Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP032756 | Lactobacillus plantarum subsp. argentoratensis strain DSM 16365 plasmid unnamed5, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
| CP032755 | Lactobacillus plantarum subsp. argentoratensis strain DSM 16365 plasmid unnamed4, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
| CP032752 | Lactobacillus plantarum subsp. argentoratensis strain DSM 16365 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| CP032754 | Lactobacillus plantarum subsp. argentoratensis strain DSM 16365 plasmid unnamed3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
| CP032751 | Lactobacillus plantarum subsp. argentoratensis strain DSM 16365 chromosome, complete genome | 4 crisprs | csa3,DinG,cas3,DEDDh,cas1,cas8e,cse2gr11,cas7,cas5,cas6e | 0 | 10 | 12 | 0 |
| CP032753 | Lactobacillus plantarum subsp. argentoratensis strain DSM 16365 plasmid unnamed2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
1. CP032754
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
328 : 10009
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP032754|328:10009|DBSCAN-SWA AATGATAATTAGTTGCGCCAATGAAAAGGGTGGTACTGGTAAAACATCTACTACAGCCTTAATCAGTTGGGAATTATCAAATATGGGATATAAAGTGCTTATGGTAGATTGTGACCCTCAAGCAAACCTAACTGATTTAATGATAAAAACAAAAAGTCACGAAAATTCCAGCATCACAATTGACCCATCTCTTTTCGCATTACTAATTAACGGAAAAGACTTAAATGACGGCATCATTAACATTAAGAACGATCTTGACTTAATACCAGCTGCTGCTGATATGAACTTATTCAGTCGGTGGGTTGATAAACAAGACATTGATGAAAAAGCTAAAGTCAGCTATCTTAAAAACTCTTTGTCAAATATATCTAGCAAATTCGACTTCGTGTTTCTTGATGTAAGCCCTACAATGAGTTTAACAAACGATAACGTTTTTATGTGCTGCGATTGGATCATTGTTATGCTACAAACTCAGCAAAGAGCATTGCTGGGAGCAAAAAGTTTCTTAAGCTATTTACAAACGAATTTAATTGACGAATTTGGAGCAAAAGTAGATGTAGCGGGTATTCTTCCAGTTCTTACAAAAGGGCAATCAATTATTGACAATGCCGTTCTTAAACAGGCCGTAGAAGAATTTGGGGAAGACAACATATTTGAAAATGTCATTACTGCTATGGAAAGAGTAAAGAGATACGACCTTACTGGAATCACTGAAAGCAGTCGTTCTGTTTGGGATAAAGCTACTCACAGCGCATATACGGCTGTTGCTACTGAATTAATATCTAGATTGGAGGCAGAATAATATGGGAGGACTTTTGAAACACGATAATGATAATCAGGTAAAAAGTCCTGATAAGAAGGTAAACGTAAATGTATCATCAATTTCTAGAAAGCAAGCAGGTTTTGGCGAAGATAGTGCGGAAAAAATTCCTACCTTCGATGTAAACATGCGAGTTGATAATCATACCAGAAACGCCGTTTTGGCTTTGTCTAAAGCAACAGCTGATAAGCGTTCAGCTAGTGAAATGGTTTCTTTGATGATTGAAAGTTATCTTGAATCACTAACTCCCCAAACACGTGATATTTACGATGAATTGGTATCGATGATGGAAACAAAGGATAAGCTTGACTATAAACTAAAAAGTAAATAATCACGCGCCCTCAGACAACACGTTCAGCTTTTAGACGTATACTTGTCCGTTTAAATGAAGCAGAATGCACGACGAATTGTCAAATCAAGCGCAACTTTGTCCCGAAGAAAACCTCAAATGGACTCTTCCAGCCTAAGACCTTACGTGGTCGGTGATTTAAATCTCTGACAAACTTGTCGATATCTTGATCAGTCAGTTGGTCTAGGTCGGTTCCTTTGGGGAAATACTCACGGATAAGTCCGTTGGTATTCTCATTGGTTCCCCGTTGCTGAGGCGCATGAGGATCTGGGAAATAGACTGGGATACTTAGCTCTTGACTAACTTCGCGGTATCCTGCGAATTCAGTTCCACGATCCGGCGTAAGCGTCCGAACGCGTTTGGGCGTCACGGTATGCAAGAGGTCAATCATCGCTTGTGTGACGTTCTTGGCGTTTACTTTGGGAACCCGCTGAGATAATAAATACCGAGATTTGCGGTCCACCAAGGTTACCAGGGCCGAACGCCCGGTTTTACCGCGAACGGTATCACCTTCCCAATGGCCAAACCAGCTTCGATTCTCACATGAAACAGGTCGTTCATGAACGGAAGGGACGTCGTTAAATCGTCCTCGACGTTCCTTAATGGTTCCCTTGACCTTTCGGGTTTTACCACGGTGACGAAGCTTACGGGCAAAGCCACGAGCCCCGTGATTCTTACGTTTGATGCCTAAATTATCGCGTTCAATCCCACGATAAATGGTGTTATAACTGATATGCCATTCACTGTTTTCGTGGACTAAACGACCGGAAATTTGTTCCGGGGACCACTGACGTTGAACAATGCAGTGAAGGACAAAATCCCGTAACTTCAAATCAGTTAGAAGCCTAGGACGTCGGCTTTTTAGCCGCCGTCCCTGATAGTTCTCTTGGGCTTTGACGGCCGAGTATGCCTTACGACCACCATTGCGCTTGATTTCGCGCGATACGGTGGCTTTAGAACACCCAATTTTCTCCGCAATAACTTGATAGGTATCGTTTAAAGTGACGCCCAACAGTATGCATTCTCGGTCTTTTAAGGTAAGATGGTTGTACGGACTCATAGCCTAGGATCTCCTTTAGATGATTGTTGTGGTGACTTCATTTTACAGGACTCAGGCTATGAGTTCTTTTTTATTTTCTTCTTACTTGTTGCACTTCAATTGTAAATTCGTCACACAAAAAAGTCCTCTATTATGCGGAATAGAGGGCTTTTTTGAAATCAGTACATACAGGCTTTGCTTAGTAGCGTTGCTTGTGTCCATTTAGGACATACACAATCATATAACAATCAATCAATGCTGTCACTTAACTTACTCAAAAAATATTCACAACCTATCTGAGCAACCGTTTCCAAAAGTTCTCTCTCGTCTCATGGAATACTGATAATACTGAGCATAGTATTTCCGATAGACTAAATATTTCGTTTCATAATTTTCCCCGCATTATTTCAAAAAATAGTTACTTGATACTTGTCAAAACTTAAGGCTTGTAAAAAATACACCTATTGGTTTCAAGTCTGTCTCAATAGTAAAACTATAAAATTTGAATCCTGGCCGTTTTCACATATATTATTGTTCAATACCCAACTGCTCTACGTGATCAAAGCAACAATTTTCTAATCAGTGACTAGTAGATTATAGCCGTTTTTTCATATTAAAACGTCTATTAATTTTTATTCTTTACTGTGCTGCCAATTAACATGGTATCTTTTGCGTTGATAACTAAAGCCCTCTCCAATCACTTCATGGGCATCCAGTACCGTCACAAATGCCCGTTCATCAATCGCTTTAATTAATTGCTTCAATTGTGGAATTTCCCGCGGTTGAACCACCAAATAAATCACTTGCTTTTGATCATGCTGATAACCACCTTCAGCTTGCAAATATGTCAATCCTCTATTTAAAGAAACATCAATTAATTGGGAAATTTTTTGGCTTTTATCTGACACAATGAATAATACCTTAGCACGATTGGGCCCTTCTTGGACCATATCAATTACTTTAGATAATACGAAACTAACAATTAGCGAGTACGCGATGTGATACAGATCTAAGTATGATAGTGATAGCCCTAATACTACGTAGTCAGTAATCAAAATTCCTTTTCCCGAAGAAAATCCAAAACTTCTCTGGCCAACCCGAGCAATAATATCACTACCACCAGTAGTTCCGTTATAACGAAAAACCAGACCAATTCCCAACCCTGATAATACCCCTGCAACCAGTGATGACAATAATAAATCATTTCTCAATGGTAGTGGTTGAATCAGAGCCTGCTGTGACCATATTATTAGAAATAGTGATAAACAAATGGTGCCATAAATAGTGTAAGCCATCATGCGCTTGCCTAAGTAGCGCAAACCAATTAGTATCAATGGAATATTCAGAAATAAAGTACTAATTCCCAAGTTAATATGAAAGAAATGACGAATAATCAGAGTTATTCCGCTCAGACCGCCGTCTGCCAAGCCGCTTGGAATAGAGACTAAATCTAGACTGAACGCATAAATGCTACATCCCAACGTAATCATAACTAATTCGAAACTATTGTATTTTGTCCAATCTTTAAAAAACATAGTTCATCTCCAAAATGTTTTATCAATGTAAGTGCTTTATTATTTGACCGATGGTCCCTAAAAAACACTAACTTGTCCTGTAGGCCCTAACTATTCACTTCCCTTTTGGGAGTGCCTAAGTCTCCAACTTTTAAAGCATATTCTTTAATACGATAAATTTGTCGTCGTTGTACGCCAGTACTCCTTGCAATTTGTGCAATATTCGTTCCATCCCTGAGCATTTGAACTACCCTTTTATATAGGTAGCGTTTTGATCCATGTGGACTATATTGCCGCCTTCTTCCTTTATACTCCCCGCGCTCCTTAGCTAATTGGATTCCCTGATTCTGCCTAGCATGAATTTTGTTGCGCTCTTCTTCAGCTGTATATTTGTATATTTCAAAAACCAAATTGGTTAATAAACCACGTAAGTTAACATCTTGTATATCAGTGAAACTCGATAAACTTAAAACATCTAGTGTGGCTTCCTTTTGTTGAATCAAGTTAATGGTGTCAGTAATGTCCTGAGCATTTCTACCAAGTCGATCTAAATCCAAAACAGTGACAATATCTTTTTCACGAATGAACTCTAACATTTTTTGCAATTCAGGGCGATTTTGAACTGATTTTCCGGAAACTTTTTCCTGAAATATTTTCTCTACACCAGACTTTTTTAGAGCTTCAATCTGCCGAGTTAAATTCTGATTTTCAGACGACACCCTAGCATAACCAATTTTCATATATTTGCCTTCTTATCATATTAATTCTGACGTCAGTTTCTGGGCAACTACTCAACTAGTTGATCTGATTAAGATTTAAAAGTTACTGTGTCACACTCTAATGTCTCACGCGTTTGATCTATTATACCACAGCTCAGGAAGGAGACATTAGGGTACATCGTAACGTAACGGATTGGGGGATTCGAGATAACTTCTTAACTGGACGGGTTCAATATTGGTATAACCAGCATCATCAAAGTATTGGTAGTACCAAAATATTATCTAATCTCAGAAAAGACCCGGCCGTCACCGAATAGGTGACGTTAAAGCAAGTTAAGCGGATTATGAGCAAGCTAGGCATTCGTTGCCAGGTTCATCAGAAAAAGCATTCACGAATCAAACAACAGGAGCAATACTTACAAGATAATGTTTTAAATCAGCGTTTTGGCGTTAACCAACCAAACCAGGTTTGGTTAGCTGATTCAACGGAATTGACCTATGGTGTTAACGGTCAGTATAAAGTGCGTTTGAGTGGCGCGCTGGATCTTTACGGTCGCCATCTAATTGCCCATAAATTAAGTGAAACTGAAACTTCGAAGGCAAAAGTTCAGGTTTTTCAACGGGCCTTTAATTTTGCGGGTGACGTCCACCCTGTAGTGCATACTGACCCAGGTTCGGCATGTACATCAGGAACATTCAATAACTTTTTGGCGCAACATGAAGTCACCCGTAGTATGTCACGACCAGGGACACCGTATGATAACGCACCAATGGAACGTTGGTGGAACGAGTTCAAATTGCGCTGGATTGATCGACACGCTAAACCAGTTACCTATAAAGAATTAGTGGCCTTGGTCGAAGAAGGCATCAACTATTTTAATCAACTAGATCGTTCACCAGCAAGAAACGACCTCACCCCAGCGGAATACTGGAATGAGGCCGTTTAAGCAAAGCAAAACTTATATTATTTCAAATGACAACTTGACAGGGACTAGTACAACTCAGGGGGCTTTACTTTAATATTTCCTGTAGATATTAGCCTTTTTTTAATTTTAATTATGCCTAGAAGCCTATGTTAGAAGTCATAGTCGCCGCTACTCATAGCTTCAGCATTACCCATTAGATAGCCAGCACCAACTTGTGAGAAGAAATCATGATTGGCCGTTTCGGTTGAAATTCCGTTCATTACGATTGGGTTGATATCTTTAATCTCAGCATTGGGGAAGCGGGATTCAAAGCCCATATTTTGGAGCGCCTTGTTGGCGTTGTAGTGAACGAATTGTTTAACGTCTTCCGCTAACCCAATCGGCGCGTAAACTTCTTCGGTGAACGCAAACTCGTTCTCAAGGAGATCGTCGAGCAACTCATCCATCCACTTTTTGAATGTTTTTTGTTCAGTCGCCGATAGCTCGTTATATCCCAATTGAAATTTGTAGCCGAGGTAGGTACCATGAACAGATTCATCGCGGATCACCAGTTTGATGACTTCAGAAAGATTTGCCAGCTTATTGTTACCACGGTACCAAAGTGGGGTAAAAAAGTTGGTGTAGTACAAAATTCCTTCAAGAAAGACGCTTGCAACTTTCTTTTCAAGGTTGTTTCCCGTTTGATAAATATCATTGATCCGTTTGGCTTTGTATTGCATTCGGGGATTATTGTTCATCCACTTAAACACTTCGTCAACAGTGGCTTGATCGTTCAAAGATGTCAAAATAGTGCCGTAACTTTTGGCATGAATTGACTCCATCATCAAAAAGTCATTGAGGACTGCTGCTTCTTTTCGTGTCCGAACGTCGGGCCGCATCACGTCGACTCCTTCTTCAGATTGGAGTGTGTCCAGCAAGGCTAATCCACCCACAACCCGATTGATAACCGATTTTTCGGTGCCAGAGAGTGTCCGCCAGTCCCGTAAATCATTAGAAACAGGTACTCGCGTATCCAGCCAGTATTGTGCCGTTGCTTTATCCCATACATATTCGTCAAGTTCGTCTTCGATGATGTTCCAATTAATTGTTTTATAGCTCATTAGTTGAATACTCCTTAAAAGTCATAGTCGTCATCGGTCATTTTTTCAGTGTCCGATTCATTGTTTGCAGCCGTTACCTGTTGCAAAAATTGATTTTGGTCAATCATCAGTTCTTTGAGTTGCGCCACTAGTGAAGACGGTTGAACTTCGTAGACAGCGTTAAAGCCAAGTGACATTAATGCATGATTGGCACCATAGGAGGCCAGATTGATGGCTTCGGTGGCATCGTCAAGGTTAGCTTCTAAGAAATCTTTTTCGGTTTGCATGAGTTGATCAAACTGGGTGTTAATCCAATGCTGCAGTTCGGCTTGGTCACTTGACGCGAGGTCTTCAAACCCAAGGTGAAATTTGTAGCCGACATAGGCACTAAAGATGGCACTTCCACGAAGAATATTGGCCAACATTTGGTAGGTATTGACGAGAGAATGGGTTTGAAGGGTTGTCCAATATTTACCAAATGAAAGGCCAGTTTCGGTCAAAATAAAAAGGGCTTTTTTTTGTAAAGCCGTGCCATTGGTGCTCGTTTGAGCGAGTTGGTCGATTTCAGCTTGCAGATTGGCATTATCATCTGCCCAAGTAAAACTTTCACCGCCGTTACCCGGAATCAGAGCCCGGAAAATGGTCGTACAGCTTTTGGCATGGACTGATTTCATGAAGGTAATGGTATTTAATACGGATTCTTCTTGTTGGGTTCGCCGATCATGGCGAATGGCAGGAGTGCCGACCTCTGATTGGTAGACGGCTAACATCGATGCACCTGCCAACATGCGGGTAATGGCCTGTTGTTGAGTGTCTGCTAGCTGTTGCCAAGCTGGTTGATCATTCGTGACGGGAATCCGAATGTCCAACCAAAAGTTAGTGGTGAGTTGTTCCCACGTGTATTTATCGAAATTATCTTTAATGTCATCCCAGTTAATTGCTTTGTAGTATAAATAGTCCATCGTTATTTGTTCGTCTCCCTAGTTAGGATTCACAGGTGTACGGGCACCGTGATCCAATAACGTGTTGTCGGTGGGTTAAACGGGCGCTAACCCTGAATACATCCCCTAGATCATGCATGACTCGCATTCATTTGCGGTTTTGATTTCGTCGTCTTCTGTGAATGTTCGAATGTAGTAAAGTGACTTGATGCCCTTGGTCCAGGCGTAATTCCGTAACCGGTTAAGGTCTCGGGTTGTCATCTTTAAATTGTTATTGTCCTTCCACTCGTAAAGGTCAGGTTTCAAAACTGAACGCATAAATAGTGTCAGACTCATGCCTTGATCAATGTGCTTTTGAGCTACGGCATAGGTGTCAATAATTTTTCGTTGATCAATATCATATGCGGGTGTGTAGTAAGGCAAAGTTTCGTTAGACAGGTAAGGTGCTGGATAGAAGATTGAGCCTACCTTATTTTCCTGACGTTGTTCTACTAATTGTGTGATTGGATGAAGTGATGCACTTGTTTCATTGACGTACGAAATTGACCCGTTCGGTGCCACAGCGAGTCTATTACGATGATAAAGGCCGCCAGTAATCACAGCTTGCTTGAGTGCCTTCCAATCTGTAACAGATGGTAATTTAATATTTTTGAAGATTTTTGCAACTTTGGTACTCTTAAATTTAAAGTCTGCGTTCAAGTATTGATCGAAGTAACTGCCATCAGCGTACTTTGATTGGTCAAATTTAGAGAAGGTTTCGTGGCGTTCACGGGCAATTCGATTGCTCGTAACGAGTGAATAGTAGTTTAAAGCTAGGAAGTAGGCATCAGTAAATTCAAGGGCCTCTGGTGAGCCATACTCAATTTGGTGGCGTGCAAGGGCAGTATGCAGACCCATAGCCCCTAATCCAATCGTGTGGTAAAGTTCGTTACCATGTTTAACAGTCGGTACTTCCTTAACGTCGGTTGTGTCAGTTACGAGGGTGAGCGCACGAACAGCAACCTCAACTGAGTGACCGAAGTCCGGCGAGTCAATCATATTCATGATATTGGTTGATCCGAGATTACATGAAATATCGGTGCCAGTTGTCTTGTACGATAGGTCATCATCAAGTTTTGACGGTTCTTGAGGCTGTAAGATCTCACTACAAAGGTTACTCATAATAATTTTGCCATCGACAGGGTTAGTTTGGTTGGCCGTATCAATGTTCAAGATGTAAGGATAACCAGATTCTTGTTGGAGTTGAGAAATCTTTTGTTCTAGTTTCCGCGCGTTAAAAACTGACTTCTTAATATTGGGGTTAGCGACCATGTTGTTATATTCTTTGGTGATATCGATGTAAGCAAATGGCGTACGATATTCACGTTCGACATCATAGGGGCTAAAAAGATACATTGGTTCGTTAGTCTTGAGTAATTCATAATATTTATCAGGAACAATCAAACCGAGGGACAAGGTCTTCACCCGAATTTTTTCGTCCGCATTTTCCTTTTTGGTATCCAGAAAATGTAAGATGTCAGGATGGAAGACGTTGAGATAAACCACTCCGGCGCCGTTCCGTTGCCCAAGTTGGTTACTGTAGCTAAATGAGTCTTCAAGTAACTTCATCACTGGTACAACGCCAGACGAGGCGTTGGAAATCTGCTTAATAGGATCACCTGAGGCGCGCAAGTTTGACAGGTTAACGCCGACGCCCCCACCGATTCGAGATAGTTGAAGGGCAGAATTAACGCCACGTCCAATTGAGAGCATGGAATCGGCCATATCAATTAGGAAACACGACACCATTTCTCCGCGGCGCTTTTTCCCCGCGTTGAGGAAAGTGGGAGTGGCAGGCTGATAACGTTGTGAAATCAATTCATCGGCAACGTCATTGGCAAGTTGTTCATCACCATTAGCGAGATAGAGGGCATTGAAGACGACGCGATCGACAAAGTCTTCCAAAAATTGCTGGCCATCATTAGTTTTCATGGCATATTGTGTGTAGAACTTGTAGGCACCGAGAAAGCTGCGAAAACGAAAGTGATGGTCTCTCATTTGGTCGAACAAGGACTGCACAAACTTGTGAGAGTATTGTTCCAGGATACTTGGATCGATATAATCTTCGTCAACCAAGTAATTTAACTTGGCATTTAACGAATCAAATTGCTTGGTCTTCGGTTTAACTGTCTCTTCGAAATAAGCCTTTAGAGCTTCTTGATCATAATGTAGCGGAATTTCTCCGTTGCTTGGGATATTTACGAGGTTATTTAAGTAAAAATAGGTATTTTCCATTTCTGGGGTGCTAGTTACCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP032754|328:10009|3167_4070_-|AYJ37213.1|DBSCAN-SWA MFFKDWTKYNSFELVMITLGCSIYAFSLDLVSIPSGLADGGLSGITLIIRHFFHINLGISTLFLNIPLILIGLRYLGKRMMAYTIYGTICLSLFLIIWSQQALIQPLPLRNDLLLSSLVAGVLSGLGIGLVFRYNGTTGGSDIIARVGQRSFGFSSGKGILITDYVVLGLSLSYLDLYHIAYSLIVSFVLSKVIDMVQEGPNRAKVLFIVSDKSQKISQLIDVSLNRGLTYLQAEGGYQHDQKQVIYLVVQPREIPQLKQLIKAIDERAFVTVLDAHEVIGEGFSYQRKRYHVNWQHSKE >CP032754|328:10009|1557_2556_-|AYJ37212.1|transposase|DBSCAN-SWA MSPYNHLTLKDRECILLGVTLNDTYQVIAEKIGCSKATVSREIKRNGGRKAYSAVKAQENYQGRRLKSRRPRLLTDLKLRDFVLHCIVQRQWSPEQISGRLVHENSEWHISYNTIYRGIERDNLGIKRKNHGARGFARKLRHRGKTRKVKGTIKERRGRFNDVPSVHERPVSCENRSWFGHWEGDTVRGKTGRSALVTLVDRKSRYLLSQRVPKVNAKNVTQAMIDLLHTVTPKRVRTLTPDRGTEFAGYREVSQELSIPVYFPDPHAPQQRGTNENTNGLIREYFPKGTDLDQLTDQDIDKFVRDLNHRPRKVLGWKSPFEVFFGTKLRLI >CP032754|328:10009|4156_4789_-|AYJ37214.1|DBSCAN-SWA MKIGYARVSSENQNLTRQIEALKKSGVEKIFQEKVSGKSVQNRPELQKMLEFIREKDIVTVLDLDRLGRNAQDITDTINLIQQKEATLDVLSLSSFTDIQDVNLRGLLTNLVFEIYKYTAEEERNKIHARQNQGIQLAKERGEYKGRRRQYSPHGSKRYLYKRVVQMLRDGTNIAQIARSTGVQRRQIYRIKEYALKVGDLGTPKREVNS >CP032754|328:10009|5843_6794_-|AYJ37216.1|DBSCAN-SWA MSYKTINWNIIEDELDEYVWDKATAQYWLDTRVPVSNDLRDWRTLSGTEKSVINRVVGGLALLDTLQSEEGVDVMRPDVRTRKEAAVLNDFLMMESIHAKSYGTILTSLNDQATVDEVFKWMNNNPRMQYKAKRINDIYQTGNNLEKKVASVFLEGILYYTNFFTPLWYRGNNKLANLSEVIKLVIRDESVHGTYLGYKFQLGYNELSATEQKTFKKWMDELLDDLLENEFAFTEEVYAPIGLAEDVKQFVHYNANKALQNMGFESRFPNAEIKDINPIVMNGISTETANHDFFSQVGAGYLMGNAEAMSSGDYDF >CP032754|328:10009|7840_10009_-|AYJ37218.1|DBSCAN-SWA MVTSTPEMENTYFYLNNLVNIPSNGEIPLHYDQEALKAYFEETVKPKTKQFDSLNAKLNYLVDEDYIDPSILEQYSHKFVQSLFDQMRDHHFRFRSFLGAYKFYTQYAMKTNDGQQFLEDFVDRVVFNALYLANGDEQLANDVADELISQRYQPATPTFLNAGKKRRGEMVSCFLIDMADSMLSIGRGVNSALQLSRIGGGVGVNLSNLRASGDPIKQISNASSGVVPVMKLLEDSFSYSNQLGQRNGAGVVYLNVFHPDILHFLDTKKENADEKIRVKTLSLGLIVPDKYYELLKTNEPMYLFSPYDVEREYRTPFAYIDITKEYNNMVANPNIKKSVFNARKLEQKISQLQQESGYPYILNIDTANQTNPVDGKIIMSNLCSEILQPQEPSKLDDDLSYKTTGTDISCNLGSTNIMNMIDSPDFGHSVEVAVRALTLVTDTTDVKEVPTVKHGNELYHTIGLGAMGLHTALARHQIEYGSPEALEFTDAYFLALNYYSLVTSNRIARERHETFSKFDQSKYADGSYFDQYLNADFKFKSTKVAKIFKNIKLPSVTDWKALKQAVITGGLYHRNRLAVAPNGSISYVNETSASLHPITQLVEQRQENKVGSIFYPAPYLSNETLPYYTPAYDIDQRKIIDTYAVAQKHIDQGMSLTLFMRSVLKPDLYEWKDNNNLKMTTRDLNRLRNYAWTKGIKSLYYIRTFTEDDEIKTANECESCMI >CP032754|328:10009|5112_5715_+|AYJ37215.1|transposase|DBSCAN-SWA MSKLGIRCQVHQKKHSRIKQQEQYLQDNVLNQRFGVNQPNQVWLADSTELTYGVNGQYKVRLSGALDLYGRHLIAHKLSETETSKAKVQVFQRAFNFAGDVHPVVHTDPGSACTSGTFNNFLAQHEVTRSMSRPGTPYDNAPMERWWNEFKLRWIDRHAKPVTYKELVALVEEGINYFNQLDRSPARNDLTPAEYWNEAV >CP032754|328:10009|6808_7735_-|AYJ37217.1|DBSCAN-SWA MDYLYYKAINWDDIKDNFDKYTWEQLTTNFWLDIRIPVTNDQPAWQQLADTQQQAITRMLAGASMLAVYQSEVGTPAIRHDRRTQQEESVLNTITFMKSVHAKSCTTIFRALIPGNGGESFTWADDNANLQAEIDQLAQTSTNGTALQKKALFILTETGLSFGKYWTTLQTHSLVNTYQMLANILRGSAIFSAYVGYKFHLGFEDLASSDQAELQHWINTQFDQLMQTEKDFLEANLDDATEAINLASYGANHALMSLGFNAVYEVQPSSLVAQLKELMIDQNQFLQQVTAANNESDTEKMTDDDYDF >CP032754|328:10009|1130_1478_+|AYJ37211.1|DBSCAN-SWA MGGLLKHDNDNQVKSPDKKVNVNVSSISRKQAGFGEDSAEKIPTFDVNMRVDNHTRNAVLALSKATADKRSASEMVSLMIESYLESLTPQTRDIYDELVSMMETKDKLDYKLKSK >CP032754|328:10009|328_1129_+|AYJ37210.1|DBSCAN-SWA MIISCANEKGGTGKTSTTALISWELSNMGYKVLMVDCDPQANLTDLMIKTKSHENSSITIDPSLFALLINGKDLNDGIINIKNDLDLIPAAADMNLFSRWVDKQDIDEKAKVSYLKNSLSNISSKFDFVFLDVSPTMSLTNDNVFMCCDWIIVMLQTQQRALLGAKSFLSYLQTNLIDEFGAKVDVAGILPVLTKGQSIIDNAVLKQAVEEFGEDNIFENVITAMERVKRYDLTGITESSRSVWDKATHSAYTAVATELISRLEAE |
9 | Enterococcus_phage(37.5%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
|---|
2. CP032751
Click the left colored region to show detailed information
0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP032751_1 | 1268117-1268449 | TypeI-E |
NA
Consensus repeat of CP032751_1
|
5 spacers
spacers of CP032751_1
>1.1|1268145|33|CP032751|CRISPRCasFinder CAAGACGAGTTACCATGTGATCGAAATTAAGAA >1.2|1268206|33|CP032751|CRISPRCasFinder GTCAACTTCTTAGTAATATCAGGACGGCCGTAG >1.3|1268267|33|CP032751|CRISPRCasFinder TACTCTCAATAATCGTGACCTTTTCCCCGATTG >1.4|1268328|33|CP032751|CRISPRCasFinder CGTTGAAACTACCGATGAAAGTTTTGCCGCATA >1.5|1268389|33|CP032751|CRISPRCasFinder AGGGTGCCGGAATGTACGGTTACATGGAGGTTG >1.6|1268268|31|CP032751|PILER-CR TACTCTCAATAATCGTGACCTTTTCCCCGAT >1.7|1268329|31|CP032751|PILER-CR CGTTGAAACTACCGATGAAAGTTTTGCCGCA >1.8|1268390|31|CP032751|PILER-CR AGGGTGCCGGAATGTACGGTTACATGGAGGT |
cas1,DEDDh,cas3,cas8e,cse2gr11,cas7,cas5,cas6e |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP032751_1
The CRISPR arrays of CP032751_1 >merge|CP032751|1|1268117-1268449|CRISPRCasFinder,PILER-CR AGATTACCCCCGTATACACGGGGAACAGCAAGACGAGTTACCATGTGATCGAAATTAAGAAGGATCACCCCCGTATACACAGAGAACAGGTCAACTTCTTAGTAATATCAGGACGGCCGTAGGGATCACCCCCGTATACACGGGGAACAGTACTCTCAATAATCGTGACCTTTTCCCCGATTGGGATCACCCCCGCATACACGGGGAACAGCGTTGAAACTACCGATGAAAGTTTTGCCGCATAGGATCACCCCCGCATACACGGGGAACAGAGGGTGCCGGAATGTACGGTTACATGGAGGTTGGGATCACCCCCGTATACACGGGGAACAG >CP032751|1|1|1268117-1268449|CRISPRCasFinder AGATTACCCCCGTATACACGGGGAACAG CAAGACGAGTTACCATGTGATCGAAATTAAGAA GGATCACCCCCGTATACACAGAGAACAG GTCAACTTCTTAGTAATATCAGGACGGCCGTAG GGATCACCCCCGTATACACGGGGAACAG TACTCTCAATAATCGTGACCTTTTCCCCGATTG GGATCACCCCCGCATACACGGGGAACAG CGTTGAAACTACCGATGAAAGTTTTGCCGCATA GGATCACCCCCGCATACACGGGGAACAG AGGGTGCCGGAATGTACGGTTACATGGAGGTTG GGATCACCCCCGTATACACGGGGAACAG >CP032751|1|1|1268238-1268449|PILER-CR GGGATCACCCCCGTATACACGGGGAACAGT ACTCTCAATAATCGTGACCTTTTCCCCGATT GGGATCACCCCCGCATACACGGGGAACAGC GTTGAAACTACCGATGAAAGTTTTGCCGCAT AGGATCACCCCCGCATACACGGGGAACAGA GGGTGCCGGAATGTACGGTTACATGGAGGTT GGGATCACCCCCGTATACACGGGGAACAG
>CP032751.1|AYJ35336.1|1266679_1267942_-|replication-associated-recombination-protein-A MAFKTPLADQMRPQSLEQMVGQQDLLKAGQPLRQIIDQHVNIPLILWGPPGTGKTSLAQIIASQDDYPFVAFNASTENKAQLTKAIAQYPEQSFVLLIDEIHRMTKTLQDFLLPYLENGHVMLIGSTTENPIMSIVPAIRSRCQIFEFQPLSDTDIEIALRRAVTDIYNLTDDQVDAKALNLIAISAEGDLRIALNILETLHAIDQKQITVAAVQHFAQQQHFIYDRKATKHYDYLSAYSDSMAGSDTDAALYYLTILLKNDDLPSVVRRLREIPYTYIGLANPEQVTQIVVAANQAEKIGMPKAKYPLMFATMLMCISPKSGSFDQSWEKLDQDTQNPSQHPMPRGLRDMHYKHSEEITGGGLIDNPFQMPHQIAQQNYMPKGLAGRRYYYPKDNENERKLGAQYLKLHRFIYNEDYHE >CP032751.1|AYJ35335.1|1266200_1266512_+|hypothetical-protein MATVLPKAVKVWMGANILQIEFDNGEFRYMRTHFIDDYVSAWSPKKGKGKRRNLWLMPSWEWLGANARIEPDGTVVLFEKDIYTAQELWHNSVTRIDLVSGVH >CP032751.1|AYJ35334.1|1265600_1265957_+|50S-ribosomal-protein-L20 MARVKGGTVTRKRRKRILKLAKGYRGAKHIQFKVAKDQVMKSYLYAFRDRRRRKSDFRRLWIARINAAARINDISYSQLMHGLKLANVDVNRKMLADLAVNDADAFKALVDTAKKALA >CP032751.1|AYJ35333.1|1265369_1265564_+|50S-ribosomal-protein-L35 MPKQKTNRAAAKRFKVTAKGKIKSANAFTSHRFHGKTKKQRRQLRGTAIIEKPMVKTYHKLLQK >CP032751.1|AYJ35332.1|1264826_1265348_+|translation-initiation-factor-IF-3 MTIAKDSMVNDGIRAREVRLIASDGEQLGVKSRQEAMQIAEDASLDLVLVAPKAKPPVARIMDYGKYRFEQQKKDREARKKQKVVSIKEVRLSPAIDTNDFNTKLKHAEKFLSKGDKVRVSIRFKGRAITHKDIGRQVLNRMIEATKEFSTVEAYPKMDGRSMFLVLAPKTDK >CP032751.1|AYJ35331.1|1262640_1264605_+|threonine--tRNA-ligase MASINVKFPDGAEKQFDAGVTTEEIAKSISPSLAKRSVAGKFNDQIVDYRQPLTTDGSIEIIAADSEDGLNVLRQTAAQVLANAVKQLFPNIHFGSGEGNANGFFFDTDNPDEDGKQVSEDDLEAISDKMAAIIKQDLPIEREVLSKADALALVGDNPYQQDLVNERAAANNDQVVVYKQGDFVDLSDGAQLASTGKVKVFKLLSVAGAYWQGKSSNPMLQRIYGTAFLKQKDLDADLKRRQEARERDHRVIGNELDLFFVDPKVGNGLPYWMPNGATIRRQIERYIIDKEVANGYQHVYTPVLANLDVYKQSGHWDHYREDMFPPMDMGDGEQLELRPMNCPSHIQIYNHHIRSYRELPLRIAELGMMHRYEKSGALTGLSRVREMTLNDGHTFVALDQIEEEFKKILSLMVEVYEDFDISDYRFRLSYRDPENKEKYFDDDAMWERSQKMLKSAMDDMGLDYFEAEGEAAFYGPKLDVQTKTALGGEETLSTIQLDFLLPERFDLKYVGADGEEHRPVMIHRGLVSTMERFVAYLTEIYKGAFPTWLAPKQVTIIPVNNGAHGAYAETVRRRLAAEGVRVSIDDRNEKMGYKIRESQTKKVPYLLVVGDQEVANGSVSVRKYGEERTESEAVDMFIGAITQEIKHYSRGASK >CP032751.1|AYJ35330.1|1261372_1262308_+|primosomal-protein-DnaI MENISETLRTLMNRKNLNHRYEALMTAVYQDPDVRQFLAAHQNELSSDALERSAAKLYEFCEEKRKIARHEPTQAPGYQPTLVMSNHLIDIAYQPTPQMQEQQAAHALQQRVRSISMPKNIQTADLKTYDQDGDRATALMAALDFIDAYTQAPKRFHRGLYLYGSFGVGKTYLLGGMANALAANGFNTTLIHFPSFAVEMKRSISNNTSADKVDAIKRAPILMIDDIGADASSTWIRDDVLGVILEYRMQEELPTCFSSNFSMQELQDGYLTLSQKGDEEPVKAQRIMQRVRYLASEIEMVGRNRRLNPDA >CP032751.1|AYJ35329.1|1259965_1261369_+|helicase-DnaB MPNDEPLTPKTGLVVPQAPALSAAQQAVLAELYLPLMGPLAYSLYAALRSLQSSENELSNRRSHAELLGILNVDLPTVLAARRKLEATGLLRSYYQQDELGAMYIYQLQAPLLALQFFADDLLSVLLLDTVGELRYQQLAGDFAAQPIDLTAAKDVTANILDVFHVDSQKVTTPPLSVQKVRAQLAANEPAEDHSPVLSDDDFDWQLLGQILKQNYVDLKQVASSRQLIITESRVYGISEIEMAKLISEVASLTTGQFDENQLKLLIARRYERPAVSSQQVATEATVATTTTKDNKASAQLSTAEQQLVTYAKQTAPYDFLSALKQEKHGFVTSGENRLVHDLIGRGGLPNAVINMVIYYLLQNRELAALNRNLLETVANDWQQHGITTPEAALMYLKQRKQPKSTPTRRKNNRPTRKEIMPKWAQQQQQTESGKQPAQTGKQITAAQRKQLADRLAKLETNSEKED >CP032751.1|AYJ35328.1|1259428_1259944_+|transcriptional-regulator-NrdR MQCPHCHHNGSRVVDSRPTDDGRVIRRRRECENCGFRFTTFERVEATPLLVIKKNGAREEFNREKVLRGIIRSAEKRPVSMETMTGVVDDVENKVRSLGENEISSQVIGEYVMEQLADIDEISYIRFASVYRQFKDMHVFLNELQDMMERDKVKLAKPSAKTTHAPKRKKD >CP032751.1|AYJ35327.1|1258793_1259387_+|dephospho-CoA-kinase MTKLIGLTGGIATGKSTVSKLLATKLPIVDADKIAWQVEGPGQPTTQKIVAHFGQQAVLADGRLNRSWLGQLVFNDAQALQALTAITRLPIQYAMFEAIVAANQQQPDAIILDVPLLFESGWQHVCDQVLVVTAPPAVVLQRLMARNHLSQQAAQARIDSQMPLAQKVARADVVIDNGANIDKTKAAVLKWLKTITK >CP032751.1|AYJ35337.1|1269449_1270199_+|aspartate/glutamate-racemase-family-protein MENCFGIIGGMGTMATEDFVHTVNRLTVTHRDQDYLNYVVLNDAQIPDRTAYILDHNCTNPLPSLKADVQLLDRLGVKFIVMTCNTAHYFIPALTAITNVPILNMPALAVEAACQLQQPRPLRIGVLATTGTLKSQLYQQLILAKGHIPVVPTEQQQAQVMALIYEDIKQHDYVNRVKFHGLIDQLLNAANCDAVILGCTELSVAQDTAPYGSERIIDAQHELARATVQRAQAVKPTMILRQPHSTNSR >CP032751.1|AYJ35338.1|1271530_1272481_+|type-I-E-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKSGAKKPELSELSRIHDRLTFLYLEHAKLDRQDSAIRVSDARGVVFVPAAIISVLMLGPGVDVTHRAMELMGDAGMAVVWVGERGVRQYAHGRALNHSSRLLEAQARLFSNQRSRLAVARKMYQMRFPNDDVTTLSMQKLRGKEGARVRQVYRLESERTGVSWTRREYNPDNFEASSPINQALTAAHQALYGLSYSVIMAMGASAGLGFVHTGHDLSFVYDFADLYKAETSIPVAFDIVAASTADEDIARSTRLAMRDAFIDGKLLRRMVSDLKVILGVSETTTEVSNLSLWDDRLGLQEFGVQYHETEVGGIE >CP032751.1|AYJ35339.1|1272477_1273368_+|type-I-E-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MIVVTLTKVPNALRGDLTKWYQEIQTGVYVGNVNARVRDSLWLRIVENIGRGEATMVYNANNELGYQFKTTRHDHQVVDFDGIPLMMHLAASQTAEKHGYSNAAKFHKARMMTQKVQRQQSRHSDESVVAVDIETTGLDPSKDAIISIAAVKSIPDGQTSEFNRLIKIDRPLSQKIVALTGITRDMLNEQGVSIAMALSEMKVFIGNSVIVGYNFHFDEMFLKQAFIENDIERLTNHTTDLMPIVKRTNVFLDNYRLSTVLADYQIVNLRPHNALSDAKATLELTYKLINDGSLNV >CP032751.1|AYJ35340.1|1274366_1277114_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MTEFSRLAQSLWAKKRSDDGQRLWLPLIVHLKDCENTINWLFNHWLSEGQRQQLSEVTSEEDIQRLVKFLGFTHDIGKATPVFQTKPAYNGDHQLDQLLIEQLMQNGFRDLASLNLSSARESPHALAGEAILESFGVNPTVGAIIGGHHGKTASASPKRQIKDYTANYYQNDNQPDLQMAWQQVQRELVAYGLHTAGYQTTAEIPTLNQPEAVILTGLLIMADWLASSEYLNENPDKPLFPLVTTMQSATDINLQARFRDAITTWQSDDEWVPAPLDRNRDPYQVRFGFHARPVQAAITNALEATTDPGMAIVEAPMGLGKTEIALIAVEQLARTTGRDGVYMGLPTQATTNAMFARVNDWLERVADEQSARLSIKLMHGKAQFNQMYKRLPNASNVNSTDEHDGAVTVNSWFGGKKSILTKFTVGTIDNLLLMGLKQKHLFFRHLGFSGKVVVIDEVHAYDAYMNKYLLRAIEWLGAYHVPVVVLSATLPKIKRNQLLKAYIKGKYGRRYHQILKVAPTGWEDTQAYPLLSMLDGPDIKQLTNFEGQSDQAALTLEVQRNNQDDQELIMRLLKQLREGGIAGIIVNTVKRAQDLAALIPADVPLMVLHSAFLAPDRAQQEMKLQAAIGKHGERPAKLVVIGTQVLEQSLDIDFDVLYTDIAPMDLILQRAGRLHRHQMIKRPRRFQRPQLNIMGIKGFGDYGDGNEAVYGKYLLMKTDHFLKNQIKLPDDISTLVQQVYDLATDIQVPGIKAAAEEFSTKLKAEQQKAQVFQICEPQLKHGQSIHGWLDREHRDIATDQQASAAVRDIQETLEVILIQHMNHDDFLLDGRRLDEVAPAEIAQQTLRLPVAVTPNITKAINQLEDLTRPYHARWQDDIWLRGVLVLPLDQKLTAEFGKWRLSYSSQLGLSYSKEE >CP032751.1|AYJ35341.1|1277110_1278850_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse1/CasA MKTVRMQTFNLTTDPWIVVIDARTNQAVTVSLIELFQNAQYYRRLAGDMRAQDLAILRLLLAILTTIYTRYGADNQAYEWLTMNDMFEVEHVDEDYGIDEIYDDLKQTWADLFASGHFSTIVTDYLQCHAGQFDLFGDQPFYQVTASAYDEFVPEAKSVARSKRTGKPTGQVAVRQMNRRISESGNSVALFAPKVDETKNELTLAELVRWLIMYQNYTGVTDKTKINSDEKFSNGAGWLYRLNPVYASGRSLFEILMLNLVLVPTVSDEQYIVQQPVWEYATLTAYLQERQRQQVPDNLAALYTTWSRLLHLEWDDHQRPTIYSAGIPMFDTEDALIEPMTLWRQDKKTSRFRPAVNGIKYMGKAMWRNFGQYVNVNRSDDIHEAGIVAWLHYLKTEGLVADDRQLWLASTALISDGNMSSQMPATEVYDDMQIQADVLFDEATADHWPVRIEEVIELTQRIGDGYYHFAATVGQIRNIDAKQFAQRHSAQFYASLNRPFKDWLASLTGNDDRDAKIKEWRQTLQQLTLQASSVMMATSSSRDVRGIVERDKNNVPRQVNIFTANDQFRRLVFTQLSGR >CP032751.1|AYJ35342.1|1278863_1279469_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse2/CasB MESKIQSATISIIRQLYNNGNLNKGVLASVRHATALTSPQAQTLWPVMMAHLEPNMLSQDGQPTKAEVAVYTAIRFYAIQQQGTESLVYGPANPHADVKDQGMPLFRALARLRRNEETRVALDRRMQPLLATTNVASIINALTHLVSMLRANNQLQKIDYPRLAQDLYWFQQDYEHASQVRLQWGQQYYRPLTVTTEGKKN >CP032751.1|AYJ35343.1|1279468_1280548_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cse4/CasC MMTNNLYLDIHVIQTVPSSNINRDDTGAPKTALYGGVTRARVSSQSWKRAVRQSFKDDTVTVGFRTKAAAQLLKQALQKLTPELNDDDAWKQVNAVFKLASVKLDKDEETSALLLVSPGQIDQLAQYVTDNADEELDKKAIKAVLKGNQSIDLALFGRMVADNPELNVDAAAQVAHAISTHEVVPEFDYFTALDDLQPEDSTGAAMLGTLEFNSATLYRYANVNINELIANLGETAAIDGIREFVKAFVLSMPTGKQNTFANKTLPNYVMVTLRPDTPVNLVSGFEDPVASKTGYVKQSVQQLATAYQAALSFVEQPILNVDLGADESQVATPADSLTGLLEQLVAKLTEVVKDEDGND >CP032751.1|AYJ35344.1|1280528_1281236_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas5/CasD MKTVTIKLTAPLQSYGNEANFDRRTSYDYPSKSAIIGMVAAALGYSRRDPRIKTLNQLAYAVRIDQPAKPLTDFQIVEWKQNRRKLTYRDYLQDAVFMVALGSEDDSFIDQIDWAIRHPHFQLALGRRANVPAGPMMTAVCSGRNPVQVLQTASWHASQFYMRQIQHHTFVAELIADAVLLPDYPSSMVKDMVVSFDQRHRQYGFRAVAVDRVSLENPYFATKDADTEHDIMNYL >CP032751.1|AYJ35345.1|1281249_1281921_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas6/Cse3/CasE MYLSRVEIDTNNRRKIKDLSHLGAYHNWVEQSFPDEINSGQRQRHLWRIDRLNGKSYLLLLSATRPAPKEFERYGVAGTAVTKSYDAWLDQLKVGMVMRFRLTANPTHSIVEPNHPKGRVVPHVTIEQQKQWLADRAIGAGFELVGHRETESDKIHEFAFDVVSHDWPMLHRAKGHGVRLSRVTFEGLLCVKDLPTFKQTLTRGIGREKAFGMGLMTVIPEVQ >CP032751.1|AYJ35346.1|1282650_1283964_-|glycosyltransferase MEIMQTLKPFESIWNFVLLLLVSYPILGAFAWFIGVLCYQLIYRHRHKADIEFKQLTPEAQPFITIMIPAHNEEVMIEHTINYLMNNLNYEKYEVLVTDDGSTDETPAILERLQNVYDNLRVVTIKKNQGKAHAFNVGVGFARGEFILSNDADSIPEPDALWKYMSYFMGEEHANTAAVTANMDVQNRSTIIAKSQTVEFSSIVGVIKRSQVSALGNMYAYSGANTMYRRDALIDVGLFRQDRATEDISIAWDHQLNGWTTVFSPDILFYMNVPENLDALYHQRKRWAKGGTEVLLTNFKRVASHPGKYLKQWAFITDQTLSIIWSLFFFVSTLIFLISLITFFFTGNYERVYHMFCMAFIFVTFEMFAGVLQLLSALIVDDRGRKFKYLIFMPLYMLIYWQVNALALVTTLVPAVKTILGYGSGTWVSPVRKHHTE |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP032751_2 | 1270860-1271193 | TypeI-E |
NA
Consensus repeat of CP032751_2
|
5 spacers
spacers of CP032751_2
>2.1|1270888|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT GCCGCACTAACAATCAAACCGGCAACTGCGCCA >2.2|1270949|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTGGGCGACATCGTGAAGAATGCCAAGGGCGA >2.3|1271010|34|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCCCTTAGTAAACGTAACCGTACCAGCGTCTAGG >2.4|1271072|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCGTGGTAACACGAAATTGTATGACACAAATTA >2.5|1271133|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGAAAGGAGGAATAACAAATGGCAGATGAAGTA |
cas1,DEDDh,cas3,cas8e,cse2gr11,cas7,cas5,cas6e |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP032751_2
The CRISPR arrays of CP032751_2 >merge|CP032751|2|1270860-1271193|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGAATCACCCTGCATGTACGGGGAATAGGCCGCACTAACAATCAAACCGGCAACTGCGCCAGGATCACCCCCGTATGTACGGGGAATAGGTTGGGCGACATCGTGAAGAATGCCAAGGGCGAGGATCACCCCCGTATGTACGGGGAATAGGCCCTTAGTAAACGTAACCGTACCAGCGTCTAGGGGATCACCCCCGTATGTACGGGGAATAGCCGTGGTAACACGAAATTGTATGACACAAATTAGGATCACCCCCGTATGTACGGGGAATAGTGAAAGGAGGAATAACAAATGGCAGATGAAGTAGGATCACCCCCGTATGTACGGGGAATAG >CP032751|2|2|1270860-1271193|CRISPRCasFinder GGAATCACCCTGCATGTACGGGGAATAG GCCGCACTAACAATCAAACCGGCAACTGCGCCA GGATCACCCCCGTATGTACGGGGAATAG GTTGGGCGACATCGTGAAGAATGCCAAGGGCGA GGATCACCCCCGTATGTACGGGGAATAG GCCCTTAGTAAACGTAACCGTACCAGCGTCTAGG GGATCACCCCCGTATGTACGGGGAATAG CCGTGGTAACACGAAATTGTATGACACAAATTA GGATCACCCCCGTATGTACGGGGAATAG TGAAAGGAGGAATAACAAATGGCAGATGAAGTA GGATCACCCCCGTATGTACGGGGAATAG >CP032751|2|1|1270860-1271193|CRT GGAATCACCCTGCATGTACGGGGAATAG GCCGCACTAACAATCAAACCGGCAACTGCGCCA GGATCACCCCCGTATGTACGGGGAATAG GTTGGGCGACATCGTGAAGAATGCCAAGGGCGA GGATCACCCCCGTATGTACGGGGAATAG GCCCTTAGTAAACGTAACCGTACCAGCGTCTAGG GGATCACCCCCGTATGTACGGGGAATAG CCGTGGTAACACGAAATTGTATGACACAAATTA GGATCACCCCCGTATGTACGGGGAATAG TGAAAGGAGGAATAACAAATGGCAGATGAAGTA GGATCACCCCCGTATGTACGGGGAATAG >CP032751|2|2|1270921-1271193|PILER-CR GGATCACCCCCGTATGTACGGGGAATAG GTTGGGCGACATCGTGAAGAATGCCAAGGGCGA GGATCACCCCCGTATGTACGGGGAATAG GCCCTTAGTAAACGTAACCGTACCAGCGTCTAGG GGATCACCCCCGTATGTACGGGGAATAG CCGTGGTAACACGAAATTGTATGACACAAATTA GGATCACCCCCGTATGTACGGGGAATAG TGAAAGGAGGAATAACAAATGGCAGATGAAGTA GGATCACCCCCGTATGTACGGGGAATAG
>CP032751.1|AYJ35337.1|1269449_1270199_+|aspartate/glutamate-racemase-family-protein MENCFGIIGGMGTMATEDFVHTVNRLTVTHRDQDYLNYVVLNDAQIPDRTAYILDHNCTNPLPSLKADVQLLDRLGVKFIVMTCNTAHYFIPALTAITNVPILNMPALAVEAACQLQQPRPLRIGVLATTGTLKSQLYQQLILAKGHIPVVPTEQQQAQVMALIYEDIKQHDYVNRVKFHGLIDQLLNAANCDAVILGCTELSVAQDTAPYGSERIIDAQHELARATVQRAQAVKPTMILRQPHSTNSR >CP032751.1|AYJ35336.1|1266679_1267942_-|replication-associated-recombination-protein-A MAFKTPLADQMRPQSLEQMVGQQDLLKAGQPLRQIIDQHVNIPLILWGPPGTGKTSLAQIIASQDDYPFVAFNASTENKAQLTKAIAQYPEQSFVLLIDEIHRMTKTLQDFLLPYLENGHVMLIGSTTENPIMSIVPAIRSRCQIFEFQPLSDTDIEIALRRAVTDIYNLTDDQVDAKALNLIAISAEGDLRIALNILETLHAIDQKQITVAAVQHFAQQQHFIYDRKATKHYDYLSAYSDSMAGSDTDAALYYLTILLKNDDLPSVVRRLREIPYTYIGLANPEQVTQIVVAANQAEKIGMPKAKYPLMFATMLMCISPKSGSFDQSWEKLDQDTQNPSQHPMPRGLRDMHYKHSEEITGGGLIDNPFQMPHQIAQQNYMPKGLAGRRYYYPKDNENERKLGAQYLKLHRFIYNEDYHE >CP032751.1|AYJ35335.1|1266200_1266512_+|hypothetical-protein MATVLPKAVKVWMGANILQIEFDNGEFRYMRTHFIDDYVSAWSPKKGKGKRRNLWLMPSWEWLGANARIEPDGTVVLFEKDIYTAQELWHNSVTRIDLVSGVH >CP032751.1|AYJ35334.1|1265600_1265957_+|50S-ribosomal-protein-L20 MARVKGGTVTRKRRKRILKLAKGYRGAKHIQFKVAKDQVMKSYLYAFRDRRRRKSDFRRLWIARINAAARINDISYSQLMHGLKLANVDVNRKMLADLAVNDADAFKALVDTAKKALA >CP032751.1|AYJ35333.1|1265369_1265564_+|50S-ribosomal-protein-L35 MPKQKTNRAAAKRFKVTAKGKIKSANAFTSHRFHGKTKKQRRQLRGTAIIEKPMVKTYHKLLQK >CP032751.1|AYJ35332.1|1264826_1265348_+|translation-initiation-factor-IF-3 MTIAKDSMVNDGIRAREVRLIASDGEQLGVKSRQEAMQIAEDASLDLVLVAPKAKPPVARIMDYGKYRFEQQKKDREARKKQKVVSIKEVRLSPAIDTNDFNTKLKHAEKFLSKGDKVRVSIRFKGRAITHKDIGRQVLNRMIEATKEFSTVEAYPKMDGRSMFLVLAPKTDK >CP032751.1|AYJ35331.1|1262640_1264605_+|threonine--tRNA-ligase MASINVKFPDGAEKQFDAGVTTEEIAKSISPSLAKRSVAGKFNDQIVDYRQPLTTDGSIEIIAADSEDGLNVLRQTAAQVLANAVKQLFPNIHFGSGEGNANGFFFDTDNPDEDGKQVSEDDLEAISDKMAAIIKQDLPIEREVLSKADALALVGDNPYQQDLVNERAAANNDQVVVYKQGDFVDLSDGAQLASTGKVKVFKLLSVAGAYWQGKSSNPMLQRIYGTAFLKQKDLDADLKRRQEARERDHRVIGNELDLFFVDPKVGNGLPYWMPNGATIRRQIERYIIDKEVANGYQHVYTPVLANLDVYKQSGHWDHYREDMFPPMDMGDGEQLELRPMNCPSHIQIYNHHIRSYRELPLRIAELGMMHRYEKSGALTGLSRVREMTLNDGHTFVALDQIEEEFKKILSLMVEVYEDFDISDYRFRLSYRDPENKEKYFDDDAMWERSQKMLKSAMDDMGLDYFEAEGEAAFYGPKLDVQTKTALGGEETLSTIQLDFLLPERFDLKYVGADGEEHRPVMIHRGLVSTMERFVAYLTEIYKGAFPTWLAPKQVTIIPVNNGAHGAYAETVRRRLAAEGVRVSIDDRNEKMGYKIRESQTKKVPYLLVVGDQEVANGSVSVRKYGEERTESEAVDMFIGAITQEIKHYSRGASK >CP032751.1|AYJ35330.1|1261372_1262308_+|primosomal-protein-DnaI MENISETLRTLMNRKNLNHRYEALMTAVYQDPDVRQFLAAHQNELSSDALERSAAKLYEFCEEKRKIARHEPTQAPGYQPTLVMSNHLIDIAYQPTPQMQEQQAAHALQQRVRSISMPKNIQTADLKTYDQDGDRATALMAALDFIDAYTQAPKRFHRGLYLYGSFGVGKTYLLGGMANALAANGFNTTLIHFPSFAVEMKRSISNNTSADKVDAIKRAPILMIDDIGADASSTWIRDDVLGVILEYRMQEELPTCFSSNFSMQELQDGYLTLSQKGDEEPVKAQRIMQRVRYLASEIEMVGRNRRLNPDA >CP032751.1|AYJ35329.1|1259965_1261369_+|helicase-DnaB MPNDEPLTPKTGLVVPQAPALSAAQQAVLAELYLPLMGPLAYSLYAALRSLQSSENELSNRRSHAELLGILNVDLPTVLAARRKLEATGLLRSYYQQDELGAMYIYQLQAPLLALQFFADDLLSVLLLDTVGELRYQQLAGDFAAQPIDLTAAKDVTANILDVFHVDSQKVTTPPLSVQKVRAQLAANEPAEDHSPVLSDDDFDWQLLGQILKQNYVDLKQVASSRQLIITESRVYGISEIEMAKLISEVASLTTGQFDENQLKLLIARRYERPAVSSQQVATEATVATTTTKDNKASAQLSTAEQQLVTYAKQTAPYDFLSALKQEKHGFVTSGENRLVHDLIGRGGLPNAVINMVIYYLLQNRELAALNRNLLETVANDWQQHGITTPEAALMYLKQRKQPKSTPTRRKNNRPTRKEIMPKWAQQQQQTESGKQPAQTGKQITAAQRKQLADRLAKLETNSEKED >CP032751.1|AYJ35328.1|1259428_1259944_+|transcriptional-regulator-NrdR MQCPHCHHNGSRVVDSRPTDDGRVIRRRRECENCGFRFTTFERVEATPLLVIKKNGAREEFNREKVLRGIIRSAEKRPVSMETMTGVVDDVENKVRSLGENEISSQVIGEYVMEQLADIDEISYIRFASVYRQFKDMHVFLNELQDMMERDKVKLAKPSAKTTHAPKRKKD >CP032751.1|AYJ35338.1|1271530_1272481_+|type-I-E-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKSGAKKPELSELSRIHDRLTFLYLEHAKLDRQDSAIRVSDARGVVFVPAAIISVLMLGPGVDVTHRAMELMGDAGMAVVWVGERGVRQYAHGRALNHSSRLLEAQARLFSNQRSRLAVARKMYQMRFPNDDVTTLSMQKLRGKEGARVRQVYRLESERTGVSWTRREYNPDNFEASSPINQALTAAHQALYGLSYSVIMAMGASAGLGFVHTGHDLSFVYDFADLYKAETSIPVAFDIVAASTADEDIARSTRLAMRDAFIDGKLLRRMVSDLKVILGVSETTTEVSNLSLWDDRLGLQEFGVQYHETEVGGIE >CP032751.1|AYJ35339.1|1272477_1273368_+|type-I-E-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MIVVTLTKVPNALRGDLTKWYQEIQTGVYVGNVNARVRDSLWLRIVENIGRGEATMVYNANNELGYQFKTTRHDHQVVDFDGIPLMMHLAASQTAEKHGYSNAAKFHKARMMTQKVQRQQSRHSDESVVAVDIETTGLDPSKDAIISIAAVKSIPDGQTSEFNRLIKIDRPLSQKIVALTGITRDMLNEQGVSIAMALSEMKVFIGNSVIVGYNFHFDEMFLKQAFIENDIERLTNHTTDLMPIVKRTNVFLDNYRLSTVLADYQIVNLRPHNALSDAKATLELTYKLINDGSLNV >CP032751.1|AYJ35340.1|1274366_1277114_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MTEFSRLAQSLWAKKRSDDGQRLWLPLIVHLKDCENTINWLFNHWLSEGQRQQLSEVTSEEDIQRLVKFLGFTHDIGKATPVFQTKPAYNGDHQLDQLLIEQLMQNGFRDLASLNLSSARESPHALAGEAILESFGVNPTVGAIIGGHHGKTASASPKRQIKDYTANYYQNDNQPDLQMAWQQVQRELVAYGLHTAGYQTTAEIPTLNQPEAVILTGLLIMADWLASSEYLNENPDKPLFPLVTTMQSATDINLQARFRDAITTWQSDDEWVPAPLDRNRDPYQVRFGFHARPVQAAITNALEATTDPGMAIVEAPMGLGKTEIALIAVEQLARTTGRDGVYMGLPTQATTNAMFARVNDWLERVADEQSARLSIKLMHGKAQFNQMYKRLPNASNVNSTDEHDGAVTVNSWFGGKKSILTKFTVGTIDNLLLMGLKQKHLFFRHLGFSGKVVVIDEVHAYDAYMNKYLLRAIEWLGAYHVPVVVLSATLPKIKRNQLLKAYIKGKYGRRYHQILKVAPTGWEDTQAYPLLSMLDGPDIKQLTNFEGQSDQAALTLEVQRNNQDDQELIMRLLKQLREGGIAGIIVNTVKRAQDLAALIPADVPLMVLHSAFLAPDRAQQEMKLQAAIGKHGERPAKLVVIGTQVLEQSLDIDFDVLYTDIAPMDLILQRAGRLHRHQMIKRPRRFQRPQLNIMGIKGFGDYGDGNEAVYGKYLLMKTDHFLKNQIKLPDDISTLVQQVYDLATDIQVPGIKAAAEEFSTKLKAEQQKAQVFQICEPQLKHGQSIHGWLDREHRDIATDQQASAAVRDIQETLEVILIQHMNHDDFLLDGRRLDEVAPAEIAQQTLRLPVAVTPNITKAINQLEDLTRPYHARWQDDIWLRGVLVLPLDQKLTAEFGKWRLSYSSQLGLSYSKEE >CP032751.1|AYJ35341.1|1277110_1278850_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse1/CasA MKTVRMQTFNLTTDPWIVVIDARTNQAVTVSLIELFQNAQYYRRLAGDMRAQDLAILRLLLAILTTIYTRYGADNQAYEWLTMNDMFEVEHVDEDYGIDEIYDDLKQTWADLFASGHFSTIVTDYLQCHAGQFDLFGDQPFYQVTASAYDEFVPEAKSVARSKRTGKPTGQVAVRQMNRRISESGNSVALFAPKVDETKNELTLAELVRWLIMYQNYTGVTDKTKINSDEKFSNGAGWLYRLNPVYASGRSLFEILMLNLVLVPTVSDEQYIVQQPVWEYATLTAYLQERQRQQVPDNLAALYTTWSRLLHLEWDDHQRPTIYSAGIPMFDTEDALIEPMTLWRQDKKTSRFRPAVNGIKYMGKAMWRNFGQYVNVNRSDDIHEAGIVAWLHYLKTEGLVADDRQLWLASTALISDGNMSSQMPATEVYDDMQIQADVLFDEATADHWPVRIEEVIELTQRIGDGYYHFAATVGQIRNIDAKQFAQRHSAQFYASLNRPFKDWLASLTGNDDRDAKIKEWRQTLQQLTLQASSVMMATSSSRDVRGIVERDKNNVPRQVNIFTANDQFRRLVFTQLSGR >CP032751.1|AYJ35342.1|1278863_1279469_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse2/CasB MESKIQSATISIIRQLYNNGNLNKGVLASVRHATALTSPQAQTLWPVMMAHLEPNMLSQDGQPTKAEVAVYTAIRFYAIQQQGTESLVYGPANPHADVKDQGMPLFRALARLRRNEETRVALDRRMQPLLATTNVASIINALTHLVSMLRANNQLQKIDYPRLAQDLYWFQQDYEHASQVRLQWGQQYYRPLTVTTEGKKN >CP032751.1|AYJ35343.1|1279468_1280548_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cse4/CasC MMTNNLYLDIHVIQTVPSSNINRDDTGAPKTALYGGVTRARVSSQSWKRAVRQSFKDDTVTVGFRTKAAAQLLKQALQKLTPELNDDDAWKQVNAVFKLASVKLDKDEETSALLLVSPGQIDQLAQYVTDNADEELDKKAIKAVLKGNQSIDLALFGRMVADNPELNVDAAAQVAHAISTHEVVPEFDYFTALDDLQPEDSTGAAMLGTLEFNSATLYRYANVNINELIANLGETAAIDGIREFVKAFVLSMPTGKQNTFANKTLPNYVMVTLRPDTPVNLVSGFEDPVASKTGYVKQSVQQLATAYQAALSFVEQPILNVDLGADESQVATPADSLTGLLEQLVAKLTEVVKDEDGND >CP032751.1|AYJ35344.1|1280528_1281236_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas5/CasD MKTVTIKLTAPLQSYGNEANFDRRTSYDYPSKSAIIGMVAAALGYSRRDPRIKTLNQLAYAVRIDQPAKPLTDFQIVEWKQNRRKLTYRDYLQDAVFMVALGSEDDSFIDQIDWAIRHPHFQLALGRRANVPAGPMMTAVCSGRNPVQVLQTASWHASQFYMRQIQHHTFVAELIADAVLLPDYPSSMVKDMVVSFDQRHRQYGFRAVAVDRVSLENPYFATKDADTEHDIMNYL >CP032751.1|AYJ35345.1|1281249_1281921_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas6/Cse3/CasE MYLSRVEIDTNNRRKIKDLSHLGAYHNWVEQSFPDEINSGQRQRHLWRIDRLNGKSYLLLLSATRPAPKEFERYGVAGTAVTKSYDAWLDQLKVGMVMRFRLTANPTHSIVEPNHPKGRVVPHVTIEQQKQWLADRAIGAGFELVGHRETESDKIHEFAFDVVSHDWPMLHRAKGHGVRLSRVTFEGLLCVKDLPTFKQTLTRGIGREKAFGMGLMTVIPEVQ >CP032751.1|AYJ35346.1|1282650_1283964_-|glycosyltransferase MEIMQTLKPFESIWNFVLLLLVSYPILGAFAWFIGVLCYQLIYRHRHKADIEFKQLTPEAQPFITIMIPAHNEEVMIEHTINYLMNNLNYEKYEVLVTDDGSTDETPAILERLQNVYDNLRVVTIKKNQGKAHAFNVGVGFARGEFILSNDADSIPEPDALWKYMSYFMGEEHANTAAVTANMDVQNRSTIIAKSQTVEFSSIVGVIKRSQVSALGNMYAYSGANTMYRRDALIDVGLFRQDRATEDISIAWDHQLNGWTTVFSPDILFYMNVPENLDALYHQRKRWAKGGTEVLLTNFKRVASHPGKYLKQWAFITDQTLSIIWSLFFFVSTLIFLISLITFFFTGNYERVYHMFCMAFIFVTFEMFAGVLQLLSALIVDDRGRKFKYLIFMPLYMLIYWQVNALALVTTLVPAVKTILGYGSGTWVSPVRKHHTE >CP032751.1|AYJ35347.1|1283967_1284450_-|hypothetical-protein MEKKDVMKQYVTDKYFSKGHWWTKLWQTLVAIITWICVAVPVYWTISSTLLANNPQFIHAWKYEEGKTLFYFFDRFFIIAFILIAIVVIVSTIHNNHRVKQHISKERQYDEDQLDIRKRQLNNFYTQRFGQATFRQHVKHYTVDPEQNLDVNEIHRLYED |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP032751_3 | 1273467-1273799 | TypeI-E |
NA
Consensus repeat of CP032751_3
|
5 spacers
spacers of CP032751_3
>3.1|1273495|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT TTGATGGTTTCTTGTAACGTGGCAATCTGCTTA >3.2|1273556|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT CATCAGGTTCAACGGTCAAGGCAACCTTTTTAG >3.3|1273617|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT CTAGATGACTGTTTGCCCTCATCACCAATCGCG >3.4|1273678|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT ATTGCCCTAGCTATTTTTTATCTATTCGACATA >3.5|1273739|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT TGGTCATTTTTTAAGTTTCTTCCTTTTACACTG >3.6|1273558|33|CP032751|PILER-CR CATCAGGTTCAACGGTCAAGGCAACCTTTTTAG >3.7|1273619|33|CP032751|PILER-CR CTAGATGACTGTTTGCCCTCATCACCAATCGCG >3.8|1273680|33|CP032751|PILER-CR ATTGCCCTAGCTATTTTTTATCTATTCGACATA >3.9|1273741|33|CP032751|PILER-CR TGGTCATTTTTTAAGTTTCTTCCTTTTACACTG |
DEDDh,cas1,cas3,cas8e,cse2gr11,cas7,cas5,cas6e |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP032751_3
The CRISPR arrays of CP032751_3 >merge|CP032751|3|1273467-1273799|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGGTTACCCCCGTATACACGGGGAATAGTTGATGGTTTCTTGTAACGTGGCAATCTGCTTAGAATCACCCCCGCATACACGGGGAATAGCATCAGGTTCAACGGTCAAGGCAACCTTTTTAGGGATCACCCCCGCATACACGGGGAATAGCTAGATGACTGTTTGCCCTCATCACCAATCGCGGGATCACCCCCGCATACACGGGGAATAGATTGCCCTAGCTATTTTTTATCTATTCGACATAGGATCACCCCCGCATACACGGGGAATAGTGGTCATTTTTTAAGTTTCTTCCTTTTACACTGGGATCACCCCCGCATACACGGGGAATAG >CP032751|3|3|1273467-1273799|CRISPRCasFinder GGGTTACCCCCGTATACACGGGGAATAG TTGATGGTTTCTTGTAACGTGGCAATCTGCTTA GAATCACCCCCGCATACACGGGGAATAG CATCAGGTTCAACGGTCAAGGCAACCTTTTTAG GGATCACCCCCGCATACACGGGGAATAG CTAGATGACTGTTTGCCCTCATCACCAATCGCG GGATCACCCCCGCATACACGGGGAATAG ATTGCCCTAGCTATTTTTTATCTATTCGACATA GGATCACCCCCGCATACACGGGGAATAG TGGTCATTTTTTAAGTTTCTTCCTTTTACACTG GGATCACCCCCGCATACACGGGGAATAG >CP032751|3|2|1273467-1273799|CRT GGGTTACCCCCGTATACACGGGGAATAG TTGATGGTTTCTTGTAACGTGGCAATCTGCTTA GAATCACCCCCGCATACACGGGGAATAG CATCAGGTTCAACGGTCAAGGCAACCTTTTTAG GGATCACCCCCGCATACACGGGGAATAG CTAGATGACTGTTTGCCCTCATCACCAATCGCG GGATCACCCCCGCATACACGGGGAATAG ATTGCCCTAGCTATTTTTTATCTATTCGACATA GGATCACCCCCGCATACACGGGGAATAG TGGTCATTTTTTAAGTTTCTTCCTTTTACACTG GGATCACCCCCGCATACACGGGGAATAG >CP032751|3|3|1273530-1273799|PILER-CR ATCACCCCCGCATACACGGGGAATAGCA TCAGGTTCAACGGTCAAGGCAACCTTTTTAGGG ATCACCCCCGCATACACGGGGAATAGCT AGATGACTGTTTGCCCTCATCACCAATCGCGGG ATCACCCCCGCATACACGGGGAATAGAT TGCCCTAGCTATTTTTTATCTATTCGACATAGG ATCACCCCCGCATACACGGGGAATAGTG GTCATTTTTTAAGTTTCTTCCTTTTACACTGGG ATCACCCCCGCATACACGGGGAATAG
>CP032751.1|AYJ35339.1|1272477_1273368_+|type-I-E-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MIVVTLTKVPNALRGDLTKWYQEIQTGVYVGNVNARVRDSLWLRIVENIGRGEATMVYNANNELGYQFKTTRHDHQVVDFDGIPLMMHLAASQTAEKHGYSNAAKFHKARMMTQKVQRQQSRHSDESVVAVDIETTGLDPSKDAIISIAAVKSIPDGQTSEFNRLIKIDRPLSQKIVALTGITRDMLNEQGVSIAMALSEMKVFIGNSVIVGYNFHFDEMFLKQAFIENDIERLTNHTTDLMPIVKRTNVFLDNYRLSTVLADYQIVNLRPHNALSDAKATLELTYKLINDGSLNV >CP032751.1|AYJ35338.1|1271530_1272481_+|type-I-E-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKSGAKKPELSELSRIHDRLTFLYLEHAKLDRQDSAIRVSDARGVVFVPAAIISVLMLGPGVDVTHRAMELMGDAGMAVVWVGERGVRQYAHGRALNHSSRLLEAQARLFSNQRSRLAVARKMYQMRFPNDDVTTLSMQKLRGKEGARVRQVYRLESERTGVSWTRREYNPDNFEASSPINQALTAAHQALYGLSYSVIMAMGASAGLGFVHTGHDLSFVYDFADLYKAETSIPVAFDIVAASTADEDIARSTRLAMRDAFIDGKLLRRMVSDLKVILGVSETTTEVSNLSLWDDRLGLQEFGVQYHETEVGGIE >CP032751.1|AYJ35337.1|1269449_1270199_+|aspartate/glutamate-racemase-family-protein MENCFGIIGGMGTMATEDFVHTVNRLTVTHRDQDYLNYVVLNDAQIPDRTAYILDHNCTNPLPSLKADVQLLDRLGVKFIVMTCNTAHYFIPALTAITNVPILNMPALAVEAACQLQQPRPLRIGVLATTGTLKSQLYQQLILAKGHIPVVPTEQQQAQVMALIYEDIKQHDYVNRVKFHGLIDQLLNAANCDAVILGCTELSVAQDTAPYGSERIIDAQHELARATVQRAQAVKPTMILRQPHSTNSR >CP032751.1|AYJ35336.1|1266679_1267942_-|replication-associated-recombination-protein-A MAFKTPLADQMRPQSLEQMVGQQDLLKAGQPLRQIIDQHVNIPLILWGPPGTGKTSLAQIIASQDDYPFVAFNASTENKAQLTKAIAQYPEQSFVLLIDEIHRMTKTLQDFLLPYLENGHVMLIGSTTENPIMSIVPAIRSRCQIFEFQPLSDTDIEIALRRAVTDIYNLTDDQVDAKALNLIAISAEGDLRIALNILETLHAIDQKQITVAAVQHFAQQQHFIYDRKATKHYDYLSAYSDSMAGSDTDAALYYLTILLKNDDLPSVVRRLREIPYTYIGLANPEQVTQIVVAANQAEKIGMPKAKYPLMFATMLMCISPKSGSFDQSWEKLDQDTQNPSQHPMPRGLRDMHYKHSEEITGGGLIDNPFQMPHQIAQQNYMPKGLAGRRYYYPKDNENERKLGAQYLKLHRFIYNEDYHE >CP032751.1|AYJ35335.1|1266200_1266512_+|hypothetical-protein MATVLPKAVKVWMGANILQIEFDNGEFRYMRTHFIDDYVSAWSPKKGKGKRRNLWLMPSWEWLGANARIEPDGTVVLFEKDIYTAQELWHNSVTRIDLVSGVH >CP032751.1|AYJ35334.1|1265600_1265957_+|50S-ribosomal-protein-L20 MARVKGGTVTRKRRKRILKLAKGYRGAKHIQFKVAKDQVMKSYLYAFRDRRRRKSDFRRLWIARINAAARINDISYSQLMHGLKLANVDVNRKMLADLAVNDADAFKALVDTAKKALA >CP032751.1|AYJ35333.1|1265369_1265564_+|50S-ribosomal-protein-L35 MPKQKTNRAAAKRFKVTAKGKIKSANAFTSHRFHGKTKKQRRQLRGTAIIEKPMVKTYHKLLQK >CP032751.1|AYJ35332.1|1264826_1265348_+|translation-initiation-factor-IF-3 MTIAKDSMVNDGIRAREVRLIASDGEQLGVKSRQEAMQIAEDASLDLVLVAPKAKPPVARIMDYGKYRFEQQKKDREARKKQKVVSIKEVRLSPAIDTNDFNTKLKHAEKFLSKGDKVRVSIRFKGRAITHKDIGRQVLNRMIEATKEFSTVEAYPKMDGRSMFLVLAPKTDK >CP032751.1|AYJ35331.1|1262640_1264605_+|threonine--tRNA-ligase MASINVKFPDGAEKQFDAGVTTEEIAKSISPSLAKRSVAGKFNDQIVDYRQPLTTDGSIEIIAADSEDGLNVLRQTAAQVLANAVKQLFPNIHFGSGEGNANGFFFDTDNPDEDGKQVSEDDLEAISDKMAAIIKQDLPIEREVLSKADALALVGDNPYQQDLVNERAAANNDQVVVYKQGDFVDLSDGAQLASTGKVKVFKLLSVAGAYWQGKSSNPMLQRIYGTAFLKQKDLDADLKRRQEARERDHRVIGNELDLFFVDPKVGNGLPYWMPNGATIRRQIERYIIDKEVANGYQHVYTPVLANLDVYKQSGHWDHYREDMFPPMDMGDGEQLELRPMNCPSHIQIYNHHIRSYRELPLRIAELGMMHRYEKSGALTGLSRVREMTLNDGHTFVALDQIEEEFKKILSLMVEVYEDFDISDYRFRLSYRDPENKEKYFDDDAMWERSQKMLKSAMDDMGLDYFEAEGEAAFYGPKLDVQTKTALGGEETLSTIQLDFLLPERFDLKYVGADGEEHRPVMIHRGLVSTMERFVAYLTEIYKGAFPTWLAPKQVTIIPVNNGAHGAYAETVRRRLAAEGVRVSIDDRNEKMGYKIRESQTKKVPYLLVVGDQEVANGSVSVRKYGEERTESEAVDMFIGAITQEIKHYSRGASK >CP032751.1|AYJ35330.1|1261372_1262308_+|primosomal-protein-DnaI MENISETLRTLMNRKNLNHRYEALMTAVYQDPDVRQFLAAHQNELSSDALERSAAKLYEFCEEKRKIARHEPTQAPGYQPTLVMSNHLIDIAYQPTPQMQEQQAAHALQQRVRSISMPKNIQTADLKTYDQDGDRATALMAALDFIDAYTQAPKRFHRGLYLYGSFGVGKTYLLGGMANALAANGFNTTLIHFPSFAVEMKRSISNNTSADKVDAIKRAPILMIDDIGADASSTWIRDDVLGVILEYRMQEELPTCFSSNFSMQELQDGYLTLSQKGDEEPVKAQRIMQRVRYLASEIEMVGRNRRLNPDA >CP032751.1|AYJ35340.1|1274366_1277114_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MTEFSRLAQSLWAKKRSDDGQRLWLPLIVHLKDCENTINWLFNHWLSEGQRQQLSEVTSEEDIQRLVKFLGFTHDIGKATPVFQTKPAYNGDHQLDQLLIEQLMQNGFRDLASLNLSSARESPHALAGEAILESFGVNPTVGAIIGGHHGKTASASPKRQIKDYTANYYQNDNQPDLQMAWQQVQRELVAYGLHTAGYQTTAEIPTLNQPEAVILTGLLIMADWLASSEYLNENPDKPLFPLVTTMQSATDINLQARFRDAITTWQSDDEWVPAPLDRNRDPYQVRFGFHARPVQAAITNALEATTDPGMAIVEAPMGLGKTEIALIAVEQLARTTGRDGVYMGLPTQATTNAMFARVNDWLERVADEQSARLSIKLMHGKAQFNQMYKRLPNASNVNSTDEHDGAVTVNSWFGGKKSILTKFTVGTIDNLLLMGLKQKHLFFRHLGFSGKVVVIDEVHAYDAYMNKYLLRAIEWLGAYHVPVVVLSATLPKIKRNQLLKAYIKGKYGRRYHQILKVAPTGWEDTQAYPLLSMLDGPDIKQLTNFEGQSDQAALTLEVQRNNQDDQELIMRLLKQLREGGIAGIIVNTVKRAQDLAALIPADVPLMVLHSAFLAPDRAQQEMKLQAAIGKHGERPAKLVVIGTQVLEQSLDIDFDVLYTDIAPMDLILQRAGRLHRHQMIKRPRRFQRPQLNIMGIKGFGDYGDGNEAVYGKYLLMKTDHFLKNQIKLPDDISTLVQQVYDLATDIQVPGIKAAAEEFSTKLKAEQQKAQVFQICEPQLKHGQSIHGWLDREHRDIATDQQASAAVRDIQETLEVILIQHMNHDDFLLDGRRLDEVAPAEIAQQTLRLPVAVTPNITKAINQLEDLTRPYHARWQDDIWLRGVLVLPLDQKLTAEFGKWRLSYSSQLGLSYSKEE >CP032751.1|AYJ35341.1|1277110_1278850_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse1/CasA MKTVRMQTFNLTTDPWIVVIDARTNQAVTVSLIELFQNAQYYRRLAGDMRAQDLAILRLLLAILTTIYTRYGADNQAYEWLTMNDMFEVEHVDEDYGIDEIYDDLKQTWADLFASGHFSTIVTDYLQCHAGQFDLFGDQPFYQVTASAYDEFVPEAKSVARSKRTGKPTGQVAVRQMNRRISESGNSVALFAPKVDETKNELTLAELVRWLIMYQNYTGVTDKTKINSDEKFSNGAGWLYRLNPVYASGRSLFEILMLNLVLVPTVSDEQYIVQQPVWEYATLTAYLQERQRQQVPDNLAALYTTWSRLLHLEWDDHQRPTIYSAGIPMFDTEDALIEPMTLWRQDKKTSRFRPAVNGIKYMGKAMWRNFGQYVNVNRSDDIHEAGIVAWLHYLKTEGLVADDRQLWLASTALISDGNMSSQMPATEVYDDMQIQADVLFDEATADHWPVRIEEVIELTQRIGDGYYHFAATVGQIRNIDAKQFAQRHSAQFYASLNRPFKDWLASLTGNDDRDAKIKEWRQTLQQLTLQASSVMMATSSSRDVRGIVERDKNNVPRQVNIFTANDQFRRLVFTQLSGR >CP032751.1|AYJ35342.1|1278863_1279469_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse2/CasB MESKIQSATISIIRQLYNNGNLNKGVLASVRHATALTSPQAQTLWPVMMAHLEPNMLSQDGQPTKAEVAVYTAIRFYAIQQQGTESLVYGPANPHADVKDQGMPLFRALARLRRNEETRVALDRRMQPLLATTNVASIINALTHLVSMLRANNQLQKIDYPRLAQDLYWFQQDYEHASQVRLQWGQQYYRPLTVTTEGKKN >CP032751.1|AYJ35343.1|1279468_1280548_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cse4/CasC MMTNNLYLDIHVIQTVPSSNINRDDTGAPKTALYGGVTRARVSSQSWKRAVRQSFKDDTVTVGFRTKAAAQLLKQALQKLTPELNDDDAWKQVNAVFKLASVKLDKDEETSALLLVSPGQIDQLAQYVTDNADEELDKKAIKAVLKGNQSIDLALFGRMVADNPELNVDAAAQVAHAISTHEVVPEFDYFTALDDLQPEDSTGAAMLGTLEFNSATLYRYANVNINELIANLGETAAIDGIREFVKAFVLSMPTGKQNTFANKTLPNYVMVTLRPDTPVNLVSGFEDPVASKTGYVKQSVQQLATAYQAALSFVEQPILNVDLGADESQVATPADSLTGLLEQLVAKLTEVVKDEDGND >CP032751.1|AYJ35344.1|1280528_1281236_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas5/CasD MKTVTIKLTAPLQSYGNEANFDRRTSYDYPSKSAIIGMVAAALGYSRRDPRIKTLNQLAYAVRIDQPAKPLTDFQIVEWKQNRRKLTYRDYLQDAVFMVALGSEDDSFIDQIDWAIRHPHFQLALGRRANVPAGPMMTAVCSGRNPVQVLQTASWHASQFYMRQIQHHTFVAELIADAVLLPDYPSSMVKDMVVSFDQRHRQYGFRAVAVDRVSLENPYFATKDADTEHDIMNYL >CP032751.1|AYJ35345.1|1281249_1281921_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas6/Cse3/CasE MYLSRVEIDTNNRRKIKDLSHLGAYHNWVEQSFPDEINSGQRQRHLWRIDRLNGKSYLLLLSATRPAPKEFERYGVAGTAVTKSYDAWLDQLKVGMVMRFRLTANPTHSIVEPNHPKGRVVPHVTIEQQKQWLADRAIGAGFELVGHRETESDKIHEFAFDVVSHDWPMLHRAKGHGVRLSRVTFEGLLCVKDLPTFKQTLTRGIGREKAFGMGLMTVIPEVQ >CP032751.1|AYJ35346.1|1282650_1283964_-|glycosyltransferase MEIMQTLKPFESIWNFVLLLLVSYPILGAFAWFIGVLCYQLIYRHRHKADIEFKQLTPEAQPFITIMIPAHNEEVMIEHTINYLMNNLNYEKYEVLVTDDGSTDETPAILERLQNVYDNLRVVTIKKNQGKAHAFNVGVGFARGEFILSNDADSIPEPDALWKYMSYFMGEEHANTAAVTANMDVQNRSTIIAKSQTVEFSSIVGVIKRSQVSALGNMYAYSGANTMYRRDALIDVGLFRQDRATEDISIAWDHQLNGWTTVFSPDILFYMNVPENLDALYHQRKRWAKGGTEVLLTNFKRVASHPGKYLKQWAFITDQTLSIIWSLFFFVSTLIFLISLITFFFTGNYERVYHMFCMAFIFVTFEMFAGVLQLLSALIVDDRGRKFKYLIFMPLYMLIYWQVNALALVTTLVPAVKTILGYGSGTWVSPVRKHHTE >CP032751.1|AYJ35347.1|1283967_1284450_-|hypothetical-protein MEKKDVMKQYVTDKYFSKGHWWTKLWQTLVAIITWICVAVPVYWTISSTLLANNPQFIHAWKYEEGKTLFYFFDRFFIIAFILIAIVVIVSTIHNNHRVKQHISKERQYDEDQLDIRKRQLNNFYTQRFGQATFRQHVKHYTVDPEQNLDVNEIHRLYED >CP032751.1|AYJ35348.1|1285090_1285621_+|YqeG-family-HAD-IIIA-type-phosphatase MIKQFKPTWMIPAIYNVTPAQLRAQGIKAVFTDLDNTLIAWDNPDGTPELKKWLHALQDAGIPLVVVSNNSEARIAKALQSLELPFVSRSLKPLPLGISKARHDLGLHKNEVVMVGDQYITDMWAAHLAGVPSILVQPIVKTDAWNTRINRFFERFIKLRLAHVYPEMHFQEDLNK >CP032751.1|AYJ35349.1|1285617_1286754_+|ribosome-biogenesis-GTPase-YqeH MSETSEETLYCIGCGAAIQTADPKAAGYTPNSALQKSLASDAQDLYCQRCFRLRHYNEIVPVGLTDDDFRHLLATIRDANALVVYVVDIFDLNGSIIPGLQRFVGDNPVLLVGNKEDVLPRQLRRTKLREWMNQQVRAQGIKPVDVALTSAKKGHSIDELLAMIEKYRRGRDVYVVGVTNVGKSTLINRIIANNTGLKDLITTSRFPGTTLDKIEIPLDDGHMMVDTPGIIHPEQMAHVLSGDDLKLVSPQREIRPKGFQLGNGQTLFLGGVARLDIVDTLKATGTVYVDNNLTLHRTRTENADNFYTKHVGELITPPTGDAVADFPPLVRHEFKVTEISDIVFEGLGWVTVAADTRVAAWAPKGVAVLTRPAMINKR |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP032751_4 | 1282119-1282573 | TypeI-E |
NA
Consensus repeat of CP032751_4
|
7 spacers
spacers of CP032751_4
>4.1|1282147|33|CP032751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAACTCTTGATTGTCGCTACTTTCAGCAGTTTC >4.2|1282208|33|CP032751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGGACTGCTACCGTAACTGCAACGAGTGGTACG >4.3|1282269|33|CP032751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CACATTCCCAGAAACTGGTATTGCAAGTGAACC >4.4|1282330|33|CP032751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAACGCGGAAGCTATACTTAAGAACCACAACGG >4.5|1282391|33|CP032751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTCTTTCATGAAGGCCGCGTTATTGCGGTCA >4.6|1282452|33|CP032751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCCACCAGTTACAGAGGAAGACATACCTTTGAT >4.7|1282513|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT TGCGGGGTGAGTTGTGGAGTACATGGTAATCCA |
cas6e,cas5,cas7,cse2gr11,cas8e,cas3,DEDDh,cas1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP032751_4
The CRISPR arrays of CP032751_4 >merge|CP032751|4|1282119-1282573|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCCTAACTCTTGATTGTCGCTACTTTCAGCAGTTTCGTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCCGGGACTGCTACCGTAACTGCAACGAGTGGTACGGTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCCCACATTCCCAGAAACTGGTATTGCAAGTGAACCGTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCCTAACGCGGAAGCTATACTTAAGAACCACAACGGGTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCCATTTCTTTCATGAAGGCCGCGTTATTGCGGTCAGTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCCTCCACCAGTTACAGAGGAAGACATACCTTTGATGTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCCTGCGGGGTGAGTTGTGGAGTACATGGTAATCCAGTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGGTGTGA >CP032751|4|4|1282119-1282512|PILER-CR GTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC TAACTCTTGATTGTCGCTACTTTCAGCAGTTTC GTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC GGGACTGCTACCGTAACTGCAACGAGTGGTACG GTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC CACATTCCCAGAAACTGGTATTGCAAGTGAACC GTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC TAACGCGGAAGCTATACTTAAGAACCACAACGG GTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC ATTTCTTTCATGAAGGCCGCGTTATTGCGGTCA GTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC TCCACCAGTTACAGAGGAAGACATACCTTTGAT GTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC >CP032751|4|4|1282119-1282573|CRISPRCasFinder GTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC TAACTCTTGATTGTCGCTACTTTCAGCAGTTTC GTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC GGGACTGCTACCGTAACTGCAACGAGTGGTACG GTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC CACATTCCCAGAAACTGGTATTGCAAGTGAACC GTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC TAACGCGGAAGCTATACTTAAGAACCACAACGG GTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC ATTTCTTTCATGAAGGCCGCGTTATTGCGGTCA GTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC TCCACCAGTTACAGAGGAAGACATACCTTTGAT GTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC TGCGGGGTGAGTTGTGGAGTACATGGTAATCCA GTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGGTGTGA >CP032751|4|3|1282119-1282573|CRT GTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC TAACTCTTGATTGTCGCTACTTTCAGCAGTTTC GTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC GGGACTGCTACCGTAACTGCAACGAGTGGTACG GTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC CACATTCCCAGAAACTGGTATTGCAAGTGAACC GTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC TAACGCGGAAGCTATACTTAAGAACCACAACGG GTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC ATTTCTTTCATGAAGGCCGCGTTATTGCGGTCA GTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC TCCACCAGTTACAGAGGAAGACATACCTTTGAT GTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC TGCGGGGTGAGTTGTGGAGTACATGGTAATCCA GTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGGTGTGA
>CP032751.1|AYJ35345.1|1281249_1281921_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas6/Cse3/CasE MYLSRVEIDTNNRRKIKDLSHLGAYHNWVEQSFPDEINSGQRQRHLWRIDRLNGKSYLLLLSATRPAPKEFERYGVAGTAVTKSYDAWLDQLKVGMVMRFRLTANPTHSIVEPNHPKGRVVPHVTIEQQKQWLADRAIGAGFELVGHRETESDKIHEFAFDVVSHDWPMLHRAKGHGVRLSRVTFEGLLCVKDLPTFKQTLTRGIGREKAFGMGLMTVIPEVQ >CP032751.1|AYJ35344.1|1280528_1281236_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas5/CasD MKTVTIKLTAPLQSYGNEANFDRRTSYDYPSKSAIIGMVAAALGYSRRDPRIKTLNQLAYAVRIDQPAKPLTDFQIVEWKQNRRKLTYRDYLQDAVFMVALGSEDDSFIDQIDWAIRHPHFQLALGRRANVPAGPMMTAVCSGRNPVQVLQTASWHASQFYMRQIQHHTFVAELIADAVLLPDYPSSMVKDMVVSFDQRHRQYGFRAVAVDRVSLENPYFATKDADTEHDIMNYL >CP032751.1|AYJ35343.1|1279468_1280548_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cse4/CasC MMTNNLYLDIHVIQTVPSSNINRDDTGAPKTALYGGVTRARVSSQSWKRAVRQSFKDDTVTVGFRTKAAAQLLKQALQKLTPELNDDDAWKQVNAVFKLASVKLDKDEETSALLLVSPGQIDQLAQYVTDNADEELDKKAIKAVLKGNQSIDLALFGRMVADNPELNVDAAAQVAHAISTHEVVPEFDYFTALDDLQPEDSTGAAMLGTLEFNSATLYRYANVNINELIANLGETAAIDGIREFVKAFVLSMPTGKQNTFANKTLPNYVMVTLRPDTPVNLVSGFEDPVASKTGYVKQSVQQLATAYQAALSFVEQPILNVDLGADESQVATPADSLTGLLEQLVAKLTEVVKDEDGND >CP032751.1|AYJ35342.1|1278863_1279469_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse2/CasB MESKIQSATISIIRQLYNNGNLNKGVLASVRHATALTSPQAQTLWPVMMAHLEPNMLSQDGQPTKAEVAVYTAIRFYAIQQQGTESLVYGPANPHADVKDQGMPLFRALARLRRNEETRVALDRRMQPLLATTNVASIINALTHLVSMLRANNQLQKIDYPRLAQDLYWFQQDYEHASQVRLQWGQQYYRPLTVTTEGKKN >CP032751.1|AYJ35341.1|1277110_1278850_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse1/CasA MKTVRMQTFNLTTDPWIVVIDARTNQAVTVSLIELFQNAQYYRRLAGDMRAQDLAILRLLLAILTTIYTRYGADNQAYEWLTMNDMFEVEHVDEDYGIDEIYDDLKQTWADLFASGHFSTIVTDYLQCHAGQFDLFGDQPFYQVTASAYDEFVPEAKSVARSKRTGKPTGQVAVRQMNRRISESGNSVALFAPKVDETKNELTLAELVRWLIMYQNYTGVTDKTKINSDEKFSNGAGWLYRLNPVYASGRSLFEILMLNLVLVPTVSDEQYIVQQPVWEYATLTAYLQERQRQQVPDNLAALYTTWSRLLHLEWDDHQRPTIYSAGIPMFDTEDALIEPMTLWRQDKKTSRFRPAVNGIKYMGKAMWRNFGQYVNVNRSDDIHEAGIVAWLHYLKTEGLVADDRQLWLASTALISDGNMSSQMPATEVYDDMQIQADVLFDEATADHWPVRIEEVIELTQRIGDGYYHFAATVGQIRNIDAKQFAQRHSAQFYASLNRPFKDWLASLTGNDDRDAKIKEWRQTLQQLTLQASSVMMATSSSRDVRGIVERDKNNVPRQVNIFTANDQFRRLVFTQLSGR >CP032751.1|AYJ35340.1|1274366_1277114_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MTEFSRLAQSLWAKKRSDDGQRLWLPLIVHLKDCENTINWLFNHWLSEGQRQQLSEVTSEEDIQRLVKFLGFTHDIGKATPVFQTKPAYNGDHQLDQLLIEQLMQNGFRDLASLNLSSARESPHALAGEAILESFGVNPTVGAIIGGHHGKTASASPKRQIKDYTANYYQNDNQPDLQMAWQQVQRELVAYGLHTAGYQTTAEIPTLNQPEAVILTGLLIMADWLASSEYLNENPDKPLFPLVTTMQSATDINLQARFRDAITTWQSDDEWVPAPLDRNRDPYQVRFGFHARPVQAAITNALEATTDPGMAIVEAPMGLGKTEIALIAVEQLARTTGRDGVYMGLPTQATTNAMFARVNDWLERVADEQSARLSIKLMHGKAQFNQMYKRLPNASNVNSTDEHDGAVTVNSWFGGKKSILTKFTVGTIDNLLLMGLKQKHLFFRHLGFSGKVVVIDEVHAYDAYMNKYLLRAIEWLGAYHVPVVVLSATLPKIKRNQLLKAYIKGKYGRRYHQILKVAPTGWEDTQAYPLLSMLDGPDIKQLTNFEGQSDQAALTLEVQRNNQDDQELIMRLLKQLREGGIAGIIVNTVKRAQDLAALIPADVPLMVLHSAFLAPDRAQQEMKLQAAIGKHGERPAKLVVIGTQVLEQSLDIDFDVLYTDIAPMDLILQRAGRLHRHQMIKRPRRFQRPQLNIMGIKGFGDYGDGNEAVYGKYLLMKTDHFLKNQIKLPDDISTLVQQVYDLATDIQVPGIKAAAEEFSTKLKAEQQKAQVFQICEPQLKHGQSIHGWLDREHRDIATDQQASAAVRDIQETLEVILIQHMNHDDFLLDGRRLDEVAPAEIAQQTLRLPVAVTPNITKAINQLEDLTRPYHARWQDDIWLRGVLVLPLDQKLTAEFGKWRLSYSSQLGLSYSKEE >CP032751.1|AYJ35339.1|1272477_1273368_+|type-I-E-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MIVVTLTKVPNALRGDLTKWYQEIQTGVYVGNVNARVRDSLWLRIVENIGRGEATMVYNANNELGYQFKTTRHDHQVVDFDGIPLMMHLAASQTAEKHGYSNAAKFHKARMMTQKVQRQQSRHSDESVVAVDIETTGLDPSKDAIISIAAVKSIPDGQTSEFNRLIKIDRPLSQKIVALTGITRDMLNEQGVSIAMALSEMKVFIGNSVIVGYNFHFDEMFLKQAFIENDIERLTNHTTDLMPIVKRTNVFLDNYRLSTVLADYQIVNLRPHNALSDAKATLELTYKLINDGSLNV >CP032751.1|AYJ35338.1|1271530_1272481_+|type-I-E-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKSGAKKPELSELSRIHDRLTFLYLEHAKLDRQDSAIRVSDARGVVFVPAAIISVLMLGPGVDVTHRAMELMGDAGMAVVWVGERGVRQYAHGRALNHSSRLLEAQARLFSNQRSRLAVARKMYQMRFPNDDVTTLSMQKLRGKEGARVRQVYRLESERTGVSWTRREYNPDNFEASSPINQALTAAHQALYGLSYSVIMAMGASAGLGFVHTGHDLSFVYDFADLYKAETSIPVAFDIVAASTADEDIARSTRLAMRDAFIDGKLLRRMVSDLKVILGVSETTTEVSNLSLWDDRLGLQEFGVQYHETEVGGIE >CP032751.1|AYJ35337.1|1269449_1270199_+|aspartate/glutamate-racemase-family-protein MENCFGIIGGMGTMATEDFVHTVNRLTVTHRDQDYLNYVVLNDAQIPDRTAYILDHNCTNPLPSLKADVQLLDRLGVKFIVMTCNTAHYFIPALTAITNVPILNMPALAVEAACQLQQPRPLRIGVLATTGTLKSQLYQQLILAKGHIPVVPTEQQQAQVMALIYEDIKQHDYVNRVKFHGLIDQLLNAANCDAVILGCTELSVAQDTAPYGSERIIDAQHELARATVQRAQAVKPTMILRQPHSTNSR >CP032751.1|AYJ35336.1|1266679_1267942_-|replication-associated-recombination-protein-A MAFKTPLADQMRPQSLEQMVGQQDLLKAGQPLRQIIDQHVNIPLILWGPPGTGKTSLAQIIASQDDYPFVAFNASTENKAQLTKAIAQYPEQSFVLLIDEIHRMTKTLQDFLLPYLENGHVMLIGSTTENPIMSIVPAIRSRCQIFEFQPLSDTDIEIALRRAVTDIYNLTDDQVDAKALNLIAISAEGDLRIALNILETLHAIDQKQITVAAVQHFAQQQHFIYDRKATKHYDYLSAYSDSMAGSDTDAALYYLTILLKNDDLPSVVRRLREIPYTYIGLANPEQVTQIVVAANQAEKIGMPKAKYPLMFATMLMCISPKSGSFDQSWEKLDQDTQNPSQHPMPRGLRDMHYKHSEEITGGGLIDNPFQMPHQIAQQNYMPKGLAGRRYYYPKDNENERKLGAQYLKLHRFIYNEDYHE >CP032751.1|AYJ35346.1|1282650_1283964_-|glycosyltransferase MEIMQTLKPFESIWNFVLLLLVSYPILGAFAWFIGVLCYQLIYRHRHKADIEFKQLTPEAQPFITIMIPAHNEEVMIEHTINYLMNNLNYEKYEVLVTDDGSTDETPAILERLQNVYDNLRVVTIKKNQGKAHAFNVGVGFARGEFILSNDADSIPEPDALWKYMSYFMGEEHANTAAVTANMDVQNRSTIIAKSQTVEFSSIVGVIKRSQVSALGNMYAYSGANTMYRRDALIDVGLFRQDRATEDISIAWDHQLNGWTTVFSPDILFYMNVPENLDALYHQRKRWAKGGTEVLLTNFKRVASHPGKYLKQWAFITDQTLSIIWSLFFFVSTLIFLISLITFFFTGNYERVYHMFCMAFIFVTFEMFAGVLQLLSALIVDDRGRKFKYLIFMPLYMLIYWQVNALALVTTLVPAVKTILGYGSGTWVSPVRKHHTE >CP032751.1|AYJ35347.1|1283967_1284450_-|hypothetical-protein MEKKDVMKQYVTDKYFSKGHWWTKLWQTLVAIITWICVAVPVYWTISSTLLANNPQFIHAWKYEEGKTLFYFFDRFFIIAFILIAIVVIVSTIHNNHRVKQHISKERQYDEDQLDIRKRQLNNFYTQRFGQATFRQHVKHYTVDPEQNLDVNEIHRLYED >CP032751.1|AYJ35348.1|1285090_1285621_+|YqeG-family-HAD-IIIA-type-phosphatase MIKQFKPTWMIPAIYNVTPAQLRAQGIKAVFTDLDNTLIAWDNPDGTPELKKWLHALQDAGIPLVVVSNNSEARIAKALQSLELPFVSRSLKPLPLGISKARHDLGLHKNEVVMVGDQYITDMWAAHLAGVPSILVQPIVKTDAWNTRINRFFERFIKLRLAHVYPEMHFQEDLNK >CP032751.1|AYJ35349.1|1285617_1286754_+|ribosome-biogenesis-GTPase-YqeH MSETSEETLYCIGCGAAIQTADPKAAGYTPNSALQKSLASDAQDLYCQRCFRLRHYNEIVPVGLTDDDFRHLLATIRDANALVVYVVDIFDLNGSIIPGLQRFVGDNPVLLVGNKEDVLPRQLRRTKLREWMNQQVRAQGIKPVDVALTSAKKGHSIDELLAMIEKYRRGRDVYVVGVTNVGKSTLINRIIANNTGLKDLITTSRFPGTTLDKIEIPLDDGHMMVDTPGIIHPEQMAHVLSGDDLKLVSPQREIRPKGFQLGNGQTLFLGGVARLDIVDTLKATGTVYVDNNLTLHRTRTENADNFYTKHVGELITPPTGDAVADFPPLVRHEFKVTEISDIVFEGLGWVTVAADTRVAAWAPKGVAVLTRPAMINKR >CP032751.1|AYJ35350.1|1286824_1287139_+|ribosome-assembly-RNA-binding-protein-YhbY MENLRGKQKHYLRGEAHHMRPLFAVGKNGLTDEWLTQLTGALDKRELIKVNILQNADVTTAEVKAAIEQKTAITVVQTIGRVLVLYLPASHEEDQHYSLEVAKL >CP032751.1|AYJ35351.1|1287151_1287787_+|nicotinate-nucleotide-adenylyltransferase MQTVNQTATKVLTETVTAILHRRVGILGGTFNPPHLGHLIMAQQVGDQLGLDEVRFMPDAQPPHVDEKKTIAVEDRANMVQEAIVDNPLFRLETAEIERGGKSYTYETMKFLKAKHPDTQYYFIIGGDMVDYLHTWYHIDELVKLVTFVGIKRTGYPTTSQYPVIWVDAPLIDISSTQIRQKISHGHSVRYLVPEAVAAYIKEHHLYEQND >CP032751.1|AYJ35352.1|1287770_1288388_+|HDIG-domain-containing-protein MSKTIEYTEAIVPYRHEELMAKVAAQLTDKRYQHCLRVEETARQLAADNGVDVELAGIAGLLHDYAKQRDDQTFIQLIKTRGMDPDLVSYGNGVWHGYVGAELIKDELHIYNEPILNAVRLHTVGAPYMTKLDQIIFMADFIEPARDFPGVEAAREATAKSLADGVRFQIQHTLDYLIQKGAPVYPQTLATYNAWVGGVDPQFAN >CP032751.1|AYJ35353.1|1288405_1288762_+|ribosome-silencing-factor MDSKELLQLTVEAADDKRADDIVALDVAEVSLMADYFVILSADSKRQVQAIADNIVDFVRKAGSDVKSVEGRTAGEWVLIDAGDVIVHVFQKDARAHYNLEKLWSDAPIVDVAQWVNA >CP032751.1|AYJ35354.1|1288758_1289493_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MIYQTFAELYDELFDPAMYQQWLDFVRREYPNQDGQLLELACGTGRLGVLLAQAGYQVTGLDLSENMLALAQRHADEAAVTLPLLQGDMLDLSEIGTFDAVTCFADSFCYLPDITTVQRAFEQVAQHLTAAGEFLFDVITPYQTDEVYPGYMYNYRDEDRAFMWTSYAGEQPHSAEHDLTFFIYNDDKQAFDEVSELHQEQTYVLADYQQALQAAGFNHVTVSADFGRQQPDDQTTRWFFKCRK >CP032751.1|AYJ35355.1|1289506_1290658_+|nucleotidyltransferase MQAVGLITEYNPLHNGHRYHLQQAQQLTNADCVVVVMSGNWLQRGEPAILDKWTRAKLALENGADLVIELPVFFATQPAHLFARGGIELLSALDCTSVVFGAEHPELDFQRLATAIAARQGSFTHYNATFATQFNAALQAATGVTLTAANDMLSFCYYAANQTLAHPMQLLPIKRRQADHATTTIAADSRYASGTAVRQAALAQDWAALKPVVPADTFTALTTQRLQRWSDFWPFLQYQLLTVDVARSGQYDQMAEGLEYRMQAMAQHATTFDDFIHQVKSKRYTYTRLQRVATAALLQLNQIEIQNAQAHNYLRVLGFTPKGQAYLHQVKKQLPLPLYTKINQDLRQHALNLDYRAGRVYQLINGQSQDLYRRPWRLPATIG |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP032751_1 | 1.4|1268328|33|CP032751|CRISPRCasFinder | 1268328-1268360 | 33 | NC_004305 | Lactobacillus phage phig1e, complete genome | 3112-3144 | 1 | 0.97 |
| CP032751_1 | 1.4|1268328|33|CP032751|CRISPRCasFinder | 1268328-1268360 | 33 | X98106 | Lactobacillus bacteriophage phig1e complete genomic DNA | 3112-3144 | 1 | 0.97 |
| CP032751_1 | 1.4|1268328|33|CP032751|CRISPRCasFinder | 1268328-1268360 | 33 | X90510 | Lactobacillus bacteriophage phig1e DNA for Rorf49, Lorf49, Lorf132, Lorf143, Lorf304, Lorf66, Int, and Rorf192 genes | 3111-3143 | 1 | 0.97 |
| CP032751_1 | 1.7|1268329|31|CP032751|PILER-CR | 1268329-1268359 | 31 | NC_004305 | Lactobacillus phage phig1e, complete genome | 3112-3142 | 1 | 0.968 |
| CP032751_1 | 1.7|1268329|31|CP032751|PILER-CR | 1268329-1268359 | 31 | X98106 | Lactobacillus bacteriophage phig1e complete genomic DNA | 3112-3142 | 1 | 0.968 |
| CP032751_1 | 1.7|1268329|31|CP032751|PILER-CR | 1268329-1268359 | 31 | X90510 | Lactobacillus bacteriophage phig1e DNA for Rorf49, Lorf49, Lorf132, Lorf143, Lorf304, Lorf66, Int, and Rorf192 genes | 3111-3141 | 1 | 0.968 |
| CP032751_2 | 2.5|1271133|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1271133-1271165 | 33 | NZ_CP018210 | Lactobacillus plantarum strain BLS41 plasmid pLPBLS41_1, complete sequence | 30982-31014 | 1 | 0.97 |
| CP032751_2 | 2.4|1271072|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1271072-1271104 | 33 | NZ_CP024415 | Lactobacillus plantarum strain ATCC 8014 plasmid pLP39, complete sequence | 13728-13760 | 2 | 0.939 |
| CP032751_2 | 2.4|1271072|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1271072-1271104 | 33 | NZ_CP018210 | Lactobacillus plantarum strain BLS41 plasmid pLPBLS41_1, complete sequence | 32297-32329 | 2 | 0.939 |
| CP032751_2 | 2.4|1271072|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1271072-1271104 | 33 | MG788324 | Lactobacillus phage PM411, complete genome | 35798-35830 | 2 | 0.939 |
| CP032751_2 | 2.5|1271133|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1271133-1271165 | 33 | NZ_CP024415 | Lactobacillus plantarum strain ATCC 8014 plasmid pLP39, complete sequence | 12490-12522 | 2 | 0.939 |
| CP032751_2 | 2.5|1271133|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1271133-1271165 | 33 | MG788324 | Lactobacillus phage PM411, complete genome | 37333-37365 | 2 | 0.939 |
| CP032751_1 | 1.7|1268329|31|CP032751|PILER-CR | 1268329-1268359 | 31 | NZ_CP009975 | Pseudomonas putida S12 plasmid pTTS12, complete sequence | 520756-520786 | 6 | 0.806 |
| CP032751_1 | 1.3|1268267|33|CP032751|CRISPRCasFinder | 1268267-1268299 | 33 | MH593835 | Microviridae sp. isolate ctbf9, complete genome | 1011-1043 | 7 | 0.788 |
| CP032751_2 | 2.5|1271133|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1271133-1271165 | 33 | AP013643 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C42-MedDCM-OCT-S38-C173, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 8703-8735 | 7 | 0.788 |
| CP032751_2 | 2.5|1271133|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1271133-1271165 | 33 | AP013387 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G15, isolate: uvMED-CGR-C42-MedDCM-OCT-S29-C52 | 22403-22435 | 7 | 0.788 |
| CP032751_2 | 2.5|1271133|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1271133-1271165 | 33 | AP013642 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C42-MedDCM-OCT-S37-C124, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 7216-7248 | 7 | 0.788 |
| CP032751_3 | 3.4|1273678|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT | 1273678-1273710 | 33 | NZ_CP038446 | Aeromonas media strain R25-3 plasmid pAeme3, complete sequence | 159742-159774 | 7 | 0.788 |
| CP032751_3 | 3.4|1273678|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT | 1273678-1273710 | 33 | NZ_CP034714 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Mikawasima strain RSE15 plasmid pRSE15, complete sequence | 25228-25260 | 7 | 0.788 |
| CP032751_3 | 3.4|1273678|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT | 1273678-1273710 | 33 | NZ_CP038449 | Aeromonas media strain R50-22 plasmid pAeme5, complete sequence | 101866-101898 | 7 | 0.788 |
| CP032751_3 | 3.4|1273678|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT | 1273678-1273710 | 33 | NZ_MG550958 | Escherichia coli strain G3216 plasmid pG3216.2, complete sequence | 57284-57316 | 7 | 0.788 |
| CP032751_3 | 3.4|1273678|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT | 1273678-1273710 | 33 | NZ_MH325469 | Enterobacter hormaechei strain Ec13 plasmid pEc13, complete sequence | 129989-130021 | 7 | 0.788 |
| CP032751_3 | 3.4|1273678|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT | 1273678-1273710 | 33 | NZ_MH325468 | Enterobacter hormaechei strain Ec09 plasmid pEc09, complete sequence | 47671-47703 | 7 | 0.788 |
| CP032751_3 | 3.4|1273678|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT | 1273678-1273710 | 33 | NZ_MG053108 | Citrobacter freundii strain 33587 plasmid pCf587, complete sequence | 25658-25690 | 7 | 0.788 |
| CP032751_3 | 3.8|1273680|33|CP032751|PILER-CR | 1273680-1273712 | 33 | NZ_CP038446 | Aeromonas media strain R25-3 plasmid pAeme3, complete sequence | 159742-159774 | 7 | 0.788 |
| CP032751_3 | 3.8|1273680|33|CP032751|PILER-CR | 1273680-1273712 | 33 | NZ_CP034714 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Mikawasima strain RSE15 plasmid pRSE15, complete sequence | 25228-25260 | 7 | 0.788 |
| CP032751_3 | 3.8|1273680|33|CP032751|PILER-CR | 1273680-1273712 | 33 | NZ_CP038449 | Aeromonas media strain R50-22 plasmid pAeme5, complete sequence | 101866-101898 | 7 | 0.788 |
| CP032751_3 | 3.8|1273680|33|CP032751|PILER-CR | 1273680-1273712 | 33 | NZ_MG550958 | Escherichia coli strain G3216 plasmid pG3216.2, complete sequence | 57284-57316 | 7 | 0.788 |
| CP032751_3 | 3.8|1273680|33|CP032751|PILER-CR | 1273680-1273712 | 33 | NZ_MH325469 | Enterobacter hormaechei strain Ec13 plasmid pEc13, complete sequence | 129989-130021 | 7 | 0.788 |
| CP032751_3 | 3.8|1273680|33|CP032751|PILER-CR | 1273680-1273712 | 33 | NZ_MH325468 | Enterobacter hormaechei strain Ec09 plasmid pEc09, complete sequence | 47671-47703 | 7 | 0.788 |
| CP032751_3 | 3.8|1273680|33|CP032751|PILER-CR | 1273680-1273712 | 33 | NZ_MG053108 | Citrobacter freundii strain 33587 plasmid pCf587, complete sequence | 25658-25690 | 7 | 0.788 |
| CP032751_1 | 1.6|1268268|31|CP032751|PILER-CR | 1268268-1268298 | 31 | MH593835 | Microviridae sp. isolate ctbf9, complete genome | 1011-1041 | 8 | 0.742 |
| CP032751_2 | 2.5|1271133|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1271133-1271165 | 33 | MK448724 | Streptococcus phage Javan273, complete genome | 21243-21275 | 8 | 0.758 |
| CP032751_2 | 2.5|1271133|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1271133-1271165 | 33 | MG945859 | UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 17180-1502, complete genome | 4649-4681 | 8 | 0.758 |
| CP032751_4 | 4.3|1282269|33|CP032751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1282269-1282301 | 33 | NC_041936 | Escherichia phage ECD7, complete genome | 97835-97867 | 8 | 0.758 |
| CP032751_4 | 4.3|1282269|33|CP032751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1282269-1282301 | 33 | MN882349 | Escherichia virus Ec_Makalu_003, complete genome | 95154-95186 | 8 | 0.758 |
| CP032751_1 | 1.6|1268268|31|CP032751|PILER-CR | 1268268-1268298 | 31 | NC_019777 | Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence | 47690-47720 | 9 | 0.71 |
| CP032751_2 | 2.5|1271133|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1271133-1271165 | 33 | NZ_CP021170 | Paenibacillus bovis strain BD3526 plasmid unnamed1, complete sequence | 119494-119526 | 9 | 0.727 |
| CP032751_2 | 2.5|1271133|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1271133-1271165 | 33 | LC513943 | Enterococcus phage vB_EfaS-DELF1 DNA, complete genome | 23122-23154 | 9 | 0.727 |
| CP032751_2 | 2.5|1271133|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1271133-1271165 | 33 | NC_048797 | Bacillus phage vB_BmeM-Goe8, complete genome | 37393-37425 | 9 | 0.727 |
| CP032751_3 | 3.4|1273678|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT | 1273678-1273710 | 33 | CP024689 | Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-5-125K, complete sequence | 2243-2275 | 9 | 0.727 |
| CP032751_3 | 3.8|1273680|33|CP032751|PILER-CR | 1273680-1273712 | 33 | CP024689 | Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-5-125K, complete sequence | 2243-2275 | 9 | 0.727 |
| CP032751_4 | 4.3|1282269|33|CP032751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1282269-1282301 | 33 | MN655998 | Escherichia phage E26, complete genome | 94903-94935 | 9 | 0.727 |
| CP032751_4 | 4.3|1282269|33|CP032751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1282269-1282301 | 33 | MT764208 | Escherichia phage JEP8, complete genome | 9364-9396 | 9 | 0.727 |
| CP032751_4 | 4.3|1282269|33|CP032751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1282269-1282301 | 33 | MK327941 | Escherichia phage vB_EcoM_G37-3, complete genome | 96619-96651 | 9 | 0.727 |
| CP032751_4 | 4.3|1282269|33|CP032751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1282269-1282301 | 33 | HQ634190 | Cyanophage Syn2 genomic sequence | 116423-116455 | 9 | 0.727 |
| CP032751_4 | 4.3|1282269|33|CP032751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1282269-1282301 | 33 | AY343333 | Enterobacteria phage RB49, complete genome | 93841-93873 | 9 | 0.727 |
| CP032751_4 | 4.3|1282269|33|CP032751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1282269-1282301 | 33 | NC_015286 | Synechococcus phage Syn19, complete genome | 7084-7116 | 9 | 0.727 |
| CP032751_3 | 3.4|1273678|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT | 1273678-1273710 | 33 | NZ_CP015355 | Bacillus thuringiensis strain MYBT18246 plasmid p109822, complete sequence | 82163-82195 | 10 | 0.697 |
| CP032751_3 | 3.4|1273678|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT | 1273678-1273710 | 33 | NC_022782 | Bacillus toyonensis BCT-7112 plasmid pBCT77, complete sequence | 52783-52815 | 10 | 0.697 |
| CP032751_3 | 3.8|1273680|33|CP032751|PILER-CR | 1273680-1273712 | 33 | NZ_CP015355 | Bacillus thuringiensis strain MYBT18246 plasmid p109822, complete sequence | 82163-82195 | 10 | 0.697 |
| CP032751_3 | 3.8|1273680|33|CP032751|PILER-CR | 1273680-1273712 | 33 | NC_022782 | Bacillus toyonensis BCT-7112 plasmid pBCT77, complete sequence | 52783-52815 | 10 | 0.697 |
| CP032751_2 | 2.3|1271010|34|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1271010-1271043 | 34 | CP022016 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar India str. SA20085604 plasmid unnamed1, complete sequence | 442810-442843 | 11 | 0.676 |
1. spacer 1.4|1268328|33|CP032751|CRISPRCasFinder matches to NC_004305 (Lactobacillus phage phig1e, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
cgttgaaactaccgatgaaagttttgccgcata CRISPR spacer cgttgaaaccaccgatgaaagttttgccgcata Protospacer *********.***********************
2. spacer 1.4|1268328|33|CP032751|CRISPRCasFinder matches to X98106 (Lactobacillus bacteriophage phig1e complete genomic DNA) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
cgttgaaactaccgatgaaagttttgccgcata CRISPR spacer cgttgaaaccaccgatgaaagttttgccgcata Protospacer *********.***********************
3. spacer 1.4|1268328|33|CP032751|CRISPRCasFinder matches to X90510 (Lactobacillus bacteriophage phig1e DNA for Rorf49, Lorf49, Lorf132, Lorf143, Lorf304, Lorf66, Int, and Rorf192 genes) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
cgttgaaactaccgatgaaagttttgccgcata CRISPR spacer cgttgaaaccaccgatgaaagttttgccgcata Protospacer *********.***********************
4. spacer 1.7|1268329|31|CP032751|PILER-CR matches to NC_004305 (Lactobacillus phage phig1e, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.968
cgttgaaactaccgatgaaagttttgccgca CRISPR spacer cgttgaaaccaccgatgaaagttttgccgca Protospacer *********.*********************
5. spacer 1.7|1268329|31|CP032751|PILER-CR matches to X98106 (Lactobacillus bacteriophage phig1e complete genomic DNA) position: , mismatch: 1, identity: 0.968
cgttgaaactaccgatgaaagttttgccgca CRISPR spacer cgttgaaaccaccgatgaaagttttgccgca Protospacer *********.*********************
6. spacer 1.7|1268329|31|CP032751|PILER-CR matches to X90510 (Lactobacillus bacteriophage phig1e DNA for Rorf49, Lorf49, Lorf132, Lorf143, Lorf304, Lorf66, Int, and Rorf192 genes) position: , mismatch: 1, identity: 0.968
cgttgaaactaccgatgaaagttttgccgca CRISPR spacer cgttgaaaccaccgatgaaagttttgccgca Protospacer *********.*********************
7. spacer 2.5|1271133|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP018210 (Lactobacillus plantarum strain BLS41 plasmid pLPBLS41_1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
tgaaaggaggaataacaaatggcagatgaagta CRISPR spacer tgaaaggaggaataataaatggcagatgaagta Protospacer ***************.*****************
8. spacer 2.4|1271072|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP024415 (Lactobacillus plantarum strain ATCC 8014 plasmid pLP39, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
ccgtggtaacacgaaattgtatgacacaaatta CRISPR spacer ccgcggtaacactaaattgtatgacacaaatta Protospacer ***.******** ********************
9. spacer 2.4|1271072|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP018210 (Lactobacillus plantarum strain BLS41 plasmid pLPBLS41_1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
ccgtggtaacacgaaattgtatgacacaaatta CRISPR spacer ccgcggtaacactaaattgtatgacacaaatta Protospacer ***.******** ********************
10. spacer 2.4|1271072|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG788324 (Lactobacillus phage PM411, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
ccgtggtaacacgaaattgtatgacacaaatta CRISPR spacer ccgaggcaacacgaaattgtatgacacaaatta Protospacer *** **.**************************
11. spacer 2.5|1271133|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP024415 (Lactobacillus plantarum strain ATCC 8014 plasmid pLP39, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tgaaaggaggaataacaaatggcagatgaagta CRISPR spacer tgaagggaggaataataaatggcagatgaagta Protospacer ****.**********.*****************
12. spacer 2.5|1271133|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG788324 (Lactobacillus phage PM411, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tgaaaggaggaataacaaatggcagatgaagta CRISPR spacer tgaagggaggaataataaatggcagatgaagta Protospacer ****.**********.*****************
13. spacer 1.7|1268329|31|CP032751|PILER-CR matches to NZ_CP009975 (Pseudomonas putida S12 plasmid pTTS12, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
--cgttgaaactaccgatgaaagttttgccgca CRISPR spacer ggcgctg--gctgccgatgaaagtgttgccgca Protospacer **.** .**.*********** ********
14. spacer 1.3|1268267|33|CP032751|CRISPRCasFinder matches to MH593835 (Microviridae sp. isolate ctbf9, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
tactctcaataatcgtgaccttttc---cccgattg CRISPR spacer gactctgaatagtcgtgaccttttcggtcctga--- Protospacer ***** ****.************* **.**
15. spacer 2.5|1271133|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AP013643 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C42-MedDCM-OCT-S38-C173, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
tgaaaggaggaataacaaatggcagatgaagta CRISPR spacer accaaggagtaataacaaatggctgatgatata Protospacer ****** ************* ***** .**
16. spacer 2.5|1271133|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AP013387 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G15, isolate: uvMED-CGR-C42-MedDCM-OCT-S29-C52) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
tgaaaggaggaataacaaatggcagatgaagta CRISPR spacer accaaggagtaataacaaatggctgatgatata Protospacer ****** ************* ***** .**
17. spacer 2.5|1271133|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AP013642 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C42-MedDCM-OCT-S37-C124, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
tgaaaggaggaataacaaatggcagatgaagta CRISPR spacer accaaggagtaataacaaatggctgatgatata Protospacer ****** ************* ***** .**
18. spacer 3.4|1273678|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP038446 (Aeromonas media strain R25-3 plasmid pAeme3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
attgccctagctattttttatctattcgacata CRISPR spacer tttgggtgagctattttttatctgttccacata Protospacer *** . ***************.*** *****
19. spacer 3.4|1273678|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP034714 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Mikawasima strain RSE15 plasmid pRSE15, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
attgccctagctattttttatctattcgacata CRISPR spacer cttgggtgagctattttttatctgttccacata Protospacer *** . ***************.*** *****
20. spacer 3.4|1273678|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP038449 (Aeromonas media strain R50-22 plasmid pAeme5, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
attgccctagctattttttatctattcgacata CRISPR spacer tttgggtgagctattttttatctgttccacata Protospacer *** . ***************.*** *****
21. spacer 3.4|1273678|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG550958 (Escherichia coli strain G3216 plasmid pG3216.2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
attgccctagctattttttatctattcgacata CRISPR spacer cttgggtgagctattttttatctgttccacata Protospacer *** . ***************.*** *****
22. spacer 3.4|1273678|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MH325469 (Enterobacter hormaechei strain Ec13 plasmid pEc13, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
attgccctagctattttttatctattcgacata CRISPR spacer cttgggtgagctattttttatctgttccacata Protospacer *** . ***************.*** *****
23. spacer 3.4|1273678|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MH325468 (Enterobacter hormaechei strain Ec09 plasmid pEc09, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
attgccctagctattttttatctattcgacata CRISPR spacer cttgggtgagctattttttatctgttccacata Protospacer *** . ***************.*** *****
24. spacer 3.4|1273678|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG053108 (Citrobacter freundii strain 33587 plasmid pCf587, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
attgccctagctattttttatctattcgacata CRISPR spacer cttgggtgagctattttttatctgttccacata Protospacer *** . ***************.*** *****
25. spacer 3.8|1273680|33|CP032751|PILER-CR matches to NZ_CP038446 (Aeromonas media strain R25-3 plasmid pAeme3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
attgccctagctattttttatctattcgacata CRISPR spacer tttgggtgagctattttttatctgttccacata Protospacer *** . ***************.*** *****
26. spacer 3.8|1273680|33|CP032751|PILER-CR matches to NZ_CP034714 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Mikawasima strain RSE15 plasmid pRSE15, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
attgccctagctattttttatctattcgacata CRISPR spacer cttgggtgagctattttttatctgttccacata Protospacer *** . ***************.*** *****
27. spacer 3.8|1273680|33|CP032751|PILER-CR matches to NZ_CP038449 (Aeromonas media strain R50-22 plasmid pAeme5, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
attgccctagctattttttatctattcgacata CRISPR spacer tttgggtgagctattttttatctgttccacata Protospacer *** . ***************.*** *****
28. spacer 3.8|1273680|33|CP032751|PILER-CR matches to NZ_MG550958 (Escherichia coli strain G3216 plasmid pG3216.2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
attgccctagctattttttatctattcgacata CRISPR spacer cttgggtgagctattttttatctgttccacata Protospacer *** . ***************.*** *****
29. spacer 3.8|1273680|33|CP032751|PILER-CR matches to NZ_MH325469 (Enterobacter hormaechei strain Ec13 plasmid pEc13, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
attgccctagctattttttatctattcgacata CRISPR spacer cttgggtgagctattttttatctgttccacata Protospacer *** . ***************.*** *****
30. spacer 3.8|1273680|33|CP032751|PILER-CR matches to NZ_MH325468 (Enterobacter hormaechei strain Ec09 plasmid pEc09, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
attgccctagctattttttatctattcgacata CRISPR spacer cttgggtgagctattttttatctgttccacata Protospacer *** . ***************.*** *****
31. spacer 3.8|1273680|33|CP032751|PILER-CR matches to NZ_MG053108 (Citrobacter freundii strain 33587 plasmid pCf587, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
attgccctagctattttttatctattcgacata CRISPR spacer cttgggtgagctattttttatctgttccacata Protospacer *** . ***************.*** *****
32. spacer 1.6|1268268|31|CP032751|PILER-CR matches to MH593835 (Microviridae sp. isolate ctbf9, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tactctcaataatcgtgaccttttccccgat CRISPR spacer gactctgaatagtcgtgaccttttcggtcct Protospacer ***** ****.************* . *
33. spacer 2.5|1271133|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448724 (Streptococcus phage Javan273, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
tgaaaggaggaataacaaatggcagatgaagta CRISPR spacer tgaaaggaataataacaaatggcagaagctaat Protospacer ********. **************** * .
34. spacer 2.5|1271133|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG945859 (UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 17180-1502, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
tgaaaggaggaataacaaatggcagatgaagta CRISPR spacer aaaaaggagtaataaaaaatggcagatatattt Protospacer .******* ***** ***********. * *
35. spacer 4.3|1282269|33|CP032751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_041936 (Escherichia phage ECD7, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
cacattcccagaaactggtattgcaagtgaacc CRISPR spacer caccttcgcagaaactggtattgcatatctgca Protospacer *** *** ***************** .* .*
36. spacer 4.3|1282269|33|CP032751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN882349 (Escherichia virus Ec_Makalu_003, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
cacattcccagaaactggtattgcaagtgaacc CRISPR spacer cacattcgcagaaactggcattgcatatctgca Protospacer ******* **********.****** .* .*
37. spacer 1.6|1268268|31|CP032751|PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
tactctcaataatcgtgaccttttccccgat CRISPR spacer tttcatcaataatcgtgaccattaccccacg Protospacer * .. *************** ** ****.
38. spacer 2.5|1271133|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP021170 (Paenibacillus bovis strain BD3526 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
tgaaaggaggaataacaaatggcagatgaagta CRISPR spacer ccaaaggaggaatataaaatggcagaatatgat Protospacer . ************ ********** * *
39. spacer 2.5|1271133|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LC513943 (Enterococcus phage vB_EfaS-DELF1 DNA, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
tgaaaggaggaataacaaatggcagatgaagta CRISPR spacer ctaaaggaggaaaaacaaatgacagacttaatt Protospacer . ********** ********.****. *.*
40. spacer 2.5|1271133|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_048797 (Bacillus phage vB_BmeM-Goe8, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
tgaaaggaggaataacaaatggcagatgaagta CRISPR spacer ctaaaggaggggtaacaaatggcagaaaaaccg Protospacer . ********..************** .** ..
41. spacer 3.4|1273678|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP024689 (Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-5-125K, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
attgccctagctattttttatctattcgacata CRISPR spacer attgccctagttattttttctctacttaccccc Protospacer **********.******** ****.*.. * .
42. spacer 3.8|1273680|33|CP032751|PILER-CR matches to CP024689 (Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-5-125K, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
attgccctagctattttttatctattcgacata CRISPR spacer attgccctagttattttttctctacttaccccc Protospacer **********.******** ****.*.. * .
43. spacer 4.3|1282269|33|CP032751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN655998 (Escherichia phage E26, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
cacattcccagaaactggtattgcaagtgaacc CRISPR spacer caccttcgcagaaactggtattgcttatctgca Protospacer *** *** **************** .* .*
44. spacer 4.3|1282269|33|CP032751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT764208 (Escherichia phage JEP8, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
cacattcccagaaactggtattgcaagtgaacc CRISPR spacer caccttcgcagaaactggtattgcttatctgca Protospacer *** *** **************** .* .*
45. spacer 4.3|1282269|33|CP032751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK327941 (Escherichia phage vB_EcoM_G37-3, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
cacattcccagaaactggtattgcaagtgaacc CRISPR spacer caccttcgcagaaactggtattgcgtatctgca Protospacer *** *** ****************. .* .*
46. spacer 4.3|1282269|33|CP032751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HQ634190 (Cyanophage Syn2 genomic sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
cacattcccagaaactggtattgcaagtgaacc CRISPR spacer aacgaatccagaaactggtgttgaaagtgaagt Protospacer **. .************.*** ******* .
47. spacer 4.3|1282269|33|CP032751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY343333 (Enterobacteria phage RB49, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
cacattcccagaaactggtattgcaagtgaacc CRISPR spacer caccttcgcagaaactggtattgcttatctgca Protospacer *** *** **************** .* .*
48. spacer 4.3|1282269|33|CP032751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_015286 (Synechococcus phage Syn19, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
cacattcccagaaactggtattgcaagtgaacc CRISPR spacer aacgaatccagaaactggtgttgaaagtgaagt Protospacer **. .************.*** ******* .
49. spacer 3.4|1273678|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015355 (Bacillus thuringiensis strain MYBT18246 plasmid p109822, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
attgccctagctattttttatctattcgacata CRISPR spacer attgccctagttattttttctctacttactccc Protospacer **********.******** ****.*.. . .
50. spacer 3.4|1273678|33|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_022782 (Bacillus toyonensis BCT-7112 plasmid pBCT77, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
attgccctagctattttttatctattcgacata CRISPR spacer attgccctagttattttttctctacttactccc Protospacer **********.******** ****.*.. . .
51. spacer 3.8|1273680|33|CP032751|PILER-CR matches to NZ_CP015355 (Bacillus thuringiensis strain MYBT18246 plasmid p109822, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
attgccctagctattttttatctattcgacata CRISPR spacer attgccctagttattttttctctacttactccc Protospacer **********.******** ****.*.. . .
52. spacer 3.8|1273680|33|CP032751|PILER-CR matches to NC_022782 (Bacillus toyonensis BCT-7112 plasmid pBCT77, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
attgccctagctattttttatctattcgacata CRISPR spacer attgccctagttattttttctctacttactccc Protospacer **********.******** ****.*.. . .
53. spacer 2.3|1271010|34|CP032751|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP022016 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar India str. SA20085604 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
gcccttagtaaacgtaaccgtaccagcgtctagg CRISPR spacer ttaaacagtaaacctaacggtaccagcgtcagcg Protospacer . .******* **** *********** . *
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
335408 : 395059
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP032751|335408:395059|DBSCAN-SWA GTCAAATCAAGCGCAACTTTTTGCCGAAGAAAACTTCACTTGGACTTTTCCATCCCAAGACCTTGCGTGGACGGTTATTTAAATCTGTGACGAATGCGATAATCTCTTGGTCATTTAAATCGTTCAAATCAGTTCCTTTGGGGAAATATTCACGAATTAAACCGTTAGTATTTTCATTGGTTCCACGTTGTTGTGGTGCGTGTGGATCTGGAAAAAATACCGGTATTTCTAAAGTGTCAATGACGTCTTGATAATTGGCAAACTCAGTTCCACGATCAGGTGTAAGTGTCTTTACCCGTTCCGGTGTGACGCTATTTAATAAGTCCATCATAGCTTGTGCCACGGGTTTAGCTGCGACTTTACTTACCCGTTCCGCTAATAAATACCGTGATTTACGGTCCACCAGCGTCACCAGCGCTGAACGTCCGGTTTTACCACGCACTGTGTCACCTTCCCAGTGACCAAACCGAGTTCTATTTTCAGCCGAAAGTGGGCGGTCGTGGATTGAAGGTACATCGTTAAAACGACCACGCCGTTCCTTGATAGTTCCCTTAACTTTGCGCGTTTTACCTCGATGTCTTAATTGGCGGGCGAATCCACGGGCACCATGACTTTTACGCTTTTCACCAAGATTATTCAAAGCAATTCCACGATAAATTGTGTTGTAACTGATTTTCCAGTTACTATGCTCAAAATTTAGCCGTCCTGCGATTTGTTCTGGGGACCATTTACGATGGACGATACAATTAATGACAAATGCCCGGATATCAGTTTGCGATAAGATCCGTGGCCGTCGACTTTTCAAACGTTGACGCTCATAATTTAGTTGCGCATTAACTGCGGAATATTTAGAACGACCACCATTCCGGCTAACTTCCCGTGAAATAGTCGCTTTAGAACAACCGATGCGTTGGGCAATGGCCTGGTAAGACTGTTTTAAAGTTAGCCCAACTAGTAGGCATTCACGGTCATTTAAGGTAAGATGATGATATAGGCTCATAGTCTGAGTCCTCCTTGTAAGTAAGTTGTGGTGACTATATTTTACAAGGACTCAGGCTGTGAGTCTTCTTTTTGATCATTTGTTGCACTTCAATTGTAAATTCGTCGGATAAAAAATCGAAACATAAGTGATGATTAAATGAGATAGCACCTCGAACGATGATGTCGTCCTGAGAGGTGCTATTTTTTTGCCCAAAAATCGATTTGAGAAGTACTGGTGTTTAGCCGTTTTAATCTAGCATTAAACGTGAACTGGGTTATTCGATAACGGAGGGGCATAATTAAAAAATCAGTTTGGCTCCTTGAGATATATCTAAAAGATATATATACTTAACAACGCGAAAGATTGGTGAGTTTAATGTATGAATTGTTTATTTTAGGACAGTTGATGGATCATCCGATGACGGGCTACCAGTTGCGTAAAGCGCTGGTAAACGTAGTCGGTTCAGAATTAACCATTAGTTTTGGCGCGTTGTACCCGTTGCTAGATAAGTTAGCCGCGGCTGAAGAATTAACACTGGCGTTTAAGCGGACCACTAATAAACGGCCACAAAAGTTAGCCACGATAACAGCGGCTGGTCGCACGCAATTTTGGCAGTTAGTTATGACGCCAGTCGCGCTCAACAAGCAAACGCAGTTAACGTTTCAAATAAAGCTGAATTTTTTACATTTATTAAGTCGTGATCAGCAGCAAGTAATCTTGTTGGATTTTCAGCAATTTGCACGGGGACAGGTCGCACGCTTAACGGCGCAGCACAAACGGGTGATGACGAATACCCACATGCTTGCCGCTGATATTCAAGATGCGTTGATGGTCAATGAGTTACAACGGGTACGAGCCCAAGCACAATTAGACTGGCTTGAACGCCAGTTGCACAATGGAGGGGAAGTTAAGGGATGAAAACAATGTCGTTTGTGACTGATCCACAAATTCAAAAGCATCGCTGGTGGATACTGGTTGCGGTATGTTTATTTACGTTCATGTCAACGTTAGATGGGAGTATTGTGAACATTGCCTTGCCAGTCATGAGTAAGGATTTAGCGATTCCAATGAATCAGGCAGAATGGGTCGTCTCAATTTATTTGATTGTGATTTGTGCGTTATTGTTATTATTTGGTAAATTAGGTGATATTTACGGTAAGATTCGGGTGTTTAAAATCGGGTCCTTACTATTCATTATTGGCTCGTTATTGTCAGGATTCAGTGTGGGGTTGCCATTTCTACTCATTGCACGCAGTATTCAAGCAGTCGGAGCGGCAATGACGATGAGTACGAACAACGGGATTATTACCGAAGTTTTCCCGTTTAAGGAACGGGGCCGGGCGCTAGGTATGATTGGCTCATTCGTTGCATTGGGGAGTATTGCTGGCCCCGGTATCGGTGGTTTGATCCTAGCTCATTTGAGCTGGGGCTATATTTTCTGGATCAACGTTCCGGTGGGAATCTTGGCGATGATTTTAGGTGCAATGATTTTGCCAAAAGACGTTACGACGACGCAACAACCATTGGATAAGACCGGGGCGGGGCTATTTGCCGTACTCATGGTTGCACTATTTGCAGGGGTGTTTATCGGGCAACAGATTGGGTTCTTGCAGCCGGTTATCTTAGCCTTGTTTGCAGTGGCAATTGTGACGCTGATTATTTTTGTTCGCGTCGAGTTGCGCCATGAAAATCCGCTGCTAGCGCTACAATTATTTAAGAATGCCCGTTTTAGCATTAGTATCTTATGTGCGTTATTAATTTTTATTGCGAACTTTTTCTTTAACGTGATTGCCCCGTTTTATTTAGAAAATGCTCGGGGGCTAGCGGCAAACTATGCGGGCTACGCCTTGATGGTATTCCCCATCGTACAAGTGGTGGTCGCCCCGATTGCTGGGACGATTTCTGACAAGATCGGGCCAGAATTGTTAACGTTCGTGGGATTGGTCCTGATTTCAATCAGTCAAGTGGGTTACATGGTTGTGGGGCTAGCAACACCACTTTGGTTCTTCTTATTATTCGTCGGATTAGTTGGATTTGGCAATGGTATCTTCATGGCACCTAATAATTCGATCGTGATGAGTTCAGTGGCGGTCAAGGACTTGGGCGTTGCTGGCGGGATTAACGCGTTGGCACGTGAATTAGGTATGATTGTTGGAATTTCGGTTGCCACGACCGTACTATATTCGGCAATGAGTCAATCAGCGGGGTATAAGGTTACGTCATACCTGCCAACTCACCCGGAGATCTTTATTGATGGTATGCACATTGCGTTCATGGTCTCGTTAGGGATTTGTTTAGTTGCGACGGTCATTACTGGCGGGCGGTTACTAAAACATCGACGCACGGCACCTGCCAAGTAAACATTAGTAAATCAAAAAACGTGTTGCGAGAAATCTGAGATGATTTCTTGCGACACGTTTTTATATTCTTGCATCCTTGATGTTGCTGAAATGGGGTCGTTAAATCAGGCTTGTTTTAAAGATCCAGGGCATAAGCTCACTGAAAAAAACTCGGATTAGCGCCGTTATGACGCCAAACTCGTCGTTTAATTCCCTAGTTAGGCTAATCCTCAGTCTTCTCCCGTCTGATTTATGCCCGCTTGTGATACTGAGCATTGATAGAAATGCCATGCGACTGCTTTCTCGAACGCACTGAAACCTGTGCATATTACGCCCATGATTCCGATTATCGGAATCGTTGTTGCTTATCTAGCAGTTGCGCTAACTGACCACGAAATTCATCGCTATGGTGTTGGATGCTCGTCAAGTCGTGACTCATTTGAACGGTGTAGTCAGCGACTTCGCCGTGTTCGCCTTGATCGAGTCCGAGTTCTTCCTCTTGTTCGTCAACGCGCATTCTGATGACTCGTTTCAATAGTACGATAATGACGATGCAAACGATGGTAGTAAAGCCAATGGTAAAGATCGTTGCTAATAGTTGTAATCCGAATAATTTAAAGCCGCCACCATAGAAAAGACCGTTTAGAGAAATTGTGCGATTAACGGCTTTGCTAGCGAATAGCCCAGTCATGATACTGCCGACCATGCCGGAAACACCGTGGCAGCCAAAGGCATCGAGTGCATCATCAATACCTAAGCGTGGTTTGATGAACGTAATGAAGCCGTAACTAGTTAATGTGGCGATAAGGCCAATCCAAAAGGCACCAGAAATGGTGACGTAGCCACAAGCAGGTGTAATCGCAACGAGACCACAAAGGGTACCGGTGCAGACGCCGACTAGGGTTGGTTTGCCCTTGGTTAGCATATCAACGACCATCCACGTCATCATGGAAGTGGCGGTGGCAACGGTCGTGGTTAAGAAGGCTTGGATGGCGATGTCGTTCATGGCAAGCGCCGAACCGGCGTTGAAACCGTACCAGCCAATCCATAAAATAGCGGTCCCCAGCAATACCCATAAGATGTTATAGTGCTGGGTCGCATCTTTGCCATACTTGTGGCGGGCACCTAAGAATGCTGATAAGACTAAAGCGGTGATACCGGCATTGATGTGGACGACGGTGCCACCAGCGAAGTCGATGACGCCGAGTTTAGCTAATAAACCGTTATCCCAAACCATATGAACCATTGGATAGTAGATGAGGAGTGACCAGAAGATGATGAAGGTTAATAAGAATTTAAAACGGATACGGCCGACCACCGCGCCAACAAATAGTGCCGGCGTGATGATGGCGAACATCATTTGAAAGATGAGATATAAACCGTTGGGAATCTTTGTTGCGGTAAGCGCGGTCAAGTCGACACCATGCAACCAAGTGGCTCTGAGATTACCGACAAAGCCACCTAAATCACCGGAAAAAGATAGTGAATAACCGAATGCGAGCCATAACAAGATTGCTAAGCCACAAATCATGAAGACGGATAACATGGTGTTAACGACATTCCGTTTGGAAACTAAGCCACCGTAGAAAAATGCTAATCCGGGCGTCATGAATAATACCAATATACTAGATAACACTAAAAACGTTGAATTTGCAGCGTTCATACTCCCAACCCCTATC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55 | Staphylococcus_phage(42.86%) | bacteriocin,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
587344 : 595967
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP032751|587344:595967|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP032751|587344:595967|587344_589042_+|AYJ34756.1|DBSCAN-SWA MYRALYRVWRPQRFDEIVGQQMITQTLKNAIMTHQTSHAYLFTGPRGTGKTSAAKIFAKAINCHHLVDGEPCNECETCTAITKGQLNDVIEIDAASNNGVEEIRDIRDKAKYAPTQADYKVYIIDEVHMLSTGAFNALLKTLEEPPANVIFILATTEPHKIPLTIISRTQRFDFRRITAKDSYDRMVYILNEKDVTYDEKALRVIAAAAEGGMRDALSILDQVISFGDNTVTLDDALMVTGSVTKQLLANYVSEVTDHDTKPALETMRQILQEGKDANRFIEDLISYTRDVLLYQQAPEMVDSVAMGEDDQQFEAFAKQIDAEVLYQMVKTLNDIQQQMRFTTHPDVYLEVLTVKLAQLDGQAAVQPVAAAAVNPEDPTVHKLAQQVEQLQSEVKTLRSQGGSVTKPAPAKPRSSNGPVVKKVNVSQIYPILGAATKNDLIKVRDVWTDLMNILSVTQRALMHVAQPVAASSEGVVVAFDYAFVYQKAIDDQTLIDALGNGLDRLMGQAPKIVCVPKEQWPQIRKDYLATHQPGGATSEQQAPAKEPVVEEAKNMFGDLVEVQPD >CP032751|587344:595967|594971_595967_+|AYJ34766.1|DBSCAN-SWA MSILVLGGAGYIGSHMVDRLVEHGTDVVVVDNLVTGHRAAVNSAAKFYQGDLRDADFLNHVFDTEDIEAVVHFAAFSIVPESMSKPLKYFDNNTGGMITLLETMQAHDVKQIVFSSTAATYGTPKQIPIKETDPQLPINPYGASKLMMEQIMHWADVAYGIKFVALRYFNVAGAKPDGSIGEDHGPETHLVPIILQVAQGKRDELKIFGDDYNTPDGTNVRDYVHVIDLADAHILALKYLAAGNDSNAFNLGSSTGFSNKQMLAAAREVTGQPIPAKLAPRRPGDPDSLVAASDKARDVLGWQPNYDNVNDIIETAWAWTQKHPNGYDDRD >CP032751|587344:595967|589387_589987_+|AYJ34758.1|DBSCAN-SWA MQYPEPIAKLIDSYMKLPGIGGKTATRLAFYTIDMNGDDVTEFAKSLIAAKRDLHFCSICGNITEDDPCVICKDKSRDQSTVLVVEEAKDVMAMEKIKEYNGLYHVLHGVLSPIDGKGPEDINIASLLKRLQQNEAIKEVIIATNATPEGEATAMYISRLVKPAGIKVTRLAHGLSVGSDIQYADEMTLFKAVEGRQEM >CP032751|587344:595967|591312_591642_+|AYJ34761.1|DBSCAN-SWA MKLIIAIVQDKDSNRLSSQFIEANVRATKLSTTGGFLRSGNTTFMIGIDDDRVDEVLAMIKETSHAREQFMTPPVNLDVTMDGAAAYPVEVQVGGATVFVLPIEQFYQF >CP032751|587344:595967|592702_593050_+|AYJ34763.1|DBSCAN-SWA MDKRDLYDSFGEMEQQMQQMLDKMAKLRADMTTVLEKNAELVIENEHLREHMVEIENELPKKAASTTTLSKSRQNLEKLYDEGFHVCNQFYGKRRDDDESCVFCLEVIYGERERA >CP032751|587344:595967|590650_591316_+|AYJ34760.1|DBSCAN-SWA MLTGKLVTFEGPDGAGKTSALNAIVAKLQPQLGDRLVVTREPGGNQISEAIRKIILDRHNTAMDDRTEALLYAAARRQHIVQTIQPALQNDQLVLCDRYIDSSVAYQGAGRGIGEQAVYDMNQFATAGLTADLTLYFDVDAAVGLNRIQQHRQNEINRLDVEALSFHHRVQAAYLRLLADHPDRIKRVDASQPLDQVVTQALEIIASQLPTYVASKGGEDQ >CP032751|587344:595967|589063_589372_+|AYJ34757.1|DBSCAN-SWA MMRGMGNMQSMMKQMKKMQAQMTAEQAALNEQTFTGAAPDDMVKVTFTGDKKMKDITINPDAVDPDDVDMLQDLVVAAVNDALTKVDEQTQSTMGKYTKGLQ >CP032751|587344:595967|590001_590253_+|AYJ34759.1|DBSCAN-SWA MFKRKQKIKHPKEVFDEQLLSTLNAAKLDWDRAKQNQEAVYDNNTSELVTQTALARAKYLYLYREARLRQVHGQTIQRSVIDK >CP032751|587344:595967|593147_594044_+|AYJ34764.1|DBSCAN-SWA METQQSFADHAGIGTLYLVPTPIGNLQDMTYRAVATLKTVDLIAAEDTRNTQKLLNHFEITTKQISFHEHNTQERIPQLIEKLQTGVNLAQVSDAGMPSISDPGKELVAACIAANIPVVPLPGANAGLTALIASGLVPQPFYFYGFLPRKKNEQKADLAKLARRHETVVLYESPFRVAKTLTLLATVCEGTRPIVACRELTKRYEEFARGTLAEMVTWAQDHQLKGEFVLLIGGNPDKDEPETTDELAQLPVKAQVEALIAAGDKPNVAIKTIAKRRNIPRQSVYNQFHELNTNDEES >CP032751|587344:595967|591658_592678_+|AYJ34762.1|DBSCAN-SWA MATTESFAQTLAAKQPRLLAAFKHIIAQNHLAHAYLFAGMEGAGQPELAHWIAQRLFCLHINDGEPDGTCEECVRIANGSHPDIVTVAPEGQRIHVDQVRYLKAEFSKSAVEGNRKLFIINDAEKMTASAANSLLKFIEEPSGNVTALLLTTNKQLMLPTIISRTQVIEFPPLNAQALQQTFEQAGIAPNQAQMLRGLTNSVTQAQALLADDWLPQAAQALWRWFDQAVKGDPRSFVAVQVNLVGLAKDADHQLVMLDLIAALFQDLLQLHFEVATTALTFGQYQKELAGLTAEVSDEQLIAATELALTAKRQLASNISFQNVLEGLTLKLWPIFQTNA >CP032751|587344:595967|594047_594833_+|AYJ34765.1|DBSCAN-SWA MATLGANASLYSEQHRITYYECDRTGRATLTTLIDIAVLASEDQSDALGLTTEMVQSHGVGWVVTQYAIDITRMPRQDEVVTIAVRGSAYNPYFAYREFWIRDADGQQLAYITSIWVMMSQTTRRIVKILPELVAPYQSEVVKRIPRLPRPISFEATDTTITKPYHVRFFDIDPNRHVNNAHYFDWLVDTLPATFLLQHDLVHVDVRYENEVKYGQTVTAHANILPSEVADQVTTSHLIEVDDEKCCEVTIQWRTLPEPIQ |
11 | Streptococcus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1015293 : 1067429
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP032751|1015293:1067429|DBSCAN-SWA 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>CP032751|1015293:1067429|1035946_1036495_+|AYJ35156.1|DBSCAN-SWA MAREAKGPKEGDFITIKSYKHDGSLHRTWRDTMVLKTSENVLIGCNDHTLVTEDDGRRWVTREPAIVYFHKHYWFNIVAMIRDNGVSYYCNLASPYVLDKEALKYIDYDLDVKVFPDGERRLLDVDEYEEHGAQWRYSADTDRILKANVKVLVDWIKNKKGPFSQDYIDIWYSRYQELSRRQ |
45 | Staphylococcus_phage(23.08%) | protease,transposase,integrase | attL 1005324:1005339|attR 1067605:1067620 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1201821 : 1211659
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP032751|1201821:1211659|DBSCAN-SWA TGTGGCACGTGACGGGACCGTCACAGAGACAAATGATTTAAAATTGCACGCATTAGGGGAGATTATCGGGATGAACGAACAAGAAGCATATGTAACGACATTTTATTGGCTCGCGGATTGTTGGTTGGAAACTAGCTATCTGGGACTTGAGGATGAATTTGACGACGATGAAATCGATGACGCCGTCAAGTCACTACTAAATCGGATGCAAGCCGGGGCAATTTATGAGGTAACGGCGGATGATCCAATGTGGCAAGCATGGAAGCGGGCAGTTAGGGCCGTGCTTACGCCCAATGATCATGCTGAACATGAAGTTGATGAGACCGACGGAGAGGATGAATTAGTGCTGCCAGCTGGAGTACGACCTGAACGTCAATTAGAAGAAGTTCAAGCCTATGCAGCGATGAATGCGTTTTTGCAGGCACAAGATCAGGAATATCTGCAAGAAATTGGTAAACGGGCGGCCACTCAGGTCAGTGGTGCCGGGTGGCAAGTGTGGCGTGCACATCGTCAGAGCATGCATCCGGAGTCTGCCGCCCCGTCGACGTTGACTGCTGAACAATTACCAGCCGTGATGTGGGCCTTTTTCGATAAGTACCAGGATACTGAGGACTCTTTTGAGATTTTTGAATTGGTTAACCAACTTGAACAATGGCAAAAAAGTGCTGATCGAGATTTGGACGCGCAATGGTCACAGCTGGTGGCGAAAAGTCAGATTGATCCGGCCGCAATTACGCCCATGCAGGGCTTGTCGTTAGCGATTGAGTTCTTCGATCAGCTTGAGTGGGACGGTGATTTGACTGCCAAGGCAACTTTGCAGAATAAATTGATGCAACGCACGCTCGATGACGCCCTCAATGATGAGACGACAGCCAACTGGACGGATGCCTGGCAACACTGGGATTTAGCAGATCCGTTGACAACTGAACAGTGGGCCCGACGGTTTGATCCGGCGGACGACTATGAAGACGAGAGTGAAGAAGATGGCGCGGCTCGGCCAGCTTGGCAACTTGGTGCGAGTTATAGTACCGTTTTGATTGCAATGCGCTTAGTCGCTTACGGTGTACTGCGGCCTGAGAGTGTGCCTGGTATGGCAACTGTGAAGATGGCGAACCGTGCACTGGCAGCCACCGTCAGTATTGGGATCGTGTTAGTCGCTTGGCTGGTCACAGCTATTCTGATTACAATTGTAATTTGGGGATGGCGGTGGATGCGTAAGCTGATTTTTTAGTGCAGCTGAACGGCTAACTGAATCACAATAGTGCCGATTGACTAGGCTGAAGTTTGTGAATCTAGTAGTTGAAGCTGAAAGGACGGGGCGTCAGTGGTAGTGCTTCATGATGGTTCGTAACTCGGACAGAAAGTCGGCATCTAAATGGGGCGATTGGCCTAATTGTAATGGTGCCAATGGCTGACATAACGTTGGTATGTCTGGCTTTAACGGCTGGTTATTGAAGTATTGCTGACCATGGATTTTGACGGTCGCTTTGAGCGTGCCAATCGTCATGACGGCCACGGCGGTATTTAAAAAGACGCCACCATTGAGACTAGTATATCCAGCGGAAGAACGCCCAACTAAAGTAACGTGCGGGTTACGTTTTAGCGCCATGATGGTCACCTCCGCGGCACTCGCTGTCTGGTTACCAATAATGGCATAAATATGACGAAAGTGGGCCGCCGTTGGTTGCGAAAAGTTAAAGTCATCTTGACCAAGTCCACCAGTGATGCGGCCATGGTACATCACACGCGGCCGGTTGCGATGATGGTTCGTGATGCCGGTGTAGAGGGTGCCGTCGGGAATGATGGTGGCCAGGCCAGCAATCATCGGTGCCGAACTACCACCAGTATTTGCTGCGAAGTTTAAGATTAAATCGGTTGTCGGCTTAGTTTGTTTAATCAGGTGCTGGAGTTGTGTCCAATACTGTTTTTGTAATTGGTGCTGACTGCTGTAAAATGCTGGCACATTGATGATGGTGAGGCCGGCACTCATTGTCTTGGTCGGACGGGTGGCATGTTCGACTTGGCGGAGATTGGCGACGGCGAATGAATGTAAATTTGCAGCGCGCAGAATTTGATTGAGTTGGGTCAGTGACGTGATTTTGCGACCATGATCAGTCGCATGCAGCATGGCTTGCCATTGCGTGCGATGGTTGATAATGCCATATTTTGACATGTAGGTGATGGCCGGCGTAGCGTTGAAGGACGCACGGAGCCGATTAGAAGCGGAAAGACCAAACGTTAGGACTATCGAAATTAGACCTACCAGTCCGTAACGGCATTTATTCGTTATCATGATAAGCCATCCTTACTTTTCGTGACTAGATTAGCATGTATTGGTTAGCTAAATTGTAGGCGTGGCGTCAAAATTTCGCAACGAAAAGCATATCTCAACTGATGCGTCTTTGAAATAATGGTTCCTGTTAAAATACCCATCTACATTGGCCGTCTTAACGGCTAAGTAGATGGGTATTTGTTGTATCATGAAATTGTTGACGATTGTGCCAGATCGGCTTCTAACTGGGTTAAGAAGATCGTCACCAAGTCTTTTTCCACCTGGTTCAGTGAATGCTCAGCTGAAAAGGCAATGAAATAATTCAGGGACATTAACGCTTGGGGCAAGGGTAAGATGTTATAGCGTTCTGGATCAGGTTGGGTATGCACACTGTCTGGTAAAAAGGTAACACCCAGTCCAGCGGTGGCTAGTTTGGTGATGGTGGCGGTATTCGTGCTCTCAATTACGATATTCGGTGTCACGTTGTGCTTTTGTAATAAGTAGTCAACTTGGCGTCGAATCGATGACCCGTGGGGCGACAAGACTAGCGGCGCTTGTAGCAGGTCGTTGAGGGGTAACGCTCCCGGATTAATGAAGGCCTGATGGGGTTGGTACCAGTTGACGGTGTTCGGGATAATCGCGTAGTACCCGTCGCGACCGCGGTCATAGCTTTCAAGCCCCGGCGCGATGGTTTCCGGGTTTTGACCAATTAAGAAGTCCAGCTCACCGTGGAGCACGCGCTGTTCGTTGCGACTAGCGATATCTTCGGTTAATTCGATCTTAGTGGCCGGGTGGGCTTTCAAAAAAGCAGGTAGGAACAGGGGCAATAAGTAATAGCCGAGGCTAGATAAGACGCCCAGCCGAATCACTTGTTGGTTGGCATGCGTGTATTGCCTAATTTGCTTATTAAAGTAATCCTTCTCGTTTTCGAGCACCGTCAAATATTGATAATAAGTCCGCCCAGCCGTGGTCAGTCGCAGTGGCGTGACTTCACGATTGATGATGGTGACGCCCAGTTCTTTTTCCACGTTGCGGATGCTTTGGGTGAGGTAAGGTTGTGAAATGTAGAGATCTTTAGCCGCCCGGGTAAAATTGCCGTGCTTGAGCAACACATCTAAAAACCGTCGCATTTCGCTGGAATCTGATTTTGGCATAAAGCGCCTTCCTCTCGCATTGTGATTAAGTGATTATTCGTTTGATTGCTGATTTGGTCATGTTGGGTTAGTTGCATCGCCATAAGGACGTTCAAAACATGTTCAATAAGTTCGGTCAACATCCTGACGATAGTGGCTAAACCGCATTATGACCAACCATTTTAACATGATTAATTTTAACGCGAATCGTCGACATAGTAAATTTGTTATCGGGGTATAGATAAATAAATATTTCACAAGCACAGCGCTTTCACTTACACTAATCAGTATTAAGAGTGGCCAATCATTCAGTAGCTACTCGTCGAAAACGACTGTTTAAATCATCCTGAAAGGATCTGAAATTATGAAATTTGTTGGGATTGTTGGGACGAATGCAACCAAATCGACCAACCGGCAGTTACTGCAATATATGCAACGGCATTTTCAGCAACAAGCCACGATTGAAATTTGTGAAATAAAAGATTTACCGGCTTTTAATGAACCGGAAGACCGAACAGCACCAGTAGCAATTCAACAGCTCAGTGATAAGATCACCGCAGCAGATGGCGTGATCTTTGCCACGCCGGAGTATGATCATTCAATTCCGGCCGTACTGAAAAGCGCGATCGAATGGCTGTCATATACCACGCGGCCGTTAATTAATAAACCAGTTATGATTGTTGGGGCCTCGAACGGTTCACTGGGAACCTCACGTGCTCAAGCGCACCTACGCCAGATTTTAGAGGCACCGGAATTAAAAGCACTGGTGATGCCGAATATTGAATACTTACTAGGCCGTTCACTACAAGCTTTTGATGATCAGGGTGACCTGACTTATCCGGATAAGGTTCAGGAATTAGACAATGCGTTTGGCGAATTCATTGATTTTGTGGATTTAACGAATAAGATCATGCCGTCGAGTCAGTTTTTCGAAAAGAGTAAGCAGTTCTCGTGGCGACAAGTGACTGGGGAGGAATAAACATGAAATTTGTTGGAATTGTTGGGACGAATGCTCAGCATTCATATAATCGGATGTTACTGGAGTTTATGCAACGACATTTTGCGACGCAAGCCGAAATTGAAATCTTAGAATTGACTGATGTCCCAATGTTTGATGAATCGAATAATCAAACTGACAGTACCATCATTCAAAACTTTGCCACCAAAATCGCGGCGGCTGACGGGGTTATCATTGCCTCACCGGAACACAATCATTCCGTACCTTCCGCGTTGAAAAGTATTATTGAATGGTTATCATTCAAAATTCACCCATTAGATGGGCAAGCAGTAATGATTGTTGGGGCTTCATACAGTGTCCAAGGATCGTCACGCGCGCAACTACACCTGCGCCAGATTTTAGACGCTCCCGGTGTTAACGCCAGTGTCATGCCCGGTTCAGAATTCTTATTAGGTCGTGCCCAAACGGCTTTTGACGATCAAGGTAATTTAAAGGTGCAAGGGACGGTTGATTTTCTGGACAGTTGTTTTGCAAAGTTTCAGAAGTTTGCGACCATCGTCGCCGAGATGCGGGCACCAGAAGCGCTTAGCTTTGCCCCGGGTACTTATCAGGTGACGGCCACTGGACATAATGGCGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP032751|1201821:1211659|1203141_1204113_-|AYJ35278.1|DBSCAN-SWA MITNKCRYGLVGLISIVLTFGLSASNRLRASFNATPAITYMSKYGIINHRTQWQAMLHATDHGRKITSLTQLNQILRAANLHSFAVANLRQVEHATRPTKTMSAGLTIINVPAFYSSQHQLQKQYWTQLQHLIKQTKPTTDLILNFAANTGGSSAPMIAGLATIIPDGTLYTGITNHHRNRPRVMYHGRITGGLGQDDFNFSQPTAAHFRHIYAIIGNQTASAAEVTIMALKRNPHVTLVGRSSAGYTSLNGGVFLNTAVAVMTIGTLKATVKIHGQQYFNNQPLKPDIPTLCQPLAPLQLGQSPHLDADFLSELRTIMKHYH >CP032751|1201821:1211659|1210663_1211659_+|AYJ35285.1|DBSCAN-SWA MPNPRLAIIVPCYNEEAVLPKSAHILDGILTDLIQHKQVNAASKLLFVDDGSQDKTWKLIKSLEKQYSTVTGLKFSRNFGHQNALMAGMQVASPTAEIVITIDADLQDDPQVIPEMVARYRAGSDIVLGVRNDRSSDSLFKRWTADGFYRLMKRIGVQLVPNHADFRLLSQRAVQALLTYEETNLFLRGIVPRLGFPTTKLYYHRQPRFAGVSKYPLRKMVAFAFDGITSFSIAPIKVILLFGMVISGGSLMMMLYALIQGLLGTATSGWSSLMTSLWFLGGMQLIGISIVGEYVGKTFAEVKHRPRYIIETDDYTATQQPAIVNSQRVHG >CP032751|1201821:1211659|1209899_1210037_+|AYJ35284.1|DBSCAN-SWA MATDQSGQVSKAVTLPQTSENHQSLLIAILGLALLLLMLVWLPAK >CP032751|1201821:1211659|1204298_1205246_-|AYJ35279.1|DBSCAN-SWA MPKSDSSEMRRFLDVLLKHGNFTRAAKDLYISQPYLTQSIRNVEKELGVTIINREVTPLRLTTAGRTYYQYLTVLENEKDYFNKQIRQYTHANQQVIRLGVLSSLGYYLLPLFLPAFLKAHPATKIELTEDIASRNEQRVLHGELDFLIGQNPETIAPGLESYDRGRDGYYAIIPNTVNWYQPHQAFINPGALPLNDLLQAPLVLSPHGSSIRRQVDYLLQKHNVTPNIVIESTNTATITKLATAGLGVTFLPDSVHTQPDPERYNILPLPQALMSLNYFIAFSAEHSLNQVEKDLVTIFLTQLEADLAQSSTIS >CP032751|1201821:1211659|1201821_1203051_+|AYJ35277.1|DBSCAN-SWA MARDGTVTETNDLKLHALGEIIGMNEQEAYVTTFYWLADCWLETSYLGLEDEFDDDEIDDAVKSLLNRMQAGAIYEVTADDPMWQAWKRAVRAVLTPNDHAEHEVDETDGEDELVLPAGVRPERQLEEVQAYAAMNAFLQAQDQEYLQEIGKRAATQVSGAGWQVWRAHRQSMHPESAAPSTLTAEQLPAVMWAFFDKYQDTEDSFEIFELVNQLEQWQKSADRDLDAQWSQLVAKSQIDPAAITPMQGLSLAIEFFDQLEWDGDLTAKATLQNKLMQRTLDDALNDETTANWTDAWQHWDLADPLTTEQWARRFDPADDYEDESEEDGAARPAWQLGASYSTVLIAMRLVAYGVLRPESVPGMATVKMANRALAATVSIGIVLVAWLVTAILITIVIWGWRWMRKLIF >CP032751|1201821:1211659|1208732_1209293_+|AYJ35282.1|DBSCAN-SWA MQKPMPVAVTNIADNITHQPAYMTIVLNDHKYSTARKKTPFILKALNEGAAAHGRLTITPSRLSLADERGTVFQTLAPIPTVITDVELGLYRSIVRQLGNGVRMKARYTLAVTLTSDTATYQMLNTDLSVLKPLLAWITDFHLHLTDSLQLATGDIDWPNLTADQFEALTKGTPYFAWQQTIGAHW >CP032751|1201821:1211659|1209363_1209804_-|AYJ35283.1|DBSCAN-SWA MAQIYIASPFFSPEQVTRVTQLEEALAQNPTVTDFYSPRLHQDAQAEQFTKTWATEIFHRDMAQIAAAQVIVTVLDFEAKNLDSGTAYELGVATMRDLPIIALQEKDEAVNLMITESLHWYTKQVSDFETYDFQQLPQGDFVGEIL >CP032751|1201821:1211659|1205589_1206204_+|AYJ35280.1|DBSCAN-SWA MKFVGIVGTNATKSTNRQLLQYMQRHFQQQATIEICEIKDLPAFNEPEDRTAPVAIQQLSDKITAADGVIFATPEYDHSIPAVLKSAIEWLSYTTRPLINKPVMIVGASNGSLGTSRAQAHLRQILEAPELKALVMPNIEYLLGRSLQAFDDQGDLTYPDKVQELDNAFGEFIDFVDLTNKIMPSSQFFEKSKQFSWRQVTGEE >CP032751|1201821:1211659|1206206_1208645_+|AYJ35281.1|DBSCAN-SWA MKFVGIVGTNAQHSYNRMLLEFMQRHFATQAEIEILELTDVPMFDESNNQTDSTIIQNFATKIAAADGVIIASPEHNHSVPSALKSIIEWLSFKIHPLDGQAVMIVGASYSVQGSSRAQLHLRQILDAPGVNASVMPGSEFLLGRAQTAFDDQGNLKVQGTVDFLDSCFAKFQKFATIVAEMRAPEALSFAPGTYQVTATGHNGELPMRVTLSADRIENIEIDTSSETQGIADVAFERIPKEIIAGQTLAVDAISGASITSHGVIDGVARAVKEAGANPDDLKKRRATKQVAQPAAREVTTDVVVVGAGGAGLTAAAKVLQAGHQAVVLEKFPAVGGNTVRAGGPMNAADPDWQRHFAALPGEKQTLKDLSERDESTIAPEYRADFRKLKQQIDAYLTANTNQKGTLFDSTLLHRIQTYLGGQRTDLNGQEIHGQYDLVKELTDNALDSVKWLQSIGVKFDESQVTMPVGAIWRRGHKPMGDLGFAYIKTLRAFVEQQGGTIMTETPVKELLVTDGQVRGVIATNAAHEKVIVHADAVILASGGFAANTKMLQKYNTYWTAIDDDVKTTNSPAMTGDGIRLGTSVGAALVGMGFSQMMPVSDPETGELFSGLQVPPANFVMVNQQGKRFVNEYGSRDELTQAAIDNGSLFYLIADDEIKKTAYNTTQAKIDQQVANGTLFRADTLTDLAHQIGMDPAALTKTIADYNRYVDAGEDPEFHKTAFDLKVAVAPFYATPRKPATHHTMGGLKIDPDAHVLNTDGQIIDGLYAAGEVAGGIHAGNRLGGNSLSDIFTFGRIAAAHAVAEHVDPVTA |
9 | Lactobacillus_phage(87.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
2030261 : 2047379
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP032751|2030261:2047379|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP032751|2030261:2047379|2031334_2032477_-|AYJ36033.1|DBSCAN-SWA MNSPLSQFKGERLKQARLLRMLTGTELALLISDKKVIKQQQISYWESNRRVPNFEEIQKLSAVLKVPYYFFLKGDSRNNVDTANFFRRSAAVPTKNRNSMQELVFLYSSFFKVIGRYIKLPDFKDNDLVISSHEFRLVDVDEIDELAKSIRRRYHLGIGPISNVTLLMEKMGVRVIFTNEDIAGIDALTKVVDNQFYVIINTKGKSAVRIRFSLAHELGHVFLHSRYSESILKSSEKNKRVESEAQMFASLFLMPEEGILMDMVATNLEFLKSLKSHWLVSIQALAIRGKQIGLLTQSEMTHVFQQISRNGWRKKEPLDDTISIEFPTFIKTVLEYLNSEGISVDDALYQEGLSFDFLNSLFSAIQISEIKEKGPNLKLL >CP032751|2030261:2047379|2039940_2041122_-|AYJ36041.1|DBSCAN-SWA MMIQYPKLTISDRLNQQRERLPLPDLQETFKESWTVNEKWQVTFAITDSLAYEHAIQLLDVQNVIQYDGQSYVITQCTKTVSGGVSVYEVTASHLFYRLANNARQNNVKTGTLTYGLADAVNFMLANNDQGITAKFIGDFPKIQIENLGNSSFNKFMQDYTSKFDASYIIDNQQITFYSATYLKQQPVIDTLFYQHDVEDVKLSLDTTSLVNEVRCLGKPIDQGSGTNDSQTKYQVDFTYRDDDSVKKWGLQRGDPLSDERFTDQGSMTEYAQQTVQAQPIATLTTTAWDVVIRQCETVKLIMPNLDWQTNVALNGYERNPFNQFSLPTITFDNASLAVNDINVAMFKHIVNAHANVDKTMIQLQAALGELQNGDLITDEDTIDKLNELGGIS 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>CP032751|2030261:2047379|2035209_2035473_-|AYJ36036.1|holin|DBSCAN-SWA MLQYDDTTKLLMDIQKDVATTKTKVENIEEKLTRVDDIDNKADKALAKSIEIEHEIERVTQIQNWVIGVLVSGTLVTLVVYIAEKFL >CP032751|2030261:2047379|2033710_2034709_+|AYJ36035.1|transposase|DBSCAN-SWA MSLYHHLTLNDRECLLVGLTLKQSYQAIAQRIGCSKATISREVSRNGGRSKYSAVNAQLNYERQRLKSRRPRILSQTDIRAFVINCIVHRKWSPEQIAGRLNFEHSNWKISYNTIYRGIALNNLGEKRKSHGARGFARQLRHRGKTRKVKGTIKERRGRFNDVPSIHDRPLSAENRTRFGHWEGDTVRGKTGRSALVTLVDRKSRYLLAERVSKVAAKPVAQAMMDLLNSVTPERVKTLTPDRGTEFANYQDVIDTLEIPVFFPDPHAPQQRGTNENTNGLIREYFPKGTDLNDLNDQEIIAFVTDLNNRPRKVLGWKSPSEVFFGKKLRLI >CP032751|2030261:2047379|2039686_2039944_-|AYJ36040.1|DBSCAN-SWA MSIALKDAVKIVTDTVSDINNRFPIKWEDISNKPTIDVTDFYTKEEVDTIFKASNQLISPDGTVWEPAIDNNGVVSWKKVINDGQ >CP032751|2030261:2047379|2045950_2046187_-|AYJ36044.1|DBSCAN-SWA MLNQQREQMHARLMPQATYGVELSQPLGEVVERSDEQIANEISKLTDYRTVEERQPDTPQMAMYRRLMEAKADREEAD >CP032751|2030261:2047379|2035472_2036627_-|AYJ36037.1|DBSCAN-SWA 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16 | Lactobacillus_phage(50.0%) | tail,holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
2054984 : 2108277
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP032751|2054984:2108277|DBSCAN-SWA 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76 | Lactobacillus_phage(65.85%) | tail,portal,transposase,head,integrase,terminase,holin,capsid | attL 2068283:2068310|attR 2109917:2109944 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
2112513 : 2150220
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP032751|2112513:2150220|DBSCAN-SWA 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44 | Lactobacillus_phage(64.0%) | tail,transposase,integrase,terminase,holin | attL 2106431:2106490|attR 2148374:2154455 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_8 |
2154456 : 2170668
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP032751|2154456:2170668|DBSCAN-SWA CATGTCAGTAACCAAACTTAATAATGGTAAATGGCAAGCCCGTGTCTCTTATAAAGATGATGACGGTAACTATAAGTCAGTTACTCATTTAGAAAAGCGCAAAACTGACGCCGCTGAGTGGGAAACTAAAACTAAAAATGCTCTGCTGGAAGGTGCTGACTTATCACGTAGCACTGAGAGTCTAAAGCATTATTTTCTTGATTGGATCAGAATTTACAAAACTGACGGCGTATCGCGTCATACTCACGAGCTGTATATGGGCAACTGGCACCACATCTCCGCATATTTTAAGGATCAACCTATGAGCGCAATTAAACGGCCGGATTATCAGAAATTTCTGAATGAATTTGGTCGCAGTCATGGAATTGCCACATCTCACAAACTTCATCAACAAGTACACACCGCAATCAAGGACGCTGTAGCCGATGGTATTCTAAAACGTGACTTTGCTTACAAGGCACACGTCACTGGACGCCCTCCTAAGCCCGTAGAGGAAAAGTATTTGACGTTGTCCGATTATAAGAAACTGCGTAAATATCTCATTAAAACAGCTGATTATGACCACATGACTATGCTGATGATGCTGTTTCAACTAGAAACTGGAACCAGGTTCGAGGAAGCTGCTGGCCTAACGTGGGATAATTTGGATTTGAATAATGGAATAGTTCACATTAAACAGCAATGGGACGCCCGTAGACAGACTTTTCGTCCAACTAAGGGAAATGGACAGGCAGATGGAGATATAACCATAGGACCCGCCTACTGTCGTTTTATGAGGAGCTATCGTAATGCGCAGAAAGATTATTTAGAATTACACGAAATGAAGAATCCTAAGAACCTCGTATTTTGGTCCAAACTAGGAAAAATAGTGGGCAATGGGAATGCAAACGAAGAGCTAGGACGTATTTGTAACCGTCTAAAGATCAACAAAGTTACAACACACGCCATGAGGCACACACACGCTTCAATTCTTATCTTAAATCATGAGTCCCTTCCCTATGTTCAACATCGCCTTCGACATCAAAAACTAGAAACGACCGTTAACACCTACGTCCATCTTATTGAAGAAGAAAACGGCGTGTCAGATAAGAAGGCCACTGAGCTAATGGACGAAGGATTTTAGAAAATGATAATTTTGTGATTGCTGTATTCCTTGTGCCACAAGGGATTACAAAATCATTTGTTAATTTTTCTTCCAAAAACTGCTATATTTTGACTACTTTTTTCGTTTTTGGAAGAATCGTGGAAGAACATATCGTGTTTGAGTGGTTTTCGAGTGTAAGACAAAAGCACCAAAACGCCTTTATATCAGCGTTTTGGTGCTTTGCCGTTTCTCTATATTTGTCAACTTATCACCCGCACGGGGATCGAACCCGTAACTCCGCCTTGAGAGGGCGACGTCTTAACCAATTTGACCAGCGGGCACAAATTCATTTACTATCTTACCGAATGATAAGCGGCTTGTCAAATCTAATTATGATTTTCGCCACCTAAAAATCGTCACAATAACTAATCCAACAAATAGGAGTAGACAATAGACGACACTGCACCAAAAAACGAAGGTCAATAGTTGTGGTAACAAGAAGCTACGCATCACAGCTAACCCAATAGCCGTAACTGCCCATACGATCAATTGTTGTCGCAGATGATTGAATAACCGATCTAATTCCGACTTCGACATACACTCACCTTCCCTTCAACTAGTTTAGCCGCCGACTGGCACGATATTCAAGTAAAAATGCAAAAAACACGCATAAAATTCCAGCAAAGTCTTGACAGTATTTGCTGGAAAAGTTACTATTAAATAGTTGTTATTGGGTATTCGCCAAATTGGTAAGGCAGCGGACTCTGAATCCGTAATTTACTGGTTCGAGCCCAGTATACCCAATATTCGTTATCAGCTGTTATCATTGGTTGTCAAAGACACCGTGATTGCAGCTTTTTTATTACTTTAGTTTATCATTAATTGTCATCTCTTTTCACTAAAAGTCAGCCAAAAGGACAGCCAAAAATATAACAAAAAAGCCACTGTTTCCAGTGACTTAATACTTGCGCGGGGTAGTGACTGTTAGCCAACTTTGGTTAGCAGTTTTTTTCGTTAGGCCATTAGTCTAACGCTTATTGTCAAGGCAATGACTGCAATAGTAATGTGTATCACAAAAATAACCTTTCTTATAGTTTTAGGTTCATGATAATCAAACGGCCACTGAATAAAGTCAAATACTGACAGAATCATAAAGTTAAACGCTAATAAATTTAGCCCATAAACAGTCACCGGCATAGACAAGCTGAAAGCCATGCGGCCATATTGTAATATGCTACACGTTATCAAATATGCCGGAATAATCAACAATGTAATATTTACAGTAACTTCAAAAAACCATTTTTTAATGAAATAACTCATTTACAAGGACACTCCAGTAAATATTTAACTGCACATTATTAATTATACAGTAAAATTGTTGAAGTTGGGCTATAGTAGCATTCAAACCGTTAGATCACTGTAAAATTTTGCAAAAGCGTGTAATGCTTCATTCTTCATATAATTAAACTTGCTAACACTAACCGATAATTGGTTACAAGCTTCATTGCGGGTGAAATGCTTCTCAATAACGTAATCATGTAAAATAAATTGATATTGTGGATCATCAATTGCATTTAGGGCGTCTTCGACTTCTTTTAGCTGGTAAGACAGGTCAACATGGTTTATCAGGCGGCTTTCAGCGCCGTTTCGGCTGCTATGGCTTGACACTCCATCGAATGAGGGGCTGGAAACTTGATTAAAAGCCGTCAAATCACGTTTTAGTTTGGCATATTGCTTTAATAAATTACGAATTTTCTTAACATCTTGACGCATCGGAATCACACTTTCTGATCCCAGATATATGTATAAAAAAGAGGCTCGGGGGAGAGCCTCTCACTATAGGATATGATAATCGCCGTTATTACGGGAAAGTAATATTAGGACAAATTACAACATTAATTTTAGTGCCAATCATTTCATATGTCAAACCTAAGCTTCAATTTTTCCACGCAGTTGTTGAATCATACTGACAACTTGATACGGTGTCTTTGTCATATCAGTTACTCTGTTTTGATACCAGAATTGTGTCAGCAAGGACACCGCAAAATCGTACTGTTTGTAGACAGTCAGATCTTCATTCTTGCTAACAGCCGTCTGCACGTAGTCCTTGGCGGCGTCTAAATAACTTTGAATCATTGGATCATCTTCAGTTACATCAATTCGCAGGCTTAGTTTAATGTCGTCTACAGTCACTGCCAACTAATCACTTCCTCATAAGTTTAACTTTACTCTCATAAAATTATATGGTATAAATATAGAGTACTCATTGCCCGGTAGTTCAGCGGTAGAATAATTGACTGTTAATCAAGAGATCGCTGGTTCGATCCCAGCCCGGGCAGTCTCCAAAACACATATTTATCATAAAAGGCCGTGACCTTGAAGTCACGGCCTTTTTATTACCAAGTCATAGCATAATAGATTACCTCAAACACTTTAAAAGCAACATATGCGGCGAATACATACGTGATGATAATACCACTGTATGCAAGGATAAATGTGTTCTTCATGAAATCACTCCTAAAATTATAGCTGCACGTTCCATTAAAATATGATAAGCATTATCATCATACTATCACTTGTTGTTTGAAATTCCACTTACTTTGTCTTCCTATTTACCAGCAGTTGCAGTTCCTAACGCCACATTAATTACAGCGGTCTTGTCAATCACTTCATAATCATTCCGCACAATGACGGAAAGCCCTTGACTGAACTGGTCGAACTTGTCCCATTGGGCGGTTACTTGGTTACGCCGGAAGACAGCCACGGCTTGTGATAAGTCCCCCGCAATCATTGGGAACGTCCCGTCGGCGTTGTTGGCCAGTAACTTGTCACTAATCATGACGACTGGTGCCCCTAACAAGGTGAACCCACTGGGTGCCGTTGGGTTCGGCTGTAATAAGTAACGGCCTTCGGAATCCTTCAAGGTATCAAGGTAATTGAACCCGGATTGGTTCACTAGCCACATTTTGCTCAAGGCGGGATCTAACGTCACATTGAAAATCTTTTTAAGATCATCAATACTGGTTGCCGTTGCTTTAGTAAAGTTGCTACCAGTTAACAAGCTCATAATCTGCGTGTTGTCCGTGTTATCAACCAGTTGTTGCAATTGGGTTTTAACTTCGCTAACAATATCCACTTCGGCGTCTTCCACCACTTCATTAGATAAGGCAATCTTCCCCGCCCGGGTCTTTACATCAAACGGCACTTCCGTAAACATGTTCGCGTCAATGTCGGCAATATCGGCTAATTCGTCCTTAGTAGCCAGTACCGCAGATTGTTGGCTGGTGGCAATTGGATAAGTCCCGGAACCGCTAGAAACTTGCTTAACCGTCGCATATTGGGCGAGGTTGTAATTGGATTGCTTTAATTGGAATACAGGAGTGATCAGTTCCTTAGGAATAACCGCACTGGCACCGTCAGTCTTTAAACCGTCCCGTGTTTCCCCGTGTGTCCGCACATATTGTTCAAAGGCGGGAATACCGGTTTTGCTTTCGTTACCATTGTCATTGCTGTTAGGATCAATAATTGTTTGTTTTGCCATGTTGTCAGGCTCCTTTTCTTGATTAATAAATTTTTCATAGCTACGGGTATCAACTTGCACATTTGTATCGTCATAAGCGGGAACAGCTACCACCGACACGTCGAACAAACTCTTAACTTGATTAATGGTGCGCGTGATATTACCGCCATCATCTTTAGTCCATTCGTCGGTGTCGTCGTCACTATCAAAGCCAAATGAACAGGAATCAACATTCCCACTCTGAACTTCTTCGTAGACGTCATTAGCAAACGACGTATTCGGCAACTGCGCGGTGAAATGTAGCCCCTTGTCGTCCGTTTCTAGCGTTAACGTGCCCGCCTTGGCACTGGCTAACACTTGGGTATAGTCGTGGTTATTAAGCATAAGAACGTTTGA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21 | Lactobacillus_phage(44.44%) | tail,portal,head,integrase,terminase,capsid | attL 2156443:2156464|attR 2170844:2170865 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
2363007 : 2371521
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP032751|2363007:2371521|DBSCAN-SWA CTTAAATTGCTCCTTCATTAATGAGTGTCTGTAATACATCTGGATAAAATTGGTGTTCACAATCATGAATCCGGGTCGCCAGGCTGGCTAGCGTATCGTCTGGTGCAACCGGAACGACCCGCTGGGCAATAATTTGCCCGGTATCGATTCCGGCATCGATATAGTGAATGGTAACGCCCGTCTCAGTCACACCAGCGGCAAAAGCATCCTCGATGCCGTGACGACCAGGAAACTTTGGTAACAATGCTGGGTGAATATTGATGATTTTATGAGCATACGCATTCAAGAGGGTCGGACCAATAATGCGCATGTACCCGGCCAATAATACCAGTTCAATTTGCCGTGCTTGCAAGGCCGTCAAAATGATTGCTTCCGCGGCCGCTTTATTCGCATAATCATGAAAATCAACAATTAATATCGGTACGTTAGCTGCCCGGGCTTTATCAATGACCGGCGCCGTGGGTTGATCACAGACGAGTAACCCAATCACCACCGGTAACTGCCGTTCAATAATCGCTTGGTACAGCGCGTCAAAGTTCGTGCCGTTCCCCGAAGCAAATACCGCAATCTTATTAGGCATGTTCAGCCTCCTCGAAAATGACGGGGGCCGTCCCAGTTTGGACTGTTCCGACGCGATAATAGGACTGCGCGTTGGCCGTTAAATTAGCCGTCACAGCTGCCACTTGGTCGGGGTGAACGACCAGAACCATTCCCAAGCCCAAGTTAAAGGTCGACCGAAGATCCGTGGCAGTCAGCCCACCGAGTTCGGCCAATAACGTCATAATTGGTGGTACTGGCCATTGACCCAATTCAAGGTGTGCACTCAAGCCGTCCGGTAACGCTCTGGCGACGTTTTCAATCAAGCCGCCCCCGGTAATGTGGGCGATACTCGTCACTAATTTTTGCTGTAGCAATGGTTGAACTGCATCAACGTAAATAGTCGTTGGTCGTAACAGTTCCGTTTGTAAATCATGACCAAGTTCGTCAAAAACCGTGGTCAATTGGTAGTCGTGTTGTTTGAATAAAATATCGCGAACTAGACTAAACCCGTTCGAGTGGAGGCCATTCGACGGTAATCCAATCAAGACATCCCCAGCCCGAACATTTGCTGGTGATAACAGGTCCGCGCGGTTCGCAATTCCGACCGCAAAACCAGCGAGGTCGTAATGGTCCTGACCATACATATCGGGCATCTCCGCAGTCTCGCCACCAATCAACGCTGTATGGGCCTGCTGACAGCCCGCAACAACGCCAGTCAAAATGGCTTTGACCCGCTTCTGGTCCGTATGTCCGAGGCCTAAGTAATCTAGGAAGAACTGGGGCGTCGCGCCTTGTGCCAAAATATCATTCACACACATTGCGACCAAGTCAATGCCAATCGTGGTATGTTGATCAGCAGCGATTGCGACTAAGAGCTTAGTTCCCACGCCATCCGTCCCGGCTACTAACACGGGATCGTTGGCAGTTGCATCTGAACTAAGTGGAAACGCCCCCCCAAAAGCGCCTAATTGCTGATTGCCACTCATTTGTTTGACCGTCTTTAGAACGTCGTAACCAGCGTTGATATCAACGCCAGCCCGCTTATACGCATCACTCACTTGATCACCCCTTCATGATTGGCTTGTAATTGCGCGATTTCCGCATCATACTCGGCTTGATAATCATACAAGGCCGTTGGATAATCTCCATTAAAGTAAGCCATACATAGCCCACCATATGGTTCGGTGGTCGACAAGCCAACTGCATCGACGACACCCTGTTCACTGAGAAAACCTAGCGAGTCGGCACCAAACGTCTGACACATCTCAGGAATCGTTTGTTGAGCCGCAATCAACTCATTAGTCGATTGAATGTCGATACCGTAAAAGCACGGGTAGCGTAATGGTGGCGATGCAATTCGTAAATGAACTGACTTGGCACCCGCATCTTTCAATAATTTGACGATCCGCCGACTGGTGGTACCACGTACAATCGAATCATCGATTAAGACGACCCGTTTACCAGCGACGACCCCTTTGACTGCTGAAAGTTTCATCCGGACCCCTTGTTCTCGCAATGCCTGGGTTGGCTGAATAAAGGTCCGTGACGAGTATTGATTCTTAATTAAGCCCATCTCATAAGGCAGGCCACTCGCTTCCGCATAGCCGGTCGCCGCTGATAAGGATGAATTGGGTACCCCAACAACAATGTCGGCGTCCACGGGCTGCTCAACTGCGAGCCGAGCGCCCATGCGTTTACGTGCAGAATGAACGTTGACACCGTGAATATCGGAATCTGGCCGTGCAAAGTAGATAAACTCCATTGAACAAATCGCCAACTGTGTATCAGTCGTATAATGGTCGATCGTCAAGCCATGATCATCGATCGTTAACAATTCTCCCGGCTGAACATCCTGAACAAACGTCGCACCAATCGTATCAAGCGCGCAAGTTTCACTACAAACGACGTACCCGCCCGTGGGTAACTGACCGACGACTAATGGTCGCAGCCCGTTTGGATCCAACGCAGCAATTAAACAATCATTCGTTAGTAGTAAGTAAGCGAAGCCCCCGTGGACTTGACGTAAAGCATCCTTAACCTGTTCCGTTAACGTTGCTGCGGGGCTGCGTCTAATCAGATGCATTAAAATCTCACTATCAGAACTGGCGTGAAAAATCGCGCCGTGCTGTTCCAACCGTCGCCGCAGTGTCACCGCGTTCGTCAAATTGCCGTTATGTGCGAGTGCAAACTGTGAGTCGCTAAAATTAAAACTCAGGGGTTGAATGTTTTCCAATCCATGATTGCCAGCCGTGGCATACCGCACGTGGCCGACTGCGGCTTGACCCGTCAAACGAGCCAACCGCCGTGGATCCCGAAAGACATCAGCCAACAACCCTAGTCCGCGTTCCGTCTGCAGTTTGCCGTGATCATTCGCCGTGATACCGGCTCCTTCTTGCCCTCGGTGTTGTAACGCATGGAGCCCAAAGTACGTTAATTGGGCGGCGTCCGGCGAGCCCCAAACCCCAAAGACGCCGCATTCTTCATTCAAACTTCTTACTTCAGTAGGCATGGTAAGGCCCCTTCCCACAATTGTTTGGCGAAGCTAACCTTGATATCAAACGCCTGATCAGCAGTTTGAACGTGTAGCCGATCCGTGGCAGTCGTTCGCCCTAAATAGGTGACATATGGTTCCATTAAACTTTCAAACGCGGCTTGCTGTTCCGGCGTCACTGAGATAACAAACCGTGATTGCGTTTCTGAAAAGAAGTTAGCAGCAGGCAAGTCACTGACCAGTTCCACCCCGACATTTTGTGGAAAACATGCTTCCGCAATCGTCGTAATCAAGCCACCTTCAGAAACGTCATGCGCACTAGCAACTAGTCCTTTTTGGATGGCCGTTAACAATAAGCGCTGATTGCGATTTTCCGTCACAAGGTCAAAATCAAACAACTCGCCACTGATCGTTCCCGTTAACATCTTTTGCAGCTCACTACCATTGAAATCAGCTTCGGTGGTCCCTAATACGTAGACTGCATCGCCAGCGTGCTTGAAATCACTAGTCGTAATATCTTTCTGATGCTTTATTAACCCGACCATCCCAATCATTGGGGTAGGATAGATGGCTTCCCCGTTCGATTCATTGTTCAGCGAGACATTGCCGGAAATCACGGGCGTATTGAATAATTGGCAGGCCCGAGCGATGCCCATCGCCGATTCGTCCAAATCGTAAAATTGTTCAGGTTTCTCTGGATTACCAAAATTCAAGCAATCAGTGATACCTAAAGGTTGCCCACCGGAAGCAACAATGTTACGGGCCGCTTCGGCTACGGCGATTTCCCCACCGATACGGGGGTTTAAGTATAAGTAGCGTCCGTTAACATCGGTAGTGATCGCCAACGCCTTATCCGTATGCCGAATCCGAATAACCCCCGCATCGGCCCCCGGCTTAACGACCGTATTCGTTTGGACCTGCGAATCATACGTCCCATATAACGACGCCTTGGAAGCAATCGTTGGCTGTTGAAGCATCTTCTTCAATGTGCCAGTTGCATCAACTAGTCGTGGCATAAATTGATGATGGCTTTGATGGTTCAAGCGCGTTGGGCGTTTCTTTTCGCGTTCATAGACTGGCGCTTTAGTCGCAAGCGCATCGACGGGCACATCTGCAACTAACTTGCCATGATGGAATAATTGATACTGATGGCCGGCTGTCACTTTACCAATTGTGACTGCATCCAGACCGTACTTTTCAAAGACTTGATAAATTTCTGCTTCAGCACCAGCTTTGACGCATAGTAGCATCCGCTCCTGTGATTCAGAGAGCATCAGTTCAAACGGTGTCATGCCAGTTTCACGTTGTGGCACCAAGTCGAGATTCAGTGACAACCCACTGCCGGCTTTCGACGCCATTTCGGCTGAGGAGGAAACTAGGCCTGCCGCGCCCATATCTTGAATCCCGATTAAAACCTCCCGATGATCTTGGATGACTTCGAGACACGCTTCCATCAATAATTTTTCCATAAAGGGATCACCAACCTGAACCGCGGAACGCTGGGTTTCATTGGCGTCATTAAATTCAGCAGAGGCGAAGGACGCCCCGTTGATGCCGTCACGCCCAGTTTTTGCGCCGACATAAATAACGGCGTTGCCAATACCGGTTGCTTGGCCCTTCTGAATATCAGCTTGATCCAAGATTCCAACACACATGGCGTTCACCAACGGGTTCTTCTGATAACTCGCATCAAATACCGTATCACCACCGATTGTCGGAATGCCAATACAGTTGCCATAACCGCCAATGCCGGCGACCACTTGTGAAATCAAGTATTTCGTATGCGCATCAGTCGGTTCCCCAAAGCGAAGACTGTCCAGCAGCGCAATCGGCCGGGCCCCCATCGAAAAGATGTCCCGAATGATACCACCCACACCCGTTGCCGCACCCTCATAAGGTTCAACTGCAGACGGATGATTATGACTTTCAGCTTTAAAGACGACAGCCTGACCATCACCGATGTCGATAATACCGGCACCTTCGCCGGGCCCTTCAAGTACCTGTTCACCCTGCGTCCAGAATTTTTTCAAGACTGGTTTTGAATTCTTGTAGGAGCAATGTTCGCTCCACATGCCGGAAAATAACCCGGTTTCAGTCTCGTTAGGTAAGCGTTGCAGGACTTTATCCGTTAATAACTGATACTCAGCATCGGTTAAGCCCCAATCCCGATAAACCTTGGAATCGCGAACATCCGTAGGTGATAATGGTTGCTTTTTAAGCATGGGTGACCTCCTCTTGACGTGCAATGACCGATTGAAAAATTCCGAGACCGTCCGTGGAACCTAAGATCATCTCCACGGCCCGTTCCGGATGGGGCATCATCCCAAGCACATTGCCCGCTTCATTTGTAATGCCAGCAATATTAGCCGTGCTGCCATTTGGATTCTCGACATATTCGAAGATGATTTGATGATTAGCACGTAATTGTGCCAAGGTGGCGTCATCACAATAATAATTGCCCTCGCCGTGGGCAATCGGTAAACTGATCTGATCCGTCGACCCGTATGCCGCGGTAAAAATCGTCTCATGATTGGCAATTCGTAATGGGCTGTCCTGACAAATAAACTTCGCTGAGCGATTGGCCTGCAATGCACCAGGTAATAATCCGGCTTCGGTCAAGACTTGAAAGCCATTGCAGATTCCGATGACTGGTTTACCAGCGTTAGCAAATGCAATAACGGCCGGCATGATGGGCGCAAAGCGAGCAATCGCCCCACTCCGTAAATAATCACCGTACGAAAAGCCACCAGGTAACACCACCGCGTCATAACCTGCTAATGAGGTCGCTGTCGCCGGAATCAAATCAGCCGTAACGTGTAAAATATCGCGCAAGGCGTTCACCATGTCATGATCACAATTAGAACCAGGAAAGACTGGTACGGCAAATTTCATCATTACAAAGCCTCCATCTCAGTAATTTCGTAACGATAAGTTTCCATATTAACGTTGGCTAATAAGCGATCACACATCTCATCGATTTCAGCAGCCACTGGCCGATCATCCGCGTGAATTTTCACCTCAAAATACTTACCTAATTCAACGGCATCGACATTCGTATATCCGAGTCGGTGTAAGGCATCATGGATTGCCTCACCCTTGGGGTCCAGAATTGATTGCTTATAAGTCACATAGATTTTAACTAAGTACATGTTAGGCCTCCTCGACGGTTGCTAGCCGCGTCAATACTTCCTGATAAACACTAGTCAAGTCGCCTAGATCCTTGCGGAAGACATCCTTATCAAGCGATGCACCGGTCTTTAGGTCGACTAACCGACAACTATCTGGTGAGATTTCATCAGCCAGCAAGACTTTACCGGTGGTCGTCAACCCAAATTCGATTTTAAAATCAACGAGCTGTACCCCCATCGCCGCAAAAATTGCCGTCAAACGTCGGTTAACCTGTAAGGCCTGCCGTTTAATTTCCGCCACGATTGCCGGTGTTGCAACATTTAGCGCGTGGATTTGTGAATCATTGATAAATGGATCATCCAGCTGATCACTCTTATAGAAAAATTCCAGTACTGGTTCTGCAAATTTAGTTAAGTGTGGCACGGCAAATTTACGCTCAAAACTACCCGAAGCGGCATTCCGAACAACTGTCTCCAGGGGAATCATGGTTACGCGGCGGACAAGTTGCACGTAGTCTGAAGGTTGCTCAATAAAATGGTTGGCGATGCCGTGGTTTGCTAAGTCTTTGAAAATCAAACTTGCAATCCGATTATTCAAGCGGCCTTTCTGGTCAATGGGCACCTTCCGCTTACCATTTAACGCCGTTGCTTGATCTAAGTATTCGACCCATAGAATTTCAGGATCATTAGTGGCATACATCGCCTTCGCCTTACCCGTGTATAGCAAAGCTTGTTTCTCAATCGCTGCCGTCATGATTATTGTTCCCCTTTCAAAATTGCCACTGACGTTAATGCTGCGTCAATATCGTGATTTAATACGGTGACATGGCCCATCTTGCGCTGGGGCTTAATGGCCGCCTTACCGTAGTCGTGAAAATGCCATTCTGGGTGTTCAACCAACTGTTGCCGTGCCACTGTTAAGTCATCACCTAGCAGATTACGCATCACTGCCGGACTGGTCTGCGTAATGGCCGGAATCGGTAAGCCACAGATACTTCGAATATGGGCCTCAAACTGCGAGATGTTGCAGGCCTCAATCGTATAGTGACCAGAATTATGTGGGCGTGGTGCCAGTTCATTGACTAATAAAGTATCATCCGGTAAAACAAAGAATTCGATTCCTAGCACGCCACGTAGTTCCAGGGCTTCAGCAATCGAAACCGCAATTTTGCGGGCCGCACTATGAACACTGGGCTGAACATTAGCCGGGGCAATCGTTGTGTGTAAGATATGATGTTGATGCTGATTTTCAACTAACGGAAAAGTCGTCACAACACCAGCAGCACTACGCGTCACCATCATGGAAACTTCTGTTCGAAATTTCTGCCGCGCCTCTAGAATGCACGGCTGTGTCAATAAGGCGCTAGCGGCTTTTGTCACCACTGCTGTGTCTAGATCCGTTTGTCCGTGACCATCGTAGCCACCTGCCGCCGTTTTGAGAATTGCCGGCGTACCAACACGGTTGAGGGCGTAATTTAATGACTGTAAATCCGTCACCGGTGCGAAAGATGTGACTGGGATGCCATGATCATGAAGAAATTGCTTCTCATTAAGACGATCTCCAGTAATATGCAGGAGTGCAGTGCCCTGCGGTAACTTTGCATAGGCTTGCGCAGCAATCAAAGCATTCTCATCAACGTTTTCGAACTCGTAGGTCAAGACATCACTACGGCGCGCTAGATCAAGTAAAGCCGCCTGATCATCATAAGCCGCAACAATCTGAAAATCTGCGACCTGGGCTGCCGGTGCTTTGGGTGTCGGGTCAAGTACACCTACCCGATAGCCCATCGCCTTCGCGCTAAGTGCCATCATCTGACCGAGCTGACCACCACCAACGATTCCGATCGTTGCGGGCGGTAAGATTGCTTCCTTAAAATTGGCGTTCACTTTGTTCAGCCTCCTGACGTTGATGCGTACGAAATTCTCCAATTGCACGTTGCACTTGCGGTTCGCGCAAACCAATAATTTGCGCAGCCATCAACGCGCCATTCTTAGCTCCCGCATCACCGATTGCCATCGTCGCCACGGGTACGCCCGCTGGCATCTGTACGATTGACAATAATGAATCGACTCCGTTCAACGTATGGGTCTTAATGGGCACCCCAATTACTGGGAGTAGTGTATTAGCAGCTAGCATTCCGGGTAAATGGGCAGCGCCCCCCGCACCCGCAATAATGACTTGAATTCCCCGTGACGCTGCTTCTTCACCATAGGATTGTAATGTCTGGGGCATTCGGTGGGCCGAAATAACGTGACGCTCATAAGAGACTCCCAGTGCCGTTAACTGTTCTGCCGCTAATTGCATGGTTGGCCAATCAGAAATTGACCCCATAATCAAACCAACTTTCGCCATCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP032751|2363007:2371521|2366039_2368259_-|AYJ36378.1|DBSCAN-SWA MLKKQPLSPTDVRDSKVYRDWGLTDAEYQLLTDKVLQRLPNETETGLFSGMWSEHCSYKNSKPVLKKFWTQGEQVLEGPGEGAGIIDIGDGQAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGEPTDAHTKYLISQVVAGIGGYGNCIGIPTIGGDTVFDASYQKNPLVNAMCVGILDQADIQKGQATGIGNAVIYVGAKTGRDGINGASFASAEFNDANETQRSAVQVGDPFMEKLLMEACLEVIQDHREVLIGIQDMGAAGLVSSSAEMASKAGSGLSLNLDLVPQRETGMTPFELMLSESQERMLLCVKAGAEAEIYQVFEKYGLDAVTIGKVTAGHQYQLFHHGKLVADVPVDALATKAPVYEREKKRPTRLNHQSHHQFMPRLVDATGTLKKMLQQPTIASKASLYGTYDSQVQTNTVVKPGADAGVIRIRHTDKALAITTDVNGRYLYLNPRIGGEIAVAEAARNIVASGGQPLGITDCLNFGNPEKPEQFYDLDESAMGIARACQLFNTPVISGNVSLNNESNGEAIYPTPMIGMVGLIKHQKDITTSDFKHAGDAVYVLGTTEADFNGSELQKMLTGTISGELFDFDLVTENRNQRLLLTAIQKGLVASAHDVSEGGLITTIAEACFPQNVGVELVSDLPAANFFSETQSRFVISVTPEQQAAFESLMEPYVTYLGRTTATDRLHVQTADQAFDIKVSFAKQLWEGALPCLLK >CP032751|2363007:2371521|2363578_2364604_-|AYJ36376.1|DBSCAN-SWA MSDAYKRAGVDINAGYDVLKTVKQMSGNQQLGAFGGAFPLSSDATANDPVLVAGTDGVGTKLLVAIAADQHTTIGIDLVAMCVNDILAQGATPQFFLDYLGLGHTDQKRVKAILTGVVAGCQQAHTALIGGETAEMPDMYGQDHYDLAGFAVGIANRADLLSPANVRAGDVLIGLPSNGLHSNGFSLVRDILFKQHDYQLTTVFDELGHDLQTELLRPTTIYVDAVQPLLQQKLVTSIAHITGGGLIENVARALPDGLSAHLELGQWPVPPIMTLLAELGGLTATDLRSTFNLGLGMVLVVHPDQVAAVTANLTANAQSYYRVGTVQTGTAPVIFEEAEHA >CP032751|2363007:2371521|2369187_2369919_-|AYJ36381.1|DBSCAN-SWA MTAAIEKQALLYTGKAKAMYATNDPEILWVEYLDQATALNGKRKVPIDQKGRLNNRIASLIFKDLANHGIANHFIEQPSDYVQLVRRVTMIPLETVVRNAASGSFERKFAVPHLTKFAEPVLEFFYKSDQLDDPFINDSQIHALNVATPAIVAEIKRQALQVNRRLTAIFAAMGVQLVDFKIEFGLTTTGKVLLADEISPDSCRLVDLKTGASLDKDVFRKDLGDLTSVYQEVLTRLATVEEA >CP032751|2363007:2371521|2368251_2368932_-|AYJ36379.1|DBSCAN-SWA MMKFAVPVFPGSNCDHDMVNALRDILHVTADLIPATATSLAGYDAVVLPGGFSYGDYLRSGAIARFAPIMPAVIAFANAGKPVIGICNGFQVLTEAGLLPGALQANRSAKFICQDSPLRIANHETIFTAAYGSTDQISLPIAHGEGNYYCDDATLAQLRANHQIIFEYVENPNGSTANIAGITNEAGNVLGMMPHPERAVEMILGSTDGLGIFQSVIARQEEVTHA >CP032751|2363007:2371521|2363007_2363586_-|AYJ36375.1|DBSCAN-SWA MPNKIAVFASGNGTNFDALYQAIIERQLPVVIGLLVCDQPTAPVIDKARAANVPILIVDFHDYANKAAAEAIILTALQARQIELVLLAGYMRIIGPTLLNAYAHKIINIHPALLPKFPGRHGIEDAFAAGVTETGVTIHYIDAGIDTGQIIAQRVVPVAPDDTLASLATRIHDCEHQFYPDVLQTLINEGAI >CP032751|2363007:2371521|2369921_2371052_-|AYJ36382.1|DBSCAN-SWA MNANFKEAILPPATIGIVGGGQLGQMMALSAKAMGYRVGVLDPTPKAPAAQVADFQIVAAYDDQAALLDLARRSDVLTYEFENVDENALIAAQAYAKLPQGTALLHITGDRLNEKQFLHDHGIPVTSFAPVTDLQSLNYALNRVGTPAILKTAAGGYDGHGQTDLDTAVVTKAASALLTQPCILEARQKFRTEVSMMVTRSAAGVVTTFPLVENQHQHHILHTTIAPANVQPSVHSAARKIAVSIAEALELRGVLGIEFFVLPDDTLLVNELAPRPHNSGHYTIEACNISQFEAHIRSICGLPIPAITQTSPAVMRNLLGDDLTVARQQLVEHPEWHFHDYGKAAIKPQRKMGHVTVLNHDIDAALTSVAILKGEQ >CP032751|2363007:2371521|2364600_2366055_-|AYJ36377.1|DBSCAN-SWA MPTEVRSLNEECGVFGVWGSPDAAQLTYFGLHALQHRGQEGAGITANDHGKLQTERGLGLLADVFRDPRRLARLTGQAAVGHVRYATAGNHGLENIQPLSFNFSDSQFALAHNGNLTNAVTLRRRLEQHGAIFHASSDSEILMHLIRRSPAATLTEQVKDALRQVHGGFAYLLLTNDCLIAALDPNGLRPLVVGQLPTGGYVVCSETCALDTIGATFVQDVQPGELLTIDDHGLTIDHYTTDTQLAICSMEFIYFARPDSDIHGVNVHSARKRMGARLAVEQPVDADIVVGVPNSSLSAATGYAEASGLPYEMGLIKNQYSSRTFIQPTQALREQGVRMKLSAVKGVVAGKRVVLIDDSIVRGTTSRRIVKLLKDAGAKSVHLRIASPPLRYPCFYGIDIQSTNELIAAQQTIPEMCQTFGADSLGFLSEQGVVDAVGLSTTEPYGGLCMAYFNGDYPTALYDYQAEYDAEIAQLQANHEGVIK >CP032751|2363007:2371521|2371035_2371521_-|AYJ36383.1|DBSCAN-SWA MMAKVGLIMGSISDWPTMQLAAEQLTALGVSYERHVISAHRMPQTLQSYGEEAASRGIQVIIAGAGGAAHLPGMLAANTLLPVIGVPIKTHTLNGVDSLLSIVQMPAGVPVATMAIGDAGAKNGALMAAQIIGLREPQVQRAIGEFRTHQRQEAEQSERQF >CP032751|2363007:2371521|2368931_2369186_-|AYJ36380.1|DBSCAN-SWA MYLVKIYVTYKQSILDPKGEAIHDALHRLGYTNVDAVELGKYFEVKIHADDRPVAAEIDEMCDRLLANVNMETYRYEITEMEAL |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_10 |
2517884 : 2572340
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP032751|2517884:2572340|DBSCAN-SWA 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45 | Staphylococcus_phage(30.0%) | bacteriocin,protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_11 |
2745243 : 2796370
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP032751|2745243:2796370|DBSCAN-SWA 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52 | Staphylococcus_phage(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_12 |
2815195 : 2862534
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >CP032751|2815195:2862534|DBSCAN-SWA 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41 | Staphylococcus_phage(41.67%) | bacteriocin,holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
|---|
3. CP032753
Click the left colored region to show detailed information
0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
13466 : 27037
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP032753|13466:27037|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP032753|13466:27037|25192_27037_-|AYJ37189.1|DBSCAN-SWA MSKVTKIISFIGLTIAMFMGTLDSTIVNIALPKIMTHFNANLTDTSWVATIYTLALAVFMITGSKIADRYGRKKIMLLGLALFGGFSAACMLATSLPELIAFRFFQGLGGAIITPIVLPMGIEIFGKAHMSKIASVVGAVTALAAAGGPPIGGVIIEYASWRWVFGINVPLTIVAFLIIAMGVRESYDKSLAGRIDLPGTILLTLGLGGLTFGLLEGRQYGWQSGIILGTLIGGVLAIGLFIFIESKVKHPLLELDLFREKTLTASSLVYFLTGFALVSPTLILNYFLQDVLNDTALHAALIIIPVSLTIMVAMPLGTKLFDQVGAVPVTLIGLLVMAASLLLLSFITTTTPKAVIITFLVINGVGFGFSSVSLVASVKHLPKNKSGIGSGIVNAARQIGTCLGIAILVTVLDNNVNTAKQHIHQDAIQIVDRQQLSPKVNKVAHQQLNSLFSTTGSAKLTTKNKQTNLRRALKQAAKSQVDLPQPQKGTDLHQIYQAQKKLALATDNLKAGNQQLALTLTKLENQNTAISKLSVASQKINLGNQQISQGQKKMLVGLKQLAQKEALTTALRKIKHTKNRQISQAFSHTYLVGAVIVLILSPIALLTDRKPLKS >CP032753|13466:27037|23046_23751_-|AYJ37187.1|DBSCAN-SWA MKSIWEMDAPIGLVFFFGPASIIGIMMLISGFNTVSAIMVLVLVLCGLKYMHTSIIGKYRIMKSIVNSIHLKKDSKILDAGCGHGAFMLQFNRQAANISEIIGIDIWSNKDQGSNSIAATQKIMENSNLADKVKLKTANILNMPFNDNEFDLIVSSLVLHNIKPFEKRKAALVNIARVQKQKGQLVIMDIGYETSKYVRILKDLGYQNVNIANTGYNGWWGTPMVPTFVITATK >CP032753|13466:27037|16542_17145_-|AYJ37180.1|DBSCAN-SWA MTTPNIHIKNPKPTKIKQFANPKPKEWLAKDLSKGLYADWKFPSVSDGNGVRGSLFVSGCMFHCHNCFNASIWNFNNGKPFTKDVQDKIIQDLSHSYVQGLTLLGGEPFLNTNILIPLIDRVRKELPTKDIWSWSGYTWEELLKDSDDKLEMLSKLDVLVDGRFDERLKAGDHPFRGSSNQRIIDVPASLKQHKLIKLME >CP032753|13466:27037|13466_15206_-|AYJ37178.1|DBSCAN-SWA MAQKASEQLVDVLIDWHVKHVYGLPGDSIDTTVDALRKQQDQIGFVQVRHEEVASLAAAAEAKLTGKLGVCLSIGGPGAIHMLNGLYDAKMDHVPVLALLGQVDTQFLNEEYFQEVNTPQLFADVAVYNKLISATDNLAEIVDEAIRTAYEKHGVAVLTIPDNLPEQRVSDHYISSASSFQLTSPQMDDNRLNTAAKLICDSKKPLALVGLGAKKAGSQVAAFLEQNHIPFISTLPAKGIIGDSHPNSLGNVGKLGTKPAYEAMQNTDLLLMFGTNYPYTAYLPKPGTAKSIQINTSASAIGKRYPADVGLVADIKDVIKQLNSSETTILHPDDGFLKACQENVASWNRWMTGKRELDSKPVAPEALFNDINETAPLNTIYSIDVGTATSWSARFLNVSPTQKFILSSYLGTMGCALPGAIAAKINYPDRPVISVNGDGAFAMVMQDFITAVKYKLPLINIVLNNSKLAFIEYEQQAAGQLNYQIDLQDMDYAKFADAAGGVGITAKTSEEFKNALNRAYRVQNMPVLINAYVSDDAPLPGKIVGQEAKGYMKFGSQYLKEEKKIPELPPLKDILRQFF >CP032753|13466:27037|22519_23038_+|AYJ37186.1|integrase|DBSCAN-SWA MSEQLCHNYTVFQVGKATLLRVSDVMRLRWTDVFNENGSVRQNAFIHDQKIGKANLLYLKPAQNDLLVYQAWLQENHLISDWLFPSLQHPERHITEKQFYKIMSKVADLLGTNYLGTHTMRKTGAYRVYTQSNYNIGLVMNLLNHSSETMTLACLGLDQASQETMLDQIDFG >CP032753|13466:27037|17233_19657_-|AYJ37181.1|DBSCAN-SWA MQLKDVVNELSLSEMQITRLANDKKIVRYHKNHSKMWEYDDESVFVYKHYLEEKQRLAQRYNTQKTVIKRNKSIAKFHRENITNAVTKAFDDVYSNIEDHITKIDQIVDLTINKLLRQNKMQFDITEIQSAVEQSLVDVEEFKVAEAYTAYRLQHDINRKKQTSVDYQINKLLKKDDDVVNENANKDADVYATKRDLTAGAVSKAIGLKILPKKIADANIKGLIHWHDLDYSPANQYHNCGLIDLEDMLKNGFTLGNADVESPHTLTTAVAQASQILSAISSSQYGGCSYDRIDEVLAPYAKKSFKKHLKIAKSLNIEDQKNYAEIMTRREIQQAMQSFEYEINTLYSSNGQTPFVTLGFGLGTSWFEREIQIGILHQRIAGLGKDHRTAIFPKLLFTIKPGVNMHPKDPNYDIKKLALKSVIKRMSPEILNYDNVIDITGSFKASMGCRSFLSAMSPEDLKARGETHDYSSGRLNLGVVSLNLPRIALDSNGDKEKFWKLLDERLNLQRDALLFRIENVKQALPKYNPAGFMYGGYGRLDPDGNVDELFNHNRASVSMGYVGLYEMTARFYGDWQHDHTYNQEAHDFAYSVIKHMNEKAAAWKKQYGYGFSVYGTPAESLNSTFEEIDHKLYPNVPFVTDHDFYTNSFHYFVERKPTPFEKLDFEAPFQKLSNGGFISYVELPCMKDNLDALEAIWDYSYKAGIGYFEINTAIDHCLECDFHGEYTADEKGYHCPNCGNSNPETSDVTRRICGYLGNPMKRPPKHGRQAEIIHRVKHMSGTLGRLDNGEFLESDIADKNKVRKLNN >CP032753|13466:27037|20516_20804_+|AYJ37183.1|transposase|DBSCAN-SWA MTKHSYDKEFKEQAVQYYLDNKDHMTMNEISKNLGIGASTLHKWIKLFTETGEFGRGSGNFASDKDKEIARLKRQLRDAEGAIEVLKKSIGILSK >CP032753|13466:27037|22104_22482_-|AYJ37185.1|DBSCAN-SWA MKLNKPHIIGGGYTGHIGLIGPTIIPFQGACWNCFERKYKNDLKDHHFDILLNTRKSSGAVVFLSSIIANIQAWDGVRVITGIGSPLMLNRKGFLDLDTLKIDWEIVSKDPNCEVCQTNSYDKNN >CP032753|13466:27037|19815_20469_+|AYJ37182.1|transposase|DBSCAN-SWA MENYFKGRHFQKDIILVAVGYYFRFSLSYRDVVEILCDRGIIIHHTTVMRWVHHYGPLFKLLWRKQRDTHSQSWRVDETYIKIKGRWHYFYRAIDSHGLTLDFELRKHRDYQSAYHFLKRLLTTYGRPDCLVTDQYAGTLKAIKQVIKDGLLVKANHQCSKYRNNLIEQDHRLIKHVLVKSSGFQSLRTALKTLSGIEVMHQLHVDGGPRIKSVQVK >CP032753|13466:27037|20827_21706_+|AYJ37184.1|transposase|DBSCAN-SWA MDVQHALESHPSINGMCDYVGISRSGYYQRERRHNHQSPRKLRKKLIQGEIKAIWLKSLCIYGAGKITQELRSKGYKIAERTVGKYMRELGIHAVYLTPWTTTTRNSKFDKQLINILDEQFNPLRPNAVWCIDTTYIPVHDGFVYLTSIMDLYSRRIIGWDLSETLEVSNVIPLIEKTKHSRHISKPLIMHSDRGSQFTSEAYNQVTANMTLSYSKKAYPWDNACIESFHALIKREWINRFKIHSYSEAKRLVFQYIETFYNTVRIHSHCGFKSPKQLEDEYQTQIQNLVVA >CP032753|13466:27037|15382_16303_+|AYJ37179.1|transposase|DBSCAN-SWA MGTSTLSRFQRGALAQLVSEGHHTYQDMADALGVAKSTISYELDRVKPYDPELAQQDADHKRRACGRHSILTPSLTILITNHLRLTWSPEAIATAFNLSTASIYNWLKLGWLPFNLADLPNRNVRQRRANEHRGTFTSGTSIEQRPKSVNQRLAFGHWEVDTVLSSRGQSRACLVTFVERKTRLLWAIKAPNRTAKALNDTFGKFMGTFGSQVKSITVDHGKEFADYRSIEQDYQIKVYFCHPYSPWERGSNEYFNRRLRWFFPKKTNFDQITTDEILAALELINQRPLKIHHQQTAIESFRACSD >CP032753|13466:27037|23965_25021_-|AYJ37188.1|DBSCAN-SWA MILKKFDYKTLNNLEITSSMNDKLNQIYELKGRLSATSITYKEALDHLVNVAKVQSTDASNRIEGIYTSNTRLKQLVHQKISPRNRSEAEIAGYRDVLALIHEQYAYIPINNSSILTLHKRLFSYTNSTWGGQFKDSDNQIITEYADGRQEVRFQPPAAYLTPKLVQELCINYNLAVDQQTFAPLILLGAFIFDFVSIHPFRDGNGRMSRLLMLLTMYQAQLNVGKYISLENLIEKTKRSYYEVLKQSSLNWQNNQNDYAPFLDYFFGVILQAYRNLNDRLNLVQDKPVSATDLILTTLTQELKPLSRSELTALIPQYSDITIKRALSELKKSQRIKLIGKGRSSKYILKN |
12 | Enterococcus_phage(22.22%) | transposase,integrase | attL 15282:15341|attR 33425:34460 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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