Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP031770 | Streptococcus pyogenes strain SASM4-Duke chromosome, complete genome | 1 crisprs | DinG,csm6,cas9,cas1,cas2,csn2,cas4,cas7,cas8c,cas5,cas3,DEDDh,csa3 | 0 | 8 | 7 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP031770_1 | 1333644-1334004 | TypeI |
I-C
Consensus repeat of CP031770_1
|
5 spacers
spacers of CP031770_1
>1.1|1333676|33|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT CACTCTTACTTTGAGAGTAAAGAAGCTCATGAA >1.2|1333741|34|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT TATGTGGGTGTATTGGCTAGTCATGTAATTATTT >1.3|1333807|35|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT GCTTAAAATCGGTATTGTAACTGGTATCATCTTAG >1.4|1333874|33|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT TGACTCTATTATTGATTGAGGAGGTGACGAAAT >1.5|1333939|34|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT GGTAAGATTAATACCGGCTATCTCAACGCTAGTA >1.6|1333677|33|CP031770|PILER-CR CACTCTTACTTTGAGAGTAAAGAAGCTCATGAA >1.7|1333742|34|CP031770|PILER-CR TATGTGGGTGTATTGGCTAGTCATGTAATTATTT >1.8|1333808|35|CP031770|PILER-CR GCTTAAAATCGGTATTGTAACTGGTATCATCTTAG >1.9|1333875|33|CP031770|PILER-CR TGACTCTATTATTGATTGAGGAGGTGACGAAAT >1.10|1333940|34|CP031770|PILER-CR GGTAAGATTAATACCGGCTATCTCAACGCTAGTA |
cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP031770_1
The CRISPR arrays of CP031770_1 >merge|CP031770|1|1333644-1334004|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGACCACTCTTACTTTGAGAGTAAAGAAGCTCATGAAATTTCAATCCACTCACCCATAAAGGGTGAGACTATGTGGGTGTATTGGCTAGTCATGTAATTATTTATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGACGCTTAAAATCGGTATTGTAACTGGTATCATCTTAGATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGACTGACTCTATTATTGATTGAGGAGGTGACGAAATATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGACGGTAAGATTAATACCGGCTATCTCAACGCTAGTAATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC >CP031770|1|1|1333644-1334004|CRISPRCasFinder CTTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC CACTCTTACTTTGAGAGTAAAGAAGCTCATGAA ATTTCAATCCACTCACCCATAAAGGGTGAGAC TATGTGGGTGTATTGGCTAGTCATGTAATTATTT ATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC GCTTAAAATCGGTATTGTAACTGGTATCATCTTAG ATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC TGACTCTATTATTGATTGAGGAGGTGACGAAAT ATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC GGTAAGATTAATACCGGCTATCTCAACGCTAGTA ATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC >CP031770|1|1|1333644-1334004|CRT CTTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC CACTCTTACTTTGAGAGTAAAGAAGCTCATGAA ATTTCAATCCACTCACCCATAAAGGGTGAGAC TATGTGGGTGTATTGGCTAGTCATGTAATTATTT ATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC GCTTAAAATCGGTATTGTAACTGGTATCATCTTAG ATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC TGACTCTATTATTGATTGAGGAGGTGACGAAAT ATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC GGTAAGATTAATACCGGCTATCTCAACGCTAGTA ATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC >CP031770|1|1|1333645-1334004|PILER-CR TTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGACC ACTCTTACTTTGAGAGTAAAGAAGCTCATGAAA TTTCAATCCACTCACCCATAAAGGGTGAGACT ATGTGGGTGTATTGGCTAGTCATGTAATTATTTA TTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGACG CTTAAAATCGGTATTGTAACTGGTATCATCTTAGA TTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGACT GACTCTATTATTGATTGAGGAGGTGACGAAATA TTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGACG GTAAGATTAATACCGGCTATCTCAACGCTAGTAA TTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC
>CP031770.1|AYJ02801.1|1332773_1333484_-|cytochrome-c-biogenesis-protein-CcdA MTLSLVLMVSVFGAGLLSFFSPCIFPVLPVYLGILLDADDSKTITIFDKKLYWYGIVKTLAFIFGLSTIFVILGYGAGFLGNILYAVWFRYLLGALVIILGIHQMGLITIKSLQFQKSLTFHNNKNRNGLFNAFILGLTFSFGWTPCVGPVLSSVLALVASGGNGAWQGGVLMIIYTLGLGIPFLLISFASGIVLKQFNKLKPHMLLLKKVGGVLIIVMGILLMTGTLNNLAQLFG >CP031770.1|AYJ02800.1|1332137_1332761_-|TlpA-family-protein-disulfide-reductase MKKGLLVTTGLACLGLLTACSTQDNMAKKEITQDKMSMAAKKKDEMSTSKDKSMMADKTSDKKMTNDGPMAPDFELKGIDGKTYRLSEFKGKKVYLKFWASWCSICLSTLADTEDLAKMSDKDYVVLTVVSPGHQGEKSEADFTKWFQGTDYKDLPVLLDPDGKLLEAYGVRSYPTEVFIGSDGVLAKKHIGYAKKSDIKKTLKGIH >CP031770.1|AYJ02799.1|1330988_1332095_-|peptide-methionine-(R)-S-oxide-reductase MEHKWKLWLFIVGVVLLIGGASVLIQKGQAKAFSQGKPQLPAKKVKSTKVDPNAPVDQKMIYLAGGCFWGVEEYFSQVDGVLDAVSGYANGRGDTTNYQLIHQTGHAETVEVAYDANRISLKELLLHFFRIIDPTSLNKQGNDRGSQYRTGIYYTDKADLAIIDEVFKEKAKDYKKKIVVEKAPLKHFIKAEEYHQDYLKKNPNGYCHIDINQATYPVIDESKYPKPSATEIKAKLSADEYRVTQKNETEKAFSNRYWDSFDAGIYVDVVTGEPLFSSKDKFESGCGWPSFSRPLSPDVVRYKEDKSFNMTRTEVRSRSGNSHLGHAFTDGPKDQGGLRYCINSLSITFIPKADMEAKGYGYLLSSVE >CP031770.1|AYJ02798.1|1330160_1330901_-|DNA-binding-response-regulator MYSLLIVEDEYLIRQGIRSLVDFSQFKIDRVNEAENGQLAWDLFQKEPYDIVLTDINMPKLNGIQLAELIKEHAPQTHLVFLTGYDDFNYALSALKLGADDYLLKPFSKADVEDMLGKLRKKLDLSKKTETIQELVEQPQKEVSAIAMAIHEQLADSDLTLKSLAQQLGFSPNYLSVLIKKELGMPFQDYLVQERLKKAKLLLLTSNLKIYEIAEQVGFEDMNYFSQRFKQLVGVTPSQYKKGGQA >CP031770.1|AYJ02797.1|1328430_1330164_-|sensor-histidine-kinase MKRYPLLVQLISYVFVIVIALITTLGLLYYQTSSRNIRQLIERDTRQSIRQSSQFIDAYIKPLKETISVLAKNSEIKDFASQIHQENDKQVFQLMKMVLATNSDLQAAVLVTKDGRTVSTNPQLIMKTSSDMMAEPWYKAAIDRQAMPILTPARQLSLSSKKEWVVSVTQEVVDAVGHNLGVLRLDIAYPTIKASLDQLQLGRQGFAFIVNDKHEFVYHPKKSVYSSSKEMAAMKPYLAIQNGYTKDKTSFVYQKLIPNSQWTLVGVASLDQLHRVQRQIFWSFLGTGLLACLICSFATVLALRRWIRPIQQLQQVILAIQKGDRQLRAQETGSPELTDLVQQFNALLDQIDSLMVAVADKEKAIGQYRLQALASQINPHFLYNTLDTIIWMAEFNDSKRVVEVTKSLAKYFRLALNQGNEYIRLADELDHVSQYLFIQKQRYGDKLSYEVQGLDVYADFVIPKLILQPLVENAIYHGIKEVDRKGMIKVTVSDTAQHLMLTVWDNGKGIEDSSLTNSQSLLARGGVGLKNVDQRLKLHYGEGYHMTIHSQSDQFTEIQLSLPKMHELMADDTQENE >CP031770.1|AYJ02796.1|1327278_1328358_-|MmcQ/YjbR-family-DNA-binding-protein MSLASDYFSRQTPIVEKLMAYGFEKRNNGYFYNERFMEEEFEAQLRIDEAGNIWDRVIDCDLEEDYLPLQQAAWQGTYTGQVRAAYLELLERLSVACFEATPFQSMQANRLAKHITKEWSDPMDYPFEKHPDLATYRVGGKWYAMIFSLLADKLDQIPERLVGQTCEVMTVKVNPKDLPQLLQQEGIYPAYHMSKKNWISIILDDKITDDKLWTLVTQSRQLVNPNGLSNPNGPDYWVIPANLKYYDIDAEFAANDVILWTQKAGIAVGDYVLIYITAPVKSIRYVCQVLETDIPNEGYRKNPNIDKLMRLRKCQQYKDGLLSFDLMKEHGVAAVRGPRRLSPQLIAFLKEKEYFKENN >CP031770.1|AYJ02795.1|1326548_1327265_-|hypothetical-protein MVEFVADQSFWELFPDAKLGVVLLKDVQNQAESPEDVKQLLADSHELAKAYLTADNFSDNQVVQVYRKAYQHFKTKKGARSSIEALLKRVSNGQSIPSINPLVDIYNAASLRFGLPAGAEDSDSFIGDLRLTITDGGDDFYLIGDADNNSTLPNELCYKDDIGAVCRCLNWRDGERTMVTEHTKNAFLIIEALDQEGQNRLQEALKFIEGSAKMYLHAITSVHVLDKDNPHVPLFTEN >CP031770.1|AYJ02794.1|1325908_1326382_+|arginine-repressor MNKKETRHQLIRSLISETTIHTQQELQERLQKNGITITQATLSRDMKELNLVKVTSGNDTHYEALAISQTRWEHRLRFYMEDALVMLKIVQHQIILKTLPGLAQSFGSILDAMQIPEIVATICGDDTCLIVCEDNEQAKACYETLSHYTPPFFFSNK >CP031770.1|AYJ02793.1|1325086_1325767_-|Crp/Fnr-family-transcriptional-regulator MIRREDYQYLRKLNDFRYFSIEQFDKIVGQMEFRKAKKDHILFFEGDKRDKLFLVTSGYFKVEQSDQSGTFMYTDFIRHGTIFPYGGLFTDDYYHFSVVAMTDVTYFYFPVDLFEDYSLENRLQMKHLYSKMSKLLELHELRVRNLITSSASSRVIQSLAILLVEMGKDSDTLPFQLTTTDIAQISGTTRETVSHVLRDLKKQELITIKGKYLTYLDKDYFLQYTK >CP031770.1|AYJ02792.1|1323577_1324813_-|arginine-deiminase MTAQTPIHVYSEIGKLKKVLLHRPGKEIENLMPDYLERLLFDDIPFLEDAQKEHDAFAQALRDEGIEVLYLETLAAESLVTPEIREAFIDEYLSEANIRGRATKKAIRELLMAIEDNQELIEKTMAGVQKSELPEIPASEKGLTDLVESNYPFAIDPMPNLYFTRDPFATIGTGVSLNHMFSETRNRETLYGKYIFTHHPIYGGGKVPMVYDRNETTRIEGGDELVLSKDVLAVGISQRTDAASIEKLLVNIFKQNLGFKKVLAFEFANNRKFMHLDTVFTMVDYDKFTIHPEIEGDLRVYSVTYDNEELHIVEEKGDLAELLAANLGVEKVDLIRCGGDNLVAAGREQWNDGSNTLTIAPGVVVVYNRNTITNAILESKGLKLIKIHGSELVRGRGGPRCMSMPFEREDI >CP031770.1|AYJ02802.1|1334152_1334446_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MMVLVTYDVNTETPAGRKRLRHVAKLCVDYGQRVQNSVFECSVTPAEFVDIKHRLTQIIDEKTDSIRFYLLGKNWQRRVETLGRSDSYDPDKGVLLL >CP031770.1|AYJ02803.1|1334456_1335482_-|type-I-C-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKLLNTLYLTQEDFYVTKEGDNIVIKQEGKVLKRFPFRIIDGIVCFSYLGVSPALVKLCTENQINLSFHTPQGRFCGRYIGSTNGNVLLRREHYRLSDREESLEYAKRFILAKISNSRKYLLRFKRDHRQQIDTKLFEAVNDELIWALEMVQAADNKDSLRGIEGQAANQYFRIFNDLVLTDKKTFYFQGRSKRPPLDCVNALLSFGYSLLTFECQSALEAVGLDSYVGFFHTDRPGCASLALDLVEEFRSYIVDRFVFSLINKGQLQKKHFEVKENGSILMTENGRAIFIDLWQKRKHTEVEHPFTKEKVKLMLLPYVQAQLLAKAIRGDLESYPPFMV >CP031770.1|AYJ02804.1|1335478_1336153_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MVYAEDDYLMLSGIQHFQFCKRQWALIHIEQQWLDNEATAHGQVLHTKADNPYIKEKRKELLVSRAMPISSAELGLSGIMDVVEFYKDDQGVSLRGKRGKWLPKVVEYKRGKPKKDTRDIVQLVAQTMCLEETLDCDINEGCLYYHSVNQRVIVPMTSALRQEVKELAAEMQEVYQSQMLPKAAYFKNCQLCSLVDICKPRLSKKTRSVSRYINEAMTSEEMDL >CP031770.1|AYJ02805.1|1336154_1337003_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csd2 MLEHKIDFMVTLEVKEANANGDPLNGNMPRTDAKGYGVMSDVSIKRKIRNRLQDMGKSIFVQANERIEDDFRSLERRFSQHFTAKTPDKEIEEKANALWFDVRAFGQVFTYLKKSIGVRGPVSISMAKSLEPIVISSLQITRSTNGMEAKNNSGRSSDTMGTKHFVDYGVYVLEGSINAYFAEKTGFSQEDAEAIKEVLVSLCENDASSARPEGSMRVCEVFWFTHSSKLGNVSSARVFDLLEYHQSIEEKSTYDAYQIHLNQEKLAKYEAKGLTVEILEGL >CP031770.1|AYJ02806.1|1337007_1338903_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1 MDFFTSLLKTYEKAELADLVDHQKRSNEPVLLPIYHTSLKSNGKNIISVKLDKDGQFHKAEFMADKQMIIFPVTADSVARSGSHPAPHPLVDKFAYYSAEMGQSQYDSFHKQLNNWIDYCEEGDVKRFLTIVQQFILKPEFLTLILDSLIAPDYQHNQLKVIYFDATGKEKLIDLSACFLEFSIDQFQGFKNESVSTFKALHQSYISFVEANRENLGICNISGREEQLTDKHRGLMGNAKIISVSNKREAYKGRFREREDVFSVGYETSEKIHLMIKYLLENKNTSTWLGSSQYLINWFSDDLTNDSRLDIVSPIFDDGLEEDDDDDTPPVITLATEDNKRIGKSFIKGQKLFANDATYYVAILNKTSNGRIALKYFRQLQASQLLTNLNKWQETYSWESRSKFGKSRLRTPTFHDILNVSYGVDRDRFLELDNDNFKSDQIQKLVASLIDGKPMPQSIVKKLGNNVKERHRYRKHWYQVEQVCLAILHKQNGEEFSPMLDHTNQNRSYLFGRLLAIFELIETLRYGLDGNNNDRITNAERYWTAYTGQPTKLMMLLENKIKPYEEPLKLNRRGSWMKLEKEKEEILELLNPLLETETMEKPLDYRFIFGYYAEKNYYYTKQNTEVTESEE >CP031770.1|AYJ02807.1|1338902_1339631_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas5 MYRSRDFYVRVSGQRALFTNPASKGGSERSSYSVPTRQALNGIVDAIYYKPTFTNIVTEVKVINQIQTELQGVRALLHDYSADLSYVSYLSDVVYLIKFHFVWNEDRKDLNSDRLPAKHEAIMERSIRKGGRRDVFLGTRECLGLVDDISQEEYETTVSYYNGVNIDLGIMFHSFAYPKDKKTPLKSYFTKTVMKNGVITFKAQSECDIVNTLSSYAFKAPEEIKSVNDECMEYDAMEKGEN >CP031770.1|AYJ02808.1|1341916_1344565_-|valine--tRNA-ligase MTELSPKYNPAEVEAGRYQKWLDADVFKPSGDQKAKPYSIVIPPPNVTGKLHLGHAWDTTLQDIIIRQKRMQGFDTLWLPGMDHAGIATQAKVEERLRGQGITRYDLGRDKFLDKVWEWKDEYATTIKEQWGKMGLSVDYSRERFTLDEGLSKAVRKVFVDLYKKGWIYRGEFIINWDPAARTALSDIEVIHKDVEGAFYHMNYMLEDGSRALQVATTRPETMFGDVAVAVNPEDPRYKDLIGKHVILPIVNKLIPIVGDEHADPEFGTGVVKITPAHDPNDFEVGQRHNLPQVNVMNDDGTMNELAGDFAGMDRFEARQATVAKLEELGALVNIEKRVHSVGHSERSGAVVEPRLSTQWFVKMDELAKQAMDNQETDDRIDFYPPRFNDTFLQWMENVHDWVISRQLWWGHQIPAWYNAEGEIYVGEEAPEGDGWTQDEDVLDTWFSSALWPFSTMGWPDTDVEDFKRYFPTSTLVTGYDIIFFWVSRMIFQSLEFTGRQPFQNVLIHGLIRDEEGRKMSKSLGNGIDPMDVIEKYGADSLRWFLSNGSAPGQDVRFSYEKMDASWNFINKIWNISRYILMNNEGLTLEDAESNVAKVAASEAGNVTDQWILHNLNETIAKVTENFDKFEFGVAGHILYNFIWEEFANWYVELTKEVLYSDNEAEKVITRSVLLYTLDKIVRLLHPIMPFVTEEIYAQYAQGSIVTVDYPVVRPAFENEAAHKGVERLKDLIRAVRNARAEVNVAPSKPITILVKTADSELEDFFTSNVNYIKRFTNPEKLEISSAIAAPELAMTSIITGAEIYLPLADLLNVEEELARLDKELAKWQKELDMVGKKLGNERFVANAKPEVIQKEKDKQADYQAKYDATQERIAEMQKIKS >CP031770.1|AYJ02809.1|1344566_1345130_-|shikimate-kinase MNLIIIGAQASGKMTIGQEVARQTGMTLFHNHDSIDFVLRFMPWSQESTALIERIRFAFFETFAKTGQDMIFTIVIDFNDPNDVAMLEKIQAVFQSYDQEVLFVELKTDIEERLTRNRTENRLKHKPLKRNIEWSEQDIQSTMAYAVFNPEEPPKTLTHYQKINNTHLTAAETAQLIIQKMTHIKEN >CP031770.1|AYJ02810.1|1345126_1345327_-|N-acetyltransferase MGFTLLDLHKIELGCYDYNKQSQAVARKLGFTLEANARDRKDVQGRRCGDMRFGLLRSEWEEQKQK >CP031770.1|AYJ02811.1|1345475_1345709_+|hypothetical-protein MKPNNPYPAYTGQGRISCYDFRGTTTVSDHKMGLLLFISDFLSSATSLDICADFSTPPLSVTDQLNAPLIANILTNL |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP031770_1 | 1.1|1333676|33|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT | 1333676-1333708 | 33 | MK448771 | Streptococcus phage Javan481, complete genome | 6934-6966 | 0 | 1.0 |
CP031770_1 | 1.1|1333676|33|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT | 1333676-1333708 | 33 | MK448681 | Streptococcus phage Javan141, complete genome | 6532-6564 | 0 | 1.0 |
CP031770_1 | 1.1|1333676|33|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT | 1333676-1333708 | 33 | MK448944 | Streptococcus phage Javan452, complete genome | 11198-11230 | 0 | 1.0 |
CP031770_1 | 1.1|1333676|33|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT | 1333676-1333708 | 33 | MK448672 | Streptococcus phage Javan117, complete genome | 6780-6812 | 0 | 1.0 |
CP031770_1 | 1.1|1333676|33|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT | 1333676-1333708 | 33 | MK448849 | Streptococcus phage Javan128, complete genome | 6683-6715 | 0 | 1.0 |
CP031770_1 | 1.1|1333676|33|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT | 1333676-1333708 | 33 | MK448774 | Streptococcus phage Javan487, complete genome | 6919-6951 | 0 | 1.0 |
CP031770_1 | 1.1|1333676|33|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT | 1333676-1333708 | 33 | MK448958 | Streptococcus phage Javan486, complete genome | 9163-9195 | 0 | 1.0 |
CP031770_1 | 1.1|1333676|33|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT | 1333676-1333708 | 33 | MK448742 | Streptococcus phage Javan37, complete genome | 9155-9187 | 0 | 1.0 |
CP031770_1 | 1.2|1333741|34|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT | 1333741-1333774 | 34 | MK448762 | Streptococcus phage Javan447, complete genome | 55-88 | 0 | 1.0 |
CP031770_1 | 1.2|1333741|34|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT | 1333741-1333774 | 34 | MK448798 | Streptococcus phage Javan533, complete genome | 55-88 | 0 | 1.0 |
CP031770_1 | 1.2|1333741|34|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT | 1333741-1333774 | 34 | MK448793 | Streptococcus phage Javan523, complete genome | 55-88 | 0 | 1.0 |
CP031770_1 | 1.2|1333741|34|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT | 1333741-1333774 | 34 | MK448967 | Streptococcus phage Javan510, complete genome | 55-88 | 0 | 1.0 |
CP031770_1 | 1.2|1333741|34|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT | 1333741-1333774 | 34 | MK448954 | Streptococcus phage Javan476, complete genome | 55-88 | 0 | 1.0 |
CP031770_1 | 1.2|1333741|34|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT | 1333741-1333774 | 34 | NC_004588 | Streptococcus prophage 315.5, complete genome | 204-237 | 0 | 1.0 |
CP031770_1 | 1.3|1333807|35|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT | 1333807-1333841 | 35 | MK448771 | Streptococcus phage Javan481, complete genome | 8314-8348 | 0 | 1.0 |
CP031770_1 | 1.3|1333807|35|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT | 1333807-1333841 | 35 | MK449010 | Streptococcus phage Javan90, complete genome | 10748-10782 | 0 | 1.0 |
CP031770_1 | 1.3|1333807|35|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT | 1333807-1333841 | 35 | MK449012 | Streptococcus phage Javan94, complete genome | 9759-9793 | 0 | 1.0 |
CP031770_1 | 1.3|1333807|35|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT | 1333807-1333841 | 35 | MK448972 | Streptococcus phage Javan520, complete genome | 8239-8273 | 0 | 1.0 |
CP031770_1 | 1.3|1333807|35|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT | 1333807-1333841 | 35 | MK448763 | Streptococcus phage Javan451, complete genome | 9432-9466 | 0 | 1.0 |
CP031770_1 | 1.3|1333807|35|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT | 1333807-1333841 | 35 | MK448845 | Streptococcus phage Javan118, complete genome | 10042-10076 | 0 | 1.0 |
CP031770_1 | 1.3|1333807|35|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT | 1333807-1333841 | 35 | MK448833 | Streptococcus phage Javan87, complete genome | 10748-10782 | 0 | 1.0 |
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CP031770_1 | 1.6|1333677|33|CP031770|PILER-CR | 1333677-1333709 | 33 | MK448681 | Streptococcus phage Javan141, complete genome | 6532-6564 | 0 | 1.0 |
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11. spacer 1.2|1333741|34|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448793 (Streptococcus phage Javan523, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tatgtgggtgtattggctagtcatgtaattattt CRISPR spacer tatgtgggtgtattggctagtcatgtaattattt Protospacer **********************************
12. spacer 1.2|1333741|34|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448967 (Streptococcus phage Javan510, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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13. spacer 1.2|1333741|34|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448954 (Streptococcus phage Javan476, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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14. spacer 1.2|1333741|34|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004588 (Streptococcus prophage 315.5, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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15. spacer 1.3|1333807|35|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448771 (Streptococcus phage Javan481, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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32. spacer 1.7|1333742|34|CP031770|PILER-CR matches to MK448793 (Streptococcus phage Javan523, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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35. spacer 1.7|1333742|34|CP031770|PILER-CR matches to NC_004588 (Streptococcus prophage 315.5, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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36. spacer 1.8|1333808|35|CP031770|PILER-CR matches to MK448771 (Streptococcus phage Javan481, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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41. spacer 1.8|1333808|35|CP031770|PILER-CR matches to MK448845 (Streptococcus phage Javan118, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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42. spacer 1.8|1333808|35|CP031770|PILER-CR matches to MK448833 (Streptococcus phage Javan87, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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43. spacer 1.1|1333676|33|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448767 (Streptococcus phage Javan467, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
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44. spacer 1.1|1333676|33|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448973 (Streptococcus phage Javan522, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
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45. spacer 1.1|1333676|33|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448862 (Streptococcus phage Javan178, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
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46. spacer 1.1|1333676|33|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448942 (Streptococcus phage Javan448, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
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49. spacer 1.1|1333676|33|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004586 (Streptococcus pyogenes phage 315.3, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
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55. spacer 1.1|1333676|33|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448963 (Streptococcus phage Javan498, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
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56. spacer 1.1|1333676|33|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448773 (Streptococcus phage Javan485, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
cactcttactttgagagtaaagaagctcatgaa CRISPR spacer cactcttactttgagagtaaagcagctcatgaa Protospacer ********************** **********
57. spacer 1.1|1333676|33|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448851 (Streptococcus phage Javan14, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
cactcttactttgagagtaaagaagctcatgaa CRISPR spacer cactcttactttgagagtaaagcagctcatgaa Protospacer ********************** **********
58. spacer 1.1|1333676|33|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448833 (Streptococcus phage Javan87, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
cactcttactttgagagtaaagaagctcatgaa CRISPR spacer cactcttactttgagagtaaaaaagctcatgaa Protospacer *********************.***********
59. spacer 1.1|1333676|33|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448673 (Streptococcus phage Javan119, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
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60. spacer 1.3|1333807|35|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448862 (Streptococcus phage Javan178, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
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61. spacer 1.3|1333807|35|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448681 (Streptococcus phage Javan141, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gcttaaaatcggtattgtaactggtatcatcttag CRISPR spacer gcttaaaatcggtattgtaactggcatcatcttag Protospacer ************************.**********
62. spacer 1.3|1333807|35|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448672 (Streptococcus phage Javan117, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
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63. spacer 1.3|1333807|35|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448849 (Streptococcus phage Javan128, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
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64. spacer 1.3|1333807|35|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448850 (Streptococcus phage Javan132, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
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65. spacer 1.6|1333677|33|CP031770|PILER-CR matches to MK448767 (Streptococcus phage Javan467, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
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66. spacer 1.6|1333677|33|CP031770|PILER-CR matches to MK448973 (Streptococcus phage Javan522, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
cactcttactttgagagtaaagaagctcatgaa CRISPR spacer cactcttactttgagagtaaaaaagctcatgaa Protospacer *********************.***********
67. spacer 1.6|1333677|33|CP031770|PILER-CR matches to MK448862 (Streptococcus phage Javan178, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
cactcttactttgagagtaaagaagctcatgaa CRISPR spacer cactcttactttgagagtaaagcagctcatgaa Protospacer ********************** **********
68. spacer 1.6|1333677|33|CP031770|PILER-CR matches to MK448942 (Streptococcus phage Javan448, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
cactcttactttgagagtaaagaagctcatgaa CRISPR spacer cactcttactttgagagtaaaaaagctcatgaa Protospacer *********************.***********
69. spacer 1.6|1333677|33|CP031770|PILER-CR matches to MK449010 (Streptococcus phage Javan90, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
cactcttactttgagagtaaagaagctcatgaa CRISPR spacer cactcttactttgagagtaaaaaagctcatgaa Protospacer *********************.***********
70. spacer 1.6|1333677|33|CP031770|PILER-CR matches to MK449012 (Streptococcus phage Javan94, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
cactcttactttgagagtaaagaagctcatgaa CRISPR spacer cactcttactttgagagtaaaaaagctcatgaa Protospacer *********************.***********
71. spacer 1.6|1333677|33|CP031770|PILER-CR matches to NC_004586 (Streptococcus pyogenes phage 315.3, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
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72. spacer 1.6|1333677|33|CP031770|PILER-CR matches to MK448969 (Streptococcus phage Javan514, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
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77. spacer 1.6|1333677|33|CP031770|PILER-CR matches to MK448963 (Streptococcus phage Javan498, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
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83. spacer 1.8|1333808|35|CP031770|PILER-CR matches to MK448681 (Streptococcus phage Javan141, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
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84. spacer 1.8|1333808|35|CP031770|PILER-CR matches to MK448672 (Streptococcus phage Javan117, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gcttaaaatcggtattgtaactggtatcatcttag CRISPR spacer gcttaaaatcggtattgtaactggcatcatcttag Protospacer ************************.**********
85. spacer 1.8|1333808|35|CP031770|PILER-CR matches to MK448849 (Streptococcus phage Javan128, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gcttaaaatcggtattgtaactggtatcatcttag CRISPR spacer gcttaaaatcggtattgttactggtatcatcttag Protospacer ****************** ****************
86. spacer 1.8|1333808|35|CP031770|PILER-CR matches to MK448850 (Streptococcus phage Javan132, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gcttaaaatcggtattgtaactggtatcatcttag CRISPR spacer gcttaaaatcggtattgtaactggcatcatcttag Protospacer ************************.**********
87. spacer 1.1|1333676|33|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448964 (Streptococcus phage Javan502, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
cactcttactttgagagtaaagaagctcatgaa CRISPR spacer cactcttactttgagggtaaaaaagctcatgaa Protospacer ***************.*****.***********
88. spacer 1.4|1333874|33|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448955 (Streptococcus phage Javan478, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tgactctattattgattgaggaggtgacgaaat CRISPR spacer tgactctattatttattgaggagttgacgaaat Protospacer ************* ********* *********
89. spacer 1.6|1333677|33|CP031770|PILER-CR matches to MK448964 (Streptococcus phage Javan502, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
cactcttactttgagagtaaagaagctcatgaa CRISPR spacer cactcttactttgagggtaaaaaagctcatgaa Protospacer ***************.*****.***********
90. spacer 1.9|1333875|33|CP031770|PILER-CR matches to MK448955 (Streptococcus phage Javan478, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tgactctattattgattgaggaggtgacgaaat CRISPR spacer tgactctattatttattgaggagttgacgaaat Protospacer ************* ********* *********
91. spacer 1.1|1333676|33|CP031770|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448845 (Streptococcus phage Javan118, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.848
cactcttactttgagagtaaagaagctcatgaa CRISPR spacer cactcttactttgagagtaaagcagcttattcc Protospacer ********************** ****.**
92. spacer 1.6|1333677|33|CP031770|PILER-CR matches to MK448845 (Streptococcus phage Javan118, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.848
cactcttactttgagagtaaagaagctcatgaa CRISPR spacer cactcttactttgagagtaaagcagcttattcc Protospacer ********************** ****.**
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
335926 : 341960
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP031770|335926:341960|DBSCAN-SWA GATGATCACAGGAAAACTCATAACCGTTGAAGGTCCAGATGGCGCAGGGAAAACGACTGTTTTAGAGCAACTCATTCCACTGTTAAAACAAAAAGTGGCTCAGGAGATCTTGACAACAAGAGAGCCTGGAGGTGTTGCCATTTCAGAATATATTAGAGAACTTATTTTAGACATCAACCATACTACTATGGACCCTAAAACAGAACTCTTACTTTATATTGCGGCTCGAAGGCAGCATTTGGTAGAAAAGGTACTACCAGCTCTTGAAGCAGGCCGGTTGGTTTTTATTGATCGTTTCATCGATAGTTCAGTAGCTTATCAAGGTGCGGGACGCGGTTTGATCAAAGCAGACATTCAGTGGCTCAACGAGTTCGCAACAGATGGTTTAGAGCCTGACTTGACCCTTTATTTTGATGTTCCTTCTGAAATTGGTTTAGCACGGATTAACGCGAACCAACAAAGAGAAGTCAATCGTTTAGATTTGGAAACAATAGAGATACATCAACGAGTACGAAAAGGATACCTAGCCTTAGCTAAGGAGCATCCAAAACGTATTGTCACAATTGATGCGACTAAACCATTGAAAGAAGTTGTCTCTGTCGCTTTGGAACATGTCTTAGCCTTGCTTTTAGCCTAGGATAAGGGAGGGTAGGAATGGATTTAGCGCAAAAAGCTCCTAACGTTTATCAAGCTTTTCAGACGATTTTAAAGAAAGACCGTCTGAATCATGCTTATCTTTTTTCGGGTGATTTTGCTAATGAAGAAATGGCTCTTTTTTTAGCTAAGGTCATCTTTTGTGAACAGAAAAAGGATCAGACGCCCTGCGGGCATTGTCGCTCTTGTCAATTGATTGAACAAGGAGATTTTGCCGATGTGACGGTATTGGAACCAACAGGGCAAGTGATTAAAACGGATGTGGTCAAAGAAATGATGGCTAACTTTTCTCAGACAGGATATGAAAACAAACGACAAGTTTTTATTATCAAAGATTGTGACAAAATGCATACCAATGCCGCTAATAGCTTGCTAAAGTATATTGAGGAGCCTCAGGGAGAAGCTTACATGTTTTTGCTGACCAATGATGATAACAAAGTGCTTCCGACCATTAAAAGTCGGACACAGGTTTTTCAGTTTCCTAAAAACGAAGCCTATCTTTACCAATTGGCACAAGAAAAGGGATTATTAAACCATCAGGCTAAGCTAGTAGCCAAACTTGCCACAAACACCAGTCATCTAGAACGTCTGTTGCAAACGAGCAAGCTTTTAGAACTGATAACTCAAGCAGAGCGTTTTGTATCTATTTGGCTGAAAGATCAGTTGCAGGCATATTTAGCGTTGAACCGTCTGGTACAGTTAGCAACTGAAAAAGAAGAACAAGATTTAGTTTTGACCCTTTTGACCTTGCTCTTGGCAAGAGAGCGTGCGCAAACGCCTTTGACACAATTGGAGGCTGTTTATCAGGCTAGGCTCATGTGGCAGAGCAATGTTAATTTTCAAAACACATTAGAATATATGGTGATGTCAGAATAAGTGCAATTGGAATTCGTTATGGGGAAACGAAGCTTGTCAAAAGACTTGCCCGTAGCGACCAAAGTAGCGGCGCATAGGGGCAAAAAAGCTTTTGAAGAAAATACTGCCTTTGCAACAGATTTGATGAAAGAAGTATCACGATTAATAACACAAAATAAACTTGAAATGACGTTTATTAATAGTGTCTTTCTCTTAGATCAGCATGTTGTCCTAATTCCCTTTTCAGCAGAAGAGCACATGGATTTTTACAACTGTTAAAAGATTTAGCGGCCGATTTTAGGTCAAGAAGTGAGCTGCCCCAGATTAACAGCCAAGAAGAAACCAAGATTTATGGTCGCTTAGGACCGTGTGGCAGACCACTGTGCTGCTTTCGTTTTTGGGAAAATTTCTGACAATATCTATTAAAATACTAAAAAATCAAAGGTTATCATTGACTTTGGGTAAAGCAACAAGCCCTTATGGCCGTTTGCTTTGCTGTCTCTATGATGAAGGTGGCTTTTACCAATAAAGCAAGAAAAAATTCCCTGAATATGGTACCATAGTAGAGACAAGTGATGGCCCTGCAACAGTAGCAGCCTTGATATATTTACAGATCCCATTAAGGTGCGGTTAAAAGACCAGTTGACCTTAGTCACTTATGCTTTAGAGGAGGTTAAAGTAGGTGAATAAAAAAGAATTATTCGATGCTTTTGATGGATTTTCCCAAAATTTAATGGTTACTTTAGCTGAAATTGAAGCCATGAAAAAACAAGTCCAATCACTAGTAGAAGAAAACACGATTCTTCGCCTAGAAAATACAAAACTACGGGAACGTTTGAGTCACCTAGAACATGAAACGGTAGCTAAAAATCCTTCCAAACAAAGGAAGGATCACTTAGAGGGAATTTATGATGAAGGGTTTCATATCTGCAATTTTTTCTATGGACAACGTCGTGAAAATGATGAAGAATGTATGTTTTGCAGAGAATTATTAGATAGAAAGTAAGGGCATGCAGGTTCAAAAAAGTTTTAAAGACAAAAAAACAAGCGGAACCTTGTATTTGGTTCCAACCCCAATTGGCAATCTGCAGGACATGACCTTTAGAGCAGTGGCAACGTTAAAAGAGGTTGATTTTATTTGTGCAGAAGACACAAGAAACACAGGTCTTTTGCTAAAACACTTTGACATTGCTACCAAGCAAATCAGCTTTCATGAGCACAACGCCTATGAGAAGATTCCTGATTTAATTGATTTATTAATATCAGGACGGTCACTAGCTCAGGTATCTGATGCAGGAATGCCATCGATTTCTGATCCTGGGCATGATTTGGTCAAGGCTGCTATTGATAGTGATATCGCAGTCGTTGCTTTACCAGGTGCCTCAGCAGGGATTACAGCTTTGATTGCTAGTGGACTGGCTCCTCAACCCCATGTTTTTTATGGATTTTTACCCAGAAAAGCAGGGCAACAAAAGGCTTTCTTTGAGGACAAACACCATTACCCAGAGACACAAATGTTTTATGAATCGCCCTATCGCATCAAAGATACCCTGACCAATATGTTGGCTTGTTATGGTGATCGTCAAGTGGTACTTGTTAGAGAATTAACCAAGCTTTTTGAGGAGTACCAACGGGGGTCGATTTTAGAAATCTTGTCCTACCTTGAGGAAACACCCCTAAAAGGGGAGTGTCTGCTGATTGTGGCTGGAGCCCAAGTAGACAGTGAGGTTGAGCTGACAGCTGATGTTGACTTAGTGTCTCTAGTGCAAAAAGAAATCCAAGCAGGAGCCAAGCCAAATCAGGCTATTAAAACAATTGCTAAAGCTTACCAGGTAAATCGCCAAGAGCTTTACCAACAATTTCATGACTTATAAGTCATCGTAGATTAGGAGAAAAACAAATGACAGAAGATCAAGCAACTATCCTTATTTTAGGAGTATACGGAATCATATTGGCTGTATTCTTATTATCAGCCTTATTATGCCTTATCGCTAACTGGCGACTCTTTAAAAGAGCAGGTTACAAAGGATGGTATAGTCTCATTCCTTTCTATGCAGGTTTTGTCAAACACAAAATCACTTTTGGAGAAGATAATAAATGGTTTTACTTTATTGGTTGGGTCATTGCTATTTATTATTACTATGTGCACTTTTGCTATGTCCGTGCTTTTGGTGGATCAAAGGGTCTAGCAGTATTTGGCTTGTTTTTCCCAGGCATTGCTTCTTTGATAGTGGCTTTTGGAAAAACTTATACCACACAAGAATGCCACCCTGTGCCACATCTTTTAAACTAAGAGAAAAAAGACCATCAATTGGATTTATTGATGGTCTTTTAGGTGTTTAAATGATTTTAGTCCCGTGAACAATGGCCGTTCCAGTGAGTTGACTCAAGCTTTGGCAATTCTCAGCAGTGACGCCTCCTCCAATCATGATTTCAATGCGTTTATTGGCATAGGTCACAAGACTTTTAAGCTGTTCCACATTATCTGTAATAGGAGTAGCTTCAGGGGAGCCATGAGTTAGCACACGCACAAAGCCATAATCAATCAGTTGGTCAAGCGCTTGGTGCTGGTGATCAGTCGGAATCCGGTCAAAAGCCATGTGGAAAACCAGTGGCAGTCCTTGTGTTGCAGGCAGTAATTGCTCGATAGCGTCGGTATCCAGTTGATTTTCTGTGGTCAGCAAGCCTAAGACTAGCGCATCTGAGCCAGCTTCAACAGCTTTTAAGATATCTTCTTCCATAGCTTTTAGTTCGAGGTCGTTATAGACAAAATCACCACCGCGAGGTCGAATCATGGTCGCTACGCTAATCTTTTTATCGTGTAAGAGCTGACAGGCTTCTTTGATGACGCCATAAGATGGTGTTGTTCCCCCGACAGCTAGGTTATCACAGAGTTCCACACGACTGACTTGACCAGCATCAAGGGTTGGCAGTAGTGTGAGGTTCTCAGCACAAAATTCTTTAATCATTTTTAGATCTCCTTTATCACTAATATTATAGCACGAATGAAGCTAGTCATCAGGAAACATTTTTGTCAAATCATGGACATTATGCTATACTCACTAGTATTAAAAGTAGGCCAAAACAGCAGCAAATACTTTGAAAAAAGATTGCTATGTTCTACGGCAATATCAGTCTTTACCAACGAACTCTCAAGAAGAAAAGAAAGACAAAGCTTAGCATTTTAAAAAAGCCCCCCCTTTTTTTGTGAAATGATGACCAAAAACAGGCGCCTCACGCCTAAAACAGTTACCCTAAAGGAGAACAAATGATTACGATTTACCAATACCCAAAATGTAGCACCTGCCAAAGAGCCATGGCTGAATTAAAGCAACTGGTTAGTGACTTTGAAGCCATTGACATCAAAGCTAATCCACCCAAAGCTCAGGACCTCAAACATTGGATGGAAACATCTGGTTATACCATCAAAAATTTCTTTAATACCAGTGGTAACAGCTACCGCGAATTGGGACTTAAAGATAAAATAGACCAGCTTAGCCTTGATAAAGCTGCTGAACTCTTAGCCACAGATGGTATGCTGATTAAACGGCCTATTCTGATTAAGGACGGTAAAGTCCTACAAGTTGGCTATCGCAAGCCATATCAAGAGTTGGATTTAGGATAATGCGACAAAGTCTCAAAAAAGGACAAGGCAACATTATAACGCCTTGTCCTTTTTTGGGATCTGTTTTTAGACATTAGAGATCAATATCTAGTAAAATTGGCGTATGGTCTTGGCGTTCCCCAGAAGAAATCATTTCAGAACGCTTAATCTTATCCACGATTCGGTTTGAAGCTAGCCAATAGTCAATTCTCCAACCGGTATTATTGATTTTGCTGGTTTTACTACGTTGTGCCCACCAGGTATAAACATGAGGAATATCGCCGTGCAAGTGACGAAAAGTATCTGTAAAGCCTCTTGCTAATAGGTTAGTAAAGCCTTGACGTTCTTCGTCGGTAAAACCAGGGGAACGTCGATTGCTGCTTGGATTTGCCAAATCAATCTCTTTGTGGGCAACGTTGTAATCTCCCGTAGCCAAAACAGGCTTTTGAGTATCCAGTTCAGTCAAGTAATCAGCGTATTTGTGGTCCCAGATTTGACGGTCATCTAACCGTCTAAGGCCATCACCAGCATTAGGCGTGTAAACCTGTGTGACGAAAAAGTCTTCAAATTCTAGGGTAATGATACGACCCTCAGCATCCATTGTTGTTGGGGCACCAATTTCTGGAAAAGTAATGACAGGGTTTAGCGTGTTTTTGTACAGGAACATGGTGCCAGCATAGCCTTTCCTAGCAGGCTCAACTGAAGAACGCCACACATGCAAATAGTTTGGAAAGTAACTAAGTAGGGTCTCGATATGTTTTTTGGTAGGCCCCTTAGCAGATAATTTAGTTTCTTGAATGGCAATAATATCCGCATCTTGAGCGACTAAAGTGTCTAAAACAGCGCGTGATAAAAGCGCACGAGGGGACTCTCCTGTGAGAGCAGCATTTAAGGAATCAATGTTCCATGAAATCAGTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP031770|335926:341960|335926_336562_+|AYJ01853.1|DBSCAN-SWA MITGKLITVEGPDGAGKTTVLEQLIPLLKQKVAQEILTTREPGGVAISEYIRELILDINHTTMDPKTELLLYIAARRQHLVEKVLPALEAGRLVFIDRFIDSSVAYQGAGRGLIKADIQWLNEFATDGLEPDLTLYFDVPSEIGLARINANQQREVNRLDLETIEIHQRVRKGYLALAKEHPKRIVTIDATKPLKEVVSVALEHVLALLLA >CP031770|335926:341960|338116_338440_+|AYJ01856.1|DBSCAN-SWA MNKKELFDAFDGFSQNLMVTLAEIEAMKKQVQSLVEENTILRLENTKLRERLSHLEHETVAKNPSKQRKDHLEGIYDEGFHICNFFYGQRRENDEECMFCRELLDRK >CP031770|335926:341960|341132_341960_-|AYJ01861.1|DBSCAN-SWA MKLISWNIDSLNAALTGESPRALLSRAVLDTLVAQDADIIAIQETKLSAKGPTKKHIETLLSYFPNYLHVWRSSVEPARKGYAGTMFLYKNTLNPVITFPEIGAPTTMDAEGRIITLEFEDFFVTQVYTPNAGDGLRRLDDRQIWDHKYADYLTELDTQKPVLATGDYNVAHKEIDLANPSSNRRSPGFTDEERQGFTNLLARGFTDTFRHLHGDIPHVYTWWAQRSKTSKINNTGWRIDYWLASNRIVDKIKRSEMISSGERQDHTPILLDIDL >CP031770|335926:341960|340702_341059_+|AYJ01860.1|DBSCAN-SWA MITIYQYPKCSTCQRAMAELKQLVSDFEAIDIKANPPKAQDLKHWMETSGYTIKNFFNTSGNSYRELGLKDKIDQLSLDKAAELLATDGMLIKRPILIKDGKVLQVGYRKPYQELDLG >CP031770|335926:341960|338444_339308_+|AYJ01857.1|DBSCAN-SWA MQVQKSFKDKKTSGTLYLVPTPIGNLQDMTFRAVATLKEVDFICAEDTRNTGLLLKHFDIATKQISFHEHNAYEKIPDLIDLLISGRSLAQVSDAGMPSISDPGHDLVKAAIDSDIAVVALPGASAGITALIASGLAPQPHVFYGFLPRKAGQQKAFFEDKHHYPETQMFYESPYRIKDTLTNMLACYGDRQVVLVRELTKLFEEYQRGSILEILSYLEETPLKGECLLIVAGAQVDSEVELTADVDLVSLVQKEIQAGAKPNQAIKTIAKAYQVNRQELYQQFHDL >CP031770|335926:341960|339773_340403_-|AYJ01859.1|DBSCAN-SWA MIKEFCAENLTLLPTLDAGQVSRVELCDNLAVGGTTPSYGVIKEACQLLHDKKISVATMIRPRGGDFVYNDLELKAMEEDILKAVEAGSDALVLGLLTTENQLDTDAIEQLLPATQGLPLVFHMAFDRIPTDHQHQALDQLIDYGFVRVLTHGSPEATPITDNVEQLKSLVTYANKRIEIMIGGGVTAENCQSLSQLTGTAIVHGTKII >CP031770|335926:341960|337473_337713_+|AYJ01855.1|DBSCAN-SWA MGKRSLSKDLPVATKVAAHRGKKAFEENTAFATDLMKEVSRLITQNKLEMTFINSVFLLDQHVVLIPFSAEEHMDFYNC >CP031770|335926:341960|336579_337455_+|AYJ01854.1|DBSCAN-SWA MDLAQKAPNVYQAFQTILKKDRLNHAYLFSGDFANEEMALFLAKVIFCEQKKDQTPCGHCRSCQLIEQGDFADVTVLEPTGQVIKTDVVKEMMANFSQTGYENKRQVFIIKDCDKMHTNAANSLLKYIEEPQGEAYMFLLTNDDNKVLPTIKSRTQVFQFPKNEAYLYQLAQEKGLLNHQAKLVAKLATNTSHLERLLQTSKLLELITQAERFVSIWLKDQLQAYLALNRLVQLATEKEEQDLVLTLLTLLLARERAQTPLTQLEAVYQARLMWQSNVNFQNTLEYMVMSE >CP031770|335926:341960|339334_339727_+|AYJ01858.1|DBSCAN-SWA MTEDQATILILGVYGIILAVFLLSALLCLIANWRLFKRAGYKGWYSLIPFYAGFVKHKITFGEDNKWFYFIGWVIAIYYYYVHFCYVRAFGGSKGLAVFGLFFPGIASLIVAFGKTYTTQECHPVPHLLN |
9 | Streptococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
351558 : 400376
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP031770|351558:400376|DBSCAN-SWA TATGATGAAAAAACCATTTTACATTACGACACCCATTTATTACCCATCTGGGAAATTACACATTGGTTCTGCTTATACAACTATTGCTTGTGATGTCTTGGCACGCTACAAGCGCTTGATGGGCCATGAGGTCTTTTACCTCACAGGGCTTGATGAGCACGGACAAAAGATTCAAACCAAGGCAAAAGAAGCTGGTATTACACCTCAAACCTATGTTGATAACATGGCAAAGGATGTCAAAGCCCTTTGGCAATTGCTAGATATTTCCTATGACACATTTATCCGGACAACGGACGATTACCACGAAGAGGTCGTTGCTGCTGTCTTTGAAAAATTGCTGGCGCAAGACGACATTTACCTTGGCGAATACTCTGGTTGGTATTCTGTCTCTGATGAGGAATTTTTCACTGAAAGCCAATTAAAAGAAGTCTTTAGAGATGAAGACGGTCAGGTTATTGGAGGGATTGCCCCATCAGGTCATGAGGTCGAGTGGGTCTCTGAAGAATCCTACTTCCTACGCCTTAGCAAATACGCTGATCGTCTTGTGGCCTTCTTTAAAGAGCGACCTGACTTTATCCAACCAGATGGTCGTATGAATGAAATGGTGAAAAACTTTATCGAGCCAGGCCTAGAAGATTTGGCTGTTAGCCGTACTACCTTTACATGGGGTGTACCTGTTCCATCAGACCCAAAACACGTGGTTTATGTGTGGATTGATGCCCTCTTAAATTACGCGACAGCTCTTGGTTATGGTCAAGCTAATCACGCTAACTTTGATAAATTCTGGAATGGAACGGTTTTCCACATGGTTGGAAAAGATATCTTACGTTTTCATAGCATCTACTGGCCAATCTTACTCATGATGCTTGATTTACCAATGCCAGACCGCTTAATTGCTCATGGTTGGTTTGTCATGAAAGACGGTAAAATGTCTAAATCAAAAGGCAATGTGGTCTATCCAGAAATGTTAGTGGAGCGCTTTGGACTTGATCCTCTTCGTTATTACCTCATGCGTTCTTTGCCAGTTGGTTCAGACGGAACCTTTACCCCTGAAGATTATGTGGGTCGTATCAACTATGAGTTAGCCAACGACCTTGGTAATTTATTGAACCGTACCGTTGCCATGATCAACAAGTATTTTGATGGCACGGTGCCAGCTTATGTTGACAATGGAACTGCCTTTGATGCTGACTTAAGTCAACTGATTGATGCTCAGCTAGCAGACTACCATAAGCACATGGAAGCGGTGGACTACCCACGCGCCTTAGAAGCCATTTGGACCATCATTGCTCGTACCAACAAATACATTGATGAGACAGCTCCTTGGGTGCTCGCTAAAGAAGATGGTGACAAGGCTCAACTAGCCAGTGTCATGGCACACTTGGCAGCTAGCTTGCGCGTGGTCGCTCATGTGATCCAACCCTTTATGATGGAAACATCAGCTGCTATCATGGCCCAGCTTGGCTTAGCGCCTGTTTCTGACTTGTCAACACTTGCTCTAGCAGATTTTCCTGCCAATACAAAGGTCGTTGCCAAAGGCACACCGATTTTCCCACGTCTTGATATGGAAGCTGAGATTGACTACATCAAAGCCCAAATGGGTGACAGCTCAGCTATTTCCCAAGAAAAAGAATGGGTCCCTGAAGAGGTTGCGCTCAAATCTGAAAAAGACGTCATCACATTTGAAACCTTTGATGCTGTGGAAATCCGTGTGGCAGAAGTCAAGGAAGTGTCAAAAGTGGAAGGTTCAGAAAAATTGCTGCGCTTTAGAGTAGATGCAGGAGACGGGCAAGACCGTCAAATCTTGTCAGGTATTGCCAAATTTTACCCCAACGAACAAGAATTAGTGGGCAAAAAACTACAAATTGTTGCTAACCTGAAACCGCGTAAAATGATGAAACAATACATCAGCCAAGGCATGATTTTATCAGCAGAGCATGGAGATCAGCTAACGGTCTTAACCGTTGATCCCTCTGTTCCAAATGGAAGTATCATTGGCTGATGCTGACCTATTATTCAAAAAACCTAAGCAAGAACATGTGCTTAGGTTTTTTTGATTGCCTTCAAGAAAGACGAATAACGAGATGGGTGATATGACATCAAAAGCATAACTATCCTAGGACCTGTCCTAGTAAGATTGCTGTGCTTTTGACAAGTGAACAGAGAGGTCTTAAAACTATATCTTGTCATAAAAAAGATTGCAAAACACTATATCTTGTGTTATTATGGTTTTTATAAAAGTTAAGCATGCTTAACTTTAGCCAAACAAAAGAGGACACTAGAGCGTGTCCCACAAGACAGTTGAGCCCTTCGCTTTTTTAGTAGAGTAGGAGTGCTCAAGTCAAAAAGAGACATCCCATCAAACCATTGCTGTTTAGCAGGTCTTTTTGTGTTGCTCAAAAAAACAGTTCCTGTCTGTTTGGCGTCTAGTGATGACTTAGGCTTAGCGCTACTAGACTTTTGTTTGAAAAATACCTCAAGCCTTGAAGGAGACAAATGACCCAATATTATTATGAACGTTCGCAATCCCCAATTGAATACGCCCTATCTGAAACACAAAAACAGTTGCGCTCCATCAATTGGAATTACCTTAATGATGACAAAGATTTGGAAGTGTGGAACCGTGTCACTCAAAATTTTTGGTTGCCTGAAAAGGTTCCTGTTTCTAATGATTTAAATTCTTGGCGCTCCTTGGGTGAGGATTGGCAACAGCTCATCACAAGGACCTACACTGGGTTGACCTTACTAGATACAGTACAAGCAACGGTTGGTGATGTGGCACAAATTCAGCATTCACAAACCGACCACGAACAAGTCATCTATACGAACTTTGCCTTTATGGTGGGGATTCATGCCCGCTCTTACGGGACGATTTTTTCGACCCTTTGCAGCAGTGAGCAAATCGAAGAAGCACATGAATGGGTGGTCTCAACACAGAGCTTGCAAGACCGTGCCCGTGTCTTGATTCCTTACTATACGGGTGATGACCCTTTGAAATCAAAAGTAGCAGCAGCTATGATGCCAGGATTTTTGCTGTATGGCGGCTTTTACCTTCCTTTTTACCTATCAGCACGTGGTAAAATGCCAAACACCTCTGATATCATCCGTCTGATTTTACGCGACAAAGTTATTCACAACTATTACAGCGGTTACAAATACCAACAAAAAGTAGCACGTCTTAGCCCAGAAAAACAGGCTGAAATGAAGGCCTTTGTCTTTGACTTGCTCTATGAACTCATCGACCTTGAAAAAGCTTACTTGAGAGAACTGTATGCAGGCTTTGATTTGGCAGAAGATGCTATCCGCTTTAGCCTTTATAACGCTGGAAAATTCCTTCAAAATTTGGGATATGAGTCGCCATTTACAGAAGAAGAAACGCGCGTTTCACCAGAAGTATTTGCTCAGCTATCAGCGCGTGCAGACGAAAACCATGACTTTTTCTCAGGCAATGGCTCATCTTATGTGATGGGGATCACCGAAGAAACCACAGATGACGATTGGGAGTTTTAAGAAATGGCAGAGCTGATTATTGTGTATTTTTCATCTAAGTCCAATAACACCCATCGCTTCGTCCAAAAATTAGGCCTGCCTGCTCAGCGCATACCAGTAGATAATAGGCCACTTGAAGTTTCAACCCATTACCTTTTGATTGTGCCTACCTATGCAGCTGGTGGCTCAGATGCCAAAGGAGCCGTTCCTAAACAAGTGATTCGTTTTTTGAATAATCCTAACAATCGTAAACATTGTAAGGGAGTGATCTCTTCAGGAAATACCAATTTTGGCGATACCTTTGCCTTAGCAGGCCCTATCATTTCTCAAAAATTGCAGGTCCCCTTATTACACCAATTTGAACTATTAGGCACTGCTACAGATGTTAAAAAGGTACAGGCGATTTTTGCCCGCTTAAAGCATCACACACACGACAAGCAAAACAAACCAACAACCTGATTACAGAAAGGACACACCCATGTCACAAACCAATGCGTCATACCTCTCATTAAATGCACTGACTCGTTTTAAAAAACCAGACGGCAGCTACCATTTTGATAGCGATAAAGAAGCTGTTAGGCGCTACCTGGAAGAACATGTCTCTCCCAATCAAATGGCTTTTAACTCACTAGAAGATAAGCTAGCTTACCTCATCAATGAAGGGTATTATGAGCAGGCCATTTTTGATGCCTATCCTAACGACCTTATCAAGGAGGCCTTTCATTATGCCTATCAACAAGGCTATCGCTTTTTAAATCTCATGGGCGCTATGAAATTTTACCAGTCCTATGCCTTAAAAACCTTGGACGGTAAGCATTACCTAGAAACATTTGAAGACCGTGCTGTGATGAATGCACTCTTTTTAGCTGATGGAGATCAAACCTTTGTCTTTGACGTGATTGATGCCATCTTGCACCGACGCTTTCAACCAGCTACCCCAACCTTTTTAAATGCCGGAAAAAAACGCCGTGGCGAATACATTTCGTGCTATCTTCTTCGTGTCGAAGACAATATGGAATCTATCTCTCGCGCCATTAGCACCAGCTTGCAACTCTCAAAAAGAGGAGGCGGAGTCGCCTTGTGCCTCACCAACCTCAGAGAAATCGGAGCACCGATAAAAGGGATTGAAAATCAGGCAACAGGTATCGTTCCTGTCATGAAACTACTAGAGGACTCTTTTTCCTATGCCAATCAACTAGGTCAGCGCCAAGGAGCAGGTGCGGTTTACCTTCATGCCCATCACCCCGAGGTCCTGACCTTTTTAGACACCAAACGTGAAAATGCCGATGAGAAAATTCGCATTAAGTCCCTAGCATTGGGACTTGTGATCCCAGATATTACCTTCCAGTTAGCCAAAGAAAACAAAGACATGGCTCTCTTTTCACCCTATGATATTAAGCGTGCCTATGGCAAGGACATGTCAGACATCTCCATCACAGAGGAATACGATAAACTGCTAGCCAATCCGGCCATCAAAAAGACCTACATCAGTGCTAGAAAGTTCTTTCAGT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MKKTLTLLLALFAIGVTSSVRAEDEIKWELDPDTSPAIHVTISPENGTNKLHFTLPKGWSVSFKKKDSSANKSYSPVKINDKSLSEYCKPQHNNGTQGTKNTSPKVITSDSETNHCKLSFIYNDNHGDGGLPITVTVDKPNEGDELTLLYRADDGFFGGFTKLKDSQTLKKEKEKKERQLAEEKQIEEERKHVEQKQLEESMLKQIREEDHKPWHQRLSESIQQDQWWNFKGLFQ |
54 | Mycobacterium_phage(14.29%) | tRNA,transposase,protease,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
531331 : 690451
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP031770|531331:690451|DBSCAN-SWA TATGACTATTAAGGCAGAAATTAAGGCGCTCGCCAAAGAAATTGGTATCTCTAAAATTGGTTTTACGACGGCAGATAACTTTGATTATTTGGAAAAGTCATTGCGTGCTTCTGTGGAAGAGGGGCGCAATTCAGGATTTGAACATAAAGTCATAGAGGATCGTATCTCCCCTGAAAGTCTTTTAGAATCGGCTAAAACGATTATTTCAATTGGCGTTGCTTATCCTCACAAACTTCCTCAGCAACCTCAAAAAACACCTTATAAACGTGGAAAAATTACACCTAGTTCGTGGGGGCTTGATTATCATTATGTGGTCGGCGAAAAGTTAGACAGACTATCAAAAGGCATTGAAGAGCTGTGTCGAGATTTTCCTTTGCAACAAAAAGCAATGGTCGATACTGGAGCTTTAGTTGATACTGCAGTTGCCCAAAGAGCGGGTATTGGTTTTATAGGAAAAAATGGTCTAGTTATTTCTAAAGAATATGGCTCTTATATGTTTTTGGGAGAATTAATTACCAATTTAGAGATCGAGCCAGACAAGCCTGTCGATTATGATTGTGGTGACTGTCGTCGTTGTCTAGATGCCTGTCCAACTTCTTGTTTAATTGGTGATGGCTCAATGAATGCCAAGCGTTGTCTATCATTTCAAACCCAAGATAAGGGAATGATGGACACAGAGTTTCGAAAAAAGATTAAAACAGTTATCTATGGTTGTGATATTTGCCAAATTTGCTGTCCTTATAACAAGGGTATAAACAATTCACCAGCTACAGAGATTGATCCTGAGTTGGCTCAACCAGAATTAATACCATTTTTGAGTTTATCAAATGGACAATTTAAAGAAAAATTTGGTATGATTGCTGGAAGTTGGCGAGGTAAAAATATTTTACAGCGTAATGCCATTATTGCGCTAGCAAATGCTCATGATAAAACCGCAGTGGTCAAATTAATAGAGATTATTGATAAAAATAATAACCCTATTCATACTGCAACAGCTATATGGGCATTGGGAGAAATTGTCAAAAAACCAAACGATGAGATGCTGGCGTTTATGAGTCATTTAACCTTAAAAGATGAAGATAGCCGAAAAGAGTTGGAATTAATCCGTCGTAAATGGCAAGTTTAAGCCTTTTATGGTATTTTTAAGAACCTTATGATAAAATAAAACAGATTAACAAAGATTGGAGAAATCTCATGGAAGTGGCTGAAATTCGCCAAAAAATAGTAGAAAATAAAGAGAAGTTGACTAGCTTCAGGAGGTCTCTTTGACTTAGATCGTTTGGAAGAGGAGATTGCTCTTCTTGAAAATCACATGACTGAGCCAGACTTTTGGAATGACAATATTGCAGCGCAAAAGACATCTCAAGAACTAAATGAGTTAAAAGGTAAGTATGATACTTTCCATAATATGCAAGAATTATCTGACGAAACAGAACTCTTACTTGAGATGCTTGACGAAGATGATTCTTTGAAAGAAGAATTAGAAGAAAATCTAATGCAGCTAGATAAGATAATGGGTGCTTATGAAATGACGCTTCTCTTATCTGAACCCTATGACCACAATAATGCTATCTTAGAAATCCATCCTGGTTCAGGAGGAACTGAAGCGCAAGATTGGGGAGATTTACTCTTACGAATGTATACCCGTTTTGGTAATGCTAATGGTTTCAAAGTAGAAGTATTGGATTATCAAGCAGGAGATGAAGCTGGTATTAAATCGGTTACCCTCTCTTTTGAAGGCCCCAATGCTTACGGTTTGTTGAAATCAGAAATGGGAGTTCATCGCCTCGTTCGTATATCACCTTTTGATTCAGCTAAACGTCGTCATACTTCATTTGCTTCAGTTGAAGTGATGCCAGAGTTAGATGATACGATTGAAGTAGAAGTACGTGATGATGACATTAAAATGGATACTTTCCGTTCCGGAGGAGCTGGTGGTCAGAACGTCAATAAAGTATCAACAGGTGTTCGTTTGACGCATATTCCAACTGGAATTGTGGTATCGTCTACCGTTGACCGTACTCAATATGGAAACCGCGATCGCGCTATGAAGATGTTGCAGGCTAAGCTATATCAGTTAGAACAAGAAAAGAAAGCACAAGAAGTAGATGCTCTCAAGGGTGATAAAAAAGAAATCACTTGGGGAAGTCAGATTCGTTCTTATGTTTTCACCCCTTATACGATGGTGAAGGATCATCGTACTAACTTTGAGCTTGCTCAGGTAGATAAGGTTATGGATGGAGAAATCAATGGCTTTATTGATGCCTACCTTAAGTGGCGCATTGAAGACTAAAAATAATAAAGGAGAAACATGGCACTAATAGAAATGTCTGGTGTTACTAAAAAATACCGCCGCTCAACGACCGCCCTCAGAGACGTCAATGTTTCTGTTAACCAAGGTGAGTTTGTTTATCTCGTAGGCCCATCAGGTGCTGGTAAATCAACTTTTATCAAACTCCTTTACCGTGAAGAACAACTGACAACTGGTAAGCTATATGTGGGTGAATTCAATTTAACTAAGCTAAAAGCACGTGATGTTCCGATTCTTCGTCGTCACATCGGAGTAGTTTTTCAAGATTACAAACTGCTACCAAGAAAAACAGTCTTTGAAAATGTAGCTTACGCCATGGAAGTTATTGGTGAAAAGCGCCGCCACATTAAAAAACGCGTGCCAGAGGTACTCGATTTAGTTGGCTTGAAACATAAGATGCGTTCTTTTCCAAGTCAGCTATCAGGAGGGGAGCAGCAACGTGTGGCCATTGCGCGTGCGATTGTTAACAACCCTAAATTATTGATTGCAGATGAACCGACAGGGAATTTAGATCCTGAGATTTCATGGGAAATTATGCAGTTACTTGAACGTATTAATGTTCAGGGAACAACTATCTTAATGGCGACACACAACAGTCATATTGTGAATACATTTCGTCATCGTGTTGTTGCTATTGAAGATGGTCGCATAGTACGTGATGAAGAAAAAGGAGATTATGGTTACGATGATTAGATACTTTTTCCGTCATATTTGGGAATCCATTAAAAATCTTAAACGCAACTTTTGGATGACATTTGCTTCAGTTAGTATGGTGGCTGTTACATTGACTTTAGTTGGTGTTTTTGCGGCGACATTGTTGAATATACAGCGTGTTGCTTCGGGTGTTGAAAATAATGTCCATATCAATACCTACTTACAAGTTGATTCAACTGATGCTGCAAAAGTTATTCAAAATACTGCCGGTGAACCTGTTAATAACGATAACTACCACAGTGTTTACGACAAAATTGCTCAGATAAAAGGTGTCAAAAAGATTACATTTTCTAGCAAGGATGAACAATTGAAAAAATTGCAAGAAACCTTAGGTGATGTTTGGAATATGTATGACCAAGACACTAATCCGCTCCAAGATATCTATCTTATTGAGACCCAGACGCCTAAACAAGTTAAGGCGATCACTAAAAAGATCAGAACGATTGAAGGCGTAGAAGCCGCAGATTATGGAGGGATTAACTCCGATAAACTATTTAAGTTTTCAACATTAATTCAAACTTGGGGGTTGATCGGAACAGCAATGCTATTATTTGTAGCTGTCTTTCTCATTTCAAACACTATTCGTATGACTATTATGTCTCGTAAACGCGACATTGAAATTATGCGGTTAGTTGGTGCTAAAAATTCTTATATTCGAGGGCCTTTCTTTTTTGAAGGGGCTTGGGTTGGCTTGTTAGGAGCTGTTTTACCATCTCTTCTGATTTATTATGGATATGATCTTGTTTATAAGCATTTTGCACAAGAATTACAACGTAATAATCTCTCGATGTATCCGCTTGATCCTTATGTATATTACCTGATTGGTGCTTTGTTTGTCATAGGTATTATGATTGGTTCGCTTGGTTCAGTGCTTTCTATGAGACGTTATTTAAAATTCTAAAAAAAGCGCTGCTGACGAAACGTAGCGACCCCCAAAAGTTGGACCTCTTATGTTATTCCAAGGACTTCGTTTTGTATTGCACAGGACTGGTCCTTTTCATTTTGTTTTGATTCATTTGTTTATTTGTAATAGGCAATATAGTTTAAAATAGCAGTTTCTAAGGTTTCAAGAGAAGAAAAGCACCCCAAAAGTTAGATGTTTGATGTATCTAACTTTTGGGGTGTCATTCAAAATTTAGTGGCTCTTTTTTAGTAAAATACTATGATTTCAGTTTTAGGATAACCTCAAACAGTATCTAAAATAGCTATGTCAATGAAAAAAGGGGTTAGCATTTTTTTCGTGACAAATGGTAGTAGAAGGACCATGCCCAGGATAAACTCGGTAATGATTAGGTAAGGTGAATAGTTCTTGGCGAATACCAGTAATGAGGTCCTCAAAGTTACTGGTAGGTAAGTCAGTACGACCGATAGTTTCACGAAATAGAGCATCGCCAGTAACGACTAATTCATCTGAGTGGAAAACAAATGAGACTCCTCCCCAAGAATGACCAGGTGTTGGTAAAACTGTGAATTCAAAACCATTTAGTTGATAGGGTTGCTTTAATTTAAAAAAGTTCTCTGCCGGTCTTGCTATAACAGTAATGATATCATCATGACGGCCTAAGCCAGATAAATTATCATCTGGGGAAGATAGCCAAGCGGCTTCTTTTTCTGAAACATAAACAGGTGGATGATCAAAAGCATCTCTGACCAAATCTAAACTAAAAATATGATCATAGTGAGTATGCGTTAAGAGGATAGCCACTAAAGGTTTTTCAAAGGATTTAATTTTAGCAATGATTTCTTGGCCGTTACTTCCTGGATCAATGAGGATAACAGCTTGATCATTAACGAGGTAATAAGTATTTTCACCAGCAATGTGGTTTATTGTTTTATAGATTTTCATAAGGATAGTGTACCAAAAAATCAAGGCTTTGTTAAAAAAAAGAGTGGCGGAAAATAAATGGCAATTAGTTTCAGAAAATATGAGATCTCACAGCAATTTATTGACACCGTTTTCATAAAGGTGTATCAT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>CP031770|531331:690451|551802_552048_+|AYJ02063.1|DBSCAN-SWA MEIVHIKDIVTEPYSADDETLGKIFGYTKRQMQDRRYEMVKIPYFSKYLLEQGGRVTIDGMREYLFYRKSIEWEKDKEKYL |
176 | Streptococcus_phage(44.54%) | terminase,bacteriocin,integrase,protease,capsid,tail,tRNA,head,holin,portal | attL 565366:565383|attR 618597:618614 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
727184 : 737788
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP031770|727184:737788|DBSCAN-SWA ATTATTCTCTATTTTTGGTGTTATCCTCTTTTAGTTCAGAAGTTGCCGCGTCAGCTTCTACGGGATTTAGTTCTAAGTAAGATGGTGCTTTAAAAAGTTTCTGAGTTGATTTATGACCATTTTTACTGTATAAACTTGTTGACTCTGATCCGAGTTTTGCTGAAATATCTTTCAGTTGTTTTAACTGCTTAGTGTAGATAAACTGGTTAGGATCAATAGCTTTTAGACCATTTTGAGTATCAAAGCGCAGGAGATCACCCGTTTGAATAGCGTCGCTAGCTGCTAGTTGTTGAGCAACAGCAGAGCGAATTTCCTTAGTTTTGGCTATAGTCATTTCATCGGGATTAGTGATTTCTAAACCTGTTTGCGTGTTGTACAGACGTCCACTATAGTTAGTGTATTCAGGAGTCATATAAGTCCCAGATGTTCGTTGTGCCACAATCTGGCTATTTTGAGGTGATAATAAATCTTGTCCTAATTGAACAAACTGACTAGTGTCAATACCAAGTATGTGGAGTAAAGTAGGAAGAGCATCGATTTCACCGCCAAAGGTTTCTTTGATACTACCATTCGTATAACCTGGAATATGGATCATATACGGGACTCGTTGTAGCATAGCATTATCATATTCAGACCAAGTTTCAGAATCTTTACCAAGAAGTGGAGCAAGACTAGAATTACGAGAATTTGAAATACCATAATGGTCACCATATAAAACAAAAATAGAATTGTCGTACAAACCAGTGGCTTTCAAGTAATCAAAAAAAGATTTAAGGGCAGCGTCTAAATAATTGGCAGTAGCAAAGTAACCATTGATCGTTTCATCGTCTGTTTTGGCTAAAGGAAAACCTTCTTCACTACTTTCGCCTTTTAGACTAGTATAAGGATAGTGATTACTCACAGTGATAAACTTGGTATAAAAAGGTTGTTGCATCTGTTCAAGATATTTTATGGAATCCTTAAACATGTACTTATCATTTAACCCATATTGAAAAGAGTTCTTACTATTTTGTTTAGAGAAGTAGCTAGAATCAAAAAAATAATTATAGCCCCATTGTTTATAAGCATTATTGCGATTCCAGAAAGTTCCAACGTTACCATGAAAGACAGCGCTGGTATAGCCACCTTTTTGGGCTAAAATACTTGGAGTAGCAAATTGTGTATTTTCACCACCGTAGTTCACCATAAAAGAACCACTATTTAAACCAAATAAGGAATTCTCCATCATGGTTTCAGCATCAGAAGTTTTACCTGCTTTAACCTGATGAAAAAAGTTAGGGAATGCTAAGGTAGCATTTGAGTGATAAAGCGAGTTGATAAAAGGCGTTACCTCATATTCTTTATCTCCTTCTTTTAGTTTATAATCTATTAAGAATTGTTGAAAGCTTTCTAAATGAAGAACAATAATATTTTTGCCTTTTCCAATTCCAAAATACTGGGGATCAGGTGCTGCATAATGTCCTTTGACATAAGTTTTAACATCAATTAATTCTTCTGCAGTAGCTCCATTTCGTTCTTTTTGAGCTTGATAGGTTTGATTGCCGCTATAGAGGGTAAACGCTGGTAATCCTAAAGCTCTCACAATATAAGTATTTGAAAAGCCACGTGTTAATAGTTCCGGACGATCAATTTCTGCTAAAAAAAGATTAATAGAAAGCAATAGACTAGATAAAGCGGTGATGGCAAATGCTGCGCGCTTGTTAAAAGGACGTTGATCATTTTTGATTTTTTTAGTGATAGATAAACTAATTAGAATAATAAAATCAAGAATATAGATAATATCCCAGATGCGTAAAAGGTTTAAAGCAGAGTCCCCTAATCCAGCGGAGACTTTACTGCTAGCTAGCATGGCACTCACTGTAATAAAGTCTGAAAATTCTCGGTAATATATAGAATTTGATATCAAGAGAATGTTAAGGATAATATAAACCACCCAAGAACAGATATAAAAGGCTCGGGTATTCTTAACGTAAAGAGCGACCCCCAAAAGTAAAAAAGCTAGTGGGATTGGATTGATAATTGTTAGAAAGACTTGGTATATATTTCCCAAATCTAGTGAAAAGTCTGTATGATATGCCCACAGAGTCTTTATCCAGTAACAAAAGAGTAGAGTAATTATAAAACCCAATCTTGTGTTGATAAAACCTGTGATAAGTGTTTTAAATTTCTTCACAGTAGCAACTTCCTTATCGTTTTTTCCTAAAGATGTCATCTCCAAATAAAATCTCAGATTAAATTATACCAAAAATGTGAAGCTAATGCTTGTTGTAAGTTCAAATTTAGTAGGATTTTTTATCAGATTTTGTTATAATAAAAACTATGAATAAACTCTATATTGATTCTTTTGTCGAAAAGAAGCTGACAGCAGGGGTACAATTATTAGATGAAAAAGATTTTTCTAATATAAAGGAAAAAAATCAGTTGGTTCAACTGGTGACCAAGTCCAATCGTCCCATTGGAACAGCATATATCTCTAAGCAAAATAAAGGAATTGGTTGGTATCTAGGACCAGAAAAAATCGACTTGTCTATCTCTTATTTTGTTAGTCTATTTTCAGTTGCTAAAGCCAAAAGACAAGATTTTGCTCAATCGGACGAGACCAATGCTTATCGCCTTTTTAATCAAGAAGGAGACGGTTTTGGTGGAGTAACAATTGATCTTTATAAAGATTTTGCAGTCTTTTCATGGTACAATGCCTTTGTCTATGACAAAAAAGAAATGATTATGGAGGCTTTTCAACAGGTTTTTCCTGAAGTCAAAGGAGCTTATGAAAAGTGTCGCTTTAAAGGTCCAGATACTGAAACTGCTCATCTGTATGGTGAGCTGGCACAAGAAACCTTTTCGATTTTAGAAAATGGCATAGCCTATCAAGTCTTCTTGAATGAGGGCTTAATGACAGGTATTTTTCTAGACCAGCATGATGTTAGAAGAGCACTAGTAGATGGTTTAGCTATGGGCAAGTCCCTTCTTAACCTATTTTCCTATACAGCTGCCTTTTCTGTAGCAGCTGCTATGGGTGGTGCTATCGAGACCACTTCTGTGGACTTGGCTAAACGATCGAGAGAATTATCACTAGCTCATTTTGAGCATAACCAGTTAAACTTAGCCTCACATCATTTTGTGGTGATGGATGTTTTTGAATACTTCAAATATGCCAAACGGAAAAAATTAATTTTTGATGTGATTGTGATTGACCCACCAAGCTTTGCTAGAAATAAAAAACAAACTTTCTCTGTGAGCAGGGACTACCACAAATTAATCACAGAGGCCTTGGACATATTGAGTCCTAAGGGAACTATTATAGCTTCAACAAATGCTGCTAATATGACTGTTAGCCAGTTCAAAAAGCAAATTATCAAAGGATTTGGAAGTCGTCGTCCTGAGTCTATGACTCTCCAGCAGCTTCCGAGTGACTTTACTATCAATAAAGCAGATGAAAGAAGTAACTATTTAAAGGTATTTACTATAAAGGTACGAGAATGAGAATTGTAGCACCAGTCATGCCAAGACATTTTGACGAGGCTCAAGCCATTGATATTTCTAAATATGAAGATGTTAATTTAATTGAATGGCGAGCAGACTTTCTTCCCAAGGATGAGATTGTCGCAGTAGCACCAGCTATTTTTGAAAAATTTGCCGGAAAAGAAATTATCTTTACCCTTCGGACCGTTCAAGAAGGGGGGAATATTACCCTTTCAAGTCAGGAGTATGTTGATATTATCAAAGAAATCAATGCTATTTATAATCCAGACTATATTGACTTTGAGTATTTTACGCACAAGTCAGTATTTCAAGAAATGCTTGATTTTCCAAATCTTATTTTGTCTTATCACAACTTTGAAGAGACTCCTGAAAATTTAATGGAAGCTTTTTCAGAAATGACCAAGTTGGCACCGCGTGTGGTTAAAATTGCTGTGATGCCCCAGAGTGAACAAGATGTTCTAGATTTGATGAACTATACCAGAGGCTTTAAGACGCTCAATCCTGAGCAAGAATTTGCAACTATATCTATGGGGAAATTAGGAAGATTGTCTCGTTTTGCGGGAGATGTCATTGGCTCTTCCTGGACATACGTTTCATTAGATCATGTTAGCGGTCCAGGTCAAGTGACTCTCAATGATATGAAACGTATTATTGAGGTCTTAGAAATGGATATCTCTAACTAGTGAATGGTCTAAAAATATTATTTCTACAATAGTTAAGAAATGATGTTTTTAGATTAATGTTTTTAAAATAAGTGGAACCAAAAAGGAGAAAAATTGCGTTATTTAACAGCAGGAGAATCTCATGGGCCATCCTTAACAGCTATTATTGAAGGTATACCAGCAGGATTAACTCTTCATCCAGCGGATATTGATCACGAATTACAGCGACGTCAAGGAGGTTATGGCCGTGGTGCCAGAATGTCTATTGAGACTGATCGGGTTCAAATATCCTCAGGAGTTCGTCATGGCAAAACAACAGGGGCCCCCATTACCTTAACGGTAATTAATAAGGACCACCAAAAATGGCTAGATGTCATGGCTGTAGGAGACATTGAAGAGACTCTCAAGTTAAAGCGTCGTGTTAAGCATCCTAGACCAGGACATGCGGATTTGGTAGGAGGTATTAAATATCATTTTAACGATTTAAGAGATGCTTTAGAGCGTTCCTCGGCTAGAGAAACAACGATGAGAGTGGCTGTAGGCGCTGTTGCTAAACGTATCTTAGCTGAACTTGGAATTGATATGTTACATCATATCTTAATATTTGGTGGTATAACGATCACAATACCTTCTAAGCTCTCTTTTAGAGAGTTGCAAGAAAGGGCTCTCCATTCAGAATTATCTATTGTTAATCCAAAGCAAGAAGAAGAAATTAAAACGTATATTGATAAGATAAAAAAAGAAGGGGATACTATTGGTGGTATTATCGAAACGATAGTTCAAGGGGTGCCAGCAGGTCTTGGATCTTATGTCCAATGGGATAAAAAATTAGATGCCAAGCTGGCTCAAGCAGTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP031770|727184:737788|733232_734585_+|AYJ02250.1|DBSCAN-SWA MVIPYDYIVIGGGSAGIASANRAAMHGAKVLLAEGKEIGGTCVNLGCVPKKVMWYGAQVADILGTYAKDYGFDFKDKAFDFKQLKANRQAYIDRIHASYERGFEQNGVDRIYDYAVFKDAHTVEIAGQLYTAPHILIATGGHPVFPDIEGAQYGISSDGFFALDEVPKRTAVVGAGYIAVELAGVLHALGSKTDLFIRHDRPLRSFDKAIVDVLVEEMAVGGPCLHPHSEVAKVVKNTDESLTLYLKDGQEVEVDQLIWAIGRKPNLEGFGLDKTGVTLNDKGYIETDAYENTSVKGIYAVGDVNGKLALTPVAVAAGRRLSERLFNGKTDEKLDYQNVATVIFSHPVIGSVGLSEEAAVKQYGQEAVKTYQSRFTSMFTAITNHRQPCLMKLVTVGDTEKIVGLHGIGYGVDEMIQGFAVAIKMGATKADFDNTVAIHPTGSEEFVTMR >CP031770|727184:737788|731442_732609_+|AYJ02248.1|DBSCAN-SWA MRYLTAGESHGPSLTAIIEGIPAGLTLHPADIDHELQRRQGGYGRGARMSIETDRVQISSGVRHGKTTGAPITLTVINKDHQKWLDVMAVGDIEETLKLKRRVKHPRPGHADLVGGIKYHFNDLRDALERSSARETTMRVAVGAVAKRILAELGIDMLHHILIFGGITITIPSKLSFRELQERALHSELSIVNPKQEEEIKTYIDKIKKEGDTIGGIIETIVQGVPAGLGSYVQWDKKLDAKLAQAVLSINAFKGVEFGVGFDMGFQKGSQVMDEITWTPTQGYGRQTNHLGGFEGGMTTGQPLVVKGVMKPIPTLYKPLMSVDIDSHEPYKATVERSDPTALPAAGVIMENVVATVLAKEILETFSSTTMSELQKAFSDYRAYVKQF >CP031770|727184:737788|735970_736411_-|AYJ02252.1|DBSCAN-SWA MSSHYSRQQKPRKSGGVPTEHIKTGFTAFQKSIALIGSILSIIVATITITRALQPVPDKTSNDTPKESSNTIVKIIEKESSQGNQNHTGTPETTDDNKTTLPSSSTTPSHNETTPTAPETPSTTEGTQLPNATGAEDANTGLPTNP >CP031770|727184:737788|729502_730666_+|AYJ02246.1|DBSCAN-SWA MNKLYIDSFVEKKLTAGVQLLDEKDFSNIKEKNQLVQLVTKSNRPIGTAYISKQNKGIGWYLGPEKIDLSISYFVSLFSVAKAKRQDFAQSDETNAYRLFNQEGDGFGGVTIDLYKDFAVFSWYNAFVYDKKEMIMEAFQQVFPEVKGAYEKCRFKGPDTETAHLYGELAQETFSILENGIAYQVFLNEGLMTGIFLDQHDVRRALVDGLAMGKSLLNLFSYTAAFSVAAAMGGAIETTSVDLAKRSRELSLAHFEHNQLNLASHHFVVMDVFEYFKYAKRKKLIFDVIVIDPPSFARNKKQTFSVSRDYHKLITEALDILSPKGTIIASTNAANMTVSQFKKQIIKGFGSRRPESMTLQQLPSDFTINKADERSNYLKVFTIKVRE >CP031770|727184:737788|734672_735941_-|AYJ02251.1|DBSCAN-SWA MTTYDSISWIHSFKANGRKTDLARMAWLLEALGRPQDKFPAIHVVGTNGKGSVTAYLQHILSTSGYQVGTFTSPFIISFHDRICLNGQPISDLELAQCVSVIRPILTKMSLETNWDRPTEFELVTLIMFCYFANLKPVDIAIIEAGIGGKTDATNVFHALAVVCPSISFDHQERLGYSLAEIAHQKAEVIKAKEPVIIGQLEQEASQVFQQVTQKAGSRLYQLGKDFLLNPSEKTISFQHDNLNLTKLRLKLLGQHQKANACLAIMTAQLLRKSFPKISPKTIQKGIETTTWPGRSEFIQPNLLLDGAHNPDSIAKLKSLMQEEFPKRPIHILFAGLKRKPLADLLAQLDTFEVSVTTFDFPEANLLEDYPDKYPQVKDYRDWLQGSVTSDELFVVTGSLYFISKVRQYCLSNANIFKNIFP >CP031770|727184:737788|732669_733011_+|AYJ02249.1|DBSCAN-SWA MSQEIYDYANQLERAVRALPEYQKVLEVKEAIQADASASELFDEFVAMQEKIQEMMQSGQMPTAEEQTSIQELSQKIEANDQLKAYFEAQQALSVYMSDIERIVFAPLKDLVK >CP031770|727184:737788|730662_731349_+|AYJ02247.1|DBSCAN-SWA MRIVAPVMPRHFDEAQAIDISKYEDVNLIEWRADFLPKDEIVAVAPAIFEKFAGKEIIFTLRTVQEGGNITLSSQEYVDIIKEINAIYNPDYIDFEYFTHKSVFQEMLDFPNLILSYHNFEETPENLMEAFSEMTKLAPRVVKIAVMPQSEQDVLDLMNYTRGFKTLNPEQEFATISMGKLGRLSRFAGDVIGSSWTYVSLDHVSGPGQVTLNDMKRIIEVLEMDISN >CP031770|727184:737788|736645_737788_+|AYJ02253.1|DBSCAN-SWA MIYFDNAATTIPYGEALKTYQEVATKIYGNPSSLHQLGTNASRILEASRKQIAGLLGVKSEEIFFTSGGTESANWAIKGIAFEKTAFGKHIIISAIEHPAVSESVKWLLTQGFEVSYAPVTTQGVVDVNALAELIRPDTILISIMAVNNEMGAIQPIRAISNLLANQPTITFHVDAVQAIGKIPLCDYMTNRVDLASFSGHKFHSVRGVGFLYKKAGKRLNPLLSGGGQEQELRSTTENVAGIASMAKALRIVTEKQVSVLPKLTAMRDVIYKALSAYPDVTVFSAQEGFAPNILTFGIRGVRGEVIVHAFEKYEIYISTTSACSSKAGKPAGSLVAMGVPVKTAQTAVRISLDDDNDMGQVEQFLTIFKQIYDKTQKVR >CP031770|727184:737788|727184_729395_-|AYJ02245.1|DBSCAN-SWA MTSLGKNDKEVATVKKFKTLITGFINTRLGFIITLLFCYWIKTLWAYHTDFSLDLGNIYQVFLTIINPIPLAFLLLGVALYVKNTRAFYICSWVVYIILNILLISNSIYYREFSDFITVSAMLASSKVSAGLGDSALNLLRIWDIIYILDFIILISLSITKKIKNDQRPFNKRAAFAITALSSLLLSINLFLAEIDRPELLTRGFSNTYIVRALGLPAFTLYSGNQTYQAQKERNGATAEELIDVKTYVKGHYAAPDPQYFGIGKGKNIIVLHLESFQQFLIDYKLKEGDKEYEVTPFINSLYHSNATLAFPNFFHQVKAGKTSDAETMMENSLFGLNSGSFMVNYGGENTQFATPSILAQKGGYTSAVFHGNVGTFWNRNNAYKQWGYNYFFDSSYFSKQNSKNSFQYGLNDKYMFKDSIKYLEQMQQPFYTKFITVSNHYPYTSLKGESSEEGFPLAKTDDETINGYFATANYLDAALKSFFDYLKATGLYDNSIFVLYGDHYGISNSRNSSLAPLLGKDSETWSEYDNAMLQRVPYMIHIPGYTNGSIKETFGGEIDALPTLLHILGIDTSQFVQLGQDLLSPQNSQIVAQRTSGTYMTPEYTNYSGRLYNTQTGLEITNPDEMTIAKTKEIRSAVAQQLAASDAIQTGDLLRFDTQNGLKAIDPNQFIYTKQLKQLKDISAKLGSESTSLYSKNGHKSTQKLFKAPSYLELNPVEADAATSELKEDNTKNRE |
9 | Streptococcus_phage(57.14%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
798807 : 867037
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP031770|798807:867037|DBSCAN-SWA AATGGCAGGAAGTAGAACTAACGATATTAAAGTATACTGTTCATTTTGTGGTAAAAGCCAGGATGACGTTAAAAAAATTATCGCAGGAAATAATGTTTTCATCTGCAATGAATGCGTAGCTTTATCACAAGAAATTATAAAAGAAGAATTGGCTGAAGAAGTCCTTGCCGATTTGACAGAAGTTCCAAAACCAAAAGAGCTCCTTGATGTTTTAAATCAATATGTGGTTGGTCAAGATCGTGCTAAACGTGCTTTATCAGTTGCTGTGTACAATCATTATAAGCGTGTCTCGTTTACAGAAAGTCGTGATGACGATGATGTGGATTTACAAAAGTCCAACATTTTGATGATTGGACCAACAGGTTCAGGAAAAACCTTCTTAGCACAAACTCTGGCTAAAAGCCTCAATGTACCATTTGCTATTGCAGATGCAACTTCTTTGACTGAAGCAGGGTATGTTGGAGAAGATGTGGAAAATATTTTACTCAAACTGATTCAGGCTGCTGACTATAATGTCGAACGAGCAGAGCGTGGTATTATTTATGTTGATGAAATAGATAAGATTGCTAAAAAAGGTGAGAACGTATCTATCACACGTGATGTATCTGGTGAAGGTGTACAGCAAGCCCTTCTTAAAATTATTGAAGGTACGGTAGCAAGTGTTCCCCCACAAGGTGGGCGGAAGCACCCTAATCAAGAAATGATCCAAATTGATACAAAAAATATCTTGTTTATTGTTGGCGGGGCTTTTGATGGCATCGAGGAGATTGTTAAACAACGTTTAGGTGAAAAAGTTATTGGTTTTGGTCAAAACAGCCGTAAAATTGATGACAATGCTTCTTATATGCAAGAAATTATTTCAGAAGATATTCAAAAGTTTGGGCTTATTCCAGAATTTATTGGCCGCTTACCAGTTGTGGCAGCCCTTGAACAACTAAACACATCAGATTTGATTCAAATTTTGACAGAACCAAGAAATGCCCTGGTCAAGCAATATCAGGCCCTTCTTTCTTACGATGGCGTCGAATTGGCATTTGATAAGGAAGCCTTAGAAGCCATTGCCAATAAAGCCATTGAACGTAAAACAGGAGCACGTGGTCTTCGTTCTATTATTGAAGAAACGATGTTAGACATTATGTTTGAAATTCCAAGCCAAGAAGATGTCACAAAAGTGCGTATCACCAAGGCTGCTGTCGAAGGCAAGTCAAAACCCGTTTTAGAGACAGCTTAAGGAGAAATAATGGCTGAAGAACAAGTCTTAAATACCCATAACGCCTCAATTTTATTGAGCGCTGCCAATAAATCTCATTACCCCCAAGATGATTTGCCAGAAATTGCCCTTGCTGGACGTTCAAATGTTGGTAAATCAAGTTTTATTAATACCATATTGGGGCGCAAAAATTTGGCAAGAACCTCAAGCAAGCCAGGAAAAACCCAACTATTAAATTTTTTCAATATTGATAACAAGCTTAGATTTGTGGATGTCCCTGGTTATGGCTATGCCAAGGTTTCTAAAAGTGAACGGGCCAAATGGGGAAAGATGATCGAAGAATACTTAACCAGCAGAGACAATCTGCGTGCAGTCGTGAGTTTGGTTGATTTACGTCATGCCCCTTCAAAAGAAGATATTCAGATGTATGACTTTTTGAAGTACTATGACATTCCTGTTATTGTTGTGGCAACCAAAGCAGATAAGATTCCTCGTGGCAAATGGAACAAACATGAGTCTGTGGTCAAGAAAGCTTTGAATTTTGACAAATCTGATACTTTTATAGTATTTTCTTCGGTAGAACGTATTGGTATCGATGATTCTTGGGATGCTATTTTAGAGCAGGTCTAGCGATAGGTGTTGATTTATCTATGCTAAAACATTCTCAGTAGAGGGTGTTTTTCTTATCGAAAACATAAAAAATCATAGTTAGGTTTACCGATTTTACTTGACGCCTTAATGATGACATGCTAGTATTTTATATTAAGGAGATGAGTCATGACACAAGTAGCCCAAGGGCGCTCTAAAGGAAAGTCATTGTTATGCCATCAATGCAATGCCCTTTTTGTATTTATTATTTTTCTTATCTTGCTTGCTGTACTTTTTGGTGTTCGATATCGTAATAGCTCTATTGAAGGTATCTGGCGAACAACAAGCATTGATCAGAAGTTAGGCGATGATTTTGCTAAACGTCTTACTGGTTTGCATCAGAGCCCTCTTATTTGATGATAGTTTATTAACGTCATCTCAGATGATACTAACAGTTAAAAATAACAACGTTGACTTGAGTTTTAGTGTTCAAGTTGAACGAGACATTTTTGTCAAACGTTTAGCTGCTTATCACCAAAATGAATTATTAAAGACATTAAAGGAAAATCATTTAGTTGTTGGTGACTTGAGTAGTAAAGAACGCCAAATTATTGAGAATAGTATGCCAGCTAGCCATGAATTAGAAATGATTTTAGATCAAGCTTTTGAGAAATTAGCTTCTCAGATCGGAGGCAAATATAATCAAAAAACAGGACATTTATCTGCTGTTGTTCTCAAAGGAAAAGTTAATCGTATTTTGCACACCATTGATATCAAAGAAGAAGTAGCAGCGGGACATACTTCTTTTTCAAAAGGATTGCTCACACCTAATGGTTATTTTGATTACACCAGATTTGGAAAGAAACTTGAGTTATTAGGCGATGAAAAAATTATTTTTAAAAAAGTGCTAAAAAAAAGTCCGTCAAGTGTATAACGTAGTCACAAGACGGATTTTTTCATGTTTTGAAAATTATTCAATTGAAGAAGTTTATTACTGATCGTTTTGCCTAATCACTAGTTGTCCTTCTTTTAGGATTGCCTGAAGTTTTTTGACTTCTGGATGGTCAAGATAATAATCAGTTATACGGTCACGAATTTCCTGTTCGATAATACGTCGTAATGGACGAGCTCCCATAGCGCGATTGTACCCTAAATCTATCAAATGAGCTTTAGCGTCATCAGCAATCGTTAAACTAATACCTTTTTTTGCGGTGGTTTGATTTACTTCAGCTAGCATTAAATCAACAATTTCTTCTAAATTTTCTTTTTGCAGATGATTAAATTTAATGATACTATTAAAACGGTTCAAAAACTCTGGTCTGAAATAAGGTGCAATGCGATCCATAATGTTAAACCCAGAAGTTTCCGTATCTTGTTGGCCAAAACCGGCATTTGATGTAGCAATAATAACGGTATTTTTAAAGTTAATAGTATTTCCTTGTCCATCTGTCAATCGTCCATCATCTAACACTTGTAGAAGAAGTGTAATGATTTGAGGATCAGCTTTTTCAATTTCATCTAGTAAGACAATAGCATAAGGGTTACGACGAACACGCTCAGTTAGGGTATTATTATTATCATCGTAGCCAACATAACCAGCCGTTGTCCCAATCAATTTTGACACAGCAGTGCGATCGTTATATTCGGACATATCAAGTCGAATAATAGCATCTTTGGAACCAAATAAATCAAGTGCTAATTGTTTAGCTAACTCTGTTTTACCAACACCAGTTGGACCCACAAAAAGGAAAGAACCTATTGGACGGTTACCATCATCAAAACCTGCTCGATTTCGTCGAATAGCGCGTGCTACTGCTGCAACAGCCTCATCTTGTCCGATGACATGGCTTTTTAAGCGGCTGCTAATTCCTTTGAGCCTTTCTAAATCATTAGTCCCCATGTTAGAGACAGGAATACCAGTTAAGCGCTCTACAGACTCTGCGATATCATTGACTGTAGCAGTGACATTTTGGGTTTGGTTATGTTGCTCAATTTGCTTTTGTAATGTTTCAATCCGTGTTTTTGCTGCTAAAGCTTTTTCAAAGTCTTCTTTGGCGACAGCTTTTTCTTGCCTCTCTTTTTGTTTAGCTATTTCAGTTTCGAGTGTTTTTAAGTCAGTGACCGGGTGTTGCGCAGCTAAATGAGCAGCTGTCATATCCAGTAAGTCAATTGCTTTATCTGGCAGGCTACGCTGTGGGATGTATTGAATAGAATAATCAACAGCAGCTTTTAGAACATTATCAGGAAGGGTAATATGGTGGTGTTGTTCATAAAGATTACGAATACCCATTAAAATGTGAAAAGTATCTTCAGCTGATGGTGCATTCACTTTAACTTCATTAAAGCGACGAGCGAGAGCAGCATTTTTTAAAATAGTATTGCGGTATTCGTCTTGAGTAGTAGCACCAATCAGTGTTAATTCTCCTCGTGACAAGGCTGGTTTAAGAATATCTGCAAGTCCCTTTGAGCCTGAATCACTGCTTGTGGCACCAGCACCAACTATTTGATGAATTTCATCAAAAAATAAGATGATATTCCCAGCTTCTTTTACTTCTTGAATCAAGTTTTGAATGGTCTCTTCAAAGGAACCACGATACTGTGTACCAGCTTCAAGACTAGAAATATCAATTGATACGATTTCCTTGTTTTTAATAGCAGCTGGGACATCTCCATTAACAATGGCTTGAGCTAAACCTTCAATGACTGCAGTTTTACCGACACCAGCATCTCCGACAAGGACAGGATTATTTTTAGTTCGTCGTGCCAAGATTTCAGCGGTATCTTGAATTTCTTTGTTACGACCGATGACGGGATCAAGATGCCCTTGACGAGCTTCTTGTGTTAAGTTAGTTCCGAGTTGAGTCAATACACTATCAGCTTTAGGTGTTAACATTTGAGAATTTGTTGCTTTGGTTGTCGCTACAGGGAGTTGTCCTGTTTGACGATAGTGTTGGAATTCTTCGGGAGTTATTTCGCGACCGTTAACGAGATAGCGGGGATTTTCGCTACGATAACCACCCATGTTTGCCATTAATTGGTTGAAAATATCATCCATATTTACAAAAGGATCTTTACCAGAAAAATGTGTCATATCAGTTACCTCGCAATAAAAAATAGACTATAAGATGTTTGTAAGCAGTCGCAGAATCGTTGTTAGGATTTCACATGATAGGAAACCCTTTGCTAATAAAATGATTCAGAC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72 | Streptococcus_pyogenes_phage(52.63%) | integrase,protease,capsid,tail,tRNA,holin | attL 846917:846962|attR 867205:867250 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1205034 : 1275430
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP031770|1205034:1275430|DBSCAN-SWA 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>CP031770|1205034:1275430|1221938_1222544_-|AYJ02693.1|DBSCAN-SWA MAIILPELPYAYDALEPQFDAETMTLHHDKHHATYVANTNAALEKHPEIGENLEELLADVTKIPEDIRQALINNGGGHLNHALFWELLSPEKQDVTPDVAQAIDDAFGSFDAFKEQFTAAATGRFGSGWAWLVVNKEGQLEITSTANQDTPISEGKKPILALDVWEHAYYLNYRNVRPNYIKAFFEIINWKKVSELYQAAK >CP031770|1205034:1275430|1250233_1250461_-|AYJ02716.1|holin|DBSCAN-SWA MINLKLRLQNKVTLMAILGAIFLLAQQLGIKLPSNIADIANTAVTLLVLLGVVTDPTTKGLSDSEQALTYHEPKQ |
73 | Streptococcus_phage(58.54%) | terminase,protease,capsid,tail,tRNA,holin,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1826074 : 1846240
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP031770|1826074:1846240|DBSCAN-SWA 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>CP031770|1826074:1846240|1832948_1833149_+|AYJ03231.1|DBSCAN-SWA MTVGDKIKTIRLNLGETMEEFGKRFGTSKGTVNNWEKGRNLPNRNSLLRIAQLANQTVSDFLAITD >CP031770|1826074:1846240|1836557_1836887_+|AYJ03238.1|DBSCAN-SWA MTLPENYRRVLNLIKVGADNPITGAEISLILKLEERSVQSIISSLITRYNVPIIGIRHGFNRGYFIPANKEELLDGAKAFYNQVQKEQERLSVLLNADLTSYKELLKGG >CP031770|1826074:1846240|1839979_1840153_+|AYJ03243.1|DBSCAN-SWA MKIKLFYQKHNESLDDFEHRVNLFTLSVSVIDIKFQEATYGNYEDMDSRTGLLVLYR |
26 | Streptococcus_phage(56.25%) | holin,integrase | attL 1829273:1829293|attR 1843541:1843561 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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