVGMVGDGVNDAPALAASSVGVAMGGAGTDTALETADIALMSDDLSKLPYTIKLSRKALAIIKQNITFSLAIKLVALLLVMPGWLTLWIAIFADMGATLLVTLNSLRLLKVKG >CP023491|19546:54955|31996_34939_+|AYE60405.1|DBSCAN-SWA MNPKITAEVKLYGKKMLVLSALTLTIAPLVTVGNQRGMTARADSTGNGSQTNGLKVKVDDKALQTAVTQAKAAGVNVTQKATKNTVATSGQATQAQKDIATDYNTQTTALAKVTATQKATMDKYNTAEAQYKKDLAAWEAYMKDPEYTNSTQWSKQTLQDLIGNNPANVTYVSNSTNKMKLDYGNVSKMTAAQFKTFLETTYKGGSTTSSVDNKNGTWVVLKVGSTFTYQSPFVDVSTGKPVDVKFTVDKLDNQKTPAYAYLSKYAMGANLATPNLYGHYKVNFYDHASGKLVTLKEALIGMGDLDASQYVKFDGQAVKTIYGDKVTKVSDDSYKAHDDTAYDDSETGTQVWRRLDNVSGFSYTWGQAIDHWSAPYQSDDYFAVGNIDFSIKLKPKPVAPTKPKAETASYQLTDLMVTPSNHKDVTAGDNQGKDTASINGKTVDKGDTLTYPLTNSDLPANRTDDIKSYVLTDKVQKELTVNQAETVKANTKNWDVKVDGQTVTYTAKADLLKTMNADKSKAYAVPEAKLVTTVNADNVTVKNNFTTKINDVTTDSNTPSNPVEKLSPSLVAKRVEDAQGKLATTSDNVNILTGKDVYFDIFNQYDNNSHTDDLTDTDQLPKAAKVDTSKIKVMMSDGKADAFSMTADKLTGLSYTKDMTSDVTIAYKDGKLTVTPKAGKEAEFKNQQTKVRFGASLPKEKADSQLTKKDGDYVWHNKVAKGDQTSNNVDYNAEKGPDLITKKVETKDGKLADNVANANIINAKTVPFNIFNQYNNLGETQYMTDTDQLPKDAKVDLKAVKVYLADTTTTDTNSSSKADDQSSTAMSASSSAKTDDQSTSKTSKIDAKTMTKEKLATLTYTKDVTADFTVKFENGKLTVTPKADKIAEYAGKQTKTRFVASLPTDKVASELTKQGQTYTWNNQASNGKDKTSTVKYHTDKPATPAKPTTPAAKSTVTKVVKMAQTGYHQTWFDRLVAWFK >CP023491|19546:54955|20462_20567_+|AYE60394.1|holin|DBSCAN-SWA MSVSDALQLMLAFGTFIVALIALIVELIKSQQKK >CP023491|19546:54955|25027_25993_+|AYE60398.1|DBSCAN-SWA MALELADYVSYAGLPFKHEGRYLRSQEHDSLIIDTRKNYFIWNSQGLAGNLSQFIKAYYGISDREMHFRLKAFTKTNPQQKVAVKADYTTKSAVGPVAPLDAAGMAYLTQYRHLDSRLITFAARQGLLGSDGYHNVIFNWFDAAGILVGQDVQGTVINRQRYPKHGSLKQIKAGSKPHYGFNVRFRGPFRHLYVFESPIDLLSYWQMYARELSGSQLLSLSGASAKIQTINDYLLTQPALPAYLHLAPDNDVAGRALIEKFQHMRLITPHQTCQNLVEWSGAKDWNAQLQPAKAGPYTKLTFDMQTFDQFQLFKKLRECLS >CP023491|19546:54955|51644_52559_-|AYE60420.1|DBSCAN-SWA MLNTFLSNWVIFGSERVALVDQLLFRKLKQQPYLHGDETPIQVLREPGKSATSKSFLWEMRSAANAATSIIHFHYDPSRSEKVARAIYEGFNGTLVCDGYAGYNHIPPGIRRAGCWAHGRRKFVDGTNGIESQRSLGRKFVKKFDQLFAIERKAQGFSPQQLLEIRQRESKPIVDSIWQLMSETTPINKSKLGRAYTYMVNQREQLEVFLNDPGVAISNNIAERSIKTSVIGRKNWLFSTGQRGAKANALFLGLFETAIANHLDFKKYLVYLFTYLPRLGDSPTDEELEAYLPWAKAVQQSCAA >CP023491|19546:54955|41822_42254_-|AYE60413.1|DBSCAN-SWA MSTAFKRILVGVDDSADAKLAFMHAINQAIQDEAELVIVSVLEKDDMNVYQALSKGFVHGERTELEKHILEYQKEAQTAGVKNVRALVAEGEPGEVIVKDIIPHVEPDVLIIGSEAKRGIRRHFGSQAAYMAKYSPISVLVIR |
31 | Streptococcus_phage(20.0%) | transposase,holin,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP023494_1 | 19655-19764 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP023494_1
|
1 spacers
spacers of CP023494_1
>1.1|19689|42|CP023494|CRISPRCasFinder ATAGTCTAGTTGGTTGAATAACCTTAGACAACCTGATGAAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP023494_1
The CRISPR arrays of CP023494_1 >merge|CP023494|1|19655-19764|CRISPRCasFinder GTCTATTGATACAATCTAGAAAGAATAACCTAGAATAGTCTAGTTGGTTGAATAACCTTAGACAACCTGATGAAATGTCTATTGATACAATCTAGAAAGAATAATCTAGA >CP023494|1|1|19655-19764|CRISPRCasFinder GTCTATTGATACAATCTAGAAAGAATAACCTAGA ATAGTCTAGTTGGTTGAATAACCTTAGACAACCTGATGAAAT GTCTATTGATACAATCTAGAAAGAATAATCTAGA
>CP023494.1|AYE60543.1|18501_18744_+|hypothetical-protein MLGSLLQLLGLSRWYHHEQHADKSNARKASGQSAFSYQDLKGLRKLAFWLFVISVFMNWGMFGAIMLIAWIAMWAVSLLF >CP023494.1|AYE60542.1|18016_18250_+|hypothetical-protein MADDFLNKLAQQANQQLGDNESPFKQKKEVTRPVQVRESTYKMVKDIAYHKDAKIVDVIDSMLKYAINSDEFSENNK >CP023494.1|AYE60541.1|17235_18024_+|ATPase MTCKTLLHFNFKGGVGKTTLSVMDTYLLGELGHKVLLIDLDPQANATEIMRTTYNVKTEPNVDLFNGLLKLDLTHSIIELTDNVSMIPADWSLSLWPGKVEKIRNHDRMLILKTLIEQFKSQFEYIIIDVPPTLSIFTNNAILASDYVSLVLQTQKQAYTSVLKTAQYMYQLKNDYHATFDVSGVILYLVKRDAKVDREITKAATESFGDAVFINRIWQQERVKLFSNAGIKDEDYWDKKAISMYTMVLKEELHRIEEINNG >CP023494.1|AYE60540.1|15682_16681_+|IS30-family-transposase MSPYTHLTLKDRECILLGVTLHHTYQVIADQIGCSKATVSREIKRNGGRGAYSAVKAQQNYQQRRLKSRRLRVLENLKLRDFVLHCILQRQWSPEQIAGRLSLENSNWHISYNTIYRGIERNNLGVKRKSHGARGFARKLRHRGKTRKVKGTVNERRGRFNNVPSVHERPVSCENRTRFGHWEGDTVRGKIGRSGLVSLVDRKSRYLLSERVPKVNAKNVTQAMIDLLHTVTPKRVRTLTPDRGTEFAGYREVGKELGISVYFPDPHAPQQRGTNENTNGLIREYFPKGTDLDELTDQDIAKFVRDLNNRPRKVLVWKTPSEVFFGKKLHLI >CP023494.1|AYE60539.1|14678_15056_-|hypothetical-protein MIYDISVITMLALFLFSFVVLIRWILKKFFKINIPNLSRIRIVVVSLLSGLLIVGLGYQFRTSAQKRMDEQSESKAAIESSKKAKTKKPKQQYKNIETIFNMHSIKYLSKNVFRIFSRVFAGRLS >CP023494.1|AYE60538.1|13919_14719_+|IS5/IS1182-family-transposase MKSFAHHYSSDISREQFELIRTDLEGIRKRTKPRKVDLYDIFCALLYTLKNGCVWRDLPSDFPKWETVYYYWLLWTKTPSPAGITPLDKVFKKIVSQHRLAQKRSVYTSFIILDAQSVKNTDPAESSGYDGGKKVSGIKRHLAVDINGLPMAVHVTTANVSERDGANALLALNKSQFDLVQRVMADGGYTGNNFAQSVQAMINAEVIIAKQSDLRHGQVTPQRWVIERSFSWLGKYRRLWRNCERKLNTSKMMISLAFLRILLKRF >CP023494.1|AYE60537.1|13642_13945_+|plasmid-mobilization-relaxosome-protein-MobC MANIKANSDKQTKRINFRLNELEYEKLSQSASTYGLTVSSYAKQLALKSNLRKPYFSASDTQQIILELRTCLDTLTFDLILVKLDQKQEFLIHEKLCTPL >CP023494.1|AYE60536.1|12947_13277_+|hypothetical-protein MNELEKIEQLEKQLKARKREALKKGYEKLGRKFYKKTGAKNITTAENMLDHTPVFEKRETASPTLTTEQFQQLQNIANAMTYNGNFWKIEDLKDVSQWLSQFRTENEQS >CP023494.1|AYE60535.1|12018_12945_+|replication-initiation-protein MSNELVKYQPELNTIPLRKFTPTEMNLFFSIVSRMRDKGDQTVRFSFEQLKELSNYKPTANRRFIDDIKRTYDHLMDLRFGSQSKSGLSFTRFVMFTKFQINGDADEPYVDVEVYRDAIPLLNNLESWVRYALTEFRDLKSSYAKTMFRLLKGYRTTGYAYFSKNDFFELLAIPVSYSTKMANVDSKVLAPIKEELTPFFRGLTIRKKYGKGRGKPVIGYAFAWKAERKDAEDVHVSKTERLKTAKFNIEHNGELSDKEKWRAIDKIKGLKLGTTEAEHNKQEQAKREEQIRADERKKTLEELRKGWH >CP023494.1|AYE60534.1|10538_10982_-|hypothetical-protein MSTISSDTKFLGNGKWVNQDTGEMIEVNEVVKRVPRSGFEITYLTYFMDLFDKLGGQKYQVFKYIIENRSRDNNTLVTTNKELSRLTKTSTKTVQDTINLLKEAGLIERRMGAIMLNPKLVHRGSNQKEKYLLQRFEAFDQADSTEK >CP023494.1|AYE60544.1|20473_21472_+|IS30-family-transposase MSPYTHLTLKDRECILLGVTLHHTYQVIADQIGCSKATVSREIKRNGGRGAYSAVKAQQNYQQRRLKSRRLRVLENLKLRDFVLHCILQRQWSPEQIAGRLSLENSNWHISYNTIYRGIERNNLGVKRKSHGARGFARKLRHRGKTRKVKGTVNERRGRFNNVPSVHERPVSCENRTRFGHWEGDTVRGKIGRSGLVSLVDRKSRYLLSERVPKVNAKNVTQAMIDLLHTVTPKRVRTLTPDRGTEFAGYREVGKELGISVYFPDPHAPQQRGTNENTNGLIREYFPKGTDLDELTDQDIAKFVRDLNNRPRKVLVWKTPSEVFFGKKLHLI >CP023494.1|AYE60545.1|21576_22134_-|DUF1541-domain-containing-protein MKKLVRYVCAVVAMLFLVAGCSSNSTQKEGSSTHSHSSEKTEMHEHTGSKKVHGLKKAEQPKYKAGTKVKLTADHMKGMKDANATIVNAYGSKLYAVDYKSTSDKKMVKDHKWVTINEIEGNRKEYKKGDKVTLKADHMAGMKNSSATIVEIQKGPAYMVNYQPTNGGKQVTNHKWVAEDEIEKR >CP023494.1|AYE60546.1|22315_22528_-|hypothetical-protein MVNTILKEADLFCPNSVRINFTIYLLIIFPGNIIGGTILYAVTALVMTDPTQGDHSDDGDSVIKGEFREK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP023494_1 | 1.1|19689|42|CP023494|CRISPRCasFinder | 19689-19730 | 42 | NZ_CP026508 | Lactobacillus plantarum strain NCIMB700965.EF.A plasmid punamed3, complete sequence | 5601-5642 | 0 | 1.0 |
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1. spacer 1.1|19689|42|CP023494|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026508 (Lactobacillus plantarum strain NCIMB700965.EF.A plasmid punamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
37871 : 98354
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP023490|37871:98354|DBSCAN-SWA 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56 | unidentified_phage(12.5%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
250664 : 348402
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP023490|250664:348402|DBSCAN-SWA 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102 | Lactobacillus_phage(66.0%) | tail,capsid,tRNA,portal,integrase,terminase,transposase,holin,protease,head | attL 293575:293592|attR 355335:355352 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
639324 : 702688
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP023490|639324:702688|DBSCAN-SWA 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80 | Lactobacillus_phage(41.03%) | tail,capsid,portal,integrase,terminase,transposase,holin,head | attL 687731:687752|attR 701971:701992 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
898291 : 906805
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP023490|898291:906805|DBSCAN-SWA CTTAAATTGCTCCTTCATTAATGAGTGTCTGTAATACATCTGGATAAAATTGGTGTTCACAATCATGAATCCGGGTCGCCAGGCTGGCTAGCGTATCGTCTGGTGCAACCGGAATGACCCGCTGGGCAATAATTTGCCCGGTATCGATTCCGGCATCGATATAGTGAATGGTAACGCCCGTCTCAGTCACACCAGCGTCAAAAGCATCCTCGATGCCGTGACGACCAGGAAACTTTGGTAACAATGCTGGGTGAATATTGATGATTTTATGAGCATACGCATTCAAGAGGGTCGGACCAATAATGCGCATGTACCCGGCCAATAATACCAGTTCAATTTGCCGTGCTTGCAAGGCCGTCAAAATGATTGCTTCCGCGGCCGCTTTATTCGCATAATCATGAAAATCAACAATTAATATCGGTACGTTAGCTGCCCGGGCCTTGTCAATTACCGGCGCTGTCGGCTGATCACACACAAGTAACCCAATCACTACCGGTAATTGTCGTTCAATAATCGCTTGATGGAGTGCAACAAAGTTGGTGCCGTTACCCGAAGCAAATACTGCAATTTTATTAGGCATGCTCAGCCTCCTCAAAAACAACGGATGTCGTACCAGTTTGGACTGTTCCAACTCGATAATAGGATTGAGCGTTGGCCGTCAAATTAGCCGTCACAGCTGCCACTTGGTCGGGGTGAACAATCAGAACCATTCCCAAGCCCAAGTTAAAGGTCGACCGAAGATCCGTAGCAGTCAGCCCACCGAGTTCGGCCAATAACGTCATAATTGGCGGTGCCGGCCATTGACCCAATTCAAGGTGCGCACTCAAGCCCGCCGGTAACGCTCTGGCGACGTTCTCAATCAAGCCGCCCCCGGTAATGTGGGCGATACTCGTCACTAATTTCTGCTGTAATAATGGTTGAACTGCATCAACGTAAATGGTCGTTGGTCGTAAAAGTTCCGTTTGTAAATCATGACCAAGTTCGTCAAAAACCGTGGTCAATTGGTAGTCGTGTTGTTTGAATAAAATATCACGAACTAGACTAAACCCATTCGAGTGGAGGCCATTAGACGGCAACCCAATCAAGACGTCCCCAGCCCGAACATTTGCTGGTGATAACAGGTCCGCGCGGTTCGCAATTCCGACCGCAAAACCAGCGAGGTCGTAATGGTCCTGACCGTACATATCGGGCATCTCCGCAGTCTCGCCACCAATCAACGCTGTATGGGCCTGCTGACAGCCCGCGACGACGCCAGTCAAAATGGCTTTGACCCGCTTCTGATCCGTATGTCCAAGACCTAAGTAATCTAAAAAGAACTGGGGGGTCGCGCCTTGTGCCAAAATATCATTCACACACATTGCGACCAAGTCAATTCCAATCGTGGTGTGTTGATTAGCAGCGATTGCGACTAAGAGCTTAGTCCCCACACCATCCGTCCCCGCTACTAACACGGGATCGTTGGCAGTTGCATCCGGACTAAGTGGAAACGCCCCCCCAAACGCGCCTAATTGCTGATTGCCACTCATTTGTTTGACCGTCTTTAAGACGTCGTAACCAGCGTTGATATCAACGCCAGCCCGCTTATACGCATCACTCACTTGATCACCCCTTCATGATTGGCTTGTAATTGCGCAATTTCCGCATCATACTCGGCTTGGTAATCATACAGGGCCGTTGGATAATCCCCATTAAAGTAGGCCATACATAGTCCACCATACGGTTCGGTGGTCGACAAGCCAACTGCATCAACGACGCCCTGTTCACTGAGAAAACCAAGTGAGTCCGCACCAAACGTCTGACACATCTCCGGAATCGTTTGCTGAGCCGCAATCAATTCATTAGTCGATTGAATATCGATACCGTAAAAACATGGATAGCGTAATGGTGGCGATGCAATTCGTAAATGAACTGACTTTGCACCCGCATCTTTCAATAATTTGACGATCCGCCGACTGGTGGTACCACGTACAATCGAATCATCGATTAAGACGACTCGTTTACCAGCGACAACACCTTTGACCGCTGAAAGCTTCATCCGAACCCCCTGTTCTCGCAATGCTTGGGTCGGCTGAATAAAGGTCCGTGACGAATATTGATTTTTAATTAATCCCATCTCGTAAGGCAGGCCACTCGCTTCCGCATAGCCGGTCGCCGCTGATAAAGATGAATTGGGTACCCCGACAACAATGTCGGCGTCCACGGGCTGTTCAACAGCGAGCTGAGCACCCATTCGTTTACGTGCAGAATGGACGTTGACGCCGTGAATATCAGAATCTGGACGTGCAAAGTAGATAAACTCCATTGAACAAATCGCCAACTGTGTATCAGTCGTATAATGGTCGATCGTCAAGCCATGATCATCAATCGTTAACAATTCTCCCGGCTGAACATCTTGAACAAACGTCGCACCAATCGTATCAAGCGCGCAAGTTTCACTACAAACGACGTACCCGCCCGTGGGTAACTGACCGACGACTAATGGTCGTAACCCGTTAGGATCCAAAGCGGCAATCAAACAATCATTCGTTAGTAGTAAGTAAGCAAAGCCTCCGTGGACTTGACGTAAAGCATCCTTAACCTGTTCCGTTAACGTTGCTGCGGGGCTGCGTCGAATCAGATGCATTAAAATCTCACTATCAGAACTAGCATGAAAAATGGCACCATGCTGTTCCAACCGTCGCCGCAGTGTCACCGCGTTCGTCAAATTGCCGTTATGTGCGAGTGCAAACTGTGAGTCGCTAAAATTAAAACTCAAGGGTTGAATGTTTTCCAATCCATGATTACCAGCCGTGGCATAACGTACATGGCCGACTGCAGCTTGACCCGTCAAACGCGCCAACCGCCGTGGGTCCCGAAAGACATCAGCCAACAACCCTAGTCCGCGTTCCGTCTGCAGTTTGCCGTGATCATTCGCCGTGATACCGGCTCCTTCTTGCCCCCGGTGTTGTAACGCATGGAGCCCAAAGTACGTTAATTGGGCGGCGTCCGGCGAGCCCCAAACCCCAAAGACACCACATTCTTCATTCAGACTTCTTACTTCAGTAGGCATGGTAAGGCCCCTTCCCACAACTGTTTGGCGAAGCTAACCTTAATATCAAACGCCTGATCAGCAGTTTGAACGTGTAGCCGATCCGTTGCAGTTGTTCTTCCTAAATAGGTCACATATGGTTCCATTAAACTTTCAAACGCGGCTTGATGTGCTGGTGTCACTGAGATAACAAATCGTGACTGCGTTTCTGAAAAGAAGTTGGCAGCGGGCAAGTCACTGGCCAGTTCCACCCCGATATTTTGTGGAAAACATGATTCTGCAATCGTCGTAATCAAGCCACCTTCAGAAACGTCGTGGGCACTAGCAACTAGTCCTTTTTGAATCGCAGTTAACAATAGACGCTGATTACGATTTTCAGTCACAAGGTCAAAATCAAACAGCTCGCCACTGATCGTTCCCGTCAACATCTTTTGCAGCTCACTACCATTGAAATCGGCTTCTGTGGTACCTAACACGTAGACTGCATCGCCAGCGTGTTTAAAATCGCTAGTCGTAATATCTTTCTGATGCTTAATTAACCCGACCATCCCAATCATTGGGGTGGGATAGATAGCTTCCCCGTTCGATTCATTGTTCAACGAGACATTGCCAGAAATCACGGGCGTATTGAATAATTGGCAGGCACGAGCGATGCCCATCGCCGATTCGTCCAAATCGTAAAATTGTTCAGGTTTCTCTGGATTACCATAGTTCAAGCAATCAGTGATGCCTAAAGGTTGCCCACCGGAAGCGACAATGTTTCGAGCAGCTTCCGCAACGGCGATTTCCCCACCGACACGGGGGTTTAAGTATAAGTATCGCCCGTTAACATCGGTGGTGACCGCCAACGCCTTATCCGTATGTCGAATCCGTATGACCCCCGCATCGGAACCCGGCTTGACGACCGTATTCGTTTGGACCTGCGAGTCATACGTTCCATATAACGACGCTTTGGAAGCAATTGTTGGCTGTTGGAGCATCTTCTTCAATGTGCCAGTTGCATCAACTAGTCGTGGCATAAATTGATGATGGCTCTGATGGTTCAAGCGCGTTGGTCGTTTCTTTTCGCGTTCATAGACCGGCGCTTTGGTCGCAAGTGCATCGACGGGAACATCTGCAACTAACTTACCATGATGGAATAATTGATACTGGTGGCCGGCTGTCACTTTACCAATTGTGACAGCATCAAGACCGTACTTTTCAAAGACTTGATAAATTTCTGCTTCGGCACCAGCTTTGACACATAGTAACATCCGTTCCTGTGATTCAGAGAGCATCAGTTCAAACGGCGTCATGCCAGTTTCACGTTGTGGTACCAAGTCAAGATTCAGTGACAACCCACTGCCTGCTTTGGATGCCATTTCGGCTGAGGAGGAAACTAGGCCCGCCGCGCCCATATCTTGAATCCCGATTAAAACATCACGATGATCATGAATAACCTCGAGACACGCCTCCATCAATGATTTTTCCATAAAGGGATCACCAACTTGAACCGCGGAACGCTGGGTTTCATTGGCGTCATTAAATTCAGCAGAGGCAAAGGACGCACCGTTAATACCGTCACGCCCCGTTTTTGCGCCGACATAAATAACGGCGTTGCCAATTCCTGTTGCTTGGCCCTTCTGAATATCAGCTTGATCCAAGATTCCAACACACATAGCGTTCACCAACGGGTTCTTCTGATAACTCGCATCAAATACCGTATCACCACCGATTGTCGGAATTCCAATACAGTTGCCATAACCGCCAATGCCGGCAACTACTTGTGAAATCAAGTATTTCGTATGAGCATCAGTCGGTTCCCCAAAGCGAAGACTGTCCAGCAGCGCAATCGGCCGGGCCCCCATCGAAAAGATGTCCCGAATGATACCACCCACACCCGTTGCCGCACCCTCATAAGGTTCAACTGCAGACGGATGATTATGACTTTCAGCTTTAAAGACCACGGCCTGACCATCACCGATGTCGATAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP023490|898291:906805|901323_903543_-|AYE58494.1|DBSCAN-SWA MLKKQPLSPTDVRDSKVYRDWGLTDAEYQLLTDKILQRLPNETETGLFSGMWSEHCSYKNSKPVLKKFWTQGEQVLEGPGEGAGIIDIGDGQAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGEPTDAHTKYLISQVVAGIGGYGNCIGIPTIGGDTVFDASYQKNPLVNAMCVGILDQADIQKGQATGIGNAVIYVGAKTGRDGINGASFASAEFNDANETQRSAVQVGDPFMEKSLMEACLEVIHDHRDVLIGIQDMGAAGLVSSSAEMASKAGSGLSLNLDLVPQRETGMTPFELMLSESQERMLLCVKAGAEAEIYQVFEKYGLDAVTIGKVTAGHQYQLFHHGKLVADVPVDALATKAPVYEREKKRPTRLNHQSHHQFMPRLVDATGTLKKMLQQPTIASKASLYGTYDSQVQTNTVVKPGSDAGVIRIRHTDKALAVTTDVNGRYLYLNPRVGGEIAVAEAARNIVASGGQPLGITDCLNYGNPEKPEQFYDLDESAMGIARACQLFNTPVISGNVSLNNESNGEAIYPTPMIGMVGLIKHQKDITTSDFKHAGDAVYVLGTTEADFNGSELQKMLTGTISGELFDFDLVTENRNQRLLLTAIQKGLVASAHDVSEGGLITTIAESCFPQNIGVELASDLPAANFFSETQSRFVISVTPAHQAAFESLMEPYVTYLGRTTATDRLHVQTADQAFDIKVSFAKQLWEGALPCLLK >CP023490|898291:906805|904215_904470_-|AYE58496.1|DBSCAN-SWA MYLVKIYVTYKQSILDPKGEAIHDALHRLGYTNVDAVELGKYFEVKIHADDRPVAAEIDEMCDRLLANVNMETYRYEITEMEAL >CP023490|898291:906805|906319_906805_-|AYE58499.1|DBSCAN-SWA MMAKVGLIMGSISDWPTMQLAAEQLTALGVSYERHVISAHRMPQTLQSYGEEAASRGIQVIIAGAGGAAHLPGMLAANTLLPVVGVPIKTHTLNGVDSLLSIVQMPAGVPVATMAIGDAGAKNGALMAAQIIGLREPQVQHAIGEFRARQRQEAEQSERQF >CP023490|898291:906805|898862_899888_-|AYE58492.1|DBSCAN-SWA MSDAYKRAGVDINAGYDVLKTVKQMSGNQQLGAFGGAFPLSPDATANDPVLVAGTDGVGTKLLVAIAANQHTTIGIDLVAMCVNDILAQGATPQFFLDYLGLGHTDQKRVKAILTGVVAGCQQAHTALIGGETAEMPDMYGQDHYDLAGFAVGIANRADLLSPANVRAGDVLIGLPSNGLHSNGFSLVRDILFKQHDYQLTTVFDELGHDLQTELLRPTTIYVDAVQPLLQQKLVTSIAHITGGGLIENVARALPAGLSAHLELGQWPAPPIMTLLAELGGLTATDLRSTFNLGLGMVLIVHPDQVAAVTANLTANAQSYYRVGTVQTGTTSVVFEEAEHA >CP023490|898291:906805|903535_904216_-|AYE58495.1|DBSCAN-SWA MMKFAVPVFPGSNCDHDMVNALRDILHVTADLIPATATSLAGYDAVVLPGGFSYGDYLRSGAIARFAPIMPAVIAFANAGKPVIGICNGFQVLTEAGLLPGALQANRSAKFICQDSPLRIANHETIFTTAYGSTDQISLPIAHGEGNYYCDEATLAQLRANHQIIFEYVENPNGSTANIAGITNEAGNVLGMMPHPERAVEMILGSTDGLGIFQSVIASQEEVTHA >CP023490|898291:906805|899884_901339_-|AYE58493.1|DBSCAN-SWA MPTEVRSLNEECGVFGVWGSPDAAQLTYFGLHALQHRGQEGAGITANDHGKLQTERGLGLLADVFRDPRRLARLTGQAAVGHVRYATAGNHGLENIQPLSFNFSDSQFALAHNGNLTNAVTLRRRLEQHGAIFHASSDSEILMHLIRRSPAATLTEQVKDALRQVHGGFAYLLLTNDCLIAALDPNGLRPLVVGQLPTGGYVVCSETCALDTIGATFVQDVQPGELLTIDDHGLTIDHYTTDTQLAICSMEFIYFARPDSDIHGVNVHSARKRMGAQLAVEQPVDADIVVGVPNSSLSAATGYAEASGLPYEMGLIKNQYSSRTFIQPTQALREQGVRMKLSAVKGVVAGKRVVLIDDSIVRGTTSRRIVKLLKDAGAKSVHLRIASPPLRYPCFYGIDIQSTNELIAAQQTIPEMCQTFGADSLGFLSEQGVVDAVGLSTTEPYGGLCMAYFNGDYPTALYDYQAEYDAEIAQLQANHEGVIK >CP023490|898291:906805|898291_898870_-|AYE58491.1|DBSCAN-SWA MPNKIAVFASGNGTNFVALHQAIIERQLPVVIGLLVCDQPTAPVIDKARAANVPILIVDFHDYANKAAAEAIILTALQARQIELVLLAGYMRIIGPTLLNAYAHKIINIHPALLPKFPGRHGIEDAFDAGVTETGVTIHYIDAGIDTGQIIAQRVIPVAPDDTLASLATRIHDCEHQFYPDVLQTLINEGAI >CP023490|898291:906805|904471_905203_-|AYE58497.1|DBSCAN-SWA MTAAIEKQALLYTGKAKAMYATNDPEILWVEYLDQATALNGKRKVPIDQKGRLNNRIASLIFKDLANHGIANHFIEQPSDYVQLVRRVTMIPLETVVRNAASGSFERKFAVPHLTKFAEPVLEFFYKSDQLDDPFINDSQIHALNVATPAIVAEIKRQALQVNQRLTAIFAAMGVQLVDFKIEFGLTTTGKVLLADEISPDSCRLVDLKTGASLDKDVFRKDLGDLTSVYQEVLTRLATVEEA >CP023490|898291:906805|905205_906336_-|AYE58498.1|DBSCAN-SWA MNANFKEALLPPATIGIVGGGQLGQMMTLSAKAMGYRVGVLDPTPKASAAQVADFQIVAAYDDQAALLDLARRSDVLTYEFENVDENALIAAQAYAKLPQGTALLHITGDRLNEKQFLHDHGIPVTSFAPVTDLQSLNYALNRVGTPAILKTAAGGYDGHGQTDLDTAVVTKAASALLTQPCILEARQKFRTEVSMMVTRSAAGVVTTFPLVENQHQHHILHTTIAPANVQPSVHSAARKIAVSIAEALELRGVLGIEFFVLPDDTLLVNELAPRPHNSGHYTIEACNISQFEAHIRSICGLPIPAITQTSPAVMRNLLGDDLTVARQQLVEHPEWHFHDYGKAAIKPQRKMGHVTVLNHDIDAALASVANLKGEQ |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1038083 : 1078708
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP023490|1038083:1078708|DBSCAN-SWA GATGAGCACCACTATTTTATCATTCCAGAACCGTGTTGTCATTGAAACGCTTCATAATGAAGGACGTTCCTTGCGATACATCGCTAACTACTTAGGCTTTAGTCAGACCAACATCTTTAACGAACTTCACCGGCTAAATAGTGAGTATCAAGCTGAACTAGCGCAAACTGACTTTGAACGAAAGGCTAGTCAACGGGGGCGAAAGTCTTCGCTTACTAAAAACCTTAAACACTTGATCGAGGAAAAGATTCAAGTCCAGAAGTGGTCCCCTGAACAAGTTGCCCATGTGGTTGGGATTGCCTACAAGACGGTCTATAACTGGATTGATCAAGGATGGATTGATATACAGTTGCCCGATTTGCCTGATCATGGAATTCGCCGTCATCGTGCTAAAGAAAAGCGTGGTACGTTCAATCACGGACGCTCCATTGAGGAGCGTCCTCATAAAGTCGAAACTCGCCAGGAATTCGGCCACTTTGAAGCTGATACCGTACTTTCTGGTAAACGTAAAGGTCAAGCTGTGGCTACTTTTGTGGAGCGTAAGAGTCGCCTGACAATTGTTAAACGGCTCCATGGTCGCGACAGTCAGTCCATGACTCAAGCCGTACTTGAACTAGCTAGTCAACTTCAAGACAAGCTCAAGACGCTTACCGTAGATCATGGTAAAGAGTTCGCTAACTATCAGACAATTGAACGGCGAACTGGTACACAGGTTTATTTTGCCCATGCCTATTCACCGCATGAAAGAGGCAGTAATGAGAACCGTAACCGAGTTTTGCGGCGCTTTATTCCCAAAGGCCAAGCCATTGAAGAACTAAGTGATCATCAATTGGTTCAAATTAATTGGTATTTGAATTCACGGCCACTTAAATGTCTTAATTGGCATACACCAATCGAGATCTTCTTGCTTAATTTACGTCATTAAATTCGTTCAAGTTATTTCTTGCAATCTGCCATATTCATTGGATAAGGCCCGCCGTTGATCAGAAAAATTCAAATCAATTTTTCCTGTCTGTAATAATTCATAGAGTTCTTCGTGCGTGCCACTACTAATTTTGATTTTCACTTTAGGAAACTCCTGAGTAAACTTCGAAACAGTTTGTAAAAACTCAGCAGTCCCAAAACTTCTTAAATAGCCAACCCGCAACTCGACCTCATCATTCTTTTCAATTTTGATGGTTTTCTTTATAAGTTGGTCCACATCCGCCAAAATATCCTGACTATGAATATAAAAGTACTGACCCCCTTCAGTAACTTCAAAGCTGCGTCCTTTCCGATTCAATAACTTCACACCAAGTTGACTTTCCAACTCCTTCATTTGCTGAGAAATCGCTGACTGCGAAATGTGGCAGTCCACGGCCGCTTGAGTAAACCTATGATTATTAACGATTGCGATAAAATACTGCATCTGTTGAAACATTACCGGCACCTCAACCTTTACAAAATTATCTTTGAATGTTCAAATTTGTCATATTATTTTAATTAGTATAACCTTAATCAACAATTTGAGAAATGTTTTGCAGCAGAACCTGAACCGATTCCCTGCCATGCTTATAAACGAAAAAAGCCACTAGCTATCTAGCTAATGACCTTTTGAATATTATTTTGCATTTAGTCCAACACTATCATGTGCATAATAATCATTATCGACAATCGCATTCTTGACAAAATCCGCAATTGAATTGATTGAGACATCATGCCCACCAAATGGTTCGCCTTTTTTCGTGATTTCATAATCAACAGGACCACCAGTAAACCAGCCCGGACGAATCAGGGTGTAGTTCAAATCAGAAGCTTCAACAACATCGGCGGCTTCCCGATAAGTGCGTAGCACTGGATTACTACTTAAATTTCCACTAGCACCAACCGAAGCGGGAATTTCATCATAAATACCCATTGAAGTAATAAACAGCAATCGTGAAACCTTATTCCGGTCCATTGCCGCAACAATTTTTTTGGCAAAGCGACCTAAAGAACCACTCAAGGCAACAAAAACAACGTCTTGTCCTGCAATCGCCTTGTCTAAGTCACTATCTTTAGTAACATCGCCAGCGATAACACTTTCACGCTCACTAGTCTTTAATCGATTGGCACTTCTAGCAAACAACGTTAACTGATTATCGGTTTCATTCAAAAGCGTTTGTCGAACTCCACCGCCAATAGTCCCCGTTGCACCAACAATTAAAACTTTCTTCATGTTTCCCTCCTATTTATCACTGACAATGACCAATGACTTAATCGCATTCCGTTGGTCCATTGCTTCGTACGCAGCTTGAATATCATCTAACATAAACCGTTTCGTAAAGACTTGGTCGGGCTGAATTTTCCCCGTCAAAACAGCATCTAACAAAACTTGCTTGTCATCCGTCGTTACAGCAGCAATCCCACCACGTAAGCCAATGTTCTTCCAAAAAAGATTATTAGTATTCATTTCAGCCTTTTGTGGGACCCCAACGCGACCAACAACCGCACCAGGACGGCCGACTTTAACTGCTGTGTCAACGGATTGTTCAGTACCTACACATTCAAGTACCGCGTCAGCCCCAGTTTCGGTCAAAGCCATCACTTTGGCAACTGCTTCATCACCACGTTCAGCGATAATGTCCGTGGCGCCAAATGCTTTTGCTAACTTTTGCCGATCTTCATGGCGACTCATTGCGATGATCCGCTTAGCGCCAAGCAATTTTGCGGAAAGCACCCCGCTCAAACCAACGGCACCATCACCCATCACAACAACGGTATCATCTTTTTTGACTTCTGCGCTAGTTGCGGCGTGGAAACCCGTTGCCATCACGTCAGCTAAGGCTAAAAAGTTGTTCAGCATGTCGTCAGAATAATCTTCGAGTTGTCCAGGAATCTTAACTAACGCCCAGTTTGCATTGGTAAAGCGTAAGTATTCACCTTGATAGCCACCGTTACCGCCGGCTTCTTGGTTTAAGCAATCCCCATCAAAACCGGCTAAACAAGCGGCACAGTGCCCACAACCATGGGTGAACGGTGCAATCACGAAATCGCCTGCTTGTACATCTTTAACGGCTGAACCAACAGATTCAACAATTCCAATTGCTTCATGACCAACGGTTGAACCTTCTTGGCGTTGTGAAATCCCGCGGAACCACCACAAATCCGACCCACATACACAGGCCCGGAGCACCCGAATAATTGCATCGGTTGGCTTTTGAATAGTTGTTTTGTCGTATTCTTTAACTTCGACTTTTCCTGGTTCAATAAAAGTTGCTGCTTTCATAATAAACTCTCCTTAAAATTCTATTTCTGGACGCCATTGTTACGAACTTCTGAAACATTACCATACCAATATTGTGCGGTAATTCCGCCATCAACCAAGAAATCACTCCCTGTGATAAAGGCACCACGGCGATCCATTAAGAGTTCCGCCAAATTGGCAATTTCATCGGGTGTTCCTGGACGCTTCGTAACCATTGACTCGAACATCTTTTTGTAACCCGCACCACGCGGCCCGTTCAATTCGTCAACGGCTAATGGTGTCATGATAATACCGGGGCTGATCGTGTTGATCCGTGCACTGCGAGCTTGCCACTTAACCGATTCGGCAGCGACCCGTAAAACATTGGTTCGTTTCGCATATTGATAAGCCGCCAATGAATCCTTGATCACGTCCGGTTGTAAAATTGGTAAATCCAATAATTCTTCAGTCGGTGTCATGGCCAAGGCTTGATTATCTGCTTGTGATAAGGCGGGTAATCGGTGTCCTGATTGCGACGAAATTACGATTCCCGCACTTCCGGGAGCCATGACTTGACCAAATTCTTCTAACAAAACGGCAGTCCCGTAAAGGTCCACTTTGAGCACTTGTTCTGGGCTCGCTTGGGATGGTGAAACGCCAGCCGCGTTGACCAATCCCATAATCTTACCAAGCGATTGTGCCTTAGCAACCACTGTCTTAATAGATTCCCGTGATGAAAGATCCGCTTGGATGGTCTTAACGTTAAATCCAGCTTCCGTCAAGTGTTGTTTCATTTCAACTAATTTTGCTTCATTATAGTCTGCCAACAATAAATTTCTGCCGGCAGCGACACGTCGAACAATTGCTTCGCCGATTGAACCGGCACCGAAAAGTACGATTACTTCGTCATTCATATTCATTGACCTCTTTACTTGTTTTGATTCACCTTAACTTACAAGTCATATCTTACAAGCAAACGTCTTTTAGACCAATTTCAAATTCAGCTCACATTGATAAGTTTTACTTATGAAAAGCAATATCAGGAAATCGGCCACCGCTAGACCTGGTTTTCTGATATTAATTGTATCTCTAATTGTTTTTTTTTAAAATCAAATGTAAGCCGCCGTCCTCTTTGTACTGTCGCCACTAACGTGTGGTGCAATGACTGTTTTTTATCCGTTATACTTAACCTCCTTTACTCTTTGTTAAAACAATCCCTCAAAAAGAGTCGCTTCAATAAAAAAGGATTGCCCAGCGCCCTACTGAACAATCCTATTTAACATCATCAGAATACTAGTACCATCAAAAAACTGATGCGCTTTAAGTAACTAACACTATAATTGCCTGTCACTAACCAGTTTAGGAGTCAGCTAACTGGTCCCATTCACGGTCTGCTTGGGAGATACTGTCACGAAAACCCACCCAATCATCTGGATTAGCAAAAAGTTCCGAATTGATTGGTGTCATAATCAGTGCCGGACCACTTTGCTCAATTCTATAACGTGCCCCTACTTCAAGGCTCAGTTCATTGGGAAAAATGATTCCCTGAGCATTGCCAATCTTACGAATACTCACTTCCATCTATCAGCACACCTTTCCATCACAACTTAATTTTCAGTTAATCCCAACGACATGTCACGGTCACTTTACCACGAAGTCATAGAAGCTAGCAAACATCTGATTTGCTCAAATGAACACTGCTTTGATAACAACGGTATTCAAGACACAACCACTATTATTCATCATCAACACCATCGCCGGAAAATGATACTCAAGACACAACAAAAAAAGCCCT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP023490|1038083:1078708|1045129_1045645_-|AYE58624.1|DBSCAN-SWA MRALVEVNQNKINIELDDLAKLIWGIDKNGLWINHAGTTQTLKDEFRLSFSLFPSDLNPEWQNVPLEWKADGLLIQPAKENSKKVAVFTEFETELPFNQKGFYNLVAYLATHLNGKISEDDGNHWEPVAQFRAKHKSIMTADFDQLLSESIKIGSNISPVDEPKYYDLLNE >CP023490|1038083:1078708|1064738_1066490_-|AYE58645.1|DBSCAN-SWA MSIFLKLGWYFRREWKLYLAGVLGLVLTAIIGIVPPRIIGDVVDGINQHSLTAHTLTVYLVIIGVAAVGQYLARYLWRNAIWGGAAGLERMLRERLFWHFMKMDATFYQQYRTGDLMAHATNDLTAVERVAGGGILQFADSIITGGTTLIAMMTLIDWRLTLIAVVPFPLLAVVSRYLGKKIHVAFRASQAAFSRLNNKAQESISGIKVIKALGQEKADVADFNQQIDQTIKINRHVNVLDSLFDPAITMIIALSYGATIILGGLYVTHGVITIGNLVSFVTYLGMMVWPMFAVGMLFNTMERGNASYDRVMELLNQQSAIIDAKRGIEQRPHGDIQYQIKQFNYPNDAGTSLSNVDFTLKAGQTLGIVGRVGAGKSTIMKLILREFDQYEGHITYGGHDIKQYALDSYLPALGYVPQDSFLFSNTIRKNIRFADPTVSQAVVEAVAAKSDLSGQIASMPAGYDTQVGEEGISLSGGQRQRLAIARALLINPELLILDDALSAVDAETEAEILANLKAERADKTTIIAAHRLSSVMNADEIIVLDAGHVVERGTHAQLMTQHGWYQKMFTRQQLETKVEGAVQ >CP023490|1038083:1078708|1060316_1061183_-|AYE58642.1|DBSCAN-SWA 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>CP023490|1038083:1078708|1048949_1050272_-|AYE58629.1|DBSCAN-SWA MHLHKIFYALGCNMADEMVLKVQKWLNKTYGGLSGYEYAPENGRTGWPTIYSLREALQIETKSKAIGQGFGPATEESVSKYVDKIKLEYEGKLASLVQGAFWCKGINPGAFNGVIIGETVEAIATLQRNAGLSGTGKMSTKLMKALFDMSAFTLVHGGSSTVRAMQQYLNGKYQSYFGILPCDGIYQRDTNTALIYGLQAAEGMDEDTANGFYGPGTSQRTPTLQVGDSGDFFRILQYGLLVNGFYNGPFDSVFTVDVGGAIASFRKFMNLEPFVMTADLTVFKGLLTTNGNTNRNSIACDTSKQLTLTDVQTIKRAEFSIVGRYLTGTVGVGSSRRNKNLTTKEIEIITGEGLSIFPIYQDGGADEDYFTAAQGRRDGQKAVLAASKLGFPHSATIYFAVDVDIENGNIPGTVIPYITGVAASVSKYKVGIYGTRNVCS >CP023490|1038083:1078708|1051818_1052445_-|AYE58631.1|DBSCAN-SWA MKINTKTFYIGIVVMTTATLFTGFRIFHVNHRQNETTSGKSMSTKKISKKESAENVRTEKRRVEEIENRVDLSGNVKMMKTQFGKTIDGILSTTLYKPTVKKVSLKKNVVIQVKIPYKLELPRYFPTDDKKVYKRRVTDFIRIEAGGTVWVAAPGKKHLISNSNKVETGTATINMFIQRGYSETDLKKYKVKLVEPTGTDLTLLYSVS >CP023490|1038083:1078708|1046066_1046414_-|AYE58625.1|DBSCAN-SWA MTYLPKQKDIIWIDFDPQRGREIKKRRPAVVLSSNLYTQNTGFVIVSPITSTMRDLPGYFSLNGYNTHGQIAAAQIYSFDATPRAGRSITYIETMRSADFYHVAQTVYYNFDFPF >CP023490|1038083:1078708|1041349_1042207_-|AYE58619.1|DBSCAN-SWA MNMNDEVIVLFGAGSIGEAIVRRVAAGRNLLLADYNEAKLVEMKQHLTEAGFNVKTIQADLSSRESIKTVVAKAQSLGKIMGLVNAAGVSPSQASPEQVLKVDLYGTAVLLEEFGQVMAPGSAGIVISSQSGHRLPALSQADNQALAMTPTEELLDLPILQPDVIKDSLAAYQYAKRTNVLRVAAESVKWQARSARINTISPGIIMTPLAVDELNGPRGAGYKKMFESMVTKRPGTPDEIANLAELLMDRRGAFITGSDFLVDGGITAQYWYGNVSEVRNNGVQK >CP023490|1038083:1078708|1061285_1062314_-|AYE58643.1|DBSCAN-SWA MQYRQLGTSDLKVSSIALGCMGFGAGTGTALNQRSWAVGQTQANQVLDRAISLGINFFDTAPVYQAGASERVLGQGLKKFQRDQLVLATKFTNRTTQEIENHVSGREHVLRSLDQSLQNLQTDYVDLYIYHIWDWLTPMAEIMAGLNEAVQAGKVRYIGISNAYSWQIAQINALAVRYGYPQFVSIQSHYNLVYREDERELFSYAHENGLATTPYSPLASGRLAHPFGTQTTRRQQDTFADTKYQATSEMDKPIIDRVEELAHQHHVSMAAINLAWLQQRVTAPIIGATKPHHLDAVAEAAGLALTASEIQYLETPYQPHDLEGVMALNRSRTNNWNQYSGQ >CP023490|1038083:1078708|1043123_1043567_-|AYE58621.1|DBSCAN-SWA MSEMSPKEFKHILVGVDDSDDAQLAFRYAINRAKSDGAKLTIVSILEQDNMNVYEAMSKDFVHGQRKDLEEHVQQYQKLARDLGVTDVNAVVDEGDPGETIVKTVIPALKPDLLVIGSVAKHGVRKYFGSQAAYMAKHAPISVLVIR >CP023490|1038083:1078708|1040288_1041329_-|AYE58618.1|DBSCAN-SWA MKAATFIEPGKVEVKEYDKTTIQKPTDAIIRVLRACVCGSDLWWFRGISQRQEGSTVGHEAIGIVESVGSAVKDVQAGDFVIAPFTHGCGHCAACLAGFDGDCLNQEAGGNGGYQGEYLRFTNANWALVKIPGQLEDYSDDMLNNFLALADVMATGFHAATSAEVKKDDTVVVMGDGAVGLSGVLSAKLLGAKRIIAMSRHEDRQKLAKAFGATDIIAERGDEAVAKVMALTETGADAVLECVGTEQSVDTAVKVGRPGAVVGRVGVPQKAEMNTNNLFWKNIGLRGGIAAVTTDDKQVLLDAVLTGKIQPDQVFTKRFMLDDIQAAYEAMDQRNAIKSLVIVSDK >CP023490|1038083:1078708|1039682_1040279_-|AYE58617.1|DBSCAN-SWA MKKVLIVGATGTIGGGVRQTLLNETDNQLTLFARSANRLKTSERESVIAGDVTKDSDLDKAIAGQDVVFVALSGSLGRFAKKIVAAMDRNKVSRLLFITSMGIYDEIPASVGASGNLSSNPVLRTYREAADVVEASDLNYTLIRPGWFTGGPVDYEITKKGEPFGGHDVSINSIADFVKNAIVDNDYYAHDSVGLNAK >CP023490|1038083:1078708|1058419_1059013_-|AYE58641.1|DBSCAN-SWA MEIGIIGAGTVGTVLAKTFARGDHQIKLSRHSGAASLATRRAEFAANVAFVEVAEALQQPLVILAVPFEQAPAVLAQVADYKQRIVVDLTNQFTADFKKIKTAPLTGSEVIARAANNARVIKAFNTIPPEFMDGHVAGPGKRVLFYAGDDVAAKKEFAALVRPLNFRPVNLGKLRHGGSVMQVGGGLGNTHFVQIEE >CP023490|1038083:1078708|1053087_1053687_-|AYE58633.1|DBSCAN-SWA MIKHGYNSSWMFRGVSLDEFKAINAPLPFFWHWFLIWNVISLYPLIDSVTKKYCEQCLLKINSRIVFWITHFISLALFCILLNSLMLLLVDIFWTDIAGEAIIVFILGQIIIVEVCLLISNVVSLKIAFGLTVLFPILGIDNYITWLPANFLMQIRVQEAGLDFSDVLGRELLFLLCLFFGGWVICVRQQYYSVNGGQR >CP023490|1038083:1078708|1055545_1056313_-|AYE58637.1|transposase|DBSCAN-SWA MRHRLSIILSALKLPRSTYYHWKRYQPSQHERVDNQLKEKIKLIWENNYRAYGYPRITMVLRKSGICVGSKRILRLMRETEIHSLMNRRFKKTGTHVDHSQRPNLIKHQPNARIWRADITYLELRPGTWVYLSSIYEPKVHQVLAFKIGRQMEATLVVETINQALECHQKPQYFHSDMGSQYTSNEVETLLERHQISHSYSKQGYPYDNGPIEAFHSLLKREFAFQTTFSNFEDLVIRTSNYISWFNSDRIRTSV >CP023490|1038083:1078708|1075571_1076117_-|AYE58653.1|DBSCAN-SWA MTAIITIRPLQRAELTTLWQLGFSDPNAEWTRWNGPYFHDQLPTQTDFETIIGPRDWLIRPRNWVITRDGVIVGSVNWHFVDGSLKRWLEVGIIIYNHEHWGEHIGRTALTKWLTHLFQDETTLPHIGLTTWSGNMRMMRLAEAVGLKQEAWIPQVRYWQGQYYDSVKYGILRNDWQVQKD >CP023490|1038083:1078708|1062951_1064739_-|AYE58644.1|DBSCAN-SWA MAARQSVWARSMPVKEQLTVIRRLLPYAKPFKWFFIAAIVFSGLISVVNIYLPRVLQTFIDHYLKTGHATVPVMWYFAGLYFFGMVVRALMQFVQNFNSTMGAEYMLENVRRQMFAKLHRMGMRYFDQVPGGSILSRLTNDTMSFSNFWALFNTLFTAFFAVISSFVAMYLTDAQIALWLLVFMPFLAVTIWYYQRYSSRVYRRMRERLSELNTKLSEAITGISVIQQFRQEHRINGEFDHTNDAYFKTRQAMIRTNSLLLSPLIDLFYALGTVMVLGIFGVRGLNGYVAAGVVYAFITYLNNFYNPMTSMMDNLSDFQDGVVAGSRVLRVMDDPTIAPAQHADPTAKITRGKIEFRHVTFAYDGQHPVLKDVSFVAEPGQTVALVGQTGSGKTSTINVLMRFYEFQSGEVLIDDRDIREYPAEELRQKMGLVLQEPFMFYGDINSNIRMFNDQISDEQVQAAARFVKDDDFINDLPENYQSRVIERGASYSSGQRQLISFARTIVTDPKILILDEATANVDTETEEMIQTGLDRIQENRTTIAIAHRLSTIQNADLILVLNQGQIVERGSNDELLQQHGYYYDMIQLQNSAHVD >CP023490|1038083:1078708|1047395_1047935_-|AYE58627.1|DBSCAN-SWA MSSYSNELLMLIFRSTLFKQVIILFAYGGLYCLVTHFIDKKIQHQKQFLLKLGLVKLKKRNKTRWEKIRLIMQLFLIVSILVLVVSTFVLNPDDQYILLVIYVMKLATFTSFAIAFVDSLGPIKEIQQLIVGAQSSDTLDSDKKVLTVTIFKKIRWMLILYQVLKVPLLVILLTLSVDY >CP023490|1038083:1078708|1044304_1044988_+|AYE58623.1|DBSCAN-SWA 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>CP023490|1038083:1078708|1056351_1056615_-|AYE58638.1|transposase|DBSCAN-SWA MKRYQDDFKASIVKMHREEKRSIRSLSEEYGVSPAAIHNWVKGAKSVELEDGTEVTSKEFKQLQKENQRLKEELEILKAAAVLLGKH >CP023490|1038083:1078708|1066758_1068153_+|AYE58646.1|DBSCAN-SWA MSQPSTVTLKTKLAILSVGLLSFVGILVETSMNVTFPTLIKTMRVSLDTVQWLTTGYLLLTTIVMSTTAYVLKRFNPKPLFLFAALVCLLGGILCWLAPNFPVLLTGRLLQAVATGISIPLMFQLIFTYVPRNQLGTYTGLASVIVSLAPALGPTYGGILTNVWSWRAIFVGIVPLLALLAILGAFNILGKALGVGDKKFDYLGAILLAITFTSLLFTFNNAGTHGWLSPNFGLWCLWSIVMIGAMVTYAIKGRRQLIDYSILKLPILRLRLFNYFGLQFINIGLSFVLPLFAQTVLGASAMTAGLMMLPGAIVGAITGPIAGRIYDKQGPTTLLTFSAIMASAALLLFWLTTDYFTVIIMAVIYALLRVGFNTGFGTAISDGSTRVPLPQKSDQNSMFSMMQQYAGSIGTSIMSAVIAGYEIHHPTVTGTIMGSKLDFLLLFVLAIAILVSVLHVKRLEIRQN >CP023490|1038083:1078708|1050359_1051535_+|AYE58630.1|transposase|DBSCAN-SWA 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MTPETEQLLRRWYMGQLIVLFGAAFIQLFTFDGGVFFPVGGMQLLIWGLLAWWPAAEEDQAQWWRLRHVNYYVQTVLQFTLLPILLANLVAWLSQLSWLDEQGLIAVGMAYLMVAFVPVAVVVTKPIESVIGRIAVLITAIFSGVVSAQQTFLILPNLQAPSVFEMVSDTGILGALGFVIAVGVLLRGWGLTGPSWRFNRQAQTSLVVGLIVVGTAFSLWNAFSAGGSWATTFTHWDFQLRSATWKMFLSGLEPGIAEEWLYRFAVLTLLLQAFRHRRHQLDWAVWLSGGLFGMWHITNVFAGQPLSATVEQIIFAATLGWFLASTYLYSGSILLPMVIHAAIDILSMMASGSQTMVKPDAFEWQTIGATVIIFVGITIYFLTGSRRQVIQAHVNQRLLAQ >CP023490|1038083:1078708|1068642_1069194_+|AYE58648.1|DBSCAN-SWA MNYTSQANIHKFTLIIILLSSILISTTITLKISANTTSSSQQAIDCIAQELADVSNSIQYDPQTGLATNLDVNALVSKYGSNNQNQLQHINEIMKYEYKRNLQFNQGKLNSIQTRSFWSCMKNQLLDMIGYQTFQALLRGGIQGLIQRKAWKAAAKLLIRYLGDGIGVGFIAAQLAWYAIRCA >CP023490|1038083:1078708|1053736_1053832_-|AYE58634.1|DBSCAN-SWA MVNTILKEADLFCPNSVRINFTIYLKNFKSS >CP023490|1038083:1078708|1048103_1048871_-|AYE58628.1|DBSCAN-SWA MPNSWAFDQFVEYNLTADLPIDQVAASGRDKGTSKFDTINDCDSTAVSIMEEIIKSSSEFGVFSQVNFSLETSKDIYTPLGDYHLKWKSDWSIGDDSKLASIKVTNGKAKLALNQTIQTFPGVFEPNTMELTEDFLNRLAPTVGNGNIQIGPVIKDGRIGTKFVIKCKRECSKNDVITLSTIIEIYWNNAGFPLTAPEFVTVSDGIENIQHKMPEFNRRDVLEVIGGVVAFGFMLVATKNIISAVKVGAWAMTLV >CP023490|1038083:1078708|1073079_1073727_-|AYE58650.1|DBSCAN-SWA MNTSNRCTGMQRCFYGNYILIFEYKNLKNEVMLISIRTELDLQRAMYQLLEQRSISQITVEQICKQAFIHRSSFYRYYTDKFDLLRQMVMHTLDELLAAERTDTVGSAIMSTFIGAHTQVLRHLLVTNNEGDNTRSQQVINDCFVTVAETGADDRVFAMIRQSQHPDLTAYLVSGVVTSIVQWLNNGHRDGQAASTQAMIQGTLATVFSLEQHTV >CP023490|1038083:1078708|1068321_1068549_-|AYE58647.1|DBSCAN-SWA MMAVFKSSFKQSMIVFGISVIYFFVLHGGYDLLTQYKYWFTEYCANVLGISIIYFVMSLVFNYGIIIWKLYFRKH >CP023490|1038083:1078708|1076379_1076907_-|AYE58654.1|DBSCAN-SWA MTQFETERLILRPMTAADHDALADMIFDPQVVAYLRYRRVQSPATFEQLFTTHFLADTTTVFGIERRRDHQLIGFYEFHGSGATGELTYALSPAAWGHGYVAEAGNCLMHYGFETLNYETIEAHYASANPNSGRVMAKMGMQAAGELHTFTSDKGEVIHVMRYLLTKATWRQLSA >CP023490|1038083:1078708|1074550_1075495_-|AYE58652.1|DBSCAN-SWA MVKLMRRVGIAGLLSLSLLLGGCSLLTSGTDTTSSTTSQQSESSRNQTTSATGNTQQTYKQLAKMTYQSGSAAAIKVNSGKSTLAASQWKNSKIDYGNLDSLNRTTTDTAYLSKANLGRSEGRTAQTWSPTGWHNQPITVNGKRVYPQNRGHLIAYTLSFNLTSNGQYRAGEDGSLDNPKNLATQTAYSNQKTMQIYEDQVRTALEQGKKVIYRVTTVFRGNELMPRGYWSQAVSTDGSVNFNVYIWNVEPGVSFDYATGRGKADSTMQVAGADKVSSSQNTSASRSSQSTTTSKQVERELVKYGYKYVKKALN >CP023490|1038083:1078708|1056657_1057290_-|AYE58639.1|DBSCAN-SWA MVKYLFARIIRRPSVYFAVFIGSLVTLAQVQEVSMYDDKTQSLYTHWIESFTGSPLPGVFWMLFPLVVAIPCASLISADKRDNYLYLIQIKGRFRSFSKNVFGVNFIVGGLVGIIPLILSFLAIAMILPAKSPNLILDGDGNITINKASLTLFPALFYSNPFLHVLIYLLIGFLVGGLLASVALSIGMWSDRPFVATISCSYPSIWYINF |
40 | Bacillus_phage(37.5%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1174731 : 1240464
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP023490|1174731:1240464|DBSCAN-SWA TTTAATCCGAATTTTTGGACAAATTTGTCAGCATAACCTGATACGGTGTTTGCCAGTCGAGTATTTTAAGCGGTCGCTTGTTAATTTGGAGTAACGTCGTCGTTAAATCTTGAGCACTAATGTGCTCGAAACGAGTCCCTTTAGGATAAAAATAACGTAAATTCCGATTAAAGCGTTCATTACTACCACGTTCAGCTGGCGTATAAGCATGGCAGTAATAGGTCTTAATACCATATTGTGATTCAAGTGATACTAGCCCACTAAACTCAGTGCCACGGTCCACAGTAAAGCTGTGCACCGGACCATTAAAAGTGGTTAGGAACTTAGTTAGTGCTTCATTAACAGTCGCTGTCGTCCGATCTTTTAACCGGTATGCCCAAAGGAACCGTGATTTGCGATCGATTAAAGTTAATAAAACTGCCTTACTATGCCCACGAGGACCAACGACTGTATCTAGTTCAAAATCGCCGATGCGATTACGTTGATTAATCATCATGGGACGCTGTTCAATTGATCGCCCCAAAGATTGATTATATTTGGATCGTTGGTCAACGTTACGCCGTTGGCGTACGCCATGTTCAGGTAGATCATTCAAGGAGAAACCAATTCTCCCCTGATTTAGCCAATTATAAATAGATTTAGTAGCTAGTTTAAATTCGTGAGCAATCATTCCTGGTGACCAGCTTAGACGTAAATGGTTGAGAATTTTTTGCTTTAACTCATCGCTCAGCTTAGTTTTCCGACCACATCGTGATCGCTTGTATTCGGCATCTGTTTGTGCTAATTCAGCCTGATAAGGTTGACATCGAGATAATTCATAAGAAATTGTTGACGGTGATCGGTTCAGCCGAACGCCCATTTGGATATTGGACAGCCCTAGTTCACAAAAGGTTTCGATTTTAATTCGTTCGGAATAGGTTATACTAGACAAAAGATCAGCTCCTAAAAGATGGGTTTGTGGTAAACACCATTTTAAAGGAAGCTGATCTTTTTTGTCCGAACAGCGTTCGGATTAATTTTACAATCTACCCCATGATAAAACCCTCTCGAATTTGATGAATAGATTTCCATAATGGCGCTGGCCAGCTACCGTTCTTTGATTACCTTTATCCTAACTGCTCGAACGGGTTTCAGGTCAAGGGTTTTATTTAATTTGTTTGATTAATAGCCATTTTGAATCAGCAGCCGTCCTTTAAAATTAAGCACTGCCAAAGTAACGTCCACACTAAATGCTTCTCTCGCTTACTCGCCTGCACACCCTCGCAGTACCGTATCACGGGCCCCAGCCACCGACAAAAAAATTCCCCACCAGCATTTAGCCAGTGAGGAATCGTAACATATATAACATCCTGAGATGCCCACCACCAAAACAATCTAGGATTTGGTTAGTGTTTGATTATCACTCGGACAAGTCCCAATCATGTTAAAGCAACCACCGCACACGTTGGTGATTCACGATTGCATTGACTTCCCCGGTTAAATCCTAATTATCTGTCGCCGAGTAACTTTTCAGCTGCTTGTAAGACATTTTCACCATTCATCATGCCATAGTCGGACATATTGATGATATCCATTGGAATCCCAGCCTTATCAGTCTTCTTCTTCACGTCATTCGCCATGTAGCGAACTTGTGGTCCTAATAACAAGACATCGGGATGCGGATCTTGACTCAGTTGATGGTCAATATCAGCCGCTGAGGTGGCAAAGATCTTGTAGTCAACACCATCTTGCTTTGCCGCAGCTTCCATCTTAGACACTAATAGTGAGGTTGACATTCCCGCAGAACATGCCAACATAATAATTTTTTCAGCCATAATTATTTAATTCCTTTCTATAATTACATCTTTTCAATTTCAGCGTTACCAGCAGCAGCTTCCGCAGCGGCCTTTTCACCTTCTTCCTTCGTTAAGATAGCATCGTACTTCTTAGCGAATGGGAAGTAAATTGCAGTTGACATGACTAACGTAATTGTTTGCCAGATAGCCATCTTCCAGCCACCAATCAGGAAGCCAGAAATGATTGCTGGGGTCGTCCACGGCGCCGCGAAACCATTCAATGGTGGCACAATGCCGAAGTAGATGACTAGGTAAGTGGATAAGGCCACGATAACTGGTGTCAAGAAGAATGGAATTGCCAAGAATGGGTTCATCACGATCGGTACCCCGAACAAGAATGGTTCGTTAATGTTGAATAATGCTGGCACAAATTCAACTTTACCAATCGTCTTAAATTGAACGGACTTAGCAGCAAACAACGTAAAGATAACAAGTCCGATCGTAATCCCAGAACCAGTTAAGTTAATGAAGTTATTGTAGAATTCATTAGTTACAATGTGGGCACCTTGGGCAACGGTCAACTTACCTGCTTTATATAATGAAGCATTGTCGAACGTGTTCGGAATCAGTAACCCACTAGTAATGGCACCCATGATCAACCCACCATGGACCCCAAAGAACCAGAAGAATGGCACTAAGAACGCAATAACCAGCGCACCACCGAGTGAATCCGATAATCCTTGAAGCGGTGTTTGAAGAACCTTGTAAATAAATTGCAACATGTCAGTATTACCGAAAGCACTGAAGGCCGCAAAGATTAACATTGCAACAATCAAGATGACCCCGGCAGGAATCATGGCAGTAAATTGGTTGGCAACACTAGCTGGTACTTGTTCTGGTAGGGTAATCTTCCAACCTTTACGAATCATAGCGGAGTAAGCCCAACCAACTAAGATACCGACAATAATGGCGGCGATCATCCCCTGACCACCTAGCCAAGTAATATTAACAACCCCAGTAACGGGTGCTTGCACAAAATTTTGTAGGACCTTTGGTAATTTATCGATATTCTGTGAAACGGCGCTACCTGACATCACGACATTCCCAGCAGCATTGGTAATCCCAGTACCGGCTTTACCCATCGCAGCTACTAATGGATTGGCAATGTTAAGCGTTTGCAAAAGTAAGAATACGGCCATGGAAGTTAACCCAGCGGGCAGTGGTTCATACCCTTCGTTACGCACATATACATAGGCAATCCCAACGGCCGCCCAAAGTGAGAGAACCCCAAACGTTACTGTATAGGCCTGGTTAAAGAACGCTGCCCAACCAGAGGCCTTAATAACAGCAGCCACAGCTGGAATTGGAATATTAGATAAGATCAAGAATACGGACCCAATGATAATAAATGGTAAGGCGTAGACCATCCCGTCTTGTAAGGCTTTAACTGGTTTAGTGTTAACGAACTTCATTATTGGCGGTAAAACTTTGTTGTTAATGAAATTGCTAACAGCACCATTACTACTATTTTCCATTACAATTCATCTCCATTTTTTGCTAGGATCCCTTGCAGCCAATAATATGACTTCTTGGGAACCCGCTTTAAGTCTTTTAGATCATGATTACTCCGGTTAACGTAAACAACCCCGTAACGTTTTTCGATATCTGCGTGTGAACTTGGAATATCAATCAAGCCCCAGCCGAGATAACCTAGTACCTTAGCGCCGTCGATCAACATGGCATCTTTCATCGCCTTGATATGTTCTTCATGATAAGTAATCCGCTCATCATCTTCGATCATATGCTGGCCATCCCAGTGCTCGCGTAACCCAATCCCATTTTCAATCGGGAACACGGGTACTTCGTACTGGTCATACAACTTGGTAATCAAGTTGCGGAAACCGAGTGGATCAATCGCCCAGCCCCATTCATTAGCTTGTAAAAAGCGGTTGGCCTCAAATGAATAATTGAGATAACGATTCGGAACGGCATCAACGGGTATCTTATCCCCATTGATAACCGTTGAACGATAATAACTAAAGGCCAAAAAATCCGCTTTCATTTTGCTGATGATTGCCTCATCACCTGGTTGCAAATCATAATCGATGCCCTGTTGTTCAACGTAACGCAGGACTTCTGGTGAATAGTGCCCGTGCACGTAAGCGTCATTCAAGTTGTTGTTCAAAAATTCGTCACTCTTACGAGCCGCCATAATATCAATTGGCTTAGCTGTTTCTGGATAAACCGGGGTGTAAGCTAACATACCACCAATCTTCACGTCATCGTAGTTCTGATGAACAAAGTCATCTAGGCGCGCGTGCGCTAACATAGTATGGTGGAAAATCCGGTATAAGTCGTTAACACTTTGATCACCCTTGGTGTACCCTGAAATGTTGAAGACTTCGTCGGTAAAGTATAAATTATGTTCATTGAACACGATCCAATATTTAACCCGGTCAGCAAAGTGGGCAATCATCTGTTCACCAAAACGGACGAACGCATCAACGGTGTGGCGCGACATGAACCCGTTTTCATTTTCAGCTAAGGCTAACGGCATATCAAAGTGATACAGGCAAATCATCGGTGTAATCCCCCGTGCCAGCATCGCATCAACCAGCCGATCATAAAACGCAATCCCAGCGGCATTAAACTCACCATCACCATCTGGAACTACTCGTGACCATGAAATCTGAATTCGATACATATTCAAATGTAAGTCCTTCATCAAATCAAGGTCTTCCTCGTAACGATGATATTCATCAATGGCATCATGCCAATCCGAAGTGGTTGCTGTCGCAGGACGAACATCATAAACTGAACGACCCTTACCGTCTTCATCCCAAGCACCCTCAGTTTGCATACTTGACACTGAATTGCCCCAGAAAAAATCTTTGGGCATCTGTCGCTCCTTATCCATCAAACTCCTCCTCTGTGTCATTTATTTTGGAAAACGCTTTCCTCGTGAAATAATACTATCCTATTTCTATTTCAAAATCAATACTTTTACTTTAAAAATGTATACTTTTGTTAAAATAACTAAGCCCGGTTGCCACTAAAGTAGCTACAAAAAGCGGCCTGGTAGTAAATACTACTGCTAGACCGTTTTGATCGTCCTATTTATTCAAATCATTCTTAACCAGTGTATCGACAGCGGCTAATACCGCAGTATCAGCTGAGCGCGCTTGCCACCCTAACAATTGCTGGGCTTTTTGGGTACTGACCTCG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54 | unidentified_phage(25.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1286772 : 1342238
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP023490|1286772:1342238|DBSCAN-SWA 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49 | Erysipelothrix_phage(18.18%) | tRNA,holin,bacteriocin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1432139 : 1493664
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP023490|1432139:1493664|DBSCAN-SWA 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>CP023490|1432139:1493664|1470811_1471384_-|AYE58993.1|DBSCAN-SWA MKKYLGTLVAGMTLMAGLPLVGQAADTETTTKAEVELIQDDTNKDITLDQAPGVSFGTEKITNDSKTYDAKNVTGDLKVTNPGNTDGWLVQVKGSKFMNADDTRELRGATLTFAQVNATADDANNISKAKAYKVDITDQNQIIMDAEANEGIGKFTSKYATNEVSLLIPAGNAAGAYTSTLTWTLGNAPS >CP023490|1432139:1493664|1485935_1486722_+|AYE59004.1|transposase|DBSCAN-SWA MPDYPSNISRAQFALIQPDLENFRKHTRPHRYDLYDVFNAILYSLTTGCQWRELPHDFPEWHTVYRYYDMWRDKPDPTADSLLERLLKKPVASYRFAQGRSARTSFVIVDAQSVKTTDLTKNSGYDGGKKISGIKRHMAVDINGLPQAILVTRANVSDRSGALAMLSLASQNLELVQHVMVDGGYTGNDFADQVKLILNAKTTVAKRNELHTFTVLPQRWIIERSWSWLDKCRRLWKNCERALNSSLQMVVLAFLKIVLKRY >CP023490|1432139:1493664|1461528_1463445_+|AYE58987.1|DBSCAN-SWA 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58 | unidentified_phage(10.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1832521 : 1889813
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP023490|1832521:1889813|DBSCAN-SWA 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57 | unidentified_phage(30.0%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1906462 : 1940498
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP023490|1906462:1940498|DBSCAN-SWA 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31 | Bacillus_phage(25.0%) | tRNA,transposase,bacteriocin,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2109620 : 2118233
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP023490|2109620:2118233|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP023490|2109620:2118233|2113922_2114942_+|AYE59539.1|DBSCAN-SWA MATTESFAQTLAAKQPRLLAAFKHIIAQNHLAHAYLFAGMEGAGQPELAHWIAQRLFCLHINDGEPDGTCEECVRIANGSHPDIVTVAPEGQRIHVDQVRYLKAEFSKSAVEGNRKLFIINDAEKMTASAANSLLKFIEEPSGNVTALLLTTNKQLMLPTIISRTQVIEFPPLNAQALQQTFEQAGIAPNQAQMLRGLTNSVTQAQALLADDWLPQAAQALWRWFDQAVKGDPRSFVAVQVNLVGLAKDADHQLVMLDLIAALFQDLLQLHFEVATTALTFGQYQKELAGLTAEVSDEQLIAATELALTAKRQLASNISFQNVLEGLTLKLWPIFQTNA >CP023490|2109620:2118233|2116313_2117099_+|AYE59542.1|DBSCAN-SWA MATLGANASLYSEQHRITYYECDRTGRATLTTLIDIAVLASEDQSDVLGLTTEMVQSHGVGWVVTQYAIDITRMPRQDEVVTIAVRGSAYNPYFAYREFWIRDADGQQLAYITSIWVMMSQTTRRIVKILPELVAPYQSEVVKRIPRLPRPISFEATDTTITKPYHVRFFDIDPNRHVNNAHYFDWLVDTLPATFLLQHDLVHVDVRYENEVKYGQTVTAHANILPSEVADQVTTSHLIEVDDEKCCEVTIQWRTLPEPIQ >CP023490|2109620:2118233|2111339_2111648_+|AYE59534.1|DBSCAN-SWA MMRGMGNMQSMMKQMKKMQAQMTAEQAALNEQTFTGAAPDDMVKVTFTGDKKMKDITINPDAVDPDDVDMLQDLVVVAVNDALTKVDEQTQSTMGKYTKGLQ >CP023490|2109620:2118233|2109620_2111318_+|AYE59533.1|DBSCAN-SWA MYRALYRVWRPQRFDEIVGQQMITQTLKNAIMTHQTSHAYLFTGPRGTGKTSAAKIFAKAINCHHLVDGEPCNECETCTAITKGQLNDVIEIDAASNNGVEEIRDIRDKAKYAPTQADYKVYIIDEVHMLSTGAFNALLKTLEEPPANVIFILATTEPHKIPLTIISRTQRFDFRRITAKDSYDRMVYILNEKDVTYDEKALRVIAAAAEGGMRDALSILDQVISFGDNTVTLDDALMVTGSVTKQLLANYVSEVTDHDTKPALETMRQILQEGKDANRFIEDLISYTRDVLLYQQAPEMVDSVAMGEDDQQFEAFAKQIDAEVLYQMVKTLNDIQQQMRFTTHPDVYLEVLTVKLAQLDGQAAVQPVAAATVNPEDPTVHKLAQQVEQLQSEVKTLRSQGGSVTKPAPAKPRSSNGPVVKKVNVSQIYPILGAATKNDLIKVRDVWTDLMNILSVTQRALMHVAQPVAASSEGVVVAFDYAFVYQKAIDDQTLIDALGNGLDRLMGQAPKIVCVPKEQWPQIRKDYLATHQPGGATSEQQAPAKEPVVEEAKNMFGDLVEVQPD >CP023490|2109620:2118233|2113576_2113906_+|AYE59538.1|DBSCAN-SWA MKLIIAIVQDKDSNRLSSQFIEANVRATKLSTTGGFLRSGNTTFMIGIDDDRVDEVLAMIKETSHAREQFMTPPVNLDVTMDGAAAYPVEVQVGGATVFVLPIEQFHQF >CP023490|2109620:2118233|2117237_2118233_+|AYE59543.1|DBSCAN-SWA MSILVLGGAGYIGSHMVDRLVEHGTDVVVVDNLVTGHRAAVNSAAKFYQGDLRDADFLNHVFDTEDIEAVVHFAAFSIVPESMSKPLKYFDNNTGGMITLLETMQAHNVKQIVFSSTAATYGTPKQIPIKETDPQLPINPYGASKLMMEQIMHWADVAYGIKFVALRYFNVAGAKPDGSIGEDHGPETHLVPIILQVAQGKRDELKIFGDDYNTPDGTNVRDYVHVIDLADAHILALKYLAAGNDSNAFNLGSSTGFSNKQMLAAAREVTGQPIPAKLAPRRPGDPDSLVAASDKARDVLGWQPNYDNVNDIIETAWAWTQKHPNGYDDRD >CP023490|2109620:2118233|2112914_2113580_+|AYE59537.1|DBSCAN-SWA MLTGKLVTFEGPDGAGKTSALNAIVAKLQPQLGDRLVVTREPGGNQISEAIRKIILDRHNTAMDDRTEALLYAAARRQHIVQTIQPALQNDQLVLCDRYIDSSVAYQGAGRGIGEQAVYDMNQFATAGLTADLTLYFDVDAAVGLNRIQQHRQNEINRLDVEALSFHHRVQAAYLRLLADHPDRIKRVDASQPLDQVVTQALEIMASQLPTYVASKGGEDQ >CP023490|2109620:2118233|2112277_2112529_+|AYE59536.1|DBSCAN-SWA MFKRKQKIKHPKEVFDEQLLSTLNAAKLDWDRAKQNQEAVYDNNTSELVTQTALARAKYLYLYREARLRQVHGQTIQRSVIDK >CP023490|2109620:2118233|2111663_2112263_+|AYE59535.1|DBSCAN-SWA MQYPEPIAKLIDSYMKLPGIGGKTATRLAFYTIDMNGDDVTEFAKSLIAAKRDLHFCSICGNITEDDPCVICKDKSRDQSTVLVVEEAKDVMAMEKIKEYNGLYHVLHGVLSPIDGKGPEDINIASLLKRLQQNEAIKEVIIATNATPEGEATAMYISRLVKPAGIKVTRLAHGLSVGSDIQYADEMTLFKAVEGRQEM >CP023490|2109620:2118233|2114967_2115315_+|AYE59540.1|DBSCAN-SWA MDKRDLYDSFGEMEQQMQQMLDKMAKLRADMTTVLEKNAELVIENEHLREHMVEIENELPKKAASTTTLSKSRQNLEKLYDEGFHVCNQFYGKRRDDDESCVFCLEVIYGERERA >CP023490|2109620:2118233|2115413_2116310_+|AYE59541.1|DBSCAN-SWA METQQSFADHAGIGTLYLVPTPIGNLQDMTYRAVATLKTVDLIAAEDTRNTQKLLNHFEITTKQISFHEHNTQERIPQLIEKLQTGVNLAQVSDAGMPSISDPGKELVAACIAANIPVVPLPGANAGLTALIASGLVPQPFYFYGFLPRKKNEQKADLAKLARRHETVVLYESPFRVAKTLTLLATVCEGTRPIVACRELTKRYEEFARGTLAEMVTWAQDHQLKGEFVLLIGGNPDKDEPETTDELAQLPVKAQVEALIAAGDKPNVAIKTIAKRRNIPRQSVYNQFHELNTNDEES |
11 | Streptococcus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
2198216 : 2248957
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >CP023490|2198216:2248957|DBSCAN-SWA CTTATTTTAATTTGTTGTTTTCCATAATATCATCGATCAAACCGTAGTCTTTAGCCTCTTGTGCGCTTAAGTAGTTATCACGTTCAGTATCATGGTTCAACTTTTCAACGGATTGTCCCGAGTTGTCAGCTAAAATCTGGTTGATCTTTTTACGAGTCTTCAAGATTTCTTCCGCAACAATTTCAATTTCCGTTTGTTGACCTTGAGCACCACCAGATGGTTGGTGAATCAAGATTTCAGAGTTAGGTAAAGCAAACCGCTTGCCCTTAGTACCAGATGAAGCTAAGACGCTGGCCATGGAAGCAGCCATCCCCATAACGATGGTTTGAACATCAGATTTGATGAAGTTCATCGTATCGTAGATTGCTAAGCCGGCGGTAACGACACCACCGGGTGAGTTGATATAGAGATAGATGTCCTTACCTGAATCTTGGGCATCCAAGAAGAGTAGTTGGGCAATAATGGCGTTTGCCATGTTATCTTCAATGGGACCGGATAACATAATGATACGGTCCTTTAATAGTCGTGAATAGATGTCATAAGCACGTTCGCCACGTGATGACTGTTCAATAACTGTAGGAACTGGATACATGATTTGTTAGCCTCCTAAGGTTGCATTATTTGATTAGCTGATTGCTAATATAAATGTAGTTTACCGCTAAGGTCAGTGAAGGTCAAAAGAAAAACCTCAAAAACAGAATTCCGTTTATGCAGTTAACGTGGTATACTTAGGTTTCTATCATAATACGGCTTGAGATTGGGTGAACCCAATCTCTTTTTTTCGACGACTTTAGTCAGTAGGCCTTGGATCAAGTGTTGCGTCTACCTTGGTTTGAAAACGATGTTCTCTTATAATAATGAGTCAAGATTAAGCAGTGATGAACTTGCATATTCAGCACTAATGTGGTGATTTAAAAGTAGTCGACCCACATAATTTTATTATCGCGATAGTAGGTGAATCGATTTACTGATAGTGACCCACAACGATGAGTCTAATAGAAGTTGGAAATTCGCACGTGAGCCGACATATCAAACGACTTGACCTTGTTGCTGGACTCAAGTTGCTCGCAACGAATTAATCAGTATCGGATGCATGAATGAAATTTACCATGATTAAAACGATTCTATAATATAATAACAATTGTAGTAATTATTATTTGAATAGTGTAAGTTTAGCTGTTATTAAATCTACTAAACGACTACACTGGTATATGGTTTACTTGAACTGATTACTTTTTGATTATTTTTACTTGGACGAGCGGGTATAGGTACGATTACTGACCCCGAAAGGATATTACTTGTTGTTTGGTTTAAATTAAGTTACCATATGGAGATGTGACTGGTATAGTCCAGTAGTTGTCACTTAAATAAGTGCACAAAAAAAGCTGAGAATCACTTCTCAGCTACCGATGCGCCCGGAGGGAATCGAACCCCCATCTCAAGAACCGGAATCTTACGTGCTATCCATTACACCACGGGCGCCTAAACAACATATTATATTCTAGCGAATAATGGATAAAAACACAAGGGTTTTACATAAAAATTTATTCAGGGAGGTATTTTTATGGCACTGGGACCAGGATTTCGCCAGCAACAGCGGCAATCACAGAAGTTAGCGATGACCCAGCGACTACAACAATCCATTCAGATGTTGCAGTTTAATGTGGAAGAACTAAGAGATTTTCTAACGCAAAAAGCATTAGAAAACCCATTGATCGATGTGGATACAAATTGGAATAATAATCACGCCAGCTTGAACGCAGCCAAAAATGTAACCACTAAGGCGGATTTCATTGAGCGTGTGTCGACCTCTAATCAGCATTCGTTGTTCGAATACTTGTTGGATCAGATTCACCTAACGATGCGTGATACCCATTTGCGCCAGATTGTCCTTTATTTAATTGAGTACGTTGACGTGAATGGTTATTTGCGGATTGATGAGAGGCAGGTTCGGCAAGAAACTAAGGCAACGCCAATTGAGTTGTTGGATGCAATTACCTTATTACAACAACTTGATCCGCCGGGTGTTGGGGCGCGGAGCTTGCAAGAAGCGCTGATGTTGCAGACAGAAAATGATGACCATGCACCGAACTTAGCCTATATTATCTTGGAAGAAAGTTTTGACGAGCTGGTTAATCGACAATGGGACTTGTTGGCTAAGAAGTATCAGGTGACGCTTGCGGACATTTCAAGTATTTATGATTATGTGCGAACACTGACACCCGTACCCGGTGCGGCAATCGGGCAGGAGACGACCGGGTACATCTTTCCCGATTTAGTGGTGACGAATCAGGGAGGCCAGCTGGCATTGCGGACCGCATCCATGGCTCAACCGGTGGTTAAATTCCGCAGTCGGTATTATCAGCAGATGGGGCAGCATGATGATCAGGAAGTTACGGAATATTTGAAAGAAAAGAAAAGTGAGTACGACTGGATCGCTAACAGTTTGCAGCAACGCGAGGCAACCATTTTTCGAGTGGGAACGGCCATTATCGAGCGTCAAGCAGACTTCTTCTTGGAAAAAACGACGGATTTACGGCCACTATTGTTACGAGATGTTGCCCAACAGTTAAAAGTGCATGAATCAACAATCAGTCGAAGTATTAATGGAAAGTACATTCAAACGGACTTCGGTATGTTCGAACTTAAACGTTTCTTTACCAAAGCGGTCAGTAAACGTCCCACTGGTGGCAAAATCGTTTCGGCCGACAGTGTTCAACACCGAATTATGACCCTGATCGAACAGGAAAATAAAGAAAAACCGCTTTCAGACCAAAAAATTGTTCAGATTCTTAATGCGGAAAATGTCGAACTTTCTCGGCGGACAGTGGCGAAATATCGCGAAAATCTTAATATTCCGTCATCATCAAGGCGAAAACAATACTTGAGAACCGAACGATAATTTAACGCGCCATTTGGACCAGTCGGTTATAAGTTTAATTGGGGTTTCATTTGCAACCACCTTATGAACCTGTTATAATTCATGTTGTGGTAAGAGAGGTATGCAACATTGATTTCTTAGTGAATTTGCGTTGTGTGCTTTGTTTTTTGAAGTCTTTGGGTCGCTTTTCGACATAGCTGGACCAGACCCGTCCCACTAGAGAGCAGGTTGGATGCCATGCATTCAGATATTCAATGGATTGAGGCAATTGCCCCAGATATGGTTGACATGCTGAGTCGTCGTTACTTAGTATTAAGAACCATTAATTGGATGGCCCCAGTTGGACGTCGGCTATTAGCTCAGACGTTAGGTGTTAGCGAACGGACGTTACGGACCGAAACGGATACATTGCGGAAGCTAGATTTGATTATGACAAACAAATCGGGCATGCAAGTTACCCAGCAAGGTCAAGACGTGTTAGTAGGCCTAAGTCATTTTATGGATGAGCTAATGGGCATTCGCCAGAAAGAACGACAGTTGGCGCAATACTTTAATATTAAGCGTTGCATCATCGTTTCTGGTGGTTCCGATCGACAGTTGAAAGTTATTGGGACCATGGGCGAAGAAGTGAACCAGCTATTACAGCAATTATTGCCGGAAGGGCGTAATATTATTGCTGTTATGGGTGGGCATACCATGGAACATGTGGCAACTCACTTAACTAATAAATTAGGTGATAAACGTGATTTGTTATTTGTTCCGGCGCGTGGTGGTGTTGGTGAATCGGTTGCGATTCAAGCAAATACCATCGCGTCACAAATGGCACAACATACTGGCGGTAAGTTCCGCTCGTTGTTTGTACCAGAACAGGTCAGTGAACGAACGTATGAACCACTCCTCAAAGAACCAAGTATTCAAGAGGTGCTGGCGATTATCGGGCAAGCTAACGTGGTCGTGCATAGTATCGGTGAAGCCATTTCAATGGCCCATCGCCGGAATATGTCTGAGGATCAGATCAAGGTGTTACGCAGTCGTGAAGCGATTGGTGAAGCCTTTGGTTACTTCTTTGATAAGAAGGGTAACGTGGTCTACCGAATTCCACGGATTGGTTTGCAAATCGGAGAACTGGCCCATCGGGAGATTATACTCGCCATTGCGGGTGGGGCTTCAAAAGCCACCGCAATTGCCGCGTATATGAAGAACATTGCACCTAAACAGACGTGTTTGATCACGGATGAGGGTGCGGCTAACTTGATTTTAAAAAAGTAATCTTCTATAGTGAAGTTGCTTTTTAAAATAAAACTATTTTTATTTCCACAAGGAGGAAATTCTAGTATGTCTGTAAAAATTGGTATTAATGGTTTCGGACGTATCGGTCGTTTAGCATTCCGTCGTATCTTAGAACTTGGTGAAAAGTCAAGTGATATCGAAGTTGTTGCTATTAACGATTTAACTTCACCTGCATTGTTGGCTCATCTTTTGAAGTATGACTCAACTCATGGTACTTTGAACGCTGACGTTTCAGCAACCGACGATTCAATCGTTGTTAACGGTAAGAACTACCGTGTTTATGCTGAACCACAAGCACAAAATATTCCTTGGGTTAAGAACGACGGTGTTGACTTCGTTCTCGAATGTACTGGTTTCTACACTTCAAAGGCTAAGTCACAAGCTCACTTGGACGCTGGTGCAAAGCGTGTCTTGATTTCTGCTCCTGCTGGCTCAGACTTGAAGACCATCGTTTACAACGTTAACGATGACATCTTGACTGCAGATGACCGTATCGTTTCTGCTGGTTCATGTACTACTAACTGCCTTGCACCATTAGCATTCTTTGAAAACAAAGAATTCGGTATCAAGGTTGGTACTATGACTACTATCCATGCTTACACTTCAACTCAAATGTTACTTGACGGCCCTGTACGTGGTGGTAACTTCCGTGCTGCCCGTGCTGCCGGTGTAAACACTATTCCTCATTCAACTGGTGCTGCTAAGGCTCTTGGCTTAGTTATCCCAGAATTGAACGGTAAATTACAAGGCCATGCACAACGTGTTGGTGTTGTTGATGGTTCATTAACTGAATTAGTTGCTATCTTAGACAAGAAAGTTACTGCTGACG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43 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
2315053 : 2370239
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >CP023490|2315053:2370239|DBSCAN-SWA 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MSITEMLGIQYPIFSGAMMRIATHELVGAVSEAGGLGVLGSAGLSAEQLRAEIQATRKLTDKPFGVNLMLQMKNCPELAQVIIDEGVKVVTTGAGNPTSYIPPLHAAGIKVIPVIASVHHAHKMVAAGADAVVVEGQESGGHIGQTSTMALLPQVVDAVDIPVIGAGGVGDGRSIAAMFALGAQGVQCGTIFLTAEECPVPASYKQRVLAASDTDTIVTGRSQRDPVRALVNPMLAQYLQLEQTNAPVAELHALADGSFAKAVEDGDMEHGTPMAGEVAGMMTTIRPVKEIITALFSQAREVAAQLKIK |
39 | unidentified_phage(40.0%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
2511430 : 2572894
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >CP023490|2511430:2572894|DBSCAN-SWA 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MKKIVNWLLGSVLMIAAVTMLSSVTANASTYYHRTPTRATARKAYYTTDTKSHTFRANGNYNRWTFRANHDLKNYRNTVWTTTQQTDIIMHGKKVRYYWVHNSKNGATGWIWSGYLKPVKAKAATPSEATLVSRMRVSEKAQQIVTVIQNGSSTATLKLWQKTNRGWKNTLTSASRIGAAGIGNSHEGSSTTPKGVYHLSFAFGKAASARTSGMAYRQINRKSYWIEDPHDRQYNTWQNRNWTNNKNEHLIDYTKAAPHNQYQLAIVMDNHGQHNGSGFFIHVKNQWATAGCVSINYNDVRTLLSRLGTKAYVVDVQNRAQLQNY |
50 | Bacillus_phage(23.53%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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